KR101577147B1 - 사이코스의 생산 방법 - Google Patents

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최민진
정성희
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경상대학교산학협력단
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Abstract

본 발명은 사이코스의 생산 방법에 관한 것으로, 보다 상세하게는 기질인 과당과 그 에피머라제를 미생물 내에서 40℃ 이상의 온도로 반응시키는 단계를 포함함으로써, 사이코스의 생산량 및 생산 속도를 현저히 개선할 수 있는 사이코스의 생산 방법에 관한 것이다.

Description

사이코스의 생산 방법 {PREPARING METHOD FOR PSICOSE}
본 발명은 미생물을 이용하여 사이코스를 생산하는 방법에 관한 것이다.
사이코스 (D-psicose)는 과당 (D-fructose)의 3번 탄소의 에피머 (epimer)로써 일반 당류들처럼 감미를 가지지만 인체 내에서 대사가 되지 않아서 거의 칼로리는 제로에 가까워 당뇨 및 비만환자에게 설탕 대체 기능성 감미료로 사용될 수 있는 기능성 당이다. 또한 간에서의 지질합성에 관여하는 효소 활성을 억제해서 복부비만을 감소시키는 기능을 가지고 있고 당뇨병과 동맥경화 치료제로 현재 연구 중에 있는 당이다.
이처럼 사이코스는 감미료로 각광받으면서 식품 산업 분야에 있어 사이코스를 효율적으로 생산할 수 있는 방법에 대한 개발의 필요성이 점점 높아지고 있다. 사이코스는 천연물질 내에는 당밀 처리 과정 또는 포도당 이성화 반응과정 중에 매우 소량 존재하기에 기존의 사이코스 생산은 주로 화학적 과정을 거쳐 이루어졌다. 빌릭 (Bilik)등은 몰리브딕산(molybdic acid) 이온의 촉매작용을 활용하여 과당으로부터 사이코스를 생산하는 기술을 개발하였다. 맥도날드 (McDonald)는 1,2:4,5-디-o-이소프로필리덴-베타-D-프락토피라노즈 (1,2:4,5-di-o-isppropylidene-bata-D-fructopyranose)로부터 3단계의 화학적 처리과정으로 사이코스를 생산하였다. 또한, 도너 (Doner)는 에탄올과 트리에틸아민과 함께 과당을 가열하는 방법으로 사이코스를 생산하였다. 그러나, 이들 화학적 방법에 의한 사이코스 생산은 비용이 많이 소모되는 반면 그 생산효율은 낮고 또한 부산물의 과량 발생한다는 문제점이 있다.
생물학적 방법에 의한 사이코스 생산방법으로 이즈모리 (Ken Izumori)등은 미생물 세포반응을 활용하여 갈락시톨 (galacitol), 디-타가토스 (D-tagatose) 또는 디-탈리톨 (D-talitol) 등으로부터 사이코스를 생산할 수 있다는 것을 보였다. 그러나, 이 기질들 또한 자연계에서 비교적 희귀한 당 또는 당알코올로 그 원가가 높다는 단점이 있다.
효소 전환방법으로는 분리미생물 슈도모나스 치코리 ST-24 (Pseudomonas cichorii ST-24)의 디-타가토스-3-에피머화 효소 (D-tagatose-3-epimerase)를 재조합 대장균에서 생산하고 정제하여 과당을 사이코스로 효소 전환하는 방법이 있으며, 이즈모리 등은 디-타가토스-3-에피머화 효소를 고정화시킨 반응시스템으로 약 25%의 전환율로 사이코스를 생산한 바 있다.
이러한 종래 기술에 의하면, 과당으로부터 사이코스를 생산하기 위해서 효소를 정제하고 그 정제된 효소를 고정화하여 사이코스 생산성을 높이는 방향으로 연구되어왔다. 이처럼 효소를 정제하는 과정에는 시간 및 비용이 많이 요구되는 것이 현실이다.
따라서, 효소 정제의 과정을 생략하여 제조원가가 낮고 사이코스를 높은 효율로 생산할 수 있는 균주 및 이를 이용하여 사이코스를 생산하는 방법이 요구되고 있다.
한국공개특허 제2006-125971호에는 사이코스 에피머화 효소에 의한 사이코스의 생산 방법이 개시되어 있다.
한국공개특허 제2006-125971호
Choi JG, Ju YH, Yeom SJ and Oh DK (2011), Improvement in the Thermostability of D-Psicose 3-Epimerase from Agrobacterium tumefaciens by Random and Site-Directed Mutagenesis, Appl Environ Microbiol 77(20):7316-20
본 발명은 사이코스의 생산량 및 생산 속도를 현저히 개선할 수 있는 사이코스의 생산 방법을 제공하는 것을 목적으로 한다.
일 양상은 기질인 과당과 그 에피머라제를 미생물 내에서 40℃ 이상의 온도로 반응시키는 단계를 포함하는 사이코스의 생산 방법을 제공한다.
본 발명의 발명자들은 기질인 과당과 그 에피머라제와의 반응을 40℃ 이상의 온도로 수행하는 경우 사이코스의 생산량 및 생산 속도가 현저히 증가하고, 온도가 증가함에 따라 사이코스 생산량 및 생산 속도가 증가함을 발견하여 본 발명을 착안하였다.
한편, 에피머라제 등의 효소는 일반적으로 40℃ 이상의 고온에서는 열 변성되어 활성을 잃게 되나, 본 발명은 상기 반응을 미생물 내에서 수행함으로써, 효소 상태로 외부에 노출된 경우에 비해 외부로부터 보호됨에 따라 고온에서도 변성 없이 상기 반응을 수행할 수 있다.
반응 온도가 증가함에 따라 사이코스 생산능이 더 증가하므로, 반응 온도는 40℃ 이상이면서 미생물이 열에 의해 손상되거나 단백질이나 당이 변성되지 않는 범위 내라면 특별히 한정되지 않는다. 예를 들면, 40 내지 50℃, 40 내지 60℃, 40 내지 70℃, 40 내지 80℃, 40 내지 90℃, 45 내지 60℃, 45 내지 70℃, 45 내지 80℃, 45 내지 90℃, 50 내지 70℃, 50 내지 80℃, 50 내지 90℃, 55 내지 60℃, 55 내지 70℃, 55 내지 80℃, 55 내지 90℃, 60 내지 70℃, 60 내지 80℃, 60 내지 90℃, 70 내지 80℃, 70 내지 90℃ 등일 수 있다. 상기 사이코스 생산능을 극대화한다는 측면에서 바람직하게는 하한은 50℃ 이상일 수 있고, 열 손상 및 변성의 억제 측면에서 바람직하게는 상한은 90℃ 이하 일 수 있다.
본 명세서에서 용어 "미생물"은 액체 배지 중에서 배양될 수 있는 세포일 수 있다.
상기 미생물은 상기 에피머라제를 내재적으로 또는 형질전환에 의해 발현시키는 것일 수 있다. 그러한 경우, 미생물 내에서 에피머라제가 생성되어 상기 과당과 에피머라제의 미생물 내에서의 반응에 의한 사이코스의 생산이 연속적으로 수행될 수 있다.
상기 미생물이 에피머라제를 코딩하는 유전자로 형질전환되어 에피머라제를 발현시키는 경우, 상기 에피머라제를 코딩하는 유전자는 서열번호 1의 아그로박테리움 튜메패시엔스(Agrobacterium tumefaciens) 유래 사이코스-3-에피머라제를 코딩하는 유전자, 또는 서열번호 2의 아내로스티페스 카캐(Anaerostipes caccae) 유래 사이코스-3-에피머라제를 코딩하는 유전자일 수 있다.
아그로박테리움 튜메패시엔스 유래 사이코스-3-에피머라제는 서열번호 3의 아미노산 서열을 가질 수 있고, 아내로스티페스 카캐 유래 사이코스-3-에피머라제는 서열번호 4의 아미노산 서열을 가질 수 있다.
에피머라제가 보다 우수한 고온 안정성을 갖는다는 측면에서 바람직하게는 에피머라제를 코딩하는 유전자는 서열번호 5의 사이코스-3-에피머라제의 아미노산 서열을 코딩하는 유전자일 수 있다.
상기 서열번호 5의 아미노산 서열은 아그로박테리움 튜메패시엔스 유래 사이코스-3-에피머라제의 아미노산 서열에서 33번 아미노산이 류신으로, 213번 아미노산이 시스테인으로 교체된 서열로, 참고문헌 1에 의해 열 안정성이 우수하다고 알려져 있다.
본 발명의 발명자들은 클로스트리디움 속 유래의 사이코스-3-에피머라제가 열 안정성이 우수함을 확인하였는데, 도 7을 참조해보면, 열 안정성이 높았던 클로스트리디움 속 유래의 사이코스-3-에피머라제의 경우 한 개의 아미노산이 이에 상응하는 서열을 가지고 있거나 혹은 두 개 모두를 가지고 있음을 확인하였다.
이에, 아그로박테리움 튜메패시엔스 유래 사이코스-3-에피머라제 뿐만이 아니라, 다른 균주로부터 유래한 사이코스-3-에피머라제라도 상기 아그로박테리움 튜메패시엔스 유래 사이코스-3-에피머라제의 아미노산 서열의 33번, 213번 아미노산에 대응되는 아미노산 서열이 열 안정성 증대에 중요한 서열임을 확인하였다.
이러한 아미노산 서열의 구체적인 예를 들자면, 서열번호 6의 아미노산 서열에서 32번째 아미노산이 류신으로 치환되거나, 196번째 아미노산이 시스테인으로 치환된 서열일 수 있다. 서열번호 6은 도 7의 박스로 표시한 서열을 나열한 것으로 본 발명에서 사용한 아그로박테리움 튜메패시엔스, 아내로스티페스 카캐, 클로스트리디움 볼테애, 클로스트리디움 힐레모내 유래 사이코스-3-에피머라제 아미노산 서열들(서열번호 3번, 4번, 9번, 10번)의 공통 염기 서열이다. 따라서 상기 미생물은 상기 아미노산 서열을 코딩하는 유전자로 치환된 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
또한, 마찬가지로 우수한 고온 안정성, 그리고 사이코스 생산능의 측면에서 에피머라제는 클로스트리디움 속 유래 사이코스-3-에피머라제일 수 있고, 이를 코딩하는 유전자는 서열번호 7의 클로스트리디움 볼테애(Clostridium bolteae) 유래 사이코스-3-에피머라제를 코딩하는 유전자, 또는 서열번호 8의 클로스트리디움 힐레모내(Clostridium hylemonae) 유래 사이코스-3-에피머라제를 코딩하는 유전자일 수 있다. 고온 안정성을 극대화하는 측면에서 바람직하게는 서열번호 8의 클로스트리디움 힐레모내 유래 사이코스-3-에피머라제를 코딩하는 유전자일 수 있다.
클로스트리디움 볼테애 유래 사이코스-3-에피머라제는 서열번호 9의 아미노산 서열을 가질 수 있고, 클로스트리디움 힐레모내 유래 사이코스-3-에피머라제는 서열번호 10의 아미노산 서열을 가질 수 있다.
상기 미생물은 원핵 세포 또는 진핵 세포로 액체 배지에서 배양될 수 있으면서, 전술한 고온의 온도에서 배양이 가능한 것일 수 있다. 상기 미생물은 예를 들면, 박테리아, 곰팡이, 또는 이들의 조합일 수 있다. 박테리아는 그람 양성 박테리아, 그람 음성 박테리아, 또는 이들의 조합일 수 있으며, 사이코스 생산성 증가의 측면에서 바람직하게는 그람 양성 박테리아일 수 있다. 그람 음성 박테리아는 에세리키아 (Escherichia) 속일 수 있다. 그람 양성 박테리아는 바실러스 속, 코리네박테리움 속, 액티노마이세스 속, 유산균 또는 이들의 조합일 수 있다. 곰팡이는 효모, 클루베로마이세스 속, 또는 이들의 조합일 수 있다.
에세리키아 속 미생물은 대장균일 수 있고, 구체적으로 DH5α, MG1655, BL21(DE), S17-1, XL1-Blue, BW25113 또는 이들의 조합에 에피머라제를 코딩하는 유전자가 도입된 것일 수 있다.
또한, 상기 대장균은 내재적 6-포스포프락토키나제를 코딩하는 유전자 및 알로즈 대사 오페론 (allose metabolic operon)으로 이루어진 하나의 영역이 불활성화된 것일 수 있다.
상기 6-포스포프락토키나제를 코딩하는 유전자는 예를 들면, 서열번호 11의 뉴클레오티드 서열을 갖는 것일 수 있고, 6-포스포프락토키나제는 서열번호 12의 아미노산 서열을 갖는 것일 수 있다.
상기 알로즈 대사 오페론을 구성하는 유전자는 rpiB, alsR, alsB, alsA, alsC, alsE 및 alsK로서, 이들 중 하나 이상의 유전자가 불활성화된 것일 수 있다.
상기 rpiB, alsR, alsB,alsA, alsC, alsE, 및 alsK 유전자는 예를 들면, 서열번호 13, 14, 15, 16, 17, 18 및 19의 뉴클레오티드 서열을 각각 갖는 것일 수 있다.
상기 rpiB, alsR, alsB,alsA, alsC, alsE, 및 alsK 유전자는 서열번호 20, 21, 22, 23, 24, 25 및 26의 아미노산 서열을 각각 코딩하는 것일 수 있다.
용어 "불활성화"란 상기 유전자의 발현이 감소되거나 발현이 이루어지지 않는 것을 의미한다. 상기 "불활성화"는 당업계에 알려진 방법에 의하여 이루어질 수 있다. 예를 들면, 상동 재조합 (homologuous recombination)에 의 하여 불활성화된 것일 수 있다. 상기 상동 재조합은 예를 들면, 전이인자 돌연변이 (transposon mutagenesis) 또는 P1 형질도입 (P1 transduction)에 의하여 매개된 것일 수 있다.
코리네박테리움 속 미생물은 코리네박테리움 글루타미쿰일 수 있고, 구체적으로 코리네박테리움 글루타미쿰 ATCC 13032에 에피머라제를 코딩하는 유전자가 도입된 것일 수 있다.
코리네박테리움 속 미생물은 내재적 디-프락토오스를 디-프락토오스 1-포스페이트로 전환하면서 균체 내로 수송하는 PTS 수송 시스템인 ptsF(EIIFru, fruA, NCgl1861, GI:19553141, EC 2.7.1.69) 유전자를 결손 또는 불활성화시킨 것일 수 있다.
ptsF 유전자는 서열번호 27의 뉴클레오티드 서열을 갖는 것일 수 있고, 서열번호 28의 아미노산 서열을 코딩하는 것일 수 있다.
사이코스는 D-프락토오스(D-fructose)로부터 생성되므로, 상기 유전자를 결손 또는 불활성화시키면 프락토오스의 인산화를 억제할 수 있으므로, 사이코스의 생성 효율을 현저히 개선할 수 있다.
또한, 코리네박테리움 속 미생물은 만니톨 2-디하이드로게나아제(mannitol 2-dehydrogenase)를 코딩하는 mtlD (NCgl0108, GI:19551360, EC 1.1.1.67) 유전자를 결손 또는 불활성화시킨 것일 수 있다.
mtlD 유전자는 서열번호 29의 뉴클레오티드 서열을 갖는 것일 수 있고, 서열번호 30의 아미노산 서열을 코딩하는 것일 수 있다.
상기 과당과 그 에피머라제의 반응은 미생물 내에서 수행되는 것인바, 미생물을 과당을 포함하는 배지 중에서 배양할 수 있다.
상기 배지는 2YT 배지, LB 배지, TB 배지 등의 효모추출물과 질소원을 포함하는 영양배지일 수 있다.
배지에 포함되는 과당 농도는 특별히 한정되지 않으며, 예를 들면 1%(w/v) 내지 80%(w/v)의 농도로 포함될 수 있고, 상기 범위 내에서 예컨대, 1%(w/v) 내지 35%(w/v), 10%(w/v) 내지 80%(w/v), 20%(w/v) 내지 80%(w/v), 30%(w/v) 내지 80%(w/v), 40 %(w/v) 내지 80 %(w/v) 등 일 수 있다. 바람직하게는 1%(w/v) 내지 50%(w/v)일 수 있다.
또한, 포도당, 글리세롤 등을 포함하는 탄소원; 암모니아, 우레아(urea) 등을 포함하는 질소원; 나트륨, 칼륨, 칼슘, 마그네슘, 망간, 코발트 등의 필수 금속이온; 비타민 등을 포함하는 당 분야에서 통상적으로 사용되는 구명배지(defined 배지)일 수 있다.
상기 배양은 연속, 반연속, 또는 배치 (batch) 형식 배양일 수 있다.
상기 미생물은 과당을 포함하는 배지에서 균체의 탁도(600nm 흡광도에서의 측정치, 이하 OD600)가 0.01 내지 300, 예를 들면 1 내지 300, 10 내지 300, 20 내지 300, 5 내지 300, 또는 40 내지 300이 되도록 하는 농도로 접종될 수 있다. 이렇게 고농도의 상기 효소를 포함하는 균체를 사용함으로써, 배지 중에서 고농도로 과당이 포함된 배지에서 효율적으로 과당을 사이코스로 전환할 수 있다.
상기 배양은 에피머라제를 코딩하는 유전자의 발현을 유도하는 물질을 더 첨가하여 수행될 수 있다.
유전자의 발현을 유도하는 물질은 특별히 한정되지 않으며, 당 분야에서 통상적으로 사용되는 물질일 수 있다.
본 발명의 사이코스의 생산 방법이 상기 반응 이전에, 후술할 휴면 세포를 갖도록 유도하는 단계를 더 포함하는 경우, 상기 반응은 기질인 과당과 보조인자의 공급을 위한 무기염만을 포함하는 배지 중에서 수행될 수 있다. 상기 무기염은 예를 들면 망간염 또는 코발트염일 수 있다. 보다 개선된 사이코스의 생산 속도를 나타낸다는 측면에서는 코발트염이 바람직하고, 생산된 사이코스를 식품 등으로 안전하게 활용할 수 있다는 측면에서는 망간염이 바람직하다.
상기 미생물의 배양물은 사이코스를 포함하는데, 사이코스를 회수하는 방법은 특별히 한정되지 않고 당 분야에 공지된 방법에 의할 수 있으며, 예를 들면 원심분리, 여과, 결정화, 이온교환 크로마토그래피 등의 방법을 들 수 있다.
구체적으로. 배양물을 원심분리하여 배양액을 미생물로부터 분리하고, 상기 회수 방법에 의하여 사이코스를 배양액으로부터 분리함으로써 수행될 수 있다.
본 발명의 사이코스의 생산 방법은 상기 과당과 에피머라제의 반응 이전에, 상기 미생물을 상기 과당이 포함되지 않은 배지에서 배양하여 상기 미생물이 휴면 세포를 갖도록 유도하는 단계를 더 포함할 수 있다.
상기 휴면 세포를 갖도록 하는 유도는 상기 미생물은 과당을 포함하지 않는 배지 중에서 정지기(stationary phase)까지 배양함으로써 수행될 수 있다.
본 명세서에서 휴면세포(resting cell)는 더 이상 증식하지 않는 상태의 배양 세포를 의미한다. 본 명세서에서 정지기(stationary phase)는 세포를 배양하는 경우 대수기(exponential phase)를 지나 세포의 분열 및 증식이 정지하여 세포 개체 수의 증가가 나타나지 않으며, 세포 성분의 합성과 분해가 균형을 이룬 상태를 의미한다.
따라서, 본 발명에 따른 휴면 세포는 성장이 완료되고, 세포 내에서 에피머라제의 발현이 충분히 이루어진 상태의 세포를 의미하는 것으로서, 미생물이 휴면 세포를 갖도록 유도되는 경우 에피머라제의 발현량이 최대치를 나타내는 바, 사이코스의 생산을 극대화할 수 있다.
과당을 포함하지 않은 배지는, 과당을 포함하지 않은 것을 제외하고는 전술한 과당을 포함한 배지와 동일한 배지일 수 있다.
또한, 본 발명은 상기 과당과 그 에피머라제의 반응 이후에, 상기 미생물을 회수하여 다른 기질의 사이코스로의 전환에 재사용하는 단계를 더 포함할 수 있다.
본 발명은 과당과 그 에피머라제의 반응을 미생물 내에서 수행하는 바, 고온에 노출되어도 미생물에 의해 에피머라제가 보호되어 여전히 효소 활성을 나타내는 바, 재사용이 가능하다.
즉, 상기 반응 이후에 상기 미생물을 회수하여 또 다른 기질을 사이코스로의 전환에 재사용할 수 있다.
분리된 미생물의 생육이 유지되는 환경 중에서 반응을 수행한다면 재사용 회수는 한정되지 않고, 수백회 이상, 수천회 이상도 재사용이 가능하다.
미생물을 재사용하는 단계를 더 포함하는 경우 미생물이 고온에 복수회 노출되므로, 열 안정성이 높은 고온성 미생물(thermophiles)을 사용하는 것이 재사용시에 효소 활성이 높다는 점에서 바람직하다.
전술한 예시 중에서는 바람직하게는 코리네박테리움 속, 액티노마이세스 속일 수 있고, 보다 바람직하게는 코리네박테리움 글루타미쿰, 가장 바람직하게는 코리네박테리움 글루타미쿰 ATCC 13032에 전술한 에피머라제를 코딩하는 유전자가 도입된 것일 수 있다.
본 발명의 방법에 의하면 사이코스의 생산량 및 생산 속도가 현저히 개선된다.
본 발명의 방법에 의하면 미생물을 회수하여 과당의 사이코스로의 전환에 반복적으로 재사용이 가능하여, 공정 수율을 현저히 개선할 수 있다.
도 1은 사이코스-3-에피머라제를 도입한 코리네박테리움 글루타미쿰 형질전환체로부터 휴면세포전환반응의 반응 온도에 따른 기질인 과당으로부터의 사이코스 생산량을 측정하여 나타낸 것이다.
도 2는 사이코스-3-에피머라제를 도입한 대장균 MG1655 형질전환체로부터 휴면세포전환반응의 반응 온도에 따른 기질인 과당으로부터의 사이코스 생산량을 측정하여 나타낸 것이다.
도 3은 사이코스-3-에피머라제를 도입한 코리네박테리움 글루타미쿰과 대장균 MG1655 형질전환체를 이용해서 60℃에서 3시간 동안 사이코스 생산 휴면세포전환반응을 한 후에 균체를 다시 회수하여 동일 반응 조건 하에서 반응을 시켜서 얻은 사이코스 생산량을 측정하여 나타낸 것이다.
도 4는 사이코스-3-에피머라제를 도입한 코리네박테리움 글루타미쿰 형질전환체의 휴면세포전환반응에 사용되는 사이코스 생산반응 배지의 조성 변화에 따른 과당으로부터 사이코스의 생산량을 나타낸 것이다.
도 5는 사이코스-3-에피머라제를 도입한 코리네박테리움 글루타미쿰 형질전환체의 휴면세포전환반응시에 사이코스-3-에피머라제의 유래 균주 및 사이코스 생산반응 배지 조성에 따른 사이코스의 생산량을 나타낸 것이다.
도 6은 사이코스-3-에피머라제를 도입한 코리네박테리움 글루타미쿰 형질전환체의 휴면세포전환반응시에 사이코스-3-에피머라제의 유래 균주 및 가열 시간에 따른 사이코스의 생산량을 나타낸 것이다.
도 7은 다양한 균주 유래의 사이코스-3-에피머라제의 아미노산 서열을 비교한 것이다.
도 8은 클로스트리디움 속 유래의 사이코스-3-에피머라제를 도입한 코리네박테리움 글루타미쿰의 재사용 횟수에 따른 사이코스의 생산량을 나타낸 것이다.
이하, 본 발명을 구체적으로 설명하기 위해 실시예를 들어 상세하게 설명하기로 한다.
실시예
1. 코리네박테리움 글루타미쿰 균주를 이용한 과당으로부터 사이코스를 생산하는 과정에서 온도에 따른 사이코스 생산속도 및 생산량 변화
(1) 재조합 균주의 제조
대장균-코리네박테리움 셔틀벡터인 pCES208 (J. Microbiol. Biotechnol., 18:639-647, 2008)를 변형하여 종결자(terminator)와 lac 프로모터가 삽입된 pSGT208 셔틀벡터를 제작하여 사용하였다.
코리네박테리움 글루타미쿰에서 사이코스를 생산하기 위하여 사이코스-3-에피머라제는 아그로박테리움 투메파시엔스(Agrobacterium tumefaciens str. C58; taxid:176299; GenBank NID: NC_003062, ATCC33970)의 dpe 유전자(AGR_L_260, GI:15890243, 서열번호 1)를 상기 제작한 pSGT208 셔틀벡터에 도입하여 사용하였다.
상세히 설명하면 서열번호 31의 프라이머 1과 서열번호 32의 프라이머 2를 이용하여 아그로박테리움 투메파시엔스 게놈으로부터 dpe 유전자를 증폭하고, 이를 제한효소 KpnI와 BamHI로 절단하여 pSGT208 셔틀벡터의 동일 부위로 삽입하여 사이코스-3-에피머라제를 포함하는 pS208-dpe 재조합 셔틀벡터를 제작하였다.
이후에, 코리네박테리움 글루타미쿰에서 사이코스-3-에피머라제의 발현량을 증대시키기 위하여 pS208-dpe에서 lac 프로모터를 pTrc99a에서 유래한 trc 프로모터로 교체하였으며, 이를 pS208cT-dpe로 명명하였다.
상기 제작한 사이코스-3-에피머라제를 포함하는 재조합 벡터 pS208-dpe, pS208cT-dpe와 이에 대한 음성 대조군인 pSGT208 벡터를 야생형 코리네박테리움 글루타미쿰 ATCC 13032에 도입하여 형질전환시키고, 이를 과당으로부터 사이코스 생산에 이용하였다. 형질전환법은 Handbook of Corynebacterium glutamicum (Lothar Eggeling 등, ISBN 0-8493-1821-1, 2005 by CRC press)에 명시된 방법을 따랐다.
(2) 재조합 균주의 배양 및 이를 이용한 사이코스의 생산
고농도의 균체를 확보하기 위해 상기 위에서 제조된 코리네박테리움 글루타미쿰 형질전환체를 20㎍/㎖의 카나마이신을 포함하는 5 ㎖의 LB 배지(Difco)에 접종하여 30℃, 250rpm 조건으로 종배양한 후, 10g/L 포도당 및 20㎍/㎖의 카나마이신이 있는 최소 배지(1리터 당 1g K2HPO4, 10g (NH4)2SO4, 0.4g MgSO47H2O, 20mg FeSO47H2O, 20mg MnSO45H2O, 50mg NaCl, 2g urea, 0.1mg biotin, 0.1mg thiamine)에 접종하여 본배양하였다. 본배양은 홈이 파인 500 ㎖ 삼각플라스크에 100㎖ 부피로 30℃, 180 rpm 조건에서 12 시간 배양하여 충분한 균체량과 단백질의 충분한 발현을 유도하였다.
얻어진 상기 배양액을 원심분리하여 상층액을 제거하고 균체를 회수하여, 기질인 40%(w/v) 과당을 함유하는 상기와 동일한 최소배지에 균체농도를 40 OD600로 재현탁한 뒤, 25, 30, 37, 50, 60 또는 70℃, 180rpm 조건에서 휴면세포전환반응을 하였다.
과당 및 사이코스의 농도는 고성능액체크로마토그래피(HPLC)를 이용하여 측정하였다. HPLC는 Kromasil 5NH2 칼럼(4.6 mm X 250 mm)을 장착한 SCL-10A(Shimadzu, 일본)를 사용하였으며, 이동상은 75% 아세토니트릴을 이용하여 1.5 mL/분으로 흘리면서 40℃에서 분리한 후 RI (Reflective Index) 검출기를 이용하여 분석하였다. 상기의 조건에서 과당의 머무름시간 (retention time)은 5.5분, 사이코스는 4.6분이었다.
측정 결과는 도 1에 나타내었다. 도 1을 참조하면, pSGT208cT-dpe 셔틀벡터를 도입한 코리네박테리움 글루타미쿰 ATCC13032 균주를 40% 과당을 함유하는 배지에서 전환반응을 시킨 결과, 반응 온도가 높아질수록 사이코스의 생산 속도가 현저히 빨라지고 생산량도 증가하는 것으로 보인다. 특히 50, 60, 70℃에서 반응시킨 실험군의 경우 대략 3시간 안에 사이코스-3-에피머라제 효소의 반응평형에 도달하여 약 120g/L의 사이코스를 생산했으며, 이는 사이코스-3-에피머라제의 과당으로부터 사이코스의 전환속도 및 생산량은 온도에 의존적임을 나타내는 결과로 볼 수 있다.
50℃를 기점으로 생산량이 급격히 증가하였는데, 이는 통상의 효소 반응에 요구되는 온도보다 현저히 높은 온도로서, 해당 온도에서 효소와 기질간의 반응의 양상이 달라진 것으로 판단된다.
2. 대장균을 이용한 과당으로부터 사이코스를 생산하는 과정에서 온도에 따른 사이코스 생산속도 및 생산량 변화
대한민국 특허등록번호 제 10-1106253호의 실시예 1에 기재된 방법에 따라, pTrc99A 벡터에 아그로박테리움 튜메패시엔스 유래 사이코스-3-에피머라제를 도입한 pTPE 플라스미드로 형질전환된 E. coli MG1655(ΔpfkA, als2) 균주를 제조하였다.
사이코스 분해경로를 차단하기 위해 pfkA(서열번호 11)와 als2(서열번호 14, 15, 16, 17, 18 및 19) 유전자가 결손된 대장균 MG1655를 이용하였다.
고농도의 균체를 확보하기 위해 상기 위에서 제조된 대장균 MG1655 형질전환체를 100㎍/㎖의 엠피실린을 포함하는 5 ㎖의 LB 배지(Difco)에 접종하여 37℃, 250rpm 조건으로 종배양한 후, 10g/L 포도당 및 100㎍/㎖의 엠피실린이 있는 2YT 배지에 접종하여 본배양 하였다. 본배양은 홈이 파인 500 ㎖ 삼각플라스크에 100㎖ 부피로 37℃, 180 rpm 조건에서 12 시간 배양하여 충분한 균체량과 단백질의 충분한 발현을 유도하였다.
얻어진 상기 배양액을 원심분리하여 상층액을 제거하고 균체를 회수하여, 기질인 40%(w/v) 과당을 함유하는 대장균 최소배지 M9 배지(1리터당 11.3g M9 minimal salts(Difco), 0.1mL 1M CaCl2, 2mL 1M MgSO4, 1mL 100mM MnSO45H2O)에 균체농도를 40 OD600로 재현탁한 뒤, 각각 37, 60 또는 70℃, 180rpm 조건에서 휴면세포전환반응을 하였다. 과당 및 사이코스의 농도는 상기의 실시예 1에 기술된 방법에 따라서 분석하였다. 측정 결과는 도 2에 나타내었다.
도 2를 참조하면, pTPE 벡터를 도입한 대장균 MG1655 (ΔpfkA, als2) 균주도 역시 40% 과당을 함유하는 배지에서 전환반응을 시킨 결과, 반응 온도가 높아질수록 사이코스의 생산속도가 빨라지고 생산량도 증가하는 것으로 보인다. 특히 60, 70℃에서 반응시킨 실험군의 경우 코리네박테리움에서의 실험과 마찬가지로 약 2시간 안에 사이코스-3-에피머라제의 반응평형에 도달하여 약 120g/L의 사이코스를 생산했다.
이는 사이코스-3-에피머라제의 과당으로부터 사이코스의 전환속도 및 생산량은 온도에 의존적임을 나타내는 결과로 다시 확인되었다.
대표적인 그람양성 세균인 코리네박테리움과 대표적인 그람음성세균인 대장균을 대상으로 고온에서 휴면세포전환반응 실험을 해 본 결과, 당 전환 효소인 사이코스-3-에피머라제가 세포 안에서 극한 외부환경으로부터 보호받기 때문에 순수한 효소 상태에서 보다는 고온에서 열변성이 되지 않고 더 빠른 속도로 사이코스를 생산하는 것을 알 수 있었다. 이런 세포전환반응의 이점은 대부분의 미생물에도 적용이 될 것으로 보인다.
3. 코리네박테리움 글루타미쿰 형질전환 균체의 휴면세포전환반응에서의 균체 회수 및 재사용을 통한 과당으로부터 사이코스의 연속생산
상기 실시예 1, 2의 결과에서 사이코스-3-에피머라제를 코리네박테리움과 대장균 형질전환체 내에 도입하여 50℃ 이상의 고온의 조건으로 전환반응하였을 때, 3시간 이내에 사이코스 생산량의 최대치에 도달한 이후에 더 이상 증가하지 않았다.
즉 사이코스 생산이 최대가 되는 반응평형에 도달한 3시간 이후에도 사이코스-3-에피머라제가 과당을 사이코스로 전환하는 활성이 얼마나 잔존하는 가를 확인하기 위하여, 과당의 존재 하에서 3시간 동안 휴면세포전환반응을 통해서 사이코스 생산에 이용된 균체를 회수하여, 다시 사이코스 생산 휴면세포전환반응에 재사용하였다.
상기의 균체 재사용 휴면세포전환반응은 60℃ 온도에서 3회 반복하였다. 최초의 휴면세포전환반응은 R0, 앞의 반응액에서 균체를 회수해서 1차 재사용한 휴면세포전환반응은 R1, 2차 재사용한 휴면세포전환반응은 R2, 3차 재사용한 휴면세포전환반응은 R3로 표시하였다. 배양 조건 및 분석 방법은 실시예 1과 동일하게 수행하였다. 결과는 도 3에 나타내었다.
도 3을 참조하면, 60℃ 고온의 당 전환 반응 시에도 균체의 재사용이 가능하다. 하지만 균체를 재사용할수록 효소 활성이 일정부분 감소하는 것으로 보인다. 또한 고온에서 균체를 재사용함에 있어서 그람양성균인 코리네박테리움 글루타미쿰 균주가 그람음성균인 대장균 MG1655 균주보다 잔존 효소 활성이 더 높은 것을 알 수 있다.
4. 다양한 휴면세포전환반응 배지에서의 과당으로부터 사이코스의 생산
상기 실시예 1에서 코리네박테리움 글루타미쿰에서 과당으로부터 사이코스를 생산하는 전환반응에 있어 40% Fructose를 포함한 최소 배지(1리터 당 1g K2HPO4, 10g (NH4)2SO4, 0.4g MgSO47H2O, 20mg FeSO47H2O, 20mg MnSO45H2O, 50mg NaCl, 2g urea, 0.1mg biotin, 0.1mg thiamine)를 이용하였다. 이 전환반응에 사용되는 배지의 구성성분들을 최소화해서 보다 경제적이고 간편한 배지를 조제하고 실시예 1에 사용한 배지와의 사이코스 생산성 비교를 수행하였다.
도 4를 참조하면 40% Fructose와 0.1mM MnSO4를 포함한 phosphate buffer (pH 7) 배지, 더 간편하게는 오직 40% Fructose와 0.1mM MnSO4 만을 포함한 배지를 사용하여도 최종적으로 생산되는 사이코스 생산량에는 별다른 차이가 없었다. 상기의 양상은 반응 온도 30℃와 60℃에서 모두 동일하게 관찰되었다. 0.1mM MnSO4는 사이코스-3-에피머레이즈의 보조인자로 첨가하지 않은 경우에는 생산량의 감소하는 결과를 얻었다.
상기 실시예에서 사이코스 생산 휴면세포전환반응에 사용하는 배지의 성분은 기질인 과당과 사이코스-3-에피머레이즈의 보조인자인 MnSO4만 있으면 된다는 것을 알 수 있었다.
5. 다양한 균주 유래의 사이코스 -3- 에피머라제 아미노산 서열을 코딩하는 폴리뉴클레오티드를 포함하는 재조합 코리네박테리움 글루타미쿰의 제조
아내로스티페스 카캐(Anaerostipes caccae DSM 14662; taxid: 411490)의 전제 유전자를 독인 DSMZ사에서 구입하였다. 구입한 전체 게놈을 주형으로 하여 사이코스-3-에피머라제 추정 유전자(AP endonuclease; Sequence ID: gb|EDR98778.1|; GI: 167654649; 서열번호 4)를 포함하도록 서열번호 33 및 34의 프라이머 쌍을 프라이머로 하여 첫 번째 PCR을 수행하였다. 증폭된 PCR 산물을 주형으로 하여 사이코스-3-에피머라제 유전자에 특이적으로 결합하는 서열번호 35 및 36의 프라이머 쌍을 프라이머로 사용하여 두 번째 PCR을 수행하였다.
얻어진 PCR 산물을 제한 효소 BamHⅠ과 XbaⅠ을 사용하여 pS208cT-dpe(대한민국 특허출원번호 10-2013-0060703의 실시예 1에서 기술한 벡터)의 동일한 효소 부위에 삽입하여 재조합 벡터 pS208cT-AcDPE를 제조하였다.
제작한 pS208cT-AcDPE 벡터를 야생형 코리네박테리움 글루타미쿰 ATCC 13032에 도입하여 형질전환시키고, 이를 과당으로부터 사이코스 생산에 이용하였다. 형질전환법은 Handbook of Corynebacterium glutamicum (Lothar Eggeling 등, ISBN 0-8493-1821-1, 2005 by CRC press)에 명시된 방법을 따랐다.
얻어진 재조합 코리네박테리움 글루타미쿰 균주는 -80℃에 보관한 후 배양에 사용하였다.
클로스트리디움 볼테애(Clostridium bolteae ATCC BAA-613; taxid:411902)의 사이코스-3-에피머라제 추정 유전자(hypothetical protein CLOBOL_00069; Sequence ID: gb|EDP19602.1|; GI:15844190; 서열번호 9)를 포함한 플라스미드를 ㈜한국야쿠르트로부터 얻었다. 사이코스-3-에피머라제 유전자에 특이적으로 결합하는 서열번호 37 및 38의 프라이머 쌍을 프라이머로 사용하여 PCR을 수행하였다.
얻어진 PCR 산물을 제한 효소 KpnⅠ과 XbaⅠ을 사용하여 pS208cT-dpe(대한민국 특허출원번호 10-2013-0060703의 실시예 1에서 기술한 벡터)의 동일한 효소 부위에 삽입하여 재조합 벡터 pS208cT-CbDPE를 제조하였다.
제작한 재조합 벡터 pS208cT-CbDPE 벡터를 야생형 코리네박테리움 글루타미쿰 ATCC 13032에 위와 같은 방법으로 도입, 형질전환시키고, 이를 과당으로부터 사이코스 생산에 이용하였다. 얻어진 재조합 코리네박테리움 글루타미쿰 균주는 -80℃에 보관한 후 배양에 사용하였다
클로스트리디움 힐레모내(Clostridium hylemonae DSM 15053; taxid:553973)의 전체 유전자를 독일 DSMZ사에서 구입하였다. 구입한 전체 게놈을 주형으로 하여 사이코스-3-에피머라제 추정 유전자(dolichol monophosphate mannose synthase; Sequence ID:ref|WP_006442985.1|; GI:225161759; 서열번호 10)를 포함하도록 서열번호 39 및 40의 프라이머 쌍을 프라이머로 사용하여 첫 번째 PCR을 수행하였다. 증폭된 PCR 산물을 주형으로 하여 사이코스-3-에피머라제 유전자에 특이적으로 결합하는 서열번호 41 및 42의 프라이머 쌍을 프라이머로 사용하여 두 번째 PCR을 수행하였다.
얻어진 PCR 산물을 제한 효소 BamHⅠ과 XbaⅠ을 사용하여 pS208cT-dpe(대한민국 특허출원번호 10-2013-0060703의 실시예 1에서 기술한 벡터)의 동일한 효소 부위에 삽입하여 재조합 벡터 pS208cT-ChDPE를 제조하였다.
제작한 pS208cT-ChDPE 벡터를 야생형 코리네박테리움 글루타미쿰 ATCC 13032에 위와 같은 방법으로 도입, 형질전환시키고, 이를 과당으로부터 사이코스 생산에 이용하였다. 얻어진 재조합 코리네박테리움 글루타미쿰 균주는 -80℃에 보관한 후 배양에 사용하였다.
6. 다양한 균주 유래의 사이코스 -3- 에피머라제를 도입한 재조합 코리네박테리움 글루타미쿰 균주를 이용한 과당으로부터 사이코스 생산
상기 실시예 5에서 제작된 코리네박테리움 글루타미쿰 형질전환체를 이용하여 고농도의 과당으로부터 사이코스 생산을 확인하였다.
상기의 형질전환체를 카나마이신 20㎍/㎖을 포함하는 2YT배지에 접종하여 30℃, 250rpm으로 종배양한 후, 다시 형질전환체를 카나마이신 20㎍/㎖을 포함하는 2YT 배지에 접종하여 본배양하였다. 본배양은 홈이 파인 300 ㎖ 삼각플라스크에 60㎖ 부피로 30℃, 180 rpm 조건에서 7시간 배양하여 충분한 균체량과 단백질의 발현을 유도하였다.
얻어진 상기 배양액을 원심분리하여 상층액을 제거하고 균체를 회수하여, 20㎍/㎖ 카나마이신, 기질인 40%(w/v) 과당과 사이코스-3-에피머라제의 주 보조인자로 알려진 망간 또는 코발트를 0.1mM 농도로 가지는 간단한 전환반응 배지를 사용하여 55℃에서 휴면세포전환반응을 진행하였다. 과당과 사이코스의 농도는 상기 실시예 1의 기술방법과 동일하게 측정하였다. 그 결과를 도 5에 나타내었다. (AtDPE는 기존 사용중인 아그로박테리움 투메패시엔스의 사이코스-3-에피머라제를 말한다.)
도 5를 참조하면, 모든 다양한 사이코스-3-에피머라제를 도입한 재조합 균주에서 망간보다 코발트를 보조인자로 하였을 때, 사이코스의 생산속도가 조금 더 빨라지는 것으로 보인다.
아내로스티페스와 아그로박테리움 유래의 사이코스-3-에피머라제를 도입한 재조합 코리네박테리움 글루타미쿰의 사이코스 생산량은 6시간에 평형에 도달하는 것으로 보이지만, 클로스트리디움 유래의 사이코스-3-에피머라제를 도입한 재조합 코리네박테리움 글루타미쿰의 사이코스 생산량은 망간을 보조인자로 사용하였을 때에도 3시간에 평형에 도달한 것으로 보인다.
이로써 클로스트리디움 유래의 사이코스-3-에피머라제의 과당으로부터 사이코스 생산을 확인할 수 있을 뿐 아니라, 아그로박테리움 유래의 사이코스-3-에피머라제보다 사이코스 생산 속도가 더 빠른 것을 알 수 있다.
7. 다양한 균주 유래의 사이코스 -3- 에피머라제를 도입한 재조합 코리네박테리움 글루타미쿰 균주의 고온에서의 지속적인 사이코스 생산 활성 유지
상기 실시예 1, 2의 결과에서 50℃ 이상의 고온 조건으로 전환 반응을 하였을 때, 3시간 이내에 모든 사이코스 생산이 이루어짐을 확인하였다. 이처럼 고온의 조건에서, 과당으로부터 사이코스의 생산이 빠르기 때문에 균체를 재 사용할 시에 오랜 시간 고온에서도 안정적인 사이코스-3-에피머라제가 필요하다. 따라서 다양한 균주 유래의 사이코스-3-에피머라제가 고온에서 어느 정도나 활성을 유지하는지 확인하였다.
상기 실시예 1의 기술방법으로 얻은 균체를 2YT에 부유시켜 진탕배양기를 이용해 0, 3, 6, 9, 12, 24시간 동안 60℃의 열을 지속적으로 주었다. 각 시간별로 열을 준 후, 균체를 회수하여 20㎍/㎖ 카나마이신과 0.1mM 망간과 40%(w/v) 과당만을 포함하는 간단한 전환반응 배지에 부유시켜 다시 60℃에서 3시간 동안 휴면세포전환반응을 진행하였다. 과당과 사이코스의 농도는 상기 실시예 1의 기술방법과 동일하게 측정하였다. 결과는 도 6에 나타내었다.
도 6을 참조해보면, 기존에 사용하던 아그로박테리움 유래의 사이코스-3-에피머라제와 아내로스티페스 유래의 사이코스-3-에피머라제를 도입한 재조합 코리네박테리움 글루타미쿰은 60℃의 열을 3시간 받은 후에는 사이코스 생산을 거의 하지 못하는 것으로 보인다. 그에 반해 클로스트리디움 속 유래의 사이코스-3-에피머라제를 도입한 재조합 코리네박테리움 글루타미쿰은 24시간의 열을 받은 후에도 사이코스 생산을 유지하는 것으로 보여 고온 공정에서의 사이코스 생산에서 아그로박테리움 유래의 사이코스-3-에피머라제보다 유리한 것으로 생각된다.
아그로박테리움 튜메패시엔스 유래 사이코스-3-에피머라제의 열안정성에 중요한 서열(참고문헌 1) 중 33번 또는 213번 아미노산이 각각 루신, 시스테인으로 교체되었을 때, 50℃에서 효소의 반 수명이 각각 3.3배, 7.2배 또는 두 개 모두 교체되었을 때 29.9배 증가한다고 알려져 있다.
아그로박테리움 튜메패시엔스 유래 사이코스-3-에피머라제의 아미노산 서열과 클로스트리디움 속 유래의 사이코스-3-에피머라제의 아미노산 서열간의 비교는 도 7에 나타내었는데, 이를 참조하면, 열 안정성이 높았던 클로스트리디움 속 유래의 사이코스-3-에피머라제의 경우 한 개의 아미노산이 이에 상응하는 서열을 가지고 있거나 혹은 두 개 모두를 가지고 있었다.
8. 클로스트리디움 속 유래의 사이코스 -3- 에피머라제 도입한 재조합 코리네박테리움 글루타미쿰 균체의 휴면세포전환반응에서의 균체 회수 및 재사용을 통한 과당으로부터 사이코스의 생산
상기 실시예 7에서 클로스트리디움 속 유래의 사이코스-3-에피머라제가 고온에 대한 안정성이 높다는 것을 확인하였으므로, 두 클로스트리디움 속 유래의 사이코스-3-에피머라제를 도입한 재조합 균주 중 대표적으로 클로스트리디움 힐레모내의 사이코스-3-에피머라제를 도입한 재조합 코리네박테리움 글루타미쿰 균체의 고온에서의 휴면세포전환반응 후 균제 재사용 효과를 확인하였다.
상기 실시예 3에 기술한 방법과 동일하게 얻은 균체를 60℃에서 3시간 동안 휴면세포전환반응을 시킨 후, 균체를 다시 회수하여 동일하게 휴면세포전환반응을 실시하였고 균체는 총 3번 재사용하였다(상기 실시 예 3과 동일한 조건으로 실험 진행). 최초의 휴면세포전환반응은 R0, 앞의 반응액에서 균체를 회수해서 1차 재사용한 휴면세포전환반응은 R1, 2차 재사용한 휴면세포전환반응은 R2, 3차 재사용한 휴면세포전환반응은 R3로 표시하였다. 결과는 도 8에 나타내었다.
도 8을 참조해보면, 고온에서 균체를 여러 번 재사용 함에 있어서 클로스트리디움 속의 사이코스-3-에피머라제를 도입한 재조한 균체는 어떠한 사이코스 생산량 감소도 없이 일정량 유지됨을 알 수 있다. 상기 실시예 7에서의 결과와 함께 보았을 때, 효소 자체의 열 안정성이 고온에서의 지속적인 당 전환반응뿐만 아니라 균체의 재사용에 있어서도 매우 유리함을 확인할 수 있다.
<110> GYEONGSANG NATIONAL UNIVERSITY OFFICE OF ACADEMY AND INDUSTRY COLLABORATION <120> PREPARING METHOD FOR PSICOSE <130> P2014-451 <160> 42 <170> KopatentIn 2.0 <210> 1 <211> 870 <212> DNA <213> Agrobacterium tumefaciens <400> 1 atgaaacacg gcatctatta ttcttactgg gaacatgagt ggagcgccaa gttcggtccc 60 tatatcgaga aggtcgccaa gctcggtttc gacatcatcg aagtcgccgc ccaccatatc 120 aacgaataca gcgacgccga actcgcgacc atcaggaaga gcgcgaagga taacggcatc 180 atcctcaccg ccggcatcgg tccgtcgaaa accaagaacc tgtcgtcgga agatgctgcg 240 gtgcgtgcgg ccggcaaggc gttctttgaa agaacccttt cgaacgtcgc caagctcgat 300 atccacacca tcggcggcgc attgcattcc tattggccaa tcgattattc gcagcccgtc 360 gacaaggcag gcgattatgc gcgcggcgtc gagggtatca acggcattgc cgatttcgcc 420 aatgatctcg gcatcaacct gtgcatcgaa gtcctcaacc gctttgaaaa ccacgtcctc 480 aacacggcgg cggaaggcgt cgcttttgtg aaggatgtcg gcaagaacaa tgtgaaagtc 540 atgctggata ccttccacat gaacatcgag gaagacagtt tcggtgacgc catccgcacg 600 gccggcccgc ttctggggca cttccatacc ggtgaaagca atcgccgcgt accgggcaag 660 ggcagaatgc cgtggcacga aatcggcctt gcgctgcgtg atatcaacta caccggcgcg 720 gtaatcatgg agcctttcgt caagacaggc ggcaccatcg gctcggatat caaggtgtgg 780 cgcgacctga gcggtggcgc cgacatcgcg aaaatggatg aagatgcccg caatgcgctg 840 gcattctccc gcttcgttct tggtggctaa 870 <210> 2 <211> 858 <212> DNA <213> Anaerostipes caccae <400> 2 atgaaaaata aattcggagt tgacagtttt atttggactg aatccttttc taaaaaagat 60 ttatggatca tccccaaggc aaaagaactg ggatttgaag tcatcgactt tgcgatctcc 120 aacccattca cattccctgt agagaaagtg aaggcagagc tagagagagt gggaatcgac 180 tgtgtctgca ctaccacgct gacacctgaa accaatccga tttctccgga tgccgagatc 240 cgtgcggcag gcgtaaaagc catgaaaaaa tgtgtggata tctgcaacga actgggtgca 300 ccgatcttag gcggtgtaaa ttatgcaggc tggggatatc tgacgaagaa gccaaggacc 360 gaggaagagt ggaactgggg cgtagagtgc atgagggaag ttgccgagta cgcaaagcaa 420 accggagatg ttaccatctg tgtggaatgt gtcaacagat ttgaaaccca cttcttaaac 480 attgcggaag atgcagtggc cttctgtaag gatgttggaa caggaaatgt caaggttcat 540 ctcgactgct tccatatgat cagagaagaa aagagctttg caggggcagt aaagacctgc 600 ggcaaagaat atctcggata cattcatgtc aatgaaaacg acagaggtat tcctggaaca 660 gggcttgtac cgtttaaaga atttttcaat gcattagtag agatcgggta tgacggacct 720 ttggtgatcg aatcttttga tccgagcttt gaagaactgt ccggcaactg tgcgatctgg 780 agaaaacttg ccgatactgg agaagaactt gcgattgaag ggctgaaaaa tctgaaagcc 840 atcgctgctg agatataa 858 <210> 3 <211> 289 <212> PRT <213> Agrobacterium tumefaciens <400> 3 Met Lys His Gly Ile Tyr Tyr Ser Tyr Trp Glu His Glu Trp Ser Ala 1 5 10 15 Lys Phe Gly Pro Tyr Ile Glu Lys Val Ala Lys Leu Gly Phe Asp Ile 20 25 30 Ile Glu Val Ala Ala His His Ile Asn Glu Tyr Ser Asp Ala Glu Leu 35 40 45 Ala Thr Ile Arg Lys Ser Ala Lys Asp Asn Gly Ile Ile Leu Thr Ala 50 55 60 Gly Ile Gly Pro Ser Lys Thr Lys Asn Leu Ser Ser Glu Asp Ala Ala 65 70 75 80 Val Arg Ala Ala Gly Lys Ala Phe Phe Glu Arg Thr Leu Ser Asn Val 85 90 95 Ala Lys Leu Asp Ile His Thr Ile Gly Gly Ala Leu His Ser Tyr Trp 100 105 110 Pro Ile Asp Tyr Ser Gln Pro Val Asp Lys Ala Gly Asp Tyr Ala Arg 115 120 125 Gly Val Glu Gly Ile Asn Gly Ile Ala Asp Phe Ala Asn Asp Leu Gly 130 135 140 Ile Asn Leu Cys Ile Glu Val Leu Asn Arg Phe Glu Asn His Val Leu 145 150 155 160 Asn Thr Ala Ala Glu Gly Val Ala Phe Val Lys Asp Val Gly Lys Asn 165 170 175 Asn Val Lys Val Met Leu Asp Thr Phe His Met Asn Ile Glu Glu Asp 180 185 190 Ser Phe Gly Asp Ala Ile Arg Thr Ala Gly Pro Leu Leu Gly His Phe 195 200 205 His Thr Gly Glu Ser Asn Arg Arg Val Pro Gly Lys Gly Arg Met Pro 210 215 220 Trp His Glu Ile Gly Leu Ala Leu Arg Asp Ile Asn Tyr Thr Gly Ala 225 230 235 240 Val Ile Met Glu Pro Phe Val Lys Thr Gly Gly Thr Ile Gly Ser Asp 245 250 255 Ile Lys Val Trp Arg Asp Leu Ser Gly Gly Ala Asp Ile Ala Lys Met 260 265 270 Asp Glu Asp Ala Arg Asn Ala Leu Ala Phe Ser Arg Phe Val Leu Gly 275 280 285 Gly <210> 4 <211> 285 <212> PRT <213> Anaerostipes caccae <400> 4 Met Lys Asn Lys Phe Gly Val Asp Ser Phe Ile Trp Thr Glu Ser Phe 1 5 10 15 Ser Lys Lys Asp Leu Trp Ile Ile Pro Lys Ala Lys Glu Leu Gly Phe 20 25 30 Glu Val Ile Asp Phe Ala Ile Ser Asn Pro Phe Thr Phe Pro Val Glu 35 40 45 Lys Val Lys Ala Glu Leu Glu Arg Val Gly Ile Asp Cys Val Cys Thr 50 55 60 Thr Thr Leu Thr Pro Glu Thr Asn Pro Ile Ser Pro Asp Ala Glu Ile 65 70 75 80 Arg Ala Ala Gly Val Lys Ala Met Lys Lys Cys Val Asp Ile Cys Asn 85 90 95 Glu Leu Gly Ala Pro Ile Leu Gly Gly Val Asn Tyr Ala Gly Trp Gly 100 105 110 Tyr Leu Thr Lys Lys Pro Arg Thr Glu Glu Glu Trp Asn Trp Gly Val 115 120 125 Glu Cys Met Arg Glu Val Ala Glu Tyr Ala Lys Gln Thr Gly Asp Val 130 135 140 Thr Ile Cys Val Glu Cys Val Asn Arg Phe Glu Thr His Phe Leu Asn 145 150 155 160 Ile Ala Glu Asp Ala Val Ala Phe Cys Lys Asp Val Gly Thr Gly Asn 165 170 175 Val Lys Val His Leu Asp Cys Phe His Met Ile Arg Glu Glu Lys Ser 180 185 190 Phe Ala Gly Ala Val Lys Thr Cys Gly Lys Glu Tyr Leu Gly Tyr Ile 195 200 205 His Val Asn Glu Asn Asp Arg Gly Ile Pro Gly Thr Gly Leu Val Pro 210 215 220 Phe Lys Glu Phe Phe Asn Ala Leu Val Glu Ile Gly Tyr Asp Gly Pro 225 230 235 240 Leu Val Ile Glu Ser Phe Asp Pro Ser Phe Glu Glu Leu Ser Gly Asn 245 250 255 Cys Ala Ile Trp Arg Lys Leu Ala Asp Thr Gly Glu Glu Leu Ala Ile 260 265 270 Glu Gly Leu Lys Asn Leu Lys Ala Ile Ala Ala Glu Ile 275 280 285 <210> 5 <211> 289 <212> PRT <213> Agrobacterium tumefaciens <400> 5 Met Lys His Gly Ile Tyr Tyr Ser Tyr Trp Glu His Glu Trp Ser Ala 1 5 10 15 Lys Phe Gly Pro Tyr Ile Glu Lys Val Ala Lys Leu Gly Phe Asp Ile 20 25 30 Leu Glu Val Ala Ala His His Ile Asn Glu Tyr Ser Asp Ala Glu Leu 35 40 45 Ala Thr Ile Arg Lys Ser Ala Lys Asp Asn Gly Ile Ile Leu Thr Ala 50 55 60 Gly Ile Gly Pro Ser Lys Thr Lys Asn Leu Ser Ser Glu Asp Ala Ala 65 70 75 80 Val Arg Ala Ala Gly Lys Ala Phe Phe Glu Arg Thr Leu Ser Asn Val 85 90 95 Ala Lys Leu Asp Ile His Thr Ile Gly Gly Ala Leu His Ser Tyr Trp 100 105 110 Pro Ile Asp Tyr Ser Gln Pro Val Asp Lys Ala Gly Asp Tyr Ala Arg 115 120 125 Gly Val Glu Gly Ile Asn Gly Ile Ala Asp Phe Ala Asn Asp Leu Gly 130 135 140 Ile Asn Leu Cys Ile Glu Val Leu Asn Arg Phe Glu Asn His Val Leu 145 150 155 160 Asn Thr Ala Ala Glu Gly Val Ala Phe Val Lys Asp Val Gly Lys Asn 165 170 175 Asn Val Lys Val Met Leu Asp Thr Phe His Met Asn Ile Glu Glu Asp 180 185 190 Ser Phe Gly Asp Ala Ile Arg Thr Ala Gly Pro Leu Leu Gly His Phe 195 200 205 His Thr Gly Glu Cys Asn Arg Arg Val Pro Gly Lys Gly Arg Met Pro 210 215 220 Trp His Glu Ile Gly Leu Ala Leu Arg Asp Ile Asn Tyr Thr Gly Ala 225 230 235 240 Val Ile Met Glu Pro Phe Val Lys Thr Gly Gly Thr Ile Gly Ser Asp 245 250 255 Ile Lys Val Trp Arg Asp Leu Ser Gly Gly Ala Asp Ile Ala Lys Met 260 265 270 Asp Glu Asp Ala Arg Asn Ala Leu Ala Phe Ser Arg Phe Val Leu Gly 275 280 285 Gly <210> 6 <211> 269 <212> PRT <213> Unknown <220> <223> psicose 3-epimerase <400> 6 Met Lys His Gly Ile Tyr Tyr Ala Tyr Trp Thr Glu Trp Ser Ala Lys 1 5 10 15 Tyr Lys Lys Tyr Ile Glu Lys Val Ala Lys Leu Gly Phe Asp Ile Ile 20 25 30 Glu Ile Ala Ala Ala Leu Glu Tyr Ser Asp Asp Leu Glu Leu Lys Lys 35 40 45 Ala Lys Asp Asn Gly Ile Ile Leu Thr Ala Gly Tyr Gly Pro Thr Lys 50 55 60 Asn Leu Ser Glu Asp Ala 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bolteae <400> 7 atgaaatatg gtatttattt tgcttattgg acgaaggaat ggtttgctga ttataagaag 60 tatatggata aggtgtctgc tttggggttt gatgtcctgg aaatttcctg tgcagccctc 120 agagatgtat acacaaccaa ggaacagctg attgagctac gtgaatacgc caaagaaaaa 180 gggcttgttc taacagctgg ttatggacct actaaagcag aaaatctgtg ttcagaagac 240 ccggaggcag tgagacgggc catgacattc ttcaaggacc tgcttccaaa gctgcagtta 300 atggatatcc atatcctggg agggggatta tattcctact ggcccgtgga ttttaccatt 360 aataatgaca agcagggaga ccgggccagg gctgtcagga atctgaggga attgtccaaa 420 acagcggagg aatgtgacgt ggtgcttgga atggaggtac tgaaccgcta tgaggggtat 480 attcttaata cctgtgaaga ggcaattgat tttgtcgatg agattggaag cagccatgta 540 aaaatcatgc tggatacttt ccatatgaat attgaagaga caaatatggc tgatgcaatc 600 cgcaaggcgg gagacaggct gggacatctc catctgggag aacagaaccg cctggtgccg 660 ggaaaaggca gcctgccatg ggctgagata gggcaggcgc tccgtgatat taactatcag 720 ggagccgctg tcatggaacc ttttgtcatg cagggaggga ccatcggttc tgagataaag 780 gtatggagag acatggtgcc ggatctttct gaggaagcac tggacaggga tgcaaagggt 840 gcgctggaat tctgcaggca tgtgtttggt atctaa 876 <210> 8 <211> 870 <212> DNA <213> Clostridium hylemonae <400> 8 atgaaacatg gtatctatta tgcatactgg gaacaagaat gggcggccga ctacaagcgc 60 tatgttgaaa aggtggcaaa gcttgggttt gacattctgg agatcggcgc tgggccgctg 120 ccggaatacg cagagcagga tgtgaaggaa ctgaagaaat gtgcgcagga caatgggatc 180 acgctgacgg ccggatatgg tccgacgttc aaccacaata tcggttcttc agacgccggg 240 gtaagggaag aggcgctgga atggtataag aggttatttg aagtgctggc agagcttgat 300 atccacctga tcggaggggc gctctattct tactggcctg tcgattttgc aaacgccgat 360 aaaacggaag actggaagtg gagtgtagag ggcatgcaga ggctggcgcc ggccgcggcc 420 aaatatgaca tcaacctggg catggaagtt ctgaaccggt ttgagagcca tatcctgaat 480 acagccgagg aaggtgtgaa gtttgtagag gaagtcggca tggacaacgt aaaggtcatg 540 ctggatacat tccatatgaa tatagaagag caaagcatag gcggcgcgat ccgccgggca 600 ggaaaactgc tcgggcattt ccacaccgga gaatgcaacc gcatggtgcc cgggaaggga 660 cgtattccat ggcgtgagat aggggatgct ctccgtgata tcggatatga cggaactgct 720 gtaatggagc cgttcgttcg catgggagga caggtcggcg ctgatatcaa ggtgtggaga 780 gacataagcc gtggagcaga cgaggcacag cttgacgatg acgcgcgccg tgcgctggag 840 ttccagagat atatgctgga gtggaagtaa 870 <210> 9 <211> 291 <212> PRT <213> Clostridium bolteae <400> 9 Met Lys Tyr Gly Ile Tyr Phe Ala Tyr Trp Thr Lys Glu Trp Phe Ala 1 5 10 15 Asp Tyr Lys Lys Tyr Met Asp Lys Val Ser Ala Leu Gly Phe Asp Val 20 25 30 Leu Glu Ile Ser Cys Ala Ala Leu Arg Asp Val Tyr Thr Thr Lys Glu 35 40 45 Gln Leu Ile Glu Leu Arg Glu Tyr Ala Lys Glu Lys Gly Leu Val Leu 50 55 60 Thr Ala Gly Tyr Gly Pro Thr Lys Ala Glu Asn Leu Cys Ser Glu Asp 65 70 75 80 Pro Glu Ala Val Arg Arg Ala Met Thr Phe Phe Lys Asp Leu Leu Pro 85 90 95 Lys Leu Gln Leu Met Asp Ile His Ile Leu Gly Gly Gly Leu Tyr Ser 100 105 110 Tyr Trp Pro Val Asp Phe Thr Ile Asn Asn Asp Lys Gln Gly Asp Arg 115 120 125 Ala Arg Ala Val Arg Asn Leu Arg Glu Leu Ser Lys Thr Ala Glu Glu 130 135 140 Cys Asp Val Val Leu Gly Met Glu Val Leu Asn Arg Tyr Glu Gly Tyr 145 150 155 160 Ile Leu Asn Thr Cys Glu Glu Ala Ile Asp Phe Val Asp Glu Ile Gly 165 170 175 Ser Ser His Val Lys Ile Met Leu Asp Thr Phe His Met Asn Ile Glu 180 185 190 Glu Thr Asn Met Ala Asp Ala Ile Arg Lys Ala Gly Asp Arg Leu Gly 195 200 205 His Leu His Leu Gly Glu Gln Asn Arg Leu Val Pro Gly Lys Gly Ser 210 215 220 Leu Pro Trp Ala Glu Ile Gly Gln Ala Leu Arg Asp Ile Asn Tyr Gln 225 230 235 240 Gly Ala Ala Val Met Glu Pro Phe Val Met Gln Gly Gly Thr Ile Gly 245 250 255 Ser Glu Ile Lys Val Trp Arg Asp Met Val Pro Asp Leu Ser Glu Glu 260 265 270 Ala Leu Asp Arg Asp Ala Lys Gly Ala Leu Glu Phe Cys Arg His Val 275 280 285 Phe Gly Ile 290 <210> 10 <211> 289 <212> PRT <213> Clostridium hylemonae <400> 10 Met Lys His Gly Ile Tyr Tyr Ala Tyr Trp Glu Gln Glu Trp Ala Ala 1 5 10 15 Asp Tyr Lys Arg Tyr Val Glu Lys Val Ala Lys Leu Gly Phe Asp Ile 20 25 30 Leu Glu Ile Gly Ala Gly Pro Leu Pro Glu Tyr Ala Glu Gln Asp Val 35 40 45 Lys Glu Leu Lys Lys Cys Ala Gln Asp Asn Gly Ile Thr Leu Thr Ala 50 55 60 Gly Tyr Gly Pro Thr Phe Asn His Asn Ile Gly Ser Ser Asp Ala Gly 65 70 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Lys <210> 11 <211> 963 <212> DNA <213> escherichia coli <400> 11 atgattaaga aaatcggtgt gttgacaagc ggcggtgatg cgccaggcat gaacgccgca 60 attcgcgggg ttgttcgttc tgcgctgaca gaaggtctgg aagtaatggg tatttatgac 120 ggctatctgg gtctgtatga agaccgtatg gtacagctag accgttacag cgtgtctgac 180 atgatcaacc gtggcggtac gttcctcggt tctgcgcgtt tcccggaatt ccgcgacgag 240 aacatccgcg ccgtggctat cgaaaacctg aaaaaacgtg gtatcgacgc gctggtggtt 300 atcggcggtg acggttccta catgggtgca atgcgtctga ccgaaatggg cttcccgtgc 360 atcggtctgc cgggcactat cgacaacgac atcaaaggca ctgactacac tatcggtttc 420 ttcactgcgc tgagcaccgt tgtagaagcg atcgaccgtc tgcgtgacac ctcttcttct 480 caccagcgta tttccgtggt ggaagtgatg ggccgttatt gtggagatct gacgttggct 540 gcggccattg ccggtggctg tgaattcgtt gtggttccgg aagttgaatt cagccgtgaa 600 gacctggtaa acgaaatcaa agcgggtatc gcgaaaggta aaaaacacgc gatcgtggcg 660 attaccgaac atatgtgtga tgttgacgaa ctggcgcatt tcatcgagaa agaaaccggt 720 cgtgaaaccc gcgcaactgt gctgggccac atccagcgcg gtggttctcc ggtgccttac 780 gaccgtattc tggcttcccg tatgggcgct tacgctatcg atctgctgct ggcaggttac 840 ggcggtcgtt gtgtaggtat ccagaacgaa cagctggttc accacgacat catcgacgct 900 atcgaaaaca tgaagcgtcc gttcaaaggt gactggctgg actgcgcgaa aaaactgtat 960 taa 963 <210> 12 <211> 320 <212> PRT <213> eschreichia coli <400> 12 Met Ile Lys Lys Ile Gly Val Leu Thr Ser Gly Gly Asp Ala Pro Gly 1 5 10 15 Met Asn Ala Ala Ile Arg Gly Val Val Arg Ser Ala Leu Thr Glu Gly 20 25 30 Leu Glu Val Met Gly Ile Tyr Asp Gly Tyr Leu Gly Leu Tyr Glu Asp 35 40 45 Arg Met Val Gln Leu Asp Arg Tyr Ser Val Ser Asp Met Ile Asn Arg 50 55 60 Gly Gly Thr Phe Leu Gly Ser Ala Arg Phe Pro Glu Phe Arg Asp Glu 65 70 75 80 Asn Ile Arg Ala Val Ala Ile Glu Asn Leu Lys Lys Arg Gly Ile Asp 85 90 95 Ala Leu Val Val Ile Gly Gly Asp Gly Ser Tyr Met Gly Ala Met Arg 100 105 110 Leu Thr Glu Met Gly Phe Pro Cys Ile Gly Leu Pro Gly Thr Ile Asp 115 120 125 Asn Asp Ile Lys Gly Thr Asp Tyr Thr Ile Gly Phe Phe Thr Ala Leu 130 135 140 Ser Thr Val Val Glu Ala Ile Asp Arg Leu Arg Asp Thr Ser Ser Ser 145 150 155 160 His Gln Arg Ile Ser Val Val Glu Val Met Gly Arg Tyr Cys Gly Asp 165 170 175 Leu Thr Leu Ala Ala Ala Ile Ala Gly Gly Cys Glu Phe Val Val Val 180 185 190 Pro Glu Val Glu Phe Ser Arg Glu Asp Leu Val Asn Glu Ile Lys Ala 195 200 205 Gly Ile Ala Lys Gly Lys Lys His Ala Ile Val Ala Ile Thr Glu His 210 215 220 Met Cys Asp Val Asp Glu Leu Ala His Phe Ile Glu Lys Glu Thr Gly 225 230 235 240 Arg Glu Thr Arg Ala Thr Val Leu Gly His Ile Gln Arg Gly Gly Ser 245 250 255 Pro Val Pro Tyr Asp Arg Ile Leu Ala Ser Arg Met Gly Ala Tyr Ala 260 265 270 Ile Asp Leu Leu Leu Ala Gly Tyr Gly Gly Arg Cys Val Gly Ile Gln 275 280 285 Asn Glu Gln Leu Val His His Asp Ile Ile Asp Ala Ile Glu Asn Met 290 295 300 Lys Arg Pro Phe Lys Gly Asp Trp Leu Asp Cys Ala Lys Lys Leu Tyr 305 310 315 320 <210> 13 <211> 450 <212> DNA <213> escherichia coli <400> 13 atgaaaaaga ttgcatttgg ctgtgatcat gtcggtttca ttttaaaaca tgaaatagtg 60 gcacatttag ttgagcgtgg cgttgaagtg attgataaag gaacctggtc gtcagagcgt 120 actgattatc cacattacgc 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tgcgcattgg cgtacgctgt caggcctatc ctgatgctca catcatgatg 540 atgtccgctt cgttgttaca ggaaggagat gttgtgctgg tagtgaccca ttccgggcga 600 accagtgatg taaaagcggc cgtagaactg gcaaaaaaga acggggcaaa gattatttgt 660 ataacccata gctaccattc accgatagcg aaactggccg attatattat ttgctcacca 720 gccccggaaa cgccgttatt aggtcgtaat gcctcggcaa gaatattaca actaactttg 780 ctggacgctt tttttgtctc tgtcgcccag ctcaacattg aacaagctaa tattaatatg 840 caaaaaaccg gcgcaattgt tgatttcttc tcaccaggcg cgctgaaata a 891 <210> 15 <211> 936 <212> DNA <213> escherichia coli <400> 15 atgaataaat atctgaaata tttcagcggc acactcgtgg gcttaatgtt gtcaaccagc 60 gcttttgctg ccgccgaata tgctgtcgta ttgaaaaccc tctccaaccc attttgggta 120 gatatgaaaa aaggcattga agatgaagca aaaacactgg gcgtcagcgt tgatattttt 180 gcctctcctt cagaaggcga ttttcaatct caattgcagt tatttgaaga tctcagtaat 240 aaaaattaca aaggtatcgc cttcgctcca ttatcctcag tgaatctggt catgcctgtc 300 gcccgcgcat ggaaaaaagg catttatctg gttaatctcg atgaaaaaat cgacatggat 360 aatctgaaaa aagctggcgg caatgtggaa gcttttgtca 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escherichia coli <400> 22 Met Asn Lys Tyr Leu Lys Tyr Phe Ser Gly Thr Leu Val Gly Leu Met 1 5 10 15 Leu Ser Thr Ser Ala Phe Ala Ala Ala Glu Tyr Ala Val Val Leu Lys 20 25 30 Thr Leu Ser Asn Pro Phe Trp Val Asp Met Lys Lys Gly Ile Glu Asp 35 40 45 Glu Ala Lys Thr Leu Gly Val Ser Val Asp Ile Phe Ala Ser Pro Ser 50 55 60 Glu Gly Asp Phe Gln Ser Gln Leu Gln Leu Phe Glu Asp Leu Ser Asn 65 70 75 80 Lys Asn Tyr Lys Gly Ile Ala Phe Ala Pro Leu Ser Ser Val Asn Leu 85 90 95 Val Met Pro Val Ala Arg Ala Trp Lys Lys Gly Ile Tyr Leu Val Asn 100 105 110 Leu Asp Glu Lys Ile Asp Met Asp Asn Leu Lys Lys Ala Gly Gly Asn 115 120 125 Val Glu Ala Phe Val Thr Thr Asp Asn Val Ala Val Gly Ala Lys Gly 130 135 140 Ala Ser Phe Ile Ile Asp Lys Leu Gly Ala Glu Gly Gly Glu Val Ala 145 150 155 160 Ile Ile Glu Gly Lys Ala Gly Asn Ala Ser Gly Glu Ala Arg Arg Asn 165 170 175 Gly Ala Thr Glu Ala Phe Lys Lys Ala Ser Gln Ile Lys Leu Val Ala 180 185 190 Ser Gln Pro Ala Asp Trp Asp Arg Ile Lys Ala Leu Asp Val Ala Thr 195 200 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Ala Pro Trp Thr Gly Ala His Gly Val 145 150 155 160 Ala Gly Glu Leu Gly His Ile Pro Leu Gly Asp Met Thr Gln His Cys 165 170 175 Ala Cys Gly Asn Pro Gly Cys Leu Glu Thr Asn Cys Ser Gly Met Ala 180 185 190 Leu Arg Arg Trp Tyr Glu Gln Gln Pro Arg Asn Tyr Pro Leu Arg Asp 195 200 205 Leu Phe Val His Ala Glu Asn Ala Pro Phe Val Gln Ser Leu Leu Glu 210 215 220 Asn Ala Ala Arg Ala Ile Ala Thr Ser Ile Asn Leu Phe Asp Pro Asp 225 230 235 240 Ala Val Ile Leu Gly Gly Gly Val Met Asp Met Pro Ala Phe Pro Arg 245 250 255 Glu Thr Leu Val Ala Met Thr Gln Lys Tyr Leu Arg Arg Pro Leu Pro 260 265 270 His Gln Val Val Arg Phe Ile Ala Ala Ser Ser Ser Asp Phe Asn Gly 275 280 285 Ala Gln Gly Ala Ala Ile Leu Ala His Gln Arg Phe Leu Pro Gln Phe 290 295 300 Cys Ala Lys Ala Pro 305 <210> 27 <211> 2067 <212> DNA <213> corynebacterium <400> 27 atgaatagcg taaataattc ctcgcttgtc cggctggatg tcgatttcgg cgactccacc 60 acggatgtca tcaacaacct tgccactgtt attttcgacg ctggccgagc ttcctccgcc 120 gacgcccttg ccaaagacgc gctggatcgt 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cattcggtgg atacgacatg 1020 gcgaacggct ggcaagcaat cgccacccag ttctctctga ccaacctgcc aggcaacacc 1080 gtcgatgttg acggcgtggc catgaccttc gagcgttcag gcttcctgtt gtacttcggc 1140 gcagtcctgt tcgccaccgg ccaagcagcc atgggcttca tcgtggcagc cctgtctggc 1200 tacaccgcat acgcacttgc tggacgccca ggcatcgcgc cgggcttcgt cggtggcgcc 1260 atctccgtca ccatcggcgc tggcttcatt ggtggtctgg ttaccggtat cttggctggt 1320 ctcattgccc tgtggattgg ctcctggaag gtgccacgcg tggtgcagtc actgatgcct 1380 gtggtcatca tcccgctact tacctcagtg gttgttggtc tcgtcatgta cctcctgctg 1440 ggtcgcccac tcgcatccat catgactggt ttgcaggact ggctatcgtc aatgtccgga 1500 agctccgcca tcttgctggg tatcatcttg ggcctcatga tgtgtttcga cctcggcgga 1560 ccagtaaaca aggcagccta cctctttggt accgcaggcc tgtctaccgg cgaccaagct 1620 tccatggaaa tcatggccgc gatcatggca gctggcatgg tcccaccaat cgcgttgtcc 1680 attgctaccc tgctgcgcaa gaagctgttc accccagcag agcaagaaaa cggcaagtct 1740 tcctggctgc ttggcctggc attcgtctcc gaaggtgcca tcccattcgc cgcagctgac 1800 ccattccgtg tgatcccagc aatgatggct ggcggtgcaa 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140 Asp Ala Val Leu Asn Pro Ala Pro Lys Thr Thr Glu Pro Ala Ala Ala 145 150 155 160 Pro Ala Ala Ala Ala Val Ala Glu Ser Gly Ala Ala Ser Thr Ser Val 165 170 175 Thr Arg Ile Val Ala Ile Thr Ala Cys Pro Thr Gly Ile Ala His Thr 180 185 190 Tyr Met Ala Ala Asp Ser Leu Thr Gln Asn Ala Glu Gly Arg Asp Asp 195 200 205 Val Glu Leu Val Val Glu Thr Gln Gly Ser Ser Ala Val Thr Pro Val 210 215 220 Asp Pro Lys Ile Ile Glu Ala Ala Asp Ala Val Ile Phe Ala Thr Asp 225 230 235 240 Val Gly Val Lys Asp Arg Glu Arg Phe Ala Gly Lys Pro Val Ile Glu 245 250 255 Ser Gly Val Lys Arg Ala Ile Asn Glu Pro Ala Lys Met Ile Asp Glu 260 265 270 Ala Ile Ala Ala Ser Lys Asn Pro Asn Ala Arg Lys Val Ser Gly Ser 275 280 285 Gly Val Ala Ala Ser Ala Glu Thr Thr Gly Glu Lys Leu Gly Trp Gly 290 295 300 Lys Arg Ile Gln Gln Ala Val Met Thr Gly Val Ser Tyr Met Val Pro 305 310 315 320 Phe Val Ala Ala Gly Gly Leu Leu Leu Ala Leu Gly Phe Ala Phe Gly 325 330 335 Gly Tyr Asp Met Ala Asn Gly Trp Gln Ala Ile Ala Thr Gln Phe Ser 340 345 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Gly Ser Ile Ile Asp Tyr Val 100 105 110 Phe Ala Pro Glu Asp Pro Ala Arg Ala Val Ala Thr Leu Ala Gln Asp 115 120 125 Ser Ile Arg Ile Val Ser Leu Thr Val Thr Glu Gly Gly Tyr Asn Ile 130 135 140 Asp Pro Ala Thr Glu Asp Phe Asp His Thr Asn Pro Arg Ile Val Ala 145 150 155 160 Asp Arg Glu Ala Leu Gln Ala Gly Asp Thr Ser Thr Leu Gln Thr Phe 165 170 175 Phe Gly Leu Ile Thr Ala Ala Leu Ile Ser Arg Lys Glu Ser Gly Ser 180 185 190 Thr Pro Phe Thr Ile Met Ser Cys Asp Asn Ile Gln Gly Asn Gly Asp 195 200 205 Leu Ala Lys Arg Phe Phe Leu Ala Phe Ala His Ser Val Ser Ser Glu 210 215 220 Leu Gly Glu Trp Val Glu Asn Asn Val Ala Phe Pro Asn Ser Met Val 225 230 235 240 Asp Arg Ile Thr Pro Glu Thr Thr Asp Gly Asp Arg Asp Asp Ile Lys 245 250 255 Glu Ile Gly Tyr Ile Asp Ala Trp Pro Val Val Ser Glu Asp Phe Thr 260 265 270 Gln Trp Val Leu Glu Asp Ala Phe Thr Gln Gly Arg Pro Ala Tyr Glu 275 280 285 Glu Val Gly Val Gln Val Val Ser Asp Val Glu Pro Tyr Glu Leu Met 290 295 300 Lys Leu Arg Leu Leu Asn Ala Ser His Gln Gly Leu Cys Tyr Phe Gly 305 310 315 320 His Leu Ala Gly His His Met Val His Asp Val Met Ala Asp Thr Arg 325 330 335 Phe Gln Asp Phe Leu Leu Ala Tyr Met Glu Arg Glu Ala Thr Pro Thr 340 345 350 Leu Lys Glu Leu Pro Gly Val Asp Leu Asp Ala Tyr Arg Arg Gln Leu 355 360 365 Ile Ala Arg Phe Gly Asn Ala Ala Val Lys Asp Thr Val Pro Arg Leu 370 375 380 Cys Ala Glu Ser Ser Asp Arg Ile Pro Lys Trp Leu Leu Pro Val Val 385 390 395 400 Arg Glu Asn Leu Ala Ala Gly Arg Asp Val Thr Leu Ser Ala Ala Ile 405 410 415 Val Ala Ser Trp Ala Arg Tyr Ala Glu Gly Thr Asp Glu Gln Gly Asn 420 425 430 Pro Ile Lys Ile Val Asp Arg Leu Ser Glu Arg Val Gln Glu Asn Ala 435 440 445 Ser Gly Asn Arg Thr Asp Ile Leu Ser Phe Ile Arg Asp Arg Gly Ile 450 455 460 Phe Gly Asp Leu Val Asp Ala Glu Pro Phe Thr Lys Ala Tyr Ser Glu 465 470 475 480 Thr Leu Ser Ser Leu His Asp Arg Gly Ala Glu Ala Thr Ile Asp Ala 485 490 495 Leu Leu Thr Gln Val Thr Val 500 <210> 31 <211> 53 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer <400> 31 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Claims (14)

  1. 기질인 과당과 그 에피머라제를 미생물 내에서 40℃ 이상의 온도로 반응시키는 단계를 포함하고,
    상기 미생물은 서열번호 1의 아그로박테리움 튜메패시엔스(Agrobacterium tumefaciens) 유래 사이코스-3-에피머라제를 코딩하는 유전자, 서열번호 5의 아미노산 서열을 코딩하는 유전자, 서열번호 6의 아미노산 서열에서 32번째 아미노산이 류신으로 치환되거나, 196번째 아미노산이 시스테인으로 치환된 아미노산 서열을 코딩하는 유전자, 서열번호 7의 클로스트리디움 볼테애(Clostridium bolteae) 유래 사이코스-3-에피머라제를 코딩하는 유전자, 또는 서열번호 8의 클로스트리디움 힐레모내(Clostridium hylemonae) 유래 사이코스-3-에피머라제를 코딩하는 유전자로 형질 전환된 코리네박테리움 속이며,
    상기 과당은 무기염과 과당만 포함된 배지로부터 제공되는 것인, 사이코스의 생산 방법.
  2. 청구항 1에 있어서, 상기 미생물은 상기 에피머라제를 내재적으로 또는 형질전환에 의해 발현시키는 것인, 사이코스의 생산 방법.
  3. 청구항 1에 있어서, 상기 반응 이전에, 상기 미생물을 상기 과당이 포함되지 않은 배지에서 배양하여 상기 미생물이 휴면 세포를 갖도록 유도하는 단계를 더 포함하는, 사이코스의 생산 방법.
  4. 청구항 1에 있어서, 상기 반응 이후에, 상기 미생물을 회수하여 과당의 사이코스로의 전환에 재사용하는 단계를 더 포함하는, 사이코스의 생산 방법.
  5. 삭제
  6. 삭제
  7. 청구항 1에 있어서, 상기 무기염은 망간염 또는 코발트염인, 사이코스의 생산 방법.
  8. 청구항 1에 있어서, 상기 반응 온도는 40℃ 내지 90℃인, 사이코스의 생산 방법.
  9. 청구항 1에 있어서, 상기 미생물은 코리네박테리움 글루타미쿰인, 사이코스의 생산 방법.
  10. 삭제
  11. 삭제
  12. 삭제
  13. 삭제
  14. 삭제
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