KR100901084B1 - Ｈｉｖ-1 및 ｈｉｖ-2를 효율적으로 검출하기 위한 올리고뉴클레오타이드 역전사 프라이머, 이의 사용 방법 및 이를 포함하는 키트 - Google Patents

Ｈｉｖ-1 및 ｈｉｖ-2를 효율적으로 검출하기 위한 올리고뉴클레오타이드 역전사 프라이머, 이의 사용 방법 및 이를 포함하는 키트 Download PDF

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Abstract

본원에는 사람 개체의 생물학적 샘플내의 사람 면역결핍 바이러스를 검출하는 방법 및 키트가 기재되어 있다. 또한, 사람 면역결핍 바이러스를 검출하기 위한 방법 및 키트에 사용하기 위한 올리고뉴클레오타이드 역전사 프라이머가 기재되어 있다.
사람 면역결핍 바이러스 HIV, 역전사 프라이머 및 랜덤 헥사머 프라이머

Description

ＨＩＶ-1 및 ＨＩＶ-2를 효율적으로 검출하기 위한 올리고뉴클레오타이드 역전사 프라이머, 이의 사용 방법 및 이를 포함하는 키트{Oligonucleotide reverse transcription primers for efficient detection of HIV-1 and HIV-2, methods of use thereof and a kit comprising the same}
도 1은 역전사 프라이머로서 (a) 랜덤 헥사머 프라이머(레인 2 내지 10); 또는 (b) 랜덤 헥사머 프라이머와 LTR8RT의 혼합물(레인 12 내지 20)을 사용하여 수득한 HIV-1-특이적 증폭 생성물을 나타내는, 에티디움 브로마이드로 염색된 4% 아가로즈 겔의 사진 설명도이다. 레인 1은 마커를 포함하며, 레인 22, 24 및 26은 대조군 샘플이다.
도 2는 역전사 프라이머로서 (a) 랜덤 헥사머 프라이머와 POL3RT의 혼합물(레인 2 내지 10) 또는 (b) LTR8RT와 POL3RT의 혼합물(레인 12 내지 20)을 사용하여 수득한 HIV-1-특이적 증폭 생성물을 나타내는, 에티디움 브로마이드로 염색된 4% 아가로즈 겔의 사진 설명도이다. 레인 1은 마커를 포함하며, 레인 22, 24 및 26은 대조군 샘플이다.
도 3은 (a) 랜덤 헥사머 프라이머(레인 2 내지 13) 또는 (b) 랜덤 헥사머 및 POL3RT, LTR8RT, 2LTRRT 및 2EnvRT의 혼합물(레인 15 내지 26)을 사용하여 수득한 HIV-1-특이적 증폭 생성물을 나타내는, 에티디움 브로마이드로 염색된 4% 아가로즈 겔의 사진 설명도이다. 레인 1은 마커를 포함한다.
도 4는 (a) 랜덤 헥사머 프라이머(레인 2 내지 15) 또는 (b) 랜덤 헥사머 및 POL3RT, LTR8RT, 2LTRRT 및 2EnvRT의 혼합물(레인 16 내지 29)을 사용하여 수득한 HIV-1-특이적 증폭 생성물을 나타내는, 에티디움 브로마이드로 염색된 4% 아가로즈 겔의 사진 설명도이다. 레인 1 및 30은 마커를 포함한다.
본 발명은 생물학적 샘플내의 핵산 서열, 특히 감염성 미생물로부터 유래된 서열을 검출하는 개선된 방법에 관한 것이다.
전세계적으로, 수백만명의 사람이 사람 면역결핍 바이러스(HIV)에 감염된다. 따라서, HIV 감염은 심각한 보건 문제이다. 오염된 혈액 생성물에 의한 HIV 감염의 확산은 환자 샘플내의 소량의 HIV RNA를 검출할 수 있는 스크리닝 방법이 필요하다는 것을 의미한다. 더욱이, 개선된 HIV 감염 치료의 유용성을 증대시킨다는 것은 적절한 치료 중재를 개시하기 위해 환자의 감염을 조기 검출하는 것이 중요하다는 것을 의미한다.
따라서, 진단 및 스크리닝에 사용될 수 있는 HIV에 대한 고도의 민감한 검출 방법이 본 기술 분야에서 요구되고 있다.
본 발명은 (a) 생물학적 샘플로부터 유도된 RNA를 (i) 5'-CTTGTATTACTACTG-3'(서열 1), (ii) 5'-CCCTGTGGCGCC-3'(서열 2), (iii) 5'-GCGACTAGGAGAGA-3'(서열 3), (iv) 5'-CCCAGACGGTCAGT-3'(서열 4) 또는 (v) 상기 서열의 임의의 배합물로 이루어진 그룹중에서 선택된 올리고뉴클레오타이드가 상기 RNA의 적어도 한 부위에 상보성인 DNA의 합성을 개시하는 조건하에 상기 올리고뉴클레오타이드와 접촉시킴을 포함하여, 생물학적 샘플내의 사람 면역결핍 바이러스(HIV) RNA를 역전사시키는 방법을 제공한다.
또다른 양태에 있어서, 본 발명은 (a) 주형으로서 생물학적 샘플로부터 유도된 RNA를 사용하고 프라이머로서 상기 RNA내에 포함된 뉴클레오타이드 서열에 상보성인 올리고뉴클레오타이드(여기서, 프라이머는 (i) 5'-CTTGTATTACTACTG-3'(서열 1), (ii) 5'-CCCTGTGGCGCC-3'(서열 2), (iii) 5'-GCGACTAGGAGAGA-3'(서열 3), (iv) 5'-CCCAGACGGTCAGT-3'(서열 4) 또는 (v) 상기 서열의 임의의 배합물로 이루어진 그룹중에서 선택된다)를 사용하여 역전사 반응을 수행함으로써 HIV-특이적 역전사 생성물을 생성하는 단계;
(b) 상기 역전사 반응의 생성물을 증폭시켜 증폭 생성물을 생성하는 단계; 및
(c) 증폭 생성물을 검출하는 단계(여기서, 증폭 생성물의 검출은 샘플내에 HIV RNA의 존재를 나타낸다)를 포함하여, 생물학적 샘플내의 HIV RNA의 존재를 검출하는 방법을 제공한다.
증폭은 임의의 방법, 바람직하게는 폴리머라제 연쇄 반응(PCR)에 의해 수행할 수 있다. 본 발명에 따른 HIV-특이적 역전사 프라이머의 사용은 샘플, 바람직하게는 혈장내의 HIV-1 및/또는 HIV-2를 검출하는 민감한 방법을 제공한다.
또다른 양태에 있어서, 본 발명은 (a) 5'-CTTGTATTACTACTG-3'(서열 1),
(b) 5'-CCCTGTGGCGCC-3'(서열 2),
(c) 5'-GCGACTAGGAGAGA-3'(서열 3),
(d) 5'-CCCAGACGGTCAGT-3'(서열 4) 또는
(e) 상기 서열의 임의의 배합물로 이루어진 그룹중에서 선택된 역전사 프라이머를 포함하는, 생물학적 샘플내의 HIV-1, HIV-2 또는 이의 배합물을 검출하기 위한 키트를 제공한다. 또한, 본 발명의 키트는 역전사, 증폭 및 생성물 검출을 위한 시약 및 지침을 포함할 수 있다.
본 발명자들은 HIV RNA에 존재하는 특정한 서열에 상보성인 서열을 갖는 올리고뉴클레오타이드가 역전사용 프라이머로서 사용되는 경우 생물학적 샘플내의 사람 면역결핍 바이러스(HIV) RNA 검출이 더욱 효율적임을 발견하였다. 바람직하게는, 상기 프라이머의 서열은 HIV RNA의 3' 말단에 인접한 서열에 상응한다.
분자 생물학, 미생물학, 재조합 DNA 및 단백질 생화학내의 많은 기술, 예를 들어 문헌[참조: Current Protocols in Molecular Biology, Volumes I, II, and III, 1997(F.M., Ausubel ed.); Sambrook et al., 1989, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Second Edition, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, New York; DNA Cloning: A Practical Approach, Volumes I and II, 1985(D.N. Glover ed.); Oligonucleotide Synthesis, 1984, (M.L. Gait ed.); Transcription and Translation, 1984(Hames and Higgins eds.); A Practical Guide to Molecular Cloning; the series, Methods in Enzymology (Academic Press, Inc.); and Protein Purification: Principles and Practice, Second Edition (Springer-Verlag, N.Y.]에 설명된 기술이 본 발명의 실시에 사용된다.
본원에 사용된 바와 같이 "핵산" 또는 "폴리뉴클레오타이드"는 임의의 길이의 푸린- 및 피리미딘-함유 중합체, 즉 폴리리보뉴클레오타이드 또는 폴리데옥시리보뉴클레오타이드 또는 혼합된 폴리리보-폴리데옥시리보뉴클레오타이드를 의미한다. 여기에는 일본쇄 및 이본쇄 분자, 예를 들어 DNA-DNA, DNA-RNA 및 RNA-RNA 하이브리드 뿐만 아니라 아미노산 골격(backbone)에 염기를 접합시켜 형성된 "단백질 핵산"(PNA)가 포함된다. 또한, 여기에는 변형된 염기를 함유하는 핵산이 포함된다.
본원에 사용된 바와 같이 핵산 서열의 "상보체"는 원래 서열과의 왓슨-크릭 염기쌍 형성에 관여하는 안티센스 서열을 의미한다.
본원에 사용된 바와 같이 "프라이머"는 목적하는 일본쇄 핵산 서열과 이본쇄(duplex)를 형성하고 예를 들어 역전사효소 또는 DNA 폴리머라제를 사용하여 상보성 쇄의 중합화를 가능케 하는, 약 5 내지 약 50개 뉴클레오타이드 길이, 바람직하게는 약 6 내지 약 25개 뉴클레오타이드 길이 및 가장 바람직하게는 약 6 내지 약 18개 뉴클레오타이드 길이의 올리고뉴클레오타이드를 의미한다.
본원에 사용된 바와 같이 "분리된" 핵산 또는 폴리펩타이드는 이의 원래 환경(예: 천연 발생인 경우에는 이의 천연 환경 또는 합성인 경우에는 반응 혼합물)로부터 제거된 성분을 의미한다. 분리된 핵산 또는 폴리펩타이드는 전형적으로 약 50% 미만, 바람직하게는 약 75% 미만 및 가장 바람직하게는 약 90% 미만의 최초 관련된 성분을 함유한다.
지정된 서열로부터 "유도된" 핵산 서열은 지정된 서열 영역에 상응하는 서열을 의미한다. 이것은 당해 서열과 상동성 또는 상보성인 서열을 포함한다.
내부 양성 대조군
Figure 112008069701476-pat00001
(IPC) 표적 핵산은, 전형적으로 제한 엔도뉴클레아제의 작용에 의해, 후속적으로 선형화되는 플라스미드 벡터내로 클로닝된 합성 핵산 서열을 의미한다. IPC는 전형적으로 일반적인 프로브-결합 영역을 둘러싸고 있는 다중 프라이머 결합 서열을 포함하며, 핵산 증폭 반응에서 잘못된 음성 결과에 대한 일반적인 대조군으로서 작용할 것이다.
바람직한 내부 양성 대조군 표적 DNA의 서열은 다음과 같다:
5'-CGCCAGCGTGGACCATCAAGTAGTAATGAACGCACGGACGAGGACATCATAGAGATTACACCTTTAT CCACAGTTCTCGGTCTAACGCAGCAGTCAGTGTATCAGCACCAGCATCCGTAGTGAGTCTTCAGTGTCTGCTCCAGGATCGTG-3'(서열 5).
본원에 사용된 바와 같이, 역전사에 적합한 조건, 즉 올리고뉴클레오타이드가 cDNA 합성을 개시하는 조건은 RNA 및 프라이머 올리고뉴클레오타이드를 역전사효소 및 뉴클레오타이드와 함께 cDNA를 합성하는 온도에서 및 시간 동안 항온처리하는 것을 포함한다.
본원에 기술된 임의의 서열 또는 이의 아서열을 포함하는 핵산은 통상의 방법으로 제조할 수 있다. 예를 들면, DNA는 포스포르아미디트 고형 지지체 방법[참조: Matteucci et al., 1981, J. Am. Chem. Soc. 103: 3185], 문헌[참조: Yoo et al., 1989, J. Biol. Chem. 764: 17078]의 방법, 또는 기타 공지된 방법을 사용하여 화학적으로 합성할 수 있다. 또한, 핵산은 본 기술 분야에 공지된 다수의 수단에 의해 변형시킬 수 있다. 이러한 변형의 비제한적인 예에는 메틸화, "캡스(caps)", 유사체에 의한 하나 이상의 천연 발생 뉴클레오타이드의 치환, 및 예를 들어 비하전된 결합(예: 메틸 포스포네이트, 포스포트리에스테르, 포스포로아미데이트, 카바메이트 등) 또는 하전된 결합(예: 포스포로티오에이트, 포스포로디티오에이트 등)에 의한 것과 같은 뉴클레오타이드 상호 변형이 포함된다. 핵산은 하나 이상의 추가의 공유 결합된 잔기, 예를 들어 단백질(예: 뉴클레아제, 독소, 항체, 시그날 펩타이드, 폴리-L-리신 등), 삽입체(예: 아크리딘, 소랄렌 등), 킬레이트제(예: 금속, 방사활성 금속, 철, 산화 금속 등) 및 알킬화제를 함유할 수 있다. PNA가 또한 용어 "핵산"에 포함된다. 핵산은 메틸 또는 에틸 포스포트리에스테르 또는 알킬 포스포르아미데이트 결합을 형성함으로써 유도체화될 수 있다. 더욱이, 본 발명의 핵산 서열은 또한 직접 또는 간접적으로 검출가능한 시그날을 제공할 수 있는 표지로 변형시킬 수 있다. 예시적인 표지에는 방사선동위원소, 형광 분자, 비오틴 등이 포함된다.
본원에 사용된 증폭은 핵산이 복제되는 반복 과정을 의미한다. 증폭에 적합한 방법에는, 이로써 제한되는 것은 아니지만, 폴리머라제 연쇄 반응, 리가제 연쇄 반응 및 전사-중재된 증폭이 포함된다.
본원에 사용된 바와 같이 사람 면역결핍 바이러스(HIV)는 HIV-1, HIV-2 및 SIV를 포함하여 레트로비리다에(Retroviridae)속의 종 및 이의 변이체 균주를 의미한다. 본 발명에 의해 검출될 수 있는 HIV의 분리체에는, 이로써 제한되는 것은 아니지만, HIV-1 및 HIV-2가 포함된다.
본 발명은 생물학적 샘플내의 HIV 검출에 유용한, 생물학적 샘플로부터의 HIV RNA를 역전사시키는 방법을 제공한다. HIV-특이적 증폭 생성물의 검출은 당해 샘플내에 HIV RNA의 존재를 나타낸다.
본 발명에 따르면, 생물학적 샘플은 모든 통상적인 수단에 의해 환자로부터 수득된다. 적합한 생물학적 샘플에는, 이로써 제한되는 것은 아니지만, 혈액, 혈청, 혈장, 뇨, 모유, 조직 샘플 및 뇌척수액이 포함된다. 바람직하게는, 혈장이 HIV RNA의 공급원으로서 사용된다.
생물학적 샘플은 샘플내에 포함된 RNA, 특히 HIV RNA에 역전사 시약의 접근을 제공하는 모든 방법으로 처리된다. 생물학적 샘플로부터 "유래된" RNA는 샘플내에 본래 존재하고 당해 샘플을 처리함으로써 역전사 시약의 접근이 가능해진 임의의 RNA이다. 바람직하게는, RNA는 본 기술 분야에 공지된 모든 방법, 예를 들어 구아니디늄 티오시아네이트를 사용하거나 시판되는 시약을 사용하는 방법 및 젠트라 시스템 인코포레이티드(Gentra Systems, Inc.)(Minneapolis MN)사의 PureScript9와 같은 방법을 사용하여 샘플로부터 추출한다. RNase의 RNA, 다른 단백질, 및/또는 역전사를 방해할 수 있는 기타 성분으로부터 분리시키는 모든 추출 공정을 사용할 수 있다.
이어서, 샘플로부터 추출된 RNA를 당해 올리고뉴클레오타이드가 추출된 RNA의 적어도 일부분과 상보성인 DNA의 합성을 개시하는 조건하에 올리고뉴클레오타이드 프라이머와 접촉시킨다. 올리고뉴클레오타이드 프라이머의 서열은 HIV의 서열로부터 유도된다. 당해 프라이머는 검출이 요구되는 영역의 하부(즉, 3')에 존재할 수 있는 HIV RNA 영역에 상응한다. 이 영역은 예를 들어 긴 말단 반복(LTR) 영역; 바이러스 역전사효소(Pol), Gag 단백질, Tat 단백질, 엔벨로프 당단백질, Vif, Vpr 및 Vpu 단백질를 암호화하는 영역; 및 전사 인자 반응 요소를 암호화하는 Rev 영역을 포함할 수 있다. 바람직하게는, 프라이머는 HIV 게놈의 3' 말단에 인접한 서열에 상응한다. 프라이머 서열은 HIV의 특정한 분리체(예: HIV-1 및 HIV-2의 분리체)를 특이적으로 동정하기 위해 사용될 수 있다. 프라이머는 상이한 분리체로부터의 RNA와 하이브리드화하지 않는 조건(즉, 프라이머 자체는 분리체간에 상이한 서열을 포함할 수 있다)하에 특정한 분리체로부터 유도된 RNA와 하이브리드화시킴으로써 특정한 분리체를 동정할 수 있다. 한편, 프라이머 서열은 분리체간에 상이한 HIV RNA의 단편(즉, 분리체간에 상이한 서열은 프라이머 서열의 하부에 존재할 수 있다)의 합성을 개시하기 위해 사용될 수 있다.
본 발명의 실시에 유용한 역전사 프라이머는 서열 보존의 이론적 연구, 분자내 및 분자간 상호작용, 및 앰플리콘(amplicon) 및 주변 서열의 추정되는 2차 구조에 기초하여 선별한다. 더욱이, 프라이머 및 검정 시스템은 HIV 게놈의 다중 영역, 다중 바이러스 종, 및 내부 양성 대조군(IPC) RNA(또는 DNA)의 동시-증폭(및 동시-검출)을 가능하게 하도록 디자인한다.
본 발명에 따른 역전사 프라이머의 비제한적 예는 하기 표 1에 제시되어 있다.
공급원 명칭 서열 서열 번호
HIV-1 POL3RT 5'-CTTGTATTACTACTG-3' 1
HIV-1 LTR8RT 5'-CCCTGTGGCGCC-3' 2
HIV-2 2LTR1RT 5'-GCGACTAGGAGAGA-3' 3
HIV-2 2Env2RT 5'-CCCAGACGGTCAGT-3' 4
역전사는 하나 이상의 상기 프라이머를 사용하여 수행한다. 예를 들어 랜덤 헥사머 역전사 프라이머(N6, Pharmacia Biotech, Piscataway, NY)와 같은 랜덤 프라이머를 부가할 수도 있다. 역전사는 문헌[참조: Current Protocols in Molecular Biology, Volumes I, II, and III, 1997(F.M., Ausubel ed.)]; 미국 특허 제5,322,770호; 문헌[참조: Young, et al., J. Clin. Microbiol. 31(4): 882(1993); Myers et al., Biochemistry 30(3): 7661(1991)] 또는 공동 계류중인 미국 특허원 제60/118,520호에 기재된 바와 같은 통상의 공정을 사용하여 수행한다.
역전사 반응시킨 후, cDNA 생성물 또는 생성물들을 통상의 방법으로 분리하여 회수할 수 있다. 바람직하게는, cDNA 생성물 또는 생성물들을 증폭시킨다. 모든 증폭 방법을 사용할 수 있으며, 이로써 제한되는 것은 아니지만, 폴리머라제 연쇄 반응(PCR), 리가제 연쇄 반응, 쇄 대체 증폭(strand displacement amplification), 전사 중재된 증폭 및 핵산 단일 염기 증폭이 포함된다. 바람직하게는, PCR이 사용된다. 전형적으로, PCR을 위한 모든 필요한 성분(HIV-특이적 증폭 프라이머 포함)을 함유하는 반응 혼합물을 역전사 반응 혼합물에 직접 가한다. 이어서, 사용되는 프라이머 쌍에 의해 명시된 조건을 사용하여 증폭을 수행한다. 적합한 증폭 프라이머 쌍은 예를 들어 미국 특허원 제60/118,498호 및 하기 실시예에 기재되어 있다.
증폭시킨 후, 본 기술 분야에 공지된 모든 방법, 예를 들어 이로써 제한되는 것은 아니지만, 아가로즈 또는 아크릴아미드내에서의 겔 전기영동; 고형 지지체상에서 증폭 생성물의 포획 및 이어서 비색 검출(하기 실시예 1 참조); ECi 검출; 형광, 방사선동위원소 검출 및 화학발광을 사용하여 증폭 생성물을 검출할 수 있다. 이와 같은 검출 방법용 시약은 예를 들어 제조원[Molecular Probes, Eugene, Oregon and Ortho Clinical Diagnostics(Rochester, NY)]로부터 시판되고 있다.
HIV-특이적 증폭 생성물의 검출은 샘플내에 HIV RNA의 존재를 나타낸다. 겔 전기영동을 사용하는 경우, HIV-특이적 증폭 생성물은 반응에 사용된 증폭 프라이머에 상응하는 서열의 HIV RNA내의 위치에 의해 예상되는 바와 같이 크기에 따라 확인된다.
본 발명은 상기 표 1에 제시된 하나 이상의 역전사 프라이머를 포함하는, 생물학적 샘플내의 HIV RNA의 검출을 위한 키트를 제공한다. 또한, 본 발명의 키트는 역전사를 위한 시약 뿐만 아니라 예를 들어 PCR에 의한 HIV cDNA의 검출을 위한 추가의 시약을 포함할 수 있다.
바람직한 양태의 상세한 설명
하기 실시예는 제한 없이 본 발명을 설명한다.
방법:
1. 샘플 제조:
RNA는 구아니디늄 티오시아네이트 또는 PureScript® RNA 분리 시약(Gentra Systems, Minneapolis MN)을 사용하여 혈장 샘플로부터 제조한다. 제조업자의 프로토콜에 따른 체액의 변형은 바이러스 RNA의 침전을 보조하기 위한 담체로서 20㎍의 글리코겐보다는 차라리 40㎍ 글리코겐을 사용하는 것을 포함한다. 또한, 대부분의 경우, RNA를 이소프로필 알콜로 침전시키고 RNA 펠렛을 에탄올로 세척시킨 후, RNA 펠렛을 제조업자가 제공한 RNA 수화 용액보다는 차라리 RT 완충 혼합물에 재현탁시킨다.
2. 역전사:
RNA로부터 cDNA의 합성은 50mM 트리스-HCl(pH 8.3), 75mM KCl, 3mM MgCl2, 10mM DTT, 각각 0.4mM dNTP(Pharmacia Biotech), 4μM 랜덤 헥사머(Pharmacia Biotech, Piscataway, NJ) 및/또는 특이적 역전사 프라이머의 50㎕ 용액중의 100U 재조합 몰로니 쥐 백혈병 바이러스(M-MLV) 역전사효소(RT)(Gibco BRL, Gaithersburg, Maryland) 및 디에틸피로카보네이트(DEPC)-처리된 물중의 20유니트 RNasin(Promega, Madison, Wisconsin)을 첨가하여 촉매한다. 42℃에서 30분 동안 항온처리한 후, RT 반응물을 100℃에서 5분 동안 유지시켜 RT 활성을 파괴시킨다. 각각의 반응물을 1분 동안 냉각시킨 다음 16000×g에서 4초 동안 미세원심분리한다.
3. PCR 증폭:
PCR은 25mM 트리스-HCl, 3mM MgCl2, 0.725mM EDTA, 54mM KCl, 3.72mM NaCl, 40μM DTT, 108㎍/ml 젤라틴(타입 IV), 9.5% 글리세롤, 0.02% 트윈 20, 0.02% NP40, 송아지 흉선 DNA(2㎍), 각각 1.2mM dNTP, 각각 0.4μM 프라이머, 10개 카피의 선형화된 내부 양성 대조군(IPC) 플라스미드 DNA 및 16U Taq 폴리머라제의 100㎕ 용액중에서 IN A PE9600 열순환기(Perkin-Elmer)로 수행한다. 제조 방법이 미국 특허 제5,338,671호에 기재되어 있는 Taq, TP1-12 및 TP4-9에 대한 모노클로날 항체를 각각 50:1 및 5:1의 몰비로 반응물에 가하여 55:1 몰비의 항체 대 Taq 폴리머라제를 수득한다. 96℃에서 3분 동안 초기 변성시킨 후, 96℃에서 5초 동안 및 68℃에서 40초 동안 40주기 증폭시킨다. 순환 말기에, 5분 동안 103℃에서 후속 가열 단계를 수행하여 Taq 폴리머라제를 불활성화시킨다. 사용된 증폭 프라이머는 하기 표 2에 제시되어 있다.
ID 공급원 서열 서열 번호
JBLT R4 HIV-1(s) 5'-CTG CTT AAG CCT CAA TAA AGC TTG CCT TGA-3' 6
JBLT R6 HIV-1(as) 5'-GGG TCT GAG GGA TCT CTA GTT ACC AGA GT-3' 7
JBLT R8 HIV-1(as) 5'-TGT TCG GGC GCC ACT GCT AGA GA-3' 8
2LTRe HIV-2(s) 5'-GGG AGG TTC TCT CCA GCA CTA GCA-3' 9
2LTR-R1 HIV-2(as) 5'-GCG ACT AGG AGA GAT GGG AAC ACA CA-3' 10
4. PCR 생성물의 검출:
PCR 생성물은 (i) 겔 전기영동시킨 다음 에티디움 브로마이드로 염색하거나; (ii) 증폭중에 5'-비오틴-표지된 프라이머(센스 쇄)를 사용하여 검출한다. 이 경우, 증폭 생성물은 막(SureCell9 시험물, Ortho Clinical Diagnostics, Rochester, NY)을 통해 유동 표면상에 침착된 라텍스 입자에 공유 결합된 올리고뉴클레오타이드 프로브와 하이브리드화시켜 포획한다. HIV-1 프로브는 5'-CAACAGACGGGCACACACTACT-3'(JBLTRpr)(서열 11) 및 5'-GAACAGATGGGCACACACTGCT-3'(JBLTRpr4)(서열 12)이고; HIV-2 프로브는 5'-CCACGCTTGCTTGCTTAAAGACCTC-3'(2LTRpr1)(서열 13)이다. 프로브/생성물 복합체는 염료 전구체의 염료(청색)로의 산화적 전환을 촉매하는 스트렙트아비딘(SA)-서양고추냉이 퍼옥시다제(HRP) 접합체와 반응시킨다. 청색 강도는 채색 강도를 채색 표준물과 비교하여 시각적으로 스코어링한다(0 내지 10). 3보다 큰 모든 시각 채색 스코어를 양성 결과인 것으로 간주한다.
실시예 1
HIV-특이적 프라이머 또는 랜덤 프라이머를 사용한 역전사 효능
하기 실시예는 본 발명에 따른 HIV-특이적 프라이머 또는 랜덤 헥사머 역전사 프라이머(N6, Pharmacia Biotech)를 사용하여 사람 혈장 샘플로부터 유도된 HIV RNA의 역전사 효능을 비교하기 위해 수행했다.
사람 혈장은 100㎕당 1000카피의 HIV RNA를 함유하도록 희석시켜 반응당 대략 100카피의 HIV RNA를 제조했다. RNA는 구아니디늄 티오시아네이트를 사용하여 혈장으로부터 추출했다. RNA 펠렛을 디에틸피로카보네이트-처리된 물 26㎕에 용해시켰다.
역전사 반응물은 RNA 13㎕, 역전사 혼합물(제1-쇄 완충제, 0.1M DTT, 20U RNasin(Promega, Madison, WI), 각각 0.4mM dNTP, 및 200유니트의 몰로니 쥐 백혈병 바이러스(M-MLV) 역전사효소를 함유함)10㎕를 함유했다. 하기 프라이머 혼합물(모두 50μM) 2㎕를 처리 조건에 따라 추가로 가했다: (1) N6 랜덤 프라이머 2㎕; (2) N6 랜덤 프라이머 1㎕ + LTR8RT 프라이머 1㎕; (3) N6 랜덤 프라이머 1㎕ + POL3RT 프라이머 1㎕; (4) LTR8RT 1㎕ + POL3RT 1㎕. 역전사 반응물을 42℃에서 30분 동안 항온처리하고, 100℃에서 5분 동안 가열한 다음 얼음상에서 1분 동안 냉각시켰다. 이어서, PCR 마스터 혼합물 75㎕를 cDNA-함유 반응 혼합물에 가하고, PCR을 하기 조건하에 수행했다: 96℃에서 3분간 예비가열, 이어서 96℃에서 용융시킨 다음 62℃에서 5초 동안 어닐링 및 증폭 5주기, 이어서 96℃에서 용융시킨 다음 68℃에서 40초 동안 어닐링 및 증폭 35주기. 이어서, 증폭 생성물을 4% 아가로즈 겔에서 분리시키고, 에티디움 브로마이드를 사용하여 가시화했다.
결과: 도 1 및 2에 도시된 바와 같이, HIV-특이적 역전사 프라이머를 단독으로 또는 랜덤 헥사머 프라이머와 배합하여 사용하는 것은 현저히 많은 HIV-1-특이적 증폭 생성물의 검출을 초래했다. 도 1의 레인 2 내지 10(랜덤 프라이머 단독)을 도 1의 레인 12 내지 20(LTR8RT + 랜덤 프라이머); 도 2의 레인 2 내지 10(POL3RT + 랜덤 프라이머) 및 도 2의 레인 12 내지 20(LTR8RT + POL3RT)과 비교한다. 또한, 이 결과는 100μM 또는 200μM 랜덤 프라이머를 사용하는 경우에도 관찰되었다.
실시예 2
환자 샘플내의 HIV RNA의 검출
하기 연구는 랜덤 헥사머 역전사 프라이머 또는 랜덤 프라이머를 HIV-특이적 역전사 프라이머와 배합 사용하여 환자 샘플에서 HIV RNA의 검출을 비교하기 위해 수행되었다.
HIV-양성 혈장 샘플은 CD4 T-세포 수가 500을 초과하는 환자로부터 수집하였는데, 이는 이들이 무증후성이고 바이러스 로드가 비교적 낮다는 것을 나타낸다.
RNA를 상기 실시예 1에 기재된 바와 같이 혈장 샘플로부터 추출했다. RNA 용액 13㎕를 물 15㎕에 희석시켰다. 각각의 샘플은 역전사를 위해 2개의 12㎕ 분액으로 나눴다. 2개의 역전사 반응 혼합물은 상기 실시예 1에 기재된 바와 같이 제조했다. 각각의 혼합물은 100μM 랜덤 프라이머 2㎕ + 물 1㎕, 또는 100μM 랜덤 프라이머 2㎕ + 동일한 양의 하기 프라이머를 함유하는 50μM HIV-특이적 프라이머 혼합물 1㎕를 함유했다: (1) POL3RT; (2) LTR8RT; (3) 2LTRRT; 및 (4) 2EnvRT. 역전사 및 증폭 반응은 상기 실시예 1에 기재된 바와 같이 수행했다.
HIV-특이적 증폭 생성물은 에티디움 브로마이드로 염색한 4% 아가로즈 겔상에서 겔 전기영동에 의해 또는 상기 기재된 SureCell® 비색 방법에 의해 검출했다.
결과: 도 3 및 도 4는 겔 전기영동에 의해 검출된 증폭 생성물을 나타낸다. 비색 방법에 의한 HIV-특이적 증폭 생성물의 검출은 표 3에 상대 값으로 나타낸다. IPC는 내부 양성 대조군
Figure 112008069701476-pat00002
프라이머를 나타낸다.
랜던 프라이머 단독 N6 + RT 프라이머
LTR POL IPC LTR POL IPC
샘플 3/4 3/4 1P 3/4 3/4 1P
1 0 0 8 0 0 8
2 8 7 8 8 7 7.5
3 5 6 8 7 7 7.5
4 5 5 8 5 5 8
5 7 5 8 7.5 7.5 8
6 na na na na na na
7 6 7 8 5 7.5 8
8 8 8 8 8 8 8
9 2 2 8 3 0 8
10 5 7 8 7 8 8
11 6 7 8 6 6 8
12 8 8.5 8 7.5 9 7.5
13 8 7.5 8 8 7.5 8
14 0 0 8 0 0 9
15 0 0 8 0 0 8
16 2 0 8 7 8 9
17 7.5 7.5 8 7.5 7.5 8
18 6 7 8 6 7 8
19 7.5 7.5 7.5 7.5 8 8
20 2 1 8 5 5 8
21 6.5 6.5 8 7 7.5 7
22 1 1 8 3 5 8
23 3 1 8 2 2 8
24 7 9 8 7 9 7
25 na na na na na na
26 9 9 7 9 9 6.5
27 3 4 7 5 7 8.5
28 2 2 8 2 2 8.5
Neg 0 0 7 0 0 7
Pos 5 5 7 5 5 7
샘플 3 및 10에 있어서, 랜덤 헥사머 프라이머에 HIV-특이적 RT 프라이머의 부가는 랜덤 프라이머 단독을 사용하는 것보다 큰 증폭도를 나타냈다. 또한, 비색 방법에 의해 검출된 생성물의 양도 HIV-특이적 RT 프라이머가 사용된 경우에 상기 샘플들에서 더 많았다.
샘플 16, 20 및 22에서는 역전사 반응에서 단지 랜덤 프라이머만을 사용하는 경우에 겔 전기영동 또는 비색에 의해 검출되지 않았다. 그러나, 이들 샘플은 HIV-특이적 RT 프라이머가 랜덤 프라이머에 추가로 사용되는 경우에 양성이었다.
이들 결과는 본 발명의 방법 및 조성물이 HIV에 대한 환자 또는 혈액 공급물의 스크리닝에 있어서 잘못된 음성 결과의 빈도를 감소시킬 수 있음을 나타낸다.
상기 언급된 모든 특허 문헌, 특허원, 문헌, 간행물 및 시험 방법은 전체로서 본원에서 참조로 인용된다.
본 발명의 많은 변형은 상기 상세한 설명에 비추어 본 기술 분야의 통상의 지식을 가진자에게 자명할 것이다. 이와 같은 명백한 변형은 첨부된 특허청구범위의 의도된 범위내에 포함된다.
본 발명의 방법 및 조성물은 HIV에 대한 환자 또는 혈액 공급물의 스크리닝에 있어서 잘못된 음성 결과의 빈도를 감소시킬 수 있다.
<110> Ortho-Clinical Diagnostics, Inc. <120> Oligonucleotide reverse transcription primers for efficient detection of HIV-1 and HIV-2, methods of use thereof and a kit comprising the same <130> 2094/1E284-US1 <150> US 60/118,417 <151> 1999-02-02 <160> 13 <170> KopatentIn 1.71 <210> 1 <211> 15 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Oligonucleotide primer <400> 1 cttgtattac tactg 15 <210> 2 <211> 12 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Oligonucleotide primer <400> 2 ccctgtggcg cc 12 <210> 3 <211> 15 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Oligonucleotide primer <400> 3 gcgactagga gaaga 15 <210> 4 <211> 14 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Oligonucleotide primer <400> 4 cccagacgct cagt 14 <210> 5 <211> 150 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> target nucleic acid for an internal positive control <400> 5 cgccagcgtg gaccatcaag tagtaatgaa cgcacggacg aggacatcat agagattaca 60 cctttatcca cagttctcgg tctaacgcag cagtcagtgt atcagcacca gcatccgtag 120 tgatctttca gtgtctgctc caggatcgtg 150 <210> 6 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Oligonucleotide primer <400> 6 ctgcttaagc ctcaataaag cttgccttga 30 <210> 7 <211> 29 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Oligonucleotide primer <400> 7 gggtctgagg gatctctagt taccagagt 29 <210> 8 <211> 23 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Oligonucleotide primer <400> 8 tgttcgggcg ccactgctag aga 23 <210> 9 <211> 24 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Oligonucleotide primer <400> 9 gggaggttct ctccagcact agca 24 <210> 10 <211> 26 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Oligonucleotide primer <400> 10 gcgactagga gagatgggaa cacaca 26 <210> 11 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Oligonucleotide primer <400> 11 caacagacgg gcacacacta ct 22 <210> 12 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Oligonucleotide primer <400> 12 gaacagatgg gcacacactg ct 22 <210> 13 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Oligonucleotide primer <400> 13 ccacgcttgc ttgcttaaag acctc 25

Claims (18)

  1. (a) 혈액, 혈청, 혈장, 뇨 또는 타액 중에서 선택되는 생물학적 샘플로부터 유래된 RNA를, (i) 5'-CTTGTATTACTACTG-3'(서열 1), (ii) 5'-CCCTGTGGCGCC-3'(서열 2) 및 (iii) 상기 서열의 배합물로 이루어진 그룹 중에서 선택되는 올리고뉴클레오타이드가 상기 RNA의 부위에 상보성인 DNA의 합성을 개시하는 조건하에 상기 올리고뉴클레오타이드와 접촉시킴을 포함하는, 상기 생물학적 샘플 내의 사람 면역결핍 바이러스(HIV) RNA를 역전사시키는 방법.
  2. 삭제
  3. 제1항에 있어서, cDNA를 회수하는 단계 (b)를 추가로 포함하는 방법.
  4. (a) 주형으로서 혈액, 혈청, 혈장, 뇨 또는 타액 중에서 선택되는 생물학적 샘플로부터 유래된 RNA를 사용하고, (i) 5'-CTTGTATTACTACTG-3'(서열 1), (ii) 5'-CCCTGTGGCGCC-3'(서열 2) 및 (iii) 상기 서열의 배합물로 이루어진 그룹 중에서 선택되는, 상기 RNA내에 포함된 뉴클레오타이드 서열에 상보성인 올리고뉴클레오타이드를 역전사 프라이머로서 사용하여 역전사 반응을 수행함으로써 HIV-특이적 역전사 생성물을 생성하는 단계;
    (b) 상기 역전사 생성물을 증폭시켜 증폭 생성물을 생성하는 단계; 및
    (c) 증폭 생성물을 검출하는 단계(여기서, 증폭 생성물의 검출은 상기 샘플 내에 HIV RNA가 존재함을 나타낸다)를 포함하여, 상기 생물학적 샘플 내의 HIV RNA의 존재를 검출하는 방법.
  5. 삭제
  6. 제4항에 있어서, 증폭이 폴리머라제 연쇄 반응, 리가제 연쇄 반응 또는 쇄 대체 증폭에 의해 수행되는 방법.
  7. 제4항에 있어서, 검출이 증폭 생성물의 겔 전기영동, 고형 지지체상에 증폭 생성물의 포획 또는 증폭 생성물의 화학발광 검출에 의해 수행되는 방법.
  8. 삭제
  9. 올리고뉴클레오타이드 5'-CCCTGTGGCGCC-3'(서열 2).
  10. 삭제
  11. 삭제
  12. 올리고뉴클레오타이드 5'-CTTGTATTACTACTG-3'(서열 1)로 구성되는 HIV-특이적 역전사 프라이머.
  13. 올리고뉴클레오타이드 5'-CCCTGTGGCGCC-3'(서열 2)로 구성되는 HIV-특이적 역전사 프라이머.
  14. 삭제
  15. 삭제
  16. (a) 5'-CTTGTATTACTACTG-3'(서열 1),
    (b) 5'-CCCTGTGGCGCC-3'(서열 2) 및
    (c) 상기 서열의 배합물로 이루어진 그룹 중에서 선택되는 역전사 프라이머를 포함하는, 생물학적 샘플내의 HIV-1, HIV-2 또는 이의 배합물을 검출하기 위한 키트.
  17. 제1항에 있어서, 상기 생물학적 샘플로부터 유래된 RNA를, 랜덤 헥사머 올리고뉴클레오타이드가 상기 RNA의 부위에 상보성인 DNA의 합성을 개시하는 조건하에 랜덤 헥사머 올리고뉴클레오타이드와 동시에 접촉시키는 단계를 추가로 포함하는 방법.
  18. 제4항에 있어서, 단계 (a)에서 랜덤 헥사머 올리고뉴클레오타이드가 추가로 역전사 프라이머로서 사용되는 방법.
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Families Citing this family (30)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US8036741B2 (en) 1996-04-30 2011-10-11 Medtronic, Inc. Method and system for nerve stimulation and cardiac sensing prior to and during a medical procedure
US6479523B1 (en) * 1997-08-26 2002-11-12 Emory University Pharmacologic drug combination in vagal-induced asystole
US7840278B1 (en) 1999-06-25 2010-11-23 Puskas John D Devices and methods for vagus nerve stimulation
DE60041489D1 (de) * 1999-07-09 2009-03-19 Gen Probe Inc Nachweis von hiv-1 durch amplifizierung von nukleinsäuren
CA2318730C (en) * 1999-09-20 2008-01-22 Ortho-Clinical Diagnostics, Inc. A method for reverse transcribing rna isolated in dry form
WO2002034951A2 (en) * 2000-10-23 2002-05-02 Gen-Probe Incorporated Compositions and methods for detecting human immunodeficiency virus 2 (hiv-2)
JP4699384B2 (ja) * 2003-12-19 2011-06-08 ジェン−プロウブ インコーポレイテッド Ｈｉｖ−１およびｈｉｖ−２の核酸を検出するための組成物、方法およびキット
CN100340673C (zh) * 2005-02-03 2007-10-03 上海科华生物工程股份有限公司 人类免疫缺陷病毒hiv－1核酸扩增－荧光定量检测试剂盒
GB0701253D0 (en) 2007-01-23 2007-02-28 Diagnostics For The Real World Nucleic acid amplification and testing
EP2550362B1 (en) 2010-03-25 2017-01-04 Oregon Health&Science University Cmv glycoproteins and recombinant vectors
US8423134B2 (en) 2010-04-29 2013-04-16 Medtronic, Inc. Therapy using perturbation and effect of physiological systems
US8639327B2 (en) 2010-04-29 2014-01-28 Medtronic, Inc. Nerve signal differentiation in cardiac therapy
US8620425B2 (en) 2010-04-29 2013-12-31 Medtronic, Inc. Nerve signal differentiation in cardiac therapy
US8718763B2 (en) 2011-01-19 2014-05-06 Medtronic, Inc. Vagal stimulation
US8725259B2 (en) 2011-01-19 2014-05-13 Medtronic, Inc. Vagal stimulation
US8781583B2 (en) 2011-01-19 2014-07-15 Medtronic, Inc. Vagal stimulation
US8706223B2 (en) 2011-01-19 2014-04-22 Medtronic, Inc. Preventative vagal stimulation
US8781582B2 (en) 2011-01-19 2014-07-15 Medtronic, Inc. Vagal stimulation
CA2832109C (en) 2011-06-10 2021-07-06 Oregon Health & Science University Cmv glycoproteins and recombinant vectors
AU2012216792A1 (en) 2011-09-12 2013-03-28 International Aids Vaccine Initiative Immunoselection of recombinant vesicular stomatitis virus expressing HIV-1 proteins by broadly neutralizing antibodies
WO2013111800A1 (ja) * 2012-01-25 2013-08-01 独立行政法人科学技術振興機構 Ｈｉｖ検出用オリゴヌクレオチド、ｈｉｖ検出キット、及びｈｉｖ検出方法
EP2679596B1 (en) 2012-06-27 2017-04-12 International Aids Vaccine Initiative HIV-1 env glycoprotein variant
US20150065381A1 (en) 2013-09-05 2015-03-05 International Aids Vaccine Initiative Methods of identifying novel hiv-1 immunogens
EP2873423B1 (en) 2013-10-07 2017-05-31 International Aids Vaccine Initiative Soluble hiv-1 envelope glycoprotein trimers
US10385410B2 (en) 2014-05-27 2019-08-20 Universite Paris Descartes In vitro method for the detection and quantification of HIV-2
EP3069730A3 (en) 2015-03-20 2017-03-15 International Aids Vaccine Initiative Soluble hiv-1 envelope glycoprotein trimers
EP3072901A1 (en) 2015-03-23 2016-09-28 International Aids Vaccine Initiative Soluble hiv-1 envelope glycoprotein trimers
EP3491152B1 (en) * 2016-07-29 2022-06-29 Juno Therapeutics, Inc. Methods for assessing the presence or absence of replication competent virus
EP3510172B1 (en) * 2016-09-07 2023-11-29 St Vincent's Hospital Sydney Limited Methods of detecting hiv
CN106498095A (zh) * 2016-11-14 2017-03-15 湖南圣湘生物科技有限公司 一种人类免疫性缺陷病毒2型核酸检测试剂盒

Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5688637A (en) * 1989-06-02 1997-11-18 Institut Pasteur Nucleotide sequences derived from the genome of retroviruses of the HIV-1, HIV-2 and SIV type, and their uses in particular for the amplification of the genomes of these retroviruses and for the in vitro diagnosis of the disease due to these viruses
US5840480A (en) * 1992-10-06 1998-11-24 Behring Diagnostics Gmbh Retrovirus from the HIV group and its use
WO1998058086A2 (en) * 1997-06-16 1998-12-23 Abbott Laboratories Nucleic acid primers and probes for detecting hiv-1 and hiv-2
EP0887427A2 (en) * 1997-06-25 1998-12-30 Ortho-Clinical Diagnostics, Inc. Amplification and detection of hiv-1 and/or hiv-2

Family Cites Families (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5478724A (en) 1991-08-16 1995-12-26 The Rockefeller University Lentivirus-specific nucleotide probes and methods of use
US5599662A (en) * 1995-02-17 1997-02-04 Hoffmann-La Roche Inc. Oliconucleotide primers and probes for the detection of HIV-1

Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5688637A (en) * 1989-06-02 1997-11-18 Institut Pasteur Nucleotide sequences derived from the genome of retroviruses of the HIV-1, HIV-2 and SIV type, and their uses in particular for the amplification of the genomes of these retroviruses and for the in vitro diagnosis of the disease due to these viruses
US5840480A (en) * 1992-10-06 1998-11-24 Behring Diagnostics Gmbh Retrovirus from the HIV group and its use
WO1998058086A2 (en) * 1997-06-16 1998-12-23 Abbott Laboratories Nucleic acid primers and probes for detecting hiv-1 and hiv-2
EP0887427A2 (en) * 1997-06-25 1998-12-30 Ortho-Clinical Diagnostics, Inc. Amplification and detection of hiv-1 and/or hiv-2

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