KR100491995B1 - 일본인으로부터의 이-형 간염 바이러스로부터 유래하는폴리누클레오티드 프로브 및 프라이머, 이들을 갖는 칩,이들을 갖는 키트, 및 이들에 의한 이-형 간염 바이러스를검출하는 방법 - Google Patents

일본인으로부터의 이-형 간염 바이러스로부터 유래하는폴리누클레오티드 프로브 및 프라이머, 이들을 갖는 칩,이들을 갖는 키트, 및 이들에 의한 이-형 간염 바이러스를검출하는 방법 Download PDF

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    • C12Q1/707—Specific hybridization probes for hepatitis non-A, non-B Hepatitis, excluding hepatitis D

Abstract

E형 간염 바이러스의 폴리누클레오티드를 검출하기 위한, 적어도 8의 누클레오티드의 연속하는 서열을 포함하는 폴리누클레오티드 프로브에 있어서, 당해 적어도 8의 누클레오티드로부터 되는 연속하는 서열이, 상기 E형 간염 바이러스의 폴리누클레오티드와 하이브리다이즈하고, 그 것에 의해서, E형 간염 바이러스의 검출을 하기 위한 서열인 것을 특징으로 하는 폴리누클레오티드 프로브.

Description

일본인으로부터의 이-형 간염 바이러스로부터 유래하는 폴리누클레오티드 프로브 및 프라이머, 이들을 갖는 칩, 이들을 갖는 키트, 및 이들에 의한 이-형 간염 바이러스를 검출하는 방법{POLYNUCLEOTIDE PROBE AND PRIMER DERIVED FROM HEPATITIS E VIRUS COLLECTED FROM JAPANESE, CHIP INCLUDING THE SAME, KIT INCLUDING THE SAME, AND METHOD OF DETECTING HEPATITIS E VIRUS USING THE SAME}
본 발명은, E형 간염 바이러스의 신규 검출방법에 관한 것이다. 또한, 본 발명은, 이와 같은 신규 검출방법을 확립하기 위하여 중요한, 일본인으로부터 분리된 신규 E형 간염 바이러스주 및 신규한 극증(劇症)E형 간염주, 및 이들로부터 유래하는 폴리누클레오티드에 관한 것이다.
간염환자의 간장에서 증식한 E형 바이러스(Hepatitis E virus; 이하 「HEV」로 약칭한다)는 혈 중 보다는 오히려 분변 중에 배설된다. 따라서, HEV의 감염양식은 주로 경구감염이다. 그 때문에, 때때로 수계오염이 생겨서 국지적 집단발생을 보는 것도 있다. 이러한 감염양식을 취하기 위하여, HEV에 의해서 야기되는 E형 간염은, 주로 아시아 및 아프리카 등의 위생환경 불비 지역에 많이 발생하는 경향이 있다. 다른 한편, 일본이나 구미 등의 선진 제국에 있어서는 HEV 감염은 드물고, 간혹 발견되는 E형 간염예의 많은 것은, 유행지로 도항해서 귀국한 여행자에 있어서 발견된다. 따라서, 「E형 간염=수입감염증」이라고 생각하는 편이 일반적인 인식으로 된다.
HEV는 1990년에 미국 진랩스회사의 라이에스 등에 의해서 세계에서 최초로 유전자 클로닝되고, 그 후, HEV게놈의 전체 염기서열이 밝혀졌다. 그들이 해석한 HEV주는 Mexico주와 Burma주이였다. 그 후, 계속해서 India주, Pakistan주, Nepal주, Burma주, China주 및 USA주 등의 유전자 염기서열이 밝혀지고 있다. 그러나, 「일본주」의 보고는 보이지 않는다.
종래의 HEV감염의 진단에는 이하와 같은 방법이 있다. 즉, 상기한 여러가지 기지 HEV주의 염기서열에 기초해서 디자인된 프라이머를 사용해서 PCR법을 행하여 바이러스의 유전자를 검출하는 방법이나, 기지 HEV주의 아미노산서열에 기초하여 합성 펩티드나 발현단백질을 항원으로서 사용하고, 거기에 대한 항체를 검출하는 방법 등이다.
따라서, 만약, 기지 HEV주와 계통을 달리하는 미지 HEV주가 검사 대상 중에 존재하는 경우에는, 종래의 기술에서는, 그의 바이러스를 검출할 수 없는 가능성도 있다.
도 1은, E형 간염 바이러스주의 계통수(系統樹)를 나타낸 도이다.
도 2는, HEV JRA1의 유전자지도를 나타낸 도이다.
도 3a 및 도 3b는, HEV JRA1의 부분염기서열과 Mexico주의 부분염기서열과의 비교를 나타낸 도이다.
도 4a 및 도 4b는, 도 3a 및 도 3b에 계속해서, HEV JRA1의 부분염기서열과 Mexico주의 부분염기서열과의 비교를 나타낸 도이다.
도 5a 및 도 5b는, 도 4a 및 도 4b에 계속해서, HEV JRA1의 부분염기서열과 Mexico주의 부분염기서열과의 비교를 나타낸 도이다.
도 6은, 본 발명의 태양인 프라이머 및 프로브를 나타낸 도이다.
도 7은, HEV JSN-FN의 부분염기서열과 Mexico주의 부분염기서열과의 비교를 나타낸 도이다.
도 8은, 도 7에 계속해서, HEV JSN-FN의 부분염기서열과 Mexico주의 부분염기서열과의 비교를 나타낸 도이다.
도 9는, 도 8에 계속해서, HEV JSN-FN의 부분염기서열과 Mexico주의 부분염기서열과의 비교를 나타낸 도이다.
도 10은, 도 9에 계속해서, HEV JSN-FN의 부분염기서열과 Mexico주의 부분염기서열과의 비교를 나타낸 도이다.
도 11은, 도 10에 계속해서, HEV JSN-FN의 부분염기서열과 Mexico주의 부분염기서열과의 비교를 나타낸 도이다.
도 12는, 도 11에 계속해서, HEV JSN-FN의 부분염기서열과 Mexico주의 부분염기서열과의 비교를 나타낸 도이다.
도 13은, 여러 가지의 HEV주의 ORF 영역의 비교를 나타낸 도이다.
도 14는, HEV주의 계통수를 나타낸 도이다.
도 15는, 여러 가지의 HEV주의 ORF1의 서열을 비교한 도이다.
도 16은, 도 15에 계속해서, 여러 가지의 HEV주의 ORF1의 서열을 비교한 도이다.
도 17은, 도 16에 계속해서, 여러 가지의 HEV주의 ORF1의 서열을 비교한 도이다.
도 18은, 도 17에 계속해서, 여러 가지의 HEV주의 ORF1의 서열을 비교한 도이다.
도 19는, 어떤 환자로부터의 혈청 샘플 중의 HEV의 RNA의 존재와, 간기능검사수치의 변화를 나타낸 도이다.
도 20은, 본 발명의 태양에 따른 프라이머를 사용해서 얻은 non A,B,C 급성 간염환자의 샘플에 대해서 HEV를 검출한 결과를 나타낸 도이다.
도 21은, 본 발명의 태양에 따라, 어떤 환자에 대해서 계속적으로 HEV를 검출한 결과를 나타낸 도이다.
도 22는, 본 발명의 태양에 따라, 증폭된 HEV를 전기영동해서 검출한 결과를 나타낸 도이다.
도 23a ~ 도 23e는, 프로브의 종류와 HEV의 게노타입과 흡광도와의 관계를 나타낸 도이다.
본 발명의 목적은, 다양한 계통에 속하는 HEV를 광범위로 검출할 수 있는 방법을 제공하는 것이다. 본 발명의 또 다른 목적은, 다양한 계통에 속하는 HEV를 광범위로 검출하기 위한 폴리누클레오티드, 및 검출된 HEV의 계통을 결정하기 위한 폴리누클레오티드를 제공하는 것이다.
또한, 본 발명의 또 하나의 목적은, 신규 일본 고유 HEV주에 유래하는 폴리누클레오티드, 및 신규 HEV극중간염주에 유래하는 폴리누클레오티드, 및 이들의 염기서열에 의해 코드되는 폴리펩티드를 제공하는 것이다.
본 발명의 또 다른 목적은, 이상의 신규 HEV의 유전자정보와 함께 종래 공지의 HEV의 유전자정보를 이용함으로써, 달성되는 드러그 디자인을 행하는 방법을 제공하는 것이다.
본 발명은, 본 발명자들이, 처음으로 일본인 환자로부터, HEV주, 즉 HEV Japan JRA1주, JKN-Sap주, JMY-Haw주, JKK-Sap주 및 JAK-Sai주를 단리하는 것, 극증간염증예보다 신규 HEV주인 HEV Japan JSN-FH주를 단리한 것, 및 이들의 바이러스의 게놈서열을 결정한 것에 기초해서 달성되었다.
본 발명의 제1 태양에 따르면, E형 간염 바이러스의 폴리누클레오티드를 검출하기 위하여, 적어도 8의 누클레오티드의 연속하는 서열을 갖는 폴리누클레오티드 프로브에 있어서, 이하의 것을 특징으로 하는 폴리누클레오티드 프로브;
(1) 당해 적어도 8의 누클레오티드로부터 되는 연속하는 서열이, 상기 E형 간염 바이러스의 폴리누클레오티드와 하이브리다이즈하고, 그와 같은 하이브리다이제이션에 의해서, E형 간염 바이러스의 검출을 하기 위한 서열인 것;
(2) 당해 적어도 8의 누클레오티드의 연속하는 서열이, 서열번호 11, 서열번호 44, 서열번호 45, 서열번호 46, 서열번호 47 및 서열번호 48, 및 이들의 상보쇄(相補鎖)로부터 되는 군에서 선택되는 서열에서 얻어지는 것이 제공된다.
본 발명의 제2 태양에 따르면, E형 간염 바이러스의 폴리누클레오티드를 증폭하기 위한 한 쌍 내지 복수 쌍의 PCR용 프라이머에 있어서, 그의 한 쌍 내지 복수 쌍의 PCR 프라이머가 각각 독립해서, 적어도 8의 누클레오티드의 연속하는 서열을 갖고, 이하의 것을 특징으로 하는 한 쌍 내지 복수 쌍의 PCR용 프라이머;
(1) 당해 적어도 8의 누클레오티드로부터 되는 연속하는 서열이, 상기 E형 간염 바이러스의 폴리누클레오티드와 하이브리다이즈하고, 그와 같은 하이브리다이제이션에 의해서, E형 간염 바이러스의 폴리누클레오티드의 일부를 증폭하기 위한 서열인 것;
(2) 당해 적어도 8의 누클레오티드의 연속하는 서열이, 서열번호 11, 서열번호 44, 서열번호 45, 서열번호 46, 서열번호 47 및 서열번호 48 및 이들의 상보쇄로부터 되는 군에 의해 선택되는 서열에서 얻어지는 것이 제공된다.
본 발명의 제3 태양에 따르면,
(1) 대상에서 샘플을 얻는 것,
(2) 상기 (1)에 의해 얻어진 샘플과, 제1 태양에 기재된 폴리누클레오티드 프로브를 반응시키는 것,
(3) 상기 (2)의 반응에 의해 생긴 2중쇄를 검출하는 것,
(4) 상기 (3)의 검출의 결과에서, 상기 샘플에 E형 간염 바이러스가 존재하는가 아닌가를 판정하는 것을 구비하는 샘플 중의 E형 간염 바이러스의 존재를 검출하는 방법이 제공된다.
본 발명의 제4 태양에 따르면,
(1) 대상에서 샘플을 얻는 것,
(2) 상기 (1)에 의해 얻어진 샘플과, 제2 태양에 기재된 한 쌍의 PCR용 프라이머와 폴리머라제를 적당한 증폭이 얻어지는 조건 하에서 반응시키는 것,
(3) 상기 (2)의 반응에 의해 얻어진 증폭산물의 존재를 검출하는 것,
(4) 상기 (3)의 검출의 결과에서, 상기 샘플에 E형 간염 바이러스가 존재하는가 아닌가를 판정하는 것을 구비하는 샘플 중의 E형 간염 바이러스의 존재를 검출하는 방법이 제공된다.
본 발명의 제5 태양에 따르면,
(1) 샘플과 청구항 12에 기재된 한 쌍의 PCR용 프라이머와 폴리머라제를 적당한 증폭이 얻어지는 조건하에서 반응시키는 것,
(2) 상기 (1)의 반응에 의해 얻어진 증폭산물의 길이를 결정하는 것,
(3) 상기 (2)의 결과에서, 상기 샘플에 존재하는 E형 간염 바이러스의 게노타입을 판정하는 것을 구비하는 샘플 중의 E형 간염 바이러스의 게노타입을 결정하는 방법이 제공된다.
본 발명의 제6 태양에 따르면, 제1 태양에 기재된 폴리누클레오티드 프로브를 구비하는 프로브 어쎄이 키트가 제공된다.
본 발명의 제7 태양에 따르면, 제2 태양에 기재된 PCR용 프라이머를 구비하는 프로브 어쎄이 키트가 제공된다.
본 발명의 제8 태양에 따르면, 제1 태양에 기재된 폴리누클레오티드 프로브가 고상화된 염기서열검출용 칩이 제공된다.
Ⅰ. 용어
여기서 사용하는 「폴리누클레오티드」는, 편의적으로 폴리누클레오티드 및 올리고누클레오티드 등을 총괄한 의미로 사용한다. 또한, 여기서 「폴리누클레오티드」라 함은, 2 이상의 누클레오시드가 인산에스테르결합에 의해서 결합해서 되는 물질을 의미한다. 누클레오시드에는 데옥시리보누클레오시드 및 리보누클레오시드가 포함되지만, 이 것에 한정되지는 않는다. 또한, 「올리고누클레오티드」라 함은, 수개로부터 수십개의 누클레오시드의 인산 에스테르(즉, 누클레오티드)가 포스포디에스테르결합으로 중합한 물질을 의미하고, 올리고리보누클레오티드와 올리고데옥시리보누클레오티드가 포함되지만, 이들에 한정되는 것은 아니다. 또한, 본 발명의 태양인 폴리누클레오티드는, HEV JRA1주에서 단리한 바이러스 게놈 RNA이어도, 그 것을 기초해서 얻은 DNA 등 이어도 좋다. 또한, 본 발명에 있어서, 「폴리누클레오티드」라 함은, 펩티드핵산, 모르폴리노핵산, 메틸포스포네이트핵산, S-올리고 핵산 등의 인공합성 핵산도 지칭하는 것이다.
여기서 사용되는 「폴리펩티드」는, 2개 이상의 아미노산으로부터 되는 펩티드, 올리고펩티드 및 단백질을 나타낸다. 또한, 이들에 한정되는 것은 아니지만, 합성 펩티드 및 발현단백질의 양자를 포함하고, 또한, 아미노산만으로 되는 단순 단백질이어도, 아미노산 이외의 구성 성분을 갖는 복합단백질이어도 좋다.
여기서 사용하는 「대상」이라 함은 인간, 개, 고양이, 소, 염소, 돼지, 양 및 원숭이를 포함하는 임의의 포유동물 등의 개체일 수 있지만, 인간이 가장 적합한 대상이다.
여기서 사용되는 「샘플」이라 함은, 생물개체에서 채취한 혈액, 혈청, 임파액 및 조직 등의 생물시료를 말한다. 또한, 「샘플」은, 필요에 따라서, 생물시료를 호모지네이트 및 추출 등의 필요한 임의의 전처리를 행해서 얻은 시료이어도 좋다. 이와 같은 전처리는, 대상으로 되는 생물시료에 따라서 당업자에 의해서 선택될 수 있는 것이다.
여기서 사용되는 「오픈 리딩 프레임」이라 함은, 폴리펩티드를 코드하는 폴리누클레오티드서열의 영역을 가리킨다. 이 영역은 코딩서열의 인식 또는 코딩서열의 전체를 의미한다.
여기서 사용되는 「E형 간염 바이러스」라 함은, 소화관을 통한, 음료수 매개의, 주로 아시아 또는 아프리카에서 발생하는 유행성 비A비B 간염의 주요 원인 바이러스를 의미한다. RNA 바이러스이고, 카리시비리다에과 카리시바이러스속으로 분류된다. 또한, 본 명세서에 있어서 HEV의 용어는, 일반적으로 사용되는 분류인 게노타입Ⅰ,Ⅱ,Ⅲ 및 Ⅳ에 속하는 바이러스를 총괄적으로 나타내는 말이다. 또한, 본 발명의 태양에 따르면, HEV에 속하지만 아직 단리 및/또는 동정되지 않는 균주의 검출 및/또는 동정 또는 게노타입으로 분류화가 가능하다. 따라서, 여기서 사용되는 HEV의 용어에는, 미지의 HEV 및 본 발명의 태양에 따라서 검출 및/또는 동정 또는 분류화되는 바이러스도 포함될 수 있다. 또한, 여기서 말하는 「HEV」라 함은, 야생형, 변이주, 및 HEV의 근린주 등이 포함된다. 특히, 서열번호1에 나타낸 JRA1의 5'단측의 약 2500염기의 서열에 대해서 약 50% 이상, 바람직하기는 60% 이상, 더욱 바람직하기는 65% 이상의 상동성을 갖는 균주이다.
Ⅱ. 신규 E형 간염 바이러스주
본 발명자들은, 일본에서는 드문 것으로 말하는 것이지만, 해외 도항이력이 없는 사람에 있어서도 E형 간염의 발증을 볼 수 있는 점에 착안하여, HEV 일본고유주의 존재를 가정했다. 이 가정하에, 또는 일본인 급성간염환자에서 HEV의 유전자 클로닝을 시험했다. 그 결과, 신규의 계통에 속하는 것으로 사료되는 HEV주를 5주 단리하는 것에 성공했다.
이들의 신규 HEV주는, 본 발명자들이 각각 HEV Japan JRA1주(Hepatitis E virus Japan JRA1, 이하 JRA1주로도 기재한다, NCBI accession no. AP003430), HEV Japan JKN-Sap주(Hepatitis E virus, 이하 JKN-Sap주로도 기재한다, NCBI accession no. AB074918), HEV Japan JMY-Haw주(Hepatitis E virus, 이하, JMY-Haw주로도 기재한다, NCBI accession no. AB074920), HEV Japan JKK-Sap주(Hepatitis E virus, 이하 JKK-Sap주로도 기재한다, NCBI accession no. AB074917) 및 HEV Japan JAK-Sai주(Hepatitis E virus, 이하 JAK-Sai로도 기재한다, NCBI accession no. AB074915)로 명명한 합계 5개의 균주이다. 각각의 바이러스의 유래는, JKK-Sap, JKN-Sap 및 JMY-Haw의 3개의 균주가 호카이도(北海道)에 거주하는 급성 E형 간염 환자로부터, JAK-Sai는 사이다마(埼玉)에 거주하는 급성 E형 간염 환자로부터, JRA1는 도쿄의 환자로부터이다.
또한, 본 발명자들은, 극증간염증예에서 신규 HEV주인 HEV JSN-FH주 (Hepatitis E virus, 이하 JSN-FH주로도 기재한다)를 단리했다.
JRA1주의 게놈 RNA서열 중 오픈 리딩 프레임1(이하, ORF1으로 기재한다)을 서열번호 1에, 전장(全長)을 서열번호 48에 나타낸다.
JSN-FH주의 게놈 RNA서열의 5'단측의 비코딩서열의 일부를 제외한 준전장(準全長)을 서열번호 11에 나타냈다. JSN-FH주의 게놈 RNA서열의 ORF1 및 ORF2에 코드되는 아미노산서열을, 각각 서열번호 12 및 서열번호 13에 나타냈다.
또한, JKN-Sap주, JMY-Haw주, JAK-Sai주 및 JKK-Sap주의 게놈 RNA서열의 ORF1의 일부를, 각각 서열번호 16, 서열번호 17, 서열번호 20 및 서열번호 21에 나타냈다. 또한, JKN-Sap주, JMY-Haw주, JAK-Sai주 및 JKK-Sap주의 게놈 RNA서열의 전장을, 각각 서열번호 44, 서열번호 45(준전장), 서열번호 46(준전장) 및 서열번호 47(준전장)에 나타냈다.
2. HEV JRA1주
(1) HEV JRA1주
본 발명자들은, 서열번호 1에 기재한 JRA1주의 염기서열이 세계 각지에서 얻어진 여러가지 기지주와의 비교에 있어서, 도 1에 나타낸 계통수에 나타낸 바와 같이, 신규 게놈타입에 속하는 것인 것을 명확히 했다.
기지주와의 차이는 게놈 5'단의 약 2500염기에 있어서 특히 현저하다. 도 2에 나타낸 바와 같이, HEV-JRA1을 포함하는 일반적인 E형 간염 바이러스게놈에는, 오픈 리딩 프레임(이하, ORF로 약칭한다)이, ORF1, ORF2 및 ORF3의 3개가 포함된다. 당해 5'단의 약 5000염기는 ORF1에 포함된다. 그의 하류의 게놈영역, 즉 ORF2 및 ORF3의 영역을 포함하는 다른 영역은 ORF1에 비해서 주(株)사이의 보존성이 상대적으로 높다.
또한, 이 ORF1영역 중에서도 5'단의 약 2500염기의 서열은, 후에 기술하는 서열표의 서열번호 7에서 나타낸 JRA1주의 부분염기서열에 관해서, 라이에스 등의 특허에 개시된 염기서열 중에서도 가장 높은 상동성을 갖는 Mexico주(미국특허 제 5789559호의 서열번호 10, NCBI accession no. M74506, 서열번호 49에 나타냈다)와 비교해서도, 그의 염기서열의 일치도는 70% 이하이였다. 양자의 서열의 비교를 도 3a, 도 3b, 도 4a, 도 4b, 도 5a 및 도 5b에 나타냈다. 도 3a, 도 3b, 도 4a, 도 4b, 도 5a 및 도 5b에는, 상단에 HEV-JRA1주의 서열을 하단에 Mexico주의 서열의 일부를 함께 나타냈다. 그의 상동성은 2432염기당 69.9%이다.
따라서, 이와 같은 JRA1주에 특이한 신규 서열을 명확히 함으로써, 종래에서는 그의 검출이 의도되지 않고, 따라서 검출하는 것은 곤란한 JRA1주를 용이하게 또한 정확하게 검출하는 것이 가능했다. 또한, 종래에는 검출하는 것이 곤란한 그의 근린주에 대해서도 마찬가지로 검출하는 것이 가능하게 되었다. 이와 같은 신규 E형 간염 바이러스주의 신규 게놈서열의 결정에 기초하여, 본 발명의 태양에 대해서 또 다른 설명을 이하에 기술한다.
(2) 폴리누클레오티드
본 발명의 한 태양에 따르면, JRA1주에 특이적이고, 또한 신규 서열을 갖는 폴리누클레오티드가 제공된다. 예를 들면, 이와 같은 서열은, 5138염기로부터 되는 서열번호1의 염기서열에 의해 나타내지는 폴리누클레오티드이어도 좋다. 또한, 이 폴리누클레노티드의 어느 영역의 염기서열에 의해 나타내지는 폴리누클레오티드단편이어도 좋다. 예를 들면, 2442염기로부터 되는 서열번호 7의 염기서열에 의해 나타내지는 폴리누클레오티드이어도 좋다. 또한, 이들 서열의 상보쇄이어도 좋고, 또한 이 폴리누클레오티드 및 그의 상보쇄인 폴리누클레오티드의 일부분을 구성하는 폴리누클레오티드단편이어도 좋다.
또한, 상기 폴리누클레오티드는, 거기에 있어서 1개 또는 수개의 누클레오티드가 결실, 치환 또는 부가·수식된 폴리누클레오티드이어도 좋다.
또한, 본 발명의 한 태양에 따르면, 서열번호 1 내지 7에 기재된 염기서열 또는 그의 상보쇄, 또는 그의 어느 것의 단편을 갖는 폴리누클레오티드 단편으로부터 되는 프라이머 및 프로브가 제공된다. 이들의 프라이머 및 프로브는, 예를 들면, 검출대상에 있어서 HEV를 검출하기 위한 각종 증폭, 예를 들면, PCR증폭 등을 위한 프라이머로서, 또는 소위 DNA칩에 있어서 사용하는 프로브로서 사용해도 좋다. 이 경우, 이 폴리누클레오티드는, 10 누클레오티드 이상 30 누클레오티드 이하인 것이 바람직하다. 폴리누클레오티드 단편의 길이가 과도하게 길면, 1개의 누클레오티드의 상위를 식별하는 것이 곤란하게 된다. 또한, 기본적으로 폴리누클레오티드의 길이가 과도하게 짧으면 시료 중에 포함되는 폴리누클레오티드의 염기서열의 결정이 곤란하게 된다.
예를 들면, 이와 같은 프라이머 및 프로브에는, HEV를 포괄적으로 검출하기 위한 프라이머 및 프로브, 및 HEV의 각종 게노타입을 선택적으로 검출하기 위한 프라이머 및 프로브가 포함된다.
도 6에, JRA1주의 염기서열정보의 일부와 그 것에 상당하는 부위에 있어서 기지주의 염기서열정보를 비교한 예를 나타냈다. 이와 같이 염기서열을 비교함으로써, HEV를 포괄적으로 검출하기 위한 프라이머나 프로브를 설정하는데 유용한 고도보존영역이나 HEV의 각종 게노타입을 선택적으로 검출하기 위한 고도변이영역을 명확히 하는 것이 가능하다.
여기서 사용되는 「고도보존영역」이라 함은, HEV-JRA1주의 염기서열과 종래 주의 염기서열의 상동성이 높은, 예를 들면 90% 이상, 바람직하기는 95% 이상, 특히 바람직하기는 100%의 상동성을 갖고 있는 영역을 나타낸다. 또한, 여기서 사용되는 「고도변이영역」이라 함은, HEV-JRA1주에 특이적인 염기서열에 있어서, 종래 주의 서열과는 상동성이 낮은, 예를 들면 80% 이하, 바람직하기는 75% 이하, 특히 바람직하기는 70% 이하의 상동성 밖에 없는 것과 같은 영역을 나타낸다.
도 6에는, 포괄적 HEV 검출용의 프라이머 및 프로브의 설정후보 영역의 예이다. HEV-JRA1주의 서열번호 1의 111위치부터 124위치와, 그 것에 상당하는 종래주의 영역을 나타내고 있다. 또한, 예를 들면, 포괄적 HEV 검출용의 프라이머 및 프로브로서는, 서열번호 2 내지 5에 기재된 염기서열 또는 그의 상보쇄를 포함하는 폴리누클레오티드를 프라이머 또는 프로브로서 사용할 수 있지만, 포괄적 HEV 검출용의 프라이머 및 프로브로서 사용할 수 있는 서열번호 1의 영역은 여기에 한정하는 것은 아니다.
또한, 마찬가지로, 도 6에 있어서, 선택적 HEV 검출용의 프라이머 및 프로브의 설정후보영역의 예인 JRA1주의 서열번호 1의 353위치로부터 371위치와, 그 것에 상당하는 종래주의 영역을 나타내고 있다. 또한, 예를 들면, 선택적 HEV 검출용의 프라이머 및 프로브로서는, 서열번호 1 및 7에 기재된 염기서열 또는 상보쇄를 포함하는 폴리누클레오티드, 예를 들면, 서열번호 6 또는 그의 상보쇄를 포함하는 폴리누클레오티드를 프라이머 또는 프로브로서 사용할 수 있지만, 선택적 HEV 검출용의 프라이머 및 프로브로서 사용할 수 있는 서열번호 1 및 7의 영역은 그 것에 한정하는 것은 아니다.
또한, 본 발명의 태양에 따르면, 서열번호 1로부터 7의 폴리누클레오티드는 그의 단편을 그의 일부로서 포함하는 폴리누클레오티드가 제공된다. 이와 같은 폴리누클레오티드는, 또한 프로모터, 인핸서, 상류 활성화 서열, 사이렌서(silencer), 상류 제어서열, 어테뉴에이터, 폴리A테일, 핵 전이 시그날, ISRE, 약물내성인자, 시그날펩티드의 유전자, 막관통영역의 유전자, 루시페린, 녹색 형광 단백질, 휘코시아닌(phycocyanin), 고추냉이 퍼옥시다제를 함유하는 마커 단백질의 유전자 등의 유전자로부터 되는 군에서 선택되는 적어도 1개의 폴리누클레오티드가 연결되어서 이루어지는 폴리누클레오티드를 구비하는 폴리누클레오티드이어도 좋고, 다른 임의의 염기서열을 갖는 폴리누클레오티드이어도 좋다.
(3) 폴리펩티드
또한, 본 발명의 태양에 따르면, 서열번호 8에 기재된 아미노산서열에 의해 나타내지는 폴리펩티드가 제공된다. 당해 폴리펩티드는, HEV-JRA1 환자에 있어서 조기에 생산되는 폴리펩티드인 것, 또한, 이 폴리펩티드에 대한 항체도 HEV-JRA1 환자에 있어서 조기에 생산되는 항체인 것을, 본 발명자들은 임상적인 연구를 해서 증명했다. 따라서, 이 폴리펩티드 및/또는 이 항체를 HEV-JRA1의 검출용 마커로서도 사용하는 것도 가능하다. 이와 같은 폴리펩티드 및 항체는 그 자체 공지의 수단에 의해 얻는 것이 가능하다. 또한, 이와 같은 폴리펩티드의 단편 및 이 것을 함유하는 폴리펩티드, 및 서열번호 8에 기재된 아미노산서열에 있어서, 1개 또는 수개의 펩티드가 결실, 치환, 또는 부가·수식된 폴리펩티드도 본 발명의 범위에 포함된다.
이 태양에 따르면, 예를 들면, 그 자신에 항체를 결합시켜서 이 항체를 검출하는 항체검출용 폴리펩티드로서 사용하는 경우에는, 합성 펩티드이면, 서열번호 8에 포함되는 연속한 15로부터 50까지 아미노산 잔기에 의해 나타내지는 폴리펩티드를 포함할 수 있다. 또한, 발현 단백질이면, 서열번호 8에 포함되는 연속한 150부터 250까지의 아미노산 잔기에 의해 나타내지는 폴리펩티드를 포함할 수 있다.
3. HEV Japan JSN-FH주
(1) HEV Japan JSN-FH주
상기한 바와 같이, JSN-FH주는, 극증간염증예에서 단리한 신규 HEV주이다. 극증간염과 통상의 급성 간염에서는, 그의 치료방법은 전혀 다르다. 따라서, 극증간염과의 진단이 조기에 행해지면, 예를 들면, 감염 직후에 진단이 가능하면, 구명율은 높게 된다. 그렇지만, 극증간염환자에 있어서 HEV 바이러스 발현량은 대단히 낮다. 그 때문에, 종래에서는, 극증간염환자로부터 HEV가 단리된 예는 거의 없고, 더구나 전장에 걸친 시퀀싱을 조사하는 것은 곤란하게 되어 있다. 그와 같은 상황에도 불구하고, 본 발명자들은 극증간염환자로부터의 HEV의 단리에 성공하고, 또한, 그의 게놈의 대강의 전장(또는 준전장)을 결정했다.
극증간염환자로부터 단리한 HEV의 게놈은, 전체상으로서도 독특한 서열을 갖고 있다. 또한, 서브클로닝에 의해 얻어진 클론의 1개에는 일찌기 한번도 보고된 것은 없고, 변이점(point mutation)을 알았다. 그의 변이는 누클레오캅시드 단백질을 코드하는 오픈 리딩 프레임(ORF2)내에 스톱코돈을 생기게 하는 변이에 있어서, 통상의 E형 간염 바이러스주의 ORF2가 코드하는 660아미노산으로부터 되는 번역산물의 길이를 211 아미노산으로 단축시키는 변이이었다. 즉, ORF2의 제212번째의 코돈이 TAA, TAG 또는 TGA의 어느 스톱코돈으로 바뀌었다.
B형 간염의 경우에서는, 프리코어·코어영역이 코드하는 번역산물이 풀사이즈에서는 할 수 없는 변이주에 감염한 경우, 그의 환자는 극증간염으로 되는 확률이 높은 것을 알았다.
JSN-FH주와 Mexico주(M74506)와의 염기서열의 비교를 도 7 내지 도 12에 나타냈다. 상단에 HEV JSN-FH주의 서열을, 하단에 Mexico주(M74506)의 서열을 나열해서 나타냈다. 그의 상동성은 2631염기당 69.4% 이였다.
따라서, 이와 같은 JSN-FH주에 특이적인 신규서열을 명확히함으로써, 종래에서는 그의 검출이 의도되지 않고, 따라서 검출하는 것이 곤란한 JSN-FH주를 용이하게, 또한 정확하게 검출하는 것이 가능해졌다. 또한, 종래에서는 검출하는 것이 곤란한 그의 근린주에 대해서도 마찬가지로 검출하는 것이 가능하게 될 것이다. 또한, 환자에 있어서, JSN-FH주가 검출된 경우, 그 후 극증간염을 발증하는 것으로 시사된다.
(2) 폴리누클레오티드
본 발명의 한 태양에 따르면, JSN-FH주에 특이적이고, 또한 신규서열을 갖는 폴리누클레오티드가 제공된다. 예를 들면, 그와 같은 서열은, 7234염기로부터 되는 서열번호 11의 염기서열에 의해 나타내지는 폴리누클레오티드이어도 좋다. 또한, 이 폴리누클레오티드의 어느 영역의 염기서열에 의해 나타내지는 폴리누클레오티드이어도 좋다. 예를 들면, 238염기로부터 되는 서열번호 22의 염기서열에 의해 나타내지는 폴리누클레오티드이어도 좋다. 또한, 이들의 서열의 상보쇄이어도 좋다. 또한, 이 폴리누클레오티드 및 그의 상보쇄인 폴리누클레오티드의 일부분을 구성하는 폴리누클레오티드 단편이어도 좋다.
또한, 특히, 그의 ORF2에 스톱코돈을 갖는 주인가 아닌가를 검출하기 위한 폴리누클레오티드로서, 서열번호 9 및 10에 기재된 염기서열을 갖는 폴리누클레오티드 또는 그의 상보쇄, 또는 그의 어느 단편을 갖는 폴리누클레오티드 단편이 제공되어도 좋다. 또한, 이 것에 의해, 프라이머 및 프로브가 제공되어도 좋다. 또한, 서열번호 9 및 10에 기재된 염기서열은, JSN-FH주의 ORF2의 일부분의 서열이다. 서열번호 9에 기재된 염기서열은, 스톱코돈 없는 주를 특이적으로 검출가능한 서열이다. 서열번호 10에 기재된 염기서열은, 스톱코돈 있는 주를 특이적으로 검출가능한 서열이다. 또한, 이 부분을 포함하는 염기를 증폭하기 위한 염기서열을 포함하는 프라이머도 본 발명의 범위이다. 대상에서 채취한 시료에 포함되는 핵산의 ORF2에 풀사이즈에서의 번역산물이 얻어지지 않는 서열을 검출하고, 그 것을 기초로, 대상이 ORF2에 그와 같은 스톱코돈을 갖는 바이러스주에 감염해 있는 것을 검출하려면, 감염초기에 극증간염 바이러스에 감염해 있는 것을 진단하는 것이 가능하다. 또한, 상기한 폴리누클레오티드는, 거기에 있어서 1개 또는 수개의 누클레오티드가 결실, 치환, 또는 부가·수식된 폴리누클레오티드이어도 좋다.
또한, 본 발명의 한 태양에 따르면, 서열번호 11 및 22에 기재된 염기서열 또는 그의 상보쇄, 또는 그의 어느 단편을 갖는 폴리누클레오티드 단편으로부터 되는 프라이머 및 프로브가 제공된다. 이들의 프라이머 및 프로브는, 예를 들면, 검출대상에 있어서 HEV를 검출하기 위한 각종 증폭, 예를 들면 PCR증폭 등을 위한 프라이머로서, 또는 소위 DNA칩에 있어서 사용하는 프로브로서 사용해도 좋다. 이 경우, 이 폴리누클레오티드는, 10 누클레오티드 이상 30 누클레오티드 이하인 것이 바람직하다. 폴리누클레오티드 단편의 길이가 지나치게 길면, 1개의 누클레오티드의 상위를 식별하는 것이 곤란하게 된다. 또한, 기본적으로 폴리누클레오티드의 길이가 지나치게 짧으면 시료 중에 포함되는 폴리누클레오티드의 염기서열의 결정이 곤란하게 된다.
또한, 본 발명의 태양에 따르면, 서열번호 11, 22, 9 및 10의 폴리누클레오티드 또는 그의 단편을 그의 일부로서 포함하는 폴리누클레오티드가 제공된다. 그와 같은 폴리누클레오티드는, 또한, 프로모터, 인핸서, 상류 활성화 서열, 사이렌서, 상류 억제 서열, 어테뉴에이터, 폴리A테일, 핵 전이 시그날, ISRE, 약물내성인자, 시그날 펩티드의 유전자, 막관통영역의 유전자, 루시페린, 녹색 형광 단백질, 휘코시아닌, 고추냉이 퍼옥시다제를 포함하는 마커 단백질의 유전자 등의 유전자로부터 이루어지는 군에서 선택되는 적어도 1개의 폴리누클레오티드가 연결되어서 되는 폴리누클레오티드를 구비하는 폴리누클레오티드이어도 좋고, 다른 임의의 염기서열을 갖는 폴리누클레오티드이어도 좋다.
(3) 폴리펩티드
또한, 본 발명의 태양에 따르면, 서열번호 12 및 서열번호 13에 기재된 아미노산서열에 의해 나타내지는 폴리펩티드가 제공된다. 서열번호 12에 기재된 아미노산서열은, JSN-FH주의 게놈서열의 ORF1의 영역에 대응하는 서열이다. 서열번호 13에 기재된 아미노산서열은, JSN-FH주의 게놈서열의 ORF2의 영역에 대응하는 서열이다.
당해 폴리펩티드 및/또는 당해 항체를 JSN-FH의 검출용 마커로서 사용하는 것도 가능하다. 이와 같은 폴리펩티드 및 항체는 그 자신 공지의 수단에 의해 얻는 것이 가능하다. 또한, 이와 같은 폴리펩티드의 단편 및 이 것을 포함하는 폴리펩티드, 및 서열번호 12 또는 서열번호 13에 기재된 아미노산서열에 있어서, 1개 또는 수개의 펩티드가 결실, 치환, 또는 부가·수식된 폴리펩티드도 본 발명의 범위에 포함된다.
이 태양에 따르면, 예를 들면, 그 자신에 항체를 결합시켜서 이 항체를 검출하는 항체 검출용 폴리펩티드로서 사용하는 경우에는, 합성 펩티드이면, 서열번호 12 또는 13에 포함되는 연속한 15부터 50 아미노산 잔기에 의해 표시되는 폴리펩티드를 포함할 수 있다. 또한, 발현단백질이면, 서열번호 12 또는 13에 포함되는 연속한 150부터 250 아미노산 잔기에 의해 표시되는 폴리펩티드를 포함할 수 있다.
또한, 서열번호 12에 의해 표시되는 ORF1은, 비리온의 복제 등에 필요한 여러가지 효소 단백질을 코드하는 영역이다. 따라서, 서열번호 12의 일차 구조 뿐만 아니라, 이차 구조 및/또는 삼차 구조의 데이타를, 예를 들면 X선 회절 등의 그 자신 공지의 방법에 의해 얻고, 그의 데이타를 기초하여 드러그 디자인을 행해도 좋다. 그와 같은 드러그 디자인 자체 및 그 것에 의해 얻어진 약제도 본 발명의 범위에 포함된다.
또한, 서열번호 13에 의해 표시되는 ORF2에 유래하는, 단축된 누클레오캅시드 단백질에 대한 특이항체를, 그 자신 공지의 수단을 사용해서 제조해도 좋다. 그와 같은 항체를 사용한 항원항체반응을 이용하면, 대상에서 채취한 샘플을 사용해서 용이하게 HEV감염을 진단하는 것이 가능하다.
또한, 누클레오캅시드 단백질에 대한 항체를 인식하는 항체를, 그 자신 공지의 방법에 의해서 제작해도 좋다. 그와 같은 항체를 사용해도 대상에서 채취한 샘플을 사용해서 용이하게 HEV감염을 진단하는 것이 가능하다.
4. 신규 HEV주와 종래의 HEV주의 비교
(1) 신규 HEV주와 종래의 HEV주의 비교
도 13에, 각각의 ORF가, 게놈서열의 어디에 위치하는 가에 대해서, HEV Burma B1주(M73218), HEV Mexico주(M74506), HEV USA US-1주(AFO60669), HEV Japan JRA1(APO03430), 게놈타입 4, 및 HEV Japan JSN-FH의 사이에서 비교한 결과를 나타냈다. 각각의 균주 이름의 뒤에 기재한 괄호내의 번호는 NCBI accession no.이다. 또한, 본 명세서에서는 각 균주 이름의 「HEV」를 생략해서 기재한 것도 있다(예를 들면, HEV USA US-1주를 「USA US-1주」로 기재하는 것도 있다).
각각의 균주 이름의 오른쪽 이웃의 괄호내에 나타낸 로마숫자는 각각의 균주에 속하는 게노타입을 나타낸다. 도 13에 나타낸 바와 같이, JSN-FH주는, OFR2에 종지코돈 TGA가 존재한다.
도 14에, 본 발명의 5종류의 신규주를 포함하는 7종류의 일본고유주와, 일본 이외의 나라에서 발견한 HEV주와를 OFR1의 326nt 영역을 기초해서 작성한 계통수(neighbor-joining method에 의함)를 나타낸다. 여기에 나타낸 바와 같이, JMM-Sai는 타입I에, JKN-Sap, JHA-Sap 및 JMY-Haw는 타입Ⅲ에, JSY-Sap, JKK-Sap 및 JAK-Sai는 타입Ⅳ에 각각 분류화되었다.
도 15로부터 도 18에, ORF1의 영역의 염기서열 정보에 대해서, 본 발명의 한 태양인 일본 고유주 5종류{Japan JRA1주(서열번호 15), JKN-Sap주(서열번호 16), JMY-Haw주(서열번호 17), JKK-Sap주(서열번호 21) 및 JAK-Sai(서열번호 20)} 및 극증간염환자유래주(JSN-FH주, 서열번호 22), 및 종래 공지의 외국주{USA US-1(AFO60669), 서열번호 18), SWINE HEV(AFO82843, 서열번호 19), China type 4(AJ272108, 서열번호 23), Burma B1(M73218, 서열번호 24), China Uigh(D11093, 서열번호 25), China Hebei(M94177, 서열번호 26), China Xinjiang(D11092, 서열번호 27), Nepali(AFO51830, 서열번호 28), India FH strain(X98292, 서열번호 29), Pakistan SAR55(M80581, 서열번호 30), Mexico(M74506, 서열번호 31)}를 비교하기 위하여 나열해서 나타냈다.
도 15로부터 도 18 중에는, 균주 이름과 균주 이름 오른 쪽의 괄호내에 나타낸 NCBI accession no.와 그의 우측에 염기서열 정보를 나타냈다. 또한, 서열의 좌우에 기재한 번호는 전사개시부위를 1로 한 경우의 각각의 누클레오티드의 번호를 나타냈다. 최상단의 JRA1주를 표준으로 해서, 기타 주에 대해서 특정 위치에 있어서 염기의 종류가, 당해 위치에 있어서 JRA1주의 염기의 종류와 같은 경우에는 「.」를 표시하고, 다른 경우에는 해당하는 염기의 종류를 기재했다. 또한, 최하단에는, 병기한 복수의 서열에 있어서 서열의 보존성을 나타냈다. 즉, 특정의 위치에 있어서 모두의 균주의 서열이 같은 경우, 최하단에는 「*」를 표시하고, 1주에서도 다른 경우에는 「.」를 표시했다.
이와 같은 신규의 주 및 그의 염기서열은 모두 본 발명의 범위내이다.
(2) 폴리누클레오티드
본 발명의 한 태양에 따르면, JKN-Sap, JMY-Haw, JKK-Sap 및 JAK-Sai주에, 각각 특이적이고, 또한 신규 서열을 갖는 폴리누클레오티드가 제공된다. 예를 들면, 이와 같은 서열은, 각각 JKN-Sap, JMY-Haw, JKK-Sap 및 JKA-Sai주의 게놈서열을 나타내는 서열인 서열번호 44, 서열번호 45, 서열번호 46 및 서열번호 47의 염기서열에 의해 표시되는 폴리누클레오티드이어도 좋다. 또한, 이들 서열의 상보쇄이어도 좋고, 또한, 이 폴리누클레오티드 및 그의 상보쇄인 폴리누클레오티드의 일부분을 구성하는 폴리누클레오티드 단편이어도 좋다.
이 폴리누클레오티드의 어느 영역의 염기서열에 의해 표시되는 폴리누클레오티드 단편이어도 좋다. 또한, ORF1 영역을 코드하는 염기서열인 서열번호 16, 서열번호 17, 서열번호 20 및 서열번호 21의 염기서열에 의해 표시되는 폴리누클레오티드이어도 좋다. 또한, 이들의 서열의 상보쇄이어도 좋고, 또한, 이 폴리누클레오티드 및 그의 상보쇄인 폴리누클레오티드의 일부분을 구성하는 폴리누클레오티드 단편이어도 좋다.
또한, 예를 들면, 서열번호 16, 서열번호 17, 서열번호 20 및 서열번호 21의 염기서열을 포함하는 염기를 증폭하기 위한 염기서열을 포함하는 프라이머도 본 발명의 범위이다.
또한, 상기한 폴리누클레오티드는, 거기에 있어서 1개 또는 수개의 펩티드가 결실, 치환, 또는 부가 수식된 폴리누클레오티드이어도 좋다.
본 발명의 한 태양에 따르면, 서열번호 44, 서열번호 45, 서열번호 46 및 서열번호 47에 기재된 염기서열 또는 그의 상보쇄, 또는 그의 어느 단편을 갖는 폴리누클레오티드 단편으로부터 되는 프라이머 및 프로브가 제공된다. 이들 프라이머 및 프로브는, 예를 들면, 검출대상에 있어서 HEV를 검출하기 위한 각종 증폭, 예를 들면, PCR증폭 등을 위한 프라이머로서, 또는 소위 DNA칩에 있어서 사용하는 프로브로서 사용해도 좋다. 이 경우, 이 폴리누클레오티드는, 10누클레오티드 이상 30 누클레오티드 이하인 것이 바람직하다. 폴리누클레오티드 단편의 길이가 지나치게 길면, 1개의 누클레오티드의 상위를 식별하는 것이 곤란하게 된다. 또한, 기본적으로 폴리누클레오티드의 길이가 지나치게 짧으면 시료 중에 포함되는 폴리누클레오티드의 염기서열의 결정이 곤란하게 된다.
또한, 본 발명의 태양에 따르면, 서열번호 44, 서열번호 45, 서열번호 46 및 서열번호 47, 및 서열번호 16, 서열번호 17, 서열번호 20 및 서열번호 21의 폴리누클레오티드 또는 그의 단편을 그의 일부로서 포함하는 폴리누클레오티드가 제공된다. 그와 같은 폴리누클레오티드는, 또한, 프로모터, 인핸서, 상류 활성화 서열, 사이렌서, 상류 억제 서열, 어테뉴에이터, 폴리A테일, 핵 전이 시그날, ISRE, 약물내성인자, 시그날펩티드의 유전자, 막관통영역의 유전자, 루시페린, 녹색형광단백질, 휘코시아닌, 고추냉이 퍼옥시다제를 포함하는 마커 단백질의 유전자 등의 유전자로부터 되는 군에서 선택되는 적어도 1개의 폴리누클레오티드가 연결되어서 되는 폴리누클레오티드를 구비하는 폴리누클레오티드이어도 좋고, 다른 임의의 염기서열을 포함하는 폴리누클레오티드이어도 좋다.
(3) 폴리펩티드
또한, 본 발명의 태양에 따르면, JKN-Sap, JMY-Haw, JKK-Sap 및 JAK-Sai주에 특이적인 서열번호 44, 서열번호 45, 서열번호 46 및 서열번호 47, 및 서열번호 16, 서열번호 17, 서열번호 20 및 서열번호 21에 기재된 폴리누클레오티드 서열이 코드하는 아미노산서열에 의해 표시되는 폴리펩티드가 제공된다. 또한, JKN-Sap, JMY-Haw, JKK-Sap 및 JAK-Sai주에 각각 특이적인 ORF1영역의 아미노산서열을 나타내는 서열번호 50, 서열번호 52, 서열번호 54 및 서열번호 56과, ORF2영역의 아미노산서열을 나타내는 서열번호 51, 서열번호 53, 서열번호 55, 및 서열번호 57의 아미노산서열에 의해 나타내지는 폴리펩티드 및 그의 단편이 제공된다.
ORF1의 영역이 코드하는 아미노산서열에 유래하는 폴리펩티드는 드러그 디자인을 위하여 이용하는 것이 가능하다.
ORF2의 영역이 코드하는 아미노산서열에 유래하는 폴리펩티드는, 각각의 주를 검출하기 위한 항체를 제작하기 위하여 사용해도 좋고, 그 자신을 항원으로서 검출해서 진단을 행하기 위하여 사용되어도 좋다. 또한, 이 것을 사용해서 왁친을 제조해도 좋다.
이 태양에 따르면, 예를 들면, 그 자신에 항체를 결합시켜서 이 항체를 검출하는 항체 검출용 폴리펩티드로서 사용하는 경우에는, 합성 펩티드이면, 각각의 신규주에 유래하는 염기서열의 ORF2의 영역에 의해 표시되는 아미노산 서열, 예를 들면, 서열번호 51, 서열번호 53, 서열번호 55 또는 서열번호 57에 포함되는 연속한 15부터 50 아미노산 잔기에 의해 표시되는 폴리펩티드를 포함할 수 있다. 또한, 발현단백질이면, 서열번호 51, 서열번호 53, 서열번호 55 또는 서열번호 57에 포함되는 연속한 150부터 250 아미노산 잔기에 의해 표시되는 폴리펩티드를 포함할 수 있다.
이 폴리펩티드 및/또는 이 항체를 HEV JKN-Sap, JMY-Haw, JKK-Sap 및 JAK-Sai의 검출용 마커로서 사용하는 것도 가능하다. 이와 같은 폴리펩티드 및 항체는 그 자신 공지의 수단에 의해 얻는 것이 가능하다. 또한, 이와 같은 폴리펩티드의 단편 및 이 것을 함유하는 폴리펩티드, 및 서열번호 50 내지 서열번호 57에 기재된 아미노산 서열에 있어서, 1개 또는 수개의 누클레오티드가 결실, 치환 또는 부가·수식된 폴리펩티드도 본 발명의 범위에 포함된다.
이 태양에 따르면, 예를 들면, 그 자신에 항체를 결합시켜서 이 항체를 검출하는 항체 검출용 폴리펩티드로서 사용하는 경우에는, 합성 펩티드이면, 서열번호 8에 포함되는 연속한 15부터 50 아미노산 잔기에 의해 표시되는 폴리펩티드를 포함할 수 있다. 또한, 발현단백질이면, 서열번호 8에 포함되는 연속한 150부터 250 아미노산 잔기에 의해 표시되는 폴리펩티드를 포함할 수 있다.
5. 포괄적 HEV 검출용의 프라이머 및 프로브
상기한 바와 같이 신규 HEV주를 발견하고, 그의 서열을 특정함으로써, 미지의 균주를 포함하는 보다 광범위한 HEV를 한꺼번에 증폭하는 것이 가능한 프라이머, 즉 유니버살 프라이머(즉, 포괄적 HEV 검출용의 프라이머)나, 미지의 균주를 포함하는 보다 광범위한 HEV를 한꺼번에 검출하는 것이 가능한 프로브(즉, 포괄적 HEV 검출용의 프로브)를 제공하는 것이 가능해졌다. 이와 같은 유니버살 프라이머에 대해서 이하에 설명한다.
도 15 내지 도 18에, 그룹 Ⅰ,Ⅱ, Ⅲ 및 Ⅳ에 속하는 대표적인 HEV주의 ORF1의 서열을 열기했다. 표 중의 균주 이름 오른쪽의 괄호 내의 기호는 NCBI accession no.이다. 또한, 서열의 좌우에 기재한 번호는 전사개시부위를 1로한 경우의 각각의 누클레오티드의 번호를 나타낸다.
「유니버살 프라이머」 또는 「유니버살 프로브」라 함은, 미지의 균주의 HEV를 포함하는 HEV를 포괄적으로 검출하는 것이 가능한 염기서열을 포함하는 폴리누클레오티드 단편을 가리킨다. 예를 들면, 이와 같은 유니버살 프라이머의 염기서열은, 도 15부터 도 18에 나타낸 서열에서 선택하는 것이 가능하다. 예를 들면, 이와 같은 서열은 고도보존영역인 것이 바람직하다.
여기서 사용되는 「고도보존영역」이라 함은, HEV-JRA1주의 염기서열과 종래주의 염기서열의 상동성이 높고, 예를 들면 90% 이상, 바람직하기는 95% 이상, 특히 바람직하기는 100%의 상동성을 갖고 있는 영역을 나타낸다.
도 15 내지 도 18에, JSN-FH주의 염기서열정보의 일부와 그 것에 상당하는 부위에 있어서 기지주의 염기서열정보를 비교한 예를 나타냈다. 이와 같이 염기서열을 비교함으로써, HEV를 포괄적으로 검출하기 위한 프라이머나 프로브를 설정하는데 유용한 고도보존영역이나, HEV의 각종 게노타입을 선택적으로 검출하기 위한 고도변이영역을 명확하게 하는 것이 가능하다.
도 15 내지 도 18에는, 포괄적 HEV 검출용의 프라이머 및 프로브의 설정후보영역의 예를 나타냈다. 도 15 중의 (1)의 영역, 즉 HEV-JRA1주의 서열번호 15의 19위치로부터 37위치와, 거기에 상당하는 종래주의 영역; 도 16 중의 (4)의 영역, 즉 HEV-JRA1주의 서열번호 15의 111위치로부터 127위치와, 거기에 상당하는 종래주의 영역; 도 17 중의 (5)의 영역, 즉 HEV-JRA1주의 서열번호 15의 174위치로부터 181위치와, 거기에 상당하는 종래주의 영역; 도 17 중의 (6)의 영역, 즉 HEV-JRA1주의 서열번호 15의 213위치로부터 220위치와, 거기에 상당하는 종래주의 영역이 고도보존영역의 바람직한 예이다.
포괄적 HEV검출용의 프라이머는, 바람직하기는 도 15 중의 (1)의 영역에 포함되는 서열을 구비하는 6염기로부터 100염기, 더욱 바람직하기는 15염기로부터 25염기의 폴리누클레오티드를 센스 프라이머로서 사용하면 좋다. 또한, 이 센스 프라이머와 동시에, 도 15 중의 (4), (5) 및/또는 (6)의 영역에 포함되는 서열을 구비하는 6염기부터 100염기, 바람직하기는 15염기부터 25염기의 폴리누클레오티드를 센스 프라이머로서 사용하면 더욱 바람직하다.
또한, 도 15 및 16 중의 (7)의 영역, 즉 HEV-JRA1주의 서열번호 15의 48위치로부터 100위치와, 거기에 상당하는 종래주의 영역도, 포괄적 HEV 검출용의 프라이머군으로서 사용하는 것이 가능하다. 이 경우, (7)의 영역 전장에 걸친 서열은 반드시 필요하지는 않고, (7)의 영역으로부터 선택되는 6염기로부터 25염기, 바람직하기는 15염기로부터 22염기의 연속한 서열을 사용하면 좋다. 예를 들면, 포괄적 HEV 검출용의 프라이머의 바람직한 예를 이하에 나타낸다.
5'-gcagaccacrtatgtgktcg-3' (서열번호 32),
5'-ccacrtatgtggtcgaygcc-3' (서열번호 33),
5'-acmarctgscgrggytgcat-3' (서열번호 34),
5'-cgytgratwggrtgrttcca-3' (서열번호 35),
5'-tgktcgaygccatggaggc-3' (서열번호 36),
5'-tgktcgaygccatggaggc-3' (서열번호 37),
5'-aygccatggaggcccaycag-3' (서열번호 38),
5'-ckracyaccacagcattcgc-3' (서열번호 39) 및
5'-ggcckracyaccacagcatt-3' (서열번호 40) 이다.
여기서, 명세서 중 「a」또는 「A」는 아데닌, 「c」또는 「C」는 시토신, 「g」 또는 「G」는 구아닌, 「t」 또는 「T」는 티민, 「r」 또는 「R」는 G 또는 A, 「y」 또는 「Y」는 T 또는 U 또는 U, 「w」 또는 「W」는 A 또는 T 또는 U를 나타낸다.
이들의 포괄적 HEV 검출용의 프라이머군은, 예를 들면, 이하와 같이 2단계로 나눠서 해석에 사용하는 것이 더욱 바람직하다. 예를 들면, 상기 서열번호 32 및 서열번호 33을 센스 프라이머로서 사용하고, 또한 서열번호 34 및 서열번호 35를 안티센스 프라이머로서 사용하고, 제1회째의 증폭에 사용한다. 계속해서, 상기 서열번호 36, 서열번호 37 및 서열번호 38을 센스 프라이머로 하고, 또한 서열번호 39 및 서열번호 40을 안티센스 프라이머로 해서 제2회째의 증폭을 행한다. 이 것에 의해, 광범위한 미지의 HEV변이주에 유래하는 폴리누클레오티드 단편을 얻는 것이 가능하다. 또한, 얻어진 증폭산물을 전기영동 등의 그 자신 공지의 수단에 의해서 해석해도 좋다. 또한, 그 후, 얻어진 폴리누클레오티드 단편에 대해서 분류화를 행해도 좋다.
또한, 상기의 서열을 프로브로서 사용하는 경우, 포괄적 HEV 검출용의 프로브는, 바람직하기는 도 15 중의(1)의 영역에 포함되는 연속한 서열을 그의 서열에 포함하는 6염기로부터 100염기, 더욱 바람직하기는 12염기로부터 25염기의 폴리누클레오티드를 프로브로서 사용하면 좋다. 또한, 마찬가지로, 도 15 중의 (4), (5) 및/또는 (6)의 영역에 포함되는 연속한 서열을 그의 서열에 포함하는 6염기로부터 100염기, 더욱 바람직하기는 12염기로부터 25염기의 폴리누클레오티드를 프로브로서 사용하면 더욱 바람직하다.
이상에 바람직한 포괄적 HEV 검출용의 프라이머의 예를 나타냈지만, 이 것에 한정하는 것은 아니다.
6. 분류화용 누클레오티드 서열
상기한 바와 같이, 고도보존영역의 서열을 선택하면, 포괄적 HEV 검출용 프라이머 및 프로브가 얻어지고, 이 것에 의해 포괄적인 바이러스 검출이 가능하다. 그 것에 대해서, 한편으로, 고도변이영역의 서열을 선택하면, 선택적 HEV 검출용 프라이머 및 프로브가 얻어진다. 또한, 이와 같은 서열을 사용함으로써 선택적인 바이러스의 검출 및/또는 동정이 가능하다.
또한, 여기서 사용되는 「고도변이영역」이라 함은, HEV-JRA1주에 특이적인 염기서열이고, 종래주의 서열과는 상동성이 낮은, 예를 들면, 80% 이하, 바람직하기는 75% 이하, 특히 바람직하기는 70% 이하의 상동성 밖에 없는 영역을 나타낸다.
도 15, 도 16, 도 17 및 도 18에는, 선택적 HEV 검출용의 프라이머 및 프로브의 설정후보로 되는 영역의 예를 나타냈다. 예를 들면, 도 15 중의 (2)의 영역, 즉 HEV-JRA1주의 서열번호 15의 52위치로부터 69위치와, 거기에 상당하는 종래주의 영역; 도 16 중의 (3)의 영역, 즉 HEV-JRA1주의 서열번호 15의 77위치로부터 95위치와, 거기에 상당하는 종래주의 영역이 고도변이영역의 바람직한 예이다.
예를 들면, 도 15의 (2)의 영역은, 게노타입에 의해서 그의 염기서열이 변하는 영역이다. 또한, 이 (2)의 영역은 게노타입마다 3개의 부분으로 나뉘었다. 즉, 도면 중 「Ⅲ」을 기호로 붙인 부분에 포함되는 주는 게노타입Ⅲ이고, 「Ⅳ」를 붙인 부분은 게노타입 Ⅳ이고, 「Ⅰ,Ⅱ」를 붙인 부분은 게노타입 Ⅰ 및 Ⅱ를 포함하는 부분이다. 또한, 도 16의 (3)의 영역에 대해서도 마찬가지이다. 이와 같이, 게노타입마다, 특정 부위의 염기의 종류가 다른 것을 이용해서, 해석하려고 하는 HEV의 분류화를 행하는 것이 가능하다.
또한, 상기 서열을 프로브로서 사용하는 경우에는, 선택적 HEV 검출용의 프로브는, 바람직하기는 도 15 중의 (2)의 영역에 포함되는 연속한 서열을 그의 서열에 포함하는 6염기로부터 100염기, 더욱 바람직하기는 12염기로부터 25염기의 폴리누클레오티드를 프로브로서 사용하면 좋다. 또한, 마찬가지로, 도 16 중의 (3)의 영역에 포함되는 연속한 서열을 그의 서열에 포함하는 6염기로부터 100염기, 더욱 바람직하기는 12염기로부터 25염기의 폴리누클레오티드를 프로브로서 사용하면 더욱 바람직하다.
또한, 상기 서열을 프라이머로서 사용하는 경우에는, 선택적 HEV 검출용 프라이머는, 바람직하기는 도 15 중의 (2)의 영역에 포함되는 연속한 서열을 그의 서열에 포함하는 6염기로부터 100염기, 더욱 바람직하기는 12염기로부터 25염기의 폴리누클레오티드를 프라이머로서 사용하면 좋다. 또한, 마찬가지로, 도 16 중의 (3)의 영역에 포함되는 연속한 서열을 그의 서열에 포함하는 6염기로부터 100염기, 더욱 바람직하기는 12염기로부터 25염기의 폴리누클레오티드를 프라이머로서 사용하면 더욱 바람직하다. 또는, 도 15 중의 (2)의 영역 및/또는 도 16 중의 (3)의 영역을 적어도 포함하는 폴리누클레오티드를 증폭할 수 있는 프라이머를 선택하면 좋다.
5. HEV 바이러스 검출 방법
본 발명의 또 다른 태양에 따르면, 본 발명은 시료에 있어서 HEV 바이러스의 검출방법이 제공된다.
여기서 사용되는 「샘플」이라 함은, 생물에서, 채취한 혈액, 혈청, 임파액 및 조직 등, 분변 및 뇨 등의 배설물의 생물시료, 및 하천 및 하수 등의 환경에서 채취한 물 및 흙 등의 환경시료인 미처리의 시료를, 필요에 따라서, 호모지네이트 및 추출 등의 필요한 임의의 전처리를 행한 것을 말한다. 이와 같은 전처리는, 대상으로 되는 시료에 따라서 당업자에 의해서 선택될 수 있는 것이다.
본 발명의 태양에 따르면, HEV 바이러스 검출방법은, 상기한 프라이머를 사용하고, 그 자신 공지의 증폭반응, 예를 들면, 폴리머라제 연쇄반응(일반적으로 PCR로 칭해진다. 이하, PCR로 기재한다)을 이용한 방법에 의해 행하는 것이 가능하다. 예를 들면, 전형적으로는 역전사 PCR, 역전사 nested PCR, 또는 그의 변형법, 예를 들면, 역 PCR, 5'RACE, 3'RACE일 수 있다. 예를 들면, 그와 같은 검출방법은 이하와 같이 행할 수 있다. 우선, E형 간염 바이러스 게놈이 함유되는 시료에 소망의 프라이머를 혼합하고, 적절한 PCR 조건하에, 예를 들면, 온도변화의 조건 설정은 95℃ 4분에 이어서 {95℃ 30초, 55℃ 30초, 72℃ 45초}를 30사이클, 그리고 최후로 72℃ 7분으로 PCR 반응을 행한다. 이어서, 생산물을 전기영동, DNA칩, 등의 수단에 의해 해석함으로써 E형 간염 바이러스 유래의 게놈단편을 검출함으로써 E형 간염 바이러스를 검출하는 것이 가능하다. 예를 들면, 전기영동이라면, HEV 게놈 유래의 밴드의 유무를 조사함으로써 E형 간염 바이러스 유래의 게놈단편을 검출할 수 있다.
본 발명의 또 하나의 태양에 따르면, HEV 바이러스 검출방법은, 상기한 프로브를 사용하고, 그 자신 공지의 하이브리다이제이션 반응을 이용한 검출방법에 의해 행하는 것이 가능하다. 또한, 이 경우, 당해 프로브를 소망의 표지물질에 의해 표지하는 것도 가능하다.
상기한 바와 같은 포괄적 HEV 검출용 프라이머 및 프로브를 사용함으로써 포괄적인 바이러스 검출이 가능하고, 또한, 선택적 HEV 검출용 프라이머 및 프로브를 사용함으로써 선택적인 바이러스의 검출이 가능하다. 예를 들면, 고도보존영역을 사용한 검출계를 조직함으로써 HEV 감염의 진단정도를 향상시킬 수 있다. 또한, 한편으로, 고도변이영역을 사용한 게노타입 특이검출계는 감염경로의 해명이나 역학연구에 기여하는 것도 가능하다. 또한, 수혈용 혈액에 있어서 이 바이러스 검사에도 사용하는 것이 가능하다. 또한, 환경에 유래하는 시료에 있어서 이 바이러스검사에도 사용하는 것이 가능하다.
본 발명의 태양에 따르면, 이 바이러스의 검출은, 상기한 핵산 레벨 뿐만 아니라 아미노산 레벨에서도 달성될 수 있다. 예를 들면, 서열번호 8 등으로 표시되는 아미노산서열은, 상기 폴리누클레오티드와 마찬가지로, HEV 존재의 마커로서 사용하는 것이 가능하다. 예를 들면, 인간을 포함한 생물에 있어서 이 바이러스감염을 포괄적으로 진단하기 위하여도, 또한, 게노타입 특이적으로 진단하기 위한 것 등에 사용하는 것이 가능하다. 마찬가지로, 상기 어느 아미노산서열도 이와 같은 목적에 사용해도 좋다.
상기한 본 발명에 따른 HEV-JRA1 유래의 유전자 및 폴리누클레오티드는, 신규 물질이다. 이들 폴리누클레오티드 또는 이 것에 기초해서 제작되는 폴리펩티드 및 항체를 사용해서, HEV를 검출하는 방법은, 시료에 있어서 바이러스 게놈이나 바이러스 항체 등을 검출하는 것에 더하여, 종래의 기술을 능가하는 유용성을 갖는 것이다. 다음에, 실시예를 들어서 본 발명의 유용성을 구체적으로 나타낸다.
또한, HEV의 검출방법 및 HEV 감염의 진단기술을 향상시키기 위하여는, 이러한 새로운 균주의 유전자 염기서열 정보를 검출계 및 진단계에 반영시켜서 행하는 것이 바람직하다.
8. 염기서열 검출용 칩
본 발명의 태양에 따르면, 상기한 폴리누클레오티드를 구비하는 염기서열 검출용 칩이 제공된다. 이들은, 예를 들면, 형광 검출용 DNA칩 및 전류검출형 DNA칩 등이지만, 이들에 한정되는 것은 아니다. 바이러스의 검출을, 상기 폴리누클레오티드 또는 그의 상보쇄를 프로브로서 배치한 염기서열 검출용 칩을 사용해서 행하면, 검출방법은 간편화 및 효율화된다. 염기서열 검출용 칩은, 이하의 순서에 의해 작성할 수 있다.
(a) 형광 검출용 염기서열 검출용 칩의 제작
상기한 본 발명의 태양에 따른 폴리누클레오티드 또는 그의 일부의 서열을 갖는 폴리누클레오티드, 또는 그들의 서열에 상보적인 서열을 갖는 폴리누클레오티드를 기판에 고정화한다. 기판은, 예를 들면, 유리기판 및 실리콘기판 등, 종래 사용되는 어느 기판도 사용하는 것이 가능하다. 고정화 수단은, 스포터 등을 사용하는 수단, 일반적인 반도체기술을 사용한 수단 등, 당업자에 그 자신 공지의 수단을 사용해서 고정화하는 것이 가능하다.
(b) 전류검출형 염기서열 검출용 칩의 제작
상기한 본 발명의 태양에 따른 폴리누클레오티드 또는 그의 일부의 서열을 갖는 폴리누클레오티드, 또는 그들의 서열에 상보적인 서열을 갖는 폴리누클레오티드를, 기판, 예를 들면, 전극기판에 공유결합, 이온결합, 물리흡착 또는 화학흡착 등에 의해서 고정화한다. 전류검출형 DNA칩의 예는, 1996년 10월 24일에 등록된 일본 특허 제 2,573,443호의 유전자 검출장치 등이지만, 이 것에 한정되는 것은 아니다.
본 발명의 태양에 따라서, 폴리누클레오티드류를 구비하는 프로브 및 유전자서열 검출용 칩을 사용해서 바이러스의 검출을 행하면, 그의 검출을 간편하고 또한 효율 좋게 행할 수 있다.
9. 프로테인 칩
본 발명의 한 태양에 따르면, 상기 검출방법을 간편하게 실시할 수 있는 프로테인 칩이 제공된다. 그와 같은 프로테인 칩은, 상기한 폴리펩티드를 인식하는 항체를 프로브로서 배치한 것이다. 이 것을 이용해서 시료 중의 HEV를 간편하고 또한 효율적으로 검출하는 것이 가능하다. 프로테인 칩에는, 형광검출용 프로테인 칩(일반적으로, 형광색소형 프로테인 칩으로도 칭한다), 및 전류검출형 프로테인 칩(일반적으로, 전위형 프로테인 칩으로도 칭한다) 등이 있지만, 이들에 한정되는 것은 아니다. 이하에, 그의 제작 순서의 예를 나타낸다.
(a) 형광검출용 프로테인 칩의 제작
미리 당해 폴리펩티드의 모노클로날항체를 제작하고, 이 것을 기판에 고정화한다. 기판은, 예를 들면, 유리기판 및 실리콘 기판 등의 종래 사용되는 어느 기판이어도 좋다. 고정화수단은, 스포터 등을 사용하는 수단 등, 일반적인 반도체기술을 이용한 수단 등, 그 자신 공지의 수단의 어느 것을 선택해도 좋다. 또한, 이 검출을 행하기 위한 표지는, 형광물질, 방사성 동위원소 및 색소 등을 사용해도 좋다.
(b) 전류검출형 프로테인 칩의 제작
미리 폴리펩티드의 모노 클로날항체를 제작하고, 이 것을 일반적인 전류검출형 DNA칩에 사용하는 기판에 대해서 고정해서 제조해도 좋다.
본 발명의 태양에 따라, 상기한 항체를 구비하는 프로테인칩을 사용해서 바이러스의 검출을 행하면, 그의 검출을 간편하고 또한 효율좋게 행할 수 있다.
또한, 상기의 항체로 바꿔서, 상기한 폴리펩티드를 기판에 고정한 칩을 제작하고, 이 것을 사용해서 이 폴리펩티드에 대한 항체를 검출하기 위하여 사용해도 좋다.
10. 진단계
상기한 바와 같은 본 발명의 태양에 따른 신규 HEV주, 및 폴리누클레오티드 및 폴리펩티드를 사용해서, 대상이 HEV에 감염해 있는가 아닌가, 및/또는 감염해 있다면 그의 게노타입은 어느 것으로 되는가, 및/또는 대상이 극증HEV에 감염해 있는가 아닌가를 진단하는 것이 가능하다.
그와 같은 진단방법은, 예를 들면, 우선, 대상으로부터 그 자신 공지의 방법으로 샘플을 채취하는 것, 필요에 따라서 샘플의 정제나 핵산의 증폭을 행하는 것, 상기 정제에 의해 핵산시료를 얻는 것을 행한다. 다음에, 본 발명에 따른 폴리펩티드를 사용해서, 예를 들면, 표적서열의 증폭의 유무를 검출하기도 하고, 하이브리다이제이션의 유무를 검출하는 것에 의해서, 목적으로 하는 진단을 행하는 것이 가능하다. 또한, 상기한 바와 같은, 본 발명에 따른 폴리펩티드를 항체검출용 폴리펩티드로서 사용하고, 항원항체반응을 이용함으로써 목적하는 진단을 행해도 좋다.
11. 예방용 왁친
본 발명의 한 태양에 따르면, HEV에 대한 왁친이 제공된다. 그와 같은 왁친은, 상기한 바와 같은 본 발명에 따른 신규 HEV 바이러스 염기서열에 코드되어 유래하는 핵산을 함유하는 HCV유래의 면역원성 폴리펩티드의 1종류 또는 그 이상의 폴리펩티드를 사용해서 조정하는 것이 가능하다. 예를 들면, 상기한 어느 신규주의 ORF2영역의 폴리펩티드를 사용해도 좋다. 또한, 면역원성의 폴리펩티드를 함유하는 왁친의 제조는, 그 자신 공지의 어느 방법을 사용해서 행하는 것이 가능하다.
12. 드러그 디자인
상기한 신규 HEV유래의 유전정보는, 항바이러스제의 개발 및 개량에 유용하다. 예를 들면, 일반적으로는, 「포스트 게놈 디자인」으로 불려지는 그 자신 공지의 드러그 디자인의 방법을 사용해서, 이하의 프로세스에 의해서 행하는 것이 가능하다.
(1) HEV게놈의 ORF1이 코드하는 복수의 효소단백질의 3차원 구조를, 발현단백질의 X선 결정해석 및/또는 NMR해석에 의해 실제로 계측한다. 또는, 아미노산서열 정보만 기초해서, 컴퓨터상에서 시뮬레이트함으로써, 효소단백질의 3차원 구조를 얻는다. 이들의 정보를 기초로, 약제의 표적으로 될 수 있는 도메인(이하, 「리셉터 도메인」으로 기재한다)의 후보를 탐색한다.
(2) HEV ORF1단백질의 효소활성을 저해하는 것이 이미 판명되어 있는 약제, 저해효과는 아직 불명하지만 이미 합성되어 있는 화합물, 아직 합성되어 있지 않지만 구성식이 기지인 화합물, 및 신규의 구조식을 갖는 가공의 화합물, 이들(이하「리간드」로 기재한다)에 대해서, 각각의 3차원 구조를 컴퓨터에 입력한다.
(3) 상기 (2)의 컴퓨터를 사용해서, 상기 (1)에서 얻어진 리셉터
도메인후보와 상기 (2)에서 얻어진 리간드가, 삼차원적으로 결합이 가능한가 아닌가를, 삼차원적 도킹해석을 행함으로써 결정된다. 이 것에 의해, 리셉터 도메인과의 유효한 조합을 선택한다. 또는, 더욱 유효한 도킹상태를 초래하기 위한 리간드측의 분자의 개량을, 컴퓨터에 의해서 시뮬레이트한다.
(4) 상기 (3)의 공정에 의해 얻어진 (즉, 상기 공정에 의해 선택 또는 개량된)리간드는 HEV의 증식을 억제 또는 저지하는 유효한 항바이러스제로 될 수 있다.
HEV는 다양성이 풍부한 바이러스이다. 따라서, 그와 같은 HEV의 모두의 (또는 가능한한 많은)주에 대해서, 같은 유효성을 발휘하는 항바이러스제를 개발 및/또는 개량하기 위하여는, 현존하는 모두의 (또는 가능한한 많은) HEV주의 염기서열정보를 획득해 놓을 필요가 있다. 상기한 본 발명의 측면에 따르면, 그와 같은 염기서열정보의 획득에 대해서 유리한 효과가 제공된다.
이와 같은 이용은, 상기한 어느 신규 HEV에 유래하는 어느 ORF1에 대해서 행해도 좋다. 또한, 이와 같은 방법에 의해 얻어진 약제도 본 발명의 범위에 포함된다.
13. 어쎄이 키트
본 발명은, 또한 상기한 바와 같은 본 발명의 어느 태양에 따른 폴리누클레오티드, 폴리누클레오티드 단편, 폴리누클레오티드 프로브, 폴리누클레오티드 프라이머, 폴리펩티드, 항원 및 항체는, 사용목적에 따라서, 적절한 키트로서 제공되어도 좋다. 예를 들면, 폴리누클레오티드나 폴리누클레오티드 단편 등은, 염기서열 검출용 칩을 제조하기 위하여, 기판 및/또는 여러가지의 시약 및/또는 표지물질 등과 조합해서 킷트를 형성해도 좋다. 또한, 폴리누클레오티드 프로브는, 반응용기 및/또는 완충액용 염류 및/또는 기타 필요한 시약 등과 조합해서 키트를 형성해도 좋다. 예를 들면, 폴리누클레오티드 프라이머의 경우는, 반응용기 및/또는 완충액용 염류 및/또는 기타 필요한 시약, 예를 들면, 폴리머라제 및/또는 기질 등과 조합해서 키트를 형성해도 좋다. 그렇지만, 본 발명에 의해 제공되는 키트는, 이상의 조합에 한정되는 것은 아니고, 필요에 따라서 여러가지의 것과 조합해서 키트로서 제공되어도 좋다. 또한, 사용목적도 이 것에 한정하는 것은 아니고, 상기한 어느 목적에 대한 키트를 형성하는 것이 가능하다. 그와 같은 키트도 본 발명의 범위에 포함된다.
이하, 본 발명에 따른 HEV게놈의 검출에 관한 예를 기재하지만, 이 기재는 예시를 목적으로 하는 것이고, 본 발명의 범위를 제한하는 것은 아니다.
예 1. RT-PCR법에 의한 HEV 게놈 RNA의 검출
1. 프라이머
이 예의 RT-PCR에 있어서는, 서열표의 서열번호 1 또는 2에 기재된 HEV-JRA1유래 염기서열에서 선별한 하기의 염기서열을 갖는 4종의 올리고 누클레오티드 프라이머를 사용했다.
#HE5-1 (5'-TCGATGCCATGGAGGCCCA-3')(센스, 서열표 1의 nt 19-37에 대응)(밑줄친 부분은 서열표 서열번호 2에 상당)
#HE5-2 (5'-GCCYTKGCGAATGCTGTGG-3')(센스, 서열표 1의 nt 105-123에 대응)(Y=C 또는 T; K=G 또는 T)(밑줄친 부분은 서열표 서열번호 3에 상당)
#HE5-3 (5'-TCRAARCAGTARGTGCGGTC-3')(안티센스, 서열표 1의 nt 450-469에 대응)(R=A 또는 G)(밑줄친 부분은 서열표 서열번호 4에 상당)
#HE5-4 (5'-CATAGCCTCSGCRACATCAG-3')(안티센스, 서열표 1의 nt 541-560에 대응)(S=G 또는 C; R=A 또는 G)(밑줄친 부분은 서열표 서열번호 5에 상당).
2. 검출방법
우선 환자 혈청 50㎕로부터 SMITEST EX R&D(Genome Science Laboratories)로부터 핵산을 추출했다. 이 핵산에 대해서, 안티센스 프라이머인 #HE5-4를 첨가하고, 폴리머라제 MMLV-RT(Stratagene)의 존재하에 37℃ 30분 동안 반응시킴으로써 cDNA합성(즉, RNA로부터 DNA으로의 역전사반응)을 행했다.
이와 같이해서 합성된 cDNA에 대해서, 다음에, 상기 4종의 프라이머와 Fast Start Tag-DNA Polymerase(Roche회사)를 사용해서 nested PCT를 행했다. 온도변화의 조건설정은 95℃ 4분에 계속해서 {95℃ 30초, 55℃ 30초, 72℃ 45초}를 30사이클, 그리고 최후로 72℃ 7분이였다. PCR반응산물은 아가로스겔을 사용해서 전기영동을 행하고, 365bp의 길이의 HEV 게놈 유래의 밴드의 유무를 조사했다.
3. 결과 및 고찰
도 7에 나타낸 것은, 어떤 일본인 급성 간염환자로부터 경시적으로 채취하는 것이 가능했었던 혈청샘플에 대해서, 상기 방법에 의해 HEV 게놈 RNA를 검출한 결과이다. 도 7의 그라프에는, 간염의 경과를 상징하는 간기능검사수치의 변화를 나타냈다. 도면 중의 약어는 이하와 같다. AST는 아스파르틱 아미노트랜스퍼라제를, ALT는 알라닌 아미노트랜스퍼라제를, 총빌리루빈(Total bilirubin)은 빌리루빈의 총 농도를 나타낸다. 도 7의 사진은, 당해 그룹에 대응하는 시기에 같은 환자로부터 얻은 혈청으로부터의 PCR산물의 전기영동의 결과를 나타낸다(즉, RT-PCR:역전사 폴리머라제 연쇄반응법에 의한다). 횡축은 입원 후의 일수이다.
이 증례에 있어서는, 도 7과 같이, HEV RNA가 병 초기부터 27일 이상에 걸처서 계속적으로 혈청 중에 검출되었다. 이 것은 종래의 상식을 뒤집어 엎는 새로운 발견이다. 왜냐하면, 종래의 상식에서는, HEV RNA가 혈 중에 출현하는 것은, AST나 ALT나 총 빌리루빈이 피크에 도달하기 까지의 극히 짧은 시간으로 생각되어 왔었기 때문이다(Purcell, R.H. In Fields Virology, eds. Fields, B.N., Knipe, D.M., & Howley, P.M. Lippincott-Raven, philadelphia, 1996, 3rd Ed., Vol. 2, pp. 2831-2843).
이와 같은 결과는, 본 발명에 기초해서 구축할 수 있는 HEV 게놈 RNA의 검출계가 극히 감도가 높은 것으로 될 수 있는 것을 시사하고, 또한 이러한 검출계를 사용해서 해석된 임상 데이타가 HEV감염에 관한 학문적 이해를 더욱 깊게하는 효과를 초래하는 유용성을 시사하는 것이다.
예2. 신규 HEV주의 단리
7예의 급성 E형 간염환자에 대해서 시험했다. JHA-Sap, JKK-Sap, JKN-Sap, JMY-Haw 및 JSY-Sap를 단리한 5예는 호카이도(北海道)에, JAK-Sai 및 JMM-Sai를 단리한 2예는 사이다마껭(埼玉縣)에 거주하는 환자이였다. 각각의 환자에 있어서 질환의 발증은, 시간 및 장소의 양쪽 모두, 다른 환자와의 관련성은 없고, 또한, 국지적인 유행에 관련하는 것이라도 없다. 6예의 환자에는 최근의 해외여행은 없었다. JMY-Haw를 단리한 환자에 대해서만, 그의 환자에 있어서 질환발증의 1개월 전에 하와이로 여행했었다. 환자로부터의 혈청 샘플은, 급성기에 채취하여 바이러스학적 해석을 행하기 까지 -20℃ 이하에서 동결보존했다.
HEV서열은, 다카하시 등의 방법(Takahashi K, Iwata K, Watanabe N, et al. Virology 2001; 287: 9-12)에 준하여, 해당 방법에 약간의 개량을 가해서 행했다. 핵산 샘플은, 시판하는 핵산추출용 키트(SMITEST EX-R&D; Genome. Science. Laboratories)를 사용해서 혈청 25㎖로부터 추출했다. 제1스트랜드 cDNA를, 몰로니(Moloney)-마우스 백혈병 바이러스 역전사효소(Stratagene사제)로 37℃에서 30분간 합성했다. 안티센스 프라이머로서 HE5-4(5'-CATAGCCTCSGCRACATCAG-3';NT541-560)와 HE5-5(5'-CATYGCCTCSGCAACATCGG-3';nt541-560 ; 각각의 누클레오티드의 위치는 HEV-JRA1주의 그 것에 상당한다)의 혼합물을 사용했다. 다음에, cDNA에 대해서, 네스테드 폴리머라제(nested polymerase)연쇄반응(이하, PCR로 기재한다)을 행했다. 제1 라운드 PCR를 위해서는, Fast Start Taq DNA Polymerase (Roche사)와, 외측 센스 프라이머 HE5-1(5'-TCGATGCCATGGAGGCCCA-3';nt19-37)와, 외측 안티센스 프라이머 HE5-4/HE5-5(서열은 상기한 것을 참조)혼합물을 사용했다. 이어서, 제2 라운드 PCR를 위해서는, 내측 센스프라이머 HE5-2(5'-GCCYTKGCGAATGCTGTGG-3';nt105-123)와, 내측 안티센스 프라이머 HE5-3(5'-TCRAARCAGTARGTGCGGTC-3';nt450-569)와 HE5-6(5'-TYAAAACAGTAGGTTCGATC-3';nt450-469)의 혼합물을 사용하고, 온도변화의 조건 설정은 95℃ 4분에 계속해서{95℃ 30초, 55℃ 30초, 72℃ 45초}를 30사이클, 그리고 최후로 72℃ 7분 이였다.
이 것에 의해 326-nt 영역이 HEV 게놈의 ORF1로부터 증폭되었다. 다음에, Dye Terminator Cycle Sequencing FS Ready Reaction Kit(Perkin-Elmer Applied Biosystems사)와 373A DNA 시퀀서(Applied Biosystem사)를 사용해서 시퀀싱을 행했다.
이들의 일본인 유래의 단리주로부터 얻어진 서열은, 여러 가지의 국적의 환자로부터 얻어진 단리주의 서열과 비교했다. 비교에는, 컴퓨터 소프트웨어 GENETYX-MAC version 10.1(Software Development사)을 사용했다.
상기 비교의 결과를 도 14에 나타냈다. 326-nt ORF1 서열을 비교하면, 7개의 일본 고유주는, 크게는 3개의 그룹으로 나뉘어졌다. JMM-Sai서열은, 다른 6개의 단리주와 73.0%로부터 75.7%의 상동성을 갖고 있다. JKN-Sap, JHA-Sap 및 JMY-Haw는 그룹 내에서는 95.4%로부터 98.8%의 상동성이 있지만, 다른 그룹의 단리주와는 73.0%로부터 79.1%의 상동성 밖에 없었다. JSY-Sap, JKK-Sap 및 JAK-Sai는, 서로 89.0%로부터 99.7%의 상동성을 갖고 있지만, 다른 4개의 주에 대해서는 74.8%로부터 78.8%의 상동성 밖에 없었다. 프로토타입인 JRA1주의 전장 게놈은 이들의 단리주에 대해서 90% 미만의 상동성 밖에 갖고 있지 않았다.
예3. HEV의 포괄적 검출
우선, 복수의 환자로부터 채혈했다. 각각의 환자혈청 50㎖로부터 SMITEST EX R&D (Genome Science Laboratories)로부터 핵산을 추출했다. 이들의 핵산에 대해서, 각각 센스 프라이머로서 5'-gcagaccacrtatgtgktcg-3' (서열번호 32) 및 5'-ccacrtatgtggtcgaygcc-3' (서열번호 33)과, 안티센스 프라이머로서 5'-acmarctgscgrggytgcat-3' (서열번호 34) 및 5'-cgytgratwggrtgrttcca-3' (서열번호 35)을 첨가했다. 이들을 폴리머라제 MMLV-RT (Stratagene)의 존재하에 37℃에서 30분간 반응시킴으로써 cDNA합성(즉, RNA로부터 DNA으로의 역전사 반응)을 행했다.
이와 같이해서 합성된 각각의 cDNA에 대해서, 센스 프라이머로서 5'-tgktcgaygccatggaggc-3' (서열번호 36), 5'-tgktcgaygccatggaggc-3' (서열번호 37) 및 5'-aygccatggaggcccaycag-3' (서열번호 38)과, 안티센스 프라이머로서 5'-ckracyaccacagcattcgc-3' (서열번호 39) 및 5'-ggcckracyaccacagcatt-3' (서열번호 40)을 갖고, Fast Start Taq DNA Polymerase (Roche사)를 사용해서 nested PCR를 행했다. 온도변화의 조건 설정은 95℃ 4분에 계속해서 {95℃ 30초, 55℃ 30초, 72℃ 45초}를 30사이클, 그리고 최후로 72℃ 7분 이였다. PCR 반응산물은 아가로스겔을 사용해서 전기영동을 행했다.
그 결과, 상기한 바와 같은 본 예의 방법에 의해, 37예 중 8예에 대해서 증폭산물이 얻어졌다. 전기영동에 의해 밴드가 얻어진 8예에 대해서, 얻어진 밴드를 모식적으로 도 22에 나타냈다. 각 샘플마다 얻어진 밴드는, 도 22에 나타낸 바와 같이 다른 위치에서 관찰되었다. 이 것으로부터, 이들의 8예는 사용된 복수의 프라이머가, 몇개의 조합으로 샘플 중의 HEV게놈에 대해서 작용해서, 증폭이 행해진 것이 시사되었다. 즉, HEV양성의 환자로부터 검출된 HEV의 게노타입은 다른 것이 시사되었다.
비ABC형 급성 간염환자 37예의 샘플에 대해서, 각각 증폭반응을 행했다. 증폭의 결과를, 종래의 방법으로 행해서 얻은 결과와 본 예의 방법으로 행해서 얻은 결과를 도 20에 통합해서 나타냈다. 도 20 중의 「채혈일」의 항목은, 각 환자에서 채혈한 날짜를 나타내고, 그의 오른쪽 이웃의 알파벳은 환자의 머릿글자이다. 도면 중 「sample No.」는 원 내에 있어서 일련의 샘플 번호이다. 도면 중 「종래」의 항목은 종래의 프라이머를 사용해서 증폭한 경우의 HEV 바이러스의 검출의 유무를 나타내고, 「본 예」의 항목은 본 예의 방법에 의한 HEV의 검출의 유무를 나타낸다. 이들의 시험에 있어서, HEV가 검출된 경우에는 「+」를, 검출되지 않은 경우에는 「-」를 기록한다. 도 20에 나타낸 바와 같이, 종래의 프라이머로 동일한 증폭 및 전기영동을 행한 경우에는 검출되지 않았던 바이러스주에 관해서도, 본 예의 방법은 검출하는 것이 가능했다.
예 4. 1환자에 있어서 추적조사
급성 E형 간염에 걸려있는 환자에 대해서, 그의 혈 중에 존재하는 바이러스를 계속적으로 측정했다. 측정의 방법은, 상기 예3에 나타낸 방법에 의한 본 발명의 태양에 따른 방법과, 예3에 나타낸 종래의 방법을 사용했다. 그 결과를 도 21에 나타냈다. 도면 중의 가장 왼쪽의 항목은 채혈일을 나타낸다. 그 오른쪽 이웃의 숫자는 당해 환자의 입원일로부터의 일수이다. 도면 중 「sample No」는 원 내에 있어서 일련의 샘플번호이다. 도면 중 「종래」의 항목은 종래의 프라이머를 사용해서 증폭한 경우의 HEV 바이러스의 검출의 유무를 나타내고, 「본 예」의 항목은 본 예의 방법에 의한 HEV의 검출의 유무를 나타낸다. 이들의 시험에 있어서, HEV가 검출된 경우에는 「+」를, 검출되지 않은 경우에는 「-」를 기록했다.
본 발명의 태양에 따른 프라이머를 사용한 경우의 쪽이, 종래의 방법 보다 더 적은 바이러스에 대해서도 검출될 수 있었다.
50. HEV의 분류화
다음에, 예3에서 얻어진 각각의 증폭산물을, 이하와 같은 프로브 고정화 플레이트를 사용해서 분류화했다.
(1) 프로브 고정화 플레이트
시판 마이크로 타이터 플레이트의 웰에, 53mer의 프로브(5'-aaggctcctggcrtyactactgcyatwgagcaggcwgctctrgcwgcggccaa-3'), HEV-I, Ⅱ용 프로브 (5'-ctcctggcatcactactgc-3') 및 HEV-Ⅲ용 프로브(5'-ctcctggcattactactgc-3'), HEV-Ⅳ용 프로브(5'-ctcctggcgtcactactg-3')를 각각 고상화했다.
(2) 하이브리다이제이션 어쎄이에 의한 분류화
상기 (1)에서 준비한 프로브 고정화 플레이트에 대해서, 예3에서 얻어진 각각의 증폭산물을 첨가하고, 하이브리다이제이션을 행했다. 다음에, 각각의 웰의 흡광도(O.D)를 측정했다.
결과를 도 23a로부터 도 23e에 나타냈다. 도 23a의 그라프, 도 23b의 그라프, 도 23c의 그라프, 도 23d의 그라프 및 도 23e의 그라프는, 각각 다른 게노타입을 갖는 HEV, 즉, JRA1주, JKN-Sap주, JKK-Sap주, JAK-Sai주, JMM-Sai주에 대해서 행한 분류화의 결과를 나타낸다. 모두의 그라프의 횡축은, 왼쪽부터 HEV-Ⅰ,Ⅱ고상 웰, HEV-Ⅲ고상 웰, HEV-Ⅳ (54mer 프라이머)고상 웰이다. 게노타입Ⅲ의 경우, HEV-Ⅲ용 프로브만 고상화한 웰의 O.D만이 다른 웰에 비해서 높았다. 게노타입Ⅳ의 경우, HEV-Ⅳ용 프로브만을 고상화한 웰의 O.D만이 다른 웰에 비해서 높았다. 또한, 게노타입Ⅰ의 경우, V-Ⅰ,Ⅱ고상 웰이 다른 웰에 비해서 O.D가 높았다. 이와 같은 지표를 기초로, 당해 프로브를 사용해서 환자의 혈청 중의 바이러스를 분류화했다. 그 결과는 도 20의 「genotype」의 항목에 나타냈다. 이 결과로부터 알 수 있는 바와 같이, 본 발명의 태양에 따른 프로브를 사용해서, 환자에서 채취한 HEV의 분류화를 용이하게 행하는 것이 가능한 것이 증명되었다.
여기에서 인용되는 문헌은, 인용되는 것에 의해 그의 전체에 걸처서 본 명세서에 편입된다.
또 다른 이익 및 변경이 당업자에 의해서 용이하게 상도될 수 있다. 따라서, 그 것 보다 넓은 범위의 측면에 있어서 본 발명은, 여기에 나타내고, 또한 기재된 상세 및 대표적인 태양에 의해 한정되는 것은 아니다. 따라서, 첨부된 청구의 범위 및 그들의 등가물에 의해 한정되는 전반적인 발명의 사상의 정신 및 범위로부터 일탈하지 않고, 여러 가지의 변경이 만들어지는 것이 가능하다.
SEQUENCE LISTING <110> KABUSHIKI KAISHA TOSHIBA <120> Polynucleotide probe and primer derived from hepatitis E virus collected from Japanese, chip including the same, kit including the same, and method of detecting hepatitis E virus using the same <130> 02S0741P <140> PCT/JP02/06365 <141> 2002-6-25 <150> JP2001-191837 <151>2001-6-25 <160> 57 <210> 1 <211> 5138 <212> DNA <213> Hepatitis E virus JRA1 <400> 1 ggcagaccac gtatgtggtc gatgccatgg aggcccacca gttcattaag gctcctggca 60 ttactactgc catagagcag gctgctctgg ctgcggccaa ctccgccttg gcgaatgctg 120 tggtggttcg gccgtttttg tctcgcgtac aaaccgagat ccttattaat ttgatgcaac 180 cccggcagtt ggttttccgc cctgaggtgc tttggaacca tcctattcag agggttatac 240 acaatgaatt agaacagtac tgccgggccc gggccggtcg ttgcctggag attggggctc 300 atccaagatc tattaatgat aaccccaatg ttttgcaccg gtgttttctc aggccggtcg 360 gtagggacgt ccagcgctgg tattctgccc ccacccgcgg ccctgcagcc aactgccgcc 420 gctctgcatt gcgtggcctc ccccctgtcg accgcactta ctgttttgat ggattttcca 480 gttgtgcttt cgccgcagag accggcgtgg ccctttactc tctacatgac ctttggccag 540 ctgatgttgc ggaggctatg gcccgccatg gaatgacacg tctttatgct gcactccacc 600 tccctcccga ggtgttgtta ccacccggta cttaccacac aacctcgtat cttctgatcc 660 atgacggcaa ccgtgctgtt gtgacttatg aaggtgatac tagtgcaggt tacaaccatg 720 acgtttccat acttcgtgca tggattcgca cgactaaaat agttggtgac catccgttgg 780 ttatagagcg tgtgcgggct attggttgtc attttgtgct gctgctcacc gcggcccctg 840 agccatcgcc catgccttac gtcccttacc cccgttccac ggaggtgtat gtccgatcta 900 tatttggccc tggtggctcc ccatccttgt ttccgtcagc ttgctctaca aaatctacct 960 tccatgctgt tccagttcac atatgggacc ggcttatgct ttttggtgcc accttggacg 1020 accaggcgtt ttgctgctca cggctcatga catacctccg tggcattagc tacaaagtca 1080 ctgtcggtgc gcttgttgct aatgaggggt ggaatgcctc tgaagatgcc ctcaccgcag 1140 taatcactgc agcctacttg accatctgtc accagcgcta cctccgtacc caggcgatat 1200 ctaagggtat gcgccggttg gaggttgagc acgcccagaa gtttattaca agactttaca 1260 gctggttatt tgagaagtct ggtcgtgact acatccccgg ccgccaactt cagttctatg 1320 cccagtgccg gcggtggcta tctgcgggct ttcacctaga ccccagagtg ctcgtctttg 1380 atgagtcagt gccctgccgc tgtaggactt tcttaaagaa ggttgcgggt aaattctgtt 1440 gcttcatgcg gtggttaggg caggagtgta cttgtttctt agaaccagct gagggcttag 1500 ttggcgatca aggccatgat aatgaggctt atgagggttc tgaggttgac caggccgagc 1560 ctgtacacct tgatgtgtcg gggacctatg ctgtccacgg gcaccagctt gaggccctct 1620 acagggcact caacattcca cacgatattg ctgctcgagc tgcccgatta acggctactg 1680 ttgagctcgc tgcaggcccc gaccgtctgg agtgccgcac cgtgctcggg aacaagactt 1740 tccggacgac ggtgactgat ggcgcccatc tagaagcgaa cggccctgag caatatgttc 1800 tgtcgttcga tgcctcccgc cagtctatgg gggccgggtc ccatagcctc acttacgagc 1860 ttacacccgc cggcttgcag gttaagatct catctaatgg cctagactgc actgccgtat 1920 tcccccctgg tggcgcccct agcgcgccgc cgggggaggt ggcggctttt tgcagcgccc 1980 tctacaggta taacagattc acccagcggc attcgctgac cggcggtttg tggctacatc 2040 ccgaggggtt gctaggcgtt ttcccccctt tttcccctgg gcacatttgg gagtctgcca 2100 accccttctg cggtgagggt accttgtata ctcgcacctg gtctacatct ggtttttcta 2160 gtgacttttc ccctcctgag gcggccgccc 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actcggtagt cctctgtagt gattaccgac 4740 agagtcgtaa cgcggcagcc ttaatcgcag gttgtgggct caagttgaag gttgactatc 4800 gccctattgg gctgtacgct ggtgtggtgg tggcccctgg cttggggaca ctgcctgatg 4860 tagtgcgatt tgctggccgg ctgtccgaaa agaattgggg ccctggccca gagcgtgctg 4920 agcagctgcg tcttgctgtc tgtgacttcc ttcgagggtt aacgaatgtt gcgcaggttt 4980 gtgttgatgt tgtgtcccgt gtttatggag tcagccccgg gctggtacat aaccttattg 5040 gcatgctgca gaccattgct gatggcaagg cccactttac agagtcaatt aaacctgtgc 5100 ttgaccttac aaattctatt atacagcggg tggaatga 5138 <210> 2 <211> 15 <212> DNA <213> Hepatitis E virus <400> 2 tgccatggag gccca 15 <210> 3 <211> 15 <212> DNA <213> Hepatitis E virus <400> 3 tkgcgaatgc tgtgg 15 <210> 4 <211> 15 <212> DNA <213> Hepatitis E virus <400> 4 rcagtargtg cggtc 15 <210> 5 <211> 15 <212> DNA <213> Hepatitis E virus <400> 5 cctcsgcrac atcag 15 <210> 6 <211> 15 <212> DNA <213> Hepatitis E virus <400> 6 gtcggtaggg acgtc 15 <210> 7 <211> 2442 <212> DNA <213> Hepatitis E virus <400> 7 tcgatgccat ggaggcccac cagttcatta 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Gly Leu Leu Arg Glu Val Gly Ile Ser Asp Ala Ile Val Asn Asn 1205 1210 1215 Phe Phe Leu Ser Gly Gly Gln Ile Gly Gln His Arg Pro Ser Val Ile 1220 1225 1230 Pro Arg Gly Thr Val Asp Ser Asn Val Asp Thr Leu Asp Ala Phe Pro 1235 1240 1245 Pro Ser Cys Gln Phe Ser Ala Tyr His Gln Leu Ala Glu Glu Leu Gly 1250 1255 1260 His Arg Pro Ala Pro Ile Ala Ala Val Leu Pro Pro Cys Pro Glu Leu 1265 1270 1275 1280 Glu Gln Gly Leu Leu Tyr Met Pro Gln Glu Leu Thr Thr Ser Asp Ser 1285 1290 1295 Val Leu Thr Phe Glu Leu Thr Asp Ile Val His Cys Arg Met Ala Ala 1300 1305 1310 Pro Ser Gln Arg Lys Ala Val Leu Ser Thr Leu Val Gly Arg Tyr Gly 1315 1320 1325 Arg Arg Thr Lys Leu Tyr Glu Ala Ala His Ala Asp Val Arg Gly Ser 1330 1335 1340 Leu Asn His Phe Ile Pro Glu Leu Gly Pro Ile Ser Val Thr Thr Cys 1345 1350 1355 1360 Glu Leu Tyr Glu Leu Val Glu Ala Met Val Glu Lys Gly Gln Asp Gly 1365 1370 1375 Ser Ala Val Leu Glu Leu Asp Leu Cys Ser Arg Asp Val Ser Arg Ile 1380 1385 1390 Thr Phe Phe Gln Lys Asp Cys Asn Lys Phe Thr Thr Gly Glu Thr Ile 1395 1400 1405 Ala His Gly Lys Val Gly Gln Gly Ile Ser Ala Trp Ser Lys Thr Phe 1410 1415 1420 Cys Ala Leu Phe Gly Pro Trp Phe Arg Ala Ile Glu Lys Glu Ile Leu 1425 1430 1435 1440 Ala Ala Leu Ala Pro Asn Val Phe Tyr Gly Asp Ala Tyr Glu Asp Thr 1445 1450 1455 Val Leu Ala Ala Ala Val Ala Gly Ala Pro Gly Cys Lys Val Phe Glu 1460 1465 1470 Asn Asp Phe Ser Glu Phe Asp Ser Thr Gln Asn Asn Phe Ser Leu Gly 1475 1480 1485 Leu Glu Cys Ile Ile Met Glu Glu Cys Gly Met Pro Gln Trp Met Ile 1490 1495 1500 Arg Leu Tyr His Leu Val Arg Ser Ala Trp Val Leu Gln Ala Pro Lys 1505 1510 1515 1520 Glu Ser Leu Arg Gly Phe Trp Lys Lys His Ser Gly Glu Pro Gly Thr 1525 1530 1535 Leu Leu Trp Asn Thr Val Trp Asn Met Ala Val Ile Ala His Cys Tyr 1540 1545 1550 Glu Phe Arg Asp Leu Lys Val Ala Ala Phe Lys Gly Asp Asp Ser Val 1555 1560 1565 Val Leu Cys Ser Asp Tyr Arg Gln Ser Arg Asn Ala Ala Ala Leu Ile 1570 1575 1580 Thr Gly Cys Gly Leu Lys Leu Lys Val Asp Phe Arg Pro Ile Gly Leu 1585 1590 1595 1600 Tyr Ala Gly Val Val Val Ala Pro Gly Leu Gly Thr Leu Pro Asp Val 1605 1610 1615 Val Arg Phe Ala Gly Arg Leu Ser Glu Lys Asn Trp Gly Pro Gly Pro 1620 1625 1630 Glu Arg Ala Glu Gln Leu Arg Leu Ala Val Cys Asp Phe Leu Arg Lys 1635 1640 1645 Leu Thr Asn Val Ala Gln Val Cys Val Asp Val Val Ser Arg Val Tyr 1650 1655 1660 Gly Val Ser Pro Gly Leu Val His Asn Leu Ile Gly Met Leu Gln Thr 1665 1670 1675 1680 Ile Ala Asp Gly Lys Ala His Phe Thr Glu Thr Val Lys Pro Val Leu 1685 1690 1695 Asp Leu Thr Asn Ser Ile Ile His Arg Val Glu 1700 1705 <210> 57 <211> 674 <212> PRT <213> Hepatitis E Virus JAK-Sai (ORF2) <400> 57 Met Asn Asn Met Phe Phe Cys Ser Val His Gly Asp Ala Thr Met Arg 1 5 10 15 Ser Arg Ala Leu Leu Phe Leu Leu Phe Val Phe Leu Pro Met Leu Pro 20 25 30 Ala Pro Pro Ala Gly Gln Pro Ser Gly Arg Arg Arg Gly Arg Arg Ser 35 40 45 Gly Gly Ala Gly Gly Gly Phe Trp Gly Asp Arg Val Asp Ser Gln Pro 50 55 60 Phe Ala Leu Pro Tyr Ile His Pro Thr Asn Pro Phe Ala Ser Asp Ile 65 70 75 80 Pro Thr Ala Ala Gly Ala Gly Ala Arg Pro Arg Gln Pro Ala Arg Pro 85 90 95 Leu Gly Ser Ala Trp Arg Asp Gln Ser Gln Arg Pro Thr Ala Ser Ala 100 105 110 Arg Arg Arg Pro Ala Pro Ala Gly Ala Ala Pro Leu Thr Ala Val Ala 115 120 125 Pro Ala Pro Asp Thr Ala Pro Val Pro Asp Val Asp Ser Arg Gly Ala 130 135 140 Ile Leu Arg Arg Gln Tyr Asn Leu Ser Thr Ser Pro Leu Thr Ser Thr 145 150 155 160 Ile Ala Thr Gly Thr Asn Leu Val Leu Tyr Ala Ala Pro Leu Ser Pro 165 170 175 Leu Leu Pro Leu Gln Asp Gly Thr Asn Thr His Ile Met Ala Thr Glu 180 185 190 Ala Ser Asn Tyr Ala Gln Tyr Arg Val Val Arg Ala Thr Ile Arg Tyr 195 200 205 Arg Pro Leu Val Pro Asn Ala Val Gly Gly Tyr Ala Ile Ser Ile Ser 210 215 220 Phe Trp Pro Gln Thr Thr Thr Thr Pro Thr Ser Val Asp Met Asn Ser 225 230 235 240 Ile Thr Ser Thr Asp Val Arg Ile Leu Val Gln Pro Gly Ile Ala Ser 245 250 255 Glu Leu Val Ile Pro Ser Glu Arg Leu His Tyr Arg Asn Gln Gly Trp 260 265 270 Arg Ser Val Glu Thr Ser Gly Val Ala Glu Glu Glu Ala Thr Ser Gly 275 280 285 Leu Val Met Leu Cys Ile His Gly Ser Pro Val Asn Ser Tyr Thr Asn 290 295 300 Thr Pro Tyr Thr Gly Ala Leu Gly Leu Leu Asp Phe Ala Leu Glu Leu 305 310 315 320 Glu Phe Arg Asn Leu Thr Pro Gly Asn Thr Asn Thr Arg Val Ser Arg 325 330 335 Tyr Ser Ser Ser Ala Arg His Lys Leu Arg Arg Gly Pro Asp Gly Thr 340 345 350 Ala Glu Leu Thr Thr Thr Ala Ala Thr Arg Phe Met Lys Asp Leu His 355 360 365 Phe Thr Gly Thr Asn Gly Val Gly Glu Val Gly Arg Gly Ile Ala Leu 370 375 380 Thr Leu Phe Asn Leu Ala Asp Thr Leu Leu Gly Gly Leu Pro Thr Glu 385 390 395 400 Leu Ile Ser Ser Ala Gly Gly Gln Leu Phe Tyr Ser Arg Pro Val Val 405 410 415 Ser Ala Asn Gly Glu Pro Thr Val Lys Leu Tyr Thr Ser Val Glu Asn 420 425 430 Ala Gln Gln Asp Lys Gly Ile Ala Ile Pro His Asp Ile Asp Leu Gly 435 440 445 Glu Ser Arg Val Val Ile Gln Asp Tyr Asp Asn Gln His Glu Gln Asp 450 455 460 Arg Pro Thr Pro Ser Pro Ala Pro Ser Arg Pro Phe Ser Val Leu Arg 465 470 475 480 Ala Asn Asp Val Leu Trp Leu Ser Leu Thr Ala Ala Glu Tyr Asp Gln 485 490 495 Thr Thr Tyr Gly Ser Ser Thr Asn Pro Met Tyr Val Ser Asp Thr Val 500 505 510 Thr Phe Val Asn Val Ala Thr Gly Ala Gln Gly Val Ser Arg Ser Leu 515 520 525 Asp Trp Ser Lys Val Thr Leu Asp Gly Arg Pro Leu Thr Thr Ile Gln 530 535 540 Gln Tyr Ser Lys Thr Phe Phe Val Leu Pro Leu Arg Gly Lys Leu Ser 545 550 555 560 Phe Trp Glu Ala Gly Thr Thr Lys Ala Gly Tyr Pro Tyr Asn Tyr Asn 565 570 575 Thr Thr Ala Ser Asp Gln Ile Leu Ile Glu Asn Ala Ala Gly His Arg 580 585 590 Val Cys Ile Ser Thr Tyr Thr Thr Asn Leu Gly Ser Gly Pro Val Ser 595 600 605 Ile Ser Ala Val Gly Val Leu Ala Pro His Ser Ala Leu Ala Ala Leu 610 615 620 Glu Asp Thr Val Asp Tyr Pro Ala Arg Ala His Thr Phe Asp Asp Phe 625 630 635 640 Cys Pro Glu Cys Arg Thr Leu Gly Leu Gln Gly Cys Ala Phe Gln Ser 645 650 655 Thr Val Ala Glu Leu Gln Arg Leu Lys Met Lys Val Gly Lys Thr Arg 660 665 670 Glu Tyr

Claims (20)

  1. E형 간염 바이러스의 폴리누클레오티드를 검출하기 위한, 적어도 8의 누클레오티드의 연속하는 서열을 갖는 폴리누클레오티드 프로브에 있어서, 이하의 것을 특징으로 하는 폴리누클레오티드 프로브;
    (1) 당해 적어도 8의 누클레오티드로부터 되는 연속하는 서열이, 상기 E형 간염 바이러스의 폴리누클레오티드와 하이브리다이즈하고, 그와 같은 하이브리다이제이션에 의해서, E형 간염 바이러스의 검출을 하기 위한 서열인 것;
    (2) 당해 적어도 8의 누클레오티드의 연속하는 서열이, 서열번호 11, 서열번호 44, 서열번호 45, 서열번호 46, 서열번호 47 및 서열번호 48에 기재되는 염기서열 및 이들의 상보쇄로부터 되는 군에서 선택되는 서열로부터 얻어지는 것.
  2. 제 1항에 있어서, 상기 적어도 8의 누클레오티드의 연속하는 서열이, HCV의 비구조 단백질 및 누클레오캅시드 단백질을 코드하는 누클레오티드서열 또는 그의 서열의 상보쇄로부터 얻어지는 것을 특징으로 하는 폴리누클레오티드 프로브.
  3. 제 1항에 기재된 폴리누클레오티드 프로브를 구비하는 프로브 어쎄이 키트.
  4. 제 1항에 있어서, 적어도 8의 누클레오티드의 연속하는 서열이, 서열번호 15의 19위치로부터 37위치, 서열번호 15의 52위치로부터 69위치, 서열번호 15의 77위치로부터 95위치, 서열번호 15의 111위치로부터 127위치, 서열번호 15의 174위치로부터 181위치, 서열번호 15의 213위치로부터 220위치, 서열번호 15의 48위치로부터 100위치, 및 이들의 상보적 서열로부터 되는 군에서 선택되는 것을 특징으로 하는 폴리누클레오티드 프로브.
  5. 제 1항에 있어서, 상기 E형 간염 바이러스가 극증 E형 간염 야기성이고, 상기 (2)에서 선택되는 상기 적어도 8의 누클레오티드의 연속하는 서열이 서열번호 11에 기재된 염기서열로부터 얻어지는 것을 특징으로 하는 폴리누클레오티드 프로브.
  6. 제 1항에 있어서, 상기 E형 간염 바이러스가 극증 E형 간염이고, 상기 (2)에서 선택되는 상기 적어도 8의 누클레오티드의 연속하는 서열이 서열번호 9 및 서열번호 10으로부터 이루어지는 군에서 선택되는 것을 특징으로 하는 폴리누클레오티드 프로브.
  7. (1) 인체로부터 채취된 또는 배출된 혈액, 혈청, 소변, 또는 대변으로 이루어진 샘플과, 제 1항에 기재된 폴리누클레오티드 프로브를 반응시키는 것,
    (2) 상기 (1)의 반응에 의해 생긴 2중쇄를 검출하는 것,
    (3) 상기 (2)의 검출의 결과로부터, 상기 샘플에 E형 간염 바이러스가 존재하는가 아닌가를 판정하는 것을 구비하는 샘플 중의 E형 간염 바이러스의 존재를 검출하는 방법.
  8. (1) 인체로부터 채취된 또는 배출된 혈액, 혈청, 소변, 또는 대변으로 이루어진 샘플과, 제 6항에 기재된 폴리누클레오티드 프로브를 반응시키는 것,
    (2) 상기 (1)의 반응에 의해 생긴 2중쇄를 검출하는 것,
    (3) 상기 (2)의 검출의 결과로부터, 상기 샘플에 E형 간염 바이러스가 존재하는가 아닌가를 판정하는 것을 구비하는 샘플 중의 극증 E형 간염 바이러스의 존재를 검출하는 방법.
  9. (1) 인체로부터 채취된 또는 배출된 혈액, 혈청, 소변, 또는 대변으로 이루어진 샘플과, 제 1항에 기재된 폴리누클레오티드 프로브를 반응시키는 것,
    (2) 상기 (1)의 반응에 의해 생긴 2중쇄를 검출하는 것,
    (3) 상기 (2)의 검출의 결과로부터, 상기 샘플에 존재하는 E형 간염 바이러스의 게노타입을 판정하는 것을 구비하는 샘플 중의 E형 간염 바이러스의 게노타입을 결정하는 방법.
  10. 제 1항에 기재된 폴리누클레오티드 프로브를 고상화한 염기서열 검출용 칩.
  11. 제 6항에 기재된 폴리누클레오티드 프로브를 고상화한 염기서열 검출용 칩.
  12. E형 간염 바이러스의 폴리누클레오티드를 증폭하기 위한 한 쌍 내지 복수 쌍의 PCR용 프라이머에 있어서, 그의 한 쌍 내지 복수 쌍의 PCR 프라이머가, 각각 독립해서, 적어도 8의 누클레오티드의 연속하는 서열을 포함하고, 이하의 것을 특징으로 하는 한 쌍 내지 복수 쌍의 PCR용 프라이머;
    (1) 당해 적어도 8의 누클레오티드로부터 되는 연속하는 서열이, 상기 E형 간염 바이러스의 폴리누클레오티드와 하이브리다이즈하고, 그와 같은 하이브리다이제이션에 의해서, E형 간염 바이러스의 폴리누클레오티드의 일부를 증폭하기 위한 서열인 것;
    (2) 당해 적어도 8의 누클레오티드의 연속하는 서열이, 서열번호 11, 서열번호 44, 서열번호 45, 서열번호 46, 서열번호 47 및 서열번호 48 및 이들의 상보쇄로부터 이루어지는 군에서 선택되는 서열로부터 얻어지는 것.
  13. 제 12항에 있어서, 상기 적어도 8의 누클레오티드의 연속하는 서열이, HCV의 누클레오캅시드 단백질을 코드하는 누클레오티드 서열 또는 그의 서열의 상보쇄로부터 얻어지는 것을 특징으로 하는 한 쌍 내지 복수 쌍의 PCR용 프라이머.
  14. 제 12항에 기재된 한 쌍 내지 복수 쌍의 PCR용 프라이머를 구비하는 PCR 어쎄이 키트.
  15. 제 12항에 있어서, 적어도 8의 누클레오티드의 연속하는 서열이, 서열번호 15의 19위치부터 37위치, 서열번호 15의 52위치부터 69위치, 서열번호 15의 77위치부터 95위치, 서열번호 15의 111위치부터 127위치, 서열번호 15의 174위치부터 181위치, 서열번호 15의 213위치부터 220위치, 서열번호 15의 48위치부터 100위치, 및 이들의 상보적 서열로부터 이루어지는 군에서 선택되는 것을 특징으로 하는 한 쌍 내지 복수 쌍의 PCR용 프라이머.
  16. 제 12항에 있어서, 상기 E형 간염 바이러스가 극증 E형 간염이고, 상기 (2)에서 선택되는 상기 적어도 8의 누클레오티드의 연속하는 서열이 서열번호 11에 기재된 염기서열로부터 얻어지는 것을 특징으로 하는 한 쌍 내지 복수 쌍의 PCR용 프라이머.
  17. 제 12항에 있어서, 상기 E형 간염 바이러스가 극증 E형 간염이고, 상기 (2)에서 선택되는 상기 적어도 8의 누클레오티드의 연속하는 서열이 서열번호 9 및 서열번호 10으로부터 되는 군에서 선택되는 것을 특징으로 하는 한 쌍 내지 복수 쌍의 PCR용 프라이머.
  18. (1) 인체로부터 채취된 또는 배출된 혈액, 혈청, 소변, 또는 대변으로 이루어진 샘플과, 제 12항에 기재된 한 쌍의 PCR용 프라이머와 폴리머라제를 적절한 증폭이 얻어지는 조건 하에서 반응시키는 것,
    (2) 상기 (1)의 반응에 의해 얻어진 증폭산물의 존재를 검출하는 것,
    (3) 상기 (2)의 검출의 결과로부터, 상기 샘플에 E형 간염 바이러스가 존재하는가 아닌가를 판정하는 것을 구비하는 샘플 중의 E형 간염 바이러스의 존재를 검출하는 방법.
  19. (1) 인체로부터 채취된 또는 배출된 혈액, 혈청, 소변, 또는 대변으로 이루어진 샘플과, 제 17항에 기재된 한 쌍 내지 복수 쌍의 PCR용 프라이머와 폴리머라제를 적절한 증폭이 얻어지는 조건하에서 반응시키는 것,
    (2) 상기 (1)의 반응에 의해 얻어진 증폭산물의 존재를 검출하는 것,
    (3) 상기 (2)의 결과로부터, 상기 샘플에 E형 간염 바이러스가 존재하는가 아닌가를 판정하는 것을 구비하는 샘플 중의 극증 E형 간염 바이러스의 존재를 검출하는 방법.
  20. (1) 인체로부터 채취된 또는 배출된 혈액, 혈청, 소변, 또는 대변으로 이루어진 샘플과, 제 12항에 기재된 한 쌍의 PCR용 프라이머와 폴리머라제를 적절한 증폭이 얻어지는 조건하에서 반응시키는 것,
    (2) 상기 (1)의 반응에 의해 얻어진 증폭산물의 길이를 결정하는 것,
    (3) 상기 (2)의 결과로부터, 상기 샘플에 존재하는 E형 간염 바이러스의 게노타입을 판정하는 것을 구비하는 샘플 중의 E형 간염 바이러스의 게노타입을 결정하는 방법.
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Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
KR101924093B1 (ko) 2017-04-18 2018-11-30 건국대학교 산학협력단 E형 간염 바이러스 유전자형 3 및 4 진단용 프라이머 세트 및 이를 이용한 진단 방법

Families Citing this family (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2005102689A (ja) * 2003-09-08 2005-04-21 Mitsubishi Kagaku Bio-Clinical Laboratories Inc Ｅ型肝炎ウイルス様中空粒子
KR100597380B1 (ko) * 2004-10-13 2006-07-06 재단법인서울대학교산학협력재단 E 형 간염 바이러스 특이 유전자 및 그 검출 방법
ES2338853B1 (es) * 2008-11-11 2011-09-14 Instituto De Salud Carlos Iii Metodo y kit para la deteccion del virus de la hepatitis e (vhe).
WO2013052124A2 (en) * 2011-10-03 2013-04-11 University Of Florida Research Foundation, Inc. Rapid and reliable detection of infectious agents
CN104321443A (zh) * 2012-04-18 2015-01-28 霍夫曼-拉罗奇有限公司 Hev测定
AU2014306512C1 (en) * 2013-08-14 2021-07-08 Gen-Probe Incorporated Compositions and methods for detecting HEV nucleic acid

Family Cites Families (11)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5541308A (en) * 1986-11-24 1996-07-30 Gen-Probe Incorporated Nucleic acid probes for detection and/or quantitation of non-viral organisms
CA1336479C (en) * 1988-08-30 1995-08-01 Yoshikuni Mori Coloring fine particle and toner for developing electrostatic images using the same
US5800992A (en) * 1989-06-07 1998-09-01 Fodor; Stephen P.A. Method of detecting nucleic acids
CA2036022A1 (en) * 1990-02-09 1991-08-10 Tetsuo Nakamura Non-a, non-b hepatitis related nucleic acids, antigens, antibodies and their detection reagents
CN1075112C (zh) * 1990-04-05 2001-11-21 基因实验室有限公司 制备hev蛋白质和检测hev感染的方法
JP3549201B2 (ja) * 1990-10-24 2004-08-04 中外製薬株式会社 非ａ非ｂ型肝炎特異的遺伝子の検出方法及び検出用試薬組成物
US6582908B2 (en) * 1990-12-06 2003-06-24 Affymetrix, Inc. Oligonucleotides
JP3889808B2 (ja) * 1994-10-03 2007-03-07 アメリカ合衆国 Ｅ型肝炎のパキスタン菌株の組み換えタンパク質並びにその診断法及び種痘における利用
CA2306451A1 (en) * 1997-10-15 1999-04-22 Abbott Laboratories Methods and compositions for detecting hepatitis e virus
US20030049601A1 (en) * 1997-10-15 2003-03-13 George G. Schlauder Methods and compositions for detecting hepatitis e virus
CN1058751C (zh) * 1998-06-15 2000-11-22 中国人民解放军第二军医大学 庚型肝炎病毒基因组全长cDNA克隆及其构建方法

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
KR101924093B1 (ko) 2017-04-18 2018-11-30 건국대학교 산학협력단 E형 간염 바이러스 유전자형 3 및 4 진단용 프라이머 세트 및 이를 이용한 진단 방법

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