이하, 본 발명을 보다 구체적으로 설명하고자 한다.
본 발명자들은 산업적으로 유용한 호열성 또는 내열성 아라비노스 이성화효소를 제조하기 위하여, 서모토가 네아폴리타나 5068(Thermotoga neapolitana5068, DSM 5068)의 전체 유전자(genomic DNA)로부터 아라비노스 이성화효소를 암호화하는 유전자를 클로닝하고, 전기 유전자의 염기서열 및 그로 부터 유추되는 아미노산서열을 분석하였다. 그 결과, 본 발명의 아라비노스 이성화효소를 암호화하는 유전자(서열번호 3)는 게놈프로젝트에 의해 그 유전자 염기서열이 모두 밝혀진 서모토가 마리티마(Thermotoga maritima)의 아라비노스 이성화효소일 것으로 추정되고 있는 유전자의 염기서열과 83.2%의 상동성을 지니고, 그로 부터 유추되는 아미노산 서열(서열번호 4)은 94.8%의 상동성을 지니는 것을 확인하였다.
전기 클로닝된 아라비노스 이성화효소를 대장균에서 대량으로 발현시키기 위하여, 발현벡터 pET22b(+)(Novagen, U.S.A.)에 전기 효소의 유전자를 삽입시켜 재조합 발현벡터 pTNAI를 제조하고, 전기 재조합 발현벡터 pTNAI로 대장균 BL21(E. coliBL21)을 형질전환시켜 재조합 균주를 수득한 후, 대장균 BL21/DE3 (pTNAI)(E. coliBL21/DE3 (pTNAI))라 명명하였으며, 그를 2000년 12월 4일자로 대한민국 서울특별시 서대문구 홍제 1동 361-221번지에 소재하는 국제기탁기관인 한국종균협회 부설 한국미생물보존센터(Korean Culture Center of Microorganisms, KCCM)에 기탁번호 KCCM-10231로 기탁하였다.
전기 대장균(E.coli)BL21/DE3 (pTNAI)를 배양하고, 이로 부터 생산되는 재조합 아라비노스 이성화효소의 활성을 조사한 결과, 반응최적 pH가 7이고, 반응 최적온도가 85℃이며, 80℃에서 2시간 열처리한 후의 잔존효소 활성이 80%이상으로 열에 매우 안정함을 확인하였다.
한편, 본 발명의 서모토가 속(Thermotogasp.)의 균주에서 유래한 아라비노스 이성화효소 유전자를 포함하는 재조합 발현벡터로 형질전환된 균주에서 생산된 아라비노스 이성화효소를 이용하여, 갈락토스를 기질로 pH 5 내지 8, 보다 바람직하게는 pH 6 내지 8, 가장 바람직하게는 pH 7의 중성 pH 조건 및, 60 내지 100℃, 보다 바람직하게는 70 내지 95℃, 가장 바람직하게는 85℃의 온도에서 반응시켜 타가토스를 제조할 수 있다.
본 발명의 재조합 아라비노스 이성화효소를 이용하여 갈락토스의 수용액을 이성화반응시킨 결과, 80℃의 반응온도에서 68%이상의 전환수율로 타가토스를 생산함을 확인하였다.
전기 재조합 아라비노스 이성화효소를 사용하여 산업적으로 타가토스를 생산할 경우, 재조합 아라비노스 이성화효소를 반응용액에 용해시킨 상태로 이용할 수도 있으나, 산업적으로 이용가능한 비드에 고정화시킨 상태로 사용함이 바람직하다. 예를 들면, 본 발명의 재조합 아라비노스 이성화효소를 실리카(silica) 비드에 고정화시킨 결과, 90℃에서 방치하였을 경우 20일이 경과한 후에도 80% 이상의 잔존활성이 존재하여, 산업적으로 80℃ 이상의 고온에서 사용가능할 수 있었다.
이하, 실시예를 통하여 본 발명을 더욱 상세히 설명하고자 한다. 이들 실시예는 오로지 본 발명을 보다 구체적으로 설명하기 위한 것으로, 본 발명의 요지에 따라 본 발명의 범위가 이들 실시예에 의해 제한되지 않는다는 것은 당업계에서 통상의 지식을 가진 자에 있어서 자명할 것이다.
실시예 1: 아라비노스 이성화효소 유전자의 클로닝
서모토가 네아폴리타나 5068(Thermotoga neapolitana5068, DSM 5068)을 혐기적으로 배양하고, 원심분리(8000×g, 10분)하여 균체를 수득하였다. 전기 수득된 균체로부터 유전자를 분리하고, 제한효소Sau3AI(TaKaRa Biotechnology, Japan)으로 부분절단하여 12kb 이하의 유전자 단편을 수득하였다. 전기 유전자 단편을 잽발현벡터(ZAP Express Vector, Stratagene, U.S.A.)에 삽입시키고, 패키징(packaging)하여 서모토가 네아폴리타나 5068의 유전자 라이브러리(genomic DNA library)를 제조하였다. 종래의 호열성 또는 내열성 아라비노스 이성화효소를 암호화하는 유전자의 염기서열을 분석하여, 프라이머 araAF: 5'-ATGATCGATCTCAAACAGTATGAG-3'(서열번호 1)과 프라이머 araAR: 5'-TCATCTTTTTAAAAGTCCCC-3'(서열번호 2)를 제작하고, 전기 프라이머를 이용하여 상기에서 수득한 서모토가 네아폴리타나 5068의 전체 유전자로부터 PCR을 이용하여 DNA-DNA 혼성화반응(hybridization)에 사용할 탐침(probe)을 제조하였다. DNA-DNA혼성화반응을 통하여 전기 유전자 라이브러리로부터 아라비노스 이성화효소를 포함하는 유전자를 선별하여, 서모토가 네아폴리타나 5068의 아라비노스 이성화효소를 암호화하는 유전자를 포함하는 벡터를 제작하였다. 전기에서 클로닝한 아라비노스 이성화효소 유전자의 염기서열(서열번호 3) 및 전기 유전자로부터 유추되는 아미노산 서열(서열번호 4)을 종래의 공지된 아라비노스 이성화효소 유전자의 염기서열 및 아미노산 서열과 비교하였다(참조: 표 1).
표 1: 아라비노스 이성화효소간의 상동성 비교
균주 |
유전자 서열(상동성, %) |
아미노산 서열(상동성, %) |
서모토가 마리티마(Thermotoga maritima) |
83.2 |
94.8 |
바실러스 스테아로서모필러스(Bacillus stearothermophilus) |
61.9 |
62.8 |
바실러스 할로두란스(Bacillus halodurans) |
59.1 |
59.0 |
바실러스 서브틸리스(Bacillus subtilis) |
58.6 |
55.5 |
살모넬라 티피무리움(Salmonella typhimurium) |
57.8 |
54.5 |
대장균(Escherichia coli) |
59.0 |
54.3 |
마이코박테리움 스메그마티스(Mycobacterium smegmatis) |
56.3 |
50.7 |
상기 표 1에서 보듯이, 본 발명의 아라비노스 이성화효소는 종래의 서모토가 마리티마의 아라비노스 이성화효소로 추정되는 유전자와 유전자 차원에서 83.2%, 아미노산 차원에서 94.8%의 상동성을 나타내는 신규한 효소임을 확인할 수 있었다.
실시예 2: 재조합 발현벡터 및 재조합 균주의 제조
실시예 1의 아라비노스 이성화효소를 암호화하는 유전자를 이용하여, 전기 호열성 아라비노스 이성화효소를 대장균에서 대량으로 발현시키기 위하여,NdeI과EcoRI으로 절단한 발현벡터 pET 22b(+)(Novagen, U.S.A.)에 전기 효소의 유전자를 삽입시켜 재조합 발현벡터 pTNAI를 제조하고(참조: 도 1), 전기 재조합 발현벡터 pTNAI로 대장균 BL21(E. coliBL21)을 형질전환시켜 재조합 균주를 제조한 후, 대장균 BL21/DE3 (pTNAI)(E. coliBL21/DE3 (pTNAI))라 명명하였으며, 그를 2000년 12월 4일자로 대한민국 서울특별시 서대문구 홍제 1동 361-221번지에 소재하는 국제기탁기관인 한국종균협회 부설 한국미생물보존센터(Korean Culture Center of Microorganisms, KCCM)에 기탁번호 KCCM-10231로 기탁하였다.
실시예 3: 재조합 아라비노스 이성화효소의 발현
상기 실시예 2에서 제조된 재조합 균주 대장균(E.coli) BL21/DE3(pTNAI) (KCCM-10231)를 LB(Luria-Bertani) 배지에 1%(v/v) 접종하고, 37℃에서 2시간 동안 배양한 다음, 최종 농도가 1mM이 되도록 락토오스를 첨가하여, 12시간 동안 재조합 아라비노스 이성화효소의 발현을 유도하였다. 발현된 아라비노스 이성화효소의 활성을 측정하기 위하여, 배양액을 원심분리(8000 ×g, 10분)하여 균체만을 모으고, 100mM MOPS 완충용액(4-morpholinepropanesulfonic acid, pH 7.0) 10㎖에 다시 현탁시킨 후, 초음파처리(sonication)하여 세포를 완전히 파쇄한 다음, 이를 조효소액으로 사용하여 갈락토스 이성화반응을 실시하였다. 갈락토스 이성화반응은 전기 조효소액 100㎕와 기질로 40mM 갈락토스를 혼합하고, 조인자(최종농도 1mM MnCl2, 1mM CoCl2)를 포함하는 1㎖의 효소반응액(100mM MOPS 완충용액, pH 7.0)을 85℃에서 20분간 반응시켜서 수행하였다. 생성된 산물은 시스테인-카바졸-황산(cysteine-carbazole-sulfuric acid)법을 사용하여 검출한 결과(참조: Dische, Z., and E. Borenfreund., A New Spectrophotometric Method for the Detection and Determination of Keto Sugars and Trioses,J. Biol. Chem.,192:583-587, 1951), 정상적인 갈락토스 이성화반응이 수행됨을 알 수 있었다.
실시예 4: 재조합 아라비노스 이성화효소의 순수분리
상기 실시예 3의 방법으로 발현시킨 재조합 아라비노스 이성화효소를 정제하기 위하여, 재조합균주 배양액을 원심분리(8000 ×g, 19분)하여 균주만을 모은 다음, 초음파처리하여 대장균의 세포벽을 파괴하고, 20,000 ×g에서 20분간 원심분리하여 침전물(균체)을 제거하고 상등액을 수득하였다. 이어, 전기 상등액을 85℃에서 20분간 열처리하고, 20,000×g에서 20분간 원심분리하여 침전물을 제거한 후, 상등액을 수득한 다음, 암모니움설페이트 침전법을 이용하여 잔존 오염단백질을 제거하고, 최종적으로 이온교환컬럼(Q-Sepharose Fast Flow, Pharmacia, Sweden)을 이용한 컬럼크로마토그래피를 수행하여, 재조합 아라비노스 이성화효소를 순수분리하였다. pH에 따른 전기 순수분리된 효소의 활성을 조사한 결과, 반응최적 pH는 7근처임을 알 수 있었다.
실시예 5: 재조합 아라비노스 이성화효소의 반응최적 pH 및 온도
상기 실시예 4에서 순수분리된 재조합 아라비노스 이성화효소의 갈락토스의 pH에 따른 전기 순수분리된 효소의 활성을 조사한 결과, 반응최적 pH는 7근처임을 알 수 있었다. 한편, 이성화 반응최적온도를 구하기 위하여, 상기 실시예 3에서와 동일한 방법을 이용하여, 반응온도에 따른 효소의 반응활성을 측정하였다. 이때, 반응온도는 60, 70, 75, 80, 85, 90, 95 및 100℃이고, 각각의 온도에서 갈락토스 이성화반응활성을 측정한 결과, 85℃ 부근에서 최대활성을 나타냄을 알 수 있었다(참조: 도 2).
실시예 6: 재조합 아라비노스 이성화효소의 내열성 조사
본 발명의 재조합 아라비노스 이성화효소의 열에 대한 안정성을 알아보기 위하여, 상기 실시예 3의 조효소액을 60, 70, 80 및 90℃에서 10, 20, 30, 60, 90 및 120분 동안 열처리하고, 이를 포함하는 효소반응액 1㎖을 이성화반응시켜, 재조합 아라비노스 이성화효소의 잔존활성을 실시예 3에서와 동일한 방법을 이용하여, 측정하였다(참조: 도 3). 도 3에서 보듯이, 80℃에서 2시간 열처리하였을 경우, 80%이상의 잔존활성이 남아있음을 알 수 있었다.
실시예 7: 온도에 따른 갈락토스로 부터 타가토스의 전환율
본 발명의 재조합 아라비노스 이성화효소를 이용하여 갈락토스로부터 타가토스를 제조할 때, 각 온도에서 이성화반응 시간의 경과에 따른 전환율을 측정하였다. 상기 실시예 3의 효소반응액에 기질을 40mM 갈락토스 대신 10mM 갈락토스로 하여 60, 70, 80 및 90℃에서 20시간 반응시키고, 제조된 타가토스의 수율을 BioLC를 이용하여 분석하였다(참조: 표 2, 도 4).
표 2: 온도에 따른 타가토스로의 전환율
효소반응온도 |
60℃ |
70℃ |
80℃ |
90℃ |
타가토스 전환율(%) |
31.7 |
40.4 |
68.1 |
57.4 |
상기 표 2와 도 4에서 보듯이, 반응온도가 증가할수록 타가토스로의 전환율이 증가하고, 80℃의 반응온도에서 68% 이상의 높은 전환율로 타가토스를 제조할 수 있음을 확인하였다.
실시예 8: 아라비노스 이성화효소의 고정화 및 내열성증대
아라비노스 이성화효소를 실리카를 비드로 사용하여 고정화하여, 90℃의 수용액상에 방치한 후, 열처리시간의 경과에 따른 잔존활성의 변화를 측정하였다(참조: 도 5). 도 5에서 보듯이, 고정화된 효소의 경우 90℃에서 처리한지 20일이 지나도 80% 이상의 잔존활성을 나타내었으며, 30일이 경과한 후에도 60% 이상의 잔존활성을 보였는 바, 산업적으로 고온공정에서 사용가능함을 확인하였다.