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Description
８５．前記方法が、
ステップａ）において、前記患者の前記腫瘍組織において１つ以上の患者特異的抗原を同定すること
ステップｃ）において、前記同定された１つ以上の患者特異的抗原又はその１つ以上の部分の免疫原性を、前記患者のＨＬＡクラスＩ及び／又はＩＩ対立遺伝子に対するそれらの予測される結合性により予測すること
ステップｄ）において、１つ以上の患者特異的抗原又はその１つ以上の部分を、ステップｃ）において予測されたそれらの免疫原性に基づいて選択すること
を更に含み；
並びにステップｅ）の前記ポリヌクレオチド配列が、ステップｄ）において選択された前記１つ以上の患者特異的抗原又はその１つ以上の部分をコードするヌクレオチド配列を更に含む、
実施形態Ｂ８４に記載の方法。
本発明の態様の一部を以下に記載する。
１．免疫学的に有効な量の、
（ｉ）標的化ユニット、二量体化ユニット及び抗原性ユニットをコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドであって、前記抗原性ユニットが、少なくとも１つの患者提示共有抗原配列若しくはその１つ以上の部分を含む、前記ポリヌクレオチド；又は
（ｉｉ）（ｉ）において定義される前記ポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチド；又は
（ｉｉｉ）（ｉ）において定義される前記ポリヌクレオチドによりコードされる２つのポリペプチドからなる二量体タンパク質；並びに
医薬的に許容される担体
を含む、個別化された治療用抗がんワクチン。
２．前記抗原性ユニットが１つ以上の患者特異的抗原配列又はその１つ以上の部分を更に含む、項目１に記載のワクチン。
３．前記少なくとも１つの患者提示共有抗原配列が、過剰発現される細胞タンパク質、異常に発現される細胞タンパク質、がん精巣抗原、ウイルス抗原、分化抗原、突然変異型がん遺伝子、突然変異型腫瘍抑制因子遺伝子、がん胎児性抗原、共有融合抗原、共有イントロン保持抗原、ダークマター抗原、スプライセオソーム突然変異により引き起こされる共有抗原及びフレームシフト突然変異により引き起こされる共有抗原からなる群から選択される共有抗原の配列である、項目１又は２のいずれかに記載のワクチン。
４．前記少なくとも１つの患者提示共有抗原配列が、ヒト細胞タンパク質である共有抗原の配列である、項目１～３のいずれかに記載のワクチン。
５．前記少なくとも１つの患者提示共有抗原配列又はその１つ以上の部分が、免疫原性であることが既知であるか、又は前記患者のＨＬＡクラスＩ及び／若しくはＨＬＡクラスＩＩ対立遺伝子に結合することが予測される、項目１～４のいずれかに記載のワクチン。
６．前記少なくとも１つの患者提示共有抗原配列又は前記その１つ以上の部分が、前記患者のＨＬＡ対立遺伝子による提示のために好適な長さを有し、好ましくは７～３０アミノ酸の長さを有する、項目１～５のいずれかに記載のワクチン。
７．前記抗原性ユニットが、いくつかの患者提示共有抗原の配列又はその１つ以上の部分を含む、項目１～６のいずれかに記載のワクチン。
８．前記抗原性ユニットが、いくつかの患者提示共有抗原の配列のいくつかの部分を含む、項目７に記載のワクチン。
９．前記抗原性ユニットが、いくつかの患者提示共有抗原のいくつかのエピトープを含み、前記エピトープが、免疫原性であることが既知であるか、又は前記患者のＨＬＡクラスＩ及び／若しくはＨＬＡクラスＩＩ対立遺伝子に結合することが予測される、項目８に記載のワクチン。
１０．前記抗原性ユニットが、１つ以上の患者提示共有抗原配列の全長を含む、項目１～９のいずれかに記載のワクチン。
１１．前記抗原性ユニットが、少なくとも１つの患者提示共有抗原配列の１～３０個の部分を含む、項目１～１０のいずれかに記載のワクチン。
１２．前記部分が、前記患者のＨＬＡクラスＩ及び／又はＨＬＡクラスＩＩ対立遺伝子に結合することが予測される複数のエピトープを含む、項目１１に記載のワクチン。
１３．前記抗原性ユニットが、エピトープの形態の１～５０個の患者提示共有抗原配列を含む、項目１～１２のいずれかに記載のワクチン。
１４．前記エピトープが、前記患者のＨＬＡクラスＩ及び／又はＨＬＡクラスＩＩ対立遺伝子に結合することが予測される、項目１３に記載のワクチン。
１５．前記エピトープが７～３０アミノ酸の長さを有する、項目１３～１４のいずれかに記載のワクチン。
１６．前記抗原性ユニットが、いくつかの患者特異的抗原配列又はその１つ以上の部分を含む、項目２～１５のいずれかに記載のワクチン。
１７．前記抗原性ユニットが１つ以上の患者特異的エピトープを含む、項目２～１６のいずれかに記載のワクチン。
１８．前記１つ以上の患者特異的エピトープが７～３０アミノ酸の長さを有する、項目１７に記載のワクチン。
１９．抗原性ユニットが少なくとも５個の患者特異的エピトープを含む、項目１７～１８のいずれかに記載のワクチン。
２０．前記抗原性ユニットが７～２０００アミノ酸を含む、項目１～１９のいずれかに記載のワクチン。
２１．前記抗原性ユニットが、１つ以上のリンカー、好ましくは前記抗原配列を互いから分離する１つ以上のリンカーを含む、項目１～２０のいずれかに記載のワクチン。
２２．前記二量体化ユニットが、ヒンジ領域、好ましくはＩｇに由来するヒンジ領域を含む、項目１～２１のいずれかに記載のワクチン。
２３．前記二量体化ユニットが、二量体化を促す別のドメイン、好ましくは免疫グロブリンドメイン、より好ましくは免疫グロブリン定常ドメインを更に含む、項目２２に記載のワクチン。
２４．前記他のドメインが、ＩｇＧに由来する、好ましくはＩｇＧ３に由来するカルボキシ末端Ｃドメインである、項目２２又は２３のいずれかに記載のワクチン。
２５．前記二量体化ユニットが、リンカー、好ましくは前記ヒンジ領域と二量体化を促す前記他のドメインとを接続するリンカーを更に含む、項目２２～２４のいずれかに記載のワクチン。
２６．前記二量体化ユニットが、リンカーを通じてヒトＩｇＧ３のＣＨ３ドメインに接続されたヒンジエクソンｈ１及びｈ４を含む、項目２２～２５のいずれかに記載のワクチン。
２７．前記抗原性ユニット及び前記二量体化ユニットが、リンカー、好ましくは制限部位を含むリンカーを通じて接続されている、項目１～２６のいずれかに記載のワクチン。
２８．前記標的化ユニットが抗原提示細胞を標的化し、好ましくは前記標的化ユニットが、前記抗原提示細胞上の表面分子と相互作用する部分であるか、又は前記部分を含み、好ましくは表面分子が、ＨＬＡ、ＣＤ１４、ＣＤ４０、ケモカイン受容体及びＴｏｌｌ様受容体からなる群から選択される、項目１～２７のいずれかに記載のワクチン。
２９．前記標的化ユニットが、可溶性ＣＤ４０リガンド、ＲＡＮＴＥＳ、ＭＩＰ－１α、ＸＣＬ１、ＸＣＬ２、フラジェリン、抗ＨＬＡ－ＤＰ、抗ＨＬＡ－ＤＲ、抗汎ＨＬＡクラスＩＩ又は抗ＣＤ４０、抗ＴＬＲ－２、抗ＴＬＲ－４若しくは抗ＴＬＲ－５に対して特異性を有する抗体可変ドメインを含むか又はそれからなり、好ましくはＭＩＰ－１αを含むか又はそれからなる、項目２８に記載のワクチン。
３０．ポリヌクレオチド、好ましくはＲＮＡ又はＤＮＡを含む、項目１～２９のいずれかに記載のワクチン。
３１．前記ポリヌクレオチドが、シグナルペプチドをコードするヌクレオチド配列を更に含む、項目３０に記載のワクチン。
３２．前記ポリペプチド中の前記標的化ユニット、二量体化ユニット及び抗原性ユニットが、標的化ユニット、二量体化ユニット及び抗原性ユニットというＮ末端からＣ末端への順序にあるか、又は前記ポリヌクレオチド中の前記標的化ユニット、二量体化ユニット及び抗原性ユニットが、標的化ユニット、二量体化ユニット及び抗原性ユニットという５’から３’への順序にある、項目１～３１のいずれかに記載のワクチン。
３３．前記医薬的に許容される担体が、食塩水、緩衝食塩水、ＰＢＳ、デキストロース、水、グリセロール、エタノール、無菌等張水性緩衝液、及びこれらの組合せからなる群から選択される、項目１～３２のいずれかに記載のワクチン。
３４．項目１に記載の個別化された治療用抗がんワクチンを調製する方法であって、
ａ）患者の腫瘍組織又は体液中の少なくとも１つの患者提示共有抗原を同定するステップ
ｂ）前記患者のＨＬＡクラスＩ及び／又はクラスＩＩ対立遺伝子を決定するステップ
ｃ）前記同定された少なくとも１つの抗原又はその１つ以上の部分の免疫原性を、前記患者のＨＬＡクラスＩ及び／又はＩＩ対立遺伝子に対するそれらの予測される結合性により予測するステップ
ｄ）少なくとも１つの抗原又はその１つ以上の部分を、ステップｃ）において予測されたそれらの免疫原性に基づいて選択するステップ；
ｅ）ステップｄ）において選択された前記少なくとも１つの抗原又はその１つ以上の部分をコードするヌクレオチド配列を含む抗原性ユニットを含むポリヌクレオチド配列を調製するステップ；
ｆ）前記ポリヌクレオチド配列を、標的化ユニット及び二量体化ユニットをコードするヌクレオチド配列を含む発現ベクター中にクローニングするステップ；並びに
ｇ）ステップｆにおいて得られた前記発現ベクターを医薬的に許容される担体と混合するステップ
を含む、前記方法。
３５．項目２に記載の個別化された抗がんワクチンを調製するための、項目３４に記載の方法であって、前記方法が、
ステップａ）において、前記患者の前記腫瘍組織中の１つ以上の患者特異的抗原を同定すること
ステップｃ）において、前記同定された１つ以上の患者特異的抗原又はその１つ以上の部分の免疫原性を、前記患者のＨＬＡクラスＩ及び／又はＩＩ対立遺伝子に対するそれらの予測される結合性により予測すること
ステップｄ）において、１つ以上の患者特異的抗原又はその１つ以上の部分を、ステップｃ）において予測されたそれらの免疫原性に基づいて選択すること
を更に含み；
並びにステップｅ）の前記ポリヌクレオチド配列が、ステップｄ）において選択された前記１つ以上の患者特異的抗原又はその１つ以上の部分をコードするヌクレオチド配列を更に含む、
前記方法。
３６．項目１～３２のいずれかにおいて定義されるポリヌクレオチド。
３７．項目３６に記載のポリヌクレオチドを含むベクター。
３８．項目１～３２のいずれかにおいて定義されるポリヌクレオチドを含むか、又は項目３７に記載のベクターを含む、宿主細胞。
３９．項目１～３２のいずれかにおいて定義されるポリヌクレオチド配列によりコードされるポリペプチド。
４０．項目３９において定義される２つのポリペプチドからなる二量体タンパク質。
４１．ホモ二量体タンパク質である、項目４０に記載の二量体タンパク質。
４２．医薬としての使用のための、項目３６に記載のポリヌクレオチド又は項目３９に記載のポリペプチド又は項目４０若しくは４１のいずれかに記載の二量体タンパク質。
４３．がんを有する患者を処置する方法であって、前記患者のために特異的に調製された、項目１～３３のいずれかに記載のワクチンを前記患者に投与することを含む、前記方法。
４４．前記ワクチンがポリヌクレオチドを含み、及び皮内に又は筋肉内に投与される、項目４３に記載の方法。
ステップａ）において、前記患者の前記腫瘍組織において１つ以上の患者特異的抗原を同定すること
ステップｃ）において、前記同定された１つ以上の患者特異的抗原又はその１つ以上の部分の免疫原性を、前記患者のＨＬＡクラスＩ及び／又はＩＩ対立遺伝子に対するそれらの予測される結合性により予測すること
ステップｄ）において、１つ以上の患者特異的抗原又はその１つ以上の部分を、ステップｃ）において予測されたそれらの免疫原性に基づいて選択すること
を更に含み；
並びにステップｅ）の前記ポリヌクレオチド配列が、ステップｄ）において選択された前記１つ以上の患者特異的抗原又はその１つ以上の部分をコードするヌクレオチド配列を更に含む、
実施形態Ｂ８４に記載の方法。
本発明の態様の一部を以下に記載する。
１．免疫学的に有効な量の、
（ｉ）標的化ユニット、二量体化ユニット及び抗原性ユニットをコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドであって、前記抗原性ユニットが、少なくとも１つの患者提示共有抗原配列若しくはその１つ以上の部分を含む、前記ポリヌクレオチド；又は
（ｉｉ）（ｉ）において定義される前記ポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチド；又は
（ｉｉｉ）（ｉ）において定義される前記ポリヌクレオチドによりコードされる２つのポリペプチドからなる二量体タンパク質；並びに
医薬的に許容される担体
を含む、個別化された治療用抗がんワクチン。
２．前記抗原性ユニットが１つ以上の患者特異的抗原配列又はその１つ以上の部分を更に含む、項目１に記載のワクチン。
３．前記少なくとも１つの患者提示共有抗原配列が、過剰発現される細胞タンパク質、異常に発現される細胞タンパク質、がん精巣抗原、ウイルス抗原、分化抗原、突然変異型がん遺伝子、突然変異型腫瘍抑制因子遺伝子、がん胎児性抗原、共有融合抗原、共有イントロン保持抗原、ダークマター抗原、スプライセオソーム突然変異により引き起こされる共有抗原及びフレームシフト突然変異により引き起こされる共有抗原からなる群から選択される共有抗原の配列である、項目１又は２のいずれかに記載のワクチン。
４．前記少なくとも１つの患者提示共有抗原配列が、ヒト細胞タンパク質である共有抗原の配列である、項目１～３のいずれかに記載のワクチン。
５．前記少なくとも１つの患者提示共有抗原配列又はその１つ以上の部分が、免疫原性であることが既知であるか、又は前記患者のＨＬＡクラスＩ及び／若しくはＨＬＡクラスＩＩ対立遺伝子に結合することが予測される、項目１～４のいずれかに記載のワクチン。
６．前記少なくとも１つの患者提示共有抗原配列又は前記その１つ以上の部分が、前記患者のＨＬＡ対立遺伝子による提示のために好適な長さを有し、好ましくは７～３０アミノ酸の長さを有する、項目１～５のいずれかに記載のワクチン。
７．前記抗原性ユニットが、いくつかの患者提示共有抗原の配列又はその１つ以上の部分を含む、項目１～６のいずれかに記載のワクチン。
８．前記抗原性ユニットが、いくつかの患者提示共有抗原の配列のいくつかの部分を含む、項目７に記載のワクチン。
９．前記抗原性ユニットが、いくつかの患者提示共有抗原のいくつかのエピトープを含み、前記エピトープが、免疫原性であることが既知であるか、又は前記患者のＨＬＡクラスＩ及び／若しくはＨＬＡクラスＩＩ対立遺伝子に結合することが予測される、項目８に記載のワクチン。
１０．前記抗原性ユニットが、１つ以上の患者提示共有抗原配列の全長を含む、項目１～９のいずれかに記載のワクチン。
１１．前記抗原性ユニットが、少なくとも１つの患者提示共有抗原配列の１～３０個の部分を含む、項目１～１０のいずれかに記載のワクチン。
１２．前記部分が、前記患者のＨＬＡクラスＩ及び／又はＨＬＡクラスＩＩ対立遺伝子に結合することが予測される複数のエピトープを含む、項目１１に記載のワクチン。
１３．前記抗原性ユニットが、エピトープの形態の１～５０個の患者提示共有抗原配列を含む、項目１～１２のいずれかに記載のワクチン。
１４．前記エピトープが、前記患者のＨＬＡクラスＩ及び／又はＨＬＡクラスＩＩ対立遺伝子に結合することが予測される、項目１３に記載のワクチン。
１５．前記エピトープが７～３０アミノ酸の長さを有する、項目１３～１４のいずれかに記載のワクチン。
１６．前記抗原性ユニットが、いくつかの患者特異的抗原配列又はその１つ以上の部分を含む、項目２～１５のいずれかに記載のワクチン。
１７．前記抗原性ユニットが１つ以上の患者特異的エピトープを含む、項目２～１６のいずれかに記載のワクチン。
１８．前記１つ以上の患者特異的エピトープが７～３０アミノ酸の長さを有する、項目１７に記載のワクチン。
１９．抗原性ユニットが少なくとも５個の患者特異的エピトープを含む、項目１７～１８のいずれかに記載のワクチン。
２０．前記抗原性ユニットが７～２０００アミノ酸を含む、項目１～１９のいずれかに記載のワクチン。
２１．前記抗原性ユニットが、１つ以上のリンカー、好ましくは前記抗原配列を互いから分離する１つ以上のリンカーを含む、項目１～２０のいずれかに記載のワクチン。
２２．前記二量体化ユニットが、ヒンジ領域、好ましくはＩｇに由来するヒンジ領域を含む、項目１～２１のいずれかに記載のワクチン。
２３．前記二量体化ユニットが、二量体化を促す別のドメイン、好ましくは免疫グロブリンドメイン、より好ましくは免疫グロブリン定常ドメインを更に含む、項目２２に記載のワクチン。
２４．前記他のドメインが、ＩｇＧに由来する、好ましくはＩｇＧ３に由来するカルボキシ末端Ｃドメインである、項目２２又は２３のいずれかに記載のワクチン。
２５．前記二量体化ユニットが、リンカー、好ましくは前記ヒンジ領域と二量体化を促す前記他のドメインとを接続するリンカーを更に含む、項目２２～２４のいずれかに記載のワクチン。
２６．前記二量体化ユニットが、リンカーを通じてヒトＩｇＧ３のＣＨ３ドメインに接続されたヒンジエクソンｈ１及びｈ４を含む、項目２２～２５のいずれかに記載のワクチン。
２７．前記抗原性ユニット及び前記二量体化ユニットが、リンカー、好ましくは制限部位を含むリンカーを通じて接続されている、項目１～２６のいずれかに記載のワクチン。
２８．前記標的化ユニットが抗原提示細胞を標的化し、好ましくは前記標的化ユニットが、前記抗原提示細胞上の表面分子と相互作用する部分であるか、又は前記部分を含み、好ましくは表面分子が、ＨＬＡ、ＣＤ１４、ＣＤ４０、ケモカイン受容体及びＴｏｌｌ様受容体からなる群から選択される、項目１～２７のいずれかに記載のワクチン。
２９．前記標的化ユニットが、可溶性ＣＤ４０リガンド、ＲＡＮＴＥＳ、ＭＩＰ－１α、ＸＣＬ１、ＸＣＬ２、フラジェリン、抗ＨＬＡ－ＤＰ、抗ＨＬＡ－ＤＲ、抗汎ＨＬＡクラスＩＩ又は抗ＣＤ４０、抗ＴＬＲ－２、抗ＴＬＲ－４若しくは抗ＴＬＲ－５に対して特異性を有する抗体可変ドメインを含むか又はそれからなり、好ましくはＭＩＰ－１αを含むか又はそれからなる、項目２８に記載のワクチン。
３０．ポリヌクレオチド、好ましくはＲＮＡ又はＤＮＡを含む、項目１～２９のいずれかに記載のワクチン。
３１．前記ポリヌクレオチドが、シグナルペプチドをコードするヌクレオチド配列を更に含む、項目３０に記載のワクチン。
３２．前記ポリペプチド中の前記標的化ユニット、二量体化ユニット及び抗原性ユニットが、標的化ユニット、二量体化ユニット及び抗原性ユニットというＮ末端からＣ末端への順序にあるか、又は前記ポリヌクレオチド中の前記標的化ユニット、二量体化ユニット及び抗原性ユニットが、標的化ユニット、二量体化ユニット及び抗原性ユニットという５’から３’への順序にある、項目１～３１のいずれかに記載のワクチン。
３３．前記医薬的に許容される担体が、食塩水、緩衝食塩水、ＰＢＳ、デキストロース、水、グリセロール、エタノール、無菌等張水性緩衝液、及びこれらの組合せからなる群から選択される、項目１～３２のいずれかに記載のワクチン。
３４．項目１に記載の個別化された治療用抗がんワクチンを調製する方法であって、
ａ）患者の腫瘍組織又は体液中の少なくとも１つの患者提示共有抗原を同定するステップ
ｂ）前記患者のＨＬＡクラスＩ及び／又はクラスＩＩ対立遺伝子を決定するステップ
ｃ）前記同定された少なくとも１つの抗原又はその１つ以上の部分の免疫原性を、前記患者のＨＬＡクラスＩ及び／又はＩＩ対立遺伝子に対するそれらの予測される結合性により予測するステップ
ｄ）少なくとも１つの抗原又はその１つ以上の部分を、ステップｃ）において予測されたそれらの免疫原性に基づいて選択するステップ；
ｅ）ステップｄ）において選択された前記少なくとも１つの抗原又はその１つ以上の部分をコードするヌクレオチド配列を含む抗原性ユニットを含むポリヌクレオチド配列を調製するステップ；
ｆ）前記ポリヌクレオチド配列を、標的化ユニット及び二量体化ユニットをコードするヌクレオチド配列を含む発現ベクター中にクローニングするステップ；並びに
ｇ）ステップｆにおいて得られた前記発現ベクターを医薬的に許容される担体と混合するステップ
を含む、前記方法。
３５．項目２に記載の個別化された抗がんワクチンを調製するための、項目３４に記載の方法であって、前記方法が、
ステップａ）において、前記患者の前記腫瘍組織中の１つ以上の患者特異的抗原を同定すること
ステップｃ）において、前記同定された１つ以上の患者特異的抗原又はその１つ以上の部分の免疫原性を、前記患者のＨＬＡクラスＩ及び／又はＩＩ対立遺伝子に対するそれらの予測される結合性により予測すること
ステップｄ）において、１つ以上の患者特異的抗原又はその１つ以上の部分を、ステップｃ）において予測されたそれらの免疫原性に基づいて選択すること
を更に含み；
並びにステップｅ）の前記ポリヌクレオチド配列が、ステップｄ）において選択された前記１つ以上の患者特異的抗原又はその１つ以上の部分をコードするヌクレオチド配列を更に含む、
前記方法。
３６．項目１～３２のいずれかにおいて定義されるポリヌクレオチド。
３７．項目３６に記載のポリヌクレオチドを含むベクター。
３８．項目１～３２のいずれかにおいて定義されるポリヌクレオチドを含むか、又は項目３７に記載のベクターを含む、宿主細胞。
３９．項目１～３２のいずれかにおいて定義されるポリヌクレオチド配列によりコードされるポリペプチド。
４０．項目３９において定義される２つのポリペプチドからなる二量体タンパク質。
４１．ホモ二量体タンパク質である、項目４０に記載の二量体タンパク質。
４２．医薬としての使用のための、項目３６に記載のポリヌクレオチド又は項目３９に記載のポリペプチド又は項目４０若しくは４１のいずれかに記載の二量体タンパク質。
４３．がんを有する患者を処置する方法であって、前記患者のために特異的に調製された、項目１～３３のいずれかに記載のワクチンを前記患者に投与することを含む、前記方法。
４４．前記ワクチンがポリヌクレオチドを含み、及び皮内に又は筋肉内に投与される、項目４３に記載の方法。
Claims (17)
- 免疫学的に有効な量の、
（ｉ）標的化ユニット、二量体化ユニット及び抗原性ユニットをコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドであって、前記抗原性ユニットが、少なくとも１つの患者提示共有抗原配列若しくはその１つ以上の部分を含み、及び前記抗原性ユニットが、１つ以上の患者特異的抗原配列又はその１つ以上の部分を更に含む、前記ポリヌクレオチド；又は
（ｉｉ）（ｉ）において定義される前記ポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチド；又は
（ｉｉｉ）（ｉ）において定義される前記ポリヌクレオチドによりコードされる２つのポリペプチドからなる二量体タンパク質；並びに
医薬的に許容される担体
を含む、個別化された治療用抗がんワクチン。 - 前記少なくとも１つの患者提示共有抗原配列が、過剰発現される細胞タンパク質、異常に発現される細胞タンパク質、がん精巣抗原、ウイルス抗原、分化抗原、突然変異型がん遺伝子、突然変異型腫瘍抑制因子遺伝子、がん胎児性抗原、共有融合抗原、共有イントロン保持抗原、ダークマター抗原、スプライセオソーム突然変異により引き起こされる共有抗原及びフレームシフト突然変異により引き起こされる共有抗原からなる群から選択される共有抗原の配列であり、及び／又は前記少なくとも１つの患者提示共有抗原配列が、ヒト細胞タンパク質である共有抗原の配列であり、及び／又は前記少なくとも１つの患者提示共有抗原配列又はその１つ以上の部分が、免疫原性であることが既知であるか、又は前記患者のＨＬＡクラスＩ及び／若しくはＨＬＡクラスＩＩ対立遺伝子に結合することが予測される、請求項１に記載のワクチン。
- 前記抗原性ユニットが、いくつかの患者提示共有抗原の配列又はその１つ以上の部分を含み、例えば、前記抗原性ユニットが、いくつかの患者提示共有抗原の配列のいくつかの部分を含み、好ましくは前記抗原性ユニットが、いくつかの患者提示共有抗原のいくつかのエピトープを含み、前記エピトープが、免疫原性であることが既知であるか、又は前記患者のＨＬＡクラスＩ及び／若しくはＨＬＡクラスＩＩ対立遺伝子に結合することが予測される、請求項１又は２に記載のワクチン。
- 前記抗原性ユニットが、１つ以上の患者提示共有抗原配列の全長を含み、及び／又は前記抗原性ユニットが、少なくとも１つの患者提示共有抗原配列の１～３０個の部分を含み、好ましくは、前記部分が、前記患者のＨＬＡクラスＩ及び／又はＨＬＡクラスＩＩ対立遺伝子に結合することが予測される複数のエピトープを含む、請求項１～３のいずれかに記載のワクチン。
- 前記抗原性ユニットが、エピトープの形態の１～５０個の患者提示共有抗原配列を含み、好ましくは前記エピトープが、前記患者のＨＬＡクラスＩ及び／又はＨＬＡクラスＩＩ対立遺伝子に結合することが予測される、請求項１～４のいずれかに記載のワクチン。
- 前記抗原性ユニットが、いくつかの患者特異的抗原配列又はその１つ以上の部分を含み、好ましくは前記抗原性ユニットが１つ以上の患者特異的エピトープを含み、例えば抗原性ユニットが少なくとも５個の患者特異的エピトープを含む、請求項１～５のいずれかに記載のワクチン。
- 前記二量体化ユニットが、リンカーを通じてヒトＩｇＧ３のＣＨ３ドメインに接続されたヒンジエクソンｈ１及びｈ４を含み、好ましくは前記二量体化ユニットが、配列番号２のアミノ酸配列９４～２３７に対して少なくとも８５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか又はそれからなる、請求項１～６のいずれかに記載のワクチン。
- 前記標的化ユニットが、可溶性ＣＤ４０リガンド、ＲＡＮＴＥＳ、ＭＩＰ－１α、ＸＣＬ１、ＸＣＬ２、フラジェリン、抗ＨＬＡ－ＤＰ、抗ＨＬＡ－ＤＲ、抗汎ＨＬＡクラスＩＩ又は抗ＣＤ４０、抗ＴＬＲ－２、抗ＴＬＲ－４若しくは抗ＴＬＲ－５に対して特異性を有する抗体可変ドメインを含むか又はそれからなり、好ましくはＭＩＰ－１αを含むか又はそれからなり、より好ましくは前記標的化ユニットが、配列番号１のアミノ酸配列２４～９３に対して少なくとも８５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むか又はそれからなる、請求項１～７のいずれかに記載のワクチン。
- ポリヌクレオチド、好ましくはＲＮＡ又はＤＮＡポリヌクレオチド、より好ましくはＤＮＡポリヌクレオチドを含む、請求項１～８のいずれかに記載のワクチン。
- 前記ポリヌクレオチドが、シグナルペプチドをコードするヌクレオチド配列を更に含む、請求項９に記載のワクチン。
- 前記医薬的に許容される担体が、食塩水、緩衝食塩水、ＰＢＳ、デキストロース、水、グリセロール、エタノール、無菌等張水性緩衝液、及びこれらの組合せからなる群から選択される、請求項１～１０のいずれかに記載のワクチン。
- 請求項１～１１のいずれかで定義される個別化された治療用抗がんワクチンを調製する方法であって、
ａ）患者の腫瘍組織又は体液中の少なくとも１つの患者提示共有抗原及び前記患者の前記腫瘍組織中の１つ以上の患者特異的抗原を同定するステップ
ｂ）前記患者のＨＬＡクラスＩ及び／又はクラスＩＩ対立遺伝子を決定するステップ
ｃ）前記同定された少なくとも１つの患者提示共有抗原又はその１つ以上の部分の、及び前記同定された１つ以上の患者特異的抗原又はその１つ以上の部分の、免疫原性を、前記患者のＨＬＡクラスＩ及び／又はＩＩ対立遺伝子に対するそれらの予測される結合性により予測するステップ
ｄ）少なくとも１つの患者提示共有抗原又はその１つ以上の部分及び１つ以上の患者特異的抗原又はその１つ以上の部分を、ステップｃ）において予測されたそれらの免疫原性に基づいて選択するステップ；
ｅ）ステップｄ）において選択された、前記少なくとも１つの患者提示共有抗原又はその１つ以上の部分をコードするヌクレオチド配列を含み、及び前記１つ以上の患者特異的抗原又はその１つ以上の部分をコードするヌクレオチド配列更に含む抗原性ユニットを含むポリヌクレオチド配列を調製するステップ；
ｆ）前記ポリヌクレオチド配列を、標的化ユニット及び二量体化ユニットをコードするヌクレオチド配列を含む発現ベクター中にクローニングするステップ；並びに
ｇ）ステップｆにおいて得られた前記発現ベクターを医薬的に許容される担体と混合するステップ
を含む、前記方法。 - 請求項１～１０のいずれかにおいて定義されるポリヌクレオチド。
- 請求項１３に記載のポリヌクレオチドを含むベクター。
- 請求項１～１０のいずれかにおいて定義されるポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチド、又は２つの前記ポリペプチドからなる二量体タンパク質。
- 医薬としての使用のための、請求項１３に記載のポリヌクレオチド又は請求項１５に記載のポリペプチド又は二量体タンパク質。
- がんを有する患者を処置するための、請求項１～１１のいずれかに記載のワクチンであって、前記ワクチンは、前記患者のために特異的に調製され、好ましくは前記ワクチンは、前記ポリヌクレオチドを含み、及び前記患者に皮内に又は筋肉内に投与される、ワクチン。
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