JPWO2021053713A5 - - Google Patents

Claims (14)

1. 電気泳動を用いて生体試料を分析する生体試料分析装置であって、
   前記生体試料を含むサンプルを電気泳動させながら前記生体試料を測定する測定部、
   前記測定部による測定結果を記述した測定データを生成する演算部、
   を備え、
   前記生体試料は互いに異なる２種類以上の蛍光標識が付与されており、
   前記演算部は、前記生体試料を含む第１サンプルを電気泳動させながら前記第１サンプルを測定することにより得られる測定結果を記述した第１測定データを生成し、
   前記演算部は、前記生体試料を定量化するための基準となる基準試料を含む第２サンプルを電気泳動させながら前記第２サンプルを測定することにより得られる測定結果を記述した第２測定データを生成し、
   前記演算部は、前記第１測定データと前記第２測定データとの間の差分を閾値と比較することにより、前記生体試料を再測定する前に前記第２サンプルを再測定することを介して前記生体試料を定量化するための基準値を再取得する必要があるか否かを判定する
   ことを特徴とする生体試料分析装置。
2. 前記演算部は、前記第１測定データが記述している第１データ値と、前記第１データ値が表す測定結果との間の第１対応関係を記述した第１対応関係データを用いて、前記第１サンプルに含まれる前記生体試料を定量化し、
   前記演算部は、前記第２測定データが記述している第２データ値と、前記第２データ値が表す測定結果との間の第２対応関係を記述した第２対応関係データを用いて、前記第２サンプルに含まれる前記基準試料を定量化し、
   前記演算部は、前記第１サンプルに含まれる前記生体試料を定量化した結果が、前記第２サンプルに含まれる前記基準試料を定量化した結果に対して異なっている量を用いて、前記差分を算出する
   ことを特徴とする請求項１記載の生体試料分析装置。
3. 前記第１サンプルと前記第２サンプルはともに、前記測定部により得られる測定値が既知である第１標準物質を含んでおり、
   前記第１測定データは、前記第１サンプルを電気泳動させながら測定することにより得られる第１蛍光強度波形を記述しており、
   前記第２測定データは、前記第２サンプルを電気泳動させながら測定することにより得られる第２蛍光強度波形を記述しており、
   前記演算部は、前記第１蛍光強度波形において前記生体試料を表す波形と、前記第１蛍光強度波形において前記第１標準物質を表す波形との間の第１距離を算出し、
   前記演算部は、前記第２蛍光強度波形において前記基準試料を表す波形と、前記第２蛍光強度波形において前記第１標準物質を表す波形との間の第２距離を算出し、
   前記演算部は、前記第１距離と前記第２距離との間の距離差を、前記差分として算出する
   ことを特徴とする請求項１記載の生体試料分析装置。
4. 前記生体試料は、ＤＮＡサンプルであり、
   前記第２サンプルは、アレリックラダーであり、
   前記第１標準物質は、ＤＮＡ断片長を測定するための基準サイズとなる既知のサイズを有するサイズスタンダードであり、
   前記演算部は、前記第１測定データを用いて前記生体試料のＤＮＡ断片長を算出する
   ことを特徴とする請求項３記載の生体試料分析装置。
5. 前記演算部は、前記差分が前記閾値を超えたとき、その旨のアラームを出力する
   ことを特徴とする請求項１記載の生体試料分析装置。
6. 前記演算部は、前記差分が前記閾値を超えたとき、前記第２サンプルを再測定することを介して前記生体試料を定量化するための基準値を再取得するまで、前記生体試料を再測定することができないように、前記測定部に対して使用制限をかける
   ことを特徴とする請求項１記載の生体試料分析装置。
7. 前記第１サンプルと前記第２サンプルはともに、前記測定部により得られる測定値が既知である第１および第２標準物質を含んでおり、
   前記第１測定データは、前記第１サンプルを電気泳動させながら測定することにより得られる第１蛍光強度波形を記述しており、
   前記第２測定データは、前記第２サンプルを電気泳動させながら測定することにより得られる第２蛍光強度波形を記述しており、
   前記演算部は、前記第１蛍光強度波形において前記生体試料を表す波形と、前記第１蛍光強度波形において前記第１標準物質を表す波形との間の第１距離を算出するとともに、前記第１蛍光強度波形において前記生体試料を表す波形と、前記第１蛍光強度波形において前記第２標準物質を表す波形との間の第２距離を算出し、
   前記演算部は、前記第２蛍光強度波形において前記基準試料を表す波形と、前記第２蛍光強度波形において前記第１標準物質を表す波形との間の第３距離を算出するとともに、前記第２蛍光強度波形において前記基準試料を表す波形と、前記第２蛍光強度波形において前記第２標準物質を表す波形との間の第４距離を算出し、
   前記演算部は、前記第１距離と前記第２距離の第１比率が、前記第３距離と前記第４距離の第２比率と比較して異なっている量を、前記差分として算出し、または、
   前記演算部は、前記第１距離と前記第２距離との間の第１差分が、前記第３距離と前記第４距離との間の第２差分と比較して異なっている量を、前記差分として算出する
   ことを特徴とする請求項１記載の生体試料分析装置。
8. 前記演算部は、前記第２サンプルに含まれる前記生体試料を定量化した結果を取得するとともに、その定量化結果の標準偏差を算出し、
   前記演算部は、前記標準偏差が閾値以上に達しているか否かに基づき、前記生体試料を再測定する前に前記第２サンプルを再測定することを介して前記生体試料を定量化するための基準値を再取得する必要があるか否かを判定する
   ことを特徴とする請求項１記載の生体試料分析装置。
9. 前記測定部は、前記第１測定データによって記述する測定結果として、前記第１サンプルを電気泳動させているとき前記第１サンプルの測定結果に対して影響を与える第１パラメータを測定し、
   前記測定部は、前記第２測定データによって記述する測定結果として、前記第２サンプルを電気泳動させているとき前記第２サンプルの測定結果に対して影響を与える第２パラメータを測定し、
   前記演算部は、前記第１パラメータが前記第２パラメータと比較して異なっている量を前記差分として算出する
   ことを特徴とする請求項１記載の生体試料分析装置。
10. 前記測定部は、前記第１パラメータおよび前記第２パラメータとして、
    サンプルを電気泳動させているときそのサンプルに流れる電流値、
    前記生体試料分析装置の内部における温度、湿度、または気圧のうち少なくともいずれか、
    前記生体試料分析装置の外部における温度、湿度、または気圧のうち少なくともいずれか、
    サンプルを測定するときそのサンプルと併せて供給する分離媒体の物性値、
    サンプルを測定するときそのサンプルと併せて供給する緩衝液の物性値、
    前記分離媒体の使用済回数または前記緩衝液の使用済回数、
    前記分離媒体の使用開始日からの経過日数または前記緩衝液の使用開始日からの経過日数、
    前記分離媒体の製造ロット番号または前記緩衝液の製造ロット番号、
    サンプルを電気泳動させるときそのサンプルを通過させるキャピラリの使用済回数、
    前記キャピラリの使用開始日からの経過日数、
    前記キャピラリの製造ロット番号、
    のうち少なくともいずれかを測定する
    ことを特徴とする請求項９記載の生体試料分析装置。
11. 前記第１測定データは、前記第１サンプルに含まれる前記生体試料を表す第１値を記述しており、
    前記第２測定データは、前記第２サンプルに含まれる前記基準試料を表す第２値を記述しており、
    前記演算部は、前記第１値および前記第２値として、
    前記測定部が前記生体試料を検出した時刻を表す値、
    前記測定部が測定を開始してから前記生体試料を検出するまでに経過した時間長を表す値、
    サンプルに含まれる前記生体試料以外の物質を前記測定部が検出してから前記測定部が前記生体試料を検出するまでに経過した時間長を表す値、
    のうち少なくともいずれかを用いる
    ことを特徴とする請求項１記載の生体試料分析装置。
12. 前記生体試料は、ＤＮＡサンプルであり、
    前記演算部は、サンプルを電気泳動させながら測定することにより得られる蛍光強度波形を前記測定データとして生成し、
    前記演算部は、前記蛍光強度波形のなかの第１および第２波形を前記第１測定データと前記第２測定データとの間で比較することにより、前記差分を算出し、
    前記演算部は、前記第１波形および前記第２波形として、
    蛍光標識したサンプルから得られる前記蛍光強度波形のピーク位置、
    前記蛍光強度波形のうちＸ染色体に由来する部分、
    前記蛍光強度波形のうち、前記測定部により得られる測定値が既知であるサイズスタンダードに対応する部分、
    前記蛍光強度波形のうち、ＰＣＲ反応の良否を判定するためにＰＣＲ試薬に混合されているクオリティセンサーに対応する部分、
    前記蛍光強度波形のうち、参照物質としてサンプルに混合した蛍光オリゴヌクレオチドに対応する部分、
    のうち少なくともいずれかを用いる
    ことを特徴とする請求項１記載の生体試料分析装置。
13. 前記第１サンプルに含まれる前記生体試料と、前記第２サンプルに含まれる前記基準試料には、同じ色の蛍光標識が付与されている
    ことを特徴とする請求項１記載の生体試料分析装置。
14. 電気泳動を用いて生体試料を分析する生体試料分析方法であって、
    前記生体試料を含むサンプルを電気泳動させながら前記生体試料を測定する測定ステップ、
    前記測定ステップにおける測定結果を記述した測定データを生成する演算ステップ、
    を有し、
    前記生体試料は互いに異なる２種類以上の蛍光標識が付与されており、
    前記演算ステップにおいては、前記生体試料を含む第１サンプルを電気泳動させながら前記第１サンプルを測定することにより得られる測定結果を記述した第１測定データを生成し、
    前記演算ステップにおいては、前記生体試料を定量化するための基準となる基準試料を含む第２サンプルを電気泳動させながら前記第２サンプルを測定することにより得られる測定結果を記述した第２測定データを生成し、
    前記演算ステップにおいては、前記第１測定データと前記第２測定データとの間の差分を閾値と比較することにより、前記生体試料を再測定する前に前記第２サンプルを再測定することを介して前記生体試料を定量化するための基準値を再取得する必要があるか否かを判定する
    ことを特徴とする生体試料分析方法。