JPWO2020167668A5 - - Google Patents
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重鎖及び軽鎖であって、前記重鎖は、
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から選択される配列を含む、重鎖及び軽鎖、
を含み、
前記抗体またはその抗原結合フラグメントはC型レクチンドメインファミリー2メンバーD(CLEC2D)に結合する、
前記単離抗体またはその抗原結合フラグメント。 - 重鎖及び軽鎖を含む単離抗体またはその抗原結合フラグメントであって、前記重鎖は、配列番号:1~108のいずれか1つから選択される配列を含み、または、前記軽鎖は、配列番号:217~324のいずれか1つから選択される配列を含み、または、前記重鎖は、配列番号:1~108のいずれか1つから選択される配列を含み、前記軽鎖は、配列番号:217~324のいずれか1つから選択される配列を含み、前記抗体またはその抗原結合フラグメントはCLEC2Dに結合する、前記単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
- a.配列番号:433~485から選択されるHC CDR1配列、配列番号:486~546から選択されるHC CDR2配列、及び配列番号:547~653から選択されるHC CDR3配列、を含む重鎖、または
b.配列番号:654~726から選択されるLC CDR1配列、配列番号:727~783から選択されるLC CDR2配列、及び配列番号:784~885から選択されるLC CDR3配列、を含む軽鎖、または、
c.これらの組み合わせ、
を含む、単離抗体またはその抗原結合フラグメントであって、
前記抗体またはその抗原結合フラグメントはCLEC2Dに結合する、
前記単離抗体またはその抗原結合フラグメント。 - a.配列番号:886~909及び930~1003から選択される配列を含むヒトCLEC2Dポリペプチド、
b.配列番号:918~920から選択される配列を含むカニクイザルCLEC2Dポリペプチド、
c.配列番号:911~915から選択される配列を含むマウスCLEC2Dポリペプチド、
d.配列番号:910の配列を含むラットCLEC2Dポリペプチド、及び/または、
e.配列番号:916~917から選択される配列を含むイヌCLEC2Dポリペプチド、
に結合する、請求項1から請求項3のいずれか1項に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメント。 - 重鎖及び軽鎖を含む単離抗体またはその抗原結合フラグメントであって、
前記重鎖は、表9Aの抗CLEC2D抗体番号:A1~N2のいずれか1つの重鎖相補性決定領域(CDRH)1、CDRH2、及びCDRH3アミノ酸配列を含み、前記軽鎖は、表9Aの抗CLEC2D抗体番号:A1~N2のいずれか1つの軽鎖相補性決定領域(CDRL)1、CDRL2、及びCDRL3アミノ酸配列を含む、あるいは
前記重鎖は、表9AのA1、B1、E1、P1、U1、Y1、E2、I2、及びL2からなる群から選択される抗CLEC2D抗体の重鎖相補性決定領域(CDRH)1、CDRH2、及びCDRH3アミノ酸配列を含み、前記軽鎖は、表9AのA1、B1、E1、P1、U1、Y1、E2、I2、及びL2からなる群から選択される抗CLEC2D抗体の軽鎖相補性決定領域(CDRL)1、CDRL2、及びCDRL3アミノ酸配列を含む、あるいは
前記重鎖は、表9AのA1、B1、E1、P1、U1、Y1、E2、I2、及びL2からなる群から選択される抗CLEC2D抗体の可変重鎖アミノ酸配列を含み、前記軽鎖は、表9AのA1、B1、E1、P1、U1、Y1、E2、I2、及びL2からなる群から選択される抗CLEC2D抗体の可変軽鎖アミノ酸配列を含む、あるいは
前記重鎖は、表9Aの抗CLEC2D抗体番号:A1~N2のいずれか1つの重鎖アミノ酸配列を含み、前記軽鎖は、表9Aの抗CLEC2D抗体番号:A1~N2のいずれか1つの軽鎖アミノ酸配列を含む、あるいは
前記重鎖は、重鎖アミノ酸配列を含み、前記軽鎖は、表9Aの
a)F1、P1およびC2;
b)A1、B1、D1、L1、U1およびL2;
c)C1およびG2;
d)E1、I1およびM2;
e)G1
f)H1およびH2;
g)J1
h)K1;
i)M1;
j)N1、X1、A2およびB2;
k)O1;
l)Q1;
m)S1’
n)T1;
o)V1;
p)W1;
q)Y1;
r)Z1;
s)D2;
t)E2;
u)F2;
v)R1;
w)G2
x)I2;
y)K2;または
z)J2およびN2
からなる群から選択される抗CLEC2D抗体のいずれか1つの軽鎖アミノ酸配列を含む、あるいは
前記重鎖は、可変重鎖アミノ酸配列を含み、前記軽鎖は、表9Aの
a)P1;
b)A1、B1、U1およびL2
c)E1およびI1;
d)Y1;
e)E2;または
f)I2
からなる群から選択される抗CLEC2D抗体のいずれか1つの可変軽鎖アミノ酸配列を含む、あるいは
前記重鎖及び前記軽鎖は、それぞれ、表9Bの
a)P1;
b)A1、B1、U1およびL2
c)E1およびI1;
d)Y1;
e)E2;または
f)I2
からなる群から選択される、抗CLEC2D抗体の重鎖及び軽鎖の生殖細胞系ファミリーのフレームワーク領域配列を含む、前記単離抗体またはその抗原結合フラグメント。 - 前記抗CLEC2D抗体は、表9A及び表9Bの抗CLEC2D抗体番号:A1、B1、E1、P1、U1、Y1、E2、I2またはL2である、請求項5に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
- モノクローナル抗体である、請求項1から請求項6のいずれか1項に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
- 受容体へのCLEC2Dの結合を調節または遮断する、請求項1から請求項6のいずれか1項に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
- 前記受容体はCD161受容体を含み、前記CD161受容体は、配列番号:921~929から選択される配列を含む、請求項8に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
- 前記抗体またはその抗原結合フラグメントはアフコシル化されている、請求項1から請求項9のいずれか1項に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
- 前記抗体またはその抗原結合フラグメントはIgG1 Fc領域、IgG4 Fc領域、IgG1 N~A Fc領域、IgG2 Fc領域を含む、請求項1から請求項10のいずれか1項に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
- CLEC2D抗原の構造的エピトープを認識して結合し、CD161受容体相互作用アミノ酸残基と重複する及び/または重複しないアミノ酸部位からなる、
CLEC2D抗原の構造的エピトープを認識して結合する別の抗体を阻害もしくは抑止するまたは競合する、可変重鎖配列及び可変軽鎖配列を含み、CD161受容体相互作用アミノ酸残基と重複する及び/または重複しないのいずれかとなるアミノ酸部位からなる、
アミノ酸部位ARG175、TYR177、GLU179、ARG153、ARG84、HIS190、ARG101、GLU150、GLN154、THR152、GLN141、SER105、ASP107、ASP92、THR93、LYS94、LYS144、GLU138、CYS176、GLN139、ARG180、SER187、LYS181、PHE116、ASN95、またはこれらの組み合わせのいずれかを含む、CLEC2D抗原の構造的エピトープに結合する、可変重鎖配列及び可変軽鎖配列を含む、
アミノ酸部位ARG175、TYR177、GLU179、ARG153、ARG84、HIS190、ARG101、GLU150、GLN154、THR152、GLN141、SER105、ASP107、ASP92、THR93、LYS94、LYS144、GLU138、CYS176、GLN139、ARG180、SER187、LYS181、PHE116、ASN95、またはこれらの組み合わせのいずれかを含む、CLEC2D抗原の構造的エピトープへの、別の抗体の結合を阻害もしくは抑止するまたは競合する、可変重鎖配列及び可変軽鎖配列を含む、
配列番号:886~920及び930~1003のアミノ酸部位ARG175、TYR177、GLU179、ARG153、ARG84、HIS190、ARG101、GLU150、GLN154、THR152、GLN141、SER105、ASP107、ASP92、THR93、LYS94、LYS144、GLU138、CYS176、GLN139、ARG180、SER187、LYS181、PHE116、ASN95のうちの少なくとも1つを含む、CLEC2D抗原の構造的エピトープに結合して、CD161受容体相互作用アミノ酸残基に対する非線形スキャフォールドを構成することにより、CLEC2D受容体とCD161受容体の間の相互作用を遮断する、可変重鎖配列及び可変軽鎖配列を含む、
配列番号:886~920及び930~1003のアミノ酸部位ARG175、TYR177、GLU179、ARG153、ARG84、HIS190、ARG101、GLU150、GLN154、THR152、GLN141、SER105、ASP107、ASP92、THR93、LYS94、LYS144、GLU138、CYS176、GLN139、ARG180、SER187、LYS181、PHE116、ASN95のうちの少なくとも1つを含む、CLEC2D抗原の構造的エピトープに結合して、CD161受容体非相互作用アミノ酸残基に対するアロステリックかつ非線形スキャフォールドを構成することにより、CLEC2D受容体とCD161受容体の間の相互作用を遮断する、可変重鎖配列及び可変軽鎖配列を含む、あるいは
配列番号:886~920及び930~1003から選択されるCLEC2Dに結合する際に、アミノ酸部位ARG175、TYR177、GLU179、ARG153、ARG84、HIS190、ARG101、GLU150、GLN154、THR152、GLN141、SER105、ASP107、ASP92、THR93、LYS94、LYS144、GLU138、CYS176、GLN139、ARG180、SER187、LYS181、PHE116、ASN95のうちの少なくとも1つに結合して、単独または組み合わせで、腫瘍殺傷または細胞傷害を誘導する、可変重鎖配列及び可変軽鎖配列を含む、請求項1から請求項11のいずれか1項に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメント。 - 第2の抗原に結合する、請求項1から請求項12のいずれか1項に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
- 前記第2の抗原が、免疫チェックポイントタンパク質または腫瘍抗原である、請求項13に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
- 第2の抗原に向かうキメラ抗原受容体T細胞(CAR-T)またはキメラ抗原受容体NK細胞(CAR-NK)を含む養子細胞療法剤と組み合わせて使用するためのものである、請求項1から請求項14のいずれか1項に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメント。
- 請求項1から請求項15のいずれか1項に記載の抗体またはその抗原結合フラグメントを含む医薬組成物。
- 配列番号:109~216から選択されるアミノ酸重鎖配列または配列番号:325~432から選択されるアミノ酸軽鎖配列をコードするポリヌクレオチド配列を含む単離核酸。
- 請求項1から請求項15のいずれか1項に記載の重鎖アミノ酸配列もしくは軽鎖アミノ酸配列またはこれらの組み合わせをコードするポリヌクレオチド配列を含む単離核酸。
- 請求項17または請求項18に記載の単離核酸を含むベクター。
- 請求項17もしくは請求項18に記載の単離核酸または請求項19に記載のベクターを含む、細胞であって、真核細胞である、前記細胞。
- 請求項1から請求項15のいずれか1項に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメントを産生する細胞。
- 疾患の治療を必要とする対象においてそれを実施するための組成物であって、請求項1から請求項15のいずれか1項に記載の単離抗体またはその抗原結合フラグメントを含む、前記組成物。
- 前記疾患は関節リウマチまたはがんである、請求項22に記載の組成物。
- 前記がんは、乳癌、前立腺癌、子宮内膜癌、膀胱癌、腎臓癌、食道癌、扁平上皮細胞癌、ブドウ膜黒色腫、濾胞性リンパ腫、腎細胞癌、子宮頸癌、卵巣癌、肺癌、結腸直腸癌、脳癌、膵臓癌、頭頸部癌、肝臓癌、白血病、リンパ腫、ホジキン病、多発性骨髄腫、黒色腫、星状細胞腫、胃癌、及び肺腺癌からなる群から選択される、請求項23に記載の組成物。
- 前記がんは、副腎皮質癌、膀胱尿路上皮癌、浸潤性乳癌、子宮頸部扁平上皮細胞癌及び子宮頸腺癌、胆管癌、結腸腺癌、リンパ系腫瘍びまん性大細胞型B細胞リンパ腫、食道癌、多形膠芽腫、頭頸部扁平上皮細胞癌、色素嫌性腎癌、腎臓腎明細胞癌、腎臓腎乳頭細胞癌、急性骨髄性白血病、脳低グレード神経膠腫、肝臓肝細胞癌、肺腺癌、肺扁平上皮細胞癌、中皮腫、卵巣漿液性嚢胞腺癌、膵腺癌、褐色細胞腫及び傍神経節腫、前立腺腺癌、直腸腺癌、肉腫、皮膚皮膚黒色腫、胃腺癌、精巣胚細胞腫瘍、甲状腺癌、胸腺腫、子宮体部子宮内膜癌、子宮癌肉腫、ならびにブドウ膜黒色腫からなる群から選択される、請求項23に記載の組成物。
- 微生物によって引き起こされる疾患、障害、または感染症に対する免疫応答の活性化の調節を必要とする対象においてそれを実施するための組成物であって、請求項1から請求項15のいずれか1項に記載の抗体またはその抗原結合フラグメントを含み、前記免疫応答は、自然免疫応答もしくは適応免疫応答またはこれらの組み合わせである、前記組成物。
- ナチュラルキラー細胞の細胞傷害の上昇を必要とする対象においてそれを実施するための組成物であって、請求項1から請求項15のいずれか1項に記載の抗体またはその抗原結合フラグメントを含む、前記組成物。
- 少なくとも約108の固有のモノクローナル抗体クローンを含む抗体ライブラリであって、前記抗体クローンのうちの少なくとも約80%は、配列番号:886~920及び930~1003から選択されるアミノ酸配列を含むCLEC2D抗原に検出可能かつ特異的に結合する、前記抗体ライブラリ。
- CLEC2D抗原に結合する抗体で高多様性抗体遺伝子ライブラリをスクリーニングするための方法であって、
a)抗体遺伝子のライブラリをファージタンパク質遺伝子に挿入して、複数のファージを形質転換してファージライブラリを作製することであって、前記ファージライブラリ内の前記ファージは、前記ファージの表面上に前記抗体遺伝子のライブラリを提示している、前記作製すること、
b)前記CLEC2D抗原に結合する個々のファージに対する前記CLEC2D抗原で前記ファージライブラリをパニングすることにより、前記CLEC2D抗原に結合する抗体をコードする抗体遺伝子を濃縮させた濃縮ファージライブラリを作製すること、
c)前記工程(b)を少なくとも1回または少なくとも2回繰り返すこと、
d)前記濃縮ファージライブラリに由来する前記抗体遺伝子を酵母表面ディスプレイライブラリに導入すること、
e)前記酵母表面ディスプレイライブラリから、前記CLEC2D抗原に結合する個々の酵母細胞を単離すること、
f)前記CLEC2D抗原に結合する前記単離された個々の酵母細胞を培養して、酵母表面ディスプレイライブラリクローンを作製すること、及び、
g)前記酵母表面ディスプレイライブラリクローンをシークエンシングすること、
により、前記CLEC2D抗原に結合する抗体遺伝子を単離すること、
を含む、前記方法。 - FLAGタグ、c-Mycタグ、ポリヒスチジンタグ、またはV5タグを用いて、前記抗体遺伝子の表面発現を解析することを更に含む、請求項29に記載の方法。
- 前記CLEC2D抗原に結合する前記抗体遺伝子を哺乳動物発現ベクターにクローニングすることを更に含む、請求項29または請求項30に記載の方法。
- 抗CLEC2D抗体またはその抗原結合フラグメントを含む組成物を作製するための方法であって、
a)プロモーターをコードする配列及び前記抗CLEC2D抗体またはその抗原結合フラグメントをコードする配列を含むベクターで哺乳動物細胞を形質転換することであって、前記プロモーターをコードする前記配列及び前記抗CLEC2D抗体またはその抗原結合フラグメントをコードする前記配列は機能的に連結している、前記形質転換すること、
b)前記抗CLEC2D抗体またはその抗原結合フラグメントの発現に好適な条件下で前記哺乳動物細胞を培養すること、ならびに、
c)前記培養哺乳動物細胞から前記抗CLEC2D抗体またはその抗原結合フラグメントを得て、上清を作製すること、
を含む、前記方法。 - 工程(d)前記工程(c)の後に前記上清を濾過すること、を更に含む、請求項32に記載の方法。
- 工程(e)前記濾過上清を精製すること、を更に含む、請求項32または請求項33に記載の方法。
- 疾患の治療を必要とする対象においてそれを実施するための方法における使用のための組成物であって、前記組成物は、CLEC2D抗体を含み、前記方法は、
a.前記対象におけるCLEC2Dタンパク質のレベルを測定すること、及び、
b.前記組成物を前記対象に投与すること、
を含む、前記組成物。 - 前記疾患はがんまたは自己免疫性障害もしくは炎症性障害である、請求項35に記載の組成物。
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