JPWO2018021200A1 - Runx阻害剤 - Google Patents
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Abstract
Description
[1]DNA上のRUNX結合配列に結合して、RUNXファミリーメンバーの該結合配列への結合を阻害する、RUNX阻害剤、
[2]RUNX結合配列に結合するPIポリアミドを含む、[1]記載のRUNX阻害剤、
[3]作用剤およびPIポリアミドの複合体を含むRUNX阻害剤であって、該PIポリアミドがRUNX結合配列に結合する、[2]記載のRUNX阻害剤、
[4]作用剤およびPIポリアミドの複合体が式I:
X1はCHまたはNを示し、X2はCHまたはNを示し、X3はCHまたはNを示し、X4はCHまたはNを示し、X5はCHまたはNを示し、X6はCHまたはNを示し、X7はCHまたはNを示し、X8はCHまたはNを示し、
R1はHまたはアルキル基を示し、R2はHまたはアルキル基を示し、R3はHまたはアルキル基を示し、R4はHまたはアルキル基を示し、R5はHまたはアルキル基を示し、R6はHまたはアルキル基を示し、R7はHまたはアルキル基を示し、R8はHまたはアルキル基を示し、
R9はHまたはNHR11を示し、R10はHまたはNHR11を示し、
R11はH、ビオチン、または蛍光基を示し、
Rは作用剤を示し、
Yは、アミド結合、ホスホジスルフィド結合、エステル結合、配位結合、またはエーテル結合そのものを示すか、あるいはこれらの結合の1種類以上を形成する官能基を含む部分を示し、mは0〜5の整数を示す。]
によって示される化合物からなる群から選ばれる、[3]記載のRUNX阻害剤、
[5]作用剤がアルキル化剤である、[3]または[4]記載のRUNX阻害剤、
[6]アルキル化剤がクロラムブシル(chlorambucil)、デュオカルマイシン(duocarmycin)、seco−CBI(1−クロロメチル−5−ヒドロキシ−1,2−ジヒドロ−3H−ベンゾ[e]インドール)、ピロロベンゾジアゼピン、およびナイトロジェンマスタードからなる群から選択される、[5]記載のRUNX阻害剤、
[7]アルキル化剤がクロラムブシルである、[6]記載のRUNX阻害剤、
[8]クロラムブシルおよびPIポリアミドの複合体が式:
[9]RUNXファミリーの全てのメンバーのRUNX結合配列への結合を阻害する、[1]〜[8]のいずれかに記載のRUNX阻害剤、
[10][1]〜[9]のいずれかに記載のRUNX阻害剤を含む、医薬組成物、
[11]抗腫瘍剤である、[10]記載の医薬組成物、
[12]抗アレルギー剤である、[10]記載の医薬組成物、
[13]他の抗腫瘍剤と組み合わせて使用される、[11]記載の医薬組成物、
[14]白血病、リンパ腫、多発性骨髄腫、肺癌、食道癌、胃癌、大腸癌、腎細胞癌、神経芽細胞腫、皮膚癌、乳癌、前立腺癌および脳腫瘍からなる群から選択される1以上を予防または治療するための、[11]または[13]記載の医薬組成物、
[15][10]記載の医薬組成物を対象に投与することを特徴とする、癌の予防または治療方法、
[16][10]記載の医薬組成物と他の抗腫瘍剤と組み合わせて投与することを特徴とする、癌の予防または治療方法、
[17]癌が白血病、リンパ腫、多発性骨髄腫、肺癌、食道癌、胃癌、大腸癌、腎細胞癌、神経芽細胞腫、皮膚癌、乳癌、前立腺癌および脳腫瘍からなる群から選択される、[15]または[16]記載の予防または治療方法、
[18]抗腫瘍剤を製造するための、[1]〜[9]のいずれかに記載のRUNX阻害剤の使用、
[19]抗アレルギー剤を製造するための、[1]〜[9]のいずれかに記載のRUNX阻害剤の使用、
[20]癌の予防または治療に使用するための、[1]〜[9]のいずれかに記載のRUNX阻害剤、
[21]癌が白血病、リンパ腫、多発性骨髄腫、肺癌、食道癌、胃癌、大腸癌、腎細胞癌、神経芽細胞腫、皮膚癌、乳癌、前立腺癌および脳腫瘍からなる群から選択される、[20]記載のRUNX阻害剤、
[22]DNA上のRUNX結合配列に対するRUNXファミリーメンバーの結合を阻害することを含む、癌の予防または治療方法、
[23]癌が白血病、リンパ腫、多発性骨髄腫、肺癌、食道癌、胃癌、大腸癌、腎細胞癌、神経芽細胞腫、皮膚癌、乳癌、前立腺癌および脳腫瘍からなる群から選択される、[22]記載の予防または治療方法。
本発明のRUNX阻害剤は、DNA上のRUNX結合配列に結合して、RUNXファミリーメンバーの該結合配列への結合を阻害し、それにより、RUNXファミリーの活性を阻害する。
X1はCHまたはNを示し、X2はCHまたはNを示し、X3はCHまたはNを示し、X4はCHまたはNを示し、X5はCHまたはNを示し、X6はCHまたはNを示し、X7はCHまたはNを示し、X8はCHまたはNを示し、ここに、X1〜X8は、PIポリアミドがRUNXコンセンサス配列を認識可能になる組み合わせで選択される、
R1はHまたはアルキル基を示し、R2はHまたはアルキル基を示し、R3はHまたはアルキル基を示し、R4はHまたはアルキル基を示し、R5はHまたはアルキル基を示し、R6はHまたはアルキル基を示し、R7はHまたはアルキル基を示し、R8はHまたはアルキル基を示し、
R9はHまたはNHR11を示し、R10はHまたはNHR11を示し、
R11はH、またはビオチン、蛍光基等の分子を示し、
Rは作用剤を示し、好ましくは、アルキル化剤、さらに好ましくは、クロラムブシル、デュオカルマイシン、seco−CBI、ピロロベンゾジアゼピン、およびナイトロジェンマスタードからなる群から選択されるアルキル化剤を示し、
Yは、リンカー部分を示し、
mは0〜5の整数を示し、好ましくは0〜3の整数を示し、より好ましくは0または1を示す。]
によって示される化合物、ならびにその修飾物が挙げられる。
Aは、カルボニル[−C(=O)−]またはイミノ(−NH−)であり、
Bは、エーテル結合(−O−)またはイミノ(−NH−)もしくはメチルイミノ[−N(−CH3)−]であり、
gおよびkは各々独立して、1〜3の整数を示し、
hおよびjは各々独立して、0〜5の整数を示し、
iは、0〜2の整数を示す]
で示される構造が挙げられる。例えば、hおよびjは各々独立して、0〜3の整数であることが好ましい。また、上記の式III中、エステル結合の位置と、Bで表されるエーテル結合またはイミノ結合の位置は入れ替わっていてもよい。上記式IIIで示されるリンカー部分において、例えば、右端の位置は作用剤と連結し、左端の位置はPIポリアミドと連結するが、該連結位置は逆であってもよい。例えば、上記式IIIで示されるリンカー部分の左端の位置がPIポリアミドのC末端と連結する場合、Aはイミノであることが好ましい。
Rは作用剤を示し、好ましくは、アルキル化剤を示し、さらに好ましくは、クロラムブシル、デュオカルマイシン、seco−CBI、ピロロベンゾジアゼピン、およびナイトロジェンマスタードからなる群から選択されるアルキル化剤を示し、
nは0、1、2、3、4、または5を示し、好ましくは1、2、または3を示し、さらに好ましくはnは1を示す。]
によって示される化合物、ならびにその修飾物が挙げられる。
X1はCHまたはNを示し、X2はCHまたはNを示し、X3はCHまたはNを示し、X4はCHまたはNを示し、X5はCHまたはNを示し、X6はCHまたはNを示し、X7はCHまたはNを示し、X8はCHまたはNを示し、ここに、X1〜X8は、PIポリアミドがRUNXコンセンサス配列を認識可能になる組み合わせで選択される、
R1はHまたはアルキル基を示し、R2はHまたはアルキル基を示し、R3はHまたはアルキル基を示し、R4はHまたはアルキル基を示し、R5はHまたはアルキル基を示し、R6はHまたはアルキル基を示し、R7はHまたはアルキル基を示し、R8はHまたはアルキル基を示し、
R9はHまたはNHR11を示し、R10はHまたはNHR11を示し、
R11はH、またはビオチン、蛍光基等の分子を示し、
nは、0、1、2、3、4、または5を示し、好ましくは1、2、または3を示し、さらに好ましくはnは1を示す。]
本発明の医薬組成物は、本発明のRUNX阻害剤を含む組成物である。好ましくは、本発明の医薬組成物は、PIポリアミドまたはPIポリアミドと作用剤との複合体を含むRUNX阻害剤を含む。上記のとおり、本発明のRUNX阻害剤は、ゲノム上のRUNXコンセンサス結合配列を認識し、結合する。RUNXコンセンサス配列(RUNXファミリー蛋白結合配列)は、様々な遺伝子の調節領域中に存在する。RUNXファミリーメンバーは、調節領域中にあるコンセンサス配列に結合することによって、様々な標的遺伝子の発現を制御する。本発明の医薬組成物は、RUNXコンセンサス配列に結合することによって、各RUNXファミリーメンバーが標的とする様々な遺伝子の発現をダウンレギュレートする。このような標的遺伝子の例としては、限定するものではないが、CBF白血病において高発現する遺伝子(例えば、IL3、CSF2、CSF2RB等)、RUNXファミリー自身(RUNX1、RUNX2、RUNX3)、p53抑制因子(例えば、BCL11、TRIM24等)、c−kit遺伝子等が挙げられる。
材料および方法
細胞系統
THP−1およびKG−1aのAML細胞系統、K562のCML細胞系統、A549の肺癌細胞系統、およびTE−1、TE−5およびTE−11の食道癌細胞系統は、理研バイオリソースセンター(RIKEN biological resource center (BRC), Japan)から購入した。Kasumi−1およびHL60のAML細胞系統、LU99A、ABC−1、およびRERF−LC−MSの肺癌細胞系統、MKN7およびMKN45の胃癌細胞系統、C32TGおよびMewoのメラノーマ細胞系統、Caki−1の腎癌細胞系統、HCT116およびLOVOの直腸癌細胞系統、およびHEK293T細胞の胚性腎癌細胞系統は、JCRB(Japanese Collection of Research Bioresources , Japan)より入手した。OCI−AML2、OCI−AML3およびMOLM13のAML細胞系統は、DSMZ(Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen GmbH , Germany)から購入し、MV4−11およびKG−1aのAML細胞系統、RS4;11のALL細胞系統、SU−DHL−5、RajiおよびDaujiのリンパ腫細胞系統、KMS−12−BMの骨髄腫細胞系統、NCI−H2228の肺癌細胞系統、およびDU4475、MCF7、HCC1937、MDA−MB−231およびHTB−27の乳癌細胞系統は、ATCC(American Type Culture Collection, USA)から入手した。SU−Ph2およびSU/SR細胞のALL細胞系統は、A.Kanamaru博士(Department of Internal Medicine, Kinki University School of Medicine, Osaka, Japan)から提供された。KOCL−45のALL細胞系統は、K.Sugita博士(Department of Pediatrics, Yamanashi University, Yamanashi, Japan)から提供された。TP53 R248W変異を有するMV4−11NR細胞のAML細胞系統は、T.Ikezoe博士(Department of Hematology and Respiratory Medicine, Kochi University, Kochi, Japan)から提供された。Caki−1およびHEK293T細胞は、10%熱不活性化胎仔ウシ血清(FBS)および1%ペニシリン−ストレプトマイシン(PS)を補足したダルベッコ変法イーグル培地(DMEM)中、37℃、5%CO2下で維持した。他の細胞系統は、10%FBSおよび1%PSを含有するRPMI(Roswell Park Memorial Institute)1640培地中、37℃、5%CO2下で培養した。
細胞増殖を評価するために、1×105細胞のAML細胞系統を、5mL培地を含有する6ウェルプレートに移した。テトラサイクリン誘導遺伝子またはshRNA発現のために、ドキシサイクリン(doxycycline)を3μM加えた。一日おきに、トリパンブルーで細胞数をカウントした。
全RNAをRNeasyミニキット(Qiagen)で単離し、Reverse scriptキット(TOYOBO)で逆転写してcDNAを生成した。リアルタイム定量ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)は、7500 Real−Time PCR System(Applied Biosystems)を用いて、製造者の指示書にしたがって実施した。結果は、GAPDHレベルに対して標準化した。相対的発現レベルは、2−ΔΔCt法を用いて算出した。qRT−PCRに用いたプライマーを表1に示す。
細胞を氷冷したリン酸緩衝化セーライン(PBS)で2回洗浄し、タンパク質溶解バッファー[50mM Tris(pH7.4)、100mM NaCl、0.1mM EDTA、1mMデニルメチルスルホニルフルオリド、1mM β−グリセロホスフェート、2.5mMピロリン酸ナトリウム、1mM Na3VO4、1xプロテアーゼ阻害剤(Roche)およびPhosSTOP(Roche)]中に回収した。全細胞抽出物をSDS−ポリアクリルアミドゲル電気泳動(SDS−PAGE)によって分離し、ポリビニリデンジフルオリド膜上に転移させた。膜を以下の抗体:抗−Ctip1抗体(ab19487)(abcam)、抗−TRIM24抗体(Bethyl Laboratories, Inc)、抗−RUNX1抗体(A−2)、抗−GAPDH(FL−335)、抗−p21(C−19)、抗−Bax(N−20)抗体(Santa Cruz Biotechnology, Inc.)、抗−RUNX2、抗−RUNX3抗−p53抗体(Cell Signaling Technology)、抗−CBFβ(FL-182, Santa Cruz Biotechnology, Inc.)、抗−Cleaved Caspase−3(5A1E, Cell Signaling Technology)、抗−PARP(46D11, Cell Signaling Technology)でプローブした。二次抗体に、抗−ウサギIgGまたは抗−マウスIgG HRP結合抗体(Cell Signaling Technology)を用いた。Chemi−Lumi One Super(nacalai tesque, Inc.)およびChemiDocTM XRS+ Imager(Bio-Rad Laboratories, Inc.)を用いて、製造者の推奨にしたがって、ブロットを検出した。タンパク質レベルは、Image Lab Software(Bio-Rad Laboratories, Inc.)を用いて定量した。
全RNAを単離する前に、MV4−11細胞を1μMのChb−M’、Chb−50またはDMSOで6時間処理した。対照shRNA(sh_Luc.)またはRUNX1(sh_Rx1 #1および#2)、RUNX2(sh_Rx2)およびRUNX3(sh_Rx3)を標的とするshRNA(下記「siRNA干渉」参照)が導入されたMV4−11細胞を、3μMドキシサイクリンと共に24時間インキュベートした。次いで、細胞から全RNAを単離した。RNA抽出は、RNeasy MINIキット(Qiagen, CA, USA)を用いて、製造者の指示書にしたがって行った。RNA試料のクオリティは、Agilent 2100 Bioanalyzer(Agilent Technologies, USA)を用いて調べた。全RNA試料由来のmRNAをdsDNAに増幅した。T7ポリメラーゼを用いて、シアニン3−標識cRNAを生成した。該標識cRNAを、RNeasy Miniキットを用いて精製し、濃縮物をNanodrop ND1000 v3.5.2(Thermo Scientific)を用いて測定した。cRNA(825ng)を断片化し、次いで、Human Gene 2.1 ST Array Strip(Affymetrix, USA)にハイブリダイズした。生データおよび付随する試料情報は、GeneSpring GX v12.1.0(Agilent Technologies, USA)によって処理した。マイクロアレイデータは、NCBIのGene Expression Omnibusに寄託し、GEO Seriesアクセッション番号によってアクセス可能である。得られたマイクロアレイデータの解釈は、Gene Set Enrichment Analysis(GSEA)(Subramanian, A. et al. Gene set enrichment analysis: a knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proc Natl Acad Sci U S A 102, 15545-15550, doi:10.1073/pnas.0506580102 (2005))によって行う。遺伝子オントロジー強化分析(Gene ontology enrichment analysis)は、DAVID(Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery)バイオインフォマティクス・リソース6.7ソフトウェアにより、提供元の指示にしたがって行った(Huang da, W., Sherman, B. T. & Lempicki, R. A. Systematic and integrative analysis of large gene lists using DAVID bioinformatics resources. Nat Protoc 4, 44-57, doi:10.1038/nprot.2008.211 (2009)、およびHuang da, W., Sherman, B. T. & Lempicki, R. A. Bioinformatics enrichment tools: paths toward the comprehensive functional analysis of large gene lists. Nucleic Acids Res 37, 1-13, doi:10.1093/nar/gkn923 (2009)参照)。
ヒトRUNX1、RUNX2、およびRUNX3を標的とする特異的shRNA(テトラサイクリン誘導性ショートヘアピンRNA)を設計し、pENTR4−H1tetOx1、CS−RfA−ETBsd、CS−RfA−ETV、CS−RfA−ETRベクター(RIKEN BRC)中でクローニングした。対照shRNAは、ルシフェラーゼを標的とする非機能的構築物(sh_Luc.)とした。標的配列を表2に示す。
群間の統計学的有意差は、対応のない両側スチューデントt検定で評価した。2集団における等分散性は、F検定で算出した。差は、0.05未満のP値で統計学的に有意とみなされた。結果は、3つの独立した実験由来の平均±SEM値で表した。移植実験において、動物は無作為に、各実験群に割り当て、盲検で処理した。マウスの全生存は、Kaplan−Meier曲線によって描いた。群間の生存は、ログランク検定で比較した。癌患者の全生存を分析するために、データ抽出および最小P値の計算にPrognoScanソフトウェアを利用した(Mizuno, H., Kitada, K., Nakai, K. & Sarai, A., BMC Med Genomics 2, 18, doi:10.1186/1755-8794-2-18 (2009)参照)。mRNAまたはタンパク質発現間の相関測定のために、スピアマンの順位相関係数を用いた。
NOD/Shi−scid,IL−2RγKO(NOG)マウスは、公益財団法人 実験動物研究所(Central Institute for Experimental Animals, Japan)から購入した。全実験において、対照として同腹子を用いた。
4つのピロール−イミダゾール対の連続的な結合により、5’−TGTGGT−3’および5’−TGCGGT−3’のRUNXコンセンサス結合配列を特異的に認識するPIポリアミドを設計し、合成した(図1)。Chb−M’は、5’−TGTGGT−3’を標的とし、Chb−50は、5’−TGCGGT−3’を標的とする。また、対照として、5’−WGGCCW−3’配列を標的とするPIポリアミド(Chb−S)を合成した(図1)。ここで、WはAもしくはTのいずれかである。
試薬および溶媒は、標準的な供給元から入手し、さらに精製することなく使用した。フラッシュカラム精製は、C18 RediSep Rfフラッシュカラムを用いてCombiFlash Rf(Teledyne Isco, Inc.)によって行った。ESI−TOF MS(Electrospray ionization time-of-flight mass spectrometry)は、Bio−TOF II(Bruker Daltonics)マススペクトロメ−ターで、陽イオン化モードを用いて行った。機械によるポリアミド合成は、コンピューター制御されたPSSM−8(Shimadzu)システムで行った。プロトン核磁気共鳴(1H NMR)スペクトルは、600MHzで作動しているJEOL JNM ECA−600スペクトロメーターで、内部標準として使用されるテトラメチルシランと比べて低磁場側への百万分率(ppm)として記録された。下記の略語は、スピン多重度:s(シングレット)、d(ダブレット)、t(トリプレット)、q(カルテット)、quint(クインテット)、m(マルチプレット)を示す。
Fmoc固相合成法による段階的反応によって、オキシム樹脂によって担持されたPIポリアミドを調製した。オキシム樹脂を有する生産物に、N,N−ジメチル−1,3−プロパンジアミン(1.0mL)を加え、45℃で3時間処理して、切り出しを行った。ろ過により樹脂を除き、残留物を最少量のジクロロメタン中に溶解し、ジエチルエーテルで洗浄して、59.6mgを得た。この粗化合物(59.6mg、48.1μmol)に、N,N−ジメチルホルムアミド(DMF)(300μL)中のクロラムブシル(32.6mg、107μmol)、PyBOP(ベンゾトリアゾール−1−イル−オキシ−トリス−ピロリジノ−ホスホニウムヘキサフルオロホスフェート)(101mg、195μmol)、およびN,N−ジイソプロピルエチルアミン(100μL、581μmol)を加えた。反応混合物を室温で1.5時間インキュベートし、ジエチルエーテルおよびDMFで3回洗浄し、真空乾燥させた。該粗生成物を逆相フラッシュカラムクロマトグラフィー(0.1%トリフルオロ酢酸水溶液/MeCN)で精製した。凍結乾燥後、生成物を得た(30.2mg、19.8μmol)。アルキル化剤クロラムブシルは、PIポリアミドに、より強力かつ不可逆性のDNA結合能を付与した。
1H NMR (600 MHz, DMSO (ジメチルスルホキシド)-d6):δ=10.43 (s, 1H), 10.30 (s, 1H), 9.92 (s, 1H), 9.90 (s, 1H), 9.894 (s, 1H), 9.890 (s, 1H), 9.83 (s, 1H), 9.44 (s, 1H), 8.30 (t, J = 6.2 Hz, 1H), 8.15 (t, J = 6.2 Hz, 1H), 7.86 (t, J = 5.9 Hz, 1H), 7.63 (s, 1H), 7.52 (s, 1H), 7.44 (s, 1H), 7.39 (d, J = 2.0 Hz, 1H), 7.22 (d, J = 1.4 Hz, 2H), 7.18 (d, J = 1.3 Hz, 1H), 7.17 (d, J = 1.3 Hz, 1H), 7.15 (d, J = 1.3 Hz, 1H), 7.073 (d, J = 2.1 Hz, 1H), 7.066 (d, J = 2.0 Hz, 1H), 6.98 (d, J = 8.9 Hz, 2H), 6.95 (d, J = 2.0 Hz, 1H), 6.88 (d, J = 1.4 Hz, 1H), 6.62 (d, J = 8.9 Hz, 2H), 4.01 (s, 3H), 3.96 (s, 3H), 3.94 (s, 3H), 3.87 (s, 3H), 3.84 (s, 6H), 3.83 (s, 3H), 3.81 (s, 3H), 3.67 (m, 8H), 3.32-3.23 (m, 6H), 3.07 (m, 2H), 2.79 (d, J = 4.8 Hz, 6H), 2.52 (m, 2H), 2.40 (apparent t, J = 7.6 Hz, 2H), 2.28 (apparent t, J = 7.2 Hz, 2H), 2.04 (apparent t, J = 7.4 Hz, 2H), 1.82 (m, 4H), 1.70 (m, 2H)
ESI-TOF-MS m/z C71H90Cl2N24O11 2+ [M + 2H]2+ 計算値762.3293, 763.3279, 測定値 762.3277, 763.3244
1H NMR (600 MHz, DMSO-d6):δ=10.38 (s, 1H), 10.29 (s, 1H), 10.22 (s, 1H), 9.99 (s, 1H), 9.920 (s, 1H), 9.916 (s, 1H), 9.86 (s, 1H), 9.42 (s, 1H), 8.48 (t, J = 6.2 Hz, 1H), 8.06 (t, J = 5.5 Hz, 1H), 7.87 (t, J = 5.8 Hz, 1H), 7.63 (s, 1H), 7.545 (s, 1H), 7.538 (s, 1H), 7.46 (s, 1H), 7.37 (s, 1H), 7.32 (s, 1H), 7.21 (s, 1H), 7.19 (s, 1H), 7.17 (s, 1H), 7.08 (s, 1H), 6.99 (d, J = 7.6 Hz, 2H), 6.98 (s, 1H), 6.89 (s, 1H), 6.63 (d, J = 8.2 Hz, 2H), 4.01 (s, 3H), 3.98 (s, 3H), 3.97 (s, 3H), 3.96 (s, 3H), 3.87 (s, 3H), 3.86 (s, 3H), 3.82 (s, 3H), 3.81 (s, 3H), 3.68 (m, 8H), 3.30 (apparent quint, J = 6.2 Hz, 4H), 3.21 (apparent q, J = 6.2 Hz, 2H), 3.07 (m, 2H), 2.78 (d, J = 4.8 Hz, 6H), 2.43-2.34 (m, 6H), 2.05 (t, J = 7.6 Hz, 2H), 1.86 (quint, J = 7.6 Hz, 2H), 1.80 (quint, J = 7.6 Hz, 2H), 1.71 (quint, J = 7.6 Hz, 2H)
ESI-TOF-MS m/z C70H89Cl2N25O11 2+ [M + 2H]2+ 計算値762.8270, 763.8255, 測定値762.8247, 763.8251
1H NMR (600 MHz, DMSO-d6):δ=10.34 (s, 2H), 10.33 (s, 1H), 10.32 (s, 1H), 9.93 (s, 2H), 9.33 (s, 1H), 9.31 (s, 1H), 8.15 (t, J = 5.5 Hz, 1H), 8.04 (t, J = 5.2 Hz, 1H), 7.89 (t, J = 5.5 Hz, 1H), 7.58 (s, 2H), 7.55 (s, 1H), 7.52 (s, 1H), 7.26 (s, 2H), 7.17 (s, 4H), 6.97 (d, J = 7.6 Hz, 2H), 6.95 (s, 1H), 6.91 (s, 1H), 6.61 (d, J = 7.6 Hz, 2H), 4.01 (s, 6H), 3.99 (s, 3H), 3.98 (s, 3H), 3.85 (s, 6H), 3.813 (s, 3H), 3.807 (s, 3H), 3.66 (m, 8H), 3.32 (q, J = 6.2 Hz, 2H), 3.23 (m, 4H), 3.06 (m, 2H), 2.79 (d, J = 3.4 Hz, 6H), 2.52 (m, 2H), 2.38 (m, 4H), 2.04 (t, J = 7.5 Hz, 2H), 1.82 (m, 4H), 1.70 (m, 2H).
ESI-TOF-MS m/z C70H89Cl2N25O11 2+ [M + 2H]2+ 計算値762.8270, 763.8255, 測定値762.8247, 763.8230
(1)RUNX1標的遺伝子の発現阻害
アルキル化剤クロラムブシルにコンジュゲートしたPIポリアミド(Chb−M’およびChb−50)を用いて、リアルタイム定量PCR(qRT−PCR)法により、mRNAレベルでのRUNX標的遺伝子の発現抑制を確認した。簡単に言うと、MV4−11細胞を5μMのChb−M’またはChb−50で6時間処理した。処理後の細胞から全RNAを抽出し、qRT−PCR(上記「リアルタイム定量PCR(qRT−PCR)」参照)により、RUNX1の標的遺伝子であるIL3、CSF2およびCSF2RBの発現量を定量した。対照としてDMSOで処理した細胞を用い、各処理細胞で得られた値を対照細胞の値に対して標準化した(n=3)。
p53の抑制因子として知られているBCL11AおよびTRIM24(どちらも、直接または間接的にp53を分解することが報告されている)、ならびにp53の下流標的遺伝子p21、BAX、PUMA、およびMDM2ついて、上記(1)と同様の方法で、mRNAレベルでの発現抑制を確認した。但し、1μMのChb−M’およびChb−50を使用した。結果を図3に示す。
アルキル化剤クロラムブシルにコンジュゲートしたPIポリアミド(Chb−M’およびChb−50)を用いて、マイクロアレイ分析(上記「遺伝子発現マイクロアレイ分析」参照)にて、ゲノムレベルでの遺伝子発現パターンを確認した。簡単に言うと、MV4−11細胞を1μMのChb−M’またはChb−50で6時間処理し、該細胞においてアップレギュレートされた上位500個の遺伝子およびダウンレギュレートされた上位500個の遺伝子を、RUNX遺伝子ファミリーをノックダウンしたMV4−11細胞での転写産物と比較した。その結果、Chb−M’またはChb−50で処理した細胞における遺伝子発現パターンは、RUNXファミリーの全メンバー(RUNX1、RUNX2、RUNX3)の遺伝子発現をノックダウンした場合に有意に相関していた。
機能的p53発現を有するいくつかのAML細胞系統(MV4−11、OCI−AML2、OCI−AML3、およびMOLM−13)に対する、種々の濃度のPIポリアミドコンジュゲートによる増殖阻害を試験した。簡単に言うと、細胞を1×105細胞/mL密度にし、種々の濃度のPIポリアミドコンジュゲート(Chb−M’またはChb−50)を培地に加え、48時間インキュベートした(n=3)。PIポリアミドコンジュゲート非添加時(DMSOコントロール)の細胞生存数を対照として、細胞生存率を、Cell Count Reagent SF(nacalai tesque, Inc.)およびInfinite(登録商標)200 PROマルチモードリーダー(TECAN)を用いて、製造者の指示書にしたがって、生存細胞をカウントすることによって評価した。得られた用量応答曲線を図5に示す。その結果、Chb−M’およびChb−50は、上記AML細胞に対し、ナノモルないし低マイクロモルレベルで大いに有効であった。
多様な起源の癌細胞に対するChb−M’およびChb−50の効果を調べた。具体的には、機能的p53発現を有する以下の癌細胞:AML細胞(MV4−11、OCI−AML2、OCI−AML3、MOLM−13)、ALL細胞(SU−Ph2、SU/SR、RS4−11)、リンパ腫細胞(SU−DHL−5)、骨髄腫細胞(KMS−12−BM)、肺癌細胞(A549、LU99A、NCI−H2228)、胃癌細胞(MKN45)、食道癌細胞(TE1)、乳癌細胞(HTB−27、DU4475、MCF7)、メラノーマ細胞(C32TG)、腎癌細胞(Caki−1)、および直腸癌細胞(HCT116、LOVO)に対する、Chb−M’およびChb−50の50%阻害濃度(IC50)を求めた。簡単に言うと、細胞を1×105細胞/mL密度に培養し、種々の濃度のChb−M’またはChb−50を培地に加え、48時間インキュベートした(n=3)。細胞生存率を、Cell Count Reagent SF(nacalai tesque, Inc.)およびInfinite(登録商標)200 PROマルチモードリーダー(TECAN)を用いて、製造者の指示書にしたがって、生存細胞をカウントすることによって評価した。増殖を50%阻害する用量(IC50)は、median-effect法によって分析した(Chou, T. C. & Talalay, P., Adv Enzyme Regul 22, 27-55 (1984))。また、変異型p53を有するか、またはp53を持たない種々の癌細胞(以下、まとめて「p53変異癌細胞」という)についても同様に試験した。p53変異癌細胞として、AML細胞(MV4−11NR、HL60、ME1、KG1a、THP1、Kasumi−1、NB4、K562)、ALL細胞(KOCL−45)、リンパ腫細胞(Raji、Dauji)、肺癌細胞(ABC−1)、胃癌細胞(MKN7)、メラノーマ細胞(Mewo)、乳癌細胞(HCC1937、MDA−MB−231)、および食道癌細胞(TE5、TE11)を使用した。
これらのPIポリアミドコンジュゲートは、機能的p53発現を有する癌細胞の場合と比べて、試験したp53変異癌細胞の多くにおいて効力が減少した(図6および図7)。そこで、p53誘導剤との併用効果を調べた。具体的には、MV4−11NR、HL60、KG1a、THP1、およびKasumi−1細胞を、種々の濃度のChb−M’またはp53誘導剤PRIMA−1の単剤存在下、あるいは種々の濃度のChb−M’および5μMのPRIMA−1の両剤存在下で48時間培養し(n=3)、IC50値を求めた。KG1aおよびHL60細胞はp53を持たない細胞(p53null細胞株)であり、MV4−11NR、Kasumi−1およびTHP−1は、変異したp53を有する細胞(p53mut(+)株)である。各細胞において得られたIC50値を表3に示す。
1.PIポリアミドコンジュゲートの安全性試験
まず、PIポリアミドコンジュゲートのインビボでの薬理学的安全性をチェックするために、マウスにおけるChb−M’の急性毒性試験を行った。NOD/Shi−scid,IL−2RγKO(NOG)マウスに、種々の濃度のChb−M’を注射し、全血球計算、血液生化学、および体重を測定した(n=5)。結果を図9に示す。体重1kgあたり10mgのChb−M’注射でわずかな血小板数の減少がもたらされた(図9(a))。この用量は、PIポリアミドコンジュゲートの薬物学的効果を得る量の30倍以上であり、該分子がインビボで非常に許容可能であることが確証された。
Chb−M’およびChb−50のインビボでの抗腫瘍効果を調べるために、NOGマウスを用いて、ヒト癌細胞系統の異種移植マウスモデルを作成した。白血病マウスモデルの場合、マウス1個体あたり2.5×106細胞のMV4−11またはSU/SR細胞を静脈内注射した。末梢血(PB)を毎週収集し、抗−ヒトCD45抗体(BD Biosciences)を用いて、キメラ現象をチェックした。7日目に、各処理を開始した。肺癌マウスモデルを作成する場合、マウス1個体あたり1×106細胞のA549細胞を眼窩後静脈より注射した。該肺癌細胞は、細胞トラフィッキングのために、pLenti−ルシフェラーゼベクター(addgene)によって生産されたルシフェラーゼ発現レンチウイルスを形質導入した。150mg/kg体重のD−ルシフェリン(Wako Pure Chemical Industries, Ltd.)を腹膜内注射し、腫瘍体積の量をIVIS Spectrum In Vivo Imaging System(PerkinElmer)で毎週評価した。胃癌異種移植マウスモデルを作成する場合、マウス1個体あたり1×106細胞のMKN45細胞を右背部側面に皮下注射した。該胃癌細胞はルシフェラーゼでマーキングされ、腫瘍成長はIVISによってモニターされた。
上記2で作成した異種移植AMLマウスモデルに、移植後7日目に、320μg/kg体重のChb−M’またはChb−50を週2回静脈内注射し、その効力を試験した(n=7)。対照として、溶媒(ジメチルスルホキシド:DMSO)(320μg/kg体重を週に2回静脈内注射)、クロラムブシル(320μg/kg体重を週に2回静脈内注射)、Chb−S(320μg/kg体重を週に2回静脈内注射)、およびシタラビン(Ara−C)(Wako Pure Chemical Industries, Ltd.)(100mg/kg体重を5日間連続(7日目から11日目まで)腹腔内注射)処理を用いた。14日目に、AMLマウスから骨髄、肝臓、および脾臓組織を採取し、ヘマトキシリンおよびエオシン染色(以下、「HE染色」ともいう)および抗−ヒトCD45抗体での免疫組織化学染色(以下、「hCD45染色」ともいう)を行い、顕微鏡画像を撮影した。HE染色は造血系組織を染色する。hCD45染色はヒトの造血細胞を茶色に染色し、マウス組織を染色しない。
上記2で作成した異種移植ALLマウスモデルに、320μg/kg体重のChb−M’を週2回静脈内注射し、その効力を試験した(n=5)。対照として、DMSO(320μg/kg体重を週に2回静脈内注射)、およびイマチニブ処理を用いた。イマチニブ処理は、100mg/kg体重のイマチニブメシラート(imatinib mesylate)(Focus Biomolecules)を、レシピエントマウスが該疾患で死亡するまで、7日目から1日2回経口投与することにより行った。上記3と同様に、ALLマウスから骨髄、肝臓、および脾臓組織を採取し、HE染色およびhCD45染色を行い、顕微鏡画像を撮影した。各処理によるマウスの生存試験の結果を図12に示す。各処理によるALLマウス由来の各組織の顕微鏡画像を図13(骨髄)、図14(肝臓)および図15(脾臓)に示す。
上記2で作成した異種移植肺癌マウスモデルに、移植後7日目に、Chb−M’(320μg/kg体重、週に2回静脈内注射)、DMSO(320μg/kg体重、週に2回静脈内注射)、またはゲフィチニブ(gefitinib)(100mg/kg体重を週に5回経口注入)処理を開始した(n=5)。移植後7日目から毎週、ルシフェリンを腹腔内注射し、IVISで撮影して肺癌細胞の生着をチェックした。また、移植後14日目に、肺癌マウスから肺組織を採取し、HE染色および抗−ヒトKi−67抗体での免疫組織化学染色を行い、顕微鏡画像を撮影した。結果を図16〜19に示す。
上記2で作成した異種移植胃癌マウスモデルに、移植後7日目に、Chb−M’(320μg/kg体重、週に2回静脈内注射)または等量のDMSOの処理を開始した(n=8)。移植後7日目から35日目まで週2回、ルシフェリンを腹腔内注射し、IVISで撮影し、腫瘍成長をモニターした。また、移植後35日目に、胃癌マウスから移植した腫瘍片を取り出し、縦、横、奥行きの長さより胃癌ボリュームを測定した。結果を図20〜22に示す。
全RUNXファミリーメンバーを癌治療の標的とするために、癌組織およびその対応する正常組織におけるRUNX1、RUNX2、RUNX3およびCBFβの発現をチェックした。以前に報告されたアレイデータセット(Reference database for gene Expression Analysis; RefExA)に基づくと(Ge, X. et al., Genomics 86, 127-141, doi:10.1016/j.ygeno.2005.04.008 (2005))、CBFβの発現は、正常組織に比べて癌組織において一貫して高く、各RUNX発現は癌とその正常組織との間で様々であった。しかしながら、興味深いことに、上記「リアルタイム定量PCR(qRT−PCR)」法により、RUNX1−3の共通領域を検出するプライマーを用いて、AML細胞(MV4−11、MOLM−13、OCI−AML2、OCI−AML3、MV4−11NR、HL60、THP−1、KG1a、Kasumi−1)における全RUNX発現(RUNX1+RUNX2+RUNX3)を定量したところ、CBFβの発現に正に相関した(図23)。該現象はまた、上記「イムノブロッティング」法により、タンパク質レベルでも観察された(図24)。したがって、CBFβ発現が、本発明のPIポリアミドコンジュゲートの標的である全てのRUNXファミリーメンバーの発現の代理マーカーとなり得ることが示された。CBFβは、実際、種々の癌組織においてmRNAレベルで最もアップレギュレートされた遺伝子の一つであり、幅広い種類の癌の腫瘍マーカーとして特徴を有する。
CMLおよびPhALLは、BCR−ABLヒュージョン蛋白が原因となる白血病である。そこで、CMLおよびPhALL細胞に対するChb−M’およびChb−50の効果を調べた。CML細胞として、BV173細胞株およびMYL細胞株(佐賀医大血液呼吸器内科より供与)を用いた。BV173およびMYLはどちらも、野生型p53及び野生型p210BCR−ABLを有する細胞株である。PhALL細胞として、SU−Ph2細胞株およびSU/SR細胞株を用いた。SU−Ph2は、野生型のp190BCR−ABLを有する細胞株である。SU/SRは、T351Iポイントミューテーションを有する変異型のp190BCR−ABLを有するチロシンキナーゼ阻害剤耐性株である。
BV173細胞、MYL細胞、SU−Ph2細胞、およびSU/SR細胞に3μMまたは1μMのChb−M’を投与した。6時間後、細胞から全RNAを抽出し、qRT−PCR(上記「リアルタイム定量PCR(qRT−PCR)」参照)により、BCR−ABL遺伝子の発現量を定量した。対照として、DMSOを投与した。MYL細胞ならびにSU−Ph2細胞およびSU/SR細胞の結果を図25−1および図25−2に示す。図中、DMSO(対照)投与群でのp210BCR−ABL mRNA量またはp190BCR−ABL mRNA量を1とした場合の相対値を示す。
種々の濃度のChb−M’を培地に加え、MYL細胞を48時間インキュベートした。また、種々の濃度の各種薬剤(Chb−50、Chb−M’、またはイマチニブ)を培地に加え、SU−Ph2細胞およびSU/SR細胞を48時間インキュベートした。Cell Count Reagent SF(nacalai tesque, Inc.)およびInfinite(登録商標)200 PROマルチモードリーダー(TECAN)を用いて、48時間の細胞生存率を計測し、IC50値(50%生存率)を計測した(SF試薬を用いたMTSアッセイ)。結果を図27−1および図27−2に示す。
骨髄ニッチは、白血病細胞が、潜む(ホーミングする:Homing)ための重要な部位である。骨髄ニッチには、血管内皮と骨芽ニッチの2つが重要である。E−セレクチン(E-Selectin)は、骨髄の血管内皮ニッチのみに発現する重要因子である。
0μM、0.5μM、1μM、または5μMの各濃度のChb−M’でHUVEC(ヒト臍帯静脈内皮細胞株)(ATCCカタログナンバー:ATCC CRL−1730)を6時間処理した。HUVECは、Chb−M’によって増殖が阻害されない細胞株である(IC50値は50μM以上)。6時間後、細胞から全RNAを抽出し、qRT−PCR(上記「リアルタイム定量PCR(qRT−PCR)」参照)により、E−セレクチン遺伝子の発現量を定量した。また、対照として、P−セレクチン、Tie2、ICAM−1、VCAM−1、およびJagged−1も定量した。結果を図28に示す。図中、Chb−M’0μM:対照(DMSO)での各種遺伝子のmRNA発現レベルを1とした時の相対発現度をグラフとした。E−セレクチン1とE−セレクチン2は、RE−セレクチン用のRT−PCRプライマー2種によって定量した。
HUVECを用いて、RUNX阻害剤およびRUNXノックダウンによる、E−セレクチンの発現量の変化をFACS(蛍光活性化セルソーター)で解析した。HUVECに1μMのChb−M’を投与し、24時間後に各種抗体を用いて免疫染色し、CD62E(E−セレクチン)の細胞表面での発現変化を計測した。対照として、DMSOを投与した。また、sh_RUNX1 #2によりRUNX1遺伝子発現をノックダウンしたHUVECを、各種抗体を用いて免疫染色し、CD62E(E−セレクチン)の細胞表面での発現変化を計測した。対照として、細胞を、ルシフェラーゼを標的とするsiRNA(sh_Luc.)でノックダウンした。抗体として、抗−ヒトCD62E(E−セレクチン)抗体(eBioscience製)、および抗−ヒトCD62E(E−セレクチン)抗体のアイソタイプ抗体(マウスIgG1)(eBioscience製)を使用した。
Chb−M’投与による骨髄内皮細胞に発現するE−セレクチンの発現量の変化をイン・ビボで調べた。正常マウスに、DMSO(対照)またはChb−M’を2週間で6回投与(1回 320μg/kg)し、最終投与の24時間後(Chb−M’がマウス体内より消失した状態)に、大腿骨と脛骨を採取し、骨髄造血細胞を除いたうえ、内皮細胞を取り出してFACS解析に付した。CD45陰性細胞(骨髄造血細胞が除去された骨髄細胞)をゲーティング(gating)し、CD31陽性細胞(血管内皮マーカー陽性)Lin陰性CD45陰性CD31陽性E−セレクチン陽性細胞(E−セレクチンが陽性の骨髄血管内皮細胞)の比率をFACSで計測した。実験スキームの概略を図30に示す。結果を図31に示す。
白血病幹細胞がある特定の離れた場所に移動することをホーミング効果という。本実験では、静脈注射により移植した白血病幹細胞が骨髄へと移動し、微小環境に生着する個数を測定した。
Her2陽性胃癌では、RTK(Receptor Tyrosine Kinase)であるHer2により、PI3−AKTシグナルおよびMAPK−ERKシグナルが増強し、細胞増殖が亢進している。Her2は、細胞膜下のGRB2−SOS1アダプター蛋白で制御されており、該アダプター蛋白が増強、活性化することにより、Her2がリン酸化され、活性化が維持される。
(1)EGFR野生型p53野生型肺腺癌細胞株に対する効果
種々の濃度の各種薬剤(Chb−M’、ゲフィチニブ、またはクロラムブシル)を培地に加え、EGFR野生型p53野生型肺腺癌細胞株(A549およびLU99A)を48時間インキュベートした。Cell Count Reagent SF(nacalai tesque, Inc.)およびInfinite(登録商標)200 PROマルチモードリーダー(TECAN)を用いて、48時間の細胞生存率を計測し、IC50値(50%生存率)を計測した(SF試薬を用いたMTSアッセイ)。結果を図37に示す。
種々の濃度の各種薬剤(Chb−M’、ゲフィチニブ、クロラムブシル、またはChb−S)を培地に加え、EGFR野生型p53変異型肺腺癌細胞株(ABC−1およびRERF−LC−MS)を48時間インキュベートした。Cell Count Reagent SF(nacalai tesque, Inc.)およびInfinite(登録商標)200 PROマルチモードリーダー(TECAN)を用いて、48時間の細胞生存率を計測し、IC50値(50%生存率)を計測した(SF試薬を用いたMTSアッセイ)。結果を図38に示す。
LU99A細胞およびA549細胞に、1μMのChb−M’を投与し、24時間後、ウェスタンブロット法(上記「イムノブロッティング」参照)により、Mig6のタンパク質発現を評価した。対照としてDMSOを投与した。結果を図39に示す。
A549細胞およびLU99A細胞に、1μMのChb−M’を投与し、24時間後、ウェスタンブロット法(上記「イムノブロッティング」参照)により、アポトーシス関連因子(p53、p21、PUMA、およびBAX)の発現量を評価した。対照として、DMSOを投与した。結果を図40に示す。図中、「C−M」は、Chb−M’投与群を示す。
マスト細胞は、受容体を介して活性化することにより、アレルギー反応等の症状または疾患を引き起こす。さらに、c−kitシグナル伝達は、刺激されたマスト細胞からの化学メディエーターの放出を増強する。そこで、ヒトマスト細胞に対するRUNX阻害剤の効果を調べた。ヒトマスト細胞として、LAD2細胞株(野生型c−kitを発現している)およびHMC−1.2細胞株(変異型c−kitを発現している)を用いた。なお、HMC−1.2細胞株は、KIT D816V変異およびV560G変異を有する。野生型c−kitはSCFの受容体であり、SCF依存的な細胞増殖であるため、LAD2細胞株には、50ng/mlのSCFを投与して以下の実験を行った。HMC−1.2細胞株はc−kitに変異を有し、SCF非依存的な細胞増殖であるため、HMC−1.2細胞株にはSCFを投与せずに以下の実験を行った。RUNX阻害剤として、Chb−M’を用いた。LAD2細胞株は、Kirshenbaum AS博士およびMetcalfe DD博士(ともに、Laboratory of Allergic Diseases, NIAID, NIH)から分与された。HMC−1.2細胞株は、Nilsson G博士(Department of Genetics and Pathology, Uppsala University)が樹立したものを、Metcalfe DD博士(Laboratory of Allergic Diseases, NIAID, NIH)から分与された。
LAD2細胞株に、10μMのChb−M’を投与し、3時間後および18時間後に各種抗体を用いて細胞表面に表出するc−kitを免疫染色し、発現量をFACS(蛍光活性化セルソーター)によって計測した。HMC−1.2細胞株に、10μMのChb−M’を投与し、18時間後に各種抗体を用いて細胞表面に表出するc−kitを免疫染色し、発現量をFACSによって計測した。対照として、Chb−M’の代わりにDMSOを投与して同様の実験を行った。抗体として、抗−ヒトCD117(c−kit)抗体(クローン104D2,BioLegend製)、およびマウスIgG1,κアイソタイプCtrl(FC)抗体(クローンMOPC−21,BioLegend製)を使用した。
LAD2細胞株およびHMC−1.2細胞株に10μMのChb−M’を投与し、18時間培養した後、該細胞から抽出液を得、c−kit、リン酸化c−kit、AKT、リン酸化AKT、Mitf、およびGAPDHのタンパク質発現量について、各種抗体を用いてウェスタンブロット解析を行った(上記「イムノブロッティング」参照)。AKTは、c−kit下流の重要なシグナル蛋白である。Mitfは、c−kitの代表的な転写ドライバーである。対照としてDMSOを投与した。結果を図42に示す。図中、「KIT」はc−kitを示し、「pKIT」はリン酸化c−kitを示し、「pAKT」はリン酸化AKTを示す。なお、一次抗体として、抗−c−Kit抗体(Ab81,Cell Signaling Technology製)、抗−ホスホc−Kit(Tyr719)抗体(Cell Signaling Technology製)、抗−Akt抗体(Cell Signaling Technology製)、抗−ホスホ−Akt抗体(Ser473)(Cell Signaling Technology製)、抗−Mitf抗体(Cosmo Bio製)、抗−GAPDH抗体(0411,Santa Cruz Biotechnology, Inc.製)を用いた。二次抗体として、ECLTM抗−マウスIgG西洋ワサビペルオキシダーゼ結合whole抗体(GE Healthcare製)、ECLTM抗−ウサギIgG結合whole抗体(GE Healthcare製)を用いた。
種々の濃度の各種薬剤(Chb−M’、またはクロラムブシル)を培地に加え、p53変異型大腸癌細胞株HT29(JCRB細胞バンクより購入)を72時間インキュベートした。Cell Count Reagent SF(nacalai tesque, Inc.)およびInfinite(登録商標)200 PROマルチモードリーダー(TECAN)を用いて、72時間の細胞生存率を計測し(図43)、IC50値(50%生存率)を計測した(SF試薬を用いたMTSアッセイ)(表5)。図43から明らかなように、Chb−M’は、HT29細胞の増殖を抑制した。
(1)細胞増殖阻害試験
種々の濃度の各種薬剤(Chb−M’、Chb−S、クロラムブシル、またはエンタルザミド(Entaluzamide))を培地に加え、前立腺癌細胞株PC−3(p53null/PTEN del/アンドロゲン非依存性)(ATCCより購入)、DU−145(アンドロゲン非依存性)(JCRB細胞バンクより購入)、およびLNCaP(アンドロゲン依存性)(ATCCより購入)を48時間インキュベートした。Cell Count Reagent SF(nacalai tesque, Inc.)およびInfinite(登録商標)200 PROマルチモードリーダー(TECAN)を用いて、48時間の細胞生存率を計測し、IC50値(50%生存率)を計測した(SF試薬を用いたMTSアッセイ)。結果を図44および表6に示す。
前立腺癌細胞株PC−3に、5μMのChb−M’を投与し、6時間後、qRT−PCR(上記「リアルタイム定量PCR(qRT−PCR)」参照)により、前立腺癌細胞増殖に重要な遺伝子であるGATA2、E2F5、およびAR(アンドロゲン受容体)のmRNA量を評価した。対照としてDMSOを投与した。結果を図45に示す。図中、DMSO処理群でのGATA2、E2F5、およびARのmRNA発現量を1とした場合の相対値を示す。図45から明らかなように、Chb−M’により、GATA2、E2F5、およびARの発現が転写レベルで抑制された。
PC−3細胞に、3μMのChb−M’を投与し、48時間後および72時間後に、PI−AnnexinVアポトーシス染色にて、アポトーシスのパーセントを調べた。対照として、DMSOを投与した。その結果、Chb−M’の濃度依存的にアポトーシスの比率が増大した(図46)。
(1)細胞増殖試験
種々の濃度の各種薬剤(Chb−M’、Chb−S、またはクロラムブシル)を培地に加え、髄芽腫細胞株DAOY(SHH,TP53変異型)を48時間インキュベートした。Cell Count Reagent SF(nacalai tesque, Inc.)およびInfinite(登録商標)200 PROマルチモードリーダー(TECAN)を用いて、48時間の細胞生存率を計測し、IC50値(50%生存率)を計測した(SF試薬を用いたMTSアッセイ)。結果を図47および表7に示す。図47から明らかなように、Chb−M’は、髄芽腫細胞株の増殖を劇的に抑制した。また、Chb−M’は他の試薬と比べて遙かに小さいIC50値(0.812μM)を示した。
髄芽腫細胞株DAOYに、1μMのChb−M’を投与し、6時間後、qRT−PCR(上記「リアルタイム定量PCR(qRT−PCR)」参照)により、髄芽腫瘍に重要な癌促進因子ROR1およびROR2のmRNA量を評価した。対照としてDMSOを投与した。結果を図48に示す。図中、DMSO処理群でのROR1およびROR2のmRNA発現量を1とした場合の相対値を示す。図48から明らかなように、Chb−M’により、RORファミリーの発現が転写レベルで抑制された。
Chb−M’、またはATRA(all−transレチノイン酸:ビタミンA誘導体)を培地に加え、p53変異型APL細胞株 NB4(DSMZ(Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen)より購入)またはp53−null APL細胞株 UF1(慶応大学医学部血液・腫瘍内科より供与)を48時間または72時間インキュベートした。Cell Count Reagent SF(nacalai tesque, Inc.)およびInfinite(登録商標)200 PROマルチモードリーダー(TECAN)を用いて、細胞生存率を計測し、IC50値(50%生存率)を計測した(SF試薬を用いたMTSアッセイ)。結果を図50−1および図50−2ならびに表8に示す。なお、ATRAは、APLの一般臨床においてファーストラインで使用される治療薬である。
SEQ ID NO:2: Reverse primer for amplification of GAPDH gene
SEQ ID NO:3: Forward primer for amplification of BCL11A gene
SEQ ID NO:4: Reverse primer for amplification of BCL11A gene
SEQ ID NO:5: Forward primer for amplification of TRIM24 gene
SEQ ID NO:6: Reverse primer for amplification of TRIM24 gene
SEQ ID NO:7: Forward primer for amplification of IL3 gene
SEQ ID NO:8: Reverse primer for amplification of IL3 gene
SEQ ID NO:9: Forward primer for amplification of CSF2RB gene
SEQ ID NO:10: Reverse primer for amplification of CSF2RB gene
SEQ ID NO:11: Forward primer for amplification of p53 gene
SEQ ID NO:12: Reverse primer for amplification of p53 gene
SEQ ID NO:13: Forward primer for amplification of CSF2 gene
SEQ ID NO:14: Reverse primer for amplification of CSF2 gene
SEQ ID NO:15: Forward primer for amplification of p21 gene
SEQ ID NO:16: Reverse primer for amplification of p21 gene
SEQ ID NO:17: Forward primer for amplification of BAX gene
SEQ ID NO:18: Reverse primer for amplification of BAX gene
SEQ ID NO:19: Forward primer for amplification of PUMA gene
SEQ ID NO:20: Reverse primer for amplification of PUMA gene
SEQ ID NO:21: Forward primer for amplification of MDM2 gene
SEQ ID NO:22: Reverse primer for amplification of MDM2 gene
SEQ ID NO:23: Forward primer for amplification of RUNX1 gene
SEQ ID NO:24: Reverse primer for amplification of RUNX1 gene
SEQ ID NO:25: Forward primer for amplification of RUNX2 gene
SEQ ID NO:26: Reverse primer for amplification of RUNX2 gene
SEQ ID NO:27: Forward primer for amplification of RUNX3 gene
SEQ ID NO:28: Reverse primer for amplification of RUNX3 gene
SEQ ID NO:29: Forward primer for amplification of Pan RUNX gene
SEQ ID NO:30: Reverse primer for amplification of Pan RUNX gene
SEQ ID NO:31: Forward primer for amplification of CBFB gene
SEQ ID NO:32: Reverse primer for amplification of CBFB gene
Claims (14)
- DNA上のRUNX結合配列に結合して、RUNXファミリーメンバーの該結合配列への結合を阻害する、RUNX阻害剤。
- RUNX結合配列に結合するピロール−イミダゾールポリアミドを含む、請求項1記載のRUNX阻害剤。
- 作用剤およびピロール−イミダゾールポリアミドの複合体を含むRUNX阻害剤であって、該ピロール−イミダゾールポリアミドがRUNX結合配列に結合する、請求項2記載のRUNX阻害剤。
- 作用剤およびピロール−イミダゾールポリアミドの複合体が式I:
式II:
X1はCHまたはNを示し、X2はCHまたはNを示し、X3はCHまたはNを示し、X4はCHまたはNを示し、X5はCHまたはNを示し、X6はCHまたはNを示し、X7はCHまたはNを示し、X8はCHまたはNを示し、
Yは、アミド結合、ホスホジスルフィド結合、エステル結合、配位結合、またはエーテル結合を示すか、あるいはこれらの結合の1種類以上を形成する官能基を含む部分を示し、mは0〜5の整数を示し、
R1はHまたはアルキル基を示し、R2はHまたはアルキル基を示し、R3はHまたはアルキル基を示し、R4はHまたはアルキル基を示し、R5はHまたはアルキル基を示し、R6はHまたはアルキル基を示し、R7はHまたはアルキル基を示し、R8はHまたはアルキル基を示し、
R9はHまたはNHR11を示し、R10はHまたはNHR11を示し、
R11はH、ビオチン、または蛍光基を示し、
Rは作用剤を示し、
nは、0、1、2、3、4、または5を示す。]
によって示される化合物からなる群から選ばれる、請求項3記載のRUNX阻害剤。 - 作用剤がアルキル化剤である、請求項3または4記載のRUNX阻害剤。
- アルキル化剤がクロラムブシル、デュオカルマイシン、seco−CBI(1−クロロメチル−5−ヒドロキシ−1,2−ジヒドロ−3H−ベンゾ[e]インドール)、ピロロベンゾジアゼピン、およびナイトロジェンマスタードからなる群から選択される、請求項5記載のRUNX阻害剤。
- アルキル化剤がクロラムブシルである、請求項6記載のRUNX阻害剤。
- RUNXファミリーの全てのメンバーのRUNX結合配列への結合を阻害する、請求項1〜8のいずれか1項記載のRUNX阻害剤。
- 請求項1〜9のいずれか1項記載のRUNX阻害剤を含む、医薬組成物。
- 抗腫瘍剤である、請求項10記載の医薬組成物。
- 抗アレルギー剤である、請求項10記載の医薬組成物。
- 他の抗腫瘍剤と組み合わせて使用される、請求項11記載の医薬組成物。
- 白血病、リンパ腫、多発性骨髄腫、肺癌、食道癌、胃癌、大腸癌、腎細胞癌、神経芽細胞腫、皮膚癌、乳癌、前立腺癌および脳腫瘍からなる群から選択される1以上を予防または治療するための、請求項11または13記載の医薬組成物。
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