JPWO2014157704A1 - Erap1によるトリミング機能をきっかけとしたコンジュゲートワクチン - Google Patents
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Abstract
Description
具体的には、上記課題の解決策を検討する過程で、異なる2つの癌抗原ペプチドを複合化する際に、必要なシステインを、MHCクラスIへの抗原提示に影響することなく、N−末端またはC−末端へ任意の位置へ導入する方法を着想した。更なる検討の結果、癌抗原ペプチドのN末端にシステインを含む0〜5個のアミノ酸を導入したペプチドや、当該ペプチドのシステインを介したジスルフィド結合を含むコンジュゲート体を創製した。そして、当該ペプチドやコンジュゲート体が、in vitroおよび/またはin vivoでERAP1によるトリミングを受け易く、その結果癌抗原ペプチドを生成することを、本発明者らが初めて確認し、本発明が完成された。
製造容易で、汎用性に優れ、かつCTLを効率良く誘導する新規な多価抗原ペプチド提示型ペプチド癌ワクチンの開発が望まれていたところ、本発明者らが発明したコンジュゲート体により、CTLが効率よく誘導され、物理化学的性質に優れ、製造が容易で、製造の管理も容易で、汎用性に優れた多価抗原ペプチド提示型ペプチド癌ワクチンを開発することが可能となった。
癌抗原ペプチドAは、7〜30残基のアミノ酸からなるMHCクラスI拘束性癌抗原ペプチドを表し、癌抗原ペプチドAのN末端アミノ酸のアミノ基が式(1)中のYaと結合し、癌抗原ペプチドAのC末端アミノ酸のカルボニル基が式(1)中の水酸基と結合し、
R1は、水素原子、式(2):
癌抗原ペプチドBは、癌抗原ペプチドAとは配列が異なり且つ7〜30残基のアミノ酸からなるMHCクラスI拘束性癌抗原ペプチドまたは7〜30残基のアミノ酸からなるMHCクラスII拘束性癌抗原ペプチドを表し、癌抗原ペプチドBのN末端アミノ酸のアミノ基が式(2)中のYbと結合し、癌抗原ペプチドBのC末端アミノ酸のカルボニル基が式(2)中の水酸基と結合し、
式(2)中のチオエーテル基が、式(1)中のチオエーテル基と結合する。)
で表される基、式(3):
癌抗原ペプチドCは、7〜30残基のアミノ酸からなるMHCクラスII拘束性癌抗原ペプチドを表し、癌抗原ペプチドCのC末端アミノ酸のカルボニル基が式(3)中のXcと結合し、癌抗原ペプチドCのN末端アミノ酸のアミノ基が式(3)中の水素原子と結合し、
式(3)中のチオエーテル基が、式(1)中のチオエーテル基と結合する。)
で表される基、または癌抗原ペプチドDを表し、
癌抗原ペプチドDは、1つのシステイン残基を含む7〜30残基のアミノ酸からなるMHCクラスI拘束性癌抗原ペプチドまたは1つのシステイン残基を含む7〜30残基のアミノ酸からなるMHCクラスII拘束性癌抗原ペプチドを表し、癌抗原ペプチドDのシステイン残基のチオエーテル基が式(1)中のチオエーテル基と結合する。
但し、R1が水素原子である場合、式(1)で表される化合物の配列は癌抗原タンパク質の部分配列と同一ではない。]
で表される化合物、またはその薬学上許容される塩;
NYKHCFPEI (配列番号:3)、
EYLQLVFGI (配列番号:11)、
FLWGPRALV (配列番号:13)、
GLYDGMEHL (配列番号:19)、
SLLMWITQCFL (配列番号:26)、
QLSLLMWIT (配列番号:27)、
AAGIGILTV (配列番号:29)、
LIYRRRLMK (配列番号:33)、
YMDGTMSQV (配列番号:40)、
AFLPWHRLF (配列番号:41)、
VLQELNVTV (配列番号:43)、
YLSGANLNL (配列番号:50)、
KIFGSLAFL (配列番号:53)、
AYIDFEMKI (配列番号:66)、
AYACNTSTL (配列番号:83)、
KWFPSCQFLL (配列番号:84)および
GYDQIMPKK (配列番号:85)
の中から選ばれるいずれかのアミノ酸配列を含むペプチドであるか、または配列番号:3、11、13、19、26、27、29、33、40、41、43、50、53、66、83、84および85の中から選ばれるいずれかのアミノ酸配列中にアミノ酸残基の改変を含有する改変アミノ酸配列を含み且つCTL誘導活性を有するペプチドである、項1〜8のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学上許容される塩;
GLYDGMEHL (配列番号:19)、
VLQELNVTV (配列番号:43)および
KIFGSLAFL (配列番号:53)
の中から選ばれるいずれかのアミノ酸配列からなるペプチドである、項1〜9のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学上許容される塩;
CAGLYDGMEHL (配列番号:89)、
CLGLYDGMEHL (配列番号:90)、
CMGLYDGMEHL (配列番号:91)、
CAVLQELNVTV (配列番号:92)、
CLVLQELNVTV (配列番号:93)、
CMVLQELNVTV (配列番号:94)、
CAKIFGSLAFL (配列番号:95)、
CLKIFGSLAFL (配列番号:96)および
CMKIFGSLAFL (配列番号:97)
の中から選ばれるいずれかのアミノ酸配列からなるペプチドである、項1〜3および6〜11のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学上許容される塩;
CGLYDGMEHL (配列番号:98)、
CVLQELNVTV (配列番号:99)および
CKIFGSLAFL (配列番号:100)
の中から選ばれるいずれかのアミノ酸配列からなるペプチドである、項1〜11のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学上許容される塩;
NYKHCFPEI (配列番号:3)、
EYLQLVFGI (配列番号:11)、
FLWGPRALV (配列番号:13)、
GLYDGMEHL (配列番号:19)、
SLLMWITQCFL (配列番号:26)、
QLSLLMWIT (配列番号:27)、
AAGIGILTV (配列番号:29)、
LIYRRRLMK (配列番号:33)、
YMDGTMSQV (配列番号:40)、
AFLPWHRLF (配列番号:41)、
VLQELNVTV (配列番号:43)、
YLSGANLNL (配列番号:50)、
KIFGSLAFL (配列番号:53)、
AYIDFEMKI (配列番号:66)、
AYACNTSTL (配列番号:83)、
KWFPSCQFLL (配列番号:84)および
GYDQIMPKK (配列番号:85)
の中から選ばれるいずれかのアミノ酸配列を含むペプチドであるか、または配列番号:3、11、13、19、26、27、29、33、40、41、43、50、53、66、83、84および85の中から選ばれるいずれかのアミノ酸配列中にアミノ酸残基の改変を含有する改変アミノ酸配列を含み且つCTL誘導活性を有するペプチドである、項1〜10および14〜22のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学上許容される塩;
GLYDGMEHL (配列番号:19)、
VLQELNVTV (配列番号:43)および
KIFGSLAFL (配列番号:53)
の中から選ばれるいずれかのアミノ酸配列からなるペプチドである、項1〜10および14〜23のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学上許容される塩;
で表される化合物、または式(5):
で表される化合物である、項1〜10および14〜24のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学上許容される塩;
癌抗原ペプチドEは、7〜30残基のアミノ酸からなるMHCクラスII拘束性癌抗原ペプチドを表し、癌抗原ペプチドEのC末端アミノ酸のカルボニル基が式(20)中のXeと結合し、癌抗原ペプチドEのN末端アミノ酸のアミノ基が式(20)中の水素原子と結合する。)
中のチオエーテル基と結合している、項1〜10、14〜15のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学上許容される塩;
NYKHCFPEI (配列番号:3)、
EYLQLVFGI (配列番号:11)、
FLWGPRALV (配列番号:13)、
GLYDGMEHL (配列番号:19)、
SLLMWITQCFL (配列番号:26)、
QLSLLMWIT (配列番号:27)、
AAGIGILTV (配列番号:29)、
LIYRRRLMK (配列番号:33)、
YMDGTMSQV (配列番号:40)、
AFLPWHRLF (配列番号:41)、
VLQELNVTV (配列番号:43)、
YLSGANLNL (配列番号:50)、
KIFGSLAFL (配列番号:53)、
AYIDFEMKI (配列番号:66)、
AYACNTSTL (配列番号:83)、
KWFPSCQFLL (配列番号:84)および
GYDQIMPKK (配列番号:85)
の中から選ばれるいずれかのアミノ酸配列を含むペプチドであるか、または配列番号:3、11、13、19、26、27、29、33、40、41、43、50、53、66、83、84および85の中から選ばれるいずれかのアミノ酸配列中にアミノ酸残基の改変を含有する改変アミノ酸配列を含み且つCTL誘導活性を有するペプチドである、項26〜31のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学上許容される塩;
GLYDGMEHL (配列番号:19)、
VLQELNVTV (配列番号:43)および
KIFGSLAFL (配列番号:53)
の中から選ばれるいずれかのアミノ酸配列からなるペプチドである、項26〜32のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学上許容される塩;
AKFVAAWTLKAAA (配列番号:101)および
aKFVAAWTLKAAa (配列番号:102)
の中から選ばれるいずれかのアミノ酸配列を含むペプチドであるか、または配列番号:101および102の中から選ばれるいずれかのアミノ酸配列中にアミノ酸残基の改変を含有する改変アミノ酸配列を含み且つヘルパーT細胞誘導活性を有するペプチドである、項26〜40のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学上許容される塩;
AKFVAAWTLKAAA (配列番号:101)および
aKFVAAWTLKAAa (配列番号:102)
の中から選ばれるいずれかのアミノ酸配列からなるペプチドである、項26〜41のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学上許容される塩;
で表される化合物、または式(21):
で表される化合物である、項1〜10、14〜15および26〜42のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学上許容される塩;
AKFVAAWTLKAAA (配列番号:101)および
aKFVAAWTLKAAa (配列番号:102)
の中から選ばれるいずれかのアミノ酸配列を含むペプチドであるか、または配列番号:101および102の中から選ばれるいずれかのアミノ酸配列中にアミノ酸残基の改変を含有する改変アミノ酸配列を含み且つヘルパーT細胞誘導活性を有するペプチドである、項1〜10、14〜18および44〜46のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学上許容される塩;
AKFVAAWTLKAAA (配列番号:101)および
aKFVAAWTLKAAa (配列番号:102)
の中から選ばれるいずれかのアミノ酸配列からなるペプチドである、項1〜10、14〜18および44〜47のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学上許容される塩;
で表される化合物、式(7):
で表される化合物、式(15):
で表される化合物、または式(16):
で表される化合物である、項1〜10、14〜18および44〜48のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学上許容される塩;
AKFVAAWTLKAAA (配列番号:101)および
aKFVAAWTLKAAa (配列番号:102)
の中から選ばれるいずれかのアミノ酸配列を含むペプチドであるか、または配列番号:101および102の中から選ばれるいずれかのアミノ酸配列中にアミノ酸残基の改変を含有する改変アミノ酸配列を含み且つヘルパーT細胞誘導活性を有するペプチドである、項1〜10および50〜57のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学上許容される塩;
AKFVAAWTLKAAA (配列番号:101)および
aKFVAAWTLKAAa (配列番号:102)
の中から選ばれるいずれかのアミノ酸配列からなるペプチドである、項1〜10および50〜58のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学上許容される塩;
で表される化合物、式(9):
で表される化合物、式(18):
で表される化合物、または式(17):
で表される化合物である、項1〜10および50〜59のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学上許容される塩;
VYGFVRACL (配列番号:87)および
SLLMWITQC (配列番号:88)
の中から選ばれるいずれかのアミノ酸配列を含むペプチドであるか、または配列番号:87および88の中から選ばれるいずれかのアミノ酸配列中にアミノ酸残基の改変を含有する改変アミノ酸配列を含み且つCTL誘導活性を有するペプチドである、項1〜10および61〜65のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学上許容される塩;
VYGFVRACL (配列番号:87)および
SLLMWITQC (配列番号:88)
の中から選ばれるいずれかのアミノ酸配列からなるペプチドである、項1〜10および61〜66のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学上許容される塩;
で表される化合物または式(11):
で表される化合物である、項1〜10および61〜67のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学上許容される塩;
aK−Cha−VAAWTLKAAa−Ahx−C (配列番号:103)
のアミノ酸配列を含むペプチドであるか、または配列番号:103のアミノ酸配列中にアミノ酸残基の改変を含有する改変アミノ酸配列を含み且つヘルパーT細胞誘導活性を有するペプチドである、項1〜10、61および69〜71のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学上許容される塩;
aK−Cha−VAAWTLKAAa−Ahx−C (配列番号:103)
のアミノ酸配列からなるペプチドである、項1〜10、61および69〜72のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学上許容される塩;
で表される化合物である、項1〜10、61および69〜73のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学上許容される塩;
AADHRQLQLSISSCLQQL (配列番号:104)、
RNGYRALMDKSLHVGTQCALTRR (配列番号:105)、
KKLQCVQLHVISM (配列番号:106)および
GSYVSRLLGICL (配列番号:107)
の中から選ばれるいずれかのアミノ酸配列を含むペプチドであるか、または配列番号:104、105、106および107の中から選ばれるいずれかのアミノ酸配列中にアミノ酸残基の改変を含有する改変アミノ酸配列を含み且つヘルパーT細胞誘導活性を有するペプチドである、項1〜10、61、69〜70および75のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学上許容される塩;
AADHRQLQLSISSCLQQL (配列番号:104)、
RNGYRALMDKSLHVGTQCALTRR (配列番号:105)、
KKLQCVQLHVISM (配列番号:106)および
GSYVSRLLGICL (配列番号:107)
の中から選ばれるいずれかのアミノ酸配列からなるペプチドである、項1〜10、61、69〜70および75〜76のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学上許容される塩;
(1)Fmoc−C(Mmt)A−SBnおよび1つのシステイン残基がN末端に結合している癌抗原ペプチドBを用いて、C(Mmt)AのC末端アミノ酸のカルボニル基と癌抗原ペプチドBのN末端に結合しているN末端アミノ酸のアミノ基が結合したペプチドを合成する工程であって、癌抗原ペプチドBが7〜15残基のアミノ酸からなるMHCクラスI拘束性癌抗原ペプチドを表す工程、
(2)前記工程(1)で得られたペプチドおよびSPy基で保護された1つのシステイン残基がN末端に結合している癌抗原ペプチドAを用いて、前記工程(1)で得られたペプチド中の癌抗原ペプチドBのN末端に結合しているシステイン残基のチオエーテル基と癌抗原ペプチドAのN末端に結合しているシステイン残基のチオエーテル基が結合したペプチドを合成する工程であって、癌抗原ペプチドAは、7〜30残基のアミノ酸からなるMHCクラスI拘束性癌抗原ペプチドを表す工程、および
(3)前記工程(2)で得られたペプチドおよびSPy基で保護された1つのシステイン残基がC末端に結合している癌抗原ペプチドEを用いて、前記工程(2)で得られたペプチド中の癌抗原ペプチドAのN末端に結合しているシステイン残基のチオエーテル基と癌抗原ペプチドEのC末端に結合しているシステイン残基のチオエーテル基が結合したペプチドを合成する工程であって、癌抗原ペプチドEは、7〜30残基のアミノ酸からなるMHCクラスII拘束性癌抗原ペプチドを表す工程、
に関する。
中でも、配列の異なる2つのMHCクラスI拘束性ペプチドのHLAのサブタイプに関し、A02タイプ(A−0201、A0206など)のペプチドとA24タイプ(A−2402など)のペプチドとと組み合わせ得られる本発明の化合物(コンジュゲート体)が、特に好ましい。欧米人(Caucasian)においては、HLA−A0201タイプまたはHLA−A0206タイプであるPopulationが約47%と最も多く、次いでHLA−A2402タイプが約13%であり、これらのタイプの総和は、重複(すなわち両方のタイプを有するヒトを二重に計算すること)を除くと約56%を占める(Human Immunol. 62:1009;2001)。一方日本人などにおいては、HLA−A2402であるPopulationが約60%と最も多く、次いでHLA−A0201またはHLA−A0206が約39%であり、これらのタイプの総和は、重複(すなわち両方のタイプを有するヒトを二重に計算すること)を除くと約81%を占める(www.bmdc.irc.or.jp/GF−A.htm)。従って、本発明の化合物の利点としては、具体的には、より大きなPopulationを一つの本発明の化合物でカバーするという利点、および必ずしも投与の事前に患者のHLAのサブタイプを選別することが必須ではなくなり得るという利点などが挙げられる。
また、本発明の化合物により、物理化学的性質や安定性に優れ、製造が容易な癌ワクチンの有効成分を提供することが可能となった。これにより、癌ワクチンの製剤化も容易となった。
具体的には、物理化学的性質としては、溶解度、溶液の粘度、これに伴う精製の容易さ、凍結乾燥後の取り扱い易さ、これに伴う精製の容易さなどが挙げられる。安定性として、塩置換した後の安定性、吸湿性、熱安定性、エマルション形成後の安定性などが挙げられる。さらに薬理活性としては、癌ワクチンとしての薬効、API(Active Pharmaceutical Ingredient、医薬品有効成分)によって生じる違い、製剤中の添加剤との相互作用などが挙げられる。このうちAPIによって生じる違いとは、APIによる癌ワクチンとしての違いであり、具体的には、溶解度が大きく異なる2つのAPIにおいては、溶解度が小さいAPIの場合析出し易く、医薬品には必須要件であるメンブランフィルターの濾過による滅菌処理ができなくなる可能性が十分予想される。または、辛うじて溶解度が小さいAPIの濾過による滅菌処理を行っても、濾液に含まれるAPIの量が大きく減少し、癌ワクチンとして必須のCTL誘導能も著しく低下すると考えられる。よって、溶解度が小さいAPIでは、生産上の効率が著しく低下するというデメリットが容易に予想される。
AlaまたはA:アラニン残基
a:D−アラニン残基
ArgまたはR:アルギニン残基
AsnまたはN:アスパラギン残基
AspまたはD:アスパラギン酸残基
CysまたはC:システイン残基
GlnまたはQ:グルタミン残基
GluまたはE:グルタミン酸残基
GlyまたはG:グリシン残基
HisまたはH:ヒスチジン残基
IleまたはI:イソロイシン残基
LeuまたはL:ロイシン残基
LysまたはK:リジン残基
MetまたはM:メチオニン残基
PheまたはF:フェニルアラニン残基
ProまたはP:プロリン残基
SerまたはS:セリン残基
ThrまたはT:スレオニン残基
TrpまたはW:トリプトファン残基
TyrまたはY:チロシン残基
ValまたはV:バリン残基
Abu:2−アミノ酪酸残基(α−アミノ酪酸残基とも言う)
Orn:オルニチン残基
Cit:シトルリン残基
Cha:シクロヘキシルアラニン残基(Cyclohexylalanine残基)
Ahx:2−アミノヘキサン酸残基(2−Aminohexanoic acid残基)
本発明の化合物において、たとえば式(4)〜(12)で表される化合物において、その部分構造にあたるペプチドについても、特に断りの無い限り、N末端アミノ酸のアミノ酸残基のアミノ基は水素原子と結合し、C末端アミノ酸のアミノ酸残基のカルボニル基は水酸基と結合している。
当該和の整数として、好ましくは0〜2が挙げられ、より好ましくは0〜1が挙げられ、最も好ましくは0が挙げられる。すなわち、XaおよびYaとしては、共に単結合である場合が最も好ましい。
当該和の整数が2である場合としては、Xaが2残基のアミノ酸からなるペプチドの二価基であり且つYaが単結合である場合、XaおよびYaが独立して1残基のアミノ酸からなるペプチドの二価基である場合、またはXaが単結合であり且つYaが2残基のアミノ酸からなるペプチドの二価基である場合が挙げられる。
当該和の整数が1である場合としては、Xaが1残基のアミノ酸からなるペプチドの二価基であり且つYaが単結合である場合、またはXaが単結合であり且つYaが1残基のアミノ酸からなるペプチドの二価基である場合が挙げられる。このうち好ましくは、Xaが単結合であり且つYaがアラニン残基、ロイシン残基またはメチオニン残基である場合、あるいははXaがアラニン残基、グリシン残基、セリン残基またはチロシン残基であり且つYaが単結合である場合が挙げられる。
HLAの各サブタイプについて、多型(対立遺伝子)が知られている。HLA−Aの多型としては、HLA−A1、HLA−A0201、HLA−A24などの27種以上が挙げられ、HLA−Bの多型としては、HLA−B7、HLA−B40、HLA−B4403などの59種以上が挙げられ、HLA−Cwの多型としては、HLA−Cw0301、HLA−Cw0401、HLA−Cw0602などの10種以上が挙げられる。これら多型の中、好ましくは、HLA−A0201やHLA−A24が挙げられる。
但し、本発明における「癌抗原ペプチド」には、ヒトWT1タンパク質(Cell,60:509,1990、GenBank Acc.No.A38080)は含まれない。すなわち、本発明の化合物においては、癌抗原ペプチドA、癌抗原ペプチドB、癌抗原ペプチドC、または/および癌抗原ペプチドDが、WT1タンパク質由来の癌抗原ペプチドではない。癌抗原ペプチドA、癌抗原ペプチドB、癌抗原ペプチドCまたは癌抗原ペプチドDがWT1タンパク質由来の癌抗原ペプチドではないことがより好ましく、癌抗原ペプチドA、癌抗原ペプチドB、癌抗原ペプチドCおよび癌抗原ペプチドDが、WT1タンパク質由来の癌抗原ペプチドではないことがさらに好ましい。
具体的には、前記の項1に示した式(1)で表される化合物において、癌抗原ペプチドAが癌抗原タンパク質のアミノ酸配列において連続する7〜30残基のアミノ酸からなるMHCクラスI拘束性癌抗原ペプチドであり且つWT1タンパク質由来の癌抗原ペプチドとは異なり、R1が式(2)で表される基である場合、癌抗原タンパク質のアミノ酸配列において連続する7〜30残基のアミノ酸からなるMHCクラスIまたはMHCクラスII拘束性癌抗原ペプチドであり且つWT1タンパク質由来の癌抗原ペプチドとは異なり、R1が式(3)で表される基である場合、癌抗原ペプチドCが癌抗原タンパク質のアミノ酸配列において連続する7〜30残基のアミノ酸からなるMHCクラスII拘束性癌抗原ペプチドであり且つWT1タンパク質由来の癌抗原ペプチドとは異なり、またR1が癌抗原ペプチドDである場合、癌抗原ペプチドDが癌抗原タンパク質のアミノ酸配列において連続する7〜30残基のアミノ酸からなるMHCクラスIまたはMHCクラスII拘束性癌抗原ペプチドであり且つWT1タンパク質由来の癌抗原ペプチドとは異なることが好ましい。
表1中の配列番号:8のペプチドと配列番号:9のペプチドは、同じアミノ酸配列からなる同一のペプチドである。当該ペプチドは、HLA−Cw3拘束性癌抗原ペプチドであり、またHLA−Cw16拘束性癌抗原ペプチドでもある。
NYKHCFPEI (配列番号:3)、
EYLQLVFGI (配列番号:11)、
FLWGPRALV (配列番号:13)、
GLYDGMEHL (配列番号:19)、
SLLMWITQCFL (配列番号:26)、
QLSLLMWIT (配列番号:27)、
AAGIGILTV (配列番号:29)、
LIYRRRLMK (配列番号:33)、
YMDGTMSQV (配列番号:40)、
AFLPWHRLF (配列番号:41)、
VLQELNVTV (配列番号:43)、
YLSGANLNL (配列番号:50)、
KIFGSLAFL (配列番号:53)、
AYIDFEMKI (配列番号:66)、
AYACNTSTL (配列番号:83)、
KWFPSCQFLL (配列番号:84)、
GYDQIMPKK (配列番号:85)、
VYGFVRACL (配列番号:87)および
SLLMWITQC (配列番号:88)
の中から選ばれるいずれかのアミノ酸配列を含むペプチド、または配列番号:3、11、13、19、26、27、29、33、40、41、43、50、53、66、83、84、85、87および88の中から選ばれるいずれかのアミノ酸配列中にアミノ酸残基の改変を含有する改変アミノ酸配列を含み且つCTL誘導活性を有するペプチドが挙げられる。「MHCクラスI拘束性癌抗原ペプチド」として、配列番号:3、11、13、19、26、27、29、33、40、41、43、50、53、66、83、84、85、87および88の中から選ばれるいずれかのアミノ酸配列からなるペプチドがより好ましく、配列番号:19、43および53の中から選ばれるいずれかのアミノ酸配列からなるペプチドが更により好ましい。
で表される化合物すなわちペプチドである。
CAGLYDGMEHL (配列番号:89)、
CLGLYDGMEHL (配列番号:90)、
CMGLYDGMEHL (配列番号:91)、
CAVLQELNVTV (配列番号:92)、
CLVLQELNVTV (配列番号:93)、
CMVLQELNVTV (配列番号:94)、
CAKIFGSLAFL (配列番号:95)、
CLKIFGSLAFL (配列番号:96)および
CMKIFGSLAFL (配列番号:97)
の中から選ばれるいずれかのアミノ酸配列からなるペプチドが好ましく、さらに配列番号:89〜91の中から選ばれるいずれかのアミノ酸配列からなるペプチドが更により好ましい。
CGLYDGMEHL (配列番号:98)、
CVLQELNVTV (配列番号:99)および
CKIFGSLAFL (配列番号:100)
の中から選ばれるいずれかのアミノ酸配列からなるペプチドも好ましく、さらに配列番号:98のアミノ酸配列からなるペプチドが更により好ましい。
当該和の整数として、好ましくは0〜2が挙げられ、より好ましくは0〜1が挙げられ、最も好ましくは0が挙げられる。すなわち、XbおよびYbとしては、共に単結合である場合が最も好ましい。
当該和の整数が2である場合としては、Xbが2残基のアミノ酸からなるペプチドの二価基であり且つYbが単結合である場合、XbおよびYbが独立して1残基のアミノ酸からなるペプチドの二価基である場合、またはXbが単結合であり且つYbが2残基のアミノ酸からなるペプチドの二価基である場合が挙げられる。
当該和の整数が1である場合としては、Xbが1残基のアミノ酸からなるペプチドの二価基であり且つYbが単結合である場合、またはXbが単結合であり且つYbが1残基のアミノ酸からなるペプチドの二価基である場合が挙げられる。このうち好ましくは、Xbが単結合であり且つYbがアラニン残基、ロイシン残基またはメチオニン残基である場合である場合が挙げられる。
癌抗原ペプチドAと癌抗原ペプチドBが同時に同じペプチドであることはないことから、R1が前記の式(2)で表される基である式(1)の化合物は、仮にXaおよびXbが同じで且つYaおよびYbが同じであっても、ホモダイマーではなく、ヘテロダイマーである。ホモダイマーは、同じペプチド単量体が二量体化された二量体を意味し、ヘテロダイマーは、異なるペプチド単量体が二量体化された二量体を意味する。
で表される化合物または式(5):
で表される化合物が挙げられる。
当該和の整数として、好ましくは0〜2が挙げられ、より好ましくは0〜1が挙げられ、最も好ましくは0が挙げられる。すなわち、XeおよびYeとしては、共に単結合である場合が最も好ましい。
当該和の整数が2である場合としては、Xeが2残基のアミノ酸からなるペプチドの二価基であり且つYeが単結合である場合、XeおよびYeが独立して1残基のアミノ酸からなるペプチドの二価基である場合、またはXeが単結合であり且つYeが2残基のアミノ酸からなるペプチドの二価基である場合が挙げられる。
当該和の整数が1である場合としては、Xeが1残基のアミノ酸からなるペプチドの二価基であり且つYeが単結合である場合、またはXeが単結合であり且つYeが1残基のアミノ酸からなるペプチドの二価基である場合が挙げられる。このうち好ましくは、Xeが単結合であり且つYeがアラニン残基、ロイシン残基またはメチオニン残基である場合が挙げられる。
AKFVAAWTLKAAA (配列番号:101)および
aKFVAAWTLKAAa (配列番号:102)
の中から選ばれるいずれかのアミノ酸配列からなるペプチドが挙げられる。
で表される化合物、または式(21):
で表される化合物が挙げられる。
当該「アミノ酸配列を含む」は、前記と同義である「アミノ酸配列中にアミノ酸残基の改変を含有する改変アミノ酸配列を含み且つヘルパーT細胞誘導活性を有するペプチド」は、「改変ヘルパーペプチド」とも呼ばれる。当該改変ヘルパーペプチドは、アミノ酸配列において、1〜3個のアミノ酸が、欠失、置換および/または付加されたアミノ酸配列からなり、MHCクラスIIに結合し、ヘルパーT細胞を誘導するペプチドを意味する。付加(挿入も包含される)されるアミノ酸の数は好ましくは1〜3である。欠失されるアミノ酸の数は好ましくは1〜5である。改変において、付加されるアミノ酸または置換されるアミノ酸は、遺伝子によりコードされる20種類のアミノ酸以外の非天然アミノ酸であってもよい。
で表される化合物、式(7):
で表される化合物、式(15):
で表される化合物、または式(16):
で表される化合物が挙げられる。
当該和の整数として、好ましくは0〜2が挙げられ、より好ましくは0〜1が挙げられ、最も好ましくは0が挙げられる。すなわち、XcおよびYcとしては、共に単結合である場合が最も好ましい。
当該和の整数が2である場合としては、Xcが2残基のアミノ酸からなるペプチドの二価基であり且つYcが単結合である場合、XcおよびYcが独立して1残基のアミノ酸からなるペプチドの二価基である場合、またはXcが単結合であり且つYcが2残基のアミノ酸からなるペプチドの二価基である場合が挙げられる。
当該和の整数が1である場合としては、Xcが1残基のアミノ酸からなるペプチドの二価基であり且つYcが単結合である場合、またはXcが単結合であり且つYcが1残基のアミノ酸からなるペプチドの二価基である場合が挙げられる。このうち好ましくは、Xcが単結合であり且つYcがアラニン残基、ロイシン残基またはメチオニン残基である場合である場合が挙げられる。
本発明における「癌抗原ペプチドC」が7〜30残基のアミノ酸からなるMHCクラスII拘束性癌抗原ペプチドである場合、アミノ酸残基数は、9〜15が好ましく、13〜15がより好ましい。癌抗原ペプチドCとしては、13〜15残基のアミノ酸からなるHLA−DR拘束性のユニバーサル癌抗原ペプチドがさらに好ましい。当該「HLA−DR拘束性のユニバーサル癌抗原ペプチド」については、前記と同義である。
で表される化合物、式(9):
で表される化合物、式(18):
で表される化合物、または式(17):
で表される化合物が挙げられる。
癌抗原ペプチドDは、1つのシステイン残基を含む7〜30残基のアミノ酸からなるMHCクラスI拘束性癌抗原ペプチドまたは1つのシステイン残基を含む7〜30残基のアミノ酸からなるMHCクラスII拘束性癌抗原ペプチドを表す。
VYGFVRACL (配列番号:87)および
SLLMWITQC (配列番号:88)
の中から選ばれるいずれかのアミノ酸配列を含むペプチド、または配列番号:87および88の中から選ばれるいずれかのアミノ酸配列中にアミノ酸残基の改変を含有する改変アミノ酸配列を含み且つCTL誘導活性を有するペプチドが挙げられ、最も好ましくは、配列番号:87および88の中から選ばれるいずれかのアミノ酸配列からなるペプチドが挙げられる。当該「アミノ酸配列を含む」および「アミノ酸配列中にアミノ酸残基の改変を含有する改変アミノ酸配列を含み且つCTL誘導活性を有するペプチド」は、前記と同義である。
で表される化合物または式(11):
で表される化合物が挙げられる。
で表される化合物が挙げられる。
例えば、Fmoc法もしくはBoc法を用いて固相合成機で製造する方法や、Boc−アミノ酸もしくはZ−アミノ酸を液相合成法で逐次縮合させて製造する方法が挙げられる(Fmocは9−フルオレニルメトキシカルボニル基、Bocはt−ブトキシカルボニル基、Zはベンジルオキシカルボニル基をそれぞれ表わす)。
本発明の化合物を製造するための中間体において、アミノ基、カルボキシ基、メルカプト基などの官能基は、必要に応じて保護、脱保護の技術を用い、適当な保護基で保護し、また脱保護することができる。好適な保護基、保護する方法、および脱保護する方法としては、「Protective Groups in Organic Synthesis 2nd Edition (John Wiley & Sons, Inc.;1990)」などに詳細に記載されている。たとえば、メルカプト基の保護基としてはアセトアミドメチル基またはトリチル基などが挙げられる。
ジスルフィド化合物の精製方法は、文献(ペプタイド・シンセシス(Peptide Synthesis),Interscience,New York,1966;ザ・プロテインズ(The Proteins),Vol 2,Academic Press Inc.,New York,1976;ペプチド合成,丸善(株),1975;ペプチド合成の基礎と実験、丸善(株),1985;医薬品の開発 続 第14巻・ペプチド合成,広川書店,1991)などに記載されている。中でも、HPLCが好ましい。
本発明の化合物は、その物理化学的性質においても、医薬品原薬として大量製造可能な性質を有する。具体的には、溶解性が高い、溶液中安定性に優れている、または濃縮された際にゲル化しにくいなどの性質を有し、逆相HPLCなどのカラムクロマトグラフィーによる精製工程で、大量スケールにおいても容易に高純度の化合物を原薬として製造することができる。
本発明の化合物は、癌免疫療法におけるCTL誘導剤の有効成分として、癌ワクチンの有効成分として、また医薬組成物の有効成分として有用である。すなわち本発明の化合物は、本明細書の実施例に示すとおり、優れた免疫原性を有し、優れたCTL誘導活性を効率よく示すことができる。また、本発明の化合物によって誘導されるCTLは、驚くべきことに、癌細胞が本来保有する癌抗原タンパクの天然型部分ペプチドを認識することができる。
CTL誘導活性は、HLAテトラマー法(Int.J.Cancer:100,565−570(2002))または限界希釈法(Nat.Med.:4,321−327(1998))によりCTLの数を測定することにより確認することができる。あるいは、例えばHLA−A24拘束性のCTL誘導活性の場合、国際公開第02/47474号およびInt.J.Cancer:100,565−570(2002)に記述されたHLA−A24モデルマウスを用いることなどにより調べることができる。
また本発明の化合物は、リポソーム製剤、直径数μm のビーズに結合させた粒子状の製剤、リピッドを結合させた製剤などにして投与することもできる。
さらに本発明の化合物(コンジュゲート体)は、MHCクラスII拘束性ペプチド(すなわちヘルパーペプチド)と共に投与することができる。共に投与する方法としては、コンジュゲート体とヘルパーペプチドを個別に投与することも可能であるが、一つの医薬組成物の中にコンジュゲート体とヘルパーペプチドを含むカクテル製剤(カクテル剤、カクテル)がより好ましい。本カクテル製剤は、MHCクラスI拘束性ペプチド(すなわちキラーペプチド)を生じ得るコンジュゲート体およびMHCクラスII拘束性ペプチド(すなわちヘルパーペプチド)を含むものである。よって、癌免疫療法における癌ワクチンとして、ヘルパーペプチドを含有した本カクテル製剤を投与することによって、CTLを含む他のT cellの機能亢進に重要であるヘルパーT細胞(helper T cell)の活性化も可能となり、コンジュゲート体の機能・薬効(細胞性免疫能など)を向上させることができる。
MHCクラスII拘束性ペプチド(すなわちヘルパーペプチド)については、本願明細書中に記載したとおりである。本カクテル製剤は、細胞性免疫能などの癌ワクチンとしての薬効が向上されたものであることを、一例として本願明細書の実施例や試験例として示したように、確認できた。
投与方法としては、皮内投与、皮下投与、筋肉内投与、静脈内投与、経皮投与などが挙げられる。CTLを効率良く誘導する皮内投与や皮下投与が好ましい。投与回数および投与間隔は、治療または予防目的の疾患、患者の個体差により適宜調整することができるが、通常複数回であり、数日ないし数月に1回投与するのが好ましい。
このような本発明の化合物を有効成分とする医薬組成物を癌抗原タンパク陽性の患者に投与することにより、癌を治療または予防するための方法を提供することができる。
以下のアミノ酸配列:
CKIFGSLAFL (配列番号:100)
からなるペプチドの合成
Fmoc−Leu−Alko−樹脂(Alkoはp−アルコキシベンジルアルコール)8.25g(渡辺化学製;0.77mmol/g)を1.0Lガラス製反応容器内に入れ、30%Pip(ピペリジン)/DMF(ジメチルホルムアミド)150mL溶液で処理(10分×1回、5分×2回:合計450mL)し、Fmoc基を除去した(工程1)。DMFおよびジエチルエーテルで樹脂を洗浄した後、Fmoc−Phe−OH 6.2g(5当量)、HBTU(O−ベンゾトリアゾール−1−イル−N,N,N’,N’−テトラメチルウロニウムヘキサフルオロホスファート)6.04g(5当量)およびHOBT(1−ヒドロキシベンゾトリアゾール)2.46g(5当量)を加え、次いでDMF 150mlとDIEA(N,N−ジイソプロピルエチルアミン)5.52ml(5当量)を加えて3時間室温撹拌を行った(工程2)。DMFで樹脂を2回洗浄し、Fmoc−Phe−Leu−Alko樹脂を合成した。
Fmoc−Ala−OH 5.14g、Fmoc−Leu−OH 5.69g、Fmoc−Ser(tBu)−OH 6.18g、Fmoc−Gly−OH 4.97g、Fmoc−Phe−OH 6.63g、Fmoc−Ile−OH 5.98g、Fmoc−Lys(Boc)−OH 7.83g。
但しFmoc−Ser(tBu)−OHについては工程2を3回繰り返して行った後、得られた樹脂をDMFで洗浄後、25%Ac2O(無水酢酸)を用いて、未反応のアミノ基をキャッピングした(15分×2回)。最後に、DMF洗浄操作を実施し、Fmoc-Lys(Boc)-Ile-Phe-Gly-Ser(tBu)-Leu-Ala-Phe-Leu-Alko-Resin 14.14gを得た。
上記操作によって得られた保護ペプチド樹脂Fmoc-Lys(Boc)-Ile-Phe-Gly-Ser(tBu)-Leu-Ala-Phe-Leu-Alko-Resin 503mgを25mlガラス製反応容器に入れ国産化学社製ロータリーシェーカーN−500で振とうしながら、工程1の脱保護操作を行い、H-Lys(Boc)-Ile-Phe-Gly-Ser(tBu)-Leu-Ala-Phe-Leu-Alko-Resinとした。Fmoc-Cys(tBu)-OH 340.4mgとHBTU 248.2mg、HOBT 92.9mgをDMF 10mlに溶解した溶液を加え、更にDIEA 0.2mlを加えて 3時間室温で振とうし、工程2のカップリング反応を行った。DMF 10mlで4回洗浄した後に、30%Pip/DMF 10mlで処理(10分×1回及び5分×2回)してFmoc基を切断した。TFAカクテル(2.5%テトライソプロピルシラン/2.5%ドデカンチオール/2.5%H2O/92.5%TFA溶液)100mlを加え、室温で2.0時間攪拌した。その後、ジエチルエーテルを加え、グラスフィルターで濾過を行い、TFAカクテルとジエチルエーテルを濾液として除いた。濾上物をジエチルエーテルで洗浄し、粗ペプチド(CKIFGSLAFL(配列番号:100))269.5mgを得た。
得られた粗ペプチド269.5mgを、1液=H2O/0.1%TFAと2液=CH3CN/0.1%TFAの溶出液で、2液=CH3CN/0.1%TFAの濃度を24.3%で平衡化しているDaiso社製 Daiso−Pak ODS 30 I.D.x250mmのカラムをセットしたHPLC(Shimadzu製;LC8AD型)にチャージした。220nmのUVでモニターしながら2液の濃度44.3%まで80分間で上昇させ、目的ペプチドを含む分画を集めた。得られた溶液を凍結乾燥することによって目的とする精製品49mgを得た。
ポンプ:Shimadzu製;LC−8A型
カラム:ODS Daiso−Pak ODS 30 I.D. cmφ×cmL
溶出液1:H2O/0.1%TFA
溶出液2:CH3CN/0.1%TFA
流速:20ml/min
カラム温度:40℃
検出:UV220nm
質量分析:LC−ESI/MS m/z =1098.9 [M+1]+(理論値=1098.4)
実施例1と同様の方法で、配列番号:95〜97、108〜123のアミノ酸配列からなる各ペプチドを合成した。表16〜17に、合成した各ペプチドの質量分析結果を示した。
表16〜17の何れのペプチドも、式(1)において、R1が水素原子であり、Xaが単結合であり、Yaが1残基のアミノ酸からなるペプチドの二価基であり、且つ癌抗原ペプチドAが癌抗原タンパクHER2/neuの部分ペプチドであるHER2/neu369-377ペプチド(KIFGSLAFL)(配列番号:53)である、本発明の化合物である。
実施例1と同様の方法で、配列番号:86のアミノ酸配列からなるペプチドを合成した。表18に、合成したペプチドの質量分析結果を示した。
配列番号:86のペプチドは、前記のとおり、本発明の化合物ではないことから、参考例1として記した。
実施例1と同様の方法で、配列番号:92〜94、99のアミノ酸配列からなる各ペプチドを合成した。表19に、合成した各ペプチドの質量分析結果を示した。
表19の何れのペプチドも、式(1)において、R1が水素原子であり、Xaが単結合であり、Yaが単結合または1残基のアミノ酸からなるペプチドの二価基であり、且つ癌抗原ペプチドAが癌抗原タンパクProteinase−3の部分ペプチドであるProteinase−3169-177ペプチド(VLQELNVTV)(配列番号:43)である本発明の化合物である。
実施例1と同様の方法で、配列番号:98、89〜91のアミノ酸配列からなる各ペプチドを合成した。表20に、合成した各ペプチドの質量分析結果を示した。
表20の何れのペプチドも、式(1)において、R1が水素原子であり、Xaが単結合であり、Yaが単結合または1残基のアミノ酸からなるペプチドの二価基であり、且つ癌抗原ペプチドAが癌抗原タンパクMAGE−A10の部分ペプチドであるMAGE−A10254-262ペプチド(GLYDGMEHL)(配列番号:19)である本発明の化合物である。
実施例1〜20にて合成したペプチドのN末端アミノ酸のトリミング効率をERAP1(PLoS One November 2008, vol.3, Issue 11, e3658)を用いて評価した。50μlのERAP1(50ng/ml)pH8.0 20mM Tris・HCl− 100mM NaCl バッファー(Tris・HClバッファー)溶液を142μlのTris・HClバッファーに加えた。2.5mMのペプチド水溶液8.0μlを上述のERAP1溶液に加えて、良く混和した後に室温で静置した。1.0時間後に50μlUFLC(分析条件は以下に示す。)に打ち込み、目的とするペプチドのAUCを求めた。トリミングによって得られるペプチドを別に化学的に合成し、酵素の無い同様の条件で分析して得られたAUCを基にして、トリミングによって得られたペプチド〔HER2/neu369-377ペプチド(KIFGSLAFL)(配列番号:53)〕の生成率を求め、表21に示した。
分析条件
ポンプ:Shimadzu社製 UFLC
カラム:Shim−pack XR−ODS 3.0mmi.d.x75mm
溶液:0.05% TFA H2O(A)― 0.05% TFA CH3CN(B)
オーブン温度:40℃
流速:1.0ml/min
検出波長:λ=220nm
グラジエント:0.0minから5.0minでB液濃度を10%から60%まで上昇
実施例1〜2、11〜12、21〜28にて合成した各ペプチドについて、ERAP1によるN末端アミノ酸のトリミングの時間経過による変化を評価した。20μlのERAP1(0.5mg/ml)Tris・HClバッファー溶液を172μlのTris・HClバッファーに加えた。10mMの各ペプチドのDMSO溶液8.0μlを上述のERAP1溶液に加えて、良く混和した後に室温で静置した。1.0、2.0、4.0および8.0時間後に50μlのサンプルを150μlのMeOHに加えて反応を停止し、25μlをUFLC(分析条件は以下に示す。)に打ち込み、目的とするペプチドのAUCを求めた。トリミングによって得られるペプチドを別に化学的に合成し、酵素の無い同様の条件で分析して得られたAUCを基にして、トリミングによって得られたペプチドの生成率を求め、表22に示した。
分析条件
ポンプ:Shimadzu社製 UFLC
カラム:Shim−pack XR−ODS 3.0mmi.d.x75mm
溶液:0.05% TFA H2O(A)― 0.05% TFA CH3CN(B)
オーブン温度:40℃
流速:1.0ml/min
検出波長:λ=220nm
グラジエント: 0.0minから5.0minでB液濃度を1.0%から70%まで上昇
目的とするペプチド:
ERAP1によるN末端アミノ酸のトリミングにより得られるペプチドは、
配列番号:100および95〜97の各ペプチドの場合、HER2/neu369-377ペプチド(KIFGSLAFL)(配列番号:53)であり、
配列番号:99および92〜94の各ペプチドの場合、Proteinase−3169-177ペプチド(VLQELNVTV)(配列番号:43)であり、また
配列番号:98および89〜91のペプチドの場合、MAGE−A10254-262ペプチド(GLYDGMEHL)(配列番号:19)である。
表23に示すシステイン(Cys)を延長した各ペプチド(Cys延長ペプチド)のCTL誘導能を、HLA−A0201遺伝子導入マウスを用いたin vivo CTL誘導試験によって評価した。
Cysを延長した各ペプチド(配列番号:100、99または98)の投与により、がん細胞に内因性に提示されるペプチド(配列番号:53、43または19)に対するCTLが誘導されるか否かは、Cysを延長したペプチド(配列番号:100、99または98)を投与した上記マウス由来の脾細胞をペプチド(配列番号:53、43または19)で再刺激を行った場合にIFNγを産生するか測定することで判断した。表24に示したがん細胞に内因性に提示されるペプチド(配列番号:53、43または19)は、本試験例においては、Cys非延長ペプチドともいう。
IFNγ ELISPOT assayの結果は図5〜7に示す。各図において、縦軸は播種細胞数中に反応した細胞数を示している。何れの図でも非パルスの場合の結果を示す白棒の値は、殆ど認められていない。このことはペプチド非再刺激ではそれぞれの遺伝子導入マウスの脾細胞は全く反応しなかったことを示している。即ち、色棒と白棒の値の差がin vitro再刺激時に利用したペプチドに特異的なCTLの数を示しており、各ペプチドの投与によってマウス生体内で誘導されたことを示す。ここで、色棒とは、Cys非延長ペプチドでパルスした場合の結果を示す黒棒、またはCys延長ペプチドでパルスした場合の結果を示す灰色棒を意味する。図5は配列番号:53あるいは100で示されるペプチドを投与した結果を、図6は配列番号:43あるいは99で示されるペプチドを投与した結果を、図7は配列番号:19あるいは98で示されるペプチドを投与した結果を示す。これより、HLA−A0201遺伝子導入マウス由来の脾細胞において、in vivo投与したペプチドのCysの延長の有無に関らずCys非延長ペプチドあるいはCys延長ペプチドによるin vitroの刺激に対して同程度のIFNγ産生が確認され、Cys延長ペプチド(配列番号:100、99および98)がin vivoにおいてCTL誘導能を持つことが判明した。即ち、Cys延長ペプチドの投与(配列番号:100、99または98)により、Cys非延長ペプチド(配列番号:53、43または19)を認識できるCTLを誘導し得ることが判明した。このことは、Cys延長ペプチドはがん細胞に内因性に提示されるペプチド(Cys非延長ペプチド)を認識するCTLを誘導できることを示しており、マウス生体内でCys延長ペプチドがERAP1による適切なトリミングを受けて、Cys非延長ペプチドへ実際に生成されることが強く示唆された。
式(4)
で表される化合物の合成
〔すなわち式(13):
実施例25で得たH-Cys-Gly-Leu-Tyr-Asp-Gly-Met-Glu-His-Leu-OH(配列番号:98)274mgの2.74mLの20%w/w酢酸水溶液に、2,2’-ビスピリジルジスルフィドのイソプロパノール溶液(0.2M)を1.20mL加えた後、室温にて30分攪拌した。反応液を逆相HPLCにて精製した。
ポンプ:Shimadzu製;LC−8A型
カラム:YMC ODS−A 3cmφ×25cmL, 10μm
溶出液1:H2O/0.1%TFA
溶出液2:CH3CN/0.1%TFA
流速:20ml/min
検出:UV220nm
2液濃度10%で平衡化させたカラムに当該反応液を注入した。その後10分間かけて、2液濃度を32%まで上昇させた後、更に2液濃度を1分間あたり0.25%の割合で上昇させた。目的物を含む画分を集め凍結乾燥を行うことで、H-Cys(Pys)-Gly-Leu-Tyr-Asp-Gly-Met-Glu-His-Leu-OH(すなわち式(13)で表される化合物)230mgを得た。
質量分析:LC−ESI/MS m/z =1246.7[M+H]1+ (理論値=1246.5)
〔すなわち式(4)
で表される化合物の合成〕
工程1で得たH-Cys(Pys)-Gly-Leu-Tyr-Asp-Gly-Met-Glu-His-Leu-OH(すなわち式(13)で表される化合物)27mgと実施例1で得たH-Cys-Lys-Ile-Phe-Gly-Ser-Leu-Ala-Phe-Leu-OH(配列番号:100)23mgとを混合し、20%v/v酢酸水を2mL加え、室温にて30分間攪拌した。反応液を逆相HPLCにて精製した。
ポンプ:Shimadzu製;LC−8A型
カラム:YMC ODS−A 3cmφ×25cmL, 10μm
溶出液1:H2O/0.1%TFA
溶出液2:CH3CN/0.1%TFA
流速:20ml/min
検出:UV220nm
2液濃度10%で平衡化させたカラムに当該反応液を注入した。その後2液濃度を10分間かけて34%まで上昇させた後、更に1分間あたり0.25%の割合で上昇させた。目的物を含む画分を集め凍結乾燥し、目的とする式(4)で表される化合物21mgを得た。
質量分析:LC−ESI/MS m/z =1118.0[M+2H]2+ (理論値=1117.8)
式(10)
で表される化合物の合成
質量分析:LC−ESI/MS m/z =1082.2[M+2H]2+ (理論値=1082.3)
で表される化合物は、前記の式(1)に照らすと、特に癌抗原ペプチドAがGLYDGMEHL(配列番号:19)であり且つ癌抗原ペプチドBがKIFGSLAFL(配列番号:53)である化合物である。GLYDGMEHL(配列番号:19)およびKIFGSLAFL(配列番号:53)はHLA−A0201拘束性癌抗原ペプチドである。
図8において、縦軸は播種細胞数中に反応した細胞数を示す。図8の黒棒、斜線棒はHLA−A0201遺伝子導入マウス由来の脾細胞を配列番号:19、53で表される各ペプチドをパルスしながら培養した結果を示し、白棒は非パルスで培養した結果を示す。即ち、黒棒または斜線棒と白棒の値の差がペプチド特異的CTLの数を示し、式(4)で表される化合物の投与によってマウス生体内において配列番号:19、53で表される各ペプチドに特異的なCTLが誘導されたことを示す。
図8において白棒の値は認められていない。このことは目的のペプチドをパルスしない場合にはHLA−A0201遺伝子導入マウスの脾細胞は全く反応しなかったことを示している。本試験の結果、HLA−A0201遺伝子導入マウス由来の脾細胞において配列番号:19、53で表されるペプチドに特異的なIFNγの産生が確認された。
すなわち、本発明の化合物の一例である式(4)で表される化合物は、異なる2種のペプチドを式(1)に示されたようなジスルフィド結合を介して複合化されたコンジュゲート体であり、実際にin vivoにおいて異なる2種のCTLを誘導できる癌抗原ペプチドコンジュゲートワクチンであることが、明らかとなった。
で表される化合物は、前記の式(1)に照らすと、特に癌抗原ペプチドAがGLYDGMEHL(配列番号:19)であり且つ癌抗原ペプチドDがVYGFVRACL(配列番号:87)である化合物である。GLYDGMEHL(配列番号:19)はHLA−A0201拘束性癌抗原ペプチドであり、VYGFVRACL(配列番号:87)はHLA−A24拘束性癌抗原ペプチドである。
各図において、縦軸は播種細胞数中に反応した細胞数を示す。図9の黒棒、白棒はHLA−A0201遺伝子導入マウス由来の脾細胞を配列番号:19で表されるペプチドのパルスおよび非パルスしながら培養した結果を、図10の黒棒、白棒はHLA−A2402遺伝子導入マウス由来の脾細胞を配列番号:87で表されるペプチドのパルスおよび非パルスしながら培養した結果を示す。即ち、黒棒と白棒の値の差がペプチド特異的CTLの数を示し、式(10)で表される化合物の投与によってマウス生体内において配列番号:19、87で表される各ペプチドに特異的なCTLが誘導されたことを示す。
特に図9において白棒の値は認められていない。このことは目的のペプチド非存在下ではHLA−A0201遺伝子導入マウスの脾細胞は全く反応しなかったことを示している。本試験の結果、HLA−A0201遺伝子導入マウス由来の脾細胞においては配列番号:19で表されるペプチドに特異的なIFNγの産生が、HLA−A2402遺伝子導入マウス由来の脾細胞においては配列番号:87で表されるペプチド特異的なIFNγの産生が確認された。
すなわち、本発明の化合物の一例である式(10)で表される化合物は、異なる2種のペプチドを式(1)に示されたようなジスルフィド結合を介して複合化されたコンジュゲート体であり、実際にin vivoにおいて異なる2種のCTLを誘導できる癌抗原ペプチドコンジュゲートワクチンであることが、明らかとなった。
実施例1と同様の方法で、配列番号:124〜142のアミノ酸配列からなる各ペプチドを合成した。表25〜26に、合成した各ペプチドの質量分析結果を示した。
表25〜26の何れのペプチドも、式(1)において、R1が水素原子であり、Xaが1残基のアミノ酸からなるペプチドの二価基であり、Yaが単結合であり、且つ癌抗原ペプチドAが癌抗原タンパクHER2/neuの部分ペプチドであるHER2/neu369-377ペプチド(KIFGSLAFL)(配列番号:53)である、本発明の化合物である。
実施例1と同様の方法で、配列番号:143〜161のアミノ酸配列からなる各ペプチドを合成した。表27〜28に、合成した各ペプチドの質量分析結果を示した。
表27〜28の何れのペプチドも、式(1)において、R1が水素原子であり、Xaが1残基のアミノ酸からなるペプチドの二価基であり、Yaが単結合であり、且つ癌抗原ペプチドAが癌抗原タンパクProteinase−3の部分ペプチドであるProteinase−3169-177ペプチド(VLQELNVTV)(配列番号:43)である、本発明の化合物である。
実施例1と同様の方法で、配列番号:162〜177のアミノ酸配列からなる各ペプチドを合成した。表29〜30に、合成した各ペプチドの質量分析結果を示した。
表29〜30の何れのペプチドも、式(1)において、R1が水素原子であり、Xaが単結合であり、Yaが1残基のアミノ酸からなるペプチドの二価基であり、且つ癌抗原ペプチドAが癌抗原タンパクMAGE−A10の部分ペプチドであるMAGE−A10254-262ペプチド(GLYDGMEHL)(配列番号:19)である、本発明の化合物である。
実施例1と同様の方法で、配列番号:178〜196のアミノ酸配列からなる各ペプチドを合成した。表31〜32に、合成した各ペプチドの質量分析結果を示した。
表31〜32の何れのペプチドも、式(1)において、R1が水素原子であり、Xaが1残基のアミノ酸からなるペプチドの二価基であり、Yaが単結合であり、且つ癌抗原ペプチドAが癌抗原タンパクMAGE−A10の部分ペプチドであるMAGE−A10254-262ペプチド(GLYDGMEHL)(配列番号:19)である、本発明の化合物である。
実施例31〜49にて合成したペプチドのN末端アミノ酸のトリミング効率をERAP1を用いて評価した。50μlのERAP1(50μg/ml)pH8.0 20mM Tris・HCl− 100mM NaCl バッファー(Tris・HClバッファー)溶液を142μlのTris・HClバッファーに加えた。10mMのペプチドDMSO溶液2.0μlおよびDMSO6.0μLを上述のERAP1溶液に加えて、良く混和した後に30℃で静置した。1.0時間後に50μlUFLC(分析条件は以下に示す。)に打ち込み、目的とするペプチドのAUCを求めた。トリミングによって得られるペプチドを別に化学的に合成し、酵素の無い同様の条件で分析して得られたAUCを基にして、トリミングによって得られたペプチド〔HER2/neu369-377ペプチド(KIFGSLAFL)(配列番号:53)〕の生成率を求め、表33に示した。
分析条件
ポンプ:Shimadzu社製 UFLC
カラム:Shim−pack XR−ODS 3.0mmi.d.x75mm
溶液:0.05% TFA H2O(A)― 0.05% TFA CH3CN(B)
オーブン温度:40℃
流速:1.0ml/min
検出波長:λ=220nm
グラジエント:0.0minから5.0minでB液濃度を10%から70%まで上昇
工程1.等張緩衝液の調製
1.75%リン酸水素二ナトリウム水溶液と5.53%クエン酸水溶液を混合し、pH6.0および7.4の緩衝液を調製した。
工程2.試験溶液の調製
被験物を1mg程度秤量し、等張緩衝液を0.5mL加えこれを試験溶液とした。調製した試験溶液は室温にて90分間振とう(振とう条件: TAITEC社製RECIPRO SHAKER SR-1N, Speed=8)後、遠心分離(15000rpm、5分間、室温)を行い、遠心分離後の上清を試験溶液とした。
工程3.標準液の調製
被験物約1mgを精秤し、0.1%TFA水/アセトニトリル=1/1にて溶解し、全量を10mLとし、これを被験物の標準液として用いた。
工程4.被験物の濃度測定
被験物の標準液及び試験溶液をHPLC(分析条件は表34に記載)にて分析を行い、標準液のピーク面積比より被験物の溶解度を算出する。
HPLC測定条件
カラム:Chemcopack Quicksorb(4.6 mmφ×150 mm, 5μm) ケムコ株式会社製
移動相:A液;0.1%TFA水、B液;0.1%TFAアセトニトリル溶液
カラム温度:室温
流速:1mL/min
検出波長:UV254nm,230nm(2波長検出)
サンプル注入量:10μL
実施例1と同様の方法で、配列番号197および198のアミノ酸配列からなる各ペプチドを合成した。表36に、合成した各ペプチドの質量分析結果を示した。
表36の何れのペプチドも、式(2)において、Xbが単結合であり、Ybが単結合であり、且つ癌抗原ペプチドBがHLA−DR拘束性のユニバーサル癌抗原ペプチド(配列番号:101および102)である、本発明の化合物である。
実施例1と同様の方法で、配列番号199および200のアミノ酸配列からなる各ペプチドを合成した。表37に、合成した各ペプチドの質量分析結果を示した。
表37の何れのペプチドも、式(3)において、Xcが単結合であり、Ycが単結合であり、且つ癌抗原ペプチドCがHLA−DR拘束性のユニバーサル癌抗原ペプチド(配列番号:101および102)である、本発明の化合物である。
式(14)
質量分析:LC−ESI/MS m/z =1208.1[M+H]+ (理論値=1208.5)
実施例29工程2記載の合成法及び実施例108記載の合成法を用いて式(5)、(11)および(15)〜(17)で表される各化合物(コンジュゲート体)を合成した。表38に質量分析結果を示した。(式中、CとCの間の結合はジスルフィド結合を表す。)
実施例1と同様の方法で、配列番号:201〜230のアミノ酸配列からなるペプチドを合成した。表39〜41に、合成した各ペプチドの質量分析結果を示した。
表39〜41の何れのペプチドも、式(1)において、R1が水素原子であり、Xaが単結合であり、Yaが単結合であり、且つ癌抗原ペプチドAが表1〜9に示したMHCクラスI拘束性癌抗原ペプチドである、本発明の化合物である。
実施例109〜113にて合成した式(5)、(11)および(15)〜(17)で表される化合物(コンジュゲート体)について、試験例7に示した溶解度測定を行い、各溶解度を表42に示した。
実施例69〜84にて合成したペプチドのN末端アミノ酸のトリミング効率をERAP1を用いて評価した。50μlのERAP1(10μg/ml)pH8.0 20mM Tris・HCl− 100mM NaCl バッファー(Tris・HClバッファー)溶液を142μlのTris・HClバッファーに加えた。10mMのペプチドDMSO溶液2.0μlおよびDMSO6.0μLを上述のERAP1溶液に加えて、良く混和した後に30℃で静置した。1.0時間後に50μlUFLC(分析条件は以下に示す。)に打ち込み、目的とするペプチドのAUCを求めた。トリミングによって得られるペプチドを別に化学的に合成し、酵素の無い同様の条件で分析して得られたAUCを基にして、トリミングによって得られたペプチド〔MAGE‐A10254‐262ペプチド(GLYDGMEHL)(配列番号:19)〕の生成率を求め、表43および44に示した。
分析条件
ポンプ:Shimadzu社製 UFLC
カラム:Kinetex 2.6u C18 100A 3.0mmi.d.x75mm
溶液:0.1% TFA H2O(A)― 0.1% TFA CH3CN(B)
オーブン温度:40℃
流速:1.0ml/min
検出波長:λ=220nm
グラジエント:0.0minから8.5minでB液濃度を10%から50%まで上昇
実施例85〜103にて合成したペプチドのN末端アミノ酸のトリミング効率をERAP1を用いて評価した。50μlのERAP1(10μg/ml)pH8.0 20mM Tris・HCl− 100mM NaCl バッファー(Tris・HClバッファー)溶液を142μlのTris・HClバッファーに加えた。10mMのペプチドDMSO溶液2.0μlおよびDMSO6.0μLを上述のERAP1溶液に加えて、良く混和した後に30℃で静置した。1.0時間後に50μlUFLC(分析条件は以下に示す。)に打ち込み、目的とするペプチドのAUCを求めた。トリミングによって得られるペプチドを別に化学的に合成し、酵素の無い同様の条件で分析して得られたAUCを基にして、トリミングによって得られたペプチド〔MAGE‐A10254‐262ペプチド(GLYDGMEHL)(配列番号:19)〕の生成率を求め、表45および46に示した。
分析条件
ポンプ:Shimadzu社製 UFLC
カラム:Kinetex 2.6u C18 100A 3.0mmi.d.x75mm
溶液:0.1% TFA H2O(A)― 0.1% TFA CH3CN(B)
オーブン温度:40℃
流速:1.0ml/min
検出波長:λ=220nm
グラジエント:0.0minから8.5minでB液濃度を10%から50%まで上昇
実施例50、56、64及び67にて合成したペプチドのN末端アミノ酸のトリミング効率をERAP1を用いて評価した。50μlのERAP1(10μg/ml)pH8.0 20mM Tris・HCl− 100mM NaCl バッファー(Tris・HClバッファー)溶液を142μlのTris・HClバッファーに加えた。10mMのペプチドDMSO溶液2.0μlおよびDMSO6.0μLを上述のERAP1溶液に加えて、良く混和した後に30℃で静置した。1.0時間後に50μlUFLC(分析条件は以下に示す。)に打ち込み、目的とするペプチドのAUCを求めた。トリミングによって得られるペプチドを別に化学的に合成し、酵素の無い同様の条件で分析して得られたAUCを基にして、トリミングによって得られたペプチド〔Proteinase−3169-177ペプチド(VLQELNVTV)(配列番号:43)〕の生成率を求め、表47に示した。
分析条件
ポンプ:Shimadzu社製 UFLC
カラム:Kinetex 2.6u C18 100A 3.0mmi.d.x75mm
溶液:0.1% TFA H2O(A)― 0.1% TFA CH3CN(B)
オーブン温度:40℃
流速:1.0ml/min
検出波長:λ=220nm
グラジエント:0.0minから8.5minでB液濃度を10%から50%まで上昇
実施例114〜115、118〜122、126、129、132、137、139および141〜143にて合成したペプチドのN末端アミノ酸のトリミング効率をERAP1を用いて評価した。50μlのERAP1(10μg/ml)pH8.0 20mM Tris・HCl− 100mM NaCl バッファー(Tris・HClバッファー)溶液を142μlのTris・HClバッファーに加えた。10mMのペプチドDMSO溶液2.0μlおよびDMSO6.0μLを上述のERAP1溶液に加えて、良く混和した後に30℃で静置した。1.0時間後に50μlUFLC(分析条件は以下に示す。)に打ち込み、目的とするペプチドのAUCを求めた。トリミングによって得られるペプチドを別に化学的に合成し、酵素の無い同様の条件で分析して得られたAUCを基にして、トリミングによって得られたペプチドの生成率を求め、表48〜49に示した。
分析条件
ポンプ:Shimadzu社製 UFLC
カラム:Kinetex 2.6u C18 100A 3.0mmi.d.x75mm
溶液:0.1% TFA H2O(A)― 0.1% TFA CH3CN(B)
オーブン温度:40℃
流速:1.0ml/min
検出波長:λ=220nm
グラジエント:0.0minから8.5minでB液濃度を10%から50%まで上昇
実施例29と同様の方法で、式(7)〜(9)で表される各化合物(コンジュゲート体)を合成した。表50に質量分析結果を示した。(式中、CとCの間の結合はジスルフィド結合を表す。)
で表される化合物は、前記の式(1)に照らすと、特に癌抗原ペプチドAがGLYDGMEHL(配列番号:19)であり且つ癌抗原ペプチドDがSLLMWITQC(配列番号:88)である化合物である。GLYDGMEHL(配列番号:19)およびSLLMWITQC(配列番号:88)はHLA−A0201拘束性癌抗原ペプチドである。
図11において、縦軸は播種細胞数中に反応した細胞数を示す。図11の黒棒、斜線棒はHLA−A0201遺伝子導入マウス由来の脾細胞を配列番号:19、88で表される各ペプチドをパルスしながら培養した結果を示し、白棒は非パルスで培養した結果を示す。即ち、黒棒または斜線棒と白棒の値の差がペプチド特異的CTLの数を示し、式(11)で表される化合物の投与によってマウス生体内において配列番号:19、88で表される各ペプチドに特異的なCTLが誘導されたことを示す。
図11において白棒の値は認められていない。このことは目的のペプチドをパルスしない場合にはHLA−A0201遺伝子導入マウスの脾細胞は全く反応しなかったことを示している。本試験の結果、HLA−A0201遺伝子導入マウス由来の脾細胞において配列番号:19、88で表されるペプチドに特異的なIFNγの産生が確認された。
すなわち、本発明の化合物の一例である式(11)で表される化合物は、異なる2種のペプチドを式(1)に示されたようなジスルフィド結合を介して複合化されたコンジュゲート体であり、実際にin vivoにおいて異なる2種のCTLを誘導できる癌抗原ペプチドコンジュゲートワクチンであることが、明らかとなった。
で表される化合物は、前記の式(1)に照らすと、特に癌抗原ペプチドAがGLYDGMEHL(配列番号:19)であり且つ癌抗原ペプチドAがVLQELNVTV(配列番号:43)である化合物である。GLYDGMEHL(配列番号:19)およびVLQELNVTV(配列番号:43)はHLA−A0201拘束性癌抗原ペプチドである。
図12において、縦軸は播種細胞数中に反応した細胞数を示す。図12の黒棒、斜線棒はHLA−A0201遺伝子導入マウス由来の脾細胞を配列番号:19、43で表される各ペプチドをパルスしながら培養した結果を示し、白棒は非パルスで培養した結果を示す。即ち、黒棒または斜線棒と白棒の値の差がペプチド特異的CTLの数を示し、式(5)で表される化合物の投与によってマウス生体内において配列番号:19、43で表される各ペプチドに特異的なCTLが誘導されたことを示す。
図12において白棒の値は認められていない。このことは目的のペプチドをパルスしない場合にはHLA−A0201遺伝子導入マウスの脾細胞は全く反応しなかったことを示している。本試験の結果、HLA−A0201遺伝子導入マウス由来の脾細胞において配列番号:19、43で表されるペプチドに特異的なIFNγの産生が確認された。
すなわち、本発明の化合物の一例である式(5)で表される化合物は、異なる2種のペプチドを式(1)に示されたようなジスルフィド結合を介して複合化されたコンジュゲート体であり、実際にin vivoにおいて異なる2種のCTLを誘導できる癌抗原ペプチドコンジュゲートワクチンであることが、明らかとなった。
実施例123〜125、130、134〜135及び138にて合成したペプチドのN末端アミノ酸のトリミング効率をERAP1を用いて評価した。50μlのERAP1(50μg/ml)pH8.0 20mM Tris・HCl− 100mM NaCl バッファー(Tris・HClバッファー)溶液を142μlのTris・HClバッファーに加えた。10mMのペプチドDMSO溶液2.0μlおよびDMSO6.0μLを上述のERAP1溶液に加えて、良く混和した後に30℃で静置した。1.0時間後に50μlUFLC(分析条件は以下に示す。)に打ち込み、目的とするペプチドのAUCを求めた。トリミングによって得られるペプチドを別に化学的に合成し、酵素の無い同様の条件で分析して得られたAUCを基にして、トリミングによって得られたペプチドの生成率を求め、表51に示した。
分析条件
ポンプ:Shimadzu社製 UFLC
カラム:Kinetex 2.6u C18 100A 3.0mmi.d.x75mm
溶液:0.1% TFA H2O(A)― 0.1% TFA CH3CN(B)
オーブン温度:40℃
流速:1.0ml/min
検出波長:λ=220nm
グラジエント:0.0minから8.5minでB液濃度を10%から50%まで上昇
実施例140にて合成したペプチドのN末端アミノ酸のトリミング効率をERAP1を用いて評価した。50μlのERAP1(50μg/ml)pH8.0 20mM Tris・HCl− 100mM NaCl バッファー(Tris・HClバッファー)溶液を142μlのTris・HClバッファーに加えた。10mMのペプチドDMSO溶液2.0μlおよびDMSO6.0μLを上述のERAP1溶液に加えて、良く混和した後に30℃で静置した。1.0時間後に50μlUFLC(分析条件は以下に示す。)に打ち込み、目的とするペプチドのAUCを求めた。トリミングによって得られるペプチドを別に化学的に合成し、酵素の無い同様の条件で分析して得られたAUCを基にして、トリミングによって得られたペプチドの生成率を求め、表52に示した。
分析条件
ポンプ:Shimadzu社製 UFLC
カラム:Kinetex 2.6u C18 100A 3.0mmi.d.x75mm
溶液:0.1% TFA H2O(A)― 0.1% TFA CH3CN(B)
オーブン温度:40℃
流速:1.0ml/min
検出波長:λ=220nm
グラジエント:0.0minから8.5minでB液濃度を1%から30%まで上昇
実施例131にて合成したペプチドのN末端アミノ酸のトリミング効率をERAP1を用いて評価した。50μlのERAP1(100μg/ml)pH8.0 20mM Tris・HCl− 100mM NaCl バッファー(Tris・HClバッファー)溶液を142μlのTris・HClバッファーに加えた。10mMのペプチドDMSO溶液8.0μlを上述のERAP1溶液に加えて、良く混和した後に30℃で静置した。1.0時間後に10μlUFLC(分析条件は以下に示す。)に打ち込み、目的とするペプチドのAUCを求めた。トリミングによって得られるペプチドを別に化学的に合成し、酵素の無い同様の条件で分析して得られたAUCを基にして、トリミングによって得られたペプチドの生成率を求め、表53に示した。
分析条件
ポンプ:Shimadzu社製 UFLC
カラム:Kinetex 2.6u C18 100A 3.0mmi.d.x75mm
溶液:0.1% TFA H2O(A)― 0.1% TFA CH3CN(B)
オーブン温度:40℃
流速:1.0ml/min
検出波長:λ=220nm
グラジエント:0.0minから8.5minでB液濃度を10%から50%まで上昇
実施例136にて合成したペプチドのN末端アミノ酸のトリミング効率をERAP1を用いて評価した。50μlのERAP1(100μg/ml)pH8.0 20mM Tris・HCl− 100mM NaCl バッファー(Tris・HClバッファー)溶液を142μlのTris・HClバッファーに加えた。10mMのペプチドDMSO溶液8.0μlを上述のERAP1溶液に加えて、良く混和した後に30℃で静置した。1.0時間後に10μlUFLC(分析条件は以下に示す。)に打ち込み、目的とするペプチドのAUCを求めた。トリミングによって得られるペプチドを別に化学的に合成し、酵素の無い同様の条件で分析して得られたAUCを基にして、トリミングによって得られたペプチドの生成率を求め、表54に示した。
分析条件
ポンプ:Shimadzu社製 UFLC
カラム:Kinetex 2.6u C18 100A 3.0mmi.d.x75mm
溶液:0.1% TFA H2O(A)― 0.1% TFA CH3CN(B)
オーブン温度:40℃
流速:1.0ml/min
検出波長:λ=220nm
グラジエント:0.0minから8.5minでB液濃度を1%から30%まで上昇
実施例29と同様の方法で、式(12)及び(18)で表される各化合物(コンジュゲート体)を合成した。表55に質量分析結果を示した。(式中、CとCの間の結合はジスルフィド結合を表す。)
実施例1と同様の方法で、配列番号:231〜238のアミノ酸配列からなるペプチドを合成した。表56に、合成した各ペプチドの質量分析結果を示した。
配列番号:231〜238は本発明の化合物ではないことから参考例として記載した。
式(19)
で表される化合物の合成
(Fmoc−C(Mmt)A−SBnの合成)
Fmoc−Cys(Mmt)−OH(4.80g)、N,N−ジイソプロピルエチルアミン(2.56mL)、ヘキサフルオロリン酸(ベンゾトリアゾール-1-イルオキシ)トリピロリジノホスホニウム(4.50g)及び公知の方法(例えばJournal of Organic Chemistry, Vol. 64, No. 24 8761-8769)にて合成されたH−Ala−SBnのクロロホルム(20mL)溶液を室温にて1時間撹拌した。反応液をカラムクロマトグラフィー(溶出溶媒はヘキサン/酢酸エチル)にて精製することで目的化合物であるFmoc−C(Mmt)A−SBn(2.80g)を得た。
NMR:1H NMR (CDCl3)δ 7.72 (t, J = 7.6 Hz, 2H), 7.54 (d, J = 7.2 Hz, 1H), 7.38-7.34 (m, 7H), 7.29-7.25 (m, 6H), 7.23-7.15 (m, 7H), 6.76 (d, J = 8.8 Hz, 2H), 6.15 (d, J = 8.0 Hz, 1H), 4.95 (d, J = 7.2 Hz, 1H), 4.57 (quin, J = 7.6 Hz, 1H), 4.35 (d, J = 6.8 Hz, 2H) 4.19-4.17 (m, 1H), 4.04 (s, 2H), 3.73 (s, 3H), 2.72 (dd, J = 13.2, 8.4 Hz, 1H), 2.61 (d, J = 9.6 Hz, 1H), 1.31 (d, J = 7.2 Hz, 3H).
(C(Mmt)ACGLYDGMEHLの合成)
工程1で得たFmoc-Cys(Mmt)-Ala-SBn(11mg)と実施例25で合成したH-Cys-Gly-Leu-Tyr-Asp-Gly-Met-Glu-His-Leu-OH(16mg)、N,N−ジイソプロピルエチルアミン(200μL)、3,3',3’’−フォスファネトリルトリプロパン酸塩酸塩(1mg)、4−メルカプトフェニル酢酸(1mg)及び0.1Mリン酸ナトリウム緩衝液(pH7.5、200μL)のDMF(400μL)溶液を室温にて4時間撹拌した。反応液にジエチルアミン(200μL)を加え更に15分撹拌した。反応液を逆相HPLCにて精製することで、目的化合物であるC(Mmt)ACGLYDGMEHL(6mg)を得た。
質量分析:LC−ESI/MS m/z=792.7 [M+2H]2+ (理論値=792.9)
〔すなわち式(20):
で表される化合物の合成〕
工程2で得たH-Cys(Mmt)-Ala-Cys-Gly-Leu-Tyr-Asp-Gly-Met-Glu-His-Leu-OH(19mg)と実施例108で得た(H-Cys(Pys)-Lys-Ile-Phe-Gly-Ser-Leu-Ala-Phe-Leu-OH(15mg)のDMF(1mL)溶液を室温にて2時間撹拌した。反応液を逆相HPLCにて精製することで目的化合物である(H-Cys(Mmt)-Ala-Cys-Gly-Leu-Tyr-Asp-Gly-Met-Glu-His-Leu-OH)(H-Cys-Lys-Ile-Phe-Gly-Ser-Leu-Ala-Phe-Leu-OH) disulfide bond〔すなわち式(20)で示される化合物〕を19mg得た。
質量分析:LC−ESI/MS m/z=803.3 [M−Mmt+3H]2+ (理論値=803.3)
aKFVAAWTLKAAaC(Pys)の合成
実施例107で得たaKFVAAWTLKAAaC(138mg)と2,2’−ジピリジルビスルフィド(0.2Mイソプロパノール溶液、718μL)の(20%w/w酢酸水)/(アセトニトリル)=1/1(5mL)溶液を室温にて2時間撹拌した。2,2’−ジピリジルビスルフィド(0.2Mイソプロパノール溶液、350μL)を更に加え、2時間撹拌した。反応液を逆相HPLCにて精製することで目的化合物であるaKFVAAWTLKAAaC(Pys)を34mg得た。
質量分析:LC−ESI/MS m/z= 520.5[M+3H]3+ (理論値=521.0)
工程3で得た(H-Cys(Mmt)-Ala-Cys-Gly-Leu-Tyr-Asp-Gly-Met-Glu-His-Leu-OH)(H-Cys-Lys-Ile-Phe-Gly-Ser-Leu-Ala-Phe-Leu-OH) disulfide bond〔すなわち式(20)で示される化合物〕(40mg)、工程4で得たaKFVAAWTLKAAaC(Pys)(35mg)及びトリイソプロピルシラン(30μL)のトリフルオロ酢酸(570μL)溶液を室温にて30分撹拌した。反応液を逆相HPLCにて精製することで目的化合物である式(19)で表される化合物を5mg得た。
質量分析:LC−ESI/MS m/z= 1285.8[M+3H]3+ (理論値=1286.5)
で表される化合物は、前記の式(1)に照らすと、特に癌抗原ペプチドAがKIFGSLAFL(配列番号:53)であり且つ癌抗原ペプチドBがaKFVAAWTLKAAa(配列番号:102)である化合物である。KIFGSLAFL(配列番号:53)はHLA−A0201拘束性癌抗原ペプチドであり、aKFVAAWTLKAAa(配列番号:102)はHLA−DR拘束性のユニバーサル癌抗原ペプチド(すなわちヘルパーペプチド)である。
すなわち、本発明の化合物の一例である式(16)で表される化合物は、異なる2種のペプチドを式(1)に示されたようなジスルフィド結合を介して複合化されたコンジュゲート体であり、実際にin vivoにおいてCTLおよびヘルパーペプチド反応性細胞を誘導できる癌抗原ペプチドコンジュゲートワクチンであることが、明らかとなった。
で表される化合物は、前記の式(1)に照らすと、特に癌抗原ペプチドAがKIFGSLAFL(配列番号:53)であり且つ癌抗原ペプチドCがaKFVAAWTLKAAa(配列番号:102)である化合物である。KIFGSLAFL(配列番号:53)はHLA−A0201拘束性癌抗原ペプチドであり、aKFVAAWTLKAAa(配列番号:102)はHLA−DR拘束性のユニバーサル癌抗原ペプチド(すなわちヘルパーペプチド)である。
すなわち、本発明の化合物の一例である式(17)で表される化合物は、異なる2種のペプチドを式(1)に示されたようなジスルフィド結合を介して複合化されたコンジュゲート体であり、実際にin vivoにおいてCTLおよびヘルパーペプチド反応性細胞を誘導できる癌抗原ペプチドコンジュゲートワクチンであることが、明らかとなった。
で表される化合物は、前記の式(1)に照らすと、特に癌抗原ペプチドAがKIFGSLAFL(配列番号:53)であり且つ癌抗原ペプチドCがAKFVAAWTLKAAA(配列番号:101)である化合物である。KIFGSLAFL(配列番号:53)はHLA−A0201拘束性癌抗原ペプチドであり、AKFVAAWTLKAAA(配列番号:101)はHLA−DR拘束性のユニバーサル癌抗原ペプチド(すなわちヘルパーペプチド)である。
すなわち、本発明の化合物の一例である式(18)で表される化合物は、異なる2種のペプチドを式(1)に示されたようなジスルフィド結合を介して複合化されたコンジュゲート体であり、実際にin vivoにおいてCTLおよびヘルパーペプチド反応性細胞を誘導できる癌抗原ペプチドコンジュゲートワクチンであることが、明らかとなった。
で表される化合物は、前記の式(1)に照らすと、特に癌抗原ペプチドAがKIFGSLAFL(配列番号:53)であり且つ癌抗原ペプチドBがAKFVAAWTLKAAA(配列番号:101)である化合物である。KIFGSLAFL(配列番号:53)はHLA−A0201拘束性癌抗原ペプチドであり、AKFVAAWTLKAAA(配列番号:101)はHLA−DR拘束性のユニバーサル癌抗原ペプチド(すなわちヘルパーペプチド)である。
HLA−A0201遺伝子導入マウスを用いた、in vivoでのCTL誘導能の評価
で表される化合物に含まれるKIFGSLAFL(配列番号:53)およびGLYDGMEHL(配列番号:19)はHLA−A0201拘束性癌抗原ペプチドであり、aKFVAAWTLKAAa(配列番号:102)はHLA−DR拘束性のユニバーサル癌抗原ペプチド(すなわちヘルパーペプチド)である。
各図中において白棒の値は認められていない。このことは目的のペプチド非存在下ではそれぞれの遺伝子導入マウスの脾細胞は反応しなかったことを示している。本試験の結果、式(4)および式(19)で表される化合物を投与したHLA−A0201遺伝子導入マウス由来の脾細胞において配列番号:19、53で表される目的のペプチド特異的なIFNγ産生がそれぞれ確認された。また、各図において式(19)で表される化合物の投与によって誘導された配列番号:19、53で表されるペプチドに特異的なIFNγ産生細胞の数は、式(4)で表される化合物の投与によって誘導されたペプチド特異的なIFNγ産生細胞の数より多かった。
すなわち、本発明の化合物の一例である式(19)で表される化合物は、異なる3種のペプチドをジスルフィド結合を介して複合化されたコンジュゲート体であり、実際にin vivoにおいてCTLおよびヘルパーペプチド反応性細胞を誘導できる癌抗原ペプチドコンジュゲートワクチンであることが明らかとなった。
HLA−A0201遺伝子導入マウスを用いた、in vivoでのCTL誘導能の評価
で表される化合物については、試験例4に記したとおりである。配列番号:231および232で表されるペプチドは、HLA−A0201拘束性の癌抗原ペプチドAであるGLYDGMEHL(配列番号:19)および癌抗原ペプチドBであるKIFGSLAFL(配列番号:53)をアミド結合で連結した長鎖ペプチドである。
各図中において白棒の値は認められていない。このことは目的のペプチド非存在下ではそれぞれの遺伝子導入マウスの脾細胞は全く反応しなかったことを示している。本試験の結果、式(4)で表される化合物を投与したHLA−A0201遺伝子導入マウス由来の脾細胞において配列番号:19、53で表される目的のペプチド特異的なIFNγ産生がそれぞれ確認された。一方で、配列番号:231で表されるペプチドを投与したマウス由来の脾細胞においては配列番号:19で表される目的のペプチド特異的なIFNγ産生は認められたものの、式(4)で表される化合物を投与したマウス由来の脾細胞と比較するとその数は少なかった。配列番号:232で表されるペプチドを投与したマウス由来の脾細胞においては配列番号:19で表される目的のペプチド特異的なIFNγ産生が確認された。また、配列番号:231、232で表されるペプチドを投与したマウス由来の脾細胞においては配列番号:53で表される目的のペプチド特異的なIFNγ産生は認められたものの、式(4)で表される化合物を投与したマウス由来の脾細胞と比較するとその数は非常に少なかった。
HLA−A0201遺伝子導入マウスを用いた、in vivoでのCTL誘導能の評価
で表される化合物については、試験例4に記したとおりである。配列番号:233および234で表されるペプチドは、HLA−A0201拘束性の癌抗原ペプチドAであるGLYDGMEHL(配列番号:19)および癌抗原ペプチドBであるKIFGSLAFL(配列番号:53)を、ペプチドスペーサーとして6個のグリシンを介してアミド結合で連結した長鎖ペプチドである。
各図中において白棒の値は認められていない。このことは目的のペプチド非存在下ではそれぞれの遺伝子導入マウスの脾細胞は全く反応しなかったことを示している。本試験の結果、式(4)で表される化合物を投与したHLA−A0201遺伝子導入マウス由来の脾細胞において配列番号:19、53で表される目的のペプチド特異的なIFNγ産生がそれぞれ確認された。一方で、配列番号:233、234で表されるペプチドを投与したマウス由来の脾細胞においても配列番号:19で表される目的のペプチド特異的なIFNγ産生が確認された。しかし、配列番号:233、234で表されるペプチドを投与したマウス由来の脾細胞において、配列番号:53で表される目的のペプチド特異的なIFNγ産生は認められたものの、式(4)で表される化合物を投与したマウス由来の脾細胞と比較するとその数は非常に少なかった。
実施例1と同様の方法で、配列番号:239〜242のアミノ酸配列からなるペプチドを合成した。表57に、合成した各ペプチドの質量分析結果を示した。
配列番号:239〜242は本発明の化合物ではないことから参考例として記載した。
フィルター濾過を経た後に、HLA−A2401遺伝子導入マウスを用いた、in vivoでのCTL誘導能の評価
ジスルフィド結合を介して形成した配列番号4のホモダイマーおよび式(5)で表される化合物を3−10mg/mLとなるように注射用水にて溶解する。各化合物の薬理活性を、CTL誘導活性を指標としてHLA−A2402遺伝子導入マウス (C57BL/6CrHLA−A2402/Kb)を利用して評価する。HLA−A2402遺伝子導入マウスに投与するにあたり、注射用水で溶解した化合物をタンパク質低結合性のフィルター(注射剤の滅菌処理を目的としたグレードのメンブランフィルター)にて濾過滅菌したのち、不完全フロイントアジュバントと混合しエマルション化させる。
エマルション化させた化合物はHLA−A2402遺伝子導入マウスの尾根部皮内に投与する。投与1週間後、マウスをCO2ガスにより安楽死させたのち脾臓あるいは鼠蹊部リンパ節を摘出し、脾細胞あるいはリンパ節細胞を調製する。IFNγ産生の測定には、IFNγ ELISPOT assay kitを用いる。細胞調製の前日に、ELISPOTプレートを抗マウスIFNγ抗体で処理し、当日に10%FBSを含むRPMI1640培地でブロッキングする。調製したマウス由来の細胞をブロッキングしたELISPOTプレートに播種する。ペプチド(配列番号:4)をDMSOで40mg/mLに溶解し、さらに10%FBSを含むRPMI1640培地で40μg/mLに希釈する。希釈したペプチド(配列番号:4)を、最終濃度10μg/mLでHLA−A2402遺伝子導入マウス由来の脾細胞あるいはリンパ節細胞に添加する。ペプチドを添加した細胞を、16−20時間、37℃、5% CO2下で培養することで、in vitroにおけるペプチド再刺激を加える。培養後に上清を除いたのち、ELISPOTプレートを、添付のプロトコールに従って発色させる。発色したスポット数は、ImmunoSpot Analyzer(C.T.L.社製)によって測定する。
但し、本発明における「癌抗原ペプチド」には、ヒトWT1タンパク質(Cell,60:509,1990、GenBank Acc.No.A38080)は含まれない。すなわち、本発明の化合物においては、癌抗原ペプチドA、癌抗原ペプチドB、癌抗原ペプチドC、または/および癌抗原ペプチドDが、WT1タンパク質由来の癌抗原ペプチドではない。癌抗原ペプチドA、癌抗原ペプチドB、癌抗原ペプチドCまたは癌抗原ペプチドDがWT1タンパク質由来の癌抗原ペプチドではないことがより好ましく、癌抗原ペプチドA、癌抗原ペプチドB、癌抗原ペプチドCおよび癌抗原ペプチドDが、WT1タンパク質由来の癌抗原ペプチドではないことがさらに好ましい。
具体的には、前記の項1に示した式(1)で表される化合物において、癌抗原ペプチドAが癌抗原タンパク質のアミノ酸配列において連続する7〜30残基のアミノ酸からなるMHCクラスI拘束性癌抗原ペプチドであり且つWT1タンパク質由来の癌抗原ペプチドとは異なり、R1が式(2)で表される基である場合、癌抗原ペプチドBが癌抗原タンパク質のアミノ酸配列において連続する7〜30残基のアミノ酸からなるMHCクラスIまたはMHCクラスII拘束性癌抗原ペプチドであり且つWT1タンパク質由来の癌抗原ペプチドとは異なり、R1が式(3)で表される基である場合、癌抗原ペプチドCが癌抗原タンパク質のアミノ酸配列において連続する7〜30残基のアミノ酸からなるMHCクラスII拘束性癌抗原ペプチドであり且つWT1タンパク質由来の癌抗原ペプチドとは異なり、またR1が癌抗原ペプチドDである場合、癌抗原ペプチドDが癌抗原タンパク質のアミノ酸配列において連続する7〜30残基のアミノ酸からなるMHCクラスIまたはMHCクラスII拘束性癌抗原ペプチドであり且つWT1タンパク質由来の癌抗原ペプチドとは異なることが好ましい。
Cysを延長した各ペプチド(配列番号:100、99または98)の投与により、がん細胞に内因性に提示されるペプチド(配列番号:53、43または19)に対するCTLが誘導されるか否かは、Cysを延長したペプチド(配列番号:100、99または98)を投与した上記マウス由来の脾細胞をペプチド(配列番号:53、43または19)で再刺激を行った場合にIFNγを産生するか測定することで判断した。表24に示したがん細胞に内因性に提示されるペプチド(配列番号:53、43または19)は、本試験例においては、Cys非延長ペプチドともいう。
Claims (19)
- 式(1):
癌抗原ペプチドAは、7〜30残基のアミノ酸からなるMHCクラスI拘束性癌抗原ペプチドを表し、癌抗原ペプチドAのN末端アミノ酸のアミノ基が式(1)中のYaと結合し、癌抗原ペプチドAのC末端アミノ酸のカルボニル基が式(1)中の水酸基と結合し、
R1は、水素原子、式(2):
癌抗原ペプチドBは、癌抗原ペプチドAとは異なり且つ7〜30残基のアミノ酸からなるMHCクラスI拘束性癌抗原ペプチドまたは7〜30残基のアミノ酸からなるMHCクラスII拘束性癌抗原ペプチドを表し、癌抗原ペプチドBのN末端アミノ酸のアミノ基が式(2)中のYbと結合し、癌抗原ペプチドBのC末端アミノ酸のカルボニル基が式(2)中の水酸基と結合し、
式(2)中のチオエーテル基が、式(1)中のチオエーテル基と結合する。)
で表される基、式(3):
癌抗原ペプチドCは、7〜30残基のアミノ酸からなるMHCクラスII拘束性癌抗原ペプチドを表し、癌抗原ペプチドCのC末端アミノ酸のカルボニル基が式(3)中のXcと結合し、癌抗原ペプチドCのN末端アミノ酸のアミノ基が式(3)中の水素原子と結合し、
式(3)中のチオエーテル基が、式(1)中のチオエーテル基と結合する。)
で表される基、または癌抗原ペプチドDを表し、
癌抗原ペプチドDは、1つのシステイン残基を含む7〜30残基のアミノ酸からなるMHCクラスI拘束性癌抗原ペプチドまたは1つのシステイン残基を含む7〜30残基のアミノ酸からなるMHCクラスII拘束性癌抗原ペプチドを表し、癌抗原ペプチドDのシステイン残基のチオエーテル基が式(1)中のチオエーテル基と結合する。
但し、R1が水素原子である場合、式(1)の配列は癌抗原タンパクの部分配列と同一ではない。]
で表される化合物、またはその薬学上許容される塩。 - Xaが単結合であり、Yaが単結合、アラニン残基、ロイシン残基またはメチオニン残基である、請求項1に記載の化合物、またはその薬学上許容される塩。
- Xaが単結合、アラニン残基、グリシン残基、セリン残基またはチロシン残基であり、Yaが単結合である、請求項1に記載の化合物、またはその薬学上許容される塩。
- XaおよびYaが単結合である、請求項1〜3のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学上許容される塩。
- 癌抗原ペプチドAが、以下のアミノ酸配列:
GLYDGMEHL (配列番号:19)、
VLQELNVTV (配列番号:43)および
KIFGSLAFL (配列番号:53)
の中から選ばれるいずれかのアミノ酸配列からなるペプチドである、請求項1〜4のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学上許容される塩。 - R1が水素原子である、請求項1〜5のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学上許容される塩。
- R1が式(2)で表される基である、請求項1〜5のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学上許容される塩。
- XbおよびYbが単結合である、請求項1〜5および7のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学上許容される塩。
- 癌抗原ペプチドBが、以下のアミノ酸配列:
GLYDGMEHL (配列番号:19)、
VLQELNVTV (配列番号:43)および
KIFGSLAFL (配列番号:53)
の中から選ばれるいずれかのアミノ酸配列からなるペプチドである、請求項1〜5および7〜8のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学上許容される塩。 - 癌抗原ペプチドBが、以下のアミノ酸配列:
AKFVAAWTLKAAA (配列番号:101)および
aKFVAAWTLKAAa (配列番号:102)
の中から選ばれるいずれかのアミノ酸配列からなるペプチドである、請求項1〜5および7〜8のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学上許容される塩。 - R1が式(3)で表される基である、請求項1〜5のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学上許容される塩。
- XcおよびYcが単結合である、請求項1〜5および11のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学上許容される塩。
- 癌抗原ペプチドCが、以下のアミノ酸配列:
AKFVAAWTLKAAA (配列番号:101)および
aKFVAAWTLKAAa (配列番号:102)
の中から選ばれるいずれかのアミノ酸配列からなるペプチドである、請求項1〜5および11〜12のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学上許容される塩。 - R1が癌抗原ペプチドDである、請求項1〜5のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学上許容される塩。
- 癌抗原ペプチドDが、以下のアミノ酸配列:
VYGFVRACL (配列番号:87)、および
SLLMWITQC (配列番号:88)
の中から選ばれるいずれかのアミノ酸配列からなるペプチドである、請求項1〜5および14のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学上許容される塩。 - 癌抗原ペプチドDが、以下のアミノ酸配列:
aK−Cha−VAAWTLKAAa−Ahx−C (配列番号:103)
のアミノ酸配列からなるペプチドである、請求項1〜5および14のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学上許容される塩。 - 癌抗原ペプチドDが、以下のアミノ酸配列:
AADHRQLQLSISSCLQQL (配列番号:104)、
RNGYRALMDKSLHVGTQCALTRR (配列番号:105)、
KKLQCVQLHVISM (配列番号:106)および
GSYVSRLLGICL (配列番号:107)
の中から選ばれるいずれかのアミノ酸配列からなるペプチドである、請求項1〜5および14のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学上許容される塩。 - 請求項1〜17のいずれか一項に記載の化合物またはその薬学上許容される塩、および薬学的に許容される担体を含有する医薬組成物。
- 癌を治療または予防するための方法であって、請求項1〜17のいずれか一項に記載の化合物またはその薬学上許容される塩の治療または予防に有効な量を、それを必要としている癌抗原タンパク質陽性の癌患者に投与することからなる方法。
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