JPWO2013011611A1 - 核酸分析方法及び核酸分析装置 - Google Patents
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- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
- C12N15/1034—Isolating an individual clone by screening libraries
- C12N15/1065—Preparation or screening of tagged libraries, e.g. tagged microorganisms by STM-mutagenesis, tagged polynucleotides, gene tags
Abstract
Description
102,202,303,509 接着パッド
103,203,308,401,508,608 微粒子
104,204,310,404,506,606 捕捉分子
105,507,607 結合分子
106,501,601 解析対象の核酸断片
107,502,602 捕捉用タグ分子
108 蛍光体標識付核酸分子
205,304 線状分子
206,207 官能基
301 平滑な支持基体
302 電子線用ポジ型レジスト
305,306 線状分子末端の官能基
307 非特異吸着防止用分子
309 アビジン
402,403,406,408 結合サイト
405 オリゴヌクレオチド
407 磁気微粒子
503,603 蛍光色素
504,604 核酸分子
505,605 蛍光体
511,610 検出器
609,704 流路
701 核酸分析用デバイス基板
702 流路形成部材
703 温調プレート
705 送液ユニット
706 対物レンズ
707 YAGレーザ光源
708 レンズ
709,714 ダイクロイックミラー
710 光学フィルタ
711 結像レンズ
712 2次元CCDカメラ
713 He−Neレーザ光源
Claims (14)
- 解析対象の核酸断片群を用意し、既知の塩基配列を有しかつ蛍光体標識された核酸分子を前記解析対象の核酸断片群とハイブリダイゼーションさせ、ハイブリダイゼーションした核酸分子に標識された蛍光体を検出し、前記蛍光体の個数を計数することを特徴とする、核酸分析方法。
- 解析対象の核酸断片群を一分子ずつ用意し、既知の塩基配列を有しかつ蛍光体標識された核酸分子を前記解析対象の核酸断片群とハイブリダイゼーションさせ、ハイブリダイゼーションした核酸分子に標識された蛍光体を検出することを特徴とする、核酸分析方法。
- 解析対象の核酸分子群を、一分子ずつ、空間的に分離された位置に固定する工程と、既知の塩基配列を有しかつ蛍光体標識された核酸分子を、前記解析対象の核酸分子群とハイブリダイゼーションする工程と、前記ハイブリダイゼーションの工程後に、前記蛍光体の蛍光を測定する工程を含むことを特徴とする、核酸分析方法。
- 解析対象の核酸分子群を、一分子ずつ、支持基体上の異なる位置に固定する工程と、既知の塩基配列を有しかつ蛍光体標識された核酸分子を前記支持基体上の核酸断片群とハイブリダイゼーションする工程と、前記ハイブリダイゼーションの工程後に、前記蛍光体の蛍光を測定する工程を含むことを特徴とする、核酸分析方法。
- 解析対象の核酸断片群を、微粒子上に、微粒子一つあたり前記核酸断片を一分子ずつ固定する工程と、既知の塩基配列を有しかつ蛍光体標識された核酸分子を、前記微粒子上の核酸断片とハイブリダイゼーションする工程と、前記ハイブリダイゼーションの工程後に、前記微粒子を支持基体上に固定する工程と、前記蛍光体の蛍光を測定する工程を含むことを特徴とする、核酸分析方法。
- 請求項1において、解析対象の核酸断片群は、個々の核酸試料ごとに壁で隔離されてはいない状態で、すべての核酸断片群が、既知の塩基配列を有しかつ蛍光体標識された核酸分子を含む同一の溶液と反応することで、ハイブリダイゼーションさせることを特徴とする、核酸分析方法。
- 請求項1において、前記蛍光体標識が、解析対象の核酸の種類ごとに、配合割合が異なった複数種類の蛍光体を含む微粒子であることを特徴とする、核酸分析方法。
- 請求項7において、特定の核酸種以外の核酸種に対しては同一の蛍光体標識を用い、前記核酸分子ごとに蛍光輝点数を計数した上で、総輝点数に対する特定の核酸種ごとの輝点数の比を算出することで、前記特定の核酸種ごとの存在量を評価することを特徴とする、核酸分析方法。
- 請求項7において、解析対象の核酸断片群に対して共通の蛍光体標識を施し、前記蛍光体とは異なる蛍光体で標識された既知の塩基配列を有する核酸分子をハイブリダイゼーションする工程を含み、前者と後者の蛍光体の輝点数の比を算出することで、前記解析対象の核酸断片の種類ごとの存在量を評価することを特徴とする、核酸分析方法。
- 解析対象の核酸断片群を一分子ずつ固定した微粒子を用意し、既知の塩基配列を有しかつ蛍光体標識された核酸分子を前記解析対象の核酸断片群とハイブリダイゼーションさせ、ハイブリダイゼーションした前記核酸分子に標識された蛍光体を検出することを特徴とする、核酸分析方法。
- 請求項10において、解析対象の核酸断片群を一分子ずつ固定した前記微粒子が磁気微粒子であり、前記蛍光体標識が、解析対象の核酸の種類ごとに、配合割合が異なった複数種類の蛍光体を含む微粒子であり、ハイブリダイゼーション後に、ハイブリダイゼーションしなかった前記蛍光体標識された核酸分子と前記磁気微粒子を分離した後、前記磁気微粒子上の核酸分子とハイブリダイゼーションした核酸分子に標識された蛍光体を検出することを特徴とする、核酸分析方法。
- 請求項10において、特定の核酸種以外の核酸種に対しては同一の蛍光体標識を用い、前記核酸分子ごとに蛍光輝点数を計数した上で、総輝点数に対する特定の核酸種ごとの輝点数の割合を算出することで、前記特定の核酸種ごとの存在量を評価することを特徴とする、核酸分析方法。
- 請求項10において、解析対象の核酸分子群に対して同一の蛍光体標識を施し、前記蛍光体とは異なる蛍光体で標識された既知の塩基配列を有する核酸分子をハイブリダイゼーションする工程を含み、前者と後者の蛍光輝点数の比を算出することで、前記解析対象の核酸の種類ごとの存在量を評価することを特徴とする、核酸分析方法。
- 解析対象の核酸分子群を、一分子ずつ、空間的に分離された位置に固定する手段と、既知の塩基配列を有しかつ蛍光体標識された核酸分子を、前記解析対象の核酸分子群とハイブリダイゼーションする手段と、前記ハイブリダイゼーションの工程後に、前記蛍光体の蛍光を測定する手段を具備することを特徴とする核酸分析装置。
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