JPS60500002A - 発癌遺伝子の解明およびそれに基づく検定法 - Google Patents
発癌遺伝子の解明およびそれに基づく検定法Info
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Abstract
(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるため要約のデータは記録されません。
Description
【発明の詳細な説明】
発明の名称
発癌遺伝子の解明およびそれに基づく検定法政府の支持
本明細書て記載する研究成果は、米国予防衛生研究所(NIH)の許可により支
持されている。
技術分野
本発明は分子生物学の分野であり、特に突然変異体対立遺伝子およびその対応す
る野生型の対立遺伝子特に発癌遺伝子および始原発癌遺伝子間の相違を明らかに
し、その相違を利用して検定する事に関する。
背景技術
化学発癌に関連した従来の研究成果は化合物の発癌力がしばしばその変異誘発素
としての能力と相関する事を示してきた。
McCann、 J、 Chat、 E+、 Yamasaki、 E、および
Ames、 B、 N、 Proc、’Nat1.Acad、Sci、USA
72: 5135−5139(1975);McCann、 J、およびAme
s、 B+N、 Proc、 Natl、 Acad−Sci。
USA 73 : 950−954 (1976) ; Br11g1es、
B、 A、 Nature261 : 195−200 (1976) ;およ
びBouck、 N、およびdiMayorca、 Cr、 Nature 2
64 : 722−727 (1976)を参照されたい。この事j主DNAが
発癌活性化の終局の標的である事を示そしている。このため、研究者はしばしば
”発癌遺伝子“と称さ几、その変fヒが発癌への変化に決定的に重要である癌細
胞中のDNAセグメントの同定2よひ研究を試みてきた。
2
フオームN工H3T3マウス線維芽細胞内へEJ膀胱癌細胞株からの腫瘍細胞D
NAが導入された。この方法により細胞から細胞へ細胞トランスフ万一メーショ
ンの表現型が移せる事が発見された。腫瘍DNAは受容NIH単層培養において
トランスフオームした細胞のフォーカスを誘導できるが、正常の非トランスフオ
ーム供与細胞71)らのDNAはフォーカスを生成しない。
5hih、 G、、 5hilo、 B、、 Goldfarb、 M、 P、
、 Dannenberg、 A、およびWeinberg、 R,A、 Pr
oc、 Natl、 Acaa、 Sci、 USA 76 :5714−57
18 (1979) ; Cooper、 G、 M、、 0kenqist、
S、およびSilverman、 L、 Nature 284 : 418
421 (1980) ;5hih、 C,、Pad、hy、 L、 C,、M
urray、 M、 J、およびWeinberg。
R,A、 Nature 290: 261−264(1981) ; Kro
ntiris。
27: 467−476(1981)を参照されたい。
これらの結果はEJ肺腫瘍細胞株DNA中存在する発癌遺伝子因子は明らかに正
常細胞のDNAには存在しない事を示している。
種々の部位−特異性エンドヌクレアーゼの処理による、EJ膀胱癌細胞株からの
発癌遺伝子の感受性または抵抗性を検討した研究は、その細胞トランスフォーメ
ーションにはある種の特別な供与I)NA配列が関係している事を示した。La
ne、 M、 A、。
5ainten、 A、およびCooper、 Cr、 M、 Proc、 N
atl、 Acad、 Sci。
USA78 : 5185−5189(1981) ; mよび5hi1o、
B、およびWeinberg、 R,A、 Nature、289 : 607
−609 (1981)3i1’+Mj60−500(102(3)を参照され
たい。分離および特定可能な発癌遺伝子のこの概念は、後にRobert A、
Weinbergの名前で1982年5月19日付で出願中の出願番号379
,721号に記載されている方法により、EJヒト膀胱癌細胞株から独立したト
ランスフォーミング遺伝子の分子単離により直接示された。
この出願中の出願に記載されている如く、EJ細胞株から単離されたDNAを、
ヒト膀胱癌発癌遺伝子およびマーカーのみを実質的に含有するマウス線維芽細胞
が選別されるまでNIH3T3マウス線維芽綱胞にトランスフェクションして連
続的に取り込ませる。この作業で用いられたマーカーはAlu DNA配列であ
り、ヒ)DNAにおいては約300,000回繰り返しているがマウス線維芽細
胞DNAには存在しない。このような種間トランスフェクションにより最終的に
マーカーを伴った目的とする発癌遺伝子を含有する細胞が選別される。このトラ
ンスフェクトされた細胞からの全てのDNAを用いラムグファージ内にゲノムラ
イブラリーをつくり、適当なキメララムダファージをヒトA1uマーカーに特異
的なプローブを用いて選択する。
この研究により、エンドヌクレアーゼBamH丁により生じる66Kbの長さの
DNAセグメントにEJ膀胱i%DNAの発癌遺伝子の活性が位置している事が
解明された。6,6KbセグメントをプラスミドベクターpBR322にクロー
ン化し、サザーン・プロット分析における配列プローズj′C使用する。これに
より正常ヒトゲノムに存在する類似の構造の配列から該発癌遺伝子が誘導された
事が示された。Goldfarb、 M、、 Shimizu、 Peruch
o。
M、およびWigler、 M、 Nature 296 : 404−409
(] 982) ;および5hih、 C,およびWeinberg、 R,
、Ce1l 29 : 161−169(1982)を参照されたい。このよう
に、発癌過程の間に正常細胞遺伝子の突然変異によりヒト膀胱発癌遺伝子が生じ
ると思われる。
EJ膀胱発癌遺伝子とその対応する正常細胞配列(″始原発癌遺伝子“)の比較
は、この発癌遺伝子がラット由来のHa rveyラット肉腫ウィルスのトラン
スフォーメーション遺伝子と類似しているという続いての発見により促進された
。Der、 G、。
Krontiris、 ’r、 G、およびCooper、 Cr、 M、 P
roc、 Natl、 Acad。
Sci、 USA 79 : 3637−3640 (1982) ; Par
aaa、 L、 F、。
343−347(1982)を参照されたい。このラット肉腫ウィルス遺伝子(
y−Ha−rasと名付けられている)はキメラウィルスゲノムの形成の過程に
おいてラットゲノムから得られたものである。5co1nick、 E、 M、
およびParks、 W、 P、J、 Virol。
13: 1211−1219(1974);および5hih、 T、 Y、、
Williams。
D、 R−、Weeks、 M、○、、 Maryak、 J、 M、、 Va
ss、 W、 C,および5co1nick、 E、 M、J、 Virol、
27: 45−55(1978)を参照されたい。この遺伝子の研究の過程に
8いて、v −Ha −ras フラットおよびヒト細胞相同体が単離された。
DeFeo、 D、、 Gonda。
M、 A、、 Young、 H,A、、 Change、 E、H,、Low
y、 D、 R,、5colnick。
E、 M、およびExlis、 R,W、 Proc、 Natl、 Acaa
、 Sci、 USA78: 3328−3332(1981);および、Ch
ang、 E、 H,、Gonda。
M、 A、、 Ellis、 R,W、、 5colnick、 E、 M、お
よびLowy、 D、R1Proc、 Natl、 Acad、Sci、 US
A 79. 4848−4852 (19i32)を参照されたい。ヒト細胞y
−Ha−rae相同体はEJ膀胱発癌遺伝子の正常前1駆体と正確に対応する
事が見い出された。
Parada、 L、 F、、 Tabin、 C,J、、 5hih、 c、
およびWeinbevg。
R,A、Nature 297: 474−479(1982)を参朋されたい
。
EJ発癌遺伝子およびその正常細胞対応物(c−Ha−rasと名付けられてい
る)の予備的な比較がなされた。Ellis、 R。
W、、 DeFeo、 D、、 Maryak、 J、 M、、 Your+g
、 H,A、、 5nih、 T、 Y、。
Chang、 E、 H,、Lowy、 D、 R,および5colnick、
E、 M。
J、 Vivol、 36 : 408−420 (1980)。この研究に2
いて、NIH3T3単層に塀えた場合正常MJ胞遺伝子からの分子クローンはフ
ォーカスを誘導しないのに対し、膀胱発癌遺伝子はトランスフェクトしたDNA
マイクロダラム当り約5X10”のフォーカスを形成させる生物活性を持つ事が
示されている。5hih。
C3およびWeinber[!、、 R,A、Cex129: 161−169
(1982);およびChahg、 E、 H,、Conda、 M、 A、、
Ellis、 R,W、、 5co1.n1ck。
E、 M、およびLowy、 D、 R,Proc、 Natl、 Acad、
、 Sci、 USAヱ旦: 4848−52(1982)を参照されたい。
この純然たる機能上の相違は2つのクローン間の明らかな構造的相違としては相
関しない。EJ発癌遺伝子クローンおよび非クローン化関連ヒト始原発癌遺伝子
の大まかな制限エンドヌクレアーゼ部泣地図作成では、EJ発癌遺伝子のトラン
スフォーミンダ活性を含有する6、6 Kb配列のすべてにわたって、この2つ
は基本的に区別できない事が示された。5hih、 c、およびWeinber
g、 R,A、 Ce1l 29: 161−169(1982)を参照さ6
れたい。後になされた精密な地図作成は2つの遺伝子の分子クローンの直接の比
較を可能に1−だが、やはり遺伝子の暗号付はヌクレアーゼを用いても相違は観
察されなかった。この相違は他の研究者により以前に証明されたタイプの、遺伝
子プール中に存在する遺伝子の機能とは無関係な多形性を現わすものとして説明
された。Goldfarb、 M、、 Si11m1zu、 Perucho、
M、およびWigler、 M、 Nature 296 : 404−40
9 (1982)を参照されたい。
このように、ヒト膀胱癌発癌遺伝子およびその正常始原発癌遺伝子の2つの構造
的に同様の遺伝子の劇的な機能上の相違が示されてきた。2つの遺伝子の構造上
の相違は従菊朱知であるが、機能的相違を産み出す相違は次の2つのうちの何れ
かの仕組による+つと推測された。即ち、機能上の変化は、遺伝子の発現を調節
している配列の変化によるか、もしくはトランスフ丁−ムした発現型の変化は遺
伝子の蛋白質をコードする部分の変化によるかである。第1の仮説は遺伝子の転
写または翻訳を上昇させ、高水準の普通ならば正常の蛋白質を産生ずるに違いな
いし、一方第2の仮説は変った蛋白質の合成を水製している。
両方の型の変化もまた観察される機能上の相違を創造する事に関係するように働
くかも知れない。
発明の開示
本発明は、従来ヒト膀胱癌を起こすことが示されているEJ発癌遺伝子およびそ
の始原発癌遺伝子間の相違を調べる事に関する。示される方法はどんな変異体対
立遺伝子およびその対応7j、1.胸60−500002 (4)する野生型対
立遺伝子間の相違を決定するのに応用できる;この方法は発癌遺伝子および始原
発癌遺伝子間の相違を決定するのに特に有効である。
最初に、EJ発癌遺伝子およびその始原発癌遺伝子間の劇的な機能の相違が調節
機構によるものか、または配列の相違にはるものかを決定する実験を実施した。
これらの実験により、前記遺伝子の調節の促進が細胞トランスフォーメーション
の原因ではない事を示すデータが提供された。それ故、劇的な機能変化は前記遺
伝子のDNA配列の変化によるに違いないと決定された。
N工H3T3線維芽細胞の細胞トランスフォーメーションの原因となる6、6K
bpEJの範囲を一連のヱZ(Σ二での遺伝子組換えにより350塩基対のセグ
メントにしぼった。この350塩基対セグメントについて、発癌遺伝子および始
原発癌遺伝子の配列がめられ、Xma I制限部位から60番目のヌクレオチド
の相違で説明される単一の塩基の置換が観察された。この通常Cz G Cとし
て存在するグリシン(G1y12)のためのコドンが置換され、バリンを発現す
るコドンのCTC配列に変化していた。
それ故、EJおよびその始原発癌遺伝子からの細胞DNA中の特定の相違の場所
がつきとめられ、対応するp21蛋白質のアミノ酸配列の相違もまた決定された
。
次に、DNA配列内のそのような変化を検出する検定法を開発した。一つの型の
検定法では発癌遺伝子または始原発癌遺伝子の両方の部位に特有の制限酵素(し
かし、他のものにはそうではない)を用い、そのDNA配列中の相違を検出する
。
これらの遺伝子により暗号化されたp21蛋白質もまた異っているので、p21
蛋白質中の変化した、または正常配列領域に、または発癌の間に生じる変化には
含まれないアミノ酸配列に特異的なポリクローナルまたはモノクローナル抗体の
如き血清学の試薬もまた発展できた。そのような血清学試薬はヒト膀胱発癌のた
めの非常に感度の良い試験を提供する種々のプロトコールに用いる事ができる。
同様に、これらの検定は他の変異体対立遺伝子により起こされる野生株の対立遺
伝子の変化を検出するのに用いる事ができる。
図面の簡単な説明
図IAは正常およびトランスフオーム膀胱細胞の両方から得られた総細胞RNA
の電気泳動ゲルパターンを示し、そのパターンはオートラジオグラフィーにより
視覚化した;旦すハ、v−Ha−μis p21蛋白質に対するモノクローナル
抗血清を用い、EJおよび正常膀胱細胞両方からの代謝的標識蛋白質溶解物の沈
降により得られた電気泳動ゲル・eターンを示す;
図8Aは、pEJまたはpECでトランスフェクトした4つの細胞株からの細胞
DNAの電気泳動ゲルパターンを示す。
図2Bは、同一の4つのトランスフェクトした細胞株からの総ポリアデニル化R
NAの電気泳動ゲルパターンを示す;図2Cは同一の4つのトランスフェクトし
た細胞株の細胞溶解物かもp21蛋白質免疫沈降した電気泳動ゲルパターンを示
す;
の細胞株を500倍の倍率の位相差顕微鏡を通して得た写真である;
図4はpEJまたはpECでトランスフエツトした細胞からの免疫沈降1)21
蛋白質の電気泳動ゲルパターンを示す;・・に示したものであり、その遺伝子組
み換え体で実施した実験のトランスフェクションおよびトランスフォーメーショ
ンのデータの概要もまた含んでいる;
図6はインビトロでEJ発癌遺伝子クローン(pEJ)およびその相同始原発癌
遺伝子クローン(pEC)の組み換え体でトランスフェクトした細胞から免疫沈
降したp21蛋白質の移動の電気泳動ゲルパターンを示す;
図7はEJ、)ランスフォーミング遺伝子およびその非−トランスフォーミング
細胞相同体の分子クローンのDNA配列の比較を示しており、また各々の発現す
るアミノ酸配列も示す;図8はNaeI制限酵素で切断されるEJおよびEC遺
伝子のクローンのフラグメントの相違を示した電気泳動ゲルレバターンはトラン
スフォーミング遺伝子で暗号化された蛋白質に対する抗血清を用いる検定プロト
コールを示したブロックグイアグラ前(C指摘した如く、出願中の米国特許出願
第379,7:0号に10
記載されている方法により、EJ膀胱癌細胞株から発癌遺伝子が単離された。発
癌遺伝子は6.6Kbを含みNIH3T3マウス線維芽細胞線維上細胞ンスフ万
一ムさせる活性を持つ事が示された。ここに記載した研究はこの従来の研究の続
きであるから、この先行する出、頭巾の出頭番号第379.721号はそのため
説明的に本明細書に含まれる。
ここにおいてパ発癌遺伝子”の用語は、細胞中での発現型が細胞を正常細胞から
癌細胞へ変換する事を誘導する遺伝子配列を意味するものとして用いる。同様に
、用語゛始原発癌遺伝子′。
は正常、非癌細胞の正常ゲノム中に存在しており、適当な方法で変化させた場合
発癌遺伝子になる能力を持つ遺伝子配列を意味する。
米国特許出願第379.721号に記載されている方法で単離した完全な発癌遺
伝子クローン(pEJ)およびその正常ヒト相同体クローン(pEc)の配列決
定は、これら2つの遺伝子の配列の単純な比較には用いられない。発癌遺伝子お
よびその正常始原発癌遺伝子相対物配列は別々の個体から得られたDNA5であ
るので、これらの間の多くの配列の相違はこの座位における自然に存在する単な
る多形性を反映しているかもしれない。他の配列の相違は発癌の間に受ける突然
変異傷害の結果・フ・もじれず、それは機能的に不活性であり、活性化過程、に
は重要性を持たない。
発癌遺伝子および始原発癌遺伝子間の有意な相違が調節の相違((よるかどうか
を決定する為、正常ヒト膀胱上皮細胞株からのc−PLa−ras始原発癌遺伝
子(EC)の発現と、EJでトランスフ万一ムされた膀胱細胞中の発癌遺伝子の
発現の比較を行った。用いたHbl−5膀胱上皮@胞は、5ケ月のヒト膀胱から
得られた不活性化NIH3T3フィーダーし・キー上で増殖させた初代組織培養
のものである。この培養細胞を新鮮ヒト膀胱組織から成長させると、遷堅的な膀
胱上皮(τ期待さ肚るいくつかの性(質を示した。それは基礎にある間質1質が
なく、その結果、膀胱癌の由来した細胞に厳密に相当するものである。
総細胞RNAが正常およびトランスフオームした膀胱細胞から調製された。ホル
ムアルデヒドゲル上でRNAを展開し、ニトロセルロースフィルターに8bし、
ニック〜トランスレートシたEJ発癌遺伝子クローンでフィルターをプローブし
、転写RNAを分析した。用いた具体的方法は以下の如くである。
総ポリアデニル化RN1.まVarmu8らの技術:Cより調製した。
Varmus、 H,E、、 Quintrell、 N、および0rtiz、
S、 Ce1l 25 :23−36(1981)を参照さり、たい。次に、
4マイクログラムのRNAをホルムアルデヒドゝ含有2パーセントアガロースゲ
ルを通した電気泳動により分画し、ニトロセルロースへ移行させる。ニー特異プ
ローブは、pEJをBamHIで切断し、生じる断片を1パーセントアガロース
を通して分1面し、6.6Kb断片をNaIおよびガラスピーズで抽出すること
により調製した。
ニック−トランスレートしたフラグメント(6,6X 1107cp/マイクロ
グラム)を固定rヒしたRNAKアニールした。Rigby。
2
い。プローブと相同のバンドはオートラジオグラフィーにより視覚化する。分子
量は、アデノウィルスレイトプロモーターのインビトロ ラン−オフ転写(Cよ
り得られたマーカーとの比較尾より決定した。Manley、 J、 L、らP
roc、 Natl、 Acad、 Sci。
USA 77: 3855−3859(1980)を参照されたい。
図IAI、12つの細胞型中のc−Ha−三二特異RNAの相対レベルを示す:
レーン1、EJ!:fB胞からのRNA;レーン2、Hbl−5細胞からのRN
A0観察される如く、同じレベルのRNAが2つの培@1剖胞で検出され、転写
されたサイズは1.2 K1:+でルトンの質量の蛋白質(p21と名付レナら
れている)である。
EJ:I;よび正常膀胱細胞の両方からのp21蛋白質溶解物の泳動速度を分析
する実験を行った。v−Ha−ras p21蛋白37((対するモノクローナ
ル抗血清を用いた。Furth、 M、 E、、 Davis。
免疫沈降が必要とするより過剰の抗体量を使用した事は対照実験(・こより確認
した。結果を図IBに示す。
具体的には、培養細胞を12時間35S−メチオニンで標識した。その後1容弊
物を調製し、非免疫皿清(レーン1aおよび2a)、Ha、 −Mu S Vで
コードされたp2−1を沈降させ、しがしKi−MuSVてコードされたp21
は沈降させないモノクローナル抗血清(Yi3−238)(レーン1bおよび2
b)またばHa=MuSVおよびK〕−MuSVのp21を両方検出するモノク
ローナル抗血清3
(Y13−259)(レーンICおよび2c)で免疫沈降させる。
5hih、 T+Y、、 Weeks、 M、○、、 Young、 H,A、
および5colnick。
E、 M、 Virology 96 : 64−79 (1979)を参照さ
れタイ。試料当り20X106cpmの溶解物を125パーセント5DS−7ク
リルアミトゝゲルの電気泳動で分離した。
図IBはEJ細胞クローン(レーン1、a−c)およびHbl−5細胞(レーン
2、a−C)の細胞溶解物から免疫沈降したp21蛋白質の比較を示す。これら
のデータは正常膀胱1@胞からの抗−p21血清により放射原職蛋白質の少くと
も2つのバンドが特異的に免疫沈降した事を示す。膀胱癌細胞の蛋白質パターン
の詳細な解析によりバンドの複雑な配列が明らかになった:近い間隔の2重バン
ドが2対。p21バンドの強度を非特異的に沈降させたバックグラワンドゝのバ
ンドの強度の比較により、正常Sよび癌削胞のp2]蛋白質は同程度の計存在す
る事が明らかとなった。
上記のデータは転写の活発化がEJ発癌遺伝子により示される新しい活を生の原
因ではない事を示している。この結論は用いたハイプリグイゼーノヨンの灸訃下
、発癌遺伝子プローブがヒトc−Ha−ras遺伝子の転写物に独占的に反応す
るという事実に一部依存している。蛋白質のデータの解釈はあまり明確ではない
が、両方の細胞がHarvey −!I′t−異血清に反1L性のある同しよう
な量の蛋白質を持ち、これらの蛋白質は集合的にp21″′と称される事は明ら
かである。
膀胱上皮細胞が膀胱癌細胞の正常前駆体の代表ではないとい14
トランスフォーメーションを誘導する事なく高い水準で発現され、第2の細胞種
に16いて不適当に発現される場合にのみこの表現型を達成する可能性があるの
で、上記可能性は解釈を難がしくする。それ故、2つの遺伝子を同じ細胞のバッ
クグラワンド下において転写および翻訳の程度を測定した。
両方の遺伝子の分子クローンをNIH3T3細胞に導入した。
EJ発癌遺伝子を獲得したコロニーは容易にそのトランスフオームした形態から
同定される。しかしながら、正常対立遺伝子のクローンを獲得した細胞は、挙動
上の明瞭な変化による同定をすることができない。
この為、優性で選択できるEcogpt遺伝子のクローンを10倍過剰量のクロ
ーン化EJ発癌遺伝子またはクロン化始原発癌遺伝子(pEC)と−緒にNIH
3T3細胞にトランスフェクトした。特に2×106細胞当り、75マイクログ
ラムのNIH3T3キャリアDNA、500ngのpEJまたはpEc DNA
、および50n7のpsVZgptを用い、既知の技術を用いトランスフェクシ
ョンを実施した。Graham、 F、 L、およびVar+ der Eb、
A、 J。
Virology 52: 456−471(1973) ;およびAnder
sson。
P、、 Co1afarb、 M、 P、およびWejnberg、 R,A、
Ce1l 16 : 63−75(1979)を参照されたい。各々の場合、
Ecogpt;遺伝子により与えられるミコフェノール酸への抵抗性でコロニー
を選択USA 73: 2072−2076 (1981)を参、照されたい。
非運がセグメントの導入が選択可能遺伝子との共トランスフェクションにより確
められるのでこの戦略を用いた。Wigler。
M、らCe1146: 777−785(1,979)を参照されたい。この例
では、EcogptおよびpEJの共トランスフェクションにより誘導すれる7
5パーセントのミコフェノール酸耐性コロニーが形態的にトランスフオームして
いる事が観察された:予期した通り、pECによる共トランスフェクション後現
われろコロニーはトランスフオームしていなう1つだ。
両方の種類のコロニーの細胞DNAをpECまたはp、 E J配列が存在する
か否かのために分析した。クローン化発癌遺伝子または始原発癌遺伝子の各々の
無傷のコピーから6.6Kbフラグメントを遊離する事が期待されるエンドゝヌ
クレアーゼBamHIで各々のDNAIQマイクログラムを消化した。消化され
たDNAは1パーセントアガロースゲルを通して分画し、ニトロセルロース−ぐ
−・ξ−に移す。5X106cpmのニー特異プローブ(@に記載したものと同
じ)をフィルターに結合したDNAとインキュベートする。結果は図2Aに示し
てありレーンは:レーン1、NIH3T3 DNA;レーン2および3、pEJ
でトランスフェクトした細胞株からのDNA: EJ/Gpt−2t2)および
EJ/Gpt −3(3) yレーン4および5、pECでトランスフェクトし
た細胞株からのDNA : EC/Gpt −1’4)およびEC:/Gpt−
5・:5)。
正常マウスras遺伝子相同体はpEJプローブと非常に弱くハイブリダイズす
る。Parada、 L、 F、、Ta、bin、 G、 J、、 5hih。
C0およびWeinberg、 R,A、 Nature 297 : 474
−479 (1982)を参照されたい。従って、その存在・は結果に不鮮明さ
をもたらさない。トランスフェクションたpBR322配列がデータの解釈6
す、プローブとして使用した。始原発癌遺伝子でトランスフェクトされた非トラ
ンスフオームコロニーの75係およびトランスフオームした発癌遺伝子でトラン
スフェクトされたコロニーの全てが、6.6Kbの泳動部にpEJ−相同体配列
の存在を示した。
陽性のコロニーはまたプローブにアニールされた他のサイズのBamHIフラグ
メントを持つ。これらはトランスフェクション過程の間に分解したクローンのコ
ピーである。
発癌遺伝子の無傷のコピーを含有する2つの細胞株および始原発癌遺伝子の無傷
のコピーと殆んど等しいものを含有する2つの細胞株を更に別の分析の為に選択
する。図3 ic 50 Q Xの倍率での位相差顕微鏡で撮ったこれらの細胞
株の写真を示した。
pEJでトランスフェクトした細胞株はコンフルエントの状態(EJ/Gpt−
2,写真3A)およびサブコンフルエント(EJ/Gpt−3,写真3B)で示
しである。pECでトランスフェクトした細胞株もまたコンフルエン) (EC
/G pt −5−写真3G)およびザブコンフルエン) (EC/Gpt −
L写真3D)で示しである。
細胞総RNAをすべてのトランスフェクトした細胞株から調製する。次いで、R
NA調製物をホルムアルデヒドゲル上で泳iaL、ニトロセルロースフィルター
に移し、ヱー特1DNAでプローブした。前に記載した方法を用い、結果を図2
Bに示した(図中のレーン(Cおいて:レーン1.NI’H3T3細胞ρ)らの
RNA;レーン2. E J、、/Gpt −2細月包;し′−ン3.EJ/G
pt−’3細バ包;レーン4.EC/Gpt−1細戸包;レーンs、EC/Gp
t−5細胞)。
これらの細胞中のp21のレベルもまた試、験した。細胞溶解7
物を調製し、免疫沈降させ、前に記載した方法で分析した。結果を図2Gに示し
た:非−免疫血清(レーン1.2.7.8 )またはHa −MuSV p21
を沈降させるモノクローナル抗血清(Y13−238) (レーン3−6)を用
いて免疫沈降した。細胞溶解物ばEJ/Gpt−2(レーン1.3 ) ; E
CM、/Gpt −1(レーン2,4.);EJ・弓pt−3Cレーン5,7)
およびEC/Gpt −5(レーン6.8)から調製した。観察される如く、p
21に対する。モノクローナル血清はpECおよびpEJ トランスフェクト細
胞中の同量のp21蛋白質を沈降させる。
これらのデータは、これら特定のp、EJトランスフェクト細胞中で、獲得され
たpEJのコピーの一部のもののみが活性であり、一方で他の細胞中のトランス
フェクトされたp E G遺伝子の全てのコピーが活団である可能性も形式上は
否定できないので、細胞中で2つのクローンrヒ遺伝子が同じ速度で転写される
かどうかという質問だ完全に答えるわけではない。そのような場合、壊察される
蛋白質またはFfNAの同じようなレベルが正確に2つの遺伝子の固有の転写活
性を反茨(−ているわけではない。
しかしながら、一つの点は明確になつ1こ:E J −%定p21 ノアルレベ
ルでトランスフ万一メーゾヨンが誘導さ、?t1一方1同じレベルの始原発m遺
伝子−特定のp2]は細胞の表現型に影響を及ぼさない。p2]蛋白質はこれら
の遺伝子で暗号さイするたた1つの明らかな遺伝子産物てちるのて、EJ発癌遺
伝子および始原発癌遺伝子間の機能の相違はp2]蛋白質中の調造変化1(誘導
されるに違いないと結論される。反対]8
(て、調節的変化は発癌遺伝子のトランスフオーム化活性に決定的でないように
思われる。
このため、以前に検出されていた異った細胞からのp21蛋白質の移動速度の僅
かな変化(図1bおよび2c)に新たな重要性が与えられる。それ故、p21蛋
白質を移動の相違がより容易に分離できるような条件下で再分析した。結果を図
4に示した。詳細には、細胞を3時間353−メチオニンで代謝的に標識する:
細胞溶解物を調製し、免疫沈降させ、前に記載した如く分析する。細胞株EJ/
Gpt−3(レーン1,3)および細胞株EC、/Gpt −1,(レーン2,
4)からの溶解物をモノクローナル抗p21抗血清Y13−238(レーン1.
2)または非免疫血清(レーン3゜4)で沈降させる。模式的泳動図(レーン5
: EJ/Gpt −3;レーン6 : EC/Gpt−1)に動力学的デー
タおよび以前(で公表された実験に基づいての検出されたp21バンドの相対的
位置およびこれらのバンドの関係(矢印)の両方を示I−た。5hih。
T、 Y、らJ、Virol、42: 253−261(1982)を参照され
たい。
図4のデータはpEJおよびpECでトランスフェクトされたものでは各々p2
1の2つのバンドが現われる事を示している。
より高い分子量のpEJトランスフエク)p21蛋白質はより高い分子量のpE
Cトランスフェクト蛋白質よりゆっくりと移動し、より低い分子量のpEJトラ
ンスフェクトp21;まより低い。
分子量のpECECトランスフエフトル2りより(りつ(り移動した。各々の場
合よりゆっくり移動するバンドばより急速に移動するバンドの動力学的前、…体
の如く行動した。v−Ha−rasのp21蛋白質についての相当する従来デー
タは、高分子量側のバンドは翻訳後に切断を受けて低分子量側のより速く移動す
るバンドに変ることを示している。5hih T、 Y、らJ、 ViroI4
2 :253−261(1982)を参照されたい。
これらp21蛋白質は全部少しもリン酸化されていないと思われるので、pEJ
およびpEC蛋白質間の移動速度の相違にはアミノ酸の数まf暑まコンホメーシ
ョンの変化が寄与する可能性が最も高い。
図4のデータSよび模式図は正常およびトランスフ万一ムした膀胱細胞で観察さ
れるp21蛋白質の複雑さく図1b)の説明を提供する:正常細胞は始原発癌遺
伝子の発現による2つのバンドを示し;癌細胞は4つのバンドを示すように思わ
れ、2つはこれらの細胞の発癌遺伝子により特定され、2つは他の相同染色体の
正常始原発癌遺伝子による。
発癌遺伝子および始原発癌遺伝子からのp2121蛋白質観察される物理的相違
は、p21蛋白質における機能的に重要な変化を反映するか、またはそうではな
く、トランスフォーメーションの過程に影響を及;ぼさない相違を反映している
可能性もある。これを決定する為、蛋白質の移動速度の変fヒを支配し、遺伝子
機能の変化を起こすような発癌遺伝子の遺伝子領域をつきとめるための一連の独
立した実験を計画した。これらの実験はインビトロでの2つの遺伝子のクローン
間の相同的+IJ1換えに基づ(ものである。
実検の原理は、発癌遺伝子クローン(pEJ)から制限フラグメントを取り出し
、これを用いて始原発癌遺伝子クローン(pEC)0
の相同部分と置き換えることである。同時に、始原発癌遺伝子クローンのフラグ
メントを発癌遺伝子クローン中にスプライシングし、逆の組み変えも実施する。
これらの組み換え構成物のトランスフオーム活性をトランスフェクション検定で
E%Jjる。
検定は発癌遺伝子のフラグメントを始原発癌遺伝子クローン中に組込んだときト
ランスフオーム活性を発揮し、反対:・こ、逆の組換えにおいて、対応する始原
発癌遺伝子フラグメントを発癌遺伝子クローン中に挿入した場合活性を喪失する
事を測定する。
図5に実施した特定の構成のダイヤグラムおよび得られたトランスフェクション
およびトランスフォーメーションのデータを示した。
図5の制限地図は、1)BR322ilこ挿入した56Kb Ba、mH工断片
内の種々の酵素に対する切断部位を示した。明瞭に4定されていない幾つかの他
の部位にも作用するXrna 丁を除いて、酵素に対する全ての特異的部位を示
した。13stE IIの最初の部位とKpn1部位との間のXma1部位のみ
を示した。地図上の黒く塗りつぶした箱型部分は暗号付けしているエフノンの場
所を示している。
図5において、pEJから誘導されたセグメントを塗りつぶした帯として、pE
Cかものセグメントを白抜帯としてI)EJ/pECキメラを示した。各々の示
したフラグメントを得るために必嘔とされる完全または部分消化によって、示し
た酵素てpEJ@dよびpECを切断する。生成物を12パーセントアガロース
を通す電気泳動により分離し、N訂を溶融して溶離させ、ガラスピーズ:fC吸
着させる。pBR322を含むフラグメントを子牛腸ホスファターゼで処理する
。図5・ンて示したフラグメントは酵素T4−DNAIJガーゼによりまには酵
素を用いないモノク連結で結合した。a−Bの構成は2分子の連結で行った。f
の構成は同時((3つのフラグメントを混合し、gおよび)1においては同時に
4つのフラグメントを混合ニーた。連結混合物は直接大腸菌のHBIOI味中ヘ
トランスフオームした。モック連結からのコロニーが連結の2パーセント以下で
あるようなコロニーについて、適当な制限地図を持つコロニーの存在を分析した
。
各々のクローンの201]fでN工H3T3細胞を前に記載した如くトランスフ
ェクトし、10−14日でフォーカスカー見えてくるまで選別せずに保持(−だ
。トランスフェクションの結果は図5の第1欄に示した。第2欄はスクリーンさ
れ、その後NIH3T3細胞にトランスフェクトされた独立したバクテリアコロ
ニーの数を示している。
トランスフオーム活性のあるクローンは、pEJ:tgよひI)ECの一方また
は他方から由来する夾雑物によるものでrく、pEJおよびpECの結合物由来
のモメラであることを立証することが重要でちる。これは3つの方法で行った。
2つの7ラグメントを同時(て連結するより単純な構成:て名いては、増幅さ7
tた組換えクローンにより得られた結果は、連結反応での来増幅生成物およびリ
ガーゼで処理されていない単流されたフラグメン1、を含むモノク連結での未増
幅生成′吻を直接トランスフェクトする事により立証される。第2の確証は、そ
れぞれの細胞遺伝子を含むプラスミドp E J JvよひpEGは、pBR3
22プラスミド゛ベクターに反対方向罠挿入されるという事実に開存している。
22
それ故、組み換え遺伝子の一つの両親の起源はフランキングプラスミド領域の特
徴的制限消化により決定される。pEcの混在はそれ自体では為両回の結果を与
え得ないので、始原発癌遺伝子フランキング配列を持つ活性クローンはトランス
フオーム活性の遺伝子部分を得た結果生じたに違いない。最後に、その結果は連
結反応から得られる幾つかの独立したクローンで確認された。
図5に観察される如く、350ヌクレオチド8の長さの遺伝子領域が発癌遺伝子
から始原発癌遺伝子の対応する領域に移された時、後者に活性を与える事が最終
的に同定された。この領域はXma エンドヌクレアーゼの最初の部位がらKp
nI部位に拡がっている。この領域の55パーセントは暗号付けしている最初の
エクソンであり、10パーセントはエクソンへの5′であり、35パーセントは
最初のイントロンの一部である。
先行実験は発癌遺伝子および始原発癌遺伝子で暗号付(すされたp21蛋白質の
移動の相違を同定した。今、トランスフオーム化障害を含む短い領域の遺伝子が
決定された。従って、この領域がまた蛋白質を変化させる特異性を持っているか
どうかを確める事が重要になってきた。それ故、±ye五二で組み換えた生成物
でトランスフェクトした細胞の免疫沈降を行った。
NIH3T3細胞をEJ膀胱癌発癌遺伝子、その正常始原発癌遺伝子、または2
つの遺伝子間の組換え体でトランスフ万一ムし、まず生物学的に035パーセン
ト寒天甲でクローン化し、その後18時間353−メチオニンで代謝的に標識し
た。溶解物を調製し、Ha−MuSVで暗号付げされたp21を検出し、K1−
231、FSBa60−50[1002(8))、4uSVで暗号付けされたp
21は検出しないモノクローナル抗体(Y13−172)で免疫沈降する(TC
A−沈澱可能物のカウントは5X106cpm)。Furth、M、E、、Da
vi、d、L、J、、Fleurdelys。
B、および5colnick、 E、 M、 J、 Virol、、 43:
294−v304(1982);巧よび5hih、 T、 Y、、 Weeks
、 M、 0.、 Young、 H,A。
および5colnick、 E、 M、 Virology 96 : 64−
’79(1979)を参照されたい。溶解した免疫沈降物は、次に12パーセン
)SDS−ホリアクリルアミドゲルで分離する。その結果を図6に示す:レーン
1−7a、抗体なし;レーン1−7J抗Harvey p21 モノクローナル
抗体。細胞溶解物ば: NIH3T3細胞(レーン1);始原発癌遺伝子[:
Payne、 G、 S、、 Courtneidge、 s、 A、、 Cr
1tt−endon、 L、 B、、 Fadly、 A、 M、、 B15h
op、 J、 M、およびVarmus。
H,E、Ce1123: 311−322(1981)に記載されているLTR
−活性rb3Kb Sac Iフラグメント〕でトランスフェクトサれた細胞(
レーン2);EJ発癌遺伝子(pBFl中の66Kbフラグメント)でトランス
フオームされたクローン504−17(レーン3);始原発癌遺伝子IKbSa
clフラグメントをEJ発癌遺伝子3KbSaclフラグメンI・に連結したも
のでトランス72r−ムされたクローン511−74(レーン4);EJ発癌遺
伝子のX)1.01部位から第2のBstE ■部位に拡がるフラグメントを相
同フラグメントが除去された始原発癌遺伝子のクローンに連結したものでトラン
スフオームしたクローン510−9および5 ]−0−13(レーン5.6);
充よびKpn1部位の左側のEJ発癌遺伝子をこの部位の右側の始原発癌遺伝子
に連結したものでトランスフオームしたクローン508−8 (し〜ン7)。
図6に観察される如く、Xho−BstEl[、Sac I −8ac I、お
よびBs t E II−Kpn1組換え体でトランスフェクトされた細胞から
の溶解物に含まれる蛋白質はすべてEJ蛋白質と一緒に9動し、EC蛋白質から
のものと異った移動度であった。培養物を18時間標識すると、より低い分子量
の形のp21が高いレベルで標識され、動力学的に不安定なより高い分子量の形
へ標識された量は検出不能であった。得られたデータから、発癌遺伝子(でよる
トランスフォーメーションの表現型および電気泳動移動の分離環化には関連があ
り、およびこの2つはDNAの同じ350nt(ヌクレオチド)セグメントで暗
号されていると結論される。変化した移動速度は機能的に重要な蛋白質の変化を
反映しているのではないかと考えられる。
短い(350Kb)フラグメントが生物的意味を持っている事が示されたので発
癌遺伝子および始原発癌遺伝子からのD N Aの配列を決めた。5sifらの
前後ジデオキシDNA配列決定方法およびMaxamおよびG11bertの化
学的方法で配列を決定した。5eif、 1.、 Khoury、 G、および
Dhar、 R,Nucl、 Ac1d Res。
8 :22252238 (1980) ;およびMaxam、 A、 H,お
よびG11bert、 w、 Proc、 Natl、 Acad、 Sci、
USA 74 : 560−564(1977)を参照されたい。結果を図7
に示した、図中暗号付けDNAストランドを相当するアミノ酸配列と滲に示しで
ある。
EJと始原発癌遺伝子とは、コト゛ンおよびアミノ酸の双方が異なることが示さ
れている。
図7に観察される如く、既知の最初のエクソンのp21暗号付は領域中(特にX
ma切断部位から60番目のヌクレオチド゛)5
に2つのDNAセグメント間の唯一の相違があった。それは正常ラットおよびヒ
トc −Ha−ras遺伝子においてグリシンを暗号化するトリプレットに起こ
っている。EJ発癌遺伝子に観察される配列はバリンを暗号化している。それ故
、この変化はp21蛋白質の機能の変化およびEJ膀胱癌で起こるc −Ha−
ras遺伝子の発癌遺伝子活性化に対応する。
この唯一の塩基変化の結果、2つの異った部位−特異性エンドヌクレアーゼの切
断部位が変化する。始原発癌遺伝子にはGCCGGG配列が現れ、これがエンド
ヌクレアーゼNaelの認識部位となる。この配列はまたエンドヌクレアーゼH
palの認識部(QCCCGも含んでいる。これら両方が発癌遺伝子では変化す
る。何故ならば、相当領域の配列がGCCGTCになっているからである。
Nae lエンドヌクレアーゼを個々に用い2つの配列の間の相違を立証する。
NaelはHpaJよりDNAを頻繁に切j析しないのでHpa lの代りにN
ae [を用いた。期待される如く、pECクローンの挿入断片はpEJ相対物
より1つ多い切断部位を示す。この事はまたヱyeムo組換えクローンの遡及検
定を提供する。
トランスフ万一メージョンおよび異常なp2]啓動を指令する対立遺伝子は、こ
の都立でのNae■切断を許さない対立a嵌子と正確に同一視される。
図8はEJ発癌遺伝子およびその対応する始原発癌じ■成子のNae I fj
ll限酵素検定の結果を示す。記載した方法iL′Cより、始原発癌遺伝子には
Nael制限゛部位が存在し、発癌遺伝子iCより生じる変化でそれが消失して
いる事か決定された。発癌遺云子26
(pEJ)および始原発癌遺伝子(pEc)および各々がクローン化されている
プラスミド簀pBR322)の分子クローンを既知の方法で各々純化する。各々
1マイクログラムを酵素NaeIにて切断し、生じるフラグメントを15パーセ
ントビス−アクリルアミドゲルを通しての電気泳動により分離する。ゲルは色素
エチジウムプロミドを入れる事により染色し、紫外線下に写真撮影した。
図8のレーンは次の通りであるニレ−71は既知のサイズのパン[パを産生ずる
マーカーレーンとしてφX174DNAを酵素HaelIIで切断;L/−72
はpBR322をNaelで切断し、プラスミドゝベクター由来のフラグメント
を示し;レーン3はpEJDNAをNaelで切断;2よび、レーン4はpEc
DNAをNae 1で切断。
pEJ DNAには分子量1200塩基対と同じ移動をするバンドが含まれるが
、それはpECレーンでは消失している。しかしながら、pECレーンは2つの
余分のパン[゛があり、1つは400塩基であり、そして他方は800塩基の長
さであり、それはpEJレーンでは消失している。このように、pEc中のNa
e1部位(1200bpバントゝを400および800塩基の2つの〕Sンドに
切断する事を許す)はEJ発癌遺伝子の創造により失なわれる。
p21蛋白質ににニー1−るバリンのグリシンへの羊純な置換では、p21蛋白
質の機能面にどけるそのような重大な変化が起こるとは考え難いかも知れない。
それにも拘わらず、幾つ0・の考察によ扛ば、この構造変[ヒンては重要性があ
るように思われる。その第1の根拠は、ヒ) c−Ha−ras遺伝子、ラット
c−Ha−ras遺伝子およびHarysy肉腫ウィルスのv−Ha−ra、s
発癌潰伝子で暗号化されたp21のこの領域の比較から生じる。上記2つの細胞
遺伝子の第1のエクソンで暗号化された37残基のアミノ酸配列は同一であり、
この領域の偉人な進化の保存を示している。しかしながら、Harvey肉腫ウ
ィルス発つ遺伝子の分析でラットの遺伝子とこの領域でただ一つの位置が異って
いる事が明らかj(なり、それはEJ発癌遺伝子で変化していたものと正確同じ
残基がグリシンからアルギニンに変換していた。従ってこの決定的残基の変化は
そのラット細胞前駆体からのv−Ha−ras遺伝子の活性化および正常ヒト相
対物からのEJ膀胱発癌遺伝子の活性化の両方に重要だと推測される。同様の変
化が二遺伝子ファミIJ−の他のメンバーのKirstenネズミ肉腫のV−に
1−=遺伝子の発癌遺伝子活性化においても重要である。
Kirsten )ランスフ万一ム活性遺伝子は非常1c v −Ha −ra
s遺伝子:テ類似している。Dhar、 R,、Ellis、 R,W、、 5
hih、 ’r、 y、。
○roszlan、 S、、 5hapiro、 B、、 Maizel、、
J、、 Lowy、 D、 R,および5colnj、ck、 E、 M、 5
cience 217: 934−936(1982)を参照されたい。v −
Ki −rasのp21およびv −Ha−rasのp21間の唯一の相違:ま
最初の36アミノ酸の12番目でありKj、r S tenにおける残基はセリ
ンである。Tsuchida、 N、、 Ryder、 T、および0htsu
bo、 E、 5cience 217 : 937−939(1982)を参
照されたい。これはEJおよびHarvey肉腫ウィルスが暗号化したp21に
26ける変化と正確に同じ部位である。v−Ki−ras8
発癌遺伝子の活性化には12番目のグリシンの他の新しいアミノ酸残基への変換
が含まれている事が推測されている。
前記推測の第2の根拠は、観察された特定のアミノ酸変化の側鎖を欠いているの
で20のアミノ酸の中では池と異なる構造の代表である。その結果、ポリハプチ
ド鎖は極端におれたり、たたみ込まれる事を可能ならしめ、アルファーヘソック
スの破壊に最も関与する。Cantor、 G、 R,およびSchimmel
、 P、 R。
Bi、ophysical Chemistry、 Vow、I、 p 303
. W、 H,Freemanand Co、、 San Francisco
(1980)を参照された℃1゜それ故、バリンまたはアルギニンによるグリシ
ンの置換は蛋白質の局部的立体化学に急激な変化を示す。
12番目の残基のグリシンの消失はp21蛋白質の必須な領域の有意な変化を示
す事が信じられている。その第1の結果として、この変化は蛋白質のコンホメー
ションのずれを起こし、それが更にp21蛋白質の異常な電気泳動の移動や生合
成の変化につながる。第2のより重大な結果として、p21蛋白質の機能に対す
る重大な影響が生ずる。この変化がp21と細胞標的との相互作用に影響するの
はありそうな事でちる。他の嚇−のアミノ酸変化が細胞および生体生理学に絶大
な効果を示した先例が存在する。これらの内最もよく知られているのは鎌状赤血
球圭侯群であり、それはグルタミンのバリンへの変換が赤血球内のヘモグロビン
の溶罫俳に影響を及、・了している。
ここに記載した発見は、発癌:Cおいてかなめとなる出来事と9
しての過剰調節を示す一連の最近の実験に反駁するように思える。そのような実
験には、鳥類のレトロウィルスの白血病誘発の間にmyc始原発癌遺伝子の活性
化[:Neel、 B、 G、、 Hayward−。
W、 S、、 Robinson、 H,L、、 Fang、 J、およびAs
trin、 s、 %。
Ce1123: 323−334(1981) :およびPayne、 Cr、
S、、 Court−neiage、 S、 A、、 Cr1ttend、o
n、 L、 B、、 Faaly、 A−M、、 B15hop。
J、 M、およびVarmue、 H,E、 Ce1123: 311−322
(1981)を参照されたい〕;およびレトロウィルスのLTRプロモーターお
よび細胞始原発癌遺伝子のヱ臣旦二での融合でトランスフオーム活性遺伝子が生
ずることの実証1: DeFeo、 D、。
G、)nda、 M、 A、、 Young、 H,A、、 Cha、ng、
E、 H,、Lowy、 D、 R,。
5colnick、 E、 M、およびEllis、 R,W、 Proc、
Natl、 Acad。
Sci USA 78: 3328−3332(1981) ; Blai、r
、 D、 G、。
0skarsson、 M、、、 wood、、 ’r、 Cr、、 McCl
ements、 W、 L、、 Fj、schinger。
P、 J、およびVand、ewoud、e、 G、 Sci、ence 21
2 : 941−943(1981);:r、、−よびChange、 E、
J、、 Furth、 M、 E、、 5colnick。
E、 M、およびLowy、 D、 R,Nature 297: 479−4
83(1982)を参照されたい〕がある。これらの後者の結果はその幾つかは
ラットおよびヒ) c−Ha−ras始原発癌遺伝子のクローンの活性化を実証
しているので特:(密凄な関係がある。これらのC−Ha−ras遺伝子の蛋白
質暗号化配列がこれらウィルス−1細胞ギメラ構成の間に構造的変化を受ける事
は考え:(<い。むしろ始原発癌遺伝子およびそのLTR−活j生化相対吻の唯
一の本質的相違は発現の速度((ある事は明らかである。この事は工始原発卒遺
成子は第2の独立した機構てl和牛化できる事を意味30
し、その機構も原理的に不明、!+ll書に記載した機構と同様に発癌遺伝子形
成に重要である。
他の癌の発癌遺伝子もまた辿るとニー遺伝子である。特に結腸および肺癌は細胞
Ki −ras遺伝子の活圀化による発癌遺伝子を有している事が観察されてい
る。Der、 C,、Krontiris、 T。
3637−3640(1980)を参照されたい。それ故、多くのこれらの発癌
遺伝子の活性化もまた前に報告さハているものと同様に構造的変化に依存するよ
うである。
前に記載した如く、EJ発癌遺伝子中のG1y12のコドンの変化は、発癌遺伝
子に2けるこのコドンの変化により超こされる発癌またシまトランスフオーメー
シヨンの簡単な診断用検定法を可能にする。発癌またシま関連する過程の間に起
こったG]、y12コトゝンのどんな突然変異もNaeしυよびHpalエンド
ゝヌクレアーゼの切断認識部位を変化させ、発癌遺伝子の変化したDNAはこの
部位での切断に抵抗するようになる。それ故、これらのエンド9ヌクレアーゼ:
(よるこの部位(CおけるDNAの切断され易さの試験は、始原発癌遺伝子のこ
の領域の突然変異変化の特徴的な試験となる。
この試険は、目的のDNAを例えばNae■で処理し、生じるフラグメントをア
ガロースゲル電気泳動により分離し、硝酸セルロースのフィルターに分離したフ
ラグメントを移し、配列特異性の放射1されたプローブとフィルター・をイン千
ユベートし、続いてラジオオートグラフィーにより移さnたフラグメントを検出
する。方法はよく知ら、ltているものである。5outhern。
311ン4.t+冗0−500002 (10)J、Mo2.Biol、98:
503−17(1975)を参照されたい。
そのような実験で吏用する配列プローブは、始原発癌遺伝子の領域と重なるか、
またシま始原発癌遺伝子のこの領域に非常に隣接した所にある多数のDNAセグ
メントから誘導できる。記載する実施例では、プローブは、変化したコドンの左
糎1のNae1部位から始まり、その右のNae I部位で終る発癌遺伝子のN
aBIフラグメントであってよい。正常始原発癌遺伝子を持つ細胞のDNAはこ
の部位でNae Iにより2つの部分に切断され、一方EJ膀胱癌発癌遺伝子の
DNAはNaelエンドヌクレアーゼによる処理ではこの部位は影響を受けない
。
この検定は、始原発癌遺伝子のDNAのその対応する発癌遺伝子への変化に対し
て一般的に応用できる。始原発癌遺伝子または発癌遺伝子の何れが一方のみのD
NA配列が制限エンド9ヌクレアーゼの切断に感受性で、他の配列lま感受性で
ないことが検定法の基本原理である。
発癌遺伝子により暗号fヒされたp21蛋白質から始原発癌遺伝子により暗号化
されたp21蛋白質へのアミノ酸配列の変化の他の結果:ま、両方の特異的な血
清学の試薬での検出を可能にする。そのような血清学試薬:′!、正常始原発癌
遺伝子が特定するアミノ酸配列ぞ蛋白質のこの部位で特定てき、または発癌遺伝
子が特定する変化したアミノ酸配列を蛋白質のこの部位で特定できる。未変化の
蛋白質領域と反応し、その結果p21蛋白質の正常または異常な形の一方と反応
性の、らるような他の血清学試薬も用いる事ができる。
クローニング技術を用い、始原発癌遺伝子の正常部位または2
発癌遺伝子の変化部位で1暗号(lされるp21蛋白質を有意の量単離できる。
そのような蛋白質セグメントを用い標準的な抗体産生技術により抗体を産生ずる
。すなわち、ポリクローナル抗体の産生のため、その蛋白質を用い、ウサギまた
)まラットの如き宿主に免疫し、該蛋白質洸対する抗体を宿主から得られる血清
β・ら集める。
さらに、ハイブリド−マ細胞を形成する典壓的な融合技術で単離された遺伝子セ
グメントの産生ずる蛋白質に対する抗体を産生ずる細胞を用い、モノクローナ)
v抗体を産生できる。基本的に、これらの技術は抗体産生細胞をミエローマ細胞
の如き不滅の細胞と融合せしめ、希望する抗体を産生ずる永久増殖性融合細胞ハ
イブリッドを提供する事からなり;本願の場合、希望する抗体とは、単離された
遺伝子セグメントにより暗号化されたp21蛋白質の正常または変異セグメンI
I/c対する抗体である。ハイブリッド細胞を抗体産生の助けとなるような条件
下で培養12、その後、細胞培養培地から抗体を集める。そのようなモノクロー
ナル抗体を産生ずる技術は文献によく記載されている。例えば、米国特許第4,
172.i24号および第4,196,265号(Hi]、ary Kopro
wskiらに特許された)を参照されたい。その技術はここでは参照のたぬ含ま
れる。
より具体的(・こt−よ、そのような血清学試薬は既知の方法YCより得る事が
できる。Walter、 Cx、、 Scbeidtmann、 K、 H,、
Carbone。
R,A、、 Green、 N、、 Alexand、er、 H+、 Liu
、 F、 T、、 5ut−cliffe。
3
J、 G、、および5chinnick、 ’r、M+、 Proc、 Nat
l、 Acad、 Sci。
USA、78: 3403−3407 (1981)を参照されたい。
実際に、はゾチドセグメントを標準的な有機合成技術で合成し、合成された(プ
チド配列が研究している目的の蛋白質領域のアミノ酸配列に正確に対応するよう
にすることができる。次いでこのにプチドをキャリヤ蛋白質と結合させ、適切な
宿主(例えばマウス)に注射し、免疫応答を起こす。この方法で免疫された動物
の血清を免疫した〈プチドおよびより重要であるが、その一つの領域にこのアミ
ノ酸配列を持つ蛋白質の両方に対して免疫沈降させるために用いる事ができる。
従って、正常な始原発癌遺伝子から発癌遺伝子に転換する際に変化するアミノ酸
残基部位を持つオリゴ゛はプチド配列(例えばデカはゾチl−゛)に対する血清
が作れる。そのような血清は正常の投プチド配列か、または変化した配列に対し
て作る事ができる。免疫グロ7′リンー抗原相互作用の特異性は、あるオリゴ(
プチドと反応する血清はその一つの領域に同じ対応した配列を持つ蛋白質とのみ
反応し、その一つの領域に変化したこの配列を持つ蛋白質とは交叉反応しない事
を保証する。
腫瘍試料または組織ホモジネートまたは目已融解した腫瘍片からの遊離液から、
ここに記載した突然変異変化変叱に影響されない蛋白質の領域(列えBf−C−
末端)と交叉反応ずろ一般の非特異的p21血清を用い、p21蛋白質を免疫沈
降する事ができる。別個に、12番目の残基を取り囲むN末端正常〈プチドに対
して特異的な血清を同じ溶屏夜からの蛋白質の免疫沈降(・C使用できる。もし
非病理組玉からの正常p21を免疫沈降ずろ34
事ができるこのN末:@特異的血清が目的の試験Mi織よりp21を免疫沈降で
きないなら、この試験組織のp21は正常のN末端配列に反応性のある血清と反
応する能力に影響する形の変化があったと考えられる。一般の非特異的血清でこ
の組織より免疫沈降するp21の量が正常N末端配列と反応性のある血清により
沈降しうるp21の量の対照となる。
上記の免疫沈降は、組織試料中の変化したp21の存在の測定に用いる事ができ
ろ。これと別個に、この領域の正常のアミノ酸配列が異常配列に変化する時どの
型の特異変化が起きているかを診断するため、一連のRプチドに特異的血清を開
発できる。例えば、12@残基を暗号化するコドンで単一の点突然変異による起
こるアミノ酸置換のリストを作る事ができろ。これらの各々の置換に対し、この
領域の新しい翻訳のオリコ゛投プチドを推論でき、前忙記載した使用のための対
応するはプチト8が合成される。これらの血清の各々は、各血清を誘導するのに
使用したオリゴ深プチド片に対応する変化したp21と特異的に反応する。
用語“免疫沈降”は更に一連の変化した技術操作により更に記述する。通常使用
される技術は、代、謝的に標識した蛋白質を免疫沈降し、続いてゲル電気泳動お
J:び得られたゲルのオートラジオグラフィーを行うものである。組織試料を代
謝的に簿識するのが困難であるので、ここでは他の方法が良好である;即ち、非
標識蛋白質をゲル電気泳動し、分離した蛋白質をニトロセルロースフィルターに
移し、目的の蛋白質を、放射−標識免疫グロブリンとフィルターをインキュベー
)卜する事により検出35’+話&UEiO−500002(11)する。免疫
グロブリンは直接三−ド化によりま1暑ま間接的に第1のイムノグロブリンの定
常領域と反応する第2の放射標識イムノグロブリンとインキュに一トすることに
より放射標識rヒされる。
本発明の応用についての議論および多くの実験的仕事は、ヒトの膀胱癌のEJ遺
伝子およびその始原発癌遺伝子(c−Ha−二k)との相違を検出することに向
けられたが、これらの相違を検出する技術ならびにそれらに基づく検定、去は、
非常に普遍性を有する。事実、そのような技術と検定(・ま、突然変異して野生
株の対立遺伝子とは劇的に異なる機能を帯びた変異対立遺伝子またはジーンを生
じた如何なる野生株ジーンまたは対立遺伝子に対しても適用可能と信じられる。
例えばそのような技術と検定は、野生株遺伝子およびLesch−Nyan症挨
詐【関連する突然変異遺伝子の差を検出するのに適していると期待さnる。
本発明方法は、発癌遺伝子と始原発癌遺伝子の差異を検出するのに勿論特別の応
用と有用性を持つ。一連のrasファ、? IJ−のメンバーについては前に記
載した。しかしながら、ここに記載された技術は二二ファミリーのメンバー以外
の始原発癌細胞σ相違の発見も可能とする。例えば、HL−60細胞株((存在
する、前骨髄注白血病、ある種の結腸癌およびHairy細胞白血病に関連する
事が知られている発1俗遺云子とその始原発癌遺伝子との差異はここに記載した
方法を用いて決定できる。これらの差異は記載された型の検定に用いられる。
野生型遺伝子とそれに対応する容態変異遺伝子の差異を検定する非常に一般的な
手1頂は以下の如くである:%
A、遺伝病の発現に対して遺伝子の正常機能または異常機能が関連するような遺
伝子の4:y 山o検定法を開発する:そのようなインビトロでの検定は、一般
に、遺伝子移植により遺伝子を受けた培養細胞の行動の観察できる変化に依存す
る。
B、上述の遺伝子の対立遺伝子を分子クローンとして単離するため(・C1上述
のインビトロ検定を用いる。そのような対立遺伝子は野生型対立遺伝子かまたは
その野生型対立遺伝子の機能不全性変異対立遺伝子である。
C,B項からの単離対立遺伝子を用い、組換えDNA技術を1重用して遺伝子の
他の対立遺伝子の形を単離する。即ち、正常対立遺伝子を配列プローブとして使
用し、変異−非野生型遺伝子に子の同定および単離が可能になる。
D、インビトロ検定系において、野生型対立遺伝子および非野生型変異遺伝子の
観察できる差異および別個の挙動を実証する。
E、インビトロで野生型および非野生型対立遺伝子のクローン間で遺伝子組換え
を行い、野生型および非野生型の対立遺伝子による表現型を検定する(D項)こ
とにより立ヨ検出系で組換え体を試験する。このようにして、2つの対立遺伝子
間の機能の差に関与する非野生型対立遺伝子の領域を遺伝的な地図にする。
F、2つの対立遺伝子の間の機能の相違をコートゝすることがE項で証明された
非野生型対立遺伝子の領域の構造的配列分析を実施する。
G、その伴狂が非野生型遺伝子の変イヒした表現型を決定する、7
決定的に変化した配列を同定した後(F項)、野生型対立遺伝子を非野生型変異
遺伝子シて変換した過程で切断認識都立が変化□した部位特異性制限酵素(エン
ドヌクレアーゼ)を決定する。
Hlその変化が遺伝子の機能、シて影響することが前に示されたエンドヌクレア
ーゼ部位(0項)の存在または不存在をスクリーニングすることによって、試験
DNAがその遺伝子中の該遺伝子およびその非野生型対立遺伝子変異体の機能の
支配を決定することが前記E項で示された遺伝子部分中に、配列変化を有するか
否かを決定するために、試験サンプルまたは試験組織をスクリーニングするだめ
の配列プローブとして、クローン化した野生型遺伝子を使用する。
T、正常野生型対立遺伝子の遺伝子およびその非野生型変異形により暗号比され
たアミノ酸配列を推論する。前に地図にし、遺伝子の機能に影響がある事(F項
)がわかっているヌクレオチド配列の差異が、同様に野生型と非野生型対立遺伝
子が暗号付ける蛋白質のアミノ酸の配列に影響があるか否かを決定する。
J、もし、アミノ酸配列に影響があれば、野生型と非野生型の蛋白質((対する
特異的な血清を開発する。例えば野生型蛋白質と機能的に異なる非野生型蛋白質
の領域の配列で、ちる(1項)オリゴ″はプチド片を合成する事ができる:対応
する野生型オリゴRゾチドを合成する。野生型または非野生型蛋白・盲と反応す
る特異的な抗血清を引き出すための免疫原として両者を用いる。
K、前記特異的抗血a(J項)を利用し、前記蛋白質の野生型または非野生型の
存在:C関して試@細胞または試験組織の蛋白貴うでスクリーニングスル。
■・、前記蛋白質スフ)ルーニングを利用(〜(K項)、遺伝病の表現型を媒介
するのに重要な構造の蛋白質の存在を診断する。
産業上の利用i牛
こごに記載されている本発明は始原発癌遺伝子およびその対1心ずう発′I■遺
伝子、そのような遺伝子で暗号rヒされた蛋白質の間の差異の決定、そのような
蛋白質ま、rこ)まその一部の抗体の製造、および発癌を調べるたぬそのような
始原発癌遺伝子または発癌遺伝子の存在をそのような抗体を利用し2て検定する
のに有′!屁首者は日常的試験を行なうだけで、ここに記載した本発明の特定の
具体例に多くの均等節ノlをlめ、確認できる。そのような均等範囲は以下の請
求の範囲:fこ含まれろ事を−をし1する。
浄彊ζカ“′−′ニーr断ニジ)
2
し ◆ 薯
シ
12345
、 (実 !
t″ig、 、;C
jF7g、 、?D
Fig、1
〇 二 (−) ”’OC) に σ −口P(ニア/(lG Sj / OI
F/〕5.補正命令の日付 昭和釣竿 宿月 9日(発送日)6、補正の対象
・国際調査報告
Claims (1)
- 【特許請求の範囲】 1 野生型対立−を云子の突然変異遺伝子への突然変異の検定法に3いて; 野生型対立遺伝子頂た(ま突然変異対立遺伝子の一方のみに存在する切断部位に 対する特定の制限酵素を用いる改良法。 2、前記野生型対立遺伝子が始原発癌遺伝子であり、および前記突然変異対立遺 伝子が発癌遺伝子である請求の範囲第1項記載の改良法。 3 前記始原遺伝子がras遺伝子である請求の範囲第2項記載の改良法。 4 前記発癌遺伝子がヒト膀胱癌の発癌遺伝子である請求の範囲第3項記載の改 良法。 5 下記a、 −CIの工程からなる始原発癌遺伝子が発癌遺伝子忙突然変異し たかどうかを検出する方法:a、前記始原発癌遺伝子および前記発癌遺伝子を含 む細胞からのDNAを車力「シ; b、前記の単離したD I’J Aの領域を発癌遺伝子化の原因となるDNA溝 造の相違の−7−(を含む短いセグメントにせげめ;C1前記発癌遺伝子および 前記始原全県遺伝子の前記短いセグメントのDNA1列の相違を決定し;d、前 記始原発癌遺伝子ぢよひ前記発情遺伝子の何れか一方のDNA記列相違5分:て 1動らくが、他方のDNA配列相当部′::+)ては働らかないような制限酵素 を選択し;およびe、前記始原全県遺伝子が前記発癌遺伝子に突然変異したかど うかの検定に前記の選択した制限酵素を用いて検出する。 0 6 前記始原発癌遺伝子がras遺伝子ファミリーの構成員である請求の範囲第 5項記載の方法。 7、前記始原発癌遺伝子および前記発癌遺伝子からの一連のエコ化での組換体を 用いて、前記pNA中の唯一の相違部を含む前記短いDNAセグメントを単離す ることにより、遺伝子の相違を決定する請求の範囲第6項記載の方法。 8 前記発癌遺伝子がヒト膀胱癌発癌遺伝子またはその対立遺伝子の変異体であ る請求の範囲第7項記載の方法。 9、前記D N A配列の相違が始原発癌遺伝子のG]、y ] 2コビンに位 置する請求の範囲第8項記載の方法。 10 前記制限酵素がNaelエンドヌクレアーゼである請求の範囲第9項記載 の方法。 II 前記制限酵素がHpa、lエンドヌクレアーゼである請求の範囲第9項記 唯の方法。 124 下記a−bの工程からなる試験7刑胞のヒト膀胱癌の検定法: a、前記試験細胞からDNAを単離し:およびす、前記ヤ碓DNAがc−Ha− 二豆I始原発癌遺伝子のたaIおよびKpn l切断部位の間の350ヌクレオ チド配列中に制限酵素Naelに対する切断部位があるがどうかを決定する。 13 下記a−’2の工程からなる野生型対立遺伝子が変異対立遺伝子に突然変 異したかを検出できる抗体を産生する方法:a、変異したとき前記変異対立遺伝 子を生ずる前記野生型対立遺伝子のD N Aセグメントを単離し、b、前記野 生型対立遺伝子および前記変異対立遺伝子、間の41 機能の相違)て関係するD N A配列の相違を反映する抗体の産生を宿主に免 疫したとき誘発しうる抗原をっくり;およびC0前記宿主が前記抗体を産生ずる ような条件で宿主に免疫する。 14、前記野生型対立遺伝子が始原発癌遺伝子であり、前記変異対立遺伝子が発 癌遺伝子である請求の範囲第13項記載の方法。 15、前記始原発癌遺伝子が=始原発癌遺伝子である請求の範囲第14項記載の 方法。 16 前記ヨ始原発癌遺伝子がヒト膀胱癌の始原発癌遺伝子である請求の範囲第 15項記載の方法。 17、前記DNAのセグメントが前記始原発癌遺伝子から発現されるp21蛋白 質のG1y12のためのコドンを含む請求の範囲第16項記載の方法。 18、前記抗原がポリ投プチドキャリアに結合したオリコ゛投プテドである請求 の範囲第17項記載の方法。 19、抗体産生細胞を前記宿主から選択し、モノクローナル抗体産生細胞し)る 請求の範囲第18項記載の方法。 20、前記の選択された抗体産生細胞を他の細胞と融合せしめ、モノクローナル 抗体産生ができる融合雑種細胞を産生ずる請求の範囲第19項記載の方法。 21、請求の範囲13,15.18または20項に記載した方法とより生産され た抗体。 22、始原発布遺伝子の発癌遺伝子への突然変異により起こされる発癌の検定法 において; 42j、込511GO−500002(2)前記発癌遺伝子により発現される蛋 白質および前記始原発癌遺伝子により発現さ2する蛋白質間の相違を検出する改 良法。 23、前記遺伝子がras遺伝子ファミリーの構成員である請求の範囲第22項 記載の方法。 24 検出される蛋白質の相違がp21蛋白質のN−末端部にある請求の範囲第 23項記載の方法。 25゜前記発癌遺伝子がヒト膀胱癌をひき起こすものである請求の範囲第24項 記載の方法。 26、前記検出される相違がp21蛋白質中のC1y I 2、特許請求の範囲 第25項記載の方法。 27、ras始原発癌遺伝子の相同部分と相違する!発癌遺伝子の部分により発 現されるアミノ酸配列と結合したポリペプチドキャリアよりなることを特徴とす る免疫した宿主中で抗体生産可能な抗原。 28、二発癌遺伝子により発現され、単離されたp21蛋白質。 29 前記工発癌遺云子がヒト膀胱癌をひき起こすものである請求の範囲第28 項記載の単離されたp21蛋白質。 30 請求の範囲第28または29項記載の単離さnたp21蛋白質に対する抗 体。 31、請求の範囲第28または29項記載の単離されたp’21蛋白質に対する モノクローナル抗体。 32、始原発癌遺伝子の発癌遺伝子−1の突然変異を検定するための試薬の集合 よりなる医学診膚のためのスクリーニングキット。 3 33 下記a−hの工程からなる始原発癌遺伝子の発癌遺伝子への突然変異によ り起こされる発癌を検出できる抗体を産生ずる方法: a、前記始原発癌遺伝子と前記発癌遺伝子とで異なっているDNAセグメントを 単離し; b、2つの遺伝子により特定されている蛋白質を暗号化しているヌクレオチド9 配列を決定し; C,2つの暗号化されている蛋白質のアミノ酸配列を推定し; d、その機能の相違に2つの暗号化された蛋白質間のアミノ酸配列のどの相違が 決定的であるかを決定し;e、始原発癌遺伝子で暗号化された蛋白質の残基であ って、その変化が始原発癌遺伝子の発癌遺伝子への活性比に重大な関連がある残 基を取り囲みおよび含むアミノ酸配列を直接反映するオリゴにプテドを合成し; f、同定された発癌遺伝子に暗号化された蛋白質の対応する領域のオリゴイプチ ドを合成し; g、前記始原発癌遺伝子または前記発癌遺伝子の一方に暗号化されたアミノ酸配 列に対応する前記オリコ゛投プチドで宿主を、前記宿主の細胞:゛こより前記セ グメントに対する抗体が産生される条件下で免疫し;および り、前記宿主を始原発布遺伝子の他方の変異体型の対立遺伝子に暗号比されたオ リゴ梗プチドで前記宿主を免疫する(各々の前記変異体は変化したアミノ酸残基 を暗号化したヌ1 浄乞(内γfに変更なし)
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