JPH09508004A - レトロウイルスパッケージング配列を標的とするリボザイム、その発現構築物、および斯かる構築物を含む組換えレトロウイルス - Google Patents

レトロウイルスパッケージング配列を標的とするリボザイム、その発現構築物、および斯かる構築物を含む組換えレトロウイルス

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Abstract

(57)【要約】 本発明は、天然に存在しない合成オリゴヌクレオチド化合物であって、保存された触媒領域を定義する配列を有するヌクレオチドと、RNAウイルスのパッケージング配列内の所定の標的配列とハイブリダイズできる配列を有するヌクレオチドとを含んだ合成オリゴヌクレオチド化合物に向けられている。好ましくは、前記ウイルスパッケージング配列は、レトロウイルスパッケージング配列またはHIV−1プサイパッケージング配列である。前記RNAウイルスは、HIV−1、ネコ白血病ウイルス、ネコ免疫不全ウイルスまたは表1に挙げたウイルスの一つであればよい。前記保存された触媒領域は、ハンマーヘッドリボザイム、ヘアピンリボザイム、デルタ肝炎リボザイム、RNAasePリボザイム、グループIイントロン、グループIIイントロンから誘導される。本発明はまた、RNAウイルスに対してターゲットされた多重リボザイム、アンチセンスを伴うか又は伴わないリボザイムの組み合わせ、リボザイムのアンチセンスとの組み合わせ、TARデコイ(decoy)、polyTARまたはRREデコイに向けられている。ベクターもまた開示される。更に、in vivoおよびex vivoの両方での治療方法および使用方法が開示される。

Description

【発明の詳細な説明】 レトロウイルスパッケージング配列を標的とするリボザイムその発現構築物、および斯かる構築物を含む組換えレトロウイルス 本出願は、1994年1月5日出願の米国特許出願第08/178,082号の一部継続 出願である。本出願では、種々の刊行物がかっこ内の著者名と発行年により参照 される。完全な参照文献情報は、実験の項の後にアルファベット順にリストされ る。本発明が属する技術の現状をより充分に記載するための参照として、これら の刊行物の開示は全体として本出願の一部をなす。 〔発明の背景〕レトロウイルス レトロウイルスは、RNAをゲノム物質として有するウイルスである。これら は、自身のゲノムRNAのcDNAコピーを宿主細胞ゲノム中に安定に組み込む ことにより、自身の複製のために宿主細胞を利用する(Miller,1992;およびBrown ,1987)。このウイルスゲノムは、ウイルスのプロウイルスcDNA型の各末端( 5’および3’)の長末端反復配列(Long TerminalRepeat)(LTR)よりな る。5’から3’方向に進むと、このLTRは、Rと呼ばれる短い配列で結合さ れたU3およびU5配列よりなる。転写は、5’LTR内で開始し、3’LTR 内のポリアデニル化部位で停止する。LTRに隣接して、逆転写酵素による正の DNA鎖と負のDNA鎖合成の開始誘導(priming)に必要な短い配列がある。 ゲノムにはスプライス供与配列および受容配列も存在し、これらは、サブゲノム RNA種の産生に関与している。5’LTRに直接隣り合っているのは、ウイル スRNAをキャプシドで包みこんでウイルス粒子にするのに必要な配列である。 これは、Psiパッケージング配列と呼ばれる。これは、ウイルスRNAのパッ ケージングを保証する必須で特異的なシグナルである。ウイルスRNAの大部分 は、各々、コア蛋白(gag)、インテグラーゼ、プロテアーゼおよび逆転写酵 素の酵素類(pol)、およびエンベロープ蛋白(env)をコードする、ga polおよびenv複製遺伝子よりなる。 細胞のレトロウイルス感染は、ウイルス糖蛋白と細胞受容体との相互作用によ り開始する(A)(図1参照)。吸着と脱外被(uncoating)後、ウイルスRN Aは標的細胞に入って、ウイルス粒子に運ばれる酵素である逆転写酵素の作用に よりcDNAに変換される(B)。このcDNAは環状であり(C)、二重鎖c DNAに変換され、次いでインテグラーゼの作用により宿主細胞のゲノムDNA 中に組み込まれる(D)。いったん組み込まれると、プロウイルスcDNAが5 ’LTR内のプロモーターから転写される(E)。転写されたRNAは、mRN Aとして作用して翻訳されてウイルス蛋白を産生する(F)か、または新生RN Aとして残る。このウイルスRNAは、ウイルス粒子へのパッケージングに必須 のPsiパッケージング配列を含有する(G)。いったんウイルス粒子が産生さ れると、これは原形質膜からの出芽により細胞から放出される(H)。一般にレ トロウイルスは、宿主細胞の溶解を起こさないが、HIVはこの例外である。プ ロウイルスcDNAは、宿主ゲノムに安定に組み込まれて残り、宿主DNAと共 に複製されるため子孫細胞もこのプロウイルスを受け継ぐ。これらの複製調節点 のいずれかを標的にすることにより、抗ウイルス剤を見い出す可能性がある。ヒト免疫不全ウイルス(HIV) HIVは、レトロウイルスの分類に属し、その複製は上に略述したとおりであ る。Tリンパ球、単球およびマクロファージを含む細胞中へのHIVの侵入は一 般に、HIVのgp120エンベロープ蛋白と標的細胞表面上のCD4受容体と の相互作用により行われる。gp120のアミノ酸配列は、異なる患者間(また は同じ患者でさえ)で大いに変化しやすく、このためワクチン製造は非常に困難 である(Brown,1987;およびPeterlinら,1988)。この可変性は、疾患の進行と関 連しているものと考えられる。HIVの主な特色は、i)(レンチウイルス群の 他のものと同様に)宿主細胞のゲノム中に組み込まれた後プロウイルスが潜伏し ている潜伏期間があり、そしてii)Tリンパ球標的細胞に対して細胞変性作用を 持つことである。HIVは、ブロウイルスが入った細胞が活性化された後に複製 を開始する。細胞活性化とこれに伴うウイルス複製の刺激は未だ明確には同定さ れていない(Brown,1987;およびPeterlinら,1988)。全てのレトロウイルスのよ うに、gagpolおよびenv遺伝子産物は構造蛋白および酵素蛋白に翻訳 される。HIVの場合には、さらに調節遺伝子が存在する。具体的には、tat およびrev遺伝子産物が調節蛋白に翻訳されて、転写増強物質として作用し、 高レベルの遺伝子発現を誘導する。nefは、ウイルス複製レベルを調節するた めの別の調節遺伝子である(Jones,1989;Greene,1990;およびEpstein,1991)。 HIVの複製は、活性化し増殖している細胞で最高に達する;細胞の活性化が 、核内転写因子および細胞内エンハンサー因子(cellular enhancer factors) と、HIV LTRとの結合を引き起こし、転写レベルの上昇が起こる。全ての レトロウイルスのように、パッケージング領域(Psi)は、ゲノムRNAのキ ャプシド包み込みに必要なHIVゲノム上に存在するシス作用性RNA配列であ る。gag蛋白、pol酵素およびウイルスRNAを組み込むコアの形成は、H IV複製サイクルの最後の段階である。このコアは、膜を獲得し、細胞膜を通り 抜ける出芽により細胞から出る(Peterlinら,1988;Jones,K.A.,1989;Greene,199 0;およびEpstein,1991)。 現在まで、HIVの抑制のための多くの物質が検討されてきた。図1に示す複 製段階を標的とした幾つかの物質を以下に説明する。 (A)標的細胞へのウイルス吸着 可溶性CD4は、ウイルス受容体の大部分を占有して、このためウイルスが細 胞膜に結合できないようにすることを目指して使用されてきた。しかし現在まで この治療方針は成功したことがない(Stevensonら,1992)。硫酸化多糖類は、恐 らく細胞−ウイルス融合を妨害することにより、HIV感染を阻害する能力を示 した(McClureら,1992)。CD4結合外毒素(Stevensonら,1992)と同様に、H IV自体、宿主細胞受容体またはHIVエンベロープ抗原決定基に対する抗体は 、ウイルスの細胞への侵入を妨害する他の可能な方法である。 (B)逆転写酵素によるcDNAの産生 アジドチミジン三リン酸(AZT)のような化学物質がインビトロで逆転写酵 素を阻害することが見い出された。現在AZTは、日常的にAIDS患者に、お よび骨髄移植を受ける時に投与されているが、後者の場合は残存HIVから骨髄 を保護することを目指して行われている(Miller,1992)。 (C)細胞質から核へのcDNAのトランスロケーション 核膜孔を通るcDNAのトランスロケーションまたは核内輸送(nuclear tran sport)自体を妨害することは可能であるかもしれないが、この試みは未だ成功 していない。 (D)宿主ゲノムへのcDNAの組み込み 宿主細胞ゲノムへのプロウイルスcDNAの組み込みを防止することも可能で あるかもしれない(Stevensonら,1992)。現在までに、有効であることが判った 候補化合物はない。 (E)プロウイルス転写 5,6−ジクロロ−1−ベータ−D−リボフラノシルベンズイミダゾールは、 転写の伸長を妨害することが知られている(Stevensonら,1992)。センスTAR 類似体もtat蛋白に結合して、HIVを活性化するこの蛋白の能力を阻害する ことにより、転写に影響を及ぼし得る(Miller,1992;およびSullengerら,1990) 。 (F)HIVmRNAの翻訳 アンチセンスRNAは、ウイルスRNAに結合することにより、ウイルスの複 製を阻害するかもしれない(Sczakielら,1992)。mRNAへの結合により、翻 訳は阻害され;また新生ウイルスRNAへの結合は、ウイルス粒子へのRNAの 生産的パッケージングを阻害するように作用するであろう。 (G)ウイルスパッケージングと成熟ウイルス粒子の産生 プロテアーゼは、HIVポリ蛋白の特異的な切断を誘導する。この活性は、成 熟した、感染性ウイルス粒子の産生には必須である。α,α−ジフルオロケトン 類のような数種の化合物が、HIVプロテアーゼを阻害することが見い出され、 組織培養物においてある程度の抗ウイルス活性が証明されている。しかし、多く のプロテアーゼ阻害剤は、短い血清半減期、迅速な胆汁クリアランスおよび経口 利用性の低さを示している(Debouck,1992)。リボザイム リボザイムは、RNAを切断し代謝回転を示す酵素的RNAである。ある分類 のリボザイムにおいては、相補配列アームの添加により、これらは特異的標的R NAと対を形成して、RNAのホスホジエステル基本骨格に沿った特異的部位で の切断を誘導することが可能になる(Haseloffら,1988;Rossiら,1992;Hampel, 1990;Ojwang,1992)。ハンマーヘッドリボザイムは、小さく、単純で、種々の隣 接する配列モチーフに組み込まれる時に部位特異的切断を維持する能力を有する (Haseloffら,1988;Rossiら,1992)。これらの特徴により、遺伝子の抑制に特に 適したものになっている。 〔発明の概要〕 本発明は、その配列が、保存された触媒領域を規定するヌクレオチドと、その 配列が、RNAウイルスのパッケージンク配列内の前もって決定された標的配列 とハイブリダイズすることができるヌクレオチドを含む、合成の非天然オリゴヌ クレオチド化合物に関する。好適には、このウイルスパッケージング配列は、レ トロウイルスパッケージング配列であり、1つの実施態様においてHIV−1 Psiパッケージング配列である。このRNAウイルスは、HIV−1、ネコ白 血病ウイルス、ネコ免疫不全症ウイルスまたは表6にリストしたウイルスの1つ であってよい。保存された触媒領域は、ハンマーヘッドリボザイム、ヘアピンリ ボザイム、肝炎デルタリボザイム、RNAasePリボザイム、グループIイン トロン、グループIIイントロンから誘導することができる。本発明はまた、多重 リボザイム、およびリボザイムと、RNAウイルスを標的とするアンチセンスの 組合せ(このような組合せは、さらにポリTAR、RREまたはTARデコイ(deco y)を含む)に関する。アンチセンスおよびポリTAR、RREまたはTARデコ イと一緒の、またはこれらを含まないベクターまたはリボザイムも記載される。 さらに、インビボおよびエクスビボの治療方法と使用方法が記載される。 〔図面の簡単な説明〕図 1 .典型的なレトロウイルスの複製サイクル。 (A)ウイルスは標的細胞上の細胞表面受容体に結合して、融合とウイルスの 脱外被後、ゲノムRNAが標的細胞に侵入する。 (B)逆転写により、cDNAへのウイルスRNAの変換が起こる。 (C)cDNAが核内に入り、環状に変換される。 (D)次にcDNAが宿主細胞ゲノム中に組み込まれる。 (E)プロウイルスの転写により、ウイルスRNAとmRNAが産生される。 (F)翻訳より、ウイルス蛋白が産生される。 (G)ウイルスがコードする蛋白からウイルスコアが形成されて、ウイルスR NAがパッケージングされる。 (H)このコアが膜を獲得し、細胞膜を通り抜ける出芽により細胞を出る。図 2 .Mo−MLV Psiパッケージング領域内のリボザイム標的部位。 Mo−MLV5’領域は、pMLV−1(本文に定義される)のBalI/ BalI断片(nt212〜nt747)である。矢印は、全部がGUC残基で あるリボザイム標的部位を示す。図 3 .モロニーマウス白血病ウイルス(Moloney murine leukemia virus)の ゲノム。 MoMLVのゲノムは、複製遺伝子gagpolおよびenvと、5’およ び3’の長い末端反復配列(long terminal repeats)(LTR)よりなる。P siパッケージング部位は、ウイルス粒子へのウイルスRNAのパッケージング に必要である。図 4 .アンチ−Mo−MLVおよびアンチ−HIVパッケージング部位構築物 。 標準的な発現構築物はpSV2neoに基づき、設計されたリボザイムの1つ またはneorのSmaI部位に挿入されたPsiパッケージング配列に相補的 なアンチセンス配列(アンチ−Psi)と一緒の、neor遺伝子の上流のSV 40プロモーターよりなる。図 5 .標的にしたHIVパッケージング部位。 この図は、リボザイム9がそのPsiパッケージング部位内の配列を標的とし た、HIVゲノムの簡略化した見取り図を示す。図 6インビトロで作成したMo−MLVパッケージング領域RNAのリボザ イムによるインビトロ切断。 レーン1は、HinfIで消化したpBR322マーカーDNAである。レー ン2は、約550kbの基質である。レーン3、5、7および9は夫々、インビト で作成した単独のRz243、Rz274、Rz366およびRz−M7単独 である。下記のリボザイムが標的基質RNAに添加された:レーン4、Rz24 3;レーン6、Rz274;レーン8、Rz366;レーン10、Rz−M7。 切断反応は、試料を10mMトリス.Cl、pH7.5中で80℃で2分間加熱 後、10mM MgCl2、50mMトリス.Cl、pH7.5中で37℃で30 分間行った。図 7 .リボザイムまたはアンチセンス構築物でトランスフェクションした細胞 株からのDNAのサザンハイブリダイゼーション。 種々の構築物(レーン1、pSV243;レーン2、pSV274;レーン3 、pSV366;レーン4、pSV−M7;レーン5、pSVAs−Psi;お よびレーン6、pSV2neoベクター単独)でトランスフェクションした3T 3−Mo−MLV細胞からのゲノムDNA(10μg)をHindIII/Nru Iで消化し、0.6%アガロースゲルで分離して、ニトロセルロースフィルター にブロットし、32P標識neor遺伝子プローブとハイブリダイズさせた。矢印 は、neor遺伝子単独(1.34kb)、neor遺伝子+単一リボザイム(1. 38kb)、+多重Rz(1.98kb)、または+アンチセンス(1.89kb)の 予測サイズを示す。図 8 .リボザイム/アンチセンス構築物の発現を試験するためのRNase保 護分析。 32P標識リボプローブ(riboprobes)を使用して、一連のトランスフェクショ ンした細胞からの全RNA20μgを、リボザイムまたはアンチセンス構築物の 発現に関して分析した。レーン1、サイズマーカーであるHinfIで消化した pBR322の末端標識DNA断片;レーン2、酵母RNAとハイブリダイズさ せRNaseで消化したRzM7のリボプローブ;レーン3、酵母RNAとハイ ブリダイズさせ、次にRNase消化を行わなかったRzM7のリボプローブ; レーン4〜8、各々pSV243、pSV274、pSV366、pSV−M7 およびpSVAs−Psiでトランスフェクションした細胞からのRNAとハイ ブリダイズさせてRNaseで消化した、Rz243、Rz274、Rz366 、RzM7およびAs−Psiのリボプローブ;レーン9〜13、夫々単独のR zM7、Rz243、Rz274、Rz366およびAs−Psiのリボプロー ブのみ。Mo−MLV複製を最も抑制した各構築物につき1つのクローンを測定 に使用した。図 9 .異なるMo−MLV産生3T3細胞から誘導したウイルスRNAのドッ トブロットのオートラジオグラフ。 1:1、1:5および1:10希釈のウイルスRNA調製物を、前述のように Mo−MLV Psiパッケージング領域に相補的な32P標識リボプローブでプ ローブ結合させた。レーン1、酵母RNA;レーン2〜7、pSV243、pS V274、pSV366、pSV−M7、pSVAsPsiおよびpSV2ne oでトランスフェクションした3T3−Mo−MLV細胞の上澄液からのRNA 。ウイルスRNAレベルは、インビトロでRNA標的分子を切断するのに有効な リボザイムおよびアンチセンスにより低下がみられる。図10 .長期測定におけるp24レベル。 このヒストグラムは、HIVパッケージング部位を標的とするリボザイム構築 物であるリボザイム9(Rz−9)について8、13および22日後のp24レ ベルにより測定したHIV複製に関するデータを示す。ベクターは対照構築物で ある。Rz−2とRz−Mは、HIVのtat遺伝子を標的とする2つのリボザ イム構築物である。Rz−Mは、tat内の異なる部位を標的とする幾つかのリ ボザイムを含有する多重リボザイムである。これは、Rz−2に標的とされる部 位を含む。図11 .ジーンバンク(Genebank)(所在:HIVSF2CG)からのHIV− 1 SF2単離体の配列データにより、抗−HIV−1 tatリボザイムが設計 された。標的部位は、GUC(Rz1)、GUA(Rz2)、GUC(Rz3) およびCUC(Rz4)である。図12tatが保存された配列。図13 .種々のtat標的配列の比較。図14 .Rz2(a、d、f)で保護を示すトランスフェクションしたクローン 化T細胞株(Sup T1)。ベクター(pSV2 neo、neo−a)および ランダム対照(Ran a、b、c、d、e、f)を含有するクローン性細胞株 。図15A〜15C .レトロウイルスベクター構築物とこれらの結果としての発現 の概略図(一定の比率では描かれていない)。15A、リボザイム構築物RRz 2;15B、アンチセンス構築物RASH5;15C、ポリマー性TAR構築物 R20TAR。親のレトロウイルスベクターはカッコ内に注記される。詳細は本 文を参照のこと。図16A〜16C .形質導入したPBLにおけるレトロウイルス構築物の発現。 リボザイム(図16A)、アンチセンス(図16B)および20TAR RNA(図 16C)の発現を、対応する32P標識プローブを使用してノーザン解析により試 験した。詳細は本文を参照のこと。図17A〜17C .形質導入したPBLにおけるHIV−1 III B複製の阻害 。形質導入し選択したPBLは、材料と方法に記載したように投与して測定した 。 プロットしたデータは、5名のドナー(図17A、リボザイム構築物および図1 7B、アンチセンス構築物)と2名のドナー(図17C、ポリマー性TAR構築 物)の平均である。図18A〜18C .臨床的な単離体82Hによる感染に対する形質導入したPB Lの耐性。材料と方法に記載したように、PBLをリボザイム構築物(図18A )、アンチセンス構築物(図18B)およびポリマー性TAR構築物(図18C )で形質導入して、82Hで感染させた。プロットしたデータは、2名のドナー の平均である。図19 .形質導入したPBLの増殖測定。データは平均±SD(n=3)として 示される。形質導入していないPBLであるPBLのみ;対応するレトロウイル スで形質導入した、LXSN、R−20TAR、LNHL、RASH−5、LN L6およびRRz2。図20 .CEMT4 Tリンパ球細胞株をウイルスで形質導入してG418選択 を行った。プールした細胞集団は、ランダム組み込み体と種々の構築物発現レベ ルを有する細胞を含有しており、次にこれらにHIV−1を投与する。図21A〜21B .RzMは、tatに対する多重リボザイムであり、そしてR Rzpsi/Mは、パッケージングに対するリボザイム/tatに対する多重リ ボザイムが一緒になっている。 〔発明の詳細な説明〕 本発明は、その配列が、保存された触媒領域を規定するヌクレオチドと、その 配列が、RNAウイルスのパッケージング配列内の前もって決定された標的配列 とハイブリダイズすることができるヌクレオチドを含む、合成の非天然オリゴヌ クレオチド化合物に関する。好適には、このウイルスパッケージング配列は、レ トロウイルスパッケージング配列であり、1つの実施態様においてHIV−1 Psiパッケージング配列である。このRNAウイルスは、HIV−1、ネコ白 血病ウイルス、ネコ免疫不全症ウイルスまたは表6〜7にリストしたウイルスの 1つであってよい。保存された触媒領域は、ハンマーヘッドリボザイム(Haselo ffら、米国特許第5,245,678号;Rossiら、米国特許第5,249,796号参照)、ヘアピ ンリボザイム(Hampelら、1989年9月20日出願のヨーロッパ特許出願第89 117424号参照)、肝炎デルタリボザイム(Goldbergら、1991年4月4日発行 の、PCT国際出願WO91/04319およびWO91/04324参照)、RNAasePリ ボザイム(Altmanら、米国特許第5,168,053号参照)、グループIイントロン(Ce chら、米国特許第4,987,071号参照)、またはグループIIイントロン(Pyle,1993 参照)から誘導することができる。 1つの実施態様において本化合物は、下記構造(配列番号1): (式中、各Xは、同一かまたは異なるヌクレオチドを表し、その糖、リン酸また は塩基が修飾または置換されていてもよく;各A、C、U、およびGは、リボヌ クレオチドを表し、その糖、リン酸または塩基が修飾されていないか、または修 飾または置換されていてもよく;3’−AAG....AGUCX−5’は、保 存された触媒領域を表し;各(X)nAおよび(X)n'は、その配列がRNAウ イルスのパッケージング配列内の前もって決定された標的配列とハイブリダイズ することができるヌクレオチドを表し;各*は、その両側に位置するヌクレオチ ド間の塩基対を表し;各実線は、これの両側に位置するヌクレオチド間の共有結 合 を提供する化学結合を表し;各点線は、独立に、その両側に位置するヌクレオチ ド間の共有結合を提供する化学結合を表すか、またはこのような化学結合が存在 しないことを表し;aは、0または1であり、もしaが0であるならば、(X)a の5’に位置するAは、(X)aの3’に位置するXに結合する、ヌクレオチド の数を表す整数を表し;各mおよびm’は、1またはそれ以上の整数を表し;( X)bは、オリゴヌクレオチドを表し;そしてbは、2またはそれ以上の整数を 表す)を有する。 あるいは、本化合物は、下記構造(配列番号2): (式中、3’−AAG....AGUCX−5’は、保存された触媒領域を表し ;mは、2〜20の整数を表し;そしてヌクレオチド(X)mのいずれも、本化 合物内の他のどのヌクレオチドともワトソン・クリック塩基対を形成しない)を 有する。 別の実施態様において請求の範囲第1項記載の化合物は、下記構造(配列番号 3): (式中、3’(X)P4....(X)P1−5’は、保存された触媒領域を表し; 各(X)F4および(X)F3は、その配列がRNAウイルスのパッケージング配列 内の前もって決定された標的配列とハイブリダイズすることができるヌクレオチ ドを表し;各実線は、その両側に位置するヌクレオチド間の共有結合を提供する 化学結合を表し;F3は、F3が3またはそれ以上である、オリゴヌクレオチド 中のヌクレオチドの数を表し;F4は、F4が3〜5である、オリゴヌクレオチ ド中のヌクレオチドの数を表し;各(X)P1および(X)P4は、(X)P4が(X )P1 の3〜6塩基と塩基対を形成する、前もって決定された配列を有するオリゴヌ クレオチドを表し;P1は、P1が3〜6であり、かつP1とF4の和が9であ るオリゴヌクレオチド中のオリゴの数を表し;各(X)P2および(X)P3は、( X)P2が(X)P3の少なくとも3塩基と塩基対を形成する、前もって決定された 配列を有するオリゴヌクレオチドを表し;各点線は、独立に、その両側に位置す るヌクレオチド間の共有結合を提供する化学結合を表すか、またはこのような化 学結合が存在しないことを表し;そして(X)L2は、存在するかまたは存在しな いオリゴヌクレオチドを表し、もし(X)L2が存在するならば、L2は3または それ以上の整数を表す)を有する。 別の実施態様において、配列が保存された触媒領域を定義するヌクレオチドは 、肝炎デルタウイルスの保存された領域由来である。あるいは、配列が保存され た触媒領域を規定するヌクレオチドは、その3’末端に配列NCCAを含有する 。 本発明はまた、同一かまたは異なる前もって決定された標的配列を標的とする 、同一かまたは異なる保存された触媒領域を有する多重化合物またはリボザイム に関する。この実施態様において、天然に存在しない合成オリゴヌクレオチド化 合物は、同一もしくは異なる2以上のドメインを含み、夫々のドメインは、保存 された触媒領域を定義する配列を有するヌクレオチドと、RNAウイルスのパッ ケージング配列内の所定の標的配列とハイブリダイズできる配列を有するヌクレ オチドとを含む合成オリゴヌクレオチド化合物。この化合物はまた、RNAウイ ルスのパッケージング配列内の、このオリゴヌクレオチド化合物と同一かまたは 異なってもよい、所定の配列とハイブリダイズすることができるアンチセンス核 酸化合物に対して共有結合していてもよい。 1つの好適な実施態様において、ヌクレオチドは、MoMLVの243、27 4、366または553標的配列、およびHIVPsiパッケージング部位中の 部位749とハイブリダイズすることができる。このオリゴヌクレオチド化合物 はさらに、RNAウイルスゲノムの異なる遺伝子に共有結合され、これを標的と する、少なくとも1つのさらなる合成の非天然オリゴ化合物またはアンチセンス 分子を含んでもよい。RNAウイルスがHIVである場合に、HIVゲノムの異 なる領域は、長末端反復配列(long terminal repeats)、5’非翻訳領域、ス プライ ス供与−受容部位、プライマー結合部位、3’非翻訳領域、gag、pol、プ ロテアーセ、インテグラーゼ、env、tat、rev、nef、vif、vp r、vpu、vpx、またはtev領域よりなる群から選択されてよい。 好適には、第1のオリゴヌクレオチド化合物は、MoMLVの243、274 、366または553標的部位またはこれらの組合せ、およびHIVPsiパッ ケージング部位の部位749とハイブリダイズすることができ、そして第2の追 加化合物のヌクレオチドは、HIV tat領域の5792、5849、588 6、または6042標的部位またはこれらの組合せとハイブリダイズすることが できる。追加の標的は、HIVゲノム内(表III)(配列番号4〜7)、特に at 配列内およびpsiパッケージング領域(HIV−1 SF2) (すなわち表III)に存在してよい。本明細書で使用された具体的なリボザイム 配列は、Rz−2、Rz−MおよびRz−ψである。抗HIVリボザイム配列: Rz−2(単一抗tat Rz−M(多重抗tat Rz−ψ(単一抗IVψ) リボザイムによるHIV RNAの切断は、有用な方法になりうる。治療上、 これは幾つかの重要な性質を有する: i)特異性、 ii)比較的多数の可能性ある部位を標的とする能力、 iii)細胞に対する毒性の欠如、 iv)リボザイム分子の代謝回転、 v)適用可能な導入方法の多様性および vi)種々の製造方法の可能性:a)化学合成(短い分子であるため)、b)イ ンビトロ転写による生化学的産生、およびc)組み込んだ構築物からのプロモー ターに推進されるインビボ産生。 本発明は、HIV複製を阻害する抗パッケージング部位(Psi)リボザイム を利用する。この活性は、レベルA、E、FおよびGで作用するであろう。この 部位の切断は、以下の阻害効果を及ぼしうる:i)標的細胞へのウイルスの侵入; ii)ウイルスRNAの産生;iii)ウイルス蛋白へのウイルスmRNAの翻訳;およ びiv)ウイルス粒子へのウイルスゲノムRNAのパッケージング。PSIパッケージング配列 Psiパッケージング配列は、ウイルス粒子へのウイルスRNAの特異的なキ ャプシド包み込みに必要なシス作用性ウイルスゲノム配列である(Aronoffら,1 991)。ウイルス粒子へのRNAのパッケージングは高い特異性を示し、これは Psi部位によるものであるらしいことが示された。Mo−MLVとHIV−1 の両方に関してPsiパッケージング部位の位置は、機能欠失(すなわち、ある 配列を除去してウイルスRNAのパッケージング過程が継続するかどうかの観察 )により同定された。この配列は、レトロウイルスの5’非翻訳領域内に存在し 、パッケージングされないRNAには存在しないことが示された。本発明に関し て、RNAがパッケージングされるものとして容易に認識されるようにするには 、パッケージング配列は露出しており利用しやすくかつ認識することができなけ ればならないと我々は推論した。Mo−MLVとHIV−1パッケージングシグ ナル両方の検討により、各場合に保存された安定な2次構造が存在することが判 つた(Alfordら,1992およびHarrisonら,1992)。我々の考えでは、これらの特徴 によりPsiパッケージング部位はリボザイム作用の有力な標的になっている。 レトロウイルスパッケージング配列に対するアンチセンスを使用する以前の検討 により、モロニーマウス白血病ウイルス(Mo−MLV)の複製はトランスジェ ニック動物ではPsi配列による妨害のため阻害されうることが判った(Hanら, 1991)。モロニーマウス白血病ウイルス(Mo−MLV)およびヒト免疫不全ウイルス(H IV−1) Mo−MLVは、癌遺伝子を含まないマウスの野生型レトロウイルスである( 図3)(Teichら,1985)。これは、挿入突然変異のため長い潜伏期でマウスに白 血病を引き起こす。我々は抗ウイルスリボザイムの有効性の原理を立証するため の第1段階としてMo−MLVを使用した。Mo−MLVは、その複製が図1に 略述した線にそって進行し、パッケージングがPsiパッケージング部位により 行われる典型的なレトロウイルスである。本発明の1つの実施態様において、P siパッケージング部位を標的とし、発現ベクター内でクローン化された抗Mo −MLVリボザイムを、組織培養でウイルス産生を低下させるその能力に関して 試験した。 後天性免疫不全症候群(AIDS)の活性成分であるHIV−1は、Tリンパ 球の細胞死を誘導する(McCune,1991;Levy,1993)。これらの細胞は免疫応答に 極めて重大に寄与している。抗HIV法が有効であるためには、これらの細胞の 喪失のため免疫系が機能しなくなる前にウイルスの複製を実質的に低下させるか または阻害することが必須である。現在AIDSの有効な治療法はない。しかし 、ウイルス力価を低下させることにより疾患の進行が遅延しさらに停止しうるこ とが期待される。抗HIVパッケージング配列リボザイムの開発は、ウイルス産 生を実質的に阻害し、さらには停止させる実行可能な方法であると考えられる。 リボザイムを発現する細胞においてgag−RNAとp24のレベルを低下さ せることができることが証明された抗HIV−gagリボザイムが既に開発され ている(Sarverら,1990)。インテグラーゼ蛋白の翻訳を防止するため大腸菌に おいてHIV−1インテグラーゼRNAを切断するハンマーヘッドリボザイムが 開発されている(Sioudら,1991)。HIVの5’非翻訳領域であるU5または at においてHIV−1 RNAも切断するリボザイムが、T細胞をHIV−1 から保護することができることを示した研究もある(Dropulicら,1992;Ojwang ら,1992;Loら,1992;およびWeerasingheら,1991)。 本発明の別の好適な実施態様において、Psiパッケージング部位を標的とす る抗HIVリボザイムが、抗Mo−MLV構築物と同じ発現ベクター内でクロー ン化された。これらの構築物も、組織培養でウイルス産生を低下させる能力に関 して試験した。発現構築物の導入 標的細胞中に発現構築物を導入する主な手段は、電気穿孔法、リポゾーム介在 およびレトロウイルス媒介性遺伝子導入を含むトランスフェクションである。定義 本明細書で使用される「Psiパッケージング部位」とは、ウイルス粒子への ウイルスRNAのキャプシド包み込みに関与する5’LTRに直接隣り合う領域 を意味する。 本明細書で使用される「相補的アーム」は、標的RNAの特異的な領域に結合 させることのできるコアハンマーヘッドリボザイムに付加された配列である。 本明細書で使用される「リボザイム」は、標的RNAを切断することができる 、ハンマーヘッドヘアピン、肝炎デルタ、RNAaseP、グループIイントロ ンまたはグループIIイントロンのリボザイムであってよい。ハンマーヘッドリボ ザイムは、HaseloffとGerlach(Haseloffら,1988)の論文の主題であり、多くの 研究室により続いて論文が出た。説明 本発明は、病原物質が、そのゲノム物質としてRNAを有し、このRNAがウ イルス粒子にパッケージングされる、ウイルス疾患、特にAIDSの治療に関す る。本方法は、ウイルスゲノムRNAのパッケージングに必要な認識配列である Psiパッケージング部位でウイルスRNAを破壊することにより、ウイルスの 複製を阻害するものである。この部位の切断は、i)標的細胞へのウイルスの侵 入、および続いての宿主ゲノム中へのプロウイルスの組み込み、ii)ウイルスRN Aの産生、iii)ウイルス蛋白へのウイルスmRNAの翻訳、およびiv)ウイルス 粒子へのウイルスゲノムRNAのパッケージングに阻害効果を有する。 本発明の1つの実施態様において、目的のヌクレオチド配列を含む幾つかの発 現構築物が提供される。好適な発現構築物において、リボザイム発現構築物は、 Mo−MLVまたはHIV−1感染細胞である細胞に導入されると、リボザイム を取り巻く相補的アームのためMo−MLVまたはHIV−1 RNAに結合す ることができるRNAの転写を指令することができるリボザイム発現構築物が提 供される。これらの相補的アームは短く、RNAを切断してRNA分子の作用を 妨害するのはリボザイム配列の存在である。 本発明は幾つかの方法で試験された。1セットの実験は、インビトロのMo− MLVウイルスPsiパッケージング配列のリボザイム介在切断と、Mo−ML V複製のインビボの抑制の間の正の相関を証明した。この結論に到達するには下 記3つの主要な段階があった: i)リボザイム介在インビトロ切断の証明。ii)Mo−MLV感染細胞へのリボ ザイム含有構築物のトランスフェクション。iii)a)構築物の組み込み、b)リ ボザイム構築物の発現、c)ウイルス複製のレベルに及ぼすリボザイム構築物発 現の影響を証明するための種々の測定。 HIVに関して、同様な段階は以下のとおりであった: i)リボザイム構築物の設計と作成、ii)ヒトTリンパ球細胞株へのリボザイム含 有構築物のトランスフェクション、iii)a)構築物の組み込み、b)リボザイム 構築物の発現、c)ウイルス複製のレベルに及ぼすリボザイム構築物発現の影響 を証明するための種々の測定。 本発明は、以下の両方にウイルス抑制剤として作用する:i)ウイルスが標的 細胞に侵入する際にウイルスRNAを捕捉することにより、非感染細胞へのウイ ルスの侵入を阻害する:およびii)感染細胞を出る機能性ウイルスのレベルを低 下させる。両方の場合に、これはウイルスRNAを切断する(第1の場合には侵 入時点で、そして第2の場合には細胞を出る時点で)。後者の場合に、切断は、 ウイルスおよびmRNAの両方を切断することによりRNAレベルを低下させる 。Psiパッケージング部位の特異的な切断もウイルスRNAのパッケージング を阻害する作用を有する。 抗ウイルスリボザイム作用の標的を選択するために幾つか考慮したことがある 。本発明のために使用した評価基準は、以下のとおりであった: i)この標的は機能的に重要なものである必要がある。ii)標的領域内で異なる HIV−1単離体間の配列の保存の程度が高くなければならない。iii)ハンマー ヘッドリボザイムの場合には、GUCまたはGUAのようなリボザイム標的配列 が、 好適にはその配列または関連するトリプレットGUU、CUCなどの中に存在す る(Perrimanら,1992)。iv)標的配列は容易に利用可能であるべきであり、例え ば、広範囲の2次構造を欠いている(Rossiら,1992)。 Psiパッケージング部位は、上記評価基準に合致しており、リボザイムによ る切断の標的として選択された。この部位は、i)レトロウイルス複製サイクル における必須の機能を有し、ii)比較的利用しやすく、パッケージングが起こるた めに他の成分に対して認識され利用しやすくなければならないRNA上の部位で あり、そしてiii)同じウイルスの異なる株間で保存された性質を有する。 Mo−MLVとHIVの両方の異なる株で各ウイルスのPsiパッケージング 領域における配列と構造に強い保存性があることが観察された。HIVとMo− MLVのパッケージング部位間に構造または配列の明らかな保存性はないが、各 ウイルスのPsi部位の同一の機能のため、これらに類似性があると推測するこ とは合理的である。ウイルスRNAの2次構造が検討され、リボザイム作用に利 用可能であると考えられたPsi配列の部位が選択された。これらはループ領域 、すなわちRNAの一本鎖の塩基対非形成領域にある。Psiパッケージング配 列の塩基対非形成領域の位置を見つけるために、ズーカー(Zuker's)のFOLDRNA プログラムを使用した。このリボザイムはこれらの部位を標的とするよう設計さ れた。選択された部位には、GUC塩基配列も存在した。 本発明に使用された構築物は、ネオマイシン耐性遺伝子(neor)の3’非 翻訳領域中に挿入したリボザイムを利用した。この基本的な構築物を図4に示す 。このような構築物により、組み込みと発現を評価することができた。前者はサ ザン解析により測定され、後者はG418毒性に対する細胞耐性とRNAse保 護測定法により測定された。利用した設計物のさらなる利点は、より大きなne or遺伝子メッセンジャーの3’末端にある小さなリボザイム配列とのキメラR NAが、細胞中でリボザイムを安定に維持する作用を有するらしいことである。 安定性なしにはリボザイムの効果は非常に小さいため、後者は極めて重要な点で ある。考察 本発明は、ヒトを含む動物をレトロウイルスにより引き起こされる疾患から保 護するためにリボザイムを使用する方法の根拠を提供する。本発明の基本原理は 、 より大きな遺伝子に標的レトロウイルスのパッケージング部位に対するリボザイ ムを組み込むことである。この担体遺伝子は、選択性(本出願のように)または 非選択性であってよい。この大きな担体遺伝子の発現は、より安定なキメラリボ ザイムRNA分子を提供する。このDNA構築物を、感染していない細胞集団に トランスフェクションして細胞を保護するか、またはウイルスに感染した細胞集 団に導入してウイルス力価を低下させることができる。さらなる実施態様におい て、このリボザイム発現構築物は、レトロウイルス媒介性遺伝子導入により導入 効率を上昇させることもできる。本発明の第3の実施態様は、抗パッケージング 部位リボザイムを含むレトロウイルスである。このレトロウイルスベクターがM oMLVに基づくならば、HIVのパッケージング部位を標的とするリボザイム は、2つのレトロウイルスの配列の相違のためMoMLVパッケージング部位を 切断しないであろう。 治療的には本出願は、この構築物のエクスビボでのTリンパ球への導入、また はエクスビボでの造血幹細胞への導入に関する。1つの好適な研究法は、両種向 性(amphotropic)Mo−MLVのようなレトロウイルスベクターによりリンパ 球または幹細胞中にリボザイム構築物を組み込むことであろう。造血前駆細胞と 真の幹細胞は、これらが骨髄に存在するかまたは末梢血に移動することができる ため、遺伝子治療の有力な標的である。前駆細胞は、骨髄系細胞およびリンパ系 細胞の両方に分化し、真の幹細胞は、全ての細胞系統の細胞に分化する。治療は 、リボザイムを含有するHIV感染造血系と幹細胞を破壊する放射線照射を行い 、次に患者に注入することを伴う。その結果、患者の細胞はHIVに抵抗性にな る。 本発明はまた、転写により上述の化合物になるヌクレオチド配列を含有するR NAまたはDNAまたはこれらの組合せを含むトランスファーベクターに関する 。このトランスファーベクターは、HIVの長末端反復配列(LTR)、アデノ ウイルス関連トランスファーベクター、SV40プロモーター、Mo−MLV、 または両種向性を示すレトロウイルスベクターであってよい。このトランスファ ーベクターは、このオリゴヌクレオチド化合物をインビボで特定の臓器または細 胞、あるいは細胞内の特定の領域に指向させる配列をさらに含んでよい。細胞の 特定の領域に局在する例は、パッケージングシグナルの使用がある(Sullengerら, 1993)。 本発明はまた、適切な担体中に上述の化合物またはトランスファーベクターを含 有する組成物に関する。担体は、薬剤学的に、獣医学的に、または農学的に許容 しうる担体または賦形剤であってよい。この組成物はさらにTARデコイ(decoy )、ポリTARまたはRREデコイを含んでもよい。 本発明のDNA配列の原核生物または真核生物宿主中での産生のため、本発明 のプロモーター配列は原核生物、真核生物またはウイルス由来であってよい。適 切なプロモーターは、誘導可能、抑制可能、またはより好適には、構成的なもの である。適切な原核生物プロモーターは、T4ポリメラーゼを認識することがで きるプロモーター(Malik,S.ら,J.Molec.Biol.195:471-480(1987);Hu,M.ら,Gen e42:21-30 (1986))、T3、Sp6、およびT7(Chamberlin,Mら,Nature 228: 227-231(1970);Bailey,J.N.ら,Proc.Natl.Acad.Sci(USA)80:2814-2818(1983);Da vanloo,p.ら,Proc.Natl.Acad.Sci.(USA)81:2035-2039(1984));バクテリオファ ージラムダのPRおよびPLプロモーター(バクテリオファージラムダ(The Bacte riophageLambda ),Hershey,A.D.編,Cold Spring Harbor Press,コールドスプリン グハーバー、ニューヨーク(1973);ラムダII(Lambda II),Hendrix,R.W.編,Co ld Spring Harbor press,コールドスプリングハーバー、ニューヨーク(1980)); 大腸菌のtrprecA、熱ショック、およびlacZプロモーター;バクテ リオファージラムダのintプロモーター;pBR322のβ−ラクタマーゼ遺 伝子のblaプロモーター、およびpPR325のクロラムフェニコールアセチ ルトランスフェラーゼ遺伝子のCATプロモーターなどを含む。原核生物プロモ ーターは、Glick,B.R.J.Ind.Microbiol. 1:277-282(1987));Cenatiempo,Y. (Biochimie 68:505-516(1986));Watson,J.D.ら(J.Mol.Appl.Gen.1:273-288(1 982))による総説がある;ヘルペスウイルスのTKプロモーター(McKnight,S. ,Cell 31:355-365(1982));SV40初期プロモーター(Benoist,C.ら,Nature( London) 290:304-310(1981))および酵母gal4遺伝子プロモーター(Johnston ,S.A.ら,Proc.Natl.Acad.Sci.(USA)79:6971-6975(1982);Silver,P.A.ら,Proc.Na tl.Acad.Sci.(USA)81 :5951-5955(1984))。 感受性のある真核細胞または完全な動物のレトロウイルス感染を阻害するのに 使用するベクターの調製のため、上述のように真核生物プロモーターを利用しな ければならない。好適なプロモーターと、ポリアデニル化シグナルのような追加 の制御要素は、レトロウイルスの感染を阻害すべき細胞の型において最大の発現 が得られるようなものである。すなわち、例えば、モロニーマウス白血病ウイル スだけでなく、HIV−1、HIV−2、HTLV−1およびHTLV−2は全 てリンパ球に感染し、そしてリボザイム構築物単独、またはこれらのウイルスの 1つ(またはそれ以上)のパッケージング配列に相補的なアンチセンスRNAと の組合せで充分に発現させるために、転写調節単位(プロモーターとポリアデニ ル化シグナル)が造血細胞、特にリンパ球(またはリンパ組織)で充分な発現を 可能にするように選択される。以下に例示されるように、好適なプロモーターは 、場合により成長ホルモンポリアデニル化シグナル(33)と連結して使用され る、サイトメガロウイルス極初期プロモーター(32)、およびリンパ親和性レ トロウイルスでの使用のための、モロニー−MuLVLTRのプロモーターであ る。モロニー−MuLVLTRプロモーターの望ましい特徴は、レトロウイルス と同じ組織指向性を有することである。CMVプロモーターは、リンパ球で発現 される。他のプロモーターは、VAIおよびtRNAプロモーターを含む。メタ ロチオネインプロモーターは、誘導性で利点を有する。SV40初期プロモータ ーは、骨髄細胞でインビトロで高レベル発現を示す。 本発明はまた、(a)DNA、RNAまたはこれらの組合せを含むトランスフ ァーベクター中に化合物に対応するヌクレオチド配列を連結し;(b)RNAポ リメラーゼにより工程(a)のヌクレオチド配列を転写し;そして(c)化合物 を回収する工程を含む、化合物を製造する方法に関する。 本発明はまた、上述の化合物であるか、または転写によりこれを与えるヌクレ オチド配列を含む、原核生物または真核生物宿主細胞に関する。この細胞は、動 物細胞、前駆細胞に分化する造血幹細胞、全造血細胞系統のさらに成熟した細胞 、および完全に成熟した細胞、全造血細胞系統の成熟した細胞に分化する前駆細 胞、特定の造血細胞系統に分化することが決まっている前駆細胞、Tリンパ球前 駆細胞、未成熟Tリンパ球、成熟Tリンパ球、骨髄系前駆細胞、または単球/マ クロファージ細胞であってよい。 本発明はまた、造血幹細胞、前駆細胞、分化の決まった前駆細胞、Tリンパ球 前駆細胞、未成熟Tリンパ球、成熟Tリンパ球、骨髄系前駆細胞、または単球/ マクロファージ細胞を保護するための上記化合物の使用に関する。さらに、上記 トランスファーベクターを造血細胞に導入し、細胞をHIVに抵抗性にして、こ れによりHIVを抑制/治療またはこれに対して保護することを含む、患者にお いてHIVを抑制/治療またはこれに対して保護する方法に関する。導入はエク スビボ で行い、細胞は、骨髄切除(myeloablation)をしたか、またはしない自 己由来、または異種由来の細胞である。本発明の1つの実施態様において、Mo −MLVPsiパッケージング部位内の異なる部位を標的として3つの単一のハ ンマーヘッドリボザイムと1つの多重ハンマーヘッドリボザイムを設計し、HI VPsiパッケージング部位内の部位を標的として1つのリボザイムを設計した (図2参照)。作用の原理を決定するレトロウイルスの例としてMo−MLVを 選択した。これらの原理は、HIVを含む他のレトロウイルスにも適用されるで あろう。試験はHIV−1についても行った。 本発明において、非ヒト動物とその子孫は、非天然オリゴヌクレオチド化合物 を発現するかまたは保持する少なくとも幾つかの細胞を含有する。トランスジェ ニック非ヒト動物は、その生殖細胞と体細胞の全てが、その動物、またはその祖 先に対して、米国特許第4,736,866 号、5,175,383 号、5,175,384 号、または5,175, 385号に記載されたように胚形成期に導入された、発現可能な形の非天然オリゴ ヌクレオチド化合物を含有している。以下も参照のこと(Van Brunt,1988;Hamm er,1985;Gordonら,1987;Pittiusら,1988;Simonsら,1987;Simonsら,1988)。 本発明はまた、上述の非天然オリゴヌクレオチド化合物で細胞を処理すること を含む、ウイルス感染に対して細胞を抵抗性にする方法を含む。好適には、この 処理はエクスビボで行われる。さらに、本明細書で使用されるアンチセンスとリ ボザイムという用語は、ヌクレオチド、デオキシヌクレオチド、ペプチド、核酸 などで修飾した化合物も含む。これらはエクスビボの処理または局所処理に使用 される。 本発明の非天然オリゴヌクレオチド化合物の有効量は、局所適用用のクリーム 、無菌注射用組成物、または他の非経口投与用組成物などの投薬形中に、一般に 約1nM〜約1mM濃度を含む。局所用処方に関しては、約50μM〜約500μ Mの非天然オリゴヌクレオチド化合物を使用することが一般に好適である。ホス ホロチオ酸塩またはメチルホスホン酸誘導体のような化学修飾した基を含む誘導 体である、ヌクレオチド誘導体を含む化合物は、ナノモル濃度で活性であろう。 このような濃度は、毒性を回避するためにも使用することができる。 本発明の化合物を利用する疾患の治療に関する治療方針は、一般に(Chrisley ,1991)のアンチセンス出版目録に記載されたようなアンチセンス法に関するも のと同じである。特に、使用される化合物の濃度、投与方法および投与様式、お よび関係する処方は、アンチセンス適用に使用されるものと同じであってよい。 本明細書に使用される「有効量」とは、ある病状の哺乳動物に目的の効果と、 投与方法を提供する量を意味する。適切な希釈剤、保存料、可溶化剤、乳化剤、 補助剤および/または担体と一緒に有効量を含む組成物は治療に有用である。こ のような組成物は、液体か、または凍結乾燥か他の方法で乾燥した処方であり、 種々の緩衝化剤含量(例えば、トリス−HCL、酢酸塩リン酸塩)、pHおよび イオン強度の希釈剤、アルブミンまたはゼラチンのような表面への吸収を防止す る添加剤、界面活性剤(例えば、ツイン20、ツイン80、プルロニックF68 、胆汁酸塩)、可溶化剤(例えば、チメロサール、ベンジルアルコール)、増量 剤(bulking substances)または張度調節剤(tonicity modifiers)(例えば、 ラクトース、マニトール)、非天然オリゴヌクレオチド化合物へのポリマー(例 えば、ポリエチレングリコール)の共有結合、金属イオンとの錯体化、またはポ リマー性化合物(例えば、ポリ乳酸、ポリグリコール酸、ポリビニルピロリドン など)の粒状調製物中または表面上への本物質の組み込み、またはリポゾーム、 マイクロエマルジョン、ミセル、単層または多層小胞、赤血球ゴースト、または スフェロプラストへの組み込みを含む。このような組成物は、オリゴヌクレオチ ドの物理的状態、溶解性、安定性、インビボの放出速度、インビボのクリアラン ス速度に影響する。抗酸化剤(例えば、アスコルビン酸);低分子量(約10残 基未満)のポリペプチド(すなわち、ポリアルギニンまたはトリペプチド);蛋 白(例えば、血清アルブミン、ゼラチン、またはイムノグロブリン);アミノ酸 (例えば、グリシン、グルタミン酸、アスパラギン酸、またはアルギニン):E DTAのようなキレート化剤;および糖アルコール(例えば、マニトール、ソル ビトール)のような他の成分も場合により添加してもよい。可能な徐放性組成物 は、親油性貯 蔵物(例えば、脂肪酸、ロウ、油)を含む。ポリマー(例えば、ポリオキサマー (polyoxamers)、またはポリオキサミン)でコートした粒状組成物や、組織特 異的受容体、リガンドまたは抗原に対する抗体に結合した、または組織特異的受 容体のリガンドに結合した非天然オリゴヌクレオチド化合物も本発明に包含され る。 さらに、特異的ヌクレオチド配列を、本発明の非天然オリゴヌクレオチド化合 物を標的とするため、核、プラスチド、細胞質または特定の型の細胞に添加して もよい。本発明の組成物の他の実施態様は、粒子型保護コーティング、プロテア ーゼ阻害剤または非経口、肺内、鼻内および経口を含む種々の投与経路の浸透増 強剤を組み込む。 適切な局所用処方は、ゲル剤、クリーム剤、液剤、乳剤、炭水化物ポリマー、 その生物分解性マトリックス;蒸気、ミスト、エーロゾル、または他の吸入剤を 含む。非天然オリゴヌクレオチド化合物は、ウエハース(wafer)、ロウ、フィ ルムまたはチューイングガムを含む固体担体中にカプセル化してもよい。表皮層 の通過を助ける浸透増強剤も当該分野で公知であり、ジメチルスルホキシドおよ びグリコールを含むが、これらに限定されない。 リボヌクレオチドおよびデオキシリボヌクレオチド誘導体または修飾体は、当 該分野で周知であり、市販のDNA合成機に適合可能である(Saengcr,1984参照 、特に 159-200ページ)。ヌクレオチドは、塩基、糖および一リン酸基を含む。 従って、ヌクレオチド誘導体、置換体、または修飾体は、塩基、糖、または一リ ン酸のレベルで製造することができる。 多数の修飾塩基が天然に見い出され、広い範囲の修飾塩基が合成的に製造され ている(Saenger,1984;および生化学のCRCハンドブック(CRC Handbool of Biochemistry))。適切な塩基は、イノシン、5’−メチルシトシン、5’− ブロモウラシル、キサンチン、ヒポキサンチンおよび他のこのような塩基を含む 。例えば、アミノ基と環窒素がアルキル化(例えば、環窒素または炭素原子のア ルキル化(例えば、グアニンのN1およびN7、およびシトシンのC5))されても よく;チオケト基によるケトの置換;炭素−炭素二重結合の飽和、およびシュー ドウリジンのC−グリコシル結合の導入がある。チオケト誘導体の例は、6−メ ルカプトプリンおよび6−メルカプトグアニンである。 塩基は、ハロゲン、ヒドロキシ、アミン、アルキル、アジド、ニトロ、フェニ ルなどのような種々の基で置換されてよい。塩基は、他の化学物質(例えば、酸 性または塩基性基)を組み込むかまたは組み込まない、アミノ酸側鎖またはリン カーのような他の化学種で置換されていてもよい。例えば、グアニン(G3)は 、チロシン、および同様にヒスチジンで置換されたシトシン(C1)またはアデ ニン(a1)で置換されていてもよい。 ヌクレオチドの糖残基も、当該分野で公知の方法により修飾されてよい(Saen ger,1984)。本発明は、このような修飾が化合物の切断活性を破壊しない限り 、ヌクレオチドの糖残基への種々の修飾を包含する。修飾糖の例は、第二級ヒド ロキシル基のハロゲン、アミノまたはアジド基による置換;2’−メチル化;O2 '−ヒドロキシルがグリコシルC1に対してcis配向したような配座変異体、 アラビノヌクレオシドを与えるような−N結合、およびα−ヌクレオシドを与え るC1炭素の配座異性体などを含む。さらに、ヘキソース(例えば、グルコース )、ペントース(例えば、アラビノース)のような非リボース糖を使用すること ができる。 ヌクレオシドのリン酸残基も、当該分野で公知のとおり誘導体化または修飾す ることができる。例えば、窒素、硫黄または炭素誘導体により酸素を置換して、 各々ホスホルアミド酸、ホスホロチオ酸、ホスホジチオール酸、およびホスホン 酸を与える。窒素、硫黄または炭素誘導体による酸素の置換は、架橋または非架 橋位置で行われてよい。アンチセンスオリゴヌクレオシドに関する研究から、恐 らく細胞受容体との会合のため、ホスホジエステルとホスホロチオ酸誘導体が効 率的に細胞に導入される(特に長さが短い時に)ことは充分に確立されている。 メチルホスホン酸は、これらが電気的に中性であるため、細胞に恐らく容易に取 り込まれる。 リン酸残基は、ペプチド核酸により完全に置換されていてもよい(Hanvey ら ,1992;Nielson,1991;およびEgholm,1992 を参照)。他の置換も当業者には 公知であり、例えば、シロキサン架橋、炭酸架橋、アセトアミド酸(acetamidat e)架橋、カルバミン酸架橋、チオエーテル架橋などがある(UhlmannとPeymann, 1990)。 以下の実施例は、特許請求した発明の説明のために与えられる。本発明は、以 下の詳細な実験の項で説明される。これらの項は、本発明の理解を助けるために 与えられるものであり、その後に続く請求の範囲に述べる本発明をなんら制限す る意図はなく、制限すると解釈されてはならない。 実施例1 Mo−MLVPsiパッケージ配列の リボザイムに触媒されるインビトロ開裂 ターゲット部位が実際に開裂可能であることを示すために、細胞培養中でリボ ザイムテストを行う前にインビトロで開裂反応を実施した。 Mo−MLVパッケージ領域で、GUC塩基の存在およびズッカーのFOLD RNAプログラム(Zuker et al.,1981)から提案されるRNA二次構造内にある 部位のアクヤス可能性によって、4つの部位を選択した。該部位は、ウイルスの 転写物の5’末端からのヌクレオチドの距離を基に、243、274、366、 および553と命名された(図2)。これらヌクレオチドの位置は、RNA腫瘍 ウイルスに記載されている通りである(Coffin,1985)。2種類のリボザイムが デザインされた。その内の一つは、三つの部位243、273、366の個々に ターゲットされた、12ヌクレオチドの長さの腕をもった3つの単一リボザイム であり、他の一つは、4つの部位の全てにターゲットされ、各ターゲット部位間 に挟まれた配列の長さの腕を持つ多重リボザイムである。該部位および全体のデ ザインは、図2に示されている。 単一リボザイムは、張り出したPstIとEcoRI末端を持つ人工の二本鎖 挿入物を、pGEM3Zf(+)中にクローニングすることによって構築された 。得られたプラスミドは、pGEM243,pGEM274、pGEM366で あった。多重リボザイムは、標準インビトロ突然変異プロトコールの変法によっ て構築された(Warrilow et al.,1992)。このプラスミドは、pGEM-M7と 命名された。クローニングの成功および配列の完璧さは、DNA配列決定によっ て確認された。 pMLV−1(Coffin,1985)から得られるMo−MLVのBalI−Bal I断片中に存在するPsiパッケージ配列が、pGEM3Zf(+)ベクター中 にクローン化され、インビトロリボザイム開裂用の基質として転写された。リボ ザイ ムまたは基質を生成させるためのランオフ転写用混合物(mn-off transcription mixture)(50μl)は、1μlの直線化されたプロテナーゼKで処理したDN Aテンプレート、30mMのジチオトレイトール、400μMの各rNTPs、 40mMTris−Cl、pH8.0、2mMスペルミジン、6mM MgCl2 、50mM NaCl、1μlの[a-32P]-UTP(400-800 Ci/m mole,10m Ci/ml ),1ユニット RNasin、および10ユニットのT7またはSP6 RNA ポリメラーゼ(Stratagene)を含んでいた。37℃で1時間インキュベーション した後、RNaseを含まない10ユニットのDNase(Promega)を加え、該 混合物を37℃で15分インキュベートした。フェノール・クロロホルムで抽出 した後、RNA転写物を0.1体積の3M酢酸ナトリウムおよび2.5体積のエ タノールを加えることによって沈澱させた。開裂反応用に、リボザイムおよび基 質(1:1モル比率)を80℃で2分間予備インキュベーションし、その後、5 0mM Tris−Cl、pH7.5および10mM MgCl2の存在下におい て、37℃で30分インキュベーションした。反応を、同量の停止混合物(8M 尿素、50mMEDTA,0.05%ブロムフェノール・ブルー、および0.0 5%キシレンシアノール)を加えて停止させ、8M尿素を含む変性6%のポリア クリルアミド・ゲル上で分析し、オートラジオグラフィーにかけた。 Mo−MLVプロウイルス・パケージング配列の別の部位をターゲットする加 エリボザイム(engineering ribozymes)は、目的のRNAを選択された部位でイン ビトロ開裂することがわかった リボザイム構築物の大半は、32Pで標識されたプサイ(Psi)転写物を32P で標識されたリボザイムRNAと共に、約等モル量でインキュベーションすると 、温和な物理的状態(37℃、10mM Mgcl2、50 mM Tris-Cl ,pH7.5)下で基質の有効な開裂を導いた。これらの消化物の代表的な例を 図6に示す。Rz274およびRz366によって産生された開裂プサイ断片の サイズは、開裂予想部位の位置と一致しており、夫々、62nt+473ntお よび154nt+381ntのバンドとなって得られた。多重リボザイム(Rz −M7)は、いくつかの部分開裂断片と同様に予想通り4断片(50nt,92 nt,187nt、および240nt)を産生した(図3)。Rz243につい ては、 37℃では、視認可能な開裂はなく、50℃では弱い開裂があり、適合サイズの 断片が産生した(データ表示せず)。リボザイム243を除いて、これらの結果 によって、部位特異的リボザイムに媒介された開裂が有効に行われることがわが った。 実施例2 抗Mo−MLVパッケージング部位プサイ(Psi)構築物 有効なインビトロ開裂を実証した後、加工リボザイムおよびPsiパッケージ ング領域と相補的な長いアンチセンス配列を、サル・ウイルス(SV40)初期 プロモータと繋がったneor遺伝子の3'の未翻訳領域にクローン化した(図4) 。neor遺伝子は、燐酸化酵素をコードする原核生物の遺伝子であり、燐酸化 によってネオマイシンまたはネオマイシン類似物G418を不活性化する。後者 は、哺乳類細胞にとって有毒であり、外因性neor遺伝子が発現すると、細胞 が生存できる。neor遺伝子と繋がったSV40プロモータを持つこの構築物 は、哺乳類発現ベクターpSV2neo内にあり、図4に図式的に示される。 リボザイム挿入物およびアンチセンス対照(antisense control)を、平滑末端 連結によってneorの3’未翻訳領域のSmaI部位にクローン化した。得ら れたベクターは、それぞれpSV243,pSV274,pSV366,pSV M7およびpSVas Psi(アンチセンス構築物)と命名された。 実施例3 構築物類の3T3−Mo−MLV産生細胞系 へのトランスフェクション 種々のpSV2neo系構築物を、燐酸カルシウム・トランスフェクション・ プロトコールを使用して、3T3−Mo−MLV細胞中にトランスフェクトした (Chen et al.,1987)。陽性コロニーは、500μg/mlのG418の存在下に おいて、9〜12日後に形成された。各構築物について、4〜7コロニーをクロ ーニング・シリンダーを使用して単離した。これらのコロニーを成長させ、液体 窒素中に貯蔵して、その後の分析に使用した。500μg/mlのG418中で 10〜14日、選別した後、各構築物について、いくつかの安定したクローン細 胞系が確立された。トランスフェクトされたDNA発現構築物の統合を確認する た め、ゲノムDNAをトランスフェクトされたいくつかの細胞系から調整し、サザ ン分析を行なった。制限酵素HindllIおよびNruIを使用して、ゲノム DNAを消化し、neor遺伝子プラス挿入物(リボザイムまたはアンチセンス )を含む断片を産生した。次に、構築物の存在を、neor特異的プローブを使 用することで決定された。図7に示されたサザン分析からは、リボザイムおよび アンチセンス両構築物によってトランスフェクトされ、G418中で選択された 細胞が、neor遺伝子プラス適宜なリボザイムまたはアンチセンス配列を含ん でいることが明らかである。neorプローブによってハイブリダイズされたH indIII−NruI断片のサイズは、各ケースにおいて予想されたサイズ、 つまりneor遺伝子単独では、1.3kb;neor+単独リボザイムは、1. 38kb;neor+多重リボザイムは、1.98kb;neor+アンチセンス 配列は、1.89kbであることがわかった。 リボザイムまたはアンチセンス構築物の発現は、陽性トランスフェクト物中の G418耐性によって推定された。これは更に、トランスフェクトされた細胞中 において、RNaseプロテクション分析を使用して調べられた。全RNAは、 グアジニウム・チオシアネート法を使用していくつかの細胞系から抽出され、全 RNA20μgが32Pで標識された対応するリボプローブ(5x104cpm) によって、80%のイオン除去されたホルムアミド、100mMクエン酸ナトリ ウムpH6.4、300mM酢酸ナトリウムpH6.4、1mM EDTAを含 む溶液中でハイブリダイズされ、続いてハイブリダイズされたRNAsのRNa se消化を行った(5μg/mlのRNaseAおよび10ユニット/mlRN aseT1)。リボザイムが発現されなければ、その時は相補的なリボプローブ が結合することができない。RNAは、単一鎖のまま残り、RNaseで全部消 化される。次に、反応混合物を、電気泳動により分離した。図8に示すように、 全リボザイムおよびアンチセンス構築物が予想されたように発現されたことが分 析によって明かとなった。プロテクトされた断片は、65bp(単一リボザイム );588bp多重リボザイム、524bp(アンチセンス)である。 実施例4 Mo−MLV複製を抑制する構築物の能力 異なる構築物によってトランスフェクトされた安定な3T3Mo−MLVクロ ーン細胞系が確立された後、XCプラーク分析を採用してMo−MLV複製のレ ベルを評価した。XC分析は、Mo−MLVのシンシチウム・プラーク分析法で あり、これは、Mo−MLV産生細胞がXC細胞融合を引き起こすことができる かの観測に立脚して行われ、ターゲット細胞へのウイルスの結合を高めるために 、感染の際に8μg/mlのポリブレン(Sigma)を存在させ、それ以外は(gautsc he et al.,1976)に記載されるようにMo−MLVを適定した。異なるMo−M LV産生細胞系の培養物から得られた上澄み液を、感染前に一時間、8μg/m lのポリブレンで予備処理した未感染マウスNIH3T3細胞に加えた。成長培 地で20時間インキュベーションを行った後、感染したNIH3T3細胞をXC 細胞と共に、2x2mm2の格子目を付けたプレート中で3〜4日間共培養した 。該プレートを、次にメタノールで固定し、1%メチレンブルー + 0.1% ゲンチアン・バイオレットで染色し、顕微鏡でシンチニウム・プラークをスキャ ンした。分析が用量−反応曲線の直線部分内で確実に行われる様に、1ブレート 当たり3.5x105細胞に、2倍に連続希釈したウイルスを感染させ、24時 間後にXC細胞を混合させた培養基に移した。表1の結果は、3つの別々の実験 から得られた。シンシチウム・プラーク形成を74%から77%阻害することが 、pSV2neoベクター含有細胞に関連したRz274,Rz366,Rz− M7およびAs−Psiを含む細胞から観察されたが、Rz−243含有細胞に ついては、はっきりした阻害がみられなかった。これらのデータは、Rz243 は、使用された条件下で有効に基質を開裂したようにはみえないというインビト ロの開裂結果(図6)と一致する。 これらの抑制効果は、ウイルスRNAドット・ブロテイングを使用して確認さ れ、NIH3T3ウイルス産生細胞の16時間培養物から1mlの上澄み液をマ イクロ遠心分離機で遠心分離(12,000 rpm,10分,4℃)することによつて解明さ れた。ウイルスRNAは、8%PEG8,000および0.5MNaCl中で沈澱さ せた。フェノール・クロロホルム抽出後、アルカリ・トランスファー溶液中(Ree d et al,1985)で、RNAを陽電気荷電したナイロン膜上(ゼータ・プローブ、Bi o-Rad)にブロットした。 ハイブリダイゼーションを、42℃で一晩、50%ホルムアミド、5X SS PE、5Xデンハート溶液、0.5%SDS、100mg/ml変性サケ精子D NAおよびpGEM−PsiのT7プロモータから転写された32Pで標識のリボ プローブの中で行った。ウイルスRNAは、ドット・シンチレーション計測によ って定量された。リボザイムまたはアンチセンスでトランスフェクトされた3T 3−Mo−MLV細胞から得られた上澄み液中のウイルスRNAが測定され、p SV2neoでトランスフェクトされた3T3−Mo−MLV細胞から得られる 上澄み液中のウイルスRNAと比較された。図9および表2(Rz243発現細 胞を除く)からもわかるように、リボザイムまたはアンチセンスを発現する全て の細胞系から産生されるウイルスRNAの量は、シンシチア分析によって観測さ れる量と同じ量だけ実質的に減少した。 これらのリボザイム構築物をMo−MLV感染細胞中にトランスフェクトした 後、有効なインビトロ開裂を示すリボザイムのみが、インビトロのMo−MLV 複製を抑制(約70〜80%)する能力を示した。これらの結果から、インビト ロ開裂と、インビトロでのリボザイム媒介性ウイルス抑制との間に直接の相関関 係があることが実証された。 先の実験は、ウイルス適定を減少させるために、HIV・Psiパッケージ配 列上の部位にターゲットとするようにデザインされたリボザイムをさらに研究す る基礎となった。 実施例5 抗HIVパケジング部位構築物 GUA部位が、リボザイム・ターゲテング用のHIV−1(HIVSF2,Lev y,1984)Psiパケージング領域(HIVゲノムの5’末端よりnuc735か らnuc765)の中からひとつ選ばれた。先の構築物について、合成リボザイ ム挿入物が、pSVneoベクターのneor遺伝子の3’未翻訳部分における Sma1部位に平滑末端連結によりクローンされた。クローニングの成功および 配列の完全性は、DNA配列決定により確認された。この構築物は、pSV−R z− HIV−Psiと命名された。図4は、該構築物の図を示している。 実施例6 pSV−Rz−HIV−Ps1構築物のT−リンパ球 へのトランスフェクション 抗HIVパケージング部位構築物pSV−Rz−HIV−Psiを電気穿孔し てSupT−1細胞、ヒトT−リンパ腫細胞系に導入した。指数関数的に成長す る細胞を採収して、生存細胞の数を色素排除によって計測した。細胞をPBSで 洗浄し、生存細胞密度1x107/mlで、FCSは含まないが10mMデキス トローゼおよび0.1mMジチオスレイトールを含むRPMI培地に再懸濁した 。0.4cmキュベット(Bio-Rad)での電気穿孔につき、0.4mlの細胞懸濁 物および10μgのpSV−Rz−HIV−PsiプラスミドDNAを使用した 。細胞およびDNA混合物を遺伝子パルサー(Bio Rad)からの単独パルス960 μF、200Vに供した。ショックを与えた後、キュベットを10分間室温でイ ンキュベーションして、細胞を10%FCSを含む10mlのRPMI培地に移 し、インキュベータ中(5%CO2,37℃)に載置した。電気穿孔後48時間 目に細胞が800μg/mlG418を補給した培地中で選別された。9〜12 日後、陽性コロニーを単離し、HIVプロテクション分析に使用されるクローン 単離物として生育させた。 実施例7 リボザイム発現構築物のHIV感作に対する 防御を与える能力の評価 p24抗原およびシンチウム形成の二つの分析が行なわれ、細胞培養中におけ る抗HIV−Psiリボザイム構築物の有効性を評価した。HIV−1 p24 抗原分析は、酵素免疫分析であり、これはマイクロウエル・ストリップ上に被覆 されたHIV−核抗原に対するネズミモノクローナル抗体を使用している。HI V−1シンチウム分析は、HIV−1が融合を起こすことによってターゲットT リンパ球と相互作用してシンシチア、つまり多くの核を含む大細胞、の形成に至 るという観測に基づいている。クローナル・リボソーム構成物を発現する細胞+ コントロールにHIV−1(SF2)を0.1から1のm.o.i.で感染させ た。2時間後、細胞を洗浄し、10mlの新しい培地を加えた。3〜4日毎にシ ンシチアおよび生存細胞両方の数を計測した。シンシチア形成に付いては、おお よそ2対数高い投与量が、リボザイムを含まないコントロールと同等の結果を得 るために必要であった(表3)。加えて、リボザイムの存在はシンシチア形成を 遅らせた(表4)。 別の実験プロトコールでは、細胞をペレットにし、p24分析用にその上澄 み液のアリコットを採取した。代表的な結果を図10に示す。この実験では、感 作後22日目までp24レベルの阻害があった。ベクターのみを含む細胞と比較 すると、感作後8〜13日でp24生産の80%を超える阻害が、リボザイムを 発現している細胞に見られたが、22日目には、約60%の阻害が観察された。 これらの結果は、HIV複製が、Psiパケージング部位に対するリボザイム をTリンパ球に添加することによって阻害できるという証拠となった。 実施例8 我々は、(ψターゲットに加えて)他のリボザイム構築物の有効性に付いても 評価した。予期しながったことだが、我々はHIV−1(Rz2)のtat遺伝 子内の配列をターゲットにした単一リボザイムが、HIV−1の複製を阻害する のに有効であることを発見した。我々はこのtat領域の配列保存性を調べ、こ の領域が異なるHIV−1単離物の中で高度に保存されていることを発見した( 図12)。これらは、HIV−1リボザイム・ターゲット部位であるtat配列 による最初の実験である。該文献での報告は図13に示されるが、そこに記載さ れたtatターゲット部位は、他の研究者の部位1(Crisell et al.,1993)およ び部位3(Lo et al.,1992 Zhou et al.,1992)によってターゲットされた。 要 約 ヒト抹消血液リンパ球(PBLs)は、多数の組替レトロウイルスによって形 質導入された。このような組替レトロウイルスには、RRz2、すなわちネオマ イシン耐性遺伝子(neor)の3’領域内に挿入されたHIVtat遺伝子転 写物をターゲットするリボザイムをもったLNL6系のウイルス; RASH− 5、すなわちヒトサイトメガロウイルス(HCMV)ブロモータの下流のHIV −1の5’リーダー領域に対するアンチセンス配列を含むLNHL系ウイルス; R20TAR、すなわち、モロニー(Moloney)ネズミ白血病ウイルスの長末端 反復配列(LTR)によって駆動されるHIV−1 TAR配列の20タンデム ・リピートを持つLXSN系ウイルスが含まれる。G418選別後、形質導入さ れたPBLsを、HIV−1実験室株IIIBおよび一次臨床単離物で感作させた。 結果は、異なるドナーから得られるPBLsが形質導入され得ることで、これが HIV−1感染に対する耐性を与えることを示した。構築物の各々については、 対応する対照ベクターが形質導入されたPBLsに関連して、p24の抗原のレ ベ ルに約70%減少が見られた。分子的分析では、レトロウイルスLTRから得ら れる形質導入された全遺伝子が構成的に発現したが、アンチセンス構築物に対す る内部HCMVプロモータからの検出可能な転写物はみられなかった。PBLs の形質導入および続くPBLs中における導入遺伝子の発現は、(フローサイト メトリーで測定される)CD+/CD8+の表面の発現にも([3H]チミジンの取込 分析によって調べられる)細胞増殖にも影響を与えなかった。これらの結果は、 これらの抗HIV−1遺伝子の治療剤の使用可能性を示し、このPBL分析シス テムの予備臨床的価値を示す。 ヒト免疫不全ウイルス(HIV)は、後天性免疫不全症候群(AIDS)およ びその関連疾患の病原物体として確認されている(Barre-Sinoussi,F.et al.,198 3;Gallo,R.C.et al.1984)。現在のところ、この疾患には適切な治療法がなく、 HIVの複製を阻止する遺伝子学的操作を利用することが、AIDS治療の新規 かつ有望なアプローチであるようだ。HIV−1の複製という側面に介在する有 望な遺伝子治療的アプローチには、リボザイム発現を利用して触媒作用で開裂を 行ない、HIV−IRNAを不活性化させること,アンチセンスRNA発現によ り、HIV RNAの逆転写、プロセッシング、および翻訳を阻害すること;突 然変異HIV構造、または優性抑制遺伝子活性を持つ調節遺伝子を発現させるこ と;およびRNAデコイを発現させ、HIV−1転写、プロセッシング、パッケ ージングを阻害すること;があげられる。 今までに公開された報告においては、レトロウイルス・ベクターが、導入遺伝 子、遺伝子治療の抗HIV−1薬剤を導入するための選ばれたデリバリー法であ った。これらのベクターは、CEM,SupT1およびMOLTー4(Surver,N et al.,1990;Weerashingee,M et al.,1991;Yu,M.et al.1993;Yamanda,O.et al., 1994;Rhodes,A.and James W.1991;Sczakiel,G.et al.1992;Lisziewicz,J.et al. 1991,1993;Trono,D.et al.1989;Malim,M.H.et al.1992)等の、ヒト造血Tリンパ 球細胞系でテストされている。これらは、インビトロ分析用に無限の成長可能性 を持つことをはじめとして、好ましい特徴をいくつか備えてはいるが、形質転換 された細胞であるという欠点を有している。それ故、抗HIV遺伝子治療剤の有 効性を、抹消血液リンパ球(PBLs)等のヒト始原細胞(human primary cells )でテストする必 要がある。これらの細胞にとって、HIV感染の鍵となろターゲット細胞はCD 4+のサブ細胞集団であり、AIDS患者に主に欠けているは、この細胞集団で ある。しかしながら今の処、始原PBL分析が抗HIV遺伝子治療アプローチ用 に使用されてきたという報告はない。 我々は、i)リボザイム、アンチセンスおよびRNA・TARデコイをはじめ とする抗HIV薬剤をテストし、ii)実験室および臨床的HIV−1の単離物 の両者を使用したPBL形質導入、G418選別、HIV−1感作の条件を確立 するために、ヒトPBLsについての包括的な研究を行なってきた。これらの実 験で、HIV−1 tat遺伝子をターゲットするリボザイムを発現するレトロウ イルス構築物;HIV−1の5’リーダー配列に対して相補的なアンチセンス配 列;または20TAR RNAデコイ;を始原PBLsへ形質導入することによ り、HIV−1感染に対して実質的耐性が与えられることを実証した。この分析 システムは、抗HIVレトロウイルス構築物の先の分析を基に改良したものであ り、現在のT細胞系分析を補足する役割を果たす。このシステムを利用すること により、我々は、HIV遺伝子治療の臨床に関わる重要なデータを産みだした。 材料および方法 細胞系:パケージング細胞系 ψ2(Mann,R.et al.1983)およびPA317 (ATCC CRL 9078)を、10%牛胎児血清(FBS)を含むダルベッコ変性イー グル培地(DME)中で培養した。6週間毎に、PA317細胞をHAT培地に おける5〜7日の選別に供した。ψCREおよびψCRIP(Danos,O.Mulligan ,R.C.1988)は、DME+10%子牛血清(BCS)中で生育させた。 レトロウイルス・ベクター構築:HIV−1tat遺伝子転写物(HIV−1 IIIB、のnt 5865からnt5882、GGAGCCAGTAGATCCTA)をターゲットする化学的に 合成されたハンマーヘッドリボザイムを、ネオマイシン耐性遺伝子(図15A) の3’未翻訳部位内にあるLNL6ベクター(Bender,M.A.et al.1987)のSal I部位にクローン化した。この構築物はRRz2と命名された。アンチセンス構 築物として、gag遺伝子(nt78からnt628)のR、U5および5’部 の一部を含むHXB2のクローン550bpのBamHI断片を、BamHI部 位(YeeJ.K.et al.1987))でHPRT cDNAを除去することによって、pN HP−1ベクターから得られるLNHLベクター(図15B)のBamHI部位 にアンチセンスの方向でクローン化した。その結果得られる構築物を、RASH 5と呼称した。重合体TAR構築物は、20TAR断片を、LXSNベクター(M iller,A.D.et,al,1989)内のXhoIおよびBamHI部位に挿入することによ って作成し、R20TARと名付けた(図15C)。配列の統合およ該構築物の 配向をDNA配列決定または制限酵素マッピングによって確認した。 両栄養性レトロウイルスの産生:レトロウイルスLNL6およびRRz2をパ ケージング細胞系ψ2およびPA317細胞を包含するトランス感染によって産 生した。約80%の集密なψ細胞に、10μgの構築物DNAをカルシウム沈澱 を使用し、10%のFBS(DME成長培地)を含むDME培地で14時間イン キュベーションすることによってトランスフェクトした。次に培地を除去して、 新しいDME成長培地で置換して、一晩37℃5%のCO2でインキュベーショ ンした。次に環境栄養性ウイルスの上澄液をトランスフェクトされたψ2細胞か ら採集して使用し、DME成長培地中で4μg/mlのポリブレンの存在下、や や集密(60〜80%)なPA317細胞に感染させた。37℃、5%CO22 4時間インキュベーションした後、被感染PA317は、トリプシン処理し、7 50μg/ml G418を含むDME成長培地により1:20に分割された。 培地は、コロニーが形成されるまで3〜4日毎に取り変えられた。構築物の各々 から10〜29のコロニーを摘みとり、ウイルス力価(ネオマイシン耐性コロニ ー分析)および複製コンピテント・レトロウイルス(PCR)分析(Miller,A.D. Rosma,G.J.1989)用に増殖させた。レトロウイルスLNHL,RASH5、LX SN、およびR20TARは、ψCREをトランスフェクトし、ψCRIP細胞 を感染させることにより生成された。 ヒトPBLsの形質導入: 抹消血単核細胞(PBMCs)を健康なドナーの 白血球パックからフィコール・ハイパクー勾配遠心によって調整した。CD4+ 細胞が、CD8+細胞をマイクロセレクター(microCELLector)フラスコ(Appli ed Immune Science)を使用してメーカーの指示に従って除去することにより濃 縮された。CD4+に富むPBLs(5x1O5細胞/ml)は、5μg/mlの 植物凝集素(PHA、Sigma)またはOKT3モノクローナル抗体(Janssen-Cil ag)10n g/mlを使用して、10%のFBSおよび20ユニット/mlのヒト組替イン ターロイキン2(RPMI成長培地)を補給したRPMI 1640培地中で4 8時間から72時間、刺激された。刺激されたPBLsは、産生細胞を含まない レトロウイルスストックに、4μg/ポリブレン(m.o.i0.5を使用)の 存在下で細胞を18時間曝すことによって形質導入された。形質導入後48時間 して、PBLsが、300から500μg/mlのG418を含むRPMI成長 培地で10〜14日間かけて選別された。その後、これを新RPMI成長培地に おいて1週間の期間で回収し、PBLsにHIV−1を感作させた。 HIV感染:HIV−1実験株 IIIB および臨床的な単離物82Hの感染力価 (TCID50)を、(Johnson,V.A.et al.1990)に記載のようにヒトPBLs上で測定し た。5/105形質導入されたPBLsに100TCID50HIVウイルスを 2時間37℃で感染させて、その後、細胞を二回RPMI−1640で洗浄し、 5mlのRPMI成長培地に再懸濁させた。3〜4日毎に、上澄み液のアリコッ トをp24抗原ELISA(Coulter)用のサンプルとした。 RNA分析: 全細胞質RNAを、形質転換したPBLsからグアニヂウム・ イソチオシアネート法(Chirgwin,J.J.et al.1979)を使用して抽出した。15μ gのRNAを1%のアガロース・ホルムアルデヒド・ゲル上で分画してナイロン 膜(Hybond-N)に移し、夫々neorリボザイム、アンチセンスおよびTARの発 現を検出するために、32P標識したneor特異的プローブ、HIV−1 HXB 2の550bp BamHI断片または20TAR断片でハイブリダイズした。 形質導入されたPBLsのFACS分析: 1x105の形質導入されたPBL sを20分4℃で、CD4またはCD8特異的なフルオレセイン・イソチオシア ネート(FITC)が抱合したモノクローナル抗体(Becton Dickinson)またはコ ントロール抗体(FITCマウスIgG1、Becton Dickinson)と共にインキュ ベーションした。PBS中で二回洗浄した後、細胞をBecton Dickinson FACScan 上で分析した。 増殖分析: PBLsは上記に記載の様に形質導入された。G418中での選 別に続いて、新RPMI成長培地中で回収し、生存率をトリパンブルー排除によ って評価し、細胞数を1x106生存細胞/mlに調整した。3重ウエル(Corni ng, 24ウエル・プレート)中に、1x106細胞を植え付け、1μCi6−[3H] チミジン(5Ci/mmol、Amersham)を各ウエルに添加した。培養48時間 後、真空下で細胞をグラスファイバー・フィルターに移し、氷冷燐酸緩衝生理食 塩水で3回洗浄し、3x5mlの氷冷10%トリクロロ酢酸(w/v)で沈澱さ せた。フィルターをエタノールですすぎ、ベータ・シンチレーション計測に供し た。統計学的分析をスチューデント式テストを使用して行なった。 結 果 種々のトランス遺伝子を含有する高力価の両栄養性レトロウイルスの生成: トランス遺伝子(リボザイム、アンチセンスまたは重合性TAR)を発現する 3種類のレトロウイルスを、異なるベクターのバックボーン上に構築した。RR z2は、抗HIVtatリボザイム遺伝子を、LNL6ベクター(図15A)に おけるMoMLVロングターミナルリピート(LTR)によって駆動されるne or遺伝子の3’未翻訳領域に挿入することによって構築した。neorおよびリ ボザイム遺伝子の両方を含むキメラRNA転写物は、このレトロウイルスから得 られる。RASH5レトロウイルス(図15B)において、アンチセンス配列は 、ウイルスLTRまたは内臓のヒトCMVプロモーターから転写することが可能 であった。R20TAR構築物においては、重合系TARは、ウイルスLTR( 図15C)から発現される。3つのレトロウイルス構築物および対応するコント ロールベクターを使用して両栄養性の産生細胞系を生成した。ウイルスの力価は 、標準プロトコール(Miller,A.D.and Rosma,G.J.et al.1989)で測定したところ 、105から5x106cfu/ml範囲内であった。一般に、形質導入の試験で は、>106cfu/mlのレトロウイルスの力価が使用された。全てのウイル スのストックがテストされ、RCRのないことが確認され、−80℃で貯蔵され た。 PBLsのレトロウイルス形質導入:レトロウイルスの形質導入用にPBLs 刺激を至適化するために、CD4+が豊富なPBLsのPHAに対する反応また はOKT3抗体に対する反応が比較された。PHAまたはOKT3のどちらを用 いても培養基内では、細胞世代時間、生存率および形質導入能力について何の変 化も観察されなかった。この実験では、ヒトでの使用を認可されているという理 由によってOKT3抗体を使用した。刺激されたPBLsは、次に、m.o.i . 0.5を使用して両栄養性レトロウイルによって形質導入された。相対的形質転 換効率は、G418選別を生き抜いた細胞数に基づいて決定された。全体の形質 導入効率は、ドナーの血液パックに依存して、2〜7%変化することがわかった 。 形質導入されたPBLsのG418選別は、PBL分析の内の重要な段階であ ることがわかった。完璧な選別を行うために、二段階法が採用された。PBLs の各バッチについて、G418有毒投与量法がセットアップされ、同時に300 μg/mlのベースラインG418濃度を、初めの7〜9日間、形質導入したP BLsに与えた。この初期期間の後、G418の濃度を有毒投与量分析において 決められた濃度に調整した。テストした10ドナーについて、初期細胞濃度105 細胞/mlを使用した場合、G418有毒投与量が、300から500μg/ mlにわたることがわかった。形質導入および選別後、PBLsはG418無し で1週間、新培地にて培養された。この回収段階は、引き続きHIV−1感作分 析用に細胞の生存率を高めて細胞数を増加させる為に重要である(G418で見 られた増加に対して3から5倍の増加が見られた)。 形質導入されたPBLs中でのトランス遺伝子の発現: 形質導入されたPB Ls中でのリボザイム、アンチセンスまたはTAR配列の発現を評価した。図1 6A−16Cは、ノーザン分析の代表的パターンを示す。RRz2およびLNL 6形質導入細胞(図16A)において、neorリボザイムまたはneorの情報 を含むスプライスされた転写物および未スプライスの転写物の両者をneor特 異的プローブ(3.2kbおよび2.4kb)を使用して検出した。優勢なRN A種は、未スプライス転写物であった。ブロットがリボザイム特異的プローブに よってハイブリダイズされると、RRz2についてのみ同じパターンが観察され た。RASH5形質導入PBLsにおいて、5’LTRから得られる2つの転写 物(スプライスおよび未スプライス)が、550bpプローブを使用して検出さ れ、予想されたサイズ(4.8kbおよび4.0kb)(図16B)であること が確認された。しかしながら、内臓CMVプロモーターから得られると期待され る、より短い転写物は発現されなかった。これは、CMVプロモーターが、この 構築物中で停止していることがわかる。R20TARベクターは、予想通り、L XSNにおいてスプライス・ドナーを不活性化することによって、未スプライス の4.6kbの転写物をTARプローブとハイブリダイズしていろ5’LTRか ら生成した(図16C)。 ヒトPBLsにおけるHIV−1の阻害: HIV−1遺伝子治療の研究に対 するPBVL分析システム関連を分析するために、HIV感作実験が実験室株( IIIB)および第一次臨床単離物(82H)の両方を使用して、形質導入されたP BLsについて行なわれた。感染は重複して行なわれ、3から5個の別々のPB Lsバッチで、繰り返された。HIV−1の複製は、p24抗原レベルを培養上 澄み液中で測定することにより、様々な時点でモニターされた。HIV−1 III B株を使用した感作実験では、p24産生が、PBLs発現するリボザイム中( 図17A)、アンチセンス(図17B)、TARデコイ(図17C)において、 対応するコントロール・ベクターによって形質導入されたPBLsに関連して、 著しく減少した(70%)。形質導入されたPBLsでは、阻害も、より低い度 合い(70%に比べて40%)まで観察されたが、選別されたPBLsでは、観 察されなかった。形質導入され、選別されたPBLsは、その一次HIV−1単 離物の感染に対する耐性についても評価された。該一次臨床単離物82Hは、患 者のPBMCsから直接得られ、T細胞栄養性およびシンシチアを誘導する単離 物として特徴づけられている。IIIBについては、(p24抗原ELISAによっ て分析された)82Hの複製が、HIV−1 IIIBに感染したPBLs(図18 A〜18C)に見られると同じレベルにまで阻害された。これらの結果は、レト ロウイルス・ベクターを通してヒトPBLsに運ばれたこれらのトランス遺伝子 が、HIV−1の複製を、始原造血細胞中で阻害できることを提示している。 形質導入されたPBLsの分析:形質導入およびPBL増殖における構築物発 現の起こり得る影響を調査するために、[3H]チミジン取り込み分析が、形質転 換され、選別された全PBLsについて行われた。形質転換されていない通常の PBLsに比べた場合、トランス遺伝子構築物およびベクター形質導入されたP BLs(P<0.02);(図19)には明らかに有害な影響は何もなかった。 加えて、FACS分析では、CD4表面マーカーが、形質導入後も変わらずに残 ったことがわかった(表5)。これによって、HIV−1感作分析によって観察 された阻害効果が、形質導入PBLs上のCD4受容体の数の減少によるもので はないことが実証された。 図20は、ウイルスにより形質導入され、G418の選別に供されたCEMT 4Tリンパ球細胞系の結果を示す。プールされた細胞集団は、ランダムな構成要 素を持つ細胞、構築物発現レベルが変わりやすい細胞を含み、これらは、つぎに HIV−1によって感作される。 図21A−21Bは、tatに対向する多重リボザイムであるRzM; パケ ージング部位およtat両者に対向するリボザイムであるRRzpsi/Mの結 果を示す。 考 察 遺伝子治療が、インビボでHIV−1複製を阻害することに最終的に使用され るようにするためには、このような遺伝子治療的アプローチを、まず実験的シス テムで調べる必要がある。今日までは、これらの実験的システムには、主にヒト Tリンパ球細胞系が関わってきた。始原PBLs(Yu,M.et al.1994)において は、利用可能な公開データはない。予備臨床データを作成するために、始原造血 細胞中で抗HIV−1遺伝子治療剤をテストすることが重要である。これらの細 胞はHIV−1感染、複製の主なターゲットであり、細胞系とPBLs間には、 成長特性、インビトロ操作に対する応答性,HIV−1感染の反応性に著しい差 異がある。それはHIV−1遺伝子治療のCD4+PBL集団である。これらの 理由により、我々は、PBI分析システムを確立するために本研究を行った。 本研究では、リボザイム、アンチセンスまたはTARデコイ遺伝子を発現する 3つの異なるレトロウイルス・ベクターのヒトPBLs中での抗ウイルス効能に ついてテストした。それらは異なるレトロウイルス・ベクター中で構築されたけ れども、3Hチミジンの取り込み分析およびFACS分析で測定したところ、そ れらは全てHIV−1プロテクション分析において、はっきりした細胞毒性をも たず、同レベルの有効性を示した。これらの所見は、HIV−1遺伝子治療のタ ーゲットとしてのPBLsの可能性を示す。 PBLsを分析システムとしてまたは治療ターゲット細胞のいずれかに利用す るためには、いくつかのポイントを指摘される。まず、高ウイルス力価がPBL sの有効な形質導入を達成するために決定的な因子となる。これは特に、臨床学 的な目的の場合であって、形質導入されたPBLsをG418で選別するには望 ましくない。我々は、高力価治療用レトロウイルス(>106cfu/ml)に よって形質導入された選別PBLsおよび未選別PBLsの両方をテストした。 未選別のPBLsもまた、阻害の程度は選別PBLsに見られるよりも低いけれ ども、HIV−1感染に対して抵抗性があることがわかった。これは、ビボ外( ex vivo)で形質導入されたPBLsを418Gの選別なしで臨床的に使用でき る可能性のあることを示唆している。G418選別は、しかしながら、力価の低 いウイルスを遺伝子治療のインビトロテストに使用されるようにすることが可能 だ。我々は、2段階G418手法を開発し、これによって完璧な選別が容易に達 成できる。これらの手法は、インビトロ培養の時間を最小化でき、それによって T細胞集団に対するいかなる修飾をも削減することに役立つ。我々の実験では、 PB Lsをインビトロでの連続培養を2週間行っても、表面抗原(CD4+およびCD 8+)に重篤な衝撃を与えることはなかった。この期間(2週間)の長さは、治療 目的のPBLsのex vivo操作にとって充分であろう。 レトロウイルスのベクターのデザインは、有効な遺伝子転換および発現に取っ ての、もうひとつの重要な側面となる。本研究に使用される3つのベクターデザ インの間で直接的な比較はできないが、2つの所見は注目される。まず、ウイル スのLTR(ひとつの構築物については、CMV内臓プロモータがらは得られな い)によって調整される全てのトランス遺伝子は、ヒト始原造血細胞において構 成的に、有効に発現される。第2に、リボザイム遺伝子を、レトロウイルス・ベ クターにおいてneor等の遺伝子の3’未翻訳領域に挿入するという戦略は、 PBLsにおいてもT細胞系におけると同様に有効であると思われる。これらの 所見は、遺伝子治療デザインをこれから改良していくに有効であろう。結論とし て、ヒト始原PBLsの形質導入およびそのHIV−1のex vivo感染から、そ れらを防御することは、この開示中に提示されているプロトコールを使用して、 完遂することができる。これは、インビトロ遺伝子治療剤の評価の為の有効なシ ステムを提供するばかりでなく、CD4+リンパ球にターゲットするHIV−1 遺伝子治療の基盤を形成することにもなる。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.6 識別記号 庁内整理番号 FI A61K 48/00 ADY 9051−4C A61K 48/00 ADY C07H 21/04 8615−4C C07H 21/04 B C12N 5/10 7823−4B C12Q 1/68 A C12Q 1/68 7508−4H A01N 63/00 Z // A01N 63/00 9282−4B C12N 5/00 B (C12N 15/09 C12R 1:92) (81)指定国 EP(AT,BE,CH,DE, DK,ES,FR,GB,GR,IE,IT,LU,M C,NL,PT,SE),OA(BF,BJ,CF,CG ,CI,CM,GA,GN,ML,MR,NE,SN, TD,TG),AP(KE,MW,SD,SZ),AM, AT,AU,BB,BG,BR,BY,CA,CH,C N,CZ,DE,DK,EE,ES,FI,GB,GE ,HU,JP,KE,KG,KP,KR,KZ,LK, LR,LT,LU,LV,MD,MG,MN,MW,M X,NL,NO,NZ,PL,PT,RO,RU,SD ,SE,SI,SK,TJ,TT,UA,US,UZ, VN (72)発明者 サン、ルン − クアン オーストラリア国、エヌエスダブリュ 2112、ライド、フォーセット・ストリート 74

Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 1.天然に存在しない合成オリゴヌクレオチド化合物であって、保存された触 媒領域を定義する配列を有するヌクレオチドと、RNAウイルスのパッケージン グ配列内の所定の標的配列とハイブリダイズできる配列を有するヌクレオチドと を含んだ合成オリゴヌクレオチド化合物。 2.請求項1に記載の化合物であって、前記ウイルスのパッケージング配列が レトロウイルスパッケージング配列である化合物。 3.請求項1に記載の化合物であって、前記パッケージング配列がHIVプサ イのパッケージング配列である化合物。 4.請求項1に記載の化合物であって、前記RNAウイルスがネコ白血病ウイ ルスである化合物。 5.請求項1に記載の化合物であって、前記RNAウイルスがネコ免疫不全ウ イルスである化合物。 6.下記の構造を有する請求項1に記載の化合物。 上記式において、 Xは、その糖、リン酸もしくは塩基部分において修飾もしくは置換されても よい同一もしくは異なるヌクレオチドであり、 A,C,UおよびGの夫々は、その糖、リン酸もしくは塩基部分において修 飾もしくは非修飾または置換されてもよいリボヌクレオチドを表し、 3´−AAG……AGUCX−5´は、保存された触媒領域を定義し、 (X)nAおよび(X)の夫々は、RNAウイルスのパッケージング配列 内の所定の標的配列とハイブリダイズできる配列を有するヌクレオチを定義し、 夫々の★は、その両側に位置するヌクレオチドの間の塩基対形成を表し、 夫々の実線は、その両側に位置するヌクレオチド間の共有結合を与える化学 的結合を表し、 夫々の破線は、独立に、その両側に位置するヌクレオチド間の共有結合を与 える化学的結合または斯かる化学的結合の不存在を表し、 aは、ヌクレオチドの数を定義する整数を表し(但し、aは0または1であ ってもよく、もし0であれば、(X)aの5´に位置するAは(X)aの3´に位 置するXに結合される)、 mおよびm´の夫々は、1以上の整数を表し、 (X)bはオリゴヌクレオチドを表し、bは2以上の整数を表す。 7.下記の構造を有する請求項1に記載の化合物。 上記式において、 Xは、その糖、リン酸もしくは塩基部分において修飾もしくは置換されても よい同一もしくは異なるリボヌクレオチドまたはデオキシリボヌクレオチドであ り、 A,C,UおよびGの夫々は、その糖、リン酸もしくは塩基部分において修 飾もしくは非修飾または置換されてもよいリボヌクレオチドを表し、 3´−AAG……AGUCX−5´は、保存された触媒領域を定義し、 (X)nAおよび(X)の夫々は、RNAウイルスのパッケージング配列 内の所定の標的配列とハイブリダイズできる配列を有するヌクレオチを定義し、 夫々の実線は、その両側に位置するヌクレオチド間の共有結合を与える化学 的結合を表し、 mは、2〜20の整数を表し、 ヌクレオチド(X)mは何れも、当該化合物内の何れのヌクレオチドともワ トソン-クリックの塩基対形成をしていない化合物。 8.下記の構造を有する請求項1に記載の化合物。 上記式において、 Xは、その糖、リン酸もしくは塩基部分において修飾もしくは置換されても よい同一もしくは異なるリボヌクレオチドまたはデオキシリボヌクレオチドであ り、 A,C,UおよびGの夫々は、その糖、リン酸もしくは塩基部分において修 飾もしくは非修飾または置換されてもよいリボヌクレオチドを表し、 3´(X)p4…(X)p1−5´は、保存された触媒領域を定義し、 (X)F4および(X)F3の夫々は、RNAウイルスのパッケージング配列内 の所定の標的配列とハイブリダイズできる配列を有するヌクレオチを定義し、 夫々の実線は、その両側に位置するヌクレオチド間の共有結合を与える化学 的結合を表し、 F3は、当該オリゴヌクレオチド内のヌクレオチドの数を定義する整数を表 し(但し、F3は3以上である)、 F4は、当該オリゴヌクレオチド内のヌクレオチドの数を定義する整数を表 し(但し、F4は3〜5である)、 (X)P1および(X)P4の夫々は、(X)P4が(X)P1の3〜4の塩基と塩 基対を形成するような所定の配列を有するオリゴヌクレオチドを表し、 P1は、当該オリゴヌクレオチド内のヌクレオチドの数を定義する整数を表 し(但し、P1は3〜6であり、P1およびF4の合計は9である)、 (X)P2および(X)P3の夫々は、(X)P2が(X)P3の少なくとも3塩基 と塩基対を形成するような所定の配列を有するオリゴヌクレオチドを表し、 夫々の★は、その両側に位置するヌクレオチドの間の塩基対形成を表し、 夫々の実線は、その両側に位置するヌクレオチド間の共有結合を与える化学 的結合を表し、 夫々の破線は、独立に、その両側に位置するヌクレオチド間の共有結合を与 える化学的結合または斯かる化学的結合の不存在を表し、 (X)L2は、存在しても存在しなくてもよいヌクレオチドを表す(但し、存 在するときには、L2は3以上の整数を表す)。 9.請求項1に記載の化合物であって、保存された触媒領域を定義する配列を 有する前記ヌクレオチドが、デルタ肝炎ウイルスの保存領域に由来する化合物。 10.請求項1に記載の化合物であって、保存された触媒領域を定義する配列 を有する前記ヌクレオチドが、その3´末端に配列NCCΛを含んでいる化合物 。 11.天然に存在しない合成オリゴヌクレオチド化合物であって、同一もしく は異なる2以上のドメインを含み、夫々のドメインは、保存された触媒領域を定 義する配列を有するヌクレオチドと、RNAウイルスのパッケージング配列内の 所定の標的配列とハイブリダイズできる配列を有するヌクレオチドとを含む合成 オリゴヌクレオチド化合物。 12.請求項1に記載の化合物であって、更に、RNAウイルスのパッケージ ング配列内の、同一若しくは異なった、所定の標的配列とハイブリダイズできる 共有結合的に結合したアンチセンス核酸化合物を含んだ化合物。 13.請求項1に記載の化合物であって、前記ヌクレオチドは、NoMLVに おける243,274,366,または533標的配列、およびHIVプサイパ ッケージング部位における749部位とハイブリダイズすることができる化合物 。 14.請求項1に記載の化合物を含む化合物であって、更に、共有結合的に結 合し且つRNAウイルスゲノムの異なった遺伝子にターゲットされるアンチセン ス分子を有するか又は有さない、少なくとも一つの天然に存在しない追加の合成 オリゴヌクレオチド化合物を含む化合物。 15.請求項14に記載の化合物であって、前記RNAウイルスはHIVであ り、また該HIVゲノムの異なった領域は、長い末端繰り返し、5´非翻訳領域 、スプライス・ドナー・アクセプター部位、プライマー結合部位、3´非翻訳領 域、gag、pol、プロテアーゼ、インテグラーゼ、env、tat、rev 、nef、vif、vpr、vpu、vpx、およびtev領域からなる群から 選択される化合物。 16.請求項15に記載の化合物であって、前記ヌクレオチドは、NoMLV における243,274,366若しくは533標的部位またはその組み合わせ 、およびHIVプサイパッケージング部位における749部位とハイブリダイズ することができ、また前記追加の化合物のヌクレオチドは、HIVtat領域に おける5792、5849、5886、または6042標的部位またはその組み 合わせとハイブリダイズすることができる化合物。 17.薬学的、獣医学的、または農学的に許容可能なキャリアまたは賦形剤と 共に、請求項1または14に記載の化合物を含有する組成物。 18.アンチセンスを伴うか又は伴わずに、請求項1の化合物を含有し、更に TARデコイ(decoy)、polyTARまたはRREデコイを含有する組成物。 19.請求項1に記載の化合物を製造する方法であって、 (a)DNA、RNAまたはそれらの組み合わせから構成されるトランスフ ァーベクターに、前記化合物に対応するヌクレオチド配列を連結する工程と、 (b)RNAポリメラーゼを用いて、工程(a)のヌクレオチド配列を転写 する工程と、 (c)前記化合物を回収する工程とを具備した方法。 20.DNA、RNAまたはそれらの組み合わせから構成されるトランスファ ーベクターであって、転写に際して請求項1の化合物を生じるヌクレオチド配列 を含んだトランスファーベクター。 21.請求項20に記載のトランスファーベクターであって、前記トランスフ ァーベクターは、HIVの長い末端繰り返し、アデノウイルス関連トランスファ ーベクター、SV40プロモータ、Mo−MLV、または両栄養性ウイルスベク ターを含むトランスファーベクター。 22.請求項20に記載のトランスファーベクターであって、更に、前記オリ ゴヌクレオチド化合物を、インビボにおいて特定の器官もしくは細胞または該細 胞内の特定の領域に向ける配列を含んだトランスファーベクター。 23.薬学的、獣医学的または農学的に許容可能なキャリアまたは賦形剤と共 に、請求項20に記載のトランスファーベクターを含有する組成物。 24.請求項1に記載の化合物であるヌクレオチド配列、または転写に際して 請求項1の化合物を生じるヌクレオチド配列を含んだ、原核性または真核性の細 胞。 25.請求項24に記載の細胞であって、前記細胞が真核細胞である細胞。 26.請求項25に記載の真核細胞であって、前記細胞が動物細胞である細胞 。 27.請求項25に記載の真核細胞であって、前記細胞は、全ての造血細胞系 統の前駆体細胞、より成熟した細胞および完全に成熟した細胞を生じる造血幹細 胞である真核細胞。 28.請求項25に記載の真核細胞であって、前記細胞は、全ての造血細胞系 統の成熟細胞を生じる前駆体細胞である真核細胞。 29.請求項25に記載の真核細胞であって、前記細胞は、特定の造血系統を 発生するようにコミットされた前駆体細胞である真核細胞。 30.請求項25に記載の真核細胞であって、前記細胞はTリンパ球前駆体細 胞である真核細胞。 31.請求項25に記載の真核細胞であって、前記細胞は未成熟Tリンパ球で ある真核細胞。 32.請求項25に記載の真核細胞であって、前記細胞は成熟Tリンパ球であ る真核細胞。 33.請求項25に記載の真核細胞であって、前記細胞は骨髄前駆体細胞であ る真核細胞。 35.請求項1に記載の化合物の使用であって、造血幹細胞、前駆体細胞、コ ミットされた前駆体細胞、Tリンパ球前駆体細胞、未成熟Tリンパ球、成熟リン パ球、骨髄前駆体細胞、または単球/マクロファージ細胞を保護するための使用 。 36.AIDS患者においてHIVを抑制する方法であって、請求項20に記 載のトランスファーベクターを造血細胞に導入することにより該細胞をHIVに 対して耐性にし、これによってAIDS患者におけるHIVを抑制することを具 備した方法。 37.請求項36に記載の方法であって、前記の導入はエクスビボで行われ、 また前記細胞は自己細胞または異種細胞である方法。 38.請求項36に記載の方法であって、前記導入はエクスビボで行われ、ま た前記細胞は骨髄切除(myeloablation)なしで移植される方法。 39.請求項36に記載の方法であって、前記導入はエクスビボで行われ、ま た前記細胞は骨髄切除を伴って移植される方法。 40.個体をHIV感染から防御する方法であって、請求項20のトランスフ ァーベクターを前記個体の細胞に組み込み、これによって前記個体を高レベルの 前記ウイルスの作用から保護することを具備した方法。
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