JPH08308585A - 組換えdnaウイルスおよびその製造方法 - Google Patents

組換えdnaウイルスおよびその製造方法

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JPH08308585A
JPH08308585A JP7276335A JP27633595A JPH08308585A JP H08308585 A JPH08308585 A JP H08308585A JP 7276335 A JP7276335 A JP 7276335A JP 27633595 A JP27633595 A JP 27633595A JP H08308585 A JPH08308585 A JP H08308585A
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dna
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Abstract

(57)【要約】 【解決手段】外来遺伝子および外来遺伝子の発現を制御
するプロモーターを有する、E2A遺伝子の機能が完全
に欠失した、動物細胞感染用の組換えDNAウイルス、
及びE2A遺伝子領域の両側に位置する同方向を向いた
二つのリコンビナーゼ認識配列を有する動物細胞感染用
の組換えDNAウイルス、並びにこれらの動物細胞感染
用の組換えDNAウイルスの製造方法。 【効果】本発明により、広範な動物細胞に外来遺伝子を
安定な形で導入することのできる組換えDNAウイルス
を提供することができる。また、本発明はこの組換えD
NAウイルスの簡易な製造方法を提供する。特に、本発
明の組換えアデノウイルスは遺伝病の治療に有用であ
る。

Description

【発明の詳細な説明】
【0001】
【発明の属する技術分野】本発明は動物細胞感染用の組
換えDNAウイルスおよびその製造方法に関する。さら
に、該組換えDNAウイルスの製造に用いられる、リコ
ンビナーゼの認識配列をコードするDNA配列を含む組
換えDNAウイルスベクターに関する。
【0002】
【従来の技術・発明が解決しようとする課題】これまで
遺伝子導入のウイルスベクターとしてレトロウイルスが
良く用いられたが、このウイルスは分裂している細胞に
しか導入できないことや宿主細胞の染色体に組み込まれ
てしまうことにより、特に遺伝子治療においてはその安
全性の観点より問題があり、その応用範囲は限られてい
ると考えられている。アデノウイルスベクターは、種々
の動物培養細胞で100%近い導入効率を示すこと、ま
たレトロウイルスと異なり積極的な染色体組み込みの機
構を持たないこと、さらに、休止期の細胞でも遺伝子導
入出来るという利点もあり、外来遺伝子導入実験のベク
ターとしての応用範囲は極めて広く、近い将来は遺伝子
治療の主要技術の一つとして確立するであろうと考えら
れている。
【0003】アデノウイルスベクターの利用は遺伝子治
療技術の一つとして、また神経系などの高度に分化した
細胞での発現研究の面で急速に普及してきている。遺伝
子治療技術としては、既に構築され機能している組織へ
直接投与することにより機能を担っている生細胞へ直接
欠損した遺伝子を補う、いわゆる in vivo遺伝子治療の
方法として研究が精力的に進められている。既に嚢胞性
繊維症では、米国で5グループが実際に患者への実験治
療を認められており、筋ジストロフィー症、家族性高コ
レステロール血症、また脳腫瘍等に対して活発に研究さ
れるようになった。一方でアデノウイルスベクターは休
止期の細胞へも遺伝子導入が可能であり、分化した細胞
や、特に神経系への遺伝子導入方法として、初代培養や
動物個体への遺伝子導入実験が注目されている。以上よ
り、アデノウイルスベクターは、神経系を含む多くの分
化、未分化細胞への遺伝子治療導入だけでなく、動物個
体への直接注入・投与による遺伝子発現が可能であるこ
とから、特に遺伝子治療への応用が期待されている。
【0004】しかし、アデノウイルスはレトロウイルス
と異なり、積極的な染色体組み込みの機構を持たないこ
とから、発現が一時的である。その期間は1〜2週間か
ら、長くても2ヶ月程度である。そのため治療効果を継
続させる必要がある場合には、なるべく長期間細胞内で
アデノウイルスが安定に存在し、アデノウイルス中に挿
入された外来遺伝子の発現産物を産生し続けることが望
ましい。そして、最近、アデノウイルスゲノムのE2A
遺伝子領域の存在がアデノウイルスの細胞内安定性に悪
影響を及ぼしていることが分かってきた。従って、本発
明の目的は、動物細胞内に導入されたアデノウイルスベ
クターが、細胞内でより安定に存在し、外来遺伝子産物
を産生し続け得る組換えアデノウイルスベクターの系を
構築することにあり、さらに、かかる系を遺伝子治療用
に提供することにある。
【0005】
【課題を解決するための手段】そこで、本発明者らは、
上記の問題を解決するために鋭意検討し、アデノウイル
スE2A遺伝子領域とL3遺伝子領域の間に外来ヌクレ
オチドを導入し得る領域が存在することを発見した。こ
の領域には常法によりそのまま外来ヌクレオチドを導入
することができるが、一旦適当なリンカーを常法により
導入して必要な制限酵素部位を導入した後外来ヌクレオ
チドを導入してもよい。外来ヌクレオチドとしては、動
物細胞に感染させた後その細胞内で発現することが望ま
れるポリペプチドをコードする外来遺伝子でもよく、ま
たその外来ヌクレオチドがそのまま細胞中に共存する酵
素の基質となるものであってもよい。さらに、本発明者
らは、上記の領域に外来ヌクレオチドとしてリコンビナ
ーゼの認識配列を導入することにより、動物細胞内で発
現しうるリコンビナーゼ遺伝子を挿入した動物細胞感染
用の組換えDNAウイルスベクターと併用すれば動物細
胞内でアデノウイルスゲノムのE2A遺伝子領域を欠失
させることができるようなアデノウイルスベクターの系
を動物細胞感染用のDNAウイルスベクターとして構築
できることを見い出した。
【0006】ここに、リコンビナーゼとは、特異的なD
NA組換え酵素で、数十塩基からなる特異的なDNA配
列を認識し、この配列間でDNAの切断・鎖の交換と結
合の全行程を行う。そこで、この酵素を発現する組換え
アデノウイルスベクターと、E2A遺伝子領域の両側に
この認識配列を同じ向きに2コピーを持つ組換えアデノ
ウイルスベクターを作製し、両方を細胞に共感染させる
と、発現したリコンビナーゼにより2つの認識配列間の
再構成が起き、挟まれた部分が環状分子として切り出さ
れる。従って、こうして得られるE2A遺伝子領域を欠
失したアデノウイルスベクターは、E2A遺伝子領域を
含むアデノウイルスベクターに比して顕著に安定にな
り、遺伝子治療に有利に使用できると期待できる。
【0007】しかし、従来はE2A遺伝子領域の右側
(図1参照)すなわちE3領域内には外来DNA配列を
導入できることが知られていたが、E2A遺伝子領域の
左側には外来DNA配列を挿入できる部位の存在は知ら
れていなかった。今回本発明者らにより、E2A遺伝子
の終止コドンとL3遺伝子の終止コドンとの間に外来D
NA配列を導入できる部位が存在することが発見され
た。これにより、初めてE2A遺伝子の機能を損なわず
またアデノウイルスの増殖の機能を保持したままE2A
遺伝子領域を挟んでリコンビナーゼ認識配列を導入でき
ることが明らかにされたのである。本発明は、かかる知
見に基づいて、さらに研究を進めて完成するに至ったも
のである。
【0008】即ち、本発明の要旨は、(1) 外来遺伝
子及び外来遺伝子の発現を制御するプロモーターを有す
る、E2A遺伝子の機能が完全に欠失した動物細胞感染
用の組換えDNAウイルス、(2) DNAウイルスが
アデノウイルスである前記(1)記載の組換えDNAウ
イルス、(3) E2A遺伝子領域の一部または全部を
欠失した前記(1)または(2)記載の組換えDNAウ
イルス、(4) 外来遺伝子及び外来遺伝子の発現を制
御するプロモーターが左向き(本来のE1A、E1B遺
伝子の転写の向きと逆向きをいう。)に組み込まれてい
ることを特徴とする前記(1)ないし(3)いずれか記
載の組換えDNAウイルス、(5) アデノウイルスゲ
ノムがE1A遺伝子領域を含む1.3〜9.3%断片を
欠失していることを特徴とする前記(2)ないし(4)
いずれか記載の組換えDNAウイルス、(6) E1A
遺伝子領域の欠失部位に外来遺伝子および外来遺伝子の
発現を制御するプロモーターが挿入されていることを特
徴とする前記(5)記載の組換えDNAウイルス、
(7) アデノウイルスゲノムがさらにE3遺伝子領域
を含む79.6〜84.8%断片を欠失していることを
特徴とする前記(6)記載の組換えDNAウイルス、
(8) 外来遺伝子の発現を制御するプロモーターが、
サイトメガロウイルスエンハンサー、ニワトリβ−アク
チンプロモーター、ウサギβグロビンのスプライシング
アクセプターおよびポリA配列からなるハイブリッドプ
ロモーター(CAGプロモーター)であることを特徴と
する前記(1)ないし(7)いずれか記載の組換えDN
Aウイルス、(9) E2A遺伝子領域の両側に位置す
る同方向を向いた二つのリコンビナーゼ認識配列を有す
る動物細胞感染用の組換えDNAウイルス、(10)
DNAウイルスがアデノウイルスである前記(9)記載
の組換えDNAウイルス、(11) 二つのリコンビナ
ーゼ認識配列の挿入部位の一方が、E2A遺伝子の終止
コドンとL3遺伝子の終止コドンの間であって、両遺伝
子のポリA付加シグナルの機能を欠失しない範囲である
ことを特徴とする前記(9)又は(10)記載の組換え
DNAウイルス、(12) もう一方のリコンビナーゼ
認識配列の挿入部位が、アデノウイルスゲノムの79.
6〜84.4%の範囲であることを特徴とする前記(1
1)記載の組換えDNAウイルス、(13) リコンビ
ナーゼが大腸菌P1ファージ由来のリコンビナーゼCr
eである前記(9)ないし(12)いずれか記載の組換
えDNAウイルス、(14) リコンビナーゼ認識配列
がリコンビナーゼCreの基質となる下記loxPのD
NA配列(配列番号:1) 5'-ATAACTTCGTATAGCATACATTATACGAAGTTAT-3' 3'-TATTGAAGCATATCGTATGTAATATGCTTCAATA-5' である前記(9)ないし(13)いずれか記載の組換え
DNAウイルス、(15) 外来遺伝子を有することを
特徴とする前記(9)ないし(14)いずれか記載の組
換えDNAウイルス、(16) 外来遺伝子の発現を制
御するプロモーターを有することを特徴とする前記(1
5)記載の組換えDNAウイルス、(17) 外来遺伝
子および外来遺伝子の発現を制御するプロモーターが左
向き(本来のE1A、E1B遺伝子の転写の向きと逆向
きをいう。)に組み込まれていることを特徴とする前記
(16)記載の組換えDNAウイルス、(18) アデ
ノウイルスゲノムがE1A遺伝子領域を含む1.3〜
9.3%断片を欠失していることを特徴とする前記(1
0)ないし(17)いずれか記載の組換えDNAウイル
ス、(19) E1A遺伝子領域の欠失部位に外来遺伝
子および外来遺伝子の発現を制御するプロモーターが挿
入されていることを特徴とする前記(18)記載の組換
えDNAウイルス、(20) アデノウイルスゲノムが
さらにE3遺伝子領域を含む79.6〜84.8%断片
を欠失していることを特徴とする前記(19)記載の組
換えDNAウイルス、(21) 外来遺伝子の発現を制
御するプロモーターが、サイトメガロウイルスエンハン
サー、ニワトリβ−アクチンプロモーター、ウサギβグ
ロビンのスプライシングアクセプターおよびポリA配列
からなるハイブリッドプロモーター(CAGプロモータ
ー)であることを特徴とする前記(16)ないし(2
0)いずれか記載の組換えDNAウイルス、(22)
プロモーター、リコンビナーゼ遺伝子およびポリA配列
を組み込んだベクター(a)と、E2A遺伝子領域の両
側に位置する同方向を向いた2つのリコンビナーゼ認識
配列を有する組換えDNAウイルス(b)とを、動物細
胞株へ導入し、2つのリコンビナーゼ認識配列間に存す
るE2A遺伝子領域を切除することからなる、E2A遺
伝子の機能が完全に欠失した組換えDNAウイルスの製
造方法、(23) DNAウイルス(b)がアデノウイ
ルスである前記(22)記載の組換えDNAウイルスの
製造方法、(24) さらにベクター(a)がアデノウ
イルスである前記(23)記載の組換えDNAウイルス
の製造方法、(25) 2つのリコンビナーゼ認識配列
の挿入部位の一方が、E2A遺伝子の終止コドンとL3
遺伝子の終止コドンの間であって、両遺伝子のポリA付
加シグナルの機能を欠失しない範囲であることを特徴と
する前記(22)ないし(24)いずれか記載の組換え
DNAウイルスの製造方法、(26) リコンビナーゼ
が大腸菌P1ファージ由来のリコンビナーゼCreであ
る前記(22)ないし(25)いずれか記載の組換えD
NAウイルスの製造方法、(27) リコンビナーゼ認
識配列がリコンビナーゼCreの基質となるloxPの
DNA配列(配列番号:1)である前記(22)ないし
(26)いずれか記載の組換えDNAウイルスの製造方
法、(28) DNAウイルス(b)が外来遺伝子を有
することを特徴とする前記(22)ないし(27)いず
れか記載の組換えDNAウイルスの製造方法、(29)
DNAウイルス(b)がさらに外来遺伝子の発現を制
御するプロモーターを有することを特徴とする前記(2
8)記載の組換えDNAウイルスの製造方法、(30)
外来遺伝子および外来遺伝子の発現を制御するプロモ
ーターが左向き(本来のE1A、E1B遺伝子の転写の
向きと逆向きをいう。)に組み込まれていることを特徴
とする前記(29)記載の組換えDNAウイルスの製造
方法、(31) ベクター(a)およびDNAウイルス
(b)のアデノウイルスゲノムがE1A遺伝子領域を含
む1.3〜9.3%断片を欠失していることを特徴とす
る前記(24)ないし(30)いずれか記載の組換えD
NAウイルスの製造方法、(32) DNAウイルス
(b)のE1A遺伝子領域の欠失している部位に、外来
遺伝子および外来遺伝子の発現を制御するプロモーター
が挿入されていることを特徴とする前記(31)記載の
組換えDNAウイルスの製造方法、(33) DNAウ
イルス(b)のアデノウイルスゲノムがさらにE3遺伝
子領域を含む79.6〜84.8%断片を欠失している
ことを特徴とする前記(32)記載の組換えDNAウイ
ルスの製造方法、(34) 外来遺伝子の発現を制御す
るプロモーターが、サイトメガロウイルスエンハンサ
ー、ニワトリβ−アクチンプロモーター、ウサギβグロ
ビンのスプライシングアクセプターおよびポリA配列か
らなるハイブリッドプロモーター(CAGプロモータ
ー)であることを特徴とする前記(29)ないし(3
3)いずれか記載の組換えDNAウイルスの製造方法、
(35) ベクター(a)およびDNAウイルス(b)
のE1A遺伝子の機能が欠失され、動物細胞株がE1A
遺伝子を発現している動物細胞株である、前記(22)
記載の組換えDNAウイルスの製造方法、並びに(3
6) E2A遺伝子の終止コドンとL3遺伝子の終止コ
ドンの間に、外来遺伝子が挿入されたことを特徴とする
動物細胞感染用の組換えアデノウイルス、に関する。
【0009】
【発明の実施の形態】以下に本発明について詳細に説明
する。本発明における動物細胞感染用のDNAウイルス
ベクターは、アデノウイルスのように細胞に感染後染色
体外でしか存在し得ないようなDNAウイルス由来のベ
クターであれば、特に制限されることなく用いることが
できる。例えば、アデノウイルスベクター、ワクシニア
ウイルスベクター、パポパウイルスベクター等が挙げら
れる。以下、リコンビナーゼ遺伝子又はリコンビナーゼ
認識配列をもつ動物細胞感染用のDNAウイルスベクタ
ーの好適な例として、アデノウイルスベクターを用いて
本発明を説明する。
【0010】本発明に用いられるアデノウイルスは、動
物を自然宿主とするものであり、特にヒトを宿主とする
ヒトアデノウイルスが好適に用いられる。ヒトアデノウ
イルスのゲノムは、約36kbpの2本鎖線状DNAで
あって、DNA鎖両端にはおよそ100bpからなる逆
方向反復塩基配列があり、そのDNA鎖両端の5’末端
にはE2B遺伝子産物が切断加工された55kのタンパ
ク質が共有結合しているという特異な構造をしている。
【0011】本発明に用いられるアデノウイルスのゲノ
ムは、E1遺伝子領域特にE1A遺伝子領域を欠失して
いることが好ましい。これは、アデノウイルスの細胞ガ
ン化活性に関与するE1A遺伝子領域を欠失させること
により、アデノウイルスを無毒化し、ゲノム中に組み込
んだ外来の遺伝子配列のみを発現させるためである。必
ずしもE1A遺伝子領域の全てを欠失させる必要はない
が、例えば1.3〜9.3%の断片を除去すれば、目的
は達成される。また、本発明に用いられるアデノウイル
スのゲノムは、E3遺伝子領域を欠失させてもよい。特
に、E3遺伝子領域の79.6〜84.8%を欠失させ
たものが好ましい。アデノウイルスの複製には不要であ
るからである。したがってE1A、E1B遺伝子を持続
的に発現しているヒト胎児腎由来細胞株(293細胞)
を除き、宿主細胞内で増殖することができないという特
徴を有する。
【0012】しかしながら、実際にヒトや動物に投与し
た場合、E1A蛋白と同様の機能を有する蛋白が細胞中
に存在し、これによりわずかにアデノウイルス蛋白が発
現する。これが細胞免疫を引起し、ウイルスDNAを保
持する細胞が攻撃を受け排除されることがわかってい
る。現在使用されているE1A、E1B欠損型アデノウ
イルスベクターによる遺伝子発現が短期間である原因は
ここにある。これを防ぐためには、E2A遺伝子の機能
を欠失させることが有効であることがYangらにより
明らかにされた(Nature Genetics, vol.7, 362-369, 1
993)。これは、温度感受性のE2A遺伝子変異株を利用
したものであるが、動物に投与した場合、E2A遺伝子
の機能発現が抑制されるものの機能発現を完全に止める
ことができない。E2A遺伝子の機能発現を完全に止め
る手段としてはE2A遺伝子領域を欠失させることが考
えられるが、E2A遺伝子産物はアデノウイルスゲノム
の複製に必須であるため、E2A遺伝子を欠失したアデ
ノウイルス自身は293細胞においても増殖できない。
本発明は、E2A遺伝子の両端にリコンビナーゼ認識配
列を配置した組換えアデノウイルスとリコンビナーゼ発
現用アデノウイルスを動物培養細胞に共感染させ、細胞
内で発現したリコンビナーゼによりE2A遺伝子欠失型
感染性ウイルス粒子を作製するというものである。E2
A遺伝子産物は少なくともリコンビナーゼ発現用アデノ
ウイルスから十分量補充される。得られるE2A遺伝子
欠失型ウイルスはE2A遺伝子の発現が皆無であるた
め、目的とする遺伝子の発現期間が大幅に延長すること
は間違いない。
【0013】リコンビナーゼの認識配列の挿入位置は、
E2A遺伝子領域の右側には従来から知られている領域
があるが、E2A遺伝子領域の左側については、E2A
遺伝子の終止コドンとL3遺伝子の終止コドンの間であ
って、得られる組換えアデノウイルスの増殖を阻害しな
い部位が選択される。E2A遺伝子領域やL3遺伝子領
域の一部欠失あるいはポリA付加シグナル領域が一部欠
失することになると、得られる組換えアデノウイルスの
増殖が阻害されるため好ましくない。
【0014】本発明に用いられるプロモーターとして
は、動物ウイルス遺伝子プロモーターおよび動物細胞遺
伝子プロモーターが挙げられる。前者の例としてはSV
40遺伝子プロモーター、アデノウイルス主要後期遺伝
子プロモーター等があり、また、後者の例としては、チ
ミジンキナーゼ遺伝子プロモーター、メタロチオネイン
遺伝子プロモーター、免疫グロブリン遺伝子プロモータ
ー等がある。しかし本発明には、CAGプロモーターが
特に有利に用いられる。このプロモーターは、サイトメ
ガロウイルスエンハンサー、ニワトリβ−アクチンプロ
モーター、ウサギβグロビンのスプライシングアクセプ
ターおよびウサギβグロビン由来のポリA配列からなる
ハイブリッドプロモーターであり、高発現ベクターとし
て特開平3−168087号公報に開示されている。そ
の調製は同公報に記載されているpCAGGS(特開平
3−168087、13頁20行〜20頁14行および
22頁1行〜25頁6行)から制限酵素SalI,Hi
ndIII で切り出すことにより行うことができ、本発明
に利用することができる。
【0015】本発明に用いられるリコンビナーゼは、特
異的なDNA組換え酵素で、特定の塩基配列を認識し、
この配列間でDNAの切断、鎖の交換と結合の全行程を
行う。かかる酵素としては、大腸菌のバクテリオファー
ジP1がコードするもの(リコンビナーゼCre)があ
る。これはバクテリオファージP1内のloxP(Abre
mskiら、J. Biol. Chem.1984、1509−1514;および Hoe
ssら、P.N.A.S.、1984、81、1026−1029)配列を基質と
する。即ち、loxP配列がリコンビナーゼCreの認
識配列となる。また、他のリコンビナーゼとして酵母の
2μプラスミド由来のFLP遺伝子がコードするリコン
ビナーゼが挙げられる(James R. Broarchら、Cell、2
9、227-234)。さらに、チゴサッカロマイセス・ルーイ
イのpSR1プラスミド由来のものも使用できる。これ
はR遺伝子にコードされる(Matsuzaki ら、Molecular
and Cellular Biology、、955-962 (1988)) 。これら
の中では、バクテリオファージP1のリコンビナーゼが
本発明に特に好適である。
【0016】リコンビナーゼ遺伝子は、例えば、リコン
ビナーゼCre遺伝子の場合は、バクテリオファージP
1のDNAのリコンビナーゼ遺伝子をコードする部分を
ポリメラーゼ・チェイン・リアクション(PCR)法を
用いて増幅して本発明に使用することができる。その他
のリコンビナーゼ遺伝子の場合も同様にPCR法を用い
て調製することができる。この場合に使用するプライマ
ーは、リコンビナーゼ遺伝子の全配列がカバーされるよ
うに選択され、さらに組換えアデノウイルスベクターの
構築の便宜のため、各プライマーの外側に適当な制限酵
素切断配列を付加したものを使用することが好ましい。
【0017】上記のリコンビナーゼの認識配列(基質と
なる配列)は数十bpであり、例えばloxP配列は3
4bpであり、全て、塩基配列が知られているので(Ab
remskiら、J. Biol. Chem.1984、1509-1514 ;および H
oessら、P.N.A.S.、1984、81、1026−1029) 、常法によ
り化学合成して本発明に使用することができる。
【0018】本発明に用いられるポリA配列としては、
特に限定されるものでないが、ウサギβグロビン由来の
ものが特に好ましい。
【0019】本発明においては、リコンビナーゼ遺伝子
をアデノウイルスベクターに組み込む場合に、同時に核
移行シグナル配列を組み込むことが好ましい。例えば、
SV40の核移行シグナルが利用できる。これは、アデ
ノウイルスベクターにより感染細胞の細胞質内で発現し
たリコンビナーゼがその認識配列を有するアデノウイル
スベクターに作用するには、核内に移行する必要があ
り、核移行シグナル配列はこれを促進する(Daniel Kal
deron ら、Cell. 39、499-509 (1984)) からである。
【0020】本発明に使用される外来遺伝子としては、
上記のハイブリッドプロモーター(CAGプロモータ
ー)あるいはその他のプロモーターにより発現すること
ができる遺伝子であれば、特に限定されるものではな
く、有用性の観点から、ヒトの欠損遺伝子に対応する正
常遺伝子の配列(例えばアデノシンデアミナーゼ、ジス
トロフィン、低密度リポ蛋白レセプター、α−1アンチ
トリプシン、血液凝固第8因子、血液凝固第9因子、ガ
ラクトシダーゼα、もしくはβ)、サイトカイン類(例
えばインターロイキン−1〜12、インターフェロン−
α,βもしくはγ、腫瘍壊死因子−αもしくはβ、顆粒
球コロニー刺激因子、顆粒球マクロファージコロニー刺
激因子、エリスロポエチン、成長ホルモン、インシュリ
ン、インシュリン様成長ホルモン)、神経栄養因子類、
非自己抗原遺伝子(例えばアロHLA(HLA−B
7))、ウィルス抗原等をコードするヌクレオチド配
列、ガン抑制遺伝子(例えば、p53、RB、WT−
1、NM23、NF−1)、ガン遺伝子であるRas等
のアンチセンス配列、またはチミジンキナーゼやシトシ
ンデアミナーゼのような自殺遺伝子と呼ばれるものが挙
げられる。
【0021】本発明の組換えアデノウイルスベクターに
組み込まれるプロモーター、外来遺伝子およびポリA配
列は上流からこの順に配向していても逆の順に配向して
いてもよい。
【0022】次に、本発明の組換えアデノウイルスの製
造方法について説明する。 (1) まず、E2A遺伝子領域の両側にある同方向を
向いた二つのリコンビナーゼ認識配列、プロモーター、
外来遺伝子およびポリA配列を有する組換えアデノウイ
ルスベクターの製造方法について述べる。便宜上、リコ
ンビナーゼとしてはリコンビナーゼCreを、その認識
配列としてはloxPを、プロモーターおよびポリA配
列としては前記のCAGプロモーターを、外来遺伝子と
してはLacZ遺伝子を使用する場合について述べる
が、その他のリコンビナーゼ、その認識配列、プロモー
ターおよびポリA配列を使用する場合も実質的に同様の
手法を利用することができる。
【0023】(a)(pAdexlCAwtの構築) CAGプロモーターを含むプラスミドpCMwCH
31の構築 CAGプロモーターを含むプラスミドpCAGGS(Ni
waら、Gene、108 、193-200(1990) )をEcoRIで切
断した後、Klenow酵素により平滑化し、SwaI
リンカーとのリガーゼ反応を行う。次に、得られたプラ
スミドをSalIで切断した後、Klenow酵素によ
り平滑化し、ClaIリンカーとのリガーゼ反応を行
う。さらに、得られたプラスミドをPstIで切断した
後、Klenow酵素により平滑化し、XhoIリンカ
ーとのリガーゼ反応を行い、CAGプロモーターを含む
プラスミドpCMwCH31を取得する。元の制限酵素
部位の消失および各リンカーの挿入は各制限酵素切断の
後、アガロースゲル電気泳動により確認する。
【0024】 pAdex1cの構築 実施例1(i)〜(vi)に記載の方法により構築す
る。その概要は以下のとおりである。E1遺伝子領域を
欠失したアデノウイルスゲノム左側末端の17%を含む
プラスミド(pUAF0−17D)、5型アデノウイル
スDNAにBamHリンカーを結合させた後HindII
I 消化して得られるフラグメント(2.8kb、アデノ
ウイルスゲノムの左側末端の8%に当たる)をpUC1
9に挿入して得られるプラスミド(pUAF0−8)、
およびアデノウイルスDNAをHindIII 消化して得
られる3.4kbフラグメント(アデノウイルスゲノム
の左側末端の8−17%に当たる)をpUC19のHi
ndIII 部位へ挿入して得られるプラスミド(pUAF
8−17)とを調製し、ついでpUAF0−8由来の4
54bpのBamHI−ClaIフラグメントと、pU
AF8−17由来の2.9kbのHindIII −Cla
Iフラグメントをつなぎ、pUC19のBamHI/H
indIII 部位へ挿入してpUAF0−17Dを得る。
【0025】さらに、5型アデノウイルスDNAをBs
t1107とEcoRIで消化し21.6kbのフラグ
メントを得る。また、アデノウイルスゲノム由来のpX
2WのEcoRI−SalIフラグメント(6.5k
b)を調製する。一方、charomid9−11(I. Saito &
G. Stark, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., vol. 83,
p8664-8668, 1986) をAsp718とBamHIで消化
し、Klenow酵素で平滑化後、セルフライゲーショ
ンする。ついでそのEcoRI部位へBamHIリンカ
ーを挿入し、シャロミドをchdRBR7−11を調製
する。
【0026】上記のpUAF0−17DのBamHI−
Bst1107フラグメント(2.9kb)とアデノウ
イルスゲノムのBst1107−EcoRIフラグメン
ト(21.6kb)とpX2WのEcoRI−SwaI
フラグメント(6.5kb)をEcoRIとEcl36
Iで消化したchdRBR7−11とライゲーションす
る。その後、in vitroパッケージングし、DH5αへ感
染させる。形質転換株から目的のフラグメントをもつも
のを単離し、pAdex1cと名づける。
【0027】 カセットコスミドpAdex1cwの
構築 ClaIで切断した後エタノール沈澱により回収したp
Adex1cと、5’末端リン酸化を施した下記の合成
リンカー(1)(配列番号:2)(SwaI、Cla
I、SalI、NruI部位を含む)を混合し、AT
P、T4DNAリガーゼを含む反応液中で一晩結合させ
る。リガーゼを熱失活させた後、SwaIで消化する。
この切断はリンカーが複数個挿入されたものからSwa
I断片を切り出し、リンカーが1個のみ挿入された構造
のコスミドを得るために行う。次に、反応液をSpun
column(Pharmacia社製)にかけ、リ
ンカー由来の小断片を除去した後、T4DNAリガーゼ
でライゲーションを行い、セルフアニーリングによる環
状化を行う。ついでイン・ビトロ・パッケージングを行
い、各コロニーから調製したコスミドDNAの構造をB
amHIおよびNruI同時消化により確認する。目的
とする方向に挿入された場合483bp、逆方向に挿入
された場合、464bpの断片を生じる。この確認によ
り目的とするカセットコスミドpAdex1cw(図
1)を取得する。 合成リンカー (1) 5'-CGATTTAAATCGATTGTCGACTCGCGA-3' 3'-TAAATTTAGCTAACAGCTGAGCGCTGC-5'
【0028】 カセットコスミドpAdexlpCA
wの構築 で構築したプラスミドpCMwCH31をHindII
I およびClaIで同時消化し、Klenow酵素によ
り平滑化し、5'末端リン酸化を施したPmeIリンカー
とのライゲーションを行う。リガーゼを熱失活させた
後、Psp1406Iで消化する。この切断はリンカー
が複数個挿入されたものからPsp1406I断片を切
り出し、リンカーがDNA断片の両端にそれぞれ1個連
結した構造の断片を得るために行う。このあと、反応液
をアガロースゲル電気泳動に供し、2.3kbのDNA
断片を含むゲルを切り出し、電気泳動によりゲルからD
NA断片を回収する。次に、pAdexlcwをCla
Iで切断した後、生じた小断片をSpun colum
n(Pharmacia製)により除去した後のDNA
断片と前述の2.3kbのDNA断片をT4DNAリガ
ーゼでライゲーションさせる。リガーゼを熱失活させた
後、ClaIを添加し、セルフアニーリングにより生じ
た環状コスミドを切断する。ついで、イン・ビトロ・パ
ッケージングに用いる。更に、各コロニーから調製した
コスミドDNAの構造をBamHIおよびXhoI同時
消化により確認する。目的とする方向に挿入された場合
483bpと4.8kb、逆方向に挿入された場合、
2.7及び2.5kbの断片を生じる。この確認により
目的とするカセットコスミドpAdexlpCAwを取
得する。
【0029】 カセットコスミドpAdexlCAw
t(細胞工学、Vol.13、No.8、P759)の構築 SwaIで切断した後エタノール沈澱により回収したp
AdexlpCAwを、5'末端リン酸化を施した下記の
合成リンカー(2)(配列番号:3)(ClaI、Xb
aI、SpeI、PacI、SwaI、ClaI部位を
含む)を混合し、ATP、T4DNAリガーゼを含む反
応液中で一晩結合させる。リガーゼを熱失活させた後、
PacI(20unit)を添加し、反応させる。この
切断はリンカーが複数個挿入されたものからPacI断
片を切り出し、リンカーが1個のみ挿入された構造のコ
スミドを得るために行う。次に、反応液をSpun c
olumn(Pharmacia製)にかけ、リンカー
由来の小断片を除去した後、T4DNAリガーゼを含む
反応液中で一晩結合させ、セルフアニーリングによる環
状化を行う。リガーゼを熱失活させた後、イン・ビトロ
・パッケージングに用いる。次に、各コロニーから調製
したコスミドDNAの構造をXbaIおよびXhoI同
時消化により確認する。目的とする方向に挿入された場
合552bp、逆方向に挿入された場合、568bpの
断片を生じる。これを確認することにより目的とするカ
セットコスミドpAdexlCAwt(図2)を取得す
る。 合成リンカーの構造 (2) 5'-ATCGATTCTAGACTAGTTTAATTAATTTAAATCGAT-3' 3'-TAGCTAAGATCTGATCAAATTAATTAAATTTAGCTA-5'
【0030】(b)(loxP挿入コスミドの構築その
1)pAdex2L3LCAwtの作製 pA60X99Xの作製 pAdexlCAwtをBamHIで切断した後、熱処
理によりBamHIを失活させる。次にT4DNAリガ
ーゼにより一晩結合させる。次いでこの反応混液を用い
て大腸菌DH5α(GIBCO BRL製)を形質転換
し、得られた形質転換体からプラスミドDNAを調製
し、目的とするプラスミドpA60X99Xを得る。
【0031】 pA60X99の作製(アデノウイル
ス以外のXbaI部位の除去) pA60X99XをXbaI処理し、反応混液をアガロ
ースゲル電気泳動し、2ヶ所のXbaI部位のうち1ヶ
所のみで切断された23.8kbのDNA断片を含むゲ
ルを切り出し、電気泳動によりゲルからDNA断片を回
収する。次に、この断片をKlenow酵素(宝酒造
製)で両末端を平滑化し、T4DNAリガーゼで一晩結
合させる。次いでこの反応混液を用いて大腸菌DH5α
を形質転換し、得られた形質転換体からプラスミドDN
Aを調製する。これらのプラスミドDNAをBsrGI
およびXbaIで同時消化し、6.2kbの断片すなわ
ちプラスミドpA60X99(図3)を得る。
【0032】 pA2L60X99の作製(BsrG
I部位へのloxPの挿入) pULL2rをXholで切断した後、Klenow酵
素(宝酒造製)で両末端を平滑化する。その後フェノー
ル:クロロホルム(1:1)処理を施した後、エタノー
ル沈澱する。沈澱物を遠心分離により取得し、TE60
μlに溶解する。これと5’末端リン酸化KpnIリン
カー(宝酒造製)、ATPおよびT4DNAリガーゼを
含むリガーゼ反応液(最終容量50μl)中で一晩結合
させる。次に、Asp718(ベーリンガー製)で消化
する。反応混液をアガロースゲル電気泳動し、loxP
を含む64bpのDNA断片を含むゲルを切り出し、電
気泳動によりゲルからDNA断片を回収する。
【0033】なお、上記のpULL2rは以下のように
して調製する。pUC119(宝酒造製)を制限酵素E
cl136IIで切断し、アルカリホスファターゼ処理を
施した後、末端にMluI部位およびXhoI部位を有
しこれが連結するとNruI部位を生じるように設計さ
れているloxP配列を含む下記の合成DNA断片(配
列番号:4)とのligation反応を行い該合成DNA断片
が2つ挿入されたプラスミドpULL2rを得る。 5'-CGAACGCGTATAACTTCGTATAGCATACATTATACGAAGTTATCTCGAGTCG-3' 3'-GCTTGCGCATATTGAAGCATATCGTATGTAATATGCTTCAATAGAGCTCAGC-5' (下線部分の配列がloxP部位である。)
【0034】一方、プラスミドpA60X99(10μ
g)をBsrGI(50unit)を含む反応系50μ
l中で切断した後、反応混液をアガロースゲル電気泳動
し、23.8kbのDNA断片を含むゲルを切り出し、
電気泳動によりゲルからDNA断片を回収する。このD
NA断片と前述のloxPを含む64bpのDNA断
片、ATPおよびT4DNAリガーゼを含むリガーゼ反
応液中で一晩結合させる。これに滅菌水、BsrGI反
応bufferを加え、70℃で10分間インキュベー
トすることによりリガーゼを熱失活させた後、BsrG
Iで処理してセルフアニーリングにより生じた環状のp
A60X99を切断する。次いでこの反応混液10μl
を用いて大腸菌DH5αを形質転換し、得られた形質転
換体からプラスミドDNAを調製する。
【0035】挿入されたloxPの方向を確認するた
め、ApaIとMluIの同時消化を行い、反応混液を
アガロースゲル電気泳動する。目的とする方向に挿入さ
れた場合、366および219bp、逆方向に挿入され
た場合、334および251bpの断片が生じる。ま
た、NruIで消化した場合、目的とする方向に挿入さ
れた場合573bp、逆方向に挿入された場合、533
bpの断片が生じる。さらに、DraIとKpnIで同
時消化した場合、目的とする方向にloxPが1つ挿入
された場合320bp、2つ挿入された場合、384b
pの断片が生じる。これら3種の条件をすべて満たす、
すなわち、目的とする方向にloxPが1つ挿入された
目的のプラスミドpA2L60X99(図4)を取得す
る。
【0036】 pA2L3L6099の作製(Xba
I部位へのloxPの挿入) pULL2rをXhoIを含む反応系100μl中で切
断した後、Klenow酵素(宝酒造製)で両末端を平
滑化する。ついで、フェノール:クロロホルム(1:
1)処理を施した後、エタノール沈澱する。沈澱物を遠
心分離により取得し、TEに溶解する。これと5’末端
リン酸化SpeIリンカー(宝酒造製)、ATPおよび
T4DNAリガーゼを含む反応液中で一晩結合させる。
さらに、SpeIを加え消化した後、反応混液をアガロ
ースゲル電気泳動し、loxPを含む64bpのDNA
断片を含むゲルを切り出し、電気泳動によりゲルからD
NA断片を回収する。
【0037】一方、pA2L60X99を、XbaIで
切断した後、反応混液をアガロースゲル電気泳動し、2
3.8kbのDNA断片を含むゲルを切り出し、電気泳
動によりゲルからDNAを回収する。このDNA断片と
前述のloxPを含む64bpのDNA断片、ATPお
よびT4DNAリガーゼを含む反応液中で一晩結合させ
る。リガーゼを熱失活させ、ついでこれをXbaIで処
理し、セルフアニーリングにより生じた環状のpA2L
60X99を切断する。この反応混液を用いて大腸菌D
H5αを形質転換し、得られた形質転換体からプラスミ
ドDNAを調製する。
【0038】挿入されたloxPの方向を確認するた
め、BglIIとMluIの同時消化を行い、反応混液を
アガロースゲル電気泳動する。目的とする方向に挿入さ
れた場合、366および503bp、逆方向に挿入され
た場合、398および471bpの断片が生じる。ま
た、ApaIとMluIで同時消化した場合、目的とす
る方向に挿入された場合660bp、逆方向に挿入され
た場合、628bpの断片が生じる。EcoNIとMl
uIで消化した場合、目的とする方向に挿入された場合
311bp、逆方向に挿入された場合、343bpの断
片が生じる。さらに、HpaIとSacIで同時消化し
た場合、目的とする方向にloxPが1つ挿入された場
合397bp、2つ挿入された場合、461bpの断片
が生じる。これら4種の条件をすべて満たす、すなわ
ち、目的とする方向にloxPが1つ挿入された目的の
プラスミドpA2L3L6099(図5)を取得する。
【0039】 pAdex2L3LCAwtの作製 pAdex1CAwtを、Csp45I(東洋紡製)で
切断し、次いで、同反応液中でBamHI、さらにEc
oRIで切断した後、アガロースゲル電気泳動によるチ
ェックを行う。21kbのDNA断片を含むゲルを切り
出し、電気泳動によりゲルからDNA断片を回収する。
なお、Csp451およびEcoRIによる切断は21
kbのBamHIDNA断片を回収する際、他の断片が
混入するのを防ぐためである。
【0040】pA2L3L6099をBamHIで切断
した後、フェノール:クロロホルム(1:1)処理を施
し、水層をTEで平衡化したSephadexG25に
よりゲル濾過する。回収したDNA断片と前述の21k
bのDNA断片、ATPおよびT4DNAリガーゼを含
む反応液中で一晩結合させる。リガーゼを熱失活させた
後、これをイン・ビトロ・パッケージングに用いる。
【0041】即ち、ラムダ・イン・ビトロ・パッケージ
ングキットであるギガバックXL(Stratagen
e製)を用い、残りは−80℃に凍結する。ギガバック
XLは42kb以下のコスミドのパッケージ効率が低い
のでインサートが入って大きくなったコスミドをある程
度選択することができる。本発明では、10個のコロニ
ーを拾えば大半はインサートを含んでおり、目的のクロ
ーン(ウイルスゲノムが正しく連結されたクローン)を
容易に得ることができる。コスミドの扱い方について
は、常法(斎藤 泉他、実験医学:7:183-187, 1989)
に従って行う。
【0042】パッケージングされたコスミドを大腸菌D
H5α(GibcoBRL製)に感染させる。即ち、A
+ (アンピシリン添加)寒天プレートとAp+ LB
(pool)に各種の濃度で接種し、一晩培養する。p
oolのminiprepDNAを抽出・調製し、制限
酵素DraI切断によりインサートがはいったものの割
合を調べる。コロニーは丸ごと寒天ごと取りAp+ LB
で一晩培養し、miniprepDNAを調製する。次
に、各コロニーから調製したコスミドDNAの構造をD
raI切断により確認する。目的とする方向に挿入され
た場合891bp、逆方向に挿入された場合1.4kb
の断片を生じる。これにより目的とするカセットコスミ
ドpAdex2L3LCAwtを取得する。
【0043】(c)(loxP挿入コスミドの構築その
2)pAdex2LA3LCAwtの作製 pUCA6065の作製 pA60X99をBamHIおよびPstIにより切断
し、反応混液をアガロースゲル電気泳動し、BsrGI
部位を含む1.7kbのDNA断片を含むゲルを切り出
し、電気泳動によりゲルからDNA断片を回収する。同
様の操作によりpUC19をBamHIおよびPstI
により切断し、2.7kbの断片を回収する。次に両断
片をリガーゼ反応buffer中に加え、さらにAT
P、T4DNAリガーゼを加え、一晩結合させる。次い
でこの反応混液を用いて大腸菌DH5αを形質転換し、
得られた形質転換体からプラスミドDNAを調製し、目
的とするプラスミドpUCA6065を得る。
【0044】 p2LA6065の作製 pUCA6065をBamHIおよびAflIII で切断
し、780bpの断片を調製し、また、同プラスミドを
BamHIおよびBsrGIで切断し、3.6kbの断
片を調製する。これら両断片とloxP配列を含む下記
のリンカーDNA(配列番号:11)を混合しリガーゼ
反応buffer中に加え、さらにATP、T4DNA
リガーゼを加え、一晩結合させる。次いでこの反応混液
を用いて大腸菌DH5αを形質転換し、得られた形質転
換体からプラスミドDNAを調製し、リンカーDNAが
1つ挿入された、目的とするプラスミドp2LA606
5を得る。 5'-CATGTAATTT AAATCTCGAG ATAACTTCGT ATAATGTATG CTATACGAAG TTATACGCGT 3'-ATTAAA TTTAGAGCTC TATTGAAGCA TATTACATAC GATATGCTTC AATATGCGCA ATTTAAATGT AAAAATAATG TACTAGAGAC ACTTTCAATA AAGGCAAATG CTTTTATTT-3' TAAATTTACA TTTTTATTAC ATGATCTCTG TGAAAGTTAT TTCCGTTTAC GAAAATAAAC ATG-5'
【0045】 pA2LA3L6099の作製 p2LA6065をBamHIおよびSfiI(あるい
はBglI)により切断し、1.5kbの断片を調製す
る。また、pA2L3L6099をBamHIおよびS
fiIにより切断し、約22kbの断片を調製する。次
に両断片をリガーゼ反応buffer中に加え、さらに
ATP、T4DNAリガーゼを加え、一晩結合させる。
次いでこの反応混液を用いて大腸菌DH5αを形質転換
し、得られた形質転換体からプラスミドDNAを調製
し、目的とするプラスミドpA2LA3L6099を得
る。
【0046】 pAdex2LA3LCAwtの作製 pAdex2L3LCAwt作製の際のと同様の操作
により、pA2LA3L6099とpAdexlCAw
tからpAdex2LA3LCAwtを作製する。
【0047】(d)(loxP挿入コスミドの構築その
3)pAdex2LD3LCAwtの作製 pHSGA6065の作製 pA60X99をBamHIおよびPstIにより切断
し、反応混液をアガロースゲル電気泳動し、BsrGI
部位を含む1.7kbのDNA断片を含むゲルを切り出
し、電気泳動によりゲルからDNA断片を回収する。p
HSG299(宝酒造)をBamHIおよびPstIに
より切断し、同様の操作により2.7kbの断片を回収
する。次に両断片をリガーゼ反応buffer中に加
え、さらにATP、T4DNAリガーゼを加え、一晩結
合させる。次いでこの反応混液を用いて大腸菌DH5α
を形質転換し、得られた形質転換体からプラスミドDN
Aを調製し、目的とするプラスミドpHSGA6065
を得る。
【0048】 p2LD6065の作製 pHSGA6065をBsrGIおよびDraIで切断
し4.4kbの断片を調製し、これとloxP配列を含
む下記のリンカーDNA(配列番号:12)を混合し、
リガーゼ反応buffer中に加え、さらにATP、T
4DNAリガーゼを加え、一晩結合させる。次いでこの
反応混液を用いて大腸菌DH5αを形質転換し、得られ
た形質転換体からプラスミドDNAを調製し、リンカー
DNAが1つ挿入された目的とするプラスミドp2LD
6065を得る。 5'-GTACACTCTC GGGTGATTAT TTACCCCCAC CCTTGCCGTC TGCGCCGATT TAAATCTCGA 3'-TGAGAG CCCACTAATA AATGGGGGTG GGAACGGCAG ACGCGGCTAA ATTTAGAGCT GATAACTTCG TATAATGTAT GCTATACGAA GTTATACGCG TATTTAAATC CGTTT-3' CTATTGAAGC ATATTACATA CGATATGCTT CAATATGCGC ATAAATTTAG GCAAA-5'
【0049】 pA2LD3L6099の作製 p2LD6065をBamHIおよびSfiI(あるい
はBglI)により切断し1.5kbの断片を調製す
る。また、pA2L3L6099をBamHIおよびS
fiIにより切断し、約22kbの断片を調製する。次
に両断片をリガーゼ反応buffer中に加え、さらに
ATP、T4DNAリガーゼを加え、一晩結合させる。
次いでこの反応混液を用いて大腸菌DH5αを形質転換
し、得られた形質転換体からプラスミドDNAを調製
し、目的とするプラスミドpA2LD3L6099を得
る。
【0050】 pAdex2LD3LCAwtの作製 pAdex2L3LCAwt作製の際のと同様の操作
により、pA2LD3L6099とpAdexlCAw
tからpAdex2LD3LCAwtを作製する。
【0051】(e)アデノウイルスDNA−末端蛋白複
合体(Ad5 dlX DNA−TPCおよびAdex
1CANLacZ DNA−TPC)の調製 アデノウイルスDNAとしては、Ad5 dlX
(I. Saito et al., J.Virology, vol.54, 711-719 (19
85))またはAdex1CANLacZを用いる。Ad5
dlXをHeLa細胞(Roux 10本分)に、A
dex1CANLacZを293細胞にそれぞれ感染さ
せ、培養を行う。即ち、Ad5−dlXまたはAdex
1CANLacZのウイルス液(〜109 PFU/m
l)を0.2ml/Roux感染させ、3日後に、はが
れた細胞を遠心分離により集める。アデノウイルス粒子
のほとんどはメディウム中ではなく細胞の核内にいるの
で感染細胞からウイルスを精製できる利点がある。(以
下の操作は非無菌的に行う。)
【0052】 得られた細胞をTris−HCl(p
H8.0)に懸濁し、密封型ソニケーターを用いて細胞
を破砕し、ウイルスを細胞内から放出させる。 得られた破砕物を遠心分離により沈澱を除いた後、
超遠心分離機 SW28チューブに塩化セシウム溶液
(比重1.43)を入れ、その上に上清を重層し、クッ
ション遠心による濃縮を行う。 界面直下のウイルス層をSW50.1チューブに移
す。界面直下のウイルス層は通常目視でき、ウイルス層
とその下層の塩化セシウムを5ml採取する。同時にも
う一本に塩化セシウム溶液(比重1.34)を満たす。
これらを、35krpm、4℃で一晩超遠心にかけた。
次いで、白いウイルスのバンドを分取し、既に勾配がで
きたチューブに乗せ替える。さらに、35krpm、4
℃4時間以上超遠心にかける。
【0053】 白いウイルスのバンドを分取し、等量
の8M塩酸グアニジンと室温で混合し、4M塩酸グアニ
ジン飽和塩化セシウムを加えてVTi65チューブに満
たす。4M塩酸グアニジンにより、粒子蛋白は変性を受
けて解離し、DNA−TPCが放出される。
【0054】 上記のチューブを、55krpm、1
5℃で一晩超遠心にかけ、0.2mlずつ分画し、その
1μlずつを1μg/mlのエチジウムブロミド水溶液
20μlと混合し、蛍光染色することによりDNAの有
無を確認する。DNAを含む2〜3フラクションを集め
る。 500mlのTEに一晩透析(2回)し、−80℃
に保存した。こうして得られたAd5dlX DNA−
TPCまたはAdex1CANLacZ DNA−TP
Cの量をOD260 から通常のDNAと同様に算出する。 得られたAd5dlX DNA−TPCまたはAd
ex1CANLacZDNA−TPCを、次のステップ
のloxP挿入組換えアデノウイルス作成のため、充分
量のAgeIで2時間切断し、Sephadex G2
5カラムでゲル濾過後、−80℃に保存する。
【0055】(f)loxP挿入組み換えアデノウイル
スの作製 なお、NLacZは大腸菌LacZ遺伝子のN末端にS
V40の核移行シグナルを付加したものである。 10%FCS添加DMEで培養した293細胞の6
cm、10cmシャーレ各1枚用意する。 −1.(Ad5dlX2L3LまたはAdex2L3
LCANLacZの作製) 発現ユニットを組み込んだloxPを挿入したコスミド
pAdex2L3LCAwt DNAの8μgとAge
Iで切断したAd5dlX DNA−TPCまたはAg
eIで切断したAdex1CANLacZ DNA−T
PCの1μgを混合し、セルフェクト(ファルマシア
製)キットを用いて、6cmシャーレ1枚にリン酸カル
シウム法でトランスフェクションを行う。6cmシャー
レのメディウムの上から混合液を滴下し、培養を続け
る。一晩培養(約16時間)し、午前中に培養液を交換
し、夕方、コラーゲンコート96穴3枚(原液・10倍
希釈・100倍希釈)に、5%FCS添加DMEを用
い、各ウエル当たり0.1mlでまき直す。細胞数が各
プレートで大きく違わないように、希釈2枚分には10
cmシャーレの293細胞を1/3ずつ混ぜて播く。
【0056】−2.(Ad5dlX2LA3Lまたは
Adex2LA3LCANLacZの作製) 発現ユニットを組み込んだloxPを挿入したコスミド
pAdex2LA3LCAwt DNAの8μgとAg
eIで切断したAd5dlX DNA−TPCまたはA
geIで切断したAdex1CANLacZ DNA−
TPCの1μgを混合し、セルフェクト(ファルマシア
製)キットを用いて、6cmシャーレ1枚にリン酸カル
シウム法でトランスフェクションを行う。6cmシャー
レのメディウムの上から混合液を滴下し、培養を続け
る。一晩培養(約16時間)し、午前中に培養液を交換
し、夕方、コラーゲンコート96穴3枚(原液・10倍
希釈・100倍希釈)に、5%FCS添加DMEを用
い、各ウエル当たり0.1mlでまき直す。細胞数が各
プレートで大きく違わないように、希釈2枚分には10
cmシャーレの293細胞を1/3ずつ混ぜて播く。
【0057】−3.(Ad5dlX2LD3Lまたは
Adex2LD3LCANLacZの作製) 発現ユニットを組み込んだloxPを挿入したコスミド
pAdex2LD3LCAwt DNAの8μgとAg
eIで切断したAd5dlX DNA−TPCまたはA
geIで切断したAdex1CANLacZ DNA−
TPCの1μgを混合し、セルフェクト(ファルマシア
製)キットを用いて、6cmシャーレ1枚にリン酸カル
シウム法でトランスフェクションを行う。6cmシャー
レのメディウムの上から混合液を滴下し、培養を続け
る。一晩培養(約16時間)し、午前中に培養液を交換
し、夕方、コラーゲンコート96穴3枚(原液・10倍
希釈・100倍希釈)に、5%FCS添加DMEを用
い、各ウエル当たり0.1mlでまき直す。細胞数が各
プレートで大きく違わないように、希釈2枚分には10
cmシャーレの293細胞を1/3ずつ混ぜて播く。
【0058】 3〜4日後と8〜10日後に、各ウエ
ルに50μlの10%FCS添加DMEを加える。29
3細胞がやせてきたら早めに加える。ウイルスが増殖し
細胞が死滅したウエルが7〜20日の間に現れる。ウエ
ルの細胞が完全に死滅するごとに滅菌パスツールピペッ
トで培養液(死細胞ごと)を滅菌した1.5mlチュー
ブに無菌的に移して、ドライアイスで急凍して−80℃
に保存する。 15〜25日で判定は終了する。比較的遅く細胞が
死んだウエルから回収した培養液チューブを約10個選
び、超音波破砕後、5000rpm10分遠心して得ら
れた上清を1次ウイルス液(first seed)として−80
℃に保存する。早めにウイルス増殖が起こったウエルは
複数のウイルス株の混合感染の可能性が高いからであ
る。
【0059】 24穴プレートに293細胞を用意
し、5%FCS−DME(0.4ml/ウエル)と1次
ウイルス液10μlをそれぞれ2ウエルずつ添加する。 約3日で細胞が完全に死滅したら、1ウエルは1次
ウイルス液作製と同様に超音波破砕と遠心分離で上清を
得、これを2次ウイルス液(second seed) として−80
℃に保存する。他の1ウエルの死滅した細胞を5000
rpmで5分間遠心し、上清を捨てて細胞だけを−80
℃に保存する(セルパック)。10種類のウイルス株の
セルパックが集まったら以下の方法で感染細胞の全DN
Aを抽出する。セルパックには、400μlのcell DNA
用TNE (50mM Tris-HCl pH7.5, 100mM NaCl, 10mM EDT
A)、4μlのproteinaseK (10mg/ml) および4μlの10
%SDSを加える。
【0060】 50℃で1時間処理した後、フェノー
ル・クロロホルム抽出2回、クロロホルム抽出2回、つ
いでエタノール沈澱により得られた核酸をRNaseを
20μg/ml含む50μlのTEに溶かす。その15
μlを発現ユニットを切断する酵素の中で認識配列にC
Gを含む酵素であるXhoIで切断し、発現コスミドカ
セットのXhoI切断と共に、15cm位の長さのアガ
ロースゲルで一晩電気泳動を行い、パターンを比較す
る。XhoIは挿入したloxP配列内に認識部位があ
るので、loxPが2個挿入された切断パターンを示す
クローンを選択する。説明できないバンドが薄く見える
クローンは、欠失のあるウイルスとの混合の可能性があ
るので廃棄する。
【0061】ここで得られるloxP挿入組換えアデノ
ウイルスAd5dlX2L3L、Ad5dlX2LA3
L、Ad5dlX2LD3L等と、目的の外来遺伝子発
現ユニットを含むコスミドを用いて、公知の組換えアデ
ノウイルス作製方法、例えばCOS−TPC法(「実験
医学別冊」バイオマニュアルシリーズ4、遺伝子導入と
発現・解析法、43〜58頁)に従って、目的の外来遺
伝子発現ユニットとloxPが挿入された組換えアデノ
ウイルスを作製することができる。
【0062】(g)E2A遺伝子欠損アデノウイルスの
作製と構造確認 組み換えアデノウイルスAdex2L3LCANLac
ZおよびAdex1CANCreをそれぞれmoi=1
0および3で293細胞に感染させ、培養を行う。4日
目に細胞を回収し、前述の方法によりDNAを調製す
る。loxPで挟まれた領域(E2A遺伝子を含む)が
切り出された構造を有するAdexdl23CANLa
cZの生成を2つの方法で確認する。なお、Adex2
LA3LCANLacZおよびAdex2LD3LCA
NLacZに関しても同様の操作により構造が確認でき
る。
【0063】1.SmaI消化 SmaI消化の後、ゲル電気泳動した結果、loxPで
挟まれた領域が切り出されて生ずる4.7kbの断片が
認められる。このバンドとAdex2L3LCANLa
cZ、Adex1CANCre、およびAdexdl2
3CANLacZにおいて共通して見られる4.45k
bのバンドの濃さの比較から、回収した組換えアデノウ
イルス中の約何%がAdexdl23CANLacZで
あるかが分かる。
【0064】2.PCRによる確認 調製したDNA0.1ngをテンプレートとし、通常の
条件でPCRを行い、生成物をアガロースゲル電気泳動
により分析する。用いるプライマーは、下記に示すオリ
ゴヌクレオチド(1)(配列番号:5)、オリゴヌクレ
オチド(2)(配列番号:6)、オリゴヌクレオチド
(3)(配列番号:7)およびオリゴヌクレオチド
(4)(配列番号:8)が好ましい。 (1) 5'−CAACTCCATGCTCAACAGTCC
CCAGGTACA−3' (2) 5'−GATTTTTAAACGGCGCAGACG
GCAAG−3' (3) 5'−GTGAGCTTAGAAAACCCTTAG
−3' (4) 5'−AGATACCCCTTTTGCACTGGT
GCAAGTTAAC−3' PCR反応液組成は、10mMのTris・HCl(p
H8.3)中、50mMのKCl、1.5mMのMgC
2 、0.2mMのdNTP mixture および各0.2
μMのプライマー、0.1ngのテンプレートDNAお
よび0.5unitのTaq ポリメラーゼを含むもの
が好ましい。PCR反応条件としては、二本鎖解離を9
5℃で1.5分、アニーリングを64℃で1.0分、伸
長反応を70℃で1.0分、反応サイクル30回、が好
ましい1例である。プライマーとして(1)と(4)を
用いた場合、393bpと推定されるバンドが検出さ
れ、E2A遺伝子が欠失したAdexdl23CANL
acZの存在が明らかとなり、また、(2)と(3)を
用いた場合、221bpと推定されるバンドが検出さ
れ、Cre遺伝子産物により切り出された環状のE2A
遺伝子の存在も裏付けられ、Adex2L3LCANL
acZからloxPではさまれた領域(E2A遺伝子を
含む)が切り出されたAdexdl23CANLacZ
の生成が明らかになる(図6)。
【0065】(2) 次に、プロモーター、リコンビナ
ーゼ遺伝子およびポリA配列を有する組換えアデノウイ
ルスベクターの製造方法について説明する。以下に、リ
コンビナーゼ遺伝子としてリコンビナーゼCre遺伝子
を使用した場合について述べるが、他のリコンビナーゼ
遺伝子の場合もほぼ同様である。
【0066】 PCR法で調製したリコンビナーゼC
re遺伝子およびプラスミドpUC19(宝酒造製)と
をそれぞれ制限酵素PstI(宝酒造製)およびXba
I(宝酒造製)で同時消化したのち混合・ライゲーショ
ンし、リコンビナーゼCre遺伝子が組み込まれたプラ
スミドpUCCreを得る。 CAGプロモーターを含むカセットコスミドpAd
ex1CAwtを制限酵素SwaI(Boehringer製)で
処理したものと、pUCCreを制限酵素PstI(宝
酒造製)およびXbaI(宝酒造製)で同時消化したの
ちKlenow酵素(宝酒造製)で両端を平滑化したも
のとを混合する。ついでカセットコスミドを沈澱させ、
T4 DNAリガーゼで結合させ、リコンビナーゼCr
e遺伝子を組み込んだカセットコスミドを得る。
【0067】CAGプロモーター以外のプロモーターを
使用する場合は、まず、アデノウイルスゲノム(36k
b)の全長のうち、複製に不要なE3領域(1.9k
b)とE1A・E1B領域(2.9kb)を欠失させた
約31kbのゲノムDNAをもつカセットコスミドを作
成し、他方、使用しようとするプロモーター、リコンビ
ナーゼCre遺伝子およびポリA配列を含むプラスミド
を作製し、適当な制限酵素で処理してアデノウイルスゲ
ノムのE1A・E1B欠失部位にリコンビナーゼCre
遺伝子発現ユニットを組み込んだカセットコスミドを得
る。 次に、得られたカセットコスミドを、ラムダ・イン
ビトロ・パッケージングキットであるギガパックXL
(Stratagene製)を用いて、インビトロ・パ
ッケージングを行う。
【0068】 一方、アデノウイルスDNA−末端蛋
白複合体(Ad5dlX DNA−TPC)を調製す
る。アデノウイルスDNAとしては、Ad5dlX(I.
Saitoet al., J.Virology, vol.54, 711-719 (1985)
)を用い、Ad5dlXをHeLa細胞(Roux瓶
10本分)に感染させ、培養を行う。ウイルス粒子を回
収し、塩酸グアニジン処理・超遠心によりDNA−TP
Cを分離・回収する。こうして得られたAd5dlX
DNA−TPCを次のステップの組換えアデノウイルス
作製のため充分量のEcoT22Iで処理する。
【0069】 最後のステップとして、リコンビナー
ゼCre遺伝子を組み込んだカセットコスミドとEco
T22Iで処理したAd5dlX DNA−TPCを混
合し、セルフェクト(ファルマシア製)キットを用いて
リン酸カルシウム法でトランスフェクションを行う。ウ
イルスの増殖のため細胞が死滅したものからウイルス液
を回収しプロモーター、リコンビナーゼ遺伝子およびポ
リA配列を有する組換えアデノウイルスベクターを得
る。
【0070】本発明の方法により上記のようにして得ら
れる、目的の外来遺伝子発現ユニットを有し、E2A遺
伝子の機能が完全に欠失した本発明の組換えアデノウイ
ルスの高力価ウイルス溶液は、適宜希釈して局所注入
(中枢神経系・門脈など)、経口(腸溶剤を用いる)投
与、経気道投与、経皮投与等の投与方法により共感染さ
せ、遺伝病を含む各種疾患の治療に用いることができ
る。
【0071】
【実施例】以下、実施例、参考例により本発明をさらに
詳しく説明するが、本発明はこれらの実施例等によりな
んら限定されるものではない。なお、実施例中のファー
ジ、プラスミド、DNA、各種酵素、大腸菌、培養細胞
などを取り扱う諸操作は、特に断らない限り、「Molecu
lar Cloning, A Laboratory Manual. T. Maniatis ら
編、第2版(1989 )、Cold Spring Harbor Laborat
ory 」に記載の方法に準じて行った。また、DNA制限
酵素および修飾酵素は、宝酒造、New Englan
d Biolabs(NEB)社、Stratagen
e社又はBoehringer社から購入し、製造者指
示書に従って使用した。
【0072】実施例1(pAdex1CAwtの構築) CAGプロモーターを含むプラスミドpCMwCH
31の構築 CAGプロモーターを含むプラスミドpCAGGS(Ni
waら、Gene、108 、193-200(1990) )をEcoRIで切
断した後、Klenow酵素により平滑化し、SwaI
リンカーとのリガーゼ反応を行った。次に、得られたプ
ラスミドをSalIで切断した後、Klenow酵素に
より平滑化し、ClaIリンカーとのリガーゼ反応を行
った。さらに、得られたプラスミドをPstIで切断し
た後、Klenow酵素により平滑化し、XhoIリン
カーとのリガーゼ反応を行った。元の制限酵素部位の消
失および各リンカーの挿入は各制限酵素切断の後、アガ
ロースゲル電気泳動により確認した。
【0073】 pAdex1cの構築 (i)E1遺伝子領域を欠失したアデノウイルスゲノム
左側末端の17%を含むプラスミド(pUAF0−17
D)の調製 5型アデノウイルスDNAをS1処理して平滑末端と
し、その平滑末端にBamHリンカーを結合させ、その
後HindIII 消化し、目的のフラグメント(2.8k
b、アデノウイルスゲノムの左側末端の8%に当たる)
をアガロースゲル電気泳動で分離・回収し、BamHI
/HindIII 消化したpUC19のBamHI/Hi
ndIII 部位へ挿入した。得られた目的のプラスミドを
pUAF0−8と名づけた。
【0074】(ii)アデノウイルスDNAをHindII
I 消化し、アガロースゲル電気泳動で分離し、目的の
3.4kbのフラグメント(アデノウイルスゲノムの左
側末端の8−17%に当たる)をゲルから回収し、pU
C19のHindIII 部位へ挿入した(pUAF8−1
7と命名)。pUAF0−8の塩基番号(ここでいう塩
基番号はアデノウイルスDNA由来)454番目のPv
uII部位をClaIリンカーを用いてClaI部位に変
換した。そして、このプラスミドをBamHI/Cla
I消化し、454bpのBamHI−ClaIフラグメ
ントをアガロースゲル電気泳動で回収した。pUAF8
−17の塩基番号3328番目のBglII部位をCla
Iリンカーを用いてClaI部位に変換した。そしてこ
のプラスミドをHindIII /ClaI消化し、2.9
kbのHindIII −ClaIフラグメントをアガロー
スゲル電気泳動で回収した。pUAF0−8由来の45
4bpのBamHI−ClaIフラグメントと、pUA
F8−17由来の2.9kbのHindIII −ClaI
フラグメントをつなぎ、pUC19のBamHI/Hi
ndIII 部位へ挿入した。得られたプラスミドをpUA
F0−17Dと命名した。このプラスミドはE1遺伝子
領域を欠失したアデノウイルスゲノム左側末端の17%
を含む。
【0075】(iii)アデノウイルスゲノムのBst11
07−EcoRIフラグメント(21.6kb)の調製 5型アデノウイルスDNAをBst1107とEcoR
Iで消化し、アガロースゲル電気泳動で分離した後、目
的の21.6kbのフラグメントを回収した。
【0076】(iv)アデノウイルスゲノムのEcoRI
−SalIフラグメント(6.5kb)の調製 pX2S(I. Saito et. al., J. of Virology, vol. 5
4, p711-719, 1985)のSalI部位をSwaIリンカー
(メーカー名)を用いてSwaI部位へ変換しpX2W
を得た。pX2WをEcoRIとSwaIで消化し、ア
ガロースゲル電気泳動で分離した後、目的の6.5kb
のフラグメントを回収した。
【0077】(v)シャロミド(chdRBR7−1
1)の調製 charomid9−11(I. Saito & G. Stark, Proc. Natl.
Acad. Sci. U.S.A., vol. 83, p8664-8668, 1986) のK
pnI、SmaI、BamHIを除くため、charomid9
−11をAsp718とBamHIで消化し、Klen
ow酵素で平滑化後、セルフライゲーションした。これ
を用いて形質転換し、目的のシャロミドを単離し、char
omid6−11と名づけた。charomid6−11のEcoR
I部位へBamHIリンカーを挿入し、得られたシャロ
ミドをchdRBR7−11と名づけた。
【0078】(vi)pAdex1cの調製 pUAF0−17DのBamHI−Bst1107フラ
グメント(2.9kb)とアデノウイルスゲノムのBs
t1107−EcoRIフラグメント(21.6kb)
とpX2WのEcoRI−SwaIフラグメント(6.
5kb)をEcoRIとEcl36Iで消化したchd
RBR7−11とライゲーションした。その後、in vit
roパッケージングし、大腸菌DH5αへ感染させた。形
質転換株から目的のフラグメントをもつものを単離し、
pAdex1cと名づけた。
【0079】 カセットコスミドpAdex1cwの
構築 ClaI(20unit)で切断した後エタノール沈澱
により回収したpAdex1c(1μg)と、5’末端
リン酸化を施した下記の合成リンカー(1)(配列番
号:2)0.01μg(SwaI、ClaI、Sal
I、NruI部位を含む)を混合し、ATP、T4DN
Aリガーゼを含む反応液(最終容量18μl)中で一晩
結合させた。70℃で10分間インキュベートすること
によりリガーゼを熱失活させた後、SwaI(20un
it)を添加し、反応させた。この切断はリンカーが複
数個挿入されたものからSwaI断片を切り出し、リン
カーが1個のみ挿入された構造のコスミドを得るために
行った。次に、反応液をSpun column(Ph
armacia製)にかけ、リンカー由来の小断片を除
去した後、ATP、T4DNAリガーゼを含む反応液
(最終容量18μl)中で一晩結合させ、セルフアニー
リングにより環状化を行った。70℃で10分間インキ
ュベートすることによりリガーゼを熱失活させ、1μl
をイン・ビトロ・パッケージングに用いた。次に、各コ
ロニーから調製したコスミドDNAの構造をBamHI
およびNruI同時消化により確認した。目的とする方
向に挿入された場合483bp、逆方向に挿入された場
合、464bpの断片を生じる。この確認により目的と
するカセットコスミドpAdex1cw(図1)を取得
した。 合成リンカー (1) 5'-CGATTTAAATCGATTGTCGACTCGCGA-3' 3'-TAAATTTAGCTAACAGCTGAGCGCTGC-5'
【0080】 カセットコスミドpAdexlpCA
wの構築 で構築したプラスミドpCMwCH31をHindII
I およびClaIで同時消化し、Klenow酵素によ
り平滑化し、5'末端リン酸化を施したPmeIリンカー
とのリガーゼ反応を行った。70℃で10分間インキュ
ベートすることによりリガーゼを熱失活させた後、Ps
p1406Iを添加し、反応させた。この切断はリンカ
ーが複数個挿入されたものからPsp1406I断片を
切り出し、リンカーがDNA断片の両端にそれぞれ1個
連結した構造の断片を得るために行った。このあと、反
応液をアガロースゲル電気泳動に供し、2.3kbのD
NA断片を含むゲルを切り出し、電気泳動によりゲルか
らDNA断片を回収した。次に、pAdexlcwをC
laIで切断した後、生じた小断片をSpun col
umn(Pharmacia製)により除去した後のD
NA断片1μgと前述の2.3kbのDNA断片0.1
μgをATP、T4DNAリガーゼを含む反応液(最終
容量18μl)中で一晩結合させた。70℃で10分間
インキュベートすることによりリガーゼを熱失活させた
後、これの1/4量にClaIを添加し(最終容量20
μl)、セルフアニーリングにより生じた環状コスミド
を切断した。1μlをイン・ビトロ・パッケージングに
用いた。次に、各コロニーから調製したコスミドDNA
の構造をBamHI及びXhoI同時消化により確認し
た。目的とする方向に挿入された場合483bpと4.
8kb、逆方向に挿入された場合、2.7および2.5
kbの断片を生じる。この確認により目的とするカセッ
トコスミドpAdexlpCAwを取得した。
【0081】 カセットコスミドpAdexlCAw
t(細胞工学、Vol.13、No.8、P759)の構築 SwaI(20unit)で切断した後エタノール沈澱
により回収したpAdexlpCAw(1μg)と、5'
末端リン酸化を施した下記の合成リンカー(2)(配列
番号:3)(0.01μg)(ClaI、XbaI、S
peI、PacI、SwaI、ClaI部位を含む)を
混合し、ATP、T4DNAリガーゼを含む反応液(最
終容量18μl)中で一晩結合させた。70℃で10分
間インキュベートすることによりリガーゼを熱失活させ
た後、PacI(20unit)を添加し、反応させ
た。この切断はリンカーが複数個挿入されたものからP
acI断片を切り出し、リンカーが1個のみ挿入された
構造のコスミドを得るために行った。次に、反応液をS
pun column(Pharmacia製)にか
け、リンカー由来の小断片を除去した後、ATP、T4
DNAリガーゼを含む反応液(最終容量18μl)中で
一晩結合させ、セルフアニーリングによる環状化を行っ
た。70℃で10分間インキュベートすることによりリ
ガーゼを熱失活させた1μlをイン・ビトロ・パッケー
ジングに用いた。次に、各コロニーから調製したコスミ
ドDNAの構造をXbaIおよびXhoI同時消化によ
り確認した。目的とする方向に挿入された場合552b
p、逆方向に挿入された場合、568bpの断片を生じ
る。これを確認することにより目的とするカセットコス
ミドpAdexlCAwt(図2)を取得した。 合成リンカーの構造 (2) 5'-ATCGATTCTAGACTAGTTTAATTAATTTAAATCGAT-3' 3'-TAGCTAAGATCTGATCAAATTAATTAAATTTAGCTA-5'
【0082】実施例2(loxP挿入コスミドの構築) pA60X99Xの作製 pAdexlCAwt(0.5μg)をBamHI(1
5unit)を含む反応系20μl中で切断した後、熱
処理(70℃、15分間)によりBamHIを失活させ
た。次にその1/4量を用いリガーゼ反応buffer
中でATP、T4DNAリガーゼを加え、最終容量20
μlで一晩結合させた。次いでこの反応混液10μlを
用いて大腸菌DH5αを形質転換し、得られた形質転換
体からプラスミドDNAを調製し、目的とするプラスミ
ドpA60X99Xを得た。
【0083】 pA60X99の作製(アデノウイル
ス以外のXbaI部位を除去する) pA60X99X(5μg)をXbaI(10uni
t)を含む反応系50μl中で5分間反応させ、反応混
液をアガロースゲル電気泳動し、2ヶ所のXbaI部位
のうち1ヶ所のみで切断された23.8kbのDNA断
片を含むゲルを切り出し、電気泳動によりゲルからDN
A断片を回収した。次に、この断片0.2μgをKle
now酵素(宝酒造製)5unitを含む反応系50μ
l中で反応させ両末端を平滑化し、さらに、これの1/
5量、ATPおよびT4DNAリガーゼを含む反応液
(最終容量20μl)中で一晩結合させた。次いでこの
反応混液10μlを用いて大腸菌DH5αを形質転換
し、得られた形質転換体からプラスミドDNAを調製し
た。これらのプラスミドDNAをBsrGIおよびXb
aIで同時消化し、6.2kbの断片を生じる、すなわ
ち図1の構造を有するプラスミドpA60X99(図
3)を得た。
【0084】 pA2L60X99の作製(BsrG
I部位へのloxPの挿入) pULL2r(30μg)をXhol(150uni
t)を含む反応系125μl中で切断した後、熱処理
(70℃、15分間)によりXhoIを失活させた。続
いてKlenow酵素(宝酒造製)12unitを含む
反応系中で両末端を平滑化し、その後フェノール:クロ
ロホルム(1:1)処理を施した後、エタノール沈澱し
た。沈澱物を遠心分離により取得し、10mMトリス−
塩酸(pH7.5)に1mMのEDTAを添加した溶液
(TE)60μlに溶解した。次に、これの1/2量と
5’末端リン酸化KpnIリンカー(宝酒造製)0.2
μg、ATPおよびT4DNAリガーゼを含むリガーゼ
反応液(最終容量50μl)中で一晩結合させた。次
に、熱処理(70℃、15分間)によりリガーゼを失活
させた後、Asp718(100unit)を含む反応
系80μl中で消化した。反応混液をアガロースゲル電
気泳動し、loxPを含む64bpのDNA断片を含む
ゲルを切り出し、電気泳動によりゲルからDNA断片を
回収した。
【0085】なお、上記のpULL2rは以下のように
して調製した。pUC119(宝酒造製)を制限酵素E
cl136IIで切断し、アルカリホスファターゼ処理を
施した後、末端にMluI部位およびXhoI部位を有
しこれが連結するとNruI部位を生じるように設計さ
れているloxP配列を含む下記の合成DNA断片(配
列番号:4)とのligation反応を行い該合成DNA断片
が2つ挿入されたプラスミドpULL2rを得た。 5'-CGAACGCGTATAACTTCGTATAGCATACATTATACGAAGTTATCTCGAGTCG-3' 3'-GCTTGCGCATATTGAAGCATATCGTATGTAATATGCTTCAATAGAGCTCAGC-5' (下線部分の配列がloxP部位である。)
【0086】一方、プラスミドpA60X99(10μ
g)をBsrGI(50unit)を含む反応系50μ
l中で切断した後、反応混液をアガロースゲル電気泳動
し、23.8kbのDNA断片を含むゲルを切り出し、
電気泳動によりゲルからDNA断片を回収した。このD
NA断片0.5μgと前述のloxPを含む64bpの
DNA断片0.005μg、ATPおよびT4DNAリ
ガーゼを含むリガーゼ反応液(最終容量25μl)中で
一晩結合させた。これの1/2量に滅菌水、BsrGI
反応bufferを加えて18μlとしてから、70℃
で10分間インキュベートすることによりリガーゼを熱
失活させた。さらに、20unitのBsrGIを加え
(最終容量20μl)37℃で1時間反応させることに
よりセルフアニーリングにより生じた環状のpA60X
99を切断した。次いでこの反応混液10μlを用いて
大腸菌DH5αを形質転換し、得られた形質転換体から
プラスミドDNAを調製した。
【0087】挿入されたloxPの方向を確認するた
め、ApaIとMluIの同時消化を行い、反応混液を
アガロースゲル電気泳動した。目的とする方向に挿入さ
れた場合、366および219bp、逆方向に挿入され
た場合、334および251bpの断片が生じる。ま
た、NruIで消化した場合、目的とする方向に挿入さ
れた場合573bp、逆方向に挿入された場合、533
bpの断片が生じる。さらに、DraIとKpnIで同
時消化した場合、目的とする方向にloxPが1つ挿入
された場合320bp、2つ挿入された場合、384b
pの断片が生じる。これら3種の条件をすべて満たす、
すなわち、目的とする方向にloxPが1つ挿入された
目的のプラスミドpA2L60X99(図4)を取得し
た。
【0088】 pA2L3L6099の作製(Xba
I部位へのloxPの挿入) pULL2r(20μg)をXhoI(100uni
t)を含む反応系100μl中で切断した後、熱処理
(70℃、15分間)によりXhoIを失活させた。続
いてKlenow酵素(宝酒造製)8unitを含む反
応系において両末端を平滑化し、その後フェノール:ク
ロロホルム(1:1)処理を施した後、エタノール沈澱
した。沈澱物を遠心分離により取得し、TE30μlに
溶解した。これの全量と5’末端リン酸化SpeIリン
カー(宝酒造製)0.4μg、ATPおよびT4DNA
リガーゼを含む反応液(最終容量50μl)中で一晩結
合させ、70℃で10分間インキュベートすることによ
りリガーゼを熱失活させた。さらに、SpeI(54u
nit)を加え消化した後、反応混液をアガロースゲル
電気泳動し、loxPを含む64bpのDNA断片を含
むゲルを切り出し、電気泳動によりゲルからDNA断片
を回収した。
【0089】一方、pA2L60X99(10μg)
を、XbaI(100unit)を含む反応系50μl
において切断した後、反応混液をアガロースゲル電気泳
動し、23.8kbのDNA断片を含むゲルを切り出
し、電気泳動によりゲルからDNAを回収した。このD
NA断片0.5μgと前述のloxPを含む64bpの
DNA断片0.005μg、ATPおよびT4DNAリ
ガーゼを含む反応液(最終容量16μl)中で一晩結合
させた。これに5倍希釈したTE14μlを加え、70
℃で10分間インキュベートすることによりリガーゼを
熱失活させた。次いでこれの1/4量に20unitの
XbaIを添加し(最終容量20μl)、セルフアニー
リングにより生じた環状のpA2L60X99を切断し
た。この反応混液10μlを用いて大腸菌DH5αを形
質転換し、得られた形質転換体からプラスミドDNAを
調製した。
【0090】挿入されたloxPの方向を確認するた
め、BglIIとMluIの同時消化を行い、反応混液を
アガロースゲル電気泳動した。目的とする方向に挿入さ
れた場合、366および503bp、逆方向に挿入され
た場合、398および471bpの断片が生じる。ま
た、ApaIとMluIで同時消化した場合、目的とす
る方向に挿入された場合660bp、逆方向に挿入され
た場合、628bpの断片が生じる。EcoNIとMl
uIで消化した場合、目的とする方向に挿入された場合
311bp、逆方向に挿入された場合、343bpの断
片が生じる。さらに、HpaIとSacIで同時消化し
た場合、目的とする方向にloxPが1つ挿入された場
合397bp、2つ挿入された場合、461bpの断片
が生じる。これら4種の条件をすべて満たす、すなわ
ち、目的とする方向にloxPが1つ挿入された目的の
プラスミドpA2L3L6099(図5)を取得した。
【0091】 pAdex2L3LCAwtの作製 pAdex1CAwt(10μg)を、Csp45I
(40unit)を含む反応系100μl中で切断し、
次いで、同反応液中にBamHI(30unit)、さ
らにEcoRI(40unit)を順次添加した。21
kbのDNA断片を含むゲルを切り出し、電気泳動によ
りゲルからDNA断片を回収した。なお、Csp451
およびEcoRIによる切断は21kbのBamHID
NA断片を回収する際、他の断片が混入するのを防ぐた
めである。
【0092】pA2L3L6099(5μg)を、Ba
mHI(30unit)を含む反応系50μl中で切断
した後フェノール:クロロホルム(1:1)処理を施
し、水層をTEで平衡化したSephadexG25に
よりゲル濾過した。回収したDNA断片0.5μgと前
述の21kbのDNA断片0.5μg、ATPおよびT
4DNAリガーゼを含む反応液(最終容量18μl)中
で一晩結合させた。70℃で10分間インキュベートす
ることによりリガーゼを熱失活させた後、1μlをイン
・ビトロ・パッケージングに用いた。
【0093】即ち、ラムダ・イン・ビトロ・パッケージ
ングキットであるギガバックXL(Stratagen
e社製)を1/4スケールで用い、残りは−80℃に凍
結した。ギガバックXLは42kb以下のコスミドのパ
ッケージ効率が低いのでインサートが入って大きくなっ
たコスミドをある程度選択することができる。本実験で
は、10個のコロニーを拾えば大半はインサートを含ん
でおり、目的のクローン(ウイルスゲノムが正しく連結
されたクローン)を容易に得ることができた。コスミド
の扱い方については、常法(斎藤 泉他、実験医学:
7:183-187, 1989)に従って行った。
【0094】パッケージングされたコスミドを大腸菌D
H5α(GibcoBRL)に感染させた。即ち、3枚
のAp+ (アンピシリン添加)寒天プレートと5mlの
Ap+ LB(pool)にそれぞれ1/200量、1/
20量、1/2量、残り全量を接種し、一晩培養した。
poolのminiprepDNAを抽出・調製し、制
限酵素DraI切断によりインサートがはいったものの
割合を調べた。コロニーは丸ごと寒天ごと取り1.5m
lのAp+ LBで、一晩培養し、miniprepDN
Aを調製した。次に、各コロニーから調製したコスミド
DNAの構造をDraI切断により確認した。目的とす
る方向に挿入された場合891bp、逆方向に挿入され
た場合1.4kbの断片を生じる。これにより目的とす
るカセットコスミドpAdex2L3LCAwtを取得
した。
【0095】実施例3 (アデノウイルスDNA−末端蛋白複合体(Ad5 d
lX DNA−TPCおよびAdex1CANLacZ
DNA−TPC)の調製) アデノウイルスDNAとしては、Ad5 dlX
(I. Saito et al., J.Virology, vol.54, 711-719 (19
85))またはAdex1CANLacZを用いる。Ad5
dlXをHeLa細胞(Roux 10本分)にまた
Adex1CANLacZを293細胞にそれぞれ感染
させ、培養を行った。即ち、Ad5−dlXまたはAd
ex1CANLacZのウイルス液(〜109 PFU/
ml)を0.2ml/Roux感染させ、3日後に、は
がれた細胞を遠心分離により集めた。アデノウイルス粒
子のほとんどはメディウム中ではなく細胞の核内にいる
ので感染細胞からウイルスを精製できる利点がある。
(以下の操作は非無菌的に行う。)
【0096】 得られた細胞をTris−HCl(p
H8.0)に懸濁し、密封型ソニケーターを用いて細胞
を破砕し、ウイルスを細胞内から放出させた。 得られた破砕物を遠心分離により沈澱を除いた後、
超遠心分離機 SW28チューブに塩化セシウム溶液
(比重1.43)を入れ、その上に上清を重層し、クッ
ション遠心による濃縮を行った。
【0097】 界面直下のウイルス層をSW50.1
チューブに移した。界面直下のウイルス層は通常目視で
き、ウイルス層とその下層の塩化セシウムを5ml採取
した。同時にもう一本に塩化セシウム溶液(比重1.3
4)を満たした。これらを、35krpm、4℃で一晩
超遠心にかけた。次いで、白いウイルスのバンドを分取
し、既に勾配ができたチューブに乗せ替えた。さらに、
35krpm、4℃4時間以上超遠心にかけた。
【0098】 白いウイルスのバンドを分取し、等量
の8M塩酸グアニジンと室温で混合し、4M塩酸グアニ
ジン飽和塩化セシウムを加えてVTi65チューブに満
たした。4M塩酸グアニジンにより、粒子蛋白は変性を
受けて解離し、DNA−TPCが放出された。
【0099】 上記のチューブを、55krpm、1
5℃で一晩超遠心にかけ、0.2mlずつ分画し、その
1μlずつを1μg/mlのエチジウムブロミド水溶液
20μlと混合し、蛍光染色することによりDNAの有
無を確認する。DNAを含む2〜3フラクションを集め
た。 500mlのTEに一晩透析(2回)し、−80℃
に保存した。こうして得られたAd5dlXおよびAd
ex1CANLacZ DNA−TPCの量をOD260
から通常のDNAと同様に算出した。 得られたAd5dlXおよびAdex1CANLa
cZ DNA−TPCを、第3ステップの組換えアデノ
ウイルス作成のため、充分量のAgeIで2時間切断
し、Sephadex G25カラムでゲル濾過後、−
80℃に保存した。
【0100】なお、DNA−TPCは制限酵素による切
断、透析、ゲル濾過はできるが電気泳動・フェノール処
理・エタノール沈澱はできない。濃縮法は塩化セシウム
平衡遠心しかないのでなるべく濃厚状態に保った。10
Rouxの感染細胞から約300μg程度のDNA−T
PCを得ることができた。 一部を分取し、泳動用BPB bufferを10
μl加えた後に、1μlのプロテイナーゼK(10mg
/ml)を加えて37℃で10分間反応させて末端蛋白
を消化した。フェノール抽出し、上清をアガロースゲル
電気泳動で分離し、完全切断を確認した。AgeI切断
DNA−TPC中の制限酵素bufferを、遠心ゲル
濾過によって除いた後、分注し−80℃に保存した。
【0101】実施例4 (loxP挿入組み換えアデノウイルス(Ad5dlX
2L3LまたはAdex2L3LCANLacZ)の作
製)なお、NLacZは大腸菌LacZ遺伝子のN末端
にSV40の核移行シグナルを付加したものである。 10%FCS添加DMEで培養した293細胞の6
cm、10cmシャーレ各1枚用意した。 発現ユニットを組み込んだloxPを挿入したコス
ミドpAdex2L3LCAwt DNAの8μgとA
geIで切断したAd5dlX DNA−TPCまたは
AgeIで切断したAdex1CANLacZ DNA
−TPCの1μgを混合し、セルフェクト(ファルマシ
ア製)キットを用いて、6cmシャーレ1枚にリン酸カ
ルシウム法でトランスフェクションを行った。6cmシ
ャーレのメディウムの上から混合液を滴下し、培養を続
けた。一晩培養(約16時間)し、午前中に培養液を交
換し、夕方、コラーゲンコート96穴3枚(原液・10
倍希釈・100倍希釈)に、5%FCS添加DMEを用
い、各ウエル当たり0.1mlでまき直した。細胞数が
各プレートで大きく違わないように、希釈2枚分には1
0cmシャーレの293細胞を1/3ずつ混ぜて播い
た。
【0102】 3〜4日後と8〜10日後に、各ウエ
ルに50μlの10%FCS添加DMEを加えた。29
3細胞がやせてきたら早めに加えた。ウイルスが増殖し
細胞が死滅したウエルが7〜20日の間に現れた。ウエ
ルの細胞が完全に死滅するごとに滅菌パスツールピペッ
トで培養液(死細胞ごと)を滅菌した1.5mlチュー
ブに無菌的に移して、ドライアイスで急凍して−80℃
に保存した。 15〜25日で判定は終了した。比較的遅く細胞が
死んだウエルから回収した培養液チューブを約10個選
び、超音波破砕後、5000rpm10分遠心分離して
得られた上清を1次ウイルス液(first seed)として−
80℃に保存した。早めにウイルス増殖が起こったウエ
ルは複数のウイルス株の混合感染の可能性が高いからで
ある。
【0103】 24穴プレートに293細胞を用意
し、5%FCS−DME(0.4ml/ウエル)と1次
ウイルス液10μlをそれぞれ2ウエルずつ添加した。 約3日で細胞が完全に死滅したら、1ウエルは1次
ウイルス液作製と同様に超音波破砕と遠心分離で上清を
得、これを2次ウイルス液(second seed) として−80
℃に保存した。他の1ウエルの死滅した細胞を5000
rpmで5分間遠心し、上清を捨てて細胞だけを−80
℃に保存した(セルパック)。10種類のウイルス株の
セルパックが集まったら以下の方法で感染細胞の全DN
Aを抽出した。セルパックには、400μlのcell DNA
用TNE (50mM Tris-HCl pH7.5, 100mM NaCl, 10mM EDT
A)、4μlのproteinaseK (10mg/ml) および4μlの10
%SDSを加えた。
【0104】 50℃で1時間処理した後、フェノー
ル・クロロホルム抽出2回、クロロホルム抽出2回、つ
いでエタノール沈澱により得られた核酸をRNaseを
20μg/ml含む50μlのTEに溶かした。その1
5μlを発現ユニットを切断する酵素の中で認識配列に
CGを含む酵素であるXhoIで切断し、発現コスミド
カセットのXhoI切断と共に、15cm位の長さのア
ガロースゲルで一晩電気泳動を行い、パターンを比較し
た。XhoIは挿入したloxP配列内に認識部位があ
るので、loxPが2個挿入された切断パターンを示す
クローンを選択する。説明できないバンドが薄く見える
クローンは、欠失のあるウイルスとの混合の可能性があ
るので廃棄した。
【0105】実施例5 (E2A遺伝子欠損アデノウイルスの作製と構造確認)
組み換えアデノウイルスAdex2L3LCANLac
ZおよびAdex1CANCreをそれぞれmoi=1
0および3で293細胞に感染させ、培養を行った。な
お、NCreは、NLacZと同様、SV40の核移行
シグナルをCreのN末端に付加したものである。4日
目に細胞を回収し、前述の方法によりDNAを調製し
た。loxPで挟まれた領域(E2A遺伝子を含む)が
切り出された構造を有するAdexd123CANLa
cZの生成を2つの方法で確認した。
【0106】1.SmaI消化 SmaI消化の後、ゲル電気泳動した結果、loxPで
挟まれた領域が切り出されて生じる4.7kbの断片が
認められた。このバンドとAdex2L3LCANLa
cZ、Adex1CANCre、およびAdexd12
3CANLacZにおいて共通して見られる4.45k
bのバンドの濃さの比較から、回収した組換えアデノウ
イルス中の約30%がAdexd123CANLacZ
であることが分かった。
【0107】2.PCRによる確認 調製したDNA0.1ngをテンプレートとし、下記の
条件でPCRを行い、生成物をアガロースゲル電気泳動
により分析した。用いたプライマーは、下記に示すオリ
ゴヌクレオチド(1)(配列番号:5)、オリゴヌクレ
オチド(2)(配列番号:6)、オリゴヌクレオチド
(3)(配列番号:7)およびオリゴヌクレオチド
(4)(配列番号:8)である。 (1) 5'−CAACTCCATGCTCAACAGTCC
CCAGGTACA−3' (2) 5'−GATTTTTAAACGGCGCAGACG
GCAAG−3' (3) 5'−GTGAGCTTAGAAAACCCTTAG
−3' (4) 5'−AGATACCCCTTTTGCACTGGT
GCAAGTTAAC−3' PCR反応液組成(総容量20μl) Tris・HCl(pH8.3) 10 mM KCl 50 mM MgCl2 1.5mM dNTP mixture 0.2mM プライマー 各0.2μM テンプレートDNA 0.1ng Taq polymerase 0.5unit PCR反応条件 二本鎖解離 : 95℃ 1.5分 アニーリング: 64℃ 1.0分 伸長反応 : 70℃ 1.0分 反応サイクル: 30回 その結果を図6に示す。プライマーとして(1)と
(4)を用いた場合、393bpと推定されるバンドが
検出され、E2A遺伝子が欠失したAdexd123C
ANLacZの存在が明らかとなった(図6、レーン
1)。また、(2)と(3)を用いた場合、221bp
と推定されるバンドが検出され、Cre遺伝子産物によ
り切り出された環状のE2A遺伝子の存在が裏付けられ
た(図6、レーン2)。以上、1および2の結果から、
Adex2L3LCANLacZからloxPではさま
れた領域(E2A遺伝子を含む)が除去されたAdex
d123CANLacZの生成が明らかになった。
【0108】参考例1 <リコンビナーゼCre遺伝子およびCAGプロモータ
ーを有する組換えアデノウイルスベクターの作製> (1)リコンビナーゼCre遺伝子発現用カセットコス
ミドの作製 リコンビナーゼCre遺伝子を含む大腸菌ファージ
P1DNA(ATCC11303−B23)をテンプレ
ートとし、5’−プライマーとして下記の(配列番号:
9)のオリゴヌクレオチドを、3’−プライマーとして
下記の(配列番号:10)のオリゴヌクレオチドを、耐
熱性ポリメラーゼとしてNEB社製のVentR を用
い、以下の条件でPCR反応を行い、生成物をアガロー
スゲル電気泳動にかけ、約1kbのバンドを切り出し、
リコンビナーゼCre遺伝子を含む約1kbのDNA断
片を得た。 5'-CGT CTGCAG TGCA TCATGA GTAATTTACTGACCGTACACCAAAATTTGCCTGC-3' PstI BspHI 3'-GACCTTCTACCGCTAATCGGTAAT TCGCGAGATCT CGG-5' Aor51HI;XbaI (下線部分は、制限酵素の認識部位である。)
【0109】PCR反応条件 緩衝液: 10mMのKCl、20mMのTris−H
Cl(pH8.8)、10mMの(NH4 2 SO4
2mMのMgSO4 、0.1%のTriton X−1
00(NEB社添付の緩衝液を使用) 耐熱性ポリメラーゼ: 2ユニット dNTP: 400μM プライマー: 1μM P1ファージDNA: 1ng 2本鎖解離温度: 95℃ 1.5分間 アニーリング温度: 60℃ 1.5分間 伸長反応温度: 74℃ 2.0分間 反応サイクル: 20回
【0110】この断片およびpUC19(宝酒造製)を
それぞれ制限酵素PstI(宝酒造製)およびXbaI
(宝酒造製)により同時消化したのち、回収し、モル比
が約3:1になるように混合し、T4DNAリガーゼ
(宝酒造製)を用いてligation反応を行った。さらに、
この反応混液を用いて大腸菌JM109株(ATCC5
3323)を形質転換した。アンピシリン(100μg
/ml)を添加したLB寒天プレートから形質転換株を
拾い、リコンビナーゼCre遺伝子を含むプラスミドp
UCCreを得た。
【0111】次に、CAGプロモーターを含むカセット
コスミドpAdex1CAwtをSwaIで切断したも
の1μgと、pUCCreをPstIおよびXbaIに
より同時消化し、さらにKlenow酵素(宝酒造製)
により両端を平滑化して得た約1kbの断片0.1μg
とを混合した。
【0112】 次に、混合液にエタノールを加えてコ
スミドを沈澱させた。沈澱物を遠心分離により取得し、
10mMトリス−塩酸(pH7.5)に1mMのEDT
Aを添加した溶液(TE)の5倍希釈液に溶解した。 得られたコスミドをリガーゼ反応buffer中で
ATP,T4DNAリガーゼを加え、最終容量7μlで
一晩結合させた。ついで滅菌水、SwaI反応buff
erを加えて48μlとしてから70℃10分でリガー
ゼを熱失活させた。この際、プラズミドと異なり、コス
ミドでは、環状ではなく直鎖状タンデムに結合した巨大
分子が効率よくパッケージされる。
【0113】 2μlのSwaI(Boehring
er製)を加え、25℃で1時間切断した。SwaI切
断を行う意味は、カセットコスミドが発現ユニットをく
わえ込むことなく再結合するとSwal認識配列が再生
されるため、このステップで発現ユニットの組み込まれ
ていないコスミドを再切断し、コロニーを作らなくする
ためである。この方法はインサートをもつカセットコス
ミドだけを選択する強力な方法である。 常法(Molecular Cloning vol.3 E.34)に従い、カ
セットコスミドのフェノール抽出、遠心分離、ついでゲ
ル濾過を行った。 再度、Swal切断を行った。即ち、SwaI反応
buffer中、5μlのSwaIを加え、25℃で2
時間切断した。その理由は上記の通りである。
【0114】 得られたコスミドの1μlについてイ
ン・ビトロ・パッケージングを行った。即ち、ラムダ・
イン・ビトロ・パッケージングキットであるギガバック
XL(Stratagene製)を1/4スケールで用
い、残りは−80℃に凍結した。ギガバックXLは42
kb以下のコスミドのパッケージ効率が低いのでインサ
ートが入って大きくなったコスミドをある程度選択する
ことができる。本実験では、10個のコロニーを拾えば
大半はインサートを含んでおり、目的の向き(左向き)
のクローンを容易に得ることができた。コスミドの扱い
方については、常法(斎藤 泉他、実験医学:7:183-
187, 1989)に従って行った。
【0115】 パッケージングされたコスミドを大腸
菌DH1(ATCC33849)に感染させた。即ち、
3枚のAp+ (アンピシリン添加)寒天プレートと5m
lのAp+ LB(pool)にそれぞれ1/200量、
1/20量、1/2量、残り全量を接種し、一晩培養し
た。poolのminiprepDNAを抽出・調製
し、全酵素切断によりインサートが入ったものの割合を
調べた。コロニーは丸ごと寒天ごと取り1.5mlのA
+ LBで、一晩培養し、miniprepDNAを調
製した。 次に、制限酵素切断により、発現ユニットの向きと
構造を確認した。なお、NruIとリガーゼを用いて、
発現単位を含むが大部分のアデノウイルスDNAを欠失
したプラスミドを作製し、DNAを調製して、cDNA
クローン化の最終確認をした。
【0116】(2)アデノウイルスDNA−末端蛋白複
合体(Ad5 dlX DNA−TPC)の調製 アデノウイルスDNAとしては、Ad5 dlX
(I. Saito et al., J.Virology, vol.54, 711-719 (19
85))を用いた。Ad5 dlXを293細胞(Roux
10本分)に感染させ、培養を行った。即ち、Ad5
−dlXのウイルス液(〜109 PFU/ml)を0.
2ml/Roux感染させ、3日後に、はがれた細胞を
1500rpm、5分にて遠心分離して集めた。アデノ
ウイルス粒子のほとんどはメディウム中ではなく細胞の
核内にいるので感染細胞からウイルスを精製できる利点
がある。(以下の操作は非無菌的に行った。)
【0117】 得られた細胞を10mMのTris−
HCl(pH8.0)の20mlに懸濁し、密封型ソニ
ケーターを用い、200W、2分(30秒×4)で細胞
を破砕し、ウイルスを細胞内から放出させた。ウイルス
を細胞内から放出させるには5ml以下なら凍結融解5
回でもよいが、それ以上の容量ではソニケーターが便利
である。ただし、必ず密封型(専用カップのあるもの)
を用いる。通常の投げ込み型は、たとえ安全キャビネッ
トの中でも危険性がある。
【0118】 得られた破砕物を遠心分離(10kr
pm、10分)により沈澱を除いた後、超遠心機 SW
28チューブに15mlの塩化セシウム溶液(比重1.
43)を入れ、その上に上清を重層し、クッション遠心
(25krpm、1時間、4℃)による濃縮を行った。 界面直下のウイルス層をSW50.1チューブに移
した。界面直下のウイルス層は通常目視でき、ウイルス
層とその下層の塩化セシウムを5ml採取した。同時に
もう一本に塩化セシウム溶液(比重1.34)を満たし
た。これらを、35krpm、4℃で一晩超遠心にかけ
た。次いで、白いウイルスのバンドを分取し、既に勾配
ができたチューブに乗せ替えた。さらに、35krp
m、4℃4時間以上超遠心にかけた。
【0119】 白いウイルスのバンドを分取し、等量
の8M塩酸グアニジンと室温で混合し、4M塩酸グアニ
ジン飽和塩化セシウムを加えてVTi65チューブに満
たした。4M塩酸グアニジンにより、粒子蛋白は変性を
受けて解離し、DNA−TPCが放出された。エチジウ
ムブロミドは後で除く方法が確立されていないため利用
できなかった。
【0120】 上記のチューブを、55krpm、1
5℃で一晩超遠心にかけ、0.2mlずつ分画し、その
1μlずつを1μg/mlのエチジウムブロミド水溶液
20μlと混合し、蛍光染色することによりDNAの有
無を確認した。DNAを含む2〜3フラクションを集め
た。 500mlのTEに一晩透析(2回)し、−80℃
に保存した。こうして得られたAd5dlX DNA−
TPCの量をOD260 から通常のDNAと同様に算出し
た。
【0121】 得られたAd5d1X DNA−TP
Cを、第3ステップの組換えアデノウイルス作成のた
め、充分量のEcoT22Iで2時間切断した後、−8
0℃に保存した。
【0122】なお、DNA−TPCは制限酵素による切
断、透析、ゲル濾過はできるが電気泳動・フェノール処
理・エタノール沈澱はできなかった。濃縮法は塩化セシ
ウム平衡遠心しかないのでなるべく濃厚状態に保った。
10Rouxの感染細胞から約300μg程度のDNA
−TPCを得ることができた。 一部を分取し、泳動用BPB bufferを10
μl加えた後に、1μlのプロテイナーゼK(10mg
/ml)を加えて37℃で10分間反応させて末端蛋白
を消化した。フェノール抽出し、上清をアガロースゲル
電気泳動で分離し、完全切断を確認した。EcoT22
I切断DNA−TPC中の制限酵素bufferを、遠
心ゲル濾過によって除いた後、分注し−80℃に保存し
た。
【0123】(3)組換えウイルスの分離と高力価ウイ
ルス液の作製 10%FCS添加DMEで培養した293細胞の6
cm、10cmシャーレ各1枚用意した。 発現ユニットを組み込んだpAdex1w DNA
の8μg(3〜9μgが適当である)とEcoT22I
で切断したAd5dlX DNA−TPCの1μgを混
合し、セルフェクト(ファルマシア製)キットを用い
て、6cmシャーレ1枚にリン酸カルシウム法でトラン
スフェクションを行った。6cmシャーレのメディウム
の上から混合液を滴下し、培養を続けた。一晩培養(約
16時間)し、午前中に培養液を交換し、夕方、コラー
ゲンコート96穴3枚(原液・10倍希釈・100倍希
釈)に、5%FCS添加DMEを用い、各ウエル当たり
0.1mlでまき直した。細胞数が各プレートで大きく
違わないように、希釈2枚分には10cmシャーレの2
93細胞を1/3ずつ混ぜて播いた。
【0124】 3〜4日後と8〜10日後に、各ウエ
ルに50μlの5%FCS添加DMEを加えた。293
細胞がやせてきたら早めに加えた。ウイルスが増殖し細
胞が死滅したウエルが7〜15日の間に現れた。ウエル
の細胞が完全に死滅するごとに滅菌パスツールピペット
で培養液(死細胞ごと)を滅菌した1.5mlチューブ
に無菌的に移して、ドライアイスで急凍して−80℃に
保存した。 15〜18日で判定は終了した。比較的遅く細胞が
死んだウエルから回収した培養液チューブを約10個選
び、凍結融解6回後、5krpm10分遠心して得られ
た上清を1次ウイルス液(first seed)として−80℃
に保存した。早めにウイルス増殖が起こったウエルは複
数のウイルス株の混合感染の可能性が高いからである。
【0125】 24穴プレートに293細胞を用意
し、5%FCS−DME(0.4ml/ウエル)と1次
ウイルス液10μlをそれぞれ2ウエルずつ添加した。 約3日で細胞が完全に死滅したら、1ウエルは1次
ウイルス液作製と同様に6回の凍結融解と遠心で上清を
得、これを2次ウイルス液(second seed) として−80
℃に保存した。2次ウイルス液の力価は107 〜108
PFU/ml程度であった。他の1ウエルの死滅した細
胞を5krpmで5分間遠心し、上清を捨てて細胞だけ
を−80℃に保存した(セルパック)。10種類のウイ
ルス株のセルパックが集まったら以下の方法で感染細胞
の全DNAを抽出した。セルパックには、400μlの
cell DNA用TNE (50mM Tris-HCl pH7.5, 100mM NaCl, 10
mMEDTA)、4μlのproteinaseK (10mg/ml) および4μ
lの10%SDSを加えた。
【0126】 50℃で1時間処理した後、フェノー
ル・クロロホルム抽出2回、クロロホルム抽出2回、つ
いでエタノール沈澱により得られた核酸をRNaseを
20μg/ml含む50μlのTEに溶かした。その1
5μlを発現ユニットを切断する酵素の中で認識配列に
CGを含む酵素であるXhoIで切断し、発現コスミド
カセットのXhoI切断と共に、15cm位の長さのア
ガロースゲルで一晩電気泳動を行い、パターンを比較し
た。発現ユニット内の切断点からアデノウイルスゲノム
の左端までのバンドが正確に出現しているものを選択し
た。また、説明できないバンドが薄く見えるクローン
は、欠失のあるウイルスとの混合の可能性があるので廃
棄した。アデノウイルスDNAは細胞あたり10,00
0コピーに増殖するので、細胞DNAと一緒に全DNA
を抽出し制限酵素切断によりウイルスDNAのバンドを
みることができる。Xholなどのように認識配列にC
Gを含む酵素は、細胞DNAを切断しないので、パター
ンが見やすい。これ以外の酵素を用いるときは、非感染
293細胞DNAをコントロールにおくことが必要であ
った。(ヒト細胞の反復配列由来のバンドが出現し
た)。
【0127】 Xhol切断で同定された目的のウイ
ルス株の2次ウイルス液の0.1mlを、コラーゲンコ
ートした150cm2 ボトル(培地は25ml)の29
3細胞へ感染させた。3日後に細胞が死滅したら、死細
胞ごと25mlの培地を無菌的に密閉型ソニケーター2
00w最高出力2分(30秒×4回)で破砕してウイル
スを遊離させた。3krpm、4℃で10分間遠心して
沈澱を除去し、5ml凍結用チューブに2mlずつ13
本に分注し、ドライアイスで急凍して−80℃に保存
し、3次ウイルス液を調製した。3次ウイルス液は本発
明の組換えアデノウイルスを含む液であり、109 PF
U/ml程度の高力価のものであった。なお、3次ウイ
ルス液5μlを24穴プレートの293細胞1ウエルに
感染し、増殖したウイルスDNAの酵素切断パターンを
上記の方法で確認した。もし、欠失ウイルスあるいは親
ウイルスとの混合物であることが疑われたら、2次ウイ
ルス液の段階で既にわずかに混在していた欠失ウイルス
が増殖が早いため見えてきた可能性があるので、全ての
3次シードを廃棄して、別の2次ウイルス液から改めて
やり直すか、その1次ウイルス液から限界希釈法によ
り、目的のウイルスを純化した。
【0128】
【発明の効果】本発明により、広範な動物細胞に外来遺
伝子を安定な形で導入することのできる組換えDNAウ
イルスを提供することができる。また、本発明はこの組
換えDNAウイルスの簡易な製造方法を提供する。特
に、本発明の組換えアデノウイルスは遺伝病の治療に有
用である。
【0129】
【配列表】
配列番号:1 配列の長さ:34 配列の型:核酸 鎖の数:二本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:Genomic DNA ハイポセティカル配列:NO アンチセンス:NO 起源:大腸菌ファージP1DNA 配列の特徴 特徴を決定した方法:S 配列 ATAACTTCGT ATAGCATACA TTATACGAAG TTAT 34
【0130】配列番号:2 配列の長さ:27 配列の型:核酸 鎖の数:二本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸(合成された任意のDNA) ハイポセティカル配列:YES アンチセンス:NO 配列の特徴 特徴を決定した方法:S 配列 CGATTTAAAT CGATTGTCGA CTCGCGA 27
【0131】配列番号:3 配列の長さ:36 配列の型:核酸 鎖の数:二本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸(合成された任意のDNA) ハイポセティカル配列:YES アンチセンス:NO 配列の特徴 特徴を決定した方法:S 配列 ATCGATTCTA GACTAGTTTA ATTAATTTAA ATCGAT 36
【0132】配列番号:4 配列の長さ:52 配列の型:核酸 鎖の数:二本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸(一部Genomic DNA を含む任意の
DNA) ハイポセティカル配列:YES アンチセンス:NO 起源:大腸菌ファージP1DNA 配列の特徴 特徴を決定した方法:S 配列 CGAACGCGTA TAACTTCGTA TAGCATACAT TATACGAAGT TATCTCGAGT CG 52
【0133】配列番号:5 配列の長さ:30 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸(一部Genomic DNA を含む任意の
DNA) ハイポセティカル配列:YES アンチセンス:NO 配列の特徴 特徴を決定した方法:S 配列 CAACTCCATG CTCAACAGTC CCCAGGTACA 30
【0134】配列番号:6 配列の長さ:26 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸(一部Genomic DNA を含む任意の
DNA) ハイポセティカル配列:YES アンチセンス:NO 配列の特徴 特徴を決定した方法:S 配列 GATTTTTAAA CGGCGCAGAC GGCAAG 26
【0135】配列番号:7 配列の長さ:21 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸(一部Genomic DNA を含む任意の
DNA) ハイポセティカル配列:YES アンチセンス:NO 配列の特徴 特徴を決定した方法:S 配列 GTGAGCTTAG AAAACCCTTA G 21
【0136】配列番号:8 配列の長さ:31 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸(一部Genomic DNA を含む任意の
DNA) ハイポセティカル配列:YES アンチセンス:NO 配列の特徴 特徴を決定した方法:S 配列 AGATACCCCT TTTGCACTGG TGCAAGTTAA C 31
【0137】配列番号:9 配列の長さ:53 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸(一部Genomic DNA を含む任意の
DNA) ハイポセティカル配列:YES アンチセンス:NO 起源:大腸菌ファージP1DNA 配列の特徴 特徴を決定した方法:S 配列 CGTCTGCAGT GCATCATGAG TAATTTACTG ACCGTACACC AAAATTTGCC TGC 53
【0138】配列番号:10 配列の長さ:38 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸(一部Genomic DNA を含む任意の
DNA) ハイポセティカル配列:YES アンチセンス:NO 起源:大腸菌ファージP1DNA 配列の特徴 特徴を決定した方法:S 配列 GGCTCTAGAG CGCTTAATGG CTAATCGCCA TCTTCCAG 38
【0139】配列番号:11 配列の長さ:119 配列の型:核酸 鎖の数:二本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸(一部Genomic DNA を含む任意の
DNA) ハイポセティカル配列:YES アンチセンス:NO 起源:大腸菌ファージP1DNA 配列の特徴 特徴を決定した方法:S 配列 CATGTAATTT AAATCTCGAG ATAACTTCGT ATAATGTATG CTATACGAAG TTATACGCGT 60 ATTTAAATGT AAAAATAATG TACTAGAGAC ACTTTCAATA AAGGCAAATG CTTTTATTT 119
【0140】配列番号:12 配列の長さ:115 配列の型:核酸 鎖の数:二本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸(一部Genomic DNA を含む任意の
DNA) ハイポセティカル配列:YES アンチセンス:NO 起源:大腸菌ファージP1DNA 配列の特徴 特徴を決定した方法:S 配列 GTACACTCTC GGGTGATTAT TTACCCCCAC CCTTGCCGTC TGCGCCGATT TAAATCTCGA 60 GATAACTTCG TATAATGTAT GCTATACGAA GTTATACGCG TATTTAAATC CGTTT 115
【図面の簡単な説明】
【図1】図1は、コスミドpAdex1cwの構造を示
す概念図である。
【図2】図2は、コスミドpAdex1CAwtの構造
を示す概念図である。
【図3】図3は、プラスミドpA60X99の構造を示
す概念図である。
【図4】図4は、プラスミドpA2L60X99の構造
を示す概念図である。
【図5】図5は、プラスミドpA2L3L6099の構
造を示す概念図である。
【図6】図6は、組換えアデノウイルスAdex2L3
LCANLacZおよびAdex1CANCreを29
3細胞に共感染させた後に回収した細胞からDNAを抽
出し、これをテンプレートとしてPCRを行った結果を
示す図である。レーン1はプライマー(1)と(4)を
用いた場合、レーン2はプライマー(2)と(3)を用
いた場合の電気泳動図をそれぞれ示す。

Claims (36)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】 外来遺伝子および外来遺伝子の発現を制
    御するプロモーターを有する、E2A遺伝子の機能が完
    全に欠失した、動物細胞感染用の組換えDNAウイル
    ス。
  2. 【請求項2】 DNAウイルスがアデノウイルスである
    請求項1記載の組換えDNAウイルス。
  3. 【請求項3】 E2A遺伝子領域の一部または全部を欠
    失した請求項1または請求項2記載の組換えDNAウイ
    ルス。
  4. 【請求項4】 外来遺伝子および外来遺伝子の発現を制
    御するプロモーターが左向きに組み込まれていることを
    特徴とする請求項1ないし請求項3いずれか1項記載の
    組換えDNAウイルス。
  5. 【請求項5】 アデノウイルスゲノムがE1A遺伝子領
    域を含む1.3〜9.3%断片を欠失していることを特
    徴とする請求項2ないし請求項4いずれか1項記載の組
    換えDNAウイルス。
  6. 【請求項6】 E1A遺伝子領域の欠失部位に外来遺伝
    子および外来遺伝子の発現を制御するプロモーターが挿
    入されていることを特徴とする請求項5記載の組換えD
    NAウイルス。
  7. 【請求項7】 アデノウイルスゲノムがさらにE3遺伝
    子領域を含む79.6〜84.8%断片を欠失している
    ことを特徴とする請求項6記載の組換えDNAウイル
    ス。
  8. 【請求項8】 外来遺伝子の発現を制御するプロモータ
    ーが、サイトメガロウイルスエンハンサー、ニワトリβ
    −アクチンプロモーター、ウサギβグロビンのスプライ
    シングアクセプターおよびポリA配列からなるハイブリ
    ッドプロモーター(CAGプロモーター)であることを
    特徴とする請求項1ないし請求項7いずれか1項記載の
    組換えDNAウイルス。
  9. 【請求項9】 E2A遺伝子領域の両側に位置する同方
    向を向いた二つのリコンビナーゼ認識配列を有する動物
    細胞感染用の組換えDNAウイルス。
  10. 【請求項10】 DNAウイルスがアデノウイルスであ
    る請求項9記載の組換えDNAウイルス。
  11. 【請求項11】 二つのリコンビナーゼ認識配列の挿入
    部位の一方が、E2A遺伝子の終止コドンとL3遺伝子
    の終止コドンの間であって、両遺伝子のポリA付加シグ
    ナルの機能を欠失しない範囲であることを特徴とする請
    求項9又は10記載の組換えDNAウイルス。
  12. 【請求項12】 もう一方のリコンビナーゼ認識配列の
    挿入部位が、アデノウイルスゲノムの79.6〜84.
    4%の範囲であることを特徴とする請求項11記載の組
    換えDNAウイルス。
  13. 【請求項13】 リコンビナーゼが大腸菌P1ファージ
    由来のリコンビナーゼCreである請求項9ないし請求
    項12いずれか記載の組換えDNAウイルス。
  14. 【請求項14】 リコンビナーゼ認識配列がリコンビナ
    ーゼCreの基質となる下記loxPのDNA配列(配
    列番号:1) 5'-ATAACTTCGTATAGCATACATTATACGAAGTTAT-3' 3'-TATTGAAGCATATCGTATGTAATATGCTTCAATA-5' である請求項9ないし請求項13いずれか1項記載の組
    換えDNAウイルス。
  15. 【請求項15】 外来遺伝子を有することを特徴とする
    請求項9ないし請求項14いずれか1項記載の組換えD
    NAウイルス。
  16. 【請求項16】 外来遺伝子の発現を制御するプロモー
    ターを有することを特徴とする請求項15記載の組換え
    DNAウイルス。
  17. 【請求項17】 外来遺伝子および外来遺伝子の発現を
    制御するプロモーターが左向きに組み込まれていること
    を特徴とする請求項16記載の組換えDNAウイルス。
  18. 【請求項18】 アデノウイルスゲノムがE1A遺伝子
    領域を含む1.3〜9.3%断片を欠失していることを
    特徴とする請求項10ないし請求項17いずれか1項記
    載の組換えDNAウイルス。
  19. 【請求項19】 E1A遺伝子領域の欠失部位に外来遺
    伝子および外来遺伝子の発現を制御するプロモーターが
    挿入されていることを特徴とする請求項18記載の組換
    えDNAウイルス。
  20. 【請求項20】 アデノウイルスゲノムがさらにE3遺
    伝子領域を含む79.6〜84.8%断片を欠失してい
    ることを特徴とする請求項19記載の組換えDNAウイ
    ルス。
  21. 【請求項21】 外来遺伝子の発現を制御するプロモー
    ターが、サイトメガロウイルスエンハンサー、ニワトリ
    β−アクチンプロモーター、ウサギβグロビンのスプラ
    イシングアクセプターおよびポリA配列からなるハイブ
    リッドプロモーター(CAGプロモーター)であること
    を特徴とする請求項16ないし請求項20いずれか1項
    記載の組換えDNAウイルス。
  22. 【請求項22】 プロモーター、リコンビナーゼ遺伝子
    およびポリA配列を組み込んだベクター(a)と、E2
    A遺伝子領域の両側に位置する同方向を向いた2つのリ
    コンビナーゼ認識配列を有する組換えDNAウイルス
    (b)とを、動物細胞株へ導入し、2つのリコンビナー
    ゼ認識配列間に存するE2A遺伝子領域を切除すること
    からなる、E2A遺伝子の機能が完全に欠失した組換え
    DNAウイルスの製造方法。
  23. 【請求項23】 DNAウイルス(b)がアデノウイル
    スである請求項22記載の組換えDNAウイルスの製造
    方法。
  24. 【請求項24】 さらにベクター(a)がアデノウイル
    スである請求項23記載の組換えDNAウイルスの製造
    方法。
  25. 【請求項25】 2つのリコンビナーゼ認識配列の挿入
    部位の一方が、E2A遺伝子の終止コドンとL3遺伝子
    の終止コドンの間であって、両遺伝子のポリA付加シグ
    ナルの機能を欠失しない範囲であることを特徴とする請
    求項22ないし請求項24いずれか1項記載の組換えD
    NAウイルスの製造方法。
  26. 【請求項26】 リコンビナーゼが大腸菌P1ファージ
    由来のリコンビナーゼCreである請求項22ないし請
    求項25いずれか1項記載の組換えDNAウイルスの製
    造方法。
  27. 【請求項27】 リコンビナーゼ認識配列がリコンビナ
    ーゼCreの基質となるloxPのDNA配列(配列番
    号:1)である請求項22ないし請求項26いずれか1
    項記載の組換えDNAウイルスの製造方法。
  28. 【請求項28】 DNAウイルス(b)が外来遺伝子を
    有することを特徴とする請求項22ないし請求項27い
    ずれか1項記載の組換えDNAウイルスの製造方法。
  29. 【請求項29】 DNAウイルス(b)がさらに外来遺
    伝子の発現を制御するプロモーターを有することを特徴
    とする請求項28記載の組換えDNAウイルスの製造方
    法。
  30. 【請求項30】 外来遺伝子および外来遺伝子の発現を
    制御するプロモーターが左向きに組み込まれていること
    を特徴とする請求項29記載の組換えDNAウイルスの
    製造方法。
  31. 【請求項31】 ベクター(a)およびDNAウイルス
    (b)のアデノウイルスゲノムがE1A遺伝子領域を含
    む1.3〜9.3%断片を欠失していることを特徴とす
    る請求項24ないし請求項30いずれか1項記載の組換
    えDNAウイルスの製造方法。
  32. 【請求項32】 DNAウイルス(b)のE1A遺伝子
    領域の欠失している部位に、外来遺伝子および外来遺伝
    子の発現を制御するプロモーターが挿入されていること
    を特徴とする請求項31記載の組換えDNAウイルスの
    製造方法。
  33. 【請求項33】 DNAウイルス(b)のアデノウイル
    スゲノムがさらにE3遺伝子領域を含む79.6〜8
    4.8%断片を欠失していることを特徴とする請求項3
    2記載の組換えDNAウイルスの製造方法。
  34. 【請求項34】 外来遺伝子の発現を制御するプロモー
    ターが、サイトメガロウイルスエンハンサー、ニワトリ
    β−アクチンプロモーター、ウサギβグロビンのスプラ
    イシングアクセプターおよびポリA配列からなるハイブ
    リッドプロモーター(CAGプロモーター)であること
    を特徴とする請求項29ないし請求項33いずれか1項
    記載の組換えDNAウイルスの製造方法。
  35. 【請求項35】 ベクター(a)およびDNAウイルス
    (b)のE1A遺伝子の機能が欠失され、動物細胞株が
    E1A遺伝子を発現している動物細胞株である、請求項
    22記載の組換えDNAウイルスの製造方法。
  36. 【請求項36】 E2A遺伝子の終止コドンとL3遺伝
    子の終止コドンの間に、外来遺伝子が挿入されたことを
    特徴とする動物細胞感染用の組換えアデノウイルス。
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