JP7521729B2 - Cd3結合抗体 - Google Patents
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Description
本出願は、2016年9月14日に出願された米国仮特許出願第62/394,360号、及び2017年4月28日に提出された米国仮特許出願第62/491,908号の利益を主張し、これらの出願は、その全体が本明細書に参考として援用される。
身体の免疫システムは、感染、傷害及びがんに対する防御の役割を果たす。2つの別々ではあるが、相互に関連したシステムである、体液性免疫システムと細胞性免疫システムは、身体を保護するために一緒に働く。体液性システムは、抗体と呼ばれる可溶性因子によって媒介され、体内で異物として認識される生成物を中和する。対照的に、細胞性システムは、外来の侵入物を除去し中和するT細胞及びマクロファージなどの細胞を含む。
:251-6;Durben et al. Molecular Therapy(2
015);23 4, 648-655を参照されたい。結果として生じるサイトカイン
放出症候群のために、治療目的のためにこれらの抗体の開発に重要なブロックとなっていた。
63-569)。多くのT細胞アゴニストの重大な副作用を考慮すると、炎症誘発性サイトカインの放出を減少させながら、強力な抗腫瘍効果を維持することが好ましい場合もある。しかしながら、部分アゴニスト抗CD3抗体は、CD3ε鎖を最適以下に変化させて無効なシグナル伝達をもたらし、ほとんどの抗CD3抗体は、両方の経路に対して完全アゴニストである。これらのエフェクター機能を分離できるかどうかは不明である。多くの既存の抗CD3抗体(例えば、SP-34、UCHT1、OKT3)は、1~50nM KDの範囲で親和性を有するが、これは、治療的使用には最適ではないかもしれない。
CD3抗体は、例えば、米国特許第5,585,097号、5,929,212号、5,968,509号、6,706,265号、6,750,325号、7,381,803号、7,728,114号に開示されている。CD3結合特異性を有する二重特異性抗体は、例えば、米国特許第7,262,276号、7,635,472号、7,862,813号、及び8,236,308号に開示され、それぞれは本明細書に参照により具体的に組み込まれる。
その組成物及びその使用方法は、CD3に結合し、CD3を介してシグナル伝達を活性化(例えば、CD3+T細胞の活性化)する密接に関連した抗体のファミリーのために提供される。前記抗体のファミリーは、本明細書で定義されるCDR配列のセットを含む。抗体ファミリーは、臨床的治療剤(複数可)としての有用性に寄与する多くの利益を提供する。ファミリー内の抗体は、ある範囲の結合親和性を有するメンバーを含み、所望の親和性を有する特定の配列の選択を可能にする。親和性を微調整する能力は、治療される個
体において、CD3活性化のレベルを管理し、それによって毒性を低減することが特に重要である。
ここで、
X5は、任意のアミノ酸であってもよく、いくつかの実施形態において、X5は、D、AまたはHであり、いくつかの実施形態において、X5は、Dである。
X6は、任意のアミノ酸であってもよく、いくつかの実施形態において、X6は、DまたはNであり、いくつかの実施形態において、D6は、Dである。
いくつかの実施形態において、ファミリー2の抗CD3抗体のCDR1配列は、配列番号1~18、残基26~33のいずれかに記載の配列を含む。
いくつかの実施形態において、ファミリー2の抗CD3抗体のCDR2配列は、配列番号1~18、残基51~58のいずれかに記載の配列を含む。
ここで、
X9’’は、任意のアミノ酸であってもよく、いくつかの実施形態において、X9’’は、DまたはSであり、いくつかの実施形態において、X9’’は、Dであり、
X11’’は、任意のアミノ酸であってもよく、いくつかの実施形態において、X11’’は、RまたはSであり、
X12’’は、任意のアミノ酸であってもよく、いくつかの実施形態において、X12’’は、LまたはRである。
を有し、式中、X11”及びX12”は、上記で定義した通りである。いくつかの実施形態において、ファミリー2の抗CD3抗体のCDR3配列は、配列番号1~18、残基97~112のいずれかに記載の配列を含む。いくつかの実施形態において、ファミリー2の抗体のCD3結合VHドメインは、軽鎖可変領域ドメインと対になる。このようないくつかの実施形態において、軽鎖は、固定された軽鎖である。
れか1つのCDR配列またはCDR配列のセットに対して、1つ、2つ、3つまたはそれ以上のアミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態において、アミノ酸置換(複数可)は、上記のファミリー2の式に対して、CDR1の5位または10位、CDR2の2位、6位または7位、CDR3の1位、8位、9位または10位の1つ以上である。
同じ縮尺ではないことが強調される。逆に、様々な特徴の寸法は、明確にするために、任意に拡大または縮小される。図面には、以下の図が含まれる。
本発明の理解を容易にするために、いくつかの用語を以下に定義する。
ook, Molecular Cloning:A Laboratory Manu
al(1982);Sambrook, Russell and Sambrook,Molecular Cloning:A Laboratory Manual(2001);Harlow, Lane and Harlow, Using Antibod
ies:A Laboratory Manual:Portable Protocol No.I, Cold Spring Harbor Laboratory(1998);and Harlow and Lane, Antibodies:A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Labora
tory;(1988)を参照されたい。
「含む」とは、列挙された要素が組成物/方法/キットにおいて必要とされることを意味するが、他の要素は、請求項の範囲内において組成物/方法/キットなどを形成するために含まれ得る。
生するのを防止すること、(b)疾患を阻害すること、すなわち、その発症を阻止すること、または(c)疾患を緩和すること、疾患を退行させること、を含む。治療剤は、疾患または傷害の発症前、発症中または発症後に投与され得る。治療が患者の望ましくない臨床症状を安定化または減少させる、進行中の疾患の治療は、特に注目されるものである。このような治療は、罹患した組織における機能の完全な消失に先立って行われることが望ましい。主題の療法は、疾患の症状の段階の間に、場合によっては、疾患の症状の段階の後に投与してもよい。
n Applied Mathematics 2(1981), 482-489の局所相同性アルゴリズムを利用する。特定の配列が、例えば、本発明の参照配列と95%の同一性を有するかどうかを決定するために、Bestfitまたは他の配列アラインメントプログラムを使用する場合、パラメータは、好ましくは、同一性のパーセンテージが参照配列の全長にわたって計算されるように、また参照配列におけるヌクレオチドの総数の5%までの相同性ギャップが許容されるように調節される。Bestfitを使用する場合、いわゆるオプションパラメータは、好ましくは、それらのプリセット(「デフォルト」)値のままである。所与の配列と本発明の上記の配列との比較において現れる偏差は、例えば、付加、欠失、置換、挿入または組換えによって引き起こされ得る。このような配列比較は、好ましくは、プログラム「fasta20u66」(バ-ジョン2.0u66,1998年9月,William R. Pearson and the Univ
ersity of Virginia;W.R.Pearson(1990), Met
hods in Enzymology 183, 63-98、添付の例、及びhtt
p://workbench.sdsc.edu/も参照されたい。)を用いても実施され得る。この目的のために、「デフォルト」パラメータ設定を使用してもよい。
し、容易に解離する傾向があるが、高親和性抗体は、抗原(または受容体)をより強固に結合し、より長く結合したままである。
重特異性抗体)、重鎖のみの抗体、三本鎖抗体、一本鎖Fv、ナノボディなどを含み、また、それらが所望の生物学的活性を示す限り、抗体断片を含む(Miller et al(2003)Jour.of Immunology 170:4854-4861)。抗体は、マウス、ヒト、ヒト化、キメラ、または他の種の由来であってもよい。
Interest, 5th Ed. Public Health Service,
National Institutes of Health, Bethesda,
Md.を参照されたい)。定常ドメインは、抗原に対する抗体の結合に直接関与しない
が、抗体依存性細胞傷害性(ADCC)への抗体の関与のような様々なエフェクター機能を示す。
nal approach for determining antibody complementarity determining regions.” Mol
Immunol. 2010;47:694-700を参照されたい)、これは配列の可
変性に基づいており、最も一般的に用いられている。Chothiaの定義は、構造ループ領域の位置に基づいている(Chothia et al. “Conformati
ons of immunoglobulin hypervariable regi
ons.” Nature. 1989;342:877-883)。別の目的のCDRの定義は、限定されるものではないが、Honegger, “Yet another numbering scheme for immunoglobulin variable domains:an automatic modeling and analysis tool.” J Mol Biol. 2001;309:657-670;Ofran et al. “Automated identification of complementarity determining regions(CDRs)reveals peculiar characteristics of CDRs and B cell epitopes.” J Immunol. 2008;181:6230-6235;Almagro “Identification of differences in the specificity-determining residues of antibodies that recognize antigens of different size:implica
tions for the rational design of antibody repertoires.” J Mol Recognit. 2004;17:132-143;及びPadlanet al. “Identification of
specificity-determining residues in antibodies.” Faseb J. 1995;9:133-139.によって開示さ
れたものを含み、これらのそれぞれは、参照により本明細書に具体的に援用される。
Acad. Sci. USA, 81:6851-6855)。本明細書中の目的のキ
メラ抗体は、非ヒト霊長類(例えば、旧世界ザル、類人猿など)に由来する可変ドメイン抗原結合配列、及びヒト定常領域配列を含む「霊長類化」抗体を含む。
表面受容体のダウンレギュレーションが含まれる。定常領域の変異体は、エフェクタープロファイルを変化させるもの、Fc受容体への結合などを含む。
29310)。任意の脊椎動物種由来の抗体の軽鎖は、それらの定常ドメインのアミノ酸配列に基づいて、κ及びλと呼ばれる2つの型のうちの1つに割り当てられ得る。
らの変異体が含まれる。
78:661(1993)、及びCanfield and Morrison, J. Exp. Med. 173:1483(1991)を参照されたい)。233~236位のIgG2残基及び327位、330位及び331位のIgG4残基のヒトIgG1への
置換は、ADCC及びCDCを大幅に低下させる(例えば、Armour KL. et
al., 1999 Eur J Immunol. 29(8):2613-24;及
びShields RL. et al., 2001. J Biol Chem. 27
6(9):6591-604を参照されたい)。他のFc変異体も可能であり、限定されるものではないが、ジスルフィド結合を形成することができる領域が欠失しているもの、あるいは、特定のアミノ酸残基が天然のFc形態のN末端で除去されているか、またはメチオニン残基がそれに付加されているものを含む。したがって、本発明の1つの実施形態において、ScFc分子の1つ以上のFc部分は、ジスルフィド結合を排除するために、ヒンジ領域に1つ以上の突然変異を含み得る。さらに別の実施形態において、Fcのヒンジ領域は、完全に除去され得る。さらに別の実施形態において、分子は、Fc変異体を含み得る。
269(27):17872(1994);Ujita-Lee et al., J.
Biol. Chem., 264(23):13848(1989);Imai-Ni
shiya, et al, BMC Biotechnology 7:84(2007);及びWO07/055916を参照されたい)。シアリル化活性が変化するように操作された細胞の一例として、アルファ-2,6-シアリルトランスフェラーゼ1遺伝子は
、チャイニーズハムスター卵巣細胞及びsf9細胞に操作されている。したがって、これらの操作された細胞によって発現される抗体は、外因性遺伝子産物によってシアリル化される。複数の天然分子と比較して、修飾された量の糖残基を有するFc分子を得るためのさらなる方法は、例えば、レクチンアフィニティークロマトグラフィーを用いて、上記複数の分子をグリコシル化及び非グリコシル化画分に分離することを含む(例えば、WO07/117505を参照されたい)。特定のグリコシル化部分の存在は、免疫グロブリンの機能を変化させることが示されている。例えば、Fc分子からの糖鎖の除去は、第1の補体成分C1のC1q部分に対する結合親和性の急激な低下、及び抗体依存性細胞媒介性細胞傷害性(ADCC)または補体依存性細胞傷害性(CDC)の減少または喪失をもたらし、それによってインビボで不必要な免疫反応を誘導しない。さらなる重要な修飾としては、シアリル化及びフコシル化が挙げられ、IgGにおけるシアル酸の存在は、抗炎症活性(例えば、Kaneko,et al, Science 313:760(2006)を参照されたい)と相関しているが、IgGからのフコースの除去は、ADCC活性の増強を導く(例えば、Shoj-Hosaka, et al, J.Biochem.,
140:777(2006)を参照されたい)。
289(6):3571-90を参照されたく、本明細書に具体的に参考として援用される。
a et al(1989)Nature 342:877;Riechmann et
al(1992)J. Mol. Biol. 224, 487-499;Foote and Winter,(1992)J. Mol. Biol. 224:487-499;Presta et al(1993)J. Immunol. 151, 2623-
2632;Werther et al(1996)J. Immunol. Methods 157:4986-4995;及びPresta et al(2001)Thromb. Haemost. 85:379-389を参照されたい。さらなる詳細については、米国特許第5,225,539号、第6,548,640号、第6,982,32
1号、第5,585,089号、第5,693,761号、第6,407,213号、Jones et al(1986)Nature, 321:522-525;及びRi
echmann et al(1988)Nature 332:323-329を参照されたい。
)。抗体は、同じ種または異なる種に由来するものであってもよい。例えば、ラット及びマウス抗体を発現する細胞株は、優先的に種制限された重鎖及び軽鎖の対形成のために、機能的な二重特異性Abを分泌する。他の実施形態において、Fc領域は、特定の方法で一緒に適合するようにのみ設計される。
f immunology 139, p 2367-75, 1987;Peter Borchmann et al., Blood, Vol.100, No.9, p3101
-3107, 2002を参照されたい)。
5個のアミノ酸)、scFvを強制的に二量化させるリンカーペプチドを用いて作製され得る。このタイプは、ダイアボディ-として知られている(Adams et al., British journal of cancer 77, p1405-12, 1998)。Dual-Affinity Re-Targeting(DART)プラットフォ-ム技術(Macrogenics, Rockville, Md)。この融合タンパク質技術は、約55キロダルトンの単一ペプチド鎖上の異なる抗体の2つの一本鎖可変断片(scFv)を使用する。SCORPION Therapeutics(Emergent Biosolutions,Inc., Seattle, Wash.)は、一本鎖タンパク質において、2つの抗原結合ドメインを組み合わせている。免疫グロブリンFc領域に基づいて、1つの結合ドメインは、C末端にあり、第2の結合ドメインはエフェクタードメインのN末端にある。
めに、2つのmAbのVドメインを、N末端の第1抗体軽(VL)鎖の可変ドメインと、短いリンカー(TVAAP)によってタンデムに融合させ、続いて、他の抗体VL及びCkが続き、DVD-Igタンパク質軽鎖を形成する。同様に、2つのmAbの重(VH)鎖の可変領域を、短いリンカー(ASTKGP)によって、N末端の第1の抗体とタンデムに融合させ、続いて、他の抗体及び重鎖定常ドメインを融合させて、DVD-Igタンパク質重鎖(VH1/VL1)を形成する。ジスルフィド結合完全IgG様分子の形成に重要であるため、DVD-Ig設計では、すべての軽鎖及び重鎖定常ドメインが保存されている。DVD-Ig軽鎖及び重鎖をコードする発現ベクターによる哺乳動物細胞の同時トランスフェクションは、約200kDaの分子量を有するIgG様分子の単一種の分泌をもたらす。この分子は、各mAbから2つの4つの結合部位を有する。
イン、及び少なくとも1つのCH(CH1、CH2、CH3またはCH4)ドメインからなるが、ヒンジ領域を含まない。重鎖のみの抗体は、2つの重鎖がジスルフィド結合されていてもよく、そうでなければ、互いに共有結合または非共有結合された二量体の形態であってもよい。重鎖抗体は、IgGサブクラスに属し得るが、IgM、IgA、IgD及びIgEサブクラスなどの他のサブクラスに属する抗体も本明細書に含まれる。特定の実施形態において、重鎖抗体は、IgG1、IgG2、IgG3、またはIgG4サブタイ
プ、特に、IgG1サブタイプである。
ture. 363, 446-448(1993))。これらの抗体は、2つの重鎖によって形成されるが、軽鎖が欠如している。結果として、可変抗原結合部分はVHHドメインといい、それは長さが約120個のアミノ酸のみである最小の天然に存在するインタクトな抗原結合部位を表す(Desmyter, A., et al. J. Biol. Chem. 276, 26285-26290(2001))。高い特異性及び親和性を有する重鎖抗体は、免疫化により種々の抗原に対して生成され得(van der Linden, R.H., et al. Biochim. Biophys. Acta. 1431, 37-46(1999))、VHH部分は、容易にクロ-ン化され、酵母で発現
され得る(Frenken, L.G.J., et al. J.Biotechnol. 78, 11-21(2000))。それらの発現レベル、溶解性及び安定性は、古典的な
F(ab)またはFv断片のレベルよりも著しく高い(Ghahroudi, M.A.
et al. FEBS Lett. 414, 521-526(1997))。サメは
、VNARという抗体において、単一のVH様ドメインを有することも示されている(Nuttall et al. Eur. J. Biochem. 270, 3543-3
554(2003);Nuttall et al. Function and Bi
oinformatics 55, 187-197(2004);Dooley et
al., Molecular Immunology 40, 25-33(2003
))。
本発明は、CD3に結合し、CD3を介してシグナル伝達を活性化(例えば、CD3+T細胞の活性化)する密接に関連する抗体のファミリーを提供する。ファミリー内の抗体は、本明細書で定義されるCDR配列のセットを含み、配列番号1~18の提供されるVH配列によって例示される。抗体のファミリーは、臨床的治療剤(複数可)としての有用性に寄与する多くの利益を提供する。ファミリー内の抗体は、ある範囲の結合親和性を有するメンバーを含み、所望の親和性を有する特定の配列の選択を可能にする。親和性を微調整する能力は、治療される個体におけるCD3活性化のレベルを管理し、それによって、毒性を低減することが特に重要である。例えば、小さく豊富な腫瘍抗原(細胞当たり10,000分子未満)が標的化される場合、高い親和性のCD3結合剤(<30nM)が好ましいと予測される。非常に豊富な腫瘍抗原(細胞あたり50,000分子以上)が標的化される場合、低い親和性(>50nM)を有するCD3結合体が好ましい。親和性とは別に評価されるのは、T細胞に結合した場合には、サイトカインの放出、例えば、サイ
トカインの放出の減少が望ましい場合には、IL-2、IFNγなどの放出を誘導する抗体の傾向であり得る。
ここで、X5は、任意のアミノ酸であってもよく、いくつかの実施形態において、X5は、D、AまたはHであり、いくつかの実施形態において、X5は、Dである。X6は、任意のアミノ酸であってもよく、いくつかの実施形態において、X6は、DまたはNであり、いくつかの実施形態において、D6は、Dである。いくつかの実施形態において、ファミリー2の抗CD3抗体のCDR1配列は、配列番号1~18、残基26~33のいずれかに記載の配列を含む。
いくつかの実施形態において、ファミリー2の抗CD3抗体のCDR2配列は、配列番号1~18、残基51~58のいずれかに記載の配列を含む。
X9’’は、任意のアミノ酸であってもよく、いくつかの実施形態において、X9’’は、DまたはSであり、いくつかの実施形態において、X9’’は、Dであり、
X11’’は、任意のアミノ酸であってもよく、いくつかの実施形態において、X11’’は、RまたはSであり、
X12’’は、任意のアミノ酸であってもよく、いくつかの実施形態において、X12’’は、LまたはRである。
ている)及び核因子κBリガンドの受容体活性化因子(RANKL、TNFSF11としても知られている。)が含まれる。血管新生に関与する抗原は、通常、血管内皮増殖因子(VEGF)、VEGF受容体(VEGFR)、インテグリンαVβ3及びインテグリンα5β1を含む、新しい微小血管系の形成を支持するタンパク質または成長因子である。腫瘍間質及び細胞外マトリックスは、腫瘍にとって不可欠な支持構造である。治療標的である間質及び細胞外マトリックス抗原には、線維芽細胞活性化タンパク質(FAP)及びテネイシンが含まれる。
C-Cケモカイン受容体4(CCR4)に対するヒト化モノクローナル抗体を含む。CCR2は、炎症性マクロファージ上に発現され、これは様々な炎症状態、例えば、リウマチ性関節炎において見出され得、また、腫瘍促進マクロファージで発現していると同定されている。CCR2は、調節性T細胞でも発現され、CCR2リガンドであるCCL2は、調節性T細胞の腫瘍への動員を媒介する。調節性T細胞は、抗腫瘍T細胞の応答を抑制し、したがって、それらの阻害または欠乏が望まれる。
抗体は、化学合成によって調製され得るが、典型的には、例えば、単一の組み換え宿主細胞においてタンパク質を構成するすべての鎖の共発現、または重鎖ポリペプチド及び抗体(例えば、ヒト抗体)の共発現などの組換えDNA技術の方法によって産生される。さらに、抗体の重鎖及び軽鎖は、単一のポリシストロニック発現ベクターを用いて、発現させることもできる。個々のポリペプチドの精製は、親和性(プロテインA)クロマトグラフィー、サイズ排除クロマトグラフィー及び/または疎水性相互作用クロマトグラフィーなどの標準的なタンパク質精製技術を用いて達成される。二重特異性物質はサイズ及び疎水性において十分に異なり、精製は標準的な手順を用いて実施され得る。
本発明の別の態様は、適切な薬学的に許容される担体と混合した本発明の1つ以上のタンパク質を含む医薬組成物を提供することである。本明細書で使用される薬学的に許容される担体は、限定されるものではないが、アジュバント、固体担体、水、緩衝液、もしくは治療成分を保持するために当該技術分野で使用される他の担体、またはそれらの組み合わせを例示する。
特に、抗原結合性組成物が治療される状態に適した多重特異性抗体である場合、例えば、関連するがん細胞の治療のために、1つの結合部分(関連する感染症の治療のために、目的の病原体に対する特異的な結合部分など)が腫瘍関連抗原に特異的に結合する場合、標的細胞を本発明の抗原結合性組成物と接触させることを含むレジメンにおいて、限定されるものではないが、感染症、自己免疫疾患、原発性または転移性がんなどを含む疾患を治療または軽減するための方法が提供される。そのような方法は、治療有効量または本発明の有効量の薬剤を、治療を必要とする対象に投与することを含み、限定されるものではないが、試薬と化学療法剤、放射線療法、または手術との組合せを含む。
mg/kg、より一般的には0.01~5mg/kgの範囲であり得る。例えば、投薬量は、1mg/kg体重または10mg/kg体重、または1~10mg/kgの範囲内であり得る。例示的な治療レジメンは、2週間に1回または1ヶ月に1回または3~6ヶ月に1回の投与を伴う。本発明の治療物質は、通常、複数の機会に投与される。単回投与間の間隔は、毎週、毎月、または毎年であり得る。間隔は、患者の治療物質の血中濃度を測定することによって示されるように、不規則であってもよい。あるいは、本発明の治療物質は、徐放性処方物として投与され得、この場合、より少ない投与回数が必要とされる。投薬量及び頻度は、患者におけるポリペプチドの半減期に依存して変化する。
7-119, 1997)。本発明の薬剤は、活性成分の持続放出またはパルス放出を可
能にするような様式で製剤化され得る、デポー注射またはインプラント調製の形態で投与され得る。医薬組成物は、一般に、無菌で、実質的に等張性で、米国食品医薬品局のすべての医薬品製造管理及び品質管理基準(GMP)規則に完全に適合して製剤化される。
ロゼンジを含む。本発明の組成物は、経口投与された場合、消化から保護されるべきであると認識される。これは、典型的には、分子を組成物と複合させて、それらを酸性及び酵素的加水分解に耐性にすることにより、または分子をリポソ-ムまたは保護バリアなどの適切に耐性のある担体にパッケージすることによって達成される。消化から薬剤を保護する手段は、当該技術分野において周知である。
is of Therapeutics(Hardman et al., eds., 1996))。
重鎖のみの抗体を発現する遺伝子操作されたラット
ヒトIgH遺伝子座を、ヒトVH6-D-JH領域の下流に連結したラットC領域遺伝子の改変及び連結を含むいくつかの部分で構築し、組み立てた。次いで、ヒトVH遺伝子の別々のクラスターを有する2つのBACを、組み立てられた(ヒトVH6-D-JH-ラットC)断片をコードするBACと同時に注入した。
前に記載されている突然変異した内因性重鎖及び軽鎖の遺伝子座を有するラットと交配させた。そのような動物の解析は、ラット免疫グロブリンの重鎖及び軽鎖の発現の不活性化、ならびにヒトV、D及びJ遺伝子によってコードされる可変領域を有する重鎖抗体の高レベルの発現を示した。トランスジェニックラットの免疫化は、抗原特異的な重鎖抗体の高力価の血清反応の産生をもたらした。ヒトVDJ領域を有する重鎖抗体を発現するこれらのトランスジェニックラットは、UniRatsと呼ばれた。
固定された軽鎖抗体を発現する遺伝子操作されたラット
トランスジェニックヒト抗体レパートリーは、固有のL鎖と組み合わせて、多様な(VH-D-JH)n再編成を有するH鎖から生成された。このために、再編成したL鎖ヒトVk-Jk1-CkをDNAマイクロインジェクションによりラット生殖系列に組み込み、得られたトランスジェニック動物を、ヒトH鎖レパートリーを天然に発現する以前に記載されたラット株で飼育した(Osborn et al., 2013)。この新しいラット株は、OmniFlicと命名された。
トランスジェニックラットにおける抗原特異的抗体の生成
ラットにおける抗原特異的重鎖抗体の生成のために、遺伝子操作された発現ラットを2つの方法で免疫化した。
nc.(Fargo、ND)でヒト及びカニクイザルのCD3-イプシロン/デルタ構築物で免疫化した。最終的な追加免疫及びRNA単離後に、流入領域リンパ節を採取した。cDNAの合成後、IgH重鎖抗体のレパートリーは、次世代シークエンシング及び独自の社内ソフトウェアによって特徴付けられた。抗原特異的な陽性選択の証拠を示す候補抗原特異的なVH配列を選択した。FlicAbSをコードする数百のVH配列を遺伝子組換えのために選択し、発現ベクターにクローニングした。続いて、フロー及びELISAによる解析のために、完全ヒトヒトFlicAb IgG1抗体をHEK細胞において発現させた。フローにより、初代ヒトT細胞及びJurkat細胞への結合について、ヒトFlicAbを試験した。さらに、ELISAにおいて、組換えCD3δεタンパク質を用いて、ヒトFlicAbを試験した。ヒトT細胞に対する陽性結合を有するすべてのFlicAbを図1及び2に列挙する。T細胞活性化アッセイにおいて、選択された配列をさらに特徴化した。
図3のデータ表は、単一特異性及び二重特異性フォーマットにおけるファミリー2の抗CD3抗体の挙動を要約している。列1は、抗CD3 VH配列の配列IDを示す。列2は、親単一特異性抗CD3のJurkat細胞結合についてのMFI値を示す。列3は、親単一特異性抗CD3のカニクイザルT細胞結合についてのMFI値を示す。列4は、aCD3:aBCMA二重特異性抗体の名称を示す。列5は、指示された用量で、プラスチックに被覆されたBCMAタンパク質に結合する二重特異性抗体によって刺激された、汎T細胞によって放出されたIL-2のピコグラムを示す。列6は、指示された用量で、プラスチックに被覆されたBCMAタンパク質に結合する二重特異性抗体によって刺激された、汎T細胞によって放出されたIL-6のピコグラムを示す。列7は、指示された用量で、プラスチックに被覆されたBCMAタンパク質に結合する二重特異性抗体によって刺激された、汎T細胞によって放出されたIL-10のピコグラムを示す。列8は、指示された用量で、プラスチックに被覆されたBCMAタンパク質に結合する二重特異性抗体によって刺激された、汎T細胞によって放出されたIFNγのピコグラムを示す。列9は、指示された用量で、プラスチックに被覆されたBCMAタンパク質に結合する二重特異性抗体によって刺激された、汎T細胞によって放出されたTNFαのピコグラムを示す。列10は、ヒト汎T細胞の存在下において、二重特異性抗体媒介性U266腫瘍細胞溶解のEC50を示す。列11は、二重特異性抗体及びヒト汎T細胞の存在下において、二重特異性抗体333ng/mLの用量でのU266腫瘍細胞の溶解パ-セントを示す。列12は、オクテットによって測定された、二重特異性抗体の抗CD3アームのタンパク質結合親和性を示す。列13は、二重特異性抗体のJurkat細胞結合のMFI値を示す。
それぞれ固有の抗CD3アーム及び共通の抗BCMAアームを有する7つのαCD3_fam2:aBCMA二重特異性抗体を、活性化した初代T細胞のリダイレクションを通して、U266 BCMA+腫瘍細胞を殺傷させる能力について試験した。この実験において、BCMAを発現するU266細胞を、二重特異性抗体の添加と共に、10:1 E:T比で活性化汎T細胞と混合した。図4に示すように、X軸は、使用した抗体の濃度を示し、Y軸は、抗体を添加して6時間後の腫瘍細胞の%溶解を示す。
αCD3_F1F:αBCMA二重特異性抗体を、活性化した初代T細胞のリダイレクションを介して、3つの異なるBCMA+腫瘍細胞及び1つのBCMA陰性細胞株を殺傷させる能力についてアッセイした。この実験において、二重特異性抗体の添加と共に、10:1のE:T比で、腫瘍細胞を、活性化した汎T細胞と混合した。結果を図8A~6Dに示す。パネルAは、RPMI-8226細胞の死滅を示し、パネルBは、NCI-H929細胞の死滅を示し、パネルCは、U-266細胞の死滅を示し、パネルDは、陰性対照のK562細胞の死滅を示す。X軸は、使用した抗体の濃度を示し、Y軸は、抗体を添加して6時間後の腫瘍細胞の%溶解を示す。
以下に、本願の当初の特許請求の範囲に記載された発明を付記する。
[1] ヒトVHフレームワークにおいてCDR1、CDR2及びCDR3配列を含む可変重鎖ドメインと、
可変軽鎖ドメインと、
を含むCD3に対して特異的な抗原結合タンパク質であって、
前記CDR1配列は、式
を有し、
X 5 、X 6 は、任意のアミノ酸であってもよく、
前記CDR2配列は、式
を有し、
前記CDR3配列は、式
を有し、
X 9’’ 、X 11’’ 、X 12’’ は、任意のアミノ酸であってもよい、前記抗原結合タンパク質。
[2] ヒトVHフレームワークにおいて、CDR1、CDR2及びCDR3配列を含む可変重鎖ドメインと、
可変軽鎖ドメインと、
を含む[1]に記載の抗原結合タンパク質であって、
前記CDR1、CDR2またはCDR3は、任意の配列番号1~18に見出される、前記抗原結合タンパク質。
[3] ヒトVHフレームワークにおいて、CDR1、CDR2及びCDR3配列を含む可変重鎖ドメインと、
可変軽鎖ドメインと、
を含む[1]に記載の抗原結合タンパク質であって、
前記CDR配列は、配列番号1~18の任意の1つにおいて、CDR配列またはCDR配列のセットに対して少なくとも85%の同一性を有する配列である、前記抗原結合タンパク質。
[4] ヒトVHフレームワークにおいて、CDR1、CDR2及びCDR3配列を含む可変重鎖ドメインと、
可変軽鎖ドメインと、
を含む[1]に記載の抗原結合タンパク質であって、
前記CDR配列は、配列番号1~78または配列番号80~102の任意の1つにおいて、CDR配列またはCDR配列のセットに対して3個までのアミノ酸置換を有する配列である、前記抗原結合タンパク質。
[5] 前記可変軽鎖ドメインは、ヒトVLフレームワークにおいて、CDR1、CDR2及びCDR3配列を含み、
前記CDR配列は、配列番号19において、CDR配列またはCDR配列のセットに対して3個までのアミノ酸置換を有する配列であるか、または、
前記CDR配列は、配列番号19において、CDR配列またはCDR配列のセットに対して少なくとも85%の同一性を有する配列である、[1]~[4]のいずれかに記載の抗原結合タンパク質。
[6] 前記可変重鎖ドメインは、配列番号1~18のいずれかに記載のアミノ酸配列を含む、[1]~[5]のいずれかに記載の抗原結合タンパク質。
[7] 前記可変軽鎖ドメインは、配列番号19のアミノ酸配列を含む、[1]~[6]のいずれかに記載の抗原結合タンパク質。
[8] 活性化アッセイにおいてT細胞と接触させた場合、前記抗原結合タンパク質は、参照抗CD3抗体と比較して、IL-2及びIL-6の一方または両方の低下したレベルの放出を誘導する、[1]~[7]のいずれかに記載の抗原結合タンパク質。
[9] Fc領域をさらに含む、[1]~[8]のいずれかに記載の抗原結合タンパク質。
[10] 前記Fc領域は、エフェクター機能を低下させるように操作されている、[9]に記載の抗原結合タンパク質。
[11] ヒトCD3デルタイプシロンに対する前記タンパク質の親和性(KD)は、約10-6Mから約10-11Mである、[1]~[10]のいずれかに記載の抗原結合タンパク質。
[12] 前記タンパク質が一本鎖である、[1]~[11]のいずれかに記載の抗原結合タンパク質。
[13] 前記タンパク質が二本鎖またはその倍数である、[1]~[11]のいずれかに記載の抗原結合タンパク質。
[14] 前記タンパク質が三本鎖である、[1]~[11]のいずれかに記載の抗原結合タンパク質。
[15] 前記タンパク質が三本鎖であり、両方の抗原結合性アームが抗体の重鎖及び軽鎖を含む、[1]~[11]のいずれかに記載の抗原結合タンパク質。
[16] 前記タンパク質は、CD3以外のタンパク質に特異的な可変重鎖ドメインをさらに含む、[1]~[11]のいずれかに記載の抗原結合タンパク質。
[17] 前記タンパク質は、CD3以外のタンパク質に特異的な可変重鎖ドメインをさらに含み、
活性化アッセイにおいてT細胞と接触させた場合、前記抗原結合タンパク質は、参照抗CD3抗体と比較して、IL-2及びIL-10の一方または両方の低下したレベルの放出を誘導し、
腫瘍細胞及びヒトT細胞を用いた標準インビトロアッセイにおいて、30%を超える腫瘍細胞傷害性を誘導する、[1]~[16]のいずれかに記載の抗原結合タンパク質。
[18] CD3以外のタンパク質に特異的な前記可変重鎖ドメインは、重鎖のみのドメインである、[16]に記載の抗原結合タンパク質。
[19] CD3以外のタンパク質に特異的な可変重鎖ドメインは、軽鎖可変領域をさらに含む、[16]に記載の抗原結合タンパク質。
[20] 前記軽鎖可変領域は、前記CD3結合領域の軽鎖可変領域と同一である、[16]に記載の抗原結合タンパク質。
[21] CD3以外の前記タンパク質は、腫瘍関連抗原である、[16]~[20]のいずれかに記載の抗原結合タンパク質。
[22] CD3以外の前記タンパク質は、病原体抗原である、[16]~[20]のいずれかに記載の抗原結合タンパク質。
[23] CD3以外の前記タンパク質は、免疫調節タンパク質である、[16]~[20]のいずれかに記載の抗原結合タンパク質。
[24] [1]~[23]のいずれかに記載の抗原結合タンパク質を含む医薬組成物。
[25] 単位用量の製剤化における、[24]に記載の医薬製剤。
[26] [1]~[23]のいずれかに記載の抗原結合タンパク質をコードするポリヌクレオチド。
[27] [26]に記載のポリヌクレオチドを含むベクター。
[28] [27]に記載のベクターを含む細胞。
[29] 前記タンパク質の発現を許容する条件下で、[29]に記載の細胞を増殖させ、前記タンパク質を前記細胞から単離することを含む、[1]~[24]のいずれかに記載の抗原結合タンパク質の製造方法。
[31] 有効量の[1]~[23]のいずれかに記載の抗原結合タンパク質を個体に投与することを含む、治療方法。
[32] 前記個体がヒトである、[30]に記載の方法。
[33] CD3に特異的に結合する抗原結合タンパク質を作製する方法であって、
OmniFlicまたはUniRat動物をCD3で免疫すること、及び
抗原特異的な重鎖配列を同定することを含む、前記方法。
[34] OmniFlicまたはUniRat動物をCD3以外の抗原で免疫すること、及び
[1]~[15]のいずれかに記載の前記抗原結合タンパク質を含む分子において、組み合わせ得る抗原特異的な重鎖配列を同定すること、を含む[16]に記載の抗原結合タンパク質を作製する方法。
[35] 前記タンパク質は、CD3に対して特異的な結合ドメイン及びCD3以外の抗原に特異的な結合ドメインを含み、
活性化アッセイにおいてT細胞と接触させた場合、前記二重特異性抗原結合タンパク質は、参照抗CD3抗体と比較して、IL-2及びIL-10の一方または両方の低下したレベルの放出を誘導し、
腫瘍細胞及びヒトT細胞を用いた標準インビトロアッセイにおいて、30%を超える腫瘍細胞傷害性を誘導する、前記二重特異性抗原結合タンパク質。
[36] (i)ヒトVHフレームワークにおいて、配列番号1のCDR1、CDR2及びCDR3配列を含むCD3結合可変領域と、
(ii)ヒトVLフレームワークにおいて、配列番号19のCDR1、CDR2及びCDR3配列を含む可変軽鎖ドメインと、
(iii)単一またはタンデムな構成において、配列番号20の26~33位、51~58位、97~108位のそれぞれで、CDR1、CDR2及びCDR3配列を含む一本鎖抗BCMA可変領域含む二重特異性抗体。
[37] Fc領域をさらに含む、[36]に記載の二重特異性抗体。
[38] 前記CD3結合可変領域は、配列番号1を含み、前記軽鎖可変領域は、配列番号19を含み、また、前記BCMA結合可変領域は、配列番号20または配列番号21を含む、[36]に記載の二重特異性抗体。
Claims (14)
- (a)(i)GFTFDDYA(配列番号29)のアミノ酸配列を有するCDR1、ISWNSGSI(配列番号24)のアミノ酸配列を有するCDR2、及びAKDSRGYGDYRLGGAY(配列番号41)のアミノ酸配列を有するCDR3を含む重鎖可変(VH)ドメインを含む第1のポリペプチドサブユニット、及び
(ii)QSVSSN(配列番号35)のアミノ酸配列を有するCDR1、GAS(配列番号38)のアミノ酸配列を有するCDR2、及びQQYNNWPWT(配列番号45)のアミノ酸配列を有するCDR3を含む軽鎖可変(VL)ドメインを含む第2のポリペプチドサブユニット
を含むヒトCD3δεに特異的な第1の結合部分と、
(b)(i)GFTVSSYG(配列番号36)のアミノ酸配列を有するCDR1、IRGSDGST(配列番号39)のアミノ酸配列を有するCDR2、及びAKQGENDGPFDH(配列番号46)のアミノ酸配列を有するCDR3を含むVHドメインを含む第3のポリペプチドサブユニット
を含むヒトBCMAに特異的な第2の結合部分と
を含み、
前記第2の結合部分はVLドメインを含まない、
二重特異性抗体。 - 前記第1のポリペプチドサブユニットのVHドメインにおけるCDR1、CDR2、及びCDR3配列が、ヒトVHフレームワークに存在する、請求項1に記載の二重特異性抗体。
- 前記第2のポリペプチドサブユニットのVLドメインにおけるCDR1、CDR2、及びCDR3配列が、ヒトVLフレームワークに存在する、請求項1に記載の二重特異性抗体。
- 前記第1のポリペプチドサブユニットのVHドメインにおけるCDR1、CDR2、及びCDR3配列が、ヒトVHフレームワークに存在し、前記第2のポリペプチドサブユニットのVLドメインにおけるCDR1、CDR2、及びCDR3配列が、ヒトVLフレームワークに存在する、請求項1に記載の二重特異性抗体。
- 前記第1のポリペプチドサブユニットが、配列番号1のアミノ酸配列を有するVHドメインを含む、請求項1に記載の二重特異性抗体。
- 前記第2のポリペプチドサブユニットが、配列番号19のアミノ酸配列を有するVLドメインを含む、請求項1に記載の二重特異性抗体。
- 前記第1のポリペプチドサブユニットが、配列番号1のアミノ酸配列を有するVHドメインを含み、前記第2のポリペプチドサブユニットが、配列番号19のアミノ酸配列を有するVLドメインを含む、請求項1に記載の二重特異性抗体。
- 前記第3のポリペプチドサブニットが、配列番号21のアミノ酸配列を有するVHドメインを含む、請求項1に記載の二重特異性抗体。
- 前記第3のポリペプチドサブニットが、配列番号20のアミノ酸配列を有する、請求項1に記載の二重特異性抗体。
- 前記第3のポリペプチドサブニットが、配列番号21のアミノ酸配列を有するVHドメインを含む、請求項5に記載の二重特異性抗体。
- 前記第3のポリペプチドサブニットが、配列番号20のアミノ酸配列を有する、請求項5に記載の二重特異性抗体。
- 前記第3のポリペプチドサブニットが、配列番号21のアミノ酸配列を有するVHドメインを含む、請求項6に記載の二重特異性抗体。
- 前記第3のポリペプチドサブニットが、配列番号20のアミノ酸配列を有する、請求項6に記載の二重特異性抗体。
- 請求項1~13のいずれか一項に記載の二重特異性抗体と、薬学的に許容される担体とを含む、BCMAを発現するがんを治療するための医薬組成物。
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