JP7506607B2 - TfRに結合するバイスペシフィック抗体 - Google Patents
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Description
1.Transferrin Receptor(TfR)に結合するIgG部分、および細胞表面抗原に結合するN末端側ポリペプチドを含むバイスペシフィック抗体または該バイスペシフィック抗体断片であって、該ポリペプチドが該IgG部分の重鎖のN末端に直接またはリンカーを介して結合する、TfRおよび細胞表面抗原に結合するバイスペシフィック抗体または該バイスペシフィック抗体断片。
2.前記IgG部分が、
配列番号32で表されるアミノ酸配列もしくは配列番号32で表されるアミノ酸配列から、2番目のチロシンのアラニンもしくはフェニルアラニンへの置換および3番目のスレオニンのアラニンもしくはグリシンへの置換から選ばれる少なくとも1つの置換により改変されたアミノ酸配列を含む相補性決定領域(complementarity determining region;CDR)1、
配列番号33で表されるアミノ酸配列もしくは配列番号33で表されるアミノ酸配列から、1番目のバリンのアラニンへの置換、2番目のイソロイシンのアラニンもしくはロイシンへの置換、7番目のバリンのグルタミン酸への置換、10番目のアスパラギン酸のアラニンへの置換および13番目のアスパラギン酸のプロリンへの置換から選ばれる少なくとも一つの置換により改変されたアミノ酸配列を含むCDR2および
配列番号34で表されるアミノ酸配列もしくは配列番号34で表されるアミノ酸配列から、3番目のグルタミンのアラニンもしくはアスパラギン酸への置換、4番目のプロリンの任意の天然アミノ酸への置換、5番目のトリプトファンのアラニン、フェニルアラニン、ヒスチジンもしくはチロシンへの置換、7番目のチロシンのアラニンもしくはフェニルアラニンへの置換および13番目のバリンのロイシンへの置換から選ばれる少なくとも1つの置換により改変されたアミノ酸配列を含むCDR3を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに
それぞれ配列番号17~19で表されるアミノ酸配列を含むCDR1~3を含む軽鎖可変領域(VL)を含む、前記1に記載のバイスペシフィック抗体または該バイスペシフィック抗体断片。
3.前記IgG部分が、以下の(ai)~(ci)から選ばれる1のVH、およびそれぞれ配列番号17~19で表されるアミノ酸配列を含むCDR1~3を含むVLを含む、前記1に記載のバイスペシフィック抗体または該バイスペシフィック抗体断片。
(ai)それぞれ配列番号32~34で表されるアミノ酸配列を含むCDR1~3を含むVH
(bi)それぞれ配列番号42~44で表されるアミノ酸配列を含むCDR1~3を含むVH
(ci)それぞれ配列番号47~49で表されるアミノ酸配列を含むCDR1~3を含むVH
4.前記IgG部分が、配列番号26、31、36、41、および46のいずれか1つで表されるアミノ酸配列を含むVH、および配列番号16で表されるアミノ酸配列を含むVLを含む、前記1または2に記載のバイスペシフィック抗体または該バイスペシフィック抗体断片。
5.前記IgG部分が、それぞれ配列番号17~19で表されるアミノ酸配列を含むCDR1~3を含むVL、および、以下の(a)~(m)から選ばれる1のVHを含む、前記1に記載のバイスペシフィック抗体または該バイスペシフィック抗体断片。
(a)それぞれ配列番号33および34で表されるアミノ酸配列を含むCDR2および3、ならびに、配列番号32で表されるアミノ酸配列から、2番目のチロシンのアラニンまたはフェニルアラニンへの置換により改変されたアミノ酸配列を含むCDR1を含むVH
(b)それぞれ配列番号33および34で表されるアミノ酸配列を含むCDR2および3、ならびに、配列番号32で表されるアミノ酸配列から、3番目のスレオニンのアラニンまたはグリシンへの置換により改変されたアミノ酸配列を含むCDR1を含むVH
(c)それぞれ配列番号32および34で表されるアミノ酸配列を含むCDR1および3、ならびに、配列番号33で表されるアミノ酸配列から、1番目のバリンのアラニンへの置換により改変されたアミノ酸配列を含むCDR2を含むVH
(d)それぞれ配列番号32および34で表されるアミノ酸配列を含むCDR1および3、ならびに、配列番号33で表されるアミノ酸配列から、2番目のイソロイシンのアラニンまたはロイシンへの置換により改変されたアミノ酸配列を含むCDR2を含むVH
(e)それぞれ配列番号32および34で表されるアミノ酸配列を含むCDR1および3、ならびに、配列番号33で表されるアミノ酸配列から、7番目のバリンのグルタミン酸への置換により改変されたアミノ酸配列を含むCDR2を含むVH
(f)それぞれ配列番号32および34で表されるアミノ酸配列を含むCDR1および3、ならびに、配列番号33で表されるアミノ酸配列から、10番目のアスパラギン酸のアラニンへの置換により改変されたアミノ酸配列を含むCDR2を含むVH
(g)それぞれ配列番号32および34で表されるアミノ酸配列を含むCDR1および3、ならびに、配列番号33で表されるアミノ酸配列から、13番目のアスパラギン酸のプロリンへの置換により改変されたアミノ酸配列を含むCDR2を含むVH
(h)それぞれ配列番号32および33で表されるアミノ酸配列を含むCDR1および2、ならびに、配列番号34で表されるアミノ酸配列から、3番目のグルタミンのアラニンまたはアスパラギン酸への置換により改変されたアミノ酸配列を含むCDR3を含むVH
(i)それぞれ配列番号32および33で表されるアミノ酸配列を含むCDR1および2、ならびに、配列番号34で表されるアミノ酸配列から、4番目のプロリンの任意の天然アミノ酸への置換により改変されたアミノ酸配列を含むCDR3を含むVH
(j)それぞれ配列番号32および33で表されるアミノ酸配列を含むCDR1および2、ならびに、配列番号34で表されるアミノ酸配列から、4番目のプロリンのアラニン、チロシン、セリン、アスパラギン酸、グルタミン、グルタミン酸、スレオニン、アルギニン、グリシン、リジン、メチオニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、トリプトファン、フェニルアラニンもしくはヒスチジンへの置換により改変されたアミノ酸配列を含むCDR3を含むVH
(k)それぞれ配列番号32および33で表されるアミノ酸配列を含むCDR1および2、ならびに、配列番号34で表されるアミノ酸配列から、5番目のトリプトファンのアラニン、フェニルアラニン、ヒスチジンまたはチロシンへの置換により改変されたアミノ酸配列を含むCDR3を含むVH
(l)それぞれ配列番号32および33で表されるアミノ酸配列を含むCDR1および2、ならびに、配列番号34で表されるアミノ酸配列から、7番目のチロシンのアラニンまたはフェニルアラニンへの置換により改変されたアミノ酸配列を含むCDR3を含むVH
(m)それぞれ配列番号32および33で表されるアミノ酸配列を含むCDR1および2、ならびに、配列番号34で表されるアミノ酸配列から、バリンのロイシンへの置換により改変されたアミノ酸配列を含むCDR3を含むVH
6.前記IgG部分が、配列番号16で表されるアミノ酸配列を含むVL、ならびに配列番号31で表されるアミノ酸配列から、KabatらによるEUインデックス(以下、EUインデックス)により示されるY32A、Y32F、T33A、T33G、L45A、V48A、V50A、I51A、I51L、V55E、D58A、D61P、Q97A、Q97D、W99A、W99F、W99H、W99Y、Y100AA、Y100AF、V102L、およびP98の任意のアミノ酸への置換から選ばれる少なくとも1つの置換により改変されたアミノ酸配列を含むVHを含む、前記1に記載のバイスペシフィック抗体または該バイスペシフィック抗体断片。
7.前記IgG部分が、配列番号16で表されるアミノ酸配列を含むVL、ならびに配列番号31で表されるアミノ酸配列から、EUインデックスにより示されるY32A、Y32F、T33A、T33G、L45A、V48A、V50A、I51A、I51L、V55E、D58A、D61P、Q97A、Q97D、W99A、W99F、W99H、W99Y、Y100AA、Y100AF、V102L、P98A、P98Y、P98S、P98D、P98Q、P98E、P98T、P98R、P98G、P98K、P98M、P98V、P98L、P98I、P98W、P98F、およびP98Hから選ばれるいずれか1つの置換により改変されたアミノ酸配列を含むVHを含む、前記1に記載のバイスペシフィック抗体または該バイスペシフィック抗体断片。
8.前記IgG部分が、配列番号6で表されるTfRのアミノ酸配列の352番目のAsp、355番目のSer、356番目のAsp、および358番目のLysから選ばれる少なくとも1つのアミノ酸残基、並びに、365番目のMet、366番目のVal、および369番目のGluから選ばれる少なくとも1つのアミノ酸残基を認識する、前記1に記載のバイスペシフィック抗体または該バイスペシフィック抗体断片。
9.前記IgG部分の重鎖定常領域が配列番号84または配列番号86で表されるアミノ酸配列を含む前記1~8のいずれか1に記載のバイスペシフィック抗体または該バイスペシフィック抗体断片。
10.前記細胞表面抗原がEGFRまたはGPC3である、前記1~9のいずれか1に記載のバイスペシフィック抗体または該バイスペシフィック抗体断片。
11.前記細胞表面抗原がEGFRである、前記1~10のいずれか1に記載のバイスペシフィック抗体または該バイスペシフィック抗体断片。
12.前記N末端側ポリペプチドが前記細胞表面抗原に対する抗体のFab、Fab’、scFv、dsFvおよびVHHのいずれか1つである、前記1~11のいずれか1に記載のバイスペシフィック抗体または該バイスペシフィック抗体断片。
13.前記N末端側ポリペプチドが、前記細胞表面抗原に対する抗体のFabである、前記1~12のいずれか1に記載のバイスペシフィック抗体または該バイスペシフィック抗体断片。
14.前記N末端側ポリペプチドが、EGFRに対する抗体のFabであって、該抗体がそれぞれ配列番号60~62またはそれぞれ配列番号65~67で表されるアミノ酸配列を含むCDR1~3を含むVH、およびそれぞれ配列番号17~19で表されるアミノ酸配列を含むCDR1~3を含むVLを含む抗体である、前記1~9のいずれか1に記載のバイスペシフィック抗体または該バイスペシフィック抗体断片。
15.前記EGFRに対する抗体が、以下の(a)~(e)から選ばれる1の抗体である、前記14に記載のバイスペシフィック抗体または該バイスペシフィック抗体断片。
(a)配列番号59または配列番号64で表されるアミノ酸配列を含むVH、および配列番号16で表されるアミノ酸配列を含むVLを含む抗体
(b)配列番号110で表されるアミノ酸配列を含むVH、および配列番号111で表されるアミノ酸配列を含むVLを含む抗体
(c)配列番号112で表されるアミノ酸配列を含むVH、および配列番号113で表されるアミノ酸配列を含むVLを含む抗体
(d)配列番号114で表されるアミノ酸配列を含むVH、および配列番号115で表されるアミノ酸配列を含むVLを含む抗体
(e)配列番号116で表されるアミノ酸配列を含むVH、および配列番号117で表されるアミノ酸配列を含むVLを含む抗体
16.前記Fabの重鎖C末端が前記IgG部分の重鎖N末端に直接結合する、前記13~15のいずれか1に記載のバイスペシフィック抗体または該バイスペシフィック抗体断片。
17.前記Fabの重鎖C末端がIgG部分の重鎖N末端にリンカーを介して結合する、前記13~15のいずれか1に記載のバイスペシフィック抗体または該バイスペシフィック抗体断片。
18.上記リンカーのアミノ酸配列がIgGのヒンジ領域のアミノ酸配列の一部または全部からなる、前記17に記載のバイスペシフィック抗体または該バイスペシフィック抗体断片。
19.前記Fabおよび前記IgG部分が同一のアミノ酸配列からなる軽鎖を含む前記13~18のいずれか1に記載のバイスペシフィック抗体または該バイスペシフィック抗体断片。
20.前記1~19のいずれか1に記載のバイスペシフィック抗体または該バイスペシフィック抗体断片をコードするDNA。
21.前記20に記載のDNAを含有する組換え体ベクター。
22.前記21に記載の組換え体ベクターを宿主細胞に導入して得られる形質転換株。
23.前記22に記載の形質転換株を培地に培養し、培養物中に前記1~19のいずれか1に記載のバイスペシフィック抗体または該バイスペシフィック抗体断片を生産蓄積させ、該培養物からバイスペシフィック抗体または該バイスペシフィック抗体断片を採取することを特徴とする前記1~19のいずれか1に記載のバイスペシフィック抗体または該バイスペシフィック抗体断片の製造方法。
24.前記1~19のいずれか1に記載のバイスペシフィック抗体または該バイスペシフィック抗体断片を有効成分として含有する、ヒトTfRおよび細胞表面抗原の少なくとも一方が関係する疾患の治療および/または診断薬。
25.ヒトTfRおよび細胞表面抗原の少なくとも一方が関係する疾患ががんである前記24に記載の治療薬および/または診断薬。
26.前記1~19のいずれか1に記載のバイスペシフィック抗体または該バイスペシフィック抗体断片を用いる、ヒトTfRおよび細胞表面抗原の少なくとも一方が関係する疾患の治療および/または診断方法。
27.ヒトTfRおよび細胞表面抗原の少なくとも一方が関係する疾患ががんである前記26に記載の方法。
28.ヒトTfRおよび細胞表面抗原の少なくとも一方が関係する疾患の治療および/または診断に使用するための、前記1~19のいずれか1に記載のバイスペシフィック抗体または該バイスペシフィック抗体断片。
29.ヒトTfRおよび細胞表面抗原の少なくとも一方が関係する疾患ががんである前記28に記載のバイスペシフィック抗体または該バイスペシフィック抗体断片。
30.ヒトTfRおよび細胞表面抗原の少なくとも一方が関係する疾患の治療および/または診断剤の製造のための、前記1~19のいずれか1に記載のバイスペシフィック抗体または該バイスペシフィック抗体断片の使用。
31.ヒトTfRおよび細胞表面抗原の少なくとも一方が関係する疾患ががんである前記30に記載の使用。
32.前記1~19のいずれか1に記載のバイスペシフィック抗体または該バイスペシフィック抗体断片を含む、ヒトTfRおよび細胞表面抗原の少なくとも一方を検出または測定するための試薬。
B群:アスパラギン酸、グルタミン酸、イソアスパラギン酸、イソグルタミン酸、2-アミノアジピン酸、2-アミノスベリン酸
C群:アスパラギン、グルタミン
D群:リジン、アルギニン、オルニチン、2,4-ジアミノブタン酸、2,3-ジアミノプロピオン酸
E群:プロリン、3-ヒドロキシプロリン、4-ヒドロキシプロリン
F群:セリン、スレオニン、ホモセリン
G群:フェニルアラニン、チロシン
(1)細胞表面抗原に対する抗体の可変領域を含むFabおよびTfRに結合するIgG部分を含むバイスペシフィック抗体であって、該FabがIgG部分の重鎖のN末端に直接結合するバイスペシフィック抗体、
(2)細胞表面抗原に対する抗体のVHのCDR1~3を含むVHおよびVLのCDR1~3を含むVLを含むFabならびにTfRに結合するIgG部分を含むバイスペシフィック抗体であって、該FabがIgG部分の重鎖のN末端に直接結合するバイスペシフィック抗体、
(3)細胞表面抗原への抗体のVHおよびVLを含むFabならびにTfRに結合するIgG部分を含むバイスペシフィック抗体であって、該FabがIgG部分の重鎖のN末端に直接結合するバイスペシフィック抗体、ならびに
(4)細胞表面抗原に結合するVHHおよびTfRに結合するIgG部分を含むバイスペシフィック抗体であって、該VHHがIgG部分の重鎖のN末端に直接結合するバイスペシフィック抗体。
1)配列番号32で表されるアミノ酸配列もしくは配列番号32で表されるアミノ酸配列から、2番目のチロシンのアラニンもしくはフェニルアラニンへの置換および3番目のスレオニンのアラニンもしくはグリシンへの置換から選ばれる少なくとも1つの置換により改変されたアミノ酸配列を含むCDR1。
2)配列番号33で表されるアミノ酸配列もしくは配列番号33で表されるアミノ酸配列から、1番目のバリンのアラニンへの置換、2番目のイソロイシンのアラニンもしくはロイシンへの置換、7番目のバリンのグルタミン酸への置換、10番目のアスパラギン酸のアラニンへの置換および13番目のアスパラギン酸のプロリンへの置換から選ばれる少なくとも一つの置換により改変されたアミノ酸配列を含むCDR2。
3)配列番号34で表されるアミノ酸配列もしくは配列番号34で表されるアミノ酸配列から、3番目のグルタミンのアラニンもしくはアスパラギン酸への置換、4番目のプロリンの任意の天然アミノ酸への置換、5番目のトリプトファンのアラニン、フェニルアラニン、ヒスチジンもしくはチロシンへの置換、7番目のチロシンのアラニンもしくはフェニルアラニンへの置換および13番目のバリンのロイシンへの置換から選ばれる少なくとも1つの置換により改変されたアミノ酸配列を含むCDR3。4番目のプロリンの任意の天然アミノ酸への置換としては、例えば、アラニン、チロシン、セリン、アスパラギン酸、グルタミン、グルタミン酸、スレオニン、アルギニン、グリシン、リジン、メチオニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、トリプトファン、フェニルアラニンもしくはヒスチジンへの置換が挙げられる。
(ai)それぞれ配列番号17、18および19で示されるアミノ酸配列を含むCDR1、2および3を含むVLならびにそれぞれ配列番号32、33および34で示されるアミノ酸配列を含むCDR1、2および3を含むVHを含む抗TfR抗体と、競合してTfRに結合するTfRに結合するIgG部分。
(aii)それぞれ配列番号17、18および19で示されるアミノ酸配列を含むCDR1、2および3を含むVLならびにそれぞれ配列番号32、33および34で示されるアミノ酸配列を含むCDR1、2および3を含むVHを含む抗TfR抗体と同じエピトープに結合するTfRに結合するIgG部分。
(bi)それぞれ配列番号17、18および19で示されるアミノ酸配列を含むCDR1、2および3を含むVLならびにそれぞれ配列番号42、43および44で示されるアミノ酸配列を含むCDR1、2および3を含むVHを含む抗TfR抗体と、競合してTfRに結合するIgG部分。
(bii)それぞれ配列番号17、18および19で示されるアミノ酸配列を含むCDR1、2および3を含むVLならびにそれぞれ配列番号42、43および44で示されるアミノ酸配列を含むCDR1、2および3を含むVHを含む抗TfR抗体と同じエピトープに結合する、TfRに結合するIgG部分。
(ci)それぞれ配列番号17、18および19で示されるアミノ酸配列を含むCDR1、2および3を含むVLならびにそれぞれ配列番号47、48および49で示されるアミノ酸配列を含むCDR1、2および3を含むVHを含む抗TfR抗体と、競合してTfRに結合するIgG部分。
(cii)それぞれ配列番号17、18および19で示されるアミノ酸配列を含むCDR1、2および3を含むVLならびにそれぞれ配列番号47、48および49で示されるアミノ酸配列を含むCDR1、2および3を含むVHを含む抗TfR抗体と同じエピトープに結合する、TfRに結合するIgG部分。
(a)それぞれ配列番号33および34で表されるアミノ酸配列を含むCDR2および3、ならびに、配列番号32で表されるアミノ酸配列から、2番目のチロシンのアラニンまたはフェニルアラニンへの置換により改変されたアミノ酸配列を含むCDR1を含むVH
(b)それぞれ配列番号33および34で表されるアミノ酸配列を含むCDR2および3、ならびに、配列番号32で表されるアミノ酸配列から、3番目のスレオニンのアラニンまたはグリシンへの置換により改変されたアミノ酸配列を含むCDR1を含むVH
(c)それぞれ配列番号32および34で表されるアミノ酸配列を含むCDR1および3、ならびに、配列番号33で表されるアミノ酸配列から、1番目のバリンのアラニンへの置換により改変されたアミノ酸配列を含むCDR2を含むVH
(d)それぞれ配列番号32および34で表されるアミノ酸配列を含むCDR1および3、ならびに、配列番号33で表されるアミノ酸配列から、2番目のイソロイシンのアラニンまたはロイシンへの置換により改変されたアミノ酸配列を含むCDR2を含むVH
(e)それぞれ配列番号32および34で表されるアミノ酸配列を含むCDR1および3、ならびに、配列番号33で表されるアミノ酸配列から、7番目のバリンのグルタミン酸への置換により改変されたアミノ酸配列を含むCDR2を含むVH
(f)それぞれ配列番号32および34で表されるアミノ酸配列を含むCDR1および3、ならびに、配列番号33で表されるアミノ酸配列から、10番目のアスパラギン酸のアラニンへの置換により改変されたアミノ酸配列を含むCDR2を含むVH
(g)それぞれ配列番号32および34で表されるアミノ酸配列を含むCDR1および3、ならびに、配列番号33で表されるアミノ酸配列から、13番目のアスパラギン酸のプロリンへの置換により改変されたアミノ酸配列を含むCDR2を含むVH
(h)それぞれ配列番号32および33で表されるアミノ酸配列を含むCDR1および2、ならびに、配列番号34で表されるアミノ酸配列から、3番目のグルタミンのアラニンまたはアスパラギン酸への置換により改変されたアミノ酸配列を含むCDR3を含むVH
(i)それぞれ配列番号32および33で表されるアミノ酸配列を含むCDR1および2、ならびに、配列番号34で表されるアミノ酸配列から、4番目のプロリンの任意の天然アミノ酸への置換により改変されたアミノ酸配列を含むCDR3を含むVH
(j)それぞれ配列番号32および33で表されるアミノ酸配列を含むCDR1および2、ならびに、配列番号34で表されるアミノ酸配列から、4番目のプロリンのアラニン、チロシン、セリン、アスパラギン酸、グルタミン、グルタミン酸、スレオニン、アルギニン、グリシン、リジン、メチオニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、トリプトファン、フェニルアラニンもしくはヒスチジンへの置換により改変されたアミノ酸配列を含むCDR3を含むVH
(k)それぞれ配列番号32および33で表されるアミノ酸配列を含むCDR1および2、ならびに、配列番号34で表されるアミノ酸配列から、5番目のトリプトファンのアラニン、フェニルアラニン、ヒスチジンまたはチロシンへの置換により改変されたアミノ酸配列を含むCDR3を含むVH
(l)それぞれ配列番号32および33で表されるアミノ酸配列を含むCDR1および2、ならびに、配列番号34で表されるアミノ酸配列から、7番目のチロシンのアラニンまたはフェニルアラニンへの置換により改変されたアミノ酸配列を含むCDR3を含むVH
(m)それぞれ配列番号32および33で表されるアミノ酸配列を含むCDR1および2、ならびに、配列番号34で表されるアミノ酸配列から、バリンのロイシンへの置換により改変されたアミノ酸配列を含むCDR3を含むVH
(2a)それぞれ配列番号60、61および62で示されるアミノ酸配列を含むCDR1、2および3を含むVH、
(2b)それぞれ配列番号65、66および67で示されるアミノ酸配列を含むCDR1、2および3を含むVH。
(i)それぞれ配列番号17、18および19で示されるアミノ酸配列を含むCDR1、2および3を含むVLならびに上記(2a)~(2b)のいずれか1つに示されるVHを含む抗EGFR抗体と、競合してEGFRに結合する抗体。
(ii)それぞれ配列番号17、18および19で示されるアミノ酸配列を含むCDR1、2および3を含むVLならびに上記(2a)~(2b)のいずれか1つに示されるVHを含む抗EGFR抗体と同じエピトープに結合する抗体。
(a)配列番号59または配列番号64で表されるアミノ酸配列を含むVH、および配列番号16で表されるアミノ酸配列を含むVLを含む抗体
(b)配列番号110で表されるアミノ酸配列を含むVH、および配列番号111で表されるアミノ酸配列を含むVLを含む抗体
(c)配列番号112で表されるアミノ酸配列を含むVH、および配列番号113で表されるアミノ酸配列を含むVLを含む抗体
(d)配列番号114で表されるアミノ酸配列を含むVH、および配列番号115で表されるアミノ酸配列を含むVLを含む抗体
(e)配列番号116で表されるアミノ酸配列を含むVH、および配列番号117で表されるアミノ酸配列を含むVLを含む抗体
該TfRに結合するIgG部分の重鎖N末端に直接またはリンカーを介して該Fabが結合するバイスペシフィック抗体。
(a)それぞれ配列番号22、23および24で示されるアミノ酸配列を含むCDR1、2および3を含むVH
(b)それぞれ配列番号27、28および29で示されるアミノ酸配列を含むCDR1、2および3を含むVH
(c)それぞれ配列番号32、33および34で示されるアミノ酸配列を含むCDR1、2および3を含むVH
(d)それぞれ配列番号37、38および39で示されるアミノ酸配列を含むCDR1、2および3を含むVH
(e)それぞれ配列番号42、43および44で示されるアミノ酸配列を含むCDR1、2および3を含むVH
(f)それぞれ配列番号47、48および49で示されるアミノ酸配列を含むCDR1、2および3を含むVH
該TfRに結合するIgG部分の重鎖N末端に直接またはリンカーを介して該Fabが結合するバイスペシフィック抗体。
(a)それぞれ配列番号22、23および24で示されるアミノ酸配列を含むCDR1、2および3を含むVH
(b)それぞれ配列番号27、28および29で示されるアミノ酸配列を含むCDR1、2および3を含むVH
(c) それぞれ配列番号32、33および34で示されるアミノ酸配列を含むCDR1、2および3を含むVH
(d)それぞれ配列番号37、38および39で示されるアミノ酸配列を含むCDR1、2および3を含むVH
(e)それぞれ配列番号42、43および44で示されるアミノ酸配列を含むCDR1、2および3を含むVH
(f)それぞれ配列番号47、48および49で示されるアミノ酸配列を含むCDR1、2および3を含むVH
該TfRに結合するIgG部分の重鎖N末端に直接またはリンカーを介して該Fabが結合するバイスペシフィック抗体。
(a)それぞれ配列番号22、23および24で示されるアミノ酸配列を含むCDR1、2および3を含むVH
(b)それぞれ配列番号27、28および29で示されるアミノ酸配列を含むCDR1、2および3を含むVH
(c)それぞれ配列番号32、33および34で示されるアミノ酸配列を含むCDR1、2および3を含むVH
(d)それぞれ配列番号37、38および39で示されるアミノ酸配列を含むCDR1、2および3を含むVH
(e)それぞれ配列番号42、43および44で示されるアミノ酸配列を含むCDR1、2および3を含むVH
(f)それぞれ配列番号47、48および49で示されるアミノ酸配列を含むCDR1、2および3を含むVH
該TfRに結合するIgG部分の重鎖N末端に直接またはリンカーを介して該Fabが結合するバイスペシフィック抗体。
該TfRに結合するIgG部分の重鎖N末端に直接またはリンカーを介して該Fabが結合するバイスペシフィック抗体。
該TfRに結合するIgG部分の重鎖N末端に直接またはリンカーを介して該Fabが結合するバイスペシフィック抗体。
該TfRに結合するIgG部分の重鎖N末端に直接またはリンカーを介してN末端側ポリペプチドが結合するバイスペシフィック抗体が挙げられる。
本発明におけるモノクローナル抗体の製造方法は、下記の作業工程を包含する。すなわち、(1)免疫原として使用する抗原の精製および細胞表面に抗原が過剰発現した細胞の作製の少なくとも一方、(2)抗原を動物に免疫した後、血液を採取しその抗体価を検定して脾臓などを摘出する時期を決定し、抗体産生細胞を調製する工程、(3)骨髄腫細胞(ミエローマ)の調製、(4)抗体産生細胞とミエローマとの細胞融合、(5)目的とする抗体を産生するハイブリドーマ群の選別、(6)ハイブリドーマ群からの単クローン(monoclonal)細胞の分離(クローニング)、(7)場合によっては、モノクローナル抗体を大量に製造するためのハイブリドーマの培養、またはハイブリドーマを移植した動物の飼育、(8)このようにして製造されたモノクローナル抗体の生理活性およびその抗原結合特異性の検討、または標識試薬としての特性の検定、などである。
EGFR等の細胞表面抗原またはTfRを発現させた細胞は、EGFR等の細胞表面抗原またはTfRの全長またはその部分長をコードするcDNAを含む発現ベクターを、大腸菌、酵母、昆虫細胞または動物細胞などに導入することにより、得ることができる。また、TfRおよびEGFR等の細胞表面抗原の少なくとも一方を多量に発現している各種ヒト腫瘍培養細胞またはヒト組織などからTfRおよびEGFR等の細胞表面抗原の少なくとも一方を精製し、抗原として使用することができる。また、該腫瘍培養細胞または該組織などをそのまま抗原として用いることもできる。さらに、Fmoc法またはtBoc法などの化学合成法によりEGFR等の細胞表面抗原またはTfRの部分配列を有する合成ペプチドを調製し、抗原に用いることもできる。
マウス、ラット、ハムスター、ウサギ、ウシ、またはアルパカなどの動物に、(1)で得られる抗原を免疫して、その動物の脾臓、リンパ節または末梢血中の抗体産生細胞を採取する。また、動物としては、例えば、富塚らの文献[Tomizuka. et al., Proc Natl Acad Sci USA., 97、722,(2000)]に記載されているヒト由来抗体を産生するトランスジェニックマウス、免疫原性を高めるためにTfRまたはEGFR等の細胞表面抗原のコンディショナルノックアウトマウスなどが被免疫動物として挙げられる。
ミエローマとしては、マウス、ラット、モルモット、ハムスター、ウサギまたはヒト等の哺乳動物に由来する自己抗体産生能のない細胞を用いることが出来るが、一般的にはマウスから得られた株化細胞、例えば、8-アザグアニン耐性マウス(BALB/c由来)ミエローマ細胞株P3-X63Ag8-U1(P3-U1)[Current Topics in Microbiology and Immunology, 18, 1(1978)]、P3-NS1/1-Ag41(NS-1)[European J. Immunology, 6, 511 (1976)]、SP2/0-Ag14(SP-2)[Nature, 276, 269(1978)]、P3-X63-Ag8653(653)[J. Immunology, 123, 1548 (1979)]、またはP3-X63-Ag8(X63)[Nature, 256, 495(1975)]などが用いられる。該細胞株は、適当な培地、例えば8-アザグアニン培地[グルタミン、2-メルカプトエタノール、ゲンタマイシン、FCSおよび8-アザグアニンを加えたRPMI-1640培地]、イスコフ改変ダルベッコ培地(Iscove’s Modified Dulbecco’s Medium;以下「IMDM」という)、またはダルベッコ改変イーグル培地(Dulbecco’s Modified Eagle Medium;以下「DMEM」という)などの培地で継代培養する。細胞融合の3~4日前に上記の細胞株を正常培地(例えば、10% FCSを含むDMEM培地)で継代培養し、融合を行う当日に2×107個以上の細胞数を確保する。
(2)で得られる融合用抗体産生細胞と(3)で得られるミエローマ細胞を、Minimum Essential Medium(MEM)培地またはPBS(リン酸二ナトリウム1.83g、リン酸一カリウム0.21g、食塩7.65g、蒸留水1リットル、pH7.2)でよく洗浄し、融合用抗体産生細胞:ミエローマ細胞=5:1~10:1になるように混合し、遠心分離した後、上清を除く。沈澱した細胞集塊をよくほぐした後、ポリエチレングリコール-1000(PEG-1000)、MEM培地およびジメチルスルホキシドの混合液を、37℃にて攪拌しながら加える。さらに1~2分間毎にMEM培地1~2mLを数回加えた後、MEM培地を加えて全量が50mLになるようにする。遠心分離後、上清を除き、沈澱した細胞集塊を緩やかにほぐした後、HAT培地[ヒポキサンチン、チミジンおよびアミノプテリンを加えた正常培地]中に緩やかに細胞を懸濁する。この懸濁液を5%CO2インキュベーター中、37℃にて7~14日間培養する。
融合に用いたミエローマ細胞が8-アザグアニン耐性株である場合、すなわちヒポキサンチン・グアニン・ホスホリボシルトランスフェラーゼ(HGPRT)欠損株である場合は、融合しなかったミエローマ細胞およびミエローマ細胞同士の融合細胞は、HAT培地中では生存することができない。一方、抗体産生細胞同士の融合細胞および抗体産生細胞とミエローマ細胞とのハイブリドーマは、HAT培地中で生存することができるが、抗体産生細胞同士の融合細胞はやがて寿命に達する。したがって、HAT培地中での培養を続けることによって、抗体産生細胞とミエローマ細胞とのハイブリドーマのみが生き残り、結果的にハイブリドーマを取得することができる。
プリスタン処理[2,6,10,14-テトラメチルペンタデカン(Pristane)0.5mLを腹腔内投与し、2週間飼育する]した8~10週令のマウスまたはヌードマウスに、(5)で得られるモノクローナル抗体産生ハイブリドーマを腹腔内に注射する。10~21日でハイブリドーマは腹水癌化する。このマウスから腹水を採取し、遠心分離して固形分を除去後、40~50%硫酸アンモニウムで塩析し、カプリル酸沈殿法、DEAE-セファロースカラム、プロテインAカラムまたはゲル濾過カラムによる精製を行い、IgGまたはIgM画分を集め、精製モノクローナル抗体とする。また、同系統のマウス(例えば、BALB/c)若しくはNu/Nuマウス、ラット、モルモット、ハムスターまたはウサギ等の腹腔内で該ハイブリドーマを増殖させることにより、TfRまたはEGFR等の細胞表面抗原に結合するモノクローナル抗体を大量に含む腹水を得ることができる。
TfRまたはEGFR等の細胞表面抗原に対するモノクローナル抗体の結合活性は、オクテルロニー(Ouchterlony)法、ELISA法、RIA法、フローサイトメトリー法(FCM)または表面プラズモン共鳴法(SPR)などのバインディングアッセイ系により測定することができる。
本発明において、抗体が認識し結合するエピトープの同定は以下のようにして行うことができる。
遺伝子組換え抗体の作製例として、P. J. Delves., ANTIBODY PRODUCTION ESSENTIAL TECHNIQUES., 1997 WILEY、P. Shepherd and C. Dean. Monoclonal Antibodies., 2000 OXFORD UNIVERSITY PRESSおよびJ. W. Goding., Monoclonal Antibodies:principles and practice., 1993 ACADEMIC PRESSなどに概説されているが、以下にキメラ抗体、ヒト化抗体およびヒト抗体の作製方法を示す。また、遺伝子組換えマウス、ラット、ハムスターおよびラビット抗体についても、同様の方法で作製することができる。
モノクローナル抗体のVHおよびVLをコードするcDNAの取得は、例えば以下のようにして行うことができる。
遺伝子組換え抗体発現用ベクターは、動物細胞用発現ベクターにヒト抗体のCHおよびCLの少なくとも一方をコードするDNAをクローニングすることにより構築することができる。
[Biochem. Biophys. Res. Commun., 149, 960 (1987)]、CMVプロモーター(米国特許第5,168,062号明細書)または免疫グロブリンH鎖のプロモーター[Cell, 41, 479 (1985)]とエンハンサー[Cell, 33, 717(1983)]などを用いることができる。
(2)で得られる遺伝子組換え抗体発現用ベクター内のヒト抗体のCHまたはCLをコードする遺伝子の各々の上流に、(1)で得られる非ヒト抗体のVHまたはVLをコードするcDNAを各々クローニングすることで、キメラ抗体発現ベクターを構築することができる。
ヒト化抗体のVHまたはVLをコードするcDNAは、以下のようにして作製することができる。まず、(1)で得られる非ヒト抗体のVHまたはVLのCDRのアミノ酸配列を移植するヒト抗体のVHまたはVLのフレームワーク領域(以下、FRと表記する)のアミノ酸配列をそれぞれ選択する。
ヒト化抗体は、非ヒト抗体のVHおよびVLのCDRのみをヒト抗体のVHおよびVLのFRに移植しただけでは、その抗原結合活性は元の非ヒト抗体に比べて低下する[BIO/TECHNOLOGY, 9, 266(1991)]。そのため、ヒト抗体のVHおよびVLのFRのアミノ酸配列のうち、直接抗原との結合に関与しているアミノ酸残基、CDRのアミノ酸残基と相互作用するアミノ酸残基、および抗体の立体構造を維持し間接的に抗原との結合に関与しているアミノ酸残基を同定し、それらのアミノ酸残基を元の非ヒト抗体のアミノ酸残基に置換することにより、低下したヒト化抗体の抗原結合活性を上昇させることができる。
(2)で得られる遺伝子組換え抗体発現用ベクターのヒト抗体のCHまたはCLをコードするそれぞれの遺伝子の上流に、構築したヒト化抗体のVHまたはVLをコードするcDNAをそれぞれクローニングし、ヒト化抗体発現ベクターを構築することができる。
ヒト抗体を産生する動物を被免疫動物として用いて、モノクローナル抗体を産生するハイブリドーマを樹立した場合には、(1)において、ヒト抗体のVHおよびVLのアミノ酸配列およびcDNA配列を得ることができる。そこで、(2)で得られる遺伝子組換え抗体発現用ベクターのヒト抗体のCHまたはCLをコードするそれぞれの遺伝子の上流に、(1)で得たヒト抗体のVHまたはVLをコードする遺伝子をそれぞれクローニングすることで、ヒト抗体発現ベクターを構築することができる。
(3)、(6)および(7)で得られる遺伝子組換え抗体発現用ベクター、またはそれらを改変した発現ベクターを用いて遺伝子組換え抗体を一過性に発現させ、得られた多種類の遺伝子組換え抗体の抗原結合活性を効率的に評価することができる。
(3)、(6)および(7)で得られた遺伝子組換え抗体発現ベクターを適当な宿主細胞に導入することにより遺伝子組換え抗体を安定的に発現する形質転換株を得ることができる。
本発明のバイスペシフィック抗体は、N末端側ポリペプチドとIgG部分とをそれぞれ設計し、それらを連結させたバイスペシフィック抗体を設計することによって作製することができる。
IgG部分は、上記1.に記載の方法を用いてモノクローナル抗体を取得し、各抗体のCDRおよび可変領域のcDNA配列を上記2.に記載の方法を用いて決定し、抗体のCDRまたは可変領域を含むIgG部分を設計することにより得ることができる。
N末端側ポリペプチドに、抗体のCDRまたは可変領域が含まれる場合、上記1.および2.に記載の方法で、抗体のCDRまたは可変領域のDNA配列を決定し、それらを含むN末端側ポリペプチドを設計することによって作製することができる。このようなN末端側ポリペプチドとしては、scFvなどのようにVHとVLを直接もしくは適当なリンカーを介して結合させた1本鎖のもの、FabおよびdsFvなどのように2本鎖で発現させ、発現後にS-S結合するよう設計したもの、またはVHHなども用いることができる。N末端側ポリペプチドの抗原結合活性は、上記方法で評価し、抗原結合活性を保持しているものを選択することができる。
4-1.軽鎖共通型バイスペシフィック抗体の作製
N末端側ポリペプチドがFabであり、該FabとIgG部分の軽鎖が共通であるバイスペシフィック抗体は、具体的に以下のように作製することができる。
(1)N末端側ポリペプチドがFabである軽鎖非共通型バイスペシフィック抗体は、具体的に以下のように作製することができる。
N末端側ポリペプチドのVL-CLとIgG部分のVHを連結したポリペプチドをコードするDNA、N末端側ポリペプチドのVH-CH1をコードするDNA、およびIgG部分のVLをコードするDNAを合成し、これらのDNAを上記2.(2)に記載の遺伝子組換え抗体発現ベクターに組み込み、当該バイスペシフィック抗体を発現させることで、作製することができる。IgG部分とN末端側ポリペプチドがリンカーを介して結合している場合、そのリンカー配列をコードするDNAも含めて合成する。
VHHとIgG部分のVHを連結したポリペプチドをコードするDNA、およびIgG部分のVLをコードするDNAを合成し、これらのDNAを上記2.(2)に記載の遺伝子組換え抗体発現ベクターに組み込み、当該バイスペシフィック抗体を発現させることで、作製することができる。該VHHとIgG部分がリンカーを介して結合している場合、そのリンカー配列をコードするDNAも含めて合成する。
N末端側ポリペプチドが1本鎖の場合は、N末端側ポリペプチドをコードするDNAとIgG部分のVHをコードするDNAとを連結したDNAを合成する。N末端側ポリペプチドが2つの一本鎖ポリペプチドからなる会合体の場合は、N末端側ポリペプチドを構成する一方の一本鎖ポリペプチドを、IgG部分のVHをコードするDNAと連結して合成するとともに、N末端側ポリペプチドを構成するもう一方の本鎖ポリペプチドをコードするDNAも合成する。また、IgG部分のVLをコードするDNAも合成する。IgG部分とN末端側ポリペプチドがリンカーを介して結合している場合、そのリンカー配列をコードするDNAも含めて合成する。これらのDNAを上記2.(2)に記載の遺伝子組換え抗体発現ベクターに組み込み、当該バイスペシフィック抗体を発現させることで、作製することができる。
N末端側ポリペプチドが上記以外のポリペプチドである場合、本発明のバイスペシフィック抗体は具体的には以下のように作製することができる。
N末端側ポリペプチドが1本鎖の場合は、N末端側ポリペプチドをコードするDNAとIgG部分のVHをコードするDNAとを連結したDNAを合成する。N末端側ポリペプチドが2本以上の一本鎖ポリペプチドからなる会合体の場合は、N末端側ポリペプチドを構成するうちの1本の一本鎖ポリペプチドを、IgG部分のVHをコードするDNAと連結して合成するとともに、N末端側ポリペプチドを構成する残りの一本鎖ポリペプチドをコードするDNAも合成する。また、IgG部分のVLをコードするDNAも合成する。IgG部分とN末端側ポリペプチドがリンカーを介して結合している場合、そのリンカー配列をコードするDNAも含めて合成する。これらのDNAを上記2.(2)に記載の遺伝子組換え抗体発現ベクターに組み込み、当該バイスペシフィック抗体を発現させることで、作製することができる。
精製したバイスペシフィック抗体または該バイスペシフィック抗体断片の活性評価は、以下のように行うことができる。
本発明のバイスペシフィック抗体または該バイスペシフィック抗体断片は、TfRおよびEGFR等の細胞表面抗原の少なくとも一方が関係する疾患、好ましくはTfRおよびEGFR等の細胞表面抗原の発現細胞が関与する疾患の治療に用いることができる。TfRおよびEGFR等の細胞表面抗原の少なくとも一方が関係する疾患としては、例えば、悪性腫瘍およびがんなどが挙げられる。
本発明のバイスペシフィック抗体または該バイスペシフィック抗体断片を用いて、TfRおよびEGFR等の細胞表面抗原の少なくとも一方が発現した細胞を検出または測定することにより、TfRおよびEGFR等の細胞表面抗原の少なくとも一方が関係する疾患、好ましくはTfRおよびEGFR等の細胞表面抗原の発現細胞が関与する疾患を診断することができる。
N末端にFLAG-Fcが付加されたヒトおよびサルTfRの細胞外ドメインタンパク質をそれぞれ以下に記載する方法で作製した。ヒトTfR細胞外ドメインをコードする塩基配列を配列番号1に、当該塩基配列から推定されるアミノ酸配列を配列番号2に、サルTfR細胞外ドメインをコードする塩基配列を配列番号3に、当該塩基配列から推定されるアミノ酸配列を配列番号4に示す。
ヒトTfR遺伝子配列(Genbank Accession Number:NM_003234.2、配列番号5;該遺伝子がコードするアミノ酸配列を配列番号6に示す)を基に配列番号1で示される塩基配列からなるヒトTfRの細胞外ドメインの遺伝子断片を合成した。
C末端にFLAG-FcまたはGSTが付加されたヒトまたはサルEGFRの細胞外ドメインタンパク質をそれぞれ以下に記載する方法で作製した。ヒトEGFRのシグナル配列および細胞外ドメインをコードする塩基配列を配列番号9に、当該塩基配列から推定されるアミノ酸配列を配列番号10に、サルEGFRのシグナル配列および細胞外ドメインをコードする塩基配列を配列番号11に、当該塩基配列から推定されるアミノ酸配列を配列番号12に示す。
pKANTEX(米国特許第6423511号明細書に記載)に配列番号5に示すヒトTfR遺伝子をクローニングし、膜発現用ヒトTfR発現ベクターpKANTEX-ヒトTfR fullを得た。
ヒトTfR、ヒトEGFRに対するモノクローナル抗体を取得するために、ヒト抗体産生動物にアジュバントで混合したFLAG-Fc-ヒトTfR、ヒトEGFR-FLAG-Fcを計4~5回免疫した。被免疫動物から血清を回収し、ヒトTfR、ヒトEGFRに対する結合活性をELISAにより解析し、抗体価が上がっていることを確認した。
1.軽鎖がA27のTfR免疫ヒト抗体M13ファージライブラリーの作製
免疫動物から得られた脾臓細胞または末梢血単核細胞(peripheral blood mononuculear cell;PBMC)からRNeasy Mini kit(QIAGEN社製)を用いてRNAを抽出し、SMARTer RACE cDNA増幅キット(Clontech社製)にてcDNAを増幅し、さらにPCRにてVH遺伝子断片を増幅させた。該VH遺伝子断片およびヒトの抗体germ-line配列であり、配列番号15で示される塩基配列からなるA27配列をファージミドpCANTAB 5E(Amersham Pharmacia社製)に挿入し、大腸菌TG1(Lucigen社製)を形質転換してプラスミドを得た。
このTfR免疫ヒト抗体M13ファージライブラリーを用いて、下記のファージディスプレイ法により、A27にコードされるVLを有する抗TfRモノクローナル抗体を取得した。
ヒトTfR(BBI Solutions社製)を固相化し、SuperBlock Blockig Buffer(Thermo Fisher社製)を用いてヒトTfRが結合していない部位をブロックしたMAXISORP STARTUBE(NUNC社製)と、ヒト抗体M13ファージライブラリーを室温下で1~2時間反応させ、D-PBS(-)および0.1% Tween20含有PBS(以下PBS-Tと記載する。和光純薬工業社製)でそれぞれ3回洗浄後に0.1MのGly-HCl(pH2.2)でファージを溶出し、溶出液を2MのTris-HCl(pH8.5)で中和した。
CHO細胞にヒト抗体M13ファージライブラリーを氷上で30分間反応させ、遠心分離により細胞を除いた上清を回収してCHO細胞と反応後のファージ溶液を調製した。このファージ液と、実施例1で取得したCFSE染色されたヒトTfR/CHOを氷上で30分間~1時間反応させた後、遠心分離により上清を除去した。5%ウシ胎仔血清、1mMのEDTAおよび0.1%NaN3を含有したD-PBS(-)(以下SMバッファーと記載する)で洗浄を複数回繰り返し行った後、1次抗体として抗M13抗体(GEヘルスケア社)を加えて氷上で30分間反応させた。遠心分離により上清を除去し、SMバッファーによる洗浄を複数回繰り返し行った後、2次抗体としてAPC標識Goat抗mouse IgG(H+L)抗体(Southern Biotech社)を加えて氷上で30分間反応させた。遠心分離により上清を除去し、SMバッファーによる洗浄を複数回繰り返し行った後、7-aminoactinomycin D(AAD)(BD Biosciences社)を添加し、氷上で10分間反応させた後、フローサイトメーター(BDバイオサイエンス社、FACS AriaIII)で7-AAD陰性の生細胞画分かつCFSE陽性の抗原発現細胞画分のソーティングをおこなった。なお、抗原発現細胞結合ファージの濃縮が確認できたラウンドにおいては上記に加えてさらにAPC陽性のファージ結合画分をソートした。ソートされた細胞から0.1MのGly-HCl(pH2.2)でファージを溶出し、溶出液を2MのTris-HCl(pH8.5)で中和した。
(1)細胞融合によるハイブリドーマ作製
マウスミエローマ細胞株 P3-U1(P3X63Ag8U.1、ATCC CRL-1597)をエスクロンクローニングメディウム(エーディア社)で培養して無血清馴化したのち、細胞融合の親株として用いた。被免疫動物の脾臓を無菌的に採取しRED BLOOD CELL LYSING BUFFER(Sigma-Aldrich社)で溶血後、PBSで2回洗浄し、脾細胞とP3-U1の細胞数が、脾臓細胞:P3-U1=8:1になるよう混合し、遠心分離(1200rpm、5分間)した。
ハイブリドーマ培養上清に含まれる抗体のTfRへの結合活性をELISAで評価した。被験サンプルにはハイブリドーマ培養上清を使用し、測定は上記2.(2)と同様の手順で実施した。
スクリーニングで陽性であったウェルの細胞についてサブクローニングを行い、クローニングメディウム中で約7~10日間培養した。
クローニングしたハイブリドーマからRneasy mini kit(Qiagen社)を用いてトータルRNAを抽出し、5’-RACE法により抗体遺伝子を増幅させた。RACE用cDNAの合成にはSMARTer RACE Kit(Clontech社)を用いた。増幅させた抗体可変領域断片を、TOPO TA cloning(Invitrogen社)を用いてクローニングして該DNA断片の塩基配列を確認した。
取得した抗TfR抗体の遺伝子が組み込まれた可溶性IgGの発現ベクターをそれぞれ作製した。まず、共通のVLをコードするA27遺伝子をN5KG4PE(IDEC Pharmaceuticals)またはN5KG4PE R409K(国際公開第2006/033386号に記載)にサブクローニングした。
(1)EGFR抗体の作製
1.EGFR免疫ヒト抗体M13ファージライブラリーの作製
実施例4の1.と同様の方法により、A27配列からなるVL遺伝子または抗TfR抗体2230のVL遺伝子を有し、VH遺伝子がライブラリー化されたEGFR免疫ヒト抗体M13ファージライブラリーを得た。
実施例1で取得したヒトEGFR-FcまたはサルEGFR-Fcを固相化し、SuperBlock Blockig Buffer(Thermo Fisher社製)を用いて抗原が結合していない部位をブロックしたMAXISORP STARTUBE(NUNC社製)と、EGFR免疫ヒト抗体M13ファージライブラリーを用い、実施例4の2と同様の方法によりヒトEGFR及びサルEGFRに特異的に結合するscFvを提示したファージを単クローン化した。
国際公開第2012/145469号に記載された抗Glypican-3モノクローナル抗体HN3の可変領域をもつ抗体を作製した。HN3のVHのアミノ酸配列を配列番号78に示す。HN3のVHをコードする遺伝子を合成し、実施例4と同様の方法で、N5KG4PE R409Kにサブクローニングし、ヒトIgG4PE R409Kの定常領域をもつ抗Glypican-3モノクローナル抗体HN3の発現ベクターを得た。
図1(A)に記載する構造を有する、ヒト及びサルTfRならびにヒト及びサルEGFRに結合するバイスペシフィック抗体を以下の方法で作製した。図1(A)~(C)において、N末端側ポリペプチドに含まれるVHをVH1、C末端側のIgG部分に含まれるVHをVH2という。バイスペシフィック抗体の形状には国際公開第2009/131239号に記載の形状を採用した。
以下の工程で作製されるバイスペシフィック抗体のリンカー配列としては、IgG4のヒンジ領域の一部(ES(配列番号79)、ESKYG(配列番号80)およびESKYGPP(配列番号81)など)を連結させたもの、あるいはGSリンカー(GGGGS(配列番号82)やGGGGSの3回繰り返し配列)を用いた。また、IgG部分の重鎖定常領域として、IgG4PEまたは国際公開第2006/033386号記載のIgG4PE R409Kの重鎖定常領域(塩基配列を配列番号83、アミノ酸配列を配列番号84で示す)を用いた。
表3に記載されたバイスペシフィック抗体のうち、図1(A)に示す軽鎖共通型バイスペシフィック抗体発現ベクターを以下に記載する方法で作製した。
この二つの遺伝子断片を実施例4または実施例5で取得した抗体の発現ベクターのVH1とIgG部分のCH1の間にサブクローニングして、バイスペシフィック抗体発現ベクターを得た。
表3に記載されたバイスペシフィック抗体のうち、軽鎖非共通型バイスペシフィック抗体について、発現ベクターを以下に記載する方法で作製した。
実施例4から実施例6で抗体発現ベクターにサブクローニングした抗TfRモノクローナル抗体、細胞表面抗原に対するモノクローナル抗体、および両抗原に対する結合部位を有するバイスペシフィック抗体を下記の方法でそれぞれ発現させ、精製した。
実施例7で得られたEGFR-TfRバイスペシフィック抗体のヒトTfRおよびサルTfRならびにヒトEGFRおよびサルEGFRそれぞれに対する結合活性と種交差性を確認することを目的として、実施例1で作製したFLAG-Fc-ヒトTfR、FLAG-Fc-サルTfR、ヒトEGFR-GSTおよびサルEGFR-GSTを用いて、表面プラズモン共鳴法(SPR法)による結合性試験を実施した。測定機器として、BiacoreT100(GEヘルスケア社製)を使用した。
各種がん細胞株における各種抗原発現量を、以下の手順に従いfluoresence activated cell sorting(FACS)法により評価した。評価にはPE標識抗ヒトCD71抗体(BD Pharmingen社)および、AlexaFluor488標識抗EGFR抗体(SantaCruz社)を用いた。
がん細胞株に対する増殖阻害活性を指標として、実施例4で得られたTfRモノクローナル抗体の増殖阻害活性を以下のように評価した。
がん細胞株に対する増殖阻害活性を指標として、実施例5で得られた細胞表面抗原に対する抗体の増殖阻害活性を以下のように評価した。
がん細胞株に対する増殖阻害活性を指標として、実施例6で得られたバイスペシフィック抗体の増殖阻害活性を以下のように評価した。
抗TfR抗体の可変領域をN末端側ポリペプチドに含むバイスペシフィック抗体は、ほとんど増殖阻害活性を示さなかった。
バイスペシフィック抗体のがん細胞に対する増殖阻害活性の作用機序を明らかにするため、EGFR-TfRバイスペシフィック抗体が、がん細胞上のTfRとトランスフェリンの結合を阻害するかフローサイトメーターを用いて以下のように評価した。
バイスペシフィック抗体のがん細胞に対する増殖阻害活性の作用機序を明らかにするため、がん細胞にEGFR-TfRバイスペシフィック抗体を添加したときの、EGFRの下流シグナル、およびTfRタンパク質の量への影響をウェスタンブロッティングにより以下のように評価した。
バイスペシフィック抗体のがん細胞に対する増殖阻害活性の作用機序を明らかにするため、EGFR-TfRバイスペシフィック抗体が細胞膜上のTfR発現量に影響するか以下のように評価した。
EGFR-TfRバイスペシフィック抗体のがん細胞に対する増殖阻害活性に鉄が関係しているか確認するため、以下のように評価した。
EGFRシグナル阻害とTfR阻害、2つの増殖阻害メカニズム間の活性を比較するため、IncuCyte(Sartorius社)を用いて評価した。
バイスペシフィック抗体E08-TfR1071およびE12-TfR1071の正常ヒト骨髄細胞(EGFR陰性、TfR陽性)に対する影響を確認するため、以下のように評価した。
TfR1071のVHのアミノ酸を改変したE12-TfR1071バイスペシフィック抗体の増殖阻害活性を、OE21細胞を用いて実施例12と同様の方法で評価した。まず、アミノ酸改変したEGFR-TfRバイスペシフィック抗体を以下のように作製した。アミノ酸改変(アミノ酸置換とも言う)したバイスペシフィック抗体の発現ベクターは、E12-TfR1071の発現ベクターにおいて、置換前のアミノ酸をコードする塩基配列を、置換後のアミノ酸をコードする塩基配列に置き換えたベクターを、実施例6に記載の方法に準じて作製した。アミノ酸改変したバイスペシフィック抗体の発現および調製は、実施例7に記載の方法に準じて行った。アミノ酸改変したバイスペシフィック抗体としては、以下のものを作製した。
Y32A、Y32F、T33A、T33G、L45A、V48A、V50A、I51A、I51L、N52A-A、N52A-D、V55E、D58A、D61P、Q97A、Q97D、P98A、W99A、W99F、W99H、W99Y、Y100A-A、Y100A-F、V102L、P98Y、P98S、P98D、P98Q、P98E、P98T、P98R、P98G、P98K、P98M、P98V、P98L、P98I、P98W、P98F、P98H
抗TfR抗体1071のエピトープを以下のように同定した。
国際公開第2014/189973号に記載されている配列情報から、ヒトTfRのApicalドメインに結合する抗TfR抗体15G11v5、7A4v15、および16F6v4、ならびにProtease-likeドメインを認識する抗TfR抗体7G7v1を実施例7に記載した方法と同様にして作製した。
本発明のバイスペシフィック抗体の増殖阻害活性とTfRに結合するIgG部分の可変領域のエピトープの関連性を解析するため、エピトープの異なる各種抗TfR抗体でE12-TfRバイスペシフィック抗体を作製し、増殖阻害活性を評価した。
バイスペシフィック抗体の増殖阻害活性にTfR1071が重要であるか確認するため、上市されているEGFR阻害活性のある抗EGFR抗体とTfR抗体TfR1071でEGFR-TfRバイスペシフィック抗体を作製し、増殖阻害活性を評価した。
本発明のバイスペシフィック抗体の増殖阻害活性において、TfRとEGFRに結合する価数の影響を解析するため、抗EGFR抗体E12と抗TfR抗体TfR1071の抗原結合ドメインをそれぞれ一つずつ有するヘテロ二量体型バイスペシフィック抗体(以下ヘテロ二量体抗体と記載する。)を作製し、増殖阻害活性を評価した。図18(B)に、作製したヘテロ二量体抗体の構造の模式図を示す。
TfR1071のVH配列(配列番号31)の1番目のアミノ酸をY(チロシン)からE(グルタミン酸)に置換したVH配列(配列番号106)を有する、E12-TfR1071YEバイスペシフィック抗体を、常法により作製した。実施例20に記載の方法と同様にして、ELISAによりヒトTfRタンパク質への結合活性を解析した。その結果、E12-TfR1071YEはE12-TfR1071と同等の結合活性を示した
配列番号2:ヒトTfR細胞外ドメインのアミノ酸配列
配列番号3:サルTfR細胞外ドメインの塩基配列
配列番号4:サルTfR細胞外ドメインのアミノ酸配列
配列番号5:ヒトTfRの塩基配列
配列番号6:ヒトTfRのアミノ酸配列
配列番号7:カニクイザルTfRの塩基配列
配列番号8:カニクイザルTfRのアミノ酸配列
配列番号9:ヒトEGFR細胞外ドメインの塩基配列(シグナル配列を含む)
配列番号10:ヒトEGFR細胞外ドメインのアミノ酸配列(シグナル配列を含む)
配列番号11:サルEGFR細胞外ドメインの塩基配列(シグナル配列を含む)
配列番号12:サルEGFR細胞外ドメインのアミノ酸配列(シグナル配列を含む)
配列番号13:ヒトEGFRの塩基配列
配列番号14:ヒトEGFRのアミノ酸配列
配列番号15:A27 VLの塩基配列
配列番号16:A27 VLのアミノ酸配列
配列番号17:A27 LCDR1のアミノ酸配列
配列番号18:A27 LCDR2のアミノ酸配列
配列番号19:A27 LCDR3のアミノ酸配列
配列番号20:PSM4072 VHの塩基配列
配列番号21:PSM4072 VHのアミノ酸配列
配列番号22:PSM4072 HCDR1のアミノ酸配列
配列番号23:PSM4072 HCDR2のアミノ酸配列
配列番号24:PSM4072 HCDR3のアミノ酸配列
配列番号25:R327 VHの塩基配列
配列番号26:R327 VHのアミノ酸配列
配列番号27:R327 HCDR1のアミノ酸配列
配列番号28:R327 HCDR2のアミノ酸配列
配列番号29:R327 HCDR3のアミノ酸配列
配列番号30:TfR1071 VHの塩基配列
配列番号31:TfR1071 VHのアミノ酸配列
配列番号32:TfR1071 HCDR1のアミノ酸配列
配列番号33:TfR1071 HCDR2のアミノ酸配列
配列番号34:TfR1071 HCDR3のアミノ酸配列
配列番号35:TfR4016 VHの塩基配列
配列番号36:TfR4016 VHのアミノ酸配列
配列番号37:TfR4016 HCDR1のアミノ酸配列
配列番号38:TfR4016 HCDR2のアミノ酸配列
配列番号39:TfR4016 HCDR3のアミノ酸配列
配列番号40:cyno186 VHの塩基配列
配列番号41:cyno186 VHのアミノ酸配列
配列番号42:cyno186 HCDR1のアミノ酸配列
配列番号43:cyno186 HCDR2のアミノ酸配列
配列番号44:cyno186 HCDR3のアミノ酸配列
配列番号45:cyno292 VHの塩基配列
配列番号46:cyno292 VHのアミノ酸配列
配列番号47:cyno292 HCDR1のアミノ酸配列
配列番号48:cyno292 HCDR2のアミノ酸配列
配列番号49:cyno292 HCDR3のアミノ酸配列
配列番号50:TfR1007 VHのアミノ酸配列
配列番号51:cyno163 VHのアミノ酸配列
配列番号52:2230 VHのアミノ酸配列
配列番号53:2230 VLのアミノ酸配列
配列番号54:T14 VHのアミノ酸配列
配列番号55:TfR434 VHのアミノ酸配列
配列番号56:TfR435 VHのアミノ酸配列
配列番号57:TfR434、435 VLのアミノ酸配列
配列番号58:E08 VHの塩基配列
配列番号59:E08 VHのアミノ酸配列
配列番号60:E08 HCDR1のアミノ酸配列
配列番号61:E08 HCDR2のアミノ酸配列
配列番号62:E08 HCDR3のアミノ酸配列
配列番号63:E12 VHの塩基配列
配列番号64:E12 VHのアミノ酸配列
配列番号65:E12 HCDR1のアミノ酸配列
配列番号66:E12 HCDR2のアミノ酸配列
配列番号67:E12 HCDR3のアミノ酸配列
配列番号68:E17 VHの塩基配列
配列番号69:E17 VHのアミノ酸配列
配列番号70:E17 HCDR1のアミノ酸配列
配列番号71:E17 HCDR2のアミノ酸配列
配列番号72:E17 HCDR3のアミノ酸配列
配列番号73:KME07 VHのアミノ酸配列
配列番号74:KME09 VHのアミノ酸配列
配列番号75:KME11 VHのアミノ酸配列
配列番号76:Cetuximab VHのアミノ酸配列
配列番号77:Cetuximab VLのアミノ酸配列
配列番号78:HN3 VHのアミノ酸配列
配列番号79:リンカーのアミノ酸配列
配列番号80:リンカーのアミノ酸配列
配列番号81:リンカーのアミノ酸配列
配列番号82:リンカーのアミノ酸配列
配列番号83:IgG4PE R409K 定常領域の塩基配列
配列番号84:IgG4PE R409K 定常領域のアミノ酸配列
配列番号85:IgG4 CH1の改変コドンの塩基配列
配列番号86:IgG4PE 定常領域のアミノ酸配列
配列番号87:マウスTfRのアミノ酸配列
配列番号88:ヒトTfR細胞外ドメインのApicalドメインマウスキメラ体のアミノ酸配列
配列番号89:ヒトTfR細胞外ドメインのProtease-likeドメインマウスキメラ体のアミノ酸配列
配列番号90:A01のアミノ酸配列
配列番号91:A02のアミノ酸配列
配列番号92:A03のアミノ酸配列
配列番号93:A04のアミノ酸配列
配列番号94:A05のアミノ酸配列
配列番号95:A06のアミノ酸配列
配列番号96:A07のアミノ酸配列
配列番号97:A08のアミノ酸配列
配列番号98:A09のアミノ酸配列
配列番号99:A10のアミノ酸配列
配列番号100:A11のアミノ酸配列
配列番号101:A12のアミノ酸配列
配列番号102:A13のアミノ酸配列
配列番号103:A14のアミノ酸配列
配列番号104:A15のアミノ酸配列
配列番号105:A16のアミノ酸配列
配列番号106:TfR1071 EVQLで始まるVHのアミノ酸配列
配列番号107:TfR1007 HCDR1のアミノ酸配列
配列番号108:TfR1007 HCDR2のアミノ酸配列
配列番号109:TfR1007 HCDR3のアミノ酸配列
配列番号110:Cetuximab VHのアミノ酸配列
配列番号111:Cetuximab VLのアミノ酸配列
配列番号112:Panitumumab VHのアミノ酸配列
配列番号113:Panitumumab VLのアミノ酸配列
配列番号114:Necitumumab VHのアミノ酸配列
配列番号115:Necitumumab VLのアミノ酸配列
配列番号116:Nimotuzumab VHのアミノ酸配列
配列番号117:Nimotuzumab VLのアミノ酸配列
Claims (23)
- Transferrin Receptor(TfR)に結合するIgG部分、および細胞表面抗原に結合するN末端側ポリペプチドを含み、該N末端側ポリペプチドが該IgG部分の重鎖のN末端に直接またはリンカーを介して結合する、
TfRおよび前記細胞表面抗原に結合するバイスペシフィック抗体であって、
前記IgG部分が、以下の(ai)~(ci)から選ばれる1のVH、およびそれぞれ配列番号17~19で表されるアミノ酸配列を含むCDR1~3を含むVLを含み、
前記細胞表面抗原がEGFRであり、
前記N末端側ポリペプチドが、EGFRに対する抗体のFabであって、該抗体がそれぞれ配列番号60~62またはそれぞれ配列番号65~67で表されるアミノ酸配列を含むCDR1~3を含むVH、およびそれぞれ配列番号17~19で表されるアミノ酸配列を含むCDR1~3を含むVLを含む抗体である、バイスペシフィック抗体。
(ai)それぞれ配列番号32~34で表されるアミノ酸配列を含むCDR1~3を含むVH
(bi)それぞれ配列番号42~44で表されるアミノ酸配列を含むCDR1~3を含むVH
(ci)それぞれ配列番号47~49で表されるアミノ酸配列を含むCDR1~3を含むVH - TfRおよび前記細胞表面抗原にそれぞれ2価で結合する、請求項1に記載のバイスペシフィック抗体。
- 前記IgG部分が、配列番号31、41、および46のいずれか1つで表されるアミノ酸配列を含むVH、および配列番号16で表されるアミノ酸配列を含むVLを含む、請求項1又は2に記載のバイスペシフィック抗体。
- 前記IgG部分の重鎖定常領域が配列番号84または配列番号86で表されるアミノ酸配列を含む請求項1~3のいずれか1項に記載のバイスペシフィック抗体。
- 前記EGFRに対する抗体が、以下の(a)の抗体である、請求項1~4のいずれか1項に記載のバイスペシフィック抗体。
(a)配列番号59または配列番号64で表されるアミノ酸配列を含むVH、および配列番号16で表されるアミノ酸配列を含むVLを含む抗体 - 前記Fabの重鎖C末端が前記IgG部分の重鎖N末端に直接結合する、請求項1~5のいずれか1項に記載のバイスペシフィック抗体。
- 前記Fabの重鎖C末端が前記IgG部分の重鎖N末端にリンカーを介して結合する、請求項1~5のいずれか1項に記載のバイスペシフィック抗体。
- 上記リンカーのアミノ酸配列がIgGのヒンジ領域のアミノ酸配列の一部または全部からなる、請求項7に記載のバイスペシフィック抗体。
- 前記Fabおよび前記IgG部分が同一のアミノ酸配列からなる軽鎖を含む請求項1~8のいずれか1項に記載のバイスペシフィック抗体。
- Transferrin Receptor(TfR)に結合するIgG部分、および細胞表面抗原に結合するN末端側ポリペプチドを含み、該N末端側ポリペプチドが該IgG部分の重鎖のN末端に直接結合する、
TfRおよび前記細胞表面抗原にそれぞれ2価で結合するバイスペシフィック抗体であって、
前記IgG部分が、配列番号31で表されるアミノ酸配列を含むVH、および配列番号16で表されるアミノ酸配列を含むVLを含み、
前記細胞表面抗原がEGFRであり、
前記N末端側ポリペプチドが、EGFRに対する抗体のFabであって、該抗体が配列番号64で表されるアミノ酸配列を含むVH、および配列番号16で表されるアミノ酸配列を含むVLを含む抗体である、バイスペシフィック抗体。 - Transferrin Receptor(TfR)に結合するIgG部分、および細胞表面抗原に結合するN末端側ポリペプチドを含み、該N末端側ポリペプチドが該IgG部分の重鎖のN末端に直接結合する、
TfRおよび前記細胞表面抗原にそれぞれ2価で結合するバイスペシフィック抗体であって、
前記IgG部分が、配列番号41で表されるアミノ酸配列を含むVH、および配列番号16で表されるアミノ酸配列を含むVLを含み、
前記細胞表面抗原がEGFRであり、
前記N末端側ポリペプチドが、EGFRに対する抗体のFabであって、該抗体が配列番号59で表されるアミノ酸配列を含むVH、および配列番号16で表されるアミノ酸配列を含むVLを含む抗体である、バイスペシフィック抗体。 - Transferrin Receptor(TfR)に結合するIgG部分、および細胞表面抗原に結合するN末端側ポリペプチドを含み、該N末端側ポリペプチドが該IgG部分の重鎖のN末端に直接結合する、
TfRおよび前記細胞表面抗原にそれぞれ2価で結合するバイスペシフィック抗体であって、
前記IgG部分が、配列番号41で表されるアミノ酸配列を含むVH、および配列番号16で表されるアミノ酸配列を含むVLを含み、
前記細胞表面抗原がEGFRであり、
前記N末端側ポリペプチドが、EGFRに対する抗体のFabであって、該抗体が配列番号64で表されるアミノ酸配列を含むVH、および配列番号16で表されるアミノ酸配列を含むVLを含む抗体である、バイスペシフィック抗体。 - 請求項1~12のいずれか1項に記載のバイスペシフィック抗体をコードするDNA。
- 請求項13に記載のDNAを含有する組換え体ベクター。
- 請求項14に記載の組換え体ベクターを宿主細胞に導入して得られる形質転換株。
- 請求項15に記載の形質転換株を培地に培養し、培養物中に請求項1~12のいずれか1項に記載のバイスペシフィック抗体を生産蓄積させ、該培養物からバイスペシフィック抗体を採取することを特徴とする請求項1~12のいずれか1項に記載のバイスペシフィック抗体の製造方法。
- 請求項1~12のいずれか1項に記載のバイスペシフィック抗体を有効成分として含有する、ヒトTfRおよび前記細胞表面抗原の少なくとも一方が関係する疾患の治療薬および/または診断薬。
- ヒトTfRおよび前記細胞表面抗原の少なくとも一方が関係する疾患ががんである請求項17に記載の治療薬および/または診断薬。
- ヒトTfRおよび前記細胞表面抗原の少なくとも一方が関係する疾患の治療および/または診断に使用するための、請求項1~12のいずれか1項に記載のバイスペシフィック抗体。
- ヒトTfRおよび前記細胞表面抗原の少なくとも一方が関係する疾患ががんである請求項19に記載のバイスペシフィック抗体。
- ヒトTfRおよび前記細胞表面抗原の少なくとも一方が関係する疾患の治療および/または診断剤の製造のための、請求項1~12のいずれか1項に記載のバイスペシフィック抗体の使用。
- ヒトTfRおよび前記細胞表面抗原の少なくとも一方が関係する疾患ががんである請求項21に記載の使用。
- 請求項1~12のいずれか1項に記載のバイスペシフィック抗体を含む、ヒトTfRおよび前記細胞表面抗原の少なくとも一方を検出または測定するための試薬。
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