JP7385575B2 - Wnt/sfrp複合体、wnt含有組成物、wnt発現細胞、並びにそれらを生成、精製及び使用する方法 - Google Patents
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Description
本出願は、参照により本明細書に組み込まれる、2017年10月9日に出願された米国仮出願第62/569,748号の利益を主張する。
本出願には、2018年10月9日に作成され、84キロバイトのサイズを有する「541-00060201_ST25.txt」と題するASCIIテキストファイルとして、EFS-Webを介して米国特許商標庁に電子的に提出された配列表リストが含まれる。配列表リストの電子出願により、電子的に提出された配列表リストは、37 CFR §1.821(c)により要求される紙書類及び§1.821(e)により要求されるCRFの両方として機能する。配列表リストに含まれる情報は、本明細書に参照により取り込まれる。
本明細書は、Wingless/Integrated-1タンパク質(Wnt)及び分泌Frizzled関連タンパク質(sFRP)を含む単離されたタンパク質複合体;Wntを含む組成物であって、組成物が界面活性剤を実質的に含まない組成物;Wnt及びsFRPを過剰発現する細胞;Wntを過剰発現する細胞及びsFRPを過剰発現する細胞を含む組成物;タンパク質複合体、組成物及び細胞を作製する方法;並びにタンパク質複合体、組成物及び細胞を使用する方法を開示する。本明細書は、さらに、Wnt及びsFRPを含む複合体を形成し、Wntを単離する方法を開示する。本明細書は、また、本発明の時点で利用可能なWnt精製手順を用いて精製できなかった、例えば、連結された(tethered)Wntを含むWntを精製するために使用可能な方法も開示する。本明細書は、さらに、界面活性剤を使用せずに、例えば分泌Wntを含むWntを精製するために使用され得る方法を開示する。
Wntは、任意のWntタンパク質又はWntタンパク質の組み合わせを含み得る。Wntタンパク質は、Wnt1、Wnt2、Wnt2b、Wnt3、Wnt3a、Wnt4、Wnt5a、Wnt5b、Wnt6、Wnt7a、 Wnt7b、Wnt8a、Wnt8b、Wnt9a、Wnt9b、Wnt10a、Wnt10b、Wnt11及びWnt16のうちの少なくとも1つを含むことができる。一部の施形態では、Wntは、分泌Wnt及び/又は連結されたWntを含む。一部の実施形態では、分泌Wntは、Wnt3a、Wnt5a、Wnt5b、Wnt8a及びWnt10aのうちの少なくとも1つを含み得る。
sFRPは、任意のsFRPタンパク質又はsFRPタンパク質の組み合わせを含み得る。sFRPは例えば、sFRP1、sFRP2、sFRP3、sFRP4及びsFRP5のうちの少なくとも1つを含み得る。
一部の態様において、本開示は、Wnt及びsFRPを含む単離されたタンパク質複合体について示す。一部の実施形態では「単離されたタンパク質複合体」は、天然に見られるものとは異なる組成物又は環境、すなわち天然又は本来の細胞又は身体環境に見出されるものとは異なる、組成物又は環境に存在するタンパク質複合体を意味する。「単離されたタンパク質複合体」は、他の天然に共存する細胞又は組織成分の少なくとも50%、少なくとも75%、少なくとも90%、又は少なくとも95%から単離され得る。「単離されたタンパク質複合体」は、人工生成物及び/又は非天然宿主細胞中に天然に存在するタンパク質複合体を含み得る。一部の実施形態では「単離されたWnt/sFRPタンパク質複合体」は、非天然に高レベルの組換えWnt及びsFRPを発現するように操作された細胞から単離されたWnt/sFRP複合体を含み得る。一部の実施形態では、細胞は、非天然宿主細胞を含んでもよく、及び/又は、細胞は、細胞のゲノムに組み込まれた非天然DNAを含んでもよい。
さらなる態様では、本開示は、Wnt及びsFRPを含む複合体を形成すること、及びWntを単離することを含む方法を示す。一部の実施形態において、Wntは、Wnt及びsFRPを含む複合体を形成する前に単離され得る。一部の実施形態において、Wntは、Wnt及びsFRPを含む複合体から単離され得る。一部に実施形態において、WntがWnt及びsFRPを含む複合体から単離される場合を含み、Wntは、好ましくは界面活性剤を使用せずに単離され得る。
別の態様において、本開示は、本明細書中に示すように、単離されたタンパク質複合体を使用する方法を示す。例えば、単離されたタンパク質複合体、本明細書中に記載される単離されたWnt及び/又は組成物は、培地添加剤として使用され得る。一部の実施形態において、培地添加剤は、例えば、幹細胞培養物又はオルガノイド培養物を含む細胞培養物において使用され得る。一部の実施形態において、本明細書に示される単離されたタンパク質複合体、単離されたWnt及び/又は組成物は、疾患モデルにおいて使用され得る。一部の実施形態において、本明細書中に記載される単離されたタンパク質複合体、単離されたWnt及び/又は組成物は、例えば、胚性幹細胞又は誘導された多能性幹細胞を含む細胞の分化を指向するために使用され得る。細胞は、例えば、ニューロン、神経外胚葉、心筋細胞、間葉幹細胞、及び/又は間葉誘導体を含む任意の所望の細胞型に分化され得る(例えば、Lam et al., 2014, Semin Nephrol, 34(4):445-461; Spence et al., 2011, Nature, 470:105-109; Paige et al., 2010, PLoS One 5(6):e11134. doi: 10.1371/journal.pone.0011134; Murashov et al., 2004 FASEB 19(2):252-4を参照のこと)。
単離されたタンパク質複合体の実施形態
1.Wnt及びsFRPを含む単離されたタンパク質複合体。
2.Wntが、Wnt1、Wnt2、Wnt2b、Wnt3、Wnt3a、Wnt4、Wnt5a、Wnt5b、Wnt6、Wnt7a、Wnt7b、Wnt8a、Wnt8b、Wnt9a、Wnt9b、Wnt10a、Wnt10b、Wnt11 及びWnt16のうち、少なくとも1つを含む、実施形態1の単離されたタンパク質複合体。
3.Wntが、Wnt3a、Wnt5a、Wnt5b、Wnt8a及びWnt10aのうち、少なくとも1つを含む、実施形態1又は2の単離されたタンパク質複合体。
4.sFRPが、sFRP1、sFRP2、sFRP3、sFRP4及びsFRP5のうち、少なくとも1つを含む、実施形態1~3のいずれかの単離されたタンパク質複合体。
5.Wntが活性なWntを含む、実施形態1~4のいずれかの単離されたタンパク質複合体。
6.活性なWntが、β-カテニンシグナル伝達を活性化するWntを含む、実施形態5の単離されたタンパク質複合体。
7.活性なWntが、分泌アルカリフォスファターゼ(SEAP)レポーターアッセイを用いて測定される、Wntレポーター活性を有するWntを含む、実施形態5又は6の単離されたタンパク質複合体。
8.単離されたタンパク質複合体が、SEAPレポーターアッセイを用いて測定した場合に、Wntを含まない単離されたタンパク質複合体よりも2倍以上のWntレポーター活性を有する、実施形態7の単離されたタンパク質複合体。
9.タンパク質複合体が、実質的に界面活性剤を含まない、実施形態1~8のいずれかの単離されたタンパク質複合体。
10.タンパク質複合体が、HEK293 TCF9-SEAP hFz4/hLRP5 Wntレポーターアッセイを用いて測定した場合に、1000 ng/mL未満、500 ng/mL未満又は100 ng/mL未満の50%有効量(ED50)を示す、実施形態1~9のいずれかの単離されたタンパク質複合体。
11.Wntが哺乳動物Wntを含む、実施形態1~10のいずれかの単離されたタンパク質複合体。
12.WntがヒトWnt又はマウスWntを含む、実施形態1~11のいずれかの単離されたタンパク質複合体。
13.sFRPが哺乳動物sFRPを含む、実施形態1~12のいずれかの単離されたタンパク質複合体。
14.sFRPがヒトsFRP又はマウスsFRPを含む、実施形態1~13のいずれかの単離されたタンパク質複合体。
15.sFRPがタグ付けされたsFRPを含む、実施形態1~14のいずれかの単離されたタンパク質複合体。
16.タグ付けされたsFRPが、ヒスチジンでタグ付けされたsFRPを含む、実施形態15の単離されたタンパク質複合体。
17.タグ付けされたsFRPが、C末端がタグ付けされたsFRPを含む、実施形態15又は16の単離されたタンパク質複合体。
18.Wntがタグ付けされたWntを含む、実施形態1~17のいずれかの単離されたタンパク質複合体。
19.タグ付けされたWntが、ヒスチジンでタグ付けされたWntを含む、実施形態18の単離されたタンパク質複合体。
20.タグ付けされたWntが、C末端がタグ付けされたWntを含む、実施形態18又は19の単離されたタンパク質複合体。
21.複合体が、Wnt-sFRP融合タンパク質を含む、実施形態1~20のいずれかの単離されたタンパク質複合体。
22.Wnt-sFRP融合タンパク質がリンカーを含む、実施形態21の単離されたタンパク質複合体。
23.リンカーがペプチドリンカーを含む、実施形態22の単離されたタンパク質複合体。
24.単離されたタンパク質が、R-スポンジン 1、R-スポンジン 2、 R-スポンジン 3 及び R-スポンジン 4のうち少なくとも1つをさらに含む、実施形態1~23のいずれかの単離されたタンパク質複合体。
25.R-スポンジン1、R-スポンジン2、R-スポンジン3及びR-スポンジン4のうち少なくとも1つが、sFRP1と融合して融合タンパク質を形成する、実施形態24の単離されたタンパク質複合体。
26.R-スポンジン1、R-スポンジン2、R-スポンジン3 及びR-スポンジン4のうち少なくとも1つが、リンカーを介してsFRPと融合する、実施形態25の単離されたタンパク質複合体。
27.リンカーがペプチドリンカーを含む、実施形態26の単離されたタンパク質複合体。
28.融合タンパク質が、さらにWntを含む、実施形態25~27のいずれかの単離されたタンパク質複合体。
29.R-スポンジン1、R-スポンジン2、R-スポンジン3及びR-スポンジン4のうち、少なくとの1つがWntと融合して融合タンパク質を形成する、実施形態24又は実施形態28の単離されたタンパク質複合体。
30.R-スポンジン1、R-スポンジン2、R-スポンジン3及びR-スポンジン4のうち少なくとも1つが、リンカーを介してWntと融合する、実施形態29の単離されたタンパク質複合体。
31.リンカーがペプチドリンカーを含む、実施形態30の単離されたタンパク質複合体。
32.ペプチドリンカーが、GGGS(配列番号1)、GGGGS(配列番号2)、(配列番号3)、GGGGG(配列番号4)、及びGSGSGGSGSG(配列番号5)のうち、少なくとも1つを含む、実施形態23、27又は31のいずれかの単離されたタンパク質複合体。
33.単離されたタンパク質複合体が、リポカリン7をさらに含む、実施形態1~32のいずれかの単離されたタンパク質複合体。
34.単離されたタンパク質複合体が、WIF1をさらに含む、実施形態1~33のいずれかの単離されたタンパク質複合体。
35.実施形態1~34のいずれかの単離されたタンパク質複合体を使用する方法。
1.組成物が、実質的に界面活性剤を含まない、Wntを含む組成物。
2.Wntが活性なWntを含む、実施形態1の組成物。
3.Wntが活性なWntを含む、Wntを含む組成物。
4.活性なWntが標準的なβカテニンシグナル伝達を活性化するWntを含む、実施形態2又は3の組成物。
5.活性なWntが、分泌アルカリフォスファターゼ(SEAP)レポーターアッセイを用いて測定される、Wntレポーター活性を有するWntを含む、実施形態2又は3の組成物。
6.単離されたタンパク質複合体が、SEAPレポーターアッセイを用いて測定した場合に、Wntを含まない単離されたタンパク質複合体よりも2倍以上のWntレポーター活性を有する、実施形態5の組成物。
7.Wntが、HEK293 TCF9-SEAP hFz4/hLRP5 Wntレポーターアッセイを用いて測定した場合に、1000 ng/mL未満、500 ng/mL未満又は100 ng/mL未満の50%有効量(ED50)を示す、実施形態2~6のいずれかの組成物。
8.Wntが、Wnt1、Wnt2、Wnt2b、Wnt3、Wnt3a、Wnt4、Wnt5a、Wnt5b、Wnt6、Wnt7a、Wnt7b、Wnt8a、Wnt8b、Wnt9a、Wnt9b、Wnt10a、Wnt10b、Wnt11及びWnt16のうち、少なくとも1つを含む、実施形態1~7のいずれかの組成物。
9.Wntが、Wnt3a、Wnt5a、Wnt5b、Wnt8a及び Wnt10aのうち、少なくとも1つを含む、実施形態1~8のいずれかの組成物。
10.Wntが哺乳動物Wntを含む、実施形態1~9のいずれかの組成物。
11.WntがヒトWnt又はマウスWntを含む、実施形態1~10のいずれかの組成物。
12.組成物が、sFRPをさらに含む、実施形態1~11のいずれかの組成物。
13.sFRPがsFRP1、sFRP2、sFRP3、sFRP4 及びsFRP5のうち少なくとも1つを含む、実施形態12の組成物。
14.組成物が、Wnt-sFRP融合タンパク質を含む、実施形態12又は13の組成物。
15.Wnt-sFRP融合タンパク質がリンカーを含む、実施形態14の組成物。
16.リンカーがペプチドリンカーを含む、実施形態15の組成物。
17.sFRPが哺乳動物sFRPを含む、実施形態12~15のいずれかの組成物。
18.sFRPがヒトsFRP又はマウスsFRPを含む、実施形態12~17のいずれかの組成物。
19.sFRPがタグ付けされたsFRPを含む、実施形態12~18のいずれかの組成物。
20.タグ付けされたsFRPがヒスチジンでタグ付けされたsFRPを含む、実施形態19の組成物。
21.タグ付けされたsFRPが、C末端がタグ付けされたsFRPを含む、実施形態20又は21の組成物。
22.Wntがタグ付けされたWntを含む、実施形態1~21のいずれかの組成物。
23.タグ付けされたWntが、ヒスチジンでタグ付けされたWntを含む、実施形態22の組成物。
24.タグ付けされたWntが、C末端がタグ付けされたWntを含む、実施形態22又は23の組成物。
25.組成物が、R-スポンジン1、R-スポンジン2、R-スポンジン3及びR-スポンジン 4のうち、少なくとも1つを含む、実施形態1~24のいずれかの組成物。
26.R-スポンジン1、R-スポンジン2、R-スポンジン3及びR-スポンジン4のうち、少なくとも1つがWntと融合して融合タンパク質を形成する、実施形態25の組成物。
27.R-スポンジン1、R-スポンジン2、R-スポンジン3及びR-スポンジン4のうち、少なくとも1つがペプチドリンカーを介してWntを融合する、実施形態23の組成物。
28.組成物がsFRPを含み、Wnt、R-スポンジン1、R-スポンジン2、R-スポンジン3及びR-スポンジン4のうち、少なくとも1つがsFRPと融合して融合タンパク質を形成する、実施形態25~27のいずれかの組成物。
29.Wnt、R-スポンジン1、R-スポンジン2、R-スポンジン3及びR-スポンジン4のうち、少なくとも1つがペプチドリンカーを介していsFRPと融合する、実施形態28の組成物。
30.ペプチドリンカーが、GGGS(配列番号1)、GGGGS(配列番号2)、(配列番号3)、GGGGG(配列番号4)及びGSGSGGSGSG(配列番号5)のうち、少なくとも1つを含む、実施形態16、27又は29の組成物。
31.組成物が、さらにリポカリン7を含む、実施形態1~30のいずれかの組成物。
32.組成物が、さらにWIF1を含む、実施形態1~31のいずれかの組成物。
33.実施形態1~32のいずれかの組成物を使用する方法。
1.Wnt及びsFRPを過剰発現する細胞。
2.Wntが、Wnt1、Wnt2、Wnt2b、Wnt3、Wnt3a、Wnt4、Wnt5a、Wnt5b、Wnt6、Wnt7a、Wnt7b、Wnt8a、Wnt8b、Wnt9a、Wnt9b、Wnt10a、Wnt10b、Wnt11及びWnt16のうち、少なくとも1つを含む、実施形態1の細胞。
3.Wntが、Wnt3a、Wnt5a、Wnt5b、Wnt8a及びWnt10aのうち、少なくとも1つを含む、実施形態1又は2の細胞。
4.sFRPがsFRP1、sFRP2、sFRP3、sFRP4及びsFRP5のうち少なくとも1つを含む、実施形態1~3のいずれかの細胞。
5.Wntが活性なWntを含む、実施形態1~4のいずれかの細胞。
6.活性なWntが、β-カテニンのシグナル伝達を活性化するWntを含む、実施形態5の細胞。
7.Wntが、HEK293 TCF9-SEAP hFz4/hLRP5 Wntレポーターアッセイを用いて測定した場合に、1000 ng/mL未満、500 ng/mL未満,又は100 ng/mL未満の50%有効量(ED50)を示す、実施形態1~6のいずれかの細胞。
8.Wntが、哺乳動物Wntを含む、実施形態1~7のいずれかの細胞。
9.WntがヒトWnt又はマウスWntを含む、実施形態1~8のいずれかの細胞。
10.sFRPが哺乳動物sFRPを含む、実施形態1~9のいずれかの細胞。
11.sFRPが、ヒトsFRP又はマウスsFRPを含む、実施形態1~10のいずれかの細胞。
12.sFRPがタグ付けされたsFRPを含む、実施形態1~11のいずれかの細胞。
13.タグ付けされたsFRPが、ヒスチジンでタグ付けされたsFRPを含む、実施形態12の細胞。
14.タグ付けされたsFRPが、C末端がタグ付けされたsFRPを含む、実施形態12又は13の細胞。
15.Wntが、タグ付けされたWntを含む、実施形態1~14のいずれかの細胞。
16.Wntが、ヒスチジンでタグ付けされたWntを含む、実施形態15の細胞。
17.Wntが、C末端がタグ付けされたWntを含む、実施形態15又は16の細胞。
18.細胞が、Wnt-sFRP融合タンパク質を発現する、実施形態1~17のいずれかの細胞。
19.Wnt-sFRP融合タンパク質がリンカーを含む、実施形態18の細胞。
20.リンカーがペプチドリンカーを含む、実施形態19の細胞。
21.細胞が、R-スポンジン1、R-スポンジン2、R-スポンジン3及びR-スポンジン4のうち少なくとも1つをさらに発現する実施形態1~20のいずれかの細胞。
22.R-スポンジン1、R-スポンジン2、R-スポンジン3及びR-スポンジン4のうち少なくとも1つがsFRPと融合して融合タンパク質を形成する、実施形態21の細胞。
23.R-スポンジン1、R-スポンジン2、R-スポンジン3及びR-スポンジン4のうち少なくとも1つが、リンカーを介してsFRPと融合する、実施形態22の細胞。
24.リンカーがペプチドリンカーを含む、実施形態23の細胞。
25.融合タンパク質が、さらにWntを含む、実施形態22~27のいずれかの細胞。
26.R-スポンジン1、R-スポンジン2、R-スポンジン3及びR-スポンジン4のうち少なくとも1つがWntと融合して融合タンパク質を形成する、実施形態21又は25の細胞。
27.R-スポンジン1、R-スポンジン2、R-スポンジン3及びR-スポンジン4のうち少なくとも1つが、リンカーを介してWntと融合する、実施形態26の細胞。
28.リンカーがペプチドリンカーを含む、実施形態27の細胞。
29.ペプチドリンカーが、GGGS(配列番号1)、GGGGS(配列番号2)、(配列番号3)、GGGGG(配列番号4)及び GSGSGGSGSG(配列番号5)のうち、少なくとも1つを含む、実施形態20、24又は28の細胞。
30.実施形態1~29のいずれかの細胞を用いる方法。
1.Wntを過剰発現する細胞:及び
sFRPを過剰発現する細胞、
を含む組成物。
2.Wntが、Wnt1、Wnt2、Wnt2b、Wnt3、Wnt3a、Wnt4、Wnt5a、Wnt5b、Wnt6、Wnt7a、Wnt7b、Wnt8a、Wnt8b、Wnt9a、Wnt9b、Wnt10a、Wnt10b、Wnt11及びWnt16のうち、少なくとも1つを含む、実施形態1の組成物
3.Wntが、Wnt3a、Wnt5a、Wnt5b、Wnt8a及びWnt10aのうち、少なくとも1つを含む、実施形態1又は2の組成物。
4.sFRPがsFRP1、sFRP2、sFRP3、sFRP4及びsFRP5のうち少なくとも1つを含む、実施形態1~3のいずれかの組成物。
5.Wntが活性なWntを含む、実施形態1~4のいずれかの組成物。
6.活性なWntが、β-カテニンのシグナル伝達を活性化するWntを含む、実施形態5の組成物。
7.Wntが、HEK293 TCF9-SEAP hFz4/hLRP5 Wntレポーターアッセイを用いて測定した場合に、1000 ng/mL未満、500 ng/mL未満又は100 ng/mL未満の50%有効量(ED50)を示す、実施形態1~6のいずれかの組成物。
8.Wntが、哺乳動物Wntを含む、実施形態1~7のいずれかの組成物。
9.WntがヒトWnt又はマウスWntを含む、実施形態1~8のいずれかの組成物。
10.sFRPが哺乳動物sFRPを含む、実施形態1~9のいずれかの組成物。
11.sFRPがヒトsFRP又はマウスsFRPを含む、実施形態1~10のいずれかの組成物。
12.sFRPがタグ付けされたsFRPを含む、実施形態1~11のいずれかの組成物。
13.タグ付けされたsFRPが、ヒスチジンでタグ付けされたsFRPを含む、実施形態12の組成物。
14.タグ付けされたsFRPが、C末端がタグ付けされたsFRPを含む、実施形態12又は13の組成物。
15.Wntがタグ付けされたWntを含む、実施形態1~14のいずれかの組成物。
16.タグ付けされたWntが、ヒスチジンでタグ付けされたWntを含む、実施形態15の組成物。
17.タグ付けされたWntが、C末端がタグ付けされたWntを含む、実施形態15又は16の組成物。
18.組成物が、R-スポンジン1、R-スポンジン2、R-スポンジン3及びR-スポンジン4のうち少なくとも1つをさらに含む、実施形態1~17のいずれかの組成物。
19.R-スポンジン1、R-スポンジン2、R-スポンジン3及びR-スポンジン4のうち少なくとも1つが、sFRPと融合して融合タンパク質を形成する、実施形態18の組成物。
20.R-スポンジン1、R-スポンジン2、R-スポンジン3及びR-スポンジン4のうち少なくとも1つが、リンカーを介してsFRPと融合する、実施形態19の組成物。
21.リンカーがペプチドリンカーを含む、実施形態20の組成物。
22.R-スポンジン1、R-スポンジン2、R-スポンジン3及びR-スポンジン4のうち少なくとも1つが、Wntと融合して融合タンパク質を形成する、実施形態18の組成物。
23.R-スポンジン1、R-スポンジン2、R-スポンジン3及びR-スポンジン4のうち少なくとも1つが、リンカーを介してWntと融合する、実施形態22の組成物。
24.リンカーがペプチドリンカーを含む、実施形態23の組成物。
25.ペプチドリンカーが、GGGS(配列番号1)、GGGGS(配列番号2)、(配列番号3)、GGGGG(配列番号4)及び GSGSGGSGSG(配列番号5)のうち、少なくとも1つを含む、実施形態21又は24の組成物。
26.Wntを過剰発現する細胞及びsFRPを過剰発現する細胞のうち少なくとも1つが、プラスミドによって形質転換される、実施形態1~25のいずれかの組成物。
27.実施形態1~26のいずれかの細胞を使用する方法。
1.WntとsFRPを含む複合体を形成する工程;及び
Wntを単離する工程、
を含む、方法。
2.Wntを単離する工程が、水性精製手順を含む、実施形態1の方法。
3.Wntを単離する工程が、クロマトグラフィー精製を含む、実施形態1又は2の方法。
4.方法が、Wntを過剰発現する工程をさらに含む、実施形態1~3のいずれかの方法。
5.方法が、sFRPを過剰発現する工程をさらに含む、実施形態1~4のいずれかの方法。
6.WntとsFRPを含む複合体を形成する工程が、Wnt発現細胞をsFRP発現細胞と共培養する工程を含む、実施形態1~5のいずれかの方法。
7.WntとsFRPを含む複合体が、Wntを単離する工程の後で形成される、実施形態1~6のいずれかの方法。
8.Wntを単離する工程が、界面活性剤の使用を含む、実施形態1~7のいずれかの方法。
9.WntとsFRPを含む複合体が、Wntを単離する工程の前に形成される、実施形態1~7のいずれかの方法。
10.Wntを単離する工程が、界面活性剤の使用を含まない、実施形態1~7又は9のいずれかの方法。
11.Wntが、Wnt1、Wnt2、Wnt2b、Wnt3、Wnt3a、Wnt4、Wnt5a、Wnt5b、Wnt6、Wnt7a、Wnt7b、Wnt8a、Wnt8b、Wnt9a、Wnt9b、Wnt10a、Wnt10b、Wnt11及びWnt16のうち、少なくとも1つを含む、実施形態1~10のいずれかの方法。
12.Wntが、Wnt3a、Wnt5a、Wnt5b、Wnt8a及びWnt10aのうち、少なくとも1つを含む、実施形態1~11のいずれかの方法。
13.sFRPがsFRP1、sFRP2、sFRP3、sFRP4及びsFRP5のうち少なくとも1つを含む、実施形態1~12のいずれかの方法。
14.Wmtが、哺乳動物Wntを含む、実施形態1~13のいずれかの方法。
15.Wntが、ヒトWnt又はマウスWntを含む、実施形態1~14のいずれかの方法。
16.sFRPが、哺乳動物sFRPを含む、実施形態1~15のいずれかの方法。
17.sFRPが、ヒトsFRP又はマウスsFRPを含む、実施形態1~16のいずれかの方法。
18.sFRPがタグ付けされたsFRPを含む、実施形態1~17のいずれかの方法。
19.タグ付けされたSFRPが、ヒスチジンでタグ付けされたsFRPを含む、実施形態18の方法。
20.タグ付けされたsFRPが、C末端がタグ付けされたsFRPを含む、実施形態18又は19の方法。
21.Wntが、タグ付けされたWntを含む、実施形態1~20のいずれかの方法。
22.タグ付けされたWntが、ヒスチジンでタグ付けされたWntを含む、実施形態21の方法。
23.タグ付けされたWntが、C末端がタグ付けされたWntを含む、実施形態21又は22の方法。
24.複合体が、R-スポンジン1、R-スポンジン2、R-スポンジン3、R-スポンジン4、リポカリン7及び WIF1のうち少なくとも1つをさらに含む、実施形態1~23のいずれかの方法。
25.方法が、Wntを発現する細胞を培養する工程を含む、実施形態1~24のいずれかの方法。
26.方法が、sFRPを発現する細胞を培養する工程を含む、実施形態1~25のいずれかの方法。
27.Wntを過剰発現する細胞及びsFRPを過剰発現する細胞が共培養される、実施形態26の方法。
28.方法が、WntとsFRPを発現する細胞を培養する工程を含む、実施形態1~27のいずれかの方法。
29.方法が、馴化培地を単離する工程をさらに含む、実施形態25~28のいずれかの方法。
30.方法が、馴化培地からWntとsFRPを含む複合体を単離する工程を含む、実施形態29の方法。
31.方法が、WntとsFRPを含む複合体から界面活性剤を除去する工程をさらに含む、実施形態1~30のいずれかの方法。
32.方法が、複合体を培地添加物として使用する工程をさらに含む、実施形態1~31のいずれかの方法。
33.方法が、複合体を幹細胞培地又はオルガネラ培地に添加する工程をさらに含む、実施形態1~32のいずれかの方法。
本実施例は、界面活性剤の使用を除外し、組換えWntタンパク質の活性を維持する、Wntタンパク質を精製する方法を開示する。方法は、Wntに結合するsFRPを共発現する工程を含む。理論に束縛されることを意図しないが、sFRPは水性環境からWntタンパク質の脂質修飾を保護すると考えられる。本明細書中に提示されるデータはまた、sFRPがWntを産生する細胞の馴化培地中の活性なWntと複合体を形成し、その量を増強するために使用され得ることを実証する。
細胞培養及び細胞の形質転換
CHO、CHO mWnt-1、CHO mFRP-1、CHO mWnt-1/msFRP-1及びCHO mWnt-1/msFRP-1/msFRP-1-Hisを含むすべての細胞株を、2ミリモル(mM)のL-グルタミン-ペニシリン-ストレプトマイシン(Sigma)、並びに適切な選択用抗生物質(Puromycin、G418、及び/又はHygromycin;すべてThermoFisher Scientific、Waltham、MAから入手)を含むIMDM(ThermoFisher Scientific、Waltham、MA)中で培養した。細胞を、Lipofectamine 2000試薬(ThermoFisher Scientific、Waltham、MA)を使用して、製造者の指示に従って、発現プラスミドで形質転換した。
分泌アルカリホスファターゼ(SEAP)の上流の全長ヒトLRP5、全長ヒトFZ4、及び9×T細胞因子DNA結合部位(TCF9)を発現するクローン性HEK293細胞を96ウェルプレートに播種し、37℃+5% CO2で一晩培養した。次いで、細胞を、馴化培地又はタンパク質のいずれかで18時間処理した。内因性アルカリフォスファターゼの熱で不活性化させた後、各ウェルからの馴化培地10マイクロリットル(μL)を、50μLのSEAP Reporter Assay Buffer/Substrate(0.1M Tris-HCl、pH 9.0、0.1mM DiFMUP(ThermoFisher Scientific, Waltham, MA))と混合し、暗所、室温で15分間~30分間インキュベートした。SEAP活性を、マイクロプレートリーダー(Spectra Max Gemini EM, Molecular Devices, LLC, Sunnyvale, CA)上で、励起波長350ナノメートル(nm)、発光波長450nm、及びカットオフ波長435nmの条件下で測定した。
馴化培地又は組換えタンパク質を、2×還元サンプル緩衝液(20mMジチオトレイトール、6% SDS、0.25モル(M)トリス、pH 6.8、10%グリセロール、10mM NaF及びブロモフェニルブルー)中で溶解し、95℃で3分間変性させ、4~20%SDS-PAGEゲル上で分離した。ゲルをPVDFメンブレン(Millipore, Billerica, MA)に移し、5%脱脂粉乳を含むブロッキング緩衝液(25mM Tris、pH 7.4、0.15 M NaCl、0.1% Tween-20)中、4℃で一晩、一次抗体と共にインキュベートした。十分に洗浄した後、ブロッキング緩衝液中でメンブレンを二次抗体と共に室温で1時間インキュベートした。免疫標識は、SuperSignal West Pico Chemiluminescent Substrate(ThermoFisher Scientific, Waltham, MA)を用いた化学発光反応によって検出した。ウェスタンブロッティングに使用した抗体は以下の通りであった; Gt x mWnt-1,1μg/mL(カタログ番号AF1620, Bio-Techne, Minneapolis, MN):Gt x hsFRP-1,1μg/mL(カタログ番号AF1384, Bio-Techne, Minneapolis, MN):Dk x Gt IgG、HRP、1:1000希釈(カタログ番号HAF109, Bio-Techne, Minneapolis, MN)。
5×104のCHO mWnt-1/msFRP1細胞を12ウェルディッシュに播種し、インキュベーター中、37℃、5% CO2で4日間培養した。馴化培地を回収し、細胞残屑を遠心分離によって除去した。まず、馴化培地500μLを免疫沈降抗体と共に4℃で2時間~4時間インキュベートし、次いで50μLのプロテインG-アガロースビーズ(Pierce Protein Biology / ThermoFisher Scientific, Waltham, MA)を添加し、2時間インキュベートした。結合した免疫複合体を回収し、ダルベッコリン酸緩衝食塩水(DPBS)で3回洗浄した。タンパク質をSDS-PAGEによって分離し、PVDFメンブレンに移してウェスタンブロット分析に供した。免疫沈殿及びウェスタンブロッティングに使用した抗体は、以下の通りであった;Gt x mWnt-1, 1μg/mL (カタログ番号 AF1620, Bio-Techne, Minneapolis, MN): Ms x His, 1μg/mL (カタログ番号MAB050R, Bio-Techne, Minneapolis, MN): Dk x Gt IgG, HRP, 1:1000 希釈 (カタログ番号 HAF109, Bio-Techne, Minneapolis, MN:Gt x Ms IgG, HRP (カタログ番号HAF007, Bio-Techne, Minneapolis, MN)。
5×104のCHO mWnt2b/msFRP1細胞を12ウェルディッシュに播種し、インキュベーター中で、37℃、5% CO2で4日間培養した。馴化培地を回収し、細胞残屑を遠心分離によって除去した。まず、馴化培地500μLを免疫沈降抗体と共に4℃で2時間~4時間インキュベートし、次いで50μLのプロテインG-アガロースビーズ(Pierce Protein Biology / ThermoFisher Scientific、Waltham、MA)を添加し、2時間インキュベートした。結合した免疫複合体を回収し、DPBSで3回洗浄した。タンパク質をSDS-PAGEによって分離し、PVDFメンブレンに移してウェスタンブロット分析に供した。免疫沈降及びウェスタンブロッティングに使用した抗体は以下の通りであった; Gt x mWnt2b, 1μg/mL (カタログ番号 AF3900, Bio-Techne, Minneapolis, MN): Gt x hsFRP-1, 1μg/mL (カタログ番号 AF1384 Bio-Techne, Minneapolis, MN): Dk x Gt IgG, HRP, 1:1000 希釈 (カタログ番号 HAF109, Bio-Techne, Minneapolis, MN)。
5×104 Wnt発現細胞を12ウェルディッシュに播種し、37℃、5% CO2のインキュベーターで3日間培養した。2×105のmsFRP発現細胞をWnt発現細胞に添加し、1日間共培養した。馴化培地を回収し、HEK293 Wntレポーター細胞に適用した。
12ウェルプレートに、0.6ミリリットル(mL)の培養液中の4×105 CHO mWnt-1細胞を播種した。細胞を37℃で1時間インキュベートし、次いで、50μg/mLから開始して1:2で連続希釈したmsFRP-1タンパク質処理液を添加した。24時間後、レポーター細胞を添加する前に、5分間遠心分離して細胞残屑を除去し、馴化培地を回収した。
マウスWnt-1及びマウスsFRP1を同時発現したCHO細胞からの馴化培地を、20mM MOPS、0.1M NaCl、pH 6.8で平衡化したSPセファロースFast Flowカラム(GE Healthcare、Chicago、IL)にロードした。直線勾配の高塩緩衝液(20mM MOPS、1.6M NaCl、pH 6.8)を用いて、結合したタンパク質を溶出した。SDS-PAGEの銀染色を用いて、マウスsFRP1の溶出(~37kDa)をモニタリングし、抗マウスWnt-1で捕捉したウェスタンブロットを用いて、マウスWnt-1の溶出(~40kDa)をモニタリングした。Wnt-1及びsFRP1の両方を含むタンパク質ピークを収集した。濃縮後、プールしたピークをSuperdex-200カラム(GE Healthcare、Chicago、IL)にロードして、遊離sFRP1からWnt-1/sFRP1複合体を分離し、前の工程と同様にSDS-PAGE銀染色及びウェスタンブロットの両方によってモニタリングした。
96ウェル組織培養プレートをPBS中1% BSAでブロックし、溶液中結合プレートとして使用した。 100ng/mL組換えマウス(rm)Wnt3aビオチン化タンパク質及びsFRP(1:3連続希釈)を含有する総体積120μLの溶液を、結合プレート中で4℃、一晩インキュベートした。次いで、100μLの結合溶液を、ストレプトアビジンでコーティングした96ウェルELISAプレートに移し、4℃で一晩インキュベートし、続いてHRPを検出した。マウスsFRP1はヤギ抗マウスsFRP1抗体で検出され、マウスsFRP2及びマウスsFRP3はHisでタグ付けされてマウス抗His抗体で検出され、マウスsFRP4はヒツジ抗マウスsFRP4抗体で検出され、HAでタグ付けされたマウスsFRP5はマウス抗HAペプチドで検出された。抗HRP二次抗体を使用して、一次抗体を検出し、続いて比色測定の読取りを行った。
マウスsFRP1(msFRP1)又はマウスsFRP1-His(msFRP1-His)の発現がCHO細胞の馴化培地(CM)中のマウスWnt1(mWnt1)の量を増強するかどうかを測定するために、mWnt1、msFRP1、mWnt1及びmsFRP1、並びにmWnt1及びmsFRP1-Hisを発現する安定なクローン株を作成した。馴化培地のウェスタンブロット分析は、mWnt1のmsFRP1又はmsFRP1-Hisとの同時発現によって、CHO、CHO mWnt1又はCHO msFRP1の馴化培地と比較して、馴化培地において有意に高いレベルのmWnt1が得られることを実証した(図1A)。また、msFRP1を過剰発現するCHO細胞では、CHO又はCHO mWnt1の馴化培地中のmsFRP1レベルと比較して、より高いレベルのmsFRP1が明らかに見られた(図1A)。
本開示は以下の実施形態を包含する。
[1] WntとsFRPを含む単離されたタンパク質複合体。
[2] Wntが、Wnt1、Wnt2、Wnt2b、Wnt3、Wnt3a、Wnt4, 、Wnt5a, 、Wnt5b、Wnt6、Wnt7a、Wnt7b、Wnt8a、Wnt8b、Wnt9a、Wnt9b、Wnt10a、Wnt10b、Wnt11及びWnt16のうちの1以上を含む、実施形態1に記載の単離されたタンパク質複合体。
[3] sFRPが、sFRP1、sFRP2、sFRP3、sFRP4及びsFRP5のうちの1以上を含む、実施形態1又は2に記載の単離されたタンパク質複合体。
[4] Wntが活性なWntを含む、実施形態1~3のいずれかに記載の単離されたタンパク質複合体。
[5] 活性なWntが、分泌アルカリフォスファターゼ(SEAP)レポーターアッセイを用いて測定されるWntレポーター活性を有するWntを含む、実施形態4に記載の単離されたタンパク質複合体。
[6] タンパク質複合体が、実質的に界面活性剤を含まない、実施形態1~5のいずれかに記載の単離されたタンパク質複合体。
[7] WntがマウスWntを含み、sFRPがマウスsFRPを含む、実施形態1~6のいずれかに記載の単離されたタンパク質複合体。
[8] WntがマウスWnt1を含み、sFRPがマウスsFRP1を含む、実施形態1~7のいずれかに記載の単離されたタンパク質複合体。
[9] タンパク質複合体が、HEK293 TCF9-SEAP hFz4/hLRP5 Wntレポーターアッセイを用いた測定で、500ng/mL未満の50%有効量(ED 50 )を示す、実施形態1~8のいずれかに記載の単離されたタンパク質複合体。
[10] タンパク質複合体が、HEK293 TCF9-SEAP hFz4/hLRP5 Wntレポーターアッセイを用いた測定で、100ng/mL未満の50%有効量(ED 50 )を示す、実施形態1~9のいずれかに記載の単離されたタンパク質複合体。
[11] Wntを含む組成物であって、実質的に界面活性剤を含まない、組成物。
[12] Wntが、Wnt1、Wnt2、Wnt2b、Wnt3、Wnt3a、Wnt4、Wnt5a、Wnt5b、Wnt6、Wnt7a、Wnt7b、Wnt8a、Wnt8b、Wnt9a、Wnt9b、Wnt10a、Wnt10b、Wnt11及びWnt16のうちの1以上を含む、実施形態11に記載の組成物。
[13] Wntが活性なWntを含む、実施形態11又は12に記載の組成物。
[14] 活性なWntが、分泌アルカリフォスファターゼ(SEAP)レポーターアッセイを用いて測定されるWntレポーター活性を有するWntを含む、実施形態13に記載の組成物。
[15] 組成物が、さらにsFRPを含む、実施形態11~14のいずれかに記載の組成物。
[16] sFPRが、sFRP1、FRP2、sFRP3、sFRP4及び sFRP5のうちの1以上を含む、実施形態15に記載の組成物。
[17] WntがマウスWntを含み、sFRPがマウスsFRPを含む、実施形態15又は16に記載の組成物。
[18] WntがマウスWnt1を含み、sFRPがマウスsFRP1を含む、実施形態15~17のいずれかに記載の組成物。
[19] Wntが、HEK293 TCF9-SEAP hFz4/hLRP5 Wntレポーターアッセイを用いた測定で、100ng/mL未満の50%有効量(ED 50 )を示す、実施形態11~18のいずれかに記載の組成物。
[20] 組成物が、R-スポンジン 1、R-スポンジン 2、R-スポンジン 3、R-スポンジン 4、リポカリン7又はWIF1のうち1以上をさらに含む、実施形態11~19のいずれかに記載の組成物。
[21] Wnt及びsFRPを過剰発現させる工程:
WntとsFRPを含む複合体を形成する工程:及び
Wntを単離する工程を含み、Wntを単離する工程が、水性精製手順を含む、方法。
[22] WntとsFRPを含む複合体が、Wntを単離する工程の前に形成される、実施形態21に記載の方法。
[23] Wntを単離する工程が、界面活性剤の使用する工程を含まない、実施形態21又は22に記載の方法。
[24] Wntを単離する工程が、WntとsFRPを含む複合体から界面活性剤を除去する工程を含む、実施形態21又は22に記載の方法。
[25] Wntが、Wnt1、Wnt2、Wnt2b、Wnt3、Wnt3a、Wnt4、Wnt5a、Wnt5b、Wnt6、Wnt7a、Wnt7b、Wnt8a、Wnt8b、Wnt9a、Wnt9b、Wnt10a、Wnt10b、Wnt11及び Wnt16のうちの1以上を含む、実施形態21~24のいずれかに記載の方法。
[26] sFRPが、sFRP1、sFRP2、sFRP3、sFRP4及びsFRP5のうちの1以上を含む、実施形態21~25のいずれかに記載の方法。
Claims (15)
- 哺乳動物Wingless/Integrated-1タンパク質(Wnt)と哺乳動物分泌Frizzled関連タンパク質(sFRP)とを含む単離されたタンパク質複合体であって、
該Wntが活性Wnt1を含み、かつ、該sFRPがsFRP1を含む、
該Wntが活性Wnt1を含み、かつ、該sFRPがsFRP5を含む、
該Wntが活性Wnt2bを含み、かつ、該sFRPがsFRP1を含む、
該Wntが活性Wnt6を含み、かつ、該sFRPがsFRP1を含む、または、
該Wntが活性Wnt6を含み、かつ、該sFRPがsFRP5を含む、
ものであり、
該Wntが活性Wntを含み、かつ、
該活性Wntが、分泌型アルカリフォスファターゼ(SEAP)レポーターアッセイを用いた測定で、標準的なβ-カテニンシグナル伝達を活性化し、HEK293 TCF9-分泌アルカリフォスファターゼ(SEAP) hFz4/hLRP5 Wntレポーターアッセイを用いた測定で、500ng/mL未満の50%有効量(ED50)を示す、前記タンパク質複合体。 - Wnt1が連結されたWnt1を含む、
Wnt2bが連結されたWnt2bを含む、又は
Wnt6が連結されたWnt6を含む、
請求項1に記載の単離されたタンパク質複合体。 - WntがヒトWntを含み、sFRPがヒトsFRPを含む、請求項1又は2に記載の単離されたタンパク質複合体。
- タンパク質複合体が、実質的に界面活性剤を含まない、請求項1~3のいずれか1項に記載の単離されたタンパク質複合体。
- WntがマウスWntを含み、sFRPがマウスsFRPを含む、請求項1、請求項2、又は、請求項1若しくは2に従属する請求項4に記載の単離されたタンパク質複合体。
- 単離された哺乳動物Wingless/Integrated-1タンパク質(Wnt)と単離された哺乳動物分泌Frizzled関連タンパク質(sFRP)とを含む組成物、ここで
該Wntが活性Wnt1を含み、かつ、該sFRPがsFRP1を含む、
該Wntが活性Wnt1を含み、かつ、該sFRPがsFRP5を含む、
該Wntが活性Wnt2bを含み、かつ、該sFRPがsFRP1を含む、
該Wntが活性Wnt6を含み、かつ、該sFRPがsFRP1を含む、または、
該Wntが活性Wnt6を含み、かつ、該sFRPがsFRP5を含む、
ものであり、
前記Wntは活性なWntを含み、前記組成物は実質的に界面活性剤を含まない、前記組成物。 - Wnt1が連結されたWnt1を含む、
Wnt2bが連結されたWnt2bを含む、又は
Wnt6が連結されたWnt6を含む、
請求項6に記載の組成物。 - 活性なWntが、分泌アルカリフォスファターゼ(SEAP)レポーターアッセイを用いて測定されるWntレポーター活性を有するWntを含む、請求項6又は7に記載の組成物。
- WntがヒトWntを含み、sFRPがヒトsFRPを含む、請求項6~8のいずれか1項に記載の組成物。
- WntがマウスWntを含み、sFRPがマウスsFRPを含む、請求項6~8のいずれか1項に記載の組成物。
- Wntが、HEK293 TCF9-SEAP hFz4/hLRP5 Wntレポーターアッセイを用いた測定で、100ng/mL未満の50%有効量(ED50)を示す、請求項6~10のいずれか1項に記載の組成物。
- 組成物が、R-スポンジン 1、R-スポンジン 2、R-スポンジン 3、R-スポンジン 4、リポカリン7若しくはWIF1又はそれらの組み合わせをさらに含む、請求項6~11のいずれか1項に記載の組成物。
- Wnt1を発現する細胞とsFRP1を発現する細胞とを共培養する工程:
培養上清を単離する工程、並びに、
Wnt1及びsFRP1の複合体を前記培養上清から単離する工程を含み、
ここで、前記培養上清から前記Wnt1とsFRP1との複合体を単離する工程が、水性精製手順を含み、界面活性剤の使用を含まないものであり、かつ、
前記Wnt1は活性なWnt1を含む、
方法。 - 哺乳動物Wingless/Integrated-1タンパク質(Wnt)、及び、哺乳動物分泌Frizzled関連タンパク質(sFRP)の両方を発現する細胞を培養する工程、ここで、
該Wntが活性Wnt1を含み、かつ、該sFRPがsFRP1を含む、
該Wntが活性Wnt1を含み、かつ、該sFRPがsFRP5を含む、
該Wntが活性Wnt2bを含み、かつ、該sFRPがsFRP1を含む、
該Wntが活性Wnt6を含み、かつ、該sFRPがsFRP1を含む、または、
該Wntが活性Wnt6を含み、かつ、該sFRPがsFRP5を含む、
ものである、
培養上清を単離する工程、並びに、
該Wntタンパク質及びsFRPタンパク質の複合体を前記培養上清から単離する工程、を含み、
ここで、前記培養上清から前記Wntタンパク質とsFRPタンパク質との複合体を単離する工程が、水性精製手順を含み、界面活性剤の使用を含まないものであり、かつ、
前記Wntタンパク質は活性なWntタンパク質を含むものである、
方法。 - 哺乳動物Wingless/Integrated-1タンパク質(Wnt)を発現する細胞を、哺乳動物分泌Frizzled関連タンパク質(sFRP)の調製物と共に培養する工程、ここで、
該Wntが活性Wnt1を含み、かつ、該sFRPがsFRP1を含む、
該Wntが活性Wnt1を含み、かつ、該sFRPがsFRP5を含む、
該Wntが活性Wnt2bを含み、かつ、該sFRPがsFRP1を含む、
該Wntが活性Wnt6を含み、かつ、該sFRPがsFRP1を含む、または、
該Wntが活性Wnt6を含み、かつ、該sFRPがsFRP5を含む、
ものである、
培養上清を単離する工程、並びに、
前記培養上清から、該Wntタンパク質と該sFRPタンパク質との複合体を単離する工程、を含み、
ここで、前記培養上清から該Wntタンパク質と該sFRPタンパク質との複合体を単離する工程が、水性精製手順を含み、界面活性剤の使用を含まないものであり、かつ、
前記Wntタンパク質は活性なWntタンパク質を含むものである、
方法。
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