JP7350994B2 - 新規なプロモーター及びそれを用いた標的物質生産方法 - Google Patents
新規なプロモーター及びそれを用いた標的物質生産方法 Download PDFInfo
- Publication number
- JP7350994B2 JP7350994B2 JP2022514254A JP2022514254A JP7350994B2 JP 7350994 B2 JP7350994 B2 JP 7350994B2 JP 2022514254 A JP2022514254 A JP 2022514254A JP 2022514254 A JP2022514254 A JP 2022514254A JP 7350994 B2 JP7350994 B2 JP 7350994B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- polynucleotide
- strain
- promoter
- ilvc
- microorganism
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P13/00—Preparation of nitrogen-containing organic compounds
- C12P13/04—Alpha- or beta- amino acids
- C12P13/06—Alanine; Leucine; Isoleucine; Serine; Homoserine
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/74—Vectors or expression systems specially adapted for prokaryotic hosts other than E. coli, e.g. Lactobacillus, Micromonospora
- C12N15/77—Vectors or expression systems specially adapted for prokaryotic hosts other than E. coli, e.g. Lactobacillus, Micromonospora for Corynebacterium; for Brevibacterium
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N1/00—Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
- C12N1/20—Bacteria; Culture media therefor
- C12N1/205—Bacterial isolates
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/0004—Oxidoreductases (1.)
- C12N9/0006—Oxidoreductases (1.) acting on CH-OH groups as donors (1.1)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P13/00—Preparation of nitrogen-containing organic compounds
- C12P13/04—Alpha- or beta- amino acids
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P13/00—Preparation of nitrogen-containing organic compounds
- C12P13/04—Alpha- or beta- amino acids
- C12P13/08—Lysine; Diaminopimelic acid; Threonine; Valine
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y101/00—Oxidoreductases acting on the CH-OH group of donors (1.1)
- C12Y101/01—Oxidoreductases acting on the CH-OH group of donors (1.1) with NAD+ or NADP+ as acceptor (1.1.1)
- C12Y101/01086—Ketol-acid reductoisomerase (1.1.1.86)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2800/00—Nucleic acids vectors
- C12N2800/10—Plasmid DNA
- C12N2800/101—Plasmid DNA for bacteria
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12R—INDEXING SCHEME ASSOCIATED WITH SUBCLASSES C12C - C12Q, RELATING TO MICROORGANISMS
- C12R2001/00—Microorganisms ; Processes using microorganisms
- C12R2001/01—Bacteria or Actinomycetales ; using bacteria or Actinomycetales
- C12R2001/15—Corynebacterium
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
- Virology (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
Description
本出願は、前記ポリヌクレオチドを含むプロモーターを提供する。
本出願は、前記ポリヌクレオチドを含むコリネバクテリウム属微生物を提供する。
本出願は、前記プロモーターを標的遺伝子に作動可能に連結させるステップを含む、標的遺伝子の発現強化方法を提供する。
本出願における「ポリヌクレオチド」とは、ヌクレオチド単量体(monomer)が共有結合により長く鎖状につながったヌクレオチドの重合体(polymer)であって、所定の長さより長いDNA鎖を意味する。
X-Y-Z
具体的には、前記一般式1において、XはCN1GN2であり、YはCTAATTN3であり、ZはCATGTGTGTGGTATAATで表されるものであってもよく、N1、N2及びN3はそれぞれA(アデニン)、T(チミン)、G(グアニン)又はC(シトシン)から選択されるいずれかであってもよい。
本出願において「特定配列番号で表されるヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチド」、「特定配列番号で表されるヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド」と記載されていても、当該配列番号のヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチドと同一又は相当する活性を有するものであれば、一部の配列が欠失、改変、置換又は付加されたヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドであっても本出願に用いられることは言うまでもない。例えば、前記ポリヌクレオチドと同一又は相当する活性を有するものであれば、当該配列番号のヌクレオチド配列の前後の無意味な配列付加、自然に発生する突然変異、又はその非表現突然変異(silent mutation)を除外するものではなく、このような配列付加又は突然変異を有するものも本出願に含まれることは言うまでもない。
相同性及び同一性は、しばしば相互交換的に用いられる。
本出願の他の態様は、本出願のポリヌクレオチドを含むプロモーターを提供する。
本出願のさらに他の態様は、本出願のプロモーター及び標的タンパク質をコードする遺伝子を含むベクターを提供する。
本出願における「ベクター」とは、好適な宿主内で標的ポリヌクレオチドを発現させることができるように、好適な発現調節領域又は発現調節配列に作動可能に連結された前記標的ポリヌクレオチドをコードする塩基配列を含有するDNA産物を意味する。前記発現調節配列には、転写を開始するプロモーター、その転写を調節するための任意のオペレーター配列、好適なmRNAリボソーム結合部位をコードする配列、並びに転写及び翻訳の終結を調節する配列が含まれ、具体的には本出願のプロモーターが含まれる。ベクターは、好適な宿主細胞内に形質転換されると、宿主ゲノムに関係なく複製及び機能することができ、ゲノム自体に組み込まれる。
本出願のさらに他の態様は、本出願のポリヌクレオチド及び標的タンパク質をコードする遺伝子を含むコリネバクテリウム属(Corynebacterium sp.)微生物を提供する。
X-Y-Z
一例として、本出願の微生物は、本出願のポリヌクレオチド及び標的タンパク質をコードする遺伝子を含むベクターで形質転換され、標的タンパク質の活性が強化されたものであってもよい。
本出願における「分枝鎖アミノ酸」とは、側鎖に分岐アルキル基を有するアミノ酸を意味し、バリン、ロイシン及びイソロイシンが含まれるものである。具体的には、本出願における前記分枝鎖アミノ酸は、L-分枝鎖アミノ酸であり、前記L-分枝鎖アミノ酸は、L-バリン、L-イソロイシン又はL-ロイシンであってもよいが、これらに限定されるものではない。
具体的には、前記標的物質はアミノ酸であり、より具体的には、分枝鎖アミノ酸であってもよいが、これらに限定されるものではない。
本出願の前記培養ステップで生産された標的物質を回収する方法は、培養方法に応じて、当該分野で公知の好適な方法を用いて培養液から目的とする物質を回収(collect)することができる。例えば、遠心分離、濾過、陰イオン交換クロマトグラフィー、結晶化、HPLCなどが用いられ、当該分野で公知の好適な方法を用いて培地又は微生物から目的とする物質を回収することができる。
前記ポリヌクレオチド、標的遺伝子、プロモーターなどについては前述した通りである。
実施例1-1:UV照射によるランダム突然変異誘発
バリン生産能が向上した変異株を選択するために、寒天を含む栄養培地にバリン生産菌株であるコリネバクテリウム・グルタミカムKCCM11201P(特許文献3)を塗抹し、30℃で36時間培養した。このようにして得られた数百個のコロニーに室温でUVを照射し、菌株のゲノムにランダム突然変異を誘発した。
グルコース10g,肉汁5g,ポリペプトン10g,塩化ナトリウム2.5g,酵母エキス5g,寒天20g,尿素2g(蒸留水1リットル中)
実施例1-2:突然変異誘発菌株の発酵力価試験及び菌株の選択
親株として用いたコリネバクテリウム・グルタミカムKCCM11201Pに比べてL-バリンの生産能が向上した変異株を選択するために、ランダム突然変異を誘発した菌株を対象に発酵力価試験を行った。各コロニーを栄養培地で継代培養し、その後生産培地25mlを含有する250mlのコーナーバッフルフラスコに各菌株を接種し、30℃、200rpmで72時間振盪培養した。その後、HPLCを用いてL-バリンの濃度を分析した。分析したL-バリンの濃度を表1に示す。
グルコース10g,肉汁5g,ポリペプトン10g,塩化ナトリウム2.5g,酵母エキス5g,寒天20g,尿素2g(蒸留水1リットル中)
<生産培地(pH7.0)>
グルコース100g,硫酸アンモニウム40g,大豆タンパク質2.5g,コーンスティープソリッド(Corn Steep Solids)5g,尿素3g,リン酸水素二カリウム1g,硫酸マグネシウム7水塩0.5g,ビオチン100μg,チアミンHCl1mg,パントテン酸カルシウム2mg,ニコチンアミド3mg,炭酸カルシウム30g(蒸留水1リットル中)
バリン生産能が向上した前記M4及びM15菌株のバリン生合成経路における主要遺伝子をシーケンシングし、KCCM11201P菌株、コリネバクテリウム・グルタミカム野生型菌株ATCC14067、ATCC13032及びATCC13869と比較した。その結果、前記M4及びM15菌株がアセトヒドロキシ酸イソメロレダクターゼ(Acetohydroxy acid isomeroreductase; AHAIR)をコードする遺伝子であるilvCのプロモーター領域(promoter region)の特定位置に同じ変異を含むことが確認された(図1)。具体的には、M4及びM15は、配列番号5で表される配列を含むプロモーター領域の配列における14番目のヌクレオチドであるG、及び17番目のヌクレオチドであるCがTに置換されていることが確認された。配列番号5で表される配列は、野生型コリネバクテリウム・グルタミカム(ATCC14067、ATCC13032及びATCC13869)のilvCのプロモーター領域に共通して含まれる配列である。以下の実施例においては、前記変異がコリネバクテリウム属微生物のアミノ酸の生産量に影響を及ぼすか否かを確認する。
実施例3-1:コリネバクテリウム・グルタミカムKCCM11201Pに変異を導入した菌株の作製及びバリン生産能の評価
実施例3-1-1:菌株の作製
配列番号5で表されるポリヌクレオチド配列の14番目、17番目のヌクレオチドをTに置換し、その変異をバリン生産菌株コリネバクテリウム・グルタミカムKCCM11201Pに導入するために、ターゲット変異を含むベクターを作製した。
バリン生産菌株であるコリネバクテリウム・グルタミカムKCCM11201PとKCCM11201P-ilvC(Pm3)のバリン生産能を比較するために、発酵力価評価を行った。各菌株を栄養培地で継代培養し、その後生産培地25mlを含有する250mlのコーナーバッフルフラスコに各菌株を接種し、30℃、200rpmで72時間振盪培養した。その後、HPLCを用いてL-バリンの濃度を分析した。分析したL-バリンの濃度を表3に示す。
グルコース10g,肉汁5g,ポリペプトン10g,塩化ナトリウム2.5g,酵母エキス5g,寒天20g,尿素2g(蒸留水1リットル中)
<生産培地(pH7.0)>
グルコース100g,硫酸アンモニウム40g,大豆タンパク質2.5g,コーンスティープソリッド(Corn Steep Solids)5g,尿素3g,リン酸水素二カリウム1g,硫酸マグネシウム7水塩0.5g,ビオチン100μg,チアミンHCl1mg,パントテン酸カルシウム2mg,ニコチンアミド3mg,炭酸カルシウム30g(蒸留水1リットル中)
実施例3-2-1:バリン生産菌株CJ7Vの作製
L-バリンを生産する他のコリネバクテリウム・グルタミカム属菌株においても前記と同じ効果があるか否かを確認するために、野生株コリネバクテリウム・グルタミカムATCC14067に1種の変異[ilvN(A42V);非特許文献12]を導入してL-バリン生産能が向上した菌株を作製した。
実施例3-2-1で作製したL-バリン生産能を有するコリネバクテリウム・グルタミカムCJ7Vを対象に、実施例3-1と同様にpDZ-ilvC(Pm3)-14067を形質転換させてilvC遺伝子のプロモーターに変異を導入した菌株を作製し、CJ7V-ilvC(Pm3)と命名した(図3)。作製した菌株のL-バリン生産能を比較するために、実施例3-1と同様に培養してL-バリンの濃度を分析した。分析したL-バリンの濃度を表5に示す。
実施例3-3-1:バリン生産菌株CJ8Vの作製
L-バリンを生産するさらに他のコリネバクテリウム・グルタミカム属菌株においても前記と同じ効果があるか否かを確認するために、実施例3-2と同様に野生株コリネバクテリウム・グルタミカムATCC13869に1種の変異[ilvN(A42V)]を導入してL-バリン生産能を有する変異株を作製し、前記組換え菌株をコリネバクテリウム・グルタミカムCJ8Vと命名した。
実施例3-3-1で作製したL-バリン生産能を有するコリネバクテリウム・グルタミカムCJ8Vを対象に、ilvCプロモーター変異を導入した菌株の作製を試みた。よって、実施例3-1-1で作製した組換えベクターpDZ-ilvC(Pm3)-14067、pDZ-ilvC(Pm3)-13869をそれぞれCJ8Vに形質転換した(非特許文献16)。相同性配列の組換えにより染色体上にベクターが挿入された菌株は、カナマイシン(kanamycin)25mg/lを含有する培地から選択した。その後、2次組換えが完了した前記コリネバクテリウム・グルタミカム形質転換株を対象に、プライマー1及び4を用いたPCRにより、染色体上でilvCプロモーターに変異を導入した菌株CJ8V-ilvC(Pm3)とCJ8V-ilvC(Pm3)-2を作製した(図4)。前記組換え菌株のうちCJ8V-ilvC(Pm3)-2をコリネバクテリウム・グルタミカムCA08-2034と命名し、2019年8月21日付けでブダペスト条約上の国際寄託機関である韓国微生物保存センター(KCCM)に受託番号KCCM12575Pとして寄託した。
実施例4-1:L-イソロイシン生産菌株コリネバクテリウム・グルタミカムKCCM11248P菌株にilvCプロモーター変異を導入した菌株の作製及び評価
実施例3と同様に、L-イソロイシン生産菌株であるコリネバクテリウム・グルタミカムKCCM11248P(特許文献5)に実施例3-1で作製した組換えプラスミドpDZ-ilvC(Pm3)-14067及びpDZ-ilvC(Pm3)-13869を染色体上での相同組換えにより導入した菌株を作製し、それぞれKCCM11248P::ilvC(Pm3)及びKCCM11248P::ilvC(Pm3)-2と命名した(図5)。作製した菌株を次の方法で培養し、イソロイシン生産能を比較した。
グルコース20g,ペプトン10g,酵母エキス5g,尿素1.5g,KH2PO44g,K2HPO48g,MgSO47H2O0.5g,ビオチン100μg,チアミンHCl1000μg,パントテン酸カルシウム2000μg,ニコチンアミド2000μg(蒸留水1リットル中)
<生産培地(pH7.0)>
グルコース50g,(NH4)2SO4 12.5g,大豆タンパク質2.5g,コーンスティープソリッド(Corn Steep Solids)5g,尿素3g,KH2PO41g,MgSO47H2O0.5g,ビオチン100μg,チアミン塩酸塩1000μg,パントテン酸カルシウム2000μg,ニコチンアミド3000μg,CaCO330g(蒸留水1リットル中)
培養終了後に、HPLCによりL-イソロイシンの生産能を測定した。実験を行った各菌株における培養液中のL-イソロイシン濃度を表7に示す。
ilvCプロモーター導入によるL-イソロイシン生産能に及ぼす効果を確認するために、コリネバクテリウム・グルタミカムATCC13032(以下、WT)菌株をベースにlysC(L377K)変異体(特許文献6)とhom(G378E)変異体(非特許文献13)を導入して菌株を作製し、公知のトレオニンデヒドラターゼ(L-threonine dehydratase)をコードする遺伝子にilvA(V383A)変異(非特許文献14)を導入してL-イソロイシン生産能を比較した。用いたプライマー配列を表8に示す。
WTの染色体を鋳型とし、プライマー9とプライマー10のプライマー対、又はプライマー11とプライマー12のプライマー対を用いてPCRを行った。95℃で5分間の変性後、95℃で30秒間の変性、55℃で30秒間のアニーリング、72℃で30秒間の重合を30サイクル行い、次いで72℃で7分間の重合反応を行った。その結果、lysC遺伝子の変異を中心に、5’末端上流の509bpのDNA断片と、3’末端下流の520bpのDNA断片がそれぞれ得られた。
hom(G378E)変異を導入するベクターを作製するために、WT genomicDNAを鋳型とし、プライマー13とプライマー14のプライマー対、プライマー15とプライマー16のプライマー対を用いて、それぞれPCRを行った。PCR条件は、95℃で5分間の変性後、95℃で30秒間の変性、55℃で30秒間のアニーリング、72℃で30秒間の重合を30サイクル行い、次いで72℃で7分間の重合反応を行うものとした。その結果、hom遺伝子の変異を中心に、5’末端上流の220bpのDNA断片と、3’末端下流の220bpのDNA断片が得られた。この2つのPCRproductを鋳型とし、プライマー13とプライマー16のプライマー対を用いてPCRを行った。95℃で5分間の変性後、95℃で30秒間の変性、55℃で30秒間のアニーリング、72℃で30秒間の重合を30サイクル行い、次いで72℃で7分間の重合反応を行った。その結果、hom遺伝子の変異を含む440bpのDNA断片が増幅された。用いたプライマー配列を表9に示す。
前記実施例と同様に、実施例4-2-2で作製したWT::lysC(L377K)-hom(G378E)菌株に実施例3-1で作製した組換えプラスミドpDZ-ilvC(Pm3)-14067及びpDZ-ilvC(Pm3)-13032を染色体上での相同組換えにより導入した菌株を作製し、それぞれWT::lysC(L377K)-hom(G378E)-ilvC(Pm3)及びWT::lysC(L377K)-hom(G378E)-ilvC(Pm3)-3と命名した。
ilvA遺伝子を対象に、公知のilvA(V383A)変異(非特許文献14)を導入したベクターを作製するために、変異位置を中心に、5’末端上流を増幅するためのプライマー1対(プライマー17及び18)と、3’末端下流を増幅するためのプライマー1対(プライマー19及び20)を考案した。プライマー17及び20の各末端にBamHI制限酵素部位(下線表示)を挿入し、プライマー18及び19は交差するように考案した部位にヌクレオチド置換変異(下線表示)が位置するようにした。用いたプライマー配列を表10に示す。
実施例4-1のフラスコ培養法と同様に培養し、培養液中のL-イソロイシン濃度を分析した。
実施例5-1:L-ロイシン生産菌株コリネバクテリウム・グルタミカムKCCM11661P、KCCM11662P菌株にilvCプロモーター変異を導入した菌株の作製及びロイシン生産能の評価
実施例3-1で作製した組換えプラスミドpDZ-ilvC(Pm3)-14067を染色体上での相同組換えにより、L-ロイシン生産菌株であるコリネバクテリウム・グルタミカムKCCM11661P(特許文献8)、KCCM11662P(特許文献8)に形質転換した(非特許文献16)。相同性配列の組換えにより染色体上にベクターが挿入された菌株は、カナマイシン(kanamycin)25mg/lを含有する培地から選択した。その後、2次組換えが完了した前記コリネバクテリウム・グルタミカム形質転換株を対象に、プライマー1及び4を用いたPCRにより、染色体上でilvCプロモーターに変異を導入した菌株を作製した。前記組換え菌株をコリネバクテリウム・グルタミカムKCCM11661P-ilvC(Pm3)及びKCCM11662P-ilvC(Pm3)と命名した(図7)。ロイシン生産菌株であるコリネバクテリウム・グルタミカムKCCM11661P-ilvC(Pm3)及びKCCM11662P-ilvC(Pm3)のロイシン生成能を比較するために、発酵力価評価を行った。各菌株を栄養培地で継代培養し、その後生産培地25mlを含有する250mlのコーナーバッフルフラスコに各菌株を接種し、30℃、200rpmで72時間振盪培養した。その後、HPLCを用いてL-ロイシンの濃度を分析した。分析したL-ロイシンの濃度を表12に示す。
グルコース10g,肉汁5g,ポリペプトン10g,塩化ナトリウム2.5g,酵母エキス5g,寒天20g,尿素2g(蒸留水1リットル中)
<生産培地(pH7.0)>
グルコース50g,硫酸アンモニウム20g,コーンスティープソリッド(Corn Steep Solids)20g,リン酸水素二カリウム1g,硫酸マグネシウム7水塩0.5g,ビオチン100μg,チアミンHCl 1mg,炭酸カルシウム15g(蒸留水1リットル中)
L-ロイシンを生産する他のコリネバクテリウム・グルタミカム属菌株においても前記と同じ効果があるか否かを確認するために、野生株コリネバクテリウム・グルタミカムATCC13032に1種の変異[leuA(R558H,G561D);特許文献2]を導入してL-ロイシン生産能が向上した菌株を作製した。
Claims (15)
- 下記一般式1で表されるヌクレオチド配列を含む、プロモーター活性を有するポリヌクレオチドであって、
下記一般式1において、
XはCN1GN2であり、
YはCTAATTN3であり、
ZはCATGTGTGTGGTATAATであり、
前記N1、前記N2及び前記N3は、それぞれA(アデニン)、T(チミン)、G(グアニン)又はC(シトシン)から選択されるいずれかであるポリヌクレオチド。
[一般式1]
X-Y-Z - 前記XのN1は、C(シトシン)又はG(グアニン)である、請求項1に記載のポリヌクレオチド。
- 前記XのN2は、A(アデニン)又はT(チミン)である、請求項1に記載のポリヌクレオチド。
- 前記YのN3は、A(アデニン)又はG(グアニン)である、請求項1に記載のポリヌクレオチド。
- 前記Xは配列番号8~11のいずれかであり、Yは配列番号6又は7である、請求項3に記載のポリヌクレオチド。
- 前記ポリヌクレオチドは、配列番号13~20から選択されるいずれかのポリヌクレオチド配列を有する、請求項1に記載のポリヌクレオチド。
- 請求項1~6のいずれか一項に記載のポリヌクレオチドを含むプロモーター。
- 請求項7に記載のプロモーター、及び標的タンパク質をコードする遺伝子を含むベクター。
- 前記標的タンパク質はアセトヒドロキシ酸イソメロレダクターゼ(acetohydroxy acid isomeroreductase)である、請求項8に記載のベクター。
- 請求項1~6のいずれか一項に記載のポリヌクレオチドを含むコリネバクテリウム属微生物。
- 前記コリネバクテリウム属微生物はコリネバクテリウム・グルタミカムである、請求項10に記載の微生物。
- 請求項10に記載のコリネバクテリウム属微生物を培地で培養するステップと、
前記培地から標的物質を回収するステップとを含む、
標的物質を生産する方法。 - 前記標的物質はアミノ酸である、請求項12に記載の方法。
- 前記アミノ酸はL-分枝鎖アミノ酸である、請求項13に記載の方法。
- 請求項1~6のいずれか一項に記載のポリヌクレオチドを含むプロモーターを標的遺伝子と作動可能に連結させるステップを含む標的遺伝子発現強化方法。
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
KR1020190108263A KR102153534B1 (ko) | 2019-09-02 | 2019-09-02 | 신규한 프로모터 및 이를 이용한 아미노산 생산 방법 |
KR10-2019-0108263 | 2019-09-02 | ||
PCT/KR2020/011679 WO2021045472A1 (ko) | 2019-09-02 | 2020-09-01 | 신규한 프로모터 및 이를 이용한 목적 물질 생산 방법 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2022547466A JP2022547466A (ja) | 2022-11-14 |
JP7350994B2 true JP7350994B2 (ja) | 2023-09-26 |
Family
ID=72451560
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2022514254A Active JP7350994B2 (ja) | 2019-09-02 | 2020-09-01 | 新規なプロモーター及びそれを用いた標的物質生産方法 |
Country Status (9)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US20220340940A1 (ja) |
EP (1) | EP4023756A4 (ja) |
JP (1) | JP7350994B2 (ja) |
KR (1) | KR102153534B1 (ja) |
CN (1) | CN114729378B (ja) |
BR (1) | BR112022003828A2 (ja) |
CA (1) | CA3153110A1 (ja) |
MX (1) | MX2022002563A (ja) |
WO (1) | WO2021045472A1 (ja) |
Families Citing this family (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN113994002B (zh) * | 2021-05-07 | 2022-06-03 | Cj第一制糖株式会社 | 新型启动子及其用途 |
Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2006028063A1 (ja) | 2004-09-09 | 2006-03-16 | Research Institute Of Innovative Technology For The Earth | プロモーター機能を有するdna断片 |
JP2009521960A (ja) | 2007-01-17 | 2009-06-11 | コリア アドバンスド インスティチュート オブ サイエンス アンド テクノロジー | 分枝鎖アミノ酸生成能が改善した変異微生物及びそれを使用した分枝鎖アミノ酸の製造方法 |
JP2015513892A (ja) | 2012-04-02 | 2015-05-18 | 味の素株式会社 | 自己誘導性発現系、及び腸内細菌科の細菌を使用する有用な代謝産物を製造するためのその使用 |
JP2016519949A (ja) | 2013-06-03 | 2016-07-11 | エボニック デグサ ゲーエムベーハーEvonik Degussa GmbH | プロピオン酸塩によって誘導可能な、ilvBNオペロンを含む組換え型コリネバクテリウム属細菌を使用したL−ロイシン、L−バリン、L−イソロイシン、α−ケトイソ吉草酸、α−ケト−β−メチル吉草酸又はα−ケトイソカプロン酸の製造方法 |
Family Cites Families (14)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JPH0787977A (ja) * | 1993-08-12 | 1995-04-04 | Mitsubishi Chem Corp | コリネ型細菌内でプロモーター機能を有するdna断片 |
CN101082050A (zh) * | 1999-06-25 | 2007-12-05 | Basf公司 | 编码胁迫、抗性和耐受性蛋白的谷氨酸棒杆菌基因 |
CN100577799C (zh) | 2003-07-29 | 2010-01-06 | 味之素株式会社 | 用苹果酸酶活性减弱的埃希氏菌生产l-赖氨酸或l-苏氨酸的方法 |
JP5756259B2 (ja) | 2006-09-15 | 2015-07-29 | シージェイ チェイルジェダン コーポレイション | L−リジン生産能の向上したコリネバクテリウム属およびそれを用いたl−リジン生産方法 |
KR101117022B1 (ko) | 2011-08-16 | 2012-03-16 | 씨제이제일제당 (주) | L-발린 생산능이 향상된 미생물 및 이를 이용한 l-발린 제조방법 |
KR101335789B1 (ko) | 2012-01-13 | 2013-12-02 | 씨제이제일제당 (주) | L-이소루신을 생산하는 미생물 및 이를 이용한 l-이소루신 제조방법 |
KR101632642B1 (ko) * | 2015-01-29 | 2016-06-22 | 씨제이제일제당 주식회사 | 신규한 프로모터 및 그의 용도 |
CN106148336B (zh) * | 2015-04-07 | 2019-11-05 | 中国科学院天津工业生物技术研究所 | 新型的l-苏氨酸-诱导型启动子及其应用 |
KR101796830B1 (ko) | 2015-08-25 | 2017-11-13 | 씨제이제일제당 (주) | L-류신 생산능을 가지는 미생물 및 이를 이용한 l-류신의 제조방법 |
CN108559746B (zh) * | 2016-08-31 | 2021-09-03 | Cj第一制糖株式会社 | 新型启动子及其应用 |
CN106318964B (zh) * | 2016-09-01 | 2017-07-18 | 宁夏伊品生物科技股份有限公司 | 棒杆菌发酵生产l‑赖氨酸的方法及其启动子改造 |
JP6848067B2 (ja) | 2016-12-28 | 2021-03-24 | シージェイ チェイルジェダン コーポレーション | 新規なイソプロピルリンゴ酸シンターゼ変異体及びそれを用いたl−ロイシンの生産方法 |
KR102011994B1 (ko) | 2017-06-30 | 2019-08-20 | 씨제이제일제당 주식회사 | 신규한 아스파토키나제 변이체 및 이를 이용한 l-아미노산의 제조방법 |
KR102063909B1 (ko) * | 2019-03-29 | 2020-01-08 | 씨제이제일제당 주식회사 | 아세토하이드록시산 신타아제 변이체, 이를 포함하는 미생물 또는 이를 이용하는 l-분지쇄 아미노산 생산 방법 |
-
2019
- 2019-09-02 KR KR1020190108263A patent/KR102153534B1/ko active IP Right Grant
-
2020
- 2020-09-01 MX MX2022002563A patent/MX2022002563A/es unknown
- 2020-09-01 EP EP20861340.6A patent/EP4023756A4/en active Pending
- 2020-09-01 BR BR112022003828A patent/BR112022003828A2/pt unknown
- 2020-09-01 US US17/639,765 patent/US20220340940A1/en active Pending
- 2020-09-01 CN CN202080073870.5A patent/CN114729378B/zh active Active
- 2020-09-01 CA CA3153110A patent/CA3153110A1/en active Pending
- 2020-09-01 WO PCT/KR2020/011679 patent/WO2021045472A1/ko unknown
- 2020-09-01 JP JP2022514254A patent/JP7350994B2/ja active Active
Patent Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2006028063A1 (ja) | 2004-09-09 | 2006-03-16 | Research Institute Of Innovative Technology For The Earth | プロモーター機能を有するdna断片 |
JP2009521960A (ja) | 2007-01-17 | 2009-06-11 | コリア アドバンスド インスティチュート オブ サイエンス アンド テクノロジー | 分枝鎖アミノ酸生成能が改善した変異微生物及びそれを使用した分枝鎖アミノ酸の製造方法 |
JP2015513892A (ja) | 2012-04-02 | 2015-05-18 | 味の素株式会社 | 自己誘導性発現系、及び腸内細菌科の細菌を使用する有用な代謝産物を製造するためのその使用 |
JP2016519949A (ja) | 2013-06-03 | 2016-07-11 | エボニック デグサ ゲーエムベーハーEvonik Degussa GmbH | プロピオン酸塩によって誘導可能な、ilvBNオペロンを含む組換え型コリネバクテリウム属細菌を使用したL−ロイシン、L−バリン、L−イソロイシン、α−ケトイソ吉草酸、α−ケト−β−メチル吉草酸又はα−ケトイソカプロン酸の製造方法 |
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
Miroslav Patek et al.,Microbiology,1996年,vol.142,pp.1297-1309 |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
CA3153110A1 (en) | 2021-03-11 |
EP4023756A1 (en) | 2022-07-06 |
MX2022002563A (es) | 2022-06-08 |
JP2022547466A (ja) | 2022-11-14 |
KR102153534B1 (ko) | 2020-09-09 |
CN114729378A (zh) | 2022-07-08 |
US20220340940A1 (en) | 2022-10-27 |
WO2021045472A1 (ko) | 2021-03-11 |
CN114729378B (zh) | 2023-12-19 |
BR112022003828A2 (pt) | 2022-05-31 |
EP4023756A4 (en) | 2023-01-11 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
CN113544141B (zh) | 包含突变的LysE的微生物和使用其生产L-氨基酸的方法 | |
JP6679803B2 (ja) | 新規プロモーター及びその用途 | |
JP7033665B2 (ja) | プリンヌクレオチドを生産するコリネバクテリウム属微生物及びそれを用いたプリンヌクレオチドの生産方法 | |
JP6476212B2 (ja) | L−アルギニンを生産するコリネバクテリウム属の微生物及びそれを用いたl−アルギニンの製造方法 | |
RU2733426C1 (ru) | Модифицированная гомосериндегидрогеназа и способ получения гомосерина или l-аминокислоты, имеющей происхождение от гомосерина, с использованием такой гомосериндегидрогеназы | |
JP2023071883A (ja) | L-グルタミン酸生産能が向上した変異菌株、およびそれを用いたl-グルタミン酸の製造方法 | |
JP7193902B2 (ja) | Nadp依存的グリセルアルデヒド-3-ホスフェートデヒドロゲナーゼを含む微生物を用いてl-アミノ酸を生産する方法 | |
JP7378621B2 (ja) | 新規な分枝鎖アミノ酸アミノトランスフェラーゼ変異体及びそれを用いたロイシン生産方法 | |
CN104561163A (zh) | 生产l-氨基酸的方法 | |
JP2023550754A (ja) | シュワネラ・オネイデンシス由来蛋白質を発現する微生物、およびこれを利用したl-アミノ酸の生産方法 | |
KR101564753B1 (ko) | 코리네형 세균 유래의 치환된 개시코돈을 포함하는 재조합 벡터, 형질전환된 숙주세포 및 이를 이용한 아미노산의 생산방법 | |
JP7350994B2 (ja) | 新規なプロモーター及びそれを用いた標的物質生産方法 | |
JP2021534765A (ja) | α−グルコシダーゼの活性が強化されたL−アミノ酸を生産する微生物及びそれを用いたL−アミノ酸生産方法 | |
RU2794946C1 (ru) | Новый промотор и способ получения желаемого вещества с его использованием | |
JP7462776B2 (ja) | L-分岐鎖アミノ酸の生産能が強化された微生物及びそれを用いたl-分岐鎖アミノ酸の生産方法 | |
JP7549665B2 (ja) | L-分枝鎖アミノ酸生産能が強化された微生物及びそれを用いてl-分枝鎖アミノ酸を生産する方法 | |
RU2802274C1 (ru) | Новый вариант аминотрансферазы аминокислот с разветвленной цепью и способ получения лейцина с его использованием | |
KR102377745B1 (ko) | 신규 프로모터 및 이의 용도 | |
JP7447294B2 (ja) | シュワネラ・アトランティカ由来蛋白質を発現する微生物、およびこれを利用したl-アミノ酸生産方法 | |
CN114008206B (zh) | 具有增强的细胞色素c活性的l-氨基酸生产微生物及使用其的l-氨基酸生产方法 | |
KR102673796B1 (ko) | 신규한 아세토하이드록시산 신테아제 변이체 및 이를 이용한 l-이소류신 생산방법 | |
JP2023551275A (ja) | 変異型atp依存性プロテアーゼ及びそれを用いたl-アミノ酸の生産方法 | |
WO2023142881A1 (zh) | 产苏氨酸菌株的构建方法 | |
CA3222017A1 (en) | Strain for producing highly concentrated l-glutamic acid, and l-glutamic acid production method using same | |
JP2024510838A (ja) | L-アミノ酸を生産するコリネバクテリウム属微生物及びそれを用いたl-アミノ酸の生産方法 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A821 Effective date: 20220302 |
|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20220304 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20230301 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20230531 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20230815 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20230913 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 7350994 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |