JP7232992B2 - 試験試料が植物病原性菌を含有するかどうかを判定する方法 - Google Patents

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Description

本発明は、試験試料が植物病原性菌を含有するかどうかを判定する方法に関する。
特許文献1は、糸状菌計量方法を開示している。図10は、特許文献1に開示された糸状菌計量方法のために用いられる微多孔膜支持体の断面図を示す。特許文献1に開示された糸状菌計量方法は、被験材料中の糸状菌数を計量するのに短時間の培養で糸状菌を計量し、また、正確な糸状菌を計量することができる糸状菌計量方法を提供することを目的としている。この糸状菌計量方法は、液体培養で培養した糸状菌13、または微多孔膜支持体4の微多孔膜1上で培養した糸状菌13の複数に伸びた菌糸を撮像した後、形状と面積および発光輝度を画像解析手段10で認識し解析させることにより、糸状菌13を短時間の培養で計量できるという作用を有する。微多孔膜1は、押さえリング2およびベース3の間に挟まれている。
非特許文献1は、植物病原性卵菌の1種であるPhytophthora sojaeの偽菌糸が、3マイクロメートルの孔を有するPET膜を貫通することを開示している。
特許文献2は、試験試料が植物病原性卵菌を含有するかどうかを判定する方法を開示している。
特開2005-287337号公報 特開2017-029131号公報
本発明の目的は、植物病原性菌および植物非病原性菌の2種類の菌の中から、試験試料が植物病原性菌を含有するかどうかを選択的に判定する方法を提供することである。
本発明は、試験試料が植物病原性菌を含有するかどうかを判定する方法を提供する。当該方法は、以下の工程を具備する。
(a) 貫通孔を具備する基板の表側の面に、前記試験試料を配置する工程、
ここで、
前記基板は、セルロースフィルムを、その裏側の面に具備しており、
前記基板の貫通孔は、7.065マイクロ平方メートル以上19.625マイクロ平方メートル以下の断面積を有しており、 前記セルロースフィルムは貫通孔を有しておらず、かつ
前記セルロースフィルムは、0.5マイクロメートル以上3.7マイクロメートル以下の厚みを有しており、
(b) 工程(a)の後、前記試験試料を静置する工程、
(c) 工程(b)の後、前記セルロースフィルムの表側の面に対向するように設置された紫外線光源を用いて、前記セルロースフィルムに紫外線を照射する工程、
(d) 前記工程(c)の後、前記セルロースフィルムの裏面の面を、菌呈色試薬に接触させる工程、および
(e) 前記菌呈色試薬が呈色した場合には、前記試験試料は前記植物病原性菌を含有すると判定する工程。
本発明は、植物病原性菌および植物非病原性菌の2種類の菌の中から、試験試料が植物病原性菌を含有するかどうかを選択的に判定する方法を提供する。
図1は、第1容器100の断面図を示す。 図2は、セルロースフィルム104を裏面の面に具備する基板170の断面図を示す。 図3は、試験試料が供給された第1容器100の断面図を示す。 図4は、植物病原性菌が表面に配置された基板170の断面図を示す。 図5Aは、植物病原性菌が貫通孔172およびセルロースフィルム104を貫通した様子を示す断面図である。 図5Bは、工程(c)での断面図である。 図5Cは、工程(c)の後の断面図である。 図6は、菌の培養を加速させる方法の一例の断面図を示す。 図7は、図6に続き、菌の培養を加速させる方法の一例の断面図を示す。 図8は、セルロースフィルム104の裏面の面から菌を観察する様子を示す断面図である。 図9は、セルロースフィルム104の裏面の面から菌を観察する様子を示す断面図である。 図10は、特許文献1に開示された糸状菌計量方法のために用いられる微多孔膜支持体の断面図を示す。
まず、本明細書において用いられる用語「菌」が説明される。用語「菌」は、真菌および卵菌を含む。菌は、植物病原性菌および植物非病原性菌の2種類の菌に大別される。植物病原性真菌は、例えば、Fusarium属、Colletotrichum属、Botrytis属、Passalora属またはPseudocercospora属を含む。植物病原性真菌の例は、Fusarium avenaceum、Colletotrichum gloeosporioides、Botrytis cinerea、Passalora fulvaまたはPseudocercospora fuligenaである。これらの植物病原性菌は、根腐れ病(Root rot disease)、いもち病(blast)、炭疽病(Anthrax)、灰色かび病(Gray mold)などを引き起こす。これらの植物病原性菌は、植物を枯らす。植物非病原性菌の例は、Saccharomyces cerevisiae、Penicillium chysogeum、またはAspergillus oryzaeである。
用語「植物病原性」とは、植物に対して病原性を有していることを意味する。用語「植物非病原性」とは、植物に対して病原性を有していないことを意味する。菌が病原性を有しているとしても、植物に対して病原性を有していないのであれば、その菌は「植物非病原性」である。言い換えれば、菌が植物に対して悪影響を与えないのであれば、その菌は「植物非病原性」である。用語「植物非病原性」に含まれる接頭語「非」は、「植物」を修飾しない。接頭語「非」は「病原性」を修飾する。
以下、本発明の実施形態が図面を参照しながら詳細に説明される。日本国特許第6167309号、米国特許第9695459号、欧州特許第3128001号、日本特許第6167310号、米国特許第9689020号、欧州特許第3128002号、国際特許出願PCT/JP2016/004417、および国際特許出願PCT/JP2017/008407は、本明細書に参考として援用される。
(工程(a))
工程(a)では、貫通孔172を具備する基板170の表側の面に試験試料が配置される。基板170の裏側の面170bには、セルロースフィルム104が貼付されている。言い換えれば、セルロースフィルム104の表側の面104aは、基板170の裏側の面170bに接している。表側の面104aとは、セルロースフィルム104の上側の面を意味する。
具体的には、図1に示されるように、容器100が用意される。容器100は、上端にフランジ102を具備していることが望ましい。容器100の底面は、基板170から形成されている。
図2に示されるように、基板170は、その裏側の面170bに、セルロースフィルム104を具備する。基板170は、その表側の面170aから裏側の面170bまで貫通する貫通孔172を具備している。貫通孔172は、3マイクロメートル以上5マイクロメートル以下の直径を有している。出願3および出願4を参照せよ。言い換えれば、貫通孔172は、7.065マイクロ平方メートル以上19.625マイクロ平方メートル以下の断面積を有している。出願3および出願4を参照せよ。なお、基板170とは異なり、セルロースフィルム104は貫通孔を有さないことに留意せよ。
図3に示されるように、この容器100の内部に、試験試料200が供給される。このようにして、基板170の表側の面170a上に試験試料200が配置される。試験試料200が植物病原性菌202を含有している場合、図4に示されるように、基板170の表側の面170a上に植物病原性菌202が配置される。
試験試料200は、固体、液体、または気体である。試験試料200は、固体または液体であることが望ましい。固体の試験試料200の例は、土壌または破砕された植物である。他の例は、バーミキュライト、ロックウール、またはウレタンのような農業資材である。液体の試験試料200の例は、農業用水、水耕栽培のために用いられた溶液、植物を洗浄するために使用した後の液体、植物から抽出された液体、農業資材を洗浄するために使用した後の液体、または作業者の衣類あるいは靴を洗浄するために使用した後の液体である。
(工程(b))
工程(b)では、工程(a)の後、試験試料200が所定の培養時間、静置される。望ましくは、試験試料200は、4~150時間程度(より望ましくは24~120時間程度)静置される。このようにして、菌は培養される。言い換えれば、培養時間はおおよそ4~150時間程度(望ましくは24~120時間程度)であることが望ましい。以下、セルロースフィルム104の厚みおよび貫通孔172の大きさの重要性が以下、説明される。
工程(b)においては、試験試料200に含有される様々な菌が成長する。出願1~出願4においても実証されているように、以下の(I)が充足される場合、植物病原性菌202は、図5Aに示されるように、セルロースフィルム104を貫通するように成長する。その結果、セルロースフィルム104の裏面の面104bに植物病原性菌202が現れる。
条件(I) セルロースフィルム104が、0.5マイクロメートル以上、3.7マイクロメートル以下の厚みを有すること。
上記(I)の条件が充足される場合、植物非病原性菌は、セルロースフィルム104をほとんど貫通しない。そのため、植物非病原性菌は、セルロースフィルム104の裏面の面104bにほとんど現れない。一方、植物病原性菌202が選択的に裏面の面104bに現れる。このように、植物病原性菌202が選択的に容器100の外側に現れる。裏側の面104bとは、セルロースフィルム104の下側の面を意味する。
セルロースフィルム104が、3.7マイクロメートルを超える厚みを有する場合、植物非病原性菌だけでなく植物病原性菌も、セルロースフィルム104を貫通しない。従って、セルロースフィルム104が3.7マイクロメートルを超える厚みを有する場合、選択性が失われる。セルロースフィルム104が、0.5マイクロメートル未満の厚みを有する場合(セルロースフィルム104が設けられない場合を含む)、植物病原性菌だけでなく植物非病原性菌も、セルロースフィルム104を貫通する(または、基板170の裏側の面170bに見いだされる)。従って、セルロースフィルム104が0.5マイクロメートル未満の厚みを有する場合、選択性が失われる。
貫通孔172が7.065マイクロ平方メートル未満の断面積(すなわち、3マイクロメートル未満の直径)を有する場合、植物非病原性菌だけでなく植物病原性菌もまた、セルロースフィルム104を貫通しにくくなる。一方、貫通孔172が19.625マイクロ平方メートルを超える断面積(すなわち、5マイクロメートルを超える直径)を有する場合、貫通孔172が19.625マイクロ平方メートルの断面積(すなわち、5マイクロメートルの直径)を有する場合と比較して、侵入点数が減少する傾向がある。
セルロースフィルム104は、基板170の裏側の面170b上にピンと張られる。このように、基板170はセルロースフィルム104をサポートする。
図2に示されるように、基板170は複数の貫通孔172を有する。基板170の厚みは限定されないが、一例として1マイクロメートル以上500マイクロメートル以下である。セルロースフィルム104は非常に薄い。しかし、このような基板170上にセルロースフィルム104が配置されると、セルロースフィルム104の取り扱いが容易となる。
菌の培養を加速させるために、試験試料200に培地が供給され得る。具体的には、試験試料200を含有する容器100の内部に培地が供給され得る。培地は液体であることが望ましい。培地は、工程(b)において供給され得る。これに代えて、培地は工程(b)よりも前に供給され得る。言い換えれば、培地は工程(a)において供給され得る。培地は工程(a)の前に容器100の内部に供給されても良い。
図6は、菌の培養を加速させる他の方法を示す。図6に示されるように、セルロースフィルム104の裏面の面104bを液体の培地302に接触させることが望ましい。まず、液体の培地302を内部に有する第2容器300が用意される。以下、第2容器300から区別するため、容器100は「第1容器100」と呼ばれる。フランジ102の下面が第2容器300の上端に接触するように、第1容器100が第2容器300に重ね合わされる。言い換えれば、第1容器100が第2容器300の上端によって支持される。このようにして、液体の培地302がセルロースフィルム104の裏面の面104bおよび第2容器300の底面の間に挟まれる。
あるいは、第1容器100が第2容器300に重ね合わされた後に、セルロースフィルム104の裏面の面104bおよび第2容器300の底面の間に液体の培地302が供給されても良い。
液体の培地302に代えて、粘性を有する固体の培地も用いられ得る。図6に示されるように、固体の培地304および液体の培地302の両者が用いられ得る。この場合、液体の培地302が固体の培地304およびセルロースフィルム104の間に挟まれる。図5Aに示されるように、裏面の面104bに現れた植物病原性菌の培養が、液体培地302および固体培地304の少なくとも一方により加速される。
(工程(c))
工程(c)では、工程(b)の後、図5Bに示されるように、セルロースフィルム104の表側の面104aに対向するように設置された紫外線光源400を用いて、セルロースフィルム104に紫外線を照射する。
紫外線の殺菌作用により、図5Cに示されるように、セルロースフィルム104の表側の面104a上に位置している部分の植物病原性菌202は死滅する。図5Cに含まれる破線を参照せよ。同様に、セルロースフィルム104の表側の面104a上に位置している植物非病原性菌もまた、死滅する。一方、セルロースフィルム104が、紫外線を遮蔽するため、セルロースフィルム104の裏側の面104bに位置している植物病原性菌202の部分(すなわち、セルロースフィルム104を貫通した植物病原性菌202の一部分)は、生存したままである。基板170もまた、紫外線を遮蔽する。
紫外線の強度および照射時間は、本明細書を読解した当業者によって適切に選択され得る。余りにも高い強度を有する紫外線は、セルロースフィルム104および基板170によって十分遮蔽されないため、セルロースフィルム104の裏側の面104bに位置している植物病原性菌202の部分も死滅させる。その結果、菌の選択性が失われる。余りにも長い紫外線の照射時間も、同様の問題を引き起こす。
(工程(d))
工程(d)では、工程(c)の後、セルロースフィルム104の裏側の面104bを、菌呈色試薬に接触させる。このようにして、セルロースフィルム104の裏面の面104bに現れた植物病原性菌202の一部分(図5Cを参照せよ)は、菌呈色試薬を呈色させる。菌呈色試薬は、生きている菌と反応し呈色する一方で、死んでいる菌とは反応せず呈色しない。菌呈色試薬は、一般に水溶性である。
理論上、第二容器300と第一容器100はセルロースフィルム104によって隔てられているので、菌呈色試薬は第1容器100の内部には広がらない。従って、第1容器100に含有されている植物病原性菌は、菌呈色試薬を呈色させない。
しかし、実際には、セルロースフィルム104を貫通した植物病原性菌202の周囲に形成された小さな隙間を通って、菌呈色試薬は、第1容器100の内部には広がり得る。また、菌呈示試薬は一般に水溶性であるため、セルロースフィルム104の内部を通ってセルロースフィルム104の表側の面104aに広がり得る。
そのため、セルロースフィルム104の表側の面104a上に位置している植物病原性菌202の一部分も、菌呈色試薬を呈色させる。さらに、セルロースフィルム104の表側の面104a上に位置している植物非病原性菌(図示せず)もまた、菌呈色試薬を呈色させる。そのため、菌の選択性が失われる。
一方、本実施形態では、図5Cに示されるように、紫外線の照射により、セルロースフィルム104の表側の面104a上では、植物病原性菌202および植物非病原性菌(図示せず)は死滅している。しかし、植物病原性菌202の一部分がセルロースフィルム104の裏側の面104bに生き残っており、当該一部分が菌呈色試薬を呈色させる。言うまでもないが、植物非病原性菌は、セルロースフィルム104を貫通しないので、菌呈色試薬を呈色させない。このようにして、本実施形態では、セルロースフィルム104を貫通した植物病原性菌202の一部分が、選択的に、菌呈色試薬を呈色させる。
菌呈色試薬の例は、以下の化1の化学構造を有する化学物質である。当該化学物質は、WST-8と呼ばれる。
Figure 0007232992000001
具体的には、工程(c)の後、第2容器300から液体の培地302および固体の培地304が除去される。次いで、第2容器300の内部に、菌呈色試薬が添加される。次いで、図7に示されるように、第1容器100は、菌呈色試薬を内部に有する第2容器300に重ね合わされる。あるいは、第1容器100が第2容器300に重ね合わされた後に、セルロースフィルム104の裏面の面104bおよび第2容器300の底面の間に菌呈色試薬を含有する溶液402が供給されても良い。また、セルロースフィルム104から液が染み出すため、菌呈色試薬を含有する溶液402が第1容器100内に供給されても良い。
(工程(e))
工程(e)では、工程(d)において菌呈色試薬が呈色された場合には、試験試料は植物病原性菌を含有すると判定される。
本発明には、上述の植物病原性菌を含有するかどうかを選択的に判定する方法の実施に用いられるデバイスも含まれる。
本発明のデバイスは、少なくとも、基板と、セルロースフィルムとを備える。基板は、7.065マイクロ平方メートル以上19.625マイクロ平方メートル以下の断面積、言い換えれば3マイクロメートル以上5マイクロメートル以下の直径を有する貫通孔を具備する。基板は、当該基板で底面が構成され、フランジを備える容器であってもよい。セルロースフィルムは、基板の一方の面に具備され、0.5マイクロメートル以上3.7マイクロメートル以下の厚みを有し、貫通孔を有していない。
本発明のデバイスは、菌の培養を加速させるための培地、菌呈色試薬などを含んでいてもよい。また、本発明のデバイスは、セルロースフィルムに紫外線を照射するための紫外線光源、菌呈色試薬の呈色を光学的に検出するための光学センサ、検出した結果を表示するための表示素子などを備えることもできる。
本発明の効果を阻害しない限り、セルロースフィルムおよび基板の間には、他の層が挟まれ得る。しかし、セルロースフィルムは基板上に接していることが望ましい。言い換えれば、本発明の効果を阻害しない限り、セルロースフィルムは、基板と接する必要はなく、この場合には、セルロースフィルムおよび基板の間には、他の層が挟まれるように、基板の上にセルロースフィルムが位置し得る。しかし、繰り返しになるが、セルロースフィルムは基板上に接するように、基板の上にセルロースフィルムが位置していることが望ましい。
(実施例)
以下の実施例を参照しながら、本発明がさらにより詳細に説明される。
(培地の用意)
まず、本発明者らは、純水(1リットル)に、0.56mMの硫酸鉄(III)、1.53mMの硝酸亜鉛、および1,1mMの硫酸マンガン(II)を溶解し、水溶液を調製した。次に、本発明者らは、この水溶液(2ミリリットル)に、純水(1リットル)、ラクトース(37.5グラム、SIGMA-ALDRICH社より入手)、カゼイン水和物(3.0グラム、Difco社より入手)、リン酸二水素カリウム(1.0グラム、和光純薬工業株式会社より入手)、硫酸マグネシウム(0.5グラム、和光純薬工業株式会社より入手)を混合かつ溶解して、混合物を調製した。本発明者らは、オートクレーブを用いて混合物を滅菌した。得られた混合物のpHは6.0であった。本発明者らは、この混合物を純水で10倍に希釈して、培地を得た。以下、このようにして得られた培地を「10%LCH培地」という。
(WST反応液の調製)
本発明者らは、Duroquinone(東京化成工業株式会社より入手、CAS番号:527-17-3)をエタノール(和光純薬工業株式会社より入手)に溶解し、Duroquinoneエタノール溶液(50mM)を得た。これとは別に、本発明者らは、2-Cyclohexylaminoethanesulfonic Acid(東京化成工業株式会社より入手、CAS:103-47-9、以下「Chem」という)を純水に溶解し、Chem溶液(100mM)を得た。本発明者らは、Chem溶液のpHを、NaOH水溶液(1M、和光純薬工業株式会社より入手)を滴下することにより、9.5に調整した。
本発明者らは、以下の表1に示される試薬を混合して、WST反応液を得た。
Figure 0007232992000002
WST-8溶液は、株式会社 同仁化学研究所より、商品名:WST-8 Microbial Viability Assay Kit-WSTとして入手した商品に含まれていた。WST-8は、「化1」として上述された化学構造を有していた。
(実験例1)
(Colletotrichum gloeosporioideの培養)
植物病原菌の一種であるColletotrichum gloeosporioideが、ポテトデキストロース寒天培地に接種された。次いで、培地は摂氏25度の温度下で1週間静置された。Colletotrichum gloeosporioideは岐阜大学応用生物科学部に所属する清水准教授より与えられた。
次いで、菌糸の先端を含む部分が、培地と共に1センチメートル×1センチメートルの大きさで切り出された。切り出された部分は、12ウェルプレート上に配置された10%LCH培地に浸された。各純水の容積は1ミリリットルであった。
12ウェルプレート上に配置された水が光学顕微鏡で観察された。その結果、12ウェルプレート上に配置された水にColletotrichum gloeosporioideの胞子が放出されていることが確認された。このようにして、Colletotrichum gloeosporioideを含有する水溶液が得られた。以下、この水溶液は、「植物病原性菌水溶液」と呼ばれる。
(実験例1)
実験例1は、実施例1A~実施例1Dからなる。
(実施例1A)
図1に示される第1容器100が以下のように用意された。
まず、セルロース(SIGMA-ALDRICH社より入手、商品名:Avicel PH-101)がイオン液体に溶解され、1%の濃度を有するセルロース溶液が調製された。イオン液体は、1-Butyl-3-methyl imidazolium chloride(SIGMA-ALDRICH社より入手)であった。
セルロース溶液は、摂氏60度に加温された。次に、セルロース溶液が、底面にポリエチレンテレフタラートフィルムを有する容器(ミリポア社より入手、商品名:Millicell PISP 12R 48)の裏面の面にスピンコート法により30秒間、2000rpmの回転速度で塗布された。ポリエチレンテレフタラートフィルムは、基板170として機能した。ポリエチレンテレフタラートフィルムは、3マイクロメートルの直径を有する複数の貫通孔172をランダムに有していた。このようにして、ポリエチレンテレフタラートフィルムの裏側の面に、0.5マイクロメートルの厚みを有するセルロースフィルム104が形成された。ミリポア社によると、貫通孔172の直径には、プラスマイナス10%程度の誤差の範囲があり得る。
容器は、エタノール中で12時間、室温で静置された。このようにして、1-Butyl-3-methyl imidazolium chlorideは、エタノールに置換された。言い換えれば、1-Butyl-3-methyl imidazolium chlorideがセルロースフィルム104から除去された。
最後に、容器は真空デシケーター内で乾燥された。このようにして、図1に示される第1容器100が得られた。図1においては、基板170として機能するポリエチレンテレフタラートフィルムが図示されていないことに留意せよ。
次に、図6に示されるように、第1容器100が第2容器300に重ねられた。第2容器300としては、24ウェルプレート(コーニング社より入手)が用いられた。セルロースフィルム104の裏面の面104bは、液体の培地302に接していた。液体の培地302としては、10%LCH培地が用いられた。1000個のColletotrichum gloeosporioideの胞子を含む植物病原菌水溶液が第1容器100の内部に添加された。
第1容器100は、摂氏25度の温度で24時間静置された。言い換えれば、実施例1Aでは、培養時間は24時間であった。
(菌の検出)
次いで、本発明者らは、第1容器100を第2容器300から分離した。さらに、本発明者らは、第1容器100の内部に含まれている溶液を、ピペットを用いて除去した。その後、本発明者らは、第1容器100の周囲を、黒色24ウェルプレート(zell-kontakt社より入手、商品名:Imaging plate FC)を用いて取り囲み、第1容器100を遮光した。
図5Bおよび図5Cに示されるように、紫外線光源400(パナソニック株式会社製、商品名:UV-EC910ZA)を用いて、セルロースフィルム104に紫外線を照射した。紫外線光源400およびセルロースフィルム104の間の間隔は、1.5cmであった。紫外線光源400には、0.1アンペアの電流が10分間、流された。
次いで、本発明者らは、セルロースフィルム104の裏側の面104bに、WST反応液(100マイクロリットル)を接触させた。続いて、光がセルロースフィルム104に照射されないように、摂氏25度で1時間、第1容器100は遮光された。
本発明者らは、セルロースフィルム104の裏側の面104bに接触されたWST反応液(50マイクロリットル)を、96ウェル平底透明プレート(Greiner社より入手)に移した。次いで、本発明者らは、460ナノメートルの波長でのWST反応液の吸光度を、プレートリーダー(TECAN社より入手、商品名:M1000Pro)を用いて測定した。
これとは別に、参照として、WST反応液が摂氏25度で1時間静置され、次いでその吸光度が同様に測定された。言うまでもないが、参照として用いられたWST反応液は、セルロースフィルム104の裏側の面104bに接触されなかった。実施例1Aは2回、繰り返された。
本発明者らは、以下の数式(I)に従って、呈色度を算出した。
呈色度=(セルロースフィルム104の裏側の面104bに接触されたWST反応液の吸光度)-(参照としてのWST反応液の吸光度) (I)
結果は、以下の表2に示される。
Figure 0007232992000003
上記の表2から、実施例1におけるColletotrichum gloeosporioideの呈色度の平均値は、0.32(=((0.428-0.046)+(0.308-0.044))/2)である。
(実施例1B)
実施例1Bにおいては、セルロース溶液が3%の濃度を有していたこと、およびセルロースフィルム104が3.7マイクロメートルの厚みを有していたことを除き、実施例1Aと同様の実験が行われた。結果は以下の表3に示される。
Figure 0007232992000004
(実施例1C)
実施例1Cにおいては、セルロースフィルム104の裏側の面104bの全面に、防水テープ(日東電工株式会社より入手、商品名:57130SB)が貼付されたこと以外は、実施例1Aと同様の実験が行われた。防水テープは、菌が、セルロースフィルム104の裏側の面104bの外側に伸び出すことを抑制した。結果は以下の表4に示される。
Figure 0007232992000005
(実施例1D)
実施例1Dにおいては、セルロース溶液が3%の濃度を有していたこと、セルロースフィルム104が3.7マイクロメートルの厚みを有していたこと、およびセルロースフィルム104の裏側の面104bの全面に防水テープが貼付されたことを除き、実施例1Aと同様の実験が行われた。結果は以下の表5に示される。
Figure 0007232992000006
(実験例2)
実験例2は、実施例2A~実施例2Dからなる。実験例2では、Colletotrichum gloeosporioideに代えて、Fusarium avenaceumが用いられたこと以外は、実験例1と同様の実験が行われた。
実施例2Aの結果は以下の表6に示される。
Figure 0007232992000007
実施例2Bの結果は以下の表7に示される。
Figure 0007232992000008
実施例2Cの結果は以下の表8に示される。
Figure 0007232992000009
実施例2Dの結果は以下の表9に示される。
Figure 0007232992000010
以下の表10は、実施例1A~実施例1Dおよび実施例2A~実施例2Dの結果を示す。
Figure 0007232992000011
上記の表10から明らかなように、セルロースフィルム104を貫通した植物病原性菌が検出された。
(実験例3)
植物病原菌の一種であるBotrytis cinerea(トマト灰色カビ病菌)について、上述の実験例1と同様にして、Botrytis cinereaの胞子を含む植物病原菌水溶液が得られた。
実験例3は、実施例3および比較例3A~3Cからなる。
(実施例3)
図1に示される第1容器100が、上述の実施例1と同様に用意された。
次に、図6に示されるように、第1容器100が第2容器300に重ねられた。第2容器300および液体の培地302としては、上述の実施例1と同様のものが用いられた。1000個のBotrytis cinereaの胞子を含む植物病原菌水溶液が第1容器100の内部に添加された。
第1容器100は、摂氏25度の温度で40時間静置された。
次いで、上述の実施例1と同様に、第1容器100が第2容器300から分離され、第1容器100の内部に含まれている溶液が除去された後、第1容器100が遮光された。
図5Bおよび図5Cに示されるように、上述の実施例1と同様にして、紫外線光源400を用いて、セルロースフィルム104に紫外線が照射された。
次いで、セルロースフィルム104の裏側の面104bに、WST反応液(100マイクロリットル)が接触された。続いて、光がセルロースフィルム104に照射されないように、摂氏25度で3時間、第1容器100は遮光された。
次いで、上述の実施例1と同様にして、セルロースフィルム104の裏側の面104bに接触されたWST反応液(50マイクロリットル)の吸光度が測定された。 (比較例3A)
比較例3Aにおいては、実施例3における第1容器100を用意する際、1%の濃度を有するセルロース溶液に代えて、5%の濃度を有するセルロース溶液が用いられたこと、および底面に複数の貫通孔を有するポリエチレンテレフタラートフィルムを有する容器として、貫通孔の直径が3マイクロメートルのもの(ミリポア社 商品名:Millicell PISP 12R 48)に代えて、貫通孔の直径が1マイクロメートルのもの(ミリポア社 商品名:Millicell PIRP 12R 48)が用いられたことを除いては、上述の実施例3と同様の実験が行われた。
(比較例3B)
比較例3Bにおいては、セルロースフィルム104に紫外線が照射されなかったこと以外は、上述の実施例3と同様の実験が行われた。
(比較例3C) 比較例3Cにおいては、セルロースフィルム104に紫外線が照射されなかったこと以外は、上述の比較例3Aと同様の実験が行われた。
(実験例4)
植物病原菌の一種であるPassalora fulva(トマト葉カビ病菌)について、上述の実験例1と同様にして、Passalora fulvaの胞子を含む植物病原菌水溶液が得られた。
実験例4は、実施例4および比較例4A~4Bからなる。
(実施例4)
図1に示される第1容器100が、上述の実施例1と同様に用意された。
次に、図6に示されるように、第1容器100が第2容器300に重ねられた。第2容器300および液体の培地302としては、上述の実施例1と同様のものが用いられた。1000個のPassalora fulvaの胞子を含む植物病原菌水溶液が第1容器100の内部に添加された。
第1容器100は、摂氏25度の温度で120時間静置された。
次いで、上述の実施例1と同様に、第1容器100が第2容器300から分離され、第1容器100の内部に含まれている溶液が除去された後、第1容器100が遮光された。
図5Bおよび図5Cに示されるように、上述の実施例1と同様にして、紫外線光源400を用いて、セルロースフィルム104に紫外線が照射された。
次いで、セルロースフィルム104の裏側の面104bに、WST反応液(100マイクロリットル)が接触された。続いて、光がセルロースフィルム104に照射されないように、摂氏25度で3時間、第1容器100は遮光された。
次いで、上述の実施例1と同様にして、セルロースフィルム104の裏側の面104bに接触されたWST反応液(50マイクロリットル)の吸光度が測定された。
(比較例4A)
比較例4Aにおいては、実施例4における第1容器100を用意する際、1%の濃度を有するセルロース溶液に代えて、5%の濃度を有するセルロース溶液が用いられたこと、および底面に複数の貫通孔を有するポリエチレンテレフタラートフィルムを有する容器として、貫通孔の直径が3マイクロメートルのもの(ミリポア社 商品名:Millicell PISP 12R 48)に代えて、貫通孔の直径が1マイクロメートルのもの(ミリポア社 商品名:Millicell PIRP 12R 48)が用いられたことを除いては、上述の実施例4と同様の実験が行われた。
(比較例4B)
比較例4Bにおいては、セルロースフィルム104に紫外線が照射されなかったこと以外は、上述の実施例4と同様の実験が行われた。
(実験例5)
植物病原菌の一種であるPseudocercospora fuligena(トマトすすカビ病菌)について、上述の実験例1と同様にして、Pseudocercospora fuligenaの胞子を含む植物病原菌水溶液が得られた。
実験例5は、実施例5および比較例5A~5Bからなる。
(実施例5)
図1に示される第1容器100が、上述の実施例1と同様に用意された。
次に、図6に示されるように、第1容器100が第2容器300に重ねられた。第2容器300および液体の培地302としては、上述の実施例1と同様のものが用いられた。1000個のPseudocercospora fuligenaの胞子を含む植物病原菌水溶液が第1容器100の内部に添加された。
第1容器100は、摂氏25度の温度で75時間静置された。
次いで、上述の実施例1と同様に、第1容器100が第2容器300から分離され、第1容器100の内部に含まれている溶液が除去された後、第1容器100が遮光された。
図5Bおよび図5Cに示されるように、上述の実施例1と同様にして、紫外線光源400を用いて、セルロースフィルム104に紫外線が照射された。
次いで、セルロースフィルム104の裏側の面104bに、WST反応液(100マイクロリットル)が接触された。続いて、光がセルロースフィルム104に照射されないように、摂氏25度で1時間、第1容器100は遮光された。
次いで、上述の実施例1と同様にして、セルロースフィルム104の裏側の面104bに接触されたWST反応液(50マイクロリットル)の吸光度が測定された。
(比較例5A)
比較例5Aにおいては、実施例5における第1容器100を用意する際、1%の濃度を有するセルロース溶液に代えて、5%の濃度を有するセルロース溶液が用いられたこと、および底面に複数の貫通孔を有するポリエチレンテレフタラートフィルムを有する容器として、貫通孔の直径が3マイクロメートルのもの(ミリポア社 商品名:Millicell PISP 12R 48)に代えて、貫通孔の直径が1マイクロメートルのもの(ミリポア社 商品名:Millicell PIRP 12R 48)が用いられたことを除いては、上述の実施例5と同様の実験が行われた。
(比較例5B)
比較例5Bにおいては、セルロースフィルム104に紫外線が照射されなかったこと以外は、上述の実施例5と同様の実験が行われた。
以下の表11は、実験例3~5の結果を示す。なお、表11の貫通菌糸数は、セルロースフィルム104を貫通した菌糸の数が光学顕微鏡観察よりカウントされた結果を示したものである。
Figure 0007232992000012
実施例3~5における呈色度は、紫外線照射により基板170上の菌が死滅し、セルロースフィルム104を貫通した菌糸のみによる呈色である。
また、比較例3A、4A、5Aは、菌が貫通し難い条件で実施されているため、菌の貫通がないか、菌の貫通があってもごく少数である。従って、紫外線照射により基板170上の菌が死滅し、実施例3~5に比べて非常に低い呈色度を示している。かかる比較例3A、4A、5Aと、実施例3~5のそれぞれとの比較から、本発明の方法によって貫通菌糸の有無が呈色度により判定できることが理解される。
また、比較例3B、3C、4B、5Bでは、紫外線が照射されないため、基板170上の菌が死滅しない。そのため、貫通菌糸の有無に関わらず、実施例3~5のそれぞれよりも高い呈色度を示しており、貫通菌糸の有無が判定できていない。
以上、実験例3~5の結果より、本発明の方法によれば、セルロースフィルムを貫通した植物病原性菌が菌呈色試薬を呈色させることにより、試験試料が植物病原性菌を含有するかどうかを判定することができる。
本発明は、農業用水、植物体破砕物、または土壌のような試験試料が植物病原性菌を含有するかどうかを簡単に判定するために用いられ得る。
100 第1容器
102 フランジ
104 セルロースフィルム
104a 表側の面
104b 裏側の面
170 基板
170a 表側の面
170b 裏側の面
200 試験試料
202 植物病原性菌
202a 植物病原性菌の一部分
300 第2容器
302 液体の培地
304 固体の培地
402 菌呈色試薬を含有する溶液
500 光源
600 顕微鏡

Claims (13)

  1. 試験試料が植物病原性菌を含有するかどうかを判定する方法であって、以下の工程:
    (a)貫通孔を具備する基板の表側の面に、前記試験試料を配置する工程、
    ここで、
    前記基板は、セルロースフィルムを、その裏側の面に具備しており、
    前記基板の貫通孔は、7.065マイクロ平方メートル以上19.625マイクロ平方メートル以下の断面積を有しており、前記セルロースフィルムは貫通孔を有しておらず、かつ
    前記セルロースフィルムは、0.5マイクロメートル以上3.7マイクロメートル以下の厚みを有しており、
    (b)工程(a)の後、前記試験試料を4~150時間静置する工程、
    (c)工程(b)の後、前記セルロースフィルムの表側の面に対向するように設置された紫外線光源を用いて、前記セルロースフィルムに紫外線を照射する工程、
    (d)前記工程(c)の後、前記セルロースフィルムの裏面の面を、WST-8を含む菌呈色試薬に接触させる工程、および
    (e)前記菌呈色試薬が呈色した場合には、前記試験試料は前記植物病原性菌を含有すると判定する工程、
    を具備し、
    前記植物病原性菌は、Colletotrichum属、Fusarium属、Botrytis属、Passalora属およびPseudocercospora属からなる群から選択される少なくとも1つである、
    方法。
  2. 請求項1に記載の方法であって、
    前記植物病原性菌が、Colletotrichum gloeosporioides、Fusarium avenaceum、Botrytis cinerea、Passalora fulvaおよびPseudocercospora fuligenaからなる群から選択される少なくとも1つである、
    方法。
  3. 請求項1に記載の方法であって、
    前記工程(b)の前に、前記試験試料に培地を供給する工程をさらに具備する、
    方法。
  4. 請求項3に記載の方法であって、
    前記培地が液体培地である、
    方法。
  5. 請求項3に記載の方法であって、
    前記培地が固体培地である、
    方法。
  6. 請求項1に記載の方法であって、
    前記工程(b)において、前記セルロースフィルムの裏面の面を培地に接触させながら、前記試験試料が静置される、
    方法。
  7. 請求項6に記載の方法であって、
    前記培地が液体培地である、
    方法。
  8. 請求項6に記載の方法であって、
    前記培地が固体培地である、
    方法。
  9. 請求項1に記載の方法であって、
    前記試験試料が固体である、
    方法。
  10. 請求項9に記載の方法であって、
    前記固体が、植物体の一部、土壌および破砕された植物からなる群から選択される少なくとも1つである、
    方法。
  11. 請求項1に記載の方法であって、
    前記試験試料が液体である、
    方法。
  12. 請求項11に記載の方法であって、
    前記液体が、農業用水、水耕栽培のために用いられた液体、植物を洗浄するために使用した後の液体、植物から抽出された液体、農業資材を洗浄するために使用した後の液体、および衣類または靴を洗浄するために使用した後の液体からなる群から選択される少なくとも1つである、
    方法。
  13. 請求項1から12のいずれか1項に記載の方法の実施に用いられるデバイスであって、
    前記基板と、前記セルロースフィルムとを備えるデバイス。
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