WO2019225171A1 - トマト病原性真菌の検出装置およびそれを用いた検出方法 - Google Patents

トマト病原性真菌の検出装置およびそれを用いた検出方法 Download PDF

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太郎 石堂
慶文 狩集
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    • G01N2333/00Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
    • G01N2333/37Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from fungi

Definitions

  • the present invention relates to a detection apparatus for tomato pathogenic fungi and a selective detection method using the same.
  • fungi As a property related to plant invasion, after forming and attaching an attachment device on the plant surface, look for pores such as stomatal tissues and extend mycelia into the plant body from there, or plant cells wall from mycelia It is characterized by secreting degrading enzymes (cellulase, pectinase).
  • Patent Document 1 discloses a fungal weighing method using a microporous membrane support. Further, in Non-Patent Document 1, PET (polyethylene terephthalate) has a pseudohyphae of Phytophthora sojae, which is a kind of phytopathogenic oomycete, trying to dive in a lower direction than horizontally growing, and 3 ⁇ m pores. Discloses penetrating the membrane.
  • Patent Document 2 a method for determining phytopathogenic oomycetes
  • JP 2005-287337 A Japanese Patent No. 6167309 International Publication No. 2018/011835
  • the ratio of fungal diseases is high, and the causative fungi causing the disease are tomato gray fungus (Botrytis cinerea), tomato soot fungus (Pseudocercospora fuligena), tomato leaf fungus ( It is said that it occupies most of the three types (Passalora fulva).
  • gray mold fungus (Botrytis cinerea) is polycytic and can be infected in other plants, but soot fungus fungus (Pseudocercospora fuligena) and leaf mold fungus (Passalora fulva) are only examples of infection of tomato.
  • the present inventors are able to detect tomato pathogenic fungi at a stage where it is unclear what kind of fungi are present in actual tomato leaves, that is, pathogenic fungi that can be said to be specific for tomatoes, that is, at the stage before onset. We considered it necessary and examined it.
  • the pathogenic fungi selection technique using an artificial cell wall which is the basic technique of selective fungal detection used by the present inventors as described in Patent Document 2, is applied to tomato pathogenic fungi if it is a plant pathogenic fungus.
  • Tomato cultivation is mostly from seedlings, not seeds.
  • plant pathogenic fungi other than tomato pathogenic fungi can be mixed with other plants or used in multiple plants at the same facility. The possibility of adhering to tomato seedlings cannot be denied.
  • the present invention has been made in view of such circumstances, and an object thereof is to provide a selective detection apparatus and detection method for tomato pathogenic fungi.
  • the detection apparatus for tomato pathogenic fungi includes an artificial cell wall, a test sample solution input unit provided on the artificial cell wall, and a culture solution reservoir provided on the artificial cell wall. And the test sample solution is charged with 50 to 70 mM citrate buffer, and the pH of the test sample solution is 5 to 5.5. And
  • the present invention it is possible to provide an apparatus and a method capable of selectively detecting a tomato pathogenic fungus simply and safely. According to the present invention, it is possible to detect the presence of a fungus at a pre-onset stage due to a tomato pathogenic fungus, and in that case, it is possible to avoid presentation of false positives caused by plant pathogenic bacteria other than tomato, which is very useful for industrial use. .
  • FIG. 1 is a schematic cross-sectional view showing an example of the detection apparatus of the present embodiment.
  • FIG. 2 is a schematic cross-sectional view showing an example of an artificial cell wall provided in the detection device of the present embodiment.
  • FIG. 3 is a schematic cross-sectional view showing an example of the detection apparatus of the present embodiment.
  • FIG. 4 is a photomicrograph of the back surface of the artificial cell wall showing that the tomato gray fungus (Botrytis cinerea) penetrated the artificial cell wall in Example 1.
  • FIG. 5 is a graph showing the results of Comparative Example 1.
  • FIG. 6 is a graph showing the results of Example 1.
  • FIG. 7 is a graph showing the results of Comparative Example 2.
  • FIG. 8 is a graph showing the results of Comparative Example 3.
  • FIG. 9 is a graph showing the results of Comparative Example 4.
  • FIG. 10 is a graph showing the results of Comparative Example 5.
  • FIG. 11 is a graph showing the results of Comparative Example 6.
  • an apparatus 1 for detecting a tomato pathogenic fungus includes an artificial cell wall 2, a test sample solution input unit 3 provided on the artificial cell wall 2, and the artificial cell wall.
  • the culture medium reservoir 4 provided in the lower part of the test sample liquid input section 3
  • the test sample liquid 5 contains a 50 to 70 mM citrate buffer
  • the test sample liquid The pH of 5 is 5 to 5.5.
  • the test sample solution input unit 3 is a container for supplying the test sample solution 5, and the container preferably has a flange at the upper end.
  • the bottom surface of the test sample solution charging unit 3 is formed by the artificial cell wall 2.
  • the artificial cell wall 2 preferably includes at least a substrate 21 having a through-hole 22 and a cellulose film 23 provided on one surface of the substrate 21.
  • the through hole 22 penetrates from the surface on the front side to the surface on the back side of the substrate 21.
  • the diameter of the through hole is preferably 2 to 7 ⁇ m (cross-sectional area 4.5 to 38.5 ⁇ m 2 ). When the pore diameter is in the above range, the target pathogenic fungus can be selectively detected more reliably.
  • the thickness of the cellulose membrane 23 is preferably 0.5 to 2 ⁇ m.
  • the tomato non-pathogenic fungi do not penetrate the cellulose membrane 23 by adjusting the hole diameter of the through hole 22 of the substrate 21 and the film thickness of the cellulose membrane 23 within the above ranges. It is believed that some of the tomato non-pathogenic fungi can be eliminated at this stage due to the large number. On the other hand, the tomato pathogenic fungus targeted in this embodiment selectively appears on the back surface of the substrate.
  • the thickness of the substrate 21 is not particularly limited, but is preferably about 5 to 150 ⁇ m as an example.
  • a test sample solution 5 is supplied into the test sample solution supply unit 3.
  • the tomato pathogenic fungus is present on the front surface of the substrate 21.
  • the test sample liquid 5 is a liquid mainly containing fungi adhering to the tomato leaves (bacteria recovery liquid), and is particularly limited as long as it may contain the target pathogenic fungus. Not done.
  • a liquid after used for washing tomato leaves or a liquid in which tomato leaves are immersed For example, a liquid after used for washing tomato leaves or a liquid in which tomato leaves are immersed.
  • the pH of the test sample solution 5 is 5 to 5.5 and that the test sample solution 5 contains 50 to 70 mM citrate buffer.
  • the pH of the test sample solution 5 is less than 5 or exceeds 5.5, it may be impossible to exclude all tomato non-pathogenic fungi that interfere with detection of tomato pathogenic fungi.
  • the concentration of the citrate buffer contained in the test sample solution is less than 50 mM, it may not be possible to eliminate all tomato non-pathogenic fungi that interfere with detection of tomato pathogenic fungi.
  • the concentration of the citrate buffer solution exceeds 70 mM, even a part of the target matopathogenic fungus may be excluded.
  • the citrate is not particularly limited, but is preferably a monovalent salt of citric acid, and more specifically sodium citrate and potassium citrate.
  • the EC electrical conductivity
  • the EC is usually preferably about 7 to 15 mS / cm.
  • the tomato pathogenic fungus targeted by the detection device of the present embodiment is at least one selected from tomato gray fungus (Botrytis cinerea), tomato soot fungus (Pseudocercospora fuligena), and tomato leaf fungus (Passalora fulva). Preferably there is.
  • the detection apparatus of the present embodiment may be present in tomato leaves, but does not detect fungi that are non-tomato pathogenic fungi, for example, Biscognia genus fungus, Penicillium genus fungus, Phoma genus fungus, and Trichoderma genus fungus It is preferable. More specifically, the tomato non-pathogenic fungus is Biscognauxia maritima, Penicillium olsonii, Poma multirostrata or Trichoderma asperellum.
  • tomato pathogenicity means having pathogenicity against tomato.
  • tomato non-pathogenic means not pathogenic to tomato.
  • a fungus is “tomato non-pathogenic” if it is not pathogenic to tomatoes, even if it is pathogenic. In other words, a fungus is “tomato non-pathogenic” if it does not adversely affect the tomato.
  • the prefix “non” included in the term “tomato non-pathogenic” does not modify “tomato” and the prefix “non” modifies “pathogenic”.
  • a culture solution is placed in the culture solution reservoir 4 provided at the lower part of the artificial cell wall 2.
  • the culture solution is not particularly limited as long as it is a culture solution capable of culturing fungi, and a general medium or culture solution can be used.
  • a culture solution may be added not only to the culture solution storage unit 4 but also to the test sample solution 5.
  • the tomato pathogenic fungus in the sample is observed by observing whether or not the tomato pathogenic fungi appear on the back surface of the cellulose membrane 23 of the artificial cell wall 2. The presence or absence of is detected.
  • the observation means is not particularly limited, for example, as shown in FIG. 3, the microscope 6 can be placed under the artificial cell wall 2 and optically observed by the microscope 6.
  • the fungal culture period is not particularly limited, but is preferably 72 hours or more.
  • the culture temperature is preferably about 20 to 28 ° C.
  • the present invention includes a method for detecting tomato pathogenic fungi, which comprises selectively detecting tomato pathogenic fungi using the detection apparatus as described above.
  • the method for detecting a tomato pathogenic fungus is not particularly limited as long as the above-described detection device is used.
  • a test sample solution is introduced into the test sample solution introduction unit 3 of the detection device.
  • a step of allowing the test sample solution to stand in a detection device (a step of culturing), a step of observing the back surface of the artificial cell wall 2 (cellulose membrane 23) of the detection device, and the cellulose membrane 23
  • the test sample solution includes a step of determining that the tomato pathogenic fungus is contained.
  • An apparatus for detecting a tomato pathogenic fungus includes an artificial cell wall, a test sample solution input unit provided at an upper part of the artificial cell wall, and a culture solution storage unit provided at a lower part of the artificial cell wall. And in the test sample solution input part, the test sample solution contains 50 to 70 mM citrate buffer, and the pH of the test sample solution is 5 to 5.5. To do.
  • the artificial cell wall has a through-hole having a pore diameter of 2 to 7 ⁇ m, a substrate having a thickness of 5 to 150 ⁇ m, and a cellulose membrane having a thickness of 0.5 to 2 ⁇ m provided on one surface of the substrate. It is preferable to provide at least. Thereby, it is thought that the effect mentioned above can be acquired more reliably.
  • the citrate is preferably at least one selected from sodium citrate and potassium citrate.
  • At least one tomato pathogenic fungus to be detected is selected from tomato gray fungus (Botrytis cinerea), tomato soot fungus (Pseudocercospora fuligena), and tomato leaf fungus (Passalora fulva). It is preferable that In such a case, it is considered that the above-described effects can be exhibited more.
  • the detection device may be present in tomato leaves, it is preferable not to detect the tomato non-pathogenic fungi, Biscognia genus fungus, Penicillium genus fungus, Phoma genus fungus, and Trichoderma genus fungus. In such a case, it is considered that the above-described effects can be exhibited more.
  • the non-tomato pathogenic fungus is Biscogniaux maritima, Penicillium olsonii, Poma multirostrata or Trichoderma asperellum.
  • the method for detecting a tomato pathogenic fungus includes selectively detecting a tomato pathogenic fungus using the detection device.
  • Botrytis cinerea a pathogenic fungus of tomato gray mold
  • Potato Dextrose Agar Potato Dextrose Agar
  • the Botrytis cinerea cultured potato dextrose agar medium in which the mycelium was sufficiently grown was allowed to stand for 4 days or longer under black light irradiation, and then allowed to stand in a room temperature environment for 2 weeks or more to promote spore formation.
  • Several ml of sterilized pure water was dropped onto the Botrytis cinerea cultured potato dextrose agar medium that had been subjected to the above treatment, and the mycelial surface was rubbed with a platinum loop, a brush, etc., to obtain a crushed mycelium / spore mixed suspension.
  • Pseudocercospora fuligena culture Pseudocercospora fuligena, one of the tomato pathogens and the pathogenic fungus of tomato soot mold, was inoculated into potato dextrose agar. The medium was then allowed to stand for 1 week at a temperature of 28 degrees Celsius. Pseudocercospora fuligena was sold by the National Institute of Agricultural and Food Research, Genetic Resource Center (MAFF No. 306728). Thereafter, the Pseudocercospora fuligena mycelium was transplanted from the potato dextrose agar medium to the burdock powder agar medium, and further allowed to stand at a temperature of 28 degrees Celsius for 1 to 2 weeks.
  • MAFF No. 306728 National Institute of Agricultural and Food Research, Genetic Resource Center
  • Passarola fulva one of the tomato pathogens and the pathogenic fungus of tomato leaf mold, was inoculated on a potato dextrose agar medium. The medium was then allowed to stand for 1-2 weeks at a temperature of 23 degrees Celsius. Passalora fulva was sold by the National Institute of Agricultural and Food Research, Genetic Resource Center (MAFF No. 726744).
  • Biscognia maritima, Penicillium olsonii, Poma multirostrata, and Trichoderma aspellum Biscognia maritima, Penicillium olsonii, Poma multirostrata and Trichoderma asperellum, which were not tomato pathogens but were present in tomato leaves, were collected from tomato leaves and inoculated into potato dextrose agar. Source tomatoes were collected from multiple locations. In the separation method, several tomato leaves collected in a clear resin container or resin bag are added together with a bacteria recovery solution consisting of physiological saline containing 0.1% surfactant Tween 80 (SIGMA-ALDRICH) for 1 minute.
  • SIGMA-ALDRICH surfactant Tween 80
  • Bacteria attached to the leaves after agitation were transferred to the bacterial collection solution, and this bacterial collection solution was diluted and applied to a potato dextrose agar medium containing 100 mg / L of streptomycin sulfate (Wako) by a plate agar smearing method, and then Celsius. It was isolated from fungal colonies that appeared after culturing at 25 degrees for several days. Identification was requested from the Japan Food Analysis Center Tama Research Laboratory. The Biscognia ux marilia, Penicillium olsonii, Poma multirostrata and Trichoderma asperellum inoculated on the potato dextrose agar after the isolation were allowed to stand at a temperature of 25 degrees Celsius for 1 week.
  • the artificial cell wall in the detection device was prepared as follows.
  • cellulose SIGMA-ALDRICH, trade name: Avicel PH-101
  • the cellulose solution is heated to 60 degrees Celsius, and then the cellulose solution is spin coated on the back surface of a container having a polyethylene terephthalate film on the bottom (Millipore, trade name: Millicell PISP 12R 48) for 30 seconds. It was applied at a rotational speed of 2000 rpm.
  • the polyethylene terephthalate film functioned as the substrate 21 in the artificial cell wall of FIG. 2 and randomly had a plurality of through holes having a diameter of 3 ⁇ m.
  • a cellulose film having a thickness of 0.5 micrometers was formed on the back side surface of the polyethylene terephthalate film.
  • the container in which the cellulose film was formed on the bottom surface of the polyethylene terephthalate film on the bottom surface was allowed to stand at room temperature in ethanol for 12 hours.
  • 1-Butyl-3-methyl imidazolium chloride was replaced with ethanol and removed, and finally dried in a vacuum desiccator.
  • the artificial cell wall used in the present example / comparative example was obtained.
  • the medium container is a 24-well flat bottom culture plate (Corning Incorporated, trade name: 24 Well Cell Culture Cluster Flat Bottom), and 600 ⁇ L of a liquid medium (culture medium) is formed between the medium container and the artificial cell wall forming container.
  • the container was filled so that the back of the container was in contact.
  • the liquid medium was dilute potato dextrose liquid medium (Difco TM Potato Dextrose Broth 2.4 g / L aqueous solution).
  • Example 1 Inside the artificial cell wall-forming vessel, there are 200 Botrytis cinerea, Pseudocercospora fuligena, Pasalora fulva, Biscognia uxilia, and Penicillium olsomili, Psilocerium sp. It added separately, and in the Example, the sodium citrate buffer solution was added so that the total volume with the crushed hyphae and spore mixed suspension obtained above might be 200 microliters, and the test sample solution was obtained. The sodium citrate buffer concentration in the test sample solution was adjusted to 60 mM when added to the disrupted mycelium / spore mixed suspension to 200 ⁇ L and added. The sodium citrate buffer in the artificial cell wall forming container after the addition was pH 5.5 and EC 13 mS / cm.
  • test sample solution to which the seven kinds of fungi were added was placed in the detection device prepared above, and the detection device was allowed to stand at a temperature of 25 degrees Celsius and observed at 24 hour intervals. . Every 24 hours, the number of hyphae that penetrate the artificial cell wall and are observed on the back surface thereof was counted by visual observation through an optical microscope.
  • An example of an observation photograph taken with an optical microscope (Totry gray fungus (Botrytis cinerea)) is shown in FIG.
  • Example 1 The test was conducted in the same manner as in Example 1 except that sterilized purified water was used instead of the sodium citrate buffer.
  • FIG. 5 four types of tomato pathogenic fungi that should be detected are Bisogniauxia maritima, Penicillium olsoni, Poma multirostrata, Trichoderma asperellum, which may be present in tomato leaves but should be excluded from detection. Artificial cell wall penetrating mycelia were observed earlier than Pseudocercospora fuligena and Passalora fulva, and tomato pathogenic fungi could not be selectively detected in this comparative example.
  • FIG. 6 which is an example result
  • the tomato pathogenic fungi Botrytis cinerea, Pseudocercospora fuligena, and Passalora fulva may be present in tomato leaves, but should be excluded from detection.
  • Artificial cell wall penetrating hyphae were observed earlier than 4 types of tomato non-pathogenic fungi, Biscognia uxima maritima, Penicillium olsonii, Poma multirostrata, and Trichoderma asperellum, and detection of tomato pathogenic fungi was selective in Example 1. Was confirmed.
  • Example 2 The same as in Example 1 except that the sodium citrate buffer solution having the same concentration (60 mM) as the test sample solution was also added to the detection device medium, and the pH of the culture solution was adjusted to 5.5. The test was conducted as follows. The results are shown in FIG.
  • Comparative Example 3 The test was performed in the same manner as in Example 1 except that the pH of the test sample solution was changed to 4.5. The results of the number of invading hyphae after 72 hours of culture in Comparative Example 3 are shown in FIG.
  • Comparative Example 4 The test was performed in the same manner as in Example 1 except that the pH of the test sample solution was changed to 6. The results of the number of invading hyphae after 72 hours of culture in Comparative Example 4 are shown in FIG.
  • Comparative Example 5 The test was performed in the same manner as in Example 1 except that the pH of the test sample solution was 5 and the sodium citrate buffer concentration in the test sample solution was 100 mM. The result of the number of invading hyphae after 72 hours of culture in Comparative Example 5 is shown in FIG.
  • Example 6 The test was conducted in the same manner as in Example 1 except that the pH of the test sample solution was 5 and the sodium citrate buffer concentration in the test sample solution was 40 mM. The results of the number of invading hyphae after 72 hours of culture in Comparative Example 6 are shown in FIG.
  • the detection device for tomato pathogenic fungi of the present disclosure can selectively detect a target tomato pathogenic fungus by excluding tomato non-pathogenic fungi showing false positives. For this reason, the detection device of the present disclosure can be suitably used in technical fields such as the elimination of tomato pathogenic fungi that adversely affect tomatoes and other agriculture related to tomatoes.

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Abstract

本開示は、簡易かつ確実な、トマト病原性真菌の選択的検出装置および検出方法を提供する。本開示によるトマト病原性真菌の検出装置は、人工細胞壁と、前記人工細胞壁の上部に設けられた試験試料液投入部と、前記人工細胞壁の下部に設けられた培養液貯留部とを有し、前記試験試料液投入部において、試験試料液が50~70mMのクエン酸塩緩衝液を含むこと、及び、前記試験試料液のpHが5~5.5であることを特徴とする。

Description

トマト病原性真菌の検出装置およびそれを用いた検出方法
 本発明は、トマト病原性真菌の検出装置およびそれを用いた選択的検出方法に関する。
 植物病原性真菌については、植物侵入性に係る性質として、植物表面に付着器を形成して付着後、気孔組織等細孔を探してそこから菌糸を植物体中に伸ばす、あるいは菌糸から植物細胞壁分解酵素(セルラーゼ、ペクチナーゼ)を分泌するなどの特徴がある。
 これらを利用して、例えば、特許文献1では、微多孔膜支持体を用いた真菌計量方法を開示している。また、非特許文献1では、植物病原性卵菌の1種であるPhytophthora sojaeの偽菌糸が、水平に成長するより下方向にあたかも潜ろうとすること、及び3μmの孔を有するPET(ポリエチレンテレフタレート)膜を貫通することを開示している。
 また、この性質に着目し、本発明者らは既に、植物病原性卵菌類の判定方法を提案している(特許文献2)。
特開2005-287337号公報 特許第6167309号公報 国際公開第2018/011835号
Paul F. Morris.et.al."Chemotropic and Contact Responses of Phytophthora sojae Hyphae to Soybean Isoflavonoids and Artificial Substrates",Plant Physiol.(1998)117:1171-1178 Noboru Shirane et al., "Mineal Salt Medium for the Growth of Botrytis cinerea in vitro", Ann. Phytopath. Soc. Japan 53: 191-197 (1987)
 本発明の対象植物であるトマトでは、真菌による病害の比率が高く、その原因となる病原性真菌は、トマト灰色カビ病菌(Botrytis cinerea)、トマトすすカビ病菌(Pseudocercospora fuligena)、トマト葉カビ病菌(Passalora fulva )の3種で大半を占めると言われている。これら病原性真菌について、灰色カビ病菌(Botrytis cinerea)は多犯性で他の植物でも感染するが、すすカビ病菌(Pseudocercospora fuligena)、及び葉カビ病菌(Passalora fulva)は、トマトのみの感染例しかなく、植物特異性が高い病原性真菌である。本発明らは、これらトマトに特異的ともいえる病原性真菌について、実際のトマトの葉にどのような菌が居るか不明である段階、すなわち、発症前段階においてトマト病原性真菌を検知することが必要と考え検討を行った。
 一方、特許文献2に記載されているような本発明者らの使用する選択的真菌検出の基本技術である人工細胞壁を用いた病原性真菌の選別技術は、植物病原菌ならばトマト病原性真菌に限らず検出する可能性がある。つまり、仮に他の植物の病原性真菌がトマトの葉に付着していると、これをトマト病原性真菌として検出してしまう恐れがある。トマト栽培は種ではなく苗からの栽培が大半で、苗圃場では、他の植物との混栽や、同じ施設におけ
る複数の植物での使いまわしなどで、トマト病原性真菌以外の植物病原性真菌のトマト苗への付着可能性は否定できない。また、実際の栽培現場、ビニールハウス等の栽培施設においても、前記の苗圃場と同じく、トマト以外の植物の病原性真菌のトマト苗への付着可能性がある。これを放置すると、トマト病原性真菌以外の植物病原性真菌が、人工細胞壁を用いた病原性真菌の選別技術において擬陽性を提示するおそれがあり、無用の投薬、苗更新など栽培に多大な不都合が生じる場合がある。
 この擬陽性発生可能性について、研究・調査を行ったところ、実際に、トマト病原性真菌以外の真菌で、検討途上の人工細胞壁を用いた検出方法において、擬陽性を提示する真菌に遭遇した。それは、Biscogniauxia属真菌、Penicillium属真菌、Phoma属真菌、Trichoderma属真菌の4種類であり、これらを検知しないための検討が必要になった。
 本発明は、このような実情に鑑みてなされたものであり、その目的は、トマト病原性真菌の選択的検出装置および検出方法を提供することである。
 本発明者等は、鋭意検討した結果、下記構成の検出装置によって上記課題を解消し得ることを見出し、かかる知見に基づいて更に検討を重ねることによって本発明を完成した。
 すなわち、本発明の一つの局面に関するトマト病原性真菌の検出装置は、人工細胞壁と、前記人工細胞壁の上部に設けられた試験試料液投入部と、前記人工細胞壁の下部に設けられた培養液貯留部とを有し、前記試験試料液投入部において、試験試料液が50~70mMのクエン酸塩緩衝液を含むこと、及び、前記試験試料液のpHが5~5.5であることを特徴とする。
 本発明によれば、簡易かつ安全に、トマト病原性真菌を選択的に検出できる装置および方法を提供することができる。本発明によって、トマト病原性真菌による発症前段階で菌の存在を検知することができ、その際には、トマト以外の植物病原菌による擬陽性の提示を回避できるため、産業利用上非常に有用である。
図1は、本実施形態の検出装置の一例を示す概略断面図である。 図2は、本実施形態の検出装置が備える人工細胞壁の一例を示す概略断面図である。 図3は、本実施形態の検出装置の一例を示す概略断面図である。 図4は、実施例1においてトマト灰色カビ病菌(Botrytis cinerea)が人工細胞壁を貫通した様子を示す人工細胞壁裏面の顕微鏡写真である。 図5は、比較例1の結果を示すグラフである。 図6は、実施例1の結果を示すグラフである。 図7は、比較例2の結果を示すグラフである。 図8は、比較例3の結果を示すグラフである。 図9は、比較例4の結果を示すグラフである。 図10は、比較例5の結果を示すグラフである。 図11は、比較例6の結果を示すグラフである。
 以下、本発明に係る実施形態について具体的に説明するが、本発明は、これらに限定されるものではない。
 本実施形態に係る、トマト病原性真菌を検出する装置1は、図1に示すように、人工細胞壁2と、前記人工細胞壁2の上部に設けられた試験試料液投入部3と、前記人工細胞壁2の下部に設けられた培養液貯留部4とを有し、前記試験試料液投入部3において、試験試料液5が50~70mMのクエン酸塩緩衝液を含むこと、及び、前記試験試料液5のpHが5~5.5であることを特徴とする。
 試験試料液投入部3は試験試料液5を投入するための容器であるが、当該容器は上端にフランジを具備していることが望ましい。そして、試験試料液投入部3の底面は、人工細胞壁2で形成されている。
 人工細胞壁2は、図2に示すように、貫通孔22を有する基板21と、前記基板21の片面に設けられたセルロース膜23とを少なくとも備えていることが好ましい。このような人工細胞壁を使用することによって、標的とするトマト病原性真菌を選択的に検出することがより容易になる。
 前記貫通孔22は、基板21の表側の面から裏側の面まで貫通しており、当該貫通孔の孔径は2~7μm(断面積4.5~38.5μm)であることが好ましい。孔径が前記範囲であることによって、標的の病原性真菌をより確実に選択的に検出することができる。
 また、標的の病原性真菌をより確実に選択的に検出するためには、セルロース膜23の厚みも調整することが好ましい。具体的には、セルロース膜23の厚みは、0.5~2μmであることが好ましい。
 本実施形態の人工細胞壁2において、基板21の貫通孔22の孔径およびセルロース膜23の膜厚を上記範囲のように調整することによって、トマト非病原性真菌は、セルロース膜23を貫通しないものが多いため、トマト非病原性真菌の一部をこの段階で排除することができると考えられる。一方、本実施形態で標的とするトマト病原性真菌は選択的に基板の裏面に現れる。
 また、前記基板21の厚みは特に限定されないが、一例として5~150μm程度であることが好ましい。
 図1に示されるように、試験試料液投入部3の内部に、試験試料液5が供給される。このようにして、試験試料液5がトマト病原性真菌を含有している場合、基板21の表側の面上にトマト病原性真菌が存在することになる。
 本実施形態において、試験試料液5は、主にトマトの葉に付着した真菌を含む液(菌回収液)であり、標的の病原性真菌を含んでいる可能性のある液体であれば特に限定はされない。例えば、トマトの葉を洗浄するために使用した後の液体やトマトの葉を浸漬した液体である。
 本実施形態では、この試験試料液5のpHが5~5.5であり、かつ、試験試料液5が50~70mMのクエン酸塩緩衝液を含んでいることが重要である。このような構成により、病原性真菌の検出において擬陽性を示す妨害菌(トマト非病原性真菌)を排除することができ、標的のトマト病原性真菌を選択的に検出することが可能となる。
 前記試験試料液5のpHが5未満であったり、5.5を超えたりすると、トマト病原性真菌の検出を妨害するトマト非病原性真菌を全て排除することができないおそれがある。また、前記試験試料液に含まれるクエン酸塩緩衝液の濃度が50mM未満となると、トマト病原性真菌の検出を妨害するトマト非病原性真菌を全て排除することができないおそれがある。一方で、前記クエン酸塩緩衝液の濃度が70mMを超えると、標的とするマト病原性真菌の一部までも排除してしまうおそれがある。
 前記クエン酸塩は、特に限定はされないが、クエン酸一価塩であることが好ましく、より具体的には、クエン酸ナトリウムおよびクエン酸カリウムなどであることが好ましい。
 さらに、前記試験試料液5において、EC(電気伝導度)は、通常、7~15mS/cm程度であることが好ましい。
 本実施形態の検出装置が標的とするトマト病原性真菌は、トマト灰色カビ病菌(Botrytis cinerea)、トマトすすカビ病菌(Pseudocercospora fuligena)、トマト葉カビ病菌(Passalora fulva)から選択される少なくとも一つであることが好ましい。
 また、本実施形態の検出装置は、トマト葉に存在する場合があるが、トマト非病原性真菌である真菌、例えば、Biscogniauxia属真菌、Penicillium属真菌、Phoma属真菌、およびTrichoderma属真菌を検出しないことが好ましい。より具体的には、前記トマト非病原性真菌は、Biscogniauxia maritima、Penicillium olsonii、Phoma multirostrataまたはTrichoderma asperellumである。
 なお、本明細書において、用語「トマト病原性」とは、トマトに対して病原性を有していることを意味する。用語「トマト非病原性」とは、トマトに対して病原性を有していないことを意味する。真菌が病原性を有しているとしても、トマトに対して病原性を有していないのであれば、その真菌は「トマト非病原性」である。言い換えれば、真菌がトマトに対して悪影響を与えないのであれば、その真菌は「トマト非病原性」である。用語「トマト非病原性」に含まれる接頭語「非」は、「トマト」を修飾せず、接頭語「非」は「病原性」を修飾する。
 本実施形態の検出装置において、前記人工細胞壁2の下部に設けられた培養液貯留部4には、培養液が入れられている。培養液としては、真菌が培養できる培養液であれば特に限定はされず、一般的な培地や培養液を使用できる。例えば、一般的な真菌培養用培地であるポテトデキストロース培地、サブローデキストロース培地等が使用可能である。なお、真菌の培養を加速するために、培養液貯留部4だけでなく、前記試験試料液5にも培養液を添加してもよい。
 本実施形態の検出装置では、一定の培養期間を経た後、前記人工細胞壁2のセルロース膜23の裏面に、トマト病原性真菌が現れているかどうかを観察することによって、試料中におけるトマト病原性真菌の存否を検出する。観察の手段は特に限定はされないが、例えば、図3に示すように、顕微鏡6を人工細胞壁2の下部に配置して、当該顕微鏡6によって光学的に観察することができる。
 真菌の培養期間は特に限定はされないが、72時間以上であることが好ましい。また、培養温度については、20~28℃程度とすることが好ましい。
 さらに、本発明には、上述したような検出装置を用いて、トマト病原性真菌を選択的に検出することを含む、トマト病原性真菌の検出方法が包含される。
 本実施形態のトマト病原性真菌の検出方法は、上述した検出装置を用いる限り、その他の工程については特に限定はされないが、例えば、前記検出装置の試験試料液投入部3に試験試料液を投入する工程、試験試料液を検出装置内で静置する工程(培養する工程)、静置後、前記検出装置の人工細胞壁2(セルロース膜23)の裏面を観察する工程、および、前記セルロース膜23の裏面に真菌が観察された場合、前記試験試料液はトマト病原性真菌を含んでいると判定する工程を含む。
 本明細書は、上述したように様々な態様の技術を開示しているが、そのうち主な技術を以下に纏める。
 本発明の一つの局面に係るトマト病原性真菌の検出装置は、人工細胞壁と、前記人工細胞壁の上部に設けられた試験試料液投入部と、前記人工細胞壁の下部に設けられた培養液貯留部とを有し、前記試験試料液投入部において、試験試料液が50~70mMのクエン酸塩緩衝液を含むこと、及び、前記試験試料液のpHが5~5.5であることを特徴とする。
 このような構成により、簡易かつ安全に、トマト病原性真菌を選択的に検出できる装置および方法を提供することができる。
 さらに、前記検出装置において、前記人工細胞壁が、孔径2~7μmの貫通孔を有し、かつ厚み5~150μmの基板と、当該基板の片面に設けられた厚み0.5~2μmのセルロース膜とを少なくとも備えることが好ましい。これにより、上述した効果をより確実に得ることができると考えられる。
 また、前記検出装置において、前記クエン酸塩が、クエン酸ナトリウムおよびクエン酸カリウムから選択される少なくとも一つであることが好ましい。これにより、上述した効果をより確実に得ることができると考えられる。
 さらに、前記検出装置において、検出対象とするトマト病原性真菌が、トマト灰色カビ病菌(Botrytis cinerea)、トマトすすカビ病菌(Pseudocercospora fuligena)、トマト葉カビ病菌(Passalora fulva)から選択される少なくとも一つであることが好ましい。そのような場合に、上述した効果をより発揮できると考えられる。
 また、前記検出装置が、トマト葉に存在する場合があるが、トマト非病原性真菌である、Biscogniauxia属真菌、Penicillium属真菌、Phoma属真菌、およびTrichoderma属真菌を検出しないことが好ましい。そのような場合に、上述した効果をより発揮できると考えられる。
 前記トマト非病原性真菌が、Biscogniauxia maritima、Penicillium olsonii、Phoma multirostrataまたはTrichoderma asperellumであることがより好ましい。
 本発明のさらなる局面に係るトマト病原性真菌の検出方法は、上記検出装置を用いて、トマト病原性真菌を選択的に検出することを含むことを特徴とする。
 以下に、実施例により本発明を更に具体的に説明するが、本発明の範囲はこれらに限定されるものではない。
 [真菌類の調製]
 (Botrytis cinereaの培養)
 トマト病原菌の一つで、トマト灰色カビ病の病原性真菌であるBotrytis cinereaが、ポテトデキストロース寒天培地(DifcoTM Potato Dextrose Agar)に接種された。次いで、培地は摂氏25度の温度下で1週間静置された。Botrytis cinereaは岐阜大学応用生物科学部に所属する清水准教授より与えられた。その後、十分に菌糸が生育したBotrytis cinerea培養ポテトデキストロース寒天培地をブラックライト照射下に4日間以上放置後、室温環境に2週間以上放置し、胞子形成を促した。前記処理を行ったBotrytis cinerea培養ポテトデキストロース寒天培地に滅菌純水を数ml滴下し、白金耳、筆等で菌糸表面を擦り、破砕菌糸・胞子混合懸濁液を得た。
 (Pseudocercospora fuligenaの培養)
 トマト病原菌の一つで、トマトすすカビ病の病原性真菌であるPseudocercospora fuligenaが、ポテトデキストロース寒天培地に接種された。次いで、培地は摂氏28度の温度下で1週間静置された。Pseudocercospora fuligenaは国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構 遺伝資源センターより分譲を受けた(MAFF No.306728)。その後、Pseudocercospora fuligena菌糸は、ポテトデキストロース寒天培地からゴボウ粉末寒天培地に移植され、さらに、1~2週間、摂氏28度の温度下で静置され、再度菌糸が十分生育した後、菌糸表面を白金耳、筆等で擦るなどの機械的ストレスを与え、その後、ブラックライト照射下に4日間以上放置後、室温環境に2週間以上放置し、再度胞子形成を促した。前記処理を行ったPseudocercospora fuligena培養ゴボウ粉末寒天培地に滅菌純水を数ml滴下し、白金耳、筆等で菌糸表面を擦り、破砕菌糸・胞子混合懸濁液を得た。
 (Passalora fulvaの培養)
 トマト病原菌の一つで、トマト葉カビ病の病原性真菌であるPassalora fulvaが、ポテトデキストロース寒天培地に接種された。次いで、培地は摂氏23度の温度下で1~2週間静置された。Passalora fulvaは国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構 遺伝資源センターより分譲を受けた(MAFF No.726744)。その後、十分に菌糸が生育したPassalora fulva培養ポテトデキストロース寒天培地に滅菌純水を数ml滴下し、白金耳、筆等で菌糸表面を擦り、破砕菌糸・胞子混合懸濁液を得た。
 (Biscogniauxia maritima、Penicillium olsonii、Phoma multirostrata、及びTrichoderma asperellumの培養)
 トマト病原菌ではないが、トマト葉に存在した、Biscogniauxia maritima、Penicillium olsonii、 Phoma multirostrata及びTrichoderma asperellumを、トマト葉から採取し、分離後、ポテトデキストロース寒天培地に接種した。分離源のトマトは複数の場所から採取した。分離方法は、清澄な樹脂容器または樹脂袋中に採取したトマト葉数枚を0.1%の界面活性剤Tween80(SIGMA-ALDRICH)を含む生理食塩水からなる菌回収液とともに投入し、1分間攪拌して葉に付着した菌を菌回収液へ移し、この菌回収液を希釈して、ストレプトマイシン硫酸塩(Wako)100mg/Lを含むポテトデキストロース寒天培地に、平板寒天塗抹法で塗布後、摂氏25度で数日培養して出現した真菌コロニーから分離した。同定は、(一般財団法人)日本食品分析センター多摩研究所に依頼した。前記の単離後ポテトデキストロース寒天培地に接種されたBiscogniauxia maritima、Penicillium olsonii、Phoma multirostrata及びTrichoderma asperellumは、摂氏25度の温度下で1週間静置された。その後、十分に菌糸が生育した、あるいは胞子形成が十分になされた、これら4菌種培養ポテトデキストロース寒天培地に滅菌純水を数ml滴下し、白金耳、筆等で菌糸表面を擦り、破砕菌糸・胞子混合懸濁液を得た。
 [人工細胞壁の調製]
 検出装置における人工細胞壁は次のように用意された。
 まず、セルロース(SIGMA-ALDRICH、商品名:Avicel PH-101)がイオン液体に溶解され、1%の濃度を有するセルロース溶液が調製された。イオン液体は、1-Butyl-3-methyl imidazolium chloride(SIGMA-ALDRICH製)であった。該セルロース溶液は、摂氏60度に加温され、次に、セルロース溶液が、底面にポリエチレンテレフタラートフィルムを有する容器(Millipore、商品名:Millicell PISP 12R 48)の裏面にスピンコート法により30秒間、2000rpmの回転速度で塗布された。前記ポリエチレンテレフタラートフィルムは、図2の人工細胞壁における基板21として機能し、3μmの直径を有する複数の貫通孔をランダムに有していた。このようにして、ポリエチレンテレフタラートフィルムの裏側の面に、0.5マイクロメートルの厚みを有するセルロース膜が形成された。
 この底面のポリエチレンテレフタラートフィルム裏面にセルロース膜が形成された容器は、エタノール中で12時間、室温で静置された。このようにして、1-Butyl-3-methyl imidazolium chlorideは、エタノールに置換・除去された後、最後に真空デシケーター内で乾燥された。このようにして、本実施例・比較例で供試する人工細胞壁が得られた。
 [トマト病原性真菌の検出装置の調製]
 前記の人工細胞壁とした、底面のポリエチレンテレフタラートフィルム(基板)裏面にセルロース膜が形成された容器を培地容器(培養液貯留部)に重ね、トマト病原性真菌の検出装置とした。培地容器は24ウェル平底培養プレート(Corning Incorporated、商品名:24 Well Cell Cluture Cluster Flat Bottom)であり、培地容器と人工細胞壁形成容器の間に、液体の培地(培養液)600μLが、人工細胞壁形成容器の裏面が接するように充填された。該液体の培地は、希薄ポテトデキストロース液体培地(DifcoTM Potato Dextrose Broth 2.4g/L 水溶液)であった。
 [実施例1]
 前記人工細胞壁形成容器の内部に、200個の、Botrytis cinerea、Pseudocercospora fuligena、Passalora fulva、Biscogniauxia maritima、Penicillium olsonii、 Phoma multirostrata及びTrichoderma asperellumの菌糸片と胞子を含む、破砕菌糸・胞子混合懸濁液を別々に添加し、実施例においてはクエン酸ナトリウム緩衝液を、上記で得られた破砕菌糸・胞子混合懸濁液との合計体積が200μLになるよう添加し、試験試料液を得た。前記試験試料液におけるクエン酸ナトリウム緩衝液濃度は、破砕菌糸・胞子混合懸濁液と合わせて200μLにしたとき、60mMになるよう調製して添加した。添加後の人工細胞壁形成容器の内部のクエン酸ナトリウム緩衝液は、pH5.5、EC13mS/cmであった。
 そして、前記の7種の真菌が添加された試験試料液を、上記で調製した検出装置に配置し、当該検出装置を、摂氏25度の温度で静置し、24時間間隔で観察を行った。24時間ごとに、前記人工細胞壁を貫通して、その裏面に観察される菌糸の数が、光学顕微鏡を介した目視により数えられた。光学顕微鏡での観察写真の一例(トマト灰色カビ病菌(Botrytis cinerea))を図4に示す。
 [比較例1]
 クエン酸ナトリウム緩衝液と代わりに滅菌精製水を用いた以外は、実施例1と同様にして試験を行った。
 [考察]
 比較例1の結果を図5に、実施例1の結果を図6にそれぞれ示す。
 図5において、トマト葉に存在する場合があるが、検知から排除すべきトマト非病原性真菌である、Biscogniauxia maritima、Penicillium olsonii、 Phoma multirostrata、Trichoderma asperellumの4種は、検知すべきトマト病原性真菌のPseudocercospora fuligena、Passalora fulvaより早く人工細胞壁貫通菌糸が観察され、本比較例ではトマト病原性真菌の選択的検出ができなかった。
 これに対し、実施例結果である図6においては、72h時点で、トマト病原性真菌であるBotrytis cinerea、Pseudocercospora fuligena、及びPassalora fulva は、トマト葉に存在する場合があるが、検知から排除すべきトマト非病原性真菌、Biscogniauxia maritima、Penicillium olsonii、 Phoma multirostrata、及びTrichoderma asperellumの4種より早く人工細胞壁貫通菌糸が観察され、実施例1ではトマト病原性真菌の選択的検出が可能となっていることが確かめられた。
 [比較例2]
 検出装置の培地にも、試験試料液と同濃度(60mM)のクエン酸ナトリウム緩衝液を投入し、かつ、培養液のpHも5.5となるように調製した以外は、実施例1と同じように試験を行った。結果を図7に示す。
 図7から明らかなように、比較例2では、どの真菌も人工細胞壁を貫通せず、生育もしなかった。
 [比較例3]
 試験試料液のpHを4.5に変更した以外は、実施例1と同じように試験を行った。比較例3における培養72時間後の侵入菌糸数の結果を図8に示す。
 図8から明らかなように、比較例3では、妨害菌(トマト非病原性真菌)の一部が人工細胞壁を貫通してしまい、すべての妨害菌を排除することができなかった。
 [比較例4]
 試験試料液のpHを6に変更した以外は、実施例1と同じように試験を行った。比較例4における培養72時間後の侵入菌糸数の結果を図9に示す。
 図9から明らかなように、比較例4においても、妨害菌(トマト非病原性真菌)の一部が人工細胞壁を貫通してしまい、すべての妨害菌を排除することができなかった。
 以上の比較例3および4の結果より、試験試料液のpHは、トマト病原性真菌の選択的
検出のために重要な要素の一つであることが示された。
 [比較例5]
 試験試料液のpHを5とし、試験試料液中のクエン酸ナトリウム緩衝液濃度を100mMとした以外は、実施例1と同じように試験を行った。比較例5における培養72時間後の侵入菌糸数の結果を図10に示す。
 図10の結果から、比較例4においては、妨害菌(トマト非病原性真菌)だけでなく、標的であるトマト病原性真菌も一部排除してしまうことがわかった。
 [比較例6]
 試験試料液のpHを5とし、試験試料液中のクエン酸ナトリウム緩衝液濃度を40mMとした以外は、実施例1と同じように試験を行った。比較例6における培養72時間後の侵入菌糸数の結果を図11に示す。
 図11から明らかなように、比較例6では、妨害菌(トマト非病原性真菌)の一部が人工細胞壁を貫通してしまい、すべての妨害菌を排除することができなかった。
 以上の比較例5および6の結果より、試験試料液におけるクエン酸ナトリウム緩衝液濃度が、トマト病原性真菌の選択的検出のために重要な要素の一つであることが示された。
 本開示のトマト病原性真菌の検出装置は、擬陽性を示すトマト非病原性真菌を排除して標的のトマト病原性真菌を選択的に検出することができる。このため、本開示の検出装置は、トマトに悪影響を及ぼすトマト病原性真菌の排除や、その他、トマトに関わる農業等の技術分野において好適に利用できる。
 1     検出装置
 2     人工細胞壁
 3     試験試料液投入部
 4     培養液貯留部
 5     試験試料液
 6     顕微鏡
21     基板
22     貫通孔
23     セルロース膜

Claims (7)

  1.  人工細胞壁と、前記人工細胞壁の上部に設けられた試験試料液投入部と、前記人工細胞壁の下部に設けられた培養液貯留部とを有し、
     前記試験試料液投入部において、試験試料液が50~70mMのクエン酸塩緩衝液を含むこと、及び、前記試験試料液のpHが5~5.5であることを特徴とする、
     トマト病原性真菌の検出装置。
  2.  前記人工細胞壁が、孔径2~7μmの貫通孔を有し、かつ厚み5~150μmの基板と、当該基板の片面に設けられた厚み0.5~2μmのセルロース膜とを少なくとも備える、請求項1に記載のトマト病原性真菌の検出装置。
  3.  前記クエン酸塩が、クエン酸ナトリウムおよびクエン酸カリウムから選択される少なくとも一つである、請求項1または2に記載のトマト病原性真菌の検出装置。
  4.  検出対象とするトマト病原性真菌が、トマト灰色カビ病菌(Botrytis cinerea)、トマトすすカビ病菌(Pseudocercospora fuligena)、トマト葉カビ病菌(Passalora fulva)から選択される少なくとも一つである、請求項1~3のいずれかに記載のトマト病原性真菌の検出装置。
  5.  トマト非病原性真菌である、Biscogniauxia属真菌、Penicillium属真菌、Phoma属真菌、およびTrichoderma属真菌を検出しない、請求項1~4のいずれかに記載のトマト病原性真菌の検出装置。
  6.  前記トマト非病原性真菌が、Biscogniauxia maritima、Penicillium olsonii、Phoma multirostrataまたはTrichoderma asperellumである、請求項5に記載のトマト病原性真菌の検出装置。
  7.  請求項1~6のいずれかに記載の検出装置を用いて、トマト病原性真菌を選択的に検出することを含む、トマト病原性真菌の検出方法。
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* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
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WO2020012781A1 (ja) * 2018-07-09 2020-01-16 パナソニックIpマネジメント株式会社 植物病原性真菌の検出装置、並びに、それを用いた検出方法および農薬濃度の選択方法
WO2020049866A1 (ja) * 2018-09-05 2020-03-12 パナソニックIpマネジメント株式会社 トマト病原性真菌の検出装置およびそれを用いた検出方法

Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2017029132A (ja) * 2015-08-03 2017-02-09 パナソニックIpマネジメント株式会社 試験試料が植物病原性卵菌を含有するかどうかを判定する方法
WO2018011835A1 (ja) * 2016-07-15 2018-01-18 パナソニックIpマネジメント株式会社 試験試料が植物病原性真菌を含有するかどうかを判定する方法

Family Cites Families (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
BRPI0816096A2 (pt) * 2007-08-31 2016-03-22 Basf Plant Science Gmbh método para produzir uma célula de planta transgênica, uma planta ou uma parte da mesma com maior resistência a doença de planta, molécula de ácido nucleico isolado, construção de ácido nucleico, vetor, célula hospedeira, e, tecido de planta, construção de propagação, semente, material coletado ou uma planta.
JP5441092B2 (ja) * 2008-09-30 2014-03-12 四国電力株式会社 バークホルデリア属細菌、それを用いた植物病害防除剤および防除方法
JP2016220667A (ja) * 2015-06-02 2016-12-28 パナソニックIpマネジメント株式会社 試験試料が植物病原性卵菌を含有するかどうかを判定する方法
CN106479934B (zh) * 2016-11-23 2019-02-26 河北省科学院生物研究所 一种灰霉病菌拮抗菌株及其筛选方法和应用
CN106434493B (zh) * 2016-12-01 2019-07-19 北京市农林科学院 一株生防链霉菌及其应用
CN111836880A (zh) * 2018-05-23 2020-10-27 松下知识产权经营株式会社 番茄病原性真菌的检测装置及使用了该检测装置的检测方法

Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2017029132A (ja) * 2015-08-03 2017-02-09 パナソニックIpマネジメント株式会社 試験試料が植物病原性卵菌を含有するかどうかを判定する方法
WO2018011835A1 (ja) * 2016-07-15 2018-01-18 パナソニックIpマネジメント株式会社 試験試料が植物病原性真菌を含有するかどうかを判定する方法

Non-Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
HAKKINEN, M. ET AL.: "The effects of extracellular pH and of the transcriptional regulator PACI on the transcriptome of Trichoderma reesei", MICROBIAL CELL FACTORIES, vol. 14, no. 63, 2015, pages 1 - 15, XP021222917 *
KAJI, AKIRA ET AL.: "Studies on the Pectic Enzymes (Part XXII), Pectin Enzymes Produced by Botrytis cinerea and Relation between Enzymatic Actions and Maceration of Plant Tissues", NIPPON NOGEIKAGAKU KAISHI, vol. 40, no. 4, 1966, pages 209 - 212 *
SASAKI, I. ET AL.: "beta-Glucosidase from Botrytis cinerea: Its Relation to the Pathogenicity of This Fungus", BIOSCIENCE, BIOTECHNOLOGY, AND BIOCHEMISTRY, vol. 58, no. 4, 1994, pages 616 - 620, XP055656451 *

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