JP7229768B2 - カッパ骨髄腫抗原キメラ抗原受容体およびその使用 - Google Patents
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Description
本出願は、2015年4月23日に出願された米国仮特許出願第62/151,968号、および2015年5月7日に出願された米国仮特許出願第62/158,407号からの優先権を主張し、これらはそれぞれ、全ての目的において参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
本出願に関連する配列表は、紙面の代わりにテキスト形式で提供され、参照により本明細書に組み込まれる。配列表を含むテキストファイルの名前は、HMLX_002_02WO_SeqList_ST25.txtである。テキストファイルは、約63KBであり、2016年4月22日に作成されたものであり、EFS-Webを介して電子的に提出されている。
本発明の実施形態の例として、以下の項目が挙げられる。
(項目1)
1つ以上の細胞内シグナル伝達ドメインおよび細胞外抗原結合ドメインを含むキメラ抗原受容体(CAR)であって、前記細胞外抗原結合ドメインは、カッパ骨髄腫抗原(KMA)を特異的に認識する、キメラ抗原受容体(CAR)。
(項目2)
前記1つ以上の細胞内シグナル伝達ドメインは、1つ以上の共刺激エンドドメインを含む、項目1に記載のCAR。
(項目3)
前記1つ以上の共刺激エンドドメインは、CD28ドメイン、CD3ζドメイン、4-1BBドメインもしくはOX-40ドメインまたはそれらの組み合わせの1つ以上である、項目2に記載のCAR。
(項目4)
前記共刺激エンドドメインは、CD3ζドメインおよびCD28ドメインである、項目3に記載のCAR。
(項目5)
前記共刺激エンドドメインは、CD3ζドメインおよびOX-40ドメインである、項目3に記載のCAR。
(項目6)
OX-40ドメインをさらに含む、項目4に記載のCAR。
(項目7)
前記共刺激エンドドメインは、CD3ζドメインおよび4-1BBドメインである、項目3に記載のCAR。
(項目8)
4-1BBドメインをさらに含む、項目4に記載のCAR。
(項目9)
OX-40ドメインをさらに含む、項目7に記載のCAR。
(項目10)
前記細胞外結合ドメインは、KMAを特異的に認識する一本鎖可変断片(scFv)を含む、項目1に記載のCAR。
(項目11)
前記scFvは、KappaMabモノクローナル抗体に由来する相補性決定領域(CDR)を含み、前記KappaMAb CDRは、配列番号3~8を含む、項目10に記載のCAR。
(項目12)
前記scFvは、KappaMabからのVL鎖およびVH鎖を含み、前記VL鎖は、配列番号2を含み、VH鎖は、配列番号1を含む、項目10に記載のCAR。
(項目13)
KappaMabからの前記VL鎖およびVH鎖は、グリシン-セリンリンカーを介して結合している、項目11に記載のCAR。
(項目14)
前記グリシン-セリンリンカーは、15~20アミノ酸リンカーである、項目13に記載のCAR。
(項目15)
前記15アミノ酸リンカーは、(Gly 4 Ser) 3 を含む、項目14に記載のCAR。
(項目16)
前記scFvは、スペーサーを介して前記1つ以上の細胞内シグナル伝達ドメインに結合している、項目10に記載のCAR。
(項目17)
前記スペーサーは、免疫グロブリン定常領域またはCD8α鎖である、項目16に記載のCAR。
(項目18)
前記免疫グロブリン定常領域は、IgGヒンジドメイン、IgG CH2ドメインおよびIgG CH3ドメインの1つ以上を含む、項目17に記載のCAR。
(項目19)
前記免疫グロブリン定常領域は、免疫グロブリンヒンジドメインを含む、項目18に記載のCAR。
(項目20)
前記免疫グロブリン定常領域は、IgG CH3ドメインをさらに含む、項目19に記載のCAR。
(項目21)
前記免疫グロブリン定常領域は、IgG CH2ドメインをさらに含む、項目19または20に記載のCAR。
(項目22)
前記スペーサーは、グリシン-セリンリンカーを介して前記scFVに結合している、項目17~21のいずれか一項に記載のCAR。
(項目23)
前記グリシン-セリンリンカーは、15~20アミノ酸リンカーである、項目22に記載のCAR。
(項目24)
前記15アミノ酸リンカーは、(Gly 4 Ser) 3 を含む、項目23に記載のCAR。
(項目25)
項目1~24のいずれか一項に記載のCARを発現するように操作された、遺伝子改変T細胞。
(項目26)
1つ以上の追加の生体分子を発現するようにさらに操作された、項目25に記載の遺伝子改変T細胞。
(項目27)
前記1つ以上の追加の生体分子は、IL-12、GAL3CまたはSANT7の1つ以上を含む、項目26に記載の遺伝子改変T細胞。
(項目28)
前記1つ以上の追加の生体分子は、IL-12であり、前記IL-12は、柔軟性リンカーにより繋がった1つのIL-12 p35サブユニットおよび1つのIL-12 p40サブユニットを含む一本鎖ポリペプチドにより発現される、項目26に記載の遺伝子改変T細胞。
(項目29)
前記柔軟性リンカーは、(G 4 S) 3 リンカーである、項目28に記載の遺伝子改変T細胞。
(項目30)
柔軟性リンカーにより繋がった1つのIL-12 p35サブユニットおよび1つのIL-12 p40サブユニットを含む前記一本鎖ポリペプチドは、生物活性p70 IL-12ヘテロ二量体を形成する、項目29に記載の遺伝子改変T細胞。
(項目31)
IL-12および選択可能マーカーを発現するように操作された、項目26に記載の遺伝子改変T細胞。
(項目32)
SANT-7を発現するように操作された、項目26に記載の遺伝子改変T細胞。
(項目33)
SANT-7および選択可能マーカーを発現するように操作された、項目26に記載の遺伝子改変T細胞。
(項目34)
SANT7を発現するようにさらに操作された、項目31に記載の遺伝子改変T細胞。
(項目35)
GAL3Cを発現するように操作された、項目26に記載の遺伝子改変T細胞。
(項目36)
GAL3Cおよび選択可能マーカーを発現するように操作された、項目26に記載の遺伝子改変T細胞。
(項目37)
GAL3Cを発現するようにさらに操作された、項目31に記載の遺伝子改変T細胞。
(項目38)
GAL3CおよびSANT7を発現するようにさらに操作された、項目31に記載の遺伝子改変T細胞。
(項目39)
GAL3Cを発現するようにさらに操作された、項目33に記載の遺伝子改変T細胞。
(項目40)
遺伝子改変T細胞を生成するための方法であって、1つ以上の細胞内シグナル伝達ドメインおよび細胞外抗原結合ドメインを含むCARをコードする発現ベクターをT細胞に導入することを含み、前記細胞外抗原結合ドメインは、カッパ骨髄腫抗原(KMA)を特異的に認識する方法。
(項目41)
前記発現ベクターは、転位ベクター発現系である、項目40に記載の方法。
(項目42)
前記発現ベクターは、PiggyBacトランスポゾン発現系である、項目40に記載の方法。
(項目43)
前記導入することは、エレクトロポレーションを含む、項目40に記載の方法。
(項目44)
前記1つ以上の細胞内シグナル伝達ドメインは、1つ以上の共刺激エンドドメインを含む、項目40に記載の方法。
(項目45)
前記1つ以上の共刺激エンドドメインは、CD28ドメイン、CD3ζドメイン、4-1BBドメインもしくはOX-40ドメインまたはそれらの組み合わせの1つ以上である、項目44に記載の方法。
(項目46)
前記共刺激エンドドメインは、CD3ζドメインおよびCD28ドメインである、項目45に記載の方法。
(項目47)
前記共刺激エンドドメインは、CD3ζドメインおよびOX-40ドメインである、項目45に記載の方法。
(項目48)
前記CARは、OX-40ドメインをさらに含む、項目46に記載の方法。
(項目49)
前記共刺激エンドドメインは、CD3ζドメインおよび4-1BBドメインである、項目45に記載の方法。
(項目50)
前記CARは、4-1BBドメインをさらに含む、項目46に記載の方法。
(項目51)
前記CARは、OX-40ドメインをさらに含む、項目50に記載の方法。
(項目52)
前記細胞外結合ドメインは、KMAを特異的に認識するscFvを含む、項目40に記載の方法。
(項目53)
前記scFvは、KappaMabモノクローナル抗体に由来する相補性決定領域(CDR)を含み、前記CDRは、配列番号3~8を含む、項目52に記載の方法。
(項目54)
前記scFvは、KappaMabモノクローナル抗体のVL鎖およびVH鎖を含み、前記VL鎖は、配列番号2を含み、前記VH鎖は、配列番号1を含む、項目53に記載の方法。
(項目55)
前記VL CDRおよびVH CDRは、グリシン-セリンリンカーを介して結合している、項目54に記載の方法。
(項目56)
前記グリシン-セリンリンカーは、15~20アミノ酸リンカーである、項目55に記載の方法。
(項目57)
前記15アミノ酸リンカーは、(Gly 4 Ser) 3 を含む、項目56に記載の方法。
(項目58)
前記scFvは、スペーサーを介して前記1つ以上の細胞内シグナル伝達ドメインに結合している、項目52に記載の方法。
(項目59)
前記スペーサーは、免疫グロブリン定常領域またはCD8α鎖である、項目58に記載の方法。
(項目60)
前記免疫グロブリン定常領域は、IgGヒンジドメイン、IgG CH2ドメインおよびIgG CH3ドメインの1つ以上を含む、項目59に記載の方法。
(項目61)
前記免疫グロブリン定常領域は、免疫グロブリンヒンジドメインを含む、項目59に記載の方法。
(項目62)
前記免疫グロブリン定常領域は、IgG CH3ドメインをさらに含む、項目61に記載の方法。
(項目63)
前記免疫グロブリン定常領域は、IgG CH2ドメインをさらに含む、項目61または62に記載の方法。
(項目64)
前記スペーサーは、グリシン-セリンリンカーを介して前記scFVに結合している、項目59~63のいずれか一項に記載のCAR。
(項目65)
前記グリシン-セリンリンカーは、15~20アミノ酸リンカーである、項目22に記載のCAR。
(項目66)
前記15アミノ酸リンカーは、(Gly 4 Ser) 3 を含む、項目23に記載のCAR。
(項目67)
1つ以上の追加の生体分子を発現することができる1つ以上の追加の発現ベクターを導入することをさらに含む、項目40に記載の方法。
(項目68)
前記1つ以上の追加の生体分子は、IL-12、GAL3CまたはSANT7の1つ以上を含む、項目67に記載の方法。
(項目69)
前記1つ以上の追加の生体分子は、IL-12であり、前記IL-12は、柔軟性リンカーにより繋がったIL-12 p35サブユニットおよびIL-12 p40サブユニットを含む一本鎖コンストラクトにより発現される、項目68に記載の方法。
(項目70)
前記柔軟性リンカーは、(G 4 S) 3 リンカーである、項目69に記載の方法。
(項目71)
柔軟性リンカーにより繋がったIL-12 p35サブユニットおよびIL-12 p40サブユニットを含む前記一本鎖コンストラクトは、生物活性p70 IL-12ヘテロ二量体を形成する、項目70に記載の方法。
(項目72)
1つ以上の追加の生物学的作用物質は、選択可能マーカーをさらにコードするコンストラクトを介して発現される、項目67に記載の方法。
(項目73)
前記コンストラクトは、IL-12および選択可能マーカーをコードし、前記選択可能マーカーおよびIL-12のコード配列は、2Aリボソームスキップをコードする配列により繋がっている、項目72に記載の方法。
(項目74)
前記コンストラクトは、SANT7および選択可能マーカーをコードし、前記選択可能マーカーおよびSANT7のコード配列は、2Aリボソームスキップをコードする配列により繋がっている、項目72に記載の方法。
(項目75)
前記コンストラクトは、GAL3Cおよび選択可能マーカーをコードし、前記選択可能マーカーおよびGAL3Cのコード配列は、リボソームスキップをコードする配列により繋がっている、項目72に記載の方法。
(項目76)
前記コンストラクトは、GAL3Cをさらにコードし、GAL3Cのコード配列は、追加の2Aリボソームスキップを介して、コンストラクト内のSANT7のコード配列に繋がっている、項目74に記載の方法。
(項目77)
前記コンストラクトは、SANT7をさらにコードし、SANT7のコード配列は、2Aリボソームスキップの追加のコード配列を介して、コンストラクト内のIL-12のコード配列に繋がっている、項目73に記載の方法。
(項目78)
前記コンストラクトは、GAL3Cをさらにコードし、GAL3Cのコード配列は、2Aリボソームスキップの追加のコード配列を介して、コンストラクト内のIL-12のコード配列に繋がっている、項目73に記載の方法。
(項目79)
前記コンストラクトは、SANT7をさらにコードし、IL-12、SANT7、GAL3Cおよび前記選択可能マーカーのそれぞれのコード配列は、2Aリボソームスキップを介して繋がっている、項目78に記載の方法。
(項目80)
それを必要とする対象におけるKMA発現悪性腫瘍を処置する方法であって、1つ以上の細胞内シグナル伝達ドメインおよび細胞外抗原結合ドメインを発現するように操作された遺伝子改変T細胞を投与することを含み、前記細胞外抗原結合ドメインは、カッパ骨髄腫抗原(KMA)を特異的に認識する方法。
(項目81)
前記KMA発現悪性腫瘍は、多発性骨髄腫、ワルデンシュトレームマクログロブリン血症、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫(DLBCL)、またはアミロイドーシスである、項目80に記載の方法。
(項目82)
前記1つ以上の細胞内シグナル伝達ドメインは、1つ以上の共刺激エンドドメインを含む、項目80に記載の方法。
(項目83)
前記1つ以上の共刺激エンドドメインは、CD28ドメイン、CD3ζドメイン、4-1BBドメインもしくはOX-40ドメインまたはそれらの組み合わせの1つ以上である、項目82に記載の方法。
(項目84)
前記共刺激エンドドメインは、CD3ζドメインおよびCD28ドメインである、項目83に記載の方法。
(項目85)
前記共刺激エンドドメインは、CD3ζドメインおよびOX-40ドメインである、項目83に記載の方法。
(項目86)
前記細胞内シグナル伝達ドメインは、OX-40ドメインをさらに含む、項目84に記載の方法。
(項目87)
前記共刺激エンドドメインは、CD3ζドメインおよび41-BBドメインである、項目83に記載の方法。
(項目88)
41-BBドメインをさらに含む、項目84に記載の方法。
(項目89)
前記細胞外結合ドメインは、KMAを特異的に認識するscFvを含む、項目80に記載の方法。
(項目90)
前記scFvは、KMAを認識し、KappaMabモノクローナル抗体に由来する相補性決定領域(CDR)を含み、前記CDRは、配列番号3~8を含む、項目89に記載の方法。
(項目91)
前記scFvは、KappaMabモノクローナル抗体のVL鎖およびVH鎖を含み、前記VL鎖は、配列番号2を含み、前記VH鎖は、配列番号1を含む、項目89に記載の方法。
(項目92)
前記配列番号2のVLおよび配列番号1のVHは、グリシン-セリンリンカーを介して結合している、項目91に記載の方法。
(項目93)
前記グリシン-セリンリンカーは、15~20アミノ酸リンカーである、項目92に記載の方法。
(項目94)
前記15アミノ酸リンカーは、(Gly 4 Ser) 3 を含む、項目93に記載の方法。
(項目95)
前記scFvは、スペーサーを介して前記1つ以上の細胞内シグナル伝達ドメインに結合している、項目89に記載の方法。
(項目96)
前記スペーサーは、免疫グロブリン定常領域またはCD8α鎖である、項目95に記載の方法。
(項目97)
前記免疫グロブリン定常領域は、IgGヒンジドメイン、およびIgG CH2ドメイン、およびIgG CH3ドメインの1つ以上を含む、項目96に記載の方法。
(項目98)
前記免疫グロブリン定常領域は、免疫グロブリンヒンジドメインを含む、項目97に記載の方法。
(項目99)
前記免疫グロブリン定常領域は、IgG CH3ドメインをさらに含む、項目98に記載の方法。
(項目100)
前記免疫グロブリン定常領域は、IgG CH2ドメインをさらに含む、項目98または99に記載の方法。
(項目101)
前記スペーサーは、グリシン-セリンリンカーを介して前記scFVに結合している、項目96~100のいずれか一項に記載のCAR。
(項目102)
前記グリシン-セリンリンカーは、15~20アミノ酸リンカーである、項目101に記載のCAR。
(項目103)
前記15アミノ酸リンカーは、(Gly 4 Ser) 3 を含む、項目102に記載のCAR。
(項目104)
前記遺伝子改変T細胞は、1つ以上の追加の生体分子を発現するようにさらに操作された、項目80に記載の方法。
(項目105)
前記1つ以上の追加の生体分子は、IL-12、GAL3CまたはSANT7の1つ以上を含む、項目104に記載の方法。
(項目106)
前記1つ以上の追加の生体分子は、IL-12であり、前記IL-12は、柔軟性リンカーにより繋がったIL-12 p35サブユニットおよびIL-12 p40サブユニットを含む一本鎖ポリペプチドとして発現される、項目104に記載の方法。
(項目107)
前記柔軟性リンカーは、(G 4 S) 3 リンカーである、項目106に記載の方法。
(項目108)
柔軟性リンカーにより繋がったIL-12 p35サブユニットおよびIL-12 p40サブユニットを含む前記一本鎖ポリペプチドは、生物活性p70 IL-12ヘテロ二量体を形成する、項目106に記載の方法。
(項目109)
前記CAR T細胞は、IL-12および選択可能マーカーを発現するように操作された、項目105に記載の方法。
(項目110)
前記CAR T細胞は、SANT7および選択可能マーカーを発現するように操作された、項目104に記載の方法。
(項目111)
前記CAR T細胞は、GAL3Cおよび選択可能マーカーを発現するように操作された、項目104に記載の方法。
(項目112)
前記CAR T細胞は、SANT7、IL-12および選択可能マーカーを発現するように操作された、項目104に記載の方法。
(項目113)
前記CAR T細胞は、SANT7、GAL3Cおよび選択可能マーカーを発現するように操作された、項目104に記載の方法。
(項目114)
前記CAR T細胞は、IL-12、GAL3Cおよび選択可能マーカーを発現するように操作された、項目104に記載の方法。
(項目115)
前記CAR T細胞は、IL-12、GAL3C、SANT7および選択可能マーカーを発現するように操作された、項目104に記載の方法。
(項目116)
1つ以上の追加の生物学的または薬学的に活性な薬剤を投与することをさらに含む、項目80に記載の方法。
(項目117)
前記1つ以上の追加の生物学的に活性な薬剤は、IL-12、IL-6受容体拮抗薬またはSANT7を含む、項目116に記載の方法。
(項目118)
前記追加の薬学的に活性な薬剤は、1つ以上の化学療法剤を含む、項目116に記載の方法。
(項目119)
前記追加の薬学的に活性な薬剤は、免疫調節薬である、項目116に記載の方法。
(項目120)
前記免疫調節薬は、サリドマイドまたはその類似体である、項目119に記載の方法。
(項目121)
前記サリドマイド類似体は、アクチミド、レナリドミドまたはポマリドミドである、項目120に記載の方法。
(項目122)
前記追加の薬学的に活性な薬剤は、ヒストン脱アセチル化酵素阻害薬である、項目116に記載の方法。
(項目123)
前記ヒストン脱アセチル化酵素阻害薬は、パノビノスタット、ボリノスタット、トリコスタチンA、デプシペプチド、フェニル酪酸、バルプロ酸、ベリノスタット、LAQ824、エンチノスタット、CI944、またはモセチノスタットである、項目122に記載の方法。
(項目124)
前記1つ以上の追加の生物学的または薬学的に活性な薬剤は、遺伝子改変T細胞による処置の前、その間、またはその後に投与される、項目116に記載の方法。
(項目125)
前記遺伝子改変T細胞は、静脈内投与される、項目80に記載の方法。
(項目126)
前記遺伝子改変T細胞は、患者に由来する、項目80に記載の方法。
(項目127)
前記遺伝子改変T細胞は、患者に由来するものではない、項目80に記載の方法。
(項目128)
HGF結合タンパク質を発現するようにさらに操作された、項目26または27に記載の遺伝子改変T細胞。
(項目129)
前記HGF結合タンパク質は、HGF抗体またはその断片である、項目128に記載の遺伝子改変T細胞。
(項目130)
前記1つ以上の追加の生体分子は、HGF結合タンパク質である、項目67または104に記載の方法。
(項目131)
前記HGF結合タンパク質は、抗体またはその断片である、項目130に記載の方法。
(項目132)
前記遺伝子改変T細胞は、幹細胞移植の前、その間またはその後に投与される、項目80に記載の方法。
(項目133)
前記幹細胞移植は、同種幹細胞移植である、項目132に記載の方法。
(項目134)
前記幹細胞移植は、同種異系幹細胞移植である、項目132に記載の方法。
カッパ骨髄腫抗原またはKMAは、骨髄腫細胞の表面上に見られる細胞膜抗原である。具体的には、KMAは、細胞膜上のアクチンと非共有結合的に関連した遊離カッパ軽鎖からなる(Goodnow et al.(1985)J. Immunol. 135:1276)。KMAに特異的に結合する任意の抗体が、本明細書に従って使用され得るが、好ましい実施形態において、KappaMabモノクローナル抗体は、本発明のCARの細胞外抗原結合ドメインの基礎として使用される。KappaMabとして指定される(以前はIST-1097として指定されていた、MDX-1097としても知られる)モノクローナル抗体は、カッパ鎖が重鎖に関連していない、したがって無傷カッパ鎖含有IgG、IgM、IgEまたはIgAに結合していない場合にのみ利用可能である、ヒトカッパ遊離軽鎖のスイッチ領域における立体構造エピトープに結合する(Hutchinson et al.(2011)Mol. Immunol.)。患者の骨髄生検に由来する原発性骨髄腫細胞上のKMAの典型的な発現は、図3においてKappaMab結合により示されている。KappaMab抗体は、配列番号1のVH鎖および配列番号2のVL鎖を含み得る。より具体的には、KappaMab VH鎖は、配列番号3~5のCDR、および配列番号6~8のVL CDRを含み得る。さらに、KappaMabは、配列番号22のVH領域および配列番号21のVL領域を含み得る。
キメラ抗原受容体(CAR)は、一連のリンカー(複数可)およびスペーサー(複数可)により互いに保持された、モノクローナル抗体の腫瘍抗原結合領域、および単一ポリペプチド鎖におけるT細胞受容体複合体の細胞内活性化部分からなる、人工的受容体である(図1A~1B)。最も一般的には、CARは、CD3ζ膜貫通ドメインに融合した一本鎖可変断片(ScFv)の融合タンパク質である。しかしながら、CD28、41-BBおよびOx40等の他の細胞内シグナル伝達ドメインが、様々な組み合わせで使用され、所望の細胞内シグナルを生じてもよい。いくつかの実施形態において、本明細書で提供されるCARは、Ig重鎖リーダーペプチドを含む。リーダーペプチドは、配列番号20であってもよい。
一実施形態において、本発明のCARは、MM細胞上に発現した1つ以上のKMAエピトープに特異的であるモノクローナル抗体からの細胞外抗原結合ドメインを含む。一実施形態において、本発明のCARは、KappaMabからの細胞外抗原結合ドメインを含む。一実施形態において、細胞外結合ドメインは、配列番号6~8のVL CDRおよび配列番号3~5のVH CDRを含む。具体的実施形態において、細胞外結合ドメインは、KappaMabのVL(配列番号2)ドメインおよびVH(配列番号1)ドメインを含むscFvである。別の実施形態において、細胞外結合ドメインは、KappaMabのVL(配列番号21)ドメインおよびVH(配列番号22)ドメインを含むscFvである。
さらなる実施形態において、KappaMab VLは、柔軟性リンカーを介してKappaMab VHに連結している。具体的には、柔軟性リンカーは、約10~30アミノ酸(例えば、30、25、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、または5アミノ酸)のグリシン/セリンリンカーであり、構造(Gly4Ser)3を含む。具体的実施形態において、リンカーは、15アミノ酸の長さである。リンカーの長さは、CARの重要な決定因子である。理論に束縛されないが、より短いリンカーは、親和性を向上させ得るが、同時に細胞内多量体形成をもたらし、したがってCARの発現を低下させ得、一方、より長いリンカーは、VLおよびVH CDRを空間的により遠くに移動させることにより、抗原親和性を減少させる傾向を有する。
細胞外抗原結合ドメイン(例えばKappaMab scFv)は、「スペーサー」の使用により、細胞内シグナル伝達ドメインに連結している。スペーサーは、抗原認識および結合を促進するような様式での抗原結合ドメインの配向を可能にするのに十分に柔軟となるように設計される。スペーサーは、免疫グロブリン自体に由来してもよく、またIgG1ヒンジ領域、またはIgGのCH2および/もしくはCH3領域を含み得る。代替として、ヒンジは、CD8α鎖の全てまたは一部を含んでもよい。スペーサー(複数可)の長さおよび柔軟性は、抗原認識ドメインおよび細胞内結合領域の両方に依存し、1つのCARコンストラクトに対して機能的および/または最適となり得るものは、別のCARに対してはそうではない可能性がある。ある特定の場合において、最適なスペーサーの識別および長さが、使用される細胞外結合部分および選択される細胞内シグナル伝達ドメインに依存して変動することを示すために、スペーサーは、本明細書において「opti」として指定され得る(例えば図6A~6C)。ある特定の実施形態において、IgGヒンジのみが使用される。他の実施形態において、IgGヒンジは、IgG CH2ドメインの全てまたは一部と共に使用される。他の実施形態において、IgGヒンジは、IgG CH3ドメインの全てまたは一部と共に使用される。他の実施形態において、IgGヒンジは、IgG CH2およびCH3ドメインの両方の全てまたは一部と共に使用される。他の実施形態において、IgG CH2ドメインの全てまたは一部が使用される。他の実施形態において、IgG CH3ドメインの全てまたは一部が使用される。さらに他の実施形態において、IgG CH2およびCH3ドメインの両方の全てまたは一部が使用される。一実施形態において、本明細書で提供されるコンストラクトのいずれかにおいて使用されるヒンジ、CH2およびCH3ドメインは、Uniprot P01857のアミノ酸位置103におけるヒンジ領域でのCからPの突然変異を含む。一実施形態において、本明細書で提供されるコンストラクトのいずれかにおいて使用されるヒンジ、CH2およびCH3ドメインは、配列番号24である。別の実施形態において、ヒンジは、IgG CH2およびCH3ドメインの両方の全てまたは一部と共に使用され、Fc受容体とのCH2相互作用に重要なアミノ酸において突然変異が導入される。これらの突然変異は、本明細書で提供されるCAR T細胞とのFc相互作用を減少させることにより、改善された注入後生存率を媒介し得る。これらの突然変異の例は、本明細書で提供されるような実施例3において示されるKM.CAR_hCH2CH3mut_28TM_41BBzコンストラクトにおいて確認され得る。さらなる実施形態において、CD8αポリペプチドが使用される。さらなる実施形態において、スペーサー(例えば、本明細書に記載のような免疫グロブリンドメインに由来する)は、柔軟性リンカーを介してscFVに結合してもよい。具体的には、柔軟性リンカーは、約10~30アミノ酸(例えば、30、25、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、または5アミノ酸)のグリシン/セリンリンカーであり、構造(Gly4Ser)x(式中、Xは、1~5である)を含む。他の実施形態において、グリシン/セリンリンカーは、(Gly4Ser)3を含む。
細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζ鎖の全てまたは一部を含む。CD247としても知られるCD3ζは、CD4またはCD8 T細胞共受容体のいずれかと共に、細胞外抗原認識を細胞内シグナル伝達カスケードに連結することを担う。一実施形態において、本明細書で提供されるコンストラクトのいずれかにおいて使用されるCD3ζは、配列番号26である。
本発明のCAR T細胞は、KappaMAb単独の使用と比較して、組成物の抗腫瘍機能および/または安全性を向上させるために追加の生物学的に活性な分子を含有するようにさらに改変可能である追加的利益を有する。一実施形態において、CAR T細胞は、全身毒性を回避しながら腫瘍微小環境/がん細胞への集中的な送達を可能にする、抗腫瘍サイトカインを生成するようにさらに遺伝子改変され得る。本発明のCAR T細胞の抗腫瘍反応を向上させ得る追加の生物学的に活性な分子の例は、これらに限定されないが、IL-12、炭水化物結合タンパク質ガレクチン-3(GAL3)またはその切断形態GAL3C、およびサイトカイン受容体超拮抗薬SANT7を含む。別の実施形態において、本発明のCAR T細胞はまた、肝細胞成長因子(HGF)結合タンパク質を発現するプラスミドと同時形質導入されてもよい。一実施形態において肝細胞成長因子タンパク質は、HGFに結合してその機能を阻害し得る抗体またはその断片である。
肝細胞成長因子(HGF)およびその受容体であるMETは、がんの発生および進行、特に腫瘍浸潤および転移性疾患への進行に関与している。多発性骨髄腫は、HGFおよびMETの両方を発現し、したがって自己分泌および傍分泌ループの両方を形成する一方で、正常な形質細胞はHGFを発現しない(Zhan et al.(2002)、Borset, et al.(1996)。さらに、HGF濃度は、多発性骨髄腫に罹患した血漿患者の血液および骨髄中で著しく増加し、血清HGFレベルは、進行期の疾患および広範囲の骨病変に相関する(Seidel et al.(1998)、Wader, et al.(2008)、Alexandrakis, et al.(2003))。さらに、KappaMabによる第1相臨床試験における患者の血清バイオマーカー分析では、対照と比較して、KappaMabによる処置後の血清HGFにおける統計的に有意な用量関連減少が示されている。血清HGFにおけるこの低減を向上させるために、ある特定の実施形態において、HGF結合タンパク質が、本発明のCAR T細胞において発現される。具体的実施形態において、発現されるHGF結合タンパク質は、抗体またはその断片である。具体的実施形態において、抗HGF結合タンパク質は、抗体、ジアボディ、scFvまたはFabである。一実施形態において、HGF結合タンパク質は、CARコンストラクトと同じ発現ベクターにおいて発現される。さらなる実施形態において、HGF結合タンパク質は、別個の発現ベクターにおいて発現されるが、CARコンストラクトと同時形質導入される。さらなる実施形態において、CAR-T細胞は、CAR、HGF結合タンパク質およびIL-12を発現する。さらなる実施形態において、CAR-T細胞は、CAR、HGF結合タンパク質およびSANT7を発現する。さらなる実施形態において、CAR-T細胞は、CAR、HGF結合タンパク質およびGAL3Cを発現する。さらなる実施形態において、CAR-T細胞は、CAR、HGF結合タンパク質およびIL-12およびGAL3Cを発現する。さらなる実施形態において、CAR-T細胞は、CAR、HGF結合タンパク質およびSANT7およびGAL3Cを発現する。さらに別の実施形態において、CAR-T細胞は、CAR、抗HGF結合タンパク質、IL-12およびSANT7を発現する。さらなる実施形態において、CAR-T細胞は、CAR、HGF結合タンパク質、IL-12、SANT7およびGAL3Cを発現する。
一態様において、本明細書に記載のCAR(複数可)、ならびに任意選択で1つ以上の抗腫瘍サイトカイン(例えばIL-12および/もしくはSANT7)、ならびに/または1つ以上のHGF結合タンパク質を発現するCAR T細胞を生成するための方法が提供される。本発明のCARおよび抗腫瘍サイトカイン/抗体を含有する発現ベクターを構築する好ましい方法が本明細書に記載されるが、これらの構成成分を発現するためにT細胞を形質導入することができる任意の方法が使用され得ることが、当業者に容易に理解される。
一態様において、本明細書で提供されるCAR T細胞により、それを必要とする対象を処置するための方法が提供される。具体的態様において、それを必要とする対象は、KMAを発現する悪性腫瘍、例えばKMAを発現するB細胞悪性腫瘍を有すると診断された、またはそれを有することが疑われるヒト対象である。ある特定の実施形態において、患者は、多発性骨髄腫(MM)、ワルデンシュトレームマクログロブリン血症、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫(DLBCL)、またはアミロイドーシスを有する、または有することが疑われる。KMAを発現するB細胞悪性腫瘍、例えば、多発性骨髄腫(MM)、ワルデンシュトレームマクログロブリン血症、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫(DLBCL)、およびアミロイドーシスを診断するための方法は、当技術分野において知られており、したがって本明細書において詳細には説明されない。CAR T細胞は、単独で、または多発性骨髄腫(MM)、ワルデンシュトレームマクログロブリン血症、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫(DLBCL)、アミロイドーシスもしくはKMAを発現する別のB細胞悪性腫瘍の処置のための他の治療有効薬剤と組み合わせて使用され得る。ある特定の態様において、本発明のCAR T細胞は、静脈内送達に好適な医薬製剤として投与される。
KappaMabの可変領域をコードするヌクレオチド配列(配列番号9および10)に基づいて、scFvを設計し、免疫グロブリン重鎖ヒンジ、CD28共刺激ドメインおよびCD3-ゼータエンドドメインを含有するCARコンストラクト内にクローニングした(図6A)。コンストラクトは、Haemalogix Pty Ltd.により提供された抗体可変領域の遺伝子配列を使用して、Clone Manage 9(Sci-Ed Software)において設計した。このコンストラクト(すなわちKM.CAR-hCH2CH3-28z、図6A)の一部の5’から3’のアミノ酸配列は、以下の通りである。
多発性骨髄腫のマウスへのヒト骨髄腫の異種移植モデルを確立した。RPMI8226または代替の骨髄腫細胞株を、Rag2-/-γc-/-(BALB/c)マウスに静脈内接種し、Rag MMモデルを形成した(図5A~5D)。Rag2-/-γc-/-(BALB/c)マウスは、マウスリンパ球(T、BおよびNK細胞)を有さず、ヒト異種移植試験の受容宿主である。このモデルは、新規抗体と組み合わせてボルテゾミブ等の新規治療薬を試験するために成功裏に使用されている(図5E)。我々は、KMA.CAR T細胞を試験およびさらに最適化するために、このMMモデルを使用する。
実施例1に記載のコンストラクトに基づいて、可変長スペーサー領域および共刺激エンドドメイン(例えば、CD28または4-1BB(CD137-Uniport Q07011))を有する実施例1に記載のKM scFvを含有する6つのCARコンストラクトをCD3ゼータエンドドメインと共に構築した(図2および図6B~6D)。スペーサー長を変化させることにより、T細胞と標的細胞との間の距離が改変され、スペーサーが短いほど、標的細胞溶解を向上させることができた。全てのコンストラクトにおいて、KMA.CARの安定なT細胞表面発現を確実とするために、CD28膜貫通ドメインを使用した。スペーサーとしてIgG1重鎖定常領域の成分が使用された全ての場合において、第2の(G4S)3柔軟性リンカーをscFvとスペーサー領域との間に配置した。これらのCARは、genscriptにより商業的に合成され、さらなる試験のために、pVAX1PB PiggyBacトランスポゾンプラスミド内にクローニングされた。
構成的に活性なプロモーター(EF1アルファ)および活性化誘導性プロモーター(NFATpro)を含有する単一トランスポゾンカセットを設計し、クローニングした。活性化誘導性遺伝子発現カセットは、Fiering et al(8)に基づき、Clone Manage 9(Sci-Ed Software)を使用してNFATproを設計することにより生成した。これは、第4染色体上に見られる、活性化T細胞の核因子(NFAT-RE)が結合した30塩基対DNA配列の6つのコピー(反応要素-RE)-GGAGGAAAAACTGTTTCATACAGAAGGCGT(配列番号35)に続く、最小IL-2プロモーター- ACATTTTGACACCCCCATAATATTTTTCCAGAATTAACAGTATAAATTGCATCTCTTGTTCAAGAGTTCCCTATCACTCTCTTTAATCACTACTCACAGTAACCTCAACTCCTG(配列番号36)を含む(NCBI参照配列:NG_016779.1)。
実施例4からのpVAX1PB NFATGFP-RQR8トランスポゾン(図9を参照されたい)の機能を実証するために、4×106のPBMCを、それぞれ5ugのトランスポゾンおよびトランスポザーゼプラスミドの存在下でエレクトロポレーションした。エレクトロポレーションされた細胞を24時間静置し、次いで50ng/mlのホルボールミリスチン酸アセテート(PMA:Sigma-Aldrich)および1ug/mlのイオノマイシン(Sigma-Aldrich)で一晩非特異的に刺激し、非刺激対照と比較した。形質導入された細胞を、RQR8マーカー発現に関してQBEnd10染色により識別し、活性化誘導遺伝子発現(eGFP)を19時間で評価した。その時点において、形質導入細胞の50%が、eGFPを発現することが確認された(図10)。
IL-12および/またはインターロイキン-6受容体拮抗薬SANT7を含有し、また活性化誘導性プロモーターの制御下でIL-12および/またはSANT7の発現を有する最適化されたキメラ抗原受容体を含有する発現プラスミド(Hooijberg et al. 2000)もまた構築した。SANT-7配列は、Prof Rocco Savinoにより提供され、Savino et al 1994およびSporeno et al 1996(14~17)に従い提供される野生型IL-6遺伝子配列(NCBI参照配列:NM_000600.4)の突然変異に基づいていた。配列を、Clone Manage 9(Sci-Ed Software)にインポートし、ELISAによる上澄み中での検出のために6×Hisタグを追加した。
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Claims (20)
- 1つ以上の細胞内シグナル伝達ドメインおよび細胞外抗原結合ドメインを含むキメラ抗原受容体(CAR)であって、前記細胞外抗原結合ドメインは、カッパ骨髄腫抗原(KMA)に特異的に結合し、かつ免疫グロブリン(Ig)カッパ重鎖を伴う免疫グロブリン(Ig)カッパ軽鎖に結合しない一本鎖可変断片(scFv)を含み、前記scFvは、Kappaモノクローナル抗体(KappaMab)に由来する相補性決定領域(CDR)を含み、前記KappaMAb CDRは、配列番号3~8を含む、キメラ抗原受容体(CAR)。
- 前記1つ以上の細胞内シグナル伝達ドメインは、1つ以上の共刺激エンドドメインを含む、請求項1に記載のCAR。
- 前記1つ以上の共刺激エンドドメインは、CD28ドメイン、CD3ζドメイン、4-1BBドメイン、OX-40ドメインまたはそれらの組み合わせの1つ以上である、請求項2に記載のCAR。
- 前記scFvは、KappaMabからのVL鎖およびVH鎖を含み、前記VL鎖は、配列番号21を含み、前記VH鎖は、配列番号22を含む、請求項1に記載のCAR。
- 前記KappaMabからの前記VL鎖および前記VH鎖は、グリシン-セリンリンカーを介して結合しており、前記グリシン-セリンリンカーは、(Gly4Ser)3を含む15アミノ酸リンカーである、請求項1に記載のCAR。
- 前記scFvは、スペーサーを介して前記1つ以上の細胞内シグナル伝達ドメインに結合しており、前記スペーサーは、免疫グロブリン定常領域またはCD8α鎖である、請求項1に記載のCAR。
- 前記免疫グロブリン定常領域は、IgGヒンジドメイン、IgG CH2ドメインおよびIgG CH3ドメインの1つ以上を含む、請求項6に記載のCAR。
- 前記スペーサーは、グリシン-セリンリンカーを介して前記scFVに結合しており、前記グリシン-セリンリンカーは、(Gly4Ser)3を含む15アミノ酸リンカーである、請求項6または7に記載のCAR。
- 請求項1~8のいずれか一項に記載のCARを発現するように操作された、遺伝子改変T細胞。
- 1つ以上の追加の生体分子を発現するようにさらに操作された、請求項9に記載の遺伝子改変T細胞。
- 前記1つ以上の追加の生体分子は、IL-12、肝細胞成長因子(HGF)結合タンパク質、ガレクチン-3C(GAL3C)またはSANT7の1つ以上を含む、請求項10に記載の遺伝子改変T細胞。
- 選択可能マーカーを発現するようにさらに操作された、請求項10に記載の遺伝子改変T細胞。
- 対象におけるカッパ骨髄腫抗原(KMA)発現悪性腫瘍を処置するための医薬の製造における、1つ以上の細胞内シグナル伝達ドメインおよび細胞外抗原結合ドメインを発現するように操作された遺伝子改変T細胞の使用であって、前記細胞外抗原結合ドメインは、KMAに特異的に結合し、かつ免疫グロブリン(Ig)カッパ重鎖を伴う免疫グロブリン(Ig)カッパ軽鎖に結合しない一本鎖可変断片(scFv)を含み、前記scFvは、Kappaモノクローナル抗体(KappaMab)に由来する相補性決定領域(CDR)を含み、前記KappaMAb CDRは、配列番号3~8を含む、使用。
- 前記医薬が、1つ以上の薬学的に活性な薬剤と共に提供され、前記1つ以上の薬学的に活性な薬剤は、1つ以上の化学療法剤、免疫調節薬またはヒストン脱アセチル化酵素阻害薬を含む、請求項13に記載の使用。
- 前記遺伝子改変T細胞は、前記対象に由来する、請求項13または14に記載の使用。
- 前記KMA発現悪性腫瘍は、多発性骨髄腫、ワルデンシュトレームマクログロブリン血症、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫(DLBCL)、またはアミロイドーシスである、請求項13~15のいずれか一項に記載の使用。
- 対象におけるカッパ骨髄腫抗原(KMA)発現悪性腫瘍を処置するための、1つ以上の細胞内シグナル伝達ドメインおよび細胞外抗原結合ドメインを発現するように操作された遺伝子改変T細胞を含む組成物であって、前記細胞外抗原結合ドメインは、KMAに特異的に結合し、かつ免疫グロブリン(Ig)カッパ重鎖を伴う免疫グロブリン(Ig)カッパ軽鎖に結合しない一本鎖可変断片(scFv)を含み、前記scFvは、Kappaモノクローナル抗体(KappaMab)に由来する相補性決定領域(CDR)を含み、前記KappaMAb CDRは、配列番号3~8を含む、組成物。
- 前記組成物は、1つ以上の薬学的に活性な薬剤と組み合わせて投与されることを特徴とし、前記1つ以上の薬学的に活性な薬剤は、1つ以上の化学療法剤、免疫調節薬またはヒストン脱アセチル化酵素阻害薬を含む、請求項17に記載の組成物。
- 前記遺伝子改変T細胞は、前記対象に由来する、請求項17または18に記載の組成物。
- 前記KMA発現悪性腫瘍は、多発性骨髄腫、ワルデンシュトレームマクログロブリン血症、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫(DLBCL)、またはアミロイドーシスである、請求項17~19のいずれか一項に記載の組成物。
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