JP7227438B2 - 核磁気共鳴測定により試料に関する情報を抽出する方法 - Google Patents
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Description
試料について複数の磁気共鳴測定を実施する工程であって、各測定が、試料を符号化シーケンスにかける工程を含んでなり、シーケンスの少なくとも1部が、核緩和及び拡散に起因する磁気共鳴信号の減衰を符号化することに適切であり、
符号化シーケンスの勾配パルス・シーケンスのうちの少なくとも1つのパラメータを、複数の測定のうちの少なくとも1つの部分集合のうちで変更し、部分集合の少なくとも1つの測定が、1つより多くの非ゼロの固有値を有する拡散符号化テンソル表記を有する勾配パルス・シーケンスを含み、
複数の測定のうちの少なくとも1つの部分集合が、核緩和に起因する異なるレベルの磁気共鳴信号の減衰について符号化する工程を含む、複数の磁気共鳴測定を実施する工程と、
複数の磁気共鳴測定からもたらされる信号から試料に関する情報を抽出する工程であって、情報が試料についての核緩和特性及び拡散特性を含む、情報を抽出する工程とを備える。
勾配パルス・シーケンスの拡散符号化テンソル表記とは、磁気共鳴測定(たとえば、磁気共鳴測定iの勾配パルス・シーケンスGiのテンソル表記biといった)の磁気勾配パルス・シーケンスGの拡散符号化テンソル表記bということもでき、bは
確率分布は、こうして、核緩和特性と拡散特性の特定の組合せが試料に存在する確率又は尤度の(たとえば、0と1の間の数としての)推定を示すことができる。
核緩和特性と拡散特性の組合せは、縦及び/又は横緩和率と、等方性拡散、異方性拡散、及び拡散テンソルの方位のうちの1つ以上との組合せを含むことができる。
抽出した情報の核緩和特性は、横緩和率及び/又は縦緩和率の推定を含むことができる。抽出した情報は、試料の各構成成分について、横緩和率及び/又は縦緩和率のそれぞれの推定を含むことができる。
方法は、流れの特性を含む試料に関する情報を抽出する工程をさらに含むことができる。
上記ならびに本発明の概念のさらなる目的、特徴、及び利点は、添付図面を参照し、本発明の概念の好適な実施形態の、以下の例示的で非限定的な詳細な記載を通して、よりよく理解されよう。
本発明の概念の理解を促進するために、ここで、いくつかの理論上の概念の議論を、図面を参照して提供することとする。
緩和及び拡散NMR実験は、通常、図1a中の一般的パルス・シーケンス及び図1b中の具体的な実装で描かれるような、信号検出を有するブロックの前の、緩和及び拡散符号化を有するブロックを含むパルス・シーケンスで実施される。したがって、図1aは、緩和率及び拡散テンソルの値にしたがってNMR信号を変調する「符号化ブロック」と、(たとえば、スペクトル又は画像として)NMR信号が読み出される「検出ブロック」とを示す。図1bは、90°及び180°の無線周波数パルス(細い縦線及び太い縦線)、3つの直交方向の変調した勾配(実線、破線、及び点線)、及び検出信号(太い実線)を有するNMRパルス・シーケンスを描く。以下で詳細に記載されるように、信号は、それぞれ、[1-exp(-τ1R1)]、exp(-τ2R2)、及びexp(-b:D)という係数の、縦復元、横緩和、及び拡散によって変調される。
ステイスカル-タナー(Stejskal-Tanner)パルス・シーケンスに基づく拡散NMR及びMRI方法は、値bΔ=1に限られ、b||が唯一の非ゼロの固有値であることを意味する。等方性拡散符号化29、18は、bΔ=0と等価であり、すべての固有値が非ゼロで等しく、b||=b⊥であることを意味する。
このパラメータ化で、式(10)中のテンソル・スカラー積は、次式のように好都合に表すことができる。
(取得プロトコル)
上記に鑑みて、例示的な連続測定は、1つではなくbΔでの測定、ならびに、1つより多くの値での時間期間τ1とτ2のうちの少なくとも一方のサンプリング、それによって、拡散成分の等方的に平均化した拡散性、拡散異方性、及び核緩和ならびにそれらの相関関係に関する情報を与えることを含むことができる。そのようなプロトコルの例が図2に表示される。一般的に、パルス・シーケンスは、(式(22)により与えられる)カーネル中の取得パラメータを制御できるように変えられる。図では、サンプリングされたデータ点が、縦復元時間τ1、横脱相時間τ2、bテンソルの大きさb、bテンソルの異方性bΔ、及びbテンソルの方位(Θ、Φ)といった次元を有する6D取得空間の、すべての可能な2D投影にプロットされる。図2aは、横緩和率R2、等方拡散性Diso、拡散テンソル異方性DΔ、及び拡散テンソル方位(θ、φ)の5D相関関係の推定を可能にする。図2bは、縦緩和率R1、等方拡散性Diso、拡散テンソル異方性DΔ、及び拡散テンソル方位(θ、φ)の5D相関関係の推定を可能にする。図2cは、縦緩和率R1、横緩和率R2、等方拡散性Diso、拡散テンソル異方性DΔ、及び拡散テンソル方位(θ、φ)の6D相関関係の推定を可能にする。図2dは図2cと同様であるが、6D取得空間の擬似ランダム・サンプリングを行う。図2a及び図2b中に示される例は、それぞれ、拡散テンソル・パラメータ(Diso、DΔ、θ、φ)と緩和率R1又はR2との間の相関関係の推定を可能にする一方、図2c及び図2d中のサンプリング方式は、(Diso、DΔ、θ、φ)と、緩和率R1及びR2の両方との間の相関関係の推定を可能にする。6D取得空間(τ1、τ2、b、bΔ、Θ、Φ)は、図1b中のパルス・シーケンスでサンプリングすることができる。他のオプションとしては、bΔ次元の連続サンプリングを可能にするため、トップガード(Topgaard)17により導入され、エリクソン(Eriksson)ら24によりさらに修正されたパルス・シーケンスが挙げられる。最初の90°パルス及びその後の復元遅延τ1をこのエリクソン(Eriksson)らのシーケンスに加えることによって、完全な6D取得空間がアクセス可能になる。これらの異なるプロトコルは異なるシナリオでの利益を提供することができるが、全体的な発明の概念の基盤となる発明のアイデアでは、取得パラメータ空間の探査を可能にする任意のパルス・シーケンスを使用できることに留意されたい。好ましくは、実験の測定間で、取得パラメータ/変数(τ1、τ2、b、bΔ、Θ、Φ)のばらつきを可能にするパルス・シーケンスを使用することができる。
以下では、原理証明実験の例、ならびにその結果を記載することになる。
(試料準備)
10mlの小ビンの中で、ナトリウム1,4-ビス(2-エチルヘキソキシ)-1,4-ジオキソブタン-2-スルホネート(38wt%)と2,2,4-トリメチルペンタン(14wt%)と水(48wt%)を混合することによって、逆6方晶リオトロピック液晶が調製された。混合物を均質にするための広範囲にわたる手作業での混合及び遠心分離の後、0.5mlが5mmNMRチューブに移された。逆6方晶相は、25℃で熱力学的に安定であり31、温度を上げると逆ミセル相へと溶解する。試料は、逆6方晶と逆ミセル相が共存する29℃で調べられた。
NMR実験は、500.13MHz 1H共鳴周波数で動作するBruker AVII-500スペクトロメータ上で実施された。スペクトロメータは、3つの直交方向に、大きさ3T/mを有する磁場勾配を送出することが可能なMIC-5マイクロイメージング・プローブを装着した11.7Tのウルトラシールドした磁石を装備する。液晶試料は、トップガード(Topgaard)17により導入され、ここでは、上述の理論セクションで記載されたような、変数(τ1、τ2、b、bΔ、Θ、Φ)のすべてを用いた信号符号化を可能にする、3重刺激エコー・パルス・シーケンスの変調バージョンで調べられた。図2dに描かれるような、ランダム・サンプリングの手法を使用して、6D取得空間の1024点を選択した。取得変数の実際の値は、図3a~図3bに示される。パルス・シーケンス・ブロックの後に緩和及び拡散符号化が続き、信号は、自由誘導減衰(FID:free induction decay)として検出され、フーリエ変換して高解像度NMRスペクトルが得られた。水共鳴線は、さらなる分析のために組み込まれて記録された。
6D分布は、非負最小自乗(NNLS:non negative least squares)法34を使用した、式(21)の数値的逆積分変換によって推定された。
(図3(c)中の結果を得るための例)
6D分布P(R1、R2、Diso、DΔ、θ、φ)は、以下のようなブートストラップ手順で推定された。
1)N=1024のカラム・ベクトルとして、信号S及び取得変数(τ1、τ2、b、bΔ、Θ、Φ)を構成する。
2)置換とランダム・サンプリングを使用して、取得したデータ点の完全な組から、信号ベクトルsの「ブートストラップ・リサンプル」33を作る。
3)-1≦log(R1)≦1、-0.3≦log(R2)≦2.7、-11≦log(D||)≦-8.3、-11≦log(D⊥)≦-8.3、-1≦cos(θ)≦1、及び0≦φ≦2πという制限内で、6D[log(R1)、log(R2)、log(D||)、log(D⊥)、cos(θ)、φ]空間中のランダムな点を選択することにより、M=500の「構成成分」を作る。
4)log(R1)、log(R2)、log(D||)、log(D⊥)、及びcos(θ)をR1、R2、D||、D⊥、及びθに変換する。
5)式(16)及び式(17)で、D||及びD⊥をDiso及びDΔに変換する。
6)M個の要素(R1、R2、Diso、DΔ、θ、φ)及びN個の要素(τ1、τ2、b、bΔ、Θ、Φ)を有するベクトルをM×N行列へと展開する。
7)(R1、R2、Diso、DΔ、θ、φ)及び(τ1、τ2、b、bΔ、Θ、Φ)行列を式(22)に代入することによって、カーネルKでM×N行列を計算する。
8)NNLS方法を使用して、M=500のカラム・ベクトルpについて式(24)を解く。(非限定の例として、Matlab R201532のIsqnonnegルーチンを使用することができる34。)
9)ベクトルp中の非ゼロの値を有する構成成分を選択し、他の値を破棄する。
10)(R1、R2、D||、D⊥)の値に0.9と1.1の間のランダムな数を乗算すること、及び角度(θ、φ)に-2°と+2°の間のランダムな数を加算することによって、工程9)からの構成成分を「変異」させる。
11)工程3)を繰り返す。
12)工程11)からの構成成分を、工程9)からの非ゼロの構成成分及び工程10)での変異した構成成分で置換する。
13)工程4)~工程12)を102回繰り返し、得られたベクトルpを記憶する。
14)工程2)~工程13)を103回繰り返し、103個のベクトルpの組を作る。
15)103個のベクトルp中の非ゼロの大きさを有する構成成分を選択する。
16)工程15)からの離散した構成成分の、log(R1)、log(R2)、log(Diso)、及びlog(D||/D⊥)空間中の100×100の矩形グリッドへのガウス畳み込みによって、P(R1、R2、Diso、DΔ)の、すべての可能な1D及び2D投影を計算する。
17)等高線プロット及びトレースとして、2D及び1D分布を表示する。
18)D||/D⊥>10で構成成分を選択する。
19)103個のノードでの、工程19)からの離散した構成成分の球状のメッシュへのガウス畳み込みによって、方位分布関数P(θ、φ)を計算する。
20)P(θ、φ)の対応する値によってスケーリングされた各メッシュ点についての半径を有する球状のメッシュとして分布P(θ、φ)を表示する。
図3a~図3bは、取得数の関数としての、信号Sならびにτ1、τ2、b、bΔ、Θ、及びΦの値としての取得プロトコルを示す。推定される分布P(R1、R2、Diso、DΔ、θ、φ)の投影が図3cに表示される。図は、パラメータR1、R2、Diso、及びD||/D⊥の各対についての2D投影(等高線プロット)ならびに1D投影(トレース)を示す。分布及び残差(S-Sfit)から計算された信号Sfitが図3aにプロットされる。(S-Sfit)の値は、τ1=∞、τ2=0、及びb=0で取得したデータ点についての信号対雑音比を示す。調べた試料は逆ミセル相及び逆6方晶相を含むために、逆ミセルからの1つの等方性成分と1に近いDΔの値を有する1つの成分といった、拡散異方性の明瞭な値を有する2つの水成分が予想される。P(R1)、P(R2)、P(Diso)、及びP(D||/D⊥)といった1D投影で開始すると、2つの構成成分は、R2次元及びD||/D⊥次元でのみ分解することができる一方、それらは、R1次元及びDiso次元では区別できないことがわかる。ピーク幅は、適合不確実性からの寄与を含み、ブートストラップ・リサンプルの各々からの構成成分のわずかに異なる位置を生じさせる。R2次元における解像によって、2D投影P(R2、Diso)中のDisoのわずかな差異を検出し、両方の構成成分が、2D投影P(R1、R2)において同一のR1を有することを検証することが可能になる。図3cへの代入で、P(θ、φ)の方向依存値によってスケーリングされた半径を有する球状のメッシュとして、log(D||/D⊥)>1を有する構成成分についての、2D方位分布関数(ODF:orientation distribution function)P(θ、φ)を示す。関数は、逆6方晶相の晶子が、主要磁場と一致する、研究室基準系のz方向に整合されることを示す。
図4は、試料に関する情報を抽出する方法の一般的なフローチャートを描く。試料は、たとえば、脳組織又は任意の臓器の細胞の(懸濁液)の生体検査試料など、水を含む生物学的試料であってよい。より一般的には、試料は、その性質を磁気共鳴技法によって測定できる核スピン系を含む。
上記の開示において、上付で示した1つ以上の番号は、以下の参考資料のリストの対応する番号で表示した文書を引用する。
Claims (7)
- 試料について複数の磁気共鳴測定(402-1,402n)を実施する工程であって、各測定が、前記試料を符号化シーケンスにかける工程を含んでなり、前記シーケンスの少なくとも1部が、核緩和及び拡散に起因する磁気共鳴信号の減衰を符号化するように適合され、
勾配パルス・シーケンスのうちの少なくとも1つのパラメータを、前記複数の測定のうちの少なくとも1つの部分集合の間で変更し、前記部分集合に対する少なくとも1つの測定が、1つより多くの非ゼロの固有値を有する拡散符号化テンソル表記を有する勾配パルス・シーケンスを含み、
前記複数の測定のうちの少なくとも1つの部分集合が、核緩和に起因する異なるレベルの磁気共鳴信号の減衰について符号化する工程を含んでなる、複数の磁気共鳴測定を実施する工程と、
前記複数の磁気共鳴測定からもたらされる信号から前記試料に関する情報を抽出する工程(404)であって、前記情報が前記試料についての核緩和特性及び拡散特性を含む、情報を抽出する工程と、を備え、
前記情報を抽出する工程(404)は、前記試料における核緩和特性と拡散特性の特定の組合せを見つける確率を示す確率分布を推定する工程を含んでなり、前記組合せは、横緩和率及び縦緩和率のうちの少なくとも一方と、等方拡散性、異方拡散性及び拡散テンソルの方位のうちの1つ以上との組合せであり、
前記確率分布は、複数の測定からもたらされるエコー信号を、カーネルと前記確率分布の積と関係づける式に対する解を決定することによって推定され、前記カーネルの構成成分は、拡散特性又は緩和特性と、前記複数の測定のそれぞれの測定の前記符号化シーケンスの取得パラメータとに基づくものであり、前記取得パラメータは前記測定の緩和又は拡散符号化に起因する信号の減衰のレベルを制御する、
試料に関する情報を抽出する方法。 - 前記試料における異なる拡散符号化を提供するために、勾配パルス・シーケンスの前記少なくとも1つのパラメータを複数の測定の間で変更する、請求項1に記載の方法。
- 異なるレベルの信号の減衰について符号化するために、勾配パルス・シーケンスの前記少なくとも1つのパラメータを複数の測定の間で変更する、請求項1又は2に記載の方法。
- 勾配パルス・シーケンスの変調、最大の勾配の大きさ、及び前記拡散符号化の方位のうちの少なくとも1つ又はこれらの組合せを複数の測定の間で変更する、請求項1~3のいずれか1項に記載の方法。
- 前記複数の測定の少なくとも1つの部分集合が、横緩和及び縦緩和のうちの少なくとも一方に起因する異なるレベルの信号の減衰についての符号化を含んでなる、請求項1~4のいずれか1項に記載の方法。
- 前記抽出した情報の前記核緩和特性が、前記試料についての横緩和率及び縦緩和率のうちの少なくとも一方の推定を含んでなる、請求項1~5のいずれか1項に記載の方法。
- 前記抽出した情報の前記拡散特性が前記試料における構成成分についての拡散を表す拡散テンソルDの要素の推定を含んでなる、請求項1~6のいずれか1項に記載の方法。
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