JP7132553B2 - 分類装置、分類方法およびプログラム - Google Patents

分類装置、分類方法およびプログラム Download PDF

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特許法第30条第2項適用 平成30年5月11日、″https://confit.atlas.jp/guide/event-img/jpgu2018/MIS10-10/public/pdf?type=in&lang=ja″、および、″https://confit.atlas.jp/guide/event-img/jpgu2018/MIS10-10/public/pdf?type=in&lang=en″ 平成30年5月23日、日本地球惑星科学連合2018年大会(JpGU2018) 平成30年6月22日、日本古生物学会2018年年会講演予稿集、日本古生物学会 平成30年6月22日、″http://www.palaeo-soc-japan.jp/events/PSJ201806_TohokuAbstract.pdf″ 平成30年6月23日、日本古生物学会2018年年会
本発明は、分類装置、分類方法およびプログラムに関する。
微細粒子の分類に関連して、特許文献1には、液体中の微細粒子を選んで取得するスクリーニング装置が記載されている。このスクリーニング装置は、試液中の細胞など液体中の微細粒子が発する蛍光を計測し、蛍光の輝度が所定の閾値を超えるなど回収条件を満たした微細粒子を目的検体として特定する。そして、このスクリーニング装置は、吸引・吐出キャピラリを用いて目的検体を取得する。
再公表WO2015/133337号公報
微細粒子を分類する方法として、微細粒子が発する蛍光の輝度を用いて微細粒子を分類する方法以外に、微細粒子の形状に基づいて微細粒子を分類する方法が考えられる。例えば、人(分類作業者)が顕微鏡で微細粒子を見て形状を把握し、微細粒子を分類することが考えられる。しかしながら、この方法を用いる場合、分類対象の微細粒子の数が増加すると、分類に要する時間が増加し、分類作業者の負担が大きくなってしまう。
本発明の目的の一例は、上述の課題を解決することのできる分類装置、分類方法およびプログラムを提供することである。
本発明の第1の態様によれば、分類装置は、トレイに設けられた複数の穴に1つずつ配置された粒子状の複数の分類対象物を撮影して、前記複数の分類対象物を含む画像を得る撮像部と、得られた前記画像を切り出すことにより、前記複数の分類対象物毎の画像を得る取得部と、得られた前記複数の分類対象物毎の画像を機械学習結果を用いて分類し、その分類結果に基づいて前記複数の分類対象物を並び替える並び替え部であって、前記複数の分類対象物のうちの一つの分類対象物が分類されるクラス毎の確度のうち最大の確度を、全てのクラスについての確度の合計から減算した差の2乗が、その分類対象物の前記クラス毎の確度のうち最大の確度を、全てのクラスについての確度の合計に第1の重み係数を乗算した値から減算した差の2乗と、その分類対象物の前記クラス毎の確度のうち2番目に大きい確度を、全てのクラスについての確度の合計に第2の重み係数を乗算した値から減算した差の2乗との合計よりも小さい場合のみ、その分類対象物を前記確度が最大のクラスに分類する並び替え部と、を備える。
本発明の第2の態様によれば、分類装置は、トレイに設けられた複数の穴に1つずつ配置された粒子状の複数の分類対象物を撮影して、前記複数の分類対象物を含む画像を取得する撮像部と、得られた前記画像を切り出すことにより、前記複数の分類対象物毎の画像を得る取得部と、得られた前記複数の分類対象物毎の画像を機械学習結果を用いて分類する分類部であって、前記複数の分類対象物のうちの一つの分類対象物について、その分類対象物が分類されるクラス毎の確度のうち、最大の確度を、全てのクラスについての確度の合計から減算した差の2乗が、その分類対象物の前記クラス毎の確度のうち最大の確度を、全てのクラスについての確度の合計に第1の重み係数を乗算した値から減算した差の2乗と、その分類対象物の前記クラス毎の確度のうち2番目に大きい確度を、全てのクラスについての確度の合計に第2の重み係数を乗算した値から減算した差の2乗との合計よりも小さい場合のみ、その分類対象物を前記確度が最大のクラスに分類する分類部と、を備える。
本発明の第3の態様によれば、分類方法は、トレイに設けられた複数の穴に1つずつ配置された粒子状の複数の分類対象物を撮影して、前記複数の分類対象物を含む画像を得ることと、得られた前記画像を切り出すことにより、前記複数の分類対象物毎の画像を得ることと、得られた前記複数の分類対象物毎の画像を、機械学習結果を用いて分類する際に、前記複数の分類対象物のうちの一つの分類対象物が分類されるクラス毎の確度のうち最大の確度を、全てのクラスについての確度の合計から減算した差の2乗が、その分類対象物の前記クラス毎の確度のうち最大の確度を、全てのクラスについての確度の合計に第1の重み係数を乗算した値から減算した差の2乗と、その分類対象物の前記クラス毎の確度のうち2番目に大きい確度を、全てのクラスについての確度の合計に第2の重み係数を乗算した値から減算した差の2乗との合計よりも小さい場合のみ、その分類対象物を前記確度が最大のクラスに分類することと、分類結果に基づいて前記複数の分類対象物を並び替えることと、を含む。
本発明の第4の態様によれば、分類方法は、トレイに設けられた複数の穴に1つずつ配置された粒子状の複数の分類対象物を撮影して、前記複数の分類対象物を含む画像を得ることと、得られた前記画像を切り出すことにより、前記複数の分類対象物毎の画像を得ることと、得られた前記複数の分類対象物毎の画像を、機械学習結果を用いて分類する際に、前記複数の分類対象物のうちの一つの分類対象物が分類されるクラス毎の確度のうち最大の確度を、全てのクラスについての確度の合計から減算した差の2乗が、その分類対象物の前記クラス毎の確度のうち最大の確度を、全てのクラスについての確度の合計に第1の重み係数を乗算した値から減算した差の2乗と、その分類対象物の前記クラス毎の確度のうち2番目に大きい確度を、全てのクラスについての確度の合計に第2の重み係数を乗算した値から減算した差の2乗との合計よりも小さい場合のみ、その分類対象物を前記確度が最大のクラスに分類することと、を含む。
本発明の第5の態様によれば、プログラムは、コンピュータに、トレイに設けられた複数の穴に1つずつ配置された粒子状の複数の分類対象物を撮影して、前記複数の分類対象物を含む画像を得ることと、得られた前記画像を切り出すことにより、前記複数の分類対象物毎の画像を得ることと、得られた前記複数の分類対象物毎の画像を、機械学習結果を用いて分類する際に、前記複数の分類対象物のうちの一つの分類対象物が分類されるクラス毎の確度のうち最大の確度を、全てのクラスについての確度の合計から減算した差の2乗が、その分類対象物の前記クラス毎の確度のうち最大の確度を、全てのクラスについての確度の合計に第1の重み係数を乗算した値から減算した差の2乗と、その分類対象物の前記クラス毎の確度のうち2番目に大きい確度を、全てのクラスについての確度の合計に第2の重み係数を乗算した値から減算した差の2乗との合計よりも小さい場合のみ、その分類対象物を前記確度が最大のクラスに分類することと、分類結果に基づいて前記複数の分類対象物を並び替えることと、を実行させるためのプログラムである。
本発明の第6の態様によれば、プログラムは、コンピュータに、トレイに設けられた複数の穴に1つずつ配置された粒子状の複数の分類対象物を撮影して、前記複数の分類対象物を含む画像を得ることと、得られた前記画像を切り出すことにより、前記複数の分類対象物毎の画像を得ることと、得られた前記複数の分類対象物毎の画像を、機械学習結果を用いて分類する際に、前記複数の分類対象物のうちの一つの分類対象物が分類されるクラス毎の確度のうち最大の確度を、全てのクラスについての確度の合計から減算した差の2乗が、その分類対象物の前記クラス毎の確度のうち最大の確度を、全てのクラスについての確度の合計に第1の重み係数を乗算した値から減算した差の2乗と、その分類対象物の前記クラス毎の確度のうち2番目に大きい確度を、全てのクラスについての確度の合計に第2の重み係数を乗算した値から減算した差の2乗との合計よりも小さい場合のみ、その分類対象物を前記確度が最大のクラスに分類することと、を実行させるためのプログラムである。
この発明によれば、微細粒子を分類するときの人の負担が比較的小さくて済む。
実施形態に係る分類装置の構成例を示す概略ブロック図である。 実施形態に係る撮像・配置装置の構成の例を示す概略構成図である。 実施形態に係る撮像・配置装置の外形例の概略を示す図である。 実施形態に係るトレイの形状の例を示す図である。 実施形態に係る処理装置の機能構成の例を示す概略ブロック図である。 実施形態における、式(1)の基準に基づく分類の例を示す図である。 実施形態における、式(4)の基準に基づく分類の例を示す図である。 実施形態における、式(6)の基準に基づく分類の例を示す図である。 実施形態に係る分類部が、式(7)および(8)を用いて算出する組成比率(組成割合)の例を示す図である。 実施形態における、式(10)に基づく分類の例を示す図である。 実施形態に係る分類装置の処理手順の例を示すフローチャートである。 実施形態に係る分類装置による微化石の並び替えの例を示す図である。 実施形態に係る分類装置が学習用データを生成する処理手順の例を示すフローチャートである。 実施形態に係る分類装置が微化石の並び替えを行う処理手順の例を示すフローチャートである。 実施形態に係る実施形態に係る分類装置の構成の例を示す図である。 実施形態に係る実施形態に係る分類装置の構成のもう1つの例を示す図である。
以下、本発明の実施形態を説明するが、以下の実施形態は請求の範囲にかかる発明を限定するものではない。また、実施形態の中で説明されている特徴の組み合わせの全てが発明の解決手段に必須であるとは限らない。
図1は、実施形態に係る分類装置の構成例を示す概略ブロック図である。図1に示すように、分類装置1は、撮像・配置装置(撮像及び配置装置)100と、処理装置200とを備える。
分類装置1は、粒子状の分類対象物を分類する。分類装置1による分類対象となる粒子状の物を微細粒子とも称する。
以下では、分類装置1が微化石を微化石の種類別に分類する場合を例に説明する。ここでいう微化石は、微細粒子状の化石である。ここでいう微化石の種類は、微化石になった生物の種類である。微化石の種類は、クラス分け(分類)におけるクラスの例に該当する。
但し、分類装置1による分類対象の微細粒子は、特定の種類のものに限定されない。分類装置1による分類対象の微細粒子の大きさは、砂粒の大きさ(62.5マイクロメートル(μm)以上2ミリメートル(mm)以下)であってもよいが、これに限定されない。分類装置1が微細粒子を分類するクラスも、特定のものに限定されない。
撮像・配置装置100は、微化石を分類するための画像を撮像する。また、撮像・配置装置100は、微化石の分類結果に基づいて、微化石の並び替えを行う。
処理装置200は、撮像・配置装置100を制御して微化石の画像を撮像させ、得られた画像を用いて微化石を分類する。また、処理装置200は、撮像・配置装置100を制御して、微化石を分類に従って並び替えさせる。処理装置200は、例えばパソコン(Personal Computer;PC)またはワークステーション(Workstation)等のコンピュータを用いて構成される。
図2は、撮像・配置装置100の構成の例を示す概略構成図である。図2に示す構成で、可動部112は、支柱111に支持されて、上下方向に移動可能に設けられている。また、可動部112に撮像部140と吸引ロボット150とが設置されている。撮像部140は、顕微鏡141と撮像装置142とを備える。吸引ロボット150は、ノズル151を備える。ノズル151は、チューブ160を介して圧縮機170に接続されている。
撮像部140および吸引ロボット150の下方には載置台120が設置されている。載置台120は、載置台120自らの上面に電動ステージ121を備えている。電動ステージ121にトレイ130が載置される。
図3は、撮像・配置装置100の外形例を示す図である。図3には、図2を参照して説明した撮像・配置装置100の各部のうち、支柱111と、可動部112と、載置台120と、電動ステージ121と、トレイ130と、撮像部140の顕微鏡141および撮像装置142と、ノズル151を備える吸引ロボット150と、チューブ160とが示されている。
図2および図3に示す構成の撮像・配置装置100で、トレイ130が微化石を収容し、撮像部140が、トレイ130上の微化石を撮像する。吸引ロボット150は、トレイ130上の微化石を一時的に吸引し、微化石をトレイ130上で移動させる。
電動ステージ121は、自らが水平方向に二次元的に(前後および左右に)移動することで、トレイ130を水平方向に二次元的に移動させる。また、可動部112は、自らが上下に移動することで、撮像部140および吸引ロボット150を上下に移動させる。これにより、トレイ130と撮像部140および吸引ロボット150との相対位置を三次元的に(前後、左右および上下の何れにも)変化させることができる。
撮像部140では、撮像装置142が顕微鏡141を通してトレイ130を撮像する。これにより、撮像装置142は、トレイ130上の微化石の拡大画像(顕微鏡画像)を撮像する。
吸引ロボット150では、ノズル151の先端の口径が、微化石の大きさ(直径)よりも小さくなっている。ノズル151の先端が移動対象の微化石の近くに位置する状態で、圧縮機170がチューブ160を介してノズル151の先端から空気を吸引することで、ノズル151が移動対象の微化石を吸引する。ノズル151の先端の口径が微化石の大きさよりも小さいことで、微化石はノズル151内には吸い込まれず、ノズル151の先端に一時的に吸着される。
撮像部140がトレイ130上の微化石を撮像する場合、可動部112の上下によって撮像部140とトレイ130との距離を調整する。電動ステージ121が水平方向に二次元的に移動しながら撮像部140が撮像を繰り返すことで、撮像部140は、トレイ130の上面全体を撮像する。これにより、撮像部140は、トレイ130上の全ての微化石を撮像する。
吸引ロボット150が微化石を移動させる場合、電動ステージ121がトレイ130を水平方向に移動させて、移動対象の微化石をノズル151の先端付近に位置させる。この状態で、上記のように圧縮機170が空気を吸引することで、ノズル151が移動対象の微化石をノズル151自らの先端に吸着させる。吸引ロボット150が、ノズル151の先端を持ち上げ、電動ステージ121がトレイ130を水平方向に移動させて、トレイ130上での微化石の移動先の位置をノズル151の先端付近に持ってくる。吸引ロボット150がノズル151の先端を下げ、圧縮機170が空気の吸入を中止することで、ノズル151の吸引力がなくなり、微化石は、トレイ130上での移動先の位置に落下する。
電動ステージ121、トレイ130、吸引ロボット150、チューブ160および圧縮機170の組み合わせは並び替え部の例に該当し、微化石の分類結果に基づいて微化石の並び替えを行う。
微化石が静電気によってノズル151の先端に付着すると、圧縮機170が空気の吸入を中止しても微化石がノズル151の先端に付着したままになってしまうことが考えられる。これを防止するために、トレイ130の上面に比較的粘着力の弱い粘着シートを設置し、微化石を粘着シートに付着させるようにしてもよい。あるいは、ノズル151の先端付近でイオンのミストを発生させて静電気の蓄積を防止するなど、ノズル151の先端に微化石が静電気によって付着することを防止するようにしてもよい。
図4は、トレイ130の形状の例を示す図である。図4の例で、トレイ130の上面には、1つの微化石が入る大きさの穴(窪み)が水平方向の縦横に並んで設けられている。穴の大きさ(特に、直径)が微化石の大きさよりもやや大きくなっており、1つの穴に1つの微化石が収容される。これにより、撮像部140は、微化石が互いに重なっていない状態で微化石を撮像することができる。具体的には、撮像部140は、トレイ130に設けられた複数の穴に1つずつ配置された微化石を含む画像を撮像する。また、吸引ロボット150は、移動対象の微化石を、より確実にノズル151の先端に吸着させることができる。
図5は、処理装置200の機能構成の例を示す概略ブロック図である。図5に示す構成で、処理装置200は、表示部210と、操作入力部220と、記憶部280と、制御部290とを備える。制御部290は、分類対象物画像取得部(取得部)291と、機械学習部292と、分類部293と、指示部294とを備える。
表示部210は、例えば液晶パネルまたはLED(Light Emitting Diode、発光ダイオード)パネル等の表示画面を備え、各種画像を表示する。
操作入力部220は、例えばキーボードおよびマウス等の入力デバイスを備え、ユーザ操作を受け付ける。
記憶部280は、各種データを記憶する。記憶部280は、処理装置200が備える記憶でデバイスを用いて構成される。
制御部290は、処理装置200の各部を制御して、各種処理を実行する。制御部290は、処理装置200が備えるCPU(Central processing unit;中央処理装置)が、記憶部280からプログラムを読み出して実行することで構成される。
分類対象物画像取得部291は、各微化石の画像を取得する。具体的には、分類対象物画像取得部291は、撮像部140が撮像した微化石を含む画像から各微化石の画像を切り出す。
機械学習部292は、分類対象物画像取得部291が切り出した各微化石の画像のうち幾つかの画像を用いて、微化石の画像の分類を機械学習する。
具体的には、機械学習部292は、分類対象物画像取得部291が切り出した各微化石の画像のうちの幾つかを選択する。そして、選択した画像を表示部210に表示させ、操作入力部220が受け付けるユーザ操作に基づいて、画像毎(微化石毎)に分類先のクラスを特定する。このクラスは、微化石の画像の分類の正解に該当する。
微化石の画像とその画像の分類先とが組み合わされた学習用データを用いて、微化石の画像の分類を機械学習する。機械学習部292は、機械学習の結果として、微化石の画像の入力を受けて、分類先のクラス毎に、その画像がそのクラスに分類される確度(確からしさ)を出力するモデルを取得する。
機械学習部292が行う機械学習の方式は、特定の方式に限定されない。例えば、機械学習部292が、ディープラーニングなどのニューラルネットワークによる機械学習を行うようにしてもよい。あるいは、機械学習部292が、ベイズ線形回帰による機械学習を行うようにしてもよい。
分類部293は、分類対象物画像取得部291が切り出した各微化石の画像を、機械学習結果を用いて分類する。具体的には、分類部293は、分類対象物画像取得部291が切り出した各微化石の画像をモデルに入力して、分類先のクラス毎に、その画像がそのクラスに分類される確度を算出する。
あるいは、学習用データに用いられた画像については既に分類先のクラスが確定しているので、分類部293が、分類対象物画像取得部291が切り出した各微化石の画像のうち、学習用データに用いられた画像以外の画像を、機械学習結果を用いて分類するようにしてもよい。
指示部294は、撮像・配置装置100の各部を制御する。
具体的には、指示部294は、電動ステージ121および可動部112を制御してトレイ130と撮像部140との相対的な位置合わせを行い、撮像部140に撮像を行わせる。指示部294は、電動ステージ121を制御してトレイ130を水平方向に移動させ、撮像部140に撮像を行わせることを繰り返すことで、撮像部140にトレイ130の上面全体を撮像させる。
また、指示部294は、電動ステージ121を制御してトレイ130を水平方向に移動させて、移動対象の微化石をノズル151の先端付近に位置させる。そして、指示部294は、圧縮機170および吸引ロボット150を制御して、上記のように移動対象の微化石をノズル151の先端に吸着させて持ち上げさせる。指示部294は、電動ステージ121を制御してトレイ130を水平方向に移動させて、トレイ130上での微化石の移動先の位置をノズル151の先端付近に持ってくる。指示部294は、圧縮機170および吸引ロボット150を制御して、上記のように微化石を、トレイ130上での移動先の位置に落下させる。
処理装置200が、1つのコンピュータを用いて構成されていてもよい。あるいは、機械学習部292および分類部293と指示部294とが別々のコンピュータを用いて構成されるなど、処理装置200が複数のコンピュータを用いて構成されていてもよい。
分類部293が、さらに、微化石の分類先のクラスを特定するようにしてもよい。
例えば、1つの微化石(分類対象になっている微化石)について、式(1)を満たす微化石の種類が1つのみ存在する(num(Vrs)=1)場合、分類部293が、その微化石を、その微化石の種類に分類するようにしてもよい。
Figure 0007132553000001
“r”は、微化石を特定する識別番号を示す。“s”は、微化石の種類を特定する識別番号を示す。“Vrs”は、“r”によって識別される微化石(分類対象になっている微化石)が、“s”によって特定される微化石の種類に分類される確度を示す。“Vrs”は、学習結果のモデルの出力として得られる。
“C”は正の定数の係数である。“C”を許容係数と称する。
“σr”は、式(2)のように示される。
Figure 0007132553000002
“n”(nはn≧1の整数)は、微化石の種類の個数を示す。すなわち、“n”は、微化石の分類先のクラスの数を示す。
“μ”は、“r”によって識別される微化石が各クラスに分類される確度の平均を示し、式(3)のように示される。
Figure 0007132553000003
図6は、式(1)の基準に基づく分類の例を示す図である。図6では、粒子a、b、c、dの4つの試料それぞれについて、微化石A、B、C、Dの各々への分類の確度Vrsと、確度の平均に標準偏差(SD)を加えた値とが示されている。粒子a、b、c、dは、それぞれ微化石の例に該当する、微化石A、B、C、Dは、それぞれ微化石の種類の例に該当する。
図6の例で、粒子aについて式(1)を満たす確度Vrsは、微化石Cへの分類の確度の0.80のみである。そこで、分類部293は、粒子aを微化石Cに分類する。
粒子bの場合、微化石Aへの分類の確度Vrsは0.98、微化石Dへの分類の確度Vrsは0.80であり、何れも式(1)を満たす。この場合、式(1)を満たす確度Vrsが複数あるので、分類部293は、粒子bを何れの微化石の種類へも分類しない。
粒子cについて式(1)を満たす確度Vrsは、微化石Cへの分類の確度の0.60のみである。そこで、分類部293は、粒子cを微化石Cに分類する。
粒子dの場合、微化石Bへの分類の確度Vrsは0.98、微化石Cへの分類の確度Vrsは0.90であり、何れも式(1)を満たす。この場合、式(1)を満たす確度Vrsが複数あるので、分類部293は、粒子dを何れの微化石の種類へも分類しない。
上記の例の場合、粒子b、dを特定の微化石の種類に分類できなかったことを示す未分類というクラスに分類してもよい。
このように、分類部293は、式(1)を用いて微化石を分類することで、特定の微化石の種類への分類の確度が他の微化石の種類への分類の確度よりも特に大きい場合のみ、微化石を特定の微化石の種類に分類する。この点で、分類部293が、特定の微化石の種類への分類の信頼性が他の微化石の種類への分類の信頼性よりも特に大きい場合のみ、微化石を特定の微化石の種類に分類するようにすることができる。
上述した式(1)は、分類部293が、分類対象の分類対象物があるクラスに分類される確度が、他のクラスに分類される確度よりも所定の条件以上に高い場合のみ、その分類対象物を何れかのクラスに分類するための、所定の条件の例に該当する。また、上述した式(1)は、分類部293が、分類対象の分類対象物があるクラスに分類される確度が、他のクラスに分類される確度よりも所定の条件以上に高い場合のみ、その分類対象物をそのあるクラスに分類するための、所定の条件の例に該当する。
あるいは、分類部293が、式(4)が成立する場合に、微化石を確度Vrsが最大の微化石の種類に分類し、式(4)が成立しない場合は、微化石を特定の微化石の種類に分類しないようにしてもよい。
Figure 0007132553000004
“C”(iは、i≧1の整数)は、各順位の重みを示す正の定数である。従って、“C”は、第1位の重みを示す。“C”は、第2位の重みを示す。例えば、“C”、“C”共に値を2に設定する。
“maxs-1rs”は、微化石の種類毎の確度Vrsのうち、2番目に大きい確度を示す。
微化石の種類毎の確度Vrsのうち最大のものの値は、式(5)の右辺のように示される。
Figure 0007132553000005
確度Vを、“r”によって識別される微化石(分類対象になっている微化石)の分類の確度と称する。
図7は、式(4)の基準に基づく分類の例を示す図である。図7では、粒子a、b、c、dの4つの試料それぞれについて、微化石A、B、C、Dの各々への分類の確度Vrsと、式(4)の左辺、右辺それぞれの値とが示されている。粒子a、b、c、dは、それぞれ微化石の例に該当する、微化石A、B、C、Dは、それぞれ微化石の種類の例に該当する。
図7の例で、粒子aおよびcについては、何れも式(4)が成立している。粒子aの場合、分類部293は、確度Vrsが最大値0.80をとる微化石Cに分類する。粒子cの場合、分類部293は、確度Vrsが最大値0.60をとる微化石Cに分類する。
一方、粒子bおよびdについては、何れも式(4)が成立していない。そこで、分類部293は、粒子b、dについては、特定の微化石の種類への分類を行わない。この場合、粒子b、dを特定の微化石の種類に分類できなかったことを示す未分類というクラスに分類してもよい。
このように、分類部293は、式(4)を用いて微化石を分類することで、特定の微化石の種類への分類の確度が他の微化石の種類への分類の確度よりも特に大きい場合のみ、微化石を特定の微化石の種類に分類する。この点で、分類部293が、特定の微化石の種類への分類の信頼性が他の微化石の種類への分類の信頼性よりも特に大きい場合のみ、微化石を特定の微化石の種類に分類するようにすることができる。
上述した式(4)は、分類部293が、分類対象の分類対象物があるクラスに分類される確度が、他のクラスに分類される確度よりも所定の条件以上に高い場合のみ、その分類対象物を何れかのクラスに分類するための、所定の条件の例に該当する。
あるいは、分類部293が、式(6)が成立する場合に、微化石を確度Vrsが最大の微化石の種類に分類し、式(6)が成立しない場合は、微化石を特定の微化石の種類に分類しないようにしてもよい。
Figure 0007132553000006
式(6)では、“C”は、確度の許容の閾値を示す正の定数である。例えば、定数Cを0.6に設定する。
図8は、式(6)の基準に基づく分類の例を示す図である。図8では、粒子a、b、c、dの4つの試料それぞれについて、微化石A、B、C、Dの各々への分類の確度Vrsと、正規化後の確度とが示されている。粒子a、b、c、dは、それぞれ微化石の例に該当する、微化石A、B、C、Dは、それぞれ微化石の種類の例に該当する。
ここでの正規化は、確度の合計が1になるように、確度Vrsを確度の合計で除算することである。正規化後の確度は、式(6)の右辺のように、“Vrs/(Σrs)”と表される。
図8の例では、定数Cの値は0.6に設定されている。粒子aについて、微化石Cの正規化後の確度の値0.73は、0.6よりも大きくなっている。そこで、分類部293は、粒子aを微化石Cに分類する。
また、粒子cについて、微化石Cの正規化後の確度の値0.67は、0.6よりも大きくなっている。そこで、分類部293は、粒子cを微化石Cに分類する。
一方、粒子bおよびdについては、いずれも、正規化後の確度が定数C以下になっている。このため、粒子b、dについては、分類部293は、特定の微化石の種類への分類を行わない。この場合、粒子b、dを特定の微化石の種類に分類できなかったことを示す未分類というクラスに分類してもよい。
このように、分類部293は、式(6)を用いて微化石を分類することで、特定の微化石の種類への分類の確度が他の微化石の種類への分類の確度よりも特に大きい場合のみ、微化石を特定の微化石の種類に分類する。この点で、分類部293が、特定の微化石の種類への分類の信頼性が他の微化石の種類への分類の信頼性よりも特に大きい場合のみ、微化石を特定の微化石の種類に分類するようにすることができる。
上述した式(6)は、分類部293が、分類対象の分類対象物があるクラスに分類される確度が、他のクラスに分類される確度よりも所定の条件以上に高い場合のみ、その分類対象物を何れかのクラスに分類するための、所定の条件の例に該当する。
あるいは、分類部293が、試料全体の組成比率を算出するようにしてもよい。ここでいう組成比率は、試料に含まれる微化石が各クラスに分類される、クラス毎の比率である。
例えば、分類部293は、まず、式(7)に基づいてVを算出する。
Figure 0007132553000007
“V”は、”s”によって特定されるクラスにおける、各微化石がそのクラスに分類される確度を正規化した値の合計を示す。分類部293は、このVを式(8)のように正規化して組成比率を算出する。
Figure 0007132553000008
“V’”は、“s”によって特定されるクラスの組成比率を示す。
分類部293が、式(7)での加算の前にフィルタを入れて、値の小さい確度を組成比率に組み込まないようにするか、あるいは、値の小さい確度の影響を小さくしてもよい。
例えば、分類部293が、“Vrs”に代えて式(9)の“Vrsn”を用いるようにしてもよい。
Figure 0007132553000009
式(9)のように“Vrs”を2乗することで、確度が低いものの影響が小さくなる。
図9は、分類部293が、式(7)および(8)を用いて算出する組成比率の例を示す図である。図9では、粒子a、b、c、dの4つの試料それぞれについて、微化石A、B、C、Dの各々への分類の確度Vrsが示されている。粒子a、b、c、dは、それぞれ微化石の例に該当する、微化石A、B、C、Dは、それぞれ微化石の種類の例に該当する。
図9に示す確度Vrsは、図8の例の場合と同じである。従って、正規化後の確度は、図8に示される正規化後の確度のようになる。
図9の例で、分類部293は、式(7)に基づいて微化石の種類毎に正規化後の確度を合計し確度Vを算出する。分類部293は、微化石Aの確度Vを0.62、微化石Bの確度Vを0.77、微化石Cの確度Vを2.00、微化石Dの確度Vを0.63と算出する。分類部293は、これらの値を正規化して、図9に示されるように、微化石Aの組成比率V’を0.15、微化石Bの組成比率V’を0.19、微化石Cの組成比率V’を0.50、微化石Dの組成比率V’を0.16と算出する。
あるいは、分類部293が、全ての微化石を何れかの微化石の種類に分類するようにしてもよい。例えば、分類部293は、上述した式(5)に基づいて、微化石の種類毎の確度Vrsのうち最大の確度Vを求める。そして、分類部293は、式(10)が成立する場合に、微化石を確度Vrsが最大の微化石の種類に分類し、式(10)が成立しない場合は、微化石を特定の微化石の種類に分類しない。
Figure 0007132553000010
式(10)における“C”は、確度Vの閾値として用いられる正の定数である。式(10)における“C”を、確度許容定数と称する。
図10は、式(10)に基づく分類の例を示す図である。図10では、粒子a、b、c、dの4つの試料それぞれについて、微化石A、B、C、Dの各々への分類の確度Vrsが示されている。粒子a、b、c、dは、それぞれ微化石の例に該当する、微化石A、B、C、Dは、それぞれ微化石の種類の例に該当する。
確度許容定数Cの値が0.95に設定されている場合、式(10)を満たすのは、粒子bが微化石Aに分類される確度の0.98と、粒子dが微化石Bに分類される確度の0.98との2つである。この場合、分類部293は、粒子bを微化石Aに分類し、粒子dを微化石Bに分類する。
一方、確度許容定数Cの値が0に設定されている場合、分類部293は、全ての微化石を確度Vrsが最大の微化石の種類に分類する。図10の例では、分類部293は、粒子aを微化石Cに分類し、粒子bを微化石Aに分類し、粒子cを微化石Cに分類し、粒子dを微化石Bに分類する。
このように、分類部293が式(10)に基づいて分類を行う場合、確度許容定数Cの値を調整することで、微化石が微化石の種類に分類される程度を調整できる。特に、確度許容定数Cの値を0にすることで、分類部293が、全ての微化石を確度Vrsが最大の微化石の種類に分類するようにすることができる。
次に、図11~13を参照して、分類装置1の動作について説明する。
図11は、分類装置1の処理手順の例を示すフローチャートである。分類装置1は、トレイ130に微化石が用意された状態で、処理開始を指示するユーザ操作を受けると、図11の処理を開始する。
図11の処理で、撮像装置142は、処理装置200の制御に従って、微化石を含む画像を撮像する(ステップS111)。分類対象物画像取得部291は、撮像装置142が撮像した画像から、各微化石の画像を切り出す(ステップS112)。
そして、機械学習部292は、得られた画像のうち一部の画像を用いて学習用データを生成する(ステップS113)。
機械学習部292は、得られた学習用データを用いて機械学習を行う(ステップS114)。
分類部293は、ステップS111で得られた各微化石の画像を機械学習の結果に基づいて分類する(ステップS115)。
分類装置1は、トレイ130内の微化石を分類結果に基づいて並び替える(ステップS116)。
図12は、分類装置1による微化石の並び替えの例を示す図である。図2の例では、分類装置1は、微化石を微化石の種類毎に図12の横方向に整列させている。このように、分類装置1が微化石の並び替えを行うことで、ユーザが、微化石を微化石の種類毎に取り出し易くなる。未分類のクラスの微化石は、種類毎に微化石が並べられている列とは別の列に並べてもよい。
ステップS116の後、分類装置1は、図11の処理を終了する。
図13は、分類装置1が学習用データを生成する処理手順の例を示すフローチャートである。分類装置1は、図11のステップS113で、図13の処理を行う。
図13の処理で、機械学習部292は、図11のステップS111で得られた各試料の画像のうちいずれか1つを、処理対象の画像として選択する(ステップS211)。機械学習部292が処理対象の画像を選択する方法は、特定の方法に限定されない。例えば、機械学習部292が、トレイ130での試料の配列に従って、1つずつ順番に試料の画像を選択するようにしてもよい。あるいは、表示部210が各試料の画像を表示して操作入力部220が画像を選択するユーザ操作を受け付け、機械学習部292が、ユーザ操作に従って画像を選択するようにしてもよい。
次に、機械学習部292は、選択した画像の粒子境界を検出する(ステップS212)。すなわち、機械学習部292は、選択した画像における試料の輪郭を検出する。
次に、機械学習部292は、処理対象の画像の分類結果を示す分類結果情報を取得する(ステップS213)。例えば、表示部210が処理対象の画像を表示し、操作入力部220が、ユーザによる分類結果の入力を受け付けるようにしてもよい。そして、機械学習部292が、ユーザによる分類結果の情報を取得するようにしてもよい。
そして、機械学習部292は、処理対象の画像と、その画像の分類結果情報とを組み合わせた学習用データを生成する(ステップS214)。
そして、機械学習部292は、学習用データの個数が予定された個数に到達したか否かを判定する(ステップS215)。
学習用データの個数が予定された個数に到達していないと機械学習部292が判定した場合(ステップS215:NO)、処理がステップS211へ戻る。
一方、学習用データの個数が予定された個数に到達したと機械学習部292が判定した場合(ステップS215:YES)、分類装置1は、図13の処理を終了する。
図14は、分類装置1が微化石の並び替えを行う処理手順の例を示すフローチャートである。分類装置1は、図11のステップS116で、図14の処理を行う。
図14の処理で、指示部294は、微化石の分類結果に基づいて並び替え対象の微化石を選択し、並び替え先の位置を決定する(ステップS311)。
次に、電動ステージ121が指示部294の制御に従って、並び替え対象の微化石がノズル151の先端付近に来る位置までトレイ130を水平に移動させる(ステップS312)。
そして、吸引ロボット150が並び替え対象の微化石をノズル151の先端に保持する(ステップS313)。具体的には、圧縮機170が指示部294の制御に従って空気を吸引することで、並び替え対象の微化石をノズル151の先端に吸着させる。そして、吸引ロボット150は、ノズル151の先端を持ち上げる。
電動ステージ121は、指示部294の制御に従って、トレイ130上の並び替え先の位置がノズル151の先端付近に来るようにトレイ130を水平に移動させる(ステップS314)。
そして、吸引ロボット150は、指示部294の制御に従って、並び替え対象の微化石を、並び替え先の位置に配置する(ステップS315)。具体的には、上記のように吸引ロボット150がノズル151の先端を下げ、圧縮機170が空気の吸引を中止することで、並び替え対象の微化石を並び替え先の位置に落とす。
指示部294は、並び替えの対象となっている全ての微化石を並び替えたか否かを判定する(ステップS316)。
まだ、並び替えていない微化石があると指示部294が判定した場合(ステップS316:NO)、処理がステップS311へ遷移する。
一方、全ての並び替えの対象となっている全ての微化石を並び替えたと指示部294が判定した場合(ステップS316:YES)、分類装置1は、図14の処理を終了する。
以上のように、撮像部140は、トレイに設けられた複数の穴に1つずつ配置された粒子状の分類対象物を含む画像を撮像する。分類対象物画像取得部291は、分類対象物を含む画像から各分類対象物の画像を切り出す。電動ステージ121、トレイ130、吸引ロボット150、チューブ160および圧縮機170の組み合わせは、得られた分類対象物の画像を、機械学習結果を用いて分類した分類結果に基づいて分類対象物の並び替えを行う。
このように、分類装置1では、機械学習結果を用いて分類対象物の画像を分類して並び替えることで、分類および並び替えを自動的に行うことができる。分類装置1によれば、この点で、微細粒子を分類するときの人の負担が比較的小さくて済む。
また、撮像部140は、トレイに設けられた複数の穴に1つずつ配置された粒子状の分類対象物を含む画像を撮像する。分類対象物画像取得部291は、分類対象物を含む画像から各分類対象物の画像を切り出す。分類部293は、得られた分類対象物の画像を、機械学習結果を用いて分類する。
このように、分類装置1では、機械学習結果を用いて分類対象物の画像を分類することで、分類を自動的に行うことができる。分類装置1によれば、この点で、微細粒子を分類するときの人の負担が比較的小さくて済む。
また、分類部293は、機械学習結果を用いて、分類対象物の分類先のクラス毎に、その分類対象物がそのクラスに分類される確度を算出する。
分類装置1によれば、ユーザは、確度を称することで分類対象物があるクラスに分類される確からしさを把握できる。
また、分類部293は、分類対象の分類対象物があるクラスに分類される確度が、他のクラスに分類される確度よりも所定の条件以上に高い場合のみ、その分類対象物を何れかのクラスに分類する。
分類対象の分類対象物があるクラスに分類される確度が、他のクラスに分類される確度よりも所定の条件以上に高い場合、分類対象物がそのクラスに分類される蓋然性が高いと考えられる。分類装置1によればこの点で、分類対象物の分類を高精度に行うことができる。
また、分類部293は、分類対象物がクラスに分類される確度に基づいて、複数の分類対象物全体におけるクラス毎の組成比率を算出する。
分類装置1によれば、ユーザは、分類対象物全体における組成比率を知ることができる。
また、電動ステージ121、トレイ130、吸引ロボット150、チューブ160および圧縮機170の組み合わせは、分類対象物の分類結果に基づいて分類対象物の並び替えを行う。
これにより、ユーザが、分類対象物をクラス毎に取り出し易くなる。
次に、図15および16を参照して、本発明の実施形態の構成例について説明する。
図15は、実施形態に係る分類装置の構成の例を示す図である。図15に示す構成で、分類装置310は、撮像部311と、分類対象物画像取得部312と並び替え部313と、を備える。
かかる構成にて、撮像部311は、トレイに設けられた複数の穴に1つずつ配置された粒子状の分類対象物を含む画像を撮像する。分類対象物画像取得部312は、分類対象物を含む画像から各分類対象物の画像を切り出す。並び替え部313は、得られた分類対象物の画像を、機械学習結果を用いて分類した分類結果に基づいて分類対象物の並び替えを行う。
このように、分類装置310では、機械学習結果を用いて分類対象物の画像を分類して並び替えることで、分類および並び替えを自動的に行うことができる。分類装置310によれば、この点で、微細粒子を分類するときの人の負担が比較的小さくて済む。
図16は、実施形態に係る分類装置の構成のもう1つの例を示す図である。図16に示す構成で、分類装置320は、撮像部321と、分類対象物画像取得部322と分類部323と、を備える。
かかる構成にて、撮像部321は、トレイに設けられた複数の穴に1つずつ配置された粒子状の分類対象物を含む画像を撮像する。分類対象物画像取得部322は、分類対象物を含む画像から各分類対象物の画像を切り出す。分類部323は、得られた分類対象物の画像を、機械学習結果を用いて分類する。
このように、分類装置320では、機械学習結果を用いて分類対象物の画像を分類することで、分類を自動的に行うことができる。分類装置320によれば、この点で、微細粒子を分類するときの人の負担が比較的小さくて済む。
上記のように、処理装置200は、コンピュータを用いて構成される。処理装置200が行う処理の全部または一部を実行するためのプログラムをコンピュータ読み取り可能な記録媒体に記録して、この記録媒体に記録されたプログラムをコンピュータシステムに読み込ませ、実行することにより各部の処理を行ってもよい。なお、ここでいう「コンピュータシステム」とは、OSや周辺機器等のハードウェアを含むものとする。
また、「コンピュータ読み取り可能な記録媒体」とは、フレキシブルディスク、光磁気ディスク、ROM、CD-ROM等の可搬媒体、コンピュータシステムに内蔵されるハードディスク等の記憶装置のことをいう。また上記プログラムは、前述した機能の一部を実現するためのものであっても良く、さらに前述した機能をコンピュータシステムにすでに記録されているプログラムとの組み合わせで実現できるものであっても良い。
以上、この発明の実施形態について図面を参照して詳述してきたが、具体的な構成はこの実施形態に限られるものではなく、この発明の要旨を逸脱しない範囲の設計等も含まれる。
この出願は、2018年8月31日に出願された日本国特願2018-163981を基礎とする優先権を主張し、その開示の全てをここに取り込む。
本発明は、画像処理装置、画像処理方法および記録媒体に適用してもよい。
1、310、320 分類装置
100 撮像・配置装置
111 支柱
112 可動部
120 載置台
121 電動ステージ
130 トレイ
140、311、321 撮像部
141 顕微鏡
142 撮像装置
150 吸引ロボット
151 ノズル
160 チューブ
170 圧縮機
200 処理装置
210 表示部
220 操作入力部
280 記憶部
290 制御部
291、312、322 分類対象物画像取得部
292 機械学習部
293、323 分類部
294 指示部
313 並び替え部

Claims (8)

  1. トレイに設けられた複数の穴に1つずつ配置された粒子状の複数の分類対象物を撮影して、前記複数の分類対象物を含む画像を得る撮像部と、
    得られた前記画像を切り出すことにより、前記複数の分類対象物毎の画像を得る取得部と、
    得られた前記複数の分類対象物毎の画像を機械学習結果を用いて分類し、その分類結果に基づいて前記複数の分類対象物を並び替える並び替え部であって、前記複数の分類対象物のうちの一つの分類対象物が分類されるクラス毎の確度のうち最大の確度を、全てのクラスについての確度の合計から減算した差の2乗が、その分類対象物の前記クラス毎の確度のうち最大の確度を、全てのクラスについての確度の合計に第1の重み係数を乗算した値から減算した差の2乗と、その分類対象物の前記クラス毎の確度のうち2番目に大きい確度を、全てのクラスについての確度の合計に第2の重み係数を乗算した値から減算した差の2乗との合計よりも小さい場合のみ、その分類対象物を前記確度が最大のクラスに分類する並び替え部と、
    を備える分類装置。
  2. トレイに設けられた複数の穴に1つずつ配置された粒子状の複数の分類対象物を撮影して、前記複数の分類対象物を含む画像を取得する撮像部と、
    得られた前記画像を切り出すことにより、前記複数の分類対象物毎の画像を得る取得部と、
    得られた前記複数の分類対象物毎の画像を機械学習結果を用いて分類する分類部であって、前記複数の分類対象物のうちの一つの分類対象物について、その分類対象物が分類されるクラス毎の確度のうち最大の確度を、全てのクラスについての確度の合計から減算した差の2乗が、その分類対象物の前記クラス毎の確度のうち最大の確度を、全てのクラスについての確度の合計に第1の重み係数を乗算した値から減算した差の2乗と、その分類対象物の前記クラス毎の確度のうち2番目に大きい確度を、全てのクラスについての確度の合計に第2の重み係数を乗算した値から減算した差の2乗との合計よりも小さい場合のみ、その分類対象物を前記確度が最大のクラスに分類する分類部と、
    を備える分類装置。
  3. 前記分類部は、前記機械学習結果を用いて、それぞれ別の分類に対応する複数のクラス毎に、かつ、前記複数の分類対象物毎に、その分類対象物がそのクラスに分類される確度を算出する、
    請求項に記載の分類装置。
  4. 前記分類部は、前記複数のクラス毎および前記複数の分類対象物毎の前記確度に基づいて、前記複数のクラス毎に、前記複数の分類対象物全体の組成比率を算出する、
    請求項に記載の分類装置。
  5. トレイに設けられた複数の穴に1つずつ配置された粒子状の複数の分類対象物を撮影して、前記複数の分類対象物を含む画像を得ることと、
    得られた前記画像を切り出すことにより、前記複数の分類対象物毎の画像を得ることと、
    得られた前記複数の分類対象物毎の画像を、機械学習結果を用いて分類する際に、前記複数の分類対象物のうちの一つの分類対象物が分類されるクラス毎の確度のうち最大の確度を、全てのクラスについての確度の合計から減算した差の2乗が、その分類対象物の前記クラス毎の確度のうち最大の確度を、全てのクラスについての確度の合計に第1の重み係数を乗算した値から減算した差の2乗と、その分類対象物の前記クラス毎の確度のうち2番目に大きい確度を、全てのクラスについての確度の合計に第2の重み係数を乗算した値から減算した差の2乗との合計よりも小さい場合のみ、その分類対象物を前記確度が最大のクラスに分類することと、
    分類結果に基づいて前記複数の分類対象物を並び替えることと、
    を含む分類方法。
  6. トレイに設けられた複数の穴に1つずつ配置された粒子状の複数の分類対象物を撮影して、前記複数の分類対象物を含む画像を得ることと、
    得られた前記画像を切り出すことにより、前記複数の分類対象物毎の画像を得ることと、
    得られた前記複数の分類対象物毎の画像を、機械学習結果を用いて分類する際に、前記複数の分類対象物のうちの一つの分類対象物が分類されるクラス毎の確度のうち最大の確度を、全てのクラスについての確度の合計から減算した差の2乗が、その分類対象物の前記クラス毎の確度のうち最大の確度を、全てのクラスについての確度の合計に第1の重み係数を乗算した値から減算した差の2乗と、その分類対象物の前記クラス毎の確度のうち2番目に大きい確度を、全てのクラスについての確度の合計に第2の重み係数を乗算した値から減算した差の2乗との合計よりも小さい場合のみ、その分類対象物を前記確度が最大のクラスに分類することと、
    を含む分類方法。
  7. コンピュータに、
    トレイに設けられた複数の穴に1つずつ配置された粒子状の複数の分類対象物を撮影して、前記複数の分類対象物を含む画像を得ることと、
    得られた前記画像を切り出すことにより、前記複数の分類対象物毎の画像を得ることと、
    得られた前記複数の分類対象物毎の画像を、機械学習結果を用いて分類する際に、前記複数の分類対象物のうちの一つの分類対象物が分類されるクラス毎の確度のうち最大の確度を、全てのクラスについての確度の合計から減算した差の2乗が、その分類対象物の前記クラス毎の確度のうち最大の確度を、全てのクラスについての確度の合計に第1の重み係数を乗算した値から減算した差の2乗と、その分類対象物の前記クラス毎の確度のうち2番目に大きい確度を、全てのクラスについての確度の合計に第2の重み係数を乗算した値から減算した差の2乗との合計よりも小さい場合のみ、その分類対象物を前記確度が最大のクラスに分類することと、
    分類結果に基づいて前記複数の分類対象物を並び替えることと、
    を実行させるためのプログラム。
  8. コンピュータに、
    トレイに設けられた複数の穴に1つずつ配置された粒子状の複数の分類対象物を撮影して、前記複数の分類対象物を含む画像を得ることと、
    得られた前記画像を切り出すことにより、前記複数の分類対象物毎の画像を得ることと、
    得られた前記複数の分類対象物毎の画像を、機械学習結果を用いて分類する際に、前記複数の分類対象物のうちの一つの分類対象物が分類されるクラス毎の確度のうち最大の確度を、全てのクラスについての確度の合計から減算した差の2乗が、その分類対象物の前記クラス毎の確度のうち最大の確度を、全てのクラスについての確度の合計に第1の重み係数を乗算した値から減算した差の2乗と、その分類対象物の前記クラス毎の確度のうち2番目に大きい確度を、全てのクラスについての確度の合計に第2の重み係数を乗算した値から減算した差の2乗との合計よりも小さい場合のみ、その分類対象物を前記確度が最大のクラスに分類することと、
    を実行させるためのプログラム。
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