JP7113815B2 - リシンジンジパインのケトン阻害剤 - Google Patents

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ロバート エー. ジュニア ガレモ,
スティーブン エス. ドミニー,
キャシー シー. リンチ,
レスリー ジェイ. ホルシンガー,
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Description

関連出願の引用
本出願は、2016年9月16日に出願された米国仮特許出願第62/395,938号および2017年2月15日に出願された米国仮特許出願第62/459,456号に対する優先権を主張し、これらの出願の全体が参照により本明細書に組み込まれている。
背景
細菌のPorphyromonas gingivalisによる感染は、歯周病、アルツハイマー病および他の脳障害、心血管疾患、糖尿病、がん、肝疾患、腎疾患、早産、関節炎、肺炎および他の障害の発症にリンクしている。P.gingivalisは、口腔に感染し、冠状動脈、大動脈、胎盤組織、脳、腎臓および肝臓に全身的に移動することが知られている非糖分解性嫌気性グラム陰性桿菌である。この細菌はまた、がん組織でも特定されており、ジンジパインが不死化および転移を引き起こすことができる機構が提唱されている。Gandhimadhiら、Journal of Indian Society of Periodontology.2010年、14巻(2号):114~120頁;Liaoら、Med Hypotheses,2009年、72巻(6号):732~5頁;Byrneら、Oral Microbiol Immunol,2009年、24巻(6号):469~77頁;Mahindraら、J Maxillofac Oral Surg,2009年、8巻(2号):108~13頁;Stelzelら、J Periodontol,2002年、73巻(8号):868~70頁;Katzら、Journal of Dental Research,2009年、88巻(6号):575~578頁;Pooleら、J Alzheimers Dis,2015年、43巻(1号):67~80頁;Ishikawaら、Biochim Biophys Acta,2013年、1832巻(12号):2035~2043頁;Inabaら、Cellular Microbiology,2014年、16巻(1号):131~145頁を参照されたい。
P.gingivalisは、アルギニンジンジパインA(RgpA)、アルギニンジンジパインB(RgpB)およびリシンジンジパイン(Kgp)を含めた、ジンジパインと呼ばれるプロテアーゼを産生する。ジンジパインは、その生存および毒性を含めた、生物の多くの機能に寄与している。ジンジパインは、分泌されて、P.gingivalisの外側膜表面に輸送され得るか、またはこの細菌により、外膜小胞中に放出され得る。ジンジパインは、幅広い範囲のタンパク質(例えば、免疫グロブリン、プロテイナーゼ阻害剤、アクチンおよびコラーゲン)を分解し(これは、多くのタイプの細胞中で細胞骨格の崩壊およびアポトーシスをもたらし得る)、そしてジンジパインの阻害は、P.gingivalis誘導性細胞死を予防することが見出されている。Travisら、Adv Exp Med Biol、2000年、477巻:455~65頁;Sheetsら、Infect Immun、2005年、73巻(3号):1543~52頁;Sheetsら、Infect Immun、2006年、74巻(10号):5667~78頁;Stathopoulouら、BMC Microbiol、2009年、9巻:107頁を参照されたい。ジンジパイン活性を阻害するため、ならびにジンジパイン活性およびP.gingivalis感染に関連する疾患を処置するための新規化合物が必要とされている。さらに、P.gingivalisに感染した対象を有効に診断するため、新規治療剤を特定するため、およびジンジパイン媒介性疾患を処置するための新規方法を開発するために、ジンジパイン活性の検出および定量のための化合物が必要とされている。本発明は、これらの必要性に対処するものである。
Gandhimadhiら、Journal of Indian Society of Periodontology.2010年、14巻(2号):114~120頁 Liaoら、Med Hypotheses,2009年、72巻(6号):732~5頁 Byrneら、Oral Microbiol Immunol,2009年、24巻(6号):469~77頁 Mahindraら、J Maxillofac Oral Surg,2009年、8巻(2号):108~13頁 Stelzelら、J Periodontol,2002年、73巻(8号):868~70頁 Katzら、Journal of Dental Research,2009年、88巻(6号):575~578頁 Pooleら、J Alzheimers Dis,2015年、43巻(1号):67~80頁 Ishikawaら、Biochim Biophys Acta,2013年、1832巻(12号):2035~2043頁 Inabaら、Cellular Microbiology,2014年、16巻(1号):131~145頁 Travisら、Adv Exp Med Biol、2000年、477巻:455~65頁 Sheetsら、Infect Immun、2005年、73巻(3号):1543~52頁 Sheetsら、Infect Immun、2006年、74巻(10号):5667~78頁 Stathopoulouら、BMC Microbiol、2009年、9巻:107頁
発明の簡単な要旨
第1の実施形態では、本発明は、式I:
Figure 0007113815000001
による化合物またはその薬学的に許容される塩[式中、
Aは、-CH-および-O-から選択され、
1aおよびR1bは、水素、C1~4アルキルおよびアミン保護基からそれぞれ独立して選択され、
2aおよびR2bは、水素、ハロゲン、C1~4ハロアルキルおよびC1~4ハロアルコキシからそれぞれ独立して選択され、
は、C3~8シクロアルキル、C3~8アルキル、3~12員のヘテロシクリル、C6~10アリール、5~12員のヘテロアリールおよびレポーター部分から選択され、Rは、1つまたは複数のR3a置換基により必要に応じて置換されており、
3aはそれぞれ、ハロゲン、-CN、-NO、-N、-OH、C1~4アルキル、C1~4ハロアルキル、C1~4アルコキシ、C1~4ハロアルコキシ、-N(R、-N(R、-(CHC(O)R、-NR(CHC(O)R、-O(CHC(O)R、-(CHCONR、-(CHNRC(O)R、-NR(CHCONR、-NR(CHNRC-(O)R、-O(CHCONRおよび-O(CHNRC(O)R、および必要に応じて置換されているトリアゾリルから独立して選択され、
はそれぞれ、C1~4アルキル、C1~4ハロアルキルおよびC1~4ジュウテロアルキルから独立して選択され、
はそれぞれ、水素およびC1~8アルキルから独立して選択され、
下付文字kはそれぞれ、0、1、2、3、4、5および6から独立して選択され、
下付文字uはそれぞれ、1、2、3、4、5および6から独立して選択され、
は、水素およびC1~4アルキルから選択され、
は、-CH5a、-CHS(O)(R5bおよびC1~6ハロアルキルから選択され、
5aは、-O-R、-S-R、-SO-R、-SO-R、-N(R、5~12員のヘテロアリールおよび3~12員のヘテロシクリルから選択され、
5~12員のヘテロアリールは、ハロゲン、C1~3アルキルおよびC1~3ハロアルキルから独立して選択される1つまたは複数のメンバーにより必要に応じて置換されており、
3~12員のヘテロシクリルは、オキソ、ハロゲン、C1~3アルキルおよびC1~3ハロアルキルから独立して選択される1つまたは複数のメンバーにより必要に応じて置換されており、
5bはそれぞれ、独立して選択されるC1~6アルキルであり、
およびRは、フェニル、C1~6アルキル、C1~6ハロアルキルおよび5~12員のヘテロアリールから選択され、
フェニルは、1~5個のハロゲンにより置換されており、
5~12員のヘテロアリールは、1つまたは複数のハロゲン、C1~3アルキルまたはC1~3ハロアルキルにより必要に応じて置換されており、
はそれぞれ、独立して選択されるC1~6アルキルであり、
は、消光部分Rを必要に応じて含み、
ただし、Rは、2,3,5,6-テトラフルオロフェノキシメチル以外であることを条件とする]
を提供する。
関連実施形態では、本発明は、1つまたは複数の本発明の化合物および1つまたは複数の薬学的に許容される添加剤を含む医薬組成物を提供する。
別の実施形態では、本発明は、P.gingivalis感染に関連する疾患または状態を処置する方法を提供する。本方法は、有効量の本発明の化合物または組成物を、それを必要とする対象に投与するステップを含む。一部の実施形態では、脳障害(例えば、アルツハイマー病)、歯周病、糖尿病、心血管疾患、関節炎、関節リウマチ、骨関節炎、感染性関節炎、乾癬性関節炎、早産のリスク上昇、肺炎、がん、腎臓疾患、肝疾患、網膜障害および緑内障。
別の実施形態では、本発明は、レポーター部分およびジンジパイン反応性部分を含む化合物、ならびに生物学試料中のジンジパイン活性を検出する方法を提供する。本方法は、ジンジパインが化合物のジンジパイン反応性部分と反応するのに十分な条件下で、生物学試料および上記の化合物を含む混合物を形成するステップ、混合物中の化合物のレポーター部分を検出するステップ、およびレポーター部分が検出される場合にジンジパインが生物学試料中に存在していると判定するステップとを含む。
本発明の実施形態において、例えば以下の項目が提供される。
(項目1)
式I:
Figure 0007113815000002

による化合物またはその薬学的に許容される塩[式中、
Aは、-CH -および-O-からなる群から選択され、
1a およびR 1b は、水素、C 1~4 アルキルおよびアミン保護基からなる群からそれぞれ独立して選択され、
2a およびR 2b は、水素、ハロゲン、C 1~4 ハロアルキルおよびC 1~4 ハロアルコキシからなる群からそれぞれ独立して選択され、
は、C 3~8 シクロアルキル、C 3~8 アルキル、3~12員のヘテロシクリル、C 6~10 アリール、5~12員のヘテロアリールおよびレポーター部分からなる群から選択され、R は、1つまたは複数のR 3a 置換基により必要に応じて置換されており、
3a はそれぞれ、ハロゲン、-CN、-NO 、-N 、-OH、C 1~4 アルキル、C 1~4 ハロアルキル、C 1~4 アルコキシ、C 1~4 ハロアルコキシ、-N(R 、-N (R 、-(CH C(O)R 、-NR (CH C(O)R 、-O(CH C(O)R 、-(CH CONR 、-(CH NR C(O)R 、-NR (CH CONR 、-NR (CH NR C-(O)R 、-O(CH CONR および-O(CH NR C(O)R 、および必要に応じて置換されているトリアゾリルからなる群から独立して選択され、
はそれぞれ、C 1~4 アルキル、C 1~4 ハロアルキルおよびC 1~4 ジュウテロアルキルからなる群から独立して選択され、
はそれぞれ、水素およびC 1~8 アルキルからなる群から独立して選択され、
下付文字kはそれぞれ、0、1、2、3、4、5および6から独立して選択され、
下付文字uはそれぞれ、1、2、3、4、5および6から独立して選択され、
は、水素およびC 1~4 アルキルからなる群から選択され、
は、-CH 5a 、-CHS(O)(R 5b およびC 1~6 ハロアルキルからなる群から選択され、
5a は、-O-R 、-S-R 、-SO-R 、-SO -R 、-N(R 、5~12員のヘテロアリールおよび3~12員のヘテロシクリルからなる群から選択され、
5~12員のヘテロアリールは、ハロゲン、C 1~3 アルキルおよびC 1~3 ハロアルキルからなる群から独立して選択される1つまたは複数のメンバーにより必要に応じて置換されており、
3~12員のヘテロシクリルは、オキソ、ハロゲン、C 1~3 アルキルおよびC 1~3 ハロアルキルからなる群から独立して選択される1つまたは複数のメンバーにより必要に応じて置換されており、
5b はそれぞれ、独立して選択されるC 1~6 アルキルであり、
およびR は、フェニル、C 1~6 アルキル、C 1~6 ハロアルキルおよび5~12員のヘテロアリールからなる群から選択され、
フェニルは、1~5個のハロゲンにより置換されており、
5~12員のヘテロアリールは、1つまたは複数のハロゲン、C 1~3 アルキルまたはC 1~3 ハロアルキルにより必要に応じて置換されており、
はそれぞれ、独立して選択されるC 1~6 アルキルであり、
は、消光部分R を必要に応じて含み、
ただし、R は、2,3,5,6-テトラフルオロフェノキシメチル以外であることを条件とする]。
(項目2)
が、C 3~8 シクロアルキル、C 3~8 アルキル、C 6~10 アリール、5~12員のヘテロアリールおよび3~12員のヘテロシクリルからなる群から選択され、それらはそれぞれ、1つまたは複数のR 3a 置換基により必要に応じて置換されている、項目1に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
(項目3)
が、シクロペンチルおよびフェニルからなる群から選択され、それらはそれぞれ、1つまたは複数のR 3a 置換基により必要に応じて置換されている、項目1もしくは項目2に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
(項目4)
3a がそれぞれ、ハロゲン、-N 、C 1~4 アルキル、C 1~4 ハロアルキル、C 1~4 アルコキシ、C 1~4 ハロアルコキシ、-N(R 、-N (R および-NR C(O)R からなる群から独立して選択される、項目2もしくは項目3に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
(項目5)
がシクロペンチルである、項目1に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
(項目6)
が、C 1~4 アルコキシにより置換されているC 3~8 アルキルである、項目1もしくは項目2に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
(項目7)
がメトキシプロピルである、項目6に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
(項目8)
式Ia:
Figure 0007113815000003

による構造を有する、項目5に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
(項目9)
が水素である、項目8に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
(項目10)
5a が-O-フェニルであり、フェニルが、1~5個のハロゲンにより置換されている、項目9に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
(項目11)
5a 中のハロゲンがそれぞれ、FおよびClからなる群から独立して選択される、項目10に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
(項目12)
5a が、2,3,6-トリフルオロフェノキシ、2,3,5-トリフルオロフェノキシ、2,3-ジフルオロフェノキシ、2,5-ジフルオロフェノキシ、2,6-ジフルオロフェノキシ、3,5-ジフルオロフェノキシ、2-フルオロフェノキシおよび3-フルオロフェノキシからなる群から選択される、項目11に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
(項目13)
式Ia:
Figure 0007113815000004

による構造を有する、項目1から4、6および7のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
(項目14)
が水素である、項目1から4、6、7および13のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
(項目15)
5a が、-O-フェニルであり、フェニルが、1~5個のハロゲンにより置換されている、項目13もしくは項目14に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
(項目16)
5a 中のハロゲンがそれぞれ、FおよびClからなる群から独立して選択される、項目15に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
(項目17)
5a 中のハロゲンがそれぞれ、Fである、項目16に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
(項目18)
5a が、2,3,6-トリフルオロフェノキシ、2,3,5-トリフルオロフェノキシ、2,3,4-トリフルオロフェノキシ、3,4,5-トリフルオロフェノキシ、2,3-ジフルオロフェノキシ、2,4-ジフルオロフェノキシ、2,5-ジフルオロフェノキシ、2,6-ジフルオロフェノキシ、3,4-ジフルオロフェノキシ、3,5-ジフルオロフェノキシ、2-フルオロフェノキシ、3-フルオロフェノキシおよび4-フルオロフェノキシからなる群から選択される、項目1から4、6、7および13から17のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
(項目19)
5a が、2,3,6-トリフルオロフェノキシ、2,3,5-トリフルオロフェノキシ、2,3-ジフルオロフェノキシ、2,5-ジフルオロフェノキシ、2,6-ジフルオロフェノキシ、3,5-ジフルオロフェノキシ、2-フルオロフェノキシおよび3-フルオロフェノキシからなる群から選択される、項目18に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
(項目20)
5a が、2,3,6-トリフルオロフェノキシおよび2,6-ジフルオロフェノキシからなる群から選択される、項目18に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
(項目21)
が-CH 5a であり、R 5a が-O-R であり、R がC 1~6 ハロアルキルである、項目13もしくは項目14に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
(項目22)
が、トリフルオロエチルおよびヘキサフルオロプロピルからなる群から選択される、項目21に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
(項目23)
が-CH 5a であり、R 5a が、-O-R であり、R が、ハロゲンおよびC 1~3 アルキルからなる群から独立して選択される1つまたは複数のメンバーにより必要に応じて置換されている5~12員のヘテロアリールである、項目13もしくは項目14に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
(項目24)
が、イソオキサゾリルおよびピリジニルからなる群から選択される、項目23に記載の化合物。
(項目25)
5a が、-N(R 、5~12員のヘテロアリールおよび3~12員のヘテロシクリルからなる群から選択され、
5~12員のヘテロアリールが、ハロゲン、C 1~3 アルキルおよびC 1~3 ハロアルキルからなる群から独立して選択される1つまたは複数のメンバーにより必要に応じて置換されており、
3~12員のヘテロシクリルが、オキソ、ハロゲン、C 1~3 アルキルおよびC 1~3 ハロアルキルからなる群から独立して選択される1つまたは複数のメンバーにより必要に応じて置換されている、
項目13もしくは項目14に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
(項目26)
5a が、テトラゾリルおよびオキソピリミジニルからなる群から選択される、項目25に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
(項目27)
が、-CH 5a および-CHS(O)(R 5b からなる群から選択され、
5a が、-S-R および-S-(O) からなる群から選択され、
が、C 1~6 アルキル、C 1~6 ハロアルキル、5~12員のヘテロアリールおよび3~12員のヘテロシクリルからなる群から選択される、
項目13もしくは項目14に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
(項目28)
が-CH 5a であり、R 5a が、-S-R および-S-(O) からなる群から選択され、R がC 1~6 アルキルである、項目27に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
(項目29)
が-CH 5a であり、R 5a が-S-R であり、R が、5~12員のヘテロアリールおよび3~12員のヘテロシクリルからなる群から選択される、項目27に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
(項目30)
が、イソオキサゾリル、ピリジニルおよびピリミジニルからなる群から選択される、項目29に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
(項目31)
が-CHS(O)(R 5b である、項目27に記載の化合物。
(項目32)
がC 1~6 ハロアルキルである、項目13または項目14に記載の化合物。
(項目33)
がジフルオロメチルである、項目32に記載の化合物。
(項目34)
Figure 0007113815000005

Figure 0007113815000006

Figure 0007113815000007

Figure 0007113815000008

Figure 0007113815000009

からなる群から選択される、項目1に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
(項目35)
Figure 0007113815000010

Figure 0007113815000011

Figure 0007113815000012

Figure 0007113815000013

Figure 0007113815000014

からなる群から選択される、項目1に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
(項目36)
項目1から35のいずれか一項に記載の化合物またはその薬学的に許容される塩、および薬学的に許容される添加剤を含む医薬組成物。
(項目37)
P.gingivalis感染に関連する疾患または状態を処置する方法であって、それを必要とする対象に、有効量の項目1から35のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、または有効量の項目36に記載の組成物を投与するステップを含む、方法。
(項目38)
前記疾患または状態が、脳障害、歯周病、糖尿病、心血管疾患、関節炎、関節リウマチ、骨関節炎、感染性関節炎、乾癬性関節炎、早産のリスク上昇、肺炎、がん、腎臓疾患、肝疾患、網膜障害および緑内障からなる群から選択される、項目37に記載の方法。
(項目39)
前記疾患または状態が脳障害である、項目38に記載の方法。
(項目40)
前記脳障害が、アルツハイマー病、ダウン症候群、てんかん、自閉症、パーキンソン病、本態性振戦、前頭側頭型認知症、進行性核上麻痺、筋萎縮性側索硬化症、ハンチントン病、多発性硬化症、軽度認知障害、加齢関連性記憶障害、慢性外傷性脳症、脳卒中、脳血管疾患、レビー小体病、多系統萎縮症、統合失調症およびうつ病からなる群から選択される、項目39に記載の方法。
(項目41)
前記脳障害が、アルツハイマー病である、項目40に記載の方法。
(項目42)
コリンエステラーゼ阻害剤、セロトニンモジュレーター、NMDAモジュレーター、Aβ標的治療剤、ApoE標的治療剤、ミクログリア標的治療剤、血液脳関門標的治療剤、タウ標的治療剤、補体標的治療剤および抗炎症剤からなる群から選択される1つまたは複数の活性剤を前記対象に投与するステップをさらに含む、項目41に記載の方法。
(項目43)
前記疾患または状態が歯周病である、項目38に記載の方法。
(項目44)
前記疾患または状態が肝疾患である、項目38に記載の方法。
(項目45)
前記肝疾患が非アルコール性脂肪性肝炎である、項目44に記載の方法。
(項目46)
前記疾患または状態が網膜障害である、項目38に記載の方法。
(項目47)
前記網膜障害が加齢黄斑変性である、項目46に記載の方法。
(項目48)
前記疾患または状態ががんである、項目38に記載の方法。
(項目49)
前記がんが、口腔がん、乳がん、膵臓がんおよび多型性神経膠芽腫からなる群から選択される、項目48に記載の方法。
(項目50)
前記疾患または状態が、早産のリスクの上昇である、項目38に記載の方法。
(項目51)
前記疾患または状態が関節炎である、項目38に記載の方法。
(項目52)
前記関節炎が関節リウマチまたは骨関節炎である、項目51に記載の方法。
(項目53)
前記疾患または状態が心血管疾患である、項目38に記載の方法。
(項目54)
前記疾患または状態が糖尿病である、項目38に記載の方法。
(項目55)
前記化合物が、少なくとも1カ月間、前記対象に投与される、項目37から54のいずれか一項に記載の方法。
(項目56)
前記化合物が、少なくとも1年間、前記対象に投与される、項目55に記載の方法。
(項目57)
前記化合物が、少なくとも10年間、前記対象に投与される、項目55に記載の方法。
(項目58)
前記化合物が、少なくとも60年間、前記対象に投与される、項目55に記載の方法。
(項目59)
前記対象が、ヒト、イヌまたはネコである、項目37から58のいずれか一項に記載の方法。
(項目60)
前記対象がヒトである、項目59に記載の方法。
図1は、本発明のKgp阻害剤が、SH-SY5Y神経芽細胞腫細胞をP.gingivalis誘導性細胞死から保護していることを示す。
図2は、本発明のKgp阻害剤が、ヘモグロビンの破壊、およびP.gingivalisの重要な生存増強機構である鉄の獲得を阻止していることを示す。
図3は、本発明の化合物により、マウスにおける血漿中濃度の上昇がもたらされることを示す。
図4は、本発明の化合物により、マウスにおける脳中遊離体濃度の上昇がもたらされることを示す。
図5Aは、本発明の活性プローブが、細菌塗抹の特徴付けに有用であることを示す。活性プローブ15aまたは38aに曝露されたP.gingivalisの細菌塗抹は、蛍光顕微鏡観察によって検出することができる。このシグナルはKgpの存在に依存し、Kgp遺伝子をノックアウトしたP.gingivalis W83株の細菌塗抹では検出されない。
図5Bは、本発明の活性プローブが、組織の薄片の特徴付けに有用であることを示す。歯周病を有する患者に由来する歯肉組織の薄片が、Kgpに対するポリクローナル抗体である、免疫蛍光剤CAB102により染色されている。個別の連続する組織切片は、活性プローブ15aとのインキュベーション後に、蛍光シグナルを生じる。
図6Aは、P.gingivalis W83によって感染した、または感染していないヒトJurkat細胞に由来する試料を含有するSDS-PAGEゲルの蛍光画像を示す。試料は、SDS-PAGEの前に、蛍光プローブ15a、または非蛍光Kgp阻害剤化合物である73(N-[7-アミノ-2-オキソ-1-(2,3,5,6-テトラフルオロフェノキシ)ヘプタン-3-イル]シクロペンタンカルボキサミド)と反応させた。レーン1:細胞単独。レーン2:細胞+プローブ15a。レーン3:細胞+プローブ15a(P.gingivalis感染多重度(MOI):100)。レーン4:細胞+化合物73と、次にプローブ15aとの事前インキュベーション、MOI:100。レーン5:細胞+プローブ15a、MOI:10。レーン6:細胞+化合物73と、次にプローブ15aとの事前インキュベーション、MOI:10。レーン7:精製Kgp+プローブ15a。レーン8:精製Kgp+プローブ15aを含まない溶解緩衝液。
図6Bは、滴定量のP.gingivalis W83を含有するSDS-PAGEゲルの蛍光画像を示す。レーンA:10個のコロニー形成単位(CFU);レーンB:10個のCFU;レーンC:10個のCFU;レーンD:10個のCFU;レーンE:10個のCFU;レーンF:10個のCFU:10;レーンG:精製Kgp。生物学試料中のP.gingivalis感染を定量するために、滴定した蛍光データを使用することができる。
図7は、ヒト対象の口腔から得られ、活性プローブ15aと共にインキュベートし、活性プローブの結合を分析した口腔細胞の蛍光顕微鏡イメージングを示す。活性プローブ15aによる点状染色は、一部の細胞中のKgpの存在を示す。左側の画像は、この点状染色を示す一方、右側パネルにおける細胞は、プローブにより染色しておらず、P.gingivalisに感染していないと推定される細胞を示している。青色色素は、細胞核に対するDAPI染色である。
図8は、ビオチン活性プローブ51aは、後に標識Kgpをストレプトアビジンビーズに結合させるために、P.gingivalis溶解物中のKgpを共有結合により標識するために使用することができることを示す。ビーズからの放出後、標識KgpはSDS-PAGEによって解析され、ポリクローナルKgp抗体CAB102を用いてウエスタンブロットで検出された。Kgpは、この方法により回収され、少なくとも10個のCFUのP.gingivalisから検出された。レーン1:精製Kgp。レーン2:P.gingivalis W83、10個のCFU。レーン3:W83、10個のCFU。レーン4:W83、10個のCFU。レーン5:Kgpノックアウト株、10個のCFU。レーン6:プローブ51a単独。
図9Aは、プローブ化合物71とのインキュベーション後の、SDS-PAGEによる、P.gingivalis W83溶解物およびP.gingivalis Kgpノックアウト株の溶解物の可視化を示す。
図9Bは、CAB102抗体コンジュゲートビーズとの事前インキュベーションを行った、または行わなかった、プローブ化合物71とのインキュベーション後のSDS-PAGEによるP.gingivalis溶解物の可視化を示す。
図9Cは、SDS-PAGEおよびCy5シグナルの可視化による標識P.gingivalis W83溶解物の分析(上部パネル)、またはCAB102一次抗体による検出および化学発光検出によるウエスタンブロット(下部パネル)を示す。
図10は、化合物1で処置したまたは処置しなかった、P.gingivalisに感染したマウスにおける、歯槽骨量の減少を示す。
図11は、化合物1による処置時の、感染マウスの脳組織中のP.gingivalis DNAの低下を示す。
図12は、化合物1による処置時の、感染マウスの脳組織中の海馬ニューロンの喪失の低減を示す。
発明の詳細な説明
I.一般
本発明は、P.gingivalisリシンジンジパイン(Kgp)を阻害する強力な化合物を提供する。本発明は、ある種の阻害剤が、これまで公知の化合物と同等の活性も示すと同時に、カテプシンなどの内因性プロテアーゼよりもKgpに対する選択性の向上を示すという驚くべき発見に一部、基づいている。さらに、本発明の化合物は、これまでに公知の化合物に比べると、薬物動態特性の改善を実現する。本化合物は、アルツハイマー病などの加齢関連の状態を含めた、P.gingivalis感染に関連する様々な疾患において、細胞死、炎症および他の病理学的過程を予防するために使用することができる。
II.定義
本明細書で使用する場合、用語「Porphyromonas gingivalis」および「P.gingivalis」とは、歯周炎および関連状態の病因における、重要な原因微生物と認識される、非糖分解性グラム陰性菌を指す。「P.gingivalis感染」とは、歯肉または脳などの身体組織におけるP.gingivalisの侵入および定着を指す。P.gingivalis感染は、後の組織傷害および疾患を特徴とすることが多い。
本明細書で使用する場合、用語「ジンジパイン」とは、トリプシン様特異性を有するP.gingivalisによって発現される、システインプロテアーゼ(すなわち、Lys-XaaおよびArg-Xaa)を指す。ジンジパインは、P.gingivalisの主要な毒性因子として認識されており、細菌の付着および定着、栄養の獲得、宿主防御回避および組織侵入の一因となる。用語「アルギニンジンジパイン」および「Rgp」は、互換的に使用され、EC番号でEC3.4.22.37に分類される、P.gingivalisアルギニン特異的ジンジパインRgpAおよびRgpBを指す。rgpAおよびrgpB遺伝子翻訳産生物であるRgpAおよびRgpBは、カスパーゼ様プロテアーゼドメイン(Arg-Xaaペプチド結合に特異的である)、および免疫グロブリン様ドメインを共有している。RgpAでは、プロテアーゼおよび免疫グロブリン様ドメインの後に、ヘマグルチニン接着ドメインを含有する大型C末端伸長が続く。
本明細書で使用する場合、用語「アルキル」とは、単独でかまたは別の置換基の一部として、示されている数の炭素原子を有する、直鎖または分岐の飽和脂肪族ラジカルを指す。アルキルは、C1~2、C1~3、C1~4、C1~5、C1~6、C1~7、C1~8、C1~9、C1~10、C2~3、C2~4、C2~5、C2~6、C3~4、C3~5、C3~6、C4~5、C4~6およびC5~6などの、任意の数の炭素を含み得る。例えば、C1~6アルキルには、限定されないが、メチル、エチル、プロピル、イソプロピル、ブチル、イソブチル、sec-ブチル、tert-ブチル、ペンチル、イソペンチル、ヘキシルなどが含まれる。アルキルはまた、これらに限定されないが、ヘプチル、オクチル、ノニル、デシルなどの、最大20個の炭素原子を有するアルキル基を指すことができる。アルキル基は、置換され得る、または無置換であり得る。他に特定されない限り、「置換アルキル」基は、ハロ、ヒドロキシ、アミノ、アルキルアミノ、アミド、アシル、ニトロ、シアノおよびアルコキシから選択される1つまたは複数の基により置換され得る。
本明細書で使用する場合、用語「アルコキシ」とは、単独でかまたは別の置換基の一部として、式-ORを有する基を指し、Rはアルキルである。
本明細書で使用する場合、用語「シクロアルキル」とは、単独でかまたは別の置換基の一部として、3~12個の環原子、または示されている原子数を含有する、飽和または部分的に不飽和の、単環式、縮合二環式または架橋多環式環構成(assembly)を指す。シクロアルキルは、C3~6、C4~6、C5~6、C3~8、C4~8、C5~8、C6~8、C3~9、C3~10、C3~11およびC3~12などの、任意の数の炭素を含み得る。飽和の単環式シクロアルキル環には、例えば、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロヘキシルおよびシクロオクチルが含まれる。飽和の二環式および多環式シクロアルキル環には、例えば、ノルボルナン、[2.2.2]ビシクロオクタン、デカヒドロナフタレンおよびアダマンタンが含まれる。シクロアルキル基はまた、部分的に不飽和で、環中に1つまたは複数の二重または三重結合を有することもできる。部分的に不飽和である代表的なシクロアルキル基には、限定されないが、シクロブテン、シクロペンテン、シクロヘキセン、シクロヘキサジエン(1,3-および1,4-異性体)、シクロヘプテン、シクロヘプタジエン、シクロオクテン、シクロオクタジエン(1,3-、1,4-および1,5-異性体)、ノルボルネンおよびノルボルナジエンが含まれる。シクロアルキルが飽和の単環式C3~8シクロアルキルである場合、例示的な基には、限定されないが、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロヘキシル、シクロヘプチルおよびシクロオクチルが含まれる。シクロアルキルが飽和の単環式C3~6シクロアルキルである場合、例示的な基には、限定されないが、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチルおよびシクロヘキシルが含まれる。シクロアルキル基は、置換され得る、または無置換であり得る。他に特定されない限り、「置換シクロアルキル」基は、ハロ、ヒドロキシ、アミノ、アルキルアミノ、アミド、アシル、ニトロ、シアノおよびアルコキシから選択される1つまたは複数の基により置換され得る。用語「低級シクロアルキル」とは、例えば、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロヘキシルおよびシクロヘプチルを含めた、3~7個の炭素を有するシクロアルキルラジカルを指す。
本明細書で使用する場合、用語「アルキレン」とは、少なくとも2つの他の基を連結する、上で定義されている、アルキル基(すなわち、二価のアルキルラジカル)を指す。アルキレン基に連結されている2つの部分は、アルキレン基の同一炭素原子または異なる炭素原子に連結され得る。用語「シクロアルキレン」とは、少なくとも2つの他の基を連結する、上で定義されているシクロアルキル基を指す(すなわち、二価のシクロアルキルラジカル)。シクロアルキレン基に連結されている2つの部分は、シクロアルキレン基の同一炭素原子または異なる炭素原子に連結され得る。
本明細書で使用する場合、用語「アルキルチオ」とは、単独でかまたは別の置換基の一部として、式-SRを有する基を指し、Rはアルキルである。
本明細書で使用する場合、用語「ヘテロアルキル」とは、単独でかまたは別の置換基の一部として、N、OおよびSなどの、1~3個のヘテロ原子を有する、任意の適切な長さのアルキル基を指す。例えば、ヘテロアルキルは、エーテル、チオエーテルおよびアルキル-アミンを含むことができる。これらに限定されないが、B、Al、SiおよびPを含めた、追加のヘテロ原子も有用であり得る。ヘテロ原子は、酸化されて、これらに限定されないが、-S(O)-および-S(O)-などの部分を形成することができる。ヘテロアルキルのヘテロ原子の部分はアルキル基の水素原子を置きかえて、ヒドロキシ、チオまたはアミノ基を形成することができる。あるいは、ヘテロ原子の部分は、結合する原子であり得るか、または2個の炭素原子間に挟まれ得る。
本明細書で使用する場合、用語「ヘテロアルキレン」とは、少なくとも2つの他の基を連結する、上で定義されているヘテロアルキル基(すなわち、二価のヘテロアルキルラジカル)を指す。ヘテロアルキレン基に連結されている2つの部分は、ヘテロアルキレン基の同一原子または異なる原子に連結され得る。用語「ヘテロシクリレン」とは、少なくとも2つの他の基を連結する、上で定義されているシクロアルキル基(すなわち、二価のヘテロシクリルラジカル)を指す。ヘテロシクリレン基に連結されている2つの部分は、ヘテロシクリレン基の同一原子または異なる原子に連結され得る。
本明細書で使用する場合、用語「ハロ」および「ハロゲン」とは、単独でかまたは別の置換基の一部として、フッ素、塩素、臭素またはヨウ素原子を指す。
本明細書で使用する場合、用語「ハロアルキル」とは、単独でかまたは別の置換基の一部として、その水素原子のうちの一部またはすべてがハロゲン原子により置きかえられている、アルキル基を指す。アルキル基についてと同様に、ハロアルキル基は、C1~6などの任意の適切な数の炭素原子を有することができる。例えば、ハロアルキルには、トリフルオロメチル、フルオロメチルなどが含まれる。一部の場合、用語「パーフルオロ」とは、すべての水素がフッ素により置きかえられている、化合物またはラジカルを定義するために使用することができる。例えば、パーフルオロメチルとは、1,1,1-トリフルオロメチルを指す。
本明細書で使用する場合、用語「ハロアルコキシ」とは、単独でかまたは別の置換基の一部として、その水素原子のうちの一部またはすべてがハロゲン原子により置きかえられている、アルコキシ基を指す。
本明細書で使用する場合、用語「ハロシクロアルキル」とは、単独でかまたは別の置換基の一部として、その水素原子のうちの一部またはすべてがハロゲン原子により置きかえられている、シクロアルキル基を指す。
本明細書中で使用される場合、用語「ジュウテロアルキル」とは、単独でかまたは別の置換基の一部として、その水素原子のうちの一部またはすべてがジュウテリウム原子で置き換えられている、アルキル基を指す。アルキル基についてと同様に、ジュウテロアルキル基は、C1~6などの任意の適切な数の炭素原子を有し得る。一部の例では、用語「パージュウテロ」が、すべての水素がジュウテリウムで置き換えられている化合物またはラジカルを定義するために使用され得る。
本明細書で使用する場合、用語「アリール」とは、単独でかまたは別の置換基の一部として、任意の適切な数の炭素の環原子および任意の適切な数の環を有する、芳香族環系を指す。アリール基は、C、C、C、C、C10、C11、C12、C13、C14、C15またはC16、およびC6~10、C6~12、またはC6~14など、任意の適切な数の炭素の環原子を含み得る。アリール基は、単環式とすることができるか、縮合して二環式(例えば、ベンゾシクロヘキシル)もしくは三環式基を形成することができるか、または結合により連結されてビアリール基を形成することができる。代表的なアリール基には、フェニル、ナフチルおよびビフェニルが含まれる。他のアリール基には、メチレン連結基を有するベンジルが含まれる。一部のアリール基は、フェニル、ナフチルまたはビフェニルなど、6~12個の環員を有する。他のアリール基は、フェニルまたはナフチルなど、6~10個の環員を有する。一部の他のアリール基は、フェニルなど、6個の環員を有する。アリール基は、置換され得るか、または無置換であり得る。他に特定されない限り、「置換アリール」基は、ハロ、ヒドロキシ、アミノ、アルキルアミノ、アミド、アシル、ニトロ、シアノおよびアルコキシから選択される1つまたは複数の基により置換され得る。
本明細書で使用する場合、用語「アリーレン」とは、少なくとも2つの他の基を連結する、上で定義されているアリール基(すなわち、二価のアリールラジカル)を指す。
本明細書で使用する場合、用語「ヘテロアリール」とは、単独でかまたは別の置換基の一部として、5~16個の環原子を含有する、単環式または縮合二環式もしくは三環式芳香族環構成であって、1~5個の環原子が、N、OまたはSなどのヘテロ原子であるものを指す。限定されないが、B、Al、SiおよびPを含めた、さらなるヘテロ原子も有用であり得る。ヘテロ原子は、酸化されて、限定されないが、-S(O)-および-S(O)-などの部分を形成することができる。ヘテロアリール基は、C5~6、C3~8、C4~8、C5~8、C6~8、C3~9、C3~10、C3~11、またはC3~12など任意の数の環原子を含み得、ここでこれらの炭素原子のうちの少なくとも1個は、ヘテロ原子によって置き換えられている。ヘテロアリール基中には、1、2、3、4もしくは5個または1~2、1~3、1~4、1~5、2~3、2~4、2~5、3~4もしくは3~5個などの、任意の適切な数のヘテロ原子が含まれ得る。例えば、ヘテロアリール基は、1~4個の炭素の環原子がヘテロ原子により置き換えられているC5~8ヘテロアリール、または1~3個の炭素の環原子がヘテロ原子により置き換えられているC5~8ヘテロアリール、または1~4個の炭素の環原子がヘテロ原子により置き換えられているC5~6ヘテロアリール、または1~3個の炭素の環原子がヘテロ原子により置き換えられているC5~6ヘテロアリールとすることができる。ヘテロアリール基は、ピロール、ピリジン、イミダゾール、ピラゾール、トリアゾール、テトラゾール、ピラジン、ピリミジン、ピリダジン、トリアジン(1,2,3-、1,2,4-および1,3,5-異性体)、チオフェン、フラン、チアゾール、イソチアゾール、オキサゾールおよびイソオキサゾールなどの基を含むことができる。ヘテロアリール基は、フェニル環などの芳香族環系に縮合して、限定されないが、インドールおよびイソインドールなどのベンゾピロール、キノリンおよびイソキノリンなどのベンゾピリジン、ベンゾピラジン(キノキサリン)、ベンゾピリミジン(キナゾリン)、フタラジンおよびシンノリンなどのベンゾピリダジン、ベンゾチオフェンならびにベンゾフランを含めた、メンバーを形成することもできる。他のヘテロアリール基は、ビピリジンなどの、結合によって連結されているヘテロアリール環を含む。ヘテロアリール基は、置換され得るか、または無置換であり得る。他に特定されない限り、「置換ヘテロアリール」基は、ハロ、ヒドロキシ、アミノ、アルキルアミノ、アミド、アシル、ニトロ、シアノおよびアルコキシから選択される1つまたは複数の基により置換され得る。
ヘテロアリール基は、環上の任意の位置を介して連結され得る。例えば、ピロールには、1-、2-および3-ピロールが含まれ、ピリジンには2-、3-および4-ピリジンが含まれ、イミダゾールには1-、2-、4-および5-イミダゾールが含まれ、ピラゾールには1-、3-、4-および5-ピラゾールが含まれ、トリアゾールには1-、4-および5-トリアゾールが含まれ、テトラゾールには1-および5-テトラゾールが含まれ、ピリミジンには2-、4-、5-および6-ピリミジンが含まれ、ピリダジンには3-および4-ピリダジンが含まれ、1,2,3-トリアジンには4-および5-トリアジンが含まれ、1,2,4-トリアジンには3-、5-および6-トリアジンが含まれ、1,3,5-トリアジンには2-トリアジンが含まれ、チオフェンには2-および3-チオフェンが含まれ、フランには2-および3-フランが含まれ、チアゾールには2-、4-および5-チアゾールが含まれ、イソチアゾールには3-、4-および5-イソチアゾールが含まれ、オキサゾールには2-、4-および5-オキサゾールが含まれ、イソオキサゾールには3-、4-および5-イソオキサゾールが含まれ、インドールには1-、2-および3-インドールが含まれ、イソインドールには1-および2-イソインドールが含まれ、キノリンには2-、3-および4-キノリンが含まれ、イソキノリンには1-、3-および4-イソキノリンが含まれ、キナゾリンには2-および4-キナゾリンが含まれ、シンノリンには3-および4-シンノリンが含まれ、ベンゾチオフェンには2-および3-ベンゾチオフェンが含まれ、ベンゾフランには2-および3-ベンゾフランが含まれる。
一部のヘテロアリール基には、ピロール、ピリジン、イミダゾール、ピラゾール、トリアゾール、ピラジン、ピリミジン、ピリダジン、トリアジン(1,2,3-、1,2,4-および1,3,5-異性体)、チオフェン、フラン、チアゾール、イソチアゾール、オキサゾール、イソオキサゾール、インドール、イソインドール、キノリン、イソキノリン、キノキサリン、キナゾリン、フタラジン、シンノリン、ベンゾチオフェンおよびベンゾフランなどの、N、OまたはSを含めた、5~10個の環員および1~3個の環原子を有するものが含まれる。他のヘテロアリール基には、ピロール、ピリジン、イミダゾール、ピラゾール、トリアゾール、ピラジン、ピリミジン、ピリダジン、トリアジン(1,2,3-、1,2,4-および1,3,5-異性体)、チオフェン、フラン、チアゾール、イソチアゾール、オキサゾールおよびイソオキサゾールなどの、5~8個の環員および1~3個のヘテロ原子を有するものが含まれる。一部の他のヘテロアリール基には、インドール、イソインドール、キノリン、イソキノリン、キノキサリン、キナゾリン、フタラジン、シンノリン、ベンゾチオフェン、ベンゾフランおよびビピリジンなどの、9~12個の環員および1~3個のヘテロ原子を有するものが含まれる。さらに他のヘテロアリール基には、ピロール、ピリジン、イミダゾール、ピラゾール、ピラジン、ピリミジン、ピリダジン、チオフェン、フラン、チアゾール、イソチアゾール、オキサゾールおよびイソオキサゾールなどの、N、OまたはSを含めた、5~6個の環員および1~2個の環原子を有するものが含まれる。
一部のヘテロアリール基は、ピロール、ピリジン、イミダゾール、ピラゾール、トリアゾール、ピラジン、ピリミジン、ピリダジン、トリアジン(1,2,3-、1,2,4-および1,3,5-異性体)、インドール、イソインドール、キノリン、イソキノリン、キノキサリン、キナゾリン、フタラジンおよびシンノリンなど、5~10個の環員、および窒素ヘテロ原子のみを含む。他のヘテロアリール基は、フランおよびベンゾフランなど、5~10個の環員、および酸素ヘテロ原子のみを含む。一部の他のヘテロアリール基は、チオフェンおよびベンゾチオフェンなど、5~10個の環員、および硫黄ヘテロ原子のみを含む。さらに他のヘテロアリール基は、イミダゾール、ピラゾール、トリアゾール、ピラジン、ピリミジン、ピリダジン、トリアジン(1,2,3-、1,2,4-および1,3,5-異性体)、チアゾール、イソチアゾール、オキサゾール、イソオキサゾール、キノキサリン、キナゾリン、フタラジンおよびシンノリンなど、5~10個の環員、および少なくとも2個のヘテロ原子を含む。
本明細書で使用する場合、用語「ヘテロアリーレン」とは、少なくとも2つの他の基を連結する、上で定義されているヘテロアリール基(すなわち、二価のヘテロアリールラジカル)を指す。
本明細書で使用する場合、用語「ヘテロシクリル」とは、単独でかまたは別の置換基の一部として、3~12個の環員ならびにN、OおよびSの1~4個のヘテロ原子を有する飽和の環系を指す。限定されないが、B、Al、SiおよびPを含めた、さらなるヘテロ原子も有用であり得る。ヘテロ原子は、酸化されて、限定されないが、-S(O)-および-S(O)-などの部分を形成することができる。ヘテロシクリル基は、C3~6、C4~6、C5~6、C3~8、C4~8、C5~8、C6~8、C3~9、C3~10、C3~11、またはC3~12など、任意の数の環原子を含み得、ここでこれらの炭素原子のうちの少なくとも1個は、ヘテロ原子によって置き換えられている。ヘテロシクリル基中で、1、2、3もしくは4個、または1~2、1~3、1~4、2~3、2~4もしくは3~4個などの、任意の適切な数の炭素の環原子が、ヘテロ原子で置き換えられ得る。ヘテロシクリル基は、アジリジン、アゼチジン、ピロリジン、ピペリジン、アゼパン、アゾカン、クヌクリジン、ピラゾリジン、イミダゾリジン、ピペラジン(1,2-、1,3-および1,4-異性体)、オキシラン、オキセタン、テトラヒドロフラン、オキサン(テトラヒドロピラン)、オキセパン、チイラン、チエタン、チオラン(テトラヒドロチオフェン)、チアン(テオラヒドロチオピラン)、オキサゾリジン、イソオキサゾリジン、チアゾリジン、イソチアゾリジン、ジオキソラン、ジチオラン、モルホリン、チオモルホリン、ジオキサンまたはジチアンなどの基を含むことができる。ヘテロシクリル基は、芳香族または非芳香族環系に縮合して、限定されないが、インドリンを含めたメンバーを形成することもできる。ヘテロシクリル基は、無置換であり得るか、または置換され得る。他に特定されない限り、「置換ヘテロシクリル」基は、ハロ、ヒドロキシ、アミノ、オキソ(=O)、アルキルアミノ、アミド、アシル、ニトロ、シアノおよびアルコキシから選択される1つまたは複数の基により置換され得る。
ヘテロシクリル基は、環上の任意の位置を介して連結され得る。例えば、アジリジンは1-または2-アジリジンとすることができ、アゼチジンは1-または2-アゼチジンとすることができ、ピロリジンは1-、2-または3-ピロリジンとすることができ、ピペリジンは1-、2-、3-または4-ピペリジンとすることができ、ピラゾリジンは1-、2-、3-または4-ピラゾリジンとすることができ、イミダゾリジンは1-、2-、3-または4-イミダゾリジンとすることができ、ピペラジンは1-、2-、3-または4-ピペラジンとすることができ、テトラヒドロフランは1-または2-テトラヒドロフランとすることができ、オキサゾリジンは2-、3-、4-または5-オキサゾリジンとすることができ、イソオキサゾリジンは2-、3-、4-または5-イソオキサゾリジンとすることができ、チアゾリジンは2-、3-、4-または5-チアゾリジンとすることができ、イソチアゾリジンは2-、3-、4-または5-イソチアゾリジンとすることができ、モルホリンは2-、3-または4-モルホリンとすることができる。
ヘテロシクリルが、3~8個の環員および1~3個のヘテロ原子を含む場合、代表的なメンバーには、限定されないが、ピロリジン、ピペリジン、テトラヒドロフラン、オキサン、テトラヒドロチオフェン、チアン、ピラゾリジン、イミダゾリジン、ピペラジン、オキサゾリジン、イソオキサゾリジン、チアゾリジン、イソチアゾリジン、モルホリン、チオモルホリン、ジオキサンおよびジチアンが含まれる。ヘテロシクリルは、5~6個の環員および1~2個のヘテロ原子を有する環を形成することもでき、代表的なメンバーには、限定されないが、ピロリジン、ピペリジン、テトラヒドロフラン、テトラヒドロチオフェン、ピラゾリジン、イミダゾリジン、ピペラジン、オキサゾリジン、イソオキサゾリジン、チアゾリジン、イソチアゾリジンおよびモルホリンが含まれる。
本明細書で使用する場合、用語「アミン保護基」とは、アミノ基を非反応性にするが、アミノ基を回復するよう除去可能でもある、化学部分を指す。アミン保護基の例には、これらに限定されないが、ベンジルオキシカルボニル、9-フルオレニルメチルオキシカルボニル(Fmoc)、tert-ブチルオキシカルボニル(Boc)、アリルオキシカルボニル(Alloc)、p-トルエンスルホニル(Tos)、2,2,5,7,8-ペンタメチルクロマン-6-スルホニル(Pmc)、2,2,4,6,7-ペンタメチル-2,3-ジヒドロベンゾフラン-5-スルホニル(Pbf)、メシチル-2-スルホニル(Mts)、4-メトキシ-2,3,6-トリメチルフェニルスルホニル(Mtr)、アセトアミド、フタルイミドなどが含まれる。他のアミン保護基は、例えば、GreenおよびWuts(Protective Groups in Organic Synthesis、第4版、2007年、Wiley-Interscience、New York)によって記載されているものを含め、当業者に公知である。
本明細書で使用する場合、用語「カルボニル」とは、単独でかまたは別の置換基の一部として、-C(O)-、すなわち、酸素に二重結合しており、かつカルボニルを有する部分において2つの他の基に結合している炭素原子を指す。
本明細書で使用する場合、用語「アミノ」とは、-NR部分を指し、R基はそれぞれ、Hまたはアルキルである。アミノ部分がイオン化されて、対応するアンモニウム陽イオンを形成することができる。「ジアルキルアミノ」とは、R基がそれぞれアルキルである、アミノ部分を指す。
本明細書で使用する場合、用語「スルホニル」とは、-SOR部分を指し、R基は、アルキル、ハロアルキルまたはアリールである。アミノ部分がイオン化されて、対応するアンモニウム陽イオンを形成することができる。「アルキルスルホニル」とは、R基がそれぞれアルキルである、アミノ部分を指す。
本明細書で使用する場合、用語「ヒドロキシ」とは、-OH部分を指す。
本明細書で使用する場合、用語「シアノ」とは、窒素原子に三重結合している炭素原子(すなわち、-C≡N部分)を指す。
本明細書で使用する場合、用語「カルボキシ」とは、-C(O)OH部分を指す。カルボキシ部分がイオン化されて、対応するカルボン酸陰イオンを形成することができる。
本明細書で使用する場合、用語「アミド」とは、-NRC(O)Rまたは-C(O)NR部分を指し、R基はそれぞれ、Hまたはアルキルである。
本明細書で使用する場合、用語「ニトロ」とは、-NO部分を指す。
本明細書で使用する場合、用語「オキソ」とは、化合物に二重結合している酸素原子(すなわち、O=)を指す。
本明細書で使用する場合、用語「薬学的に許容される添加剤」とは、対象への活性剤の投与を補助する物質を指す。「薬学的に許容される」とは、添加剤が製剤の他の成分と相溶性であること、およびそのレシピエントに有害ではないことを意味する。本発明において有用な医薬品用添加剤には、これらに限定されないが、結合剤、充填剤、崩壊剤、滑沢剤、流動促進剤、コーティング剤、甘味剤、フレーバーおよび着色剤が含まれる。
本明細書で使用する場合、用語「塩」とは、本発明の化合物の酸塩または塩基塩を指す。薬学的に許容される塩の例示的な例は、無機酸(塩酸、臭化水素酸、リン酸など)の塩、有機酸(酢酸、プロピオン酸、グルタミン酸、クエン酸など)の塩、四級アンモニウム(ヨウ化メチル、ヨウ化エチルなど)の塩である。薬学的に許容される塩は非毒性であることが理解される。
本発明の酸性化合物の薬学的に許容される塩は塩基と形成される塩、すなわちナトリウム、リチウム、カリウム、カルシウム、マグネシウムなどのアルカリ金属塩およびアルカリ土類金属塩などの陽イオン性塩、ならびにアンモニウム、トリメチル-アンモニウム、ジエチルアンモニウムおよびトリス-(ヒドロキシメチル)-メチル-アンモニウム塩などのアンモニウム塩である。
同様に、ピリジルなどの塩基性基が構造の一部を構成するという条件で、例えば、塩酸、メタンスルホン酸、マレイン酸などの無機酸、有機カルボン酸および有機スルホン酸などの酸付加塩も可能である。
本化合物の中性形態は、塩を塩基または酸と接触させて、従来の方法で親化合物を単離することによって再生成することができる。該化合物の親形態は、極性溶媒中への溶解度などのある種の物理特性において、様々な塩形態とは異なるが、他の面では、これらの塩は、本発明の目的では、該化合物の親形態と等価である。
塩形態に加えて、本発明は、プロドラッグ形態の化合物を提供する。本明細書に記載されている化合物のプロドラッグは、生理的条件下で化学変化を容易に受けて、本発明の化合物をもたらす化合物である。さらに、プロドラッグは、ex vivo環境において、化学的または生化学的方法によって、本発明の化合物に変換され得る。例えば、プロドラッグは、好適な酵素または化学試薬を含む経皮パッチレザーバー中に入れられると、本発明の化合物にゆっくりと変換され得る。
本明細書で使用する場合、用語「ジンジパイン反応性部分」とは、共有結合により修飾されたジンジパインを形成するよう、ジンジパイン活性部位チオールと反応する化合物中の化学官能基、または非共有結合によるジンジパイン/化合物複合体を形成するよう、ジンジパインと相互作用する化合物中の化学官能基を指す。ジンジパイン反応性部分の例には、これらに限定されないが、ハロアセトアミド基(クロロアセトアミドおよびヨードアセトアミドを含む)、マレイミド基、ベンゾチアゾリル-カルボニル基およびフェノキシメチル基(ハロゲン化フェノキシメチル基を含む)が含まれる。
本明細書で使用する場合、用語「レポーター部分」とは、これらに限定されないが、光学的方法(例えば、蛍光またはUV-可視吸光度)、および生化学的方法(例えば、抗体などの免疫化学試薬による)を含む技法を使用して検出することができる化合物中の化学官能基を指す。
本明細書で使用する場合、用語「処置する」、「処置」および「処置すること」とは、軽減;寛解;症状の減少、または症状、損傷、病理もしくは状態を患者に一層耐容可能にすること;症状の進行速度の低減;症状または状態の頻度または期間を減少させること;あるいは一部の状況では、症状の発症を予防することなどの任意の客観的または主観的パラメータを含めた、損傷、病理、状態または症状(例えば、認識機能障害)の処置または改善に成功した任意の徴候を指す。症状の処置または改善は、例えば、身体的診察の結果を含めた、任意の客観的または主観的パラメータに基づくことができる。
本明細書で使用する場合、用語「有効量」および「治療有効量」とは、投与されると治療効果を生じる、Kgp阻害剤などの化合物のある用量を指す。正確な用量は、処置目的に依存し、公知技法(例えば、Lieberman、Pharmaceutical Dosage Forms(1~3巻、1992年);Lloyd、The Art,Science and Technology of Pharmaceutical Compounding(1999年);Pickar、Dosage Calculations(1999年);Goodman & Gilman’s The Pharmacological Basis of Therapeutics、第11版、2006年、Brunton編、McGraw-Hill;およびRemington:The Science and Practice of Pharmacy、第21版、2005年、Hendrickson編、Lippincott、Williams & Wilkinsを参照されたい)を使用して当業者により確認可能であろう。
本明細書で使用する場合、用語「アルツハイマー病」とは、ヒトおよび他の哺乳動物における中枢神経系の進行性疾患を指す。アルツハイマー病は、認知症(とりわけ、高齢者において)、見当識喪失、記憶喪失、言語、計算または視覚空間能力の困難さおよび精神医学的徴候によって現れる。アルツハイマー病は、進行性神経変性および特徴的な病理、すなわち、ベータアミロイドプラークおよびタウのもつれに関連している。
本明細書で使用する場合、用語「骨関節炎」とは、関節軟骨、滑膜組織および下層骨の破壊に起因する慢性変性関節疾患を指す。
本明細書で使用する場合、用語「対象」とは、これらに限定されないが、霊長類(例えば、ヒト)、ウシ、ヒツジ、ヤギ、ウマ、イヌ、ネコ、ウサギ、ラット、マウスなどを含めた、哺乳動物などの動物を指す。
III.リシンジンジパインの阻害剤
本発明は、P.gingivalisの阻害のための化合物を提供する。第1の実施形態では、本発明は、式I:
Figure 0007113815000015
による化合物またはその薬学的に許容される塩[式中、
Aは、-CH-および-O-から選択され、
1aおよびR1bは、水素、C1~4アルキルおよびアミン保護基からそれぞれ独立して選択され、
2aおよびR2bは、水素、ハロゲン、C1~4ハロアルキルおよびC1~4ハロアルコキシからそれぞれ独立して選択され、
は、C3~8シクロアルキル、C3~8アルキル、3~12員のヘテロシクリル、C6~10アリール、5~12員のヘテロアリールおよびレポーター部分から選択され、Rは、1つまたは複数のR3a置換基により必要に応じて置換されており、
3aはそれぞれ、ハロゲン、-CN、-NO、-N、-OH、C1~4アルキル、C1~4ハロアルキル、C1~4アルコキシ、C1~4ハロアルコキシ、-N(R、-N(R、-(CHC(O)R、-NR(CHC(O)R、-O(CHC(O)R、-(CHCONR、-(CHNRC(O)R、-NR(CHCONR、-NR(CHNRC-(O)R、-O(CHCONRおよび-O(CHNRC(O)R、および必要に応じて置換されているトリアゾリルから独立して選択され、
はそれぞれ、C1~4アルキル、C1~4ハロアルキルおよびC1~4ジュウテロアルキルから独立して選択され、
はそれぞれ、水素およびC1~8アルキルから独立して選択され、
下付文字kはそれぞれ、0、1、2、3、4、5および6から独立して選択され、
下付文字uはそれぞれ、1、2、3、4、5および6から独立して選択され、
は、水素およびC1~4アルキルから選択され、
は、-CH5a、-CHS(O)(R5bおよびC1~6ハロアルキルから選択され、
5aは、-O-R、-S-R、-SO-R、-SO-R、-N(R、5~12員のヘテロアリールおよび3~12員のヘテロシクリルから選択され、
5~12員のヘテロアリールは、ハロゲン、C1~3アルキルおよびC1~3ハロアルキルから独立して選択される1つまたは複数のメンバーにより必要に応じて置換されており、
3~12員のヘテロシクリルは、オキソ、ハロゲン、C1~3アルキルおよびC1~3ハロアルキルから独立して選択される1つまたは複数のメンバーにより必要に応じて置換されており、
5bはそれぞれ、独立して選択されるC1~6アルキルであり、
およびRは、フェニル、C1~6アルキル、C1~6ハロアルキルおよび5~12員のヘテロアリールから選択され、
フェニルは、1~5個のハロゲンにより置換されており、
5~12員のヘテロアリールは、1つまたは複数のハロゲン、C1~3アルキルまたはC1~3ハロアルキルにより必要に応じて置換されており、
はそれぞれ、独立して選択されるC1~6アルキルであり、
は、消光部分Rを必要に応じて含み、
ただし、Rは、2,3,5,6-テトラフルオロフェノキシメチル以外であることを条件とする]
を提供する。
一部の実施形態では、
Aは、-CH-および-O-から選択され、
1aおよびR1bは、水素、C1~4アルキルおよびアミン保護基からそれぞれ独立して選択され、
2aおよびR2bは、水素、ハロゲン、C1~4ハロアルキルおよびC1~4ハロアルコキシからそれぞれ独立して選択され、
は、C3~8シクロアルキル、C3~8アルキル、C6~10アリール、C5~12ヘテロアリールおよびC3~12ヘテロシクリルから選択され、Rは、1つまたは複数のR3a置換基により必要に応じて置換されており、
3aはそれぞれ、ハロゲン、-CN、-NO、-N、-OH、C1~4アルキル、C1~4ハロアルキル、C1~4アルコキシ、C1~4ハロアルコキシ、-N(R、-(CHC(O)R、-NR(CHC(O)R、-O(CHC(O)R、-(CHCONR、-(CHNRC(O)R、-NR(CHCONR、-NR(CHNRC(O)R、-O(CHCONRおよび-O(CHNRC(O)R、および必要に応じて置換されているトリアゾリルから独立して選択され、
はそれぞれ、C1~4アルキル、C1~4ハロアルキルおよびC1~4ジュウテロアルキルから独立して選択され、
はそれぞれ、水素およびC1~8アルキルから独立して選択され、
下付文字kはそれぞれ、0、1、2、3、4、5および6から独立して選択され、
下付文字uはそれぞれ、1、2、3、4、5および6から独立して選択され、
は、水素およびC1~4アルキルから選択され、
は、C1~6ハロアルキルおよび-CH5aから選択され、
5aは、-O-R、-S-R、-SO-R、-SO-R、-N(RおよびC5~12ヘテロアリールから選択され、
は、フェニル、C1~6アルキル、C1~6ハロアルキルおよびC5~12ヘテロアリールから選択され、
フェニルは、1~5個のハロゲンにより置換されており、
5~12ヘテロアリールは、ハロゲンまたはC1~3ハロアルキルにより必要に応じて置換されており、
は、フェニル、C1~6アルキル、C1~6ハロアルキルおよびC5~12ヘテロアリールから選択され、
フェニルは、1~5個のハロゲンにより必要に応じて置換されており、
5~12ヘテロアリールは、ハロゲンまたはC1~3ハロアルキルにより必要に応じて置換されており、
はそれぞれ、独立して選択されるC1~6アルキルであり、
ただし、Rは、2,3,5,6-テトラフルオロフェノキシメチル以外であることを条件とする。
本発明の化合物は、保護形態(すなわち、R1aおよびR1bのうちの少なくとも1つが、アミン保護基である化合物)で調製することができる。例えば、GreenおよびWuts(Protective Groups in Organic Synthesis、第4版、2007年、Wiley-Interscience、New York)により記載されているようないくつかの好適な保護を使用することができる。一部の実施形態では、R1aはHであり、R1bは、ベンジルオキシカルボニル、9-フルオレニルメチル-オキシカルボニル、tert-ブチルオキシカルボニルおよびアリルオキシカルボニルから選択される。一部の実施形態では、R1aはHであり、R1bはtert-ブチルオキシカルボニルである。化合物はまた、アルキル化形態(すなわち、R1aおよびR1bのうちの少なくとも1つが、アルキル基である化合物)で調製することもできる。R1aおよびR1bの一方または両方が、例えば、メチル、エチル、n-プロピル、イソプロピル、n-ブチルまたはt-ブチルであることができる。
一部の実施形態では、R1aおよびR1bはHであり、R2aおよびR2bは、水素およびフルオロから独立して選択され、Aは-CH-である。
一部の実施形態では、R1aおよびR1bはHであり、R2aおよびR2bは、水素およびフルオロから独立して選択され、Aは-CH-であり、Rは、水素およびC1~4アルキルから選択される。一部のこのような実施形態では、Rは、水素およびメチルから選択される。一部のこのような実施形態では、Rは水素である。
一部の実施形態では、Aは-CH-であり、R2aは水素であり、R2bは、水素またはフルオロであり、R1aおよびR1bはHである。一部の実施形態では、Aは-CH-であり、R2aは水素であり、R2bはフルオロであり、R1aおよびR1bはHである。
一部の実施形態では、本発明は、式Ia:
Figure 0007113815000016
による構造を有する化合物およびその薬学的に許容される塩を提供する。
一部の実施形態では、本発明は、Rが、C3~8シクロアルキル、C3~8アルキル、C6~10アリール、C5~12ヘテロアリールおよびC3~12ヘテロシクリルから選択され、それらはそれぞれ、1つまたは複数のR3a置換基により必要に応じて置換されている、式Iまたは式Iaの化合物、およびそれらの薬学的に許容される塩を提供する。例えば、Rは、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロヘキシル、シクロヘプチルまたはシクロオクチルとすることができる。Rは、n-プロピル、イソプロピル、n-ブチル、イソブチル、sec-ブチル、tert-ブチル、n-ペンチル、分岐状ペンチル、n-ヘキシル、分岐状ヘキシル、n-ヘプチル、分岐状ヘプチル、n-オクチルまたは分岐状オクチルとすることができる。一部の実施形態では、Rは、無置換または置換シクロブチル、無置換または置換シクロペンチルおよび無置換または置換シクロヘキシルから選択される。一部の実施形態では、Rは、無置換または置換イソプロピルである。
一部の実施形態では、Rは、無置換または置換フェニルおよび無置換または置換ナフチルから選択される。一部の実施形態では、Rは、無置換または置換ピロリル、無置換または置換ピリジニル、無置換または置換イミダゾリル、無置換または置換ピラゾリル、無置換または置換トリアゾリル、無置換または置換ピラジニル、無置換または置換トリアジニル、無置換または置換インドリル、無置換または置換イソインドリル、および無置換または置換キノリニルから選択される。
一部の実施形態では、Rは、シクロペンチルおよびフェニルから選択され、それらはそれぞれ、1つまたは複数のR3a置換基により必要に応じて置換されている。一部のこのような実施形態では、R3aはそれぞれ、ハロゲン、-N、C1~4アルキル、C1~4ハロアルキル、C1~4アルコキシ、C1~4ハロアルコキシおよび-NRC(O)Rから独立して選択される。一部の実施形態では、Rはシクロペンチルである。
一部の実施形態では、本発明は、Rが、C3~8アルキル、C3~8シクロアルキル、C6~10アリール、C5~12ヘテロアリールおよびC3~12ヘテロシクリルから選択され、それらはそれぞれ、1つまたは複数のR3a置換基により必要に応じて置換されている、式Iまたは式Iaの化合物およびそれらの薬学的に許容される塩を提供する。一部のこのような実施形態では、Rは、イソプロピル、シクロペンチル、フェニル、ピリジン-2-イル、ピリジン-3-イルおよびピリジン-4-イルから選択され、それらはそれぞれ、1つまたは複数のR3a置換基により必要に応じて置換されている。一部のこのような実施形態では、R3aはそれぞれ、ハロゲン、-N、C1~4アルキル、C1~4ハロアルキル、C1~4アルコキシ、C1~4ハロアルコキシ、C1~4アルコキシ、C1~4ハロアルコキシ、-N(R、-N(Rおよび-NRC(O)Rから独立して選択される。
一部の実施形態では、Rはシクロペンチルである。一部の実施形態では、Rはシクロペンチルであり、Rは、以下に説明されている実施形態(A)、実施形態(B)、実施形態(C)、実施形態(D)、実施形態(E)、実施形態(F)、実施形態(G)、実施形態(H)、実施形態(J)または実施形態(K)中の置換基から選択される。
一部の実施形態では、Rは、C1~4アルコキシ(例えば、メトキシ、エトキシ、イソプロポキシ、tert-ブトキシなど)により置換されている、C3~8アルキル(例えば、n-プロピル、イソプロピル、n-ブチル、イソブチル、sec-ブチル、tert-ブチル、n-ペンチルなど)である。一部の実施形態では、Rはメトキシプロピルである。一部の実施形態では、Rは、(2-メトキシ)-プロパン-2-イルである。一部の実施形態では、Rは(2-メトキシ)プロパン-2-イルであり、Rは、以下に説明されている実施形態(A)、実施形態(B)、実施形態(C)、実施形態(D)、実施形態(E)、実施形態(F)、実施形態(G)、実施形態(H)、実施形態(J)または実施形態(K)中の置換基から選択される。
一部の実施形態では、Rは、無置換フェニルであるか、またはRは、1つもしくは複数のハロゲン、-N、C1~4ハロアルコキシおよび/もしくは-NRC(O)Rにより置換されているフェニルである。一部のこのような実施形態では、Rは、以下に説明されている実施形態(A)、実施形態(B)、実施形態(C)、実施形態(D)、実施形態(E)、実施形態(F)、実施形態(G)、実施形態(H)、実施形態(J)または実施形態(K)中の置換基から選択される。
一部の実施形態では、Rは、無置換ピリジニル(すなわち、ピリジン-2-イル、ピリジン-3-イルもしくはピリジン-4-イル)、または1つもしくは複数のハロゲン、-N(Rおよび/もしくは-N(Rにより置換されているピリジニルである。一部のこのような実施形態では、Rは、以下に説明されている実施形態(A)、実施形態(B)、実施形態(C)、実施形態(D)、実施形態(E)、実施形態(F)、実施形態(G)、実施形態(H)、実施形態(J)または実施形態(K)中の置換基から選択される。
アジド基を含有する化合物(例えば、R3aが-Nである化合物)は、アルキンを有する化合物またはホスフィンを有する化合物などの相補性反応パートナーとの反応によって、さらなる官能基により修飾され得る。一般に「クリック化学」と呼ばれる[3+2]環化付加によるアジドとアルキンの反応を使用して、本発明の化合物中に様々な置換トリアゾール基を導入することができる。したがって、本発明の一部の実施形態は、連結部分-L-が、式:
Figure 0007113815000017
(式中、波線は、R3aへの結合点であり、破線は、R3cへの結合点である)による必要に応じて置換されているトリアゾリル部分である、化合物を提供する。
一部の実施形態では、連結部分L3aは、構造-L3b-L3c-を有しており、L3bおよびL3cは、結合、二価のポリマー部分および線状または分岐状の飽和または不飽和C1~30アルキルから独立して選択され、
1~30アルキル中の1個または複数の炭素原子は、O、S、NRにより、必要に応じて、および独立して置き換えられており、
1~30アルキル中の2つまたはそれよりも多い隣接炭素原子団は、-NR(CO)-または-(CO)NR-により、必要に応じて、および独立して置き換えられており、
1~30アルキル中の2つまたはそれよりも多い隣接炭素原子団は、4~8員の二価の炭素環、またはO、SおよびNから選択される1~4個のヘテロ原子を有する、4~8員の二価の複素環により、必要に応じて、および独立して置き換えられており、
はそれぞれ、HおよびC1~6アルキルから独立して選択される。
一部の実施形態では、官能基R3cは、以下により詳細に記載されている、発色団、フルオロフォアおよび結合部分(例えば、ビオチン、グルタチオンなど)から選択される。
ある特定の実施形態では、R、およびRが結合しているカルボニルは、天然アミノ酸残基(Lアミノ酸残基)、または天然アミノ酸残基の異性体(Dアミノ酸残基)以外の部分を形成する。一部の実施形態では、R、およびRが結合しているカルボニルは、アスパラギニル、置換アスパラギニル、グルタミニル(すなわち、グルタミン残基)、置換グルタミニル(すなわち、置換グルタミン残基)、グルタミル(すなわち、グルタミン酸残基)、置換グルタミル(すなわち、置換グルタミン酸残基)、イソロイシニル、置換イソロイシニル、ロイシニル、置換ロイシニル、リシニル、置換リシニル、メチオニニル、置換メチオニニル、プロリニル、置換プロリニル、トレオニニル、置換トレオニニル、バリニルまたは置換バリニル以外の部分を形成する。置換アミノ酸残基は、アミン結合により連結している2つまたはそれよりも多いアミノ酸残基を有する、より大きなペプチド基中に存在してもよい。
一部の実施形態では、本発明は、Rが、水素またはメチルである、式Iまたは式Iaの化合物およびそれらの薬学的に許容される塩を提供する。一部のこのような実施形態では、Rは-CH5aであり、R5aは、C5~12ヘテロアリールおよび-O-Rから選択される。一部のこのような実施形態では、R5aは、-O-フェニルであり、フェニルは、1~5個のハロゲンにより置換されている。一部のこのような実施形態では、Rは水素である。
一部の実施形態では、式Iまたは式Iaの化合物中のR5aは、-S-R、-SO-R、-SO-R、C5~12ヘテロアリールおよび-N-Rから選択される。一部の実施形態では、R5aは、-O-R、C5~12ヘテロアリールおよび-N-Rから選択される。一部の実施形態では、R5aは、-O-R、-S-R、-SO-R、-SO-Rおよび-N-Rから選択される。一部の実施形態では、R5aは、-O-R、-S-R、-SO-R、-SO-RおよびC5~12ヘテロアリールから選択される。
一部の実施形態(A)では、式Iまたは式Iaの化合物中のR5aは、C1~6ハロアルコキシ(すなわち、RがC1~6ハロアルキルである-O-R)、C1~6アルキルチオ(すなわち、RがC1~6アルキルである-S-R)、C1~6ハロアルキチオ(haloalkythio)(すなわち、RがC1~6ハロアルキルである-S-R)、C1~6アルキルスルホニル(すなわち、RがC1~6アルキルである-SO-R)、(C1~6ジアルキル)アミノ(すなわち、-NR)、C5~12ヘテロアリール、3~12員のヘテロシクリル、-O-フェニル(フェニルは、1~5個のハロゲンにより置換されている)および-S-フェニル(フェニルは、1~5個のハロゲンにより必要に応じて置換されている)から選択される。実施形態(A)では、Rは、上記の置換基のいずれか、または上記の置換基のグループとすることができる。
一部の実施形態(B)では、式Iまたは式Iaの化合物中のR5aは、C1~6アルコキシ、C1~6アルキルチオ、C1~6ハロアルキチオ、C1~6アルキルスルホニル、(C1~6ジアルキル)アミノ、C5~12ヘテロアリール、3~12員のヘテロシクリル、-O-フェニル(フェニルは、1~5個のハロゲンにより置換されている)および-S-フェニル(フェニルは、1~5個のハロゲンにより必要に応じて置換されている)から選択される。実施形態(B)では、Rは、上記の置換基のいずれか、または上記の置換基のグループとすることができる。
一部の実施形態(C)では、式Iまたは式Iaの化合物中のR5aは、C1~6アルコキシ、C1~6ハロアルコキシ、C1~6ハロアルキチオ、C1~6アルキルスルホニル、(C1~6ジアルキル)アミノ、C5~12ヘテロアリール、3~12員のヘテロシクリル、-O-フェニル(フェニルは、1~5個のハロゲンにより置換されている)および-S-フェニル(フェニルは、1~5個のハロゲンにより必要に応じて置換されている)から選択される。実施形態(C)では、Rは、上記の置換基のいずれか、または上記の置換基のグループとすることができる。
一部の実施形態(D)では、式Iまたは式Iaの化合物中のR5aは、C1~6アルコキシ、C1~6ハロアルコキシ、C1~6アルキチオ、C1~6アルキルスルホニル、(C1~6ジアルキル)アミノ、C5~12ヘテロアリール、3~12員のヘテロシクリル、-O-フェニル(フェニルは、1~5個のハロゲンにより置換されている)および-S-フェニル(フェニルは、1~5個のハロゲンにより必要に応じて置換されている)から選択される。実施形態(D)では、Rは、上記の置換基のいずれか、または上記の置換基のグループとすることができる。
一部の実施形態(E)では、式Iまたは式Iaの化合物中のR5aは、C1~6アルコキシ、C1~6ハロアルコキシ、C1~6アルキチオ、C1~6ハロアルキチオ、(C1~6ジアルキル)アミノ、C5~12ヘテロアリール、3~12員のヘテロシクリル、-O-フェニル(フェニルは、1~5個のハロゲンにより置換されている)および-S-フェニル(フェニルは、1~5個のハロゲンにより必要に応じて置換されている)から選択される。実施形態(E)では、Rは、上記の置換基のいずれか、または上記の置換基のグループとすることができる。
一部の実施形態(F)では、式Iまたは式Iaの化合物中のR5aは、C1~6アルコキシ、C1~6ハロアルコキシ、C1~6アルキチオ、C1~6ハロアルキチオ、C1~6アルキルスルホニル、C5~12ヘテロアリール、3~12員のヘテロシクリル、-O-フェニル(フェニルは、1~5個のハロゲンにより置換されている)および-S-フェニル(フェニルは、1~5個のハロゲンにより必要に応じて置換されている)から選択される。実施形態(F)では、Rは、上記の置換基のいずれか、または上記の置換基のグループとすることができる。
一部の実施形態(G)では、式Iまたは式Iaの化合物中のR5aは、C1~6アルコキシ、C1~6ハロアルコキシ、C1~6アルキチオ、C1~6ハロアルキチオ、C1~6アルキルスルホニル、(C1~6ジアルキル)アミノ、3~12員のヘテロシクリル、-O-フェニル(フェニルは、1~5個のハロゲンにより置換されている)および-S-フェニル(フェニルは、1~5個のハロゲンにより必要に応じて置換されている)から選択される。実施形態(G)では、Rは、上記の置換基のいずれか、または上記の置換基のグループとすることができる。
一部の実施形態(H)では、式Iまたは式Iaの化合物中のR5aは、C1~6アルコキシ、C1~6ハロアルコキシ、C1~6アルキチオ、C1~6ハロアルキチオ、C1~6アルキルスルホニル、(C1~6ジアルキル)アミノ、C5~12ヘテロアリール、3~12員のヘテロシクリル、および-S-フェニル(フェニルは、1~5個のハロゲンにより必要に応じて置換されている)から選択される。実施形態(H)では、Rは、上記の置換基のいずれか、または上記の置換基のグループとすることができる。
一部の実施形態(J)では、式Iまたは式Iaの化合物中のR5aは、C1~6アルコキシ、C1~6ハロアルコキシ、C1~6アルキチオ、C1~6ハロアルキチオ、C1~6アルキルスルホニル、(C1~6ジアルキル)アミノ、C5~12ヘテロアリール、3~12員のヘテロシクリル、および-O-フェニル(フェニルは、1~5個のハロゲンにより置換されている)から選択される。実施形態(J)では、Rは、上記の置換基のいずれか、または上記の置換基のグループとすることができる。
一部の実施形態(K)では、式Iまたは式Iaの化合物中のR5aは、C1~6アルコキシ、C1~6ハロアルコキシ、C1~6アルキチオ、C1~6ハロアルキチオ、C1~6アルキルスルホニル、(C1~6ジアルキル)アミノ、C5~12ヘテロアリール、-O-フェニル(フェニルは、1~5個のハロゲンにより置換されている)および-S-フェニル(フェニルは、1~5個のハロゲンにより必要に応じて置換されている)から選択される。実施形態(K)では、Rは、上記の置換基のいずれか、または上記の置換基のグループとすることができる。
一部の実施形態では、R5a中のハロゲンはそれぞれ、FおよびClから独立して選択される。一部の実施形態では、R5a中のハロゲンはそれぞれ、Fである。
一部の実施形態では、R5aは、構造:
Figure 0007113815000018
を有する部分であり、式中、R5b、R5c、R5d、R5eおよびR5fは、水素およびハロゲンから独立して選択され、波線は、化合物への結合点を表す。
一部の実施形態では:
5cはハロゲンであり、R5dはHであり、R5eはHであり、R5fはHであり、かつR5gはHであるか;または
5cはHであり、R5dはハロゲンであり、R5eはHであり、R5fはHであり、かつR5gはHであるか;または
5cはHであり、R5dはHであり、R5eはハロゲンであり、R5fはHであり、かつR5gはHであるか;または
5cはHであり、R5dはHであり、R5eはHであり、R5fはハロゲンであり、かつR5gはHであるか;または
5cはHであり、R5dはHであり、R5eはHであり、R5fはHであり、かつR5gはハロゲンであるか;または
5cはハロゲンであり、R5dはハロゲンであり、R5eはHであり、R5fはHであり、かつR5gはHであるか;または
5cはハロゲンであり、R5dはHであり、R5eはハロゲンであり、R5fはHであり、かつR5gはHであるか;または
5cはハロゲンであり、R5dはHであり、R5eはHであり、R5fはハロゲンであり、かつR5gはHであるか;または
5cはハロゲンであり、R5dはHであり、R5eはHであり、R5fはHであり、かつR5gはハロゲンであるか;または
5cはHであり、R5dはハロゲンであり、R5eはハロゲンであり、R5fはHであり、かつR5gはHであるか;または
5cはHであり、R5dはハロゲンであり、R5eはHであり、R5fはハロゲンであり、かつR5gはHであるか;または
5cはHであり、R5dはハロゲンであり、R5eはHであり、R5fはHであり、かつR5gはハロゲンであるか;または
5cはHであり、R5dはHであり、R5eはハロゲンであり、R5fはハロゲンであり、かつR5gはHであるか;または
5cはHであり、R5dはHであり、R5eはハロゲンであり、R5fはHであり、かつR5gはハロゲンであるか;または
5cはHであり、R5dはHであり、R5eはHであり、R5fはハロゲンであり、かつR5gはハロゲンであるか;または
5cはハロゲンであり、R5dはハロゲンであり、R5eはハロゲンであり、R5fはHであり、かつR5gはHであるか;または
5cはハロゲンであり、R5dはハロゲンであり、R5eはHであり、R5fはハロゲンであり、かつR5gはHであるか;または
5cはハロゲンであり、R5dはハロゲンであり、R5eはHであり、R5fはHであり、かつR5gはハロゲンであるか;または
5cはハロゲンであり、R5dはHであり、R5eはハロゲンであり、R5fはハロゲンであり、かつR5gはHであるか;または
5cはハロゲンであり、R5dはHであり、R5eはハロゲンであり、R5fはHであり、かつR5gはハロゲンであるか;または
5cはハロゲンであり、R5dはHであり、R5eはHであり、R5fはハロゲンであり、かつR5gはハロゲンであるか;または
5cはHであり、R5dはハロゲンであり、R5eはハロゲンであり、R5fはハロゲンであり、かつR5gはHであるか;または
5cはHであり、R5dはハロゲンであり、R5eはハロゲンであり、R5fはHであり、かつR5gはハロゲンであるか;または
5cはHであり、R5dはハロゲンであり、R5eはHであり、R5fはハロゲンであり、かつR5gはハロゲンであるか;または
5cはHであり、R5dはHであり、R5eはハロゲンであり、R5fはハロゲンであり、かつR5gはハロゲンであるか;または
5cはHであり、R5dはハロゲンであり、R5eはハロゲンであり、R5fはハロゲンであり、かつR5gはハロゲンであるか;または
5cはハロゲンであり、R5dはHであり、R5eはハロゲンであり、R5fはハロゲンであり、かつR5gはハロゲンであるか;または
5cはハロゲンであり、R5dはハロゲンであり、R5eはハロゲンであり、R5fはHであり、かつR5gはハロゲンであるか;または
5cはハロゲンであり、R5dはハロゲンであり、R5eはハロゲンであり、R5fはハロゲンであり、かつR5gはHである。
一部の実施形態では:
5cはFもしくはClであり、R5dはHであり、R5eはHであり、R5fはHであり、かつR5gはHであるか;または
5cはHであり、R5dはFもしくはClであり、R5eはHであり、R5fはHであり、かつR5gはHであるか;または
5cはHであり、R5dはHであり、R5eはFもしくはClであり、R5fはHであり、かつR5gはHであるか;または
5cはHであり、R5dはHであり、R5eはHであり、R5fはFもしくはClであり、かつR5gはHであるか;または
5cはHであり、R5dはHであり、R5eはHであり、R5fはHであり、かつR5gはFもしくはClであるか;または
5cはFもしくはClであり、R5dはFもしくはClであり、R5eはHであり、R5fはHであり、かつR5gはHであるか;または
5cはFもしくはClであり、R5dはHであり、R5eはFもしくはClであり、R5fはHであり、かつR5gはHであるか;または
5cはFもしくはClであり、R5dはHであり、R5eはHであり、R5fはFもしくはClであり、かつR5gはHであるか;または
5cはFもしくはClであり、R5dはHであり、R5eはHであり、R5fはHであり、かつR5gはFもしくはClであるか;または
5cはHであり、R5dはFもしくはClであり、R5eはFもしくはClであり、R5fはHであり、かつR5gはHであるか;または
5cはHであり、R5dはFもしくはClであり、R5eはHであり、R5fはFもしくはClであり、かつR5gはHであるか;または
5cはHであり、R5dはFもしくはClであり、R5eはHであり、R5fはHであり、かつR5gはFもしくはClであるか;または
5cはHであり、R5dはHであり、R5eはFもしくはClであり、R5fはFもしくはClであり、かつR5gはHであるか;または
5cはHであり、R5dはHであり、R5eはFもしくはClであり、R5fはHであり、かつR5gはFもしくはClであるか;または
5cはHであり、R5dはHであり、R5eはHであり、R5fはFもしくはClであり、かつR5gはFもしくはClであるか;または
5cはFもしくはClであり、R5dはFもしくはClであり、R5eはFもしくはClであり、R5fはHであり、かつR5gはHであるか;または
5cはFもしくはClであり、R5dはFもしくはClであり、R5eはHであり、R5fはFもしくはClであり、かつR5gはHであるか;または
5cはFもしくはClであり、R5dはFもしくはClであり、R5eはHであり、R5fはHであり、かつR5gはFもしくはClであるか;または
5cはFもしくはClであり、R5dはHであり、R5eはFもしくはClであり、R5fはFもしくはClであり、かつR5gはHであるか;または
5cはFもしくはClであり、R5dはHであり、R5eはFもしくはClであり、R5fはHであり、かつR5gはFもしくはClであるか;または
5cはFもしくはClであり、R5dはHであり、R5eはHであり、R5fはFもしくはClであり、かつR5gはFもしくはClであるか;または
5cはHであり、R5dはFもしくはClであり、R5eはFもしくはClであり、R5fはFもしくはClであり、かつR5gはHであるか;または
5cはHであり、R5dはFもしくはClであり、R5eはFもしくはClであり、R5fはHであり、かつR5gはFもしくはClであるか;または
5cはHであり、R5dはFもしくはClであり、R5eはHであり、R5fはFもしくはClであり、かつR5gはFもしくはClであるか;または
5cはHであり、R5dはHであり、R5eはFもしくはClであり、R5fはFもしくはClであり、かつR5gはFもしくはClであるか;または
5cはHであり、R5dはFもしくはClであり、R5eはFもしくはClであり、R5fはFもしくはClであり、かつR5gはFもしくはClであるか;または
5cはFもしくはClであり、R5dはHであり、R5eはFもしくはClであり、R5fはFもしくはClであり、かつR5gはFもしくはClであるか;または
5cはFもしくはClであり、R5dはFもしくはClであり、R5eはFもしくはClであり、R5fはHであり、かつR5gはFもしくはClであるか;または
5cはFもしくはClであり、R5dはFもしくはClであり、R5eはFもしくはClであり、R5fはFもしくはClであり、かつR5gはHである。
一部の実施形態では:
5cはFであり、R5dはHであり、R5eはHであり、R5fはHであり、かつR5gはHであるか;または
5cはHであり、R5dはFであり、R5eはHであり、R5fはHであり、かつR5gはHであるか;または
5cはHであり、R5dはHであり、R5eはFであり、R5fはHであり、かつR5gはHであるか;または
5cはHであり、R5dはHであり、R5eはHであり、R5fはFであり、かつR5gはHであるか;または
5cはHであり、R5dはHであり、R5eはHであり、R5fはHであり、かつR5gはFであるか;または
5cはFであり、R5dはFであり、R5eはHであり、R5fはHであり、かつR5gはHであるか;または
5cはFであり、R5dはHであり、R5eはFであり、R5fはHであり、かつR5gはHであるか;または
5cはFであり、R5dはHであり、R5eはHであり、R5fはFであり、かつR5gはHであるか;または
5cはFであり、R5dはHであり、R5eはHであり、R5fはHであり、かつR5gはFであるか;または
5cはHであり、R5dはFであり、R5eはFであり、R5fはHであり、かつR5gはHであるか;または
5cはHであり、R5dはFであり、R5eはHであり、R5fはFであり、かつR5gはHであるか;または
5cはHであり、R5dはFであり、R5eはHであり、R5fはHであり、かつR5gはFであるか;または
5cはHであり、R5dはHであり、R5eはFであり、R5fはFであり、かつR5gはHであるか;または
5cはHであり、R5dはHであり、R5eはFであり、R5fはHであり、かつR5gはFであるか;または
5cはHであり、R5dはHであり、R5eはHであり、R5fはFであり、かつR5gはFであるか;または
5cはFであり、R5dはFであり、R5eはFであり、R5fはHであり、かつR5gはHであるか;または
5cはFであり、R5dはFであり、R5eはHであり、R5fはFであり、かつR5gはHであるか;または
5cはFであり、R5dはFであり、R5eはHであり、R5fはHであり、かつR5gはFであるか;または
5cはFであり、R5dはHであり、R5eはFであり、R5fはFであり、かつR5gはHであるか;または
5cはFであり、R5dはHであり、R5eはFであり、R5fはHであり、かつR5gはFであるか;または
5cはFであり、R5dはHであり、R5eはHであり、R5fはFであり、かつR5gはFであるか;または
5cはHであり、R5dはFであり、R5eはFであり、R5fはFであり、かつR5gはHであるか;または
5cはHであり、R5dはFであり、R5eはFであり、R5fはHであり、かつR5gはFであるか;または
5cはHであり、R5dはFであり、R5eはHであり、R5fはFであり、かつR5gはFであるか;または
5cはHであり、R5dはHであり、R5eはFであり、R5fはFであり、かつR5gはFであるか;または
5cはHであり、R5dはFであり、R5eはFであり、R5fはFであり、かつR5gはFであるか;または
5cはFであり、R5dはHであり、R5eはFであり、R5fはFであり、かつR5gはFであるか;または
5cはFであり、R5dはFであり、R5eはFであり、R5fはHであり、かつR5gはFであるか;または
5cはFであり、R5dはFであり、R5eはFであり、R5fはFであり、かつR5gはHである。
ある特定の実施形態では、R5aは、2,3,5,6-テトラフルオロフェノキシではない。
一部の実施形態では、本発明は、R5aが、2-フルオロフェノキシ、3-フルオロフェノキシ、4-フルオロフェノキシ、2,3-ジフルオロフェノキシ、2,4-ジフルオロフェノキシ、2,5-ジフルオロフェノキシ、2,6-ジフルオロフェノキシ、3,4-ジフルオロフェノキシ、3,5-ジフルオロフェノキシ、2,3,6-トリフルオロフェノキシ、および2,3,5-トリフルオロフェノキシから選択される、式Iの化合物およびその薬学的に許容される塩を提供する。一部のこのような実施形態では、R5aは、2-フルオロフェノキシ、3 フルオロフェノキシ、2,3-ジフルオロフェノキシ、2,5-ジフルオロフェノキシ、2,6-ジフルオロフェノキシ、3,5-ジフルオロフェノキシ、2,3,6-トリフルオロフェノキシおよび2,3,5-トリフルオロフェノキシから選択される。一部のこのような実施形態では、R5aは、2,6-ジフルオロフェノキシおよび2,3,6-トリフルオロフェノキシから選択される。
一部の実施形態では、本発明は、R5aが、2-フルオロフェノキシ、3-フルオロフェノキシ、4-フルオロフェノキシ、2,3-ジフルオロフェノキシ、2,4-ジフルオロフェノキシ、2,5-ジフルオロフェノキシ、2,6-ジフルオロフェノキシ、3,4-ジフルオロフェノキシ、3,5-ジフルオロフェノキシ、2,3,6-トリフルオロフェノキシ、および2,3,5-トリフルオロフェノキシから選択される、式Iaの化合物およびその薬学的に許容される塩を提供する。一部のこのような実施形態では、R5aは、2-フルオロフェノキシ、3 フルオロフェノキシ、2,3-ジフルオロフェノキシ、2,5-ジフルオロフェノキシ、2,6-ジフルオロフェノキシ、3,5-ジフルオロフェノキシ、2,3,6-トリフルオロフェノキシおよび2,3,5-トリフルオロフェノキシから選択される。一部のこのような実施形態では、R5aは、2,6-ジフルオロフェノキシおよび2,3,6-トリフルオロフェノキシから選択される。
一部の実施形態では、本発明は、R5aが、-N(R、5~12員のヘテロアリールおよび3~12員のヘテロシクリルから選択され、~12員のヘテロアリールは、ハロゲン、C1~3アルキルおよびC1~3ハロアルキルから独立して選択される1つまたは複数のメンバーにより必要に応じて置換されており、3~12員のヘテロシクリルは、オキソ、ハロゲン、C1~3アルキルおよびC1~3ハロアルキルから独立して選択される1つまたは複数のメンバーにより必要に応じて置換されている、式Iまたは式Iaの化合物およびそれらの薬学的に許容される塩を提供する。
一部の実施形態では、R5aは、5~12員のヘテロアリールまたは3~12員のヘテロシクリルである。R5aは、例えば、ピロリル、ピリジニル、イミダゾリル、ピラゾリル、トリアゾリル、テトラゾリル、ピラジニル、トリアジニル、インドリル、イソインドリルまたはキノリニルとすることができる。一部の実施形態では、R5aは、テトラゾリル(例えば、1H-テトラゾール-1-イルまたは2H-テトラゾール-2-イル)である。一部の実施形態では、R5aは6-オキソピリミジン-1(6H)-イルである。一部の実施形態では、R5aは、テトラゾリルまたは6-オキソピリミジン-1(6H)-イルであり、Rは、(2-メトキシ)プロパン-2-イル、無置換フェニル、フェニル(1個または複数のハロゲン、-N、C1~4ハロアルコキシおよび/または-NRC(O)Rにより置換されている)、無置換ピリジニルおよびピリジニル(1個または複数のハロゲン、-N(Rおよび/または-N(Rにより置換されている)から選択される。
一部の実施形態では、R5aは、-N(Rであり、式中、Rはそれぞれ、独立して選択されるC1~6アルキルである。このような実施形態では、Rはそれぞれ、独立して、例えば、メチル、エチル、n-プロピル、イソプロピル、n-ブチル、イソブチル、sec-ブチル、tert-ブチル、n-ペンチル、イソペンチルまたはn-ヘキシルとすることができる。一部の実施形態では、R5aはジメチルアミノである。一部の実施形態では、R5aは、ジメチルアミノであり、Rは、(2-メトキシ)プロパン-2-イル、無置換フェニル、フェニル(1個または複数のハロゲン、-N、C1~4ハロアルコキシおよび/または-NRC(O)Rにより置換されている)、無置換ピリジニルおよびピリジニル(1個または複数のハロゲン、-N(Rおよび/または-N(Rにより置換されている)から選択される。
一部の実施形態では、R5aは、-O-Rであり、RはC1~6ハロアルキルである。このような実施形態では、Rは、例えば、クロロメチル、ジクロロメチル、トリクロロメチル、フルオロメチル、ジフルオロメチル、トリフルオロメチル、2,2,2-トリクロロエチル、2,2,2-トリフルオロエチル、ペンタクロロエチル、ペンタフルオロエチル、1,1,1,3,3,3-ヘキサクロロプロピル、1,1,1,3,3,3-ヘキサフルオロプロピルなどとすることができる。一部の実施形態では、R5aは、2,2,2-トリフルオロエトキシおよび1,1,1,3,3,3-ヘキサフルオロイソプロポキシから選択される。一部のこのような実施形態では、Rは、(2-メトキシ)プロパン-2-イル、無置換フェニル、フェニル(1個または複数のハロゲン、-N、C1~4ハロアルコキシおよび/または-NRC(O)Rにより置換されている)、無置換ピリジニルおよびピリジニル(1個または複数のハロゲン、-N(Rおよび/または-N(Rにより置換されている)から選択される。
一部の実施形態では、R5aは-O-Rであり、Rは、ハロゲン、C1~3アルキルおよびC1~3ハロアルキルから独立して選択される1つまたは複数のメンバーにより必要に応じて置換されている5~12員のヘテロアリールである。R5aが-O-Rである場合、例えば、Rは、イソオキサゾリル、オキサゾリル、イミダゾリル、ピラゾリル、ピリジニル、オキサジニル、ピリミジニル、ピラジニル、ピリダジニルとすることができる。一部の実施形態では、R5aは-O-Rであり、Rは、ピリジン-2-イル、ピリジン-3-イル、ピリジン-4-イル、イソオキサゾール-3-イル、イソオキサゾール-4-イル、イソオキサゾール-5-イル、ピリミジン-2-イル、ピリミジン-4-イル、ピリミジン-5-イルおよびピリミジン-6-イルから選択される。一部の実施形態では、R5aは-O-Rであり、Rは、イソオキサゾール-3-イル、ピリジン-3-イル、ピリジン-4-イル、2,6-ジメチルピリジン-5-イルおよび2-メチルピリミジン-5-イルから選択される。一部の実施形態では、R5aは、-O-Rであり、Rは、イソオキサゾール-3-イル、ピリジン-3-イル、ピリジン-4-イル、2,6-ジメチルピリジン-5-イルおよび2-メチルピリミジン-5-イルから選択され、Rは、(2-メトキシ)プロパン-2-イル、無置換フェニル、フェニル(1個または複数のハロゲン、-N、C1~4ハロアルコキシおよび/または-NRC(O)Rにより置換されている)、無置換ピリジニルおよびピリジニル(1個または複数のハロゲン、-N(Rおよび/または-N(Rにより置換されている)から選択される。
一部の実施形態では、Rは、-CH5aおよび-CHS(O)(R5bから選択される。一部の実施形態では、Rは、-CHS(O)(R5b(例えば、ジメチル(オキソ)-λ-スルファニリデン)である。一部の実施形態では、Rは-CH5aであり、R5aは、-S-Rおよび-SO-Rから選択され、RはC1~6アルキルである。このような実施形態では、Rは、例えば、メチル、エチル、n-プロピル、イソプロピル、n-ブチル、イソブチル、sec-ブチル、tert-ブチル、n-ペンチル、イソペンチルまたはn-ヘキシルとすることができる。一部の実施形態では、R5aはメチルチオである。一部の実施形態では、R5aはメチルスルホニルである。一部の実施形態では、R5aは、メチルチオまたはメチルスルホニルであり、Rは、(2-メトキシ)プロパン-2-イル、無置換フェニル、フェニル(1個または複数のハロゲン、-N、C1~4ハロアルコキシおよび/または-NRC(O)Rにより置換されている)、無置換ピリジニルおよびピリジニル(1個または複数のハロゲン、-N(Rおよび/または-N(Rにより置換されている)から選択される。
一部の実施形態では、R5aは-S-Rであり、Rは、ハロゲン、C1~3アルキルおよびC1~3ハロアルキルから独立して選択される1つまたは複数のメンバーにより必要に応じて置換されている5~12員のヘテロアリールである。R5aが-S-Rである場合、例えば、Rは、イソオキサゾリル、オキサゾリル、イミダゾリル、ピラゾリル、ピリジニル、オキサジニル、ピリミジニル、ピラジニル、ピリダジニルとすることができる。一部の実施形態では、R5aは-S-Rであり、Rは、ピリジン-2-イル、ピリジン-3-イル、ピリジン-4-イル、イソオキサゾール-3-イル、イソオキサゾール-4-イル、イソオキサゾール-5-イル、ピリミジン-2-イル、ピリミジン-4-イル、ピリミジン-5-イルおよびピリミジン-6-イルから選択される。一部の実施形態では、R5aは-S-Rであり、Rは、イソオキサゾール-3-イル、ピリジン-3-イル、ピリジン-4-イル、2,6-ジメチルピリジン-5-イルおよび2-メチルピリミジン-5-イルから選択される。一部の実施形態では、R5aは、-S-Rであり、Rは、ピリジン-3-イル、ピリジン-4-イル、2,6-ジメチルピリジン-5-イルおよび2-メチルピリミジン-5-イルから選択され、Rは、(2-メトキシ)プロパン-2-イル、無置換フェニル、フェニル(1個または複数のハロゲン、-N、C1~4ハロアルコキシおよび/または-NRC(O)Rにより置換されている)、無置換ピリジニルおよびピリジニル(1個または複数のハロゲン、-N(Rおよび/または-N(Rにより置換されている)から選択される。
一部の実施形態では、RはC1~6ハロアルキルである。Rは、例えば、クロロメチル、ジクロロメチル、トリクロロメチル、フルオロメチル、ジフルオロメチル、トリフルオロメチル、2,2,2-トリクロロエチル、2,2,2-トリフルオロエチル、ペンタクロロエチル、ペンタフルオロエチル、1,1,1,3,3,3-ヘキサクロロプロピル、1,1,1,3,3,3-ヘキサフルオロプロピルなどとすることができる。一部の実施形態では、Rはジフルオロメチルである。一部のこのような実施形態では、Rはジフルオロメチルであり、そしてRは、(2-メトキシ)プロパン-2-イル、無置換フェニル、フェニル(1個または複数のハロゲン、-N、C1~4ハロアルコキシおよび/または-NRC(O)Rにより置換されている)、無置換ピリジニルおよびピリジニル(1個または複数のハロゲン、-N(Rおよび/または-N(Rにより置換されている)から選択される。
一部の実施形態では、本発明は、Rがハロアルキルである、式Iまたは式Iaの化合物およびそれらの薬学的に許容される塩を提供する。例えば、Rは、クロロメチル、ジクロロメチル、トリクロロメチル、ジフルオロメチルまたはトリフルオロメチルとすることができる。
一部の実施形態では、本発明は、以下の表1に示されている化合物またはその薬学的に許容される塩を提供する。
Figure 0007113815000019
Figure 0007113815000020
Figure 0007113815000021
Figure 0007113815000022
Figure 0007113815000023
Figure 0007113815000024
Figure 0007113815000025
Figure 0007113815000026
Figure 0007113815000027
Figure 0007113815000028
Figure 0007113815000029
Figure 0007113815000030
Figure 0007113815000031
Figure 0007113815000032
Figure 0007113815000033
Figure 0007113815000034
Figure 0007113815000035
Figure 0007113815000036
Figure 0007113815000037
Figure 0007113815000038
Figure 0007113815000039
Figure 0007113815000040
Figure 0007113815000041
Figure 0007113815000042
Figure 0007113815000043
Figure 0007113815000044
一部の実施形態では、本化合物は、
Figure 0007113815000045
Figure 0007113815000046
Figure 0007113815000047
Figure 0007113815000048
ならびにそれらの薬学的に許容される塩から選択される。
一部の実施形態では、本化合物は、
Figure 0007113815000049
Figure 0007113815000050
Figure 0007113815000051
Figure 0007113815000052
ならびにそれらの薬学的に許容される塩から選択される。
本明細書に記載されている化合物、およびそれらを使用する方法は、記載されている化合物の治療上活性な鏡像異性体またはジアステレオマーの調製および使用を包含する。これらの化合物のこのような鏡像異性体およびジアステレオマーはすべて、本発明の範囲に含まれている。このような化合物は、混合物(例えば、ラセミ混合物)として、または単離された鏡像異性体もしくはジアステレオマーとして使用することができる。
本発明の化合物は、ポジトロン断層法(PET)および単一光子放射コンピュータ断層撮影法(SPECT)などの診断用イメージング用途において使用するための放射性核種を含むよう調製することができる。例えば、本明細書に記載されているKgp阻害剤は、酸素-15(15O)、窒素-13(13N)、炭素-11(11C)、ヨウ素-131(131I)およびフッ素-18(18F)から選択される1種または複数種の放射性核種を含むよう調製することができる。このような放射標識化合物は、PETイメージングに使用することができる。本発明の化合物はまた、重水素化形態(すなわち、もう1個の水素原子の代わりに、1個または複数の重水素原子、Hを有する)、トリチウム化形態(すなわち、もう1個の水素原子の代わりに、1個または複数のトリチウム原子、Hを有する)、または14C標識形態(すなわち、もう1個の炭素原子の代わりに、1個または複数の14C原子を有する)でも調製することができる。
本発明の化合物は、スキーム1に示されているように、出発物質A1を使用して調製することができる。A1では、好ましいRおよびR1c基は、他方に影響を及ぼすことがない化学条件を使用して操作することができる。例えば、R1c=ベンジルは、水素およびパラジウム炭素触媒によって除去することができるが、R1cは、トリフルオロ酢酸によって影響を受けない一方、R=t-ブチルは、トリフルオロ酢酸によって除去することができるが、Rは、水素およびパラジウム炭素触媒によって影響を受けない。RおよびR1cの他の適切な推奨される(complimentary)組合せ、ならびにそれらの選択的な修飾方法は、当分野において公知である。
スキーム1
Figure 0007113815000053
A1は、有機溶媒(例えば、DMF)中、カルボン酸RCOHおよびラセミ化防止剤(例えば、HOBt)および脱水剤(例えば、EDAC)で処理して、A2を生成することができる。あるいは、A1は、有機溶媒(例えば、CHCl)中、RCOX(式中、Xは脱離基(例えば、塩化物)である)および有機塩基(例えば、EtN)で処理して、A2を生成することができる。様々な適用可能なカルボン酸(RCOH)およびその誘導体(RCOX)が、市販されているか、または公知の方法に従って調製することができる。Rは、適切な化学条件によって除去して、A3を生成することができる。A3を、クロロギ酸エステル(例えば、クロロギ酸イソブチル、クロロギ酸エチルなど)と、続いてジアゾメタンと反応させると、A4を得ることができる。A4は、ハロゲン化水素酸(すなわち、HX、式中、XはCl、BrまたはIなどのハロゲンである)での処理によって、A5に変換することができる。塩基の存在下で、化合物R5a-H(例えば、ハロゲン化フェノールまたは複素芳香族化合物)を使用するA5からのハロゲン化物の置き換えにより、保護化合物A6を得ることができ、これを脱保護すると、式Iの生成物を得ることができる。あるいは、カルボン酸A3をN-アシル化または環化して、対応する5(4H)-オキサゾロンを得ることができる。オキサゾロンは、α-フルオロ化カルボン酸の無水物(例えば、トリフルオロ酢酸無水物)とさらに反応させて、C-アシル化5(4H)-オキサゾロンを得ることができ、これは、シュウ酸を使用して脱カルボニル化し、式Iの化合物(式中、Rはハロアルキルである)を形成する(Kolbら、Liebigs. Ann. Chem.、1990年、1~6頁;Kolbら、Tet. Lett. 1986年、(27号):1579~1582頁および4437~4440頁を参照されたい)。
式(I)のある種の例の調製は、タンパク質中で見られるアミノ酸のいずれにおいても存在しない側鎖を特徴とする、非天然アミノ酸を最初に調製する必要があろう。下に要約したような、最も有用かつ重要な方法F1~4を含めた、非天然側鎖を特徴とするアミノ酸の調製に関する多様な方法が公開されている。
F1~3では図示されていないが、アミンおよびカルボン酸基は、通常、これらの方法を適用する前に保護され、この保護は、非天然側鎖の構築後に除去される。F1では、天然側鎖(R)を修飾して、非天然側鎖(R’)を形成する。天然アミノ酸であるセリン、グルタミン酸およびメチオニンは、とりわけ、式(I)および(II)の特定の例の調製用である。F2では、メタル化グリシン誘導体をアルキル化剤(R’X)で処理して、非天然側鎖(R’)を導入する。一部の場合、メタル化グリシン誘導体は、グリシン誘導体を強塩基性メタル化剤(例えば、リチウムジイソプロピルアミドまたはカリウムt-ブトキシド)で処理することにより生成される。他の場合では、出発グリシン誘導体は、かなり塩基性の低いメタル化剤(例えば、炭酸カリウム)で申し分ない程、十分に酸性である。
Figure 0007113815000054
後者の場合、メタル化グリシン誘導体は、F2に図示されている共有結合している種としてよりも、解離イオン対として存在することがある。F3では、メタル化アラニン誘導体をアルキル化剤(R’X)で処理して、非天然側鎖(R’)を導入する。ほとんどの場合では、メタル化アラニン誘導体は、ハロゲン化アラニン誘導体を低原子価金属(例えば、亜鉛粉末)で処理することにより生成する。多くの場合、可溶性パラジウム触媒を利用して、F3を促進させる。F4では、アルデヒド(R’CHO)をアンモニア源およびシアン化物源と反応させるとアミノニトリルが生成し、これを、次いで、加水分解すると、非天然側鎖(R’)を特徴とするアミノ酸が生成する。
F1~3では図示されていないが、アミンおよびカルボン酸基は、通常、これらの方法を適用する前に保護され、この保護は、非天然側鎖の構築後に除去される。F1では、天然側鎖(R)を修飾して、非天然側鎖(R’)を形成する。天然アミノ酸であるセリン、グルタミン酸およびメチオニンは、とりわけ、式(I)および(II)の特定の例の調製用である。F2では、メタル化グリシン誘導体をアルキル化剤(R’X)で処理して、非天然側鎖(R’)を導入する。一部の場合、メタル化グリシン誘導体は、グリシン誘導体を強塩基性メタル化剤(例えば、リチウムジイソプロピルアミドまたはカリウムt-ブトキシド)で処理することにより生成される。他の場合では、出発グリシン誘導体は、かなり塩基性の低いメタル化剤(例えば、炭酸カリウム)で申し分ない程、十分に酸性である。後者の場合、メタル化グリシン誘導体は、F2に図示されている共有結合している種としてよりも、解離イオン対として存在することがある。F3では、メタル化アラニン誘導体をアルキル化剤(R’X)で処理して、非天然側鎖(R’)を導入する。ほとんどの場合では、メタル化アラニン誘導体は、ハロゲン化アラニン誘導体を低原子価金属(例えば、亜鉛粉末)で処理することにより生成する。多くの場合、可溶性パラジウム触媒を利用して、F3を促進させる。F4では、アルデヒド(R’CHO)をアンモニア源およびシアン化物源と反応させるとアミノニトリルが生成し、これを、次いで、加水分解すると、非天然側鎖(R’)を特徴とするアミノ酸が生成する。
非天然側鎖を特徴とするアミノ酸を調製する適切な方法を適用した後、これらのアミノ酸は、上で記載されている通り、適切に保護することができ、次に、適切な方法を適用すると、リシン側鎖が非天然側鎖に置きかえられている、中間体および生成物を生成することができる。したがって、好適な方法を利用して、式(I)に特有の、CHAC(R2a)(R2b)CHN(R1a)(R1b)のバリエーションをもたらすことができる。
IV.リシンジンジパイン阻害剤の医薬組成物および投与
関連する態様では、本発明は、式Iの化合物および薬学的に許容される添加剤を含む医薬組成物を提供する。
医薬組成物は、製剤学および薬物送達の分野において周知の方法のいずれかによって調製することができる。一般に、組成物を調製する方法は、活性成分を1つまたは複数の補助成分を含有する担体と一緒にするステップを含む。医薬組成物は、通常、活性成分と、液体担体もしくは微粉砕固体担体またはそれらの両方とを均一かつ密に一緒にし、次に、必要な場合、この生成物を所望の製剤に成形することにより調製される。本組成物は、単位剤形で都合よく調製および/または包装することができる。
本発明の化合物を含有する医薬組成物は、経口使用向けに製剤化することができる。経口投与に適した組成物には、これらに限定されないが、錠剤、トローチ剤、ロセンジ剤、水性または油性懸濁液剤、分散性散剤または顆粒剤、エマルション剤、硬質または軟質カプセル剤、シロップ剤、エリキシル剤、溶液剤、口内パッチ剤、経口ゲル剤、咀嚼ガム剤、咀嚼錠剤、起泡性散剤および起泡性錠剤が含まれる。経口投与用組成物は、当業者に公知の任意の方法によって製剤化することができる。このような組成物は、医薬として洗練され、かつ口当たりのよい調製剤をもたらすために、甘味剤、着香剤、着色剤、抗酸化剤および保存剤から選択される1種または複数種の作用剤を含有することができる。
錠剤は、一般に、セルロース、二酸化ケイ素、酸化アルミニウム、炭酸カルシウム、炭酸ナトリウム、グルコース、マンニトール、ソルビトール、ラクトース、リン酸カルシウムおよびリン酸ナトリウムなどの不活性賦形剤、トウモロコシデンプンおよびアルギン酸などの造粒剤および崩壊剤、ポリビニルピロリドン(PVP)、セルロース、ポリエチレングリコール(PEG)、デンプン、ゼラチンおよびアカシアなどの結合剤、ならびにステアリン酸マグネシウム、ステアリン酸およびタルクなどの滑沢剤を含めた、非毒性の薬学的に許容される添加剤と混合された形で活性成分を含有する。錠剤は、コーティングされていなくてもよく、または腸溶性の、もしくは他の、胃腸管における崩壊および吸収を遅延させるための公知技法によりコーティングされ、これにより、より長い期間にわたる持続作用をもたらすことができる。例えば、モノステアリン酸グリセリルまたはジステアリン酸グリセリルなどの時間遅延物質を使用することができる。錠剤は、制御放出のための浸透ポンプ組成物を形成するために、公知の技法に従い、半透過膜および必要に応じてのポリマー状オスモジェント(osmogent)によりコーティングすることもできる。
経口投与用の組成物は、活性成分が不活発な固体賦形剤(炭酸カルシウム、リン酸カルシウムもしくはカオリンなど)と混合されている、硬質ゼラチンカプセル剤として、あるいは活性成分が水または油性媒体(ピーナッツ油、流動パラフィンもしくはオリーブ油など)と混合されている、軟質ゼラチンカプセル剤として製剤化することができる。
Kgp阻害剤は、溶液剤、軟膏剤、クリーム剤、ゲル剤または懸濁液剤として、および口腔洗液剤、点眼剤などで局所的に投与することもできる。さらに、Kgp阻害剤の経皮送達は、イオノフォレーシス(iontophoretic)パッチ剤などにより実現することができる。
Kgp阻害剤を含有する医薬組成物は、滅菌の注射可能な水性または油性の溶液剤および懸濁液剤の形態とすることもできる。滅菌の注射可能な調製剤は、水、リンゲル液および等張性塩化ナトリウム溶液、および1,3-ブタンジオールなどの許容可能な溶媒を含めた、非毒性の非経口的に許容可能なビヒクルを使用して製剤化することができる。さらに、滅菌の不揮発性油を、溶媒または懸濁媒体として使用することができる。この目的のため、合成モノグリセリド、ジグリセリドまたはトリグリセリドを含めた、任意の無刺激性の不揮発性油を使用することができる。
一部の実施形態では、Kgp阻害剤は、Pluronic F127などのポリマーと共に製剤化され得、皮下に送達され得る。Pluronicは、体温で固化するヒドロゲルであり、数日間から数週間続く期間にわたって、薬物送達の延長を実現することができる。
水性懸濁液剤は、これらに限定されないが、カルボキシメチルセルロースナトリウム、メチルセルロース、油性(oleagino)-プロピルメチルセルロース、アルギン酸ナトリウム、ポリビニル-ピロリドン、トラガカントガムおよびアカシアガムなどの懸濁化剤、レシチン、ステアリン酸ポリオキシエチレンおよびポリエチレンソルビタンモノオレートなどの分散剤または湿潤剤、ならびに安息香酸エチル、安息香酸n-プロピルおよび安息香酸p-ヒドロキシなどの保存剤を含めた、添加剤と混合された形で、1つまたは複数のKgp阻害剤を含有することができる。分散性の散剤および顆粒剤(水の添加により水性懸濁液剤を調製するのに適している)は、分散剤、湿潤剤、懸濁化剤またはそれらの組合せと混合された形で、1つまたは複数のKgp阻害剤を含有することができる。油性(oily)懸濁液剤は、植物性油(例えば、落花生油、オリーブ油、ゴマ油またはココナッツ油)中、または鉱物油(例えば、流動パラフィン)中にKgp阻害剤を懸濁させることにより製剤化することができる。油性懸濁液剤は、1種または複数種の増粘剤、例えばビーワックス、硬質パラフィンまたはセチルアルコールを含有することができる。これらの組成物は、アスコルビン酸などの抗酸化剤の添加によって保存することができる。
本発明の医薬組成物は、水中油型エマルション剤の形態とすることもできる。油性相は、植物性油、例えばオリーブ油もしくは落花生油、または鉱物油、例えば流動パラフィン、またはこれらの混合物とすることができる。適切な乳化剤は、アカシアガムまたはトラガカントガムなどの天然由来のガム、ダイズレシチンなどの天然由来のリン脂質、モノオレイン酸ソルビタンなどの脂肪酸およびヘキシトール無水物から誘導されるエステルまたは部分エステル、ならびにポリオキシエチレンソルビタンモノオレートなどの前記部分エステルとエチレンオキシドとの縮合生成物とすることができる。
能動的な輸送を促進するためのハイブリッド分子またはナノ粒子の使用は、ある特定の実施形態で、血液脳関門での輸送を高めるために使用することができる。脳への侵入を向上させるために、LPR-1受容体、トランスフェリン受容体、EGF様増殖因子またはグルタチオントランスポーターを含めた血液脳関門を越えてタンパク質を輸送する受容体に結合する、例えばリポソーム、タンパク質、工学操作されているペプチド化合物または抗体を使用することができる。浸透性開口部、超音波、レーザー、翼口蓋神経節の刺激、頭蓋内直接、くも膜下、またはポンプによる脳室内送達を含めた、物理的な技法を使用することができる。
本発明による医薬組成物は、P.gingivalis感染に関連する状態の処置において有用な、1つまたは複数の追加の活性剤も含むことができる。ある特定の実施形態では、本発明は、1つまたは複数の本明細書に記載されているKgp阻害剤を、アルツハイマー病の処置のための1つまたは複数の追加の活性剤と組み合わせて含む医薬組成物を提供する。アルツハイマー病の処置のためのいくつかの治療薬が開発中および臨床使用中である。治療戦略には、β-アミロイドおよびタウ(以下により詳細に記載されている)の循環レベルの低下、微小管の安定化、アテローム性プラークの除去、オートファジーのモジュレート、神経伝達物質レベルのモジュレートおよびGABA(A)α5受容体の阻害が含まれる。このような治療薬は、アルツハイマー病を有する対象における認知機能を維持および/または回復することができ、認知機能の後退を遅延させることができ、脳の神経可塑性および回復を促進することができる。
医薬組成物中のKgp阻害剤と一緒にすることができる活性剤には、これらに限定されないが、抗生物質(すなわち、殺菌性化合物および静菌性化合物)、コリンエステラーゼ阻害剤、アルファ-7ニコチン酸受容体モジュレーター、セロトニンモジュレーター、NMDAモジュレーター、Aβ標的治療剤(therapy)、ApoE標的治療剤、ミクログリア標的治療剤、血液/脳関門標的治療剤、タウ標的治療剤、補体標的治療剤および抗炎症剤(anti-inflammatory)が含まれる。
いかなる好適な抗生物質も、本発明の医薬組成物において1つまたは複数のKgp阻害剤と一緒にすることができる。ある特定の実施形態では、本発明は、もう1つのKgp阻害剤、およびP.gingivalisに25μg/ml未満のMIC50を有する抗生物質を含有する医薬組成物を提供する。例えば、抗生物質のP.gingivalisへのMIC50は、20μg/ml未満、15μg/ml未満、10μg/ml未満、8μg/ml未満、6μg/ml未満または5μg/ml未満であり得る。一部の実施形態では、抗生物質のP.gingivalisへのMIC50は、1μg/ml未満である。一部の実施形態では、抗生物質のP.gingivalisへのMIC50は、0.2μg/ml未満である。
殺菌性および静菌性化合物の例には、これらに限定されないが、キノロン系(例えば、モキシフロキサシン、ゲミフロキサシン、シプロフロキサシン、オフラキサシン、トロバフロキサシン、シタフロキサシンなど)、β-ラクタム系(例えば、アモキシシリン、アモキシシリン(amoxacilin)-クラブラン酸塩、ピペラシリン-タゾバクタム、ペニシリンGなどのペニシリン、およびセフトリアキソンなどのセファロスポリン)、マクロライド系(例えば、エリスロマイシン、アジスロマイシン、クラリスロマイシンなど)、カルバペネム系(例えば、ドリペネム、イミペネム、メロペネム(meropinem)、エルタペネムなど)、チアゾリド系(例えば、チゾキサニジン(tizoxanidine)、ニタゾキサニジン(nitazoxanidine)、RM4807、RM4809など)、テトラサイクリン系(例えば、テトラサイクリン、ミノサイクリン、ドキシサイクリン、エラバサイクリンなど)、クリンダマイシン、メトロニダゾール、およびサトラニダゾールが含まれる。殺菌性および静菌性化合物には、嫌気性グラム陰性菌による生物膜の形成を阻害するか、または他の方法で、それを妨害する薬剤も含まれる。このような薬剤には、オキサンテル、モランテル、チアベンダゾールなどが含まれる。本発明の組成物は、1つまたは複数(例えば、2つ、3つ、4つ、5つ、6つまたはそれより多く)の殺菌性/静菌性化合物と一緒に、1つまたは複数のKgp阻害剤を含有することができる。殺菌性/静菌性化合物を含有する組成物は、さらに、クロルヘキシジン(例えば、クロルヘキシジン二グルコン酸塩)を単独で、または亜鉛化合物(例えば、酢酸亜鉛)と組み合わせて含有することができ、投与される抗生物質と組み合わせて使用することもできる。
一部の実施形態では、ペニシリン(例えば、アモキシシリン)とメトロニダゾールとの組合せ、またはペニシリン(例えば、アモキシシリン)、メトロニダゾールおよびテトラサイクリンの組合せが使用される。一部の実施形態では、抗生物質は、ミノサイクリン、ドキシサイクリン、メトロニダゾール、アモキシシリン、クリンダマイシン、オーグメンチン、サトラニダゾールおよびそれらの組合せから選択される。
適切なコリンエステラーゼ阻害剤の例には、これらに限定されないが、ドネペジル、ドネペジル/メマンチン、ガランタミン、リバスチグミンおよびタクリン、ならびにそれらの薬学的に許容される塩が含まれる。適切なセロトニンモジュレーターの例には、これらに限定されないが、イダロピルジン、RVT-101、シタロプラム、エスシタロプラム、フルオキセチン、フルボキサミン、パロキセチンおよびセルトラリン、ならびにそれらの薬学的に許容される塩が含まれる。適切なアルファ-7ニコチン酸受容体モジュレーターの例には、これらに限定されないが、エンセニクリンおよびAPN1125などのアルファ-7アゴニストが含まれる。適切なNMDAモジュレーターには、これらに限定されないが、メマンチンおよびその誘導体などのNMDA受容体アンタゴニストが含まれる。
本発明の医薬組成物は、神経学的疾患に関連する生体分子標的を対象とする活性剤も含有することができる。このような標的には、ベータアミロイドペプチド(ベータアミロイド、abetaまたはAβとも呼ばれる)、アポリポタンパク質E(ApoEとも呼ばれる)、および微小管結合タウ(タウタンパク質または単にタウとも呼ばれる)が含まれる。
Aβ標的治療剤には、とりわけ、Aβ産生の阻害剤(ベータ-セクレターゼ阻害剤、ガンマ-セクレターゼ阻害剤、アルファ-セクレターゼアクチベーターなど)、Aβ凝集阻害剤、Aβオリゴマー化阻害剤、およびAβクリアランスの上方調節剤が含まれる(例えば、Jiaら、BioMed Research International、2014年、論文ID837157、22頁を参照されたい)。Aβ標的治療剤の例には、これらに限定されないが、抗体、ピオグリタゾン、ベガセスタット、アトルバスタチン、シンバスタチン、エタゾレートおよびトラミプロセート、ならびにそれらの薬学的に許容される塩が含まれる。
ApoE標的治療剤の例には、これらに限定されないが、レチノイドX受容体アゴニスト(Cramerら、Science 2012年、335巻(6075号)、1503~1506頁を参照されたい)およびLiuら(Nat Rev Neurol. 2013年、9巻(2号):106~118頁)により記載されている他のものが含まれる。タウ標的治療剤には、これらに限定されないが、メチルチオニニウム、ロイコ-メチルチオニニウム、抗体、およびLeeら(Cold Spring Harb Perspect Med 2011年;1巻:a006437)により記載されたものが含まれる。
本発明の医薬組成物は、補体標的治療剤を含有することもできる。このような治療剤は、自然免疫応答に関与する補体系の構成成分を標的とする。補体標的治療剤には、これらに限定されないが、RicklinおよびLambris(Nat. Biotechnology 2007年、25巻(11号):1265~1275頁)により記載されたものが含まれる。
適切な抗炎症剤の例には、これらに限定されないが、アパゾン、ジクロフェナク、イブプロフェン、インドメタシン、ケトプロフェン、ナブメトン、ナプロキセン、ピロキシカムおよびスリンダク、ならびにそれらの薬学的に許容される塩などのNSAIDが含まれる。
V.ジンジパインを阻害する、およびP.gingivalis感染に関連する状態を処置する方法
別の実施形態では、本発明は、ジンジパインを阻害する方法を提供する。本方法は、ジンジパインを有効量の本明細書に記載されている化合物と接触させるステップを含む。ある特定の実施形態では、ジンジパインは、リシンジンジパイン(すなわち、Kgpまたは、1つもしくは複数のアミノ酸の置換、欠失および/もしくは他のペプチド配列の改変を含む変異体)である。ジンジパインの阻害は、ジンジパインを、本化合物の非存在下におけるジンジパイン活性と比べて、ジンジパインの活性を低減するのに十分な量の化合物と接触させることを一般に含む。例えば、ジンジパインをジンジパイン阻害剤と接触させると、約1%~約99%のジンジパイン阻害をもたらすことができる(すなわち、阻害されたジンジパインの活性は、本化合物の非存在下でのジンジパインの活性の99%~1%の範囲となる)。ジンジパイン阻害のレベルは、約1%~約10%、または約10%~約20%、または約20%~約30%、または約30%~約40%、または約40%~約50%、または約50%~約60%、または約60%~約70%、または約70%~約80%、または約80%~約90%、または約90%~約99%の範囲とすることができる。ジンジパイン阻害のレベルは、約5%~約95%、または約10%~約90%、または約20%~約80%、または約30%~約70%、または約40%~約60%の範囲とすることができる。一部の実施形態では、ジンジパインを本明細書に記載されている化合物と接触させると、完全な(すなわち、100%)ジンジパイン阻害がもたらされる。
上記の通り、P.gingivalisによる感染およびジンジパイン活性は、歯周病、アルツハイマー病および他の脳障害、心血管疾患、糖尿病、がん、肝疾患、腎疾患、早産、関節炎、肺炎および他の障害の発症にリンクしている。Bostanciら FEMS Microbiol Lett、2012年、333巻(1号):1~9頁;Ghizoniら J Appl Oral Sci、2012年、20巻(1号):104~12頁;Gatzら、Alzheimers Dement、2006年、2巻(2号):110~7頁;Steinら J Am Dent Assoc、2007年、138巻(10号):1314~22頁;quiz 1381~2頁;Nobleら J Neurol Neurosurg Psychiatry、2009年、80巻(11号):1206~11頁;Sparks Steinら Alzheimers Dement、2012年、8巻(3号):196~203頁;Velskoら PLoS ONE、2014年、9巻(5号):e97811;Demmerら、J Dent Res、2015年、94巻(9S号):201-S-11S;AtanasovaおよびYilmaz. Molecular Oral Microbiology、2014年、29巻(2号):55~66頁;Yonedaら BMC Gastroenterol、2012年、12巻:16頁を参照されたい。
アルギニンジンジパインA(RgpA)、アルギニンジンジパインB(RgpB)およびリシンジンジパイン(Kgp)を含めた、P.gingivalisにより産生される細胞外プロテアーゼは、結合組織および血漿中の幅広い範囲のタンパク質(例えば、コラーゲン、免疫グロブリンおよびプロテイナーゼ阻害剤など)も分解することができる。ジンジパインは、体循環ならびに/または滑膜細胞および軟骨細胞に進入することができ、それらはまた、カリクレイン-キニンカスケード、血液凝固および宿主防御システムへの破壊を引き起こすことができる。関節および循環系にジンジパインを有する患者は、骨関節炎の一因となる、滑膜細胞および/または軟骨細胞のジンジパイン誘導性死滅を受けることがある。
RgpBおよびKgpは、ヒトおよびイヌの関節に浸潤することができ、骨関節炎の発症の一因となることが最近、発見された。P.gingivalisおよびジンジパインは、いくつかの経路により、関節組織に浸潤することができると考えられている。ジンジパインは、分泌されて、P.gingivalisの外側膜表面に輸送され得るか、またはこの細菌により、外膜小胞中に放出され得る。P.gingivalisは、歯周組織、冠動脈、大動脈、および最近では肝臓において既に同定されている。これらのニッチ(nich)のいずれかから体循環中へのP.gingivalisおよび/またはジンジパインの放出により、P.gingivalisおよび/またはジンジパインの関節への移行がもたらされ得る。Travisら、Adv Exp Med Biol、2000年、477巻:455~65頁;Byrneら、Oral Microbiol Immunol、2009年、24巻(6号):469~77頁;Mahendraら、J Maxillofac Oral Surg、2009年、8巻(2号):108~13頁;Stelzel.Periodontol、2002年、73巻(8号):868~70頁;Ishikawaら、Biochim Biophys Acta、2013年、1832巻(12号):2035~2043頁を参照されたい。
P.gingivalisおよび/またはジンジパインは、血液/関節バリアを保護する内皮細胞を分解することにより、または半月板損傷などの関節への外傷事象によって関節に進入することもでき、これにより、関節組織の一体性が恒久的または一時的に低下する。外傷性関節損傷におけるこのような破壊は、例えば、感染している個体における、P.gingivalisおよび/またはジンジパインの浸潤、ならびにその後の慢性骨関節炎の発症の一因となる恐れがある。フットボールのような接触スポーツにおける運動選手を含めた、外傷性関節損傷の高いリスクにあるヒトを、ジンジパイン阻害剤により予防的に処置して、外傷関連骨関節炎のリスクを低減することができる。
P.gingivalisおよびジンジパインはまた、能動輸送、受動輸送またはマクロファージ送達を含めた他の機構により、関節に到達することもできる。これらの機構のいずれかに起因する骨関節炎は、単一の関節に限定され得るか、または複数の関節に存在し得る。
ヒトと同様に、P.gingivalis感染および歯周病は、成体のイヌおよびネコに影響を及ぼす、最も一般的な感染症の1つである。関節および循環系にP.gingivalis感染およびジンジパインを有するイヌおよびネコは、ジンジパイン誘導性細胞死による、歯周病および骨関節炎を経験することがあり、これは、本発明の方法により処置または予防することができる。高齢のイヌは、前十字靱帯(ACL)の変性に関連する一般的な炎症性膝関節炎を含めた骨関節炎の多くの特徴を自然に発症する。炎症性膝関節炎およびACL変性を有するイヌのMuirらによる研究により、罹患しているイヌに由来する膝関節の37%において、幅広い範囲の細菌種に由来するDNAが検出された。Muirらは、細菌がイヌにおける炎症性関節炎の病因における重要な原因因子となり得ると仮説を立てた。Muirらの研究では、P.gingivalisに由来するDNAが、イヌの関節では検出されなかった。Muirら、Microb Pathog、2007年、42巻(2-3号):47~55頁を参照されたい。しかし、ヒトと同様に、P.gingivalisは、成体のイヌに影響を及ぼす一般的な経口病原体であり、菌血症の結果として、口腔から関節組織に移行する可能性があり得る。P.gingivalisは、in vitroで軟骨細胞に感染し、軟骨細胞のアポトーシスを引き起こすことが実証されており、イヌとヒトの両方の骨関節炎における軟骨損失の経路を示している。Rohnerら、Calcif Tissue Int、2010年、87巻(4号):333~40頁;Houleら、FEMS Microbiol Lett、2003年、221巻(2号):181~5頁;Kataokaら、FASEB J、2014年、28巻:3564~3578頁;Pischonら、Ann Rheum Dis、2009年、68巻(12号):1902~7頁を参照されたい。
したがって、Kgp阻害剤は、P.gingivalisによって引き起こされるか、または他の方法でP.gingivalisによって影響を受ける、脳障害などの疾患および状態を処置するために使用することができる。したがって、本発明の別の態様は、P.gingivalis感染に関連する疾患または状態を処置する方法を提供する。本方法は、有効量の上記の本発明の化合物または組成物を、それを必要とする対象に投与するステップを含む。
ある特定の実施形態では、本発明の化合物は、哺乳動物、例えばヒトまたは動物(例えば、イヌ)の脳における活性Kgpを阻害し、細胞保護性または神経保護性である。「神経保護性」とは、化合物が、ニューロンへの異常な変化またはニューロンの死を予防することを意味する。したがって、本発明の化合物は、例えば、脳障害(例えば、神経変性疾患(例えば、アルツハイマー病、ダウン症候群、てんかん、自閉症、パーキンソン病、本態性振戦、前頭側頭型認知症、進行性核上麻痺、筋萎縮性側索硬化症、ハンチントン病、多発性硬化症、軽度認知障害、加齢関連性記憶障害、慢性外傷性脳症、脳卒中、脳血管疾患、レビー小体病、多系統萎縮症、統合失調症およびうつ病など)、糖尿病、心血管疾患、関節炎、関節リウマチ、骨関節炎、感染性関節炎、乾癬性関節炎、網膜障害(例えば、加齢黄斑変性)および緑内障の処置に有用である。
一部の実施形態では、疾患または状態は、脳障害、歯周病、糖尿病、心血管疾患、関節炎、関節リウマチ、骨関節炎、早産、肺炎、がん、腎疾患、肝疾患、網膜障害および緑内障から選択される。
一部の実施形態では、疾患または状態は、脳障害である。
一部の実施形態では、脳障害は、アルツハイマー病、ダウン症候群、てんかん、自閉症、パーキンソン病、本態性振戦、前頭側頭型認知症、進行性核上麻痺、筋萎縮性側索硬化症、ハンチントン病、多発性硬化症、軽度認知障害、加齢関連性記憶障害、慢性外傷性脳症、脳卒中、脳血管疾患、レビー小体病、多系統萎縮症、統合失調症およびうつ病からなる群から選択される。
一部の実施形態では、脳障害はアルツハイマー病である。
一部の実施形態では、本方法は、コリンエステラーゼ阻害剤、セロトニンモジュレーター、NMDAモジュレーター、Aβ標的治療剤、ApoE標的治療剤、ミクログリア標的治療剤、血液脳関門標的治療剤、タウ標的治療剤、補体標的治療剤および抗炎症剤から選択される1つまたは複数の活性剤を対象に投与するステップをさらに含む。
一部の実施形態では、疾患または状態は、歯周病である。一部の実施形態では、疾患または状態は、肝疾患である。一部の実施形態では、肝疾患は、非アルコール性脂肪性肝炎である。一部の実施形態では、疾患または状態は、網膜障害である。一部の実施形態では、網膜障害は加齢黄斑変性である。
一部の実施形態では、疾患または状態はがんである。一部の実施形態では、がんは、乳がん、口腔がん、膵臓がんまたは多型性神経膠芽腫である。
本明細書に記載されているKgp阻害剤は、本発明の方法における任意の適切な用量で投与することができる。一般に、Kgp阻害剤は、対象の体重1キログラムあたり、約0.1ミリグラム~約1000ミリグラムの範囲の用量(すなわち、約0.1~1000mg/kg)で投与される。Kgp阻害剤の用量は、例えば、約0.1~1000mg/kg、または約1~500mg/kg、または約25~250mg/kg、または約50~100mg/kgであり得る。Kgp阻害剤の用量は、約1、2、3、4、5、10、15、20、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、85、90、95、100、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、650、700、750、800、850、900、950または1000mg/kgであり得る。投与量は、患者の必要性、処置される障害の重症度および投与される特定の製剤に応じて変えることができる。患者に投与される用量は、患者において有益な治療応答をもたらすのに十分であるべきである。用量のサイズは、特定の患者における薬物の投与に伴う、任意の有害な副作用の存在、性質および程度によっても決定されるであろう。特定の状況に対する適切な投与量の決定は、通常の医師の技量の範囲内にある。総投与量は分割して、発作障害を処置するのに適切な期間にわたり、小分けにして投与され得る。
Kgp阻害剤は、特定の障害の性質、その重症度、およびKgp阻害剤が投与される対象の総合的な状態に応じて変わることになる期間、投与することができる。投与は、例えば、1時間毎、2時間毎、3時間毎、4時間毎、6時間毎、8時間毎、または12時間毎を含めた1日2回、またはそれらの間の任意の間の間隔で行うことができる。投与は、毎日1回、または36時間もしくは48時間に1回、または1か月もしくは数カ月に1回、行うことができる。処置後、対象は、対象の状態の変化、および障害の症状の緩和をモニタリングされ得る。Kgp阻害剤の投与量は、対象が特定の投与量レベルに有意に応答しない状況では、増加させることができるか、または障害の症状の軽減が観察される場合、もしくは障害が改善された場合、もしくは許容できない副作用が特定の投与量で認められる場合、その用量は低下させることができる。
治療有効量のKgp阻害剤は、投与の間に、少なくとも1時間、または6時間、または12時間、または24時間、または36時間、または48時間の間隔を含む処置レジメンで対象に投与することができる。投与は、少なくとも72、96、120、144、168、192、216または240時間(すなわち、3、4、5、6、7、8、9または10日)の間隔で行うことができる。ある特定の実施形態では、1つまたは複数のKgp阻害剤の投与は、数カ月から数年の範囲に及ぶ期間にわたり長期的に行われる。したがって、本発明の一部の実施形態は、上記のP.gingivalis感染に関連する疾患または状態を処置する方法であって、化合物が少なくとも1年間、対象に投与される、方法を提供する。一部の実施形態では、本化合物は、少なくとも10年間、対象に投与される。一部の実施形態では、本化合物は、少なくとも60年間、対象に投与される。
本発明の方法によるKgp阻害剤の投与により、通常、対象における活性Kgpの循環レベルの低下、および/または脳における活性Kgpの低下がもたらされる。ある特定の実施形態では、本発明の方法によるKgp阻害剤の投与により、活性Kgpの循環レベルが少なくとも20%低下し、かつ/または脳における活性Kgpが少なくとも20%低下する。例えば、Kgpの循環レベルおよび/または脳におけるKgpのレベルは、Kgp阻害剤の最初の投与の24時間前の対応するKgpレベルと比べて、好ましくは約25%~約95%、または約35%~約95%、または約40%~約85%、または約40%~約80%低下する。
Kgp阻害剤は、単独で、または上記の1つもしくは複数の追加の治療活性剤と組み合わせて投与することができる。1つまたは複数の追加の治療上有効な薬剤には、例えば、(i)哺乳動物における、RgpA、RgpB、および/もしくはKgpの産生、RgpA、RgpBおよび/もしくはKgpの体循環もしくは脳への移動、ならびに/またはRgpA、RgpBおよび/もしくはKgpの病理学的作用(例えば、神経毒性作用)を阻害する、薬学的に許容される薬剤、(ii)P.gingivalisに関して、静菌性または殺菌性である抗菌剤、(iii)RgpA、RgpBおよび/またはKgpに結合する1つまたは複数の抗体(例えば、RgpBの免疫グロブリンドメインの最初の半分に結合する18E6、Kgp触媒ドメイン内のエピトープを認識する、Kgp特異的モノクローナル抗体7B9、上述のいずれかのヒト化変種である、RgpA抗体である61Bg 1.3など)、(iv)RgpA、RgpBおよび/もしくはKgp、またはP.gingivalisにより発現される他のタンパク質に結合する抗体のエピトープ、ならびに(v)上述のいずれかの組合せが含まれる。
追加の治療活性剤には、Aβペプチドレベル低下剤、病原性レベルタウ低下剤、微小管安定剤、アテローム性プラークを除去することが可能な薬剤、β-アミロイドおよびタウの循環レベルを低下させる薬剤、オートファジーのモジュレーター、神経伝達物質レベル調節剤、GABA(A)α5受容体阻害剤、ならびにアルツハイマー病の認知機能および機能欠損を維持および/もしくは回復する、ならびに/またはアルツハイマー病における認知機能の低下および機能欠損を遅延させる一助となる追加の薬剤も含まれる。
本発明の医薬組成物は、生体利用率を向上し、血液脳関門の透過を増大させ得るリトナビル(RTV)と組み合わせて、本明細書に記載されている1つまたは複数のKgp阻害剤を含有することができる。例えば、リトナビルは、P450 3A4酵素を阻害し、こうして初回通過代謝を低下させることにより、血漿中レベルを増加させる経口のペプチドHIVプロテアーゼ阻害剤と一般に一緒にされる(Walmsleyら、N Engl J Med、2002年、346巻(26号):2039~46頁を参照されたい)。さらに、RTVは、血液脳関門を含めた、多くの組織中で見いだされる、膜貫通流出ポンプであるP-グリコタンパク質に結合し、これにより、共投与される化合物のより良好な脳への接近が可能になる(Marzoliniら、Mol Pharm、2013年、10巻(6号):2340~9頁を参照されたい)。したがって、ジンジパイン阻害剤の血漿中濃度および脳レベルを増加させるために、RTVおよびKgp阻害剤の組合せが使用され得る。米国特許出願第14/875,416号に記載されるように、Kgp阻害剤であるKyt-36の15分前にRTVを経口投与することにより、半減期が増加し、したがってRTVが他のKgp阻害剤の半減期も増加させることが予期される。
一部の実施形態では、本発明の化合物は、ナツメグから単離されるメラバリコン(melabaricone)Cを含めた、天然ジンジパイン阻害剤と一緒に投与され得るか、またはクランベリー、緑茶、リンゴ、およびホップなどの植物に由来するポリフェノール化合物が、脳障害の処置または予防のために一緒に投与され得る。κ-カゼインペプチド(109-137)34、ヒスタチン5およびCL(14-25)、CL(K25A)およびCL(R24A、K25A)を含めた、天然および非天然起源の抗微生物ペプチドも、本発明のKgp阻害剤と一緒に投与することができる(例えば、Taniguchiら、Biopolymers、2014年、102巻(5号):379~89頁を参照されたい)。
本明細書に記載されているKgp阻害剤は、ジンジパインまたは他のP.gingivalisタンパク質を標的とする抗体と共に投与することができる。抗体は、脳に接近するために血液脳関門の損傷に、またはジンジパインおよびP.gingivalisの伝播による末梢の妨害に依存し得る。抗体はまた、細菌を追い払う際の免疫系の効力を刺激する一助となり得る。18E6および7B9を含む、RgpA、RgpBまたはKgpへの新規または既存の抗体を利用することができる。RgpA抗体である61BG 1.3は、以前に、歯周処置後のP.gingivalisによるコロニーの再形成の予防において、局所的な有効性を実証している。Boothら、Infect Immun、1996年、64巻(2号):422~7頁を参照されたい。抗体は、ヒトにおいて使用するために、好ましくはヒト化される。これらに限定されないが、静脈内送達、皮下送達、鼻腔内送達、くも膜下送達、関節内送達、ベクター輸送および直接的な脳送達を含めた、半減期および脳への透過を改善するための生物製剤の送達のための当業者に公知の方法を使用することができる。
本発明の方法は、本明細書に記載されているKgp阻害剤と、以下の追加の治療活性剤またはそれらの薬学的に許容される塩:アルギニン誘導体、ヒスタチン5、バキュロウイルスp35、牛痘ウイルスサイトカイン応答修飾剤(CrmA(Asp>Lys))の単一点変異体、フェニルアラニル-ウレイド-シトルリニル-バリル-シクロアルギナル(FA-70C1)、(アシクロキシ)メチルケトン(Cbz-Phe-Lys-CHOCO-2,4,6-MePh)、ペプチジルクロロ-メチルケトン(例えば、アルギニンのクロロメチルケトン誘導体、リシンのクロロメチルケトン誘導体など)、フルオロ-メチルケトン、ブロモ-メチルケトン、ケトペプチド、1-(3-フェニルプロピオニル)ピペリジン-3(R,S)-カルボン酸[4-アミノ-1(S)-(ベンゾチアゾール-2-カルボニル)ブチル]アミド(A71561)、アザペプチドフマルアミド、アザ-ペプチドマイケル受容体、ベンズアミジン化合物、アシクロメチルケトン、活性化因子X阻害剤(例えば、DX-9065a)、クランベリー非透析性画分、クランベリーポリフエノール画分、膵臓トリプシン阻害剤、Cbz-Phe-Lys-CHO-CO-2,4,6-Me-Ph、E-64、クロルヘキシジン、亜鉛(例えば、酢酸亜鉛)のうちの1つもしくは複数、または上述のいずれかのうちの2つ、3つもしくはそれより多くとの組合せとの投与も包含する。これらの実施形態の一部では、Znは、本発明の方法において使用される化合物(例えば、クロルヘキシジン、ベンズアミジンなど)の効力および選択性を高めることができる。
本発明のKgp阻害剤は、追加の治療活性剤と同じ組成物中で投与することができる。あるいは、追加の治療活性剤は、Kgp阻害剤の投与前、それと同時に、またはその後に個別に投与することができる。
VI.ジンジパイン活性プローブ
関連する実施形態では、本発明は、レポーター部分およびジンジパイン反応性部分を含む化合物、またはその薬学的に許容される塩を提供する。一部の実施形態では、ジンジパイン反応性部分は、Kgp反応性部分である。一部の実施形態では、ジンジパイン反応性部分は、Rgp反応性部分である。
一部の実施形態では、ジンジパイン反応性部分は、標的ジンジパインに可逆的に結合する。一部の実施形態では、ジンジパイン反応性部分は、標的ジンジパインに非可逆的に結合する。
一部の実施形態では、Kgp反応性部分は、消光部分をさらに含む。
一部の実施形態では、レポーター部分は、フルオロフォア、フルオロジェニック部分、発色団、色素生成部分、ビオチン、ジゴキシゲニン、FLAGペプチドなどのペプチドタグ、オリゴヌクレオチドおよびポリヌクレオチドから選択される。
本明細書で使用する場合、用語「FLAGペプチド」とは、アミノ酸配列Asp-Tyr-Lys-Asp-Asp-Asp-Asp-Lys(すなわち、DYKDDDDK)を含有する、オリゴペプチドまたはポリペプチドを指す。FLAGペプチドおよびその変異体は、例えば、Hoppらへの米国特許第4,703,004号に記載されており、この特許は参照により本明細書に組み込まれている。FLAGペプチドの代わりに使用することができる他のペプチドには、これらに限定されないが、配列Tyr-Pro-Tyr-Asp-Val-Pro-Asp-Tyr-Ala(すなわち、YPYDVPDYA)を含有するHAペプチドタグ、配列His-His-His-His-His-His(すなわち、HHHHHH)を含有するHisペプチドタグ、および配列Glu-Gln-Lys-Leu-Ile-Ser-Glu-Glu-Asp-Leu(すなわち、EQKLISEEDL)を含有するMycペプチドが含まれる。ペプチドタグは、都合のよい同定および/または定量のために、比色試薬、化学発光試薬などと使用するための、抗体または他の結合部分によって認識され得る。同様に、レポーター部分は、その公開が参照により本明細書に組み込まれている、例えば、WO2016/019929(Navratilら)に記載されているPCR技法(例えば、定量的PCR)により検出するための、相補性一次ヌクレオチドまたは他の相補性ヌクレオチドにより認識されることができる、ヌクレオチド(例えば、RNA、一本鎖DNAまたは二本鎖DNA)を含有することができる。有用なDNA配列には、これらに限定されないが、CCTGCCAGTTGAGCATTTTTATCTGCCACCTTCTCCACCAGACAAAAGCTGGAAA、CACTCTGTGCTCGTTGCTACACおよびCAGACAGCAAGCAGCACTACACが含まれる。
本明細書で使用する場合、用語「ジゴキシゲニン」とは、3-[(3S,5R,8R,9S,10S,12R,13S、14S,17R)-3,12,14-トリヒドロキシ-10,13-ジメチル-1,2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,15,16,17-テトラデカヒドロシクロペンタ[a]フェナントレン-17-イル]-2H-フラン-5-オン(CAS登録番号1672-46-4)およびその置換類似体を指す。本明細書で使用する場合、用語「ビオチン」とは、5-[(3aS,4S,6aR)-2-オキソヘキサヒドロ-1H-チエノ[3,4-d]イミダゾール-4-イル]ペンタン酸(CAS登録番号58-85-5)およびその置換類似体を指す。
一部の実施形態では、本化合物は、上記の式Iによる構造を有しており、式中、Rはレポーター部分である。一部の実施形態では、本化合物は、式II:
Figure 0007113815000055
による構造またはその薬学的に許容される塩を有し、式中、
は、側鎖IIa:
Figure 0007113815000056
または側鎖IIb:
Figure 0007113815000057
であり、
波線は式IIへの結合点を表し、
Aは、-CH-および-O-から選択され、
1a、R1b、R1c、R1dおよびR1eは、水素、C1~4アルキルおよびアミン保護基からそれぞれ独立して選択され、
2aおよびR2bは、水素、ハロゲン、C1~4ハロアルキルおよびC1~4ハロアルコキシからそれぞれ独立して選択され、
は、レポーター部分であり、
は、水素およびC1~4アルキルから選択され、
は、ジンジパイン反応性部分であり、ジンジパイン反応性部分は、消光部分Rを必要に応じて含む。
本発明の化合物は、保護形態(すなわち、R1a、R1b、R1c、R1dおよびR1eのうちの少なくとも1つがアミン保護基である化合物)で調製することができる。例えば、GreenおよびWuts(Protective Groups in Organic Synthesis、第4版、2007年、Wiley-Interscience、New York)により記載されているいくつかの好適な保護基を使用することができる。一部の実施形態では、R1aはHであり、R1bは、ベンジルオキシカルボニル、9-フルオレニルメチル-オキシカルボニル、tert-ブチルオキシカルボニルおよびアリルオキシカルボニルから選択される。一部の実施形態では、R1aはHであり、R1bはtert-ブチルオキシカルボニルである。化合物はまた、アルキル化形態(すなわち、R1aおよびR1bのうちの少なくとも1つがアルキル基である化合物)で調製することもできる。R1aおよびR1bの一方または両方は、例えば、メチル、エチル、n-プロピル、イソプロピル、n-ブチルまたはt-ブチルとすることができる。
一部の実施形態では、本化合物は、式III:
Figure 0007113815000058
による構造またはその薬学的に許容される塩を有する。
一部の実施形態では、
は、C1~6ハロアルキル、-CH-O-R、-CH-S-R、-CH-SO-R、-CH-SO-R、-CH-N(Rおよび-CH-C5~12ヘテロアリールから選択され、
およびRは、フェニル、C1~6アルキル、C1~6ハロアルキルおよびC5~12ヘテロアリールから選択され、
フェニルは、1~5個のハロゲンにより置換されており、
5~12ヘテロアリールは、ハロゲンまたはC1~3ハロアルキルにより必要に応じて置換されており、
は、独立して選択されるC1~6アルキルである。
一部の実施形態では、ジンジパイン反応性部分Rは-CH-O-フェニルであり、フェニルは、1~5個のハロゲンにより置換されている。一部の実施形態では、フェニルは、消光部分Rにより必要に応じて置換されている。一部の実施形態では、ジンジパイン反応性部分は、式:
Figure 0007113815000059
を有し、式中、波線は、式IIまたは式IIIへの結合点を表す。
一部の実施形態では:
5cはハロゲンであり、R5dはHであり、R5eはHであり、R5fはHであり、かつR5gはHであるか;または
5cはHであり、R5dはハロゲンであり、R5eはHであり、R5fはHであり、かつR5gはHであるか;または
5cはHであり、R5dはHであり、R5eはハロゲンであり、R5fはHであり、かつR5gはHであるか;または
5cはHであり、R5dはHであり、R5eはHであり、R5fはハロゲンであり、かつR5gはHであるか;または
5cはHであり、R5dはHであり、R5eはHであり、R5fはHであり、かつR5gはハロゲンであるか;または
5cはハロゲンであり、R5dはハロゲンであり、R5eはHであり、R5fはHであり、かつR5gはHであるか;または
5cはハロゲンであり、R5dはHであり、R5eはハロゲンであり、R5fはHであり、かつR5gはHであるか;または
5cはハロゲンであり、R5dはHであり、R5eはHであり、R5fはハロゲンであり、かつR5gはHであるか;または
5cはハロゲンであり、R5dはHであり、R5eはHであり、R5fはHであり、かつR5gはハロゲンであるか;または
5cはHであり、R5dはハロゲンであり、R5eはハロゲンであり、R5fはHであり、かつR5gはHであるか;または
5cはHであり、R5dはハロゲンであり、R5eはHであり、R5fはハロゲンであり、かつR5gはHであるか;または
5cはHであり、R5dはハロゲンであり、R5eはHであり、R5fはHであり、かつR5gはハロゲンであるか;または
5cはHであり、R5dはHであり、R5eはハロゲンであり、R5fはハロゲンであり、かつR5gはHであるか;または
5cはHであり、R5dはHであり、R5eはハロゲンであり、R5fはHであり、かつR5gはハロゲンであるか;または
5cはHであり、R5dはHであり、R5eはHであり、R5fはハロゲンであり、かつR5gはハロゲンであるか;または
5cはハロゲンであり、R5dはハロゲンであり、R5eはハロゲンであり、R5fはHであり、かつR5gはHであるか;または
5cはハロゲンであり、R5dはハロゲンであり、R5eはHであり、R5fはハロゲンであり、かつR5gはHであるか;または
5cはハロゲンであり、R5dはハロゲンであり、R5eはHであり、R5fはHであり、かつR5gはハロゲンであるか;または
5cはハロゲンであり、R5dはHであり、R5eはハロゲンであり、R5fはハロゲンであり、かつR5gはHであるか;または
5cはハロゲンであり、R5dはHであり、R5eはハロゲンであり、R5fはHであり、かつR5gはハロゲンであるか;または
5cはハロゲンであり、R5dはHであり、R5eはHであり、R5fはハロゲンであり、かつR5gはハロゲンであるか;または
5cはHであり、R5dはハロゲンであり、R5eはハロゲンであり、R5fはハロゲンであり、かつR5gはHであるか;または
5cはHであり、R5dはハロゲンであり、R5eはハロゲンであり、R5fはHであり、かつR5gはハロゲンであるか;または
5cはHであり、R5dはハロゲンであり、R5eはHであり、R5fはハロゲンであり、かつR5gはハロゲンであるか;または
5cはHであり、R5dはHであり、R5eはハロゲンであり、R5fはハロゲンであり、かつR5gはハロゲンであるか;または
5cはHであり、R5dはハロゲンであり、R5eはハロゲンであり、R5fはハロゲンであり、かつR5gはハロゲンであるか;または
5cはハロゲンであり、R5dはHであり、R5eはハロゲンであり、R5fはハロゲンであり、かつR5gはハロゲンであるか;または
5cはハロゲンであり、R5dはハロゲンであり、R5eはハロゲンであり、R5fはHであり、かつR5gはハロゲンであるか;または
5cはハロゲンであり、R5dはハロゲンであり、R5eはハロゲンであり、R5fはハロゲンであり、かつR5gはHであり;
ここでR5c、R5d、R5e、R5f、およびR5gのうちの1つにおけるHまたはハロゲンは、消光部分Rで必要に応じて置き換えられている。
一部の実施形態では:
5cはFもしくはClであり、R5dはHであり、R5eはHであり、R5fはHであり、かつR5gはHであるか;または
5cはHであり、R5dはFもしくはClであり、R5eはHであり、R5fはHであり、かつR5gはHであるか;または
5cはHであり、R5dはHであり、R5eはFもしくはClであり、R5fはHであり、かつR5gはHであるか;または
5cはHであり、R5dはHであり、R5eはHであり、R5fはFもしくはClであり、かつR5gはHであるか;または
5cはHであり、R5dはHであり、R5eはHであり、R5fはHであり、かつR5gはFもしくはClであるか;または
5cはFもしくはClであり、R5dはFもしくはClであり、R5eはHであり、R5fはHであり、かつR5gはHであるか;または
5cはFもしくはClであり、R5dはHであり、R5eはFもしくはClであり、R5fはHであり、かつR5gはHであるか;または
5cはFもしくはClであり、R5dはHであり、R5eはHであり、R5fはFもしくはClであり、かつR5gはHであるか;または
5cはFもしくはClであり、R5dはHであり、R5eはHであり、R5fはHであり、かつR5gはFもしくはClであるか;または
5cはHであり、R5dはFもしくはClであり、R5eはFもしくはClであり、R5fはHであり、かつR5gはHであるか;または
5cはHであり、R5dはFもしくはClであり、R5eはHであり、R5fはFもしくはClであり、かつR5gはHであるか;または
5cはHであり、R5dはFもしくはClであり、R5eはHであり、R5fはHであり、かつR5gはFもしくはClであるか;または
5cはHであり、R5dはHであり、R5eはFもしくはClであり、R5fはFもしくはClであり、かつR5gはHであるか;または
5cはHであり、R5dはHであり、R5eはFもしくはClであり、R5fはHであり、かつR5gはFもしくはClであるか;または
5cはHであり、R5dはHであり、R5eはHであり、R5fはFもしくはClであり、かつR5gはFもしくはClであるか;または
5cはFもしくはClであり、R5dはFもしくはClであり、R5eはFもしくはClであり、R5fはHであり、かつR5gはHであるか;または
5cはFもしくはClであり、R5dはFもしくはClであり、R5eはHであり、R5fはFもしくはClであり、かつR5gはHであるか;または
5cはFもしくはClであり、R5dはFもしくはClであり、R5eはHであり、R5fはHであり、かつR5gはFもしくはClであるか;または
5cはFもしくはClであり、R5dはHであり、R5eはFもしくはClであり、R5fはFもしくはClであり、かつR5gはHであるか;または
5cはFもしくはClであり、R5dはHであり、R5eはFもしくはClであり、R5fはHであり、かつR5gはFもしくはClであるか;または
5cはFもしくはClであり、R5dはHであり、R5eはHであり、R5fはFもしくはClであり、かつR5gはFもしくはClであるか;または
5cはHであり、R5dはFもしくはClであり、R5eはFもしくはClであり、R5fはFもしくはClであり、かつR5gはHであるか;または
5cはHであり、R5dはFもしくはClであり、R5eはFもしくはClであり、R5fはHであり、かつR5gはFもしくはClであるか;または
5cはHであり、R5dはFもしくはClであり、R5eはHであり、R5fはFもしくはClであり、かつR5gはFもしくはClであるか;または
5cはHであり、R5dはHであり、R5eはFもしくはClであり、R5fはFもしくはClであり、かつR5gはFもしくはClであるか;または
5cはHであり、R5dはFもしくはClであり、R5eはFもしくはClであり、R5fはFもしくはClであり、かつR5gはFもしくはClであるか;または
5cはFもしくはClであり、R5dはHであり、R5eはFもしくはClであり、R5fはFもしくはClであり、かつR5gはFもしくはClであるか;または
5cはFもしくはClであり、R5dはFもしくはClであり、R5eはFもしくはClであり、R5fはHであり、かつR5gはFもしくはClであるか;または
5cはFもしくはClであり、R5dはFもしくはClであり、R5eはFもしくはClであり、R5fはFもしくはClであり、かつR5gはHであり;
ここでR5c、R5d、R5e、R5f、およびR5gのうちの1つにおけるH、F、またはClは、消光部分Rで必要に応じて置き換えられている。
一部の実施形態では:
5cはFであり、R5dはHであり、R5eはHであり、R5fはHであり、かつR5gはHであるか;または
5cはHであり、R5dはFであり、R5eはHであり、R5fはHであり、かつR5gはHであるか;または
5cはHであり、R5dはHであり、R5eはFであり、R5fはHであり、かつR5gはHであるか;または
5cはHであり、R5dはHであり、R5eはHであり、R5fはFであり、かつR5gはHであるか;または
5cはHであり、R5dはHであり、R5eはHであり、R5fはHであり、かつR5gはFであるか;または
5cはFであり、R5dはFであり、R5eはHであり、R5fはHであり、かつR5gはHであるか;または
5cはFであり、R5dはHであり、R5eはFであり、R5fはHであり、かつR5gはHであるか;または
5cはFであり、R5dはHであり、R5eはHであり、R5fはFであり、かつR5gはHであるか;または
5cはFであり、R5dはHであり、R5eはHであり、R5fはHであり、かつR5gはFであるか;または
5cはHであり、R5dはFであり、R5eはFであり、R5fはHであり、かつR5gはHであるか;または
5cはHであり、R5dはFであり、R5eはHであり、R5fはFであり、かつR5gはHであるか;または
5cはHであり、R5dはFであり、R5eはHであり、R5fはHであり、かつR5gはFであるか;または
5cはHであり、R5dはHであり、R5eはFであり、R5fはFであり、かつR5gはHであるか;または
5cはHであり、R5dはHであり、R5eはFであり、R5fはHであり、かつR5gはFであるか;または
5cはHであり、R5dはHであり、R5eはHであり、R5fはFであり、かつR5gはFであるか;または
5cはFであり、R5dはFであり、R5eはFであり、R5fはHであり、かつR5gはHであるか;または
5cはFであり、R5dはFであり、R5eはHであり、R5fはFであり、かつR5gはHであるか;または
5cはFであり、R5dはFであり、R5eはHであり、R5fはHであり、かつR5gはFであるか;または
5cはFであり、R5dはHであり、R5eはFであり、R5fはFであり、かつR5gはHであるか;または
5cはFであり、R5dはHであり、R5eはFであり、R5fはHであり、かつR5gはFであるか;または
5cはFであり、R5dはHであり、R5eはHであり、R5fはFであり、かつR5gはFであるか;または
5cはHであり、R5dはFであり、R5eはFであり、R5fはFであり、かつR5gはHであるか;または
5cはHであり、R5dはFであり、R5eはFであり、R5fはHであり、かつR5gはFであるか;または
5cはHであり、R5dはFであり、R5eはHであり、R5fはFであり、かつR5gはFであるか;または
5cはHであり、R5dはHであり、R5eはFであり、R5fはFであり、かつR5gはFであるか;または
5cはHであり、R5dはFであり、R5eはFであり、R5fはFであり、かつR5gはFであるか;または
5cはFであり、R5dはHであり、R5eはFであり、R5fはFであり、かつR5gはFであるか;または
5cはFであり、R5dはFであり、R5eはFであり、R5fはHであり、かつR5gはFであるか;または
5cはFであり、R5dはFであり、R5eはFであり、R5fはFであり、かつR5gはHであり;
ここでR5c、R5d、R5e、R5f、およびR5gのうちの1つにおけるHまたはF、またはClは、消光部分Rで必要に応じて置き換えられている。
ある特定の実施形態では、ジンジパイン反応性部分は、2,3,5,6-テトラフルオロフェノキシメチルではない。
一部の実施形態では、本化合物は、式IIIa:
Figure 0007113815000060
による構造またはその薬学的に許容される塩を有し、式中、
5c、R5d、R5e、R5fおよびR5gのうちの1つは、水素、ハロゲンおよび消光部分から選択され、
5c、R5d、R5e、R5fおよびR5gのうちの4つは、水素およびハロゲンから独立して選択され、
ただし、R5c、R5d、R5e、R5fおよびR5gのうちの少なくとも1つはハロゲンであることを条件とする。
一部の実施形態では、本発明は、Rに含まれる消光部分を有する化合物を提供する。このような化合物は、これらに限定されないが、
Figure 0007113815000061
Figure 0007113815000062
およびそれらの薬学的に許容される塩を含む。
一部の実施形態では、本化合物は、式IV:
Figure 0007113815000063
による構造またはその薬学的に許容される塩を有し、式中、
5eは、Hおよび消光部分-L-R9aから選択され、
は、連結部分であり、
9aは、アゾベンゼン、キサンチリウム、アントラキノン(anthroquinone)およびビオロゲンから選択される。
一部の実施形態では、レポーター部分Rは、-R3b-L-R3cであり、式中、
3bは、C3~8アルキレン、C3~8シクロアルキレン、C3~12ヘテロシクリレン、C6~10アリーレンおよびC5~12ヘテロアリーレンから選択され、
は、連結部分であり、
3cは、発色団またはフルオロフォアから選択される。
発色団またはフルオロフォアを含有するレポーティング部分は、以下に記載されている、UV-可視吸収分光法または蛍光分光法を使用して標識ジンジパインを検出するのに有用であり得る。任意の好適な発色団またはフルオロフォアが、本発明の化合物において使用されることができる。一般に、好適な発色団およびフルオロフォアは、直接、または1つもしくは複数の連結基を介して、式IIの化合物に共有結合し得る、反応性基(例えば、カルボキシレート部分、アミノ部分、ハロアルキル部分など)を有する。好適な発色団およびフルオロフォアの例には、これらに限定されないが、米国特許第7,687,282号、同第7,671,214号、同第7,446,202号、同第6,972,326号、同第6,716,979号、同第6,579,718号、同第6,562,632号、同第6,399,392号、同第6,316,267号、同第6,162,931号、同第6,130,101号、同第6,005,113号、同第6,004,536号、同第5,863,753号、同第5,846,737号、同第5,798,276号、同第5,723,218号、同第5,696,157号、同第5,658,751号、同第5,656,449号、同第5,582,977号、同第5,576,424号、同第5,573,909号および同第5,187,288号に記載されているものが含まれ、これらの特許は、その全体が参照により本明細書に組み込まれている。
一部の実施形態では、R3cは、構造:
Figure 0007113815000064
を有するホウ素-ジピロメテン部分であり、
式中、
3d、R3e、R3f、R3g、R3h、R3iおよびR3jのうちの6つは、H、ハロゲン、C1~6アルキル、C3~8シクロアルキル、C6~10アリール、C7~16アリールアルキル、C1~6アシルおよび-SOHから独立して選択され、
3d、R3e、R3f、R3g、R3h、R3iおよびR3jのうちの1つは、連結部分-L-である。
一部の実施形態では、R3dおよびR3fは、独立して選択されるC1~6アルキル(例えば、メチルまたはエチル)であり、R3h、R3iおよびR3jのうちの1つは、連結部分-L-である。一部の実施形態では、R3dおよびR3fはメチルであり、R3jは連結部分-L-である。
一部の実施形態では、R3cは、構造:
Figure 0007113815000065
を有するシアニン部分であり、
式中、
3kおよびR3lは、H、C1~6アルキル、(CHCOOH、(CHSOHおよび連結部分Lから独立して選択され、
下付文字tはそれぞれ、独立して、1~10の整数であり、
3mおよびR3nは、H、ハロゲン、C1~6アルキル、-SOH、-PO、-OPO、-COOHおよび連結部分Lから独立して選択され、
Yはそれぞれ、O、S、C(R3p、-CH=CH-およびNR3pから独立して選択され、R3pはそれぞれ、独立して、HまたはC1~6アルキルであり、
下付文字nは、1~6の整数であり、ただし、R3k、R3l、R3mおよびR3nのうちの1つのみが、連結部分-L-であることを条件とする。
一部の実施形態では、R3cは、構造:
Figure 0007113815000066
を有するクマリン部分であり、
式中、
Wは、NまたはCR3uであり、
Zは、O、SまたはNR3vであり、
3q、R3s、R3t、R3uはそれぞれ、H、ハロゲン、C1~6アルキル、-CN、-CF、-COOR3v、-CON(R3v、-OR3vおよび連結部分-L-から独立して選択され、
3rは、-OR3vおよび-N(R3vから選択され、
3vはそれぞれ、H、C1~6アルキルおよび連結部分-L-から独立して選択され、
ただし、R3q、R3s、R3t、R3uおよびR3vのうちの1つのみが、連結部分-L-であることを条件とする。
一部の実施形態では、R3cは、構造:
Figure 0007113815000067
を有するキサンテン部分であり、
式中、
Tは、O、S、C(R3zおよびNR3zから選択され、
Uは、OまたはN(R3zであり、
3wはそれぞれ、H、ハロゲン、C1~6アルキル、-SOHおよび連結部分-L-から独立して選択され、
3xは、H、-OH、-OR3z、-N(R3zおよび連結部分-L-から選択され、
3yは、H、C1~6アルキル、R3aaおよび連結部分-L-から選択され、
3zはそれぞれ、独立して、HまたはC1~6アルキルであり、
3aaは、
Figure 0007113815000068
から選択され、
式中、
3abはそれぞれ、Hおよび連結部分-L-から独立して選択され、
ただし、R3w、R3x、R3yおよびR3abのうちの1つのみが、連結部分-L-であることを条件とする。
一部の実施形態では、R3cはフルオレセインであり、TおよびUはOであり、R3xはOHであり、R3yは、
Figure 0007113815000069
である。
一部の実施形態では、キサンテン部分は、エオシンであり、TおよびUはOであり、R3xはOHであり、R3wはそれぞれ、ハロゲン(例えば、ブロモ)であり、R3yは、
Figure 0007113815000070
である。
一部の実施形態では、キサンテン部分はローダミンであり、TはOであり、UはN(R3z(例えば、=NH )であり、R3xは-N(R3z(例えば、-NH)であり、R3yは、
Figure 0007113815000071
である。
一部の実施形態では、キサンテン部分は、構造:
Figure 0007113815000072
を有するローダミンであり、
式中、R3aaは、
Figure 0007113815000073
から選択され、
一方のR3abはHであり、もう一方のR3abは連結部分-L-である。
一部の実施形態では、本発明は、レポーター部分Rが-R3b-L-R3cである、式IIによる化合物を提供し、式中、
3bは、C3~8アルキレン、C3~8シクロアルキレン、C3~12ヘテロシクリレン、C6~10アリーレンおよびC5~12ヘテロアリーレンから選択され、
は、連結部分であり、
3cは、ビオチン、ジゴキシゲニンおよび抗体エピトープから選択される。
一部の実施形態では、レポーター部分Rは、-R3b-L-R3cであり、式中、
3bは、C3~8アルキレン、C3~8シクロアルキレン、C3~12ヘテロシクリレン、C6~10アリーレンおよびC5~12ヘテロアリーレンから選択され、
は、連結部分であり、
3cは、フルオレセイン、ローダミン、エオシン、シアニン、ホウ素-ジピロメテン、クマリン、ビオチン、ジゴキシゲニン、FLAGペプチド(または、他のペプチドタグ)、オリゴヌクレオチドおよびポリヌクレオチドから選択される。
当業者は、アジド基を含有する化合物(例えば、R3aが-Nである化合物)は、アルキンを有する化合物またはホスフィンを有する化合物などの相補性反応パートナーとの反応により、さらなる官能基により修飾され得ることを理解するであろう。一般に「クリック化学」と呼ばれる[3+2]環化付加によるアジドとアルキンの反応を使用して、本発明の化合物中に様々な置換トリアゾール基を導入することができる。したがって、本発明の一部の実施形態は、連結部分-L-が、式:
Figure 0007113815000074
(式中、波線は、R3aへの結合点であり、破線は、R3cへの結合点である)による必要に応じて置換されているトリアゾリル部分である、化合物を提供する。
一部の実施形態では、L3aは、構造-L3b-L3c-を有し、式中、
3bおよびL3cは、結合、二価のポリマー部分、および線状または分岐状の飽和または不飽和C1~30アルキルから独立して選択され、
1~30アルキル中の1個または複数の炭素原子は、O、S、NRにより、必要に応じて、および独立して置き換えられており、
1~30アルキル中の2つまたはそれよりも多い隣接炭素原子団は、-NR(CO)-または-(CO)NR-により、必要に応じて、および独立して置き換えられており、
1~30アルキル中の2つまたはそれよりも多い隣接炭素原子団は、4~8員の二価の炭素環、またはO、SおよびNから選択される1~4個のヘテロ原子を有する、4~8員の二価の複素環により、必要に応じて、および独立して置き換えられており、
はそれぞれ、HおよびC1~6アルキルから独立して選択される。
一部の実施形態では、本化合物は、式V:
Figure 0007113815000075
による構造またはその薬学的に許容される塩を有し、式中、
5eは、Hおよび-C(O)NH-(CH-R9aから選択され、
下付文字xは、1~4の範囲の整数である。
一部の実施形態では、本化合物は、
Figure 0007113815000076
Figure 0007113815000077
Figure 0007113815000078
Figure 0007113815000079
およびそれらの薬学的に許容される塩から選択される。
一部の実施形態では、本化合物は、
Figure 0007113815000080
Figure 0007113815000081
Figure 0007113815000082
Figure 0007113815000083
およびそれらの薬学的に許容される塩から選択される。
VII.ジンジパイン活性をプローブする方法
別の実施形態では、本発明は、生物学試料中のジンジパイン活性を検出する方法を提供する。本方法は、ジンジパインが化合物のジンジパイン反応性部分と反応するのに十分な条件下で、生物学試料および上記化合物を含む混合物を形成するステップと、混合物中の化合物のレポーター部分を検出するステップと、レポーター部分が検出される場合にジンジパインが生物学試料中に存在していると判定するステップとを含む。一部の実施形態では、本方法は、混合物中の化合物のレポーター部分を検出する前に、未反応化合物を混合物から除去するステップをさらに含む。
任意の好適な生物学試料を、本発明の方法を使用して、アッセイすることができる。好適な生物学試料の例には、これらに限定されないが、組織試料(例えば、歯肉組織試料または脳組織試料)、細胞試料(例えば、患者の口内の口腔スワブにより得られた哺乳動物細胞、またはヒト試料から培養した細菌細胞)、血液または血清試料、および唾液試料が含まれる。
生物学試料およびジンジパイン活性プローブが互いに接触する方法は、アッセイされる試料のタイプ、および活性プローブ中のレポーター部分が検出される方法などの要因に、一部、依存するであろう。ジンジパイン活性が、例えば細胞試料中で検出され得る場合、細胞は、水性緩衝液(例えば、リン酸緩衝生理食塩水、クエン酸-リン酸緩衝液など)中で懸濁され得、ジンジパイン活性プローブおよび必要に応じての共溶媒(例えば、ジメチルスルホキシド、N,N-ジメチルホルムアミドなど)を含有する混合物中に一緒にされ得、こうして、活性プローブは、細胞試料中に存在するジンジパインと反応する。活性プローブは、約1μM~約5mMの範囲の濃度で通常、使用され、細胞は、数分間から数時間、またはそれより長い範囲の期間、約4℃~約40℃までの範囲の温度でインキュベートされる。細胞は、インキュベーション期間の後に、遠心分離によって混合物から採集することができ、未反応活性プローブは、好適な量の緩衝液中で、細胞の再懸濁および遠心分離を繰り返すことによって混合物から除去することができる。次に、細胞は、光学顕微鏡または蛍光顕微鏡を用いて検査することができ、比色または蛍光レポーター部分の検出を使用して、細胞中でのジンジパインの存在および/または局在化を判定することができる。
比色または蛍光レポーター部分が検出される波長(単数または複数)は、これらに限定されないが、活性プローブの構造、および試料が分析される条件を含めた要因に依存する。レポーター部分によるUV-可視吸収は、例えば、約190nm~約1100nmの範囲(例えば、190~380nmの間または380~750nmの間)の波長で測定することができる。蛍光レポーター部分は、約300nm~約800nmの範囲の波長で励起され得、生じた蛍光の発光は、約350nm~約800nmの範囲の波長として検出することができる。他の吸収波長、励起波長および発光波長は、使用される具体的な活性プローブまたは試料に応じて、標識ジンジパインの検出に使用することができる。レポーター部分は、目視可能な査察、写真フィルム、または蛍光計、量子カウンター、プレートリーダー、顕微鏡およびフローサイトメータなどの機器の使用を含む手段によって検出することができる。UV-可視吸収に基づく方法および蛍光に基づく方法のための機器、ならびに比色または蛍光部分の光学特性は、例えば、The Molecular Probes(商標)Handbook、第11版(2010年)に記載されている通り、当業者に公知である。
ある特定の実施形態では、ジンジパイン活性プローブは、ジンジパインに結合する前の、プローブ上のレポーター部分からの吸光度シグナルおよび/または蛍光シグナルの検出を防止する消光部分を含有する。例えば、フルオレセイン、ローダミンまたはシアニンレポーター部分を有する活性プローブは、ダブシル(dabcyl)などのアミノベンゼン消光部分を含むジンジパイン反応性部分を含有することができる。標的ジンジパインとの反応前の、レポーター部分および消光部分が近位にあることにより、蛍光検出が阻止され、これにより、有利なことに、バックグラウンドシグナルを低下させることができる。次に、ジンジパイン反応性部分と標的ジンジパインとの反応時における消光部分の放出によって、蛍光レポーター部分の検出が可能となる。
対象から得られた生物学試料は、細胞溶解物または組織溶解物を調製するために使用することができ、溶解物は、溶解物中のジンジパインがプローブと反応するよう、上記の活性プローブと一緒にすることができる。未反応活性プローブは、ゲルろ過によって溶解混合物から除去することができ、ジンジパインは、UV-可視吸収分光法または蛍光分光法により、レポーター部分の検出によって混合物中で同定することができる。あるいは、標識ジンジパインは、電気泳動(例えば、SDS-PAGE、キャピラリー電気泳動、等電点電気泳動など)により、未反応活性プローブおよび他の混合物構成成分から分離することができる。標識ジンジパインは、比色または蛍光活性プローブを検出することによって、ポリアクリルアミドゲルなどの分離試料中で検出することができる。ビオチン、FLAGペプチドまたは別の親和性に基づくレポーター部分が使用される場合、ゲルは、ストレプトアビジン-フルオレセインまたは標識抗体(もしくは一次/二次抗体対)などの標識結合パートナーによりプローブされ、分離試料中の標識ジンジパインを検出することができる。必要な場合、標識ジンジパインは、検出ステップ前に、ニトロセルロース、ポリフッ化ビニリデン(PVDF)などの好適な支持材料に、ポリアクリルアミドゲルまたは他の分離試料から電気ブロッティング法により転写することができる。
組織試料を対象から得て、切片化し、ジンジパイン活性プローブによる処理のためにマウントすることができる。試料は、ジンジパイン活性プローブによる処理前に、新しく凍結されて、エタノール、ホルマリンまたは別の好適な固定剤により必要に応じて固定化されてもよい。未反応活性プローブは、レポーター部分の検出前に、1または複数の分量の水または緩衝液中にマウントされた試料を浸漬することにより、組織試料から除去されてもよい。消光部分を有するプローブの使用により、いかなる未反応活性プローブも除去する必要なしに、組織試料中のシグナルの検出が可能になり得る。標識ジンジパインは、必要な場合、1種または複数種の標識結合パートナーと組み合わせて、上記の通り、光学顕微鏡または蛍光顕微鏡を使用して検出することができる。
ジンジパインを、親和性に基づくレポーター部分(例えば、ビオチン、ジゴキシゲニン、FLAGペプチドまたは他のエピトープ)を有する活性プローブにより標識すると、標識ジンジパインは、好適な支持体上に固定化された結合パートナーを使用して、複雑な混合物(例えば、細胞溶解物または組織溶解物)から分離することができる。非限定例として、ジンジパインは、ビオチン活性プローブにより修飾して、ストレプトアビジンビーズ(例えば、共有結合または非共有結合したストレプトアジピンを有する、架橋多糖、多孔質シリカゲル、磁気粒子など)に結合させることができる。結合したジンジパインを有するビーズは、活性プローブ中のレポーター部分の検出前に、遠心分離またはろ過などの物理的手段によって混合物から単離することができる。レポーター部分のエピトープ(例えば、FLAGペプチド)に特異的な抗体を有する表面を、これらに限定されないが、ELISA(サンドイッチELISAおよび競合ELISAが挙げられる)ならびに表面プラズモン共鳴分析を含めた技法により、標識抗体を結合および検出するために使用することができる。
VIII.実施例
(実施例1)
(S)-N-(7-アミノ-2-オキソ-1-(2,3,6-トリフルオロフェノキシ)ヘプタン-3-イル)シクロペンタンカルボキサミド(1)塩酸塩の調製
Figure 0007113815000084
THF(200mL)中の化合物1.4(23.0g、67.2mmol、1.00当量)の混合物に、N(15psi)下、-40℃でNMM(6.79g、67.2mmol、7.38mL、1.00当量)、カルボノクロリド酸イソブチル(9.17g、67.2mmol、8.82mL、1.00当量)およびジアゾメタン(5.65g、134mmol、2.00当量)を加えた。この混合物を0℃で30分間、撹拌した。LCMSにより、反応が完了したことが示された。この反応物にHO(200mL)を加え、300mLの酢酸エチルにより2回抽出した。合わせた有機相を、200mLのブライン(200)により2回洗浄し、無水NaSOにより乾燥させ、ろ過して真空下で濃縮すると、粗製化合物1.3(30.0g、粗製物)が黄色油状物として得られた。
Figure 0007113815000085
EtOAc(300mL)中の化合物1.3(20.0g、54.6mmol、1.00当量)の混合物に、N(15psi)下、-20℃で臭化水素(29.8g、121.7mmol、20.0mL、33%純度、2.23当量)を加えた。この混合物を-20℃で10分間、撹拌した。TLC(石油エーテル:酢酸エチル=0:1)により、反応が完了したことが示された。この反応物のpHが8に到達するまで、飽和NaHCOを添加することにより反応物を塩基性にし、この混合物を、500mLのEtOAcにより3回抽出した。合わせた有機相を200mLのブラインにより2回洗浄し、無水NaSOで乾燥させ、ろ過して真空下で濃縮すると、粗製化合物1.2(15.0g、粗製物)が黄色固体として得られた。
Figure 0007113815000086
DMF(40.0mL)中の化合物1.2(4.00g、9.54mmol、1.00当量)の混合物に、25℃で、2,6-ジフルオロフェノール(1.49g、11.4mmol、1.20当量)およびKF(1.66g、28.6mmol、670μL、3.00当量)を加えた。この混合物を25℃で3時間、撹拌した。TLC(石油エーテル:酢酸エチル=1:1)により、反応が完了したことが示された。この混合物にHO(150mL)を加え、200mLの酢酸エチルにより2回抽出した。合わせた有機相を100mLのブラインにより2回洗浄し、無水NaSOにより乾燥させ、ろ過して真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(石油エーテル:酢酸エチル=100:1、5:1)によって精製すると、化合物1.1(2.50g、5.35mmol、56.1%収率)が黄色固体として得られた。
Figure 0007113815000087
EtOAc(3.00mL)中の化合物1.1(4.00g、8.22mmol、1.00当量)の混合物に、25℃で、HCl/EtOAc(40.0mL)を加えた。この混合物を25℃で2時間、撹拌した。TLC(石油エーテル:酢酸エチル=2:1)により、反応が完了したことが示された。この混合物を減圧中で濃縮すると、(S)-N-(7-アミノ-2-オキソ-1-(2,3,6-トリフルオロフェノキシ)ヘプタン-3-イル)シクロペンタンカルボキサミド1塩酸塩(1.34g、3.16mmol)が薄黄色固体として得られた。LCMS(ESI):m/z:[M+H]C1925の計算値:387.2;実測値387.1;RT=2.508分。1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 1.21 - 1.83 (m, 15 H) 2.60 - 2.81 (m, 3 H) 4.30 (ddd, J=9.70, 7.17, 4.52 Hz, 1 H) 5.02 - 5.22 (m, 2 H) 7.12 - 7.24 (m, 2 H) 7.98 (br s, 3 H) 8.32 (d, J=7.28 Hz, 1 H).
(実施例2)
(S)-N-(7-アミノ-1-(2,6-ジフルオロフェノキシ)-2-オキソヘプタン-3-イル)シクロペンタンカルボキサミド(2)塩酸塩の調製
Figure 0007113815000088
化合物1.2(4.00g、9.54mmol、1.00当量)を上記の通り調製し、25℃で、DMF(40.0mL)、2,6-ジフルオロフェノール(1.49g、11.5mmol、1.20当量)およびKF(1.66g、28.6mmol、670μL、3.00当量)と一緒にした。この混合物を25℃で3時間、撹拌した。TLC(石油エーテル:酢酸エチル=1:1)により、反応が完了したことが示された。この混合物にHO(150mL)を加え、酢酸エチル(100mL×2)により抽出した。合わせた有機相をブライン(100mL×2)で洗浄して無水NaSOにより乾燥させ、ろ過して真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(石油エーテル:酢酸エチル=100:1、5:1)によって精製すると、化合物2.1(2.50g、5.35mmol、56.1%収率)が黄色固体として得られた。
Figure 0007113815000089
EtOAc(2.00mL)中の化合物2.1(3.50g、7.47mmol、1.00当量)の混合物に、25℃で、HCl/EtOAc(20.0mL)を加えた。この混合物を25℃で1時間、撹拌した。TLC(石油エーテル:酢酸エチル=1:1)により、反応が完了したことが示された。この残留物を分取HPLC(酸)により予備精製すると、(S)-N-(7-アミノ-1-(2,6-ジフルオロフェノキシ)-2-オキソヘプタン-3-イル)シクロペンタンカルボキサミド2塩酸塩(1.13g、2.79mmol)が薄黄色固体として得られた。LCMS(ESI):m/z:[M+H]C1926の計算値:369.2;実測値369.1;RT=2.439分。1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 1.18 - 1.84 (m, 15 H) 2.56 - 2.82 (m, 3 H) 4.25 - 4.39 (m, 1 H) 4.92 - 5.13 (m, 2 H) 7.02 - 7.18 (m, 3 H) 7.91 (br s, 3 H) 8.27 (br d, J=7.28 Hz, 1 H).
(実施例3)
ラセミ体のN-(7-アミノ-2-オキソ-1-(2,3,6-トリフルオロフェノキシ)-ヘプタン-3-イル)シクロペンタンカルボキサミドの調製
Figure 0007113815000090
DCM(50.0mL)中のシクロペンタンカルボン酸(4.40g、38.6mmol、4.19mL、0.95当量)の混合物に、15℃で(COCl)2(5.87g、46.3mmol、4.05mL、1.14当量)を加えた。この混合物を15℃で30分間、撹拌した。次に、これを真空下で濃縮すると、残留物が形成され、これをEtOAc(40.0mL)に溶解した。HO(80.0mL)中の化合物1b.5(10.0g、40.6mmol、1.00当量)、NaCO(5.16g、48.7mmol、1.20当量)およびNaOH(1.64g、41.0mmol、1.01当量)の混合物に、0℃で得られた溶液を滴下して加えた。次に、この混合物を15℃で14時間、撹拌した。LCMSにより、反応が完了したことが示された。酢酸エチルを除去し、残留溶液を0℃に冷却した後、固体KHSOによりpHを6~7に調整した。この混合物をろ過し、化合物1b.4(12.0g、35.0mmol、86.3%収率)を白色固体として集めた。
Figure 0007113815000091
THF(300mL)中の化合物1b.4(12.0g、35.0mmol、1.00当量)の混合物に、N(15psi)下、-40℃でNMM(3.54g、35.0mmol、3.85mL、1.00当量)、カルボノクロリド酸イソブチル(isobutyl carbonochloridate)(4.79g、35.0mmol、4.61mL、1.00当量)およびジアゾメタン(2.95g、70.1mmol、2.00当量)を加えた。この混合物を0℃で30分間、撹拌した。TLC(石油エーテル:酢酸エチル=0:1)により、反応が完了したことが示された。この反応物にHO(100mL)を加え、200mLの酢酸エチルにより2回抽出した。合わせた有機相を100mLのブラインにより2回洗浄し、無水NaSOにより乾燥させ、ろ過して真空下で濃縮すると、化合物1b.3(13.7g、粗製物)が黄色油状物として得られた。
Figure 0007113815000092
EtOAc(140mL)中の化合物1b.3(13.7g、37.4mmol、1.00当量)の混合物に、N(15psi)下、-20℃で臭化水素(20.9g、85.3mmol、14.0mL、33%純度、2.28当量)を加えた。この混合物を-20℃で10分間、撹拌した。TLC(石油エーテル:酢酸エチル=2:1)により、反応が完了したことが示された。pHが8に到達するまで、飽和NaHCO3により反応物を塩基性にし、この混合物を、200mLのEtOAcにより3回抽出した。合わせた有機相を100mLのブラインにより2回洗浄し、無水NaSOで乾燥させ、ろ過して真空下で濃縮すると、化合物1b.2(8.80g、粗製物)が黄色固体として得られた。
Figure 0007113815000093
DMF(10.0mL)中の化合物1b.2(400mg、954μmol、1.00当量)の混合物に、25℃でKF(166mg、2.86mmol、67.0μL、3.00当量)および2,3,6-トリフルオロフェノール(170mg、1.14mmol、1.20当量)を加えた。この混合物を25℃で10時間、撹拌した。TLC(石油エーテル:酢酸エチル=2:1)により、反応が完了したことが示された。次に、この混合物をHO(10mL)により希釈し、10mLのEtOAcにより3回抽出した。有機層を合わせてブライン(10mL)により洗浄し、NaSOで乾燥させてろ過し、減圧下で濃縮すると、化合物21.1(400mg、822μmol、86.2%収率)が黄色油状物として得られた。
Figure 0007113815000094
EtOAc(5.00mL)中の化合物21.1(400mg、822μmol、1.00当量)の混合物に、25℃で、HCl/EtOAc(822μmol、15.0mL、1.00当量)を加えた。この混合物を25℃で30分間、撹拌した。TLC(石油エーテル:酢酸エチル=2:1)により、反応が完了したことが示された。この反応物を減圧下で濃縮した。残留物を分取HPLCにより精製すると化合物21のトリフルオロ酢酸塩(90.0mg、213μmol、25.9%収率)が薄黄色固体として得られた。
化合物1(36mg)および化合物21(36mg)を、水(2mL)およびMeOH(0.5mL)と混合した。次に、この溶媒を凍結乾燥により除去すると、ラセミ体のN-(7-アミノ-2-オキソ-1-(2,3,6-トリフルオロフェノキシ)ヘプタン-3-イル)シクロペンタンカルボキサミドトリフルオロ酢酸塩(72mg)が得られた。
(実施例4)
ラセミ体のN-(7-アミノ-1-(2,6-ジフルオロフェノキシ)-2-オキソヘプタン-3-イル)シクロペンタンカルボキサミドの調製
Figure 0007113815000095
上記の通り調製した化合物1b.2(400mg、954μmol、1.00当量)を、25℃で、DMF(10.0mL)、KF(166mg、2.86mmol、67.0μL、3.00当量)および2,6-ジフルオロフェノール(149mg、1.14mmol、1.20当量)と一緒にした。この混合物を25℃で10時間、撹拌した。TLC(石油エーテル:酢酸エチル=2:1)により、反応が完了したことが示された。この混合物をHO(10mL)により希釈し、10mLのEtOAcにより3回抽出した。有機層を合わせてブライン(10mL)により洗浄し、NaSOで乾燥させてろ過し、減圧下で濃縮すると、粗製2b.1(400mg、粗製物)が黄色油状物として得られた。
Figure 0007113815000096
EtOAc(5.00mL)中の2b.1(400mg、856μmol、1.00当量)の混合物に、25℃で、HCl/EtOAc(856μmol、15.0mL、1.00当量)を加えた。この混合物を25℃で30分間、撹拌した。TLC(石油エーテル:酢酸エチル=2:1)により、反応が完了したことが示された。この混合物を減圧下で濃縮し、得られた残留物を分取HPLCにより精製すると化合物2bのトリフルオロ酢酸塩(70.0mg、173μmol、20.2%収率)が薄黄色固体として得られた。
N-(7-アミノ-1-(2,6-ジフルオロフェノキシ)-2-オキソヘプタン-3-イル)シクロペンタンカルボキサミドトリフルオロ酢酸塩(55mg)のラセミ混合物は、化合物1および化合物21に関して上で記載されている通り、化合物2および化合物2bを混合することにより調製した。
(実施例5)
(S)-N-(7-アミノ-1-(2-フルオロフェノキシ)-2-オキソヘプタン-3-イル)シクロ-ペンタンカルボキサミド(3)の調製
Figure 0007113815000097
EtOAc(20.00mL)中の化合物1.5(10.00g、40.60mmol、1.00当量)および塩化シクロペンタンカルボニル(5.92g、44.66mmol、5.43mL、1.10当量)の混合物に、N下、0℃で、HO(80.00mL)中のNaCO(5.16g、48.72mmol、1.20当量)およびNaOH(1.64g、41.01mmol、1.01当量)を加えた。この混合物を、10℃で3時間、撹拌した。EtOAcを除去し、次に、溶液を0℃まで冷却し、HCl(1N)によりpHを6~7に調整した。懸濁液をろ過して、ろ過ケーキを50mLのPEにより洗浄して、真空下で乾燥すると、化合物1.4(10.60g、30.96mmol、76.26%収率)が白色固体として得られた。LCMS(ESI):m/z:[M+H]C1730の計算値:343.4;実測値343.2;RT=1.022分。
Figure 0007113815000098
THF(20.00mL)中の化合物1.4(2.00g、5.84mmol、1.00当量)の混合物に、N下、-20℃で、NMM(708.86mg、7.01mmol、770.50μL、1.20当量)およびカルボノクロリド酸イソブチル(797.61mg、5.84mmol、766.93μL、1.00当量)を1回で加えた。この混合物を、-20℃で1時間、撹拌した。EtO(20ml)中のジアゾメタン溶液を0℃で加え、2時間、撹拌した。この混合物をHO(20mL)により希釈して、EtOAc(3×20mL)により抽出した。有機層を合わせて、NaSOで乾燥させ、ろ過して減圧下で濃縮すると、残留物が得られ、これをシリカゲルクロマトグラフィー(PE/EtOAc=1/1)によって精製すると、化合物1.3(130.00mg、354.76μmol)が黄色固体として得られた。LCMS(ESI):m/z:[M+H]C1830の計算値:367.4;実測値339.2;RT=0.772分。
Figure 0007113815000099
EtOAc(1.00mL)中の化合物1.3(130.00mg、354.75μmol、1.00当量)の混合物に、N下、-20℃で、HBr/AcOH(150.00μL、33%純度)を1回で加えた。この混合物をN下、-20℃で10分間、撹拌し、飽和NaHCOによりpH=8まで塩基性にして、EtOAc(3×10mL)により抽出した。有機層を合わせて、NaSOで乾燥させてろ過し、濃縮すると、化合物1.2(100.00mg、238.46μmol、67.22%収率)が白色固体として得られた。LCMS(ESI):m/z:[M+H]C1831の計算値:420.3;実測値316.2;RT=0.709分。
Figure 0007113815000100
DMF(1.00mL)中の化合物1.2(50.00mg、119.23μmol、1.00当量)および2-フルオロフェノール(13.37mg、119.23μmol、11.05μL、1.00当量)の混合物に、N下、20℃でKF(20.78mg、357.69μmol、8.38μL、3.00当量)を1回で加えた。この混合物を、20℃で15時間、撹拌した。水相をEtOAc(3×5mL3)により抽出した。合わせた有機相をブライン(3mL)により洗浄して無水NaSOにより乾燥させ、ろ過して真空下で濃縮した。次に、残留物を分取HPLC(TFA条件)により精製すると、化合物3.1(15.00mg、33.29μmol、27.92%収率)が黄色油状物として得られた。LCMS(ESI):m/z:[M+H]C2436Fの計算値:451.5;実測値451.4;RT=0.929分。
Figure 0007113815000101
HCl/EtOAc(1.00mL)中の化合物3.1(15.00mg、33.29μmol、1.00当量)の混合物を、20℃で3時間、撹拌した。溶液をエバポレートして、有機溶媒を除去した。残留水溶液を凍結乾燥すると、化合物3塩酸塩(2.00mg、5.71μmol、17.14%収率)が白色固体として得られた。LCMS(ESI):m/z:[M+H]C1928Fの計算値:351.4;実測値351.3;RT=2.477分。1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 1.25 - 1.83 (m, 17 H) 2.61 - 2.87 (m, 4 H) 4.24 - 4.43 (m, 1 H) 4.95 - 5.13 (m, 2 H) 6.87 - 7.27 (m, 4 H) 7.83 (br s, 3 H) 8.31 (d, J=6.90 Hz, 1 H).
(実施例6)
(S)-N-(7-アミノ-2-オキソ-1-(2,3,5-トリフルオロフェノキシ)ヘプタン-3-イル)シクロペンタンカルボキサミド(4)の調製
Figure 0007113815000102
DMF(1.00mL)中の化合物1.2(100.00mg、238.46μmol、1.00当量)および2,3,5-トリフルオロフェノール(42.37mg、286.15μmol、1.20当量)の混合物に、N下、25℃でKF(41.56mg、715.38μmol、16.76μL、3.00当量)を1回で加えた。この混合物を、25℃で15時間、撹拌した。この反応混合物をHO(50mL)に注ぎ入れ、水相をEtOAc(3×20mL)により抽出した。合わせた有機相をブライン(5mL)により洗浄して無水NaSOにより乾燥させ、ろ過して真空下で濃縮した。次に、残留物を分取HPLC(TFA条件)により精製すると、化合物4.1(50.00mg、102.77μmol、43.10%収率)が白色固体として得られた。LCMS(ESI):m/z:[M+H]C2433の計算値:487.2;実測値487.3;RT=0.936分。
Figure 0007113815000103
HCl/EtOAc(2.00mL)中の化合物4.1(50.00mg、102.77μmol、1.00当量)の混合物を、N下、20℃で15時間、撹拌した。溶液をエバポレートして、有機溶媒を除去した。残留水溶液を凍結乾燥すると、化合物4塩酸塩(30.00mg、77.64μmol、75.55%収率)が白色固体として得られた。LCMS(ESI):m/z:[M+H]C1925の計算値:387.2;実測値387.2;RT=2.321分。1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 1.24 - 1.85 (m, 15 H) 2.63 - 2.83 (m, 3 H) 4.20 - 4.35 (m, 1 H) 5.18 (d, J=1.32 Hz, 2 H) 6.83 - 7.14 (m, 2 H) 7.98 (br s, 3 H) 8.44 (d, J=6.62 Hz, 1 H).
(実施例7)
(S)-N-(7-アミノ-1-(2,3-ジフルオロフェノキシ)-2-オキソヘプタン-3-イル)シクロペンタンカルボキサミド(5)の調製
Figure 0007113815000104
DMF(1.00mL)中の化合物1.2(100.00mg、238.46μmol、1.00当量)の混合物に、N下、20℃でKF(41.56mg、715.38μmol、16.76μL、3.00当量)および2,3-ジフルオロフェノール(37.23mg、286.15μmol、1.20当量)を1回で加えた。この混合物を、20℃で15時間、撹拌した。この反応混合物をHO(5mL)に注ぎ入れ、水相をEtOAc(3×5mL)により抽出した。合わせた有機相をブライン(3mL)により洗浄して無水NaSOにより乾燥させ、ろ過して真空下で濃縮した。次に、残留物を分取HPLC(TFA条件)により精製すると、化合物5.1(50.00mg、106.72μmol、44.75%収率)が白色固体として得られた。
Figure 0007113815000105
HCl/EtOAc(2.00mL)中の化合物5.1(50.00mg、106.72μmol、1.00当量)の混合物を、N下、20℃で15時間、撹拌した。溶液をエバポレートして、有機溶媒を除去した。残留水溶液を凍結乾燥すると、化合物5塩酸塩(15.00mg、40.71μmol、38.15%収率)が白色固体として得られた。LCMS(ESI):m/z:[M+H]C1926の計算値:369.2;実測値369.2;RT=2.246分。1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 1.23 - 1.83 (m, 15 H) 2.62 - 2.83 (m, 3 H) 4.32 (ddd, J=9.59, 6.73, 4.63 Hz, 1 H) 5.03 - 5.19 (m, 2 H) 6.77 - 7.14 (m, 3 H) 7.90 (br s, 3 H) 8.36 (d, J=6.83 Hz, 1 H).
(実施例8)
(S)-N-(7-アミノ-1-(2,5-ジフルオロフェノキシ)-2-オキソヘプタン-3-イル)シクロペンタンカルボキサミド(6)の調製
Figure 0007113815000106
DMF(1.00mL)中の化合物1.2(100.00mg、238.46μmol、1.00当量)の混合物に、N下、20℃でKF(41.56mg、715.38μmol、16.76μL、3.00当量)および2,5-ジフルオロフェノール(37.23mg、286.15μmol、1.20当量)を1回で加えた。この混合物を、20℃で15時間、撹拌した。この反応混合物をHO(5mL)に注ぎ入れ、水相をEtOAc(5mL×3)により抽出した。合わせた有機相をブライン(3mL)により洗浄して無水NaSOにより乾燥させ、ろ過して真空下で濃縮した。次に、残留物を分取HPLC(TFA条件)により精製すると、化合物6.1(41.00mg、87.51μmol、36.70%収率)が白色固体として得られた。
Figure 0007113815000107
HCl/EtOAc(2.00mL)中の化合物6.1(41.00mg、87.51μmol、1.00当量)の混合物を、N下、20℃で15時間、撹拌した。溶液をエバポレートして、有機溶媒を除去した。残留水溶液を凍結乾燥すると、化合物6塩酸塩(17.00mg、46.14μmol、52.73%収率)が白色固体として得られた。LCMS(ESI):m/z:[M+H]C1926の計算値:369.2;実測値369.2;RT=2.239分。1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 1.10 - 1.85 (m, 16 H) 2.62 - 2.84 (m, 3 H) 4.31 (br t, J=10.23 Hz, 1 H) 5.02 - 5.18 (m, 2 H) 6.69 - 7.33 (m, 3 H) 7.85 (br s, 3 H) 8.35 (br d, J=6.65 Hz, 1 H).
(実施例9)
(S)-N-(7-アミノ-1-(3-フルオロフェノキシ)-2-オキソヘプタン-3-イル)シクロペンタンカルボキサミド(7)の調製
Figure 0007113815000108
DMF(1.00mL)中の化合物1.2(100.00mg、238.46μmol、1.00当量)の混合物に、N下、20℃でKF(41.56mg、715.38μmol、16.76μL、3.00当量)および3-フルオロフェノール(32.08mg、286.15μmol、26.30μL、1.20当量)を1回で加えた。この混合物を、20℃で15時間、撹拌した。この反応混合物をHO(5mL)に注ぎ入れ、水相をEtOAc(3×5mL)により抽出した。合わせた有機相をブライン(3mL)により洗浄して無水NaSOにより乾燥させ、ろ過して真空下で濃縮した。次に、残留物を分取HPLC(TFA条件)により精製すると、化合物7.1(47.00mg、104.32μmol、43.75%収率)が白色固体として得られた。
Figure 0007113815000109
HCl/EtOAc(2.00mL)中の化合物7.1(47.00mg、104.32μmol、1.00当量)の混合物を、N下、20℃で15時間、撹拌した。溶液をエバポレートして、有機溶媒を除去した。残留水溶液を凍結乾燥すると、化合物7塩酸塩(20.00mg、57.07μmol、54.71%収率)が白色固体として得られた。LCMS(ESI):m/z:[M+H]C1927FOの計算値:351.2;実測値351.2;RT=2.205分。1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 1.19 - 1.85 (m, 15 H) 2.60 - 2.87 (m, 3 H) 4.33 (ddd, J=9.43, 6.67, 4.85 Hz, 1 H) 4.93 - 5.13 (m, 2 H) 6.61 - 6.88 (m, 3 H) 7.68 (br s, 3 H) 8.27 (d, J=6.84 Hz, 1 H).
(実施例10)
(S)-N-(7-アミノ-1-(3,5-ジフルオロフェノキシ)-2-オキソヘプタン-3-イル)シクロペンタンカルボキサミド(8)の調製
Figure 0007113815000110
DMF(1.00mL)中の化合物1.2(100.00mg、238.46μmol、1.00当量)の混合物に、N下、20℃で、KF(41.56mg、715.38μmol、16.76μL、3.00当量)および3,5-ジフルオロフェノール(37.23mg、286.15μmol、1.20当量)を1回で加えた。この混合物を、20℃で15時間、撹拌した。この反応混合物をHO(5mL)に注ぎ入れ、水相をEtOAc(3×5mL)により抽出した。合わせた有機相をブライン(3mL)により洗浄して無水NaSOにより乾燥させ、ろ過して真空下で濃縮した。次に、残留物を分取HPLC(TFA条件)により精製すると、化合物8.1(50.00mg、106.72μmol、44.75%収率)が白色固体として得られた。
Figure 0007113815000111
HCl/EtOAc(2.00mL)中の化合物8.1(50.00mg、106.72μmol、1.00当量)の混合物を、N下、20℃で4時間、撹拌した。溶液をエバポレートして、有機溶媒を除去した。残留水溶液を凍結乾燥すると、化合物8塩酸塩(20.00mg、54.29μmol、50.87%収率)が白色固体として得られた。LCMS(ESI):m/z:[M+H]C1926の計算値:369.2;実測値369.1;RT=2.750分。1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 1.24 - 1.82 (m, 15 H) 2.61 - 2.83 (m, 3 H) 4.32 (ddd, J=9.43, 6.67, 4.85 Hz, 1 H) 4.96 - 5.08 (m, 2 H) 6.67 (dd, J=9.48, 2.21 Hz, 2 H) 6.79 (tt, J=9.43, 2.26 Hz, 1 H) 7.67 (br s, 3 H) 8.26 (d, J=6.84 Hz, 1 H).
(実施例11)
(R)-3-(アセトアミド-2,2,2-d3)-N-(7-アミノ-1-(2,6-ジフルオロ-フェノキシ)-2-オキソヘプタン-3-イル)ベンズアミド(10)の調製
Figure 0007113815000112
化合物10.7(10.00g、72.92mmol、1.00当量)のMeOH(100.00mL)中溶液に、N下、0℃でSOCl(17.35g、145.84mmol、10.58mL、2.00当量)を1回で加えた。この混合物を、65℃で15時間、撹拌した。この反応混合物をHO(20mL)に注ぎ入れ、水相をEtOAc(3×10mL)により抽出した。合わせた有機相をブライン(5mL)により洗浄して無水NaSOにより乾燥させ、ろ過して真空下で濃縮すると、化合物10.6(13.10g、粗製物)が白色固体として得られた。LCMS(ESI):m/z:[M+H]CNOの計算値:152.1;実測値152.2;RT=1.191分。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 3.35 (s, 3 H) 3.95 (s, 3 H) 7.65 - 7.72 (m, 2 H) 8.07 (s, 1 H) 8.10 - 8.16 (m, 1 H)
Figure 0007113815000113
DMF(50.00mL)中の化合物10.6(3.77g、24.97mmol、1.00当量)、HOBt(3.71g、27.47mmol、1.10当量)およびEDCI(4.79g、24.97mmol、1.00当量)の混合物に、N下、0℃でDIEA(16.14g、124.85mmol、21.80mL、5.00当量)およびジュウテリオ2,2,2-トリジュウテリオアセテート(1.60g、24.97mmol、1.00当量)を1回で加えた。この混合物を、15℃で15時間、撹拌した。この反応混合物をHO(20mL)に注ぎ入れ、水相をEtOAc(3×10mL)により抽出した。合わせた有機相をブライン(5mL)により洗浄して無水NaSOにより乾燥させ、ろ過して真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO、石油エーテル/酢酸エチル=10:1~2:1)によって精製すると、化合物10.5(2.90g、14.78mmol、59.19%収率)が無色油状物として得られた。LCMS(ESI):m/z:[M+H]C10NOの計算値:197.1;実測値197.2;RT=0.634分。1H NMR (400 MHz, クロロホルム-d) δ ppm 3.91 (s, 3 H) 7.41 (t, J=7.94 Hz, 1 H) 7.51 (br s, 1 H) 7.78 (d, J=7.72 Hz, 1 H) 7.92 (br d, J=8.16 Hz, 1 H) 8.01 (s, 1 H).
Figure 0007113815000114
化合物10.5(2.90g、14.78mmol、1.00当量)のMeOH(36.00mL)中溶液に、N下、15℃でHO(12.00mL)中のNaOH(1.18g、29.56mmol、2.00当量)を1回で加えた。この混合物を、15℃で15時間、撹拌した。EtOAcを除去し、次に、溶液を0℃まで冷却し、HCl(1N)によりpHを6~7に調整した。懸濁液をろ過して、ろ過ケーキを50mLのPEにより洗浄して、真空下で乾燥すると、化合物10.4(2.10g、粗製物)が白色固体として得られた。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 7.41 (t, J=7.94 Hz, 1 H) 7.75 (dt, J=7.72, 1.32 Hz, 1 H) 7.82 (ddd, J=8.05, 2.21, 0.99 Hz, 1 H) 8.21 (t, J=1.87 Hz, 1 H).
Figure 0007113815000115
DMF(2.00mL)中の化合物10.4(1.00g、5.49mmol、1.00当量)、HOBt(815.81mg、6.04mmol、1.10当量)およびEDCI(1.16g、6.04mmol、1.10当量)の混合物に、N下、0℃でDIEA(2.84g、21.96mmol、3.83mL、4.00当量)およびメチル(2S)-2-アミノ-6-(tert-ブトキシカルボニルアミノ)ヘキサノエート(1.43g、5.49mmol、1.00当量)を1回で加えた。この混合物を、15℃で15時間、撹拌した。この反応混合物をHO(30mL)に注ぎ入れ、水相をEtOAc(3×30mL)により抽出した。合わせた有機相をブライン(5mL)により洗浄して無水NaSOにより乾燥させ、ろ過して真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO、石油エーテル/酢酸エチル=4:1~0:1)によって精製すると、化合物10.3(1.90g、4.48mmol、81.53%収率)が薄黄色固体として得られた。LCMS(ESI):m/z:[M+H]C2128の計算値:425.2;実測値325.3;RT=0.757分。1H NMR (400 MHz, クロロホルム-d) δ ppm 1.31 - 1.54 (m, 14 H) 1.70 - 1.97 (m, 2 H) 2.11 - 2.19 (m, 1 H) 3.00 - 3.12 (m, 2 H) 3.71 (s, 3 H) 4.64 - 4.81 (m, 2 H) 7.11 (br d, J=7.50 Hz, 1 H) 7.28 - 7.36 (m, 1 H) 7.47 (br d, J=7.28 Hz, 1 H) 7.75 (br s, 1 H) 7.95 (br d, J=7.72 Hz, 1 H) 8.47 (br s, 1 H).
Figure 0007113815000116
DIPA(760.95mg、7.52mmol、1.06mL、4.00当量)のTHF(15.00mL)中溶液に、N下、0℃でn-BuLi(481.73mg、7.52mmol、4.00当量)を加えた。0.5時間後、この混合物に、N2下、-78℃で、化合物10.3(800.00mg、1.88mmol、1.00当量)およびクロロ(ヨード)メタン(1.33g、7.52mmol、545.83μL、4.00当量)を加えた。得られた混合物を、-78℃で1.5時間、撹拌した。水(20mL)を加え、この混合物をEtOAc(3×20mL)により抽出した。合わせた有機層をブライン(10mL)により洗浄し、Na2SO4で乾燥させてろ過し、減圧下で濃縮すると、化合物10.2(900.00mg、粗製物)が暗褐色油状物として得られた。LCMS(ESI):m/z:[M+H]C2127ClNの計算値:442.2;実測値339.3;RT=0.748分。1H NMR (400 MHz, クロロホルム-d) δ ppm 1.35 - 1.59 (m, 17 H) 1.67 (br s, 3 H) 1.76 - 2.02 (m, 3 H) 3.11 (br d, J=6.17 Hz, 2 H) 3.77 (s, 3 H) 4.60 - 4.82 (m, 2 H) 6.87 (br s, 1 H) 7.40 (br t, J=7.61 Hz, 1 H) 7.52 (br s, 1 H) 7.66 - 7.82 (m, 2 H) 7.92 (br s, 1 H).
Figure 0007113815000117
DMF(4.00mL)中の化合物10.2(200.00mg、451.52μmol、1.00当量)および2,6-ジフルオロフェノール(58.74mg、451.52μmol、1.00当量)の混合物に、N2下、20℃でDIEA(175.06mg、1.35mmol、236.57μL、3.00当量)を1回で加えた。この混合物を、20℃で15時間、撹拌した。残留物を分取HPLC(TFA条件)により精製すると、化合物10.1(20.00mg、37.27μmol、8.26%収率)が暗褐色固体として得られた。LCMS(ESI):m/z:[M+H]C2730の計算値:537.3;実測値481.3;RT=1.208分。1H NMR (400 MHz, クロロホルム-d) δ ppm 1.41 (br s, 18 H) 1.80 (br s, 2 H) 2.08 - 2.24 (m, 2 H) 3.13 (br s, 3 H) 4.91 (br s, 3 H) 5.24 (br s, 1 H) 6.88 - 7.05 (m, 5 H) 7.37 - 7.46 (m, 3 H) 7.56 (br s, 2 H) 7.78 (br s, 1 H) 7.93 (br s, 1 H)
Figure 0007113815000118
化合物10.1(10.00mg、18.64μmol、1.00当量)のDCM(10.00mL)中溶液に、N下、20℃でTFA(3.08g、27.01mmol、2.00mL、1449.18当量)を1回で加えた。この混合物を20℃で4時間、撹拌し、真空下で濃縮した。残留物を分取HPLC(TFA条件)により精製すると、化合物10のトリフルオロ酢酸塩(1.00mg、2.29μmol、12.29%収率)が暗褐色固体として得られた。LCMS(ESI):m/z:[M+H]C2222の計算値:437.2;実測値437.3;RT=2.042分。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 1.48 - 1.87 (m, 5 H) 2.13 (br s, 1 H) 2.91 - 2.99 (m, 2 H) 4.90 - 5.08 (m, 5 H) 6.94 - 7.12 (m, 3 H) 7.39 - 7.46 (m, 1 H) 7.54 - 7.65 (m, 2 H) 8.13 (s, 1 H).
(実施例12)
ビオチン化ジンジパイン阻害剤(11)の調製
Figure 0007113815000119
化合物10.7(5.00g、36.46mmol、1.00当量)のCHCN(50.00mL)中溶液に、N下、0℃で、t-BuONO(5.64g、54.69mmol、6.48mL、1.50当量)およびTMSN(5.04g、43.75mmol、5.73mL、1.20当量)を1回で加えた。この混合物を15℃で1時間、撹拌し、ろ過して真空下で濃縮した。HO(20mL)を加え、この水相をEtOAc(3×10mL)により抽出した。合わせた有機相をブライン(5mL)により洗浄して無水NaSOにより乾燥させ、ろ過して真空下で濃縮すると、化合物11.6(4.00g、粗製物)が白色固体として得られた。LCMS(ESI):m/z:[M+H]Cの計算値:164.0;実測値164.1;RT=0.705分。1H NMR (400 MHz, クロロホルム-d) δ ppm 2.71 (d, J=9.48 Hz, 1 H) 6.93 - 6.98 (m, 1 H) 7.27 - 7.32 (m, 1 H) 7.44 - 7.57 (m, 1 H) 7.79 - 7.84 (m, 1 H) 7.90 - 7.95 (m, 1 H).
Figure 0007113815000120
DMF(40.00mL)中の化合物11.6(2.00g、12.26mmol、1.00当量)、HOBt(1.82g、13.49mmol、1.10当量)およびEDCI(2.59g、13.49mmol、1.10当量)の混合物に、N下、0℃でメチル(2S)-2-アミノ-6-(tert-ブトキシカルボニルアミノ)ヘキサノエート(3.19g、12.26mmol、1.00当量)およびDIEA(6.34g、49.04mmol、8.57mL、4.00当量)を1回で加えた。この混合物を、15℃で4時間、撹拌した。この反応混合物をHO(20mL)に注ぎ入れた。水相をEtOAc(3×50mL)により抽出した。合わせた有機相をブライン(5mL)により洗浄して無水NaSOにより乾燥させ、ろ過して真空下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO、石油エーテル/酢酸エチル=10:1~2:1)によって精製すると、化合物11.5(3.50g、8.63mmol、70.39%収率)が白色固体として得られた。LCMS(ESI):m/z:[M+H]C1927の計算値:406.2;実測値350.2;RT=0.840分。1H NMR (400 MHz, クロロホルム-d) δ ppm 1.39 (s, 10 H) 1.46 - 1.56 (m, 3 H) 1.75 - 2.00 (m, 2 H) 3.05 - 3.14 (m, 2 H) 3.77 (s, 3 H) 4.64 (br s, 1 H) 4.72 - 4.80 (m, 1 H) 6.94 (br d, J=7.06 Hz, 1 H) 7.14 (ddd, J=8.05, 2.32, 0.88 Hz, 1 H) 7.40 (t, J=7.83 Hz, 1 H) 7.47 - 7.56 (m, 2 H)
Figure 0007113815000121
DIPA(2.25g、22.20mmol、3.12mL、6.00当量)のTHF(40.00mL)中溶液に、N下、0℃でn-BuLi(1.42g、22.20mmol、6.00当量)を加えた。0.5時間後、この混合物に、N下、-78℃で、化合物11.5(1.50g、3.70mmol、1.00当量)およびクロロ(ヨード)メタン(2.61g、14.80mmol、1.07mL、4.00当量)を加えた。得られた混合物を、-78℃で1.5時間、撹拌した。この反応混合物を水(20mL)に加え、この溶液をEtOAc(3×20mL)により抽出した。合わせた有機層をブライン(10mL)により洗浄し、NaSOで乾燥させてろ過し、減圧下で濃縮すると、残留物が得られ、化合物11.4(1.50g、粗製物)が暗褐色油状物として得られた。
Figure 0007113815000122
DMF(15.00mL)中の化合物11.4(1.50g、3.54mmol、1.00当量)および2,6-ジフルオロフェノール(460.34mg、3.54mmol、1.00当量)の混合物に、N下、20℃でDIEA(1.37g、10.62mmol、1.85mL、3.00当量)を1回で加えた。この混合物を、20℃で15時間、撹拌した。この反応混合物を水(20mL)に加え、この溶液をEtOAc(3×20mL)により抽出した。合わせた有機層をブライン(10mL)により洗浄し、NaSOで乾燥させてろ過し、減圧下で濃縮すると、残留物が得られた。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO、石油エーテル/酢酸エチル=10:1~2:1)によって精製すると、化合物11.3(400.00mg、772.92μmol、21.83%収率)が薄黄色油状物として得られた。LCMS(ESI):m/z:[M+H]C2529の計算値:518.2;実測値518.3;RT=0.912分。
Figure 0007113815000123
CHCN(4.00mL)中の化合物11.3(270.00mg、521.72μmol、1.00当量)およびプロパ-2-イン-1-アミン(28.74mg、521.72μmol、33.41μL、1.00当量)の混合物に、N下、20℃でCuSO(4.16mg、26.09μmol、4.00μL、0.05当量)およびアスコルビン酸ナトリウム(20.67mg、104.34μmol、0.20当量)を1回で加えた。この混合物を、20℃で15時間、撹拌した。残留物を分取HPLC(TFA条件)により精製すると、化合物11.2(70.00mg、122.25μmol、23.43%収率)が暗褐色油状物として得られた。LCMS(ESI):m/z:[M+H]C2834の計算値:573.3;実測値573.5;RT=0.846分。1H NMR (400 MHz, クロロホルム-d) δ ppm 1.19 - 1.69 (m, 8 H) 2.04 (br s, 1 H) 2.67 - 3.25 (m, 3 H) 4.45 (br s, 1 H) 4.72 - 5.15 (m, 2 H) 6.78 - 7.09 (m, 2 H) 7.58 - 8.01 (m, 2 H) 8.16 - 8.49 (m, 1 H) 8.63 - 9.26 (m, 1 H).
Figure 0007113815000124
DMF(1.00mL)中のビオチン-DPEG(4)-COOH(34.34mg、69.86μmol、1.00当量)、HOBt(9.44mg、69.86μmol、1.00当量)およびEDCI(13.39mg、69.86μmol、1.00当量)の混合物に、N下、0℃で化合物11.2(40.00mg、69.86μmol、1.00当量)およびDIEA(36.11mg、279.44μmol、48.80μL、4.00当量)を1回で加えた。この混合物を、20℃で15時間、撹拌した。残留物を分取HPLC(TFA条件)により精製すると、化合物11.1(20.00mg、19.12μmol、27.37%収率)が白色固体として得られた。LCMS(ESI):m/z:[M+H]C496912Sの計算値:1046.5;実測値1046.3;RT=1.115分。1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 1.21 - 1.34 (m, 12 H) 1.35 - 1.75 (m, 9 H) 1.85 (br dd, J=9.59, 3.64 Hz, 1 H) 2.05 (t, J=7.39 Hz, 2 H) 2.35 - 2.42 (m, 1 H) 2.38 (t, J=6.50 Hz, 1 H) 2.53 - 2.60 (m, 2 H) 2.80 (dd, J=12.35, 5.07 Hz, 1 H) 2.89 (br d, J=5.95 Hz, 2 H) 3.08 (ddd, J=8.49, 6.06, 4.63 Hz, 1 H) 3.16 (q, J=5.88 Hz, 2 H) 3.44 - 3.50 (m, 15 H) 3.62 (t, J=6.50 Hz, 3 H) 4.11 (dd, J=7.72, 4.41 Hz, 1 H) 4.29 (dd, J=7.72, 4.41 Hz, 1 H) 4.40 (d, J=5.73 Hz, 2 H) 4.59 - 4.67 (m, 1 H) 5.06 - 5.20 (m, 2 H) 6.76 (br t, J=5.51 Hz, 1 H) 7.06 - 7.14 (m, 3 H) 7.71 (t, J=8.05 Hz, 1 H) 7.82 (t, J=5.62 Hz, 1 H) 7.95 - 8.00 (m, 1 H) 8.06 (ddd, J=8.16, 2.21, 0.88 Hz, 1 H) 8.36 (t, J=1.76 Hz, 1 H) 8.45 (t, J=5.51 Hz, 1 H) 8.64 (s, 1 H) 8.95 (d, J=7.28 Hz, 1 H).
Figure 0007113815000125
化合物11.1(20.00mg、19.12μmol、1.00当量)のTFA(1.03g、9.00mmol、666.11μL、470.61当量)中溶液を、N下、20℃で4時間、撹拌した。この混合物をろ過して真空下で濃縮すると、化合物11のトリフルオロ酢酸塩(18.00mg、16.98μmol、88.81%収率、TFA)が白色固体として得られた。LCMS(ESI):m/z:[M+H]C446110Sの計算値:946.4;実測値946.6;RT=2.076分。1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 1.10 - 1.77 (m, 14 H) 1.82 - 1.95 (m, 1 H) 2.05 (t, J=7.40 Hz, 2 H) 2.17 (t, J=8.03 Hz, 1 H) 2.30 - 2.42 (m, 2 H) 2.53 - 2.60 (m, 3 H) 2.64 - 2.71 (m, 2 H) 2.73 - 2.85 (m, 3 H) 3.04 - 3.12 (m, 2 H) 3.17 (q, J=5.86 Hz, 3 H) 3.44 - 3.52 (m, 14 H) 3.63 (br t, J=6.46 Hz, 2 H) 4.08 - 4.15 (m, 1 H) 4.26 - 4.33 (m, 1 H) 4.40 (d, J=5.52 Hz, 2 H) 4.63 - 4.72 (m, 1 H) 5.07 - 5.21 (m, 2 H) 6.31 - 6.42 (m, 2 H) 6.95 - 6.99 (m, 1 H) 6.97 (s, 1 H) 7.06 - 7.15 (m, 3 H) 7.23 (s, 1 H) 7.58 - 7.76 (m, 4 H) 7.81 (br t, J=5.46 Hz, 1 H) 7.95 - 8.01 (m, 1 H) 7.98 (d, J=7.91 Hz, 1 H) 8.07 (dd, J=8.03, 1.25 Hz, 1 H) 8.38 (s, 1 H) 8.45 (t, J=5.52 Hz, 1 H) 8.63 - 8.66 (m, 1 H) 8.64 (s, 1 H) 8.98 (d, J=7.53 Hz, 1 H).
(実施例13)
(S)-N-(7-アミノ-1-(2,6-ジフルオロフェノキシ)-2-オキソヘプタン-3-イル)-3-アジドベンズアミド(12)の調製
Figure 0007113815000126
CHCN(70.00mL)中の化合物12.7(5.00g、36.46mmol、1.00当量)およびt-BuONO(5.64g、54.69mmol、6.48mL、1.50当量)の混合物に、N下、18℃でTMSN(5.04g、43.75mmol、5.73mL、1.20当量)を1回で加えた。この混合物を、18℃で10時間、撹拌した。この反応混合物をHO(100mL)により希釈し、EtOAc(3×50mL)により抽出した。合わせた有機層をブライン(100mL)により洗浄し、NaSOで乾燥させてろ過し、減圧下で濃縮すると、残留物が得られた。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO、DCM:MeOH=10:1)によって精製すると、化合物12.6(3.00g、18.39mmol、50.44%収率)が黄色固体として得られた。
Figure 0007113815000127
THF(160.00mL)およびMeOH(40.00mL)中の化合物12.5(20.00g、81.20mmol、1.00当量)の溶液に、N下、25℃でTMSCHN(27.82g、243.60mmol、3.00当量)を滴下して加えた。この混合物を、25℃で20時間、撹拌した。この反応混合物を減圧下で濃縮すると、残留物が得られた。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO、酢酸エチル)によって精製すると、化合物12.4(8.00g、30.73mmol、37.85%収率)が無色油状物として得られた。
Figure 0007113815000128
DMF(20.00mL)中の化合物12.6(1.25g、7.68mmol、1.00当量)およびEDCI(1.62g、8.45mmol、1.10当量)の混合物に、N下、0℃でHOBt(1.14g、8.45mmol、1.10当量)を1回で加えた。この混合物を0℃で1時間、撹拌し、次に、この混合物を、化合物12.4(2.00g、7.68mmol、1.00当量)のDMF(5mL)中溶液に滴下して加えた。DIPEA(2.98g、23.04mmol、4.03mL、3.00当量)を滴下して加え、この混合物を0℃で1時間、撹拌した。この反応混合物をHO(20mL)により希釈し、EtOAc(3×15mL)により抽出した。合わせた有機層をブライン(40mL)により洗浄し、NaSOで乾燥させてろ過し、減圧下で濃縮すると、残留物が得られた。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO、石油エーテル/酢酸エチル=1:1)によって精製すると、化合物12.3(2.80g、6.91mmol、89.97%収率)が黄色油状物として得られた。1H NMR (400 MHz, CD3OD-d4) δ ppm 1.40 (s, 8 H) 1.44 - 1.58 (m, 4 H) 1.80 - 2.00 (m, 2 H) 3.00 - 3.10 (m, 2 H) 3.74 (s, 3 H) 4.58 (dd, J=9.26, 5.07 Hz, 1 H) 7.25 (ddd, J=8.05, 2.32, 1.10 Hz, 1 H) 7.49 (t, J=7.83 Hz, 1 H) 7.56 (t, J=1.76 Hz, 1 H) 7.63 - 7.69 (m, 1 H).LCMS(ESI):m/z:[M+H]C1927の計算値:405;実測値350, 306;RT=0.897分。
Figure 0007113815000129
DIPA(1.50g、14.80mmol、2.08mL、6当量)のTHF(15.00mL)中溶液に、0℃でn-BuLi(2.5M、5.92mL、6.00当量)を加え、この混合物を0℃で30分間、撹拌した。この混合物に、-78℃で、化合物12.3(1.00g、2.47mmol、1.00当量)およびクロロ(ヨード)メタン(2.18g、12.35mmol、895.11μL、5.00当量)のTHF(15.00mL)中溶液を加えた。この混合物を-78℃で30分間、撹拌した。飽和水性NHCl(10mL)を加え、次に、混合物をEtOAc(3×15mL)により抽出した。合わせた有機層を水性飽和NaSO(20)およびブライン(20mL)により洗浄し、NaSOで乾燥させてろ過して、減圧下で濃縮すると、粗製化合物12.2(2.00g、粗製物)が黄色油状物として得られ、これを次のステップに使用した。
Figure 0007113815000130
DMF(5.00mL)中の化合物12.2(2.00g、4.72mmol、1.00当量)および2,6-ジフルオロフェノール(613.79mg、4.72mmol、1.00当量)の混合物に、N下、20℃でDIPEA(2.44g、18.87mmol、3.30mL、4.00当量)を1回で加えた。この混合物を、20℃で10時間、撹拌した。残留物を分取HPLC(TFA条件)により精製すると、化合物12.1(200.00mg、386.46μmol、8.19%収率)が黄色油状物として得られた。
Figure 0007113815000131
化合物12.1(100.00mg、193.23μmol、1.00当量)のDCM(5.00mL)中溶液に、N下、18℃でTFA(1.54g、13.51mmol、1.00mL、69.90当量)を1回で加えた。この混合物を、18℃で10時間、撹拌した。この反応混合物を減圧下で濃縮すると、残留物が得られた。残留物を分取HPLC(TFA条件)により精製すると、化合物12のトリフルオロ酢酸塩(80.00mg、191.66μmol、99.19%)が黄色油状物として得られた。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 1.49 - 1.67 (m, 2 H) 1.67 - 1.88 (m, 3 H) 2.11 (dddd, J=13.84, 9.48, 6.78, 4.30 Hz, 1 H) 2.89 - 2.99 (m, 2 H) 4.91 - 5.08 (m, 3 H) 6.95 - 7.05 (m, 2 H) 7.05 - 7.12 (m, 1 H) 7.26 - 7.31 (m, 1 H) 7.48 - 7.54 (m, 1 H) 7.56 (t, J=1.87 Hz, 1 H) 7.64 - 7.70 (m, 1 H).LCMS(ESI):m/z:[M+H]C2021の計算値:418;実測値418;RT=3.08分。
(実施例14)
(S)-N-(7-アミノ-2-オキソ-1-(1H-テトラゾール-1-イル)ヘプタン-3-イル)シクロペンタンカルボキサミド(13)および(S)-N-(7-アミノ-2-オキソ-1-(2H-テトラゾール-2-イル)ヘプタン-3-イル)シクロペンタンカルボキサミド(14)の調製
Figure 0007113815000132
化合物1.2(50.00mg、119.23μmol、1.00当量)のDMF(3.00mL)中溶液に、DIEA(46.23mg、357.70μmol、62.47μL、3.00当量)およびテトラゾール(0.45M、264.96μL、1.00当量)を加えた。この混合物を、25℃で15時間、撹拌した。この残留物を分取HPLC(TFA条件)によって精製した。化合物13.1(5.00mg、12.24μmol、10.27%収率)が白色固体として得られ、5mgの化合物14.1が白色固体として得られた。
Figure 0007113815000133
DCM(5.00mL)およびTFA(1.00mL)中の化合物13.1(5.00mg、12.24μmol、1.00当量)の混合物を、25℃で2時間、撹拌した。この混合物を減圧下で濃縮すると、化合物13のトリフルオロ酢酸塩(5.00mg、11.84μmol、96.71%収率、TFA)が得られた。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 1.25 - 1.57 (m, 4 H) 1.58 - 1.81 (m, 12 H) 1.84 - 2.09 (m, 6 H) 2.68 - 2.84 (m, 1 H) 2.94 (br t, J=7.50 Hz, 3 H) 4.44 - 4.58 (m, 1 H) 5.51 - 5.79 (m, 2 H) 9.06 - 9.18 (m, 1 H).LCMS(ESI):m/z:[M+H]C1424・CHFの計算値:423;実測値309;RT=1.208分。
Figure 0007113815000134
DCM(5.00mL)およびTFA(1.00mL)中の化合物14.1(5.00mg、12.24μmol、1.00当量)の混合物を、25℃で2時間、撹拌した。この混合物を減圧下で濃縮すると、化合物14のトリフルオロ酢酸塩(5.00mg、11.84μmol、96.71%収率、TFA)が得られた。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 1.20 - 1.53 (m, 5 H) 1.54 - 1.80 (m, 12 H) 1.82 - 2.08 (m, 5 H) 2.64 - 2.83 (m, 1 H) 2.93 (br t, J=7.28 Hz, 3 H) 4.55 (dd, J=9.37, 4.74 Hz, 1 H) 5.71 - 5.94 (m, 2 H) 8.76 (s, 1 H).LCMS(ESI):m/z:[M+H]C1424・CHFの計算値:423;実測値309;RT=1.606分。
(実施例15)
蛍光ジンジパイン活性プローブ:(S)-N-(7-アミノ-1-(2,6-ジフルオロフェノキシ)-2-オキソヘプタン-3-イル)-3-(4-((3-(5,5-ジフルオロ-7,9-ジメチル-5H-5l4,6l4-ジピロロ[1,2-c:2’,1’-f][1,3,2]ジアザボリニン-3-イル)プロパンアミド)メチル)-1H-1,2,3-トリアゾール-1-イル)ベンズアミド(15)の調製
Figure 0007113815000135
THF(60.00mL)中の化合物15.7(5.00g、52.58mmol、1.00当量)およびメチル2-ジエトキシホスホリルアセテート(11.05g、52.58mmol、1.00当量)の混合物に、N下、50℃でKCO(14.53g、105.16mmol、2.00当量)を1回で加えた。この混合物を、50℃で10時間、撹拌した。この反応混合物をHO(50mL)により希釈し、EtOAc(3×50mL)により抽出した。合わせた有機層をブライン(100mL)により洗浄し、NaSOで乾燥させてろ過し、減圧下で濃縮すると、残留物が得られた。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO、石油エーテル/酢酸エチル=5:1)によって精製すると、15.6(8.60g、56.89mmol、108.20%収率)が白色固体として得られた。
Figure 0007113815000136
化合物15.6(8.60g、56.89mmol、1.00当量)のMeOH(100.00mL)中溶液に、N下、Pd-C(10%、0.9g)を加えた。この懸濁液を真空下で脱気してHによりパージすることを数回行った。この混合物を、H(50psi)下、18℃で10時間、撹拌した。この反応混合物をろ過して、減圧下で濃縮すると、残留物が得られた。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO、石油エーテル/酢酸エチル=5:1)によって精製すると、化合物15.5(5.00g、32.64mmol、57.37%収率)が無色油状物として得られた。
Figure 0007113815000137
DCM(60.00mL)中の化合物15.5(3.00g、19.58mmol、1.00当量)および化合物15.4(2.65g、21.54mmol、1.10当量)の混合物に、N下、18℃でPOCl(3.30g、21.54mmol、2.00mL、1.10当量)を1回で加えた。この混合物を18℃で10時間、撹拌し、次いで、18℃でBF・EtO(11.12g、78.32mmol、9.67mL、4.00当量)およびDIEA(10.63g、82.24mmol、14.36mL、4.20当量)を滴下して加えた。この混合物を、18℃で10時間、撹拌した。この反応混合物をろ過してHO(50mL)により希釈し、DCM(3×50mL)により抽出した。合わせた有機層をブライン(100mL)により洗浄し、NaSOで乾燥させてろ過し、減圧下で濃縮すると、残留物が得られた。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO、石油エーテル/酢酸エチル=1:4)によって精製すると、化合物15.3(3.00g、9.80mmol、50.05%収率)が赤色固体として得られた。
Figure 0007113815000138
THF(120.00mL)およびHO(80.00mL)中の化合物15.3(1.00g、3.27mmol、1.00当量)の混合物に、N下、18℃でHCl(51.11g、519.15mmol、50.11mL、37%純度、158.76当量)を1回で加えた。この混合物を、18℃で10時間、撹拌した。DCM(100mL)の添加によりこの反応混合物をクエンチして、次に、DCM(3×100mL)により抽出した。合わせた有機層をブライン(300mL)により洗浄し、NaSOで乾燥させてろ過し、減圧下で濃縮すると、残留物が得られた。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO、DCM:MeOH=20:1)によって精製すると、化合物15.2(700.00mg、2.40mmol、73.29%収率)が赤色固体として得られた。
Figure 0007113815000139
DMF(3.00mL)中の化合物15.2(300.00mg、1.03mmol、1.00当量)およびHOBt(152.66mg、1.13mmol、1.10当量)の混合物に、N下、0℃でEDCI(216.58mg、1.13mmol、1.10当量)を1回で加えた。この混合物を、0℃で1時間、撹拌した。次に、0℃で、プロパルギルアミン(56.57mg、1.03mmol、65.78μL、1.00当量)およびDIPEA(398.22mg、3.08mmol、538.13μL、3.00当量)を1回で加え、この混合物を0℃で1時間、撹拌した。この反応混合物をEtOAc(4mL)により希釈し、EtOAc(3×3mL)により抽出した。合わせた有機層をブライン(5mL)により洗浄し、NaSOで乾燥させてろ過し、減圧下で濃縮すると、残留物が得られた。残留物を分取TLC(SiO、DCM:MeOH=20:1)によって精製すると、化合物15.1(150.00mg、455.72μmol、44.24%収率)が赤色固体として得られた。
Figure 0007113815000140
アセトニトリル(2.00mL)中の化合物15.1(100.00mg、303.81μmol、1.00当量)および化合物12(126.81mg、303.81μmol、1.00当量)の混合物に、N下、18℃でCuSO(2.42mg、15.19μmol、2.33μL、0.05当量)のHO(100.00μL)中溶液を1回で、およびアスコルビン酸ナトリウム(120.38mg、607.62μmol、2.00当量)を加えた。この混合物を、18℃で10時間、撹拌した。残留物を分取HPLC(TFA条件)により精製すると、化合物15のトリフルオロ酢酸塩(5.00mg、6.70μmol、2.21%収率)が赤色固体として得られた。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 1.46 - 1.68 (m, 1 H) 1.46 - 1.67 (m, 1 H) 1.69 - 1.90 (m, 1 H) 2.04 - 2.18 (m, 2 H) 2.19 - 2.31 (m, 3 H) 2.48 (s, 2 H) 2.69 (br t, J=7.45 Hz, 2 H) 2.95 (br s, 2 H) 3.19 - 3.28 (m, 2 H) 4.52 (s, 2 H) 5.04 (br s, 3 H) 6.19 (s, 1 H) 6.31 (br d, J=3.51 Hz, 1 H) 6.91 - 7.12 (m, 4 H) 7.31 - 7.32 (m, 1 H) 7.35 (s, 1 H) 7.68 (br t, J=8.11 Hz, 1 H) 7.65 - 7.71 (m, 1 H) 7.95 - 8.04 (m, 2 H) 8.25 - 8.36 (m, 2 H).LCMS(ESI):m/z:[M+H]C3739Bの計算値:746;実測値747;RT=2.117分
(実施例16)
(S)-N-(7-アミノ-1-(メチルチオ)-2-オキソヘプタン-3-イル)シクロ-ペンタン-カルボキサミド(16)の調製
Figure 0007113815000141
化合物1.2(100.00mg、240μmol、1.00当量)のDMF(2.00mL)中溶液に、メチルスルファニルナトリウム(16mg、240μmol、15μL、1.00当量)を加えた。この混合物を、25℃で0.5時間、撹拌した。この残留物を分取HPLC(TFA条件)によって精製した。化合物16.1(50.00mg、99.89μmol、55.16%収率、TFA)が、黄色油状物として得られた。
Figure 0007113815000142
化合物16.1(50.00mg、129.35μmol、1.00当量)のDCM(5.00mL)中溶液に、TFA(1.00mL)を加えた。この混合物を、25℃で5時間、撹拌した。この混合物を減圧下で濃縮すると、化合物16のトリフルオロ酢酸塩(5.00mg、17.46μmol、13.50%収率)が得られた。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 1.33 - 1.54 (m, 2 H) 1.55 - 1.79 (m, 11 H) 1.80 - 1.99 (m, 4 H) 2.06 (s, 3 H) 2.64 - 2.80 (m, 1 H) 2.86 - 2.99 (m, 2 H) 3.36 (d, J=1.54 Hz, 2 H) 4.67 (dd, J=9.48, 4.41 Hz, 1 H).LCMS(ESI):m/z:[M+H]C1426SOの計算値:287;実測値287;RT=1.826分。
(実施例17)
(S)-N-(7-アミノ-2-オキソ-1-(2,2,2-トリフルオロエトキシ)ヘプタン-3-イル)シクロ-ペンタンカルボキサミド(17)の調製
Figure 0007113815000143
化合物1.2(50.00mg、119.23μmol、1.00当量)のDMF(2.00mL)中溶液に、K2CO3(49.44mg、357.69μmol、3.00当量)および2,2,2-トリフルオロエタン-1-オール(11.93mg、119.23μmol、8.58μL、1.00当量)を加えた。この混合物を、25℃で15時間、撹拌した。この残留物を分取HPLC(TFA条件)によって精製した。化合物17.1(10.00mg、22.81μmol、19.13%収率)が、黄色油状物として得られた。
Figure 0007113815000144
tert-ブチル化合物17.1(10.00mg、22.81μmol、1.00当量)のDCM(2.50mL)中溶液に、TFA(500.00μL)を加えた。この混合物を、25℃で2時間、撹拌した。この混合物を減圧下で濃縮すると、化合物17のトリフルオロ酢酸塩(5.00mg、14.78μmol、64.78%収率)が黄色油状物として得られた。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 1.32 - 1.51 (m, 3 H) 1.53 - 1.78 (m, 10 H) 1.80 - 1.96 (m, 4 H) 2.72 (quin, J=7.88 Hz, 1 H) 2.86 - 2.99 (m, 2 H) 3.96 - 4.08 (m, 2 H) 4.36 - 4.55 (m, 3 H).LCMS(ESI):m/z:[M+H]C1525の計算値:339;実測値339;RT=2.060分。
(実施例18)
(S)-N-(7-アミノ-1-((1,1,1,3,3,3-ヘキサフルオロプロパン-2-イル)オキシ)-2-オキソヘプタン-3-イル)シクロペンタンカルボキサミド(18)の調製
Figure 0007113815000145
化合物1.2(50.00mg、119.23μmol、1.00当量)のDMF(2.00mL)中溶液に、K2CO3(49.44mg、357.69μmol、3.00当量)および1,1,1,3,3,3-ヘキサフルオロプロパン-2-オール(20.04mg、119.23μmol、1.00当量)を加えた。この混合物を、25℃で15時間、撹拌した。この残留物を分取HPLC(TFA条件)によって精製した。化合物18.1(15.00mg、29.62μmol、24.84%収率)が、黄色油状物として得られた。
Figure 0007113815000146
化合物18.1(15.00mg、29.62μmol、1.00当量)のDCM(5.00mL)中溶液に、TFA(1.00mL)を加えた。この混合物を、25℃で15時間、撹拌した。この混合物を減圧下で濃縮すると、化合物18のトリフルオロ酢酸塩(5.00mg、12.30μmol、41.54%収率)が黄色油状物として得られた。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 1.35 - 1.54 (m, 2 H) 1.55 - 1.78 (m, 10 H) 1.80 - 1.97 (m, 3 H) 2.65 - 2.79 (m, 1 H) 2.85 - 2.98 (m, 2 H) 4.45 - 4.54 (m, 1 H) 4.60 - 4.78 (m, 1 H) 4.98 - 5.08 (m, 1 H).LCMS(ESI):m/z:[M+H]C1624の計算値:407;実測値407;RT=2.356分。
(実施例19)
(S)-N-(7-アミノ-1-(ジメチルアミノ)-2-オキソヘプタン-3-イル)シクロ-ペンタンカルボキサミド(19)の調製
Figure 0007113815000147
DMF(1.00mL)中の化合物1.2(100.00mg、238.46μmol、1.00当量)およびN-メチルメタンアミン(19.44mg、238.46μmol、21.85μL、1.00当量、HCl)の混合物に、N下、20℃でDIPEA(123.28mg、953.86μmol、166.59μL、4.00当量)を1回で加えた。この混合物を、20℃で1時間、撹拌した。残留物を分取HPLC(TFA条件)により精製すると、化合物19.1(50.00mg、130.37μmol、54.67%収率)が無色油状物として得られた。LCMS(ESI):m/z:[M+H]C2037の計算値:383;実測値384;RT=0.672分
Figure 0007113815000148
化合物19.1(50.00mg、130.37μmol、1.00当量)をDMF(1.00mL)に溶解し、この混合物にTFA(1.12g、9.85mmol、728.95μL、75.52当量)を加え、18℃で10時間、撹拌した。この反応混合物を減圧下で濃縮すると、化合物19のトリフルオロ酢酸塩(50.00mg、粗製物)が無色油状物として得られた。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 1.39 - 1.58 (m, 3 H) 1.59 - 1.66 (m, 2 H) 1.66 - 1.78 (m, 7 H) 1.87 - 1.98 (m, 3 H) 2.68 - 2.81 (m, 1 H) 2.90 (s, 6 H) 2.92 - 2.97 (m, 2 H) 4.28 - 4.32 (m, 1 H) 4.32 - 4.42 (m, 2 H).LCMS(ESI):m/z:[M+H]C1529の計算値:283;実測値284;RT=2.365分
(実施例20)
(S)-3-アセトアミド-N-(7-アミノ-1-(2,6-ジフルオロフェノキシ)-2-オキソヘプタン-3-イル)ベンズアミド(9)の調製
Figure 0007113815000149
化合物3-アセトアミド安息香酸(1.21g、6.74mmol、1.00当量)のDMF(30.00mL)溶液に、HOBt(1.00g、7.41mmol、1.10当量)およびEDCI(1.42g、7.41mmol、1.10当量)を加えた。添加後、この混合物を0℃で30分間、撹拌した。次に、上記の混合物に、N下、0℃で、DIEA(3.48g、26.96mmol、4.71mL、4.00当量)および化合物9.4(2.00g、6.74mmol、1.00当量)を加えた。得られた混合物を、25℃で15.5時間、撹拌した。この反応混合物を水(10mL)に加え、EtOAc(30mL×3)により抽出した。有機相を分離してNaCl(10mL)により洗浄し、Na2SO4で乾燥させてろ過し、減圧下で濃縮すると、残留物が得られた。化合物9.3(2.30g、5.46mmol、80.96%収率)が、白色固体として得られた。LCMS(ESI):m/z:[M+H]C2131の計算値:421.22;実測値322.3;RT=0.748分。1H NMR (400 MHz, クロロホルム-d) δ ppm 1.30 - 1.56 (m, 14 H) 1.68 - 1.98 (m, 2 H) 2.16 (s, 3 H) 2.98 - 3.15 (m, 2 H) 3.71 (s, 3 H) 4.61 - 4.83 (m, 2 H) 7.14 (br d, J=7.50 Hz, 1 H) 7.28 - 7.37 (m, 1 H) 7.47 (br d, J=7.06 Hz, 1 H) 7.74 (br s, 1 H) 7.91 - 8.02 (m, 1 H) 8.52 (br s, 1 H).
Figure 0007113815000150
DIPA(384.12mg、3.80mmol、533.50μL、4.00当量)のTHF(10.00mL)中溶液に、N下、0℃でn-BuLi(243.17mg、3.80mmol、4.00当量)を加えた。0.5時間後、上記の混合物に、N下、-78℃で、化合物9.3(400.00mg、949.01μmol、1.00当量)およびクロロヨードメタン(669.55mg、3.80mmol、275.53μL、4.00当量)を加えた。得られた混合物を、-78℃で1.5時間、撹拌した。この反応混合物を水(20mL)に加え、EtOAc(20mL×3)により抽出した。合わせた有機層をブライン(10mL×1)により洗浄し、Na2SO4で乾燥させてろ過し、減圧下で濃縮すると、残留物が得られた。化合物9.2(500.00mg、粗製物)が、黒褐色油状物として得られた。
Figure 0007113815000151
化合物9.2(200.00mg、454.62μmol、1.00当量)およびDIEA(176.27mg、1.36mmol、238.20μL、3.00当量)のDMF(4.00mL)中溶液に、N2下、25℃で2,6-ジフルオロフェノール(118.28mg、909.24μmol、2.00当量)を加えた。得られた混合物を、25℃で16時間、撹拌した。この反応混合物を水(10mL)に加え、EtOAc(10mL×3)により抽出した。合わせた有機層をブライン(5mL×1)により洗浄し、Na2SO4で乾燥させてろ過し、減圧下で濃縮すると、残留物が得られた。粗生成物(500.00mg)が黄色油状物として得られた。この残留物を分取HPLC(中性条件)によって精製した。化合物9.1(10.00mg、18.74μmol、2.00%収率)が、白色固体として得られた。
Figure 0007113815000152
化合物9.1(5.00mg、9.37μmol、1.00当量)のDCM(2.00mL)溶液に、N2下、TFA(2.14mg、18.74μmol、1.39μL、2.00当量)を加えた。この混合物を、25℃で16時間、撹拌した。濃縮すると、残留物が得られた。化合物9のトリフルオロ酢酸塩(5.00mg、9.13μmol、97.47%収率、TFA)が、赤色油状物として得られた。LCMS(ESI):m/z:[M+H]C2225の計算値:433.18;実測値434.2;RT=2.052分。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 1.44 - 1.88 (m, 1 H) 1.44 - 1.51 (m, 1 H) 1.51 - 1.84 (m, 1 H) 1.52 - 1.82 (m, 1 H) 1.52 - 1.85 (m, 1 H) 1.83 - 1.85 (m, 1 H) 2.07 - 2.20 (m, 1 H) 2.94 (br t, J=6.50 Hz, 1 H) 4.90 - 5.10 (m, 1 H) 4.91 - 5.10 (m, 1 H) 6.91 - 7.13 (m, 1 H) 7.33 - 7.47 (m, 1 H) 7.49 - 7.68 (m, 1 H) 8.03 - 8.18 (m, 1 H)
追加の化合物は、これまでの実施例における手順に従い合成した。
(実施例21)
(S)-N-(7-アミノ-1-(メチルスルホニル)-2-オキソヘプタン-3-イル)-シクロペンタンカルボキサミド(20)の調製
Figure 0007113815000153
化合物1.2(200.00mg、476.93μmol、1.00当量)のDMF(3.00mL)中溶液に、メチルスルファニルナトリウム(33.43mg、476.93μmol、30.39uL、1.00当量)を加えた。この混合物を、25℃で0.5時間、撹拌した。残留物を分取HPLCにより精製し、化合物20.2(80.00mg、206.96μmol、43.39%収率)が黄色油状物として得られた。
Figure 0007113815000154
化合物20.2(60.00mg、155.22μmol、1.00当量)のTHF(2.00mL)およびHO(600.00μL)中溶液に、オキソン(190.85mg、310.44μmol、2.00当量)を加えた。この混合物を、25℃で12時間、撹拌した。残留物を分取HPLCにより精製すると、化合物20.1(20.00mg、47.78μmol、30.78%収率)が白色固体として得られた。
Figure 0007113815000155
TFA(1.00mL)およびDCM(5.00mL)中の化合物20.1(20.00mg、47.78μmol、1.00当量)を、25℃で14時間、撹拌した。この混合物を減圧下で濃縮すると、化合物20のトリフルオロ酢酸塩(10.00mg、31.40μmol、65.73%収率)が黄色油状物として得られた。1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 1.18 - 1.39 (m, 1 H) 1.18 - 1.39 (m, 1 H) 1.39 - 1.66 (m, 9 H) 1.67 - 1.88 (m, 3 H) 2.58 - 2.86 (m, 3 H) 3.08 (s, 3 H) 4.15 - 4.32 (m, 1 H) 4.39 - 4.61 (m, 2 H) 7.70 (br s, 3 H) 8.23 (d, J=7.06 Hz, 1 H).LCMS(ESI):m/z:[M+H]C1426SOの計算値:319;実測値319;RT=1.916分。
(実施例22)
(S)-N-(7-アミノ-1-(2,6-ジフルオロフェノキシ)-2-オキソヘプタン-3-イル)-3-フルオロベンズアミド(26)の調製
Figure 0007113815000156
DMF(10mL)中の化合物26.1(420.44mg、3.0mmol、1当量)およびEDCI(632.77mg、3.3mmol、1.1当量)、HOBt(446.01mg、3.3mmol、1.1当量)の混合物に、N下、0℃で化合物26.2(1g、3mmol、1当量)およびDIEA(1.55g、12mmol、2.09mL、4当量)を1回で加えた。この混合物を、0℃で15時間、撹拌した。水相をEtOAc(20mL×3)により抽出した。合わせた有機相をブライン(5mL)で洗浄して無水NaSOにより乾燥させ、ろ過して真空で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO、石油エーテル/酢酸エチル=10:1~1:1)によって精製すると、化合物26.3(600mg、1.57mmol、52.3%収率)が白色固体として得られた。LCMS[M+H]:383;保持時間=0.824分。
Figure 0007113815000157
THF(6mL)中のn-BuLi(301.51mg、4.71mmol、6当量)およびDIPA(476.28mg、4.71mmol、661.49μL、6当量)の混合物を、N下、0℃で撹拌した。0.5時間後、上記の混合物に、N下、-78℃で、26.3(300mg、784.46μmol、1当量)およびヨードクロロメタン(553.45mg、3.14mmol、227.76μL、4当量)を加えた。得られた混合物を、-78℃で2時間、撹拌した。この反応混合物に水(20mL)を加え、次に、この反応混合物をEtOAc(20xmL×3)により抽出した。合わせた有機層をブライン(10mL)により洗浄してNaSOで乾燥させ、ろ過して減圧下で濃縮した。26.4(200mg、499μmol、63.6%収率)が褐色油状物として得られた。
Figure 0007113815000158
DMF(4mL)中の化合物26.4(200mg、499μmol、1当量)および2,6-ジフルオロフェノール(64.9mg、499μmol、1当量)の混合物に、N下、20℃でDIEA(193.44mg、1.5mmol、261.41μL、3当量)を1回で加えた。この混合物を、20℃で15時間、撹拌した。この残留物を分取スケールのHPLC(TFA条件)によって精製した。化合物26.5(18mg、36.4μmol、1当量)が、白色固体として得られた。LCMS[M+H]:496;保持時間=0.886分。
Figure 0007113815000159
HCl/EtOAc(10mL)中の化合物26.5(18mg、36.4μmol、1当量)の混合物を、20℃で4時間、撹拌した。次に、ろ過して真空下で濃縮した。残留物を半分取スケールのHPLC(TFA条件)により精製すると、化合物26(12mg)が無色油状物として得られた。LCMS[M+H]:395;保持時間=1.53分。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 1.48 - 1.63 (m, 2 H), 1.67 - 1.86 (m, 3 H), 2.07 - 2.18 (m, 1 H), 2.89 - 2.99 (m, 2 H), 4.92 - 4.96 (m, 1 H), 4.96 - 5.06 (m, 2 H), 6.95 - 7.03 (m, 2 H), 7.03 - 7.12 (m, 1 H), 7.29 - 7.35 (m, 1 H), 7.51 (td, J=7.99, 5.62 Hz, 1 H), 7.60 (dt, J=9.70, 2.09 Hz, 1 H), 7.67 - 7.71 (m, 1 H).
(実施例23)
(S)-N-(7-アミノ-1-(2,6-ジフルオロフェノキシ)-2-オキソヘプタン-3-イル)-3-(2-フルオロエトキシ)ベンズアミド(27)の調製
Figure 0007113815000160
DMF(10mL)中の27.1(1g、6.57mmol、1当量)および1-フルオロ-2-ブロモエタン(834.44mg、6.57mmol、1当量)の混合物に、N下、20℃でKCO(2.72g、19.71mmol、3当量)を1回で加えた。この混合物を、80℃で15時間、撹拌した。水相をEtOAc(20mL×3)により抽出した。合わせた有機相をブライン(5mL)で洗浄して無水NaSOにより乾燥させ、ろ過して真空で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO、石油エーテル/酢酸エチル=10/1~2/1)によって精製すると、化合物27.2(890mg、4.49mmol、68.35%収率)が無色油状物として得られた。LCMS[M+H]:199;保持時間=0.77分。
Figure 0007113815000161
27.2(890mg、4.49mmol、1当量)のMeOH(27mL)およびNaOH(1M、8.98mL、2当量)中溶液を20℃で15時間、撹拌した。合わせた水層をEtOAc(40mL×2)により抽出し、中性不純物を除去した。水相を水性HClでpH5まで酸性にし、EtOAc(40mL)により抽出した。化合物27.3(600mg、3.26mmol、72.6%収率)が、無色油状物として得られた。
Figure 0007113815000162
DMF(10mL)中の化合物27.3(600mg、3.26mmol、1当量)およびHOBt(484.54mg、3.59mmol、1.1当量)、EDCI(687.44mg、3.59mmol、1.1当量)の混合物に、N下、0℃で26.1(967.54mg、3.26mmol、1当量、HCl)およびDIEA(1.69g、13.04mmol、2.28mL、4当量)を1回で加えた。この混合物を、20℃で15時間、撹拌した。この反応混合物を水(20mL)に加え、次に、EtOAc(20mL×3)により抽出した。合わせた有機層をブライン(10mL)により洗浄し、NaSOで乾燥させてろ過し、減圧下で濃縮すると、27.4(1.17g、2.74mmol、84%収率)が無色油状物として得られた。LCMS[M+H]:427;保持時間=0.825分。
Figure 0007113815000163
THF(6mL)中のDIPA(427.08mg、4.22mmol、593.17μL、6当量)に、N下、0℃でn-BuLi(270.37mg、4.22mmol、6当量)を1回で加えた。0.5時間後、上記の混合物に、N下、-78℃で、27.4(300mg、703.43μmol、1当量)およびヨードクロロメタン(744.43mg、4.22mmol、306.35μL、6当量)を加えた。得られた混合物を、-78℃で2時間、撹拌した。この反応混合物に水(20mL)を加え、次に、この反応混合物をEtOAc(20mL×3)により抽出した。合わせた有機層をブライン(10mL)により洗浄してNaSOで乾燥させ、ろ過して減圧下で濃縮した。化合物27.5(300mg、粗製物)が褐色油状物として得られた。
Figure 0007113815000164
DMF(4mL)中の化合物27.5(300mg、674.3μmol、1当量)および2,6-ジフルオロフェノール(87.72mg、674.28μmol、1当量)の混合物に、N下、20℃でDIEA(261.43mg、2.02mmol、353.29μL、3当量)を1回で加えた。この混合物を、20℃で15時間、撹拌した。この残留物を分取HPLC(TFA条件)によって精製した。化合物27.6(72mg、133.7μmol、19.8%収率)が褐色固体として得られた。LCMS[M+H]:539;保持時間=2.85分。
Figure 0007113815000165
27.6(72mg、133.7μmol、1当量)のDCM(1mL)中溶液に、TFA(304.87mg、2.67mmol、197.97μL、20当量)を加えた。この混合物を、20℃で4時間、撹拌した。これをろ過して真空中で濃縮すると、化合物27(50mg、75.02μmol、56%収率、2TFA)が得られた。LCMS[M+H]:667;保持時間=0.69分。1H NMR (400 MHz, DMSO- d6) δ ppm 1.37 - 1.55 (m, 2 H), 1.57 - 1.59 (m, 2 H), 1.69 - 1.72 (m, 2 H), 1.73-1.85 (m, 2 H), 2.75 - 2.79 (t, J=8.0 Hz, 2 H), 4.26 - 4.27 (d, J=4.0 Hz, 1 H), 4.33 - 4.34 (d, J=3.6 Hz, 2 H), 4.34 - 4.35 (m, 1 H), 4.69 - 4.71(m, 1 H), 4.81 - 4.82(m, 1 H), 5.09 - 5.13(dd, J=1.6 Hz, 2 H), 7.09 - 7.12(m, 4 H), 7.39-7.48(m, 4 H), 7.73(s, 2 H), 8.77 - 8.78 (d, J=7.6 Hz, 2 H).
(実施例24)
(S)-N-(7-アミノ-1-(2,6-ジフルオロフェノキシ)-2-オキソヘプタン-3-イル)-6-フルオロピコリンアミド(28)の調製
Figure 0007113815000166
化合物28.1(366.07mg、2.6mmol、1.1当量)のDMF(15mL)中溶液に、HOBt(350.77mg、2.6mmol、1.1当量)およびEDCI(497.65mg、2.60mmol、1.1当量)を加えた。この混合物を0℃で1時間、撹拌した。次に、この混合物に、化合物26.1(700mg、2.36mmol、1当量、HCl)およびDIEA(1.22g、9.44mmol、1.65mL、4当量)を加えた。この混合物を、25℃で14時間、撹拌した。この反応混合物をHO(30mL)の添加によりクエンチし、酢酸エチル(30xmL×3)により抽出した。合わせた有機層を飽和ブライン(5mL)により洗浄して無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、ろ過して減圧下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO、DCM:MeOH=10:1)によって精製すると、化合物28.2(750mg、1.96mmol、83%収率)が黄色油状物として得られた。LCMS[M+H-Boc]:384;保持時間=0.817分。1H NMR (400 MHz, クロロホルム-d) δ ppm 1.42 (s, 11 H), 1.53 (br d, J=6.17 Hz, 2 H), 1.65 (s, 1 H), 1.75 - 2.05 (m, 2 H), 3.12 (br d, J=6.17 Hz, 2 H), 3.78 (d, J=0.66 Hz, 3 H), 4.57 (br s, 1 H), 4.67 - 4.89 (m, 1 H), 6.97 - 7.18 (m, 1 H), 7.87 - 8.03 (m, 1 H), 8.05 - 8.22 (m, 2 H).
Figure 0007113815000167
DIPA(526.19mg、5.2mmol、730.82μL、5当量)のTHF(5mL)中溶液に、n-BuLi(2.5M、2.08mL、5当量)を加えた。N下、この混合物を0℃で0.5時間、撹拌した。次に、この混合物に、化合物28.2(400mg、1.04mmol、1当量)およびクロロ(ヨード)メタン(917.18mg、5.2mmol、377.44μL、5当量)のTHF(10mL)中溶液を加えた。これを、-78℃で0.5時間、撹拌した。25℃でこの反応混合物を飽和NHCl(20ml)の添加によりクエンチし、酢酸エチル(15mL×3)により抽出した。合わせた有機層を飽和NaSO(10mL)、飽和NaHCO(10mL)およびブライン(10mL)により洗浄した。次に、これを無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、ろ過して減圧下で濃縮すると、28.3(500mg、粗製物)が黄色油状物として得られた。
Figure 0007113815000168
28.3(500mg、1.24mmol、1当量)のDMF(8mL)中溶液に、DIEA(481mg、3.72mmol、649.69μL、3当量)および2,6-ジフルオロフェノール(241.97mg、1.86mmol、1.5当量)を加えた。この混合物を、25℃で15時間、撹拌した。残留物を半分取スケールのHPLC(TFA条件)により精製すると、28.4(50mg、101μmol、8%収率)が黄色油状物として得られた。LCMS[M+H]:496;保持時間=2.84分。
Figure 0007113815000169
28.4(50mg、101μmol、1当量)のDCM(5mL)中溶液に、TFA(1mL)を加えた。この混合物を25℃で15時間、撹拌し、次に、減圧下で濃縮すると、化合物28(20mg、50.6μmol、50%収率)が得られた。LCMS[M+H]:396;保持時間=2.11分。1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 1.21 - 1.44 (m, 2 H), 1.45 - 1.65 (m, 2 H), 1.71 - 2.01 (m, 2 H), 2.69 - 2.85 (m, 2 H), 4.55 - 4.76 (m, 2 H), 4.97 - 5.34 (m, 2 H), 7.03 - 7.21 (m, 2 H), 7.48 (dd, J=8.27, 1.65 Hz, 1 H), 7.68 (br s, 3 H), 7.99 (dd, J=7.28, 1.76 Hz, 1 H), 8.22 (q, J=8.08 Hz, 1 H), 8.98 (d, J=8.38 Hz, 1 H).
(実施例25)
(S)-N-(7-アミノ-1-(2,6-ジフルオロフェノキシ)-2-オキソヘプタン-3-イル)-6-フルオロニコチンアミド(29)の調製
Figure 0007113815000170
6-フルオロニコチン酸(366.3mg、2.6mmol、1.1当量)のDMF(15mL)中溶液に、HOBt(351mg、2.6mmol、1.1当量)およびEDCI(497.65mg、2.60mmol、1.1当量)を加えた。この混合物を0℃で1時間、撹拌した。次に、この混合物に、化合物26.1(700mg、2.36mmol、1当量、HCl塩)およびDIEA(1.22g、9.44mmol、1.65mL、4当量)を加えた。この混合物を、25℃で14時間、撹拌した。この反応混合物をHO(50mL)の添加によりクエンチし、酢酸エチル(30mL×3)により抽出した。合わせた有機層を飽和ブライン(5mL)により洗浄して無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、ろ過して減圧下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO、石油エーテル/酢酸エチル=2/1)によって精製すると、29.1(300mg、782.45μmol、33.15%収率)が得られた。LCMS[M+H-Boc]:384;保持時間=0.7分。1H NMR (400 MHz, クロロホルム-d) δ ppm 1.40 (s, 11 H), 1.48 - 1.59 (m, 3 H), 1.63 (s, 1 H), 1.76 - 2.04 (m, 2 H), 3.13 (br d, J=6.15 Hz, 2 H), 4.47 - 4.86 (m, 2 H), 6.93 (br s, 1 H), 7.01 (dd, J=8.53, 2.76 Hz, 1 H), 8.29 (td, J=7.97, 2.38 Hz, 1 H), 8.72 (s, 1 H).
Figure 0007113815000171
DIPA(396mg、3.91mmol、549.82μL、5当量)のTHF(5mL)中溶液に、n-BuLi(2.5M、1.56mL、5当量)を加えた。N下、この混合物を0℃で0.5時間、撹拌した。次に、この混合物を、29.1(300mg、782.43μmol、1当量)およびクロロヨードメタン(690mg、3.91mmol、284μL、5当量)のTHF(5mL)中溶液に加えた。これを、-78℃で0.5時間、撹拌した。この反応混合物を飽和NHCl(20ml)の添加によりクエンチし、次に、酢酸エチル(15mL×3)により抽出した。合わせた有機層を飽和NaSO(10mL)、飽和NaHCO(10mL)およびブライン(10mL)により洗浄した。これを無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、ろ過して減圧下で濃縮すると、29.2(500mg、粗製物)が黄色油状物として得られた。
Figure 0007113815000172
29.2(300.00mg、746.53μmol、1.00当量)および2,6-ジフルオロフェノール(145.7mg、1.12mmol、1.5当量)のDMF(6mL)中溶液に、DIEA(289mg、2.24mmol、391μL、3当量)を加えた。この混合物を25℃で15時間、撹拌し、次に、これをエバポレートし、半分取HPLC(TFA条件)により精製すると、29.3(40mg、81μmol、11%収率)が黄色油状物として得られた。LCMS[M+H]:496;保持時間=0.874分。
Figure 0007113815000173
DCM(5mL)中の29.3(40mg、81μmol、1当量)に、TFA(1mL)を加えた。この混合物を25℃で15時間、撹拌し、次に、エバポレートした。残留物を半分取スケールのHPLC(TFA条件)により精製すると、化合物29(10mg、25μmol、31%収率)が得られた。LCMS[M+H]:396;保持時間=0.7分。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 1.43 - 1.67 (m, 2 H), 1.67 - 1.89 (m, 3 H), 2.05 - 2.20 (m, 1 H), 2.86 - 3.01 (m, 2 H), 4.93 - 5.11 (m, 3 H), 6.92 - 7.16 (m, 2 H), 7.19 (dd, J=8.60, 2.65 Hz, 1 H), 8.38 (td, J=8.05, 2.65 Hz, 1 H), 8.71 (d, J=2.43 Hz, 1 H).
(実施例26)
(S)-N-(7-アミノ-1-(2,6-ジフルオロフェノキシ)-2-オキソヘプタン-3-イル)-3-(3-フルオロプロポキシ)ベンズアミド(30)の調製
Figure 0007113815000174
DMF(10mL)中の混合物30.1(540.13mg、3.55mmol、1当量)および30.2(500mg、3.55mmol、1当量)に、KCO(981.29mg、7.1mmol、2当量)を加えた。この混合物を、80℃で15時間、撹拌した。この反応混合物を水(20mL)により希釈し、EtOAc(20xmL×3)により抽出した。合わせた有機層をブライン(10mL)により洗浄してNaSOで乾燥させ、ろ過して減圧下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=10/1~1/1)によって精製すると、30.2(440mg、2.07mmol、58%収率)が無色油状物として得られた。LCMS[M+H]:213;保持時間=0.82分。
Figure 0007113815000175
NaOH(1M、4.14mL、2当量)を含むMeOH(12mL)中の30.2(440mg、2.07mmol、1当量)を、20℃で15時間、撹拌した。この反応物を水(40mL)により希釈し、次に、EtOAc(40mL×2)により抽出し、中性不純物を除去した。水相を水性HClでpH5まで酸性にし、次に、酢酸エチル(40mL)により抽出した。30.3(160mg、807μmol、39%収率)が、白色固体として得られた。LCMS[M+H]:199;保持時間=1.01分。
Figure 0007113815000176
DMF(2mL)中の30.3(160mg、807.31μmol、1当量)およびEDCI(170.24mg、888.04μmol、1.1当量)、HOBt(120mg、888μmol、1.1当量)に、N下、0℃で化合物26.1(210.17mg、807.31μmol、1当量)およびDIEA(417.34mg、3.23mmol、563.97μL、4当量)を1回で加えた。この混合物を、20℃で15時間、撹拌した。この反応混合物を水(20mL)により希釈し、EtOAc(20mL×3)により抽出した。合わせた有機層をブライン(10mL)により洗浄してNaSOで乾燥させ、ろ過して減圧下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO、石油エーテル/酢酸エチル=10/1~1/1)によって精製すると、30.4(240mg、545μmol、67.5%収率)が白色固体として得られた。LCMS[M+H]:441;保持時間=0.84分。
Figure 0007113815000177
n-BuLi(209.41mg、3.27mmol、6当量)の混合物に、N下、0℃でTHF(6mL)中のDIPA(330.8mg、3.3mmol、460μL、6当量)を1回で加えた。0.5時間後、上記の混合物に、N下、-78℃で、30.4(240mg、545μmol、1当量)およびクロロ(ヨード)メタン(577mg、3.3mmol、237.3μL、6当量)を加えた。得られた混合物を、-78℃で2時間、撹拌した。この反応混合物を水(20mL)により希釈し、次に、EtOAc(20mL×3)により抽出した。合わせた有機層をブライン(10mL)により洗浄し、NaSOで乾燥させてろ過し、減圧下で濃縮すると、30.5(200mg、粗製物)が褐色油状物として得られた。
Figure 0007113815000178
DMF(4mL)中の30.5(200mg、436μmol、1当量)および2,5-ジフルオロフェノール(57mg、436μmol、1当量)に、DIEA(168.96mg、1.31mmol、228.32μL、3当量)を加えた。この混合物を、20℃で15時間、撹拌した。残留物を半分取スケールのHPLC(TFA条件)により精製すると、30.6(13mg、23.5μmol、5.4%収率)が得られた。LCMS[M+H]:553;保持時間=0.91分。
Figure 0007113815000179
DCM(500μL)中の30.6(13mg、23.53μmol、1当量)に、TFA(160.97mg、1.41mmol、104.53μL、60当量)を加えた。この混合物を、20℃で3時間、撹拌した。残留物を半分取スケールのHPLC(TFA条件)により精製すると、化合物30(2mg、4.42μmol、19%収率)が無色油状物として得られた。LCMS[M+H]:453;保持時間=0.7分。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 1.47 - 1.63 (m, 2 H), 1.67 - 1.86 (m, 2 H), 2.10 - 2.23 (m, 2 H), 2.85 - 3.01 (m, 2 H), 4.10 - 4.20 (m, 1 H), 4.11 - 4.20 (m, 1 H), 4.57 (t, J=5.84 Hz, 1 H), 4.69 (t, J=5.84 Hz, 1 H), 4.90 - 5.07 (m, 4 H), 6.95 - 7.03 (m, 2 H), 7.03 - 7.11 (m, 1 H), 7.14 (ddd, J=7.94, 2.54, 1.21 Hz, 1 H), 7.35 - 7.46 (m, 3 H).
(実施例27)
(S)-N-(7-アミノ-1-(2,6-ジフルオロフェノキシ)-2-オキソヘプタン-3-イル)-2-フルオロイソニコチンアミド(31)の調製
Figure 0007113815000180
2-フルオロ-4-カルボキシピリジン(523mg、3.71mmol、1.1当量)のDMF(15mL)中溶液に、HOBt(501mg、3.71mmol、1.1当量)およびEDCI(710.5mg、3.71mmol、1.1当量)を加えた。この混合物を0℃で1時間、撹拌した。次に、この混合物に、26.1(1g、3.37mmol、1当量、HCl塩)およびDIEA(1.74g、13.48mmol、2.35mL、4当量)を加えた。この混合物を、25℃で14時間、撹拌した。この反応混合物をHO 5(0mL)の添加によりクエンチし、酢酸エチル(30mL×3)により抽出した。合わせた有機層を飽和ブライン(5mL)により洗浄して無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、ろ過して濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO、石油エーテル/酢酸エチル=2:1)によって精製すると、化合物31.1(800mg、2.1mmol、62%収率)が黄色油状物として得られた。LCMS[M+H-Boc]:384;保持時間=0.8分。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 1.27 - 1.62 (m, 14 H), 1.69 - 2.08 (m, 2 H), 3.05 (t, J=6.50 Hz, 2 H), 3.75 (s, 3 H), 4.59 (dd, J=9.37, 4.96 Hz, 1 H), 7.46 (s, 1 H), 7.69 (dt, J=5.29, 1.54 Hz, 1 H), 8.35 (d, J=5.29 Hz, 1 H)
Figure 0007113815000181
THF(5mL)中のDIPA(659.8mg、6.52mmol、916.4μL、5当量)に、n-BuLi(2.5M、2.61mL、5当量)を加えた。N下、この混合物を0℃で0.5時間、撹拌した。次に、この混合物を、31.1(500mg、1.3mmol、1当量)およびクロロ(ヨード)メタン(1.15g、6.52mmol、473.3μL、5当量)のTHF(10mL)中溶液に加えた。これを、-78℃で0.5時間、撹拌した。この反応混合物を飽和NHCl(20ml)の添加によりクエンチし、酢酸エチル(15mL×3)により抽出した。合わせた有機層を飽和NaSO(10mL)、飽和NaHCO(10mL)およびブライン(10mL)により洗浄した。これを無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、ろ過して減圧下で濃縮すると、31.2(620mg)が得られた。
Figure 0007113815000182
DMF(5mL)中の31.2(620mg、1.54mmol、1当量)に、DIEA(598.2mg、4.63mmol、808.36μL、3当量)および2,6-ジフルオロフェノール(301.1mg、2.31mmol、1.5当量)を加えた。これを、25℃で15時間、撹拌した。水性(aqueous)の後処理後、残留物を半分取スケールのHPLC(TFA条件)により精製すると、31.3(20mg、40.36μmol、3%収率)が得られた。
Figure 0007113815000183
DCM(5mL)およびTFA(1mL)中の31.3(50mg、101μmol、1当量)を、25℃で15時間、撹拌した。残留物を半分取スケールのHPLC(TFA条件)により精製すると、化合物31(10mg、25.3μmol、25%収率)が得られた。LCMS[M+H]:396;保持時間=1.3分。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 1.40 - 1.91 (m, 5 H), 2.03 - 2.22 (m, 1 H), 2.83 - 3.03 (m, 2 H), 4.87 - 5.15 (m, 3 H), 6.90 - 7.17 (m, 2 H), 7.38 - 7.53 (m, 1 H), 7.60 - 7.74 (m, 1 H), 8.24 - 8.39 (m, 1 H).
(実施例28)
(S)-N-(7-アミノ-1-(2,6-ジフルオロフェノキシ)-2-オキソヘプタン-3-イル)-2-フルオロニコチンアミド(32)の調製
Figure 0007113815000184
DMF(15mL)中の2-(フルオロ)ニコチン酸(366.3mg、2.6mmol、1.1当量)に、HOBt(350.8mg、2.6mmol、1.1当量)およびEDCI(497.65mg、2.6mmol、1.1当量)を加えた。この混合物を0℃で1時間、撹拌した。次に、この混合物に、26.1(700mg、2.36mmol、1当量、HCl塩)およびDIEA(1.22g、9.44mmol、1.65mL、4当量)を加えた。この混合物を、25℃で14時間、撹拌した。この反応混合物をHO(50mL)によりクエンチし、次に、酢酸エチル(30mL×3)により抽出した。合わせた有機層をブライン(5mL)により洗浄し、次に、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、ろ過して減圧下で濃縮した。この残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO、石油エーテル/酢酸エチル=2/1)によって精製すると、32.1(600mg、1.56mmol、66%収率)が褐色油状物として得られた。LCMS[M+H]:284;保持時間=0.7分。1H NMR (400 MHz, クロロホルム-d) δ ppm 1.42 (s, 11 H), 1.54 (dt, J=13.68, 6.84 Hz, 3 H), 1.63 (s, 1 H), 1.76 - 2.10 (m, 2 H), 3.12 (br d, J=6.15 Hz, 2 H), 3.80 (s, 3 H), 4.57 (br s, 1 H), 4.76 - 4.90 (m, 1 H), 7.30 - 7.48 (m, 2 H), 8.36 (br d, J=4.52 Hz, 1 H), 8.55 (ddd, J=9.66, 7.72, 1.95 Hz, 1 H).
Figure 0007113815000185
THF(5mL)中のDIPA(527.8mg、5.2mmol、733μL、5当量)に、n-BuLi(2.5M、2.1mL、5当量)を加えた。この混合物を、N下、0℃で0.5時間、撹拌した。次に、この混合物を、THF(5mL)中の32.2(400mg、1.04mmol、1当量)およびクロロ(ヨード)メタン(920mg、5.22mmol、378.6μL、5当量)に加えた。これを、-78℃で0.5時間、撹拌した。この反応混合物を飽和NHCl(20ml)によりクエンチし、酢酸エチル(15xmL×3)により抽出した。合わせた有機層を飽和NaSO(10mL)、飽和NaHCO(10mL)およびブライン(10mL)により洗浄した。これを無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、ろ過して減圧下で濃縮すると、32.2(620mg)が得られた。
Figure 0007113815000186
DMF(6mL)中の32.2(500mg、1.24mmol、1当量)および2,6-ジフルオロフェノール(242.8mg、1.87mmol、1.5当量)に、DIEA(482.41mg、3.73mmol、652μL、3当量)を加えた。この混合物を、25℃で15時間、撹拌した。残留物を半分取スケールのHPLC(TFA条件)により精製すると、32.2(20mg、40.4μmol、3%収率)が得られた。LCMS[M+H]:496;保持時間=0.86分。
Figure 0007113815000187
DCM(5mL)およびTFA(1mL)中の32.2(20mg、40.4μmol、1当量)を、25℃で15時間、撹拌した。残留物を半分取スケールのHPLC(TFA条件)により精製すると、化合物32(5mg、12.65μmol、31%収率)が得られた。LCMS[M+H]:396;保持時間=1.25分。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 1.44 - 1.87 (m, 5 H), 2.06 - 2.22 (m, 1 H), 2.85 - 3.03 (m, 2 H), 4.89 - 5.12 (m, 3 H), 6.93 - 7.05 (m, 2 H), 7.06 - 7.15 (m, 1 H), 7.45 (ddd, J=7.22, 5.02, 1.87 Hz, 1 H), 8.26 (ddd, J=9.48, 7.50, 1.98 Hz, 1 H), 8.30 - 8.40 (m, 1 H).
(実施例29)
(S)-N-(7-アミノ-1-(2,6-ジフルオロフェノキシ)-2-オキソヘプタン-3-イル)-3-アジドベンズアミド(33)の調製
Figure 0007113815000188
AcN(70mL)中の33.1(5g、36.5mmol、1当量)およびt-BuONO(5.64g、54.7mmol、6.5mL、1.5当量)に、N下、18℃でTMSN(5.04g、43.75mmol、5.73mL、1.2当量)を1回で加えた。この混合物を、18℃で10時間、撹拌した。この反応混合物をHO(100mL)により希釈し、EtOAc(50mL×3)により抽出した。合わせた有機層をブライン(100mL)により洗浄してNaSOで乾燥させ、ろ過して減圧下で濃縮した。この物質をカラムクロマトグラフィー(SiO、DCM:MeOH=10:1)によって精製すると、33.2(3g、18.4mmol、50%収率)が得られた。
Figure 0007113815000189
DMF(20mL)中の33.2(1.25g、7.68mmol、1当量)およびEDCI(1.62g、8.45mmol、1.1当量)に、HOBt(1.14g、8.45mmol、1.1当量)を加えた。この混合物を、0℃で1時間、撹拌した。次に、26.1(2g、7.68mmol、1当量)のDMF(5mL)中溶液を滴下して加え、次いでDIPEA(2.98g、23.04mmol、4.03mL、3当量)を加えた。この混合物を、0℃で1時間、撹拌した。この反応混合物をHO(20mL)により希釈し、EtOAc(15mL×3)により抽出した。合わせた有機層をブライン(40mL×1)により洗浄してNaSOで乾燥させ、ろ過して濃縮した。この残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO、石油エーテル/酢酸エチル=1/1)によって精製すると、33.3(2.8g、6.91mmol、90%収率)が得られた。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 1.40 (s, 8 H), 1.44 - 1.58 (m, 4 H), 1.80 - 2.00 (m, 2 H), 3.00 - 3.10 (m, 2 H), 3.74 (s, 3 H), 4.58 (dd, J=9.26, 5.07 Hz, 1 H), 7.25 (ddd, J=8.05, 2.32, 1.10 Hz, 1 H), 7.49 (t, J=7.83 Hz, 1 H), 7.56 (t, J=1.76 Hz, 1 H), 7.63 - 7.69 (m, 1 H).
Figure 0007113815000190
DIPA(1.5g、14.8mmol、2.08mL、6当量)のTHF(15mL)中溶液に、0℃でn-BuLi(2.5M、5.92mL、6当量)を加え、この混合物を30分間、撹拌した。これを、THF(15mL)中の33.3(1g、2.47mmol、1当量)およびクロロ(ヨード)メタン(2.18g、12.35mmol、895.11μL、5当量)に-78℃で加えた。この混合物を-78℃で30分間、撹拌した。この反応混合物をNHCl(10mL)の添加によりクエンチし、次に、EtOAc(15mL×3)により抽出した。合わせた有機層をNaSO(20mL)およびブライン(20mL)により洗浄し、NaSOで乾燥させた。次に、ろ過して濃縮すると33.4(2g)が得られ、これを次のステップに使用した。
Figure 0007113815000191
DMF(5mL)中の33.4(2g)および2,6-ジフルオロフェノール(614mg、4.72mmol、1当量)に、DIPEA(2.44g、18.87mmol、3.3mL、4当量)を加えた。この混合物を、20℃で10時間、撹拌した。水性の後処理後、残留物を半分取HPLC(TFA条件)により精製すると、33.5(200mg、386.46μmol、8%収率)が得られた。
Figure 0007113815000192
DCM(5mL)およびTFA(1mL)中の33.5 5(100mg、193.23μmol、1当量)を、18℃で10時間、撹拌した。反応混合物を減圧下で濃縮し、次に、半分取HPLC(TFA条件)により精製すると、化合物33(80mg、192μmol、99%収率)が黄色油状物として得られた。LCMS[M+H]:418;保持時間=3.1分。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 1.49 - 1.67 (m, 2 H) 1.67 - 1.88 (m, 3 H) 2.11 (dddd, J=13.84, 9.48, 6.78, 4.30 Hz, 1 H) 2.89 - 2.99 (m, 2 H) 4.91 - 5.08 (m, 3 H) 6.95 - 7.05 (m, 2 H) 7.05 - 7.12 (m, 1 H) 7.26 - 7.31 (m, 1 H) 7.48 - 7.54 (m, 1 H) 7.56 (t, J=1.87 Hz, 1 H) 7.64 - 7.70 (m, 1 H).
(実施例30)
(S)-N-(7-アミノ-1-(2,6-ジフルオロフェノキシ)-2-オキソヘプタン-3-イル)-2-ブロモニコチンアミド(34)の調製
Figure 0007113815000193
DMF(30mL)中の2-(ブロモ)ニコチン酸(748.71mg、3.71mmol、1.1当量)に、HOBt(501mg、3.71mmol、1.1当量)およびEDCI(710.5mg、3.71mmol、1.1当量)を加えた。これを、0℃で1時間、撹拌した。この混合物に、化合物26.1(1g、3.37mmol、1当量、HCl塩)およびDIEA(1.74g、13.48mmol、2.35mL、4当量)を加えた。これを、25℃で14時間、撹拌した。この反応混合物をHO(50mL)の添加によりクエンチし、酢酸エチル(30mL×3)により抽出した。合わせた有機層をブライン(5mL)により洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、ろ過して減圧下で濃縮した。この残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO、石油エーテル/酢酸エチル=2/1)によって精製すると、34.1(950mg、2.14mmol、63.5%収率)が黄色油状物として得られた。LCMS[M+H]:345;保持時間=0.73分。1H NMR (400 MHz, クロロホルム-d) δ ppm 1.29 - 1.60 (m, 16 H), 1.76 - 2.04 (m, 2 H), 2.98 - 3.27 (m, 2 H), 3.80 (s, 3 H), 4.59 (br s, 1 H), 4.71 - 4.86 (m, 1 H), 6.95 (br d, J=6.61 Hz, 1 H), 7.36 (dd, J=7.61, 4.74 Hz, 1 H), 7.92 (dd, J=7.61, 1.87 Hz, 1 H), 8.45 (dd, J=4.85, 1.98 Hz, 1 H)
Figure 0007113815000194
THF(5mL)中のDIPA(1.08g、10.69mmol、1.50mL、5当量)に、n-BuLi(2.5M、4.28mL、5当量)を加えた。この混合物を、N下、0℃で0.5時間、撹拌した。この混合物を、THF(10mL)中の34.1(950mg、2.14mmol、1当量)およびクロロ(ヨード)メタン(1.89g、10.7mmol、776.65μL、5当量)に加え、-78℃で0.5時間、撹拌した。25℃でこの反応混合物をNHCl(20ml)によりクエンチし、酢酸エチル(15mL×3)により抽出した。合わせた有機層を飽和NaSO(10mL)、NaHCO(10mL)およびブライン(10mL)により洗浄した。これを無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、ろ過して減圧下で濃縮すると、34.2(1.1g)が得られた。
Figure 0007113815000195
DMF(10mL)中の34.2(1.1g、2.38mmol、1当量)に、DIEA(921.63mg、7.13mmol、1.25mL、3当量)および2,6-ジフルオロフェノール(463.84mg、3.57mmol、1.5当量)を加えた。この混合物を、25℃で15時間、撹拌した。水性の後処理後、生成物を半分取HPLC(TFA条件)により精製すると、34.3(150mg、269.6μmol、11%収率)が得られた。
Figure 0007113815000196
DCM(10mL)およびTFA(2mL)中の34.3(150mg、270μmol、1当量)を、25℃で14時間、撹拌した。この混合物を減圧下で濃縮すると、化合物34(100mg、219.16μmol、81.3%収率)が得られた。LCMS[M+H]:456;保持時間=2.28分。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 1.51 - 1.88 (m, 6 H), 1.97 - 2.21 (m, 1 H), 2.95 (br t, J=7.50 Hz, 2 H), 4.96 (dd, J=9.70, 4.19 Hz, 1 H), 5.00 - 5.14 (m, 1 H), 6.93 - 7.15 (m, 2 H), 7.41 - 7.56 (m, 1 H), 7.73 - 7.89 (m, 1 H), 8.35 - 8.48 (m, 1 H).
(実施例31)
(S)-N-(7-アミノ-1-(2,6-ジフルオロフェノキシ)-2-オキソヘプタン-3-イル)-4-フルオロベンズアミド(35)の調製
Figure 0007113815000197
DMF(15mL)中の4-(フルオロ)安息香酸(538.2mg、3.84mmol、1当量)に、HOBt(570.75mg、4.22mmol、1.1当量)およびEDCI(809.74mg、4.22mmol、1.1当量)を加えた。この混合物を、25℃で0.5時間、撹拌した。この混合物に、26.1(1g、3.84mmol、1当量)およびDIEA(1.99g、15.36mmol、2.68mL、4当量)を加えた。この反応物を14時間、撹拌した。この反応混合物をHO(50mL)の添加によりクエンチし、EtOAc(50mL×3)により抽出した。合わせた有機層を飽和NaHCO(25mL)により洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、ろ過して減圧下で濃縮すると、35.1(1.10g)が得られた。LCMS[M+H]:369;保持時間=0.8分。
Figure 0007113815000198
THF(10mL)中のDIPA(1.32g、13.05mmol、1.83mL、5当量)に、n-BuLi(835.98mg、13.05mmol、5当量)を加えた。これを、N下、25℃で0.5時間、撹拌した。この混合物を、THF(10mL)中の35.1(1g、2.61mmol、1当量)およびクロロ(ヨード)メタン(5当量)に加え、次に、-78℃で2時間、撹拌した。この反応混合物を飽和塩化アンモニウム(30mL)の添加によりクエンチし、EtOAc(50mL×3)により抽出した。合わせた有機層を飽和亜硫酸水素ナトリウム(25mL)およびブラインにより洗浄した。これを無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、ろ過して減圧下で濃縮すると、35.2(800mg、2mmol、77%収率)が得られた。この生成物を、さらに精製することなく次のステップに使用した。LCMS[M+H]:402;保持時間=0.8分。
Figure 0007113815000199
DMF(10mL)中の35.2(800mg、2mmol、1当量)に、DIEA(773.76mg、5.99mmol、1.05mL、3当量)および2,6-ジフルオロフェノール(389.42mg、2.99mmol、1.5当量)を加えた。この混合物を、25℃で15時間、撹拌した。水性の後処理後、これを半分取HPLC(TFA条件)により精製すると、35.3(80mg、161.78μmol、8%収率)が得られた。LCMS[M+H]:495;保持時間=0.94分。
Figure 0007113815000200
HCl/EtOAc(15mL)中の35.3(80mg、232.95μmol)を、25℃で14時間、撹拌した。この反応混合物をろ過して減圧下で濃縮すると、化合物35(50mg、205.51μmol、88%収率)が得られた。LCMS[M+H]:244;保持時間=0.104分。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 1.51 - 1.65 (m, 2 H), 1.67 - 1.87 (m, 3 H), 2.05 - 2.18 (m, 1 H), 2.95 (br d, J=5.29 Hz, 2 H), 4.90 - 4.95 (m, 1 H), 4.95 - 5.07 (m, 2 H), 6.96 - 7.02 (m, 2 H), 7.03 - 7.12 (m, 1 H), 7.22 (t, J=8.82 Hz, 2 H), 7.92 (dd, J=8.82, 5.29 Hz, 2 H).
(実施例32)
N-(7-アミノ-1,1,1-トリフルオロ-2-オキソヘプタン-3-イル)ベンズアミド(36)の調製
Figure 0007113815000201
O(6mL)中のε-Cbzリシン(2.4g、8.56mmol、1当量)に、N下、0℃でNaOH(684.93mg、17.12mmol、2当量)を1回で加えた。この混合物を、0℃で1時間、撹拌した。次に、この混合物を化合物である塩化ベンゾイル(1.20g、8.56mmol、994.64μL、1当量)に滴下して加え、この混合物を9時間、撹拌した。この反応混合物をろ過して、固体をEtOAc(10ml)により洗浄すると、36.1(4g)が白色固体として得られた。LCMS[M+H]:385;保持時間=0.77分。
Figure 0007113815000202
DCM(40mL)中の36.1(4g、10.41mmol、1当量)に、N下、18℃でEDCI(2g、10.41mmol、1当量)を1回で加えた。この混合物を、18℃で0.5時間、撹拌した。この反応混合物をHO(40mL)の添加によりクエンチし、次に、DCM(20mL×3)により抽出した。合わせた有機層をNaHCO(50mL)により洗浄し、NaSOで乾燥させてろ過し、減圧下で濃縮すると、36.2(5g)が得られた。LCMS[M+H]:367;保持時間=0.87分。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 1.33 - 2.02 (m, 7 H), 3.10 - 3.17 (m, 2 H), 4.35 - 4.54 (m, 1 H), 4.98 - 5.06 (m, 2 H), 7.28 - 7.38 (m, 5 H), 7.42 - 7.50 (m, 2 H), 7.52 - 7.58 (m, 1 H), 7.76 - 7.86 (m, 2 H).
Figure 0007113815000203
36.2(3g、8.19mmol、1当量)にTFAA(2.06g、9.83mmol、1.37mL、1.2当量)を加えた。これを、40℃で10時間、撹拌した。この反応混合物を減圧下で濃縮すると、36.3(3.5g、7.57mmol、92%収率)が得られた。LCMS[M+H]:463;保持時間=0.96分。
Figure 0007113815000204
36.3(3g、6.49mmol、1当量)に、シュウ酸(934.53mg、10.38mmol、916μL、1当量)を加えた。この混合物を120℃で5分間、撹拌した。次に、これをHO(20mL)の添加によりクエンチし、EtOAc(20mL×2)により抽出した。合わせた有機層をブライン(40mL)により洗浄してNaSOで乾燥させ、ろ過して濃縮した。残留物を半分取HPLC(TFA条件)により精製すると、36.4(200mg、458.27μmol、7%収率)が得られた。LCMS[M+H]:437;保持時間=0.9分。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 1.21 - 1.96 (m, 7 H), 3.04 - 3.16 (m, 2 H), 4.30 - 4.51 (m, 1 H), 4.99 (s, 1 H), 7.27 - 7.34 (m, 3 H), 7.40 - 7.47 (m, 1 H), 7.48 - 7.56 (m, 1 H), 7.74 - 7.83 (m, 1 H).
Figure 0007113815000205
i-PrOH(10mL)およびHCl(1M、2mL、8.73当量)中の36.4(100mg、229.14μmol、1.00当量)に、N下、Pd-C(10%、0.02g)を加えた。この懸濁液を真空下で脱気してHによりパージすることを数回行った。この混合物を、H(50psi)下、18℃で10時間、撹拌した。この反応混合物をろ過し、減圧下で濃縮した。残留物を半分取HPLC(中性条件)により精製すると、化合物36(20mg、66.16μmol、29%収率)が得られた。LCMS[M+H]:303;保持時間=1.73分。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 1.27 - 2.04 (m, 6 H), 2.88 (br s, 1 H), 4.50 (br t, J=12.04 Hz, 1 H), 7.44 - 7.52 (m, 2 H), 7.53 - 7.61 (m, 1 H), 7.73 - 7.90 (m, 2 H).
(実施例33)
N-(7-アミノ-1,1-ジフルオロ-2-オキソヘプタン-3-イル)ベンズアミド(37)の調製
Figure 0007113815000206
ジフルオロ酢酸無水物(1.71g、9.83mmol、3当量)中の36.2(1.2g、3.28mmol、1当量)を、40℃で2時間、撹拌した。この反応混合物を減圧下で濃縮すると、37.1(1.2g、粗製物)が得られた。LCMS[M+H]:445;保持時間=0.91分。
Figure 0007113815000207
37.1(1.2g、2.70mmol、1当量)およびシュウ酸(486.18mg、5.40mmol、476.64μL、2当量)を、N下、120℃で10分間、撹拌した。この混合物を減圧下で濃縮し、カラムクロマトグラフィー(SiO、酢酸エチル)により精製すると、粗製37.2が得られ、次に、半分取スケールのHPLC(中性条件)によりさらに精製すると、純粋な37.2(120mg、286.79μmol、80%収率)が得られた。LCMS[M+H]:419;保持時間=0.79分。
Figure 0007113815000208
HCl(1mL)およびジオキサン(1mL)中の37.2(10mg、23.9μmol、1当量)を、50℃で2時間、撹拌した。この混合物を減圧下で濃縮し、半分取スケールのHPLC(中性条件)により精製すると、化合物37(120mg、287μmol、80%収率)が得られた。LCMS[M+H]:285;保持時間=2.0分。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 1.38 - 1.57 (m, 1 H), 1.72 - 1.97 (m, 5 H), 2.01 - 2.14 (m, 1 H), 3.70 - 3.85 (m, 1 H), 4.05 (br dd, J=12.35, 6.84 Hz, 1 H), 5.95 - 6.29 (m, 1 H), 7.44 - 7.60 (m, 4 H), 7.81 - 7.90 (m, 2 H).
(実施例34)
切断可能な消光基(quencher)を有する蛍光ジンジパイン活性プローブ:(S,E)-N-(7-アミノ-1-(4-((4-((4-(ジメチルアミノ)フェニル)ジアゼニル)ベンズアミド)-メチル)-2,6-ジフルオロフェノキシ)-2-オキソヘプタン-3-イル)-3-(4-((3-(5,5-ジフルオロ-7,9-ジメチル-5H-5l4,6l4-ジピロロ[1,2-c:2’,1’-f][1,3,2]ジアザボリニン-3-イル)プロパンアミド)メチル)-1H-1,2,3-トリアゾール-1-イル)ベンズアミド(38)の調製
Figure 0007113815000209
2,6-ジフルオロ-4-シアノフェノール(2.5g、16.12mmol、1当量)に、BH3-THF(1M、64.48mL、4当量)を加えた。この混合物を、70℃で10時間、撹拌した。25℃でHCl(6M、5mL)の添加によりこの反応をクエンチし、これを減圧下で濃縮すると、38.1(7.1g、粗製物)が白色固体として得られた。
Figure 0007113815000210
DMF(15mL)中の38.2(6.09g、22.62mmol、1当量)に、HOBt(3.36g、24.88mmol、1.1当量)およびEDCI(4.77g、24.88mmol、1.1当量)を加えた。この混合物を0℃で1時間、撹拌し、次に、38.1(3.60g、22.62mmol、1当量)およびDIEA(11.70g、90.48mmol、15.81mL、4.00当量)を加えた。この混合物を、25℃で11時間、撹拌した。この反応物をHO(20mL)により希釈し、EtOAc(20mL×3)により抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)により洗浄してNaSOで乾燥させ、ろ過して減圧下で濃縮した。これをカラムクロマトグラフィー(SiO、石油エーテル/酢酸エチル=1/1)によって精製すると、38.3(400mg、974.6μmol)が赤色固体として得られた。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 3.11 (s, 6 H), 4.48 (s, 2 H), 6.84 (d, J=9.29 Hz, 2 H), 6.90 - 6.98 (m, 2 H), 7.78 - 7.90 (m, 4 H), 7.94 - 8.01 (m, 2 H).
Figure 0007113815000211
DMF(10mL)中の33.4(1g、2.36mmol、1当量)および38.3(100mg、243.65μmol、0.1当量)に、N下、20℃でDIPEA(1.22g、9.44mmol、1.65mL、4当量)を1回で加えた。この混合物を、20℃で10時間、撹拌した。この反応混合物をHO(10mL)により希釈し、EtOAc(10mL×3)により抽出した。合わせた有機層をブライン(30mL)により洗浄してNaSOで乾燥させ、ろ過して濃縮した。これをカラムクロマトグラフィー(SiO、石油エーテル/酢酸エチル=1/1)によって精製すると、38.4(250mg、313.34μmol)が赤色固体として得られた。
Figure 0007113815000212
DMSO(2mL)中の38.4(220mg、275.74μmol、1当量)およびプロパ-2-イン-1-アミン(15.19mg、275.74μmol、17.66μL、1当量)の混合物に、N下、18℃で、CuSO(8.8mg、55.15μmol、8.46μL、0.2当量)のHO(100μL)中溶液およびアスコルビン酸ナトリウム(109.25mg、551.48μmol、2当量)を1回で加えた。この混合物を18℃で5分間、撹拌した。この反応混合物をHO(5mL)により希釈し、EtOAc(5mL×3)により抽出した。合わせた有機層をブライン(10mL)により洗浄し、NaSOで乾燥させてろ過し、濃縮すると、38.5(250mg)が褐色固体として得られた。LCMS[M+H]:853;保持時間=1.14分。
Figure 0007113815000213
THF(60mL)中の2-ホルミルピロール(5g、52.58mmol、1当量)およびメチル2-ジエトキシホスホリルアセテート(11.05g、52.58mmol、1当量)に、N下、50℃でKCO(14.53g、105.16mmol、2当量)を加えた。この混合物を、50℃で10時間、撹拌した。この反応物をHO(50mL)により希釈し、EtOAc(50mL×3)により抽出した。合わせた有機層をブライン(100mL)により洗浄してNaSOで乾燥させ、ろ過して濃縮した。この物質をカラムクロマトグラフィー(SiO、石油エーテル/酢酸エチル=5/1)によって精製すると、38.6(8.6g、57mmol)が白色固体として得られた。LCMS[M+H]:152;保持時間=0.68分。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 3.69 - 3.76 (m, 3 H), 6.04 - 6.13 (m, 1 H), 6.15 - 6.21 (m, 1 H) ,6.31 (dt, J=3.91, 2.12 Hz, 1 H,) 6.45 - 6.57 (m, 1 H), 6.92 (br d, J=1.32 Hz, 1 H), 6.98 - 7.21 (m, 1 H), 7.44 - 7.59 (m, 1 H).
Figure 0007113815000214
下、MeOH(100mL)中の38.6(8.6g、56.89mmol)にPd-C(10%、0.9g)を加えた。この懸濁液を真空下で脱気してHによりパージすることを数回行った。この混合物を、H(50psi)下、18℃で10時間、撹拌した。この反応混合物をろ過して濃縮した。この物質をカラムクロマトグラフィー(SiO、石油エーテル/酢酸エチル=5/1)によって精製すると、38.6(5g、32.64mmol)が得られた。LCMS[M+H]:154;保持時間=0.55分。1H NMR (400 MHz, クロロホルム-d) δ ppm 2.66 (t, J=6.78 Hz, 2 H), 2.93 (t, J=6.71 Hz, 2 H), 3.62 - 3.78 (m, 3 H), 5.80 - 5.99 (m, 1 H), 6.12 (q, J=2.76 Hz, 1 H) 6.60 - 6.76 (m, 1 H), 8.54 (br s, 1 H).
Figure 0007113815000215
DCM(60mL)中の38.6(3g、19.58mmol、1当量)および化合物2-ホルミル-3,5-ジメチルピロール(2.65g、21.54mmol、1.1当量)に、N下、18℃でPOCl(3.3g、21.54mmol、2mL、1.1当量)を1回で加えた。この混合物を18℃で10時間、撹拌し、次に、BF3.EtO(11.12g、78.32mmol、9.67mL、4当量)およびDIEA(10.63g、82.24mmol、14.36mL、4.2当量)を18℃で滴下して加えた。この混合物を、18℃で10時間、撹拌した。この反応混合物をろ過して、次に、HO(50mL)により希釈し、DCM(50mL×3)より抽出した。合わせた有機層をブライン(100mL)により洗浄してNaSOで乾燥させ、ろ過して濃縮した。これをカラムクロマトグラフィー(SiO、石油エーテル/酢酸エチル=1/4)によって精製すると、38.7(3g、9.80mmol)が得られた。1H NMR (400 MHz, クロロホルム-d) δ ppm 2.25 (s, 3 H), 2.57 (s, 3 H), 2.78 (t, J=7.59 Hz, 2 H), 3.30 (t, J=7.65 Hz, 2 H), 3.67 - 3.78 (m, 3 H), 6.11 (s, 1 H), 6.27 (d, J=3.89 Hz, 1 H), 6.88 (d, J=3.89 Hz, 1 H), 7.08 (s, 1 H).
Figure 0007113815000216
THF(120mL)およびHO(80mL)中の38.7(1.2g、3.92mmol、1当量)およびHCl(50mL、37%)を、18℃で24時間、撹拌した。この反応混合物をDCM(80mL)により分配し、水層をDCM(100mL×2)により抽出した。合わせた有機層をブライン(300mL)により洗浄してNaSOで乾燥させ、ろ過して濃縮した。この物質を分取スケールのTLC(SiO、DCM:MeOH=10:1)によって精製すると、38.8(700mg、2.4mmol)が赤色固体として得られた。
Figure 0007113815000217
DMF(2mL)中の38.8(109.59mg、375.18μmol、2当量)およびHOBt(152.08mg、1.13mmol、6当量)の混合物に、N下、0℃でEDCI(215.76mg、1.13mmol、6当量)を加えた。この混合物を0℃で10分間、撹拌した。この混合物に、38.5(160mg、187.59μmol、1当量)およびDIPEA(145.46mg、1.13mmol、196.57μL、6当量)を加え、この混合物を0℃で20分間、撹拌した。この反応混合物をHO(5mL)により希釈し、EtOAc(5mL×3)により抽出した。合わせた有機層をブライン(10mL)により洗浄してNaSOで乾燥させ、ろ過して濃縮した。この残留物を分取スケールのTLC(SiO、EtOAc)によって精製すると、38.9(60mg、53.24μmol)が得られた。LCMS[M+H]:1128;保持時間=1.45分。
Figure 0007113815000218
HCl/EtOAc(5mL)に38.9(50mg、44.37μmol、1当量)を加え、この混合物を18℃で10分間、撹拌した。この反応物を減圧下で濃縮し、次に、半分取スケールのHPLC(TFA条件)により精製すると、化合物38(10mg、9.74μmol)が得られた。LCMS[M+H]:1027;保持時間=2.82分。1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 1.23 - 1.59 (m, 4 H), 1.67 (br d, J=9.48 Hz, 1 H), 1.85 (br d, J=6.62 Hz, 1 H), 2.21 (s, 2 H), 2.42 (s, 3 H), 2.53 (br d, J=7.94 Hz, 2 H), 2.74 (br d, J=6.39 Hz, 2 H), 3.04 (s, 5 H), 3.06 - 3.11 (m, 1 H), 4.39 (br d, J=5.51 Hz, 5 H), 4.64 (br s, 1 H), 4.99 - 5.20 (m, 2 H), 6.25 (s, 1 H), 6.32 (br d, J=3.97 Hz, 1 H), 6.81 (br d, J=9.04 Hz, 2 H), 6.96 - 7.10 (m, 2 H), 7.52 - 7.62 (m, 3 H), 7.68 (br t, J=8.05 Hz, 1 H), 7.79 (br dd, J=8.60, 4.41 Hz, 3 H), 7.90 - 8.01 (m, 2 H), 8.04 (d, J=7.72 Hz, 1 H), 8.36 (s, 1 H), 8.47 - 8.58 (m, 1 H), 8.64 (s, 1 H), 8.96 (br d, J=7.50 Hz, 1 H), 9.07 - 9.20 (m, 1 H).
(実施例35)
(S)-N-(7-アミノ-2-オキソ-1-(6-オキソピリミジン-1(6H)-イル)ヘプタン-3-イル)シクロペンタンカルボキサミド(39)の調製
Figure 0007113815000219
DMF(2mL)中の1.2(150mg、357.7μmol、1当量)に、KCO(148.31mg、1.07mmol、3当量)および4-ヒドロキシルピリミジン(34.37mg、357.7μmol、1当量)を加えた。この混合物を、25℃で15時間、撹拌した。残留物を半分取スケールのHPLC(TFA条件)により精製すると、39.1(40mg、92.05μmol)が得られた。LCMS[M+H]:435;保持時間=0.76分。
Figure 0007113815000220
DCM(5mL)およびTFA(1mL)中の39.1(40mg、92.05μmol、1当量)を、25℃で15時間、撹拌した。この混合物を減圧下で濃縮すると、化合物39(20mg、59.8μmol、65%収率)が得られた。LCMS[M+H]:335;保持時間=0.25分。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 1.37 - 1.57 (m, 2 H), 1.57 - 1.81 (m, 10 H), 1.83 - 2.06 (m, 3 H), 2.63 - 2.83 (m, 1 H), 2.94 (br t, J=7.50 Hz, 2 H), 4.52 (dd, J=8.49, 5.40 Hz, 1 H), 4.95 - 4.99 (m, 1 H), 4.97 (s, 1 H), 6.51 (d, J=6.61 Hz, 1 H), 8.00 (d, J=6.61 Hz, 1 H), 8.32 (s, 1 H).
(実施例36)
(S)-N-(7-アミノ-2-オキソ-1-(4-オキソピリミジン-1(4H)-イル)ヘプタン-3-イル)シクロペンタンカルボキサミド(40)の調製
Figure 0007113815000221
DMF(3mL)中の1.2(100mg、238.46μmol、1当量)に、AgCO(197.27mg、715.38μmol、32.45μL、3.00当量)および4-ヒドロキシピリミジン(22.91mg、238.46μmol、1当量)を加えた。この混合物を、25℃で15時間、撹拌した。残留物を半分取スケールのHPLC(TFA条件)により精製すると、40.1(30mg、69.04μmol、29%収率)が白色固体として得られた。LCMS[M+H]:435;保持時間=0.74分。
Figure 0007113815000222
TFA(1mL)およびDCM(5mL)中の40.1(30mg、69μmol、1当量)を、25℃で15時間、撹拌した。この混合物を減圧下で濃縮すると、化合物40(2mg、6μmol)が得られた。LCMS[M+H]:335;保持時間=0.43分。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 1.24 - 1.57 (m, 4 H), 1.58 - 1.81 (m, 10 H), 1.82 - 2.03 (m, 4 H), 2.66 - 2.84 (m, 1 H), 2.86 - 3.03 (m, 2 H), 4.31 - 4.48 (m, 1 H), 4.95 - 5.19 (m, 2 H), 6.30 (d, J=7.58 Hz, 1 H), 7.62 (br d, J=7.34 Hz, 1 H), 8.23 (br s, 1 H).
(実施例37)
(S)-N-(7-アミノ-1-(5-フルオロ-6-オキソピリミジン-1(6H)-イル)-2-オキソヘプタン-3-イル)シクロペンタンカルボキサミド(41)の調製
Figure 0007113815000223
DMF(2mL)中の1.2(150mg、357.7μmol、1当量)に、KCO(148.31mg、1.07mmol、3当量)および5-フルオロピリミジン-4-オール(40.81mg、357.7μmol、1当量)を加えた。この混合物を、25℃で15時間、撹拌した。残留物を半分取スケールのHPLC(TFA条件)により精製すると、41.1(50.00mg、110.49μmol、30.89%収率)が白色固体として得られた。LCMS[M+H]:453;保持時間=0.8分。
Figure 0007113815000224
DCM(5mL)およびTFA(1mL)中の41.1(50mg、110.49μmol、1当量)を、25℃で15時間、撹拌した。この混合物を減圧下で濃縮すると、化合物41(30mg、85.13μmol、77%収率)が白色固体として得られた。LCMS[M+H]:353;保持時間=0.16分。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 1.28 - 1.47 (m, 2 H), 1.48 - 1.73 (m, 9 H), 1.75 - 1.98 (m, 3 H), 2.56 - 2.73 (m, 1 H), 2.86 (br t, J=7.52 Hz, 2 H), 4.44 (dd, J=8.56, 5.50 Hz, 1 H), 4.90 - 5.04 (m, 2 H), 7.95 (d, J=2.45 Hz, 1 H), 8.05 (s, 1 H).
(実施例38)
(S)-N-(7-アミノ-2-オキソ-1-(2,3,6-トリフルオロフェノキシ)ヘプタン-3-イル)ニコチンアミド(42)の調製
Figure 0007113815000225
DMF(10mL)中のニコチン酸(497.86mg、4.04mmol、339μL、1.2当量)に、HOBt(501mg、3.71mmol、1.1当量)およびEDCI(710.5mg、3.71mmol、1.1当量)を加えた。この混合物を、0℃で1時間、撹拌した。次に、この混合物をDIPEA(1.74g、13.48mmol、2.35mL、4当量)および26.1(1g、3.37mmol、1.00当量、HCl塩)に加え、25℃で11時間、撹拌した。この反応混合物をHO(20mL)により希釈し、EtOAc(20xmL×3)により抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)により洗浄してNaSOで乾燥させ、ろ過して濃縮した。この残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO、石油エーテル/酢酸エチル=20/1~0/1)によって精製すると、42.1(800mg、2.19mmol、65%収率)が無色油状物として得られた。1H NMR (400 MHz, クロロホルム-d) δ ppm 1.41 (br s, 10 H), 1.54 (br d, J=6.11 Hz, 3 H), 1.81 - 2.06 (m, 3 H), 3.14 (br s, 2 H), 3.80 (br d, J=2.69 Hz, 3 H), 4.06 - 4.20 (m, 1 H), 7.04 (br s, 1 H), 7.40 (br d, J=5.14 Hz, 1 H), 8.16 (br s, 1 H), 8.76 (br s, 1 H), 9.07 (br s, 1 H).
Figure 0007113815000226
DIPA(648mg、6.4mmol、9μL、6当量)のTHF(5mL)中溶液に、n-BuLi(2.5M、2.56mL、6当量)を加えた。これを、0℃で1時間、撹拌した。THF(5mL)中の42.1(390mg、1.07mmol、1当量)に、クロロ(ヨード)メタン(1.13g、6.4mmol、464.8μL、6当量)を加えた。これを、-78℃で30分間、撹拌した。次に、これら2つの混合物を一緒にして、-78℃で2時間、撹拌した。この反応をNHCl溶液(15mL)の添加によりクエンチし、EtOAc(20mL×3)により抽出した。合わせた有機層をNaSO溶液(15mL)、NaHCO溶液(15mL)およびブライン(15mL)により洗浄した。これをNaSOで乾燥させ、ろ過して減圧下で濃縮すると、42.2(410mg)が得られた。LCMS[M+H]:384;保持時間=0.79分。
Figure 0007113815000227
DMF(5mL)中の42.2(410mg、1.07mmol、1当量)に、DIPEA(553.15mg、4.28mmol、747.5μL、4当量)および2,3,6-トリフルオロフェノール(158.45mg、1.07mmol、1当量)を加えた。この混合物を、25℃で12時間、撹拌した。この残留物を半分取スケールのHPLC(カラム:Waters Xbridge150×25×5μ;移動相:[A:水(0.1%TFA);B:AcN];Bのグラジエント:12分間かけて24%~65%)によって精製すると、42.3(40mg、90μmol)が得られた。LCMS[M+H]:496;保持時間=0.80分。
Figure 0007113815000228
CHCl(5mL)中の42.3(40.00mg、80.73μmol)にTFA(1mL)を加え、25℃で12時間、撹拌した。この反応混合物を減圧下で濃縮して溶媒を除去すると、化合物42(20mg、50.59μmol、63%収率)が得られた。LCMS[M+H]:396;保持時間=0.76分。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 1.48 - 1.67 (m, 2 H), 1.70 - 1.91 (m, 3 H), 2.08 - 2.19 (m, 1 H), 2.91 - 3.03 (m, 1 H), 2.97 (br t, J=7.03 Hz, 1 H), 4.95 - 5.01 (m, 1 H), 5.05 - 5.25 (m, 2 H), 6.94 - 7.09 (m, 2 H), 7.68 - 7.81 (m, 1 H), 8.39 - 8.51 (m, 1 H), 8.75 - 8.85 (m, 1 H), 9.01 - 9.14 (m, 1 H).
(実施例39)
(S)-N-(7-アミノ-1-(2,6-ジフルオロフェノキシ)-2-オキソヘプタン-3-イル)ニコチンアミド(43)の調製
Figure 0007113815000229
DMF(10mL)中のニコチン酸(497.86mg、4.04mmol、338.68μL、1.2当量)に、HOBt(500.8mg、3.71mmol、1.1当量)およびEDCI(710.5mg、3.71mmol、1.1当量)を加えた。この混合物を、0℃で1時間、撹拌した。この混合物にDIPEA(1.74g、13.48mmol、2.35mL、4当量)および26.1(1g、3.37mmol、1当量、HCl)を加えた。これを25℃で11時間、撹拌した。この反応混合物をHO(20mL)により希釈し、EtOAc(20mL×3)により抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)により洗浄してNaSOで乾燥させ、ろ過して濃縮した。この残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO、石油エーテル/酢酸エチル=20:1~0:1)によって精製すると、43.1(800mg、2.19mmol)が得られた。LCMS[M+H]:366;保持時間=0.69分。1H NMR (400 MHz, クロロホルム-d) δ ppm 1.39 (s, 9 H), 1.49 - 1.59 (m, 2 H), 1.78 - 2.05 (m, 5 H), 3.12 (br d, J=5.70 Hz, 2 H), 3.79 (s, 2 H), 3.78 - 3.81 (m, 1 H), 4.65 (br s, 1 H), 4.79 (br d, J=5.26 Hz, 1 H), 7.02 (br d, J=5.70 Hz, 1 H), 7.39 (dd, J=7.67, 5.04 Hz, 1 H), 8.15 (br d, J=7.89 Hz, 1 H), 8.74 (br d, J=4.38 Hz, 1 H), 9.06 (br s, 1 H).
Figure 0007113815000230
DIPA(662mg、6.54mmol、919μL、6当量)のTHF(5mL)中溶液に、n-BuLi(2.5M、2.62mL、6当量)を加えた。これを、0℃で1時間、撹拌した。THF(5mL)中の43.1(400mg、1.09mmol、1当量)にクロロ(ヨード)メタン(1.15g、6.54mmol、474.7μL、6当量)を加え、-78℃で30分間、撹拌した。次に、この混合物を前の混合物に加え、-78℃で2時間、撹拌した。この反応混合物を25℃でNHCl溶液15mLの添加によりクエンチし、EtOAc(15mL×3)により抽出した。合わせた有機層をNaSO溶液(15mL)、NaHCO溶液(15mL)およびブライン(15mL)により洗浄した。次に、NaSOで乾燥させ、ろ過して濃縮すると、43.2(500mg)が得られた。
Figure 0007113815000231
DMF(5mL)中の43.3(500mg、1.30mmol、1当量)に、DIPEA(672.05mg、5.2mmol、908.18μL、4当量)および2,6-ジフルオロフェノール(186.03mg、1.43mmol、1.1当量)を加えた。この混合物を、25℃で12時間、撹拌した。この残留物を分取HPLC(カラム:Waters Xbridge150×25×5μ;移動相:[A:水(0.1%TFA);B:AcN];Bのグラジエント:12分間かけて23%~63%)により精製すると、43.4(40mg、86.30μmol)が得られた。
Figure 0007113815000232
CHCl(5mL)およびTFA(1mL)中の43.4(40mg、83.77μmol)を、25℃で7時間、撹拌した。この反応混合物を減圧下で濃縮すると、化合物43(15mg)が得られた。LCMS[M+H]:378;保持時間=0.61分。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 1.51 - 1.68 (m, 2 H), 1.72 - 1.90 (m, 3 H), 2.08 - 2.24 (m, 1 H), 2.97 (br t, J=6.60 Hz, 2 H), 4.97 - 5.12 (m, 3 H), 6.95 - 7.06 (m, 2 H), 7.06 - 7.15 (m, 1 H), 7.71 - 7.83 (m, 1 H), 8.50 (br d, J=7.95 Hz, 1 H), 8.82 (br d, J=3.67 Hz, 1 H), 9.03 - 9.17 (m, 1 H).
(実施例40)
(S,E)-N-(7-アミノ-1-(4-((4-((4-(ジメチルアミノ)フェニル)ジ-アゼニル)ベンズアミド)メチル)-2,6-ジフルオロフェノキシ)-2-オキソヘプタン-3-イル)-3-アジドベンズアミド(44)の調製
Figure 0007113815000233
38.4(100mg、125.34umol、1当量)のCHCl(5mL)中溶液に、TFA(1.54g、13.51mmol、1mL、107.76当量)を加え、25℃で12時間、撹拌した。この残留物を分取HPLC(Waters Xbridge150×25×5μ;移動相:[A:水(0.1%TFA)およびB:ACN];B%:31%~61%、12分間)により精製すると、化合物44(40mg、57.33umol、46%収率)が赤色固体として得られた。LCMS[M+H]:698;保持時間=2.764分。1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 1.29 - 1.46 (m, 2 H), 1.52 (dt, J=14.28, 7.30 Hz, 2 H), 1.63 - 1.74 (m, 1 H), 1.79 - 1.91 (m, 1 H), 2.71 - 2.81 (m, 2 H), 3.07 (s, 5 H), 4.42 (br d, J=5.73 Hz, 2 H), 4.54 - 4.67 (m, 1 H), 4.95 - 5.19 (m, 2 H), 6.84 (br d, J=9.04 Hz, 2 H), 7.01 - 7.11 (m, 2 H), 7.30 (br d, J=7.94 Hz, 1 H), 7.52 (br t, J=7.83 Hz, 1 H), 7.57 (s, 1 H), 7.63 (br s, 2 H), 7.68 (br d, J=7.72 Hz, 1 H), 7.82 (dd, J=8.71, 4.74 Hz, 3 H), 7.94 - 8.10 (m, 1 H), 8.85 (br d, J=7.50 Hz, 1 H), 9.11 - 9.24 (m, 1 H).
(実施例41)
(S,E)-N-(7-アミノ-1-(4-(2-(4-((4-(ジメチルアミノ)フェニル)ジ-アゼニル)ベンズアミド)エチル)-2,6-ジフルオロフェノキシ)-2-オキソヘプタン-3-イル)-3-(4-((3-(5,5-ジフルオロ-7,9-ジメチル-5H-5l4,6l4-ジピロロ[1,2-c:2’,1’-f][1,3,2]ジアザボリニン-3-イル)プロパンアミド)メチル)-1H-1,2,3-トリアゾール-1-イル)ベンズアミド(45)の調製
Figure 0007113815000234
3,5-ジフルオロ-4-ヒドロキシベンズアルデヒド(5g、31.63mmol、1当量)の酢酸(50.00mL)中溶液に、ニトロメタン(11.58g、189.78mmol、10.25mL、6.00当量)およびCHCOONH(9.75g、126.52mmol、4.00当量)を加えた。この混合物を、110℃で1.5時間、撹拌した。この反応混合物をHO(20mL)により希釈し、EtOAc(20mL×3)により抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)により洗浄し、NaSOで乾燥させてろ過し、減圧下で濃縮すると、残留物が得られた。この残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO、石油エーテル/酢酸エチル=20/1~1:1)によって精製すると、45.1(4.60g、22.87mmol、72%収率)が黄色固体として得られた。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 7.33 - 7.40 (m, 2 H),7.77 - 7.89 (m, 1 H), 7.90 - 8.01 (m, 1 H).
Figure 0007113815000235
45.1(2.10g、10.44mmol、1.00当量)のEtOH(200.00mL)中溶液に、Ar雰囲気下、0℃でHCl(6M、12.60mL、7.24当量)およびPd/C(10%、1.5g)を加えた。この懸濁液を脱気してHによりパージすることを3回行った。この混合物を、H(15Psi)下、0℃で3時間、撹拌した。この反応混合物を減圧下で濃縮してEtOHを除去すると、45.2(2.00g、粗製物)が褐色固体として得られた。LCMS[M+H]:174;保持時間=0.102分。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 2.88 (t, J=7.52 Hz, 2 H) 3.08 - 3.20 (m, 2 H), 6.85 - 6.93 (m, 2 H).
Figure 0007113815000236
ジアゾ化合物(3.11g、11.55mmol、1.00当量)のDMF(20.00mL)中溶液に、EDCI(2.44g、12.71mmol、1.10当量)およびHOBt(1.72g、12.71mmol、1.10当量)を加え、0℃で1時間、撹拌した。次に、この混合物に45.2(2.00g、11.55mmol、1.00当量)およびDIPEA(5.97g、46.20mmol、8.07mL、4.00当量)を加え、25℃で11時間、撹拌した。この反応混合物をHO(20mL)により希釈し、EtOAc(20mL×3)により抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)により洗浄し、NaSOで乾燥させてろ過し、減圧下で濃縮すると、残留物が得られた。この残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO、石油エーテル/酢酸エチル=20/1~1:1)によって精製すると、45.3(600mg、1.41mmol)が得られた。LCMS[M+H]:425;保持時間=0.848分。1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 3.04 - 3.09 (m, 6 H), 3.43 - 3.51 (m, 1 H), 4.37 (br d, J=5.99 Hz, 1 H), 4.54 (br d, J=5.75 Hz, 1 H), 6.76 - 7.02 (m, 3 H), 6.79 (br s, 1 H), 7.71 - 7.85 (m, 4 H) 7.88 - 8.01 (m, 2 H).
Figure 0007113815000237
45.3(310.00mg、730.37μmol、0.18当量)のDMF(10.00mL)中溶液に、33.4(1.70g、4.01mmol、1.00当量)およびDIPEA(2.07g、16.04mmol、2.80mL、4.00当量)を加えた。この混合物を、25℃で12時間、撹拌した。この反応混合物をHO(20mL)により希釈し、EtOAc(20mL×3)により抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)により洗浄し、NaSOで乾燥させてろ過し、減圧下で濃縮すると、残留物が得られた。この残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO、石油エーテル/酢酸エチル=20/1~1:1)によって精製すると、45.4(350mg)が得られた。LCMS[M+H]:813;保持時間=1.393分。
Figure 0007113815000238
45.4(200.00mg、246.34μmol、1.00当量)のDMSO(2.00mL)中溶液に、HO(200.00μL)中の化合物14A(13.57mg、246.34μmol、15.78μL、1.00当量)およびCuSO(1.97mg、12.32μmol、1.89μL、0.05当量)、ならびにアスコルビン酸ナトリウム(97.61mg、492.68μmol、2.00当量)を加えた。この混合物を、25℃で1時間、撹拌した。この反応混合物をHO(20mL)により希釈し、EtOAc(20mL×3)により抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)により洗浄し、NaSOで乾燥させてろ過し、減圧下で濃縮すると、残留物が得られた。この残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO、石油エーテル/酢酸エチル=20/1~1:1)によって精製すると、45.5(130mg)が得られた。
Figure 0007113815000239
DMF(2.00mL)中のジフルオロボレート色素(48.18mg、164.95μmol、1.10当量)の混合物に、0℃でEDCI(31.62mg、164.95μmol、1.10当量)およびHOBt(22.29mg、164.95μmol、1.10当量)を加え、1時間、撹拌した。次に、この混合物に45.5(130.00mg、149.95μmol、1.00当量)およびDIPEA(77.52mg、599.80μmol、104.76μL、4.00当量)を加え、25℃で11時間、撹拌した。この反応混合物をHO(20mL)により希釈し、EtOAc(20mL×3)により抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)により洗浄し、NaSOで乾燥させてろ過し、減圧下で濃縮すると、残留物が得られた。この残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO、酢酸エチル)によって精製すると、45.6(120.00mg)が得られた。LCMS[M+H]:1142;保持時間=1.461分。
Figure 0007113815000240
化合物15(120.00mg、105.17μmol、1.00当量)のHCl/EtOAc(5.00mL)中溶液を、25℃で0.1時間、撹拌した。この残留物を分取HPLC(カラム:Luna C18 100×30×5u;移動相:A:水(0.1%TFA)、B:ACN;B%:30%~60%、10分間)により精製すると、化合物45(20.00mg、19.21μmol、18.27%収率)が赤色固体として得られた。1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 1.33 - 1.51 (m, 2 H), 1.56 (dt, J=14.00, 7.06 Hz, 2 H), 1.73 (br dd, J=9.29, 4.40 Hz, 1 H), 1.90 (br d, J=6.24 Hz, 1 H), 2.25 (s, 3 H), 2.46 (s, 3 H), 2.74 - 2.87 (m, 5 H), 3.08 (s, 6 H), 3.46 - 3.55 (m, 2 H), 4.44 (br d, J=5.01 Hz, 2 H), 4.64 - 4.73 (m, 1 H), 5.01 - 5.18 (m, 2 H), 6.30 (s, 1 H), 6.36 (d, J=4.03 Hz, 1 H), 6.86 (d, J=9.17 Hz, 2 H), 7.01 - 7.11 (m, 3 H), 7.62 - 7.76 (m, 4 H), 7.78 - 7.87 (m, 4 H), 7.92 - 8.11 (m, 4 H), 8.40 (s, 1 H), 8.57 (br t, J=5.50 Hz, 1 H), 8.61 - 8.70 (m, 2 H), 8.99 (br d, J=7.34 Hz, 1 H).
(実施例42)
切断可能な消光基を有する蛍光ジンジパイン活性プローブ:(S,E)-N-(7-アミノ-1-(4-(2-(4-((4-(ジメチルアミノ)フェニル)ジアゼニル)ベンズアミド)エチル)-2,6-ジフルオロフェノキシ)-2-オキソヘプタン-3-イル)-3-アジドベンズアミド(46)の調製
Figure 0007113815000241
45.5(150.00mg、188.01μmol、1.00当量)のHCl/EtOAc(5.00mL)中溶液を、25℃で0.2時間、撹拌した。この残留物を分取HPLC(カラム:Waters Xbridge Prep OBD C18 150×30×5u;移動相:A:水(0.1%TFA)、B:ACN;B%:26%~66%、12分間)により精製すると、化合物46(10.00mg、14.33μmol、7.62%収率)が赤色固体として得られた。LCMS[M+H]:712;保持時間=2.76分。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 1.52 - 1.60 (m, 2 H), 1.67 - 1.85 (m, 4 H), 2.09 (br s, 1 H), 2.85 - 3.00 (m, 4 H), 3.13 (s, 6 H), 3.61 (br t, J=7.24 Hz, 2 H), 4.52 (s, 1 H),4.92 - 5.04 (m, 2 H),6.87 (d, J=8.77 Hz, 2 H),6.95 (br d, J=9.21 Hz, 1 H),7.03 (br d, J=9.65 Hz, 1 H), 7.27 (br d, J=7.89 Hz, 1 H),7.47 - 7.53 (m, 1 H),7.55 (br s, 1 H),7.65 (br d, J=7.02 Hz, 1 H),7.80 - 7.91 (m, 5 H),7.98 (d, J=8.77 Hz, 1 H).
(実施例43)
(S)-N-(7-アミノ-2-オキソ-1-(2,3,6-トリフルオロフェノキシ)ヘプタン-3-イル)-2-メトキシ-2-メチルプロパンアミド(47)の調製
Figure 0007113815000242
2-メトキシ-2-メチル-プロパン酸(398.03mg、3.37mmol、1.00当量)のDMF(15.00mL)中溶液に、HOBt(500.89mg、3.71mmol、1.10当量)およびEDCI(710.63mg、3.71mmol、1.10当量)を加え、この混合物を25℃で1時間、撹拌した。次に、この混合物にDIPEA(1.74g、13.48mmol、2.35mL、4.00当量)および26.4(1.00g、3.37mmol、1.00当量、HCl)を加えた。この混合物を、25℃で14時間、撹拌した。この反応混合物をHO(20mL)により希釈し、EtOAc(20mL×3)により抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)により洗浄し、NaSOで乾燥させてろ過し、減圧下で濃縮すると、残留物が得られた。この残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO、石油エーテル/酢酸エチル=2:1)によって精製すると、47.1(1.00g、2.77mmol、82.33%収率)が黄色油状物として得られた。LCMS[M+H]:361;保持時間=0.780分。1H NMR (400 MHz, クロロホルム-d) δ ppm 1.20 - 1.58 (m, 17 H), 1.60 - 1.75 (m, 1 H), 1.81 - 1.94 (m, 1 H), 3.09 (br d, J=6.17 Hz, 2 H), 3.29 (s, 3 H), 3.74 (s, 3 H), 4.45 - 4.73 (m, 2 H), 7.09 (br d, J=8.38 Hz, 1 H).
Figure 0007113815000243
DIPA(1.54g、15.24mmol、2.14mL、5.50当量)のTHF(10mL)中溶液に、n-BuLi(2.5M、6.09mL、5.50当量)を加えた。この混合物を、N下、0℃で0.5時間、撹拌した。次に、この混合物を、化合物2(1.00g、2.77mmol、1.00当量)およびクロロ(ヨード)メタン(2.69g、15.24mmol、1.11mL、5.50当量)のTHF(10mL)中溶液に加え、-78℃で0.5時間、撹拌した。この反応混合物をHO(20mL)により希釈し、EtOAc(20mL×3)により抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)により洗浄し、NaSOで乾燥させてろ過し、減圧下で濃縮すると、残留物が得られ、47.2(1.30g、粗製物)が褐色油状物として得られた。
Figure 0007113815000244
47.2(650.00mg、1.72mmol、1.00当量)のDMF(10.00mL)中溶液に、DIPEA(666.88mg、5.16mmol、901.19μL、3.00当量)および2,3,6-トリフルオロフェノール(280.17mg、1.89mmol、1.10当量)を加えた。この混合物を、25℃で15時間、撹拌した。残留物を分取HPLC(TFA条件)により精製すると、47.3(50.00mg、128.07μmol、7.45%収率)が黄色油状物として得られた。LCMS[M+H]:391;保持時間=0.877分。
Figure 0007113815000245
DCM(5.00mL)およびTFA(1.00mL)中の47.3(50.00mg、101.93μmol、1.00当量)の混合物を、25℃で15時間、撹拌した。この混合物を減圧下で濃縮すると、化合物47(30.00mg、76.84μmol、75.39%収率)が褐色油状物として得られた。LCMS[M+H]:391;保持時間=0.681分。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 1.26 - 1.39 (m, 6 H), 1.39 - 1.56 (m, 2 H), 1.57 - 1.84 (m, 3 H), 1.96 - 2.12 (m, 1 H), 2.82 - 3.01 (m, 2 H), 3.27 - 3.31 (m, 3 H), 4.68 (dd, J=9.60, 4.34 Hz, 1 H), 4.95 - 5.15 (m, 1 H), 6.89 - 7.12 (m, 2 H).
(実施例44)
(S)-N-(7-アミノ-1-(2,6-ジフルオロフェノキシ)-2-オキソヘプタン-3-イル)-2-メトキシ-2-メチルプロパンアミド(48)の調製
Figure 0007113815000246
47.2(650.00mg、1.72mmol、1.00当量)のDMF(10.00mL)中溶液に、DIPEA(666.88mg、5.16mmol、901.19μL、3.00当量)および2,6-ジフルオロフェノール(246.13mg、1.89mmol、1.10当量)を加えた。この混合物を、25℃で14時間、撹拌した。残留物を分取HPLC(TFA条件)により精製すると、48.1(50.00mg、134.26μmol、7.81%収率)が黄色油状物として得られた。LCMS[M+H]:473;保持時間=0.864分。
Figure 0007113815000247
DCM(5.00mL)およびTFA(1.00mL)中の48.1(50.00mg、105.82μmol、1.00当量)を、25℃で15時間、撹拌した。この混合物を減圧下で濃縮すると、化合物48(30.00mg、80.56μmol、76.13%収率)が得られた。LCMS[M+H]:373;保持時間=0.671分。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 1.18 - 1.39 (m, 6 H), 1.41 - 1.56 (m, 2 H), 1.57 - 1.82 (m, 3 H), 1.88 - 2.15 (m, 1 H), 2.78 - 3.03 (m, 2 H), 3.25 - 3.31 (m, 3 H), 4.74 (dd, J=9.54, 4.28 Hz, 1 H), 4.90 - 5.03 (m, 2 H), 6.89 - 7.20 (m, 3 H).
(実施例45)
(S)-N-(7-アミノ-1-(イソオキサゾール-3-イルオキシ)-2-オキソヘプタン-3-イル)シクロペンタンカルボキサミド(49)の調製。
Figure 0007113815000248
1.2(0.3g、715.39μmol、1当量)のDMF(5mL)中溶液に、KCO(296.62mg、2.15mmol、3当量)およびイソオキサゾール(66.94mg、786.92μmol、1.1当量)を加えた。この混合物を、25℃で15時間、撹拌した。この反応混合物を25℃でHO(10mL)の添加によりクエンチし、酢酸エチル(15mL×3)により抽出した。合わせた有機層をブライン(10mL)により洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥させてろ過し、減圧下で濃縮すると、粗生成物が得られた。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=2:1)によって精製すると、49.1(100mg、236.13μmol、33.01%収率)が黄色固体として得られた。LCMS[M+H+Na]:446;保持時間=1.443分。
Figure 0007113815000249
49.1(0.1g)のDCM(5mL)中溶液に、TFA(1mL)を加えた。この混合物を、25℃で14時間、撹拌した。この混合物を減圧下で濃縮すると、残留物が得られた。残留物を分取HPLC(TFA条件)により精製すると、化合物49(20mg、61.85μmol、26.19%収率)が黄色油状物として得られた。LCMS[M+H]:324;保持時間=2.072分。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 1.37 - 1.55 (m, 2 H) ,1.57 - 1.80 (m, 10 H) 1.89, (br dd, J=12.68, 5.62 Hz, 3 H), 2.73 (quin, J=7.77 Hz, 1 H), 2.93 (br t, J=6.84 Hz, 2 H), 4.52 (dd, J=9.04, 5.07 Hz, 1 H), 4.96 - 5.17 (m, 2 H), 6.17 (d, J=1.54 Hz, 1 H), 8.38 (d, J=1.54 Hz, 1 H).
(実施例46)
(S)-N-(7-アミノ-2-オキソ-1-(2,3,6-トリフルオロフェノキシ)ヘプタン-3-イル)ピコリンアミド(50)の調製
Figure 0007113815000250
50.1は、34.2と同じ方法であるが、2-ブロモニコチン酸の代わりにピリジン-2-カルボン酸を用いて調製した。
DMF(5.00mL)中の50.1(600.00mg、1.56mmol、1.00当量)に、DIPEA(606.02mg、4.69mmol、818.94μL、3.00当量)および2,3,6-トリフルオロフェノール(231.45mg、1.56mmol、1.00当量)を加えた。この混合物を、25℃で15時間、撹拌した。残留物を分取HPLC(TFA条件)により精製すると、化合物50.2(50.00mg、100.91μmol、6.47%収率)が黄色油状物として得られた。LCMS[M+H]:496;保持時間=1.302分。
Figure 0007113815000251
この反応は、化合物34と同じ方法で行った。得られた生成物を分取HPLC(TFA条件)により精製すると、化合物50(10mg)が得られた。LCMS[M+H]:396;保持時間=2.187分。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 1.43 - 1.62 (m, 2 H), 1.62 - 1.93 (m, 3 H), 2.06 - 2.24 (m, 1 H), 2.93 (br t, J=7.28 Hz, 2 H), 4.97 (br dd, J=9.48, 4.19 Hz, 1 H), 5.03 - 5.21 (m, 2 H), 6.91 - 7.07 (m, 2 H), 7.60 (dd, J=6.95, 5.40 Hz, 1 H), 8.00 (td, J=7.66, 1.65 Hz, 1 H), 8.12 (d, J=7.72 Hz, 1 H), 8.60 - 8.74 (m, 1 H).
(実施例47)
ビオチン化ジンジパイン活性プローブ:N-((S)-7-アミノ-1-(2,6-ジフルオロフェノキシ)-2-オキソヘプタン-3-イル)-3-(4-((5-((3aS,4S,6aR)-2-オキソヘキサヒドロ-1H-チエノ[3,4-d]イミダゾール-4-イル)ペンタンアミド)メチル)-1H-1,2,3-トリアゾール-1-イル)ベンズアミド(51)の調製
Figure 0007113815000252
DMF(10.00mL)中の51.1(2.00g、4.72mmol、1.00当量)およびフェノール(613.79mg、4.72mmol、1.00当量)に、N下、20CでDIPEA(2.44g、18.87mmol、3.30mL、4.00当量)を1回で加えた。この混合物を、20℃で10時間、撹拌した。この反応混合物をHO 10mLにより希釈し、EtOAc(10mL×3)により抽出した。合わせた有機層をブライン(30mL)により洗浄し、NaSOで乾燥させてろ過し、減圧下で濃縮すると、残留物が得られた。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=1:1)によって精製すると、51.2(160.00mg、309.17μmol、6.55%収率)が黄色油状物として得られた。LCMS[M+H]:518;保持時間=0.909分。
Figure 0007113815000253
DMSO(3.00mL)中の51.2(140.00mg、270.52μmol、1.00当量)およびアミノプロピン(14.90mg、270.52μmol、17.33μL、1.00当量)に、CuSO4(8.64mg、54.10μmol、8.31μL、0.20当量)のHO(100.00μL)中溶液を加えた。この混合物を18℃で5分間、撹拌した。この反応混合物をHO 10mLにより希釈し、EtOAc(10mL×3)により抽出した。合わせた有機層をブライン(30mL)により洗浄し、NaSOで乾燥させてろ過し、減圧下で濃縮すると、51.3(150.00mg、粗製物)が赤色固体として得られた。
Figure 0007113815000254
DMF(2.00mL)中の51.4(64.00mg、261.96μmol、1.00当量)およびHOBt(38.94mg、288.16μmol、1.10当量)の混合物に、N下、0℃でEDCI(55.24mg、288.16μmol、1.10当量)を1回で加えた。この混合物を0℃で1時間、撹拌し、次に、この混合物に、0℃で51.3(150.00mg、261.96μmol、1.00当量)およびDIPEA(101.57mg、785.88μmol、137.26μL、3.00当量)を1回で加え、この混合物を0℃で1時間、撹拌した。この反応混合物をHO 10mLにより希釈し、EtOAc(10mL×3)により抽出した。合わせた有機層をブライン(30mL)により洗浄し、NaSOで乾燥させてろ過し、減圧下で濃縮すると、51.5(200.00mg、250.34μmol、95.57%収率)が黄色固体として得られた。LCMS[M+H]:799;保持時間=1.373分。
Figure 0007113815000255
51.5(200mg)をHCl/EtOAc(5mL)に溶解し、この混合物を18℃で1分間、撹拌した。この反応混合物を減圧下で濃縮すると、残留物が得られた。残留物を分取HPLC(TFA条件)により精製すると、化合物51(40mg)が白色固体として得られた。LCMS[M+H]:699;保持時間=2.391分。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 1.34 - 1.46 (m, 2 H), 1.48 - 1.63 (m, 3 H), 1.64 - 1.77 (m, 4 H), 1.77 - 1.91 (m, 2 H), 2.08 - 2.20 (m, 1 H), 2.27 (t, J=7.17 Hz, 2 H), 2.62 (d, J=12.79 Hz, 1 H), 2.80 - 2.89 (m, 1 H), 2.95 (br t, J=6.50 Hz, 2 H), 3.11 - 3.19 (m, 1 H), 4.24 (dd, J=7.94, 4.41 Hz, 1 H), 4.43 (dd, J=7.50, 4.63 Hz, 1 H), 4.53 (s, 2 H), 4.98 (br d, J=3.75 Hz, 1 H), 5.00 - 5.10 (m, 2 H), 6.96 - 7.05 (m, 2 H), 7.06 - 7.13 (m, 1 H), 7.68 - 7.74 (m, 1 H), 7.95 - 8.00 (m, 1 H), 8.02 - 8.08 (m, 1 H), 8.35 (t, J=1.76 Hz, 1 H), 8.46 (s, 1 H).
(実施例48)
(S)-N-(7-アミノ-2-オキソ-1-(2,3,6-トリフルオロフェノキシ)ヘプタン-3-イル)イソニコチンアミド(52)の調製
Figure 0007113815000256
52.1は、34.2と同じ方法であるが、2-ブロモニコチン酸の代わりにピリジン-4-カルボン酸を用いて調製した。
DMF(10.00mL)中の52.1(783.60mg、2.04mmol、1.00当量)に、DIPEA(791.46mg、6.12mmol、1.07mL、3.00当量)およびトリフルオロフェノール(302.28mg、2.04mmol、1.00当量)を加えた。この混合物を、25℃で15時間、撹拌した。この反応混合物をHO(10mL)により希釈し、EtOAc(10mL×3)により抽出した。合わせた有機層をブライン(30mL)により洗浄してNaSOで乾燥させ、ろ過して減圧下で濃縮した。この残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO、石油エーテル/酢酸エチル=10/1~1/1)によって精製すると、52.2(50.00mg)が得られた。LCMS[M+H]:496;保持時間=0.777分。
Figure 0007113815000257
DCM(500.00μL)中の52.2(10.00mg、20.18μmol、1.00当量)に、TFA(154.00mg、1.35mmol、100.00μL、66.93当量)を加えた。この混合物を、25℃で15時間、撹拌した。この反応混合物を減圧下で濃縮すると、化合物52(7.50mg、18.97μmol)が得られた。LCMS[M+H]:397;保持時間=2.128分。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 1.49 - 1.66 (m, 2 H), 1.67 - 1.92 (m, 3 H), 2.04 - 2.21 (m, 1 H), 2.94 (br t, J=7.61 Hz, 2 H), 4.95 (dd, J=9.70, 4.41 Hz, 1 H), 5.05 - 5.18 (m, 2 H), 6.88 - 7.13 (m, 2 H), 7.86 - 8.00 (m, 2 H), 8.79 (br d, J=4.19 Hz, 2 H).
(実施例49)
(S)-N-(7-アミノ-2-オキソ-1-(2H-テトラゾール-2-イル)ヘプタン-3-イル)-6-フルオロニコチンアミド(53)の調製
Figure 0007113815000258
DMF(10.00mL)中の29.2(1.70g、4.23mmol、1.00当量)に、テトラゾール(0.45M、10.34mL、1.10当量)およびDIPEA(2.19g、16.92mmol、2.96mL、4.00当量)を加えた。この混合物を、10℃で12時間、撹拌した。この反応混合物をHO(10mL)により希釈し、EtOAc(10mL×3)により抽出した。合わせた有機層をブライン(30mL)により洗浄してNaSOで乾燥させ、ろ過して減圧下で濃縮した。この残留物を分取HPLC(カラム:Luna C18 100×30×5u;移動相:A:水(0.1%TFA)およびB:ACN;B%:20%~60%、10分間)により精製すると、53.1(10.00mg)が得られた。
Figure 0007113815000259
DCM(2.50mL)中の53.1(10.00mg)に、TFA(0.5mL)を加えた。この混合物を、10℃で12時間、撹拌した。この反応混合物を減圧下で濃縮すると、化合物53(2.00mg、5.96μmol)が得られた。LCMS[M+H]:336;保持時間=0.593分。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 1.49 - 1.66 (m, 2 H), 1.67 - 1.80 (m, 2 H), 1.83 - 1.93 (m, 1 H), 2.06 - 2.16 (m, 1 H), 2.89 - 3.00 (m, 2 H), 4.79 (br s, 1 H), 5.87 - 6.01 (m, 2 H), 7.15 - 7.24 (m, 1 H), 8.35 - 8.46 (m, 1 H), 8.68 - 8.79 (m, 2 H).
(実施例50)
(S)-N-(7-アミノ-2-オキソ-1-(2H-テトラゾール-2-イル)ヘプタン-3-イル)-2-フルオロニコチンアミド(54)の調製
Figure 0007113815000260
DMF(10.00mL)中の32.2(1.70g、4.23mmol、1.00当量)に、テトラゾール(0.45M、10.34mL、1.10当量)およびDIPEA(2.19g、16.92mmol、2.96mL、4.00当量)を加えた。この混合物を、10℃で12時間、撹拌した。この反応混合物をHO(10mL)により希釈し、EtOAc(10mL×3)により抽出した。合わせた有機層をブライン(30mL)により洗浄してNaSOで乾燥させ、ろ過して減圧下で濃縮した。この残留物を分取HPLC(カラム:Luna C18 100×30×5u;移動相:A:水(0.1%TFA)、B:ACN;B%:20%~60%、10分間)により精製すると、54.1(5.00mg)が得られた。
Figure 0007113815000261
DCM(2.50mL)中の54.1(5.00mg)に、TFA(0.5mL)を加えた。この混合物を、10℃で12時間、撹拌した。この反応混合物を減圧下で濃縮すると、化合物54(2.00mg)が得られた。LCMS[M+H]:336;保持時間=3.720分。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 1.51 - 1.66 (m, 2 H), 1.70 - 1.79 (m, 2 H), 1.81 - 1.91 (m, 1 H), 2.03 - 2.19 (m, 1 H), 2.96 (br t, J=7.61 Hz, 2 H), 3.77 (s, 1 H), 4.84 (br d, J=4.85 Hz, 1 H), 5.96 (d, J=2.65 Hz, 2 H), 7.46 (ddd, J=7.22, 5.13, 1.76 Hz, 1 H) ,8.25 - 8.41 (m, 2 H) ,8.68 - 8.80 (m, 1 H).
(実施例51)
(S)-N-(7-アミノ-1-(イソオキサゾール-3-イルオキシ)-2-オキソヘプタン-3-イル)-6-フルオロニコチンアミド(55)の調製
Figure 0007113815000262
O(150.00mL)およびMeOH(170.00mL)中の混合物55.1(10.00g、101.94mmol、10.00mL、1.00当量)、ヒドロキシルアミン塩酸塩(9.21g、132.52mmol、1.30当量)、NaOH(15.25g、381.26mmol、3.74当量)を25℃で100時間、撹拌した。この混合物を濃塩酸によりpH2に酸性にし、次に、塩化ナトリウムにより飽和させた。この溶液をDCM(8×150ml)により抽出し、抽出物を合わせて乾燥させ、溶媒を蒸発させた。固体残留物を熱イソ-ヘキサン(3×100ml)により洗浄し、最終懸濁液を放冷して、生じた固体をろ過により集め、真空下で乾燥すると、55.2(4.00g、47.03mmol、46.13%収率)が黄色固体として得られた。1H NMR (400 MHz, クロロホルム-d) δ ppm 6.04 (d, J=1.76 Hz, 1 H), 8.10 (d, J=1.76 Hz, 1 H), 11.11 (br s, 1 H).
Figure 0007113815000263
DMF(3.00mL)中の29.2(200.00mg、497.69μmol、1.00当量)に、KCO(206.36mg、1.49mmol、3.00当量)および55.2(55.03mg、647.00μmol、1.30当量)を加えた。この混合物を、25℃で15時間、撹拌した。この反応混合物をHO(10mL)により希釈し、EtOAc(10mL×3)により抽出した。合わせた有機層をブライン(30mL)により洗浄してNaSOで乾燥させ、ろ過して減圧下で濃縮した。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO2、石油エーテル/酢酸エチル=2:1)によって精製すると、55.3(0.1g、222.00μmol、44.61%収率)が黄色油状物として得られた。LCMS[M+H]:451;保持時間=1.145分。
Figure 0007113815000264
55.3(0.1g)のDCM(5mL)中溶液にTFA(1mL)を加えた。この混合物を、25℃で15時間、撹拌した。この混合物を減圧下で濃縮すると、残留物が得られた。残留物を分取HPLC(TFA条件)により精製すると、化合物55(20mg)が得られた。LCMS[M+H]:351;保持時間=0.850分。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 1.44 - 1.66 (m, 2 H), 1.67 - 1.90 (m, 3 H), 2.00 - 2.18 (m, 1 H), 2.82 - 3.09 (m, 2 H), 4.79 (dd, J=9.26, 4.85 Hz, 1 H), 5.06 - 5.22 (m, 2 H), 6.18 (d, J=1.10 Hz, 1 H), 7.07 - 7.27 (m, 1 H), 8.30 - 8.47 (m, 2 H), 8.72 (d, J=1.98 Hz, 1 H).
(実施例52)
(S)-N-(7-アミノ-1-(イソオキサゾール-3-イルオキシ)-2-オキソヘプタン-3-イル)-2-フルオロニコチンアミド(56)の調製
Figure 0007113815000265
DMF(15.00mL)中の32.2(1.40g、3.48mmol、1.00当量)に、KCO(1.44g、10.44mmol、3.00当量)およびイソオキサゾール-3-オール(55.2、296.01mg、3.48mmol、1.00当量)を加えた。この混合物を、25℃で15時間、撹拌した。この反応混合物をHO(10mL)により希釈し、EtOAc(10mL×3)により抽出した。合わせた有機層をブライン(30mL)により洗浄してNaSOで乾燥させ、ろ過して減圧下で濃縮した。この残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO、石油エーテル/酢酸エチル=2:1)によって精製すると、56.1(300mg)が得られた。LCMS[M+H]:453;保持時間=1.379分。
Figure 0007113815000266
DCM(5mL)中の56.1(0.3g)に、TFA(1mL)を加えた。この混合物を、25℃で15時間、撹拌した。この混合物を減圧下で濃縮すると、残留物が得られた。残留物を分取HPLC(TFA条件)により精製すると、化合物56(20mg)が得られた。LCMS[M+H]:351;保持時間=0.730分。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 1.45 - 1.64 (m, 2 H), 1.65 - 1.89 (m, 3 H), 1.96 - 2.18 (m, 1 H), 2.95 (br t, J=7.50 Hz, 2 H), 4.81 (br dd, J=9.15, 4.74 Hz, 1 H), 5.16 (s, 2 H),6.19 (s, 1 H), 7.46 (br t, J=6.06 Hz, 1 H), 8.14 - 8.50 (m, 3 H).
(実施例53)
(S)-N-(7-アミノ-1-(イソオキサゾール-3-イルオキシ)-2-オキソヘプタン-3-イル)-2-メトキシ-2-メチルプロパンアミド(57)の調製
Figure 0007113815000267
47.2(893mg、2.36mmol、1当量)およびイソオキサゾール-3-オール(200.48mg、2.36mmol、1当量)のDMF(8mL)中溶液に、DIPEA(913.83mg、7.07mmol、1.23mL、3当量)を加えた。この混合物を、25℃で10時間、撹拌した。この反応混合物をHO(10mL)により希釈し、EtOAc(10mL×3)により抽出した。合わせた有機層をブライン(30mL)により洗浄してNaSOで乾燥させ、ろ過して減圧下で濃縮した。この残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO、石油エーテル/酢酸エチル=10/1~1/1)によって精製すると、57.1(130mg)が得られた。LCMS[M+H]:428;保持時間=0.649分。
Figure 0007113815000268
DCM(5mL)中の57.1(50mg)に、TFA(1mL)を加えた。この混合物を、25℃で10時間、撹拌した。残留物を分取HPLC(TFA条件)により精製すると、化合物57(10mg)が得られた。LCMS[M+H]:328;保持時間=2.430分。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 1.38 (s, 7 H), 1.45 (br d, J=6.84 Hz, 2 H), 1.58 - 1.80 (m, 4 H), 2.01 (br s, 1 H), 2.92 (br d, J=7.28 Hz, 2 H), 3.31 - 3.33 (m, 3 H), 4.53 - 4.62 (m, 1 H), 4.99 - 5.14 (m, 2 H), 6.17 (s, 1 H), 8.38 (s, 1 H).
(実施例54)
(S)-N-(7-アミノ-1-(ジメチル(オキソ)-λ6-スルファニリデン)-2-オキソヘプタン-3-イル)シクロペンタンカルボキサミド(58)の調製
Figure 0007113815000269
BLAHメタンクロリド(BLAHmethane chloride)(896.67mg、6.97mmol、3.55当量)のトルエン(17mL)懸濁液に、25℃でカリウム2-メチルプロパン-2-オレート(1M、5.87mL、2.99当量)を滴下して加えた。この混合物を4時間、70℃まで加熱して、次に、0℃まで冷却した。58.1(0.7g、1.96mmol、1当量)のTHF(15mL)懸濁液を0℃で滴下して加え、得られた溶液を0℃で16時間、撹拌した。この溶液をMTBEによって3回洗浄した。このろ過ケーキを減圧下で濃縮すると、58.2(630mg、1.51mmol、38.51%収率)が白色固体として得られた。LCMS[M+H]:417;保持時間=0.910分。
Figure 0007113815000270
58.2(50mg)のDCM(2mL)中溶液に、N下、18℃でTFA(0.4mL)を1回で加えた。この混合物を18℃で30分間、撹拌した。この反応混合物を減圧下で濃縮すると、化合物58(50mg)が黄色油状物として得られた。LCMS[M+H]:317;保持時間=1.782分。1H NMR (400 MHz, アセトニトリル-d3) δ ppm 1.39 - 1.51 (m, 2 H), 1.56 (br d, J=6.60 Hz, 2 H), 1.67 (br d, J=4.77 Hz, 6 H), 1.75 - 1.89 (m, 4 H), 2.70 (dt, J=15.68, 7.75 Hz, 1 H), 2.94 (br s, 2 H), 3.63 (s, 8 H), 4.17 - 4.26 (m, 1 H).
(実施例55)
N-((S)-7-アミノ-1-(2,6-ジフルオロフェノキシ)-2-オキソヘプタン-3-イル)-3-(4-(15-オキソ-19-((3aS,4S,6aR)-2-オキソヘキサヒドロ-1H-チエノ[3,4-d]イミダゾール-4-イル)-2,5,8,11-テトラオキサ-14-アザノナデシル)-1H-1,2,3-トリアゾール-1-イル)ベンズアミド(59)の調製
Figure 0007113815000271
DMF(2mL)中の混合物ビオチン(159.29mg、982.36μmol、1.2当量)を、25℃で12時間、撹拌した。この混合物をろ過して減圧下で濃縮すると、59.1(200mg、粗製物)が白色固体として得られた。LCMS[M+H]:295;保持時間=0.298分。
Figure 0007113815000272
DMF(3mL)中の59.1(127.28mg、432.36μmol、1当量)、59.2(100mg、432.36μmol、1当量)、DIPEA(167.64mg、1.30mmol、225.93μL、3当量)の混合物を、25℃で12時間、撹拌した。残留物を分取HPLC(TFA条件)により精製すると、59.3(100mg、218.54μmol、50.55%収率)が白色固体として得られた。LCMS[M+H]:458;保持時間=1.052分。
Figure 0007113815000273
DMSO(2mL)およびHO(0.2mL)中の59.3(80mg、174.83μmol、1当量)の溶液に、33.5(90.48mg、174.83μmol、1当量)およびCuSO(5.58mg、34.97μmol、5.37μL、0.2当量)およびアスコルビン酸ナトリウム(69.27mg、349.66μmol、2当量)を加えた。この混合物を25℃で10分間、撹拌した。この反応混合物を25℃でHO 10mLの添加によりクエンチし、酢酸エチル(10mL×3)により抽出した。合わせた有機層を飽和ブライン(5mL)により洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、ろ過して減圧下で濃縮すると、粗生成物が得られた。残留物を分取TLC(SiO、DCM:MeOH=10:1)によって精製すると、59.4(90mg、92.30μmol、52.79%収率)が黄色油状物として得られた。LCMS[M+H]:951;保持時間=1.160分。
Figure 0007113815000274
DCM(5mL)およびTFA(1mL)中の59.4(90mg、92.30μmol)を、N雰囲気下、25℃で12時間、撹拌した。この反応混合物を減圧下で濃縮すると、残留物が得られた。残留物を分取HPLC(TFA条件)により精製すると、化合物59(20mg、22.86μmol)が白色固体として得られた。LCMS[M+H]:875;保持時間=0.870分。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 1.25 - 1.46 (m, 2 H), 1.47 - 1.95 (m, 9 H), 2.02 - 2.29 (m, 3 H), 2.68 (d, J=12.57 Hz, 1 H), 2.82 - 3.04 (m, 3 H), 3.07 - 3.22 (m, 1 H), 3.31 - 3.35 (m, 2 H), 3.43 - 3.54 (m, 2 H), 3.54 - 3.66 (m, 8 H), 3.67 - 3.78 (m, 4 H), 4.18 - 4.35 (m, 1 H), 4.47 (dd, J=7.72, 4.85 Hz, 1 H), 4.75 (s, 2 H), 4.92 - 5.17 (m, 3 H), 6.88 - 7.18 (m, 2 H), 7.72 (t, J=7.94 Hz, 1 H) ,7.89 - 8.13 (m, 2 H), 8.30 - 8.43 (m, 1 H), 8.62 (s, 1 H).
(実施例56)
N-((S)-7-アミノ-1-(2,6-ジフルオロフェノキシ)-2-オキソヘプタン-3-イル)-3-(4-(3,43-ジオキソ-47-((3aS,4S,6aR)-2-オキソヘキサヒドロ-1H-チエノ[3,4-d]イミダゾール-4-イル)-6,9,12,15,18,21,24,27,30,33,36,39-ドデカオキサ-2,42-ジアザヘプタテトラコンチル)-1H-1,2,3-トリアゾール-1-イル)ベンズアミド(60)の調製
Figure 0007113815000275
プロパ-2-イン-1-アミン(21.29mg、386.46μmol、24.75μL、1当量)および33.5(200mg、386.46μmol、1当量)のDMSO(2mL)中溶液に、HO(0.1mL)中のCuSO(362.30ug、2.27μmol、3.48μL、0.2当量)、およびアスコルビン酸ナトリウム(153.12mg、772.91μmol、2当量)を加えた。この混合物を25℃で15分間、撹拌した。この反応混合物を25℃でHO 10mLの添加によりクエンチし、酢酸エチル(10mL×3)により抽出した。合わせた有機層を飽和ブライン(5mL)により洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、ろ過して減圧下で濃縮すると、粗生成物が得られた。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO、DCM:MeOH=0:1)によって精製すると、60.1(140mg、244.50μmol、63.27%収率)が黄色固体として得られた。LCMS[M+H]:573;保持時間=0.991分。
Figure 0007113815000276
60.2(200mg、236.96μmol、1当量)のDMF(5mL)中溶液に、HOBt(35.22mg、260.66μmol、1.1当量)およびEDCI(49.97mg、260.66μmol、1.1当量)を加えた。この混合物を、25℃で1時間、撹拌した。次に、この混合物に、60.1(135.69mg、236.96μmol、1当量)およびDIPEA(122.50mg、947.85μmol、165.10μL、4当量)を加えた。この混合物を、25℃で11時間、撹拌した。残留物を分取HPLC(TFA条件)により精製すると、60.3(55mg、39.32μmol、16.60%収率)が黄色固体として得られた。LCMS[M+H]:700;保持時間=1.225分。
Figure 0007113815000277
DCM(5mL)およびTFA(1mL)中の60.3(50mg、35.75μmol)の混合物を、25℃で12時間、撹拌した。この混合物を真空中で濃縮すると、粗生成物が得られた。残留物を分取HPLC(TFA条件)により精製すると、化合物60(15mg、11.55μmol)が黄色油状物として得られた。LCMS[M+H]:1299;保持時間=1.06分。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 1.32 - 1.93 (m, 12 H), 2.06 - 2.27 (m, 3 H), 2.52 (t, J=5.95 Hz, 2 H), 2.70 (d, J=12.79 Hz, 1 H), 2.86 - 3.05 (m, 3 H), 3.14 - 3.24 (m, 1 H), 3.32 - 3.38 (m, 2 H), 3.45 - 3.68 (m, 49 H), 3.77 (t, J=5.84 Hz, 2 H), 4.30 (dd, J=7.83, 4.52 Hz, 1 H), 4.49 (dd, J=7.72, 4.63 Hz, 1 H), 4.56 (s, 2 H), 4.96 - 5.13 (m, 2 H), 6.94 - 7.14 (m, 3 H), 7.64 - 7.77 (m, 1 H), 7.91 - 8.10 (m, 2 H), 8.28 - 8.39 (m, 1 H), 8.44 - 8.52 (m, 1 H).
(実施例57)
(S)-5-((7-アミノ-1-(イソオキサゾール-3-イルオキシ)-2-オキソヘプタン-3-イル)カルバモイル)-N,N,N-トリメチルピリジン-2-アミニウムクロリド(61)の調製
Figure 0007113815000278
N,N-ジメチルメタンアミン(2M、4.44mL、20当量)のTHF(0.5mL)中溶液に、18℃で55.3(0.2g、443.99μmol、1当量)を1回で加えた。この混合物を、18℃で10時間、撹拌した。この反応混合物を減圧下で濃縮すると、残留物が得られた。この残留物を分取HPLC(HCl条件)により精製すると、61.1(20mg、40.77μmol、9.18%収率)および62.1(20mg、42.06μmol、9.47%収率)が白色固体として得られた。LCMS[M+H]、C2437+;RT=1.136分。
Figure 0007113815000279
61.1(20mg)をHCl/MeOH(2mL)に溶解し、この混合物を25℃で10分間、撹拌した。この反応混合物を減圧下で濃縮すると、化合物61(15mg)が黄色油状物として得られた。LCMS[M+H]、C1929+:391;RT=0.149分。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 1.47 - 1.66 (m, 2 H), 1.68 - 1.82 (m, 2 H), 1.84 - 1.97 (m, 1 H), 2.01 - 2.16 (m, 1 H), 2.97 (br t, J=7.45 Hz, 2 H), 3.67 - 3.74 (m, 9 H), 4.81 (dd, J=9.43, 4.60 Hz, 1 H), 5.15 - 5.21 (m, 2 H), 6.17 - 6.23 (m, 1 H), 8.10 - 8.19 (m, 1 H), 8.39 (d, J=1.75 Hz, 1 H), 8.64 (dd, J=8.77, 2.19 Hz, 1 H), 9.11 (d, J=1.75 Hz, 1 H).
(実施例58)
(S)-N-(7-アミノ-1-(イソオキサゾール-3-イルオキシ)-2-オキソヘプタン-3-イル)-6-(ジメチルアミノ)ニコチンアミド(62)の調製
Figure 0007113815000280
62.1(20mg)をHCl/MeOH(2mL)に溶解し、この混合物を25℃で10分間、撹拌した。この反応混合物を減圧下で濃縮すると、化合物62(15mg)が黄色油状物として得られた。LCMS[M+H]、C1826:376;RT=2.077分。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 1.46 - 1.67 (m, 2 H), 1.75 (br d, J=7.02 Hz, 2 H), 1.87 (dtd, J=14.25, 9.65, 9.65, 4.60 Hz, 1 H), 2.00 - 2.11 (m, 1 H), 2.97 (br t, J=7.45 Hz, 2 H), 3.34 - 3.41 (m, 6 H), 4.74 (dd, J=9.21, 4.82 Hz, 1 H), 5.16 (d, J=1.75 Hz, 2 H), 6.19 (d, J=1.75 Hz, 1 H), 7.33 (d, J=9.65 Hz, 1 H), 8.39 (d, J=1.75 Hz, 1 H), 8.43 (dd, J=9.65, 1.75 Hz, 1 H), 8.52 (d, J=1.75 Hz, 1 H).
(実施例59)
(S)-N-(7-アミノ-1-((2,6-ジメチルピリジン-4-イル)オキシ)-2-オキソヘプタン-3-イル)-2-メトキシ-2-メチルプロパンアミド(63)の調製
Figure 0007113815000281
DMF(9mL)中の47.2(423mg、1.12mmol、1当量)および2,6-ジメチル-4-ヒドロキシピリジン(137.49mg、1.12mmol、1当量)に、N下、25℃でKCO(462.89mg、3.35mmol、3当量)およびKI(185.33mg、1.12mmol、1当量)を1回で加えた。次に、この混合物を2時間、撹拌した。この反応混合物をHO(20mL)の添加によりクエンチし、次に、EtOAc(20mL)により希釈し、EtOAc(10mL×3)により抽出した。合わせた有機層をHO(10mL×3)により洗浄し、乾燥させてろ過し、減圧下で濃縮すると、残留物が得られた。残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO、石油エーテル/酢酸エチル=3:1)によって精製すると、63.1(85mg、182.57μmol)が白色固体として得られた。LCMS[M+H]:466;保持時間=1.155分。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 1.38 (d, J=5.51 Hz, 8 H) ,1.43 (s, 11 H) ,1.50 (dt, J=13.67, 6.84 Hz, 3 H), 1.64 - 1.77 (m, 2 H) ,1.88 - 1.99 (m, 2 H), 2.41 - 2.46 (m, 6 H) ,2.99 - 3.09 (m, 3 H) ,3.31 - 3.32 (m, 3 H), 4.55 - 4.62 (m, 2 H) ,4.92 - 5.04 (m, 3 H) ,6.66 (s, 2 H).
Figure 0007113815000282
DCM(5mL)およびTFA(1mL)中の63.1(85mg)を、0.5時間、撹拌した。この反応混合物を減圧下で濃縮した。この残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO、石油エーテル/酢酸エチル=2:1)によって精製すると、化合物63(50mg)が得られた。LCMS[M+H]:366;保持時間=1.517分。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 1.25 - 1.40 (m, 6 H) ,1.46 - 1.59 (m, 2 H) ,1.67 - 1.80 (m, 3 H) ,1.94 - 2.05 (m, 1 H), 2.61 - 2.66 (m, 6 H) ,2.93 (br t, J=7.58 Hz, 2 H) ,3.30 - 3.32 (m, 3 H) ,4.47 (dd, J=9.66, 4.40 Hz, 1 H), 5.22 - 5.40 (m, 2 H) ,7.13 - 7.22 (m, 2 H).
(実施例60)
(S)-N-(7-アミノ-2-オキソ-1-(ピリジン-3-イルオキシ)ヘプタン-3-イル)-2-メトキシ-2-メチルプロパンアミド(64)の調製
Figure 0007113815000283
化合物64は、2,6-ジメチル-4-ヒドロキシピリジンの代わりに3-ヒドロキシピリジン(3-hydrozypyridine)を使用して、化合物63に使用した同じ方法により調製した。LCMS[M+H]:338;保持時間=4.585分。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 1.21 - 1.40 (m, 6 H), 1.42 - 1.58 (m, 2 H) ,1.64 - 1.80 (m, 3 H), 1.95 - 2.05 (m, 1 H) ,2.93 (br t, J=7.64 Hz, 2 H) ,3.30 - 3.32 (m, 3 H), 4.51 (dd, J=9.66, 4.40 Hz, 1 H), 5.14 - 5.29 (m, 2 H) ,7.86 (dd, J=8.80, 5.38 Hz, 1 H) ,7.98 - 8.03 (m, 1 H), 8.41 (br d, J=5.14 Hz, 1 H), 8.51 (br d, J=2.08 Hz, 1 H).
(実施例61)
(S)-N-(7-アミノ-1-((2-メチルピリミジン-5-イル)オキシ)-2-オキソヘプタン-3-イル)-2-メトキシ-2-メチルプロパンアミド(65)の調製
Figure 0007113815000284
化合物65は、2,6-ジメチル-4-ヒドロキシピリジンの代わりに5-ヒドロキシピリミジンを使用して、化合物63に使用した同じ方法により調製した。LCMS[M+H]:353;保持時間=1.98分。1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 1.24 (br s, 1 H), 1.31 (s, 7 H), 1.34 (br s, 1 H), 1.45 - 1.58 (m, 2 H), 1.65 (dtd, J=14.00, 9.48, 9.48, 4.71 Hz, 1 H), 1.78 - 1.89 (m, 1 H), 2.55 (s, 3 H), 2.72 - 2.85 (m, 2 H), 3.20 (s, 3 H), 4.19 - 4.61 (m, 1 H), 5.18 (br s, 2 H), 7.68 (br s, 2 H), 8.21 (d, J=7.70 Hz, 1 H), 8.36 (s, 2 H).
(実施例62)
(S)-N-(7-アミノ-2-オキソ-1-(ピリジン-3-イルチオ)ヘプタン-3-イル)-2-メトキシ-2-メチルプロパンアミド(66)の調製
Figure 0007113815000285
ジオキサン(20mL)中の66.1(2g、12.66mmol、1.22mL、1当量)に、66.2(2.90g、13.29mmol、1.05当量)、DIPEA(3.27g、25.32mmol、4.41mL、2当量)およびXantphos(732.45mg、1.27mmol、0.1当量)、Pd(dba)(579.58mg、632.93μmol、0.05当量)を加えた。この混合物を100℃で2時間、撹拌した。この反応混合物をHO(20mL)の添加によりクエンチし、EtOAc(20mL×3)により抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)により洗浄し、NaSOで乾燥させて、減圧下で濃縮すると、残留物が得られた。この残留物をMPLC(SiO、石油エーテル/酢酸エチル=10/1~1:1)によって精製すると、66.3(3.6g、12.19mmol、96.26%収率)が黄色油状物として得られた。
Figure 0007113815000286
THF(10mL)中の66.3(800mg、2.71mmol、1当量)に、t-BuOK/THF(1M、4.06mL、1.5当量)を加えた。この混合物を-78℃で1時間、撹拌した。この反応混合物を減圧下で濃縮すると、残留物が得られた。この残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO、EtOAc/MEOH=10/1~1:1)によって精製すると、66.4(80mg)が黄色油状物として得られた。1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 8.53 (d, J=1.75 Hz, 1 H), 8.31 (dd, J=4.82, 1.32 Hz, 1 H), 7.83 - 7.91 (m, 1 H), 7.30(dd, J=7.45, 4.82 Hz, 1 H),3.58 (br s, 8 H) 3.38 - 3.73 (m, 1 H).
Figure 0007113815000287
DMF(5mL)中の47.2(500mg、1.32mmol、1当量)に、66.4(80mg、719.65μmol、5.45当量)、KCO(547.15mg、3.96mmol、3当量)およびKI(219.06mg、1.32mmol、1当量)を加えた。この混合物を、25℃で5時間、撹拌した。この反応混合物をろ過し、所望の化合物はろ液中に存在した。このろ液を分取HPLC(カラム:Phenomenex Luna C18 200×40mm×10um;移動相:A:水(0.1%TFA)-B:ACN;B%:15%~35%、8分間)により精製すると、66.5(40mg、88.18μmol)が得られた。
Figure 0007113815000288
DCM(5mL)中の66.5に、TFA(1mL)を加えた。この混合物を、25℃で1時間、撹拌した。この反応混合物を減圧下で濃縮すると、残留物が得られ、化合物66(12mg)が得られた。LCMS[M+H]:354;保持時間=1.83分。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 8.62 (br s, 1 H) ,8.49 (br s, 1 H) ,8.14 (d, J=8.33 Hz, 1 H) ,7.62 (dd, J=8.33, 4.82 Hz, 1 H) ,4.60 (dd, J=9.43, 4.17 Hz, 1 H), 4.10 - 4.21 (m, 1 H), 3.29 (br s, 3 H), 2.90 (br t, J=7.45 Hz, 2 H), 1.97 (br d, J=10.09 Hz, 1 H), 1.62 - 1.74 (m, 3 H), 1.42 (br d, J=4.39 Hz, 1 H), 1.36 (d, J=4.38 Hz, 8 H), 1.27 - 1.33 (m, 1 H).
(実施例63)
(S)-N-(7-アミノ-1-((2,6-ジメチルピリジン-4-イル)チオ)-2-オキソヘプタン-3-イル)-2-メトキシ-2-メチルプロパンアミド(67)の調製
Figure 0007113815000289
DMF(20mL)中の2,6-ジメチル-4-クロロピリジン(2g、14.12mmol、1当量)に、NaSH(1.98g、35.31mmol、2.5当量)を加えた。この混合物を、140℃で2時間、撹拌した。この反応混合物を減圧下で濃縮すると、残留物が得られた。この残留物をMPLC(ジクロロメタン:メタノール SiO=10/1~1:1)によって精製すると、67.1(2.7g)が黄色固体として得られた。
Figure 0007113815000290
DMF(7mL)中の67.1(367.44mg、2.64mmol、1当量)に、47.2(1g、2.64mmol、1当量)、KCO(1.09g、7.92mmol、3当量)およびKI(438.12mg、2.64mmol、1当量)を加えた。この混合物を、25℃で2時間、撹拌した。この反応混合物をろ過し、所望の化合物はろ液中に存在した。このろ液を分取HPLC(カラム:Phenomenex Luna(2) C18、250×50×10u;移動相A:水(0.1%TFA)およびB:ACN;グラジエントB%:20分間かけて10%~40%)により精製すると、67.2(353mg)が得られた。
Figure 0007113815000291
DCM(5mL)中の67.2(353mg)に、TFA(1mL)を加えた。この混合物を、25℃で1時間、撹拌した。この反応混合物を減圧下で濃縮すると、化合物67(350mg)が得られた。LCMS[M+H]:382;保持時間=1.799分。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 7.40 - 7.52 (m, 2 H) ,4.32 - 4.57 (m, 3 H), 3.32 (br s, 3 H) ,2.94 (br t, J=7.64 Hz, 2 H), 2.63 (s, 6 H) ,1.95 - 2.08 (m, 1 H) ,1.65 - 1.83 (m, 3 H) ,1.43 - 1.57 (m, 2 H) ,1.39 (d, J=5.62 Hz, 6 H).
(実施例64)
(S)-N-(7-アミノ-1-((2-メチルピリミジン-5-イル)チオ)-2-オキソヘプタン-3-イル)-2-メトキシ-2-メチルプロパンアミド(68)の調製
Figure 0007113815000292
化合物68は、3-ブロモピリジンの代わりに2-メチル-5-ブロモピリミジンを使用して、化合物66に使用した同じ方法により調製した。LCMS[M+H]:369;保持時間=2.0分。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 1.36 (s, 8 H), 1.38 - 1.48 (m, 2 H) ,1.60 - 1.74 (m, 3 H) ,1.90 - 2.01 (m, 1 H), 2.65 (s, 3 H) ,2.90 (br t, J=6.80 Hz, 2 H), 3.29 (s, 3 H) ,3.91 - 4.10 (m, 2 H), 4.62 (dd, J=9.43, 4.60 Hz, 1 H) ,8.68 (s, 2 H).
(実施例65)
(S)-N-(7-アミノ-1-((1,1,1,3,3,3-ヘキサフルオロプロパン-2-イル)オキシ)-2-オキソヘプタン-3-イル)-2-メトキシ-2-メチルプロパンアミド(69)の調製
Figure 0007113815000293
DMF(7mL)中の化合物1.2(1.0g、2.36mmol、1.0当量)、1,1,13,3,3-ヘキサフルオロイソプロパノール(595mg、3.54mmol、1.5当量)、KF(411mg、7.09mmol、3.0当量)の懸濁液を脱気してNによりパージすることを3回行い、次に、この懸濁液をN雰囲気下、25℃で2時間、撹拌した。LCMSにより、化合物1.2が完全に消費されたことが示された。この反応を水(21mL)によりゆっくりとクエンチし、次に、EtOAc(20mL×2)により抽出した。合わせた有機相をブライン(10mL)により洗浄して無水NaSOで乾燥させ、ろ過して真空で濃縮した。この残留物をカラムクロマトグラフィー(SiO、石油エーテル:酢酸エチル=15:1~3:1)によって精製すると、69.1(0.90g、1.67mmol、70%収率)が無色ガム状物として得られた。1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 8.05 (d, J = 8.4 Hz, 1H), 6.73(broad s, 1H), 5.42-5.50 (m, 1H), 4.65 (dd, J = 1.2 Hz, J = 1.2 Hz, 2H), 4.26-4.32 (m, 1H), 3.15 (s, 3H), 2.80-2.91 (m, 2H), 1.67-1.75 (m, 1H), 1.52-1.58 (m, 1H), 1.33 (s, 11H), 1.25 (s, 6H) ppm.
Figure 0007113815000294
化合物3(0.90g、1.76mmol、1.0当量)のEtOAc(10mL)中溶液に、0℃でHCl/EtOAc(4M、10mL、22当量)を加えた。この溶液を、0℃で1時間、撹拌した。LCMSにより、化合物69.1が完全に消費されたことが示された。この反応混合物を減圧下で濃縮すると、残留物が得られた。これを凍結乾燥器により乾燥すると、化合物69(0.78g、合計収率:63.7%、HCl塩)が黄色ガム状物として得られた。1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 8.09 (d, J = 8.4 Hz, 1H), 7.91 (br.s, 3H), 5.47-5.54 (m, 1H), 4.61-4.79 (m, 2H), 3.15 (s, 3H), 2.64-2.72 (m, 2H), 1.58-1.74 (m, 1H), 1.52-1.58 (m, 3H), 1.33-1.34 (m, 2H), 1.33 (s, 6H) ppm.
(実施例66)
シアニンジンジパイン活性プローブ70、71および72の調製
プローブ化合物70は、以下のスキームに従って調製した。
Figure 0007113815000295
プローブ化合物71は、以下のスキームに従って調製した。
Figure 0007113815000296
プローブ化合物72は、以下のスキームに従って調製した。
Figure 0007113815000297
(実施例67)
リシンジンジパインの阻害
リシンジンジパインの活性を阻害する本発明の化合物の能力を、Barret(Biochemical Journal. 1980年、187巻(3号)、909頁)により記載されているものと類似のフルオロジェニックアッセイ(fuluorogenic assay)で測定した。具体的なアッセイ条件は、以下の通りであった。緩衝剤:pH=7.5、100mM Tris-HCl、75mM NaCl、2.5mM CaCl、10mMシステイン、すべてを添加した後に1%DMSO。タンパク質:Pikeら(J. Biol. Chem. 1994年、269巻(1号)、406頁)ならびにPotempaおよびNguyen(Current Protocols in Protein Science. 2007年、21.20.1~21.20.27)により記載されている通り、Porphyromonas gingivalisの培養物から単離した0.1nM Kgp。フルオロジェニック基質:10μMのZ-His-Glu-Lys-MCA。時間=90分間。温度=37℃。各化合物:100μMまたは100nMのいずれかで開始し、それより低い濃度は段階的3倍希釈により生成された、10通りの濃度。各化合物に関する濃度範囲を試験することにより、リシンジンジパインの活性を50%阻害するのに必要な濃度(「IC50」)を決定した。記載されているアッセイ条件下では、シグナル対ノイズ比は優れており、Zファクターは0.6を超えた。表1中の化合物、および以下の表2に示されている化合物を試験した。
カテプシンB、H、K、LおよびSの活性を阻害する本発明の化合物の能力を類似アッセイにおいて測定した。カテプシンBアッセイに、DTT(1mM)およびEDTA(2mM)を含有する酢酸ナトリウム緩衝液(50mM、pH5.5)中のBoc-Leu-Arg-Arg-AMC(20μM)を使用した。カテプシンHアッセイに、DTT(1mM)およびEDTA(2mM)を含有する酢酸ナトリウム緩衝液(50mM、pH5.5)中のL-Arg-AMC(20μM)を使用した。カテプシンKアッセイに、DTT(2.5mM)およびEDTA(1mM)を含有するHEPES緩衝液(50mM、pH7.4)中のZ-Phe-Arg-AMC(10μM)を使用した。カテプシンLアッセイに、DTT(1mM)およびEDTA(2mM)を含有する酢酸ナトリウム緩衝液(50mM、pH5.5)中のZ-Phe-Arg-AMC(20μM)を使用した。カテプシンSアッセイに、DTT(2.5mM)およびNaCl(50mM)を含有する酢酸ナトリウム緩衝液(25mM、pH4.5)中のZ-Leu-Arg-AMC(10μM)を使用した。カテプシンF、VおよびZの活性を阻害する本化合物の能力も測定した。表1中の化合物、および以下の表2に示されている化合物を試験した。
Figure 0007113815000298
本発明の化合物によるKgpおよびカテプシンの阻害に関するIC50値が、表3に示されている。これらの結果より、本発明の化合物および参照化合物73は、Kgp阻害活性に関して同等であり、ナノモル濃度以下のKgp IC50値を有することが示される。驚くべきことに、本発明の化合物は、Kgpに対して優れた選択性を示す。例えば、化合物2に関する、CatHおよびCatS IC50値は、参照化合物73のIC50値よりも10倍超高く、化合物2は、参照化合物73ほど有効なカテプシン阻害剤ではないことを示す。化合物2のCatB IC50値は、参照化合物73のCatB IC50値よりも20倍超高い。化合物2のCatKおよびCatL IC50値は、参照化合物73のIC50値よりも100倍超高い。
カテプシンは、MHC-II媒介性抗原提示、骨の再建、ケラチノサイト分化およびプロホルモン活性化を含めた、いくつかの重要な生理学的過程に関与するリソソームプロテアーゼであるので、化合物のカテプシン阻害活性が低いことは有利である。したがって、本発明の化合物は、対象において内因性カテプシン活性を撹乱することなく、侵襲性P.gingivalisに起因する、対象におけるKgpを選択的に阻害するために使用することができる。
Figure 0007113815000299
Figure 0007113815000300
(実施例68)
本発明の化合物の神経保護作用
13継代のヒト神経芽細胞腫SH-SY5Y細胞を接種し、5%COインキュベーター(Thermal Fisher371)において、2mM L-グルタミン(Invitrogen25030164)、10%熱不活性化ウシ胎児血清(Invitrogen-10099141)および1%ペニシリン-ストレプトマイシン(Pen/Strep;Invitrogen-15140122)を補給した完全培地DMEM/F12(Invitrogen11330-032)中で培養した。手作業でI型コラーゲンによりコーティングした96ウェル黒色/平底プレート(Greiner-655090)中で、細胞を2~4×10個の細胞/ウェル(1~2×10個の細胞/mLを200μl)の密度で播種した。このプレートを37℃でCOインキュベーターにおいてインキュベートした。
ウェル中の細胞培養物が70~80%の集密度(約6×10個の細胞/ウェル)に到達すると、それらに、様々な濃度の試験化合物の存在下、または試験化合物の非存在下で、P.gingivalisを接種した。化合物の保存溶液は、滅菌v底96-ウェルプレート中で、DMSOを用いる段階希釈により調製した(2.8、6.4、3.2、1.6、0.8、0.4、0.2、0.1、0.05および0mg/ml)。次に、保存溶液(6μL)を594μLの完全培地-ペニシリン/ストレプトマイシンを充填した96ディープウェルプレートに移し、さらなる試験のための作業溶液(128、64、32、16、8、4、2、1、0.5および0μg/mL)を得た。
株P.gingivalis ATCC BAA-308を-80℃の保存溶液からブレインハートインフュージョン寒天培地(BHA)(BD-211065)上にストリークした。嫌気性ワークステーション(Shanghaiyuejin、YQX-II)において、このプレートを37℃で72時間、インキュベートした。雰囲気を80% N、10% COおよび10% Hに維持した。試験時に、このプレートを嫌気性ワークステーションから取り出し、周囲雰囲気中で処理した。細菌を収穫して、完全培地-ペニシリン/ストレプトマイシン(ペニシリン/ストレプトマイシンを含まない)中で懸濁させた。懸濁液の濁度をSiemens MicroScan(登録商標)濁度計(Siemens)により、約6×10cfu/mLに等しい0.5に調整した。細菌の懸濁液を完全培地-ペニシリン/ストレプトマイシン中に希釈して、陰性対照として細菌を含まない1つのウェルを含めて、6×10cfu/ml(MOI 1:1000の場合)の最終細菌密度にした。
試験プレート中の細胞を、200μLの完全培地-ペニシリン/ストレプトマイシンにより1回洗浄した。次に、100μLの作業溶液を加えた。このステップの直後に、100μLの細菌懸濁液を加えた。試験化合物の最終濃度は、64、32、16、8、4、2、1、0.5、0.025および0μg/mL(1%DMSOを含む)とした。試験プレートを37℃で5%COインキュベーターにおいて24時間、インキュベートした。
細胞生存率は、AlamarBlue(Invitrogen-527026)を使用して決定した。試験プレート中の細胞を、完全培地-ペニシリン/ストレプトマイシンを使用して2回洗浄し、懸濁液から細菌を除去した。この直後に、マルチピペットを使用して、試験プレートの各ウェルに、220μLのAlamarBlue/培地ミックス(200μLの完全培地-ペニシリン/ストレプトマイシンおよび20μLのAlamarBlueからなる)を加えた。次に、蛍光の低下したAlamarBlueを発色させるため、試験プレートを37℃のCOインキュベーター中でインキュベートし、5~6時間の発色後に、飽和することなく、SpectraMax M2eプレートリーダー(Molecular Devices)を使用して読み取り可能であった。励起および発光波長は、供給業者のマニュアル(Invitrogen)に従い、530nmおよび590nmにそれぞれ設定した。
本発明のKgp阻害剤は、図1に示されている通り、SH-SY5Y神経芽細胞腫細胞をP.gingivalis誘導性細胞死から保護した。
(実施例69)
P.gingivalisによる鉄獲得の阻止
試験日の3日前に、細菌の株を-80℃のグリセロール保存溶液からブレインハートインフュージョン寒天培地(BHA)(BD-211065)プレート上にストリークして、YQX-II嫌気性ワークステーション中、37℃で72時間、インキュベートした。白金耳(Greiner-731175)を使用して単一コロニーをつつき、5mlの滅菌生理食塩水に懸濁させた。この懸濁液の濁度を約2×10cfu/mLに等しい0.2に調整した(Siemens MicroScan濁度計)。次に、この細菌の懸濁液を、試験用培地中で、100×に希釈した。これを接種用娘プレートに使用した。
細菌懸濁液100μlの一定分量を、娘プレートの各ウェルに接種した。各ウェルは約1.0×10cfu/mL細菌、1% DMSOおよび200μLのブルセラブロス(BRU)中で段階希釈した化合物を含んだ。YQX-II嫌気性ワークステーションにおいて、プレートを37℃で、6日間、インキュベートした。鉄獲得の結果は、細菌の色が黒色に変わるのを可視化することによって読み取った。
図2は、本発明の化合物が、参照化合物73と比べて、P.gingivalisの重要な生存機構であるヘモグロビンの破壊および鉄獲得の阻止に約2倍有効であることを示す。
(実施例70)
Kgp阻害剤の薬物動態特性の改善
イソフルラン(2%、800mL/分のO)を使用して、成体Balb/C雄マウス(20~25グラム、Harlan Laboratories、米国)を麻酔した。ブピバカイン/エピネフリンを局所鎮痛に使用し、カルプロフェンを術中/術後の鎮痛に使用した。動物は、定位フレーム(Kopf instruments、米国)に置いた。MetaQuant(MQ)微小透析プローブ(再生セルロース膜、3mmの露出表面、BrainLink、オランダ)を海馬に挿入し、カニューレを頚静脈に挿入した。海馬プローブの先端の座標は以下とした:前後方向(AP)=ブレグマから-3.1mm、側部(L)=正中線から-2.8mm、および前面(V)=硬膜(dura)から-4.1mm、トゥースバー(toothbar)を0mmに設定した。術後、動物をケージに個別に収容し、食物および水を自由摂取させた。
化合物1および参照化合物73を、2% DMSOおよび98%生理食塩水中、2mg/mLで新しく調製し、最終投与濃度10mg/kgとなる、5mL/kgでp.o.投与した。
微小透析サンプリングは、術後1日目に開始した。実験の当日に、可撓性PEEKチューブを用いてプローブを微小潅流ポンプ(Harvard PHD2000シリンジポンプ、Holliston、MA、または類似品)に接続した。微小透析プローブに、147mM NaCl、3.0mM KCl、1.2mM CaCl、1.2mM MgClおよび0.15% BSAを含有するCSFを、0.15μL/分の低流速および0.8μL/分の速度のキャリア流(UP水、0.04%アスコルビン酸および0.15% BSA)で潅流した。自動化フラクションコレクター(820Microsampler、Univentor、Malta)により、微小透析試料を15分間または30分間、300μLまで採集した。安定後に、ベースライン試料の1つを採集し、参照化合物73(10mg/kg;PO)をすべての動物に投与した。試料をさらに8時間、採集した。参照化合物73の投与後、15、30、60、120、240、360、480および720分時に、尾部静脈から血漿も採集した。試料はすべて、-80℃で保管し、Brains On-Lineによる分析に待機させた。実験の完了後、プローブ確認のため、マウスを屠殺して、脳を採集した。
透析物および血漿中の薬物濃度はタンデム型質量(MS/MS)検出を装備したHPLCにより決定した。自動化試料インジェクタ(Sil20ACHT、島津製作所、日本)により、LCシステム(LC20XR、島津製作所、日本)に、なんら試料の事前処理なしで、微小透析試料を注入した。血漿試料を、80%ACNを含有する混合物を用いて沈殿させた。試料を、0.1%ギ酸を含有する水によりさらに希釈した。
クロマトグラフィー分離は、逆相カラム(2.1×50mm、粒子サイズ:2.5μm、Xbridge C8、Waters、米国)で行った。構成成分を、0.1%ギ酸を含有する高純度H2O中の、0.1%ギ酸を含有するアセトニトリルの直線グラジエント(流速0.2mL/分)を使用して分離した。
MS分析は、API4000トリプル四重極検出器およびTurbo Ion Sprayインターフェース(どちらもApplied Biosystems製、米国)からなるAPI4000トリプル四重極システムを使用して行った。アクイジションは、ポジティブイオン化モードで、分析物に対して最適化された設定で行った。機器は、405.2から221.3までの質量トランジッションを使用して、多重反応モニタリング(MRM)モードで操作した。データは、濃度に対する分析物の応答を使用して、Analyst(商標)データシステム(Applied Biosystem)を使用して較正し、定量した。
本発明の化合物により、それぞれ、図3および図4に示される通り、マウスにおいて、血漿中濃度および脳中遊離体濃度の上昇がもたらされる。
(実施例71)
リシンジンジパインの阻害
KgpならびにカテプシンB、H、K、LおよびSに対する本発明の化合物の阻害活性を測定するさらなるアッセイを、実施例66に記載されている通り行った。カテプシンF、VおよびZの活性を阻害する本化合物の能力も測定した。まとめると、実施例66および実施例70の結果は、本明細書に記載されている化合物が、ナノモル濃度およびピコモル濃度のIC50値を示す、Kgpの非常に有効な阻害剤であることを示している。さらに、表4に示されている通り、化合物1、2、7および50を含めたいくつかの化合物は、参照化合物73と比べて、内因性カテプシンよりもKgpに対する選択性が向上していることを示している。化合物18、47、55および69は、特に、参照化合物73と比較して、内因性カテプシンよりもKgpに対してかなり選択的である。
これらの化合物はまた、他の重要な利点を示した。例えば、化合物1、47、48および69は、参照化合物73と比べて、雄のCD-1マウスに投与(10mg/kgでp.o.投与)すると、経口利用率の改善および血漿中濃度の上昇を示した。化合物47および69により、参照化合物73と比べて、脳および脳脊髄液(CSF)中での濃度の上昇がもたらされ、これはアルツハイマー病などの脳状態を処置するのに特に有用であり得る。化合物49を含めた他の化合物は、脳および/または脳脊髄液中での濃度の低下を示した。このような化合物は、歯周病または関節炎などの、脳に影響しない末梢状態を処置するのに有用であり得る。
Figure 0007113815000301
Figure 0007113815000302
(実施例72)
プローブ化合物によるKgp阻害活性の測定。
リシンジンジパイン(Kgp)の活性を阻害する本発明の化合物の能力を、フルオロジェニック基質として10μMのZ-His-Glu-Lys-MCAを使用して、Barret(Biochemical Journal.1980年、187巻(3号)、909頁)によって記載されているものと類似のフルオロジェニックアッセイ(fluorogenic assay)で、37℃で測定した。各化合物に関する濃度範囲を試験することにより、表5に示されている通り、リシンジンジパインの活性を50%阻害するのに必要な濃度(「IC50」)を決定した。
Figure 0007113815000303
(実施例73)
ジンジパイン活性プローブを使用する細菌塗抹の分析。
W83細菌または細菌のW83 Kgpノックアウト株を、37℃で1時間、1μMの活性プローブ15aまたは活性プローブ38aと共にインキュベートした。次に、細菌をペレット化し、20μLのPBS中で再懸濁させ、これをポリ-L-リシンでコーティングしたスライド上に滴下し、この液滴を乾燥させるため、約2時間、室温で暗箱中に維持した。次に、このスライドをPBS中で3回、洗浄した。スライドに、細菌のDNAに対するDAPI染色を含有する封入剤をマウントし、蛍光顕微鏡法で可視化した。W83細菌は、活性Kgpの発現に基づいて、活性プローブ15aまたは活性プローブ38aへの曝露後に蛍光性となる。Kgpノックアウト細菌、および活性プローブへの曝露のない細菌は、青色DAPIの蛍光だけを示し、細菌核の存在が確認される(図5A)。この実施例は、活性プローブが細菌を染色し、Kgpとの特異的な共有結合反応によってその検出が可能となることを実証している。
(実施例74)
ジンジパイン活性プローブを使用する歯肉組織試料の分析。
新しく凍結した歯肉組織のスライド(5ミクロン厚さ)を、-80℃の冷凍庫から取り出し、10分間、室温で解凍した。次に、この組織を加湿チャンバー中、活性プローブ15a(PBS中の1μM)に直ちに浸漬し、このチャンバーを光から覆い、37℃で1時間、インキュベートした。次に、スライドをPBS中で3回、それぞれ5分間、洗浄し、次に、新しい4% PFA中に室温で15分間、固定化し、次に、PBS中で再度、3回洗浄した。次に、スライドを室温で30分間、1×のTrueblack作業溶液(Biotium)と共にインキュベートした。次に、スライドをPBS中で3回洗浄し、DAPIを含有する抗褪色性封入剤をマウントした(図5B)。得られた顕微鏡写真により、ヒト組織試料中の活性Kgpの存在を可視化するため、活性プローブを使用することができることが実証された。
(実施例75)
ジンジパイン活性プローブを使用する感染細胞の分析。
P.gingivalis W83またはW83 Kgpノックアウト株による感染を有するおよび有しないヒトJurkat細胞を、活性プローブ15aに曝露させた。一部の感染細胞は、活性プローブ15aへの曝露前に1時間、非蛍光活性部位のKgp阻害剤である73(N-[7-アミノ-2-オキソ-1-(2,3,5,6-テトラフルオロフェノキシ)ヘプタン-3-イル]シクロペンタンカルボキサミド)と共に事前インキュベートした。図6Aに示されている通り、プローブ15aは、精製Kgpに、およびKgpのサイズに対応する感染細胞中のタンパク質に非可逆的に結合する。P.gingivalis感染細胞中のこの標識タンパク質の同一性は、ウエスタンブロットによって、Kgpであることが確認された。さらに、活性プローブ15aの添加前の、感染細胞との化合物70(N-[7-アミノ-2-オキソ-1-(2,3,5,6-テトラフルオロフェノキシ)ヘプタン-3-イル]シクロペンタンカルボキサミド)の事前インキュベーションにより、プローブ15aがKgpに結合するのを遮断し、これにより、このプローブはKgpに特異的であることが確認された。
Jurkat細胞成長中の細菌の滴定により、感染細胞中のKgpレベルの定量的決定が可能となった(図6B)。この実施例は、Kgpが、細菌および細菌感染細胞において定量的に検出され得ること、ならびにKgpがまた、阻害剤による標的捕捉(target engagement)を測定するために使用することができることを実証している。
(実施例76)
ジンジパイン活性プローブを使用する口腔細胞試料の分析。
滅菌ループを用いていくつかのヒトドナーから採取した口腔細胞を、活性プローブ15a(PBS中1μM)の溶液中で懸濁させた。細胞を37℃で1時間、インキュベートし、ペレット化した。細胞を20μLのPBSに再懸濁させて、ポリ-L-リシンでコーティングしたスライドに置き、洗浄して乾燥させた。DAPIを含有する抗褪色性封入剤をスライドにマウントし、蛍光顕微鏡で可視化した。活性プローブ15aと共にインキュベートした一部の口腔細胞は、顕著な点状染色を示した一方、他のものは示さず(図7)、一部の細胞中のKgpの存在を示している。この実施例は、P.gingivalis、およびKgpの存在が、口内ヒト口腔細胞試料中に検出され得ることを実証している。
(実施例77)
ジンジパインの単離および分析のためのビオチン化活性プローブの使用。
P.gingivalis W83を4℃で15分間、B-Per緩衝液により溶解した。得られた上澄み液に2mMのビオチンKgp活性プローブ51aをスパイクとして添加し、室温で1時間、インキュベートした。5mgのストレプトアビジン-ビーズを、反転プラットフォームで、室温で1時間、すべての試料と共にインキュベートした。ビーズを1時間後に採集し、0.1%SDSと共に100℃で5分間、加熱し、ビオチン-ストレプトアビジン結合を破壊した。得られた上澄み液を、SDS-PAGE、およびCAB102を有するKgpの特異的検出用のウェスタンブロッティング法によって分析した(図8)。この実施例は、ビオチンプローブを活性Kgpの破壊および定量に使用することができることを実証している。
(実施例78)
Cy5活性をベースとするプローブを使用するKgpの検出。
この実施例は、Kgpに非可逆的に結合するCy5コンジュゲートされた活性をベースとするプローブであるプローブ化合物71を利用する、活性Kgpの検出を実証する。このプローブは、Kgp活性部位に結合する弾頭(warhead)、ペプチドをベースとするコアおよび検出用のCy5フルオロフォアを有する。標識された標的タンパク質は、2-Dゲル電気泳動による分画を用いた試料の生化学的分離、ならびに適切な励起および発光波長におけるCy5に由来する蛍光シグナルの検出によって可視化することができる。試験化合物(例えば、候補Kgp阻害剤)へのKgpの結合後の固定濃度のプローブのインキュベーションにより、試験化合物がまだ結合していないKgp活性部位への活性プローブの結合がもたらされる。
P.gingivalis溶解物の調製。10個の細菌を採集して、10分間、4℃で、5000gで遠心分離し、上澄み液を廃棄した。細菌の細胞ペレットを氷上で10分間、1mLのB-Per溶解緩衝液(Thermo Fischer)により溶解し、次に、14000g、4℃で10分間、遠心分離した。上澄み液含有タンパク質の溶解物を採集した。生物学試料を4℃で10分間、B-Per溶解緩衝液により溶解した。
KgpのCy5による直接標識化。生物学試料、P.gingivalis溶解物または精製Kgpを、振盪しながら、37℃で1時間、消光可能なCy5プローブ化合物71(1μM)と共にインキュベートした。次に、試料を、50mMのDTTを含有するNUPAGE LDS試料緩衝液(Thermo Fisher)により、95℃で10分間、変性させて、Criterion4~15%プレキャストゲル(Bio-Rad)およびTris/グリシン/SDS泳動用緩衝液(Bio-Rad)を使用するSDS-PAGE電気泳動に供した。ゲルを75Vで10分間、次に、125Vで1.5時間、泳動させた。次に、ゲルをプラスチック製カセットから取り出し、ChemiDocイメージングシステム(Bio-Rad)によりCy5可視化に供した。
Cy5プローブにより標識したKgpの免疫沈降。試料を、振盪しながら、37℃で1時間、消光可能なCy5プローブ化合物71(1μM)により標識した。Cy5標識Kgpの免疫沈降のために、次に、この試料を4℃で一晩、回転させながら、10μgのウサギポリクローナルCAB102抗体と共にインキュベートした。次に、試料を、室温で20分間、回転させながら、予め洗浄したDynabeadプロテインGビーズと共にインキュベートした。磁気ラックを使用して、試料を200μLの洗浄用緩衝液により4回洗浄した。ビーズを20μLの溶出用緩衝液および10μLのNUPAGE LDS試料緩衝液、50mM DTT中で懸濁させて、70℃で10分間、加熱した。次に、磁気ラックを使用して、免疫沈降したタンパク質を磁気ビーズから溶出した。次に、試料をSDS-PAGE電気泳動に供し、ChemiDocイメージングシステム(Bio-Rad)を使用して、Cy5シグナルを可視化した。
Cy5標識試料のウエスタンブロット解析。Cy5検出によりイメージングした後に、トランスブロットTurboトランスファーシステム(Bio-Rad)を使用して、SDS-PAGEゲルをウエスタンブロット解析に供し、タンパク質をPVDF膜に移動させた。次に、膜を5分間、TBSにより洗浄し、TBST緩衝液中の3%BSAにより、1時間またはそれより長くブロッキングした。次に、ブロットを、ブロッキング用緩衝液中、室温で2時間、または4℃で一晩、一次抗体CAB102と1:1000でインキュベートした。次に、ブロットをTBST緩衝液により3回、それぞれ5分間、洗浄し、次に、TBST中の1:50,000のヤギ抗ウサギIgG吸収HRPコンジュゲート抗体(Thermo Fisher、#31462)と共に、室温で45分間、インキュベートした。次に、ブロットをTBSTで4回洗浄し、SuperSignal West Femto Maximum Sensitivity Substrate(Thermo Fisher)およびChemiDocイメージングシステムを使用して、化学発光イメージングに供した。
結果。プローブ化合物71を使用するKgpの検出は高感度であり、500個のCFUの見かけ検出限界であった。3種の実験によって実証された通り、検出はKgpに特異的であった。第1に、図9A中で示されている通り、野生型のW83 P.gingivalis細菌培養試料では、Kgpタンパク質(50kDaの分子量)の単一バンドの特異的な検出があり、P.gingivalisのKgpノックアウト株に由来する試料では検出がなかった。
第2に、プローブ化合物71によるKgpの標識化は、事前インキュベーションおよびKgp特異的ポリクローナル抗体であるCAB102による免疫枯渇によって特異的に枯渇された。図9Bにおけるレーン1は、プローブ化合物71による野生型P.gingivalisの標識化を示す一方、図9Bにおけるランド(land)2は、ウサギポリクローナル抗体CAB102コンジュゲートビーズによる、標識したKgpの免疫枯渇後の試料分析を示している。レーン1および2には、全試料体積の10分の1を等しくロードした。図9Bのレーン3は、CAB102コンジュゲートビーズからの標識Kgpの溶出を示す。レーン3には、全溶出体積の3分の2をロードした。
最後に、検出は、Kgpに対して選択的であり、かつ相同性アルギニンジンジパインであるRgpを阻害しない濃度の化合物1(100nM)と共に事前インキュベートすることにより完了する。図9Cは、標識アッセイの検出限界を判定するための、様々な濃度の野生型P.gingivalisの標識化および検出を示す。最も高いCFU(コロニー形成単位)試料も、100nMの化合物1と共にインキュベートした。試料は、CAB102抗体によるウェスタンブロッティング法によって、およびCy5シグナルの可視化によって検出した。この最後の研究により、化合物1が、プローブ化合物71と、活性部位への結合をめぐって競合し、このことにより、化合物1などのKgp低分子阻害剤によるKgp標的捕捉のレベルの検出が可能になることが実証される。これらのデータにより、プローブ化合物71による、無傷細菌培養物および精製タンパク質におけるKgpタンパク質の標識化が確立され、かつ化合物により処理された試料における標的捕捉を評価する方法が確立される。
(実施例79)
P.gingivalis感染の複数の態様が、Kgpを阻害することにより処置される。
歯肉炎のモデルとして、数週間にわたりマウスの歯肉に直接適用したP.gingivalisが使用されている。このモデルを使用すると、歯周炎進行の顕著な特徴である、歯槽骨吸収が通常、観察される。さらに最近では、このモデルの使用により、経口での定着と同時に蓄積し、続いて、海馬ニューロンの炎症および喪失などの有害作用を引き起こす、脳中での有意な量のP.gingivalisの発見ももたらされた。以下に記載されている通り、化合物1および本明細書に開示されている他の化合物は、P.gingivalisに感染した対象を処置するために使用した場合、これらの作用を予防することができる。
この研究の開始時に、8週齢のBALB/C雌マウスに、飲用水中の抗生物質(0.87mg/mLのスルファメトキサゾルム(sulfamethoxazolum)、0.17mg/mLのトリメトプリム(trimethoprimum))を10日間、摂取させて、実験感染からのマイクロバイオーム保護を低下させた。実験的歯周炎は、結紮糸の留置、その後のP.gingivalisへの複数回の曝露により誘導した。結紮手順の間に、マウスに、ケタミン(200mg/kg)およびキシラジン(10mg/kg)の腹腔内注射により麻酔をかけ、眼は軟膏剤(Puralube Vet;Pharmaderm、Melville、NY)で潤滑させた。次に、5-0のシルク製結紮糸(Roboz Surgical Instrument Co.)を、上顎の左および右の2番目の臼歯の周辺で結んだ。縫合糸を適用して、緩やかに結び、歯周組織への損傷を防止した。結紮糸は、全実験期間中、定位置に放置して、炎症が、結紮糸内の細菌の定着によって絶えず誘導され得るようにした。
マウス(n=8~10/群)を、6週間、1日おきに感染させた。感染のために、上顎の頬側面に細菌溶液100μLを局所的に施用した。細菌の調製のために、P.gingivalis W83(ATCC、Rockville、MD)を、トリプチックソイブロス(TSB)寒天プレート(0.5mg/mL L-システイン、5μg/mLへミンおよび0.5μg/mLビタミンKを補給した5%ヒツジ血液)上にストリークして、嫌気性条件下、37℃で5~7日間、成長させた。次に、対数中期(OD600=0.5~0.7)まで、ヘミン、ビタミンKおよびL-システインを含むTSB(TSB-HKC)中で、試料に接種した。細菌をPBS中で洗浄し、PBS+2%メチルセルロース(CMC)中で、1×1010個細胞/mLの最終濃度で調製した。
マウスには、5週間(36~70日目)、ビヒクルまたは化合物1を摂取させた。化合物1は、PBS中、3、10または30mg/kgで、b.i.d.で口腔に経口投与した。ビヒクル処置動物には、PBSだけを摂取させた。5週間時点で、処置の開始前のベースライン測定値を集めるため、動物の亜群(n=16)を安楽死させた。10週間後、マウスを安楽死させて、脳、血清および上顎組織を採取して、液体窒素中で凍結させた。
OsiriX MDソフトウェア(PixmeoSARL、Bernex、スイス)を使用して、上顎の骨量減少をex vivoで盲検測定した。測定点は、3D多断面再構成(MPR)図を使用して取得し、この場合、第1の臼歯の前根の接線で、上顎を第2の臼歯の表在根および第1の臼歯の後根に沿って真っ直ぐにスライスした。セメントエナメル境(CEJ)と歯槽骨頂(ABC)との間の距離は、CEJから、第2の臼歯の両側の各々の表在根に垂直に置かれるABC上の基準線までを測定した。図10は、ビヒクルまたは化合物1により処置されたマウスにおける、10週のエンドポイントにおける感染誘導性の歯槽骨量の減少を示している(###p<0.0001)。骨量減少は、5~10週目の間の化合物1(30mg/kgまたは10mg/kg)による処置によって改善された。3mg/kgの化合物1による処置によって、改善の方向に向かったが、ビヒクル処置マウスより有意な改善をもたらさなかった。(ANOVA:F(5,24)=15.71、p<0.0001;ボンフェローニ補正によるt検定:**p<0.005、***p<0.001)。
製造業者のプロトコールに従い、DNeasyBLOOD&TISSUE KIT(Qiagen、ドイツ)を使用して、脳組織からDNAを抽出した。フォワードおよびリバースプライマー(それぞれ、5’-AGCAACCAGCTACCG-TTTAT-3’および5’-GTACCTGTCGGTTTACCATCTT-3’)ならびに検出用プローブ(6-FAM-TACCATGTTTCGCAGAAGCCCTGA-TAMRA)により、Bio-Rad CFX96 Real-Time System C1000 Touch ThermalCyclerで、カッパプローブ高速型qPCR Mix(Rox Low)を用いて、Taqman qPCRを行った。プライマーは、P.gingivalisアルギニン特異的システインプロテイナーゼ遺伝子の単回コピーに基づいた。二連の試料を、100ngのテンプレート脳ゲノムDNA溶液、TaqMan Universal PCR Master Mix(2×)(Kapa Biosystems、米国)、ならびにフォワードおよびリバースプライマーの場合、562.5nMに相当し、プローブプライマーの場合、100nMに相当する、特定の一組のプライマー(最終濃度5μM)およびプローブ(最終濃度4μM)(GenoMed、ポーランド)を含有する全体積10μL中でアッセイした。50℃で2分間の初期インキュベーションステップ、および95℃で20秒間の変性後に、40回のPCRサイクル(95℃で20秒間、60℃で30秒間)を行った。P.gingivalisゲノムのコピーの数は、Cq値と、培養したP.gingivalis W83(WT)の段階希釈から調製した標準曲線とを一致させることにより算出した。図11に示されている通り、P.gingivalis特異的RgpB遺伝子の有意なコピー数が、5および10週間の感染後に、脳組織中で見出された。30mg/kgの化合物1による、5~10週目の間の処置により、DNAのコピー数は約80%低下した(***p<0.001)。10mg/kgまたは3mg/kgによる処置により、コピー数は約50%低下した(**p<0.01、***p<0.001)。ANOVA:F(6,59)=23.31、p<0.0001;ボンフェローニ補正によるt検定。
GAD67に陽性である介在ニューロンの定量は、CellSens1.5ソフトウェアで行った。門の領域は、開口側上の直線によってつながる歯状回のブレード(blade)間の領域として定義した。海馬を通る40番目毎の区分の細胞数を計数した。図12に示される通り、歯状回におけるGAD67にポジティブな介在ニューロンの定量により、10週間時において、モック感染対照と比べて、感染マウスにおける介在ニューロンの約25%の喪失が明らかになった(p<0.05)。対照的に、化合物1により処置されたマウスにおけるGAD67細胞は、モック感染マウスにおける、GAD67細胞と同じレベルにあった。結果は図12にあり、組織体積あたりの細胞数として表されている。
まとめると、この実施例における結果は、化合物1が、歯槽骨量の減少、脳組織における細菌レベル、および海馬ニューロンの喪失を含めた、P.gingivalis感染の複数の態様を処置することを示している。化合物1は、関連研究において、脳abeta42の誘導および神経炎症を軽減することも観察された。本明細書において開示されている化合物は、Kgpを阻害することによって、P.gingivalis感染自体、ならびに神経学的疾患および他の感染関連状態の有害作用を処置することができる。
上述は、明確さおよび理解を目的として、例示および実施例によってある程度詳細に記載されたものであるが、当業者は、添付の特許請求の範囲内で、ある種の変更および修正を行うことができることを認識するであろう。さらに、本明細書において提示されているそれぞれの参考文献は、それぞれの参考文献が個々に参照により組み込まれているのと同じ程度に、その全体が参照により組み込まれている。

Claims (21)

  1. 式I:
    Figure 0007113815000304

    による化合物またはその薬学的に許容される塩[式中、
    Aは、-CHであり
    1aおよびR1bは、それぞれ水素であり
    2aおよびR2bは、それぞれ水素であり
    は、
    (i)シクロペンチルフェニルおよびピリジニルからなる群から選択され、
    それらはそれぞれ、1つまたは複数のR3a置換基により必要に応じて置換されており、
    3aはそれぞれ、ハロゲン、-N 、C 1~4 アルキル、C 1~4 ハロアルキル、C 1~4 アルコキシ、C 1~4 ハロアルコキシ、-N(R 、-N (R および-NR C(O)R からなる群から独立して選択される;または
    (ii)C 1~4 アルコキシにより置換されているC 3~8 アルキルであり、
    は、水素であり
    は、-CH5a および-CHS(O)(R5b らなる群から選択され、
    5aは、-O-R、-S-R、-SO-R、-SO-R、-N(R、5~12員のヘテロアリールおよび3~12員のヘテロシクリルからなる群から選択され、
    5~12員のヘテロアリールは、ハロゲン、C1~3アルキルおよびC1~3ハロアルキルからなる群から独立して選択される1つまたは複数のメンバーにより必要に応じて置換されており、
    3~12員のヘテロシクリルは、オキソ、ハロゲン、C1~3アルキルおよびC1~3ハロアルキルからなる群から独立して選択される1つまたは複数のメンバーにより必要に応じて置換されており、
    5bはそれぞれ、独立して選択されるC1~6アルキルであり、
    およびR1~6アルキル、C1~6ハロアルキルおよび5~12員のヘテロアリールからなる群から選択され
    5~12員のヘテロアリールは、1つまたは複数のハロゲン、C1~3アルキルまたはC1~3ハロアルキルにより必要に応じて置換されており、ならびに
    はそれぞれ、独立して選択されるC1~6アルキルであ]。
  2. が、シクロペンチルおよびフェニルからなる群から選択され、それらはそれぞれ、1つまたは複数のR3a置換基により必要に応じて置換されている、請求項1記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
  3. がシクロペンチルである、請求項1に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
  4. がメトキシプロピルである、請求項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
  5. 式Ia:
    Figure 0007113815000305

    による構造を有する、請求項1からのいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
  6. が-CH5aであり、R5aが-O-Rであり、RがC1~6ハロアルキ
    ルである、請求項1から5のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
  7. が-CH5aであり、R5aが、-O-Rであり、Rが、ハロゲンおよびC1~3アルキルからなる群から独立して選択される1つまたは複数のメンバーにより必要に応じて置換されている5~12員のヘテロアリールである、請求項1から5のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
  8. 5aが、-N(R、5~12員のヘテロアリールおよび3~12員のヘテロシクリルからなる群から選択され、
    5~12員のヘテロアリールが、ハロゲン、C1~3アルキルおよびC1~3ハロアルキルからなる群から独立して選択される1つまたは複数のメンバーにより必要に応じて置換されており、
    3~12員のヘテロシクリルが、オキソ、ハロゲン、C1~3アルキルおよびC1~3ハロアルキルからなる群から独立して選択される1つまたは複数のメンバーにより必要に応じて置換されている、
    請求項1から5のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
  9. が、-CH5aおよび-CHS(O)(R5bからなる群から選択され、
    5aが、-S-Rおよび-S-(O)からなる群から選択され、
    が、C1~6アルキル、C1~6ハロアルキル、5~12員のヘテロアリールおよび3~12員のヘテロシクリルからなる群から選択される、
    請求項1から5のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
  10. (i)R が、-CH 5a であり、および
    5a が、テトラゾリル、6-オキソピリミジン-1(6H)-イル、ジメチルアミノ、2,2,2-トリフルオロエトキシ、1,1,1,3,3,3-ヘキサフルオロイソプロポキシ、イソオキサゾール-3-イルオキシ、ピリジン-3-イルオキシ、ピリジン-4-イルオキシ、2,6-ジメチルピリジン-5-イルオキシ、2-メチルピリミジン-5-イルオキシ、メチルチオ、イソオキサゾール-3-イルチオ、ピリジン-3-イルチオ、ピリジン-4-イルチオ、2,6-ジメチルピリジン-5-イルチオ、および2-メチルピリミジン-5-イルチオである、または
    (ii)R が、-CHS(O)(R 5b であり、および
    5b のそれぞれが、メチルである、
    請求項1から5のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
  11. Figure 0007113815000306
    Figure 0007113815000307
    Figure 0007113815000308

    からなる群から選択される、請求項1に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
  12. Figure 0007113815000309
    Figure 0007113815000310
    Figure 0007113815000311

    からなる群から選択される、請求項1に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
  13. 請求項1から12のいずれか一項に記載の化合物またはその薬学的に許容される塩、および薬学的に許容される添加剤を含む医薬組成物。
  14. P.gingivalis感染に関連する疾患または状態を処置するための、請求項1から12のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩を含む組成物であって、
    前記疾患または状態が、脳障害、歯周病、糖尿病、心血管疾患、関節炎、関節リウマチ、骨関節炎、感染性関節炎、乾癬性関節炎、早産のリスク上昇、肺炎、がん、腎臓疾患、肝疾患、網膜障害および緑内障からなる群から選択され、
    前記組成物は、前記化合物もしくは前記その薬学的に許容される塩の有効量で前記対象に投与されることを特徴とする、組成物。
  15. 前記疾患または状態が脳障害である、請求項14に記載の組成物。
  16. 前記脳障害が、アルツハイマー病、ダウン症候群、てんかん、自閉症、パーキンソン病、本態性振戦、前頭側頭型認知症、進行性核上麻痺、筋萎縮性側索硬化症、ハンチントン病、多発性硬化症、軽度認知障害、加齢関連性記憶障害、慢性外傷性脳症、脳卒中、脳血管疾患、レビー小体病、多系統萎縮症、統合失調症およびうつ病からなる群から選択される、請求項14に記載の組成物。
  17. 前記組成物が、コリンエステラーゼ阻害剤、セロトニンモジュレーター、NMDAモジュレーター、Aβ標的治療剤、ApoE標的治療剤、ミクログリア標的治療剤、血液脳関門標的治療剤、タウ標的治療剤、補体標的治療剤および抗炎症剤からなる群から選択される1つまたは複数の活性剤と組み合わせて前記対象に投与されることを特徴とする、請求項15に記載の組成物。
  18. 前記組成物が、少なくとも1カ月間、または少なくとも1年間、または少なくとも10年間、前記対象に投与されることを特徴とする、請求項14から17のいずれか一項に記載の組成物。
  19. 前記対象が、ヒト、イヌまたはネコであることを特徴とする、請求項14から18のいずれか一項に記載の組成物。
  20. リシンジンジパインを阻害するための、請求項1から12のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩を含む組成物。
  21. リシンジンジパインを阻害するためのインビトロの方法であって、リシンジンジパインを請求項1から12のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩の有効量と接触させることを含む、方法。
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