JP7100629B2 - 化学修飾されたカプシドを有するraav - Google Patents
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Description
カプシドタンパク質に含まれる1以上の第一級アミノ基を有するアデノ随伴ウイルス(AAV)粒子を用意する工程、及び
上記AAV粒子を次の式(II)の試薬
B-N=C=S (II)
(式中、Bは、(L)m(X)Ar-基であり、
Lは本明細書の以降で定義する通りであり、
mは1~1000の整数を表し、
Arは、アリーレン又はヘテロアリーレン基を表し、特に本明細書の以降で定義する通りであり、
Xは結合又は上記リガンドLとArとの間のスペーサーを表す。)と、第一級アミノ基を式(II)の試薬の-N=C=S基と反応させるのに適した条件下で、接触させる工程
を含む方法に関する。
別途記載しない限り、本明細書で用いるすべての用語は当業者が理解するものと同じ意味を有し、本発明の実施に際しては、当業者の技術的知識の範囲内の分子生物学、ウイルス学及び組換えDNA技術の慣用技術が用いられる。
あらゆる組換えアデノ随伴ウイルスを本発明で実施し得る。
カプシドは、天然のままの又は天然のものではないアミノ基を含んでいてもよい。カプシドの表面に存在するアミノ基は化学カップリングに関与する。
本発明は、AAVカプシドの表面に存在する第一級アミノ基にリガンドLを共有結合でグラフトさせることによってAAVカプシドを化学修飾するための新規な方法を提供する。
・ハロゲン原子は、フッ素原子、塩素原子、臭素原子又はヨウ素原子であり、特にハロゲン原子はフッ素原子である。
・アルキル基は、別途記載しない限り、炭素原子数1~5の直鎖又は枝分れ飽和脂肪族基でる。具体例としては、メチル、エチル、プロピル、イソプロピル、ブチル、イソブチル、tert-ブチル及びペンチル基が挙げられる。
・アルコキシ基は、-O-アルキルの基であり、アルキル基は上記で定義した通りであり、特にアルキル基はメチル又はエチルである。
本明細書で用いる「カップリング」という用語は、AAV粒子の表面に存在する第一級アミノ基の、共有結合が形成される状態での第一級アミノ化学修飾をいう。カップリングは、AAV粒子の構造的完全性及びそれらのコアタンパク質機能が維持される手順をいう。カプシドの表面のある種の第一級アミノ基だけが修飾される。
第1の実施形態では、化合物3を工程(iii)で、溶媒(例えばDMF)中で1,1’-チオカルボニルジ-2(1H)-ピリドンと反応させると、化合物4を得ることができる。得られた化合物4を、次の工程(iv)で、溶媒(例えばDMF)中、例えば40~100℃の範囲内の温度(例えば60℃)で、好ましくは不活性雰囲気下、特に窒素雰囲気下で、p-フェニレンジアミンと反応させると、化合物5を得ることができる。
第2の実施形態では、化合物3を、工程(vi)で、溶媒(例えばDMF)中で、例えば室温で、好ましくは不活性雰囲気下、特に窒素雰囲気下でp-フェニレンジイソチオシアネートと反応させると、化合物6を得ることができる。
本発明に係る組換えアデノ随伴ウイルス(rAAV)ベクター粒子の製造方法によって得られる組換えアデノ随伴ウイルス(rAAV)ベクター粒子も本発明の一部をなす。
・AAV2による肝細胞形質導入は、ヒトを含むすべての哺乳動物で低い。
・治療効果を達成するには高用量のベクター(1kg当たり約1012個のAAV2粒子)を注射することが必要とされるが、この用量は治療効果に有害な免疫毒性を生じかねない。
・肝細胞だけでなく、肝臓の最大30%を示す肝臓細網内皮系区画の他の細胞型もAAV2によって形質導入されてしまう。このような形質導入プロファイルの「分散」は、AAVの治療指数を低下させる。
・AAV2の全身注射はT細胞反応を誘導又は活性化し、結局は形質導入細胞の排除を招く。
・人口の80%以上がAAV2に対する中和抗体を有しているため、大量のウイルス粒子を投与しない限り、効率的な形質導入ができない。
すべての化学試薬はAcros Organics社又はAldrich社から購入し、それ以上精製せずに使用した。AAVカプシドタンパク質(B1)、ウサギポリクローナル及びマウスモノクローナルA20は、PROGEN Biotechnik社から入手した。フルオレセイン標識化合物を検出するためのAnti-Fluorescein-AP,Fabフラグメント(Sigma-Aldrich社)はRoche社から入手した。FITC-大豆凝集素(SBA)は、Vector laboratories社から購入した。無水条件を必要とする反応は窒素下で実施した。すべての化合物は、1H(400.133又は300.135MHz)、13C(125.773又は75.480MHz)NMR分光法(Bruker Avance 300 Ultra Shield又はBruker Avance III 400分光計)によって十分に特性解析した。ケミカルシフトはppm単位で記載し、カップリング定数はHz単位で記載する。以下の略語を使用した:s=シングレット、d=ダブレット、t=トリプレット、q=カルテット、クイン=クインテット、br=ブロードシングレット。必要に応じて、13C異種核HMQC及びHMBCを用いて、構造を明確にした。高分解能マススペクトル(HRMS)は、ThermofisherハイブリッドLTQ-オービトラップ分光計(ESI+)及びBruker Autoflex III SmartBeam分光計(MALDI)を用いて記録した。
-[1]Rensen PC et al. “Design及びsynthesis of novel N-acetylgalactosamine-terminated glycolipids for targeting of lipoproteins to the hepatic asialoglycoprotein receptor”. Journal of medicinal chemistry. 2004;47:5798-808、及び
-[2]Rajeev KG, et al. “Inhibitory RNA interference agents modified with saccharide ligands”国際公開第2012037254号、2012。
-[3]Chevolot Y, et al. “DNA-Based Carbohydrate Biochips: A Platform for Surface Glyco-Engineering”. Angewandte Chemie International Edition, 2007;46:2398-2402。
-[4]Nagarajan, K., et al. “Quest for anthelmintic agents. Part I. Para substituted phenylisothiocyanates, heterocyclylisothiocyanates and bisisothiocyanates,”. Indian Journal of Pharmaceutical Sciences, 48(3), 53-9; 1986。
化合物3:1H NMR(MeOD):2.0(s,3H,NAc),2.79(t,2H,CH2NH2,JH-H=5.2Hz),3.4-4.0(m,16H,CH2O,H-2,H-3,H-4,H-5,H-6),4.44(d,1H,H-1,J1-2=8.4Hz);13C NMR(MeOD):23.1,42.1,54.3,62.6,69.7,69.8,71.3,71.5,71.6,73.5,73.6,76.8,103.1,174.2;C14H29N2O8のHRMS(MALDI)[M+H]+,理論値:353.1924、実測値:353.1918。
化合物4:1H NMR(MeOD):2.0(s,3H,NAc),3.4-4.0(m,19H,CH2O,CH2NCS,H-2,H-3,H-4,H-5,H-6),4.44(d,1H,H-1,J1-2=8.4Hz);13C NMR(MeOD):23.1,46.3,54.3,62.6,69.7,69.8,70.5,71.5,71.6,73.5,73.6,76.8,103.1,133.2,174.2;C15H26N2O8NaSのHRMS(MALDI)[M+Na]+,理論値:417.1308、実測値:417.1318。
化合物4(50mg、0.13mmol)を乾燥DMFに溶解し、次いでp-フェニレンジアミン(28mg、0.26mmol)を添加し、反応液をN2雰囲気下70℃で一晩撹拌した。溶液を次いで減圧下で蒸発させ、フラッシュクロマトグラフィーで精製した(DCM/MeOH:100/0~80/20)。(収率:化合物5=74%)。
化合物5:1H NMR(MeOD):1.97(s,3H,NAc),3.4-4.0(m,17H,CH2O,H-2,H-3,H-4,H-5,H-6),4.43(d,1H,H-1,J1-2=8.4Hz),6.72(d,2H,JH-H=8.8Hz),6.98(d,2H,JH-H=8.8Hz);13C NMR(MeOD):23.1,45.4,54.4,62.6,69.7,69.8,70.4,71.4,71.5,71.6,73.4,76.8,103.1,2×116.9,2×128.1,128.3,148.3,174.1,182.4;C21H35N4O8SのHRMS(MALDI)[M+H]+,理論値:503.2176、実測値:503.2171。
化合物6:1H NMR(MeOD):1.99(s,3H,NAc),3.4-4.0(m,17H,CH2O,H-2,H-3,H-4,H-5,H-6),4.42(d,1H,H-1,J1-2=8.4Hz),7.24(d,2H,JH-H=8.8Hz),7.54(d,2H,JH-H=8.8Hz);13C NMR(MeOD):23.2,45.4,54.3,62.6,69.7,69.9,70.3,71.4,71.5,71.6,73.4,76.8,103.2,2×125.8,2×127.1,128.5,136.6,139.8,174.2,182.5;C22H33N4O8S2のHRMS(MALDI)[M+H]+,理論値:545.1740、実測値:545.1742。
化合物3(64mg、0.18mmol)を乾燥DMFに溶解し、次いでp-フェニレンジイソチオシアネート(175mg、0.9mmol)を添加し、反応液をN2雰囲気下20℃で2時間撹拌した。溶液を次いで減圧下で蒸発させ、フラッシュクロマトグラフィーで精製した(DCM/MeOH:100/0~80/20)。(収率:化合物6=85%)。
化合物6:1H NMR(MeOD):1.99(s,3H,NAc),3.4-4.0(m,17H,CH2O,H-2,H-3,H-4,H-5,H-6),4.42(d,1H,H-1,J1-2=8.4Hz),7.24(d,2H,JH-H=8.8Hz),7.54(d,2H,JH-H=8.8Hz);13C NMR(MeOD):23.2,45.4,54.3,62.6,69.7,69.9,70.3,71.4,71.5,71.6,73.4,76.8,103.2,2×125.8,2×127.1,128.5,136.6,139.8,174.2,182.5;C22H33N4O8S2のHRMS(MALDI)[M+H]+,理論値:545.1740、実測値:545.1742。
化合物8:1H NMR(MeOD):1.19(t,3H,CH3,JH-H=7.2Hz),1.93(s,3H,OCH3),1.94(s,3H,OCH3),2.03(s,3H,OCH3),2.14(s,3H,NAc),3.5-4.2(m,14H,CH2O,H-2,H-5,H-6),4.67(d,1H,H-1,J1-2=8.4Hz),5.04(dd,1H3,J3-4=3.2Hz,J3-2=11.2Hz),5.33(d,1H-4,J3-4=3.2Hz);13C NMR(MeOD):15.4,20.5,2×20.6,22.9,51.6,54.8,62.7,67.6,68.2,70.0,70.9,71.6,71.8,72.3,102.8,171.7,2×172.1,173.5;C20H34NO11のHRMS(MALDI)[M+H]+,理論値:464.2132、実測値:464.2141。
化合物9:1H NMR(MeOD):1.2(t,3H,JH-H=6.8Hz),1.99(s,3H,NAc),3.4-4.0(m,16H,CH2O,H-2,H-3,H-4,H-5,H-6),4.45(d,1H,H-1,J1-2=8.4Hz);13C NMR(MeOD):15.4,23.1,54.3,62.6,67.6,69.7,69.8,71.0,71.6,71.7,73.6,76.8,103.1,174.2;C14Η28ΝO8のHRMS(MALDI)[M+H]+,理論値:338.1815、実測値:338.1819。
化合物12:1H NMR(MeOD):1.99(s,9H,NAc),2.79(t,6H,CH2CO,JH-H=6Hz),3.22(s,2H,CH2NH2),3.4-4.0(m,66H,CH2O,H-2,H-3,H-4,H-5,H-6),4.44(d,3H,H-1,J1-2=8.4Hz),13C NMR(MeOD):3×23.1,3×37.6,3×40.4,45.7,3×54.3,61.2,3×62.6,3×68.0,3×69.7,3×69.8,3×70.2,3×70.7,3×71.4,3×71.5,3×71.6,3×73.5,3×76.8,3×130.1,3×174.0,3×174.1,175.35;C57H105N8O31のHRMS(MALDI)[M+H]+,理論値:1397.6886、実測値:1397.6803。
化合物13:1H NMR(MeOD):2.00(s,9H,NAc),2.46(t,6H,CH2CO,JH-H=6Hz),3.30-4.20(m,66H,CH2O,H-2,H-3,H-4,H-5,H-6),4.28(s,2H,CH2NH2),4.46(d,3H,H-1,J1-2=8.4Hz),7.29(d,2H,JH-H=9Hz),7.60(d,2H,JH-H=9Hz);C65H108N10O31NaS2のHRMS(MALDI)[M+Na]+,理論値:1611.6521、実測値:1611.6487。
化合物16:1H NMR(MeOD):2.80(t,2H,CH2NH2,JH-H=5.4Hz),3.5-4.0(m,16H,CH2O,H-2,H-3,H-4,H-5,H-6),4.81(d,1H,H-1,J1-2=1.8Hz);C12H26NO8のHRMS(MALDI)[M+H]+,理論値:311.1603、実測値:311.1600。
化合物17:1H NMR(MeOD):3.5-4.0(m,18H,CH2O,CH2N,H-2,H-3,H-4,H-5,H-6),4.82(d,1H,H-1,J1-2=1.8Hz);7.26(d,2H,JH-H=8.8Hz),7.52(d,2H,JH-H=8.8Hz);C20H29N3O8NaS2のHRMS(MALDI)[M+Na]+,理論値:526.1302、実測値:526.1294。
化合物18:1H NMR(DMSO):1.79(s,3H,NAc),3.2-4.6(m,18H,CH2O,H-2,H-3,H-4,H-5,H-6),4.28(d,1H,H-1,J1-2=8.4Hz),7.07(d,1H,JH-H=7.5Hz),7.16(d,1H,JH-H=8.1Hz),7.60(m,NH),7.86(t,1H,JH-H=8.1Hz);C21H32N5O8S2のHRMS(MALDI)[M+H]+,理論値:546.1697、実測値:546.1692。
化合物19:1H NMR(DMSO):1.80(s,3H,NAc),3.2-4.6(m,18H,CH2O,H-2,H-3,H-4,H-5,H-6),4.29(d,1H,H-1,J1-2=8.4Hz),7.6-8.1(m,8H,6Harom,2NH),9.83(m,1H,NH);C26H34N4O8NaS2のHRMS(MALDI)[M+Na]+,理論値:617.1717、実測値:617.1716。
化合物22:1H NMR(MeOD):1.19(t,3H,JH-H=6.9Hz),3.4-4.0(m,16H,CH2O,H-2,H-3,H-4,H-5,H-6),4.79(d,1H,H-1,J1-2=1.8Hz);C20H29N3O8NaS2のHRMS(MALDI)[M+Na]+,理論値:526.1302、実測値:526.1294。
2.1.AAV2の生産と精製
AAV2ベクターは、AAV Rep2-Cap2及びアデノウイルスヘルパー遺伝子(E2A、VA RNA及びE4)をコードするpHelper,PDP2-KANA並びにpVector ss-CAG-eGFPの2つのプラスミドから生産した。すべてのベクターは、リン酸カルシウム-HeBS法を用いたHEK293細胞の一過性トランスフェクションによって生産した。トランスフェクションして48時間後に、ベクターで生成した細胞を収集し、まず37℃で1時間1%Triton及びベンゾナーゼ(25U/mL)で処理した。37℃で1時間インキュベートした後、バルクを2000rpmで20分間遠心分離し、凍結融解サイクルに付してベクター粒子を遊離させた。細胞残渣を2500rpmで15分間遠心分離して除去した。細胞溶解物をPEGで一晩沈殿させ、4000rpmで1時間遠心分離して清澄化した。次いで沈殿をベンゾナーゼと37℃で30分間インキュベートし、4℃で10分間10000gで遠心分離した後に回収した。ベクターを二重塩化セシウム(CsCl)勾配超遠心分離によって精製した。次いで、ウイルス懸濁液を、Slide-a-Lyzerカセット(Pierce社)で、若干撹拌しながらdPBS(Ca++及びMg++を含有する)に対して4回続けて透析した。
下記の式のフルオレセインイソチオシアネート(FITC)(発明外)、化合物6(本発明)、化合物9(比較)、化合物13(本発明)、化合物16(比較)、化合物17(本発明)、化合物18(本発明)、化合物19(本発明)又は化合物22(比較)を含有するTRIS緩衝液pH9.3の溶液に、AAV2-GFP(1E12vg、2.49nmol)を様々なモル比(3E5~1.5E7当量)で添加し、20℃で4時間インキュベートした。次にベクターを含む溶液をdPBS+0.001%Pluronicに対して透析して、AAVカプシドに結合していない遊離分子を除去した。
ベクターサンプル中の残留DNAを除去するため、3μLのAAV2又は化学修飾AAV2を37℃で45分間20単位のDNaseI(Roche社#04716728001)で処理した。DNaseI処理後、20μLのプロテイナーゼK 20mg/mL(MACHEREY-NAGEL社#740506)を加え、70℃で20分間インキュベートした。精製AAVベクターからのDNAの抽出には、抽出カラム(NucleoSpin(商標)RNA Virus)を使用した。
定量リアルタイムPCR(qPCR)は、StepOnePlus(商標)Real-Time PCR System Upgrade(Life Technologies社)を用いて実施した。すべてのPCRは、プライマー、プローブ、PCR Master Mix(タカラバイオ(株))及び5μLの鋳型DNA(プラスミド標準、又はサンプルDNA)を含む20μLの最終体積のPCRで行った。qPCRは、95℃で20秒間の初期変性工程、次いで95℃で1秒間の変性と56℃で20秒間のアニーリング/伸長の45サイクルで行った。Sca-I制限酵素で線状化したプラスミドpTR-UF-11(ATCC(登録商標)MBA-331(商標))の7回連続希釈したもの(108~102コピーのプラスミドを含む)を用いてプラスミド標準を生成した。
すべてのベクターを、Laemmliサンプル緩衝液を用いて100℃で5分間変性させ、SDS-PAGE 10%Tris-グリシンポリアクリルアミドゲル(Life Technologies社)で分離した。Precision plus Protein All Blue Standards(Bio-Rad社)を分子量サイズマーカーとして用いた。Trans-Blot SD Semi-Dry Transfer Cell(Bio-Rad社)において、トランスファー緩衝液(25mM Tris/192mMグリシン/0.1(w/v)SDS/20%MeOH)を用いて150mAで1時間タンパク質をニトロセルロースメンブレンに移動させた後、室温で2時間、メンブレンをPBS-Tween中の5%セミスキムミルク(0.1%)又はPBS-Tween中の1%ゼラチン、0.1%Igepal(0.01%)で飽和させた。飽和後、メンブレンを、AAV2及び化学修飾AAV2に対する抗血清(ポリクローナル、B1モノクローナル又はAnti-Fluorescein-AP)で或いはFITC-大豆凝集素又はFITC-コンカナバリンAで4℃で一晩プローブした。各段階の間に3回洗浄を行い、未結合の試薬をPBS-Tween(0.1%)で室温で15分間除去した。バンドは、アルカリホスファターゼ(AP)又はホースラディッシュペルオキシダーゼ(HRP)結合二次抗体を用いて化学発光によって可視化し、X線フィルムに撮像した。
PBSに短時間浸漬したニトロセルロース紙上に非変性AAV2及び化学修飾AAV2を付着させてから、ドットブロットマニホールド(Bio-Rad社)を組み立てた。ニトロセルロースメンブレンはウエスタンブロッティングと同様に処理した。
DLSはMalvern社製Zetasizer Nano ZSを用いて行った。キャリブレーションは、30及び300nmのNanospereサイズ標準溶液を用いることによって予め制御した。各50μLのベクターをMalvern社製の専用キュベットDTSO118に入れ、容量分析した。
マウス及びヒト初代培養肝細胞及び培地は、BIOPREDIC International社(フランス国レンヌ)から購入した。マウス及びヒト肝細胞を、24ウェルプラスチック表面に約2.5E5細胞/ウェルの密度で播種した。受領後、細胞培養培地を除去して、添加物(ADD222)を含む1mL基本培地(MIL600)と交換し、37℃-5%CO2中で2時間インキュベートした。実施例に示すように、マウス又はヒト初代培養肝細胞を、0.5mL培地中のAAV3b、AAV2又は化学修飾AAV2ベクターによって1E5のMOIで形質導入した。形質導入して6時間後に、0.5mLの新鮮培地を各ウェルに添加した。すべてのAAVベクターはGFPをコードしていた。培養プレートを37℃、5%CO2で48時間インキュベートしてから、GFP陽性細胞のフローサイトメトリー分析に付した。細胞をトリプシン-EDTA(Sigma-Aldrich社)で剥がし、4%パラホルムアルデヒドで固定し、BD-LSRII Flow Cytometer(BD Bioscience社)で分析した。すべてのデータはFlow Jo(V10;Flowjo社(米国オレゴン州アシュランド))で処理した。
成体オスのSprague-Dawleyラットに、AEV2対照又は化学修飾ベクターのいずれかを1E12vg/mLの濃度で含有する2.5μlの溶液を網膜下注射した。すべての動物で両側に、すなわち一方の眼にAAV2対照を、反対側の眼に化学修飾AAV2+17ベクターを注射した。2群の動物(1群当たりn=8)を使用し、1つの群はAAV2対照対AAV2+17を3E5当量で注射し、2番目の群はAAV2対照対AAV2+17を3E6当量で注射した。眼底でのGFP発現による蛍光を追跡するため、非侵襲的イメージングシステムを注射後1週間乃至注射後1.5ヶ月までの様々な時点で使用した。
すべての実験は平均±標準誤差(SEM)として示す。統計分析にはGraphPad Prism5ソフトウェアを使用した。データは一元配置分散分析(ANOVA)に付した。*p<0.05、**p<0.01、***p<0.001の場合に、サンプルは有意に異なるとみなした。
図1は、AAV2のカプシド上の第一級アミノ基を介するFITCの共有結合カップリングを表す。
(A)1E12vgの用量のAAV2-GFPベクターをTBS緩衝液(pH9.3)中のFITC(1E5又は3E5当量)の溶液に添加し、室温で4時間インキュベートした。ベクターを含む溶液をdPBS+0.001%Pluronicに対して透析して、AAVカプシドに結合していない遊離のFITC分子を除去した。
(B)対照として、TBS(pH9.3)中のFITCを、反応性残基(-N=C=S)を含まないフルオレセイン(3E5当量)で置き換えたことを除いて、同じ実験手順を行った。
(C~E)AAV2対照、TBS緩衝液中のFITCとインキュベートしたAAV2ベクターのサンプル(AAV2 FITC(1E5)及びAAV2 FITC(3E5))又はTBS緩衝液中のフルオレセインとインキュベートしたAAV2ベクターのサンプル(AAV2 Fluo(3E5))を蛍光発光及びドットブロットによって分析した。この目的のため、各条件の総用量1E9vgをニトロセルロースメンブレンにロードし、直接蛍光発光によって(C)、抗FITC抗体を用いたドットブロットによって(D)又はカプシド全体を認識するA20抗体を用いることによって(E)分析した。
(F、G)用量5E8vgの同じサンプルを、変性AAVカプシドタンパク質を検出するためのポリクローナル抗体(F)又は抗FITC抗体(G)を用いたウエスタンブロットによって分析した。
(H)各条件の総用量1E10vgを硝酸銀染色によって分析した。VP1、VP2及びVP3は、AAVカプシドを構成する3種類のタンパク質である。タンパク質の大きさは、タンパク質ラダーに従って画像の左側に示してある。
(A)1E12vgの用量のAAV2-GFPベクターを、TBS緩衝液(pH9.3)中の化合物4(-N=C=S反応性官能基を有するGalNAcリガンドを含む)又は化合物6(アリール-N=C=S反応性官能基を有するGalNAcリガンドを含む)(3E5当量)の溶液を添加し、室温で4時間インキュベートした。インキュベーション後、ベクターをdPBS+0.001%Pluronicに対して透析して、AAVカプシドに結合していない遊離のGalNAcリガンド分子を除去した。対照として、TBS(pH9.3)中の反応性残基(-N=C=S)を含まない化合物9(3E5当量)を用いて同じ実験手順を行った。
(B、C)AAV2対照及びTBS緩衝液中のGalNAcリガンドとインキュベートしたAAV2ベクターのサンプル(AAV2+4、AAV2+6及びAAV2+9)をドットブロットによって分析した。この目的のため、各条件の総用量1E10vgをニトロセルロースメンブレンにロードし、カプシド全体を認識するA20抗体(B)を用いて又はα-アセチルガラクトサミン糖を認識する大豆-FITCレクチン(C)を用いて標識した。
(A)1E12vgの用量のAAV2-GFPベクターを、TBS緩衝液(いずれもpH9.3)中の化合物6(アリール-N=C=S反応性官能基を有するGalNAcモノマーリガンド)又は化合物13(アリール-N=C=S反応性官能基を有するGalNAcトリマーリガンド)の溶液(3E5当量)に添加し、室温で4時間インキュベートした。インキュベーション後、ベクターをdPBS+0.001%Pluronicに対して透析して、AAVカプシドに結合していない遊離のGalNAcリガンド分子を除去した。対照として、TBS(pH9.3)中の反応性残基を含まない化合物9(3E5当量)を用いて同じ実験手順を行った。
(B、C)AAV2対照及びTBS緩衝液中のGalNAcリガンドとインキュベートしたAAV2ベクターのサンプル(AAV2+6、AAV2+9及びAAV2+13)をドットブロットによって分析した。この目的のため、各条件の総用量1E10vgをニトロセルロースメンブレンにロードし、集合カプシド全体を認識するA20抗体(B)を用いて又はα-アセチルガラクトサミン糖を認識する大豆-FITCレクチン(C)を用いて標識した。
(D、E)AAV2対照及びTBS緩衝液中のGalNAcリガンドとインキュベートしたAAV2ベクターのサンプル(AAV2+6、AAV2+9及びAAV2+13)をウエスタンブロットによって分析した。各条件の全用量の1E10vgをニトロセルロースメンブレンにロードし、変性AAVカプシドタンパク質を検出するためのポリクローナル抗体(D)によって又は大豆-FITCレクチン(E)を用いて標識した。VP1、VP2及びVP3は、AAVカプシドを構成する3種類のタンパク質である。タンパク質の大きさは、タンパク質ラダーに従って画像の左側に示してある。
(A)1E12vgの用量のAAV2-GFPベクターを、TBS緩衝液(pH9.3)中のFITC(3E5当量、3E5当量-10×(3E5当量であるが、反応体積を1/10に減少させたもの)、3E6当量、1.5E7)の溶液に添加し、室温で4時間インキュベートした。ベクターを含む溶液をdPBS+0.001%Pluronicに対して透析して、AAVカプシドに結合していない遊離のFITC分子を除去した。
(B)対照として、TBS(pH9.3)中のFITCを反応性残基(N=C=S)を含まないフルオレセイン(1.5E7当量)で置き換えたことを除いて、同じ実験手順を行った。
(C、D)AAV2対照及びTBS緩衝液中のFITCとインキュベートしたAAV2ベクターのサンプル(AAV2 FITC(3E5)、AAV2 FITC(3E5-10×)、AAV2 FITC(3E6)及びAAV2 FITC(1.5E7))又はTBS緩衝液中のフルオレセインとインキュベートしたAAV2ベクターのサンプル(AAV2 Fluo(1.5E7))をドットブロットによって分析した。各条件の総用量1E9vgをニトロセルロースメンブレンにロードし、カプシド全体を認識するA20抗体(C)によって又は抗FITC抗体(D)を用いて標識した。
(E、F)用量5E8vgの同じサンプルを、変性AAVカプシドタンパク質を検出するためのポリクローナル抗体(E)又は抗FITC抗体(F)を用いたウエスタンブロットによって分析した。VP1、VP2及びVP3は、AAVカプシドを構成する3種類のタンパク質である。タンパク質の大きさは、タンパク質ラダーに従って画像の左側に示してある。
(G)HeLa細胞(2E5細胞/ウェル)を細胞スタック内でインキュベートし、AAV2 FITC(3E5)、AAV2 FITC(3E6)及びAAV2 FITC(1.5E7)によって1E5のMOIで形質導入した。すべてのAAVベクターはGFPをコードしていた。GFPの発現を回避するため形質導入の4時間後に、緑色FITC蛍光及び赤色蛍光A20免疫標識(A20一次抗体及びA1647二次抗体)の可視化による共焦点顕微鏡分析を行った。
(A、B)用量12μlのAAV2-GFPベクターを、TBS緩衝液(pH9.3)中の化合物6及び13(3E5及び3E6当量)の溶液に添加し、室温で4時間インキュベートした。ベクターを含む溶液をdPBS+0.001%Pluronicに対して透析して、AAVカプシドに結合していない遊離のGalNAcリガンド分子を除去した。
AAV2対照及びTBS緩衝液中のGalNAcリガンドとインキュベートしたAAV2ベクターのサンプルをウエスタンブロットによって分析した。各条件の総用量1E10vgをニトロセルロースメンブレンにロードし、変性AAVカプシドタンパク質を検出するためのポリクローナル抗体(A)によって又は大豆-FITCレクチン(B)を用いて標識した。VP1、VP2及びVP3はAAVカプシドの3種類のタンパク質である。タンパク質の大きさは、タンパク質ラダーに従って画像の左側に示してある。
(C)GalNAcリガンドで化学修飾したAAV2及びAAV2ベクターによるマウス初代培養肝細胞の形質導入。マウス初代培養肝細胞(2E5細胞/ウェル)をP24プレートでインキュベートし、AAV2対照(融解直後)、GalNAc-AAV2(AAV2+6(3E5及び3E6当量))によって1E5のMOIで形質導入した。すべてのAAVベクターはCAGプロモーターの制御下でGFPをコードしていた。形質導入の72時間後に、GFP陽性細胞の百分率をFACS分析によって測定した。非形質導入細胞(細胞)を対照として使用した(すなわち蛍光バックグラウンド)。各条件の3回の反復実験をANOVA検定によって分析した(***p<0.001、**p<0.01)。データは平均値±SDとして示す。
(A)1E12vgの用量のAAV2-GFPベクターを、TBS緩衝液(いずれもpH9.3)中の化合物17(アリール-N=C=S反応性官能基を有するマンノースモノマーリガンド)(3E5及び3E6当量)の溶液に添加し、室温で4時間インキュベートした。インキュベーション後、ベクターをdPBS+0.001%Pluronicに対して透析して、AAVカプシドに結合していない遊離マンノースリガンド分子を除去した。対照として、TBS(pH9.3)中の反応性残基を含まない(アリール-N=C=S)化合物22(3E6当量)を用いて、同じ実験手順を行った。
(B、C)AAV2対照及びTBS緩衝液中のマンノースリガンドとインキュベートしたAAV2ベクターのサンプルをウエスタンブロットによって分析した。各条件の総用量1E10vgをニトロセルロースメンブレンにロードし、変性AAVカプシドタンパク質を検出するためのポリクローナル抗体(B)によって又はマンノース基を特異的に認識するコンカナバリンAレクチン(C)を用いて標識した。VP1、VP2及びVP3は、AAVカプシドを構成する3種類のタンパク質である。タンパク質の大きさは、タンパク質ラダーに従って画像の左側に示してある。
(D)AAV2対照(AAV2)又はマンノースリガンド(化合物17)とインキュベートしたAAV2を2つの異なる用量(3E5当量及び3E6当量)で網膜下に注射したラットの眼底におけるGFP蛍光の直接可視化。画像は、注射後1週間乃至注射後1.5ヶ月までの様々な時点で非侵襲的技術を用いて取得した。
(A)1E12vgの用量のAAV2-GFPベクターを、TBS緩衝液(pH9.3)中の化合物18又は19(3E6当量)の溶液に添加し、室温で4時間インキュベートした。インキュベーション後、ベクターをdPBS+0.001%Pluronicに対して透析して、AAVカプシドに結合していない遊離GalNAcリガンドを除去した。
(B、C)変性AAVカプシドタンパク質を検出するためのポリクローナル抗体(B)又は大豆レクチン(C)を用いたウェスタンブロットによって各サンプルの1E10vgの用量を分析した。
(A、B)各条件の総用量1E9vgをニトロセルロースメンブレン上にロードし、集合カプシドを認識するA20抗体(A)及び大豆レクチン(B)を用いたドットブロットによって分析した。
(C、D)用量1E10vgの同じサンプルを、変性AAVカプシドタンパク質を検出するためのポリクローナル抗体(C)又は大豆レクチン(D)を用いたウエスタンブロットによって分析した。
カップリングに用いた実験条件によって、AAV2及びAAV3bのカプシドの表面上のリガンドのカップリングを調節できることをはっきりと示している。このようにカプシド表面のあらゆる性状のリガンドを化学的にカップリングすることによって新たなAAV由来ベクターを得ることができる。ベクターの比活性及び治療指数もこの方法によって改善することができる。
Claims (48)
- 上記組換えアデノ随伴ウイルスベクターが、天然に存在するセロタイプ由来の野生型カプシドタンパク質から構成される、請求項1乃至3のいずれか1項に記載のrAAVベクター粒子。
- 上記組換えアデノ随伴ウイルスが、天然に存在するセロタイプ由来のカプシドタンパク質が遺伝子改変されたアデノ随伴ウイルス又は合成カプシドによって構成されるアデノ随伴ウイルスである、請求項1乃至4のいずれか1項に記載のrAAVベクター粒子。
- リガンドLが、ターゲティング剤、中和抗体との相互作用を避けるための立体遮蔽剤、標識剤又は磁性剤である、請求項1乃至5のいずれか1項に記載のrAAVベクター粒子。
- 前記ターゲティング剤としての前記リガンドLが、細胞型特異的リガンドである、請求項6に記載のrAAVベクター粒子。
- 前記細胞型特異的リガンドが、タンパク質から、単糖類もしくは多糖類から、ステロイドホルモンから、RGDモチーフペプチドから、ビタミン類から、小分子から、又はターゲティングペプチドから誘導されるものである、請求項7に記載のrAAVベクター粒子。
- 前記細胞型特異的リガンドが、ガラクトース、N-アセチルグルコサミン、又はマンノースから誘導されるものである、請求項7又は8に記載のrAAVベクター粒子。
- 前記立体遮蔽剤としての前記リガンドLが、合成ポリマーから誘導される、中和抗体との相互作用を避けるための立体遮蔽剤である、請求項6に記載のrAAVベクター粒子。
- 前記合成ポリマーが、ポリエチレングリコール(PEG)又はpHPMAである、請求項9に記載のrAAVベクター粒子。
- 前記標識剤としての前記リガンドLが、分析遺伝子導入のための標識剤である、請求項6に記載のrAAVベクター粒子。
- 前記標識剤が、蛍光色素、ナノ金粒子又は放射性色素である、請求項12に記載のrAAVベクター粒子。
- 前記標識剤が、フルオレセイン、ローダミン、 18F、124,125,131I、64Cu又は67Cuである、請求項13に記載のrAAVベクター粒子。
- 前記磁性剤としての前記リガンドLが、鉄粒子である、請求項6に記載のrAAVベクター粒子。
- アデノ随伴ウイルス(AAV)ベクター粒子を1以上のリガンドLと化学的にカップリングさせるための方法であって、少なくとも以下の工程:
カプシドタンパク質に含まれる1以上の第一級アミノ基を有するアデノ随伴ウイルス(AAV)粒子を用意する工程、及び
上記AAV粒子を次の式(II)の試薬
B-N=C=S (II)
(式中、Bは、(L)m(X)Ar-基であり、
リガンドLは請求項6乃至15のいずれか1項で定義した通りであり、
mは1~1000の整数を表し、
Arは、アリーレン又はヘテロアリーレン基を表し、又は請求項2若しくは3で定義した通りであり、
Xは結合又は上記リガンドLとArとの間のスペーサーを表す。)と、第一級アミノ基を式(II)の試薬の-N=C=S基と反応させるのに適した条件下で、接触させる工程
を含む方法。 - 上記AAV粒子を式(II)の試薬と接触させる工程が、TRIS緩衝食塩水、炭酸ナトリウム-重炭酸ナトリウム緩衝液、PBS及びdPBSから選択される緩衝液の存在下で行われる、請求項17乃至25のいずれか1項に記載の方法。
- 上記AAV粒子を式(II)の試薬と接触させる工程が、TRIS緩衝食塩水の存在下で行われる、請求項26に記載の方法。
- 上記反応が、7~9.6のpHで行われる、請求項17乃至27のいずれか1項に記載の方法。
- 上記反応が、9.2~9.4のpHで行われる、請求項28に記載の方法。
- 第2のカップリング工程においてカプシドタンパク質を修飾するために、得られた上記rAAVベクター粒子をさらに反応させる、請求項17乃至29のいずれか1項に記載の方法。
- 第1のカップリング工程からの未反応のアミノ基との化学カップリングによって、得られた上記rAAVベクター粒子をさらに反応させる、請求項17乃至30のいずれか1項に記載の方法。
- 当該方法が、(i)アデノ随伴ウイルス(AAV)のトロピズムを変化させるためのものであり、(ii)特定の細胞又は組織の形質導入を増強するためのものであり、又は(iii)中和抗体との相互作用を低減させるためのものである、請求項17乃至31のいずれか1項に記載の方法。
- 当該方法が、前記(i)においてさらに、所望の特定の器官、組織又は細胞型をターゲティングするためのものである、請求項32に記載の方法。
- 医薬として使用するための、予防手段として使用するための、診断手段として使用するための、或いは遺伝子治療の効率研究に使用するための、請求項1乃至16のいずれか1項に記載のrAAVベクター粒子。
- 造影剤として使用するための、請求項34に記載のrAAVベクター粒子。
- 治療用核酸を送達するための又は矯正ゲノム編集を誘導するための医薬品として使用する為の、請求項34に記載のrAAVベクター粒子。
- アデノ随伴ウイルス(AAV)のトロピズムを変化させるための、請求項1乃至16のいずれか1項に記載のrAAVベクター粒子。
- 所望の特定の器官、組織又は細胞型をターゲティングするためのものである、請求項37に記載のrAAVベクター粒子。
- 当該rAAVベクター粒子に対する液性免疫反応を損なうための、請求項1乃至16及び34乃至38のいずれか1項に記載のrAAVベクター粒子。
- 中和抗体との相互作用を低減させるための、請求項1乃至16及び34乃至38のいずれか1項に記載のrAAVベクター粒子。
- 当該rAAVベクター粒子が、眼、肺、心臓、腎臓、肝臓、脳、脾臓、腫瘍若しくは筋肉細胞、又は中枢神経系の細胞に対して、選択的トロピズムを有する、請求項1乃至16及び34乃至40のいずれか1項に記載のrAAVベクター粒子。
- 当該rAAVベクター粒子が、肝細胞、網膜、網膜色素上皮、光受容細胞、筋細胞又は心筋細胞に対して、選択的トロピズムを有する、請求項41に記載のrAAVベクター粒子。
- 請求項1乃至16及び34乃至42のいずれか1項に記載のrAAVベクター粒子を薬学的に許容される媒体中に含む医薬組成物。
- (i)診断方法に使用するのための、又は(ii)遺伝子治療に使用するのため、又は(iii)免疫療法及びワクチン接種に使用するための、請求項1乃至16及び34乃至42のいずれか1項に記載のrAAVベクター粒子又は請求項43に記載の医薬組成物。
- 前記(ii)において、遺伝性障害又は後天性障害の治療に使用するのためのものである、請求項44に記載のrAAVベクター粒子又は医薬組成物。
- 心不全、神経障害、筋障害、肝疾患、血液疾患、代謝疾患、眼病又はがんの治療に使用するのためのものである、請求項45に記載のrAAVベクター粒子又は医薬組成物。
- 前記リガンドLが、マンノース、ガラクトース又はN-アセチルガラクトサミンから誘導される細胞型特異的リガンドである、デュシェンヌ型筋ジストロフィー(DMD)の治療に使用する為の、請求項1乃至16及び34乃至42のいずれか1項に記載のrAAVベクター粒子又は請求項43に記載の医薬組成物。
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