JP7097814B2 - ヒト心室前駆細胞の生着のための遺伝子マーカー - Google Patents
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Description
本出願は、2016年2月19日に出願した米国特許出願第62/297,217号の優先権および利益を主張し、その全体が、参照により本明細書に組み込まれる。
したがって、当該技術分野において、生体内で組織移植片を首尾よく形成することができるそれらの細胞の同定を可能にするであろう心筋前駆細胞の遺伝子マーカー、特に、心室筋細胞に分化することができ、ならびに生体内で、血管新生および細胞外基質形成を達成することができる前駆細胞の同定のための遺伝子マーカーが依然として必要である。
HVPにおける少なくとも1つの生着マーカーの発現を検出し、これにより、生着可能なHVPを同定すること
を含む、生着可能なヒト心室前駆細胞(HVP)を同定する方法を提供し、ここで、
HVPはまた、JAG1、FZD4、LIFR、FGFR3および/またはTNFSF9からなる群から選択される少なくとも1つの表面マーカーを発現する。
心筋前駆細胞を含有するヒト細胞をヒト心室前駆細胞(HVP)への分化を引き起こす条件下で培養すること;
JAG1、FZD4、LIFR、FGFR3および/またはTNFSF9からなる群から選択される少なくとも1つの表面マーカーのHVP上での発現を検出すること;
少なくとも1つの生着マーカーのHVPにおける発現を検出すること;ならびに
少なくとも1つの表面マーカーと少なくとも1つの生着マーカーを共発現するHVPを単離し、これにより、生着可能なHVPを単離すること
を含む、生着可能なヒト心室前駆細胞(HVP)を単離する方法を提供する。
ヒト心室組織が対象において生着されるように、生着可能なヒト心室前駆細胞(HVP)を対象に移植すること
を含む、対象においてヒト心室組織を生着させる方法を提供し、
ここで、移植に先立ち、生着可能なHVPが、HVPにおける少なくとも1つの生着マーカーの発現を検出することにより同定され;
HVPは、JAG1、FZD4、LIFR、FGFR3および/またはTNFSF9からなる群から選択される少なくとも1つの表面マーカーを発現する。
心筋前駆細胞を含有するヒト細胞をヒト心室前駆細胞(HVP)への分化を引き起こす条件下で培養すること;
JAG1、FZD4、LIFR、FGFR3および/またはTNFSF9からなる群から選択される少なくとも1つの表面マーカーのHVP上での発現を検出すること;
少なくとも1つの生着マーカーのHVPにおける発現を検出すること;
少なくとも1つの表面マーカーと少なくとも1つの生着マーカーを共発現するHVPを単離し、これにより、生着可能なHVPを単離すること;ならびに
ヒト心室組織が対象において生着されるように、生着可能なHVPを対象に移植すること
を含む、対象においてヒト心室組織を生着させる方法を提供する。
JAG1、FZD4、LIFR、FGFR3および/またはTNFSF9からなる群から選択される少なくとも1つの表面マーカーを発現するヒト心室前駆細胞(HVP)への分化を引き起こす条件下で心筋前駆細胞を含有するヒト細胞を培養すること;
少なくとも1つの表面マーカーを発現するHVPを単離して、HVP集団を形成すること;
HVP集団の試料における少なくとも1つの生着マーカーの発現を検出すること;ならびに
ヒト心室組織が、対象において生着されるように、少なくとも1つの表面マーカーおよび少なくとも1つの生着マーカーを発現するHVPを対象に移植すること
を含む、対象においてヒト心室組織を生着させる方法を提供する。
少なくとも1つの陽性の細胞外基質マーカーを、FGF10、SMOC1、CCBE1、COL6A6、ADAMTS12、COL19A1、LAMA1、BMP4、FBLN7、FBLN2、NDNF、HTRA1、HAPLN1、EMILIN1、SPOCK3、PODNL1、IHH、ACAN、NID2、COL4A6、LAMC1、FMOD、MUC4、EMID1、HMCN1、NID1、VCAN、CILP2、SOD3、ADAMTS3、ZP3、ANGPTL4、CRTAC1、LTBP4およびFREM1からなる群から選択することができる。
少なくとも1つの陽性の細胞外基質マーカーは、FGF10、SMOC1、CCBE1、COL6A6、ADAMTS12、COL19A1、LAMA1、BMP4、FBLN7、FBLN2、NDNFおよびHTRA1からなる群から選択される。
少なくとも1つの陽性の細胞外基質マーカーは、FGF10、SMOC1およびCCBE1からなる群から選択される。
少なくとも1つの陰性の細胞外基質マーカーを、FKBP1A、CLU、TFP12、PLSCR1、FBLN5、VWA1、ADAMTS16、MMP25、SFRP2およびSOD1からなる群から選択することができる。
生着可能なHVPが、分化の5~7日目の間(例えば、6日目)で、以下、ならびに実施例1および11において記載される培養条件下で典型的には発生し、細胞内マーカーIslet1を発現し、JAG1、FZD4、LIFR、FGFR3および/またはTNFSF9を含む細胞表面マーカーを発現することが決定されている(例えば、2015年8月21日に出願された米国出願番号第14/832,324号、および2015年12月30日に出願された米国出願番号第14/984,783号を参照、それぞれの全内容が、参照により本明細書において取り込まれる)。生着可能なHVPの遺伝子発現特性をさらに特徴付けるために、RNA配列決定を、実施例12および13において記載される通り、異なる時点にて、分化を経験するHVP上にて行った。異なる時点での遺伝子発現特性のクラスター解析を使用して、ステージ特異的符号遺伝子が同定された。次に、遺伝子個体発生研究が、本明細書において生着マーカーとして言及される、細胞生着に重要な遺伝子(血管新生ファミリー遺伝子および細胞外基質ファミリー遺伝子)の同定を可能にした。
HVPにおける少なくとも1つの生着マーカーの発現を検出し、これにより、生着可能なHVPを同定すること
を含む、生着可能なヒト心室前駆細胞(HVP)を同定する方法を提供し、ここで、
HVPはまた、JAG1、FZD4、LIFR、FGFR3および/またはTNFSF9からなる群から選択される少なくとも1つの表面マーカーを発現する。
心筋前駆細胞を含有するヒト細胞をヒト心室前駆細胞(HVP)への分化を引き起こす条件下で培養すること;
JAG1、FZD4、LIFR、FGFR3および/またはTNFSF9からなる群から選択される少なくとも1つの表面マーカーのHVP上での発現を検出すること;
少なくとも1つの生着マーカーのHVPにおける発現を検出すること;ならびに
少なくとも1つの表面マーカーと少なくとも1つの生着マーカーを共発現するHVPを単離し、これにより、生着可能なHVPを単離すること
を含む、生着可能なヒト心室前駆細胞(HVP)を単離する方法を提供する。
ヒト心室組織が対象において生着されるように、生着可能なヒト心室前駆細胞(HVP)を対象に移植すること
を含む、対象においてヒト心室組織を生着させる方法を提供し、
ここで、移植に先立ち、生着可能なHVPが、HVPにおける少なくとも1つの生着マーカーの発現を検出することにより同定され;
HVPは、JAG1、FZD4、LIFR、FGFR3および/またはTNFSF9からなる群から選択される少なくとも1つの表面マーカーを発現する。
心筋前駆細胞を含有するヒト細胞をヒト心室前駆細胞(HVP)への分化を引き起こす条件下で培養すること;
JAG1、FZD4、LIFR、FGFR3および/またはTNFSF9からなる群から選択される少なくとも1つの表面マーカーのHVP上での発現を検出すること;
少なくとも1つの生着マーカーのHVPにおける発現を検出すること;
少なくとも1つの表面マーカーと少なくとも1つの生着マーカーを共発現するHVPを単離し、これにより、生着可能なHVPを単離すること;ならびに
ヒト心室組織が対象において生着されるように、生着可能なHVPを対象に移植すること
を含む、対象においてヒト心室組織を生着させる方法を提供する。
JAG1、FZD4、LIFR、FGFR3および/またはTNFSF9からなる群から選択される少なくとも1つの表面マーカーを発現するヒト心室前駆細胞(HVP)への分化を引き起こす条件下で心筋前駆細胞を含有するヒト細胞を培養すること;
少なくとも1つの表面マーカーを発現するHVPを単離して、HVP集団を形成すること;
HVP集団の試料における少なくとも1つの生着マーカーの発現を検出すること;ならびに
ヒト心室組織が、対象において生着されるように、少なくとも1つの表面マーカーおよび少なくとも1つの生着マーカーを発現するHVPを対象に移植すること
を含む、対象においてヒト心室組織を生着させる方法を提供する。
HVPの集団が単離されるように、ヒト心室前駆細胞(HVP)を含有するヒト細胞の培養物を、JAG1、FZD4、LIFR、FGFR3および/またはTNFSF9からなる群から選択される少なくとも1つの表面マーカーと反応性の少なくとも1つの薬剤と接触させること;
HVPのクローン集団をHVPの単離された集団から拡大すること;
HVPのクローン集団の試料において少なくとも1つの生着マーカーの発現を検出すること;ならびに
ヒト心室組織が対象において生着されるように、少なくとも1つの表面マーカーおよび少なくとも1つの生着マーカーを発現するHVPのクローン集団を対象に移植すること
を含む、対象においてヒト心室組織を生着させる方法を提供する。
少なくとも1つの陽性の細胞外基質マーカーを、FGF10、SMOC1、CCBE1、COL6A6、ADAMTS12、COL19A1、LAMA1、BMP4、FBLN7、FBLN2、NDNF、HTRA1、HAPLN1、EMILIN1、SPOCK3、PODNL1、IHH、ACAN、NID2、COL4A6、LAMC1、FMOD、MUC4、EMID1、HMCN1、NID1、VCAN、CILP2、SOD3、ADAMTS3、ZP3、ANGPTL4、CRTAC1、LTBP4およびFREM1からなる群から選択することができる。
少なくとも1つの陽性の細胞外基質マーカーは、FGF10、SMOC1、CCBE1、COL6A6、ADAMTS12、COL19A1、LAMA1、BMP4、FBLN7、FBLN2、NDNFおよびHTRA1からなる群から選択される。
少なくとも1つの陽性の細胞外基質マーカーは、FGF10、SMOC1およびCCBE1からなる群から選択される。
少なくとも1つの陰性の細胞外基質マーカーを、FKBP1A、CLU、TFP12、PLSCR1、FBLN5、VWA1、ADAMTS16、MMP25、SFRP2およびSOD1からなる群から選択することができる。
al.,1997,Current Protocols of Molecular Biology,John Wiley&Sonsを参照。RNA抽出および調製のための売主の指示と共に市販のキットの使用が、広くいきわたり、一般的である。様々なRNA単離製品および完成キットの商業上の売主は、キアゲン(バレンシア、カリフォルニア州)、インビトロジェン(カールズバッド、カリフォルニア州)、アンビオン(オースティン、テキサス州)およびエキシコン(ウォバーン、マサチューセッツ州)を含む。
JAG1、FZD4、LIFR、FGFR3および/またはTNFSF9からなる群から選択される少なくとも1つの表面マーカーを発現するヒト心室前駆細胞(HVP)への分化を引き起こす条件下で心筋前駆細胞を含有するヒト細胞を培養すること;
少なくとも1つの表面マーカーを発現するHVPを単離して、HVP集団を形成すること;
HVP集団の試料において少なくとも1つの陽性の生着マーカーの発現を検出すること;
HVP集団の試料において少なくとも1つの陰性の生着マーカーの発現の欠如を検出すること;ならびに
ヒト心室組織が対象において生着されるように、少なくとも1つの表面マーカーおよび少なくとも1つの陽性の生着マーカーを発現し、少なくとも1つの陰性の生着マーカーの発現を欠くHVPを対象に移植すること
を含む、対象においてヒト心室組織を生着させる方法を提供する。
ヒト多能性幹細胞は、ヒト心室前駆細胞の非クローン集団の生成に至る条件下で培養することができる。心筋前駆細胞を生成するための培養条件は、当該技術分野において記載されており(例えば、Lian,X.et al.(2012)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 109:E1848-1857;米国特許公開第20130189785号を参照)、また実施例1および図面、および実施例11において詳細に記載されている。典型的には、Wnt/β-カテニンシグナル伝達は、hPSCにおいてまず活性化され、インキュベーション期間が続き、Wnt/β-カテニンシグナル伝達の阻害が続く。
細胞表面マーカー発現(例えば、JAG1、FZD4、LIFR、FGFR3および/またはTNFSF9)に基づきHVPを単離する方法は、2015年8月21日に出願された米国出願番号第14/832,324号、および2015年12月30日に出願された米国出願番号第14/984,783号(そのそれぞれの全体的内容は、明確に参照により本明細書に取り込まれる)において詳細に記載される。簡単に言うと、細胞表面マーカーと反応性の薬剤を使用して、当該技術分野において十分に確立された手法に従い、HVPを単離することができる。HVPの細胞表面マーカーとしてのJAG1、FZD4、LIFRおよびFGFR3の同定はまた、実施例2、4および5において詳細に記載される。
十億以上の細胞のクローン集団を達成することができるように、HVPのクローン集団を、HVPの拡大および増殖により得ることができる。かかる多数までヒト心室前駆細胞をクローンで拡大する能力は、かかる使用が、十億以上の細胞のオーダーで必要とするので、心機能を増強するために生体内でこれらの細胞の首尾よい使用に必須の特性である。実施例において詳細に記載される通り、かかる単一細胞を、心筋芽前駆体の生成を促進する条件下の培養のおよそ6日目にて得ることができる。ヒト心臓心室前駆体のクローン集団を、その細胞が心室マーカーMLC2vを発現するように、インビトロでさらに培養し、分化させることができる。好ましくは、単一ヒト心臓の心室前駆細胞は、蛍光標識細胞分取により単離される。あるいは、細胞を、MACSにより、または当該技術分野において公知の、および/もしくは本明細書において記載される他の細胞分取方法により単離することができる。好ましくは、単一ヒト心臓の心室前駆細胞は、本明細書において記載される(例えば、実施例3を参照)、心臓前駆体培養(CPC)培地において培養される。
ヒト心室前駆体(HVP)が、ヌードマウスにおいて腎被膜下に移植された、実施例7および8において記載される、生体内移植研究は、腎被膜の表面上の成熟、機能的、ヒト心室筋の巨大な壁に自発的にアセンブルするHVPの能力を証明する。血管新生は、マウス脈管構造を心室筋壁と呼ぶことにより、パラクリン経路を介して生じ、一方、基質は、細胞の自律的経路を介して前駆体自体から生成される。HVPが、正常マウス心臓に移植される、実施例9において記載される、生体内心筋内移植研究は、HVPが、それらが拡大し、続いて、分化し、心外膜の表面上のヒト心室筋の壁に成熟する、心外膜表面に自発的に遊走することを証明する。まとめると、これらの研究は、ヒト心室形成が、精製されたHVPを介して生体内で完全な細胞の自律的経路を介して生じることができ、これにより、器官に対する器官の生体内組織操作においてそれらを使用することが可能となることを示す。
生着可能なHVPを同定し、生着させる本発明の方法を、生体内で使用して、細胞を心臓に直接移植することにより、心機能を増強することができる。HVPが、全3つのタイプの心臓系統細胞(心筋細胞、内皮細胞および平滑筋細胞)に分化する能力を有することは、ここで示されている(実施例3を参照)。さらに、心室系統に向けてバイアスをかける条件下で培養されたとき、HVPは、生体内の天然の心室環境に移植されるとき、主に心室筋表現型に適合することが示され、これは、これらの前駆細胞が、心室環境を「認識し」、生体内で適当に応答し、分化することを示している。心室環境に対する損傷は、心臓の疾患および障害における障害された心機能の大きな原因となるので、本発明の心室前駆細胞を使用して心室筋細胞を回復させる能力は、当該技術分野における大きな進歩を表す。
少なくとも1つの細胞表面マーカー(JAG1、FZD4、LIFR、FGFR3および/またはTNFSF9)、ならびに少なくとも1つの生着マーカー(血管新生マーカーおよび/または細胞外基質マーカー)を発現すると同定された、本発明の心臓心室前駆細胞は、心臓の成熟および分化の様々な態様の研究において、特に、心臓の成熟および分化のプロセスに関与する細胞シグナル伝達経路ならびに生物学的メディエータの同定において、インビトロで使用することができる。
細胞を試験化合物と接触させること;ならびに
細胞に対する試験化合物の毒性を測定すること
を含み、
ここで、細胞に対する試験化合物の毒性は、試験化合物の心毒性を示す、
試験化合物の心毒性についてスクリーニングする方法を提供する。
JAG1、FZD4、LIFR、FGFR3およびTNFSF9からなる群から選択される少なくとも1つの細胞表面マーカーを発現し、(ii)少なくとも1つの生着マーカーを発現するヒト心臓の心室前駆細胞を用意すること;
試験化合物の存在または非存在下で細胞を培養すること;
試験化合物の存在または非存在下で細胞の分化を測定すること;ならびに
試験化合物の非存在下での分化と比較して、ヒト心臓の心室前駆細胞分化を調節する試験化合物を選択し、これにより、ヒト心臓の心室前駆細胞分化を調節する化合物を同定すること
を含む、ヒト心臓の心室前駆細胞分化を調節する化合物を同定する方法をさらに提供する。
JAG1、FZD4、LIFR、FGFR3およびTNFSF9からなる群から選択される少なくとも1つの細胞表面マーカーを発現し、(ii)少なくとも1つの生着マーカーを発現するヒト心臓の心室前駆細胞を用意すること;
ヒト心室心筋細胞を生成する条件下で試験化合物の存在または非存在下で細胞を培養すること;
試験化合物の存在または非存在下でヒト心室心筋細胞の機能を測定すること;ならびに
試験化合物の非存在下での機能と比較して、ヒト心室心筋細胞機能を調節する試験化合物を選択し、これにより、ヒト心室心筋細胞機能を調節する化合物を同定すること
を含む、ヒト心室心筋細胞機能を調節する化合物を同定する方法をさらに提供する。
心臓の疾患のモデルに基づくヒトiPSおよびES細胞の発生は、開発および発見中に心血管薬物における新たな限界を開放する。しかしながら、これまで、これらのシステムは、培養された細胞システムにおいて2D構造物に基づく制限を有していた。加えて、細胞の胎児性および未成熟特性は、成人の心臓のそれらの有用性および忠実度を制限する。ヒト心臓疾患、特に、心不全は、腎臓のような、治療標的についての公知の部位である環境、ホルモン、および他の鍵となる器官により影響される、複雑な、多機能の、多器官の疾患である。異所性、またはインタクトな正常マウス心臓の表面上のいずれかに成熟した機能的ヒト心室器官を構築する能力は、通常、心室性不整脈、収縮力の生成、線維症、および再生の可能性のような、成熟ヒト心室筋チャンバーにおいてアッセイされるのみであり得る研究を可能にする新規生体内でモデルを始める。したがって、インビトロでの組織培養システムの外側、かつ生体内での心不全の状況において直接的に、ヒト心臓の疾患を研究するための開始は、ここで明確に可能である。
生着可能なHVPを非ヒト動物の器官に移植すること、ここで、生着可能なHVPは、(i)JAG1、FZD4、LIFR、FGFR3およびTNFSF9からなる群から選択される少なくとも1つの細胞表面マーカーを発現し;(ii)少なくとも1つの生着マーカーを発現する;
ヒト心室組織が生成されるように、前駆体が生体内で成長することを可能にすること;
試験化合物を非ヒト動物に投与すること;ならびに
非ヒト動物においてヒト心室組織に対する試験化合物の効果を評価すること
を含む。
試験化合物を非ヒト動物に投与すること、ここで、非ヒト動物は、非ヒト動物の器官に移植された生着可能なヒト心室前駆体(HVP)を含み、生着可能なHVPは、(i)JAG1、FZD4、LIFR、FGFR3およびTNFSF9からなる群から選択される少なくとも1つの細胞表面マーカーを発現し;(ii)少なくとも1つの生着マーカーを発現する;ならびに
非ヒト動物において生着可能なHVPに対する試験化合物の効果を評価すること
を含む。
別の態様において、本発明は、生着可能なHVPを生成するためのキットを提供する。1つの実施形態において、キットは、生着可能なHVPを単離するためのキットの使用のための指示書と共に、JAG1、FZD4、LIFR、FGFR3およびTNFSF9からなる群から選択される少なくとも1つの細胞表面マーカーを発現するHVPを単離するための手段、ならびに単離されたHVPにより発現される少なくとも1つの生着マーカーを検出するための手段を含む。1つの実施形態において、キットは、少なくとも1つの血管新生生着マーカー(陽性のおよび/または陰性の血管新生マーカー)を検出するための手段を含む。別の実施形態において、キットは、少なくとも1つの細胞外基質生着マーカー(陽性のおよび/または陰性の細胞外基質マーカー)を検出するための手段を含む。なお別の実施形態において、キットは、少なくとも1つの血管新生生着マーカーおよび少なくとも1つの細胞外基質生着マーカーを検出するための手段を含む。生着可能なHVPを同定し、移植する方法に関して上で記載された生着マーカーのいずれかを検出するための手段は、本発明のキットにおいて含まれ得る。本発明のキットにおける検出のための好ましい血管新生マーカーは、FGF10、PRKD1、CCBE1、PDGFRA、EPHB2、GATA2およびNTRK1を含む。本発明のキットにおける検出のための好ましい細胞外基質マーカーは、FGF10、SMOC1およびCCBE1を含む。
古典的なWntシグナル伝達の一時的調節は、多数のhPSC株から高収量かつ純度で機能的心筋細胞を生成するのに十分であることが示されている(Lian,X.et al.(2012)Proc.Natl.Acad.Sci.USA109:E1848-1857;Lian,X.et al.(2013)Nat.Protoc.8:162-175)。このアプローチにおいて、Wnt/β-カテニンシグナル伝達は、hPSCにおいてまず活性化され、インキュベーション期間が続き、Wnt/β-カテニンシグナル伝達の阻害が続く。元々公開されたプロトコールにおいて、Wnt/β-カテニンシグナル伝達活性化は、Gsk3阻害剤CHIR99021(GSK-3α、IC50=10nM;GSK-3、βIC50=6.7nM)とのインキュベーションにより達成され、Wnt/β-カテニンシグナル伝達阻害は、Porcn阻害剤IWP2(IC50=27nM)とのインキュベーションにより達成された。本発明者らは、心臓の分化のためGsk3阻害剤およびWnt産生産性阻害剤を使用したので、このプロトコールを、GiWiプロトコールと呼んだ。元々のプロトコールの効率を改善し、元々のプロトコールにおいて使用された小分子の可能性のある副作用を低減するために、より高い阻害効力を有する小分子の別のセットを使用する第2の生成プロトコールを開発した。この第2の生成GiWiプロトコールにおいて、Wnt/β-カテニンシグナル伝達活性化を、Gsk3阻害剤CHIR98014(CAS556813-39-9;例えば、Selleckchemから市販されている)(GSK-3α、IC50=0.65nM;GSK-3,βIC50=0.58nM)とのインキュベーションにより達成し、Wnt/β-カテニンシグナル伝達阻害を、Porcn阻害剤Wnt-C59(CAS1243243-89-1;例えば、SelleckchemまたはTocrisから市販されている)(IC50=74pM)とのインキュベーションにより達成した。Gsk3阻害剤CHIR98014を使用して、心臓の中胚葉分化を促進し、一方、Porcn阻害剤Wnt-C59を使用して、中胚葉細胞からの心室前駆体分化を増強した。
心臓の分化プロセス中にゲノムスケールレベルで生じる転写変化の特性を明らかにするために、RNA配列決定(RNA-seq)を、心臓の発生の転写景色を構築するための分化後の異なる時点にて行った。本発明者らは、0日目~7日目の試料、ならびに19日目および35日目の試料(時点当たりの2つの独立した生物学的複製物)においてRNA-seq実験を行った。illumine Hiseq 2000プラットフォームを使用して、2つのバッチのRNA-seq(読み取り長100bpおよび50bp)を行った。合計で、20の試料を調べた。BowtieおよびTophatを使用して、本発明者らの読み取り値を参照ヒトゲノム(hg19)にマッピングし、本発明者らは、RPKM方法(百万の読み取り値当たりの1キロベースの転写物当たりの読み取り値)を使用して、それぞれの遺伝子発現(Refseqによる遺伝子のアノテーション)を計算する。心筋細胞へのhPSCの分化は、5つの主要な細胞タイプ:多能性幹細胞(0日目)、中胚葉前駆体(1日目~2日目)、心臓の中胚葉細胞(3日目~4日目)、心臓フィールドの前駆体(5日目、6日目および7日目)、ならびに心筋細胞(10日以降)を含む。
Isl1+Jag1+細胞のクローン分化の可能性を特徴付けるために、心筋芽前駆細胞を、実施例1において記載した培養プロトコールにより生成し、1つの単一Isl1+Jag1+細胞を、マトリゲルコート48ウェルプレートの1つのウェルに播種した。細胞を、Jag1の抗体で精製し、次に、1つの単一細胞を、1つのウェルに播種した。次に、単一細胞を、3週間、心臓前駆体培養(CPC)培地(2.5mM GlutaMAX、100μg/mlビタミンC、20%ノックアウト血清代替物を添加した高度DMEM/F12)において培養した。
実施例2において記載した通り、Frizzled4(FZD4)を、心筋前駆細胞において表したRNA-seq解析により同定した。したがって、心筋前駆細胞の細胞表面マーカーとしてFZD4を確実にするために、FZD4発現を、ウエスタンブロット解析を介して心臓分化中に評価した。結果は、FZD4が、多能性幹細胞および最初の3日間の分化した細胞において発現しなかったことを示した。しかしながら、FZD4は、4日目に発現を開始し、発現の、5日目におけるその発現を最大にした。
実施例2において記載した通り、LIFR(CD118)およびFGFR3を、心筋前駆細胞において表したRNA-seq解析により同定した。この実験において、ヒト心室前駆細胞についてのこれらのさらなる細胞表面マーカーの発現を、フローサイトメトリー解析により確かにした。ヒト心室前駆体(HVP)細胞を、実施例1または11において記載する通り生成し、6日目細胞を、標準的フローサイトメトリーにより解析した。抗Islet1および抗白血病抑制因子受容体(LIFR)抗体を使用した二重染色フローサイトメトリー実験を行った。結果は、HVP細胞が、Islet1およびLIFRを共発現することを示し、これにより、LIFRが、HVP細胞についての細胞表面マーカーであることを確かにする。さらに、6日目のHVP細胞上でのLIFRおよび線維芽細胞成長因子受容体3(FGFR3)の発現を、未分化の胚性幹(Es)細胞と比較することを含む、フローサイトメトリー実験を行った。結果は、LIFRおよびFGFR3が共に、HVP細胞上での発現について高度に富化されていることを示し、これにより、LIFRおよびFGFR3が共に、HVP細胞についての細胞表面マーカーであることを確かにする。
ES03ヒト胚性幹細胞(hESC)株(WiCell Research Instituteから得た)は、心臓特異的cTnTプロモーターによりもたらされた緑色蛍光タンパク質(GFP)を発現する。ES03細胞を使用して、実施例1において記載した培養プロトコールを使用して、Isl1+Jag1+心筋芽前駆細胞を生成した。Isl1+Jag1+心筋芽前駆細胞を、重症複合免疫不全(SCID)であるベージュマウスの心臓に移植して、生体内でのそれらの発生の可能性を立証した。
心室心筋チャンバーの構築は、ヒト器官形成中の最も重大かつ初期工程の1つであり、遊走、増殖、血管新生、構築、および基質アライメントを含む、一連の協調した工程を必要とする。生体内で心室形成をもたらすHVPの能力を試験するために、本発明者らは、精製したHVPまたは未精製のHVP(92.0±1.9%ISL1+)を免疫不全状態のマウスの腎被膜下に移植した。移植の2か月後、未精製のHVPを移植した動物は腫瘍を形成し、これは、腫瘍形成効率100%(100%、4/4)をもたらし、一方、精製したHVPを移植した動物は、腫瘍を全く形成しなかった(0%、0/10)。
ヒト心臓生物学および疾患の研究のためのhPSCの有用性についての重大な制限の1つは、胎児アイソフォームの発現の成熟度および持続をそれらが欠くことである。HVP由来器官が、機能的成熟心室筋になることができたかを決定するために、長期移植研究を行い、その後、T管の形成(Brette,F.and Orchard,C.(2003)Circ.Res.92:1182-1192;Marks,A.R.(2013)J.Clin.Invest.123:46-52)、操作した心室組織の他の研究に匹敵する力を生成する能力、自動性の喪失、および成人の杆体形の心室心筋細胞の獲得を含む成人の心室心筋の十分に許容される特性のパネルの詳細な解析を行った。
心外膜は、緻密な領域拡大中に心室チャンバーの成長をもたらし、ならびに心筋障害後に拡大することができ、VEGFのような、公知の血管細胞運命スイッチに応答して血管新生をもたらすことができる成人の心外膜前駆体として働く、心臓前駆体のための公知の微小環境である(Giordano,F.J.et al.(2001)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 98:5780-5785;Masters,M.and Riley,P.R.(2014)Stem Cell Res.13:683-692;Zangi,L.et al.(2013)Nat.Biotechnol.31:898-907)。HVPが、正常な心臓の心外膜表面に自発的に遊走し得るかを決定するために、精製緑色蛍光タンパク質(GFP)-標識HVPを、免疫不全状態のマウスの心臓に心筋内注射した。移植の1週間後または1か月後、動物を屠殺し、生着した心臓を組織診断のため取り出した。移植の1週間後、GFP+細胞の大部分が、心筋において保持された。しかしながら、ほぼ全てのGFP+細胞が、移植の1か月後に心外膜に遊走した。加えて、GFP+細胞は、移植の1週間後にISL1+およびKi67+であった。
この実施例において、実施例1~9において使用した実験材料および方法についてのさらなる詳細を提供する。
hESC(ES03、H9)およびヒトiPSC(19-9-11)を、既に公開された方法(Lian,X.et al.(2013)Nat.Proc.8:162-175;Lian,X.et al.(2013)Stem Cells 31:447-457)に従い、マトリゲル(ベクトン・デッキンソンバイオサイエンス)コートプレート上、mTeSR1培地(STEMCELL Technologies)において維持した。
マトリゲルコート表面上、mTeSR1中で維持したhPSCを、Accutaseで、37℃にて10分間、単一細胞に分離し、次に、マトリゲルコート細胞培養皿に、5μM ROCK阻害剤Y-27632を添加したmTeSR1中100,000~200,000細胞/cm2にて(-2日目)24時間播種した。-1日目に、細胞をmTeSR1において培養した。0日目に、細胞を、インスリンを含まないB27を添加したRPMI(RPMI/B27-ins)中1μM CHIR-98014(Selleckchem)で24時間(0日目~1日目)処理し、次に、それを、1日目の培地交換中に取り出した。3日目に、培地の半分を、2μM Wnt-C59(Selleckchem)を含有するRPMI/B27-ins培地に交換し、次に、それを、5日目の培地交換中に取り出した。6日目に、細胞を、単一細胞に分離させ、抗JAG1または抗FZD4抗体で精製した。
RNAを、単離し(RNeasy Mini kit、キアゲン)、定量し(Qubit RNA Assay Kit、ライフテクノロジーズ)、品質を管理した(BioAnalyzer 2100、アジレント)。各試料由来のRNA(800ng)を、Illumina TruSeq mRNA Sample Prep Kit v2(イルミナ)用のインプットとして使用し、製造元の指示に従い、配列決定ライブラリーを創出した。簡単に言うと、ポリA含有mRNA分子を、ポリTオリゴ結合磁気ビーズを使用して精製した。精製後、mRNAを断片化し、ランダムプライマーおよび逆転写酵素を使用して、第1の鎖相補性DNAにコピーした。次に、第2の鎖cDNA合成を、DNAポリメラーゼIおよびRNaseHを使用して行った。cDNAをアダプターにライゲーションし、PCRで富化して、最終的なcDNAライブラリーを創出した。ライブラリーをプールし、製造元の指示によって、HiSeq 2000(イルミナ)装置上で配列決定した。
RNA-seq読み取り値を編集し、Tophat2を使用して、hg19参照にマッピングした。平均して、1つの試料当たりおよそ2300万の読み取り値を生成し、これらの読み取り値の76%を独自にマッピングした。各遺伝子についての発現レベルを、パイソンスクリプトrpkmforgeneを使用して定量し、RefSeqを使用して注釈を付けた。少なくとも10の読み取り値を含む少なくとも1つの試料を含まない遺伝子を、解析から除いた。主成分分析およびヒートマップを、それぞれ、Rおよび遺伝子Eを使用して行った。
精製HVP200万個のアリコートを、エッペンドルフチューブに集めた。細胞をスピンダウンし、上清を捨てた。各チューブの細胞を、既に記載されたプロトコール(Shultz,L.D.et al.(2005)J.Immunol.174:6477-6489)に従い、それぞれ、免疫不全マウス、NOD.Cg-Prkdcscid Il2rgtm1Wjl/SzJまたはSCID-ベージュ(Charles River France)の腎被膜下に移植するか、または心臓に心筋内注射した。組織学的および生理学的解析のため、様々な時間間隔で、生着した腎臓または心臓を回収した。
細胞を、Accutaseで10分間、単一細胞に分離し、次に、1%パラホルムアルデヒドで20分間室温にて固定し、PBSプラス0.1%トリトンX-100および0.5%BSAにおいて1次抗体および2次抗体で染色した。データを、FACSCaliberフローサイトメーター(ベクトン・ディッキンソン)において収集し、FlowJoを使用して解析した。
細胞を、4%パラホルムアルデヒドで15分間室温にて固定し、次に、PBSプラス0.4%トリトンX-100および5%無脂肪乾燥ミルク(バイオ・ラッド)中の1次抗体ならびに2次抗体で染色した。核を、DAPIを含むGoldアンチフェード試薬(インビトロジェン)で染色した。画像解析のため、落射蛍光顕微鏡および共焦点顕微鏡(ZEISS、LSM700)を使用した。
細胞を、M-PER哺乳類タンパク質抽出試薬(Pierce)においてHaltタンパク質分解酵素およびホスファターゼ阻害剤カクテル(Pierce)の存在下で溶解した。タンパク質を、10%トリス-グリシンSDS/PAGE(インビトロジェン)により、変性条件下で分離し、ニトロセルロース膜に移した。TBST中の5%乾燥ミルクでブロッキング後、膜を、1次抗体と一晩4℃にてインキュベーションした。次に、膜を洗浄し、抗マウス/ウサギペルオキシダーゼ抱合2次抗体と室温にて1時間インキュベーションし、SuperSignal化学発光(Pierce)により現像した。
拍動する心室筋細胞クラスターを、顕微解剖し、記録前にガラスカバーガラスに再播種した。120mM K D-グルコン酸、25mM KCl、4mM MgATP、2mM NaGTP、4mM Na2-ホスホ-クレアチン、10mM EGTA、1mM CaCl2、および10mM HEPES(pH7.4、25℃にてHClで調節)からなる細胞内溶液を充填したホウケイ酸ガラスピペット(抵抗4~5M Ohm)を使用して、活動電位活性を評価した。カバーガラス皿上に播種した培養した心筋細胞を、140mM NaCl、5.4mM KCl、1mM MgCl2、10mMグルコース、1.8mM CaCl2、および10mM HEPES(pH7.4、25℃にてNaOHで調節)を含有する細胞外溶液(タイロード液)に浸した。自発活動電位を、1kHzで低減フィルターをかけたMulticlamp 700B amplifier(モレキュラーデバイス、カリフォルニア州、米国)ソフトウエアを使用して行ったパッチクランプ技術(細胞全体、現在のクランプ配置)を使用して、37℃にて記録し、Digidata 1322AおよびClampex 9.6ソフトウエア(モレキュラーデバイス、カリフォルニア州、米国)を使用して、デジタル化し、保存した。
データを、平均±平均の標準誤差(SEM)として表す。統計学的有意差を、2群間のスチューデントt検定(両側)により決定した。P<0.05を、統計学的に有意であるとみなした。
この実施例において、定義した異種成分不含有の培養培地、Essential8を利用する、ヒト心室前駆体の分化についての代わりの分化プロトコールを提供する。ヒト多能性幹細胞(hPSC)の成長および拡大のため、Essential8培地が開発され、Chen,G.et al.(2011)Nat.Methods 8:424-429(そこで「E8」培地として言及される)においてさらに記載される。
この実施例において、ヒト心室前駆細胞(HVP)において発現する血管新生ファミリー内の遺伝子を同定した。実施例1または11において記載した通り、HVPを生成し、実施例2において記載した通り、分化後の異なる時点にてRNA配列決定(RNA-seq)を行った。HVP分化中の異なる時点での遺伝子発現特性のクラスター解析により、ステージ特異的符号遺伝子を同定した。これらの遺伝子を、それらの発現特性の類似性に基づき、階層的にクラスター化した。まず、4つの異なるカテゴリーの発現を示す遺伝子を同定した:(i)細胞表面発現;(ii)Islet1との共発現;(iii)分化の5日目での高発現;および(iv)高い5日目/0日目の比。この解析により、JAG1、FZD4、FGFR3、LIFR(CD118)およびTNFSF9のHVPについての細胞表面マーカーを確かにした。次に、細胞表面マーカーを同定したHVPのこの同じ集団から、遺伝子個体発生検索を行い、HVPのこの集団において発現した血管新生ファミリー遺伝子を同定し、これにより、細胞生着に重大な遺伝子を同定する遺伝子フィンガープリント特性を同定した。
る血管新生遺伝子を挙げる。
この実施例において、ヒト心室前駆細胞(HVP)において発現する細胞外基質ファミリー内の遺伝子を同定した。実施例1または11において記載した通り、HVPを生成し、実施例2において記載した通り、分化後の異なる時点にてRNA配列決定(RNA-seq)を行った。HVP分化中の異なる時点での遺伝子発現特性のクラスター解析により、ステージ特異的符号遺伝子を同定した。これらの遺伝子を、それらの発現特性の類似性に基づき、階層的にクラスター化した。まず、4つの異なるカテゴリーの発現を示す遺伝子を同定した:(i)細胞表面発現;(ii)Islet1との共発現;(iii)分化の5日目での高発現;および(iv)高い5日目/0日目の比。この解析により、JAG1、FZD4、FGFR3、LIFR(CD118)およびTNFSF9のHVPについての細胞表面マーカーを確かにした。次に、細胞表面マーカーを同定したHVPのこの同じ集団から、遺伝子個体発生検索を行い、HVPのこの集団において発現した細胞外基質ファミリー遺伝子を同定し、これにより、細胞生着に重大な遺伝子を同定する遺伝子フィンガープリント特性を同定した。
この実施例において、遺伝子発現特性を、6日目のHVP集団内のIslet1陰性細胞について決定して、生着可能なHVPとして認定するための必須のマーカーを発現しない6日目の集団内の細胞の亜集団をさらに特徴付けた。実施例1または11において記載した通り、6日目のHVP集団を生成し、実施例2において記載した通り、分化後にRNA配列決定(RNA-seq)を行った。Islet1陰性(Isl1-)である細胞を、それらの遺伝子発現特性に関してさらに解析した。平均RNAコピー数2000以上を有するIsl1-細胞において発現する遺伝子を、表9において以下で示す。
当業者は、たかだか日常的な実験を使用して、本明細書において記載される本発明の特定の実施形態の多くの均等物を認識するか、または確定することができるだろう。かかる均等物は、以下の請求項により包含されることが意図される。
本発明の実施形態の例として以下の項目が挙げられる。
(項目1)
生着可能なヒト心室前駆細胞(HVP)を同定する方法であって、
前記HVPにおける少なくとも1つの生着マーカーの発現を検出し、これにより、生着可能なHVPを同定すること、を含み、
前記HVPはまた、JAG1、FZD4、LIFR、FGFR3および/またはTNFSF9からなる群から選択される少なくとも1つの表面マーカーを発現する、方法。
(項目2)
生着可能なヒト心室前駆細胞(HVP)を単離する方法であって、
心筋前駆細胞を含有するヒト細胞をヒト心室前駆細胞(HVP)への分化を引き起こす条件下で培養すること、
JAG1、FZD4、LIFR、FGFR3および/またはTNFSF9からなる群から選択される少なくとも1つの表面マーカーの前記HVP上での発現を検出すること、
少なくとも1つの生着マーカーの前記HVPにおける発現を検出すること、および、
前記少なくとも1つの表面マーカーと前記少なくとも1つの生着マーカーを共発現するHVPを単離し、これにより、生着可能なHVPを単離すること、を含む、方法。
(項目3)
対象においてヒト心室組織を生着させる方法であって、
ヒト心室組織が前記対象において生着されるように、生着可能なヒト心室前駆細胞(HVP)を前記対象に移植すること、を含み、
移植に先立ち、生着可能なHVPが、前記HVPにおける少なくとも1つの生着マーカーの発現を検出することにより同定され、
前記HVPが、JAG1、FZD4、LIFR、FGFR3および/またはTNFSF9からなる群から選択される少なくとも1つの表面マーカーを発現する、方法。
(項目4)
対象においてヒト心室組織を生着させる方法であって、
心筋前駆細胞を含有するヒト細胞をヒト心室前駆細胞(HVP)への分化を引き起こす条件下で培養すること、
JAG1、FZD4、LIFR、FGFR3および/またはTNFSF9からなる群から選択される少なくとも1つの表面マーカーの前記HVP上での発現を検出すること、
少なくとも1つの生着マーカーの前記HVPにおける発現を検出すること、
前記少なくとも1つの表面マーカーと前記少なくとも1つの生着マーカーを共発現するHVPを単離し、これにより、生着可能なHVPを単離すること、および、
ヒト心室組織が前記対象において生着されるように、生着可能な前記HVPを前記対象に移植すること、を含む、方法。
(項目5)
対象においてヒト心室組織を生着させる方法であって、
JAG1、FZD4、LIFR、FGFR3および/またはTNFSF9からなる群から選択される少なくとも1つの表面マーカーを発現するヒト心室前駆細胞(HVP)への分化を引き起こす条件下で心筋前駆細胞を含有するヒト細胞を培養すること、
前記少なくとも1つの表面マーカーを発現する前記HVPを単離して、HVP集団を形成すること;
前記HVP集団の試料における少なくとも1つの生着マーカーの発現を検出すること、および、
ヒト心室組織が、前記対象において生着されるように、前記少なくとも1つの表面マーカーおよび前記少なくとも1つの生着マーカーを発現する前記HVPを前記対象に移植すること、を含む、方法。
(項目6)
前記検出される少なくとも1つの生着マーカーが、少なくとも1つの陽性の血管新生マーカーである、項目1~5のいずれか1項に記載の方法。
(項目7)
3つ以上の陽性の血管新生マーカーが検出される、項目6に記載の方法。
(項目8)
10以上の陽性の血管新生マーカーが検出される、項目6に記載の方法。
(項目9)
前記検出される少なくとも1つの生着マーカーが、少なくとも1つの陽性の細胞外基質マーカーである、項目1~5のいずれか1項に記載の方法。
(項目10)
3つ以上の陽性の細胞外基質マーカーが検出される、項目9に記載の方法。
(項目11)
10以上の陽性の細胞外基質マーカーが検出される、項目9に記載の方法。
(項目12)
前記検出される少なくとも1つの生着マーカーが、少なくとも1つの陽性の血管新生マーカーおよび少なくとも1つの陽性の細胞外基質マーカーである、項目1~5のいずれか1項に記載の方法。
(項目13)
前記少なくとも1つの陽性の血管新生マーカーが、FGF10、PRKD1、CCBE1、PDGFRA、EPHB2、GATA2、NTRK1、PTGIS、BMPER、BMP4、C1GALT1、MEIS1、TBX1、PKNOX1、ID1、TCF21、HEY1、HOXB3、HGF、IL6、GHRL、IHH、SRPK2、GATA6、HAND1、AMOT、NRP2、PTEN、SEMA3E、APOLD1、SETD2、DAB2IP、KDR、PGF、EMP2、TAL1、ACVR1、HIPK2、CSPG4、TNFAIP3、NRP1、NFATC4、CDC42、ANGPTL4、BCAS3、HIPK1、NRXN3、FZD5およびHHEXからなる群から選択される、項目6~8および12のいずれか1項に記載の方法。
(項目14)
前記少なくとも1つの陽性の血管新生マーカーが、FGF10、PRKD1、CCBE1、PDGFRA、EPHB2、GATA2、NTRK1、PTGIS、BMPER、BMP4、C1GALT1、MEIS1、TBX1、PKNOX1、ID1、TCF21およびHEY1からなる群から選択される、項目13に記載の方法。
(項目15)
前記少なくとも陽性の血管新生マーカーが、FGF10、PRKD1、CCBE1、PDGFRA、EPHB2、GATA2およびNTRK1からなる群から選択される、項目13に記載の方法。
(項目16)
前記少なくとも1つの陽性の細胞外基質マーカーが、FGF10、SMOC1、CCBE1、COL6A6、ADAMTS12、COL19A1、LAMA1、BMP4、FBLN7、FBLN2、NDNF、HTRA1、HAPLN1、EMILIN1、SPOCK3、PODNL1、IHH、ACAN、NID2、COL4A6、LAMC1、FMOD、MUC4、EMID1、HMCN1、NID1、VCAN、CILP2、SOD3、ADAMTS3、ZP3、ANGPTL4、CRTAC1、LTBP4およびFREM1からなる群から選択される、項目9~12のいずれか1項に記載の方法。
(項目17)
前記少なくとも1つの陽性の細胞外基質マーカーが、FGF10、SMOC1、CCBE1、COL6A6、ADAMTS12、COL19A1、LAMA1、BMP4、FBLN7、FBLN2、NDNFおよびHTRA1からなる群から選択される、項目16に記載の方法。
(項目18)
前記少なくとも1つの陽性の細胞外基質マーカーが、FGF10、SMOC1およびCCBE1からなる群から選択される、項目16に記載の方法。
(項目19)
前記少なくとも1つの陽性の血管新生マーカーが、FGF10、PRKD1、CCBE1、PDGFRA、EPHB2、GATA2、NTRK1、PTGIS、BMPER、BMP4、C1GALT1、MEIS1、TBX1、PKNOX1、ID1、TCF21、HEY1、HOXB3、HGF、IL6、GHRL、IHH、SRPK2、GATA6、HAND1、AMOT、NRP2、PTEN、SEMA3E、APOLD1、SETD2、DAB2IP、KDR、PGF、EMP2、TAL1、ACVR1、HIPK2、CSPG4、TNFAIP3、NRP1、NFATC4、CDC42、ANGPTL4、BCAS3、HIPK1、NRXN3、FZD5およびHHEXからなる群から選択され、
前記少なくとも1つの陽性の細胞外基質マーカーが、FGF10、SMOC1、CCBE1、COL6A6、ADAMTS12、COL19A1、LAMA1、BMP4、FBLN7、FBLN2、NDNF、HTRA1、HAPLN1、EMILIN1、SPOCK3、PODNL1、IHH、ACAN、NID2、COL4A6、LAMC1、FMOD、MUC4、EMID1、HMCN1、NID1、VCAN、CILP2、SOD3、ADAMTS3、ZP3、ANGPTL4、CRTAC1、LTBP4およびFREM1からなる群から選択される、項目12に記載の方法。
(項目20)
前記少なくとも1つの陽性の血管新生マーカーが、FGF10、PRKD1、CCBE1、PDGFRA、EPHB2、GATA2、NTRK1、PTGIS、BMPER、BMP4、C1GALT1、MEIS1、TBX1、PKNOX1、ID1、TCF21およびHEY1からなる群から選択され、
前記少なくとも1つの陽性の細胞外基質マーカーが、FGF10、SMOC1、CCBE1、COL6A6、ADAMTS12、COL19A1、LAMA1、BMP4、FBLN7、FBLN2、NDNFおよびHTRA1からなる群から選択される、項目19に記載の方法。
(項目21)
前記少なくとも1つの陽性の血管新生マーカーが、FGF10、PRKD1、CCBE1、PDGFRA、EPHB2、GATA2およびNTRK1からなる群から選択され、
前記少なくとも1つの陽性の細胞外基質マーカーが、FGF10、SMOC1およびCCBE1からなる群から選択される、項目19に記載の方法。
(項目22)
前記検出される少なくとも1つの生着マーカーが、少なくとも1つの陰性の血管新生マーカーである、項目1~5のいずれか1項に記載の方法。
(項目23)
前記検出される少なくとも1つの生着マーカーが、少なくとも1つの陰性の細胞外基質マーカーである、項目1~5のいずれか1項に記載の方法。
(項目24)
前記検出される少なくとも1つの生着マーカーが、少なくとも1つの陰性の血管新生マーカーおよび少なくとも1つの陰性の細胞外基質マーカーである、項目1~5のいずれか1項に記載の方法。
(項目25)
前記少なくとも1つの陰性の血管新生マーカーが、ETS1、BAX、XBP1、TDGF1、C5AR1、EPHA1、HS6ST1、SHC1、SP100、JAM3、CASP8、FLT4、SFRP2、HPSE、BAK1、GPX1、VAV3、VAV2、EGF、ADAM15およびAGGF1からなる群から選択される、項目22または項目24に記載の方法。
(項目26)
前記少なくとも1つの陰性の血管新生マーカーが、VAV3、VAV2、EGF、ADAM15およびAGGF1からなる群から選択される、項目25に記載の方法。
(項目27)
前記少なくとも1つの陰性の細胞外基質マーカーが、FKBP1A、CLU、TFP12、PLSCR1、FBLN5、VWA1、ADAMTS16、MMP25、SFRP2およびSOD1からなる群から選択される、項目23または24に記載の方法。
(項目28)
前記少なくとも1つの陰性の血管新生マーカーが、ETS1、BAX、XBP1、TDGF1、C5AR1、EPHA1、HS6ST1、SHC1、SP100、JAM3、CASP8、FLT4、SFRP2、HPSE、BAK1、GPX1、VAV3、VAV2、EGF、ADAM15およびAGGF1からなる群から選択され、
前記少なくとも1つの陰性の細胞外基質マーカーが、FKBP1A、CLU、TFP12、PLSCR1、FBLN5、VWA1、ADAMTS16、MMP25、SFRP2およびSOD1からなる群から選択される、項目24に記載の方法。
(項目29)
少なくとも1つの生着マーカーの発現を検出することが、前記HVPにおける前記少なくとも1つの生着マーカーをコードするmRNAの発現を検出することを含む、項目1~21のいずれか1項に記載の方法。
(項目30)
少なくとも1つの生着マーカーの発現を検出することが、前記HVPにおける前記少なくとも1つの生着マーカーをコードするmRNAの発現の欠如を検出することを含む、項目1~5および22~28のいずれか1項に記載の方法。
Claims (25)
- 生着可能なIsl1+ヒト心室前駆細胞(HVP)を含むヒト心室前駆細胞(HVP)の集団を同定する方法であって、
培養の0日目に、Gsk3阻害剤を含む培養培地中でヒト多能性幹細胞(HPSC)を培養し、3日目に培養培地を交換し、培養の3~5日目にPorcn阻害剤を含む培養培地中で該細胞をさらに培養し、培養の5~7日目にHVPを単離することにより、Isl1+HVPを含む前記HVPの集団を同定すること、
前記Isl1+HVPを含む前記同定されたHVPの集団から試料を得ること、および
前記試料における少なくとも1つの生着マーカーの発現を検出すること
を含み、
前記Isl1+HVPはまた、JAG1、FZD4、LIFR、FGFR3および/またはTNFSF9からなる群から選択される少なくとも1つの表面マーカーを発現し、
前記少なくとも1つの生着マーカーは、少なくとも1つの血管新生マーカーおよび/または少なくとも1つの細胞外基質マーカーであり、
前記少なくとも1つの血管新生マーカーが、少なくとも1つの陽性の血管新生マーカーまたは少なくとも1つの陰性の血管新生マーカーであり、ここで、
前記少なくとも1つの陽性の血管新生マーカーが、FGF10、PRKD1、CCBE1、PDGFRA、EPHB2、GATA2、NTRK1、PTGIS、BMPER、BMP4、C1GALT1、MEIS1、TBX1、PKNOX1、ID1、TCF21、HEY1、HOXB3、HGF、IL6、GHRL、IHH、SRPK2、GATA6、HAND1、AMOT、NRP2、PTEN、SEMA3E、APOLD1、SETD2、DAB2IP、KDR、PGF、EMP2、TAL1、ACVR1、HIPK2、CSPG4、TNFAIP3、NRP1、NFATC4、CDC42、ANGPTL4、B+CAS3、HIPK1、NRXN3、FZD5およびHHEXからなる群から選択され;
前記少なくとも1つの陰性の血管新生マーカーが、ETS1、BAX、XBP1、TDGF1、C5AR1、EPHA1、HS6ST1、SHC1、SP100、JAM3、CASP8、FLT4、SFRP2、HPSE、BAK1、GPX1、VAV3、VAV2、EGF、ADAM15およびAGGF1からなる群から選択され、
前記少なくとも1つの細胞外基質マーカーが、少なくとも1つの陽性の細胞外基質マーカーまたは少なくとも1つの陰性の細胞外基質マーカーであり、ここで、
前記少なくとも1つの陽性の細胞外基質マーカーが、FGF10、SMOC1、CCBE1、COL6A6、ADAMTS12、COL19A1、LAMA1、BMP4、FBLN7、FBLN2、NDNF、HTRA1、HAPLN1、EMILIN1、SPOCK3、PODNL1、IHH、ACAN、NID2、COL4A6、LAMC1、FMOD、MUC4、EMID1、HMCN1、NID1、VCAN、CILP2、SOD3、ADAMTS3、ZP3、ANGPTL4、CRTAC1、LTBP4およびFREM1からなる群から選択され;
前記少なくとも1つの陰性の細胞外基質マーカーが、FKBP1A、CLU、TFP12、PLSCR1、FBLN5、VWA1、ADAMTS16、MMP25、SFRP2およびSOD1からなる群から選択され;
前記少なくとも1つの生着マーカーの発現が、前記同定されたHVPの集団が生着可能なIsl1+HVPを含むことを示す、方法。 - 対象においてヒト心室組織を生着させるための、生着可能なIsl1+のヒト心室前駆細胞(Isl1+HVP)を含むヒト心室前駆細胞(HVP)の集団を含む組成物であって、前記組成物は、ヒト心室組織が前記対象において生着されるように前記対象に移植されることを特徴とし、ここで、
生着可能なIsl1+HVPを含む前記HVPの集団は、
培養の0日目に、Gsk3阻害剤を含む培養培地中でヒト多能性幹細胞(HPSC)を培養し、3日目に培養培地を交換し、培養の3~5日目にPorcn阻害剤を含む培養培地中で該細胞をさらに培養し、培養の5~7日目に細胞を単離することによってIsl1+HVPを含む前記HVPの集団を得ることによって得られ、
生着可能なIsl1+HVPを含む前記HVPの集団は、Isl1+HVPを含む前記HVPの集団の試料を得て、Isl1+HVPを含む前記HVPの集団の前記試料における少なくとも1つの生着マーカーの発現を検出することにより移植に先立って同定されたものであり、前記少なくとも1つの生着マーカーは、少なくとも1つの血管新生マーカーおよび/または少なくとも1つの細胞外基質マーカーであり、
前記Isl1+HVPが、JAG1、FZD4、LIFR、FGFR3および/またはTNFSF9からなる群から選択される少なくとも1つの表面マーカーを発現し、
前記少なくとも1つの血管新生マーカーが、少なくとも1つの陽性の血管新生マーカーまたは少なくとも1つの陰性の血管新生マーカーであり、ここで、
前記少なくとも1つの陽性の血管新生マーカーが、FGF10、PRKD1、CCBE1、PDGFRA、EPHB2、GATA2、NTRK1、PTGIS、BMPER、BMP4、C1GALT1、MEIS1、TBX1、PKNOX1、ID1、TCF21、HEY1、HOXB3、HGF、IL6、GHRL、IHH、SRPK2、GATA6、HAND1、AMOT、NRP2、PTEN、SEMA3E、APOLD1、SETD2、DAB2IP、KDR、PGF、EMP2、TAL1、ACVR1、HIPK2、CSPG4、TNFAIP3、NRP1、NFATC4、CDC42、ANGPTL4、BCAS3、HIPK1、NRXN3、FZD5およびHHEXからなる群から選択され;
前記少なくとも1つの陰性の血管新生マーカーが、ETS1、BAX、XBP1、TDGF1、C5AR1、EPHA1、HS6ST1、SHC1、SP100、JAM3、CASP8、FLT4、SFRP2、HPSE、BAK1、GPX1、VAV3、VAV2、EGF、ADAM15およびAGGF1からなる群から選択され、
前記少なくとも1つの細胞外基質マーカーが、少なくとも1つの陽性の細胞外基質マーカーまたは少なくとも1つの陰性の細胞外基質マーカーであり、ここで、
前記少なくとも1つの陽性の細胞外基質マーカーが、FGF10、SMOC1、CCBE1、COL6A6、ADAMTS12、COL19A1、LAMA1、BMP4、FBLN7、FBLN2、NDNF、HTRA1、HAPLN1、EMILIN1、SPOCK3、PODNL1、IHH、ACAN、NID2、COL4A6、LAMC1、FMOD、MUC4、EMID1、HMCN1、NID1、VCAN、CILP2、SOD3、ADAMTS3、ZP3、ANGPTL4、CRTAC1、LTBP4およびFREM1からなる群から選択され;
前記少なくとも1つの陰性の細胞外基質マーカーが、FKBP1A、CLU、TFP12、PLSCR1、FBLN5、VWA1、ADAMTS16、MMP25、SFRP2およびSOD1からなる群から選択され;
前記少なくとも1つの生着マーカーの発現が、前記HVPの集団が生着可能なIsl1+HVPを含むことを示す、組成物。 - 対象においてヒト心室組織を生着させるための、生着可能なIsl1+のヒト心室前駆細胞(Isl1+HVP)を含むヒト心室前駆細胞(HVP)の集団を含む組成物であって、生着可能なIsl1+HVPを含む前記HVPの集団は、
培養の0日目に、Gsk3阻害剤を含む培養培地中でヒト多能性幹細胞(HPSC)を培養し、3日目に培養培地を交換し、培養の3~5日目にPorcn阻害剤を含む培養培地中で該細胞をさらに培養し、培養の5~7日目に細胞を単離することにより、JAG1、FZD4、LIFR、FGFR3および/またはTNFSF9からなる群から選択される少なくとも1つの表面マーカーを発現するIsl1+ヒト心室前駆細胞(Isl1+HVP)を含む前記HVPの集団を得ること;および
前記HVPの集団の試料における少なくとも1つの生着マーカーの発現を検出することであって、前記少なくとも1つの生着マーカーは、少なくとも1つの血管新生マーカーおよび/または少なくとも1つの細胞外基質マーカーである、検出すること
によって得られたものであり、前記組成物は、ヒト心室組織が、前記対象において生着されるように、前記対象に移植されることを特徴とし、
前記少なくとも1つの血管新生マーカーが、少なくとも1つの陽性の血管新生マーカーまたは少なくとも1つの陰性の血管新生マーカーであり、ここで、
前記少なくとも1つの陽性の血管新生マーカーが、FGF10、PRKD1、CCBE1、PDGFRA、EPHB2、GATA2、NTRK1、PTGIS、BMPER、BMP4、C1GALT1、MEIS1、TBX1、PKNOX1、ID1、TCF21、HEY1、HOXB3、HGF、IL6、GHRL、IHH、SRPK2、GATA6、HAND1、AMOT、NRP2、PTEN、SEMA3E、APOLD1、SETD2、DAB2IP、KDR、PGF、EMP2、TAL1、ACVR1、HIPK2、CSPG4、TNFAIP3、NRP1、NFATC4、CDC42、ANGPTL4、BCAS3、HIPK1、NRXN3、FZD5およびHHEXからなる群から選択され;
前記少なくとも1つの陰性の血管新生マーカーが、ETS1、BAX、XBP1、TDGF1、C5AR1、EPHA1、HS6ST1、SHC1、SP100、JAM3、CASP8、FLT4、SFRP2、HPSE、BAK1、GPX1、VAV3、VAV2、EGF、ADAM15およびAGGF1からなる群から選択され、
前記少なくとも1つの細胞外基質マーカーが、少なくとも1つの陽性の細胞外基質マーカーまたは少なくとも1つの陰性の細胞外基質マーカーであり、ここで、
前記少なくとも1つの陽性の細胞外基質マーカーが、FGF10、SMOC1、CCBE1、COL6A6、ADAMTS12、COL19A1、LAMA1、BMP4、FBLN7、FBLN2、NDNF、HTRA1、HAPLN1、EMILIN1、SPOCK3、PODNL1、IHH、ACAN、NID2、COL4A6、LAMC1、FMOD、MUC4、EMID1、HMCN1、NID1、VCAN、CILP2、SOD3、ADAMTS3、ZP3、ANGPTL4、CRTAC1、LTBP4およびFREM1からなる群から選択され;
前記少なくとも1つの陰性の細胞外基質マーカーが、FKBP1A、CLU、TFP12、PLSCR1、FBLN5、VWA1、ADAMTS16、MMP25、SFRP2およびSOD1からなる群から選択され;
前記少なくとも1つの生着マーカーの発現が、前記HVPの集団が生着可能なIsl1+HVPを含むことを示す、組成物。 - 前記検出される少なくとも1つの生着マーカーが、少なくとも1つの陽性の血管新生マーカーおよび/または少なくとも1つの陽性の細胞外基質マーカーである、請求項1に記載の方法。
- 3つ以上の陽性の血管新生マーカーが検出される、および/または3つ以上の陽性の細胞外基質マーカーが検出される、請求項4に記載の方法。
- 10以上の陽性の血管新生マーカーが検出される、および/または10以上の陽性の細胞外基質マーカーが検出される、請求項4に記載の方法。
- 前記検出される少なくとも1つの生着マーカーが、少なくとも1つの陽性の血管新生マーカーおよび少なくとも1つの陽性の細胞外基質マーカーである、請求項1に記載の方法。
- 前記少なくとも1つの陽性の血管新生マーカーが、FGF10、PRKD1、CCBE1、PDGFRA、EPHB2、GATA2、NTRK1、PTGIS、BMPER、BMP4、C1GALT1、MEIS1、TBX1、PKNOX1、ID1、TCF21およびHEY1からなる群から選択される;および/または
前記少なくとも1つの陽性の細胞外基質マーカーが、FGF10、SMOC1、CCBE1、COL6A6、ADAMTS12、COL19A1、LAMA1、BMP4、FBLN7、FBLN2、NDNFおよびHTRA1からなる群から選択される、請求項4~7のいずれか1項に記載の方法。 - 前記少なくとも1つの陽性の血管新生マーカーが、FGF10、PRKD1、CCBE1、PDGFRA、EPHB2、GATA2およびNTRK1からなる群から選択される;および/または
前記少なくとも1つの陽性の細胞外基質マーカーが、FGF10、SMOC1およびCCBE1からなる群から選択される、請求項4~7のいずれか1項に記載の方法。 - 前記検出される少なくとも1つの生着マーカーが、少なくとも1つの陰性の血管新生マーカーおよび/または少なくとも1つの陰性の細胞外基質マーカーである、請求項1に記載の方法。
- 前記検出される少なくとも1つの生着マーカーが、少なくとも1つの陰性の血管新生マーカーおよび少なくとも1つの陰性の細胞外基質マーカーである、請求項1に記載の方法。
- 前記少なくとも1つの陰性の血管新生マーカーが、VAV3、VAV2、EGF、ADAM15およびAGGF1からなる群から選択される、請求項10または11に記載の方法。
- 少なくとも1つの生着マーカーの発現を検出することが、前記HVPにおける前記少なくとも1つの生着マーカーをコードするmRNAの発現を検出することを含む、請求項1および4~9のいずれか1項に記載の方法。
- 少なくとも1つの生着マーカーの発現を検出することが、前記HVPにおける前記少なくとも1つの生着マーカーをコードするmRNAの発現の欠如を検出することを含む、請求項1および10~12のいずれか1項に記載の方法。
- 前記検出される少なくとも1つの生着マーカーが、少なくとも1つの陽性の血管新生マーカーおよび/または少なくとも1つの陽性の細胞外基質マーカーである、請求項2または3に記載の組成物。
- 3つ以上の陽性の血管新生マーカーが検出されている、および/または3つ以上の陽性の細胞外基質マーカーが検出されている、請求項15に記載の組成物。
- 10以上の陽性の血管新生マーカーが検出されている、および/または10以上の陽性の細胞外基質マーカーが検出されている、請求項16に記載の組成物。
- 前記検出される少なくとも1つの生着マーカーが、少なくとも1つの陽性の血管新生マーカーおよび少なくとも1つの陽性の細胞外基質マーカーである、請求項2または3に記載の組成物。
- 前記少なくとも1つの陽性の血管新生マーカーが、FGF10、PRKD1、CCBE1、PDGFRA、EPHB2、GATA2、NTRK1、PTGIS、BMPER、BMP4、C1GALT1、MEIS1、TBX1、PKNOX1、ID1、TCF21およびHEY1からなる群から選択される;および/または
前記少なくとも1つの陽性の細胞外基質マーカーが、FGF10、SMOC1、CCBE1、COL6A6、ADAMTS12、COL19A1、LAMA1、BMP4、FBLN7、FBLN2、NDNFおよびHTRA1からなる群から選択される、請求項15~18のいずれか1項に記載の組成物。 - 前記少なくとも1つの陽性の血管新生マーカーが、FGF10、PRKD1、CCBE1、PDGFRA、EPHB2、GATA2およびNTRK1からなる群から選択される;および/または
前記少なくとも1つの陽性の細胞外基質マーカーが、FGF10、SMOC1およびCCBE1からなる群から選択される、請求項19に記載の組成物。 - 前記検出される少なくとも1つの生着マーカーが、少なくとも1つの陰性の血管新生マーカーおよび/または少なくとも1つの陰性の細胞外基質マーカーである、請求項2または3に記載の組成物。
- 前記検出される少なくとも1つの生着マーカーが、少なくとも1つの陰性の血管新生マーカーおよび少なくとも1つの陰性の細胞外基質マーカーである、請求項2または3に記載の組成物。
- 前記少なくとも1つの陰性の血管新生マーカーが、VAV3、VAV2、EGF、ADAM15およびAGGF1からなる群から選択される、請求項21または22に記載の組成物。
- 少なくとも1つの生着マーカーの発現を検出することが、前記HVPの集団に由来する前記試料における前記少なくとも1つの生着マーカーをコードするmRNAの発現を検出することを含む、請求項2、3および15~20のいずれか1項に記載の組成物。
- 少なくとも1つの生着マーカーの発現を検出することが、前記HVPの集団に由来する前記試料における前記少なくとも1つの生着マーカーをコードするmRNAの発現の欠如を検出することを含む、請求項2、3および21~23のいずれか1項に記載の組成物。
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