JP6658884B2 - クロマトグラフ質量分析用データ処理装置 - Google Patents
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Description
a)含有を確認したい測定対象化合物に対応付けて、保持時間、保持指標、定量イオンの質量電荷比、確認イオンの質量電荷比、確認イオン比のうちの少なくとも一つを含む化合物情報が記憶された化合物情報記憶部と、
b)クロマトグラフ質量分析装置で測定を行うことにより得られたデータに基づいてクロマトグラムを作成し、該クロマトグラム上で検出されるピークについて、前記化合物情報記憶部に記憶されている一つの測定対象化合物に対応する化合物情報を利用して前記ピークが当該化合物に対応するか否かを判定し、対応する場合に該化合物をそのピークに対応する化合物候補として決定する、という処理を測定対象化合物毎に行うピーク同定部と、
c)前記ピーク同定部により決定された化合物候補と該化合物候補に対応付けられているピークの実測保持時間とをリスト化し、ピークの実測保持時間が同一である又は同一の所定許容時間範囲内である複数の化合物候補をリストから抽出する同一ピーク対応化合物候補抽出部と、
を備えることを特徴としている。
前記化合物情報記憶部には化合物情報として保持時間が記憶されており、
前記化合物候補グループ化部によりグループ化された、一つのピークに対応する複数の化合物候補のグループ毎に、当該グループに含まれる複数の化合物候補についての前記化合物情報記憶部に記憶されている保持時間と実測保持時間との差の絶対値を比較し、その差の絶対値が最小である化合物候補を該候補が抽出されたピークに対応する最も確からしい化合物として判断する化合物候補判定部、をさらに備えることを特徴としている。
前記化合物情報記憶部には化合物情報としてマススペクトルが記憶されており、
前記化合物候補グループ化部によりグループ化された、一つのピークに対応する複数の化合物候補のグループ毎に、当該グループに含まれる複数の化合物候補についてのマススペクトルと該候補が抽出されたクロマトグラムピークのピークトップ位置における実測マススペクトルとの類似度を算出し、その類似度が最も高い化合物候補を該候補が抽出されたピークに対応する最も確からしい化合物として判断する化合物候補判定部、をさらに備えることを特徴としている。
前記化合物情報記憶部には化合物情報として確認イオン比の基準値が記憶されており、
前記化合物候補グループ化部によりグループ化された、一つのピークに対応する複数の化合物候補のグループ毎に、当該グループに含まれる複数の化合物候補についての前記基準値と該候補が抽出されたクロマトグラムピークのピークトップ位置における確認イオン比との差の絶対値を算出し、その差の絶対値が最小である化合物候補を該候補が抽出されたピークに対応する最も確からしい化合物として判断する化合物候補判定部、をさらに備えることを特徴としている。
前記化合物情報記憶部には化合物情報として確認イオン比の基準値が記憶されており、
前記化合物候補グループ化部によりグループ化された、一つのピークに対応する複数の化合物候補のグループ毎に、当該グループに含まれる複数の化合物候補についての前記基準値と該候補が抽出されたクロマトグラムピークのピークトップ位置における確認イオン比との比率を算出し、その比率と1との差の絶対値が最小である化合物候補を該候補が抽出されたピークに対応する最も確からしい化合物として判断する化合物候補判定部、をさらに備えることを特徴としている。
ただし、例えば化合物情報である保持時間情報と実測保持時間との差が全く同じ化合物候補が複数存在する場合には、その複数の化合物候補をそのままそのピークに対応する化合物として決定してもよい。即ち、必ずしも或る一つの化合物として一つのピークを同定しなくてもよい。
即ち、本発明に係るクロマトグラフ質量分析用データ処理装置では、
前記化合物候補グループ化部によりグループ化された、一つのピークに対応する複数の化合物候補のグループ毎に、当該グループに含まれる複数の化合物候補についての前記化合物情報記憶部に記憶されている保持時間と実測保持時間との差の絶対値を比較し、その差の絶対値が最小である化合物候補を該候補が抽出されたピークに対応する化合物として判断する第1の判定処理と、
前記化合物候補グループ化部によりグループ化された、一つのピークに対応する複数の化合物候補のグループ毎に、当該グループに含まれる複数の化合物候補についてのマススペクトルと該候補が抽出されたクロマトグラムピークのピークトップ位置における実測マススペクトルとの類似度を算出し、その類似度が最も高い化合物候補を該候補が抽出されたピークに対応する化合物として判断する第2の判定処理と、
前記化合物候補グループ化部によりグループ化された、一つのピークに対応する複数の化合物候補のグループ毎に、当該グループに含まれる複数の化合物候補についての前記基準値と該候補が抽出されたクロマトグラムピークのピークトップ位置における確認イオン比との差の絶対値を算出し、その差の絶対値が最小である化合物候補を該候補が抽出されたピークに対応する化合物として判断する、又は、そのグループに含まれる複数の化合物候補についての前記基準値と該候補が抽出されたクロマトグラムピークのピークトップ位置における確認イオン比との比率を算出し、その比率と1との差の絶対値が最小である化合物候補を該候補が抽出されたピークに対応する化合物として判断する第3の判定処理と、のうちの二つ以上の判定処理を用いて得られた化合物候補を、抽出されたピークに対応する最も確からしい化合物として判断する化合物候補判定部、をさらに備える構成としてもよい。
なお、データ処理部2、分析制御部3、中央制御部4は、パーソナルコンピュータやより高性能なワークステーションをハードウエアとし、該コンピュータにインストールされた専用の制御・処理ソフトウエアを実行することによりそれぞれの機能を具現化する構成とすることができる。
まず、測定部1により目的試料に対するGC/MS分析を実行しデータを収集する(ステップS1)。即ち、分析者が入力部5で所定の操作を行うと、中央制御部4から指示を受けた分析制御部3の制御の下で、測定部1では目的試料に対するGC/MS分析が実行される。この際に、MS部12では予め設定された質量電荷比範囲に亘るスキャン測定が繰り返し実行され、1回のスキャン測定毎に該質量電荷比範囲のマススペクトルデータがデータ処理部2に入力されデータ格納部21に格納される。
具体的に、ピーク同定部23は、収集されたデータに基づいて、化合物データベース22に登録されている化合物毎に、その保持時間付近の所定時間範囲について定量イオンの質量電荷比及び確認イオンの質量電荷比におけるマスクロマトグラム(抽出イオンクロマトグラム)を作成し、該マスクロマトグラム上でピークを検出する。或る測定対象化合物について、定量イオンの質量電荷比におけるマスクロマトグラム上のピークのピークトップの位置を実測保持時間とし、その実測保持時間とデータベース22に登録されている保持時間(設定保持時間)との差が所定の許容値以内であるか否かを判定する。保持時間差が許容値以内である場合には、さらに、マスクロマトグラム上のピークの面積値から算出した確認イオン比と確認イオン比基準値との差が所定の許容値以内であるか否かを判定し、その差が許容値以内であれば、その対象とする化合物をそのピークに対応する化合物候補として決定する。なお、上述したように、確認イオン比に代えて又は確認イオン比と併せて、マススペクトルのパターンの類似度を判定することにより、対象とする化合物としてピークを同定することの可否を決定するようにしてもよい。
まず保持時間リスト作成部24は、ピーク同定結果で挙げられている化合物全てについて、同定されたピークの実測保持時間のリストを作成する(ステップS3)。図3(a)はこの保持時間リストの簡単な一例である。化合物(化合物候補)は名称がA〜Gである7種類であり、Ta〜Tgは化合物データベース22に登録されている各化合物A〜Gに対応する保持時間である。x1、x2、x3は上記ステップS2におけるピーク同定の際に、当該化合物として同定されたピークの実測保持時間である。
(1)化合物候補の設定保持時間と同定されたピークの実測保持時間との差の絶対値を計算し、グループ内でその値が最も小さい化合物候補を選定する。図3(b)に示すグループ1では、化合物(化合物候補)Aに対する保持時間差は|Ta−x1|、化合物(化合物候補)Bに対する保持時間差は|Tb−x1|である。もし|Ta−x1|<|Tb−x1|であれば化合物Aが選定され、|Ta−x1|>|Tb−x1|であれば化合物Bが選定される。
(2)化合物候補に対応する標準マススペクトルと同定されたピークのピークトップ位置における実測マススペクトルとのパターンの類似度を計算し、グループ内で類似度の値が最も大きい化合物候補を選定する。
(3)化合物候補に対応する確認イオン比基準値と同定されたピークについて実測のマスクロマトグラムから求めた確認イオン比との値の差の絶対値を計算し、グループ内でその値が最も小さい(つまりは実測の確認イオン比が確認イオン比基準値に最も近い)化合物候補を選定する。
(4)化合物候補に対応する確認イオン比基準値に対する同定されたピークについての実測の確認イオン比の値の比を計算し、その比の値と1との差(絶対値)が最小である化合物候補を選定する。これは(3)と同様に、実測の確認イオン比が確認イオン比基準値に最も近い化合物候補を探索する方法である。
同定結果表示処理部27は、このように多重同定がある場合には最も確からしい化合物として自動的に選定された化合物候補を明示したうえでピーク同定結果を表示部6の画面上に表示する(ステップS8)。これにより、分析者は多重同定されているピークを確認するとともに、そのピークに対する最も確からしい化合物候補を知ることができる。
11…ガスクロマトグラフ(GC)部
12…質量分析(MS)部
13…アナログデジタル変換器
2…データ処理部
21…データ格納部
22…化合物データベース
23…ピーク同定部
24…保持時間リスト作成部
25…多重同定識別部
26…化合物候補判定部
27…同定結果表示処理部
3…分析制御部
4…中央制御部
5…入力部
6…表示部
Claims (14)
- 目的試料に対しクロマトグラフ質量分析装置で所定質量電荷比範囲のスキャン測定、所定の質量電荷比におけるSIM測定、又は所定のMRMトランジションにおけるMRM測定のいずれかを繰り返し行うことで得られたデータに基づいて作成されるクロマトグラム上で検出されるピークに対応する化合物を特定するクロマトグラフ質量分析データ処理装置であって、
a)含有を確認したい測定対象化合物に対応付けて、保持時間、保持指標、定量イオンの質量電荷比、確認イオンの質量電荷比、確認イオン比のうちの少なくとも一つを含む化合物情報が記憶された化合物情報記憶部と、
b)クロマトグラフ質量分析装置で測定を行うことにより得られたデータに基づいてクロマトグラムを作成し、該クロマトグラム上で検出されるピークについて、前記化合物情報記憶部に記憶されている一つの測定対象化合物に対応する化合物情報を利用して前記ピークが当該化合物に対応するか否かを判定し、対応する場合に該化合物をそのピークに対応する化合物候補として決定する、という処理を測定対象化合物毎に行うピーク同定部と、
c)前記ピーク同定部により決定された化合物候補と該化合物候補に対応付けられているピークの実測保持時間とをリスト化し、ピークの実測保持時間が同一である又は同一の所定許容時間範囲内である複数の化合物候補をリストから抽出する同一ピーク対応化合物候補抽出部と、
を備えることを特徴とするクロマトグラフ質量分析用データ処理装置。 - 請求項1に記載のクロマトグラフ質量分析用データ処理装置であって、
前記化合物情報記憶部には化合物情報としてマススペクトルが記憶されており、
前記ピーク同定部は、前記化合物情報記憶部に記憶されている一つの測定対象化合物に対応する化合物情報を利用して前記ピークが当該化合物に対応するか否かを判定するとともに、該ピークの位置におけるマススペクトルと前記化合物情報として記憶されているマススペクトルとのパターンの類似度を判定し、それら二つの判定結果により該化合物をそのピークに対応する化合物候補として決定する、という処理を行うことを特徴とするクロマトグラフ質量分析用データ処理装置。 - 請求項1に記載のクロマトグラフ質量分析用データ処理装置であって、
前記同一ピーク対応化合物候補抽出部により抽出された化合物候補を、各ピークに対応付けてグループ分けする化合物候補グループ化部、をさらに備えることを特徴とするクロマトグラフ質量分析用データ処理装置。 - 請求項3に記載のクロマトグラフ質量分析用データ処理装置であって、
前記化合物候補グループ化部により各ピークに対応付けてグループ化された化合物候補を示す情報を外部へと出力する情報出力部、をさらに備えることを特徴とするクロマトグラフ質量分析用データ処理装置。 - 請求項3に記載のクロマトグラフ質量分析用データ処理装置であって、
前記化合物情報記憶部には化合物情報として保持時間が記憶されており、
前記化合物候補グループ化部によりグループ化された、一つのピークに対応する複数の化合物候補のグループ毎に、当該グループに含まれる複数の化合物候補についての前記化合物情報記憶部に記憶されている保持時間と実測保持時間との差の絶対値を比較し、その差の絶対値が最小である化合物候補を該候補が抽出されたピークに対応する最も確からしい化合物として判断する化合物候補判定部、をさらに備えることを特徴とするクロマトグラフ質量分析用データ処理装置。 - 請求項3に記載のクロマトグラフ質量分析用データ処理装置であって、
前記化合物情報記憶部には化合物情報としてマススペクトルが記憶されており、
前記化合物候補グループ化部によりグループ化された、一つのピークに対応する複数の化合物候補のグループ毎に、当該グループに含まれる複数の化合物候補についてのマススペクトルと該候補が抽出されたクロマトグラムピークのピークトップ位置における実測マススペクトルとの類似度を算出し、その類似度が最も高い化合物候補を該候補が抽出されたピークに対応する最も確からしい化合物として判断する化合物候補判定部、をさらに備えることを特徴とするクロマトグラフ質量分析用データ処理装置。 - 請求項3に記載のクロマトグラフ質量分析用データ処理装置であって、
前記化合物情報記憶部には化合物情報として確認イオン比の基準値が記憶されており、
前記化合物候補グループ化部によりグループ化された、一つのピークに対応する複数の化合物候補のグループ毎に、当該グループに含まれる複数の化合物候補についての前記基準値と該候補が抽出されたクロマトグラムピークのピークトップ位置における確認イオン比との差の絶対値を算出し、その差の絶対値が最小である化合物候補を該候補が抽出されたピークに対応する最も確からしい化合物として判断する化合物候補判定部、をさらに備えることを特徴とするクロマトグラフ質量分析用データ処理装置。 - 請求項3に記載のクロマトグラフ質量分析用データ処理装置であって、
前記化合物情報記憶部には化合物情報として確認イオン比の基準値が記憶されており、
前記化合物候補グループ化部によりグループ化された、一つのピークに対応する複数の化合物候補のグループ毎に、当該グループに含まれる複数の化合物候補についての前記基準値と該候補が抽出されたクロマトグラムピークのピークトップ位置における確認イオン比との比率を算出し、その比率と1との差の絶対値が最小である化合物候補を該候補が抽出されたピークに対応する最も確からしい化合物として判断する化合物候補判定部、をさらに備えることを特徴とするクロマトグラフ質量分析用データ処理装置。 - 請求項3に記載のクロマトグラフ質量分析用データ処理装置であって、
前記化合物情報記憶部には化合物情報として確認イオン比の基準値が記憶されており、
前記化合物候補グループ化部によりグループ化された、一つのピークに対応する複数の化合物候補のグループ毎に、当該グループに含まれる複数の化合物候補についての前記化合物情報記憶部に記憶されている保持時間と実測保持時間との差の絶対値を比較し、その差の絶対値が最小である化合物候補を該候補が抽出されたピークに対応する化合物として判断する第1の判定処理と、
前記化合物候補グループ化部によりグループ化された、一つのピークに対応する複数の化合物候補のグループ毎に、当該グループに含まれる複数の化合物候補についてのマススペクトルと該候補が抽出されたクロマトグラムピークのピークトップ位置における実測マススペクトルとの類似度を算出し、その類似度が最も高い化合物候補を該候補が抽出されたピークに対応する化合物として判断する第2の判定処理と、
前記化合物候補グループ化部によりグループ化された、一つのピークに対応する複数の化合物候補のグループ毎に、当該グループに含まれる複数の化合物候補についての前記基準値と該候補が抽出されたクロマトグラムピークのピークトップ位置における確認イオン比との差の絶対値を算出し、その差の絶対値が最小である化合物候補を該候補が抽出されたピークに対応する化合物として判断する、又は、そのグループに含まれる複数の化合物候補についての前記基準値と該候補が抽出されたクロマトグラムピークのピークトップ位置における確認イオン比との比率を算出し、その比率と1との差の絶対値が最小である化合物候補を該候補が抽出されたピークに対応する化合物として判断する第3の判定処理と、のうちの二つ以上の判定処理を用いて得られた化合物候補を、抽出されたピークに対応する最も確からしい化合物として判断する化合物候補判定部、をさらに備えることを特徴とするクロマトグラフ質量分析用データ処理装置。 - 請求項5〜9のいずれか1項に記載のクロマトグラフ質量分析用データ処理装置であって、
一つのピークに対応する複数の化合物候補のグループ毎に、複数の化合物候補のうちで前記化合物候補判定部で最も確からしい化合物として判断された化合物候補以外の化合物候補を不要なピーク同定結果として自動的に削除する同定結果整理部、をさらに備えることを特徴とするクロマトグラフ質量分析用データ処理装置。 - 請求項3に記載のクロマトグラフ質量分析用データ処理装置であって、
前記化合物情報記憶部には化合物情報として定量イオン及び確認イオンの質量電荷比が記憶されており、
前記化合物候補グループ化部によりグループ化された、一つのピークに対応する複数の化合物候補のグループ毎に、ピーク検出のための定量イオン及び確認イオンの質量電荷比同士を比較し共通しているものがあるか否かを判定する化合物共通性判定部をさらに備えることを特徴とするクロマトグラフ質量分析用データ処理装置。 - 請求項3に記載のクロマトグラフ質量分析用データ処理装置であって、
前記化合物情報記憶部には化合物情報として定量イオン及び確認イオンの質量電荷比、並びにマススペクトルが記憶されており、
前記化合物候補グループ化部によりグループ化された、一つのピークに対応する複数の化合物候補のグループ毎に、一つの化合物候補のピーク検出のための定量イオン及び確認イオンの質量電荷比が他の化合物候補のマススペクトルに含まれるか否かを判定する化合物共通性判定部、をさらに備えることを特徴とするクロマトグラフ質量分析用データ処理装置。 - 請求項12に記載のクロマトグラフ質量分析用データ処理装置であって、
前記化合物共通性判定部は、前記他の化合物候補のマススペクトルの中でベースピークに対する強度比に基づいて選択したマススペクトルピークについて定量イオン及び確認イオンの質量電荷比が含まれるか否か判定することを特徴とするクロマトグラフ質量分析用データ処理装置。 - 請求項3に記載のクロマトグラフ質量分析用データ処理装置であって、
前記化合物候補グループ化部により各ピークに対応付けてグループ化された結果が修正される際に、その修正前の結果を自動的に保存するとともに所定の操作に応じて該結果を表示することを可能としたことを特徴とするクロマトグラフ質量分析用データ処理装置。
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