JP6582995B2 - App切断型ペプチドの測定方法 - Google Patents
App切断型ペプチドの測定方法 Download PDFInfo
- Publication number
- JP6582995B2 JP6582995B2 JP2015558791A JP2015558791A JP6582995B2 JP 6582995 B2 JP6582995 B2 JP 6582995B2 JP 2015558791 A JP2015558791 A JP 2015558791A JP 2015558791 A JP2015558791 A JP 2015558791A JP 6582995 B2 JP6582995 B2 JP 6582995B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- app
- solution
- washing
- antibody
- binding
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/68—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
- G01N33/6893—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids related to diseases not provided for elsewhere
- G01N33/6896—Neurological disorders, e.g. Alzheimer's disease
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
- G01N2333/435—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans
- G01N2333/46—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans from vertebrates
- G01N2333/47—Assays involving proteins of known structure or function as defined in the subgroups
- G01N2333/4701—Details
- G01N2333/4709—Amyloid plaque core protein
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2560/00—Chemical aspects of mass spectrometric analysis of biological material
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2800/00—Detection or diagnosis of diseases
- G01N2800/28—Neurological disorders
- G01N2800/2814—Dementia; Cognitive disorders
- G01N2800/2821—Alzheimer
Landscapes
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Hematology (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Neurosurgery (AREA)
- Neurology (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Pathology (AREA)
- Other Investigation Or Analysis Of Materials By Electrical Means (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
Description
(1) 血液試料中のアミロイド前駆タンパク質(APP)切断型ペプチドを測定する方法であって、
担体と、前記担体に結合した、アミロイド前駆タンパク質(APP)切断型ペプチドを認識可能な抗原結合部位を持つ免疫グロブリン及びアミロイド前駆タンパク質(APP)切断型ペプチドを認識可能な抗原結合部位を含む免疫グロブリン断片からなる群から選ばれる抗体とを含む抗体固定化担体に、血液試料を結合溶液中で接触させて、前記抗体固定化担体と前記血液試料中に含まれるAPP切断型ペプチドとを結合させる工程と、
前記抗体固定化担体と前記APP切断型ペプチドとの結合体を、洗浄溶液を用いて洗浄する工程と、
前記抗体固定化担体から前記APP切断型ペプチドを、有機溶媒を含む酸性水溶液を用いて解離させる工程と、
解離された前記APP切断型ペプチドを検出する工程と、
を含む血液試料中のAPP切断型ペプチドを測定する方法。
(4) 前記中性緩衝液における界面活性剤濃度は、0.001〜10%(w/v)である、(3)に記載の方法。
(5) 前記界面活性剤が、マルトースを親水性部分に持つ中性界面活性剤、トレハロースを親水性部分に持つ中性界面活性剤、及びグルコースを親水性部分に持つ中性界面活性剤からなる群から選ばれる、(3)又は(4)に記載の方法。
(8) 前記質量分析において、マトリックス支援レーザー脱離イオン化型質量分析装置を用いる、(7)に記載の方法。
(9) 前記マトリックス支援レーザー脱離イオン化型質量分析装置において、0.1〜20mg/mLの濃度のマトリックスと、0.1〜10%(w/v)の濃度のマトリックス添加剤とを使用する、(8)に記載の方法。
担体と、前記担体に結合した抗体とを含む抗体固定化担体に、血液試料を結合溶液中で接触させて、前記抗体固定化担体と前記血液試料中に含まれるAPP切断型ペプチドとを結合させる工程と、
前記抗体固定化担体と前記APP切断型ペプチドとの結合体を、洗浄溶液を用いて洗浄する工程と、
前記抗体固定化担体から前記APP切断型ペプチドを、有機溶媒を含む酸性水溶液を用いて解離させる工程と、
解離された前記APP切断型ペプチドを検出する工程と、
を含む。
本発明において用いる抗体固定化担体は、担体に、アミロイド前駆タンパク質(APP)切断型ペプチドを認識可能な抗原結合部位を持つ免疫グロブリン及び/又はアミロイド前駆タンパク質(APP)切断型ペプチドを認識可能な抗原結合部位を含む免疫グロブリン断片が結合しているものである。免疫グロブリンとしては、IgG、IgM、IgA、IgY、IgD、及びIgEが挙げられる。IgG としては、IgG1、IgG2、IgG3、及びIgG4等が挙げられる。アミロイド前駆タンパク質(APP)切断型ペプチドを認識可能な抗原結合部位を持つ免疫グロブリン(以下、「抗APP切断型ペプチド抗体」とも言う)としては、例えば、6E10, 4G8, 1E11, 11A50-B10, 12F4, 9C4, 82E1, 12B2, 1A10等が挙げられる。なお、これらの抗体は、抗アミロイド・ベータ抗体として公知のものである。アミロイド前駆タンパク質(APP)切断型ペプチドを認識可能な抗原結合部位を含む免疫グロブリン断片としては、例えば、F(ab’)2、F(ab’)、F(ab)、Fd、Fv、L鎖、及びH鎖からなる群から選ばれることができる。これらの中でも、Fc領域を有しない、免疫グロブリンF(ab’)断片、免疫グロブリンF(ab)断片、及びFv断片からなる群から選ばれることが、非特異的吸着を抑制する観点から好ましい。担体に固定化する抗APP切断型ペプチド抗体としては、モノクローナル抗体、ポリクローナル抗体のいずれでもよい。本発明において用いる抗体固定化担体は、以上の抗APP切断型ペプチド抗体及び/又は抗APP切断型ペプチド抗体断片が、任意の方法により担体に固定化されたものを使用することができる。
まず、前記抗体固定化担体に、血液試料を結合溶液中で接触させて、前記抗体固定化担体と前記血液試料中に含まれるAPP切断型ペプチドとを結合させる。
n-Decyl-β-D-maltoside (DM) [cmc: 0.087%]
n-Dodecyl-β-D-maltoside (DDM) [cmc: 0.009%]
n-Nonyl-β-D-thiomaltoside (NTM) [cmc: 0.116%]
等が挙げられる。CMCは、臨界ミセル濃度である。
α-D-Glucopyranosyl-α-Dglucopyranoside monooctanoate (Trehalose C8)[cmc: 0.262%]
α-D-Glucopyranosyl-α-Dglucopyranoside monododecanoate (Trehalose C12)[cmc: 0.008%]
α-D-Glucopyranosyl-α-Dglucopyranoside monomyristate (Trehalose C14)[cmc: 0.0007%]
等が挙げられる。
n-Octyl-β-D-thioglucoside (OTG) [cmc: 0.278%]
n-Octyl-β-D-glucoside (OG) [cmc: 0.731%]
n-Heptyl-β -D-thioglucoside (HTG) [cmc: 0.883%]
等が挙げられる。
次に、結合工程により得られた前記抗体固定化担体と前記APP切断型ペプチドとの結合体を、洗浄溶液を用いて洗浄する。
次に、洗浄後の前記抗体固定化担体と前記APP切断型ペプチドとの結合体について、前記抗体固定化担体から前記APP切断型ペプチドを、有機溶媒を含む酸性水溶液を溶出液として用いて解離させる。
次に、解離され溶出された前記APP切断型ペプチドを、適切な検出系によって検出する。
(1) F(ab’)固定化ビーズの作製
ヒト血漿中のAPP切断型ペプチドを抗体固定化担体へ結合させ、得られたAPP切断型ペプチドと抗体固定化担体の結合体を洗浄し、その後、抗体固定化担体からAPP切断型ペプチドを解離させる工程を、免役沈降法を用いて実施した。免役沈降法で用いる抗体固定化担体はF(ab’) 固定化ビーズを使用した。F(ab’) 固定化ビーズの作製方法は次の通りである。
ヒト血漿 50 μL(C.C Biotech社)に等量の結合溶液 (2%(w/v) n-オクチル-β-D-チオグリコシド(OTG), 800mM GlcNAc, 100mM Tris-HCl, 300mM NaCl, pH7.4)を混合させた後、10%(w/v) PEG6000 (ナカライ)をヒト血漿の1/50量(例えば、ヒト血漿 50 μLに対して10%(w/v) PEG6000 を0.5 μL)を添加した。この血漿サンプルに含まれる沈殿物はUltrafree-MC, DV 0.65 μm, centrifugal filter devices (Millipore, Cork, IR)を用いたフィルター遠心により除去した。Protein G Plus Agarose (50% slurry; Pierce, Rockford, IL)をH2Oで1回洗浄後、洗浄溶液(1%(w/v) OTG, 50mM Tris-HCl, 150mM NaCl, pH7.4)で3回洗浄した。この時に用いたProtein G Plus Agarose (50% slurry)の量は、ヒト血漿の2倍量(例えば、ヒト血漿 50 μLに対してProtein G Plus Agarose 100 μL)である。また、このProtein G Plus Agaroseを洗浄するために用いたH2Oおよび洗浄溶液の容量は1回の洗浄につき、Protein G Plus Agarose の4/5量(例えば、Protein G Plus Agarose 100 μLに対してH2Oおよび洗浄溶液80 μL)である。そのProtein G Plus Agaroseに先ほどの、沈殿物除去後の血漿サンプルを混合させて4℃で1時間転倒混和することにより血漿中に含まれている抗体をProtein G Plus Agaroseへ結合させた。その後、血漿サンプルからProtein G Plus Agaroseを取り除いた。
OTG-glycineバッファー(1%(w/v) OTG, 50mM glycine , pH2.8)で2回洗浄、前記洗浄溶液100 μLで3回洗浄された6E10/4G8 F(ab’) 固定化ビーズ 150 μgに、前記前処理により抗体を取り除いた血漿サンプルを混合させて4℃で1時間転倒混和することにより、ビーズへAPP切断型ペプチドを結合させた。その後、前記洗浄溶液500 μLでビーズを攪拌することにより洗浄する操作を1回行い、前記洗浄溶液100 μLでビーズを攪拌することにより洗浄する操作を4回行った。さらにH2O 20 μLでビーズを攪拌することにより洗浄する操作を1回行った後、溶出液として3 mM 塩酸5μLを用いた場合[比較例1、図2(A)]、又は3 mM 塩酸を含む50%(v/v) アセトニトリル 5 μLを用いた場合[実施例1、図2(B)]の2条件において、各々の溶出液中でビーズを攪拌することにより、6E10/4G8 F(ab’) 固定化ビーズに結合されたAPP切断型ペプチドを解離させて、溶出液中へ放出させた。その溶出液を0.5 μL取り、μFocus MALDI plateTM 900 μm (Hudson Surface Technology, Inc., Fort Lee, NJ)上へ滴下した。
検出工程はMALDI-TOF MSを用いた。マススペクトルデータはAXIMA(登録商標) Performance (Shimadzu/KRATOS, Manchester, UK)を用いて、ポジティブイオンモードのLinear TOFで取得した。1wellに対して2500ショットずつ積算した。Linear TOF用のマトリックスとしてα-cyano-4-hydroxycinnamic acid (CHCA)を用いた。マトリックス溶液はCHCA 5mgを70%(v/v) アセトニトリル 1mLで溶解することによって調製した。マトリックス添加剤として、2%(w/v) methanediphosphonic acid (MDPNA)を用いた。5 mg/mL CHCA溶液 0.5 μLと2%(w/v) MDPNA 0.5 μLをμFocus MALDI plate上で溶出液に加えた。
本実施例で用いた方法は、免疫沈降法の後に質量分析で検出するため、IP-MSと呼ばれる。
洗浄工程で用いられる洗浄溶液にはTris緩衝液やリン酸緩衝液などの緩衝液を使用することが多いが、その溶液中にはカリウムやナトリウムなどの陽イオン金属元素が含まれている。MALDI-TOF MS測定において陽イオン金属元素の混入は、目的ピークのシグナルを減少させるため、できるだけ金属元素の混入を避ける必要がある。陽イオン金属元素をMALDI-TOF MS測定に混入させない方法として、洗浄工程に酢酸アンモニウム緩衝液による洗浄を追加した。アンモニウムイオンは揮発性のため、MALDI-TOF MSのシグナルをほとんど減少させない。洗浄溶液(1%(w/v) OTG, 50mM Tris-HCl, 150mM NaCl, pH7.4)で洗浄した後、残存している洗浄溶液の陽イオン金属元素を除去する目的で酢酸アンモニウム緩衝液を用いた。また、界面活性剤が溶液中に存在していると6E10/4G8 F(ab’) 固定化ビーズが磁石へ集積しやすく、洗浄操作がしやすいため、0.1%(w/v) OTGも酢酸アンモニウム緩衝液へ加えた。
ヒト血漿500 μL(C.C Biotech社)に等量の結合溶液 (2%(w/v) n-オクチル-β-D-チオグリコシド(OTG), 800mM GlcNAc, 100mM Tris-HCl, 300mM NaCl, pH7.4)を混合させた後、10%(w/v) PEG6000を10 μL添加した。この血漿サンプルに含まれる沈殿物はUltrafree-MC, DV 0.65 μm, centrifugal filter devicesを用いたフィルター遠心により除去した。Protein G Plus Agarose 1000 μLをH2Oで1回洗浄後、洗浄溶液(1%(w/v) OTG, 50mM Tris-HCl, 150mM NaCl, pH7.4)で3回洗浄した。このProtein G Plus Agaroseに先ほどの血漿サンプルを混合させて4℃で1時間転倒混和することにより血漿中に含まれている抗体をProtein G Plus Agaroseへ結合させた。その後、血漿サンプルからProtein G Plus Agaroseを取り除いた。
測定対象のペプチド量に応じて使用するマトリックス濃度及び/又はマトリックス添加剤濃度を最適化することによって、良好なMSシグナルを得ることができる。CHCAとMDPNAの濃度を検討した。
ヒト血漿250 μL(C.C Biotech社)に等量の結合溶液 (2%(w/v) n-オクチル-β-D-チオグリコシド(OTG), 800mM GlcNAc, 100mM Tris-HCl, 300mM NaCl, pH7.4)を混合させた後、10%(w/v) PEG6000を5 μL添加した。この血漿サンプルに含まれる沈殿物はUltrafree-MC, DV 0.65 μm, centrifugal filter devicesを用いたフィルター遠心により除去した。Protein G Plus Agarose 500 μLをH2Oで1回洗浄後、洗浄溶液(1%(w/v) OTG, 50mM Tris-HCl, 150mM NaCl, pH7.4)で3回洗浄した。このProtein G Plus Agaroseに先ほどの血漿サンプルを混合させて4℃で1時間転倒混和することにより血漿中に含まれている抗体をProtein G Plus Agaroseへ結合させた。その後、血漿サンプルからProtein G Plus Agaroseを取り除いた。
(A) 5 mg/mL CHCA溶液 0.5 μL、及び2%(w/v) MDPNA0.5 μL
(B) 1.5 mg/mL CHCA溶液 0.5 μL、及び0.6%(w/v) MDPNA0.5 μL
(C) 0.5 mg/mL CHCA溶液 0.5 μL、及び0.2%(w/v) MDPNA0.5 μL
溶出に最適なアセトニトリル濃度を検討した。
ヒト血漿250 μL(Tennessee Blood Services社)に等量の結合溶液 (0.2%(w/v) DDM, 0.2%(w/v) NTM, 800mM GlcNAc, 100mM Tris-HCl, 300mM NaCl, pH7.4)を混合させた。この血漿サンプルに含まれる沈殿物はUltrafree-MC, DV 0.65 μm, centrifugal filter devicesを用いたフィルター遠心により除去した。Protein G Plus Agarose 500 μLをH2Oで1回洗浄後、洗浄溶液(0.1%(w/v) DDM, 0.1%(w/v) NTM, 50mM Tris-HCl, 150mM NaCl, pH7.4)で3回洗浄した。このProtein G Plus Agaroseに先ほどの血漿サンプルを混合させて4℃で1時間転倒混和することにより血漿中に含まれている抗体をProtein G Plus Agaroseへ結合させた。その後、血漿サンプルからProtein G Plus Agaroseを取り除いた。
(B) 5mM HCl/20%(v/v)アセトニトリル
(C) 5mM HCl/25%(v/v)アセトニトリル
(D) 5mM HCl/50%(v/v)アセトニトリル
(E) 5mM HCl/70%(v/v)アセトニトリル
以上の実施例で得られたマススペクトルにおいて検出されるm/z:3765付近のピークがマススペクトルで検出される原因が、血漿サンプル由来の分子が担体のビーズに非特異的に吸着することにより引き起こされているか否かを検証した。
ヒト血漿250 μL(C.C Biotech社)に等量の結合溶液 (1%(w/v) n-オクチル-β-D-チオグリコシド(OTG), 800mM GlcNAc, 100mM Tris-HCl, 300mM NaCl, pH7.4)を混合させた後、10%(w/v) PEG6000を5 μL添加した。この血漿サンプルに含まれる沈殿物はUltrafree-MC, DV 0.65 μm, centrifugal filter devicesを用いたフィルター遠心により除去した。Protein G Plus Agarose 500 μLをH2Oで1回洗浄後、洗浄溶液(0.5%(w/v) OTG, 50mM Tris-HCl, 150mM NaCl, pH7.4)で3回洗浄した。このProtein G Plus Agaroseに先ほどの血漿サンプルを混合させて4℃で1時間転倒混和することにより血漿中に含まれている抗体をProtein G Plus Agaroseへ結合させた。その後、血漿サンプルからProtein G Plus Agaroseを取り除いた。
実施例5により、マススペクトル中に検出されるm/z3765付近のピークは、担体のビーズに非特異的に吸着したヒト血漿サンプル由来分子であることが分かった。結合溶液及び洗浄溶液に加えている界面活性剤は非特異的な結合を抑えるために使用しているが、その種類によって抗原抗体の結合力および非特異的吸着は変化する。OTGの他に下記の界面活性剤を使用することによるMSスペクトルへの影響を調べた。[ ]内には、各界面活性剤の臨界ミセル濃度(cmc)を表示した。
(2) n-Octyl- β -D-glucoside (OG) [cmc: 0.731%]
(3) n-Decyl- β -D-maltoside (DM) [cmc: 0.087%]
(4) n-Dodecyl- β -D-maltoside (DDM) [cmc: 0.009%]
(5) n-Nonyl-β-D-thiomaltoside (NTM) [cmc: 0.116%]
ヒト血漿250 μL(Tennessee Blood Services社)に等量の結合溶液を混合させた。この血漿サンプルに含まれる沈殿物はUltrafree-MC, DV 0.65 μm, centrifugal filter devicesを用いたフィルター遠心により除去した。Protein G Plus Agarose 500 μLをH2Oで1回洗浄後、洗浄溶液で3回洗浄した。このProtein G Plus Agaroseに先ほどの血漿サンプルを混合させて4℃で1時間転倒混和することにより血漿中に含まれている抗体をProtein G Plus Agaroseへ結合させた。その後、血漿サンプルからProtein G Plus Agaroseを取り除いた。
洗浄溶液(0.5%(w/v) OTG, 50mM Tris-HCl, 150mM NaCl, pH7.4)
(B)結合溶液(3%(w/v) OG, 800mM GlcNAc, 100mM Tris-HCl, 300mM NaCl, pH7.4)、
洗浄溶液(1.5%(w/v) OG, 50mM Tris-HCl, 150mM NaCl, pH7.4)
(C)結合溶液(0.3%(w/v) DM, 800mM GlcNAc, 100mM Tris-HCl, 300mM NaCl, pH7.4)、
洗浄溶液(0.15%(w/v) DM, 50mM Tris-HCl, 150mM NaCl, pH7.4)
(D)結合溶液(0.03%(w/v) DDM, 800mM GlcNAc, 100mM Tris-HCl, 300mM NaCl, pH7.4)、
洗浄溶液(0.015%(w/v) DDM, 50mM Tris-HCl, 150mM NaCl, pH7.4)
(E)結合溶液(0.4%(w/v) NTM, 800mM GlcNAc, 100mM Tris-HCl, 300mM NaCl, pH7.4)、
洗浄溶液(0.2%(w/v) NTM, 50mM Tris-HCl, 150mM NaCl, pH7.4)
洗浄溶液(0.015%(w/v) DDM, 50mM Tris-HCl, 150mM NaCl, pH7.4)
(D-2) 結合溶液 (0.1%(w/v) DDM, 800mM GlcNAc, 100mM Tris-HCl, 300mM NaCl, pH7.4)、
洗浄溶液(0.05%(w/v) DDM, 50mM Tris-HCl, 150mM NaCl, pH7.4)
(D-3) 結合溶液 (0.3%(w/v) DDM, 800mM GlcNAc, 100mM Tris-HCl, 300mM NaCl, pH7.4)、
洗浄溶液(0.15%(w/v) DDM, 50mM Tris-HCl, 150mM NaCl, pH7.4)
洗浄溶液(0.2%(w/v) NTM, 50mM Tris-HCl, 150mM NaCl, pH7.4)
(E-2) 結合溶液 (0.3%(w/v) NTM, 800mM GlcNAc, 100mM Tris-HCl, 300mM NaCl, pH7.4)、
洗浄溶液(0.15%(w/v) NTM, 50mM Tris-HCl, 150mM NaCl, pH7.4)
(E-3) 結合溶液 (0.2%(w/v) NTM, 800mM GlcNAc, 100mM Tris-HCl, 300mM NaCl, pH7.4)、
洗浄溶液(0.1%(w/v) NTM, 50mM Tris-HCl, 150mM NaCl, pH7.4)
洗浄溶液(0.1%(w/v) DDM, 0.1%(w/v) NTM, 50mM Tris-HCl, 150mM NaCl, pH7.4)
(A)結合溶液 (1%(w/v) OTG, 800mM GlcNAc, 100mM Tris-HCl, 300mM NaCl, pH7.4)、
洗浄溶液(0.5%(w/v) OTG, 50mM Tris-HCl, 150mM NaCl, pH7.4)
この(A)は、前述のものと同じである。
実施例1で作製したF(ab’) 固定化ビーズ以外の抗体固定化担体を用いた、本発明の免疫沈降法による感度向上の効果を調べた。F(ab’) 固定化ビーズ以外の抗体固定化担体として、アミロイド・ベータ(1-40)のC末端をエピトープとする抗アミロイド抗体(11A50-B10)を固定化したビーズは次の通り作製した。
アミロイド・ベータ(1-40)のC末端をエピトープとする抗アミロイド・ベータ抗体(11A50-B10)をDynabeads Tosylactivated (Invirtogen)の製品に添付の手順書に従ってビーズへ直接固定化した。具体的には、抗アミロイド・ベータ抗体(11A50-B10)7.5 μgをDynabeads Tosylactivated 55 μL (ビーズ量:1.66 mg)のトシル基に結合させるために、バッファー(1.2M 硫酸アンモニウム、100mM リン酸バッファー、pH7.4)中で37℃、16時間反応させた。その後、TBS(150mM NaCl, 50 mM Tris-HCl, pH7.4)中で37℃、1時間反応させてブロッキングした。作製された11A50-B10 IgG固定化ビーズは使用するまで4℃で保存した。
作製した抗体固定化担体を用いて、免疫沈降法の前処理と、免疫沈降法は次のとおりに実施した。
洗浄溶液(1%(w/v) OTG, 50mM Tris-HCl, 150mM NaCl, pH7.4)、
溶出液(5mM HCl)
(B)結合溶液 (0.2%(w/v) DDM, 0.2%(w/v) NTM, 800mM GlcNAc, 100mM Tris-HCl, 300mM NaCl, pH7.4)、
洗浄溶液(0.1%(w/v) DDM, 0.1%(w/v) NTM, 50mM Tris-HCl, 150mM NaCl, pH7.4)、
溶出液(5mM HCl/70%(v/v)アセトニトリル)
本発明を用いたIP-MSを行い、ヒト血漿中に存在する各種APP切断型ペプチドの検出及び同定を試みた。
ヒト血漿 250 μLに結合溶液 (1% n-オクチル-β-D-チオグリコシド(OTG), 800mM GlcNAc, 100mM Tris-HCl, 300mM NaCl, pH7.4) 250 μLと10% PEG6000 5 μLを混合させた。この血漿サンプルに含まれる沈殿物は Ultrafree-MC, DV 0.65 μm, centrifugal filter devicesを用いたフィルター遠心により除去した。Protein G Plus Agarose (50% slurry; Pierce, Rockford, IL) 500 μLをH2O 400 μLで1回洗浄後、洗浄溶液(0.5% OTG, 50mM Tris-HCl, 150mM NaCl, pH7.4) 400 μLで3回洗浄した。そのProtein G Plus Agaroseに先ほどの血漿サンプルを混合させて4℃で1時間インキュベーションすることにより、血漿中に含まれている抗体をProtein G Plus Agaroseへ結合させた。その後、血漿サンプルからProtein G Plus Agaroseを取り除いた。
OTG-glycineバッファー(1% OTG, 50mM glycine , pH2.8)で2回洗浄、前記洗浄溶液100 μLで3回洗浄された 6E10/4G8 F(ab’) 固定化ビーズ (実施例1で作製したもの)150 μgに、抗体を取り除いた血漿サンプルを混合させて4℃で1時間インキュベーションすることによりAPP切断型ペプチドと結合させた。その後、前記洗浄溶液500 μLでビーズを攪拌することにより洗浄する操作を1回行い、前記洗浄溶液100 μLでビーズを攪拌することにより洗浄する操作を4回行った。その後、50mM酢酸アンモニウム緩衝液(pH7.4)20 μLでビーズを攪拌することにより洗浄する操作を2回行った。さらにH2O 20 μLでビーズを攪拌することにより洗浄する操作を1回行った後、5 mM 塩酸を含む70% アセトニトリル 2.5 μLで 6E10/4G8 F(ab’) 固定化ビーズに結合されたAPP切断型ペプチドを解離させ、溶出した。その溶出液は次のようにμFocus MALDI plateTM 900 μm上へ滴下した。Linear TOF MSで測定する場合は、溶出液を0.5 μLずつ 4 wellへ滴下した。検出されたピークの同定で用いる四重極イオントラップ(QIT) reflectron TOF MSで測定する場合は、溶出液 2 μLを 1 wellへ滴下した。
マススペクトルデータは AXIMA Performanceを用いて、ポジティブイオンモードのLinear TOFで取得した。Linear TOFではラスターモードで400ヶ所のそれぞれの点に対して40ショットずつ積算した。APP切断型ペプチドの同定のために、AXIMA Resonance (Shimadzu/KRATOS)を用いてQIT reflectron TOFのポジティブイオンモードでMS/MS解析を行った。Linear TOF用のマトリックスとしてα-cyano-4-hydroxycinnamic acid (CHCA)を、QIT reflectron TOF用のマトリックスとして2,5-dihydroxybenzoic acid (DHB)を用いた。マトリックス溶液はCHCA 1mgとDHB 5mgそれぞれを70%アセトニトリル 1mLで溶解することによって調製した。マトリックス添加剤として、0.4% methanediphosphonic acid (MDPNA)を用いた。CHCA溶液とDHB溶液に0.4% MDPNAを等量混ぜた後、そのマトリックス・添加剤混合液 0.5 μLをμFocus MALDI plate上で溶出液に加えた。
MSで検出されたAPP切断型ペプチドを同定するために、検出された22種類のピークのうち20種類のピークについてMS/MS解析をおこなった。6種類のピークについてはMascot scoreは20以上であったが、その他のピークはシグナルが弱かったためMascot scoreは低かった(表2)。しかし、CIDで優先的に起きやすいアスパラギン酸およびグルタミン酸のC末端側の開裂により生成されるフラグメントイオンがMS/MS解析した全てのスペクトルにおいて検出された(表2、図13〜図22)。さらに、6E10/4G8 F(ab’) 固定化ビーズによる選択性、測定マス値の精度、使用した抗体 6E10、または、4G8のエピトープを含む配列であること、を合わせて考慮すると、表1〜表2に示されたAPP切断型ペプチドの同定の正確性はかなり高い。検出されたAPP切断型ペプチドの質量の高い2つのピークは、今回使用した装置では十分な選択性でイオントラップができないため、MS/MSデータは取得できなかった。
MDAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLMVGGVV
APP669-709(配列番号15):
VKMDAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLMVGG
APP669-710(配列番号17):
VKMDAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLMVGGV
APP669-711(配列番号18):
VKMDAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLMVGGVV
APP666-709(配列番号19):
ISEVKMDAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLMVGG
APP666-711(配列番号20):
ISEVKMDAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLMVGGVV
APP664-711(配列番号21):
EEISEVKMDAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLMVGGVV
及び、
APP663-711(配列番号22):
TEEISEVKMDAEFRHDSGYEVHHQKLVFFAEDVGSNKGAIIGLMVGGVV
Claims (7)
- 血液試料中のアミロイド前駆タンパク質(APP)切断型ペプチドを測定する方法であって、
担体と、前記担体に結合した、アミロイド前駆タンパク質(APP)切断型ペプチドを認識可能な抗原結合部位を持つ免疫グロブリン及びアミロイド前駆タンパク質(APP)切断型ペプチドを認識可能な抗原結合部位を含む免疫グロブリン断片からなる群から選ばれる抗体とを含む抗体固定化担体に、血液試料を結合溶液中で接触させて、前記抗体固定化担体と前記血液試料中に含まれるAPP切断型ペプチドとを結合させる結合工程と、
前記抗体固定化担体と前記APP切断型ペプチドとの結合体を、洗浄溶液を用いて洗浄する洗浄工程と、
前記抗体固定化担体から前記APP切断型ペプチドを、アセトニトリル、アセトン、メタノール、エタノール、イソプロパノール、及びクロロホルムからなる群から選ばれる有機溶媒を20〜80%(v/v)の濃度で含む酸性水溶液を用いて解離させ溶出させる解離工程と、
解離され溶出された前記APP切断型ペプチドを質量分析により検出する検出工程と、
を含む血液試料中のAPP切断型ペプチドを測定する方法。 - 前記結合工程において、前記結合溶液は、界面活性剤を含む中性緩衝液である、請求項1に記載の方法。
- 前記中性緩衝液における界面活性剤濃度は、0.001〜10%(w/v)である、請求項2に記載の方法。
- 前記界面活性剤が、マルトースを親水性部分に持つ中性界面活性剤、トレハロースを親水性部分に持つ中性界面活性剤、及びグルコースを親水性部分に持つ中性界面活性剤からなる群から選ばれる、請求項2又は3に記載の方法。
- 前記洗浄工程において、前記洗浄溶液として界面活性剤を含む中性緩衝液を用いて洗浄を行い、その後、前記洗浄溶液としてアンモニウムイオンを含む水溶液を用いて洗浄を行う、請求項1〜4のいずれかに記載の方法。
- 前記質量分析において、マトリックス支援レーザー脱離イオン化型質量分析装置を用いる、請求項1〜5のいずれかに記載の方法。
- 前記マトリックス支援レーザー脱離イオン化型質量分析装置において、0.1〜20mg/mLの濃度のマトリックスと、0.1〜10%(w/v)の濃度のマトリックス添加剤とを使用する、請求項6に記載の方法。
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2014009010 | 2014-01-21 | ||
JP2014009010 | 2014-01-21 | ||
PCT/JP2015/050255 WO2015111430A1 (ja) | 2014-01-21 | 2015-01-07 | App切断型ペプチドの測定方法 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JPWO2015111430A1 JPWO2015111430A1 (ja) | 2017-03-23 |
JP6582995B2 true JP6582995B2 (ja) | 2019-10-02 |
Family
ID=53681238
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2015558791A Active JP6582995B2 (ja) | 2014-01-21 | 2015-01-07 | App切断型ペプチドの測定方法 |
Country Status (3)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US10942190B2 (ja) |
JP (1) | JP6582995B2 (ja) |
WO (1) | WO2015111430A1 (ja) |
Families Citing this family (11)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2015178398A1 (ja) | 2014-05-22 | 2015-11-26 | 株式会社 島津製作所 | 脳内のアミロイドβペプチド蓄積状態を評価するサロゲート・バイオマーカー及びその分析方法 |
JP6424757B2 (ja) * | 2015-07-14 | 2018-11-21 | 株式会社島津製作所 | ポリペプチドの質量分析方法 |
EP3351939B1 (en) | 2015-09-16 | 2020-11-04 | Shimadzu Corporation | Multiplex biomarker for use in evaluation of state of accumulation of amyloid b in brain, and analysis method for said evaluation |
JP6883847B2 (ja) * | 2017-03-30 | 2021-06-09 | 国立大学法人滋賀医科大学 | アミロイドβ蛋白並びにタウ蛋白及び/又はリン酸化タウ蛋白の測定方法 |
JP2019138809A (ja) | 2018-02-13 | 2019-08-22 | 株式会社島津製作所 | 微生物分析方法 |
JP7297273B2 (ja) * | 2018-02-13 | 2023-06-26 | 株式会社島津製作所 | 微生物分析方法 |
JP2020139789A (ja) * | 2019-02-27 | 2020-09-03 | 株式会社島津製作所 | 微生物分析用試料の調製方法、微生物の分析方法、微生物の識別方法および微生物分析用キット |
WO2021005857A1 (ja) | 2019-07-05 | 2021-01-14 | 株式会社 島津製作所 | アミロイドベータに対するモノクローナル抗体、及びその抗体を用いるアミロイドベータ関連ペプチドの測定方法 |
WO2021009074A1 (en) | 2019-07-12 | 2021-01-21 | Adx Neurosciences Nv | Novel markers as early predictors of alzheimer's pathology |
JP7478040B2 (ja) * | 2020-06-25 | 2024-05-02 | シスメックス株式会社 | Aβペプチドの測定方法及びその方法に用いられる試薬組成物 |
WO2022168417A1 (ja) | 2021-02-08 | 2022-08-11 | 株式会社島津製作所 | 分析方法 |
Family Cites Families (12)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US20040014142A1 (en) | 1998-07-03 | 2004-01-22 | Innogenetics N.V. | Differential diagnosis of neurodegeneration |
JP2002519702A (ja) | 1998-07-03 | 2002-07-02 | イノジェネティックス・ナムローゼ・フェンノートシャップ | 神経変性の分別診断 |
US20050221385A1 (en) | 2000-11-07 | 2005-10-06 | Caliper Life Sciences, Inc. | Pressure based mobility shift assays |
WO2005044847A1 (ja) * | 2003-11-05 | 2005-05-19 | Toshiharu Suzuki | アルツハイマー病のマーカーペプチド |
WO2006065806A2 (en) * | 2004-12-14 | 2006-06-22 | The Regents Of The University Of California | Polymer composite photonic particles |
EP2088426B1 (en) | 2006-11-29 | 2013-05-15 | Shimadzu Corporation | Mass spectrometry of biological sample using immunoprecipitation |
US7939075B2 (en) | 2007-01-11 | 2011-05-10 | Philipps-Universitaet Marburg | Human monoclonal anti-amyloid-beta antibodies |
US8445649B2 (en) | 2007-10-29 | 2013-05-21 | Tao Health Life Pharma Co., Ltd. | Antibody and use thereof |
CA2714413C (en) | 2008-02-08 | 2017-01-24 | Immunas Pharma, Inc. | Antibody capable of binding specifically to ab-oligomer, and use thereof |
JP5934432B2 (ja) | 2012-04-27 | 2016-06-15 | ゼネラル・エレクトリック・カンパニイ | ガスタービンエンジンの燃料漏れを防止するためのシステムおよび方法 |
JP6231263B2 (ja) | 2012-07-17 | 2017-11-15 | 株式会社島津製作所 | アフィニティ支持体及びそれを用いた物質の捕捉方法 |
JP6424757B2 (ja) * | 2015-07-14 | 2018-11-21 | 株式会社島津製作所 | ポリペプチドの質量分析方法 |
-
2015
- 2015-01-07 US US15/112,916 patent/US10942190B2/en active Active
- 2015-01-07 JP JP2015558791A patent/JP6582995B2/ja active Active
- 2015-01-07 WO PCT/JP2015/050255 patent/WO2015111430A1/ja active Application Filing
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
JPWO2015111430A1 (ja) | 2017-03-23 |
WO2015111430A1 (ja) | 2015-07-30 |
US10942190B2 (en) | 2021-03-09 |
US20160334420A1 (en) | 2016-11-17 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP6582995B2 (ja) | App切断型ペプチドの測定方法 | |
JP6424757B2 (ja) | ポリペプチドの質量分析方法 | |
US20220017583A1 (en) | Affinity support and method for trapping substance using the same | |
EP3256858B1 (en) | Histone h4 peptide as a biomarker | |
WO2022239537A1 (ja) | ニューログラニン関連ペプチドの分析方法 | |
JP7299566B2 (ja) | アミロイドベータに対するモノクローナル抗体、及びその抗体を用いるアミロイドベータ関連ペプチドの測定方法 | |
JP6891222B2 (ja) | アフィニティ支持体及びそれを用いた物質の捕捉方法 | |
WO2023136043A1 (ja) | ニューログラニン関連ペプチドの分析方法 | |
WO2023228497A1 (ja) | ニューログラニン関連ペプチド含有試料溶液の調製方法およびニューログラニン関連ペプチドの分析方法 | |
JP7439962B2 (ja) | 分析方法 | |
JP6542842B2 (ja) | アフィニティ支持体及びそれを用いた物質の捕捉方法 | |
JP7298855B2 (ja) | アフィニティ支持体及びそれを用いた物質の捕捉方法 | |
WO2022215341A1 (ja) | 検量線の作成方法およびアミロイドβ関連ペプチドの測定方法 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A521 | Written amendment |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20171102 |
|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20171102 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20181211 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20190208 |
|
A521 | Written amendment |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20190311 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20190806 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20190819 |
|
R151 | Written notification of patent or utility model registration |
Ref document number: 6582995 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R151 |