JP6303205B2 - 動物種鑑別方法及び装置 - Google Patents
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Description
昨今は、品質表示を適正に行うために、製品の流通段階で確実な畜種の判定を求められることが増えている。しかし、現状のところ鑑別の公定法は無い。これら雑貨工業品に係る表示に関して、試験や検査で一般的に用いられる鑑別方法としては、外観観察(厚さ,大きさ,色や柄,毛並み,艶,感触など)、顕微鏡観察(毛穴配列,断面構造,毛小皮紋理,毛髄質など)、機器分析(元素,成分,染料,薬剤分析など)、DNA鑑別が挙げられる(例えば特許文献1)。
最初に、特定の1種の動物種に特異的に検出されるペプチド断片を用いて試料の動物種を鑑別することにより、効率よく、鑑別対象試料の動物種を鑑別することが可能になる。すなわち、特定の1種の動物種にのみ、特異的に検出されるペプチド断片があるならば、そのペプチド断片の有無を判別し、そのペプチド断片が見つかれば特定の1種の動物種に同定できるのである。
すなわち、Collagen I α1,Collagen I α2,Collagen III α1(以下、それぞれ、COL1A1,COL1A2,COL3A1と略する)の部分配列である、GEPGPAGLPGPPGER(配列番号1)、GEPGPTGLPGPPGER(配列番号2)、GFPGADGVAGPK(配列番号3)、GFPGSDGVAGPK(配列番号4)、GLTGPIGPPGPAGAPGDKGEAGPSGPAGPTGAR(配列番号5)、GLTGPIGPPGPAGAPGDKGETGPSGPAGPTGAR(配列番号6)、GETGPAGRPGEVGPPGPPGPAGEK(配列番号7)、GETGPAGRPGEAGPPGPPGPAGEK(配列番号8)、AGEVGPPGPPGPAGEK(配列番号9)、SGDRGETGPAGPAGPIGPVGAR(配列番号10)、SGDRGEAGPAGPAGPIGPVGAR(配列番号11)、SGDRGETGPAGPAGPVGPVGAR(配列番号12)、GIPGPVGAAGATGAR(配列番号13)、GIPGPAGAAGATGAR(配列番号14)、EGPVGLPGIDGRPGPIGPAGAR(配列番号15)、EGPAGLPGIDGRPGPIGPAGAR(配列番号16)、GEQGPAGPPGFQGLPGPAGTAGEAGKPGER(配列番号17)、GEQGPAGPPGFQGLPGPAGTAGEVGKPGER(配列番号18)、GIPGEFGLPGPAGAR(配列番号19)、GIPGEFGLPGPAGPR(配列番号20)、GPPGESGAAGPTGPIGSR(配列番号21)、GPPGESGAAGPAGPIGSR(配列番号22)、GDGGPPGATGFPGAAGR(配列番号23)、GDGGPPGVTGFPGAAGR(配列番号24)、GLPGVAGSVGEPGPLGIAGPPGAR(配列番号25)、GLPGVAGSLGEPGPLGIAGPPGAR(配列番号26)、GEPGPAGAVGPAGAVGPR(配列番号27)、GEPGPVGSVGPVGAVGPR(配列番号28)、GEPGPAGSVGPAGAVGPR(配列番号29)、GEPGPVGAVGPAGAVGPR(配列番号30)、IGQPGAVGPAGIR(配列番号31)、SGQPGTVGPAGVR(配列番号32)、TGQPGAVGPAGIR(配列番号33)、GEMGPAGIPGAPGLIGAR(配列番号34)、GEMGPAGIPGAPGLMGAR(配列番号35)、GAPGPQGPPGAPGPLGIAGLTGAR(配列番号36)、GSPGPQGPPGVPGPSGLIGITGAR(配列番号37)、及び、GSPGPQGPPGAPGPGGISGITGAR(配列番号38)のペプチド断片の中で、少なくとも何れかのペプチド断片の有無を判別し、ウシ、ウマ、ブタ、ヒツジ、ヤギ及びシカの6種の動物種を鑑別する。
配列番号1〜38のペプチド断片は、COL1A1,COL1A2及びCOL3A1について、ウシ、ウマ、ブタ、ヒツジ、ヤギ及びシカの6種の動物種全てに共通する部分配列ではなく、少なくとも1種の動物種に特異的に存在する部分配列である。配列番号1〜38のペプチド断片のアミノ酸配列は、コラーゲン分子の安定性から、6種の動物種間において保存性が高いものである。
配列番号5〜14、配列番号19〜22、及び配列番号25〜33のアミノ酸配列のペプチド断片によれば、質量分析機器によらず、安定的に検出できる。
配列番号5及び31のペプチド断片は、ウシ、ウマ、ブタ、ヒツジ、ヤギ及びシカの6種の動物の中で、ウシのみに特異的に有るペプチド断片であり、これらのペプチド断片のみで、ウシを同定できる。
配列番号2,11,24,26,28,32及び37のペプチド断片は、ウシ、ウマ、ブタ、ヒツジ、ヤギ及びシカの6種の動物の中で、ウマのみに特異的に有るペプチド断片であり、これらのペプチド断片のみで、ウマを同定できる。
配列番号8,12,20,29,35及び38のペプチド断片は、ウシ、ウマ、ブタ、ヒツジ、ヤギ及びシカの動物6種の中で、ブタのみに特異的に有るペプチド断片であり、これらのペプチド断片のみで、ブタを同定できる。
配列番号9のペプチド断片は、ウシ、ウマ、ブタ、ヒツジ、ヤギ及びシカの6種の動物の中で、ヒツジのみに特異的に有るペプチド断片であり、これらのペプチド断片のみで、ヒツジを同定できる。
配列番号27のペプチド断片は、ウシ、ウマ、ブタ、ヒツジ、ヤギ及びシカの6種の動物の中で、ウシとシカだけに特異的に有るペプチド断片であり、これらのペプチド断片のみで、ウシかシカに絞り込むか、或は、ウシかシカに同定できる。
配列番号4及び30のペプチド断片は、ウシ、ウマ、ブタ、ヒツジ、ヤギ及びシカの6種の動物の中で、ヒツジとヤギだけに特異的に有るペプチド断片であり、これらのペプチド断片のみで、ヒツジかヤギに絞り込むか、或は、ヒツジかヤギに同定できる。
配列番号14及び18のペプチド断片は、ウシ、ウマ、ブタ、ヒツジ、ヤギ及びシカの6種の動物の中で、ウマとブタだけに特異的に有るペプチド断片であり、これらのペプチド断片のみで、ウマかブタに絞り込むか、或は、ウマかブタに同定できる。
1)配列番号5、配列番号27及び配列番号31のアミノ酸配列のペプチド断片の有無を判別してウシを同定するステップ
2)配列番号27及び配列番号33のアミノ酸配列のペプチド断片の有無を判別してシカを同定するステップ
3)配列番号11又は配列番号28のアミノ酸配列のペプチド断片の有無を判別してウマを同定するステップ
4)配列番号12又は配列番号29のアミノ酸配列のペプチド断片の有無を判別してブタを同定するステップ
5)上記1〜4のステップを行っても、未だ同定されていない残りの試料に対して、配列番号9のアミノ酸配列のペプチド断片の有無を判別してヒツジを同定し、配列番号7のアミノ酸配列のペプチド断片の有無を判別してヤギを同定するステップ
上記1)〜5)のステップでは、質量電荷比(m/z)の測定結果で、COL1A1の3つのピークとCOL1A2の2つのピークの計5ピークのみに着目することにより簡便に動物種の同定が可能になる。
本発明の動物種鑑別装置は、ウシ、ウマ、ブタ、ヒツジ、ヤギ及びシカの6種の動物から選択される少なくとも1種の動物由来の動物皮の鑑別装置であって、鑑別対象試料から抽出したコラーゲンをトリプシンで分解したものに対して、配列番号1〜38のアミノ酸配列のペプチド断片の中で、少なくとも何れかのペプチド断片の有無を判別する手段を備え、動物種を鑑別することを特徴とする動物種鑑別装置である。
ここで、ペプチド断片の有無を判別する手段は、液体クロマトグラフ−質量分析計(LC−MS)を用いたタンデムマス(MS/MS)解析により、ペプチド断片のプレカーサーイオンとプロダクトイオンの質量電荷比(m/z)を測定し、ペプチド断片の有無を判別するのが好ましい。
上述したように、本発明の動物種鑑別方法では、鑑別対象試料から動物の線維状タンパク質群を抽出し(ステップS101)、線維状タンパク質群をタンパク質分解酵素(プロテアーゼ)で切断してペプチド断片に分解し(ステップS102)、ペプチド断片のアミノ酸配列を解析する(ステップS103)。次に、解析した全てのペプチド断片から、鑑別する動物種全てに共通して検出されるペプチド断片を除外する(ステップS104)。
そこで、少なくとも1種の動物種で特異的に検出されるペプチド断片を選出し(ステップS105)、その選出したペプチド断片を用いて試料の動物種を鑑別する(ステップS106)。
先ず、天然皮革の動物種に関して、皮の組織および主要な繊維であるコラーゲンについて説明する。動物皮は、表皮層,真皮層並びにその下の皮下結合組織からなっている。表皮層は角質層、顆粒層など4層からなっており、革としては不用な層であり除去される。また、乳頭層中および皮下組織中のエラスチン繊維も、製造工程中の機械的操作や薬品処理でほとんど除去される。さらに、毛を構成するケラチンは、毛皮の場合を除き革の製造には不用で、石灰付け処理で分解除去される。よって、革を構成する繊維は、コラーゲン線維が大部分を占める。真皮層は乳頭層(銀面層)と網状層に分かれる。真皮層の最上層は革でいう銀面層に当たり、この層は網状層より遥かに細かい繊維が緻密に交絡し、繊維の多くは水平方向に走行している。そのため、革の銀面層は網状層に比べ組織が緻密であり、伸びや水分透過性は悪くなる。
以下では、図2及び図3を参照して、上記の鑑別対象試料に対する6種の動物種鑑別方法のフローについて詳細に説明する。
ジエチルエーテル(和光純薬製)中に試料を浸漬し、1時間に6回以上循環するようにして2時間洗浄した。ジエチルエーテルが蒸発するよう試料を静置した後、純水に1時間浸漬した。この場合に使用する浴比は100:1とし、時々かき混ぜる。試料から余分な水を除去した後、試料を静置し自然乾燥した。
冷凍粉砕機(日本分析工業製;JFC−300)を使用して、洗浄した繊維を液体窒素で凍結させ15分間粉砕した。
試料を約0.5mgに秤量しチューブに移し、25mM炭酸水素アンモニウム(和光純薬製)を各チューブに対して500μLずつ加え、60℃でインキュベーターを用い1250rpmにて1時間処理を行い、10分間室温にて静置した。20μgトリプシン(Promega製タンパク質配列決定用)を50μLの25mM炭酸水素アンモニウム(和光純薬製)で溶かし、各チューブに加えた。インキュベーターを用い37℃,250rpmにて18時間酵素反応を行った。
試料(約550μL)を0.22μmフィルター(タカラバイオ製;SUPRECTM−01)を用いて4℃下4900xgで10分間フィルトレーションした。その後、試料を−80℃で10分間凍結し、凍結乾燥機(東京理科器械製;EYELAFDU−1200)を用いて、−50℃で真空凍結乾燥をオーバーナイトで行った。
次に、試料を0.1%ギ酸で溶解し、ボルテックスした後、少々遠心して5分間ソニケーションをおこなった。ソニケーションした試料は、再び0.22μmフィルターを用いて4℃下4900xgで10分間フィルトレーションし、採取した試料のうち2μLをLC−MS/MS解析に用いた。ギ酸はLCMS用を用いた。
質量分析には、高速液体クロマトグラフイオントラップ型−飛行時間型質量分析計(島津製作所製;LCMS−IT−TOF)ならびにトリプル四重極LCMS/MSシステム(アジレント・テクノロジー製;G6460 QQQ LC−MS)を使用した。
LCMS−IT−TOFタンパク質同定ソフト(Mascot)にあるError Tolerant Search(プレカーサーイオンの質量の違いを許容する検索)を用い、動物種に特徴的なペプチド断片を探索した。なお、ヒドロキシプロリン,ヒドロキシリジンを含むペプチドを検索可能にするため、タンパク質翻訳後修飾のパラメーターで、システイン修飾(アルキル化)を外し、一般的に用いるOxidation(M)のみならず、Oxidation(P)およびOxidation(K)を加えた。
(A)LCMS−IT−TOF
LCMS−IT−TOFで分析後おこなったMascotサーチで、主にコラーゲン3種(COL1A1,COL1A2,COL3A1)が検出された。そこで各コラーゲンについて、6種の動物種でアミノ酸配列が異なる部分を選出した。COL1A1,COL1A2,COL3A1それぞれの結果を、表1,2,3に示す。なお、下記表中の項目AAの表記はウシのアミノ酸配列に相当するアミノ配列の番号を示し、項目Oxは酸化修飾されるアミノ酸の数の総和を示し、項目m/zは主に検出されるイオンの質量電荷比を示し、項目Mr(calc)は 理論分子量(モノアイソトピック質量)を示している。
なお、配列番号19と同じ質量電荷比、同じ理論分子量のアミノ酸配列が、既存のデータベースに存在する。すなわち、GIPGEFGLPGPAGAR(配列番号19)とは異なるアミノ酸配列のGLPGEFGLPGPAGAR(配列番号39)が存在する。これは、ロイシン(L)とイソロイシン(I)は同じ分子量で、質量としては差異がないからである。同様に、配列番号34と同じ質量電荷比、同じ理論分子量のアミノ酸配列が、既存のデータベースに存在する。GEMGPAGIPGAPGLIGAR(配列番号34)とは異なるアミノ酸配列のGEMGPAGIPGAPGLLGAR(配列番号40)が存在する。
LCMS−IT−TOF分析結果より明らかとなった動物種同定が可能なペプチド断片のうち、QQQ LC−MS分析で安定して検出されたペプチド断片を表4に示す。
(1)先ず、最も流通量の多いウシに特異的に検出されるm/z951.8,604.8,767に着目し、ウシを同定する。
(2)この時、m/z767はシカにも共通に検出されるが、シカはm/z590.8も特異的であるから、これらの検出有無によりシカを同定する。
(3)ウマは、特異的m/z649.3あるいはm/z802.9に着目し同定する。なお、確認のために、m/z591.8の有無を確認しても良い。
(4)ブタは、特異的m/z654.7あるいはm/z774.8に着目し、同定する。
(5)ヒツジとヤギは、ヒツジが特異的m/z724.9を示し、ヤギが特異的m/z739.3を示すという違いに着目して、これらを同定する。
DNA鑑別法やMALDI-TOF MSを用いた分析では、皮革の加工段階での薬剤による損傷や染料、なめし剤等の來雑物が原因で鑑別が困難であるが、本発明の動物種鑑別方法では、いずれの課題も解決されており実用の可能性がある。
先ず、フォックス,ラクーン,ミンク等の毛皮からケラチンを抽出する(ステップS101)。抽出したケラチンをケラチン分解酵素で分解する(ステップS102)。ケラチン分解酵素としては、トリプシンを用いることができる。
そして、実施例1と同様に、ペプチド断片のアミノ酸配列を解析し(ステップS103)、鑑別する動物種全てに共通して検出されるペプチド断片を除外し(ステップS104)、動物種で特異的に検出されるペプチド断片を選出する(ステップS105)。そして、選出したペプチド断片を用いて試料の動物種を鑑別する(ステップS106)。
(1)鑑別対象がウシである場合、図5に示すように、配列番号5又は配列番号31のアミノ酸配列のペプチド断片の有無を判別しウシであることを鑑別できる。
(2)鑑別対象がウマである場合、図6に示すように、配列番号2、配列番号11、配列番号24、配列番号26、配列番号28、配列番号32又は配列番号37のアミノ酸配列のペプチド断片の有無を判別しウマであることを鑑別できる。
(3)鑑別対象がブタである場合、図7に示すように、配列番号8、配列番号12、配列番号20、配列番号29、配列番号35又は配列番号38のアミノ酸配列のペプチド断片の有無を判別しブタであることを鑑別できる。
(4)鑑別対象がヒツジである場合、図8に示すように、配列番号9のアミノ酸配列のペプチド断片の有無を判別しヒツジであることを鑑別できる。
(5)鑑別対象の動物種を絞り込む際、図9に示すように、配列番号27のアミノ酸配列のペプチド断片の有無を判別して、鑑別対象をウシかシカに絞込むことができる。
(6)鑑別対象の動物種を絞り込む際に、図10に示すように、配列番号4又は配列番号30のアミノ酸配列のペプチド断片の有無を判別して、鑑別対象をヒツジかヤギに絞込むことができる。
(7)鑑別対象の動物種を絞り込む際、図11に示すように、配列番号14又は配列番号18のアミノ酸配列のペプチド断片の有無を判別して、鑑別対象をウマかブタに絞込むことができる。
Claims (8)
- ウシ、ウマ、ブタ、ヒツジ、ヤギ及びシカの6種の動物から選択される少なくとも1種の動物由来の動物皮の鑑別方法であって、鑑別対象試料から皮由来コラーゲンを抽出しトリプシンで分解したものから得られた配列番号1〜38のアミノ酸配列データ群を参照し、GEPGPAGAVGPAGAVGPR(配列番号27)のアミノ酸配列のペプチド断片の有無を判別して、鑑別対象をウシかシカに絞込み、動物種を鑑別する動物種鑑別方法。
- ウシ、ウマ、ブタ、ヒツジ、ヤギ及びシカの6種の動物から選択される少なくとも1種の動物由来の動物皮の鑑別方法であって、鑑別対象試料から皮由来コラーゲンを抽出しトリプシンで分解したものから得られた配列番号1〜38のアミノ酸配列データ群を参照し、GIPGPAGAAGATGAR(配列番号14)又はGEQGPAGPPGFQGLPGPAGTAGEVGKPGER(配列番号18)のアミノ酸配列のペプチド断片の有無を判別して、鑑別対象をウマかブタに絞込み、動物種を鑑別する動物種鑑別方法。
- ウシ、ウマ、ブタ、ヒツジ、ヤギ及びシカの6種の動物から選択される少なくとも1種の動物由来の動物皮の鑑別方法であって、鑑別対象試料から皮由来コラーゲンを抽出しトリプシンで分解したものから得られた配列番号1〜38のアミノ酸配列データ群を参照し、1)配列番号5、配列番号27及び配列番号31のアミノ酸配列のペプチド断片の有無を判別してウシを同定するステップと、2)配列番号27及び配列番号33のアミノ酸配列のペプチド断片の有無を判別してシカを同定するステップと、3)配列番号11又は配列番号28のアミノ酸配列のペプチド断片の有無を判別してウマを同定するステップと、4)配列番号12又は配列番号29のアミノ酸配列のペプチド断片の有無を判別してブタを同定するステップと、5)未だ同定されていない残りの試料に対して、配列番号9のアミノ酸配列のペプチド断片の有無を判別してヒツジを同定し、配列番号7のアミノ酸配列のペプチド断片の有無を判別してヤギを同定するステップ、を行うことを特徴とする動物種鑑別方法。
- ウシ、ウマ、ブタ、ヒツジ、ヤギ及びシカの6種の動物から選択される少なくとも1種の動物由来の動物皮の鑑別方法であって、鑑別対象試料から皮由来コラーゲンを抽出しトリプシンで分解したものから得られた配列番号1〜38のアミノ酸配列データ群を参照し、GFPGSDGVAGPK(配列番号4)のアミノ酸配列のペプチド断片の有無を判別して、鑑別対象をヒツジかヤギに絞込み、動物種を鑑別することを特徴とする動物種鑑別方法。
- ウシ、ウマ、ブタ、ヒツジ、ヤギ及びシカの6種の動物から選択される少なくとも1種の動物由来の動物皮の鑑別方法であって、
鑑別対象試料から抽出した動物皮の皮由来コラーゲンをトリプシンで分解してペプチド断片にしたものに対し、鑑別する動物種全てに共通して検出されるペプチド断片を取り除いた後、少なくとも1種の動物種で特異的に検出される配列番号1〜38のアミノ酸配列データ群を参照し、
1)GEPGPAGAVGPAGAVGPR(配列番号27)のアミノ酸配列のペプチド断片の有無を判別して、鑑別対象をウシかシカに絞込み、動物種を鑑別し、
或は、
2)GIPGPAGAAGATGAR(配列番号14)、及び、GEQGPAGPPGFQGLPGPAGTAGEVGKPGER(配列番号18)のアミノ酸配列のペプチド断片の中で、少なくとも何れかのペプチド断片の有無を判別して、鑑別対象をウマかブタに絞込み、動物種を鑑別、することを特徴とする動物種鑑別方法。 - ウシ、ウマ、ブタ、ヒツジ、ヤギ及びシカの6種の動物から選択される少なくとも1種の動物由来の動物皮の鑑別方法であって、
鑑別対象試料から抽出した動物皮の皮由来コラーゲンをトリプシンで分解してペプチド断片にしたものに対し、鑑別する動物種全てに共通して検出されるペプチド断片を取り除いた後、少なくとも1種の動物種で特異的に検出される配列番号1〜38のアミノ酸配列データ群を参照し、
GEPGPAGLPGPPGER(配列番号2)、SGDRGEAGPAGPAGPIGPVGAR(配列番号11)、GDGGPPGVTGFPGAAGR(配列番号24)、GLPGVAGSLGEPGPLGIAGPPGAR(配列番号26)、GEPGPVGSVGPVGAVGPR(配列番号28)、SGQPGTVGPAGVR(配列番号32)、及び、GSPGPQGPPGVPGPSGILGLTGAR(配列番号37)のアミノ酸配列のペプチド断片の中で、少なくとも何れかのペプチド断片の有無を判別し動物種をウマと鑑別することを特徴とする動物種鑑別方法。 - ウシ、ウマ、ブタ、ヒツジ、ヤギ及びシカの6種の動物から選択される少なくとも1種の動物由来の動物皮の鑑別方法であって、
鑑別対象試料から抽出した動物皮の皮由来コラーゲンをトリプシンで分解してペプチド断片にしたものに対し、鑑別する動物種全てに共通して検出されるペプチド断片を取り除いた後、少なくとも1種の動物種で特異的に検出される配列番号1〜38のアミノ酸配列データ群を参照し、
GETGPAGRPGEVGPPGPPGPAGEK(配列番号8)、SGDRGETGPAGPAGPVGPVGAR(配列番号12)、GIPGEFGLPGPAGPR(配列番号20)、GEPGPAGSVGPAGAVGPR(配列番号29)、GEMGPAGIPGAPGLMGAR(配列番号35)、及び、GSPGPQGPPGAPGPGGISGLTGAR(配列番号38)のアミノ酸配列のペプチド断片の中で、少なくとも何れかのペプチド断片の有無を判別し動物種をブタと鑑別することを特徴とする動物種鑑別方法。 - ウシ、ウマ、ブタ、ヒツジ、ヤギ及びシカの6種の動物から選択される少なくとも1種の動物由来の動物皮の鑑別方法であって、
鑑別対象試料から抽出した動物皮の皮由来コラーゲンをトリプシンで分解してペプチド断片にしたものに対し、鑑別する動物種全てに共通して検出されるペプチド断片を取り除いた後、少なくとも1種の動物種で特異的に検出される配列番号1〜38のアミノ酸配列データ群を参照し、
AGEVGPPGPPGPAGEK(配列番号9)のアミノ酸配列のペプチド断片の有無を判別し動物種をヒツジと鑑別することを特徴とする動物種鑑別方法。
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