JP6268129B2 - 癌抗原特異的t細胞のレセプター遺伝子およびそれによりコードされるペプチドならびにそれらの使用 - Google Patents
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Description
Valmori D. et al., J. Immunol. 168:4231-4240, 2002 Dietrich PY. et al., Cancer Res. 61:2047-2054, 2001 Coulie PG. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98:10290-10295, 2001 Godelaine D. et al. J. Immunol. 171:4893-4897, 2003 Mandruzzato S. et al., J. Immunol. 169:4017-4024, 2002
すなわち、本発明は以下のものを提供する。
(1)WT1特異的細胞障害性T細胞(CTL)のT細胞レセプター(TCR)のVβ鎖のCDR3をコードするヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドであって、配列番号:1〜1695に示すいずれかのCDR3ヌクレオチド配列を有するDNA、またはその相補的RNA、またはそれらの相補配列を有するポリヌクレオチド;
(2)配列番号:1〜1695に示すいずれかのCDR3ヌクレオチド配列からなるDNA、またはその相補的RNA、またはそれらの相補配列からなる(1)記載のポリヌクレオチド;
(3)WT1特異的細胞障害性T細胞(CTL)のT細胞レセプター(TCR)のVβ鎖のCDR3のアミノ酸配列を有するペプチドであって、配列番号:1696〜3389に示すいずれかのCDR3アミノ酸配列を有するペプチド;
(4)配列番号:1696〜3389に示すいずれかのCDR3アミノ酸配列からなる(3)記載のペプチド;
(5)(1)または(2)記載のポリヌクレオチドあるいは(3)または(4)記載のペプチドの、癌マーカーとしての使用;
(6)治療前にHLA−A*2402陽性患者から得られた試料中の、(1)または(2)記載のいずれかのポリヌクレオチドあるいは(3)または(4)記載のいずれかのペプチドを有するWT1特異的CTLのクロナリティーを調べることを特徴とする、癌の診断方法であって、該クロナリティーが複数のWT1特異的CTLが存在する場合に、該患者が癌にかかっている可能性があると判定する方法;
(7)治療前の患者におけるいずれかのCDR3ポリヌクレオチドまたはいずれかのCDR3ペプチドを有する3以上のクロナリティーを有するWT1特異的CTLのクロナリティーが大きいほど、あるいは3以上のクロナリティーを有するWT1特異的CTLの種類が多いほど、該患者が癌にかかっている可能性が高いと判定する(6)記載の方法;
(8)治療前においてHLA−A*2402陽性患者から得られた試料中の、(1)または(2)記載のいずれかのポリヌクレオチドあるいは(3)または(4)記載のいずれかのペプチドを有するWT1特異的CTLの種類およびクロナリティーを調べることを特徴とする、WT1ペプチド免疫療法に対する患者の感受性を調べる方法であって、該患者におけるクロナリティーが複数であるWT1特異的CTLの種類が、WT1ペプチド免疫療法に対する無応答者のそれよりも多い場合に、WT1ペプチド免疫療法に対する該患者の感受性があると判定する方法;
(9)治療前の患者におけるクロナリティーが複数であるWT1特異的CTLクローンの種類が多いほど、あるいはクロナリティーが大きいほど、WT1ペプチド免疫療法に対する該患者の感受性が高いと判定する(8)記載の方法;
(10)WT1ペプチド免疫療法の前後において、HLA−A*2402陽性患者から得られた試料中の、(1)または(2)記載のいずれかのポリヌクレオチドあるいは(3)または(4)記載のいずれかのペプチドを有するWT1特異的CTLクローンのクロナリティーを調べることを特徴とする、該患者におけるWT1ペプチド免疫療法のモニタリング方法であって、いずれかのクローンに関してWT1ペプチド免疫療法前よりもWT1ペプチド免疫療法後において該WT1特異的CTLのクロナリティーが増加した場合に、該患者がWT1ペプチド免疫療法に応答したと判定する方法;
(11)WT1ペプチド免疫療法後において、クロナリティーの増加の割合が大きいほど、あるいはクロナリティーが増加したクローンの種類が多いほど、WT1ペプチド免疫療法に対する応答性が高いと判定する(10)記載の方法;
(12)(3)または(4)記載のペプチドに対する抗体;
(13)(1)または(2)記載のポリヌクレオチド、(3)または(4)記載のペプチド、あるいは(12)記載の抗体を含むチップ;
(14)配列番号:3391〜3418に示す配列から選択される配列を有するCDR3ポリペプチド増幅用プライマー;
(15)(1)または(2)記載のポリヌクレオチドあるいは(3)または(4)記載のペプチドを有するWT1特異的CTLを検出するための手段を含む、癌の診断キット、WT1ペプチド免疫療法に対する癌患者の感受性を調べるためのキット、またはWT1ペプチド免疫療法のモニタリング用キット;
(16)(1)または(2)記載のポリヌクレオチドあるいは(3)または(4)記載のペプチドを有するWT1特異的CTLを検出するための手段を含む、癌の診断装置、WT1ペプチド免疫療法に対する癌患者の感受性を調べるための装置、またはWT1ペプチド免疫療法のモニタリング用装置;
(17)(13)記載のチップまたは(14)記載のプライマーを含む(15)記載のキット;
(18)(13)記載のチップまたは(14)記載のプライマーが用いられる(16)記載の装置;
(19)(1)または(2)記載のポリヌクレオチド配列を含むT細胞レセプター遺伝子を導入したHLA−A*2402陽性癌患者のリンパ球。
(1)細胞
5人の健康ボランティア(HV1〜HV5)ならびに4人のHLA−A*2402陽性AML患者(AML1〜AML4)から末梢血試料を得た。5人のHLA−A*2402陽性MDS患者(MDS1〜MDS5)から骨髄試料または末梢血試料を得た。すなわち、AML1からは、治療前、治療開始から4、8、12、42週目に末梢血を得た。AML2からは、治療前、治療開始から4週目、8週目、12週目および42週目に末梢血を得た。AML3からは、治療前、治療開始から4週目、8週目に末梢血を得た。AML4からは、治療前、治療開始から4週目に末梢血を得た。MDS1からは、治療前の骨髄、治療前の末梢血、治療開始から4週目、8週目および12週目に末梢血を得た。MDS2〜5からは、治療前の末梢血および治療前の骨髄を得た。得られた末梢血試料をFicoll-Hypaque(Pharmacia, Uppsala, Sweden)を用いる密度勾配遠心分離に供して末梢血単核細胞(PBMCs)を分離し、使用するまで−170℃にて冷凍した。上記患者に対する治療は、WT1ペプチド免疫療法にて行った。治療に使用したWT1ペプチドのアミノ酸配列はCys−Tyr−Thr−Trp−Asn−Gln−Met−Asn−Leu(配列番号:3390)であり、2週間間隔で皮内注射により投与した。
先ず、1試料あたり2x106個のPBMCsを、FACSバッファー(2%ウシ胎児血清含有PBS)中にて37℃で30分、PE抱合HLA−A*2402−WT1 235−243テトラマー(MBL, Tokyo, Japan)にて染色した。次いで、下記の5色の蛍光標識モノクローナル抗体にて、暗所かつ氷上で25分染色した:FITC−標識抗−CD4、CD14、CD16、CD19およびCD56、抗−CD3−PerCP、抗−CD8−APC−Cy7(BD Bioscience, San Jose, CA)、抗−CD45RA−APCおよび抗−CCR7−PE−Cy7(BD Pharmingen, San Diego, CA)。染色された細胞をFACSバッファーにて2回洗浄した。FACSAria装置(BD Biosciences)を用いてソーティングを行い、FACSDivaソフトウェア(BD Biosciences)にてデータ解析を行って、CD4−CD14−CD16−CD19−CD56−細胞フラクション中の単一のHLA−A*2402−WT1 235−243テトラマー+CD3+CD8+細胞を得て、WT1−Tet+細胞と定義した。
DNAのコンタミネーションをなくし、十分な単一細胞のRT−PCRを行うために、cDNA合成を行い、すべてのPCR工程を別個のクリーンベンチ内で行った。単一WT1−Tet+細胞を、15μlのcDNA反応ミックスを入れたPCRチューブ中に直接ソーティングした。このcDNA反応ミックスは、下記のものを溶解バッファー(0.5% Triton X-100を含有する1XcDNAバッファー)中に含むものであった:逆転写酵素(SuperScript III, Invitrogen, Carlsbad, CA)、0.5mM dNTPs(Invitrogen)、20ユニット(U)のRnaseインヒビター(Invitrogen)、100μg/mlのゼラチン(Roche, Indianapolis, IN)、100μg/mlのtRNA(Roche)および200nMのTCR−β鎖不変領域特異的プライマー(5’-CACCAGTGTGGCCTTTTG-3’(配列番号:3391))。ソーティング後、cDNA合成のために試料を50℃で90分インキュベーションし、次いで、反応を停止させるために95℃で5分インキュベーションした。
上記手順により得た10μlの合成cDNA生成物を、40μlの反応ミックス中に添加した。この反応ミッックスは、1XPCRバッファー、2mM MgCl2、0.25mM dNTPs、1.25U DNAポリメラーゼ(Platinum Taq DNA Polymerase, Invitrogen)、5nMの24種のVβファミリー特異的フォワードプライマーの混合物(表1に示す)および5nMの3’Cβリバースプライマー(5’−GCTTCTGATGGCTCAAACACAGC−3’(配列番号:3392))を含んでいた。PCR手順は以下のとおりであった:プレ−PCR加熱工程を95℃で2分、次いで、95℃で45秒の変性工程、57℃で45秒のアニーリング工程および72℃で50秒の伸長工程からなるサイクルを40サイクル。
増幅されたTCR−β遺伝子フラグメントを、PCR Purification Kit(Qiagen, Valencia, CA)により精製した。対応するTCR Vβ特異的フォワードプライマーを用いて配列決定を行った。配列決定にはABI PRIAM BigDye Terminator v 3.1 Cycle Sequencing kit(Applied Biosystems, Foster City, CA, USA)を用い、ABI PRISM 3100 Genetic Analyzer(Applied Biosystems)にて分析を行った。IMGTヒトTCR遺伝子データベースのサイト(http://imgt.cines.fr)と比較することによりCDR3の配列データを分析した。
健常人および癌患者(AML1〜4、MDS1〜5)由来のWT1特異的CTLのVβ鎖遺伝子の配列、J領域の配列、D領域の配列、N領域の配列、CDR3ヌクレオチド配列およびCDR3アミノ酸配列を図1−1〜図1−36に示す。個々のWT1特異的CTLのクロナリティーを図2−1〜図2−36に示す。また、CDR3ヌクレオチド配列を配列番号:1〜1695に示し(クローン#24.29と#28.92のCDR3ヌクレオチド配列は同じものとなるのでクローン#24.29のほうを配列表に記載)、CDR3アミノ酸配列を配列番号:1696〜3389に示した(クローン#2.53と#28.58のCDR3アミノ酸配列は同じものであり、クローン#24.29と#28.92のCDR3アミノ酸配列も同じものであるので、クローン#2.53、クローン#24.19を配列表に記載)。なお、AML患者のうち、AML1およびAML2は治療に対して応答し、AML3およびAML4は応答しなかった。MDS患者については治療に対する応答を判定していない。
ティーが複数である細胞の種類の増加は、患者において癌細胞に対する防御・攻撃が既に開始されている可能性を示すものであり、既に癌細胞が患者に存在する可能性があると考えられる。
Claims (12)
- 治療前にHLA−A*2402陽性患者から得られた試料中の下記ポリヌクレオチドあるいは下記ペプチドを有するWT1特異的CTLのクロナリティーを調べることを特徴とし、該クロナリティーが複数のWT1特異的CTLが存在する場合に、該患者が癌にかかっている可能性があると判定する方法あって、
ポリヌクレオチドが、(i)WT1特異的細胞障害性T細胞(CTL)のT細胞レセプター(TCR)のVβ鎖のCDR3をコードするヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドであって、配列番号:23、27、53、79、144、194、211、223、240、320、329、331、341、364、374、397、410、432、454、507、509、564、640、702、706、721、841、851、855、905、940、947、954、966、976、990、1002、1025、1034、1036、1041、1078、1101、1120、1183、1191、1212、1216、1227、1235、1298、1339、1349、1362、1441、1485、1488、1513、1514、1611、1622、1687に示すいずれかのCDR3ヌクレオチド配列を有するDNA、またはその相補的RNA、またはそれらの相補配列を有するポリヌクレオチドであるか、あるいは(ii)配列番号:23、27、53、79、144、194、211、223、240、320、329、331、341、364、374、397、410、432、454、507、509、564、640、702、706、721、841、851、855、905、940、947、954、966、976、990、1002、1025、1034、1036、1041、1078、1101、1120、1183、1191、1212、1216、1227、1235、1298、1339、1349、1362、1441、1485、1488、1513、1514、1611、1622、1687に示すいずれかのCDR3ヌクレオチド配列からなるDNA、またはその相補的RNA、またはそれらの相補配列からなる(i)記載のポリヌクレオチドであり、
ペプチドが、(i)WT1特異的細胞障害性T細胞(CTL)のT細胞レセプター(TCR)のVβ鎖のCDR3のアミノ酸配列を有するペプチドであって、配列番号:1718、1722、1748、1774、1839、1889、1906、1918、1935、2015、2024、2026、2036、2059、2069、2092、2105、2127、2149、2202、2204、2259、2335、2397、2401、2416、2536、2546、2550、2600、2635、2642、2649、2661、2671、2685、2697、2720、2729、2731、2736、2773、2796、2815、2878、2886、2907、2911、2922、2930、2993、3034、3044、3057、3136、3180、3183、3208、3209、3305、3316、3381に示すいずれかのCDR3アミノ酸配列を有するペプチドであるか、あるいは(ii)配列番号:1718、1722、1748、1774、1839、1889、1906、1918、1935、2015、2024、2026、2036、2059、2069、2092、2105、2127、2149、2202、2204、2259、2335、2397、2401、2416、2536、2546、2550、2600、2635、2642、2649、2661、2671、2685、2697、2720、2729、2731、2736、2773、2796、2815、2878、2886、2907、2911、2922、2930、2993、3034、3044、3057、3136、3180、3183、3208、3209、3305、3316、3381に示すいずれかのCDR3アミノ酸配列からなる(i)記載のペプチドである方法。 - 治療前の患者におけるいずれかのCDR3ポリヌクレオチドまたはいずれかのCDR3ペプチドを有する3以上のクロナリティーを有するWT1特異的CTLのクロナリティーが大きいほど、あるいは3以上のクロナリティーを有するWT1特異的CTLの種類が多いほど、該患者が癌にかかっている可能性が高いと判定する請求項1記載の方法。
- 治療前においてHLA−A*2402陽性患者から得られた試料中の下記ポリヌクレオチドあるいは下記ペプチドを有するWT1特異的CTLの種類およびクロナリティーを調べることを特徴とし、該患者におけるクロナリティーが複数であるWT1特異的CTLの種類が、WT1ペプチド免疫療法に対する無応答者のそれよりも多い場合に、WT1ペプチド免疫療法に対する該患者の感受性があると判定するWT1ペプチド免疫療法に対する
患者の感受性を調べる方法であって、
ポリヌクレオチドが、(i)WT1特異的細胞障害性T細胞(CTL)のT細胞レセプター(TCR)のVβ鎖のCDR3をコードするヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドであって、配列番号:23、27、240、341、851、855、1002、1078、1183、1298、1362、1513、1687に示すいずれかのCDR3ヌクレオチド配列を有するDNA、またはその相補的RNA、またはそれらの相補配列を有するポリヌクレオチドであるか、あるいは(ii)配列番号:23、27、240、341、851、855、1002、1078、1183、1298、1362、1513、1687に示すいずれかのCDR3ヌクレオチド配列からなるDNA、またはその相補的RNA、またはそれらの相補配列からなる(i)記載のポリヌクレオチドであり、
ペプチドが、(i)WT1特異的細胞障害性T細胞(CTL)のT細胞レセプター(TCR)のVβ鎖のCDR3のアミノ酸配列を有するペプチドであって、配列番号:1718、1722、1935、2036、2546、2550、2697、2773、2878、2993、3057、3208、3381に示すいずれかのCDR3アミノ酸配列を有するペプチドであるか、あるいは(ii)配列番号:1718、1722、1935、2036、2546、2550、2697、2773、2878、2993、3057、3208、3381に示すいずれかのCDR3アミノ酸配列からなる(i)記載のペプチド
である方法。 - 治療前の患者におけるクロナリティーが複数であるWT1特異的CTLクローンの種類が多いほど、あるいはクロナリティーが大きいほど、WT1ペプチド免疫療法に対する該患者の感受性が高いと判定する請求項3記載の方法。
- WT1ペプチド免疫療法の前後において、あるいはWT1ペプチド免疫療法の期間中において、HLA−A*2402陽性患者から得られた試料中の下記ポリヌクレオチドあるいは下記ペプチドを有するWT1特異的CTLクローンのクロナリティーを調べることを特徴とし、いずれかのクローンに関してWT1ペプチド免疫療法前よりもWT1ペプチド免疫療法後において該WT1特異的CTLのクロナリティーが増加した場合に、あるいはWT1ペプチド免疫療法期間中にクロナリティーが増加した場合に、該患者がWT1ペプチド免疫療法に応答したと判定する該患者におけるWT1ペプチド免疫療法のモニタリング方法であって、
ポリヌクレオチドが、(i)WT1特異的細胞障害性T細胞(CTL)のT細胞レセプター(TCR)のVβ鎖のCDR3をコードするヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドであって、配列番号:27、28、240、341、347、425、855、923、1002、1078、1256、1414、1430、1611、34、350、1361に示すいずれかのCDR3ヌクレオチド配列を有するDNA、またはその相補的RNA、またはそれらの相補配列を有するポリヌクレオチドであるか、あるいは(ii)配列番号:27、28、240、341、347、425、855、923、1002、1078、1256、1414、1430、1611、34、350、1361に示すいずれかのCDR3ヌクレオチド配列からなるDNA、またはその相補的RNA、またはそれらの相補配列からなる(i)記載のポリヌクレオチドであり、
ペプチドが、(i)WT1特異的細胞障害性T細胞(CTL)のT細胞レセプター(TCR)のVβ鎖のCDR3のアミノ酸配列を有するペプチドであって、配列番号:1722、1723、1935、2036、2042、2120、2550、2618、2697、2773、2951、3109、3125、3305、1729、2045、3056に示すいずれかのCDR3アミノ酸配列を有するペプチドであるか、あるいは(ii)配列番号:1722、1723、1935、2036、2042、2120、2550、2618、2697、2773、2951、3109、3125、3305、1729、2045、3056に示すいずれかのCDR3アミノ酸配列からなる(i)記載のペプチド
である方法。 - WT1ペプチド免疫療法後において、あるいはWT1ペプチド免疫療法期間中に、クロナリティーの増加の割合が大きいほど、あるいはクロナリティーが増加したクローンの種類が多いほど、WT1ペプチド免疫療法に対する応答性が高いと判定する請求項5記載の方法。
- 下記ペプチド:
(i)WT1特異的細胞障害性T細胞(CTL)のT細胞レセプター(TCR)のVβ鎖のCDR3のアミノ酸配列を有するペプチドであって、
(a)配列番号:1718、1722、1748、1774、1839、1889、1906、1918、1935、2015、2024、2026、2036、2059、2069、2092、2105、2127、2149、2202、2204、2259、2335、2397、2401、2416、2536、2546、2550、2600、2635、2642、2649、2661、2671、2685、2697、2720、2729、2731、2736、2773、2796、2815、2878、2886、2907、2911、2922、2930、2993、3034、3044、3057、3136、3180、3183、3208、3209、3305、3316、3381に示すいずれかのCDR3アミノ酸配列を有するペプチド、
(b)配列番号:1718、1722、1935、2036、2546、2550、2697、2773、2878、2993、3057、3208、3381に示すいずれかのCDR3アミノ酸配列を有するペプチド、あるいは
(c)配列番号:1722、1723、1935、2036、2042、2120、2550、2618、2697、2773、2951、3109、3125、3305、1729、2045、3056に示すいずれかのCDR3アミノ酸配列を有するペプチド、あるいは
(ii)WT1特異的細胞障害性T細胞(CTL)のT細胞レセプター(TCR)のVβ鎖のCDR3のアミノ酸配列からなるペプチドであって、
(a)配列番号:1718、1722、1748、1774、1839、1889、1906、1918、1935、2015、2024、2026、2036、2059、2069、2092、2105、2127、2149、2202、2204、2259、2335、2397、2401、2416、2536、2546、2550、2600、2635、2642、2649、2661、2671、2685、2697、2720、2729、2731、2736、2773、2796、2815、2878、2886、2907、2911、2922、2930、2993、3034、3044、3057、3136、3180、3183、3208、3209、3305、3316、3381に示すいずれかのCDR3アミノ酸配列からなるペプチド、
(b)配列番号:1718、1722、1935、2036、2546、2550、2697、2773、2878、2993、3057、3208、3381に示すいずれかのCDR3アミノ酸配列からなるペプチド、あるいは
(c)配列番号:1722、1723、1935、2036、2042、2120、2550、2618、2697、2773、2951、3109、3125、3305、1729、2045、3056に示すいずれかのCDR3アミノ酸配列からなるペプチド
に対する抗体。 - 下記ポリヌクレオチド、下記ペプチド、あるいは請求項7記載の抗体を含むチップであって、
ポリヌクレオチドが、
(i)WT1特異的細胞障害性T細胞(CTL)のT細胞レセプター(TCR)のVβ鎖のCDR3をコードするヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドであって、
(a)配列番号:23、27、53、79、144、194、211、223、240、320、329、331、341、364、374、397、410、432、454、507、509、564、640、702、706、721、841、851、855、905、940、947、954、966、976、990、1002、1025、1034、1036、1041、1078、1101、1120、1183、1191、1212、1216、1227、1235、1298、1339、1349、1362、1441、1485、1488、1513、1514、1611、1622、1687、
(b)配列番号:23、27、240、341、851、855、1002、1078、1183、1298、1362、1513、1687、あるいは
(c)配列番号:27、28、240、341、347、425、855、923、1002、1078、1256、1414、1430、1611、34、350、1361
に示すいずれかのCDR3ヌクレオチド配列を有するDNA、またはその相補的RNA、またはそれらの相補配列を有するポリヌクレオチドであるか、あるいは
(ii)WT1特異的細胞障害性T細胞(CTL)のT細胞レセプター(TCR)のVβ鎖のCDR3をコードするヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチドであって、
(a)配列番号:23、27、53、79、144、194、211、223、240、320、329、331、341、364、374、397、410、432、454、507、509、564、640、702、706、721、841、851、855、905、940、947、954、966、976、990、1002、1025、1034、1036、1041、1078、1101、1120、1183、1191、1212、1216、1227、1235、1298、1339、1349、1362、1441、1485、1488、1513、1514、1611、1622、1687、
(b)配列番号:23、27、240、341、851、855、1002、1078、1183、1298、1362、1513、1687、あるいは
(c)配列番号:27、28、240、341、347、425、855、923、1002、1078、1256、1414、1430、1611、34、350、1361
に示すいずれかのCDR3ヌクレオチド配列からなるDNA、またはその相補的RNA、またはそれらの相補配列からなるポリヌクレオチドであり、
ペプチドが、
(i)WT1特異的細胞障害性T細胞(CTL)のT細胞レセプター(TCR)のVβ鎖のCDR3のアミノ酸配列を有するペプチドであって、
(a)配列番号:1718、1722、1748、1774、1839、1889、1906、1918、1935、2015、2024、2026、2036、2059、2069、2092、2105、2127、2149、2202、2204、2259、2335、2397、2401、2416、2536、2546、2550、2600、2635、2642、2649、2661、2671、2685、2697、2720、2729、2731、2736、2773、2796、2815、2878、2886、2907、2911、2922、2930、2993、3034、3044、3057、3136、3180、3183、3208、3209、3305、3316、3381、
(b)配列番号:1718、1722、1935、2036、2546、2550、2697、2773、2878、2993、3057、3208、3381、あるいは
(c)配列番号:1722、1723、1935、2036、2042、2120、2550、2618、2697、2773、2951、3109、3125、3305、1729、2045、3056
に示すいずれかのCDR3アミノ酸配列を有するペプチドであるか、あるいは
(ii)WT1特異的細胞障害性T細胞(CTL)のT細胞レセプター(TCR)のVβ鎖のCDR3のアミノ酸配列からなるペプチドであって、
(a)配列番号:1718、1722、1748、1774、1839、1889、1906、1918、1935、2015、2024、2026、2036、2059、2069、2092、2105、2127、2149、2202、2204、2259、2335、2397、2401、2416、2536、2546、2550、2600、2635、2642、2649、2661、2671、2685、2697、2720、2729、2731、2736、2773、2796、2815、2878、2886、2907、2911、2922、2930、2993、3034、3044、3057、3136、3180、3183、3208、3209、3305、3316、3381、
(b)配列番号:1718、1722、1935、2036、2546、2550、2697、2773、2878、2993、3057、3208、3381、あるいは
(c)配列番号:1722、1723、1935、2036、2042、2120、2550、2618、2697、2773、2951、3109、3125、3305、1729、2045、3056
に示すいずれかのCDR3アミノ酸配列からなるペプチド
であるチップ。 - 下記ポリヌクレオチドあるいは下記ペプチドを有するWT1特異的CTLを検出するための手段を含む、癌の診断キット、WT1ペプチド免疫療法に対する癌患者の感受性を調べるためのキット、またはWT1ペプチド免疫療法のモニタリング用キットであって、
ポリヌクレオチドが、
(i)WT1特異的細胞障害性T細胞(CTL)のT細胞レセプター(TCR)のVβ鎖のCDR3をコードするヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドであって、
(a)配列番号:23、27、53、79、144、194、211、223、240、320、329、331、341、364、374、397、410、432、454、507、509、564、640、702、706、721、841、851、855、905、940、947、954、966、976、990、1002、1025、1034、1036、1041、1078、1101、1120、1183、1191、1212、1216、1227、1235、1298、1339、1349、1362、1441、1485、1488、1513、1514、1611、1622、1687、
(b)配列番号:23、27、240、341、851、855、1002、1078、1183、1298、1362、1513、1687、あるいは
(c)配列番号:27、28、240、341、347、425、855、923、1002、1078、1256、1414、1430、1611、34、350、1361
に示すいずれかのCDR3ヌクレオチド配列を有するDNA、またはその相補的RNA、またはそれらの相補配列を有するポリヌクレオチドであるか、あるいは
(ii)WT1特異的細胞障害性T細胞(CTL)のT細胞レセプター(TCR)のVβ鎖のCDR3をコードするヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチドであって、
(a)配列番号:23、27、53、79、144、194、211、223、240、320、329、331、341、364、374、397、410、432、454、507、509、564、640、702、706、721、841、851、855、905、940、947、954、966、976、990、1002、1025、1034、1036、1041、1078、1101、1120、1183、1191、1212、1216、1227、1235、1298、1339、1349、1362、1441、1485、1488、1513、1514、1611、1622、1687、
(b)配列番号:23、27、240、341、851、855、1002、1078、1183、1298、1362、1513、1687、あるいは
(c)配列番号:27、28、240、341、347、425、855、923、1002、1078、1256、1414、1430、1611、34、350、1361
に示すいずれかのCDR3ヌクレオチド配列からなるDNA、またはその相補的RNA、またはそれらの相補配列からなるポリヌクレオチドであり、
ペプチドが、
(i)WT1特異的細胞障害性T細胞(CTL)のT細胞レセプター(TCR)のVβ鎖のCDR3のアミノ酸配列を有するペプチドであって、
(a)配列番号:1718、1722、1748、1774、1839、1889、1906、1918、1935、2015、2024、2026、2036、2059、2069、2092、2105、2127、2149、2202、2204、2259、2335、2397、2401、2416、2536、2546、2550、2600、2635、2642、2649、2661、2671、2685、2697、2720、2729、2731、2736、2773、2796、2815、2878、2886、2907、2911、2922、2930、2993、3034、3044、3057、3136、3180、3183、3208、3209、3305、3316、3381、
(b)配列番号:1718、1722、1935、2036、2546、2550、2697、2773、2878、2993、3057、3208、3381、あるいは
(c)配列番号:1722、1723、1935、2036、2042、2120、2550、2618、2697、2773、2951、3109、3125、3305、1729、2045、3056
に示すいずれかのCDR3アミノ酸配列を有するペプチドであるか、あるいは
(ii)WT1特異的細胞障害性T細胞(CTL)のT細胞レセプター(TCR)のVβ鎖のCDR3のアミノ酸配列からなるペプチドであって、
(a)配列番号:1718、1722、1748、1774、1839、1889、1906、1918、1935、2015、2024、2026、2036、2059、2069、2092、2105、2127、2149、2202、2204、2259、2335、2397、2401、2416、2536、2546、2550、2600、2635、2642、2649、2661、2671、2685、2697、2720、2729、2731、2736、2773、2796、2815、2878、2886、2907、2911、2922、2930、2993、3034、3044、3057、3136、3180、3183、3208、3209、3305、3316、3381、
(b)配列番号:1718、1722、1935、2036、2546、2550、2697、2773、2878、2993、3057、3208、3381、あるいは
(c)配列番号:1722、1723、1935、2036、2042、2120、2550、2618、2697、2773、2951、3109、3125、3305、1729、2045、3056
に示すいずれかのCDR3アミノ酸配列からなるペプチド
であるキット。 - 下記ポリヌクレオチドあるいは下記ペプチドを有するWT1特異的CTLを検出するための手段を含む、癌の診断装置、WT1ペプチド免疫療法に対する癌患者の感受性を調べるための装置、またはWT1ペプチド免疫療法のモニタリング用装置であって、
ポリヌクレオチドが、
(i)WT1特異的細胞障害性T細胞(CTL)のT細胞レセプター(TCR)のVβ鎖のCDR3をコードするヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドであって、
(a)配列番号:23、27、53、79、144、194、211、223、240、320、329、331、341、364、374、397、410、432、454、507、509、564、640、702、706、721、841、851、855、905、940、947、954、966、976、990、1002、1025、1034、1036、1041、1078、1101、1120、1183、1191、1212、1216、1227、1235、1298、1339、1349、1362、1441、1485、1488、1513、1514、1611、1622、1687
(b)配列番号:23、27、240、341、851、855、1002、1078、1183、1298、1362、1513、1687、あるいは
(c)配列番号:27、28、240、341、347、425、855、923、1002、1078、1256、1414、1430、1611、34、350、1361
に示すいずれかのCDR3ヌクレオチド配列を有するDNA、またはその相補的RNA、またはそれらの相補配列を有するポリヌクレオチドであるか、あるいは
(ii)WT1特異的細胞障害性T細胞(CTL)のT細胞レセプター(TCR)のVβ鎖のCDR3をコードするヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチドであって、
(a)配列番号:23、27、53、79、144、194、211、223、240、320、329、331、341、364、374、397、410、432、454、507、509、564、640、702、706、721、841、851、855、905、940、947、954、966、976、990、1002、1025、1034、1036、1041、1078、1101、1120、1183、1191、1212、1216、1227、1235、1298、1339、1349、1362、1441、1485、1488、1513、1514、1611、1622、1687
(b)配列番号:23、27、240、341、851、855、1002、1078、1183、1298、1362、1513、1687、あるいは
(c)配列番号:27、28、240、341、347、425、855、923、1002、1078、1256、1414、1430、1611、34、350、1361
に示すいずれかのCDR3ヌクレオチド配列からなるDNA、またはその相補的RNA、またはそれらの相補配列からなるポリヌクレオチドであり、
ペプチドが、
(i)WT1特異的細胞障害性T細胞(CTL)のT細胞レセプター(TCR)のVβ鎖のCDR3のアミノ酸配列を有するペプチドであって、
(a)配列番号:1718、1722、1748、1774、1839、1889、1906、1918、1935、2015、2024、2026、2036、2059、2069、2092、2105、2127、2149、2202、2204、2259、2335、2397、2401、2416、2536、2546、2550、2600、2635、2642、2649、2661、2671、2685、2697、2720、2729、2731、2736、2773、2796、2815、2878、2886、2907、2911、2922、2930、2993、3034、3044、3057、3136、3180、3183、3208、3209、3305、3316、3381
(b)配列番号:1718、1722、1935、2036、2546、2550、2697、2773、2878、2993、3057、3208、3381、あるいは
(c)配列番号:1722、1723、1935、2036、2042、2120、2550、2618、2697、2773、2951、3109、3125、3305、1729、2045、3056
に示すいずれかのCDR3アミノ酸配列を有するペプチドであるか、あるいは
(ii)WT1特異的細胞障害性T細胞(CTL)のT細胞レセプター(TCR)のVβ鎖のCDR3のアミノ酸配列からなるペプチドであって、
(a)配列番号:1718、1722、1748、1774、1839、1889、1906、1918、1935、2015、2024、2026、2036、2059、2069、2092、2105、2127、2149、2202、2204、2259、2335、2397、2401、2416、2536、2546、2550、2600、2635、2642、2649、2661、2671、2685、2697、2720、2729、2731、2736、2773、2796、2815、2878、2886、2907、2911、2922、2930、2993、3034、3044、3057、3136、3180、3183、3208、3209、3305、3316、3381
(b)配列番号:1718、1722、1935、2036、2546、2550、2697、2773、2878、2993、3057、3208、3381、あるいは
(c)配列番号:1722、1723、1935、2036、2042、2120、2550、2618、2697、2773、2951、3109、3125、3305、1729、2045、3056
に示すいずれかのCDR3アミノ酸配列からなるペプチド
である装置。 - 請求項8記載のチップを含む、請求項9記載のキット。
- 請求項8記載のチップが用いられる、請求項10記載の装置。
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