JP6248103B2 - β−ターン環式ペプチド模倣化合物の合成 - Google Patents

Description

本出願は、２０１２年６月２２日出願の米国特許出願第６１／６６３，３８７号に基づく優先権を主張するものであり、この米国特許出願の開示は、参照により全体として本明細書に組み込まれる。

本発明は、β−ターン環式ペプチド模倣化合物及びその中間体の製造方法に関する。

イントロダクション：
特定のβ−ターン環式ペプチド模倣化合物の合成については知られている。しかし、これらの方法は、Ｉｎ Ｖｉｖｏ及び臨床研究に必要なグラム単位及びキログラム単位での本化合物の大量生産に適用する際には、特に二量体副生成物の形成という点で困難性が生じる。

β−ターン環式ペプチド模倣化合物のクラスにおけるいくつかの化合物の有望な薬理学的活性を踏まえると、よりコスト効率のよい生産が可能な新しい合成方法を開発する必要性が存在する。

従って、本発明の一態様は、上述した従来の制限を克服するβ−ターン環式ペプチド模倣化合物を製造する新たな合成方法を提供することである。本発明の更なる一態様は、商業ベースで実現可能なこれらの化合物を生産する方法を提供することにある。

図１は、本発明の実施形態における、一般の反応であるスキーム１を表し、構造式（Ｉ）のβ−ターン環式ペプチド模倣化合物へ到る反応を示す。

図２は、本発明の実施形態における、例示的な反応であるスキーム２を表し、２−クロロトリチルクロライド（２−ＣＴＣ）樹脂を用いてＤ３の構造を有するβ−ターンペプチド模倣環式化合物を製造する反応経路を示す。

様々な実施形態によって、本発明に係るβ−ターン環式ペプチド模倣化合物の合成方法が開示される。他の実施形態によって、上記方法による有用な本発明に係る中間体が開示される。合成方法及び新規の中間体は、図１（スキーム１）言及される実施形態において記載される。

本発明のある実施形態に係る方法は、構造式（Ｉ）のβ−ターンペプチド模倣環式化合物を製造する方法であり、
この方法は、

（ａ）構造式（ＩＩＩ）の保護された線形ペプチド模倣化合物を提供し、



（ｂ）分子内芳香族求核置換反応により構造式（ＩＶ）の保護されたβ−ターンペ
プチド模倣環式化合物を形成するため、構造式（ＩＩＩ）の保護された線形ペプチド
模倣化合物を環状化し、



（ｃ） 構造式（ＩＶ）の保護されたβ−ターンペプチド模倣環式化合物における
アミノ酸の側鎖保護基を脱保護化し、

Ｒ₁及びＲ₃は、それぞれ独立に、水素、Ｃ₁からＣ₆のアルキル、アリール、又は自然又は非自然のアミノ酸のアミノ酸側鎖置換基でもよく、
Ｒ₂及びＲ₄は、それぞれ独立に、水素又はＣ₁からＣ₆のアルキルであり、Ｒ₁及びＲ₂は、それらが結合しているＣ原子と一緒になってシクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、又はシクロヘキシル基を形成し、又はＲ₃及びＲ₄は、それらが結合しているＣ原子と一緒にシクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、又はシクロヘキシル基を形成してもよく、
Ｒ₅、Ｒ₆及びＲ₇は、それぞれ独立に、水素又はＣ₁からＣ₆のアルキルであり、
Ｙは、水素、−ＮＯ₂、ＣＯＯＲ₈、−ＯＣ（Ｒ₈）₃、−ＳＯ₃Ｒ₈、又はＳＯ₂Ｒ₈であってもよく、
Ｒ８は、それぞれアルキル又はアリールであってもよく、
Ｘは、Ｏ、Ｎ、Ｓ、Ｐ、Ｓｅ、Ｃ、Ｃ₁からＣ₆のアルキレン、ＳＯ、ＳＯ₂又はＮＨであってもよく、
Ｚは、Ｆ、Ｃｌ、Ｂｒ、又はＩであってもよく、
Ｒ₁₁及びＲ₁₃は、それぞれ独立に、水素、又は保護基であってもよく、
Ｗ₁及びＷ₃は、それぞれ独立に、自然又は非自然のアミノ酸のアミノ酸側鎖置換基であって、Ｒ₁₁及びＲ₁₃各々のアタッチメントポイントに水素原子がなく、
ｎは０、１、２、３、４、又は５であってもよく、
Ｌ₂はＨ、ＮＨ₂、ＯＨ、ＳＨ、ＣＯＯＨ、ＮＨ−ＣＨ₂−ＣＯＯＨ、Ｃ₁からＣ₆アルキル、又はＣ₁からＣ₆アリールでもよい。

ある実施形態において、構造式（ＩＩ）の固相支持体に付加される保護された線形ペプチド模倣化合物であって
Ｒ₂及びＲ₄は、それぞれ独立に、水素又はＣ₁からＣ₆アルキルから選択され、Ｗ₁及びＲ₂は、それらが結合している炭素原子と一緒になってシクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、又はシクロヘキシル基を形成し、又はＷ₃及びＲ₄は、それらが結合している炭素原子と一緒にシクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、又はシクロヘキシル基を形成してもよく、
Ｒ₅、Ｒ₆、及びＲ₇はそれぞれ独立に、水素、又はＣ₁からＣ₆アルキルでもよく、
Ｙは、水素、−ＮＯ₂、ＣＯＯＲ₈、−ＯＣ（Ｒ₈）₃、−ＳＯ₃Ｒ₈、又はＳＯ₂ＮＲ₈であってもよく、
Ｒ₈は、それぞれアルキル又はアリールであってもよく、
Ｘは、Ｏ、Ｎ、Ｓ、Ｐ、Ｓｅ、Ｃ、Ｃ₁からＣ₆アルキレン、ＳＯ、ＳＯ₂、又はＮＨであってもよく、
Ｚは、Ｆ、Ｃｌ、Ｂｒ、又はＩであってもよく、
Ｒ₁₁、Ｒ₁₂、及びＲ₁₃は、それぞれ独立に、水素、又は保護基であってもよく、
Ｗ₁及びＷ₃は、それぞれ独立に、自然又は非自然のアミノ酸のアミノ酸側鎖置換基であって、水素原子がなく、
ｎは０、１、２、３、４、又は５であってもよく、
Ｌ₁は、ｎｕｌｌ、ＮＨ、Ｏ、Ｓ、ＣＯＯ−、ＮＨ−ＣＨ₂−ＣＯＯ−、Ｃ₁からＣ₆のアルキレン、又はＣ₁からＣ₆アリーレンでもよく、
前記固相支持体は、２−クロロトリチルクロライド（２−ＣＴＣ）、４−ヒドロキシメチル−３−メトキシフェノキシブチル酸ＭＢＨＡ（ＨＭＰＢ−ＭＢＨＡ）、９−Ｆｍｏｃ−アミノ−キサンテン−３−イロキシ−メリフィールド樹脂（Ｓｅｉｂｅｒ Ａｍｉｄｅ）、トリチルアルコール、４−メチルトリチルクロライド、４−メトキシトリチルクロライド、４（２'，４'−ジメトキシフェニル−ヒドロキシメチル）−フェノキシ樹脂（Ｒｉｎｋ Ａｃｉｄ Ｒｅｓｉｎ）、２−メトキシ−4−アルコキシベンジルアルコール樹脂（Ｓａｓｒｉｎ Ｒｅｓｉｎ）、３−（Ｎ−Ｆｍｏｃ−Ｎ−メトキシ）プロピル−アミドメチル樹脂（Ｗｅｉｎｒｅｂ ａｍｉｄｅ ｒｅｓｉｎ）からなるグループから選択された官能基を備える樹脂であってもよい。

ある実施形態において、構造式（ＩＩＩ）の保護された線形ペプチド模倣化合物が提供されてもよく、

Ｒ₂及びＲ₄は、それぞれ独立に、水素又はＣ₁からＣ₆アルキルから選択され、Ｗ₁及びＲ₂は、それらが結合している炭素原子と一緒になってシクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、又はシクロヘキシル基を形成し、又はＷ₃及びＲ₄は、それらが結合している炭素原子と一緒にシクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、又はシクロヘキシル基を形成してもよく、
Ｒ₅、Ｒ₆、及びＲ₇は、それぞれ独立に、水素、又ははＣ₁からＣ₆アルキルであってもよく、
Ｙは、水素、−ＮＯ₂、ＣＯＯＲ₈、−ＯＣ（Ｒ₈）₃、−ＳＯ₃Ｒ₈、又はＳＯ₂ＮＲ₈であってもよく、
Ｒ₈は、それぞれアルキル又はアリールであってもよく、
Ｘは、Ｏ、Ｎ、Ｓ、Ｐ、Ｓｅ、Ｃ、Ｃ₁からＣ₆のアルキレン、ＳＯ、ＳＯ₂、又はＮＨであってもよく、
Ｚは、Ｆ、Ｃｌ、Ｂｒ、又はＩであってもよく、
Ｒ₁₁及びＲ₁₃はそれぞれ独立に、水素、又は保護基であってもよく、
Ｗ₁及びＷ₃は、それぞれ独立に、自然又は非自然のアミノ酸のアミノ酸側鎖置換基であって、Ｒ₁₁及びＲ₁₃各々のアタッチメントポイントに水素原子がなく、
ｎは０、１、２、３、４、又は５であってもよく、
Ｌ₂はＨ、ＮＨ₂、ＯＨ、ＳＨ、ＣＯＯＨ、ＮＨ−ＣＨ₂−ＣＯＯＨ、Ｃ₁からＣ₆のアルキル、又はＣ₁からＣ₆のアリールでもよい。

ある実施形態において、構造式（ＩＶ）の保護されたβ−ターンペプチド模倣環式化合物が提供されてもよく、
Ｒ₂及びＲ₄は、それぞれ独立に、水素又はＣ₁からＣ₆のアルキルでもよく、Ｗ₁及びＲ₂は、それらが結合している炭素原子と一緒になってシクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、又はシクロヘキシル基を形成し、又はＷ₃及びＲ₄は、それらが結合している炭素原子と一緒にシクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、又はシクロヘキシル基を形成してもよく、
Ｒ₅、Ｒ₆、及びＲ₇は、それぞれ独立に、水素、又はＣ₁からＣ₆のアルキルであってもよく、
Ｙは、水素、−ＮＯ₂、ＣＯＯＲ₈、−ＯＣ（Ｒ₈）₃、−ＳＯ₃Ｒ₈、又は−ＳＯ₂ＮＲ₈であってもよく、
Ｒ₈は、それぞれアルキル又はアリールであってもよく、
Ｘは、Ｏ、Ｎ、Ｓ、Ｐ、Ｓｅ、Ｃ₁からＣ₆アルキレン、ＳＯ、ＳＯ₂、又はＮＨであってもよく、
Ｚは、Ｆ、Ｃｌ、Ｂｒ、又はＩであってもよく、
Ｒ₁₁及びＲ₁₃はそれぞれ独立に、水素、又は保護基であってもよく、
Ｗ₁及びＷ₃は、それぞれ独立に、自然又は非自然のアミノ酸のアミノ酸側鎖置換基であって、水素原子がなく、
ｎは０、１、２、３、４、又は５であってもよく、
Ｌ₂はＨ、ＮＨ₂、ＯＨ、ＳＨ、ＣＯＯＨ、ＮＨ−ＣＨ₂−ＣＯＯＨ、Ｃ₁からＣ₆のアルキル、又はＣ₁からＣ₆のアリールでもよい。

これらの図面は、例を示しているものであって、一般的に本明細書で議論される様々な実施形態を非限定的な方法で示すものである。

本発明に係る実施形態における、構造式（Ｉ）のβ−ターンペプチド模倣環式化合物の製造のための合成方法を概念的に示す図

本発明に係る実施形態における、２−クロロトリチルクロライド（２−ＣＴＣ）樹脂を用いた構造Ｄ３のβ−ターンペプチド模倣環式化合物を製造する反応スキームの例を示す図

定義：

本明細書で「ａ」、又は「ａｎ」という用語は、特許の書面で共通に用いられる通りに用いられ、「少なくとも一つ」、又は「一又は複数」という他の用法と独立して、一以上の一又は複数を含む。

本明細書で「約」という用語は、概ね、略、ほとんど、又は、述べられた量に対し等しいといえる近傍、又は等しいことを示す。

本明細書の「非自然のアミノ酸」は、上述の通り自然のアミノ酸ではないすべてのアミノ酸を示す。このようなアミノ酸には、上述の通り、光学活性を有する１９種全てのＤ体、及び自然に存在するグリシンが含まれる。非自然のアミノ酸には、ホモセリン、ホモシステイン、シトルリン、２−３−ジアミノプロピオン酸、ヒドロキシプロリン、オルニチン、ノルロイシン、及びチロシンが含まれる。追加的な非自然のアミノ酸は当業者にとって周知の事項である。非自然のアミノ酸はＤ−体又はＬ−体である。非自然のアミノ酸には、αアミノ酸、βアミノ酸、又はγアミノ酸が含まれる。非自然のアミノ酸には、翻訳後修飾アミノ酸、リン酸化セリン、トレオニン又はチロシン、アシル化リシン、又はアルキル化リシン又はアルギニンが含まれてもよい。翻訳後修飾アミノ酸の多くの形がすでに知られている。

本明細書では、「保護基」とは、多機能化合物中のもう一つの反応部位において反応が選択的に行われるよう、特定の機能残基、例えばＯ、Ｓ、又はＮが一時的にブロックされることをさす。

本明細書で使用されるとおり、「プロトン性溶媒」という用語は、ヒドロキシル基内のような酸素に付加された水素を運ぶ、又はアミノ基内のような窒素に付加された水素を運ぶ溶媒をさす。このような溶媒はＨ＋（プロトン）を供与する。「プロトン性溶媒」の例として、水、エタノール、ｔｅｒｔ−ブタノール、及びジエチルラミンが含まれる。

本明細書で使用されるとおり、「非プロトン性溶媒」という用語は、ヒドロキシル基内のような酸素に付加された水素をほとんど又は全く運ぶことがない、又はアミノ基内のような窒素に付加された水素をほとんど又は全く運ぶことがない溶媒をさす。

本明細書で使用されるとおり、「リング（環）」という用語は、環式の形状で化学構造式中に配置される原子を有する化合物を意味する。

本明細書で使用されるとおり、「アルキル」という用語は、線形、環式、分岐、又はこれらの組み合わせであって、指定された炭素数を有する炭化水素基を意味する。アルキル基の例として、メチル、エチル、ｎ−プロピル、イソプロピル、ｎ−ブチル、ｔ−ブチル、イソブチル、ｓｅｃ−ブチル、ペンチル、イソ−アミル、ヘキシル、オクチル、ノイル、等が含まれる。本明細書において、アルキル基は、置換されてもよい。本明細書で用いられる「アルキレン」という用語は、メチレン（−ＣＨ₂−）のような二つ以上の場所に付加された飽和炭化水素の直鎖又は分岐鎖由来の飽和脂肪族基をさす。

本明細書で用いられるとおり、「アリル」という用語は、アリル基（すなわちＣＨ₂＝ＣＨ−ＣＨ₂−）を含む化合物をさす。

本明細書で用いられるとおり、「アリール」とは、一つ、二つ、又は三つのリングであって、このようなリングが一緒に垂れ下がって付加され、又は縮合されている炭素環式芳香族システムを意味する。「アリール」という用語は、ベンジル、フェニル、ナフチル、アントラセニル、フェナンスリル、インデニル、アヌレニル、アズレニル、テトラヒドロナフチル、及びビフェニルといった芳香族ラジカルを包含する。本明細書において、アリール基は、置換されてもよい。「アリーレン」という用語は、アリール（上記で定義したとおり）から水素原子の引き抜きによって二価の基となったいずれのものを示す。

基が「ヌル（ｎｕｌｌ）」と定義された場合は、基が存在しないことを意味する。

基が置換された場合、その置換は、非限定的に、以下のグループ又は、特定のグループから独立して一つ又は組合わされて選択される一又は複数の置換を含む：低級アルキル、低級アルキニル、低級アルカノイル、低級へテロアルキル、低級へテロシクロアルキル、低級へテロシクロアルキル、低級ハロアルキル、低級ハロアルケニル、低級ハロアルキニル、低級ペルハロアルキル、低級ペルハロアルコキシ、低級シクロアルキル、フェニル、アリール、アリールオキシ、低級アルコキシ、低級ハロアルコキシ、オキソ、低級アシルオキシ、カルボニル、カルボキシル、低級アルキルカルボニル、シアノ、水素、ハロゲン、ヒドロキシ、アミノ、低級アルキルアミノ、アリールアミノ、アミド、ニトロ、チオール、低級アルキルチオ、アリールチオ、低級アルキルスルスルフォニル、アリールスルフィニル、アリールスルフォニル、アリールチオ、スルフォネート、スルホン酸、三置換シリル、Ｎ３、ＳＨ、ＳＣＨ３、Ｃ（Ｏ）ＣＨ３、ピリジニル、チオフェン、フラニル、低級カルバマート、及び低級尿素。

明瞭化のため、及び、本明細書で開示され特許請求の範囲に記載されている本発明の理解の助けのために、以下の用語及び略語が次の通り定義される。

Ｂｏｃ： ｔ−ブチルオキシカルボニル

Ｃｂｚ： ベンジルオキシカルボニル

ＣＴＣ： クロロトリチルクロライド

ＤＢＵ： １，８，−ジアゾビシクロ［５，４，０］ウンデカ−７−エン

ＤＣＭ： ジクロロメタン

ＤＩＣ： １，３−ジイソプロピルカルボジイミド

ＤＩＥＡ： Ｎ，Ｎ−ジイソプロピルエチルアミン

ＤＩＰＥＡ： Ｎ，Ｎ−ジイソプロピルエチルアミン

ＤＭＦ： ジメチルホルムアミド

Ｆｍｏｃ： ９−フルオレニルメトキシカルボニル

ＨＢＴＵ： Ｏ−ベンゾトリアゾル−Ｎ，Ｎ，Ｎ'，Ｎ'−テトラメチル−ウロニウム−ヘクサフルオロ−フォスフェート

ＨＭＰＢ−ＭＢＨＡ： ４−ヒロドキシメチル−３−メトキシフェノキシブチル酸ＭＢＨＡ、又は４−（４−ヒロドキシメチル−３−メトキシフェノキシ）−ブチリル−ｐ−メチル−ベンズヒドリルアミン

ＨＯＢｔ： Ｎ−ヒドロキシベンゾトリアゾル

Ｍｔｔ： メチルトリチル

Ｐｂｆ： ペンタメチルジヒドロベンゾフランスルホニル

ＳＰＰＳ： 固相ペプチド合成

ＴＢＡＦ： テトラブチルアンモニウムフルオリド

ＴＢＤＭＳ： ｔｅｒｔ−ブチルジメチルシラン

ｔＢｕ： ｔｅｒｔ−ブチルエステル

ＴＦＡ： トリフルオロ酢酸

ＴＨＦ： テトラヒドロフラン

ＴＩＳ： トリイソプロピルシラン

ＴＭＧ： テトラメチルグアニジン

Ｔｒｔ： トリチル

図１は、構造式（Ｉ）のβ−ターンペプチド模倣環式化合物を製造するのに一般的な経路であるスキーム１を示す。すなわち、（ａ）構造式（ＩＩＩ）の保護された線形ペプチド模倣化合物を提供し、（ｂ）構造式（ＩＶ）の保護されたβ−ターンペプチド模倣環式化合物を,分子内芳香族求核置換によって形成するために構造式（ＩＩＩ）の保護された線形ペプチド模倣化合物を環状化し、（ｃ）構造式（ＩＶ）の保護されたβ−ターンペプチド模倣環式化合物における保護基のアミノ酸側鎖を脱保護化することを含む手順を示す。

本発明に係る実施形態において、構造式（Ｉ）の１４個から１６個の環原子の大環状環（リング）を有するβ−ターンペプチド模倣環式化合物が開示される。

ある実施形態に係る方法において、Ｒ₁及びＲ₃がアミノ酸側鎖置換基である化合物を提供する。典型的には、Ｒ₁及びＲ₃は、それぞれ独立に、自然のアミノ酸又は非自然のアミノ酸由来であってよい。例えば、Ｒ₁及びＲ₃は、それぞれ独立に、いずれかの鏡像異性配置における２０種の自然に発生するアミノ酸（自然のアミノ酸）、又は修飾アミノ酸（非自然のアミノ酸）から由来してもよい。２０種の自然のアミノ酸は、グリシン（Ｇｌｙ）、アラニン（Ａｌａ）、バリン（Ｖａｌ）、ロイシン（Ｌｅｕ）、イソロイシン（Ｉｌｅ）、リシン（Ｌｙｓ）、アルギニン（Ａｒｇ）、ヒスチジン（Ｈｉｓ）、プロリン（Ｐｒｏ）、セリン（Ｓｅｒ）、トレオニン（Ｔｈｒ）、フェニルアラニン（Ｐｈｅ）、チロシン（Ｔｙｒ）、トリプトファン（Ｔｒｐ）、アスパラギン酸（Ａｓｐ）、グルタミン酸（Ｇｌｕ）、アスパラギン（Ａｓｎ）、グルタミン（Ｇｌｎ）、システイン（Ｃｙｓ）及びメチオニン（Ｍｅｔ）を含むαアミノ酸である。α−アミノ酸の一般的な構造は構造式Ａで表せられる。Ｈ₂ＮＣＨ（Ｒ^*）ＣＯＯＨＲ^*は、アミノ酸の側鎖置換基を表しており、本発明におけるＲ₁又はＲ₃のいずれかを示している。

非自然のアミノ酸は、典型的には、Ｒ^*基が２０種の自然のアミノ酸中に用いられるもの以外の置換基である構造式Ａの構造を有するものである。例えば、２０種の自然のアミノ酸の構造については、Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ，Ｌ．Ｓｔｒｙｅｒ，３１（１ ｅｄ． １９８８），Ｆｒｅｅｍａｎ ａｎｄ Ｃｏｍｐａｎｙ， Ｎｅｗ Ｙｏｒｋを参照。非自然のアミノ酸は、上述する２０種のαアミノ酸以外の自然に存在する化合物であってもよい。

このような非自然のアミノ酸には、上述の通り、光学活性を有する１９種全てのＤ体、及び自然に存在するグリシンが含まれる。非自然のアミノ酸には、ホモセリン、ホモシステイン、２−３−ジアミノプロピオン酸、ヒドロキシプロリン、オルニチン、ノルロイシン、及びチロシンが含まれる。追加的な非自然のアミノ酸は当業者にとって周知の事項である。非自然のアミノ酸はＤ−体又はＬ−体である。非自然のアミノ酸は、構造式Ｂ：Ｈ₂Ｎ（ＣＨ）_n（Ｒ^*）ＣＯＯＨを有し、ｎが２又は３であり、Ｒ^*は、２０種のたんぱく質を構成するアミノ酸の置換基又は２０種のアミノ酸の中で用いられる置換基以外の置換基であるβアミノ酸又はγアミノ酸であってもよい。非自然のアミノ酸には、翻訳後修飾アミノ酸、リン酸化セリン、トレオニン又はチロシン、アシル化リシン、又はアルキル化リシン又はアルギニンが含まれてもよい。翻訳後修飾アミノ酸の多くの形がすでに知られている。

ある実施形態に係る方法により、Ｒ₁及びＲ₃が、それぞれ独立に、２つの異なるアミノ酸の側鎖置換基である化合物が提供されてもよい。このような実施形態におけるある実施形態において、Ｒ₁及びＲ₃が、それぞれ独立に、リシン、グルタミン酸、チロシン、イソロイシン、アスパラギン、アルギニン、又はトレオニンの側鎖置換基であってもよい。このような実施形態におけるある実施形態において、Ｒ₁及びＲ₃が、それぞれ独立に、グルタミン酸、リシン、イソロイシン、又はアルギニンの側鎖置換基であってもよい。このような実施形態における一の実施形態において、Ｒ₁及びＲ₃が、それぞれ独立に、グルタミン酸、又はリシンの側鎖置換基であってもよい。このような実施形態におけるもう一つの実施形態において、Ｒ₁及びＲ₃が、それぞれ独立に、イソロイシン、又はアルギニンの側鎖置換基であってもよい。

一般的に、本発明に係るβ−ターン環式ペプチド模倣合成物を製造する方法における環状化工程の前に、アミノ酸側鎖置換基（Ｒ₁及びＲ₃）は、適切な保護基（それぞれ、Ｒ₁₁及びＲ₁₃）によって保護される。アミノ酸側鎖置換基、Ｒ₁及びＲ₃が保護される際、Ｒ₁及びＲ₃は、それぞれＷ₁Ｒ₁₁及びＷ₃Ｒ₃₃と表す。Ｗ₁及びＷ₃は、それぞれ独立して、自然のアミノ酸又は非自然のアミノ酸のアミノ酸側鎖置換基であって、Ｒ₁₁及びＲ₁₃それぞれのアタッチメントポイントにおいて水素原子が一つ以下であるものである。水素原子が一つであるのは、アミノ酸側鎖置換基であるカルボン酸、アミン、チオール、アミド、ヒドロキシル、グアニジンといった官能基で通常発見される。

本発明に係る方法の工程において、合成に関わる分子であって他の敏感な反応基のアミノ酸側鎖保護は、例えば以下に記載さているような当該分野で知られている伝統的な保護基によって行われる： Ｔ． Ｗ． Ｇｒｅｅｎｅ ＆ Ｐ． Ｇ． Ｍ． Ｗｕｔｓ（Ｐｒｏｔｅｃｔｉｖｅ Ｇｒｏｕｐｓ Ｉｎ Ｏｒｇａｎｉｃ Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ １９９１ Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ａｎｄ Ｓｏｎｓ， Ｎｅｗ−Ｙｏｒｋ）； Ｓｅｗａｌｄ ａｎｄ Ｊａｋｕｂｋｅ （Ｐｅｐｔｉｄｅｓ： ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ ａｎｄ Ｂｉｏｌｏｇｙ， ２００２， Ｗｉｌｅｙ−ＶＣＨ， Ｗｈｅｉｎｈｅｉｍ ｐ．１４２）。例えばαアミノ保護基は、限定されるものではないが、アシル型保護基（例えば、トリフルオアセチル、ホルミル、アセチル）、脂肪族ウレタン保護基（例えば、ｔ−ブチルオキシカルボニル（Ｂｏｃ）、シクロヘキシルオキシカルボニル）、芳香族ウレタン型保護基（例えば、フルオレニル−９−メトキシ−カルボニル（Ｆｍｏｃ）、ベンジルオキシカルボニル（Ｃｂｚ）、Ｃｂｚ誘導体）及びアルキル型保護基（例えば、トリフェニルメチル、ベンジル）を含む。

アミノ酸側鎖保護基は、セリン、トレオニン、及びチロシンに対してはｔｅｒｔ−ブチルエーテル、リシン、トリプトファン、及びヒスチジンに対してはＢｏｃ、セリン、スレオニン、アスパラギン、グルタミン、システイン、及びヒスチジンに対してはトリチル、アスパラギン酸及びグルタミン酸に対してはｔｅｒｔ−ブチル又はアリルエステル、アルギニンに対してはＰｂｆ、スレオニン及びセリンに対してはベンジル、チロシン、トレオニン、セリン、アルギニン、及びリシンに対してはＣｂｚ、セリン及びトレオニンに対してはアルキルシラン、及び当該分野で広く知られている他の全ての保護基を含む。

ある実施形態において、Ｒ₁₁及びＲ₁₃が、それぞれ独立に、トリフルオロアセチル、ホルミル、アセチル、ｔ−ブチルオキシカルボニル（ＢＯＣ）、シクロヘキシルオキシカルボニル、フルオレニルー９−メトキシ−カルボニル（Ｆｍｏｃ）、ベンジルオキシカルボニル（Ｃｂｚ）、Ｃｂｚ誘導体、トリフェニル、メチル、ベンジル、アリロオキシカルボニル、ｔｅｒｔ−ブチル、アルキルシラン及びアリルを含むグループから選択される化合物を本発明に係る方法が提供してもよい。

ある実施形態において、本発明に係る方法は、Ｒ₁がグルタミン酸の側鎖置換基であり、Ｒ₁₁がアリル又はｔｅｒｔ−ブチルである化合物を提供してもよい。このような実施形態のある実施形態において、Ｒ₁がグルタミン酸の側鎖置換基であり、Ｒ₁₁がｔｅｒｔ−ブチルであってもよい。

ある実施形態において、本発明に係る方法は、Ｒ₃がリシンの側鎖置換基であり、Ｒ₁₃がベンジルオキシカルボニル、アリルオキシカルボニル、又はｔｅｒｔ−ブチルオキシカルボニル（Ｂｏｃ）である化合物を提供してもよい。このような実施形態のある実施形態において、Ｒ₃がリシンの側鎖置換基でありＲ₁₃がｔｅｒｔ−ブチルオキシカルボニル（Ｂｏｃ）であってもよい。

保護基は、当該分野で広く知られた方法を用いて後の便利な段階で除去してもよい。ある実施形態において、アミノ酸側鎖Ｒ₁及びＲ₃の保護基は、固相支持からペプチド模倣化合物を切断するために使用した同じ条件では除去されなくてもよい。ある実施形態において、アミノ酸側鎖Ｒ₁及びＲ₃の保護基は、固相支持からペプチド模倣化合物を切断するために使用した同じ酸性条件では除去されなくてもよい。

ある実施形態に係る方法により、Ｒ₂及びＲ₄が、それぞれ独立に、水素又はＣ₁からＣ₆アルキルである化合物が提供されてもよい。

ある実施形態に係る方法において、Ｒ₅、Ｒ₆及びＲ₇が水素である化合物が提供されてもよい。

ある実施形態に係る方法において、ＸがＯ、Ｓ、又はＮＨである化合物が提供されてもよい。

ある実施形態に係る方法において、Ｌ₁／Ｌ₂がホモ二官能性化合物との化学反応により構造式（Ｉ）のβ−ターンペプチド模倣環式化合物の二量体を効果的に形成する連結基となる化合物が提供されてもよい。Ｌ₁は、ｎｕｌｌ、ＮＨ、Ｏ、Ｓ、ＣＯＯ、ＮＨ−ＣＨ₂−ＣＯＯ−、Ｃ₁からＣ₆アルキレン、又はＣ₁からＣ₆アリーレンでもよい。ある実施形態において、Ｌ₁はＮＨ−ＣＨ₂−ＣＯＯ−であってもよい。Ｌ₂は、Ｈ、ＮＨ₂、ＯＨ、ＳＨ、ＣＯＯＨ、ＮＨ−ＣＨ₂−ＣＯＯＨ、Ｃ₁からＣ₆アルキル、又はＣ₁からＣ₆アリールを含んでもよい。ある実施形態において、Ｌ₂はＮＨ−ＣＨ₂−ＣＯＯＨであってもよい。

ある実施形態に係る方法において、ｎが１である化合物が提供されてもよい。

ある実施形態に係る方法において、Ｙが、アミド基のアタッチメントポイントと関連したメタ位における構造式のベンゼン環に付加された化合物を提供してもよい。ある実施形態において、Ｙは−ＮＯ₂である。

ある実施形態に係る方法において、Ｚが、アミド基のアタッチメントポイントと関連したオルト位における構造式のベンゼン環に付加された化合物を提供してもよい。ある実施形態においてＺはＦである。

固相支持体からの切断：

図１（スキーム１）を参照して、構造式（ＩＩＩ）の保護された線形ペプチド模倣化合物は、構造式（ＩＩ）の保護された線形ペプチド模倣化合物を切断することから得ることができる。構造式（ＩＩＩ）の保護された線形ペプチド模倣化合物は以下の構造を有している。

固相支持体からの切断は、酸、塩基、又は求核試薬の存在下で行われる。

切断溶液の処置の下、線形ペプチド模倣中間体（ＩＩＩ）を得るために、構造式（ＩＩ）の保護されたペプチド模倣化合物は、連結基を介して付加されている固相支持体から切断される。

前記固相支持体は、２−クロロトリチルクロライド（２−ＣＴＣ）、４−ヒドロキシメチル−３−メトキシフェノキシブチル酸ＭＢＨＡ（ＨＭＰＢ−ＭＢＨＡ）、９−Ｆｍｏｃ−アミノ−キサンテン−３−イロキシ−メリフィールド樹脂（Ｓｅｉｂｅｒ Ａｍｉｄｅ）、トリチルアルコール、４−メチルトリチルクロライド、４−メトキシトリチルクロライド、４（２'，４'−ジメトキシフェニル−ヒドロキシメチル）−フェノキシ樹脂（Ｒｉｎｋ Ａｃｉｄ Ｒｅｓｉｎ）、２−メトキシ−4−アルコキシベンジルアルコール樹脂（Ｓａｓｒｉｎ Ｒｅｓｉｎ）、３−（Ｎ−Ｆｍｏｃ−Ｎ−メトキシ）プロピル−アミドメチル樹脂（Ｗｅｉｎｒｅｂ ａｍｉｄｅ ｒｅｓｉｎ）といった官能基を備えた樹脂（ｒｅｓｉｎ）であってもよい。ある実施形態において、この樹脂は、２−クロロトリチルクロライド（２−ＣＴＣ）、又は２−メトキシ−４−アルコキシベンジルアルコール樹脂（Ｓａｓｒｉｎ ｒｅｓｉｎ）の官能基を備えてもよい。

本発明の固相支持体として用いられる樹脂は、少なくとも０．７５ｍｍｏｌ／ｇ、例えば１．０ｍｍｏｌ／ｇから２．０ｍｍｏｌ／ｇ、又は１．２ｍｍｏｌ／ｇから１．６ｍｍｏｌ／ｇのローディング（ｌｏａｄｉｎｇ）の官能基を有してもよい。

典型的に、樹脂は、架橋ポリスチレン／１％ジビニルベンゼン共重合体(ｃｏ−ｐｏｌｙｍｅｒ)といった不溶性重合体（ｐｏｌｙｍｅｒ）であってもよい。しかしながら、ポリスチレンベースの重合体以外の重合体、例えば、純粋、又は混合ＰＥＧ樹脂（例えば、Ｔｅｎｔａｇｎｅｌ， ＮｏｖａＰＥＧ、及びＮｏｖａＳｙｎ樹脂）も、固相支持体として用いられてもよい。これらの非ポリスチレンベースの重合体は、異なる様々な溶媒中で、より優れた膨潤特性を提供する。

構造式（ＩＩ）の保護されたペプチド模倣化合物は、酸不安定なエステル結合といった不安定な結合を介してレジンに付加される。一方、官能アミノ酸側鎖は、樹脂からペプチドを切断するのに必要な条件下において切断されない、又は、脱保護化されないより安定した保護基を用いて、保護される。このような官能アミノ酸側鎖は、官能基において強酸不安定性保護基によって保護される。官能アミノ酸側鎖に用いられる保護基は本明細書で記載される。したがって、構造式（ＩＩ）の保護された線形ペプチド模倣化合物の切断は、構造式（ＩＩ）中に存在する保護された官能基Ｒ₁₁及びＲ₁₃の大きな脱保護化を生じさせない。

ある実施形態において、構造式（ＩＩ）の保護された線形ペプチド模倣化合物の切断は弱酸性の条件の下で行われる。切断溶液は、トリフルオロ酢酸（ＴＦＡ、Ｔｒｉｆｌｕｏｒｏ ａｃｅｔｉｃ ａｃｉｄ）といった酸を約０．０１％から約５０％（ｖ／ｖ）、又は０．５％から５％（ｖ／ｖ）含む。

構造式（ＩＩ）の保護された線形ペプチド模倣化合物の切断は、異なる溶媒システム中で行われてもよい。溶媒システムには、有機溶媒、又は有機溶媒の混合物がある。溶媒システムは、ジクロロメタン、アセトニトリル、又はテトラヒドロフラン、及びこれらの混合物といった極性非プロトン性溶媒を備える。

反応中に形成されるアルキル−カルベニウムイオンによるＸ基のアルキル化を防止するため、スカベンジャーが、切断溶液に追加されうる。適したスカベンジャーとして、限定されるものではないが、トリイソプロピルシラン（ＴＩＳ）、チオアニソル、トリアルキルシラン（例えば、トリメチルシラン、トリエチルシラン）、又はこれらの混合物が含まれる。一の実施形態において、スカベンジャーはとりイソプロピルシラン（ＴＩＳ）である。

ある実施形態において、弱酸性溶液は、１０％、５％、又は３％未満の酸とスカベンジャーとの混合物が含まれる。固相支持体からの構造式（ＩＩ）の保護されたペプチド模倣化合物の切断に用いられる弱酸性溶液下での酸性物とスカベンジャーとの量の相対比は、約１：１から約１：５、約１：１から約１：３、又は１：２である。一の実施形態において、構造式（ＩＩ）の保護された線形ペプチド模倣化合物の切断は、ＴＦＡとＴＩＳを量で約１：１から１：５の比で混ぜた混合物を１０％未満含む溶液中で行われる。

ある実施形態において、末端官能基Ｘは保護されうる（すなわちＲ₁₂が保護基となる場合である。）ある実施形態において、ＸはＯであり、Ｒ₁₂はトリチル（Ｔｒｔ）、ｔｅｒｔ−ブチルジメチルシラン（ＴＢＤＭＳ）、又は例えば弱酸の条件下といった、構造式中に存在する他の保護基の脱保護化を生じさせない条件の下で除去されうる保護基である。このような実施形態のある実施形態において、ＸはＯであり、Ｒ₁₂はトリチル（Ｔｒｔ）又はｔｅｒｔ−ブチルジメチルシラン（ＴＢＤＭＳ）である。ある実施形態において、ＸはＳであり、Ｒ₁₂はトリチル（Ｔｒｔ）である。ある実施形態において、ＸはＮＨであり、Ｒ₁₂は４−メチルトリチル（Ｍｔｔ）である。

ある実施形態において、末端官能基Ｘは、構造式（ＩＩＩ）の保護された線形ペプチド模倣化合物を得るために固相支持体からペプチドを切断するのに用いられる切断溶液の処置において、脱保護化されうる。

環状化：

本発明の一側面は、溶液相において環状化反応が行われることである。線形ペプチド模倣中間体（ＩＩＩ）の固相支持体からの切断の後に環状化反応が行われるので、二量体の副産物の形成の制御において、樹脂のローディングは重要ではない。この理由のため、２ｍｍｏｌ／ｇ程度のローディングの官能基を有する置換グレードの樹脂が固相支持体として選択される。より高いローディングの樹脂を用いると、合成生成物が改善し（すなわち、一グラムのレジンあたりに生産される化合物の比が大きくなる）、生産コストを低減することができる。環状化反応は、求核分子Ｘによる芳香族求核置換反応を介して行われうる。

環状化反応は、アセトニトリル、テトラヒドロフラン、ＤＭＦ、ＤＣＭ／ＤＭＦの混合物、又はこれらの混合物といった極性プロトン性溶媒の中で行われる。ＤＣＭとＤＭＦの混合物は、約５：９５から約９５：５、約７０：３０から約９５：５、約８０：２０から約９０：１０の混合比で用いられうる。多量の水やメタノールといった溶媒は、それらが求核分子として機能し、環状化を阻害するため、避けられるべきである。本発明の一側面は、水の不存在下で環状化反応が行われることである。本発明の一側面は、メタノールの不存在下で環状化反応が行われることである。本発明の一側面は、水とメタノールの不存在下で環状化反応が行われることである。

ある実施形態において、環状化反応は、塩基触媒化環状反応である。環状化反応における塩基の役割は、官能基Ｘの求核という性質を強めることにある。用いられる塩基の例として、Ｋ₂、ＣＯ₃、ＣｓＣＯ₃、ＣｓＦ、テトラブチルアンモニウムフロライド（ＴＢＡＦ）、テトラメチルグアニジン（ＴＭＧ）がある。

環状化の段階における重要な側面は、反応の際に二量体の副産物の形成を避けるため、線形ペプチド模倣中間体（ＩＩＩ）の濃度を制御することにある。環状化反応は、線形ペプチド模倣中間体（ＩＩＩ）のより高い濃度、例えば０．０５Ｍより高い、で行われる場合は、分子間反応の比が大きくなり、二量体の副産物の形成の比を大きくしてしまう。従って、二量体の形成を避けるために、環状化反応は０．０５Ｍより低い濃度、特に０．０３Ｍより低い濃度、又は０．０２Ｍより低い濃度で行われてもよい。このような低い濃度（すなわち、高い希釈化）は、多量の溶媒を用いることで達成される。代替的に、環状化反応は、線形ペプチド模倣中間体（ＩＩＩ）を反応メディアにゆっくりと加えることで行われてもよい。これにより、大量の溶媒を用いるのを避けることができる。

環状反応は、室温で実行されてもよい。室温による反応時間は、リングサイズ、反応に必要な求核分子、塩基、及び溶媒により異なり、２４時間から４８時間である。より高い温度、例えば４０℃から６０℃に暖めた反応では、反応時間を１−５時間にまで減少させることができる。特に、環状化反応溶液が約４５℃から５５℃である場合、反応時間は２−４時間にまで減少させることができる。典型的には、環状化反応は２０℃から６５℃、２５℃から６０℃、又は４５℃から５５℃で実行される。

線形ペプチド模倣中間体（ＩＩＩ）と構造式（Ｉ）のβ−ターンペプチド模倣環式化合物は、異なる保持時間、量、及びＵＶプロファイルを有しているので、反応は分析用ＨＰＬＣ、ＬＣ−ＭＳ又はＵＶにより監視されうる。環状化が一旦終了したら、溶液は、塩基を除去するために、例えばＣｅｌｉｔｅパッドを通して、濾過されてもよい。フィルターは、例えばＴＨＦといった溶媒で洗浄されてもよく、有機層は回収され、真空化で蒸発させてもよい。

脱保護化

アミノ酸側鎖保護基の最後の脱保護化において、構造式（ＩＶ）における保護されたβ−ターンペプチド模倣環式化合物は、構造式中に存在する保護基の種類に従って、適切な試薬によって処置されてもよい。一の実施形態において、強酸溶液が用いられる。典型的には、強酸溶液は、５０％を超えるＴＦＡを含んでいる。ＴＦＡは水、又はＤＣＭ、ＴＨＦ等といった有機溶媒に溶解されうる。ある実施形態において、強酸溶液は、ＴＦＡとＨ₂Ｏとを含み、ＴＦＡ：Ｈ₂Ｏの量の比は、９０：１０から９９：１、９０：１０から９５：５、又は約９５：５であってもよい。

ある実施形態において、強酸溶液は、さらに例えばトリイソプロピルシラン（ＴＩＳ）、チオアニソル、トリアルキルシラン（例えば、トリメチルシラン、トリエチルシラン）、又はこれらの混合物といったスカベンジャーを含んでいてもよい一の実施形態において、スカベンジャーはトリイソプロピルシラン（ＴＩＳ）である。脱保護化の後、粗生成物を、エーテル又はメチルｔｅｒｔ−ブチルエーテルを用いて、０℃以下の温度で、例えば−２０(℃で、沈殿させてもよい。その後、逆相ＨＰＬＣ（ＲＰ−ＨＰＬＣ、ｒｅｖｅｒｓｅ−ｐｈａｓｅ ＨＰＬＣ）により粗生成物を濾過し、精製してもよい。

ある特定の実施形態に係る本発明は、Ｄ３のβ−ターンペプチド模倣環式化合物を製造する方法を提供する。

この方法は、

（ａ）構造式（ＩＩＩａ）の保護された線形ペプチド模倣物を提供し、

（ｂ）分子内芳香族求核置換反応により構造式（ＩＶａ）の保護されたβ−ターン
ペプチド模倣環式化合物を形成するため、構造式（ＩＩＩａ）の保護された線形ペプ
チド模倣化合物を環状化し、

（ｃ） 構造式（ＩＶａ）の保護されたβ−ターンペプチド模倣環式化合物におけ
るアミノ酸の側鎖保護基を脱保護化することである。

ある実施形態において、構造式（ＩＩａ）の固相支持体に付加される保護された線形ペプチド模倣化合物が提供される。

本発明のある実施形態に係る方法は、構造式（Ｉ）のβ−ターンペプチド模倣環式化合物を製造するのに用いられる中間体に関するものである。本明細書で開示される中間体は、構造式（Ｉ）のβ−ターンペプチド模倣環式化合物の製造に用いやすいものであり、特定の実施形態において、β−ターンペプチド模倣環式化合物Ｄ３の製造に用いやすいものである。

構造式（ＩＩ）の保護された線形ペプチド模倣化合物であり、
Ｒ₂及びＲ₄は、それぞれ独立に、水素又はＣ₁からＣ₆のアルキルから選択され、Ｗ₁及びＲ₂は、それらが結合している炭素原子と一緒になってシクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、又はシクロヘキシル基を形成し、又はＷ₃及びＲ₄は、それらが結合している炭素原子と一緒にシクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、又はシクロヘキシル基を形成し、
Ｒ₅、Ｒ₆及びＲ₇は、それぞれ独立に、水素又はＣ₁からＣ₆のアルキルであり、
Ｙは、水素、−ＮＯ₂、ＣＯＯＲ₈、−ＯＣ（Ｒ₈）₃、−ＳＯ₃Ｒ₈、及び−ＳＯ₂ＮＲ₈を含むグループから選択されてもよく、
Ｒ₈は、それぞれアルキル又はアリールであってもよく、
Ｘは、Ｏ、Ｎ、Ｓ、Ｐ、Ｓｅ、Ｃ、Ｃ₁からＣ₆のアルキレン、ＳＯ、ＳＯ₂及びＮＨを含むグループから選択されてもよく、
Ｚは、Ｆ、Ｃｌ、Ｂｒ、及びＩを含むグループから選択されてもよく、
Ｒ₁₁、Ｒ₁₂、及びＲ₁₃は、それぞれ独立に、水素、又は保護基であってもよく、
Ｗ₁及びＷ₃は、それぞれ独立に、自然又は非自然のアミノ酸のアミノ酸側鎖置換基であって、Ｒ₁₁及びＲ₁₃各々のアタッチメントポイントに水素原子がなく、
ｎは０、１、２、３、４、又は５であってもよく、及び
Ｌ₁は、ｎｕｌｌ、ＮＨ、Ｏ、Ｓ、ＣＯＯ、ＮＨ−ＣＨ₂−ＣＯＯ、Ｃ₁からＣ₆のアルキレン、又はＣ₁からＣ₆のアリーレンでもよい。
前記固相支持体は、２−クロロトリチルクロライド（２−ＣＴＣ）、４−ヒドロキシメチル−３−メトキシフェノキシブチル酸ＭＢＨＡ（ＨＭＰＢ−ＭＢＨＡ）、９−Ｆｍｏｃ−アミノ−キサンテン−３−イロキシ−メリフィールド樹脂（Ｓｅｉｂｅｒ Ａｍｉｄｅ）、トリチルアルコール、４−メチルトリチルクロライド、４−メトキシトリチルクロライド、４（２'，４'−ジメトキシフェニル−ヒドロキシメチル）−フェノキシ樹脂（Ｒｉｎｋ Ａｃｉｄ Ｒｅｓｉｎ）、２−メトキシ−4−アルコキシベンジルアルコール樹脂（Ｓａｓｒｉｎ Ｒｅｓｉｎ）、３−（Ｎ−Ｆｍｏｃ−Ｎ−メトキシ）プロピル−アミドメチル樹脂（Ｗｅｉｎｒｅｂ ａｍｉｄｅ ｒｅｓｉｎ）からなるグループから選択された官能基を備えた樹脂であることを特徴としてもよい。

本発明の一態様において、構造式（ＩＩ）の保護された線形ペプチド模倣化合物は、構造式（ＩＩａ）の構造を有してもよい。

構造式（ＩＩＩ）の保護された線形ペプチド模倣化合物であり、
Ｒ₂及びＲ₄は、それぞれ独立に、水素又はＣ₁からＣ₆のアルキルから選択され、Ｗ₁及びＲ₂は、それらが結合している炭素原子と一緒になってシクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、又はシクロヘキシル基を形成し、又はＷ₃及びＲ₄は、それらが結合している炭素原子と一緒にシクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、又はシクロヘキシル基を形成し、
Ｒ₅、Ｒ₆及びＲ₇は、それぞれ独立に、水素又はＣ₁からＣ₆のアルキルであり、
Ｙは、水素、−ＮＯ₂、ＣＯＯＲ₈、−ＯＣ（Ｒ₈）₃、−ＳＯ₃Ｒ₈、及び−ＳＯ₂ＮＲ₈であってもよく、
Ｒ₈は、それぞれアルキル又はアリールであってもよく、
Ｘは、Ｏ、Ｎ、Ｓ、Ｐ、Ｓｅ、Ｃ、Ｃ₁からＣ₆のアルキレン、ＳＯ、ＳＯ₂及びＮＨを含むグループから選択されてもよく、
Ｚは、Ｆ、Ｃｌ、Ｂｒ、及びＩを含むグループから選択されてもよく、
Ｒ₁₁及びＲ₁₃はそれぞれ独立に、水素、又は保護基であってもよく、
Ｗ₁及びＷ₃は、それぞれ独立に、自然又は非自然のアミノ酸のアミノ酸側鎖置換基であって、Ｒ₁₁及びＲ₁₃各々のアタッチメントポイントに水素原子がなく、
ｎは０、１、２、３、４、又は５であってもよく、及び
Ｌ₂は、Ｈ、ＮＨ₂、ＯＨ、ＳＨ、ＣＯＯＨ、ＮＨ−ＣＨ₂−ＣＯＯＨ、Ｃ₁からＣ₆のアルキル、又はＣ₁からＣ₆のアリールでもよい。

本発明の一態様において、構造式（ＩＩＩ）の保護された線形ペプチド模倣化合物は、構造式（ＩＩＩａ）の構造を有してもよい。

構造式（ＩＶ）の保護されたペプチド模倣化合物であり、
Ｒ₂及びＲ₄は、それぞれ独立に、水素又はＣ₁からＣ₆アルキルから選択され、Ｗ₁及びＲ₂は、それらが結合している炭素原子と一緒になってシクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、又はシクロヘキシル基を形成し、又はＷ₃及びＲ₄は、それらが結合している炭素原子と一緒にシクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、又はシクロヘキシル基を形成し、
Ｒ₅、Ｒ₆及びＲ₇は、それぞれ独立に、水素又はＣ₁からＣ₆のアルキルであり、
Ｙは、水素、−ＮＯ₂、ＣＯＯＲ₈、−ＯＣ（Ｒ₈）₃、−ＳＯ₃Ｒ₈、及び−ＳＯ₂ＮＲ₈であってもよく、
Ｒ₈は、それぞれアルキル又はアリールであってもよく、
Ｘは、Ｏ、Ｎ、Ｓ、Ｐ、Ｓｅ、Ｃ、Ｃ₁からＣ₆のアルキレン、ＳＯ、ＳＯ₂及びＮＨを含むグループから選択されてもよく、
Ｒ₁₁及びＲ₁₃はそれぞれ独立に、水素、又は保護基であってもよく、
Ｗ₁及びＷ₃は、それぞれ独立に、自然又は非自然のアミノ酸のアミノ酸側鎖置換基であって、Ｒ₁₁及びＲ₁₃各々のアタッチメントポイントに水素原子がなく、
ｎは０、１、２、３、４、又は５であってもよく、及び
Ｌ₂は、Ｈ、ＮＨ₂、ＯＨ、ＳＨ、ＣＯＯＨ、ＮＨ−ＣＨ₂−ＣＯＯＨ、Ｃ₁からＣ₆のアルキル、又はＣ₁からＣ₆のアリールでもよい。

本発明の一態様において、構造式（ＩＶ）の保護されたβ−ターンペプチド模倣化合物は、構造式（ＩＩＶａ）の構造を有してもよい。

ある特実施形態に係る本発明は、Ｄ３のβ−ターンペプチド模倣環式化合物を製造する方法を提供する。図２は、例示的なスキーム２の反応を表し、２−クロロトリチルクロライド（２−ＣＴＣ）レジンを用いてＤ３の構造を有するβ−ターンペプチド模倣環式化合物を製造する反応経路を示している。

実施例：
以下で示される実施例は、単に本発明の説明のためのものであり、これらの実施例及びこれらの等価のものは、本開示内容及び特許請求の範囲から当業者にとって明らかなものであり、どのような方法であれ本発明の範囲を限定するものと考えてはならない。本出願で用いられる全てのパーセントは、注記したものを除き、重量対重量（ｗ／ｗ）のパーセントである。

実施例１：
図２（スキーム２）は、構造式（Ｉ）のβ−ターンペプチド模倣環式化合物の一つである化合物Ｄ３の合成を示している。この合成は、２−Ｃｌ−Ｔｒｔ−Ｃｌ（２−ＣＴＣ）樹脂を固相支持体として用いることで行われる。

化合物２ｂの合成は、当該分野で知られている標準的な段階Ｆｍｏｃ ＳＰＰＳ（Ｓｏｌｉｄ ｐｈａｓｅ ｐｅｐｔｉｄｅ ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ）によって行われる。Merrifield, (J. Am. Chem. Soc. 1964, 85, 2149); Vale et al., (Science, 1981, 213,1394-1397), in U.S. Pat. Nos. 4,305,872 and 4,316,891, Bodanszky et al. (Principles of Peptide Synthesis, 2^nd ed., Springer Verlag Berlin Heidelberg 1989) 、及び、Pieta and Marshall, (Chem. Comm. 1970, 650); (Houver-Weyl, Methods of Organic Chemistry. Vol E22a. Synthesis of Peptides and Peptidomimetics, Murray Goodman, Editor-in-Chief, Thieme. Stuttgart. New York 2002)。

２−ＣＴＣ樹脂２のローディングは、ジフェニル−２'−クロロフェニルクロロメタン派生物の求核置換によって行われる。

１ｇの２−ＣＴＣ樹脂（１．２ｍｍｏｌ／ｇ）が、３０ｍＬの乾燥ジクロロメタン（ＤＣＭ）により３０分間膨潤させられる。溶媒は濾過され、Ｆｍｏｃ−Ｇｌｙ−ＯＨ（２ｅｑ）と、Ｎ，Ｎ−ジイソプロピルエチルアミン（ＤＩＰＥＡ）（４ｅｑ）との溶液が、この樹脂に追加される。少量のＮ，Ｎ'−ジメチルホルムアミド（ＤＭＦ）も酸の溶解を促進するために追加される。この溶液は、窒素雰囲気の下、室温で３０分間撹拌される。反応時間の最後に、この樹脂は濾過され、ＤＣＭ／ＤＩＰＥＡ溶液（３ｘ５分）、ＤＣＭ溶液（３ｘ５分）、及びＤＭＦ溶液（３ｘ５分）で洗浄される。アミノ酸のローディングは、１，８−ジアザビシクロウンデク−７−エン（ＤＢＵ）で、Ｎ末端Ｆｍｏｃ基の脱保護化により、及びＵＶ分光法で遊離したジベンゾフルベンの溶液濃度を計測することにより、乾燥され、重さを計測された少量の樹脂に基づいて決定される（Gude et al (Lett. Pept. Sci. 2003, 9, 203)）。

この樹脂を洗浄した後、ＤＭＦに２０％（ｖ／ｖ）のピペリジンにより１０ｍｌ、３０分間処置することで、Ｆｍｏｃ保護基は除去される。この樹脂は、塩基の超過を除去するために、濾過され、ＤＭＦ（３ｘ５分）及びＤＣＭ（３ｘ５分）で洗浄される。脱保護化の反応は、陽性ニンヒドリンテストで、少量の樹脂に基づいて監視される（E. Kaiser et al,"Analytical Biochemistry"1970, 34, 595）。

引き続くアミノ酸、Ｆｍｏｃ−ｈＳｅｒ（Ｔｒｔ）−ＯＨ、Ｆｍｏｃ−Ｌｙｓ（Ｂｏｃ）−ＯＨ、及びＦｍｏｃ−Ｇｌｕ（ＯｔＢｕ）−ＯＨのカップリングは、Ｆｍｏｃ脱保護サイクルへのカップリング反応に交替するよう段階的に行われる。カップリングについては特に、ＤＭＦ内のＦｍｏｃ保護アミノ酸（２ｅｑ）、ＨＯＢｔ（２ｅｑ）、ＤＩＣ（２ｅｑ）、及びＤＩＰＥＡ（４ｅｑ）の溶液が樹脂に追加され、室温で１時間撹拌される。それぞれのカップリングサイクルの後、試薬の超過を除去するために、この樹脂は、ＤＭＦ（３ｘ５分）及びＤＣＭ（３ｘ５分）で洗浄される。それぞれのカップリングの進展は、陰性ニンヒドリンテストで監視される。２−フルオロ−５−ニトロ安息香酸（２ｅｑ）のカップリングが、ＤＭＦ内のＨＢＴＵ及びＤＩＥＡ（４ｅｑ）の二つの透過物を用いて行われる。この樹脂は、最終的にＤＭＦ（３ｘ５分）及びＤＣＭ（３ｘ５分）で洗浄され、濾過され、窒素流により乾燥され、化合物２ｃが得られる。

この樹脂からの化合物２ｄの切断は、化合物２ｃをＤＣＭとＴＦＡとＴＩＳを９７：１；２（ｖ／ｖ）の割合で含む溶液で処置することで行われる。この溶液は、濾過前の２分の間、この樹脂と接触した状態でいることが許される。このステップは、５回繰り返される。この濾過液は、回収され、溶媒は、減圧下で除去される。残ったＴＩＳはデカントされ、残留生産物２ｄが窒素下で乾燥される。

残留生産物２ｄはＤＣＭ：ＤＭＦが９：１の溶液に２０ｍｇ／ｍＬの濃度で溶解され、Ｋ₂ＣＯ₃（２ｅｑ）が引き続き追加され、混合液は、５０℃で３時間撹拌される。(この反応は、環式生産物の完全な形成を確保するため、分析的ＲＰ（逆相）−ＨＰＬＣにより監視される。引き続き分析的逆相ＨＰＬＣ法が、工程中の制御のために用いられる。

反応混合物は、Ｃｅｌｉｔｅパッドを介して塩基を除去するために濾過され、フィルターはＴＨＦで洗浄される。濾過液は、回収され、生成物２ｅを得るためＤＭＦを除去するために、圧力を掛け、６０℃で蒸発させられる。

生成物２ｅは、１時間で、Ｈ₂Ｏ中９５％のＴＦＡの溶液に溶解させる。アミノ酸側鎖の脱保護化が完了する。この溶媒は、減圧下で濃縮され、低温のメチルｔｅｒｔブチルエーテルによって、この生成物は沈殿する。粗製生成物Ｄ３は、水中のアセトニトリルの勾配を用いて、Ｃ₁₈カラムにＲＰ−ＨＰＬＣによって精製される。ＴＦＡ塩中全体の４０％の収率の化合物Ｄ３を得るために、所望の生成物を含む破片が回収され、凍結乾燥される。

Ｄｏｗｅｘ樹脂上のイオン交換クロマトグラフィによって、精製された化合物Ｄ３のＴＦＡ塩は、化合物Ｄ３のＨＣＬ塩に交換される。クロマトグラフィによる精製の間に得られた凍結乾燥されたプールされたサブロットの水様アセトニトリル中の溶液は、１ｘ２−１００（クロライド形式）を超えたＤｏｗｅｘによって充填されたカラムを通過する。これにより、引き続き、追加される水様アセトニトリルによって洗浄され、生成物を得る。

９５％の収率のオフホワイトの無定形の固体を得るために、溶離したペプチドが、回収され、シェル凍結され、さらに凍結乾燥される。

効果のある実施形態を参照して本発明を説明したが、当業者であれば、本発明の趣旨や範囲から逸脱することなく様々な変更、修正、置換、削除がなしえることが理解できるであろう。本発明は、かかる均等物も、特許請求の範囲に含むことを意図している。

Claims (51)

1. （ａ）構造式（ＩＩＩ）の保護された線形ペプチド模倣化合物を提供する工程と、
   
   （ｂ）分子内芳香族求核置換反応により、構造式（ＩＶ）の保護されたβ−ターンペプチド模倣環式化合物を形成するため、構造式（ＩＩＩ）の保護された線形ペプチド模倣化合物を環状化する工程と、及び
   
   （ｃ）構造式（ＩＶ）の保護されたβ−ターンペプチド模倣環式化合物におけるアミノ酸側鎖保護基を脱保護化する工程と、
   を含み、
   Ｒ₁及びＲ₃は、それぞれ独立に、水素、Ｃ₁からＣ₆のアルキル、アリール、又は、自然又は非自然のアミノ酸のアミノ酸側鎖置換基であり、
   Ｒ₂及びＲ₄は、それぞれ独立に、水素又はＣ₁からＣ₆のアルキルであり、又はＲ₁及びＲ₂は、それらが結合しているＣ原子と一緒に、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、又はシクロヘキシル基を形成し、又はＲ₃及びＲ₄は、それらが結合しているＣ原子と一緒に、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、又はシクロヘキシル基を形成し、
   Ｒ₅、Ｒ₆、及びＲ₇は、それぞれ独立に、水素又はＣ₁からＣ₆のアルキルであり、
   Ｙは、水素、−ＮＯ₂、−ＣＯＯＲ₈、−ＯＣ（Ｒ₈）₃、−ＳＯ₃Ｒ₈、及び−ＳＯ₂Ｒ₈を含むグループから選択され、
   Ｒ₈は、それぞれアルキル又はアリールであり、
   Ｘは、Ｏ、Ｎ、Ｓ、Ｐ、Ｓｅ、Ｃ、Ｃ₁からＣ₆のアルキレン、ＳＯ、ＳＯ₂及びＮＨを含むグループから選択され、
   Ｚは、Ｆ、Ｃｌ、Ｂｒ、及びＩを含むグループから選択され、
   Ｒ₁₁及びＲ₁₃は、それぞれ独立に、水素、又は保護基であり、
   Ｗ₁及びＷ₃は、それぞれ独立に、自然又は非自然のアミノ酸のアミノ酸側鎖置換基であって、Ｒ₁₁及びＲ₁₃各々のアタッチメントポイントに水素原子がなく、
   ｎは、０、１、２、３、４、又は５であり、及び、
   Ｌ₂は、Ｈ、ＮＨ₂、ＯＨ、ＳＨ、ＣＯＯＨ、ＮＨ−ＣＨ₂−ＣＯＯＨ、Ｃ₁からＣ₆のアルキル、又はＣ₁からＣ₆のアリールであり、
   構造式（Ｉ）のβ−ターンペプチド模倣環式化合物を製造する方法。
   
2. 構造式（Ｉ）の前記β−ターンペプチド模倣環式化合物は、１４個から１６個の環原子の大環状環を有する請求項１記載の方法。
3. Ｒ₁及びＲ₃は、それぞれ独立に、２つの異なるアミノ酸の側鎖置換基である請求項１記載の方法。
4. Ｒ₁及びＲ₃は、それぞれ独立に、リシン、グルタミン酸、チロシン、イソロイシン、アスパラギン、アルギニン、又はトレオニンの側鎖置換基である請求項３記載の方法。
5. Ｒ₁及びＲ₃は、それぞれ独立に、グルタミン酸又はリシンの側鎖置換基である請求項１記載の方法。
6. Ｒ₁及びＲ₃は、それぞれ独立に、イソロイシン又はアルギニンの側鎖置換基である請求項１記載の方法。
7. Ｒ₁₁及びＲ₁₃は、それぞれ独立に、トリフルオロアセチル、ホルミル、アセチル、ｔ−ブチルオキシカルボニル（ＢＯＣ）、シクロヘキシルオキシカルボニル、フルオレニルー９−メトキシ−カルボニル（Ｆｍｏｃ）、ベンジルオキシカルボニル（Ｃｂｚ）、Ｃｂｚ誘導体、トリフェニル、メチル、ベンジル、アリロオキシカルボニル、ｔｅｒｔ−ブチル、アルキルシラン及びアリルを含むグループから選択される請求項１記載の方法。
8. Ｒ₁はグルタミン酸の側鎖置換基であり、及びＲ₁₁はアリル又はｔｅｒｔ−ブチルである請求項１記載の方法。
9. Ｒ₁₁は、ｔｅｒｔ−ブチルである請求項８記載の方法。
10. Ｒ₃はリシンの側鎖置換基であり、及びＲ₁₃はベンジルオキシカルボニル、アリルオキシカルボニル、又はｔｅｒｔ−ブチルオキシカルボニル（ＢＯＣ）である請求項１記載の方法。
11. Ｒ₁₃は、ｔｅｒｔ−ブチルオキシカルボニル（ＢＯＣ）である請求項１０記載の方法。
12. Ｒ₂及びＲ₄は、それぞれ独立に、水素又はＣ₁からＣ₆のアルキルである請求項１記載の方法。
13. Ｒ₅、Ｒ₆、及びＲ₇は、水素である請求項１記載の方法。
14. Ｘは、Ｏ、Ｓ、又はＮＨである請求項１記載の方法。
15. Ｌ ₂ は、ＮＨ−ＣＨ₂−ＣＯＯＨである請求項１記載の方法。
16. ｎは１である請求項１記載の方法。
17. Ｙは、アミド基のアタッチメントポイントと関連したメタ位において、前記構造式のベンゼン環に付加されている請求項１記載の方法。
18. Ｙは、−ＮＯ₂である請求項１記載の方法。
19. Ｚは、アミド基のアタッチメントポイントと関連したオルト位において、前記構造式のベンゼン環に付加されている請求項１記載の方法。
20. Ｚは、Ｆである請求項１記載の方法。
21. 構造式（ＩＩＩ）の前記保護された線形ペプチド模倣化合物は、酸、塩基、又は求核試薬の存在の下、構造式（ＩＩ）の保護された線形ペプチド模倣化合物を固相支持体から切断することにより得られ、構造式（ＩＩ）の前記保護された線形ペプチド模倣化合物は以下の構造を有しており、
    
    Ｌ₁は、ｎｕｌｌ、ＮＨ、Ｏ、Ｓ、ＣＯＯ−、ＮＨ−ＣＨ₂−ＣＯＯ−、Ｃ₁からＣ₆のアルキレン、又はＣ₁からＣ₆のアリーレンであり、
    Ｒ₁₂は、水素、又は保護基である請求項１記載の方法。
22. Ｒ₁₂は、保護基である請求項２１記載の方法。
23. ＸはＯであり、及びＲ₁₂はトリチル又はｔｅｒｔ−ブチルジメチルシラン（ＴＢＤＭＳ）である請求項２１記載の方法。
24. ＸはＳであり、及びＲ₁₂はトリチルである請求項２１記載の方法。
25. ＸはＮＨであり、及びＲ₁₂は４−メチルトリチル（Ｍｔｔ）である請求項２１記載の方法。
26. 構造式（ＩＩ）の前記保護された線形ペプチド模倣化合物の該切断では、構造式（ＩＩ）中に存在する保護された官能基Ｒ₁₁及びＲ₁₃のいずれの脱保護化も生じさせない請求項２１記載の方法。
27. 構造式（ＩＩ）の前記保護された線形ペプチド模倣化合物の該切断は、弱酸性の条件の下で行われる請求項２１記載の方法。
28. 前記弱酸性の条件では、０．０１％から５０％（ｖ／ｖ）のトリフルオロ酢酸（ＴＦＡ）を含む請求項２７記載の方法。
29. 構造式（ＩＩ）の前記保護された線形ペプチド模倣化合物の該切断は、極性非プロトン性溶媒中で行われる請求項２１記載の方法。
30. 前記極性非プロトン性溶媒は、ジクロロメタン、アセトニトリル、又はテトラヒドロフラン及びこれらの混合物を含む請求項２９記載の方法。
31. 構造式（ＩＩ）の前記保護された線形ペプチド模倣化合物の該切断では、さらにスカベンジャーを含む請求項２１記載の方法。
32. 前記スカベンジャーは、トリイソプロピルシラン（ＴＩＳ）、チオアニソル、トリアルキルシラン、又はこれらの混合物を含む請求項３１記載の方法。
33. 前記スカベンジャーは、トリイソプロピルシラン（ＴＩＳ）である、請求項３１に記載の方法。
34. 構造式（ＩＩ）の前記保護された線形ペプチド模倣化合物の該切断は、ＴＦＡとＴＩＳとの１：１から１：５の量比の混合物を１０％未満含む溶液中で行われる請求項３１記載の方法。
35. 前記固相支持体は、２−クロロトリチルクロライド、４−ヒドロキシメチル−３−メトキシフェノキシブチル酸ＭＢＨＡ、９−Ｆｍｏｃ−アミノ−キサンテン−３−イロキシ−メリフィールド樹脂、トリチルアルコール、４−メチルトリチルクロライド、４−メトキシトリチルクロライド、４（２'，４'−ジメトキシフェニル−ヒドロキシメチル）−フェノキシ樹脂、２−メトキシ−4−アルコキシベンジルアルコール樹脂、３−（Ｎ−Ｆｍｏｃ−Ｎ−メトキシ）プロピル−アミドメチル樹脂を含むグループから選択された官能基を備える樹脂である請求項２１記載の方法。
36. 前記樹脂は、少なくとも０．７５ｍｍｏｌ／ｇのローディングの官能基を有する請求項３５に記載の方法。
37. 前記樹脂は、１．０ｍｍｏｌ／ｇから２．０ｍｍｏｌ／ｇのローディングの官能基を有する請求項３５に記載の方法。
38. 前記樹脂は、不溶性重合体である請求項３５に記載の方法。
39. 前記樹脂は、架橋ポリスチレンジビニルベンゼン共重合体である請求項３５に記載の方法。
40. 該環状化は、溶液相で行われる請求項１に記載の方法。
41. 該環状化は、塩基の存在下で行われる請求項１に記載の方法。
42. 前記塩基は、Ｋ₂ＣＯ₃、ＣｓＣＯ₃、ＣｓＦ、テトラブチルアンモニウムフルオリド（ＴＢＡＦ）、テトラメチルグアニジン（ＴＭＧ）、又はこれらの混合物を含む請求項４１記載の方法。
43. 該環状化は、極性プロトン性溶媒で行われる請求項１記載の方法。
44. 前記極性プロトン性溶媒は、アセトニトリル、テトラヒドロフラン、ＤＭＦ、ＤＣＭ／ＤＭＦの混合物、又はこれらの混合物を含む請求項４３記載の方法。
45. ＤＣＭ／ＤＭＦは、それらの比で５：９５から９５：５で用いられる混合物である請求項４４記載の方法。
46. 該環状化は、水及びメタノールの不存在下で行われる請求項１記載の方法。
47. 該環状化は、前記線形ペプチド模倣化合物の濃度を０．１Ｍ未満として行われる請求項１記載の方法。
48. 該環状化は、２５℃から６０度の温度で行われる請求項１記載の方法。
49. 該脱保護化が、強酸性の条件下で行われる請求項１記載の方法。
50. 前記強酸性の条件では、５０％を超えるＴＦＡを含む請求項４９記載の方法。
51. 該脱保護化では、さらにスカベンジャーを含む請求項１記載の方法。