JP6123097B2 - チエノピリミジン化合物を製造するための方法 - Google Patents
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Description
本非仮出願は、37 CFR§1.53(b)に基づき出願されたものであるが、全体を参考することにより援用される2012年10月10日に出願された米国仮出願番号61/711900の35USC§119(e)に基づく利益を主張する。
を有する(S)−1−(4−((2−(2−アミノピリミジン−5−イル)−7−メチル−4−モルホリノチエノ[3,2−d]ピリミジン−6−イル)メチル)ピペラジン−1−イル)−2−ヒドロキシプロパン−1−オン及びその立体異性体、幾何異性体、互変異性体、並びに薬学的に許容されるそれらの塩として指定される、二重mTOR/PI3K阻害剤GDC−0980を製造する方法に関する。
用語「キラル」は、鏡像パートナーの重ね合わせができない特性を有する分子を意味し、一方で、「アキラル」という用語は、それらの鏡像パートナーに重ね合わせることができる分子を指す。
本発明は、GDC−0980合成のためのプロセス、方法、試薬、及び中間体を含み、GDC−0980とは、以下の構造
を有し、(S)−1−(4−((2−(2−アミノピリミジン−5−イル)−7−メチル−4−モルホリノチエノ[3,2−d]ピリミジン−6−イル)メチル)ピペラジン−1−イル)−2−ヒドロキシプロパン−1−オンで示され得る、PI3K及びmTORの小分子阻害剤(CAS登録番号1032754−93−0)である(US7888352;US2009/0098135;US2010/0233164)。本明細書中で使用されるように、GDC−0980は、立体異性体、幾何異性体、互変異性体、及び薬学的に許容される塩のすべてを含む。
スキーム1は、メチル 3−アミノ−4−メチルチオフェン−2−カルボンキシレート IXからの中間体4−(2−クロロ−7−メチルチエノ[3,2−d]ピリミジン−4−イル)モルホリノ VIの合成を示す。酢酸中のシアン酸カリウムと水とのIXの環化により、7−メチルチエノ[3,2−d]ピリミジン−2,4(1H,3H)−ジオン VIII(実施例1)が与えられた。オキシ塩化リン及びアセトニトリル(ACN)中のN,N−ジメチルアニリンとのVIIIの塩素化により、2,4−ジクロロ−7−メチルチエノ[3,2−d]ピリミジン VII(実施例2)が与えられた。VIIの4−クロロ基のメタノール中のモルホリンとの置換により、VI(実施例3)が得られた。
スキーム2は、4−(2−クロロ−7−メチルチエノ[3,2−d]ピリミジン−4−イル)モルホリノ VIからの中間体(S)−1−(4−((2−クロロ−7−メチル−4−モルホリノチエノ[3,2−d]ピリミジン−6−イル)メチル)ピペラジン−1−イル)−2−ヒドロキシプロパン−1−オン IIの合成を示す。塩化イソプロピルマグネシウムのグリニャール試薬、続いてn−ブチルリチウムとの10℃でのVIの処理には、続いてジメチルホルムアミドが添加され、酸水溶液でのクエンチングにより、ホルミル化中間体2−クロロ−7−メチル−4−モルホリノチエノ[3,2−d]ピリミジン−6−カルボアルデヒド IV(実施例4)が与えられた。IVの還元的アミノ化は、(S)−2−ヒドロキシ−1−(ピペラジン−1−イル)プロパン−1−オンのシュウ酸塩V、続いて還元剤、例えば、トリアセトキシ水素化ホウ素ナトリウム(方法A)、2−ピコリンボラン(方法B)又は5−エチル−2−メチルピリジンボラン(方法C)などと混合することによってもたらされ、トルエン/ヘプタン(実施例5)又はMe−THF/ヘプタン中で結晶化させたIIが得られた。
スキーム3は、(S)−2−ヒドロキシプロパン酸 (L−乳酸) 1からの中間体、(S)−2−ヒドロキシ−1−(ピペラジン−1−イル)プロパン−1−オンのシュウ酸塩Vの合成を示す。1のアセチル化によって(S)−2−アセトキシプロパン酸 2が与えられ、続いて、塩化オキサリルのような塩素化試薬での処理が行われ、酸塩化物、(S)−1−クロロ−1−オキソプロパン−2−イル アセテート 3(実施例6)が与えられた。トリエチルアミンの存在下でのジクロロメタン中の1−ベンジルピペラジンのジヒドロクロリド 塩との3の反応により、(S)−1−(4−ベンジルピペラジン−1−イル)−1−オキソプロパン−2−イル アセテート 4(実施例7)が与えられた。水酸化リチウムでの4のアセテートの加水分解により、(S)−1−(4−ベンジルピペラジン−1−イル)−2−ヒドロキシプロパン−1−オン 5(実施例8)が与えられ、続いてN−ベンジル基を除去するために水素添加が行われ、((S)−2−ヒドロキシ−1−(ピペラジン−1−イル)プロパン−1−オン 6(実施例9)が与えられた。シュウ酸塩は、エタノール及びテトラヒドロフラン中のシュウ酸を用いて6から形成され、V(実施例9)が与えられた。
スキーム4は、((S)−エチル 2−ヒドロキシプロパノエート 7からの中間体(S)−2−ヒドロキシ−1−(ピペラジン−1−イル)プロパン−1−オン Vの合成を示す。1−ベンジルピペラジン及び7をナトリウムメトキシド及びメタノール中で反応させ、AMBERLITE(登録商標)IRC−748樹脂又はシュウ酸から分離した(S)−1−(4−ベンジルピペラジン−1−イル)−2−ヒドロキシプロパン−1−オン 8が与えられ、続いて活性炭処理(実施例10)が行われた。8からのベンジル基の還元開裂除去が、水素ガス(方法A)又はシクロヘキセン(方法B)のいずれかでパラジウム触媒により行われ、中間体(S)−2−ヒドロキシ−1−(ピペラジン−1−イル)プロパン−1−オン 6(実施例11)が与えられた。シュウ酸塩が、エタノール及びテトラヒドロフラン中のシュウ酸を用いて6から形成され、V(実施例11)が与えられた。
スキーム5は、(S)−エチル 2−ヒドロキシプロパノエート 7からの(S)−2−ヒドロキシ−1−(ピペラジン−1−イル)プロパン−1−オンの中間体シュウ酸塩Vの代替的な一工程の合成を示す。保護されていない7及びピペラジンが反応して、メタノール中のナトリウムメトキシドでアミドVが形成され、続いて、不純物を除去するためにシュウ酸又はAMBERLITE(登録商標)樹脂IRC−748の処理、及びシュウ酸塩(実施例12)の形成が行われる。
スキーム6は、中間体(S)−1−(4−((2−クロロ−7−メチル−4−モルホリノチエノ[3,2−d]ピリミジン−6−イル)メチル)ピペラジン−1−イル)−2−ヒドロキシプロパン−1−オン IIからの、(S)−1−(4−((2−(2−アミノピリミジン−5−イル)−7−メチル−4−モルホリノチエノ[3,2−d]ピリミジン−6−イル)メチル)ピペラジン−1−イル)−2−ヒドロキシプロパン−1−オン、つまりGDC−0980,化学式Iの合成を示す。II及び2−アミノピリミジン−5−イルボロン酸 IIIのパラジウム触媒との鈴木−宮浦カップリングにより、粗I(実施例13)が与えられる。水が加えられ反応混合物がクエンチされ、続いて活性炭での濾過を再循環させ、パラジウムが除去された。揮発物を真空下で除去し、Iをn−プロパノール及び水から結晶化して、遊離塩基、GDC−0980、化学式Iが与えられた。方法Bにおいて、反応は、溶媒としてのn−プロパノール/水で塩基としてKHPO4を用いて行われる。
スキーム7は、5−ブロモピリミジン−2−アミン 9からの2−アミノピリミジン−5−イルボロン酸 IIIの合成を示す。ジ−tert−ブチルジカーボネート(Boc2O)などのBoc保護試薬による2−アミノ基の保護は、ビス−Boc保護された中間体、ビス−tert−ブチル 5−ブロモピリミジン−2−イル−ジカルバメート 10(実施例14)を介して進行し、続いて、1つのBoc基の塩基性加水分解が行われ、モノ−Boc保護されたtert−ブチル 5−ブロモピリミジン−2−イルカルバメート 11(実施例15)が与えられる。塩基性加水分解は、水酸化カリウム、水酸化ナトリウム、又は水酸化リチウムなどのアルカリ土類金属水酸化物を用いて実施することができる。n−ブチルリチウムなどのアルキルリチウム試薬との11のメタレーション、及びホウ酸トリイソプロピルなどのホウ酸トリアルキル試薬とのボリレーションにより、2−(tert−ブトキシカルボニルアミノ)ピリミジン−5−イルボロン酸 12(実施例16)が与えられる。水性酸性加水分解及び塩基性化又は中和による脱保護により、III(実施例17)が与えられた。
スキーム8は、5−ブロモピリミジン−2−アミン 9からの2−アミノピリミジン−5−イルボロン酸 IIIの別途合成を示す。n−ブチルリチウムとの保護されていない9のブロモのメタレーション、及びトリイソプロピルホウ酸塩とのボリレーションにより、III(実施例17)が与えられた。
GDC−0980は、ヒトを含む哺乳動物における過剰増殖性疾患の治療的処置(予防的治療を含む)のための治療的組み合わせにおいて使用するための標準的な薬務に従って処方され得る。本発明は、1又は複数の薬学的に許容される担体、流動促進剤、希釈剤、又は賦形剤と関連してGDC−0980を含む医薬組成物を提供する。
メチル 3−アミノ−4−メチルチオフェン−2−カルボンキシレート IX(100g、0.584mol)及び酢酸(750ml、13.1mol)を、透明な溶液を得るために5分間撹拌した。水(120mL)中のシアン酸カリウム(56.8g、0.70mol)の溶液を20分にわたりゆっくりと加え、混合物を1.5時間撹拌した。水(120mL)中の追加のシアン酸カリウム(56.8g、0.70mol)を20分にわたりゆっくりと加え、混合物を2時間撹拌した。水(600mL)を加え、混合物を10℃に冷却し、2時間攪拌した。固体を濾過により回収し、冷水(250mL)で洗浄した。次に、固体を水(1.4L)中の水酸化ナトリウム溶液(79.4g、1.99mol)中で12時間攪拌した。pHは、水性濃塩酸溶液(35wt%、110mL)をゆっくりと加えることにより6−7に調整され、次いで、5分間撹拌した。得られた固体を濾過により回収し、水(2×250mL)で洗浄し、24時間50℃で減圧乾燥させ、7−メチルチエノ[3,2−d]ピリミジン−2,4(1H,3H)−ジオン VIIIがオフホワイトの固体(89.6g、84%の収率)として得られた。1H NMR(500MHz、DMSO−d6)δ7.68(s、1H)、2.20(s、3H);LCMS(ESI pos)m/z[M+H]183。
アセトニトリル(450mL)中の7−メチルチエノ[3,2−d]ピリミジン−2,4(1H,3H)−ジオン VIII(89.4g、0.491mol)とN,N−ジメチルアニリン(44.6g、0.368mol)との混合物に、10分にわたってオキシ塩化リン(312g、2.04mol)を加えた。反応混合物を85℃に加熱し、24時間撹拌した。室温に冷却した後、10℃未満の温度を維持しながら、混合物をゆっくりと氷(900g)と水(300mL)との混合物に移した。混合物を30分間その温度で撹拌した。固体を濾過により回収し、水(450mL)で洗浄し、24時間50℃で減圧乾燥させ、2,4−ジクロロ−7−メチルチエノ[3,2−d]ピリミジン VIIがオフホワイトの固体(97.0g、90%の収率)として得られた。1H NMR(400MHz、CDCl3)δ7.75(s、1H)、2.50(s、3H);LCMS(ESI pos)m/z[M+H]220。
2,4−ジクロロ−7−メチルチエノ[3,2−d]ピリミジン VII(90g、0.411mol)とメタノール(900mL)との混合物を10℃に冷却した。15℃未満の温度を維持しながら、モルホリン(89.5g、1.03mol)を加えた。反応混合物を2時間撹拌し、次いで5℃まで冷却し、さらに1時間撹拌した。固体を濾過により回収し、水(450mL)で洗浄し、24時間50℃で減圧乾燥し、白色固体(105g、95%の収率)として4−(2−クロロ−7−メチルチエノ[3,2−d]ピリミジン−4−イル)モルホリノ VIが得られた。1H NMR(400MHz、CDCl3)δ7.94(s、1H)、3.95−3.86(m、4H)、3.80−3.71(m、4H)、2.9(s、3H);LCMS(ESI pos)m/z [M+H]270。
4−(2 クロロ−7−メチルチエノ[3,2 d]ピリミジン 4 yl)モルホリン VI(27.0g、100mmol)を適切な大きさの反応器に充填し、テトラヒドロフラン(無水、270mL)が加えられた。反応混合物を−10℃未満に冷却し、テトラヒドロフラン(25.7g、50.0mmol)中のi−PrMgClの20wt%溶液をゆっくりと加え、続いて、−10℃未満の内部温度を維持しながら、ヘプタン(30.0g、117mmol)中のn−BuLiの25wt%溶液をゆっくりと加えた。混合物は、−10℃未満で2時間攪拌することが許された。−10℃未満の内部温度を維持しながら、無水N,N−ジメチルホルムアミド(14.6g、200mmol)をゆっくりと加えた。反応混合物を1−2時間撹拌し、80%酢酸、37%塩酸水溶液、イソプロパノール及び水の混合物に移した。得られたスラリーを50−55℃に加熱し、1−3時間撹拌した。懸濁液を減圧濃縮し、テトラヒドロフランを除去した。次に、懸濁液を室温に冷却し、濾過し、水ですすいだ。ケーキを40−60℃で減圧乾燥し、2−クロロ−7−メチル−4−モルホリノチエノ[3,2−d]ピリミジン−6−カルボアルデヒド IVが黄色固体(29.2g、98%の収率)として得られた。1H NMR(400MHz、CDCl3)δ10.38(s、1H)、4.03−4.05(m、4H)、3.85−3.87(m、4H)、2.76(s、3H)。
ジクロロメタン(50.0kg)中の(S)−2−ヒドロキシプロパン酸(L−乳酸)1(35.0kg、388mol)の溶液を5−10℃に冷却し、反応温度を10−20℃に維持しながら、塩化アセチル(75.0kg、955mol)を加えた。反応混合物を10−20℃で4時間撹拌した。ジクロロメタン(240kg)が加えられ、続いて、反応温度を0−15℃で維持する速度で塩化オキサリル(139kg、1095mol)が加えられた。反応混合物を10−20℃で10時間熟成させ、その混合物を減圧濃縮し、(S)−1−クロロ−1−オキソプロパン−2−イル アセテート 3を含む残留物が与えられた。
容器にジクロロメタン(260kg)を充填し、続いて、トリエチルアミン(65.0kg、642mol)を加えた。混合物を0−10℃に冷却し、4−ベンジルピペラジン ジヒドロクロリド(31.8kg、128mol)を加えた。反応温度を5−15℃に維持しながら、混合物に、実施例6からの(S)−1−クロロ−1−オキソプロパン−2−イル アセテート 3を加えた。反応混合物を10−20℃で10時間撹拌した。氷水(50kg)を加え、層を分離した。水層をジクロロメタン(2×50kg)で抽出した。有機層を合わせ、5−10℃まで冷却した。HCl水溶液(4N)溶液をゆっくりと加え、pHを6−7に調整した。層を分離し、水層をジクロロメタン(2×50kg)で抽出した。有機層を組み合わせ、無水硫酸ナトリウム上で乾燥させ、濾過し、減圧濃縮して、(S)−1−(4−ベンジルピペラジン−1−イル)−1−オキソプロパン−2−イル アセテート 4を含む残留物が与えられた。
メタノール(300kg)を(S)−1−(4−ベンジルピペラジン−1−イル)−1−オキソプロパン−2−イル アセテート 4を含む実施例7からの残留物に加え、混合物を0−10℃に冷却した。反応温度を0−15℃に維持する速度で、水(100kg)中の水酸化リチウム一水和物の溶液(13.6kg、324mol)を加えた。2時間熟成させた後、5−15℃で酢酸(4.5kg、75mol)により、pHを7に調整した。混合物を減圧濃縮した。残留物にジクロロメタン(150kg)を加え、層を分離した。水層をジクロロメタン(2×150kg)で抽出した。有機層を組み合わせ、無水硫酸ナトリウム上で乾燥させ、濾過し、減圧濃縮した。エチルアセテート(31kg)を残留物に加え、続いて、シクロヘキサン(183kg)をゆっくりと加えた。混合物を40−50℃に加熱し1時間撹拌した。混合物を0−10℃に冷却し、8時間熟成させた。固体を濾過により回収し、冷シクロヘキサンで洗浄し、50℃で12時間、減圧乾燥させ、(S)−1−(4−ベンジルピペラジン−1−イル)−2−ヒドロキシプロパン−1−オン 5(46kg、71%の収率、HPLCによる98%の純度)が得られた。1H NMR(300MHz、CDCl3)δ7.42−7.20(m、5H)、4.43(q、J=6.4Hz、1H)、3.84(一般的な(broad) s、1H)、3.76−3.55(m,2H)、3.53(s、2H)、3.48−3.32(m、2H)、2.46(s、4H)、1.32(dd、J=6.6、3.9Hz、3H)。
エタノール(350kg)、パラジウム(活性炭に対して10%)(8.40kg、7.89mol)及び(S)−1−(4−ベンジルピペラジン−1−イル)−2−ヒドロキシプロパン−1−オン 5(70.0kg、282mol)を反応器に充填し、混合物を窒素でパージし、加熱還流した。シクロヘキセン(70.0kg、852mol)をゆっくりと加えた。反応混合物を加熱還流し、24時間撹拌した。周囲温度に冷却した後、混合物をCELITE(登録商標)のパッドを通して濾過し、ケーキをエタノール(20kg)で洗浄した。濾液を10−15℃に冷却し、テトラヒドロフラン(156kg)中のシュウ酸二水和物の溶液(36.0kg、286mol)を、反応温度を10−20℃で維持する速度で、ゆっくりと加えた。2時間熟成させた後、固体を濾過により回収し、エタノール(100kg)で洗浄し、50−55℃で減圧乾燥させ、(S)−2−ヒドロキシ−1−(ピペラジン−1−イル)プロパン−1−オン シュウ酸塩 V(58.2kg、83%)が与えられた。1H NMR(300MHz、D2O)δ4.73−4.51(m、1H)、3.93−3.59(m、4H)、3.26(dd、J=8.8,4.0Hz、4H)、1.27(d、J=6.7Hz、3H)。
1−ベンジルピペラジン(5.0g,28.40mmol,1.00当量)を充填したフラスコを10℃に冷却した。エチル (2S)−2−ヒドロキシプロパノエート 7(10.1g,85.1mmol,3.00当量)を、20℃未満の温度を維持する速度で加えた。20℃未満の温度を維持しながら、ナトリウムメトキシド(MeOH中25wt%)(4.9mL、21.3mmol、0.75当量)を加えた。冷水浴を除去し、次いで、反応混合物を周囲温度まで温め、16時間熟成させた。混合物をエタノール(25mL)で希釈し、AMBERLITE(登録商標)IRC−748樹脂(Dow Chemical Co.,Na+型31.6g、1.8meq/g、2当量、5%HCl水溶液を使用してH+型に予め調節されている)で処理した。懸濁液を周囲温度で2時間撹拌した。樹脂をCELITE(登録商標)(3.5g)のパッドを通した濾過により除去し、パッドをエタノール(2×33.8mL)で洗浄した。濾液及び洗浄液を合わせ、50mLまで減圧濃縮した。溶液に活性炭(DARCO(登録商標)KB−WJ、Norit Inc.,生成物3.52gの100%の理論上の収率に基づく50wt%)を加えた。懸濁液を周囲温度で18時間撹拌した。懸濁液をCELITE(登録商標)(7g)のパッドを通して濾過し、パッドをEtOH(2×33.6mL)で洗浄した。濾液及び洗浄液を合わせ、真空濃縮を行い、(S)−1−(4−ベンジルピペラジン−1−イル)−2−ヒドロキシプロパン−1−オン 8を含む残留物が得られた。
ピペラジン(10.0g、116mmol)を充填したフラスコ及び(S)−エチル 2−ヒドロキシプロパノエート 7(17.84g、151mmol、1.30当量)を10℃に冷却した。20℃未満の温度を維持しながら、ナトリウムメトキシド(MeOH中25wt%)(12.55g、58.1mmol、0.50当量)をゆっくりと加えた。冷水浴を除去し、反応混合物を周囲温度に温め、19時間熟成させた。水(6.23g、346mmol、3.0当量)を加え、混合物を16時間熟成させた。混合物をエタノール(40mL)で希釈し、減圧濃縮した。残留物をエタノール(40mL)で希釈し、エタノール(30mL)中のシュウ酸二水和物の溶液(6.58g、52.2mmol)で処理し、pHを7.5に調整した。懸濁液を10℃未満に冷却し、CELITE(登録商標)のパッドを通して濾過し、エタノール(2×60mL)で洗浄した。濾液及び洗浄液を合わせ、50mLまで濃縮した。溶液を10℃に冷却し、エタノール(60mL)中のシュウ酸二水和物の溶液(16.1g、128mmol)をゆっくりと加えた。懸濁液を周囲温度に温め、1時間攪拌した。懸濁液は、10℃に冷却され、固体を濾過により回収し、冷エタノール(2×18mL)で洗浄し、50℃で24時間減圧乾燥させ、(S)−2−ヒドロキシ−1−(ピペラジン−1−イル)プロパン−1−オンのシュウ酸塩Vが白色固体(15.2g、53%)として得られた。1H NMR(300MHz、D2O)δ4.73−4.51(m、1H)、3.93−3.59(m、4H)、3.26(dd、J=8.8、4.0Hz、4H)、1.27(d、J=6.7Hz、3H)。
ジメチルホルムアミド(DMF)(319L)中の、5−ブロモピリミジン−2−アミン 9(80.0kg、460mol)と、ジ−tert−ブチル ジカーボネート(Boc2O)(250kg、1140mol)と、トリエチルアミン(139kg,1370mol)との混合物に、4−ジメチルアミノピリジン(DMAP)(5.70kg、46.6mol)がゆっくりと加えられた。反応混合物を70−90℃に加熱し、3時間撹拌した。15−40℃まで冷却した後、混合物を氷水(6000kg)でゆっくりとクエンチし、懸濁液を1時間撹拌した。固体を濾過により回収し、水(200kg)で1時間、攪拌した。得られた固体を濾過により回収し、50℃で10時間、真空乾燥して、ビス−tert−ブチル 5−ブロモピリミジン−2−イル−ジカルバメート 10(216kg、HPLCで97A%を上回る、定量収率)が得られた。1H NMR(500MHz、CDCl3)δ8.71(s、2H)、1.40(s、18H);LCMS(ESI)m/z[M−H]373。
無水エタノール(1692L)中の2−[ビス(tert−ブトキシカルボニル)アミノ]−5−ブロモピリミジン10の溶液(216kg粗、460mol、前工程で定量収率と仮定)に、温度を0−20℃で維持しながら、水(344L)中の水酸化ナトリウムの溶液(55.2kg、1380mol)をゆっくりと加えた。2−[ビス(tert−ブトキシカルボニル)−アミノ]−5−ブロモピリミジン (10)の含有量がHPLCにより0.5%以下になるまで、混合物をその温度で撹拌した。反応混合物を0−5℃に冷却し、温度を5℃未満に維持しながら、シュウ酸(86.0kg,955mol)を加えることによって、pHを7に調整した。次に、温度を50℃未満に制御しながら、混合物を500−600Lの容積まで真空蒸留した。水(800kg)を加え、混合物を1時間撹拌した。固体を濾過により回収し、水(2×500L)で撹拌した。得られた固体を濾過により回収し、50℃で減圧乾燥し、tert−ブチル 5−ブロモピリミジン−2−イルカルバメート 11(107kg、二工程にわたって85%の収率)が得られた。1H NMR(500MHz、CDCl3)δ8.63(s、2H)、8.12(s、1H)、1.55(s、9H)。LCMS(ESI)m/z[M+H−Boc]176。
テトラヒドロフラン(910L)中のtert−ブチル(5−ブロモピリミジン−2−イル)カルバメート 11(45.0kg、164mol)にトリイソプロピル ホウ酸塩(Sigma−Aldrich社、CAS番号5419−55−6、77.4kg,412mol)をゆっくりと加え、混合物を−70℃(摂氏マイナス70度)に冷却した。温度を−65℃未満に維持しながら、n−ブチルリチウム(ヘキサン中の2.5M溶液、264L、660mol)を加え、tert−ブチル(5−ブロモピリミジン−2−イル)カルバメート 11の含有量がHPLCにより0.5%以下になるまで、反応混合物を撹拌した。温度を40℃未満に維持しながら、精製水(5kg)を加えた。混合物を5℃に冷却し、25%含水硫酸水素ナトリウム(aqueous sodium hydrogen sulfate)(270kg)を加えることによって、pHを7に調節した。混合物を50℃に加熱し、有機溶媒を減圧下で除去した。水(600kg)を加え、混合物を5℃未満に冷却し、25%含水硫酸水素ナトリウム(aqueous sodium hydrogen sulfate)(60kg)を加えることによって、pHを3.5に調整した。固体を濾過により回収し、水(240kg)で30分間、攪拌した。得られた固体を濾過により回収し、水(550kg)で再スラリー化し、この混合物を0−5℃に冷却した。温度を10℃未満に維持しながら、10% 水酸化ナトリウム水溶液(aqueous sodium hydroxide solution)を加え、混合物を2時間撹拌した。水相を石油エーテル(2x40kg)で抽出した。次いで、温度を0−10℃に維持しながら、水相のpHを、25% 硫酸水素ナトリウム水溶液(aqueous sodium hydrogen sulfate solution)を加えることによって、3.5に調節した。スラリーを濾過し、固体を水(400kg)で1時間、再スラリー化した。固体を濾過により回収し、フィルター上で乾燥させ、Boc保護された、2−(tert−ブトキシカルボニルアミノ)ピリミジン−5−イルボロン酸 12(40kg湿性、HPLCで49wt%、50%の収率)が得られた。1H NMR(500MHz、DMSO−d6)δ10.08(s、1H)、8.82(s、2H)、8.42(s、2H)、1.46(s、9H)。
水(245kg)中の[2−[(tert−ブトキシカルボニル)アミノ]ピリミジン−5−イル]ボロン酸 12(40.0kg、HPLCにより49wt%、82.0mol)の混合物に、温度を30℃未満に維持しながら濃塩酸(39.6L)を加えた。反応混合物を12時間攪拌し、次いで10℃に冷却した。温度を15℃未満に維持しながら、混合物のpHを、50%水酸化ナトリウム水溶液を加えることにより6.5に調整し、次いで、混合物を1時間撹拌した。水(69.0kg)を加え、混合物を30分間熟成させた。得られたスラリーを濾過し、ケーキを50℃で真空乾燥させ、2−アミノピリミジン−5−イルボロン酸 III(10.2kg、90%の収率)が得られた。1H NMR(300MHz、DMSO−d6)δ8.50(s、2H)、7.97(s、2H)、6.74(s、2H)。
2−[ビス(tert−ブトキシカルボニル)アミノ]−5−ブロモピリミジン 10(10g、27mmol)、クロロ(2−ジシクロヘキシルホスフィノ−2′,4′,6′−トリイソプロピル−1,1′−ビフェニル)[2−(2′−アミノ−1,1′−ビフェニル)]パラジウム(II)(101mg,0.128mmol),4,4,4’,4’,5,5,5’,5’−オクタメチル−2,2’−ビ(1,3,2−ジオキサボロラン)又はビス(ピナコラート)ジボロンとして知られているもの、B2Pin2、ピナコールジボラン(13.6g、53.4mmol)及びナトリウムアセテート(7.9g、80mmol)の溶液に、50mLのトルエンが加えられた。混合物を85℃で7時間加熱した。20℃まで冷却された後、水(90mL)中の1NのNaOHを加えた。二相混合物をセライトで濾過し、有機層を廃棄した。有機層を80℃に加熱し、水(21.2g)中の37%HClを加えた。溶液を2時間撹拌し、0℃に冷却した。水(23.7g)中の28%NaOHの溶液を、pHが7になるまで加えた。得られた懸濁液を濾過し、水ですすいだ。灰白色の固体を50℃で16時間真空乾燥させた。
Claims (15)
- 以下の構造
を有する(S)−1−(4−((2−(2−アミノピリミジン−5−イル)−7−メチル−4−モルホリノチエノ[3,2−d]ピリミジン−6−イル)メチル)ピペラジン−1−イル)−2−ヒドロキシプロパン−1−オン(I)及びその立体異性体、幾何異性体、互変異性体、並びに薬学的に許容される塩を調製するための方法であって、
(a) 以下の(S)−1−(4−((2−クロロ−7−メチル−4−モルホリノチエノ[3,2−d]ピリミジン−6−イル)メチル)ピペラジン−1−イル)−2−ヒドロキシプロパン−1−オン(II)を与えるために、以下の(S)−2−ヒドロキシ−1−(ピペラジン−1−イル)プロパン−1−オン(6)のシュウ酸塩及び以下の2−クロロ−7−メチル−4−モルホリノチエノ[3,2−d]ピリミジン−6−カルボアルデヒド(IV)を還元剤と反応させ、
;及び
(b) 上記(I)を与えるために、上記(II)、パラジウム触媒、及び以下の構造を有する2−アミノピリミジン−5−イルボロン酸(III)を反応させる
ことを含む方法。 - (S)−2−ヒドロキシ−1−(ピペラジン−1−イル)プロパン−1−オンのシュウ酸塩は、(S)−エチル 2−ヒドロキシプロパノエートを、ピペラジン、続いてシュウ酸と反応させることを含む方法によって調製される、請求項1に記載の方法。
- 以下の構造
を有する(S)−2−ヒドロキシ−1−(ピペラジン−1−イル)プロパン−1−オンのシュウ酸塩(V)は:
(a) 以下の構造を有する(S)−1−(4−ベンジルピペラジン−1−イル)−2−ヒドロキシプロパン−1−オン(8)を与えるために(S)−エチル 2−ヒドロキシプロパノエート(7)を1−ベンジルピペラジンと反応させ
;
(b) 以下の構造を有する(S)−2−ヒドロキシ−1−(ピペラジン−1−イル)プロパン−1−オン(6)を与えるために上記(8)をパラジウム触媒で還元し
;及び
(c) 上記(V)を与えるために(S)−2−ヒドロキシ−1−(ピペラジン−1−イル)プロパン−1−オンをシュウ酸と反応させる
ことを含む方法によって調製される、請求項1に記載の方法。 - (S)−2−ヒドロキシ−1−(ピペラジン−1−イル)プロパン−1−オンのシュウ酸塩(V)は:
(a) (S)−2−アセトキシプロパン酸を与えるために(S)−2−ヒドロキシプロパン酸(L−乳酸)(1)をアセチル化し;
(b) (S)−1−クロロ−1−オキソプロパン−2−イル アセテートを与えるために(S)−2−アセトキシプロパン酸を塩素化試薬と反応させ;
(c) (S)−1−(4−ベンジルピペラジン−1−イル)−1−オキソプロパン−2−イル アセテートを与えるためにS)−1−クロロ−1−オキソプロパン−2−イル アセテートを1−ベンジルピペラジンと反応させ;
(d) (S)−1−(4−ベンジルピペラジン−1−イル)−2−ヒドロキシプロパン−1−オンを与えるために(S)−1−(4−ベンジルピペラジン−1−イル)−1−オキソプロパン−2−イル アセテートのアセテートを加水分解し;
(e) (S)−2−ヒドロキシ−1−(ピペラジン−1−イル)プロパン−1−オンを与えるために(S)−1−(4−ベンジルピペラジン−1−イル)−2−ヒドロキシプロパン−1−オンのベンジル基をパラジウム触媒で還元除去し;及び
(f) 上記(V)を与えるために(S)−2−ヒドロキシ−1−(ピペラジン−1−イル)プロパン−1−オンをシュウ酸と反応させる
ことを含む方法によって調製される、請求項1に記載の方法。 - 2−アミノピリミジン−5−イルボロン酸(III)は、
(a) 以下の構造を有するビス−tert−ブチル 5−ブロモピリミジン−2−イル−ジカルバメート(10)を与えるために5−ブロモピリミジン−2−アミンをBoc保護試薬と反応させ
;
(b) 以下の構造を有するtert−ブチル 5−ブロモピリミジン−2−イルカルバメート(11)を与えるために1つのBoc基を塩基性加水分解し
;
(c) 2−(tert−ブトキシカルボニルアミノ)ピリミジン−5−イルボロン酸(12)を与えるために上記(11)をアルキルリチウム試薬でメタレーションして、ホウ酸トリアルキル試薬でボリレーションし;及び
(d) 上記(III)を与えるために(12)のBoc基を酸性脱保護する
ことを含む方法によって調製される、請求項1から4の何れか一項に記載の方法。 - 2−アミノピリミジン−5−イルボロン酸(III)は、
(a) 5−ブロモピリミジン−2−アミンを、リチウムビス(トリメチルシリル)アミド、次にn−ブチルリチウム、続いてホウ酸トリアルキル試薬と反応させ;及び
(b) 上記(III)を与えるために上記混合物を水性の酸で処理すること
を含む方法によって調製される、請求項1から4の何れか一項に記載の方法。 - 2−アミノピリミジン−5−イルボロン酸(III)が、
(a) 以下の構造を有するビス−tert−ブチル 5−(4,4,5,5−テトラメチル−1,3,2−ジオキサボロラン−2−イル)ピリミジン−2−イルジカルバメートを与えるために4,4,4’,4’,5,5,5’,5’−オクタメチル−2,2’−ビ(1,3,2−ジオキサボロラン及びビス−tert−ブチル5−ブロモピリジン−2−イル−ジカルバメート(10)を、以下:
から選択される触媒の存在条件下で反応させ
;及び
(b) 上記(III)を与えるために両方のBoc基及びピナコール基を酸加水分解する
ことを含む方法によって調製される、請求項1から7の何れか一項に記載の方法。 - パラジウム触媒が、PdCl2(PPh3)2、Pd(t−Bu)3、PdCl2dppfCH2Cl2、Pd(PPh3)4、Pd(OAc)/PPh3、Cl2Pd[(Pet3)]2、Pd(DIPHOS)2、Cl2Pd(Bipy)、[PdCl(Ph2PCH2PPh2)]2、Cl2Pd[P(o−tol)3]2、Pd2(dba)3/P(o−tol)3、Pd2(dba)/P(furyl)3、Cl2Pd[P(furyl)3]2、Cl2Pd(PMePh2)2、Cl2Pd[P(4−F−Ph)3]2、Cl2Pd[P(C6F6)3]2、Cl2Pd[P(2−COOH−Ph)(Ph)2]2、及びCl2Pd[P(4−COOH−Ph)(Ph)2]2から選択される、請求項1から11の何れか一項に記載の方法。
- 還元剤が、トリアセトキシ水素化ホウ素ナトリウム、2−ピコリンボラン、又は5−エチル−2−メチルピリジンボランである、請求項1から12の何れか一項に記載の方法。
- (II)、パラジウム触媒、及び2−アミノピリミジン−5−イルボロン酸(III)を反応させた後に、活性炭を通して反応混合物を濾過することをさらに含む、請求項1から13の何れか一項に記載の方法。
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