JP6117781B2 - 交差防御性アレナウイルスワクチンおよびそれらの使用方法 - Google Patents

交差防御性アレナウイルスワクチンおよびそれらの使用方法 Download PDF

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Description

関連出願の相互参照
本出願は、2011年7月11日に出願された米国特許仮出願第61/506,579号、および2011年7月12日に出願された同第61/507,062号の利益を主張し、その内容は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
連邦政府の支援による研究開発
本発明の主題の開発に関連する活動は、少なくともある程度、米国政府軍契約番号W81XWH−12−0154による資金提供を受けており、したがって、米国は、本発明にある権利を有し得る。
本発明は、アレナウイルスに対する防御免疫応答の誘発に効果的なDNAに基づくワクチン、ならびにそれを作製および使用する方法に関する。
アレナウイルス(AV)は、齧歯類媒介性ウイルスであり、不快感、重度の浮腫、失血、および高死亡率を伴う、急性およびしばしば致死性の出血熱を引き起こす。ラッサウイルス(LAS)は、西アフリカ地域に固有の旧世界アレナウイルスである。ラッサ熱の輸入症例は、米国、ヨーロッパ、およびカナダで報告されている。毎年、300,000〜500,000件のラッサ熱症例が発生し、入院患者の死亡率が15%〜20%であると推定されている。新世界アレナウイルス、フニンウイルス(JUNV)、マチュポウイルス(MACV)、グアナリトウイルス、およびサビアウイルスは、南アメリカに固有であり、1年に何千もの重度出血熱の症例を引き起こすことが知られている。アレナウイルスは、CDCのカテゴリーAの生物学的に脅威となる作用物質であり、これらのウイルスによる新興疾病の発生または生物テロ攻撃という不運な事件が発生した場合、一般市民が入手できるFDAに認可されている暴露前または暴露後の治療薬またはワクチンは存在しない。マウスにおいて免疫応答を誘発し得るHLAクラスI制限エピトープを特定した研究が報告されている。Botten,J.et al.,J.Vir.9947−9956(Oct 2010)を参照されたい。
その発生ならびに高い罹患率および死亡率の理由から、近年、あらゆる関心がアレナウイルスに向けられているが、利用可能な治療はほとんど存在しない。AVの予防に認可されたワクチンは存在せず、ヒトAV感染の治療に認可された唯一の薬物は、抗ウイルス薬リバビリンである。リバビリンは、暴露の初期に摂取した場合、AV感染に関連する罹患率および死亡率の減少を助けるが、強い毒性および副作用を被る。低費用および/または治療に有効な薬物、ならびに世界のAV流行地における予防に効果的であり、かつ世界の流行地において生物テロの脅威を介して、または米国軍人の配置を介して暴露と闘うのに効果的なワクチンを開発する満たされていない明確な必要性が存在する。
さらに、多剤アレナウイルスワクチンの満たされていない必要性も存在する。前述のように、競合的な効果的予防法も治療法も利用可能ではない。我々が知る限り、研究新薬(IND)の状態での限られた使用がFDAによって認可されている弱毒化生フニンウイルスワクチン(候補番号1)が、アレナウイルス感染症について試験された唯一のワクチンである。しかしながら、このワクチンも、他のアレナウイルス株に対する交差防御が不可能であることが、その後の動物研究で示されている。
したがって、アレナウイルスに対する有効薬または効果的なワクチンを提供するワクチン、および複数のアレナウイルス剤を単独で、または同時に標的とするワクチンの必要性が依然として存在する。
図1(A)、1(B)、1(C)、および1(D)は、非最適化構築物(配列番号3を含む)と対比させた、最適化構築物(配列番号1を含む)でワクチン接種されたモルモットの血清ウイルス血症および罹患率スコアを示す。図1(B2)および1(D2)は、図1(B)および1(D)のデータを示すが、それぞれ、非侵襲的電気穿孔(NIVEP)の血清ウイルス血症スコアおよび罹患率スコアを追加する。 図2(A)および2(B)は、モルモットにおける非最適化(配列番号3を含む)およびコドン最適化(配列番号NOTを含む)LASV DMAワクチンの生存率曲線を示す。 図3(A)および3(B)は、バックチャレンジ(back challenge)研究に採用したモルモットの体重および体温を示す。 LASVでの致死チャレンジに耐え抜いたLASV−GPCまたは疑似ワクチンが接種されたサルのBAERVOM聴覚スクリーニングを示す。 図5(A)、5(B)、および5(C)は、LASV−GPC(配列番号2を含む)または疑似(配列番号3を含む)DNAワクチンを受けたカニクイザルマカクの生存率曲線、血清ウイルス血症、および罹患率スコアを示す。 図6(A)は、LASV−GPC(配列番号2を含む)または疑似(配列番号3を含む)DNAワクチンを受けたカニクイザルマカクの血液化学値を示す。 図6(B)は、LASV−GPC(配列番号2を含む)または疑似(配列番号3を含む)DNAワクチンを受けたカニクイザルマカクの血液化学値を示す。 図6(C)は、LASV−GPC(配列番号2を含む)または疑似(配列番号3を含む)DNAワクチンを受けたカニクイザルマカクの血液化学値を示す。 LASV−GPC(配列番号2を含む)または疑似(配列番号3を含む)DNAワクチンを受けたカニクイザルの選択的血液学値を示す。 モルモットのためにコドン最適化されたLASV−GPC(LASV−GPC GP)、非ヒト霊長類のためにコドン最適化されたLASV−GPC(LASV−GPC NHP)、および参照LASV GPC(対照)の間の配列アライメントを示す。 モルモットのためにコドン最適化されたLASV−GPC(LASV−GPC GP)、非ヒト霊長類のためにコドン最適化されたLASV−GPC(LASV−GPC NHP)、および参照LASV GPC(対照)の間の配列アライメントを示す。 モルモットのためにコドン最適化されたLASV−GPC(LASV−GPC GP)、非ヒト霊長類のためにコドン最適化されたLASV−GPC(LASV−GPC NHP)、および参照LASV GPC(対照)の間の配列アライメントを示す。 モルモットのためにコドン最適化されたLASV−GPC(LASV−GPC GP)、非ヒト霊長類のためにコドン最適化されたLASV−GPC(LASV−GPC NHP)、および参照LASV GPC(対照)の間の配列アライメントを示す。 モルモットのためにコドン最適化されたLASV−GPC(LASV−GPC GP)、非ヒト霊長類のためにコドン最適化されたLASV−GPC(LASV−GPC NHP)、および参照LASV GPC(対照)の間の配列アライメントを示す。
本発明の態様は、アレナウイルスに対する防御免疫応答を、それを必要とする対象において生成することができる1つ以上の免疫原性タンパク質をコードするヌクレオチドコード配列を含むDNAワクチンを提供する。コード配列は、アレナウイルスの糖タンパク質前駆体をコードし、目的とされる対象のためにコドン最適化されている。さらに、このコード配列は、糖タンパク質前駆体と少なくとも98%相同性である、その免疫原性フラグメントであってもよい。
いくつかの実施形態において、コード配列は、LASVの糖タンパク質前駆体ドメイン(LASV−GPC)、LCMVの糖タンパク質前駆体ドメイン(LCMV−GPC)、MACV(MACV−GPC)の糖タンパク質前駆体ドメイン、JUNVの糖タンパク質前駆体ドメイン(JUNV−GPC)、GTOVの糖タンパク質前駆体ドメイン(GTOV−GPC)、WWAVの糖タンパク質前駆体ドメイン(WWAV−GPC)、またはPICVの糖タンパク質前駆体ドメイン(PICV−GPC)から本質的になる。好ましくは、フラグメントは、残基441〜449を含むLASV−GPCのフラグメント、残基447〜455を含むLMCV−GPCのフラグメント、残基444〜452を含むMACV−GPCのフラグメント、残基429〜437を含むJUNV−GPCのフラグメント、残基427〜435を含むGTOV−GPCのフラグメント、残基428〜436を含むWWAV−GPCのフラグメント、または残基455〜463を含むPICV−GPCのフラグメントを含む。
1つの好ましい実施形態において、DNAワクチンは、前記コード配列のうちの1つから本質的になる、単剤または一価ワクチンである。別の好ましい実施形態において、DNAワクチンは、前記コード配列のうちの少なくとも2つから本質的になる、複合剤または多価ワクチンである。好ましくは、一価または多価ワクチンには、本開示のLASV−GPCが含まれ、より好ましくは、配列番号1または2、あるいは配列番号4もしくは5をコードするヌクレオチドコード配列が含まれる。
いくつかの実施形態において、提供されるDNAワクチンは、IL−12、IL−15、IL−28、またはRANTESからなる群から選択されるアジュバントをさらに含む。
本発明の一態様において、アレナウイルスに対する防御免疫応答を誘導する方法が提供され、本方法は、本明細書に提供されるDNAワクチンを投与することと、前記対象に電気穿孔を行うこととを含む。いくつかの実施形態において、電気穿孔ステップは、投与ステップが行われた前記対象の部位に、電気穿孔エネルギーパルスを送達することを含む。好ましくは、投与ステップおよび電気穿孔ステップはいずれも、前記対象の皮内層で行われる。
本開示の発明は、対象において、1つ、またはいくつかの事例においては複数の、旧世界および新世界いずれの病原体も包含するアレナウイルス(LASV、LCMV、MACV、JUNV、GTOV、WWAV、およびPICV)に対する防御免疫応答を生成する、新規なDNAワクチンに関する。
提供されるワクチンは、免疫応答の多様性および関連するが相違する複数のウイルスに対する交差防御を増加させるAV GPCドメインDNA免疫原から成る。より広範囲の病原体を標的とすることができるアレナウイルスのために遺伝子的に最適化された免疫原、具体的には、最適化されたGPCドメインが、本明細書でさらに説明される。本ワクチンの一実施形態は、最適化されたLASVコード配列であり、これは、多剤製剤を達成するために、LASV、LCMV、MACV、JUNV、GTOV、WWAV、およびPICVウイルス、ならびに好ましくはMACVおよびJUNVウイルスを標的するワクチンをさらに含み得る。
本ワクチンを、非常に革新的な製造プロセスおよび最適化されたワクチン製剤と組み合わせて、多剤製剤の効力を強化することができる。従来的には、DNAは、2〜4mg/mLの濃度でのみ製造することが可能であった。この物理的制限が、複数の抗原を標的とするDNAプラスミドを、防御有効性を達成するのに十分に高い用量レベルで組み合わせることを困難にしている。それらの全体が本明細書に組み込まれる、米国特許第7,238,522号および米国特許公開第2009−0004716号に記載される製造プロセス等の特許権を有する製造プロセスを利用することにより、DNAプラスミドは、純度の高い10mg/mLを超える濃度で製造することができる。この高濃度製剤は、従来のID注入等、少ない注入量(0.1mL)での効果的な送達にも有益である。
本ワクチンを、非常に革新的で効率的な電気穿孔(EP)に基づくDNA送達システムと組み合わせて、注入されたDNAワクチンの効力を増加させることもできる。電気穿孔の深さが浅く、一過性が低い電気パラメーターを用いたEP送達システムは、この新しいデバイスを、予防的用途および大規模なワクチン接種に対して大幅に耐容性の高いものにする。
提供される製造プロセスおよび電気穿孔送達デバイスと組み合わせたこのDNAワクチンは、とりわけ、次の利点を提供し得る:
・ベクター誘導性の応答がなく、追加免疫の反復を行う、複合/組み合わせワクチン
・霊長類およびヒトにおいて、ウイルスベクターよりも効力が強い
・製造上の利点
モルモットおよび非ヒト霊長類チャレンジモデルにおいて、致死から100%の防御を対象において誘発することが示されている、単剤LASVワクチン候補の詳細が、本明細書に提供される。LASVワクチン候補は、非ヒト霊長類モデルにおいて、このワクチンアプローチの臨床解釈を促進することが示された。2つの異なるチャレンジモデルに対するこのような成功は、これまでの文献において、ベクターまたは非ベクターのいずれの他のアレナウイルスワクチン候補にも達成されていない。
LASVワクチン候補は、旧世界および新世界の両方のウイルスを標的とする多剤候補ワクチンである。GPC抗原(ウイルスの免疫原性構成要素)は、異なるアレナウイルスのサブタイプ(それぞれ、LASV−MACV/JUNV、およびMACV−JUNV)との相同性が42〜71%の範囲であり、異なるサブタイプ内での配列間の相違は2〜10%であり、LASV、MACV、およびJUNVにわたって高度に保存されない。したがって、多剤ワクチンを開発することは、明白ではなく、複数の技術的問題を伴う。
本明細書に提供されるワクチン候補は、それらがそれぞれの株(例えば、LASV、JUNV、MACV)に対して個別に効果を有し、これらおよび他のアレナウイルス株に対して、集合的に交差防御性となるように、候補GPCワクチンを、標的とされるウイルスサブタイプのそれぞれのために最適化したものである。ワクチン候補は、プラスミド成分が、高濃度(10mg/mL超)となるように製造される。ワクチン候補の成分は、EPでの送達用に組み合わせることができる。EP送達は、EPを用いないDNA送達と比較して、DNAトランスフェクションおよび遺伝子発現の効率を、1000倍を上回って向上させ、免疫原性および有効性を、10〜100倍を上回って向上させることが示されている。多剤DNAワクチンを少量で注入するEP送達により、このアプローチは、予防的ワクチン接種、および具体的には、多剤ワクチン送達に特に好適である。
本明細書に記載されるDNAワクチンのアプローチは、DNAワクチンが、非複製型であり、ゲノム内に統合されず、ベクターとは異なり、ベクターワクチンの効力をさらに制限し得る抗ベクター血清学をもたらすことがないため、他の競合する弱毒化生/不活化ウイルスのアプローチおよび他のベクターに基づくアプローチ(Ad5、MVA、YF)よりも、明白な安全性の利点を有する。DNAワクチンは、現在、数百の異なるワクチン試験にわたり、数千人のヒト対象に送達されているが、安全性の観点から、注目すべきものはほとんどない。EP送達とともに、DNAEPワクチン(HIV、HPV、インフルエンザ、HCV、前立腺癌、黒色腫)は、150以上の対象に、筋肉内または皮内のいずれかの経路を介して、350以上のワクチン接種が行われているが、安全性プロファイルは注目に値しない。
一実施形態において、ワクチン候補は、次の仕様を有し得る。
モルモット(Strain13)およびカニクイザルマカクにおいて、チャレンジを実行する。研究の項に記載のように、これらはいずれも、アレナウイルスチャレンジの確立したモデルである。
いくつかの実施形態において、ワクチン候補は、全2つ以上のワクチン候補(LASV、LCMV、MACV、JUNV、GTOV、WWAV、およびPICV)を含有し、これが、交差防御をもたらし得るが、一方で他の実施形態においては、2つのワクチン候補のみの組み合わせが存在し、より好ましくは、例として、1つが旧世界プラスミドであり、1つが新世界プラスミドである2つ、例えば、LASVとJUNVまたはMACVのいずれかが、AVの全ての複数株に対する防御をもたらす。一実施例において、DNAワクチンは、2つのDNAワクチンプラスミド(LASV−+−JUNV/MACV)を含む。別の実施例では、DNAワクチンは、ワクチン候補およびサイトカインプラスミドを含む。別の実施例においては、DNAワクチンは、LASV、JUNV、およびMACVを含む、3つのプラスミドワクチン候補を含む。
ワクチン候補が、例えば、IL−12およびIL−28、ならびにRANTESを例とする、分子アジュバントもまた含む、いくつかの実施形態が存在する。アジュバントは、ワクチンの免疫応答の幅、それらの規模を増加させるか、または免疫表現型を改変して、改善された株交差有効性(幅)および/または低用量で100%の有効性(効力)等の追加の利益をワクチンに与えることができる。いくつかの実施形態において、ワクチン候補は、LASVを標的とする単一のプラスミドである。この単一プラスミド候補は、致死チャレンジから、モルモットおよび非ヒト霊長類(「NHP」)を防御することに高く効果的であることが示されている。
定義
本明細書に使用される用語は、特定の実施形態を説明する目的のみであり、制限するように意図するものではない。本明細書および添付の特許請求の範囲に使用される、単数形「1つの(a)」、「1つの(an)」、および「その(the)」は、文脈によりそうでないことが明確に示されない限り、複数形の指示対象を含む。
本明細書における数値範囲の記述について、それらの間に介在する各数字は、同程度の正確さで明確に企図される。例えば、6〜9の範囲については、6および9に加えて、7および8の数字が企図され、6.0〜7.0の範囲については、6.0、6.1、6.2、6.3、6.4、6.5、6.6、6.7、6.8、6.9、および7.0という数字が、明確に企図される。
アジュバント
本明細書に使用される「アジュバント」とは、本明細書に記載されるDNAワクチンに添加され、DNAワクチンを構成するDNA構築物、および本明細書に後述されるコード核酸配列によってコードされる、抗原の免疫原性を強化する任意の分子を意味する。
コード配列
本明細書に使用される「コード配列」または「コード核酸」とは、タンパク質をコードするヌクレオチド配列を含む、核酸(RNAまたはDNA分子)を意味する。コード配列は、さらに、その核酸が投与される個体または哺乳動物の細胞内での発現を指示する能力のある、プロモーターおよびポリアデニル化シグナルを含む、制御エレメントに操作可能に接続される開始および終結シグナルを含み得る。
相補体
本明細書に使用される「相補体」または「相補的な」とは、核酸分子のヌクレオチドまたはヌクレオチド類似体の間の、Watson−Crick(例えば、A−T/UおよびC−G)またはHoogsteenの塩基対を意味し得る。
電気穿孔
本明細書で同義に使用される「電気穿孔」、「電気透過」、または「電気運動強化」(「EP」)とは、生体膜に微細通路(孔)を誘導する膜貫通電場パルスの使用を意味し、それらの存在は、プラスミド、オリゴヌクレオチド、siRNA、薬物、イオン、および水等の生体分子が、細胞膜の一方の側面から反対側に通過することを可能にする。
フラグメント
核酸配列に関して本明細書に使用される「フラグメント」とは、アレナウイルスGPC抗原と交差反応する、哺乳動物において免疫応答を誘発する能力のあるポリペプチドをコードする核酸配列またはその一部分を意味する。フラグメントは、コンセンサスアミノ酸配列およびこのような配列を含む構築物をコードする、種々のヌクレオチド配列のうちの少なくとも1つから選択される、DNAフラグメントであり得る。DNAフラグメントは、IgEまたはIgG配列等の免疫グロブリンリーダーのコード配列を含み得る。DNAフラグメントは、以下に記載されるタンパク質フラグメントをコードすることができる。
ポリペプチド配列に関する「フラグメント」とは、例えば、ラッサウイルス(LASV)、脈絡髄膜炎ウイルス(LCMV)、フニンウイルス(JUNV)、マチュポウイルス(MACV)、リンパ球性グアナリトウイルス(GTOV)、ホワイトウォーターアロヨウイルス(White−water Arroyo virus)(WWAV)、およびピチンデウイルス(PICV)を含む、アレナウイルス抗原と交差反応する、哺乳動物において免疫応答を誘発することができるポリペプチドを意味する。
LASV糖タンパク質前駆体(LASV−GPC)配列は、約491のアミノ酸配列であり、好ましくはコドン最適化されている。LASV−GPCのフラグメントは、LASV−GPCの少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%を含み得、好ましくは、フラグメントは、GPC領域の残基441〜449を含有する。いくつかの実施形態において、LASV−GPCのフラグメントは、配列番号4または5の少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%を含む。
LCMV糖タンパク質前駆体(LCMV−GPC)配列は、約498のアミノ酸であり、好ましくは、コドン最適化されており、NCBI受託番号NP 694851を参照されたく、これは、その全体が本明細書に組み込まれる。LCMV−GPCのフラグメントは、LCMV−GPCの少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%を含み得、好ましくは、フラグメントは、残基447〜455を含有する。
JUNV糖タンパク質前駆体(JUNV−GPC)配列は、約485のアミノ酸であり、好ましくは、コドン最適化されており、NCBI受託番号BAA00964を参照されたく、これはその全体が本明細書に組み込まれる。JUNV−GPCのフラグメントは、JUNV−GPCの少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%を含み得、好ましくは、フラグメントは、残基429〜437を含有する。
MACV糖タンパク質前駆体(MACV−GPC)配列は、約496のアミノ酸であり、好ましくは、コドン最適化されており、NCBI受託番号AAN05425を参照されたく、これはその全体が本明細書に組み込まれる。MACV−GPCのフラグメントは、MACV−GPCの少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%を含み得、好ましくは、フラグメントは、残基444〜452を含有する。
GTOV糖タンパク質前駆体(GTOV−GPC)配列は、約496のアミノ酸であり、好ましくはコドン最適化されており、NCBI受託番号AAN05423を参照されたく、これは、その全体が本明細書に組み込まれる。GTOV−GPCのフラグメントは、GTOV−GPCの少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%を含み得、好ましくは、フラグメントは、残基427〜435を含有する。
WWAV糖タンパク質前駆体(WWAV−GPC)配列は、約496のアミノ酸であり、好ましくはコドン最適化されており、NCBI受託番号AAK60497を参照されたく、これは、その全体が本明細書に組み込まれる。WWAV−GPCのフラグメントは、WWAV−GPCの少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%を含み得、好ましくは、フラグメントは、残基428〜436を含有する。
PICV糖タンパク質前駆体(PICV−GPC)配列は、約496のアミノ酸であり、好ましくはコドン最適化されており、NCBI受託番号AAC32281を参照されたく、これは、その全体が本明細書に組み込まれる。PICV−GPCのフラグメントは、PICV−GPCの少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%を含み得、好ましくは、フラグメントは、残基455〜463を含有する。
遺伝子構築物
本明細書に使用される際、「遺伝子構築物」という用語は、タンパク質をコードするヌクレオチド配列を含む、DNAまたはRNA分子を指す。コード配列には、核酸分子が投与される個体の細胞内での発現を指示することができる、プロモーターおよびポリアデニル化シグナルを含む、制御エレメントに操作可能に結合される開始および終結シグナルが含まれる。本明細書に使用される「発現可能な形態」という用語は、個体の細胞内に存在する場合にコード配列が発現されるように、タンパク質をコードするコード配列に操作可能に結合される、必要な制御エレメントを含有する遺伝子構築物を指す。
相同性
複数の配列アライメントおよび系統樹の相同性を、ClustalWソフトウェアを使用して生成した。
同一
2つの核酸またはポリペプチド配列に関連して本明細書に使用される「同一の」または「同一性」とは、その配列が、指定された領域にわたって同一である、指定された割合の残基を有することを意味する。その割合は、2つの配列を最適にアライメントし、指定の領域にわたり2つの配列を比較し、同一の残基が両方の配列に発生する位置の数を判定して、一致する位置の数を得、一致する位置の数を、指定領域内の位置の合計数で除し、その結果に100を掛けて、配列同一性の割合を得ることによって計算することができる。2つの配列が異なる長さであるか、またはアライメントが1つ以上の末端の食い違いをもたらし、指定の比較領域が、単一の配列のみを含む場合は、単一の配列の残基を、計算の分子ではなく、分母に含める。DNAとRNAを比較する場合、チミン(T)とウラシル(U)を、同等と見なすとができる。同一性は、手作業またはBLASTもしくはBLAST2.0等のコンピュータ配列アルゴリズムを用いて行うことができる。
免疫応答
本明細書に使用される「免疫応答」とは、アレナウイルス抗原等の抗原の導入に応答した、例として哺乳動物のものである宿主の免疫系の活性化を意味する。免疫応答は、細胞性もしくは体液性応答の形態であってもよく、またはその両方であってもよい。
核酸
本明細書に使用される「核酸」または「オリゴヌクレオチド」または「ポリヌクレオチド」とは、共有結合で一緒に結合された少なくとも2つのヌクレオチドを意味する。一本鎖の記述も、相補鎖の配列を定義する。したがって、核酸は、記述された一本鎖の相補鎖も包含する。核酸の多数の変化形を、所定の核酸と同一の目的で使用することができる。したがって、核酸は、実質的に同一の核酸およびその相補体も包含する。一本鎖は、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下で、標的配列とハイブリダイズすることが可能なプローブを提供する。したがって、核酸は、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズするプローブをもまた包含する。
核酸は、一本鎖もしくは二本鎖であってもよく、または二本鎖および一本鎖の両方の配列の部分を含有してもよい。核酸は、ゲノムおよびcDNAの両方のDNA、RNA、またはハイブリッドであり得、ここで、核酸は、デオキシリボヌクレオチドおよびリボヌクレオチドの組み合わせ、ならびにウラシル、アデニン、シトシン、グアニン、インノシン、キサンチン、ヒポキサンチン、イソシトシン、およびイソグアニンを含む、塩基の組み合わせを含有し得る。核酸は、化学合成法または組み換え法によって得られ得る。
操作可能に結合される
本明細書に使用される「操作可能に結合される」とは、遺伝子の発現が、それが空間的に接続されるプロモーターの制御下にあることを意味する。プロモーターは、その制御下にある遺伝子の5’(上流)または3’(下流)に位置し得る。プロモーターと遺伝子との間の距離は、そのプロモーターと、プロモーターが由来する遺伝子内でそれが制御する遺伝子との間の距離とおおよそ同じであり得る。当該技術分野で既知のように、この距離の変更は、プロモーター機能を損失することなく調整することができる。
プロモーター
本明細書に使用される「プロモーター」とは、細胞内で核酸の発現をもたらすか、活性化するか、または強化することが可能な合成もしくは天然由来の分子を意味する。プロモーターは、さらに、その発現を強化し、かつ/またはその空間的発現および/もしくは一時的発現を変化させる1つ以上の特定の転写制御配列を含んでもよい。プロモーターは、遠位エンハンサーまたはリプレッサーエレメントも含んでもよく、これは、転写の開始部位から、数千塩基対程度の位置にあり得る。プロモーターは、ウイルス、細菌、真菌、植物、昆虫、および動物を含む源に由来し得る。プロモーターは、発現が生じる細胞、組織、もしくは器官に関して、または発現が生じる成長段階に関して、または生理的ストレス、病原体、金属イオン、もしくは誘導剤等の外部刺激に応答して、構造的または特異的に遺伝子の発現を制御することができる。プロモーターの代表的な例には、バクテリオファージT7プロモーター、バクテリオファージT3プロモーター、SP6プロモーター、lacオペレーター−プロモーター、tacプロモーターSV40後期プロモーター、SV40早期プロモーター、RSV−LTRプロモーター、CMV IEプロモーター、SV40早期プロモーターもしくはSV40後期プロモーター、およびCMV IEプロモーターが挙げられる。
ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件
本明細書に使用される「ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件」とは、核酸の複雑な混合物において等、第1の核酸配列(例えば、プローブ)が第2の核酸配列(例えば、標的)とハイブリダイズする条件を意味する。ストリンジェントな条件は、配列依存性であり、異なる状況においては、異なるであろう。ストリンジェントな条件は、定義されたイオン強度pHで特定の配列の熱融解点(Tm)よりも約5〜10℃低くなるように、選択することができる。Tmは、標的に相補的なプローブの50%が、平衡状態で標的配列とハイブリダイズする温度(定義されたイオン強度、pH、および核濃度下で)であり得る(標的配列が、過剰に存在するため、Tmにおいて、プローブの50%は、平衡状態にある)。ストリンジェントな条件は、塩の濃度が、pH7.0〜8.3で約0.01〜1.0Mナトリウムイオン濃度(または他の塩)等、約1.0M未満のナトリウムイオンであるものであり得、温度は、短いプローブ(例えば、約10〜50ヌクレオチド)については、少なくとも約30℃であり、長いプローブ(例えば、50ヌクレオチドを上回る)については、少なくとも約60℃である。ストリンジェントな条件はまた、ホルムアミド等の不安定化剤の添加により達成することもできる。選択的または特異的ハイブリダイゼーションについては、正のシグナルは、バックグラウンドハイブリダイゼーションの少なくとも2〜10倍である。例示的なストリンジェントハイブリダイゼーション条件には、次のものが挙げられる:50%ホルムアミド、5xSSC、および1%SDS、42℃でのインキュベーション、65℃で0.2×SSCおよび0.1%SDS中での洗浄。
実質的に相補性
本明細書に使用される「実質的に相補性」とは、第1の配列が、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、180、270、360、450、540、630、720、810、900、990、1080、1170、1260、1350、または1440以上のヌクレオチドまたはアミノ酸の領域にわたり、第2の配列の相補体と、少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、97%、98%、または99%同一であるか、または2つの配列が、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズすることを意味する。
実質的に同一
本明細書に使用される「実質的に同一」とは、第1の配列が、8、9、10、11、12、13、14、15、16、7、18、19、20、21、22、23、24、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、180、270、360、450、540、630、720、810、900、990、1080、1170、1260、1350、または1440以上のヌクレオチドまたはアミノ酸の領域にわたり、第2の配列の相補体と、少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、97%、98%、または99%同一であるか、または核酸に関して、第1の配列が、第2の配列の構成要素と実質的に相補性であることを意味する。
サブタイプまたは血清型
アレナウイルスに関連して本明細書において同義に使用される「サブタイプ」または「血清型」とは、アレナウイルス抗原の遺伝的変異体を意味し、その結果、1つのサブタイプ(または変異体)は、異なるサブタイプとは別の免疫系によって認識される。
変異体
核酸に関して本明細書に使用される「変異体」とは、(i)参照ヌクレオチド配列の一部分もしくはフラグメント、(ii)参照ヌクレオチド配列の相補体もしくはその一部分、(iii)参照ヌクレオチドもしくはその相補体と実質的に同一の核酸、または(iv)参照核酸、その相補体、もしくはそれと実質的に同一の配列と、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズする、核酸を意味する。
アミノ酸配列におけるアミノ酸の挿入、欠失、または保存的置換が異なるが、少なくとも1つの生物学的活性を保持する、ペプチドまたはポリペプチドに関する「変異体」変異体は、少なくとも1つの生物学的活性を保持するアミノ酸配列を有する参照タンパク質と実質的に同一のアミノ酸配列を有するタンパク質も意味する。アミノ酸の保存的置換、すなわち、1つのアミノ酸を、類似の特性(親水性、荷電領域の程度および分布)を有する別のアミノ酸と置き換えることは、典型的に小規模な変更を伴うとして、当該技術分野で認識されている。これらの小規模な変更は、当該技術分野において理解されるように、アミノ酸の親水性指標を考慮することによって、ある程度特定され得る。Kyte et al.,J.Mol.Biol.157:105−132(1982)。アミノ酸の親水性指標は、その疎水性および電荷の考察に基づく。類似の親水性指標のアミノ酸を置換することができ、依然としてタンパク質の機能を保持することは、当該技術分野で既知である。一態様において、±2の親水性指標を有するアミノ酸を置換する。アミノ酸の親水性を使用することで、生物学的機能を保持するタンパク質をもたらす置換が判明し得る。ペプチドとの関連においてアミノ酸の親水性を考慮することにより、そのペプチドの最大局所平均親水性を計算することが可能となり、これは、抗原性および免疫原性と十分に相関性があることが報告されている有用な尺度である。米国特許第4,554,101号、参照により本明細書に完全に組み込まれる。類似の親水性値を有するアミノ酸の置換により、当該技術分野で理解されるように、免疫原性を例とする生物学的活性を保持するペプチドをもたらすことができる。置換は、それぞれの±2以内の親水性値を有するアミノ酸で行うことができる。アミノ酸の疎水性指標および親水性値のいずれも、そのアミノ酸の特定の側鎖に影響される。この見解と一致して、生物学的機能と適合性のあるアミノ酸置換は、疎水性、親水性、電荷、寸法、および他の特性によって明らかとなるアミノ酸の相対的類似性、特にそれらのアミノ酸の側鎖に依存することが理解される。
ベクター
本明細書に使用される「ベクター」とは、複製起点を含有する核酸配列を意味する。ベクターは、ベクター、バクテリオファージ、細菌人工染色体、または酵母人工染色体であり得る。ベクターは、DNAまたはRNAベクターであってもよい。ベクターは、自己複製染色体外ベクターであってもよく、好ましくは、DNAプラスミドである。
ワクチンの賦形剤および他の成分
ワクチンは、トランスフェクション促進剤、薬学的に許容される賦形剤、アジュバント等、他の成分をさらに含んでもよい。薬学的に許容される賦形剤は、ビヒクル、アジュバント、担体、または希釈剤等の機能性分子であり得る。薬学的に許容される賦形剤は、トランスフェクション促進剤であってもよく、これには、界面活性剤、例えば、免疫刺激複合体(ISCOMS)、フロイント不完全アジュバント、モノホスホリルリピドAを含むLPS類似体、ムラミルペプチド、キノン類似体、スクアレンおよびスクアレン等の小胞体、ヒアルロン酸、脂質、リポソーム、カルシウムイオン、ウイルス性タンパク質、ポリアニオン、ポリカチオン、またはナノ粒子、あるいは他の既知のトランスフェクション促進剤が含まれる。
トランスフェクション促進剤は、ポリ−L−グルタメート(LGS)を含み、ポリアニオン、ポリカチオン、または脂質であってもよい。トランスフェクション促進剤は、ポリ−L−グルタメートであってもよい。ポリ−L−グルタメートは、6mg/mL未満の濃度で、ワクチン中に存在し得る。トランスフェクション促進剤は、界面活性剤、例えば、免疫刺激複合体(ISCOMS)、フロイント不完全アジュバント、モノホスホリルリピドAを含むLPS類似体、ムラミルペプチド、キノン類似体、ならびにスクアレンおよびスクアレン等の小胞体を含み得、ヒアルロン酸も、遺伝子構築物との併用で投与することができる。いくつかの実施形態において、DNAプラスミドワクチンはまた、脂質、DNAリポソーム混合物(例えば、WO9324640号を参照されたい)として、レシチンリポソームもしくは当該技術分野で既知の他のリポソームを含む、リポソーム等のトランスフェクション促進剤、カルシウムイオン、ウイルス性タンパク質、ポリアニオン、ポリカチオン、またはナノ粒子、あるいは他の既知のトランスフェクション促進剤を含み得る。トランスフェクション促進剤は、ポリアニオン、ポリ−L−グルタメート(LGS)を含む、ポリカチオン、または脂質である。ワクチン中のトランスフェクション剤の濃度は、4mg/mL未満、2mg/mL未満、1mg/mL未満、0.750mg/mL未満、0.500mg/mL未満、0.250mg/mL未満、0.100mg/mL未満、0.050mg/mL未満、または0.010mg/mL未満である。
薬学的に許容される賦形剤は、アジュバントであり得る。アジュバントは、別のプラスミドに発現されるか、またはワクチンにおいて上述のプラスミドと組み合わせたタンパク質として送達される他の遺伝子であってもよい。アジュバントは、シグナル配列が欠失したIL−15を含み、任意でIgE由来のシグナルペプチドを含む、α−インターフェロン(IFN−α)、β−インターフェロン(IFN−β)、γ−インターフェロン、血小板由来成長因子(PDGF)、TNFα、ΤΝFβ、GM−CSF、上皮成長因子(EGF)、皮膚T細胞誘引ケモカイン(CTACK)、上皮胸腺発現ケモカイン(TECK)、粘膜関連上皮ケモカイン(MEC)、IL−12、IL−15、MHC、CD80、CD86からなる群から選択することができる。アジュバントは、IL−12、IL−15、IL−28、CTACK、TECK、血小板由来成長因子(PDGF)、TNFα、TNFβ、GM−CSF、上皮成長因子(EGF)、IL−1、IL−2、IL−4、IL−5、IL−6、IL−10、IL−12、IL−18、またはこれらの組み合わせであり得る。
有用なアジュバントであり得る他の遺伝子には、MCP−1、MIP−1a、MIP−1p、IL−8、RANTES、L−セレクチン、P−セレクチン、E−セレクチン、CD34、GlyCAM−1、MadCAM−1、LFA−1、VLA−1、Mac−1、pl50.95、PECAM、ICAM−1、ICAM−2、ICAM−3、CD2、LFA−3、M−CSF、G−CSF、IL−4、IL−18の突然変異体形態、CD40、CD40L、血管成長因子、線維芽細胞成長因子、IL−7、神経成長因子、血管内皮成長因子、Fas、TNF受容体、Flt、Apo−1、p55、WSL−1、DR3、TRAMP、Apo−3、AIR、LARD、NGRF、DR4、DR5、KILLER、TRAIL−R2、TRICK2、DR6、カスパーゼICE、Fos、c−jun、Sp−1、Ap−1、Ap−2、p38、p65Rel、MyD88、IRAK、TRAF6、IkB、不活性NIK、SAP K、SAP−1、JNK、インターフェロン応答遺伝子、NFkB、Bax、TRAIL、TRAILrec、TRAILrecDRC5、TRAIL−R3、TRAIL−R4、RANK、RANKリガンド、Ox40、Ox40リガンド、NKG2D、MICA、MICB、NKG2A、NKG2B、NKG2C、NKG2E、NKG2F、TAP1、TAP2、およびそれらの機能性フラグメントが挙げられる。ワクチンは、1994年4月1日に出願され、参照により完全に組み込まれる米国特許出願第021,579号に記載のような、遺伝子ワクチン促進剤をさらに含んでもよい。
ワクチンは、使用される投与形態に応じて製剤化することができる。注入可能なワクチンの薬学的組成物は、滅菌、発熱物質不含、かつ微粒子不含であり得る。等張製剤または溶液を使用してもよい。等張性添加剤には、塩化ナトリウム、デキストロース、マンニトール、ソルビトール、およびラクトースが含まれ得る。ワクチンは、血管収縮剤を含んでもよい。等張溶液には、リン酸緩衝食塩水が含まれ得る。
ワクチンは、ゼラチンおよびアルブミンを含む安定剤をさらに含んでもよい。安定剤は、LGSまたはポリカチオンまたはポリアニオンを含み、製剤が長期間にわたって室温または周囲温度で安定的であることを可能にし得る。
ワクチン接種の方法
対象をワクチン接種する方法が本明細書に提供される。本方法は、ワクチンを送達する機構として、電気穿孔を使用する。電気穿孔は、最小限に侵襲的なデバイスを介して行うことができる。
コドン最適化されたAV GPC抗原
LASV糖タンパク質前駆体(LASV−GPC)配列は、約491のアミノ酸配列であり、好ましくはコドン最適化されている。LASV−GPCのフラグメントは、LASV−GPCの少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%を含み得、好ましくは、フラグメントは、GPC領域の残基441〜449を含有する。いくつかの実施形態において、LASV−GPCのフラグメントは、配列番号4または5の少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%を含む。
LCMV糖タンパク質前駆体(LCMV−GPC)配列は、約498のアミノ酸であり、好ましくは、コドン最適化されており、NCBI受託番号NP 694851を参照されたく、これは、その全体が本明細書に組み込まれる。LCMV−GPCのフラグメントは、LCMV−GPCの少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%を含み得、好ましくは、フラグメントは、残基447〜455を含有する。
JUNV糖タンパク質前駆体(JUNV−GPC)配列は、約485のアミノ酸であり、好ましくは、コドン最適化され、NCBI受託番号BAA00964を参照されたく、これはその全体が本明細書に組み込まれる。JUNV−GPCのフラグメントは、JUNV−GPCの少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%を含み得、好ましくは、フラグメントは、残基429〜437を含有する。
MACV糖タンパク質前駆体(MACV−GPC)配列は、約496のアミノ酸であり、好ましくは、コドン最適化されており、NCBI受託番号AAN05425を参照されたく、これはその全体が本明細書に組み込まれる。MACV−GPCのフラグメントは、MACV−GPCの少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%を含み得、好ましくは、フラグメントは、残基444〜452を含有する。
GTOV糖タンパク質前駆体(GTOV−GPC)配列は、約496のアミノ酸であり、好ましくはコドン最適化され、NCBI受託番号AAN05423を参照されたく、これは、その全体が本明細書に組み込まれる。GTOV−GPCのフラグメントは、GTOV−GPCの少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%を含み得、好ましくは、フラグメントは、残基427〜435を含有する。
WWAV糖タンパク質前駆体(WWAV−GPC)配列は、約496のアミノ酸であり、好ましくはコドン最適化され、NCBI受託番号AAK60497を参照されたく、これは、その全体が本明細書に組み込まれる。WWAV−GPCのフラグメントは、WWAV−GPCの少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%を含み得、好ましくは、フラグメントは、残基428〜436を含有する。
PICV糖タンパク質前駆体(PICV−GPC)配列は、約496のアミノ酸であり、好ましくはコドン最適化され、NCBI受託番号AAC32281を参照されたく、これは、その全体が本明細書に組み込まれる。PICV−GPCのフラグメントは、PICV−GPCの少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%を含み得、好ましくは、フラグメントは、残基455〜463を含有する。
ヌクレオチド配列−コード配列ならびに構築物およびプラスミド
LASV糖タンパク質前駆体(LASV−GPC)ヌクレオチドコード配列は、約1476ヌクレオチドであり、好ましくは、コドン最適化されている。LASV−GPCの免疫原性フラグメントのコード配列は、LASV−GPCの少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%を含み得、好ましくは、フラグメントは、GPC領域の残基441〜449を含有する。いくつかの実施形態において、LASV−GPCのコード配列は、配列番号1および2である。いくつかの実施形態において、LASV−GPCのフラグメントのコード配列は、配列番号4または5の少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%を含む。いくつかの実施形態において、LASV−GPCのフラグメントのコード配列は、配列番号1または2の少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%を含む。
LCMV糖タンパク質前駆体(LCMV−GPC)ヌクレオチドコード配列は、約1494ヌクレオチドであり、好ましくは、コドン最適化されており、NCBI受託番号NP 694851を参照されたく、これは、その全体が本明細書に組み込まれる。LCMV−GPCの免疫原性フラグメントのコード配列は、LCMV−GPCの少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%を含み得、好ましくは、フラグメントは残基447〜455を含有する。
JUNV糖タンパク質前駆体(JUNV−GPC)ヌクレオチドコード配列は、約1455ヌクレオチドであり、好ましくは、コドン最適化されており、NCBI受託番号BAA00964を参照されたく、これは、その全体が本明細書に組み込まれる。JUNV−GPCの免疫原性フラグメントのコード配列は、JUNV−GPCの少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%を含み得、好ましくは、フラグメントは残基429〜437を含有する。
MACV糖タンパク質前駆体(MACV−GPC)ヌクレオチドコード配列は、約1488ヌクレオチドであり、好ましくは、コドン最適化されており、NCBI受託番号AAN05425を参照されたく、これは、その全体が本明細書に組み込まれる。MACV−GPCの免疫原性フラグメントのコード配列は、MACV−GPCの少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%を含み得、好ましくは、残基444〜452を含有する。
GTOV糖タンパク質前駆体(GTOV−GPC)ヌクレオチドコード配列は、約1488ヌクレオチドであり、好ましくは、コドン最適化されており、NCBI受託番号AAN05423を参照されたく、これは、その全体が本明細書に組み込まれる。GTOV−GPCの免疫原性フラグメントのコード配列は、GTOV−GPCの少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%を含有し得、好ましくは、フラグメントは、残基427〜435を含有する。
WWAV糖タンパク質前駆体(WWAV−GPC)ヌクレオチドコード配列は、約1488ヌクレオチドであり、好ましくは、コドン最適化されており、NCBI受託番号AAK60497を参照されたく、これは、その全体が本明細書に組み込まれる。WWAV−GPCの免疫原性フラグメントのコード配列は、WWAV−GPCの少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%を含み得、好ましくは、フラグメントは、残基428〜436を含有する。
PICV糖タンパク質前駆体(PICV−GPC)ヌクレオチドコード配列は、約1488ヌクレオチドであり、好ましくはコドン最適化されており、NCBI受託番号AAC32281を参照されたく、これは、その全体が本明細書に組み込まれる。PICV−GPCの免疫原性フラグメントのコード配列は、PICV−GPCの少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%を含み得、好ましくは、フラグメントは、残基455〜463を含有する。
本明細書に開示されるAV GPC抗原(その免疫原性フラグメントを含む)をコードする核酸を含み得る、遺伝子構築物が本明細書に提供される。遺伝子構築物は、機能性の染色体外分子として、細胞内に存在し得る。遺伝子構築物は、セントロメア、テロマー、またはプラスミドもしくはコスミドを含む、線形ミニ染色体であり得る。
遺伝子構築物はまた、組み換えアデノウイルス、組み換えアデノウイルス関連ウイルス、および組み換えワクチンを含む、組み換えウイルスベクターのゲノムの一部であり得る。遺伝子構築物は、細胞内に生存する弱毒化された生存する微生物または組み換え微生物ベクター中の遺伝子材料の一部であってもよい。
遺伝子構築物は、核酸のコード配列の遺伝子発現のための制御エレメントを含み得る。制御エレメントは、プロモーター、エンハンサー、開始コドン、停止コドン、またはポリアデニル化シグナルであり得る。
核酸配列は、ベクターであり得る遺伝子構築物を構成することができる。ベクターは、哺乳動物において免疫応答を誘発するのに効果的な量で、抗原を哺乳動物の細胞中で発現する能力を有し得る。ベクターは、抗原をコードする異種核酸を含み得る。ベクターはプラスミドであってもよい。ベクターは、細胞に、抗原をコードする核酸をトランスフェクトするのに有用であり得、形質転換された宿主細胞は、抗原の発現が生じる条件下で培養および維持される。
コード配列は、発現の安定性および高いレベルのために最適化することができる。いくつかの事例において、コドンは、分子内結合によって形成されるもの等、RNAの二次構造の形成を低減させるように、選択される。
ベクターは、抗原をコードする異種核酸を含み得、さらに、抗原コード配列の上流にあり得る開始コドン、および抗原コード配列の下流にあり得る停止コドンを含み得る。開始および終止コドンは、抗原コード配列のフレーム内にあり得る。ベクターはまた、抗原コード配列に操作可能に接続されるプロモーターを含み得る。抗原コード配列に操作可能に接続されるプロモーターは、シミアンウイルス(SV40)由来のプロモーター、マウス乳癌ウイルス(MMTV)プロモーター、ウシ免疫不全ウイルス(BIV)長い末端反復(LTR)プロモーター等のヒト免疫不全ウイルス(HTV)プロモーター、Moloneyウイルスプロモーター、トリ白血病ウイルス(ALV)プロモーター、CMV前初期プロモーター等のサイトメガロウイルス(CMV)プロモーター、エプスタインバーウイルス(EBV)プロモーター、またはラウス肉腫ウイルス(RSV)プロモーターであり得る。プロモーターはまた、ヒトアクチン、ヒトミオシン、ヒトヘモグロビン、ヒト筋クレアチン、またはヒトメタロチオネイン等、ヒト遺伝子由来のプロモーターであってもよい。プロモーターはまた、天然または合成の筋肉または皮膚特異的プロモーター等、組織特異的プロモーターであってもよい。このようなプロモーターの例は、米国特許出願公開第US20040175727号に記載され、その内容は、その全体が本明細書に組み込まれる。
ベクターはまた、ポリアデニル化シグナルを含み得、これは、AV GPCタンパク質コード配列の下流にあり得る。ポリアデニル化シグナルは、SV40ポリアデニル化シグナル、LTRポリアデニル化シグナル、ウシ成長ホルモン(bGH)ポリアデニル化シグナル、ヒト成長ホルモン(hGH)ポリアデニル化シグナル、またはヒトβ−グロビンポリアデニル化シグナルであり得る。SV40ポリアデニル化シグナルは、pCEP4ベクター(Invitrogen,San Diego,CA)由来のポリアデニル化シグナルであり得る。
ベクターはまた、AV GPCタンパク質コード配列の上流にエンハンサーを含んでもよい。エンハンサーは、DNA発現に必要であり得る。エンハンサーは、ヒトアクチン、ヒトミオシン、ヒトヘモグロビン、ヒト筋クレアチン、またはCMV、HA、RSVもしくはEBV等のウイルスエンハンサーであり得る。ポリヌクレオチド機能の強化は、米国特許第5,593,972号、同第5,962,428号、およびWO94/016737号に記載され、それぞれの内容は、参照により完全に組み込まれる。
ベクターはまた、ベクターを染色体外に維持し、細胞内でベクターの複数のコピーを生成するために、哺乳動物の複製起点を含み得る。ベクターは、Invitrogen(San Diego、CA)からのpWRG7077(Schmaljohn et al.(下記)を参照されたい)、pVAX1、pCEP4、またはpREP4であってもよく、これらは、エプスタインバーウイルスの複製起点および核抗原EBNA−1コード領域を含み得、これは、統合することなく高度なコピーのエピソーム複製を生成することができる。ベクターは、pVAX1または本明細書に記載される変異体プラスミド等の変更を有するpVax1変異体であり得る。変異体pVax1プラスミドは、骨格ベクタープラスミドpVAX1(Invitrogen,Carlsbad CA)の2998塩基対変異体である。CMVプロモーターは、塩基137〜724に位置する。T7プロモーター/プライミング部位は、塩基664〜683にある。多重クローニング部位は、塩基696〜811にある。ウシGHポリアデニル化シグナルは、塩基829〜1053にある。カナマイシン耐性遺伝子は、塩基1226〜2020にある。pUC起点は、塩基2320〜2993にある。Invitrogenから入手可能なpVAX1の配列に基づいて、次の突然変異体が、本明細書に記載されるプラスミド1〜6の骨格として使用されたpVAX1の配列に見いだされた。
C>G 241 CMVプロモーター中
C>T 1942 骨格、ウシ成長ホルモンポリアデニル化シグナル(bGHpolyA)の下流
A>− 2876 骨格、カナマイシン遺伝子の下流
C>T 3277 pUC複製起点(Ori)中、高コピー数の突然変異(Nucleic Acid Research 1985を参照されたい)
G>C 3753 pUC Oriの最末端、RNASeH部位の上流
塩基対2、3、および4が、骨格、CMVプロモーターの上流において、ACTからCTGに変更されている。
ベクターの骨格は、pAV0242であり得る。ベクターは、複製能欠損アデノウイルス5型(Ad5)ベクターであり得る。
ベクターはまた、ベクターが投与される哺乳動物またはヒトの細胞において、遺伝子の発現に適切であり得る制御配列を含んでもよい。AV GPCコード配列は、宿主細胞におけるコード配列のより効率的な転写を可能にすることができるコドンを含み得る。
ベクターは、エシェリキア・コリ(大腸菌)におけるタンパク質の生成に使用可能なpSE420(Invitrogen,San Diego,Calif.)であり得る。ベクターはまた、酵母のサッカロミセス・セレビシエ株におけるタンパク質生成に使用可能なpYES2(Invitrogen,San Diego,Calif.)であってもよい。ベクターはまた、昆虫細胞におけるタンパク質生成に使用可能なMAXBAC(商標)完全バキュロウイルス発現系(Invitrogen,San Diego,Calif.)であってもよい。ベクターはまた、チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞等の哺乳動物細胞におけるタンパク質生成に使用可能なpcDNA1またはpcDNA3(Invitrogen,San Diego,Calif.)であってもよい。ベクターは、参照により完全に組み込まれる、Sambrook et al.,Molecular Cloning and Laboratory Manual,Second Ed.,Cold Spring Harbor(1989)を含む、日常的な技術および容易に入手可能な開始物質によってタンパク質を生成するための発現ベクターまたは系であってもよい。
薬学的組成物
本明細書においてDNAワクチンとも表記される、本発明による薬学的組成物が本明細書に提供され、これは、約1ナノグラム〜約10mgのDNAを含む。いくつかの実施形態において、本発明による薬学的組成物は、1)少なくとも10、15、20、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、もしくは100ナノグラム、または少なくとも1、5、10、15、20、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、105、110、115、120、125、130、135、140、145、150、155、160、165、170、175、180、185、190、195、200、205、210、215、220、225、230、235、240、245、250、255、260、265、270、275、280、285、290、295、300、305、310、315、320、325、330、335、340、345、350、355、360、365、370、375、380、385、390、395、400、405、410、415、420、425、430、435、440、445、450、455、460、465、470、475、480、485、490、495、500、605、610、615、620、625、630、635、640、645、650、655、660、665、670、675、680、685、690、695、700、705、710、715、720、725、730、735、740、745、750、755、760、765、770、775、780、785、790、795、800、805、810、815、820、825、830、835、840、845、850、855、860、865、870、875、880、885、890、895、900、905、910、915、920、925、930、935、940、945、950、955、960、965、970、975、980、985、990、995、もしくは1000マイクログラム、または少なくとも1.5、2、2.5、3、3.5、4、4.5、5、5.5、6、6.5、7、7.5、8、8.5、9、9.5、もしくは10mg以上から、2)最大で15、20、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、もしくは100ナノグラム以下、または最大で1、5、10、15、20、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、105、110、115、120、125、130、135、140、145、150、155、160、165、170、175、180、185、190、195、200、205、210、215、220、225、230、235、240、245、250、255、260、265、270、275、280、285、290、295、300、305、310、315、320、325、330、335、340、345、350、355、360、365、370、375、380、385、390、395、400、405、410、415、420、425、430、435、440、445、450、455、460、465、470、475、480、485、490、495、500、605、610、615、620、625、630、635、640、645、650、655、660、665、670、675、680、685、690、695、700、705、710、715、720、725、730、735、740、745、750、755、760、765、770、775、780、785、790、795、800、805、810、815、820、825、830、835、840、845、850、855、860、865、870、875、880、885、890、895、900、905、910、915、920、925、930、935、940、945、950、955、960、965、970、975、980、985、990、995、もしくは1000マイクログラム以下、または最大で1.5、2、2.5、3、3.5、4、4.5、5、5.5、6、6.5、7、7.5、8、8.5、9、9.5、もしくは10mg以下までを含む。いくつかの実施形態において、本発明による薬学的組成物は、約5ナノグラム〜約10mgのDNAを含む。いくつかの実施形態において、本発明による薬学的組成物は、約25ナノグラム〜約5mgのDNAを含む。いくつかの実施形態において、本薬学的組成物は、約50ナノグラム〜約1mgのDNAを含有する。いくつかの実施形態において、本薬学的組成物は、約0.1〜約500マイクログラムのDNAを含有する。いくつかの実施形態において、本薬学的組成物は、約1〜約350マイクログラムのDNAを含有する。いくつかの実施形態において、本薬学的組成物は、約5〜約250マイクログラムのDNAを含有する。いくつかの実施形態において、本薬学的組成物は、約10〜約200マイクログラムのDNAを含有する。いくつかの実施形態において、本薬学的組成物は、約15〜約150マイクログラムのDNAを含有する。いくつかの実施形態において、本薬学的組成物は、約20〜約100マイクログラムのDNAを含有する。いくつかの実施形態において、本薬学的組成物は、約25〜約75マイクログラムのDNAを含有する。いくつかの実施形態において、本薬学的組成物は、約30〜約50マイクログラムのDNAを含有する。いくつかの実施形態において、本薬学的組成物は、約35〜約40マイクログラムのDNAを含有する。いくつかの実施形態において、本薬学的組成物は、約100〜約200マイクログラムのDNAを含有する。いくつかの実施形態において、本薬学的組成物は、約10マイクログラム〜約100マイクログラムのDNAを含む。いくつかの実施形態において、本薬学的組成物は、約20マイクログラム〜約80マイクログラムのDNAを含む。いくつかの実施形態において、本薬学的組成物は、約25マイクログラム〜約60マイクログラムのDNAを含む。いくつかの実施形態において、本薬学的組成物は、約30マイクログラム〜約50マイクログラムのDNAを含む。いくつかの実施形態において、本薬学的組成物は、約35マイクログラム〜約45マイクログラムのDNAを含む。いくつかの好ましい実施形態において、本薬学的組成物は、約0.1〜約500マイクログラムのDNAを含有する。いくつかの好ましい実施形態において、本薬学的組成物は、約1〜約350マイクログラムのDNAを含有する。いくつかの好ましい実施形態において、本薬学的組成物は、約25〜約250マイクログラムのDNAを含有する。いくつかの好ましい実施形態において、本薬学的組成物は、約100〜約200マイクログラムのDNAを含有する。
本発明による薬学的組成物は、使用される投与の形態に応じて製剤化される。薬学的組成物が注入可能な薬学的組成物である場合、それらは、滅菌、発熱物質不含、かつ微粒子不含である。好ましくは、等張製剤を使用する。一般的に、等張性のための添加剤には、塩化ナトリウム、デキストロース、マンニトール、ソルビトール、およびラクトースを挙げることができる。いくつかの場合において、リン酸緩衝食塩水等の等張溶液が好ましい。安定剤には、ゼラチンおよびアルブミンが含まれる。いくつかの実施形態において、血管収縮剤を、製剤に添加する。
好ましくは、本薬学的組成物は、ワクチンであり、より好ましくは、DNAワクチンである。
1つ以上のAVに対する防御免疫応答を哺乳動物において生成することができるワクチンが本明細書に提供される。ワクチンは、本明細書に記載される遺伝子構築物を含み得る。
科学的理論に制限されるものではないが、ワクチンを使用して、1つ以上の種類のAVに対して、広範に免疫応答(体液性、細胞性、またはその両方)を誘発することができる。
DNAワクチンは、米国特許第5,593,972号、同第5,739,118号、同第5,817,637号、同第5,830,876号、同第5,962,428号、同第5,981,505号、同第5,580,859号、同第5,703,055号、および同第5,676,594号に記載され、これらは、参照により完全に本明細書に組み込まれる。DNAワクチンは、それが染色体内に統合することを阻害する、要素または試薬をさらに含んでもよい。ワクチンは、AV GPCタンパク質のRNAであってもよい。RNAワクチンは、細胞に導入することができる。
ワクチンは、本明細書に記載される抗原の遺伝子構築物を含む、組み換えワクチンであってもよい。ワクチンはまた、1つ以上のタンパク質サブユニットの形態で、1つ以上のAV GPCコアタンパク質、1つ以上のAV GPCタンパク質を含む1つ以上の不活ウイルス粒子、または1つ以上のAV GPCを含む1つ以上の弱毒化ウイルス粒子を含み得る。弱毒化ワクチンは、弱毒化生ワクチン、不活ワクチン、および1つ以上のAV PCGタンパク質をコードする外来遺伝子を送達するために組み換えベクターを使用するワクチン、ならびにサブユニットおよび糖タンパク質ワクチンであり得る。外来抗原を送達するために組み換えベクターを使用する弱毒化生ワクチン、サブユニットワクチン、および糖タンパク質ワクチンは、米国特許第4,510,245号、同第4,797,368号、同第4,722,848号、同第4,790,987号、同第4,920,209号、同第5,017,487号、同第5,077,044号、同第5,110,587号、同第5,112,749号、同第5,174,993号、同第5,223,424号、同第5,225,336号、同第5,240,703号、同第5,242,829号、同第5,294,441号、同第5,294,548号、同第5,310,668号、同第5,387,744号、同第5,389,368号、同第5,424,065号、同第5,451,499号、同第5,453,364号、同第5,462,734号、同第5,470,734号、同第5,474,935号、同第5,482,713号、同第5.591,439号、同第5,643,579号、同第5,650,309号、同第5,698,202号、同第5,955,088号、同第6,034,298号、同第6,042,836号、同第6,156,319号、および同第6,589,529号に記載され、これらは、それぞれ、参照により本明細書に組み込まれる。
ワクチンは、全世界の複数の特定の地域に由来する、複数のAVを対象とするベクターおよび/またはタンパク質を含み得る。提供されるワクチンを使用して、治療的および予防的免疫応答を含む、免疫応答を誘導することができる。AV GPCタンパク質、およびさらには複数のAVウイルスにわたっても広範に対象とする、抗体および/またはキラーT細胞を、生成することができる。このような抗体および細胞を、単離することができる。
ワクチンは、薬学的に許容される賦形剤をさらに含み得る。薬学的に許容される賦形剤は、ビヒクル、アジュバント、担体、または希釈剤等の機能性分子であり得る。薬学的に許容される賦形剤は、トランスフェクション促進剤であってもよく、これには、界面活性剤、例えば、免疫刺激複合体(ISCOMS)、フロイント不完全アジュバント、モノホスホリルリピドAを含むLPS類似体、ムラミルペプチド、キノン類似体、スクアレンおよびスクアレン等の小胞体、ヒアルロン酸、脂質、リポソーム、カルシウムイオン、ウイルス性タンパク質、ポリアニオン、ポリカチオン、またはナノ粒子、あるいは他の既知のトランスフェクション促進剤が挙げられる。
トランスフェクション促進剤は、ポリ−L−グルタメート(LGS)を含む、ポリアニオン、ポリカチオン、または脂質である。トランスフェクション促進剤は、ポリ−L−グルタメートであり、より好ましくは、ポリ−L−グルタメートは、6mg/mL未満の濃度でワクチン中に存在する。トランスフェクション促進剤はまた、界面活性剤、例えば、免疫刺激複合体(ISCOMS)、フロイント不完全アジュバント、モノホスホリルリピドAを含むLPS類似体、ムラミルペプチド、キノン類似体、スクアレンおよびスクアレン等の小胞体を含み得、ヒアルロン酸もまた、遺伝子構築物との併用で投与することができる。いくつかの実施形態において、DNAベクターワクチンにはまた、脂質、レシチンリポソームもしくは当該技術分野で既知の他のリポソームを含む、DNAリポソーム混合物(例えばWO9324640号を参照されたい)としてのリポソーム、カルシウムイオン、ウイルス性タンパク質、ポリアニオン、ポリカチオン、またはナノ粒子、あるいは他の既知のトランスフェクション促進剤が挙げられる。好ましくは、トランスフェクション促進剤は、ポリアニオン、ポリ−L−グルタメート(LGS)を含むポリカチオン、または脂質である。ワクチン中のトランスフェクション剤の濃度は、4mg/mL未満、2mg/mL未満、1mg/mL未満、0.750mg/mL未満、0.500mg/mL未満、0.250mg/mL未満、0.100mg/mL未満、0.050mg/mL未満、または0.010mg/mL未満である。
アジュバント
薬学的に許容される賦形剤は、アジュバントであり得る。アジュバントは、別のプラスミドに発現されるか、またはワクチンにおいて上述のプラスミドと組み合わせたタンパク質として送達される、他の遺伝子であってもよい。アジュバントは、シグナル配列が欠失したIL−15を含み、任意でIgE由来のシグナルペプチドを含む、α−インターフェロン(IFN−α)、β−インターフェロン(IFN−β)、γ−インターフェロン、血小板由来成長因子(PDGF)、TNFα、ΤΝFβ、GM−CSF、上皮成長因子(EGF)、皮膚T細胞誘引ケモカイン(CTACK)、上皮胸腺発現ケモカイン(TECK)、粘膜関連上皮ケモカイン(MEC)、IL−12、IL−15、MHC、CD80、CD86からなる群から選択することができる。アジュバントは、IL−12、IL−15、IL−28、CTACK、TECK、血小板由来成長因子(PDGF)、TNFα、ΤΝFβ、GM−CSF、上皮成長因子(EGF)、IL−1、IL−2、IL−4、IL−5、IL−6、IL−10、IL−12、IL−18、またはこれらの組み合わせであり得る。好ましくは、アジュバントは、IL−12、IL15、IL、28、およびRANTESである。
有用なアジュバントであり得る他の遺伝子には、MCP−1、MIP−1a、MIP−1p、IL−8、RANTES、L−セレクチン、P−セレクチン、E−セレクチン、CD34、GlyCAM−1、MadCAM−1、LFA−1、VLA−1、Mac−1、pl50.95、PECAM、ICAM−1、ICAM−2、ICAM−3、CD2、LFA−3、M−CSF、G−CSF、IL−4、IL−18の突然変異体形態、CD40、CD40L、血管成長因子、線維芽細胞成長因子、IL−7、神経成長因子、血管内皮成長因子、Fas、TNF受容体、Flt、Apo−1、p55、WSL−1、DR3、TRAMP、Apo−3、AIR、LARD、NGRF、DR4、DR5、KILLER、TRAIL−R2、TRICK2、DR6、カスパーゼICE、Fos、c−jun、Sp−1、Ap−1、Ap−2、p38、p65Rel、MyD88、IRAK、TRAF6、IkB、不活性NIK、SAP K、SAP−1、JNK、インターフェロン応答遺伝子、NFkB、Bax、TRAIL、TRAILrec、TRAILrecDRC5、TRAIL−R3、TRAIL−R4、RANK、RANKリガンド、Ox40、Ox40リガンド、NKG2D、MICA、MICB、NKG2A、NKG2B、NKG2C、NKG2E、NKG2F、TAP1、TAP2、およびそれらの機能性フラグメントが挙げられる。
送達方法
エピトープを含み、それらをAVウイルス感染に対する免疫応答を誘導することができる特に効果的な免疫原にする、AV GPCタンパク質の遺伝子構築物およびタンパク質を提供するための薬学的組成物、好ましくはワクチンを提供するための方法を提供する。治療的および/または予防的免疫応答を誘導する、ワクチンを送達する方法またはワクチン接種の方法を提供することができる。ワクチン接種プロセスにより、複数のAVウイルスに対する免疫応答を、哺乳動物において生成することができる。ワクチンを個体に送達して、哺乳動物の免疫系の活性を調節し、免疫応答を強化することができる。ワクチンの送達は、細胞内に発現され、細胞表面に送達されると、免疫系によって認識されて、細胞性、体液性、または細胞性かつ体液性の応答を誘導する、核酸分子として、AV GPC抗原をトランスフェクションすることであり得る。ワクチン送達を用いて、本明細書に記載されるワクチンを哺乳動物に投与することによって、複数のAVウイルスに対する免疫応答を、哺乳動物において誘導または誘発することができる。哺乳動物へワクチンが送達され、哺乳動物の細胞内にベクターが送達されると、トランスフェクトされた細胞が、AV GPCタンパク質を発現および分泌することになる。これらの分泌されたタンパク質、または合成抗原は、免疫系によって異物として認識されることになり、それによって、免疫応答を開始することになり、これには、この抗原に対して作製される抗体およびこの抗原に特異的なT細胞応答が含まれ得る。いくつかの実施例において、本明細書に記載のワクチンをワクチン接種された哺乳動物は、準備刺激された免疫系を有することになり、AVウイルス株でチャレンジされると、準備刺激された免疫系は、体液性、細胞性、またはその両方を通じてかに関係なく、それ以降のAVウイルスの急速な排除を可能にするであろう。ワクチンを個体に送達して、個体の免疫系の活性を調節し、それによって、免疫応答を強化することができる。
ワクチンは、DNAワクチンの形態で送達することができ、DNAワクチンの送達方法は、米国特許第4,945,050号および同第5,036,006号に記載され、これらはいずれも参照により完全に組み込まれる。
ワクチンを哺乳動物に投与して、免疫応答を哺乳動物において誘発することができる。哺乳動物は、ヒト、非ヒト霊長類、ウシ、ブタ、ヒツジ、ヤギ、アンテロープ、バイソン、水牛、ウシ科動物、シカ、ハリネズミ、ゾウ、ラマ、アルパカ、マウス、ラット、またはニワトリであり得、好ましくは、ヒト、ウシ、ブタ、またはニワトリであり得る。
投与経路
ワクチンは、経口、非経口、舌下、経皮、直腸、経粘膜、局所、吸入経由、口腔投与経由、胸膜内、静脈内、動脈内、腹腔内、皮下、筋肉内、鼻腔内、髄腔内、および関節内、またはそれらの組み合わせを含む、異なる経路で投与することができる。獣医学的用途については、本組成物を、通常の獣医学診療にしたがって、好適に許容される剤形として、投与することができる。獣医師であれば、特定の動物に対して最も適切な投与の投薬レジメンおよび経路を用意に判定することができる。ワクチンは、従来型のシリンジ、無針注入デバイス、「微粒子遺伝子銃(microprojectile bombardment gone gun)」、または電気穿孔(「EP」)、「流体力学法」、もしくは超音波等の他の物理的方法によって、投与することができる。
ワクチンのベクターは、インビボ電気穿孔、リポソーム媒介性、ナノ粒子促進性、組み換えアデノウイルス、組み換えアデノウイルス関連ウイルス、および組み換えワクチン等の組み換えベクターありおよびなしでのDNA注入(DNAワクチン接種とも称される)を含む、複数の周知の技術によって、哺乳動物に送達することができる。AV GPC抗原は、DNA注入を介して、インビボ電気穿孔を伴って、送達されてもよい。
電気穿孔
ワクチンのプラスミドの電気穿孔を介したワクチンの投与は、細胞膜に可逆孔の形成をもたらすのに効果的なエネルギーパルスを哺乳動物の所望の組織に送達するように構成することが可能な電気穿孔デバイスを使用して、達成することができ、好ましくは、エネルギーパルスは、使用者によって入力された事前設定電流に類似の一定電流である。電気穿孔デバイスは、電気穿孔部品と、電極アセンブリまたはハンドルアセンブリと、を備え得る。電気穿孔構成要素は、制御器、電流波形発生器、インピーダンス試験器、波形記録装置、入力要素、状態報告要素、通信ポート、メモリー構成要素、電源、および電源スイッチを含む、電気穿孔デバイスの種々の要素のうちの1つ以上を含み、それを組み込むことができる。電気穿孔を、インビボ電気穿孔デバイス、例えば、CELLECTRA(登録商標)EPシステム(Inovio Pharmaceuticals,Inc.,Blue Bell,PA)またはElgen電気穿孔器(Inovio Pharmaceuticals,Inc.)を使用して達成し、プラスミドによる細胞のトランスフェクションを促進することができる。本発明のDNAワクチンの送達を促進することができる電気穿孔デバイスおよび電気穿孔法には、Draghia−Akliらによる米国特許第7,245,963号、Smithらによって出願された米国特許公開第2005/0052630号に記載のものが含まれ、これらの内容は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。DNAワクチンの送達を促進するために使用可能な他の電気穿孔デバイスおよび電気穿孔法には、2007年10月17日に出願され、米国特許法の下に、2006年10月17日に出願された米国仮出願第60/852,149号、および2007年10月10日に出願された同第60/978,982号の利益を主張する、同時継続中および共有される米国特許出願第11/874072号に提供されるものが挙げられ、これらの全ては、それらの全体が本明細書に組み込まれる。Draghia−Akliらによる米国特許第7,245,963号は、体内または植物内の選択された組織の細胞への生体分子の導入を促進するためのモジュール電極システムおよびそれの使用について記載している。モジュール電極システムは、複数の針電極、皮下注入針、プログラム可能な一定電極パルス制御器から複数の針電極に導電性接続を提供する電気コネクタ、および電源を備え得る。操作者は、支持構造体に載置された複数の針電極を把持し、それらを体内または植物内の選択された組織へしっかりと挿入することができる。生体分子を、次いで、皮下注入針を介して選択組織内に送達する。プログラム可能な一定電流制御器が作動し、一定電流電気パルスを複数の針電極に印加する。印加された一定電流電気パルスは、複数の電極間において生体分子の細胞内への導入を促進する。米国特許第7,245,963号の全文は、参照により本明細書に組み込まれる。
Smithらによって出願された米国特許公開第2005/0052630号は、体内または植物内の選択された組織の細胞内への生体分子の導入を効果的に促進するために使用可能な電気穿孔デバイスについて記載している。この電気穿孔デバイスは、その操作がソフトウェアまたはファームウェアによって指定される、動電デバイス(「EKDデバイス」)を含む。EKDデバイスは、ユーザ制御およびパルスパラメーターの入力に基づいて、アレイの電極間に、一連のプログラム可能な一定電流パルスパターンを生成し、電流波形データの保存および取得を可能にする。電気穿孔デバイスはまた、一連の針電極、注入針用の中央注入チャネル、および取り外し可能なガイドディスクを有する、交換可能な電極ディスクを備える。米国特許公開第2005/0052630号の全文は、参照により本明細書に組み込まれる。
米国特許第7,245,963号および米国特許公開第2005/0052630号に記載される電極アレイおよび方法は、筋肉等の組織だけでなく、他の組織または器官への深く浸透するように適合させることができる。電極アレイの構造のため、注入針(選択した生体分子を送達するための)はまた、標的期間に完全に挿入され、注入は、電極によって事前に線引きされた領域において、標的組織に垂直に投与される。米国特許第7,245,963号および米国特許公開第2005/005263号に記載される電極は、好ましくは、長さ20mmで21ゲージである。
さらに、電気穿孔デバイスおよびその使用を組み込むいくつかの実施形態に企図される、次の特許に記載されるものである電気穿孔デバイスが存在する:1993年12月28日に発行された米国特許第5,273,525号、2000年8月29日に発行された米国特許第6,110,161号、2001年7月17日に発行された同第6,261,281号、および2005年10月25日に発行された同第6,958,060号、ならびに2005年9月6日に発行された米国特許第6,939,862号。さらに、あらゆる種類のデバイスを使用してDNAの送達を考察する、2004年2月24日に発行された米国特許第6,697,669号に提供される主題を取り扱う特許、およびDNAの注入方法に注目した、2008年2月5日に発行された米国特許第7,328,064号が、本明細書に企図される。上述の特許は、参照によりそれらの全体が組み込まれる。
ワクチンを調製する方法
本明細書に記載のDNAワクチンを含むDNAプラスミドを調製するための方法が本明細書に提供される。哺乳動物の発現プラスミドへの最終サブクローニング後、DNAプラスミドは、当該技術分野で既知の方法を使用して、細胞培養物を大規模な発酵タンクに植え付けるために使用することができる。
本発明のEPデバイスとともに使用するためのDNAプラスミドは、既知のデバイスおよび技術との組み合わせを使用して製剤化または製造することができるが、好ましくは、それらは、2007年5月23日に出願された米国公開出願第20090004716号に記載される最適化されたプラスミド製造技術を使用して、製造される。いくつかの実施形態において、これらの研究で使用されるDNAプラスミドは、10mg/mL以上の濃度で製剤化することができる。製造技術はまた、米国特許出願第60/939792号に加えて、認可された特許である2007年7月3日に発行された米国特許第7,238,522号に記載のものを含む、当業者に一般的に既知の種々のデバイスまたは手順を含むか、またはそれらを組み込む。上で参照された出願および特許である米国特許出願第60/939,792号および米国特許第7,238,522号は、それぞれ、それらの全体が本明細書に組み込まれる。
本発明を、以下の実施例でさらに説明する。これらの実施例は、本発明の好ましい実施形態を含むが、例示目的のみで提供されることを理解されたい。上述の説明およびこれらの実施例から、当業者であれば、本発明の本質的な特徴を確認することができ、その精神および範囲を逸脱しない範囲で、種々の用途および状況に適合するように、本発明に種々の変更および修正を行うことができる。したがって、本明細書に示され、説明されるものに加えて、本発明の種々の修正は、前述の説明から当業者には明らかであろう。
動物研究−モルモット。Strain13モルモット(Cavia porcellus)を、6匹ずつの4群(予備研究)、または各々8匹もしくは5匹ずつの7群(後続研究)に分割した。動物を麻酔し、次いで、12μg(遺伝子銃もしくはGG)または100μg(筋肉内電気穿孔デバイス(IM EP)、最小限に侵襲的な皮内デバイス(MID)、もしくは非侵襲的デバイス(NINV)を介して)のDNAの本物のワクチン接種(LASV−GPC、配列番号1(最適化)もしくは配列番号3(非最適化))、または疑似ワクチン接種(空プラスミド)を、3週間間隔で施した。最終ワクチン接種の4週間後に、ウイルス感染を、バイオセーフティーレベル(BSL)4の条件下で行った。各動物に、1000pfuのLASVの単回皮下投与を施した。動物を、疾患の進行について毎日観察した。血液試料を、感染の7日前、または0、7、14、21、および29もしくは32日後に採取した。動物は、瀕死の時点で安楽死させた。血清試料を、ウイルス血症および血液化学値について分析した。各動物の解剖を行い、組織を、LASVに特異的な病理組織学的および免疫組織学的分析について、分析した。
動物研究−非ヒト霊長類。カニクイザルマカク(カニクイザル)を、4匹ずつ2つの群に分割した。動物を麻酔し、次いで、1mgのDNA(配列番号)の本物または疑似ワクチン接種を3週間間隔で施した。最終ワクチン接種の4週間後に、ウイルス感染を、BSL4の条件下で行った。各動物に、1000pfuのLASVの単回筋肉内投与を施した。動物を、疾患の進行について毎日観察した。血液試料を、感染の0、3、6、10、14、21、28、および45日後に採取した。動物は、瀕死の時点で安楽死させた。血清試料を、CBC、血液化学、および血清ウイルス血症について分析した。
ウイルス血症の分析。6ウェルの細胞培養プレートに播種したベロ細胞を、血清の10倍連続希釈物で1時間、37℃、5%CO2で穏やかに回転させながら吸収させ、次いで、10%ウシ胎児血清を有するEBME中0.8%アガロースを、各ウェルに適用した。細胞を、次いで、37℃、5%CO2において、4日間インキュベートし、続いて、ニュートラルレッド(Invitrogen,Carlsbad,CA)で染色した。プラークを計数し、記録した。
血液化学的分析。霊長類の血清試料を、GLU、CRE、UA、CA、ALB、TP、ALT、AST、(ALP)、TBIL、GGT、およびAMYについて、AbaxisのPiccolo血液化学分析器)で一般化学13パネルのローターを介して分析した。モルモット試料を、AbaxisのVetScan血液化学分析器を介して、総合代謝パネルにおいて上述のものについて分析した。
全血球算定。霊長類研究については、おおよそ25ul量の全EDTA血を、Hemavet Instrument(Drew Scientific)で分析した。
組織の病理学的分析。組織を、パラフィンに埋め込み、断片化し、ヘマトキシリンおよびエオシンで染色した。免疫組織化学を、LASVに特異的なモノクローナル抗体および市販のキット(Envision System:DAKO,Carpinteria,CA)を使用して行った。組織に脱パラフィン処理を行い、ブロッキングし、次いで、一次抗体および二次抗体とともにインキュベートし、続いて、ヘマトキシリンで対比染色した。
組織の病理学的分析。組織を、パラフィンに埋め込み、断片化し、ヘマトキシリンおよびエオシンで染色した。免疫組織化学を、LASVに特異的なモノクローナル抗体および市販のキット(Envision System:DAKO,Carpinteria,CA)を使用して行った。組織に脱パラフィン処理を行い、ブロッキングし、次いで、一次抗体および二次抗体とともにインキュベートし、続いて、ヘマトキシリンで対比染色した。
LASV DNAの生成
LASV DNAワクチンを、前述のように(Schmaljohn et al.,J.Vir.71,9563−9569(1997))、LASV(Josiah株)の糖タンパク質前駆体(GPC)遺伝子をコードするcDNAをプラスミドベクターpWRG7077にクローニングすることによって生成した。LASV−GPC遺伝子を、NotI/BgIII制限部位にクローニングした。発現は、CMVプロモーターの制御下で行われた。
ワクチンの防御有効性を、非ヒト霊長類(NHP)およびヒトに観察されたものに類似の出血性疾患を発症するモルモットへの筋肉内(IM)EP送達、およびモルモットでのチャレンジによって、試験した。モルモット(1群あたり6匹)に、3〜5週間間隔で、50μgのDNAワクチン(配列番号3を含む)を筋肉内(IM)EPによって、または約5μgを遺伝子銃(GG)によって、受容させた。ワクチン接種の約4週間後、モルモットに、標準的な致死チャレンジ用量である1000プラーク形成単位(pfu)のLASVの腹腔内(IP)投与によるチャレンジを行った。対照モルモットの全てがLASV感染により死亡したが、ワクチン接種した動物の83%が生存し、死亡した1匹の動物は、死亡するまでの時間の遅延を示した。LASVに対する中和抗体が、チャレンジ後、ワクチン接種したものにおいて検出されたが、対照モルモットには検出されず、初回刺激応答が、DNAワクチンによって誘発されたことを示す(データは示されない)。
このモルモット研究は、LASV DNAワクチンによるIM EPが、防御免疫性を誘発することができたことを示したとはいえ、チャレンジを行った動物は、発熱し、軽度臨床的な疾患の兆候を示し(図1A、1C)、したがって、ワクチン構築および皮内送達の方法のさらなる改善を模索した。この目標に向かって、LASV GPC DNAワクチンを、哺乳動物コドンの利用可能性を最大化し、発現を妨げることが示されたウイルス要素を除去するように、最適化した。この最適化されたワクチン(配列番号1を含む)を、修正されたパラメーターを用いて筋肉内電気穿孔デバイス(IM EP)、最小限に侵襲的な皮内デバイス(MID)、または非侵襲的デバイス(NINV)を使用して、3〜4週間間隔で3回50μgのDNAをワクチン接種させたStrain13モルモット(1群あたり8匹)において試験した。電極間隔を有する(MID)は、形状が三角形であり、1つの側面に3mm離れた電極、他の2つの側面に5mm離れた電極を有する。NINVは、皮膚を貫通する(または、代替的には、角質層内まで皮膚に入る)ことなく皮膚表面と接触する、4×4パターンの電極アレイを有する。
チャレンジ後、空プラスミドをワクチン接種した全てのモルモット、またはワクチンを受容しなかったものは、発熱し、疾病の兆候を見せ、体重が減少し、チャレンジの15〜18日後に感染により死亡した(図1)。対照的に、EP方法のいずれかによって、コドン最適化したLASV DNAワクチンでワクチン接種した全てのモルモットは、チャレンジを生存した。非最適化LASV DNAワクチンでワクチン接種したモルモットが疾病の兆候を示した予備研究とは異なり、この研究では、MIDおよびIM EPの両方の群におけるモルモットは、疾患の兆候を全く示さず、無熱状態に留まり、一定の体重を維持した。しかしながら、IM EPによってLASV DNAワクチンを受容したいくつかのモルモットにおいて、微熱およびわずかなウイルス血症を含む軽度の疾患の兆候が観察され、皮膚電気穿孔が、この研究ではより有効であったことを示唆する。
図2は、IMまたはMID皮膚EPデバイスを使用して、コドン最適化されたLASV DNAまたは空プラスミド対照をワクチン接種したモルモット(1群あたり8匹)の生存率曲線を示す。モルモットに、最終ワクチン接種の4週間後に1000pfuのLASVでチャレンジを行った。
ワクチンおよび送達方法の有効性および耐久性を確認するために、MID EPでワクチン接種したモルモットのサブセットを、バックチャレンジ実験に選択した。これらのモルモットを、120日間BSL−4封じ込め(containment)状態に保持し、次いで、同一の体重の4匹のナイーブモルモットとともに、1000pfuのLASVでチャレンジを行った。モルモットを、ウイルス感染後30日間毎日観察し、体重、体温、および疾患の進行について監視した。ワクチン接種した動物は、研究中に発病せず、再感染を生存した(図3)。
図3は、MID EPでワクチン接種したモルモットのサブセットのバックチャレンジの結果を示し、図3Aは、群における体重の変化を示し、図3Bは、群の平均体温の変化を示す。
NHPにおいてMID EPによって送達されたコドン最適化されたLASV DNAワクチン(配列番号2を含む)を、さらに評価した。NHPモデルは、これらの動物に観察された疾患が、ヒト疾患を最も厳密に模倣するため、ワクチン有効性の評価の最も有益なモデルである。
4匹のNHP群に、MID EPデバイスを使用して、3週間間隔で3回、1mgのLASV DNAワクチン(配列番号2を含む)または1mgの空ベクタープラスミドをワクチン接種し、最終ワクチン接種の4週間後に、1000pfuのLASVのIM注入によってチャレンジを行った。NHPから収集した血液試料を、CBCおよび血液化学について監視し、動物を、疾患の進行について1日2回観察した。4匹の対照NHPのうちの2匹が、出血ウインドウ(感染後13日目〜17日目)中に死亡した。他の2匹の対照NHPは、研究の最終日(チャレンジ45日後)に生成されたそれらの聴力図をLASV DNAワクチン接種したNHPのものと比較して示されるように、運動失調および難聴を含む神経学的症状を発症した(図4)。難聴(片側または両側のいずれか)は、LASV感染の十分に認識された結果であり、LASV患者のおおよそ30%に発生するが、知る限りでは、これは、NHPにおけるこの疾患の結果の証拠となる初の文書であり、疾患マーカーとして機能し得る。
図4に示されるように、NHP番号2およびNHP番号7の聴力図は、それぞれ、空プラスミドまたはLASV DNAワクチンでワクチン接種が行われたものである。0デシベルの刺激では、いずれのサルからの聴力図も、応答を示さない。NHP番号2の左耳および右耳の聴力図は、75デシベルで応答を示さず、聴力応答パターンを示すNHP番号7の聴力図とは対照的である。
対照NHPのうちの2匹が感染を生存したとはいえ、それらは、研究の間(感染後45日)、瀕死状態のままであった。対照的に、LASV DNAワクチン接種した4匹のNHPは、研究の間、健康であり、発熱がなく、正常なCBCおよび血液化学を維持した(図5)。
図5は、MID EPによってLASV DNAワクチンまたは空プラスミドでワクチン接種し、LASVでチャレンジしたNHPの生存率、ウイルス血症、および罹患率スコアを示す。図5Aは、LASV DNAをワクチン接種した全てのNHPは、LASVチャレンジを生存したが、空プラスミドでワクチン接種した4匹の対照NHPのうちの2匹は、感染により死亡したことを示す。図5Bは、空プラスミドでワクチン接種した4匹全てのNHPが発熱したが、2匹の生存したNHPは、チャレンジ28日後までにウイルスを排除することができたことを示す。LASV DNAでワクチン接種したNHPは、全ての時点において、無熱であった。C.罹患率スコアは、研究中にNHPが病気になった程度の尺度である。対照動物は、死亡する前、瀕死状態になった。死亡しなかった2匹のNHPは、研究終了時まで慢性的に疾病状態のままであり、チャレンジ前の状態に戻ることはなかった。LASV DNAでワクチン接種したNHPは、疾病状態になることはなかった。
図6は、LASV−GPC(配列番号2を含む)または疑似DNAワクチンを受容したカニクイザルに対する、選択された血液化学値を示す。
図7は、いずれもLASV−GPC(配列番号2を含む)および疑似DNAワクチンでワクチン接種したワクチン接種カニクイザル(NHP)のCBCおよび血液化学を示す。提示される結果は、NHPにおいて正常なCBCおよび血液化学を示す。
実験および方法
LASV DNAワクチンの用量範囲研究を実行する(1〜8か月):
Strain13モルモットにおいて、3つの用量のLASV DNAワクチンを評価する。先行研究において、MID EPによって3週間間隔で与えられた50μgのLASV DNAワクチンの3回のワクチン接種により、Strain13モルモットに、完全な防御免疫性を提供した。MID EPによって与えられた50μg、5μg、および1μgの用量の短期レジメン(3週間おきに2回のワクチン接種を与えた)におけるワクチンの防御有効性(表1)を比較する。
JUNVおよびMACVのDNAワクチンの交差防御の判定、ならびに多剤ワクチン製剤による干渉の測定
多剤ワクチンのプラットフォームとしてのDNAワクチンの皮膚電気穿孔システムの総合的な適合性を試験する。コドン最適化したJUNVおよびMACVに対するDNAワクチン(約96%のアミノ酸相同性を共有する)を生成し、交差チャレンジ研究(表2)を実行する。JUNVおよびMACVワクチンが交差防御性であることを判定する際、旧世界および新世界の両方のアレナウイルスからの防御を目的とする未来研究は、2つのワクチンのうちの1つのみをLASVワクチンと組み合わせて使用することができる。この研究のモルモットの群に、候補DNAワクチンの3つ全てをワクチン接種し、LASVでチャレンジを行う。
NHPチャレンジモデルにおける免疫相関性、用量減少、およびサイトカインアジュバントの測定
研究を行って、LASV DNAワクチン(配列番号2を含む)をEPによりワクチン接種した非ヒト霊長類(NHP)のサイトカインアジュバントありまたはなしでの免疫応答を測定する(以下の表3の一覧を参照されたい)。ワクチン接種後、NHPに、RSL−4封じ込め実験室において、チャレンジを行う。
IL−28およびIL−12の2つのサイトカインDNAプラスミドを、LASV DNAワクチンと組み合わせて試験する。
3週間間隔で1mgのLASV DNAワクチン(配列番号2を含む)を3回ワクチン接種したNHPは、以前の研究において、LASVでのチャレンジからの防御を示したことが示された。1mg用量のワクチンを4週間間隔で3回与えたものと同用量を8週間間隔で2回与えたものとを比較する研究を行う。さらに、強度が半分のワクチン用量(0.5mg)を、単独でか、またはIL−12もしくはIL−28サイトカインの遺伝子を発現するプラスミドと組み合わせて投与したものを比較する。これらのサイトカインは、ワクチンを補助することを意図し、改善された細胞媒介性免疫応答を提供する。
LASVワクチンおよびサイトカインアジュバントによって誘導された細胞性免疫表現型を、次の分析によって評価する:抗原特異性IFNg ELISPOT、細胞内サイトカイン染色(多官能性T細胞プロファイルのアッセイを含む)、CFSE希釈を介した増殖、ならびにHersperger et al 2010a、Hersperger et al 2010b、Morrow et al 2010b、およびMigueles et al 2008に記載されるTbet、パーフォリン、グランザイムB、およびCD107aの発現を含む、細胞溶解性CD8+T細胞のマーカーに対する染色。これらの免疫測定法の組み合わせにより、CTL(細胞毒性リンパ球)の表現型および活性を特に重視した、LASV DNAワクチンに対するCD8+T細胞応答の具体的な調査が可能となり、これは、CD8+T細胞のこの機能が、ウイルス感染した細胞の排除と直接的な相関にあり、免疫系がウイルス感染を制御および排除する主要機構を構築するためである。IL−12およびIL−28を採用した以前の研究は、これらのアジュバントのいずれも、パーフォリン放出、グランザイムB負荷および放出、ならびにCD107aの発現に著しい増加を示しているワクチン特異性CTLの誘導を促進することができることを示唆した。この研究は、アジュバントに加えてHIV抗原を使用して、NHPモデルにおいて実行し、これらの増加した応答は、PBMC、ならびに腸間膜リンパ節から採取したT細胞の両方に見られ、これらのアジュバントが、末梢血、ならびに二次リンパ器官に影響を及ぼすことを示唆した。さらに、IL−12およびIL−28のいずれも、最終免疫付与の3か月後に行った分析が、増大した抗原特異性免疫応答の継続した存在を示したため、長期的にCTL表現型および機能に影響を及ぼすことが可能であった。
LASV DNAワクチンの効力アッセイの開発
INDの申請を可能にするためには、強固かつ信頼性の高い効力アッセイが必要である。定量的フローサイトメトリーアッセイの効力アッセイを、AVワクチン、例えばLASV DNAワクチンに使用する。類似のアッセイが、既に開発されており、ハンタウイルス感染によってもたらされる腎症候群を伴う出血熱のDNAワクチンの第1相臨床試験の裏付けとして(Badger et al.2011)、およびベネズエラウマ脳炎ウイルスのDNAワクチンのIND申請を支持して、USAMRIIDにおいて3年間を上回って使用されている。一般的に、この方法は、細胞に試験DNAをトランスフェクトすること、および測定された抗原発現を、既知の量の参照物質DNAからの発現により生成されたものと比較することを伴う。
このアッセイは、高速(1日未満)で再現性が高く、既に医薬品安全性試験実施基準(GLP)のガイドライン下で実行するために適合されている。結果として、規定文書および手順は、既に定着している。これは、LASV DNAワクチンの効力を測定するためのアッセイの適合を、大いに促進するはずである。このアッセイ単独でもDNAワクチンの効力および安定性の測定には十分であるが、LASV感染に対する防御免疫性の相関性がほとんどないため、1年目の各安定性時点でモルモットの少数群にもワクチン接種し、遺伝子発現を抗原性と相関する情報を提供する。
モルモットチャレンジモデルは、AVワクチンの有効性を評価するAVの一般的に認められたモデルである。動物に、MIDデバイスを使用して、50ugのGPC DNA LASVワクチンを、3〜4週間間隔で3回ワクチン接種した。最終ワクチン接種の3週間後、動物に、1000pfuのLASVのi.m.注入によってチャレンジを行った。図2に示されるように、ワクチン接種した90%を上回る動物は、チャレンジを生存し、対照(疑似ワクチン接種した)動物の100%が、チャレンジ後15日目までに死亡した。図5は、NHP研究からのチャレンジのデータを示す。4匹ずつのNHP群に、1mgのGPC DNA LASVワクチンまたは1mgの空ベクターを、4週間間隔で3回ワクチン接種し、最終ワクチン接種の4週間後に、1000pfuのLASVのi.m.注入によりチャレンジを行った。4匹中4匹のワクチン接種したNHPが生存し、ウイルス血症の兆候を全く示さなかったが、4匹中4匹の対照動物はウイルス血症を発症し、4匹中2匹は、チャレンジにより死亡した。

Claims (8)

  1. アレナウイルスに対する防御免疫応答を、それを必要とする対象において生成することができる1つ以上の免疫原性タンパク質をコードするヌクレオチドコード配列を含むDNAワクチンであって、
    前記対象のためにコドン最適化された、アレナウイルスの糖タンパク質前駆体コードするコード配列を含み、該コード配列が配列番号1又は2に示されるヌクレオチド配列である、DNAワクチン。
  2. 前記コード配列が、LASVの糖タンパク質前駆体ドメイン(LASV−GPC)から本質的になる、請求項1に記載のDNAワクチン。
  3. 前記DNAワクチンが、前記コード配列のうちの1つから本質的になる、請求項1または2に記載のDNAワクチン。
  4. 前記DNAワクチンが、前記コード配列のうちの少なくとも2つから本質的になる、請求項1または2に記載のDNAワクチン。
  5. IL−12、IL−15、1L−28、またはRANTESからなる群から選択されるアジュバントをさらに含む、請求項1〜のいずれか1項に記載のDNAワクチン。
  6. アレナウイルスに対する防御免疫応答を誘導するための薬学的組成物であって、前記薬学的組成物は、請求項1〜のいずれか1項に記載のDNAワクチンを含み、および前記対象において電気穿孔に適していている、上記薬学的組成物。
  7. 前記電気穿孔は、電気穿孔エネルギーパルスを送達することにより行われる、請求項に記載の薬学的組成物。
  8. 前記薬学的組成物は、前記対象の皮内層への投与に適している、請求項に記載の薬学的組成物
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