JP6074049B2 - c−MAFを用いた前立腺がん転移の診断、予後診断および処置のための方法 - Google Patents
c−MAFを用いた前立腺がん転移の診断、予後診断および処置のための方法 Download PDFInfo
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Description
本願とともに出願され、電子的に提出される配列表(「3190_0030001_SEQIDListing_ascii.txt」、48,245バイト、2013年10月7日に作成)の内容は、その全体が参照により本明細書中に援用される。
本願は、2012年10月12日に出願した米国仮特許出願第61/713,318号に対する米国特許法第119条(e)項の下での優先権を主張し、この出願は、その全体が本明細書に参考として援用される。
発明の分野
本発明は、16q22−24ゲノム領域内のc−MAF遺伝子が原発腫瘍サンプルにおいて増幅されたかどうかの決定に基づく、前立腺がんの転移の診断または予後診断に関する。同様に、本発明は、前立腺がんにおける転移の診断または予後診断のための方法に関し、ならびに前立腺がんを有する被験体において個別化治療(customized therapy)をデザインするための方法にも関し、その方法は、c−MAF遺伝子の発現レベルまたは16q22−24増幅を決定する工程を含む。最後に、本発明は、前立腺がんの転移の処置のための治療標的としてのc−MAFインヒビターの使用に関する。
課題:
様々な重要な器官において腫瘍細胞と周囲の正常組織との間の込み入った相互作用によって引き起こされる複雑なプロセスである転移は、固形腫瘍を有する患者における、すべてのがんによる死亡の90パーセントを占める。原発性腫瘍に転移を形成させる分子機序および細胞機序は、この生命を脅かす大きな問題に対してよりよく対処するために理解されなければならない。転移遺伝子および機序の同定は、この致命的な状態の基本的な生物学および臨床的な実践に対するその関係の理解にとって不可欠である。
前立腺がんは、前立腺(男性の生殖系にある腺)において発生するがんの1形態である。大部分の前立腺がんは、ゆっくりと増殖する;しかし、アグレッシブ前立腺がんの症例がある。上記がん細胞は、前立腺から身体の他の部分、特に、骨およびリンパ節へと転移し得る(拡がり得る)。前立腺がんは、疼痛、排尿困難、性行為中の問題、または勃起不全を引き起こし得る。他の症状は、潜在的には、上記疾患のより後期のステージの間に発生し得る。
RUNX2は、がん細胞にアポトーシスを受けさせず、それによって、前立腺がんの発生に寄与する転写因子である。
前立腺がんの診断を十分に確認し得る唯一の検査は、生検(鏡検のために前立腺の小片を取り出すこと)である。しかし、生検前に、侵襲性のより低い検査が行われ得る。
超音波(US)および磁気共鳴画像診断法(MRI)は、前立腺がん検出のために使用される2つの主要な画像化法である。
傍神経侵襲を伴う前立腺がん(従来の腺癌)を示す顕微鏡写真。H&E染色。
次いで、組織サンプルは、顕微鏡下で検査されて、がん細胞が存在するか否かを決定し、任意の見出されるがんの顕微的特徴(もしくはグリソンスコア)を評価する。前立腺特異的膜抗原は、膜貫通型カルボキシペプチダーゼであり、葉酸ヒドロラーゼ活性を示す。このタンパク質は、前立腺がん組織において過剰発現され、より高いグリソンスコアと関連する。
組織サンプルは、転移した悪性細胞の起源を決定するために、PSAおよび他の腫瘍マーカーの存在について染色され得る。
前立腺がんを評価することの重要な部分は、ステージの決定、またはどの程度遠くまで該がんが拡がっているかである。ステージを知ることは、予後診断を明確にするのに役立ち、治療を選択する場合に有用である。最も一般的なシステムは、4段階TNMシステム(腫瘍/リンパ節/転移(Tumor/Nodes/Metastases)の略)である。その構成要素は、腫瘍のサイズ、関与しているリンパ節の数、および任意の他の転移の存在を含む。
前立腺がんスクリーニングは、思いもよらないがんを見出そうとする試みであり、より具体的な追跡検査(例えば、細胞サンプルがより厳密な調査のために採取される生検材料)をもたらし得る。選択肢としては、直腸指診(DRE)および前立腺特異的抗原(PSA)血液検査が挙げられる。このようなスクリーニングは、議論の余地があり、いくらかの患者においては、不要な、有害ですらある帰結をもたらし得る。2010年の分析から、DREもしくはPSAいずれかでの慣用的スクリーニングは、スクリーニングによる死亡率低下がないとして、証拠によって裏付けられないと結論づけられた。より近年になってからは、米国予防医学作業部会(USPSTF)は、健常男性における前立腺がんスクリーニングに関して、PSA検査に反対する勧告を出した。このUSPSTFの勧告(2011年10月発表)は、「前立腺特異的抗原ベースのスクリーニングによる前立腺がん特異的死亡率の低減は小さいかもしくは全くなく、そしてその後の評価および処置(そのうちのいくつかは不要であり得る)に関する害悪と関連する」と結論づけた「エビデンスの審査」調査に基づく。
がんが前立腺を越えて拡がってしまっている場合、処置選択肢は大きく変化するので、前立腺がんを処置する大部分の医師は、拡がる確率を、種々のノモグラムを使用して推定する。注意深い経過観察/積極的サーベイランス、外部ビーム照射療法、小線源療法、凍結手術、HIFU、および外科手術による処置は、一般に、がんが前立腺内に留まっている男性に提案される。ホルモン療法および化学療法はしばしば、前立腺を越えて拡がってしまった疾患のためにとっておかれる。しかし、例外はある:放射線療法は、一部の進行した腫瘍に使用され得、ホルモン療法は、一部の初期ステージの腫瘍に使用される。凍結療法(腫瘍を凍結するプロセス)、ホルモン療法、および化学療法はまた、最初の処置が失敗し、がんが進行する場合に提案され得る。
本発明者らは、播種性前立腺がん細胞骨転移に影響を与えるシグナルのバランスの同定が、疾患の予後診断を確立するためのおよびこの疾患に対する予防的な治療的介入のための有益な情報を提供するということを決定した。c−MAF発現レベルおよびMAF遺伝子を含む16q22−24 真正のER+乳がん骨転移ゲノム増幅、骨転移、および特に、溶骨性骨転移への寄与に基づいて、本発明者らは、MAF遺伝子を含む16q22−24がまた、前立腺骨転移病変、特に、溶骨性の前立腺骨転移を引き起こす原因であることを同定した。
(i)上記被験体の腫瘍サンプル中のc−MAF遺伝子またはタンパク質の発現レベルまたはコピー数の増加を定量する工程および
(ii)以前に得られた発現レベルまたはコピー数をコントロールサンプル中の上記遺伝子の発現レベルまたはコピーと比較する工程を含み、
コントロールサンプルにおける上記遺伝子の発現レベルと比較して、上記遺伝子の発現レベルが上昇しているかまたはゲノム領域が増幅されている場合、上記被験体は、転移について陽性の診断を有するかまたは転移を起こす傾向がより高い方法に関する。
(i)上記被験体の腫瘍サンプル中のc−MAF遺伝子またはタンパク質の発現レベルを定量する工程および
(ii)以前に得られた発現レベルをコントロールサンプル中の上記遺伝子の発現レベルと比較する工程を含み、
コントロールサンプルにおける上記遺伝子の発現レベルと比較して、発現レベルが上昇している場合、上記被験体は、転移の予防および/または処置を目指す治療を受けるのに適格である方法に関する。この方法の特定の態様において、被験体は、その後、骨転移を予防する、阻害する、および/または処置する少なくとも1つの治療薬を投与され、上記参照値と比較して、発現レベルが上昇しない場合、上記被験体は、骨転移の予防、阻害、および/または処置を目指す治療を受けるのに適格ではない。本方法の特定の態様では、次いで、被験体は、骨転移を予防、阻害、および/または処置する少なくとも1つの治療薬が投与されない。
(i)上記被験体の骨転移性腫瘍サンプル中のc−MAF遺伝子またはタンパク質発現レベルを定量する工程および
(ii)工程(i)において得られた発現レベルをコントロールサンプル中の上記遺伝子の発現レベルと比較する工程を含み、
コントロールサンプルにおける上記遺伝子またはタンパク質の発現レベルと比較して、c−MAF遺伝子またはタンパク質の発現レベルが上昇している場合、上記被験体は、骨分解の予防を目指す治療を受けるのに適格である方法に関する。この方法の特定の態様において、被験体は、その後、骨転移を予防する、阻害する、および/または処置する少なくとも1つの治療薬を投与され、上記参照値と比較して、c−MAF遺伝子またはタンパク質の発現レベルが上昇しない場合、上記被験体は、骨分解の予防のための治療を受けるのには適格ではない。本方法の特定の態様では、次いで、被験体は、骨転移を予防、阻害、および/または処置する少なくとも1つの治療薬が投与されない。
a)上記被験体からのサンプルを提供する工程;
b)上記サンプル中のc−MAFの発現レベルを定量する工程;
c)定量されたc−MAFの発現レベルを、c−MAF発現の所定の参照レベルと比較することによって上記サンプルをタイプ分けする工程;
を含み、ここで、上記タイプ分けは、上記被験体における骨転移のリスクに関する予後情報を提供する。1つの実施形態において、被験体は、タイプ分けによって提供される予後情報に基づいて、少なくとも1つの治療剤を投与されるか、またはその治療剤が除外される。
特定の実施形態では、例えば以下が提供される:
(項目1)
前立腺がんを有する被験体における転移の診断のためのおよび/または前立腺がんを有する被験体において転移を起こす傾向の予後診断のためのインビトロでの方法であって、前記方法は、
(i)前記被験体の前立腺腫瘍サンプル中のc−MAF遺伝子の発現レベルを定量する工程および
(ii)(i)において得られた発現レベルをコントロールサンプル中の前記c−MAF遺伝子の発現レベルと比較する工程を含み、
ここで前記腫瘍サンプル中の前記c−MAF遺伝子の発現レベルが、前記コントロールサンプル中の前記c−MAF遺伝子の発現レベルと比較して上昇している場合、前記被験体は、転移について陽性の診断を有するかまたは転移を起こす傾向がより高い、方法。
(項目2)
前立腺がんを有する被験体のための個別化治療をデザインするためのインビトロでの方法であって、
(i)前記被験体の前立腺腫瘍サンプル中のc−MAF遺伝子の発現レベルを定量する工程および
(ii)(i)において得られた発現レベルをコントロールサンプル中の前記c−MAF遺伝子の発現レベルと比較する工程を含み、
ここで前記腫瘍サンプル中の前記c−MAF遺伝子の発現レベルが、前記コントロールサンプル中の前記c−MAF遺伝子の発現レベルと比較して上昇している場合、前記被験体は、前記がんの転移の予防、阻害および/または処置を意図する治療を受けるのに適格である、方法。
(項目3)
前記転移が、骨転移である、項目1または2に記載の方法。
(項目4)
前記骨転移が、溶骨性転移である、項目3に記載の方法。
(項目5)
骨転移を有する前立腺がんを有する被験体のための個別化治療をデザインするためのインビトロでの方法であって、
(i)前記被験体の骨転移性腫瘍組織サンプル中のc−MAF遺伝子の発現レベルを定量する工程および
(ii)工程(i)において得られた発現レベルをコントロールサンプル中の前記c−MAF遺伝子の発現レベルと比較する工程を含み、
ここで前記腫瘍組織サンプル中の前記c−MAF遺伝子の発現レベルが前記コントロールサンプル中の前記c−MAF遺伝子の発現レベルと比較して上昇している場合、前記被験体は、骨分解の予防または阻害を意図する治療を受けるのに適格である、方法。
(項目6)
前記骨分解を予防または阻害することが意図される薬剤が、ビスホスホネート、RANKLインヒビター、PTH、PTHLHインヒビター(中和抗体およびペプチドを包含する)、PRGアナログ、ラネル酸ストロンチウム、DKK−1インヒビター、METおよびVEGFR2の二重インヒビター、エストロゲンレセプター調節因子、カルシトニン、ラジウム−223、CCR5アンタゴニスト、Srcキナーゼインヒビター、COX−2インヒビター、mTorインヒビターおよびカテプシンKインヒビターからなる群より選択される、項目5に記載の方法。
(項目7)
前記RANKLインヒビターが、RANKL特異的抗体、RANKL特異的ナノボディおよびオステオプロテゲリンからなる群より選択される、項目6に記載の方法。
(項目8)
前記RANKL特異的抗体が、デノスマブである、項目7に記載の方法。
(項目9)
前記ビスホスホネートが、ゾレドロン酸である、項目6に記載の方法。
(項目10)
前記c−MAF遺伝子の発現レベルの定量が、前記遺伝子のメッセンジャーRNA(mRNA)または前記mRNAのフラグメント、前記遺伝子の相補DNA(cDNA)または前記cDNAのフラグメントを定量する工程を含む、項目1〜9のいずれかに記載の方法。
(項目11)
前記発現レベルが、定量的ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)、またはDNAもしくはRNAアレイ、またはヌクレオチドハイブリダイゼーション技術によって定量される、項目10に記載の方法。
(項目12)
前記c−MAF遺伝子の発現レベルの定量が、前記遺伝子によってコードされるタンパク質またはそのバリアントのレベルを定量する工程を含む、項目1〜10のいずれかに記載の方法。
(項目13)
前記タンパク質のレベルが、ウエスタンブロット、ELISA、免疫組織化学またはタンパク質アレイによって定量される、項目12に記載の方法。
(項目14)
前立腺がんを有する被験体における転移を診断するためのおよび/または前立腺がんを有する被験体において転移を起こす傾向の予後診断のためのインビトロでの方法であって、前記c−MAF遺伝子が、参照遺伝子コピー数と比較して前記被験体の腫瘍サンプルにおいて増幅しているかどうかを決定する工程を含み、ここで前記参照遺伝子コピー数と比較した前記c−MAF遺伝子の増幅は、転移の存在または転移を起こすリスクがより高いことを示す、方法。
(項目15)
前記c−MAF遺伝子の増幅が、遺伝子座16q22−q24の増幅を決定することによって決定される、項目14に記載の方法。
(項目16)
前記c−MAF遺伝子の増幅が、c−MAF遺伝子特異的プローブを使用することによって決定される、項目14または項目15に記載の方法。
(項目17)
前記参照遺伝子コピー数が、転移に罹患していない被験体由来の前立腺がんの腫瘍組織サンプルのものである、項目14〜16のいずれかに記載の方法。
(項目18)
前記増幅が、インサイチュハイブリダイゼーションまたはPCRによって決定される、項目14〜17のいずれかに記載の方法。
(項目19)
前記転移が、骨転移である、項目14〜18のいずれかに記載の方法。
(項目20)
前記骨転移が、溶骨性転移である、項目19に記載の方法。
(項目21)
前立腺がんから骨転移を処置および/または予防するための医薬製品の調製におけるc−MAF阻害剤の使用。
(項目22)
前記c−MAF阻害剤が、c−MAF特異的siRNA、c−MAF特異的アンチセンスオリゴヌクレオチド、c−MAF特異的リボザイム、c−MAF阻害性抗体もしくはナノボディ、ドミナント陰性c−MAFバリアント、表1もしくは表2からの化合物、c−MAF特異的小分子、c−MAF特異的抗体、c−MAF特異的抗体様分子、c−MAF特異的な構造的に拘束された(環状)ペプチド、c−MAF特異的ステープルドペプチドまたはc−MAF特異的アルファボディからなる群から選択される、項目21に記載の使用。
(項目23)
前立腺がんに罹患しており、転移性腫瘍サンプルにおいてコントロールサンプルと比較して上昇したc−MAFレベルを有する被験体における骨転移の処置のための医薬製品の調製における、骨分解を予防または阻害することができる薬剤の使用。
(項目24)
骨分解を回避または予防することができる薬剤が、ビスホスホネート、RANKLインヒビター、PTH、PTHLHインヒビター(中和抗体およびペプチドを包含する)、PRGアナログ、ラネル酸ストロンチウム、DKK−1インヒビター、METおよびVEGFR2の二重インヒビター、エストロゲンレセプター調節因子、EGFRインヒビター、カルシトニン、ラジウム−223、CCR5アンタゴニスト、Srcキナーゼインヒビター、COX−2インヒビター、mTorインヒビターおよびカテプシンKインヒビターからなる群から選択される、項目23に記載の使用。
(項目25)
前記RANKLインヒビターが、RANKL特異的抗体、RANKL特異的ナノボディおよびオステオプロテゲリンの群から選択される、項目25に記載の使用。
(項目26)
前記RANKL特異的抗体が、デノスマブである、項目26に記載の使用。
(項目27)
前記ビスホスホネートが、ゾレドロン酸である、項目24に記載の使用。
(項目28)
前記骨転移が、溶骨性転移である、項目24〜27のいずれかに記載の使用。
(項目29)
前立腺がんに罹患している被験体における前記がんの骨転移を予測するためのキットであって、前記キットは:a)前記被験体の腫瘍サンプル中のc−MAFの発現レベルを定量するための手段;およびb)前記サンプル中の定量されたc−MAFの発現レベルを参照c−MAF発現レベルと比較するための手段を備える、キット。
(項目30)
前立腺がんに罹患している被験体のサンプルをタイプ分けするためのインビトロでの方法であって、前記方法は:
a)前記被験体からサンプルを提供する工程;
b)前記サンプル中のc−MAFの発現レベルを定量する工程;
c)定量されたc−MAFの発現レベルをc−MAF発現の所定の参照レベルと比較することによって前記サンプルをタイプ分けする工程;
を含み、ここで、前記タイプ分けは、前記被験体における骨転移のリスクに関する予後情報を提供する、インビトロでの方法。
(項目31)
前立腺がんに罹患している被験体における骨転移を予防するため、阻害するため、またはリスクを減少させるための方法であって、前記方法は、骨転移を予防するかまたは減少させる薬剤を前記被験体に投与する工程を含み、ここで、前記薬剤は、前記被験体におけるc−MAFの発現レベルの定量から決定された処置レジメンに従って投与される、方法。
(項目32)
前立腺がんに罹患している被験体をコホートに分類する方法であって、前記方法は、a)前記被験体の前立腺腫瘍サンプル中のc−MAFの発現レベルを決定する工程;b)前記サンプル中のc−MAFの発現レベルをc−MAF発現の所定の参照レベルと比較する工程;およびc)前記サンプル中のc−MAFの前記発現レベルに基づいて、前記被験体をコホートに分類する工程を含む、方法。
(項目33)
前記RANKL特異的ナノボディは、ALX−0141である、項目6に記載の方法。
(項目34)
前記METおよびVEGFR2の二重インヒビターは、カボザンチニブである、項目6に記載の方法。
(項目35)
前記RANKL特異的ナノボディは、ALX−9141である、項目24に記載の使用。
(項目36)
前記METおよびVEGFR2の二重インヒビターは、カボザンチニブである、項目24に記載の使用。
(項目37)
前記c−MAF遺伝子特異的プローブは、Vysis LSI/IGH MAF Dual Color二重融合プローブである、項目16に記載の方法。
(項目38)
前立腺がんに罹患している被験体の治療を決定するためのキットであって、前記キットは、a)前記被験体の腫瘍サンプル中のc−MAFの発現レベルを定量するための手段;b)前記サンプル中のc−MAFの定量した発現レベルを、参照c−MAF発現レベルと比較するための手段;ならびにc)前記定量した発現レベルと前記参照発現レベルとの比較に基づいて、前記被験体における骨転移を予防、阻害および/または低減させるための治療を決定するための手段を含む、キット。
(項目39)
i)前立腺がんに罹患している被験体の腫瘍サンプル中のc−MAFの発現レベルを定量するための試薬、およびii)骨転移のリスクと相関することが予め決定された1またはそれより多くのc−MAF遺伝子発現レベル指標を含む、キット。
(項目40)
前記発現を定量するための手段は、前記c−MAF遺伝子、16q23遺伝子座もしくは16q22−16q24染色体領域を特異的に結合および/もしくは増幅する、プローブおよび/もしくはプライマーのセットを含む、項目38〜39に記載のキット。
(項目41)
前立腺がんに罹患している被験体のサンプルをタイプ分けするためのインビトロでの方法であって、前記方法は、
(i)前記被験体に由来する腫瘍サンプルを提供する工程;
(ii)前記サンプル中のc−MAFの発現レベルを定量する工程;
(iii)前記c−MAFの定量した発現レベルと、c−MAF発現の所定の参照レベルとを比較することによって、前記サンプルをタイプ分けする工程;
を包含し、
ここで前記タイプ分けする工程は、前記被験体における骨転移のリスクに関連した予後情報を提供する、
方法。
(項目42)
前立腺がんに罹患している被験体における骨転移を予防するため、阻害するため、またはリスクを減少させるための方法であって、前記方法は、骨転移を予防するかまたは減少させる薬剤を、前記被験体に投与するかまたは投与しない工程を包含し、ここで前記薬剤は、前記被験体におけるc−MAFの発現レベルを定量する工程から少なくとも部分的に決定される処置レジメンに従って投与される、方法。
(項目43)
前立腺がんに罹患している被験体をコホートに分類する方法であって、前記方法は、a)前記被験体のがん腫瘍サンプル中のc−MAFの発現レベルを決定する工程;b)前記サンプル中のc−MAFの発現レベルと、c−MAF発現の所定の参照レベルとを比較する工程;およびc)前記サンプル中のc−MAFの発現レベルに基づいて、前記被験体をコホートに分類する工程、を包含する、方法。
(項目44)
前記コホートは、前記参照発現レベルとの比較において、c−MAFの匹敵する発現レベルを有すると決定された少なくとも1の他の個体を含む、項目43に記載の方法。
(項目45)
前記サンプル中のc−MAFの発現レベルは、前記所定の参照レベルと比較して増大しており、前記コホートのメンバーは、骨転移の増大したリスクを有すると分類されている、項目43または44に記載の方法。
(項目46)
前記コホートは、臨床試験を行うためのものである、項目43〜45のいずれかに記載の方法。
(項目47)
前立腺がんに罹患している被験体における前立腺がんの骨転移を推定するためのインビトロでの方法であって、前記方法は、c−MAF遺伝子が前記被験体の腫瘍サンプル中で転座しているか否かを決定する工程を包含し、ここで前記c−MAF遺伝子の転座は、骨転移の増大したリスクを示す、方法。
(項目48)
骨転移を伴う前立腺がんを有する被験体の個別化治療をデザインするためのインビトロでの方法であって、c−MAF遺伝子が、参照遺伝子コピー数と比較して前記被験体の腫瘍サンプル中で増幅されているか否かを決定する工程を包含し、ここで前記参照遺伝子コピー数と比較しての前記c−MAF遺伝子の増幅は、前記被験体が、骨分解を予防または阻害することが意図された治療を受ける候補であることを示す、方法。
(項目49)
前記骨分解を予防または阻害することが意図された薬剤は、ビスホスホネート、RANKLインヒビター、PTH、PTHLHインヒビター(中和抗体およびペプチドを包含する)、PRGアナログ、ラネル酸ストロンチウム、DKK−1インヒビター、METおよびVEGFRの二重インヒビター、エストロゲンレセプター調節因子、カルシトニン、ラジウム−223、CCR5アンタゴニスト、Srcキナーゼインヒビター、COX−2インヒビター、mTorインヒビター、およびカテプシンKインヒビターからなる群より選択される、項目48に記載の方法。
(項目50)
前記RANKLインヒビターは、RANKL特異的抗体、RANKL特異的ナノボディ、およびオステオプロテゲリンからなる群より選択される、項目49に記載の方法。
(項目51)
前記RANKL特異的抗体は、デノスマブである、項目50に記載の方法。
(項目52)
前記ビスホスホネートは、ゾレドロン酸である、項目49に記載の方法。
(項目53)
前記発現を定量するための手段は、前記c−MAF遺伝子、前記16q23遺伝子座もしくは前記16q22−16q24染色体領域を特異的に結合および/もしくは増幅するプローブおよび/もしくはプライマーのセットを含む、項目23〜28に記載の方法。
(項目54)
前記発現を定量するための手段は、前記c−MAF遺伝子、前記16q23遺伝子座もしくは前記16q22−16q24染色体領域を特異的に結合および/もしくは増幅するプローブおよび/もしくはプライマーのセットを含む、項目29〜32に記載の方法。
(項目55)
前記発現を定量するための手段は、前記c−MAF遺伝子、16q23遺伝子座もしくは16q22−16q24染色体領域を特異的に結合および/もしくは増幅するプローブおよび/もしくはプライマーのセットを含む、項目41〜47に記載の方法。
c−MAF発現レベルに基づく前立腺がん転移の診断および予後診断のための方法
本発明者らは、c−MAF遺伝子およびタンパク質が、前立腺がん転移において過剰発現されること、ならびに原発性前立腺腫瘍におけるc−MAF発現レベルが、前立腺がんの様々な臨床上のパラメーター(特に再発および転移の確率)と相関することを示した。したがって、c−MAF過剰発現は、(特に骨における)前立腺腫瘍転移の発症および高リスクと関連する。そのため、c−MAFは、前立腺がんを有する被験体における転移(特に骨転移)の診断および/または予後診断のためのマーカーとして使用することができる。
(i)上記被験体由来の腫瘍サンプル(例えば前立腺腫瘍組織、循環前立腺腫瘍細胞、循環前立腺腫瘍DNA)中のc−MAF遺伝子発現レベルを定量する工程および
(ii)以前に得られた発現レベルをコントロールサンプル中の上記遺伝子の発現レベルと比較する工程を含み、
上記遺伝子の発現レベルが、コントロールサンプル中の上記遺伝子の発現レベルと比較して上昇している場合、上記被験体は、転移について陽性の診断を有するかまたは転移(好ましい部位の骨転移で)を起こす傾向がより高い、方法に関する。
;一連の値;平均値(average value);中央値、平均値(mean value)、または特定のコントロール値もしくはベースライン値と比較される値であり得る。参照値は、個別のサンプル値、例えば、試験されている被験体から得られた値などであるが、より早い時点における値に基づき得る。参照値は、多数のサンプル(例えば、暦年齢が一致する群の被験体の集団由来)に基づいてもよいし、試験されるべきサンプルを含むまたは除外したサンプルのプールに基づいてもよい。
当該分野において公知であるように、がんに罹患している被験体に施されるべき処置は、後者が悪性腫瘍であるかどうか、すなわち、それが転移を起こす高い確率を有するかどうか、または後者が良性の腫瘍であるかどうかに左右される。第1の仮定では、一般に好まれる処置は、化学療法などの全身性処置であり、第2の仮定では、一般に好まれる処置は、放射線治療などの局所性処置である。
(i)上記被験体の腫瘍サンプル中のc−MAF遺伝子発現レベルを定量する工程、および
(ii)以前に得られた発現レベルをコントロールサンプル中の上記遺伝子の発現レベルと比較する工程
を含み、ここで、その発現レベルが、上記コントロールサンプル中の上記遺伝子の発現レベルと比較して上昇している場合、上記被験体は、転移の予防および/または処置を目指す治療を受けるのに適格である。この方法の特定の局面では、次いで、被験体は、骨転移を予防、阻害および/または処置する少なくとも1つの治療薬を投与される。
c−MAF遺伝子発現レベルが、上記参照値と比較して上昇していない場合、上記被験体は、骨分解を予防するための治療を受けるのに適格ではない。本方法の特定の態様では、次いで、被験体は、骨転移を予防、阻害および/または処置する少なくとも1つの治療薬が投与されない。
・副甲状腺ホルモン(PTH)および副甲状腺ホルモン様ホルモン(Parathyroid like hormone;PTHLH)インヒビター(ブロッキング抗体を含む)またはその組換え型(PTHのアミノ酸7〜34に対応するテリパラチド)。このホルモンは、破骨細胞を刺激してその活性を高めることによって作用する。
・ラネル酸ストロンチウムは、代替の経口処置であり、骨芽細胞の増殖を刺激し、破骨細胞の増殖を阻害するので、「二重作用骨剤」(DABA)と呼ばれる薬物の群の一部を形成する。
・「エストロゲンレセプター調節因子」(SERM)は、機序に関係なくエストロゲンがレセプターに結合するのを干渉するかまたは阻害する化合物のことを指す。エストロゲンレセプター調節因子の例としては、とりわけ、エストロゲンプロゲスターゲン、エストラジオール、ドロロキシフェン、ラロキシフェン、ラソホキシフェン、TSE−424、タモキシフェン、イドキシフェン、LY353381、LY117081、トレミフェン、フルベストラント、4−[7−(2,2−ジメチル−1−オキソプロポキシ−4−メチル−2−[4−[2−(1−ピペリジニル)エトキシ]フェニル]−2H−1−ベンゾピラン−3−イル]−フェニル−2,2−ジメチルプロパノエート 4,4’ジヒドロキシベンゾフェノン−2,4−ジニトロフェニル−ヒドラゾンおよびSH646が挙げられる。
・カルシトニンは、カルシトニンレセプターを介して破骨細胞の活性を直接阻害する。カルシトニンレセプターは、破骨細胞の表面上で同定されている。
・ビスホスホネートは、骨粗鬆症および骨転移を伴うがん(後者は、乳がんおよび前立腺がんに関連する高カルシウム血症を伴うかまたは伴わない)などの、骨吸収および再吸収を伴う疾患の予防および処置のために使用される医薬品の群である。本発明の第5の方法によってデザインされる治療において使用され得るビスホスホネートの例としては、窒素含有ビスホスホネート(例えば、パミドロネート、ネリドロネート、オルパドロネート、アレンドロネート、イバンドロネート、リセドロネート、インカドロネート、ゾレドロネートまたはゾレドロン酸など)および窒素非含有ビスホスホネート(例えば、エチドロネート、クロドロネート、チルドロネートなど)が挙げられるが、これらに限定されない。
・「カテプシンKインヒビター」とは、カテプシンKシステインプロテアーゼ活性に干渉する化合物のことを指す。カテプシンKインヒビターの非限定的な例としては、4−アミノ−ピリミジン−2−カルボニトリル誘導体(Novartis Pharma GMBHの名称下の国際特許出願WO03/020278に記載されている)、公報WO03/020721(Novartis Pharma GMBH)および公報WO04/000843(ASTRAZENECA AB)に記載されているピロロ−ピリミジン、ならびにAxys Pharmaceuticalsの公報PCT WO00/55126、Merck Frosst Canada & Co.およびAxys PharmaceuticalsのWO01/49288に記載されているインヒビターが挙げられる。
・本明細書中で使用されるとき「DKK−1(Dickkopf−1)インヒビター」は、DKK−1活性を低下させることができる任意の化合物のことを指す。DKK−1は、主に成体の骨において発現され、溶骨性病変を有するミエローマ患者においてアップレギュレートされる、可溶性Wnt経路アンタゴニストである。DKK−1を標的化する薬剤は、多発性骨髄腫患者における溶骨性骨疾患の予防に役割を果たし得る。Novartis製のBHQ880は、ファースト・イン・クラスの完全ヒト型抗DKK−1中和抗体である。前臨床試験は、BHQ880が骨形成を促進し、それによって、腫瘍が誘導する溶骨性疾患を阻害するという仮説を支持している(Ettenberg S.ら、American Association for Cancer Research Annual Meeting.4月 12−16,2008;San Diego,Calif.要旨)。
・本明細書中で使用されるとき「METおよびVEGFR2の二重インヒビター」は、METによって駆動される腫瘍エスケープを阻止するようにデザインされた、MET経路およびVEGF経路の強力な二重インヒビターである任意の化合物のことを指す。METは、腫瘍細胞および内皮細胞だけでなく、骨芽細胞(骨を形成する細胞)および破骨細胞(骨を除去する細胞)においても発現される。HGFは、これらの細胞型のすべてにおけるMETに結合し、MET経路に、複数のオートクラインループおよびパラクリンループにおいて重要な役割を与える。腫瘍細胞におけるMETの活性化は、転移性の骨病変の確立において重要であるとみられる。同時に、骨芽細胞および破骨細胞におけるMET経路の活性化は、異常な骨の成長(すなわち、芽細胞性の病変)または破壊(すなわち、溶解性の病変)を含む骨転移の病理学的特色をもたらし得る。したがって、MET経路の標的化は、転移性の骨病変の確立および進行の予防の実行可能なストラテジーであり得る。以前はXL184(CAS849217−68−1)として知られていたカボザンチニブ(Exelixis,Inc)は、METによって駆動される腫瘍エスケープを阻止するようにデザインされた、MET経路およびVEGF経路の強力な二重インヒビターである。複数の前臨床試験において、カボザンチニブは、腫瘍細胞を死滅させ、転移を減少させ、血管新生(腫瘍の成長を支えるために必要な新しい血管の形成)を阻害することが示されている。別の好適な二重インヒビターは、E7050(N−[2−フルオロ−4−({2−[4−(4−メチルピペラジン−1−イル)ピペリジン−1−イル]カルボニルアミノピリジン−4−イル}オキシ)フェニル]−N’−(4−フルオロフェニル)シクロプロパン−1,1−ジカルボキサミド(2R,3R)−タルトレート)(CAS928037−13−2)またはフォレチニブ(GSK1363089、XL880、CAS849217−64−7としても知られる)である。
・本明細書中で使用されるとき「RANKLインヒビター」は、RANK活性を低下させることができる任意の化合物のことを指す。RANKLは、ストローマ細胞およびT−リンパ球細胞の骨芽細胞膜の表面上に見出され、これらのT−リンパ球細胞は、それを分泌する能力が証明されている唯一の細胞である。その主要な機能は、骨吸収に関わる細胞である破骨細胞の活性化である。RANKLインヒビターは、RANKLがそのレセプター(RANK)に結合するのを阻止すること、RANK媒介性シグナル伝達を阻止すること、またはRANKLの転写もしくは翻訳を阻止することによってRANKLの発現を減少させることによって、作用し得る。本発明における使用に適したRANKLアンタゴニストまたはインヒビターとしては、以下が挙げられるが、これらに限定されない:
・RANKLに結合することができ、RANKタンパク質の細胞外ドメインの全体またはフラグメントを含む、好適なRANKタンパク質。可溶性RANKは、マウスもしくはヒトRANKポリペプチドのシグナルペプチドおよび細胞外ドメインを含み得るか、またはあるいは、シグナルペプチドが除去されたそのタンパク質の成熟型が使用され得る。
・オステオプロテゲリンまたはRANKL結合能を有するそのバリアント。
・RANKL特異的アンチセンス分子。
・RANKLの転写産物をプロセシングすることができるリボザイム。
・特異的な抗RANKL抗体。「抗RANKL抗体またはRANKLに対し指向する抗体」は、1つまたは複数のRANKLの機能を阻害する、核因子κBに対する活性化レセプターのリガンド(RANKL)に特異的に結合することができるすべての抗体と本明細書中で理解される。それらの抗体は、当業者に公知の任意の方法を用いて調製され得る。したがって、ポリクローナル抗体は、阻害されるべきタンパク質で動物を免疫することによって調製される。モノクローナル抗体は、Kohler,Milsteinら(Nature,1975,256:495)に記載されている方法を用いて調製される。本発明の文脈において好適な抗体としては、可変抗原結合領域および定常領域を含むインタクトな抗体、フラグメント「Fab」、「F(ab’)2」および「Fab’」、Fv、scFv、ダイアボディおよび二重特異性抗体が挙げられる。
・特異的な抗RANKLナノボディ。ナノボディは、天然に存在する重鎖抗体の独特の構造的および機能的特性を含む、抗体由来の治療タンパク質である。ナノボディ技術は、ラクダ科動物(ラクダおよびラマ)が軽鎖を欠く完全に機能的な抗体を有するという発見の後に、最初に開発された。ナノボディの一般構造は、
FR1−CDR1−FR2−CDR2−FR3−CDR3−FR4
であり、ここで、FR1からFR4は、フレームワーク領域1〜4であり、CDR1からCDR3は、相補性決定領域1〜3である。これらの重鎖抗体は、単一の可変ドメイン(VHH)および2つの定常ドメイン(CH2およびCH3)を含む。重要なことには、クローニングされ、単離されたVHHドメインは、元の重鎖抗体の完全な抗原結合能を有する完全に安定なポリペプチドである。独特の構造的および機能的特性を有するこれらの新しく発見されたVHHドメインは、Ablynxがナノボディと名付けた新世代の治療用抗体の基礎を形成している。
Midol Complete、Midol Extended Relief、Midol Liquid Gels、Midol PM、Midol Teen Formula、Migranin COATED TABLETS、ML3000、Mobic、Mohrus、Motrin、Motrin Cold and Sinus Pain、Motrin PM、Movalis ASPEN、MRX7EAT、Nalfon、Nalfon PEDINOL、Naprelan、Naprosyn、Naprosyn RPG LIFE SCIENCE、Naproxen IROKO、NCX4016、NCX701、NeoProfen LUNDBECK、Nevanac、Nexcede、Niflan、Norgesic MEDICIS、Novalgin、Nuprin SCOLR、Nurofen、Nurofen Cold and Flu、Nurofen Max Strength Migraine、Nurofen Plus、Nuromol、NyQuil with Vitamin C、Ocufen、OMS103HP、Oralease、Orudis ABBOTT JAPAN、Oruvail、Osteluc、OxycoDex、P54、Panadol、Panadol Actifast、Paradine、Paramax、Parfenac、Pedea、Pennsaid、Pentasa、Pentasa ORIFARM、Peon、Percodan、Percodan−Demi、PercoDex、Percogesic、Perfalgan、PL2200、PL3100、Ponstel、Prexige、Prolensa、PSD508、R−Ketoprofen、Rantudil、Relafen、Remura、Robaxisal、Rotec、Rowasa、ROX828、RP19583、RQ00317076、Rubor、Salofalk、Salonpas、Saridon、SDX101、Seltouch、sfRowasa、Shinbaro、Sinumax、Sinutab、Sinutab、sinus、Spalt、Sprix、Strefen、Sudafed Cold and Cough、Sudafed Head Cold and Sinus、Sudafed PE Cold plus Cough、Sudafed PE Pressure plus Pain、Sudafed PE、Severe Cold、Sudafed PE Sinus Day plus Night Relief Day Tablets、Sudafed PE Sinus Day plus Night Relief Night Tablets、Sudafed PE Sinus plus Anti−inflammatory Pain Relief、Sudafed Sinus Advance、Surgam、Synalgos−DC、Synflex、Tavist allergy/sinus/headache、TDS943、TDT070、Theraflu Cold and Sore Throat、Theraflu Daytime Severe Cold and Cough、Theraflu Daytime Warming Relief,Theraflu Warming Relief Caplets Daytime Multi−Symptom Cold、Theraflu Warming Relief Cold and Chest Congestion、Thomapyrin、Thomapyrin C、Thomapyrin Effervescent、Thomapyrin Medium、Tilcotil、Tispol、Tolectin、Toradol、TPR100、TQ1011、Trauma−Salbe、Trauma−Salbe Kwizda、Treo、Treximet、Trovex、TT063、Tylenol、Tylenol Allergy Multi−Symptom、Tylenol Back Pain、Tylenol Cold & Cough Daytime、Tylenol Cold & Cough Nighttime、Tylenol Cold and Sinus Daytime、Tylenol Cold and Sinus Nighttime、Tylenol Cold Head Congestion Severe、Tylenol Cold Multi Symptom Daytime、Tylenol Cold Multi Symptom Nighttime Liquid、Tylenol Cold Multi Symptom Severe、Tylenol Cold Non−Drowsiness Formula、Tylenol Cold Severe Congestion Daytime、Tylenol Complete Cold,Cough and Flu Night time、Tylenol Flu Nighttime、Tylenol Menstrual、Tylenol PM、Tylenol Sinus Congestion & Pain Daytime、Tylenol Sinus Congestion & Pain Nighttime、Tylenol Sinus Congestion & Pain Severe、Tylenol Sinus Severe Congestion Daytime、Tylenol Ultra Relief、Tylenol with Caffeine and Codeine phosphate、Tylenol with Codeine phosphate、Ultra Strength Bengay Cream、Ultracet、UR8880、V0498TA01A、Vicks NyQuil Cold and Flu Relief、Vicoprofen、Vimovo、Voltaren Emulgel、Voltaren GEL、Voltaren NOVARTIS CONSUMER HEALTH GMBH、Voltaren XR、VT122、Xefo、Xefo Rapid、Xefocam、Xibrom、XL3、Xodol、XP20B、XP21B、XP21L、ZipsorおよびZoenasaから選択される。別の態様において、COX−2インヒビターは、当該分野で公知の方法によって特定され得る(例えば、Dannhardt,G.and Kiefer,W.Cyclooxygenase inhibitors−current status and future prospects.2001.Eur.J.Med.Chem.36:109−126(これは本明細書中で参照により援用される)を参照のこと)。いくつかの態様において、COX−2インヒビターは、進行した前立腺がんを有する患者において転移を処置するためまたは予防するためまたは阻害するために使用される。いくつかの態様において、COX−2インヒビターは、第2の処置と組み合わせて使用される。いくつかの態様において、第2の処置は、本明細書中に記載される任意の処置である。いくつかの態様において、COX−2インヒビターは、デノスマブ、Zometa(http://www.us.zometa.com/index.jsp?usertrack.filter_applied=true&NovaId=2935376934467633633;最終アクセス日2012年12月2日)、CarbozantinibまたはCabozantinib、PTHLH(副甲状腺ホルモン様ホルモン)またはPTHrP(副甲状腺ホルモン関連タンパク質)を阻止する抗体またはペプチドからなる群より選択される第2の処置と組み合わせて使用される。
・化学療法は、がん細胞を破壊する医薬の使用である。それらの医薬は、通常、経口または静脈内の経路によって投与される。時折、化学療法は、放射線処置とともに使用される。
・ホルモン治療は、いくつかのホルモンががん成長を促進するという事実に基づく。例えば、卵巣によって生成された女性におけるエストロゲンは、時折、乳がんの成長を促進する。これらのホルモンの産生を停止するためのいくつかの方法がある。1つの方法は、それらを生成する器官を摘出することであり、女性の場合は、卵巣であって、男性の場合は、精巣である。より頻繁には、これらの器官がホルモンを生成するのを予防するかまたはホルモンががん細胞に作用するのを予防する医薬を使用することができる。
・免疫療法は、がんと戦う患者の免疫系自体を助ける処置である。患者における転移を処置するために使用される免疫療法にはいくつかのタイプがある。これらとしては、サイトカイン、モノクローナル抗体および抗腫瘍ワクチンが挙げられるがこれらに限定されない。
既に骨に転移しており、c−MAFレベルが上昇している前立腺がんに罹患している患者は、破骨細胞活性の上昇によって引き起こされる骨分解の予防を目指した治療から特に利益を得ることができる。
(i)上記被験体の骨由来の転移性腫瘍サンプル中のc−MAF遺伝子発現レベルを定量する工程および
(ii)以前に得られた発現レベルをコントロールサンプル中の上記遺伝子の発現レベルと比較する工程を含み、
発現レベルが、コントロールサンプル中の上記遺伝子の発現レベルと比較して上昇している場合、上記被験体は、骨分解の予防を目指す治療を受けるのに適格であり、
発現レベルが上記参照値と比較して上昇していない場合、上記被験体は、骨転移の予防および/または処置を目指す治療を受けるのに適格ではない方法に関する。
・副甲状腺ホルモン(PTH)および副甲状腺ホルモン様ホルモン(PTHLH)インヒビター(ブロッキング抗体を含む)またはその組換え型(PTHのアミノ酸1〜34に対応するテリパラチド)。このホルモンは、破骨細胞を刺激してその活性を高めることによって作用する。
・ラネル酸ストロンチウムは、代替の経口処置であり、骨芽細胞の増殖を刺激し、破骨細胞の増殖を阻害するので、「二重作用骨剤」(DABA)と呼ばれる薬物の群の一部を形成する。
・「エストロゲンレセプター調節因子」(SERM)は、機序に関係なくエストロゲンがレセプターに結合するのを干渉するかまたは阻害する化合物のことを指す。エストロゲンレセプター調節因子の例としては、とりわけ、エストロゲンプロゲスターゲン、エストラジオール、ドロロキシフェン、ラロキシフェン、ラソホキシフェン、TSE−424、タモキシフェン、イドキシフェン、LY353381、LY117081、トレミフェン、フルベストラント、4−[7−(2,2−ジメチル−1−オキソプロポキシ−4−メチル−2−[4−[2−(1−ピペリジニル)エトキシ]フェニル]−2H−1−ベンゾピラン−3−イル]−フェニル−2,2−ジメチルプロパノエート 4,4’ジヒドロキシベンゾフェノン−2,4−ジニトロフェニル−ヒドラゾンおよびSH646が挙げられる。
・カルシトニンは、カルシトニンレセプターを介して破骨細胞の活性を直接阻害する。カルシトニンレセプターは、破骨細胞の表面上で同定されている。
・ビスホスホネートは、骨粗鬆症および骨転移を伴うがん(後者は、乳がんおよび前立腺がんに関連する高カルシウム血症を伴うかまたは伴わない)などの、骨吸収および再吸収を伴う疾患の予防および処置のために使用される医薬品の群である。本発明の第5の方法によってデザインされる治療において使用され得るビスホスホネートの例としては、窒素含有ビスホスホネート(例えば、パミドロネート、ネリドロネート、オルパドロネート、アレンドロネート、イバンドロネート、リセドロネート、インカドロネート、ゾレドロネートまたはゾレドロン酸など)および窒素非含有ビスホスホネート(例えば、エチドロネート、クロドロネート、チルドロネートなど)が挙げられるが、これらに限定されない。
・「カテプシンKインヒビター」とは、カテプシンKシステインプロテアーゼ活性に干渉する化合物のことを指す。カテプシンKインヒビターの非限定的な例としては、4−アミノ−ピリミジン−2−カルボニトリル誘導体(Novartis Pharma GMBHの名称下の国際特許出願WO03/020278に記載されている)、公報WO03/020721(Novartis Pharma GMBH)および公報WO04/000843(ASTRAZENECA AB)に記載されているピロロ−ピリミジン、ならびにAxys Pharmaceuticalsの公報PCT WO00/55126、Merck Frosst Canada & Co.およびAxys PharmaceuticalsのWO01/49288に記載されているインヒビターが挙げられる。
・本明細書中で使用されるとき「DKK−1(Dickkopf−1)インヒビター」は、DKK−1活性を低下させることができる任意の化合物のことを指す。DKK−1は、主に成体の骨において発現され、溶骨性病変を有するミエローマ患者においてアップレギュレートされる、可溶性Wnt経路アンタゴニストである。DKK−1を標的化する薬剤は、多発性骨髄腫患者における溶骨性骨疾患の予防に役割を果たし得る。Novartis製のBHQ880は、ファースト・イン・クラスの完全にヒトの抗DKK−1中和抗体である。前臨床試験は、BHQ880が骨形成を促進し、それによって、腫瘍が誘導する溶骨性疾患を阻害するという仮説を支持している(Ettenberg S.ら、American Association for Cancer Research Annual Meeting.4月 12−16,2008;San Diego,Calif.要旨)。
・本明細書中で使用されるとき「METおよびVEGFR2の二重インヒビター」は、METによって駆動される腫瘍エスケープを阻止するようにデザインされた、MET経路およびVEGF経路の強力な二重インヒビターである任意の化合物のことを指す。METは、腫瘍細胞および内皮細胞だけでなく、骨芽細胞(骨を形成する細胞)および破骨細胞(骨を除去する細胞)においても発現される。HGFは、これらの細胞型のすべてにおけるMETに結合し、MET経路に、複数のオートクラインループおよびパラクリンループにおいて重要な役割を与える。腫瘍細胞におけるMETの活性化は、転移性の骨病変の確立において重要であるとみられる。同時に、骨芽細胞および破骨細胞におけるMET経路の活性化は、異常な骨の成長(すなわち、芽細胞性の病変)または破壊(すなわち、溶解性の病変)を含む骨転移の病理学的特色をもたらし得る。したがって、MET経路の標的化は、転移性の骨病変の確立および進行の予防の実行可能なストラテジーであり得る。以前はXL184(CAS849217−68−1)として知られていたカボザンチニブ(Exelixis,Inc)は、METによって駆動される腫瘍エスケープを阻止するようにデザインされた、MET経路およびVEGF経路の強力な二重インヒビターである。複数の前臨床試験において、カボザンチニブは、腫瘍細胞を死滅させ、転移を減少させ、血管新生(腫瘍の成長を支えるために必要な新しい血管の形成)を阻害することが示されている。別の好適な二重インヒビターは、E7050(N−[2−フルオロ−4−({2−[4−(4−メチルピペラジン−1−イル)ピペリジン−1−イル]カルボニルアミノピリジン−4−イル}オキシ)フェニル]−N’−(4−フルオロフェニル)シクロプロパン−1,1−ジカルボキサミド(2R,3R)−タルトレート)(CAS928037−13−2)またはフォレチニブ(GSK1363089、XL880、CAS849217−64−7としても知られる)である。
・本明細書中で使用されるとき「RANKLインヒビター」は、RANK活性を低下させることができる任意の化合物のことを指す。RANKLは、ストローマ細胞およびT−リンパ球細胞の骨芽細胞膜の表面上に見出され、これらのT−リンパ球細胞は、それを分泌する能力が証明されている唯一の細胞である。その主要な機能は、骨吸収に関わる細胞である破骨細胞の活性化である。RANKLインヒビターは、RANKLがそのレセプター(RANK)に結合するのを阻止すること、RANK媒介性シグナル伝達を阻止すること、またはRANKLの転写もしくは翻訳を阻止することによってRANKLの発現を減少させることによって、作用し得る。本発明における使用に適したRANKLアンタゴニストまたはインヒビターとしては、以下が挙げられるが、これらに限定されない:
・RANKLに結合することができ、RANKタンパク質の細胞外ドメインの全体またはフラグメントを含む、好適なRANKタンパク質。可溶性RANKは、マウスもしくはヒトRANKポリペプチドのシグナルペプチドおよび細胞外ドメインを含み得るか、またはあるいは、シグナルペプチドが除去されたそのタンパク質の成熟型が使用され得る。
・オステオプロテゲリンまたはRANKL結合能を有するそのバリアント。
・RANKL特異的アンチセンス分子。
・RANKLの転写産物をプロセシングすることができるリボザイム。
・特異的な抗RANKL抗体。「抗RANKL抗体またはRANKLに対し指向する抗体」は、1つまたは複数のRANKLの機能を阻害する、核因子κBに対する活性化レセプターのリガンド(RANKL)に特異的に結合することができるすべての抗体と本明細書中で理解される。それらの抗体は、当業者に公知の任意の方法を用いて調製され得る。したがって、ポリクローナル抗体は、阻害されるべきタンパク質で動物を免疫することによって調製される。モノクローナル抗体は、Kohler,Milsteinら(Nature,1975,256:495)に記載されている方法を用いて調製される。本発明の文脈において好適な抗体としては、可変抗原結合領域および定常領域を含むインタクトな抗体、フラグメント「Fab」、「F(ab’)2」および「Fab’」、Fv、scFv、ダイアボディおよび二重特異性抗体が挙げられる。
・特異的な抗RANKLナノボディ。ナノボディは、天然に存在する重鎖抗体の独特の構造的および機能的特性を含む、抗体由来の治療タンパク質である。ナノボディ技術は、ラクダ科動物(ラクダおよびラマ)が軽鎖を欠く完全に機能的な抗体を有するという発見の後に、最初に開発された。ナノボディの一般構造は、
FR1−CDR1−FR2−CDR2−FR3−CDR3−FR4
であり、ここで、FR1からFR4は、フレームワーク領域1〜4であり、CDR1からCDR3は、相補性決定領域1〜3である。これらの重鎖抗体は、単一の可変ドメイン(VHH)および2つの定常ドメイン(CH2およびCH3)を含む。重要なことには、クローニングされ、単離されたVHHドメインは、元の重鎖抗体の完全な抗原結合能を有する完全に安定なポリペプチドである。独特の構造的および機能的特性を有するこれらの新しく発見されたVHHドメインは、Ablynxがナノボディと名付けた新世代の治療用抗体の基礎を形成している。
nspiron(シロリムス)、IPI504(レタスピマイシン(retaspimycin)塩酸塩)、KRN951(チボザニブ(tivozanib))、ME344、MGA031(テプリズマブ(teplizumab))、MiStent SES(シロリムス)、MKC1、Nobori(ウミロリムス)、OSI027、OVI123(コルジセピン)、Palomid 529、PF04691502、Promus Element(エベロリムス)、PWT33597、Rapamune(シロリムス)、Resolute DES(ゾタロリムス)、RG7422、SAR245409、SF1126、SGN75(ボルセツズマブマホドチン(vorsetuzumab mafodotin))、Synergy(エベロリムス)、Taltorvic(リダフォロリムス(ridaforolimus))、Tarceva(エルロチニブ)、Torisel(テムシロリムス)、Xience Prime(エベロリムス)、Xience V(エベロリムス)、Zomaxx(ゾタロリムス)、Zortress(エベロリムス)、ゾタロリムス溶出性末梢ステント(Peripheral Stent)MEDTRONIC(ゾタロリムス)、AP23841、AP24170、ARmTOR26、BN107、BN108、Canstatin GENZYME(カンスタチン(canstatin))、CU906、EC0371、EC0565、KI1004、LOR220、NV128、Rapamycin ONCOIMMUNE(シロリムス)、SB2602、Sirolimus PNP SAMYANG BIOPHARMACEUTICALS(シロリムス)、TOP216、VLI27、VS5584、WYE125132、XL388、Advacan(エベロリムス)、AZD8055、Cypher Select Plus シロリムス溶出性冠動脈ステント(シロリムス)、Cypher シロリムス溶出性冠動脈ステント(シロリムス)、薬物コーティングされたバルーン(シロリムス)、E−Magic Plus(シロリムス)、Emtor(シロリムス)、Esprit(エベロリムス)、Evertor(エベロリムス)、HBF0079、LCP−Siro(シロリムス)、Limus CLARIS(シロリムス)、mTORインヒビター CELLZOME、Nevo シロリムス溶出性冠動脈ステント(シロリムス)、nPT−mTOR、Rapacan(シロリムス)、Renacept(シロリムス)、ReZolve(シロリムス)、Rocas(シロリムス)、SF1126、Sirolim(シロリムス)、Sirolimus NORTH CHINA(シロリムス)、Sirolimus RANBAXY(シロリムス)、Sirolimus WATSON(シロリムス)Siropan(シロリムス)、Sirova(シロリムス)、Supralimus(シロリムス)、Supralimus−Core(シロリムス)、Tacrolimus WATSON(タクロリムス)、TAFA93、Temsirolimus ACCORD(テムシロリムス)、Temsirolimus SANDOZ(テムシロリムス)、TOP216、Xience Prime(エベロリムス)、Xience V(エベロリムス)からなる群より選択される。具体的な態様において、mTorインヒビターは、Afinitor(エベロリムス)(http://www.afinitor.com/index.jsp?usertrack.filter_applied=true&NovaId=4029462064338207963;最終アクセス日2012年11月28日)である。別の態様において、mTorインヒビターは、当該分野で公知の方法によって特定され得る(例えば、Zhou,H.ら、Updates of mTor inhibitors.2010.Anticancer Agents Med.Chem.10(7):571−81(これは本明細書中で参照により援用される)を参照のこと)。いくつかの態様において、mTorインヒビターは、進行した前立腺がんを有する患者において転移を処置するためまたは予防するためまたは阻害するために使用される。いくつかの態様において、mTorインヒビターは、第2の処置と組み合わせて使用される。いくつかの態様において、第2の処置は、本明細書中に記載される任意の処置である。
Midol Complete、Midol Extended Relief、Midol Liquid Gels、Midol PM、Midol Teen Formula、Migranin COATED TABLETS、ML3000、Mobic、Mohrus、Motrin、Motrin Cold and Sinus Pain、Motrin PM、Movalis ASPEN、MRX7EAT、Nalfon、Nalfon PEDINOL、Naprelan、Naprosyn、Naprosyn RPG LIFE SCIENCE、Naproxen IROKO、NCX4016、NCX701、NeoProfen LUNDBECK、Nevanac、Nexcede、Niflan、Norgesic MEDICIS、Novalgin、Nuprin SCOLR、Nurofen、Nurofen Cold and Flu、Nurofen Max Strength Migraine、Nurofen Plus、Nuromol、NyQuil with Vitamin C、Ocufen、OMS103HP、Oralease、Orudis ABBOTT JAPAN、Oruvail、Osteluc、OxycoDex、P54、Panadol、Panadol Actifast、Paradine、Paramax、Parfenac、Pedea、Pennsaid、Pentasa、Pentasa ORIFARM、Peon、Percodan、Percodan−Demi、PercoDex、Percogesic、Perfalgan、PL2200、PL3100、Ponstel、Prexige、Prolensa、PSD508、R−Ketoprofen、Rantudil、Relafen、Remura、Robaxisal、Rotec、Rowasa、ROX828、RP19583、RQ00317076、Rubor、Salofalk、Salonpas、Saridon、SDX101、Seltouch、sfRowasa、Shinbaro、Sinumax、Sinutab、Sinutab、sinus、Spalt、Sprix、Strefen、Sudafed Cold and Cough、Sudafed Head Cold and Sinus、Sudafed PE Cold plus Cough、Sudafed PE Pressure plus Pain、Sudafed PE、Severe Cold、Sudafed PE Sinus Day plus Night Relief Day Tablets、Sudafed PE Sinus Day plus Night Relief Night Tablets、Sudafed PE Sinus plus Anti−inflammatory Pain Relief、Sudafed Sinus Advance、Surgam、Synalgos−DC、Synflex、Tavist allergy/sinus/headache、TDS943、TDT070、Theraflu Cold and Sore Throat、Theraflu Daytime Severe Cold and Cough、Theraflu Daytime Warming Relief,Theraflu Warming Relief Caplets Daytime Multi−Symptom Cold、Theraflu Warming Relief Cold and Chest Congestion、Thomapyrin、Thomapyrin C、Thomapyrin Effervescent、Thomapyrin Medium、Tilcotil、Tispol、Tolectin、Toradol、TPR100、TQ1011、Trauma−Salbe、Trauma−Salbe Kwizda、Treo、Treximet、Trovex、TT063、Tylenol、Tylenol Allergy Multi−Symptom、Tylenol Back Pain、Tylenol Cold & Cough Daytime、Tylenol Cold & Cough Nighttime、Tylenol Cold and Sinus Daytime、Tylenol Cold and Sinus Nighttime、Tylenol Cold Head Congestion Severe、Tylenol Cold Multi Symptom Daytime、Tylenol Cold Multi Symptom Nighttime Liquid、Tylenol Cold Multi Symptom Severe、Tylenol Cold Non−Drowsiness Formula、Tylenol Cold Severe Congestion Daytime、Tylenol Complete Cold,Cough and Flu Night time、Tylenol Flu Nighttime、Tylenol Menstrual、Tylenol PM、Tylenol Sinus Congestion & Pain Daytime、Tylenol Sinus Congestion & Pain Nighttime、Tylenol Sinus Congestion & Pain Severe、Tylenol Sinus Severe Congestion Daytime、Tylenol Ultra Relief、Tylenol with Caffeine and Codeine phosphate、Tylenol with Codeine phosphate、Ultra Strength Bengay Cream、Ultracet、UR8880、V0498TA01A、Vicks NyQuil Cold and Flu Relief、Vicoprofen、Vimovo、Voltaren Emulgel、Voltaren GEL、Voltaren NOVARTIS CONSUMER HEALTH GMBH、Voltaren XR、VT122、Xefo、Xefo Rapid、Xefocam、Xibrom、XL3、Xodol、XP20B、XP21B、XP21L、ZipsorおよびZoenasaから選択される。別の態様において、COX−2インヒビターは、当該分野で公知の方法によって特定され得る(例えば、Dannhardt,G.and Kiefer,W.Cyclooxygenase inhibitors−current status and future prospects.2001.Eur.J.Med.Chem.36:109−126(これは本明細書中で参照により援用される)を参照のこと)。いくつかの態様において、COX−2インヒビターは、進行した前立腺がんを有する患者において転移を処置するためまたは予防するためまたは阻害するために使用される。いくつかの態様において、COX−2インヒビターは、第2の処置と組み合わせて使用される。いくつかの態様において、第2の処置は、本明細書中に記載される任意の処置である。いくつかの態様において、COX−2インヒビターは、デノスマブ、Zometa(http://www.us.zometa.com/index.jsp?usertrack.filter_applied=true&NovaId=2935376934467633633;最終アクセス日2012年12月2日)、CarbozantinibまたはCabozantinib、PTHLH(副甲状腺ホルモン様ホルモン)またはPTHrP(副甲状腺ホルモン関連タンパク質)を阻止する抗体またはペプチドからなる群より選択される第2の処置と組み合わせて使用される。
一態様において、本発明は、前立腺がんを有する被験体における転移の診断(以後、本発明の第4の診断方法)および/または前立腺がんを有する被験体において転移を起こす傾向の予後診断のためのインビトロでの方法であって、c−MAF遺伝子が上記被験体の腫瘍組織サンプルにおいて増幅しているか否かを決定する工程を含み、上記遺伝子がコントロールサンプルと比較して増幅している場合、上記被験体は、転移について陽性の診断を有するかまたは転移を起こす傾向がより高い、方法に関する。
別の態様において、本発明は、前立腺がんに罹患している患者の臨床転帰を予測するためのインビトロでの方法に関し、その方法は、上記被験体のサンプル中のc−MAF遺伝子が、転座しているかを決定する工程を含み、ここで、c−MAF遺伝子の転座は、不良な臨床転帰を示す。
別の態様において、本発明は、前立腺がんに罹患している患者の臨床転帰を予測するためのインビトロでの方法(本明細書中以後、本発明の第7の方法)に関し、その方法は、上記被験体のサンプル中のc−MAF遺伝子が、参照遺伝子コピー数と比べて増幅されているかまたは転座しているかを決定する工程を含み、ここで、上記参照遺伝子コピー数と比較したときのc−MAF遺伝子の増幅は、不良な臨床転帰を示す。
(i)上記被験体の腫瘍サンプル中のc−MAF遺伝子を含むchr16q22−24の増幅を定量する工程および
(ii)先に得られたc−MAF遺伝子を含むchr16q22−24の増幅と、コントロールサンプル中の上記遺伝子の増幅の程度とを比較する工程、
を含み、
ここでc−MAF遺伝子を含むchr16q22−24が上記コントロールサンプル中の同じゲノム領域のコピー数と比較して増幅されている場合、上記被験体は、転移を予防および/もしくは処置することを目的とした治療を受けるのに適格である。この方法の特定の態様において、上記被験体は、その後、骨転移を予防、阻害および/もしくは処置する少なくとも1種の治療薬物を投与される。
ここでc−MAF遺伝子を含むchr16q22−24が参照サンプル中の同じゲノム領域のコピー数と比較して増幅されていない場合、上記被験体は、骨分解を予防するための治療を受けるのに適格ではない。この方法の特定の態様において、上記被験体は、その後、骨転移を予防、阻害および/もしくは処置する少なくとも1種の治療薬物を投与されない。
c−MAF阻害剤を使用する骨転移の処置
c−MAF遺伝子発現阻害剤または上記遺伝子によってコードされるタンパク質の阻害剤は、前立腺がん転移の処置および/または予防において使用することができる。
本発明のさらなる態様は、発現を阻害する、例えば、活性が阻害されるべきであるc−MAFをコードする核酸の転写および/または翻訳を阻害するための、単離された「アンチセンス」核酸の使用に関する。アンチセンス核酸は、従来の塩基相補性によって、または、例えば、二重らせんの主溝(large groove)における特異的な相互作用を介して二本鎖DNAに結合する場合、薬物の可能性のある標的に結合し得る。通常、これらの方法は、当該分野において通常使用される一連の技法のことを指し、それらには、オリゴヌクレオチド配列への特異的結合に基づく任意の方法が含まれる。
。
低分子干渉RNAまたはsiRNAは、RNA干渉によって標的遺伝子の発現を阻害することができる物質である。siRNAは、化学的に合成され得るか、インビトロ転写によって得ることができるか、または標的細胞においてインビボで合成され得る。代表的には、siRNAは、15〜40ヌクレオチド長の二本鎖RNAからなり、1〜6ヌクレオチドの3’および/または5’突出領域を含み得る。その突出領域の長さは、siRNA分子の全長と無関係である。siRNAは、転写後の標的メッセンジャーの分解またはサイレンシングによって作用する。
・ヌクレオチド間の結合が天然に見られる結合と異なる(例えば、ホスホロチオネート結合)siRNA
・フルオロフォアなどの機能的な試薬とRNA鎖の結合体
・2’位の種々のヒドロキシル官能基での修飾による、RNA鎖の末端、特に3’末端の
修飾
・2’−O−メチルリボースまたは2’−O−フルオロリボースのような2’位におけるO−アルキル化残基などの改変された糖を有するヌクレオチド
・ハロゲン化された塩基(例えば、5−ブロモウラシルおよび5−ヨードウラシル)、アルキル化された塩基(例えば、7−メチルグアノシン)などの改変された塩基を有するヌクレオチド
が挙げられる。
・siRNAは、そのままで、すなわち、上述の特徴を有する二本鎖RNAの形態で、使用され得る。あるいは、siRNAのセンス鎖配列およびアンチセンス鎖配列を含むベクターを、目的の細胞におけるその発現に好適なプロモーターの支配下で使用することが、可能である。
・siRNAの発現に適したベクターは、siRNAの2本の鎖をコードする2つのDNA領域が、転写の際にループを形成するスペーサー領域によって分断された1本の同じDNA鎖においてタンデムに配置されているベクターであり、単一のプロモーターが、shRNAを生じるDNA分子の転写を指示する。
・あるいは、siRNAを形成する各鎖が、異なる転写単位の転写から形成されるベクターを使用することも可能である。これらのベクターは、その後、分岐(divergent)転写ベクターと収束(convergent)転写ベクターとに分割される。分岐転写ベクターでは、siRNAを形成する各DNA鎖の転写が、同じであっても異なってもよいそれ自体のプロモーターに依存するように、その各DNA鎖をコードする転写単位が、ベクター内でタンデムに配置される(Wang,J.ら、2003,Proc.Natl.Acad.Sci.USA.,100:5103−5106およびLee,N.S.ら、2002,Nat.Biotechnol.,20:500−505)。収束転写ベクターでは、siRNAを生じるDNA領域は、2つの逆方向のプロモーターに隣接したDNA領域のセンス鎖およびアンチセンス鎖を形成する。センスおよびアンチセンスのRNA鎖の転写の後、後者は、機能的siRNAを形成するためにハイブリッドを形成する。2つのU6プロモーター(Tran,N.ら、2003,BMC Biotechnol.,3:21)、マウスU6プロモーターおよびヒトH1プロモーター(Zheng,L.ら、2004,Proc.Natl.Acad.Sci.USA.,135−140およびWO2005026322)ならびにヒトU6プロモーターおよびマウスH1プロモーター(Kaykas,A.and Moon,R.,2004,BMC Cell Biol.,5:16)が使用される逆方向プロモーター系を有するベクターが記載されている。
・収束発現ベクターまたは分岐発現ベクターからのsiRNAの発現におけるその使用に適したプロモーターには、siRNAを発現させようとする細胞と適合性の任意のプロモーターまたはプロモーター対が含まれる。したがって、本発明に適したプロモーターとしては、構成的プロモーター(例えば、真核生物ウイルス(例えば、ポリオーマウイルス、アデノウイルス、SV40、CMV、トリ肉腫ウイルス、B型肝炎ウイルス)のゲノムに由来するプロモーター)、メタロチオネイン遺伝子プロモーター、単純ヘルペスウイルスのチミジンキナーゼ遺伝子プロモーター、レトロウイルスLTR領域、免疫グロブリン遺伝子プロモーター、アクチン遺伝子プロモーター、EF−1アルファ遺伝子プロモーター、ならびにタンパク質発現が分子または外来性シグナルの添加に依存する誘導性プロモーター、例えば、テトラサイクリンシステム、NFカッパーB/UV光システム、Cre/Loxシステムおよび熱ショック遺伝子プロモーター、WO/2006/135436に記載されている制御可能なRNAポリメラーゼIIプロモーターならびに組織特異的プロモーター(例えば、WO2006012221に記載されているPSAプロモーター)が挙げられるが、必ずしもこれらに限定されない。好ましい実施形態において、プロモーターは、恒常的に作用するRNAポリメラーゼIIIプロモーターである。RNAポリメラーゼIIIプロモーターは、限られた数の遺伝子(例えば、5S RNA、tRNA、7SL RNAおよびU6 snRNA)にしか見られない。他のRNAポリメラーゼIIIプロモーターとは異なり、III型プロモーターは、いかなる遺伝子内配列も必要とせず、むしろ、−34および−24位におけるTATAボックス、−66〜−47の近位配列エレメントすなわちPSE、および場合によっては、−265〜−149位の遠位配列エレメントすなわちDSEを含む5’方向の配列を必要とする。好ましい実施形態において、III型RNAポリメラーゼIIIプロモーターは、ヒトまたはマウスのH1遺伝子およびU6遺伝子のプロモーターである。なおもより好ましい実施形態において、プロモーターは、2つのヒトまたはマウスのU6プロモーター、マウスU6プロモーターおよびヒトH1プロモーターまたはヒトU6プロモーターおよびマウスH1プロモーターである。
・siRNAは、siRNAを形成する逆平行鎖がループまたはヘアピン領域によって接続されていることを特徴とするいわゆるshRNA(短ヘアピンRNA)から細胞内に産生され得る。shRNAは、プラスミドまたはウイルス、特にレトロウイルスによってコードされ得、プロモーターの支配下にある。shRNAの発現に適したプロモーターは、siRNAの発現についての上記のパラグラフにおいて示されたプロモーターである。
・siRNAおよびshRNAの発現に適したベクターとしては、原核生物発現ベクター(例えば、pUC18、pUC19、Bluescriptおよびそれらの誘導体、mp18、mp19、pBR322、pMB9、CoIEl、pCRl、RP4)、ファージベクターおよびシャトルベクター(例えば、pSA3およびpAT28)、酵母発現ベクター(例えば、2−ミクロンプラスミドタイプのベクター、インテグレーションプラスミド、YEPベクター、セントロメアプラスミドなど)、昆虫細胞発現ベクター(例えば、pACシリーズベクターおよびpVLシリーズベクター)、植物発現ベクター(例えば、pIBI、pEarleyGate、pAVA、pCAMBIA、pGSA、pGWB、pMDC、pMY、pOREシリーズベクターなど)およびウイルスベクターベース(アデノウイルス、アデノウイルス随伴ウイルスならびにレトロウイルス、特にレンチウイルス)の高等真核生物細胞発現ベクターまたは非ウイルスベクター(例えば、pcDNA3、pHCMV/Zeo、pCR3.1、pEFl/His、pIND/GS、pRc/HCMV2、pSV40/Zeo2、pTRACER−HCMV、pUB6/V5−His、pVAXl、pZeoSV2、pCI、pSVLおよびpKSV−10、pBPV−1、pML2dおよびpTDTl)が挙げられる。好ましい実施形態において、ベクターは、レンチウイルスベクターである。
・本発明のsiRNAおよびshRNAは、当業者に公知の一連の技法を用いて得ることができる。siRNAをデザインするための基礎と考えられるヌクレオチド配列の領域は、限定的でなく、それは、コード配列(開始コドンと終止コドンの間)の領域を含み得るか、またはあるいは、好ましくは、25〜50ヌクレオチド長で、開始コドンに対して3’方向の任意の位置の非翻訳5’または3’領域の配列を含み得る。siRNAをデザインする1つの方法は、AA(N19)TTモチーフの識別(ここで、Nは、c−MAF遺伝子配列内の任意のヌクレオチドであり得る)および高G/C含有量を有するそれらのモチーフの選択を含む。上記モチーフが見つからない場合、NA(N21)モチーフ(ここで、Nは、任意のヌクレオチドであり得る)を識別することができる。
他方で、本発明は、本発明のc−MAF遺伝子の発現を阻害するDNA酵素の使用も企図する。DNA酵素は、アンチセンス技術とリボザイム技術の両方の機構的な特色のいくつかを組み込んでいる。DNA酵素は、アンチセンスオリゴヌクレオチドと同様の特定の標的核酸配列を認識するが、それにもかかわらず、リボザイムと同様に触媒性であり、標的核酸を特異的に切断するように、デザインされる。
活性が阻害されるべきであるc−MAFをコードするmRNAの翻訳を妨げるために標的mRNAの転写産物を触媒的に切断するためにデザインされたリボザイム分子もまた、使用され得る。リボザイムは、特定のRNAの切断を触媒することができる酵素的RNA分子である(概説として、Rossi,Current Biology 4:469−471,1994を参照のこと)。リボザイムの作用機序は、相補的な標的RNAへのリボザイム分子配列の特異的なハイブリダイゼーションとその後のエンドヌクレアーゼによる切断事象を含む。リボザイム分子の組成は、好ましくは、標的mRNAに相補的な1つまたは複数の配列およびmRNAの切断を担う周知の配列または機能的に等価な配列を含む(例えば、米国特許第5,093,246号を参照のこと)。
本発明の文脈において、「阻害性抗体」は、c−MAFタンパク質に特異的に結合して、上記タンパク質の機能の1つまたは複数、好ましくは、転写に関連する機能を阻害することができる任意の抗体と理解される。それらの抗体は、当業者に公知である任意の方法(そのうちのいくつかが上で述べられた)を使用して、調製され得る。したがって、ポリクローナル抗体は、阻害されるべきタンパク質で動物を免疫することによって調製される。モノクローナル抗体は、Kohler,Milsteinら(Nature,1975,256:495)によって記載された方法を用いて調製される。本発明の文脈において、好適な抗体としては、可変抗原結合領域および定常領域を含むインタクトな抗体、「Fab」、「F(ab’)2」および「Fab’」、Fv、scFvフラグメント、ダイアボディ、二重特異性抗体、アルファボディ、シクロペプチドおよびステープルドペプチドが挙げられる。いったん、c−MAFタンパク質結合能を有する抗体が同定されたら、このタンパク質の活性を阻害することができる抗体が、阻害剤識別アッセイを用いて選択される。
本明細書中で使用されるとき、用語「阻害性ペプチド」とは、上で説明されたようにc−MAFタンパク質に結合してその活性を阻害することができる、すなわち、c−MAFの遺伝子転写を活性化させることができることを妨げる、ペプチドのことを指す。
mafファミリーのタンパク質は、ホモ二量体化およびAP−1ファミリーの他のメンバー(例えば、FosおよびJun)とのヘテロ二量体化をすることができるので、c−MAF活性を阻害する1つの方法は、c−MAFと二量体化することができるが転写を活性化させる能力を欠くネガティブドミナントの使用によるものである。したがって、ネガティブc−MAFドミナントは、細胞に存在し、トランス活性化ドメイン(例えば、mafK、mafF、mafgおよびpi8)を含むアミノ末端の3分の2を欠く、任意の小さいmafタンパク質であり得る(Fujiwaraら(1993)Oncogene 8,2371−2380;Igarashiら(1995)J.Biol.Chem.270,7615−7624;Andrewsら(1993)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 90,11488−11492;Kataokaら(1995)Mol.Cell.Biol.15,2180−2190)(Kataokaら(1996)Oncogene 12,53−62)。
骨に転移しており、かつ上記転移においてc−MAFレベルが上昇している前立腺がんに罹患している患者は、破骨細胞活性の上昇によって引き起こされる骨分解の予防を目指した治療から特に利益を得ることができる。
別の態様において、本発明は、前立腺がんに罹患している被験体における前記がんの骨転移を予測するためのキットに関し、そのキットは:a)前記被験体のサンプル中のc−MAFの発現レベルを定量するための手段;およびb)前記サンプル中の定量されたc−MAFの発現レベルを参照c−MAF発現レベルと比較するための手段を備える。
a)前記被験体からサンプルを提供する工程;
b)前記サンプル中のc−MAFの発現レベルを定量する工程;
c)定量されたc−MAFの発現レベルをc−MAF発現の所定の参照レベルと比較することによって前記サンプルをタイプ分けする工程;
を含み、ここで、前記タイプ分けは、前記被験体における骨転移のリスクに関する予後情報を提供する。
c−MAF発現は、転移、特に骨転移のリスクに関連する。
免疫組織化学分析
c−MAF免疫染色を、コンピュータ処理されたアルゴリズムによってスコア付けした。各検体の9つの代表的な画像を、Nuance FX Multispectral Imaging System(CRI Inc)を備えたDM2000Leica顕微鏡を使用して420〜700nmにおいて10nm波長の間隔で取得した。ベールの法則の変換を使用して、参照キューブで除算したサンプルの比の負のlogを得ることによって、陽性シグナルを透過濃度から光学密度単位に変換した。コンピュータ支援閾値(computer−aided threshold)を設定した。それにより、すべての陽性シグナルを強調する疑似カラー画像が生成された。以前の解析によって、c−MAF発現の定量的測定が補助された。
これは、表4においてまとめられ、信頼区間を含めパーセンテージで表される。
本発明者らは、chr16q22−q24(c−MAFゲノム遺伝子座を含んでいた)の獲得が、前立腺がん患者における骨転移のリスクと関連するか否かを試験した。この目的のために、本発明者らは、この場合には、chr16q23およびchr14q32二重蛍光インサイチュハイブリダイゼーション(FISH)プローブによってchr16q22−q24増幅を同定する方法を使用して、chr16q22−24領域のコピー数を測定した。本発明者らはまた、chr14q32プローブを使用して、腫瘍倍数性を正規化した。
Claims (35)
- 前立腺腫瘍サンプル中のc−MAF遺伝子の発現レベルを、前立腺がんを有する被験体における転移のおよび/または前立腺がんを有する被験体において転移を起こす傾向の指標とするインビトロでの方法であって、前記方法は、
(i)前記被験体の前立腺腫瘍サンプル中の前記c−MAF遺伝子の発現レベルを定量する工程および
(ii)(i)において得られた発現レベルをコントロールサンプル中の前記c−MAF遺伝子の発現レベルと比較する工程を含み、
ここで前記腫瘍サンプル中の前記c−MAF遺伝子の発現レベルが、前記コントロールサンプル中の前記c−MAF遺伝子の発現レベルと比較して上昇している場合、前記被験体は、転移について陽性の診断を有するかまたは転移を起こす傾向がより高い、方法。 - 前立腺腫瘍サンプル中のc−MAF遺伝子の発現レベルを、前立腺がんを有する被験体のための個別化治療のデザインのための指標とするインビトロでの方法であって、
(i)前記被験体の前立腺腫瘍サンプル中の前記c−MAF遺伝子の発現レベルを定量する工程および
(ii)(i)において得られた発現レベルをコントロールサンプル中の前記c−MAF遺伝子の発現レベルと比較する工程を含み、
ここで前記腫瘍サンプル中の前記c−MAF遺伝子の発現レベルが、前記コントロールサンプル中の前記c−MAF遺伝子の発現レベルと比較して上昇している場合、前記被験体は、前記がんの転移の予防、阻害および/または処置を意図する治療を受けるのに適格である、方法。 - 前記転移が、骨転移である、請求項1または2に記載の方法。
- 前記骨転移が、溶骨性転移である、請求項3に記載の方法。
- 骨転移性腫瘍組織サンプル中のc−MAF遺伝子の発現レベルを、骨転移を有する前立腺がんを有する被験体のための個別化治療のデザインのための指標とするインビトロでの方法であって、
(i)前記被験体の骨転移性腫瘍組織サンプル中の前記c−MAF遺伝子の発現レベルを定量する工程および
(ii)工程(i)において得られた発現レベルをコントロールサンプル中の前記c−MAF遺伝子の発現レベルと比較する工程を含み、
ここで前記腫瘍組織サンプル中の前記c−MAF遺伝子の発現レベルが前記コントロールサンプル中の前記c−MAF遺伝子の発現レベルと比較して上昇している場合、前記被験体は、骨分解の予防または阻害を意図する治療を受けるのに適格である、方法。 - 前記骨分解を予防または阻害することが意図される薬剤が、ビスホスホネート、RANKLインヒビター、PTHまたはPTHLHインヒビター(中和抗体およびペプチドを包含する)、PRGアナログ、ラネル酸ストロンチウム、DKK−1インヒビター、METおよびVEGFR2の二重インヒビター、エストロゲンレセプター調節因子、カルシトニン、ラジウム−223、およびカテプシンKインヒビターからなる群より選択される、請求項5に記載の方法。
- 前記RANKLインヒビターが、RANKL特異的抗体、RANKL特異的ナノボディおよびオステオプロテゲリンからなる群より選択される、請求項6に記載の方法。
- 前記RANKL特異的抗体が、デノスマブである、請求項7に記載の方法。
- 前記ビスホスホネートが、ゾレドロン酸である、請求項6に記載の方法。
- 前記c−MAF遺伝子の発現レベルの定量が、前記遺伝子のメッセンジャーRNA(mRNA)または前記mRNAのフラグメント、前記遺伝子の相補DNA(cDNA)または前記cDNAのフラグメントを定量する工程を含む、請求項1〜9のいずれかに記載の方法。
- 前記発現レベルが、定量的ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)、またはDNAもしくはRNAアレイ、またはヌクレオチドハイブリダイゼーション技術によって定量される、請求項10に記載の方法。
- 前記c−MAF遺伝子の発現レベルの定量が、前記遺伝子によってコードされるタンパク質またはそのバリアントのレベルを定量する工程を含む、請求項1〜10のいずれかに記載の方法。
- 前記タンパク質のレベルが、ウエスタンブロット、ELISA、免疫組織化学またはタンパク質アレイによって定量される、請求項12に記載の方法。
- c−MAF遺伝子の増幅を、前立腺がんを有する被験体における転移の、および/または前立腺がんを有する被験体において転移を起こす傾向の指標とするインビトロでの方法であって、前記c−MAF遺伝子が、参照遺伝子コピー数と比較して前記被験体の腫瘍サンプルにおいて増幅しているかどうかを決定する工程を含み、ここで前記参照遺伝子コピー数と比較した前記c−MAF遺伝子の増幅は、転移の存在または転移を起こすリスクがより高いことを示す、方法。
- 前記c−MAF遺伝子の増幅が、遺伝子座16q22−q24の増幅を決定することによって決定される、請求項14に記載の方法。
- 前記c−MAF遺伝子の増幅が、c−MAF遺伝子特異的プローブを使用することによって決定される、請求項14または請求項15に記載の方法。
- 前記参照遺伝子コピー数が、転移に罹患していない被験体由来の前立腺がんの腫瘍組織サンプルのものである、請求項14〜16のいずれかに記載の方法。
- 前記増幅が、インサイチュハイブリダイゼーションまたはPCRによって決定される、請求項14〜17のいずれかに記載の方法。
- 前記転移が、骨転移である、請求項14〜18のいずれかに記載の方法。
- 前記骨転移が、溶骨性転移である、請求項19に記載の方法。
- 前立腺腫瘍サンプル中のc−MAFの発現レベルを、前立腺がんに罹患している被験体をコホートに分類することの指標とする方法であって、前記方法は、a)前記被験体の前立腺腫瘍サンプル中のc−MAFの発現レベルを決定する工程;およびb)前記サンプル中のc−MAFの発現レベルをc−MAF発現の所定の参照レベルと比較する工程;を含み、前記サンプル中のc−MAFの前記発現レベルに基づいて、前記被験体は、コホートに分類されることを特徴とし、ここで、前記サンプル中のc−MAFの発現レベルが、c−MAF発現の前記所定の参照レベルと比較して上昇している場合、前記コホートの被験体は、転移の上昇したリスクを有すると分類される、方法。
- 前記RANKL特異的ナノボディは、ALX−0141である、請求項7に記載の方法。
- 前記METおよびVEGFR2の二重インヒビターは、カボザンチニブである、請求項6に記載の方法。
- 前立腺がんに罹患している被験体における骨転移の処置のための医薬製品の調製における、骨分解を予防または阻害することができる薬剤の使用であって、ここで、前記被験体は、転移性腫瘍サンプルにおいてコントロールサンプルと比較して上昇したc−MAFレベルを有すると決定されており、ここで、前記薬剤は、RANKL特異的ナノボディALX−0141である、使用。
- 前立腺がんに罹患している被験体における骨転移の処置のための医薬製品の調製における、骨分解を予防または阻害することができる薬剤の使用であって、ここで、前記被験体は、転移性腫瘍サンプルにおいてコントロールサンプルと比較して上昇したc−MAFレベルを有すると決定されており、ここで、前記薬剤は、METおよびVEGFR2の二重インヒビターカボザンチニブである、使用。
- 前記c−MAF遺伝子特異的プローブは、Vysis LSI/IGH MAF Dual Color二重融合プローブである、請求項16に記載の方法。
- c−MAFの発現レベルを、前立腺がんに罹患している被験体から得たサンプルをタイプ分けするための指標とするインビトロでの方法であって、前記方法は、
前記サンプル中のc−MAFの発現レベルを定量する工程
を包含し、前記c−MAFの定量した発現レベルと、c−MAF発現の所定の参照レベルとを比較することによって、前記サンプルがタイプ分けされることを特徴とし、
ここで前記タイプ分けする工程は、前記被験体における骨転移のリスクに関連した予後情報を提供する、
方法。 - c−MAF遺伝子の転座を、前立腺がんに罹患している被験体における前立腺がんの骨転移の指標とするインビトロでの方法であって、前記方法は、前記c−MAF遺伝子が前記被験体から得た腫瘍サンプル中で転座しているか否かを決定する工程を包含し、ここで前記c−MAF遺伝子の転座は、骨転移の増大したリスクを示す、方法。
- c−MAF遺伝子の増幅を、骨転移を伴う前立腺がんを有する被験体の個別化治療のデザインの指標とするインビトロでの方法であって、前記c−MAF遺伝子が、参照遺伝子コピー数と比較して前記被験体の腫瘍サンプル中で増幅されているか否かを決定する工程を包含し、ここで前記参照遺伝子コピー数と比較しての前記c−MAF遺伝子の増幅は、前記被験体が、骨分解を予防または阻害することが意図された治療を受ける候補であることを示す、方法。
- 前記骨分解を予防することまたは阻害することが意図された薬剤は、ビスホスホネート、RANKLインヒビター、PTHまたはPTHLHインヒビター(中和抗体およびペプチドを包含する)、PRGアナログ、ラネル酸ストロンチウム、DKK−1インヒビター、METおよびVEGFRの二重インヒビター、エストロゲンレセプター調節因子、カルシトニン、ラジウム−223、およびカテプシンKインヒビターからなる群より選択される、請求項29に記載の方法。
- 前記RANKLインヒビターは、RANKL特異的抗体、RANKL特異的ナノボディ、およびオステオプロテゲリンからなる群より選択される、請求項30に記載の方法。
- 前記RANKL特異的抗体は、デノスマブである、請求項31に記載の方法。
- 前記ビスホスホネートは、ゾレドロン酸である、請求項30に記載の方法。
- c−MAFの前記発現レベルを定量するための手段は、前記c−MAF遺伝子、16q23遺伝子座もしくは16q22−16q24染色体領域を特異的に結合および/もしくは増幅するプローブおよび/もしくはプライマーのセットを含む、請求項27に記載の方法。
- 前記転移の予防、阻害および/または処置を意図する治療が、c−MAF阻害剤;化学療法、ホルモン療法および免疫療法を含むがこれらに限定されない全身性処置;放射線治療;手術;mTorインヒビター;Srcキナーゼインヒビター;COX−2インヒビター;アルファラディン;ビスホスホネート;RANKLインヒビター;PTHまたはPTHLHインヒビター、PRGアナログ;ラネル酸ストロンチウム;DKK−1インヒビター;METおよびVEGFR2の二重インヒビター;エストロゲンレセプター調節因子;カルシトニン;カテプシンKインヒビター;CCR5アンタゴニスト、およびこれらの組み合わせからなる群より選択される、請求項2に記載の方法。
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