JP6006235B2 - ジャイレースおよびトポイソメラーゼiv阻害剤を作製するプロセス - Google Patents
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Description
本願は、2011年1月14日に出願された米国仮特許出願第61/432,990号の利益を米国特許法§119の下、主張する。この出願の全内容が、参考として本明細書に援用される。
抗生物質に対する細菌耐性は、長い間認識されてきており、これは、今日では、深刻な世界的健康問題であると考えられている。耐性の結果として、いくつかの細菌感染症は、抗生物質で処置することが困難であり、または処置不能でさえある。この問題は、細菌のある特定の系統、例えば、Streptococcus pneumoniae(SP)、Mycobacterium tuberculosis、およびEnterococcusなどにおける多剤耐性の最近の展開を伴って特に深刻となっている。バンコマイシン耐性enterococcusの出現は、特に憂慮すべきことであった。その理由は、バンコマイシンは、以前は、この感染症を処置するための唯一の有効な抗生物質であり、多くの感染症にとって「最後の手段」の薬物であると考えられていたためである。enterococciなどの多くの他の薬物耐性細菌は、生命を危うくする疾患を引き起こさないが、耐性を誘発する遺伝子が、メチシリン耐性がすでに蔓延しているStaphylococcus aureusなどのより死に至る危険のある生物に蔓延し得るという恐怖がある(非特許文献1;非特許文献2)。
一実施形態において、本発明は、式(I)
式(II)のフェニルピリミジン化合物を、式AまたはB
式(I)の化合物を適切な酸と場合により反応させて、式(I)の化合物の薬学的に許容される塩を得るステップとを含む。
式(VI)の化合物のアミノ基をアミノ保護基により保護して、アミノ保護された化合物を得るステップと、
アミノ保護された化合物を適切なニトロ化剤によりニトロ化して、アミノ保護されたニトロ化合物を得るステップと、アミノ保護されたニトロ化合物を脱保護して、式(IV)のフェニルテトラヒドロフラン化合物を得るステップとを含む。
式(VIIIa)
パラジウム触媒の存在下、式(IX)の化合物を2,3−ジヒドロフランで処理して、ジヒドロフラニルニトロベンゼン化合物を得るステップとを含む。
を含む方法により調製することができる。
(式中、R6は、場合により置換されたアルキル、場合により置換されたアリール、場合により置換された飽和もしくは不飽和炭素環または場合により置換された飽和もしくは不飽和複素環である)の尿素誘導体と反応させて、式(I)の化合物を得るステップと、式(I)の化合物を適切な酸と場合により反応させて、式(I)の化合物の薬学的に許容される塩を得るステップとをさらに含むことができる。
例えば、本発明は、以下の項目を提供する。
(項目1)
式(I)
(式中、Rは、HもしくはFであり、R 3 、R 4 およびR 5 はそれぞれ独立して、場合により置換されたアルキルまたは場合により保護されたヒドロキシル基である)の化合物または薬学的に許容されるその塩を調製する方法であって、前記方法は、
式(II)
(式中、Rは、HまたはFであり、R 3 、R 4 およびR 5 はそれぞれ独立して、場合により置換されたアルキルまたは場合により保護されたヒドロキシル基である)のフェニルピリミジン化合物を提供するステップと、
前記式(II)のフェニルピリミジン化合物を、式AまたはB
(式中、R 6 は、場合により置換されたアルキル、場合により置換されたアリール、場合により置換された飽和もしくは不飽和炭素環または場合により置換された飽和もしくは不飽和複素環である)の尿素誘導体と反応させて、式(I)の化合物を得るステップと、
前記式(I)の化合物を適切な酸と場合により反応させて、式(I)の化合物の薬学的に許容される塩を得るステップと、
を含む、方法。
(項目2)
R 6 が、メチル、エチル、ベンジルまたはp−ニトロベンジルである、項目1に記載の方法。
(項目3)
前記反応が、ジオキサンおよびバッファーの混合物において75℃〜125℃で行われる、項目1に記載の方法。
(項目4)
前記バッファーが、pH3.5バッファーであり、前記反応が、還流において行われる、項目3に記載の方法。
(項目5)
式(II)のフェニルピリミジン化合物を提供する前記ステップが、式(IV)
(式中、Rは、HまたはFである)のフェニルテトラヒドロフラン誘導体を提供するステップと、
極性溶媒中においてパラジウム触媒の存在下、前記式(IV)のフェニルテトラヒドロフラン化合物を式(III)
(式中、R 3 、R 4 およびR 5 はそれぞれ独立して、場合により置換されたアルキルまたは場合により保護されたヒドロキシル基であり、B * は、
(R 1 およびR 2 はそれぞれ独立して、アルキルもしくはHである、またはOR 1 およびOR 2 は、これらが結合しているB原子と一緒になって、場合により置換された 5、6もしくは7員環を形成する)またはBF 3 X(Xは、任意の一価陽イオンである)である)のボロン酸誘導体と反応させて、式(V)
(式中、Rは、HまたはFであり、R 3 、R 4 およびR 5 はそれぞれ独立して、場合により置換されたアルキルまたは場合により保護されたヒドロキシル基である)のフェニルピリミジン化合物を得るステップと、
前記式(V)のフェニルピリミジン化合物を適切な還元剤で処理して、前記式(II)のフェニルピリミジン化合物を得るステップと、
を含む、項目1に記載の方法。
(項目6)
B * が、
(式中、環の炭素原子のそれぞれは、非置換であっても、1または2個のメチルまたはエチル基で置換されていてもよい)からなる群から選択される、項目5に記載の方法。
(項目7)
B * が、
である、項目6に記載の方法。
(項目8)
式(IV)のフェニルテトラヒドロフラン化合物を提供する前記ステップが、式(VI)
(式中、Rは、HまたはFである)の化合物を提供するステップと、
前記式(VI)の化合物を適切なニトロ化剤でニトロ化して、前記式(IV)のフェニルテトラヒドロフラン化合物を得るステップと、
を含む、項目5に記載の方法。
(項目9)
式(IV)のフェニルテトラヒドロフラン化合物を提供する前記ステップが、式(VI)
(式中、Rは、HまたはFである)の化合物を提供するステップと、
前記式(VI)の化合物のアミノ基をアミノ保護基により保護して、アミノ保護された化合物を得るステップと、
前記アミノ保護された化合物を適切なニトロ化剤によりニトロ化して、アミノ保護されたニトロ化合物を得るステップと、
前記アミノ保護されたニトロ化合物を脱保護して、前記式(IV)のフェニルテトラヒドロフラン化合物を得るステップと、
を含む、項目5に記載の方法。
(項目10)
式(II)のフェニルピリミジン化合物を提供する前記ステップが、式(V)
(式中、Rは、HまたはFであり、R 3 、R 4 およびR 5 はそれぞれ独立して、場合により置換されたアルキルまたは場合により保護されたヒドロキシル基である)のフェニルピリミジン誘導体を適切な還元剤により還元して、前記式(II)の化合物を得るステップをさらに含む、項目1に記載の方法。
(項目11)
前記式(VI)の化合物をニトロ化する前記ステップが、強酸の存在下、約20℃〜約50℃で前記式(VI)の化合物をNH 4 NO 3 と反応させて、化合物(IV)を得るステップを含む、項目9に記載の方法。
(項目12)
式(VI)の化合物を提供する前記ステップが、式(VII)
(式中、Rは、HまたはFである)の化合物を提供するステップと、
極性非プロトン溶媒中において前記式(VII)の化合物を臭素化剤と反応させて、前記式(VI)の化合物を得るステップと、
を含む、項目9に記載の方法。
(項目13)
前記式(VII)の化合物が、エナンチオマー富化されている、項目12に記載の方法。
(項目14)
式(VII)の化合物を提供する前記ステップが、式(VIIIa)
(式中、Rは、HまたはFである)の化合物および式(VIIIb)
(式中、Rは、HまたはFである)の化合物からなる群から選択されるジヒドロフラニルニトロベンゼン化合物を提供するステップと、
前記ジヒドロフラニルニトロベンゼン化合物を還元剤で処理して、前記式(VII)の化合物を得るステップと、
を含む、項目12に記載の方法。
(項目15)
ジヒドロフラニルニトロベンゼン化合物を提供する前記ステップが、式(IX)
(式中、Rは、HまたはFである)の化合物を提供するステップと、
パラジウム触媒の存在下、前記式(IX)の化合物を2,3−ジヒドロフランで処理して、前記ジヒドロフラニルニトロベンゼン化合物を得るステップと、
を含む、項目14に記載の方法。
(項目16)
式(II)
(式中、Rは、HまたはFであり、R 3 、R 4 およびR 5 はそれぞれ独立して、場合により置換されたアルキルまたは場合により保護されたヒドロキシル基である)の化合物。
(項目17)
式(V)
(式中、Rは、HまたはFであり、R 3 、R 4 およびR 5 はそれぞれ独立して、場合により置換されたアルキルまたは場合により保護されたヒドロキシル基である)の化合物。
(項目18)
式(I)
(式中、Rは、HもしくはFであり、R 3 、R 4 およびR 5 はそれぞれ独立して、場合により置換されたアルキルもしくは場合により保護されたヒドロキシル基である)の化合物または薬学的に許容されるその塩を調製する方法であって、
式(VIIIa)
(式中、Rは、HまたはFである)のジヒドロフラニルニトロベンゼン化合物を提供するステップと、
前記式(VIIIa)もしくは(VIIIb)またはこれらの組み合わせの化合物を、前記式(I)の化合物または薬学的に許容されるその塩に変換するステップと、
を含む、方法。
(項目19)
式(VIIIa)または(VIIIb)のジヒドロフラニルニトロベンゼン化合物を提供する前記ステップが、パラジウム触媒の存在下、式(IX)
(式中、Rは、HまたはFである)の化合物を2,3−ジヒドロフランと反応させて、前記ジヒドロフラニルニトロベンゼン化合物(VIIIa)または(VIIIb)を得るステップを含む、項目18に記載の方法。
(項目20)
前記式(VIIIa)または(VIIIb)の化合物を還元剤と反応させて、式(VII)
(式中、Rは、HまたはFである)の化合物を得るステップをさらに含む、項目19に記載の方法。
(項目21)
極性非プロトン溶媒中において前記式(VII)の化合物を臭素化剤と反応させて、前記式(VI)の化合物を得るステップをさらに含む、項目20に記載の方法。
(項目22)
前記式(VI)の化合物を適切なニトロ化剤によりニトロ化して、前記式(IV)のフェニルテトラヒドロフラン化合物を得るステップをさらに含む、項目21に記載の方法。
(項目23)
極性溶媒中においてパラジウム触媒の存在下、前記式(IV)のフェニルテトラヒドロフラン化合物を式(III)
(式中、R 3 、R 4 およびR 5 はそれぞれ独立して、場合により置換されたアルキルまたは場合により保護されたヒドロキシル基であり、B * は、
(R 1 およびR 2 はそれぞれ独立して、アルキルもしくはHである、またはOR 1 およびOR 2 は、これらが結合しているB原子と一緒になって、場合により置換された5、6もしくは7員環を形成する)またはBF 3 X(Xは、任意の一価陽イオンである)である)のボロン酸誘導体と反応させて、式(V)
(式中、Rは、HまたはFであり、R 3 、R 4 およびR 5 はそれぞれ独立して、場合により置換されたアルキルまたは場合により保護されたヒドロキシル基である)のフェニルピリミジン化合物を得るステップと、
前記式(V)のフェニルピリミジン化合物を適切な還元剤で処理して、前記式(II)のフェニルピリミジン化合物を得るステップと、
をさらに含む、項目22に記載の方法。
(項目24)
前記式(II)のフェニルピリミジン化合物を式AまたはB
(式中、R 6 は、場合により置換されたアルキル、場合により置換されたアリール、場合により置換された飽和もしくは不飽和炭素環または場合により置換された飽和もしくは不飽和複素環である)の尿素誘導体と反応させて、式(I)の化合物を得るステップと、
前記式(I)の化合物を適切な酸と場合により反応させて、前記式(I)の化合物の薬学的に許容される塩を得るステップと、
をさらに含む、項目23に記載の方法。
本願は、ジャイレース阻害剤および抗菌剤として有用な化合物および薬学的に許容されるその塩を調製する方法を対象とする。本願のジャイレース阻害剤は、米国特許第RE40245 E号明細書により一般的に網羅されており、式(I)
化合物7は、特異的なボロン酸エステルである。ボロン酸誘導体のこれらの例は、R1およびR2の置換パターンにおける可能なバリエーションの単なる例である。当業者であれば、多くの追加的な可能な改変を思い描くことができ、このような改変は全て、改変がパラジウム触媒による式(III)および(IV)の化合物間のカップリング反応に干渉しない限り、本願において企図される。
カップリング反応に干渉しない他のいかなる脱離基を用いてもよい。他の脱離基として、塩化物、ヨウ化物、トシレートおよびメシレートが挙げられる。
化合物11、12および13の合成経路
スキーム2は、化合物11、12および13を調製する方法を提供する。
2−(2−ニトロフェニル)−2,5−ジヒドロフラン(3a)および2−(2−ニトロフェニル)−2,3−ジヒドロフラン(3b)の不斉調製。
2−テトラヒドロフラン−2−イル−アニリン(4)の調製。
4−ブロモ−2−テトラヒドロフラン−2−イル−アニリン(5)の調製。
N−(4−ブロモ−2−ニトロ−6−テトラヒドロフラン−2−イル−フェニル)−2,2,2−トリフルオロ−アセトアミド(6)の調製。
4−ブロモ−2−ニトロ−6−テトラヒドロフラン−2−イル−アニリン(6a)の調製。
2−[5−(4−アミノ−3−ニトロ−5−テトラヒドロフラン−2−イル−フェニル)ピリミジン−2−イル]プロパン−2−オール(8)の調製。
2−[5−(3,4−ジアミノ−5−テトラヒドロフラン−2−イル−フェニル)ピリミジン−2−イル]プロパン−2−オール(9)の調製。
1−エチル−3−[5−[2−(1−ヒドロキシ−1−メチル−エチル)ピリミジン−5−イル]−7−テトラヒドロフラン−2−イル−1H−ベンゾイミダゾール−2−イル]尿素(11)の調製。
1−エチル−3−[5−[2−(1−ヒドロキシ−1−メチル−エチル)ピリミジン−5−イル]−7−[(2R)−テトラヒドロフラン−2−イル]−1H−ベンゾイミダゾール−2−イル]尿素(12)のキラルクロマトグラフィー単離。
1−エチル−3−[5−[2−(1−ヒドロキシ−1−メチル−エチル)ピリミジン−5−イル]−7−[(2R)−テトラヒドロフラン−2−イル]−1H−ベンゾイミダゾール−2−イル]尿素のメタンスルホン酸塩(13)の調製。
ワンポット脱保護/鈴木手順
2−[5−(4−アミノ−3−ニトロ−5−テトラヒドロフラン−2−イル−フェニル)ピリミジン−2−イル]プロパン−2−オール(8)の調製。
化合物22、23および24の合成経路
スキーム3は、化合物22、23および24を調製する方法を提供する。
3−フルオロ−2−テトラヒドロフラン−2−イル−アニリン(16)の調製。
4−ブロモ−3−フルオロ−2−テトラヒドロフラン−2−イル−アニリン(17)の調製。
N−(4−ブロモ−3−フルオロ−6−ニトロ−2−テトラヒドロフラン−2−イル−フェニル)−2,2,2−トリフルオロ−アセトアミド(18)の調製。
4−ブロモ−3−フルオロ−6−ニトロ−2−テトラヒドロフラン−2−イル−アニリン(19)の調製。
2−[5−(4−アミノ−2−フルオロ−5−ニトロ−3−テトラヒドロフラン−2−イル−フェニル)ピリミジン−2−イル]プロパン−2−オール(20)の調製。
2−[5−(4,5−ジアミノ−2−フルオロ−3−テトラヒドロフラン−2−イル−フェニル)ピリミジン−2−イル]プロパン−2−オール(21)の調製。
1−エチル−3−[6−フルオロ−5−[2−(1−ヒドロキシ−1−メチル−エチル)ピリミジン−5−イル]−7−テトラヒドロフラン−2−イル−1H−ベンゾイミダゾール−2−イル]尿素(22)の調製。
1−エチル−3−[6−フルオロ−5−[2−(1−ヒドロキシ−1−メチル−エチル)ピリミジン−5−イル]−7−[(2R)−テトラヒドロフラン−2−イル]−1H−ベンゾイミダゾール−2−イル]尿素(23)のキラルクロマトグラフィー単離。
1−エチル−3−[6−フルオロ−5−[2−(1−ヒドロキシ−1−メチル−エチル)ピリミジン−5−イル]−7−[(2R)−テトラヒドロフラン−2−イル]−1H−ベンゾイミダゾール−2−イル]尿素のメタンスルホン酸塩(24)の調製。
Claims (19)
- 式(I)
(式中、Rは、HもしくはFであり、R3、R4およびR5はそれぞれ独立して、場合により置換されたアルキルまたは場合により保護されたヒドロキシル基である)の化合物または薬学的に許容されるその塩を調製する方法であって、前記方法は、
式(II)
(式中、Rは、HまたはFであり、R3、R4およびR5はそれぞれ独立して、場合により置換されたアルキルまたは場合により保護されたヒドロキシル基である)のフェニルピリミジン化合物を提供するステップと、
前記式(II)のフェニルピリミジン化合物を、式AまたはB
(式中、R6は、場合により置換されたアルキル、場合により置換されたアリール、場合により置換された飽和もしくは不飽和炭素環または場合により置換された飽和もしくは不飽和複素環である)の尿素誘導体と反応させて、式(I)の化合物を得るステップと、
前記式(I)の化合物を適切な酸と場合により反応させて、式(I)の化合物の薬学的に許容される塩を得るステップと、
を含む、方法。 - R6が、メチル、エチル、ベンジルまたはp−ニトロベンジルである、請求項1に記載の方法。
- 前記反応が、ジオキサンおよびバッファーの混合物において75℃〜125℃で行われる、請求項1に記載の方法。
- 前記バッファーが、pH3.5バッファーであり、前記反応が、還流において行われる、請求項3に記載の方法。
- 式(II)のフェニルピリミジン化合物を提供する前記ステップが、式(IV)
(式中、Rは、HまたはFである)のフェニルテトラヒドロフラン誘導体を提供するステップと、
極性溶媒中においてパラジウム触媒の存在下、前記式(IV)のフェニルテトラヒドロフラン化合物を式(III)
(式中、R3、R4およびR5はそれぞれ独立して、場合により置換されたアルキルまたは場合により保護されたヒドロキシル基であり、B*は、
(R1およびR2はそれぞれ独立して、アルキルもしくはHである、またはOR1およびOR2は、これらが結合しているB原子と一緒になって、場合により置換された 5、6もしくは7員環を形成する)またはBF3X(Xは、任意の一価陽イオンである)である)のボロン酸誘導体と反応させて、式(V)
(式中、Rは、HまたはFであり、R3、R4およびR5はそれぞれ独立して、場合により置換されたアルキルまたは場合により保護されたヒドロキシル基である)のフェニルピリミジン化合物を得るステップと、
前記式(V)のフェニルピリミジン化合物を適切な還元剤で処理して、前記式(II)のフェニルピリミジン化合物を得るステップと、
を含む、請求項1に記載の方法。 - 前記式(VI)の化合物をニトロ化する前記ステップが、強酸の存在下、20℃〜50℃で前記式(VI)の化合物をNH4NO3と反応させて、化合物(IV)を得るステップを含む、請求項9に記載の方法。
- 前記式(VII)の化合物が、エナンチオマー富化されている、請求項12に記載の方法。
- 式(I)
(式中、Rは、HもしくはFであり、R3、R4およびR5はそれぞれ独立して、場合により置換されたアルキルもしくは場合により保護されたヒドロキシル基である)の化合物または薬学的に許容されるその塩を調製する方法であって、
式(VIIIa)または式(VIIIb)
(式中、Rは、HまたはFである)のジヒドロフラニルニトロベンゼン化合物を提供するステップと、
前記式(VIIIa)または(VIIIb)の化合物を還元剤と反応させて、式(VII)
(式中、Rは、HまたはFである)の化合物を得るステップと、
極性非プロトン溶媒中において前記式(VII)の化合物を臭素化剤と反応させて、前記式(VI)
(式中、Rは、HまたはFである)の化合物を得るステップと、
前記式(VI)の化合物を適切なニトロ化剤によりニトロ化して、前記式(IV)
(式中、Rは、HまたはFである)のフェニルテトラヒドロフラン化合物を得るステップと、
極性溶媒中においてパラジウム触媒の存在下、前記式(IV)のフェニルテトラヒドロフラン化合物を式(III)
(式中、R 3 、R 4 およびR 5 はそれぞれ独立して、場合により置換されたアルキルまたは場合により保護されたヒドロキシル基であり、B * は、
(R 1 およびR 2 はそれぞれ独立して、アルキルもしくはHである、またはOR 1 およびOR 2 は、これらが結合しているB原子と一緒になって、場合により置換された5、6もしくは7員環を形成する)またはBF 3 X(Xは、任意の一価陽イオンである)である)のボロン酸誘導体と反応させて、式(V)
(式中、Rは、HまたはFであり、R 3 、R 4 およびR 5 はそれぞれ独立して、場合により置換されたアルキルまたは場合により保護されたヒドロキシル基である)のフェニルピリミジン化合物を得るステップと、
前記式(V)のフェニルピリミジン化合物を適切な還元剤で処理して、前記式(II)
(式中、Rは、HまたはFであり、R 3 、R 4 およびR 5 はそれぞれ独立して、場合により置換されたアルキルまたは場合により保護されたヒドロキシル基である)のフェニルピリミジン化合物を得るステップと、
前記式(II)のフェニルピリミジン化合物を式AまたはB
(式中、R 6 は、場合により置換されたアルキル、場合により置換されたアリール、場合により置換された飽和もしくは不飽和炭素環または場合により置換された飽和もしくは不飽和複素環である)の尿素誘導体と反応させて、式(I)の化合物を得るステップと、
前記式(I)の化合物を適切な酸と場合により反応させて、前記式(I)の化合物の薬学的に許容される塩を得るステップと、
を含む、方法。
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