JP5822841B2 - 変異型のkrasまたはbraf遺伝子を含むがんの治療 - Google Patents
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Description
本出願は、2009年11月5日出願の米国特許出願第61/258518号および2010年9月13日出願の豪州特許出願第2010904107号に関連し、かつこれらからの優先権を主張するものであり、これらの出願のそれぞれの全内容が参照により本明細書に組み込まれている。
H、RおよびK;
D,E,NおよびQ;
V、IおよびL;
CおよびM;
S、T、P、AおよびG;ならびに
F、YおよびW。
免疫組織化学プロトコル
免疫組織化学を用いて、異なるドナーからの一範囲の腫瘍型の試料を含有する多腫瘍ヒト組織マイクロアレイを、ビオチン化されたヒト化SC104抗体異型に対する結合についてスクリーニングした。ビオチン化されたヒトIgG1アイソタイプを陰性対照染色に使用した。該抗体による免疫反応性を、染色強度および陽性細胞の百分率に基づいた4段階スケールの目視検査によって等級分けした。
異なるヒト患者からのいくつかの異なるがん型を、ヒト化SC104抗体(配列番号7/配列番号50)との結合について解析した。該ヒト化SC104抗体はヒト結腸がん組織に結合したが、ヒトアイソタイプ対照は結合せず、用いた結合条件の特異性が実証された(データは示していない)。Table2(表3)により、結腸がんにおいて陽性膜染色が最高75%まで認められたことが要約される。驚くべきことに、膵がんにおいて最高95%までの高頻度の陽性染色が認められ、他の固形腫瘍ではより低い程度であった。これに対して、消化管間質腫瘍では、染色は認められなかった。これらの結果により、該ヒト化SC104抗体は、結腸直腸、膵臓、卵巣および肺の悪性腫瘍の指標において、腫瘍診断に有用であることが示唆される。さらに、該ヒト化SC104抗体は、ヒトにおける結腸直腸、膵臓、卵巣および肺のがんの治療に有用であることが予想されうる。こうしたin vivoでの抗腫瘍効力は、マウス腫瘍異種移植モデルにおいて評価することもできる。
マウス異種移植として継代した原発性ヒト腫瘍のゲノムDNAを、KRAS遺伝子のエキソン1およびエキソン2において解析した。ヌクレオチドシーケンシング解析により、KRASタンパク質においてエキソンが正常にコードされているかまたは変異を活性化しているかどうかが明らかにされた。変異型KRAS試料の大部分は、異種接合であった。
フローサイトメトリーに基づく結合アッセイ
生存可能な腫瘍細胞および対照細胞(2x105、トリパンブルー排出によって決定される)を、96V-ウェルプレート(Eppendorf)中の100μlの緩衝液(PBSに加えて1%FCS)中、多様な濃度のマウスSC104、キメラSC104またはヒト化異型の三通り、およびヒトIgG1アイソタイプ(Sigma-Aldrich(登録商標))と共に、氷上、暗所で20分間インキュベートした。細胞を緩衝液で2回洗浄し、その後、キメラまたはマウスの抗体を検出するために、それぞれヤギ抗ヒトIgG(Fc-特異的、Sigma-Aldrich(登録商標)、FITCに結合されている)またはヤギ抗マウスIgG(Fc-特異的、Sigma-Aldrich(登録商標)、FITCに結合されている)を含有する100μlの緩衝液中で20分間インキュベートした。洗浄後、細胞を緩衝液に再懸濁し、Cell Lab Quanta(商標) SC MPL(Beckman Coulter)上でのフローサイトメトリーによってElectronic Volume(EV)、側方散乱光およびFL-1ゲートを使用して抗体結合について解析した;取得中、96-ウェルプレート中の細胞を、下に敷いた冷却パック(Eppendorf)によって冷却した。結果を平均蛍光強度(MFI)として示した;曲線勾配値は、GraphPad Prism(登録商標)ソフトウェアによる非線形回帰分析を使用して算出した。
Lymphoprep(商標)を製造業者のプロトコル(Axis-Shield PoC AS)に従って使用して、(Australian Red Cross Blood Servicesによって提供される)正常ヒトドナーのバフィーコート調製物からエフェクター(末梢血単核)細胞を精製した。生存可能なエフェクター細胞(5x106/ml)を、10%FCSを加えたRPMI1640(Gibco(登録商標))中、37℃、10%CO2で一晩インキュベートした。腫瘍標的細胞およびエフェクター細胞を、PBS中で洗浄し、その後、培地(RPMI1640 フェノールレッド不含、Gibco(登録商標)、0.5%FCS添加)中で洗浄して、培地に再懸濁し、96-ウェルUウェルプレート(Corning(登録商標))中の以下の最終濃度からなる200μlのアッセイ中、多様な濃度の抗体(キメラSC104、ヒト化SC104またはヒトIgG1アイソタイプ、Sigma-Aldrich(登録商標)、#I5154)と共に三通りでインキュベートした:標的細胞、1x105細胞/ml;エフェクター細胞、2.5x106細胞/ml;抗体範囲10から0.001μg/ml。対照としては、標的細胞のみを、1%Triton(登録商標)-X(Sigma-Aldrich(登録商標))の非存在下(最小標的)または存在下(最大標的)でインキュベートし、標的細胞およびエフェクター細胞(バックグラウンド)を、抗体の非存在下でインキュベートした。プレートを、160xgで2分間遠心処理して、加湿したCO2雰囲気中、37℃で4時間インキュベートした。乳酸デヒドロゲナーゼ放出アッセイを使用して細胞死を測定した。簡単に説明すると、プレートを250xgで5分間遠心処理し、Cytotoxicity Detection Kit(Roche)を製造業者の指針に従って使用して、100μlの細胞上清を乳酸デヒドロゲナーゼ放出について試験した。細胞の持ち越しの混入を最小限に抑えるために、該上清を、96-ウェルの0.2ミクロンAcroPrep(商標)プレート(Pall)に通して濾過した。LDH放出は、492nmにおける吸光度を読み取ることによって定量し、百分率の細胞傷害性は、以下の式を使用して算出した:100x[試料-平均(バックグラウンド)]/平均(最大標的-最小標的);EC50値は、GraphPad Prism(登録商標)ソフトウェアによる非線形回帰分析を使用して算出した。
生存可能な腫瘍標的細胞を、96-ウェル平ウェルプレート(Corning(登録商標))中の以下の最終濃度からなる150μlのアッセイ中、ヒト補体血清(Sigma-Aldrich(登録商標) #S1764)、および多様な濃度の抗体(キメラSC104、ヒト化SC104またはヒトIgG1アイソタイプ、Sigma-Aldrich(登録商標)、#I5154)を三通りで含む、培地(RPMI1640 フェノールレッド不含、Gibco(登録商標)、5%FCS添加)中でインキュベートした:標的細胞、13.3x104細胞/ml;補体、15%;抗体範囲10から0.01μg/ml。対照としては、標的細胞のみを、補体の非存在下(標的バックグラウンド)または存在下(標的および補体のバックグラウンド)でインキュベートし、補体(補体バックグラウンド)を、培地のみの中でインキュベートした。プレートを、160xgで2分間遠心処理して、加湿したCO2雰囲気中、37℃で2〜3時間インキュベートした。CellTiter 96(登録商標)キット(Promega(登録商標))を、3〜4時間のさらなるインキュベート時間を含む、製造業者の指針に従って使用して、細胞死を測定した。標的細胞の死は、492nmにおける吸光度を読み取ることによって定量し、百分率の細胞傷害性は、以下の式を使用して算出した:100x[試料-平均(標的および補体のバックグラウンド)]/[平均(補体のバックグラウンド)-平均(標的および補体のバックグラウンド)];EC50値は、GraphPad Prism(登録商標)ソフトウェアによる非線形回帰分析を使用して算出した。
結腸腫瘍細胞に対するヒト化SC104異型の細胞傷害性を、抗体依存性細胞媒介性細胞傷害性アッセイおよび補体依存性細胞傷害性アッセイにおいて試験した。該ヒト化SC104抗体異型および該キメラSC104抗体は、正常ヒトドナーの末梢血単核細胞を使用して、C170腫瘍細胞に対する強力な抗体依存性細胞媒介性細胞傷害性を有したが、ヒトアイソタイプ対照は有さなかった(図3)。他のヒトドナーからの末梢血単核細胞を使用しても同様の結果が得られた(データは示していない)。図4により、同一パネルのヒト化SC104抗体異型および該キメラSC104抗体は、ヒト補体を使用して、Colo205腫瘍細胞に対する強力な補体依存性細胞傷害性を有したが、ヒトアイソタイプ対照は有さなかったことが示される。Table 3(表4)に該ヒト化SC104抗体異型についての結合活性および殺滅活性をまとめている。
フローサイトメトリーに基づく直接殺滅アッセイ
生存可能な腫瘍細胞(2x105、トリパンブルー排出によって判定される)を、96V-ウェルプレート(Eppendorf)中の80μlの緩衝液(PBSに加えて1%FCS)中、多様な濃度のマウスSC104、キメラSC104またはヒト化異型の三通り、およびヒトIgG1アイソタイプ(Sigma-Aldrich(登録商標))と共に、室温、暗所で2.5から3時間インキュベートした。各ウェルに、20μlの緩衝液中、0.15gの7AAD(BD(登録商標) Biosciences)を添加して、細胞をさらに20分間インキュベートし、その後、Cell Lab Quanta(商標) SC MPL(Beckman Coulter)上でのフローサイトメトリーによってElectronic Volume(EV)、側方散乱光およびFL-3ゲートを使用して細胞生存率を試験した;取得中、96-ウェルプレート中の細胞を、下に敷いた冷却パック(Eppendorf)によって冷却した。結果を7AAD+細胞の百分率として示した;曲線勾配値は、GraphPad Prism(登録商標)ソフトウェアによる非線形回帰分析を使用して算出した。
フローサイトメトリーアッセイにおいて測定されるように、ヒト化してPotelligent(登録商標)で改変したSC104抗体(配列番号7/配列番号94)は、KRAS変異を有するかまたは有さないヒト膵腫瘍細胞系に結合してこれを直接的に殺滅する。
アッセイに使用されるヒト結腸がん細胞系
DLD-1(ATCCアクセッション番号CCL-221;KRAS変異体;BRAF野生型)、Colo201(ATCCアクセッション番号CCL-224;KRAS野生型;BRAF変異体)、Colo205(ATCCアクセッション番号CCL-222;KRAS野生型;BRAF変異体)、WiDr(ATCCアクセッション番号CCL-218;KRAS野生型;BRAF変異体)およびHT-29(ATCCアクセッション番号HTB-38;KRAS野生型;BRAF変異体)。これらの細胞系は、そのKRASまたはBRAF遺伝子内に変異を有することが知られている((Seth、Crookら 2009);(Davies、Logieら 2007))。
ヒト化SC104抗体(配列番号7/配列番号50)は、正常ヒトドナーの末梢血単核細胞を使用して、KRASまたはBRAFの変異を有する1パネルのヒト結腸がん細胞系に対する強力な抗体依存性細胞媒介性細胞傷害性を有したが、ヒトアイソタイプ対照は有さなかった。図5は、変異型のKRAS遺伝子を有するがBRAF遺伝子は野生型であることが知られている細胞系DLD-1の殺滅を示している。図6は、変異型のBRAF遺伝子を有するがKRAS遺伝子は野生型であることが知られている細胞系Colo201、Colo205、WiDrおよびHT-29の殺滅を示している。これらの細胞系および他のヒトドナー由来の末梢血単核細胞を使用して、同様の結果が得られた。ADCC作用は、実施例2に記載のように測定した。
SC104抗体のエフェクター機能の増強
抗体のエフェクター機能は、抗体依存性細胞媒介性細胞傷害性もしくは補体依存性細胞傷害性を増大させることによって、または抗体依存性細胞媒介性細胞傷害性と補体依存性細胞傷害性との組合せによって増強することができる。
抗体依存性細胞媒介性細胞傷害性(ADCC)活性の増強のために、抗体のFc領域に標準的な改変を用いて、SC104抗体異型およびキメラSC104を改変した。標準的な方法としては、例えば、抗体のFc領域のタンパク質改変または糖鎖改変などが挙げられる。
一連の試験において、キメラSC104抗体およびSC104ヒト化抗体異型の抗体依存性細胞媒介性細胞傷害性を増大させるために、タンパク質改変または糖鎖改変を適用した。未改変の抗体と比較して、Fcを改変した(配列番号53)またはキフネンシン処理したSC104ヒト化抗体異型およびキメラSC104抗体は、Colo205腫瘍細胞に対して増大された抗体依存性細胞媒介性細胞傷害性を示した。図7は、キフネンシン処理したヒト化SC104抗体(配列番号7/配列番号50)による、ヒト結腸がん細胞WiDr(ATCCアクセッション番号CCL-218)の著しく増加した殺滅の例を示している。
マウス異種移植腫瘍モデル
2x106個のヒト結腸がんHT-29細胞(ATCCアクセッション番号HTB-38)を、雌のBALB/cヌードマウスに皮下接種した。腫瘍細胞の接種(0日目)と同じ日に、マウスを、体重に基づいて2つの処理群に無作為化した(1群あたりn=10)。各群を、ビヒクル対照(PBS、10ml/kg)またはヒト化SC104抗体(10mg/kg)のいずれかで腹膜内に処理した。ビヒクル対照およびヒト化SC104抗体を、週2回、4週間投与した。以下の式を用いて、腫瘍体積を週3回算出した:体積(mm3)=長さx直径2xπ/6。
腫瘍を有するマウスをヒト化SC104抗体(配列番号7/配列番号50)で処理することにより、結果として、ビヒクル対照処理と比較して、腫瘍体積および腫瘍重量が有意に減少した(図8)。ヒト化SC104抗体異型は、単独療法または他の治療用抗腫瘍剤、例えば、化学療法、小分子または生物との併用のいずれとしても、ヒトにおける大腸がんの治療に有用であると予想することができる。こうした併用療法のin vivoでの効力は、マウス腫瘍異種移植モデルにおいて評価されうる。
競合アッセイ
SC104抗原陽性結腸がん細胞(Colo205;ホルムアルデヒド固定した細胞)を多様な濃度で競合抗体(ヒト化SC104異型 配列番号7/配列番号50または対照ヒトIgG1アイソタイプ)と共にインキュベートし、その後、固定の濃度(1μg/ml、上方パネル;10μg/ml、下方パネル)のFITC結合型マウスSC104抗体とインキュベートした;その後のシグナル解析は、フローサイトメトリー解析によって行った。
Claims (2)
- 対象における、変異型のKRASまたはBRAF遺伝子を含む結腸がんまたは膵がんを治療する方法において使用するための抗体またはその抗原結合性フラグメントであって、前記方法が、変異型のKRASまたはBRAF遺伝子の存在についてがんを試験するステップと、がんが変異型のKRASまたはBRAF遺伝子を含む対象に有効量の抗体またはその抗原結合性フラグメントを投与するステップとを含み、前記抗体またはその抗原結合性フラグメントが、配列番号7のV L 配列および配列番号25、50もしくは94のV H 配列を含むか、あるいは、配列番号8のV L 配列および配列番号26もしくは38のV H 配列を含む、抗体またはその抗原結合性フラグメント。
- 対象における、変異型のKRASまたはBRAF遺伝子を含む結腸がんまたは膵がんを治療するための医薬品の調製における、ヒト結腸がん細胞系Colo205に対する結合でSC104と競合する抗体またはその抗原結合性フラグメントの使用であって、前記治療が、変異型のKRASまたはBRAF遺伝子の存在についてがんを試験するステップと、がんが変異型のKRASまたはBRAF遺伝子を含む対象に有効量の抗体またはその抗原結合性フラグメントを投与するステップとを含み、前記抗体またはその抗原結合性フラグメントが、配列番号7のV L 配列および配列番号25、50もしくは94のV H 配列を含むか、あるいは、配列番号8のV L 配列および配列番号26もしくは38のV H 配列を含む、使用。
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