JP5777169B2 - 新規な蛍光色素およびその使用 - Google Patents
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Description
X1およびX2は独立にSまたはOであり;
Y1およびY2は独立にハロゲン、アルキル、ハロアルキル、アルコキシまたはアルケニルであるか、あるいは、Y1またはY2の一方はHであり、他方はハロアルキル基であり;
各々のWは独立にHまたはアルキルであり;
Z1はHまたはアルキルであり;
Z1、およびW基の1つは存在していなくてもよく、存在しない場合、環CのC4とC5との間の、点線で示す別の結合で置換されており;
Z2は、式−L−RGの標識置換基を含み、式中、Lは結合または連結基であり;
RGは、蛍光色素を別の分子に結合させることができる反応性基である。
Y1およびY2は独立にハロゲン、アルキル、ハロアルキル、アルコキシまたはアルケニルであり、
またはY1またはY2の一方はHであり、他方はハロアルキル基である。
したがって、本発明は、以下の項目を提供する:
(項目1)
式:
X 1 およびX 2 は独立にSまたはOであり;
Y 1 およびY 2 は独立にハロゲン、アルキル、ハロアルキル、アルコキシまたはアルケニルであるか、あるいは、Y 1 またはY 2 の一方はHであり、他方はハロアルキル基であり;
各々のWは独立にHまたはアルキルであり;
Z 1 はHまたはアルキルであり;
Z 1 、およびW基の1つは存在していなくてもよく、存在しない場合、環CのC 4 とC 5 との間の別の結合で置換されており;
Lは独立に結合または連結基であり;
RGは反応性基である、
蛍光色素。
(項目2)
上記連結基は、C原子、N原子、O原子、S原子、P原子およびハロゲン原子から選択される1〜50個の非水素原子を含む共有結合を含み、一重、二重、三重もしくは芳香族の炭素−炭素結合、炭素−酸素結合、炭素−硫黄結合、炭素−窒素結合、および窒素−窒素結合の任意の組み合わせからなり;
ここで、RGは、カルボン酸、カルボン酸の活性化エステル、酸無水物、酸クロリド、アシルアジド、アシルハライド、アルデヒド、クロロホルマート、アミン、ヒドロキシル、ヒドラジン、イソシアネート、イソチオシアネート、スルホニルハライド、トシル、マレイミド、N−ヒドロキシ−スクシンイミドエステル、アジリジン、イミン、およびジスルフィドからなる群から選択される反応性基を含む、
項目1に記載の蛍光色素。
(項目3)
上記連結基は、下記式:
R 1 C(O)R 2 であって、式中、R 1 は結合、または上記色素に結合したC 1〜10 メチレン(CH 2 )nであり、C(O)はカルボニル基であり、R 2 はOH、または上記カルボニル基を上記反応性基RGに結合する結合である、R 1 C(O)R 2 ;あるいは
R 1 C(O)A 1 R 3 C(O)R 2 であって、式中、R 1 は結合、またはC 1〜10 メチレンであり、C(O)はカルボニル基であり、A 1 はNH、SまたはOのいずれかであり、R 3 はアルケニル(CH 2 )n、少なくとも1つの不飽和結合を持つ5もしくは6員環、またはC 1〜10 メチレン(CH 2 )nと5もしくは6員環との組み合わせであり、R 2 はOH、または末端カルボニル基を上記反応性基RGに結合する結合である、R 1 C(O)A 1 R 3 C(O)R 2
を含む、項目1または2に記載の蛍光色素。
(項目4)
RGはカルボン酸、カルボン酸のスクシニミジルエステル、ヒドラジド、アミン、イソチオシアネートまたはマレイミドを含む、項目1〜3のいずれか1項に記載の蛍光色素。
(項目5)
式:
RはOH、スクシンイミドオキシ、NH(CH 2 )nCOOH、NH(CH 2 ) n CO−スクシンイミド、またはNH(CH 2 )n−マレイミドを表し、式中、n=1〜10である、
項目1に記載の蛍光色素。
(項目6)
式:
(項目7)
式:
RはOH、スクシンイミドオキシ、NH(CH 2 )nCOOH、NH(CH 2 ) n CO−スクシンイミド、またはNH(CH 2 )n−マレイミドを表し、式中、n=1〜10である、
項目1に記載の蛍光色素。
(項目8)
式:
(項目9)
式:
(項目10)
式:
(項目11)
式:
RはOH、スクシンイミドオキシ、NH(CH 2 )nCOOH、NH(CH 2 ) n CO−スクシンイミド、またはNH(CH 2 )n−マレイミドを表し、式中、n=1〜10である、項目1に記載の蛍光色素
(項目12)
式:
X 1 およびX 2 は独立にSまたはOであり;
Y 1 およびY 2 は独立にハロゲン、アルキル、ハロアルキル、アルコキシまたはアルケニルであるか、あるいは、Y 1 またはY 2 の一方はHであり、他方はハロアルキル基であり;
WはHまたはアルキルであり;
Lは独立に結合または連結基であり、上記連結基は、C原子、N原子、O原子、S原子、P原子およびハロゲン原子から選択される1〜50個の非水素原子を含む共有結合を含み、一重、二重、三重もしくは芳香族の炭素−炭素結合、炭素−酸素結合、炭素−硫黄結合、炭素−窒素結合、および窒素−窒素結合の任意の組み合わせからなり;
RGはカルボン酸、カルボン酸の活性化エステル、酸無水物、酸クロリド、アシルアジド、アシルハライド、アルデヒド、クロロホルマート、アミン、ヒドロキシル、ヒドラジン、イソシアネート、イソチオシアネート、スルホニルハライド、トシル、マレイミド、N−ヒドロキシ−スクシンイミドエステル、アジリジン、イミン、およびジスルフィドからなる群から選択される反応性基である、項目1に記載の蛍光色素。
(項目13)
約340nm〜約450nmの波長で励起され得る、項目1に記載の蛍光色素。
(項目14)
式:
X 1 およびX 2 は独立にSまたはOであり;
Y 1 およびY 2 は個別にH、ハロゲン、アルキル、ハロアルキル、アルコキシまたはアルケニルを表し、各々のWは独立にHまたはアルキルであり;
Z 1 はHまたはアルキルであり;
Z 1 、および上記W基の1つは存在していなくてもよく、存在しない場合、環CのC 4 とC 5 との間の別の結合で置換されており;
Lは独立に結合または連結基であり、上記連結基は、C原子、N原子、O原子、S原子、P原子およびハロゲン原子から選択される1〜50個の非水素原子を含む共有結合を含み、一重、二重、三重もしくは芳香族の炭素−炭素結合、炭素−酸素結合、炭素−硫黄結合、炭素−窒素結合、および窒素−窒素結合の任意の組み合わせからなり;
CMは、ペプチド、タンパク質、多糖、酵素、脂質、ヌクレオチド、オリゴヌクレオチドまたは核酸ポリマーを含む結合体化分子である、色素−結合体。
(項目15)
上記結合体化分子はペプチドまたはタンパク質である、項目14に記載の色素−結合体。
(項目16)
上記結合体化分子は抗体、または抗体のフラグメントである、項目14または15に記載の色素−結合体。
(項目17)
サンプル中の特異的結合対の相補的な構成要素を検出する方法であって:
a)上記相補的な構成要素に特異的に結合する項目14〜16のいずれか1項に記載の色素−結合体と上記サンプルを混合する工程;および
b)上記混合により形成される複合体を検出して上記相補的な構成要素を検出する工程
を含む、方法。
(項目18)
上記相補的な構成要素はタンパク質またはペプチドである、項目17に記載の方法。
(項目19)
上記相補的な構成要素は細菌、ウイルスまたは動物細胞に存在する、項目17または18に記載の方法。
(項目20)
上記複合体はその蛍光応答により検出される、項目17〜19のいずれか1項に記載の方法。
(項目21)
上記蛍光応答はフローサイトメーター、蛍光計、蛍光顕微鏡、または蛍光プレートリーダーを用いて検出される、項目20に記載の方法。
(項目22)
検出できる程度に異なる光学的特性を有する第2のフルオロフォアの蛍光応答と上記蛍光応答を識別する工程をさらに含む、項目20または21に記載の方法。
(項目23)
上記蛍光応答に基づき上記複合体を他のサンプル成分から分離する工程をさらに含む、項目20〜22のいずれか1項に記載の方法。
(項目24)
式:
Y 1 およびY 2 は独立にハロゲン、アルキル、ハロアルキル、アルコキシまたはアルケニルであるか
あるいは
Y1またはY 2 の一方はHであり、他方はハロアルキル基である、化合物。
本出願に使用する科学技術用語はすべて、他に記載がない限り、当該技術分野において一般的に使用される意味を有する。本出願に使用する場合、以下の語または表現は、以下に示した意味を有する。
本発明は、ホタルルシフェリンの構造をベースとし、いくつかの機能上の利点を有する蛍光色素のクラスを提供する。たとえば、本発明の蛍光色素は、より短い波長(340〜450nm)での励起に適合され、通常500nmと550nmとの間の最大発光、より狭い発光バンド幅、少なくとも約50nmの大きなストークスシフト、および他の好ましい蛍光特性も有する。
X1およびX2は独立にSまたはOであり;
Y1およびY2は独立にハロゲン、アルキル、ハロアルキル、アルコキシまたはアルケニルであるか、
または
Y1またはY2の一方はHであり、他方はハロアルキル基であり;
各々のWは独立にHまたはアルキルであり;
Z1はHまたはアルキルであり;
Z1、およびW基の1つは存在していなくてもよく、存在しない場合、環CのC4とC5との間の、点線で示す別の結合で置換されており;
Z2は、式−L−RGの標識置換基を含み、式中、Lは、色素を反応性基RGに接続する結合または連結基であり、連結基は、C原子、N原子、O原子、S原子、P原子およびハロゲン原子から選択される1〜50個の非水素原子を含む共有結合を含んでもよく、一重、二重、三重もしくは芳香族の炭素−炭素結合、炭素−酸素結合、炭素−硫黄結合、炭素−窒素結合、および窒素−窒素結合の任意の組み合わせからなり;RGは、カルボン酸基、カルボン酸の活性化エステル基、酸無水物基、酸クロリド基、アシルアジド基、アシルハライド基、アルデヒド基、クロロホルマート基、アミン基、ヒドロキシ基、ヒドラジン基、イソシアネート基、イソチオシアネート基、スルホニルハライド基、トシル基、マレイミド基、N−ヒドロキシ−スクシンイミドエステル基、アジリジン基、イミン基、およびジスルフィド基を含む。
Y1およびY2は独立にハロゲン、アルキル、ハロアルキル、アルコキシまたはアルケニルであるか、
または
Y1またはY2の一方はHであり、他方はハロアルキル基であり;
Z1はHまたはアルキルであり;
各々のWは独立にHまたはアルキルであり;
L−RGでは、Lは、色素を反応性基RGに接続する結合または連結基であり、連結基は、C原子、N原子、O原子、S原子、P原子およびハロゲン原子から選択される1〜50個の非水素原子を含む共有結合を含んでもよく、一重、二重、三重もしくは芳香族の炭素−炭素結合、炭素−酸素結合、炭素−硫黄結合、炭素−窒素結合、および窒素−窒素結合の任意の組み合わせからなり;
RGは、カルボン酸基、カルボン酸の活性化エステル基、酸無水物基、酸クロリド基、アシルアジド基、アシルハライド基、アルデヒド基、クロロホルマート基、アミン基、ヒドロキシ基、ヒドラジン基、イソシアネート基、イソチオシアネート基、スルホニルハライド基、トシル基、マレイミド基、N−ヒドロキシ−スクシンイミドエステル基、アジリジン基、イミン基、およびジスルフィド基を含んでもよい。
X1およびX2は独立にSまたはOであり;
Y1およびY2は独立にハロゲン、アルキル、ハロアルキル、アルコキシまたはアルケニルであるか;
または
Y1またはY2の一方はHであり、他方はハロアルキル基であり;
WはHまたはアルキルであり;
Lは、色素を反応性基RGに接続する結合または連結基であり、連結基は、C原子、N原子、O原子、S原子、P原子およびハロゲン原子から選択される1〜50個の非水素原子を含む共有結合を含んでもよく、一重、二重、三重もしくは芳香族の炭素−炭素結合、炭素−酸素結合、炭素−硫黄結合、炭素−窒素結合、および窒素−窒素結合の任意の組み合わせからなり;
式中、RGは、カルボン酸基、カルボン酸の活性化エステル基、酸無水物基、酸クロリド基、アシルアジド基、アシルハライド基、アルデヒド基、クロロホルマート基、アミン基、ヒドロキシ基、ヒドラジン基、イソシアネート基、イソチオシアネート基、スルホニルハライド基、トシル基、マレイミド基、N−ヒドロキシ−スクシンイミドエステル基、アジリジン基、イミン基、およびジスルフィド基を含んでもよい。
Y1およびY2は独立にハロゲン、アルキル、ハロアルキル、アルコキシまたはアルケニルであるか
または
Y1またはY2の一方はHであり、他方はハロアルキルであり;
WはHまたはアルキルであり;
Lは結合または連結基であり、連結基は、C原子、N原子、O原子、S原子、P原子およびハロゲン原子から選択される1〜50個の非水素原子を含む共有結合を含み、一重、二重、三重もしくは芳香族の炭素−炭素結合、炭素−酸素結合、炭素−硫黄結合、炭素−窒素結合、および窒素−窒素結合の任意の組み合わせからなり;
RGは反応性基であり、RGは、カルボン酸基、カルボン酸の活性化エステル基、酸無水物基、酸クロリド基、アシルアジド基、アシルハライド基、アルデヒド基、クロロホルマート基、アミン基、ヒドロキシ基、ヒドラジン基、イソシアネート基、イソチオシアネート基、スルホニルハライド基、トシル基、マレイミド基、N−ヒドロキシ−スクシンイミドエステル基、アジリジン基、イミン基、およびジスルフィド基を含んでもよい。
Y1およびY2は独立にハロゲン、アルキル、ハロアルキル、アルコキシまたはアルケニルであるか
または
Y1またはY2の一方はHであり、他方はハロアルキル基である。
X2はSまたはOであり;
各々のWは独立にHまたはアルキルであり;
Z1はHまたはアルキルであり;
LHはOHまたはNH(CH2)nCOOH(nは1〜10である)である。
X1およびX2は独立にSまたはOであり;
Y1およびY2は個別にH、ハロゲン、アルキル、ハロアルキル、アルコキシまたはアルケニルを表し、各々のWは独立にHまたはアルキルであり;
Z1はHまたはアルキルであり;
Z1、およびW基の1つは存在していなくてもよく、存在しない場合、環CのC4とC5との間の、点線で示す別の結合で置換されており;
Lは独立に結合または連結基であり、連結基は、C原子、N原子、O原子、S原子、P原子およびハロゲン原子から選択される1〜50個の非水素原子を含む共有結合を含み、一重、二重、三重もしくは芳香族の炭素−炭素結合、炭素−酸素結合、炭素−硫黄結合、炭素−窒素結合、および窒素−窒素結合の任意の組み合わせからなり;
CMは結合体化分子である。
本発明の一態様では、下記式(I)の蛍光色素を調製する方法を提供する。
X1およびX2は独立にSまたはOであり;
Y1およびY2は個別にH、ハロゲン、アルキル、ハロアルキル、アルコキシまたはアルケニルを表し、各々のWは独立にHまたはアルキルであり;
Z1はHまたはアルキルであり;
Z1、およびW基の1つは存在していなくてもよく、存在しない場合、環CのC4とC5との間の、点線で示す別の結合で置換されており;
Z2は式−L−RGの標識置換基を含み、式中、Lは独立に結合または連結基であり、連結基は、C原子、N原子、O原子、S原子、P原子およびハロゲン原子から選択される1〜50個の非水素原子を含む共有結合を含み、一重、二重、三重もしくは芳香族の炭素−炭素結合、炭素−酸素結合、炭素−硫黄結合、炭素−窒素結合、および窒素−窒素結合の任意の組み合わせからなり;
RGは、カルボン酸基、カルボン酸の活性化エステル基、酸無水物基、酸クロリド基、アシルアジド基、アシルハライド基、アルデヒド基、クロロホルマート基、アミン基、ヒドロキシル基、ヒドラジン基、イソシアネート基、イソチオシアネート基、スルホニルハライド基、トシル基、マレイミド基、N−ヒドロキシ−スクシンイミドエステル基、アジリジン基、イミン基、およびジスルフィド基からなる基から選択される反応性基である。
X2はSまたはOであり;
各々のWは独立にHまたはアルキルであり;
Z1はHまたはアルキルであり;
Lは、OまたはNH(CH2)nCOO(nは1〜10である)である
を持つ本発明の蛍光色素を、図2A〜2Dに図示する合成スキームを用いて合成してもよい。この方法は、下記ステップを含む:
(a)図2Bに示す方法を用いて、下記式を持つ色素のシアノベンゾチアゾール中間体を形成するステップ;
Y1およびY2は個別にH、ハロゲン、アルキル、ハロアルキル、アルコキシまたはアルケニルを表す。
(b)下記式:
X2はSまたはOであり;
各々のWは独立にHまたはアルキルであり;
Z1はHまたはアルキルであり;
LHはOHまたはNH(CH2)nCOOH(nは1〜10である)である、
の修飾アミノ酸とシアノベンゾチアゾール中間体を反応させることにより、色素のカルボキシル誘導体を形成して、
下記式のルシフェリン誘導体を生成するステップ:
X2はSまたはOであり;
Y1およびY2は個別にH、ハロゲン、アルキル、ハロアルキル、アルコキシまたはアルケニルを表し;
各々のWは独立にHまたはアルキルであり;
Z1はHまたはアルキルであり;
LHはOHまたはNH(CH2)nCOOH(nは1〜10である)である。
(c)LHのカルボキシル基のヒドロキシル官能基を反応性基で置換するステップ。
Y1およびY2は個別にH、ハロゲン、アルキル、ハロアルキル、アルコキシまたはアルケニルを表し;
RはHまたはアルキルである。
Y1およびY2は個別にH、ハロゲン、アルキル、ハロアルキル、アルコキシまたはアルケニルを表し;
RはHまたはアルキルである。
本発明は、サンプル中の特異的結合対の相補的な構成要素を検出する方法であって、相補的な構成要素に特異的に結合する本発明の色素−結合体と前記サンプルを混合すること;および、前記混合により形成された複合体を検出して、相補的な構成要素を検出することを含む、方法を提供する。本発明の方法は、サンプル中の分析物を検出および/または定量するために、本発明の反応性色素および色素−結合体などの蛍光色素の使用を含んでもよい。ある種の実施形態では、サンプルは、インタクトな細胞、細胞抽出物、細菌、ウイルス、オルガネラ、およびこれらの混合物など成分の不均質な混合物を含む。他の実施形態では、サンプルは、単一成分、または各成分の均質な群、たとえば、アミノ酸ポリマー、核酸ポリマー、炭水化物ポリマー、または脂質膜複合体などの生物学的ポリマーを含む。
本発明の一態様は、上記のような本発明の色素のいずれかを用いた様々なアッセイを実施しやすくする、キットの処方物である。本発明のキットは典型的には、色素−結合体の調製に有用な化学反応性標識として、あるいは、結合体化分子が特異的結合対の構成要素である色素−結合体として存在する本発明の蛍光色素を含む。選択される結合体化分子として、以下に限定されるものではないが、生体分子のポリマー(たとえば、タンパク質、核酸または炭水化物)が挙げられる。特定の実施形態では、表3および4に列挙される本発明の色素は、こうしたキットの調製に特に適している。
以下の例は、ホタルルシフェリンのジハロ誘導体、およびそのそれぞれのNHSエステルを合成する一般的な方法を説明するものである。
以下は、5,7−ジクロロ−6−ヒドロキシ−2−シアノベンゾチアゾールの調製手順である。5,7−ジフルオロ−6−ヒドロキシ−2−シアノベンゾチアゾールの調製も、同じ手順に従って実施し、非常に類似した結果が得られた。
1A Y=Cl 1H NMR(400MHz,CDCl3):δ 6.601(s,2H),3.811(s,3H),3.6−3.7(ブロード(broad) s,2H)
1B Y=F 1H NMR(400MHz,CDCl3):δ 6.22(m,2H),3.860(s,3H),3.6−3.7(ブロード s,2H) 。
2A Y=Cl 1H NMR(400MHz,CDCl3):δ 7.203(s,2H),3.933(s,3H)
2B Y=F 1H NMR(400MHz,CDCl3):δ 6.87(m,2H),4.030(s,3H) 。
3A Y=Cl 1H NMR(400MHz,CDCl3):δ 8.194(s,1H),4.027(s,3H)
3B Y=F 1H NMR(400MHz,CDCl3):δ 7.981(dd,J=10Hz & 1.6Hz,1H),4.156(s,3H) 。
4A Y=Cl 1H NMR(400MHz,アセトン−d6):δ 8.313(s)
4B Y=F 1H NMR(400MHz,アセトン−d6):δ 8.385(dd,J=10.4Hz & 1.6Hz) 。
n=0 1H NMR(400MHz,CDCl3):8.389(s,0.88H),8.328(s,0.12H),6.932(m,0.15H),6.383(m,0.82),4.620(s,0.82H),4.367(s,0.15H),4.030(dd,J=18.4Hz & 5.2Hz,1H),3.91(m,1H),2.00−1.94(m,6H),1.70−1.59(m,3H),1.47(m,12H)
n=1 1H NMR(400MHz,CDCl3):8.358(s,0.79H),8.291(s,0.15H),6.973(m,0.15H),6.486(m,0.78),4.418(s,0.80H),4.313(s,0.13H),3.6−3.4(m,2H),2.43(m,2H),2.00−1.94(m,6H),1.68−1.60(m,3H),1.44(m,12H) 。
n=0 1H NMRにより、生成物の異性体混合物が示された。1H NMR(400MHz,D2O):4.128 & 4.083(s,1H),4.043 & 4.000(s,2H),1.557(s,3H),1.481(s,3H)
n=1 1H NMR(400MHz,D2O):3.702(s,1H),3.45−3.38(m,1H),3.27−3.19(m,1H),2.441(m,2H),1.295(s,3H),1.233(s,3H) 。
これは、基本的なルシフェリン構造を調製する典型的な手順である。
6A 1H NMR(400MHz,CD3OD):7.688(dd,J=11Hz & 1.4Hz,1H),5.017(dd,J=10.2Hz & 8.2Hz,1H),4.774(m,2H)
6B 1H NMR(400MHz,CDCl3):7.795(dd,J=10Hz & 1.6Hz,1H),3.932(d,J=11.8Hz,1H),3.434(d,J=11.8Hz,1H),1.688(s,3H)
6C 1H NMR(400MHz,CD3OD):7.646(dd,J=10.4Hz & 1.2Hz,1H),4.935(s,1H),1.778(s,3H),1.488(s,3H)
6D 1H NMR(400MHz,CD3OD):8.379(ブロード s,1H),7.658(d,J=10Hz,1H),4.758(s,1H),4.000(d,J=6Hz,2H),1.829(s,3H),1.448(s,3H)
6E 1H NMR(400MHz,CD3OD):8.190(ブロード s,1H),7.647(d,J=10.4Hz,1H),4.705(s,1H),3.56−3.50(m,2H),2.558(t,J=6.6Hz,2H),1.814(s,3H),1.395(s,3H)
6F 1H NMR(400MHz,CD3OD):8.271(ブロード s,1H),8.093(s,1H),4.794(s,1H),3.610(m,2H),2.640(t,J=6.6Hz,2H),1.898(s,3H),1.478(s,3H)
6G 1H NMR(400MHz,アセトン−d6):9.838(s,1H),7.810(dd,J=10.8Hz,& 1.6Hz,1H),5.504(t,J=9.2Hz,1H),3.860(m,2H)
6H 1H NMR(400MHz,DMSO−d6):8.266(s,1H),5.007(s,1H),1.725(s,1H),1.447(s,1H)
6I 1H NMR(400MHz,アセトン−d6):8.149(s,1H),5.505(t,J=9.2Hz,1H),3.855(m,2H) 。
7B 1H NMR(400MHz,CDCl3):7.650(m,1H),4.093(d,J=11.4Hz,1H),3.481(d,J=11.4Hz,1H),1.814(s,3H)
7C 1H NMR(400MHz,CDCl3):7.660(dd,J=10.2Hz & 1.4Hz,1H),5.153(s,1H),2.858(s,4H),1.874(s,3H),1.653(s,3H)
7D 1H NMR(400MHz,CDCl3):7.678(d,J=10Hz,1H),7.608(ブロード s,1H),4.713(s,1H),4.614(dd,J=18Hz & 6.6Hz,1H),4.389(dd,J=18Hz & 5.4Hz,1H0,2.829(s,4H),1.907(s,3H),1.447(s,3H)
7E 1H NMR(400MHz,CDCl3):,7.670(d,J=10Hz,1H),7.616(ブロード s,1H),4.660(s,1H),3.82−3.65(m,2H),2.899(t,J=6Hz,2H),2.789(s,4H),1.899(s,3H),1.412(s,H)
7F 1H NMR(400MHz,CDCl3):8.073(s,1H),7.653(ブロード s,1H),4.699(s,1H),3.9−3.7(m,2H),2.932(t,J=6.0Hz,2H),2.820(s,4H),1.940(s,3H),1.451(s,3H)
7G 1H NMR(400MHz,アセトン−d6):7.840(dd,J=10.0Hz & 1.6Hz,1H),5.962(dd,J=10.2Hz & 8.2Hz,1H),4.127(t,J=10.8Hz,1H),3.914(dd,J=11.6Hz & 8Hz,1H),2.935(s,4H)
7H 1H NMR(400MHz,アセトン−d6):8.13(s,1H),5.59(s,1H),2.33(s,4H),1.89(s,3H),1.64(s,3H)
7J 1H NMR(400MHz,アセトン−d6):9.53(ブロード s,1H),8.10(s,1H),7.78(m,1H),4.69(s,1H),3.22−3.42(m,2H),2.81(s,4H),2.62(t,2H),1.86(s,3H),1.76−1.69(m,2H),1.63−1.56(m,2H),1.50−1.44(m,2H),1.42(s,3H) 。
R=H 1H NMR(400MHz,CDCl3):8.295(s,1H),7.992(s,1H),4.436(q,J=7Hz,2H),1.414(t,J=7Hz,3H)
R=Me メチルエステル 1H NMR(400MHz,CDCl3):7.964(s,1H),3.951(s,3H),2.837(s,3H) 。
10A 1H NMR(400MHz,CD3OD):8.518(s,1H),8.001(s,1H)
10B 1H NMR(400MHz,CD3OD):7.965(s,1H),2.810(s,3H) 。
3−クロロ−2−メトキシアニリンアッペル塩:1H NMR(400MHz,CDCl3):7.224(m,1H),7.068(t,J=8.2Hz,1H),6.988(d,J=8Hz,1H),3.809(s,3H)
2−シアノ−5−クロロ−4−メトキシベンゾチアゾール:1H NMR(400MHz,CDCl3):7.591(d,J=8.4Hz,1H),7.521(d,J=8.8Hz,1H),4.349(s,3H)
2−シアノ−5−クロロ−4−ヒドロキシベンゾチアゾール:1H NMR(400MHz,CDCl3):7.576(d,J=8.4Hz,1H),7.416(d,J=8.4Hz,1H),6.702(s,1H)
5−クロロ−4−ヒドロキシジメチルルシフェリン酸(11A):1H NMR(400MHz,CDCl3):7.451(d,J=8.4Hz,1H),7.370(d,J=9.2Hz,1H),6.689(s,1H),4.903(s,1H),1.886(s,3H),1.528(s,3H)
5−クロロ−4−ヒドロキシジメチルルシフェリンのNHSエステル(11B):1H NMR(400MHz,CDCl3):7.425(d,J=8.8Hz,1H),7.354(d,J=8.4Hz,1H),6.707(s,1H),5.157(s,1H),2.855(s,4H),1.882(s,3H),1.659(s,3H) 。
4−クロロ−3−メトキシアニリンアッペル塩(12A):1H NMR(400MHz,CDCl3):7.396(d,J=8.8Hz,1H),6.78−6.76(m,2H),3.882(s,3H)
2−シアノ−6−クロロ−5−メトキシベンゾチアゾール(12B):1H NMR(400MHz,CDCl3):7.929(s,1H),7.636(s,1H),3.988(s,3H)
2−シアノ−6−クロロ−5−ヒドロキシベンゾチアゾール(12C):1H NMR(400MHz,CDCl3):7.927(s,1H),7.792(s,1H),5.852(s,1H)
6−クロロ−5−ヒドロキシジメチルルシフェリン酸(12D):1H NMR(400MHz,CD3OD):7.980(s,1H),7.511(s,1H),4.927(s,1H),1.778(s,3H),1.489(s,3H) 。
3,5−ジメチル−4−メトキシアニリン(13A):1H NMR(400MHz,CDCl3):6.320(s,2H),3.615(s,3H),2.167(s,6H)
3,5−ジメチル−4−メトキシアニリンアッペル塩(13B):1H NMR(400MHz,CDCl3):6.905(s,2H),3.711(s,3H),2.278(s,6H)
2−シアノ−5,7−ジメチル−6−メトキシベンゾチアゾール(13C):1H NMR(400MHz,CDCl3):7.845(s,1H),3.782(s,3H),2.488(s,3H),2.429(s,3H)
2−シアノ−5,7−ジメチル−6−ヒドロキシベンゾチアゾール(13D):1H NMR(400MHz,CDCl3):7.805(s,1H),5.2(ブロード s,1H),2.443(s,3H),2.401(s,3H)
5,7−ジメチル−6−ヒドロキシジメチルルシフェリン酸(13E):1H NMR(400MHz,CD3OD):7.641(s,1H),4.905(s,1H),2.401(s,3H),2.333(s,3H),1.777(s,3H),1.491(s,3H) 。
4−メトキシ−3−トリフルオロメチルアニリンアッペル塩(14A):1H NMR(400MHz,CDCl3):7.522(d,J=2.4Hz,1H),7.424(dd,J=8.6Hz & 2.6Hz,1H),7.064(d,J=9.2Hz,1H),3.916(s,3H)
2−シアノ−5−トリフルオロメチル−6−メトキシベンゾチアゾール(14B):1H NMR(400MHz,CDCl3):8.384(s,1H),7.451(s,1H),4.033(s,3H)
2−シアノ−7−トリフルオロメチル−6−メトキシベンゾチアゾール(14C):1H NMR(400MHz,CDCl3):8.313(d,J=8.8Hz,1H),7.374(d,J=9.2Hz,1H),3.997(s,3H)
2−シアノ−5−トリフルオロメチル−6−ヒドロキシベンゾチアゾール(14D):1H NMR(400MHz,CDCl3):8.368(s,1H),7.492(s,1H)
5−トリフルオロメチル−6−ヒドロキシジメチルルシフェリン酸(14E):1H NMR(400MHz,CD3OD):8.168(s,1H),7.479(s,1H),4.927(s,1H),1.779(s,3H),1.492(s,3H)
5−トリフルオロメチル−6−ヒドロキシジメチルルシフェリンのNHSエステル(14F):1H NMR(400MHz,CDCl3):8.278(s,1H),7.445(s,1H),5.148(s,1H),2.861(s,4H),1.874(s,3H),1.653(s,3H) 。
HORIBA Jobin Yvon Fluoromax(登録商標)−3スペクトロメーターで蛍光測定実験を行った。他に記載がない限り、通常励起波長を405nmに設定した。励起および発光スリットは1nmであった。25mM トリス、pH8.0緩衝液中の20μMの色素の溶液を用いて蛍光スペクトルを取得し、表6に示す最大発光の波長で強度を決定した。
以下の例は、本発明の蛍光色素を抗体分子に結合体化する方法を説明するものである。
以下の例は、フローサイトメトリーにおける抗体−色素結合体の使用方法を提供するものである。
本発明の抗体−色素結合体の様々な組成物の最適な量(滴定により個別に決定される)を、全血(0.1mL)を含む生物学的標本と独立に組み合わせて、10〜15分間インキュベートし、VersaLyse(商標)溶解試薬を用いて標準的な手順により処理し、フローサイトメーターにより解析した。簡単に説明すると、処理した生物学的標本をVersaLyse(商標)試薬/0.2%ホルムアルデヒド(1mL)と10分間化合し、処理した標本を遠心沈殿させ(spin down)、上清を吸引し、ペレットをPBS(2mL)に再懸濁し、細胞懸濁液を遠心沈殿させ、ペレットをPBS/0.1%ホルムアルデヒド(1mL)に再懸濁して解析を行った。フローサイトメトリーにより前方散乱特徴と側方散乱特徴とに基づき、リンパ球集団を選択した。亜集団は、特異的モノクローナル抗体を用いて特定した。蛍光シグナルは、結合体の蛍光発光スペクトルに基づき選択した適切なバンドパスフィルターを用いて集めた。
選択した事例で、405nmレーザー線、CD8−Pacific Blue(商標)色素−結合体、および本発明のCD4−ルセフェリン誘導体色素を用いて、2カラーフロー解析を同様に行った。結果を、CD8−Pacific Blue色素結合体、およびCD4−Pacific Orange色素(Invitrogen Corporation)の対応する性能と比較した。図4に示すように、抗体−色素2結合体は、抗体−Pacific Orange(商標)結合体のシグナルと比較してより明るいシグナルを示した。
本発明の色素の1つ(色素3)について、405nmレーザー、488nmレーザーおよび635nmレーザーを備えた3レーザー10カラーPMT機器を用いて、10カラーへの適用も証明した。550/40nmバンドパスフィルターを用いて、光電子増倍管への蛍光出力を収集した。以下の抗体試薬を使用した:
1. CD45(RA)−FITC
2. CD56−PE
3. CD45(RO)−ECD
4. CD25−PC5
5. CD19−PC7
6. CD3−APC
7. CD27−APCA700
8. CD5−APCCy7
9. CD8−Pacific Blue
10. CD4−Pacific Orange/CD4−色素3。
Claims (21)
- 式:
を有する、蛍光色素であって、式中、
X1およびX2は独立にSまたはOであり;
Y1およびY2は独立にハロゲンであり;
各々のWは独立にHまたはアルキルであり;
Z1はHまたはアルキルであり;
Z1、およびW基の1つは存在していなくてもよく、存在しない場合、環CのC4とC5との間の別の結合で置換されており;
Lは独立に結合または連結基であり、
ここで、前記連結基は、C原子、N原子、O原子、S原子、P原子およびハロゲン原子から選択される1〜50個の非水素原子を含み、一重、二重、三重もしくは芳香族の炭素−炭素共有結合、炭素−酸素共有結合、炭素−硫黄共有結合、炭素−窒素共有結合、および窒素−窒素共有結合の任意の組み合わせからなり;
RGは反応性基であり、
ここで、RGは、
−C(O)Cl、−C(O)N=N + =N − 、−C(O)−ハライド、−C(O)H、−OC(O)Cl、−NH−NH 2 、−N=C(O)、−N=C=S、−SO 2 −ハライド、
からなる群から選択される、
蛍光色素。 - 前記連結基は、下記式:
R1C(O)R2であって、式中、R1は結合、または前記色素に結合したC1〜10メチレンであり、C(O)はカルボニル基であり、R2は前記カルボニル基を前記反応性基RGに結合する結合である、R1C(O)R2;あるいは
R1C(O)A1R3C(O)R2であって、式中、R1は結合、またはC1〜10メチレンであり、C(O)はカルボニル基であり、A1はNH、SまたはOのいずれかであり、R3はアルケニル、少なくとも1つの不飽和結合を持つ5もしくは6員環、またはC1〜10メチレンと5もしくは6員環との組み合わせであり、R2は末端カルボニル基を前記反応性基RGに結合する結合である、R1C(O)A1R3C(O)R2
を含む、請求項1に記載の蛍光色素。 - RGが、
、−NH−NH 2 、−N=C=Sおよび
からなる群より選択される、請求項1〜2のいずれか1項に記載の蛍光色素。 - 式:
を有し、式中、
Rは
NH(CH2)nCO−スクシンイミド、またはNH(CH2)n−マレイミドを表し、式中、n=1〜10である、
請求項1に記載の蛍光色素。 - 式:
- 式:
を有し、式中、
Rは
NH(CH2)nCO−スクシンイミド、またはNH(CH2)n−マレイミドを表し、式中、n=1〜10である、
請求項1に記載の蛍光色素。 - 式:
を有する、請求項1に記載の蛍光色素。 - 式:
を有する、請求項1に記載の蛍光色素。 - 式:
を有する、請求項1に記載の蛍光色素。 - 式:
を有し、式中、
X1およびX2は独立にSまたはOであり;
Y1およびY2は独立にハロゲンであり;
WはHまたはアルキルであり;
Lは独立に結合または連結基であり、前記連結基は、C原子、N原子、O原子、S原子、P原子およびハロゲン原子から選択される1〜50個の非水素原子を含み、一重、二重、三重もしくは芳香族の炭素−炭素共有結合、炭素−酸素共有結合、炭素−硫黄共有結合、炭素−窒素共有結合、および窒素−窒素共有結合の任意の組み合わせからなり;
RGは
−C(O)Cl、−C(O)N=N + =N − 、−C(O)−ハライド、−C(O)H、−OC(O)Cl、−NH−NH 2 、−N=C(O)、−N=C=S、−SO 2 −ハライド、
からなる群から選択される反応性基である、請求項1に記載の蛍光色素。 - 式:
を有する、色素−結合体であって、式中、
X1およびX2は独立にSまたはOであり;
Y1およびY2は個別にハロゲンを表すか、あるいは、Y1またはY2の一方はHであり、他方はハロアルキル基であり;
各々のWは独立にHまたはアルキルであり;
Z1はHまたはアルキルであり;
Z1、および前記W基の1つは存在していなくてもよく、存在しない場合、環CのC4とC5との間の別の結合で置換されており;
Lは独立に結合または連結基であり、前記連結基は、C原子、N原子、O原子、S原子、P原子およびハロゲン原子から選択される1〜50個の非水素原子を含み、一重、二重、三重もしくは芳香族の炭素−炭素共有結合、炭素−酸素共有結合、炭素−硫黄共有結合、炭素−窒素共有結合、および窒素−窒素共有結合の任意の組み合わせからなり;
CMは、ペプチド、タンパク質、多糖、酵素、脂質、ヌクレオチド、オリゴヌクレオチドまたは核酸ポリマーである結合体化分子である、色素−結合体。 - 前記結合体化分子はペプチドまたはタンパク質である、請求項11に記載の色素−結合体。
- 前記結合体化分子は抗体、または抗体のフラグメントである、請求項11または12に記載の色素−結合体。
- サンプル中の、請求項11〜13のいずれか1項に定義されている結合体化分子に特異的に結合する構成要素を検出する方法であって:
a)請求項11〜13のいずれか1項に記載の色素−結合体と前記サンプルを混合して複合体を形成する工程;および
b)前記複合体を検出して前記構成要素を検出する工程を含む、方法。 - 前記構成要素はタンパク質またはペプチドである、請求項14に記載の方法。
- 前記構成要素は細菌、ウイルスまたは動物細胞に存在する、請求項14または15に記載の方法。
- 前記複合体はその蛍光応答により検出される、請求項14〜16のいずれか1項に記載の方法。
- 前記蛍光応答はフローサイトメーター、蛍光計、蛍光顕微鏡、または蛍光プレートリーダーを用いて検出される、請求項17に記載の方法。
- 前記蛍光応答に基づき前記複合体を他のサンプル成分から分離する工程をさらに含む、請求項17〜18のいずれか1項に記載の方法。
- 式:
を有する化合物であって、式中、
Y1およびY2は独立にハロゲンであり、Y1はY2と異なるか
あるいは
Y1またはY2の一方はHであり、他方はハロアルキル基である、化合物。 - 前記RGは、
から選択される官能基を含む、請求項1に記載の蛍光色素。
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