JP5711280B2 - 食品の酵素漂白における使用向け新規酵素 - Google Patents
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Description
1)配列番号08〜12のいずれか1つに従う単離ポリペプチド又はその任意の機能的等価物、
2)配列番号01〜07のいずれか1つに従うポリヌクレオチド又はその任意の機能的等価物又は前記ポリヌクレオチドを含んでなるベクター又はその任意の機能的等価物を然るべき宿主細胞、例えばアスペルギルス・ニガー中で発現させることにより得られる単離ポリペプチド、及び
3)配列番号13〜17の少なくとも1つを含んでなるポリペプチド
からなる群より選択される1つ又は複数の特性とを有する単離ポリペプチドに関する。
本発明は、配列番号08〜12のいずれか1つに従うアミノ酸配列、ならびに配列番号01〜07のポリヌクレオチドを然るべき宿主中で発現することにより得られるアミノ酸配列を有する単離ポリペプチドを提供する。また、上記のポリペプチドの機能的等価物を含んでなるペプチド又はポリペプチドも本発明の範囲内に含まれる。上記のポリペプチドはまとめて用語「本発明に係るポリペプチド」に含まれる。
用語「機能的等価物」及び「機能変異体」は本明細書では同義的に使用される。カロアーゼ01−05DNAの機能的等価物は、本明細書に定義されるとおりのカロアーゼ01−05ニオイヒメホウライタケ漂白酵素の少なくとも1個と少なくとも同等又はより良好な漂白活性を呈するポリペプチドをコードする単離されたDNA断片である。本発明に係るカロアーゼ01−05ポリペプチドの機能的等価物は、本明細書に定義されるとおりのカロアーゼ01−05ニオイヒメホウライタケ漂白酵素の少なくとも1つと少なくとも同等又はより良好な漂白活性を呈するポリペプチドである。
本発明は、配列番号08〜12に従うアミノ酸配列又はその任意の機能的等価物を有する、カロアーゼ01−05と仮称される漂白酵素(ペルオキシダーゼ)をコードするポリヌクレオチドを提供する。カロアーゼ01−05をコードする遺伝子の配列は、ニオイヒメホウライタケから得られるcDNAを増幅することにより決定された。カロアーゼ01及びカロアーゼ02をそれぞれコードする配列番号02及び配列番号04を有する配列は、取り上げられる遺伝子の最適化バージョンであり、コドン最適化が行われている。コドン最適化は当業者に周知の方法に従い使用され得るとともに特に宿主細胞中での遺伝子の発現の改良に好適である。本発明は、カロアーゼ01−05ペルオキシダーゼをコードする遺伝子を含んでなるポリヌクレオチド配列を提供する。従って、本発明は、配列番号01〜07に従うヌクレオチド配列又はその任意の機能的等価物を含んでなる単離ポリヌクレオチドに関する。ニオイヒメホウライタケの配列番号01〜07が漂白活性を有するという発見は、特に配列は既知の漂白酵素との相同性が極めて低いことから、極めて驚くべきものであった。
本明細書に提供されるとおりの配列情報は、誤って同定される塩基の包含要件に関してそれほど狭義に解釈されるべきではない。本明細書に開示される特異的配列は完全な遺伝子を真菌類、特にニオイヒメホウライタケから単離するために容易に使用され得、ひいてはさらなる配列解析に容易に供され、それにより配列決定エラーを同定し得る。
本発明に係る核酸分子は、配列番号01〜07に示される核酸配列の部分又は断片のみを含んでなってもよく、例えばその断片はプローブ又はプライマーとして使用され得るか、又はカロアーゼ01−05タンパク質の一部をコードする断片であり得る。カロアーゼ01−05遺伝子及びcDNAのクローニングから決定されるヌクレオチド配列は、他のカロアーゼ01−05ファミリーメンバー、ならびに他の種由来のカロアーゼ01−05相同体の同定及び/又はクローニングにおける使用向けに設計されるプローブ及びプライマーの生成を可能にする。プローブ/プライマーは典型的には、好ましくは高度にストリンジェントな条件下で、配列番号01〜07に示されるヌクレオチド配列又はその任意の機能的等価物の、少なくとも約12又は15個、好ましくは約18又は20個、好ましくは約22又は25個、より好ましくは約30、35、40、45、50、55、60、65、又は75個もしくはそれ以上連続するヌクレオチドとハイブリダイズするヌクレオチド配列の領域を典型的に含んでなる、実質的に精製されたオリゴヌクレオチドを含んでなる。
用語「相同性」又は「パーセント同一性」は本明細書において同義的に使用される。本発明の目的上、本明細書の定義では、2本のアミノ酸配列又は2本の核酸配列のパーセント同一性を決定するため、配列は最適比較用に整列される(例えば、第2のアミノ又は核酸配列との最適アラインメントのため第1のアミノ酸の配列又は核酸配列中にギャップが導入され得る)。次に対応するアミノ酸位置又はヌクレオチド位置におけるアミノ酸残基又はヌクレオチドが比較される。第1の配列内の位置が第2の配列内の対応する位置と同一のアミノ酸残基又はヌクレオチドにより占有される場合、分子は当該位置において同一である。2本の配列間のパーセント同一性は、配列により共有される同一位置の数の関数である(すなわち、%同一性=同一位置の数/位置の総数(すなわち、重複位置)×100)。好ましくは、2本の配列は同じ長さである。
本明細書で使用されるとき、用語「ハイブリダイズする」はハイブリダイゼーション及び洗浄についての条件を記載することが意図され、その条件下では互いに少なくとも約55%、少なくとも約40%、少なくとも約70%、より好ましくは少なくとも約80%、さらにより好ましくは少なくとも約85%〜90%、より好ましくは少なくとも95%相同なヌクレオチド配列が典型的には互いにハイブリダイズされたまま残る。
典型的な手法においては、他の生物体、例えば糸状菌類、特にホウライタケ属菌種から構築されるcDNAライブラリがスクリーニングされ得る。
本発明の別の態様は、カロアーゼ01−05タンパク質又はそれらの機能的等価物をコードする核酸を含有するベクター、好ましくは発現ベクターに関する。本明細書で使用されるとき、用語「ベクター」は、それが連結している別の核酸の輸送能を有する核酸分子を参照する。ある種類のベクターは「プラスミド」であり、これは追加的なDNAセグメントがライゲートされ得る環状二重鎖DNAループを参照する。別の種類のベクターはウイルスベクターであり、ここでは追加的なDNAセグメントがウイルスゲノムにライゲートされ得る。特定のベクターはそれが導入される宿主細胞内での自己複製能を有する(例えば、細菌性複製起点を有する細菌ベクター及びエピソーム哺乳動物ベクター)。他のベクター(例えば、非エピソーム哺乳動物ベクター)は宿主細胞への導入時に宿主細胞のゲノムに組み込まれるとともに、それにより宿主ゲノムと共に複製される。そのうえ、特定のベクターはそれらが操作可能に連結される遺伝子の発現の誘導能を有する。本明細書においてかかるベクターは「発現ベクター」と称される。一般的に、組換えDNA技術において有用な発現ベクターはプラスミドの形態であることが多い。用語「プラスミド」及び「ベクター」が本明細書において同義的に使用され得るのは、プラスミドが最も一般的に使用されるベクターの形態であるためである。しかしながら、本発明は、ウイルスベクター(例えば、複製欠損レトロウイルス、アデノウイルス及びアデノ随伴ウイルス)などの、等価な機能を供する他の形態の発現ベクターを含むことも意図される。
別の実施形態において、本発明は、細胞、例えば、本発明により包含される核酸を含有する形質転換宿主細胞又は組換え宿主細胞を特徴とする。「形質転換細胞」又は「組換え細胞」は、組換えDNA技術によってその細胞に(又はその祖先に)本発明に係る核酸が導入された細胞である。例えば、細菌、真菌類、酵母など、原核生物及び真核生物の双方の細胞が含まれる。
本発明の別の態様は、本発明に係るポリペプチド又はその機能的等価物(これ以降、漂白酵素と称される)の、例えば洗剤、酵素ストーンウォッシュ加工又は食品製造、例えばパン製品又は乳製品などの工業プロセスにおける使用を含んでなる。
[β−カロテンの変換の計測]
[Azizによるβ−カロテン分解の計測]
酵素活性は、A.ベン・アジズ(A.Ben Aziz)(1971年)、Phytochemistry 10、1445頁に従いβ−カロテン変換活性として測定され得る。本明細書において1酵素単位は、1分間当たりに1マイクログラムのβ−カロテンを変換する酵素の量として定義される(さらには、Aziz単位と称される)。
酵素活性はまた、ゾーン(Zorn)ら(2003年)、Appl.Microbiol.Biotechnol.62:331−336頁に従いβ−カロテン変換活性として測定され得る。本明細書において1酵素単位は、1分間当たりに1マイクロモルのβ−カロテンを変換する酵素の量として定義される(さらには、Zorn単位と称される)。アッセイは次のとおり行われる:試料を含有する1.5mlの酵素がキュベット中において27℃で5分間、予備インキュベートされた後、100μlのβ−カロテン原液(詳しくは以下を参照)が添加された。必要に応じて、濃縮された培養上清がpH5.5のクエン酸/リン酸緩衝液(この緩衝液は、43mlの0.1Mクエン酸を56mlの0.2MのNa2PO4溶液と混合することにより調製された)で希釈された。吸光度の低下が温度制御された細胞ホルダー内で分光光度計を使用して15分間にわたり450nm及び27℃でモニタされた。曲線の直線性が調べられ、及び酵素活性が曲線の直線部分から次式
酵素活性[mU/ml]=(ΔE×Vt)×106/(Vs×d×ε)
に従い計算された(式中、U=上記に定義される酵素活性単位、ΔE=1分間当たりの450nmでの吸光度の低下、Vt=キュベットの総容積(ml)、Vs=キュベット中の試料容積(ml)、ε=β−カロテンの吸光係数(95,000M−1・cm−1である)、d=キュベットの厚さ(cm)である)。
β−カロテン原液は次のとおり調製される:5mgのβ−カロテン及び500mgのツイーン(Tween)80が50mLのジクロロメタン中に溶解された。ジクロロメタンはロータリーエバポレータ内で40℃及び800mbarで蒸発させた。ほぼ全てのジクロロメタンが蒸発したとき、30mlの水が添加され、及び残留ジクロロメタンがロータリーエバポレータ及び最後に窒素気流内で除去された。結果として得られた溶液がろ過され、目盛付きフラスコ内で50mlまで水で充填された。溶液は冷温で(冷蔵庫)保存される必要があり、数日間に限り安定である。
内相又は生地からのカロテノイドの抽出後に、ゲリナス(Gelinas)、Cereal Chem.75、810−184頁(1998年)により指示されるとおり漂白度が測定された。ゲリナス(Gelinas)(1998年)により指示されるとおり、パンの内相からの総脂質抽出を介してカロテノイドが測定された。
[ニオイヒメホウライタケから得られるβ−カロテン変換酵素の培養及び活性の測定]
ニオイヒメホウライタケから得られるβ−カロテン変換酵素カロアーゼ1及びカロアーゼ2の培養及び活性の測定が、ゾーン(Zorn)ら(2003年)により記載されるとおり行われた。本明細書に、ニオイヒメホウライタケのカルチャーコレクションからの菌糸体(Centraal Bureau voor Schimmelcultures−Utrecht、オランダから寄託番号CBS137.83により入手可能)を使用して乳化β−カロテンを補給された寒天プレートが接種された。プレートのインキュベーションが24℃で14日間実施された。100mlの標準栄養液(SNL、これは30g/リットルのグルコース・H2O;4.5g/リットルのアスパラギン・H2O;1.5g/リットルのKH2PO4;0.5g/リットルのMgSO4;3.0g/リットルの酵母抽出物;5mg/lのCuSO4 *5aq、80mg/lのFeC13 *6aq、90mg/lのZnSO4 *7aq、30mg/lのMnSO4 *1aq及び40mg/lのEDTAを含有する1ml/リットルの滅菌微量元素溶液(滅菌前にpHは1NのNaOHで6.0に調整された)を含有する)を含有する300mlの振盪フラスコに菌糸体が接種され、及び150rpmの振盪インキュベータ内において24℃で7日間インキュベートされた。前培養物が微生物汚染の不在について調べられ、Ultra Turraxによりホモジナイズされ、及び主培養物を接種するために使用された(500mlの三角フラスコ中250mL)。2日目より毎日2mlの試料が取り出され、遠心分離により菌糸体が除去されたうえ分光光度アッセイにおいて活性が計測された。4日間の培養後、β分解活性は無細胞上清1リットル当たり約0.3Zorn単位であった。
[ニオイヒメホウライタケから得られるβ−カロテン変換酵素カロアーゼ1及びカロアーゼ2の活性に対するH2O2の効果]
10マイクロリットルの20mM過酸化水素(H2O2)の効果が、上記に記載されるとおりのインビトロアッセイのβ−カロテン分解アッセイにおいて測定される。カロアーゼ1及びカロアーゼ2を含有するニオイヒメホウライタケの濃縮培養上清が使用された。β−カロテン分解活性はH2O2の存在下で4.3から10.9mUに増加した。熱失活した酵素が使用されたときには、β−カロテン分解は一切観測されなかった。これは、H2O2がβ−カロテン分解酵素によりβ−カロテン分解活性を刺激することを明確に実証したものである。
[ニオイヒメホウライタケから得られるカロアーゼ1及びカロアーゼ2の活性に対するアスペルギルス・ニガーグルコースオキシダーゼ(GOX)の効果]
50マイクロリットルのニオイヒメホウライタケの濃縮培養上清が1290マイクロリットルの50mM酢酸ナトリウム緩衝液(pH5.5)と混合された。160マイクロリットルの500mMグルコース溶液が添加され、及び混合物が5分間、セ氏27度で調整された。アスペルギルス・ニガーグルコースオキシダーゼはフルカ(Fluka)から入手された。0〜2マイクロリットルのグルコースオキシダーゼ原液(100U/ml、0〜200mUのGOXの活性に相当する)及び100マイクロリットルのβ−カロテン溶液(「材料及び方法」に記載されるとおりに調製)の添加により反応が開始された。450nmでの吸光度の低下が10分間、セ氏27度で記録された(表1)。
[パプ製パン試験法]
標準的な製パン工程においてパップローフが、200gの小麦粉(160gの小麦粉(Kolibri(登録商標)−Meneba、オランダ)及び40グラムの小麦粉(Ibis(登録商標)−Meneba、オランダ)の混合物)、1.4gのFermipan(登録商標)ドライイースト(DSM Bakery Ingredients、Delft、オランダ)、4gの塩、50ppmのアスコルビン酸、4ppmの真菌α−アミラーゼBakezyme(登録商標)P500(DSM Food Specialties、Delft、オランダ)、60ppmの真菌ヘミセルラーゼBakezyme(登録商標)HS2000(DSM Food Specialties、Delft、オランダ)及び表3に示されるとおりの量のβ−カロテン分解酵素及び116mlの水から、ピンミキサー中で6分間、及び15秒間、調製された。生地温度は28℃であった。混合の直後、生地は150gずつ2個に分割され、丸められ、及び30℃のホイロ室内で45分間寝かされ、成形及び型詰めされた。30℃で70分間の最終ホイロの後、生地は225℃で20分間焼き上げられた。
[ミニチーズの調製]
シャキール−ウル−レーマン(Shakeel−Ur−Rehman)ら(「Protocol for the manufacture of miniature cheeses in Lait」、78(1998年)、607〜620頁)により記載されるとおり、小型チーズが製造された。ウシの生乳が30分間63℃で加熱することにより低温殺菌された。低温殺菌された乳は広口プラスチック製遠心分離ボトル(ボトル1本につき200mL)に移され、31℃に冷却された。続いて、0.72mlの出発培養物DS 5LT1(DSM Gist B.V.、Delft、オランダ)が遠心分離ボトル内の200mlの各低温殺菌乳に添加され、乳は20分間熟成された。次に、CaCl2(熟成乳200mLにつき132μLの1mol・L−1溶液)が添加された後、凝固剤が添加された(1mlにつき0.04IMCU)。カロアーゼ01及びカロアーゼ02の使用が関わる実験の場合、この酵素は凝固剤と同時に添加される。
Claims (17)
- カロテノイドの開裂能、β−カロテン分解能又は食品の漂白能を有する単離ポリペプチドであって、
a.配列番号09に記載の単離ポリペプチド、及び
b.配列番号09と少なくとも90%同一である単離ポリペプチド。 - 配列番号09と少なくとも95%同一である、請求項1に記載の単離ポリペプチド。
- 配列番号09と少なくとも97%同一である、請求項1に記載の単離ポリペプチド。
- ニオイヒメホウライタケ(Marasmius scorodonius)から得られる請求項1〜3のいずれか一項に記載の単離ポリペプチド。
- 前記ポリペプチドが使用されない食品と比較して、その中間形態が色素を含んでなる食品の少なくとも一部の白色度が向上する、使用であって、
前記色素は、カロテノイドである、請求項1〜4のいずれか一項に記載のポリペプチドの使用。 - その中間形態が色素を含んでなる食品を製造するための方法であって、請求項1〜4のいずれか一項に記載の少なくとも1種のポリペプチドを、結果としてその製造中に前記ポリペプチドが添加されない食品と比較して結果として前記食品の少なくとも一部の白色度の向上をもたらす形態に前記色素を直接的に変換するうえで有効な量で添加するステップを含み、
前記色素は、カロテノイドである、方法。 - 前記食品が穀粉から製造される、請求項6に記載の方法。
- 前記穀粉が小麦粉である、請求項7に記載の方法。
- 前記食品が乳製品である、請求項6に記載の方法。
- 前記ポリペプチドが、微生物に由来するか、又は前記ポリペプチドの産生能を有する微生物によりインサイチュで産生されるポリペプチド調製物として添加される、請求項6〜9のいずれか一項に記載の方法。
- 前記ポリペプチドが、細菌、真菌又は酵母に由来するか、又はそれらによりインサイチュで産生されるポリペプチド調製物として添加される、請求項10に記載の方法。
- 前記真菌がホウライタケ属に属する、請求項11に記載の方法。
- 前記真菌がニオイヒメホウライタケに属する、請求項11又は12に記載の方法。
- 前記食品の製造中に追加的にオキシドレダクターゼが添加される、請求項6〜13のいずれか一項に記載の方法。
- 請求項6〜14のいずれか一項に記載の方法により得られる食品。
- 色素を結果として食品の少なくとも一部の白色度の向上をもたらす形態に直接的に変換する請求項1〜4のいずれか一項に記載のポリペプチドの使用。
- 洗剤のための、又は酵素ストーンブリーチ加工における請求項1〜4のいずれか一項に記載のポリペプチドの使用。
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