JP5693816B2 - 凝集体形成性循環タンパク質形態を、該形態を凝集させる薬剤及び形成された凝集体を捕捉するための薬剤を用いて検出する方法 - Google Patents
凝集体形成性循環タンパク質形態を、該形態を凝集させる薬剤及び形成された凝集体を捕捉するための薬剤を用いて検出する方法 Download PDFInfo
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Description
−中枢神経系の病理学的凝集過程に関与する非感染性タンパク質の循環性形態の凝集をもたらす非タンパク質薬剤I、及び
−凝集体形成性循環タンパク質形態の天然の凝集体又は前記薬剤Iによって誘導される凝集体を捕捉するための非タンパク質薬剤II
を使用する。
R1は、水素原子、ヒドロキシル基、OR基又はOCOR基(Rは以下に規定するとおりである)を表し、
R2は、水素原子、R、COR、Pol又はCH2Pol基を表し、ここで、Polは、リン酸基、硫酸基、アミン基、アンモニウム基、カルボン酸基を表し、Rは以下に規定するとおりであり、
R3は、水素原子、ヒドロキシル基、OR基又はOCOR基(式中、Rは以下に規定するとおりである)を表し、
R4は、水素原子、ヒドロキシル基、OR基、OCH2R基又はOCOR基(式中、Rは以下に規定するとおりである)を表し、
Yは、炭素、窒素又はイオウ原子であり、
R5及び6は、各々独立して、存在しないか、又は水素原子、CH2若しくは以下に規定するR基を表すか、あるいは
R5及び6は一緒になって、酸素又はイオウ原子を表し、
Xは、CH2基又は酸素若しくはイオウ原子を表し、
mは、0又は1である整数を表し、
Rは、水素原子、又は、分枝若しくは非分枝の、環状若しくは非環状の、飽和若しくは不飽和の炭化水素系の鎖を表し、ここで、該鎖は、非置換若しくはハロゲンで置換されており、極性若しくは無極性の官能基を有し、
nは3〜15の整数であり、
置換基R1〜R5、R、X、Y及び整数mは、該単位の性質に応じて異なっていてよい)
に相当する。
nは4〜8の整数であり、
各基R2は一緒になって、独立して、硫酸基又はリン酸基であり、
R7は、(CH2)t−(CO)s−(NH2)基又は(CH2)t−COOH基(式中、tは0〜6の整数であり、sは0〜6の整数である)を表す)
に相当する。
a)凝集体形成性循環タンパク質形態を凝集させるために、前記薬剤Iを前記試料に添加し、これを沈殿させる工程、
b)このようにして得られた混合物を、凝集体形成性循環タンパク質形態の前記凝集体を捕捉するために薬剤IIと一緒にする工程、及び
c)凝集体形成性循環タンパク質形態の存在を顕在化する工程
を含むか、又は該工程からなる。
i)凝集体形成性循環タンパク質形態の凝集体を反応混合物から分離する工程、及び
ii)凝集体形成性循環タンパク質形態の凝集体を変性させる工程
のさらなる工程i)及びii)の少なくとも1つを含み、
これらの工程は、適切な場合は、工程a)及び工程b)の間に含まれる。
検出可能なシグナルを、例えば、比色分析、蛍光又は発光によってもたらす酵素、例えば、ホースラディッシュペルオキシダーゼ、アルカリホスファターゼ、α−ガラクトシダーゼ、グルコース−6−ホスフェートデヒドロゲナーゼなど、
発色団、例えば、発光化合物、色素化合物など、
放射性分子、例えば、32P、35S又は125Iなど、
蛍光分子、例えば、フルオレセイン、ローダミン、アレクサ又はフィコシアニン、及び
金若しくは磁性ラテックス粒子、又はリポソームなどの粒子
からなる。
本発明者らは、「Mac Vector」ソフトウエアを用い、神経変性疾患における神経毒性凝集体沈着物と関連するタンパク質の代表的なタンパク質、すなわち、タンパク質α−シヌクレイン(配列番号1)、アミロイド前駆体タンパク質すなわちAPP(配列番号2)、パーキンタンパク質(配列番号3)及びタウタンパク質(配列番号4)のペプチド一次配列のアライメントを行なった。アミノ酸は、配列内のアライメント上に、最長のコンセンサス配列との一致に基づいて番号付けし、タンパク質の配列内の点線は、その線形ペプチド配列と、コンセンサス配列におけるすべてのタンパク質に共通する単位のアライメントとの間のシフトを表す。
i)α−シヌクレインでは、例えば、領域
−124〜143は、4つのD、E、S又はN残基を20アミノ酸上に有する、
−231〜261は、10つのD、E、S又はN残基を19アミノ酸上に有する(点線は、一次配列に対する一致に基づく番号付けにおけるシフトを示し、これは、20アミノ酸が、そのタンパク質の配列範囲内の実際の数より大きな数で番号付けされていることを意味する)及び
−232〜249でさえ、6つのD、E、S又はN残基を12アミノ酸上に有する;
ii)FAPPでは、例えば、領域
−80〜98は、5つのD、E、S又はN残基を20アミノ酸上に有する、
−193〜216は、14つのD、E、S又はN残基を17アミノ酸上に有する、
−225〜236は、6つのD、E、S又はN残基を12アミノ酸上に有する、
−247〜256は、9つのD、E、S又はN残基を10アミノ酸上に有する、
−692〜702は、5つのD、E、S又はN残基を11アミノ酸上に有する、
−713〜718は、4つのD、E、S又はN残基を6アミノ酸上に有する;
iii)パーキンでは、例えば、領域
−25〜46は、8つのD、E、S又はN残基を20アミノ酸上に有する(一致に関する番号付けにおけるシフトのため)、
−153〜172は、8つのD、E、S又はN残基を20アミノ酸上に有する、
−224〜240は、5つのD、E、S又はN残基を12アミノ酸上に有する;
iv)タウタンパク質では、領域
−31〜53は、6つのD、E、S又はN残基を20アミノ酸上に有する、
−225〜248は、12つのD、E、S又はN残基を20アミノ酸上に有する、
−236〜247は、9つのD、E、S又はN残基を12アミノ酸上に有する、
−289〜308は、8つのD、E、S又はN残基を20アミノ酸上に有する、
−361〜380は、8つのD、E、S又はN残基を20アミノ酸上に有する、
−523〜542は、9つのD、E、S又はN残基を20アミノ酸上に有する、及び
−753〜764は、5つのD、E、S又はN残基を12アミノ酸上に有する。
i)α−シヌクレインでは、領域
−106〜120は、5つのK、H、Q又はR残基を15アミノ酸上に有する、
−128〜142は、4つのK、H、Q又はR残基を15アミノ酸上に有する、
−159〜163は、3つのK、H、Q又はR残基を15アミノ酸上に有する;
ii)APPでは、領域
−90〜104は、7つのK、H、Q又はR残基を15アミノ酸上に有する、
−105〜116は、4つのK、H、Q又はR残基を12アミノ酸上に有する、
−132〜143は、5つのK、H、Q又はR残基を12アミノ酸上に有する、
−153〜163は、3つのK、H、Q又はR残基を12アミノ酸上に有する、
−697〜707は、5つのK、H、Q又はR残基を11アミノ酸上に有する;
iii)パーキンでは、領域
−83〜100は、7つのK、H、Q又はR残基を15アミノ酸上に有する、
−182〜195は、6つのK、H、Q又はR残基を12アミノ酸上に有する;
iv)タウタンパク質では、領域
−101〜108は、4つのK、H、Q又はR残基を8アミノ酸上に有する、
−135〜147は、4つのK、H、Q又はR残基を13アミノ酸上に有する、
−178〜183は、3つのK、H、Q又はR残基を6アミノ酸上に有する、
−197〜208は、5つのK、H、Q又はR残基を1アミノ酸上に有する。
2.1 解析手法
この解析は、ウエスタンブロッティング(Laemmli,UK 1970,Nature,227:680−685)に従って行なう。
このアッセイは、6ヒスチジンのテイル(Calbiochem)と融合させた1μgの組換えタウタンパク質と、薬剤Iとして、硫酸塩形態のストレプトマイシン、又はトリエチレンテトラミンすなわちTET、又はリファンピシン又はイソニアジドのいずれかを、総タンパク質量(μg)に対する薬剤Iの量(μg)の比が9/1又は35/1に等しくなるように用いて行なう。
3.1 解析手法
上記の2.1に記載のものと同じである。
このアッセイは、特許出願WO2004/059322に示されたようにして調製したC6Sを使用し、濃度範囲を0.5mM〜60mMとする以外は、上記の2.2に示すようにして行なう。
以下:
−10μgの40アミノ酸長合成β−アミロイドペプチド(β−Aペプチド1−40;配列番号5)又は10μgの42アミノ酸長合成β−アミロイドペプチド(β−Aペプチド1−42;配列番号6)、
−アミロイドペプチドに特異的なモノクローナル抗体(6E10抗体(Sigma))、
−薬剤Iとして、ストレプトマイシン及びTETを、総タンパク質量(μg)に対する薬剤Iの量(μg)の比が35/1に等しくなるように、あるいはリファンピシン及びイソニアジドを、総タンパク質量(μg)に対する薬剤Iの量(μg)の比が2/1、9/1若しくは35/1に等しくなるように、及び
−薬剤IIとして、C6Sを終濃度1mMで
使用する以外は、上記の実施例2及び3に示した手順を繰り返す。
5.1.解析手法
この解析は円偏光二色性によって行なう。
上記のような解析対象のβ−アミロイドペプチド(Aβ42とも示される)を、2.2×10−4Mの濃度で、水中20%のトリフルオロエタノール(TFE)の溶液に即時的に溶解し、β−アミロイドペプチドを構成する。p−スルホナト−カリックス[n]アレーン(Da Silva,E.ら、2003,Tetrahedron,59(37):7357−7364に記載のようにして調製)を、100μMで50mMリン酸バッファーに溶解する。試料を、リン酸バッファー中の終濃度10μMのβ−アミロイドペプチド、すなわち最終容量500μLが得られ得るように調製する。ペプチド濃度/カリックスアレーン濃度の比は、1/0〜1/5で種々であり得る。
このアッセイは、以下の表6に示すように、Aβ42ペプチド/カリックスアレーンの濃度比1/1、1/2及び1/5で行なう。対照は、カリックスアレーンなしのAβ42ペプチドの試料(1/0)である。溶液は、最終容量500μLに調製する。Aβ42ペプチドは、4514g/モルのモル質量を有する。p−スルホナト−カリックス[4]アレーンは、744g/モルのモル質量を有する。
6.1.解析手法
β−アミロイドペプチド(Aβ40ともいう)及び種々のp−スルホナト−カリックス[n]アレーン(n=4、6、8)(Da Silva,E.ら、2003(前掲)に記載のようにして調製)を、100μMの濃度で、10mM酢酸アンモニウムバッファー中にて可溶化させる。試験対象のβ−アミロイドペプチドの溶液を、p−スルホナト−カリックス[n]アレーンの溶液と即時的に混合する。試料を、電気スプレイ型の質量分析計内に直接注入する。
10mM酢酸アンモニウムバッファー中10μMのペプチドAβ40(Mw=4430g/mol)のストック溶液を調製する。種々のp−スルホナト−カリックス[n]アレーン(n=4:SC4 Mw=744g/mol;n=6:SC6 Mw=1116g/mol;n=8:SC8 Mw=1488g/mol)を、10mM酢酸アンモニウムバッファー中100μMで可溶化させる。
薬剤IIとして、コンドロイチン−6−硫酸(Sigma)を使用したこと以外は、上記実施例5に記載の手順を繰り返した。
8.1 解析手法
この解析は、Kohnkenら(Neuroscience Letters 287(2000)187−190)に記載の慣用的な「ELISAサンドイッチ型」免疫酵素手法に従って行なう。
このアッセイは、25ngの脳抽出物、及び、薬剤IとしてトリエチレンテトラミンすなわちTETを100mg/mlで用いて行なう。
このアッセイは、25ngの脳抽出物、及び、薬剤Iとして硫酸塩形態のストレプトマイシンを種々の濃度で用いて行なう。
このアッセイは、25ngの脳抽出物、及び、薬剤Iとして硫酸塩形態のストレプトマイシンを500mg/mlで用いて行なう。
−1% SDS
−グアニジンHCl 0.1M(Gnd)
−1M尿素
−1% SDS+グアニジンHCl 0.1M(Gnd)
−1% SDS+1M尿素
−グアニジンHCl 0.1M(Gnd)+1M尿素
−1% SDS+グアニジンHCl 0.1M(Gnd)+1M尿素
中に入れる。
9.1 解析手法:タンパク質ゲル及びウエスタンブロッティング
解析する試料を、SDSバッファー(125mM Tris HCl pH6.8、20%グリセロール、4%SDS、0.02%ブロモフェノールブルー)(50/50v/v)中で100℃にて5分間変性させる。ドデシル硫酸ナトリウム(SDS−PAGE)の存在下、12%ポリアクリルアミド一次元電気泳動ゲル上に載せる。泳動後、2つの選択肢を採用する。
このアッセイは、ヒト血漿プール中に添加した1μgの組換えα−シヌクレインタンパク質(SYN)(rPeptide)、及び、薬剤Iとして硫酸塩形態のストレプトマイシン又はトリエチレンテトラミンすなわちTETのいずれかを種々の濃度で用いて行なう。
10.1 解析手法:タンパク質ゲル及びウエスタンブロッティング
この手法は、実施例9に記載のものと同じである。
この解析は、慣用的な「ELISAサンドイッチ型」免疫酵素手法:ヒトα−シヌクレインELISAキット(BioSource KHB0061)を供給元の推奨に従って行なう。
このアッセイは、ヒト血漿プール中に添加した1μgの組換えα−シヌクレインタンパク質(SYN)(rPeptide)、及び、薬剤IIとして、カリックスアレーンp−スルホナト−3,7−(2−アミノ−エチルオキシ)カリックス−[6]−アレーン(C6Sとして知られている)を用いて行なう。このアッセイは、特許出願WO2004/059322に示されたようにして調製したC6Sを使用し、0〜200mg/mlの濃度範囲を用いたこと以外は、先の実施例で示したようにして行なう。
このアッセイは、ヒト血漿プール中に添加した一連の組換えα−シヌクレインタンパク質(SYN)(rPeptide)、及び、薬剤IIとしてカリックスアレーンp−スルホナト−3,7−(2−アミノ−エチルオキシ)カリックス−[6]−アレーン(C6Sとして知られる)を用いて行なう。このアッセイは、特許出願WO2004/059322に示されたようにして調製したC6Sを使用し、濃度を50mg/mlとしたこと以外は、先の実施例に示すようにして行なう。
解析手法:
この解析は、Kohnkenら(Neuroscience Letters 287(2000)187−190)に記載の慣用的な「ELISAサンドイッチ型」免疫酵素手法に従い、捕捉に通常使用される抗体の代わりにカリックスアレーンを用いて行なう。ELISAアッセイは、NHS活性化マイクロプレートの使用に基づくものであり、これに、カリックスアレーンを、0.6mg/mlの濃度で2時間、室温で結合させる。蒸留水で3回洗浄後、プレートを37℃で15分間真空乾燥させる。次いで、プレートを200μl/ウェルの0.5%乳分含有PBSで、37℃にて1時間不動態化させる。0.05% Tween20含有PBS中で3回洗浄後、プレートの使用の準備をする。
解析手法
第1の解析は、慣用的な「ELISAサンドイッチ型」免疫酵素手法:ヒトα−シヌクレインELISAキット(BioSource KHB0061)を供給元の推奨に従って行なう。
この解析手法は、抗体を、実施例12に記載のカリックスアレーン(薬剤II)に変えたこと以外は、実施例8に記載のものと同じである。使用した検出抗体は、bioMerieuxで開発されたモノクローナル抗体であり、1μg/mlの濃度のペルオキシダーゼにコンジュゲートさせて使用する。このモノクローナル抗体は、231位がリン酸化されたタウタンパク質から誘導されたリン酸化ペプチドでの免疫処置後に得た。
Claims (11)
- 凝集体形成性循環タンパク質を含み得るヒト起源の生物試料において、非感染性神経変性疾患と関連する少なくとも1つの凝集体形成性循環タンパク質を検出する方法であって、
凝集体形成性循環タンパク質が、
(a)アスパラギン酸、グルタミン酸、セリン、及びアスパラギンからなる群から選択されるアミノ酸を、20アミノ酸以下の長さのペプチド配列内に少なくとも4個含み、かつ、
(b)アルギニン、リシン、ヒスチジン、及びグルタミンからなる群から選択されるアミノ酸を、アミノ酸15以下の長さのペプチド配列内に少なくとも3個含み、
中枢神経系の病理学的凝集過程に関与する凝集体形成性循環タンパク質の凝集をもたらす、リファンピシン、イソニアジド、エタンブトール、トリエチレンテトラミン(TET)、ビス−3−アミノプロピルアミン、テトラヒドロ塩酸スペルミン、セスキ硫酸ジヒドロストレプトマイシン、及びストレプトマイシンからなる群から選択される非タンパク質薬剤I、及び凝集体形成性循環タンパク質の天然の凝集体又は前記薬剤Iによって誘導される凝集体を捕捉するための、メタシクロファン又はグリコサミノグリカンである非タンパク質薬剤IIを使用することを含む方法。 - 前記薬剤IIの前に、凝集体形成性循環タンパク質を凝集させるために前記薬剤Iを生物試料に添加することを含む、請求項1に記載の少なくとも1つの凝集体形成性循環タンパク質を検出する方法。
- a)凝集体形成性循環タンパク質を凝集させるために、前記薬剤Iを試料に添加する工程、
b)このようにして得られた混合物を、凝集体形成性循環タンパク質の前記凝集体を捕捉するために薬剤IIと一緒にする工程、及び
c)凝集体形成性循環タンパク質の存在を顕在化させる工程
を含む、請求項2に記載の少なくとも1つの凝集体形成性循環タンパク質を検出する方法。 - 以下:
i)凝集体形成性循環タンパク質の凝集体を反応混合物から分離する工程、及び
ii)凝集体形成性循環タンパク質の凝集体を変性させる工程
からなるさらなる工程i)及びii)の少なくとも1つを含み、
これらの工程は、適切な場合は、工程a)及び工程b)の間に含まれる、請求項1〜3いずれか1項に記載の少なくとも1つの凝集体形成性循環タンパク質を検出する方法。 - 凝集体形成性循環タンパク質に特異的な少なくとも1種類の結合パートナーを、凝集体形成性循環タンパク質に特異的な結合パートナーと凝集体形成性循環タンパク質との免疫反応のために、適切な場合は工程c)において添加することを含む、請求項1〜4いずれか1項に記載の少なくとも1つの凝集体形成性循環タンパク質を検出する方法。
- 前記薬剤IIが固相支持体に結合されている、請求項1〜5いずれか1項に記載の少なくとも1つの凝集体形成性循環タンパク質を検出する方法。
- メタシクロファンがカリックスアレーンである、請求項1〜6いずれか1項に記載の少なくとも1つの凝集体形成性循環タンパク質を検出する方法。
- カリックスアレーンが、下記一般式(I):
R1は、水素原子、ヒドロキシル基、OR基又はOCOR基(Rは以下に規定するとおりである)を表し、
R2は、水素原子、R、COR、Pol又はCH2Pol基を表し、ここで、Polは、リン酸基、硫酸基、アミン基、アンモニウム基、カルボン酸基を表し、Rは以下に規定するとおりであり、
R3は、水素原子、ヒドロキシル基、OR基又はOCOR基(式中、Rは以下に規定するとおりである)を表し、
R4は、水素原子、ヒドロキシル基、OR基、OCH2R基又はOCOR基(式中、Rは以下に規定するとおりである)を表し、
Yは、炭素、窒素又はイオウ原子であり、
R5及び6は、各々独立して、存在しないか、又は水素原子、CH2若しくは以下に規定するR基を表し、あるいは
R5及び6は一緒になって、酸素又はイオウ原子を表し、
Xは、CH2基又は酸素若しくはイオウ原子を表し、
mは、0又は1である整数を表し、
Rは、水素原子、又は、分枝若しくは非分枝の、環状若しくは非環状の、飽和若しくは不飽和の炭化水素系の鎖を表し、ここで、該鎖は、非置換若しくはハロゲンで置換されており、極性若しくは無極性の官能基を有し、
nは3〜15の整数であり、
置換基R1〜R5、R、X、Y及び整数mは、該単位の性質に応じて異なっていてよい)
に相当する、請求項7に記載の少なくとも1つの凝集体形成性循環タンパク質を検出する方法。 - カリックスアレーンが、式中、2つの基R2が各々、硫酸基であり、nが4、6又は8であり、R7が水素原子、−CH2COOH基、−CH2CONH2基又はCH2CH2NH2基である(Ia)のカリックスアレーンである、請求項9に記載の少なくとも1つの凝集体形成性循環タンパク質を検出する方法。
- カリックスアレーンが、式中、n=6であり、R7が−CH2CH2NH2である一般式(Ia)に相当する、請求項10に記載の凝集体形成性循環タンパク質を検出する方法。
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