JP5124062B2 - フィブロネクチン結合タンパク質組成物および使用法 - Google Patents
フィブロネクチン結合タンパク質組成物および使用法 Download PDFInfo
- Publication number
- JP5124062B2 JP5124062B2 JP53338298A JP53338298A JP5124062B2 JP 5124062 B2 JP5124062 B2 JP 5124062B2 JP 53338298 A JP53338298 A JP 53338298A JP 53338298 A JP53338298 A JP 53338298A JP 5124062 B2 JP5124062 B2 JP 5124062B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- fibronectin
- peptide
- antibody
- fibronectin binding
- binding
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Expired - Fee Related
Links
- 239000000203 mixture Substances 0.000 title claims abstract description 180
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 170
- 102000036072 fibronectin binding proteins Human genes 0.000 title claims abstract description 100
- 101000815632 Streptococcus suis (strain 05ZYH33) Rqc2 homolog RqcH Proteins 0.000 title claims description 90
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims abstract description 408
- 230000027455 binding Effects 0.000 claims abstract description 345
- 108010067306 Fibronectins Proteins 0.000 claims abstract description 171
- 102000016359 Fibronectins Human genes 0.000 claims abstract description 171
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims abstract description 91
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims abstract description 78
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims abstract description 78
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 claims abstract description 77
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 claims abstract description 56
- 238000009472 formulation Methods 0.000 claims abstract description 29
- 241000191967 Staphylococcus aureus Species 0.000 claims abstract description 20
- 230000002265 prevention Effects 0.000 claims abstract description 6
- 150000001413 amino acids Chemical group 0.000 claims description 95
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 46
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 claims description 30
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 claims description 29
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 claims description 29
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 claims description 29
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 claims description 26
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 claims description 26
- 244000005700 microbiome Species 0.000 claims description 26
- YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N (+)-Biotin Chemical compound N1C(=O)N[C@@H]2[C@H](CCCCC(=O)O)SC[C@@H]21 YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N 0.000 claims description 24
- 241000282414 Homo sapiens Species 0.000 claims description 24
- 230000000813 microbial effect Effects 0.000 claims description 23
- 238000011282 treatment Methods 0.000 claims description 23
- 108010045069 keyhole-limpet hemocyanin Proteins 0.000 claims description 21
- 241000295644 Staphylococcaceae Species 0.000 claims description 19
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 claims description 19
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 claims description 16
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 claims description 13
- 102000002260 Alkaline Phosphatase Human genes 0.000 claims description 11
- 108020004774 Alkaline Phosphatase Proteins 0.000 claims description 11
- 102000005720 Glutathione transferase Human genes 0.000 claims description 11
- 108010070675 Glutathione transferase Proteins 0.000 claims description 11
- 229960002685 biotin Drugs 0.000 claims description 11
- 235000020958 biotin Nutrition 0.000 claims description 11
- 239000011616 biotin Substances 0.000 claims description 11
- 239000003814 drug Substances 0.000 claims description 11
- 101710175625 Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein Proteins 0.000 claims description 10
- 239000003937 drug carrier Substances 0.000 claims description 10
- 206010041925 Staphylococcal infections Diseases 0.000 claims description 9
- 102000003992 Peroxidases Human genes 0.000 claims description 8
- 239000003593 chromogenic compound Substances 0.000 claims description 8
- 108040007629 peroxidase activity proteins Proteins 0.000 claims description 8
- 230000008569 process Effects 0.000 claims description 8
- 239000007850 fluorescent dye Substances 0.000 claims description 6
- 108090001008 Avidin Proteins 0.000 claims description 5
- 102000009027 Albumins Human genes 0.000 claims description 4
- 108010088751 Albumins Proteins 0.000 claims description 4
- 125000000487 histidyl group Chemical group [H]N([H])C(C(=O)O*)C([H])([H])C1=C([H])N([H])C([H])=N1 0.000 claims description 4
- 238000000926 separation method Methods 0.000 claims description 4
- 108010056458 bacterial fibronectin-binding proteins Proteins 0.000 claims description 3
- 235000019420 glucose oxidase Nutrition 0.000 claims description 3
- 230000000699 topical effect Effects 0.000 claims description 3
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 claims description 2
- 239000001257 hydrogen Substances 0.000 claims description 2
- 238000011200 topical administration Methods 0.000 claims description 2
- 125000004435 hydrogen atom Chemical class [H]* 0.000 claims 1
- 239000000825 pharmaceutical preparation Substances 0.000 claims 1
- 229940127557 pharmaceutical product Drugs 0.000 claims 1
- 208000015339 staphylococcus aureus infection Diseases 0.000 claims 1
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 abstract description 212
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 abstract description 162
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 abstract description 151
- 230000003053 immunization Effects 0.000 abstract description 33
- 229960005486 vaccine Drugs 0.000 abstract description 33
- 101150098467 fnbA gene Proteins 0.000 abstract description 30
- 101100144566 Pasteurella multocida (strain Pm70) rluD gene Proteins 0.000 abstract description 25
- 101100439107 Rattus norvegicus Cebpb gene Proteins 0.000 abstract description 25
- 238000002649 immunization Methods 0.000 abstract description 25
- 102000014914 Carrier Proteins Human genes 0.000 abstract description 15
- 241000193996 Streptococcus pyogenes Species 0.000 abstract description 14
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 abstract description 13
- 241000194042 Streptococcus dysgalactiae Species 0.000 abstract description 12
- 108091010988 fibronectin binding proteins Proteins 0.000 abstract description 10
- 101100227488 Staphylococcus aureus (strain USA300) fnbB gene Proteins 0.000 abstract description 8
- 108010078791 Carrier Proteins Proteins 0.000 abstract description 6
- 229940115920 streptococcus dysgalactiae Drugs 0.000 abstract description 6
- 238000012216 screening Methods 0.000 abstract description 5
- 208000034309 Bacterial disease carrier Diseases 0.000 abstract description 3
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 156
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 143
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 93
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 93
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 89
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 83
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 76
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 71
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 71
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 description 61
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 50
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 45
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 42
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 41
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 41
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 40
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 39
- LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I dipotassium trisodium dihydrogen phosphate hydrogen phosphate dichloride Chemical compound P(=O)(O)(O)[O-].[K+].P(=O)(O)([O-])[O-].[Na+].[Na+].[Cl-].[K+].[Cl-].[Na+] LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I 0.000 description 39
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 39
- 239000002953 phosphate buffered saline Substances 0.000 description 39
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 38
- 230000002163 immunogen Effects 0.000 description 34
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 description 33
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 33
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 33
- 230000000903 blocking effect Effects 0.000 description 32
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 32
- 102000010834 Extracellular Matrix Proteins Human genes 0.000 description 31
- 108010037362 Extracellular Matrix Proteins Proteins 0.000 description 31
- 210000004408 hybridoma Anatomy 0.000 description 30
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 27
- 108010035532 Collagen Proteins 0.000 description 26
- 102000008186 Collagen Human genes 0.000 description 26
- 102000007056 Recombinant Fusion Proteins Human genes 0.000 description 25
- 108010008281 Recombinant Fusion Proteins Proteins 0.000 description 25
- 229920001436 collagen Polymers 0.000 description 25
- 241000894007 species Species 0.000 description 25
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 24
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 24
- 229940098773 bovine serum albumin Drugs 0.000 description 24
- 210000002744 extracellular matrix Anatomy 0.000 description 24
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 23
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 22
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 22
- 239000000463 material Substances 0.000 description 22
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 21
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 19
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 19
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 19
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 19
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 19
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 18
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 18
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 18
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 17
- 230000000890 antigenic effect Effects 0.000 description 17
- 101150030247 fib gene Proteins 0.000 description 17
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 17
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 17
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 17
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 16
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 16
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 16
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 16
- 239000004480 active ingredient Substances 0.000 description 15
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 15
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 15
- 238000002741 site-directed mutagenesis Methods 0.000 description 15
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 14
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 14
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 14
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 14
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 description 14
- 230000028993 immune response Effects 0.000 description 14
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 14
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 14
- 239000002502 liposome Substances 0.000 description 14
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 description 14
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 14
- 108060003951 Immunoglobulin Proteins 0.000 description 13
- 206010035226 Plasma cell myeloma Diseases 0.000 description 13
- 210000003719 b-lymphocyte Anatomy 0.000 description 13
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 13
- 102000018358 immunoglobulin Human genes 0.000 description 13
- 201000000050 myeloid neoplasm Diseases 0.000 description 13
- 239000013615 primer Substances 0.000 description 13
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 13
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 13
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- 229920002684 Sepharose Polymers 0.000 description 12
- RAXXELZNTBOGNW-UHFFFAOYSA-N imidazole Natural products C1=CNC=N1 RAXXELZNTBOGNW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 12
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 12
- 239000000546 pharmaceutical excipient Substances 0.000 description 12
- 239000000047 product Substances 0.000 description 12
- 238000011161 development Methods 0.000 description 11
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 11
- 230000001965 increasing effect Effects 0.000 description 11
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 11
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 11
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 11
- LMDZBCPBFSXMTL-UHFFFAOYSA-N 1-ethyl-3-(3-dimethylaminopropyl)carbodiimide Chemical compound CCN=C=NCCCN(C)C LMDZBCPBFSXMTL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- 241000829100 Macaca mulatta polyomavirus 1 Species 0.000 description 10
- 230000010065 bacterial adhesion Effects 0.000 description 10
- -1 fnA Proteins 0.000 description 10
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 9
- ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N Proline Natural products OC(=O)C1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 9
- 235000014680 Saccharomyces cerevisiae Nutrition 0.000 description 9
- HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M Sodium hydroxide Chemical compound [OH-].[Na+] HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 9
- 108091008324 binding proteins Proteins 0.000 description 9
- 239000012620 biological material Substances 0.000 description 9
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 9
- 230000007423 decrease Effects 0.000 description 9
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 9
- 101150039742 fnbB gene Proteins 0.000 description 9
- 239000010931 gold Substances 0.000 description 9
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 description 9
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 9
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 9
- 229940090044 injection Drugs 0.000 description 9
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 9
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 9
- 230000009257 reactivity Effects 0.000 description 9
- 241000192125 Firmicutes Species 0.000 description 8
- WSFSSNUMVMOOMR-UHFFFAOYSA-N Formaldehyde Chemical compound O=C WSFSSNUMVMOOMR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 239000004793 Polystyrene Substances 0.000 description 8
- 108010090804 Streptavidin Proteins 0.000 description 8
- 230000003115 biocidal effect Effects 0.000 description 8
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 8
- 238000003018 immunoassay Methods 0.000 description 8
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 8
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 8
- 244000052769 pathogen Species 0.000 description 8
- 235000010482 polyoxyethylene sorbitan monooleate Nutrition 0.000 description 8
- 229920000053 polysorbate 80 Polymers 0.000 description 8
- 229920002223 polystyrene Polymers 0.000 description 8
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 8
- 210000000952 spleen Anatomy 0.000 description 8
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 8
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 8
- 208000035143 Bacterial infection Diseases 0.000 description 7
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 7
- 101710196256 Collagen adhesin Proteins 0.000 description 7
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 7
- 101100439912 Staphylococcus aureus (strain Mu50 / ATCC 700699) clfA gene Proteins 0.000 description 7
- 206010061372 Streptococcal infection Diseases 0.000 description 7
- 230000002378 acidificating effect Effects 0.000 description 7
- 239000007864 aqueous solution Substances 0.000 description 7
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 7
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 7
- 101150043616 cna gene Proteins 0.000 description 7
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 7
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 7
- 238000001990 intravenous administration Methods 0.000 description 7
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 7
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 7
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 description 7
- 125000001500 prolyl group Chemical group [H]N1C([H])(C(=O)[*])C([H])([H])C([H])([H])C1([H])[H] 0.000 description 7
- 238000002255 vaccination Methods 0.000 description 7
- XZKIHKMTEMTJQX-UHFFFAOYSA-N 4-Nitrophenyl Phosphate Chemical compound OP(O)(=O)OC1=CC=C([N+]([O-])=O)C=C1 XZKIHKMTEMTJQX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N Acetic acid Chemical compound CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N Acetonitrile Chemical compound CC#N WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 241000283707 Capra Species 0.000 description 6
- TWRXJAOTZQYOKJ-UHFFFAOYSA-L Magnesium chloride Chemical compound [Mg+2].[Cl-].[Cl-] TWRXJAOTZQYOKJ-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 6
- MUBZPKHOEPUJKR-UHFFFAOYSA-N Oxalic acid Chemical compound OC(=O)C(O)=O MUBZPKHOEPUJKR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-N Phosphoric acid Chemical compound OP(O)(O)=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 239000002202 Polyethylene glycol Substances 0.000 description 6
- 229920001213 Polysorbate 20 Polymers 0.000 description 6
- PXIPVTKHYLBLMZ-UHFFFAOYSA-N Sodium azide Chemical compound [Na+].[N-]=[N+]=[N-] PXIPVTKHYLBLMZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 241000194017 Streptococcus Species 0.000 description 6
- XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N Urea Chemical compound NC(N)=O XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 206010052428 Wound Diseases 0.000 description 6
- 208000027418 Wounds and injury Diseases 0.000 description 6
- 238000001042 affinity chromatography Methods 0.000 description 6
- 239000002775 capsule Substances 0.000 description 6
- 210000000845 cartilage Anatomy 0.000 description 6
- 210000002421 cell wall Anatomy 0.000 description 6
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 6
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 6
- 238000000576 coating method Methods 0.000 description 6
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 6
- 239000003085 diluting agent Substances 0.000 description 6
- 239000006185 dispersion Substances 0.000 description 6
- 239000002158 endotoxin Substances 0.000 description 6
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 6
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 6
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 6
- 230000009215 host defense mechanism Effects 0.000 description 6
- FDGQSTZJBFJUBT-UHFFFAOYSA-N hypoxanthine Chemical compound O=C1NC=NC2=C1NC=N2 FDGQSTZJBFJUBT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 210000000987 immune system Anatomy 0.000 description 6
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 6
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 6
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 6
- 210000004379 membrane Anatomy 0.000 description 6
- 239000000256 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Substances 0.000 description 6
- 239000000843 powder Substances 0.000 description 6
- 238000003127 radioimmunoassay Methods 0.000 description 6
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 6
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 6
- 239000011347 resin Substances 0.000 description 6
- 229920005989 resin Polymers 0.000 description 6
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 6
- 238000001179 sorption measurement Methods 0.000 description 6
- 238000001228 spectrum Methods 0.000 description 6
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 6
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 6
- 206010003445 Ascites Diseases 0.000 description 5
- 241000283690 Bos taurus Species 0.000 description 5
- VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N Hydrochloric acid Chemical compound Cl VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- ONIBWKKTOPOVIA-BYPYZUCNSA-N L-Proline Chemical compound OC(=O)[C@@H]1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 5
- ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N L-glutamine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N 0.000 description 5
- QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N L-tryptophane Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N 0.000 description 5
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 5
- 108010076504 Protein Sorting Signals Proteins 0.000 description 5
- 241000700159 Rattus Species 0.000 description 5
- DBMJMQXJHONAFJ-UHFFFAOYSA-M Sodium laurylsulphate Chemical compound [Na+].CCCCCCCCCCCCOS([O-])(=O)=O DBMJMQXJHONAFJ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 5
- QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N Tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 108010046334 Urease Proteins 0.000 description 5
- 239000003242 anti bacterial agent Substances 0.000 description 5
- 208000022362 bacterial infectious disease Diseases 0.000 description 5
- 244000052616 bacterial pathogen Species 0.000 description 5
- 239000000969 carrier Substances 0.000 description 5
- 230000008859 change Effects 0.000 description 5
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 5
- 238000013461 design Methods 0.000 description 5
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 5
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 5
- 238000010494 dissociation reaction Methods 0.000 description 5
- 230000005593 dissociations Effects 0.000 description 5
- 210000001508 eye Anatomy 0.000 description 5
- 239000012530 fluid Substances 0.000 description 5
- 235000011187 glycerol Nutrition 0.000 description 5
- 230000005847 immunogenicity Effects 0.000 description 5
- 230000001976 improved effect Effects 0.000 description 5
- 238000007918 intramuscular administration Methods 0.000 description 5
- 238000007912 intraperitoneal administration Methods 0.000 description 5
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 5
- 230000007935 neutral effect Effects 0.000 description 5
- 238000010647 peptide synthesis reaction Methods 0.000 description 5
- 239000010452 phosphate Substances 0.000 description 5
- 235000010486 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Nutrition 0.000 description 5
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 5
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 5
- 238000003860 storage Methods 0.000 description 5
- 238000007920 subcutaneous administration Methods 0.000 description 5
- 239000003826 tablet Substances 0.000 description 5
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 5
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 5
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 5
- TVZGACDUOSZQKY-LBPRGKRZSA-N 4-aminofolic acid Chemical compound C1=NC2=NC(N)=NC(N)=C2N=C1CNC1=CC=C(C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)C=C1 TVZGACDUOSZQKY-LBPRGKRZSA-N 0.000 description 4
- 108091035707 Consensus sequence Proteins 0.000 description 4
- ZHNUHDYFZUAESO-UHFFFAOYSA-N Formamide Chemical compound NC=O ZHNUHDYFZUAESO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 4
- 102000018251 Hypoxanthine Phosphoribosyltransferase Human genes 0.000 description 4
- 108010091358 Hypoxanthine Phosphoribosyltransferase Proteins 0.000 description 4
- XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N Iron Chemical compound [Fe] XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 241000191940 Staphylococcus Species 0.000 description 4
- IQFYYKKMVGJFEH-XLPZGREQSA-N Thymidine Chemical compound O=C1NC(=O)C(C)=CN1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)C1 IQFYYKKMVGJFEH-XLPZGREQSA-N 0.000 description 4
- 238000001261 affinity purification Methods 0.000 description 4
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 4
- 229960003896 aminopterin Drugs 0.000 description 4
- 238000010171 animal model Methods 0.000 description 4
- 238000011091 antibody purification Methods 0.000 description 4
- 210000000628 antibody-producing cell Anatomy 0.000 description 4
- 239000002585 base Substances 0.000 description 4
- WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N beta-D-glucose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N 0.000 description 4
- 108010005774 beta-Galactosidase Proteins 0.000 description 4
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 description 4
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 description 4
- 230000007910 cell fusion Effects 0.000 description 4
- 210000000170 cell membrane Anatomy 0.000 description 4
- 238000002983 circular dichroism Methods 0.000 description 4
- 239000011248 coating agent Substances 0.000 description 4
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 description 4
- XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N cysteine Natural products SCC(N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 230000002950 deficient Effects 0.000 description 4
- ZBCBWPMODOFKDW-UHFFFAOYSA-N diethanolamine Chemical compound OCCNCCO ZBCBWPMODOFKDW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000002552 dosage form Substances 0.000 description 4
- ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N glutamine Natural products OC(=O)C(N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 108010037896 heparin-binding hemagglutinin Proteins 0.000 description 4
- HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N histidine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 230000016784 immunoglobulin production Effects 0.000 description 4
- 238000001114 immunoprecipitation Methods 0.000 description 4
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 4
- 238000001802 infusion Methods 0.000 description 4
- 239000003978 infusion fluid Substances 0.000 description 4
- 238000011081 inoculation Methods 0.000 description 4
- BPHPUYQFMNQIOC-NXRLNHOXSA-N isopropyl beta-D-thiogalactopyranoside Chemical compound CC(C)S[C@@H]1O[C@H](CO)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O BPHPUYQFMNQIOC-NXRLNHOXSA-N 0.000 description 4
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 4
- 210000004698 lymphocyte Anatomy 0.000 description 4
- HQKMJHAJHXVSDF-UHFFFAOYSA-L magnesium stearate Chemical compound [Mg+2].CCCCCCCCCCCCCCCCCC([O-])=O.CCCCCCCCCCCCCCCCCC([O-])=O HQKMJHAJHXVSDF-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 4
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 4
- 230000003278 mimic effect Effects 0.000 description 4
- 210000004897 n-terminal region Anatomy 0.000 description 4
- 239000002088 nanocapsule Substances 0.000 description 4
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 description 4
- 239000012071 phase Substances 0.000 description 4
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K phosphate Chemical compound [O-]P([O-])([O-])=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 4
- 239000013600 plasmid vector Substances 0.000 description 4
- 238000002264 polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 4
- 229920000136 polysorbate Polymers 0.000 description 4
- 230000003389 potentiating effect Effects 0.000 description 4
- 238000003259 recombinant expression Methods 0.000 description 4
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 4
- 230000003252 repetitive effect Effects 0.000 description 4
- 239000006152 selective media Substances 0.000 description 4
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 4
- 210000003491 skin Anatomy 0.000 description 4
- 230000004936 stimulating effect Effects 0.000 description 4
- 235000000346 sugar Nutrition 0.000 description 4
- GETQZCLCWQTVFV-UHFFFAOYSA-N trimethylamine Chemical compound CN(C)C GETQZCLCWQTVFV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- MYPYJXKWCTUITO-UHFFFAOYSA-N vancomycin Natural products O1C(C(=C2)Cl)=CC=C2C(O)C(C(NC(C2=CC(O)=CC(O)=C2C=2C(O)=CC=C3C=2)C(O)=O)=O)NC(=O)C3NC(=O)C2NC(=O)C(CC(N)=O)NC(=O)C(NC(=O)C(CC(C)C)NC)C(O)C(C=C3Cl)=CC=C3OC3=CC2=CC1=C3OC1OC(CO)C(O)C(O)C1OC1CC(C)(N)C(O)C(C)O1 MYPYJXKWCTUITO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- AGNGYMCLFWQVGX-AGFFZDDWSA-N (e)-1-[(2s)-2-amino-2-carboxyethoxy]-2-diazonioethenolate Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CO\C([O-])=C\[N+]#N AGNGYMCLFWQVGX-AGFFZDDWSA-N 0.000 description 3
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 3
- 239000004475 Arginine Substances 0.000 description 3
- 206010053555 Arthritis bacterial Diseases 0.000 description 3
- DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N Asparagine Natural products OC(=O)C(N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108010077805 Bacterial Proteins Proteins 0.000 description 3
- 241000282461 Canis lupus Species 0.000 description 3
- 241000282472 Canis lupus familiaris Species 0.000 description 3
- 108010065152 Coagulase Proteins 0.000 description 3
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 3
- 241000701022 Cytomegalovirus Species 0.000 description 3
- 238000012286 ELISA Assay Methods 0.000 description 3
- 241000283073 Equus caballus Species 0.000 description 3
- 241000282326 Felis catus Species 0.000 description 3
- 108010049003 Fibrinogen Proteins 0.000 description 3
- 102000008946 Fibrinogen Human genes 0.000 description 3
- 108010010803 Gelatin Proteins 0.000 description 3
- WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N Glutamic acid Natural products OC(=O)C(N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 3
- 102000003886 Glycoproteins Human genes 0.000 description 3
- 108090000288 Glycoproteins Proteins 0.000 description 3
- 108091027305 Heteroduplex Proteins 0.000 description 3
- UGQMRVRMYYASKQ-UHFFFAOYSA-N Hypoxanthine nucleoside Natural products OC1C(O)C(CO)OC1N1C(NC=NC2=O)=C2N=C1 UGQMRVRMYYASKQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 208000004575 Infectious Arthritis Diseases 0.000 description 3
- 206010061218 Inflammation Diseases 0.000 description 3
- DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N L-asparagine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N 0.000 description 3
- CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N L-aspartic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N 0.000 description 3
- AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N L-isoleucine Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 3
- ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N L-leucine Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 3
- KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N L-lysine Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 3
- FBOZXECLQNJBKD-ZDUSSCGKSA-N L-methotrexate Chemical compound C=1N=C2N=C(N)N=C(N)C2=NC=1CN(C)C1=CC=C(C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)C=C1 FBOZXECLQNJBKD-ZDUSSCGKSA-N 0.000 description 3
- KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N L-valine Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 3
- GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N Lactose Natural products OC[C@H]1O[C@@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)C(O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N 0.000 description 3
- ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N Leucine Natural products CC(C)CC(N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 description 3
- 102000018697 Membrane Proteins Human genes 0.000 description 3
- 108010052285 Membrane Proteins Proteins 0.000 description 3
- ZMXDDKWLCZADIW-UHFFFAOYSA-N N,N-Dimethylformamide Chemical compound CN(C)C=O ZMXDDKWLCZADIW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108020004711 Nucleic Acid Probes Proteins 0.000 description 3
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 3
- 102000057297 Pepsin A Human genes 0.000 description 3
- 108090000284 Pepsin A Proteins 0.000 description 3
- 102000007079 Peptide Fragments Human genes 0.000 description 3
- 108010033276 Peptide Fragments Proteins 0.000 description 3
- DNIAPMSPPWPWGF-UHFFFAOYSA-N Propylene glycol Chemical compound CC(O)CO DNIAPMSPPWPWGF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 description 3
- 238000012300 Sequence Analysis Methods 0.000 description 3
- MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N Serine Natural products OCC(N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 241000191963 Staphylococcus epidermidis Species 0.000 description 3
- 210000001744 T-lymphocyte Anatomy 0.000 description 3
- AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N Threonine Natural products CC(O)C(N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000004473 Threonine Substances 0.000 description 3
- ZMANZCXQSJIPKH-UHFFFAOYSA-N Triethylamine Chemical compound CCN(CC)CC ZMANZCXQSJIPKH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000007983 Tris buffer Substances 0.000 description 3
- 206010053614 Type III immune complex mediated reaction Diseases 0.000 description 3
- KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N Valine Natural products CC(C)C(N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 241000251539 Vertebrata <Metazoa> Species 0.000 description 3
- 206010000269 abscess Diseases 0.000 description 3
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 3
- 230000009471 action Effects 0.000 description 3
- 229910000147 aluminium phosphate Inorganic materials 0.000 description 3
- AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N ampicillin Chemical compound C1([C@@H](N)C(=O)N[C@H]2[C@H]3SC([C@@H](N3C2=O)C(O)=O)(C)C)=CC=CC=C1 AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N 0.000 description 3
- 229960000723 ampicillin Drugs 0.000 description 3
- 229940088710 antibiotic agent Drugs 0.000 description 3
- ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N arginine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=N ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 235000009582 asparagine Nutrition 0.000 description 3
- 229960001230 asparagine Drugs 0.000 description 3
- 235000003704 aspartic acid Nutrition 0.000 description 3
- 102000005936 beta-Galactosidase Human genes 0.000 description 3
- OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N beta-carboxyaspartic acid Natural products OC(=O)C(N)C(C(O)=O)C(O)=O OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000011230 binding agent Substances 0.000 description 3
- 230000008827 biological function Effects 0.000 description 3
- 210000001124 body fluid Anatomy 0.000 description 3
- 239000010839 body fluid Substances 0.000 description 3
- 210000000988 bone and bone Anatomy 0.000 description 3
- 239000004202 carbamide Substances 0.000 description 3
- 238000001142 circular dichroism spectrum Methods 0.000 description 3
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 3
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 3
- 238000007865 diluting Methods 0.000 description 3
- 239000002612 dispersion medium Substances 0.000 description 3
- 206010014665 endocarditis Diseases 0.000 description 3
- 210000003527 eukaryotic cell Anatomy 0.000 description 3
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 3
- 230000002349 favourable effect Effects 0.000 description 3
- 239000000796 flavoring agent Substances 0.000 description 3
- 235000013355 food flavoring agent Nutrition 0.000 description 3
- 230000006870 function Effects 0.000 description 3
- 239000008273 gelatin Substances 0.000 description 3
- 229920000159 gelatin Polymers 0.000 description 3
- 235000019322 gelatine Nutrition 0.000 description 3
- 235000011852 gelatine desserts Nutrition 0.000 description 3
- 235000013922 glutamic acid Nutrition 0.000 description 3
- 239000004220 glutamic acid Substances 0.000 description 3
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 3
- PJJJBBJSCAKJQF-UHFFFAOYSA-N guanidinium chloride Chemical compound [Cl-].NC(N)=[NH2+] PJJJBBJSCAKJQF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 210000002216 heart Anatomy 0.000 description 3
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 3
- 230000002209 hydrophobic effect Effects 0.000 description 3
- 230000016178 immune complex formation Effects 0.000 description 3
- 210000004201 immune sera Anatomy 0.000 description 3
- 229940042743 immune sera Drugs 0.000 description 3
- 229940072221 immunoglobulins Drugs 0.000 description 3
- 239000007943 implant Substances 0.000 description 3
- 230000004054 inflammatory process Effects 0.000 description 3
- 239000004615 ingredient Substances 0.000 description 3
- 230000002452 interceptive effect Effects 0.000 description 3
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 3
- 150000002500 ions Chemical class 0.000 description 3
- AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N isoleucine Natural products CCC(C)C(N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 229960000310 isoleucine Drugs 0.000 description 3
- 239000008101 lactose Substances 0.000 description 3
- 229920006008 lipopolysaccharide Polymers 0.000 description 3
- 230000004807 localization Effects 0.000 description 3
- 229910001629 magnesium chloride Inorganic materials 0.000 description 3
- 238000013507 mapping Methods 0.000 description 3
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 3
- 229960000485 methotrexate Drugs 0.000 description 3
- 108091005601 modified peptides Proteins 0.000 description 3
- 239000002324 mouth wash Substances 0.000 description 3
- 238000002703 mutagenesis Methods 0.000 description 3
- 231100000350 mutagenesis Toxicity 0.000 description 3
- 210000004898 n-terminal fragment Anatomy 0.000 description 3
- 239000002853 nucleic acid probe Substances 0.000 description 3
- 238000007500 overflow downdraw method Methods 0.000 description 3
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 3
- 229940111202 pepsin Drugs 0.000 description 3
- 230000035699 permeability Effects 0.000 description 3
- 239000006187 pill Substances 0.000 description 3
- 230000008488 polyadenylation Effects 0.000 description 3
- 239000003755 preservative agent Substances 0.000 description 3
- 238000011321 prophylaxis Methods 0.000 description 3
- 230000002285 radioactive effect Effects 0.000 description 3
- 230000008707 rearrangement Effects 0.000 description 3
- 238000010188 recombinant method Methods 0.000 description 3
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 3
- 230000004044 response Effects 0.000 description 3
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 3
- 238000007423 screening assay Methods 0.000 description 3
- 201000001223 septic arthritis Diseases 0.000 description 3
- 239000007790 solid phase Substances 0.000 description 3
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 3
- 238000010254 subcutaneous injection Methods 0.000 description 3
- 239000007929 subcutaneous injection Substances 0.000 description 3
- 239000000829 suppository Substances 0.000 description 3
- 238000001356 surgical procedure Methods 0.000 description 3
- 230000002195 synergetic effect Effects 0.000 description 3
- 230000007704 transition Effects 0.000 description 3
- 230000014616 translation Effects 0.000 description 3
- LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N tris Chemical compound OCC(N)(CO)CO LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 description 3
- 239000004474 valine Substances 0.000 description 3
- 230000002792 vascular Effects 0.000 description 3
- 230000001018 virulence Effects 0.000 description 3
- YMXHPSHLTSZXKH-RVBZMBCESA-N (2,5-dioxopyrrolidin-1-yl) 5-[(3as,4s,6ar)-2-oxo-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoate Chemical compound C([C@H]1[C@H]2NC(=O)N[C@H]2CS1)CCCC(=O)ON1C(=O)CCC1=O YMXHPSHLTSZXKH-RVBZMBCESA-N 0.000 description 2
- QBYIENPQHBMVBV-HFEGYEGKSA-N (2R)-2-hydroxy-2-phenylacetic acid Chemical compound O[C@@H](C(O)=O)c1ccccc1.O[C@@H](C(O)=O)c1ccccc1 QBYIENPQHBMVBV-HFEGYEGKSA-N 0.000 description 2
- OWEGMIWEEQEYGQ-UHFFFAOYSA-N 100676-05-9 Natural products OC1C(O)C(O)C(CO)OC1OCC1C(O)C(O)C(O)C(OC2C(OC(O)C(O)C2O)CO)O1 OWEGMIWEEQEYGQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- NHBKXEKEPDILRR-UHFFFAOYSA-N 2,3-bis(butanoylsulfanyl)propyl butanoate Chemical compound CCCC(=O)OCC(SC(=O)CCC)CSC(=O)CCC NHBKXEKEPDILRR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- HQFLTUZKIRYQSP-UHFFFAOYSA-N 3-ethyl-2h-1,3-benzothiazole-6-sulfonic acid Chemical compound OS(=O)(=O)C1=CC=C2N(CC)CSC2=C1 HQFLTUZKIRYQSP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- LPXQRXLUHJKZIE-UHFFFAOYSA-N 8-azaguanine Chemical compound NC1=NC(O)=C2NN=NC2=N1 LPXQRXLUHJKZIE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229960005508 8-azaguanine Drugs 0.000 description 2
- 208000035657 Abasia Diseases 0.000 description 2
- GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N Alpha-Lactose Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)O[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N 0.000 description 2
- QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-O Ammonium Chemical compound [NH4+] QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-O 0.000 description 2
- ATRRKUHOCOJYRX-UHFFFAOYSA-N Ammonium bicarbonate Chemical compound [NH4+].OC([O-])=O ATRRKUHOCOJYRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229910000013 Ammonium bicarbonate Inorganic materials 0.000 description 2
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- DWRXFEITVBNRMK-UHFFFAOYSA-N Beta-D-1-Arabinofuranosylthymine Natural products O=C1NC(=O)C(C)=CN1C1C(O)C(O)C(CO)O1 DWRXFEITVBNRMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- BTBUEUYNUDRHOZ-UHFFFAOYSA-N Borate Chemical compound [O-]B([O-])[O-] BTBUEUYNUDRHOZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101001027553 Bos taurus Fibronectin Proteins 0.000 description 2
- 241000167854 Bourreria succulenta Species 0.000 description 2
- OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N Calcium Chemical compound [Ca] OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010001857 Cell Surface Receptors Proteins 0.000 description 2
- 102000000844 Cell Surface Receptors Human genes 0.000 description 2
- 229920002261 Corn starch Polymers 0.000 description 2
- 241000699800 Cricetinae Species 0.000 description 2
- 241000699802 Cricetulus griseus Species 0.000 description 2
- FEWJPZIEWOKRBE-JCYAYHJZSA-N Dextrotartaric acid Chemical compound OC(=O)[C@H](O)[C@@H](O)C(O)=O FEWJPZIEWOKRBE-JCYAYHJZSA-N 0.000 description 2
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 description 2
- 241000206602 Eukaryota Species 0.000 description 2
- 108010073385 Fibrin Proteins 0.000 description 2
- 102000009123 Fibrin Human genes 0.000 description 2
- BWGVNKXGVNDBDI-UHFFFAOYSA-N Fibrin monomer Chemical compound CNC(=O)CNC(=O)CN BWGVNKXGVNDBDI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000233866 Fungi Species 0.000 description 2
- SXRSQZLOMIGNAQ-UHFFFAOYSA-N Glutaraldehyde Chemical compound O=CCCCC=O SXRSQZLOMIGNAQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000238631 Hexapoda Species 0.000 description 2
- 206010061598 Immunodeficiency Diseases 0.000 description 2
- 108010021625 Immunoglobulin Fragments Proteins 0.000 description 2
- 102000008394 Immunoglobulin Fragments Human genes 0.000 description 2
- QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N L-alanine Chemical compound C[C@H](N)C(O)=O QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N 0.000 description 2
- HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N L-histidine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 2
- FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N L-methionine Chemical compound CSCC[C@H](N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 2
- COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N L-phenylalanine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 2
- OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N L-tyrosine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 2
- GUBGYTABKSRVRQ-PICCSMPSSA-N Maltose Natural products O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)OC(O)[C@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-PICCSMPSSA-N 0.000 description 2
- 241001529936 Murinae Species 0.000 description 2
- 108010021466 Mutant Proteins Proteins 0.000 description 2
- 102000008300 Mutant Proteins Human genes 0.000 description 2
- 241000187479 Mycobacterium tuberculosis Species 0.000 description 2
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 2
- 239000000020 Nitrocellulose Substances 0.000 description 2
- 206010033078 Otitis media Diseases 0.000 description 2
- 108091005804 Peptidases Proteins 0.000 description 2
- ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N Phenol Chemical compound OC1=CC=CC=C1 ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 206010035664 Pneumonia Diseases 0.000 description 2
- ZLMJMSJWJFRBEC-UHFFFAOYSA-N Potassium Chemical compound [K] ZLMJMSJWJFRBEC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000004365 Protease Substances 0.000 description 2
- IWYDHOAUDWTVEP-UHFFFAOYSA-N R-2-phenyl-2-hydroxyacetic acid Natural products OC(=O)C(O)C1=CC=CC=C1 IWYDHOAUDWTVEP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010071390 Serum Albumin Proteins 0.000 description 2
- 102000007562 Serum Albumin Human genes 0.000 description 2
- UIIMBOGNXHQVGW-UHFFFAOYSA-M Sodium bicarbonate Chemical compound [Na+].OC([O-])=O UIIMBOGNXHQVGW-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 241000191984 Staphylococcus haemolyticus Species 0.000 description 2
- 229930006000 Sucrose Natural products 0.000 description 2
- CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N Sucrose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N 0.000 description 2
- 230000005867 T cell response Effects 0.000 description 2
- FEWJPZIEWOKRBE-UHFFFAOYSA-N Tartaric acid Natural products [H+].[H+].[O-]C(=O)C(O)C(O)C([O-])=O FEWJPZIEWOKRBE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 208000031737 Tissue Adhesions Diseases 0.000 description 2
- 108700019146 Transgenes Proteins 0.000 description 2
- DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N Trifluoroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(F)(F)F DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010059993 Vancomycin Proteins 0.000 description 2
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 2
- 238000002835 absorbance Methods 0.000 description 2
- 238000010521 absorption reaction Methods 0.000 description 2
- 235000011054 acetic acid Nutrition 0.000 description 2
- 239000013543 active substance Substances 0.000 description 2
- 230000002776 aggregation Effects 0.000 description 2
- 238000004220 aggregation Methods 0.000 description 2
- 235000004279 alanine Nutrition 0.000 description 2
- WNROFYMDJYEPJX-UHFFFAOYSA-K aluminium hydroxide Chemical compound [OH-].[OH-].[OH-].[Al+3] WNROFYMDJYEPJX-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 2
- 125000003277 amino group Chemical group 0.000 description 2
- 235000012538 ammonium bicarbonate Nutrition 0.000 description 2
- 239000001099 ammonium carbonate Substances 0.000 description 2
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 2
- 210000004102 animal cell Anatomy 0.000 description 2
- 230000000844 anti-bacterial effect Effects 0.000 description 2
- 239000003429 antifungal agent Substances 0.000 description 2
- 229940121375 antifungal agent Drugs 0.000 description 2
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 2
- 239000012736 aqueous medium Substances 0.000 description 2
- 230000002238 attenuated effect Effects 0.000 description 2
- OHDRQQURAXLVGJ-HLVWOLMTSA-N azane;(2e)-3-ethyl-2-[(e)-(3-ethyl-6-sulfo-1,3-benzothiazol-2-ylidene)hydrazinylidene]-1,3-benzothiazole-6-sulfonic acid Chemical compound [NH4+].[NH4+].S/1C2=CC(S([O-])(=O)=O)=CC=C2N(CC)C\1=N/N=C1/SC2=CC(S([O-])(=O)=O)=CC=C2N1CC OHDRQQURAXLVGJ-HLVWOLMTSA-N 0.000 description 2
- 229950011321 azaserine Drugs 0.000 description 2
- 230000029586 bacterial cell surface binding Effects 0.000 description 2
- 239000011324 bead Substances 0.000 description 2
- 230000009286 beneficial effect Effects 0.000 description 2
- IQFYYKKMVGJFEH-UHFFFAOYSA-N beta-L-thymidine Natural products O=C1NC(=O)C(C)=CN1C1OC(CO)C(O)C1 IQFYYKKMVGJFEH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000008275 binding mechanism Effects 0.000 description 2
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 2
- 229910021538 borax Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000007853 buffer solution Substances 0.000 description 2
- 239000011575 calcium Substances 0.000 description 2
- 229910052791 calcium Inorganic materials 0.000 description 2
- 230000000747 cardiac effect Effects 0.000 description 2
- 239000005018 casein Substances 0.000 description 2
- BECPQYXYKAMYBN-UHFFFAOYSA-N casein, tech. Chemical compound NCCCCC(C(O)=O)N=C(O)C(CC(O)=O)N=C(O)C(CCC(O)=N)N=C(O)C(CC(C)C)N=C(O)C(CCC(O)=O)N=C(O)C(CC(O)=O)N=C(O)C(CCC(O)=O)N=C(O)C(C(C)O)N=C(O)C(CCC(O)=N)N=C(O)C(CCC(O)=N)N=C(O)C(CCC(O)=N)N=C(O)C(CCC(O)=O)N=C(O)C(CCC(O)=O)N=C(O)C(COP(O)(O)=O)N=C(O)C(CCC(O)=N)N=C(O)C(N)CC1=CC=CC=C1 BECPQYXYKAMYBN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 235000021240 caseins Nutrition 0.000 description 2
- 230000021164 cell adhesion Effects 0.000 description 2
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 2
- 230000036755 cellular response Effects 0.000 description 2
- 239000013522 chelant Substances 0.000 description 2
- 235000019693 cherries Nutrition 0.000 description 2
- OSASVXMJTNOKOY-UHFFFAOYSA-N chlorobutanol Chemical compound CC(C)(O)C(Cl)(Cl)Cl OSASVXMJTNOKOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000002759 chromosomal effect Effects 0.000 description 2
- 230000009918 complex formation Effects 0.000 description 2
- 239000011365 complex material Substances 0.000 description 2
- 230000001143 conditioned effect Effects 0.000 description 2
- 230000021615 conjugation Effects 0.000 description 2
- 108091036078 conserved sequence Proteins 0.000 description 2
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 2
- 239000008120 corn starch Substances 0.000 description 2
- 230000008878 coupling Effects 0.000 description 2
- 238000010168 coupling process Methods 0.000 description 2
- 238000005859 coupling reaction Methods 0.000 description 2
- 239000006071 cream Substances 0.000 description 2
- 230000009260 cross reactivity Effects 0.000 description 2
- 238000012258 culturing Methods 0.000 description 2
- 125000000151 cysteine group Chemical group N[C@@H](CS)C(=O)* 0.000 description 2
- 210000000805 cytoplasm Anatomy 0.000 description 2
- 231100000433 cytotoxic Toxicity 0.000 description 2
- 230000001472 cytotoxic effect Effects 0.000 description 2
- 230000007812 deficiency Effects 0.000 description 2
- 239000008367 deionised water Substances 0.000 description 2
- 229910021641 deionized water Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000008121 dextrose Substances 0.000 description 2
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 2
- 231100000673 dose–response relationship Toxicity 0.000 description 2
- 210000000959 ear middle Anatomy 0.000 description 2
- 238000010828 elution Methods 0.000 description 2
- 239000000839 emulsion Substances 0.000 description 2
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 2
- 238000001976 enzyme digestion Methods 0.000 description 2
- XJRPTMORGOIMMI-UHFFFAOYSA-N ethyl 2-amino-4-(trifluoromethyl)-1,3-thiazole-5-carboxylate Chemical compound CCOC(=O)C=1SC(N)=NC=1C(F)(F)F XJRPTMORGOIMMI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000013613 expression plasmid Substances 0.000 description 2
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 2
- 229950003499 fibrin Drugs 0.000 description 2
- 229940012952 fibrinogen Drugs 0.000 description 2
- 238000001943 fluorescence-activated cell sorting Methods 0.000 description 2
- 235000003599 food sweetener Nutrition 0.000 description 2
- 108010074605 gamma-Globulins Proteins 0.000 description 2
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 2
- 102000006602 glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase Human genes 0.000 description 2
- 108020004445 glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase Proteins 0.000 description 2
- 229960000789 guanidine hydrochloride Drugs 0.000 description 2
- 230000036541 health Effects 0.000 description 2
- 210000003709 heart valve Anatomy 0.000 description 2
- 210000005260 human cell Anatomy 0.000 description 2
- 235000011167 hydrochloric acid Nutrition 0.000 description 2
- 238000002169 hydrotherapy Methods 0.000 description 2
- NBZBKCUXIYYUSX-UHFFFAOYSA-N iminodiacetic acid Chemical compound OC(=O)CNCC(O)=O NBZBKCUXIYYUSX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000003100 immobilizing effect Effects 0.000 description 2
- 230000014726 immortalization of host cell Effects 0.000 description 2
- 230000036039 immunity Effects 0.000 description 2
- 229940127121 immunoconjugate Drugs 0.000 description 2
- 238000010324 immunological assay Methods 0.000 description 2
- 239000002955 immunomodulating agent Substances 0.000 description 2
- NOESYZHRGYRDHS-UHFFFAOYSA-N insulin Chemical compound N1C(=O)C(NC(=O)C(CCC(N)=O)NC(=O)C(CCC(O)=O)NC(=O)C(C(C)C)NC(=O)C(NC(=O)CN)C(C)CC)CSSCC(C(NC(CO)C(=O)NC(CC(C)C)C(=O)NC(CC=2C=CC(O)=CC=2)C(=O)NC(CCC(N)=O)C(=O)NC(CC(C)C)C(=O)NC(CCC(O)=O)C(=O)NC(CC(N)=O)C(=O)NC(CC=2C=CC(O)=CC=2)C(=O)NC(CSSCC(NC(=O)C(C(C)C)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(CC=2C=CC(O)=CC=2)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(C)NC(=O)C(CCC(O)=O)NC(=O)C(C(C)C)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(CC=2NC=NC=2)NC(=O)C(CO)NC(=O)CNC2=O)C(=O)NCC(=O)NC(CCC(O)=O)C(=O)NC(CCCNC(N)=N)C(=O)NCC(=O)NC(CC=3C=CC=CC=3)C(=O)NC(CC=3C=CC=CC=3)C(=O)NC(CC=3C=CC(O)=CC=3)C(=O)NC(C(C)O)C(=O)N3C(CCC3)C(=O)NC(CCCCN)C(=O)NC(C)C(O)=O)C(=O)NC(CC(N)=O)C(O)=O)=O)NC(=O)C(C(C)CC)NC(=O)C(CO)NC(=O)C(C(C)O)NC(=O)C1CSSCC2NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(NC(=O)C(CCC(N)=O)NC(=O)C(CC(N)=O)NC(=O)C(NC(=O)C(N)CC=1C=CC=CC=1)C(C)C)CC1=CN=CN1 NOESYZHRGYRDHS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000006495 integrins Human genes 0.000 description 2
- 108010044426 integrins Proteins 0.000 description 2
- 230000009878 intermolecular interaction Effects 0.000 description 2
- PGLTVOMIXTUURA-UHFFFAOYSA-N iodoacetamide Chemical compound NC(=O)CI PGLTVOMIXTUURA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229910052742 iron Inorganic materials 0.000 description 2
- JJWLVOIRVHMVIS-UHFFFAOYSA-N isopropylamine Chemical compound CC(C)N JJWLVOIRVHMVIS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101150109249 lacI gene Proteins 0.000 description 2
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 description 2
- 239000006193 liquid solution Substances 0.000 description 2
- 239000006194 liquid suspension Substances 0.000 description 2
- 244000144972 livestock Species 0.000 description 2
- 210000001165 lymph node Anatomy 0.000 description 2
- 125000003588 lysine group Chemical group [H]N([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])(N([H])[H])C(*)=O 0.000 description 2
- 235000019359 magnesium stearate Nutrition 0.000 description 2
- 229960002510 mandelic acid Drugs 0.000 description 2
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 2
- 229930182817 methionine Natural products 0.000 description 2
- 244000000010 microbial pathogen Species 0.000 description 2
- 150000007522 mineralic acids Chemical class 0.000 description 2
- 230000003505 mutagenic effect Effects 0.000 description 2
- 238000011587 new zealand white rabbit Methods 0.000 description 2
- 229920001220 nitrocellulos Polymers 0.000 description 2
- 230000009871 nonspecific binding Effects 0.000 description 2
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 2
- 239000003921 oil Substances 0.000 description 2
- 235000019198 oils Nutrition 0.000 description 2
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 2
- 150000007524 organic acids Chemical class 0.000 description 2
- 235000005985 organic acids Nutrition 0.000 description 2
- 150000007530 organic bases Chemical class 0.000 description 2
- 230000008520 organization Effects 0.000 description 2
- 230000002018 overexpression Effects 0.000 description 2
- 235000006408 oxalic acid Nutrition 0.000 description 2
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 2
- 210000005259 peripheral blood Anatomy 0.000 description 2
- 239000011886 peripheral blood Substances 0.000 description 2
- 239000008177 pharmaceutical agent Substances 0.000 description 2
- COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N phenylalanine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 150000003904 phospholipids Chemical class 0.000 description 2
- 235000011007 phosphoric acid Nutrition 0.000 description 2
- 229920002704 polyhistidine Polymers 0.000 description 2
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 description 2
- 239000011591 potassium Substances 0.000 description 2
- 235000007686 potassium Nutrition 0.000 description 2
- 229910052700 potassium Inorganic materials 0.000 description 2
- MFDFERRIHVXMIY-UHFFFAOYSA-N procaine Chemical compound CCN(CC)CCOC(=O)C1=CC=C(N)C=C1 MFDFERRIHVXMIY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229960004919 procaine Drugs 0.000 description 2
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 2
- 210000001236 prokaryotic cell Anatomy 0.000 description 2
- 230000009465 prokaryotic expression Effects 0.000 description 2
- QELSKZZBTMNZEB-UHFFFAOYSA-N propylparaben Chemical compound CCCOC(=O)C1=CC=C(O)C=C1 QELSKZZBTMNZEB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000000159 protein binding assay Methods 0.000 description 2
- 238000011002 quantification Methods 0.000 description 2
- 239000010453 quartz Substances 0.000 description 2
- 238000011160 research Methods 0.000 description 2
- 230000000241 respiratory effect Effects 0.000 description 2
- 238000004366 reverse phase liquid chromatography Methods 0.000 description 2
- CVHZOJJKTDOEJC-UHFFFAOYSA-N saccharin Chemical compound C1=CC=C2C(=O)NS(=O)(=O)C2=C1 CVHZOJJKTDOEJC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 210000003296 saliva Anatomy 0.000 description 2
- 238000005070 sampling Methods 0.000 description 2
- VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N silicon dioxide Inorganic materials O=[Si]=O VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 210000003625 skull Anatomy 0.000 description 2
- 238000002415 sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 2
- 235000010339 sodium tetraborate Nutrition 0.000 description 2
- 210000001082 somatic cell Anatomy 0.000 description 2
- 210000004989 spleen cell Anatomy 0.000 description 2
- 230000000638 stimulation Effects 0.000 description 2
- 239000005720 sucrose Substances 0.000 description 2
- 150000008163 sugars Chemical class 0.000 description 2
- 239000004094 surface-active agent Substances 0.000 description 2
- 239000003765 sweetening agent Substances 0.000 description 2
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 2
- 230000002194 synthesizing effect Effects 0.000 description 2
- 239000006188 syrup Substances 0.000 description 2
- 235000020357 syrup Nutrition 0.000 description 2
- 239000011975 tartaric acid Substances 0.000 description 2
- 235000002906 tartaric acid Nutrition 0.000 description 2
- RTKIYNMVFMVABJ-UHFFFAOYSA-L thimerosal Chemical compound [Na+].CC[Hg]SC1=CC=CC=C1C([O-])=O RTKIYNMVFMVABJ-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- 229940104230 thymidine Drugs 0.000 description 2
- 239000000606 toothpaste Substances 0.000 description 2
- 108700012359 toxins Proteins 0.000 description 2
- 238000001890 transfection Methods 0.000 description 2
- 238000002054 transplantation Methods 0.000 description 2
- BSVBQGMMJUBVOD-UHFFFAOYSA-N trisodium borate Chemical compound [Na+].[Na+].[Na+].[O-]B([O-])[O-] BSVBQGMMJUBVOD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101150108727 trpl gene Proteins 0.000 description 2
- OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N tyrosine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000701447 unidentified baculovirus Species 0.000 description 2
- 210000000626 ureter Anatomy 0.000 description 2
- MYPYJXKWCTUITO-LYRMYLQWSA-N vancomycin Chemical compound O([C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1OC1=C2C=C3C=C1OC1=CC=C(C=C1Cl)[C@@H](O)[C@H](C(N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@H]3C(=O)N[C@H]1C(=O)N[C@H](C(N[C@@H](C3=CC(O)=CC(O)=C3C=3C(O)=CC=C1C=3)C(O)=O)=O)[C@H](O)C1=CC=C(C(=C1)Cl)O2)=O)NC(=O)[C@@H](CC(C)C)NC)[C@H]1C[C@](C)(N)[C@H](O)[C@H](C)O1 MYPYJXKWCTUITO-LYRMYLQWSA-N 0.000 description 2
- 229960003165 vancomycin Drugs 0.000 description 2
- 238000001429 visible spectrum Methods 0.000 description 2
- 239000011534 wash buffer Substances 0.000 description 2
- 239000000080 wetting agent Substances 0.000 description 2
- JWDFQMWEFLOOED-UHFFFAOYSA-N (2,5-dioxopyrrolidin-1-yl) 3-(pyridin-2-yldisulfanyl)propanoate Chemical compound O=C1CCC(=O)N1OC(=O)CCSSC1=CC=CC=N1 JWDFQMWEFLOOED-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N (2S)-2-Amino-3-hydroxypropansäure Chemical compound OC[C@H](N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- ALSTYHKOOCGGFT-KTKRTIGZSA-N (9Z)-octadecen-1-ol Chemical compound CCCCCCCC\C=C/CCCCCCCCO ALSTYHKOOCGGFT-KTKRTIGZSA-N 0.000 description 1
- 125000003088 (fluoren-9-ylmethoxy)carbonyl group Chemical group 0.000 description 1
- QZCJOXAIQXPLNS-UHFFFAOYSA-N 1,1,2,2,3,3,4,4,4a,5,5,6,6,7,7,8,8,8a-octadecafluoronaphthalene 4-(2-aminoethyl)benzene-1,2-diol Chemical compound NCCc1ccc(O)c(O)c1.FC1(F)C(F)(F)C(F)(F)C2(F)C(F)(F)C(F)(F)C(F)(F)C(F)(F)C2(F)C1(F)F QZCJOXAIQXPLNS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WBQJTPDOGLYTBE-VIFPVBQESA-N 1-nitroso-L-tryptophan Chemical group C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(O)=O)=CN(N=O)C2=C1 WBQJTPDOGLYTBE-VIFPVBQESA-N 0.000 description 1
- IIZPXYDJLKNOIY-JXPKJXOSSA-N 1-palmitoyl-2-arachidonoyl-sn-glycero-3-phosphocholine Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OC[C@H](COP([O-])(=O)OCC[N+](C)(C)C)OC(=O)CCC\C=C/C\C=C/C\C=C/C\C=C/CCCCC IIZPXYDJLKNOIY-JXPKJXOSSA-N 0.000 description 1
- GZCWLCBFPRFLKL-UHFFFAOYSA-N 1-prop-2-ynoxypropan-2-ol Chemical compound CC(O)COCC#C GZCWLCBFPRFLKL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- MIJDSYMOBYNHOT-UHFFFAOYSA-N 2-(ethylamino)ethanol Chemical compound CCNCCO MIJDSYMOBYNHOT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BDOYKFSQFYNPKF-UHFFFAOYSA-N 2-[2-[bis(carboxymethyl)amino]ethyl-(carboxymethyl)amino]acetic acid;sodium Chemical compound [Na].[Na].OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O BDOYKFSQFYNPKF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- GOJUJUVQIVIZAV-UHFFFAOYSA-N 2-amino-4,6-dichloropyrimidine-5-carbaldehyde Chemical group NC1=NC(Cl)=C(C=O)C(Cl)=N1 GOJUJUVQIVIZAV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VXPSQDAMFATNNG-UHFFFAOYSA-N 3-[2-(2,5-dioxopyrrol-3-yl)phenyl]pyrrole-2,5-dione Chemical compound O=C1NC(=O)C(C=2C(=CC=CC=2)C=2C(NC(=O)C=2)=O)=C1 VXPSQDAMFATNNG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OSJPPGNTCRNQQC-UWTATZPHSA-N 3-phospho-D-glyceric acid Chemical compound OC(=O)[C@H](O)COP(O)(O)=O OSJPPGNTCRNQQC-UWTATZPHSA-N 0.000 description 1
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 description 1
- FWEOQOXTVHGIFQ-UHFFFAOYSA-N 8-anilinonaphthalene-1-sulfonic acid Chemical compound C=12C(S(=O)(=O)O)=CC=CC2=CC=CC=1NC1=CC=CC=C1 FWEOQOXTVHGIFQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010000234 Abortion spontaneous Diseases 0.000 description 1
- 102000013563 Acid Phosphatase Human genes 0.000 description 1
- 108010051457 Acid Phosphatase Proteins 0.000 description 1
- 229920000936 Agarose Polymers 0.000 description 1
- 101710187573 Alcohol dehydrogenase 2 Proteins 0.000 description 1
- 101710133776 Alcohol dehydrogenase class-3 Proteins 0.000 description 1
- 208000002109 Argyria Diseases 0.000 description 1
- 241000416162 Astragalus gummifer Species 0.000 description 1
- 244000063299 Bacillus subtilis Species 0.000 description 1
- 235000014469 Bacillus subtilis Nutrition 0.000 description 1
- 208000031729 Bacteremia Diseases 0.000 description 1
- 206010066798 Bacterial tracheitis Diseases 0.000 description 1
- 102100026189 Beta-galactosidase Human genes 0.000 description 1
- 102000004506 Blood Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010017384 Blood Proteins Proteins 0.000 description 1
- 208000031462 Bovine Mastitis Diseases 0.000 description 1
- 208000004020 Brain Abscess Diseases 0.000 description 1
- 125000001433 C-terminal amino-acid group Chemical group 0.000 description 1
- 241000282465 Canis Species 0.000 description 1
- BVKZGUZCCUSVTD-UHFFFAOYSA-L Carbonate Chemical compound [O-]C([O-])=O BVKZGUZCCUSVTD-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 241000700198 Cavia Species 0.000 description 1
- 241000700199 Cavia porcellus Species 0.000 description 1
- 101100065968 Cereibacter sphaeroides fbp1 gene Proteins 0.000 description 1
- 241001227713 Chiron Species 0.000 description 1
- 206010053567 Coagulopathies Diseases 0.000 description 1
- 102000012422 Collagen Type I Human genes 0.000 description 1
- 108010022452 Collagen Type I Proteins 0.000 description 1
- 102000000503 Collagen Type II Human genes 0.000 description 1
- 108010041390 Collagen Type II Proteins 0.000 description 1
- 102000001187 Collagen Type III Human genes 0.000 description 1
- 108010069502 Collagen Type III Proteins 0.000 description 1
- 102000012432 Collagen Type V Human genes 0.000 description 1
- 108010022514 Collagen Type V Proteins 0.000 description 1
- 102000002734 Collagen Type VI Human genes 0.000 description 1
- 108010043741 Collagen Type VI Proteins 0.000 description 1
- 102000004510 Collagen Type VII Human genes 0.000 description 1
- 108010017377 Collagen Type VII Proteins 0.000 description 1
- 102000009736 Collagen Type XI Human genes 0.000 description 1
- 108010034789 Collagen Type XI Proteins 0.000 description 1
- 208000035473 Communicable disease Diseases 0.000 description 1
- 206010010741 Conjunctivitis Diseases 0.000 description 1
- 206010011409 Cross infection Diseases 0.000 description 1
- 239000004971 Cross linker Substances 0.000 description 1
- 241001308924 Cyclorana maini Species 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N D-Mannitol Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N 0.000 description 1
- 108010040923 D3 peptide Proteins 0.000 description 1
- 102000004594 DNA Polymerase I Human genes 0.000 description 1
- 108010017826 DNA Polymerase I Proteins 0.000 description 1
- 239000003155 DNA primer Substances 0.000 description 1
- 238000001712 DNA sequencing Methods 0.000 description 1
- 238000011238 DNA vaccination Methods 0.000 description 1
- 102000016928 DNA-directed DNA polymerase Human genes 0.000 description 1
- 108010014303 DNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- 229920002307 Dextran Polymers 0.000 description 1
- 206010012735 Diarrhoea Diseases 0.000 description 1
- 235000019739 Dicalciumphosphate Nutrition 0.000 description 1
- BWGNESOTFCXPMA-UHFFFAOYSA-N Dihydrogen disulfide Chemical compound SS BWGNESOTFCXPMA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N Dimethylsulphoxide Chemical compound CS(C)=O IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108090000204 Dipeptidase 1 Proteins 0.000 description 1
- 239000006144 Dulbecco’s modified Eagle's medium Substances 0.000 description 1
- 102100021238 Dynamin-2 Human genes 0.000 description 1
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010014561 Emphysema Diseases 0.000 description 1
- 201000009273 Endometriosis Diseases 0.000 description 1
- YCAGGFXSFQFVQL-UHFFFAOYSA-N Endothion Chemical compound COC1=COC(CSP(=O)(OC)OC)=CC1=O YCAGGFXSFQFVQL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000588921 Enterobacteriaceae Species 0.000 description 1
- 241000194032 Enterococcus faecalis Species 0.000 description 1
- 241000283086 Equidae Species 0.000 description 1
- 241001524679 Escherichia virus M13 Species 0.000 description 1
- 108010071289 Factor XIII Proteins 0.000 description 1
- 206010016936 Folliculitis Diseases 0.000 description 1
- 208000010412 Glaucoma Diseases 0.000 description 1
- 102000030595 Glucokinase Human genes 0.000 description 1
- 108010021582 Glucokinase Proteins 0.000 description 1
- 239000004366 Glucose oxidase Substances 0.000 description 1
- 108010015776 Glucose oxidase Proteins 0.000 description 1
- 102000005731 Glucose-6-phosphate isomerase Human genes 0.000 description 1
- 108010070600 Glucose-6-phosphate isomerase Proteins 0.000 description 1
- 108060003393 Granulin Proteins 0.000 description 1
- 108010051696 Growth Hormone Proteins 0.000 description 1
- 241001622557 Hesperia Species 0.000 description 1
- 102000005548 Hexokinase Human genes 0.000 description 1
- 108700040460 Hexokinases Proteins 0.000 description 1
- 101000817607 Homo sapiens Dynamin-2 Proteins 0.000 description 1
- 108010001336 Horseradish Peroxidase Proteins 0.000 description 1
- 241000701109 Human adenovirus 2 Species 0.000 description 1
- AVXURJPOCDRRFD-UHFFFAOYSA-N Hydroxylamine Chemical compound ON AVXURJPOCDRRFD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229920002153 Hydroxypropyl cellulose Polymers 0.000 description 1
- 206010020751 Hypersensitivity Diseases 0.000 description 1
- 102000001706 Immunoglobulin Fab Fragments Human genes 0.000 description 1
- 108010054477 Immunoglobulin Fab Fragments Proteins 0.000 description 1
- 102000018071 Immunoglobulin Fc Fragments Human genes 0.000 description 1
- 108010091135 Immunoglobulin Fc Fragments Proteins 0.000 description 1
- 108700005091 Immunoglobulin Genes Proteins 0.000 description 1
- 102000004877 Insulin Human genes 0.000 description 1
- 108090001061 Insulin Proteins 0.000 description 1
- 108010028750 Integrin-Binding Sialoprotein Proteins 0.000 description 1
- 102000016921 Integrin-Binding Sialoprotein Human genes 0.000 description 1
- 108090001005 Interleukin-6 Proteins 0.000 description 1
- 102000004195 Isomerases Human genes 0.000 description 1
- 108090000769 Isomerases Proteins 0.000 description 1
- 241000588747 Klebsiella pneumoniae Species 0.000 description 1
- ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P L-argininium(2+) Chemical compound NC(=[NH2+])NCCC[C@H]([NH3+])C(O)=O ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P 0.000 description 1
- LEVWYRKDKASIDU-IMJSIDKUSA-N L-cystine Chemical compound [O-]C(=O)[C@@H]([NH3+])CSSC[C@H]([NH3+])C([O-])=O LEVWYRKDKASIDU-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N L-glutamic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- 229930182816 L-glutamine Natural products 0.000 description 1
- AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N L-threonine Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N 0.000 description 1
- 240000007472 Leucaena leucocephala Species 0.000 description 1
- 235000010643 Leucaena leucocephala Nutrition 0.000 description 1
- 239000000232 Lipid Bilayer Substances 0.000 description 1
- 241000857726 Lulia Species 0.000 description 1
- 108090000988 Lysostaphin Proteins 0.000 description 1
- PEEHTFAAVSWFBL-UHFFFAOYSA-N Maleimide Chemical compound O=C1NC(=O)C=C1 PEEHTFAAVSWFBL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 1
- 229930195725 Mannitol Natural products 0.000 description 1
- 201000009906 Meningitis Diseases 0.000 description 1
- 244000246386 Mentha pulegium Species 0.000 description 1
- 235000016257 Mentha pulegium Nutrition 0.000 description 1
- 235000004357 Mentha x piperita Nutrition 0.000 description 1
- 241000711408 Murine respirovirus Species 0.000 description 1
- 241000238367 Mya arenaria Species 0.000 description 1
- 241000186366 Mycobacterium bovis Species 0.000 description 1
- 125000001429 N-terminal alpha-amino-acid group Chemical group 0.000 description 1
- 229920002274 Nalgene Polymers 0.000 description 1
- 241000588650 Neisseria meningitidis Species 0.000 description 1
- 206010029164 Nephrotic syndrome Diseases 0.000 description 1
- 238000000636 Northern blotting Methods 0.000 description 1
- 239000004677 Nylon Substances 0.000 description 1
- 108020005187 Oligonucleotide Probes Proteins 0.000 description 1
- 108700026244 Open Reading Frames Proteins 0.000 description 1
- 206010031252 Osteomyelitis Diseases 0.000 description 1
- 108010058846 Ovalbumin Proteins 0.000 description 1
- 241001494479 Pecora Species 0.000 description 1
- 108010087702 Penicillinase Proteins 0.000 description 1
- 102000035195 Peptidases Human genes 0.000 description 1
- 101800005164 Peptide V Proteins 0.000 description 1
- 108010069341 Phosphofructokinases Proteins 0.000 description 1
- 102000001105 Phosphofructokinases Human genes 0.000 description 1
- 102000012288 Phosphopyruvate Hydratase Human genes 0.000 description 1
- 108010022181 Phosphopyruvate Hydratase Proteins 0.000 description 1
- 108091000080 Phosphotransferase Proteins 0.000 description 1
- 241000235648 Pichia Species 0.000 description 1
- 208000007452 Plasmacytoma Diseases 0.000 description 1
- 241000233872 Pneumocystis carinii Species 0.000 description 1
- 241000276498 Pollachius virens Species 0.000 description 1
- 206010036422 Postpartum sepsis Diseases 0.000 description 1
- 206010036790 Productive cough Diseases 0.000 description 1
- 102100024819 Prolactin Human genes 0.000 description 1
- 108010057464 Prolactin Proteins 0.000 description 1
- 108010067787 Proteoglycans Proteins 0.000 description 1
- 102000016611 Proteoglycans Human genes 0.000 description 1
- 241000589517 Pseudomonas aeruginosa Species 0.000 description 1
- 208000020264 Puerperal Infection Diseases 0.000 description 1
- 244000184734 Pyrus japonica Species 0.000 description 1
- 108010011939 Pyruvate Decarboxylase Proteins 0.000 description 1
- 102000013009 Pyruvate Kinase Human genes 0.000 description 1
- 108020005115 Pyruvate Kinase Proteins 0.000 description 1
- 239000012614 Q-Sepharose Substances 0.000 description 1
- 108020005067 RNA Splice Sites Proteins 0.000 description 1
- 238000003559 RNA-seq method Methods 0.000 description 1
- 206010038975 Retroperitoneal abscess Diseases 0.000 description 1
- 102100037486 Reverse transcriptase/ribonuclease H Human genes 0.000 description 1
- 241000293869 Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium Species 0.000 description 1
- 206010039491 Sarcoma Diseases 0.000 description 1
- 239000002262 Schiff base Substances 0.000 description 1
- 150000004753 Schiff bases Chemical class 0.000 description 1
- 241000242678 Schistosoma Species 0.000 description 1
- 239000012506 Sephacryl® Substances 0.000 description 1
- 206010040070 Septic Shock Diseases 0.000 description 1
- 241000607715 Serratia marcescens Species 0.000 description 1
- 229920001800 Shellac Polymers 0.000 description 1
- BQCADISMDOOEFD-UHFFFAOYSA-N Silver Chemical compound [Ag] BQCADISMDOOEFD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M Sodium acetate Chemical compound [Na+].CC([O-])=O VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 229920002125 Sokalan® Polymers 0.000 description 1
- 102100038803 Somatotropin Human genes 0.000 description 1
- 238000002105 Southern blotting Methods 0.000 description 1
- 108700005370 Staphylococcus aureus Fib Proteins 0.000 description 1
- 101100120103 Staphylococcus aureus fib gene Proteins 0.000 description 1
- 241001147736 Staphylococcus capitis Species 0.000 description 1
- 241000191980 Staphylococcus intermedius Species 0.000 description 1
- 241001134656 Staphylococcus lugdunensis Species 0.000 description 1
- 241001147691 Staphylococcus saprophyticus Species 0.000 description 1
- 241000191978 Staphylococcus simulans Species 0.000 description 1
- 241000192086 Staphylococcus warneri Species 0.000 description 1
- 241000191973 Staphylococcus xylosus Species 0.000 description 1
- 229920002472 Starch Polymers 0.000 description 1
- 235000021355 Stearic acid Nutrition 0.000 description 1
- 241000264435 Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis Species 0.000 description 1
- 241000282887 Suidae Species 0.000 description 1
- 241000282898 Sus scrofa Species 0.000 description 1
- 239000004098 Tetracycline Substances 0.000 description 1
- NYTOUQBROMCLBJ-UHFFFAOYSA-N Tetranitromethane Chemical compound [O-][N+](=O)C([N+]([O-])=O)([N+]([O-])=O)[N+]([O-])=O NYTOUQBROMCLBJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010022394 Threonine synthase Proteins 0.000 description 1
- 108090000190 Thrombin Proteins 0.000 description 1
- 102000002938 Thrombospondin Human genes 0.000 description 1
- 108060008245 Thrombospondin Proteins 0.000 description 1
- 206010044248 Toxic shock syndrome Diseases 0.000 description 1
- 231100000650 Toxic shock syndrome Toxicity 0.000 description 1
- 101710120037 Toxin CcdB Proteins 0.000 description 1
- 229920001615 Tragacanth Polymers 0.000 description 1
- 108700009124 Transcription Initiation Site Proteins 0.000 description 1
- 108060008539 Transglutaminase Proteins 0.000 description 1
- 241000589886 Treponema Species 0.000 description 1
- 241000589892 Treponema denticola Species 0.000 description 1
- 102000005924 Triose-Phosphate Isomerase Human genes 0.000 description 1
- 108700015934 Triose-phosphate isomerases Proteins 0.000 description 1
- 108090000631 Trypsin Proteins 0.000 description 1
- 102000004142 Trypsin Human genes 0.000 description 1
- 108090000848 Ubiquitin Proteins 0.000 description 1
- 102000044159 Ubiquitin Human genes 0.000 description 1
- 240000004922 Vigna radiata Species 0.000 description 1
- 108010031318 Vitronectin Proteins 0.000 description 1
- 102100035140 Vitronectin Human genes 0.000 description 1
- 206010048038 Wound infection Diseases 0.000 description 1
- 241000131891 Yersinia sp. Species 0.000 description 1
- 240000008042 Zea mays Species 0.000 description 1
- 235000005824 Zea mays ssp. parviglumis Nutrition 0.000 description 1
- 235000002017 Zea mays subsp mays Nutrition 0.000 description 1
- LUXUAZKGQZPOBZ-SAXJAHGMSA-N [(3S,4S,5S,6R)-3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl] (Z)-octadec-9-enoate Chemical compound CCCCCCCC\C=C/CCCCCCCC(=O)OC1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H]1O LUXUAZKGQZPOBZ-SAXJAHGMSA-N 0.000 description 1
- 239000003082 abrasive agent Substances 0.000 description 1
- 230000003213 activating effect Effects 0.000 description 1
- 230000001154 acute effect Effects 0.000 description 1
- 230000006978 adaptation Effects 0.000 description 1
- 239000000654 additive Substances 0.000 description 1
- 230000000996 additive effect Effects 0.000 description 1
- 239000000853 adhesive Substances 0.000 description 1
- 230000001070 adhesive effect Effects 0.000 description 1
- 230000000240 adjuvant effect Effects 0.000 description 1
- 230000002411 adverse Effects 0.000 description 1
- 239000000443 aerosol Substances 0.000 description 1
- 239000011543 agarose gel Substances 0.000 description 1
- 238000000246 agarose gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 238000013019 agitation Methods 0.000 description 1
- 230000007815 allergy Effects 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-PHYPRBDBSA-N alpha-D-galactose Chemical compound OC[C@H]1O[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-PHYPRBDBSA-N 0.000 description 1
- 229910052782 aluminium Inorganic materials 0.000 description 1
- XAGFODPZIPBFFR-UHFFFAOYSA-N aluminium Chemical compound [Al] XAGFODPZIPBFFR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000012870 ammonium sulfate precipitation Methods 0.000 description 1
- 239000012491 analyte Substances 0.000 description 1
- 238000002399 angioplasty Methods 0.000 description 1
- 210000002159 anterior chamber Anatomy 0.000 description 1
- 230000002788 anti-peptide Effects 0.000 description 1
- 230000002421 anti-septic effect Effects 0.000 description 1
- 230000005875 antibody response Effects 0.000 description 1
- 239000004599 antimicrobial Substances 0.000 description 1
- 239000012062 aqueous buffer Substances 0.000 description 1
- 206010003246 arthritis Diseases 0.000 description 1
- 208000029212 bacterial myositis Diseases 0.000 description 1
- HFACYLZERDEVSX-UHFFFAOYSA-N benzidine Chemical compound C1=CC(N)=CC=C1C1=CC=C(N)C=C1 HFACYLZERDEVSX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000006635 beta-lactamase Human genes 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-QUYVBRFLSA-N beta-maltose Chemical compound OC[C@H]1O[C@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-QUYVBRFLSA-N 0.000 description 1
- AFYNADDZULBEJA-UHFFFAOYSA-N bicinchoninic acid Chemical compound C1=CC=CC2=NC(C=3C=C(C4=CC=CC=C4N=3)C(=O)O)=CC(C(O)=O)=C21 AFYNADDZULBEJA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000000941 bile Anatomy 0.000 description 1
- 239000003833 bile salt Substances 0.000 description 1
- 229940093761 bile salts Drugs 0.000 description 1
- 238000002306 biochemical method Methods 0.000 description 1
- 239000003124 biologic agent Substances 0.000 description 1
- 230000008033 biological extinction Effects 0.000 description 1
- 239000012472 biological sample Substances 0.000 description 1
- 238000013378 biophysical characterization Methods 0.000 description 1
- 238000001574 biopsy Methods 0.000 description 1
- 238000007413 biotinylation Methods 0.000 description 1
- 230000006287 biotinylation Effects 0.000 description 1
- 239000002981 blocking agent Substances 0.000 description 1
- 238000009640 blood culture Methods 0.000 description 1
- 210000004204 blood vessel Anatomy 0.000 description 1
- 238000000071 blow moulding Methods 0.000 description 1
- 210000000481 breast Anatomy 0.000 description 1
- 239000006189 buccal tablet Substances 0.000 description 1
- 239000000337 buffer salt Substances 0.000 description 1
- 239000001506 calcium phosphate Substances 0.000 description 1
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 1
- 150000001718 carbodiimides Chemical class 0.000 description 1
- PFKFTWBEEFSNDU-UHFFFAOYSA-N carbonyldiimidazole Chemical compound C1=CN=CN1C(=O)N1C=CN=C1 PFKFTWBEEFSNDU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000012754 cardiac puncture Methods 0.000 description 1
- 230000002612 cardiopulmonary effect Effects 0.000 description 1
- 150000001768 cations Chemical class 0.000 description 1
- 239000013592 cell lysate Substances 0.000 description 1
- 230000036978 cell physiology Effects 0.000 description 1
- 239000006285 cell suspension Substances 0.000 description 1
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 1
- 239000001913 cellulose Substances 0.000 description 1
- 229920002678 cellulose Polymers 0.000 description 1
- 210000003169 central nervous system Anatomy 0.000 description 1
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 1
- 238000007385 chemical modification Methods 0.000 description 1
- 239000007958 cherry flavor Substances 0.000 description 1
- VDQQXEISLMTGAB-UHFFFAOYSA-N chloramine T Chemical compound [Na+].CC1=CC=C(S(=O)(=O)[N-]Cl)C=C1 VDQQXEISLMTGAB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960004926 chlorobutanol Drugs 0.000 description 1
- 239000013611 chromosomal DNA Substances 0.000 description 1
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 1
- 239000007979 citrate buffer Substances 0.000 description 1
- 230000035602 clotting Effects 0.000 description 1
- 229940096422 collagen type i Drugs 0.000 description 1
- 239000000084 colloidal system Substances 0.000 description 1
- 230000001332 colony forming effect Effects 0.000 description 1
- 230000024203 complement activation Effects 0.000 description 1
- 238000004590 computer program Methods 0.000 description 1
- 238000009833 condensation Methods 0.000 description 1
- 230000005494 condensation Effects 0.000 description 1
- 230000001268 conjugating effect Effects 0.000 description 1
- 239000000356 contaminant Substances 0.000 description 1
- 238000011109 contamination Methods 0.000 description 1
- 239000013068 control sample Substances 0.000 description 1
- 239000012050 conventional carrier Substances 0.000 description 1
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 1
- NKLPQNGYXWVELD-UHFFFAOYSA-M coomassie brilliant blue Chemical compound [Na+].C1=CC(OCC)=CC=C1NC1=CC=C(C(=C2C=CC(C=C2)=[N+](CC)CC=2C=C(C=CC=2)S([O-])(=O)=O)C=2C=CC(=CC=2)N(CC)CC=2C=C(C=CC=2)S([O-])(=O)=O)C=C1 NKLPQNGYXWVELD-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 235000005822 corn Nutrition 0.000 description 1
- 238000004132 cross linking Methods 0.000 description 1
- 230000037029 cross reaction Effects 0.000 description 1
- 239000012228 culture supernatant Substances 0.000 description 1
- 229960003067 cystine Drugs 0.000 description 1
- 230000009089 cytolysis Effects 0.000 description 1
- 210000005220 cytoplasmic tail Anatomy 0.000 description 1
- 230000001086 cytosolic effect Effects 0.000 description 1
- 238000002784 cytotoxicity assay Methods 0.000 description 1
- 231100000263 cytotoxicity test Toxicity 0.000 description 1
- 230000006378 damage Effects 0.000 description 1
- 230000007547 defect Effects 0.000 description 1
- 230000007123 defense Effects 0.000 description 1
- 230000000593 degrading effect Effects 0.000 description 1
- 230000001934 delay Effects 0.000 description 1
- 239000003405 delayed action preparation Substances 0.000 description 1
- 230000002939 deleterious effect Effects 0.000 description 1
- 238000002716 delivery method Methods 0.000 description 1
- 238000004925 denaturation Methods 0.000 description 1
- 230000036425 denaturation Effects 0.000 description 1
- 239000004053 dental implant Substances 0.000 description 1
- 239000000551 dentifrice Substances 0.000 description 1
- 238000011033 desalting Methods 0.000 description 1
- 239000003599 detergent Substances 0.000 description 1
- 238000002405 diagnostic procedure Methods 0.000 description 1
- 238000000502 dialysis Methods 0.000 description 1
- NEFBYIFKOOEVPA-UHFFFAOYSA-K dicalcium phosphate Chemical compound [Ca+2].[Ca+2].[O-]P([O-])([O-])=O NEFBYIFKOOEVPA-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 229940038472 dicalcium phosphate Drugs 0.000 description 1
- 229910000390 dicalcium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 102000004419 dihydrofolate reductase Human genes 0.000 description 1
- UGMCXQCYOVCMTB-UHFFFAOYSA-K dihydroxy(stearato)aluminium Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)O[Al](O)O UGMCXQCYOVCMTB-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 1
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 1
- 239000013024 dilution buffer Substances 0.000 description 1
- AXDDJHKBOYNJPY-UHFFFAOYSA-L dipotassium;carboxylato carbonate Chemical compound [K+].[K+].[O-]C(=O)OC([O-])=O AXDDJHKBOYNJPY-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 239000007884 disintegrant Substances 0.000 description 1
- 239000012153 distilled water Substances 0.000 description 1
- 238000003110 dot immunobinding assay Methods 0.000 description 1
- 239000006196 drop Substances 0.000 description 1
- 239000000975 dye Substances 0.000 description 1
- 239000003221 ear drop Substances 0.000 description 1
- 229940047652 ear drops Drugs 0.000 description 1
- 239000012636 effector Substances 0.000 description 1
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 description 1
- 239000003995 emulsifying agent Substances 0.000 description 1
- 101150012763 endA gene Proteins 0.000 description 1
- 230000012202 endocytosis Effects 0.000 description 1
- 206010014801 endophthalmitis Diseases 0.000 description 1
- 239000003623 enhancer Substances 0.000 description 1
- 229940032049 enterococcus faecalis Drugs 0.000 description 1
- 238000009585 enzyme analysis Methods 0.000 description 1
- 210000002615 epidermis Anatomy 0.000 description 1
- 210000002409 epiglottis Anatomy 0.000 description 1
- BEFDCLMNVWHSGT-UHFFFAOYSA-N ethenylcyclopentane Chemical compound C=CC1CCCC1 BEFDCLMNVWHSGT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000001747 exhibiting effect Effects 0.000 description 1
- 238000013401 experimental design Methods 0.000 description 1
- 239000003889 eye drop Substances 0.000 description 1
- 229940012356 eye drops Drugs 0.000 description 1
- 230000001815 facial effect Effects 0.000 description 1
- 229940012444 factor xiii Drugs 0.000 description 1
- 101150028082 fbpA gene Proteins 0.000 description 1
- 102000025748 fibrinogen binding proteins Human genes 0.000 description 1
- 108091009104 fibrinogen binding proteins Proteins 0.000 description 1
- 238000001914 filtration Methods 0.000 description 1
- 244000144992 flock Species 0.000 description 1
- 239000004088 foaming agent Substances 0.000 description 1
- 235000013305 food Nutrition 0.000 description 1
- 239000012458 free base Substances 0.000 description 1
- 238000004108 freeze drying Methods 0.000 description 1
- 230000005714 functional activity Effects 0.000 description 1
- 229930182830 galactose Natural products 0.000 description 1
- 230000002496 gastric effect Effects 0.000 description 1
- 238000001502 gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 239000007903 gelatin capsule Substances 0.000 description 1
- 238000007429 general method Methods 0.000 description 1
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 description 1
- 229940116332 glucose oxidase Drugs 0.000 description 1
- 150000004676 glycans Chemical class 0.000 description 1
- 150000002334 glycols Chemical class 0.000 description 1
- 230000002414 glycolytic effect Effects 0.000 description 1
- 102000035122 glycosylated proteins Human genes 0.000 description 1
- 108091005608 glycosylated proteins Proteins 0.000 description 1
- 125000003630 glycyl group Chemical group [H]N([H])C([H])([H])C(*)=O 0.000 description 1
- PCHJSUWPFVWCPO-UHFFFAOYSA-N gold Chemical compound [Au] PCHJSUWPFVWCPO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000003102 growth factor Substances 0.000 description 1
- 239000000122 growth hormone Substances 0.000 description 1
- 238000001631 haemodialysis Methods 0.000 description 1
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 1
- 230000000322 hemodialysis Effects 0.000 description 1
- 210000003494 hepatocyte Anatomy 0.000 description 1
- 239000005556 hormone Substances 0.000 description 1
- 229940088597 hormone Drugs 0.000 description 1
- 235000001050 hortel pimenta Nutrition 0.000 description 1
- 150000002431 hydrogen Chemical class 0.000 description 1
- 125000001165 hydrophobic group Chemical class 0.000 description 1
- 239000001863 hydroxypropyl cellulose Substances 0.000 description 1
- 235000010977 hydroxypropyl cellulose Nutrition 0.000 description 1
- 230000008073 immune recognition Effects 0.000 description 1
- 238000003119 immunoblot Methods 0.000 description 1
- 230000000984 immunochemical effect Effects 0.000 description 1
- 238000003125 immunofluorescent labeling Methods 0.000 description 1
- 229940027941 immunoglobulin g Drugs 0.000 description 1
- 230000002055 immunohistochemical effect Effects 0.000 description 1
- 239000003547 immunosorbent Substances 0.000 description 1
- 230000002637 immunotoxin Effects 0.000 description 1
- 239000002596 immunotoxin Substances 0.000 description 1
- 229940051026 immunotoxin Drugs 0.000 description 1
- 231100000608 immunotoxin Toxicity 0.000 description 1
- 238000002513 implantation Methods 0.000 description 1
- 230000006872 improvement Effects 0.000 description 1
- 230000000415 inactivating effect Effects 0.000 description 1
- 230000002779 inactivation Effects 0.000 description 1
- 239000003701 inert diluent Substances 0.000 description 1
- 239000007972 injectable composition Substances 0.000 description 1
- 229910052500 inorganic mineral Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 1
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 1
- 229940125396 insulin Drugs 0.000 description 1
- 206010022498 insulinoma Diseases 0.000 description 1
- 238000012482 interaction analysis Methods 0.000 description 1
- 230000008863 intramolecular interaction Effects 0.000 description 1
- 238000010255 intramuscular injection Methods 0.000 description 1
- 239000007927 intramuscular injection Substances 0.000 description 1
- 238000012977 invasive surgical procedure Methods 0.000 description 1
- 238000004255 ion exchange chromatography Methods 0.000 description 1
- 230000002427 irreversible effect Effects 0.000 description 1
- 239000007951 isotonicity adjuster Substances 0.000 description 1
- 206010023332 keratitis Diseases 0.000 description 1
- 210000003734 kidney Anatomy 0.000 description 1
- 101150066555 lacZ gene Proteins 0.000 description 1
- 238000011031 large-scale manufacturing process Methods 0.000 description 1
- 210000000867 larynx Anatomy 0.000 description 1
- 238000013147 laser angioplasty Methods 0.000 description 1
- 238000002536 laser-induced breakdown spectroscopy Methods 0.000 description 1
- 239000000787 lecithin Substances 0.000 description 1
- 235000010445 lecithin Nutrition 0.000 description 1
- 229940067606 lecithin Drugs 0.000 description 1
- 231100000636 lethal dose Toxicity 0.000 description 1
- 210000003041 ligament Anatomy 0.000 description 1
- 108020001756 ligand binding domains Proteins 0.000 description 1
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 description 1
- XMGQYMWWDOXHJM-UHFFFAOYSA-N limonene Chemical compound CC(=C)C1CCC(C)=CC1 XMGQYMWWDOXHJM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000011068 loading method Methods 0.000 description 1
- 239000006210 lotion Substances 0.000 description 1
- 239000000314 lubricant Substances 0.000 description 1
- 201000003453 lung abscess Diseases 0.000 description 1
- 239000006166 lysate Substances 0.000 description 1
- 210000002540 macrophage Anatomy 0.000 description 1
- ZLNQQNXFFQJAID-UHFFFAOYSA-L magnesium carbonate Chemical compound [Mg+2].[O-]C([O-])=O ZLNQQNXFFQJAID-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 239000001095 magnesium carbonate Substances 0.000 description 1
- 229910000021 magnesium carbonate Inorganic materials 0.000 description 1
- 125000005439 maleimidyl group Chemical group C1(C=CC(N1*)=O)=O 0.000 description 1
- 239000000594 mannitol Substances 0.000 description 1
- 235000010355 mannitol Nutrition 0.000 description 1
- 235000012054 meals Nutrition 0.000 description 1
- 201000001441 melanoma Diseases 0.000 description 1
- 238000002844 melting Methods 0.000 description 1
- 230000008018 melting Effects 0.000 description 1
- 230000034217 membrane fusion Effects 0.000 description 1
- 230000005499 meniscus Effects 0.000 description 1
- 230000002503 metabolic effect Effects 0.000 description 1
- 230000004060 metabolic process Effects 0.000 description 1
- 229910052751 metal Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000002184 metal Substances 0.000 description 1
- KQSSATDQUYCRGS-UHFFFAOYSA-N methyl glycinate Chemical compound COC(=O)CN KQSSATDQUYCRGS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000002496 methyl group Chemical group [H]C([H])([H])* 0.000 description 1
- 239000004292 methyl p-hydroxybenzoate Substances 0.000 description 1
- 235000010270 methyl p-hydroxybenzoate Nutrition 0.000 description 1
- OSWPMRLSEDHDFF-UHFFFAOYSA-N methyl salicylate Chemical compound COC(=O)C1=CC=CC=C1O OSWPMRLSEDHDFF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960002216 methylparaben Drugs 0.000 description 1
- 239000000693 micelle Substances 0.000 description 1
- 238000000520 microinjection Methods 0.000 description 1
- 230000027939 micturition Effects 0.000 description 1
- 235000010755 mineral Nutrition 0.000 description 1
- 239000011707 mineral Substances 0.000 description 1
- 208000015994 miscarriage Diseases 0.000 description 1
- 230000000116 mitigating effect Effects 0.000 description 1
- 230000004001 molecular interaction Effects 0.000 description 1
- 230000004784 molecular pathogenesis Effects 0.000 description 1
- 229940051866 mouthwash Drugs 0.000 description 1
- 230000036457 multidrug resistance Effects 0.000 description 1
- 210000003205 muscle Anatomy 0.000 description 1
- 231100000219 mutagenic Toxicity 0.000 description 1
- 239000003471 mutagenic agent Substances 0.000 description 1
- 231100000707 mutagenic chemical Toxicity 0.000 description 1
- 108010009719 mutanolysin Proteins 0.000 description 1
- 239000002105 nanoparticle Substances 0.000 description 1
- 208000009928 nephrosis Diseases 0.000 description 1
- 231100001027 nephrosis Toxicity 0.000 description 1
- 210000000440 neutrophil Anatomy 0.000 description 1
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 231100000252 nontoxic Toxicity 0.000 description 1
- 230000003000 nontoxic effect Effects 0.000 description 1
- 210000004940 nucleus Anatomy 0.000 description 1
- 229920001778 nylon Polymers 0.000 description 1
- QIQXTHQIDYTFRH-UHFFFAOYSA-N octadecanoic acid Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCCC(O)=O QIQXTHQIDYTFRH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OQCDKBAXFALNLD-UHFFFAOYSA-N octadecanoic acid Natural products CCCCCCCC(C)CCCCCCCCC(O)=O OQCDKBAXFALNLD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000002674 ointment Substances 0.000 description 1
- 239000003883 ointment base Substances 0.000 description 1
- 229940055577 oleyl alcohol Drugs 0.000 description 1
- XMLQWXUVTXCDDL-UHFFFAOYSA-N oleyl alcohol Natural products CCCCCCC=CCCCCCCCCCCO XMLQWXUVTXCDDL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000002751 oligonucleotide probe Substances 0.000 description 1
- 230000014207 opsonization Effects 0.000 description 1
- 239000007968 orange flavor Substances 0.000 description 1
- 210000001672 ovary Anatomy 0.000 description 1
- 238000012261 overproduction Methods 0.000 description 1
- 230000003647 oxidation Effects 0.000 description 1
- 238000007254 oxidation reaction Methods 0.000 description 1
- LXCFILQKKLGQFO-UHFFFAOYSA-N p-hydroxybenzoic acid methyl ester Natural products COC(=O)C1=CC=C(O)C=C1 LXCFILQKKLGQFO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000006179 pH buffering agent Substances 0.000 description 1
- 210000002741 palatine tonsil Anatomy 0.000 description 1
- 210000000496 pancreas Anatomy 0.000 description 1
- 208000021255 pancreatic insulinoma Diseases 0.000 description 1
- 238000007911 parenteral administration Methods 0.000 description 1
- 239000006072 paste Substances 0.000 description 1
- 235000011837 pasties Nutrition 0.000 description 1
- 230000008506 pathogenesis Effects 0.000 description 1
- 230000007918 pathogenicity Effects 0.000 description 1
- 239000008188 pellet Substances 0.000 description 1
- 230000035515 penetration Effects 0.000 description 1
- 229950009506 penicillinase Drugs 0.000 description 1
- 210000003899 penis Anatomy 0.000 description 1
- 108010091742 peptide F Proteins 0.000 description 1
- RJSZPKZQGIKVAU-UXBJKDEOSA-N peptide f Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCSC)C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)CNC(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)CNC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H]1N(CCC1)C(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CCSC)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CCSC)NC(=O)[C@H](CC=1C=CC=CC=1)NC(=O)CNC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CC=1C=CC(O)=CC=1)C(C)C)C(C)C)C1=CC=CC=C1 RJSZPKZQGIKVAU-UXBJKDEOSA-N 0.000 description 1
- 239000000816 peptidomimetic Substances 0.000 description 1
- 210000004976 peripheral blood cell Anatomy 0.000 description 1
- 210000001322 periplasm Anatomy 0.000 description 1
- 210000003200 peritoneal cavity Anatomy 0.000 description 1
- 210000004303 peritoneum Anatomy 0.000 description 1
- 238000002823 phage display Methods 0.000 description 1
- 210000001539 phagocyte Anatomy 0.000 description 1
- 230000000144 pharmacologic effect Effects 0.000 description 1
- 229960003742 phenol Drugs 0.000 description 1
- 239000008363 phosphate buffer Substances 0.000 description 1
- 230000026731 phosphorylation Effects 0.000 description 1
- 238000006366 phosphorylation reaction Methods 0.000 description 1
- 102000020233 phosphotransferase Human genes 0.000 description 1
- 230000000704 physical effect Effects 0.000 description 1
- 230000010399 physical interaction Effects 0.000 description 1
- 238000000053 physical method Methods 0.000 description 1
- 230000004962 physiological condition Effects 0.000 description 1
- 230000035479 physiological effects, processes and functions Effects 0.000 description 1
- 230000001817 pituitary effect Effects 0.000 description 1
- 210000003720 plasmablast Anatomy 0.000 description 1
- 210000004224 pleura Anatomy 0.000 description 1
- 229920000771 poly (alkylcyanoacrylate) Polymers 0.000 description 1
- 229920000729 poly(L-lysine) polymer Polymers 0.000 description 1
- 229920005862 polyol Polymers 0.000 description 1
- 150000003077 polyols Chemical class 0.000 description 1
- 229920001282 polysaccharide Polymers 0.000 description 1
- 239000005017 polysaccharide Substances 0.000 description 1
- 230000004481 post-translational protein modification Effects 0.000 description 1
- 230000001323 posttranslational effect Effects 0.000 description 1
- 229920001592 potato starch Polymers 0.000 description 1
- 235000008476 powdered milk Nutrition 0.000 description 1
- 239000002244 precipitate Substances 0.000 description 1
- 239000002243 precursor Substances 0.000 description 1
- 230000002335 preservative effect Effects 0.000 description 1
- 229940097325 prolactin Drugs 0.000 description 1
- 230000002035 prolonged effect Effects 0.000 description 1
- 230000000644 propagated effect Effects 0.000 description 1
- 230000000069 prophylactic effect Effects 0.000 description 1
- 239000004405 propyl p-hydroxybenzoate Substances 0.000 description 1
- 235000010232 propyl p-hydroxybenzoate Nutrition 0.000 description 1
- 229960003415 propylparaben Drugs 0.000 description 1
- 238000002731 protein assay Methods 0.000 description 1
- 238000000730 protein immunoprecipitation Methods 0.000 description 1
- 238000000164 protein isolation Methods 0.000 description 1
- 238000001742 protein purification Methods 0.000 description 1
- 230000007026 protein scission Effects 0.000 description 1
- 239000012460 protein solution Substances 0.000 description 1
- 230000004844 protein turnover Effects 0.000 description 1
- 230000006825 purine synthesis Effects 0.000 description 1
- 150000003212 purines Chemical class 0.000 description 1
- 150000003230 pyrimidines Chemical class 0.000 description 1
- 239000002510 pyrogen Substances 0.000 description 1
- 238000004445 quantitative analysis Methods 0.000 description 1
- 238000000163 radioactive labelling Methods 0.000 description 1
- 238000011552 rat model Methods 0.000 description 1
- 230000007420 reactivation Effects 0.000 description 1
- 238000011084 recovery Methods 0.000 description 1
- 238000010992 reflux Methods 0.000 description 1
- 230000008929 regeneration Effects 0.000 description 1
- 238000011069 regeneration method Methods 0.000 description 1
- 230000003307 reticuloendothelial effect Effects 0.000 description 1
- 230000002207 retinal effect Effects 0.000 description 1
- 238000004007 reversed phase HPLC Methods 0.000 description 1
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 1
- 238000002390 rotary evaporation Methods 0.000 description 1
- 101150098466 rpsL gene Proteins 0.000 description 1
- 235000019204 saccharin Nutrition 0.000 description 1
- 229940081974 saccharin Drugs 0.000 description 1
- 239000000901 saccharin and its Na,K and Ca salt Substances 0.000 description 1
- 235000002020 sage Nutrition 0.000 description 1
- 238000007127 saponification reaction Methods 0.000 description 1
- 229920006395 saturated elastomer Polymers 0.000 description 1
- 230000003248 secreting effect Effects 0.000 description 1
- 201000009881 secretory diarrhea Diseases 0.000 description 1
- 238000011896 sensitive detection Methods 0.000 description 1
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 1
- 238000010008 shearing Methods 0.000 description 1
- 239000004208 shellac Substances 0.000 description 1
- ZLGIYFNHBLSMPS-ATJNOEHPSA-N shellac Chemical compound OCCCCCC(O)C(O)CCCCCCCC(O)=O.C1C23[C@H](C(O)=O)CCC2[C@](C)(CO)[C@@H]1C(C(O)=O)=C[C@@H]3O ZLGIYFNHBLSMPS-ATJNOEHPSA-N 0.000 description 1
- 229940113147 shellac Drugs 0.000 description 1
- 235000013874 shellac Nutrition 0.000 description 1
- 229910052709 silver Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000004332 silver Substances 0.000 description 1
- 238000012868 site-directed mutagenesis technique Methods 0.000 description 1
- 239000002002 slurry Substances 0.000 description 1
- 239000001632 sodium acetate Substances 0.000 description 1
- 235000017281 sodium acetate Nutrition 0.000 description 1
- 235000017557 sodium bicarbonate Nutrition 0.000 description 1
- 229910000030 sodium bicarbonate Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000010532 solid phase synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 230000000392 somatic effect Effects 0.000 description 1
- 238000000527 sonication Methods 0.000 description 1
- 239000004334 sorbic acid Substances 0.000 description 1
- 235000010199 sorbic acid Nutrition 0.000 description 1
- 229940075582 sorbic acid Drugs 0.000 description 1
- 238000011895 specific detection Methods 0.000 description 1
- 238000004611 spectroscopical analysis Methods 0.000 description 1
- 208000000995 spontaneous abortion Diseases 0.000 description 1
- 208000010110 spontaneous platelet aggregation Diseases 0.000 description 1
- 210000003802 sputum Anatomy 0.000 description 1
- 208000024794 sputum Diseases 0.000 description 1
- 238000007447 staining method Methods 0.000 description 1
- 229940037648 staphylococcus simulans Drugs 0.000 description 1
- 239000008107 starch Substances 0.000 description 1
- 235000019698 starch Nutrition 0.000 description 1
- 239000008117 stearic acid Substances 0.000 description 1
- 230000001954 sterilising effect Effects 0.000 description 1
- 210000002784 stomach Anatomy 0.000 description 1
- 229960005322 streptomycin Drugs 0.000 description 1
- 125000001424 substituent group Chemical group 0.000 description 1
- 230000009469 supplementation Effects 0.000 description 1
- 230000008093 supporting effect Effects 0.000 description 1
- 238000002198 surface plasmon resonance spectroscopy Methods 0.000 description 1
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 description 1
- 238000013268 sustained release Methods 0.000 description 1
- 239000012730 sustained-release form Substances 0.000 description 1
- 239000011885 synergistic combination Substances 0.000 description 1
- 229920001059 synthetic polymer Polymers 0.000 description 1
- 208000006379 syphilis Diseases 0.000 description 1
- 230000009897 systematic effect Effects 0.000 description 1
- 230000008685 targeting Effects 0.000 description 1
- 210000002435 tendon Anatomy 0.000 description 1
- 210000001550 testis Anatomy 0.000 description 1
- 229960002180 tetracycline Drugs 0.000 description 1
- 229930101283 tetracycline Natural products 0.000 description 1
- 235000019364 tetracycline Nutrition 0.000 description 1
- 150000003522 tetracyclines Chemical class 0.000 description 1
- WROMPOXWARCANT-UHFFFAOYSA-N tfa trifluoroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(F)(F)F.OC(=O)C(F)(F)F WROMPOXWARCANT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940033663 thimerosal Drugs 0.000 description 1
- 229960004072 thrombin Drugs 0.000 description 1
- 210000001685 thyroid gland Anatomy 0.000 description 1
- 206010043778 thyroiditis Diseases 0.000 description 1
- 239000003104 tissue culture media Substances 0.000 description 1
- 230000000451 tissue damage Effects 0.000 description 1
- 231100000827 tissue damage Toxicity 0.000 description 1
- 238000004448 titration Methods 0.000 description 1
- 229940034610 toothpaste Drugs 0.000 description 1
- 239000012049 topical pharmaceutical composition Substances 0.000 description 1
- 239000003053 toxin Substances 0.000 description 1
- 231100000765 toxin Toxicity 0.000 description 1
- 210000003437 trachea Anatomy 0.000 description 1
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 1
- 230000001131 transforming effect Effects 0.000 description 1
- 102000003601 transglutaminase Human genes 0.000 description 1
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 1
- 230000005945 translocation Effects 0.000 description 1
- 150000003626 triacylglycerols Chemical class 0.000 description 1
- 239000012588 trypsin Substances 0.000 description 1
- 125000000430 tryptophan group Chemical group [H]N([H])C(C(=O)O*)C([H])([H])C1=C([H])N([H])C2=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C12 0.000 description 1
- 125000001493 tyrosinyl group Chemical group [H]OC1=C([H])C([H])=C(C([H])=C1[H])C([H])([H])C([H])(N([H])[H])C(*)=O 0.000 description 1
- 239000011882 ultra-fine particle Substances 0.000 description 1
- 241001515965 unidentified phage Species 0.000 description 1
- 210000003708 urethra Anatomy 0.000 description 1
- 210000002700 urine Anatomy 0.000 description 1
- 229940125575 vaccine candidate Drugs 0.000 description 1
- 238000001291 vacuum drying Methods 0.000 description 1
- 235000015112 vegetable and seed oil Nutrition 0.000 description 1
- 239000008158 vegetable oil Substances 0.000 description 1
- 239000003981 vehicle Substances 0.000 description 1
- 230000002861 ventricular Effects 0.000 description 1
- 210000003501 vero cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000013603 viral vector Substances 0.000 description 1
- 238000012800 visualization Methods 0.000 description 1
- 239000003643 water by type Substances 0.000 description 1
- 238000009736 wetting Methods 0.000 description 1
- 239000009637 wintergreen oil Substances 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/68—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
- G01N33/6887—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids from muscle, cartilage or connective tissue
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P43/00—Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/195—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria
- C07K14/305—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria from Micrococcaceae (F)
- C07K14/31—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria from Micrococcaceae (F) from Staphylococcus (G)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/195—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria
- C07K14/315—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria from Streptococcus (G), e.g. Enterococci
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
- C07K16/12—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from bacteria
- C07K16/1267—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from bacteria from Gram-positive bacteria
- C07K16/1271—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from bacteria from Gram-positive bacteria from Micrococcaceae (F), e.g. Staphylococcus
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
- C07K16/12—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from bacteria
- C07K16/1267—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from bacteria from Gram-positive bacteria
- C07K16/1275—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from bacteria from Gram-positive bacteria from Streptococcus (G)
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K2039/505—Medicinal preparations containing antigens or antibodies comprising antibodies
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
- C07K2317/30—Immunoglobulins specific features characterized by aspects of specificity or valency
- C07K2317/34—Identification of a linear epitope shorter than 20 amino acid residues or of a conformational epitope defined by amino acid residues
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
- G01N2333/195—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from bacteria
- G01N2333/305—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from bacteria from Micrococcaceae (F)
- G01N2333/31—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from bacteria from Micrococcaceae (F) from Staphylococcus (G)
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
- G01N2333/195—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from bacteria
- G01N2333/315—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from bacteria from Streptococcus (G), e.g. Enterococci
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
- G01N2333/435—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans
- G01N2333/78—Connective tissue peptides, e.g. collagen, elastin, laminin, fibronectin, vitronectin, cold insoluble globulin [CIG]
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Immunology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Public Health (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Hematology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Microbiology (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Pathology (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Oncology (AREA)
- Communicable Diseases (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
Description
本出願は、同時係属中の1997年1月21日付け出願の米国特許仮出願通し番号第60/036,139号の優先権を主張するものであり、かかる仮出願は、その開示内容全体が放棄されることなく引用によりここに援用する。米国政府は、国立衛生研究所からの補助金AI20624に関連して本発明に権利を有する。
1.1 発明の分野
本発明は全般的に分子生物学の分野に関する。特に、ある実施形態は細菌種から誘導されるDNAセグメントおよびタンパク質を含む方法と組成に関する。特に、本発明は黄色ブドウ球菌(Staphylococcus aureus)からのfnbA核酸とFnBPAアミノ酸組成物を提供する。また、部位特異的に修飾したあるいはトランケートしたフィブロネクチン(Fn)結合部位領域を含むペプチドエピトープおよびタンパク質配列、ならびにこれらのペプチドエピトープと結合部位領域で動物を免疫することから誘導される抗体も開示する。これらの抗体、ペプチドおよびDNAセグメント、修飾されたリガンド結合部位領域をコードするペプチドと核酸セグメント、ならびに天然および合成タンパク質を作製し、使用するための様々な方法、たとえば診断プローブやタンパク質生成のためのテンプレートとしての抗体および/あるいはDNAセグメントの使用、様々な薬理学的および免疫学的適用における抗体、タンパク質、融合タンパク質担体、ペプチドおよび核酸セグメントの使用などを開示する。
1.2 関連技術の説明
1.2.1 MSCRAMM
宿主組織への細菌の付着には、特異的微生物表面付着因子が関わっていて、MSCRAMMと称されるそのサブファミリーは細胞外マトリクス(ECM)成分を特異的に認識する。多くの病原細菌が、宿主組織でのコロニー形成機序を表すと思われる相互作用において、細胞外マトリクスの種々の成分を特異的に認識し結合することが示されてきた。この付着はMSCRAMM(接着性マトリクス分子を認識する微生物表面成分)と称される細菌タンパク質群に関わっている(Pattiら、1994年;Patti及びHook、1994年)。
いくつかのFn結合MSCRAMMが異なるグラム陽性細菌から分離され、特性付けられている。Staphylococcus aureus(Signasら、1989年)、化膿連鎖球菌(Streptococcus pyogenes)(Talayら、1994年;Hanskyら、1992年)およびStreptococcus dysgalactiae(Lindgrenら、1993年)からのFn結合MSCRAMMをコードする遺伝子がクローニングされ、配列決定された。演繹したアミノ酸配列は、非常に類似した構造組織を有する60−100kDaのタンパク質を明らかにした。N末端のシグナル配列のあとに長く伸びるユニーク配列が続き、これはある場合には約30個のアミノ酸の長さのセグメントの2つのコピーによって中断されている。リガンド結合部位はプロリンに富む領域のちょうどN末端に位置し、これがタンパク質を細胞壁に固定すると考えられる。この領域のあとには、細胞壁標的シグナルである配列LPXTGX(配列番号:1)、膜貫通ユニットを示す一続きの疎水性残基、およびひとかたまりの正に荷電した残基を含む短いC末端細胞質内領域が続く。これらのMSCRAMM上の主要なFn結合部位は、3−4回反復される30−42個のアミノ酸の長さのモチーフからなり、反復単位の大部分がコンセンサス配列を含む(Lindgrenら、1993年;McGavinら、1993年)。この領域は3回または4回繰り返される37−40個のアミノ酸の単位から成る(図1)。
種々のFn結合MSCRAMMからの反復領域に対応する組換えタンパク質はすべて、黄色ブドウ球菌、S.dysgalactiaeおよびS.pyogenesを含めた種々のグラム陽性菌へのFnの結合を阻害することができる(Johら、1994年)。さらに、個々の合成ペプチドを用いた試験は、多くの反復単位がFn結合活性を保持しており、検討したすべてのグラム陽性種によるFnの結合を阻害することを明らかにした。これらのデータは、異なるMSCRAMMについてのFnの結合部位がマトリクスタンパク質上で重複しているかあるいは近接して位置していることを示唆している。
反復領域は、大腸菌(Escherichia coli)において、rFnBDタンパク質のアフィニティ精製に使用される一続きのヒスチジン残基に組換えFn結合領域(rFnBD)が連結されている組換え融合タンパク質として過剰発現された。これらのタンパク質はそれぞれrFnBD−D、rFnBD−A、rFnBD−B、およびrFnBD−Fと命名された(図1)。これらのrFnBDは類似した結合動態と解離定数を示すことが認められた。たとえば、ブタFnに結合する4つの組換えタンパク質の解離定数がバイオセンサー分析によって測定されているが、低いnM範囲にあって、主要な解離率は1×10-4から6×10-4/秒の範囲であった。さらに、組換えタンパク質は交叉的な種特異性を持ち、多くの異なる細菌細胞へのFnの結合を阻害することが示された(Johら、1994年)。
異なるMCRAMMのFn結合領域の反復単位は著しく類似しており、コンセンサス配列を含むと思われる(McGavinら、1991年;House−Pompeoら、1996年)。反復単位は高い数の酸性残基を有しており、いくつかの位置に保存された疎水性の酸性残基が存在する。全体として、特定のMSCRAMMにおける反復単位間、ならびに異なる種からのMSCRAMM間には高度の配列類似性が存在する。反復単位に類似した合成ペプチドもFnに結合し、これらのペプチドにおけるアミノ酸置換により、すべての保存残基がFn結合に必要なわけではないと判定された(McGavinら、1991年)。
Fnは体液中に可溶性形態で、また細胞外マトリクス中では原線維形態で認められるジスルフィド結合の二量体糖タンパク質である。Fnの主要な生物学的機能は、動物細胞の接着のための基質として働くその能力に関連すると思われる。この接着は、Fnの中心部の特定の部位を認識し、これに結合する二量体受容体ファミリーによって媒介される。グラム陽性菌からのMSCRAMMへのFn中主要結合部位はNH2末端領域(N29)に位置していた(MosherとProctor、1980;Spezialeら、1984年)。この領域は約45個のアミノ酸の長さの5つの1型モジュールから成る。N29の構造は、配列中に規則正しい間隔を置いて位置するいくつかのジスルフィド結合によって安定化された一連のアンチパラレルβシートである(PottsおよびCampbell、1994年;Venyaminovら、1983年)。Fnに結合する能力はもっぱらそれぞれのDモチーフのC末端の20個のアミノ酸内に位置する(Huffら、1994年;McGavinら、1993年;McGavinら、1991年)。これらのアミノ酸には、他のFn結合付着因子の反復モチーフ内に存在する配列GG(X3,4)(I/V)DFを含み、S.dysgalactiae FnBAのFn結合A2モチーフ内では、GGあるいはIDF配列のいずれかに変化することによりFn結合の消失が生じた(McGavinら、1993年)。
黄色ブドウ球菌のFn結合MSCRAMMは、Duと命名された約30アミノ酸の長さのセグメントである追加リガンド結合部位を有しており、このDuはコンセンサス配列を含み、反復領域のN末端に位置する。このセグメントもFnおよびそのN末端領域(N29と称される)と相互作用することができる(Jonsson、1992年)。
黄色ブドウ球菌は、Fn結合タンパク質FnBPAとFnBPBをコードする2個の縦列fnb遺伝子を有しており(Jonssonら、1991年;Signasら、1989年)、そのそれぞれがD1、D2およびD3と称される3つの連続する37個あるいは38個のアミノ酸のDモチーフを持つ。縦列として、これらのモチーフは高いアフィニティのFn結合領域D1−3を含む。それぞれのモチーフを表す合成ペプチドは個々に低いアフィニティでFn結合することができ、黄色ブドウ球菌へのFn結合を競合的に阻害することができる(Huffら、1994年;Signasら、1989年)。
1.2.2 Fn結合をブロックする抗体を作製する試みは失敗に終わった
これまでに同定されたすべてのFn結合MSCRAMMにおいて、主要なリガンド結合部位は3−5回反復される37−42個のアミノ酸モチーフから成る領域に位置していた(McGavinら、1993年)。残念ながら、合成ペプチドおよび種々の形態のD1−3免疫原を用いて阻止抗体を作製するという試みは大部分が不成功に終わっている(Ciborowskiら、1992年;Rozalskaら、1994年;Spezialeら、1996年)。黄色ブドウ球菌のFnへの結合をブロックすることができるアフィニティの高い抗体を生成するというこれまでの試みはほとんど成功していない。たとえば、組換え形態の黄色ブドウ球菌 Fn結合MSCRAMM rFnBD−DとFn結合合成ペプチドD2の両方に対してウサギのポリクローナル抗体を作製したとき、これらの抗血清の力価と特異性は良好であり、両方の免疫血清から分離したIgGはウエスタンブロット分析においてそれぞれの抗原を認識したにもかかわらず、免疫血清から分離したIgGは黄色ブドウ球菌のFnへの結合を阻害しなかった。
興味深いことに、β−D−ガラクトシダーゼとFn結合MSCRAMMとの融合タンパク質で免疫したマウスから精製した抗体は、黄色ブドウ球菌の125I−Fnへの結合をブロックしなかった(Ciborowskiら、1992年)。しかし、あらかじめホルマリンで処理しておいたβ−D−ガラクトシダーゼFn結合MSCRAMM融合タンパク質に対して惹起した抗体はある程度のブロッキング活性を有していた。これらの所見は、抗原のタンパク質構造の修飾が阻止抗体を生成する能力を決定する上で極めて重要な因子であったことを示唆している。
黄色ブドウ球菌のFn結合MSCRAMMは「誘発適合(induced fit)」結合機序を通してFnと相互作用することは可能性がある。Fn結合MSCRAMMによるFn結合の「誘発適合」機序の概念を裏付けるデータが、最近、免疫学的手法(Spezialeら、1996年)と物理生化学的手法(House−Pompeoら、1996年)の両方で得られた。
S.dysgalactiaeのFn結合MSCRAMM FnBAを注入したマウスから分離したモノクローナル抗体3A10が最近同定され、特性付けられた。3A10についてのエピトープは、FnBA上の主要リガンド結合部位の反復領域のすぐ上流にある新たに同定されたFn結合モチーフ(Auと称される)に位置していた。3A10抗体は、FnのAuへの結合を阻害するのではなくむしろ結合を増強した。この作用は2つの異なるアッセイ系で明らかにされた。まず最初に3A10は、Au含有タンパク質と合成ペプチドがFnへの結合に関して細菌細胞と競合する能力を上昇させた。第二に、3A10は、ビオチンで標識した形態のAu含有タンパク質がブロット膜に固定したリガンドに結合するのを劇的に上昇させた。精製3A10 IgGはそれだけでは抗原を認識せず、抗体とエピトープ間の免疫学的相互作用のためにはFnが必要であった。ウエスタンブロット分析とELISA分析の両方でFnのこの誘発作用が示された。ELISA分析では、固定したAu含有分子を種々の濃度のFnと共に3A10でプローブした。これらのデータとその後の生物物理学的試験は、FnBAのリガンド結合部位がほとんどあるいは全く二次構造を持たないことを示唆している。しかしFnが存在するときには、リガンド誘発結合部位(LIBS)の発現をもたらす構造の再配列を受けると思われる。3A10はFnとFnBA間の複合体形成によって生じるLIBSを特異的に認識することがデータで明らかにされた。
1.3 先行技術の欠陥
Staphylococcus aureusや様々なブドウ球菌および連鎖球菌種を含めた多くの細菌種における抗生物質耐性の出現は人類にとって潜在的な脅威と考えられている(Begley、1994年)。特に心配されるのは、Staphylococcus aureusの多剤耐性である。今日、院内感染を引き起こす連鎖球菌株のほぼ半数がバンコマイシンを除くすべての抗生物質に耐性であり、バンコマイシンが無効となるのは時間の問題であると思われる(Begley、1994年)。感染を予防し、治療するという試みに新しい戦略を考慮しなければならないのはまさにこのシナリオにおいてである。ブドウ球菌や連鎖球菌によって引き起こされる感染の分子学的病因についての詳細な知識が、これらの戦略のデザインにおいて重要な基礎を提供するであろう。MSCRAMMが媒介する宿主組織への微生物付着は、大部分の感染の病原性過程における重要な第一ステップであると思われることから、新しい抗菌薬の開発における魅力的なターゲットである。
細菌性疾患の治療への様々なアプローチはある程度の成功を収めてきたが、抗生物質耐性、種間での抗原の変動性、また一部の種では抗原の突然変異を通しての抗原の変動性、さらには若齢小児や高齢者および他の免疫無防備状態の患者における非能率的な免疫系といった増大しつつある問題すべてが、克服する必要のある困難を提示していることは明白である。それ故、ヒトと動物の両方で様々な感染に使用することができる、連鎖球菌およびブドウ球菌病原体に対する有効な治療が、現在さしあたって必要とされている。
Burnhamとその協力者たちは、天然D1−D4エピトープタンパク質配列に対するモノクローナル抗体(mAb)を惹起したことを報告したが(特許願第WO94/18327号)、これらのmAbの生物学的活性あるいは阻害活性は示されなかった。
興味深いことに、β−ガラクトシダーゼのFn結合MSCRAMM融合タンパク質で免疫したマウスから精製した抗体は、黄色ブドウ球菌の125I−Fnへの結合をブロックしなかった(Ciborowskiら、1992年)。しかし、あらかじめホルマリンで処理しておいたβ−D−ガラクトシダーゼFn結合MSCRAMM融合タンパク質に対して惹起した抗体は、ある程度のブロッキング活性を有していた。これらの所見は、抗原のタンパク質構造の修飾が阻止抗体を生成する能力を決定する1つの因子であったことを示唆している。ホルマリン処理は、リシン残基においてシッフ塩基を誘発することによりタンパク質を不活性化する一般的な方法である。しかしその反応は可逆的であって、分子は潜在的に機能性を回復することができ、それ故、そのようなホルマリン処理の有益な作用を無効にしてしまうことがある。
これらの結果にはいくつかの考えられる理由がある。たとえば活性Fn結合MSCRAMMを動物に注入したとき、細菌タンパク質が直ちにFnと複合体を形成すると仮定する。そのような複合体では、結合部位であるMSCRAMMの表面はふさがっていて、免疫認識には使用できない。この論拠が正しければ、宿主の防御機序を避けるために微生物が使用する、これまで未知であった巧妙な戦略を示すことになるであろう。
天然Fn結合タンパク質に対する阻止抗体を作製することが不可能であるという事実は、細菌感染を予防することを目指した能動および受動免疫法においてそれを使用することをあらかじめ排除してきた。それ故、アフィニティの高い阻止抗体を生成する抗原の創造を導くであろう、Fn結合MSCRAMM中の部位特異的に修飾されたエピトープの作製は、感染性疾患の分野における重要な突破口であり、特にブドウ球菌および連鎖球菌疾患を治療する方法を革命的に変化させ、それによって細菌感染を治療するための抗生物質療法の必要性を回避することになるであろう。同様に、1つのFnBPからの多数のFn結合エピトープを認識するmAb群を開発することは、モノクローナル抗体を使用してFnBPへのFnの結合を阻害する方法を容易にするであろう。ペプチドエピトープをコードするDNA配列を変化させる方法は、ペプチド配列に変更を組み込むための安定で再現可能な手段を提供し、従って現在のホルマリンによる天然タンパク質の変性に比べて大きな進歩となるであろう。ECM成分と細菌細胞表面タンパク質との相互作用を阻害することによって宿主細胞への細菌付着を抑制する方法の開発は、そのような感染の治療にとって技術水準の著しい改善をもたらすであろう。
2.発明の要旨
本発明は、たとえば抗生物質以外の戦略を用いた細菌感染の治療と細菌付着の予防において使用するための新規組成物と方法を提供することにより、先行技術に固有のこれらおよびその他の1つ以上の欠点を克服する。本発明は、初めて、フィブロネクチン結合タンパク質へのフィブロネクチンの結合をブロックする抗体を提供する。これらの抗体は、フィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域からのエピトープに基づくものでありながら、フィブロネクチンには結合しないペプチドに対して誘発される。従って、動物に導入したとき、これらのペプチドエピトープはフィブロネクチンと複合体を形成しない。これによって複合体化されていないペプチドエピトープに対する抗体を作製することができ、かかる抗体はフィブロネクチンがフィブロネクチン結合タンパク質に結合するのを阻害あるいはブロックする。
フィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチンへの結合を阻害あるいはブロックする抗体、ならびに選択した動物に免疫したときそのような抗体を生成するペプチド組成物を開示する。また、宿主細胞のECM成分であるFnへの微生物結合の阻害を介した微生物感染の治療における新規ペプチドおよび抗体組成物の使用のための方法も開示する。また、選択したフィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域からのペプチドエピトープを使用して例示される、連鎖球菌およびブドウ球菌病原体のような微生物病原体に対する能動および受動免疫のための方法も開示する。本発明の特定の局面は、これらのエピトープをコードする新規核酸セグメント、ならびに様々な診断および治療処方においてそのような核酸セグメントを使用するための方法に関する。
本発明は最初に、フィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域に結合して、フィブロネクチン結合タンパク質がフィブロネクチンに結合するのを阻害する抗体を含む組成物を提供する。それ故、特定の実施形態においては、これらの抗体を阻止抗体と称する。本発明の好ましい局面では、当該抗体は、そのペプチドがフィブロネクチン結合領域の構成部分でないときにはフィブロネクチンに特異的に結合しない、フィブロネクチン結合領域のペプチドあるいはエピトープに結合する。すなわち、一部の好ましい局面では、ペプチド自体が孤立してフィブロネクチンに結合することはない。
特定の実施形態では、抗体は微生物のフィブロネクチン結合タンパク質、好ましくは連鎖球菌あるいはブドウ球菌のフィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域に結合する。他の好ましい局面では、抗体は連鎖球菌のSfb、FnBAまたはFnBB、あるいはブドウ球菌のFnBPAまたはFnBPBフィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域に結合する。さらに他の好ましい局面では、抗体はブドウ球菌のfnbA遺伝子、特にStaphylococcus aureusのfnbA遺伝子から発現されるフィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域に結合する。
フィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチンへの結合を阻害するポリクローナル抗体およびモノクローナル抗体の両方を本文中で提供する。モノクローナル抗体9C3(ATCC HB xxxxx)あるいは11A5(ATCC HB yyyyy)自体を含めて、モノクローナル抗体9C3(ATCC HB xxxxx)あるいは11A5(ATCC HB yyyyy)と同じエピトープに結合する抗体が好ましい。
ある実施形態では、放射標識、蛍光標識、核磁気スピン共鳴標識、ビオチン、アビジン、あるいはアルカリホスファターゼ、水素ペルオキシダーゼまたはグルコースオキシダーゼ酵素を含むがこれらに限定されない、色素産生基質と接触して着色産物を生じる酵素などの、ただしこれらに限定されない、検出可能な標識に抗体を連結する。
本発明の一部の局面では、抗体組成物を製薬学的に許容しうる賦形剤あるいは媒質に分散させる。
本発明はさらに、フィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域の分離したペプチドを含む組成物を提供するが、かかるペプチドはフィブロネクチンには結合しない。かかる分離したペプチド組成物に関して本文中で使用するとき、「フィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域」という用語は、分離したペプチドが、分離ペプチドとフィブロネクチン結合領域の両方に結合する抗体を生成することができる、フィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域の野生型配列の部分と十分に類似していることを意味すると理解される。分離ペプチドの配列が突然変異を生じているかまたは生じたことがある、あるいは分離ペプチドがフィブロネクチンに結合するのを妨げるほどに異なる分離ペプチドもこの説明に包含される。
従って、野生型あるいは天然に生じる変異体から分離したペプチド断片、ならびに野生型、天然に生じる変異体あるいフィブロネクチン結合タンパク質の天然に生じるフィブロネクチン結合領域に対応しない導入された突然変異に相当する合成あるいは組換えペプチドは本発明に包含される。好ましい局面では、分離ペプチドは、野生型フィブロネクチン結合領域からの対応するアミノ酸配列と比較して少なくとも1つの第一突然変異を含む。さらに他の実施形態では、分離ペプチドは突然変異を含むように設計されている。「設計される」という用語には、たとえばペプチド合成あるいは部位特異的変異誘発を通してペプチドに導入される突然変異が含まれる。
分離ペプチドは、分離ペプチドとフィブロネクチン結合領域の両方に結合し、フィブロネクチン結合タンパク質がフィブロネクチンに結合するのをブロックする抗体を生成するのに十分な長さであることだけを必要とする。一部の局面では、少なくとも約5、約6、約7、約8、約9、約10、約11、約12、約13、約14、約15、約16、約17、約18、約19、約20、約22、約24、約25、約30、約35、約40、約45あるいは約50個の連続するアミノ酸を含むペプチドが好ましい。本発明の他の好ましい局面では、分離ペプチドはフィブロネクチン結合領域の野生型配列からの少なくとも約6個の連続アミノ酸を含む。より好ましい実施形態では、分離ペプチドは配列番号:60あるいは配列番号:61からの少なくとも約8個のアミノ酸の連続アミノ酸配列を含む。さらに一層好ましい局面では、分離ペプチドは配列番号:60あるいは配列番号:61の連続アミノ酸配列を含む。
本発明の局面では、動物において免疫応答を生じさせるための分離ペプチド組成物を使用する。これらの局面では、組成物は好ましくはさらにアジュバントを含む。さらに、本発明のこれらの局面では、分離ペプチド組成物は好ましくは製薬学的に許容しうる賦形剤中に分散される。
本発明の特定の実施形態においては、単離されたペプチドを選択されたアミノ酸配列に作動可能に連結させる。したがって、本発明は、選択されたアミノ酸配列に作動可能に連結するフィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域の第1ペプチドを少なくとも含む融合タンパク質を含み、この第1ペプチドはフィブロネクチンに特異的に結合することはない。好ましい局面において、この第1ペプチドは選択された担体アミノ酸配列に作動可能に連結し、この担体アミノ酸配列にはキーホールリンペットヘモシアニン(KLH)及びウシ血清アルブミン(BSA)が含まれるがそれらに限定されるものではない。
フィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域のペプチドをコードする、単離された核酸セグメントを含む組成物であって、このペプチドがフィブロネクチンに特異的に結合することがない組成物がさらに提供される。
また、本発明は、製薬学的に許容しうる担体中に、フィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域に結合し、かつフィブロネクチン、フィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域の単離されたペプチドへのフィブロネクチン結合タンパク質の結合を阻害する有効量の抗体を含む製薬組成物であって、このペプチドがフィブロネクチン、又はフィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域のペプチドをコードする単離された核酸セグメントに特異的に結合することがなく、このペプチドがフィブロネクチンに特異的に結合することがない製薬組成物をも提供する。
本発明の組成物は免疫処方の調製において用いることが意図されている。したがって、本発明は、免疫処方の調製において本発明の組成物の使用を提供する。
また、本発明では、動物における感染を予防もしくは治療するための医薬の調製又はフィブロネクチンへの微生物の結合を阻害する処方の調製におけるここで提供される組成物の使用が意図されている。したがって、本発明は、感染を予防もしくは治療するための医薬の調製又はフィブロネクチンへの微生物の結合を阻害する処方の調製において本発明の組成物の使用を提供する。
本発明は、さらに、フィブロネクチンに結合するフィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域のペプチドを同定する方法であって、候補ペプチドをフィブロネクチンと、フィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域へのフィブロネクチンの結合を可能とするのに有効な条件下で接触させ、かつフィブロネクチンに結合しない陽性候補ペプチドを同定することを包含する方法を提供する。
フィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域に結合し、かつフィブロネクチンへのフィブロネクチン結合タンパク質の結合を阻害する抗体を産生する方法であって、免疫学的に有効な量の、フィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域の単離されたペプチドを含み、このペプチドがフィブロネクチンに特異的に結合することがない製薬組成物を動物に投与することを包含する方法も提供される。
本発明の特定の局面においては、製薬組成物は、候補ペプチドをフィブロネクチンと有効結合条件下で接触させ、フィブロネクチンと結合しない陽性候補ペプチドを同定し、かつその陽性候補ペプチドを製薬学的に許容しうる希釈剤中に分散させることにより調製する。好ましい局面においては、複数の候補ペプチドをフィブロネクチンと有効結合条件下で接触させ、フィブロネクチンに結合しない1つ以上の陽性候補ペプチドを同定する。複数の候補ペプチドは複数のペプチドに突然変異を誘発することにより生成させることができ、これは選択されたペプチドの各残基をプロリン残基で置換することにより、又は、他の実施形態においては、フィブロネクチン結合タンパク質の本来の、もしくは天然のフィブロネクチン結合領域を、例えば選択されたプロテアーゼでそのフィブロネクチン結合領域を消化することにより、分割もしくは断片化することにより例示されるが、これらに限定されるものではない。このようにして同定された陽性候補ペプチドは、本発明の特定の局面においては、担体タンパク質に連結させ、及び/又はアジュバントと混合し、又は製薬学的に許容しうる媒体もしくは賦形剤中に分散させることができる。
さらに別の局面においては、この製薬組成物は免疫学的に有効な量の、配列番号60又は配列番号61のアミノ酸配列を有するペプチドを含む。特定の好ましい実施形態においては、この製薬組成物は、微生物感染を患い、それを患っていることが疑われ、又はそれを発症する危険がある動物に投与するように設計される。
本発明は、さらに、サンプル中のフィブロネクチン結合タンパク質の検出方法であって、フィブロネクチン結合タンパク質を含むことが疑われるサンプルを、フィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域に結合し、かつそのフィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチンへの結合を阻害する抗体と、免疫複合体の形成を可能とするのに有効な条件下で接触させ、その結果形成される免疫複合体を検出することを包含する方法を提供する。
本発明の特定の実施形態においては、フィブロネクチン結合タンパク質は連鎖球菌又はブドウ球菌によって例示されるがこれらに限定されるものではない微生物によって発現され、そのサンプルはその微生物を含むことが疑われる。特定の好ましい局面においては、フィブロネクチン結合タンパク質は黄色ブドウ球菌によって発現される。微生物によって発現されるフィブロネクチン結合タンパク質は細胞表面に局在するため、好ましい局面においては、フィブロネクチン結合タンパク質は微生物細胞の表面上で検出される。
適切な容器手段内に、フィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域に結合し、かつそのフィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチンへの結合を阻害する抗体、フィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域の単離されたペプチドであってフィブロネクチンに特異的には結合しないペプチド、又はフィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域のペプチドをコードする単離された核酸セグメントであって、そのペプチドがフィブロネクチンに特異的には結合しない核酸セグメントを具備するキットも提供される。
本発明の特定の実施形態においては、このキットは、適切な容器手段内に、フィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域に結合し、かつそのフィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチンへの結合を阻害する第1抗体を具備する。したがって、特定の局面において、本発明は免疫検出キットを提供する。特定の局面において、この免疫検出キットは免疫検出試薬、例えば、第1抗体に連結される検出可能な標識をさらに具備する。他の好ましい局面において、この免疫検出キットは第1抗体に結合する第2抗体をさらに具備する。
適切な容器手段内に、製薬学的に許容しうる処方中に含まれる治療上有効な量の抗体、単離されたペプチド又は単離された核酸セグメントを具備する治療キットも提供される。この治療キットの好ましい実施形態においては、抗体は連鎖球菌又はブドウ球菌のフィブロネクチンへの結合を阻害する。さらに別の好ましい局面においては、製薬学的に許容しうる処方は局所、非経口又は経口投与に適するものである。
本発明は、さらに、動物における微生物感染を予防又は治療する方法であって、この動物に治療上有効な量の製薬組成物を投与することを包含し、この製薬組成物がフィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域に結合し、かつそのフィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチンへの結合を阻害する抗体、フィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域の単離されたペプチドであってフィブロネクチンに特異的に結合しないペプチド、又はフィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域のペプチドをコードする単離された核酸セグメントであって、そのペプチドがフィブロネクチンに特異的に結合しない核酸セグメントを含み、この製薬組成物が動物における微生物感染を予防又は阻害する方法を提供する。ここで用いられる場合、“治療上有効な量”という用語は、動物のフィブロネクチンへの微生物のフィブロネクチン結合タンパク質の結合を阻害するのに有効な量として理解される。本発明の好ましい局面においては、この方法は、動物又はヒト被験体における連鎖球菌又はブドウ球菌の感染又はコロニー化を予防し、阻害し、又は治療する。
【図面の簡単な説明】
これらの図面は本明細書の一部を形成し、本発明の特定の局面をさらに示すために含まれる。これらの図面の1つ以上をここに示される特定の実施形態の詳細な説明と組み合わせて参照することにより、本発明をよりよく理解することができる。
図1.黄色ブドウ球菌、Streptococcus dysgalactiae及び化膿連鎖球菌に由来するFn受容体の領域構成。Fn結合反復はA、B、D及びPで表される。S、シグナル配列;U、Fn受容体に独自の配列;W、細胞壁スパンニング領域;M、膜スパンニング領域;C、細胞内配列。組換えタンパク質はrFNBD−D、rFNBD−A、PAQ8、rFNBD−B及びrFNBD−Pで示される領域に対応する。Au及びDU領域は本発明者らによって同定された新規リガンド結合部位を表す。
図2A、図2B及び図2C.野生型及び突然変異体D3ペプチド1ないし21(表3)による、固定化されたフィブロネクチンへの黄色ブドウ球菌の結合の阻害。NPは阻害剤が存在しない状態での付着細菌の量を示す。図2A.5μg/ウェルで試験したペプチド。図2B.50μg/ウェルで試験したペプチド。図2C.250μg/ウェルで試験したペプチド。
図3A及び図3B.図3A.野生型ペプチドD1及びD2並びに突然変異体誘導体による、固定化されたフィブロネクチンへの黄色ブドウ球菌の結合の阻害。NPは阻害剤が存在しない状態での付着細菌の量を示す。全てのペプチドは10μg/ウェルで試験した。図3B.野生型ペプチドD1、D2及びDU並びに変異体誘導体による、固定化されたフィブロネクチンへの黄色ブドウ球菌の阻害。NPは阻害剤が存在しない状態での付着細菌の量を示す。全てのペプチドは250μg/ウェルで試験した。
図4A、図4B及び図4C.図4A.黄色ブドウ球菌FnBPAのセグメントを含むグルタチオンSトランスフェラーゼ融合タンパク質。図4B.抗D3pep抗体のエピトープの局在化。図4C.抗Fn−peps抗体のエピトープの局在化。
図5A及び図5B.抗D3pep(□)及び抗Fn−peps(■)の阻害活性対前免疫IgG(○)の阻害活性。図5A.固定化されたFnへのGST−D3の結合が示される。図5B.FnへのGST−D123(GSTD1−3)の結合が示される。
図6.D1−3(●)又はGSTD1−3(■)で免疫することにより得られたアフィニティ精製抗体の力価。マイクロタイタープレートを1μg/mlのD1−3でコートし、指示される濃度のアフィニティ精製抗体と共にインキュベートした。
図7.前免疫抗体(□)、又はGSTD1−3(■)もしくはD1−3(●)で免疫することにより得られたアフィニティ精製抗体による、黄色ブドウ球菌L857細胞への125I−Fnの結合の阻害。結果は、抗体が添加されていない状態で結合した125I−Fnのパーセンテージとして表される。各点は2回の測定の平均を表す。
図8A及び図8B.D1−3(図8A)又はGSTD1−3(図8B)で免疫することにより得られたアフィニティ精製抗体のエピトープマッピング。ペプチド配列は表9に、D1のN−末端から降順にEEDTEKDKPK(ペプチド#24;配列番号:2)を最後にして記載されており、ここでC−末端はD2モチーフの残基18を表す。表9におけるD1又はD2の命名は、1つ以上のアミノ酸にD1又はD2モチーフのいずれかが寄与するペプチドのスパンを示す。ビオチン化ペプチドをストレプトアビジン被覆マイクロタイタープレートのウェル内で捕捉し、50ng/mlアフィニティ精製抗体の100μlアリコートと共に60分間インキュベートした。各々の値は3回の測定の平均を表す。
図9A及び図9B.D1−3(図9A)又はGSTD1−3(図9B)を免疫源として用いて産生させたアフィニティ精製抗体による、D3モチーフ全体にわたるデカペプチドの認識。ペプチド配列は表10に記載されている。陰付きのバーはD1モチーフの対照ペプチドD113-20及びD123-32に向かう応答を表す。このアッセイは上記図9について説明される通りに行った。
図10.黄色ブドウ球菌Newman株から精製したFnBPへの結合に対する、可溶性Fn及び抗D121-34(●)又は抗D320-33(■)F(ab’)2断片の間の競合。これらのF(ab’)2断片は指示される濃度の可溶性Fnを含む抗体バッファ中に100μg/mlに希釈し、5μg/mlのFnBPでコートしたCorningマイクロタイタープレートのウェルに添加した。二次抗体はF(ab’)2特異的ヤギ抗ウサギIgGのアルカリホスファターゼ結合F(ab’)2断片であった。
図11.抗D121-34(●)又は抗D320−33(■)F(ab’)2断片による、黄色ブドウ球菌への125I−フィブロネクチンの結合の阻害。各点は3回の測定の平均を表し、破線はF(ab’)2断片が添加されていない状態での結合の量を示す。前免疫F(ab’)2はアッセイした濃度のいずれでもFn結合を阻害しなかった。
図12.100μg/mlの抗D121-34(バー3)又はD320-33(バー4)F(ab’)2単独による阻害と比較した、100μg/ml(バー1)及び200μg/ml(バー2)の濃度の抗D121-34及びD320-33F(ab’)2断片の混合物によるFn結合の相加的又は相乗的阻害のアッセイ。バー5はF(ab’)2断片を添加しない状態での結合を表し、各欄は3回の測定の平均を表す。
図13A、図13B及び図13C.抗LIBS抗体の単離。患者I.Z.から得られたIgGをGST−Du1234−セファロースにかけ、分画した。マイクロタイターウェル上に固定化されたGST−Du1234タンパク質(100μl中1μg)を、N29が存在しない状態(□)又は存在下(●)において、100μlの20μg/ml非分画IgG(図13A)、カラムの貫流物中に溶出した物質(図13B)、又はアフィニティマトリクスに結合し、もしくはそこから溶出した抗体(図13C)を用いてアッセイした。
図14A及び図14B.FnBPAに対する抗体は黄色ブドウ球菌へのフィブロネクチンの結合を阻害しない。図14A.GST−Du1234をマイクロタイターウェル上に固定化し(1μg/ウェル)、患者の血清に由来する2μgの精製IgGの存在下において、8×104cpmの125I標識N29で探索した。0.1%ツィーン20を含むリン酸緩衝生理食塩水で念入りに洗浄した後、プレートを200μlの2%SDSと共に37℃で30分間インキュベートし、ウェルに会合した放射能をγカウンターで定量した。図14B.黄色ブドウ球菌Cowan1の細胞(1×108)を125I−N29(5×104cpm)と共に、患者の血清から単離した50μgのIgGの存在下においてインキュベートした。抗体が存在しない状態での細菌の結合を100に設定した。
図15.黄色ブドウ球菌fnbAがコードするタンパク質へのFnの125I−N29断片の結合のmAb 9C3による阻害。CorningポリスチレンELISAウェルストリップを1μg/mlの組換えタンパク質D1−3(○)、D2−3(●)、GSTD3(△)又は1×108CFUの黄色ブドウ球菌細胞(▲)、次いで様々な濃度のmAb 9C3でコートした。次に、Fnの125I−N29断片(50,000cpm)を添加し、結合した125I−N29断片の量を定量した。結合した125I−N29のパーセンテージを縦軸に示し、9C3 mAbの濃度を横軸に示す。
図16.9C3及び11A5モノクローナル抗体の阻害活性。CorningポリスチレンELISAウェルストリップを1μg/mlの組換えタンパク質GSTD3、次いで様々な濃度のmAb 9C3(●)又はmAb 11A5(○)でコートした。次に、Fnの125I−N29断片(50,000cpm)を添加し、結合した125I−N29断片の量を定量した。結合した125I−N29のcpm(×103)を縦軸に示し、9C3及び11A5 mAbの濃度を横軸に示す。
4.好ましい実施形態の詳細な説明
本発明は、フィブロネクチン結合タンパク質へのフィブロネクチンの結合を遮断する抗体を初めて提供することにより、従来技術に固有の欠点を克服する。これらの抗体は、フィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域に由来するエピトープをベースとしながらもフィブロネクチンに結合しないペプチドに対して生じる。このような阻止抗体を産生しようとする従来の試みは失敗に終わっている。本発明者らは、この失敗が、部分的には、動物体内に導入された際のフィブロネクチンとフィブロネクチン結合タンパク質及びそれらの断片との急速な複合体形成によるものであると結論付けた。したがって、本発明者らは、フィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域をベースとしながらもフィブロネクチンに結合しないペプチドエピトープがインビボでフィブロネクチンと複合体を形成しないものと結論付けた。これにより、複合体を形成しないペプチドエピトープに対して抗体を作製することが可能となり、この抗体はフィブロネクチン結合タンパク質に対するフィブロネクチンの結合を阻害又は遮断する。
本発明は、フィブロネクチンへのフィブロネクチン結合タンパク質の結合を阻害又は遮断する抗体を含む組成物及び方法、選択された動物に対して免疫化することによりそのような抗体を産生するペプチド、そのようなペプチドを同定するための方法、並びにそのようなペプチドをコードする核酸セグメントを提供する。本発明の組成物は広範な実施形態において有用であり、これらの実施形態には、宿主細胞のフィブロネクチンへの微生物の結合の阻害が介在する微生物感染の診断及び/又は治療、並びに選択されたフィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域に由来するペプチドエピトープを用いることで例示される、連鎖球菌及びブドウ球菌のような微生物病原体に対する能動及び受動免疫のための方法が含まれるがこれらに限定されるものではない。本発明の組成物には様々な診断用及び治療用キットが含まれる。
ここに記載される技術は、細菌の付着及び引き続く宿主組織でのコロニー化を特異的に妨げ、その結果感染を予防する方法及び組成物の開発に用いられる。開示される方法及び組成物は広範に適用可能であり、多くの状況において抗生物質治療の有効性を増加させる潜在能力を有し、かつ他の用途の幾つかにおいては抗生物質治療に置き換わる。この技術は、ECM基質への細菌の付着の防止に基づく対費用効果の高い予防的治療方法を提供することにより、細菌病原体の通常の抗生物質治療に対する必要かつ望ましい代用法を体現する。
MSCRAMM(細菌細胞表面上の)及びリガンド(宿主組織内)は錠前と鍵の様式で相互作用し、宿主に細菌を付着させる分子である。微生物の付着の完全な遮断は感染の防止に必須のものではない。細菌接種を臨界量未満に保つことのみが必要である。幾つかの策略が開発されており、それらを以下にまとめる:
(1)MSCRAMM特異的抗体組成物
MSCRAMMに対して産生させた高アフィニティ抗体が細菌に結合し、宿主組織への付着を妨げる。加えて、抗体コート細菌は免疫系によってより容易に認識され、その結果その細菌がより効率的に殺される。
(2)リガンド類似体
病原性細菌が攻撃する宿主組織内の特定の構造を模倣する分子を用いて細菌表面上のMSCRAMMを飽和させ、それにより付着を妨げる。
(3)MSCRAMM類似体
細菌のMSCRAMMを模倣する分子は、宿主組織内の結合部位を飽和させ、その結果細菌の付着を阻害するのに用いられる。
このアプローチの期待される効力は、汚染の直後の期間または血液中を循環する間であって、宿主細胞に結合する前に、宿主の防御及び抗生物質に対する微生物の感受性が増加するという報文(Chuardら、1993年)に基づく。逆に、ひとたび細菌のコロニーが付着して宿主にてコロニーを形成すると、しばしば細菌を取りまくバイオフィルムが現れる。その結果、その細菌は多くの宿主防御機構及び抗生物質の攻撃に対して耐性となる。
4.1 略語
ECM、細胞外マトリクス;Fn、フィブロネクチン;N29、フィブロネクチンN−末端断片;N31、FnのN−末端トリプシン消化断片;rFnBD、組換えフィブロネクチン結合領域;FI、フィブロネクチンI型反復;PBS、リン酸緩衝生理食塩水;CD、円二色性;BSA、ウシ血清アルブミン;GuHCl、塩酸グアニジン;AAA、アミノ酸解析;ANS、8−アニリノ−1−ナフタレンスルホン酸;LIBS、リガンド誘発結合部位;aa、アミノ酸;EDTA、エチレンジアミン四酢酸二ナトリウム;SDS、ドデシル硫酸ナトリウム;PAGE、ポリアクリルアミドゲル電気泳動;DMSO、ジメチルスルホキシド;ELISA、酵素結合免疫吸着アッセイ;9C3又は11A5腹水、モノクローナル抗体9C3又は11A5を発現するクローン化ハイブリドーマ細胞を注射したマウスから得られた腹水;9C3又は11A5腹水IgG、9C3又は11A5腹水から精製したIgG;9C3又は11A5 IgG、9C3又は11A5を発現する培養クローン化ハイブリドーマ細胞から精製したIgG。
4.2 細胞外マトリクス
ECMは非常に多くの糖タンパク質及びプロテオグリカンを含み、これらは、分子間及び分子内相互作用により、不溶性マトリクスを形成する。ECMは組織内で構造的な機能を有するが、その生物の細胞生理にも影響を及ぼす。おそらく、最も特徴付けられているECMの生物学的機能は、宿主組織細胞の接着の基質としての役割を果たすその能力に関係している。このプロセスにはインテグリン、多くのECMタンパク質における特定の構造を認識するヘテロ二量体(α/β)細胞表面受容体の一集団が関与している(Hynes、1992年)。多くの細菌がECMを付着の基質として利用していることが明らかである。大部分の真核生物組織細胞と同様に、多くの細菌は幾つかの併行する付着機構を発達させており、この見かけの重複性は細菌の繁殖にとっての宿主細胞付着の重要性を反映していよう。
4.2.1 フィブロネクチン
Fnは、真核生物組織細胞の基質接着を媒介することが示された最初のECMタンパク質であった。Fnは、プレmRNAの選択的スプライシング及び翻訳後修飾の程度に応じて410−460kDaの分子量を有する二量体糖タンパク質である。Fnは大部分の細胞の表面上、多くの組織のECM内に加えて、血漿のような体液中に蓄積されていることが見出されている(Hynes、1989年)。ブドウ球菌及び連鎖球菌に由来するMSCRAMMによって認識される宿主リガンドタンパク質Fnにおける構造は部分的に決定されている。FnのN−末端領域は黄色ブドウ球菌によって認識される主要部位である(Mosher及びProctor、1980年)。この領域は5つのいわゆるI型単位を含んでなる。異なるI型単位が欠失しているこの領域の組換えバージョンは細菌細胞に結合することができず(Scottileら、1991年)、これは、これらの5つのI型単位がMSCRAMMによって認識される構造単位を形成するのに必須であることを示唆している。しかしながら、Inghamらによる最近の研究では、主要結合部位が4及び5と番号が振られているI型モジュールに位置していることが示唆されている。加えて、黄色ブドウ球菌及び化膿連鎖球菌はFnのN−末端領域の外側の部位に、おそらくはMSCRAMMを介して、従来記載されているECMタンパク質(Jonssonら、1995年)に対する広範な特異性をもって、結合するように思われる(Spezialeら、1984年;Bozziniら、1992年)。
4.2.2 フィブリノーゲン
フィブリノーゲン(Fib)は肝細胞によって産生されるもので、血漿中での主要タンパク質である。凝血の過程でフィブリノーゲンはフィブリンに変換され、このフィブリンが凝集して血餅の核を形成する。Fib結合部位を有するFnはこの血餅に取り込まれ、これらの相互作用している分子が次にトランスグルタミナーゼ(第XIII因子)の作用により互いに結合する。ECM中のFnは血餅中のFibと共に微生物の付着の基質としての役割を果たし得る。さらに、体内に置かれた物質はFib及びFnのような血漿タンパク質で迅速にコートされ、その後、これらの表面に、吸着した宿主のタンパク質に特異的に結合する細菌がコロニーを形成する(Bisno及びWaldvogel、1989年)。Fibにおいては、ブドウ球菌細胞の推定結合部位がγ鎖のC−末端領域に位置しており、この領域に相当する合成ペプチドが、ブドウ球菌が誘発するFibの“クランピング(clumping)”を阻害する(Strongら、1982年)。このFib内の領域は血小板gpIIbIIIaインテグリンによっても認識され、Fibが生体材料の表面上に吸着されたときに露出して血小板の凝集を誘発する(Farrellら、1994年)ものの、可溶性Fibにおいてはおそらくは潜在性であって露出しないものと思われる。
4.2.3 コラーゲン
コラーゲンタンパク質はECMの主要構成要素である(Bornstein及びSage、1980年)。大部分のコラーゲンは細胞内で前駆体分子として合成され、分泌されてECMもしくは他のコラーゲンに富む組織、例えば、軟骨に取り込まれる前に、広範な翻訳後処理を受ける(Ramachandran及びReddi、1976)。現在までに18種類を上回る異なる型のコラーゲンが決定されており、それらは大まかに5つの群に分類される(Vanderrest及びGarrone、1991年)。これらの群は以下の通りである:
(1)1/4ねじれ型フィブリルに関与するコラーゲン、コラーゲンI、II、III、V、及びXI型;
(2)分断された三個のらせん体を有するフィブリル、コラーゲンXII、XIV、及びIX型;
(3)シートを形成するコラーゲン、コラーゲンIV、VIII、及びX型;
(4)玉状フィラメントを形成するコラーゲン、コラーゲンVI型;並びに
(5)固着フィブリルを形成するコラーゲン、コラーゲンVII型。
4.2.4 Fn結合MSCRAMM
黄色ブドウ球菌に由来するFn結合MSCRAMMは特徴付けようとされた最初のMSCRAMMであった。これらの研究は、天然型ブドウ球菌タンパク質の精製(Fromanら、1987年)、続く対応する遺伝子のクローニング及び配列決定(Flockら、1987年)を含んでいた。主要リガンド結合部位は、38アミノ酸長のモチーフを含んでなり、このモチーフが3回繰り返される領域に局在していた(Signasら、1989年)。続いて、黄色ブドウ球菌に由来する高度に相同性のFn結合MSCRAMMをコードする第2の遺伝子が特徴付けられた(Jonssonら、1991年)。また、2種類のFn結合MSCRAMMがStreptococcus dysgalactiaeからも単離され(Lindgrenら、1992年)、対応する遺伝子の配列解析から黄色ブドウ球菌から単離されたタンパク質に類似するタンパク質組織が明らかになった(Lindgrenら、1993年)。これらのタンパク質も、約40アミノ酸長のモチーフを含んでなり、このモチーフが3−4回繰り返されるものであり、かつ主要リガンド結合部位に相当することが見出された領域を含んでいた。化膿連鎖球菌に由来するFn結合MSCRAMMも特徴付けられている(Kreikemeyerら、1995年;Selaら、1993年;Talayら、1992年)。これらのタンパク質をコードする遺伝子が配列決定されており、これらのタンパク質における主要リガンド結合部位も3−4回繰り返される約40アミノ酸長のモチーフを含んでなる領域に位置することが示されている(Johら、1994年)。異なるMSCRAMMにおける反復モチーフの配列の比較から、コンセンサス配列が明らかになった(Johら、1994年;McGavinら、1993年)。他の多くの細菌種がFnに結合することが示されており、この相互作用の原因である微生物タンパク質の幾つかが同定されている。
4.2.5 フィブリノーゲン結合MSCRAMM
3種類のブドウ球菌タンパク質がFibと結合するものと思われる(Bodon及びFlock、1994)。これらのタンパク質のうちの1つは、主として細菌により分泌される凝固酵素が細胞に会合した形態である。黄色ブドウ球菌が発現する主要Fib結合MSCRAMMであるものと思われる“クランピング因子”をコードする遺伝子が近年クローン化され、配列決定されている(McDevittら、1994年;1992年)。第3のFib結合タンパク質は、Fn及びFibを含む多数のECMタンパク質と結合する(Homonylo−McGavinら、1993年;Jonssonら、1995年)。このタンパク質をコードする遺伝子のクローニング及び配列決定から、主として6回繰り返される100アミノ酸長のモチーフを含んでなるタンパク質が明らかとなった。この反復単位中の30アミノ酸のサブセグメントは、哺乳動物MHC II分子のペプチド結合領域と非常に高い程度の配列類似性を有する。
機能的に、このブドウ球菌タンパク質はMHC II分子との類似性も示し、非グリコシル化タンパク質及び合成ペプチドと結合することが可能である(Jonssonら、1995年)。このタンパク質は観察される幾つかのECM分子(例えば、ビトロネクチン、骨シアロタンパク質及びトロンボスポンジン)の結合の原因であり、ブドウ球菌細胞上のMSCRAMMのレパートリーが1リガンド1付着因子パラダイムが関与するものほど複雑ではない可能性がある。
4.2.6 コラーゲン結合MSCRAMM
Fn結合MSCRAMMおよびFib結合MSCRAMMの発現に加えて、黄色ブドウ球菌は、コラーゲン結合MSCRAMMを発現し得る(Spezialeら、1986年)。黄色ブドウ球菌のコラーゲン結合MSCRAMMをコードするcnaと名付けられた遺伝子のクローニング、配列決定および発現が報告されている(Pattiら、1992年)。cna遺伝子は、長さが1183アミノ酸で、グラム陽性細菌から得られる表面タンパク質の特徴を有するポリペプチドをコードしている。シグナル配列(S)の後に、大きな非反復領域(A)が続く。187アミノ酸のモチーフ(B)はその直後に存在する。異なる臨床単離体から得られたcna遺伝子のPCRTM分析によって、MSCRAMMは、1個、2個、3個または4個のB反復を含有する少なくとも4つの形態で存在し得ることがわかっている(Switalskiら、1993年)。B領域の後には、推定される細胞壁会合領域(W)、疎水性の膜貫通セグメント(M)、および正に荷電したアミノ酸に富む短い細胞質内テール(C)が続く。多数の異なる臨床単離体の分析によって、コラーゲン結合活性を発現する黄色ブドウ球菌のみがcna遺伝子を含有することが明らかにされた。
コラーゲン結合性領域(CBD)は、135kDaの黄色ブドウ球菌のコラーゲンアドヘジン(付着体)の内部に存在していた(Pattiら、1993年)。ウェスタンリガンドブロットおよび直接的な結合アッセイと組み合わせた欠失変異導入を用いて、CBDが、アドヘジンの約55kDaのA領域(CBD30−529)内に位置することが最初に見出された。その後の研究によって、CBD(30−529)内の長さが168アミノ酸のセグメント(CBD151−318)に対するCBDが局在化された。さらに最近、アミノ酸D209とアミノ酸Y233との間の領域内に位置する別のコラーゲン結合部位が、黄色ブドウ球菌のコラーゲンアドヘジンの内部に見出された。さらに、N232およびY233の2つの残基が、完全なコラーゲン結合活性に必要であることが示された(Pattiら、1995年)。
コラーゲン結合MSCRAMMは、コラーゲン被覆基質に対する細菌の接着だけでなく、軟骨(複雑なコラーゲン含有組織)に対する接着にも必要とされることが明らかにされた。コラーゲン結合MSCRAMMを発現する試験した菌株のすべてが軟骨に接着することができたが、コラーゲン結合MSCRAMMを欠失する菌株は接着しなかった。さらに、コラーゲン結合MSCRAMMと天然MSCRAMMに対するポリクローナル抗体とを一緒にプレインキュベーションするか、または基質のリガンド結合部位を可溶性受容体タンパク質でブロックすることによって、細菌の結合が効果的に阻害された。コラーゲンアドヘジンは、軟骨への接着を媒介するために必要であって十分である。なぜならば、生成されたコラーゲン結合MSCRAMMタンパク質で被覆されたポリスチレンビーズは軟骨ディスクに付着したが、黄色ブドウ球菌のFn結合MSCRAMMで被覆されたビーズは付着しなかったからである(Switalskiら、1993年)。
4.3 MSCRAMMの生物学的重要性
異なるFn結合MSCRAMMおよびFib結合MSCRAMMのアドヘジンとしての重要性が、今や明確にされている。これらの細菌の表面アドヘジンは、単離されたFnまたはFibで被覆された異なる支持材料、および血漿で調整された生体物質に対する細菌の接着を媒介する。埋め込まれた生体物質での細菌のコロニー形成は、多くの場合、命を脅かす感染の原因である。血清で調整したポリマー生体物質に対して接着する黄色ブドウ球菌のMSCRAMM同質遺伝子変異体の能力を、イヌの動静脈シャントモデルにおいて調べた。黄色ブドウ球菌のFib結合MSCRAMM変異体(clf)は、その親株と比較して、血漿で調整したシャントに対する結合能力において80%を超える低下が見られた。無傷のclf遺伝子コピーを有する同質遺伝子株の補足により、そのようなシャントに対して付着するその能力は完全に回復した(Vaudauxら、1995年)。
一連のcoa−黄色ブドウ球菌変異体およびclf−黄色ブドウ球菌変異体のビルレンスを、カテーテル誘導の心内膜炎(EE)のラットモデルにおいて分析した(Moreillionら、1995年)。コアグラーゼをコードする遺伝子の不活性化は、黄色ブドウ球菌変異体のEE誘導能に影響しなかった。しかし、EE誘導能は、クランプ因子のみを欠失する変異体、またはクランプ因子およびコアグラーゼの両方を欠失する変異体において著しく減少した。さらなる研究では、このモデルにおけるFn結合MSCRAMMおよびFib結合MSCRAMMの二重欠失変異体のビルレンスを調査した。
敗血症性関節炎の病原におけるコラーゲン結合性アドヘジンの生物学的重要性が、動物モデルにおける2組の黄色ブドウ球菌変異体のビルレンスを比較することによって調べられている(Pattiら、1994年)。コラーゲンアドヘジン陰性の同質遺伝子変異体PH100を、臨床株Phillipsの染色体コラーゲンアドヘジン遺伝子(cna)をその不活性化コピーと置換することによって構築した。コラーゲンアドヘジン陽性の変異体黄色ブドウ球菌 CYL574を、cna遺伝子をCYL316(cna遺伝子が通常欠失している株)に導入することによって作製した。CNA+株を注射した70%を超えるマウスは関節炎の臨床的兆候が見られたが、CNA-株を注射した動物の27%未満が疾患症状を示した。さらに、CNA+株のphillips株を注射したマウスは、CNA+変異体PH100を注射したマウスと比較した場合、IgG1およびIL−6のレベルが著しく上昇した。まとめると、これらの結果により、コラーゲンアドヘジンは、黄色ブドウ球菌によって誘導される敗血症性関節炎の病原性の重要な役割を果たしていることが明らかにされる。
4.4Fn結合MSCRAMMにおけるLIBSの特徴づけ
Fn結合MSCRAMMの「誘導適合」リガンド結合機構(LIBS:リガンド誘導結合部位)は、高いアフィニティの阻止抗体を生成しないことの免疫学的な原因である。さらに、Fn結合配列は、いくつかの類似する(しかし、同一ではない)配列を含有し、そのそれぞれがリガンド結合し得る。従って、配列特異的な抗体は、1つのFn結合配列のエピトープを認識し、そのリガンド結合を妨害し得るが、それ以外の結合配列のいくつかまたはすべては影響を受けないままである。このことは、宿主の防御機構を回避する微生物が使用するこれまでに知られていない巧妙な戦略を表していると考えられる。従って、結合活性を欠失するFn結合MSCRAMMだけが、阻止抗体を産生するための抗原として役に立つことが予想される。
FnBPA内の酸性残基がFn結合に寄与していることが、1−エチル−3−(3−ジメチルアミノプロピル)カルボジイミド(EDC)介在によるカルボキシル基でのグリシンメチルエステルの縮合を使用する化学的修飾によって以前に決定されている(McGavinら、1991年)。このような修飾による研究によって、COOH基が、MSCRAMMのFn結合能における重要な役割を果たしていることが示された。逆に、リジン残基のジヒドロキシプロピル化還元およびテトラニトロメタンの添加によるチロシン残基の酸化は、Fn結合に何ら影響しなかった。
このような観測に基づいて、本発明者らは、結合活性を欠失しているFn結合MSCRAMMは阻止抗体を導くという仮説を立てた。Fn結合MSCRAMM組換え体、rFnBD−Dを、以前に記載された(McGavinら、1991年)ようにEDCで化学的に修飾し、黄色ブドウ球菌に対するFn結合を阻害するその能力を試験した。修飾rFnBD−Dは何ら阻害活性を示さなかったが、無傷のrFnBD−Dは、用量依存的形式で黄色ブドウ球菌に対するFn結合を阻害した。次いで、化学的に修飾したrFnBD−Dを使用して、ウサギを免疫化した。免疫血清および免疫化ウサギから精製したIgGを用いたその後の研究によって、生成した抗体は抗原に対して強く反応するが、天然rFnBD−Dに対してはほとんど反応性を示さないことが示された。さらに、精製された免疫IgGは、黄色ブドウ球菌に対するFnの結合を阻害しなかった。約98%の効率で、化学修飾は、全クラスのアミノ酸をプローブするための迅速で効率的な方法を提供する利点を有した。しかし、この全体的な方法での固有の欠点は、個々のアミノ酸の結合に対する寄与が検出されなかったことである。
4.4.1 組換えFnBPSの分析
グラム陽性細菌のいくつかの異なる種に由来する組換えFn結合MSCRAMMの生物物理学的特徴づけにより、「誘導適合」結合相互作用が示唆されている。中性pHのリン酸緩衝化生理食塩水中でのリガンド結合領域の組換え体の遠紫外CDスペクトル(190〜250nm)は、規則的な二次構造をほとんど含有しないタンパク質に特徴的であった。この領域の固有粘度は、6M塩酸グアニジンの存在下または非存在下で同じであることが見出された。このことは、天然コンフォメーションおよび変性コンフォメーションは区別できないことを示す。FnのN末端を組換えアドヘジンに対するリガンドとして添加すると、得られる遠紫外CDスペクトルの差スペクトルにおいて大きな変化が生じた。N末端が4.9モル過剰な場合、示差スペクトルは、モデル遠紫外CDスペクトルとの比較によって判断されるように、βシートのコンフォメーションが主である示差スペクトルに変化した。FnのN末端領域により、その内部トリプトファンの蛍光の微小ではあるが再現性のある青方シフトが、トリプトファン残基を含有しないrFnBD−Aを添加した際に得られる。この結果は結合時におけるN末端のトリプトファン残基の環境が大きく変化していないことを示すので、CD分析によって測定された二次構造の大きな変化は、FnのN末端に対する結合時におけるアドヘジンにおいて、主としてβシートの二次構造が誘導されたことによる。
インビボにおいて、これらの結果を説明する理由がいくつか考えられる。例えば、我々は、活性なFn結合MSCRAMM(組換え体または細菌細胞表面に局在しているもの)が動物の体内に進入すると、このタンパク質が血清中に存在するFnを迅速に認識し、それと結合すると推測している。阻止抗体が既に存在していないか、または極端に低い濃度で存在している場合、MSCRAMM上のFn結合部位はFnと結合し、重要なエピトープは免疫グロブリンによる抗原認識のためにはもはや利用されない。
この考えが正しいとすれば、それは、宿主の防御機構を回避する微生物が使用するこれまで知られていない巧妙な戦略を表しているであろう。本発明者らの最近の研究は、これが、まさに、黄色ブドウ球菌に感染した患者において起こっていることであることを示唆している。臨床的に診断された黄色ブドウ球菌感染症の患者から得られた抗体を分析した(実施例10、ならびに図13A、図13B、図13C、図14Aおよび図14Bを参照のこと)。このような子供の血清から得られた精製IgGは、ELISAによってIgGがFn結合MSCRAMMを認識したとしても、黄色ブドウ球菌のFnに対する結合を有意に阻害しなかった。最も興味深い発見は、ELISAにおいて、IgGが、Fnと複合体化したFn結合MSCRAMMに対して最も強く反応することであった。まとめると、これらのデータは、Fn結合MSCRAMMに対する阻止抗体の欠如は、実験室的現象でもなく、実験計画の人為的なものでもないことを示している。むしろ、黄色ブドウ球菌は、重要なアドヘジンを宿主の防御機構から保護する方法を見出している。さらに、Fn結合MSCRAMMにおける部位特異的な改変が、高いアフィニティの阻止抗体を生成する抗原を得るために必要であることを示している。
4.5 フィブロネクチン結合タンパク質由来ペプチドおよびエピトープ
組織接着が病原プロセスにおいて極めて重要な役割を果しているので、細菌接着が、感染の予防および治療に対する新しい戦略における目標として認められている。本発明は、従来の宿主の防御機構を助け、組織の接着を阻止するためのワクチン開発および抗体産生において、アドヘジン、特にMSCRAMMの使用が可能であること明らかにする。
4.5.1 エピトープのコア配列
本発明はまた、全細胞および他のペプチドを含まないタンパク質またはペプチドの組成物に関する。この組成物は、本発明の1つ以上の抗体と免疫学的に交差反応し得るエピトープを取り込んでいる精製されたタンパク質またはペプチドを含む。
本明細書中で使用される用語「1つ以上の抗FnBP抗体と免疫学的に交差反応し得るエピトープを取り込んでいる」は、FnBPポリペプチド内に位置するエピトープに類似する一次構造、二次構造または三次構造を含むペプチド抗原またはタンパク質抗原を示すことを意味する。類似性の程度は、一般的には、FnBPポリペプチドに対するモノクローナル抗体またはポリクローナル抗体もまた、交差反応性のペプチド抗原またはタンパク質抗原に結合するか、そうでなければ、そのような抗原を認識するような程度である。様々な免疫アッセイ法が、そのような抗体と一緒に用いられ得る:例えば、ウエスタンブロッティング、ELISA、RIAなど。これらはすべて、当業者に知られている。
ワクチンにおける使用に適切なMSCRAMMエピトープ、特にFn結合エピトープ(sfb、fnbA遺伝子、fnbB遺伝子、fnA遺伝子またはfnB遺伝子の産物および/またはそれらの機能的等価物から得られるエピトープ)の同定は、比較的直接的な事項である。例えば、米国特許第4,554,101号(これは引用により本明細書中に援用される)において教示されるように、Hoppの方法を用いることができる。米国特許第4,554,101号は、親水性に基づく、アミノ酸配列から得られるエピトープの同定および調製を教示する。いくつかの他の論文に記載される方法、およびそれに基づくソフトウエアプログラムもまた、エピトープのコア配列を同定するために使用できる(例えば、Jameson and Wolf、1988年;Wolfら、1988年;米国特許第4,554,101号を参照のこと)。次いで、これらの「エピトープのコア配列」のアミノ酸配列は、ペプチド合成の適用または組換え技術のいずれかによって、ペプチドの内部に容易に取り込むことができる。
本発明に従って使用するのに好ましいペプチドは、一般に、長さが約5個〜約25個のアミノ酸、より好ましくは長さが約8個〜約20個のアミノ酸の大きさである。それよりも短い抗原性のペプチド配列は、特定の環境(例えば、ワクチン調製または免疫学的検出アッセイ)において好都合であると考えられる。代表的な利点として、調製および精製が容易なこと、比較的低コストで再現性が改善された製造、および好都合な生体分布が挙げられる。
本発明の特定の利点が、合成ペプチドを調製することによって実現し得ると考えられる。そのようなペプチドは、修飾および/または伸長したエピトープ/免疫原性コア配列を含み、この配列により、MSCRAMM関連配列、特に、ECM成分のFnと結合するそれらのFnBP領域に対する「普遍的」エピトープペプチドが得られる。これらの領域は、動物におけるT細胞またはB細胞の刺激を促進し、従ってそのような動物における特異的抗体の産生を高めることが最も確実な領域であると考えられる。
本明細書中で使用されるエピトープコア配列は、MSCRAMMエピトープに特異的な抗体の抗原結合部位に「相補的」であり、従ってそれと結合する比較的短い範囲のアミノ酸である。さらにあるいはその代わりに、エピトープコア配列は、本発明のペプチド組成物に対する抗体と交差反応し得る配列である。本発明の開示の文脈において、用語「相補的」は、互いに親和力を示すアミノ酸またはペプチドを示すことが理解される。従って、本発明のいくつかのエピトープコア配列は、所望のタンパク質抗原の結合が、対応するタンパク質に対する抗血清によって競合するか、あるいはおそらくはそのような結合がそのような抗血清と置き換わるそれらの能力によって機能的に定義することができる。
一般に、ポリペプチド抗原の大きさは、同定されたコア配列を1つまたはそれ以上有するのに少なくとも十分である限り、特に重要ではないと考えられる。本発明の開示によって予想される最小のコア配列は、一般に、長さが約5個のアミノ酸の程度である。8個および25個程度の配列がより好ましい。従って、この大きさは、一般に、本発明に従って調製される最小のペプチド抗原に対応する。しかし、抗原の大きさは、基本的なエピトープコア配列が含まれる限り、所望する場合にはより長くすることができる。
エピトープコア配列の同定は、例えば、米国特許第4,554,101号(これは参考によりここに援用される)に記載されているように、当業者には知られている。米国特許第4,554,101号は、親水性に基づいて、アミノ酸配列から得られるエピトープの同定および調製を教示する。さらに、多数のコンピュータープログラムが、タンパク質の抗原性部分を予測する際に使用するために入手できる(例えば、Jameson and Wolf、1988年;Wolfら、1988年を参照のこと)。コンピューター化されたペプチド配列分析プログラム(例えば、DNAStar7ソフトウエア、DNAStar,Inc.、Madison、WI)もまた、合成FnBP、およびFnBP由来エピトープ、ならびに本発明の開示によるエピトープアナログを設計するのに有用であり得る。
本発明によって提供されるペプチドは、様々なブドウ球菌またはブドウ球菌関連の疾患を処置するためのワクチンまたは免疫薬剤としての使用に理想的な目標である。そのような疾患は、特に、Fn結合MSCRAMM遺伝子を含有する種、従ってsfb遺伝子、fnbA遺伝子、fnbB遺伝子、fnA遺伝子またはfnB遺伝子の産物を細胞表面で発現し、次いでECM成分(宿主細胞に対する細菌接着を促進するFnなど)と相互作用する種によって引き起こされる。この点に関して、特定の利点が、エピトープ/免疫原性のコア配列を含む合成ペプチドを調製することによって実現し得る。これらのエピトープコア配列は、ポリペプチドの親水性領域および/または可動領域、あるいはT細胞モチーフを含む配列として同定することができる。そのような領域は、B細胞またはT細胞の刺激を促進する、従って特異抗体の産生を高めることが最も確実であることが当該分野では知られている。細菌の接着を予防する場合、Fnに特異的なMSCRAMM遺伝子産物の相互作用を阻害する抗体を産生するエピトープの調製が特に望ましい。
タンパク質またはペプチドが、開示されたペプチドの1つ以上のエピトープと免疫学的に交差反応し得るか、またはそれらの生物学的な機能等価物であることを確認することもまた、直接的な事項である。これは、例えば、1つの提唱されるエピトープ配列の特異的なアッセイを使用して、あるいは例えば、無作為に作製した合成ペプチドフラグメントまたはタンパク質フラグメントの集団のより一般的なスクリーニングによって容易に決定することができる。スクリーニングアッセイを用いて、等価な抗原または交差反応性抗体のいずれかを同定することができる。いずれの場合においても、原理は同じである:すなわち、結合部位の抗体と抗原との競合に基づく。
用いることができる適切な競合アッセイは、免疫組織学的アッセイ、ELISA、RIA、ウエスタンブロッティングまたはドットブロッティングなどに基づくプロトコルを含む。いずれかの競合アッセイにおいても、結合成分の1つ、一般的に、既知の要素(FnBP由来ペプチドまたは既知の抗体)を、検出可能な標識で標識する。試験成分(これは、一般的には、標識されないままである)を、対応する反応性の抗体または抗原に結合する標識の量を減少させるそれらの能力について試験する。
代表的な実施形態として、MSCRAMMと任意の試験抗原との間の競合研究を行うために、最初にFnBPAを検出可能な標識(例えば、ビオチンあるいは酵素的、放射能的または蛍光性の標識)で標識し、その後の同定を可能にする。次いで、標識した抗原を、様々な比(例えば、1:1、1:10および1:100)で試験される試験抗原と一緒にインキュベーションする。混合した後、次いで、混合物を既知の抗体(例えば、9C3または11A5)に加える。既知の抗体は、好ましくは、例えば、ELISAプレートに結合させるなどによって固定化される。混合物の抗体に対する結合能を、特異的に結合した標識の存在を検出することによって求める。この値を、競合し得る(試験)抗原をインキュベーションにおいて含まない対照の値と比較する。
アッセイは、ハイブリダイゼーションに基づく様々な免疫学的なアッセイのいずれかである。反応性の抗原を、その標識を検出することによって、例えば、ビオチン化された抗原の場合にはストレプトアビジンを使用して、または酵素的な標識と組み合わせて発色性基質を使用することによって、あるいは放射能標識または蛍光標識を単に検出することによって検出する。
任意の試験抗原の非存在下における標識された抗原(例えば、FnBP由来ペプチド)の反応性は、対照の高い値である。対照の低い値は、標識抗原と過剰の非標識FnBP抗原とのインキュベーション(このとき、競合が起こり、結合が減少する)によって得られる。試験抗原の存在下における標識抗原の有意な減少は、「交差反応し得る」、すなわち同じ抗体に対する結合アフィニティを有する試験抗原を示し得る。本発明に関して、「有意な減少」は、結合における再現性のある(すなわち、安定して測定される)減少として定義することができる。
本明細書中に記載されるペプチド性化合物に加えて、本発明はさらに、他の立体的に類似する化合物が、ペプチド構造の中心部分を模倣するように処方され得ることを意図する。そのような化合物(これは、ペプチドミメティックスと呼ぶことができる)は、本発明のペプチドとして同様に使用することができ、従って機能的等価物でもある。構造的かつ機能的な等価物は、当業者に知られているモデリングおよび化学的設計の技術によって作製することができる。そのような立体的に類似する構造体はすべて、本発明の範囲内であることが理解される。
エピトープ配列、またはそれらの配列内の抗原性エピトープを含むペプチドの合成は、固相法などの従来の合成技術を使用して(例えば、Applied Biosystems 430A型ペプチドシンセサイザーなどの市販のペプチド合成機の使用により)容易に行うことができる。このようにして合成されるペプチド抗原は、次いで、所定量に小分けして、通常の方法(例えば、水溶液で、またはさらにより好ましくは、使用するまで粉末または凍結乾燥状態)で保存することができる。
一般に、ペプチドの相対的な安定性のために、ペプチドは、所望すれば、例えば、6ヶ月以上までのかなり長期間、水溶液(事実上、任意の水溶液)で、抗原活性の認められる分解または喪失を伴うことなく、容易に保存することができる。しかし、長い水性保存を意図する場合、一般には、約7.0〜約7.5のpHを維持するために緩衝液(トリス緩衝液またはリン酸緩衝液など)を含む薬剤を含むことが望ましい。さらに、微生物の増殖を阻害する薬剤(アジ化ナトリウムまたはメルチオレート(Merthiolate)など)を含むことは望ましいことであり得る。水性状態での長い保存に関して、溶液を4℃で、またはより好ましくは凍結して保存することが望ましい。もちろん、ペプチドを凍結乾燥状態または粉末状態で保存する場合、ペプチドは、使用前に例えば、所定量の水(好ましくは、蒸留水)または緩衝液で再水和して、その後使用できる計量された量で、実際上、無期限に保存することができる。
4.5.2 ペプチド組成物
本発明の重要な局面には、単離および精製されたSfb、FnBA、FnBB、FnBPAおよびFnBPBに由来するペプチド、これらのエピトープペプチドの修飾物、そのようなペプチドをコードする部位特異的変異誘発核酸セグメントから得られるペプチド、ならびにそのようなペプチド由来抗体を含む新規な組成物が含まれる。当然、1つ以上のMSCRAMMエピトープをコードする核酸セグメントは、本発明の方法および組成物で使用できることが理解される。従って、核酸送達法は、1つ以上のペプチドエピトープをコードするMSCRAMMエピトープコードの核酸セグメントの1つ、2つ、3つ、またはそれ以上の投与を必然的に伴う。投与され得る核酸セグメントの最大数は、実施上の考慮すべき事項(多数の核酸セグメント構築物を同時に調製する際に生じる効果、または有害な細胞毒性効果を高める可能性など)によってのみ限定される。
核酸セグメントの特定の組合せは、1つ以上の種の連鎖球菌またはブドウ球菌から得られる2つ以上の別個の核酸セグメントであり得る。あるいは、それは、Fn結合タンパク質をコードする1つの遺伝子から得られる核酸セグメントは、別の核酸セグメントおよび/または別のペプチドまたはタンパク質(細胞骨格タンパク質など)、コファクターまたは他の生体分子と一緒にされる;ホルモンまたは成長因子の遺伝子さえも、最初の核酸セグメントのポリペプチド産物と相互作用し得る細胞表面受容体の一部またはすべてをコードする核酸セグメントまたは遺伝子と一緒にすることができるようなものであり得る。
複数の核酸セグメントを使用することにおいて、それらは、1つ以上のプロモーターの制御下にある1つの遺伝的構築物において組み合わせることができる。あるいは、それらは、同じタイプまたは異なるタイプの別個の構築物として調製することができる。従って、ほとんど無限の組合せの異なる核酸セグメントおよび遺伝的構築物を用いることができる。核酸セグメントのいくつかの組合せを設計し、あるいはそうでなければ、それらを使用して、Fn結合および/またはそのような核酸セグメントの翻訳から得られるペプチドに対する免疫応答の刺激に関する相乗効果を得ることができる。すべてのそのような組合せは、本発明の範囲内にあることが理解される。実際、多くの相乗効果が科学的な文献に記載されており、その結果、当業者は、核酸セグメントの確からしい相乗的な組合せまたは核酸セグメント−ペプチドの組合せさえも容易に同定するできる。
所望する場合、特定のMSCRAMM由来ペプチドをコードする核酸セグメントまたは遺伝子を、さらなる薬剤(例えば、タンパク質またはポリペプチドまたは様々な薬学的な活性薬剤など)と組み合わせて投与され得ることもまた理解される。組成物が、MSCRAMMポリペプチドのすべてまたは一部をコードする核酸セグメントを含む限り、さらなる薬剤が標的細胞または宿主組織との接触において、有意な有害作用を生じない限り、他の成分を同様に含み得る制限は、事実上存在しない。従って、核酸は、特定の場合に必要とされる様々な他の薬剤と一緒に送達することができる。薬学的に受容可能な賦形剤および担体溶液の処方は、経口、非経口、および/または静脈内の投与および処方において、本明細書中に記載される特定の組成物を使用するための適切な投薬および処置法の開発のように、当業者には広く知られている。
4.5.3 SFB、FNBA、FNBB、FNBPAおよびFNBPB由来エピトープを発現する組換えベクター
本発明の特定の局面により、sfb、FnBA、FnBB、FnBPAおよびFnBPB由来ペプチド、これらのペプチドをコードする核酸セグメント、S.dysgalactiaeのfnbAまたはfnbB由来DNAセグメントを含む組換えベクターおよび形質転換宿主細胞、黄色ブドウ球菌のfnbAまたはfnbB由来DNAセグメントを含む組換えベクターおよび形質転換宿主細胞、ならびに化膿連鎖球菌のsfb由来DNAセグメントを含む組換えベクターおよび形質転換宿主細胞を利用する新規な方法が提供される。当業者には広く知られているように、多くのそのようなベクターおよび宿主細胞は容易に入手することができる。哺乳動物細胞での発現に適切なベクターの1つの特に詳しい例は、米国特許第5,168,050号(これは参考によりここに援用される)に記載されるベクターである。しかし、用いられるコードセグメントが目的のタンパク質またはペプチド(例えば、S.dysgalactiaeから得られるFnBAまたはFnBBのエピトープ配列、黄色ブドウ球菌から得られるFnBPAまたはFnBPBのエピトープ配列、あるいは化膿連鎖球菌から得られるSfbエピトープ配列)をコードし、細胞に悪影響を有するいかなるコードまたは調節配列も含まない限り、高度に精製されたベクターを使用する必要性はない。従って、有用な核酸配列は、コード領域の5’部分または3’部分のいずれかに隣接するさらなる非コード配列などのさらなる残基を含むか、または様々な調節配列を含むこともまた理解される。
適するエピトープをコードする核酸分子を同定した後、それは、当該分野で現在知られている多くのベクターのいずれか1つに挿入することができ、その結果、目的のタンパク質またはペプチドのエピトープ(例えば、S.dysgalactiaeから得られるFnBAまたはFnBBのエピトープ配列、あるいは黄色ブドウ球菌から得られるFnBPAまたはFnBPBのエピトープ配列)の発現および産生が、宿主細胞内に組み込まれたときに行われる。組換え発現ベクターにおいて、DNAセグメントのコード部分はプロモーターの制御下に置かれる。プロモーターは、fnA遺伝子、fnB遺伝子、fnbA遺伝子またはfnbB遺伝子あるいは核酸セグメントと天然において結合しているプロモーターの形態であり得る。これは、本明細書中に開示される組成物に関連して、コードセグメントの上流に位置する5’非コード配列を単離することによって、例えば、組換えクローニングおよび/またはPCRTM技術を使用して得ることができる。米国特許第4,683,195号および同第4,683,202号(これらは参照によりここに取込まれる)のPCRTM技術を使用する核酸の直接的な増幅は、そのような方法論において有用であることが特に意図される。
いくつかの実施形態において、いくつかの利点が、sfb、FnBA、FnBB、FnBPAまたはFnBPBをコードするDNAセグメントを組換えまたは異種のプロモーターの制御下に置くことによって得られることが意図される。本明細書中で使用されるように、組換えまたは異種のプロモーターは、sfb、FnBA、FnBB、FnBPAまたはFnBPBの遺伝子セグメントとその天然の環境下で通常結合していないプロモーターをいうことを意味する。そのようなプロモーターは、MSCRAMMをコードする遺伝子以外と通常結合しているプロモーター、および/または任意の他の細菌、ウイルス、真核生物、または哺乳動物の細胞から単離されたプロモーターを含み得る。当然なこととして、sfb、FnBA、FnBB、FnBPAまたはFnBPBをコードする核酸セグメントを含むベクターを維持する特定の細胞においてDNAセグメントの効率的な発現を行うプロモーターを用いることが重要である。
タンパク質発現を達成するために組換えプロモーターを使用することは、一般に、分子生物学の当業者には知られている。例えば、Sambrookら(1989年)を参照のこと。用いられるプロモーターは、構成的または誘導的であり得る。このようなプロモーターを適切な条件下で使用し、導入したDNAセグメントの高レベルまたは調節された発現を行うことができる。真核生物発現については、現在好ましいプロモーターは、CMV、RSV LTR、SV40プロモーター単独、およびSV40エンハンサーと組み合わせたSV40プロモーターなどのプロモーターである。本発明の核酸セグメントの原核生物発現は、当業者に知られている方法を使用して行うことができ、発現ベクターおよびプロモーター配列(tac、trp、lac、lacUV5またはT7によって提供されるプロモーター配列など)を含み得る。
4.5.4 組換えタンパク質の発現
sfb、fnba、fnbb、fnbPAおよびFnBPB由来核酸セグメントを発現する組換えクローンを使用して、精製されたペプチド抗原ならびに変異型または変異型のタンパク質を著しい量で調製することができる。選択された抗原、およびその変異体は、ブドウ球菌および連鎖球菌の感染の診断および処置において有意義に利用されると考えられる。例えば、これらの抗原、またはペプチド変異体、またはそのような抗原に対する抗体は、ブドウ球菌または連鎖球菌を検出するための免疫アッセイにおいて、あるいはブドウ球菌および/または連鎖球菌の感染を処置するためのワクチンまたは免疫療法剤、およびFnなどのECM成分に対する細菌の接着を防止するためのワクチンまたは免疫療法剤として使用することができる。
本発明のMSCRAMMエピトープに対する抗体(モノクローナル抗体を含む)が本明細書中に記載されているので、これらのペプチド、またはそれらの免疫学的に交差反応し得る変異体を精製するために免疫吸着技術を使用することもまた意図される。この目的に有用な抗体は、本明細書中に開示される技術によって一般に調製することができ、あるいはモノクローナルの調製(例えば、米国特許第4,514,498号および同第4,740,467号を参照のこと)に関して当該分野で一般に知られており、所望のタンパク質またはペプチドと反応し得る抗体が選択されると考えられる。
従って、DNA変異誘発などの技術の適用によって、本発明は、改変または単純化されたタンパク質構造を有する、いわゆる「第2世代」分子の容易な調製を可能にする。第2世代のタンパク質は、典型的には、全長の抗原と同じような特性の1つ以上(特定の抗原/免疫原性のエピトープコア配列)を有する。エピトープ配列は、ペプチドの知識またはコードDNA配列情報から調製される比較的短い分子に提供することができる。そのような変異型分子は、タンパク質構造の選択された免疫原性/抗原性の領域から誘導されるだけでなく、さらにあるいは代わりに、天然の配列に関する類似性または違いにさえ基づいて選択される機能的に等価なアミノ酸の1つ以上を含むことができる。これは、実施例3に記載されるように、Fnに対する細菌の接着を防止する阻止抗体の調製において特に望ましい。
4.5.5 SFB、FNBA、FNBB、FNBPAおよびFNBPB由来MSCRAMMエピトープの発現
MSCRAMM由来エピトープの発現について、1つ以上の適切なクローンが、それらが天然の配列または遺伝的に改変されたかどうかによらず、一旦得られると、MSCRAMM由来エピトープの組換え調製物の発現系を調製することができる。原核生物系または真核生物系での発現に必要なDNAセグメントの操作を、組換え発現の当業者に一般に知られている技術によって行うことができる。実際には、任意の発現系を、MSCRAMM由来MSCRAMMエピトープの発現において用いることができる。
MSCRAMM由来エピトープは、真核生物系において首尾良く発現することができる。しかし、細菌発現系は、すべての目的のために必要なMSCRAMM由来エピトープの調製に好ましくあり得ることもまた考えられる。所望のMSCRAMM由来エピトープ(天然エピトープまたは変異誘発エピトープのいずれか)をコードするDNA配列は、細菌系において別個に発現することができる。コードされたタンパク質は、D−グルコシダーゼ、ユビキチン、日本住血吸虫(Schistosoma japonica)のグルタチンS−トランスフェラーゼ、黄色ブドウ球菌のプロテインAおよびマルトース結合タンパク質などとの融合物として発現される。原核発現系、特に細菌発現系は、最終的には、それによって得られる物質の使用の容易さおよびその質の点で、真核生物発現系を上回る利点を有すると考えられる。
そのようなエピトープをコードするDNAセグメントによる宿主細胞の形質転換は、MSCRAMM由来エピトープペプチドを得るための簡便な方法を提供すると考えられる。ゲノム配列または染色体外の配列は、適する発現ベクター中に存在するとき、コードされたタンパク質の発現を可能にする適切な条件下での真核生物発現に適切である。なぜなら、宿主細胞は、当然、核酸を転写し、機能的なmRNAを産生し、その後タンパク質に翻訳されるからである。
ほとんどの任意の真核生物発現系を利用して、MSCRAMM由来エピトープの発現を行うことができると同様に考えられる。例えば、バキュロウイルスに基づく系、グルタミンシンターゼに基づく系、またはジヒドロ葉酸レダクターゼに基づく系を用いることができる。しかし、好ましい実施形態において、複製起点および効率的な真核生物プロモーターを組み込むプラスミドベクターは、pCMV5などのpCMV系列の真核生物ベクターにより例示されるように、最も有用であることが意図される。
このような発現に関して、コード配列は、プロモーターに隣接して、その制御下に置かれる。コード配列をそのようなプロモーターの制御下に置くために、タンパク質の転写リーディングフレームの転写開始部位の5’末端を、約1ヌクレオチドと約50ヌクレオチドの間で、選択プロモーターの「下流」(すなわち、3’)に置くことが理解される。
真核生物発現を意図する場合、典型的には、MSCRAMM由来エピトープをコードするDNA配列を含む転写ユニットに、適するポリアデニル化部位(例えば、5’−AATAAA−3’)を、最初にクローニングしたセグメント内に含まれていない場合には組み入れることはまた望ましい。典型的には、ポリA付加部位は、タンパク質の停止部位の約30〜2000ヌクレオチド「下流」で、転写終了前の位置に置かれる。
事実上、任意の一般的に用いられる宿主細胞を、本明細書によるMSCRAMM由来エピトープの発現に関連して使用できることが意図される。例として、真核発現に典型的に用いられる細胞株(239、AtT−20、HepG2、VERO、HeLa、CHO、WI 38、BHK、COS−7、RINおよびMDCKの細胞株など)が含まれる。
MSCRAMM由来エピトープペプチドを「過剰発現」させ得ること、すなわち、ヒトの細胞においてその天然の発現と比較して、またはMSCRAMM由来エピトープをコードするDNAセグメントを含有する組換え宿主細胞において他のタンパク質の発現に比較してさえも、増大したレベルで発現させ得ることが意図される。そのような過剰発現は、放射標識および/またはタンパク質精製を含む様々な方法によって評価することができる。しかし、単純で直接的な方法が好ましい。例えば、SDS/PAGEおよびタンパク質染色またはウエスタンブロッティング、その後の定量分析(得られるゲルまたはブロットの密度走査分析など)が含まれる。天然のMSCRAMM由来エピトープを産生する動物細胞でのレベルと比較して、組換えタンパク質またはペプチドのレベルの特異的な増大が、過剰発現である。これは、宿主細胞によって産生された他のタンパク質に関連して特定のタンパク質の相対的な存在量であり、例えば、ゲル上で視認できる。
本明細書中で使用される用語「操作された」細胞または用語「組換え」細胞は、組換え遺伝子(MSCRAMM由来エピトープペプチドをコードする遺伝子など)が導入された細胞をいうことを意味する。従って、操作された細胞は、組換え的に導入された遺伝子を含有しない天然に存在する細胞と区別することができる。従って、操作された細胞は、ヒトの手によって導入された1つ以上の遺伝子を有する細胞である。組換え的に導入された遺伝子は、cDNA遺伝子(すなわち、これはイントロンを含有しない)、ゲノム遺伝子のコピーのいずれかの形態であり、特定の導入遺伝子に天然では結合していないプロモーターに隣接した遺伝子を含む。
一般的には、組換え遺伝子として、cDNA体の遺伝子を用いることはより便利であり得る。cDNA体の使用は、遺伝子の大きさが、cDNA遺伝子よりも典型的には一桁までも大きいゲノム遺伝子よりも、一般に、かなり小さく、標的細胞をトランスフェクションするためにより容易に用いられる点で好都合であると考えられる。しかし、本発明者らは、所望する場合には、特定の遺伝子のゲノム体を用いる可能性を除外しない。
1つ以上の外来遺伝子の組換え体の導入が必要な場合、それが、操作のために選択された細胞タイプにおいて遺伝子を効率的に発現するプロモーターの制御下に存在するように、遺伝子を導入することが重要である。一般に、目的遺伝子の構成的な(定常的な)発現を可能にするプロモーターを用いることが所望される。一般に使用される構成的なプロモーターは、一般には、ウイルス起源であり、サイトメガロウイルス(CMV)プロモーター、Rous肉腫のロングターミナルリピート(LTR)配列、およびSV40初期遺伝子プロモーターが含まれる。これらの構成的なプロモーターの使用は、導入された遺伝子の高い一定したレベルの発現を確実にする。本発明者らは、目的の導入遺伝子から得られる発現レベルは、おそらくは染色体DNA内の組換え遺伝子の挿入部位の結果として、クローンによって変化し得ることに気付いた。従って、特定の組換え遺伝子の発現レベルは、各トランスフェクション実験から得られる異なるクローンを評価することによって選択することができる;そのレベルを一旦選択すると、構成的プロモーターは、発現の所望レベルを恒久的に確実に維持する。操作するために使用される細胞タイプに特異的なプロモーター(インスリノーマ細胞株におけるインスリンプロモーター、あるいは下垂体前葉細胞株におけるプロラクチンまたは成長ホルモンのプロモーターなど)を使用することもまた可能である。
4.5.6 DNAセグメント
他の実施形態において、いくつかの利点が、コードDNAセグメントを、組換えまたは異種のプロモーターの制御下に置くことによって得られることが意図される。本明細書中で使用されるように、組換えまたは異種のプロモーターは、MSCRAMM由来ペプチドをコードするDNAセグメントと天然の環境下で通常結合していないプロモーターをいうことを意図する。そのようなプロモーターは、他の遺伝子と通常結合しているプロモーター、および/または任意のウイルス、原核細胞(例えば、細菌)、真核生物(例えば、真菌、酵母、植物または動物)の細胞から単離されたプロモーターを含み、特に哺乳動物細胞のプロモーターを含む。当然、発現のために選択される細胞タイプ、生物、または動物にさえおけるDNAセグメントの効率的な発現を行うプロモーターを用いることは重要である。タンパク質発現のためにプロモーターおよび細胞タイプの組合せを使用することは、分子生物学の当業者に一般に知られている。例えば、Sambrookら、1989年を参照のこと。用いられるプロモーターは、構成的または誘導的であり得るし、導入されたDNAセグメントの高レベルの発現を行うために適する条件下で、組換えタンパク質またはペプチドの大規模な産生に好都合であるような条件下で使用することができる。高レベルの発現において使用することが意図される適するプロモーター/発現系は、ピキア(Pichia)発現ベクター系(Pharmacia LKB Biotechnology)、昆虫細胞における発現用のバキュロウイルス系、あるいは任意の適切な酵母または細菌の発現系であるが、これらに限定されない。
MSCRAMMコード配列に特異的にハイブリダイズするプローブとして使用され得る核酸セグメントの能力は、それによって、所定のサンプルにおける相補的な配列の存在の検出に使用することを可能にすることである。しかし、他の遺伝的構築物を調製する際に使用されるプライマーまたは変異種プライマーを調製するための配列情報の使用を含む他の使用が考えられる。
本明細書中に開示されるDNA配列と同一であるか、またはそれに相補的な約14ヌクレオチド、約15ヌクレオチド、約16ヌクレオチド、約17ヌクレオチド、約18ヌクレオチド、約19ヌクレオチド、約20ヌクレオチド、約21ヌクレオチド、約22ヌクレオチド、約23ヌクレオチド、約24ヌクレオチド、約25ヌクレオチド、約26ヌクレオチド、約27ヌクレオチド、約28ヌクレオチド、約29ヌクレオチド、約30ヌクレオチド、約31ヌクレオチド、約32ヌクレオチド、約33ヌクレオチド、約34ヌクレオチド、約35ヌクレオチド、約36ヌクレオチド、約37ヌクレオチド、約38ヌクレオチド、約39ヌクレオチド、約40ヌクレオチド、約41ヌクレオチド、約42ヌクレオチド、約43ヌクレオチド、約44ヌクレオチド、約45ヌクレオチド、約48ヌクレオチド、約50ヌクレオチド、約51ヌクレオチド、約54ヌクレオチド、約57ヌクレオチド、約60ヌクレオチド、約63ヌクレオチド、約66ヌクレオチド、約69ヌクレオチド、約72ヌクレオチド、約75ヌクレオチド、約90ヌクレオチド、またはさらには約100ヌクレオチドから約200ヌクレオチドなどの連続したヌクレオチド部分からなる配列領域を有する核酸分子は、例えば、サザンブロッティングおよびノーザンブロッティングでの使用に必要なハイブリダイゼーションプローブとして特に意図される。それよりも小さいフラグメントが、ハイブリダイゼーション実施形態で使用される。この場合、連続した相補的な領域の長さは、例えば、約10ヌクレオチドと約14ヌクレオチド、またはさらには約25ヌクレオチド、約50ヌクレオチドまたは約100ヌクレオチドまでの間で変化し得るが、より大きな連続した相補的な部分を、検出したい相補的な配列の長さに従って使用することができる。
約14ヌクレオチドの長さのハイブリダイゼーションプローブの使用は、安定であり、かつ選択的な二重鎖分子の形成を可能にする。14塩基を超える長さの領域の連続した相補的な配列を有する分子が、一般に好ましいが、ハイブリッドの安定性および選択性を増大させるために、それによって、そのような分子は、得られる特異的なハイブリッド分子の質および程度を改善する。一般に、約15個〜約25個の連続したヌクレオチド、所望する場合にはさらにより長い遺伝子−相補的領域を有する核酸分子を設計することが好ましい。
当然なことには、フラグメントはまた、機械的な剪断、または制限酵素消化などによる他の技術によって得ることができる。小さい核酸セグメントまたは5個のフラグメントは、例えば、自動化されたオリゴヌクレオチド合成機を使用して広く行われているような化学的な手段にフラグメントを直接合成することによって容易に調製することができる。フラグメントはまた、PCRTM(米国特許第4,683,202号および同第4,683,195号で例示される)などの核酸の再産生技術の適用によって、選択された配列を組換え産生用の組換えベクターに導入することによって、および分子生物学の当業者に一般に知られている他の組換えDNA技術によって得ることができる。
従って、本発明のヌクレオチド配列は、DNAフラグメントの相補的な領域を有する二重鎖を選択的に形成するそれらの能力のために使用することができる。考えられる適用に依存して、標的配列に対するプローブの様々な程度の選択性を得るために様々なハイブリダイゼーション条件を用いることが望ましい。高い選択性を必要とする適用に関して、典型的には、比較的ストリンジェントな条件を用いてハイブリッドを形成させることが望ましい。例えば、約0.02M〜約0.15MのNaClで、約50℃〜約70℃の温度によって提供されるなどの比較的低い塩および/または高温の条件が選択される。そのような選択的な条件は、プローブとテンプレートまたは標的鎖とのミスマッチが存在するとしても、そのようなミスマッチはほとんど許容されず、MSCRAMMをコードするDNAセグメントの単離に特に適切である。ハイブリダイゼーションによってDNAセグメントを検出することは、当業者によく知られている。米国特許第4,965,188号および同第5,176,995号(これらはそれぞれ、参照によりここに取込まれる)の開示は、ハイブリダイゼーション分析法を例示する。Maloyら、1994年;Segal、1976年;Prokop、1991年;およびKuby、1994年の書籍において見出される教示は特に関連する。これらは、分子生物学的方法、ハイブリダイゼーションおよび指示される酵素消化、プラスミド構築、DNAおよびRNAの配列決定、変異体構築、および分析、ならびに他の関連する方法に対する詳細な方法およびプロトコルを提供する。
もちろん、いくつかの適用に関して、例えば、存在するテンプレートにハイブリダイズする変異プライマー鎖を用いる変異体を調製することが望ましい場合、あるいはMSCRAMMをコードする配列を、関連する種または機能的等価物などから単離しようとする場合、あまりストリンジェントでないハイブリダイゼーション条件が、ヘテロ二重鎖の形成を可能にするために典型的に必要される。このような環境において、約0.15M〜約0.9Mの塩、約20℃〜約55℃の温度などの条件を用いることが望ましいことであり得る。従って、交差ハイブリダイズする種を、対照のハイブリダイゼーションに関して、ハイブリダイズする陽性シグナルとして容易に同定することができる。いずれの場合においても、条件は、ハイブリッド二重鎖を高温と同じような様式で不安定化するように作用するホルムアミドの添加量を増大させることによって、よりストリンジェントになり得ることが一般に理解される。このように、ハイブリダイゼーション条件は容易に操作することができる。従って、ハイブリダイゼーション条件は、一般には、所望の結果に依存して選択される。
いくつかの実施形態において、本発明の核酸配列を、ハイブリダイゼーションを測定するために適する手段(標識など)と組み合わせて用いることが好都合である。広範囲の様々な適する指示手段が当該分野では知られており、これには、蛍光、放射能、酵素または他のリガンド(アビジン/ビオチンなど)が含まれ、これらによって検出可能なシグナルを得ることができる。好ましい実施形態において、蛍光標識または酵素標識(ウレアーゼ、アルカリホスファターゼまたはペルオキシダーゼなど)を、放射能または他の環境に望ましくない試薬の代わりに用いることが非常に望ましい。酵素標識の場合、発色性の指示基質が知られており、これを用いて、肉眼または分光光度計的に認められる手段が提供され、相補的な核酸を含有するサンプルとの特異的なハイブリダイゼーションを同定することができる。
一般に、本明細書中に記載されるハイブリダイゼーションプローブは、溶液でのハイブリダイゼーションおよび固相を用いる実施形態の両方における試薬として有用であることが考えられる。固相が関与する実施形態において、試験DNA(またはRNA)は吸着するか、そうでない場合には、選択されたマトリクスまたは表面に添加される。この固定された単鎖の核酸は、次いで、選択されたプローブを用いて所望の条件下で特異的なハイブリダイゼーションに付される。選択される条件は、(例えば、G+C含有量、標的核酸のタイプ、核酸の起源、ハイブリダイゼーションプローブの大きさなどに依存して)必要とされる特定の基準に基づく特定の環境に依存する。ハイブリダイズした表面を洗浄して、非特異的に結合したプローブ分子を除くようにした後、特異的なハイブリダイゼーションの検出、または標識レベルによる定量化さえも行われる。
4.5.7 核酸配列の使用方法
上記のように、いくつかの面において、本開示によって提供されるDNA配列情報によって、ブドウ球菌(化膿連鎖球菌およびS.dysgalactiaeなど)から得られるsfb遺伝子、fnbA遺伝子またはfnbB遺伝子、あるいは黄色ブドウ球菌から得られるfnbA遺伝子またはfnbB遺伝子の部分をコードする核酸配列、特に、本発明者らによってFnと結合することが示されたA1〜A3およびD1〜D4の結合部位の上流に、それぞれ、位置するAuエピトープおよびDuエピトープを含む核酸配列に特異的にハイブリダイズする能力を有する比較的短いDNA(またはRNA)配列を調製することができる。これらの局面において、適する長さの核酸プローブが、使用される特定のDNAセグメントの天然配列および大きさを考慮することに基づいて調製される。そのようなDNAセグメントは、天然のSfb、FnBA、FnBB、FnBPA、またはFnBPBのエピトープのDNAセグメントであり、あるいは本明細書中に開示される新規なペプチドのいずれかを作製するために部位特異的な変異が行われたDNAセグメントであり得る。そのような核酸プローブが、対応するsfb、fnA、fnB、fnbA、またはfnbBの核酸配列、特に、S.dysgalactiaeのfnAのAu部位およびA1〜A3部位、または黄色ブドウ球菌遺伝子のDU部位およびD1〜D4部位の核酸配列に特異的にハイブリダイズする能力によって、それらは様々な実施形態において特異的に利用される。重要なことに、プローブは、所定のサンプルにおける病原性生物(特に、連鎖球菌およびブドウ球菌)の存在を検出するための様々な診断アッセイにおいて使用することができる。しかし、他の使用が考えられ、これには、タンパク質産物の発現、他の遺伝的構築物を調製する際に使用される1つ以上の変異種プライマーを調製するための配列情報の使用が含まれる。そのようなプライマーはまた、関連する細菌(特に、関連する連鎖球菌およびブドウ球菌)から得られるエピトープをコードする核酸セグメントの単離および同定に必要な診断組成物として使用することができる。
本発明によるいくつかの利点を得るために、ハイブリダイゼーション研究またはアッセイのために用いられる好ましい核酸配列は、少なくとも約14または15〜約20程度のヌクレオチドの長さを有するか、またはそれに相補的である配列を含む。しかし、約30〜約50程度のヌクレオチドの配列もまた有用であると考えられる。長さが少なくとも14〜15または20ヌクレオチドの大きさは、そのフラグメントが、安定かつ選択的な二重鎖分子の形成に十分な長さであることを確実にし得る。長さが14〜15または20塩基を超える領域の相補的な配列を有する分子が、ハイブリッドの安定性および選択性を増大させるために、そしてそれによって、得られた特異的なハイブリッド分子の質および程度を改善するために一般には好ましい。このように、sfb遺伝子、fnA遺伝子、fnB遺伝子、fnbA遺伝子、またはfnbB遺伝子に相補的な部分の14〜15から20〜25までのヌクレオチド、またはさらにはそれよりも長いヌクレオチド(約30ヌクレオチド、または約50ヌクレオチド、または約100ヌクレオチド、または所望する場合には、約200ヌクレオチドでさえ)を有する核酸分子を設計することが一般に好ましい。そのようなフラグメントは、例えば、フラグメントを化学的な手段によって直接合成することによって、米国特許第4,683,202号のPCRTMなどの核酸再産生技術の適用によって、組換え産生用の組換えベクターに導入することによって、容易に調製することができる。
本発明者らは、そのようなDNAセグメントが、本明細書中に記載されるSfb、FnBA、FnBB、FnBPAおよびFnBPB由来ペプチドエピトープの過剰発現、および特定のエピトープ領域(化膿連鎖球菌のsfb遺伝子から得られるP1〜P4領域;fnAをコードするS.dysgalactiaeのFn結合タンパク質から得られるAU領域およびA1〜A3領域、黄色ブドウ球菌のfnbA遺伝子のDUエピトープ領域およびD1〜D4エピトープ領域、ならびに黄色ブドウ球菌のfnbB遺伝子から得られるB1〜B3領域)を含む天然および部位特異的変異誘発のDNAセグメントを含有する組換えベクターの調製において利用されることをさらに意図する。
MSCRAMMタンパク質が多くの連鎖球菌およびブドウ球菌の病原体(黄色ブドウ球菌、化膿連鎖球菌、およびS.dysgalactiaeを含む)によって発現している点で、本発明は、臨床サンプルにおけるsfb、fnA、fnB、fnbA、およびfnbBに特異的なRNAまたはDNAを検出するための診断的ハイブリダイゼーションアッセイの基礎として特に利用される。従って、感染の診断において使用することができる代表的な臨床サンプルは、細菌の核酸を含み得る任意のサンプルであり、中耳液、唾液、気管支肺胞液などが含まれる。そのようなサンプルは、起源がヒト、マウス、ウマ、ウシ、ネコ、ブタ、またはイヌであり得るし、ヒトおよび様々な被験体の両方でのブドウ球菌または連鎖球菌の感染の診断において使用することができる。様々なハイブリダイゼーション技術および系が知られており、これらは、米国特許第4,358,535号(これは参照によりここに取込まれる)に記載されているアッセイなどの診断アッセイを含む、本発明のハイブリダイゼーション局面に関連して使用することができる。家畜などの経済的に重要な動物、特に連鎖球菌またはブドウ球菌の感染に敏感な動物を含む非ヒトの哺乳動物起源、から得られるサンプルはまた、臨床的標本の基準を提供し得る。本発明の面において特定の診断方法および処置方法が見出されるような診断の例には、ウシの乳房炎が含まれ、あるいはウマの腺疫、肺炎、子宮内膜炎、および流産などの疾患および症状が含まれる。
従って、本発明のヌクレオチド配列は、MSCRAMMエピトープをコードする核酸セグメントの相補的な領域と二重鎖分子を選択的に形成するそれらの能力のために重要である。考えられる適用に依存して、標的配列に対するプローブの様々な程度の選択性を得るために様々なハイブリダイゼーション条件を用いることが望ましい。高い選択性を必要とする適用に関して、典型的には、比較的ストリンジェントな条件を用いてハイブリッドを形成させることが望ましい。例えば、約0.02M〜約0.15MのNaClで、約50℃〜約70℃の温度によって提供されるなどの比較的低い塩および/または高温の条件が選択される。このような条件は、特に選択的であり、プローブとテンプレートまたは標的鎖とのミスマッチが存在しても、そのようなミスマッチはほとんど許容されない。
もちろん、いくつかの適用に関して、例えば、存在するテンプレートにハイブリダイズする変異プライマー鎖を用いる変異体を調製することが望ましい場合、あまりストリンジェントでないハイブリダイゼーション条件が、ヘテロ二重鎖の形成を可能にするためには必要とされる。このような環境において、約0.15M〜約0.9Mの塩、約20℃〜約55℃の温度などの条件が使用される。いずれの場合においても、条件は、ハイブリッド二重鎖を高温と同じような様式で不安定化するように作用するホルムアミドの添加量を増大させることによって、よりストリンジェントになり得ることが、一般に理解される。このように、ハイブリダイゼーション条件は容易に操作することができる。従って、ハイブリダイゼーション条件は、一般には、所望の結果に依存して選択される方法である。
ある実施形態において、核酸プローブを、変異MSCRAMMをコードするクローンを含有するクローン集団から変異体を単離することに用いることが望ましい。ある特定の実施形態において、固体培地で増殖するMSCRAMMをコードする遺伝子の変異体を含有する変異クローンのコロニーは、配列変異体を含有するプローブと特定のコロニーに含有される核酸配列変異体との間のハイブリダイゼーションのみを得るようなハイブリダイゼーション条件および方法(コロニーブロットアッセイで使用される条件および方法など)を使用する2連のフィルターで同定することができる。このように、これらの遺伝子の短い変異配列を含有する小さなハイブリダイゼーションプローブを利用して、固体培地で増殖する完全な遺伝子の配列変異を含有するコロニーを同定することができる。次いで、これらのクローンを増殖させ、所望量の変異核酸配列または対応する抗原を得ることができる。
臨床診断実施形態において、本発明の核酸配列は、ハイブリダイゼーションを検出するために適する手段(標識など)と組み合わせられる。広範囲の様々な適する指示手段が当該分野では知られており、これには、放射能、酵素または他のリガンド(アビジン/ビオチンなど)が含まれ、これらによって検出可能なシグナルを得ることができる。好ましい実施形態において、酵素標識(ウレアーゼ、アルカリホスファターゼまたはペルオキシダーゼなど)を、放射能または他の環境に望ましくない試薬の代わりに用いることが非常に望ましい。酵素標識の場合、発色性の指示基質が知られており、これを用いて、肉眼または分光光度計的に認められる手段が提供され、病原体の核酸を含有するサンプルとの特異的なハイブリダイゼーションを同定することができる。
他の実施形態において、MSCRAMM由来DNA配列、あるいはその天然または合成の変異体を使用して、ポリメラーゼ連鎖反応(PCRTM)アッセイにおける試薬として使用する場合、連鎖球菌単離物またはブドウ球菌単離物の高い選択的で高感度の検出が得られると考えられる。一般に、例えば、米国特許第4.683.202号に示されるようなPCRTM技術を適用することによって、本明細書中に開示される核酸配列を、特にMSCRAMMをコードする遺伝子の定義される領域、特に、サンプル中のFnBPコードの核酸セグメントのPCRTM増幅を行うためのオリゴヌクレオチドプローブとして利用することができる。次いで、配列の増幅部分を、相補的な配列を含有するハイブリダイゼーションプローブによるハイブリダイゼーションによって検出することができる。このように、かなり低い濃度の核酸を、サンプルにおいて、開示された核酸配列を利用して検出することができる。
4.5.8 核酸送達およびDNAトランスフェクションの方法
いくつかの実施形態において、本明細書中に開示される核酸セグメントを使用して、適する宿主細胞をトランスフェクションすることが意図される。DNAを細胞内に導入するための技術は、当業者にはよく知られている。核酸セグメントを細胞に送達するための4つの一般的な方法を記載する:(1)化学的方法(Graham and Van Der Eb、1973年);(2)マイクロインジェクション(Capecchi、1980年)、エレクトロポレーション(Wong and Neumann、1982;Frommら、1985年)および遺伝子銃(Yangら、1990年)などの物理的方法;(3)ウイルスベクター(Luら、1993年;Eglitis and Anders、1988年);および(4)受容体媒介機構(Curielら、1991年;Wagnerら、1992年)。
4.5.9 リポソームおよびナノカプセル
いくつかの実施形態において、本発明者らは、リポソームおよび/またはナノカプセルを使用して、特定のペプチドまたは核酸セグメントを宿主細胞に導入することを意図する。そのような処方物は、本明細書中に開示される核酸、ペプチド、および/または抗体の薬学的に受容可能な処方物の導入に好ましくあり得る。リポソームの処方および使用は、当業者に一般的に知られている(例えば、Couvreurら、1977年を参照のこと:これは、細胞内細菌感染および疾患の標的化抗生物療法におけるリポソームおよびナノカプセルの使用を記載する)。最近、血清安定性および循環半減期が改善されたリポソームが開発された(Gabizon and Papahadjopoulos、1988年;Allen and Choun、1987)。
ナノカプセルは、一般に、化合物を安定で再現性のある方法で包むことができる(Henry−Michellandら、1987年)。細胞内ポリマー過大負荷による副作用を避けるために、そのような極微細粒子(約0.1μmの大きさ)を、インビボで分解し得るポリマーを使用して設計しなければならない。これらの条件を満たす生分解性ポリアルキル−シアノアクリレートのナノ粒子は、本発明における使用が意図される。そのような粒子は、記載(Couvreurら、1977年;1988年)に従って容易に作成することができる。
リポソームは、水性媒体に分散され、自発的に多重膜の同心状二重層ベシクル(多重膜ベシクル(MLV)とも呼ばれる)を形成するリン脂質から形成される。MLVは、一般に、25nm〜4μmの直径を有する。MLVの超音波処理によって、水溶液をコアに含有する200〜500Cの範囲の直径を有する小さな単膜ベシクル(SUV)を生成する。
Couvreurら(1988年)の教示に加えて、下記の情報を、リポソーム処方物を作製する際に利用することができる。リン脂質は、脂質対水のモル比に依存して、水中に分散されたときのリポソーム以外の様々な構造を形成し得る。低い比において、リポソームは好ましい構造である。リポソームの物理的特性は、pH、イオン強度、および2価イオンの存在に依存する。リポソームはまた、イオン性基質および極性基質に対する低い透過性を示し得るが、温度を上げると、その透過性が著しく変化する相転位が生じる。相転位は、十分に詰まった秩序性構造(ゲル状態として知られている)からゆるく詰まった秩序性がなくなった構造(流動状態として知られている)への変化を伴う。これは特徴的な相転位温度で生じ、その結果、イオン、糖、および薬剤に対する透過性が増大する。
リポソームは、4つの異なる機構を介して細胞と相互作用する。細網内皮細胞系の食作用細胞(マクロファージおよび好中球など)によるエンドサイトーシス;非特異的な弱い疎水結合または静電力によるか、または細胞表面成分との特異的な相互作用によるかのいずれかによる細胞表面への吸着;リポソーム内容物の細胞質内への放出を伴うリポソーム脂質二重層のプラスマ膜への挿入によるプラスマ細胞膜との融合;およびリポソーム内容物の解離を伴わない、リポソーム脂質の細胞膜または細胞間膜への移動あるいはその逆による。多くの場合、どの機構が作用しているか、そして1つ以上の機構が同時に作用し得るかを決定することは困難である。
4.5.10 組換え宿主細胞およびベクター
本発明の特定の局面は、組換えペプチド、および天然または部位特異的変異処理のいずれかのMSCRAMMエピトープを取り込んでいる特定のペプチドのクローニングおよび発現を行うためのプラスミドベクターの使用に関する。組換えベクターの作製、宿主細胞の形質転換、および組換えタンパク質の発現は、当業者によく知られている。原核生物宿主は本発明のペプチド組成物の発現に好ましい。原核生物宿主のいくつかの例は、大腸菌のJM101株、XL1−Blue株、RR1株、LE392株、B株、X1776株(ATCC番号第31537号)およびW3110株(F−、λ−、原栄養性、ATCC番号第273325号)である。腸内細菌科の種(Salmonella typhimuriumおよびSerratia marcescensなど)およびグラム陰性の宿主(様々なPsuedomonas属の種など)もまた、本明細書中に開示される遺伝的構築物の組換え発現に利用することができる。
あるいは、グラム陽性の球菌(黄色ブドウ球菌、化膿連鎖球菌、S.dysgalactiae、S.epidermidis、S.zooepidemicus、S.xylosus、およびS.homiusなど)および桿菌(Bacillus subtilisなど)はまた、このような構築物の発現およびそれから得られる天然ペプチドまたは組換えペプチドの単離のために使用することができる。
一般に、宿主細胞と適合し得る種から得られるレプリコンおよび制御配列を含有するプラスミドベクターが、これらの宿主に関連して使用される。ベクターは、通常、複製部位、ならびに形質転換細胞における表現型選択を提供し得るマーカー配列を有する。例えば、大腸菌は、典型的に、pBR322またはその任意の誘導体(Bolivarら、1977年)などのベクターを使用して形質転換することができる。pBR322は、アンピシリン耐性およびテトラサイクリン耐性の遺伝子を含有し、従って、形質転換細胞を同定するための容易な手段を提供する。pBR322、その誘導体、または他の微生物プラスミド、あるいはバクテリオファージはまた、内在性タンパク質の発現のために微生物が使用し得るプロモーターを含有し得るか、または含有するように改変することができる。
さらに、宿主微生物と適合し得るレプリコンおよび制御配列を含有するファージベクターを、これらの宿主に関連して形質転換ベクターとして使用することができる。例えば、λGEMTM−11などのバクテリファージは、大腸菌 LE392などの感受性の宿主細胞形質転換するために使用され得る組換えベクターを作製する際に利用することができる。
組換えDNA構築物において一般的に使用されるそのようなプロモーターは、β−ラクタマーゼ(ペニシリナーゼ)およびラクトースのプロモーター系(Changら、1978年;Itakuraら、1977年;Goeddelら、1979年)またはトリプトファン(trp)プロモーター系(Goeddelら、1980年)を含む。組換えおよび天然のプロモーターの使用は、当業者によく知られている。それらのヌクレオチド配列および具体的な方法論に関する詳細は公開されており、当業者は、本発明の組成物を製造するために特定の組換えベクターおよび発現系を構築することは可能である。
原核生物における好ましい実施形態の発現に加えて、真核生物(酵母培養物など)はまた、本明細書中に開示される方法を関連して使用することができる。ビール酵母菌または一般的なパン酵母は、真核微生物の中で最も一般的に使用される。しかし、多数の他の種もまた、そのような真核生物発現系のために用いることができる。酵母菌属での発現に関して、例えば、プラスミドYRp7が一般的に使用される(Stinchcombら、1979;Kingsmanら、1979年;Tschemperら、1980年)。このプラスミドは、既に、トリプトファン存在下での生育能力を欠失している変異株(例えば、ATCC第44076号またはPEP4−1(Jones、1977年))に対する選択マーカーを提供するtrpL遺伝子を含有する。次いで、酵母宿主細胞ゲノムの特性としてのtrpL損傷の存在は、トリプトファン非存在下での生育による形質転換を検出するために効果的な環境を提供する。
酵母ベクターにおける適切なプロモーター配列は、3−ホスホグリセロリン酸キナーゼのプロモーター(Hitzemanら、1980年)、またはエノラーゼ、グリセロアルデヒド−3−リン酸デヒドロゲナーゼ、ヘキソキナーゼ、ピルビン酸デカルボキシラーゼ、ホスホフルクトキナーゼ、グルコース−6−リン酸イソメラーゼ、3−ホスホグリセリン酸ムターゼ、ピルビン酸キナーゼ、トリオースリン酸イソメラーゼ、ホスホグルコースイソメラーゼおよびグルコキナーゼなどの他の糖分解酵素のプロモーター(Hessら、1968年;Hollandら、1978年)を含む。適切な発現プラスミドを構築する際、これらの遺伝子と結合する終了配列はまた、mRNAのポリアデニル化および終了を提供するために発現することが望ましい配列の発現ベクター3N内に連結される。転写が生育条件によって制御されるというさらなる利点を有する他のプロモーターは、アルコールデヒドロゲナーゼ2,イソチトクロームC、酸性ホスファターゼ、窒素代謝に関連する分解酵素、および上記のグリセロアルデヒド−3−リン酸デヒドロゲナーゼ、ならびにマルトースおよびガラクトースの利用に関与する酵素に対するプロモーターである。酵母適合性プロモーター、複製起点および終了配列を含有する任意のプラスミドベクターは適切である。
微生物に加えて、多細胞生物から得られる細胞の培養物はまた、開示された方法の日常的な実施における宿主として使用することができる。原理的には、そのような細胞培養物はどれも、脊椎動物または無脊椎動物の培養物にかかわらず、使用することができる。しかし、脊椎動物細胞において、最大の利益が得られる。脊椎動物細胞の培養での増殖(組織培養)は、近年、日常的な手順になっている。そのような有用な宿主細胞株の例は、VERO細胞、HeLa細胞、チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞株、ならびにW138細胞株、BHK細胞株、COS−7細胞株、293細胞株、およびMDCK細胞株である。そのような細胞に対する発現ベクターは、通常、(必要ならば)、複製起点、発現され得る遺伝子の前方に位置するプロモーターを、任意の必要なリボソーム結合部位、RNAスプライス部位、ポリアデニル化部位、および転写終了配列と一緒に含む。
哺乳動物細胞における使用に関して、発現ベクターの制御機能は、多くの場合、ウイルス物質によって提供される。例えば、一般的に使用されるプロモーターは、ポリオーマ、アデノウイルス2、および最も頻繁にはシミアンウイルス40(SV40)から誘導される。SV40ウイルスの初期プロモーターおよび後期プロモーターは特に有用である。なぜなら、その両方は、ウイルスから、SV40ウイルスの複製起点をもまた含有するフラグメントとして容易に得られるからである(Fiersら、1978年)。より小さなSV40フラグメントまたはより大きなSV40フラグメントはまた、ウイルスの複製起点内に位置するHindIII部位からBglI部位に向かって拡がる約250bpの配列を含むならば、使用することができる。さらに、所望の遺伝子配列と通常結合するプロモーターまたは制御配列を利用することもまた、そのような制御配列が宿主細胞系と適合し得るならば、可能であり、多くの場合、望ましい。
複製起点は、下記のいずれかのようにして、外来性の起点を含むようにベクターを構築して例えば、SV40または他のウイルス(例えば、ポリオーマ、アデノ、VSV、BPV)源から誘導し、または宿主細胞の染色体複製機構により得られる。ベクターが宿主細胞の染色体内に組み込まれるならば、後者は、多くの場合、十分である。
4.5.11 pQETM
pQETM(Qiagen Inc.、Catsworth、CA)は、10個〜25個の長さのアミノ酸担体が、6個の連続したヒスチジン残基を含有する融合タンパク質を産生する。このHis6配列は、イミノ二酢酸で誘導体化され、Ni+イオンでキレート化されたセファロース6B Fast Flowカラムでの迅速な精製を可能にする。本発明者らは、この系が、本発明のペプチド組成物を調製するための非常に有効な発現系であり、1Lの大腸菌培養物あたり50mgまでの純粋な組換えタンパク質が得られることを明らかにした。組換えpFnBDプラスミドを有する大腸菌 XL−1 Blue(Stratagen)の一晩培養物を、50mg/mLのアンピシリンを含有する1LのLuria Broth(Gibco BRL)で1:50に希釈する。大腸菌細胞を、培養物のOD600が0.5〜0.8に達するまで生育させる。次いで、rFnBDタンパク質の発現を、IPTGを最終濃度が0.2mMになるように添加することによって誘導する。3時間の誘導の後、細胞を遠心分離によって集め、15mLの緩衝液A(5mMイミダゾール、0.5M Nacl、20mM Tris−HCl、pH7.9)に再懸濁し、20,000lb/in2で2回フレンチプレスに通すことによって溶解する。細胞破片を50,000×gで10分間遠心分離することによって除き、上清を0.45μMのフィルターに通す。組換えタンパク質を、Ni2+を負荷したイミノ二酢酸/セファロース6B(Sigma、St.Louis、MO)カラムを使用する固定化金属キレートクロマトグラフィーによって精製する(Porathら、1975年;Hochuliら、1988年)。rFnBD−AまたはrFnBD−BおよびrFnBD−DまたはrFnBD−Pを産生する細胞から得られる上清を、それぞれ、1.5mLおよび0.7mLを負荷した樹脂と混合する。予備実験により、これらの量の樹脂は、上清中の組換えタンパク質の濃度に最適であることが明らかにされた。混合物を15分間振盪しながらインキュベーションする。結合したタンパク質を有する樹脂を遠心分離(1000×g、5分間)し、10mLの緩衝液Aで2回洗浄し、カラムに移す。引き続いて、カラムを10mL〜20mLの緩衝液Aでさらに洗浄する。タンパク質を、40mMイミダゾールを含む20mM Tris−HCl、0.5M NaCl、pH7.9で溶出する。溶出したタンパク質をPBSに対して透析し、イミダゾールを除く。rFnBDタンパク質のポリヒスチジンリーダーは、本発明者らの実験室で製造された他のポリヒスチジン融合タンパク質と比較した場合、Ni2+−キレートカラムに対して比較的低いアフィニティを有する。過剰量の樹脂を使用すれば、組換えタンパク質には、樹脂に対するアフィニティを有し、10mM〜50mMのイミダゾールで溶出される細胞性タンパク質が混入するようになる。使用する負荷樹脂の能力は、意図的に、上清中に存在するすべての組換えタンパク質を結合するのに必ずしも十分でないようにする。このような手順により、30mgのrFnBD−AおよびrFnBD−B、ならびに15mgのrFnBD−DおよびrFnBD−Pが純粋な物質で得られる。
4.5.12 pGEX
pGEX(Pharmacia,Ltd、Piscataway、NJ)は、担体のグルタチオン−S−トランスフェラーゼによるグルタチン−セファロースカラムの1段階精製を可能にする組換えタンパク質をコードする(Smith and Johnson、1988年)。この系は、ELISA型またはウエスタンブロット型のアッセイにおいて使用されるマイクロタイタープレートまたはニトロセルロースメンブレンに効果的に結合するペプチドの産生に好都合である。これらの場合、より長い担体タンパク質を有する融合タンパク質を生成するpGEX系は、有用な代わりの発現系である。この系の別の利点は、担体のちょうどC末端に導入され、一旦合成された担体タンパク質からタンパク質をはずすことを可能にする選択的なタンパク質切断部位が利用できることである。
4.5.13 pMAL
pMAL(New England Biolabs、Beverly、MA)は、マルトース結合タンパク質との融合タンパク質をコードし、再度ではあるが、これによって、下記の手順による迅速なアフィニティ精製を可能にする。目的の遺伝子を、pMALJ−p2ベクター(New England Biolabs、Beverly、MA)に、malEシグナル配列および(マルトース結合タンパク質(MBP)をコードする)遺伝子の下流に読み枠を合わせてクローン化する。組換えプラスミドを大腸菌に形質転換し、培養して、IPTGを培養培地に添加することによって、MBP融合タンパク質の過剰産生を誘導する。次いで、MBP融合タンパク質を、Riggsら、1992年;Mainaら、1988年の記載に従って精製することができる。担体のために、発現した融合タンパク質は、ジスルフィド結合が生成し得るペリスラズマ空間に輸送される。この系は、FnのI型領域の製造に特に有用であるが、これもまた、本発明の多くのペプチドを調製するために使用することができる。
4.5.14 pBVL
pBVL(PharMingen、San Diego、CA)は、昆虫細胞をトランスフェクションし、真核生物細胞において相当量(1〜3mg/l)の組換えタンパク質を産生するBaculo GoldTM系と連携して使用することができる。この系は、組換え型の宿主−リガンドタンパク質の産生に特に好ましい。
そのように調製される組換えタンパク質は、本発明の様々な実施形態において利用され、免疫アッセイ試薬、感受性動物における免疫応答の生成に必要な抗原調製、ワクチン処方物、および能動的で活性な免疫化法における使用のための抗体産生に必要な基質が含まれる。組換えタンパク質の大規模調製に関しては、下記の手順を使用することができる。発現プラスミドを有する大腸菌 JM109(supE、endA、sbcB15、hsd R4、rpsL、thi)(lac−proAB)(F’traD36 proAB+ lacIqZ)M15)、大腸菌 JM105(supE、thi)(lac−proAB)(F’traD36 proAB+ lacIqZ)M15)、TG1(supE、hsd)5、thi)(lac−proAB)+(F’traD36 proAB lacZ(M15))(Carterら、1985年)、またはXL1−Blue細胞(Stratagene、La Jolla、CA)の一晩飽和培養物を、アンピシリンを補充したLuria Broth(Gibco BRL、Grand Island、NY)で1:50に希釈し、培養物のOD600が0.6〜0.7に達するまで生育させる。イソプロピル−1−チオ−β−D−ガラクトピラノシド(IPTG;Gibco BRL、Grand Island、NY)(最終濃度0.2mM)を細胞に添加し、さらに2.5〜5時間37℃で生育させる。細菌を遠心分離によって集め、細菌ペレットをリン酸緩衝化生理食塩水(PBS;10mMリン酸、0.14M NaCl、pH7.4)で再懸濁する。細胞を、20,000LB/inで2回フレンチプレス(SLM Instrument Inc.、Urbana、IL)に通すことによって溶解する。細菌溶解物を102,000×gで10分間遠心分離して、細菌破片を除く。可溶性タンパク質を含有する上清を、0.45μMメンブレン(Nalgene、Rochester、NY)でろ過して、さらなる精製のために保存する。
4.5.15 スクリーニングアッセイ
形質転換した宿主細胞を、天然および人工的に誘導した化合物または混合物のスクリーニングにおいて使用し、本発明のFnBP類と複合体を形成し得るものを選択することができる。これは、微生物のFn結合能を阻害するか、またはそうでなければ破壊するか、または増強さえする化合物の検索において有用であり得る。効果的な薬学的薬剤が、特定のMSCRAMMエピトープと複合体を形成する化合物を同定することによって開発できることが意図される。そのような化合物には、例えば、天然起源(植物、動物および海洋起源など)から単離される化合物、および様々な合成化合物が含まれる。このように試験され得る天然または人工の化合物はまた、様々な無機質およびタンパク質、ペプチドまたは抗体を含む。
4.5.16 部位特異的変異誘発
部位特異的変異誘発は、個々のペプチドあるいは生物学的な機能等価物のタンパク質またはペプチドの、元になるDNAの特異的な変異誘発による調製における有用な技術である。当業者に十分に知られているこの技術は、例えば、1つ以上のヌクレオチド配列変化をDNAに導入することによって、1つ以上の前記の検討事項を取り入れている配列変異体の調製および試験を容易に行い得ることをさらに提供する。部位特異的変異誘発は、所望の変異、ならびに十分な数の隣接ヌクレオチドのDNA配列をコードする特異的なオリゴヌクレオチド配列の使用による変異体の産生を可能にする。そのようなオリゴヌクレオチド配列は、交差する欠失接合部の両側で安定な二重鎖を形成するのに十分な大きさおよび配列多様性のプライマー配列を提供する。典型的には、長さが約14ヌクレオチド〜約25ヌクレオチドのプライマーが好ましく、接合部の両側での約5残基〜約10残基の配列が変化する。
一般に、部位特異的変異誘発の技術は、様々な出版物により例示されるように、当該分野では十分に知られている。理解されるように、この技術は、典型的には、一本鎖形態および二本鎖形態の両方で存在するファージベクターを用いる。部位特異的変異誘発において有用な典型的なベクターは、M13ファージなどのベクターを含む。これらのファージは市販されている。それらの使用は、一般に、当業者には十分に知られている。二本鎖プラスミドもまた、目的の遺伝子をプラスミドからファージに移す工程を省く部位特異的変異誘発において日常的に用いられる。
一般に、本明細書による部位特異的変異誘発は、最初に、所望のペプチドをコードするDNA配列をその配列内に含む一本鎖ベクターを得ること、またはそのような二本鎖ベクターの2つの鎖を融解して離すことによって行われる。所望の変異配列を有するオリゴヌクレオチドプライマーを、一般的には合成によって調製する。次いで、このプライマーを一本鎖ベクターとアニールし、変異を有する鎖の合成を完全に行うために、大腸菌のポリメラーゼIクレノウフラグメントなどのDNA重合化酵素で処理する。このようにして、ヘテロ二重鎖が得られる。この場合、一方の鎖は、元の非変異配列をコードし、第2鎖は所望の変異を有する。次いで、このヘテロ二重鎖ベクターを使用して、適する細胞(大腸菌細胞など)を形質転換する。変異配列配置を有する組換えベクターを含むクローンを選択する。
選択ペプチドをコードするDNAセグメントの配列変異体の、部位特異的変異誘発を使用する調製は、潜在的に有用な種を産生する手段として提供され、それらが、ペプチドおよびそれをコードするDNA配列の配列変異体を得ることができる他の方法であると限定することを意味しない。例えば、所望のペプチド配列をコードする組換えベクターを変異剤(ヒドロキシルアミンなど)で処理して、配列変異体を得ることができる。このような方法およびプロトコルに関する詳細な説明は、Maloyら、1994年;Segal、1976年;Prokop and Bajai、1991年;Kuby、1994年;およびManiatisら、1982年の教示に見出される。これらのそれぞれは、その目的に関して、参照によりここに取込まれる。
4.5.17 生物学的機能等価物
改変および変化を、本発明のペプチドの構造において、そしてそれらをコードし、所望の特徴を有するタンパク質またはペプチドをコードする機能的な分子を依然として生成するDNAセグメントの構造において行うことができる。以下は、等価物または改善された第2世代の分子さえも作製するために、タンパク質のアミノ酸を変化させることに基づく検討である。アミノ酸の変化は、表1に従って、DNA配列のコドンを変えることによって達成することができる。
例えば、いくつかのアミノ酸は、例えば、抗体の抗原結合領域または基質分子の結合部位などの構造体との相互的な結合能の認められるほどの喪失を伴うことなく、タンパク質において他のアミノ酸に置換することができる。タンパク質の相互作用的な能力および性質は、タンパク質の生物学的な機能活性を規定するため、いくつかのアミノ酸置換をタンパク質配列、および当然、その元となるDNAのコード配列において行うことができ、それにもかかわらず、同様な特性を有するタンパク質を得ることができる。従って、開示された組成物のペプチド配列、またはそのようなペプチドをコードする対応DNA配列において、それらの生物学的な利用性または活性の認められるほどの喪失を伴うことなく、様々な変化を行い得ることが本発明者らによって意図される。
そのような変化を行う際、アミノ酸のハイドロパシー指数が考慮され得る。関する相互作用的な生物学的機能をタンパク質に付与する際のアミノ酸ハイドロパシー指数の重要性は、当該分野では一般に理解されている(Kyte and Doolittle、1982年:これは参照によりここに取込まれる)。相対的アミノ酸ハイドロパシーは、得られるタンパク質の二次構造に寄与することが認められている。タンパク質の二次構造は、次いで、タンパク質と他の分子(例えば、酵素、基質、受容体、DNA、抗体、抗原など)との相互作用を規定する。それぞれのアミノ酸は、下記のような、その疎水性および電荷の特性に基づいてハイドロパシー指数が与えられている(Kyte and Doolittle、1982年)。イソロイシン(+4.5);バリン(+4.2);ロイシン(+3.8);フェニルアラニン(+2.8);システイン/シスチン(+2.5);メチオニン(+1.9);アラニン(+1.8);グリシン(−0.4);トレオニン(−0.7);セリン(−0.8);トリプトファン(−0.9);チロシン(−1.3);プロリン(−1.6);ヒスチジン(−3.2);グルタミン酸(−3.5);グルタミン(−3.5);アスパラギン酸(−3.5);アスパラギン(−3.5);リジン(−3.9);およびアルギニン(−4.5)。
いくつかのアミノ酸は、類似のハイドロパシー指数またはスコアを有するタンパク質のアミノ酸によって置換することができ、その結果、それでも、類似の生物学的な活性を有するタンパク質を得ることができる:すなわち、依然として、生物学的な機能等価タンパク質を得ることができることが当該分野で知られている。そのような変化を行う際、ハイドロパシー指数が±2以内であるアミノ酸の置換が好ましく、±1以内であるアミノ酸が特に好ましく、±0.5以内であるアミノ酸がなお特により好ましい。同様なアミノ酸の置換を、親水性に基づいて効果的に行い得ることもまた、当該分野では理解されている。米国特許第4,554,101号(これは参照によりここに取込取まれる)は、隣接アミノ酸の親水性によって影響を受けるタンパク質の最大の局所的な平均的親水性は、タンパク質の生物学的特性と相関していることを述べている。
米国特許第4,554,101号に詳しく記載されているように、以下の親水性値がアミノ酸残基に与えられている。アルギニン(+3.0);リジン(+3.0);アスパラギン酸(+3.0±1);グルタミン酸(+3.0±1);セリン(+0.3);アスパラギン(+0.2);グルタミン(+0.2);グリシン(0);トレオニン(−0.4);プロリン(−0.5±1);アラニン(−0.5);ヒスチジン(−0.5);システイン(−1.0);メチオニン(−1.3);バリン(−1.5);ロイシン(−1.8);イソロイシン(−1.8);チロシン(−2.3);フェニルアラニン(−2.5);トリプトファン(−3.4)。アミノ酸を、類似の疎水性値を有する他のアミノ酸に置換することができ、生物学的等価物、特に免疫学的等価タンパク質を得ることもできることが理解される。そのような変化において、親水性値が±2以内であるアミノ酸の置換が好ましく、±0.5以内であるアミノ酸がなお特により好ましい。
上記のように、従って、アミノ酸置換は、一般に、アミノ酸側鎖の置換基の相対的な類似性(例えば、その疎水性、親水性、電荷、大きさなど)に基づく。前記の様々な特徴を考慮した置換の例は、当業者は十分に知られており、アルギニンとリジン、グルタミン酸とアスパラギン酸、セリンとトレオニン、グルタミンとアスパラギン;およびバリン、ロイシンとイソロイシンを含む。
4.6 抗体組成物およびその製剤
抗血清から単離した抗体は、例えば、連鎖球菌またはブドウ球菌などの微生物、またはフィブリノーゲン結合タンパク質の特異的検出に、または研究手段として有用である。本明細書で使用される「抗体」という用語は、モノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、キメラ抗体、単鎖抗体、二重特異性抗体、サル化抗体、およびヒト化抗体並びにFabフラグメント(Fab免疫グロブリン発現ライブラリーの産物を含む)を含む。
抗体の製造および同定法は、当分野でよく知られている(例えば、Harlow and Lane、1988参照、引用によりここに援用する)。モノクローナル抗体(mAb)の製造法は、一般的に、ポリクローナル抗体の製造法と同じ経路に沿って始まる。簡潔には、ポリクローナル抗体は、本発明に記載の免疫原性組成物で動物を免疫化し、免疫化した動物から抗血清を回収することにより製造される。広範囲の動物種を抗血清の製造に使用することができる。典型的には、抗―抗血清の製造に使用する動物は、ウサギ、マウス、ラット、ハムスター、モルモットまたはヤギである。ウサギは比較的に血液量が多いことから、ウサギがポリクローナル抗体の産生に好んで選択される。
当分野ではよく知られているように、得られた組成物はその免疫原性が異なり得る。それ故、しばしば宿主免疫系を高めることが必要であり、これはペプチドまたはポリペプチド免疫原を担体に結合させることにより行い得る。例示的および好ましい担体は、キーホールリンペット(keyhole limpet)ヘモシアニン(KLH)およびウシ血清アルブミン(BSA)である。卵アルブミン、マウス血清アルブミンまたはウサギ血清アルブミンなどの他のアルブミンも担体として使用できる。ポリペプチドを担体タンパク質にコンジュゲートさせる方法は、当分野でよく知られており、グルタルアルデヒド、m−マレイミドベンコイル−N−ヒドロキシスクシンイミドエステル、カルボジイミドおよびビスビアゾ化ベンジジンを含む。
当分野でもよく知られているように、特定の免疫原性組成物の免疫原性は、免疫応答の非特異的刺激物質(アジュバントとして知られる)の使用により高めることができる。例示的および好ましいアジュバントには、完全フロイントアジュバント(死菌結核菌を含む免疫応答の非特異的刺激物質)、不完全フロイントアジュバントおよび水酸化アルミニウムアジュバントを含む。
ポリクローナル抗体の産生に使用する免疫原性組成物の量は、免疫原の性質並びに免疫化に使用する動物により変化する。免疫原の投与に、種々の経路を使用することができる(皮下、筋肉内、皮内、静脈内および腹膜内)。ポリクローナル抗体の産生は、種々の時点で免疫化動物の血液をサンプリングし、免疫化することにより監視し得る。第二の追加抗原注入も行い得る。追加抗原刺激および抗体価測定のプロセスは、適当な抗体価が得られるまで反復する。所望のレベルの免疫原性が得られれば、免疫化動物から採血し、血清を単離および貯蔵することができ、および/または動物を使用してmAbを産生することができる。
mAbは、米国特許第4,196,265号(引用によりここに援用する)に例示されているような、よく知られている技術の使用により容易に製造し得る。典型的には、この技術には、適当な動物を、選択した免疫原性組成物、例えば、精製または部分精製タンパク質、ポリペプチドまたはペプチドで免疫化することを含む。免疫化組成物は、抗体産生細胞を刺激するのに効果的な方法で投与する。マウスおよびラットなどのネズミが好ましい動物であるが、ウサギ、ヒツジフロッグ細胞の使用もまた可能である。ラットの使用にはいくつかの利点があるが(Goding,1986)、マウスが好ましく、BALB/cマウスが最も好ましいためこれが最も慣用的に使用され、一般的に高い割合で安定した融合が得られる。
免疫化後、抗体を産生できる体細胞、特にB―リンパ球(B細胞)を、mAb産生プロトコールに使用するために選択する。これらの細胞は、生検脾臓、扁桃またはリンパ節から、または末梢血液サンプルから得られ得る。脾臓細胞および末梢血液細胞が好ましい。なぜなら、前者は分裂している形質芽細胞段階にある抗体産生細胞が豊富なソースであり、後者は末梢血液は容易に入手できるためである。しばしば、一群の動物を免疫化し、最も高い抗体価をもつ動物の脾臓を取り出し、シリンジで脾臓をホモジナイズすることにより脾臓リンパ球を得る。典型的には、免疫化マウスの脾臓は、約5×107から約2×108リンパ球を含む。
次いで、免疫化動物の抗体産生Bリンパ球を、不死化ミエローマ細胞、一般的には免疫化した動物と同種の1つの細胞と融合させる。ハイブリドーマ産生融合方法における使用に適したミエローマ細胞系は、好ましくは、抗体を産生せず、高い融合効率および、所望の融合細胞(ハイブリドーマ)のみの生育を支持する特定の選択培地における生育を不可能とする酵素欠損を有する。
どのミエローマ細胞の1つを使用してもよく、これは当業者には公知である(Goding,1986;Campbell,1984)。例えば、免疫化動物がマウスである場合、P3X63−Ag8.653、P3−X63/Ag8、X63−Ag8.653、NS1/1Ag41、Sp210−Ag14、FO、NSO/U、MPC−11、MPC11−X45−GTG1.7およびS194/5XX0 Bulを使用し得、ラットには、R210RCY3、Y3−Ag1.2.3、IR983F、および4B210を使用し得、U−266、GM1500−GRG2、LICR−LON−HMy2およびUC729−6は全てのヒト細胞融合と関連して有用である。
1つの好ましいネズミ・ミエローマ細胞は、NS−1ミエローマ細胞系(P3−NS−1−Ag4−1とも呼ばれる)であり、これは細胞系貯蔵番号GM3573を要求することでNIGMS Human Genetic Mutant Repositoryから容易に入手できる。使用し得る別のマウス・ミエローマ細胞系は、8−アザグアニン−耐性マウスネズミミエローマSP2/0非産生細胞系である。
抗体産生脾臓またはリンパ節細胞およびミエローマ細胞のハイブリッドの産生法は、通常、体細胞とミエローマ細胞をそれぞれ2:1比で(しかしこの比は約20:1から約1:1まで変化し得る)、細胞膜の融合を促進する物質(化学的または電気的)の存在下で混合することからなる。センダイウイルスを用いる融合法が記載されており(Kohler and Milstein,1975;1976)、ポリエチレングリコール(PEG)、例えば37%(v/v)PEGを用いたものはGefterら(1977)により記載されている。電気誘導融合法の使用もまた適当である(Goding,1986)。
融合法により、通常、約1×106から約1×10-8の低頻度で生存可能なハイブリッドが産生され得る。しかし、生存可能な融合ハイブリッドは、選択培地で培養することにより、親の非融合細胞(特に、通常は際限なく分化し続ける非融合ミエローマ細胞)から識別されるので、このことは問題ではない。選択培地は、一般的に、組織培養培地におけるヌクレオチドのデノボ合成を阻害する物質を含むものである。例示的および好ましい物質はアミノプテリン、メトトレキセートおよびアザセリンである。アミノプテリンおよびメトトレキセートはプリンおよびピリミジンの両方のデノボ合成を阻害するが、アザセリンはプリン合成のみを阻害する。アミノプテリンまたはメトトレキセートを使用する場合、培地にヌクレオチド源としてヒポキサンチンおよびチミジンを追加する(HAT培地)。アザセリンヌクレオチドを使用する場合、培地にヒポキサンチンを追加する。
好ましい選択培地はHATである。サルベージ経路を作動できる細胞のみがHAT培地で生存することが可能である。メラノーマ細胞は、サルベージ経路の鍵酵素、例えばヒポキサンチンホスホリボシルトランスフェラーゼ(HPRT)などが欠損しており、生存できない。B細胞はこの経路を作動できるが、培養中において限られた寿命しかなく、一般的に約2週間以内で死滅する。それ故、選択培地で生存できる細胞のみが、ミエローマおよびB細胞から形成されたハイブリッドである。
この培養により一群のハイブリドーマが得られ、この中から特異的ハイブリドーマを選択する。典型的には、ハイブリドーマの選択は、マイクロタイタープレートに単一クローンを希釈して細胞を培養し、次いで、所望の反応性について個々のクローン上清を試験(約2から3週間後)することにより行う。アッセイは、高感度、簡易および迅速であるべきであり、例えばラジオイムノアッセイ、酵素イムノアッセイ、細胞毒性アッセイ、プラークアッセイ、ドットイムノ結合アッセイ等がある。
次いで、選択したハイブリドーマを連続希釈し、個々の抗体産生細胞系にクローン化し、次いで、そのクローンを無限に増殖させてmAbを得ることができる。細胞系は2つの基本的な方法でmAb産生に利用し得る。ハイブリドーマのサンプルを、原融合の体細胞およびミエローマ細胞を得るのに使用された組織適合性動物型に(しばしば腹膜腔に)注入することができる。注入された動物に、融合細胞ハイブリッドにより産生される特異的モノクローナル抗体を分泌する腫瘍が発生する。次いで、血清または腹水などの動物の体液を採ると、高濃度のmAbを得ることができる。個々の細胞系はまたインビトロでも培養し得、ここでmAbは自然に培養培地に分泌され、これからそれらを高濃度で容易に得ることができる。いずれの方法で産生されたmAbも、所望であれば、濾過、遠心およびHPLCまたはアフィニティクロマトグラフィーなどの種々のクロマトグラフィー法を用いてさらに精製し得る。
それ故、本発明は、9C3および11A5と呼ばれるモノクローナル抗体と同じ抗原または同じエピトープ部位に結合する抗体コンジュゲートおよびイムノトキシンなどの、抗−フィブロネクチン結合タンパク質抗体および抗体−基礎組成物を包含する。かかる抗−フィブロネクチン結合タンパク質抗体は、ポリクローナルまたはモノクローナル型であり得、モノクローナルが一般的に好ましい。
モノクローナル抗体9C3または11A5と同じ抗原、または同じエピトープに結合する抗体の同定は、かなり簡単な事柄である。これは、抗体競合を測定できる種々の免疫学的スクリーニングアッセイのどれでも1つを用いて容易に決定できる。
例えば、試験する試験抗体が、9C3または11A5とは異なる源から、例えばウサギから得られるか、または異なるアイソタイプである場合、簡単な競合アッセイを行い得、すなわち、9C3または11A5および試験抗体を事前に混合し、次いで、抗原組成物に適用する。「抗原組成物」は、使用しやすい形の、黄色ブドウ球菌 fnbA由来のD3モチーフ(D320-33;QFGGHNSVDFEEDT;配列番号61)のアミノ酸20−33に対応するペプチドである9C3および11A5により認識される抗原を含む(これは組織サンプルおよび種々の形の精製または半精製抗原を含む)任意の組成物を意味する。従って、免疫組織化学的アッセイ、ELISAおよびウエスタンブロットに基づくプロトコールは、かかる簡易な競合試験における使用に適している。
かかる実施形態において、9C3または11A5抗体と変化量の試験抗体(例えば1:1、1:10および1:100)を、例えば動物標本、ELISAプレートの抗原被覆ウェルまたは膜に吸着させた抗原(例えばドットブロットおよびウエスタンブロット)などの抗原組成物に適用する前にしばらくの間、事前に混合する。いずれかに抗−ネズミ二次抗体を用いることにより、結合9C3または11A5抗体のみを検出することができ、その結合は、モノクローナル抗体9C3および/または11A5と同一のエピトープ/抗原を認識する試験抗体の存在により減少する。
9C3および/または11A5および任意の試験抗体との間の抗体競合研究を実施するために、始めに、例えばビオチンなどの検出可能な標識ラベルまたは酵素、放射活性または蛍光ラベルで9C3または11A5を標識して、続いて同定できるようにする。これらの場合、標識抗体を、種々の割合(例えば1:1、1:10および1:100)で、試験する抗体(試験抗体)と共にインキュベートし、適当な時間の経過後に、標識9C3または11A5抗体の反応性をアッセイし、これを競合する効力のある(試験)抗体がインキュベート中には全く含まれていなかった対照値と比較する。
アッセイは、抗体ハイブリダイゼーションに基づく一連の免疫学的アッセイのいずれでもよく、9C3または11A5抗体は、例えばビオチニル化抗体の場合にはストレプトアビジンを用いて、または酵素ラベルについては色素基質を用いて、または単純に放射活性または蛍光ラベルを検出することによるといったその標識を検出することにより検出される。実質的に9C3または11A5と同一のエピトープ/抗原に結合する抗体は、効果的に結合競合し、従って、標識抗体結合における減少により実証された通り、有意に9C3または11A5結合は減少する。この場合、標識9C3または11A5抗体の試験抗体との混合後における、残余活性を測定するに適当なアッセイは、例えば、黄色ブドウ球菌 fnbA由来のD3モチーフ(D320-33;QFGGHNSVDFEEDT;配列番号61)のアミノ酸20−33に対応するペプチドを用いた、ELISA、RIA、ウエスタンまたはドットブロット、D20-33を含むタンパク質の免疫沈降;D320-33を含むタンパク質を発現する組換え細胞のELISA、RIAまたは蛍光抗体染色;連鎖球菌またはブドウ球菌などの微生物の間接的蛍光抗体染色;FACSまたは間接的蛍光抗体法によるフィブロネクチン結合タンパク質細胞表面決定基との反応性を含む。
試験抗体の非存在下での、標識9C3または11A5抗体の反応性は対照高値である。対照低値は、標識抗体を同型の非標識抗体とインキュベートすることにより、この時に競合が生じ、標識抗体の結合が減少する場合に得られる。試験抗体の存在下における標識抗体反応性の有意な減少は、標識抗体と「交差反応」する同一エピトープを認識する試験抗体の指標となる。本出願における「有意な減少」は、9C3または11A5の再現可能(すなわち継続的に観察される)な結合減少が、少なくとも約1:1の比で1%、または約1:100の比で約10%、またはより好ましくは約1:1ないし1:100の任意の比で約20%ないし約50%と定義し得る。
4.6.1 阻止抗体
別の局面において、本発明は、本発明のポリペプチドと免疫反応する抗体を含む。上記したように、本発明に記載のMSCRAMM由来ペプチドの用途の1つは、抗体を産生することである。本明細書を通して抗体の言及は、単独または他の要素とコンジュゲートした全てのポリクローナルおよびモノクローナル抗体、およびその一部を含む。抗体は、FabおよびF(ab)2フラグメントおよび単鎖抗体を含む。抗体は適当な実験動物でインビボで、または組換えDNA技術を用いてインビトロで製造され得る。抗体はポリクローナルまたはモノクローナル抗体であり得る。好ましい実施形態において、抗体はポリクローナル抗体である。抗体の製造および同定法は当分野でよく知られている(例えば、Harlow and Lane,1988参照)。
簡潔には、ポリクローナル抗体は、本発明のポリペプチドを含む免疫原を動物に免疫化し、免疫化した動物から抗血清を回収することにより産生する。広範囲の動物種を抗血清の産生に使用することができる。典型的には、抗−抗血清の産生に使用される動物はウサギ、マウス、ラット、ハムスターまたはモルモットである。ウサギは比較的血液量が多いことから、ウサギがポリクローナル抗体の産生に好んで選択される。
Sfb−、FnBA−、FnBB−、FnBPAおよびFnBPB−由来MSCRAMMエピトープに特異的なポリクローナルおよびモノクローナルの両方の抗体は、一般的に当業者には公知であるように、慣用的な免疫化技術を用いて製造し得る。特定のFn結合MSCRAMM(合成ペプチド、部位特異的変異、または短縮ペプチド)の抗原エピトープを含む組成物を、1つ以上の実験動物、例えばウサギまたはマウスに免疫化するために使用することができ、次いで、エピトープ含有MSCRAMMペプチドに対する特異的抗体が産生される。ポリクローナル抗血清が、抗体が産生される時間の経過後、動物から採血し、全血から血清サンプルを調製することにより簡易に得られ得る。
ポリクローナル抗体の産生に使用する免疫原組成物の量は、免疫原の性質、並びに免疫化に使用する動物により変化する。様々な経路を使用して免疫原を投与することができる(皮下、筋肉内、皮内、静脈内および腹膜内)。ポリクローナル抗体の産生は、免疫化後の種々の時点で免疫化動物の血液をサンプリングすることにより監視し得る。第二の追加抗原注入も行い得る。追加抗原刺激および抗体価測定のプロセスは、適当な抗体価が得られるまで反復する。所望のレベルの免疫原性が得られれば、免疫化動物から採血し、血清を単離および貯蔵することができ、および/または動物を使用してmAbを産生することができる(下記)。
本発明によりもたらされる重要な特長の1つは、この抗体の特異性の点で、比較的等質性であるポリクローナル血清である。典型的には、ポリクローナル血清は種々の異なる「クローン」、すなわち、異なる系のB細胞から誘導される。対照的に、モノクローナル抗体は、共通のB−細胞祖先の抗体産生細胞から誘導され、従って「モノ」クローン性であると定義されている。
ポリクローナル血清を産生するために、ペプチドを抗原として使用する場合、全抗原を使用した場合より、血清のクローン性においてかなり多様性が低いと予測される。残念なことに、エピトープの不完全なフラグメントが提示されれば、ペプチドは多重(そしておそらく非天然)構造をとるのは最もである。結果として、短いペプチドでも、比較的複数の特異性を有するポリクローナル抗血清を産生し、および残念なことに天然分子とは反応しないか反応性の低い抗血清を産生し得る。
本発明に記載のポリクローナル抗血清は、全ての無傷なエピトープを含むと予測されるペプチドに対して産生される。これらのエピトープは、それ故、免疫学的にはより安定であり、従って、免疫系のより一貫した免疫学的標的を発現する。このモデルでは、このペプチドに反応する効力のあるB−細胞クローンの数はかなり少なく、従って、得られた血清の均質性はより高い。種々の実施形態において、本発明は、クローン性、すなわち同一分子決定基と反応するクローンの割合が少なくとも80%であるポリクローナル抗血清を提供する。さらに高いクローン性−90%、95%またはそれ以上−が考えられる。
モノクローナル抗体を得るために、最初に実験動物、しばしば好ましくはマウスをMSCRAMM由来エピトープ含有組成物を用いて免疫化する。次いで、抗体産生が充分に行われる時間経過後、動物から一群の脾臓またはリンパ細胞を得る。次いで、脾臓またはリンパ細胞を、ヒトまたはマウスミエローマ株などの細胞系と融合し、抗体−分泌ハイブリドーマを産生する。これらのハイブリドーマは単離して、個々のクローンを得、これは所望のペプチドに対する抗体の産生のためにスクリーニングすることができる。
免疫化後、脾臓細胞を取り出し、標準的な融合プロトコールを用いて形質細胞腫細胞と融合し、MSCRAMM由来エピトープも対するモノクローナル抗体を分泌するハイブリドーマを産生する。選択した抗原に対するモノクローナル抗体を産生するハイブリドーマは、標準的な技術、例えばELISAおよびウエスタンブロット法を用いて同定する。次いで、ハイブリドーマクローンを液体培地で培養し、培養上清を精製すると、MSCRAMM由来エピトープ特異的モノクローナル抗体を得ることができる。
本発明のモノクローナル抗体は、標準的な免疫化学法、例えばELISAおよびウエスタンブロット法、並びにMSCRAMMエピトープに特異的な抗体を使用し得る他の方法において有用性がある。
また、特定のMSCRAMM由来ペプチドに対して特異的なモノクローナル抗体は他の有用な適用に使用し得ることが提案されている。例えば、免疫吸着法における使用は、天然または組換えペプチド種またはその合成または天然変化体を精製するのに有用であり得る。
一般的に、これらのペプチドに対するポリおよびモノクローナル抗体は、種々の実施形態で使用し得る。例えば、抗体クローニングプロトコールにおいて使用することで、本明細書で開示したペプチドまたは関連タンパク質をコードするcDNAまたは遺伝子が得られ得る。また、細胞または動物におけるMSCRAMM由来ペプチドの効果を解析するための阻害研究においても使用し得る。抗−MSCRAMMエピトープ抗体はまた、種々の細胞反応の間のMSCRAMMの分布の解析、例えば、異なる生理学的条件下におけるMSCRAMMペプチドの細胞または組織−特異的分布を決定するための免疫局在研究においても有用である。かかる抗体の特に有用な適用は、例えば、抗体アフィニティカラムを使用した、天然または組換えMSCRAMMの精製においてである。かかる全ての免疫学的技術の操作は、本発明の開示に照らして当業者には公知である。
4.6.2 二重特異性抗体組成物
一般的に、二重特異的抗体の製造も、Glennieら(1987)により例示されているように、当分野ではよく知られてる。二重特異的抗体は臨床的に、例えば、癌患者の治療(Bauerら,1991)に使用されている。二重特異的抗体の製造法の1つは、1つ以上のフィブロネクチン結合領域の異なるエピトープに特異性を有する抗体を、1つ以上のフィブロネクチン結合タンパク質とは別々に製造することを含む。
二重特異的抗体の製造に関する数多くの方法が当分野で公知であるが、Glennieら(1987)法は、2つの選択した抗体からのペプチドF(ab’γ)2フラグメントの製造、次いで、各々を還元して別々のFab’γSHフラグメントを得ることを含む。結合させる2つの対の一方上のSH基を、次いで、o−フェニレンジマレイミドなどの架橋剤でアルキル化し、対の一方に遊離マレイミド基を得る。この対は、次いで、チオエーテル結合により他方にコンジュゲートさせ、所望のF(ab’γ)2ヘテロコンジュゲートが得られる。
製造が簡便であること、高収率および再現性から、Glennieら(1987)法は、しばしば、二重特異的抗体の製造に好まれるが、使用でき、発明者により構想される他の方法が数多くある。例えば、SPDPまたはプロテインAとの架橋を行う、または三重特異的構築物を製造する別の技術が知られている(Titusら,1987;Tuttら,1991)。
二重特異的抗体の別の製造法は、2つのハイブリドーマによる融合によりクアドローマを形成する(Flavellら,1991,1992;Pimmら,1992;Frenchら,1991;Embletonら,1991)。本明細書で使用する場合、「クアドローマ」という用語は、2つのB細胞ハイブリドーマの産生的融合を記載するために使用する。標準的な技術を用いて、2つの抗体産生ハイブリドーマを融合すると娘細胞が得られ、次いで、両方のセットのクローン型免疫グロブリン遺伝子の発現を維持する細胞を選択する。
クアドローマを産生する好ましい方法は、少なくとも1つの親ハイブリドーマの酵素欠損変異体の選択を含む。次いで、この最初の変異ハイブリドーマ細胞系は、例えばヨードアセトアミドなどに致死的にさらした、続く生存を不可能にする二番目のハイブリドーマの細胞に融合する。細胞融合は、致死的に処理したハイブリドーマから酵素欠損の遺伝子を獲得することにより最初のハイブリドーマの救済を可能にし、および、最初のハイブリドーマへの融合により二番目のハイブリドーマの救済を可能にする。必須ではないが、好ましいのは、同じアイソタイプであるが、異なるサブクラスの免疫グロブリンの融合である。混合サブクラス抗体により、好ましいクアドローマの単離における任意のアッセイの使用が可能になる。
より詳細には、クアドローマ形成およびスクリーニングの1つの方法は、最初に選択したmAbを分泌するハイブリドーマ系を得、必須代謝酵素のヒポキサンチン−グアニンホスホリボシルトランスフェラーゼ(HGPRT)の欠損をつくることを含む。ハイブリドーマの欠損変異体を得るために、細胞を、8−アザグアニン(1×10-7Mから1×10-5M)の増加濃度の存在下で成育させる。変異体を希釈を限定することでサブクローニングし、ヒポキサンチン/アミノプテリン/チミジン(HAT)感受性について試験する。培養培地には、例えば、10%FCS、2mM L−グルタミンおよび1mMペニシリン−ストレプトマイシンを追加したDMEMからなり得る。
二番目の所望のMAbを産生する相補ハイブリドーマ細胞系を使用して、標準的な細胞融合技術(Galfreら,1981)による、またはClarkら(1988)により記載されたプロトコールを用いてクアドローマを形成する。簡潔には、4.5×107HAT−感受性の最初の細胞を、致死量の不可逆的生化学的阻害剤のヨードアセトアミド(リン酸緩衝食塩水中5mM)で融合前、氷上で30分間前処理した2.8×107HAT−感受性第二細胞と混合する。細胞融合はポリエチレングリコール(PEG)を用いて誘導し、細胞を96ウェルのマイクロタイタープレートに播く。クアドローマを、HAT−含有培地を用いて選択する。二重特異的抗体含有培養物を、例えば、固相−特異的ELISAおよびアイソタイプ特異的蛍光抗体染色を用いて同定する。
二重特異的抗体を同定する1つの同定実施形態において、マイクロタイタープレートのウェル(Falcon,Becton Dickinson Labware)を、親ハイブリドーマ抗体の1つと特異的に反応し、両方の抗体との交差反応性を欠失している薬剤で覆う。プレートを洗浄し、ブロックし、試験する上清(SN)を各ウェルに加える。プレートを2時間、室温でインキュベートし、上清を捨て、プレートを洗浄し、希釈したアルカリリン酸抗−抗体コンジュゲートを室温で2時間加えた。プレートを洗浄し、リン酸基質、例えばp−ニトロフェニルリン酸(Sigma,St.Louis)を各ウェルに加える。プレートをインキュベートし、3N NaOHを各ウェルに加え、反応を停止し、OD410値をELISA解読機を用いて決定する。
別の同定実施形態において、ポリ−L−リジンで前処理したマイクロタイタープレートを使用して、標的細胞の1つを各ウェルに結合させ、次いで、例えば1%グルタルアルデヒドを用いて細胞を固定し、二重特異的抗体の無傷細胞への結合能について試験する。さらに、FACS、免疫蛍光染色、イディオタイプ特異的抗体、抗原結合競合アッセイ、および抗体同定分野において一般的な他の方法を、本発明と関連して使用し、好ましいクアドローマを同定し得る。
クアドローマの同定後、二重特異的抗体を他の細胞産物から分けて精製する。これは免疫グロブリン精製の分野の当業者には公知の種々のタンパク質単離法によりなされ得る。抗体の製造および同定法は当分野でよく知られている(例えば、抗体:A Laboratory Manual,1988)。
例えば、選択したクアドローマの上清を、プロテインAまたはプロテインGセファロースカラム上を通過させIgG(アイソタイプによる)を結合させる。結合した抗体を、次いで、例えばpH5.0のクエン酸緩衝液で溶出する。BsAbsを含む溶出画分を、等張緩衝液に対して透析する。別に、溶出液をまた、免疫グロブリン−セファロースカラムに通過させる。BsAbを次いで、3.5M塩化マグネシウムで溶出する。このように精製したBsAbsを、次いで、例えば上記のように標的細胞のアイソタイプ−特異的ELISAおよび蛍光抗体染色アッセイにより結合活性を試験する。
精製したBsAbsおよび親抗体はまた、SDS−PAGE電気泳動、次いで銀またはクーマシーで染色することにより同定および単離し得る。これは、親抗体の一方が他方よりも高い分子量を有する場合、可能である。ただし、BsAbsのバンドは2つの親抗体の間を移動する。サンプルの減少は、2つの異なる分子量をもつ重鎖の存在を確証する。
さらに、組換え技術は、一般的に抗体の製造に利用でき、所望の二重特異性を有する抗体をコードする組換え抗体遺伝子の製造を可能とする(Van Dukら,1989)。従って、最も好ましい結合特性を有するモノクローナル抗体を選択した後、これらの抗体のそれぞれの遺伝子を、例えば、ファージ発現ライブラリーの免疫学的スクリーニング(Oi and Morrison,1986;Winter and Milstein,1991)により単離することができる。次いで、Fabコード領域の再編成を通して、適当なキメラ構築物を容易に得ることができる。
4.6.3 ヒト化抗体組成物
ヒト化モノクローナル抗体は、遺伝子工学技術を用いて修飾し、一定領域および/または可変領域枠組み配列をヒト配列で置換した、起源の抗原特異性は保持している動物起源の抗体である。かかる抗体は一般的にヒト抗原に対して特異性を有するネズミ抗体から誘導される。かかる抗体は、一般的に、インビボの治療用途に有用である。この方法は、外来の抗体に対する宿主の応答を減少させ、ヒトエフェクター機能の選択を可能にする。
ヒト化免疫グロブリンの技術は、当業者にはよく知られている。例えば、米国特許第5,693,762号は、1つ以上の相補決定領域(CDR’s)を有するヒト化免疫グロブリンの製造法および組成を開示している。無傷の抗体に結合されれば、ヒト化免疫グロブリンは実質的にヒトにおいて非免疫原性であり、実質的に抗原、例えばタンパク質またはエピトープを含む他の化合物に対してドナーの免疫グロブリンと同じアフィニティを保持する。
本発明に有用な抗体の産生を教示する他の米国特許(各々、引用によりここに援用する)は、米国特許第5,565,332号(組み合わせ法を用いたキメラ抗体の産生が記載されている);第4,816,567号(組換え免疫グロブリン調製が記載されている)および第4,867,973号(抗体治療剤コンジュゲートが記載されている)を含む。
米国特許第5,565,332号は、親抗体と同じ結合特異性を有するが、ヒト特性が増加している、抗体、または抗体フラグンメントの産生法を記載している。ヒト化抗体は、鎖再編成により、おそらくファージ提示技術を用いて得られ、かかる方法は本発明においては有用であるので米国特許第5,565,332号の全内容を引用してここに援用する。
4.6.4 ペプチドおよび抗体組成物の検出
特定のポリペプチドは、通常、SDS/PAGEゲルの解析に使用される、典型的な染色方法、例えばクーマシーブリリアントブルーまたは銀染色の検出限界以下の量で存在し得、その存在は類似のMr不活性ポリペプチドにより覆われ得ることがさらに理解されるだろう。本発明の慣用的な実行には必ずしも必要ではないが、他の検出法を、目的の特定のポリペプチドの視覚化に有利に使用し得る。本明細書に記載の酵素−、放射活性−、または蛍光−タグ抗体を用いた、例えばウエスタンブロットなどの免疫学に基づいた技術は、この観点から特に有用である。別に、本発明のペプチドは、一次抗体にアフィニティを有する二次抗体と組み合わせて本発明の抗体を用いて検出し得る。この二次抗体は、酵素−、または放射活性−、または別に、蛍光−またはコロイド金タグであり得る。かかる2段階の二次抗体技術の標識および検出法は、当業者にはよく知られている。
4.6.5 イムノアッセイ
記載したように、天然および合成由来ペプチドおよび本発明のペプチドエピトープは、例えばワクチン開発に関連して免疫原として、または反応性抗体の検出におけるイムノアッセイの抗原として有用性がみられると提案されている。始めにイムノアッセイに戻ると、最も簡便で直接的な感覚において、本発明の好ましいイムノアッセイは、種々の型の、当業者には公知である酵素結合イムノソルベントアッセイ(ELISA)を含む。しかし、MSCRAMM由来タンパク質およびペプチドの有用性はかかるアッセイに限定されず、他の有用な実施形態はRIAおよび他の非酵素結合抗体結合アッセイおよび方法を含むことが容易に理解されるだろう。
好ましいELISAアッセイにおいて、MSCRAMM由来タンパク質抗原配列を取り込んだタンパク質またはペプチドは、選択された表面に、好ましくはタンパク質アフィニティを示す表面、例えばポリスチレンマイクロタイタープレートのウェルに固定する。不完全に吸着した物質を取り除くために洗浄した後、次いで、一般的には、ウシ血清アルブミン(BSA)またはカゼインなどの試験抗血清に関して抗原性的に中性であることが知られている非特異的タンパク質を、ウェル上に結合または被覆することを望む。これにより、固定表面上の非特異的吸着部位のブロックが可能となり、抗血清の表面上への非特異的結合により引き起こされる基底値が減少する。
抗原性物質をウェルに結合させ、非反応性物質で被覆し基底値を減少させ、非結合物質を除去するために洗浄した後、固定表面を、試験する抗血清または臨床または生物学的抽出物と、免疫複合体(抗原/抗体)形成の助けとなるように接触させる。かかる条件は好ましくは、抗血清をBSA、ウシガンマグロブリン(BGG)およびリン酸緩衝食塩水(PBS)TweenTMなどの希釈剤で希釈することを含む。これらの添加した薬剤はまた、非特異的基底値の減少を助けるものである。層をなした抗血清を、次いで、例えば、2から4時間、好ましくは約25℃から約27℃の程度の温度でインキュベートする。インキュベート後、抗血清−接触表面を洗浄して非免疫複合物質を除去する。好ましい洗浄方法は、PBS/TweenTM、またはホウ酸緩衝液などの溶液を用いた洗浄を含む。
試験サンプルと結合抗原の間に特異的な免疫複合体が形成され、続けて洗浄した後、免疫複合体の頻度および量を、複合体を最初のものに特異性を有する第二の抗体にさらすことにより決定し得る。もちろん、試験サンプルは典型的にヒト起源のものであるという点において、第二の抗体は好ましくはヒト抗体に特異性を有する抗体である。検出法を提供するために、第二の抗体は好ましくは関連した検出可能な標識、例えば酵素標識を有し、適当な色素基質と共にインキュベートすることにより発色するなどの信号を発生する。従って、例えば、抗血清結合表面をウレアーゼまたはペルオキシダーゼ−コンジュゲート抗ヒトIgGと共に、一定時間、免疫複合体形成の発達に好ましい条件下(例えば、2時間室温で、例えばPBS−TweenTMなどのPBS−含有溶液中でインキュベート)接触およびインキュベートすることが望ましい。
二次標識または酵素−タグ抗体と共にインキュベートし、続いて非結合物質を除去するために洗浄した後、例えば、酵素標識としてペルオキシダーゼの場合には、尿素およびブロモクレゾールパープルまたは2,2’−アジノ−ジ−(3−エチル−ベンゾチアゾリン−6−スルホン酸[ABTS]およびH2O2などの発色基質と共にインキュベートすることにより標識量を定量化する。次いで、例えば可視スペクトル分光計を用いて、発色の度合いを測定することにより定量化する。
ELISAを、本発明に関連して使用し得る。かかるELISAアッセイにおいて、本発明の抗原性配列を取り込むタンパク質またはペプチドを、選択表面上に、好ましくはポリスチレンマイクロタイタープレートのウェルなどのタンパク質アフィニティを示す表面に固定する。不完全に吸着した物質を除去するために洗浄した後、ウシ血清アルブミン(BSA)、カゼインまたは粉末ミルクなどの試験抗血清に関して抗原性的に中性であることが知られている非特異的タンパク質でアッセイプレートウェルを結合または被覆することが望ましい。これにより、固定表面上の非特異的吸着部位のブロックが可能となり、抗血清の表面上への非特異的結合により引き起こされる基底値を減少させる。
抗原性物質をウェルに結合させ、非反応性物質で被覆し基底値を減少させ、非結合物質を除去するために洗浄した後、固定表面を、試験した抗血清または臨床または生物学的抽出物と、免疫複合体(抗原/抗体)形成の助けとなるように接触させる。かかる条件は好ましくは、抗血清をBSA、ウシガンマグロブリン(BGG)およびリン酸緩衝食塩水(PBS)TweenTMなどの希釈剤で希釈することを含む。これらの添加した薬剤はまた、非特異的基底値の減少を助けるものである。層をなした抗血清を、次いで、約2から約4時間、好ましくは約25℃から約27℃の程度の温度でインキュベートする。インキュベート後、抗血清−接触表面を洗浄して非免疫複合物質を除去する。好ましい洗浄方法は、PBS/TweenTM、またはホウ酸緩衝液などの溶液を用いた洗浄を含む。
試験サンプルと結合物質の間に特異的な免疫複合体が形成され、続けて洗浄した後、形成された僅かな量の免疫複合体でも測定し得る。
検出方法を得るために、第二抗体は、好ましくは、適当な発色基質と共にインキュベートした場合に発色する関連酵素を有する。従って、例えば、抗血清結合表面をウレアーゼまたはペルオキシダーゼ−コンジュゲート抗ヒトIgGと共に、一定時間、免疫複合体形成の発達に好ましい条件下(例えば、2時間室温で、例えばPBS/TweenTMなどのPBS−含有溶液中でインキュベート)接触およびインキュベートすることを望む。
二次標識または酵素−タグ抗体と共にインキュベートし、続いて非結合物質を除去するために洗浄した後、例えば、酵素標識としてペリオキシダーゼの場合には、尿素およびブロモクレゾールパープルまたは2,2’−アジノ−ジ−(3−エチル−ベンゾチアゾリン−6−スルホン酸[ABTS]およびH2O2などの発色基質と共にインキュベートすることにより標識量を定量化する。次いで、例えば可視スペクトル分光計を用いて、発色の度合いを測定することにより定量化する。
4.6.6 免疫沈降
本発明の抗−MSCRAMM抗体は、免疫沈降によるFn結合タンパク質の単離に特に有用である。免疫沈降は、複合混合物からの標的抗原成分の分離を含み、僅かな量のタンパク質を識別または単離するのに使用される。Sfb、FnBA、FnBB、FnBPA、およびFnBPBなどの細胞表面局在タンパク質の単離のために、リソスタフィン(黄色ブドウ球菌)またはムタノリシン(連鎖球菌)で処理することによりペプチドを細菌細胞壁から可溶化するか、または別にデタージェントミセルにしなければならない。胆汁塩などの他の薬剤は酸性pHまたは胆汁カチオンの存在下で沈降するため、非イオン性塩が好ましい。
別の実施形態において、本発明の抗体は、2つの抗原の近接並置に有用である。これは、例えば酵素基質対などの抗原の局在化濃度を上昇させるのに特に有用である。
4.6.7 ウエスタンブロット
本発明の組成物は、イムノブロットまたはウエスタンブロット解析において大いなる有用性が認められる。抗−MSCRAMM−コードエピトープ)抗体を、固体支持マトリクス、例えば、ニトロセルロース、ナイロンまたはその組み合わせ上に固定したタンパク質の同定用の高アフィニティ一次試薬として使用し得る。免疫沈降、次いでゲル電気泳動に関連して、これらは抗原を検出する用途において一段階試薬として使用し得、一方、抗原検出に使用した二次試薬は負の基底値を示す。これは、研究した抗原が免疫グロブリンである場合(免疫グロブリン結合細菌細胞壁成分の使用を除く)特に有用であり、研究した抗原は検出剤と交差反応するか、または交差反応信号と同じ相対分子量に移動する。ウエスタンブロットと同時に使用する免疫学を基盤とした検出法は、酵素−、放射標識−、または蛍光−タグ二次抗体を含み、毒素部分はこの観点から特に有用であるあると考えられる。
4.7 治療、診断、および免疫キット
本発明はまた、製薬学的に許容しうる賦形剤、担体、希釈剤、アジュバント、および追加のペプチド、抗原、細胞膜調製物などの他の成分、または特定のワクチン製剤に使用され得る弱毒化全細胞組成物と共に、MSCRAMM−由来ペプチド抗原または抗体組成物を含む。
本明細書に記載のペプチドを用いて、本発明はまた、免疫応答を引き起こす方法を提供するものであって、この方法は一般的に動物に、免疫学的に有効量のMSCRAMM−由来ペプチド組成物を含む製薬学的に許容しうる組成物を投与することを含む。好ましい動物は、哺乳動物、および特にヒトを含む。他の好ましい動物は、ネズミ、ウシ、ウマ、ブタ、イヌ、ネコを含む。組成物は、天然または組換え源から得られた、部分または十分に精製されたMSCRAMM−由来ペプチドエピトープを含み得、タンパク質またはペプチドは天然からまたは化学的に合成されるか、または別にかかるエピトープをコードするDNAセグメントを発現する組換え宿主細胞からインビトロで産生され得る。反応性エピトープを含む小さいペプチド、例えば、長さが約30ないし約100アミノ酸が、しばしば好ましい。抗原性タンパク質またはペプチドはまた、他の薬剤、例えば他のブドウ球菌または連鎖球菌ペプチドまたは核酸組成物などを所望であれば組み合わせ得る。
「免疫学的な有効量」は、受容体動物において免疫応答を発生することのできるペプチド組成物量を意味する。これは、抗体応答(B細胞応答)の発生および/または細胞毒性免疫応答(T細胞応答)の刺激を含む。かかる免疫応答の発生は、有益な生物学的薬剤、例えばCTL、およびより特定すると、反応性抗体の両方において、診断実施形態における使用に有用性を有し、また、種々の予防または治療実施形態においても有用性を有する。それ故、免疫応答の刺激に関するこれらの方法は、重症なブドウ球菌または連鎖球菌感染を予防または緩和することを指向したワクチン療法、任意の感染の深刻度または持続期間を和らげ得る治療法を含むが、これら最終結果のいずれかを達成することは、本発明のこれらの実施態様の遂行には必ずしも必要ではないことが理解されよう。かかる治療法は、特に、黄色ブドウ球菌などのコアグラーゼ陽性ブドウ球菌、表皮ブドウ球菌、Staphylococcus hemolyticus、Streptococcus dysgalactiae、化膿連鎖球菌および関連種などのコアグラーゼ陰性ブドウ球菌といった病原体により引き起こされる感染の治療に使用され得る。
上記の治療組成物および方法に加えて、タンパク質、核酸分子または抗体は、感染に関与する病原体と哺乳動物の宿主細胞間の最初の物理的相互作用、例えば細菌、特にグラム陽性細菌の内在器官上の哺乳動物細胞外マトリクスタンパク質への、または創傷細胞外マトリクスタンパク質への干渉に;タンパク質仲介哺乳動物細胞侵入をブロックするために;組織障害を仲介する、哺乳動物細胞外マトリクスタンパク質ないし細菌タンパク質間の細菌吸着をブロックするために;および内在器官の内植または外科的手術以外から開始された感染における病原体の正常進行をブロックするため有用である。
発明者により考えられた動物において免疫応答を引き起こす別の方法は、動物、またはヒト被験体に、ペプチドエピトープをコードする免疫学的に有効量の核酸組成物、またはかかる核酸組成物を含み発現する免疫学的に有効量の弱毒化生物体を含む、製薬学的に許容しうる組成物を投与することを含む。「免疫学的有効量」はB細胞および/またはT細胞応答を刺激することのできる量である。
本発明の免疫製剤は、ワクチン、治療、またはブドウ球菌および連鎖球菌の検出に有用な抗体の産生、またはFnなどのECM成分への細菌吸着の防止を意図したものであれ、部位−特異的な変異、短縮、またはこれらのタンパク質から合成的に誘導された抗原性ペプチドフラグメントを含み得る。それ自体、本明細書に記載のタンパク質およびペプチドの抗原性機能等価体も、本発明の範囲内に該当する。「抗原性機能等価体」タンパク質またはペプチドは、開示された特定のMSCRAMMタンパク質(例えば、FnBB、FnBA、FnBPBおよびFnBPA)のいずれかから誘導した1つ以上のエピトープと免疫学的に交差反応するエピトープを取り込むものである。抗原性機能等価体、またはエピトープ配列は、始めに設計または予測し、次いで、試験し得るか、または簡便に交差反応性について直接試験し得る。
別の実施形態において、本発明の新規ペプチドおよびタンパク質は、血清、血液、または他の溶液などの臨床サンプルにおいてかかるペプチドと反応する抗体の検出に使用し得る。
免疫製剤、ワクチン、または単なる抗原(例えば、検出プロトコールにおける使用)としての使用に適した、適当なMSCRAMMエピトープ、および/またはその機能等価体の同定または設計は、比較的平易な事柄である。例えば、親水性に基づくアミノ酸配列からのエピトープの同定および調製が教示されている、米国特許第4554101号(引用してここに援用する)で可能であるように、Hoppの方法を使用し得る。数種の他の論文で記載されている方法、およびこれに基づくソフトウエアプログラムを使用してもエピトープコア配列を同定することができ、例えば、Chou and Fasman(1974a,b;1978a,b;1979);Jameson and Wolf(1988);Wolfら(1988);およびKyte and Doolittle(1982)がこの主題を記載している。これらの「エピトープコア配列」のアミノ酸配列は、次いで、ペプチド合成または組換え技術のいずれかを用いて、容易にペプチドに取り込まれ得る。
黄色ブドウ球菌由来のFnBPAタンパク質のDU、D1、D2またはD3エピトープを取り込む、より短い抗原性ペプチド、例えば約25から約50、または約15から25アミノ酸長の使用が、特定の条件下、例えばワクチンの調製または免疫学的検出アッセイにおいて有利であると提示されている。例示的利点は、製造および精製の簡便性、比較的低いコストおよび産生の再生産性が向上したこと、および有利な生体分布が含まれる。
さらに別の実施形態において、本発明は免疫検出法および関連キットに関する。本発明のタンパク質またはペプチドを使用して、それと反応性を示す抗体を検出し得るか、または別に、本発明に従って製造した抗体を使用してFnBPAタンパク質またはペプチドを検出し得ることが意図される。どちらの型のキットも、ブドウ球菌および/または連鎖球菌感染の指標となる、臨床サンプル内に存在する化合物の免疫検出に使用し得る。このキットはまた、適宜、抗原または抗体精製に使用し得る。
一般的に、好ましい免疫検出法は、始めにFnBPA−反応性抗体を含有することが疑われるサンプル、例えば、該抗体を含むことが疑われる生物学的サンプル、または別に、血液、血清等などの臨床サンプルを患者から得て、サンプルを最初のFnBPAタンパク質またはペプチドと、免疫複合体(一次免疫複合体)の形成を可能にする条件下で接触させることを含む。次いで、形成される任意の免疫複合体の存在を検出する。
選択したサンプルをFnBPA−由来タンパク質またはペプチドと、(一次)免疫複合体の形成が可能となる条件下で接触させることは、一般的に、単純にタンパク質またはペプチド組成物をサンプルに添加することである。次いで、添加した抗原が免疫複合体をを形成する、すなわち、サンプル中の抗体に結合することのできる時間の間、混合物をインキュベートする。この後、サンプル組成物、例えば組織画分(section)、ELISAプレート、ドットブロットまたはウエスタンブロットを、一般的には、洗浄して非特異的結合抗原種を除去し、免疫複合体中の特異的に結合した種のみを検出できるようにする。
免疫複合体形成の検出は当分野ではよく知られており、当業者に公知の数多くの方法を適用して達成され得、種々の文献、例えば、Nakamuraら(1987)(引用してここの援用する)に記載されている。一次免疫複合体の検出は、一般的に、例えば放射活性、蛍光、生物学的、または酵素タグ(酵素タグは、例えば、アルカリホスファターゼ、ウレアーゼ、ホースラディッシュペルオキシダーゼおよびグルコースオキシダーゼが好ましい)ラベルまたはマーカーなどの検出に基づいている。使用した特定の抗原はそれ自体で検出ラベルに結合し得、単純にこのラベルを検出し、それにより組成物に存在する結合抗原の量を測定することが可能となる。
別に、一次免疫複合体は、検出可能なラベルに結合しており、第一のタンパク質またはペプチドに結合アフィニティを有する二次結合リガンドにより検出され得る。二次結合リガンドは、それ自体、しばしば抗体であり、従って「二次」抗体と呼ばれ得る。一次免疫複合体を、二次免疫複合体の形成が可能な条件下および充分な時間、標識二次結合リガンドまたは抗体と接触させる。二次免疫複合体は、次いで、一般的に洗浄して、非特異的結合標識二次抗体を除去し、次いで、残余結合ラベルを検出する。
診断目的のために、目的の抗体またはペプチドのいずれかを含むことが疑われる実質上全てのサンプルを使用し得ることが提案されている。例示的サンプルは、患者から得られた臨床サンプル、例えば、血液または血清サンプル、気管支液、耳かき、啖サンプル、中耳液または尿サンプルも使用し得る。これにより、髄膜炎、中耳炎、肺炎、菌血症および分娩後敗血症の診断が可能となる。さらに、かかる実施形態は非臨床サンプル、例えば抗体サンプルの滴定、ハイブリドーマの選択等などの非臨床サンプルにも適用し得る。別に、臨床サンプルは、動物源からでもよく、ウシ、ヒツジおよびヤギなどの家畜動物も含み得る。ネコ、イヌおよびウマ源由来のサンプルもまた、本明細書に記載の方法に従って使用し得る。
本明細書に記載の方法は、微生物感染、例えば黄色ブドウ球菌感染および例えば上気道炎(例えば中耳炎、細菌性気管炎、急性喉頭蓋、甲状腺炎)、下気道炎(例えば気腫、肺膿瘍)、心臓(例えば心内膜炎)、胃腸(例えば分泌性下痢、膿瘍、後腹膜膿瘍)中枢神経系(例えば脳膿瘍)、眼(例えば眼角部、結膜炎、角膜炎、眼内炎、前隔および眼か峰巣炎、ダークリオサイスティティス(darcryocystitis))、腎および尿管(例えば副睾丸、腎内および腎周囲膿瘍、毒素性ショック症候群)、皮膚(例えば膿痂症、毛嚢炎、皮膚膿瘍、峰巣炎、創感染、細菌性筋炎、骨および関節(例えば敗血症性関節炎、骨髄炎)の診断に有用である。
方法は、黄色ブドウ球菌などの微生物を含むことが疑われるサンプルを得る段階を含む。サンプルは、ヒトを含む動物から、例えば創傷、血液、唾液、組織、骨、筋肉、軟骨、または皮膚から得られる。
タンパク質、またはその活性フラグメント、およびタンパク質に対する抗体は、診断法に関して上記したように黄色ブドウ球菌などの細菌感染治療および診断に;能動または受動免疫の抗−黄色ブドウ球菌ワクチンの開発に有用であり;および製薬組成物として、創傷に投与するか、またはインビトロおよびインビボで医学装置またはポリマー生体物質を被覆するために使用する場合、タンパク質および抗体の両方共、創傷部位または生体物質への黄色ブドウ球菌の結合を防止または阻害するためのブロッキング剤として有用である。好ましくは、抗体を修飾して、投与する患者の免疫原性を低下させる。例えば、患者がヒトであるならば、抗体は、ハイブリドーマ由来抗体の相補決定領域を、記載したヒトモノクローナル抗体に移植することにより「ヒト化」し得る(Jonesら,1986;Tempestら1991)。
本明細書に記載の抗体、タンパク質および活性フラグメントで被覆する医学装置またはポリマー生体物質は、以下に限定されないが、ステープル、縫合針、置換心臓弁、心臓補助装置、ハードおよびソフトコンタクトレンズ、眼内レンズ移植(前房、後房または水晶体)、他の埋め込み、例えば角膜インレー、角膜−プロテーゼ、血管ステント、エピケラトファリア(epikeratophalia)装置、緑内障シャント、網膜ステープル、鞏膜バックル、歯プロテアーゼ、甲状腺形成装置、喉頭形成装置、血管移植片、軟および硬組織プロテーゼ(以下に制限されないが、ポンプ、刺激装置および記録器を含む電気装置を含む)、聴力ネフローゼ、ペースメーカー、人工喉頭、歯インプラント、乳房インプラント、陰茎インプラント、頭蓋骨/顔面腱、靭帯、半月および円盤、人工骨、人工器官(人工すい臓、人工心臓、義肢、および心臓弁を含む);ステント、ワイヤー、ガイドワイヤー、静脈内および中心静脈カテーテル、レーザーおよびバルーン血管形成術装置、血管および心臓装置(チューブ、カテーテル、バルーン)、心室補助、血液透析成分、血液人工心肺、尿道/尿管/排尿装置(フォーリーカテーテル、ステント、チューブおよびバルーン)、気道カテーテル(気管内および気管切開チューブおよびカフ)、経管栄養法(経鼻的胃、胃内および空腸チューブ)、創傷排膿チューブ、胸膜、腹膜、頭骸、および心臓腔などの体腔を流すために使用するチューブ、血液バッグ、試験チューブ、血液回収チューブ、ワクチン器、シリンジ、針、ピペット、ピペットチップ、および血液チューブを含む。
本明細書で使用した「被覆した」または「被覆する」という用語は、タンパク質、抗体または活性フラグメントを、装置の表面、好ましくは黄色ブドウ球菌感染の間などの選択された微生物にさらされるであろう外表面に適用することを意味することは当業者により理解されるだろう。装置の表面は、完全にタンパク質、抗体または活性フラグメントにより覆われる必ずしも必要はない。
関連した実施形態において、本発明は、サンプル中のMSCRAMM−由来エピトープ−特異的抗体の存在を検出するのために使用し得るキットの調製に関する。一般的に言えば、本発明に記載のキットは、免疫検出試薬と共に適当なタンパク質またはペプチドを、およびタンパク質またはペプチドおよび試薬を含む方法を含む。
免疫検出試薬は、典型的には、MSCRAMM−関連タンパク質またはペプチドに関連した、または二次結合リガンドに関連した標識を含む。例示的リガンドは、最初のMSCRAMM−関連タンパク質またはペプチドに対して指向した二次抗体、または関連したラベルを有するビオチンまたはアビジン(またはストレプトアビジン)を含む。ヒト抗体に結合アフィニティを有する抗体に結合した検出ラベルはまた、例えば、最初の試薬は、ヒトサンプル由来の反応性抗体を結合するために使用されるMSCRAMM−関連ペプチドである場合のプロトコールについて考えられる。もちろん、上記したように、数多くの例示的標識が当分野で公知であり、全てのこのような標識が本発明に関連して使用され得る。キットは、キットの使用者によりコンジュゲートされる、完全にコンジュゲートした形、中間体の形、または別々の部分のいずれかで抗原または抗体−標識コンジュゲートを含み得る。
容器は、一般的に、少なくとも1つのバイアル、試験チューブ、フラスコ、ボトル、シリンジまたは他の容器を含み、そこに抗原を静置し得、好ましくは適当に配置する。二次結合リガンドが提供されれば、キットはまた、一般的に、二次バイアルまたは他の容器を含み、そこにこのリガンドまたは抗体を静置し得る。本発明のキットはまた、典型的に、市販するために閉じた容器にバイアルを入れておく方法、例えば注入または吹き込み形成容器(これに所望のバイアルを保存する)を含む。
4.8 製薬組成物
タンパク質、核酸分子、抗体、またはそのフラグメントを含む製薬組成物は、例えば食塩水、デキストロース、水、グリセロール、エタノール、他の治療化合物、およびその組み合わせなどの医薬的担体と組み合わせて調剤し得る。製剤は、投与形態に適用でなければならない。組成物は、黄色ブドウ球菌宿主細胞のフィブロネクチンとの結合により例示されるように、フィブロネクチン結合タンパク質とフィブロネクチンの相互作用を干渉、調節、または阻害するのに有用である。
適当な投与法は、以下に限定されないが、局所、経口、肛門、膣、静脈内、腹膜内、筋肉内、皮下、鼻腔内、および皮内投与を含む。局所投与については、組成物を、軟膏、クリーム、ゲル、ローション、液滴(例えば点眼液および点耳液)、または溶液(例えばうがい薬)の形で調剤する。創傷または手術包帯、縫合およびエアロゾルに化合物を染み込ませ得る。組成物は慣用的な賦形剤、例えば保存剤、浸透を促進する溶媒、および軟化剤を含む得る。局所製剤はまた、クリームまたは軟膏ベース、エタノール、オレイルアルコールなどの慣用的な担体を含み得る。
本明細書に開示された製薬組成物は、特定の適用に基づき種々の方法で送達され得る。経口投与については、組成物は、不活性希釈剤と共にまたは同化可能な食用の担体と共に調剤され得るか、またはそれらは直接硬または軟殻ゼラチンカプセルに封入し得るか、または圧縮して錠剤にし得るか、または直接、食事の食べ物と共に取り込まれ得る。経口治療投与についいては、活性化合物を、賦形剤と共に取り込み、摂取可能な錠剤、バッカル錠剤、トローチ、カプセル、エリキシル、懸濁液、シロップ、水等の形で使用し得る。かかる組成物および調製物は、少なくとも0.1%の活性化合物を含むべきである。組成物および調製物の比率は、もちろん、変化し得、簡便には単位重量が約2ないし約60%であり得る。かかる治療的に有用な組成物における活性化合物の量は、適当な薬用量が得られるものである。
錠剤、トローチ、丸剤、カプセル剤等はまた、以下を含み得る:トラガカントゴム、アカシア、コーンスターチ、またはゼラチンなどの結合剤;リン酸ジカルシウムなどの賦形剤;コーンスターチ、ポテトスターチ、ステアリン酸等などの崩壊剤;ステアリン酸マグネシウムなどの潤滑剤;およびスクロース、ラクトース、またはサッカリンなどの甘味剤を添加し得るか、またはペパーミント、ウインターグリーン油、またはチェリー香味剤などの香味剤。投与単位形態がカプセル剤である場合、上記の種類の物質に加えて液体担体を含み得る。種々の他の物質がコーティングとして、またはそうでなければ投与単位形態の物理的形を修飾するために存在し得る。例えば、錠剤、丸剤、またはカプセル剤は、シェラック、糖またはその両方によりコーティングされ得る。エリキシルシロップは、活性化合物、甘味剤のスクロース、保存剤のメチルおよびプロピルパラベン、色素、およびチェリーまたはオレンジ香味などの香味剤を含み得る。もちろん、どの投与単位形態を調製するのに使用したどの物質も医薬的に純粋で、使用する量では実質的に無毒性でなければならない。さらに、活性化合物は、持続放出調製物および製剤に取り込まれ得る。
経口予防のために、ポリペプチドを、賦形剤と共に取り込み、摂取不可能なうがい薬および歯磨き剤の形で使用し得る。うがい薬は、必要量の有効成分を、ホウ酸ナトリウム溶液などの適当な溶媒に混ぜることにより調製し得る(ドベル溶液)。あるいは、有効成分を、ホウ酸ナトリウム、グリセリンおよび二炭酸カリウムを含む防腐洗浄水に混ぜ得る。有効成分はまた、ゲル、ペースト、粉末およびスラリーを含む歯磨き粉に分散し得る。有効成分は、水、結合剤、研磨剤、香味剤、発砲剤および湿潤剤を含み得るペースト状の歯磨き粉に、治療有効量を添加し得る。
あるいは、本明細書に開示した製薬組成物は、非経口、静脈内、筋肉内、または腹膜内に投与し得る。遊離塩基または製薬学的に許容しうる塩としての活性化合物の溶液は、水中でヒドロキシプロピルセルロースなどの表面活性剤と適当に混合することにより調製し得る。分散液はまた、グリセロール、液体ポリエチレングリコール、およびその混合物中、および油中で調製し得る。通常の貯蔵および使用条件下では、これらの調製物は、微生物の成長を防ぐために保存剤を含む。
注入用途に適当な医薬形態は、無菌注入溶液または分散液の即座の調製のための、無菌水溶液または分散液および無菌粉末を含む。全ての場合において、形は無菌でなければならず、容易にシリンジ操作ができるような程度の液体でなければならない。製造および貯蔵の条件下で安定でなければならず、細菌および真菌などの微生物の汚染作用から保護されなければならない。担体は、溶媒または分散培地となることができ、これは例えば水、エタノール、ポリオール(例えば、グリセロール、プロピレングリコール、および液体ポリエチレングリコール等)、その適当な混合物、および/または植物油を含む。例えば、レシチンなどのコーティングを使用することにより、分散の場合に必要な粒子サイズを維持することにより、および表面活性剤の使用により、適度な流動性が維持され得る。微生物の作用の防御は、種々の抗菌およ抗真菌剤、例えばパラベン、クロロブタノール、フェノール、ソルビン酸、チメロサール等によりもたらすことができる。多くの場合、例えば糖または塩化ナトリウムなどの等張化剤を含むことが好ましい。注入可能な組成物の吸収延長は、組成物において、例えばモノステアリン酸アルミニウムおよびゼラチンなどの吸収を遅延させる試薬を使用することによりもたらすことができる。
水溶液の非経口投与では、例えば、溶液は必要であれば適当に緩衝し、液体希釈剤を始めに充分な食塩水またはグルコースで等張化する。これら特定の水溶液は、特に、静脈内、筋肉内、皮下および腹膜内投与に適している。これに関連して、使用できる無菌水性媒体は、本開示に照らして当業者には公知である。例えば、1薬用量を1mlの等張NaCl溶液に溶かし、1000mlの皮下液に添加するか、または還流の指定部位に注入し得る。(例えば、「Remington’s Pharmaceutical Sciences」第15版、p.1035−1038および1570−1580参照)。処置する被験体の状態により必然的に用量は変化する。投与責任者は、とにかく、個々の被験体について、適当な用量を決定する。さらに、ヒトの投与においては、調製物は、生物学基準のFDA事務局により要求される、無菌、発熱性物質、一般的安全性および純度基準を満たさなければならない。
無菌注入溶液は、必要量の活性化合物を、上記に掲げた種々の他の成分と共に、適当な溶媒中に混合することにより調製し、必要に応じて濾過滅菌する。一般的に、分散液は、種々の無菌有効成分を、基本的な分散培地および上記の中から必要な他の成分を含む無菌媒質に混ぜることにより調製される。無菌注入溶液の調製用の無菌粉末の場合、好ましい調製法は、真空乾燥および凍結乾燥技術であり、これによりその前記した滅菌濾過溶液から、粉末の有効成分および追加的な所望の成分が得られる。
本明細書に開示した組成物は、中性または塩の形で調剤し得る。製薬学的に許容しうる塩は酸付加塩(タンパク質の遊離アミノ基で形成される)を含み、これは例えば塩酸またはリン酸などの無機酸、または酢酸、シュウ酸、酒石酸、マンデル酸等などの有機酸で形成される。遊離カルボキシル基で形成された塩も、例えば、水酸化ナトリウム、カリウム、アンモニウム、カルシウム、または鉄などの無塩基、および例えばイソプロピルアミン、トリメチルアミン、ヒスチジン、プロカイン等などの有機塩基から誘導することができる。調剤時に、溶液を投与形態に合う方法で投与し、量は治療有効量である。製剤は、例えば注入溶液、薬剤放出カプセル等など種々の投与形で容易に投与される。
本明細書で使用しているように、「担体」はあらゆる全ての溶媒、分散培地、媒質、コーティング、希釈剤、抗菌および抗真菌剤、等張および吸着遅延剤、緩衝剤、担体溶液、懸濁液、コロイド等を含む。かかる媒体および医薬的に活性な物質の薬剤の使用は当分野ではよく知られている。慣習的な媒体または薬剤が有効成分と融和性でないことを除いて、治療組成物におけるその使用が意図される。補足的な有効成分もまた、組成物中に取り込むことができる。
「医薬的に許容できる」という用語は、ヒトに投与した場合に、アレルギーまたは類似の不適当な反応を引き起こさない分子自体および組成物を意味する。有効成分としてタンパク質を含む水性組成物の調製は、当分野でよく理解されている。典型的には、かかる組成物は、液体溶液または懸濁液のいずれかの注入可能物質として、溶液または懸濁液に混ぜるのに適当な固体形態として調製され、注入前に液体も調製することができる。
4.9 ワクチン
本発明は、能動および受動免疫態様の両方において使用するワクチンに関する。ワクチンとして使用するのに適当であると提唱されている免疫原性組成物は、新規免疫原性タンパク質および/または直接的に本発明に記載のペプチドエピトープから最も容易に製造し得る。好ましくは、抗原性物質を充分に透析して所望でない小分子量分子を除去しおよび/または所望の媒体により容易に製剤化するために凍結乾燥する。
有効成分としてペプチド配列を含むワクチンの調製は、一般的に、米国特許第4,608,251号;4,601,903;4,599,231;4,599,230;4,596,792および4,578,770(これら全て引用してここに援用する)により例示されているように、当分野でよく理解されている。典型的には、かかるワクチンは、液体溶液または懸濁液として注入可能物質として、溶液または懸濁液に混ぜるのに適当な固体形態として調製され、注入前に液体も調製し得る。調製物はまた乳化してもよい。活性免疫原性物質は、しばしば、医薬的に許容され有効成分と融和性の賦形剤と混合する。適当な賦形剤は、例えば、水、食塩水、デキストロース、グリセロール、エタノール等およびその組み合わせである。さらに、所望であれば、ワクチンは、湿潤または乳化剤、pH緩衝剤、またはワクチンの効力を高めるアジュバントなどの補助物質を少量含み得る。
MSCRAMM−由来タンパク質および/またはそれ由来の天然または修飾エピトープ性ペプチドを含む組成物はまた、エンドトキシン(LPS)が減少、削除または脱毒性化する限り、ヒトおよび動物ワクチンの基礎であり得る。実質的にエンドトキシンが含まれないかかる組成物の調製は、刊行されている方法を実施することにより達成でき、例えば米国特許第4,271,147号(引用してここに援用する)は、ワクチンに使用する髄膜炎菌膜タンパク質の調製法を開示しており;非毒素タンパク質および実質的にLPSが含まれない多糖組成物が記載されている。
MSCRAMM−由来エピトープ基礎ワクチンは、慣習的には、例えば皮下または筋肉内などの注入により、非経口投与し得る。他の投与形態に適当な追加の製剤は、坐剤およびある場合には経口製剤を含む。坐剤では、伝統的な結合剤および担体は、例えば、ポリアルカングリコールまたはトリグリセライドを含み得;かかる坐剤は、有効成分を0.5%から10%、好ましくは1−2%の範囲で含む混合物から形成し得る。経口製剤は、かかる通常使用される賦形剤を、例えば医薬的等級のマンニトール、ラクトース、デンプン、ステアリン酸マグネシウム、サッカリンナトリウム、セルロース、炭酸マグネシウム等として含む。これらの組成物は溶液、懸濁液、錠剤、丸剤、カプセル剤、持続放出製剤または粉末の形態をとり、10−95%、好ましくは25−70%の有効成分を含む。
本発明のペプチドおよび/またはタンパク質は、中性または塩の形としてワクチンに調剤され得る。製薬学的に許容しうる塩は酸付加塩(ペプチドの遊離アミノ基で形成される)を含み、これは例えば塩酸またはリン酸などの無機酸、または酢酸、シュウ酸、酒石酸、マンデル酸等などの有機酸で形成される。遊離カルボキシル基で形成された塩も、例えば、水酸化ナトリウム、カリウム、アンモニウム、カルシウム、または鉄などの無塩基、および例えばイソプロピルアミン、トリメチルアミン、2−エチルアミノエタノール、ヒスチジン、プロカイン等などの有機塩基から誘導し得る。
ワクチンは、薬剤形と融和する方法で、治療的に効果があり免疫原性のある量で投与し得る。投与する量は、例えば個々の免疫系の抗体産生能、および所望の保護度などを含む、治療する被験体に依存する。投与に必要な有効成分の正確な量は、当業者により容易に決定できる。しかし、適当な用量範囲は一回のワクチンに対して活性成分が数百マイクログラムという次元である。初回投与および促進注射の適当な方法は可変であるが、初回投与に続いて次の接種または他の投与が続くのは典型的である。
適用方法は大きく変化し得る。ワクチン投与に関するどの慣習的な方法も適用可能である。これらは、固体生理学的許容基剤上、または生理学的に許容できる分散液における経口適用、非経口、注入またはその他を含むと信じられている。ワクチンの用量は投与経路に依存し、宿主のサイズにより変化する。
ワクチンのアジュバント効果を得るための種々の方法は、水酸化アルミニウムまたはリン酸化(アルミニウム)などの試薬の使用、一般的に0.05から0.1%リン酸緩衝食塩水が使用され、0.25%溶液として使用する糖の合成ポリマー(カルボポール)を添加して、それぞれ70℃ないし101℃の範囲の温度で30秒から2分間の熱処理によるワクチン中タンパク質の凝集を含む。ペプシンでの再活性化による凝集は、アルブミンに対する(Fab)抗体を処置し、C.parvumまたはエンドトキシンなどの細菌細胞またはグラム陰性細菌のリポポリサッカリド成分、モノオレイン酸マンニド(アラセルA)などの生理学的に許容される油媒体中エマルション、またはブロッキング置換基として使用する20%溶液ペルフルオロカーボン(Fluosol−DA)のエマルションもまた使用し得る。
多くの場合、複数のワクチン投与が望ましく、通常6ワクチン接種以下、より通常的には4ワクチン接種以下、好ましくは1またはそれ以上、通常少なくとも約3ワクチン接種である。ワクチン接種は、通常、2から12週間隔で、通常3から5週間隔である。定期的接種は1から5年間隔、通常3年が、抗体の防御レベルを維持するのに望ましい。免疫化の過程は、上清抗原に対する抗体アッセイにより追跡し得る。アッセイは、慣習的なラベル、例えば放射核、酵素、蛍光等で標識することにより行い得る。これらの技術はよく知られており、幅広い範囲の特許で、例えば米国特許第3,791,932;4,174,384および3,949,064で見られ、これらの型のアッセイが説明されている。
もちろん、DNAワクチン接種に関する新規な技術に照らして、実質的に全てのかかるワクチン接種療法が、DNAベクターおよび構築物での使用に適当であることが理解されよう(Ulmerら(1993)、Tangら(1992)、Coxら(1993)、Fynanら(1993)、Wangら(1993)およびWhittonら(1993)により記載、これは引用によりここに援用する)。DNA接種の非経口経路に加えて(筋肉内および静脈内注入を含む)、粘膜ワクチン接種も意図され、DNA組成物液滴を鼻または気管に投与することにより達成され得る。遺伝子弾丸を使用してDNAの免疫原性有効量を表皮に送達し得ることが特に考えられる(Fynanら1993)。
4.10 アフィニティクロマトグラフィー
アフィニティクロマトグラフィーは、一般的に、リガンドまたは抗体などの物質によるタンパク質の認識に基づいている。カラム物質は、活性化ダイなどの結合分子を、例えば不溶性マトリクスに共有結合することにより合成し得る。カラム物質は、次いで、溶液から所望の物質を吸着する。次に、結合がおこらない条件下で変化させ、基質を溶出する。アフィニティクロマトグラフィーが成功するに必要なことは:
(1)マトリクスが目的の分子に特異的に吸着しなければならない;
(2)他の汚染物質が吸着されないままであること;
(3)その結合活性を変化させることなくリガンドが結合していなければならない;
(4)リガンドはマトリクスに充分にしっかりと結合していなければならない;
(5)目的の分子を分解することなく溶出することが可能でなければならない。
本発明の好ましい実施形態は、溶液からの抗体精製におけるアフィニティクロマトグラフィー法であり、ここで、マトリクスは、セファロースCL6BまたはCL4Bに共有結合した、FnBPA、FnBPB、FnBA、FnBBまたはSfbから誘導したMSCRAMM−由来ペプチドエピトープを含む。このマトリクスは、直接本発明の抗体に結合し、塩、GuHCl、pH、または尿素などの適当な勾配による溶出によりその分離を可能とする。
別の本発明の好ましい実施形態は、溶液からのペプチドおよびペプチドエピトープの精製におけるアフィニティクロマトグラフィー法である。この方法に好ましいマトリクスは、セファロースCL4Bに共有結合した抗体9C3または11A5である。マトリクスは、直接本発明のアミノ酸組成物に結合し、上記の適当な緩衝液で溶出することにより、その分離を可能とする。
4.11 細菌病原体
発明者は、数多くの治療および予防処置において有用な本発明の方法および組成物を考える。いくつかの異なる生物体が、Fn結合MSCRAMMを発現するために記載されており、それ故、本発明には多くの可能性のある候補がある。可能性のある候補であると考えられるグラム陽性細菌には以下が含まれる:黄色ブドウ球菌、表皮ブドウ球菌、Staphylococcus hemolyticus、Staphylococcus simulans、Staphylococcus hominus、Staphylococcus lugdunensis、Staphylococcus intermedius、Staphylococcus saprophyticus、Staphylococcus capitis、Staphylococcus warneri、化膿連鎖球菌(グループA)、Streptococcus dysgalactiae(グループC)、Streptococcus equisimilis(グループC)、Streptococcus zooepidemicus(グループC)、Streptococcus spp.(グループB)、Streptococcus spp.(グループG)、Enterococcus faecalis、Pneumocystis cariniiおよび関連種。
また特に重要であると考えられるグラム陰性種には以下が含まれる:大腸菌、緑膿菌、肺炎桿菌、Yersinia sp.、らい菌、結核菌、ウシ結核菌、Treponema denticolaおよび梅毒トレポネーマ。
5.実施例
以下の実施例は本発明の好ましい実施態様を示す。以下の実施例に開示した技術は発明者らによって本発明の実施に好適であると判断された技術であり、従って本発明の好ましい実施態様であると考えられることは当業者に容易に理解されよう。しかしながら当業者はまた、この開示に基づいて、記載された特定実施態様の種々の変更が可能であり、これらの変更が本発明の要旨及び範囲を逸脱することなく同様または類似の結果を与えることも理解されよう。
5.1 実施例1−Fnに対する接着を阻害する抗体組成物:S.dysgalactiae FnbA及びFnbBに由来のエピトープ類似体の合成
以下の方法を用いて、合成ペプチドのアミノ酸置換を行ってFn結合活性を喪失したペプチドを産生する。組換えFn結合性MSCRAMMタンパク質についてこのような活性喪失を評価する。Fn結合活性の喪失に導くように変異した合成ペプチドを模擬的に作製するために、部位特異的突然変異誘発を用いて適当なアミノ酸の系統的変異を惹起する。先行文献(Spezialeら,1984)に発表された手順を使用し、単離rFnBD−Dの天然形態と突然変異形態とのFn結合活性を比較する。次に、選択された組換えFn結合性MSCRAMMと合成ペプチドとを抗体として使用して阻止抗体を産生させる。
5.1.1 ペプチドの合成及び精製
Fmoc(Chang and Meienhofer,1978)またはBoc化学法(Erickson and Merrifield,1976)を使用し、Advanced ChemTech MPS 396ペプチドシンセサイザー(Louisville,KY)でペプチドを合成する。特に注釈がない限り、先行文献(Hancock,1984)に記載の方法を使用し、分取用スケールのC18カラム(Vydac218TP510;The Separation Group,Hesparia,CA)及びWaters 625 LC HPLCシステム(Milford,MA)を用いた逆相高性能液体クロマトグラフィー(HPLC)によって粗調製物からペプチドを精製する。精製に使用した水性バッファ(バッファA)は、0.11%(容量/容量)のリン酸と、0.28%(容量/容量)のトリエチルアミンと、0.25mMのEDTA,pH6.5とから構成されていた。有機バッファ(バッファB)は、アセトニトリル中の15%(容量/容量)のバッファAから構成されていた。逆相クロマトグラフィー後、ペプチドを含有する画分を50mMの炭酸水素アンモニウムに十分に透析し凍結乾燥した。分析用C18カラム(Vydac 218TP546)を用いた逆相クロマトグラフィーによってこれらの画分の純度を分析した。このために、バッファCは0.1%(容量/容量)のトリフルオロ酢酸(TFA)水溶液から構成され、バッファDは90%(容量/容量)アセトニトリル中の0.1%(容量/容量)のTFAから構成されていた。80%のバッファEまでの勾配を使用してペプチドを溶出させ、溶出したペプチドを次に回転蒸発によって乾燥し、N末端配列解析またはアミノ酸組成分析を行った。
S.aureus fnbA遺伝子(GenBank受託番号#P14738)(Signasら,1989)のアミノ酸配列に基づいて、改変アミノ酸残基をもつペプチドを産生するために種々の突然変異を誘発し得る。太字残基はプロリン置換アミノ酸変異を示す。Auの突然変異体の作製によって記載の改変アミノ酸配列が得られる。
S.dysgalactiaeのfnbA及びfnbB遺伝子のAU、A1−A3及びB1−B3ドメインに同様の突然変異を誘発し得る。また、突然変異したエピトープを作製し、次いでS.pyogenesに対するFn結合を阻害する阻止抗体を産生させるために、近縁細菌S.pyogenesのsfb遺伝子のP1−P4ドメインにも同様の突然変異を誘発し得る。他の領域としては、S.aureusのfnbB遺伝子中の反復(リピート)、S.equisimilisのE1−E3反復及びGストレプトコッカス群のG1−G4反復がある。
種々の微生物の保存されたリガンド結合領域には高度の相同性が見出されるので、S.aureus、S.dysgalactiae及び近縁細菌に関して本発明で概説した原理は、これらの生物中で同様の突然変異を構築するために使用できる。このような結果はJohら(1994)によって証明されていた。彼らは、S.aureus D1−D3に由来のペプチドがS.dysgalactiae及びS.pyogenesに対するFnの結合を阻害することを証明した。同様に、S.dysgalactiaeに由来のペプチド(A1−A3)はFnに対するS.aureus及びS.pyogenesの結合を阻害した。
5.2 実施例2−Fnに対する接着を阻害する抗体組成物:S.aureusのFnBPA由来のDU及びD1−D4エピトープ類似体の合成
実施例1で発明者らは、種々のストレプトコッカス(連鎖球菌)及びスタフィロコッカス(ブドウ球菌)のフィブロネクチン結合性タンパク質の種々のドメインを認識する阻止抗体を産生するために使用されるエピトープ類似ペプチドの合成を報告した。この実施例では、S.aureus fnbA遺伝子のFn結合性ドメインDU及びD1−D4を用いた合成エピトープの作製を記載する(図1)。DU及びD1−D4の突然変異体の作製によって以下の表2に示す改変アミノ酸配列が得られる。
更に、複数の突然変異アミノ酸残基を有するペプチドを作製するために、表2に示すコドンと同様の修飾コドンを用いて単一突然変異、二重突然変異、三重突然変異などの多数の組合せを作製し得る。
対応する合成ペプチドの各々に生じたアミノ酸置換によるFn結合活性の喪失を評価した。次にこれらのペプチドを使用してin vitro及びin vivoの双方で細菌細胞に対するFn結合を阻止し得る抗体を産生させた。
5.3 実施例3−Fnに対するS.aureusの接着を阻害する抗体組成物:部位特異的突然変異誘発またはfbpA由来エピトープをコードするDNA
本発明のS.aureus fnbA DNAセグメントは組換えペプチドの産生に特に有用である。これらのペプチドは天然型のDUもしくはD1−D4エピトープでもよくまたは部位特異的に修飾されたDUもしくはD1−D4に由来のペプチドでもよい。本文中に開示した部位特異的突然変異誘発の汎用技術は、改変DNA配列を含む核酸セグメントの調製に使用できる。このような手順を以下に詳細に説明する。
本発明の核酸組成物の部位特異的突然変異を誘発するためには、PCR(商標)に基づく鎖オーバーラップ伸長(strand overlap exteonsion,SOE)(Hoら,1989)による部位特異的突然変異誘発が特に好ましい。PCR(商標)の技術は前述したように当業者によく知られている。SOE手順は、2段階PCR(商標)プロトコルを含み、相補的な内部プライマー対(B及びC)を使用して野生型配列にヌクレオチド変異を適宜導入する。別々の2つの反応中に、フランキングPCR(商標)プライマーA(オリゴに組み込まれた制限部位)及びD(オリゴに組み込まれた制限部位)をプライマーB及びCと共に使用して、それぞれにPCR(商標)産物AB及びCDを産生させる。PCR(商標)産物をアガロースゲル電気泳動によって精製し、オーバーラップする2つのPCR(商標)フラグメントABとCDとをフランキングプライマーA及びDに組合せて、第二のPCR(商標)反応に使用する。増幅したPCR(商標)産物をアガロースゲルで精製し、適当な酵素で消化し、発現ベクターに結合し、大腸菌株JM101,XL1−Blue(商標)(Stratagene,LaJolla,CA)、JM105またはTG1(Carterら,1985)細胞を形質転換させる。クローンを単離し、単離したプラスミドの配列決定によって突然変異を確認する。
次に、S.aureus fnbA遺伝子の部位特異的に修飾されたDNAセグメントを以後の実施例に記載するように使用して、組換えペプチドを超発現させこれらのペプチドを大量に単離する。このように単離されたペプチドは、動物体内の免疫応答の誘発、産生されたペプチド特異的抗体の単離、のような本文中に記載のいくつかの方法に使用し得る。
プロテインAアフィニティ精製したIgG調製物、抗Fn−peps及び抗D3pepについて、それらのエピトープ特異性を試験し、且つ、S.aureusのフィブロネクチン結合性MSCRAMM,FnBPAのD反復に対するフィブロネクチンの結合を阻害する能力を試験した。ELISAでは、抗D3pep抗体は主としてD3及びD4の配列と相互作用した。抗Fn−peps抗体はもっと広い特異性を示し、すべてのD反復と種々の親和性で相互作用した。
抗体の阻止活性を試験するために、表面固定化フィブロネクチンに対するD反復とグルタチオン−Sトランスフェラーゼ(GST)との融合物の結合の阻害を試験した。双方の抗体がフィブロネクチンに対するGST−D3の結合を有効に阻害した。阻害アッセイでGST−D123を使用したとき、抗Fn−pepsは強力な阻害活性を示したが、抗D3pepの効果は境界的であった。抗D3pepに強力な阻害活性が欠如していることは、エピトープ局在に観察されるような狭い特異性の表れであろう。
抗原の詳細:
抗D3pep IgGは、合成ペプチドKPSYQFPGHNSVDFEEDTLPKV(配列13)でウサギを免疫感作することによって産生した。ペプチドは7位に単一アミノ酸変異(グリシンをプロリンで置換)を含む。免疫感作に先立ってペプチドをキーホール・リンペット・ヘモシアニン(KLH)に結合させた。
抗Fn−peps IgGは、前出の表2に示した突然変異ペプチドDU(配列4)、D1(配列6)、D2(配列8)及びD3(配列10)の混合物でウサギを免疫感作することによって産生した。免疫感作に先立って4つのペプチド全部を個別にKLHに結合させ、次いで等量ずつ混合した。対応する野生型ペプチド(DU(配列3)、D1(配列5)、D2(配列7)及びD3(配列9))も表2に示している。
5.3.1 抗体エピトープ組成物及びその使用方法
抗Fn−peps IgGは全部のD反復と相互作用し、これは異種免疫原に対応し得る広い特異性を表す。抗D3pep IgGではもっと狭い特異性が観察され、その主要結合部位がD3及びD4だけに局在する。
抗Fn−peps及び抗D3pep抗体に対するエピトープの所在をELISA及びウェスタンブロット法によって決定した。ELISAでは、Staphylococcus aureusのフィブロネクチン結合タンパク質FnBPA(図4A)に由来のD反復を1つまたは複数個含むグルタチオン−Sトランスフェラーゼ(GST)融合タンパク質でマイクロタイターウェルを被覆した。次に、ウェルを抗体でプローブした。これらの試験では以下の標準ELISA手順を使用した。
(1)1μgのGST融合タンパク質を含む100μlのPBSと共にImmulon 2(登録商標)プレートのウェルを4℃で16時間インキュベートする。
(2)ウェルを空にし、3%のBSAを含む100μlのPBSを加える。室温で1時間維持し、0.1%のトゥイーン80(PBST)を含むPBSでウェルを5回洗浄する。
(3)0.1μgの抗体を含む100μlのPBSTB(PBST中の0.1%BSA)を加える。室温で1時間維持する。PBSTBでウェルを5回洗浄する。アルカリホスファターゼにコンジュゲートした0.05%のヤギ抗ウサギIgGを含む100μlのPBSTBと共にウェルを室温で1時間インキュベートする。ウェルをPBSTBで5回洗浄する。
(4)1Mのジエタノールアミン、0.5mMのMgCl2,pH9.8中に1mg/mlのp−ニトロフェニルホスフェートを含む100μlの溶液を添加し、室温で10〜20分間維持する。プレート読取り装置を使用して405nmの色の強度を測定する。
結果(図4B及び図4C)は、抗Fn−pepsが全部のD反復を種々の反応性で認識することを示す。他方、抗D3pep抗体は比較的狭い特異性を示した。抗体は主としてD3及びD4と反応した。GST−D123に対する高い反応性の理由は、組換えタンパク質中のD3反復の存在にあると推測される。
5.3.2 D反復とフィブロネクチンとの結合に対する抗体の効果
抗Fn−peps抗体及び抗D3pep抗体はフィブロネクチンとD反復との間の相互作用を有効に阻害した。
抗Fn−peps抗体及び抗D3pep抗体について、マイクロタイタープレートウェルに固定したウシのフィブロネクチンに対するGST−D3またはGST−D123の結合を阻害する能力を試験した。使用したアッセイ手順の詳細を以下に示す。
(1)1μgのウシのフィブロネクチンを含む100μlのPBSでImmulon2プレートのウェルを4℃で16時間被覆する。
(2)ウェルを空にし、3%のBSAを含む100μlのPBSを加える。室温で1時間維持し、0.1%のトゥイーン80を含むPBS(PBST)でウェルを5回洗浄する。
(3)種々の量の抗体を予め混合しておいた0.05%のビオチニル化GST融合タンパク質を含む100μlのPBSTBをウェルに加える。室温で1時間維持する。次いでPBSTでウェルを5回洗浄する。
(4)アルカリホスファターゼにコンジュゲートしたストレプトアビジンを含む100μlのPBSTBと共にウェルを室温で1時間インキュベートする。PBSTBでウェルを5回洗浄する。
(5)1Mのジエタノールアミン、0.5mMのMgCl2,pH9.8中に1mg/mlのp−ニトロフェニルホスフェートを含む100μlの溶液を添加し、室温で10〜20分間インキュベートする。ELISAプレート読取り装置を使用して405nmの色の強度を測定する。
双方の抗体は5mg/mlの濃度でフィブロネクチンに対するGST−D3の結合をほぼ完全に阻害した(図5A及び図5B)。プレ免疫血清に由来の免疫グロブリンを対照として使用した。プレ免疫IgGが結合阻害能力を有していないことは、抗Fn−peps抗体及び抗D3pep抗体が特異的活性を有することを証明した。
フィブロネクチンに対するGST−D123の結合を阻害する抗D3pepの能力は境界的であった。しかしながら、GST−D123とフィブロネクチンとの相互作用は抗Fn−pepsによって有意に低下した。抗D3pep IgGの存在下ではGST−D123はそのD1及びD2部分を介してフィブロネクチンに結合するが、この部分は抗Fn−peps抗体によって容易にブロックされると考えられる。
5.4 実施例4−fnbA由来抗原の組換え体発現
fnbA由来のMSCRAMM及び先行実施例に記載の合成的に修飾されたそれらのペプチド誘導体を超発現させるために、S.aureusのfnbA遺伝子の天然型エピトープ領域または遺伝的に修飾されたエピトープ領域をコードするDNAフラグメントを適当な発現ベクターにクローニングする。このようなベクターは、問題の核酸セグメントの発現が誘導プロモーターによって調節されるように当該核酸セグメントを配置する多数の制限酵素クローニング部位を含み得る。挿入されたセグメントの向き、プロモーターの誘発、増殖条件の決定、及び、制限酵素分析、及び、産生されたタンパク質の回収、などに関する方法は当業者に周知である。ペプチドの発現及び定量は、SDS−PAGE、ウェスタンブロット分析、タンパク質定量アッセイ、のような標準方法で測定できる。
fnbA由来のMSCRAMM及び合成的に修飾されたそれらのペプチド誘導体を超発現させるために使用される方法はまた、本文中に後述するようなS.aureusのfnbA遺伝子またはfnbB遺伝子に由来の他のペプチド、並びに、S.dysgalactiaeのfnbA遺伝子及びfnbB遺伝子に由来のペプチド、または、S.pyogenesのsfb遺伝子に由来のペプチドなどのような他の細菌のフィブロネクチン結合性タンパク質、ペプチド、及び、修飾ペプチド誘導体を超発現させるために使用できる。
本発明の1つの特徴は組換えタンパク質の量産である。このような方法は当業者に公知であり本文中でも詳細に前述した。総合的且つ普遍的な意味で、特定構築物及び組換えタンパク質産生用の種々の発現系の個々の利点に基づいて選択された種々の発現系を用いて、原核細胞中または真核細胞中で多数の組換えタンパク質が産生され得る。本発明の特徴は、本文中で詳細に前述したように、pQE(商標)(Qiagen Inc.,Catsworth,CA),pGEX(Pharmacia,Ltd.Piscataway,NJ)及びpMAL(New England Biolabs,Beverly MA)を使用することである。
5.5 実施例5−エピトープの円二色性(CD)分析
円二色性(CD,Woody,1974)の使用は突然変異タンパク質の完全分析の重要な要素である。これらのデータは結合活性の変化が突然変異タンパク質中のコンホメーション変化の結果であるか否かを判定するために有用である。
本発明の重要な特徴によれば、Jasco J720分光旋光計を使用し、組換えタンパク質及び突然変異タンパク質の平均的な二次構造及び三次構造を遠−及び近−UV円二色性(CD)分光法によってモニターする。190〜250nmのCDデータ(遠−UV CD)を表す少なくとも4つのスペクトルを0.2mm路長の水晶セル中で25℃で記録し平均化する。同様に、250〜320nmのCDデータ(近−UV CD)を表す少なくとも4つのスペクトルを1.0cm路長の水晶セル中で25℃で記録し平均化する。結果をモル楕円率(deg−cm2/モル)として表す。CBD(30−529)から観察されたスペクトルを標準として使用する。
5.6 実施例6−抗体組成物の調製
上述の合成ペプチド及び組換えペプチドを動物体内で免疫応答を誘発するため並びにこれらのエピトープに特異的な抗体を調製するために使用し得る。抗体の調製は本文中に前述したように当業者に公知である。簡単に説明すると、本発明の新規なペプチドを抗原として以下のように使用する。
各ペプチドをキーホール・リンペット・ヘモシアニン(KLH)に結合させ、皮下注射によってBALB/cマウスを免疫感作する。初回注射で250μgのタンパク質を投与し、7週後にブースター注射として250μgのKLH−結合ペプチドの各々を投与し、その1週後に採血する。注射を受けたマウス体内で産生されたポリクローナル抗体について、天然型MSCRAMM及び突然変異MSCRAMMを認識する能力をELISAアッセイで試験する。また、単離MSCRAMM及び完全形細菌に対するFnの結合を阻害する抗体の能力を、確立された阻害アッセイ(Johら,1994)を用いて試験する。阻止ポリクローナル抗体を産生するマウスからmAbが産生されるであろう。
2mgのKLHを200μlの脱イオン水で復元する。2mgのペプチドを0.5mlのコンジュゲーションバッファ(Pierce Chemical Co.,Rockford,IL)に溶解する。500μlのペプチド溶液を200μlのキャリアタンパク質溶液に添加し、次いで50μlの水に入れた0.5mgの1−エチル−3−(3−ジメチルアミノプロピル)カルボジイミド(EDC)を添加する。混合物をエンド−オーバー−エンドミキシングによって室温で2時間インキュベートする。1つの精製バッファ塩ボトルの中味を60mlの脱ガスした脱イオン水に溶解する。脱塩カラムを5mlの精製バッファで洗浄し、ペプチドキャリアー混合物をカラムの頂部から直接注入する。洗浄バッファの0.5mlのアリコートをカラムに添加し、各画分を個別の管に収集する。KLHにコンジュゲートしたペプチドがカラムの第一または第二の画分に存在する。
種々の組換えS.aureus MSCRAMM、合成ペプチド及びそれらのリガンドの相互作用に関する動力学的パラメーターを試験するために、実時間の生物物質特異的相互作用分析(BIAcore(商標;Pharmacia Biosensor AB,La Jolla,CA)を使用する。BIAcore(商標)は、表面プラスモン共鳴を利用して分子間相互作用を検出する。リガンドは、慣用の結合化学法を用いてデキストラン被覆センサチップに共有結合的に固定化され得る。微量流動システムを用い、固定化したリガンド上に“分析液”を連続的に流す。生物物質の分子間相互作用が実時間で記録されるので、大抵の場合にはオンレート(Kon,μM-1s-1)及びオフレート(Koff,s-1)のような動力学的データが得られる。更に、平衡結合定数(Kd)も計算できる。分析後、チップの表面を5mMのHClで再生する。これは、すべての結合分子を有効に除去し、次のサンプル処理を可能にする。この技術によれば、幾つかのグラム陽性細菌のMSCRAMMの解離定数、会合定数及び親和性定数の精密な値が得られる(Johら,1994;Pattiら,1995)。
5.7 実施例7−修飾MSCRAMMを用いた受動免疫方法
本文中に開示した抗体組成物は、FnのようなECM成分に対する細菌の接着を防止する動物の受動免疫に特に有用である。本文中に記載した部位特異的に修飾されたFn結合性MSCRAMMは動物ドナー、特にヒトのような哺乳動物ドナーを免疫感作するための抗原として特に有用であると考えられる。ドナーの血漿に由来の免疫グロブリン画分(Ig)を精製し、標的集団に全身的に投与できる。ストレプトコッカス及びスタフィロコッカスの感染症が進行する危険性の高い個体の非限定例としては、関節または弁の交換手術を受けた患者、心内膜炎の患者、重傷を負った患者、集中治療室の患者、免疫低下患者、連続的な外来腹腔内透析(CAPD)に使用されるカテーテルを装用している患者、外科手術を受けた患者、血管移植、皮膚移植及び他の侵入性外科処置を受けた患者がある。
本発明のペプチドで免疫感作することによって産生された抗Fn結合性MSCRAMM Igは複数の分野で特に有用である。
(1)Fnで被覆された基質に対する細菌の接着を阻止する。
(2)免疫系のオプソニン作用によるクリアランスを支援する。
(3)従来の補体経路の活性化によって細菌を溶解する。
5.8 実施例8−S.aureus菌Cowan株のビオチン標識及び突然変異合成ペプチドによるFn結合の阻害
S.aureus菌Cowan株を脳−心インフュージョンブロス(BHI;Difco)中で定速回転下に37℃で15時間培養した。遠心によって細菌を採集し、炭酸水素塩バッファ(50mMのNaHCO3,pH8.5)に最終密度1010細胞/mlまで再浮遊させた。最終密度は、サンプルの600nmの吸光度を、Petroff Hausserチェンバーでカウントした細胞とA600との関係を表す予め作成した標準曲線に比較することによって決定した。N,N−ジメチルホルムアミド中の細菌浮遊液(Pierce,Rockford,IL)に、1mlあたり100μlの1%のNHS−ビオチンを添加することによって、細菌細胞をビオチン標識した。スタフィロコッカスの細胞をNHS−ビオチンと共に定速回転下に室温で2時間インキュベートした。細菌細胞の遠心後に上清を除去することによってビオチニル化反応を停止させた。次に細菌をPBS中で3回洗浄して取込まれなかったビオチンを除去した。次に、細菌細胞浮遊液を1×1010細胞/mlに調節し、細胞をPBS,pH7.4中で4℃で保存した。非ビオチニル化細菌の増殖を防ぎバックグラウンドを低減するために、ナトリウムアジド及び0.1%BSAを添加した。
5.8.1 S.aureus FnBPAのD3野生型に基づく合成ペプチド
S.aureus FnBPAのD3反復に基づく一連のペプチドを、全配列中の各位置にプロリン残基を含むように合成した(即ち、プロリンスキャン;表3)。突然変異ペプチドについて、固定化フィブロネクチンに対するビオチニル化S.aureus結合を阻害する能力を先ず試験した。精製Fnを30μg/mlで含む100mlの溶液で、96ウェルのImmulon IIプレートのウェルを室温で2時間または4℃で一夜被覆した。ウェルを1×リン酸塩緩衝生理食塩水(PBS)−0.05%トゥイーン80で3回洗浄し、0.01%のトゥイーン80及び1%BSAを含むPBSで1時間ブロックした。1時間後、0.05%のトゥイーン80を含むPBSでウェルを再度洗浄した。合成ペプチドを1×PBSで5mg/mlの濃度に希釈し、5(図2A)、50(図2B)、または250μg/ウェル(図2C)の濃度で試験した。15〜25分後、50mlの量の合成ペプチドを各ウェルに添加し、次いで50mlのビオチニル化S.aureus細胞を添加した。プレートをシェーカーで軽く撹拌しながら室温で1時間インキュベートした。1時間後、ウェルをPBS−0.05%トゥイーン80で洗浄し、次いで1:5000に希釈した第二抗体ストレプトアビジンアルカリホスファターゼ中で30分間インキュベートした。30分後、ウェルを再度洗浄し、p−ニトロフェニルホスフェート(PNPP;1mg/ml)を含むジエタノールアミンと共に室温で30分間展開した。反応を405nmでモニターした。
更に、多重突然変異アミノ酸残基を有するペプチドを産生するために、1−21に示したコドンと同様の修飾コドンを用いて単一突然変異、二重突然変異及び三重突然変異などの多数の組合せを作製した。
同様にして、D1領域の改変アミノ酸配列を構築して表4に示す突然変異を作製し、また、表5に示すD2の突然変異、表6に示すDUの突然変異、表7に示すD4の突然変異を作製した。更に、AまたはBに誘発したアミノ酸変異とペプチドGまたはHの変異とを同時に組合せてペプチドを作製し、ペプチドVと命名した。この突然変異組合せ技術は、単一ドメインに1つ、2つ、3つまたはそれ以上の突然変異を有する一連の合成エピトープを作製するために、表3〜7に記載のすべての突然変異ペプチドに応用できる。また、各エピトープ中の単数または多数の酸残基も同様の方法で変異させ得る。このような突然変異をDU及び/またはD1−D4中で誘発し得る。
Advanced ChemTech MPS396ペプチドシンセサイザーの使用によって与えられる特別な利点は96のペプチドを同時に作製できることである。対応する合成ペプチドの各々に由来のアミノ酸置換について、それらのFn結合活性の喪失を評価する。次にこのようなペプチドを使用して、in vitor及びin vivoの双方で細菌細胞に対するFn結合を防止する抗体を産生させる。
5.8.2 結果
Fn結合性MSCRAMMに対して高い親和性をもつ阻止抗体の開発は、その“誘発適合”結合モードが障害となっていた。Fnに対する結合を不可能にするようなFnアドヘシン(付着因子)結合ドメインの部位特異的変異は、阻止抗体が産生されるような抗原を生じさせるであろう。S.aureus D3反復モチーフに基づいて21アミノ酸の長さの一連のペプチドを合成した。Fnに結合できないペプチドを作製する機会を最大にするために、21merペプチド内部の各残基を順次にプロリンで置換した(表3)。タンパク質の折返し構造(turn)中にしばしば見出されるプロリンはポリペプチドの二次構造を破壊することも知られている。次に、固定化Fnに対するS.aureusの付着を阻害するペプチドの能力をELISAによって試験した。
図2A、図2B及び図2Cに示すように、プロリン残基による置換は多少は予想外の結果を生じた。図2Cで最も明らかなように、突然変異ペプチドは概して、Fnに対するS.aureuの結合を阻害する能力が低下していた(表3のペプチド4、7)。しかしながら、幾つかの場合にはペプチドの阻害活性が増加しており(表3のペプチド1、2、3、8、11)、幾つかの場合にはペプチドはS.aureus Fn結合能力を実際に増進させた(表3のペプチド16、17、18、19、21)。S.aureusのFn結合性MSCRAMMは天然型のFn結合性MSCRAMMを表す独立の3つの結合ドメインを有しているので、ワクチン候補のタンパク質は各ドメインに部位特異的変異を含んでいなければならない。
ELISA実験に基づいて、グリシン残基が他の結合ドメイン(DU、D1及びD2)内部の同じ位置に保存されているので、S.aureusのFn結合性MSCRAMM中に見出される反復モチーフに基づく一連の追加ペプチドを、同じ位置にプロリン置換を含むように合成した(表8)。新しいペプチドについても、固定化Fnに対するS.aureus結合を阻害するそれらの能力を試験した。低濃度(10μg)のペプチド誘導体を対照サンプル(ペプチド非含有)と比較すると、D1及びD2の突然変異ペプチドは阻害活性を全く示さなかった(図3A)。より高い濃度(250μg)の突然変異ペプチドを試験すると、D1−2P及びDU−14Pから阻害活性が検出されたが(図3B)、突然変異ペプチドD2−22P及びDU−13Pは野生型ペプチドに比較して阻害活性を実質的に全く示さなかった。これらのデータは、プロリン置換がペプチドの総合的なFn結合能力を妨害したことを示唆する。
5.9 実施例9−Fn結合の阻害には幾つかのエピトープに特異的な抗体が必要である。
この実施例は異なる2つの形態の組換えD1−3免疫原に対する免疫応答を分析し、S.aureus及びFn結合性MSCRAMMに対するFn結合を阻害し得る抗体を産生するためには、抗体が保存配列を含む特異的エピトープに対する抗体でなければならないことを示す。更に、D3モチーフのC末端ハーフ中のこの保存配列に特異的な抗体を得る方法は、所望のエピトープを含む合成ペプチドによる免疫感作だけであった。
5.9.1 材料及び方法
5.9.1.1 細菌株、プラスミド及びタンパク質の精製
先行文献(Fromanら,1987)に記載されたS.aureus菌Newman株からFnBPを精製した。グルタチオンS−トランスフェラーゼ融合タンパク質GSTD1−3を大腸菌中で発現させるためのプラスミドpGEXD1−3は別の文献(Huffら,1994)に記載されていた。GSTD1−3をトロンビンで処理し、次いでイオン交換クロマトグラフィーで処理することによって組換えD1−3を精製した(Huffら,1994)。GSTD1−3及び組換えD1−3のモル吸光係数を使用して、280nmの吸光度1.0がそれぞれ0.95及び3.6mg/mlのタンパク質濃度に相当することを確認した。また、D1−3をコードするDNAをベクターpMAL−c2(New England BioLabs)中でクローニングして、マルトース結合性融合タンパク質MBPD1−3を大腸菌TB1中で発現させるpMALD1−3を作製した。MBPD1−3融合タンパク質を、細胞溶解物の選択的硫安沈殿、次いでPharmacia Gradi−Fracクロマトグラフィーシステムを用いるQ−セファロース及びフェニル−セファロース(Pharmacia)クロマトグラフィーによって精製した。抗体精製のためには、凍結乾燥した融合タンパク質を0.5Mの炭酸水素ナトリウム(2mg/ml)に溶解し、等量のカルボニルジイミダゾール活性化(Bethellら,1979)セファロースCL4B(Pharmacia)を添加することによってアフィニティマトリックスを調製した。エンド−オーバー−エンドミキシングによって4℃で48時間結合させた後、ビシンコニン酸プロトコル(Smithら,1985)を用いた残留タンパク質のアッセイによって結合効率70%を確認した。
5.9.1.2 合成ペプチド抗原の調製
Applied Biosystemsモデル431Aペプチドシンセサイザーを使用し、University of Calgary Peptide Synthesis Core Facilityによって、D1モチーフのアミノ酸21−34(D121-34;QGGNIVDIDFDSVP:配列60)及びD3モチーフのアミノ酸20−33(D320-33;QFGGHNSVDFEEDT;配列61)をN末端システインと共に合成した。Imject免疫原コンジュゲーションキット(Pierce;Rockford,IL)を備えたプロトコルに従って、ペプチドをN末端システインを介してマレイミド活性化キーホール・リンペット・ヘモシアニン(KLH)またはウシ血清アルブミン(BSA)に結合した。
5.9.1.3 坑血清の産生及び抗体の精製
6匹の雄ニュージーランド白ウサギを、フロインド完全アジュバント(Sigma)中の1mgのGSTD1−3の皮下注射によって免疫感作した。3匹のウサギのグループにはブースターとして不完全アジュバント中の80μgのGSTD1−3またはD1−3ペプチドの筋肉内注射を2週おきに投与した。各免疫感作の10日後に動物から採血し、128日後に心臓穿刺によって最終的に採血した。抗体を精製するために、ゼラチンセファロース(Miekkaら,1982)上のクロマトグラフィーによって坑血清からFnを除去し、次いでセファロースCL4Bに結合させたMBPD1−3融合タンパク質から成るアフィニティマトリックスに通した。リン酸塩緩衝生理食塩水(PBS)及び0.5Mの塩化ナトリウム含有PBSで順次洗浄後、結合抗体を3.5MのMgCl2に溶出させ、20mMの炭酸水素アンモニウムに透析し、凍結乾燥した。
抗ペプチド抗体の場合には、2匹の雄ニュージーランド白ウサギの各々を、フロインド完全アジュバントに乳濁させた100μgのBSA結合D121-34(D121-34BSA)またはKLH結合D320-33(D320-33KLH)の皮下注射によって免疫感作した。抗体価の平坦域が観察されるまで100μgのブースター用量を2週おきに投与した。免疫血清またはプレ免疫血清から得られたIgGをプロテイン−Aアガロース(Harlow and Lane,1987)で精製した。F(ab′)2フラグメントを調製するために、20mgの凍結乾燥IgGを2mlの70mMの酢酸ナトリウム、50mMのNaCl,pH4.0に溶解し、ペプシン(Boehringer Mannheim108057)を1mgのIgGあたり30μgの割合で添加した。37℃の水浴中で一夜インキュベーション後、トリスバッファ,pH8.0を0.1Mまで添加し、50mMのトリス、150mMのNaCl、0.02%のナトリウムアジド,pH7.4中で平衡させた1.5×90cmのSephacryl S100カラム(Pharmacia)上のクロマトグラフィーによって、ペプシン消化FcフラグメントからF(ab′)2フラグメントを分離した。
5.9.1.4 ELISA及びエピトープマッピング
Corningの96ウェルのマイクロタイタープレート中で、0.05%容量/容量のトゥイーン20を含有するPBSから成る洗浄バッファ、PBS中の3%重量/容量BSAのブロッキング溶液、0.05%のトゥイーン20及び0.1%のBSAを含むPBSから成る抗体希釈バッファを用いてELISAを実施した。第一及び第二の抗体のインキュベーションはオービタルミキサー上で20℃で60分間実施した。第二抗体としては、アルカリホスファターゼにコンジュゲートしたヤギ抗ウサギ免疫グロブリンG、または、F(ab′)2特異的ヤギ抗ウサギIgGのアルカリホスファターゼにコンジュゲートしたF(ab′)2フラグメント(Jackson Immuno Research Laboratories,West Grove PA)を、抗体バッファで5000倍に希釈して用いた。ELISAプレートを、0.1Mのジエタノールアミンバッファ,pH9.8中の1mg/mlのp−ニトロフェニルホスフェート(Sigma)と共に20℃で60分間展開し、405nmのフィルターを備えたTitertek Multiskan Plus ELISAプレート読取り装置で定量した。Tittersは、最大ELISA応答(A405)の1/2を生じる坑血清の希釈度または抗体の濃度であると定義される。
エピトープマッピングのために、連続するペプチド配列の各々を先行する配列に2アミノ酸だけオフセットさせて、D1モチーフとD2のN末端の18残基とにわたるオーバーラップデカペプチドを、Chiron Mimitopes(Clayton Victoria,Australia)によって合成した。D3モチーフにわたる15のオーバーラップするデカペプチドから成る別のセットも合成した。各ペプチドは、N末端ビオチンと、SGSGから成る4つのアミノ酸スペーサーとを含んでいた。Corningマイクロタイタープレートのウェルを、蒸留した脱イオンH2O中に5μg/mlのストレプトアビジン(GIBCO/BRL;Gaithersburg,MD)を含む100μlの溶液で被覆し、37℃で一夜インキュベーション中にプレート上で乾燥させた。ブロッキング及び洗浄の手順は汎用ELISAプロトコルに記載された手順を用いた。6Mのグアニジニウム塩酸塩中のビオチニル化ペプチド(2mg/ml)をPBSで1000倍に希釈し、100μlのアリコートを、ストレプトアビジンで被覆したマイクロタイタープレート中で20℃で60分間インキュベートした。次に、プレートを洗浄し、PBS−0.1%BSA−0.05%トゥイーン20中に50ng/mlに希釈したアフィニティ精製抗体を含む100μlの溶液と共に60分間インキュベートした。次に、プレートを汎用ELISAプロトコルに記載の手順で展開した。
5.9.1.5 Fn結合の阻害アッセイ
種々の抗体調製物について、CorningポリスチレンELISAウェルストリップに被覆したS.aureus細胞に対するFnの結合を阻害する能力を検定した。ヒト血漿FnをGIBCO/BRLから入手し、クロラミンT手順(Hunter,1978)を用いて比活性27MBq/ナノモルまで125Iで標識した。University of Manitoba Health Sciences Centre Clinical Microbiology Laboratoryから得られたS.aureus L857血液培養単離物をBHIブロス(Difco,Detroit,MI)中で37℃で中期対数増殖期まで増殖させた。1×1010/mlの熱殺害細菌の浮遊液を先行文献(McGavinら,1991)に記載の手順で調製し、炭酸塩:炭酸水素塩バッファで10倍希釈し、オービタルミキシングによって4℃で一夜インキュベーション中にCorningポリスチレンELISAウェルストリップを被覆した。0.05%容量/容量のトゥイーン20を含むPBSでウェルを洗浄し、3%重量/容量のBSAを含む200μlのPBSと共に37℃で60分間のインキュベーションによってブロックした。PBS−トゥイーン20で洗浄後、50μlの抗体またはF(ab′)2阻害物質を添加し、0.05%のトゥイーン80及び0.1%のBSAを含むPBSに希釈した。細胞を阻害物質と共にオービタルミキサーで30分間プレインキュベートし、次いで、同じバッファに希釈した50μlの125I−Fn(50,000cpm)を添加した。更に60分間インキュベーション後、ウェルをPBS−0.1%のトゥイーン80でよく洗い、次いで、Sarstedtの75×12mmのポリスチレン遠心管に移した。結合した125I−Fnの量をLKB Wallacモデル1272全自動ガンマカウンタで定量した。
5.9.2 結果
5.9.2.1 抗体のアフィニティ精製及びFn結合の阻害
試験抗原としてD1−3を用いたELISAによって測定すると、GSTD1−3または組換えD1−3によってブーストした動物からプールした坑血清は、110,000及び7,000〜9,000の最大抗体価を示した。300mlのプール坑血清のアフィニティ精製では、GSTD1−3免疫原及びD1−3免疫原をそれぞれ用いて産生させた坑血清から35mg及び7mgの抗体が得られた。アフィニティ精製抗体はそれぞれ20ng/ml及び10ng/mlの抗体価を示した(図6)。従って、GSTD1−3のほうが高い力価の坑血清を誘発する優れた免疫原であったが、アフィニティ精製された抗体の力価の劇的な差異はなかった。しかしながら、GSTD1−3融合タンパク質は、S.aureusに対するFn結合のより有効な阻害物質である抗体を産生した(図7)。1〜20μg/mlの抗体濃度で用量依存性阻害が観察され、20μg/mlに50%阻害が生じた。しかしながら、より高い濃度でも50%以上の阻害を促進しなかった。D1−3免疫原によって得られた抗体の場合には、50%阻害を達成するために200μg/mlの濃度が必要であった。従って、D1−3免疫原によって産生された抗体は、融合タンパク質で免疫感作することによって得られた抗体に比べてFn結合の阻害物質としての有効性が約1/10であった。
5.9.2.2 エピトープ特異性
最初に、完全D1モチーフとD2のN末端の18の個のアミノ酸にわたる24のデカペプチドを合成した。連続するペプチドの各々は先行ペプチドに8個のアミノ酸だけオーバーラップしている(表9)。D1及びD2のモチーフは高度に相同性であり、38個のアミノ酸のうちの5個だけが異なる(Signasら,1989)。従って、これらのデカペプチドは、D1モチーフ内部の優性エピトープをマップし、D1のC末端とD2のN末端とにわたるエピトープを同定するように設計された。D1−3免疫原は、広いスペクトルのエピトープ特異性を有する抗体を産生した(図8A)。それぞれD1モチーフの残基7−20(D17-20)及びD27-18にわたるSFEEDTEEDKPKYE(配列105;ペプチド#4−6;表9)及びSFEEDTEKDKPK(配列62;ペプチド#23及び24;表9)によって定義された酸性アミノ酸のクラスターによるエピトープの認識が最も顕著であった。先行の研究は、合成ペプチドD11-18及びD21-18がFnのN末端フラグメントと相互作用しないことを示した(Huffら,1994)。従って、この抗体調製物は、Fn結合に関与しないアミノ酸配列に特異的な抗体のかなり大きい集団を含む。また、配列D117-38にわたる複数のデカペプチドのもっと変動し易い認識も存在していた。
対照的に、免疫原としてGSTD1−3を用いて産生させた抗体は、制限された特異性を示し、アミノ酸配列D121-34,QGGNIVDIDFDSVP(配列60;ペプチド#11−13;表9;図8B)にわたる連続する3つのデカペプチドを主として認識した。先行の研究では、アミノ酸D218-38及びD316-36を表す合成ペプチドは完全形のD2及びD3モチーフと同等の親和性でFnのN末端フラグメントに結合した(Huffら,1994)。従って、この抗体調製物によって認識された主要エピトープは、Fn結合に必須のアミノ酸配列の内部に存在する。更に、この抗体調製物は、D1−3を免疫原として産生された抗体に対する主要エピトープである酸性アミノ酸のクラスターに対して反応性を殆ど示さなかった。どの抗体調製物もD1モチーフのC末端の8個のアミノ酸及びD2モチーフの最初の8個のアミノ酸にわたるアミノ酸配列の内部のエピトープを認識しなかった。従って、個別の2つのモチーフにわたるアミノ酸配列から成る有意なエピトープは存在しないと考えられる。
D3モチーフにわたる15のデカペプチドのシリーズで検定すると(表10;図9A及び図9B)、GSTD1−3免疫原によって得られた抗体はこれらのペプチドを明らかには認識しなかったが(図9B)、D1−3免疫原によって得られた抗体は、D3のC末端の11個のアミノ酸を表すVDFEEDTLPKV(配列86;ペプチド#14及び15;表10)を認識した。配列FEEDT(配列87)はこの11個のアミノ酸配列の内部で観察され、またこの抗体調製物によって認識されるD1及びD2モチーフの内部の2つの主要エピトープ中でも観察される。従って、D1−3免疫原は、Fn結合に関与しないD1及びD2モチーフのN末端ハーフ中で最も顕著な酸性アミノ酸のクラスターに対して高い特異性をもつ抗体を産生したと考えられる。
5.9.2.3 定義された特異性の抗体を産生するための合成ペプチドの使用
GSTD1−3免疫原は、低濃度で有効な阻害物質であり且つアミノ酸配列D121-34にわたるQGGNIVDIDFDSVP(配列60)に高い特異性を示す抗体を産生した。D2モチーフの配列D221-34(HGGNIIDIDFDSVP;配列103)はほぼ同じであり、これは、これらのエピトープに特異的な抗体だけがS.aureusに対するFn結合を阻害し得ることを示唆する。しかしながら、Fn結合の阻害は不完全であり、これらの抗体は、D3モチーフのアミノ酸20−33(D320-33)から成り且つFn結合に必須であることが判っているアミノ酸を含む配列QFGGHNSVDFEEDT(配列61)に対する反応性を全く示さなかった(McGavinら,1993;McGavinら,1991)。
この配列に特異的な抗体を得るために、マイレミド活性化KLHに結合するN末端システインをもつように合成した合成ペプチドD320-33でウサギを免疫感作した。また、GSTD1−3免疫原によって産生される抗体によって認識される主要エピトープを表すマイレミド活性化BSAに結合したD121-34でウサギを免疫感作した。双方の抗ペプチド抗体調製物は組換えD1−3ペプチドを認識した。D121-34免疫原はBSAに結合したが、抗体希釈バッファに0.1%のBSAを含有させると、ELISAアッセイに使用したBSAブロッキング試薬の認識による妨害が十分に排除された。
次いで、プロテインAを利用して免疫血清からIgGを精製し、F(ab′)2フラグメントに変換した。得られたF(ab′)2フラグメントはS.aureus菌Newman株から精製されたFnBPを認識し(図10)、漸増濃度の可溶性競合Fnの存在下では、50μg/mlの可溶性Fnの存在下でFnBPの認識が実質的に消滅するようなELISA応答の低減が観察された。Fn結合に必須のアミノ酸配列を含むエピトープの認識に符合して、双方のF(ab′)2調製物は5〜2000μg/mlの範囲でS.aureus細胞に対するFn結合の濃度依存性阻害を示した(図11)。1mg/mlの濃度で、D121-34及びD320-33で免疫感作することによって得られたF(ab′)2調製物はそれぞれ、48.5%及び45.6%のFn結合阻害を誘発した。しかしながら、2つのF(ab′)2調製物の混合物を100または200μg/mlで使用したときのFn結合阻害を試験すると、阻害の程度は、同じ濃度のいずれか一方のF(ab′)2を単独で使用した場合を上回っていなかった(図12)。従って、F(ab′)2フラグメントは、Fn結合に必須のD1及びD3モチーフの内部のエピトープに特異的であったが、組合せて試験したときに、相加効果または相乗効果は観察されなかった。
5.9.3 理論的考察
発明者らは、Fn結合を阻害する抗体に対するエピトープを構成する特異的アミノ酸配列を同定した。組換えD1−3を免疫原として産生された抗体はFn結合の比較的弱い阻害物質であり、これらの抗体のかなりの割合が、Fnに親和性を全く示していなかった(Huffら,1994)D1及びD2モチーフのN末端の18個のアミノ酸中のエピトープに特異的であった。対照的に、GSTD1−3を免疫原として産生された抗体は、低濃度で用量依存性阻害を示し、主としてアミノ酸配列D121-34の内部のエピトープに特異的であった。この配列は、S.dysgalactiaeのA2モチーフがFnに結合するために必須であり、スタフィロコッカス種及びストレプトコッカス種に由来の異なる複数のFn結合アドヘシンの反復モチーフ中に存在する保存アミノ酸GG及びIDFを含んでいる(McGavinら,1993;Pattiら,1994;Patti and Hook,1994)。
D2モチーフの対応する配列D221-34はほぼ等しい。従って、これらのデータから、Fn結合の阻害とリガンド結合に必須のアミノ酸の保存パターンを含むエピトープの認識との間に相関関係が成立する。しかしながら、双方の免疫原の限界は、D3モチーフのC末端ハーフ中のFn結合性配列に特異的な抗体を産生できなかったことである。
別の研究は、D1−3:β−ガラクトシダーゼ融合タンパク質によって免疫感作したマウスの坑血清がD1及びD2モチーフを表す合成ペプチドを認識したがD3を認識しなかったことを報告した(Rozalskaら,1994)。従って、種々の動物及び3つの異なる形態のD1−3免疫原を使用する研究では同じような困難が報告されていた。
発明者らは、D121-34がGSTD1−3免疫原によって産生された抗体に対する主要エピトープであることを証明したが、これらの抗体はD3モチーフ中のD320-33の明らかな認識を全く示さなかった。D121-34とD320-33との間の唯一の一致は、他のFn結合アドヘシンの反復モチーフ中に保存されておりFn結合に必須である保存GG及び(I/V)DF配列モチーフを含むことである。従って、これらの2つの配列は機能的に同一であるが、D1−3またはGSTD1−3を用いた免疫感作によってD320-33に特異的な抗体を得ることはできなかった。1つの解釈によればこの観察が抗原提示の関与によって説明される。D1−3ポリペプチドの1成分であるD3が免疫原として提示されるとき、Fnに対して5〜10倍の親和性を有しているD1及びD2とは異なるそのアミノ酸配列が(Huffら,1994)、低い免疫原性の原因であると考えられる。
更に、D1−3及び他のグラム陽性アドヘシン由来のFn結合性縦列反復モチーフは、溶液中では本質的に構造化されていないが、FnのN末端フラグメントとの複合体を形成するときはかなりの転移を生じる。従って、D1−3とFnとのin vivo相互作用は、リガンド結合に必須であるエピトープの遮蔽、抗原プロセシングの妨害、または、リガンド結合に必須でないアミノ酸配列に特異的な抗体の産生の促進、などを生じた。
D320-33に特異的な抗体を得る方法は、この特異的配列に対応する合成ペプチドによる免疫感作だけであった。先行する研究では、D320-33はS.aureusに対するFnの結合を阻害できなかったが、N末端にトリペプチドPSY(D317-33)またはC末端にLPK(D320-36)が付加されるとFn結合機能を回復することが知見されていた(McGavinら,1991)。従ってこの配列は、Fn結合に必須の保存GG及び(I/V)DFアミノ酸を含んでいるが、単独ではFnに結合できない。即ち、D320-33はFn結合に必須のコア配列を表すが、Fn結合に有利な二次構造を生じるためには3個またはそれ以上のN末端またはC末端アミノ酸が必要であると考えられた。
あるいは、ペプチドがリガンドとの接触を維持するために必要なコンホメーション変化はFnとの初期接触によってトリガされ、D320-33はこのコンホメーション変化を生じる能力がないのであろうという考え方も示唆された。この仮説は、D1−3がFnのN末端に接触すると構造転移が生じるという観察によって支持される。これは、多くのレセプター−リガンド相互作用に関係し、S.dysgalactiaeのFn結合性FnBAアドヘシンを免疫原として使用したときに示されたように、レセプター機能を阻害する抗体の産生にも影響を与えた。この結果として、リガンド誘発結合部位を認識するモノクローナル抗体が産生され、この抗体は、この配列を含むペプチドが有しているStapyhlococcus aureus細胞とFnとの結合を阻害する能力を促進した(Spezialeら,1996)。Fn結合性部位のリガンド結合コンホメーションがモノクローナル抗体によって安定されると考えられた。
D1−3ポリペプチドは溶液中で構造化されていないので、種々のエピトープにポリクローナル抗体が結合する結果、多くの予測できない効果が生じる。これらは、ホスホリラーゼキナーゼの触媒性g−サブユニットに特異的な抗体を産生するための合成ペプチドの使用から明らかである(Wangsgardら,1996)。アミノ酸322−346を免疫原として産生した抗体はホスホリラーゼ活性を阻害したが、部分的にオーバーラップする配列342−366に特異的な抗体は活性を促進した。
Fn結合性の反復モチーフを含む免疫原に対するポリクローナル抗体応答中に、Fn結合を促進する抗体がアドヘシン阻止抗体の効果を低下させ、その表れが、Fnに対する接着の免疫学的干渉を回避するために細菌中で生じるプロセスであるという考え方もある(Spezialeら,1996)。この場合、エピトープ特異性の多様性を制限するのが有利であろう。これが、合成ペプチドD121-34及びD320-33によって免疫感作を行う理論的根拠であった。この戦略は、リガンド結合に関与するアミノ酸配列に特異的な抗体の産生に成功を与えた。このことは、S.aureusから精製されたFnBPに対する結合において可溶性Fnが対応F(ab′)2と競合する能力を有していることから明らかであり、また、S.aureus細胞に対するFn結合の濃度依存性阻害から明らかである。しかしながら、2つのF(ab′)2調製物の混合物が単独の調製物による阻害を上回る阻害を与えることができなかった理由は明らかでない。ペプチド配列D121-34及びD221-34はほぼ等しいので(表8)、2つのF(ab′)2調製物の混合物は、3つのDモチーフの各々の内部のFn結合に必須であるエピトープを十分に認識しなければならない。相加効果または相乗効果が観察できなかった理由は、立体障害によって説明することもでき、あるいは、D320-33に対する抗体の結合が、D121-34エピトープに対する抗体の接近(またはその逆)を制限するようなコンホメーション変化をD1−3中で誘発したためであると説明することもできる。
5.10 実施例10−Staphylococcus aureus感染症と診断された患者におけるフィブロネクチン結合性MSCRAMMに対する血清抗体応答
この実施例は、S.aureus感染症と診断されたヒト患者の血清のFn結合性MSCRAMM FnBPAに対する免疫応答の分析を示す。FnBPA中のFn結合性ドメインの免疫優性が証明され、血清中の抗体の1つのクラスがFn結合のときに形成されたエピトープを認識することが確認された(LIBS抗体)。更に、スタフィロコッカスに対するFn結合を促進または阻害する抗体が存在しないことが観察された。
5.10.1 材料及び方法
5.10.1.1 ヒト血清
スタフィロコッカス感染症(S.aureus感染)の34人の患者の血清標本をOspedale di Circolodi Varese,Varese,Italyから入手した。ヒト血清はいずれも成人患者の血清である。対照IgGは健康な2歳の幼児のプール血清から得られた。血清に由来の抗体をプロテインA−セファロース(Pharmacia)クロマトグラフィーによって精製し、ヒトIgGを標準として用いた280nmの吸光度によって精製IgGの濃度を定量した。
5.10.1.2 リガンドの単離及び標識
先行文献(Vuento and Vaheri,1979)に記載の手順でヒトFnを調製した。先行文献(House−Pomepeoら,1996)に記載の手順でN末端Fnフラグメント(N29)を単離した。IODO−BEADSヨウ素化試薬を製造業者(Pierce,Rockford,IL)の指示通りに用いてN29フラグメントを125I−標識した。
5.10.1.3 組換えタンパク質:ELISAアッセイ
ヒト血清から単離した免疫グロブリンについて、FnBPA組換えタンパク質に対する抗体の存在をELISAで試験した。試験では、マイクロタイターウェル(Costar,Cambridge,MA)を、50mMの炭酸ナトリウム,pH9.5中に10μg/mlのタンパク質を含む100μlの溶液と共に4℃で一夜インキュベートした。ウェル中の追加のタンパク質結合部位を、0.13Mの塩化ナトリウム(PBS)を含む10mMのリン酸ナトリウム,pH7.4中に2%(重量/容量)のウシ血清アルブミンを含む200μlの溶液と共に1時間インキュベーションすることによってブロックした。次に、ウェルを、PBST(150mMのNaCl中の0.1%のトゥイーン20)で5回洗浄し、2%BSAを含む100μlのPBSに溶解した2μgの抗体と共に22℃でインキュベートした。ウェルをPBSTで5回洗浄することによって未結合の抗体を除去した。結合した抗体は、1:2000に希釈したペルオキシダーゼにコンジュゲートしたウサギ抗ヒトIgG(Dako,Gostrup,Denmark)と共にインキュベーション(37℃で1時間)することによって検出した。洗浄後、コンジュゲートした酵素をo−フェニレンジアミン二塩酸塩(Sigma)と反応させ、492nmの吸光度をマイクロタイター読取り装置(Bio−Rad)でモニターした。
5.10.1.4 組換えタンパク質:Fn結合アッセイ
マイクロタイタープレート中で表面固定化MSCRAMMに125I−N29を結合させた。50mMの炭酸ナトリウム中にGST−Du1234(10μg/ml)を含む100μlの溶液でウェルを被覆し、4℃で一夜インキュベートし、次いで2%(重量/容量)のウシ血清アルブミンを含む200μlのPBSでブロッキング処理した。ウェルを次に、125I標識N29(8×104cpm)と共に37℃で2時間インキュベートした。PBST(0.1%トゥイーン含有PBS)でよく洗い(×5)、ウェルに結合した放射能をγカウンタで定量した。スタフィロコッカスに対する125I標識N29の結合を先行文献(Spezialeら,1996)に記載の手順で定量した。
5.10.1.5 GSTA−DU1234−セファロース上のアフィニティクロマトグラフィーによる抗LIBS抗体の単離
患者(I.Z.)から単離した8mgのIgGをゼラチン−セファロースに吸着させ、結合しなかった材料を、GST−DU1234組換えタンパク質で置換しPBS−アジドで平衡させたセファロース4Bのカラム(1×4cm)に通した。カラム流出液の280nmの吸光度の安定な基底線が観察されるまでカラムを平衡バッファで洗浄し(フロースルー)、次にリン酸塩バッファ中の0.4MのNaClで洗浄した。カラムに特異的に結合した材料を、0.1Mのグリシン,pH2.8で溶出させ、画分を1Mのトリスで中和した。未吸着の材料及び結合してカラムから溶出した材料をELISA、ウェスタンブロット及びドットブロットで分析した。
5.10.2.結果
5.10.2.1.抗LIBS抗体の単離
LIBSエピトープが特定クラスのIgGによって認識されるか否かを判定するために、患者(I.Z.)の血清から単離した免疫グロブリンを、PBS−アジドで平衡させたGST−Du124−セファロースアフィニティマトリックスに充填した。0.4MのNaClを含む10mMのリン酸塩バッファでカラムを洗浄し、カラムに吸着されたタンパク質を0.1Mのグリシン,pH2.8で溶出させ、1Mのトリスで中和し、PBSに透析した。ELISAによる分析は、アフィニティマトリックスで精製したIgGがN29の存在に関わりなくGST−Du1234に反応性であるが(図13C)、未結合材料(フロースルー)はN29の存在下でのみGST−Du1234を優先的に認識する抗体を含む(図13B)ことを示した。分画化されなかった材料は中間的効果を示した(図13A)。
5.10.2.2 細菌とFnとの結合に対する抗体の効果
上記のデータは、スタフィロコッカス感染症と診断されたすべての患者の血清がFnに誘発されたエピトープを認識する抗体を含むことを示す。全部の患者から単離されたIgGの存在下でS.aureus細胞を125I−N29と共にインキュベートすることによって、血清中の阻止抗体の存在を分析した。細菌に対する125I−N29の結合を阻害する抗体は存在しなかった(図14B)。更に、IgGは、マイクロタイターウェルに吸着された組換えGST−Du1234に対するリガンドの結合に影響を及ぼさなかった(図14A)。従って、スタフィロコッカスのFn結合性MSCRAMMによって誘発される免疫応答は阻止抗体を産生しない。
5.11 実施例11−S.aureus FnBPAペプチドに対するモノクローナル抗体
この実施例は、S.aureusのFnBPAに由来のD320-33ペプチドでマウスを免疫感作することによって産生された2つのモノクローナル抗体、即ち、mAb 9C3及びmAb 11A5の産生、スクリーニング及び阻害活性を記載する。
Applied Biosystemsモデル431Aペプチドシンセサイザーを使用し、University of Calgary Peptide Synthesis Core Facilityによって、S.aureus fnbAに由来のD3モチーフのアミノ酸20−33(D320-33;QFGGHNSVDFEEDT;配列61)に対応する合成ペプチドをN末端システインをもつように合成した。N末端システインを介してペプチドをマレイミド活性化キーホール・リンペット・ヘモシアニン(KLH)に結合させた。完全フロインドアジュバント中のエマルジョンの形態の100μgのD320-33−KLHペプチドを後足の肉趾に皮下注射することによってBalb/Cマウスを免疫感作した。生理食塩水中の100μgのD320-33−KLHペプチドから成る3回の追加注射を4、8及び15日目に行った。16日目にマウスを殺し、膝窩リンパ節のリンパ球を採取し、マウスメラノーマ細胞系P3X63−Ag8.653に融合させた。15%ウシ胎仔血清、ペニシリン−ストレプトマイシン、グルタミン及び2−メルカプトエタノールを含むRPMI 1640 HAT培地で細胞を培養した。
融合の14日後に、BSAに結合したD320-33を認識するためにハイブリドーマをELISAによってスクリーニングした。次に、D320-33−BSAに反応するクローンについて、野生型ペプチドD320-33及び組換えペプチドGST−D1−D3に対する反応性をELISAで試験した。最終的にmAb 9C3及びmAb 11A5と命名した2つのクローンを選択し、腹水産生に使用した。双方のmAbがD3モチーフ中の配列SVDFEEDT(配列104)を認識した。S、V、D、E、EまたはD位の1つのアラニン置換の結果としてmAb認識は完全に失われたが、FまたはT位の置換はmAbの反応性に全く影響を与えなかった。
S.aureus fnbAでコードされるタンパク質に対するFnの125I−N29フラグメントの結合がmAb 9C3によって阻害されか否かを判断するために、CorningポリスチレンELISAウェルストリップを、オービタルミキシングを伴う4℃で一夜のインキュベーションによって、1μg/mlの組換えタンパク質D1−3、D2−3、GSTD3または1×108CFUのS.aureus細胞で被覆した。0.05%容量/容量のトゥイーン20を含むPBSでウェルを洗浄し、3%重量/容量のBSAを含む200μlのPBSと共に37℃で60分間のインキュベーションによってブロックした。PBS−トゥイーン20で洗浄後、50μlの抗体阻害物質を添加し、0.05%のトゥイーン80及び0.1%のBSAを含有するPBSで希釈した。ウェルを阻害物質と共にオービタルミキサーで30分間プレインキュベートし、次いで同じバッファに希釈した50μlのFnの125I−N29フラグメント(50,000cpm)を添加した。更に60分間インキュベーション後、ウェルをPBS−0.1%トゥイーン80でよく洗い、次いで、Sarstedtの75×12mmのポリスチレン遠心管に移した。次に、結合した125I−N29フラグメントの量をLKBWallacモデル1272全自動ガンマカウンタで定量した。結果は、mAb 9C3が、S.aureus fnbAでコードされたタンパク質に対するFnのN29フラグメントの結合を用量依存的に阻害することを示す(図15)。
また、CorningポリスチレンELISAウェルストリップをオービタルミキシングを伴う4℃で一夜のインキュベーション中に1μg/mlの組換えタンパク質GSTD3で被覆することによって、9C3及び11A5モノクローナル抗体の阻害活性を証明した。サンプルを上述のように調製し、分析した。mAb 9C3及びmAb 11A5の双方がS.aureus fnbAでコードされたタンパク質に対するFnのN29フラグメントの結合を用量依存的に阻害することが証明された(図16)。
5.12 実施例12−心内膜炎、肺炎及び眼球内炎の動物モデルに対する受動免疫効果の検出方法
Moreillonと共同研究者(Moreillonら,1995)によって記載されたような心内膜炎のin vivoモデルを使用して本発明の抗体の防御効果を試験し得る。精製した抗Fn MSCRAMM超免疫抗体(例えば、1kgのIgGあたり約100mg〜約600mgの複数の用量を使用し得る)を、S.aureusまたは他のスタフィロコッカス種による感染に先立つ種々の時点(例えば、21日、14日、7日または1日前)に静脈内投与し得る。
簡単に説明すると、右頸動脈から動脈弁にポリエチレンカテーテルを挿入することによって雌のウィスターラットに不稔性の疣腫を発生させる。絹の結紮糸でカテーテルを固定し、24時間静置する。カテーテル挿入の24時間後、ラットの尾の静脈に、対数増殖期の培養物に由来の細菌細胞を含む0.5mlの生理食塩水を接種する。12時間後にラットを殺し、動脈弁と疣腫とを摘出し、計量し、1mlの生理食塩水中で均質化し、ホモジェネートの希釈物を平板培養してコロニーをカウントする。
受動免疫の有効性を、先行文献(Ramisseら,1993)に記載されたような肺炎モデルを用いて測定する。Center for Disease Controlによれば、S.aureusは下部呼吸器感染の原因となることが二番目に多い生物である(Center for Disease Control,1986)。免疫治療によって肺炎感染を予防または最小に抑制する能力は、スタフィロコッカス攻撃の前または後に、抗Fn結合性MSCRAMM Ig(例えば1kgのIgGあたり100mg〜600mgの範囲の複数の用量で使用できる)を静脈内または鼻孔内投与することによって試験し得る。3週齢の雌のBALB/cマウスをシクロホスファミド(200mg/kgの静注)で処理して一時的な激しい白血球減少を誘発する。白血球減少は、血球計で計数された白血球の総数の減少によって確認される。免疫抑制マウスを次に、シクロホスファミド注入の4日後にS.aureusで攻撃する。50μlの細菌接種物(6×107cfu/ml)をマウスに鼻孔内投与する。S.aureusを脳−心インフュージョンブロス(Difco,Detroit,MI)中で定速回転を伴って37℃で培養し、遠心によって採集し、無菌のリン酸塩緩衝生理食塩水(PBS;10mMリン酸塩,150mMのNaCl,pH7.4)に再浮遊させる。細胞数とA600との関係を表す標準曲線にサンプルのA600を比較することによって決定した最終密度が6×107cfu/mlになるように細菌を再浮遊させる。次に、上記のような細菌をマウスに鼻孔内接種する。接種後の選択時点でマウスを殺し、肺を摘出し、PBS中で均質化し、血液寒天プレート上で100μlのアリコートを平板培養することによってホモジェネートを系列希釈する。37℃で24時間の増殖後に細菌のカウント数を測定する。
あるいは、スタフィロコッカス性眼球内炎の動物モデルを使用して受動免疫方法(Ravindranathら,1995)の効果を判定してもよい。S.aureus及びS.epidermidisは手術後の眼球内炎の進行の重要な病因物質である。更に、S.aureus性眼球内炎は無治療で放置されると、失明に進行するのが速い(Maoら,1993)。スタフィロコッカス性眼球内炎を防御する抗Fn MSCRAMM Igの能力は上記のモデルを用いて測定できる。精製した抗D320-33エピトープMSCRAMM超免疫抗体、または、9C3もしくは11A5モノクローナル抗体(例えば1kgのIgGあたり100mg〜600mgの複数の用量を使用し得る)を、S.aureusまたは他のスタフィロコッカス種による感染に先立つ種々の時点(21、14、7または1日前)で静脈内投与する。
簡単に説明すると、スタフィロコッカスを脳−心インフュージョンブロス(Difco,Detroit,MI)中で定速回転を伴って37℃で培養し、遠心によって採取し、無菌のリン酸塩緩衝生理食塩水(PBS;10mMのリン酸塩,150mMのNaCl,pH7.4)に再浮遊させる。細胞数とA600との関係を表す標準曲線にサンプルのA600を比較することによって決定した最終密度が1.5×108cfu/mlになるように細菌を再浮遊させる。再遊液を次に生理食塩水で、硝子体内注入用の65cfu/50μlの濃度に系列希釈する。7〜8週齢の雌のルイスラットにMetafane(商標)(メトキシフルラン;Pitman−Moore,Mundelein,IL)を含浸させた綿球を5分間吸入させることによって麻酔する。全身麻酔後、1滴の0.5%プロパラカイン溶液(Alcaine R;Alcon,Humanco PR)を点眼する。眼内圧の上昇を制限し細菌接種物の押出を最小に抑制するために、細菌の硝子体内注入の直前に、ツベルクリン注射器に取付けた30Ga針を用いて穿刺して角強膜縁から5μlの水様液を採取する。次に、ラットの右眼の硝子体に50μlの細菌浮遊液を注入し、左眼は対照として維持する。数日後(3、7、14、21日、など)、ラットの結果を外的肉眼検査及び直像検眼法によって評価し、その後に殺す。ツベルクリン注射器に取付けた20Ga針を毛様体輪から挿入して両眼から硝子体液(20〜25μl)を採取する。サンプルを系列希釈し、血液寒天プレートで平板培養し、37℃で24時間インキュベートする。24時間後の細菌増殖をcfu/mlで表す。
5.13 実施例13−修飾MSCRAMMを用いる能動免疫方法
本発明の部位特異的に修飾したFn結合性MSCRAMMはまた、スタフィロコッカス感染症を防御するために動物、特にヒトのような哺乳動物を免疫感作するサブユニットワクチン中の抗原として有用であると考えられる。
部位特異的に修飾されたFn結合性MSCRAMMは子宮内膜炎、乳腺炎、イヌの膿皮症、腺疫または耳炎に対して動物を免疫感作するために使用できるので、このような方法は獣医学にも有用である。
5.14 実施例14−免疫効果の検出方法:乳腺炎の動物モデル
部位特異的に修飾されたFn結合性MSCRAMMによる能動免疫の効果を、先行文献(Mamoら,1994)に記載されたような乳腺炎のマウスモデルを用いて試験し得る。フロインド完全アジュバント(Difco)中のエマルジョンにした100μgの抗原の皮下注射によって雌のマウスを免疫感作する。14日後に、フロインド不完全アジュバント中のエマルジョンにした50μgの抗原をブースターとして投与する。最終ブースターの3週後に、左右の上部乳腺に0.1mlの細菌浮遊液(1×106cfu/ml)を乳内接種することによってマウスに抗原投与する。48時間後にマウスを殺し、乳腺を無菌的に摘出して組織病理学検査及び細菌定量を行う。摘出した乳腺の各々を5mlの無菌生理食塩水を収容したガラス管に入れ、均質化する。細菌をカウントするためにホモジェネートの系列希釈物を平板培養する。これらの動物試験から得られた結果は、家畜の乳腺炎の治療に使用するために有望であることを示す。
あるいは、子宮内膜炎の動物モデル(Widdersら,1995)及び腺疫の動物モデル(極めて伝染性のウマの呼吸器疾患)(Wallaceら,1995)を使用して、免疫方法の有効性を判定してもよい。子宮内膜炎は不妊につながるウマの生殖器感染症であり、ウマの繁殖業に経済的な大打撃を与える。S.zooepidemicusがこの疾患の主因であり、54%という高い感染率を示す。グループCのストレプトコッカス及び主としてS.equiは腺疫の主要な病因物質であり、世界中のウマ繁殖業者に甚大な被害を与える。
5.15.実施例15−FnBP MSCRAMMを発現する単離物の臨床的検出
考察される臨床的検出の1つでは、PCR(商標)に基づく検出系でfnA、fnB、fnbA、fnbB、fse及びsfb遺伝子を検出する分子プローブとして本発明の核酸配列を使用する。検出/増幅すべき配列の長さは、50〜500bpの範囲であると考えられる。プライマーとして使用された特定遺伝子セグメントの領域からDNA配列を決定するためにサザンハイブリダイゼーション分析を容易に実施でき、検出されるDNA配列は、染色体またプラスミドにコードされたDNAまたはRNA配列を特異的に検出する。また、選択された1セットまたは複数セットのプライマーは、種々の異なる単離物から特異的DNAフラグメントの合成を再現的にプライムするために使用され得る。従って、臨床サンプル及び非臨床サンプルの双方でスタフィロコッカス菌及びストレプトコッカス菌を同定するために複数セットのプライマーを使用し得る。
検出のためには、単離物の臨床サンプル(即ち、肺の喀痰、中耳または内耳の分泌物、脳脊髄液)を患者から採取する。単離物を遠心して細菌をペレット化する。あるいは、同定に先立って細菌サンプルを選択培地で培養することによって増殖させてもよい。細菌細胞を溶解し、ペレット化し、上清のサンプルを、本文中に開示されたFnBP特異的核酸セグメントを用いてPCR(商標)反応に加える。増幅後、産生物をアガロースゲル電気泳動によって分離し、バンド形成パターンを臭化エチジウムによって可視化する。このような遺伝子特異的プライマーを用いて増幅されたDNAフラグメントの存在は、臨床単離物中のスタフィロコッカス菌またはストレプトコッカス菌の存在の指標となる。特定のMSCRAMMコーディング遺伝子の種特異的配列である特定の核酸セグメントを使用することによって、この方法によって検出された特定細菌を更に同定し、種を類別することさえも可能である。本発明の新規なDNAセグメントから成る組成物、このようなセグメントを含む診断用キット、FnBPコーディング核酸の検出方法はすべての本発明の目的に包含される。
5.16.実施例16−組換えfnbA由来のエピトープを用いるFnに対する細菌接着の予防方法
本発明の別の特徴は、ECM成分Fnに対する細菌接着を予防する治療用組成物にS.aureusのfnbA及び/またはfnbB遺伝子に由来の天然型及び組換えペプチドを使用することである。動物のスタフィロコッカス感染及びストレプトコッカス感染の予防に有用な医薬組成物が考察されている。
簡単に説明すると、Fnを認識し結合するペプチドエピトープを動物体内に導入すると、このペプチドエピトープは、空いたECM Fnを有効に飽和させることによって同一基質に対する細菌接着の競合的阻害物質として作用し、これによって表面にFnBPAを発現する細菌がFnに接着することを防止する。
移植生物材料、カテーテルまたは移植血管のようなFn被覆材料に対する細菌の接着を阻害するFnBP由来のエピトープの能力の効果は、in vitro潅流連続流システムを用いて証明できる。このような方法は当業者に公知であり、他の文献(Sapatnekarら,1995)に詳細に記載されている。簡単に説明すると、ヒトの血液を一連の被験材料(例えば親水性ポリマー、疎水性ポリマー、など)に連続的にポンプ循環させる。次に、トリチウム標識細菌を血液に添加し、被験材料と相互作用させる。次に被験材料を洗浄して未接着の細菌を除去し、残留細菌を13−カウンタで定量し得る。FnBP由来のタンパク質を添加すると、被験材料に対する細菌の結合が用量依存的に阻害される。
Vaudauxらも同様のモデルを開発した。このモデルでは、無菌チューブ(ポリ塩化ビニルまたはポリエチレン)断片をイヌの大腿動脈に縫合する。チューブを種々の時間接触させ、取出し、PBSで洗浄し、1.5cmの切片に切断する。各切片で種々の量のトリチウム標識細菌をインキュベートする。fnbA由来のタンパク質を添加すると、被験材料に対する細菌の結合が用量依存的に阻害される。
別の可能な使用方法では、fnbA由来タンパク質をカテーテルまたは移植組織に共有結合させる。結合したfnbA由来タンパク質は、通常は細菌が使用する部位と同じ部位でFnに結合し、これによって生物材料におけるコロニー形成が防止される。
特定のFn類似体を調製するために、Fn(N29)のアミノ末端ドメインをコードしているcDNAを酵母、ウイルスまたは細菌中で発現させる組換えDNA技術を使用し得る。発現したタンパク質は標準クロマトグラフィー技術を適正に使用することによって精製できる。例えば、Fn類似体を創傷包帯に共有結合させる。修飾した創傷包帯を皮膚感染部位(創傷)に当て、創傷部位に存在する細菌を創傷包帯に特異的に結合させる。
修飾した創傷包帯を頻繁に交換すると、創傷の細菌数が劇的に減少し、これによって感染が最小に抑制され、また創傷治癒も促進される。
5.17 実施例17−Fnに対する接着を阻害する抗体組成物:FnBPエピトープをコードするDNAの部位特異的突然変異誘発
本発明のS.dysgalactiae fnA及びfnB DNAセグメントの特に重要な用途は組換えペプチドの産生である。これらのペプチドは天然型AUまたはA1−A3エピトープでもよく、部位特異的に修飾されたAu−またはA1−A3−由来のペプチドでもよい。上記に開示された部位特異的突然変異誘発の汎用技術は、改変されたDNA配列を含む核酸セグメントを製造するために使用され得る。次に、このようなセグメントを使用して組換えペプチドを超発現させ、これらのペプチドを大量に単離し得る。このように単離されたペプチドを、本文中に記載の幾つかの方法に従って、動物体内の免疫応答の誘発、産生されたペプチドに特異的な抗体の単離、などに使用し得る。
実施例2に記載した手順と同様の手順で、S.dysgalactiae fnA及びfnB遺伝子のAu、A1−A3及びB1−B3領域、並びに、S.pyogenes sfb遺伝子のP1−P4領域に対応するペプチドが合成される。これらのペプチドは、S.aureus fnbA及びfnBペプチドに関して上述した本発明の用途と同じ用途に使用できると考えられる。
本文中及び請求の範囲に開示したすべての組成物及び方法は、本文中の開示に基づいて過大な実験を要することなく調製及び実施し得る。本発明の組成物及び方法を好ましい実施態様に基づいて説明したが、組成物、方法、及び本文中に記載の方法の段階または連続段階に、本発明の構想、要旨及び範囲に包含される種々の変更を加えてもよいことは当業者に理解されよう。より詳細には、本文中に記載の物質に置換して化学的及び生理学的に近縁のいくつかの物質を使用し、同一または類似の結果が得られることも理解されよう。当業者に明らかなこの種の類似の置換及び修飾はすべて、請求の範囲に定義された本発明の要旨、範囲及び構想に包含されると理解されたい。
6.参考文献目録
以下の引用文献及び本文中の引用文献は、これらの文献が本文中に引用されたことによって、本文中の関連する箇所に包含される。
【配列表】
配列番号:1
配列の長さ:6
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列の特徴
特徴を表す記号:修飾部位
存在位置:3..6
他の情報:/注=″X=任意のアミノ酸″
配列
配列番号:2
配列の長さ:10
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:3
配列の長さ:31
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:4
配列の長さ:31
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:5
配列の長さ:38
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:6
配列の長さ:38
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:7
配列の長さ:38
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:8
配列の長さ:38
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:9
配列の長さ:21
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:10
配列の長さ:21
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:11
配列の長さ:19
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:12
配列の長さ:19
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:13
配列の長さ:22
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:14
配列の長さ:21
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:15
配列の長さ:21
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:16
配列の長さ:21
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:17
配列の長さ:21
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:18
配列の長さ:21
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:19
配列の長さ:21
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:20
配列の長さ:21
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:21
配列の長さ:21
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:22
配列の長さ:21
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:23
配列の長さ:21
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:24
配列の長さ:21
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:25
配列の長さ:21
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:26
配列の長さ:21
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:27
配列の長さ:21
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:28
配列の長さ:21
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:29
配列の長さ:21
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:30
配列の長さ:21
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:31
配列の長さ:21
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:32
配列の長さ:21
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:33
配列の長さ:21
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:34
配列の長さ:21
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:35
配列の長さ:38
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:36
配列の長さ:38
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:37
配列の長さ:38
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:38
配列の長さ:38
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:39
配列の長さ:38
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:40
配列の長さ:38
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:41
配列の長さ:38
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:42
配列の長さ:38
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:43
配列の長さ:38
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:44
配列の長さ:38
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:45
配列の長さ:38
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:46
配列の長さ:38
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:47
配列の長さ:38
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:48
配列の長さ:38
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:49
配列の長さ:38
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:50
配列の長さ:38
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:51
配列の長さ:19
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:52
配列の長さ:19
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:53
配列の長さ:19
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:54
配列の長さ:31
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:55
配列の長さ:31
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:56
配列の長さ:39
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:57
配列の長さ:39
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:58
配列の長さ:36
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:59
配列の長さ:36
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:60
配列の長さ:14
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:61
配列の長さ:14
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:62
配列の長さ:12
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:63
配列の長さ:10
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:64
配列の長さ:10
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:65
配列の長さ:10
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:66
配列の長さ:10
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:67
配列の長さ:10
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:68
配列の長さ:10
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:69
配列の長さ:10
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:70
配列の長さ:10
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:71
配列の長さ:10
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:72
配列の長さ:10
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:73
配列の長さ:10
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:74
配列の長さ:10
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:75
配列の長さ:10
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:76
配列の長さ:10
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:77
配列の長さ:10
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:78
配列の長さ:10
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:79
配列の長さ:10
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:80
配列の長さ:10
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:81
配列の長さ:10
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:82
配列の長さ:10
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:83
配列の長さ:10
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:84
配列の長さ:10
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:85
配列の長さ:10
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:86
配列の長さ:11
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:87
配列の長さ:5
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:88
配列の長さ:10
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:89
配列の長さ:10
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:90
配列の長さ:10
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:91
配列の長さ:10
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:92
配列の長さ:10
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:93
配列の長さ:10
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:94
配列の長さ:10
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:95
配列の長さ:10
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:96
配列の長さ:10
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:97
配列の長さ:10
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:98
配列の長さ:10
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:99
配列の長さ:10
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:100
配列の長さ:10
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:101
配列の長さ:10
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:102
配列の長さ:10
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:103
配列の長さ:14
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:104
配列の長さ:8
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
配列番号:105
配列の長さ:14
配列の型:アミノ酸
鎖の数:
トポロジー:直鎖状
配列
Claims (42)
- フィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域に結合し、かつ当該フィブロネクチン結合タンパク質がフィブロネクチンに結合することを阻害する抗体を含み、当該抗体が、フィブロネクチンに特異的に結合しない、上記のフィブロネクチン結合領域のペプチドに結合し、当該ペプチドが配列番号60又は61のアミノ酸配列からなる、組成物であって、当該組成物が製薬学的に許容しうる担体中に分散している、組成物。
- 当該抗体が微生物のフィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域に結合する請求項1の組成物。
- 当該抗体が連鎖球菌あるいはブドウ球菌のフィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域に結合する請求項2の組成物。
- 当該抗体が連鎖球菌のSfb、FnBAまたはFnBB、あるいはブドウ球菌のFnBPAまたはFnBPBフィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域に結合する請求項3の組成物。
- 当該抗体がブドウ球菌のFnBPAフィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域に結合する請求項4の組成物。
- 当該抗体が黄色ブドウ球菌のFnBPAフィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域に結合する請求項5の組成物。
- 当該抗体がモノクローナル抗体である請求項1の組成物。
- 当該抗体が検出可能な標識に連結されている請求項1の組成物。
- 当該抗体が放射標識、蛍光標識、核磁気スピン共鳴標識、ビオチン、アビジンあるいは色素産生基質と接触して着色産物を生じる酵素に連結されている請求項8の組成物。
- 当該抗体がアルカリホスファターゼ、水素ペルオキシダーゼあるいはグルコースオキシダーゼ酵素に連結されている請求項9の組成物。
- フィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域の分離されたペプチドを含む組成物であって、当該ペプチドが配列番号60のアミノ酸配列からなり、当該組成物が製薬学的に許容しうる担体中に分散している、組成物。
- 当該分離ペプチドが、キーホール・リンペット・ヘモシアニン(KLH)およびアルブミンからなる群より選択された担体分子に作動可能に連結されている請求項11の組成物。
- フィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域の分離されたペプチドおよびアジュバントを含む組成物であって、当該ペプチドが配列番号60又は61のアミノ酸配列からなり、当該組成物が製薬学的に許容しうる担体中に分散している組成物。
- 6個のヒスチジン残基(His 6 )、グルタチオン−S−トランスフェラーゼおよびマルトース結合タンパク質(MBP)からなる群より選択されたアミノ酸配列に作動可能に連結されている、フィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域のフィブロネクチンに特異的に結合しない第一ペプチドを少なくとも含む融合タンパク質を含む組成物であって、当該第一ペプチドが配列番号60のアミノ酸配列からなり、当該組成物が製薬学的に許容しうる担体中に分散している、組成物。
- 当該第一ペプチドが、キーホール・リンペット・ヘモシアニン(KLH)およびアルブミンからなる群より選択された担体のアミノ酸配列に作動可能に連結されている請求項14の組成物。
- 6個のヒスチジン残基(His6)、グルタチオン−S−トランスフェラーゼおよびマルトース結合タンパク質(MBP)からなる群より選択されたアミノ酸配列に作動可能に連結されている、フィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域のフィブロネクチンに特異的に結合しない第一ペプチドを少なくとも含む融合タンパク質を含む組成物であって、当該第一ペプチドが配列番号60又は61のアミノ酸配列からなり、更にキーホールリンペットヘモシアニンに作動可能に連結されており、当該組成物が製薬学的に許容しうる担体中に分散している、前記組成物。
- フィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域の、フィブロネクチンに特異的に結合しないペプチドをコードする分離された核酸セグメントを含む組成物であって、当該ペプチドが配列番号60のアミノ酸配列からなり、当該組成物が製薬学的に許容しうる担体中に分散している、前記組成物。
- 製薬学的に許容しうる担体中に、
a)フィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域に結合し、かつ当該フィブロネクチン結合タンパク質がフィブロネクチンに結合することを阻害する抗体(ただし当該抗体は、ペプチドが当該フィブロネクチン結合領域の構成部分でないときにはフィブロネクチンに特異的に結合しない、当該フィブロネクチン結合領域のペプチドであって、配列番号60又は61のアミノ酸配列からなる前記ペプチドに結合する)、
b)フィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域の分離されたペプチドであって、配列番号60のアミノ酸配列からなる前記ペプチド(ただし当該ペプチドはフィブロネクチンに特異的に結合しない)、または
c)フィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域のペプチドをコードする分離された核酸セグメントであって、当該ペプチドが配列番号60のアミノ酸配列からなる、前記核酸セグメント(ただし当該ペプチドはフィブロネクチンに特異的に結合しない)、
の有効量を含む医薬組成物。 - フィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域に結合し、かつ当該フィブロネクチン結合タンパク質がフィブロネクチンに結合することを阻害する抗体を含む請求項18の医薬組成物。
- フィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域の分離された、フィブロネクチンに特異的に結合しないペプチドを含む請求項18の医薬組成物。
- 免疫製剤の調製において使用するための請求項1−20のいずれか一項の組成物。
- 免疫製剤の調製における、請求項1−20のいずれか一項の組成物の使用。
- 動物における感染の予防あるいは治療のための薬剤の調製において使用するための請求項1−20のいずれか一項の組成物。
- 感染を予防するあるいは治療するための薬剤の調製における、請求項1−20のいずれか一項の組成物の使用。
- 微生物のフィブロネクチンへの結合を阻害する製剤の調製において使用するための請求項1−20のいずれか一項の組成物。
- 微生物のフィブロネクチンへの結合を阻害する製剤の調製における、請求項1−20のいずれか一項の組成物の使用。
- フィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域の分離された、フィブロネクチンと特異的に結合しないペプチドの免疫学的に有効な量を含む医薬組成物を非ヒト動物に投与することを含む、フィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域に結合し、かつ当該フィブロネクチン結合タンパク質がフィブロネクチンに結合することを阻害する抗体を生成する方法であって、当該ペプチドが配列番号60又は61のアミノ酸配列からなる、前記方法。
- 当該非ヒト動物が微生物感染を生じている、あるいは生じた疑いがある、あるいは微生物感染を発現する危険性があるものである請求項27の方法。
- フィブロネクチン結合タンパク質を含有している疑いのするサンプルを、免疫複合体を形成することができる有効条件下で、フィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域に結合し、かつ当該フィブロネクチン結合タンパク質がフィブロネクチンに結合することを阻害する抗体に接触させ、そのようにして形成された免疫複合体を検出することを含み、ただし当該抗体は、ペプチドが当該フィブロネクチン結合領域の構成部分でないときにはフィブロネクチンに特異的に結合しない、当該フィブロネクチン結合領域のペプチドに結合する、サンプル中のフィブロネクチン結合タンパク質を検出するための方法であって、当該ペプチドが配列番号60又は61のアミノ酸配列からなる、前記方法。
- 当該フィブロネクチン結合タンパク質が微生物によって発現され、当該サンプルが当該微生物を含有している疑いがある請求項29の方法。
- 当該フィブロネクチン結合タンパク質が連鎖球菌あるいはブドウ球菌によって発現される請求項30の方法。
- 当該フィブロネクチン結合タンパク質が黄色ブドウ球菌(Staphylococcus aureus)によって発現される請求項31の方法。
- 適当な容器媒体中に、
a)フィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域に結合し、かつ当該フィブロネクチン結合タンパク質がフィブロネクチンに結合することを阻害する抗体(ただし当該抗体は、ペプチドが当該フィブロネクチン結合領域の構成部分でないときにはフィブロネクチンに特異的に結合しない、当該フィブロネクチン結合領域のペプチドであって、配列番号60又は61のアミノ酸配列からなる前記ペプチドに結合する)、
b)フィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域の分離されたペプチドであって、配列番号60のアミノ酸配列からなる前記ペプチド(ただし当該ペプチドはフィブロネクチンに特異的に結合しない)、または
c)フィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域のペプチドをコードする分離された核酸セグメントであって、当該ペプチドが配列番号60のアミノ酸配列からなる、前記核酸セグメント(ただし当該ペプチドはフィブロネクチンに特異的に結合しない)、
を含むキットであって、治療上有効な量の当該抗体、当該分離ペプチドあるいは当該分離核酸セグメントが製薬学的に許容しうる製剤中に含まれている前記キット。 - 適当な容器媒体中に、フィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域に結合し、かつ当該フィブロネクチン結合タンパク質がフィブロネクチンに結合することを阻害する第一抗体を含む請求項33のキット。
- さらに免疫検出試薬を含む請求項34のキット。
- 当該免疫検出試薬が当該第一抗体に連結された検出可能標識である請求項35のキット。
- さらに当該第一抗体に結合する第二抗体を含む請求項34のキット。
- 当該抗体が連鎖球菌あるいはブドウ球菌のフィブロネクチンへの結合を阻害する請求項33のキット。
- 上記の製薬学的に許容しうる製剤が局所、非経口あるいは経口投与に適する請求項33のキット。
- 上記の製薬学的に許容しうる製剤が局所投与に適する請求項39のキット。
- a)フィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域に結合し、かつ当該フィブロネクチン結合タンパク質がフィブロネクチンに結合することを阻害する抗体(ただし当該抗体は、ペプチドが当該フィブロネクチン結合領域の構成部分でないときにはフィブロネクチンに特異的に結合しない、当該フィブロネクチン結合領域のペプチドであって、配列番号60又は61のアミノ酸配列からなる前記ペプチドに結合する)、
b)フィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域の分離されたペプチドであって、配列番号60又は61のアミノ酸配列からなる前記ペプチド(ただし当該ペプチドはフィブロネクチンに特異的に結合しない)、または
c)フィブロネクチン結合タンパク質のフィブロネクチン結合領域のペプチドをコードする分離された核酸セグメントであって、当該ペプチドが配列番号60又は61のアミノ酸配列からなる、前記核酸セグメント(ただし当該ペプチドはフィブロネクチンに特異的に結合しない)、
を含む医薬組成物の治療上有効な量を非ヒト動物に投与することを含む、動物における微生物感染を予防あるいは治療する方法。 - 当該方法が当該非ヒト動物における連鎖球菌あるいはブドウ球菌感染を予防あるいは治療する請求項41の方法。
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US3613997P | 1997-01-21 | 1997-01-21 | |
US60/036,139 | 1997-01-21 | ||
PCT/US1998/001222 WO1998031389A2 (en) | 1997-01-21 | 1998-01-21 | Fibronectin binding protein compositions, antibodies thereto, and methods of use |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2002513398A JP2002513398A (ja) | 2002-05-08 |
JP5124062B2 true JP5124062B2 (ja) | 2013-01-23 |
Family
ID=21886867
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP53338298A Expired - Fee Related JP5124062B2 (ja) | 1997-01-21 | 1998-01-21 | フィブロネクチン結合タンパク質組成物および使用法 |
Country Status (8)
Country | Link |
---|---|
EP (1) | EP0971740B1 (ja) |
JP (1) | JP5124062B2 (ja) |
AT (1) | ATE439862T1 (ja) |
AU (1) | AU744723B2 (ja) |
CA (1) | CA2277793A1 (ja) |
DE (1) | DE69841073D1 (ja) |
NZ (1) | NZ336781A (ja) |
WO (1) | WO1998031389A2 (ja) |
Families Citing this family (13)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US6660842B1 (en) | 1994-04-28 | 2003-12-09 | Tripep Ab | Ligand/receptor specificity exchangers that redirect antibodies to receptors on a pathogen |
US6933366B2 (en) | 1996-12-27 | 2005-08-23 | Tripep Ab | Specificity exchangers that redirect antibodies to bacterial adhesion receptors |
EP1121149A4 (en) * | 1998-08-31 | 2002-03-20 | Inhibitex Inc | IMMUNOTHERAPY METHOD FOR STAPHYLOCOCCAL INFECTIONS INCLUDING DONOR SELECTION AND DONOR STIMULATION |
US6692739B1 (en) | 1998-08-31 | 2004-02-17 | Inhibitex, Inc. | Staphylococcal immunotherapeutics via donor selection and donor stimulation |
DE69940404D1 (de) * | 1998-08-31 | 2009-03-26 | Inhibitex Inc | Multikomponenten Impfstoffe gegen Staphylococcus aureus |
SE9804491D0 (sv) * | 1998-12-22 | 1998-12-22 | Bengt Guss | Novel fibronectin-binding protein |
US7115264B2 (en) | 2001-11-05 | 2006-10-03 | Inhibitex | Monoclonal antibodies to the fibronectin binding protein and method of use in treating or preventing infections |
US7335359B2 (en) | 2003-02-06 | 2008-02-26 | Tripep Ab | Glycosylated specificity exchangers |
JP2007516157A (ja) | 2003-02-06 | 2007-06-21 | トリペップ アクチ ボラゲット | グリコシル化された抗原/抗体又はリガンド/受容体特異性交換体 |
CA2562037A1 (en) * | 2004-05-21 | 2005-12-08 | Wyeth | Altered fibronectin-binding protein of staphylococcus aureus |
TW200637907A (en) * | 2004-12-20 | 2006-11-01 | Scient Feed Lab Co Ltd | Novel vaccine for fish diseases against strepcococcemia |
FR2935002B1 (fr) * | 2008-08-13 | 2014-09-05 | Biomerieux Sa | Milieu de culture permettant de differencier staphylococcus aureus des staphylococcus a coagulase negative |
EP2561888A1 (en) * | 2011-08-23 | 2013-02-27 | Deutsches Krebsforschungszentrum | Protein comprising NC-1 for treating angiogenesis-related diseases |
Family Cites Families (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
SE8901687D0 (sv) * | 1989-05-11 | 1989-05-11 | Alfa Laval Agri Int | Fibronectin binding protein as well as its preparation |
SE9002617D0 (sv) * | 1990-08-10 | 1990-08-10 | Alfa Laval Agri Int | A fibronectin binding peptide |
WO1994018327A1 (en) * | 1993-02-05 | 1994-08-18 | Smithkline Beecham Plc | Fibronectin binding protein; monoclonal antibody and their use in preventing bacterial adhesion |
GB9415900D0 (en) * | 1994-08-05 | 1994-09-28 | Smithkline Beecham Plc | Novel compounds and treatment |
GB9415901D0 (en) * | 1994-08-05 | 1994-09-28 | Smithkline Beecham Plc | Novel compounds and treatment |
-
1998
- 1998-01-21 JP JP53338298A patent/JP5124062B2/ja not_active Expired - Fee Related
- 1998-01-21 EP EP98908439A patent/EP0971740B1/en not_active Expired - Lifetime
- 1998-01-21 CA CA002277793A patent/CA2277793A1/en not_active Abandoned
- 1998-01-21 AU AU66479/98A patent/AU744723B2/en not_active Ceased
- 1998-01-21 AT AT98908439T patent/ATE439862T1/de not_active IP Right Cessation
- 1998-01-21 NZ NZ336781A patent/NZ336781A/xx not_active IP Right Cessation
- 1998-01-21 DE DE69841073T patent/DE69841073D1/de not_active Expired - Lifetime
- 1998-01-21 WO PCT/US1998/001222 patent/WO1998031389A2/en active IP Right Grant
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
DE69841073D1 (de) | 2009-10-01 |
WO1998031389A2 (en) | 1998-07-23 |
JP2002513398A (ja) | 2002-05-08 |
EP0971740A2 (en) | 2000-01-19 |
AU6647998A (en) | 1998-08-07 |
ATE439862T1 (de) | 2009-09-15 |
CA2277793A1 (en) | 1998-07-23 |
AU744723B2 (en) | 2002-02-28 |
EP0971740B1 (en) | 2009-08-19 |
WO1998031389A3 (en) | 1999-01-21 |
NZ336781A (en) | 2002-10-25 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
US8211432B2 (en) | Treatment of Staphylococcus aureus infections utilizing antibodies that bind to fibronectin binding proteins | |
EP0950068B1 (en) | Collagen binding protein compositions and methods of use | |
US11447543B2 (en) | Antibodies to S. aureus surface determinants | |
US7045131B2 (en) | Staphylococcal immunotherapeutics via donor selection and donor stimulation | |
JP4691225B2 (ja) | グラム陽性細菌のリポテイコ酸に特異的なオプソニン的かつ防御的モノクローナルおよびキメラ抗体 | |
AU762978B2 (en) | Staphylococcal immunotherapeutics via donor selection and donor stimulation | |
JP2020537509A (ja) | Tigit抗体、その抗原結合断片及びその医療用途 本願は、2019年9月29日に出願された出願番号cn201710908565.3に基づいたものであり、その優先権を主張する。その開示は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。 | |
RU2529946C9 (ru) | Моноклональное антитело человека против альфа-токсина из s. aureus и его применение в лечении или предотвращении образования абсцесса | |
JP5124062B2 (ja) | フィブロネクチン結合タンパク質組成物および使用法 | |
JPH05501399A (ja) | 敗血症治療用組成物 | |
WO2021052461A1 (zh) | 抗α-溶血素的抗体及其应用 | |
JP2010013454A (ja) | グラム陽性細菌のペプチドグリカンに対する多機能性モノクローナル抗体 | |
WO1998031389A9 (en) | Fibronectin binding protein compositions, antibodies thereto, and methods of use | |
JP2005514053A6 (ja) | グラム陽性細菌のリポタイコ酸に特異的なオプソニン性モノクローナルおよびキメラ抗体 | |
JP2005514053A (ja) | グラム陽性細菌のリポタイコ酸に特異的なオプソニン性モノクローナルおよびキメラ抗体 | |
WO2016073860A1 (en) | Binding molecules specific for staphylococcus protein a and uses thereof | |
JP4044733B2 (ja) | ベロ毒素iiを認識するヒト型化抗体、および該抗体を産生する細胞株 | |
US20220080036A1 (en) | Human monoclonal antibodies to staphylococcal aureus isd proteins and uses thereof | |
Corbeil | Antibodies as effectors | |
HOOK et al. | Patent 2255669 Summary | |
JPWO2014142356A1 (ja) | 強皮症治療剤 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20041102 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20080311 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20080604 |
|
A602 | Written permission of extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A602 Effective date: 20080714 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20080911 |
|
A02 | Decision of refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A02 Effective date: 20090310 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20090624 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20090624 |
|
A911 | Transfer to examiner for re-examination before appeal (zenchi) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A911 Effective date: 20090806 |
|
A912 | Re-examination (zenchi) completed and case transferred to appeal board |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A912 Effective date: 20091001 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20110520 |
|
A602 | Written permission of extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A602 Effective date: 20110531 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20120802 |
|
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20121029 |
|
FPAY | Renewal fee payment (event date is renewal date of database) |
Free format text: PAYMENT UNTIL: 20151102 Year of fee payment: 3 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
LAPS | Cancellation because of no payment of annual fees |