JP5005247B2 - 光測定装置、光測定方法、及び光測定プログラム - Google Patents
光測定装置、光測定方法、及び光測定プログラム Download PDFInfo
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Description
解析領域での光強度/解析領域の面積
によって求めることができる。
解析画素での光強度の積分値/(解析画素数×1画素の面積)
によって求めることができる。
Data[Well][Pixel]
が選択される(S502)。
SData[Well][SampleNo]
として選択される(S504)。
D12=D10−D11
が導出される。
D23=D20−D21−D22
が導出される。
D35=(D30−D31−D32)/D33×(D33の平均値)
が導出される。
50…データ解析装置、51…解析処理部、52…平均光強度算出部、53…解析データ選択部、54…測定データ補正部、56…測定領域設定部、57…解析領域抽出部、58…閾値設定部、61…測定データ記憶部、62…領域データ記憶部、63…閾値データ記憶部、64…補正データ記憶部、71…表示装置、72…入力装置、73…モニタ、74…キーボード、75…マウス、80…バス、81…演算部、82…画像メモリ、83…インターフェース、84…プログラム記憶部、85…データ記憶部。
Claims (17)
- それぞれ試料を保持可能な複数のウェルが2次元アレイ状に配置されたマイクロプレートによって保持された状態で測定位置に配置された試料からの光を測定する光測定装置であって、
マイクロプレートのウェル内に保持された試料である細胞からの光を含む前記マイクロプレートの2次元光像を検出して、2次元の光検出画像を取得する画像取得手段と、
前記光検出画像を含む測定データに対して解析処理を行うデータ解析手段と
を備え、
前記データ解析手段は、
前記光検出画像に対し、前記マイクロプレートの複数の前記ウェルのそれぞれについて前記ウェルに対応する測定領域を設定する測定領域設定手段と、
前記光検出画像から得られる前記測定領域内での細胞の分布に対応した2次元の光強度分布と所定の光強度閾値とを比較することによって、前記測定領域から前記解析処理の対象となる前記細胞の分布に対応した解析領域を抽出する解析領域抽出手段と、
前記解析領域内での光強度のデータを解析データとして、前記細胞についての前記解析処理を行う解析処理手段と
を有し、
前記画像取得手段は、複数の画素が2次元に配列された2次元画素構造を有する撮像装置を含み、
前記測定領域設定手段は、前記ウェルに対応するように前記測定領域として測定画素群を設定するとともに、
前記解析領域抽出手段は、前記撮像装置での前記複数の画素に対応し前記光検出画像を構成する複数の画素成分のそれぞれについて、前記画素成分での光強度と前記光強度閾値とを比較して前記解析処理の対象とするか否かを設定することによって、前記解析領域として解析画素群を抽出することを特徴とする光測定装置。 - 前記解析処理手段は、前記解析処理として前記解析画素群内での光強度分布における平均光強度を算出する処理を行う平均光強度算出手段を有することを特徴とする請求項1記載の光測定装置。
- 前記平均光強度算出手段は、前記解析画素群に含まれる解析画素について画素単位で前記解析処理を行い、前記平均光強度を
解析画素での光強度の積分値/(解析画素数×1画素の面積)
によって算出することを特徴とする請求項2記載の光測定装置。 - 前記データ解析手段は、前記解析領域抽出手段における前記解析画素群の抽出に用いられる前記光強度閾値を設定する閾値設定手段を有することを特徴とする請求項1〜3のいずれか一項記載の光測定装置。
- 前記解析処理手段は、前記解析画素群内での光強度のデータのみを前記解析データとして前記解析処理を行って、前記解析画素群についての解析結果を得ることを特徴とする請求項1〜4のいずれか一項記載の光測定装置。
- 前記解析処理手段は、前記解析画素群を含む前記測定画素群内での光強度のデータを前記解析データとして前記解析処理を行い、その後に前記解析画素群に応じて解析結果を選択することによって、前記解析画素群についての解析結果を得ることを特徴とする請求項1〜4のいずれか一項記載の光測定装置。
- 前記解析領域抽出手段は、前記光強度分布中で前記光強度閾値を超える光強度を有する画素群を抽出して前記解析画素群とするとともに、前記光強度閾値よりも高い値に設定された第2の光強度閾値を参照し、前記第2の光強度閾値を超える光強度を有する画素群を前記解析画素群から除外することを特徴とする請求項1〜6のいずれか一項記載の光測定装置。
- 前記解析領域抽出手段は、単一の前記測定画素群に対する前記解析画素群として、複数の解析画素群を抽出するとともに、
前記解析処理手段は、前記複数の解析画素群のそれぞれについて、解析画素群内での光強度のデータを前記解析データとして、前記細胞についての前記解析処理を別個に行うことを特徴とする請求項1〜7のいずれか一項記載の光測定装置。 - それぞれ試料を保持可能な複数のウェルが2次元アレイ状に配置されたマイクロプレートによって保持された状態で測定位置に配置された試料からの光を測定する光測定方法であって、
マイクロプレートのウェル内に保持された試料である細胞からの光を含む前記マイクロプレートの2次元光像を検出して、2次元の光検出画像を取得する画像取得ステップと、
前記光検出画像を含む測定データに対して解析処理を行うデータ解析ステップと
を備え、
前記データ解析ステップは、
前記光検出画像に対し、前記マイクロプレートの複数の前記ウェルのそれぞれについて前記ウェルに対応する測定領域を設定する測定領域設定ステップと、
前記光検出画像から得られる前記測定領域内での細胞の分布に対応した2次元の光強度分布と所定の光強度閾値とを比較することによって、前記測定領域から前記解析処理の対象となる前記細胞の分布に対応した解析領域を抽出する解析領域抽出ステップと、
前記解析領域内での光強度のデータを解析データとして、前記細胞についての前記解析処理を行う解析処理ステップと
を含み、
前記画像取得ステップにおいて、複数の画素が2次元に配列された2次元画素構造を有する撮像装置を用い、
前記測定領域設定ステップは、前記ウェルに対応するように前記測定領域として測定画素群を設定するとともに、
前記解析領域抽出ステップは、前記撮像装置での前記複数の画素に対応し前記光検出画像を構成する複数の画素成分のそれぞれについて、前記画素成分での光強度と前記光強度閾値とを比較して前記解析処理の対象とするか否かを設定することによって、前記解析領域として解析画素群を抽出することを特徴とする光測定方法。 - 前記解析処理ステップは、前記解析処理として前記解析画素群内での光強度分布における平均光強度を算出する処理を行う平均光強度算出ステップを含むことを特徴とする請求項9記載の光測定方法。
- 前記平均光強度算出ステップは、前記解析画素群に含まれる解析画素について画素単位で前記解析処理を行い、前記平均光強度を
解析画素での光強度の積分値/(解析画素数×1画素の面積)
によって算出することを特徴とする請求項10記載の光測定方法。 - 前記データ解析ステップは、前記解析領域抽出ステップにおける前記解析画素群の抽出に用いられる前記光強度閾値を設定する閾値設定ステップを含むことを特徴とする請求項9〜11のいずれか一項記載の光測定方法。
- 前記解析処理ステップは、前記解析画素群内での光強度のデータのみを前記解析データとして前記解析処理を行って、前記解析画素群についての解析結果を得ることを特徴とする請求項9〜12のいずれか一項記載の光測定方法。
- 前記解析処理ステップは、前記解析画素群を含む前記測定画素群内での光強度のデータを前記解析データとして前記解析処理を行い、その後に前記解析画素群に応じて解析結果を選択することによって、前記解析画素群についての解析結果を得ることを特徴とする請求項9〜12のいずれか一項記載の光測定方法。
- 前記解析領域抽出ステップは、前記光強度分布中で前記光強度閾値を超える光強度を有する画素群を抽出して前記解析画素群とするとともに、前記光強度閾値よりも高い値に設定された第2の光強度閾値を参照し、前記第2の光強度閾値を超える光強度を有する画素群を前記解析画素群から除外することを特徴とする請求項9〜14のいずれか一項記載の光測定方法。
- 前記解析領域抽出ステップは、単一の前記測定画素群に対する前記解析画素群として、複数の解析画素群を抽出するとともに、
前記解析処理ステップは、前記複数の解析画素群のそれぞれについて、解析画素群内での光強度のデータを前記解析データとして、前記細胞についての前記解析処理を別個に行うことを特徴とする請求項9〜15のいずれか一項記載の光測定方法。 - それぞれ試料を保持可能な複数のウェルが2次元アレイ状に配置されたマイクロプレートによって保持された状態で測定位置に配置された試料からの光を測定する光測定をコンピュータに実行させるためのプログラムであって、
画像取得手段によって取得された、マイクロプレートのウェル内に保持された試料である細胞からの光を含む前記マイクロプレートの2次元光像を検出した2次元の光検出画像に対し、前記マイクロプレートの複数の前記ウェルのそれぞれについて前記ウェルに対応する測定領域を設定する測定領域設定処理と、
前記光検出画像から得られる前記測定領域内での細胞の分布に対応した2次元の光強度分布と所定の光強度閾値とを比較することによって、前記測定領域から前記解析処理の対象となる前記細胞の分布に対応した解析領域を抽出する解析領域抽出処理と、
前記解析領域内での光強度のデータを解析データとして、前記細胞についての解析処理を行う解析処理と
を含むデータ解析処理をコンピュータに実行させ、
前記画像取得手段は、複数の画素が2次元に配列された2次元画素構造を有する撮像装置を含み、
前記測定領域設定処理は、前記ウェルに対応するように前記測定領域として測定画素群を設定するとともに、
前記解析領域抽出処理は、前記撮像装置での前記複数の画素に対応し前記光検出画像を構成する複数の画素成分のそれぞれについて、前記画素成分での光強度と前記光強度閾値とを比較して前記解析処理の対象とするか否かを設定することによって、前記解析領域として解析画素群を抽出することを特徴とする光測定プログラム。
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