JP4336198B2 - 細胞の選択、および/または定性および/または定量検出のための方法および診断キット - Google Patents
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Description
結腸癌の初期検出に加えて、特に転移細胞を最も初期に検出し得ることが、治療が成功を治めるのに非常に重要である。
腫瘍細胞の静脈血への横断が転移プロセスの開始時に起こり得るので、分子遺伝学的方法が、抹消血において腫瘍細胞を検出するのに有用であると考えられる。
この方法は、請求項1記載の方法により、および請求項29記載の診断キットにより達成される。本発明記載の方法および本発明記載の診断キットに関する有利な開発事項は、各従属請求項に示す。
例えば、腫瘍細胞の特異的表面タンパク質の発現は、この細胞タイプの非形質転換細胞とは異なる。
種々の分離法が可能である。
フローサイトメトリー分析に関しては、抗体を蛍光着色剤と結合させる。単離細胞に、一定の液流にて個々に光源(レーザー)を通す。細胞を照射すると、抗体に結合した蛍光着色剤が励起し、特定の波長の光を放射する。放射光を検出し、測定されたシグナルをディジタル形態で保存する。光シグナルにより、個々の細胞を指定することができる。抗体でマークされた細胞をこうして検出し、他の細胞から分離することができる。分離に関しては、細胞は最少の滴へと単離される。抗体でマークされた細胞の検出後、対応する滴を収集容器へと入れる。このタイプの濃縮は、例えば、FACSフローサイトメトリーにより行うことができる。例えば、腫瘍特異的表面タンパク質に対する蛍光マークモノクローナル抗体と共に、濃縮された細胞をインキュベートする。マークされた細胞を2回PBSにて洗浄し、その後、107個の細胞を1mlのPBSに再懸濁する。腫瘍細胞の単離に関しては、FACSヴァンテージSEフローサイトメーター(Becton Dickinson)を用いる。データの記録、装置のコントロール、およびデータの評価を、セルクエストプログラムにより行う。ソートされた細胞を1.5mlの反応容器(1mlのPBSで満たした)に移す。RNAを次いで、後に記載するごとく単離することができる。
抗体を、磁気分離のために、擬-磁性粒子に結合させる。磁気フィールドへ擬-磁性粒子を導入後、粒子が磁気フィールドを移動する。この磁気フィールドにおける移動の間、これらの結合抗体が結合した細胞が運び去られ、他の細胞から分離される。
Verlagsgesellschaft mbH, Weinheim, pp 507-529中のJames P. Gosling, 固相概念および設計から公知である。分離の特異性は、抗体の特異性により決定する。標的細胞を含んでいる血液サンプルを抗体結合磁性粒子と混合し、粒子および血液を、例えば、密封容器中に位置するサンプルの「オーバーヘッドローテーション」により、または磁気フィールドを変化させることによる粒子の移動により、互いに対して移動させる。固相に結合させた、つまり安定に結合させた抗体により検出されるこれらの標的細胞は、粒子の移動に従う。結果として、細胞を結合した粒子を血液から(例えば分離容器の壁上に)取り出すことができる。この方法にて標的細胞が枯渇する血液は、他の溶液、インサイチュに残っている、磁性粒子により分離される細胞と、磁気フィールドのスイッチングオフ/除去、およびさらなる適用のために利用されるまで、交換することができる。
発明に従い、特定の抗体混合物を腫瘍細胞の検出のために都合よく用いる。例えば、抗体MOC-31びBer-EP4の組み合わせが、血液中の腫瘍細胞を検出するのに適している。
このタイプの抗体混合物は、細胞検出および細胞分離に関し、それぞれ別個に用いる抗体と比較して、適用される方法に依存して、増加した感受性を示す。
-GA733.2
-GCAP/PLAP
-HMGI-C
-GRPR
a)EGFR、CEA、スタニオカルシン、MAGE 3、CK20、クラウジン7、Her-2/neu、MUC1、およびGA733.2;
b)CK20、MAGE3、およびMUC1
c)Her-2/neuおよびクラウジン7、および、
d)EGFR、CEA、およびスタニオカルシン
a)CK20、EGFR、GA733.2、CEA、およびスタニオカルシン
b)CK20、EGFR、CEA、およびスタニオカルシン、および、
c)EGFR、CEA、および733.2
基本操作は、全実施例において共通しており、該操作は、標的細胞の免疫学的濃縮を含む第一ステップ、および免疫学的に濃縮された細胞におけるmRNAマーカーの検出の第二ステップを含む。以下に、これらのステップを、それらが全実施例に関して同様である限り、一般形態にて記載する。
まず、抹消血サンプルを採取し、規定数の標的細胞、例えば、2、10、100細胞の特定の腫瘍タイプを、それに添加した。
さらに、抗体を磁性粒子に結合させた。抗体としては、以下の表3に示す抗体を用いた。
Mouse IgGキット、Dynal Co.)の粒子濃度で用いた。抗体濃度と結合抗体の間の割合を表4に再現する。
腫瘍細胞の第一の相対的濃縮は、赤血球の枯渇により行う。この目的のために、全ての血液(EDTAを含む)を低張赤血球溶解バッファーと混合し、30分間室温にてインキュベートする。残る核含有細胞を遠心分離し、次いでPBS/BSAに再懸濁する。こうして得られた細胞を次いで、フルオロフォアにてマークされる抗体とインキュベートする。抗体への結合を用いて蛍光化にてマークされる標的細胞を、FACSにより分離した。
まず、前記のごとく単離された細胞の全RNAの単離を行う。これは、製造業者の指示に従いQIAamp RNA血液Miniキット(Qiagen Co., Hilden)を用いて行い、ここで、溶解バッファーを、磁性粒子に結合した細胞に対して直接適用する。カラム上の追加のDNA消化により、ゲノムDNAでのコンタミネーションが回避される。このDNA消化は、RNAseを含まないDNAseセット、Qiagen Co., Hildenを用いて行う。
別法として、さらに、例えば、オリゴ(dT)-結合磁性粒子、Dynabeads(登録商標)mRNA(登録商標)Microキット(Dynal Co.)を用いて、mRNAの単離を行うことができる。この単離は、キットにて示される製造業者の指示に従って行う。
Co. BRL, NY, USA)の添加により溶解し、ピペットを用いてホモジェナイズする。次なるクロロホルム抽出後、RNAを含んでいる水相をイソプロパノール中に、-80℃にて沈殿させる。2回洗浄し、80%エタノールにて遠心分離した後、ペレットを空気乾燥し、次いで、RNAseを含まない水に再懸濁する。この再プロセシングステップも同様に、常套のプロトコルに従い行う。
mRNAをcDNAへ転写する逆転写を、RNAの単離後に行う。
加えて、オリゴ(dt)15プライマー(Promega Co., Mannheim)を含む表6の反応バッチに従う対応する体積の水にて、5分間65℃にてRNAを変性し、次いで直接氷上にてインキュベートする。
mRNAを単離するためのオリゴ(dT)−結合磁性粒子をすでに用いている場合は、オリゴ(dT)プライマーの添加は省略する、即ち、オリゴ(dT)-リンカーが逆転写のためのプライマーとして同時に役立ち、磁性粒子がバッチに残る。
mRNAのcDNAへの転写に次いで、ポリメラーゼ鎖反応(PCR)を、内部コントロールとしてβ-アクチンを用いてなす。
表7に記載するオリゴヌクレオチドを、第一欄に示す種々のマーカー遺伝子に対応するcDNAの増幅のためのPCRプライマーとして用いた。
別法として、フラグメント分析はまた、ABIプリズム310ジェネティックアナライザー(PEアプライド バイオシステム カンパニー、Weitertstadt)を用いて行うことができる。この目的のために、1μlのPCR産物を、次いで希釈1:50にて用いる。この場合、蛍光マークされたプライマーを用いる。
分子生物学的マーカーのそれぞれを用いて、5ミリリットル当たり2個を下る細胞の検出が、免疫学的選択ステップにおいて、細胞の選択のために抗体のこの3つの組み合わせを用いた場合に、成功する。
Claims (26)
- 生物細胞を含んでいるサンプルからのまたは当該サンプルにおける、予め決定された生物細胞の定性および/または定量検出のための方法であって、
検出されるべき細胞に選択的に存在する別個のエピトープに対してその結合部位にて結合する少なくとも2つの抗体および/または抗体誘導体の予め決定された組み合わせ;および/または、検出されるべき細胞に選択的に存在する別個のエピトープに対して、共にその2つの結合部位にて結合する少なくとも1つの二特異的抗体および/または抗体誘導体と、サンプルを混合すること、
少なくとも1つの抗体および/または抗体誘導体でマークされた細胞を、サンプルから分離すること、
次いで、分離された細胞を、少なくとも2つの分子生物学的検出試薬の予め決定された組み合わせで、少なくとも2つのmRNA部分の予め決定された組み合わせの発現に関して試験し、ここで該発現は検出されるべき細胞において選択的にもたらされ、かつ、当該mRNA部分の少なくとも1つが発現されるかどうかを検出すること、
を特徴とする方法。 - マークされた細胞の分離を液相または固相にて行うことを特徴とする、請求項1に記載の方法。
- サンプルから標的細胞を分離するために、固相結合抗体または抗体誘導体を用いることを特徴とする、請求項1または請求項2に記載の方法。
- フルオロフォアでマークした抗体または抗体誘導体を用いること、およびサンプルからのマークされた細胞の分離をフローサイトメトリーを用いて行うことを特徴とする、請求項1〜3のいずれか1項に記載の方法。
- 磁性または擬−磁性粒子に結合した抗体または抗体誘導体を用いること、およびマークされた細胞をサンプルから分離するのに、サンプルと混合後、抗体を結合した磁性または擬−磁性粒子をサンプルから磁気的に分離することを特徴とする、請求項1〜4のいずれか1項に記載の方法。
- 抗体または抗体誘導体が、腫瘍細胞に結合する結合部位を有することを特徴とする、請求項1〜5のいずれか1項に記載の方法。
- 抗体または抗体誘導体が、1つまたはそれ以上の特定の腫瘍タイプまたはサブタイプの細胞に結合する結合部位を有することを特徴とする、請求項1〜6のいずれか1項に記載の方法。
- 特定の腫瘍タイプまたはサブタイプの腫瘍細胞または細胞を分離するために、抗体または抗体誘導体が、上皮抗原、上皮膜抗原、抗原MUC1、および/または抗原PLAPのエピトープに結合する結合部位を有することを特徴とする、請求項1〜7のいずれか1項に記載の方法。
- 抗体GP1.4、MOC-31、Ber-EP4、HMPV.2、8B6、E29、および131-11741の少なくとも1つを用いることを特徴とする、請求項1〜8のいずれか1項に記載の方法。
- 一般の、または特定タイプもしくはサブタイプの腫瘍細胞を分離するために、抗体Ber-EP4およびMOC31、または抗体HMPV.2、GP1.4およびBer-EP4の少なくとも2つを含む抗体の組み合わせを用いることを特徴とする、請求項1〜9のいずれか1項に記載の方法。
- 乳癌細胞を分離するために、抗体131-11741、GP1.4、E29、およびHMPV.2の少なくとも2つ、または抗体HMPV.2、GP1.4、およびBer-EP4の少なくとも2つを含む抗体の組み合わせを用いることを特徴とする、請求項1〜10のいずれか1項に記載の方法。
- 腸腫瘍細胞を分離するために、抗体Ber-EP4およびMOC-31を含む抗体の組み合わせを用いることを特徴とする、請求項1〜11のいずれか1項に記載の方法。
- 精巣腫瘍細胞を分離するために、抗体MOC-31 、Ber-EP4および8B6の少なくとも2つを含む抗体の組み合わせを用いることを特徴とする、請求項1〜12のいずれか1項に記載の方法。
- 特定の腫瘍タイプまたはサブタイプの腫瘍細胞または細胞を検出するために、遺伝子GA733.2、EGFR、CEA、HER2/neu、クラウジン-7(CLDN7)、GCAP(ALPPL2)/ALPP、GRPR、HMGIC、CK20、MAGE3、MUC1、およびスタニオカルシン(STC1)の少なくとも2つの配列部分に対応するmRNA部分を含むmRNA部分の組み合わせを試験することを特徴とする、請求項1〜13のいずれか1項に記載の方法。
- 特定の腫瘍タイプまたはサブタイプの腫瘍細胞または細胞を検出するために、遺伝子EGFR、GA733.2、およびHER-2/NEUの少なくとも2つの配列部分に対応するmRNA部分を含むmRNA部分の組み合わせを試験することを特徴とする、請求項1〜14のいずれか1項に記載の方法。
- 乳癌細胞を検出するために、遺伝子GA733.2、MUC1、Her-2/neu、クラウジン7、CK20、MAGE-3、スタニオカルシン、EGFR、およびCEAの少なくとも2つの配列部分に対応するmRNA部分を含むmRNA部分の組み合わせを用いることを特徴とする、請求項14に記載の方法。
- 乳癌細胞を検出するために、2つの遺伝子GA733.2およびMUC1の配列部分に対応している、2つの遺伝子Her-2/neuおよびクラウジン7の配列部分に対応している、遺伝子CK20、MAGE-3、およびMUC1の少なくとも2つの配列部分に対応している、および/または遺伝子スタニオカルシン、EGFR、およびCEAの少なくとも2つの配列部分に対応しているmRNA部分を含むmRNA部分の組み合わせを用いることを特徴とする、請求項16に記載の方法。
- 結腸腫瘍細胞を検出するために、遺伝子CK20、EGFR、GA733.2、CEA、およびスタニオカルシンの少なくとも2つの配列部分に対応するmRNA部分を含むmRNA部分の組み合わせを用いることを特徴とする、請求項14に記載の方法。
- 結腸腫瘍細胞を検出するために、遺伝子CK20、EGFR、CEA、およびスタニオカルシンの少なくとも2つの配列部分に対応する、および/または遺伝子EGFR、CEA、およびGA733.2の少なくとも2つの配列部分に対応するmRNA部分を含むmRNA部分の組み合わせを用いることを特徴とする、請求項18に記載の方法。
- 精巣腫瘍細胞を検出するために、遺伝子ALPP/ALPPL2(GCAP)、GA733.2(=EGP-40)、HMGI-C、GRPRの少なくとも2つの配列部分に対応するmRNA部分を含むmRNA部分の組み合わせを用いることを特徴とする、請求項14に記載の方法。
- mRNA部分を、ポリメラーゼ鎖反応(PCR)、LCR、NASBA RT-PCRおよび/またはハイブリダイゼーション法を用いて増幅および/または検出することを特徴とする、請求項1〜20のいずれか1項に記載の方法。
- 分離された細胞のmRNAをcDNAに逆転写し、cDNAを増幅し、次いで検出すべきmRNA部分の存在または不在を検出することを特徴とする、請求項1〜21のいずれか1項に記載の方法。
- 増幅されたcDNAを適当な制限酵素で消化し、検出すべきmRNAの存在または不在を生じたcDNAフラグメントを用いて検出することを特徴とする、請求項22に記載の方法。
- 検出すべきmRNAに対応するcDNAを蛍光に基づくリアルタイム−PCRを用いて検出することを特徴とする、請求項22または請求項23に記載の方法。
- タンパク質β−アクチンのmRNAを内部コントロールとして検出することを特徴とする、請求項1〜24のいずれか1項に記載の方法。
- 体液、抹消血、痰、腹水、リンパ液、尿、骨髄、および生検材料から成る群から選択されるサスペンションおよび細胞混合物中の、腫瘍細胞、上皮細胞、および内皮細胞から成る群から選択される異常タイプの細胞を検出するための、および/または、羊水または母体抹消血中の胎児細胞を検出するための、請求項1〜25のいずれか1項に記載の方法。
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