JP3527200B2 - アンチセンスオリゴヌクレオチド組成物及びjnkタンパク質のモジュレーション方法 - Google Patents

アンチセンスオリゴヌクレオチド組成物及びjnkタンパク質のモジュレーション方法

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Description

【発明の詳細な説明】
【0001】本出願は、1997年8月13日に出願さ
れた米国特許出願第08/910,626号の一部継続
出願である。
【0002】
【発明の分野】本発明は、JNK遺伝子によってコード
される酵素である、JunN−末端キナーゼ(JNKタ
ンパク質)のレベルを検出及びモジュレートするための
組成物及び方法を提供する。特に、本発明は、JNKタ
ンパク質をコードする核酸と特異的にハイブリダイズし
得るアンチセンスオリゴヌクレオチドに関する。アンチ
センスオリゴヌクレオチドがこのような及び他のJNK
タンパク質の発現をモジュレートし得ることが見出され
ている。このキナーゼは、転写因子AP−1のc−Ju
nサブユニットのリン酸化を触媒してAP−1活性を高
め得る能力によって初め発見された。ATF−2のよう
な他の転写因子もJNKタンパク質によって同じように
活性化され、他の様々な細胞内エフェクターがJNKタ
ンパク質の基質として役立ち得る(Gupta et al., Scie
nce, 1995, 267, 389)。いずれの事象でも、転写因子
AP−1は、異常な細胞増殖、腫瘍遺伝子の形質転換、
及び腫瘍の形成、発達及び維持との関連が示唆されてき
た(Vogt, Chapter 15 In: The FOS and JUN Families
of Transcription Factors, Angel and Herrlich, Ed
s., CRC Press, Boca Raton, FL, 1994)。それ故、
(1)ある新生物及び腫瘍ではJNKタンパク質が異常
に発現され、AP−1活性の増加をもたらす、及び
(2)JNK遺伝子が異常発現してはいない異常増殖し
ている細胞においてさえ、JNK発現を阻害すればAP
−1活性が減少し、それによって異常な細胞増殖及び腫
瘍の形成、発達及び維持が阻害される、と考えられてい
る。故に本発明は、細胞の過剰増殖及び腫瘍の形成、発
達及び維持を検出する診断方法及びそれを阻害する治療
方法に向けられている。さらに本発明は、JNK遺伝子
の異常発現に関連した病態の治療に向けられている。本
発明はまたJNKタンパク質発現のモジュレーションに
応答する病態又は障害の治療薬、診断薬及び研究試薬に
関する。細胞の過剰増殖の阻害及び対応する予防、軽減
及び治療効果が本発明のオリゴヌクレオチドを用いた処
置からもたらされる。
【0003】
【発明の背景】転写因子は、細胞外シグナルによる刺激
時の特定遺伝子の発現において中心的な役割を担ってい
て、それにより複雑な配列をした生物学的プロセスを調
節する。AP−1(活性化タンパク質−1)と呼ばれる
転写因子ファミリーのメンバーは、成長因子、サイトカ
イン、腫瘍プロモーター、発癌物質及びある種の腫瘍遺
伝子の発現上昇に応じて遺伝子発現を変化させる(Rahm
sdorf, Chapter 13, andRapp et al., Chapter 16 In:
The FOS and JUN Families of Transcription Factors,
Angel and Herrlich, Eds., CRC Press, Boca Raton,
FL, 1994)。成長因子及びサイトカインは、特定の細胞
表面受容体に結合することによりその機能を発揮する。
受容体の占有が核へのシグナル伝達カスケードの引き金
になる。このカスケードでは、AP−1のような転写因
子は、遺伝子発現をモジュレートすることにより、細胞
外の要因に対して長期にわたり応答する。細胞内の遺伝
子発現におけるそのような変化がDNA合成、及び最終
的には分化した誘導体の形成を導く(Angel and Karin,
Biochim. Biophys. Acta, 1991, 1072, 129)。一般的
に言うと、AP−1は、真核細胞又はウイルスに見出さ
れる関連のヘテロダイマー性転写因子複合体ファミリー
の1メンバーである(The FOS and JUNFamilies of Tra
nscription Factors, Angel and Herrlich, Eds., CRC
Press,Boca Raton, FL, 1994; Bohmann et al., Scienc
e, 1987, 238, 1386; Angel etal., Nature, 1988, 33
2, 166)。c−Fos及びc−Junは、2種の比較的
よく特徴付けられたAP−1サブユニットであり、これ
ら2つのタンパク質はそれぞれ、c−fos及びc−j
un癌原遺伝子の産物である。c−fos又はc−ju
nのいずれか、又は両方の癌原遺伝子の活性を抑制し、
その結果としてc−Fos及びc−Junタンパク質の
形成を阻害することは、細胞増殖、腫瘍形成及び腫瘍成
長の阻害にとって望ましい。
【0004】タンパク質のリン酸化は細胞外シグナルの
細胞内伝達において主要な役割を担う。そのようなリン
酸化をもたらす酵素である、マイトジェン活性化プロテ
インキナーゼ(MAPK)は、成長因子、ホルモン及び
細胞代謝、増殖及び分化に関わる他の薬剤が作用するた
めの標的である(Cobb et al., J. Biol. Chem., 1995,
270, 14843)。MAPK(細胞外シグナル被調節プロ
テインキナーゼ、又はERKとも言及される)は、例え
ば、受容体チロシンキナーゼ、Gタンパク質共役型受容
体、プロテインキナーゼC(PKC)及び明らかにMA
PK専属のキナーゼであるMEK1及びMEK2により
触媒されるリン酸化によって自ら活性化される。一般
に、MAPキナーゼは、細胞外の刺激を癌原遺伝子の産
物へ伝達して細胞増殖及び/又は分化をモジュレートす
るように機能する多様なシグナル伝達経路(重なったり
併行する場合もある)に関わる(Seger et al., FASEB
J.,1995, 9, 726; Cano et al., Trends Biochem. Sc
i., 1995, 20, 117)。典型的なMAPキナーゼ経路で
は、MEKKと呼ばれる第一のMAPキナーゼがMEK
と呼ばれる第二のMAPキナーゼをリン酸化して活性化
し、これが次にMAPK/ERK又はJNK/SAPK
酵素(「SAPK」はストレス活性化プロテインキナー
ゼの省略語である)をリン酸化及び活性化する。最終的
に、活性化されたMAPK/ERK又はJNK/SAP
K酵素そのものが転写因子(例えばAP−1のような)
又は他の基質をリン酸化及び活性化する(Cano et al.,
Trends Biochem. Sci., 1995, 20, 117)。この規範的
なカスケードは単純に書けば以下のように表し得る:
【0005】
【式1】 MEKK → MEK → MAPK/ERK又はJN
K/SAPK → 転写因子又は他の基質
【0006】シグナル伝達経路の1つは、MAPキナー
ゼであるJunN末端キナーゼ1(JNK1)及びJu
nN末端キナーゼ2(JNK2)を含み、これらはc−
Junのアミノ端部分の特定部位(セリン63及びセリ
ン73)のリン酸化を担っている。これらの部位がリン
酸化されると、転写を活性化するAP−1の能力が高め
られる(Binetruy et al., Nature, 1991, 351, 122; S
meal et al., Nature,1991, 354, 494)。JNK1及び
JNK2以外の他のJNKファミリーメンバーも、p4
3F12キナーゼと初め命名されたJNK3(Gupta et a
l., EMBO Journal, 1996, 15, 2760)を包含して記載さ
れている(Mohit et al., Neuron, 1994, 14, 67)。本
明細書で使用されるように「JNKタンパク質」という
用語は、JNK1、JNK2、JKK3及びそのイソ型
(Gupta et al., EMBO Journal, 1996, 15, 2760)及び
それ自身のJunN−末端キナーゼとして作用する(つ
まり、特定のアミノ末端部位でJunをリン酸化する)
かしない他のJNKタンパク質ファミリーメンバーを、
限定しないが包含する、JNKキナーゼファミリーのメ
ンバーを意味する。 少なくとも1種のヒトの白血球癌
遺伝子は、JunN−末端キナーゼ機能を強めることが
示された(Raitano et al., Proc. Natl.Acad. Sci.(US
A), 1995, 92, 11746)。1種又はそれ以上のJNKタ
ンパク質の発現のモジュレーションが望ましいのは、細
胞の過剰増殖及び、AP−1や他のJNKタンパク質の
リン酸化基質によって刺激される遺伝子の転写に干渉す
るためである。また、1種又はそれ以上の他のJNKタ
ンパク質の発現のモジュレーションが望ましいのは、特
定のシグナル伝達経路での異常に由来する細胞の過剰増
殖に干渉するためである。今日まで、1種又はそれ以上
のJNKタンパク質の遺伝子発現を有効に阻害する治療
薬は知られていない。従って、特定のJNKタンパク質
の発現をモジュレートするための改良された組成物及び
方法に対する待望のニーズが残っている。 さらに、動
物における細胞の過剰増殖はいくつかの結果をもたらし
得る。内部のプロセスは、腫瘍が形成されないうちに、
過剰増殖性の細胞を消滅させ得る。腫瘍は細胞の過剰増
殖に由来する異常な成長物である。過剰に増殖するがそ
のままに留まる細胞は、良性腫瘍を形成するが、それは
通常局部手術によって除去され得る。対照的に、悪性腫
瘍又は癌は、転移、つまり過剰増殖性の細胞が循環又は
リンパ系を介して体内の他の部分へ広がり、その内部に
留まるプロセスを実施し得る細胞を含む(概論として、
Chapter 16 In: Molecular Biology of the Cell, Albe
rts et al., eds., Garland Publishing, Inc., New Yo
rk, 1983を参照のこと)。アンチセンスオリゴヌクレオ
チドを使用すると、驚くべきことに、転移のために必要
とされる酵素をコードするいくつかの遺伝子がAP−1
によってポジティブに調節されていて、それが1種又は
それ以上のJNKタンパク質を標的とするアンチセンス
オリゴヌクレオチドによってモジュレートされ得る、と
いうことが発見された。従って、本発明は、悪性腫瘍の
転移をモジュレートする改良された組成物及び方法に対
する待望のニーズを満たすものである。
【0007】
【発明の要旨】本発明によれば、JNKタンパク質をコ
ードする核酸と特異的にハイブリダイズするオリゴヌク
レオチドが提供される。本発明のある種のオリゴヌクレ
オチドは、JNKタンパク質をコードするJNK遺伝子
から転写されるmRNAに直接結合するか又はそのDN
Aの選択される部分に結合してその発現及び/又はJN
Kタンパク質の1種又はそれ以上の基質のリン酸化をモ
ジュレートするように設計されている。本発明のオリゴ
ヌクレオチドを含んでなる医薬組成物、及び、1つ又は
それ以上の転移事象をモジュレートする方法を包含す
る、本発明のオリゴヌクレオチドを使用する様々な方法
も本明細書に提供される。
【0008】
【発明の具体的な説明】オリゴヌクレオチドは、特定の
核酸と特異的なハイブリダイゼーションをするのに、同
一性及び数において十分なヌクレオチド配列を含み得
る。そのようなオリゴヌクレオチドは通常「アンチセン
ス」として記載される。アンチセンスオリゴヌクレオチ
ドは通常研究試薬、診断薬及び治療薬として使用され
る。JunN−末端キナーゼ(JNKタンパク質)をコ
ードする遺伝子(JNK)は、特にこのアプローチに従
うことが見出された。本発明の文脈では、「JunN−
末端キナーゼ」及び「JNKタンパク質」は、AP−1
のJunサブユニットのアミノ末端(N−末端)部分を
リン酸化することが実際に知られているタンパク質、並
びに、アミノ酸配列に基づいてJNKタンパク質として
一時的に同定されてはいるが、実は他の転写因子(例、
ATF2)又は転写に関わることが知られていないキナ
ーゼ基質に、追加的又は代替的に結合及び/又はリン酸
化し得るタンパク質に言及する(Derijard et al., Cel
l, 1994, 76, 1025; Kallunki et al., Genes & Develo
pment, 1994, 8, 2996; Gupta et al., EMBO J., 1996,
15, 2760)。より特定すると、本発明はJNK1、J
NK2及びJNK3タンパク質をモジュレートするアン
チセンスオリゴヌクレオチドに向けられている。細胞増
殖とAP−1、他の転写因子及び/又は他のタンパク質
の(リン酸化を介した)JNKタンパク質による活性化
との連結の結果として、1種又はそれ以上のJNKタン
パク質の発現の阻害がAP−1及び/又は細胞増殖に関
わる他の因子の活性化、細胞周期の進展又は転移性の事
象の阻害をもたらし、それによりこれらの活性のモジュ
レーションをもたらす。このようなモジュレーション
は、様々な癌のような、様々な過剰増殖性の障害又は疾
患を治療、軽減又は予防するのに望ましい。そのような
阻害は、そのような疾患又は障害に罹っていることが疑
われるか又は罹っていることが知られている動物におけ
るそのような疾患又は障害の進展を予防又はモジュレー
トするのにさらに望ましい。所望されるならば、1つの
JNKタンパク質の発現のモジュレーションは、AP−
1−介在性の転写に干渉するのに必要なレベルを達成す
るために、1種又はそれ以上の追加的なJNKタンパク
質のモジュレーションと組み合わせ得る。
【0009】JNKタンパク質をコードする核酸と特異
的にハイブリダイズし得るオリゴヌクレオチドに動物を
接触させることを含んでなる、JNKタンパク質の発現
をモジュレートする方法が本明細書に提供される。これ
らの方法は、キナーゼ介在性のAP−1活性化と細胞増
殖との連結の結果として、治療的にも診断的にも有用で
あると考えられている。これらの方法はまた、例えば、
様々な細胞の機能及び生理学的なプロセス及び状態にお
けるキナーゼ介在性AP−1活性化の役割を検出及び決
定するためのツールとして、及びそのような発現又は活
性化に関連した病態の診断のために有用である。
【0010】本発明はまた、本発明のオリゴヌクレオチ
ドを使用してJNK介在性の活性化を阻害する方法を含
む。異常又は過剰なJNK介在性の細胞増殖が起きてい
る病態を治療する方法も提供される。これらの方法は本
発明のオリゴヌクレオチドを利用し、治療的にも臨床研
究及び診断ツールとしても有用であると考えられてい
る。本発明のオリゴヌクレオチドはまた研究目的にも使
用され得る。従って、本発明のオリゴヌクレオチドによ
って示される特異的なハイブリダイゼーションは、アッ
セイ、精製、細胞産物の調製、及び当業者に理解され得
る他の方法において使用され得る。
【0011】本発明は、タンパク質をコードするDNA
又はメッセンジャーRNA(mRNA)の機能のアンチ
センスモジュレーションに使用されるオリゴヌクレオチ
ドを利用する。そのモジュレーションは、究極的にはそ
のタンパク質の量を調節することが所望される。アンチ
センスオリゴヌクレオチドのその標的mRNAとのハイ
ブリダイゼーションはmRNAの正常な役割に干渉し、
細胞内のその機能のモジュレーションを引き起こす。干
渉されるmRNAの機能は、タンパク質翻訳部位へのR
NAの転座、RNAからタンパク質の実際の翻訳、1つ
又はそれ以上のmRNA種を生じるRNAスプライシン
グ、及びRNAにより従事され得るおそらくは独立した
触媒活性、というような全ての本質的な機能を包含す
る。mRNA機能に対するそのような干渉の全体効果は
タンパク質発現のモジュレーションであり、ここで「モ
ジュレーション」はタンパク質発現の増加(刺激)又は
減少(阻害)のいずれかを意味する。本発明の文脈で
は、遺伝子発現モジュレーションの好ましい形態は阻害
である。
【0012】アンチセンス攻撃のためには特定の遺伝子
を標的にすることが好ましい。本発明の文脈では、関連
する核酸にオリゴヌクレオチドを「標的化」すること
は、多工程の方法である。この方法は通常その機能がモ
ジュレートされるべき核酸配列を同定することから始ま
る。これは、例えば、その発現が特定の障害又は病態に
関連している細胞遺伝子(又はその遺伝子から転写され
るmRNA)、又は感染病原体由来の異種核酸であり得
る。本発明では、標的は過剰増殖性の障害に関連した細
胞遺伝子である。標的化の方法は、所望される効果、つ
まりタンパク質発現の検出又はモジュレーションがもた
らされるようにオリゴヌクレオチド相互作用が起こるこ
の遺伝子内の部位を決定することも包含する。標的部位
が同定されれば、その標的に十分相補的である、つまり
十分強くて十分な特異性をもってハイブリダイズして所
望の効果をもたらすオリゴヌクレオチドが選択される。
一般に、アンチセンスモジュレーションの標的になり得
る遺伝子の部位は5つ存在する:5'非翻訳領域(以
後、「5'−UTR」)、翻訳開始コドン領域(以後、
「tIR」)、オープンリーディングフレーム(以後、
「ORF」)、翻訳終止コドン領域(以後、「tT
R」)及び3'非翻訳領域(以後、「3'−UTR」)で
ある。当技術分野で知られているように、これらの領域
は典型的なメッセンジャーRNA分子内では以下の順に
配置される(左から右、5'から3'へ):5'−UT
R、tIR、ORF、tTR、3'−UTR。当技術分
野で知られているように、真核生物の転写産物のなかに
は直接翻訳されるものもあるが、多くのORFは1つ又
はそれ以上の配列、つまり翻訳される前に転写産物から
切出される「イントロン」及び「エクソン」として言及
されるORFの発現される(切出されない)部分を含有
するものである(Alberts et al., Molecular Biology
of theCell, 1983, Garland Publishing, Inc., New Yo
rk, pp. 411-415)。さらに、多くの真核ORFは10
00ヌクレオチド又はそれ以上の長さであるので、例え
ば5'ORF領域、中央ORF領域及び3'ORF領域と
いうようにORFを細分割することがしばしば便利であ
る。ある例では、ORFはin vivoにおけるある機能上
の意義により標的とされ得る1つ又はそれ以上の部位を
含有する。後者タイプの部位の例は、遺伝子内ステムル
ープ構造(例えば、米国特許第5,512,438号を
参照のこと)、及びプロセシングしないmRNA分子内
のイントロン/エクソンスプライス部位を包含する。
【0013】本発明の文脈内では、1つの好ましい遺伝
子内部位は、遺伝子のオープンリーディングフレーム
(ORF)の翻訳開始コドンを網羅する領域である。当
技術分野で知られているように、翻訳開始コドンは典型
的には5'−AUG(転写されたmRNA分子内で;対
応するDNA分子では5'−ATG)であるので、翻訳
開始コドンは「AUGコドン」、「開始コドン」又は
「AUG開始コドン」としても言及される。少数の遺伝
子は、5'−GUG、5'−UUG又は5'−CUGなる
RNA配列を有する翻訳開始コドンを有し、5'−AU
A、5'−ACG及び5'−CUGはin vivoで機能する
ことが示された。さらに、5'−UUUはin vitroで翻
訳開始コドンとして機能する(Brigstock et al., Grow
th Factors, 1990, 4, 45; Gelbert et al., Somat. Ce
ll. Mol. Genet., 1990, 16, 173; Goldand Stormo, i
n: Escherichia coli and Salmonella typhimurium: Ce
llular and Molecular Biology, Vol. 2, 1987, Neidha
rdt et al., eds., American Society for Microbiolog
y, Washington, D. C., p. 1303)。従って、「翻訳開
始コドン」及び「開始コドン」という用語は、たとえ個
々の例における開始アミノ酸が典型的にはメチオニン
(真核生物)又はホルミルメチオニン(原核生物)であ
るとしても、多くのコドン配列を網羅し得る。真核及び
原核生物の遺伝子が2種又はそれ以上の代替的な開始コ
ドンを有する場合があり、特定の細胞型又は組織、又は
特定の条件セットにおいてはそのうちの1つが選好的に
翻訳開始に利用され、異なるアミノ末端配列を有する近
縁のポリペプチドを産生する、ということも当技術分野
で知られている(Markussen et al., Development, 199
5, 121, 3723; Gao et al., Cancer Res., 1995, 55, 7
43; McDermott et al., Gene, 1992, 117, 193; Perri
et al., J. Biol. Chem., 1991, 266, 12536; French e
t al., J. Virol., 1989, 63, 3270; Pushpa-Rekha et
al., J. Biol. Chem., 1995,270, 26993; Monaco et a
l., J. Biol. Chem., 1994, 269, 347; DeVirgilio et
al., Yeast, 1992, 8, 1043; Kanagasundaram et al.,
Biochim. Biophys. Acta, 1992, 1171, 198; Olsen et
al., Mol. Endocrinol., 1991, 5, 1246; Saulet al.,
Appl. Environ. Microbiol., 1990, 56, 3117; Yaoita
et al., Proc.Natl. Acad. Sci. USA, 1990, 87, 7090;
Rogers et al., EMBO J., 1990, 9,2273)。本発明の
文脈では、「開始コドン」及び「翻訳開始コドン」は、
そのようなコドンの配列に拘らず、JNKタンパク質を
コードする遺伝子から転写されたmRNA分子の翻訳を
in vivoで開始するために使用されるコドンに言及す
る。当技術分野では、遺伝子の翻訳終止コドン(又は
「停止コドン」)が3つの配列、即ち、5'−UAA、
5'−UAG及び5'−UGA(対応するDNA配列は、
それぞれ5'−TAA、5'−TAG及び5'−TGAで
ある)の1つを有し得ることが知られている。「開始コ
ドン領域」及び「翻訳開始領域」という用語は、翻訳開
始コドンから両方向(即ち、5'又は3')にある約25
〜約50の連続したヌクレオチドを網羅するようなmR
NA又は遺伝子の部分に言及する。同様に、「停止コド
ン領域」及び「翻訳終止領域」という用語は、翻訳終止
コドンから両方向(即ち、5'又は3')にある約25〜
約50の連続したヌクレオチドを網羅するようなmRN
A又は遺伝子の部分に言及する。
【0014】「具体的な説明」の残りでは、(1)本発
明のオリゴヌクレオチド及びその(2)生物学的同等
物、(3)有用性、(4)医薬組成物及び(5)投与方
法をより詳しく述べる。 1.本発明のオリゴヌクレオチド:本発明は1種又はそ
れ以上のJNKタンパク質のアンチセンスモジュレーシ
ョンに使用するオリゴヌクレオチドを利用する。本発明
の文脈では、「オリゴヌクレオチド」という用語は、リ
ボ核酸又はデオキシリボ核酸のオリゴマー又はポリマー
に言及する。この用語は、天然に存在するヌクレオベー
ス、糖及び糖間(骨格)共有結合からなるオリゴヌクレ
オチド、並びに同様に機能する天然に存在しない部分を
有するオリゴヌクレオチドを包含する。そのような修飾
されたか又は置換されたオリゴヌクレオチドがネーティ
ブな形態よりしばしば好ましいのは、強められた細胞取
込み、強められた標的結合性及びヌクレアーゼ存在下で
の高められた安定性のような所望される特性のためであ
る。
【0015】オリゴヌクレオチドは、ヌクレオチドとし
て一般に知られている繰り返し単位からなるポリマーで
ある。本発明によるオリゴヌクレオチドは、好ましくは
約8〜約30のヌクレオチドを含む。未修飾の(天然に
存在する)ヌクレオチドは3つの成分を有する:(1)
窒素を含有するへテロ環式塩基、(2)その窒素原子の
1つにより連結した5−ペントフラノシル糖及び(3)
糖の5'又は3'炭素原子の1つにエステル結合したリン
酸。このオリゴヌクレオチド鎖に取り込まれるとき、第
一ヌクレオチドのリン酸は、3'−5'リン酸結合を介し
て第二の隣接ヌクレオチドの隣の糖へもエステル結合す
る。未修飾オリゴヌクレオチドの「骨格」は(2)及び
(3)、つまり、第一のヌクレオチドの糖の5'炭素と
第二の隣接ヌクレオチドの3'炭素との間のホスホジエ
ステル結合によって連結している糖からなる。「ヌクレ
オシド」は、(1)ヌクレオベース及び(3)リン酸部
分の不在下の(2)糖を組み合わせたものである(Korn
berg,A., DNA Replication, W.H.Freeman & Co., San F
rancisco,1980,pages 4-7)。オリゴヌクレオチドの骨格
は連続した塩基を特定の順序で配置し、この連続した塩
基の書かれた表示は、従来から5'から3'へ記載される
が、ヌクレオチド配列として知られている。
【0016】オリゴヌクレオチドは特定の核酸との特異
的なハイブリダイゼーションをもたらすのに同一性及び
数において十分なヌクレオチド配列を含み得る。遺伝子
のセンス鎖の部分に特異的にハイブリダイズするそのよ
うなオリゴヌクレオチドは、通常「アンチセンス」とし
て記載される。本発明の文脈では、「ハイブリダイゼー
ション」は、ワトソン−クリック、フーグスティーン又
は逆フーグスティーン型の水素結合であり得る、相補的
なヌクレオチド間の水素結合を意味する。例えば、アデ
ニン及びチミンは、水素結合の形成を介して対合する相
補的なヌクレオベースである。本明細書で使用されるよ
うに、「相補的」は、2つのヌクレオチド間の正確な対
合能力に言及する。例えば、オリゴヌクレオチドのある
部位のヌクレオチドがDNA又はRNA分子の同じ位置
に有るヌクレオチドと水素結合することができる場合、
このオリゴヌクレオチドとDNA又はRNAはその位置
でお互いに相補的であると考えられる。オリゴヌクレオ
チドとDNA又はRNAがお互いに相補的であるのは、
各分子内の対応する位置の十分な数がお互いに水素結合
し得るヌクレオチドによって占められているときであ
る。従って、「特異的にハイブリダイズし得る」及び
「相補的」とは、オリゴヌクレオチドとDNA又はRN
A標的との間に安定で特異的な結合が起こるほど十分な
程度の相補性又は正確な対合を示すことに使用される。
オリゴヌクレオチドがその標的配列に特異的にハイブリ
ダイズするのは、核酸二重鎖の内部にある特定の対とな
るヌクレオベース間の塩基対合の形成によるものであ
る。天然に存在するヌクレオベースの間では、グアニン
(G)がシトシン(C)に結合し、アデニン(A)がチ
ミン(T)又はウラシル(U)に結合する。Aの対合相
手としてのU(RNA)及びT(DNA)の同等性に加
えて、5−メチルシトシン、5−ヒドロキシメチルシト
シン(HMC)、グリコシルHMC及びゲンチオビオシ
ルHMC(Cの同等物)及び5−ヒドロキシメチルウラ
シル(Uの同等物)を包含する、他の天然に存在するヌ
クレオベース同等物が知られている。さらに、対合特異
性を保持する人工のヌクレオベースが当技術分野で知ら
れていて、それは例えば、Cに対する対合特異性を保持
する7−デアザ−グアニンを包含する。従って、標的オ
リゴヌクレオチド内の対合ヌクレオベースに対する特異
性にさして影響しない、オリゴヌクレオチドのヌクレオ
チド配列内のヌクレオベースに対するいかなる化学修飾
によっても、その標的配列に特異的にハイブリダイズす
るオリゴヌクレオチドの能力は変化しないだろう。当技
術分野では、オリゴヌクレオチドは、特異的にハイブリ
ダイズし得るのに、その標的DNA配列に対して100
%相補的である必要はないと理解されている。オリゴヌ
クレオチドが特異的にハイブリダイズし得るのは、特異
的な結合が所望される条件、即ちin vivo アッセイ又は
治療処置の場合、又はin vitroアッセイの場合の生理学
的条件、そのようなアッセイが実施される条件下で、非
標的配列に対するオリゴヌクレオチドの非特異的な結合
を回避するのに十分な程度の相補性があるときである。
【0017】アンチセンスオリゴヌクレオチドは、研究
試薬、診断薬、治療薬として通常使用される。例えば、
強い特異性をもって遺伝子発現を阻害し得るアンチセン
スオリゴヌクレオチドは、特定遺伝子の機能を解明す
る、例えば生物学的経路の様々なメンバーの諸機能を判
別するために、当業者によってしばしば使用される。従
って、この特異的な阻害効果は、当業者により研究上の
使用のために利用されてきた。オリゴヌクレオチドの特
異性及び感度はまた当業者によって治療上の使用のため
に利用されている。
【0018】A.修飾された結合:本発明に想定されて
いる好ましい修飾オリゴヌクレオチドの特定の例は、ホ
スホロチオエート、ホスホトリエステル、メチルホスホ
ネート、短鎖アルキル又はシクロアルキル糖間結合又は
短鎖ヘテロ原子又はヘテロ環式糖間結合を含有するもの
を包含する。最も好ましいのはホスホロチオエートを有
するオリゴヌクレオチド、及びCH2−NH−O−C
2、CH2−N(CH3)−O−CH2[メチレン(メチ
ルイミノ)又はMMI骨格として知られる]、CH2
O−N(CH3)−CH2、CH2−N(CH3)−N(C
3)−CH2及びO−N(CH3)−CH2−CH2骨格
を有するものであり、ここでネーティブなホスホジエス
テル骨格は、O−P−O−CH2として表される。また
好ましいのは、モルホリノ骨格の構造を有するオリゴヌ
クレオチドである(SummertonとWeller,米国特許第5,
034,506号)。さらに好ましいのは、NR−C
(*)−CH2−CH2、CH2−NR−C(*)−C
2、CH2−CH2−NR−C(*)、C(*)−NR
−CH2−CH2及びCH2−C(*)−NR−CH2骨格
を有するオリゴヌクレオチドであり、ここで「*」はO
又はSを表す(アミド骨格として知られている;DeMesm
aekerら、WO92/20823号、1992年11月
26日公開)。他の好ましい態様では、ペプチド核酸
(PNA)骨格のように、オリゴヌクレオチドのホスホ
ジエステル骨格がポリアミド骨格に置換されていて、ヌ
クレオベースはポリアミド骨格のアザ窒素原子に直接又
は間接的に結合している(Nielsen et al., Science, 1
991, 254: 1497;米国特許第5,539,082号)。
【0019】B.修飾されたヌクレオベース:本発明の
オリゴヌクレオチドはヌクレオベース修飾又は置換を追
加的又は代替的に包含し得る。本明細書で使用されるよ
うに、「未修飾の」又は「天然の」ヌクレオベースは、
アデニン(A)、グアニン(G)、チミン(T)、シト
シン(C)及びウラシル(U)を包含する。修飾された
ヌクレオベースは天然の核酸に稀に又は一時的にしか見
出されないヌクレオベース、例えば、ヒポキサンチン、
6−メチルアデニン、5−メチルシトシン、5−ヒドロ
キシメチルシトシン(HMC)、グリコシルHMC及び
ゲンチオビオシルHMC、並びに人工のヌクレオベー
ス、例えば、2−アミノアデニン、2−チオウラシル、
2−チオチミン、5−ブロモウラシル、5−ヒドロキシ
メチルウラシル、8−アザグアニン、7−デアザグアニ
ン、N6(6−アミノヘキシル)アデニン及び2,6−
ジアミノプリン(Kornberg, A., DNA Replication, W.
H.Freeman & Co., San Francisco, 1980, pages 75-77;
Gebeyehu, G., et al.,Nucleic Acids Res., 1987, 1
5, 4513)を包含する。
【0020】C.糖の修飾:本発明のオリゴヌクレオチ
ドは個々のヌクレオチドの糖部分の置換を追加的又は代
替的に含む場合がある。例えば、オリゴヌクレオチドは
また、ペントフラノシル基の代わりにシクロブチルのよ
うな糖模擬体を有する場合がある。他の好ましい修飾オ
リゴヌクレオチドは、2'位に以下の1つを含んでなる
1種又はそれ以上の置換された糖部分を含有し得る:O
H、SH、SCH3、F、OCN、OCH3OCH3、O
CH3O(CH2nCH3、O(CH2nNH2又はO
(CH2nCH3(ここでnは1〜約10である);C1
〜C10の低級アルキル、アルコキシアルコキシ、置換さ
れた低級アルキル、アルカリール又はアラルキル;C
l;Br;CN;CF3;OCF3;O−、S−又はN−
アルキル;O−、S−又はN−アルケニル;SOC
3;SO2CH3;ONO2;NO2;N3;NH2;ヘテ
ロシクロアルキル;ヘテロシクロアルカリール;アミノ
アルキルアミノ;ポリアルキルアミノ;置換されたシリ
ル;RNA開裂基;レポーター基;挿入剤;オリゴヌク
レオチドの薬力学特性を改善する基;又はオリゴヌクレ
オチドの薬物動態特性を改善する基、及び同様の特性を
有する他の置換基。好ましい修飾の例は、2'−メトキ
シエトキシ[2'−O−CH2CH2OCH3、2'−O−
(2−メトキシエチル)としても知られる]である(Ma
rtin et al., Helv. Chim. Acta, 1995, 78: 486).他
の好ましい修飾は、2'−メトキシ−(2'−O−C
3)、2'−プロポキシ−(2'−OCH2CH2CH3
及び2'−フルオロ−(2'−F)を包含する。
【0021】D.他の修飾:同様の修飾が、オリゴヌク
レオチドの他の位置、特に3'末端ヌクレオチドの糖の
3'位及び5'末端ヌクレオチドの5'位でなされ得る。
オリゴヌクレオチドの5'及び3'末端も、例えば親油性
の部分(すぐ後のパラグラフを参照)、挿入剤(Kuyavi
nら、WO96/32496号、1996年10月17
日公開;Nguyenら、米国特許第4,835,263号、
1989年5月30日発行)又はヒドロキシアルキル基
(Heleneら、WO96/34008号、1996年10月
31日公開)が化学結合する部位として役立つように修
飾され得る。
【0022】本発明のオリゴヌクレオチド内の他の位置
は、1種又はそれ以上のエフェクター基を化学的に連結
してオリゴヌクレオチド結合体を形成するために使用さ
れ得る。「エフェクター基」は、特定の化学的又は生物
学的な機能を実行し得る化学部分である。そのようなエ
フェクター基の例は、限定しないが、RNA開裂基、レ
ポーター基、挿入剤、オリゴヌクレオチドの薬力学特性
を改善する基又はオリゴヌクレオチドの薬物動態特性を
改善する基、及び同様の特性を有する他の置換基を包含
する。多種多様の化学リンカーがエフェクター基を本発
明のオリゴヌクレオチドに結合するために使用し得る。
1例として、Cookらへの米国特許第5,578,718
号は、追加的な基を包含するようにさらに誘導体化され
得るアルキルチオリンカーをリボフラノシルの位置、ヌ
クレオシド塩基の位置又はヌクレオシド間結合上に付け
る方法を開示する。オリゴヌクレオチドを様々なエフェ
クター基へ結合させるさらなる方法が当技術分野で知ら
れている。例えば、Protocols for Oligonucleotide Co
njugates (Methods in Molecular Biology, Volume26)
Agrawal, S., ed., Humana Press, Totowa, NJ, 1994を
参照のこと。
【0023】本発明のオリゴヌクレオチドの別の好まし
い追加的又は代替的な修飾は、オリゴヌクレオチドへ、
オリゴヌクレオチドの細胞取込みを増強する1種又はそ
れ以上の親油性部分を化学的に連結させることを含む。
そのような親油性部分はオリゴヌクレオチドのいくつか
の異なる位置でオリゴヌクレオチドに連結され得る。あ
る好ましい位置は、3'末端ヌクレオチドの糖の3'位、
5'末端ヌクレオチドの糖の5'位及び任意のヌクレオチ
ドの糖の2'位を包含する。プリンヌクレオベースのN6
位も本発明のオリゴヌクレオチドへ親油性部分を連結す
るために利用され得る(Gebeyehu, G., et al., Nuclei
c Acids Res., 1987, 15, 4513)。そのような親油性部
分は、限定しないが、コレステリル部分(Letsinger et
al.,Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 1989, 86: 65
53)、コール酸(Manoharan et al., Bioorg. Med. Che
m. Let., 1994, 4: 1053)、チオエステル、例えばヘキ
シル−S−トリチルチオール(Manoharan et al., Ann.
N. Y. Acad. Sci., 1992 660: 306; Manoharan et a
l., Bioorg. Med. Chem. Let., 1993, 3: 2765)、チオ
コレステロール(Oberhauser et al., Nucl. Acids Re
s., 1992, 20: 533)、脂肪族の鎖、例えばドデカンジ
オール又はウンデシル残基(Saison-Behmoaras et al.,
EMBO J., 1991, 10: 111; Kabanov et al., FEBS Let
t., 1990, 259: 327; Svinarchuk et al., Biochimie,
1993, 75: 49)、リン脂質、例えばジ−ヘキサデシル−
rac−グリセロール又は1,2−ジ−O−ヘキサデシ
ル−rac−グリセロ−3−H−リン酸トリエチルアン
モニウム(Manoharan et al.,Tetrahedron Lett., 199
5, 36: 3651; Shea et al., Nucl. Acids Res., 1990,1
8: 3777)、ポリアミン又はポリエチレングリコール鎖
(Manoharan et al., Nucleosides & Nucleotides, 199
5, 14: 969)又はアダマンタン酢酸(Manoharanet al.,
Tetrahedron Lett., 1995, 36: 3651)、パルミチル部
分(Mishra et al., Biochim. Biophys. Acta, 1995, 1
264: 229)、又はオクタデシルアミン又はヘキシルアミ
ノ−カルボニル−オキシコレステロール部分(Crooke e
t al., J. Pharmacol. Exp. Ther., 1996, 277: 927)
を包含する。親油性部分を含んでなるオリゴヌクレオチ
ド及びそのようなオリゴヌクレオチドを製造する方法
は、米国特許第5,138,045号、5,218,1
05号及び5,459,255号に開示されている。
【0024】本発明はまた、オリゴヌクレオチド内の特
定の位置に関して実質的にキラリティーが純粋であるオ
リゴヌクレオチドを包含する。実質的にキラリティーが
純粋であるオリゴヌクレオチドの例は、限定しないが、
少なくとも75%Sp又はRpであるホスホロチオエー
ト結合を有するもの(Cookら、米国特許第5,587,
361号)及び実質的にキラリティーが純粋である(S
p又はRp)アルキルホスホネート、ホスホロアミダイ
ト又はホスホトリエステル結合を有するものを包含する
(Cook,米国特許第5,212,295号及び5,52
1,302号)。
【0025】E.キメラオリゴヌクレオチド:本発明は
またキメラオリゴヌクレオチドであるオリゴヌクレオチ
ドを包含する。「キメラ」オリゴヌクレオチド又は「キ
メラ」は、本発明の文脈において、それぞれ少なくとも
1つのヌクレオチドからなる、2種又はそれ以上の化学
的に異なる領域を含有するオリゴヌクレオチドである。
典型的には、これらオリゴヌクレオチドは、ヌクレアー
ゼ分解に対する増加した抵抗性、増加した細胞取込み及
び/又は標的核酸に対する増加した結合親和性をオリゴ
ヌクレオチドに与えるようにオリゴヌクレオチドが修飾
されている領域を少なくとも1つ含有する。オリゴヌク
レオチドの追加領域は、RNA:DNA又はRNA:R
NAハイブリッドを開裂し得る酵素の基質として役立ち
得る。例えば、RNアーゼHはRNA:DNA二重鎖の
RNA鎖を開裂する細胞エンドヌクレアーゼである。従
って、RNアーゼHの活性化はRNA標的の開裂をもた
らし、それにより遺伝子発現のアンチセンス阻害の効率
を大いに高める。RNA標的の開裂はゲル電気泳動、及
び必要ならば、当技術分野で知られている関連した核酸
ハイブリダイゼーション技術によって定常的に検出され
得る。例えば、そのような「キメラ」は「ギャップマ
ー」即ち、オリゴヌクレオチドの中央部分(「ギャッ
プ」)が、例えばRNアーゼHの基質として役立ち、
5'及び3'位(「ウィング」)が標的RNA分子に対し
てより強い親和性を有するように修飾されているが、ヌ
クレアーゼ活性を支持することはできない(例えば、
2'−フルオロ又は2'ーメトキシエトキシ−で置換され
ている)オリゴヌクレオチドで有り得る。他のキメラ
は、「ウィングマー」、即ち5'部分が例えばRNアー
ゼHの基質として役立つのに対し、3'部分は標的RN
A分子に対してより強い親和性を有するように修飾され
ているが、ヌクレアーゼ活性を支持することはできない
(例えば、2'−フルオロ又は2'ーメトキシエトキシ−
で置換されている)オリゴヌクレオチド、又はその逆の
オリゴヌクレオチドを包含する。
【0026】F.合成:本発明により使用されるオリゴ
ヌクレオチドは固相合成の既知技術を介して簡便かつ定
常的に作ることが可能である。そのような合成のための
装置は、例えばアプライド・バイオシステムズ(フォス
ターシティ、CA)を包含するいくつかのベンダーによ
って販売されている。当技術分野で知られているそのよ
うな合成の他の任意の手段は、追加的又は代替的に利用
し得る。ホスホロチオエート及びアルキル化誘導体のよ
うな他のオリゴヌクレオチドを製造する同様の技術を使
用することも知られている。
【0027】1.教示 特定の修飾を施されるオリゴヌ
クレオチドの合成に関する教示は以下の米国特許又は出
願中の特許出願に見出され得るが、そのいずれも本出願
と同様に譲渡されている:米国特許第5,138,04
5及び5,218,105号、ポリアミンが結合したオ
リゴヌクレオチドへ引用;米国特許第5,212,29
5号、キラルなリン結合を有するオリゴヌクレオチドを
製造するためのモノマーへ引用;米国特許第5,37
8,825号及び5,541,307号、修飾された骨
格を有するオリゴヌクレオチドへ引用;米国特許第5,
386,023号、骨格が修飾されたオリゴヌクレオチ
ド及び還元カップリングを介したその製造へ引用;米国
特許第5,457,191号、3−デアザプリン環シス
テムに基づいて修飾されたヌクレオベース及びその合成
法へ引用;米国特許第5,459,255号、N−2置
換されたプリンに基づいて修飾されたヌクレオベースに
引用;米国特許第5,521,302号、キラルなリン
結合を有するオリゴヌクレオチドの製造法へ引用;米国
特許第5,539,082号、ペプチド核酸へ引用;米
国特許第5,554,746号、β−ラクタム骨格を有
するオリゴヌクレオチドへ引用;米国特許第5,57
1,902号、オリゴヌクレオチド合成の方法及び材料
へ引用;米国特許第5,578,718号、ヌクレオシ
ドの様々な任意の位置に結合した他の部分へのリンカー
として使用され得るアルキルチオ基を有するヌクレオシ
ドへ引用;米国特許第5,587,361号及び5,5
99,797号、キラル純度の高いホスホロチオエート
結合を有するオリゴヌクレオチドへ引用;米国特許第
5,506,351号、2,6−ジアミノプリン化合物
を包含する、2'−O−アルキルグアノシン及び関連化
合物の製造方法へ引用;米国特許第5,587,469
号、N−2が置換されたプリンを有するオリゴヌクレオ
チドへ引用;米国特許第5,587,470号、3−デ
アザプリンを有するオリゴヌクレオチドへ引用;米国特
許第5,223,168号、1993年6月29日発
行、及び5,608,046号、いずれも結合した4'
−デスメチルヌクレオシド類似体へ引用;米国特許第
5,602,240号及び5,610,289号、骨格
修飾したオリゴヌクレオチド類似体へ引用;及び米国特
許出願第08/383,666号、1995年2月3日
出願、及び米国特許第5,459,255号、とりわけ
2'−フルオロ−オリゴヌクレオチドの合成法へ引用。
【0028】2.5−メチル−シトシン:2'−メトキ
シエトキシ修飾オリゴヌクレオチドでは、5−メチル−
2'−メトキシエトキシ−シトシン残基が使用され、以
下のように製造される。
【0029】(a)2,2’−アンヒドロ[1−β−D
−アラビノフラノシル)−5−メチルウリジン]:5−
メチルウリジン(リボシルチミン、ヤマサ、銚子、日本
の市販品)(72.0g,0.279M)、ジフェニル
カーボネート(90.0g,0.420M)及び重炭酸
ナトリウム(2.0g,0.024M)をDMF(30
0mL)に加えた。この混合液を撹拌しながら還流加熱
し、発生する二酸化炭素ガスを制御されたやり方で放出
させた。1時間後、やや黒ずんだ溶液を減圧濃縮した。
得られたシロップを、撹拌しながら、ジエチルエーテル
(2.5L)へ注いだ。生成物はゴムを形成した。エー
テルをデカントし、残渣を最少量のメタノール(約40
0mL)に溶かした。この溶液を新鮮なエーテル(2.
5L)に注ぐと、堅いゴムを生じた。エーテルをデカン
トし、このゴムを真空オーブンにて乾燥させ(60℃、
1mmHg、24時間)、得られた固形物を粉砕して明
褐色の粉末にした(57g、粗収率85%)。この物質
を以後の反応に使用した。
【0030】(b)2'−O−メトキシエチル−5−メ
チルウリジン:2,2'−アンヒドロ−5−メチルウリ
ジン(195g,0.81M)、ホウ酸トリス(2−メ
トキシエチル)(231g,0.98M)及び2−メト
キシエタノール(1.2L)を2Lのステンレス鋼圧力
容器へ加え、前もって160℃に加熱した油浴に置い
た。155−160℃で48時間加熱した後、この容器
を開き、この溶液を蒸発乾固させ、MeOH(200m
L)を加えて磨砕した。残渣を温アセトン(1L)に懸
濁した。不溶性の塩を濾過し、アセトン(150mL)
で洗浄し、濾液を蒸発させた。残渣(280g)をCH
3CN(600mL)に溶かし、蒸発させた。0.5%
Et3NHを含有するCH2Cl2/アセトン/MeOH
(20:5:3)でシリカゲルカラム(3kg)を充填
した。残渣をCH2Cl2(250mL)に溶かし、シリ
カ(150g)に吸着させてからカラムにロードした。
充填溶媒で生成物を溶出させ、生成物160g(63
%)を得た。
【0031】(c)2'−O−メトキシエチル−5'−O
−ジメトキシトリチル−5−メチルウリジン:2'−O
−メトキシエチル−5−メチルウリジン(160g,
0.506M)をピリジン(250mL)と共沸させ、
残渣を乾燥させてからピリジン(1.3L)に溶かし
た。ジメトキシトリチルクロリドの第一アリコート(9
4.3g,0.278M)を加え、この混合物を室温で
1時間撹拌した。ジメトキシトリチルクロリドの第二ア
リコート(94.3g,0.278M)を加え、この反
応物をさらに1時間撹拌した。次いでメタノール(17
0mL)を加えて反応を止めた。HPLCは、約70%
の生成物の存在を示した。溶媒を蒸発させ、CH3CN
(200mL)を加えて磨砕した。残渣をCHCl
3(1.5L)に溶かし、2x500mLの飽和NaH
CO3及び2x500mLの飽和NaClで抽出した。
有機層をNa2SO4で乾燥し、濾過して、蒸発させた。
275gの残渣が得られた。この残渣を、0.5%Et
3NHを含有するEtOAc/ヘキサン/アセトン
(5:5:1)で充填して溶出させる3.5kgシリカ
ゲルカラムで精製した。純粋な分画を蒸発させて生成物
164gを得た。純度の低い分画からさらに約20gを
得て、全体収量183g(57%)を得た。
【0032】(d)3'−O−アセチル−2'−O−メト
キシエチル−5'−O−ジメトキシトリチル−5−メチ
ルウリジン:2'−O−メトキシエチル−5'−O−ジメ
トキシトリチル−5−メチルウリジン(106g,0.
167M)、DMF/ピリジン(DMF562mL及び
ピリジン188mLから調製された3:1の混合液75
0mL)及び無水酢酸(24.38mL,0.258
M)を合わせて室温で24時間撹拌した。最初にtlc
サンプルをMeOH添加で急冷し、tlcにより反応を
モニターした。tlcで判断して、反応終了後、MeO
H(50mL)を加え、混合液を35℃で蒸発させた。
残渣をCHCl3(800mL)に溶かし、2x200
mLの飽和重炭酸ナトリウム及び2x200mLの飽和
NaClで抽出した。水層はCHCl3200mLで再
抽出した。一緒にした有機層を硫酸ナトリウムで乾燥
し、蒸発させ、残渣122gを得た(約90%の生成
物)。この残渣を、3.5kgシリカゲルカラムで精製
し、EtOAc/ヘキサン(4:1)を使用して溶出さ
た。純粋な生成物分画を蒸発させて96g(84%)を
得た。
【0033】(e)3'−O−アセチル−2'−O−メト
キシエチル−5'−O−ジメトキシトリチル−5−メチ
ル−4−トリアゾールウリジン:3'−O−アセチル−
2'−O−メトキシエチル−5'−O−ジメトキシトリチ
ル−5−メチルウリジン(96g,0.144M)をC
3CN(700mL)に溶かして第一の溶液を調製
し、取って置いた。トリアゾール(90g,1.3M)
のCH3CN(1L)溶液へトリエチルアミン(189
mL,1.44M)を加え、−5℃に冷却し、オーバー
ヘッド撹拌子を使用して0.5時間撹拌した。この溶液
を撹拌しながら、0−10℃に保ちながら、POCl3
を1滴ずつ30分かけて加え、得られた混合液をさらに
2時間撹拌した。この溶液へ、第一の溶液を1滴ずつ4
5分間かけて加えた。得られた反応混合物を一晩冷室に
保管した。反応混合液から塩を濾過し、溶液を蒸発させ
た。残渣をEtOAc(1L)に溶かし、不溶性の固形
物を濾過で除去した。濾液を1x300mLのNaHC
3及び2x300mLの飽和NaClで洗浄し、硫酸
ナトリウムで乾燥し、蒸発させた。残渣をEtOAcで
磨砕し、表題化合物を得た。
【0034】(f)2’−O−メトキシエチル−5’−
O−ジメトキシトリチル−5−メチルシチジン:3’−
O−アセチル−2’−O−メトキシエチル−5’−O−
ジメトキシトリチル−5−メチル−4−トリアゾールウ
リジン(103g,0.141M)のジオキサン(50
0mL)溶液及びNH4 OH(30mL)を室温で2時
間撹拌した。このジオキサン溶液を蒸発させ、残渣をM
eOH(2x200mL)で共沸させた。残渣をMeO
H(300mL)に溶かし、2リットルのステンレス鋼
圧力容器へ移した。NH3 ガスが飽和したメタノール
(400mL)を加え、容器を2時間100℃へ加熱し
た(薄層クロマトグラフィー、tlcは完全な変換を示
した)。容器の内容物を蒸発乾固させ、残渣をEtOA
c(500mL)に溶かし、飽和NaCl(200m
L)で一度洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥
し、溶媒を蒸発させ、表題化合物85g(95%)を得
た。
【0035】(g)N4−ベンゾイル−2'−O−メトキ
シエチル−5'−O−ジメトキシトリチル−5−メチル
シチジン:2'−O−メトキシエチル−5'−O−ジメト
キシトリチル−5−メチルシチジン(85g,0.13
4M)をDMF(800mL)に溶かし、無水安息香酸
(37.2g,0.165M)を撹拌しながら加えた。
3時間撹拌した後、tlcは反応が約95%完了したこ
とを示した。溶媒を蒸発させ、残渣をMeOH(200
mL)で共沸させた。残渣をCHCl3(700mL)
に溶かし、飽和NaHCO3(2x300mL)及び飽
和NaCl(2x300mL)で抽出し、MgSO4
乾燥し、蒸発させ、残渣(96g)を得た。この残渣
を、0.5%Et3NHを含有するEtOAc/ヘキサ
ン(1:1)を溶出溶媒として使用する1.5kgシリ
カゲルカラムでクロマトグラフ処理した。生成物の純粋
な分画を蒸発させて表題化合物90g(90%)を得
た。
【0036】(h)N4−ベンゾイル−2'−O−メトキ
シエチル−5'−O−ジメトキシトリチル−5−メチル
シチジン−3'−アミダイト:N4−ベンゾイル−2'−
O−メトキシエチル−5'−O−ジメトキシトリチル−
5−メチルシチジン(74g,0.10M)をCH2
2(1L)に溶かした。テトラゾールジイソプロピル
アミン(7.1g)及び2−シアノエトキシ−テトラ
(イソプロピル)亜リン酸塩(40.5mL,0.12
3M)を撹拌しながら窒素環境下で加えた。得られた混
合液を室温で20時間撹拌した(tlcは反応が約95
%完了したことを示した)。反応混合液を飽和NaHC
3(1x300mL)及び飽和NaCl(3x300
mL)で抽出した。水性の洗浄液はCH2Cl2(300
mL)で再抽出し、抽出物を合わせ、MgSO4で乾燥
し、濃縮した。得られた残渣を、EtOAc/ヘキサン
(3:1)を溶出溶媒として使用する1.5kgシリカ
ゲルカラムでクロマトグラフ処理した。純粋な分画を合
わせて表題化合物90.6g(87%)を得た。
【0037】2.生物学的同等物:本発明の化合物は、
ヒトを包含する動物への投与時に、生物学的に活性なそ
の代謝物又は残基を(直接的又は間接的に)提供し得る
製剤的に許容される塩、エステル又はそのようなエステ
ルの塩又は他の任意の化合物を網羅する。従って、例え
ば、本発明の開示は本発明のオリゴヌクレオチドの「プ
ロドラッグ」及び「製剤的に許容される塩」、そのよう
なプロドラッグの製剤的に許容される塩及び他の生物学
的同等物へも引用される。
【0038】A.オリゴヌクレオチドプロドラッグ:本
発明のオリゴヌクレオチドは「プロドラッグ」の形態で
デリバリーされるように追加的又は代替的に製造され得
る。「プロドラッグ」という用語は、生体又はその細胞
の内部で、内因性の酵素又は他の化学品及び/又は条件
の作用によって活性形(つまり、薬物)へ変換される不
活性形で製造されている治療薬を示す。特に、本発明の
オリゴヌクレオチドのプロドラッグバージョンは、WO
93/24510号、Gosselinら、1993年12月9
日公開、に開示された方法に準拠して、SATE[リン
酸(S−アセチル−2−チオエチル)]誘導体として製
造される。
【0039】B.製剤的に許容される塩:「製剤的に許
容される塩」という用語は、本発明のオリゴヌクレオチ
ドの生理学的及び製剤的に許容される塩、即ち、親化合
物の所望の生物学的活性を保持し、所望されない毒性効
果をそれへ分与しない塩に言及する。
【0040】製剤的に許容される塩基付加塩は、アルカ
リ及びアルカリ土類金属又は有機アミンのような金属又
はアミンとともに形成される。カチオンとして使用され
る金属の例は、ナトリウム、カリウム、マグネシウム、
カルシウム等である。好適なアミンの例は、N,N'−
ジベンジルエチレンジアミン、クロロプロカイン、コリ
ン、ジエタノールアミン、ジシクロヘキシルアミン、エ
チレンジアミン、N−メチルグルカミン及びプロカイン
である(例えば、Berge et al., "Pharmaceutical Salt
s," J. of Pharma Sci., 1977, 66: 1を参照のこと)。
前記酸性化合物の塩基付加塩は、従来法で塩を産生する
ために、十分量の所望の塩基にフリーの酸を接触させる
ことによって製造される。フリーの酸は、従来法でこの
塩形態を酸に接触させ、フリーの酸を単離することによ
って再生され得る。フリーの酸形態は、極性溶媒におけ
る溶解度のようなある物理的性質においてそれぞれの塩
形態とやや異なるが、他の点では、本発明の目的にとっ
て塩はそれぞれのフリー酸と同等である。本明細書で使
用されるように、「医薬付加塩」は、本発明の組成物を
構成する成分の1つの酸形態の製剤的に許容される塩を
包含する。これらは、上記アミンの有機又は無機酸塩を
包含する。好ましい酸塩は、塩酸塩、酢酸塩、サリチル
酸塩、硝酸塩及びリン酸塩である。他の好適な製剤的に
許容される塩は当業者によく知られていて、様々な無機
及び有機酸の塩基性塩を包含する。この酸は、例えば塩
酸、臭酸、硫酸又はリン酸のような無機酸;例えば酢
酸、プロピオン酸、グリコール酸、コハク酸、マレイン
酸、ヒドロキシマレイン酸、メチルマレイン酸、フマル
酸、リンゴ酸、酒石酸、乳酸、シュウ酸、グルコン酸、
グルカル酸、グルクロン酸、クエン酸、安息香酸、ケイ
皮酸、マンデル酸、サリチル酸、4−アミノサリチル
酸、2−フェノキシ安息香酸、2−アセトキシ安息香
酸、エンボン酸、ニコチン酸又はイソニコチン酸といっ
た、有機カルボン酸、スルホン酸、スルホ又はホスホ酸
又はN−置換スルファミン酸;例えば、グルタミン酸又
はアスパラギン酸といった天然のタンパク質合成に関わ
る20種のアルファ−アミノ酸のようなアミノ酸;フェ
ニル酢酸、メタンスルホン酸、エタンスルホン酸、2−
ヒドロキシエタンスルホン酸、エタン−1,2−ジスル
ホン酸、ベンゼンスルホン酸、4−メチルベンゼンスル
ホン酸、ナフタレン−2−スルホン酸、ナフタレン−
1,5−ジスルホン酸、2−又は3−ホスホグリセリン
酸エステル、グルコース−6−リン酸、N−シクロヘキ
シルスルファミン酸(シクラメートの形成とともに)、
又はアスコルビン酸のような他の酸有機化合物である。
化合物の製剤的に許容される塩はまた製剤的に許容され
るカチオンとともに製造し得る。製剤的に許容される好
適なカチオンは当業者によく知られていて、アルカリ、
アルカリ土類、アンモニウム及び4級アンモニウムカチ
オンを包含する。炭酸塩又は炭酸水素塩も可能である。
【0041】オリゴヌクレオチドにとっては、製剤的に
許容される塩の好ましい例は、限定しないが、(a)ナ
トリウム、カリウム、アンモニウム、マグネシウム、カ
ルシウム、スペルミン及びスペルミジンのようなポリア
ミン等のようなカチオンとともに形成される塩;(b)
塩酸、臭酸、硫酸、リン酸、硝酸等の無機酸と形成され
る酸付加塩;(c)例えば酢酸、シュウ酸、酒石酸、コ
ハク酸、マレイン酸、フマル酸、グルコン酸、クエン
酸、リンゴ酸、アスコルビン酸、安息香酸、タンニン
酸、パルミチン酸、アルギン酸、ポリグルタミン酸、ナ
フタレンスルホン酸、メタンスルホン酸、p−トルエン
スルホン酸、ナフタレンジスルホン酸、ポリガラクツロ
ン酸等のような有機酸と形成される塩;及び(d)塩
素、臭素及びヨウ素のようなアニオン元素から形成され
る塩を包含する。
【0042】3.本発明の有用性の例:本発明のオリゴ
ヌクレオチドはJNKタンパク質をコードする核酸(例
えば、mRNA)に特異的にハイブリダイズする。本発
明のオリゴヌクレオチドは治療用化合物として、キット
へ取込まれ得る診断ツール又は研究試薬として、及び精
製及び細胞産物の調製並びに他の方法において利用さ
れ、それらは当業者により理解される。
【0043】A.アッセイ及び診断上の応用:本発明の
オリゴヌクレオチドはJNKタンパク質特異的な核酸の
細胞又は組織サンプルにおける存在を検出するために使
用され得る。例えば、ポリヌクレオチドキナーゼを用い
て5'末端に32P標識化をすることにより放射標識オリ
ゴヌクレオチドを製造し得る(Sambrook et al., Molec
ular Cloning. A Laboratory Manual, Cold Spring Har
bor Laboratory Press, 1989, Volume 2, pg. 10. 5
9.)。次いで放射標識オリゴヌクレオチドを、JNKタ
ンパク質メッセージRNA(及びJNKタンパク質)を
含有することが疑われる細胞又は組織サンプルに接触さ
せ、そのサンプルを洗浄して非結合オリゴヌクレオチド
を除去する。サンプルに残存する放射活性は、結合した
オリゴヌクレオチドの存在を示し、さらにオリゴヌクレ
オチドに相補的な核酸の存在を示し、シンチレーション
カウンター又は他の常法を使用して定量化され得る。こ
のように上記タンパク質をコードする核酸の発現が検出
される。
【0044】本発明の放射標識オリゴヌクレオチドはま
た、研究、診断又は治療の目的でJNKタンパク質の局
在化、分布及び定量を決定するために組織のオートラジ
オグラフィーを実施するために使用され得る。そのよう
な研究では、組織切片を放射標識オリゴヌクレオチドで
処理し、上記のように洗浄し、通常のオートラジオグラ
フィー法により写真用乳剤へ感光させる。この乳剤は、
現像すると、JNKタンパク質遺伝子を発現している領
域に銀粒子を造影する。銀粒子の定量により上記タンパ
ク質をコードするmRNA分子の発現の検出及びこれら
エリアに対するオリゴヌクレオチドの標的化が可能にな
る。
【0045】放射標識の代わりにフルオレセイン又は他
の蛍光性タグと結合した本発明のオリゴヌクレオチドを
使用して、JNKタンパク質核酸の発現を蛍光検出する
類似のアッセイが開発され得る。そのような結合は、蛍
光物質で標識したアミダイト又は制御孔ガラス(CP
G)カラムを使用する固相合成の間に常法により達成さ
れる。フルオレセイン標識アミダイト及びCPGは、例
えばGlen Research,Sterling VAから入手可能である。
オリゴヌクレオチドを標識する他の方法が当技術分野で
知られている(例えば、Ruth, Chapter 6 In: Methods
in Molecular Biology, Volume 26: Protocols for Oli
gonucleotide Conjugates, Agrawal, ed.,Humana Press
Inc., Totowa, NJ, 1994, pages 167-185を参照のこ
と)。
【0046】JNKタンパク質の発現の存在又は不在を
検出するキットも製造され得る。そのようなキットは、
適切な遺伝子、即ちJNKタンパク質をコードする遺伝
子を標的にしたオリゴヌクレオチドを包含する。例え
ば、「サンドイッチ」アッセイのような適切なキット及
びアッセイフォーマットが当技術分野で知られていて、
本発明のオリゴヌクレオチドを用いた使用のために容易
に適用し得る。JNKタンパク質をコードしている核酸
と本発明のオリゴヌクレオチドのハイブリダイゼーショ
ンは、当技術分野に知られている手段により検出され得
る。そのような手段は、酵素のオリゴヌクレオチドへの
結合、オリゴヌクレオチドの放射標識化又は他の適切な
検出システムを包含する。
【0047】B.タンパク質の精製:本発明のオリゴヌ
クレオチドはまた、ポリペプチド配列及び生化学的特性
に関して互いに似ているJNKタンパク質のセットを通
常発現する細胞から特定のJunキナーゼタンパク質を
精製するために有用である。1例として、JNK1、J
NK2及びJNK3タンパク質を発現する細胞からJN
K1タンパク質を精製することは、JNK2及びJNK
3の発現を阻害するオリゴヌクレオチド及び/又はJN
K1の発現を増加させるオリゴヌクレオチドでそのよう
な細胞をまず処理することによって強化され得る。なぜ
なら、そのような処理がJNK2及びJNK3に対する
JNK1の相対比を高めるからである。結果として、そ
のように処理された細胞から調製される抽出物におけ
る、生化学的に似ている(従って混在する可能性が高
い)JNK2及びJNK3タンパク質の量が減少するの
で、以下の精製工程におけるJNK1の収率が増加す
る。
【0048】C.生物学的に活性なオリゴヌクレオチ
ド:本発明はまた、生物学的活性を有するオリゴヌクレ
オチドの、培養細胞、単離組織及び臓器及び動物への投
与へ引用される。「生物学的活性を有する」とは、培養
細胞、単離組織又は臓器及び/又は動物における1種ま
たはそれ以上の遺伝子の発現をモジュレートするように
オリゴヌクレオチドが機能することを意味する。そのよ
うなモジュレーションは、限定しないが、転写停止;R
NAプロセシング(キャッピング、ポリアデニル化及び
スプライシング)及び輸送に対する効果;標的核酸の細
胞分解の強化;及び翻訳停止を含む、当技術分野で知ら
れている多様なメカニズムを介してアンチセンスオリゴ
ヌクレオチドにより達成され得る(Crook et al., Exp.
Opin. Ther. Patents, 1996, 6: 855)。
【0049】ヒト以外の動物において、本発明の組成物
及び方法は動物の1種またはそれ以上の遺伝子の機能を
研究するために使用され得る。例えば、アンチセンスオ
リゴヌクレオチドは、神経死におけるN−メチル−D−
アスパラギン酸受容体の役割を研究するためにラット
へ、プロテインキナーゼC−αの生物学的役割を検討す
るためにマウスへ及び不安症における神経ペプチドY1
受容体の役割を検証するためにラットへ、全身投与され
てきた(それぞれ、Wahlestedt et al., Nature,1993,
363: 260; Dean et al., Proc. Natl. Acad. Sci. U.
S. A., 1994, 91:11762; 及びWahlestedt et al., Scie
nce, 1993, 259: 528)。関連するタンパク質の複合フ
ァミリーが研究されている例では、「アンチセンスノッ
クアウト」(即ち、アンチセンスオリゴヌクレオチドの
全身投与による遺伝子の阻害)は、このファミリーの特
定メンバーを検証するための最も正確な手段を代表し得
る(概論として、Albert et al., Trends Pharmacol. S
ci., 1994, 15: 250を参照のこと)。
【0050】本発明の組成物及び方法は、1種又はそれ
以上の核酸を用いて全体的又は部分的に治療され得る疾
患又は障害を有している(即ち、病んでいる)又は罹り
やすいことが知られているか又は疑われる、ヒトを包含
する動物における治療上の使用を有する。「治療上の使
用」という用語は、in vivo又はex vivoのいずれかで本
発明のオリゴヌクレオチドを動物の細胞と接触させる予
防、一時緩和及び治癒上の使用を網羅する。動物細胞と
ex vivoで接触させる場合、治療上の使用は、本発明の
1種又はそれ以上のオリゴヌクレオチドで処理した後で
そのような細胞を動物へ取込ませることを包含する。
【0051】治療上の使用のために、JNKタンパク質
の発現又は活性をモジュレートすることにより治療又は
予防され得る疾患又は障害を有していると疑われる動物
は、例えば、本発明に準拠してオリゴヌクレオチドを投
与することによって治療される。本発明のオリゴヌクレ
オチドは、有効量のオリゴヌクレオチドを、例えば希釈
剤のような製剤的に許容される好適な担体へ加えること
によって、医薬組成物において利用され得る。本分野の
研究者たちは、ウイルス、真菌及び代謝性の疾患との関
連が示唆される遺伝子の発現をモジュレートし得る、ア
ンチセンス、三重鎖及び他のオリゴヌクレオチド組成物
を同定した。アンチセンスオリゴヌクレオチドはヒトに
対して安全に投与され、すでにいくつかの臨床試験が進
行している。従って、オリゴヌクレオチドが細胞、組織
及び動物、特にヒトの治療のための治療方式に有用であ
るように形成し得る、有用な治療手段となり得ることは
すでに立証されている。以下の米国特許は、アンチセン
スオリゴヌクレオチドを利用した症状改善、治療及び他
の方法を示す。米国特許第5,135,917号はヒト
インターロイキン−1受容体の発現を阻害するアンチセ
ンスオリゴヌクレオチドを提供する。米国特許第5,0
98,890号は、c−myb癌遺伝子に相補的なアン
チセンスオリゴヌクレオチド及びある癌性病態に対する
アンチセンスオリゴヌクレオチド治療に向けられてい
る。米国特許第5,087,617号は、アンチセンス
オリゴヌクレオチドを用いて癌患者を治療する方法を提
供する。米国特許第5,166,195号は、ヒト免疫
不全ウイルス(HIV)のオリゴヌクレオチド阻害剤を
提供する。米国特許第5,004,810号は、単純ヘ
ルペス・ウイルスのVmw65mRNAにハイブリダイ
ズして複製を阻害し得るオリゴマーを提供する。米国特
許第5,194,428号は、インフルエンザ・ウイル
スに対する抗ウイルス活性を有するアンチセンスオリゴ
ヌクレオチドを提供する。米国特許第4,806,46
3号は、アンチセンスオリゴヌクレオチド及びそれを使
用してHTLV−IIIの複製を阻害する方法を提供す
る。米国特許第5,286,717号は、癌遺伝子の一
部に対して相補的な塩基配列を有するオリゴヌクレオチ
ドを提供する。米国特許第5,276,019号及び米
国特許第5,264,423号は、細胞における異種核
酸の複製を阻害するために使用されるホスホロチオエー
ト・オリゴヌクレオチド類似体に向けられている。米国
特許第4,689,320号は、サイトメガロウイルス
(CMV)に特異的な抗ウイルス剤としてのアンチセン
スオリゴヌクレオチドに向けられている。米国特許第
5,098,890号は、ヒトc−myb遺伝子のmR
NA転写物の少なくとも一部に相補的なオリゴヌクレオ
チドを提供する。米国特許第5,242,906号は、
潜在性エプスタイン−バー・ウイルス(EBV)感染の
治療に有用なアンチセンスオリゴヌクレオチドを提供す
る。
【0052】本明細書で使用される「疾患又は障害」と
いう用語は、(1)特に感染、生まれつきの弱さ、環境
上のストレスの結果として、正常な生理機能を損なわせ
る生物体又はその部分の異常な状態を包含し;(2)妊
娠そのものは除外するが、妊娠に関連した自己免疫及び
他の疾患は除外せず;(3)癌及び腫瘍を包含する。
「疾患又は障害に罹りやすいことが知られているか又は
疑われる」という用語は、被検動物が、その動物の一般
集団に比較して、本明細書に定義されたような特定の疾
患又は障害を発症するリスクがより高いと決定された、
又はその疑いがあるということを示している。例えば、
「疾患又は障害に罹りやすいことが知られているか又は
疑われる」被検動物は、特定の疾患又は障害の頻発を包
含する既往歴及び/又は家族歴を有し得る。他の例とし
て、「疾患又は障害に罹りやすいことが知られているか
又は疑われる」被検動物は、当技術分野で知られている
技術に準じた遺伝子スクリーニングによって決定される
罹病性を有し得る(例えば、U.S.Congress,Office of T
echnology Assessment, Chapter 5 In:Genetic Monitor
ing and Screening in the Workplace, OTA-BA-455, U.
S.Government Printing Office,Washington D.C., 199
0, pages 75-99を参照のこと)。「1種又はそれ以上の
核酸を用いて全体的又は部分的に治療され得る疾患又は
障害」という用語は、本明細書に定義される疾患又は障
害に言及し、(1)その管理、モジュレーション又は治
療及び/又は(2)その治療、一次緩和及び/又は予防
的な救済は、アンチセンスオリゴヌクレオチドの投与を
介して提供され得る。
【0053】4.医薬組成物:本発明のオリゴヌクレオ
チドを含んでなる医薬組成物の製剤及びその後の投与は
当業者の技術の範囲内にあると考えられる。
【0054】A.治療上の考察:一般に、治療応用のた
めには、患者(即ち、疾患又は障害を有するか又はその
素因がある、ヒトを包含する動物)へ、本発明により、
患者の年齢及び治療される障害又は病態の重症度に依存
して体重kgあたり0.01μg〜100gの範囲の用
量で、製剤的に許容される担体において、1種又はそれ
以上のオリゴヌクレオチドが投与される。さらに、治療
方式は、特定の疾患又は障害の性質、その重症度及び患
者の全般的な状態に応じて変化し得る時間だけ続き得る
し、1日1回から20年に1回まで拡張し得る。本発明
の文脈では、「治療方式」は、治療、症状緩和及び予防
のモダリティを網羅すると意味される。治療の後に、患
者は彼/彼女の状態変化及び障害又は病態の症状緩和に
ついてモニターされる。核酸の投与量は、現行の投与レ
ベルに対し患者が有意に反応しない場合に増加され得る
か、障害又は病態の症状緩和が認められるか又は障害又
は病態が消失すれば、用量は減少され得る。
【0055】投与は治療される病態の重症度及び反応性
に依存し、治療期間は数日から数ヶ月、又は治療が効果
を示すか又は病態の減衰が達成されるまで続く。最適な
投与スケジュールは、患者体内の薬物蓄積量の測定から
算出され得る。当業者は、最適投与量、投与方法及び反
復率を容易に決定し得る。最適投与量は個々のオリゴヌ
クレオチドの相対効力によって変化し得るが、一般には
in vitro及びin vivo動物モデルにおいて有効とされた
EC50に基づいて推定され得る。一般に、投与量は体重
kgあたり0.01μg〜100gであり、1日、1
週、1月又は1年につき1回又はそれ以上、又は2〜2
0年に1回でさえ与えられ得る。最適な投与スジュール
は、特定の投与形式を介して投与される治療有効量のオ
リゴヌクレオチドをデリバリーするために使用される。
【0056】「治療有効量」という用語は、本発明の目
的のためには、(毒性、刺激又はアレルギー反応のよう
な)望まれない副作用を伴わずに意図された目的を達成
するために有効であるオリゴヌクレオチド含有医薬組成
物の量に言及する。個々のニーズは異なり得るが、有効
量の医薬組成物の最適範囲を決定することは、当技術分
野の技術内にある。ヒトへの投与量は動物試験から外挿
され得る(Katocs etal., Chapter 27 In:Remington's
Pharmaceutical Sciences, 18th Ed.,Gennaro, ed., Ma
ck Publishing Co., Easton, PA, 1990)。一般に、有
効量の医薬組成物を提供するのに必要とされる投与量
は、当業者によって調整され得るが、レシピエントの年
齢、健康、身体状態、体重、疾患又は障害のタイプ及び
程度、治療頻度、(もしあれば)併用療法の性質及び所
望される効果の性質及び範囲に依存して変化する(Nies
et al., Chapter 3 In: Goodman & Gilman's The Phar
macological Basis of Therapeutics, 9th Ed., Hardma
n et al., eds., McGraw-Hill, New York,NY,1996)。
【0057】本明細書で使用されるように、「ハイリス
ク者」という用語は、例えば個人又は家族の病歴又は遺
伝子検査によって、疾患又は障害の発症又は再発に罹る
確率が正常より有意に高いことが決定された個人に言及
する。ハイリスク者に対する治療様式の技術として、そ
の個人は疾患又は障害の発症又は再発を防ぐために予防
的に治療され得る。「予防的に有効な量」という用語
は、疾患又は障害の発症又は再発の予防として認められ
る効果を生み出す医薬組成物の量に言及することを意味
する。医薬組成物の予防的に有効な量は、典型的には、
同様の状態にある個人へ活性薬剤のない第二の医薬組成
物を投与したときに観察される効果と比較した効果によ
って決定される。
【0058】成功した治療の後には、患者に維持療法を
施し、病態の再発を予防することが望ましい場合があ
る。ここで核酸は、体重kgあたり0.01μg〜10
0gの範囲で、1日1回又はそれ以上〜20年ごとに1
回まで、維持用量で投与される。例えば、自己免疫又は
炎症疾患に罹りやすいことが知られているか又は疑われ
る個人の症例では、体重kgあたり0.01μg〜10
0gの範囲で、1日1回又はそれ以上〜20年ごとに1
回まで予防用量を投与することにより予防効果が達成さ
れ得る。同様のやり方で、ある医学治療の結果として起
こることが予測される炎症疾患(例えば細胞、組織又は
臓器を個人へ移植することから生じる対宿主移植片)に
対して個人は罹りにくくなり得る。
【0059】ある症例では、治療方式の効力を高めるた
めに、本発明のオリゴヌクレオチドを他の従来治療モダ
リティと併用して治療することがより有効であり得る。
本発明の文脈では、「治療方式」という用語は、治療、
一時緩和及び予防モダリティを網羅することを意味す
る。例えば、患者は、従来の化学療法剤、特に腫瘍及び
癌の治療に使用されているものを用いて治療され得る。
そのような化学療法剤の例は、限定しないが、ダウノル
ビシン、ダウノマイシン、ダクチノマイシン、ドキソル
ビシン、エピルビシン、イダルビシン、エソルビシン、
ブレオマイシン、マホスファミド、イホスファミド、シ
トシンアラビノシド、ビス−クロロエチルニトロソ尿
素、ブスルファン、マイトマイシンC、アクチノマイシ
ンD、ミトラマイシン、プレドニゾン、ヒドロキシプロ
ゲステロン、テストステロン、タモキシフェン、ダカル
バジン、プロカルバジン、ヘキサメチルメラミン、ペン
タメチルメラミン、ミトザントロン、アムサクリン、ク
ロラムブシル、メチルシクロヘキシルニトロソ尿素、ナ
イトロジェンマスタード、メルファラン、シクロホスフ
ァミド、6−メルカプトプリン、6−チオグアニン、シ
タラビン(CA)、5−アザシチジン、ヒドロキシ尿
素、デオキシコフォルマイシン、4−ヒドロキシぺルオ
キシシクロホスホルアミド、5−フルオロウラシル(5
−FU)、5−フルオロデオキシウリジン(5−FUd
R)、メトトレキセート(MTX)、コルヒチン、ビン
クリスチン、ビンブラスチン、エトポシド、トリメトレ
キセート、テニポシド、シスプラチン及びジエチルスチ
ルベストロール(DES)を包含する(一般論として
は、The Merck Manual of Diagnosis and Therapy, 15t
h Ed., pp. 1206-1228, Berkow et al., eds., Rahay,
N.J., 1987を参考のこと)。本発明の化合物とともに使
用されるとき、そのような化学療法剤は別個に(例え
ば、5−FUとオリゴヌクレオチド)、連続的に(例え
ば、ある期間の5−FUとオリゴヌクレオチドの後でM
TXとオリゴヌクレオチド、というように)又は1種又
はそれ以上の他の化学療法剤とともに(例えば、5−F
U、MTX及びオリゴヌクレオチド、又は5−FU、放
射線療法及びオリゴヌクレオチド)使用され得る。
【0060】本発明の別の好ましい態様では、第一のJ
NKタンパク質を標的にした第一のアンチセンスオリゴ
ヌクレオチドは、第二のJNKタンパク質を標的にした
第二のアンチセンスオリゴヌクレオチドと複合して使用
され、いずれかのオリゴヌクレオチドを別々に使用する
ときより広汎な程度でJNKタンパク質への標的化が達
成される。本発明の様々な態様では、そのようなオリゴ
ヌクレオチドによって標的化された第一及び第二のJN
Kタンパク質は、同一であるか、異なるJNKタンパク
質であるか又は同一JNKタンパク質の異なるイソ型で
ある。
【0061】B.医薬組成物:オリゴヌクレオチドの非
腸管外投与用の医薬組成物は、緩衝液、希釈剤及び他の
適切な添加剤も含有する滅菌水溶液を包含し得る。非腸
管外投与に好適で、オリゴヌクレオチドとは有害に反応
しない、製剤的に許容される有機又は無機の担体物質が
使用され得る。適切な製剤的に許容され得る担体は、限
定しないが、水、塩溶液、アルコール、ポリエチレング
リコール、ゼラチン、ラクトース、アミロース、ステア
リン酸マグネシウム、タルク、ケイ酸、粘性パラフィ
ン、ヒドロキシメチルセルロース、ポリビニルピロリド
ン等を包含する。医薬組成物は滅菌され、所望ならば、
医薬組成物のオリゴヌクレオチドとは有害に反応しない
補助剤、例えば潤滑剤、保存剤、安定化剤、湿潤剤、乳
化剤、浸透圧に影響を与えるための塩、緩衝液、着色
剤、矯味矯臭剤及び/又は芳香剤等、と混合され得る。
水性懸濁液の形態の医薬組成物は、例えば、カルボキシ
メチルセルロースナトリウム、ソルビトール及び/又は
デキストランを包含する、懸濁液の粘度を高める物質を
含有し得る。所望により、そのような懸濁液は安定化剤
をも含有し得る。
【0062】本発明の1つの態様では、オリゴヌクレオ
チドは経直腸の形式を介して投与される。特に、直腸投
与用の医薬組成物は、泡剤、溶液(浣腸剤)及び坐剤を
包含する。成人用直腸坐剤は、普通片端又は両端が先細
になっていて、典型的には1つあたり約2gの重さであ
り、幼児用の直腸坐剤は、典型的にはその約半分の重量
で、通常の基剤にココア脂が使用される(Block, Chapt
er 87 In: Remington's Pharmaceutical Sciences, 18t
h Ed., Gennaro, ed., Mack Publishing Co.,Easton, P
A, 1990)。
【0063】本発明の好ましい態様では、1種又はそれ
以上の核酸が経口デリバリーを介して投与される。経口
投与の医薬組成物は、散剤又は顆粒剤、水又は非水性媒
体の懸濁液又は溶液、カプセル、小袋(sachet)、トロ
ーチ、錠剤又はSEC(軟弾性のカプセル又は「カプレ
ット」)を包含する。濃縮剤、矯味矯臭剤、希釈剤、乳
化剤、分散補助剤、担体物質又は結合剤が所望によりそ
のような医薬組成物へ加え得る。そのような医薬組成物
の使用は、オリゴヌクレオチドを消化管へデリバリーし
てその粘膜へ曝す効果を有する。従って、この医薬組成
物は、胃の極端なpHからオリゴヌクレオチドを防御す
るか又は時間をかけてオリゴヌクレオチドを放出し特定
の粘膜部位へのそのデリバリーを最適化するのに有効な
材料から構成され得る。酸抵抗性の錠剤、カプセル及び
カプレットの腸溶コーティング剤が当技術分野で知られ
ていて、典型的には酢酸フタレート、プロピレングリコ
ール及びソルビタンモノオレアートを包含する。
【0064】消化管デリバリー用の医薬組成物を生産す
るための様々な方法が当技術分野でよく知られている。
一般論としては、Nairn, Chapter 83; Block, Chapter
87;Rudnic et al., Chapter 89; Porter, Chapter 90:
and Longer et al., Chapter91 In: Remington's Pharm
aceutical Sciences, 18th Ed., Gennaro, ed., Mack P
ublishing Co., Easton, PA, 1990を参照のこと。本発
明のオリゴヌクレオチドは、不活性で毒性のない、製剤
的に許容される担体(賦形剤)を使用して、錠剤、被覆
された錠剤、丸剤、顆粒剤、エアゾール、シロップ、乳
剤、懸濁剤及び溶液のような通常の医薬組成物へ既知の
方法で取込まれ得る。治療活性のある化合物は、いずれ
の製剤の場合でも、全混合物の約0.5〜約95の重量
%濃度、つまり、所定の投与量の範囲を達成するに十分
な量で存在すべきである。医薬組成物は、例えば、乳化
剤及び/又は分散剤を適宜使用して、製剤的に許容され
る担体で活性化合物を希釈することによって調製される
し、例えば水が希釈剤として使用される場合は、有機溶
媒が補助溶媒として適宜使用され得る。医薬組成物は製
剤的に許容される担体を適宜追加して使用する従来の方
法で製剤化され得る。従って、組成物は、結合剤(例、
ゼラチン化トウモロコシデンプン、ポリビニルピロリド
ン又はヒドロキシプロピルメチルセルロース);充填剤
(例、ラクトース、微結晶性セルロース又はリン酸水素
カルシウム);潤滑剤(例、ステアリン酸マグネシウ
ム、タルク又はシリカ);崩壊剤(例、デンプン又はス
ターチグリコール酸ナトリウム);又は湿潤剤(例、ラ
ウリル硫酸ナトリウム)のような追加の賦形剤を用いる
従来の手段によって調製され得る。錠剤は当技術分野で
よく知られている方法により被覆し得る。この調製物は
また矯味矯臭剤、着色剤及び/又は甘味剤を適宜含有し
得る。
【0065】この医薬組成物は、ユニット投与量の形態
で簡便にも表され得るが、製薬業界でよく知られている
従来技術に準じて調製され得る。そのような技術は、活
性成分を製剤的に許容される担体と会合させる工程を包
含する。一般に、この医薬組成物は、活性成分を液状の
賦形剤又は微細化した固体の賦形剤と、又はその両方
と、均一かつ緊密に会合させることにより、次いで必要
ならば、生成物を成型することにより、調製される。
【0066】経口投与に適した本発明の医薬組成物は、
カプセル剤、カシェ剤又は錠剤のようなそれぞれ一定量
の活性成分を含有する別個のユニットとして、散剤又は
顆粒剤として、水性液体又は非水性液体の溶液又は懸濁
液として、又は水中油系の乳濁液又は油中水系の液体乳
剤として表され得る。錠剤は、所望により1つ又はそれ
以上の副成分とともに、圧縮又は成型により作られ得
る。圧縮錠剤は、紛体や顆粒のような自由に流動する形
態のなかにある活性成分を、所望により結合剤、潤滑
剤、不活性希釈剤、保存剤、界面活性又は分散剤ととも
に混合して、適切な機械において圧縮することにより製
造され得る。成型錠剤は、不活性な液体希釈剤で湿らし
た紛体化した化合物の混合物を適切な機械において成型
することにより作られ得る。錠剤は所望により被覆した
り刻みを入れることが可能であり、そのなかの活性成分
の遅延又は制御された放出をもたらすように製剤化され
得る。腸管外、鞘内又は脳室内投与の医薬組成物、又は
コロイド分散系は、緩衝液、希釈剤及び他の適切な添加
剤も含有し得る滅菌水溶液を包含し得る。
【0067】C.浸透増進剤:本発明のオリゴヌクレオ
チドを含んでなる医薬組成物は、オリゴヌクレオチドの
消化管デリバリーを増強するために浸透増進剤も包含し
得る。浸透増進剤は5つの広いカテゴリー、即ち、脂肪
酸、胆汁酸塩、キレート剤、界面活性剤及び非界面活性
剤、の1つに属するものとして分類され得る(Leeet a
l., Critical Reviews in Therapeutic Drug Carrier S
ystems, 1991, 8:91-192; Muranishi, Critical Review
s in Therapeutic Drug Carrier Systems, 1990, 7:
1)。
【0068】1.脂肪酸:浸透増進剤として作用する様
々な脂肪酸及びその誘導体は、例えばオレイン酸、ラウ
リン酸、カプリン酸、ミリスチン酸、パルミチン酸、ス
テアリン酸、リノール酸、リノレン酸、ジカプリレー
ト、トリカプリレート、レシンレエート、モノオレイン
(1−モノオレオイル−rac−グリセロールとしても
知られる)、ジラウリン、カプリル酸、アラキドン酸、
グリセリル−1−モノカプレート、1−ドデシルアザシ
クロヘプタン−2−オン、アシルカルニチン、アシルコ
リン、モノ及びジグリセリド、及びそれらの生理学的に
許容される塩(即ち、オレエート、ラウレート、カプレ
ート、ミリステート、パルミテート、ステアレート、リ
ノレエート等)を包含する(Lee et al., Critical Rev
iews in Therapeutic Drug Carrier Systems, 1991, pa
ge 92; Muranishi, Critical Reviews in Therapeutic
Drug Carrier Systems, 1990, 7:1; El-Hariri et al.,
J. Pharm. Pharmacol., 1992, 44:651)。
【0069】2.胆汁酸塩:胆汁の生理学的役割は、脂
質及び脂溶性ビタミンの分散及び吸収の促進を包含する
(Brunton, Chapter 38 In: Goodman & Gilman's The P
harmacological Basis of Therapeutics, 9th Ed., Har
dman et al., eds., McGraw-Hill, New York,NY,1996,
pages 934-935)。様々な天然の胆汁酸塩及びその合成
誘導体が浸透増進剤として作用する。従って、「胆汁酸
塩」という用語は、胆汁の天然に存在する成分並びにそ
の任意の合成誘導体を包含する。
【0070】3.キレート剤:キレート剤はDNアーゼ
阻害剤としても役立つという追加の利点を有し、限定し
ないが、エチレンジアミン四酢酸二ナトリウム(EDT
A)、クエン酸、サリチル酸塩(例えば、サリチル酸ナ
トリウム、5−メトキシサリチル酸塩及びホモバニレー
ト)、コラーゲンのN−アシル誘導体、ラウレス−9及
びベータ−ジケトンのN−アミノアシル誘導体(エナミ
ン)を包含する(Lee et al., Critical Reviews in Th
erapeutic Drug Carrier Systems, 1991,page 92; Mura
nishi, Critical Reviews in Therapeutic Drug Carrie
r Systems, 1990, 7:1; Buur et al., J. Control Re
l., 1990, 14:43)。
【0071】4.界面活性剤:界面活性剤は、例えば、
ラウリル硫酸ナトリウム、ポリオキシエチレン−9−ラ
ウリルエーテル及びポリオキシエチレン−20−セチル
エーテル(Lee et al., Critical Reviews in Therapeu
tic Drug Carrier Systems, 1991, page 92);及びF
C−43のようなペルフルオロケミカル乳剤(Takahash
i et al., J. Pharm. Pharmacol., 1988, 40:252)を包
含する。
【0072】5.非界面活性剤:非界面活性剤は、例え
ば、不飽和環式尿素、1−アルキル及び1−アルケニルア
ザシクロ−アルカノン誘導体(Lee et al., CriticalRe
views in Therapeutic Drug Carrier Systems, 1991, p
age 92);及びジクロフェナクナトリウム、インドメタ
シン及びフェニルブタゾンのような非ステロイド性抗炎
症薬(Yamashita et al., J. Pharm. Pharmacol., 198
7, 39:621)を包含する。
【0073】D.担体化合物:本明細書で使用される
「担体化合物」は、不活性である(即ち、それ自身は生
物学的活性を保有しない)が、例えば生物学的に活性の
ある核酸を分解するか又はその循環からの除去を促進す
ることによって、生物学的活性を有する核酸のバイオア
ベイラビリティを減少させるin vivoプロセスによって
核酸として認知される核酸又はその類似体に言及する。
核酸及び担体化合物の同時投与は、典型的には後者の物
質が過剰であるが、肝臓、腎臓又は他の循環外レザバー
において回収される核酸の量を実質的に減少させるが、
これは恐らく共通の受容体に対する担体化合物と核酸の
競合によるものであろう。例えば、部分的にホスホロチ
オエート化されたオリゴヌクレオチドの肝臓組織におけ
る回収は、それがポリイノシン酸、硫酸デキストラン、
ポリシチジン酸又は4−アセトアミド−4'−イソチオ
シアノ−スチルベン−2,2'−ジスルホン酸と同時投
与されるとき、減少する(Miyao et al., Antisense Re
s. Dev., 1995, 5:115; Takakura et al., Antisense &
Nucl. Acid Drug Dev., 1996, 6:177)。
【0074】E.担体化合物とは対照的に、「製剤的に
許容される担体」(賦形剤)は、製剤的に許容される溶
媒、懸濁剤、又は1種又はそれ以上の核酸を動物へデリ
バリーする他の任意の薬理学的に不活性な担体である。
製剤的に許容される担体は、液体又は固体であり得て、
計画された投与方法に基づいて、規定された医薬組成物
の核酸及び他の成分とともに組み合わせたときに、所望
の大きさ、コンシステンシー等をもたらすように選択さ
れる。典型的な製剤的に許容される担体は、限定しない
が、結合剤(例、ゼラチン化トウモロコシデンプン、ポ
リビニルピロリドン又はヒドロキシプロピルメチルセル
ロース等);充填剤(例、ラクトース及び他の糖、微結
晶性セルロース、ペクチン、ゼラチン、硫酸カルシウ
ム、エチルセルロース、ポリアクリレート又はリン酸水
素カルシウム等);潤滑剤(例、ステアリン酸マグネシ
ウム、タルク、シリカ、コロイダル二酸化シリコン、ス
テアリン酸、金属ステアリン酸塩、水素添加植物油、コ
ーンスターチ、ポリエチレングリコール、安息香酸ナト
リウム、酢酸ナトリウム等);崩壊剤(例、デンプン、
スターチグリコール酸ナトリウム等);又は湿潤剤(ラ
ウリル硫酸ナトリウム等)を包含する。持続放出型の経
口デリバリーシステム及び/又は経口投与剤形の腸溶コ
ーティング剤については米国特許第4,704,295
号;4,556,552号;4,309,406号;及
び4,309,404号に記載されている。
【0075】F.他の追加成分:本発明の組成物は、医
薬組成物に従来的に見出される他の付加成分を、その現
行技術で確立された使用レベルで、追加的に含有し得
る。従って、例えば本発明の組成物は、例えば止痒剤、
収斂薬、局所麻酔剤又は抗炎症剤のような適合性のある
追加の医薬活性物質を含有し得るか又は、着色剤、矯味
矯臭剤、保存剤,抗酸化剤、混濁剤、濃化剤及び安定化
剤のような、本発明の組成物の様々な剤形を物理的に製
剤化するのに有用である追加の物質を含有し得る。しか
しながら、そのような物質は、追加されたときに、本発
明の組成物の成分の生物学的活性に不当に干渉してはな
らない。
【0076】G.コロイド分散系:本発明のオリゴヌク
レオチドを患者へ導入する方法が何であれ、コロイド分
散系は、オリゴヌクレオチドのin vivo安定性を高める
こと及び/又は特定の臓器、組織又は細胞へオリゴヌク
レオチドを標的化するためのデリバリー担体として使用
され得る。コロイド分散系は、限定しないが、高分子複
合体、ナノカプセル、ミクロスフェア、ビーズ、及び水
中油系の乳化剤、ミセル、混合ミセル及びリポソームを
包含する脂質をベースとするシステムを包含する。好ま
しいコロイド分散系は、生物活性剤のin vitro及びin v
ivoの細胞デリバリー担体として使用され得る、複数の
リポソーム、人工膜の小胞である(Mannino et al., Bi
otechniques, 1988, 6, 682; Blume and Cevc, Bioche
m. et Biophys. Acta, 1990, 1029, 91; Lappalainen e
t al., Antiviral Res., 1994,23, 119; Chonn and Cul
lis, Current Op. Biotech., 1995, 6, 698)。0.2
−0.4μmのサイズ範囲をとる単膜リポソームは、巨
大分子を含有する水性緩衝液のかなりの割合を被包化し
得る。RNA、DNA及び生のビリオンがこの水性内膜
に被胞化され、生物学的に活性な形態で脳細胞へデリバ
リーされる(Fraley et al., Trends Biochem. Sci., 1
981, 6, 77)。リポソームの組成は、通常、脂質、特に
リン脂質、とりわけ相転移温度の高いリン脂質を1種又
はそれ以上のステロイド、特にコレステロールと通常複
合したものである。リポソーム生産に有用な脂質の例
は、ホスファチジルグリセロール、ホスファチジルコリ
ン、ホスファチジルセリン、スフィンゴ脂質、ホスファ
チジルエタノールアミン、セレブロシド及びガングリオ
シドのようなホスファチジル化合物を包含する。特に有
用なのはジアシルホスファチジルグリセロールであり、
ここでは脂質部分が14−18の炭素原子、特に16−
18の炭素原子を含有し、飽和している(14−18の
炭素原子鎖の内部に二重結合を欠いている)。代表的な
リン脂質は、ホスファチジルコリン、ジパルミトイルホ
スファチジルコリン及びジステアロイルホスファチジル
コリンを包含する。
【0077】リポソームを包含するコロイド分散系の標
的化は、受動的又は能動的のいずれかであり得る。受動
的な標的化は、洞様毛細血管を含有する臓器の網内系細
胞へ分布しようとするリポソーム本来の傾向を利用す
る。対照的に、能動的な標的化はウイルスのタンパク質
コート(Morishita et al., Proc. Natl. Acad. Sci.
(U. S. A.), 1993, 90, 8474)、モノクローナル抗体
(又はその適切な結合部分)、糖、糖脂質又はタンパク
質(又はその適切なオリゴペプチドフラグメント)のよ
うな特定のリガンドをリポソームへカップルさせるこ
と、又は天然に存在する局在部位以外の臓器及び細胞型
への分布を達成するためにリポソームの組成を変えるこ
とによってリポソームを修飾することを含む。標的化さ
れたコロイド分散系の表面は様々なやり方で修飾され得
る。リポソームで標的したデリバリーシステムでは、脂
質二重層との緊密な会合において標的リガンドを維持す
るために、リポソームの脂質二重層へ脂質基が取込まれ
得る。脂質鎖を標的リガンドと結びつけるために様々な
連結基が使用され得る。本発明のオリゴヌクレオチドの
デリバリーが所望される細胞の上に支配的に見出される
特定の細胞表面分子に結合する標的リガンドは、例え
ば、(1)デリバリーが所望される細胞によって支配的
に発現される特定の細胞受容体と結合している、ホルモ
ン、成長因子又はその適切なオリゴペプチドフラグメン
ト、又は(2)標的細胞上で支配的に見出される抗原性
エピトープと特異的に結合する、ポリクローナル又はモ
ノクローナル抗体、又はその適切なフラグメント(例え
ば、Fab;F(ab')2)、であり得る。2種又はそ
れ以上の生物活性剤(例えば、オリゴヌクレオチドと従
来薬;2種のオリゴヌクレオチド)は、単一のリポソー
ム内部で複合し、デリバリーされ得る。内容物の細胞内
安定性及び/又は標的化を高める薬剤をコロイド分散系
へ追加することも可能である。
【0078】5.投与手段:本発明は、動物への投与を
意図したオリゴヌクレオチドを含んでなる組成物を提供
する。本発明の目的のためには、特に断らなければ、
「動物」という用語は、ヒト、並びに爬虫類、両生類及
び鳥類といった他の動物を網羅することを意味する。
【0079】A.腸管外デリバリー:「腸管外デリバリ
ー」という用語は、消化管を介すること以外の方法で本
発明のオリゴヌクレオチドを動物へ投与することに言及
する。腸管外医薬組成物を製造して投与する手段は当技
術分野に知られている(例えば、Avis, Chapter 84 In:
Remington's Pharmaceutical Sciences, 18th Ed., Ge
nnaro, ed., Mack Publishing Co., Easton, PA, 1990,
pages 1545-1569を参照のこと)。腸管外デリバリーの
方法は、限定しないが、以下の具体例を包含する。
【0080】1.硝子体内注射:薬物を哺乳動物の眼の
硝子体液へ直接デリバリーすることが米国特許第5,5
91,720号に記載されていて、この内容は参照によ
り本明細書に組込まれている。眼科用調製物を製造・投
与する手段が当技術分野に知られている(例えば、Mull
ins et al., Chapter 84 In: Remington's Pharmaceuti
cal Sciences, 18th Ed., Gennaro, ed., Mack Publish
ing Co., Easton,PA, 1990, pages 1581-1595 を参照の
こと)。
【0081】2.静脈内投与:アンチセンスオリゴヌク
レオチドを様々な非ヒト哺乳動物へ静脈内投与すること
は、Iversenにより記載された(Chapter 26 In: Antise
nse Research and Applications, Crooke et al., ed
s., CRC Press, Boca Raton, FL、1993, pages 461-46
9)。腹腔内の手段を介したオリゴヌクレオチドの非ヒ
ト哺乳動物への全身投与についても記載されている(De
an et al., Proc. Natl. Acad. Sci. (U. S. A.), 199
4, 91, 11766)。
【0082】3.薬物の管腔内投与:管状の臓器又は組
織(例えば、動脈、静脈、尿管又は尿道)の単離された
部分へ薬物を直接デリバリーすることは、そのような臓
器又は組織の内腔を病んでいる疾患又は状態の患者の治
療に所望され得る。このオリゴヌクレオチド投与形式を
有効にするには、カテーテル又はカニューレを適切な手
段により外科的に導入する。例えば、左総頚動脈の治療
には、外頚動脈を介してそこへカニューレを挿入する。
治療が求められる管状の臓器又は組織の部分を単離した
後、本発明のオリゴヌクレオチドを含んでなる組成物
を、カニューレ又はカテーテルを介して単離部分へ注入
する。約1〜約120分間のインキュベーションの後、
その間にオリゴヌクレオチドは管内腔の細胞によって取
込まれ、注入カニューレ又はカテーテルを除去し、その
部分の単離をもたらした結紮糸を除去することにより管
状臓器又は組織内のフローが回復する(Morishita et a
l., Proc. Natl. Acad. Sci. (U. S. A.), 1993, 90, 8
474)。アンチセンスオリゴヌクレオチドはまた、ヒド
ロゲル材料のような生体適合性マトリックスと複合さ
せ、in vivoで血管組織へ直接適用してもよい(Rosenbe
rgら、米国特許第5,593,974号、1997年1
月15日発行)。
【0083】4.薬物の脳室内投与:患者の脳へ薬物を
直接デリバリーする脳室内投与は、脳を病んでいる疾患
又は状態の患者の治療に所望され得る。このオリゴヌク
レオチド投与形式を有効にするには、シリコンカテーテ
ルをヒト患者の脳室へ外科的に導入し、腹部領域に外科
的に埋め込まれた皮下注入ポンプ(メドトロニック社、
ミネアポリス、MN)に連結させる(Zimm et al., Can
cer Research, 1984, 44, 1698; Shaw, Cancer, 1993,
72(11 Suppl.), 3416)。このポンプは、外部プログラ
ム装置の助けを借りて、オリゴヌクレオチドを注入し、
投与スケジュールにおける正確な用量調節及び変更を可
能にするために使用される。このポンプの貯留能力は1
8〜20mLで、注入速度は0.1mL/h〜1mL/
hの範囲をとり得る。日〜月あたりの回数の範囲をとる
投与頻度、及び体重kgあたり0.01μg〜100g
の範囲をとる投与薬物量に依存して、ポンプレザバーは
3〜10週間隔で再充填され得る。ポンプの再充填は、
ポンプの自己密封式隔壁へ経皮的に穿刺することにより
達成される。
【0084】5.薬物の鞘内投与:患者の脊柱へ薬物を
導入する鞘内投与は、中枢神経系の疾患を有する患者の
治療に所望され得る。このオリゴヌクレオチド投与ルー
トを有効にするには、シリコンカテーテルをヒト患者の
L3−4腰椎間空へ外科的に埋め込み、上腹部領域に外
科的に埋め込まれた皮下注入ポンプに連結させる(Luer
and Hatton, The Annals of Pharmacotherapy, 1993,
27, 912; Ettinger et al., 1978, Cancer, 41, 1270,
1978; Yaida et al., Regul. Pept., 1995, 59, 19
3)。このポンプは、外部プログラム装置の助けを借り
て、オリゴヌクレオチドを注入し、投与スケジュールに
おける正確な用量調節及び変更を可能にするために使用
される。このポンプの貯留能力は18〜20mLで、注
入速度は0.1mL/h〜1mL/hの範囲をとり得
る。日〜月あたりの回数の範囲をとる投与頻度、及び体
重kgあたり0.01μg〜100gの範囲をとる投与
薬物量に依存して、ポンプレザバーは3〜10週間隔で
再充填され得る。ポンプの再充填は、ポンプの自己密封
式隔壁へ経皮的に単回穿刺することにより達成される。
中枢神経系内におけるオリゴヌクレオチドの分布、安定
性及び薬物動態は、既知の方法により追跡し得る(Whit
esell et al., Proc. Natl. Acad. Sci. (USA), 1993,
90, 4665)。
【0085】この方法を介して脳又は脊椎以外のエリア
へオリゴヌクレオチドをデリバリーするには、シリコン
カテーテルを成形して、皮下注入ポンプを、例えば肝臓
へのデリバリーのためには肝動脈へ連結するようにする
(Kemeny et al., Cancer, 1993, 71, 1964)。注入ポ
ンプはオリゴヌクレオチドの全身デリバリーを有効にす
るためにも使用され得る(Ewel et al., Cancer Resear
ch, 1992, 52, 3005;Rubenstein et al., J. Surg. Onc
ol., 1996, 62, 194)。
【0086】6.表皮及び経皮デリバリー:薬物を含有
する医薬組成物を局所的に適用する場合、局所の真皮又
はさらなる浸透のために吸収される薬物を投与するには
表皮デリバリーが、基底組織による吸収には経皮デリバ
リーが使用され得る。局所投与用の薬剤を製造して投与
する手段が当技術分野で知られている(例えばBlock, C
hapter 87 In: Remington's Pharmaceutical Sciences,
18th Ed., Gennaro, ed., Mack Publishing Co., East
on, PA, 1990, pages 1596-1609を参照のこと)。
【0087】7.膣デリバリー:このデリバリーは局所
治療を提供し、初回通過代謝、消化酵素による分解及び
可能性のある全身性の副作用を回避する。この投与形式
は、膣に通常生息している病原体、例えば Trichomonas
vaginalisを標的にしたアンチセンスオリゴヌクレオチ
ドに好ましい可能性がある。他の態様では、懐妊及びそ
の後の妊娠の確率を高めるために、精子特異的な抗体を
コードする遺伝子に対するアンチセンスオリゴヌクレオ
チドがこの投与形式によってデリバリーされ得る。膣坐
剤(Block, Chapter 87 In: Remington's Pharmaceutic
al Sciences, 18th Ed., Gennaro, ed., Mack Publishi
ng Co., Easton, PA, 1990, pages1609-1614 )又は局
所軟膏もこのデリバリー形式を有効にするために使用さ
れ得る。
【0088】8.膀胱内デリバリー:このデリバリーは
局所治療を提供し、初回通過代謝、消化酵素による分解
及び可能性のある全身性の副作用を回避する。しかしな
がら、この方法は患者の尿道カテーテル法及び熟練スタ
ッフを要求する。それでも、この投与形式は、尿生殖管
に侵襲し得る、T. vaginalisのような病原体を標的にし
たアンチセンスオリゴヌクレオチドに好ましい可能性が
ある。
【0089】B.消化管デリバリー:「消化管デリバリ
ー」という用語は、動物の消化管の一部へ、直接的に又
は他の方法で投与することに言及する。「消化管」とい
う用語は、食物の消化及び吸収、及び食物残渣の消去に
機能し、口から肛門に至る管状の通路、及びその部分又
はセグメント、例えば口腔、食道、胃、小腸及び大腸及
び結腸の一部又は全部、並びに、例えば胃腸管のような
それらの複合部分に言及する。従って、「消化管デリバ
リー」という用語は、限定しないが、口、直腸、内視鏡
及び舌下/頬側からの投与を包含するいくつかの投与ル
ートを網羅する。これらの投与形式に共通する必要条件
は、そのように投与される核酸が消化管の一部又は全部
に渡って吸収されること、及び効率的に粘膜を浸透すべ
きことである。
【0090】1.頬側/舌下投与:口の粘膜を介した薬
物のデリバリーは、多くの例において、経口デリバリー
よりも薬物の血漿濃度がより速やかに上昇することを包
含する、いくつかの望ましい特徴を有する(Harvey, Ch
apter 35 In: Remington's Pharmaceutical Sciences,
18th Ed., Gennaro, ed., Mack Publishing Co.,Easto
n, PA, 1990, page 711 )。さらに、口からの静脈ドレ
ナージが上大静脈に対しているので、このルートはまた
肝臓による迅速な初回通過代謝を迂回する。これらの特
性は、いずれも舌下ルートをニトログリセリンの選好的
な投与形式にすることに貢献する(Benet et al., Chap
ter 1 In:Goodman & Gilman's ThePharmacological Bas
is of Therapeutics, 9th Ed., Hardman et al., eds.,
McGraw‐Hill, New York, NY, 1996, page 7)。
【0091】2.内視鏡投与:内視鏡は消化管の内部へ
薬物を直接デリバリーするのに使用され得る。例えば、
内視鏡的逆行性胆管膵管造影法(ERCP)は、拡張さ
れた胃鏡検査を利用して、胆管及び膵管への選択的アク
セスを可能にする(Hirakata et al., Gan to Kagaku R
yoho, 1992, 19(10 Suppl.):1591)。しかしながら、こ
の方法は患者にとって不快であり、高度に熟練したスタ
ッフを要求する。
【0092】3.直腸投与:経口ルートで投与される薬
物は、別のやり方では低位の腸ルートによって、即ち、
肛門から直腸又は低位の腸へ、しばしば投与され得る。
直腸坐剤、貯留浣腸剤又は直腸カテーテルがこの目的の
ために使用され、患者コンプライアンスが他の方法では
達成するのが困難であり得る(例えば、小児又は老人へ
の適用、又は患者が嘔吐したり、又は意識が無い場合)
ときに好ましい場合がある。直腸投与は経口ルートより
速やかでより高い血液レベルをもたらし得るが、逆の場
合もある(Harvey, Chapter 35 In: Remington's Pharm
aceuticalSciences, 18th Ed., Gennaro, ed., Mack Pu
blishing Co., Easton, PA, 1990,page 711 )。直腸か
ら吸収される薬物の約50%は肝臓を迂回するので、こ
のルートによる投与は初回通過代謝の可能性を著しく減
少させる(Benet et al.,Chapter 1 In:Goodman & Gilm
an's The Pharmacological Basis of Therapeutics, 9t
h Ed., Hardman et al., eds., McGraw‐Hill, New Yor
k, NY, 1996)。
【0093】4.経口投与:経口デリバリーは好ましい
投与方法であり、典型的には体循環へアクセスするため
の最も簡便なルートである。消化管からの吸収は、一般
的に当てはまるいくつかの要因、例えば、吸収の表面
積、吸収部位への血液フロー、薬物の物理学的状態及び
その吸収部位における濃度、によって支配されている
(Benet et al., Chapter 1 In:Goodman & Gilman's Th
e Pharmacological Basis of Therapeutics, 9th Ed.,
Hardman et al., eds., McGraw‐Hill, New York, NY,
1996, pages 5-7)。薬物の経口バイオアベイラビリテ
ィを制限し得る重要な要因は「初回通過効果」の度合い
である。例えば、ある物質はあまりに早く肝臓で取込ま
れ、吸収された物質のごく一部分しか末梢血に入らない
(Van Berge-Henegouwen et al., Gastroenterology, 1
977, 73:300)。本発明の組成物及び方法は、核酸の改
善された取込みを提供し、それにより例えば肝臓の取込
みシステムを飽和させ、投与された核酸の大部分が末梢
循環に到達することを可能にすることによって、少なく
とも部分的には、そのような初回通過効果を回避する。
追加的又は代替的には、肝臓の取込みシステムは、活性
のある核酸を投与する前に、1つ又はそれ以上の不活性
な「担体」核酸で飽和される。
【0094】以下の実施例は、本発明を具体的に示し、
それを制限することを意図しない。当業者は、定常的な
実験により、本明細書に記載される特定の物質及び方法
に対する多くの同等物を認識し、確認することができる
だろう。そのような同等物は本発明の範囲内にあると考
えられる。
【0095】
【実施例】実施例1:オリゴヌクレオチドの合成 A.一般的な合成技術:オリゴヌクレオチドは、ヨウ素
酸化を用いる標準的なホスホロアミダイト化学を使用す
る自動DNA合成機で合成した。β−シアノエチルジイ
ソプロピルホスホロアミダイトはアプライドバイオシス
テムズ(フォスターシティ、CA)より購入した。ホス
ホロチオエートオリゴヌクレオチドのためには、亜リン
酸結合の段階的チオエート化に用いる3H−1,2−ベ
ンゾジチオール−3−オン−1,1−ジオキシドの0.
2Mアセトニトリル溶液に標準酸化ボトルを置き換え
た。
【0096】2'−O−メチル(別名、2'−メトキシ)
ホスホロチオエートオリゴヌクレオチドの合成は上記の
方法によるが、標準的なホスホロアミダイトの代わりに
2'−O−メチル−β−シアノエチルジイソプロピルホ
スホロアミダイト(ケムジーンズ、ニーダム、MA)を
用いて、テトラゾール及び塩基のパルスデリバリー後の
待ちサイクルを360秒に高めている。同様に、2'−
O−プロピル(別名、2'−プロポキシ)ホスホロチオ
エートオリゴヌクレオチドは、上記方法をわずかに変更
し、本質的には米国特許出願第08/383,666号
(1995年2月3日出願、本出願と同じ譲受人へ譲渡
されている)に開示された方法によって製造される。
【0097】本発明の2'−フルオロ−ホスホロチオエ
ートオリゴヌクレオチドは、5'−ジメトキシトリチル
−3'−ホスホロアミダイトを使用して合成され、米国
特許出願第08/383,666号(1995年2月3
日出願)及び米国特許第5,459,255号(199
6年10月8日発行)(いずれも本出願と同じ譲受人へ
譲渡されている)に開示されたようにして製造される。
2'−フルオロ−オリゴヌクレオチドは、ホスホロアミ
ダイト化学及びわずかに変更した標準DNA合成プロト
コールを使用して製造された(即ち、室温でメタノール
性アンモニアを使用して脱保護化した)。
【0098】2'−メトキシエトキシオリゴヌクレオチ
ドは、本質的にはMartin等の方法により合成された(He
lv. Chim. Acta, 1995, 78, 486)。合成を容易にする
ために、2'−メトキシエトキシオリゴヌクレオチドの
3'ヌクレオチドはデオキシヌクレオチドとし、2'−O
−CH2CH2OCH3−シトシンは5−メチルシトシン
とし、これらを以下に記載の方法により合成した。PN
Aアンチセンス類似体は、本質的には米国特許第5,5
39,082号及び5,539,083号に記載された
ようにして製造される。この特許はいずれも(1)19
96年7月23日に発行され、(2)本出願と同じ譲受
人へ譲渡されている。
【0099】B.精製:制御孔ガラスカラム(アプライ
ドバイオシステムズ)から分離し、55℃で18時間、
濃水酸化アンモニウムにて脱保護化した後、オリゴヌク
レオチドは、0.5M NaClと2.5倍量のエタノ
ールからの2度の沈殿によって精製した。20%アクリ
ルアミド、8M尿素、45mMトリスホウ酸緩衝液、p
H7.0において分析用ゲル電気泳動を実施した。オリ
ゴデオキシヌクレオチド及びそのホスホロチオエート類
似体は、電気泳動から、完全長の物質の80%以上の大
きさであると判断された。
【0100】実施例2:ヒト腫瘍細胞におけるJNK・
mRNA発現に対するオリゴヌクレオチド介在性阻害の
アッセイ JNKをモジュレートする可能性があるオリゴヌクレオ
チドの活性を評価するために、以下の実施例に示すよう
な、ヒト肺癌細胞系A549(アメリカ・タイプ・カル
チャー・コレクション、ロックビル、MD No.AT
CC CCL−185)細胞又は他の細胞系を増殖さ
せ、以下のようにオリゴヌクレオチド又は対照溶液で処
理した。採取後、細胞抽出物を調製し、特定のJNK・
mRNAレベル又はJNKタンパク質レベル(それぞ
れ、ノーザン又はウェスタンアッセイ)について検査し
た。いずれの場合も、「発現%」は、無処置の細胞(又
はオリゴヌクレオチドを含まない対照溶液で処理した細
胞)に対するオリゴヌクレオチド処理細胞におけるJN
K特異的シグナルの量に言及し、「阻害%」は、100
%−発現%=阻害%として計算される。
【0101】ノーザンアッセイ:各JNKタンパク質の
mRNA発現量は、それに特異的にハイブリダイズする
核酸プローブを使用して定量した。JNK1、JNK2
及びJNK3に特異的な核酸プローブは、それぞれ実施
例3、4及び5に記載されている。プローブは当技術分
野でよく知られている手段によって放射標識した(例え
ば、Short Protocols in Molecular Biology, 2nd Ed.,
Ausubel et al., eds., John Wiley & Sons, New Yor
k, 1992, pages 3-11 to 2-3-44 and 4-17 to 4-18; Ru
th, Chapter 6 In: Methods in Molecular Biology, Vo
lume 26: Protocols for Oligonucleotide Conjugates,
Agrawal, ed., Humana Press Inc., Totowa, NJ, 199
4, pages 167-185; 及びChapter 10 In: Molecular Clo
ning: A Laboratory Manual, 2nd Ed., Sambrook et a
l., eds., pages 10.1-10.70を参照のこと)。ブロット
を切出し、32P−標識グリセルアルデヒド3−リン酸デ
ヒドロゲナーゼ(G3PDH)プローブ(クローンテッ
クラボラトリーズ社、パロアルト、CA)を用いて再プ
ローブし、RNAローディング量の同一性を確かめ、J
NK転写物のレベルをG3PDHシグナルに関して標準
化した。
【0102】A549細胞をT−75フラスコで80−
90%の集密度になるまで増殖させた。この時点で細胞
を2度媒体(DMEM)10mLで洗浄し、次いでLI
POFECTIN(商標)(即ち、1:1(w/w)D
OTMA/DOPE、ライフテクノロジーズ、ゲイサー
スバーグ、MD;DOTMA=N−[1−(2,3−ジ
オレイオキシ)プロピル]−N,N,N−トリメチルア
ンモニウムクロリド;DOPE=ジオレオイルホスファ
チジルエタノールアミン)20μg/mLを含有するD
MEMを5mL加えた。10μMのストック溶液からオ
リゴヌクレオチドを加えて最終濃度400nMとし、フ
ラスコを渦状に揺らして2つの溶液を混ぜた。対照とし
て、オリゴヌクレオチド処理サンプルと同一の条件及び
同一の時間で、オリゴヌクレオチドのないLIPOFE
CTIN(商標)で細胞を処理した。37℃で4時間
後、新鮮なDMEM含有10%血清に培地を代えた。細
胞を18時間回復させた。次いで全細胞RNAをグアニ
ジニウムに抽出し、ゲル電気泳動にかけ、当技術分野で
知られている技術によりフィルターへ移した(例えば、
Chapter 7 In: Molecular Cloning: A Laboratory Manu
al, 2nd Ed., Sambrook et al., eds., pages 7.1-7.87
及びShort Protocols in Molecular Biology,2nd Ed.,
Ausubel et al., eds., John Wiley & Sons, New York,
1992, pages2-24 to 2-30 and 4-14 to 4-29を参照の
こと)。典型的には、このフィルターを、関心対象の特
定のJNK遺伝子に特異的なプローブとハイブリダイゼ
ーション緩衝液(25mM KPO4,pH7.4;5
xSSC;5xデンハート溶液;サケ精子DNA100
μg/mL;及び50%ホルムアミド)において一晩ハ
イブリダイズさせた(Alahari et al., Nucl. Acids Re
s., 1993, 21, 4079)。次いでこれを1xSSC,0.
1%SDSで2回、0.25xSSC,0.1%SDS
で2回洗浄した。ハイブリダイズしたバンドは、X−O
MAT ARフィルムに露出して視覚化し、製造業者の
指示書(モレキュラーダイナミクス、サニベール、C
A)にほとんど従ってPHOSPHORIMAGER
(商標)を使用して定量化した。
【0103】ウェスタンアッセイ:上記のようにA54
9細胞を増殖させ、オリゴヌクレオチドで処理した。当
技術分野で知られている手段によって、細胞を溶解し、
タンパク質抽出物を電気泳動(SDS−PAGE)にか
け、ニトロセルロースフィルターに移した(例えば、Ch
apter 18 In: Molecular Cloning: A Laboratory Manua
l, 2nd Ed., Sambrook et al., eds., pages 18.34, 1
8.47-18.54 and 18.60-18.75を参照のこと)。各JNK
タンパク質の量は、適切なJNKタンパク質を特異的に
認識する一次抗体を使用して定量した。各JNKタンパ
ク質に特異的な一次抗体については以下の実施例に記載
されている。一次抗体は当技術分野でよく知られている
手段により検出され(例えば、Short Protocols in Mol
ecular Biology, 2nd Ed., Ausubel et al., eds., Joh
n Wiley & Sons, New York, 1992, pages 10-33 to 10-
35;及びChapter 18 In: Molecular Cloning: A Laborat
ory Manual, 2nd Ed., Sambrook et al., eds., pages
18.1-18.75 and 18.86-18.88を参照のこと)、製造業者
の指示書(モレキュラーダイナミクス、サニベール、C
A)にほとんど従ってPHOSPHORIMAGER
(商標)を使用して定量化した。
【0104】JNKタンパク質のレベルはまたその対応
するキナーゼ活性のレベルを測定することによっても定
量し得る。そのようなキナーゼアッセイは、in situで
ゲルにおいて(Hibi at al., Genes & Dev., 1993, 7,
2153)又は細胞抽出液からの免疫沈澱の後に(Derijard
et al., Cell, 1994, 76, 1025)なし得る。そのよう
なアッセイ用の基質及び/又はキットは、例えば、アッ
プステートバイオテクノロジー社(レークプラシッド、
NY)、ニューイングランドバイオラブズ社(ビバリ
ー、MA)及びカルビオケム−ノバビオケムバイオサイ
エンス社(ラジョラ、CA)から市販されている。
【0105】実施例3:JNK1発現のオリゴヌクレオ
チド介在性阻害 A.JNK1のオリゴヌクレオチド配列:表1は、JN
K1・mRNAに特異的にハイブリダイズするように設
計されたオリゴヌクレオチドのセットのヌクレオチド配
列及びそれに対応するISISとSEQ ID NOを
リストする。標的遺伝子であるJNK1のヌクレオチド
座標、及び遺伝子標的領域も包含されている。ヌクレオ
チド座標は、GenBank登録番号:L26318、
遺伝子座名「HUMJNK1」に由来する(また、Deri
jard et al., Cell, 1994, 76, 1025の図1(A)を参
照のこと)。遺伝子標的領域の略語は以下の通りであ
る:5'−UTR、5'非翻訳領域;tIR、翻訳開始領
域;ORF、オープンリーディングフレーム;3'−U
TR、3'非翻訳領域。配列が表1に示されているオリ
ゴヌクレオチドのヌクレオチドはホスホロチオエート結
合で連結し、2'位は非修飾である(即ち、2'−デオキ
シ)。オリゴヌクレオチドが座標位置を標的にするこ
と、及び遺伝子標的領域がJNK1の関連イソ型をコー
ドするmRNA内部で変化し得ることに留意すべきであ
る(以下のG節を参照のこと)。
【0106】ISIS No.12548(SEQ I
D NO:17)及び12551(SEQ ID N
O:20)の完全なオリゴヌクレオチド配列は、ヒトJ
NK1・mRNAにハイブリダイズすることに加えて、
「p54γ」と呼ばれるストレス活性化プロテインキナ
ーゼをコードする、Rattus norvegicus 由来のmRNA
の5'末端にハイブリダイズする(Kyriakis et al., Na
ture, 1994, 369, 156)。特定すると、ISIS 12
548(SEQ ID NO:17)は、GenBan
k登録番号L27129、遺伝子座名「RATSAPK
D」の塩基498−517にハイブリダイズし、ISI
S 12551(SEQ ID NO:20)は、同一
配列の塩基803−822にハイブリダイズする。従っ
て、これらのオリゴヌクレオチドは、in vitro、即ち全
動物由来の培養細胞又は組織において、又はin vivoに
おいて、ラットp54γプロテインキナーゼの役割を研
究する本発明の好ましい態様となる。
【0107】B.JNK1特異的プローブ:JNK1配
列から派生したオリゴヌクレオチドセットの生物活性に
ついての最初のスクリーニングにおいて、JNK1のc
DNAクローン(Derijard et al., Cell, 1994, 76, 1
025)を放射標識し、ノーザンブロットにおけるJNK
1特異的プローブとして使用した。しかしながら、表1
の1種又はそれ以上のオリゴヌクレオチドは、別のやり
方でも検出できるように標識し、JNK1特異的プロー
ブとして使用した。 表 1 JNK1オリゴヌクレオチドのヌクレオチド配列
【0108】
【表1】
【0109】C.JNK1オリゴヌクレオチドの活性:
JNK1特異的ホスホロチオエートオリゴヌクレオチド
のセットをスクリーニングしたデータ(表2)は、以下
の結果を示す。JNK1・mRNAレベルの約50%以
上〜約100%の阻害レベルによって反映される、この
アッセイにおける活性を示すオリゴヌクレオチドは、I
SIS No.11982、11983、12463、
12464、12538、12539、12548、1
2549、12550、12552、12553、12
554、12555、12556及び12557(それ
ぞれ、SEQID NO:5、6、13、14、15、
16、17、18、19、21、22、23、24、2
5及び26)を包含する。従って、これらのオリゴヌク
レオチドはJNK1の発現をモジュレートするための本
発明の好ましい態様である。このアッセイにおいてJN
K1・mRNAレベルの約80%以上〜約100%の阻
害レベルを示すオリゴヌクレオチドは、ISIS N
o.11982、12539、12548、12554
及び12464(それぞれ、SEQ ID NO:5、
16、17、23及び14)を包含する。従って、これ
らのオリゴヌクレオチドはJNK1の発現をモジュレー
トするための本発明のより好ましい態様である。
【0110】ISIS 12539(SEQ ID N
O:16)によるJNK1・mRNA発現阻害の時間経
過を表3に示す。ISIS 12539で処理して4時
間経過した時点(t=0h)でJNK1の阻害レベルは
約85%以上であり、t=4hでは約95%阻害へ上昇
し、次いで約80%より高いかそれに等しい(t=12
h及び48h)か、又は60%(72h)を保った。 表 2 JNK1オリゴヌクレオチドの活性
【0111】
【表2】
【0112】
【表3】
【0113】表 3 JNK1アンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)に
対する反応の時間経過
【0114】
【表4】
【0115】D.追加のJNK1オリゴヌクレオチド:
JNK1特異的オリゴヌクレオチドの試験結果(表2)
は、JNK1の発現をモジュレートする最も活性なホス
ホロチオエートオリゴヌクレオチドの1つがISIS
12539(SEQ IDNO:16)であることを示
す。表4に詳しく示されるように、上記の知見を確認し
て拡張するために、このオリゴヌクレオチドに基づいた
追加のオリゴヌクレオチドを設計した。
【0116】オリゴヌクレオチドのISIS No.1
4320(SEQ ID NO:27)及び14321
(SEQ ID NO:28)は、それぞれ、ISIS
12539(SEQ ID NO:16)に対する
2'−デオキシ−ホスホロチオエートセンス鎖対照及び
無秩序(ごた混ぜにした)対照である。ISIS N
o.15346及び15347はISIS 12539
に対応する「ギャップマー」であり、いずれも2'−メ
トキシエトキシ「ウィング」(ISIS 15346の
場合はホスホロチオエート結合、ISIS 15347
の場合はホスホジエステル結合を有する)及び、標的m
RNA分子に対するRNアーゼH活性を支援するように
設計された中央の2'−デオキシ「ギャップ」を有す
る。同様に、ISIS No.15348〜15350
はISIS 12539に対応する「ウィングマー」で
あり、5'又は3'2'−メトキシエトキシRNアーゼH
不応性「ウィング」及び、標的JNK1・mRNAに対
するRNアーゼH活性を支援するように設計された、
(それぞれ)3'又は5'の2−デオキシ「ウィング」を
有する。
【0117】ISIS 12539(SEQ ID N
O:16)の化学修飾した誘導体を本明細書に記載され
るノーザンアッセイで100及び400nMの濃度で試
験した。データ(表5)は以下の結果を示す。400n
Mでは、2'非修飾オリゴヌクレオチドであるISIS
12539に比較して、いずれの「ギャップマー」
(ISIS No.15346及び15347)も少な
くとも約80%までのJNK1・mRNA発現の阻害を
もたらした。同様に、4種の「ウィングマー」(ISI
S No.15348〜15351)も少なくとも約6
0〜70%までのJNK1発現の阻害をもたらした。 表 4 化学修飾したJNK1オリゴヌクレオチド
【0118】
【表5】
【0119】* 太字の残基:“C"残基、5−メチルシ
トシンを包含する2'−メトキシエトキシ残基(他は2'
−デオキシ);“o":ホスホジエステル結合:“s":ホ
スホロチオエート結合。“"残基:2'−デオキシ−5
−メチルシトシン残基。 表 5 化学修飾したJNK1アンチセンスオリゴヌクレオチド
の活性
【0120】
【表6】
【0121】* 略号:P=O、ホスホジエステル結合;
P=S、ホスホロチオエート結合;MOE、メトキシエ
トキシ−
【0122】E.JNK1オリゴヌクレオチドに対する
用量及び配列依存性の反応:ISIS 12539(S
EQ ID NO:16)に対する用量依存的な反応性
を示すために、A549細胞におけるJNK1・mRN
Aレベルに対する効果について、様々な濃度(即ち、5
0、100、200及び400nM)のISIS 12
539を試験した(表6)。さらに、ISIS 125
39の特異性を示すために、2種の対照オリゴヌクレオ
チド(ISIS 14320、SEQ IDNO:2
7、センス対照及びISIS 14321、SEQ I
D NO:28、無秩序対照;表4も参照のこと)もA
549細胞へ適用した。この結果(表6)は、ISIS
12539に対するA549細胞の反応がほぼ直線形
式の用量依存的であることを示す。対照的に、対照のオ
リゴヌクレオチドはいずれもJNK1・mRNAレベル
に対して首尾一貫した反応をしていない。
【0123】F.ウェスタンアッセイ:JNK1・mR
NAへ標的されたオリゴヌクレオチドのJNK1タンパ
ク質レベルに対する効果を評価するために、ほとんど上
記実施例2に記載したようにしてウェスタンアッセイを
実施したが、以下の例外及び/又は変更があった。JN
K1に特異的に結合する一次抗体(カタログ番号sc−
474−G)はサンタクルツ・バイオテクノロジー社
(サンタクルツ、CA)より購入したが、他のJNK1
特異抗体は、ストレスジェン・バイオテクノロジー社、
ビクトリア、BC、カナダ;及びリサーチ・ダイアグノ
シス社、フランダース、NJから提供される。この実験
では、細胞を増殖させ、最初の20時間はオリゴヌクレ
オチド300nMで処理し、次いで4時間200nMで
処理した。t=48hにおいて、ノーザン及びウェスタ
ン分析のためのアリコートを除き、新鮮な培地を加え
た。分析用アリコートは、t=72hでも採取した。上
記のノーザン及びウェスタンアッセイを使用して、t=
48及びt=72hからのサンプルを分析した。 表 6 JNK1アンチセンスオリゴヌクレオチドに対する用量
依存的な反応
【0124】
【表7】
【0125】このデータ(表7)は以下の結果を示す。
このアッセイでは、t=48hにおいて、約70%以上
〜約100%までのmRNA阻害%レベルを示すオリゴ
ヌクレオチドは、ISIS No.12539(ホスホ
ロチオエート結合)、15346及び15347(「ギ
ャップマー」)、及び15348及び15351(5'
「ウィングマー」)(SEQ ID NO:16)を包
含する。約90%以上〜約100%までのJNK1・m
RNAのmRNA阻害レベルをこのアッセイで示すオリ
ゴヌクレオチドは、ISIS No.12539、15
347及び15346(SEQ ID NO:16)を
包含する。試験したオリゴヌクレオチドはJNK1タン
パク質阻害のほぼ相似したレベルを示した。つまり、I
SISNo.12539、15346〜15348及び
15351は約40%以上のタンパク質阻害レベルをも
たらし、ISIS No.12539、15346及び
15347は約55%以上のタンパク質阻害レベルをも
たらした。
【0126】t=72hにおいて、約70%以上〜約1
00%までのmRNA阻害%レベルを示すオリゴヌクレ
オチドは、ISIS No.12539(ホスホロチオ
エート結合)、15346及び15347(「ギャップ
マー」)、及び15348(5'「ウィングマー」)
(SEQ ID NO:16)を包含する。約90%以
上〜約100%までのJNK1・mRNAのmRNA阻
害レベルをこのアッセイで示すオリゴヌクレオチドは、
ISIS No.12539及び15346(SEQ
ID NO:16)を包含する。全体に、試験したオリ
ゴヌクレオチドは、このアッセイのこの時点でより高い
レベルのJNK1タンパク質阻害を示した。完全に2'
−メトキシエトキシ修飾したISIS 15345を除
くと、表7のオリゴヌクレオチドは全て約40%以上の
タンパク質阻害をもたらした。ISIS No.125
39、15346〜15348及び15351は約60
%以上のタンパク質阻害レベルをもたらし、ISIS
No.12539、15346及び15347は約70
%以上のタンパク質阻害レベルをもたらした。 表 7 修飾されたJNK1アンチセンスオリゴヌクレオチドに
よるJNK1・mRNA及びJNK1タンパク質レベル
のモジュレーション
【0127】
【表8】
【0128】G.JNK1イソ型に特異的なオリゴヌク
レオチド:JNK1に関する初期の記述(Derijard et
al., Cell, 1994, 76, 1025)に続き、JNK1の関連
イソ型をコードするcDNAをクローニングし、それら
のヌクレオチド配列を決定した(Gupta et al., EMBO J
ournal, 1996, 15, 2760)。JNK1のアミノ酸配列と
同一のアミノ酸配列を有するポリペプチドをコードす
る、JNK1−α1(GenBank登録番号:L26
318、遺伝子座名「HUMJNK1」)だけでなく、
追加のイソ型は、JNK1−α2(GenBank登録
番号:U34822、遺伝子座名「HSU3482
2」)、JNK1−β1(GenBank登録番号:U
35004、遺伝子座名「HSU35004」)及びJ
NK1−β2(GenBank登録番号:U3500
5、遺伝子座名「HSU35005」)を包含する。こ
の4種のJNK1のイソ型は、おそらく選択的mRNA
スプライシングから生じるが、異なる転写因子又は転写
因子のセットとそれぞれ相互作用し得る(Gupta et a
l., EMBO Journal, 1996, 15, 2760)。以下に詳しく示
すように、本発明のオリゴヌクレオチドは、これらJN
K1のイソ型のある種のメンバー又はセットに対して特
異的である。
【0129】JNK1/JNK1−α1及びJNK1−
α2をコードするmRNAのORFでは、JNK1/J
NK1−α1(GenBank登録番号:L2631
8)のヌクレオチド(nt)631−665及びJNK
1−α2(GenBank登録番号:U34822)の
nt625−659がSEQ ID NO:63として
以下に示される配列を有するのに対し、JNK1−β1
及びJNK1−β2をコードするmRNAのORFで
は、JNK1−β1(GenBank登録番号:U35
004)のnt631−665及びJNK1−β2(G
enBank登録番号:U35005)のnt626−
660がSEQ ID NO:64として以下に示され
る配列を有する。説明のために、SEQ ID NO:
63及び64を互いに並置して示す(垂直のマーク、
“|"は、2つの配列で同一である塩基を示す)。
【0130】
【化1】
【0131】このa及びbのJNK1イソ型間の違いに
より、SEQ ID NO:63の逆相補体(即ち、S
EQ ID NO:65、以下を参照のこと)由来のア
ンチセンスオリゴヌクレオチドは、JNK1−β1及び
JNK1−β2の発現に有意に影響することなくJNK
1/JNK1−α1及びJNK1−α2の発現をモジュ
レートするために使用され得る。同様に、SEQ ID
NO:64の逆相補体(即ち、SEQ ID NO:
66、以下を参照のこと)由来のアンチセンスオリゴヌ
クレオチドは、JNK1/JNK1−α1及びJNK1
−α2の発現に有意に影響することなくJNK1−β1
及びJNK1−β2の発現をモジュレートするために選
択され、使用され得る。1例として、SEQ ID N
O:65由来の配列を有するがSEQ ID NO:6
6は有さないオリゴヌクレオチドは、JNK1/JNK
1−α1及びJNK1−α2をコードするmRNAと特
異的にハイブリダイズするが、JNK1−β1及びJN
K1−β2をコードするmRNAとはハイブリダイズし
ない。
【0132】
【化2】
【0133】さらなる例として、JNK1/JNK1−
α1及びJNK1−α2をコードするmRNAのORF
では、JNK1/JNK1−α1(GenBank登録
番号:L26318)のnt668−711及びJNK
1−α2(GenBank登録番号:U34822)の
nt662−705がSEQ ID NO:67として
以下に示される配列を有するのに対し、JNK1−β1
及びJNK1−β2をコードするmRNAのORFで
は、JNK1−β1(GenBank登録番号:U35
004)のnt668−711及びJNK1−β2(G
enBank登録番号:U35005)のnt663−
706がSEQ ID NO:68として以下に示され
る配列を有する。説明のために、SEQ ID NO:
67及び68を以下のように互いに並置して示す。
【0134】
【化3】
【0135】このa及びbのJNK1イソ型間の違いに
より、SEQ ID NO:67の逆相補体(即ち、S
EQ ID NO:69、以下を参照のこと)由来のア
ンチセンスオリゴヌクレオチドは、JNK1−β1及び
JNK1−β2の発現に有意に影響することなく、JN
K1/JNK1−α1及びJNK1−α2をコードする
mRNAと特異的にハイブリダイズし、その発現をモジ
ュレートするために選択され、使用され得る。同様に、
SEQ ID NO:68の逆相補体(即ち、SEQ
ID NO:70、以下を参照のこと)由来のアンチセ
ンスオリゴヌクレオチドは、JNK1/JNK1−α1
及びJNK1−α2の発現に有意に影響することなく、
JNK1−β1及びJNK1−β2をコードするmRN
Aと特異的にハイブリダイズし、その発現をモジュレー
トするために選択され、使用され得る。
【0136】
【化4】
【0137】JNK1イソ型のカルボキシル末端部分で
は、JNK1/JNK1−α1はJNK1−β1と同一
性を共有し、同様に、JNK1−α2とJNK1−β2
は同一のカルボキシ末端部分を有する。上記イソ型のア
ミノ酸配列における実質的な違い(JNK1/JNK1
−α1及びJNK1−β1の5個のアミノ酸がJNK1
−α2及びJNK1−β2では48個のアミノ酸に置換
されている)は、リーディングフレームをシフトさせる
ヌクレオチド配列におけるわずかな違いから生じてい
る。特定すると、JNK1/JNK1−α1及びJNK
1−β1をコードするmRNAのORFでは、JNK1
/JNK1−α1(GenBank登録番号:L263
18)及びJNK1−β1(GenBank登録番号:
U35004)のnt1144−1175がSEQ I
D NO:71として以下に示される配列を有するのに
対し、JNK1−α2及びJNK1−β2をコードする
mRNAのORFでは、JNK1−α2(GenBan
k登録番号:U34822)のnt1138−1164
及びJNK1−β2(GenBank登録番号:U35
005)のnt1139−1165がSEQ ID N
O:72として以下に示される配列を有する。説明のた
めに、SEQ ID NO:71及び72を互いに並置
して示す(ダッシュ、“−"は、提示された配列で欠損
している塩基を示し、太字の塩基は、JNK1/JNK
1−α1及びJNK1−β1のORFに対する終止コド
ンを示す):
【0138】
【化5】
【0139】このJNK1イソ型間の違いにより、SE
Q ID NO:71の逆相補体(即ち、SEQ ID
NO:73、以下を参照のこと)由来のアンチセンス
オリゴヌクレオチドは、JNK1/JNK1−α1及び
JNK1−β1をコードするmRNAと特異的にハイブ
リダイズし、JNK1−α2及びJNK1−β2の発現
に有意に影響することなく、その発現をモジュレートす
るために選択され、使用され得る。同様に、SEQ I
D NO:72の逆相補体(即ち、SEQ IDNO:
74、以下を参照のこと)由来のアンチセンスオリゴヌ
クレオチドは、JNK1/JNK1−α1及びJNK1
−β1の発現に有意に影響することなく、JNK1−α
2及びJNK1−β2をコードするmRNAと特異的に
ハイブリダイズし、その発現をモジュレートするために
選択され、使用され得る:
【0140】
【化6】
【0141】好ましい態様では、そのようなイソ型特異
的オリゴヌクレオチドは、上記に記載されるように、メ
トキシエトキシ「ギャップマー」又は「ウィングマー」
であり、そこではRNアーゼH感受性の「ギャップ」又
は「ウィング」が上記アンチセンス配列、即ちSEQ
ID NO:65、66、69、70、73及び74の
非同一性領域を覆うように位置付けられている。
【0142】実施例4:JNK2発現のオリゴヌクレオ
チド介在性阻害 A.JNK2のオリゴヌクレオチド配列:表8は、JN
K2・mRNAと特異的にハイブリダイズするように設
計されたオリゴヌクレオチドのヌクレオチド配列及びそ
れに対応するISISとSEQ ID NOをリストす
る。標的遺伝子のヌクレオチド座標及び遺伝子標的領域
も包含されている。ヌクレオチド座標は、GenBan
k登録番号:L31951、遺伝子座名「HUMJNK
2」に由来する(また、Sluss et al., Mol. Cel. Bio
l., 1994, 14, 8376の図1(A)及びKallunki et al.,
Genes & Development, 1994, 8, 2996を参照のこ
と)。遺伝子標的領域の略語は以下の通りである:5'
−UTR、5'非翻訳領域;tIR、翻訳開始領域;O
RF、オープンリーディングフレーム;3'−UTR、
3'非翻訳領域。配列が表8に示されているオリゴヌク
レオチドのヌクレオチドはホスホロチオエート結合で連
結し、2'位は非修飾である(即ち、2'−デオキシ)。
オリゴヌクレオチドの標的座標位置及び遺伝子標的領域
がJNK2の関連イソ型をコードするmRNA内部で変
化し得ることに留意すべきである(以下のG節を参照の
こと)。
【0143】ISIS No.12562(SEQ I
D NO:33)の完全なオリゴヌクレオチド配列は、
ヒトJNK2・mRNAにハイブリダイズすることに加
えて、「p54α2」と呼ばれるストレス活性化プロテ
インキナーゼをコードする、Rattus norvegicus 由来の
mRNAのORFにハイブリダイズする(Kyriakis et
al., Nature, 1994, 369,156)。特定すると、ISIS
12562(SEQID NO:33)は、GenB
ank登録番号L27112、遺伝子座名「RATSA
PKB」の塩基649−668にハイブリダイズする。
従って、このオリゴヌクレオチドは、in vitro、即ち全
動物由来の培養細胞又は組織において、又はin vivoに
おいて、ラットp54α2プロテインキナーゼの役割を
研究する本発明の好ましい態様となる。
【0144】B.JNK2特異的プローブ:JNK2配
列から派生したオリゴヌクレオチドセット(表9)の生
物活性についての最初のスクリーニングにおいて、JN
K2のcDNAクローン(Kallunki et al., Genes & D
evelopment, 1994, 8, 2996)を放射標識し、ノーザン
ブロットにおけるJNK2特異的プローブとして使用し
た。しかしながら、表8の1種又はそれ以上のオリゴヌ
クレオチドは、別のやり方でも検出できるように標識
し、JNK2特異的プローブとして使用した。
【0145】C.JNK2オリゴヌクレオチドの活性:
JNK2特異的ホスホロチオエートオリゴヌクレオチド
のセットをスクリーニングしたデータ(表9)は、以下
の結果を示す。JNK2・mRNAレベルの約50%以
上〜約100%の阻害レベルによって反映される、この
アッセイにおける活性を示すオリゴヌクレオチドは、I
SIS No.12558、12559、12560、
12563、12564、12565、12566、1
2567、12568、12569及び12570(そ
れぞれ、SEQ ID NO:29、30、31、3
4、35、36、37、38、39、40及び41)を
包含する。従って、これらのオリゴヌクレオチドはJN
K2の発現をモジュレートするための本発明の好ましい
態様である。このアッセイにおいてJNK2・mRNA
レベルの約80%以上〜約100%の阻害レベルを示す
オリゴヌクレオチドは、ISIS No.12558、
12560、12565、12567、12568及び
12569(それぞれ、SEQ ID NO:29、3
1、36、38、39及び40)を包含する。従って、
これらのオリゴヌクレオチドはJNK2の発現をモジュ
レートするための本発明のより好ましい態様である。
【0146】ISIS 12560(SEQ ID N
O:31)によるJNK2・mRNA発現阻害の時間経
過を表10に示す。ISIS 12560で処理して4
時間経過した後、少なくとも12時間、JNK2の阻害
レベルは約80%より高いかそれに等しく、少なくとも
約t=48hまでは約60%より高いかそれに等しかっ
た。 表 8 JNK2オリゴヌクレオチドのヌクレオチド配列
【0147】
【表9】
【0148】表 9 JNK2オリゴヌクレオチドの活性
【0149】
【表10】
【0150】表 10 JNK2アンチセンスオリゴヌクレオチドに対する反応
の時間経過
【0151】
【表11】
【0152】D.追加のJNK2オリゴヌクレオチド:
JNK2特異的オリゴヌクレオチドの試験結果(表9)
は、JNK2の発現をモジュレートする最も活性なホス
ホロチオエートオリゴヌクレオチドの1つがISIS
12560(SEQ IDNO:31)であることを示
す。表11に詳しく示されるように、上記の知見を確認
して拡張するために、このオリゴヌクレオチドに基づい
た追加のオリゴヌクレオチドを設計した。
【0153】オリゴヌクレオチドのISIS No.1
4318(SEQ ID NO:42)及び14319
(SEQ ID NO:43)は、それぞれ、ISIS
12560(SEQ ID NO:31)に対する
2'−デオキシ−ホスホロチオエートセンス鎖及び無秩
序対照である。ISIS No.15353及び153
54はISIS 12560に対応する「ギャップマ
ー」であり、いずれも2'−メトキシエトキシ「ウィン
グ」(ISIS 15353の場合はホスホロチオエー
ト結合、ISIS 15354の場合はホスホジエステ
ル結合を有する)及び、標的mRNAに対するRNアー
ゼH活性を支援するように設計された中央の2'−デオ
キシ「ギャップ」を有する。同様に、ISIS No.
15355〜15358はISIS 12560に対応
する「ウィングマー」であり、5'又は3'2'−メトキ
シエトキシRNアーゼH不応性「ウィング」及び、標的
JNK2・mRNAに対するRNアーゼH活性を支援す
るように設計された、(それぞれ)3'又は5'の2−デ
オキシ「ウィング」を有する。
【0154】ISIS 12560(SEQ ID N
O:31)の化学修飾した誘導体を本明細書に記載され
るノーザンアッセイで100及び400nMの濃度で試
験した。データ(表12)は以下の結果を示す。400
nMでは、2'非修飾オリゴヌクレオチドであるISI
S 12560に比較して、いずれの「ギャップマー」
(ISIS No.15353及び15354)も少な
くとも約80%までのJNK2・mRNA発現の阻害を
もたらした。同様に、4種の「ウィングマー」(ISI
S No.15355〜15358)も少なくとも約7
0〜90%までのJNK2発現の阻害をもたらした。
【0155】E.JNK2オリゴヌクレオチドに対する
用量及び配列依存性の反応:ISIS 12560(S
EQ ID NO:31)に対する用量依存的な反応性
を示すために、A549細胞におけるJNK2・mRN
Aレベルに対する効果について、様々な濃度(即ち、5
0、100、200及び400nM)のISIS 12
560を試験した(表13)。さらに、ISIS 12
560の特異性を示すために、2つの対照オリゴヌクレ
オチド(ISIS 14318、SEQ IDNO:4
2、センス対照及びISIS 14319、SEQ I
D NO:43、無秩序対照;表11も参照のこと)も
A549細胞へ適用した。この結果(表12)は、IS
IS 12560に対するA549細胞の反応がほぼ直
線形式の用量依存的であることを示す。対照的に、対照
のオリゴヌクレオチドはいずれもJNK2・mRNAレ
ベルに対して首尾一貫した反応をしていない。 表 11 化学修飾したJNK2オリゴヌクレオチド
【0156】
【表12】
【0157】* 太字の残基:“C"残基、5−メチルシ
トシンを包含する2'−メトキシエトキシ残基(他は2'
−デオキシ);“o":ホスホジエステル結合:“s":ホ
スホロチオエート結合。“"残基:2'−デオキシ−5
−メチルシトシン残基。 表 12 化学修飾したJNK2アンチセンスオリゴヌクレオチド
の活性
【0158】
【表13】
【0159】表 13 JNK2アンチセンスオリゴヌクレオチドに対する用量
依存的な反応
【0160】
【表14】
【0161】F.ウェスタンアッセイ:JNK2・mR
NAへ標的されたオリゴヌクレオチドのJNK2タンパ
ク質レベルに対する効果を評価するために、ほとんど上
記実施例2及び3に記載したようにしてウェスタンアッ
セイを実施する。JNK2に特異的に結合する一次抗体
は、例えばサンタクルツ・バイオテクノロジー社、サン
タクルツ、CA;アップステートバイオテクノロジー
社、レークプラシッド、NY;ストレスジェン・バイオ
テクノロジー社、ビクトリア、BC、カナダ;又はリサ
ーチ・ダイアグノシス社、フランダース、NJより購入
する。
【0162】G.JNK2イソ型に特異的なオリゴヌク
レオチド:JNK2に関する初期の記述(Sluss et a
l., Mol. Cel. Biol., 1994, 14, 8376;Kallunki et a
l., Genes and Development, 1994, 8, 2996;GenB
ank登録番号HSU09759、遺伝子座名「U09
759」)に続き、JNK2の関連イソ型をコードする
cDNAをクローニングし、それらのヌクレオチド配列
を決定した(Gupta et al., EMBO Journal, 1996, 15,
2760)。JNK2のアミノ酸配列と同一のアミノ酸配列
を有するポリペプチドをコードする、JNK2−α2
(GenBank登録番号:L31951、遺伝子座名
「HUMJNK2」)だけでなく、追加のイソ型は、J
NK2−α1(GenBank登録番号:U3482
1、遺伝子座名「HSU34821」)、JNK2−β
1(GenBank登録番号:U35002、遺伝子座
名「HSU35002」)及びJNK2−β2(Gen
Bank登録番号:U35003、遺伝子座名「HSU
35003」)を包含する。この4種のJNK2のイソ
型は、おそらく選択的mRNAスプライシングから生じ
るが、それぞれ異なる転写因子又は転写因子のセットと
相互作用し得る(Gupta et al., EMBO Journal, 1996,
15, 2760)。以下に詳しく示すように、本発明のオリゴ
ヌクレオチドは、これらJNK2のイソ型のある種のメ
ンバー又はセットに対して特異的である。
【0163】JNK2/JNK2−α2及びJNK2−
α1をコードするmRNAのORFでは、JNK2/J
NK2−α2(GenBank登録番号:L3195
1)のヌクレオチド(nt)689−748及びJNK
2−α1(GenBank登録番号:U34821)の
nt675−734がSEQ ID NO:75として
以下に示される配列を有するのに対し、JNK2−β1
及びJNK2−β2をコードするmRNAのORFで
は、JNK2−β1(GenBank登録番号:U35
002)のnt653−712及びJNK2−β2(G
enBank登録番号:U35003)のnt665−
724がSEQ ID NO:76として以下に示され
る配列を有する。説明のために、SEQ ID NO:
75及び76を互いに並置して示す(垂直のマーク、
“|"は、2つの配列で同一である塩基を示す):
【0164】
【化7】
【0165】このa及びbのJNK2イソ型間の違いに
より、SEQ ID NO:75の逆相補体(即ち、S
EQ ID NO:77、以下を参照のこと)から派生
したアンチセンスオリゴヌクレオチドは、JNK2−β
1及びJNK2−β2の発現に有意に影響することな
く、JNK2/JNK2−α2及びJNK2−α1と特
異的にハイブリダイズし、JNK2/JNK2−α2及
びJNK2−α1の発現をモジュレートするために選択
され使用され得る。同様に、SEQ ID NO:76
の逆相補体(即ち、SEQ ID NO:78、以下を
参照のこと)から派生したアンチセンスオリゴヌクレオ
チドは、JNK2/JNK2−α2及びJNK2−α1
の発現に有意に影響することなく、JNK2−β1及び
JNK2−β2と特異的にハイブリダイズし、その発現
をモジュレートするために選択され、使用され得る。1
例として、SEQ ID NO:77由来の配列を有す
るがSEQ ID NO:78は有さないオリゴヌクレ
オチドは、JNK2/JNK2−α1及びJNK2−α
2をコードするmRNAと特異的にハイブリダイズする
が、JNK2−β1及びJNK2−β2をコードするm
RNAとはハイブリダイズしない:
【0166】
【化8】
【0167】JNK2イソ型のカルボキシル末端部分で
は、JNK2/JNK2−α2はJNK2−β2と同一
性を共有し、同様に、JNK2−α1とJNK2−β1
は同一のカルボキシ末端部分を有する。上記イソ型のア
ミノ酸配列における実質的な違い(JNK2−α1及び
JNK2−β1の5個のアミノ酸がJNK2/JNK2
−α2及びJNK2−β2では47個のアミノ酸に置換
されている)は、リーディングフレームをシフトさせる
ヌクレオチド配列におけるわずかな違いから生じてい
る。特定すると、JNK2−α1及びJNK2−β1を
コードするmRNAのORFでは、JNK2−α1(G
enBank登録番号:U34821)のnt1164
−1198及びJNK2−β1(GenBank登録番
号:U35002)のnt1142−1176がSEQ
ID NO:79として以下に示される配列を有する
のに対し、JNK2/JNK2−α2及びJNK2−β
2をコードするmRNAのORFでは、JNK2/JN
K2−α2(GenBank登録番号:L31951)
のnt1178−1207及びJNK2−β2(Gen
Bank登録番号:U35003)のnt1154−1
183がSEQ IDNO:80として以下に示される
配列を有する。説明のために、SEQ IDNO:79
及び80を互いに並置して示す(ダッシュ、“−"は、
提示された配列で欠損している塩基を示し、太字の塩基
は、JNK2−α1及びJNK2−β1のORFに対す
る終止コドンを示す):
【0168】
【化9】
【0169】このJNK2イソ型間の違いにより、SE
Q ID NO:79の逆相補体(即ち、SEQ ID
NO:81、以下を参照のこと)から派生したアンチ
センスオリゴヌクレオチドは、JNK2/JNK2−α
2及びJNK2−β2の発現に有意に影響することな
く、JNK2−α1及びJNK2−β1をコードするm
RNAと特異的にハイブリダイズし、その発現をモジュ
レートするために選択され、使用され得る。同様に、S
EQ ID NO:80の逆相補体(即ち、SEQID
NO:82、以下を参照のこと)から派生したアンチ
センスオリゴヌクレオチドは、JNK2−α1及びJN
K2−β1の発現に有意に影響することなく、JNK2
/JNK2−α2及びJNK2−β2をコードするmR
NAと特異的にハイブリダイズし、その発現をモジュレ
ートするために選択され、使用され得る。1例として、
ISIS 12564(SEQ ID NO:35)は
SEQ ID NO:82に対応するが、SEQ ID
NO:81には対応せず、従って、JNK2/JNK
2−α2及びJNK2−β2をコードするmRNAと特
異的にハイブリダイズし、その発現をモジュレートする
ために使用され得るが、JNK2−α1及びJNK2−
β1のそれとはハイブリダイズしない。
【0170】
【化10】
【0171】好ましい態様では、そのようなイソ型特異
的オリゴヌクレオチドは、上記に記載されるように、メ
トキシエトキシ「ギャップマー」又は「ウィングマー」
であり、そこではRNアーゼH感受性の「ギャップ」又
は「ウィング」が上記アンチセンス配列、即ちSEQ
ID NO:77、78、81及び82の非同一性領域
を覆うように位置付けられている。
【0172】実施例5:JNK3発現のオリゴヌクレオ
チド介在性阻害 A.JNK3のオリゴヌクレオチド配列:表14は、J
NK3・mRNAに特異的にハイブリダイズするように
設計されたオリゴヌクレオチドのヌクレオチド配列及び
それに対応するISISとSEQ ID NOをリスト
する。標的遺伝子のヌクレオチド座標及び遺伝子標的領
域も包含されている。ヌクレオチド座標は、GenBa
nk登録番号:U07620、遺伝子座名「HSU07
620」に由来する(また、Mohit et al., Neuron, 19
94, 14, 67の図4(A)を参照のこと)。遺伝子標的領
域の略語は以下の通りである:5'−UTR、5'非翻訳
領域;tIR、翻訳開始領域;ORF、オープンリーデ
ィングフレーム;3'−UTR、3'非翻訳領域。オリゴ
ヌクレオチドの標的座標位置及び遺伝子標的領域がJN
K3の関連イソ型をコードするmRNA内部で変化し得
ることに留意すべきである(以下のD節を参照のこ
と)。
【0173】配列が表14に表されるオリゴヌクレオチ
ドのヌクレオチドは、ホスホロチオエート結合によって
連結され、「ギャップマー」である。特定すると、3'及
び5'末端の6つのヌクレオチドは2'−メトキシエトキ
シが修飾され、表14で太字で示されているが、中央の
8つのヌクレオチドは2'位で非修飾(即ち、2−デオ
キシ)である。
【0174】ISIS No.16692、1669
3、16703、16704、16705、16707
及び16708(それぞれ、SEQ ID NO:4
6、47、56、57、58、60及び61)の完全な
オリゴヌクレオチド配列は、ヒトJNK3・mRNAと
ハイブリダイズすることに加えて、「p54β」と呼ば
れるストレス活性化プロテインキナーゼをコードする、
Rattus norvegicus 由来のmRNAに特異的にハイブリ
ダイズする(Kyriakis et al., Nature, 1994, 369,15
6;GenBank登録番号L27128、遺伝子座名
「RATSAPKC」)。さらに、16692、166
93、16695、16703、16704、1670
5、16707及び16708(それぞれ、SEQ I
D NO:46、47、49、56、57、58、60
及び61)の完全なオリゴヌクレオチド配列は、マイト
ジェン活性化タンパク質(MAP)キナーゼ及び「p4
593F12SAPキナーゼ」と呼ばれるストレス活性化タ
ンパク質をコードする、Mus musculus由来のmRNAに
特異的にハイブリダイズする(Martin et al., Brain R
es. Mol. Brain Res., 1996, 35,17;GenBank登
録番号L35236、遺伝子座名「MUSMAP
K」)。従って、これらのオリゴヌクレオチドは、in v
itro、即ち全動物由来の培養細胞又は組織において、又
はin vivoにおいて、ラット又はマウスそれぞれのp5
4β及びp4593F12SAPプロテインキナーゼの役割
を研究する本発明の好ましい態様となる。上記オリゴヌ
クレオチドの標的遺伝子のヌクレオチド座標及び遺伝子
標的領域は、これらGenBankエントリーについて
定義されるように、表15に詳しく示されている。
【0175】B.JNK3特異的プローブ:JNK3配
列から派生したオリゴヌクレオチドセットの生物活性に
ついての最初のスクリーニングにおいて、JNK3のc
DNAクローン(Derijard et al., Cell, 1994, 76, 1
025)を放射標識し、ノーザンブロットにおけるJNK
3特異的プローブとして使用した。しかしながら、表1
4の1種又はそれ以上のオリゴヌクレオチドは、別のや
り方でも検出できるように標識し、JNK3特異的プロ
ーブとして使用した。
【0176】C.ウェスタンアッセイ:JNK3・mR
NAへ標的されたオリゴヌクレオチドのJNK3タンパ
ク質レベルに対する効果を評価するために、ほとんど上
記実施例2〜4に記載したようにしてウェスタンアッセ
イを実施する。JNK3に特異的に結合する一次抗体
は、例えばアップステートバイオテクノロジー社(レー
クプラシッド、NY)、ストレスジェン・バイオテクノ
ロジー社(ビクトリア、BC、カナダ)、又はニューイ
ングランドバイオラブズ社(ビバリー、MA)から購入
する。 表 14 JNK3オリゴヌクレオチドのヌクレオチド配列
【0177】
【表15】
【0178】1 太字の残基は2'−メトキシエトキシ修
飾である。 表 15 JNK3オリゴヌクレオチドの、ラット及びマウスの遺
伝子標的位置
【0179】
【表16】
【0180】1 GenBank登録番号L27128か
らの座標、遺伝子座名「RATSAPKC」。2 GenBank登録番号L35236からの座標、遺
伝子座名「MUSMAPK」。
【0181】D.JNK3イソ型に特異的なオリゴヌク
レオチド:JNK3の2種のイソ型が記載された。JN
K3−α1はMohit et al.,(Neuron, 1995, 14, 67)
により最初にクローニングされ、「p493F12キナー
ゼ」と命名された。次いで、JNK3の関連イソ型をコ
ードする2種のcDNAがクローニングされ、それらの
ヌクレオチド配列が決定された(Gupta et al., EMBO J
ournal, 1996, 15, 2760)。このイソ型は、本明細書で
はJNK3−α1(GenBank登録番号:U348
20、遺伝子座名「HSU34820」)及びJNK3
−α2(GenBank登録番号:U34819、遺伝
子座名「HSU348192」)と命名される。この2
種のJNK3のイソ型は、おそらく選択的mRNAスプ
ライシングから生じるが、それぞれ異なる転写因子又は
転写因子のセットと相互作用し得る(Gupta et al., EM
BO Journal, 1996, 15, 2760)。以下に詳しく示すよう
に、本発明のあるオリゴヌクレオチドは、これらJNK
3の2種のイソ型のそれぞれに特異的である。
【0182】JNK3−α1及びJNK3−α2はその
カルボキシル末端部分で異なる。これらイソ型のアミノ
酸の実質的な違い(JNK3−α1の5個のアミノ酸が
JNK3−α2では47個のアミノ酸に置換されてい
る)は、リーディングフレームをシフトさせるヌクレオ
チド配列におけるわずかな違いから生じている。特定す
ると、JNK3−α1をコードするmRNAのORFで
は、JNK3−α1(GenBank登録番号:U34
820)のヌクレオチド(nt)1325−1362が
SEQ ID NO:83として以下に示される配列を
有するのに対し、JNK3−α2をコードするmRNA
のORFでは、JNK3−α2(GenBank登録番
号:U34819)のnt1301−1333がSEQ
ID NO:84として以下に示される配列を有す
る。説明のために、SEQ ID NO:83及び84
を互いに並置して示す(垂直のマーク、“|"は、2つ
の配列で同一である塩基を示す;ダッシュ、“−"は、
提示された配列で欠損している塩基を示す;太字の塩基
は、JNK3−α1のORFに対する終止コドンを示
す):
【0183】
【化11】
【0184】このJNK3イソ型間の違いにより、SE
Q ID NO:83の逆相補体(即ち、SEQ ID
NO:85、以下を参照のこと)由来のアンチセンス
オリゴヌクレオチドは、JNK3−α2の発現に有意に
影響することなく、JNK3−α1をコードするmRN
Aと特異的にハイブリダイズし、その発現をモジュレー
トするために選択され、使用され得る。同様に、SEQ
ID NO:84の逆相補体(即ち、SEQ ID
NO:86、以下を参照のこと)由来のアンチセンスオ
リゴヌクレオチドは、JNK3−α1の発現に有意に影
響することなく、JNK3−α2をコードするmRNA
と特異的にハイブリダイズし、その発現をモジュレート
するために選択され、使用され得る:
【0185】
【化12】
【0186】好ましい態様では、そのようなイソ型特異
的オリゴヌクレオチドは、上記に記載されるように、メ
トキシエトキシ「ギャップマー」又は「ウィングマー」
であり、そこではRNアーゼH感受性の「ギャップ」又
は「ウィング」が上記アンチセンス配列、即ちSEQ
ID NO:85及び86の非同一性領域を覆うように
位置付けられている。
【0187】E.JNK3オリゴヌクレオチドの活性:
JNK3特異的ホスホロチオエート、2'−メトキシエ
トキシ「ギャップマー」オリゴヌクレオチド(表14)
をSH−SY5Y細胞におけるJNK3・mRNAレベ
ルに作用する能力についてスクリーニングした(Biedle
r et al., Cancer Res., 1973, 33, 2463)。SH−S
Y5Y細胞は、多種多様なマイトジェン活性化プロテイ
ンキナーゼ(MAPK;例えば、Cheng et al., J. Bio
l. Chem., 1998, 273, 14560を参照のこと)を発現す
る。細胞は以前に記載された(例えば、 Singleton et
al., J. Biol. Chem., 1996, 271, 31791; Jalava et a
l., Cancer Res., 1990, 50, 3422)ようにしてDME
Mで増殖させ、実施例2に記載されたように200nM
濃度のオリゴヌクレオチドで処理した。対照の培養物
は、オリゴヌクレオチドを含有しないLIPOFECT
IN(商標)のアリコートで処理した。
【0188】結果を表16に示す。JNK3・mRNA
レベルの約45%以上〜約100%の阻害レベルを示す
オリゴヌクレオチドは、ISIS No.16692、
16693、16694、16695、16696、1
6697、16702、16703、16704、16
705及び16706(それぞれ、SEQ ID N
O:46、47、48、49、50、51、55、5
6、57、58及び59)を包含する。これらのオリゴ
ヌクレオチドはJNK3の発現をモジュレートするため
の本発明の好ましい態様である。このアッセイにおいて
JNK3・mRNAレベルの約60%以上〜約100%
の阻害レベルを示すオリゴヌクレオチドは、ここで
「約」とは±5%を示すが、ISIS No.1669
3、16694、16695、16702、1670
3、16704及び16705(それぞれ、SEQ I
D NO:47、48、49、55、56、57及び5
8)を包含する。従って、これらのオリゴヌクレオチド
はJNK3の発現をモジュレートするための本発明のよ
り好ましい態様である。 表16:JNKオリゴヌクレオチドの活性
【0189】
【表17】
【0190】1 LIPOFECTIN(商標)だけで処
理した細胞(オリゴヌクレオチドなし)。2 N.D.:定量不可。
【0191】実施例6:AP−1サブユニットを標的に
したオリゴヌクレオチドの癌転移関連酵素に対する効果 良性腫瘍、及び発達経過の初期に検出された原発性悪性
腫瘍を有する患者は、この良性又は原発の腫瘍を外科的
に除去することによりしばしば成功裡に治療される。し
かし、チェックされなければ、悪性腫瘍由来の細胞は、
侵襲及び転移のプロセスを経て患者の体内に拡散する。
侵襲とは付着した原発部位から分離して、例えば基底膜
へ浸透する癌細胞の能力に言及する。転移は、(1)癌
細胞がその細胞外マトリックスから分離する、(2)分
離した癌細胞が、しばしば循環系を介して患者の身体の
別の部分へ移動し、及び(3)遠位及び不適切な細胞外
マトリックスに付着し、そこに二次腫瘍が発生する病巣
を形成する、という一連の事象を示す。正常細胞は侵襲
や転移をする能力を有さず、及び/又は上記の事象が起
きてもアポトーシス(プログラム化された細胞死)をす
る能力を有さない(Ruoslahti, Sci. Amer., 1996, 27
5, 72)。
【0192】マトリックスメタロプロテイナーゼ(MM
P)は、細胞外マトリックスの成分を分解する能力を有
する酵素のファミリーである(Birkedal-Hansen, Curre
nt Op. Biol., 1995, 7, 728)。MMPファミリーの多
くのメンバーは、ヒト腫瘍並びに他の病態において上昇
した活性レベルを有することが見出されてきた(Stetle
r-Stevenson et al., Annu. Rev. Cell Biol., 1993,
9, 541; Bernhard et al., Proc. Natl. Acad. Sci.
(U.S.A.), 1994, 91, 4293)。特に、このファミリーの
1つのメンバーである、マトリックスメタロプロテイナ
ーゼ−9(MMP−9)は、しばしば腫瘍及び他の病的
な組織においてのみ発現されていることが見出されてい
る(Himelstein et al., Invasion & Metastasis, 199
4, 14, 246)。いくつかの研究は、MMP−9遺伝子の
調節がAP−1の転写因子によって制御される可能性を
示した(Kerr et al., Science, 1988, 242, 1242; Ker
r et. al., Cell, 1990, 61, 267; Gum et al., J. Bio
l. Chem., 1996, 271, 10672; Hua et. al., Cancer Re
s., 1996, 56, 5279)。MMP−9の発現がAP−1の
モジュレーションによって影響され得るかを決定するた
めに、正常なヒト表皮ケラチノサイト(NHEK)を用
いて以下の実験を実施した。NHEKは検出し得るMM
P−9を普通は発現しないが、TPA(12−O−テト
ラデカノイルホルボール−13−アセテート)を包含す
る数多くの刺激によってMMP−9が誘導され得る。c
−junを標的にしたオリゴヌクレオチドであるISI
S 10582を、MMP−9の発現をモジュレートす
る能力について評価した(出願中の特許第08/83
7,201号、1997年4月14日出願、代理人ケー
ス番号ISPH−0209を参照のこと)。試験結果
(表17)は、ISIS 10582がTPA誘導後の
MMP−9の発現を完全に阻害し得ることを示す。 表 17 MMP−9の発現に対するc−junオリゴヌクレオチ
ドの効果
【0193】
【表18】
【0194】上記の結果は、TPA介在性のMMP−9
の誘導にc−Junが必要とされることを証明し、AP
−1サブユニットを標的にしたオリゴヌクレオチドがM
MPファミリーメンバーの発現を阻害し、それにより、
患者体内の他の組織を侵襲する及び/又は他の部位へ転
移する癌細胞の能力をモジュレートし得ることを示す。
JNKタンパク質はJunサブユニットのN末端部分を
リン酸化することによりAP−1を活性化するので、本
開示のオリゴヌクレオチドによる1種又はそれ以上のJ
NKタンパク質のモジュレーションもMMPファミリー
メンバーの発現をモジュレートして癌細胞の転移能力を
制限する可能性がある。
【0195】実施例7:JNKタンパク質を標的にした
オリゴヌクレオチドによるヒト腫瘍/マウスの処理 約5x106個の乳腺癌細胞(MDA−MB−231細
胞系;アメリカ・タイプ・カルチャー・コレクション、
リッチモンド、VA、No.ATCC HTB−26)
をヌードマウス(3セットのマウス各セットにつきn=
6)の右内大腿の皮下に植え付けた。オリゴヌクレオチ
ドISIS 15346(JNK1、SEQ ID N
O:16)及び15353(JNK2、SEQ ID
NO:31)を生理食塩水に懸濁し、腫瘍体積が約10
0mm3である第1日目に、2セットのマウスに対し1
日1回投与した。生理食塩水(0.9% NaCl)の
みの溶液を、対照として第3のセットのマウスへ投与し
た。オリゴヌクレオチドは25mg/kgの用量で静脈
内注射により投与した。腫瘍細胞接種後12、19、2
6及び33日目に腫瘍サイズを測定し、腫瘍体積を算出
した。
【0196】この試験結果を表18に示す。15346
(JNK1、SEQ ID NO:16)と15353
(JNK2、SEQ ID NO:31)はいずれも対
照の生理食塩水に比較して腫瘍の増殖を阻害した。特定
すると、第26日及び33日目では、オリゴヌクレオチ
ドで処理された動物内のMDA−MB−231腫瘍は生
理食塩水で処理した動物の腫瘍より小さいサイズを有
し、オリゴヌクレオチドが腫瘍の増殖を阻害することを
示した。本発明のアンチセンス化合物は、例えばヒト頚
管上皮癌細胞(ヒーラ細胞系、ATCC No.ATC
C CCL−2)、ヒト肺癌細胞(A549細胞系、A
TCC No.ATCC CCL−185)、ヒト腺癌
細胞(SW480細胞系、ATCC No.ATCC
CCL−228)、ヒト膀胱癌細胞(T24細胞系、A
TCC No.HTB−4)、ヒト膵臓癌細胞(MIA
PaCa細胞系、ATCC No.CRL−142
0)及びヒト小細胞癌細胞(NCI−H69細胞系、A
TCC HTB−119)から生じる異種移植片の増殖
を遅延又は消滅させる能力についても試験される。上記
及び他の細胞系から生じる異種移植片は、MDA−MB
−231細胞を使用する実験について使用されたものと
ほとんど同じ技術を使用して確立される。 表18:JNK1及びJNK2を標的にしたオリゴヌク
レオチドに対するMDA−MB−231腫瘍/マウスの
応答
【0197】
【表19】
【0198】実施例8:ラットJNKタンパク質をコー
ドする遺伝子を標的にしたオリゴヌクレオチド 動物モ
デルにおけるJNKタンパク質の役割を試験するため
に、Rattus norvegicus のJNK1、JNK2及びJN
K3をコードする遺伝子を標的にするオリゴヌクレオチ
ドを製造した。これらのオリゴヌクレオチドは2'−メ
トキシエトキシ、ホスホジエステル/2'−ヒドロキシ
ル、ホスホロチオエート/2'−メトキシエトキシ、ホ
スホジエステル「ギャップマー」であり、各シトシン残
基は5−メチルシトシン(m5C)である。これらアン
チセンス化合物は、本開示の方法によって合成した。こ
れらオリゴヌクレオチドのあるものは本明細書で示され
る以外の生物種由来のJNK遺伝子と追加的、特異的に
ハイブリダイズする。この実施例に記載されるオリゴヌ
クレオチドを、先の実施例に記載の方法にほとんど準拠
して、ラットのJNK・mRNAレベルをモジュレート
する能力について試験した。但し、例外として、使用し
た細胞系はラットA10大動脈平滑筋細胞(ATCC
No.ATCC CRL−1476)であり、使用した
プローブはラットJNK1、JNK2又はJNK3に特
異的であった(以下を参照)。A10細胞を増殖させ、
ほとんどCioffiら(Mol. Pharmacol., 1997, 51,383)
により記載された方法によりオリゴヌクレオチドで処理
した。
【0199】A.JNK1:表19は、ヒトJNK1タ
ンパク質に相同である「p54γ」又は「SAPKγ」
と呼ばれるストレス活性化プロテインキナーゼ(Kyriak
is et al., Nature, 1994, 369, 156;GenBank
登録番号L27129、遺伝子座名「RATSAPK
D」)をコードする Rattus norvegicus由来の核酸と特
異的にハイブリダイズするように設計された、オリゴヌ
クレオチドISIS No.21857〜21870
(それぞれ、SEQ ID NO:111〜124)セ
ットの配列及び構造を示す。表19において、太字の残
基は2'−メトキシエトキシ残基であり(他は2'−デオ
キシ);太字“C"残基は2'−メトキシエトキシ−5−
メチルシトシンで、“C"残基は5−メチルシトシンで
ある;“o"はホスホジエステル結合を示す;“s"はホ
スホロチオエート結合を示す。標的遺伝子の座標はGe
nBank登録番号L27129、遺伝子座名「RAT
SAPKD」からのものである。
【0200】
【表20】
【0201】これらのアンチセンス化合物を、A10細
胞におけるp54γ(JNK1)及びp54a(JNK
2)mRNAのレベルをモジュレートする能力につい
て、ノーザンアッセイにより試験した。ヒトとラットの
遺伝子間の高度の配列同等性により、放射標識したヒト
JNK1(実施例3)及びJNK2(実施例4)のcD
NAは、このラット相同体に対する特異的なプローブと
して機能した。
【0202】試験結果を表20に示す。ラットJNK1
・mRNAレベルの約75%以上〜約100%の阻害レ
ベルを示すオリゴヌクレオチドは、ISIS No.2
1857〜21870(それぞれ、SEQ ID N
O:111〜124)を包含する。これらのオリゴヌク
レオチドは、ラットJNK1の発現をモジュレートする
本発明の好ましい態様である。ラットJNK1・mRN
Aレベルの約90%以上〜約100%の阻害レベルをこ
のアッセイで示すオリゴヌクレオチドは、ISIS N
o.21858、21859、21860、2186
1、21862、21865、21866及び2186
7(それぞれ、SEQ ID NO:112、113、
114、115、116、119、120及び121)
を包含する。従って、これらのオリゴヌクレオチドは、
ラットJNK1の発現をモジュレートする本発明のより
好ましい態様である。ISIS 21859(SEQ
IDNO:113)を以降の試験での使用に選択した
(以下参照)。
【0203】オリゴヌクレオチドの2つ、ISIS N
o.21861及び21817(それぞれ、SEQ I
D NO:115及び121)は、JNK1とJNK2
のいずれもモジュレートする能力を示した。そのような
オリゴヌクレオチドを本明細書で「Pan(汎)−JN
K」アンチセンス化合物として言及するのは、「汎」と
いう用語が、免疫学の文献では、例えばあるタンパク質
の全イソ型又はある細胞型の全サブタイプを認識する抗
体に言及するように使用されているからである。汎JN
Kオリゴヌクレオチドについては以下でより詳しく論じ
る。
【0204】表19に記載されたオリゴヌクレオチドの
いくつかは、ラットJNK1をコードする核酸と特異的
にハイブリダイズし得るだけでなく、他の種由来のJN
K1コード核酸とも特異的にハイブリダイズし得る。I
SIS 21859(SEQID NO:113)は、
ヒトJNK1α1及びJNK1β1(即ち、それぞれG
enBank登録番号L26318及びU35004)
をコードするcDNAの塩基4〜23に相補的である。
ISIS 21862(SEQ ID NO:116)
は、ヒトJNK1α1及びJNK1β1のcDNA(即
ち、それぞれGenBank登録番号L26318及び
U35004)の塩基294〜313、JNK1β2の
cDNA(GenBank登録番号U35005)の塩
基289〜308及びJNK1α2のcDNA(Gen
Bank登録番号U34822)の塩基288〜307
に相補的である。最後に、ISIS 21865は、ヒ
トJNK1α1のcDNA(GenBank登録番号L
26318)の塩基654〜673及びヒトJNK1α
2のcDNA(GenBank登録番号U34822)
の塩基648〜667に相補的である。これらのオリゴ
ヌクレオチドを、実施例3に記載の方法により、ヒトJ
NK1遺伝子のmRNAレベルをモジュレートする能力
について試験する。 表20:ラットJNK1を標的にしたオリゴヌクレオチ
ドの活性
【0205】
【表21】
【0206】1 LIPOFECTIN(商標)だけで処
理した細胞(オリゴヌクレオチドなし)。
【0207】B.JNK2:表21は、「p54α」又
は「SAPKα」と呼ばれるストレス活性化プロテイン
キナーゼ(Kyriakis et al., Nature, 1994, 369, 15
6)をコードする Rattus norvegicus由来の核酸と特異
的にハイブリダイズするように設計された、オリゴヌク
レオチドISIS No.18254〜18267(そ
れぞれ、SEQ ID NO:125〜138)セット
の配列及び構造を示す。3種の対照オリゴヌクレオチ
ド、ISIS No.21914〜21916(それぞ
れ、SEQ ID NO:139〜141)の構造もこ
の表に示されている。p54αの2つのイソ型が記載さ
れた:「p54α1」(GenBank登録番号L27
112、遺伝子座名「RATSAPKA」及び「p54
α2」(GenBank登録番号L27111、遺伝子
座名「RATSAPKB」)である。ISIS 182
57(SEQ ID NO:128)を除き、表21に
記載のオリゴヌクレオチドは、p54α1又はp54α
2のいずれかをコードする核酸に特異的にハイブリダイ
ズする。ISIS 18257は、p54α2(即ち、
GenBank登録番号L27111、遺伝子座名「R
ATSAPKB」)をコードする核酸と特異的にハイブ
リダイズする。表21において、太字の残基は2'−メ
トキシエトキシ残基であり(他は2'−デオキシ);太
字“C"残基は2'−メトキシエトキシ−5−メチルシト
シンで、“C"残基は5−メチルシトシンである;“o"
はホスホジエステル結合を示す;“s"はホスホロチオ
エート結合を示す。標的遺伝子の座標はGenBank
登録番号L27112、遺伝子座名「RATSAPK
B」からのものである。
【0208】
【表22】
【0209】表 22 ラットJNK2を標的にしたオリゴヌクレオチドの活性
【表23】
【0210】1 LIPOFECTIN(商標)だけで処
理した細胞(オリゴヌクレオチドなし)。
【0211】これらのアンチセンス化合物を、A10細
胞におけるp54α(JNK2)mRNAのレベルをモ
ジュレートする能力について、以下に示すように、放射
標識したヒトJNK2のcDNAをプローブとして使用
して試験した。試験結果を表22に示す。ラットJNK
2・mRNAレベルの約60%以上〜約100%の阻害
レベルを示すオリゴヌクレオチドは、ISIS No.
18254、18255、18257、18258、1
8259、18260及び18264(それぞれ、SE
Q ID NO:125、126、128、129、1
30、131及び135)を包含する。これらのオリゴ
ヌクレオチドは、ラットJNK2発現をモジュレートす
る本発明の好ましい態様である。ラットJNK2・mR
NAレベルの約80%以上〜約100%の阻害レベルを
このアッセイで示すオリゴヌクレオチドは、ISIS
No.18254、18255、18258及び182
59(それぞれ、SEQ ID NO:125、12
6、129及び130)を包含する。従って、これらの
オリゴヌクレオチドは、ラットJNK2発現をモジュレ
ートする本発明のより好ましい態様である。ISIS
18259(SEQID NO:130)を以降の試験
での使用に選択した(以下参照)。
【0212】C.用量反応性:ラットJNK1(ISI
S 21859;SEQ ID NO:113)及びJ
NK2(ISIS 18259;SEQ ID NO:
130)を標的にしたヌクレオチド及びノーザンアッセ
イを使用して用量反応試験を実施した。この結果(表2
3)は、オリゴヌクレオチド濃度が上昇するにつれて増
加する効果を示し、ISIS No.21859及び1
8259(それぞれSEQ ID NO:113及び1
30)がそれぞれJNK1及びJNK2をコードするm
RNAのレベルを特異的にモジュレートすることを確認
する。 表 23: ラットJNKアンチセンスオリゴヌクレオチド(AS
O)に対する用量依存的な反応
【0213】
【表24】
【0214】D.JNK3:表24は、ヒトJNK3タ
ンパク質に相同である「p54β」と呼ばれるストレス
活性化プロテインキナーゼ(Kyriakis et al., Nature,
1994, 369, 156;GenBank登録番号L2712
8、遺伝子座名「RATSAPKC」)をコードする R
attus norvegicus由来の核酸と特異的にハイブリダイズ
するように設計された、オリゴヌクレオチドISIS
No.21899〜21912(それぞれ、SEQ I
D NO:142〜155)のセットの配列及び構造を
示す。表24において、太字の残基は2'−メトキシエ
トキシ残基であり(他は2'−デオキシ);太字“C"残
基は2'−メトキシエトキシ−5−メチルシトシンで、
“C"残基は5−メチルシトシンである;“o"はホスホ
ジエステル結合を示す;“s"はホスホロチオエート結
合を示す。標的遺伝子の座標はGenBank登録番号
L27128、遺伝子座名「RATSAPKC」からの
ものである。先の実施例に記載された方法にほとんど準
拠して、ラットJNK3・mRNAのレベルをモジュレ
ートする能力について、これらオリゴヌクレオチドを試
験する。
【0215】表24に記載のオリゴヌクレオチドのいく
つかは、ラットJNK3をコードする核酸に特異的にハ
イブリダイズすることに加えて、ヒト及びMus muculus
(マウス)由来のJNK3をコードする核酸とも特異的
にハイブリダイズする。表25はこれらの関係を説明す
る。これらヌクレオチドを、実施例5に記載の方法によ
り、ヒトJNK遺伝子のmRNAレベルをモジュレート
する能力について試験する。
【0216】
【表25】
【0217】表25:ラットJNK3オリゴヌクレオチ
ドの交叉ハイブリダイゼーション
【表26】
【0218】1 GenBank登録番号U34820、
遺伝子座名「HSU34820」(Mohit et al., Neur
on, 1995, 14, 67及びGupta et al., EMBO Journal, 19
96, 15, 2760も参照のこと)。2 GenBank登録番号U34819、遺伝子座名
「HSU34819」(Gupta et al., EMBO Journal,
1996, 15, 2760も参照のこと)。3 p4593F12MAPKとしても知られる;GenBa
nk登録番号L35236、遺伝子座名「MUSMAP
K」(Martin et al., Brain Res. Mol. Brain Res., 1
996, 35, 47も参照のこと)。
【0219】E.汎JNKオリゴヌクレオチド:本発明
のオリゴヌクレオチドのいくつかは2種又はそれ以上の
JNKタンパク質をモジュレートし得て、本明細書では
「汎JNK」オリゴヌクレオチドとして言及される。例
えば、ISIS No.21861及び21867(そ
れぞれ、SEQ ID NO:115及び121)は、
JNK1及びJNK2のいずれもモジュレートする能力
を示した(表20)。そのようなオリゴヌクレオチド
は、いくつかのJNKタンパク質の同時モジュレーショ
ンが所望されるときに有用である。
【0220】ヒト汎JNKオリゴヌクレオチドを表26
に記載する。これらオリゴヌクレオチドは、ヒトJNK
1α1、JNK1α2、JNK2α1及びJNK2α2
をコードする核酸において、同一に保存されている配列
(即ち、SEQ ID NO:156、158、15
9、160及び161)又はせいぜい1塩基のミスマッ
チを起こしている配列(SEQ ID NO:157)
に対して相補的であるように設計されている。表26に
記載のオリゴヌクレオチドは、実施例3及び4に記載の
方法及びアッセイを使用して、A549細胞におけるJ
NK1及びJNK2のmRNAレベルをモジュレートす
る能力について、評価される。
【0221】そのような共通配列が、モジュレートする
ことが所望されるJNK遺伝子の間の1つ又はそれ以上
の塩基の違いを網羅する例では、ヒポキサンチン(イノ
シン)をそのような塩基の違いに対応するオリゴヌクレ
オチドの位置へ取込み得る(「ヒポキサンチン」はヌク
レオシドのイノシンに対応する塩基について当技術分野
で受入れられている用語であるが、「イノシン」は、本
明細書では、ヌクレオチド配列に関するU.S.及びP
CTの規約に一致して使用されている。当技術分野で知
られているように、イノシン(I)は、様々なヌクレオ
ベース水素結合し、故にハイブリダイゼーションの目的
の「汎用」塩基として機能する。例えば、1つのイノシ
ン置換を有するSEQ ID NO:157の誘導体で
ある配列(TAGGAIATTCTTTCATGAT
C,SEQ ID NO:162)を有するオリゴヌク
レオチドは、ヒトJNK1α1、JNK1α2、JNK
2α2及びJNK2α2をコードする核酸とミスマッチ
塩基を有さずに結合すると予測される。もう1つの例と
して、1つのイノシン置換を有するSEQ ID N
O:161の誘導体である配列(GGTTGCAITT
TCTTCATGAA,SEQ ID NO:163)
を有するオリゴヌクレオチドは、JNK1α1、JNK
1α2、JNK2α2及びJNK2α2に加えて、ヒト
JNK3α1及びJNK3α2をコードする核酸とミス
マッチ塩基を有さずに結合すると予測される。そのよう
なオリゴヌクレオチドは、実施例3、4及び5に記載の
方法及びアッセイを使用して、A549細胞におけるJ
NK1及びJNK2のmRNAレベルを、及びSH−S
Y5Y細胞におけるJNK3のmRNAレベルをモジュ
レートする能力について評価される。 表26:ヒト汎JNKオリゴヌクレオチド
【0222】
【表27】
【0223】* 太字の残基:2'−メトキシエトキシ残
基(他は2'−デオキシ);全ての“C"残基:5−メチ
ルシトシン残基;“o":ホスホジエステル結合:“s":
ホスホロチオエート結合。
【配列表】
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 FI C12P 19/34 C12N 15/00 ZNAA (72)発明者 ディーン,ニコラス アメリカ合衆国カリフォルニア州92024, エンシニタス,ランドクゥイスト・ドラ イブ 1614 (72)発明者 モニア,ブレット・ピー アメリカ合衆国カリフォルニア州92009, ラ・コスタ,ヌエヴァ・カスティージ ャ・ウェイ 7605 (72)発明者 ネロ,パメラ・スコット アメリカ合衆国カリフォルニア州92054, オーシャンサイド,サウス・ネバダ・ス トリート 1010 (72)発明者 ガアーデ,ウィリアム・エイ アメリカ合衆国カリフォルニア州92009, カールズバッド,ケブラダ・サークル 3105 (56)参考文献 特表 平9−507384(JP,A) EMBO J., Vol.15 (11), p.2760−2770 (1996) (58)調査した分野(Int.Cl.7,DB名) C12Q 1/68 C12N 15/09 C12P 19/34 A61K 31/7088 A61K 48/00 A61P 35/00 BIOSIS/CA/MEDLINE/R EGISTRY/WPIDS(STN)

Claims (24)

    (57)【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】 SEQ ID NO: 5、6、14〜19および21〜26
    からなる群から選択される配列を含み、共有結合により
    連結した20〜30のヌクレオチドを含んでなるオリゴヌク
    レオチドであって、JNK1タンパク質をコードする核酸と
    特異的にハイブリダイズする配列を有し、前記JNK1タン
    パク質の発現を阻害するオリゴヌクレオチド。
  2. 【請求項2】 共有結合により連結した20〜30のヌクレ
    オチドを含んでなるオリゴヌクレオチドであって、JNK1
    タンパク質をコードする核酸の開始コドンと特異的にハ
    イブリダイズする配列を有し、前記JNK1タンパク質の発
    現を阻害し、そして前記配列がSEQ ID NO:13を含むオリ
    ゴヌクレオチド。
  3. 【請求項3】 SEQ ID NO: 29〜31および34〜41からな
    る群から選択される配列を含み、共有結合により連結し
    た20〜30のヌクレオチドを含んでなるオリゴヌクレオチ
    ドであって、JNK2タンパク質をコードする核酸と特異的
    にハイブリダイズする配列を有し、前記JNK2タンパク質
    の発現を阻害するオリゴヌクレオチド。
  4. 【請求項4】 SEQ ID NO: 46〜51および55〜59からな
    る群から選択される配列を含み、共有結合により連結し
    た20〜30のヌクレオチドを含んでなるオリゴヌクレオチ
    ドであって、JNK3タンパク質をコードする核酸と特異的
    にハイブリダイズする配列を有し、そして前記JNK3タン
    パク質の発現を阻害するオリゴヌクレオチド。
  5. 【請求項5】 オリゴヌクレオチドの共有結合の少なく
    とも1つが修飾された共有結合である、請求項1〜4のい
    ずれか1項のオリゴヌクレオチド。
  6. 【請求項6】 ヌクレオチドの少なくとも1つが修飾さ
    れたヌクレオベースを有する、請求項1〜5のいずれか1
    項のオリゴヌクレオチド。
  7. 【請求項7】 修飾されたヌクレオベースが5-メチルシ
    トシンである、請求項6のオリゴヌクレオチド。
  8. 【請求項8】 ヌクレオチドの少なくとも1つが修飾さ
    れた糖部分である、請求項1〜7のいずれか1項のオリゴ
    ヌクレオチド。
  9. 【請求項9】 修飾された糖部分を有する少なくとも2
    つの非隣接ヌクレオチドを有する、請求項8のオリゴヌ
    クレオチド。
  10. 【請求項10】 修飾された糖部分が2'-修飾された糖
    部分である、請求項8または9のいずれかのオリゴヌクレ
    オチド。
  11. 【請求項11】 2'-修飾糖部分が2'-メトキシエトキシ
    修飾された糖部分である、請求項10のオリゴヌクレオチ
    ド。
  12. 【請求項12】 請求項1〜11のいずれか1項のオリゴヌ
    クレオチドであって、前記オリゴヌクレオチドの細胞取
    込みを増強する少なくとも1つの親油性部分をさらに含
    んでなるオリゴヌクレオチド。
  13. 【請求項13】 JNKタンパク質の異なるイソ型をコー
    ドする2種またはそれ以上の核酸と特異的にハイブリダ
    イズする配列を有し、そして前記JNKタンパク質の前記2
    種またはそれ以上のイソ型の発現を阻害する、請求項1
    〜12のいずれかのオリゴヌクレオチド。
  14. 【請求項14】 JNKタンパク質の第一のイソ型をコー
    ドする核酸と特異的にハイブリダイズする配列を有し、
    前記配列は前記JNKタンパク質の第二のイソ型をコード
    する核酸と特異的にはハイブリダイズせず、そして前記
    JNKタンパク質の前記第一のイソ型の発現を阻害するが
    前記JNKタンパク質の前記第二のイソ型の発現を阻害し
    ない、請求項1〜12のいずれかのオリゴヌクレオチド。
  15. 【請求項15】 JNKタンパク質が哺乳動物のものであ
    る、請求項1〜14のいずれかのオリゴヌクレオチド。
  16. 【請求項16】 細胞または組織におけるJNKタンパク
    質の発現をin vitroで阻害する方法であって、前記細胞
    または組織を請求項1〜15のいずれか1項のオリゴヌクレ
    オチドと接触させることを含んでなる方法。
  17. 【請求項17】 培養細胞またはヒトを除く動物の細胞
    における細胞周期の進行を阻害する方法であって、前記
    細胞に有効量の請求項1〜15のいずれか1項のオリゴヌク
    レオチドを投与することを含んでなる方法。
  18. 【請求項18】 培養細胞またはヒトを除く動物の細胞
    において、JNKタンパク質によりリン酸化されたタンパ
    ク質のリン酸化を阻害する方法であって、前記細胞に有
    効量の請求項1〜15のいずれか1項のオリゴヌクレオチド
    を投与することを含んでなる方法。
  19. 【請求項19】 培養細胞またはヒトを除く動物の細胞
    において、1種またはそれ以上の転移事象を促進する細
    胞タンパク質の発現を阻害する方法であって、前記細胞
    に有効量の請求項1〜15のいずれかのオリゴヌクレオチ
    ドを投与することを含んでなる方法。
  20. 【請求項20】 請求項1〜15のいずれか1項のオリゴヌ
    クレオチドまたはその生物学的同等物、および製剤的に
    許容される担体を含んでなる医薬組成物であって、前記
    生物学的同等物がオリゴヌクレオチドのプロドラッグ、
    もしくはオリゴヌクレオチドまたはプロドラッグの医薬
    的に許容可能な塩である前記医薬組成物。
  21. 【請求項21】 安定化剤、浸透増進剤、担体化合物お
    よび化学療法剤からなる群からの1種またはそれ以上の
    化合物をさらに含んでなる、請求項20の医薬組成物。
  22. 【請求項22】 請求項1〜15のいずれか1項の複数のオ
    リゴヌクレオチドまたはその生物学的同等物、および製
    剤的に許容される担体を含んでなる医薬組成物であっ
    て、前記生物学的同等物がオリゴヌクレオチドのプロド
    ラッグ、もしくはオリゴヌクレオチドまたはプロドラッ
    グの医薬的に許容可能な塩である前記医薬組成物。
  23. 【請求項23】 過剰増殖性の疾患を有するか、有する
    と疑われるか、または有する傾向のある、ヒトを除く動
    物を治療する方法であって、前記動物に予防的または治
    療的有効量の請求項20〜22のいずれか1項の医薬組成物
    を投与することを含んでなる方法。
  24. 【請求項24】 ヒトを除く動物における腫瘍の増殖を
    阻害する方法であって、前記動物に有効量の請求項20〜
    22のいずれか1項の医薬組成物を投与することを含んで
    なる方法。
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