JP3524536B2 - 癌の診断、モニタリング、ステージング、イメージングおよび処置のための新規方法 - Google Patents
癌の診断、モニタリング、ステージング、イメージングおよび処置のための新規方法Info
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Description
【０００１】発明の属する技術分野
本発明の一部は、癌、特に肺癌の検出、診断、モニタリ
ング、ステージング、予後判定、イメージングおよび処
置のための新規に開発されたアッセイに関する。
ング、ステージング、予後判定、イメージングおよび処
置のための新規に開発されたアッセイに関する。
【０００２】背景技術
肺癌は、米国で男性女性両方における２番目に最も多い
種類の癌であり、両方の性における癌による死の最も多
い原因である。肺癌は、肺に由来する原発性腫瘍、また
は、腸管または乳房などの他の器官から播種された二次
性腫瘍に結果することができる。原発性肺癌は、小細胞
肺癌、非小細胞肺癌および中皮腫の３つの主要な種類に
分かれる。小細胞肺癌は、癌細胞が独特のエンバクの形
状をしているため、「エンバク細胞」肺癌とも呼ばれて
いる。非小細胞肺癌には３つの種類がある。これらは、
同様な挙動を示し、処置に対して小細胞肺癌とは異なる
反応をするために共にまとめられている。３つの種類と
は、扁平上皮癌、腺癌および大細胞癌である。扁平上皮
癌は、最も多い種類の肺癌である。それは、気道を裏打
ちする細胞に由来する。腺癌も気道を裏打ちする細胞に
由来する。しかしながら、腺癌は、粘液（痰）を産生す
る特殊な種類の細胞に由来する。大細胞肺癌は、細胞が
顕微鏡下で見たときに大きく丸く見えるためにこのよう
に命名された。中皮腫は、胸膜と呼ばれる肺の被膜を冒
す珍しい種類の癌である。中皮腫はしばしばアスベスト
への暴露により生ずる。
種類の癌であり、両方の性における癌による死の最も多
い原因である。肺癌は、肺に由来する原発性腫瘍、また
は、腸管または乳房などの他の器官から播種された二次
性腫瘍に結果することができる。原発性肺癌は、小細胞
肺癌、非小細胞肺癌および中皮腫の３つの主要な種類に
分かれる。小細胞肺癌は、癌細胞が独特のエンバクの形
状をしているため、「エンバク細胞」肺癌とも呼ばれて
いる。非小細胞肺癌には３つの種類がある。これらは、
同様な挙動を示し、処置に対して小細胞肺癌とは異なる
反応をするために共にまとめられている。３つの種類と
は、扁平上皮癌、腺癌および大細胞癌である。扁平上皮
癌は、最も多い種類の肺癌である。それは、気道を裏打
ちする細胞に由来する。腺癌も気道を裏打ちする細胞に
由来する。しかしながら、腺癌は、粘液（痰）を産生す
る特殊な種類の細胞に由来する。大細胞肺癌は、細胞が
顕微鏡下で見たときに大きく丸く見えるためにこのよう
に命名された。中皮腫は、胸膜と呼ばれる肺の被膜を冒
す珍しい種類の癌である。中皮腫はしばしばアスベスト
への暴露により生ずる。
【０００３】二次性肺癌は、体内のどこか別の部位（例
えば乳房または腸管）で発生し、肺に播種された癌であ
る。二次性肺癌の処置の選択は、該癌がどこで発生した
かに依存する。換言すると、乳房から播種された癌は、
乳癌の処置に反応し、腸管から播種された癌は腸癌の処
置に反応するはずである。癌のステージは、癌がどの程
度まで播種されたかを示す。ステージングは、処置がし
ばしば癌のステージによって決定されるので重要であ
る。ステージングは、非小細胞肺癌と小細胞肺癌で異な
る。
えば乳房または腸管）で発生し、肺に播種された癌であ
る。二次性肺癌の処置の選択は、該癌がどこで発生した
かに依存する。換言すると、乳房から播種された癌は、
乳癌の処置に反応し、腸管から播種された癌は腸癌の処
置に反応するはずである。癌のステージは、癌がどの程
度まで播種されたかを示す。ステージングは、処置がし
ばしば癌のステージによって決定されるので重要であ
る。ステージングは、非小細胞肺癌と小細胞肺癌で異な
る。
【０００４】非小細胞癌は４つのステージに分けること
ができる。ステージＩはリンパ節に癌がない、極めて局
在化した癌である。ステージＩＩの癌は罹患肺の上部の
リンパ節に播種されている。ステージＩＩＩの癌は、癌
が発生した部位の近傍に播種されている。これは、胸
壁、肺の被膜（胸膜）、胸部の中央（縦隔）またはその
他のリンパ節であることができる。ステージＩＶの癌
は、体の他の部位に播種されている。
ができる。ステージＩはリンパ節に癌がない、極めて局
在化した癌である。ステージＩＩの癌は罹患肺の上部の
リンパ節に播種されている。ステージＩＩＩの癌は、癌
が発生した部位の近傍に播種されている。これは、胸
壁、肺の被膜（胸膜）、胸部の中央（縦隔）またはその
他のリンパ節であることができる。ステージＩＶの癌
は、体の他の部位に播種されている。
【０００５】小細胞肺癌は疾患の進行のかなり早期に播
種されるので、小細胞肺癌は、２つの群にのみ分けられ
る。これらは、癌が１つの肺および近傍のリンパ節にし
か見ることができない限局型の疾患、および、癌が肺の
外側の胸部、または、体の他の部位に播種された進展型
の疾患である。さらに、播種がスキャンで明白でない場
合でさえ、いくつかの癌細胞はそこを離れ、血流または
リンパ系を通じて移動していると考えられる。したがっ
て、安全のために、小細胞肺癌は、二次性癌が見られて
も見られなくとも、それらが播種されたものとして処置
することが好ましい。極めて早期の場合を除き、手術は
小細胞肺癌の処置に通常は用いられないため、ステージ
ングは、いくつかの他の種類の癌でのようには重要では
ない。放射線治療を伴うまたは伴わない化学療法がしば
しば使われる。最初に行なわれたスキャンおよびテスト
は、患者が処置にどれだけ反応したかを見るために後に
用いられる。
種されるので、小細胞肺癌は、２つの群にのみ分けられ
る。これらは、癌が１つの肺および近傍のリンパ節にし
か見ることができない限局型の疾患、および、癌が肺の
外側の胸部、または、体の他の部位に播種された進展型
の疾患である。さらに、播種がスキャンで明白でない場
合でさえ、いくつかの癌細胞はそこを離れ、血流または
リンパ系を通じて移動していると考えられる。したがっ
て、安全のために、小細胞肺癌は、二次性癌が見られて
も見られなくとも、それらが播種されたものとして処置
することが好ましい。極めて早期の場合を除き、手術は
小細胞肺癌の処置に通常は用いられないため、ステージ
ングは、いくつかの他の種類の癌でのようには重要では
ない。放射線治療を伴うまたは伴わない化学療法がしば
しば使われる。最初に行なわれたスキャンおよびテスト
は、患者が処置にどれだけ反応したかを見るために後に
用いられる。
【０００６】肺癌の検出、診断、モニタリング、ステー
ジングおよび予後判定のために用いられる手順は、患者
の予後に関してきわめて重要である。例えば、早期の肺
癌と診断された患者の５年生存率は、遠隔転移した肺癌
と診断された患者の生存率に比べ、一般的に大変大き
い。早期肺癌の検出に関してより高感度で特異的な新し
い診断方法が明らかに必要とされている。肺癌患者は最
初の治療の後、および、アジュバント療法の期間中、治
療への反応を決定し、転移の持続性疾患または再発性疾
患を検出するために、緊密にモニタリングされる。肺
癌、その再発および進行の検出に関してより高感度で特
異的な肺癌マーカーが明らかに必要とされている。
ジングおよび予後判定のために用いられる手順は、患者
の予後に関してきわめて重要である。例えば、早期の肺
癌と診断された患者の５年生存率は、遠隔転移した肺癌
と診断された患者の生存率に比べ、一般的に大変大き
い。早期肺癌の検出に関してより高感度で特異的な新し
い診断方法が明らかに必要とされている。肺癌患者は最
初の治療の後、および、アジュバント療法の期間中、治
療への反応を決定し、転移の持続性疾患または再発性疾
患を検出するために、緊密にモニタリングされる。肺
癌、その再発および進行の検出に関してより高感度で特
異的な肺癌マーカーが明らかに必要とされている。
【０００７】肺癌の管理におけるその他の重要なステッ
プは、患者の疾患のステージを決定すること、すなわ
ち、ステージング（病期分類）である。ステージの決定
は、潜在的な予後判定価値を有しており、最適な治療の
設計のために基準を提供する。一般的に、肺癌の病理学
的ステージングは、臨床ステージングよりも好まれる
が、これは前者がより正確な予後判定を与えるからであ
る。しかしながら、臨床ステージングは、病理学的評価
のために組織を採取する侵襲的な手順に依存しないた
め、もしそれが病理学的ステージングと同程度に正確な
ものであれば、好ましいだろう。細胞、組織または体液
において、異なる浸潤ステージ間を差別化できる新しい
マーカーを検出することにより肺癌のステージングを改
善することができるだろう。
プは、患者の疾患のステージを決定すること、すなわ
ち、ステージング（病期分類）である。ステージの決定
は、潜在的な予後判定価値を有しており、最適な治療の
設計のために基準を提供する。一般的に、肺癌の病理学
的ステージングは、臨床ステージングよりも好まれる
が、これは前者がより正確な予後判定を与えるからであ
る。しかしながら、臨床ステージングは、病理学的評価
のために組織を採取する侵襲的な手順に依存しないた
め、もしそれが病理学的ステージングと同程度に正確な
ものであれば、好ましいだろう。細胞、組織または体液
において、異なる浸潤ステージ間を差別化できる新しい
マーカーを検出することにより肺癌のステージングを改
善することができるだろう。
【０００８】本明細書に参照として組込まれている米国
特許第５，８７７，２９０号および米国特許第５，８３
７，４９８号は、ヒトスタニウス小体、スタニオカルシ
ンポリペプチドおよびこのポリペプチドをコードする核
酸配列を開示している。また、このポリペプチドを電解
質異常および骨吸収の亢進による異常の処置などの治療
目的に用いる方法も開示されている。
特許第５，８７７，２９０号および米国特許第５，８３
７，４９８号は、ヒトスタニウス小体、スタニオカルシ
ンポリペプチドおよびこのポリペプチドをコードする核
酸配列を開示している。また、このポリペプチドを電解
質異常および骨吸収の亢進による異常の処置などの治療
目的に用いる方法も開示されている。
【０００９】本明細書でＬｎｇ１０８と呼んでいるこの
ポリペプチドおよびこのポリペプチドをコードする核酸
が、癌の診断用マーカーであることが現在見出されてい
る。したがって、本発明では、Ｌｎｇ１０８を介した癌
の検出、診断、モニタリング、ステージング、予後判
定、in vivoでのイメージングおよび処置のための方法
が提供されている。Ｌｎｇ１０８は、中でも、配列番号
１または２のポリヌクレオチド配列を含む遺伝子により
発現される天然のタンパク質に関する。それによりコー
ドされるポリペプチドのアミノ酸配列を推測したもの
を、配列番号３に記述した。本明細書で「Ｌｎｇ１０
８」はまた、遺伝コードの縮重により、配列番号１また
は２に比べて異なる核酸配列を含むが、同じタンパク質
をコードしているポリヌクレオチドも意味する。別の側
面では、本明細書で用いるＬｎｇ１０８により意味され
るものは、配列番号１または２を含む遺伝子によりコー
ドされる天然のｍＲＮＡを意味し、または、配列番号１
または２を含む現在の遺伝子、または、配列番号１また
は２のアンチセンス配列にストリンジェントな条件下で
ハイブリダイズすることが可能なポリヌクレオチドのレ
ベルに関し得る。
ポリペプチドおよびこのポリペプチドをコードする核酸
が、癌の診断用マーカーであることが現在見出されてい
る。したがって、本発明では、Ｌｎｇ１０８を介した癌
の検出、診断、モニタリング、ステージング、予後判
定、in vivoでのイメージングおよび処置のための方法
が提供されている。Ｌｎｇ１０８は、中でも、配列番号
１または２のポリヌクレオチド配列を含む遺伝子により
発現される天然のタンパク質に関する。それによりコー
ドされるポリペプチドのアミノ酸配列を推測したもの
を、配列番号３に記述した。本明細書で「Ｌｎｇ１０
８」はまた、遺伝コードの縮重により、配列番号１また
は２に比べて異なる核酸配列を含むが、同じタンパク質
をコードしているポリヌクレオチドも意味する。別の側
面では、本明細書で用いるＬｎｇ１０８により意味され
るものは、配列番号１または２を含む遺伝子によりコー
ドされる天然のｍＲＮＡを意味し、または、配列番号１
または２を含む現在の遺伝子、または、配列番号１また
は２のアンチセンス配列にストリンジェントな条件下で
ハイブリダイズすることが可能なポリヌクレオチドのレ
ベルに関し得る。
【００１０】本発明のその他の目的、特徴、利点および
側面は、以下の説明により当業者に明らかになるだろ
う。しかしながら、以下の説明および具体例は、本発明
の好ましい態様を示しているが、ただ説明のためにのみ
与えられていると理解されるべきである。本開示発明の
精神および範囲内の様々な変化および変更は、以下の説
明を読み、本開示の他の部分を読むことにより、当業者
に容易に明らかになるだろう。
側面は、以下の説明により当業者に明らかになるだろ
う。しかしながら、以下の説明および具体例は、本発明
の好ましい態様を示しているが、ただ説明のためにのみ
与えられていると理解されるべきである。本開示発明の
精神および範囲内の様々な変化および変更は、以下の説
明を読み、本開示の他の部分を読むことにより、当業者
に容易に明らかになるだろう。
【００１１】本発明の概要
これらおよびその他の目標のため、本発明の目的は、細
胞、組織または体液におけるＬｎｇ１０８のレベルを、
正常ヒト対照の好ましくは同種の細胞、組織または体液
におけるＬｎｇ１０８のレベルと比較した場合の変化を
分析することにより癌の存在を診断するための方法を提
供することであって、ここでは患者におけるＬｎｇ１０
８レベルの正常ヒト対照に対する変化が癌に関係してい
る。
胞、組織または体液におけるＬｎｇ１０８のレベルを、
正常ヒト対照の好ましくは同種の細胞、組織または体液
におけるＬｎｇ１０８のレベルと比較した場合の変化を
分析することにより癌の存在を診断するための方法を提
供することであって、ここでは患者におけるＬｎｇ１０
８レベルの正常ヒト対照に対する変化が癌に関係してい
る。
【００１２】転移を有するとは知られていない癌を有す
る患者において、転移している癌を有する疑いのあるヒ
ト患者を特定し、このような患者からの細胞、組織また
は体液試料をＬｎｇ１０８について分析し、このような
細胞、組織または体液におけるＬｎｇ１０８のレベルを
正常ヒト対照の好ましくは同種の細胞、組織または体液
におけるＬｎｇ１０８のレベルと比較することにより、
転移性の癌を診断する方法がさらに提供され、ここでは
患者におけるＬｎｇ１０８のレベルの正常ヒト対照に対
する増加が転移した癌に関係している。
る患者において、転移している癌を有する疑いのあるヒ
ト患者を特定し、このような患者からの細胞、組織また
は体液試料をＬｎｇ１０８について分析し、このような
細胞、組織または体液におけるＬｎｇ１０８のレベルを
正常ヒト対照の好ましくは同種の細胞、組織または体液
におけるＬｎｇ１０８のレベルと比較することにより、
転移性の癌を診断する方法がさらに提供され、ここでは
患者におけるＬｎｇ１０８のレベルの正常ヒト対照に対
する増加が転移した癌に関係している。
【００１３】また本発明により、癌を有するヒトにおい
て、癌を有するヒト患者を特定し、このような患者から
の細胞、組織または体液試料をＬｎｇ１０８について分
析し、このような細胞、組織または体液におけるＬｎｇ
１０８のレベルを正常ヒト対照の好ましくは同種の細
胞、組織または体液におけるＬｎｇ１０８のレベルと比
較することにより、癌をステージングする方法も提供さ
れ、ここでは患者におけるＬｎｇ１０８のレベルの正常
ヒト対照に対する増加が進行している癌に関係し、そし
て、Ｌｎｇ１０８レベルの減少が消退しているまたは寛
解期にある癌に関係している。
て、癌を有するヒト患者を特定し、このような患者から
の細胞、組織または体液試料をＬｎｇ１０８について分
析し、このような細胞、組織または体液におけるＬｎｇ
１０８のレベルを正常ヒト対照の好ましくは同種の細
胞、組織または体液におけるＬｎｇ１０８のレベルと比
較することにより、癌をステージングする方法も提供さ
れ、ここでは患者におけるＬｎｇ１０８のレベルの正常
ヒト対照に対する増加が進行している癌に関係し、そし
て、Ｌｎｇ１０８レベルの減少が消退しているまたは寛
解期にある癌に関係している。
【００１４】さらに、ヒト患者における癌を、転移の開
始についてモニタリングする方法が提供される。該方法
は、転移を有するとは知られていない癌を有するヒト患
者を特定し、このような患者からの細胞、組織または体
液試料をＬｎｇ１０８について定期的に分析し、このよ
うな細胞、組織または体液におけるＬｎｇ１０８のレベ
ルを正常ヒト対照の好ましくは同種の細胞、組織または
体液試料におけるＬｎｇ１０８のレベルと比較すること
を含み、ここでは患者におけるＬｎｇ１０８のレベルの
正常ヒト対照に対する増加が転移した癌に関係してい
る。
始についてモニタリングする方法が提供される。該方法
は、転移を有するとは知られていない癌を有するヒト患
者を特定し、このような患者からの細胞、組織または体
液試料をＬｎｇ１０８について定期的に分析し、このよ
うな細胞、組織または体液におけるＬｎｇ１０８のレベ
ルを正常ヒト対照の好ましくは同種の細胞、組織または
体液試料におけるＬｎｇ１０８のレベルと比較すること
を含み、ここでは患者におけるＬｎｇ１０８のレベルの
正常ヒト対照に対する増加が転移した癌に関係してい
る。
【００１５】さらに、ヒト患者における癌のステージの
変化を、該患者のＬｎｇ１０８レベルを調べることによ
りモニタリングする方法が提供される。該方法は、癌を
有するヒト患者を特定し、このような患者からの細胞、
組織または体液試料をＬｎｇ１０８について定期的に分
析し、このような細胞、組織または体液におけるＬｎｇ
１０８のレベルを正常ヒト対照の好ましくは同種の細
胞、組織または体液試料におけるＬｎｇ１０８のレベル
と比較することを含み、ここで患者におけるＬｎｇ１０
８のレベルの正常ヒト対照に対する増加が進行している
癌に関係し、そして、Ｌｎｇ１０８のレベルの減少が消
退しているまたは寛解期にある癌に関係する。
変化を、該患者のＬｎｇ１０８レベルを調べることによ
りモニタリングする方法が提供される。該方法は、癌を
有するヒト患者を特定し、このような患者からの細胞、
組織または体液試料をＬｎｇ１０８について定期的に分
析し、このような細胞、組織または体液におけるＬｎｇ
１０８のレベルを正常ヒト対照の好ましくは同種の細
胞、組織または体液試料におけるＬｎｇ１０８のレベル
と比較することを含み、ここで患者におけるＬｎｇ１０
８のレベルの正常ヒト対照に対する増加が進行している
癌に関係し、そして、Ｌｎｇ１０８のレベルの減少が消
退しているまたは寛解期にある癌に関係する。
【００１６】さらに、癌のイメージングおよび処置に用
いるためのＬｎｇ１０８を標的にした新しい治療剤の設
計方法が提供される。例えば、１つの態様では、Ｌｎｇ
１０８を標的にした抗体またはこのような抗体の断片な
どの治療剤は、疾患または状態を検出または診断する目
的で、患者におけるＬｎｇ１０８の局在を検出またはイ
メージ化するために用いることができる。このような抗
体は、ポリクローナル、モノクローナルまたはオムニク
ローナル（omniclonal）であることができ、または分子
生物学的技術により調製することができる。ここで、そ
して、本明細書を通じて用いる場合、「抗体」という用
語はまた、ＳＥＬＥＸと呼ばれる当業者によく知られた
in vitroでの進化手順(evolution protocol)により誘導
されたものなどのアプタマーおよび一本鎖オリゴヌクレ
オチドを含むこととする。抗体は、放射性同位体および
常磁性金属を含むがこれらに限定されない様々な検出可
能な標識で標識することができる。また、Ｌｎｇ１０８
の濃度および／または活性を減少させる小分子および抗
体などの治療剤を、Ｌｎｇ１０８の発現を特徴とする疾
患の処置に用いることができる。このような剤は、本明
細書の教示に従い容易に同定することができる。
いるためのＬｎｇ１０８を標的にした新しい治療剤の設
計方法が提供される。例えば、１つの態様では、Ｌｎｇ
１０８を標的にした抗体またはこのような抗体の断片な
どの治療剤は、疾患または状態を検出または診断する目
的で、患者におけるＬｎｇ１０８の局在を検出またはイ
メージ化するために用いることができる。このような抗
体は、ポリクローナル、モノクローナルまたはオムニク
ローナル（omniclonal）であることができ、または分子
生物学的技術により調製することができる。ここで、そ
して、本明細書を通じて用いる場合、「抗体」という用
語はまた、ＳＥＬＥＸと呼ばれる当業者によく知られた
in vitroでの進化手順(evolution protocol)により誘導
されたものなどのアプタマーおよび一本鎖オリゴヌクレ
オチドを含むこととする。抗体は、放射性同位体および
常磁性金属を含むがこれらに限定されない様々な検出可
能な標識で標識することができる。また、Ｌｎｇ１０８
の濃度および／または活性を減少させる小分子および抗
体などの治療剤を、Ｌｎｇ１０８の発現を特徴とする疾
患の処置に用いることができる。このような剤は、本明
細書の教示に従い容易に同定することができる。
【００１７】本発明のその他の目的、特徴、利点および
側面は、以下の説明により当業者に明らかになるだろ
う。しかしながら、以下の説明および具体例は、本発明
の好ましい態様を示しているが、ただ説明のためにのみ
与えられていると理解されるべきである。本開示発明の
精神および範囲内の様々な変化および変更は、以下の説
明を読み、本開示の他の部分を読むことにより、当業者
に容易に明らかになるだろう。
側面は、以下の説明により当業者に明らかになるだろ
う。しかしながら、以下の説明および具体例は、本発明
の好ましい態様を示しているが、ただ説明のためにのみ
与えられていると理解されるべきである。本開示発明の
精神および範囲内の様々な変化および変更は、以下の説
明を読み、本開示の他の部分を読むことにより、当業者
に容易に明らかになるだろう。
【００１８】本発明は、Ｌｎｇ１０８のレベルを正常ヒ
ト対照におけるＬｎｇ１０８のレベルと比較することに
より、癌の検出、診断、モニタリング、ステージング、
予後判定、in vivoでのイメージングおよび処置のため
の量的および質的な診断アッセイおよび診断方法に関す
る。Ｌｎｇ１０８は、中でも、配列番号１または２のポ
リヌクレオチド配列を含む遺伝子により発現される天然
のタンパク質に関する。それによりコードされるポリペ
プチドのアミノ酸配列を推測したものを、配列番号３に
記述した。本明細書で「Ｌｎｇ１０８」はまた、遺伝子
コーディングの縮重により、配列番号１または２とは異
なる核酸配列を含むが、同じタンパク質をコードしてい
るポリヌクレオチドも意味する。別の側面では、本明細
書で用いるＬｎｇ１０８により意味されるものは、配列
番号１または２を含む遺伝子によりコードされる天然の
ｍＲＮＡを意味し、または、配列番号１または２を含む
現在の遺伝子、または、配列番号１または２のアンチセ
ンス配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズ
することが可能なポリヌクレオチドのレベルに関し得
る。このようなレベルは好ましくは、細胞、組織および
／または体液のうちの少なくとも１つにおいて測定し、
正常および異常レベルの決定を含む。したがって、例え
ば、正常対照の体液、細胞または組織試料に比較したＬ
ｎｇ１０８の過剰発現を診断するための本発明による診
断アッセイは、肺癌を含む癌の存在を診断するのに用い
てもよい。Ｌｎｇ１０８は、本発明の方法においては単
独で測定しても、または、より好ましくは、他の癌の診
断マーカーと組合せて測定してもよい。したがって、本
発明の方法は、Ｌｎｇ１０８と同様に他の癌マーカーの
レベルの測定と組合せて使うことが好ましい。本発明に
有用な、Ｌｎｇ１０８以外の他の癌マーカーは、当業者
に知られており、テストする癌に依存するだろう。
ト対照におけるＬｎｇ１０８のレベルと比較することに
より、癌の検出、診断、モニタリング、ステージング、
予後判定、in vivoでのイメージングおよび処置のため
の量的および質的な診断アッセイおよび診断方法に関す
る。Ｌｎｇ１０８は、中でも、配列番号１または２のポ
リヌクレオチド配列を含む遺伝子により発現される天然
のタンパク質に関する。それによりコードされるポリペ
プチドのアミノ酸配列を推測したものを、配列番号３に
記述した。本明細書で「Ｌｎｇ１０８」はまた、遺伝子
コーディングの縮重により、配列番号１または２とは異
なる核酸配列を含むが、同じタンパク質をコードしてい
るポリヌクレオチドも意味する。別の側面では、本明細
書で用いるＬｎｇ１０８により意味されるものは、配列
番号１または２を含む遺伝子によりコードされる天然の
ｍＲＮＡを意味し、または、配列番号１または２を含む
現在の遺伝子、または、配列番号１または２のアンチセ
ンス配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズ
することが可能なポリヌクレオチドのレベルに関し得
る。このようなレベルは好ましくは、細胞、組織および
／または体液のうちの少なくとも１つにおいて測定し、
正常および異常レベルの決定を含む。したがって、例え
ば、正常対照の体液、細胞または組織試料に比較したＬ
ｎｇ１０８の過剰発現を診断するための本発明による診
断アッセイは、肺癌を含む癌の存在を診断するのに用い
てもよい。Ｌｎｇ１０８は、本発明の方法においては単
独で測定しても、または、より好ましくは、他の癌の診
断マーカーと組合せて測定してもよい。したがって、本
発明の方法は、Ｌｎｇ１０８と同様に他の癌マーカーの
レベルの測定と組合せて使うことが好ましい。本発明に
有用な、Ｌｎｇ１０８以外の他の癌マーカーは、当業者
に知られており、テストする癌に依存するだろう。
【００１９】Ｌｎｇ１０８の検出は、肺癌において特に
有用である。しかしながら、このマーカーはまた、他の
種類の癌の診断、予後判定、ステージング、イメージン
グおよび処置にも有用である。
有用である。しかしながら、このマーカーはまた、他の
種類の癌の診断、予後判定、ステージング、イメージン
グおよび処置にも有用である。
【００２０】診断アッセイ
本発明は、細胞、組織または体液におけるＬｎｇ１０８
のレベルの、正常ヒト対照からの好ましくは同種の細
胞、組織または体液におけるＬｎｇ１０８のレベルと比
較した場合の変化を分析することにより、肺癌を含む癌
の存在を診断する方法を提供し、ここで患者におけるＬ
ｎｇ１０８のレベルの正常ヒト対照に対する増加が癌の
存在に関係している。本発明を限定することなく、量的
診断アッセイにおいては、通常、テストした患者が癌を
有することを示す陽性結果は、細胞、組織または体液に
おけるＬｎｇ１０８などの癌マーカーのレベルが、正常
ヒト対照の好ましくは同じ細胞、組織または体液におけ
るより、少なくとも２倍高い、最も好ましくは５倍高い
結果である。
のレベルの、正常ヒト対照からの好ましくは同種の細
胞、組織または体液におけるＬｎｇ１０８のレベルと比
較した場合の変化を分析することにより、肺癌を含む癌
の存在を診断する方法を提供し、ここで患者におけるＬ
ｎｇ１０８のレベルの正常ヒト対照に対する増加が癌の
存在に関係している。本発明を限定することなく、量的
診断アッセイにおいては、通常、テストした患者が癌を
有することを示す陽性結果は、細胞、組織または体液に
おけるＬｎｇ１０８などの癌マーカーのレベルが、正常
ヒト対照の好ましくは同じ細胞、組織または体液におけ
るより、少なくとも２倍高い、最も好ましくは５倍高い
結果である。
【００２１】本発明はまた、まだ転移していない癌を有
する患者において、転移性の肺癌を含む転移性の癌を診
断する方法も提供する。本発明の方法では、転移した可
能性のある（しかし、事前に転移したことが知られてい
ない）癌を有する疑いのある患者を特定する。これは、
当業者に知られた様々な手段によって達成される。本発
明において、細胞、組織または体液におけるＬｎｇ１０
８の存在を決定することは、転移していない癌と転移し
た癌とを区別するのに特に有用である。既存の技術は、
転移した癌と転移していない癌とを区別することが困難
であり、適切な処置の選択はしばしばこうした知識に依
存している。
する患者において、転移性の肺癌を含む転移性の癌を診
断する方法も提供する。本発明の方法では、転移した可
能性のある（しかし、事前に転移したことが知られてい
ない）癌を有する疑いのある患者を特定する。これは、
当業者に知られた様々な手段によって達成される。本発
明において、細胞、組織または体液におけるＬｎｇ１０
８の存在を決定することは、転移していない癌と転移し
た癌とを区別するのに特に有用である。既存の技術は、
転移した癌と転移していない癌とを区別することが困難
であり、適切な処置の選択はしばしばこうした知識に依
存している。
【００２２】本発明では、ヒト患者の細胞、組織または
体液において測定された癌マーカーレベルの１つはＬｎ
ｇ１０８である。ヒト患者におけるレベルは、正常ヒト
対照の好ましくは同種の細胞、組織または体液における
Ｌｎｇ１０８レベルと比較される。つまり、観察された
癌マーカーが血清中のＬｎｇ１０８である場合、このレ
ベルは好ましくは正常ヒト対照の血清中のＬｎｇ１０８
レベルと比較される。ヒト患者におけるＬｎｇ１０８の
正常ヒト対照に対する増加は、転移した癌と関係してい
る。
体液において測定された癌マーカーレベルの１つはＬｎ
ｇ１０８である。ヒト患者におけるレベルは、正常ヒト
対照の好ましくは同種の細胞、組織または体液における
Ｌｎｇ１０８レベルと比較される。つまり、観察された
癌マーカーが血清中のＬｎｇ１０８である場合、このレ
ベルは好ましくは正常ヒト対照の血清中のＬｎｇ１０８
レベルと比較される。ヒト患者におけるＬｎｇ１０８の
正常ヒト対照に対する増加は、転移した癌と関係してい
る。
【００２３】本発明を限定することなく、量的診断アッ
セイにおいては、通常、テストしたまたはモニタリング
した患者の癌が転移したことを示す陽性結果は、細胞、
組織または体液におけるＬｎｇ１０８などの癌マーカー
のレベルが、正常ヒト対照の好ましくは同じ細胞、組織
または体液におけるより、少なくとも２倍高い、最も好
ましくは５倍高い結果である。ここで用いる正常ヒト対
照は、癌のないヒト患者および／または患者からの非癌
性試料を含む。転移の診断またはモニタリングの方法に
おいて、正常ヒト対照はまた、転移していない肺癌など
の癌を有することが信頼できる方法で決定されたヒト患
者からの試料を含むことが好ましいだろう。
セイにおいては、通常、テストしたまたはモニタリング
した患者の癌が転移したことを示す陽性結果は、細胞、
組織または体液におけるＬｎｇ１０８などの癌マーカー
のレベルが、正常ヒト対照の好ましくは同じ細胞、組織
または体液におけるより、少なくとも２倍高い、最も好
ましくは５倍高い結果である。ここで用いる正常ヒト対
照は、癌のないヒト患者および／または患者からの非癌
性試料を含む。転移の診断またはモニタリングの方法に
おいて、正常ヒト対照はまた、転移していない肺癌など
の癌を有することが信頼できる方法で決定されたヒト患
者からの試料を含むことが好ましいだろう。
【００２４】ステージング
本発明はまた、ヒト患者において癌をステージングする
方法も提供する。該方法は、癌を有するヒト患者を特定
し、このような患者の細胞、組織または体液試料をＬｎ
ｇ１０８について分析することを含む。測定したＬｎｇ
１０８のレベルは、次に、正常ヒト対照の好ましくは同
種の細胞、組織または体液におけるＬｎｇ１０８レベル
と比較され、ここでヒト患者におけるＬｎｇ１０８のレ
ベルの正常ヒト対照に対する増加が進行している癌に関
係し、そして、Ｌｎｇ１０８のレベルの減少が消退して
いるまたは寛解期にある癌に関係する。
方法も提供する。該方法は、癌を有するヒト患者を特定
し、このような患者の細胞、組織または体液試料をＬｎ
ｇ１０８について分析することを含む。測定したＬｎｇ
１０８のレベルは、次に、正常ヒト対照の好ましくは同
種の細胞、組織または体液におけるＬｎｇ１０８レベル
と比較され、ここでヒト患者におけるＬｎｇ１０８のレ
ベルの正常ヒト対照に対する増加が進行している癌に関
係し、そして、Ｌｎｇ１０８のレベルの減少が消退して
いるまたは寛解期にある癌に関係する。
【００２５】モニタリング
さらに提供されるのは、ヒト患者における癌を、転移の
開始についてモニタリングする方法である。該方法は、
転移を有するとは知られていない癌を有するヒト患者を
特定し、このような患者からの細胞、組織または体液を
Ｌｎｇ１０８について定期的に分析し、そして、このよ
うな細胞、組織または体液におけるＬｎｇ１０８のレベ
ルを正常ヒト対照の好ましくは同種の細胞、組織または
体液におけるＬｎｇ１０８のレベルと比較することを含
み、ここで患者におけるＬｎｇ１０８のレベルの正常ヒ
ト対照に対する増加が転移した癌に関係する。
開始についてモニタリングする方法である。該方法は、
転移を有するとは知られていない癌を有するヒト患者を
特定し、このような患者からの細胞、組織または体液を
Ｌｎｇ１０８について定期的に分析し、そして、このよ
うな細胞、組織または体液におけるＬｎｇ１０８のレベ
ルを正常ヒト対照の好ましくは同種の細胞、組織または
体液におけるＬｎｇ１０８のレベルと比較することを含
み、ここで患者におけるＬｎｇ１０８のレベルの正常ヒ
ト対照に対する増加が転移した癌に関係する。
【００２６】本発明によりさらに提供されるのは、癌の
ステージの変化をモニタリングする方法である。該方法
は、癌を有するヒト患者を特定し、このような患者から
の細胞、組織または体液をＬｎｇ１０８について定期的
に分析し、そしてこのような細胞、組織または体液にお
けるＬｎｇ１０８のレベルを正常ヒト対照の好ましくは
同種の細胞、組織または体液におけるＬｎｇ１０８のレ
ベルと比較することを含み、ここで患者におけるＬｎｇ
１０８のレベルの正常ヒト対照に対する増加がステージ
の進行している癌に関係し、そして、Ｌｎｇ１０８のレ
ベルの減少がステージの後退しているまたは寛解期にあ
る癌に関係する。
ステージの変化をモニタリングする方法である。該方法
は、癌を有するヒト患者を特定し、このような患者から
の細胞、組織または体液をＬｎｇ１０８について定期的
に分析し、そしてこのような細胞、組織または体液にお
けるＬｎｇ１０８のレベルを正常ヒト対照の好ましくは
同種の細胞、組織または体液におけるＬｎｇ１０８のレ
ベルと比較することを含み、ここで患者におけるＬｎｇ
１０８のレベルの正常ヒト対照に対する増加がステージ
の進行している癌に関係し、そして、Ｌｎｇ１０８のレ
ベルの減少がステージの後退しているまたは寛解期にあ
る癌に関係する。
【００２７】このような患者を転移の開始についてモニ
タリングする場合は、定期的に、そして好ましくは年４
回を基礎に行なう。しかしながら、癌、特定の患者、お
よび癌のステージによってはより高頻度に、または、よ
り低頻度に行なってもよい。
タリングする場合は、定期的に、そして好ましくは年４
回を基礎に行なう。しかしながら、癌、特定の患者、お
よび癌のステージによってはより高頻度に、または、よ
り低頻度に行なってもよい。
【００２８】予後判定テストおよび臨床試験のモニタリ
ング ここに記載した方法は、さらに、Ｌｎｇ１０８のレベル
の増加に関係する疾患または異常を有するかまたは進行
させる危険がある対象を特定するための予後判定アッセ
イに用いることができる。本発明は、テスト試料がＬｎ
ｇ１０８が検出されたヒト患者から得られたものである
方法を提供する。正常ヒト対照に比較して高いレベルの
Ｌｎｇ１０８の存在は、該ヒト患者が癌、特に肺癌を進
行させる危険があるという診断である。
ング ここに記載した方法は、さらに、Ｌｎｇ１０８のレベル
の増加に関係する疾患または異常を有するかまたは進行
させる危険がある対象を特定するための予後判定アッセ
イに用いることができる。本発明は、テスト試料がＬｎ
ｇ１０８が検出されたヒト患者から得られたものである
方法を提供する。正常ヒト対照に比較して高いレベルの
Ｌｎｇ１０８の存在は、該ヒト患者が癌、特に肺癌を進
行させる危険があるという診断である。
【００２９】Ｌｎｇ１０８の発現または活性を減少させ
る治療剤の有効性はまた、臨床試験でのヒト患者、また
は、ヒト細胞などにおけるin vitroのスクリーニングア
ッセイおけるＬｎｇ１０８の発現レベルを分析すること
によりモニタリングできる。このように、遺伝子発現パ
ターンは、ヒト患者、または、場合によっては細胞の、
テストされた剤への生理学的反応を示すマーカーとして
利用できる。
る治療剤の有効性はまた、臨床試験でのヒト患者、また
は、ヒト細胞などにおけるin vitroのスクリーニングア
ッセイおけるＬｎｇ１０８の発現レベルを分析すること
によりモニタリングできる。このように、遺伝子発現パ
ターンは、ヒト患者、または、場合によっては細胞の、
テストされた剤への生理学的反応を示すマーカーとして
利用できる。
【００３０】遺伝子の損傷または突然変異の検出
本発明の方法は、Ｌｎｇ１０８における遺伝子損傷また
は突然変異を検出し、それにより遺伝子損傷を有するヒ
トが癌の危険を有するか、または、癌、特に肺癌を有す
るか決定することにも用いることができる。遺伝子の損
傷は、例えば、Ｌｎｇ１０８からの１個または２個以上
のヌクレオチドの欠失および／または付加および／また
は置換の存在、Ｌｎｇ１０８の染色体再構成の存在、Ｌ
ｎｇ１０８の異常修飾（ゲノムＤＮＡのメチル化パター
ンなど）、Ｌｎｇ１０８のｍＲＮＡ転写物の非野生型ス
プライシングパターンの存在、Ｌｎｇ１０８の対立遺伝
子の欠失、および／またはＬｎｇ１０８タンパク質の不
適切な翻訳後修飾の存在を確認することにより検出でき
る。Ｌｎｇ１０８におけるこのような損傷を検出する方
法は、当業者に知られている。
は突然変異を検出し、それにより遺伝子損傷を有するヒ
トが癌の危険を有するか、または、癌、特に肺癌を有す
るか決定することにも用いることができる。遺伝子の損
傷は、例えば、Ｌｎｇ１０８からの１個または２個以上
のヌクレオチドの欠失および／または付加および／また
は置換の存在、Ｌｎｇ１０８の染色体再構成の存在、Ｌ
ｎｇ１０８の異常修飾（ゲノムＤＮＡのメチル化パター
ンなど）、Ｌｎｇ１０８のｍＲＮＡ転写物の非野生型ス
プライシングパターンの存在、Ｌｎｇ１０８の対立遺伝
子の欠失、および／またはＬｎｇ１０８タンパク質の不
適切な翻訳後修飾の存在を確認することにより検出でき
る。Ｌｎｇ１０８におけるこのような損傷を検出する方
法は、当業者に知られている。
【００３１】アッセイ技術
ヒト由来の試料において、本発明のＬｎｇ１０８などの
遺伝子発現レベルを決定するのに用いることができるア
ッセイ技術は当業者によく知られている。このようなア
ッセイ方法は、ラジオイムノアッセイ、逆転写酵素ＰＣ
Ｒ（ＲＴ‐ＰＣＲ）アッセイ、免疫組織化学アッセイ、
in situハイブリダイゼーションアッセイ、結合蛋白競
合アッセイ、ウェスタンブロット分析、ＥＬＩＳＡアッ
セイおよびプロテオミクスアプローチ（proteomic appr
oache）を含む。これらの中で、ＥＬＩＳＡが、生物学
的液体における遺伝子の発現タンパク質の診断に好まれ
ることが多い。
遺伝子発現レベルを決定するのに用いることができるア
ッセイ技術は当業者によく知られている。このようなア
ッセイ方法は、ラジオイムノアッセイ、逆転写酵素ＰＣ
Ｒ（ＲＴ‐ＰＣＲ）アッセイ、免疫組織化学アッセイ、
in situハイブリダイゼーションアッセイ、結合蛋白競
合アッセイ、ウェスタンブロット分析、ＥＬＩＳＡアッ
セイおよびプロテオミクスアプローチ（proteomic appr
oache）を含む。これらの中で、ＥＬＩＳＡが、生物学
的液体における遺伝子の発現タンパク質の診断に好まれ
ることが多い。
【００３２】もし商業的に容易に入手できない場合、Ｅ
ＬＩＳＡ分析は、最初に、Ｌｎｇ１０８に特異的な抗
体、好ましくはモノクローナル抗体の調製を含む。さら
に、一般的に、Ｌｎｇ１０８に特異的に結合するレポー
ター抗体が調製される。レポーター抗体は、放射性試
薬、蛍光試薬または例えば西洋ワサビペルオキシダーゼ
酵素またはアルカリホスファターゼなどの酵素試薬など
の検出可能な試薬に付着している。
ＬＩＳＡ分析は、最初に、Ｌｎｇ１０８に特異的な抗
体、好ましくはモノクローナル抗体の調製を含む。さら
に、一般的に、Ｌｎｇ１０８に特異的に結合するレポー
ター抗体が調製される。レポーター抗体は、放射性試
薬、蛍光試薬または例えば西洋ワサビペルオキシダーゼ
酵素またはアルカリホスファターゼなどの酵素試薬など
の検出可能な試薬に付着している。
【００３３】ＥＬＩＳＡを行なう場合、Ｌｎｇ１０８に
特異的な抗体は、例えばポリスチレンディッシュなど
の、抗体を結合する固形支持体上でインキュベートされ
る。次に、ディッシュ上の任意の遊離タンパク質結合部
位（free protein binding sites）は、ウシ血清アルブ
ミンなどの非特異的タンパク質とインキュベートするこ
とにより被覆される。次に、分析される試料は、Ｌｎｇ
１０８がポリスチレンディッシュに付着した特異抗体に
結合する時間中、ディッシュ内でインキュベートされ
る。非結合試料はバッファーで洗い流される。Ｌｎｇ１
０８を特異的に指向し、西洋ワサビペルオキシダーゼな
どの検出可能な試薬を連結したレポーター抗体がディッ
シュ内に設置され、該レポーター抗体がＬｎｇ１０８に
結合した任意のモノクローナル抗体に結合する。次に非
付着レポーター抗体が洗い流される。比色基質を含むペ
ルオキシダーゼ活性のための試薬が、次にディッシュに
加えられる。Ｌｎｇ１０８抗体に連結した、固定化した
ペルオキシダーゼが着色反応産物を産生する。所定の時
間内に発生した色素の量は、試料中のＬｎｇ１０８タン
パク質の量に比例している。量的な結果は、通常標準曲
線を参照して得られる。
特異的な抗体は、例えばポリスチレンディッシュなど
の、抗体を結合する固形支持体上でインキュベートされ
る。次に、ディッシュ上の任意の遊離タンパク質結合部
位（free protein binding sites）は、ウシ血清アルブ
ミンなどの非特異的タンパク質とインキュベートするこ
とにより被覆される。次に、分析される試料は、Ｌｎｇ
１０８がポリスチレンディッシュに付着した特異抗体に
結合する時間中、ディッシュ内でインキュベートされ
る。非結合試料はバッファーで洗い流される。Ｌｎｇ１
０８を特異的に指向し、西洋ワサビペルオキシダーゼな
どの検出可能な試薬を連結したレポーター抗体がディッ
シュ内に設置され、該レポーター抗体がＬｎｇ１０８に
結合した任意のモノクローナル抗体に結合する。次に非
付着レポーター抗体が洗い流される。比色基質を含むペ
ルオキシダーゼ活性のための試薬が、次にディッシュに
加えられる。Ｌｎｇ１０８抗体に連結した、固定化した
ペルオキシダーゼが着色反応産物を産生する。所定の時
間内に発生した色素の量は、試料中のＬｎｇ１０８タン
パク質の量に比例している。量的な結果は、通常標準曲
線を参照して得られる。
【００３４】競合アッセイもまた用いることができ、そ
こでは、Ｌｎｇ１０８の特異抗体が固形支持体に付着し
ており、標識したＬｎｇ１０８および患者またはヒト対
照に由来する試料が固形支持体上を通過する。固形支持
体に付着した検出標識量を試料中のＬｎｇ１０８の量に
相関させることができる。
こでは、Ｌｎｇ１０８の特異抗体が固形支持体に付着し
ており、標識したＬｎｇ１０８および患者またはヒト対
照に由来する試料が固形支持体上を通過する。固形支持
体に付着した検出標識量を試料中のＬｎｇ１０８の量に
相関させることができる。
【００３５】Ｌｎｇ１０８の核酸配列の全てまたは一部
をハイブリダイゼーションプローブとして用いた核酸法
（nucleic acid method）もまた、肺癌を含む癌のマー
カーとしてのＬｇｎ１０８のｍＲＮＡを検出するのに用
いることができる。ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）、
およびリガーゼ連鎖反応（ＬＣＲ）および核酸配列をも
とにした増幅（ＮＡＳＡＢＡ）などのその他の核酸法
を、様々な悪性腫瘍を診断およびモニタリングするため
の悪性細胞の検出に用いることができる。例えば、逆転
写酵素ＰＣＲ（ＲＴ‐ＰＣＲ）は、特定のｍＲＮＡ集団
の存在を、何千ものその他のｍＲＮＡ種の複雑な混合物
の中で検出するために用いることができる強力な技術で
ある。ＲＴ‐ＰＣＲにおいては、１種類のｍＲＮＡが、
酵素である逆転写酵素を用いて最初に相補ＤＮＡ（ｃＤ
ＮＡ）に逆転写され、次に該ｃＤＮＡが標準的なＰＣＲ
反応と同様に増幅される。このように、ＲＴ‐ＰＣＲ
は、増幅により、単一種のｍＲＮＡの存在を明らかにす
ることができる。したがって、該ｍＲＮＡがそれを産生
する細胞に高度に特異的である場合、ＲＴ‐ＰＣＲは、
特定の種類の細胞の存在を同定するのに用いることがで
きる。
をハイブリダイゼーションプローブとして用いた核酸法
（nucleic acid method）もまた、肺癌を含む癌のマー
カーとしてのＬｇｎ１０８のｍＲＮＡを検出するのに用
いることができる。ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）、
およびリガーゼ連鎖反応（ＬＣＲ）および核酸配列をも
とにした増幅（ＮＡＳＡＢＡ）などのその他の核酸法
を、様々な悪性腫瘍を診断およびモニタリングするため
の悪性細胞の検出に用いることができる。例えば、逆転
写酵素ＰＣＲ（ＲＴ‐ＰＣＲ）は、特定のｍＲＮＡ集団
の存在を、何千ものその他のｍＲＮＡ種の複雑な混合物
の中で検出するために用いることができる強力な技術で
ある。ＲＴ‐ＰＣＲにおいては、１種類のｍＲＮＡが、
酵素である逆転写酵素を用いて最初に相補ＤＮＡ（ｃＤ
ＮＡ）に逆転写され、次に該ｃＤＮＡが標準的なＰＣＲ
反応と同様に増幅される。このように、ＲＴ‐ＰＣＲ
は、増幅により、単一種のｍＲＮＡの存在を明らかにす
ることができる。したがって、該ｍＲＮＡがそれを産生
する細胞に高度に特異的である場合、ＲＴ‐ＰＣＲは、
特定の種類の細胞の存在を同定するのに用いることがで
きる。
【００３６】固形支持体に配列（つまりグリッド化（gr
idding））されたクローンまたはオリゴヌクレオチドへ
のハイブリダイゼーションは、その遺伝子の発現の検出
および発現レベルの定量の両方に用いることができる。
この手法では、Ｌｎｇ１０８遺伝子をコードするｃＤＮ
Ａが基材に固定される。基材は、ガラス、ニトロセルロ
ース、ナイロンまたはプラスチックを含むがこれらに限
定されない任意の好適な種類であってもよい。Ｌｎｇ１
０８遺伝子をコードするＤＮＡの少なくとも一部を基材
に付着させ、次に、当該組織から単離したＲＮＡまたは
ＲＮＡのコピーである相補ＤＮＡ（ｃＤＮＡ）であって
もよい検体とインキュベートする。基材に結合したＤＮ
Ａと検体とのハイブリダイゼーションは、検体またはハ
イブリッド検出用の二次分子を放射性標識または蛍光標
識することを含むがこれらに限定されないいくつかの手
段で検出し定量することができる。遺伝子の発現レベル
の定量は、検体からの信号の強度を、既知の標準から決
定したレベルと比較することによってなされる。標準
は、標的遺伝子のin vitroでの転写、収量の定量化、そ
して、この材料を用いて標準曲線を作成することにより
得ることができる。
idding））されたクローンまたはオリゴヌクレオチドへ
のハイブリダイゼーションは、その遺伝子の発現の検出
および発現レベルの定量の両方に用いることができる。
この手法では、Ｌｎｇ１０８遺伝子をコードするｃＤＮ
Ａが基材に固定される。基材は、ガラス、ニトロセルロ
ース、ナイロンまたはプラスチックを含むがこれらに限
定されない任意の好適な種類であってもよい。Ｌｎｇ１
０８遺伝子をコードするＤＮＡの少なくとも一部を基材
に付着させ、次に、当該組織から単離したＲＮＡまたは
ＲＮＡのコピーである相補ＤＮＡ（ｃＤＮＡ）であって
もよい検体とインキュベートする。基材に結合したＤＮ
Ａと検体とのハイブリダイゼーションは、検体またはハ
イブリッド検出用の二次分子を放射性標識または蛍光標
識することを含むがこれらに限定されないいくつかの手
段で検出し定量することができる。遺伝子の発現レベル
の定量は、検体からの信号の強度を、既知の標準から決
定したレベルと比較することによってなされる。標準
は、標的遺伝子のin vitroでの転写、収量の定量化、そ
して、この材料を用いて標準曲線を作成することにより
得ることができる。
【００３７】プロテオミクスアプローチでは、２次元電
気泳動が当業者によく知られた技術である。血清などの
試料からの個別のタンパク質の単離は、通常ポリアクリ
ルアミドゲル上での、タンパク質の異なる特性による配
列決定的な分離（sequentialseparation）を用いて達成
される。最初に、タンパク質は電流を用いて大きさによ
り分離される。電流は全てのタンパク質に均等に作用
し、それにより、小さいタンパク質は大きいタンパク質
よりもゲル上で早く移動する。第２次元では、第１次元
に対して直角に電流をかけ、タンパク質を大きさに基づ
いてではなく、各タンパク質が有する特定の電荷に基づ
いて分離する。異なる配列の２つのタンパク質で大きさ
および電荷の両方に関して同一なものは存在しないた
め、２次元分離の結果は、各タンパク質が固有のスポッ
トを占有する正方形のゲルとなる。該スポットの化学的
プローブまたは抗体プローブによる分析、またはそれに
引き続くタンパク質のマイクロシーケンスにより、所定
のタンパク質の相対的な存在度を明らかにし、試料中の
タンパク質の同定をすることができる。
気泳動が当業者によく知られた技術である。血清などの
試料からの個別のタンパク質の単離は、通常ポリアクリ
ルアミドゲル上での、タンパク質の異なる特性による配
列決定的な分離（sequentialseparation）を用いて達成
される。最初に、タンパク質は電流を用いて大きさによ
り分離される。電流は全てのタンパク質に均等に作用
し、それにより、小さいタンパク質は大きいタンパク質
よりもゲル上で早く移動する。第２次元では、第１次元
に対して直角に電流をかけ、タンパク質を大きさに基づ
いてではなく、各タンパク質が有する特定の電荷に基づ
いて分離する。異なる配列の２つのタンパク質で大きさ
および電荷の両方に関して同一なものは存在しないた
め、２次元分離の結果は、各タンパク質が固有のスポッ
トを占有する正方形のゲルとなる。該スポットの化学的
プローブまたは抗体プローブによる分析、またはそれに
引き続くタンパク質のマイクロシーケンスにより、所定
のタンパク質の相対的な存在度を明らかにし、試料中の
タンパク質の同定をすることができる。
【００３８】上記のテストは、組織生検材料および検死
解剖材料を含む患者から得られた様々な細胞、体液およ
び／または組織抽出物（ホモジネートまたは可溶化した
組織）に由来する試料について行なうことができる。本
発明に有用な体液は、血液、尿、唾液または任意のその
他の体分泌物またはそれらの派生物を含む。血液は、全
血、血漿、血清、または任意の血液の派生物を含む。
解剖材料を含む患者から得られた様々な細胞、体液およ
び／または組織抽出物（ホモジネートまたは可溶化した
組織）に由来する試料について行なうことができる。本
発明に有用な体液は、血液、尿、唾液または任意のその
他の体分泌物またはそれらの派生物を含む。血液は、全
血、血漿、血清、または任意の血液の派生物を含む。
【００３９】Ｌｎｇ１０８の in vivo でのターゲティン
グ／癌治療 Ｌｎｇ１０８の同定はまた、癌、そして特に肺癌のイメ
ージングおよび処置のための新しい治療法の合理的な設
計にとって有用である。例えば、１つの態様では、Ｌｎ
ｇ１０８に特異的に結合する抗体を作製し、癌を患って
いる疑いのある患者にin vivoで用いることができる。
Ｌｎｇ１０８に特異的に結合する抗体は、癌を有する疑
いのある患者に、診断および／または治療の目的で、注
射することができる。このように、本発明の他の側面
は、このような処置を要するヒト患者において、該患者
に有効な量の抗体を投与することにより肺癌の発症を予
防し、そして、肺癌を処置するための方法に関する。
「有効な量」とは、外科切除のための腫瘍の縮小または
腫瘍の消滅をもたらすために、腫瘍上に発現した標的抗
原に結合するのに必要な抗体の量または濃度を意味す
る。該抗体のＬｎｇ１０８への結合は、このようなＬｎ
ｇ１０８を発現している癌細胞の死をもたらすと考えら
れる。in vivoでの診断のための抗体の調製および使用
は当該分野でよく知られている。たとえば、インジウム
−１１１で標識した抗体−キレーターが、癌胎児性抗原
を発現している腫瘍のラジオイムノシンチグラフィーに
よるイメージングでの使用に関して記述されている（Su
merdon et al. Nucl. Med. Biol. 1990 17:247-254）。
特にこれらの抗体‐キレーターは、再発性の結腸直腸癌
を有する疑いのある患者において腫瘍を検出するのに用
いられた（Griffin et al. J. Clin. Onc. 1991 9:631-
640）。磁気共鳴イメージングで用いる標識としての常
磁性イオンを有する抗体もまた記述されている（Lauffe
r, R.B. Magnetic Resonance in Medicine 1991 22:339
-342）。Ｌｎｇ１０８に対する抗体も同様に用いること
ができる。Ｌｎｇ１０８に特異的に結合する標識された
抗体を、癌を有する疑いのある患者に、該患者の疾患の
状態の診断またはステージングの目的で注射することが
できる。用いる標識は、用いるイメージングの様式に応
じて選択できる。例えば、インジウム‐１１１、テクネ
チウム‐９９ｍまたはヨウ素‐１３１などの放射性標識
は、平面スキャンまたはシングルフォトン断層撮影に用
いることができる。フッ素‐１８（Ｆｌｕｏｒｉｎｅ−
１８）などのポジトロン放出標識をポジトロン断層撮影
に用いることができる。ガドリニウム（ＩＩＩ）または
マンガン（ＩＩ）などの常磁性イオンを磁気共鳴イメー
ジングに用いることができる。標識の局在性は、癌の播
種の決定を可能にする。また、器官または組織内の標識
の量により、その器官または組織における癌の存在また
は欠如を決定することができる。
グ／癌治療 Ｌｎｇ１０８の同定はまた、癌、そして特に肺癌のイメ
ージングおよび処置のための新しい治療法の合理的な設
計にとって有用である。例えば、１つの態様では、Ｌｎ
ｇ１０８に特異的に結合する抗体を作製し、癌を患って
いる疑いのある患者にin vivoで用いることができる。
Ｌｎｇ１０８に特異的に結合する抗体は、癌を有する疑
いのある患者に、診断および／または治療の目的で、注
射することができる。このように、本発明の他の側面
は、このような処置を要するヒト患者において、該患者
に有効な量の抗体を投与することにより肺癌の発症を予
防し、そして、肺癌を処置するための方法に関する。
「有効な量」とは、外科切除のための腫瘍の縮小または
腫瘍の消滅をもたらすために、腫瘍上に発現した標的抗
原に結合するのに必要な抗体の量または濃度を意味す
る。該抗体のＬｎｇ１０８への結合は、このようなＬｎ
ｇ１０８を発現している癌細胞の死をもたらすと考えら
れる。in vivoでの診断のための抗体の調製および使用
は当該分野でよく知られている。たとえば、インジウム
−１１１で標識した抗体−キレーターが、癌胎児性抗原
を発現している腫瘍のラジオイムノシンチグラフィーに
よるイメージングでの使用に関して記述されている（Su
merdon et al. Nucl. Med. Biol. 1990 17:247-254）。
特にこれらの抗体‐キレーターは、再発性の結腸直腸癌
を有する疑いのある患者において腫瘍を検出するのに用
いられた（Griffin et al. J. Clin. Onc. 1991 9:631-
640）。磁気共鳴イメージングで用いる標識としての常
磁性イオンを有する抗体もまた記述されている（Lauffe
r, R.B. Magnetic Resonance in Medicine 1991 22:339
-342）。Ｌｎｇ１０８に対する抗体も同様に用いること
ができる。Ｌｎｇ１０８に特異的に結合する標識された
抗体を、癌を有する疑いのある患者に、該患者の疾患の
状態の診断またはステージングの目的で注射することが
できる。用いる標識は、用いるイメージングの様式に応
じて選択できる。例えば、インジウム‐１１１、テクネ
チウム‐９９ｍまたはヨウ素‐１３１などの放射性標識
は、平面スキャンまたはシングルフォトン断層撮影に用
いることができる。フッ素‐１８（Ｆｌｕｏｒｉｎｅ−
１８）などのポジトロン放出標識をポジトロン断層撮影
に用いることができる。ガドリニウム（ＩＩＩ）または
マンガン（ＩＩ）などの常磁性イオンを磁気共鳴イメー
ジングに用いることができる。標識の局在性は、癌の播
種の決定を可能にする。また、器官または組織内の標識
の量により、その器官または組織における癌の存在また
は欠如を決定することができる。
【００４０】in vivoでの方法に用いることができる抗
体は、ポリクローナル、モノクローナルおよびオムニク
ローナル抗体、および分子生物学的技術により調製した
抗体を含む。ＳＥＬＥＸと呼ばれる、当業者によく知ら
れた進化手順に由来するものなどの抗体断片およびアプ
タマーおよび一本鎖オリゴヌクレオチドもまた用いるこ
とができる。
体は、ポリクローナル、モノクローナルおよびオムニク
ローナル抗体、および分子生物学的技術により調製した
抗体を含む。ＳＥＬＥＸと呼ばれる、当業者によく知ら
れた進化手順に由来するものなどの抗体断片およびアプ
タマーおよび一本鎖オリゴヌクレオチドもまた用いるこ
とができる。
【００４１】スクリーニングアッセイ
本発明はまた、Ｌｎｇ１０８タンパク質に結合する調節
物質、または、Ｌｎｇ１０８タンパク質の発現または活
性に関して調節効果を有する調節物質を同定する方法も
提供する。Ｌｎｇ１０８タンパク質の発現または活性を
減少させる調節物質は、癌、特に肺癌の処置に有用と思
われる。このようなスクリーニングアッセイは、当業者
に知られており、細胞に基づくアッセイおよび細胞を用
いないアッセイを含むが、これらに限定されない。
物質、または、Ｌｎｇ１０８タンパク質の発現または活
性に関して調節効果を有する調節物質を同定する方法も
提供する。Ｌｎｇ１０８タンパク質の発現または活性を
減少させる調節物質は、癌、特に肺癌の処置に有用と思
われる。このようなスクリーニングアッセイは、当業者
に知られており、細胞に基づくアッセイおよび細胞を用
いないアッセイを含むが、これらに限定されない。
【００４２】コンピューターイメージングによりＬｎｇ
１０８の領域に特異的に結合すると予測された小分子も
また、癌のイメージングおよび処置に用いるために設計
し、合成し、そしてテストすることができる。さらに、
分子のＬｎｇ１０８への結合能力を調査することにより
潜在的な抗癌剤について、分子ライブラリーをスクリー
ニングすることができる。ライブラリーにおいて、Ｌｎ
ｇ１０８に結合できると同定された分子は、癌、特に肺
癌の処置に用いるためのさらなる評価への重要な候補で
ある。好ましい態様では、これらの分子は、細胞におけ
るＬｎｇ１０８の発現および／または活性を下方調節す
ることができる。
１０８の領域に特異的に結合すると予測された小分子も
また、癌のイメージングおよび処置に用いるために設計
し、合成し、そしてテストすることができる。さらに、
分子のＬｎｇ１０８への結合能力を調査することにより
潜在的な抗癌剤について、分子ライブラリーをスクリー
ニングすることができる。ライブラリーにおいて、Ｌｎ
ｇ１０８に結合できると同定された分子は、癌、特に肺
癌の処置に用いるためのさらなる評価への重要な候補で
ある。好ましい態様では、これらの分子は、細胞におけ
るＬｎｇ１０８の発現および／または活性を下方調節す
ることができる。
【００４３】養子免疫療法およびワクチン
癌の養子免疫療法は、抗腫瘍反応性を有する免疫細胞を
腫瘍保有宿主に投与し、該細胞が直接または間接に、定
着した腫瘍の消退を誘導することを目的とする治療的手
法に関する。リンパ球、特にＴリンパ球の移入はこの部
類に該当し、国立癌研究所（National Cancer Institut
e）（ＮＣＩ）の研究者は、いくつかのヒトの癌の処置
に、末梢血リンパ球または、皮下リンパ節の生検からの
Ｔ細胞を培養した腫瘍浸潤リンパ球（ＴＩＬ）の自家輸
血を用いた（Rosenberg, S. A.,米国特許第４，６９
０，９１４号、１９８７年９月１日発行；Rosenberg,
S. A., et al., 1988, N. England J. Med. 319:1676-1
680）。
腫瘍保有宿主に投与し、該細胞が直接または間接に、定
着した腫瘍の消退を誘導することを目的とする治療的手
法に関する。リンパ球、特にＴリンパ球の移入はこの部
類に該当し、国立癌研究所（National Cancer Institut
e）（ＮＣＩ）の研究者は、いくつかのヒトの癌の処置
に、末梢血リンパ球または、皮下リンパ節の生検からの
Ｔ細胞を培養した腫瘍浸潤リンパ球（ＴＩＬ）の自家輸
血を用いた（Rosenberg, S. A.,米国特許第４，６９
０，９１４号、１９８７年９月１日発行；Rosenberg,
S. A., et al., 1988, N. England J. Med. 319:1676-1
680）。
【００４４】本発明は、ヒトにおける原発性および転移
性の癌の予防および／または処置のための、熱ショック
タンパク質（ｈｓｐ）の非共有複合体（non-covalent c
omplexes）を含むまたは含まない抗原性のＬｎｇ１０８
タンパク質に対して感作したマクロファージを用いた養
子免疫療法の組成物および方法に関する。Ｌｎｇ１０８
の抗原性または免疫原性は、Ｌｎｇ１０８タンパク質ま
たはその断片の、抗体を産生し、または、ナイーブなエ
フェクター細胞を感作し、次いで抗原（またはエピトー
プ）を発現する標的細胞を溶解する能力により容易に確
認された。
性の癌の予防および／または処置のための、熱ショック
タンパク質（ｈｓｐ）の非共有複合体（non-covalent c
omplexes）を含むまたは含まない抗原性のＬｎｇ１０８
タンパク質に対して感作したマクロファージを用いた養
子免疫療法の組成物および方法に関する。Ｌｎｇ１０８
の抗原性または免疫原性は、Ｌｎｇ１０８タンパク質ま
たはその断片の、抗体を産生し、または、ナイーブなエ
フェクター細胞を感作し、次いで抗原（またはエピトー
プ）を発現する標的細胞を溶解する能力により容易に確
認された。
【００４５】癌細胞は、その定義から、異常であり、正
常な組織に存在しないために免疫系が外来性と認識する
タンパク質を含んでいる。しかしながら、免疫系はしば
しばこの異常を無視するようであり、腫瘍の攻撃に失敗
する。癌細胞により産生された外来性のＬｎｇ１０８タ
ンパク質は、それらの存在を明らかにするのに用いるこ
とができる。Ｌｎｇ１０８は腫瘍抗原と呼ばれる短い断
片に崩壊し、細胞表面に現れる。これらの腫瘍抗原は、
クラスＩおよびＩＩの２つの種類があるＭＨＣと呼ばれ
る分子により細胞表面に支持または提示される。ＭＨＣ
クラスＩ分子に関する腫瘍抗原は細胞傷害性Ｔ細胞に認
識されるが、抗原‐ＭＨＣクラスＩＩ複合体は、ヘルパ
ー細胞と呼ばれるＴ細胞の２番目のサブセットにより認
識される。これらの細胞は、腫瘍の成長を遅延または停
止させるサイトカインを分泌し、他の種類の白血球であ
るＢ細胞が、腫瘍細胞に対する抗体を産生するのを補助
する。
常な組織に存在しないために免疫系が外来性と認識する
タンパク質を含んでいる。しかしながら、免疫系はしば
しばこの異常を無視するようであり、腫瘍の攻撃に失敗
する。癌細胞により産生された外来性のＬｎｇ１０８タ
ンパク質は、それらの存在を明らかにするのに用いるこ
とができる。Ｌｎｇ１０８は腫瘍抗原と呼ばれる短い断
片に崩壊し、細胞表面に現れる。これらの腫瘍抗原は、
クラスＩおよびＩＩの２つの種類があるＭＨＣと呼ばれ
る分子により細胞表面に支持または提示される。ＭＨＣ
クラスＩ分子に関する腫瘍抗原は細胞傷害性Ｔ細胞に認
識されるが、抗原‐ＭＨＣクラスＩＩ複合体は、ヘルパ
ー細胞と呼ばれるＴ細胞の２番目のサブセットにより認
識される。これらの細胞は、腫瘍の成長を遅延または停
止させるサイトカインを分泌し、他の種類の白血球であ
るＢ細胞が、腫瘍細胞に対する抗体を産生するのを補助
する。
【００４６】養子免疫療法では、Ｔ細胞またはその他の
抗原提示細胞（ＡＰＣ）は、体の外（ex vivo）で、腫
瘍特異的Ｌｎｇ１０８抗原を用いて刺激される。刺激さ
れた細胞は、次に患者へ自家輸血され、そこで癌細胞を
攻撃する。研究により、細胞傷害性Ｔ細胞とヘルパーＴ
細胞の両方を用いた方が、どちらか一方のサブセットだ
けを用いるのに比べはるかに有効であることが示され
た。さらに、米国特許第５，９８５，２７０号に記載さ
れているように、ＡＰＣを刺激するためにＬｎｇ１０８
抗原は熱ショックタンパク質と複合体化してもよい。
抗原提示細胞（ＡＰＣ）は、体の外（ex vivo）で、腫
瘍特異的Ｌｎｇ１０８抗原を用いて刺激される。刺激さ
れた細胞は、次に患者へ自家輸血され、そこで癌細胞を
攻撃する。研究により、細胞傷害性Ｔ細胞とヘルパーＴ
細胞の両方を用いた方が、どちらか一方のサブセットだ
けを用いるのに比べはるかに有効であることが示され
た。さらに、米国特許第５，９８５，２７０号に記載さ
れているように、ＡＰＣを刺激するためにＬｎｇ１０８
抗原は熱ショックタンパク質と複合体化してもよい。
【００４７】ＡＰＣは、マクロファージ、樹状細胞、Ｂ
リンパ球およびこれらの組合せを含むがこれらに限定さ
れない、当業者に知られたこれらの抗原提示細胞の中か
ら選択することができ、好ましくはマクロファージであ
る。好ましい使用においては、細胞はその個体の自家細
胞であり、リンパ球、マクロファージまたはその他のＡ
ＰＣなどの自家免疫細胞が、養子移植のための免疫細胞
のドナーとして誰を選択するかという問題を回避するた
めに用いられる。自家免疫細胞の使用によって回避でき
るその他の問題は、移植片対宿主病であり、これは処置
に失敗すると致命的となることがある。
リンパ球およびこれらの組合せを含むがこれらに限定さ
れない、当業者に知られたこれらの抗原提示細胞の中か
ら選択することができ、好ましくはマクロファージであ
る。好ましい使用においては、細胞はその個体の自家細
胞であり、リンパ球、マクロファージまたはその他のＡ
ＰＣなどの自家免疫細胞が、養子移植のための免疫細胞
のドナーとして誰を選択するかという問題を回避するた
めに用いられる。自家免疫細胞の使用によって回避でき
るその他の問題は、移植片対宿主病であり、これは処置
に失敗すると致命的となることがある。
【００４８】遺伝子治療を伴う養子免疫療法では、従来
の遺伝子治療と同様にＬｎｇ１０８のＤＮＡをエフェク
ター細胞に導入することができる。これにより、エフェ
クター細胞の腫瘍細胞に対する細胞傷害性を、それらを
抗原性タンパク質を産生するように操作しているために
向上することができ、それにより養子免疫療法の改善が
もたらされる。この発明のＬｎｇ１０８抗原は、癌ワク
チンの成分としてもまた有用である。ワクチンは、免疫
刺激量（immunogenically stimulatory amount）のＬｎ
ｇ１０８抗原を含む。免疫刺激量とは、レシピエント
に、癌、特に肺癌の改善または処置のために所望する免
疫反応を惹起することが可能な抗原の量のことをいう。
有効な量は、当業者によく知られた標準的な手順により
経験的に決定してもよい。
の遺伝子治療と同様にＬｎｇ１０８のＤＮＡをエフェク
ター細胞に導入することができる。これにより、エフェ
クター細胞の腫瘍細胞に対する細胞傷害性を、それらを
抗原性タンパク質を産生するように操作しているために
向上することができ、それにより養子免疫療法の改善が
もたらされる。この発明のＬｎｇ１０８抗原は、癌ワク
チンの成分としてもまた有用である。ワクチンは、免疫
刺激量（immunogenically stimulatory amount）のＬｎ
ｇ１０８抗原を含む。免疫刺激量とは、レシピエント
に、癌、特に肺癌の改善または処置のために所望する免
疫反応を惹起することが可能な抗原の量のことをいう。
有効な量は、当業者によく知られた標準的な手順により
経験的に決定してもよい。
【００４９】Ｌｎｇ１０８抗原は、例えば抗体および／
または細胞媒介性の所望する種類の免疫反応を誘導する
ための多くの任意のワクチン製剤に提供されてもよい。
このような製剤は当該分野に知られており、米国特許第
５，５８５，１０３号に記載されているような製剤を含
むが、それらに限定されない。免疫反応を刺激するのに
用いられる本発明のワクチン製剤はまた、薬学的に許容
し得るアジュバントを含むことができる。
または細胞媒介性の所望する種類の免疫反応を誘導する
ための多くの任意のワクチン製剤に提供されてもよい。
このような製剤は当該分野に知られており、米国特許第
５，５８５，１０３号に記載されているような製剤を含
むが、それらに限定されない。免疫反応を刺激するのに
用いられる本発明のワクチン製剤はまた、薬学的に許容
し得るアジュバントを含むことができる。
【００５０】例
本発明を、以下の例でさらに説明する。当該例は、特定
の態様の参照により単に本発明を説明するためだけに提
供される。この例示は、本発明のある特定の側面を説明
するが、該開示発明の限定を記述するものでも、また、
その範囲を制限するものでもない。本明細書に記載され
た実験は、詳細に記載されている場合を除き、当業者に
よく知られ、定法となっている標準的な技術を用いて行
なった。定法による分子生物学的技術は、Sambrook et
al., MOLECULAR CLONING: A LABORATORY MANUAL, 2nd E
d.; Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spri
ng Harbor, N.Y. (1989)などの標準的な実験手引書に記
載されている通りに行なった。
の態様の参照により単に本発明を説明するためだけに提
供される。この例示は、本発明のある特定の側面を説明
するが、該開示発明の限定を記述するものでも、また、
その範囲を制限するものでもない。本明細書に記載され
た実験は、詳細に記載されている場合を除き、当業者に
よく知られ、定法となっている標準的な技術を用いて行
なった。定法による分子生物学的技術は、Sambrook et
al., MOLECULAR CLONING: A LABORATORY MANUAL, 2nd E
d.; Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spri
ng Harbor, N.Y. (1989)などの標準的な実験手引書に記
載されている通りに行なった。
【００５１】遺伝子発現の相対定量
蛍光Ｔａｑｍａｎプローブによるリアルタイム定量ＰＣ
Ｒは、Ｔａｑ ＤＮＡポリメラーゼの５’−３’ヌクレ
アーゼ活性を用いた定量検出システムである。この方法
は、５’レポーター色素および下流側の３’消光色素で
ラベルされた内部蛍光オリゴヌクレオチドプローブ（in
ternal fluorescent oligonucleotide probe）（Ｔａｑ
ｍａｎ）を用いる。ＰＣＲ中、Ｔａｑ ＤＮＡポリメラ
ーゼの５’−３’ヌクレアーゼ活性はレポーターを放出
し、その蛍光はModel 7700 Sequence Detection System
（PE Applied Biosystems, Foster City, CA, USA）の
レーザー検出器で検出できる。
Ｒは、Ｔａｑ ＤＮＡポリメラーゼの５’−３’ヌクレ
アーゼ活性を用いた定量検出システムである。この方法
は、５’レポーター色素および下流側の３’消光色素で
ラベルされた内部蛍光オリゴヌクレオチドプローブ（in
ternal fluorescent oligonucleotide probe）（Ｔａｑ
ｍａｎ）を用いる。ＰＣＲ中、Ｔａｑ ＤＮＡポリメラ
ーゼの５’−３’ヌクレアーゼ活性はレポーターを放出
し、その蛍光はModel 7700 Sequence Detection System
（PE Applied Biosystems, Foster City, CA, USA）の
レーザー検出器で検出できる。
【００５２】反応に加えたＲＮＡ試料の量を標準化し、
逆転写酵素の効率を正規化するのに内在性対照の増幅を
用いた。シクロフィリン、グリセルアルデヒド−３−リ
ン酸デヒドロゲナーゼ（ＧＡＰＤＨ）または１８Ｓリボ
ソームＲＮＡ（ｒＲＮＡ）のいずれかをこの内在性対照
として用いた。調査した全試料間の相対定量を計算する
ために、１つの試料の標的ＲＮＡレベルを比較結果（キ
ャリブレータ）の基礎として用いた。「キャリブレー
タ」に関する定量は、標準曲線法または比較法を用いて
得ることができる（User Bulletin #2: ABI PRISM 7700
Sequence Detection System）。
逆転写酵素の効率を正規化するのに内在性対照の増幅を
用いた。シクロフィリン、グリセルアルデヒド−３−リ
ン酸デヒドロゲナーゼ（ＧＡＰＤＨ）または１８Ｓリボ
ソームＲＮＡ（ｒＲＮＡ）のいずれかをこの内在性対照
として用いた。調査した全試料間の相対定量を計算する
ために、１つの試料の標的ＲＮＡレベルを比較結果（キ
ャリブレータ）の基礎として用いた。「キャリブレー
タ」に関する定量は、標準曲線法または比較法を用いて
得ることができる（User Bulletin #2: ABI PRISM 7700
Sequence Detection System）。
【００５３】正常および癌組織の各例における標的遺伝
子の組織分布およびレベルを調査した。全ＲＮＡを、正
常組織、癌組織、および癌とその対応する隣接組織から
抽出した。次に、逆転写酵素により第一鎖ｃＤＮＡを調
製し、各標的遺伝子に特異的なプライマーおよびＴａｑ
ｍａｎプローブを用いてポリメラーゼ連鎖反応を行っ
た。結果をABI PRISM 7700 Sequence Detectorで分析し
た。無名数は、キャリブレータ組織と比較した特定の組
織における標的遺伝子の相対発現レベルである。発現分
析に用いたプライマーは、 5’ TCTAGGTCAGCCCCCGAATC 3’（配列番号４）；および 5’ CCTCCAATTCCCCCTTAAACTT 3’（配列番号５）を含
む。
子の組織分布およびレベルを調査した。全ＲＮＡを、正
常組織、癌組織、および癌とその対応する隣接組織から
抽出した。次に、逆転写酵素により第一鎖ｃＤＮＡを調
製し、各標的遺伝子に特異的なプライマーおよびＴａｑ
ｍａｎプローブを用いてポリメラーゼ連鎖反応を行っ
た。結果をABI PRISM 7700 Sequence Detectorで分析し
た。無名数は、キャリブレータ組織と比較した特定の組
織における標的遺伝子の相対発現レベルである。発現分
析に用いたプライマーは、 5’ TCTAGGTCAGCCCCCGAATC 3’（配列番号４）；および 5’ CCTCCAATTCCCCCTTAAACTT 3’（配列番号５）を含
む。
【００５４】表１に示した無名数は、１２の異なる正常
組織におけるＬｎｇ１０８（クローンID 954287；遺伝
子ID 21300とも呼ばれる）の相対発現レベルである。す
べての数値は正常筋肉（キャリブレータ）と比較してあ
る。これらのＲＮＡ試料は、異なる個体からの特定組織
のプール試料に由来する、商業的に入手可能なプールで
ある。
組織におけるＬｎｇ１０８（クローンID 954287；遺伝
子ID 21300とも呼ばれる）の相対発現レベルである。す
べての数値は正常筋肉（キャリブレータ）と比較してあ
る。これらのＲＮＡ試料は、異なる個体からの特定組織
のプール試料に由来する、商業的に入手可能なプールで
ある。
【００５５】
【表１】
【００５６】表１の発現の相対レベルによると、Ｌｎｇ
１０８のｍＲＮＡが分析した１２種類の組織すべてで発
現していることが分かる。Ｌｎｇ１０８の発現レベル
は、肺で比較的高く、脳、肝臓、小腸および精巣で低
く、そして、腎臓、乳腺および子宮で中程度だった。こ
れらの結果は、Ｌｎｇ１０８のｍＲＮＡの発現が肺組織
に限定されておらず、分析したすべての種類の組織に広
く発現されていることを証明している。表１の無名数
は、異なる個体からの特定組織の試料プールを分析して
得た。これらを単一の個体の組織試料から得たＲＮＡに
由来する表２の無名数と比較することはできない。
１０８のｍＲＮＡが分析した１２種類の組織すべてで発
現していることが分かる。Ｌｎｇ１０８の発現レベル
は、肺で比較的高く、脳、肝臓、小腸および精巣で低
く、そして、腎臓、乳腺および子宮で中程度だった。こ
れらの結果は、Ｌｎｇ１０８のｍＲＮＡの発現が肺組織
に限定されておらず、分析したすべての種類の組織に広
く発現されていることを証明している。表１の無名数
は、異なる個体からの特定組織の試料プールを分析して
得た。これらを単一の個体の組織試料から得たＲＮＡに
由来する表２の無名数と比較することはできない。
【００５７】表２に示した無名数は、４８組の対応試料
と、卵巣の２つの癌組織および卵巣の２つの正常／正常
隣接組織におけるＬｎｇ１０８の相対発現レベルを示し
ている。すべての数値は正常筋肉（キャリブレータ）と
比較してある。対応ペアは、特定組織の癌試料からのｍ
ＲＮＡと、同一個体のその同一組織についての正常隣接
組織からのｍＲＮＡにより形成した。
と、卵巣の２つの癌組織および卵巣の２つの正常／正常
隣接組織におけるＬｎｇ１０８の相対発現レベルを示し
ている。すべての数値は正常筋肉（キャリブレータ）と
比較してある。対応ペアは、特定組織の癌試料からのｍ
ＲＮＡと、同一個体のその同一組織についての正常隣接
組織からのｍＲＮＡにより形成した。
【００５８】
【表２】
【００５９】
【表３】
【００６０】
【表４】
0＝陰性
【００６１】対応試料の分析では、肺組織での発現レベ
ルがより高かった。肺での発現以外に、Ｌｎｇ１０８は
また、その他のテストした１４種類の組織すべてで発現
していた。これらの結果は、Ｌｎｇ１０８は肺でより多
く発現しているが、また、分析したその他の種類の組織
にも発現していることを確認するものであり、正常プー
ル試料パネルで得た結果（表１）と合致する。
ルがより高かった。肺での発現以外に、Ｌｎｇ１０８は
また、その他のテストした１４種類の組織すべてで発現
していた。これらの結果は、Ｌｎｇ１０８は肺でより多
く発現しているが、また、分析したその他の種類の組織
にも発現していることを確認するものであり、正常プー
ル試料パネルで得た結果（表１）と合致する。
【００６２】さらに、ｍＲＮＡの発現レベルを、癌試料
と同一個体からの同系の正常隣接組織とで比較した。こ
の比較は、癌のステージの特異性についての指標を提供
する（例えば、正常隣接組織に比較した、癌試料におけ
るｍＲＮＡの高い発現レベル）。表２は、２１の肺癌組
織のうち１４（６７％）で、Ｌｎｇ１０８が、それぞれ
の正常隣接組織に比べ過剰発現していることを示してい
る。Ｌｎｇ１０８の正常隣接組織に対する過剰発現はま
た、他の癌試料でも見出される（膀胱、結腸、子宮内
膜、腎臓、肝臓、乳房、卵巣、前立腺、小腸、精巣およ
び子宮）。これらの結果は、全体として、テストした４
８の癌組織のうち３６（７５％）が、正常隣接組織に比
べＬｎｇ１０８を過剰発現していることを示している。
したがって、多くの異なる組織種におけるｍＲＮＡの発
現、そして、テストしたすべての癌対応試料の７５％に
おいて観察された過剰発現は、Ｌｎｇ１０８が肺癌の診
断マーカー、および一般的な癌の診断マーカーであるこ
とを示している。
と同一個体からの同系の正常隣接組織とで比較した。こ
の比較は、癌のステージの特異性についての指標を提供
する（例えば、正常隣接組織に比較した、癌試料におけ
るｍＲＮＡの高い発現レベル）。表２は、２１の肺癌組
織のうち１４（６７％）で、Ｌｎｇ１０８が、それぞれ
の正常隣接組織に比べ過剰発現していることを示してい
る。Ｌｎｇ１０８の正常隣接組織に対する過剰発現はま
た、他の癌試料でも見出される（膀胱、結腸、子宮内
膜、腎臓、肝臓、乳房、卵巣、前立腺、小腸、精巣およ
び子宮）。これらの結果は、全体として、テストした４
８の癌組織のうち３６（７５％）が、正常隣接組織に比
べＬｎｇ１０８を過剰発現していることを示している。
したがって、多くの異なる組織種におけるｍＲＮＡの発
現、そして、テストしたすべての癌対応試料の７５％に
おいて観察された過剰発現は、Ｌｎｇ１０８が肺癌の診
断マーカー、および一般的な癌の診断マーカーであるこ
とを示している。
【配列表】
─────────────────────────────────────────────────────
フロントページの続き
(51)Int.Cl.7 識別記号 ＦＩ
Ａ６１Ｐ 35/00 Ａ６１Ｐ 35/00
35/04 35/04
Ｇ０１Ｎ 33/15 Ｇ０１Ｎ 33/15 Ｚ
33/50 33/50 Ｚ
// Ｇ０１Ｎ 33/53 33/53 Ｄ
(72)発明者 マシーナ，ロベルト エー.
アメリカ合衆国 カリフォルニア州
95136、サン ホセ、クレッセンド ア
ベニュー 4118
(72)発明者 チェン，セイ−ユ
アメリカ合衆国 カリフォルニア州
94404、フォスター シティー、ミラ
ストリート 160
(72)発明者 スン，ヨンミン
アメリカ合衆国 カリフォルニア州
95128、サン ホセ、エス．ウィンチェ
スター ブルバード 869、アパートメ
ント 260
(56)参考文献 特表 平９−511140（ＪＰ，Ａ)
米国特許5747264（ＵＳ，Ａ)
米国特許5837498（ＵＳ，Ａ)
国際公開96／15147（ＷＯ，Ａ１)
Ｐｅｎｇ Ｌｉａｎｇ，Ｄｉｆｆｅｒ
ｅｎｔｉａｌ Ｄｉｓｐｌａｙ ａｎｄ
Ｃｌｏｎｉｎｇ ｏｆ Ｍｅｓｓｅｎ
ｇｅｒ ＲＮＡｓ ｆｒｏｍ Ｈｕｍａ
ｎ Ｂｒｅａｓｔ Ｃａｎｃｅｒ ｖｅ
ｒｓｕｓ Ｍａｍｍａｒｙ Ｅｐｉｔｈ
ｅｌｉａ，ＣＡＮＣＥＲ ＲＥＳＥＡＲ
ＣＨ，1992年12月15日，ｖｏｌ．52,
ｐ．6966−6968
Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ａｎｄ Ｃｅｌ
ｌｕｌａｒ Ｅｎｄｏｃｒｉｎｏｌｏｇ
ｙ，1995年，ｖｏｌ．112，241−247
(58)調査した分野(Int.Cl.7，ＤＢ名)
G01N 33/574
A61K 39/00
A61K 39/395
A61K 45/00
A61P 35/00
A61P 35/04
G01N 33/15
G01N 33/50
G01N 33/53
Claims (11)
- 【請求項１】 Ｌｎｇ１０８を含む癌用診断マーカーで
あって、患者から得た細胞、組織または体液において決
定された該診断マーカーのレベルの、正常ヒト対照から
得た細胞、組織または体液において決定された該診断マ
ーカーのレベルに対する増加が癌の存在に関係してい
る、前記診断マーカー。 - 【請求項２】 Ｌｎｇ１０８が、Ｌｎｇ１０８ポリヌク
レオチドおよびＬｎｇ１０８ポリペプチドからなる群よ
り選択される、請求項１に記載の診断マーカー。 - 【請求項３】 癌が肺癌である、請求項１または２に記
載の診断マーカー。 - 【請求項４】 患者における癌の存在を診断する方法で
あって、 （ａ）患者から得た細胞、組織または体液におけるＬｎ
ｇ１０８のレベルを決定すること、および （ｂ）決定したＬｎｇ１０８のレベルと、正常ヒト対照
から得た細胞、組織または体液におけるＬｎｇ１０８の
レベルとを比較することを含み、該患者の決定したＬｎ
ｇ１０８レベルの正常ヒト対照に対する増加が癌の存在
に関係している、前記方法。 - 【請求項５】 患者における癌の転移を診断する方法で
あって、 （ａ）転移したことが知られていない癌を有する患者を
特定すること、 （ｂ）該患者から得た細胞、組織または体液の試料にお
けるＬｎｇ１０８のレベルを決定すること、および （ｃ）決定したＬｎｇ１０８レベルと、正常ヒト対照か
ら得た細胞、組織または体液におけるＬｎｇ１０８のレ
ベルとを比較することを含み、該患者の決定したＬｎｇ
１０８レベルの正常ヒト対照に対する増加が転移した癌
に関係している、前記方法。 - 【請求項６】 癌を有する患者における癌のステージン
グの方法であって、 （ａ）癌を有する患者を特定すること、 （ｂ）該患者から得た細胞、組織または体液の試料にお
けるＬｎｇ１０８のレベルを決定すること、および （ｃ）決定したＬｎｇ１０８レベルと、正常ヒト対照か
ら得た細胞、組織または体液におけるＬｎｇ１０８のレ
ベルとを比較することを含み、該患者の決定したＬｎｇ
１０８レベルの正常ヒト対照に対する増加が進行してい
る癌に、そして決定したＬｎｇ１０８レベルの低下が消
退している癌または寛解期の癌に関係している、前記方
法。 - 【請求項７】 患者において、転移の開始について癌を
モニタリングする方法であって、 （ａ）転移したことが知られていない癌を有する患者を
特定すること、 （ｂ）該患者から得た細胞、組織または体液の試料にお
けるＬｎｇ１０８のレベルを定期的に決定すること、お
よび （ｃ）定期的に決定したＬｎｇ１０８レベルと、正常ヒ
ト対照から得た細胞、組織または体液におけるＬｎｇ１
０８のレベルとを比較することを含み、該患者の任意の
定期的に決定したＬｎｇ１０８レベルの正常ヒト対照に
対する増加が転移した癌に関係している、前記方法。 - 【請求項８】 Ｌｎｇ１０８のレベルが、Ｌｎｇ１０８
に特異的に結合する抗体を用いて決定される、請求項４
〜７のいずれかに記載の方法。 - 【請求項９】 抗体が、放射性試薬、蛍光試薬または酵
素試薬に付着している、請求項８に記載の方法。 - 【請求項１０】 Ｌｎｇ１０８が、Ｌｎｇ１０８ポリヌ
クレオチドおよびＬｎｇ１０８ポリペプチドからなる群
より選択される、請求項４〜９のいずれかに記載の方
法。 - 【請求項１１】 癌が肺癌である、請求項４〜１０のい
ずれかに記載の方法。
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| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US16344499P | 1999-11-04 | 1999-11-04 | |
| US60/163,444 | 1999-11-04 | ||
| PCT/US2000/030482 WO2001032209A1 (en) | 1999-11-04 | 2000-11-03 | A novel method of diagnosing, monitoring, staging, imaging and treating cancer |
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|---|---|---|---|
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|---|---|
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|---|---|---|---|
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|---|---|---|---|---|
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|---|---|---|---|---|
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- 2000-11-03 WO PCT/US2000/030482 patent/WO2001032209A1/en not_active Application Discontinuation
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- 2000-11-03 EP EP00975587A patent/EP1227841A4/en not_active Withdrawn
-
2003
- 2003-11-20 JP JP2003391380A patent/JP2004170428A/ja active Pending
Non-Patent Citations (2)
| Title |
|---|
| Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ａｎｄ Ｃｅｌｌｕｌａｒ Ｅｎｄｏｃｒｉｎｏｌｏｇｙ，１９９５年，ｖｏｌ．１１２，２４１−２４７ |
| Ｐｅｎｇ Ｌｉａｎｇ，Ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌ Ｄｉｓｐｌａｙ ａｎｄ Ｃｌｏｎｉｎｇ ｏｆ Ｍｅｓｓｅｎｇｅｒ ＲＮＡｓ ｆｒｏｍ Ｈｕｍａｎ Ｂｒｅａｓｔ Ｃａｎｃｅｒ ｖｅｒｓｕｓ Ｍａｍｍａｒｙ Ｅｐｉｔｈｅｌｉａ，ＣＡＮＣＥＲ ＲＥＳＥＡＲＣＨ，１９９２年１２月１５日，ｖｏｌ．５２，ｐ．６９６６−６９６８ |
Also Published As
| Publication number | Publication date |
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| WO2001032209A1 (en) | 2001-05-10 |
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