JP3354149B2 - 哺乳類ホスホジエステラーゼをコードするdna - Google Patents
哺乳類ホスホジエステラーゼをコードするdnaInfo
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Description
中の米国特許出願No.07/688,356の一部継続出願であ
る。
エステラーゼ(CaM−PDEs)およびサイクリック−GMP−
刺激ホスホジエステラーゼ(cGS−PDEs)をコードする
新規の精製され、単離されたヌクレオチド配列に関す
る。また、前記ヌクレオチド配列に対応する組み換え発
現物質、該物質に特異的に反応する免疫学的試薬、およ
びかような発現物質の酵素活性を調節する化合物を同定
するための方法も提供される。
を多種多様の細胞性反応に介在するとして知られてい
る。サイクリック・ヌクレオチド・ホスホジエステラー
ゼ(PDEs)は、サイクリック・アデノシン・モノホスフ
ェート(cAMP)や、サイクリック・グアノシン・モノホ
スフェート(cGMP)などの3'、5'サイクリック・ヌクレ
オチドの、対応する5'−ヌクレオチド・モノホスフェー
トへの加水分解を触媒し、従って、サイクリック・ヌク
レオチドの細胞性濃度の調節において重要である。一
方、PDEsは、トランスメンブラン・シグナルもしくはカ
ルシウム・イオン(Ca2+)あるいはcGMPなどの第二メッ
センジャー物質により調節される。そして、PDEsは、細
胞外ホルモン、神経伝達物質、あるいはメッセンジャー
としてサイクリック・ヌクレオチドを用いる他のシグナ
ルからの情報の流れを調節する際の中心的役割を果た
す。
は、ほとんどの真核生物の細胞および組織全体に分布し
ているが、普通は、微量でしか存在していない。少なく
とも五つの異なる科が、基質特異性、動力学的特性、細
胞性調節条件、大きさ、ある場合には、選択的阻害剤に
よる調整、などの特徴を基にして記されている。[Beav
o,Adv.in Second Mess.and Prot.Phosph.Res.22:1−38
(1988)]。この五つの科とは、次のものを含む。
Cyc−lic Nucleotide Phosphodiesterase:Structure,Re
gulation and Drug Action,Beavo,J.and Houslay,M.D.,
Eds.;John Wiley & Sons,New York(1990)にある、Be
avo,“Multiple Phosphodiesterase Isozymes Backgrou
nd,Numenclature and Implications",pp.3−15;Wang et
al.,“Calmodulin−Stimulated Cyclic Nucleotide Ph
osphodiesterases",pp.19−59;およびManganiello et a
l.,“Cyclic GMP−Stimulated Cyclic Nucleotide Phos
phodiesterases",pp.62−85を参照のこと。
MPおよび/またはcGMPの細胞内濃度の減少をもたらす細
胞内カルシウムに対する反応により特徴付けられる。cG
MP−刺激ホスホジエステラーゼ(cGS−PDEs)に特有の
特徴は、cAMP加水分解においてcGMPにより刺激される能
力である。
べて、ならびにキイロショウジョウバエ、タマホコリカ
ビ、および睡眠病病原虫での、Ca2+/カルモジュリンに
対する増大したPDE活性が見られた。組織、細胞性およ
び亜細胞性区画でのCaM−PDEのレベルは、多様に変化す
る。ほとんどの細胞は、脳、特に、シナプス領域におい
て、最も高い組織レベルで、少量のCaM−PDE活性を含
む、Greenberg et al.,Neuropharmacol.,17:737−745
(1978)およびKincaid et al.,PNAS(USA),84:1118
−1122(1987)。ムスカリン刺激に応答するアストロチ
トーム細胞でのcAMPの減少は、CaM−PDE活性でのカルシ
ウム依存性の増大によるものと思われる。Tanner et a
l.,Mol.Pharmacol.,29:455−460(1986)。また、CaM−
PDEは、甲状腺組織におけるcAMPの重要な調節器であろ
う。Erneux et al.,Mol.Cell.Endocrinol.,43:123−134
(1985)。
酵素があることを示唆していた。CaM−PDE科のいくつか
が、ウシ心臓から単離した59kDaのイソ酵素、およびウ
シ脳から単離した61および63kDaのイソ酵素を含むこと
が記されている。LaPorte et al.,Biochemistry,18;282
0−2825(1979);Hansen et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.U
SA,79:2788−2792(1982);およびSharma et al.,J.Bi
ol.Chem.,261:14160−14166(1986)。ウシの59および6
1kDaイソ酵素の相似物が、ラットの組織からも単離され
ており、Hansen et al.,J.Biol.Chem.,261:14636−1464
5(1986)、これら二つのイソ酵素が他の哺乳動物種に
おいても発現されうることを示唆している。
DE科での類似性および相違性双方を支持している。例え
ば、59kDa心臓イソ酵素および61kDa脳イソ酵素CaM−PDE
sは、SDS−PAGEでの移動度およびDEAEクロマトグラフィ
ーでの溶出位置において相違し、59kDaイソ酵素は、カ
ルモジュリンよりも少なくとも10−20倍高い親和性を有
している。胎盤および形質転換した細胞において非常に
高い濃度で存在する胎児/オンコカルシウム結合タンパ
ク質であるオンコモジュリンも、61kDa酵素よりも高い
親和性で59kDa酵素と結合する。しかしながら、61kDa脳
イソ酵素および59kDa心臓イソ酵素共に、単一モノクロ
ーナル抗体によって認識される。この抗体は、PDE単独
の場合よりも100倍高い親和性で、Ca2+/CaM−PDE複合体
に結合する。Hansen et al.,1986,supra。59および61kD
aイソ酵素は、ほとんど同一の基質特性ならびに動力学
定数を有している。Krinks et al.,Adv.Cyc.Nucleotide
Prot.Phosphorylation Res.,16:31−47(1984)は、ペ
プチド解析実験を基にして、心臓59kDaタンパク質が脳6
1kDaイソ酵素のタンパク質分解形態であると示唆してい
る。
実質的に相違する。63kDa酵素は、59および61kDa酵素に
結合するモノクローナル抗体によって認識されない。Ha
nsen et al.,1986,supra。61kDaタンパク質が燐酸化さ
れるのに対し、63kDaタンパク質は、cAMP依存性タンパ
ク質キナーゼによってin vitroでは燐酸化されない。そ
して、63kDaタンパク質は、CaM−キナーゼIIによっての
みin vitroで燐酸化される。Sharma et al.,Proc.Natl.
Acad.Sci.(USA),82:2603−2607(1985);およびHas
himoto et al.,J.Biol.Chem.,264:10884−10887(198
9)。しかしながら、ウシ脳からの61および63kDa CaM−
PDEイソ酵素は、同様のCaM−結合親和性を有するように
思われる。Staphylococcal V8プロテアーゼで限界タン
パク分解して調製したペプチド地図、Sharma et al.,J.
Biol.Chem.,259:9248(1984)は、61および63kDaタンパ
ク質は異なるアミノ酸配列を有することを示唆してい
る。
水分解を刺激する、非触媒作用、cGMP−特異性部位を有
するものと提案された。Stoop et al.,J.Biol.Chem.,26
4:13718(1989)。この酵素は、生理学的サイクリック
・ヌクレオチド濃度にて、cAMPの向上した加水分解によ
って、高められたcGMP濃度に応答する。そして、cGS−P
DEは、cAMP−介在反応を調節もしくは阻害するために、
cGMP濃度の上昇を許容する。本出願の発明者との共同執
筆に係る最近の、LeTrong et al.,Biochemistry,29:102
80(1990)に載せられた主要配列は、調節特性ならびに
この酵素の領域基礎構造を理解し、および異なるシグナ
ルに応答する他のPDEイソ酵素と比較するための分子骨
格が提供されている。この文献は、cGS−PDEをコードす
る2.2kbウシ副腎皮質cDNA断片のクローニングも述べて
いる。ラット褐色細胞腫細胞からの「Type II PDE」の
クローニングを報告しているThompson et al.,FASEB
J.,5(6):A1592(Abstract No.7092)も参照のこ
と。
重要な役割の発見に伴い、特異性PDEイソ酵素を選択的
に活性化あるいは阻害する薬剤の発見に努力が払われて
きた。細胞性PDE活性に影響を及ぼし、そして細胞性cAM
Pを改変する薬剤は、広範な疾患および生理学的条件を
制御するために積極的に使用できる。PDEsを阻害するこ
とによりcAMPレベルを向上するいくつかの薬品が使用さ
れているが、一般的には広範な非特異的阻害剤として機
能し、目的としない型の組織および細胞におけるcAMP活
性に関して心身に有害な副作用を呈する。従って、選択
されたPDEイソ酵素に特異的な薬剤が必要とされていた
のである。特異的PDEイソ酵素の選択的阻害剤は、強心
薬剤、抗抑制薬、抗高血圧、抗血栓症、および他の薬剤
として有用であろう。しかしながら、特定の分析用調製
物中に存在する特定のPDEイソ酵素を同定することの困
難さがために、作用薬/拮抗薬のスクリーニング研究は
複雑なものであった。さらに、すべてのPDEsが同じ基礎
反応を触媒し、すべてのPDEsの基質特異性が重複してお
り、および、すべてのPDEsが微量でしか存在しない。
みられてきた。各新規イソ酵素を単離および研究する古
典的な酵素学的方法は、精製技術の限界ならびにイソ酵
素の完全な分離がなされたか否かを正確に評価できない
ことによって、妨げられている。第二の方法は、ひとつ
のイソ酵素に寄与し、他の酵素への寄与を最小限にす
る、イソ酵素特異的分析条件を同定するものであった。
他の方法は、免疫学的同定および科集団および/または
各イソ酵素への分離であった。疑いのない同定および特
定のイソ酵素の研究のためのこれら各方法には、時間を
費やし、ある場合には、技術的に非常に困難な確立する
必要のある多数の識別基準という問題がある。その結
果、ほとんどの研究では、一個より以上のイソ酵素を含
むであろう部分的にのみ純粋なPDE調製物を用いて行わ
れていた。さらに、ほとんどの組織における多くのPDEs
は、限定タンパク質分解に非常に感受的であり、その親
物質とは異なる動力学的、調節的、および生理学的特性
を有するであろう活性タンパク質分解生成物を容易に形
成する。
による大量の組織特異性PDEsを単離する能力によって、
大きく促進される。比較的わずかなPDE遺伝子が今日ま
でクローニングされており、クローニングされたこれら
のほとんどが、ホスホジエステラーゼのcAMP特異性(cA
MP−PDEs)の科に属している。Cyclic Nucleotide Phos
phodiesterases:Structure,Regulation and Drug Actio
n,Beavo,J and Houslay,M.D.,Eds.John Wiley & Sons,
New York;1990のDavis,“Molecular Genetics of the C
yclic Nucleotide Pho−sphodiesterases",pp.227−241
を参照のこと。Faure,et al.,PNAS(USA),85:8076(1
988)−D.discoideum;Sass et al.,PNAS(USA),83:93
03(1986)−S.cerevisiae;PDE2と称するPDE class IV;
Nikawa et al.,Mol.Cell.Biol.,7:3629(1987)−S.ce
revisiae;PDE1と称する;Wilson et al.,Mol.Cell.Bio
l.,8:505(1988)−S.cerevisiae;SRA5と称する;Chen
et al.,PNAS(USA),83:9313(1986)−D.melanogaste
r,dnc+と称する;Ovchinnikow et al.,FEBS,223:169(19
87)−ウシ網膜、GMP PDEと称する;Davis et al.,PNAS
(USA),86:3604(1989)−ウサギ肝臓、rat dnc−1
と称する;Colicelli et al.,PNAS(USA),86:3599(19
89)−ウサギ脳、rat DPDと称する;Swinnen et al.,PNA
S(USA),86:5325(1989)−ラット精巣、rat PDE1、PD
E2、PDE3およびPDE4;およびLivi et al.,Mol.Cell.Bio
l.,10:2678(1990)−ヒト単球、hPDE1と称するも参照
のこと。LeTrong et al.,supraおよびThompson et al.,
supraも参照のこと。
る哺乳類cDNAクローンを検出し、単離するために用いら
れてきた。Calicelli et al.,PNAS(USA),86:3599(1
989)には、S.cerevisiae発現ベクターでのラット脳cDN
Aライブラリーの構築、該ライブラリーからの酵母にお
いてRAS2va119の表現型効果を抑制するよう機能する能
力がある遺伝子の単離、ヒトHRAS遺伝子の発癌変異体に
対するRAS2遺伝子類似体の変異体を報告している。クロ
ーニングされ、DPD(ラットdunce様ホスホジエステラー
ゼ)と称されたcDNAは、酵母株TK161−R2V(A.T.C.C.74
050)にある活性化RAS2Va119と関連する生長調節の欠
損、ならびに酵母PDE遺伝子座(pde-1、pde-2)双方に
て欠陥のある酵母変異株10DAB(A.T.C.C.74049)の生長
調節表現型の類似体欠陥を相補あるいは「救済」する能
力を有している。高親和性cAMP特異性ホスホジエステラ
ーゼをコードする遺伝子のアミノ酸配列は、Drosophila
melanogasterのdunce座によってコードされるcAMP特異
性ホスホジエステラーゼと高い相同性を示す。
出願日まで、哺乳類Ca2+/カルモジュリン刺激またはcGM
P刺激PDEs(PDE科IおよびII)のいずれもコードするDN
A配列のクローニングおよび発現は報告されておらず、
従って、当該分野においては、引き続き、これらPDEsの
完全なヌクレオチド配列情報が要望されているのであ
る。
/カルモジュリン刺激サイクリック・ヌクレオチド・ホ
スホジエステラーゼおよびcGMP刺激サイクリック・ヌク
レオチド・ホスホジエステラーゼ・ポリペプチドの発現
をコードする新規に精製され、単離したポリヌクレオチ
ド配列(例えば、センスおよびアンチセンス鎖を含むDN
AおよびRNA)を提供する。本発明によって提供されたゲ
ノミックおよびcDNA配列は、メッセンジャーRNAへのin
vivoおよびin vitroでの転写を許容する、プロモータ
ー、オペレーター、レギュレーター、ターミネーターな
どの同種あるいは異種発現調節DNA配列、そして、機能
性ホスホジエステラーゼおよび関連ポリペプチドを大量
に調製するためのmRNAsの転写に関連があるものと思わ
れる。
およびブダペスト条約の規定に従って、1991年4月11お
よび15日ならびに1992年4月14日の、American Type Cu
lture Collection,12301 Parklawn Drive,Rockville,Ma
ryland 20852への寄託の対象となった細菌プラスミドお
よびウィルス・ベクターでの哺乳類DNA挿入体として存
在する、ホスホジエステラーゼおよびその断片をコード
する哺乳類DNA配列である。本発明に関連して寄託したD
NAsには、下記のものを含む。
入体を含む大腸菌(A.T.C.C.受託No.68576)中のプラス
ミドpCAM−40; 2. 63kDa CaM−PDEイソ酵素をコードするウシ脳cDNA挿
入体を含む大腸菌(A.T.C.C.受託No.68577)中のプラス
ミドp12.3A; 3. 61kDa CaM−PDEイソ酵素を断片的にコードするヒト
海馬cDNA挿入体を含むバクテリオファージλCaM H6a
(A.T.C.C.寄託No.75000); 4. 61kDa CaM−PDEイソ酵素をコードする混成ヒトcDNA
挿入体を含む大腸菌(A.T.C.C.受託No.68963)中のプラ
スミドpHcam61−6N−7; 5. 61kDa CaM−PDEに相同な新規のPDEをコードするヒト
海馬cDNA挿入体を含む大腸菌(A.T.C.C.受託No.68964)
中のプラスミドpcamH3EF; 6. 61kDa CaM−PDEに相同な新規のPDEをコードするヒト
心臓cDNA挿入体を含む大腸菌(A.T.C.C.受託No.68965)
中のプラスミドpcamHella; 7. cGS−PDEイソ酵素をコードするウシ副腎cDNA挿入体
を含む大腸菌(A.T.C.C.受託No.68579)中のプラスミド
p3CGS−5; 8. cGS−PDEイソ酵素断片をコードするウシ脳cDNA挿入
体を含む大腸菌(A.T.C.C.受託No.68578)中のプラスミ
ドpBBCGSPDE−5; 9. cGS−PDEイソ酵素をコードするウシ脳cDNAを含む大
腸菌(A.T.C.C.受託No.68580)中のプラスミドpBBCGSPD
E−7; 10. cGS−PDEイソ酵素断片をコードするヒト心臓cDNAを
含む大腸菌(A.T.C.C.受託No.68583)中のプラスミドpG
SPDE6.1; 11. cGS−PDEイソ酵素断片をコードするヒト海馬cDNA挿
入体を含む大腸菌(A.T.C.C.受託No.68585)中のプラス
ミドpGSPDE7.1;および 12. cGS−PDEイソ酵素断片をコードするヒト海馬cDNA挿
入体を含むプラスミドpGSPDE9.2(A.T.C.C.受託No.6858
4)。
(A.T.C.C.受託No.68962)中のプラスミドpHcgs6n。
M−PDEをコードするヌクレオチドを含み、配列番号:16
および17のDNA配列およびアミノ酸配列で特徴付けられ
るウシcDNA配列である。
くは酵素断片の発現のために操作的に連繋した、転写プ
ロモーターを含むDNA構築物、PDEあるいはその断片をコ
ードするDNA配列、および転写ターミネーターに関す
る。構築物は、宿主細胞、好ましくは真核細胞、より好
ましくは哺乳類もしくは酵母細胞を形質転換あるいは形
質変換するために用いるのが好ましい。大量生産の目的
で、発現したPDEは、例えば、免疫親和的精製により細
胞から単離できる。
核および真核宿主細胞への、適切なDNAおよびRNAウィル
スベクターおよび環状DNAプラスミドベクターを含む、D
NA配列の組み込みも本発明の範疇にあり、今まで自然界
から多量の入手ができなかった有用なタンパク質の提供
も期待される。本発明によって提供されたシステムは、
上述したものを含んだ形質転換した大腸菌細胞、ならび
に、酵母および哺乳類細胞を含んだ他の形質転換した真
核細胞を含む。哺乳類宿主細胞は、本発明の組み換え発
現物質に関する至適生物学的活性を参照する必要に迫ら
れることから、翻訳後の修飾(例えば、先端削除、脂質
化、およびチロシン、セリン、もしくはスレオニン燐酸
化)への使用が予想される。
生成物、およびCaM−PDEの一次構造配座(すなわち、ア
ミノ酸配列)を有するポリペプチド、およびcGS−PDEタ
ンパク質ならびにそのペプチド断片、および、複製する
よう組み立てられた、そのアミノ酸配列の合成ペプチド
を含む。本発明のタンパク質、タンパク質断片、および
合成ペプチドは、治療、診断、および予後での用途を含
む多くの用途を意図しており、本発明のタンパク質と特
異的に免疫反応するモノクローナルおよびポリクローナ
ル抗体の基礎を提供するであろう。
免疫特異性で結合し、他のタンパク質と共通しない独特
のエピトープを認識する能力によって特徴付けられる
(ポリクローナルおよびモノクローナル抗体、キメラ抗
体、一本鎖抗体などを含む)抗体基質が、本発明によっ
てさらに提供される。本発明のモノクローナル抗体は、
CaM−PDEsおよびcGS−PDEsの親和的精製、例えば、Hans
en et al.,Meth.Enzymol.,159:543(1988)、に使用で
きる。
は変異形態、およびそれに関連した核酸(例えば、DNA
およびmRNA)の検出および/または定量のための新規の
手法が、本発明によってさらに提供される。例示的に、
本発明の抗体は、流体および組織標本中のこれらタンパ
ク質、および適切に標識付けされ、これらタンパク質を
コードするmRNAの定量検出のために用いられるであろう
本発明のDNA配列の定量検出のための公知の免疫学的手
法において用いられるであろう。
クレオチド配列をコードする新規のCaM−PDEおよびcGS
−PDE、(b)本明細書に記載した条件とほぼ同等、あ
るいはそれより寛容なハイブリダイゼーション条件下
で、新規のCaM−PDEおよびcGS−PDEをコードする配列と
ハイブリダイズする哺乳類CaM−PDEあるいは哺乳類cGS
−PDEの活性を有するポリペプチドをコードし、本発明
のcDNAsの初期単離に用いられたポリヌクレオチド配
列、および(c)少なくとも部分的に、変性コドンを使
用する時に、同じもの(もしくは、対立性変異体もしく
は類似体ポリペプチド)をコードするポリヌクレオチド
配列がある。ポリヌクレオチド配列および該ポリヌクレ
オチド配列ならびにベクターで形質転換あるいは形質変
換された原核および真核宿主細胞に組み込まれたウィル
スDNAおよびRNAベクターあるいは環状プラスミドDNAベ
クター、ならびに、これら宿主の培養成長によるこれら
タンパク質の組み換え生成のための新規の方法、および
宿主あるいはその培地からの発現タンパク質の単離が、
対応して提供される。
調節できる化合物を同定するための組成物と方法を提供
する。そのような方法は、組み換えPDEポリペプチドを
発現する真核細胞でPDE調節活性が評価される化合物を
インキュベートし、遺伝子発現によってもたらされるホ
スホジエステラーゼ活性に関する該化合物の効果を決定
することを含む。この方法は、全細胞あるいは細胞溶解
調製物のいずれでも効果的である。好ましい態様におい
て、真核細胞は、酵母細胞もしくは内因性ホスホジエス
テラーゼ活性が欠けている哺乳類細胞である。ホスホジ
エステラーゼ活性に関する化合物の効果は、cAMPおよび
/またはcGMPの加水分解を観察する生物化学的分析法、
あるいは組み換えPDEポリペプチドの有無に関連する真
核細胞の表現型特性の改変に関する化合物の効果を追跡
することにより、決定することができる。
々の例示的実施例を含む下記の本発明の詳細な説明、図
面に関する記載を考慮すれば明確になるであろう。
に並べた、単離した59kDa(ウシ心臓)および63kDa(ウ
シ脳)CaM−PDEタンパク質のアミノ酸配列決定の結果を
示している。61kDaイソ酵素に対する59および63kDaタン
パク質の同一部分を下線で示した。仮想同一部を半行下
がりで示し、およびハイフンは、未同定残基を示してい
る。リシルペプチドでブロックしたアミノ末端の組成物
からメチオニルペプチド(mDDHVTIRRK)を除去すること
で決定される、59kDaイソ酵素のN−末端を括弧で示し
た。黒塗枠を、61および59kDaイソ酵素で同定したCaM−
結合部位中の残基上に置いた。
ウシ脳からの61kDa CaM−PDEの単離、精製、および配列
決定、ならびに哺乳類宿主細胞でのその発現に関する。
実施例IIは、ウシ肺からの59kDa CaM−PDEの単離、精
製、および配列決定、ならびに哺乳類宿主細胞でのその
発現に関する。実施例IIIは、ウシ脳からの63kDa CaM−
PDEの単離、精製、および配列決定、ならびに哺乳類宿
主細胞でのその発現に関する。実施例IVは、ウシ副腎皮
質からのcGS−PDE cDNAの単離、精製、および配列決
定、ならびに哺乳類宿主細胞でのDNAの発現に関する。
実施例Vは、ウシ脳からのcGS−PDE cDNAの単離、精
製、および配列決定、ならびに哺乳類宿主細胞でのその
発現に関する。実施例VIは、ヒトcGS−PDE cDNAの取
得、およびcGS−PDEをコードするヒトcDNAの開発のため
の、cGS−PDEウシ副腎cDNAの使用に関する。実施例VII
は、ヒトCaM−PDE 61kDa cDNAおよび新規構造の関連cDN
Aの取得のための、CaM−PDE 61kDaウシ脳cDNAの使用に
関する。実施例VIIIは、酵母表現型欠陥の相補性および
発現生成物のホスホジエステラーゼ活性の確認のため
の、ウシおよびヒトPDE cDNAの発現に関する。実施例IX
は、ノザン分析および本発明のポリヌクレオチド(特
に、cDNAsおよびアンチセンスRNAs)を用いたRNアーゼ
保護研究を含む組織発現研究に関する。
場合、J.Biol.Chem.,261:13−17(1986)にて報告され
た、下記表Iの一文字表記を、不明瞭なヌクレオチド配
列のために用いることを勧める。
び配列決定 この実施例では、タンパク質のアミノ末端をコードす
る61kDaウシ脳CaM−PDEの遺伝子部分に相当するcDNA配
列が、ウシ脳mRNAから調製した第一鎖状cDNAsのコレク
ションからPCRによって単離された。PCR−調製した断片
は、全長ウシ脳CaM−PDE配列を単離するために用いられ
た。
6−159(1987)の方法を用いて、ウシ心臓から調製さ
れ、そしてmRNAが、Poly(A)Quick(登録商標)mRNA
精製キットを用いて、その使用説明書に従って選択され
た。第一鎖状cDNAは、50mM Tris HCl(pH8.3、42℃)、
10mM MgCl2、10mMジチオトレイトール、0.5mM(それぞ
れ)デオキシヌクレオチド三燐酸、50mM塩化カリウム、
2.5mMナトリウムピロ燐酸、5μgデオキシチミジル酸
オリゴマー(12−18塩基)および65℃で15分間かけて変
性した5μgウシ心臓mRNAを含む反応混合物(最終体積
40μl)に、AMV逆転写酵素の80単位を加えることによ
って合成された。
ベルした1μlのdCTP(3000Ci/mmol)が混合された。
反応物は、42℃で60分間インキュベートした。反応物
は、フェノール/塩化メチル抽出され、エタノール沈澱
された。核酸ペレットが、10mM Tris−HCl(pH7.5)/0.
1mM EDTAの50μlに、最終濃度が、15ng/μlになるよ
う再懸濁した。
スおよびアンチセンス・オリゴマーは、目的鋳型に特異
的にハイブリダイズするに充分な長さにまで、最小限の
冗長になるようにデザインされている。
pplied Biosystems社製のDNA合成機で合成した。そのオ
リゴマーは、下記アミノ酸配列; に特異的な下記配列を有していた。
された。
0mM塩化カリウム、10mM Tris−HCl(pH9.0)、1.5mM Mg
Cl2、0.01%ゼラチン、0.1%Triton X−100、0.2mM(そ
れぞれ)デオキシヌクレオチド三燐酸、1μM(それぞ
れ)CaM PCR 2SおよびCaM PCR−3ASオリゴマー、および
Thermus aquaticus DNAポリメラーゼの2.5単位を含む反
応混合物に、15ngの第一鎖状cDNAを加えることによって
合成された。反応物は、90℃で1分間、50℃で2分間、
および72℃で2分間の、30サイクルでインキュベートし
た。反応生成物は、0.5μg/mlエチジウムブロミドを含
んだ0.04M Tris−酢酸/0.001M EDTA緩衝液を用いた1%
アガロースゲルにて精製した。DNA生成物は、紫外線で
視覚化され、カミソリ刃でゲルからていねいに切り出さ
れ、Geneclean II試薬キットを用いて精製され、そし
て、EcoR Vで切り出されたpBluescriptベクターDNAに繋
がれた。
ために、サブクローニングしたPCR DNA生成物を、T3お
よびT7プロモータープライマー、およびSequenaseある
いはTaqポリメラーゼ配列決定キットのいずれかを用い
て、末端から配列決定を行った。DNAのこの断片の各末
端から約250塩基が配列決定され、図1の59および61kDa
CaM−PDEsのアミノ酸配列と対応するcDNAからの推定ア
ミノ酸配列が、PCR DNA生成物はCaM PDE cDNAの一部で
あることを確認した。
された)ラムダZAPベクターで構築されたウシ脳cDNAラ
イブラリーは、PCR増幅により得られた放射ラベルした6
15bp CaM−PDE cDNAでスクリーニングした。プローブ
は、Feinberg et al.,Anal.Biochem.,137:266−267(19
84)の方法を用いて調製し、[32P]−ラベルしたDNA
は、Elutip−D(登録商標)カラムを用いて精製した。
円形フィルターに結合したプラーク(12−150mmプレー
ト上での700,000プラーク)を、50%ホルムアミド、20m
M Tris−HCl(pH7.5)、1X Denhardt溶液、10%デキス
トラン硫酸、0.1%SDSおよび106cpm/mlの[32P]−ラベ
ルしたプローブ(109cpm/μg)を含む溶液中で、42℃
で、終夜ハイブリダイズした。フィルターは、室温で、
15分間、2X SSC/0.1%SDSで三度洗浄し、次いで、45℃
で、15分間、0.1X SSC/0.1%SDSで二度洗浄した、フィ
ルターは、終夜X線フィルムに曝された。
6個のプラークの内、任意に選択した8個のクローン
を、再培養およびスクリーニングを数回行うことにより
精製し[Maniatis et al.,Molecular Cloning:A Labora
tory Manual 545pp.Cold Spring Harbor Laboratory,Co
ld Spring Harbour,N.Y.,(1982)]、挿入cDNAは、製
造者が勧めているように、in vvivo削除[Short et a
l.,Nuc.Acids Res.,16:7583−7599(1988)]により、p
Bluescript SK(−)にサブクローニングされた。
coR Iを用いた制限分析に供した。適切な長さの二つの
クローンが、Taq Tak(登録商標)およびSequenase(登
録商標)配列決定キットを用いた配列解析のために選択
された。その二つのクローンとは、pCAM−40(2.3kb)
とpCAM−34(2.7kb)である。この方法からの配列情報
は、pCAM−40の挿入が、ウシ脳61kDa CaM−PDEの全長の
コードすることを確認した。このクローンの配列、およ
びそこから推定されたアミノ酸配列を、配列番号:5およ
び6に示した。
E cDNAの過渡発現を下記のようにして、行った。大腸菌
宿主細胞MC1061−p3中のベクターpCDM8[Seed,Nature,3
29:840−843(1987)]は、マサチューセッツ州、ボス
トンのマサチューセッツ総合病院のBrian Seed博士より
提供を受けた。このベクターは、Invitrogen社(カリフ
ォルニア州、サンジエゴ)からも入手できる。プラスミ
ドpCAM−40は、Hind IIIおよびNot Iで消化され、Hind
IIIおよびNot Iで消化されたCDM8ベクターDNAに繋がれ
る2.3kb断片を産生した。得られたプラスミドは、MC106
1−p3細胞にて増殖された。プラスミドDNAは、Ausubel
et al.,eds.,Current Protocols in Molecular Biolog
y,1:1.7.1(John Wiley & Sons,New York,1989)のア
ルカリ溶解法を用いて調製され、Qiagen−Tip 500カラ
ム(Qiagen社、カリフォルニア州、チャッツワース)を
用いて、使用説明書に従って精製した。
seqのDEAEデキストラン法を用いて、p−CAM−40/CDM8
構築物(あるいは、CDM8ベクターのみで形質変換したモ
デル)で形質変換された。具体的には、エタノール沈澱
したDNAの10μgを80μl TBS緩衝液に再懸濁し、10%Nu
Serumを補ったDMEMの4ml中の50%融合性COS−7細胞の1
00mmプレートに、10mg/ml DEAEデキストランの160μl
を滴下して加え、渦巻攪拌して混合した。細胞は、水飽
和、7%二酸化炭素雰囲気下で、37℃で、3−4時間イ
ンキュベートした。培地を取り除き、細胞を直ちに、PB
S中の10%DMSOで1分間処理した。この処理の後、細胞
はPBS、次いでDMEMで洗浄され、そして最終的に、10%
胎児ウシ血清ならびに抗生物質(50μg/mlストレプトマ
イシン硫酸)を補ったDMEMにて、7%二酸化炭素インキ
ュベーターで、36時間培養した。
l(pH=7.5)、5mM EDTA、15mMベンズアミジン、15mM
β−メルカプト・エタノール、1ml当たり1μgのペプ
スタチンA、および1ml当たり1μgのロイペプチンを
含む緩衝液(100mmプレート当たり1ml)にて、Dounceホ
モジェナイザーで均質化した。均質化物は、基質として
[3H]cGMPを用いて、Hanson et al.,Proc.Nat'l.Acad.
Sci.,U.S.A.,79:2788−2792(1982)の方法に従って、P
DE活性について分析された。20mM Tris−HCl(pH=7.
5)、20mMイミダゾール(pH=7.5)、3mM MgCl2、15mM
酢酸マグネシウム、1ml当たり0.2mgのBSA、および2mM E
GTAもしくは0.2mM塩化カルシウムを伴う1μM 3H−cAM
P、および1ml当たり4μgのCaMを含む緩衝液にて、30
℃で、10分間反応を行った。分析は、90℃の水浴で試験
管を1分間インキュベートすることで終了した。冷却
後、1ml当たり2.5mgのヘビ毒10μlを各分析物に添加
し、37℃で、5分間インキュベートした。試料は、20mM
Tris−HCl(pH=7.5)の250μlで希釈され、直ちに0.
7ml A−25イオン交換カラムに適用された。カラムは20m
M Tris−HCl(pH=7.5)の0.5mlで三度洗浄され、シン
チレーション瓶に回収された。試料は、シンチレーショ
ン計測器Packard Model 1600TRを用いて、1分間計測し
た。特異的サイクリック・ヌクレオチド加水分解活性
が、1mgタンパク質当たりの1分当たりに加水分解され
たcAMPあるいはcGMPのピコモルとして表現される。タン
パク質濃度は、標準としてBSAを用いた、Bradford,Ana
l.Biochem.,72:248−254(1976)の方法に従って見積も
った。模擬的に形質変換した細胞と比較して、pCAM−40
cDNAで形質変換した細胞の抽出物は、EGTAの存在下
で、非常に大きなcAMPおよびcGMP加水分解活性を有して
いた。カルシウムおよびCaMの存在下での、pCAM−40cDN
A形質変換細胞の分析は、cAMPおよびcGMP加水分解の刺
激を示す結果となった。
決定 ウシ心臓59kDa CaM−PDEからアミノ酸配列 に対応する完全に変性したセンス・オリゴヌクレオチ
ドが合成された。このオリゴヌクレオチドのヌクレオチ
ド配列は、 の配列を有するアミノ酸配列 に対応する、ウシ脳61kDa CaM−PDEの図1の配列か
ら、アンチセンス・オリゴヌクレオチドがデザインされ
た。
うな)ウシ心臓第一鎖状cDNAを用いたPCR反応を起こす
ために使われた。この反応では、59kDa配列独特の75b
p、54pb、ならびに59kDaと61kDaイソ酵素との間で共有
される21bpのPCR生成物が予想される。PCR生成物は、ア
ガロースゲル電気泳動を篩うことによって分析され、76
bpに泳動しているバンドをゲルから削り取った。DNA
は、pBluescript KS+にサブクローニングされ、青/白
選択法による陽性コロニーが、ベクター配列に対抗する
プライマーを使用したPCRによってスクリーニングされ
た。適当な大きさの挿入体を有するコロニーが選択さ
れ、これらの一つ(pCaM59/75.14)が配列決定のために
選抜された。Quiagen P20プッシュ・カラムを用いて、
プラスミドDNAが調製され、ジデオキシ法を用いた配列
決定での鋳型として用いられた。PCR生成物の配列は 配列の分析では、得られた配列と予想していた配列と
の間に二つのコドンの相違が認められた。センス・オリ
ゴヌクレオチドプライマー配列の再検討は、二つのコド
ンのふとした転位が、オリゴヌクレオチドのデザインに
おける誤りを導くことを示していた。59および61kDaイ
ソ酵素との重複が最小限である54bp生成物と思われる二
番目のオリゴヌクレオチドPCRプライマー対に加えて、
最初のセンス・プライマーのデザインでの誤りが訂正さ
れた第二センス・プライマーが調製された。センス・オ
リゴヌクレオチドは、配列 を有しており、アンチセンス・オリゴヌクレオチド
は、配列 このプライマー対は、鋳型としてウシ心臓第一鎖状cD
NAを用いたPCR反応を起こすために用いられ、PCR生成物
は上記したように、サブクローニングされ、正確にスク
リーニングされた。二つのクローン(pCaM59/54.9およ
びpCaM59/54.10)が挿入体の大きさを基にして、配列決
定のために選択され、上記したように配列決定され、双
方のクローンが、アミノ酸配列 が予想される、予想された配列 の54bp挿入体を含んでいた。
腎皮質ライブラリーのスクリーニングに関する、下記、
実施例IVに記載された手法を用いてスクリーニングし
た。約1.2×106プラーク形成単位が、32P−ラベルしたp
CAM−40 cDNAの1.6kb EcoR I制限エンドヌクレアーゼ開
裂生成物でプローブ検定された。この最初のスクリーニ
ングで、四つの推定59kDa CaM−PDE cDNAクローンが生
成した。予備的な配列解析にて、p59KCAMPDE−2と称す
る、一つのクローンが、推定59kDa CaM−PDEの完全なコ
ード配列を含んでいることを示した。一連の入れ子状欠
失が、p59KCAMPDE−2プラスミド[Sonnenburg et al.,
J.Biol.Chem.,266(26):17655−17661(1991)参照]
から構築され、得られた鋳型の配列決定をTaq DyeDeoxy
(登録商標)ターミネーター・サイクル・配列決定キッ
トおよびApplied Biosystems Model 373A DNA配列決定
システムを用いて行った。DNAと推定アミノ酸配列を、
配列番号:16および17にそれぞれ示した。cDNAにある大
きな読取枠が、アミノ末端18残基を除く、61kDa CaM−P
DEアミノ酸配列とほぼ同一の約59キロダルトンの推定分
子量を伴う515残基ポリペプチドをコードする。さら
に、p59KCAMPDE−2読取枠の予想されたアミノ酸配列
は、ウシ心臓から精製された59kDa CaM−PDEの利用可能
な配列、Novack,et al.,Biochemistry,30:7940−7947
(1991)と同一である。これら結果は、p59KCAMPDE−2
cDNAが、59kDa CaM−PDEをコードするmRNA種であること
を意味している。
に達成された。具体的には、2.66kbの、p59KCAMPDE−2
cDNAのEcoR I/ブラント・エンドした断片が、Xho Iで消
化され、およびブラント・エンドされたpCDM8にサブク
ローニングされた。p59KCAMPDE−2称する組換えプラス
ミドが、COS−7細胞を一過的に形質変換するために用
いられ、形質変換したCOS−7細胞から調製された抽出
物は、2μM cAMPを用いてCaM−PDE活性に関して分析さ
れた。p59KCAMPDE−2 cDNAで形質変換したCOS−7細胞
は、カルシウムおよびカルモジュリンの存在下で、4〜
5倍の刺激を受けたcAMP加水分解活性を産生した。模擬
的に形質変換したCOS−7細胞では、カルモジュリン刺
激cAMP加水分解活性は検出されなかった。
定 図1にて報告されたアミノ酸配列に対応する多数の全
体的および部分的冗長なオリゴヌクレオチドが、63kDa
CaM−PDEのためのcDNAクローンを取得する試験に使用す
るために合成された。ポリメラーゼ連鎖反応に用いられ
たアニーリング温度は、各センス−アンチセンス対の最
も低い融解オリゴヌクレオチドのための理論的融点より
低い2〜20℃の間で変化した。後述するプローブ63−12
sおよび63−13aを除いて、多様な条件下でのオリゴヌク
レオチド対の各々のPCR生成物は、アガロース・ゲル電
気泳動した時に、複数のエチジウムブロミドの帯を形成
した。63−12sおよび63−13aの使用は、配列決定した時
に、63kDa CaM−PDEをコードするためのPCR生成物に帰
する結果となった。
クレオチドは、61kDaウシCaM−PDEs(図1参照)に保存
されているアミノ酸配列 を基にして、下記配列 を含むように組み立てられた。63−13aと称する部分
的冗長なセンス32−merオリゴヌクレオチドは、 の配列を有しており、さらに63kDa CaM−PDEに保存さ
れている下記配列 ウシ大脳皮質および選択されたポリA+からメッセンジ
ャーRNAが調製された。第一鎖状相補性DNAが、AMVまた
はMMLV逆転写酵素を用いて生成された。脱トリチル化し
たオリゴヌクレオチドは、1×106cpm/nmolの1mM[γ−
32P]ATPおよびT4ポリヌクレオチドキナーゼを用いて燐
酸化した。NENsorb 20カラムを用いた遊離ATPからの5'
32P−ラベルしたオリゴヌクレオチドの分離の後、それ
ぞれが20μM(5'燐酸)ストックとして懸濁され、最終
的にPCRにおいてそれぞれ400nMにて合わされる。反応
は、約1μgのPCR生成物を得るために、50ng全cDNAお
よび200μM dNTPを用いて実施された。反応には、5分
間・94℃の最初の変性工程に続いて、1分間・94℃の変
性、1分間・50℃のアニーリング工程、および2分間・
72℃の伸長工程の30サイクルが含まれていた。反応条件
下にて、450塩基対の単一のエチジウムブロミド染色バ
ンドが、100ngのPCR生成物のアガロースゲル電気泳動に
て得られた。5'燐酸化PCR生成物の5μgが、5%PEG−
6000中のT4 DNAリガーゼを用いて、21℃で、12時間かけ
て、15ng EcoR V−切断Bluescript KS(+)プラスミド
に繋いだ。XL 1−blue形質転換の推定陽性体は、発色選
択のためのイソプロピルチオガラクトシド(IPTG)およ
びブロモ−クロロ−インドリル−ガラクトシド(Xgal)
を用いれば白いコロニーを形成した。この精選物は、T3
もしくはT7プライマー、ジデオキシヌクレオチド・ター
ミネーター、およびシークエナーゼを用いて配列決定を
行った。
および配列番号:23にそれぞれ示した、ヌクレオチド配
列および翻訳したアミノ酸配列を有していた。オリゴヌ
クレオチド63−12sに見られたアミノ酸YEHへのコドン
は、p11.5Bにあるアミノ酸配列NTRへのコドンに取って
代わられた。これはおそらく、63−12sでの汚染物質に
よるものであろう。翻訳した読取枠(ORF)が、図1に
て報告された63kDa CaM PDEと類似しているので、p11.5
Bは、cDNAクローン全長について、ウシ脳cDNAライブラ
リーをスクリーニングするために用いられた。
た。第一鎖状cDNAは、第二鎖状cDNAを合成するために、
RNase H、E.coli DNAポリメラーゼ、およびE.coli DNA
リガーゼで処理された。cDNAは、T4−DNAポリメラーゼ
でブラントエンドされ、cDNAのEcoR I部位は、EcoR Iメ
チラーゼおよびS−アデノシルメチオニンで保護され、
T4 DNAリガーゼを用いてEcoR Iリンカーがそこに繋がれ
た。EcoR I制限酵素処理した後、遊離リンカーが、Seph
arose CL−4Bを用いたゲル濾過によってcDNAから分離さ
れた。λ ZAP IIの腕はcDNAに繋がれ、Stratagene社か
ら入手したin vitro Gigapack Coldパッケージング・キ
ットによってまとめた。9.5×105の組換体が、IPTGおよ
びX−galを置くことによって検定した5.8%非組換体プ
ラークによって得られた。ライブラリーは、プレート溶
解法によって、1.4×107pfu/mlにまで一度増幅された。
スクリーニングが実施された。ハイブリダイゼーション
時に32P−ラベルしたオリゴヌクレオチド63−1sを用
い、そして40℃の温度で洗浄して、700,000pfuがスクリ
ーニングされた。オリゴヌクレオチド63−1sは、アミノ
酸配列 を有する完全に冗長な23−merである。
スクリーニングが、このスクリーニング法を用いて認め
られた非常に高いバックグラウンドによって妨げられ
た。それ故、最初に選び取った各々がプールされ、プー
ルした内の50,000pfuが任意のプライマーおよび[α−
32P]dCTPによって放射標識付けされたp11.5Bと取り代
えられ、再スクリーニングされた。プラーク精製した一
つの陽性体が得られ、そしてプラスミドp12.3aとして取
得した。そのDNA配列を配列番号:26に示した。そして、
ウシ大脳皮質ライブラリーが、p11.5Bでさらにスクリー
ニングされた。さらに二つの独立したクローン、p12.2
7.9およびp12.27.11が、最初のスクリーニングでの1.4
×106pfuから得られた。これらは、プラーク精製され
て、配列決定のために取得された。
M−PDEから単離された整列したペプチドのほとんどのタ
ンパク質配列をコードする。配列番号:26および配列番
号:27に、p12.3aのコード領域(すなわち、約2.5キロベ
ース挿入体の1844ヌクレオチド)を示した。塩基番号24
8−290は、アミノ酸配列 をコードする一方で、対応するペプチド(図1)は、 を有していた。
1)配列は、 p12.3aのいかなる読取枠にも、非整列の63kDaペプチ
ド配列は認められず、また翻訳した、p12.3aの読取枠分
子量は60,951であり、63,000ではなかった。それ故、こ
のcDNAは、63kDaタンパク質のイソ酵素変異体を意味し
ている。他の二つの独立したクローン(p12.27.9および
p12.27.11)は、p12.3aと同一の読取枠配列を有してい
るように思われる。一方のクローンの読取枠は、p12.3a
のヌクレオチド番号823から始まり、その終止コドン通
じてp12.3aと同一である。他方のクローンは、p12.3aの
ヌクレオチド番号198から開始し、その長さからしてp1
2.3aと同一である。三つのクローンのいずれも、p11.5B
に変則NTRペプチド配列を持っておらず、三つすべて
が、61kDa CaM PDEとしてYEHを有している。
下記のようにして行われた。配列番号:26の領域をコー
ドし、BamH I制限部位に位置させたタンパク質を含むプ
ラスミドp12.3のcDNA挿入体の断片が、PCRによって調製
された。具体的には、(推定開始コドンを含んだ)塩基
番号94−117および(終止コドンの3'に近接した配列を
含んだ)配列番号:26の塩基番号1719−1735のアンチセ
ンスに対応するオリゴヌクレオチドが、その5'末端にあ
る二つの一列に並んだBamH I部位によって合成された。
二つのプライマーは、下記の配列を有していた。
長反応を含む、94℃・1分間のインキュベーションか
ら、72℃・2分間のインキュベーションに至る30回のPC
Rサイクルに用いられた。5μgの1665塩基対生成物を
生成するために、100μl反応物には、20μMの各オリ
ゴヌクレオチドならびに鋳型としての100pgのp12.3aを
用いた。
旦抽出され、酢酸ナトリウムに関して0.3Mとされ、およ
びエタノールの二倍量で終夜沈澱された。沈澱物は乾燥
され、50μl中に再水和され、そしてcDNAは、37℃で、
1時間、5単位のBamH I制限エンドヌクレアーゼで消化
された。その後、溶液は1:1フェノール:クロロフォル
ムの等量で一旦抽出された。BamH I5'ならびに3'端を持
つ1641塩基対cDNAは、Qiagen Q−20カラム(Qiagen社、
チャッツワース、カリフォルニア州)およびメーカーが
作成した使用説明書を用いて、水層から精製された。
カリフォスファターゼ処理したBluescript KS(+)プ
ラスミドに繋げられた。連繋生成物は、XL1細胞にサブ
クローニングされ、得られた形質転換体は、配列決定に
よりスクリーニングされた。(p11.6.c6と称する)ある
形質転換体は、Bluescript KS(+)Hind III制限部位
が、開始コドンをコードする挿入体の配列の5'側の30塩
基であるように調整したBamH I挿入体を用いて単離され
た。このプラスミドは、1689塩基対断片を遊離するため
に、Hind IIIおよびXba I制限エンドヌクレアーゼで消
化された。この断片は、実施例Iのように、Hind III−
およびXba I−消化したCDM8ベクターDNAに繋いだ。
るいは実施例1に記載したようなDEAE−デキストラン法
を用いてCDM8のみで模擬的に形質変換した。培地中の10
0μg/mlの最終DEAE−デキストラン濃度にて、10μg DNA
/400μg DEAE−デキストランの比率が用いられた。48時
間後、細胞は1mlの均質化緩衝液(40mM Tris−HCl,pH=
7.5、15mMベンズアミジン塩酸、15mM 6−メルカプトエ
タノール、0.7μg/mlペプスタチンA、0.5μg/mlロイペ
プチン、および5mM Na4EDTA)に懸濁され、Dounceホモ
ジェナイザーを用いて氷上に粉砕した。−20℃での貯蔵
用に最終50%(v/v)グリセロールを作成するために、
均質化物は1/2に希釈され、そしてホスホジエステラー
ゼ活性の検定あるいはタンパク質濃度を決定のいずれか
のために使用された。CaM−依存性および非依存性活性
が、実施例1のように決定された。p12.3.a DNAで形質
変換された細胞は、基準レベルからして、15倍に増大し
たCaM−刺激性cAMPホスホジエステラーゼ活性および12
倍に増大したCaM−刺激性cGMPホスホジエステラーゼ活
性を有していた。模擬的に形質変換したCOS−7細胞
は、CaM刺激であっても、基準レベルからして、PDE活性
が認められなかった。
び配列決定、および発現 全RNAが、Chomczynski et al.,supraの方法を用いて
ウシ副腎外皮質から調製した。ポリアデニリル化RNA
を、Poly(A)Quick(登録商標)mRNA精製キットを用
いて、使用説明書に従って、全RNA調製物から精製され
た。第一鎖状cDNAは、80単位のAMV逆転写酵素を、50mM
Tris−HCl(pH8.3、42℃)、10mM塩化マグネシウム、10
mMジチオトレイトール、0.5mM(それぞれ)デオキシヌ
クレオチド三燐酸、50mM塩化カリウム、2.5mMナトリウ
ムピロ燐酸、5μgデオキシチミジル酸オリゴマー(12
−18塩基対)および65℃で、15分間かけて変性した5μ
gウシ副腎皮質mRNAを含む反応混合物(40μl:最終体
積)に添加することにより合成された。反応物は、42℃
で、60分間インキュベートされた。第二鎖状cDNAは、Wa
tson et al.,DNA Cloning:Practical Approach,1:79−8
7(1985)の方法を用いて合成され、cDNAの端は、T4 DN
Aポリメラーゼで鈍化させた。EcoR I制限エンドヌクレ
アーゼ部位は、EcoR Iメチラーゼ(Promega)を用いて
メチル化され[Maniatis et al.,supra]、EcoR Iリン
カー(50倍モル過剰)は、T4 DNAリガーゼを用いてcDNA
に連結された。過剰のリンカーは、cDNAをEcoR I制限エ
ンドヌクレアーゼで消化し、Sepharose CL−4Bクロマト
グラフィーによって除去した。Ausubel et al.,supra。
(1μgベクター当たり25−50ngの)cDNAは、EcoR I消
化した脱燐酸化ZAP(登録商標)II(Stratagene社)ア
ームに連繋し[Short et al.,Nuc.Acids Res.,16:7583
−7599(1988)]、Gigapack(登録商標)Gold抽出物
に、使用説明書に従って包み込んだ[Maniatis et al.,
supra]。
成し、末端をγ−[32P]ATPおよびT4ポリヌクレオチド
キナーゼでラベルした冗長な23−merアンチセンス・オ
リゴヌクレオチド・プローブでスクリーニングした。ア
ミノ酸配列 に対応するオリゴマーが、Applied Biosystems model
380A DNA合成装置を用いて作成された。これらの配列
は、以下の通りである。
0pfu)からのプラークを有する円形の複製ニトロセルロ
ース・フィルターを、6x SSC、1x Denhardt溶液、100μ
g/ml酵母tRNA、0.05%ナトリウムピロ燐酸、および(1p
mol当たり106cpmを超える)10cpm/ml放射ラベルしたプ
ローブを含む溶液中にて、45℃で一晩ハイブリダイズし
た。フィルターを、室温にて、6x SSCで三度洗浄し、続
いて、オリゴマー・プローブの最低融点より10℃低い温
度にて、綿密に調製された6x SSCで洗浄し、そして、X
線フィルムに一晩曝した。
が単離され、そして配列決定された。このクローンの大
きな読取枠によって囲まれたアミノ酸配列は、ウシ心臓
破砕懸濁液の上清画分から精製されたcGS−PDEのペプチ
ド配列と同一であった。LeTrong et al.,supra。
(3CGS−5と称する)4.2kb cDNAを産生する、[32P]
ラベルしたCGS−3:2.1部分cDNAを用いてスクリーニング
された。
あるようにして増幅され、移植され、そして、クローン
CGS−3:2.1からのウシcDNA挿入体でスクリーニングされ
た。プローブは、Feinberg et al.,supraの方法を用い
て調製され、そして、放射ラベルしたDNAが、Elutip−
D(登録商標)カラムを用いて精製された。円形フィル
ターに結合した(12個の150mmプレートにある600,000pf
uの)プラークは、50%ホルムアミド、20mM Tris−HCl
(pH7.5)、1x Denhardt溶液、10%デキストラン硫酸、
0.11%SDS、および106cpm/mlの[32P]ラベルしたプロ
ーブ(109cpm/μg)を含んだ溶液中で、42℃で、一晩
ハイブリダイズした。フィルターは、室温にて、15分
間、6x SSC/0.1%SDSで三度洗浄し、そして、45℃で、1
5分間、0.1x SSC/0.1%SDSで二度洗浄した。フィルター
は、X線フィルムに一晩曝した。Ausubel et al.,supr
a。
が同定された。これらクローンの20個が任意に選択さ
れ、再移植とスクリーニング[Maniatis et al.,supr
a]を数回反復することにより精製され、そして挿入cDN
Asは、製造者が推奨するように、in vivo削除[Short e
t al.,supra]によって、pBluescript SK(−)へサブ
クローニングされた。これらクローンから調製されたプ
ラスミドDNAは、制限分析および/または配列決定によ
り解析された。この研究から、最も大きな読取枠を表現
する4.2kb cDNAが同定された。他の推定クローンからの
cDNA挿入体は短く、挿入端のヌクレオチド配列の基づい
た同一のものであるように思われた。
に、Sequenase(登録商標)あるいはTaq Trak(登録商
標)キットを用いてSangerの方法[Sanger et al.,Pro
c.Natl.Acad.Sci.USA,74:5463−5467]の修正法によっ
て配列決定された。鋳型は、製造者の使用説明書に従っ
たエキソヌクレアーゼIIおよびヤエナリ・ヌクレアーゼ
を用いたベクター、pBluescript SK(−)(Stratagene
社)での一連の巣状削除[Heinkoff,Gene,28:351−359
(1984)]を構築することにより、cDNAsから調製され
た。この方法によって、重複した鋳型が得られなかった
場合には、cDNAsは好適な制限エンドヌクレアーゼ部位
で開裂されてpBluescriptにサブクローニングされる
か、あるいは配列決定のための鋳型を用意するために特
定のオリゴマーが製造される。一本鎖DNA鋳型は、製造
者(Stratagene社)が推奨するように、pBluescriptプ
ラスミド[Levinson,et al.,supra]に宿るヘルパー・
ファージ感染XL1細胞によって分泌されたファージから
のDNAを単離することにより選抜した。GENEBANK(Relea
se 66.0)、EMBL(Release 25.0)、およびNBRF核酸(R
elease 36.0)、およびタンパク質(Release 26.0)デ
ータベースの相同関係調査が、Devereux et al.,Nuc.Ac
ids Res.,12:387−395(1984)のGenetics Computer Gr
oupソフトウェアー・パッケージによって提供されたWor
ldsearch、FASTAおよびTFASTAプログラムを用いて実施
された。
てコードされるヌクレオチド配列および推定アミノ酸配
列を、配列番号:38および配列番号:39に示した。最初の
メチオニン・コドンから始まって、cDNAは算定分子量約
103,000の921残基ポリペプチドをコードする。この配列
に先んじる終止コドンは無いものの、反対開始メチオニ
ン一致配列[Kozak、J.Cell Biol.,108:229−241(198
9)]は同定されていた。転写終止一致配列[Birnstiel
et al.,Cell,41:349−359(1985)]に先んじられたcD
NAの3'端の36アデノシン残基は、cGS−PDE mRNAの3'未
翻訳配列のすべてが、このクローンによって表現されて
いることを示唆している。
20(1975)]の推定ホスホジエステラーゼ欠陥(PPD)
株は、DEAEデキストラン法を用いて、cGS−PDE cDNAで
一過的に形質変換した。cGS−PDE cDNAは、pZEM 228と
称する、亜鉛誘導できるメタロチオネイン・プロモータ
ーに続き、SV40転写終止配列に先がけた、哺乳類発現ベ
クターにある独特のBamH Iクローニング部位に繋がれ
た。DNAは、製造者が指示したように、Qiagen pack−50
0カラムを用いて大規模プラスミド調製物から精製され
た。PPD−S49細胞は、10%心臓不活化ウマ血清、50μg/
mlペニシリンG、および50μg/mlストレプトマイシン硫
酸を含むDMEMにて、37℃、水飽和7%二酸化炭素雰囲気
下で培養した。形質変換に先立って、細胞の集合100mm
プレートは、当初の1/5の密度で、再移植され、24−36
時間インキュベートした。典型的な形質変換実験におい
て、PPD−S49(50−80%集合)は、Tris緩衝化食塩水で
洗浄し、約2×107個の細胞が、1ml TBS中の400μg DEA
Eデキストランと混合した10μgのDNAで形質変換した。
細胞は、20分ごとにゆっくり攪拌して、37℃で、1時間
インキュベートした。次に、最終濃度が10%になるよう
DMSOが添加され、ピペットで吸引・排出して直ちに混合
した。2分後、細胞は15容量部のTBSで希釈され、遠心
分離で回収され、そしてTBSとDMEMで連続的に洗浄し
た。細胞は、完全培地に再懸濁され、新鮮な100mmプレ
ート(1−2x107細胞/10mm/プレート)に播種された。2
4時間後、細胞はTBSのみ、あるいは(最終濃度が125μ
Mの)硫酸亜鉛を含むTBSで処理され、さらに24時間イ
ンキュベートした。最終細胞ペレットは、2mlの均質化
緩衝液(40mM Tris−HCl;pH=7.5、15mMベンズアミジ
ン、15mM β−メルカプトエタノール、0.7μg/mlペプス
タインA、0.5μg/mlロイペプチン、および5mM EDTA)
に再懸濁され、dunceホモジェナイザーを用いて氷上で
粉砕した。均質化物は、4℃で、5分間、10,000xgで遠
心分離され、上清はホスホジエステラーゼ活性およびタ
ンパク質濃度について分析された。
973−1979(1982)にあるように基質として[3H]cAMP
を用いた先に示した方法によって決定した。ホスホジエ
ステラーゼ分析は、三つ並行して行った。標準としてBS
Aを用いたBradford分析法[Bradford,Anal.Biochem.,7
2:248−254(1976)]が、タンパク質を定量するために
用いられた。
るいはベクターのみで形質変換されたPPD S49細胞で
は、基本活性あるいはcGMP刺激ホスホジエステラーゼ活
性の増加は検出されなかった。しかしながら、ベクター
のみでなく、cGS−PDE cDNAで形質変換した亜鉛処理し
た細胞は、cDNAがcGS−PDEをコードすることを示す、cG
MP強化cAMPホスホジエステラーゼ活性を発現した。均質
化物と50,000xg上清の総活性には、顕著な相違は認めら
れなかった。
例Iのようにして行われた。p3CGS−5の4.2kb断片が、
Hind IIIとNot Iを用いて単離され、同じ酵素で消化さ
れているプラスミドpCDM8に挿入された。p3CGS−5/pCDM
8構築物で形質転換されたCOS−7細胞に生成した生成物
の特性は、下記実施例Vにて議論する。
的配列決定 A.ウシ脳cGS−PDE cDNAクローン、pBBCGSPDE−5の単離 (Merck、Sharp & DohmeのRonald E.Diehl氏から提
供された)λ ZAPベクターで構築されたウシ脳cDNAライ
ブラリーが、(p3CGS−5)ヌクレオチド位置番号1−4
52に対応するp3CGS−5 cDNAの450bp EcoR I/Apa I制限
エンドヌクレアーゼ開裂断片でスクリーニングされた。
Feinberg et al.,supraの方法を用いてプローブが調製
され、[32P]ラベルしたDNAが、Elutip D(登録商標)
カラムを用いて精製された。円形フィルターに結合した
(12−150mmプレート上の全600,000の)プラークを、50
%ホルムアミド、20mM Tris−HCl(pH7.5)、1x Denhar
dt溶液、10%デキストラン硫酸、0.1%SDS、および106c
pm/mlの[32P]ラベルしたプローブ(109cpm/μg)を
含んだ溶液中で、42℃で、一晩ハイブリダイズした。フ
ィルターは、室温にて、15分間、2x SSC/0.1%SDSで三
度洗浄し、そして、45℃で、15分間、0.1x SSC/0.1%SD
Sで二度洗浄した。フィルターは、X線フィルムに一晩
曝した。
選び取り、その内の6個を任意に選抜して、再移植とス
クリーニングを数回反復して精製した[Maniatis et a
l.,supra]。挿入cDNAは、製造者の推奨にあるように、
in vivo削除によってpBluescript SK(−)にサブクロ
ーニングした。各クローンの培地から調製したプラスミ
ドcDNAは、SequenaseおよびTaq Trak配列決定キットを
用いて両端から配列決定を行った。この実験から得られ
た配列は、ウシ脳cDNAクローンpBBCGSPDE−5がcGS−PD
E cDNAであり、5−端側の副腎cGS−PDE cDNAとは相違
することを確認した。
PDE−5挿入体の5'末端の部分的配列解析は、配列番号:
40に示したセンス鎖を示し、一方で、該挿入体の3'末端
の配列決定は、配列番号:41に示したアンチセンス配列
を示した。
クローンを、それぞれ宿主XL1細胞にスポットし、37℃
で、一晩インキュベートした。プラークを、(p3CGS−
5ヌクレオチド位置番号2661−3034に対応する)p3CGS
−5 cDNAの370bp Pst I/Sma I制限エンドヌクレアーゼ
開裂断片によってスクリーニングされた。プローブは、
Feinberg et al.,supra,の方法を用いて調製され、[32
P]ラベルしたDNAをElutip−D(登録商標)カラムで精
製した。円形フィルターに結合しているプラークを、50
%ホルムアミド、20mM Tris−HCl(pH7.5)、1x Denhar
dt溶液、10%デキストラン硫酸、0.1%SDS、および106c
pm/mlの[32P]ラベルしたプローブ(109cpm/μg)を
含んで溶液中で、42℃で、一晩ハイブリダイズした。フ
ィルターは、室温にて、15分間、2x SSC/0.1%SDSで三
度洗浄し、そして、45℃で、15分間、0.1x SSC/0.1%SD
Sで二度洗浄した。フィルターは、X線フィルムに一晩
曝した。
定クローンが精製され、両端から配列決定を行った。cD
NAクローンpBBCGSPDE−7の5−端側の配列は、クロー
ンpBBCGSPDE−5と同一であったが、副腎由来クローンp
3CGS−5とは異なっていた。pBBCGSPDE−7 cDNAクロー
ンの3−端側の配列は、p3CGS−5挿入配列と同一であ
った。
るDNA配列と配列番号:43のアミノ酸配列を示した。
とほぼ同一の942残基ポリペプチドをコードする。これ
ら二つのイソ酵素の第一次構造における相違点は、脳cG
S−PDEのアミノ末端残基1−46、および副腎cGS−PDEの
残基1−25にある。脳および副腎cGS−PDEの残りのカル
ボキシ末端残基は同一である。
びNot Iを用いてpBBCGSPDE−7の3.8kb断片が単離さ
れ、Hind IIIおよびNot I制限エンドヌクレアーゼで切
断されたプラスミドpCDM8に挿入された。組み換えpBBCG
SPDE−7/pCDM8構築物は、COS−7細胞を一過的に形質変
換するために用いられた。次いで、pBBCGSPDE−7/pCDM8
構築物および実施例IVにて調製したp3CGS−5/pCDM8構築
物の特性を、比較した。膜と上清画分は、形質変換した
COS−7細胞の抽出物から調製され、cGS−PDE活性に関
して分析された。pBBCGSPDE−7/pCDM8およびp3CGS−5/p
CDM8プラスミド構築物双方が、COS−7細胞抽出物に
て、cGS−PDE活性を呈し、その活性の大半は上清画分で
検出された。しかしながら、pBBCGSPDE−7/pCDM8構築物
で形質変換したCOS−7細胞抽出物からの膜において、p
3CGS−5/pCDM8構築物で形質変換したCOS−7細胞から調
製した膜よりも10倍高いパーセント数の全cGS−PDE活性
が検出された。これら結果は、副腎cGS−PDEに関して、
pBBCGSPDE−7 cDNAによってコードされたイソ酵素が、
細胞膜と優先的に関連することを示すものである。
NAの使用 ウシ・サイクリックGMP−刺激ホスホジエステラーゼ
をコードするcDNAクローンに相同な、いくつかのヒトcD
NAクローンが、ウシcDNAから誘導した核酸プローブを用
いたハイブリダイゼーションによって単離された。配列
解析とハイブリダイゼーション研究の組み合わせは、こ
れらヒトcDNAクローンが、ヒト・ホスホジエステラーゼ
に対応する読取枠を含んでいることを示している。
b cDNA挿入体を含むプラスミドp3CGS−5からのDNAで調
査した。このプラスミドは、制限酵素Sma IおよびEcoR
Iで消化した。cDNA挿入体から誘導した約3.0kb断片は単
離され、アガロースゲル電気泳動で精製された。この断
片は、PDEの全読取枠を含んでいる。この断片は、任意
プライミングにより、放射性ヌクレオチドでラベルし
た。
クの密度で、150mmペトリ皿に置かれた。二つのニトロ
セルロースフィルターのレプリカを調製した。放射性核
酸プローブを、50%ホルムアミド、5x SSPE(0.9M塩化
ナトリウム、0.05M NaH2PO4・H2O、0.04M水酸化ナトリ
ウム、および0.005M Na2EDTA・H2O)、0.5%SDS、100μ
g/mlサケ精巣DNA、および5x Denhardt溶液にて、42℃
で、一晩、フィルターにハイブリダイゼーションするた
めに用いた。フィルターを室温にて洗浄し、そして、65
℃にて、0.1%SDSを含む2x SSC中で洗浄した。陽性プラ
ークは精製され、その挿入体は標準的手法によって、DN
A配列解析用の適切な配列決定用ベクターにサブクロー
ニングされた。
海馬mRNAから調製されたλgt10 cDNAライブラリーがス
クリーニングされた。検査した約500,000プラークの
内、33個がプローブとハイブリダイズした。これらファ
ージの一つを、cDNA挿入体を除去するためにEcoR Iで消
化した。このEcoR I断片を含む挿入体を、EcoR Iで消化
されたBluescript KSにクローニングし、そして子牛腸
アルカリホスファターゼで処理した。この反応の一つの
生成物が、ウシcGS−PDE cDNAと比較した際に大きな相
違点が認められる、プラスミドpGSPDE9.2であった。pGS
PDE9.2挿入体の5'側の0.4kbが、ウシcDNAから分岐して
いた。ヒトcDNAの5'端から約0.7kbに、ウシcDNAから分
岐した0.7kb領域がある。この領域は、イントロンであ
ろう。ウシ・プローブとハイブリダイズした残りの海馬
プラークの内の25個が、PCR、ハイブリダイゼーション
および/または配列決定により検定された。この領域を
通じて、ウシとヒトcDNAsとの間における相違点は皆無
であった。
ジλGSPDE7.1およびλGSPDE7.4が、EcoR IとHind IIIで
消化された。それぞれが、cDNA挿入体の大半を含む1.8k
b断片と、約0.2kbファージλDNAを産生した。それぞれ
の場合において、cDNA挿入体を典型的に一括するEcoR I
部位の一つが、恐らくライブラリーを構築する際に壊さ
れるため、λDNAは該断片中に存在する。EcoR I/Hind I
IIは、EcoR IとHind IIIで消化されたBluescript KSに
クローニングされた。この方法により、プラスミドpGSP
DE7.1とpGSPDE7.4が得られた。cDNA挿入体は、ウシ・ホ
スホジエステラーゼcDNAの3'部分に相同のDNAをコード
する。これらクローンにある双方のcDNA挿入体は、EcoR
I部位に始まり、その配列はこの部位の直後と相同であ
る。
され、その3'端の短領域以外は同一であった。pGSPDE7.
1のcDNA挿入体は、約70個のアデニン塩基の配列で終わ
っており、一方でpGSPDE7.4のcDNA挿入体は、約20個の
アデニン塩基の配列が続く、pGSPDE7.1に存在しない三
つのヌクレオチドで終わっている。
ら調製されたcDNAライブラリーは、スクリーニングした
約500,000のプラークから、一つのハイブリダイズする
プラークを産生した。ハイブリダイズする挿入体を含む
Bluescript SK(−)プラスミドpGSPDE6.1が、λZap II
クローンからin vivoにて削除された。配列解析は、挿
入体がウシ・ホスホジエステラーゼcDNAと相同であるこ
とを示した。相同領域は、pGSPDE9.2からの挿入体の配
列とpGSPDE7.1もしくはpGSPDE7.4にある挿入体の配列を
接合することにより形成された配列中にあるEcoR Iの位
置にまで及ぶ。つまり、海馬からのクローンは、完全な
読取枠を形成しているものと考えられる。
クリーニングした約800,000のプラークから五つのハイ
ブリダイズするプラークを産生した。これら胎盤cDNAク
ローンは短く、その配列は、海馬cDNA pGSPDE9.2の部分
と同一であった。U118多形性神経膠cDNAライブラリーか
らの5×105プラーク、脾臓cDNAライブラリーからの5
×105プラーク、および副腎ライブラリー(クッシング
症候群)からの5×105プラークのスクリーニングで
は、ハイブリダイズするプラークは得られなかった。
すれば、0.4kb 5'配列が人造物であるか否かを決定する
ための、ヒトcGS−PDEの5'端を含む多数の独立したcDNA
クローンを取得することが決断される。ウシcGS cDNAプ
ラスミドp3cgs5の5'端からの約0.95kb EcoR I−Hind II
I断片は、任意にプライム化され、多数のヒトcDNAライ
ブラリーをスクリーニングするプローブとして用いた。
海馬ライブラリーのスクリーニングは、上記したスクリ
ーニング条件と同一条件下で実施した。残りのスクリー
ニングのすべては、下記実施例VIIのヒト心臓cDNAライ
ブラリーのスクリーニングに関して記述したようにして
実施した。(Hut78、dt−プライム化した)ヒトT4細胞
ライブラリーからの5×105プラーク、(任意に、dt−
プライム化した)海馬cDNAライブラリーからの106プラ
ーク、(dt−プライム化し、5'伸長した、Clontech)ヒ
ト肝臓cDNAライブラリーからの5×105プラーク、(dt
−プライム化した)ヒトSW1088多形性神経膠cDNAライブ
ラリーからの5×105プラーク、(任意に、dt−プライ
ム化した)同様のヒトcDNAライブラリーからの5×105
プラーク、および(任意にプライム化した)ヒト肺cDNA
ライブラリーからの1.5×106プラークのスクリーニング
では、陽性体は得られなかった。(任意にdt−プライム
化した、Stratagene)ヒト胎児脳cDNAライブラリーから
の5×105プラークのスクリーニングでは、二つの陽性
体が得られた。これらを、HFB9.1およびHFB9.2と称し
た。
1は、λZap IIクローンからin vivoにて削除された。DN
A配列解析では、HFB9.1は、HFB9.2よりもさらに3'側の
約80個目のヌクレオチドから始まり、HFB9.2への配列の
約1.9kbのイントロンへ読み込む。HFB9.2は、cGS−PDE
の全読取枠を覆うが、停止コドンから後の、イントロン
と思われる59個のヌクレオチドを読み込む。双方共に、
5'側の0.4kbとpGSPDE9.2に見られる推定したイントロン
が欠けている。HFB9.2の全読取枠が、単離され、酵母発
現ベクターpBNY6Nにて組み立てられた。pHcgs6nと称す
る得られたプラスミドは、EcoR I/Xho I挿入体として、
cDNAのコード領域を含む。挿入体のDNAおよび推定アミ
ノ酸配列を、配列番号:44および45にそれぞれ示した。
aウシ脳cDNAの使用 ウシ61kDa CaM−PDEをコードするcDNAと相同な、ヒト
cDNAクローン、λCaM H6aとλCaM H3aが、ウシ特異性酵
素をコードするcDNAから誘導された核酸プローブを用い
たハイブリダイゼーションによって得られた。配列解析
とハイブリダイゼーション研究の組み合わせは、λCaM
H6aが、ヒトCaM−PDEをコードする読取枠の大半を含む
ことを示している。
ョン・プローブは、PCR処理によるウシ肺組織の第一鎖
状cDNAから誘導された。具体的には、実施例IにてPCR
−2Sと称した23−merのオリゴヌクレオチド(配列番号:
1参照)は、pCAM−40挿入体のコード領域の大部分に相
当する1098塩基対のcDNA断片を作成するために、実施例
IおよびIIIの一般的手法に従って、アミノ酸配列、 のpCAM挿入配列を基にした、冗長なアンチセンス23−
merのオリゴヌクレオチド(PCR−5AS)およびウシ肺cDN
Aと、PCR反応において結合した。PCR生成物は、0.5μg/
mlのエチジウムブロミドを含む0.4M Tris−酢酸/0.001M
EDTA緩衝液を用いた1%アガロース・ゲルにて精製し
た。DNA生成物は、紫外線で視覚化され、カミソリ刃で
ゲルよりきれいに摘出され、Geneclean II試薬キットを
用いて精製され、そして、EcoR V切断したpBluescript
ベクターDNAに繋がれた。
するために、サブクローニングしたPCR DNA生成物は、T
3およびT7プロモーター・プライマーと、Sequenaseある
いはTaq Polymerase配列決定キットのいずれかを用い
て、両端から配列決定を行った。このDNAの各端から約2
50塩基は、ウシCAM−PDEのアミノ酸配列と比較され、PC
R DNA生成物が、部分的CAM PDE cDNAであることが確認
された。このクローンは、pCAM−1000と称され、pCAM−
40の挿入体の409から1505のヌクレオチドに対応する1.1
kb核酸の挿入体を含んでいた。この1.1kb断片は、アガ
ロース・ゲル電気泳動で精製され、そして、制限酵素Ac
c Iで消化された。この二つの断片は分離され、そし
て、アガロース・ゲル電気泳動で精製された。これら分
離された断片は、任意プライミングにより、放射性ヌク
レオチドがラベルされた。
り約50,000プラークの密度で移植され、そして、複製ニ
トロセルロース・フィルター・レプリカが調製された。
各プローブは、各組の複製フィルターにハイブリダイズ
された。フィルターは、3x SSC、0.1%sarkosyl、50μg
/mlサケ精巣DNA、10x Denhardt溶液、20mM燐酸ナトリウ
ム(pH6.8)にて、65℃で、一晩ハイブリダイズした。
フィルターは、65℃で、0.1%SDSを含んだ2x SSCで洗浄
した。
クリーニングした約500,000プラークから、三つのハイ
ブリダイズするプラークを産生した。これら三つのハイ
ブリダイズしたプラークの内、二つは双方のプローブと
ハイブリダイズし、三番目のものは、二つのプローブよ
りも長いプローブとハイブリダイズした。λCam H6aク
ローンは、pCAM−40のウシ・クローンをコードするcDNA
に相同な、約2kb挿入体を含む。
uescript KSにサブクローニングされた。cDNAライブラ
リーはEcoR Iリンカーで構築されてきたが、cDNA挿入体
の側面に位置すべきEcoR I部位の一つが、EcoR Iで切断
されていなかった。そして、cDNAは、約0.7kb EcoR I/H
ind III断片(pcamH6C)、および約1.3kbのcDNAと側面
に位置する0.25kbのλgt10ベクターDNA(pcamH6B)を含
む約1.6kb Hind III断片の二つの断片としてサブクロー
ニングした。DNA配列解析は、それが、コード領域の中
程にある二つの塩基対が欠けていると思われるヒトcDNA
を除いて、ウシ61k CaM−PDEと相同なヒトCaM−PDEの大
半をコードしていることを示している。これら欠けてい
るヌクレオチドは、最大の相同性を示すpCAM−40ウシ61
kDa CaM−PDE(配列番号:5)と対照すれば、ヒトcDNA配
列の626および627の位置に対応する。
海馬cDNAライブラリーからの他のcDNAクローンは、λca
mH2aであった。λcamH6a cDNAの場合のように、挿入体
の両端に存在すべき二つのEcoR I部位の一つのみを切断
する。このcDNAのための最初のサブクローニングとDNA
配列解析は、側面に位置するλgt10ベクター・アーム中
のオリゴで作成されたPCR断片を利用した。このcDNA
は、λcamH6aでの挿入体の5'端の多くと重複しており、
ウシ配列から推定された二つのヌクレオチドをさらに含
み、そして、PDE読取枠を維持することを必要とする。
λcamH2a挿入体も、イニシエーター・メチオニンと、Hi
nd III部位の下流の、二つのイントロンを含んでいるよ
うに思われる。(pcamH6Cによって覆われる領域に相当
する)λcamH2aからのEcoR I/Hind III断片は、プラス
ミドBluescript SK-にサブクローニングされ、pcamH2A
−16と称された。これは、下記する酵母発現プラスミド
の構築における、さらに二つの塩基対の源として用いら
れた。
発現のために構築された。一方のプラスミド、pHcam61
−6N−7は、全読取枠を含んでいる。二つ目のプラスミ
ド、pHcam61met140は、(ヌクレオチド位置505にて始ま
る)内部メチオニンから始まり、読取枠の終端まで伸び
る。これら発現プラスミドは、読取枠の3'部分を修飾
し、そして、3'に二つの異なる修飾した5'端を付加する
ことによって構築される。pHcam61−6N−7のcDNA挿入
体の配列を配列番号:48に示し、それによってコードさ
れるCaM−PDEの推定アミノ酸配列を配列番号:49に示し
た。cDNA挿入体の構築中に、826の位置のヌクレオチド
は、TからCに改変されたが、コードされたアミノ酸は
保存されていた。上記したように、プラスミドpHcam61m
et140は、pHcam61−6N−7のコード領域の最初の140個
のコドンが欠けているcDNA挿入体を有しているが、その
他は同一である。
いた。このcDNA挿入体は、配列解析のためにサブクロー
ニングされた。cDNAライブラリーは、EcoR Iで構築され
てきたが、λcamH3a中に挿入されたcDNAは、EcoR Iで摘
出することはできなかった。恐らく、EcoR I部位の一つ
は、ライブラリーの構築中に壊されたものと思われる。
cDNA挿入体は、λクローンからHind IIIおよびEcoR Iで
の消化によって摘出された。この消化によって、cDNA挿
入体に付いたλgt10の左アームからのDNAの一部分を含
む0.6kb Hind III断片と、cDNA挿入体の残りの部分を含
む約2.4kbのHind III/EcoR I断片、の二つの関連する断
片を産生する。これら二つの断片は、約3kbの断片を産
生するために、プラスミドBluescript KSにて組み立て
られる。小さなHind III断片の配向は、最初のλクロー
ンと同じであった。このサブクローンは、pcamH3EFとし
て知られている。このcDNAはウシCaM−PDE 61kDa cDNA
からのウシ・プローブとハイブリダイズするが、配列解
析は、異なるCaM−PDE遺伝子の生成物であると思われる
こと示した。プラスミドpcamH3EFは、全読取枠であろう
ものを含んでおり、その大半の長さにわたって、pHcam6
1−6N−7の挿入体によってコードされたタンパク質
と、約75%相同であるタンパク質をコードする。DNAと
推定アミノ酸配列を、配列番号:50と51にそれぞれ示し
た。pcamH3EFのヌクレオチド80と100の間の領域のDNA配
列は判然としていない。この領域は、イニシエーター・
メチオニン・コドンの5'側であるので、読取枠には効果
が及ばない。
R Iでの消化に続いて、ゲル精製された。この断片は、
上記したスクリーニング方法と同様に、さらにヒトcDNA
ライブラリーをスクリーニングするために用いられた。
ヒト心臓cDNAライブラリー(Stratagene)からの約5×
105個のプラークのスクリーニングは、pcamH3EFプロー
ブにハイブリダイズする二つのプラークを産生した。Bl
uescript SK-プラスミドpcamHellaは、これら陽性λZap
IIクローンの一つからin vivoにて摘出された。cDNA挿
入体のDNAと推定アミノ酸配列を、配列番号:52と53にそ
れぞれ示した。pcamHellaの配列解析は、pcamH3EFのヌ
クレオチド位置610にて挿入が始まり、DNA配列がpcamH3
EFのそれから分岐する位置であるヌクレオチド位置2066
までほとんど同一であった。pcamHellaのcDNA挿入体
は、約0.6kbにまで続いていた。この分岐の結果、cDNA
にある読取枠によってコードされるタンパク質のカルボ
キシ末端が改変される。pcamH3EF cDNAは、634アミノ酸
(分子量72,207)のタンパク質をコードすることができ
た。pcamHellaのcDNAの5'が、pcamH3EFの5'(ヌクレオ
チド位置610の5')と同じであると仮定すれば、pcamHel
laは、709アミノ酸(分子量80,759)をコードできる。
これら3'分岐端は、代替接合、接合の欠如、もしくはク
ローニング過程で近接して並べた関連のないDNA配列の
結果によるものであろう。
NAの発現 この実施例は、酵母ホスホジエステラーゼ遺伝子の突
然変異に関連する熱ショック表現型を抑制する機能性PD
E発現物質の能力を実証する酵母中でのウシおよびPDEク
ローンの発現に関し、さらに発現生成物の生化学的分析
にも関する。これら実験に用いた宿主細胞は、共に熱シ
ョック感受性、すなわち、55−56℃程度の昇温下に曝し
た細胞の生存不能によって特徴づけられる表現型に起因
するpde1-、pde2-であるS.cerevisiae酵母株10DAB(ATC
C受託No.74049)およびYKS45である。これら相補性実験
において、挿入された遺伝子生成物が熱ショック表現型
を顕著に修飾することが認められた。さらに、この能力
は、化学化合物の哺乳類Ca2+/カルモジュリン刺激性お
よびcGMP刺激性サイクリックヌクレオチド・ホスホジエ
ステラーゼのin vivoでの酵素活性を修飾する能力(お
よび、特に阻害する能力)の検定するよう設計したシス
テムの可能性を実証している。
補性酵母発現プラズミドpADNS(ATCC受託No.68588)お
よびpADNS(ATCC受託No.68587)へ挿入する2.2kb cDNA
断片は、ポリメラーゼ連鎖反応によるプラズミドpCAM−
408(実施例I)から誘導された。要約すれば、下記のP
CR増幅が、pCAM−40 DNA挿入体をベクター内においてAD
H1プロモーターと共に適切に整列するよう改変するため
に用いられた。
(オリゴA)の一つ は、塩基対位置100−116にてpCaM−40 cDNAクローン
にアニールされ、開始メチオニンコドンの前にHind III
部位を含んでいる。第二オリゴヌクレオチド・プライマ
ー(オリゴB) は、位置520−538にてアニールされるよう設計されて
おり、メチオニンコドンの前にHind III部位に二つの塩
基も含んでいた。三番目のオリゴヌクレオチド は、挿入体の3'であるプラスミド中の位置にアニール
された。
てのpCAM−40共に、プライマーとして用いられた。この
反応の核酸生成物は、全読取枠を含んでいた。第二反応
では、オリゴAとオリゴBを、鋳型pCAM−40に、プライ
マーとして用い、カルモジュリン結合領域をコードする
cDNA配列部分が欠けた核酸生成物を産生した。これら増
幅産生物は、Hind IIIおよびNot Iで消化され、Hind II
I/Not I消化酵母発現ベクターpADNSおよびpADANSに繋が
れた。挿入体を含むプラズミド・クローンが選択され、
リチウム酢酸形質転換によりS.crevisiae株10DABに形質
転換された。
ン寒天)が欠如している合成培地を含む寒天平板上に画
線培養し、30℃で、3日間生長させた。この寒天平板の
レプリカを、三つのタイプの寒天平板:SC−ロイシン寒
天のレプリカ、室温でのYPD寒天のレプリカ、および56
℃に温めたYPD寒天平板のレプリカ、を作成した。これ
ら三つの温めたレプリカを、56℃で、10、20、もしくは
30分間維持した。これらレプリカは室温にまで冷やさ
れ、すべての平板を30℃にて置いた。CaM−PDEを発現す
るよう構築したプラスミドで形質転換した酵母は、熱衝
撃耐性であった。より具体的には、全読取枠を発現する
ように設計され、さらに、pADNSもしくはpADANSのいず
れかにて、(触媒領域を含むが、カルモジュリン結合領
域を含まない)末端削除したタンパク質を発現するよう
に設計された構築物は、10DAB宿主細胞の熱ショック感
受性表現型、すなわち、56℃温度衝撃耐性、に相補的で
あった。
met140(実施例VII)が、酵母宿主10DAB中に形質転換さ
れた。熱ショック表現型は、双方の形質転換にて抑制さ
れた。
胞を含まない抽出物を調製し、抽出物の生化学的ホスホ
ジエステラーゼ活性を測定することによって評価した。
この目的のために、形質転換した酵母の200ml培養液
を、液体SC−ロイシン中にて約600万細胞/mlの密度にな
るまで生育させた。細胞は遠心分離した回収され、細胞
ペレットは冷凍された。抽出物は、氷上に冷凍細胞を解
凍し、PBS 1mlと同量のガラス・ビーズと混合し、酵母
細胞を粉砕するためこれらを撹拌し、そして、不溶性の
残骸を除去するために、粉砕した細胞を約12,000xgで、
5分間、遠心分離することにより調製した。上清が、ホ
スホジエステラーゼ活性について分析された。
試験管中の、50mM Tris(pH8.0)、1.0mM EGTA、0.01mg
/mL BSA(ウシ血清アルブミン)、[3H]−サイクリッ
クヌオクレチド(410,000cpm/pmol)、および5mM MgCl2
の最終体積250μlにて、30℃で、ホスホジエステラー
ゼ活性が分析された。インキュベーションを、0.5M炭酸
ナトリウムpH9.3、1M塩化ナトリウム、および0.1%SDS
からなる250μl加えることで終了した。ホスホジエス
テラーゼ反応の生成物は、BioRad Affi−Gel 601ホウ酸
ゲルの8×33mmカラムでのクロマトグラフィーにより、
サイクリック・ヌクレオチドから分離された。カラムは
0.25M重炭酸塩ナトリウム(pH9.3)と0.5M塩化ナトリウ
ムで平衡化された。反応はカラムにも適用された。検査
用試験管は、0.25M重炭酸塩ナトリウム(pH9.3)と0.5M
塩化ナトリウムですすぎ、このすすぎはカラムについて
も行った。ホウ酸カラムは、3.75mlの0.25M重炭酸塩ナ
トリウム(pH9.3)と0.5M塩化ナトリウムで二度洗浄さ
れ、さらに、0.5mlの50mM酢酸ナトリウム(pH4.5)によ
って洗浄された。生成物は、0.1Mソルビトールを含む2.
5mlの50mM酢酸ナトリウムによって溶出され、シンチレ
ーション瓶に回収された。溶出物は4.5mlのEcoliteシン
チレーション・カクテルと共に混合され、液体シンチレ
ーション分光測定法によって放射能が測定された。
取枠を発現するよう、また、先端削除したタンパク質を
発現するよう設計された双方の構築物は、細胞抽出物の
生化学的ホスホジエステラーゼ分析により決定した活性
タンパク質を発現した。pcam61met140を宿す10DABの抽
出物は、計測可能なホスホジエステラーゼ活性(下記、
part Dの第二方法を参照)を呈する一方で、pcamH61−6
N−7を宿す10DAB細胞の抽出物は検出可能な活性が欠如
していた。
補性 ウシcGS−PDEをコードする4.2kb DNA断片を含むプラ
スミドp3CGS−5を、プラスミドの挿入に適した制限部
位で、cDNAの最初の147塩基を置き換えることにより、p
ADNSおよびpADANSへのクローニングに適用した。オリゴ
ヌクレオチドBS1は、Hind III部位をコードする配列 を有し、cDNA挿入体の148−165の位置にアニールし
た。BS3と称するオリゴヌクレオチド を、唯一のNsi I部位の3'の835−855の位置にアニー
ルした。Hind IIIとNsi Iでの消化を終えて得られたPCR
−生成断片は、Hind IIIとNsi Iで消化されたp3CGS−5
に繋がれ、これにより、ウシcDNAの最初の5'端を取り代
えた。この結合から得られたプラスミドは、修飾cDNA挿
入体を遊離するためにHind IIIとNot Iで消化された。
挿入体は、そのHind IIIとNot I部位にて、pADNSおよび
pADANSへクローニングされた。そして、これらプラスミ
ドは、酢酸リチウム法によって、酵母株10DABに形質転
換され、形質転換された細胞を生長させ、上記Aにある
ように昇温下に曝した。ウシcGS−PDEを発現するよう構
築したプラスミドで形質転換した酵母は、熱衝撃耐性で
あった。
を、酢酸リチウム法によって、酵母宿主株YKS45に形質
転換した。プレートを最初、二日間、30℃にて培養し、
温めたプレートを56℃にて、10、20、30および45分間維
持した以外は、上記したようにして、熱ショック分析を
行った。ヒトcGS−PDEの全長を発現するように設計した
プラスミドで形質転換した酵母は、熱衝撃耐性であっ
た。
出物を調製し、抽出物の生化学的ホスホジエステラーゼ
活性を測定することによって評価した。この目的のため
に、形質転換した10DAB酵母細胞の50ml培養液を、液体S
C−ロイシン中にて約1000万細胞/mlの密度になるまで生
育させた。Sherman et al.,Methods in Yeast Genetic
s,Cold Spring Harbor Laboratory,Cold Spring Harbo
r,New York(1986)。細胞は遠心分離して回収され、細
胞ペレットは一度洗浄され、そして最終細胞ペレットは
冷凍された。抽出物を調製すつために、冷凍細胞は氷上
で解凍され、PBS 1mlと同量のガラス・ビーズと共に混
合し、酵母細胞を粉砕するためこれらを撹拌し、そし
て、不溶性の残骸を除去するために遠心分離した。そし
て、上清が、上記Bにあるように、ホスホジエステラー
ゼ活性について分析された。pADNSあるいはpADANSのい
ずれかにある構築物は、細胞抽出物の生化学的ホスホジ
エステラーゼ活性によって決定された活性タンパク質を
発現した。
107細胞/mlになるまでSC−ロイシン培地にて生育した。
細胞を遠心分離により採取し、細胞ペレットを凍結し
た。典型的には1010細胞を含んだ凍結細胞ペレットは、
全体積が2.5mlになるように、溶解緩衝液(25mM Tris−
HCl pH8、5mM EDTA、5mM EGTA、1mM o−フェナントロリ
ン、0.5mM AEBSF、0.01mg/mLペプスタチン、0.01mg/mL
ロイペプチン、0.01mg/mLアプロチニン、0.1%2−メル
カプトエタノール)と共に混合した。混合物を氷上で解
凍し、そして、等量のガラス・ビーズを添加した。細胞
を、氷上での、攪拌および冷却のサイクルによって粉砕
し、そして、5mlの全溶解緩衝液が加えられるように、
粉砕した細胞と追加の溶解緩衝液が混合された。懸濁液
は、12,000×gで、5分間、遠心分離された。上清は除
去された後、直ちに分析に供されるか、あるいはドライ
アイス・エタノール・バスにて急速冷凍されてから、−
70℃にて保存された。
および放射性物質を含んだ(40mM Tris−HCl pH8.0、1m
M EGTA、0.1mg/mL BSA)にて、細胞抽出物の部分試料を
混合し、30分間まで30℃でインキュベートし、そして、
反応を停止緩衝液(0.1MエタノールアミンpH9.0、0.5M
硫酸アンモニウム、10mM EDTA、最終濃度0.05%のSDS)
で終了することにより分析した。生成物は、BioRad Aff
i−Gel 601でのクロマトグラフィーにより、サイクリッ
ク・ヌクレオチド物質から分離された。試料を、カラム
緩衝液(0.5M硫酸アンモニウムを含んだ0.1Mエタノール
アミン)にて平衡化したAffi−Gel 601の約0.25mlを含
んだカラムに適用した。カラムを、カラム緩衝液の0.5m
lで5回洗浄した。生成物は、0.25M酢酸の4つの0.5ml
部分試料で溶出され、5mlのEcolume(ICN Biochemical
s)と共に混合した。放射性生成物は、シンチレーショ
ン計測法により測定された。ヒトcGS−PDEを発現する酵
母からの抽出物は、サイクリックAMPおよびサイクリッ
クGMP双方を、このイソ酵素においても予期されたよう
に加水分解した。
現研究 A.ノザン・ブロット分析 上記実施例I、IIIおよびIVにて単離したDNAsを、様
々な組織から単離した全選択RNAsあるいはポリA−選択
PNAsをスクリーニングするためのプローブを作成するた
めに使用し、その結果を下記にまとめた。
ら単離した約3kbの放射ラベルしたcDNA断片を用いて、
ウシ副腎皮質、副腎髄質、心臓、大動脈、大脳皮質、脳
幹神経節、海馬、大脳、骨髄/脊髄、肝臓、腎臓皮質、
腎臓髄質、腎臓乳頭、気管、肺、脾臓およびT−リンパ
球組織の種類から調製したmRNAにてノザン分析を行っ
た。単一の4.5kb mRNAは、ほとんどの組織にて検出され
た。cGS−PDE mRNAの大きさは、大脳皮質、脳幹神経節
および海馬から単離したmRNAより若干大きい(約4.6k
b)ように思われた。副腎皮質においては、cGS−PDE mR
NAが豊富であった。副腎髄質および心臓においても、cG
S−PDE mRNAは豊富であった。脳と腎臓の解剖学的に異
なる領域において、特異的に発現しているようであっ
た。五つの異なる脳の領域から単離したRNAsの内、cGS
−PDE mRNAは、海馬、大脳皮質および脳幹神経節におい
て最も豊富であった。cGS−PDE転写は、大脳あるいは骨
髄および脊髄RNAsにおいては、ほとんど検出されなかっ
た。cGS−PDE mRNAは、腎臓のすべての領域にて検出さ
れたが、外皮赤色骨髄および乳頭において豊富に認めら
れた。cGS−PDE mRNAは、肝臓、気管、肺、脾臓および
T−リンパ球RNAにおいても検出された。大動脈から単
離したRNAでは、cGS−PDE mRNAは、ほとんど検出されな
かった。
のcDNA挿入体の熱変性した1.6kb EcoR I制限エンドヌク
レアーゼ断片にまで及ぶ任意に六つのプライム化をした
断片から調製した。ノザン分析にて、DNAプローブは、
脳の3.8および4.4kb mRNAsとハイブリダイズし、分析し
た他の組織のほとんどには、大脳皮質、脳幹神経節、海
馬、大脳、骨髄および脊髄、心臓、大動脈、腎臓髄質、
腎臓乳頭および肺が含まれる。肝臓、腎臓皮質および気
管からの3.8kb mRNAとプローブとのハイブリダイゼーシ
ョンでは、比較的長い放射能写真的露光の後にのみ検出
された。
ロット分析を、プローブとして(保存されたPDE触媒領
域のほとんどを含んだ)サブクローニングされ、ラベル
されたp12.3a DNA断片を用いて行った。最も強いハイブ
リダイゼーションシグナルが、脳幹神経節からのmRNAに
おいて認められ、また、強力なシグナルが、腎臓乳頭お
よび副腎髄質を含む他の組織からのmRNAにおいても認め
られた。
なわち、p3cGS−5の触媒領域コード部分(配列番号:38
の塩基2393から2666に対応する273塩基対)に対応する
プローブIII;cGMP結合領域をコードする(塩基959から1
426に対応する468塩基対)に対応するプローブII;およ
び、アミノ末端コード領域(塩基1から457に対応する4
57塩基対)の部分およびその5'端に対応するプローブI
である。
ブIIおよびIIIを完全に保護した。副腎皮質、副腎髄質
および肝臓から単離したRNAsで、リボプローブIのほと
んど完全な保護(457塩基)も観察された。しかしなが
ら、大脳皮質、脳幹神経節および海馬から単離したRNA
は、リボプローブIの約268−塩基断片しか保護されて
いなかった。脳RNA試料にて観察された大きな断片と同
一の大きさの部分的に保護されたプローブIの比較的少
量が、肝臓を除く試験した組織のすべてから単離したRN
Asにおいても検出された。興味深いことに、心臓RNA
は、相補的に保護された(457塩基の)リボプローブ
と、脳RNAのような、268−塩基断片を産生した。しかし
ながら、他のいかなる組織から単離したRNAsを用いて観
察された保護パターンと異なり、部分的に保護されたリ
ボプローブI断片は、より豊富であるように思われた。
試験結果は、二つの異なるcGS−PDE RNA種が発現されて
いることを示唆している。
かの部分に対応する放射性ラベルしたアンチセンス・リ
ボプローブが、pCAM−40cDNAの制限エンドヌクレアーゼ
開裂断片(Acc I/Sst IおよびTth111 I/Hinc II)から
構築された。五つの異なる脳領域(大脳皮質、脳幹神経
節、海馬、大脳、骨髄/脊髄)から単離した全RNAsは、
CaM−結合および触媒領域の双方をコードするアンチセ
ンス・リボプローブを完全に保護した。心臓、大動脈、
肺、気管および腎臓からの全RNAsは、触媒領域に対応す
るリボプローブを完全に保護するが、CaM−結合領域リ
ボプローブの約150塩基しか保護せず、61kD CaM−PDEに
構造的に関連するイソ形態が、これら組織にて発現され
ていることを示唆している。
基にして作成され、配列番号:26の塩基−1から363およ
び883から1278に対応する。前者のプローブは、推定CaM
−結合領域を通じて、5'非コード配列の113塩基と開始
メチオニン・コドン含んでいるものの、後者は触媒領域
をコードした。分析したすべての組織の中で、脳幹神経
節からのRNAが最も強力に各プローブを保護した。アミ
ノ末端を意味するプローブに相当する大きさの強力なシ
グナルが、大脳皮質、小脳、脳幹神経節、海馬および副
腎髄質RNAによる保護において観察された。たとえ、組
織が保存領域プローブのノザン分析およびRNAse保護の
シグナルを示していても、腎臓乳頭あるいは精巣RNAに
よるプローブでは何の保護も付与されず、構造的に関連
のあるイソ酵素がこの組織にて発現されていることを示
唆している。
してきたが、当業者が本発明を考慮すれば、様々な改良
と変更を想到されるものと思われる。すなわち、添付し
た請求の範囲の記載にあるような限定のみが、付加され
るべきである。従って、請求した本願発明の範疇にある
同等の変更をすべて包含した、添付した請求の範囲を希
求する次第である。
ードするDNA (iii)配列の数:58 (iv)連絡先住所: (A)名宛人:マーシャル、オトゥール、ジェース
ティン、マレー アンド ビックネル (B)番地:トゥー ファースト ナショナル プ
ラザ、20サウス クラーク ストリート (C)都市名:シカゴ (D)州名:イリノイ (E)国名:米国 (F)郵便番号:60603 (v)コンピューター読取形式: (A)媒体:フロッピー ディスク (B)コンピューター:IBM PC互換機 (C)操作システム:PC−DOS/MS−DOS (D)ソフトウェア:パテント イン リリース#
1.0、バージョン#1.25 (vi)現出願データ: (A)出願番号: (B)出願日: (C)分類: (vii)先行出願データ: (A)出願番号:US 07/688,356 (B)出願日;04−4月−1991 (viii)弁護士/弁理士情報: (A)氏名:ノーランド、グレタ イー (B)登録番号:35,302 (C)参照/事件番号:27866/30822 (ix)通信情報: (A)電話:(312)346−5750 (B)ファックス:(312)984−9740 (C)テレックス:25−3856 (2)配列番号:1の情報 (i)配列特徴: (A)配列の長さ:20塩基対 (B)配列の型:核酸 (C)鎖の数:一本鎖 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:DNA (xi)配列:配列番号:1 (2)配列番号:2の情報 (i)配列特徴: (A)配列の長さ:8アミノ酸 (B)配列の型:アミノ酸 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:ペプチド (xi)配列:配列番号:2 (2)配列番号:3の情報 (i)配列特徴: (A)配列の長さ:23塩基対 (B)配列の型:核酸 (C)鎖の数:一本鎖 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:DNA (xi)配列:配列番号:3 (2)配列番号:4の情報 (i)配列特徴: (A)配列の長さ:8アミノ酸 (B)配列の型:アミノ酸 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:ペプチド (xi)配列:配列番号:4 (2)配列番号:5の情報 (i)配列特徴: (A)配列の長さ:2291塩基対 (B)配列の型:核酸 (C)鎖の数:一本鎖 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:cDNA (ix)配列の特徴: (A)特徴を表す記号:CDS (B)存在位置:100..1689 (xi)配列:配列番号:5 (2)配列番号:6の情報 (i)配列特徴: (A)配列の長さ:530アミノ酸 (B)配列の型:アミノ酸 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:タンパク質 (xi)配列:配列番号:6 (2)配列番号:7の情報 (i)配列特徴: (A)配列の長さ:7アミノ酸 (B)配列の型:アミノ酸 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:ペプチド (xi)配列:配列番号:7 (2)配列番号:8の情報 (i)配列特徴: (A)配列の長さ:20塩基対 (B)配列の型:核酸 (C)鎖の数:一本鎖 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:DNA (xi)配列:配列番号:8 (2)配列番号:9の情報 (i)配列特徴: (A)配列の長さ:7アミノ酸 (B)配列の型:アミノ酸 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:ペプチド (xi)配列:配列番号:9 (2)配列番号:10の情報 (i)配列特徴: (A)配列の長さ:21塩基対 (B)配列の型:核酸 (C)鎖の数:一本鎖 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:DNA (iv)アンチセンス:Yes (xi)配列:配列番号:10 (2)配列番号:11の情報 (i)配列特徴: (A)配列の長さ:75塩基対 (B)配列の型:核酸 (C)鎖の数:一本鎖 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:cDNA (xi)配列:配列番号:11 (2)配列番号:12の情報 (i)配列特徴: (A)配列の長さ:21塩基対 (B)配列の型:核酸 (C)鎖の数:一本鎖 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:DNA (xi)配列:配列番号:12 (2)配列番号:13の情報 (i)配列特徴: (A)配列の長さ:21塩基対 (B)配列の型:核酸 (C)鎖の数:一本鎖 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:DNA (iv)アンチセンス:Yes (xi)配列:配列番号:13 (2)配列番号:14の情報 (i)配列特徴: (A)配列の長さ:54塩基対 (B)配列の型:核酸 (C)鎖の数:一本鎖 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:cDNA (xi)配列:配列番号:14 (2)配列番号:15の情報 (i)配列特徴: (A)配列の長さ:18アミノ酸 (B)配列の型:アミノ酸 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:タンパク質 (xi)配列:配列番号:15 (2)配列番号:16の情報 (i)配列特徴: (A)配列の長さ:2656塩基対 (B)配列の型:核酸 (C)鎖の数:一本鎖 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:cDNA (ix)配列の特徴: (A)特徴を表す記号:CDS (B)存在位置:136..1677 (xi)配列:配列番号:16 (2)配列番号:17の情報 (i)配列特徴: (A)配列の長さ:514アミノ酸 (B)配列の型:アミノ酸 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:タンパク質 (xi)配列:配列番号:17 (2)配列番号:18の情報 (i)配列特徴: (A)配列の長さ:23塩基対 (B)配列の型:核酸 (C)鎖の数:一本鎖 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:DNA (xi)配列:配列番号:18 (2)配列番号:19の情報 (i)配列特徴: (A)配列の長さ:8アミノ酸 (B)配列の型:アミノ酸 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:ペプチド (xi)配列:配列番号:19 (2)配列番号:20の情報 (i)配列特徴: (A)配列の長さ:32塩基対 (B)配列の型:核酸 (C)鎖の数:一本鎖 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:DNA (xi)配列:配列番号:20 (2)配列番号:21の情報 (i)配列特徴: (A)配列の長さ:11アミノ酸 (B)配列の型:アミノ酸 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:ペプチド (xi)配列:配列番号:21 (2)配列番号:22の情報 (i)配列特徴: (A)配列の長さ:412塩基対 (B)配列の型:核酸 (C)鎖の数:一本鎖 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:cDNA (ix)配列の特徴: (A)特徴を表す記号:CDS (B)存在位置:1..412 (xi)配列:配列番号:22 (2)配列番号:23の情報 (i)配列特徴: (A)配列の長さ:137アミノ酸 (B)配列の型:アミノ酸 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:タンパク質 (xi)配列:配列番号:23 (2)配列番号:24の情報 (i)配列特徴: (A)配列の長さ:23塩基対 (B)配列の型:核酸 (C)鎖の数:一本鎖 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:DNA (xi)配列:配列番号:24 (2)配列番号:25の情報 (i)配列特徴: (A)配列の長さ:8アミノ酸 (B)配列の型:アミノ酸 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:ペプチド (xi)配列:配列番号:25 (2)配列番号:26の情報 (i)配列特徴: (A)配列の長さ:1844塩基対 (B)配列の型:核酸 (C)鎖の数:一本鎖 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:cDNA (ix)配列の特徴: 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(ii)配列の種類:DNA (xi)配列:配列番号:36 (2)配列番号:37の情報 (i)配列特徴: (A)配列の長さ:23塩基対 (B)配列の型:核酸 (C)鎖の数:一本鎖 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:DNA (xi)配列:配列番号:37 (2)配列番号:38の情報 (i)配列特徴: (A)配列の長さ:4131塩基対 (B)配列の型:核酸 (C)鎖の数:一本鎖 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:cDNA (ix)配列の特徴: (A)特徴を表す記号:CDS (B)存在位置:148..2910 (xi)配列:配列番号:38 (2)配列番号:39の情報 (i)配列特徴: (A)配列の長さ:921アミノ酸 (B)配列の型:アミノ酸 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:タンパク質 (xi)配列:配列番号:39 (2)配列番号:40の情報 (i)配列特徴: (A)配列の長さ:249塩基対 (B)配列の型:核酸 (C)鎖の数:一本鎖 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:cDNA (xi)配列:配列番号:40 (2)配列番号:41の情報 (i)配列特徴: (A)配列の長さ:250塩基対 (B)配列の型:核酸 (C)鎖の数:一本鎖 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:cDNA (iv)アンチセンス:Yes (xi)配列:配列番号:41 (2)配列番号:42の情報 (i)配列特徴: (A)配列の長さ:3789塩基対 (B)配列の型:核酸 (C)鎖の数:一本鎖 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:cDNA (ix)配列の特徴: (A)特徴を表す記号:CDS (B)存在位置:181..3006 (xi)配列:配列番号:42 (2)配列番号:43の情報 (i)配列特徴: (A)配列の長さ:942アミノ酸 (B)配列の型:アミノ酸 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:タンパク質 (xi)配列:配列番号:43 (2)配列番号:44の情報 (i)配列特徴: (A)配列の長さ:3044塩基対 (B)配列の型:核酸 (C)鎖の数:一本鎖 (D)トポロジー:直鎖状 (ii)配列の種類:cDNA (ix)配列の特徴: (A)特徴を表す記号:CDS (B)存在位置:12..2843 (xi)配列:配列番号:44 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Claims (21)
- 【請求項1】配列番号:49、51または53に記載の哺乳類C
a2+/カルモジュリン刺激サイクリックヌクレオチドホス
ホジエステラーゼ酵素をコードするDNA配列を含む、こ
とを特徴とする精製および単離したポリヌクレオチド。 - 【請求項2】前記DNA配列が、cDNA配列である請求項1
に記載のポリヌクレオチド。 - 【請求項3】前記DNA配列が、ゲノミックDNA配列である
請求項1に記載のポリヌクレオチド。 - 【請求項4】請求項1乃至3のいずれかに記載のポリヌ
クレオチドで安定して形質転換した、ことを特徴とする
原核宿主細胞。 - 【請求項5】請求項1乃至3のいずれかに記載のポリヌ
クレオチドで安定して形質転換した、ことを特徴とする
真核宿主細胞。 - 【請求項6】前記宿主細胞が、酵母細胞である請求項5
に記載の真核宿主細胞。 - 【請求項7】請求項1乃至3のいずれかに記載のポリヌ
クレオチドで挿入されてなる、ことを特徴とするDNAベ
クター。 - 【請求項8】pcamHella(A.T.C.C.68965)の名称が付与
された請求項7に記載のDNAベクター。 - 【請求項9】pcamH3EF(A.T.C.C.68964)の名称が付与
された請求項7に記載のDNAベクター。 - 【請求項10】λCAM H6a(A.T.C.C.75000)の名称が付
与された請求項7に記載のDNAベクター。 - 【請求項11】pHcam61−6N−7(A.T.C.C.68963)の名
称が付与された請求項7に記載のDNAベクター。 - 【請求項12】哺乳類Ca2+/カルモジュリン刺激サイク
リックヌクレオチドホスホジエステラーゼ酵素の酵素活
性を有する精製および単離されたポリペプチドの製造方
法であって、以下の工程、すなわち、 (a)請求項1乃至3のいずれかに記載のポリヌクレオ
チドで、原核宿主細胞または真核宿主細胞を安定して形
質転換または形質変換し:および (b)当該宿主細胞にて当該ポリヌクレオチドの発現を
許容する条件下の栄養培地で、工程(a)で形成した宿
主細胞を生育する、 工程を含む、ことを特徴とするポリペプチドの製造方
法。 - 【請求項13】前記宿主細胞において前記ポリヌクレオ
チドが発現したポリペプチド生成物を単離する工程をさ
らに含む、請求項12に記載の方法。 - 【請求項14】前記真核宿主細胞が、酵母細胞である請
求項12または13に記載の方法。 - 【請求項15】哺乳類Ca2+/カルモジュリン刺激サイク
リックヌクレオチドホスホジエステラーゼ酵素の酵素活
性を有する精製および単離されたポリヌクレオチドであ
って、当該ポリヌクレオチドが、配列番号:48、50また
は52に記載の配列のアンチセンス鎖とストリンジェント
な条件下でハイブリダイズする、ことを特徴とする精製
および単離したポリヌクレオチド。 - 【請求項16】精製および単離されたCa2+/カルモジュ
リン刺激サイクリックヌクレオチドホスホジエステラー
ゼポリペプチドであって、当該ポリペプチドが、配列番
号:49、51または53に記載のアミノ酸配列を含む、こと
を特徴とする精製および単離されたポリペプチド。 - 【請求項17】形質転換した原核宿主細胞または真核宿
主細胞での、配列番号:49、51または53に記載の哺乳類C
a2+/カルモジュリン刺激サイクリックヌクレオチドホス
ホジエステラーゼをコードするポリヌクレオチド配列の
発現によって得られるポリペプチド生成物。 - 【請求項18】哺乳類Ca2+/カルモジュリン感受性サイ
クリックヌクレオチドホスホジエステラーゼの酵素活性
を修飾する化学薬品を同定するための分析方法であっ
て、以下の工程、すなわち、 (a)当該ポリヌクレオチドの発現があり次第に改変感
受性になる表現型特性を有する原核宿主細胞または真核
宿主細胞を、請求項1乃至3のいずれかに記載のポリヌ
クレオチドで安定して形質転換し; (b)宿主細胞表現型での改変に対応して当該宿主細胞
での当該ポリヌクレオチドの発現を許容する条件下の栄
養培地で、工程(a)で形成した宿主細胞を生育し; (c)工程(b)で生育せしめた宿主細胞と分析する化
学薬品とを接触させ;および (d)工程(c)で化学薬品と接触した当該宿主細胞の
表現型の改変を決定する、 工程を含む、ことを特徴とする哺乳類Ca2+/カルモジュ
リン感受性サイクリックヌクレオチドホスホジエステラ
ーゼの酵素活性を修飾する化学薬品を同定するための分
析方法。 - 【請求項19】前記真核宿主細胞が、酵母細胞である請
求項18に記載の分析方法。 - 【請求項20】哺乳類Ca2+/カルモジュリン感受性サイ
クリックヌクレオチドホスホジエステラーゼの酵素活性
を修飾する化学薬品を同定するための分析方法であっ
て、以下の工程、すなわち、 (a)当該ポリヌクレオチド配列の発現があり次第に改
変感受性になる表現型特性を有する原核宿主細胞または
真核宿主細胞を、請求項1乃至3のいずれかに記載のポ
リヌクレオチドで安定して形質転換し; (b)宿主細胞表現型での改変に対応して当該宿主細胞
での当該ポリヌクレオチドの発現を許容する条件下の栄
養培地で、工程(a)で形成した宿主細胞を生育し; (c)改変した表現型を有する宿主細胞を同定し; (d)当該宿主細胞を粉砕し; (e)粉砕した当該宿主細胞から細胞質ゾルを単離し;
および (f)当該細胞質ゾルでの酵素活性の改変を決定する、 工程を含む、ことを特徴とする哺乳類Ca2+/カルモジュ
リン感受性サイクリックヌクレオチドホスホジエステラ
ーゼの酵素活性を修飾する化学薬品を同定するための分
析方法。 - 【請求項21】前記真核宿主細胞が、酵母細胞である請
求項20に記載の分析方法。
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