JP2023529010A - Tnfr2に結合する抗体およびその用途 - Google Patents
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Abstract
本発明は、TNFR2に特異的に結合する新規抗体および抗体断片、および前記抗体または抗体断片を含む組成物に関する。また、本発明は、前記抗体またはその抗体断片をコードする核酸およびそれらを含む宿主細胞、ならびにその関連用途に関する。さらに、本発明は、治療および診断のための前記抗体および抗体断片の使用に関する。【選択図】なし
Description
本発明は、TNFR2に特異的に結合する新規抗体またはその抗体断片、および該抗体またはその抗体断片を含む組成物に関する。また、本発明は、前記抗体またはその抗体断片をコードする核酸およびそれらを含む宿主細胞、ならびにその関連用途に関する。さらに、本発明は、治療および診断のための抗体または抗体断片の使用に関する。
腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリー(TNFRSF)は、様々な免疫細胞および非免疫細胞の機能を媒介可能な関連構造を有する29受容体の大きなクラスである(Mayes PA et al, Nat Rev Drug Discov.2018年7月;17(7):509-52)。いくつかの受容体は、免疫共刺激因子(TNFRSF5(CD40としても知られる)、TNFRSF4(OX40としても知られる)、TNFRSF9(4-1BBとしても知られる)、TNFRSF7(CD27としても知られる)およびTNFRSF18(GITRとしても知られる)として役割を果たすことを特徴としている。これらの共刺激受容体は、T細胞、B細胞およびナチュラルキラー(NK)細胞、ならびに抗原提示細胞(APC)を含む多くの免疫細胞型で発現でき、免疫細胞の機能、増殖、および生存を促進することが示されている。
腫瘍壊死因子α(TNF-α)は、実質的に全てのタイプの細胞に影響を及ぼす非常に多面的なサイトカインである。これは、炎症性遺伝子発現プログラムの誘導から、細胞増殖および分化の刺激を経て、アポトーシスや壊死などの細胞自殺プログラムの活性化に至る、細胞応答を引き起こす(Wajant H et al,Cell Death Differ.2003年1月;10(1):45-65.)。TNF-αの膜貫通型と可溶型の両方とも、TNF-α、TNFR1およびTNFR2の2つの既知の受容体と相互作用する。これらの2つの受容体はTNFRSFの異なるサブグループ(下位群)に属する。TNFR1は死の受容体(DR)であり、デスドメインを有する。TNFR2はデスドメインを持たず、プロトタイプのTNF受容体関連因子(TRAF)と相互作用するTNFRSF受容体である(Xie P,J Mol Signal.2013年6月13日;8(1):7)。したがって、TNFR2のC末端付近に短いアミノ酸モチーフが存在し、これは、TRAF1や、アポトーシスタンパク質1(cIAP1)およびcIAP2の細胞阻害剤などのアダプタータンパク質TRAF2およびTRAF2関連タンパク質の動員を可能にする。したがって、TNFR2は、本質的な細胞死誘導活性を有さないが、NF-κΒシグナル伝達および様々なキナーゼの活性化を刺激する。
TNFR1は、ほぼ全ての細胞型で発現する。TNFR2の発現は、骨髄細胞、制御性T細胞、グリア細胞、一部の内皮細胞型を含む特定の細胞型に限定されるが、上皮細胞、線維芽細胞、および特定のT細胞およびB細胞のサブセットでも誘導される(Medler and Wajant, Expert Opin Ther Targets.2019年4月;23(4):295-307)。
Heather Torreyらによる最近の研究(Sci Signal.2017年1月17日;10(462))は、拮抗抗体を用いたTNFR2阻害の効果を特徴づけた。培養ベースのアッセイでは、2つのTNFR2拮抗薬(antagonist)がTregsの増殖を阻害し、正常細胞からの可溶性TNFR2分泌を減少させ、Tエフェクター細胞の拡大を可能にすることがわかった。これらのTNFR2抗体は、卵巣癌腹水から分離されたTregsを、健康なドナーサンプルからTregsを死滅させるよりも強力に死滅させ、これらの抗体が腫瘍微小環境に対する特異性を有する可能性を示唆している。
別の研究では、Eric M.Tam(Sci Transl Med.2019年10月2日;11(512))は、抗TNFR2抗体が共刺激シグナル伝達を提供し、これは、インビトロではCD4+およびCD8+のT細胞の両方で増殖、活性化マーカー、サイトカインの増加をもたらし、ヒト化マウスモデルでも抗腫瘍効果を示すと述べた。
抑制性受容体であるCTLA-4、PD-1、またはPD-L1を標的とする免疫療法は、癌において実質的な臨床的進歩を遂げているが、かなりの割合の患者が治療に反応しないままである。新規の免疫腫瘍経路を単独で、または既存の免疫療法と併用して標的とする免疫療法は、臨床転帰を改善する可能性がある。現在、抗TNFR2抗体は臨床研究されておらず、そのため、癌治療に用いられる、エフェクターT細胞の機能を活性化し、T細胞の増殖を促進し、および/またはTregsの機能を阻害することができる、TNFR2標的療法が必要とされている。
本発明は、TNFR2に結合する抗体またはその断片またはその抗原結合断片に関する。一実施形態において、TNFR2は、ヒトまたはカニクイザル(cynomolgus)に由来する。別の実施形態において、TNFR2は、配列番号48、配列番号49または配列番号50を含む。さらなる実施形態において、抗体が結合できるTNFR2の断片は、TNFR2の細胞外領域を含み、例えば、この領域は、配列番号50を含むかまたは配列番号50からなる。さらなる実施形態において、抗体が結合できるTNFR2の断片は、配列番号50の1L~31Cのアミノ酸配列、または配列番号50の1L~96Cまたは配列番号50の17T~54Dのアミノ酸配列を含む。さらなる実施形態において、抗体が結合できるTNFR2の断片は、ヒトTNFR2タンパク質上のQ26、またはヒトTNFR2タンパク質上の26位に対応する位置のアミノ酸Qを含む。
一実施形態において、本発明の抗体は、TNFR2のエピトープに結合する。本発明の一実施形態において、本発明の抗体が結合するTNFR2のエピトープは、ヒトTNFR2タンパク質上の26位に対応する位置に、ヒトTNFR2のQ26またはアミノ酸Qを含む。一実施形態において、エピトープは、ヒトTNFR2の細胞外領域、例えば、配列番号50からなるかまたはそれを含む領域に含まれる。別の実施形態において、エピトープは、ヒトTNFR2またはそれに対応する断片における配列番号58の1Lから31Cまでのアミノ酸配列に含まれる。別の実施形態において、エピトープは、ヒトTNFR2またはそれに対応する断片における配列番号62の1Lから96Cまでのアミノ酸配列に含まれる。別の実施形態において、エピトープの1つ以上のアミノ酸は、ヒトTNFR2またはそれに対応する断片における配列番号52の17T~54Dのアミノ酸配列に含まれる。
一実施形態において、本発明の抗体は、TNFR2のエピトープに結合する。本発明の一実施形態において、本発明の抗体が結合するTNFR2のエピトープは、ヒトTNFR2タンパク質上の26位に対応する位置に、ヒトTNFR2のQ26またはアミノ酸Qを含む。一実施形態において、エピトープは、ヒトTNFR2の細胞外領域、例えば、配列番号50からなるかまたはそれを含む領域に含まれる。別の実施形態において、エピトープは、ヒトTNFR2またはそれに対応する断片における配列番号58の1Lから31Cまでのアミノ酸配列に含まれる。別の実施形態において、エピトープは、ヒトTNFR2またはそれに対応する断片における配列番号62の1Lから96Cまでのアミノ酸配列に含まれる。別の実施形態において、エピトープの1つ以上のアミノ酸は、ヒトTNFR2またはそれに対応する断片における配列番号52の17T~54Dのアミノ酸配列に含まれる。
一態様において、抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片は、以下の特性(プロパティー)の1つ以上を有する:
(1)インビトロでヒトおよび/またはカニクイザルTNFR2タンパク質またはその断片に高親和性で結合すること、
(2)細胞表面、例えば293T細胞の細胞表面、または抗CD3によって刺激されたPBMCなどの活性化細胞上に発現されるヒトおよび/またはカニクイザルTNFR2に結合すること、
(3)TNF-αと、細胞(例えば、293T細胞)上に発現されるヒトおよび/またはカニクイザルTNFR2との間の相互作用/結合をブロッキングすること、
(4)(例えば、ヒト)T細胞(例えば、CD8+T細胞またはCD4+T細胞)を活性化すること、例えば、IFN-γのようなサイトカインの分泌を増加させ、CD4+T細胞またはCD8+T細胞の増殖を増加させること、
(5)TNFR2、例えば、ヒトまたはカニクイザルTNFR2の下流シグナル経路を刺激すること、
(6)免疫応答を増強すること、
(7)誘導されたT細胞、例えば、誘導されたTreg細胞または誘導されたCD8+T細胞に対するADCC効果を誘導しないこと、
(8)薬物動態のパラメータが良好であるため、医薬品の有効成分として使用できること、
(9)例えば、腫瘍体積を減少させることによる抗腫瘍効果を有し、例えば、腫瘍体積を少なくとも20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%以上減少させることができること。
(1)インビトロでヒトおよび/またはカニクイザルTNFR2タンパク質またはその断片に高親和性で結合すること、
(2)細胞表面、例えば293T細胞の細胞表面、または抗CD3によって刺激されたPBMCなどの活性化細胞上に発現されるヒトおよび/またはカニクイザルTNFR2に結合すること、
(3)TNF-αと、細胞(例えば、293T細胞)上に発現されるヒトおよび/またはカニクイザルTNFR2との間の相互作用/結合をブロッキングすること、
(4)(例えば、ヒト)T細胞(例えば、CD8+T細胞またはCD4+T細胞)を活性化すること、例えば、IFN-γのようなサイトカインの分泌を増加させ、CD4+T細胞またはCD8+T細胞の増殖を増加させること、
(5)TNFR2、例えば、ヒトまたはカニクイザルTNFR2の下流シグナル経路を刺激すること、
(6)免疫応答を増強すること、
(7)誘導されたT細胞、例えば、誘導されたTreg細胞または誘導されたCD8+T細胞に対するADCC効果を誘導しないこと、
(8)薬物動態のパラメータが良好であるため、医薬品の有効成分として使用できること、
(9)例えば、腫瘍体積を減少させることによる抗腫瘍効果を有し、例えば、腫瘍体積を少なくとも20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%以上減少させることができること。
一態様において、本発明は、3つの重鎖相補性決定領域(CDR)HCDR1、HCDR2およびHCDR3を含む、抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片に関する。
別の態様において、本発明は、3つの軽鎖相補性決定領域(CDR)LCDR1、LCDR2およびLCDR3を含む、抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片に関する。
さらなる態様において、本発明は、3つの重鎖相補性決定領域(CDR)HCDR1、HCDR2およびHCDR3と、3つの軽鎖相補性決定領域(CDR)LCDR1、LCDR2およびLCDR3と、を含む、抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片に関する。
別の態様において、本発明は、3つの軽鎖相補性決定領域(CDR)LCDR1、LCDR2およびLCDR3を含む、抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片に関する。
さらなる態様において、本発明は、3つの重鎖相補性決定領域(CDR)HCDR1、HCDR2およびHCDR3と、3つの軽鎖相補性決定領域(CDR)LCDR1、LCDR2およびLCDR3と、を含む、抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片に関する。
別の態様において、本発明は、重鎖可変領域を含む、抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片に関する。
別の態様において、本発明は、軽鎖可変領域を含む、抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片に関する。
さらなる態様において、本発明は、重鎖可変領域および軽鎖可変領域を含む、抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片に関する。
一実施形態において、重鎖可変領域は、3つの重鎖相補性決定領域(CDR)HCDR1、HCDR2およびHCDR3を含む。
別の実施形態において、軽鎖可変領域は、3つの軽鎖相補性決定領域(CDR)HCDR1、HCDR2およびHCDR3を含む。
別の態様において、本発明は、軽鎖可変領域を含む、抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片に関する。
さらなる態様において、本発明は、重鎖可変領域および軽鎖可変領域を含む、抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片に関する。
一実施形態において、重鎖可変領域は、3つの重鎖相補性決定領域(CDR)HCDR1、HCDR2およびHCDR3を含む。
別の実施形態において、軽鎖可変領域は、3つの軽鎖相補性決定領域(CDR)HCDR1、HCDR2およびHCDR3を含む。
一実施形態において、3つの重鎖相補性決定領域HCDR1、HCDR2およびHCDR3は、以下の通りである:
(i) HCVRが配列番号7、15、25または37で表される配列を含むかまたはそれらからなる、重鎖可変領域HCVRに由来するHCDR1、HCDR2およびHCDR3、または
(ii) (i)の3つのCDRと比較して、合計で1つ以上5つ以下のアミノ酸変化(好ましくはアミノ酸置換、好ましくは保存的置換)をさらに含む、(i)のHCDR1、HCDR2およびHCDR3。
一実施形態において、3つの軽鎖相補性決定領域(CDR)LCDR1、LCDR2およびLCDR3は、以下の通りである:
(i) LCVRが配列番号8、16、26、28または38で表される配列を含むかまたはそれらからなる、軽鎖可変領域LCVRに由来するLCDR1、LCDR2およびLCDR3、または
(ii) (i)の3つのCDRと比較して、合計で1つ以上5つ以下のアミノ酸変化(好ましくはアミノ酸置換、好ましくは保存的置換)をさらに含む、(i)のLCDR1、LCDR2およびLCDR3。
一実施形態において、本発明は、抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片に関し、以下を含む、HCVRが配列番号7、15、25または37で表される配列からなる、重鎖可変領域HCVRに由来する3つの重鎖相補性決定領域(CDR)HCDR1、HCDR2およびHCDR3、およびLCVRが配列番号8、16、26、28または38で表される配列からなる、軽鎖可変領域LCVRに由来する3つの軽鎖相補性決定領域(CDR)LCDR1、LCDR2およびLCDR3。
別の実施形態において、本発明は、抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片に関し、以下を含む:
(1) 配列番号7または25で表される配列からなる重鎖可変領域HCVRに由来する3つのHCDRであるHCDR1、HCDR2およびHCDR3、および配列番号8または26または28で表される配列からなる軽鎖可変領域LCVRに由来する3つのLCDRであるLCDR1、LCDR2およびLCDR3、
(2) 配列番号15または37で表される配列からなる重鎖可変領域HCVRに由来する3つのHCDRであるHCDR1、HCDR2およびHCDR3、および配列番号16または38で表される配列からなる軽鎖可変領域LCVRに由来する3つのLCDRであるLCDR1、LCDR2およびLCDR3。
(i) HCVRが配列番号7、15、25または37で表される配列を含むかまたはそれらからなる、重鎖可変領域HCVRに由来するHCDR1、HCDR2およびHCDR3、または
(ii) (i)の3つのCDRと比較して、合計で1つ以上5つ以下のアミノ酸変化(好ましくはアミノ酸置換、好ましくは保存的置換)をさらに含む、(i)のHCDR1、HCDR2およびHCDR3。
一実施形態において、3つの軽鎖相補性決定領域(CDR)LCDR1、LCDR2およびLCDR3は、以下の通りである:
(i) LCVRが配列番号8、16、26、28または38で表される配列を含むかまたはそれらからなる、軽鎖可変領域LCVRに由来するLCDR1、LCDR2およびLCDR3、または
(ii) (i)の3つのCDRと比較して、合計で1つ以上5つ以下のアミノ酸変化(好ましくはアミノ酸置換、好ましくは保存的置換)をさらに含む、(i)のLCDR1、LCDR2およびLCDR3。
一実施形態において、本発明は、抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片に関し、以下を含む、HCVRが配列番号7、15、25または37で表される配列からなる、重鎖可変領域HCVRに由来する3つの重鎖相補性決定領域(CDR)HCDR1、HCDR2およびHCDR3、およびLCVRが配列番号8、16、26、28または38で表される配列からなる、軽鎖可変領域LCVRに由来する3つの軽鎖相補性決定領域(CDR)LCDR1、LCDR2およびLCDR3。
別の実施形態において、本発明は、抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片に関し、以下を含む:
(1) 配列番号7または25で表される配列からなる重鎖可変領域HCVRに由来する3つのHCDRであるHCDR1、HCDR2およびHCDR3、および配列番号8または26または28で表される配列からなる軽鎖可変領域LCVRに由来する3つのLCDRであるLCDR1、LCDR2およびLCDR3、
(2) 配列番号15または37で表される配列からなる重鎖可変領域HCVRに由来する3つのHCDRであるHCDR1、HCDR2およびHCDR3、および配列番号16または38で表される配列からなる軽鎖可変領域LCVRに由来する3つのLCDRであるLCDR1、LCDR2およびLCDR3。
一実施形態において、HCDR1は、配列番号1または9からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなり、あるいは、HCDR1は、配列番号1または9からなる群から選択されるアミノ酸配列と比較して、1つ、2つまたは3つの変化(好ましくはアミノ酸置換、好ましくは保存的置換)を有するアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる。
一実施形態において、HCDR2は、配列番号2または10からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなり、あるいは、HCDR2は、配列番号2または10からなる群から選択されるアミノ酸配列と比較して、1つ、2つまたは3つの変化(好ましくはアミノ酸置換、好ましくは保存的置換)を有するアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる。
一実施形態において、HCDR3は、配列番号3または11からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなり、あるいは、HCDR3は、配列番号3または11からなる群から選択されるアミノ酸配列と比較して、1つ、2つまたは3つの変化(好ましくはアミノ酸置換、好ましくは保存的置換)を有するアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる。
一実施形態において、LCDR1は、配列番号4または12からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなり、あるいは、LCDR1は、配列番号4または12からなる群から選択されるアミノ酸配列と比較して、1つ、2つまたは3つの変化(好ましくはアミノ酸置換、好ましくは保存的置換)を有するアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる。
一実施形態において、LCDR2は、配列番号5または13からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなり、あるいは、LCDR2は、配列番号5または13からなる群から選択されるアミノ酸配列と比較して、1つ、2つまたは3つの変化(好ましくはアミノ酸置換、好ましくは保存的置換)を有するアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる。
一実施形態において、LCDR3は、配列番号6または14からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなり、あるいは、LCDR3は、配列番号6または14からなる群から選択されるアミノ酸配列と比較して、1つ、2つまたは3つの変化(好ましくはアミノ酸置換、好ましくは保存的置換)を有するアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる。
一実施形態において、HCDR2は、配列番号2または10からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなり、あるいは、HCDR2は、配列番号2または10からなる群から選択されるアミノ酸配列と比較して、1つ、2つまたは3つの変化(好ましくはアミノ酸置換、好ましくは保存的置換)を有するアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる。
一実施形態において、HCDR3は、配列番号3または11からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなり、あるいは、HCDR3は、配列番号3または11からなる群から選択されるアミノ酸配列と比較して、1つ、2つまたは3つの変化(好ましくはアミノ酸置換、好ましくは保存的置換)を有するアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる。
一実施形態において、LCDR1は、配列番号4または12からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなり、あるいは、LCDR1は、配列番号4または12からなる群から選択されるアミノ酸配列と比較して、1つ、2つまたは3つの変化(好ましくはアミノ酸置換、好ましくは保存的置換)を有するアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる。
一実施形態において、LCDR2は、配列番号5または13からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなり、あるいは、LCDR2は、配列番号5または13からなる群から選択されるアミノ酸配列と比較して、1つ、2つまたは3つの変化(好ましくはアミノ酸置換、好ましくは保存的置換)を有するアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる。
一実施形態において、LCDR3は、配列番号6または14からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなり、あるいは、LCDR3は、配列番号6または14からなる群から選択されるアミノ酸配列と比較して、1つ、2つまたは3つの変化(好ましくはアミノ酸置換、好ましくは保存的置換)を有するアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる。
一実施形態において、3つの重鎖相補性決定領域HCDR1、HCDR2およびHCDR3は、以下の通りである:
(i) それぞれ配列番号1、2および3で表される配列からなるHCDR1、HCDR2およびHCDR3、または
(ii) それぞれ配列番号9、10および11で表される配列からなるHCDR1、HCDR2およびHCDR3、または
(iii) (i)または(ii)の3つのCDRと比較して、合計で1つ以上5つ以下のアミノ酸変化(好ましくはアミノ酸置換、好ましくは保存的置換)をさらに含む、(i)または(ii)のHCDR1、HCDR2およびHCDR3。
一実施形態において、3つの軽鎖相補性決定領域(CDR)LCDR1、LCDR2およびLCDR3は、以下の通りである:
(i) それぞれ配列番号4、5および6で表される配列からなるLCDR1、LCDR2およびLCDR3、または
(ii) それぞれ配列番号12、13および14で表される配列からなるLCDR1、LCDR2およびLCDR3、または
(iii) (i)の3つのCDRと比較して、合計で1つ以上5つ以下のアミノ酸変化(好ましくはアミノ酸置換、好ましくは保存的置換)をさらに含む、(i)のLCDR1、LCDR2およびLCDR3。
別の実施形態において、本発明は、抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片に関し、以下を含む:
(i) それぞれ配列番号1、2および3で表される配列からなるHCDR1、HCDR2およびHCDR3、ならびに、それぞれ配列番号4、5および6で表される配列からなるLCDR1、LCDR2およびLCDR3、
(ii) それぞれ配列番号9、10および11で表される配列からなるHCDR1、HCDR2およびHCDR3、および、それぞれ配列番号12、13および14で表される配列からなるLCDR1、LCDR2およびLCDR3。
(i) それぞれ配列番号1、2および3で表される配列からなるHCDR1、HCDR2およびHCDR3、または
(ii) それぞれ配列番号9、10および11で表される配列からなるHCDR1、HCDR2およびHCDR3、または
(iii) (i)または(ii)の3つのCDRと比較して、合計で1つ以上5つ以下のアミノ酸変化(好ましくはアミノ酸置換、好ましくは保存的置換)をさらに含む、(i)または(ii)のHCDR1、HCDR2およびHCDR3。
一実施形態において、3つの軽鎖相補性決定領域(CDR)LCDR1、LCDR2およびLCDR3は、以下の通りである:
(i) それぞれ配列番号4、5および6で表される配列からなるLCDR1、LCDR2およびLCDR3、または
(ii) それぞれ配列番号12、13および14で表される配列からなるLCDR1、LCDR2およびLCDR3、または
(iii) (i)の3つのCDRと比較して、合計で1つ以上5つ以下のアミノ酸変化(好ましくはアミノ酸置換、好ましくは保存的置換)をさらに含む、(i)のLCDR1、LCDR2およびLCDR3。
別の実施形態において、本発明は、抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片に関し、以下を含む:
(i) それぞれ配列番号1、2および3で表される配列からなるHCDR1、HCDR2およびHCDR3、ならびに、それぞれ配列番号4、5および6で表される配列からなるLCDR1、LCDR2およびLCDR3、
(ii) それぞれ配列番号9、10および11で表される配列からなるHCDR1、HCDR2およびHCDR3、および、それぞれ配列番号12、13および14で表される配列からなるLCDR1、LCDR2およびLCDR3。
一実施形態において、重鎖可変領域は、
(i)配列番号7、15、25または37からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%または99%の同一性を有するアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる、または
(ii)配列番号7、15、25または37からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる、または
(iii)配列番号7、15、25または37からなる群から選択されるアミノ酸配列と比較して、好ましくは、アミノ酸変化がCDR領域で生じず、より好ましくは、アミノ酸変化がフレームワーク領域(FR領域)、例えばFR1、FR2、FR3またはFR4領域で生じる、1つ以上(好ましくは10以下、より好ましくは5以下)のアミノ酸変化(好ましくはアミノ酸置換、より好ましくは保存的置換)を有するアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる。
別の実施形態において、軽鎖可変領域は、
(i)配列番号8、16、26、28または38からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%または99%の同一性を有するアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる、または
(ii)配列番号8、16、26、28または38からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる、または
(iii)配列番号8、16、26、28または38からなる群から選択されるアミノ酸配列と比較して、好ましくは、アミノ酸変化がCDR領域で生じず、より好ましくは、アミノ酸変化がFR領域、例えばFR1、FR2、FR3またはFR4領域で生じ、好ましくは、該変化がFR3におけるI83で生じ、特に、該変化がIからVまたはその保存的アミノ酸への変化である、1つ以上(好ましくは10以下、より好ましくは5以下)のアミノ酸変化(好ましくはアミノ酸置換、より好ましくは保存的置換)を有するアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる。
別の実施形態において、本発明は、抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片に関し、以下を含む:
配列番号7、15、25または37で表されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる重鎖可変領域、および/または
配列番号8、16、26、28または38で表されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる軽鎖可変領域。
別の実施形態において、本発明は、抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片に関し、以下を含む:
(1) 配列番号7で表されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる重鎖可変領域、および/または配列番号8で表されるアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域、
(2) 配列番号15で表されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる重鎖可変領域、および/または配列番号16で表されるアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域、
(3) 配列番号25で表されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる重鎖可変領域、および/または配列番号26で表されるアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域、
(4) 配列番号25で表されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる重鎖可変領域、および/または配列番号28で表されるアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域、
(5) 配列番号37で表されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる重鎖可変領域、および/または配列番号38で表されるアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域。
(i)配列番号7、15、25または37からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%または99%の同一性を有するアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる、または
(ii)配列番号7、15、25または37からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる、または
(iii)配列番号7、15、25または37からなる群から選択されるアミノ酸配列と比較して、好ましくは、アミノ酸変化がCDR領域で生じず、より好ましくは、アミノ酸変化がフレームワーク領域(FR領域)、例えばFR1、FR2、FR3またはFR4領域で生じる、1つ以上(好ましくは10以下、より好ましくは5以下)のアミノ酸変化(好ましくはアミノ酸置換、より好ましくは保存的置換)を有するアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる。
別の実施形態において、軽鎖可変領域は、
(i)配列番号8、16、26、28または38からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%または99%の同一性を有するアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる、または
(ii)配列番号8、16、26、28または38からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる、または
(iii)配列番号8、16、26、28または38からなる群から選択されるアミノ酸配列と比較して、好ましくは、アミノ酸変化がCDR領域で生じず、より好ましくは、アミノ酸変化がFR領域、例えばFR1、FR2、FR3またはFR4領域で生じ、好ましくは、該変化がFR3におけるI83で生じ、特に、該変化がIからVまたはその保存的アミノ酸への変化である、1つ以上(好ましくは10以下、より好ましくは5以下)のアミノ酸変化(好ましくはアミノ酸置換、より好ましくは保存的置換)を有するアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる。
別の実施形態において、本発明は、抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片に関し、以下を含む:
配列番号7、15、25または37で表されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる重鎖可変領域、および/または
配列番号8、16、26、28または38で表されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる軽鎖可変領域。
別の実施形態において、本発明は、抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片に関し、以下を含む:
(1) 配列番号7で表されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる重鎖可変領域、および/または配列番号8で表されるアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域、
(2) 配列番号15で表されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる重鎖可変領域、および/または配列番号16で表されるアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域、
(3) 配列番号25で表されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる重鎖可変領域、および/または配列番号26で表されるアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域、
(4) 配列番号25で表されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる重鎖可変領域、および/または配列番号28で表されるアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域、
(5) 配列番号37で表されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる重鎖可変領域、および/または配列番号38で表されるアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域。
さらなる態様において、抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片は、IgG1、IgG2、IgG3またはIgG4の形態である。好ましくは、本発明の抗体は、IgG1の形態である。
さらなる態様において、抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片は、重鎖定常領域および/または軽鎖定常領域を含む。
一実施形態において、重鎖定常領域は、ヒトIgG定常領域、例えば、IgG1、IgG2、IgG3またはIgG4、好ましくはIgG1定常領域であるか、あるいは、ヒトIgG定常領域に由来する。
別の実施形態において、重鎖定常領域は、
(i)配列番号40または配列番号73で表されるアミノ酸配列と少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%または99%の同一性を有するアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる、または
(ii)配列番号40または配列番号73で表されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる、または
(iii)配列番号40または73で表されるアミノ酸配列と比較して、1つ以上(好ましくは10以下、より好ましくは5以下)のアミノ酸変化(好ましくはアミノ酸置換、より好ましくは保存的置換)を有するアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる。
一実施形態において、軽鎖定常領域は、κ(カッパ)またはλ(ラムダ)軽鎖定常領域、例えば、ヒトκまたはλ軽鎖定常領域、好ましくは、ヒトκ軽鎖定常領域であるか、あるいは、κまたはλ軽鎖定常領域に由来する。
別の実施形態において、軽鎖定常領域は、
(i)配列番号42で表されるアミノ酸配列と少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%または99%の同一性を有するアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる、または
(ii)配列番号42で表されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる、または
(iii)配列番号42で表されるアミノ酸配列と比較して、1つ以上(好ましくは10以下、より好ましくは5以下)のアミノ酸変化(好ましくはアミノ酸置換、より好ましくは保存的置換)を有するアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる。
さらなる態様において、抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片は、重鎖定常領域および/または軽鎖定常領域を含む。
一実施形態において、重鎖定常領域は、ヒトIgG定常領域、例えば、IgG1、IgG2、IgG3またはIgG4、好ましくはIgG1定常領域であるか、あるいは、ヒトIgG定常領域に由来する。
別の実施形態において、重鎖定常領域は、
(i)配列番号40または配列番号73で表されるアミノ酸配列と少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%または99%の同一性を有するアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる、または
(ii)配列番号40または配列番号73で表されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる、または
(iii)配列番号40または73で表されるアミノ酸配列と比較して、1つ以上(好ましくは10以下、より好ましくは5以下)のアミノ酸変化(好ましくはアミノ酸置換、より好ましくは保存的置換)を有するアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる。
一実施形態において、軽鎖定常領域は、κ(カッパ)またはλ(ラムダ)軽鎖定常領域、例えば、ヒトκまたはλ軽鎖定常領域、好ましくは、ヒトκ軽鎖定常領域であるか、あるいは、κまたはλ軽鎖定常領域に由来する。
別の実施形態において、軽鎖定常領域は、
(i)配列番号42で表されるアミノ酸配列と少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%または99%の同一性を有するアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる、または
(ii)配列番号42で表されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる、または
(iii)配列番号42で表されるアミノ酸配列と比較して、1つ以上(好ましくは10以下、より好ましくは5以下)のアミノ酸変化(好ましくはアミノ酸置換、より好ましくは保存的置換)を有するアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる。
一実施形態において、本発明の抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片の重鎖は、シグナルペプチド配列をさらに含む。
別の実施形態において、本発明の抗TNFR2抗体は、モノクローナル抗体、キメラ抗体、ヒト化抗体またはヒト抗体である。
別の実施形態において、本発明の抗原結合断片は、Fab、Fab′、Fab′-SH、Fv、単鎖抗体(例えば、scFv)、(Fab′)2、単一ドメイン抗体(例えば、VHH)、ドメイン抗体(dAb)または線状抗体(linear antibody)からなる群から選択される抗体断片である。
別の実施形態において、本発明の抗TNFR2抗体は、二重特異性または多重特異性の抗体分子であり、好ましくは、二重特異性の抗体分子は、TNFR2および免疫チェックポイントに結合する。
さらなる態様において、本発明はさらに、本発明の抗TNFR2抗体のいずれか1つ以上の鎖をコードする単離された核酸に関する。
さらなる態様において、本発明はさらに、本発明の核酸を含むベクターに関する。一実施形態において、ベクターは発現ベクターである。
さらなる態様において、本発明はさらに、本発明の核酸またはベクターを含む宿主細胞に関する。好ましくは、宿主細胞は原核細胞または真核細胞であり、より好ましくは、酵母細胞、哺乳動物細胞(例えば、CHO細胞またはCHO-S細胞または293細胞または293T細胞)、または抗体またはその抗原結合断片の調製に適した他の細胞から選択される。
さらなる態様において、本発明はさらに、抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片を調製する方法に関し、この方法は、本発明の抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片をコードする核酸の発現に適した条件下で、本発明による宿主細胞を培養することを含み、必要に応じて、該宿主細胞から該抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片を回収することをさらに含む。
さらなる態様において、本発明はさらに、本発明による抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片と、他の薬剤(例えば、細胞毒性剤などの治療剤やマーカー)と、を含む免疫複合体に関する。
さらなる態様において、本発明はさらに、本発明による抗TNFR2抗体もしくはその抗原結合断片、または本発明の免疫複合体、および必要に応じて薬学的に許容されるアジュバントを含む医薬組成物に関する。
さらなる態様において、本発明はさらに、本発明の抗TNFR2抗体もしくはその抗原結合断片、または本発明の免疫複合体、および1つ以上の他の治療剤(例えば、化学療法剤、他の抗体、細胞毒性剤、ワクチン、抗感染剤、小分子実体、または免疫調節剤)を含む組み合わせ品に関する。
さらなる態様において、本発明はさらに、抗TNFR2抗体もしくはその抗原結合断片、または本発明の免疫複合体、または医薬組成物、または本発明の組み合わせ品を、対象に投与することを含む、対象におけるT細胞の活性化、T細胞媒介性抗腫瘍活性の誘導、T細胞媒介性免疫の増強、またはT細胞の増殖を刺激する方法に関する。
さらなる態様において、本発明はさらに、抗TNFR2抗体もしくはその抗原結合断片、または免疫複合体、または医薬組成物、または本発明の組み合わせ品を、対象に投与することを含む、対象における癌または感染症を予防または治療する方法に関する。
一実施形態において、癌は、高レベルのTNFR2(例えば、TNFR2の高タンパク質または高核酸レベル)を伴う癌である。別の実施形態において、前記癌は、非小細胞肺癌、乳癌、腎細胞癌、ホジキンリンパ腫、多発性骨髄腫、皮膚非ホジキンリンパ腫、卵巣癌、および胃腸消化管の癌(例えば、結腸直腸癌、直腸癌または大腸癌)である。
一実施形態において、感染は、ウイルス感染、細菌感染、真菌感染、または、寄生虫感染などの原虫感染である。
一実施形態において、本発明の方法はさらに、1つ以上の治療法(例えば、治療モダリティおよび/または他の治療剤)と組み合わせて該対象に投与することを含み、該治療モダリティは、手術および/または放射線療法を含むことが好ましく、および/または他の治療剤は、化学療法剤、他の抗体、細胞毒性剤、ワクチン、抗感染剤、小分子実体、または免疫調節剤からなる群から選択される。
一実施形態において、癌は、高レベルのTNFR2(例えば、TNFR2の高タンパク質または高核酸レベル)を伴う癌である。別の実施形態において、前記癌は、非小細胞肺癌、乳癌、腎細胞癌、ホジキンリンパ腫、多発性骨髄腫、皮膚非ホジキンリンパ腫、卵巣癌、および胃腸消化管の癌(例えば、結腸直腸癌、直腸癌または大腸癌)である。
一実施形態において、感染は、ウイルス感染、細菌感染、真菌感染、または、寄生虫感染などの原虫感染である。
一実施形態において、本発明の方法はさらに、1つ以上の治療法(例えば、治療モダリティおよび/または他の治療剤)と組み合わせて該対象に投与することを含み、該治療モダリティは、手術および/または放射線療法を含むことが好ましく、および/または他の治療剤は、化学療法剤、他の抗体、細胞毒性剤、ワクチン、抗感染剤、小分子実体、または免疫調節剤からなる群から選択される。
さらなる態様において、本発明はさらに、サンプル中のTNFR2を検出する方法に関し、前記方法は、以下のステップを含む:
(a)サンプルを、本発明による任意の抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片と接触させるステップ、
(b)抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片とTNFR2との間の複合体の形成を検出するステップであって、必要に応じて、抗TNFR2抗体を検出可能に標識するステップ。
(a)サンプルを、本発明による任意の抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片と接触させるステップ、
(b)抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片とTNFR2との間の複合体の形成を検出するステップであって、必要に応じて、抗TNFR2抗体を検出可能に標識するステップ。
さらなる態様において、本発明はさらに、抗TNFR2抗体もしくはその抗原結合断片、または本発明の免疫複合体を含む、TNFR2を検出するためのキットに関する。
本発明はまた、本明細書に記載の実施形態のいずれかの任意の組み合わせを包含する。本明細書に記載の実施形態のいずれか、またはそれらの任意の組み合わせは、本明細書に記載の本発明の抗TNFR2抗体または断片、ならびにその方法および用途のいずれかおよびすべてに適用可能である。
定義
本明細書を解釈する目的で、以下の定義が使用され、単数形で使用される用語は複数形を含むこともあり、適切な場合はその逆も同様である。本明細書で使用される技術用語は、特定の実施形態を説明するためのものであり、限定を意図したものではないことが理解される。
本明細書を解釈する目的で、以下の定義が使用され、単数形で使用される用語は複数形を含むこともあり、適切な場合はその逆も同様である。本明細書で使用される技術用語は、特定の実施形態を説明するためのものであり、限定を意図したものではないことが理解される。
本明細書で使用される用語「および/または」は、2つ以上の特定の特性または構成要素の各々の、他のものを伴うかまたは伴わない具体的な開示として解釈されるべきである。したがって、本明細書で「Aおよび/またはB」などの語句において使用される用語「および/または」は、「AおよびB」、「AまたはB」、「A」(単独)、および「B」(単独)を含むことを意図する。
本明細書において、態様が言語「含む」で説明される場合は常に、さもなければ「からなる」および/または「から本質的になる」という用語で説明される類似の態様もまた提供されることが理解される。
用語「約」は、数値に関して使用される場合、特定の数値より10%または5%未満の下限と、特定の数値より10%または5%超過の上限との間の範囲内の数値を包含することを意味する。
「腫瘍壊死因子受容体2型(TNFR2)」は、腫瘍浸潤性免疫抑制性CD4+FoxP3+制御性T細胞(Tregs)によって高度に発現され、これらの細胞に対する腫瘍壊死因子(TNF)の刺激作用を媒介することが示されている。最近の研究では、抗腫瘍免疫応答の主要なチェックポイントであるTregの活性化と増殖の刺激において、TNFR2が重要な役割を果たすことが示されている(Chen and Oppenheim,Sci Signal 10:eaal2328,2017)。TNFR2は、ある種の悪性細胞によっても発現され、TNFR2のリガンドがこれらの腫瘍細胞の生存と増殖を促進する。一実施形態において、本発明におけるTNFR2は、ヒト由来であり、例えば、配列番号48で表されるアミノ酸配列を有する。別の実施形態において、TNFR2はカニクイザル由来であり、例えば、配列番号49で表されるアミノ酸配列を有する。本明細書に使用されるTNFR2の断片は、TNFR2の任意の部分、特に本発明の抗TNFR2抗体が結合する部分を指す。一実施形態において、前記断片は、TNFR2の細胞外領域、例えば、配列番号50で表されるアミノ酸配列を有する領域である。
「抗抗原」抗体とは、抗原に特異的に結合する抗体のことを指す。例えば、抗TNFR2抗体はTNFR2に特異的に結合する。
「単離された」抗体は、その自然環境の構成要素(コンポーネント)から分離された抗体である。いくつかの実施形態において、抗体は、例えば、電気泳動(例えば、SDS-PAGE、等電点電気泳動(IEF)、キャピラリー電気泳動)またはクロマトグラフィー(例えば、イオン交換または逆相HPLC)によって決定される90%または95%または99%の純度を超えるまで精製される。本発明の一実施形態において、抗TNFR2抗体が単離される。
本明細書で使用される用語「抗TNFR2抗体」、「抗TNFR2」、「TNFR2抗体」または「TNFR2に結合する抗体」とは、抗体が(ヒトまたはカニクイザル)TNFR2を標的とする診断剤および/または治療剤として使用できるように、(例えば、ヒトまたはカニクイザル)TNFR2タンパク質またはその断片に十分な親和性で結合することができる抗体を指す。一実施形態において、例えば、放射免疫測定法(RIA)またはバイオライト干渉法またはMSDアッセイによって測定されるように、抗TNFR2抗体は、(例えば、ヒトまたはカニクイザル)TNFR2への抗体の結合の約10%、約20%、約30%、約40%、約50%、約60%、約70%、約80%、または約90%未満またはそれ以上の程度で、非TNFR2タンパク質(例えば、非ヒトまたは非カニクイザルTNFR2)に結合する。一実施形態において、抗体がインビトロでヒトまたはカニクイザルTNFR2タンパク質またはその断片に高親和性で結合することは、非TNFR2タンパク質(例えば、それぞれ非ヒトまたは非カニクイザルTNFR2)への結合と比較して、結合の延長が約70%、約80%または約90%またはそれ以上であることを意味する。一実施形態において、抗体がインビトロでカニクイザルTNFR2タンパク質またはその断片に高親和性で結合することは、カニクイザルTNFR2に結合する抗体のKDが、100nM、90nM、80nM、70nM、60nM、50nM、40nM、30nM、20nM、10nM、9nM、8nM、7nM、6nM、5nM、4nM、3nM、2nM、1nM、0.9nM、0.8nM、0.7nMより低く、または上記の値の間、例えば、約0.5nM~10nM、0.5nM~8nM、0.5nM~6nM)であることを意味する。一実施形態において、抗体がインビトロでヒトTNFR2タンパク質またはその断片に高親和性で結合することは、ヒトTNFR2に結合する抗体のKDが、100nM,90nM,80nM,70nM,60nM,50nM,40nM,30nM,20nM,10nM,9nM,8nM、7nM、6nM、5nM、4nM、3nM、2nM、1nM、0.9nM、0.8nM、0.7nM、0.6nM、0.5nM、0.4nMより低く、または上記の値の間、例えば、約0.3nM~5nMまたは0.3nM~4nMであることを意味する。
該抗体は、(例えば、挿入、欠失、置換、非抗体部分への結合によって)変化した抗体であってもよい。例えば、抗体は、抗体の特性(例えば、機能特性)を変化させる(天然に存在する抗体と比較して)1つ以上の変異型アミノ酸を含んでもよい。例えば、患者における抗体に対する半減期、エフェクター機能、および/または免疫応答などに影響を及ぼすいくつかの変化が、当技術分野において知られている。
用語「モノクローナル抗体」(「mAb」)とは、単一分子組成の抗体分子、すなわち、特定の抗原に対して単一の結合特異性および親和性を示す抗体分子の調製物を指す。モノクローナル抗体は、単離された抗体の一例である。MAbは、ハイブリドーマ、組換え、トランスジェニック、または当業者に知られている他の技術によって製造される。
「ヒト」抗体(HuMAb)は、フレームワーク領域とCDR領域の両方がヒト生殖細胞系免疫グロブリン配列に由来する可変領域を有する抗体を指す。用語「ヒト」抗体および「完全ヒト」抗体は、同義的に使用される。
「ヒト化抗体」とは、非ヒト抗体のCDRドメイン外のアミノ酸の一部、大部分または全てがヒト免疫グロブリン由来の対応するアミノ酸で置換されている抗体を指す。抗体のヒト化形態の一実施形態において、CDRドメイン外のアミノ酸の一部、大部分または全てがヒト免疫グロブリン由来のアミノ酸で置換されているが、1つ以上のCDR領域内のアミノ酸の一部、大部分、または全ては未変化である。アミノ酸の小さな付加、欠失、挿入、置換または修飾は、抗体が特定の抗原に結合する能力を抑制しない限り許容される。「ヒト化」抗体は、元の抗体と同様の抗原特異性を保持する。
「キメラ抗体」とは、可変領域がマウス抗体由来であり、定常領域がヒト抗体由来である抗体などの、可変領域がある種由来であり、定常領域が他の種由来である抗体を指す。
抗体の「抗原結合断片」とは、抗体全体によって結合された抗原に特異的に結合する能力を保持する抗体の1つ以上の断片を指す。抗体の「抗原結合断片」の中に包含される結合断片の例としては、Fv、Fab、Fab′、Fab′-SH、F(ab′)2、ダイアボディー、線状抗体、一本鎖抗体分子(例えばscFv)、単一ドメイン抗体、および抗体断片から形成される多種特異抗体が挙げられるが、これらに限定されない。
これらの抗体断片は、当業者に知られている従来の技術を用いて得られ、断片は無傷の抗体と同様に有用性についてスクリーニングされる。抗原結合断片は、組換えDNA技術によって、または正常な免疫グロブリンの酵素的もしくは化学的切断によって産生できる。
これらの抗体断片は、当業者に知られている従来の技術を用いて得られ、断片は無傷の抗体と同様に有用性についてスクリーニングされる。抗原結合断片は、組換えDNA技術によって、または正常な免疫グロブリンの酵素的もしくは化学的切断によって産生できる。
本明細書で使用される用語「エピトープ」は、抗体分子と特異的に相互作用する抗原(例えば、TNFR2)の部分を指す。この部分(本明細書ではエピトープ決定基と呼ばれる)は、典型的には、アミノ酸側鎖または糖側鎖またはその成分などの要素を含む。エピトープ決定基は、当技術分野で知られている方法または本明細書に開示されている方法(例えば、結晶学または水素-重水素交換)によって定義され得る。典型的には、エピトープは特定の3次元構造特性を有する。典型的には、エピトープは特定の電荷特性を有する。一部のエピトープは線状エピトープである一方、他のエピトープは立体配座エピトープである。本発明の一実施形態において、本発明の抗体が結合するTNFR2のエピトープは、ヒトTNFR2タンパク質上の26位に対応する位置に、ヒトTNFR2のQ26またはアミノ酸Qを含む。一実施形態において、エピトープは、ヒトTNFR2の細胞外領域、例えば、配列番号50からなるかまたはそれを含む領域に含まれる。別の実施形態において、エピトープは、ヒトTNFR2またはそれに対応する断片における配列番号58の1Lから31Cまでのアミノ酸配列に含まれる。別の実施形態において、エピトープは、ヒトTNFR2またはそれに対応する断片における配列番号62の1Lから96Cまでのアミノ酸配列に含まれる。別の実施形態において、エピトープは、ヒトTNFR2またはそれに対応する断片における配列番号52の17T~54Dのアミノ酸配列に含まれる。
レファレンス抗体と「同一または重複するエピトープに結合する抗体」とは、競合アッセイ(competition assay)において、レファレンス抗体のその抗原への結合を50%以上ブロックする抗体を指し、逆に、レファレンス抗体は、競合アッセイにおいて、前記抗体のその抗原への結合を50%以上ブロックする。
抗原への結合についてのレファレンス抗体と競合する抗体とは、競合アッセイにおいて、レファレンス抗体のその抗原への結合の50%、60%、70%、80%、90%または95%以上をブロックする抗体である。換言すれば、レファレンス抗体は、競合アッセイにおいて、抗体のその抗原への結合の50%、60%、70%、80%、90%または95%以上をブロックする。抗原結合タンパク質が、固相直接または間接放射免疫測定法(RIA)、固相直接または間接酵素免疫測定法(EIA)、サンドイッチ競合アッセイなどの別のアッセイと競合するかどうかを判定するために、多数のタイプの競合結合アッセイを用いることができる。
レファレンス抗体のその抗原への結合を阻害する(例えば、競合的に阻害する)抗体とは、レファレンス抗体のその抗原への結合を50%、60%、70%、80%、90%または95%以上に阻害する抗体である。逆に、レファレンス抗体は、前記抗体のその抗原に対する結合を50%、60%、70%、80%、90%または95%以上に阻害する。抗体のその抗原への結合は親和性によって測定できる。親和性を決定する方法は、当技術分野で知られている。
レファレンス抗体と同一または類似の結合親和性および/または特異性を示す抗体とは、レファレンス抗体の結合親和性および/または特異性の少なくとも50%、60%、70%、80%、90%または95%以上を有する抗体を指す。これは、結合親和性および/または特異性を決定するための、当技術分野で知られている方法により決定されてもよい。
「相補性決定領域」または「CDR領域」または「CDR」は、配列が高度に可変であり、構造的に定義されたループ(「超可変ループ」)を形成し、および/または抗原接触残基(「抗原接点」)を含む、抗体可変ドメインにおける領域である。CDRは主にエピトープへの結合を担っている。重鎖および軽鎖のCDRは、一般にCDR1、CDR2、およびCDR3と呼ばれ、N末端から順に番号が付けられている。抗体重鎖の可変ドメインに位置するCDRはHCDR1、HCDR2、およびHCDR3と呼ばれる一方、抗体軽鎖の可変ドメインに位置するCDRはLCDR1、LCDR2、およびLCDR3と呼ばれる。軽鎖可変領域または重鎖可変領域の所定のアミノ酸配列において、各CDRの正確なアミノ酸配列境界は、例えば、抗体の三次元構造とCDRループのトポロジーに基づくChothia(Chothia et al.(1989)Nature 342:877-883;Al-Lazikani et al.,“Standard conformations for the canonical structures of immunoglobulins”,Journal of Molecular Biology,273:927-948(1997))、抗体配列変動に基づくKabat(Kabat et al.,Sequences of Proteins of Immunological Interest,第4版,US Department of Health and Human Services,National Institutes of Health(1987))、AbM(バース大学)、Contact(ユニバーシティ・カレッジ・ロンドン)、International ImMunoGeneTicsデータベース(IMGT)(imgt.cines.fr/on the World Wide Web)、および多数の結晶構造を用いた親和性伝搬クラスタリングに基づくNorth CDR定義を含む、多くの周知の抗体CDR割り当てシステムのいずれか1つまたは組合せを用いて決定することができる。
CDRはまた、参照CDR配列(reference CDR sequence)(例えば、本発明の例示的CDRのいずれか)と同じKabatナンバリング位置を有することに基づいて決定することもできる。
特に明記しない限り、本発明では、用語「CDR」または「CDR配列」は、上記の方法のいずれかによって決定されたCDR配列を包含する。
特に明記しない限り、本発明では、抗体可変領域の残基(重鎖可変領域残基および軽鎖可変領域残基を含む)の位置を言及する場合、それはKabatナンバリングシステム(Kabat et al.,Sequences of Proteins of Immunological Interest,第5版 Public Health Service,National Institutes of Health, Bethesda,Md.(1991))に従うナンバリング位置を指す。
一実施形態において、本発明の抗体のCDRの境界は、Kabatスキームによって決定される。
異なる割り当てシステムによって得られた抗体の可変領域のCDRの境界は異なる場合があることに留意すべきである。すなわち、異なる割り当てシステムによって定義された抗体の可変領域のCDR配列は異なる。したがって、本発明で定義される特定のCDR配列を有する抗体を定義するということになると、その抗体の範囲はまた、可変領域配列がその特定のCDR配列を含んでなるが、異なるプロトコール(例えば、異なる割り当てシステム規則またはそれらの組み合わせ)が適用される場合に、本発明により定義されるような特定のCDR境界とは異なるCDR境界が特許請求されるような抗体を包含する。
異なる特異性(すなわち、異なる抗原に対する異なる結合部位)を有する抗体は、異なるCDR(同じ割り当てシステム下)を有する。しかしながら、CDRは抗体ごとに異なるものの、CDR内の限られた数のアミノ酸位置のみが抗原結合に直接関与する。Kabat、Chothia、AbM、Contact、およびNorth法の少なくとも2つを用いて最小の重複領域を決定することができ、抗原結合のための「最小結合単位」が得られる。この最小結合単位は、CDRの下位部分であり得る。当業者には自明であるように、残りのCDR配列の残基は、抗体構造およびタンパク質フォールディングによって決定することができる。したがって、本発明では、本明細書に示されるCDRのいずれの変異体も考慮される。例えば、1つのCDR変異体では、最小結合単位内のアミノ酸残基は不変のままであり得るが、KabatまたはChothiaにより定義される他のCDR残基は、保存的アミノ酸残基により置換されてもよい。
当技術分野で公知である抗体には:IgA、IgD、IgE、IgG、およびIgMの5つの主要なクラスがあり、これらの抗体のいくつかは、サブクラス(アイソタイプ)、例えば、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1、およびIgA2にさらに分けることができる。免疫グロブリンの異なるクラスに相当する重鎖定常ドメインは、それぞれα、δ、ε、γ、およびμと呼ばれる。当業者は、本発明の適切なクラスの抗体を実際の要望に応じて選択して得ることができる。
「IgG形態の抗体」とは、抗体の重鎖定常領域が属すIgG型を指す。同じタイプの全ての抗体の重鎖定常領域は同一であり、異なるタイプの抗体の重鎖定常領域は異なる。例えば、IgG1型の抗体とは、その重鎖定常領域のIgドメインがIgG1であるIgドメインを指す。
「単離された」核酸とは、その天然環境の構成要素から分離された核酸分子を指す。単離された核酸は、通常は核酸分子を含有する細胞に含有されるが、染色体外に、またはその本来の染色体の場所とは異なる染色体の場所に存在する核酸分子を含む。
本明細書で使用される用語「ベクター」とは、それが連結された別の核酸を伝搬し得る核酸分子を指す。この用語には、自己複製する核酸構造として働くベクター、ならびにそれが導入された宿主細胞のゲノムに組み込まれるベクターが含まれる。特定のベクターは、それらが機能的に連結される核酸の発現を導くことが可能である。このようなベクターは、本明細書では「発現ベクター」と呼ばれる。
用語「宿主細胞」とは、外因性核酸が導入される細胞を、そのような細胞の子孫(progeny)を含めて指す。宿主細胞には、「形質転換体」および「形質転換細胞」が含まれ、これらには初代形質転換細胞およびそれらに由来する子孫が継代数に関係なく含まれる。子孫は、親細胞と核酸含量が完全に同一でなくてもよく、突然変異を含んでもよい。本明細書には、最初に形質転換された細胞においてスクリーニングまたは選択されたものと同じ機能または生物活性を有する突然変異子孫が含まれる。
参照ポリペプチド配列(reference polypeptide sequence)に関する「アミノ酸配列同一性パーセント(%)」は、配列を整列し、配列同一性最大パーセントを実現するために必要な場合はギャップを導入した後に、いかなる保存的置換も配列同一性の部分として考慮せずに、参照ポリペプチド配列中のアミノ酸残基と同一である、候補配列におけるアミノ酸残基の割合(パーセント)として定義される。当該技術分野の範囲内の種々の方法で、例えば、BLAST、BLAST-2、ALIGN、またはMEGALIGN(DNASTAR)ソフトウェア等の一般的に利用可能なコンピュータソフトウェアを使用して、アミノ酸配列同一性パーセントを決定するためのアライメント(整列)を達成することができる。当業者は、比較される配列の全長にわたる最大のアライメント(整列)を達成するために必要とされる任意のアルゴリズムを含む、配列を整列するための適切なパラメータを決定することができる。
本願において配列同一性のパーセンテージが言及される場合、これらのパーセンテージは、特に指示のない限り、より長い配列の全長に対して計算される。より長い配列の全長に対する計算は、核酸配列とポリペプチド配列の両方に適用される。
本願において配列同一性のパーセンテージが言及される場合、これらのパーセンテージは、特に指示のない限り、より長い配列の全長に対して計算される。より長い配列の全長に対する計算は、核酸配列とポリペプチド配列の両方に適用される。
用語「医薬組成物」とは、その中に含有される有効成分の生物学的活性を有効にする形態の製剤(formulation)であって、当該製剤が投与される対象に対して許容できない毒性を有する付加成分を含有しない製剤を指す。
用語「薬学的に許容可能なアジュバント」とは、治療剤と同時投与される、希釈剤、アジュバント(例えば、フロイントアジュバント(完全および不完全))、賦形剤またはビヒクルを指す。
本明細書で使用される用語「治療(treatment(またはtreatまたはtreating))」とは、既存の症状、障害、病態、または疾患の進行または重症度の緩徐化、中断、休止、緩和、停止、軽減、または逆転を指す。
本明細書で使用される「予防(prevention(またはpreventまたはpreventing))」とは、疾患もしくは障害または特定の疾患もしくは障害の症状の発症または進行の阻害を含む。いくつかの実施態様において、癌の家族歴を有する対象は、予防レジメンの候補である。一般に、癌の文脈において、用語「予防」とは、特に癌のリスクのある対象において癌の徴候または症状が発症する前の薬物の投与を指す。
「T細胞を活性化する」とは、エフェクターまたは記憶T細胞が、再生し、持続し、または増幅した生物学的機能を有するように誘導し、誘発し、または刺激することを意味する。T細胞機能を増強する例には、介入前のレベルと比較して、CD8+T細胞からのγ-インターフェロン(例えば、IFN-γ)の分泌増加、CD4+T細胞の増殖増加、CD8+T細胞の増殖増加などが含まれる。
本明細書で使用される用語「治療剤」は、化学療法剤、細胞毒性剤、ワクチン、その他の抗体(例えば、免疫チェックポイント分子に対する抗体)、活性抗感染症剤、免疫調節剤、および小実体を含め、腫瘍(癌など)および感染症の予防または治療に有効ないずれの物質も包含する。
「化学療法剤」は、癌の治療に有用な化学化合物を含む。
用語「免疫チェックポイント分子」とは、CD4T細胞およびCD8T細胞の細胞表面上の分子群を指す。これらの分子は、抗腫瘍免疫応答をダウンレギュレートまたは抑制する「ブレーキ」として効果的に作用できる。
用語「抗感染剤」には、ウイルス、細菌、真菌、または原虫、例えば、寄生虫などの微生物の成長を特異的に阻害または排除し、かつ、その投与濃度および投与間隔では宿主に致死的でないいずれの分子も含まれる。本明細書において使用する用語「抗感染剤」は、抗生物質、抗菌剤、抗ウイルス剤、抗真菌剤、および抗原虫剤を含む。一特定の態様において、抗感染剤は、投与濃度および投与間隔において宿主に対して非毒性である。
免疫調節剤には、免疫チェックポイント分子阻害剤および共刺激分子活性化剤が含まれる。
用語「小分子」とは、分子量が約2000ダルトン以下、好ましくは約500ダルトン以下の任意の分子を指す。
用語「組み合わせ品」とは、2つ以上の治療剤を同時に独立して投与するか、または特定の時間間隔で別々に投与することができる、組み合わせ投与用単位剤形の固定または非固定の組み合わせ、または組み合わせ投与用のパーツのキットを指し、特に、これらの時間間隔が、組み合わせパートナーがコラボレーション、例えば相乗効果を発揮することができる。用語「固定組み合わせ」とは、本発明の抗体および組み合わせパートナー(例えば、免疫抑制剤または抗炎症剤のような免疫調節剤などの他の治療剤)が、単一の実体または用量の形で同時に患者に投与されることを意味する。用語「非固定組み合わせ」とは、本発明の抗体および組み合わせパートナー(例えば、免疫抑制剤または抗炎症剤のような免疫調節剤などの他の治療剤)が、同時に、一緒に、または別個の実体として連続的に患者に投与されることを意味し、そして、そのような投与が患者に対して治療的に有効なレベルの2つの化合物を提供する場合には、特定の時間制限はない。後者は、3つ以上の治療剤の投与などのカクテル療法にも適用される。好ましい実施形態において、薬物の組み合わせは非固定組み合わせである。
用語「癌(cancer)」および「癌性(cancerous)」とは、通常、無秩序な細胞増殖を特徴とする哺乳動物の生理学的疾患を指し、または説明する。
用語「腫瘍」とは、悪性か良性かに関係なく、全ての腫瘍性細胞の成長および増殖、ならびに全ての前癌性および癌性の細胞および組織を指す。用語「癌」、「癌性」、「細胞増殖性障害」、「増殖性障害」、および「腫瘍」とは、本明細書において言及される場合、互いに排他的ではない。
用語「感染症」とは、ウイルス感染症、細菌感染症、真菌感染症、または、寄生虫感染症などの原虫を含む病原体によって引き起こされる疾患を指す。
用語「腫瘍免疫回避」とは、免疫認識およびクリアランスを回避する腫瘍を指す。したがって、治療の概念として、腫瘍免疫は「治療」され、回避が弱まると、腫瘍は免疫系によって認識され攻撃される。腫瘍認識の例には、腫瘍結合、腫瘍縮小、および腫瘍クリアランスが含まれる。
本明細書で使用される用語「標識(label)」とは、ポリヌクレオチドプローブまたは抗体などの薬剤(agent)に直接的または間接的に結合または融合され、結合または融合される薬剤の検出を容易にする化合物または組成物を指す。標識はそれ自体検出可能であり(例えば放射性同位体標識または蛍光性標識)、または酵素標識の場合は、検出可能な基質化合物または組成物の化学変化を触媒することができる。この用語は、検出可能な物質をプローブまたは抗体に結合(すなわち、物理的連結)させることによるプローブまたは抗体の直接標識、および直接標識された別の試薬(reagent)と反応させることによるプローブまたは抗体の間接標識を包含することを意図している。
用語「有効量」とは、治療または予防を必要とする患者において、その患者に単回または複数回の用量で投与した後に期待される効果を生じる本発明の抗体、断片、複合体または組成物の量または用量(投与量)を指す。有効量は、次のような様々な因子を考慮することにより当業者としての主治医によって容易に決定され得る:哺乳動物などの種、そのサイズ、年齢、および全般的な健康状態、関与する特定の疾患、その疾患の程度または重症度、個々の患者の反応、特定の抗体の投与、投与経路、投与製剤の生物学的利用能の特性、選択される投与計画、および並行療法の使用。
「治療有効量」とは、所望の期間、必要な投与量で所望の治療結果を達成するのに有効な量を指す。抗体もしくは抗体断片、または複合体もしくは組成物の治療有効量は、個体の病態、年齢、性別、および体重、ならびに個体において所望の応答を引き起こす抗体または抗体部分の能力などの様々な要因に応じて変化し得る。治療有効量はまた、抗体もしくは抗体断片、または複合体もしくは組成物の毒性もしくは不所望な効果が、治療上有益な効果よりも劣る量でもある。「治療有効量」は、未治療の対象に対して、好ましくは少なくとも約20%、より好ましくは少なくとも約40%、さらに好ましくは少なくとも約50%、60%または70%、さらにより好ましくは少なくとも約80%または90%の測定可能なパラメータ(例えば、腫瘍増殖率)を阻害する。
「予防有効量」とは、所望の期間、必要な投与量で所望の予防結果を達成するのに有効な量を指す。一般に、予防投与量(予防用量)は、疾患の前または初期段階で対象に投与されるため、予防有効量は、治療有効量よりも少なくなる。
「個体」または「対象」には哺乳類が含まれる。哺乳動物には、家畜(例えば、ウシ、ヤギ、ネコ、イヌおよびウマ)、霊長類(例えば、ヒトおよびサル等の非ヒト霊長類)、ウサギ、および齧歯類(例えば、ネズミおよびラット)が含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態において、個体または対象はヒトである。
本明細書で使用される用語「投与する(administering)」、「投与(administration)」または「投与される(administered)」とは、当業者に知られている様々な方法および送達システムのいずれかを用いて、治療剤(例えば、抗TNFR2抗体)を含む組成物を対象に物理的に導入することを指す。投与経路には、静脈内、筋肉内、皮下、腹腔内、脊髄、または他の非経口投与経路、例えば注射または注入が含まれる。本明細書で使用される語句「非経口投与」とは、経腸および局所投与以外の、通常は注射による投与モードを意味し、静脈内、筋肉内、動脈内、髄腔内、リンパ管内、病巣内、嚢内、眼窩内、心臓内、皮内、腹腔内、経気管、皮下、表皮下、関節内、被膜下、くも膜下、脊髄内、硬膜外、および胸骨内注射および注入、ならびにインビボエレクトロポレーション(生体内での電気穿孔)を含むが、これらに限定されない。他の非-非経口投与経路には、局所、表皮または粘膜の投与経路(例えば、鼻腔内、膣内、直腸内、舌下または局所)が含まれる。
対象/患者からの「試料(サンプル)」とは、癌患者や癌対象から得た細胞または体液の集合体を意味する。組織または細胞試料のソースは、新鮮、凍結および/または保存臓器または組織試料または生検または吸引物からの固形組織、血液または血液成分、脳脊髄液、羊水、腹膜液(腹水)、または組織間液(間質液)などの体液、対象の妊娠中または発育中の任意の時点からの細胞、であってもよい。組織試料は、防腐剤、抗凝固剤、緩衝剤、固定剤、栄養素、抗生物質などの、天然の組織と自然に混在していない化合物を含有してもよい。本明細書における腫瘍試料(tumor sample)の例としては、腫瘍生検、微細針吸引、気管支肺胞洗浄、胸膜液、痰、尿、摘出標本、循環腫瘍細胞、血清、血漿、循環血漿タンパク質、腹水、腫瘍に由来するまたは腫瘍類似特性を示している初代細胞培養または細胞株、ならびに保存腫瘍試料、例えば、ホルマリン-固定、パラフィン-包埋腫瘍試料または凍結腫瘍試料が含まれるが、これらに限定されない。
本発明の抗体
本発明の抗体
本発明の一実施形態において、本明細書に記載のアミノ酸変化は、アミノ酸の置換、挿入、または欠失を含む。好ましくは、本明細書に記載のアミノ酸変化は、アミノ酸置換、好ましくは保存的置換である。
好ましい実施形態において、本明細書に記載のアミノ酸変化は、CDRの外側の領域(例えば、FR)に生じる。一実施形態において、アミノ酸変化は、HCVRまたはLCVRのFR領域、好ましくはLCVRにおいて、例えば、LCVRのFR1、FR2、FR3および/またはFR4において生じる。いくつかの実施形態において、FR領域には、1つ、2つ、または3つの変化がある。特定の実施形態において、変化は、FR3のI83におけるものであり、例えば、IからVへの置換またはその保存アミノ酸の83位にある。
より好ましくは、本明細書に記載のアミノ酸変化は、重鎖可変領域の外側および/または軽鎖可変領域の外側の領域で生じる。
いくつかの実施形態において、置換は保存的置換である。保存的置換とは、同一クラスの別のアミノ酸によるアミノ酸の置換、例えば、別の酸性アミノ酸による酸性アミノ酸置換、別の塩基性アミノ酸による塩基性アミノ酸置換、または別の中性アミノ酸による中性アミノ酸置換を指す。置換の例を以下の表に示す:
場合により、本発明の抗TNFR2抗体は、軽鎖可変領域、重鎖可変領域、軽鎖、または重鎖への翻訳後修飾を含む。例示的な翻訳後修飾には、ジスルフィド結合の形成、グリコシル化、PEG化、脂質化(リピデーション)、アセチル化、リン酸化、またはその他の操作(標識成分との抱合など)が含まれる。
特定の実施形態において、本明細書で提供される抗体は、抗体がグリコシル化される程度を増加または減少させるように改変される。抗体へのグリコシル化部位の付加または欠失は、1つ以上のグリコシル化部位が作成または除去されるようにアミノ酸配列を変えることにより、簡便に達成することができる。
本明細書に記載の抗体またはその断片に対する、本発明により包含される別の修飾(modification)は、PEG化である。抗体をPEG化して、例えば、抗体の生物学的(例えば血清)半減期を延長することができる。抗体をPEG化するために、通常、抗体またはその断片を、(PEGの反応性エステルまたはアルデヒド誘導体などの)ポリエチレングリコール(PEG)と、1つ以上のPEG基が抗体または抗体断片と付着される条件下で反応させる。
特定の実施形態において、本明細書で提供される抗体のFc領域に1つ以上のアミノ酸修飾を導入して、それにより、例えば、癌または細胞増殖性疾患の治療における抗体の有効性を高めるようにFc領域変異体を生成してもよい。例えば、抗体のADCC機能を除去または増加させるために、またはFcγ受容体への抗体の結合を除去するために、修飾を組み込むことができる。一実施形態において、L234A、L235A、D265Aおよび/またはP329A(EUナンバリング)、またはL234A/L235A/D265A/P329A(EUナンバリング)をFc領域に組み込むことができる。
一実施形態において、抗体のシステイン残基の数を変更して、抗体の特性を改変することができる。
一実施形態において、抗体の産生を改善するために、例えば、細胞における抗体の発現を改善するために、または産生された抗体の純度を改善するために、1つ以上のアミノ酸修飾をFR領域に導入することができる。例えば、FR1、FR2、FR3またはFR4領域、例えばFR3領域、例えばI83位に修飾が存在し得る。具体的には、修飾は、83位のIからVまたはその保存アミノ酸への置換であり得る。
いくつかの実施形態において、本発明の抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片は、本発明の抗体hu32-C、hu32C-V1またはhu3-Eと同一または類似の結合親和性および/または特異性を示す、および/または本発明の抗体hu32-C、hu32C-V1またはhu3-EのTNFR2への結合を阻害(例えば、競合阻害)し、および/または本発明の抗体hu32-C、hu32C-V1またはhu3-Eと同じまたは重複するエピトープに結合する、および/またはTNFR2への結合について本発明の抗体hu32-C、hu32C-V1またはhu3-Eと競合する、および/または本発明の抗体hu32-C、hu32C-V1またはhu3-Eの1つ以上の生物学的特徴を有する。
本発明の核酸およびそれを含む宿主細胞
本発明の核酸およびそれを含む宿主細胞
一態様において、本発明は、上記の抗TNFR2抗体またはその断片のいずれかをコードする核酸を提供する。核酸は、抗体の軽鎖可変領域および/または重鎖可変領域を含むアミノ酸配列、または抗体の軽鎖および/または重鎖を含むアミノ酸配列をコードすることができる。
一実施形態において、本発明の例示的な核酸は、配列番号7、8、15、16、25、26、28、37、38のいずれかから選択されるアミノ酸配列をコードする核酸、または、配列番号7、8、15、16、25、26、28、37、38のいずれかから選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%または99%の同一性を有するアミノ酸配列をコードする核酸を含む。
別の実施形態において、本発明の核酸は、配列番号23、24、27、35または36のいずれかから選択されるヌクレオチド配列、または、配列番号23、24、27、35または36のいずれかから選択されるヌクレオチド配列に対して少なくとも85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%または99%の同一性を有するヌクレオチド配列を含む。
一実施形態において、核酸のいずれかを含む1つ以上のベクターが提供される。一実施形態において、ベクターは、真核発現ベクターなどの発現ベクターである。ベクターは、ウイルス、プラスミド、コスミド、ラムダファージ、または酵母人工染色体(YAC)を含むが、これらに限定されない。多くのベクター系が使用できる。好ましい実施形態において、本発明の発現ベクターは、pCDNA、例えば、pCDNA3.1発現ベクターである。
一実施形態において、本発明は、本明細書に記載の抗体の領域または本明細書に記載のベクターをコードする核酸を含有する宿主細胞を提供する。抗体またはベクターをコードする核酸をクローニングまたは発現するのに適した宿主細胞は、本明細書に記載の原核細胞または真核細胞を含む。抗体は、例えば、細菌において産生することができる。発現後、可溶性画分中の細菌ペーストから抗体を単離し、さらに精製することができる。一実施形態において、宿主細胞はE.coliである。
別の実施形態において、宿主細胞は真核性である。宿主細胞は、酵母、哺乳動物細胞(例えば、ヒト細胞)、昆虫細胞、植物細胞、または抗体またはその抗原結合断片の調製に適する他の細胞からなる群から選択され得る。例えば、糸状菌や酵母などの真核微生物は、真菌および酵母菌株を含む、抗体をコードするベクターの適切なクローニングまたは発現宿主である。有用な哺乳動物宿主細胞株の例としては、SV40で形質転換されたサル腎臓CV1株(COS-7)、ヒト胚性腎臓株(293HEKまたは293または293T細胞)などが挙げられる。他の有用な哺乳動物宿主細胞株には、チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞、およびY0、NS0とSp2/0などの骨髄腫細胞株が含まれる。
本発明の抗体またはその抗原結合断片の調製および精製方法
本発明の抗体またはその抗原結合断片の調製および精製方法
一実施形態において、本発明は、抗TNFR2抗体を調製する方法を提供し、前記方法は、抗体または抗原結合断片を発現するのに適した条件下で、本発明の抗体または抗原結合断片(抗体のいずれか1つ以上の領域または鎖)をコードする核酸を含む宿主細胞をインキュベートするステップを含み、および必要に応じて、該宿主細胞から(または宿主細胞培養物)から該抗体または該断片を回収するステップを含む。
抗体の組換え生産のために、抗体をコードする核酸(例えば、VHまたはVLまたは重鎖または軽鎖をコードする核酸)を単離し、宿主細胞におけるさらなるクローニングおよび/または発現のために1つ以上のベクターに挿入する。従来の手順を用いて(例えば、抗体の重鎖および軽鎖をコードする遺伝子に特異的に結合するオリゴヌクレオチドプローブを用いて)、核酸を容易に単離および配列する。
一実施形態において、宿主細胞は、抗体のVLのアミノ酸配列をコードする核酸と、抗体のVHのアミノ酸配列をコードする核酸とを含むベクターを含む。一実施形態において、宿主細胞は、抗体のVLのアミノ酸配列をコードする核酸を含む第1ベクターと、抗体のVHのアミノ酸配列をコードする核酸を含む第2ベクターとを含む。
本明細書に記載のように調製される抗体分子は、高速液体クロマトグラフィー、イオン交換クロマトグラフィー、ゲル電気泳動、アフィニティークロマトグラフィー(例えば、プロテインA)、サイズ排除クロマトグラフィー等の公知の技術により精製され得る。特定のタンパク質を精製するために使用される実際の条件は、正味の電荷、疎水性および親水性などの要因にも依存し、これらは当業者には明らかであろう。本発明の抗体分子の純度は、サイズ排除クロマトグラフィー、ゲル電気泳動、高速液体クロマトグラフィーなどを含む様々な周知の分析方法のいずれかによって決定することができる。
アッセイ
アッセイ
本明細書で提供される抗TNFR2抗体は、当技術分野で知られている種々のアッセイを通じて、その物理的/化学的特性および/または生物学的活性を同定、スクリーニングまたは特徴付けることができる。一態様において、本発明の抗体の抗原結合活性は、例えば、ELISA、ウエスタンブロッティング、フローサイトメトリーおよび抗体分子でコーティングされた磁気ビーズなどの公知の方法によって試験される。
別の態様において、TNFR2への結合について、本明細書に開示される抗TNFR2抗体のいずれかと競合する抗体を同定するために、競合結合アッセイを用いることができる。いくつかの実施形態において、このような競合抗体は、本発明の抗TNFR2抗体のいずれかと同じエピトープ(例えば、線状または立体配座エピトープ)に結合する。
本発明はさらに、上記の特性の1つ以上を有する抗TNFR2抗体を同定するためのアッセイを提供する。さらに、このようなインビボおよび/またはインビトロでそのような生物学的活性を有する抗体が提供される。
いくつかの実施形態において、本発明の抗体は、上記の特性の1つ以上について試験される。
本発明のインビトロアッセイのいずれかで使用される細胞には、TNFR2を自然に発現するかまたはTNFR2を発現するように操作された細胞または細胞株が含まれる。一実施形態において、細胞は293細胞株または293T細胞株またはT細胞である。
抗TNFR2抗体の代わりに、または抗TNFR2抗体に加えて、本発明の免疫複合体を用いて、前記アッセイのいずれかを実施できることが理解される。
前記アッセイのいずれも、抗TNFR2抗体および他の薬剤を使用することによって行うことができることが理解される。
免疫複合体
免疫複合体
いくつかの実施形態において、本発明は、本明細書で提供される任意の抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片を含む免疫複合体、および、化学療法剤、他の抗体、細胞毒性剤、ワクチン、抗感染剤、小分子実体、または免疫調節剤(例えば、抗炎症剤または免疫抑制剤)を含む治療剤などの他の薬剤を提供する。一実施形態において、細胞毒性剤などの他の薬剤には、細胞に有害な任意の薬剤が含まれる。いくつかの実施形態において、免疫複合体は、癌または感染症を診断、予防または治療するために使用される。
医薬組成物、医療製剤または組み合わせ品
医薬組成物、医療製剤または組み合わせ品
本発明はさらに、抗TNFR2抗体もしくはその抗原結合もしくはその免疫複合体、または、抗TNFR2抗体もしくはその断片をコードする核酸を含む、医薬組成物、医薬製剤、または組み合わせ品を提供する。
このような組成物、製剤または組み合わせ品は、緩衝剤を含む、当技術分野で知られている医薬担体や賦形剤などの適切な医薬補助剤をさらに含んでいてもよい。
本発明における使用に適した医薬担体は、水や(石油、または動物起源、植物起源もしくは合成起源の油(例えば、落花生油、大豆油、鉱油、ゴマ油)などを含む)油の無菌の液体であり得る。水は、医薬組成物が静脈内に投与される際の好ましい担体である。生理食塩水および水性デキストロースおよびグリセロール水溶液も、液体担体として採用され、特に注射溶液に使用され得る。
好適な賦形剤には、デンプン、グルコース、乳糖、スクロース、ゼラチン、麦芽、米、小麦粉、チョーク、シリカゲル、ステアリン酸ナトリウム、モノステアリン酸グリセロール、タルク、塩化ナトリウム、乾燥スキムミルク、グリセロール、プロピレン、グリコール、水、エタノールなどが含まれる。
組成物は、所望により、少量の湿潤剤または乳化剤、またはpH緩衝剤(バッファー)をさらに含有してもよい。
医薬品補助剤の用途については、“Handbook of Pharmaceutical Excipients”, 第5版,R.C.Rowe,P.J.Seskey and S.C.Owen,Pharmaceutical Press,London,Chicago参照。
組成物は、溶液、懸濁液、エマルジョン、錠剤、丸薬、カプセル、粉末、徐放性製剤等の形態をとってもよい。
本発明の組成物は、種々の形態であってもよい。これらの形態には、例えば、液体溶液(例えば、注射用溶液および注入用溶液)、分散液または懸濁液、リポソームおよび坐薬などの、液体、半固体および固体形態が含まれる。好ましい形態は、投与および治療用途の意図された様式(モード)によって変わる。一般的に好ましいのは、注射可能な溶液または注入可能な溶液の形態である。好ましい投与様式は、非経口(例えば、静脈内、皮下、腹腔内(i.p.)、筋肉内)注射または注入である。好ましい実施形態において、抗体分子は、静脈内注入または注射により投与される。別の好ましい実施形態において、抗体分子は、筋肉内、腹腔内または皮下注射により投与される。
所望の純度を有する本発明の抗体またはその抗原結合断片は、1つ以上の任意の医薬補助剤と混合して、本発明の抗体の医薬製剤を調製することができる。医薬製剤は、凍結乾燥製剤または水溶液の形態であることが好ましい。
本発明の医薬組成物または医薬製剤は、治療すべき特定の徴候によって必要とされる複数の有効成分、好ましくは互いに悪影響を及ぼすことなく相補的な活性を有する有効成分を含んでいてもよい。例えば、他の治療剤(例えば、化学療法剤、他の抗体、細胞毒性剤、ワクチン、抗感染剤、小分子実体、または免疫調節剤)をさらに提供することが望ましい。有効成分は、意図する目的に有効な量で好適に組み合わされる。有効成分は、抗TNFR2抗体と組み合わせられる、当技術分野で知られている任意の物質であってもよい。一実施形態において、他の抗体は、PD-1抗体またはPD-L1抗体であり、例えば、ヒトPD-1抗体またはヒトPD-L1抗体である。
徐放性製剤を調製することができる。徐放性製剤の好適な例としては、抗体を含む固体疎水性ポリマーの半透性マトリックスが挙げられ、このマトリックスは成形物、例えば、フィルムまたはマイクロカプセルの形態である。
本発明はさらに、本発明の抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片、および他の治療剤(例えば、化学療法剤、他の抗体、細胞毒性剤、ワクチン、抗感染剤、小分子実体、または免疫調節剤)を含む組み合わせ品を提供する。一実施形態において、他の抗体は、PD-1抗体またはPD-L1抗体である。
用途および方法
用途および方法
一態様において、本発明は、対象における免疫応答を調節する方法を提供する。
別の態様において、本発明は、T細胞を活性化するか、またはT細胞媒介性の抗腫瘍活性を誘導する方法を提供する。一実施形態において、T細胞は、CD4+T細胞またはCD8+T細胞である。
一実施形態において、T細胞の活性化は、T細胞のサイトカイン分泌、例えば、T細胞のIFN-γ分泌を刺激することを含む。
別の実施形態において、T細胞の活性化は、T細胞の増殖を刺激することを含む。
一実施形態において、T細胞の活性化は、T細胞のサイトカイン分泌、例えば、T細胞のIFN-γ分泌を刺激することを含む。
別の実施形態において、T細胞の活性化は、T細胞の増殖を刺激することを含む。
別の態様において、本発明は、対象における腫瘍(例えば、癌)を予防または治療する方法に関する。いくつかの実施形態において、腫瘍は腫瘍免疫回避である。
一実施形態において、癌患者では、TNFR2タンパク質の発現レベルが上昇しているか、またはTNFR2タンパク質をコードする核酸のレベルが上昇している。
いくつかの実施形態において、癌などの腫瘍は、固形腫瘍および血液腫瘍および転移性病変を含む。一実施形態において、固形腫瘍の例としては、悪性腫瘍が挙げられる。癌は、早期癌、中期癌、または進行癌もしくは転移性癌のいずれもありうる。いくつかの実施形態において、腫瘍は、癌などの、T細胞の活性化を必要とする腫瘍であり、例えば、T細胞機能障害を有する腫瘍または癌である。
好ましくは、前記癌は、非小細胞肺癌、乳癌、腎細胞癌、ホジキンリンパ腫、多発性骨髄腫、皮膚非ホジキンリンパ腫、卵巣癌、および消化管癌(例えば結腸直腸癌、直腸癌または大腸癌)である。
いくつかの実施形態において、腫瘍療法は以下の利点を得る:
(i) TNFR2核酸またはタンパク質レベルの阻害、
(ii) TNFR2のそのリガンド(TNF-α等)への結合のブロッキング、
(iii) T細胞の活性化、例えば、IFN-γ等のサイトカインの分泌の増加、CD4+T細胞またはCD8+T細胞の増殖の増加、
(iv) 上記のうちのいずれか1つ以上の組み合わせが挙げられる。
一実施形態において、癌患者では、TNFR2タンパク質の発現レベルが上昇しているか、またはTNFR2タンパク質をコードする核酸のレベルが上昇している。
いくつかの実施形態において、癌などの腫瘍は、固形腫瘍および血液腫瘍および転移性病変を含む。一実施形態において、固形腫瘍の例としては、悪性腫瘍が挙げられる。癌は、早期癌、中期癌、または進行癌もしくは転移性癌のいずれもありうる。いくつかの実施形態において、腫瘍は、癌などの、T細胞の活性化を必要とする腫瘍であり、例えば、T細胞機能障害を有する腫瘍または癌である。
好ましくは、前記癌は、非小細胞肺癌、乳癌、腎細胞癌、ホジキンリンパ腫、多発性骨髄腫、皮膚非ホジキンリンパ腫、卵巣癌、および消化管癌(例えば結腸直腸癌、直腸癌または大腸癌)である。
いくつかの実施形態において、腫瘍療法は以下の利点を得る:
(i) TNFR2核酸またはタンパク質レベルの阻害、
(ii) TNFR2のそのリガンド(TNF-α等)への結合のブロッキング、
(iii) T細胞の活性化、例えば、IFN-γ等のサイトカインの分泌の増加、CD4+T細胞またはCD8+T細胞の増殖の増加、
(iv) 上記のうちのいずれか1つ以上の組み合わせが挙げられる。
別の態様において、本発明は、対象における感染症を予防または治療する方法に関する。
いくつかの実施形態において、感染は急性または慢性である。いくつかの実施形態において、慢性感染は、持続性感染、潜伏性感染、または遅発性感染である。いくつかの実施形態において、慢性感染は、細菌、ウイルス、真菌および原虫からなる群から選択される病原体によって引き起こされる。
いくつかの実施形態において、感染は急性または慢性である。いくつかの実施形態において、慢性感染は、持続性感染、潜伏性感染、または遅発性感染である。いくつかの実施形態において、慢性感染は、細菌、ウイルス、真菌および原虫からなる群から選択される病原体によって引き起こされる。
いくつかの実施形態において、上記方法は、本発明の抗体または抗原結合断片、免疫複合体、医薬組成物または製剤、組み合わせ品、または核酸を投与することを含む。
一実施形態において、上記方法は、1つ以上の治療法(例えば、治療モダリティおよび/または他の治療剤)と組み合わせて当該対象に投与することをさらに含み、該治療モダリティは、手術および/または放射線療法を含むことが好ましく、および/または他の治療剤は、化学療法剤、他の抗体、細胞毒性剤、ワクチン、抗感染剤、小分子実体、または免疫調節剤からなる群から選択される。
一実施形態において、免疫調節剤には、免疫抑制剤または抗炎症剤が含まれる。
一実施形態において、抗体は、免疫チェックポイント分子に結合する抗体であり得る。一実施形態において、他の抗体は、PD-1抗体またはPD-L1抗体である。
いくつかの実施形態において、本明細書に記載の抗体の組み合わせは、例えば、別々に、例えば別個の抗体として、または連結して(例えば、二重特異性または三重特異性抗体分子として)投与することができる。
このような併用療法には、併用投与(例えば、2つ以上の治療剤が同一の製剤または別個の製剤に含まれる)および個別投与が含まれる。一実施形態において、本発明の抗体の投与は、他の1つ以上の治療法の投与前、同時に、および/または投与後に行われる。
一実施形態において、免疫調節剤には、免疫抑制剤または抗炎症剤が含まれる。
一実施形態において、抗体は、免疫チェックポイント分子に結合する抗体であり得る。一実施形態において、他の抗体は、PD-1抗体またはPD-L1抗体である。
いくつかの実施形態において、本明細書に記載の抗体の組み合わせは、例えば、別々に、例えば別個の抗体として、または連結して(例えば、二重特異性または三重特異性抗体分子として)投与することができる。
このような併用療法には、併用投与(例えば、2つ以上の治療剤が同一の製剤または別個の製剤に含まれる)および個別投与が含まれる。一実施形態において、本発明の抗体の投与は、他の1つ以上の治療法の投与前、同時に、および/または投与後に行われる。
対象は、哺乳動物(例えば霊長類)、好ましくは高等霊長類(例えばヒト(例えば、本明細書に記載の疾患を有するか、または有するリスクのある患者))であり得る。一実施形態において、対象は、強化された免疫応答を必要とする。いくつかの実施形態において、免疫応答は抗腫瘍応答である。一実施形態において、対象は、本明細書に記載の疾患(例えば、本明細書に記載の腫瘍または感染症)を有するか、または有するリスクがある。
他の態様において、本発明は、上記用途(例えば、上記関連疾患または状態の予防または治療)のための医薬品の製造または調製における、抗TNFR2抗体またはその断片またはその免疫複合体の用途を提供する。
実施例
実施例
実施例1:ハイブリドーマスクリーニングによるTNFR2結合抗体の生成
hTNFR2-mFcタンパク質(配列番号45)とヒトTNFR2(配列番号48)を発現するCHO-K1細胞株とを交互に注射して5匹のSJL(Charles River)マウスに免疫を行った。表1の免疫(immunization)スケジュールに従い、2週ごとにタンパク質と細胞を交互に注入し、4回の免疫を行った。2回目、3回目、4回目の免疫後の免疫マウスの血液を、TNFR2タンパク質HuTNFR2-huFc(配列番号46)に対してELISAによりテストし、ヒトTNFR2(配列番号48)を安定して発現する293T細胞株に対してFACSによりテストした。
hTNFR2-mFcタンパク質(配列番号45)とヒトTNFR2(配列番号48)を発現するCHO-K1細胞株とを交互に注射して5匹のSJL(Charles River)マウスに免疫を行った。表1の免疫(immunization)スケジュールに従い、2週ごとにタンパク質と細胞を交互に注入し、4回の免疫を行った。2回目、3回目、4回目の免疫後の免疫マウスの血液を、TNFR2タンパク質HuTNFR2-huFc(配列番号46)に対してELISAによりテストし、ヒトTNFR2(配列番号48)を安定して発現する293T細胞株に対してFACSによりテストした。
ELISAとFACSの結果により、次の融合ステップのための脾細胞の供給源としてマウス5#を選んだ。結果は、マウス5#からの血清が、細胞ブロッキングアッセイでTNF-α(ACRO Biosystem,カタログ番号TNA-H5228)のTNFR2への結合を阻害する最も強力な能力を持っていることを示した。
1回の電気融合を行った。融合細胞を96ウェルプレートに播種した。陽性クローンをELISAとFACSでスクリーニングした。ヒトTNFR1タンパク質(Acro Biosystem,カタログ番号TN1-H5222)、ヒトLTBR(ACRO Biosystem,カタログ番号LTR-H5251)、ヒトオステオプロテゲリン(ACRO Biosystem,カタログ番号TNB-H5220)を、カウンタースクリーンに用いた。陽性クローンを24ウェルプレートに拡大した。スクリーニングをさらに確認するために上清を採取した。その結果、15個のクローンが配列決定に選ばれた。実施例4では、スクリーニングの具体的な手順を特定した。
実施例2:ハイブリドーマの配列決定および当該配列
実施例2:ハイブリドーマの配列決定および当該配列
マウス抗ヒトTNFR2抗体の軽鎖および重鎖可変領域の配列を、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)増幅法により得た。15抗体の全RNAをRNAprep純細胞キット(TIANGEN,カタログ番号DP430)を用いて単離し、Fast King gDNA Dispelling RT Super Mix(TIANGEN,カタログ番号KR118)を用いてcDNAを合成した。重鎖および軽鎖可変領域をPCRによりクローン化した。すべてのPCRは、高忠実度ポリメラーゼを用いて行った。PCRで増幅した各抗体のDNAを、GENEWIZ社より配列決定するためにTAクローニングベクターにクローニングした。
マウス抗体クローン32A1D5および43B7A4の可変領域のアミノ酸配列は、以下の通りである:
>32A1D5重鎖可変領域(32A1D5-VH):配列番号7
>32A1D5軽鎖可変領域(32A1D5-VL):配列番号8
>43B7A4重鎖可変領域(43B7A4-VH):配列番号15
>43B7A4軽鎖可変領域(43B7A4-VL):配列番号16
実施例3:キメラ抗体の発現および精製
>32A1D5重鎖可変領域(32A1D5-VH):配列番号7
>32A1D5軽鎖可変領域(32A1D5-VL):配列番号8
>43B7A4重鎖可変領域(43B7A4-VH):配列番号15
>43B7A4軽鎖可変領域(43B7A4-VL):配列番号16
実施例3:キメラ抗体の発現および精製
15キメラIgG1抗体を産生する方法を確立した。配列解析後、キメラ抗体の可変領域は、この配列に基づく遺伝子合成(Genscript)によって生成された。軽鎖可変領域を、配列番号42(配列番号41)で表される軽鎖定常領域をコードする核酸を含む発現ベクターpcDNA3.1に挿入し、抗体の軽鎖を発現するベクターを構築し、重鎖可変領域を、配列番号40(配列番号39)で表される重鎖定常領域をコードする核酸を含む発現ベクターpcpcDNA3.1(インビトロゲン)に挿入し、抗体の重鎖を発現するベクターを構築する。プラスミドは、EndoFree Midi Plasmid Kit(TIANGEN,カタログ番号DP108)を用いて抽出した。また、重鎖ベクターおよび軽鎖ベクターを、ExpiCHO(登録商標)発現システム(ThermoFisher,カタログ番号A29133)を用いてCHO-S細胞に1:1の比率で同時トランスフェクトした。トランスフェクトされた細胞をExpiCHO(登録商標)発現培地で12日間培養した後、培養上清を採取し、プロテインAアフィニティークロマトグラフィー(GEヘルスケア)による精製に供した。
15種のクローンはすべてサイズ排除クロマトグラフィーで試験した。各クローンからの試料20μgを、ランニングバッファーとして100mMリン酸ナトリウム+100mM Na2SO4、pH7.0を用いてTSK G3000 SWXLカラムに注入した。実行時間は30分であった。測定はすべてWaters e2695 HPLCで行った。データは、OpenLABソフトウェアを使用して分析した。13種のクローンのメインピークはSECで95%以上であり、精製キメラ抗体の高純度と完全性を示唆している。
実施例4:キメラ抗体のスクリーニングおよび同定
実施例4:キメラ抗体のスクリーニングおよび同定
15個のキメラ抗体すべてを、ELISA結合、細胞ブロッキングによってさらに試験した。また、この抗体は、TNFR2陰性細胞への非特異的結合についても試験され、これは、この抗体が細胞表面でヒトTNFR2発現なしに細胞に結合しないことを示した。
ヒト/カニクイザルTNFR2タンパク質に結合した抗TNFR2抗体
ヒト/カニクイザルTNFR2タンパク質に結合した抗TNFR2抗体
ヒトTNFR2、ヒトFcタグタンパク質(huTNFR2-huFc、配列番号46)またはカニクイザルTNFR2、ヒトFcタグタンパク質(cyno-TNFR2-huFc、配列番号47)を、96ウェルプレート(Hangzhou Xinyou,カタログ番号100096H)上に一晩中4℃でPBS(Hyclone,カタログ番号SH30256.01)でインキュベーションすることにより固定化した。次いで、プレートを、PBS中の1%のBSAと37℃で1時間インキュベートすることによりブロックした。ブロッキング後、プレートをPBST(0.05%Tween20を含むPBS)で3回洗浄した。実施例3で得られた、段階希釈した抗TNFR2抗体、およびネガティブコントロールIgG(重鎖:配列番号43、軽鎖:配列番号44、WO2008068246A1)を、希釈バッファー(0.05%Tween20および0.5%BSAを含むPBS)中に用意し、上記固定化タンパク質とともに希釈バッファー中で37℃にて1時間インキュベートした。その後、プレートをPBSTで3回洗浄し、37℃でペルオキシダーゼ AffiniPure ヤギ抗ヒトIgG,F(ab′)2断片特異的(Jackson ImmunoResearch,カタログ番号109-035-097)で1時間インキュベートし、希釈バッファー中で1/20,000希釈した後、再びPBSTで洗浄した。50μL/wellのTMB(Thermo,カタログ番号34028)をプレートに添加し、15分後、1M H2SO4で反応を停止した。450nm~620nmでの吸光度を測定した。クローンのヒト/カニクイザルTNFR2への結合に対するEC50および代表的な結合曲線を、図1に示した。
これらの結果は、2つのキメラ抗体32A1D5および43B7A4が、ヒト(それぞれEC500.04820nMおよび0.06272nMで)およびカニクイザルTNFR2タンパク質(EC500.008201nMおよび0.008974nMで)に結合できることを示した。
293T細胞の細胞表面に発現したカニクイザルTNFR2に結合した抗TNFR2抗体
293T細胞の細胞表面に発現したカニクイザルTNFR2に結合した抗TNFR2抗体
本発明の抗ヒトTNFR2抗体が、細胞表面に発現したカニクイザルTNFR2に結合できるかどうかを決定するために、細胞ベースの結合アッセイを確立した。Lipofectamine(登録商標)2000 Transfection Rediction(Invitrogen,カタログ番号11668019)を用いて、293T細胞株を、カニクイザルTNFR2タンパク質(配列番号49)をコードするヌクレオチドでトランスフェクションした。Puromycin Dihydrochloride(Gibco,カタログ番号A1113802)を用いて細胞をスクリーニングした後、カニクイザルサルTNFR2を高度に発現する細胞プールを選択した。抗TNFR2抗体32A1D5の8点階希釈(段階希釈、濃度は20μg/mLから開始し、4倍希釈)を細胞に加え、得られた混合物をPBS中で4℃で30分間インキュベートした。次に、細胞をPBSで2回洗浄した。R-PE結合AffiniPure Goat Anti-HumanIgG、Fc γ断片特異的(Jackson ImmunoResearch,カタログ番号109-116-098)を二次試薬として用いて、293T細胞上に発現したカニクイザルTNFR2に対する抗TNFR2抗体の結合活性を検出し、混合物を4℃で30分間インキュベートし、その後、PBSで2回洗浄した。次に、PBSで細胞を再懸濁した。TNFR2結合の解析は、BD Accuri C5 flow cytometer(BD Bioscience)を用いて行った。その結果を図2Aに示した。
これらの結果は、抗体32A1D5が、0.9682nMのEC50で細胞表面に発現したカニクイザルTNFR2に特異的に結合したことを示した。
抗TNFR2抗体は、293T細胞の細胞表面に発現するヒトTNFR2へのTNF-αの結合をブロックした。
抗TNFR2抗体は、293T細胞の細胞表面に発現するヒトTNFR2へのTNF-αの結合をブロックした。
本発明の抗ヒトTNFR2抗体が、細胞表面に発現したヒトTNFR2へのTNF-αの結合をブロックできるかどうかを決定するために、細胞ベースのアッセイを行う。293T細胞株を、Lipofectamine(登録商標)2000トランスフェクション試薬(Invitrogen,カタログ番号11668019)を用いて、ヒトTNFR2タンパク質(配列番号48)をコードするヌクレオチド分子でトランスフェクションした。Puromycin Dihydrochloride(Gibco,カタログ番号A1113802)を用いてスクリーニングを行い、ヒトTNFR2を高度に発現する細胞クローンを選抜した。20μg/mLから開始して4倍に希釈した濃度の抗TNFR2抗体(32A1D5および43B7A4)の8点階希釈を細胞に加え、混合物をPBS中で4℃で30分間インキュベーションした。次に、細胞を50μg/mLビオチン-TNF-α(ACRO Biosystems,カタログ番号TNA-H8211)とともに4℃で30分間インキュベートした後、PBSで2回洗浄した。PE-ストレプトアビジン(Biolegend,カタログ番号405203)を二次試薬として用いて、293T細胞表面に発現したヒトTNFR2へのビオチンTNF-αの結合を検出し、混合物をPBS中で4℃で30分間インキュベートし、その後、PBSで2回洗浄した。次に、PBSで細胞を再懸濁した。ビオチン-TNF-α結合の解析は、BD Accuri C5フローサイトメーター(BD Bioscience)を用いて行った。その結果を、図2B(32A1D5用)および図2C(43B7A4用)に示した。
これらの結果は、2つのキメラ抗体が、細胞表面に発現したTNFR2のTNF-αへの結合をブロックできることを示した。
実施例5:ヒト化抗体の生成と特徴
実施例5:ヒト化抗体の生成と特徴
2つのキメラ抗体32A1D5および43B7A4をそれぞれヒト化した。マウス抗体の可変領域の配列を用いて、マウスフレームワークに最も相同性の高いヒト生殖細胞系列を同定した。CDR移植と逆突然変異はヒト化で取られた。
32A1D5ヒト化
32A1D5ヒト化
IMGTデータベース(http://www.imgt.org)に従って、6つのCDRを最も適切なヒト生殖細胞系列に挿入することにより、これらの抗体をヒト化した。軽鎖のヒト生殖細胞系列IGKV1-27*01および重鎖のIGKV2-5*09を、それぞれCDR移植に使用した。3つのCDRを生殖細胞系列に移植して変異型重鎖可変領域(VH/HCVR)Hu32-H1およびHu32-H2を得、Hcvr上でHu32-H2に対するS30Nの逆突然変異を作製した。
>IGHV2-5*09(32A1D5VHの生殖細胞系列)
QVTLKESGPTLVKPTQTLTLTCTFSGFSLSTSGVGVGWIRQPPGKALEWLALIYWDDDKRYGPSLKSRLTITKDTSKNQVVLTMTNMDPVDTATYYCAHRYYYYYGMDVWGQGTTVTVSS(配列番号63)
>Hu32-H1 VH配列:配列番号25
>Hu32-H2 VH配列:
QVTLKESGPTLVKPTQTLTLTCTFSGFSLNTLGMGVGWIRQPPGKALEWLAHIWWDADKYYNPALKSRLTITKDTSKNQVVLTMTNMDPVDTATYYCARMTGTRYFDVWGQGTTVTVSS(配列番号64)
QVTLKESGPTLVKPTQTLTLTCTFSGFSLSTSGVGVGWIRQPPGKALEWLALIYWDDDKRYGPSLKSRLTITKDTSKNQVVLTMTNMDPVDTATYYCAHRYYYYYGMDVWGQGTTVTVSS(配列番号63)
>Hu32-H1 VH配列:配列番号25
>Hu32-H2 VH配列:
QVTLKESGPTLVKPTQTLTLTCTFSGFSLNTLGMGVGWIRQPPGKALEWLAHIWWDADKYYNPALKSRLTITKDTSKNQVVLTMTNMDPVDTATYYCARMTGTRYFDVWGQGTTVTVSS(配列番号64)
変異型軽鎖可変領域(LCVR/VL)Hu32-L1、Hu32-L2、Hu32-L3およびHu32-L2Vを、3つのCDRを生殖細胞系列に移植して得、Hu32-L2についてはQ38H、Y49H、T69S、およびF71Yの逆突然変異、Hu32-L3についてはY49H、T69S、およびF71Yの逆突然変異、ならびにHu32-L2VについてはQ38H、Y49H、T69S、およびF71Yの逆突然変異及びI83Vの突然変異を、それぞれLCVR上で作製した。
>IGKV1-27*01(32A1D5 VLの生殖細胞系列)
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQGISNYLAWYQQKPGKVPKLLIYAASTLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDVATYYCQKYNSAPLTFGGGTKVEIK(配列番号65)
>Hu32-L1
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKASQNINKFIAWYQQKPGKVPKLLIYYTSTLQPGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDVATYYCLQYGVLWTFGGGTKVEIK(配列番号66)
>Hu32-L2
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKASQNINKFIAWYQHKPGKVPKLLIHYTSTLQPGVPSRFSGSGSGSDYTLTISSLQPEDIATYYCLQYGVLWTFGGGTKVEIK(配列番号67)
>Hu32-L3 :配列番号26
>Hu32-L2V :配列番号28
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQGISNYLAWYQQKPGKVPKLLIYAASTLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDVATYYCQKYNSAPLTFGGGTKVEIK(配列番号65)
>Hu32-L1
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKASQNINKFIAWYQQKPGKVPKLLIYYTSTLQPGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDVATYYCLQYGVLWTFGGGTKVEIK(配列番号66)
>Hu32-L2
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKASQNINKFIAWYQHKPGKVPKLLIHYTSTLQPGVPSRFSGSGSGSDYTLTISSLQPEDIATYYCLQYGVLWTFGGGTKVEIK(配列番号67)
>Hu32-L3 :配列番号26
>Hu32-L2V :配列番号28
43B7A4ヒト化
軽鎖のヒト生殖細胞系列IGKV3D-7*01および重鎖のIGHV1-18*01を、それぞれCDR移植に使用した。
変異型重鎖可変領域(HCVR/VH)Hu3-H1、Hu3-H2およびHu3-H3を、3つのCDRを生殖細胞系列に移植して得、Hu3-H1についてはV2I、V67F、M69F、およびT71Lの逆突然変異、Hu3-H2についてはV2I、M69F、およびT71Lの逆突然変異、Hu3-H3についてはV2I、V67F、T68A、M69F、およびT71Lの逆突然変異を、それぞれHCVR上で作製した。
>IGHV1-18*01(43B7A4 VHの生殖細胞系列)
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYGISWVRQAPGQGLEWMGWISAYNGNTNYAQKLQGRVTMTTDTSTSTAYMELRSLRSDDTAVYYCARYFDYWGQGTLVTVSS(配列番号68)
>Hu3-H1
QIQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTTYGMSWVRQAPGQGLEWMGWIHTYSGVPTYADDFKGRFTFTLDTSTSTAYMELRSLRSDDTAVYYCARGLYGVDYWGQGTLVTVSS(配列番号69)
>Hu3-H2
QIQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTTYGMSWVRQAPGQGLEWMGWIHTYSGVPTYADDFKGRVTFTLDTSTSTAYMELRSLRSDDTAVYYCARGLYGVDYWGQGTLVTVSS(配列番号70)
>Hu3-H3 :配列番号37
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYGISWVRQAPGQGLEWMGWISAYNGNTNYAQKLQGRVTMTTDTSTSTAYMELRSLRSDDTAVYYCARYFDYWGQGTLVTVSS(配列番号68)
>Hu3-H1
QIQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTTYGMSWVRQAPGQGLEWMGWIHTYSGVPTYADDFKGRFTFTLDTSTSTAYMELRSLRSDDTAVYYCARGLYGVDYWGQGTLVTVSS(配列番号69)
>Hu3-H2
QIQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTTYGMSWVRQAPGQGLEWMGWIHTYSGVPTYADDFKGRVTFTLDTSTSTAYMELRSLRSDDTAVYYCARGLYGVDYWGQGTLVTVSS(配列番号70)
>Hu3-H3 :配列番号37
変異軽鎖可変領域(LCVR/VL)Hu3-L1およびHu32-L2を、3つのCDRを生殖細胞配列に直接移植して得、Hu3-L1についてはG68Aの逆突然変異、Hu3-L2についてはI58V、A60D、S63T、およびG68Aの逆突然変異を、それぞれLCVR上で作製した。
>IGKV3D-7*01(43B7A4 VLの生殖細胞系列)
EIVMTQSPATLSLSPGERATLSCRASQSVSSSYLSWYQQKPGQAPRLLIYGASTRATGIPARFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFAVYYCQQDYNLPYTFGQGTKLEIK(配列番号71)
>Hu3-L1 :配列番号38
>Hu3-L2
EIVMTQSPATLSLSPGERATLSCKASENVVTYVSWYQQKPGQAPRLLIYGASNRYTGVPDRFTGSGSATDFTLTISSLQPEDFAVYYCGQSYTYPYTFGQGTKLEIK(配列番号72)
EIVMTQSPATLSLSPGERATLSCRASQSVSSSYLSWYQQKPGQAPRLLIYGASTRATGIPARFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFAVYYCQQDYNLPYTFGQGTKLEIK(配列番号71)
>Hu3-L1 :配列番号38
>Hu3-L2
EIVMTQSPATLSLSPGERATLSCKASENVVTYVSWYQQKPGQAPRLLIYGASNRYTGVPDRFTGSGSATDFTLTISSLQPEDFAVYYCGQSYTYPYTFGQGTKLEIK(配列番号72)
上記重鎖可変領域および軽鎖可変領域のDNAを合成し、ヒトIgG1重鎖定常領域(配列番号:40、登録番号:P01857)をコードするヌクレオチド(配列番号39)を含む発現ベクターpcDNA3.1(インビトロゲン)と、ヒトκ軽鎖定常領域(配列番号42、登録番号P01834)をコードするヌクレオチド(配列番号41)を含む発現ベクターpcDNA3.1とにそれぞれサブクローニングした。プラスミドは、EndoFree Midi Plasmid Kit(TIANGEN,カタログ番号DP108)を用いて抽出した。この抗体の発現と精製は、実施例3で説明した手順に従う。。
ヒト化抗体hu32-Cは、VH Hu32-H1およびVH Hu32-L3を含み、ヒト化抗体hu3-Eは、VHHu3-H3およびVLHU3-L1を含む。hu32-C、hu32C-V1の変異体は、VH Hu32-H1およびVLHu32-L2Vを含む。
実施例6:抗TNFR2ヒト化抗体の評価
実施例6:抗TNFR2ヒト化抗体の評価
予備的評価は、実施例4で説明したように、ELISA結合、ELISAブロッキング、細胞ブロッキングを含む、キメラ抗体のスクリーニングおよび同定手順に従う。これらの結果に基づき、ヒト化抗体hu32-Cおよびhu3-Eを選択し、さらなるインビトロとインビボの機能評価を行った。
ELISA結合アッセイは、抗TNFR2抗体がhu32-Cおよびhu3-Eであり、コーティングされたタンパク質がヒトTNFR2、マウスFc-tag(配列番号45)に置き換えられたことを除いては、実施例4と同様に行われた。
ヒト化抗体のヒトTNFR2タンパク質への結合の結果は、図3A(hu32-C)および図3B(hu3-E)に見られる。
これらの結果は、2つのヒト化抗体が両方とも、0.06970 nM (hu32-C)および0.05079 nM(hu3-E)のEC50で、ヒトTNFR2に特異的に結合できることを示した。
抗TNFR2抗体はTNFR2とTNF-α間の相互作用を阻害した
抗TNFR2抗体はTNFR2とTNF-α間の相互作用を阻害した
高結合性の透明ポリスチレン96ウェルプレートを、ヒトTNF-αタンパク質1μg/mLの50μL/wellでコーティングし、そのタグ(Acro Biosystem,カタログ番号TNA-H5228)を炭酸塩バッファーに入れ、4℃で一晩インキュベートした。次いで、洗浄バッファー(PBS+0.05%Tween20)を使用して自動プレートウォッシャーでプレートを1回洗浄した。200μLのブロッキングバッファー(PBS+1%BSA)を各ウェルに加え、室温で1時間インキュベーションした。段階希釈した抗体(hu32-Cおよびhu3-E)、および希釈バッファー(PBS+0.5%BSA+0.05%Tween20)(開始濃度:20μg/mL(混合前の濃度)、4倍希釈)で希釈したネガティブコントロールIgGを調製し、0.1μg/mL(混合前濃度)hTNFR2-mFc(配列番号45)と体積比1:1で混合し、次いで、混合希釈を96ウェルプレートに加え、希釈バッファー(PBS中0.05%Tween20および0.5%BSA)中で室温にて1時間インキュベートした。自動プレートワッシャーで洗浄バッファーを使用して2回の洗浄を行った。希釈バッファー中のHRP結合ヤギ抗マウスFc抗体(Jackson Immunoresearch,カタログ番号115-035-164)50μL/wellを、プレートの各ウェルに添加した。その後、ELISAプレートを室温で60分間インキュベートし、250μL/ウェル洗浄バッファーでプレートを2回洗浄した。最後に、50μL/wellのTMBを各ウェルに加え、1M H2SO4を用いて反応を終了した。450nm~620nmでの吸光度を測定した。
ヒト化抗体によるTNFαへのヒトTNFR2結合をブロッキングした結果は、図3A(hu32-C)および図3B(hu3-E)に見られる。
これらの結果は、2つのヒト化抗体がTNFR2のTNF-αへの結合をブロックできることを示した。
また、細胞表面でのカニクイザルTNFR2に結合する、および細胞表面でのTNF-αのヒトTNFR2への結合をブロッキングする、ヒト化抗体の能力を調べた。アッセイ手順は、実施例4と同様であった。細胞ベースのアッセイの結果を図4に示した。
細胞ベースのアッセイの結果は、ヒト化抗体hu32-Cおよびhu3-Eが両方とも、TNFR2に結合する、およびTNF-α-TNFR2相互作用をブロッキングする能力を有することを示した。
実施例7:抗TNFR2抗体の結合親和性
実施例7:抗TNFR2抗体の結合親和性
この例では、ForteBio Octet RED 96(bio-layer interferometry)を用いて、抗ヒトTNFR2抗体の結合親和性(一価KD)を測定した。
簡単に言えば、IgG Fcキャプチャーセンサーのヒント(ForteBio,カタログ番号18-5060)をPBS中、室温で10分間水和した。動態アッセイを96ウェルプレートで行い、各ステップで次の時間を用いて実施した;a)PBSで100秒間のベースラインのバランスを取る;b)抗ヒトTNFR2抗体(hu3-E、hu32-Cおよびhu32C-V1)を少なくとも0.3ナノメートルまで負荷する;c)1000秒間のベースラインのバランスを取る;d)100nM、50nM、25nM、12.5nM、6.25nM、3.12nM、および1.56nMの連続濃度(serial concentration)で、それぞれ80秒間、タグ付きヒトTNFR2(Sino Biological,カタログ番号10417-H08H)またはカニクイザルTNFR2(Sino Biological,カタログ番号90102-C08H)と結合する;e)PBSで600秒間解離を行う。Octetソフトウェアを使用して、データセットに1:1グローバル フィッティング モデルを適用した。
これらの結果は、3つの抗体がいずれも、ヒトTNFR2に特異的に結合することを示唆した。特に、抗体hu3-EはヒトTNFR2に対して5.32nM、カニクイザルTNFR2に対して3.62nMの一価KDを示した、抗体hu32-Cは、ヒトTNFR2に対して0.61nM、カニクイザルTNFR2に対して0.37nMの一価KDを示した、抗体hu32C-V1は、ヒトTNFR2に対して0.91nM、カニクイザルTNFR2に対して0.41nMの一価KDを示した。
実施例8:ヒト化抗体のインビトロ評価
ヒトCD8+T細胞を共刺激してIFΝγを放出させる
実施例8:ヒト化抗体のインビトロ評価
ヒトCD8+T細胞を共刺激してIFΝγを放出させる
ヒトPBMCを健康なドナーから採取した。Lymphoprep密度勾配試薬(StemCell Technologies)を含むSepMate50チューブ(StemCell Technologies)で単核細胞を分離した。
全CD8+T細胞をネガティブセレクションキット(Miltenyi,カタログ番号130-096-495)で製造元の指示に従って精製した。96ウェルプレート(Corning,カタログ番号3799)を、0.5μg/mLの機能グレード抗CD3(eBioscience,カタログ番号16-0037-85)および抗TNFR2抗体(hu3-Eおよびhu32-C)の段階希釈またはネガティブ コントロールIgG(開始濃度60μg/mLから希釈、3倍段階希釈)でPBS中、4℃で一晩コーティングした。翌日、コーティングされたプレートをDPBSバッファー(Hyclone,カタログ番号SH30256.01)で2回洗浄した。200μLの培地(90%RPMI 1640(Gibco,カタログ番号22400)完全培地、10%FBS(Gibco,カタログ番号10099-141)および1μg/mL可溶性抗CD28 (Biolegend,カタログ番号302934)を含む)中の1×105CD8+T細胞を、各ウェルに添加し、37℃で72時間培養した。培養上清を集め、ELISAキット(R&D Systems、DY202)でIFνγレベルについて試験を行った。その結果を図5に示した。図中のアッセイバッファーは、PBS中の0.5μg/mLの機能グレード抗CD3抗体(eBioscience,カタログ番号16-0037-85)のみを指す。
これらの結果は、hu3-EがCD8+T細胞を刺激して用量依存的にIFΝγを放出できるが、hu32-Cは上記濃度では明らかな効果がないことを示した。
抗TNFR2抗体共刺激によるT細胞の増殖
抗TNFR2抗体共刺激によるT細胞の増殖
ヒトPBMCを健康なドナーから採取した。上記のように、Lymphoprep密度勾配試薬(StemCell Technologies)を含むSepMate50チューブ(StemCell Technologies)で単核細胞を分離した。後で使用するために、全CD8+およびCD4+T細胞を、ネガティブセレクションキット(Miltenyi,カタログ番号130-096-495およびカタログ番号130-096-533)で精製した。96ウェルプレート(Corning,カタログ番号3799)を、0.5μg/mLの機能グレードの抗CD3(eBioscience,カタログ番号16-0037-85)および抗TNFR2抗体(hu3-Eおよびhu32-C)の段階希釈またはネガティブ コントロールIgG(開始濃度60μg/mLから希釈、3倍段階希釈)でPBS中、4℃で一晩コーティングした。翌日、コーティングされたプレートをDPBSバッファー(Hyclone,カタログ番号SH30256.01)で2回洗浄した。200μLの培地(90%RPMI 1640(Gibco,カタログ番号22400)完全培地、10%FBS(Gibco,カタログ番号10099-141)および1μg/mL可溶性抗CD28 (Biolegend,カタログ番号302934)を含む)中の1×105CD8+またはCD4+T細胞を、各ウェルに添加し、37℃で72時間培養した。72時間後、ウェル当たり100μLの細胞培養上清を廃棄し、100μLのCellTiter-Glo(登録商標)発光細胞生存率アッセイ試薬(Promega,カタログ番号G7572)を添加し、よく混合した。5分後、100μLの混合物を、新しい96ウェルアッセイプレート(Corning,カタログ番号3917)に移した。マイクロプレートリーダーF200(Tecan,カタログ番号F200)を用いて、アッセイプレートを読み取った。結果を図6に示した。図中のアッセイ用バッファーは、0.5μg/mLの機能グレードの抗CD3(eBioscience,カタログ番号16-0037-85)コーティング用バッファーのみを指す。
これらの結果は、hu3-Eが、T細胞の増殖を刺激するが、hu32-Cは上記濃度では明らかな効果がないことをさらに示した。
インビトロでの抗TNFR2抗体共刺激によって媒介されるT細胞の活性化はFc架橋に依存していた。
インビトロでの抗TNFR2抗体共刺激によって媒介されるT細胞の活性化はFc架橋に依存していた。
ヒトPBMCを健康なドナーから採取した。Lymphoprep密度勾配試薬(StemCell Technologies)を含むSepMate50チューブ(StemCell Technologies)で単核細胞を分離した。
後で使用するために、全CD8+T細胞を、ネガティブセレクションキット(Miltenyi,カタログ番号130-096-495)で精製した。プレート結合抗体アッセイ(plate-bound antibody assay)では、96ウェルプレート(Corning,カタログ番号3799)を、0.5μg/mLの機能グレードの抗CD3(eBioscience,カタログ番号16-0037-85)および抗TNFR2抗体(hu3-Eおよびhu32-C)の段階希釈またはネガティブ コントロールIgG(開始濃度30μg/mLから希釈、3倍段階希釈)で、4℃で1晩コーティングした。可溶性抗体のアッセイでは、96ウェルプレートを0.5μg/mLの機能グレードの抗CD3のみでコーティングした。
翌日、コーティングされたプレートをDPBSバッファー(Hyclone,カタログ番号SH30256.01)で2回洗浄した。プレート結合抗体アッセイでは、200μLの培地(90%RPMI 1640(Gibco,カタログ番号22400)完全培地、10%FBS(Gibco,カタログ番号10099-141)および1μg/mL可溶性抗CD28 (Biolegend,カタログ番号302934)を含む)中の1×105CD8+T細胞を、各ウェルに添加し、37℃で72時間培養した。
可溶性抗体アッセイでは、200μLの培地(90%RPMI 1640(Gibco,カタログ番号22400)完全培地、10%FBS(Gibco,カタログ番号10099-141)および1μg/mL可溶性抗CD28 (Biolegend,カタログ番号302934)を含む)中の1×105CD8+T細胞を、各ウェルに添加し、その次、抗TNFR2抗体(hu3-Eおよびhu32-C)の段階希釈物およびネガティブコントロールIgG(30μg/mLの開始濃度から希釈、および3倍段階希釈)をそれぞれ添加した。培養物を37℃で72時間培養した。72時間後、培養上清を回収し、ELISAキット(R&D Systems,カタログ番号DY202)でIFNγレベルをテストし、その結果を図7に示した。
これらの結果は、hu3-EがFc架橋に依存して、インビトロで共刺激によってT細胞を活性化できることを示した。
実施例9:ラットにおけるヒト化抗体の薬物動態
実施例9:ラットにおけるヒト化抗体の薬物動態
ラットにおける抗TNFR2ヒト化抗体の薬物動態プロファイルを評価した。研究における動物のケアと用途(使用)を含む手順は、PhamaLagancyによって審査および承認された。
3匹のナイーブラット(Shanghai Sippr-BK laboratory animal Co.Ltd.)を各抗体に使用した。この研究では、抗TNFR2抗体(hu3-E、hu32-C)を、それぞれ10mg/kgの単回投与でラットに静脈内注射した。血液試料(サンプル)を、0~336時間(0~14日、0日目、1日目で10分、30分、1時間、4時間目、6時間目、および2日目、4日目、7日目、10日目および14日目)の様々な時点で採取した。全試料を処理して血清を得た後、分析するまで血清を-70℃~-86℃で凍結保存した。血清中の抗TNFR2抗体の濃度を測定した。薬物動態パラメータを表4に示した。
ヒトTNFR2、ヒトFcタグタンパク質(huTNFR2-huFc,配列番号46)を、PBS(Hyclone,カタログ番号SH30256.01)中、4℃で一晩インキュベートすることにより、0.5μg/mLで96ウェルプレート(Costar,カタログ番号42592)に固定化した。次いで、プレートを、PBS中の1%のBSAと37℃で1時間インキュベートすることによりブロックした。ブロッキング後、プレートをPBST(0.05%Tween20を含むPBS)で3回洗浄した。抗TNFR2抗体(hu32-Cまたはhu3-E)を、血清希釈バッファー(PBSは、2%v/vラット血清を含む、0.05%Tween20および0.5%BSAを含む)で0.12μg/mLで希釈し、3倍段階希釈を6回行い、合計7濃度の抗体溶液を標準曲線として得た。同時に、それぞれ高、中、低品質コントロールとして40ng/mL、4ng/mL、0.4ng/mLの抗体を、血清希釈バッファーで希釈した。全てのラット血清試料(サンプル)を、投与前の混合ラット血清と希釈バッファー(0.05%Tween20および0.5%BSAを含むPBS)で希釈し、最終濃度を40~0.4ng/mLの範囲に保ち、試料希釈には2%v/vのラット血清が含まれた。標準曲線、品質管理および試料をプレートに加え、37℃で1時間インキュベートした。次に、プレートをPBSTで3回洗浄し、希釈バッファーで1/20,000に希釈したペルオキシダーゼAffiniPureヤギ抗ヒトIgG、F(ab′)2断片特異的(Jackson ImmunoResearch,カタログ番号109-035-097)で37℃にて1時間インキュベートし、その後、PBSTで再度洗浄した。50μL/well TMB(Thermo,カタログ番号34028)をプレートに加え、15分後、1M H2SO4で反応を停止した。450nm~620nmでの吸光度を測定した。
2つのヒト化抗体hu32-Cおよびhu3-Eの薬物動態は、ラットでは正常である。
実施例10:TNFRスーパーファミリータンパク質へのファミリー交差結合
実施例10:TNFRスーパーファミリータンパク質へのファミリー交差結合
ハイブリドーマクローンは、TNFR1、LΤβR、およびオステオプロテゲリンには結合できなかったが、他のタイプのTNFRスーパーファミリータンパク質が存在する。ヒト化抗体hu3-Eとhu32-Cのヒト4-1 BB、CD40、OX40、GITR、CD27、HVEMへの結合を試験した。
4-1BB(Sino Biological,カタログ番号#10041-H08H),CD40(Sino Biological,カタログ番号10774-H08H),OX40(Sino Biological,カタログ番号10481-H08H),GITR(Sino Biological,カタログ番号13643-H08H),CD27(SinoBiological,カタログ番号10039-H31H)およびHVEM(Sino Biological,10334-H03H)を、PBS(Hyclone,カタログ番号SH30256.01)で一晩4℃でインキュベーションし、96-wellプレート上に固定化した。プレートを、PBS中の1%BSAで37℃にて1時間ブロックした。ブロッキング後、プレートをPBST(0.05%Tween20を含むPBS)で3回洗浄した。段階希釈した抗TNFR2抗体を希釈バッファー(0.05%Tween20および0.5%BSAを含むPBS)(開始濃度0.4μg/mL、3倍希釈)で調製し、プレートに加え、37℃で1時間インキュベートした。次いで、プレートをPBSTで3回洗浄した(0.05%Tween20を含むPBS)。次に、希釈バッファーで1:20000に希釈したペルオキシダーゼ標識ヤギ抗ヒトF(ab′)2 IgG(JacksonImmuno Research,カタログ番号109-035-097)を、ELISAプレートとしてプレートの各ウェルに加えた。その後、ELISAプレートを室温で60分間インキュベートし、PBSTで3回洗浄した。最後に、50μL/wellのTMB(Thermo,カタログ番号34028)を各ウェルに加え、1M H2SO4を用いて反応を終了した。プレートを450nmでマイクロプレートリーダー上で読み取った。
結果を図8に示した。これらの結果は、ヒト4-1BB、CD40、OX40、GITR、CD27、またはHVEMタンパク質にはヒト化抗体hu3-Eおよびhu32-Cが結合しないことを示唆した。
実施例11:抗TNFR2抗体はインビボで抗腫瘍効果を示した。
実施例11:抗TNFR2抗体はインビボで抗腫瘍効果を示した。
抗TNFR2抗体のインビボでの効果を、結腸癌を有するhTNFR2 KIマウスで調べた。
この実験では、ヒトTNFR2の細胞外部分を発現するヒト化マウスC57BL/6J-Tnfrsf1bem2(hTNFRSF1B)Smoc(Shanghai Model Biodies Center,Inc)を4~5週間用いた。
MC38細胞(OBiO Technology(Shanghai)Corp.,Ltd.)は、レトロウイルス形質導入を用いて、卵白アルブミン(OVA GenBank:AAB59956.1)をコードする核酸で形質導入された。続いて、細胞を限界希釈によってクローン化した。OVAタンパク質を高度に発現するクローンをMC38-OVAクローンとして選択した。MC38-OVAクローンは、10%のウシ胎児血清および4μg/mLのピューロマイシン(Gibco,カタログ番号A11138-03)を含むDMEM(Gibco,カタログ番号11995-065)で維持された。
5~6週齢のC57BL/6J-Tnfrsf1bem2(hTNFRSF1B)Smocマウスに1×106個のMC38-OVA細胞を皮下移植し、0日目に平均腫瘍体積が約60mm3(長さ×幅2/2)に達した0日目に3群にランダム化した。0日目、3日目、7日目、10日目には、マウスにhu32-C(15mg/kg)、hu3-E(15mg/kg)およびPBSをそれぞれ腹腔内投与した。試験中、週に2回キャリパー測定により腫瘍容積をモニタリングした。
2つの抗TNFR2抗体による治療(処置)は両方とも、PBS群と比較して有意な腫瘍増殖阻害(tumor growth inhibition)をもたらした。データを以下表5に示す。
実施例12:hu32-C純度の向上
hu32-C純度を向上させるために、FR領域に対する単一の点変異を行った。Q38HおよびI83V置換をhu32-C軽鎖のFR領域で行い、hu32-V1と名付けられた抗体を得た。hu32-Cおよびhu32C-V1は、実施例3で説明したように、同じ生成物下で両方とも発現および精製された。生成物の純度はSEC-HPLCにより測定し、親和性はFortebioにより測定した(実施例7参照)。SEC-HPLCの結果を図9に示し、親和性結果を表3に示した。
これらの結果から、hu32C-V1の親和性はhu32-Cと一致するが、発現産物の純度は大幅に向上したことがわかった。抗体のメインピークの割合は、SEC-HPLCで91.4%(hu32-C)から97.0%(hu32C-V1)に増加した。
これらの結果は、I83V変異が抗体hu32-Cの純度を向上できるが、親和性などのその特性に影響を与えないことを示唆した。
実施例13:エピトープマッピング
実施例13:エピトープマッピング
本発明のヒト化抗体がその標的タンパク質であるヒトTNFR2に結合するエピトープを調べるために、ヒトTNFR2(配列番号50)の細胞外ドメインの11個のセグメントを構築し、マウスTNFR2タンパク質(配列番号51)の細胞外ドメインの対応するセグメントを置換した。その結果、当該領域のヒトTNFR2の各セグメントが置換された11個のマウスTNFR2変異体(配列番号52~62)を得た。
11個のTNFR2タンパク質セグメント配列を構築し、以下の表6にリストした。
結合アッセイELISAによれば、11個の変異体、ヒトTNFR2およびマウスTNFR2タンパク質を、本発明の抗体(hu3-Eおよびhu32C-V1)との結合について試験した。異なるTNFR2タンパク質をプレート上に0.5μg/mLでコーティングし、一晩ブロックした。抗体を開始濃度0.4μg/mLから3倍段階希釈してマイクロタイタープレートに加え、37℃でインキュベートした。その後のステップは、ELISA結合法と一致していた(実施例4参照)。
結合アッセイの結果は、hu3-Eおよびhu32C-V1が両方ともヒトTNFR2に結合するが、マウスTNFR2には結合しないことを示した。
これらの結果はさらに、ヒト化抗体hu3-Eが、(019-0-0.5に結合する)1L-31C上のヒトTNFR2のエピトープに結合することを示唆した。ヒト化抗体hu3-Eは、ヒトTNFR2タンパク質の変異体019-0-0.5と019-0-1を除いて、ヒトTNFR2タンパク質の変異体(variant)019-1,019-2,019-3,019-4,019-5,019-6,019-0.5-1および019-0.5-2には結合しなかった。したがって、ヒトTNFR2の結晶構造解析によれば、Q4A、E13A、S16AおよびQ26Aのアミノ酸変異をヒトTNFR2に対して別々に行い、上記ステップによるELISA結合法でhu3-Eへの結合を調べた。これらの結果は、ヒトTNFR2の配列上の26番目のグルタミンが、ヒトTNFR2に結合したhu3-Eの重要なアミノ酸であることを示した。異なるTNFR2に対する抗体hu3-E結合の結果を、図10に示した。
別のヒト化抗体hu32-Cは、(019-12に結合する)1L-96CTNFR2タンパク質に結合した。突然)変異体(mutation)hu32C-V1は、hu32-Cと同じヒトTNFR2の結合エピトープを有する。異なるTNFR2セグメントへの抗体hu32C-V1の結合の結果を、図11に示した。ヒト化抗体hu32C-V1は019-12のみに結合し、ヒトTNFR2タンパク質の他の変異体(variant)、019-2、019-3、019-4、019-5、019-6、019-0.5-1、019-0.5-2、および019-0-0.5は、ヒト化抗体hu32C-V1と結合しなかった。また、019-1および019-0-1は、hu32C-V1との弱いが無視できない結合シグナルを示し、これは、配列17T-54Dがhu32C-V1のエピトープにアミノ酸を含み得ることを示唆した。
実施例14:抗TNFR2抗体は、抗マウスPD1抗体との組み合わせの有無にかかわらず、およびFc効果の有無にかかわらず、インビボで抗腫瘍効果を示した。
実施例14:抗TNFR2抗体は、抗マウスPD1抗体との組み合わせの有無にかかわらず、およびFc効果の有無にかかわらず、インビボで抗腫瘍効果を示した。
インビボでの抗TNFR2抗体の有効性を、結腸癌を有するhTNFR2 KIマウスで調べた。
Hu3-E(mu)、L234A、L235A、D265A、P329A(EUナンバリング)アミノ酸(突然)変異(Fc機能削除)を有する抗TNFR2抗体を構築した。この抗体の発現と精製は、実施例3で説明した手順に従う。
この実験では、ヒトTNFR2の細胞外部分を発現する4~5週齢のヒト化マウスC57BL/6J-TNFRSF1bem2(hTNFRSF1B)Smocは、上海モデル生物センター(Shanghai Model Organisms Center,Inc)から購入した。
MC38細胞(OBiO Technology(Shanghai)Corp.,Ltd.)は、レトロウイルス形質導入を用いて、卵白アルブミン(OVA GenBank:AAB59956.1)をコードする核酸で形質導入された。続いて、細胞を限界希釈によってクローン化した。OVAタンパク質を高度に発現するクローンをMC38-OVAクローンとして選択した。MC38-OVAクローンは、10%のウシ胎児血清および4μg/mLのピューロマイシン(Gibco,カタログ番号A11138-03)を含むDMEM(Gibco,カタログ番号11995-065)で維持された。
5~6週齢のC57BL/6J-Tnfrsf1bem2(hTNFRSF1B)Smocマウスに1×106個のMC38-OVA細胞を皮下移植し、0日目に平均腫瘍体積が80~100mm3(長さ×幅2/2)に達した時点で6群にランダム化した。0日目、3日目、7日目、10日目、および14日目に、マウスにhu3-E(mu)(10mg/kg)、hu3-E(3mg/kg)、hu3-E(10mg/kg)、抗PD1抗体(Bio X Cell,カタログ番号BE0146)(1mg/kg)、hu3-E(10mg/kg)付き抗PD1抗体(1mg/kg)、およびPBSをそれぞれ腹腔内投与した。試験中、週に2回キャリパー測定により腫瘍容積をモニタリングした。各群に6匹のマウスが存在する。
両方の抗TNFR2抗体の治療(処置)は、PBS群と比較して有意な腫瘍増殖阻害をもたらした。Fc部分は、hu3-Eの有効性に直接関連している。(突然)変異によりFc-FcγRの相互作用を除去することで、抗TNFR2抗体の抗腫瘍効果を低下させる、同時に、抗TNFR2抗体は、抗PD1抗体と組み合わせて有意な抗腫瘍効果を示した。これらの2つの抗体を単独で使用する場合より、組み合せ効果の方が良好である。グループ化の詳細と結果を以下の表7に示した。
実施例15:活性化PBMC上で発現するヒトTNFR2に結合する抗TNFR2抗体
本発明の抗ヒトTNFR2抗体が、活性化PBMCs上で発現しているヒトTNFR2に結合できるかどうかを決定するために、細胞ベースの結合アッセイを確立した。ヒトPBMCを健康なドナーから採取した。PBMCを、コーティングされた機能グレードの抗CD3(eBioscience,カタログ番号16-0037-85、1μg/mL)で2日間刺激し、次いで、完全培地(90%RPMI 1640HEPES(Gibco,カタログ番号2400089)と10%FBS(Gibco,カタログ番号10099-141)とを含有)で培養した。その後100IU/mL IL-2を培地に加えて、さらに7日間培養した。次に、PBMCを回収し、PBS(Hyclone,カタログ番号SH30256.01)を使用して2回洗浄した。1.5×105個のPBMC細胞を、抗TNFR2抗体hu3-E(開始濃度20μg/mLから希釈、および4倍段階希釈)およびネガティブコントロール IgGの段階希釈でそれぞれ再懸濁し、4℃で30分間インキュベートした。PBSを用いて洗浄した後、二次試薬(1:200希釈)としてR-PE結合AffiniPureヤギ抗ヒトIgG、Fcγ断片特異的(Jackson ImmunoResearch,カタログ番号109-116-098)試薬を用いて細胞を再懸濁した。混合物をPBS中、4℃で30分間インキュベートし、その後、PBSで2回洗浄した。次に、細胞をPBSに再置換した。特異的結合の解析は、BD Accuri C5フローサイトメーター(BD Bioscience)を用いて行った。
結果を図12に示した。結果から、hu3-Eが、二人のドナーからの活性化PBMC上で発現したTNFR2に結合できることが分かった。そうでない場合、IgGコントロールは、二人のドナーから混合された活性化PBMCに対する特異的結合能を持たなかった。
実施例16:Tregsに対するインビトロでのADCC効果
実施例16:Tregsに対するインビトロでのADCC効果
96ウェルプレート(Corning,カタログ番号3599)を4℃で一晩、3μg/mLの機能グレード抗CD3(eBioscience,カタログ番号16-0037-85)でコーティングした。翌日、コートされたバッファーを廃棄し、後で使用するためにプレートを2回洗浄した。Schbio Biotechから購入した健康なドナーからのPBMC細胞を解凍して採取した。PBMC細胞からの全CD4+T細胞をメーカーの指示に従ってネガティブセレクションキット(Miltenyi,カタログ番号130-096-533)で精製した。そして、精製されたCD4+T細胞を、200μLのTreg誘導バッファー(10%FBS、20ng/mLのTGFβ1、100IU/mLのIL-2、2μg/mLの抗CD28および0.04mMのβ-メルカプトエタノールを含有)中の1~5×104細胞/ウェルで、抗CD3コーティング96ウェルプレートにプレーティングし、5日間培養して、次の用途のために、誘導されたTreg細胞を得た。
PBMC細胞からの全NK細胞を、メーカーの指示に従い、ネガティブセレクションキット(Miltenyi,カタログ番号130-092-657)で精製した。ADCCアッセイでは、50μLアッセイバッファー(1%のFBS(Gibco,カタログ番号10099-141)を含む99%MEM-α(Gibco,カタログ番号41061-029))中の20,000細胞/ウェルのin vitro誘導Treg細胞を、96ウェルアッセイプレート(Corning,カタログ番号3599)に添加した。50μL/ウェルのhu3-Eまたはhu32-Cの6点段階希釈(段階希釈、最終アッセイ濃度は1.2μg/mLから開始し、5倍希釈)および抗TNFR2抗体-001-H10(BioInvent、WO2020089474A1、重鎖:配列番号74、軽鎖:配列番号75)を、コントロールとしてそれぞれ細胞に添加した。次に、1%FBS(Gibco,カタログ番号10099-141)を含む100μL99%MEM-α(カタログ番号41061-029)と200IU/mLヒト組み換えIL-2アッセイバッファー中の200,000細胞/ウェルの精製ヒトNKエフェクタ細胞を、各ウェルに添加した。96ウェルプレートを37℃,5%CO2で24時間インキュベートした。インキュベーション後、96ウェルプレートを3分間低速(2000rpm)で遠心分離し、細胞ペレットを沈殿させた。その後、50μL/wellの上清をプレートから慎重に吸引し、新しい96ウェルプレートに移した。同量のLDH細胞毒性検出溶液(Roche,カタログ番号11644793001)をプレートに加え、室温で30分間インキュベートした。波長490nmのInfinite F50プレートリーダーにより吸光度を読み取った。その結果を図13に示した。
これらの結果は、hu3-Eは誘導Treg細胞に対してADCC効果を誘導できず、hu32-Cは細胞に対してADCC効果を誘導できることを示した。
実施例17:CD8+T細胞に対するインビトロでのADCC効果
実施例17:CD8+T細胞に対するインビトロでのADCC効果
96ウェルプレート(Corning,カタログ番号3599)を4℃で一晩、1μg/mLの機能グレード抗CD3(eBioscience,カタログ番号16-0037-85)でコーティングした。翌日、コートされたバッファーを廃棄し、後で使用するためにプレートを2回洗浄した。Schbio Biotechから購入した健康なドナーからのPBMC細胞を解凍して採取した。PBMC細胞からの全CD8+T細胞をメーカーの指示に従ってネガティブセレクションキット(Miltenyi,カタログ番号130-096-495)で精製した。そして、精製されたCD8+T細胞を、200μLアッセイバッファー(10%FBS、1μg/mL抗CD28を含むRPMI1640)中の1×105細胞/ウェルで、抗CD3コーティング96ウェルプレートにメッキし、4日間培養した。
PBMC細胞からの全NK細胞を、メーカーの指示に従い、ネガティブセレクションキット(Miltenyi,カタログ番号130-092-657)で精製した。ADCCアッセイでは、50μLアッセイバッファー(1%のFBS(Gibco,カタログ番号10099-141)を含む99%MEM-α(Gibco,カタログ番号41061-029))中の15,000細胞/ウェルのin vitro活性化CD8+T細胞を、96ウェルアッセイプレート(Corning,カタログ番号3599)に添加した。50μL/ウェルのhu3-Eまたはhu32-Cの6点段階希釈(段階希釈、最終アッセイ濃度は1.2μg/mLから開始し、5倍希釈)および抗TNFR2抗体-001-H10(BioInvent、WO2020089474A1、重鎖:配列番号74、軽鎖:配列番号75)を、コントロールとしてそれぞれ細胞に添加した。次に、1%FBS(Gibco,カタログ番号10099-141)を含む100μL99%MEM-α(カタログ番号41061-029)と200IU/mLヒト組み換えIL-2アッセイバッファー中の150,000細胞/ウェルの精製ヒトNKエフェクタ細胞を、各ウェルに添加した。96ウェルプレートを37℃,5%CO2で24時間インキュベートした。インキュベーション後、96ウェルプレートを3分間低速(2000rpm)で遠心分離し、細胞ペレットを沈殿させた。その後、50μL/wellの上清をプレートから慎重に吸引し、新しい96ウェルプレートに移した。同量のLDH細胞毒性検出溶液(Roche,カタログ番号11644793001)をプレートに加え、室温で30分間インキュベートした。波長490nmのInfinite F50プレートリーダーにより吸光度を読み取った。その結果を図14に示した。
結果によれば、hu32-CがADCC効果を誘導できる一方で、hu3-Eは誘導されたCD8+T細胞に対してADCC効果を誘導できないことが分かった。
配列表
Ig blastおよびabysisによって分析された配列であり、結果はKabat形式で表される。
キメラ抗体配列
32A1D5の配列
>32A1D5-VH:配列番号7
QVTLKESGPGILQPSQTLSLTCSFSGFSLNTLGMGVGWIRQPSGKGLEWLAHIWWDADKYYNPALKSRLTISKDTSKNHVFLKIANADTADTATYYCARMTGTRYFDVWGTGTTVTVSS
>32A1D5-VL:配列番号8
DIQMTQSPSSLSASLGDKVTITCKASQNINKFIAWYQHKPGEGPRLLIHYTSTLQPGIPSRFSGSGSGSDYSFSINNLEPEDIASYYCLQYGVLWTFGGGTKLEIK
43B7A4の配列
>43B7A4-VH:配列番号15
QAQIQLVQSGPELKKPGETVKISCKASGYTFTTYGMSWVKQAPGKGLKWMGWIHTYSGVPTYADDFKGRFAFSLETSASTAFLQINNLKNEDTATYFCARGLYGVDYWGQGTTLTVSS
>43B7A4-VL:配列番号16
NIVMTQSPKSMSMSVGERVTLSCKASENVVTYVSWYQQKPEQSPKLLIYGASNRYTGVPDRFTGSGSATDFTLTISSVQAEDLADYHCGQSYTYPYTFGGGTTLEIK
hu32-Cの配列(Hu32-H1/Hu32-L3)
>VH核酸配列(Hu32-H1):配列番号23
CAGGTGACACTGAAGGAGTCTGGCCCAACCCTGGTGAAGCCCACCCAGACACTGACCCTGACATGTACCTTCTCTGGCTTTTCTCTGTCCACCCTGGGAATGGGAGTGGGATGGATCAGACAGCCACCTGGCAAGGCCCTGGAGTGGCTGGCTCACATCTGGTGGGACGCCGATAAGTACTATAATCCTGCTCTGAAGTCCCGCCTGACAATCACCAAGGACACAAGCAAGAACCAGGTGGTGCTGACAATGACCAATATGGACCCAGTGGATACAGCCACCTACTATTGCGCTAGGATGACAGGCACCCGGTATTTCGACGTGTGGGGCCAGGGCACCACAGTGACCGTGTCCAGC
>VL核酸配列(Hu32-L3):配列番号24
GACATCCAGATGACACAGAGCCCATCCAGCCTGTCCGCCTCCGTGGGCGACAGGGTGACCATCACATGCAAGGCCTCCCAGAACATCAATAAGTTTATCGCTTGGTACCAGCAGAAGCCAGGCAAGGTGCCCAAGCTGCTGATCCACTATACCAGCACACTGCAGCCCGGCGTGCCTTCTAGGTTCTCCGGCAGCGGCTCTGGCTCCGACTACACCCTGACAATCTCTTCCCTGCAGCCTGAGGATGTGGCCACCTACTATTGTCTGCAGTATGGCGTGCTGTGGACCTTTGGCGGCGGCACAAAGGTGGAGATCAAG
>hu32-C(Hu32-H1/Hu32-L3)
>VHアミノ酸配列(Hu32-H1):配列番号25
QVTLKESGPTLVKPTQTLTLTCTFSGFSLSTLGMGVGWIRQPPGKALEWLAHIWWDADKYYNPALKSRLTITKDTSKNQVVLTMTNMDPVDTATYYCARMTGTRYFDVWGQGTTVTVSS
>VLアミノ酸配列(Hu32-L3):配列番号26
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKASQNINKFIAWYQQKPGKVPKLLIHYTSTLQPGVPSRFSGSGSGSDYTLTISSLQPEDVATYYCLQYGVLWTFGGGTKVEIK
配列hu32C-V1(Hu32-H1/Hu32-L2V)(Igblastおよびabysisにより解析され、Kabat形式で表された結果)
>hu32C-V1(Hu32-H1/Hu32-L2V)
VH核酸配列(Hu32-H1):配列番号23
CAGGTGACACTGAAGGAGTCTGGCCCAACCCTGGTGAAGCCCACCCAGACACTGACCCTGACATGTACCTTCTCTGGCTTTTCTCTGTCCACCCTGGGAATGGGAGTGGGATGGATCAGACAGCCACCTGGCAAGGCCCTGGAGTGGCTGGCTCACATCTGGTGGGACGCCGATAAGTACTATAATCCTGCTCTGAAGTCCCGCCTGACAATCACCAAGGACACAAGCAAGAACCAGGTGGTGCTGACAATGACCAATATGGACCCAGTGGATACAGCCACCTACTATTGCGCTAGGATGACAGGCACCCGGTATTTCGACGTGTGGGGCCAGGGCACCACAGTGACCGTGTCCAGC
>VL核酸配列(Hu32-L2V):配列番号27
GACATCCAGATGACACAGAGCCCATCCAGCCTGTCCGCCTCCGTGGGCGATCGGGTGACCATCACATGCAAGGCCTCCCAGAACATCAATAAGTTTATCGCTTGGTACCAGCACAAGCCAGGCAAGGTGCCCAAGCTGCTGATCCATTATACCAGCACACTGCAGCCCGGCGTGCCTTCTAGGTTCTCCGGCAGCGGCTCTGGCTCCGACTACACCCTGACAATCTCTTCCCTGCAGCCTGAGGATGTGGCCACCTACTATTGTCTGCAGTATGGCGTGCTGTGGACCTTTGGCGGCGGCACAAAGGTGGAGATCAAG
>VHアミノ酸配列(Hu32-H1):配列番号25
QVTLKESGPTLVKPTQTLTLTCTFSGFSLSTLGMGVGWIRQPPGKALEWLAHIWWDADKYYNPALKSRLTITKDTSKNQVVLTMTNMDPVDTATYYCARMTGTRYFDVWGQGTTVTVSS
>VLアミノ酸配列(Hu32-L2V):配列番号28
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKASQNINKFIAWYQHKPGKVPKLLIHYTSTLQPGVPSRFSGSGSGSDYTLTISSLQPEDVATYYCLQYGVLWTFGGGTKVEIK
hu3-E(Hu3-H3/Hu3-L1)(Igblastおよびabysisで解析、結果はKabat形式で記述)およびHu3-E(mu)((Hu3-H3/Hu3-L1、Fc領域でのみ変異、変異L234A,L235A,D265A,P329A(Euナンバリング))の配列
>VH核酸配列(Hu3-H3):配列番号35
CAGATCCAGCTGGTGCAGAGCGGAGCTGAGGTGAAGAAGCCAGGAGCTTCCGTGAAGGTGAGCTGTAAGGCCTCTGGCTACACATTCACCACATATGGCATGTCTTGGGTGAGACAGGCTCCAGGACAGGGACTGGAGTGGATGGGCTGGATTCACACATACTCCGGCGTGCCTACCTATGCCGACGACTTCAAGGGCCGCTTCGCTTTTACACTGGACACCTCTACATCCACCGCCTATATGGAGCTGAGGAGCCTGCGGTCTGACGATACCGCCGTGTACTATTGCGCTAGGGGCCTGTACGGCGTGGATTATTGGGGCCAGGGCACACTGGTGACCGTGTCCAGC
>VL核酸配列(Hu3-L1):配列番号36
GAGATCGTGATGACCCAGAGCCCAGCTACACTGTCTCTGTCCCCAGGAGAGAGGGCCACCCTGAGCTGCAAGGCTTCTGAGAACGTGGTGACATACGTGTCCTGGTACCAGCAGAAGCCAGGACAGGCTCCTAGGCTGCTGATCTATGGCGCTTCCAATAGGTACACCGGCATCCCAGCTCGGTTTAGCGGCTCTGGCTCCGCTACAGACTTCACCCTGACAATCTCCAGCCTGCAGCCCGAGGATTTTGCCGTGTACTATTGTGGCCAGTCTTACACCTATCCTTACACATTCGGCCAGGGCACAAAGCTGGAGATCAAG
>VHアミノ酸配列(Hu3-H3):配列番号37
QIQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTTYGMSWVRQAPGQGLEWMGWIHTYSGVPTYADDFKGRFAFTLDTSTSTAYMELRSLRSDDTAVYYCARGLYGVDYWGQGTLVTVSS
>VLアミノ酸配列(Hu3-L1):配列番号38
EIVMTQSPATLSLSPGERATLSCKASENVVTYVSWYQQKPGQAPRLLIYGASNRYTGIPARFSGSGSATDFTLTISSLQPEDFAVYYCGQSYTYPYTFGQGTKLEIK
キメラ抗体32A1D5および43B7A4、ならびにヒト化抗体hu32-C(Hu32-H1/Hu32-L3)hu32C-V1(Hu32-H1/Hu32-L2V)およびhu3-E(Hu3-H3/Hu3-L1):P01857 https://www.uniprot.org/uniprot/P01857
>CH核酸配列:配列番号39
GCCAGCACCAAGGGACCATCCGTGTTCCCACTGGCCCCCTCCAGCAAGTCCACCAGCGGAGGAACAGCCGCTCTGGGATGCCTGGTGAAGGACTACTTCCCAGAGCCCGTGACAGTGAGCTGGAACTCTGGCGCCCTGACCAGCGGAGTGCACACATTTCCCGCCGTGCTCCAGTCTTCCGGCCTGTACTCTCTGAGCTCTGTGGTGACCGTGCCCTCCAGCTCTCTGGGCACCCAGACATATATCTGCAACGTGAATCACAAGCCAAGCAATACAAAGGTGGACAAGAAGGTGGAGCCCAAGTCTTGTGATAAGACCCATACATGCCCCCCTTGTCCTGCTCCAGAGCTGCTGGGAGGACCAAGCGTGTTCCTGTTTCCACCCAAGCCTAAGGACACCCTGATGATCTCCAGGACCCCCGAGGTGACATGCGTGGTGGTGGACGTGAGCCACGAGGACCCCGAGGTGAAGTTTAACTGGTACGTGGATGGCGTGGAGGTGCATAATGCTAAGACCAAGCCTAGGGAGGAGCAGTACAACTCTACCTATCGGGTGGTGTCCGTGCTGACAGTGCTGCACCAGGACTGGCTGAACGGCAAGGAGTATAAGTGCAAGGTGTCTAATAAGGCCCTGCCCGCTCCTATCGAGAAGACCATCTCCAAGGCCAAGGGCCAGCCTAGAGAGCCACAGGTGTACACACTGCCTCCATCTCGCGACGAGCTGACCAAGAACCAGGTGTCCCTGACATGTCTGGTGAAGGGCTTCTATCCTTCCGACATCGCTGTGGAGTGGGAGAGCAACGGCCAGCCAGAGAACAATTACAAGACCACACCCCCTGTGCTGGACTCCGATGGCAGCTTCTTTCTGTATAGCAAGCTGACCGTGGATAAGTCCAGGTGGCAGCAGGGCAACGTGTTTTCTTGCTCCGTGATGCATGAGGCTCTGCACAATCATTATACACAGAAGAGCCTGTCTCTGTCCCCTGGCAAGTAA
>CHアミノ酸配列:配列番号40
ASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK*
CH for hu3-E(mu) (Hu3-H3 /Hu3-L1)
>CHアミノ酸配列:配列番号73
ASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVAVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALAAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK*
キメラ抗体32A1D5および43B7A4、ならびにヒト化抗体 hu32-C(Hu32-H1/Hu32-L3)hu32C-V1(Hu32-H1/Hu32-L2V)およびhu3-E(Hu3-H3/Hu3-L1)およびHu3-E(mu)(Hu3-H3/Hu3-L1):P01834 https://www.uniprot.org/uniprot/P01834
>CL核酸配列:配列番号41
CGGACGGTGGCTGCACCATCTGTCTTCATCTTCCCGCCATCTGATGAGCAGTTGAAATCTGGAACTGCCTCTGTTGTGTGCCTGCTGAATAACTTCTACCCCAGAGAAGCCAAAGTGCAGTGGAAGGTGGACAACGCCCTGCAGAGCGGAAACAGCCAGGAAAGCGTGACAGAGCAGGATTCCAAGGATTCCACATACAGCCTGAGCAGCACACTGACACTGTCCAAGGCCGACTACGAGAAGCACAAGGTGTACGCCTGCGAAGTGACACACCAGGGACTGTCCTCCCCTGTGACAAAGAGCTTCAACAGAGGAGAATGCTAA
>CLアミノ酸配列:配列番号42
RTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC*
IgG(ネガティブコントロール)
WO2008068246A1 フォラビルマブ
>重鎖アミノ酸配列:配列番号43
QVQLVESGGGAVQPGRSLRLSCAASGFTFSSYGMHWVRQAPGKGLEWVAVILYDGSDKFYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAKVAVAGTHFDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPG
>軽鎖アミノ酸配列:配列番号44
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQGIRNDLGWYQQKPGKAPKLLIYAASSLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQLNSYPPTFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
huTNFR2アミノ酸配列
>huTNFR2-mFcアミノ酸配列:配列番号45
MAPVAVWAALAVGLELWAAAHALPAQVAFTPYAPEPGSTCRLREYYDQTAQMCCSKCSPGQHAKVFCTKTSDTVCDSCEDSTYTQLWNWVPECLSCGSRCSSDQVETQACTREQNRICTCRPGWYCALSKQEGCRLCAPLRKCRPGFGVARPGTETSDVVCKPCAPGTFSNTTSSTDICRPHQICNVVAIPGNASMDAVCTSTSPTRSMAPGAVHLPQPVSTRSQHTQPTPEPSTAPSTSFLLPMGPSPPAEGSTGD
GCKPCICTVPEVSSVFIFPPKPKDVLTITLTPKVTCVVVAISKDDPEVQFSWFVDDVEVHTAQTQPREEQFNSTFRSVSELPIMHQDWLNGKEFKCRVNSAAFPAPIEKTISKTKGRPKAPQVYTIPPPKEQMAKDKVSLTCMITDFFPEDITVEWQWNGQPAENYKNTQPIMNTNGSYFVYSKLNVQKSNWEAGNTFTCSVLHEGLHNHHTEKSLSHSPGK
>huTNFR2-huFcアミノ酸配列:配列番号46
MAPVAVWAALAVGLELWAAAHALPAQVAFTPYAPEPGSTCRLREYYDQTAQMCCSKCSPGQHAKVFCTKTSDTVCDSCEDSTYTQLWNWVPECLSCGSRCSSDQVETQACTREQNRICTCRPGWYCALSKQEGCRLCAPLRKCRPGFGVARPGTETSDVVCKPCAPGTFSNTTSSTDICRPHQICNVVAIPGNASMDAVCTSTSPTRSMAPGAVHLPQPVSTRSQHTQPTPEPSTAPSTSFLLPMGPSPPAEGSTGD
DKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK-
>cyno-TNFR2-huFcアミノ酸配列:配列番号47
MAPAAVWAALAVGLELWAAGHALPAQVAFTPYAPEPGGTCRLREYYDQTAQMCCSKCPPGQHAKVFCTKTSDTVCDSCEDSTYTQLWNWVPECLSCGSRCSSDQVETQACTREQNRICTCRPGWYCALSKQEGCRLCAQLRKCRPGFGVARPGTETSDVVCKPCAPGTFSNTTSSTDICRPHQICHVVAIPGNASMDAVCTSTSPTRSMAPGAVHLPQPVSTRSQHTQPTPAPSTAPGTSFLLPVGPSPPAEGSTGD
DKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK-
細胞スクリーニングおよび細胞免疫のための発現配列
>HuTNFR2:配列番号48
MAPVAVWAALAVGLELWAAAHALPAQVAFTPYAPEPGSTCRLREYYDQTAQMCCSKCSPGQHAKVFCTKTSDTVCDSCEDSTYTQLWNWVPECLSCGSRCSSDQVETQACTREQNRICTCRPGWYCALSKQEGCRLCAPLRKCRPGFGVARPGTETSDVVCKPCAPGTFSNTTSSTDICRPHQICNVVAIPGNASMDAVCTSTSPTRSMAPGAVHLPQPVSTRSQHTQPTPEPSTAPSTSFLLPMGPSPPAEGSTGDFALPVGLIVGVTALGLLIIGVVNCVIMTQVKKKPLCLQREAKVPHLPADKARGTQGPEQQHLLITAPSSSSSSLESSASALDRRAPTRNQPQAPGVEASGAGEARASTGSSDSSPGGHGTQVNVTCIVNVCSSSDHSSQCSSQASSTMGDTDSSPSESPKDEQVPFSKEECAFRSQLETPETLLGSTEEKPLPLGVPDAGMKPS-
>CynoTNFR2:配列番号49
MAPAAVWAALAVGLELWAAGHALPAQVAFTPYAPEPGGTCRLREYYDQTAQMCCSKCPPGQHAKVFCTKTSDTVCDSCEDSTYTQLWNWVPECLSCGSRCSSDQVETQACTREQNRICTCRPGWYCALSKQEGCRLCAQLRKCRPGFGVARPGTETSDVVCKPCAPGTFSNTTSSTDICRPHQICHVVAIPGNASMDAVCTSTSPTRSMAPGAVHLPQPVSTRSQHTQPTPAPSTAPGTSFLLPVGPSPPAEGSTGDIVLPVGLIVGVTALGLLIIGVVNCVI-
抗ヒトTNFR2抗体エピトープマッピング
(シグナルペプチドには下線が引かれている)
>ヒトTNFR2の細胞外領域:配列番号50
MAPVAVWAALAVGLELWAAAHALPAQVAFTPYAPEPGSTCRLREYYDQTAQMCCSKCSPGQHAKVFCTKTSDTVCDSCEDSTYTQLWNWVPECLSCGSRCSSDQVETQACTREQNRICTCRPGWYCALSKQEGCRLCAPLRKCRPGFGVARPGTETSDVVCKPCAPGTFSNTTSSTDICRPHQICNVVAIPGNASMDAVCTSTSPTRSMAPGAVHLPQPVSTRSQHTQPTPEPSTAPSTSFLLPMGPSPPAEGSTGD
>マウスTNFR2の細胞外領域:配列番号51
MAPAALWVALVFELQLWATGHTVPAQVVLTPYKPEPGYECQISQEYYDRKAQMCCAKCPPGQYVKHFCNKTSDTVCADCEASMYTQVWNQFRTCLSCSSSCTTDQVEIRACTKQQNRVCACEAGRYCALKTHSGSCRQCMRLSKCGPGFGVASSRAPNGNVLCKACAPGTFSDTTSSTDVCRPHRICSILAIPGNASTDAVCAPESPTLSAIPRTLYVSQPEPTRSQPLDQEPGPSQTPSILTSLGSTPIIEQSTKGG
>019-1:配列番号52
MYLGLNCVFIVFLLKGVQSVPAQVVLTPYKPEPGYTCRLREYYDQTAQMCCSKCSPGQHAKVFCTKTSDTVCDDCEASMYTQVWNQFRTCLSCSSSCTTDQVEIRACTKQQNRVCACEAGRYCALKTHSGSCRQCMRLSKCGPGFGVASSRAPNGNVLCKACAPGTFSDTTSSTDVCRPHRICSILAIPGNASTDAVCAPESPTLSAIPRTLYVSQPEPTRSQPLDQEPGPSQTPSILTSLGSTPIIEQSTKGGDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK*
>019-2:配列番号53
MYLGLNCVFIVFLLKGVQSVPAQVVLTPYKPEPGYECQISQEYYDRKAQMCCAKCPPGQYVKHFCNKTSDTVCASCEDSTYTQLWNWVPECLSCGSRCSSDQVETQACTREQNRICACEAGRYCALKTHSGSCRQCMRLSKCGPGFGVASSRAPNGNVLCKACAPGTFSDTTSSTDVCRPHRICSILAIPGNASTDAVCAPESPTLSAIPRTLYVSQPEPTRSQPLDQEPGPSQTPSILTSLGSTPIIEQSTKGGDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK*
>019-3:配列番号54
MYLGLNCVFIVFLLKGVQSVPAQVVLTPYKPEPGYECQISQEYYDRKAQMCCAKCPPGQYVKHFCNKTSDTVCADCEASMYTQVWNQFRTCLSCSSSCTTDQVEIRACTKQQNRVCTCRPGWYCALSKQEGCRLCAPLRKCRPGFGVARPGTETSDVVCKACAPGTFSDTTSSTDVCRPHRICSILAIPGNASTDAVCAPESPTLSAIPRTLYVSQPEPTRSQPLDQEPGPSQTPSILTSLGSTPIIEQSTKGGDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK*
>019-4:配列番号55
MYLGLNCVFIVFLLKGVQSVPAQVVLTPYKPEPGYECQISQEYYDRKAQMCCAKCPPGQYVKHFCNKTSDTVCADCEASMYTQVWNQFRTCLSCSSSCTTDQVEIRACTKQQNRVCACEAGRYCALKTHSGSCRQCMRLSKCGPGFGVASSRAPNGNVLCKPCAPGTFSNTTSSTDICRPHQICNVVAIPGNASMDAVCTPESPTLSAIPRTLYVSQPEPTRSQPLDQEPGPSQTPSILTSLGSTPIIEQSTKGGDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK*
>019-5:配列番号56
MYLGLNCVFIVFLLKGVQSVPAQVVLTPYKPEPGYECQISQEYYDRKAQMCCAKCPPGQHAKVFCTKTSDTVCDSCEDSTYTQLWNWVPECLSCSSSCTTDQVEIRACTKQQNRVCACEAGRYCALKTHSGSCRQCMRLSKCGPGFGVASSRAPNGNVLCKACAPGTFSDTTSSTDVCRPHRICSILAIPGNASTDAVCAPESPTLSAIPRTLYVSQPEPTRSQPLDQEPGPSQTPSILTSLGSTPIIEQSTKGGDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK*
>019-6:配列番号57
MYLGLNCVFIVFLLKGVQSVPAQVVLTPYKPEPGYECQISQEYYDRKAQMCCAKCPPGQYVKHFCNKTSDTVCADCEASMYTQVWNQFRTCLSCGSRCSSDQVETQACTREQNRICTCRPGWYCALSKQEGCRLCAPLRKCGPGFGVASSRAPNGNVLCKACAPGTFSDTTSSTDVCRPHRICSILAIPGNASTDAVCAPESPTLSAIPRTLYVSQPEPTRSQPLDQEPGPSQTPSILTSLGSTPIIEQSTKGGDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK*
>019-0-0.5:配列番号58
MYLGLNCVFIVFLLKGVQSLPAQVAFTPYAPEPGSTCRLREYYDQTAQMCCAKCPPGQYVKHFCNKTSDTVCADCEASMYTQVWNQFRTCLSCSSSCTTDQVEIRACTKQQNRVCACEAGRYCALKTHSGSCRQCMRLSKCGPGFGVASSRAPNGNVLCKACAPGTFSDTTSSTDVCRPHRICSILAIPGNASTDAVCAPESPTLSAIPRTLYVSQPEPTRSQPLDQEPGPSQTPSILTSLGSTPIIEQSTKGGDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK*
>019-0-1:配列番号59
MYLGLNCVFIVFLLKGVQSLPAQVAFTPYAPEPGSTCRLREYYDQTAQMCCSKCSPGQHAKVFCTKTSDTVCDDCEASMYTQVWNQFRTCLSCSSSCTTDQVEIRACTKQQNRVCACEAGRYCALKTHSGSCRQCMRLSKCGPGFGVASSRAPNGNVLCKACAPGTFSDTTSSTDVCRPHRICSILAIPGNASTDAVCAPESPTLSAIPRTLYVSQPEPTRSQPLDQEPGPSQTPSILTSLGSTPIIEQSTKGGDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK*
>019-0.5-1:配列番号60
MYLGLNCVFIVFLLKGVQSVPAQVVLTPYKPEPGYTCRLREYYDQTAQMCCAKCPPGQYVKHFCNKTSDTVCADCEASMYTQVWNQFRTCLSCSSSCTTDQVEIRACTKQQNRVCACEAGRYCALKTHSGSCRQCMRLSKCGPGFGVASSRAPNGNVLCKACAPGTFSDTTSSTDVCRPHRICSILAIPGNASTDAVCAPESPTLSAIPRTLYVSQPEPTRSQPLDQEPGPSQTPSILTSLGSTPIIEQSTKGGDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK*
>019-0-0.5-2:配列番号61
MYLGLNCVFIVFLLKGVQSLPAQVAFTPYAPEPGSECQISQEYYDRKAQMCCAKCPPGQYVKHFCNKTSDTVCADCEASMYTQVWNQFRTCLSCSSSCTTDQVEIRACTKQQNRVCACEAGRYCALKTHSGSCRQCMRLSKCGPGFGVASSRAPNGNVLCKACAPGTFSDTTSSTDVCRPHRICSILAIPGNASTDAVCAPESPTLSAIPRTLYVSQPEPTRSQPLDQEPGPSQTPSILTSLGSTPIIEQSTKGGDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK*
>019-12:配列番号62
MAPVAVWAALAVGLELWAAAHALPAQVAFTPYAPEPGSTCRLREYYDQTAQMCCSKCSPGQHAKVFCTKTSDTVCDSCEDSTYTQLWNWVPECLSCGSRCSSDQVETQACTREQNRICACEAGRYCALKTHSGSCRQCMRLSKCGPGFGVASSRAPNGNVLCKACAPGTFSDTTSSTDVCRPHRICSILAIPGNASTDAVCAPESPTLSAIPRTLYVSQPEPTRSQPLDQEPGPSQTPSILTSLGSTPIIEQSTKGGDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK*
>抗TNFR2抗体-001-H10
重鎖:配列番号74
EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFDDYGMSWVRQAPGKGLEWVSVIYSGGSTYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARDRSSSWYRDGMDVWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK*
軽鎖:配列番号75
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCTGSSSNIGAGYDVHWYQQLPGTAPKLLIYGNSNRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLRSEDEADYYCAAWDDSLSGWVFGGGTKLTVLGRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC*
配列表
Ig blastおよびabysisによって分析された配列であり、結果はKabat形式で表される。
キメラ抗体配列
32A1D5の配列
>32A1D5-VH:配列番号7
QVTLKESGPGILQPSQTLSLTCSFSGFSLNTLGMGVGWIRQPSGKGLEWLAHIWWDADKYYNPALKSRLTISKDTSKNHVFLKIANADTADTATYYCARMTGTRYFDVWGTGTTVTVSS
>32A1D5-VL:配列番号8
DIQMTQSPSSLSASLGDKVTITCKASQNINKFIAWYQHKPGEGPRLLIHYTSTLQPGIPSRFSGSGSGSDYSFSINNLEPEDIASYYCLQYGVLWTFGGGTKLEIK
43B7A4の配列
QAQIQLVQSGPELKKPGETVKISCKASGYTFTTYGMSWVKQAPGKGLKWMGWIHTYSGVPTYADDFKGRFAFSLETSASTAFLQINNLKNEDTATYFCARGLYGVDYWGQGTTLTVSS
>43B7A4-VL:配列番号16
NIVMTQSPKSMSMSVGERVTLSCKASENVVTYVSWYQQKPEQSPKLLIYGASNRYTGVPDRFTGSGSATDFTLTISSVQAEDLADYHCGQSYTYPYTFGGGTTLEIK
hu32-Cの配列(Hu32-H1/Hu32-L3)
CAGGTGACACTGAAGGAGTCTGGCCCAACCCTGGTGAAGCCCACCCAGACACTGACCCTGACATGTACCTTCTCTGGCTTTTCTCTGTCCACCCTGGGAATGGGAGTGGGATGGATCAGACAGCCACCTGGCAAGGCCCTGGAGTGGCTGGCTCACATCTGGTGGGACGCCGATAAGTACTATAATCCTGCTCTGAAGTCCCGCCTGACAATCACCAAGGACACAAGCAAGAACCAGGTGGTGCTGACAATGACCAATATGGACCCAGTGGATACAGCCACCTACTATTGCGCTAGGATGACAGGCACCCGGTATTTCGACGTGTGGGGCCAGGGCACCACAGTGACCGTGTCCAGC
>VL核酸配列(Hu32-L3):配列番号24
GACATCCAGATGACACAGAGCCCATCCAGCCTGTCCGCCTCCGTGGGCGACAGGGTGACCATCACATGCAAGGCCTCCCAGAACATCAATAAGTTTATCGCTTGGTACCAGCAGAAGCCAGGCAAGGTGCCCAAGCTGCTGATCCACTATACCAGCACACTGCAGCCCGGCGTGCCTTCTAGGTTCTCCGGCAGCGGCTCTGGCTCCGACTACACCCTGACAATCTCTTCCCTGCAGCCTGAGGATGTGGCCACCTACTATTGTCTGCAGTATGGCGTGCTGTGGACCTTTGGCGGCGGCACAAAGGTGGAGATCAAG
>hu32-C(Hu32-H1/Hu32-L3)
>VHアミノ酸配列(Hu32-H1):配列番号25
QVTLKESGPTLVKPTQTLTLTCTFSGFSLSTLGMGVGWIRQPPGKALEWLAHIWWDADKYYNPALKSRLTITKDTSKNQVVLTMTNMDPVDTATYYCARMTGTRYFDVWGQGTTVTVSS
>VLアミノ酸配列(Hu32-L3):配列番号26
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKASQNINKFIAWYQQKPGKVPKLLIHYTSTLQPGVPSRFSGSGSGSDYTLTISSLQPEDVATYYCLQYGVLWTFGGGTKVEIK
配列hu32C-V1(Hu32-H1/Hu32-L2V)(Igblastおよびabysisにより解析され、Kabat形式で表された結果)
VH核酸配列(Hu32-H1):配列番号23
CAGGTGACACTGAAGGAGTCTGGCCCAACCCTGGTGAAGCCCACCCAGACACTGACCCTGACATGTACCTTCTCTGGCTTTTCTCTGTCCACCCTGGGAATGGGAGTGGGATGGATCAGACAGCCACCTGGCAAGGCCCTGGAGTGGCTGGCTCACATCTGGTGGGACGCCGATAAGTACTATAATCCTGCTCTGAAGTCCCGCCTGACAATCACCAAGGACACAAGCAAGAACCAGGTGGTGCTGACAATGACCAATATGGACCCAGTGGATACAGCCACCTACTATTGCGCTAGGATGACAGGCACCCGGTATTTCGACGTGTGGGGCCAGGGCACCACAGTGACCGTGTCCAGC
>VL核酸配列(Hu32-L2V):配列番号27
GACATCCAGATGACACAGAGCCCATCCAGCCTGTCCGCCTCCGTGGGCGATCGGGTGACCATCACATGCAAGGCCTCCCAGAACATCAATAAGTTTATCGCTTGGTACCAGCACAAGCCAGGCAAGGTGCCCAAGCTGCTGATCCATTATACCAGCACACTGCAGCCCGGCGTGCCTTCTAGGTTCTCCGGCAGCGGCTCTGGCTCCGACTACACCCTGACAATCTCTTCCCTGCAGCCTGAGGATGTGGCCACCTACTATTGTCTGCAGTATGGCGTGCTGTGGACCTTTGGCGGCGGCACAAAGGTGGAGATCAAG
>VHアミノ酸配列(Hu32-H1):配列番号25
QVTLKESGPTLVKPTQTLTLTCTFSGFSLSTLGMGVGWIRQPPGKALEWLAHIWWDADKYYNPALKSRLTITKDTSKNQVVLTMTNMDPVDTATYYCARMTGTRYFDVWGQGTTVTVSS
>VLアミノ酸配列(Hu32-L2V):配列番号28
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKASQNINKFIAWYQHKPGKVPKLLIHYTSTLQPGVPSRFSGSGSGSDYTLTISSLQPEDVATYYCLQYGVLWTFGGGTKVEIK
hu3-E(Hu3-H3/Hu3-L1)(Igblastおよびabysisで解析、結果はKabat形式で記述)およびHu3-E(mu)((Hu3-H3/Hu3-L1、Fc領域でのみ変異、変異L234A,L235A,D265A,P329A(Euナンバリング))の配列
>VH核酸配列(Hu3-H3):配列番号35
CAGATCCAGCTGGTGCAGAGCGGAGCTGAGGTGAAGAAGCCAGGAGCTTCCGTGAAGGTGAGCTGTAAGGCCTCTGGCTACACATTCACCACATATGGCATGTCTTGGGTGAGACAGGCTCCAGGACAGGGACTGGAGTGGATGGGCTGGATTCACACATACTCCGGCGTGCCTACCTATGCCGACGACTTCAAGGGCCGCTTCGCTTTTACACTGGACACCTCTACATCCACCGCCTATATGGAGCTGAGGAGCCTGCGGTCTGACGATACCGCCGTGTACTATTGCGCTAGGGGCCTGTACGGCGTGGATTATTGGGGCCAGGGCACACTGGTGACCGTGTCCAGC
>VL核酸配列(Hu3-L1):配列番号36
GAGATCGTGATGACCCAGAGCCCAGCTACACTGTCTCTGTCCCCAGGAGAGAGGGCCACCCTGAGCTGCAAGGCTTCTGAGAACGTGGTGACATACGTGTCCTGGTACCAGCAGAAGCCAGGACAGGCTCCTAGGCTGCTGATCTATGGCGCTTCCAATAGGTACACCGGCATCCCAGCTCGGTTTAGCGGCTCTGGCTCCGCTACAGACTTCACCCTGACAATCTCCAGCCTGCAGCCCGAGGATTTTGCCGTGTACTATTGTGGCCAGTCTTACACCTATCCTTACACATTCGGCCAGGGCACAAAGCTGGAGATCAAG
>VHアミノ酸配列(Hu3-H3):配列番号37
QIQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTTYGMSWVRQAPGQGLEWMGWIHTYSGVPTYADDFKGRFAFTLDTSTSTAYMELRSLRSDDTAVYYCARGLYGVDYWGQGTLVTVSS
>VLアミノ酸配列(Hu3-L1):配列番号38
EIVMTQSPATLSLSPGERATLSCKASENVVTYVSWYQQKPGQAPRLLIYGASNRYTGIPARFSGSGSATDFTLTISSLQPEDFAVYYCGQSYTYPYTFGQGTKLEIK
キメラ抗体32A1D5および43B7A4、ならびにヒト化抗体hu32-C(Hu32-H1/Hu32-L3)hu32C-V1(Hu32-H1/Hu32-L2V)およびhu3-E(Hu3-H3/Hu3-L1):P01857 https://www.uniprot.org/uniprot/P01857
>CH核酸配列:配列番号39
GCCAGCACCAAGGGACCATCCGTGTTCCCACTGGCCCCCTCCAGCAAGTCCACCAGCGGAGGAACAGCCGCTCTGGGATGCCTGGTGAAGGACTACTTCCCAGAGCCCGTGACAGTGAGCTGGAACTCTGGCGCCCTGACCAGCGGAGTGCACACATTTCCCGCCGTGCTCCAGTCTTCCGGCCTGTACTCTCTGAGCTCTGTGGTGACCGTGCCCTCCAGCTCTCTGGGCACCCAGACATATATCTGCAACGTGAATCACAAGCCAAGCAATACAAAGGTGGACAAGAAGGTGGAGCCCAAGTCTTGTGATAAGACCCATACATGCCCCCCTTGTCCTGCTCCAGAGCTGCTGGGAGGACCAAGCGTGTTCCTGTTTCCACCCAAGCCTAAGGACACCCTGATGATCTCCAGGACCCCCGAGGTGACATGCGTGGTGGTGGACGTGAGCCACGAGGACCCCGAGGTGAAGTTTAACTGGTACGTGGATGGCGTGGAGGTGCATAATGCTAAGACCAAGCCTAGGGAGGAGCAGTACAACTCTACCTATCGGGTGGTGTCCGTGCTGACAGTGCTGCACCAGGACTGGCTGAACGGCAAGGAGTATAAGTGCAAGGTGTCTAATAAGGCCCTGCCCGCTCCTATCGAGAAGACCATCTCCAAGGCCAAGGGCCAGCCTAGAGAGCCACAGGTGTACACACTGCCTCCATCTCGCGACGAGCTGACCAAGAACCAGGTGTCCCTGACATGTCTGGTGAAGGGCTTCTATCCTTCCGACATCGCTGTGGAGTGGGAGAGCAACGGCCAGCCAGAGAACAATTACAAGACCACACCCCCTGTGCTGGACTCCGATGGCAGCTTCTTTCTGTATAGCAAGCTGACCGTGGATAAGTCCAGGTGGCAGCAGGGCAACGTGTTTTCTTGCTCCGTGATGCATGAGGCTCTGCACAATCATTATACACAGAAGAGCCTGTCTCTGTCCCCTGGCAAGTAA
>CHアミノ酸配列:配列番号40
ASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK*
CH for hu3-E(mu) (Hu3-H3 /Hu3-L1)
>CHアミノ酸配列:配列番号73
ASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVAVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALAAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK*
キメラ抗体32A1D5および43B7A4、ならびにヒト化抗体 hu32-C(Hu32-H1/Hu32-L3)hu32C-V1(Hu32-H1/Hu32-L2V)およびhu3-E(Hu3-H3/Hu3-L1)およびHu3-E(mu)(Hu3-H3/Hu3-L1):P01834 https://www.uniprot.org/uniprot/P01834
>CL核酸配列:配列番号41
CGGACGGTGGCTGCACCATCTGTCTTCATCTTCCCGCCATCTGATGAGCAGTTGAAATCTGGAACTGCCTCTGTTGTGTGCCTGCTGAATAACTTCTACCCCAGAGAAGCCAAAGTGCAGTGGAAGGTGGACAACGCCCTGCAGAGCGGAAACAGCCAGGAAAGCGTGACAGAGCAGGATTCCAAGGATTCCACATACAGCCTGAGCAGCACACTGACACTGTCCAAGGCCGACTACGAGAAGCACAAGGTGTACGCCTGCGAAGTGACACACCAGGGACTGTCCTCCCCTGTGACAAAGAGCTTCAACAGAGGAGAATGCTAA
>CLアミノ酸配列:配列番号42
RTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC*
IgG(ネガティブコントロール)
WO2008068246A1 フォラビルマブ
>重鎖アミノ酸配列:配列番号43
QVQLVESGGGAVQPGRSLRLSCAASGFTFSSYGMHWVRQAPGKGLEWVAVILYDGSDKFYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAKVAVAGTHFDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPG
>軽鎖アミノ酸配列:配列番号44
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQGIRNDLGWYQQKPGKAPKLLIYAASSLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQLNSYPPTFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
huTNFR2アミノ酸配列
>huTNFR2-mFcアミノ酸配列:配列番号45
MAPVAVWAALAVGLELWAAAHALPAQVAFTPYAPEPGSTCRLREYYDQTAQMCCSKCSPGQHAKVFCTKTSDTVCDSCEDSTYTQLWNWVPECLSCGSRCSSDQVETQACTREQNRICTCRPGWYCALSKQEGCRLCAPLRKCRPGFGVARPGTETSDVVCKPCAPGTFSNTTSSTDICRPHQICNVVAIPGNASMDAVCTSTSPTRSMAPGAVHLPQPVSTRSQHTQPTPEPSTAPSTSFLLPMGPSPPAEGSTGD
GCKPCICTVPEVSSVFIFPPKPKDVLTITLTPKVTCVVVAISKDDPEVQFSWFVDDVEVHTAQTQPREEQFNSTFRSVSELPIMHQDWLNGKEFKCRVNSAAFPAPIEKTISKTKGRPKAPQVYTIPPPKEQMAKDKVSLTCMITDFFPEDITVEWQWNGQPAENYKNTQPIMNTNGSYFVYSKLNVQKSNWEAGNTFTCSVLHEGLHNHHTEKSLSHSPGK
>huTNFR2-huFcアミノ酸配列:配列番号46
MAPVAVWAALAVGLELWAAAHALPAQVAFTPYAPEPGSTCRLREYYDQTAQMCCSKCSPGQHAKVFCTKTSDTVCDSCEDSTYTQLWNWVPECLSCGSRCSSDQVETQACTREQNRICTCRPGWYCALSKQEGCRLCAPLRKCRPGFGVARPGTETSDVVCKPCAPGTFSNTTSSTDICRPHQICNVVAIPGNASMDAVCTSTSPTRSMAPGAVHLPQPVSTRSQHTQPTPEPSTAPSTSFLLPMGPSPPAEGSTGD
DKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK-
>cyno-TNFR2-huFcアミノ酸配列:配列番号47
MAPAAVWAALAVGLELWAAGHALPAQVAFTPYAPEPGGTCRLREYYDQTAQMCCSKCPPGQHAKVFCTKTSDTVCDSCEDSTYTQLWNWVPECLSCGSRCSSDQVETQACTREQNRICTCRPGWYCALSKQEGCRLCAQLRKCRPGFGVARPGTETSDVVCKPCAPGTFSNTTSSTDICRPHQICHVVAIPGNASMDAVCTSTSPTRSMAPGAVHLPQPVSTRSQHTQPTPAPSTAPGTSFLLPVGPSPPAEGSTGD
DKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK-
細胞スクリーニングおよび細胞免疫のための発現配列
>HuTNFR2:配列番号48
MAPVAVWAALAVGLELWAAAHALPAQVAFTPYAPEPGSTCRLREYYDQTAQMCCSKCSPGQHAKVFCTKTSDTVCDSCEDSTYTQLWNWVPECLSCGSRCSSDQVETQACTREQNRICTCRPGWYCALSKQEGCRLCAPLRKCRPGFGVARPGTETSDVVCKPCAPGTFSNTTSSTDICRPHQICNVVAIPGNASMDAVCTSTSPTRSMAPGAVHLPQPVSTRSQHTQPTPEPSTAPSTSFLLPMGPSPPAEGSTGDFALPVGLIVGVTALGLLIIGVVNCVIMTQVKKKPLCLQREAKVPHLPADKARGTQGPEQQHLLITAPSSSSSSLESSASALDRRAPTRNQPQAPGVEASGAGEARASTGSSDSSPGGHGTQVNVTCIVNVCSSSDHSSQCSSQASSTMGDTDSSPSESPKDEQVPFSKEECAFRSQLETPETLLGSTEEKPLPLGVPDAGMKPS-
>CynoTNFR2:配列番号49
MAPAAVWAALAVGLELWAAGHALPAQVAFTPYAPEPGGTCRLREYYDQTAQMCCSKCPPGQHAKVFCTKTSDTVCDSCEDSTYTQLWNWVPECLSCGSRCSSDQVETQACTREQNRICTCRPGWYCALSKQEGCRLCAQLRKCRPGFGVARPGTETSDVVCKPCAPGTFSNTTSSTDICRPHQICHVVAIPGNASMDAVCTSTSPTRSMAPGAVHLPQPVSTRSQHTQPTPAPSTAPGTSFLLPVGPSPPAEGSTGDIVLPVGLIVGVTALGLLIIGVVNCVI-
抗ヒトTNFR2抗体エピトープマッピング
(シグナルペプチドには下線が引かれている)
>ヒトTNFR2の細胞外領域:配列番号50
MAPVAVWAALAVGLELWAAAHALPAQVAFTPYAPEPGSTCRLREYYDQTAQMCCSKCSPGQHAKVFCTKTSDTVCDSCEDSTYTQLWNWVPECLSCGSRCSSDQVETQACTREQNRICTCRPGWYCALSKQEGCRLCAPLRKCRPGFGVARPGTETSDVVCKPCAPGTFSNTTSSTDICRPHQICNVVAIPGNASMDAVCTSTSPTRSMAPGAVHLPQPVSTRSQHTQPTPEPSTAPSTSFLLPMGPSPPAEGSTGD
>マウスTNFR2の細胞外領域:配列番号51
MAPAALWVALVFELQLWATGHTVPAQVVLTPYKPEPGYECQISQEYYDRKAQMCCAKCPPGQYVKHFCNKTSDTVCADCEASMYTQVWNQFRTCLSCSSSCTTDQVEIRACTKQQNRVCACEAGRYCALKTHSGSCRQCMRLSKCGPGFGVASSRAPNGNVLCKACAPGTFSDTTSSTDVCRPHRICSILAIPGNASTDAVCAPESPTLSAIPRTLYVSQPEPTRSQPLDQEPGPSQTPSILTSLGSTPIIEQSTKGG
>019-1:配列番号52
MYLGLNCVFIVFLLKGVQSVPAQVVLTPYKPEPGYTCRLREYYDQTAQMCCSKCSPGQHAKVFCTKTSDTVCDDCEASMYTQVWNQFRTCLSCSSSCTTDQVEIRACTKQQNRVCACEAGRYCALKTHSGSCRQCMRLSKCGPGFGVASSRAPNGNVLCKACAPGTFSDTTSSTDVCRPHRICSILAIPGNASTDAVCAPESPTLSAIPRTLYVSQPEPTRSQPLDQEPGPSQTPSILTSLGSTPIIEQSTKGGDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK*
>019-2:配列番号53
MYLGLNCVFIVFLLKGVQSVPAQVVLTPYKPEPGYECQISQEYYDRKAQMCCAKCPPGQYVKHFCNKTSDTVCASCEDSTYTQLWNWVPECLSCGSRCSSDQVETQACTREQNRICACEAGRYCALKTHSGSCRQCMRLSKCGPGFGVASSRAPNGNVLCKACAPGTFSDTTSSTDVCRPHRICSILAIPGNASTDAVCAPESPTLSAIPRTLYVSQPEPTRSQPLDQEPGPSQTPSILTSLGSTPIIEQSTKGGDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK*
>019-3:配列番号54
MYLGLNCVFIVFLLKGVQSVPAQVVLTPYKPEPGYECQISQEYYDRKAQMCCAKCPPGQYVKHFCNKTSDTVCADCEASMYTQVWNQFRTCLSCSSSCTTDQVEIRACTKQQNRVCTCRPGWYCALSKQEGCRLCAPLRKCRPGFGVARPGTETSDVVCKACAPGTFSDTTSSTDVCRPHRICSILAIPGNASTDAVCAPESPTLSAIPRTLYVSQPEPTRSQPLDQEPGPSQTPSILTSLGSTPIIEQSTKGGDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK*
>019-4:配列番号55
MYLGLNCVFIVFLLKGVQSVPAQVVLTPYKPEPGYECQISQEYYDRKAQMCCAKCPPGQYVKHFCNKTSDTVCADCEASMYTQVWNQFRTCLSCSSSCTTDQVEIRACTKQQNRVCACEAGRYCALKTHSGSCRQCMRLSKCGPGFGVASSRAPNGNVLCKPCAPGTFSNTTSSTDICRPHQICNVVAIPGNASMDAVCTPESPTLSAIPRTLYVSQPEPTRSQPLDQEPGPSQTPSILTSLGSTPIIEQSTKGGDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK*
>019-5:配列番号56
MYLGLNCVFIVFLLKGVQSVPAQVVLTPYKPEPGYECQISQEYYDRKAQMCCAKCPPGQHAKVFCTKTSDTVCDSCEDSTYTQLWNWVPECLSCSSSCTTDQVEIRACTKQQNRVCACEAGRYCALKTHSGSCRQCMRLSKCGPGFGVASSRAPNGNVLCKACAPGTFSDTTSSTDVCRPHRICSILAIPGNASTDAVCAPESPTLSAIPRTLYVSQPEPTRSQPLDQEPGPSQTPSILTSLGSTPIIEQSTKGGDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK*
>019-6:配列番号57
MYLGLNCVFIVFLLKGVQSVPAQVVLTPYKPEPGYECQISQEYYDRKAQMCCAKCPPGQYVKHFCNKTSDTVCADCEASMYTQVWNQFRTCLSCGSRCSSDQVETQACTREQNRICTCRPGWYCALSKQEGCRLCAPLRKCGPGFGVASSRAPNGNVLCKACAPGTFSDTTSSTDVCRPHRICSILAIPGNASTDAVCAPESPTLSAIPRTLYVSQPEPTRSQPLDQEPGPSQTPSILTSLGSTPIIEQSTKGGDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK*
>019-0-0.5:配列番号58
MYLGLNCVFIVFLLKGVQSLPAQVAFTPYAPEPGSTCRLREYYDQTAQMCCAKCPPGQYVKHFCNKTSDTVCADCEASMYTQVWNQFRTCLSCSSSCTTDQVEIRACTKQQNRVCACEAGRYCALKTHSGSCRQCMRLSKCGPGFGVASSRAPNGNVLCKACAPGTFSDTTSSTDVCRPHRICSILAIPGNASTDAVCAPESPTLSAIPRTLYVSQPEPTRSQPLDQEPGPSQTPSILTSLGSTPIIEQSTKGGDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK*
>019-0-1:配列番号59
MYLGLNCVFIVFLLKGVQSLPAQVAFTPYAPEPGSTCRLREYYDQTAQMCCSKCSPGQHAKVFCTKTSDTVCDDCEASMYTQVWNQFRTCLSCSSSCTTDQVEIRACTKQQNRVCACEAGRYCALKTHSGSCRQCMRLSKCGPGFGVASSRAPNGNVLCKACAPGTFSDTTSSTDVCRPHRICSILAIPGNASTDAVCAPESPTLSAIPRTLYVSQPEPTRSQPLDQEPGPSQTPSILTSLGSTPIIEQSTKGGDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK*
>019-0.5-1:配列番号60
MYLGLNCVFIVFLLKGVQSVPAQVVLTPYKPEPGYTCRLREYYDQTAQMCCAKCPPGQYVKHFCNKTSDTVCADCEASMYTQVWNQFRTCLSCSSSCTTDQVEIRACTKQQNRVCACEAGRYCALKTHSGSCRQCMRLSKCGPGFGVASSRAPNGNVLCKACAPGTFSDTTSSTDVCRPHRICSILAIPGNASTDAVCAPESPTLSAIPRTLYVSQPEPTRSQPLDQEPGPSQTPSILTSLGSTPIIEQSTKGGDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK*
>019-0-0.5-2:配列番号61
MYLGLNCVFIVFLLKGVQSLPAQVAFTPYAPEPGSECQISQEYYDRKAQMCCAKCPPGQYVKHFCNKTSDTVCADCEASMYTQVWNQFRTCLSCSSSCTTDQVEIRACTKQQNRVCACEAGRYCALKTHSGSCRQCMRLSKCGPGFGVASSRAPNGNVLCKACAPGTFSDTTSSTDVCRPHRICSILAIPGNASTDAVCAPESPTLSAIPRTLYVSQPEPTRSQPLDQEPGPSQTPSILTSLGSTPIIEQSTKGGDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK*
>019-12:配列番号62
MAPVAVWAALAVGLELWAAAHALPAQVAFTPYAPEPGSTCRLREYYDQTAQMCCSKCSPGQHAKVFCTKTSDTVCDSCEDSTYTQLWNWVPECLSCGSRCSSDQVETQACTREQNRICACEAGRYCALKTHSGSCRQCMRLSKCGPGFGVASSRAPNGNVLCKACAPGTFSDTTSSTDVCRPHRICSILAIPGNASTDAVCAPESPTLSAIPRTLYVSQPEPTRSQPLDQEPGPSQTPSILTSLGSTPIIEQSTKGGDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK*
>抗TNFR2抗体-001-H10
重鎖:配列番号74
EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFDDYGMSWVRQAPGKGLEWVSVIYSGGSTYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARDRSSSWYRDGMDVWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK*
軽鎖:配列番号75
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCTGSSSNIGAGYDVHWYQQLPGTAPKLLIYGNSNRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLRSEDEADYYCAAWDDSLSGWVFGGGTKLTVLGRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC*
一実施形態において、重鎖可変領域は、
(i)配列番号7、15、25または37からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%または99%の同一性を有するアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる、または
(ii)配列番号7、15、25または37からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる、または
(iii)配列番号7、15、25または37からなる群から選択されるアミノ酸配列と比較して、好ましくは、アミノ酸変化がCDR領域で生じず、より好ましくは、アミノ酸変化がフレームワーク領域(FR領域)、例えばFR1、FR2、FR3またはFR4領域で生じる、1つ以上(好ましくは10以下、より好ましくは5以下)のアミノ酸変化(好ましくはアミノ酸置換、より好ましくは保存的置換)を有するアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる。
別の実施形態において、軽鎖可変領域は、
(i)配列番号8、16、26、28または38からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%または99%の同一性を有するアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる、または
(ii)配列番号8、16、26、28または38からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる、または
(iii)配列番号8、16、26、28または38からなる群から選択されるアミノ酸配列と比較して、好ましくは、アミノ酸変化がCDR領域で生じず、より好ましくは、アミノ酸変化がFR領域、例えばFR1、FR2、FR3またはFR4領域で生じ、好ましくは、該変化がFR1におけるQ38で生じ、特に、該変化がQからHまたはその保存的アミノ酸への変化である、1つ以上(好ましくは10以下、より好ましくは5以下)のアミノ酸変化(好ましくはアミノ酸置換、より好ましくは保存的置換)を有するアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる。
別の実施形態において、本発明は、抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片に関し、以下を含む:
配列番号7、15、25または37で表されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる重鎖可変領域、および/または
配列番号8、16、26、28または38で表されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる軽鎖可変領域。
別の実施形態において、本発明は、抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片に関し、以下を含む:
(1) 配列番号7で表されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる重鎖可変領域、および/または配列番号8で表されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる軽鎖可変領域、
(2) 配列番号15で表されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる重鎖可変領域、および/または配列番号16で表されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる軽鎖可変領域、
(3) 配列番号25で表されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる重鎖可変領域、および/または配列番号26で表されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる軽鎖可変領域、
(4) 配列番号25で表されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる重鎖可変領域、および/または配列番号28で表されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる軽鎖可変領域、
(5) 配列番号37で表されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる重鎖可変領域、および/または配列番号38で表されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる軽鎖可変領域。
(i)配列番号7、15、25または37からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%または99%の同一性を有するアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる、または
(ii)配列番号7、15、25または37からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる、または
(iii)配列番号7、15、25または37からなる群から選択されるアミノ酸配列と比較して、好ましくは、アミノ酸変化がCDR領域で生じず、より好ましくは、アミノ酸変化がフレームワーク領域(FR領域)、例えばFR1、FR2、FR3またはFR4領域で生じる、1つ以上(好ましくは10以下、より好ましくは5以下)のアミノ酸変化(好ましくはアミノ酸置換、より好ましくは保存的置換)を有するアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる。
別の実施形態において、軽鎖可変領域は、
(i)配列番号8、16、26、28または38からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%または99%の同一性を有するアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる、または
(ii)配列番号8、16、26、28または38からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる、または
(iii)配列番号8、16、26、28または38からなる群から選択されるアミノ酸配列と比較して、好ましくは、アミノ酸変化がCDR領域で生じず、より好ましくは、アミノ酸変化がFR領域、例えばFR1、FR2、FR3またはFR4領域で生じ、好ましくは、該変化がFR1におけるQ38で生じ、特に、該変化がQからHまたはその保存的アミノ酸への変化である、1つ以上(好ましくは10以下、より好ましくは5以下)のアミノ酸変化(好ましくはアミノ酸置換、より好ましくは保存的置換)を有するアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる。
別の実施形態において、本発明は、抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片に関し、以下を含む:
配列番号7、15、25または37で表されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる重鎖可変領域、および/または
配列番号8、16、26、28または38で表されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる軽鎖可変領域。
別の実施形態において、本発明は、抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片に関し、以下を含む:
(1) 配列番号7で表されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる重鎖可変領域、および/または配列番号8で表されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる軽鎖可変領域、
(2) 配列番号15で表されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる重鎖可変領域、および/または配列番号16で表されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる軽鎖可変領域、
(3) 配列番号25で表されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる重鎖可変領域、および/または配列番号26で表されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる軽鎖可変領域、
(4) 配列番号25で表されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる重鎖可変領域、および/または配列番号28で表されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる軽鎖可変領域、
(5) 配列番号37で表されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる重鎖可変領域、および/または配列番号38で表されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる軽鎖可変領域。
好ましい実施形態において、本明細書に記載のアミノ酸変化は、CDRの外側の領域(例えば、FR)に生じる。一実施形態において、アミノ酸変化は、HCVRまたはLCVRのFR領域、好ましくはLCVRにおいて、例えば、LCVRのFR1、FR2、FR3および/またはFR4において生じる。いくつかの実施形態において、FR領域には、1つ、2つ、または3つの変化がある。特定の実施形態において、変化は、FR1のQ38におけるものであり、例えば、QからHへの置換またはその保存アミノ酸の38位にある。
一実施形態において、抗体の産生を改善するために、例えば、細胞における抗体の発現を改善するために、または産生された抗体の純度を改善するために、1つ以上のアミノ酸修飾をFR領域に導入することができる。例えば、FR1、FR2、FR3またはFR4領域、例えばFR1領域、例えばQ38位に修飾が存在し得る。具体的には、修飾は、38位のQからHまたはその保存アミノ酸への置換であり得る。
変異型軽鎖可変領域(LCVR/VL)Hu32-L1、Hu32-L2、Hu32-L3およびHu32-L2Vを、3つのCDRを生殖細胞系列に移植して得、Hu32-L2についてはQ38H、Y49H、T69S、F71Y及びV83Iの逆突然変異、Hu32-L3についてはY49H、T69S、およびF71Yの逆突然変異、ならびにHu32-L2VについてはQ38H、Y49H、T69S、およびF71Yの逆突然変異を、それぞれLCVR上で作製した。
hu32-C純度を向上させるために、FR領域に対する単一の点変異を行った。Q38H置換をhu32-C軽鎖のFR領域で行い、hu32-V1と名付けられた抗体を得た。hu32-Cおよびhu32C-V1は、実施例3で説明したように、同じ生成物下で両方とも発現および精製された。生成物の純度はSEC-HPLCにより測定し、親和性はFortebioにより測定した(実施例7参照)。SEC-HPLCの結果を図9に示し、親和性結果を表3に示した。
これらの結果は、Q38H変異が抗体hu32-Cの純度を向上できるが、親和性などのその特性に影響を与えないことを示唆した。
Claims (24)
- 抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片であって、
配列番号7、15、25または37で表される配列からなる重鎖可変領域HCVRに由来する3つの重鎖相補性決定領域(CDR)HCDR1、HCDR2およびHCDR3と、
配列番号8、16、26、28または38で表される配列からなる軽鎖可変領域LCVRに由来する3つの軽鎖相補性決定領域(CDR)LCDR1、LCDR2およびLCDR3と、
を含む、抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片。 - (1)配列番号7または25で表される配列からなる重鎖可変領域HCVRに由来する3つのLCDRであるHCDR1、HCDR2およびHCDR3、および、配列番号8、26または28で表される配列からなる軽鎖可変領域LCVRに由来する3つのLCDRであるLCDR1、LCDR2およびLCDR3と、
(2)配列番号15または37で表される配列からなる重鎖可変領域HCVRに由来する3つのLCDRであるHCDR1、HCDR2およびHCDR3、および、配列番号16または38で表される配列からなる軽鎖可変領域LCVRに由来する3つのLCDRであるLCDR1、LCDR2およびLCDR3と、
を含む、請求項1に記載の抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片。 - 抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片であって、
(i)それぞれ配列番号1、2および3で表される配列を含むかまたはそれらからなるHCDR1、HCDR2およびHCDR3、および、それぞれ配列番号4、5および6で表される配列を含むまたはそれらからなるLCDR1、LCDR2およびLCDR3と、
(ii)それぞれ配列番号9、10および11で表される配列からなるHCDR1、HCDR2およびHCDR3、および、それぞれ配列番号12、13および14で表される配列からなるLCDR1、LCDR2およびLCDR3と、
を含む、抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片。 - 配列番号7、15、25または37で表されるアミノ酸配列、または、配列番号7、15、25または37で表される前記アミノ酸配列と少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%または99%の同一性を有するアミノ酸配列、または、配列番号7、15、25または37からなる群から選択されるアミノ酸配列と比較して、1つ以上(好ましくは10以下、より好ましくは5以下)のアミノ酸変化(好ましくはアミノ酸置換、より好ましくは保存的置換)を有し、好ましくは、前記アミノ酸変化がCDR領域で生じず、より好ましくは、前記アミノ酸変化がフレームワーク領域(FR領域)、例えばFR1、FR2、FR3またはFR4領域で生じるアミノ酸配列、を含むかまたはそれらからなる重鎖可変領域と、
配列番号8、16、26、28または38で表されるアミノ酸配列、または、配列番号8、16、26、28または38で表される前記アミノ酸配列と少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%または99%の同一性を有するアミノ酸配列、または、配列番号8、16、26、28または38からなる群から選択されるアミノ酸配列と比較して、1つ以上(好ましくは10以下、より好ましくは5以下)のアミノ酸変化(好ましくはアミノ酸置換、より好ましくは保存的置換)を有し、好ましくは、前記アミノ酸変化がCDR領域に生じず、より好ましくは、前記アミノ酸変化がフレームワーク領域(FR領域)、例えばFR1、FR2、FR3またはFR4領域で生じ、好ましくは、前記変化がFR3のI83で生じ、特に、前記変化がIからVまたはその保存的アミノ酸への変化であるアミノ酸配列、を含む軽鎖可変領域と、
を含む、請求項1~3のいずれか一項に記載の抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片。 - (1)配列番号7で表されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる重鎖可変領域、および/または配列番号8で表されるアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域と、
(2)配列番号15で表されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる重鎖可変領域、および/または配列番号16で表されるアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域と、
(3)配列番号25で表されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる重鎖可変領域、および/または配列番号26で表されるアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域と、
(4)配列番号25で表されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる重鎖可変領域、および/または配列番号28で表されるアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域と、
(5)配列番号37で表されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる重鎖可変領域、および/または配列番号38で表されるアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域と、
を含む、請求項1~3のいずれか一項に記載の抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片。 - 重鎖定常領域および/または軽鎖定常領域をさらに含み、
前記重鎖定常領域は、
(1)ヒトIgG定常領域、例えば、IgG1、IgG2、IgG3またはIgG4、好ましくはIgG1定常領域であるまたはそれに由来し、
(2)配列番号40または配列番号73で表されるアミノ酸配列と少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%または99%の同一性を有するアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなり、または
(3)配列番号40または配列番号73で表されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなり、
および/または、
前記軽鎖定常領域は、
(1)κ(カッパ)またはλ(ラムダ)軽鎖定常領域、例えば、ヒトκまたはλ軽鎖定常領域、好ましくは、ヒトκ軽鎖定常領域であるまたはそれに由来し、
(2)配列番号42で表されるアミノ酸配列と少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%または99%の同一性を有するアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなり、または
(3)配列番号42で表されるアミノ酸配列を含むかまたはそれらからなる、
請求項1~5のいずれか一項に記載の抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片。 - 前記抗体が、モノクローナル抗体である、
請求項1~6のいずれか一項に記載の抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片。 - 前記抗体が、キメラ抗体、ヒト化抗体またはヒト抗体である、
請求項1~7のいずれか一項に記載の抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片。 - 前記抗原結合断片が、Fab、Fab′、Fab′-SH、Fv、単鎖抗体(例えば、scFv)、(Fab′)2、シングルドメイン抗体(例えば、VHH)、ダイアボディドメイン抗体(dAb)または線状抗体からなる群から選択される抗体断片である、
請求項1~8のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合断片。 - 前記抗体が、二重特異性または多重特異性抗体分子であり、好ましくは、前記二重特異性抗体分子が、TNFR2および免疫チェックポイントに結合する、
請求項1~9のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合断片。 - 請求項1~10のいずれか一項に記載の抗TNFR2抗体またはその断片のいずれか1つ以上の鎖をコードする、
単離核酸。 - 好ましくは発現ベクターである、
請求項10に記載の核酸を含むベクター。 - 請求項12に記載のベクターを含む宿主細胞であって、
好ましくは、前記宿主細胞が、原核細胞または真核細胞であり、より好ましくは、酵母細胞、哺乳動物細胞(例えば、CHO細胞またはCHO-S細胞または293細胞)、または、抗体またはその抗原結合断片の調製に適した他の細胞から選択される、
宿主細胞。 - 請求項1~10のいずれか一項に記載の抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片をコードする核酸の発現に適した条件下で、請求項13に記載の宿主細胞を培養するステップを含み、
必要に応じて、前記宿主細胞から前記TNFR2抗体またはその抗原結合断片を回収するステップをさらに含む、
抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片の調製方法。 - 請求項1~10のいずれか一項に記載の抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片と、
他の薬剤(例えば、細胞毒性剤などの治療剤またはラベル)と、
を含む、免疫複合体。 - 請求項1~10のいずれか一項に記載の抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片、または、
請求項15に記載の免疫複合体、および、
必要に応じて薬学的に許容されるアジュバント、
を含む、医薬組成物。 - 請求項1~10のいずれか一項に記載の抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片、または
請求項15に記載の免疫複合体、および
1つ以上の他の治療剤(例えば、化学療法剤、他の抗体(例えば、PD-1またはPD-L1抗体)、細胞毒性剤、ワクチン、抗感染剤、小分子実体、または免疫調節剤)、
を含む、組み合わせ品。 - 対象において、T細胞を活性化する、またはT細胞媒介性抗腫瘍活性を誘導する、またはT細胞の増殖を刺激する方法であって、
有効量の請求項1~10のいずれか一項に記載の抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片、または、請求項15に記載の免疫複合体、または、請求項16に記載の医薬組成物、または、請求項17に記載の組み合わせ品を対象に投与するステップを含む、
方法。 - 対象において、癌または感染症を予防または治療する方法であって、
有効量の請求項1~10のいずれか一項に記載の抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片、または、請求項15に記載の免疫複合体、または、請求項16に記載の医薬組成物、または、請求項17に記載の組み合わせ品を対象に投与するステップを含み、
好ましくは、前記癌が、非小細胞肺癌、乳癌、腎細胞癌、ホジキンリンパ腫、多発性骨髄腫、皮膚非ホジキンリンパ腫、および卵巣癌、胃腸消化管の癌(例えば、結腸直腸癌、直腸癌または大腸癌)である、
方法。 - 1つ以上の治療法(例えば、治療モダリティおよび/または他の治療剤)と組み合わせて前記対象に投与するステップをさらに含み、
好ましくは、前記治療モダリティは、手術および/または放射線療法を含み、および/または前記他の治療剤は、化学療法剤、他の抗体(例えば、PD-1またははPD-L1抗体)、細胞毒性剤、ワクチン、抗感染剤、小分子実体、または免疫調節剤からなる群から選択される、
請求項18または19に記載の方法。 - (A)請求項1~11のいずれか一項に記載の抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片と試料とを接触させるステップと、
(B)前記抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片と前記TNFR2との間の複合体の形成を検出するステップであって、必要に応じて、前記抗TNFR2抗体を検出可能に標識するステップと、
を含む、試料中のTNFR2を検出する方法。 - 請求項1~10のいずれか一項に記載の抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片、または、
請求項15に記載の免疫複合体
を含む、TNFR2検出用キット。 - 配列番号50からなるまたはそれらを含むヒトTNFR2の細胞外領域に含まれるTNFR2のエピトープを結合し、
好ましくは、前記エピトープは、ヒトTNFR2における配列番号58の1Lから31Cまでのアミノ酸配列、または、ヒトTNFR2における、配列番号62の1Lから96Cまでのアミノ酸配列、または配列番号52の17Tから54Dまでのアミノ酸配列に含まれる、
抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片。 - (1)インビトロでヒトおよび/またはカニクイザルTNFR2タンパク質またはその断片に高親和性で結合すること、
(2)細胞表面、例えば293T細胞の細胞表面、または抗CD3によって刺激されたPBMCなどの活性化細胞上に発現されるヒトおよび/またはカニクイザルTNFR2に結合すること、
(3)TNF-αと、細胞(例えば、293T細胞)上に発現されるヒトおよび/またはカニクイザルTNFR2との間の相互作用/結合をブロッキングすること、
(4)(例えば、ヒト)T細胞(例えば、CD8+T細胞またはCD4+T細胞)を活性化すること、例えば、IFN-γのようなサイトカインの分泌を増加させ、CD4+T細胞またはCD8+T細胞の増殖を増加させること、
(5)TNFR2、例えば、ヒトまたはカニクイザルTNFR2の下流シグナル経路を刺激すること、
(6)免疫応答を増強すること、
(7)誘導されたT細胞、例えば、誘導されたTreg細胞または誘導されたCD8+T細胞に対するADCC効果を誘導しないこと、
(8)薬物動態のパラメータが良好であるため、医薬品の有効成分として使用できること、
(9)例えば、腫瘍体積を減少させることによる抗腫瘍効果を有し、例えば、腫瘍体積を少なくとも20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%以上減少させることができること、
という特性の1つ以上を有する、抗TNFR2抗体またはその抗原結合断片。
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