JP2023518538A - ヒトcd45rcに特異的なキメラ抗原受容体およびその使用 - Google Patents

ヒトcd45rcに特異的なキメラ抗原受容体およびその使用 Download PDF

Info

Publication number
JP2023518538A
JP2023518538A JP2022555951A JP2022555951A JP2023518538A JP 2023518538 A JP2023518538 A JP 2023518538A JP 2022555951 A JP2022555951 A JP 2022555951A JP 2022555951 A JP2022555951 A JP 2022555951A JP 2023518538 A JP2023518538 A JP 2023518538A
Authority
JP
Japan
Prior art keywords
seq
lcvr
hcvr
binding fragment
antibody
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
JP2022555951A
Other languages
English (en)
Other versions
JPWO2021186056A5 (ja
Inventor
ギロノー,キャロル
アネゴン,イグナシオ
Original Assignee
インセルム(インスティチュート ナショナル デ ラ サンテ エ デ ラ リシェルシェ メディカル)
ナント ユニベルシテ
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by インセルム(インスティチュート ナショナル デ ラ サンテ エ デ ラ リシェルシェ メディカル), ナント ユニベルシテ filed Critical インセルム(インスティチュート ナショナル デ ラ サンテ エ デ ラ リシェルシェ メディカル)
Publication of JP2023518538A publication Critical patent/JP2023518538A/ja
Publication of JPWO2021186056A5 publication Critical patent/JPWO2021186056A5/ja
Pending legal-status Critical Current

Links

Images

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K16/00Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/28Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • C07K16/289Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants against CD45
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/46Cellular immunotherapy
    • A61K39/461Cellular immunotherapy characterised by the cell type used
    • A61K39/4611T-cells, e.g. tumor infiltrating lymphocytes [TIL], lymphokine-activated killer cells [LAK] or regulatory T cells [Treg]
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/46Cellular immunotherapy
    • A61K39/463Cellular immunotherapy characterised by recombinant expression
    • A61K39/4631Chimeric Antigen Receptors [CAR]
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/46Cellular immunotherapy
    • A61K39/464Cellular immunotherapy characterised by the antigen targeted or presented
    • A61K39/4643Vertebrate antigens
    • A61K39/4644Cancer antigens
    • A61K39/464402Receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • A61K39/464411Immunoglobulin superfamily
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P37/00Drugs for immunological or allergic disorders
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P37/00Drugs for immunological or allergic disorders
    • A61P37/02Immunomodulators
    • A61P37/06Immunosuppressants, e.g. drugs for graft rejection
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/705Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
    • C07K14/70503Immunoglobulin superfamily
    • C07K14/7051T-cell receptor (TcR)-CD3 complex
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/705Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
    • C07K14/70503Immunoglobulin superfamily
    • C07K14/70521CD28, CD152
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K2239/00Indexing codes associated with cellular immunotherapy of group A61K39/46
    • A61K2239/46Indexing codes associated with cellular immunotherapy of group A61K39/46 characterised by the cancer treated
    • A61K2239/48Blood cells, e.g. leukemia or lymphoma
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/20Immunoglobulins specific features characterized by taxonomic origin
    • C07K2317/24Immunoglobulins specific features characterized by taxonomic origin containing regions, domains or residues from different species, e.g. chimeric, humanized or veneered
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/50Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments
    • C07K2317/56Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments variable (Fv) region, i.e. VH and/or VL
    • C07K2317/565Complementarity determining region [CDR]
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/60Immunoglobulins specific features characterized by non-natural combinations of immunoglobulin fragments
    • C07K2317/62Immunoglobulins specific features characterized by non-natural combinations of immunoglobulin fragments comprising only variable region components
    • C07K2317/622Single chain antibody (scFv)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/70Immunoglobulins specific features characterized by effect upon binding to a cell or to an antigen
    • C07K2317/73Inducing cell death, e.g. apoptosis, necrosis or inhibition of cell proliferation
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide
    • C07K2319/01Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif
    • C07K2319/02Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif containing a signal sequence
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide
    • C07K2319/01Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif
    • C07K2319/03Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif containing a transmembrane segment
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide
    • C07K2319/33Fusion polypeptide fusions for targeting to specific cell types, e.g. tissue specific targeting, targeting of a bacterial subspecies

Abstract

本発明は、免疫療法の分野に関する。特に、本発明は、ヒトCD45RCに特異的なキメラ抗原受容体(CAR)、前記CARを発現する免疫細胞および特にCD45RChigh関連疾患(自己免疫疾患、望ましくない免疫応答、単原性疾患、リンパ腫もしくは癌を含む)または移植片対宿主病(GVHD)を予防または治療するための医薬としてのその使用に関する。

Description

本発明は、免疫療法の分野に関する。特に、本発明は、ヒトCD45RCに特異的なキメラ抗原受容体(CAR)、前記CARを発現するT細胞および特にCD45RChigh関連疾患(自己免疫疾患、望ましくない免疫応答、単原性疾患、リンパ腫もしくは癌を含む)または移植片対宿主病(GVHD)を予防または治療するための医薬としてのその使用に関する。
CD45(白血球共通抗原(LCA)、EC3.1.3.48、T200、Ly5およびPTPRCとしても公知)は、最初のプロトタイプの受容体様タンパク質チロシンホスファターゼ(RPTP)を構成する。その発現は、すべての有核造血細胞に制限され、最も豊富な細胞表面糖タンパク質のうちの1つであり、細胞表面のほぼ10パーセントを構成し、原形質膜中に約25μM存在すると推定される(Trowbridge&Thomas,1994.Annu Rev Immunol.12:85-116;Hermiston et al.,2003.Annu Rev Immunol.21:107-37;Holmes,2006.Immunology.117(2):145-55)。
CD45は、細胞外ドメイン、単一の膜貫通ドメインおよび大きな細胞質ドメインを含む。膜貫通ドメインおよび細胞質ドメインは、種間で高度に保存されている。特に、CD45の細胞質ドメインは、タンデムに複製された2つのホスファターゼドメインを含み、そのうちの膜近位ドメインのみが酵素活性を有する(Desai et al.,1994.EMBO J.13(17):4002-10)。第1のドメインを安定化することによって間接的にCD45活性に寄与し得ることが示唆されているが、CD45におけるよりC末端側の第2のホスファターゼドメインの機能は、依然として不確実である。この細胞質ドメインを介して、CD45は、チロシン-タンパク質キナーゼ(T細胞におけるLck、またはB細胞におけるLyn、FynおよびLckなど)のSrcファミリーの活性を調節することによって、造血細胞におけるホスホチロシンレベルの中心的調節因子として機能する(Palacios&Weiss,2004.Oncogene.23(48):7990-8000;Lowell,2004.Mol Immunol.41(6-7):631-43)。
膜貫通ドメインおよび細胞質ドメインとは対照的に、CD45の細胞外ドメインは、異なる白血球系統間でより高い多型を示す。実際、この細胞外ドメインは、高度にグリコシル化されており、O結合型グリコシル化およびシアル化の両方である3つの選択的にスプライシングされたエクソン(4、5および6-それぞれA、BおよびC決定基をコードする)を含有する(Hermiston et al.,2003.Annu Rev Immunol.21:107-37;Holmes,2006.Immunology.117(2):145-55)。したがって、サイズ、形状および電荷が異なるCD45アイソフォームは、白血球分化および細胞活性化の両方において動的に制御された選択的スプライシングによって生成され、分子の細胞外ドメインの変化をもたらすことができる(Hall et al.,1988.J Immunol.141(8):2781-7;Lynch,2004.Nat Rev Immunol.4(12):931-40)。
3つの選択的にスプライシングされたエクソンすべてを含有する最大のCD45アイソフォームであるCD45RABCは、約235kDaであり、3つのエクソンすべてを欠く最小のアイソフォームであるCD45ROは、約180kDaである。その間に、3つのエクソンのうちの2つのみ(例えば、CD45RAB、CD45RBC)または1つのみ(例えば、CD45RB)を含むアイソフォームが可能である。
異なるCD45アイソフォームの機能は、明らかではないが、これらのアイソフォームの差次的発現は、T細胞の活性化レベルと関連しており、ナイーブT細胞対メモリーT細胞の解離を可能にする(Birkeland et al.,1989.Proc Natl Acad Sci U S A.86(17):6734-8)。例えば、CD45RAは、末梢ナイーブ成熟CD4T細胞上に存在し、CD45ROは、活性化およびメモリーCD4T細胞上に発現される。CD45RABCは、B細胞およびその前駆体上、樹状細胞および他の抗原提示細胞のサブグループ上に発現される。最終分化メモリーT細胞のサブタイプであるエフェクターメモリーRAT細胞(TEMRA)もまた、ナイーブT細胞マーカーCD45RAを再発現する(Koch et al.,2008.Immun Ageing.5:6)。重要なことに、アイソフォーム発現のこのパターンは、その機能的役割および重要性を強調して種間で高度に保存されている(Hermiston et al.,2003.Annu Rev Immunol.21:107-37)。
CD4およびCD8T細胞上のCD45RCアイソフォームの特定の発現パターンは、増殖およびサイトカイン分泌に関して異なる挙動を示す機能的に異なるアロ反応性T細胞サブセット間の分化を可能にする。例えば、げっ歯類では、CD4およびCD8T細胞の両方のCD45RChighが、移植拒絶および臓器炎症を促進する能力がある強力なT1エフェクター細胞である(Spickett et al.,1983.J Exp Med.158(3):795-810;Xystrakis et al.,2004.Eur J Immunol.34(2):408-17)一方で、検出不能または低レベルのCD45RCを発現するT細胞は、T2および調節性T細胞であり、同種移植片拒絶、移植片対宿主病(GVHD)および細胞媒介性自己免疫疾患を阻害することが示されている(Xystrakis et al.,2004.Blood.104(10):3294-30;Guillonneau et al.,2007.J Clin Invest.117(4):1096-106;Powrie&Mason,1990.J Exp Med.172(6):1701-8)。ヒトでは、移植前のCD45RCCD8T細胞の高い割合が、腎臓移植患者における移植片生存率の低下と相関している(Ordonez et al.,2013.PLoS One.8(7):e69791)。
したがって、CD45RChighT細胞集団の排除は、ヒトにおいて免疫寛容を誘導するための、したがって移植拒絶(特にGVHD)および自己免疫疾患を予防、低減および/または治療するための有望なアプローチを表す。
GVHDは、幹細胞移植患者における罹患率および死亡率の重要な原因である。それは、ドナー細胞がレシピエント細胞に対して反応するT細胞媒介性免疫反応性プロセスである。現在、コルチコステロイドなどの免疫調節薬による免疫抑制がGVHD予防の主流である。長期にわたる生存転帰の改善を伴って進行がなされてきたが、コルチコステロイドは、高い割合の患者(初期疾患重症度に応じて、急性GVHD患者の50%未満および慢性GVHD患者の40~50%未満-Garnett et al.,2013.Ther Adv Hematol.4(6):366-378)においてGVHDを予防せず、重大な毒性に関連し、現在利用可能な救済療法の多くは、免疫抑制の増加および感染性合併症に関連する。したがって、移植後の長期成績を改善するためのGVHDのための新しい治療戦略の開発に対する満たされていない必要性が依然として存在する。
本発明者らは、CD45RChighT細胞の枯渇が、寛容原性調節性T細胞を増加させながら、攻撃的エフェクターT細胞を減少させることによって移植拒絶を予防または低減する潜在的な新しい治療法になり得ることを以前に記載した。実際、一過性抗CD45RCmAb治療は、記憶免疫を維持しながら、急速なCD45RChighT細胞アポトーシスを引き起こす。さらに、本発明者らは、短期間の抗CD45RC抗体治療が、慢性拒絶の徴候を伴わずに永久的な同種移植片生存をもたらすことを示した(国際特許第2016016442号、Picarda et al.,2017.JCI Insight.2(3):e90088)。
ここで、本発明者らは、ヒトCD45RCに対する抗原結合フラグメントを含むキメラ抗原受容体(CAR)を開発した。この抗原結合フラグメントは、現在市販されている抗ヒトCD45RC抗体(MT2クローンなど)と競合し、同程度の反応性パターンを示すが、T細胞に対する細胞傷害活性は、最低濃度で有意に優れている。実際、本発明による抗hCD45RC抗原結合フラグメントは、現在利用可能な他の抗原結合フラグメントよりも良好な親和性を示し、それによってより良好な治療効果を有する。
興味深いことに、本発明によるCARはまた、免疫応答が病態に関与する特定の単一遺伝子疾患の予防または治療に有用であり得る。単遺伝子疾患は、単一遺伝子欠陥によって引き起こされる。4000を超えるヒト疾患が、ある特定の遺伝子に関連するこれらの欠陥によって引き起こされる。これまで、ほとんどの治療選択肢は、患者の生活の質を改善する試みにおいて、障害の症状を治療することを中心としている。遺伝子治療は、この種の疾患の永続的な治療に対する主な希望である。しかしながら、導入遺伝子産物またはベクターに対する免疫応答が治療有効性を制限するという事実だけではなく、障害によって影響を受ける適切な細胞への遺伝子の送達のための技術の開発中に大きな障害に遭遇している。
単一遺伝子疾患の中には、免疫系に関与する遺伝子(T細胞および/もしくはB細胞の原発性免疫不全症および多腺性内分泌不全症・カンジダ症・外胚葉ジストロフィー[APECED]など)、または免疫機能に関連しないが、その欠損が炎症および/または免疫反応に関連する遺伝子[デュシェンヌ筋ジストロフィー(DMD)など]に関連するものがある。
自己免疫性多腺性症候群I型(APS1)としても公知のAPECEDは、髄内上皮胸腺細胞(mTEC)における組織拘束性抗原(TRA)の発現および自己反応性T細胞欠失を可能にする転写調節因子であるAIRE遺伝子における突然変異によって引き起こされる稀な多臓器常染色体劣性自己免疫疾患である。ヒトでは、1~9:1000000の有病率でAPECEDを引き起こす100を超える突然変異がAIRE遺伝子に記載されている(Orphanet、http://www.orpha.net)。APECEDの臨床表現型は、通常、3つの主要な症状:副甲状腺機能低下症、副腎機能不全(アジソン病)および慢性粘膜皮膚カンジダ症(CMC)のうちの2つの存在によって定義される。この疾患はまた、1型糖尿病、エナメル質形成不全、白斑、早発卵巣不全、角膜炎、悪性貧血、脱毛症、外分泌性膵炎、間質性肺疾患、腎炎および他の障害などの複数の自己免疫性および外胚葉性の特徴に関連する。
DMDは、タンパク質ジストロフィンをコードするDMD遺伝子の突然変異が重度のX連鎖性筋ジストロフィーをもたらし、これは後の段階ですべての随意筋ならびに心臓および呼吸筋に影響を及ぼす、単一遺伝子疾患である。免疫応答は、DMD患者およびmdxマウスの両方において疾患の病態生理学に関与する(総説については、Rosenberg et al.,2015.Sci Transl Med.7(299):299rv4を参照されたい)。DMDの標準治療は、プレドニゾロンなどのコルチコイドである。mdxマウスでは、調節性T細胞(Treg)を増幅するために、静脈内免疫グロブリン、トラニラスト、ヘムオキシゲナーゼ-1誘導剤、IL-1受容体アンタゴニストおよびIL-2などのエフェクター免疫応答または炎症を減少させる処置も採用されている(Villalta et al.,2014.Sci Transl Med.6(258):258ra142;Rosenberg et al.,2015.Sci Transl Med.7(299):299rv4)。しかしながら、最近の有望な新しい治療法にもかかわらず、DMD患者の平均余命は、依然として著しく低下している。
驚くべきことに、本発明者らは、CD45RChigh細胞を特異的に枯渇させる抗CD45RC抗体によるDmd-/-ラット(Dmdmdx)の処置が筋力を高めることを実証した(Ouisse et al.,2019.Front Immunol.9;10:2131)。彼らはまた、抗CD45RCモノクローナル抗体のAire-/-ラットへの投与がCD45RChighT細胞の強力な枯渇をもたらし、APECEDの症状特徴の除去をもたらすことを実証した(国際特許出願第2019115791号)。
したがって、本発明によるCARは、DMDおよびAPECEDなどの単一遺伝子疾患を予防および/または治療するための有望なアプローチを表す。
本発明者らはまた、免疫細胞が、その細胞表面に形質導入CD45RC-CARを発現するように操作され得ることを実証した。本発明者らはまた、CD45RC-CARを形質導入された細胞がヒトT細胞においてアポトーシスを誘導し、ヒトT細胞との接触後に活性化され得ることを示した。
国際特許第2016016442号 国際特許出願第2019115791号
Trowbridge & Thomas,1994.Annu Rev Immunol.12:85-116 Hermiston et al.,2003.Annu Rev Immunol.21:107-37 Holmes,2006.Immunology.117(2):145-55 Desai et al.,1994.EMBO J.13(17):4002-10 Palacios & Weiss,2004.Oncogene.23(48):7990-8000 Lowell,2004.Mol Immunol.41(6-7):631-43 Hall et al.,1988.J Immunol.141(8):2781-7 Lynch,2004.Nat Rev Immunol.4(12):931-40 Birkeland et al.,1989.Proc Natl Acad Sci U S A.86(17):6734-8 Koch et al.,2008.Immun Ageing.5:6 Spickett et al.,1983.J Exp Med.158(3):795-810 Xystrakis et al.,2004.Eur J Immunol.34(2):408-17 Xystrakis et al.,2004.Blood.104(10):3294-30 Guillonneau et al.,2007.J Clin Invest.117(4):1096-106 Powrie & Mason,1990.J Exp Med.172(6):1701-8 Ordonez et al.,2013.PLoS One.8(7):e69791 Garnett et al.,2013.Ther Adv Hematol.4(6):366-378 Picarda et al.,2017.JCI Insight.2(3):e90088 Rosenberg et al.,2015.Sci Transl Med.7(299):299rv4 Villalta et al.,2014.Sci Transl Med.6(258):258ra142 Ouisse et al.,2019.Front Immunol.9;10:2131
本発明は、ヒトCD45RCに特異的なキメラ抗原受容体(CAR)に関し、前記CARは、
(a)少なくとも1つの細胞外結合ドメインであって、前記結合ドメインが、前記ヒトCD45RCに結合する、少なくとも1つの細胞外結合ドメイン、
(b)任意選択で、少なくとも1つの細胞外ヒンジドメイン、
(c)少なくとも1つの膜貫通ドメイン、および
(d)少なくとも1つの細胞内シグナル伝達ドメインであって、細胞内ドメインが、少なくとも1つのT細胞一次シグナル伝達ドメインおよび任意選択で、少なくとも1つのT細胞共刺激シグナル伝達ドメインを含む、少なくとも1つの細胞内シグナル伝達ドメイン、を含む。
一実施形態では、細胞外結合ドメインは、ヒトCD45RCに結合する少なくとも1つの抗原結合フラグメントを含み、該抗原結合フラグメントは、
(a)以下の3つのCDRを含むHCVR:
(i)配列番号1の配列のV-CDR1、
(ii)配列番号4、5、6、8、100、116、117、118および119の配列を含む群から選択される配列を有するV-CDR2、および
(iii)配列番号3の配列のV-CDR3、ならびに
(b)以下の3つのCDRを含むLCVR:
(i)配列番号15(SASSSVS-X12-YMH)および18(RASSSVS-X12-YMH)(X12は存在しないか、またはAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される)の配列を含む群から選択される配列を有するV-CDR1、
(ii)配列番号16、111および120の配列を含む群から選択される配列を有するV-CDR2、および
(iii)配列番号17の配列のV-CDR3、を含む。
一実施形態では、細胞外結合ドメインは、ヒトCD45RCに結合する少なくとも1つの抗原結合フラグメントを含み、該抗原結合フラグメントは、
(a)以下の3つのCDRを含むHCVR:
(i)配列番号1の配列のV-CDR1、
(ii)配列番号4および5の配列を含む群から選択される配列を有するV-CDR2、および
(iii)配列番号3の配列のV-CDR3、ならびに
(b)以下の3つのCDRを含むLCVR:
(i)配列番号15(X12は存在しない)の配列のV-CDR1、
(ii)配列番号16の配列のV-CDR2、および
(iii)配列番号17の配列のV-CDR3、を含む。
一実施形態では、細胞外結合ドメインは、ヒトCD45RCに結合する少なくとも1つの抗原結合フラグメントを含み、該抗原結合フラグメントは、
(a)以下の3つのCDRを含むHCVR:
(i)配列番号1の配列のV-CDR1、
(ii)配列番号4の配列のV-CDR2、および
(iii)配列番号3の配列のV-CDR3、ならびに
(b)以下の3つのCDRを含むLCVR:
(i)配列番号15(X12は存在しない)の配列のV-CDR1、
(ii)配列番号16の配列のV-CDR2、および
(iii)配列番号17の配列のV-CDR3、を含む。
一実施形態では、細胞外結合ドメインは、ヒトCD45RCに結合する少なくとも1つの抗原結合フラグメントを含み、該抗原結合フラグメントは、
(a)以下の3つのCDRを含むHCVR:
(i)配列番号1の配列のV-CDR1、
(ii)配列番号4、6および100の配列を含む群から選択される配列を有するV-CDR2、および
(iii)配列番号3の配列のV-CDR3、ならびに
(b)以下の3つのCDRを含むLCVR:
(i)配列番号15および18(X12は存在しない)の配列を含む群から選択される配列を有するV-CDR1、
(ii)配列番号16、111および120の配列を含む群から選択される配列を有するV-CDR2、および
(iii)配列番号17の配列のV-CDR3、を含む。
一実施形態では、細胞外結合ドメインは、ヒトCD45RCに結合する少なくとも1つの抗原結合フラグメントを含み、該抗原結合フラグメントは、
1)配列番号61の配列のHCVRおよび配列番号81の配列のLCVR、
2)配列番号62の配列のHCVRおよび配列番号82の配列のLCVR、
3)配列番号62の配列のHCVRおよび配列番号83の配列のLCVR、
4)配列番号62の配列のHCVRおよび配列番号84の配列のLCVR、
5)配列番号63の配列のHCVRおよび配列番号82の配列のLCVR、
6)配列番号63の配列のHCVRおよび配列番号83の配列のLCVR、
7)配列番号63の配列のHCVRおよび配列番号84の配列のLCVR、
8)配列番号64の配列のHCVRおよび配列番号82の配列のLCVR、
9)配列番号64の配列のHCVRおよび配列番号83の配列のLCVR、
10)配列番号64の配列のHCVRおよび配列番号84の配列のLCVR、
11)配列番号101の配列のHCVRおよび配列番号85の配列のLCVR、
12)配列番号101の配列のHCVRおよび配列番号103の配列のLCVR、
13)配列番号65の配列のHCVRおよび配列番号85の配列のLCVR、
14)配列番号65の配列のHCVRおよび配列番号103の配列のLCVR、
15)配列番号62の配列のHCVRおよび配列番号85の配列のLCVR、
16)配列番号101の配列のHCVRおよび配列番号82の配列のLCVR、
17)配列番号121の配列のHCVRおよび配列番号85の配列のLCVR、
18)配列番号122の配列のHCVRおよび配列番号85の配列のLCVR、
19)配列番号123の配列のHCVRおよび配列番号85の配列のLCVR、
20)配列番号124の配列のHCVRおよび配列番号85の配列のLCVR、
21)配列番号63の配列のHCVRおよび配列番号85の配列のLCVR、
22)配列番号67の配列のHCVRおよび配列番号85の配列のLCVR、
23)配列番号67の配列のHCVRおよび配列番号103の配列のLCVR、
24)配列番号61の配列のHCVRおよび配列番号113の配列のLCVR、
25)配列番号61の配列のHCVRおよび配列番号126の配列のLCVR、または
26)1)~23)に記載のHCVRおよびLCVRの非CDR領域の配列と少なくとも70%の同一性を共有する非CDR領域の配列を含むHCVRおよびLCVR、を含む。
一実施形態では、細胞外結合ドメインは、ヒトCD45RCに結合する少なくとも1つの抗原結合フラグメントを含み、該抗原結合フラグメントは、
(a)以下の3つのCDRを含むHCVR:
(i)配列番号1の配列のV-CDR1、
(ii)配列番号4、5、6、8、100、116、117、118および119の配列を含む群から選択される配列を有するV-CDR2、および
(iii)配列番号3の配列のV-CDR3、ならびに
(b)以下の3つのCDRを含むLCVR:
(i)配列番号15および18(配列番号15および18中のX12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される)の配列を含む群から選択される配列を有するV-CDR1、
(ii)配列番号16の配列のV-CDR2、および
(iii)配列番号17の配列のV-CDR3、を含み、
好ましくは、LCVRのKabat位置L71のアミノ酸残基は、Phe(F)である。
一実施形態では、細胞外結合ドメインは、ヒトCD45RCに対するscFvフラグメントを含む。
一実施形態では、ヒンジドメインは、好ましくは配列番号145の配列またはそれと少なくとも70%の同一性を有する配列を有する、ヒトCD8αのヒンジ領域である。
一実施形態では、膜貫通ドメインは、好ましくは配列番号153の配列またはそれと少なくとも70%の同一性を有する配列を有する、ヒトCD8αに由来する膜貫通ドメインである。
一実施形態では、一次細胞内シグナル伝達ドメインは、好ましくは配列番号157の配列またはそれと少なくとも70%の同一性を有する配列を有する、ヒトCD3ゼータのT細胞一次細胞内シグナル伝達ドメインを含む。
一実施形態では、共刺激シグナル伝達ドメインは、CD28細胞質シグナル伝達ドメイン、4-1BB細胞質シグナル伝達ドメイン、OX40細胞質シグナル伝達ドメイン、ICOS細胞質シグナル伝達ドメイン、CD27細胞質シグナル伝達ドメインおよびDAP10細胞質シグナル伝達ドメインからなる群から選択される。
一実施形態では、本発明によるCARは、
(i)好ましくは配列番号61の配列を有するHCVRおよび好ましくは配列番号134の配列を有するリンカーによって結合された、配列番号81の配列を有するLCVRを含む抗ヒトCD45RC scFv、
(ii)好ましくは配列番号145の配列を有するCD8αに由来するヒンジドメイン、
(iii)好ましくは配列番号153の配列を有するヒトCD8α膜貫通ドメイン、ならびに
(iv)好ましくは配列番号167の配列を有するヒトCD28シグナル伝達ドメインおよび好ましくは配列番号157の配列を有するヒトCD3ゼータシグナル伝達ドメインを含む細胞内シグナル伝達ドメイン、を含む。
本発明はまた、本発明によるCARをコードする核酸に関する。
本発明はまた、本発明による核酸を含む発現ベクターに関する。
本発明はさらに、本発明によるCARを細胞表面で発現するように操作された免疫細胞集団に関する。
一実施形態では、前記免疫細胞集団は、CD45RCneg細胞集団である。
一実施形態では、前記免疫細胞集団は、調節性T細胞集団、エフェクターT細胞集団、メモリーT細胞集団、NKT細胞集団またはMAIT細胞集団である。
一実施形態では、前記免疫細胞集団は、調節性T細胞集団であり、好ましくは、前記調節性T細胞集団は、CD4CD25Foxp3Treg、Tr1細胞、TGF-β分泌Th3細胞、調節性NKT細胞、調節性γδ T細胞、調節性CD8T細胞および二重陰性調節性T細胞からなる群から選択される。
本発明はまた、本発明によるCARを細胞表面に発現するように操作された少なくとも1つの免疫細胞集団を含む組成物に関し、前記組成物は、好ましくは、少なくとも1つの薬学的に許容される賦形剤または担体をさらに含む医薬組成物である。
本発明はさらに、医薬として使用するための本発明による免疫細胞集団または本発明による医薬組成物に関する。
本発明はまた、免疫寛容の誘導、移植拒絶の予防もしくは低減、または移植片対宿主病(GVHD)の予防もしくは治療をそれを必要とする対象に使用するための、本発明による免疫細胞集団または本発明による組成物に関する。
本発明はさらに、自己免疫疾患、望ましくない免疫応答、単原性疾患、リンパ腫および癌からなる群から選択されるCD45RChigh関連症状の予防、低減および/または治療に使用するための本発明による免疫細胞集団または本発明による組成物に関する。
定義
「抗体」または「免疫グロブリン」
本明細書で使用される場合、「免疫グロブリン」という用語は、それが任意の関連する特異的免疫反応性を有するかどうかにかかわらず、2つの重鎖と2つの軽鎖との組み合わせを有するタンパク質を指す。「抗体」は、目的の抗原(例えば、ヒトCD45RC)に対する有意な公知の特異的免疫反応性活性を有するそのようなアセンブリを指す。「抗hCD45RC抗体」という用語は、本明細書では、ヒトCD45RCタンパク質に対して免疫学的特異性を示す抗体を指すために使用される。本明細書の他の箇所で説明されるように、ヒトCD45RCに対する「特異性」は、hCD45RCの種ホモログとの交差反応を除外しない。
抗体および免疫グロブリンは、軽鎖および重鎖を含み、それらの間に鎖間共有結合があってもなくてもよい。脊椎動物系における基本的な免疫グロブリン構造は、比較的よく理解されている。「免疫グロブリン」という一般用語は、生化学的に区別することができる5つの異なるクラスの抗体を含む。以下の考察は、一般に免疫グロブリン分子のIgGクラスを対象とするものであるが、5つのクラスの抗体はすべて本発明の範囲内である。IgGに関して、免疫グロブリンは、分子量約23kDaの2つの同一の軽ポリペプチド鎖および分子量約53~70kDaの2つの同一の重鎖を含む。4つの鎖は、軽鎖が「Y」の口から開始し可変領域を通って続く重鎖を支持する「Y」構成のジスルフィド結合によって結合されている。抗体の軽鎖は、カッパ(κ)またはラムダ(λ)のいずれかとして分類される。各重鎖クラスは、κまたはλ軽鎖のいずれかと結合していてもよい。一般に、免疫グロブリンがハイブリドーマ、B細胞または遺伝子操作された宿主細胞のいずれかによって生成される場合、軽鎖および重鎖は、互いに共有結合し、2つの重鎖の「テール」領域は、共有ジスルフィド結合または非共有結合によって互いに結合する。重鎖において、アミノ酸配列は、Y構成の分枝した末端のN末端から各鎖の底部のC末端まで延びる。当業者は、重鎖がガンマ(γ)、ミュー(μ)、アルファ(α)、デルタ(δ)またはイプシロン(ε)に分類され、それらの中にいくつかのサブクラスがあることを理解するであろう(例えば、γ1-γ4)。抗体の「クラス」をそれぞれIgG、IgM、IgAIgDまたはIgEとして決定するのは、この鎖の性質である。免疫グロブリンサブクラスまたは「アイソタイプ」(例えば、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1など)は、十分に特徴付けられており、機能的特殊化を付与することが公知である。これらのクラスおよびアイソタイプの各々の改変バージョンは、本開示を考慮して当業者に容易に識別可能であり、したがって、本発明の範囲内である。上記のように、抗体の可変領域は、抗体が抗原上のエピトープを選択的に認識し、特異的に結合することを可能にする。すなわち、抗体の軽鎖可変ドメイン(Vドメイン)と重鎖可変ドメイン(Vドメイン)とが組み合わされて、三次元抗原結合部位を規定する可変領域を形成する。この四次抗体構造は、「Y」の各アームの末端に存在する抗原結合部位を形成する。より具体的には、抗原結合部位は、V鎖およびV鎖の各々の3つの相補性決定領域(CDR)によって定義される。
「抗体フラグメント」
本明細書で使用される場合、「抗体フラグメント」という用語は、抗原のエピトープと特異的に相互作用する(例えば、結合、立体障害、安定化/不安定化、空間分布によって)能力を保持する、インタクト抗体の少なくとも一部、好ましくはインタクト抗体の抗原結合領域または可変領域を指す。抗体フラグメントの例には、Fab、Fab’、F(ab’)、Fvフラグメント、scFv抗体フラグメント、ジスルフィド結合Fv(sdFv)、VHおよびCHIドメインからなるFdフラグメント、線状抗体、単一ドメイン抗体、例えばsdAb(VLまたはVHのいずれか)、ラクダ科VHHドメイン、抗体フラグメントから形成された多重特異性抗体、例えばヒンジ領域でジスルフィド架橋によって結合された2つのFabフラグメントを含む二価フラグメント、ならびに抗体の単離されたCDRまたは他のエピトープ結合フラグメントが含まれるが、これらに限定されない。抗原結合フラグメントはまた、単一ドメイン抗体、マキシボディ、ミニボディ、ナノボディ、イントラボディ、ダイアボディ、トリアボディ、テトラボディ、v-NARおよびビス-scFvに組み込むことができる(例えば、Hollinger and Hudson,Nature Biotechnology 23:1126-1136,2005を参照されたい)。抗原結合フラグメントはまた、フィブロネクチンIII型などのポリペプチドに基づく足場にグラフトすることができる(フィブロネクチンポリペプチドミニボディを記載する米国特許第6、703、199号を参照されたい)。抗体のパパイン消化は、「Fab」フラグメントと呼ばれる2つの同一の抗原結合フラグメントおよび容易に結晶化する能力を反映する名称である残留「Fc」フラグメントを産生する。Fabフラグメントは、H鎖の可変領域ドメイン(VH)および1つの重鎖の第1の定常ドメイン(CH1)とともにL鎖全体からなる。各Fabフラグメントは、抗原結合に関して一価であり、すなわち、単一の抗原結合部位を有する。抗体のペプシン処理は、二価の抗原結合活性を有する2つのジスルフィド結合Fabフラグメントにほぼ対応し、依然として抗原を架橋することができる単一の大きなF(ab’)フラグメントを生じる。Fab’フラグメントは、抗体ヒンジ領域からの1つ以上のシステインを含むCH1ドメインのカルボキシ末端にさらなる少数の残基を有することによってFabフラグメントとは異なる。Fab’-SHは、定常ドメインのシステイン残基が遊離チオール基を有するFab’の本明細書における呼称である。F(ab’)抗体フラグメントは、元々、それらの間にヒンジシステインを有するFab’フラグメントの対として産生された。抗体フラグメントの他の化学的カップリングも公知である。
「結合フラグメント」または「抗原結合フラグメント」
本明細書で使用される場合、「結合フラグメント」という用語は、抗体全体よりも少ないアミノ酸残基を含む本発明による抗体の一部または領域を指す。「結合フラグメント」は、抗原に結合し、および/または抗原結合についてそれが由来する抗体全体と競合する(例えば、ヒトCD45RCへの特異的結合)。抗体結合フラグメントは、いかなる単鎖抗体、Fv、Fab、Fab’、Fab’-SH、F(ab)’2、Fd、脱フコシル化抗体、ダイアボディ、トリアボディおよびテトラボディも限定することなく包含する。
「[...]アミノ酸が異なるアミノ酸で置換されていることを特徴とする」
本明細書で使用される場合、所与の配列に関して「[...]アミノ酸が異なるアミノ酸で置換されていることを特徴とする」という語句は、前記配列において「保存的アミノ酸改変」が生じることを指す。
「保存的アミノ酸改変」
本明細書で使用される場合、「保存的アミノ酸改変」という用語は、アミノ酸配列を含有する抗体またはその結合フラグメントの結合特性に有意に影響を及ぼさないかまたは変更させない改変を指す。そのような保存的改変には、アミノ酸の置換、付加および欠失が含まれる。改変は、部位特異的突然変異誘発およびPCR媒介突然変異誘発などの当技術分野で公知の標準的な技術によって、抗体またはその結合フラグメントに導入することができる。
保存的アミノ酸置換は、典型的には、アミノ酸残基が類似の物理化学的特性を有する側鎖を有するアミノ酸残基で置き換えられたものである。特定の可変領域およびCDR配列は、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34以上のアミノ酸の挿入、欠失および/または置換を含み得る。置換が行われる場合、好ましい置換は、保存的改変である。類似の側鎖を有するアミノ酸残基のファミリーは、当技術分野で定義されている。これらのファミリーには、塩基性側鎖(例えば、リジン、アルギニン、ヒスチジン)、酸性側鎖(例えば、アスパラギン酸、グルタミン酸)、非荷電極性側鎖(例えば、グリシン、アスパラギン、グルタミン、セリン、トレオニン、チロシン、システイン、トリプトファン)、非極性側鎖(例えば、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェニルアラニン、メチオニン)、β分岐側鎖(例えば、トレオニン、バリン、イソロイシン)および芳香族側鎖(例えば、チロシン、フェニルアラニン、トリプトファン、ヒスチジン)を有するアミノ酸が含まれる。したがって、本発明による抗体またはその結合フラグメントのCDRおよび/または可変領域内の1以上のアミノ酸残基を、同じ側鎖ファミリーからの他のアミノ酸残基で置き換えることができ、変更した抗体を、本明細書に記載されるアッセイを使用して、保持された機能(すなわち、例えば、hCD45RCへの結合などの本明細書中に記載される特性)について試験することができる。別の実施形態では、本発明による抗体またはその結合フラグメントのCDRおよび/または可変領域内の一連のアミノ酸は、側鎖ファミリーメンバーの順序および/または組成が異なる構造的に類似したストリングと置き換えることができる。
「CDR」または「相補性決定領域」
本明細書で使用される場合、「CDR」または「相補性決定領域」という用語は、重鎖ポリペプチドおよび軽鎖ポリペプチドの両方の可変領域内に見られる不連続な抗原結合部位を指す。CDRは、Kabat et al.,1991.Sequences of proteins of immunological interest(第5版).Bethesda,MD:米国保健福祉省;およびChothia and Lesk,1987.J Mol Biol.196(4):901-17から推論される表1の規則に従って同定した。
Figure 2023518538000001
Figure 2023518538000002
「操作された」
本明細書で使用される場合、「操作された」または「改変された」という用語は、トランスフェクト、形質転換または形質導入された細胞を指す。
「エピトープ」
本明細書で使用される場合、「エピトープ」という用語は、抗体またはその結合フラグメントが結合する1つまたは複数のタンパク質上に位置するアミノ酸の特定の配置を指す。エピトープは、多くの場合、アミノ酸または糖側鎖などの分子の化学的に活性な表面グループからなり、特定の三次元構造特性および特定の電荷特性を有する。エピトープは、線状(もしくは連続的)または立体配座であり得る、すなわち、必ずしも連続していなくてもよい抗原の様々な領域のアミノ酸の2つ以上の配列を伴う。
「フラグメント」
本明細書で使用される場合、抗原の「フラグメント」という用語は、より短いペプチドとしての抗原の任意のサブセットを指す。いくつかの実施形態では、抗原のフラグメントは、少なくとも6アミノ酸長のペプチドである。いくつかの実施形態では、抗原のフラグメントは、6~50アミノ酸長、6~30アミノ酸長または6~20アミノ酸長のペプチドである。
「フレームワーク領域」または「FR」または「非CDR領域」
本明細書で使用される場合、「フレームワーク領域」、「FR」または「非CDR領域」という用語は、可変領域の一部であるがCDRの一部ではないアミノ酸残基(例えば、CDRのKabat/Chothiaの定義を使用する)を含む。したがって、可変領域フレームワークは、約100~120アミノ酸長であるが、CDRの外側のアミノ酸のみを含む。
HCVRの具体例およびKabat/Chothiaによって定義されるCDRについて:
-FR1は、Chothia/AbMの定義によるアミノ酸1~25、またはKabatの定義による後の5残基を包含する可変領域のドメインに対応し得る、
-FR2は、アミノ酸36~49を包含する可変領域のドメインに対応し得る、
-FR3は、アミノ酸67~98を包含する可変領域のドメインに対応し得る、および
FR4は、アミノ酸104~110から可変領域の末端までの可変領域のドメインに対応し得る。
軽鎖のフレームワーク領域は、LCVRのCDRの各々によって同様に分離されている。天然に存在する抗体では、各単量体抗体上に存在する6つのCDRは、抗体が水性環境でその三次元構成をとるときに抗原結合部位を形成するように特異的に位置付けられるアミノ酸の短い不連続配列である。重鎖可変ドメインおよび軽鎖可変ドメインの残りの部分は、アミノ酸配列においてより少ない分子間可変性を示し、フレームワーク領域と称される。フレームワーク領域は、主にβシート立体配座をとり、CDRは、βシート構造を接続し、場合によってはその一部を形成するループを形成する。したがって、これらのフレームワーク領域は、鎖間の非共有結合性相互作用によって6つのCDRを正しい向きに位置付ける足場を形成するように作用する。位置付けられたCDRによって形成される抗原結合部位は、免疫反応性抗原上のエピトープに相補的な表面を画定する。この相補的な表面は、免疫反応性抗原エピトープへの抗体の非共有結合を促進する。CDRの位置は、当業者によって容易に特定され得る。
「重鎖領域」
本明細書で使用される場合、「重鎖領域」という用語は、免疫グロブリン重鎖の定常ドメインに由来するアミノ酸配列を含む。重鎖領域を含むタンパク質は、C1ドメイン、ヒンジ(例えば、上部ヒンジ領域、中間ヒンジ領域および/もしくは下部ヒンジ領域)ドメイン、C2ドメイン、C3ドメイン、またはそれらの変異体もしくはフラグメントのうちの少なくとも1つを含む。一実施形態では、本発明による抗体またはその結合フラグメントは、免疫グロブリン重鎖(例えば、ヒンジ部分、C2ドメインおよびC3ドメイン)のFc領域を含み得る。別の実施形態では、本発明による抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも定常ドメイン(例えば、C2ドメインのすべてまたは一部)の領域を欠く。特定の実施形態では、定常ドメインの少なくとも1つ、好ましくはすべては、ヒト免疫グロブリン重鎖に由来する。例えば、好ましい一実施形態では、重鎖領域は、完全ヒトヒンジドメインを含む。他の好ましい実施形態では、重鎖領域は、完全ヒトFc領域(例えば、ヒト免疫グロブリンからのヒンジ、C2およびC3ドメイン配列)を含む。特定の実施形態では、重鎖領域の構成定常ドメインは、異なる免疫グロブリン分子からのものである。例えば、タンパク質の重鎖領域は、IgG1分子に由来するC2ドメインおよびIgG3またはIgG4分子に由来するヒンジ領域を含み得る。他の実施形態では、定常ドメインは、異なる免疫グロブリン分子の領域を含むキメラドメインである。例えば、ヒンジは、IgG1分子からの第1の領域およびIgG3またはIgG4分子からの第2の領域を含み得る。上記のように、重鎖領域の定常ドメインは、天然に存在する(野生型)免疫グロブリン分子とアミノ酸配列が異なるように改変され得ることが当業者によって理解されるであろう。すなわち、本発明による抗体またはその結合フラグメントは、1つ以上の重鎖定常ドメイン(C1、ヒンジ、C2もしくはC3)および/または軽鎖定常ドメイン(C)に対する変化または改変を含み得る。例示的な改変には、1つ以上のドメインにおける1つ以上のアミノ酸の付加、欠失または置換が含まれる。
「ヒンジ領域」
抗体内で、「ヒンジ領域」という用語は、C1ドメインをC2ドメインに結合する重鎖分子の領域を含む。このヒンジ領域は、約25残基を含み、柔軟であり、したがって2つのN末端抗原結合領域が独立して動くことを可能にする。ヒンジ領域は、3つの異なるドメイン、すなわち上部、中央および下部ヒンジドメインに細分することができる(Roux et al.,1998.J Immunol.161(8):4083-90)。
CAR分子内で、「ヒンジ領域」という用語は、細胞外結合ドメインを膜貫通ドメインと接続する領域を指す。
「超可変ループ」
超可変ループ(HV)は、構造に基づいて定義されるが、CDRは、配列可変性に基づいて定義され(Kabat et al.,1991.Sequences of proteins of immunological interest(第5版).Bethesda、MD:米国保健福祉省)、HVおよびCDRの限界は、いくつかのVおよびVドメインで異なり得るので、「超可変ループ」という用語は、相補性決定領域(CDR)と厳密に同義ではない。VドメインおよびVドメインのCDRは、典型的には、本明細書の上で既に説明したようにKabat/Chothiaの定義によって定義することができる。
「同一性」または「同一」
本明細書で使用される場合、「同一性」または「同一」という用語は、2つ以上のアミノ酸配列または2つ以上の核酸配列の配列間の関係で使用される場合、2つ以上のアミノ酸残基または核酸残基のストリング間のマッチ数によって決定される、アミノ酸配列または核酸配列間の配列関連性の程度を指す。「同一性」は、特定の数学モデルまたはコンピュータプログラム(すなわち、「アルゴリズム」)によって対処されるギャップアラインメント(存在する場合)を有する2つ以上の配列のうちの小さい方の配列間の同一のマッチのパーセントを測定する。
関連するアミノ酸配列または核酸配列の同一性は、公知の方法によって容易に計算することができる。そのような方法には、LeskA.M.(1988).Computational molecular biology:Sources and methods for sequence analysis.New York,NY:Oxford University Press;Smith D.W.(1993).Biocomputing:Informatics and genome projects.San Diego,CA:Academic Press;Griffin A.M.&Griffin H.G.(1994).Computer analysis of sequence data,Part 1.Totowa,NJ:Humana Press;von Heijne G.(1987).Sequence analysis in molecular biology:treasure trove or trivial pursuit.San Diego,CA:Academic press;Gribskov M.R.&Devereux J.(1991).Sequence analysis primer.New York,NY:Stockton Press;Carillo et al.,1988.SIAM J Appl Math.48(5):1073-82に記載されているものが含まれるが、これらに限定されない。
同一性を決定するための好ましい方法は、試験される配列間で最大の一致を与えるように設計される。同一性を決定する方法は、公開されているコンピュータプログラムに記載されている。2つの配列間の同一性を決定するための好ましいコンピュータプログラム方法には、GAP(Genetics Computer Group,University of Wisconsin,Madison,WI;Devereux et al.,1984.Nucleic Acids Res.12(1 Pt 1):387-95),BLASTP,BLASTN,and FASTA(Altschul et al.,1990.J Mol Biol.215(3):403-10)を含むGCGプログラムパッケージが含まれる。BLASTXプログラムは、国立生物工学情報センター(NCBI)および他の情報源(BLAST Manual,Altschulら、NCB/NLM/NIH Bethesda,Md.20894)から公開されている。周知のSmith Watermanアルゴリズムも使用して、同一性を決定し得る。
「免疫細胞」
本明細書で使用される場合、「免疫細胞」という用語は、一般に、骨髄で産生される造血幹細胞(HSC)に由来する白血球(白血球(leukocytes))を含む。免疫細胞の例には、リンパ球(T細胞、B細胞およびナチュラルキラー(NK)細胞)ならびに骨髄由来細胞(好中球、好酸球、好塩基球、単球、マクロファージ、樹状細胞)が含まれるが、これらに限定されない。
「免疫特異的」、「特異的」または「特異的に結合する」
本明細書で使用される場合、抗体またはその結合フラグメントは、検出可能なレベルで抗原(例えば、hCD45RC)と、好ましくは約10-1以上、好ましくは約10-1、10-1、5×10-1、10-1、5×10-1以上を超える親和定数(K)で反応する場合、前記抗原に「免疫特異的」、「特異的」または「特異的に結合する」と言われる。
抗体またはその結合フラグメントのその同族抗原に対する親和性はまた、一般的に、平衡解離定数(K)として表される。抗体またはその結合フラグメントは、検出可能なレベルで抗原(例えば、hCD45RC)と、好ましくは10-6M以下、好ましくは10-7M、5×10-8M、10-8M、5×10-9M、10-9M以下のKで反応する場合、前記抗原に「免疫特異的」、「特異的」または「特異的に結合する」と言われる。
抗体またはその結合フラグメントの親和性は、従来の技術、例えばScatchard,1949.Ann NY Acad Sci.51:660-672によって記載されている技術を使用して容易に決定することができる。抗体またはその結合フラグメントの抗原、細胞または組織への結合特性は、一般に、例えばELISAを含む免疫検出法、免疫組織化学(IHC)および/もしくは蛍光活性化細胞選別(FACS)などの免疫蛍光ベースのアッセイを使用して、または表面プラズモン共鳴(SPR、例えばBIAcore(登録商標)を使用)によって決定および評価することができる。
「単離された抗体」
本明細書で使用される場合、「単離された抗体」という用語は、異なる抗原特異性を有する他の抗体(例えば、hCD45RCに特異的に結合する単離された抗体は、hCD45RC以外の抗原に特異的に結合する抗体を実質的に含まない)を実質的に含まない抗体を指すことを意図している。しかしながら、hCD45RCに特異的に結合する単離された抗体は、他の種からのCD45RC分子などの他の抗原に対して交差反応性を有し得る。さらに、単離された抗体は、他の細胞物質および/または化学物質、特に、酵素、ホルモン、および他のタンパク質性または非タンパク質性成分を含むが、これらに限定されない、抗体の診断的または治療的使用を妨げるものを実質的に含まなくてもよい。
「単離された核酸」
本明細書で使用される場合、「単離された核酸」という用語は、天然の配列に天然に付随する他のゲノムDNA配列ならびにリボソームおよびポリメラーゼなどのタンパク質または複合体から実質的に分離された核酸を指すことを意図している。この用語は、その天然に存在する環境から除去された核酸配列を包含し、組換えまたはクローニングされたDNA単離物および化学合成された類似体または異種系によって生物学的に合成された類似体を含む。実質的に純粋な核酸には、単離された形態の核酸が含まれる。もちろん、これは、最初に単離された核酸を指し、人の手によって単離された核酸に後で付加される遺伝子または配列を除外するものではない。
「リガンド」
本明細書で使用される場合、「リガンド」という用語は、リガンド/受容体対のメンバーを指し、対の他のメンバーに結合する。
「モノクローナル抗体」
本明細書で使用される場合、「モノクローナル抗体」という用語は、実質的に均一な抗体の集団から得られる抗体を指す、すなわち、集団に含まれる個々の抗体は、少量で存在し得る天然に存在する可能性のある突然変異を除いて同一である。モノクローナル抗体は、非常に特異的であり、単一の抗原部位に向けられる。さらに、異なる決定基(エピトープ)に対する異なる抗体を含むポリクローナル抗体調製物とは対照的に、各モノクローナル抗体は、抗原上の単一の決定基に対するものである。モノクローナル抗体は、それらの特異性に加えて、他の抗体によって汚染されずに合成され得るという点で有利である。修飾語「モノクローナル」は、任意の特定の方法による抗体の産生を必要とすると解釈されるべきではない。例えば、本発明によるモノクローナル抗体またはその結合フラグメントは、Kohler et al.,1975.Nature.256(5517):495-7によって最初に記載されたハイブリドーマ方法論によって調製され得るか、または細菌、真核動物もしくは植物細胞において組換えDNA法を使用して作製され得る(特許US4,816,567)。「モノクローナル抗体」はまた、例えば、Clackson et al.,1991.Nature.352(6336):624-8およびMarks et al.,1991.J Mol Biol.222(3):581-97に記載された技術を使用してファージ抗体ライブラリーから単離され得る。
「MAIT細胞」
本明細書で使用される場合、「MAIT細胞」という用語は、粘膜関連インバリアントT細胞を指す。MAIT細胞は、それらのTCRおよびTCR非依存性シグナル(例えば、サイトカイン)を介して活性化することができる。MAIT細胞は、細菌またはウイルス感染を感知し、これらのシグナルに応答してエフェクターサイトカインを産生し、および/または脱顆粒することができる。
「NK細胞」
本明細書で使用される場合、「NK細胞」または「ナチュラルキラー細胞」は、自然免疫において重要な役割を果たす細胞傷害性リンパ球を指す。NK細胞は、常に他の細胞と接触している。NK細胞は、その細胞表面に活性化および阻害受容体を発現する。この機構により、NK細胞は、細胞が「正常」である(したがって、排除されない)かどうか、または細胞が腫瘍細胞もしくは感染細胞などの「異常」である(したがって、死滅する)かどうかを認識することが可能である。
「NKT細胞」
本明細書で使用される場合、「NKT細胞」または「ナチュラルキラーT細胞」は、Tリンパ球マーカーおよびNKリンパ球マーカーを示す細胞傷害性リンパ球を指す。ナチュラルキラー(NK)細胞およびナチュラルキラーT(NKT)細胞は、自然免疫において重要な2種類の細胞である。NK細胞およびNKT細胞はいずれも細胞傷害性細胞であり、病原性細胞ならびに腫瘍細胞の細胞死を誘導する。NK細胞とNKT細胞との主な違いは、NK細胞は、大きな顆粒状リンパ球であるのに対して、NKT細胞は、T細胞の一種であることである。
「核酸」または「ポリヌクレオチド」
本明細書で使用される場合、「核酸」または「ポリヌクレオチド」という用語は、一本鎖または二本鎖形態のいずれかで、デオキシリボ核酸(DNA)またはリボ核酸(RNA)などのホスホジエステル結合によって共有結合したヌクレオチドのポリマーを指す。具体的に限定されない限り、この用語は、参照核酸と同様の結合特性を有し、天然に存在するヌクレオチドと同様の様式で代謝される天然ヌクレオチドの公知の類似体を含有する核酸を包含する。別段示されない限り、特定の核酸配列は、その保存的に改変された変異体(例えば縮重コドン置換)、対立遺伝子、オルソログ、SNPおよび相補的配列、ならびに明示的に示された配列も暗黙的に包含する。具体的には、縮重コドン置換は、1つ以上の選択された(またはすべての)コドンの3番目の位置が混合塩基および/またはデオキシイノシン残基で置換された配列を生成することによって達成され得る(Batzer et al.,Nucleic Acid Res.19:5081(1991);Ohtsuka et al.,J.Biol.Chem.260:2605-2608(1985);およびRossolini et al.,Mol.Cell.Probes 8:91-98(1994))。
「予防する」または「予防すること」または「予防」
本明細書で使用される場合、「予防する」、「予防すること」および「予防」という用語は、予防的および予防手段を指し、目的は、対象が所与の期間にわたって病的状態または障害を発症する可能性を低減することである。そのような低減は、例えば、対象における病的状態または障害の少なくとも1つの症状の発症の遅延に反映され得る。
「プロモーター」
本明細書で使用される場合、「プロモーター」という用語は、ポリヌクレオチド配列の特異的転写を開始するために必要な細胞の合成機構または導入された合成機構によって認識されるDNA配列を指す。
「対象」
本明細書で使用される場合、「対象」という用語は、哺乳動物、好ましくはヒトを指す。一実施形態では、対象は、「患者」、すなわち温血動物、より好ましくはヒトであってもよく、対象は、医療ケアの受領を待っているか、医療ケアを受けているか、医療処置の対象であったか、医療処置の対象であるか、または疾患の発症について監視されている。「哺乳動物」という用語は、本明細書では、ヒト、飼育動物および家畜、ならびに動物園、スポーツ、またはペット動物、例えばイヌ、ネコ、ウシ、ウマ、ヒツジ、ブタ、ヤギ、ウサギなどを含む任意の哺乳動物を指し、好ましくは、哺乳動物は、霊長類であり、より好ましくはヒトである。
「トランスフェクトされた」または「形質転換された」または「形質導入された」
本明細書で使用される場合、「トランスフェクトされた」または「形質転換された」または「形質導入された」という用語は、外因性核酸が宿主細胞に移入または導入されるプロセスを指す。「トランスフェクトされた」または「形質転換された」または「形質導入された」細胞は、外因性核酸でトランスフェクト、形質転換または形質導入された細胞である。細胞は、初代対象細胞およびその子孫を含む。
「治療する」または「治療」または「緩和」
本明細書で使用される場合、「治療する」または「治療」または「緩和」という用語は、予防的または予防手段を除外する治療的処置を指し、この目的は、標的とされる病的状態または障害を減速させる(軽減する)ことである。治療を必要とする者には、既に障害を有する者および障害を有すると疑われる者が含まれる。治療量の本発明による単離された抗体またはその結合フラグメント、核酸、発現ベクター、組成物、医薬組成物または医薬を受けた後、前記対象が、以下のうちの1つ以上の観察可能なおよび/または測定可能な減少を示す場合、対象は、標的病理学的状態または障害について首尾よく「治療」される:CD45RChigh細胞の数の減少、CD45RChighである全細胞のパーセントの減少、特定の疾患もしくは状態に関連する症状のうちの1つ以上のある程度の軽減、罹患率および死亡率の低下、および/または生活の質の問題の改善。疾患の成功した治療および改善を評価するための上記のパラメータは、医師によく知られている日常的な手順によって容易に測定可能である。
「Treg細胞」
本明細書で使用される場合、「Treg細胞」という用語は、例えば自己免疫またはアレルギー反応などの過剰なまたは望ましくない炎症応答を抑制、阻害または予防することができる細胞を指す。一実施形態では、本発明のTreg細胞集団は、抑制活性が可能である。一実施形態では、前記抑制活性は、接触非依存性である。別の実施形態では、前記抑制活性は、接触依存性である。一実施形態では、本発明のTreg細胞集団は、エフェクターT細胞に対する抑制作用を示し、好ましくは前記抑制作用は、TCR発現および/または活性化に依存する。
「Teff細胞」
本明細書で使用される場合、「Teff細胞」という用語は、Tエフェクター細胞を指す。Teff細胞は、CD4+Tヘルパー細胞およびCD8+細胞傷害性T細胞を含む。Teff細胞は、抗原チャレンジ後の細胞媒介性免疫において中心的な役割を果たす。Treg細胞は、Teff細胞の重要な調節因子である。
「メモリーT細胞」
本明細書で使用される場合、「メモリーT細胞」という用語は、以前に遭遇し、それらの同族抗原に応答したT細胞のサブセットを指す。T細胞がまだ抗原に曝露されていないナイーブT細胞と比較して、メモリーT細胞は、より速くより強い免疫応答を高めることができる。
「可変領域」または「可変ドメイン」
本明細書で使用される場合、「可変」という用語は、可変ドメインVおよびVの特定の領域が抗体間で配列が大きく異なり、その標的抗原に対する各特定の抗体の結合および特異性に使用されるという事実を指す。しかしながら、可変性は、抗体の可変ドメイン全体に均一に分布していない。これは、抗原結合部位の一部を形成するVドメインおよびVドメインの各々において「超可変ループ」と呼ばれる3つのセグメントに集中している。
Vλ軽鎖ドメインの第1、第2および第3の超可変ループは、本明細書ではL1(λ)、L2(λ)およびL3(λ)と呼ばれ、Vドメインに残基24~33(L1(λ)9、10または11アミノ酸残基からなる)、49~53L2(λ)、3残基からなる)および90~96(L3(λ)、6残基からなる)を含むものとして定義され得る(Morea et al.,2000.Methods.20(3):267-79)。
Vκ軽鎖ドメインの第1、第2および第3の超可変ループは、本明細書ではL1(κ)、L2(κ)およびL3(κ)と呼ばれ、Vドメインに残基25~33(L1(κ)、6、7、8、11、12または13残基からなる)、49~53(L2(κ)、3残基からなる)および90~97(L3(κ)、6残基からなる)を含むものとして定義され得る(Morea et al.,2000.Methods.20(3):267-79)。
ドメインの第1、第2および第3の超可変ループは、本明細書ではH1、H2およびH3と呼ばれ、Vドメインに残基25~33(H1、7、8または9残基からなる)、52~56(H2、3または4残基からなる)および91~105(H3、長さが非常に可変)を含むものとして定義され得る(Morea et al.,2000.Methods.20(3):267-79)。
別段示されない限り、L1、L2およびL3という用語はそれぞれ、Vドメインの第1、第2および第3の超可変ループを指し、VκアイソタイプおよびVλアイソタイプの両方から得られる超可変ループを包含する。H1、H2およびH3という用語は、それぞれVドメインの第1、第2および第3の超可変ループを指し、ガンマ(γ)、ミュー(μ)、アルファ(α)、デルタ(δ)またはイプシロン(ε)を含む公知の重鎖アイソタイプのいずれかから得られる超可変ループを包含する。超可変ループL1、L2、L3、H1、H2およびH3は各々、本明細書の上で定義されるように、「相補性決定領域」または「CDR」の一部を含み得る。
「変異体」
抗原の「変異体」という用語は、本明細書では、天然抗原とほぼ同一であり、同じ生物学的活性を共有する抗原を指す。天然抗原とその変異体との間の最小差は、例えば、アミノ酸の置換、欠失および/または付加にあり得る。そのような変異体は、例えば、保存的アミノ酸置換を含有し得る。
いくつかの実施形態では、抗原の変異体は、天然抗原の配列と少なくともまたは約70、75、80、85、90、91、92、93、94、95、96、97、98、もしくは99%の配列同一性を示す。
本発明の第1の態様は、ヒトCD45RCに特異的なキメラ抗原受容体(CAR)に関し、前記CARは、前記ヒトCD45RCに結合する少なくとも1つの細胞外結合ドメインを含む。一実施形態では、細胞外結合ドメインは、例えば、以下に記載される抗体またはその結合フラグメントなどの抗原結合ドメインである。
ヒトCD45RC(hCD45RC)に結合する単離された抗体またはその結合フラグメントが本明細書中に開示される。単離された抗体またはその結合フラグメントは、精製されてもよい。
好ましくは、単離された抗体またはその結合フラグメントは、
(1)Lowry法により決定される抗体またはその結合フラグメントの80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%以上を超える重量、最も好ましくは96%、97%、98%または99%を超える重量、
(2)紡糸カップシークエンサーを用いてN末端もしくは内部アミノ酸配列の少なくとも15残基を得るのに十分な程度、または
(3)還元条件下もしくは非還元条件下で、クーマシーブルーまたは好ましくは銀染色を使用してSDS-PAGEによって示される均一性、に精製される。
本明細書に記載の抗体またはその結合フラグメントは、ヒトCD45RC(hCD45RC)に結合する。
本明細書で使用される場合、「CD45」(CD45RまたはPTPRCとしても公知)という用語は、異なるアイソフォームに存在する膜貫通糖タンパク質を指す。CD45のこれらの異なるアイソフォームは、それぞれCD45細胞外領域のA、BおよびC決定基をコードする3つの可変エクソン(エクソン4、5および6)の選択的スプライシングから生じるそれらの細胞外ドメイン構造が異なる。制限されたエピトープと反応する抗体は、「CD45R」としてクラスター化される。したがって、抗CD45RA、抗CD45RBおよび抗CD45RC抗体は、それぞれA、BおよびC決定基の発現を含むCD45アイソフォームを認識する。CD45の様々なアイソフォームは、異なる細胞外ドメインを有するが、膜に近い同一の細胞外配列、ならびに膜貫通ドメインおよび約300残基のタンデムに相同な高度に保存された2つのホスファターゼドメインを含有する大きな細胞質尾部セグメントを有する。CD45およびそのアイソフォームは、TおよびBリンパ球上のリンパ球ホスファターゼ関連ホスホタンパク質(LPAP)と非共有結合する。CD45は、CD1、CD2、CD3およびCD4を含むいくつかの他の細胞表面抗原に関連することが報告されている。CD45は、シグナル伝達リンパ球活性化に関与する。文字「h」(例えば、hCD45)が先行する場合、CD45がヒト起源であることを含意する。
本明細書で使用される場合、「CD45RC」という用語は、当業者に周知の200~220kDaの一本鎖I型膜糖タンパク質を指す。CD45RCは、C決定基(したがって、CD45RCという専門用語、すなわち、C決定基に制限されたCD45)をコードするエクソン6を含むが、AおよびB決定基をそれぞれコードするエクソン4および5を欠く、CD45の選択的スプライシングアイソフォームである。ヒトCD45RCのアミノ酸配列は、UniProt Accession P08575-10(バージョン10、2018年3月28日修正-チェックサム:F92C874C9A114890)に対応して配列番号104で与えられる。このCD45RCアイソフォームは、B細胞、ならびにCD8T細胞およびCD4T細胞のサブセット上で発現されるが、CD8またはCD4Treg、CD14単球またはPMN上では発現されない(Picarda et al.,2017.JCI Insight.2(3):e90088)。いくつかのモノクローナル抗体は、すべての異なるアイソフォームに共通のCD45の部分のエピトープを認識することができるが(これらは、抗CD45抗体と称される)、他のモノクローナル抗体は、それらが認識する決定基に応じて、所与のアイソフォームに対する制限された特異性を有する(A、BまたはC)。文字「h」が先行する場合(例えば、hCD45RC)、CD45RCがヒト起源であることを含意する。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、hCD45RCの細胞外ドメインに結合する。一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、hCD45RCの細胞外ドメイン上に存在する少なくとも1つのエピトープに結合する。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、hCD45のエクソン6によってコードされるC決定基に結合する。一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、hCD45のエクソン6によってコードされるC決定基上の少なくとも1つのエピトープに結合する。
一実施形態では、hCD45のエクソン6によってコードされるC決定基のアミノ酸配列は、配列番号23を含むか、またはそれからなる。一実施形態では、hCD45のC決定基をコードするエクソン6の核酸配列は、配列番号24を含むか、またはそれからなる。
配列番号23
DVPGERSTASTFPTDPVSPLTTTLSLAHHSSAALPARTSNTTITANTS
配列番号24
GATGTCCCAGGAGAGAGGAGTACAGCCAGCACCTTTCCTACAGACCCAGTTTCCCCATTGACAACCACCCTCAGCCTTGCACACCACAGCTCTGCTGCCTTACCTGCACGCACCTCCAACACCACCATCACAGCGAACACCTCA
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号23もしくはそのフラグメントを含むか、またはそれからなる少なくとも1つのエピトープに結合する。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号23もしくはそのフラグメントと少なくとも約70%、好ましくは少なくとも75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する配列を含むか、またはそれからなる少なくとも1つのエピトープに結合する。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号24もしくはそのフラグメントを含むか、またはそれからなる核酸配列によってコードされる少なくとも1つのエピトープに結合する。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号24もしくはそのフラグメントと少なくとも約70%、好ましくは少なくとも75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する配列を含むか、またはそれからなる核酸配列によってコードされる少なくとも1つのエピトープに結合する。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号23の少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46もしくは47個のアミノ酸もしくはそのフラグメント、または配列番号23もしくはそのフラグメントと少なくとも約70%、好ましくは少なくとも75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する配列を含むか、またはそれらからなる少なくとも1つのエピトープに結合する。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号23の少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46もしくは47個の連続アミノ酸もしくはそのフラグメント、または配列番号23もしくはそのフラグメントと少なくとも約70%、好ましくは少なくとも75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する配列を含むか、またはそれらからなる少なくとも1つのエピトープに結合する。
一実施形態では、配列番号23を含むか、またはそれからなる少なくとも1つのエピトープのフラグメントは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46または47個のアミノ酸残基を含むか、またはそれからなる。
一実施形態では、配列番号23を含むか、またはそれからなる少なくとも1つのエピトープのフラグメントは、配列番号23を含むか、またはそれからなる配列の10、20、30、40、50、60、70、80、90、100、110、120、130、140、150、160、170、180、190、200、210、220、230、240、250、260、270、280、290、300、310、320、330、340、350、360、370、380、390、400、410、420、430、440、450、460、470、480、490、500、510、520、530、540、550、560、570、580、590、600、610、620、630、640、650、660、670、680、690、700、710、720、73、740、750、760、770、780、790、800、810、820、830、840、850、860、870、880、890、900、910、920、930、940、950、960、970、980、990、1000、1010、1020、1030、1040、1050、1060、1070、1080、1090、1100以上の連続アミノ酸残基のスパンにわたって広がる1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46または47個のアミノ酸残基を含むか、またはそれらからなる。
一実施形態では、配列番号23を含む配列は、UniProtアクセッションP08575-3(バージョン3、2018年3月28日修正-チェックサム:6E942E2BF6B17AC5)に対応する配列番号99に記載されるhCD45の配列である。
配列番号99(配列番号23には下線が引かれている)
MTMYLWLKLLAFGFAFLDTEVFVTGQSPTPSPTGLTTAKMPSVPLSSDPLPTHTTAFSPASTFERENDFSETTTSLSPDNTSTQVSPDSLDNASAFNTTGVSSVQTPHLPTHADSQTPSAGTDTQTFSGSAANAKLNPTPGSNAISDVPGERSTASTFPTDPVSPLTTTLSLAHHSSAALPARTSNTTITANTSDAYLNASETTTLSPSGSAVISTTTIATTPSKPTCDEKYANITVDYLYNKETKLFTAKLNVNENVECGNNTCTNNEVHNLTECKNASVSISHNSCTAPDKTLILDVPPGVEKFQLHDCTQVEKADTTICLKWKNIETFTCDTQNITYRFQCGNMIFDNKEIKLENLEPEHEYKCDSEILYNNHKFTNASKIIKTDFGSPGEPQIIFCRSEAAHQGVITWNPPQRSFHNFTLCYIKETEKDCLNLDKNLIKYDLQNLKPYTKYVLSLHAYIIAKVQRNGSAAMCHFTTKSAPPSQVWNMTVSMTSDNSMHVKCRPPRDRNGPHERYHLEVEAGNTLVRNESHKNCDFRVKDLQYSTDYTFKAYFHNGDYPGEPFILHHSTSYNSKALIAFLAFLIIVTSIALLVVLYKIYDLHKKRSCNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFPIKEARKPFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVDDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEEGTRAFGDVVVKINQHKRCPDYIIQKLNIVNKKEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLLLKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENKVDVYGYVVKLRRQRCLMVQVEAQYILIHQALVEYNQFGETEVNLSELHPYLHNMKKRDPPSEPSPLEAEFQRLPSYRSWRTQHIGNQEENKSKNRNSNVIPYDYNRVPLKHELEMSKESEHDSDESSDDDSDSEEPSKYINASFIMSYWKPEVMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELKHGDQEICAQYWGEGKQTYGDIEVDLKDTDKSSTYTLRVFELRHSKRKDSRTVYQYQYTNWSVEQLPAEPKELISMIQVVKQKLPQKNSSEGNKHHKSTPLLIHCRDGSQQTGIFCALLNLLESAETEEVVDIFQVVKALRKARPGMVSTFEQYQFLYDVIASTYPAQNGQVKKNNHQEDKIEFDNEVDKVKQDANCVNPLGAPEKLPEAKEQAEGSEPTSGTEGPEHSVNGPASPALNQGS
一実施形態では、配列番号23を含む配列は、UniProtアクセッションP08575-10(バージョン10、2018年3月28日修正-チェックサム:F92C874C9A114890)に対応する配列番号104に記載されるhCD45RCの配列である。
配列番号104(配列番号23には下線が引かれている)
MTMYLWLKLLAFGFAFLDTEVFVTGQSPTPSPTDVPGERSTASTFPTDPVSPLTTTLSLAHHSSAALPARTSNTTITANTSDAYLNASETTTLSPSGSAVISTTTIATTPSKPTCDEKYANITVDYLYNKETKLFTAKLNVNENVECGNNTCTNNEVHNLTECKNASVSISHNSCTAPDKTLILDVPPGVEKFQLHDCTQVEKADTTICLKWKNIETFTCDTQNITYRFQCGNMIFDNKEIKLENLEPEHEYKCDSEILYNNHKFTNASKIIKTDFGSPGEPQIIFCRSEAAHQGVITWNPPQRSFHNFTLCYIKETEKDCLNLDKNLIKYDLQNLKPYTKYVLSLHAYIIAKVQRNGSAAMCHFTTKSAPPSQVWNMTVSMTSDNSMHVKCRPPRDRNGPHERYHLEVEAGNTLVRNESHKNCDFRVKDLQYSTDYTFKAYFHNGDYPGEPFILHHSTSYNSKALIAFLAFLIIVTSIALLVVLYKIYDLHKKRSCNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFPIKEARKPFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVDDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEEGTRAFGDVVVKINQHKRCPDYIIQKLNIVNKKEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLLLKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENKVDVYGYVVKLRRQRCLMVQVEAQYILIHQALVEYNQFGETEVNLSELHPYLHNMKKRDPPSEPSPLEAEFQRLPSYRSWRTQHIGNQEENKSKNRNSNVIPYDYNRVPLKHELEMSKESEHDSDESSDDDSDSEEPSKYINASFIMSYWKPEVMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELKHGDQEICAQYWGEGKQTYGDIEVDLKDTDKSSTYTLRVFELRHSKRKDSRTVYQYQYTNWSVEQLPAEPKELISMIQVVKQKLPQKNSSEGNKHHKSTPLLIHCRDGSQQTGIFCALLNLLESAETEEVVDIFQVVKALRKARPGMVSTFEQYQFLYDVIASTYPAQNGQVKKNNHQEDKIEFDNEVDKVKQDANCVNPLGAPEKLPEAKEQAEGSEPTSGTEGPEHSVNGPASPALNQGS
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、hCD45のエクソン4によってコードされるA決定基に結合しない。一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、hCD45のエクソン4によってコードされるA決定基上の少なくとも1つのエピトープに結合しない。
一実施形態では、hCD45のエクソン4によってコードされるA決定基のアミノ酸配列は、配列番号105を含むか、またはそれからなる。
配列番号105
GLTTAKMPSVPLSSDPLPTHTTAFSPASTFERENDFSETTTSLSPDNTSTQVSPDSLDNASAFNTT
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、hCD45のエクソン5によってコードされるB決定基に結合しない。一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、hCD45のエクソン5によってコードされるB決定基上の少なくとも1つのエピトープに結合しない。
一実施形態では、hCD45のエクソン5によってコードされるB決定基のアミノ酸配列は、配列番号106を含むか、またはそれからなる。
配列番号106
GVSSVQTPHLPTHADSQTPSAGTDTQTFSGSAANAKLNPTPGSNAIS
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、hCD45RAに結合しない。一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、hCD45RAの少なくとも1つのエピトープに結合しない。
一実施形態では、hCD45RAのアミノ酸配列は、UniProtアクセッションP08575-8(バージョン8、2018年3月28日修正-チェックサム:F42C1FEC9EDE4BC0)に対応する配列番号107を含むか、またはそれからなる。
配列番号107
MTMYLWLKLLAFGFAFLDTEVFVTGQSPTPSPTGLTTAKMPSVPLSSDPLPTHTTAFSPASTFERENDFSETTTSLSPDNTSTQVSPDSLDNASAFNTTDAYLNASETTTLSPSGSAVISTTTIATTPSKPTCDEKYANITVDYLYNKETKLFTAKLNVNENVECGNNTCTNNEVHNLTECKNASVSISHNSCTAPDKTLILDVPPGVEKFQLHDCTQVEKADTTICLKWKNIETFTCDTQNITYRFQCGNMIFDNKEIKLENLEPEHEYKCDSEILYNNHKFTNASKIIKTDFGSPGEPQIIFCRSEAAHQGVITWNPPQRSFHNFTLCYIKETEKDCLNLDKNLIKYDLQNLKPYTKYVLSLHAYIIAKVQRNGSAAMCHFTTKSAPPSQVWNMTVSMTSDNSMHVKCRPPRDRNGPHERYHLEVEAGNTLVRNESHKNCDFRVKDLQYSTDYTFKAYFHNGDYPGEPFILHHSTSYNSKALIAFLAFLIIVTSIALLVVLYKIYDLHKKRSCNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFPIKEARKPFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVDDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEEGTRAFGDVVVKINQHKRCPDYIIQKLNIVNKKEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLLLKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENKVDVYGYVVKLRRQRCLMVQVEAQYILIHQALVEYNQFGETEVNLSELHPYLHNMKKRDPPSEPSPLEAEFQRLPSYRSWRTQHIGNQEENKSKNRNSNVIPYDYNRVPLKHELEMSKESEHDSDESSDDDSDSEEPSKYINASFIMSYWKPEVMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELKHGDQEICAQYWGEGKQTYGDIEVDLKDTDKSSTYTLRVFELRHSKRKDSRTVYQYQYTNWSVEQLPAEPKELISMIQVVKQKLPQKNSSEGNKHHKSTPLLIHCRDGSQQTGIFCALLNLLESAETEEVVDIFQVVKALRKARPGMVSTFEQYQFLYDVIASTYPAQNGQVKKNNHQEDKIEFDNEVDKVKQDANCVNPLGAPEKLPEAKEQAEGSEPTSGTEGPEHSVNGPASPALNQGS
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、hCD45RBに結合しない。一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、hCD45RBの少なくとも1つのエピトープに結合しない。
一実施形態では、hCD45RBのアミノ酸配列は、UniProtアクセッションP08575-9(バージョン9、2018年3月28日修正-チェックサム:745870037910C575)に対応する配列番号108を含むか、またはそれからなる。
配列番号108
MTMYLWLKLLAFGFAFLDTEVFVTGQSPTPSPTGVSSVQTPHLPTHADSQTPSAGTDTQTFSGSAANAKLNPTPGSNAISDAYLNASETTTLSPSGSAVISTTTIATTPSKPTCDEKYANITVDYLYNKETKLFTAKLNVNENVECGNNTCTNNEVHNLTECKNASVSISHNSCTAPDKTLILDVPPGVEKFQLHDCTQVEKADTTICLKWKNIETFTCDTQNITYRFQCGNMIFDNKEIKLENLEPEHEYKCDSEILYNNHKFTNASKIIKTDFGSPGEPQIIFCRSEAAHQGVITWNPPQRSFHNFTLCYIKETEKDCLNLDKNLIKYDLQNLKPYTKYVLSLHAYIIAKVQRNGSAAMCHFTTKSAPPSQVWNMTVSMTSDNSMHVKCRPPRDRNGPHERYHLEVEAGNTLVRNESHKNCDFRVKDLQYSTDYTFKAYFHNGDYPGEPFILHHSTSYNSKALIAFLAFLIIVTSIALLVVLYKIYDLHKKRSCNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFPIKEARKPFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVDDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEEGTRAFGDVVVKINQHKRCPDYIIQKLNIVNKKEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLLLKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENKVDVYGYVVKLRRQRCLMVQVEAQYILIHQALVEYNQFGETEVNLSELHPYLHNMKKRDPPSEPSPLEAEFQRLPSYRSWRTQHIGNQEENKSKNRNSNVIPYDYNRVPLKHELEMSKESEHDSDESSDDDSDSEEPSKYINASFIMSYWKPEVMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELKHGDQEICAQYWGEGKQTYGDIEVDLKDTDKSSTYTLRVFELRHSKRKDSRTVYQYQYTNWSVEQLPAEPKELISMIQVVKQKLPQKNSSEGNKHHKSTPLLIHCRDGSQQTGIFCALLNLLESAETEEVVDIFQVVKALRKARPGMVSTFEQYQFLYDVIASTYPAQNGQVKKNNHQEDKIEFDNEVDKVKQDANCVNPLGAPEKLPEAKEQAEGSEPTSGTEGPEHSVNGPASPALNQGS
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、hCD45RABに結合しない。一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、hCD45RABの少なくとも1つのエピトープに結合しない。
一実施形態では、hCD45RABのアミノ酸配列は、UniProtアクセッションP08575-5(バージョン5、2018年3月28日修正-チェックサム:EA40BE995CD98F7C)に対応する配列番号109を含むか、またはそれからなる。
配列番号109
MTMYLWLKLLAFGFAFLDTEVFVTGQSPTPSPTGLTTAKMPSVPLSSDPLPTHTTAFSPASTFERENDFSETTTSLSPDNTSTQVSPDSLDNASAFNTTGVSSVQTPHLPTHADSQTPSAGTDTQTFSGSAANAKLNPTPGSNAISDAYLNASETTTLSPSGSAVISTTTIATTPSKPTCDEKYANITVDYLYNKETKLFTAKLNVNENVECGNNTCTNNEVHNLTECKNASVSISHNSCTAPDKTLILDVPPGVEKFQLHDCTQVEKADTTICLKWKNIETFTCDTQNITYRFQCGNMIFDNKEIKLENLEPEHEYKCDSEILYNNHKFTNASKIIKTDFGSPGEPQIIFCRSEAAHQGVITWNPPQRSFHNFTLCYIKETEKDCLNLDKNLIKYDLQNLKPYTKYVLSLHAYIIAKVQRNGSAAMCHFTTKSAPPSQVWNMTVSMTSDNSMHVKCRPPRDRNGPHERYHLEVEAGNTLVRNESHKNCDFRVKDLQYSTDYTFKAYFHNGDYPGEPFILHHSTSYNSKALIAFLAFLIIVTSIALLVVLYKIYDLHKKRSCNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFPIKEARKPFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVDDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEEGTRAFGDVVVKINQHKRCPDYIIQKLNIVNKKEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLLLKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENKVDVYGYVVKLRRQRCLMVQVEAQYILIHQALVEYNQFGETEVNLSELHPYLHNMKKRDPPSEPSPLEAEFQRLPSYRSWRTQHIGNQEENKSKNRNSNVIPYDYNRVPLKHELEMSKESEHDSDESSDDDSDSEEPSKYINASFIMSYWKPEVMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELKHGDQEICAQYWGEGKQTYGDIEVDLKDTDKSSTYTLRVFELRHSKRKDSRTVYQYQYTNWSVEQLPAEPKELISMIQVVKQKLPQKNSSEGNKHHKSTPLLIHCRDGSQQTGIFCALLNLLESAETEEVVDIFQVVKALRKARPGMVSTFEQYQFLYDVIASTYPAQNGQVKKNNHQEDKIEFDNEVDKVKQDANCVNPLGAPEKLPEAKEQAEGSEPTSGTEGPEHSVNGPASPALNQGS
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、hCD45R0に結合しない。一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、hCD45R0の少なくとも1つのエピトープに結合しない。
一実施形態では、hCD45R0のアミノ酸配列は、UniProtアクセッションP08575-4(バージョン4、2018年3月28日修正-チェックサム:D3CB364EF4243384)に対応する配列番号110を含むか、またはそれからなる。
配列番号110
MTMYLWLKLLAFGFAFLDTEVFVTGQSPTPSPTDAYLNASETTTLSPSGSAVISTTTIATTPSKPTCDEKYANITVDYLYNKETKLFTAKLNVNENVECGNNTCTNNEVHNLTECKNASVSISHNSCTAPDKTLILDVPPGVEKFQLHDCTQVEKADTTICLKWKNIETFTCDTQNITYRFQCGNMIFDNKEIKLENLEPEHEYKCDSEILYNNHKFTNASKIIKTDFGSPGEPQIIFCRSEAAHQGVITWNPPQRSFHNFTLCYIKETEKDCLNLDKNLIKYDLQNLKPYTKYVLSLHAYIIAKVQRNGSAAMCHFTTKSAPPSQVWNMTVSMTSDNSMHVKCRPPRDRNGPHERYHLEVEAGNTLVRNESHKNCDFRVKDLQYSTDYTFKAYFHNGDYPGEPFILHHSTSYNSKALIAFLAFLIIVTSIALLVVLYKIYDLHKKRSCNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFPIKEARKPFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVDDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEEGTRAFGDVVVKINQHKRCPDYIIQKLNIVNKKEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLLLKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDAMLEGLEAENKVDVYGYVVKLRRQRCLMVQVEAQYILIHQALVEYNQFGETEVNLSELHPYLHNMKKRDPPSEPSPLEAEFQRLPSYRSWRTQHIGNQEENKSKNRNSNVIPYDYNRVPLKHELEMSKESEHDSDESSDDDSDSEEPSKYINASFIMSYWKPEVMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELKHGDQEICAQYWGEGKQTYGDIEVDLKDTDKSSTYTLRVFELRHSKRKDSRTVYQYQYTNWSVEQLPAEPKELISMIQVVKQKLPQKNSSEGNKHHKSTPLLIHCRDGSQQTGIFCALLNLLESAETEEVVDIFQVVKALRKARPGMVSTFEQYQFLYDVIASTYPAQNGQVKKNNHQEDKIEFDNEVDKVKQDANCVNPLGAPEKLPEAKEQAEGSEPTSGTEGPEHSVNGPASPALNQGS
一実施形態では、少なくとも1つのエピトープは、立体構造エピトープである。別の実施形態では、少なくとも1つのエピトープは、連続エピトープである。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、約5×10-7M以下、好ましくは約2.5×10-7M以下、約1×10-7M以下、約7.5×10-8M以下、約5×10-8M以下、約1×10-8M以下の平衡解離定数(K)でhCD45RCに結合する。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、約1×10-1sec-1以上、好ましくは約5×10-1sec-1以上、約1×10-1sec-1以上、約2.5×10-1sec-1以上、約5×10-1sec-1以上の会合速度(Kon)でhCD45RCに結合する。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、約5×10-2sec-1以下、好ましくは約4×10-2sec-1以下、約3×10-2sec-1以下、約2×10-2sec-1以下、約1.5×10-2sec-1以下の解離速度(Koff)でhCD45RCに結合する。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、
-約5×10-7M以下、好ましくは約2.5×10-7M以下、約1×10-7M以下、約7.5×10-8M以下、約5×10-8M以下、約1×10-8M以下の平衡解離定数(K)、
-約1×10-1sec-1以上、好ましくは約5×10-1sec-1以上、約1×10-1sec-1以上、約2.5×10-1sec-1以上、約5×10-1sec-1以上の会合速度(Kon)、および
-約5×10-2sec-1以下、好ましくは約4×10-2sec-1以下、約3×10-2sec-1以下、約2×10-2sec-1以下、約1.5×10-2sec-1以下の解離速度(Koff)、のうちの少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは3つでhCD45RCに結合する。
抗体またはその結合フラグメントのそのリガンドに対する親和性(例えば、K、koff、およびkonを決定することを含む)を決定するための方法は、当技術分野で周知であり、表面プラズモン共鳴(SPR)、蛍光活性化細胞選別(FACS)、酵素結合免疫吸着アッセイ(ELISA)、AlphaLISAおよびKinExAを含むが、これらに限定されない。
好ましい方法は、抗体またはその結合フラグメントの親和性を決定するために固定化CD45RCを使用するSPRに依存するBIAcore(登録商標)である。この方法を実施する方法は、実施例の節でさらに説明される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、ポリクローナル抗体またはその結合フラグメントである。
好ましい実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、モノクローナル抗体またはその結合フラグメントである。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、抗体全体、一本鎖抗体、二量体一本鎖抗体、単一ドメイン抗体、Fv、Fab、Fab’、Fab’-SH、F(ab)’2、Fd、脱フコシル化抗体、二重特異性抗体、ダイアボディ、トリアボディおよびテトラボディを含むか、またはそれらからなる群から選択される分子である。
抗体結合フラグメントは、標準的な方法を使用して得ることができる。例えば、FabまたはF(ab’)2フラグメントは、従来の技術に従って、単離された抗体のプロテアーゼ消化によって産生され得る。抗体またはその結合フラグメントを、公知の方法を使用して改変することができることも理解されよう。例えば、インビボでのクリアランスを遅らせ、より望ましい薬物動態学的プロファイルを得るために、抗体またはその結合フラグメントは、ポリエチレングリコール(PEG)で改変され得る。PEGを抗体またはその結合フラグメントに連結および部位特異的にコンジュゲート化するための方法は、例えば、Leong et al.,2001.Cytokine.16(3):106-19;Delgado et al.,1996.Br J Cancer.73(2):175-82に記載されている。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、ユニボディ、ドメイン抗体およびナノボディを含むか、またはそれらからなる群から選択される分子である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、アフィボディ、アフィリン、アフィチン、アデクチン、アトマー、エバシン、DARPin、アンチカリン、アビマー、フィノマー、バーサボディおよびデュオカリンを含むか、またはそれらからなる群から選択される模倣物である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントはまた、多重特異性抗体またはその結合フラグメント、すなわち、その1つが本発明によるhCD45RCである、2つ以上、例えば少なくとも2つの異なる抗原に対して免疫特異性である多重特異性抗体またはその結合フラグメントを包含する。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントはまた、抗体のポリマーまたはその結合フラグメント、すなわち同一であるか異なるかにかかわらず、直接的または間接的に共有結合している2つ以上、例えば少なくとも2つの抗体またはその結合フラグメントを包含する。
以下では、特に明記しない限り、CDRの番号付けおよび定義は、Kabat/Chothiaの定義に従う。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは以下の3つの相補性決定領域(CDR)を含む重鎖可変領域(本明細書ではHCVRまたはVと略される)を含み:
-CDR1:NYYIG(配列番号1)、
-CDR2:X-IF-X-GG-X-Y-X-N-X-X-X-X-X-X10-G(配列番号2)、および
-CDR3:RNFDY(配列番号3)、
は、Asp(D)、Ile(I)およびArg(R)から選択され、
は、Pro(P)およびSer(S)から選択され、
は、Asp(D)、Ser(S)およびGly(G)から選択され、
は、Ala(A)およびThr(T)から選択され、
は、Ser(S)およびTyr(Y)から選択され、
は、Asn(N)、Ala(A)およびSer(S)から選択され、
は、Glu(E)、Asp(D)、Pro(P)およびGln(Q)から選択され、
は、Lys(K)およびSer(S)から選択され、
は、Phe(F)およびVal(V)から選択され、
10は、Lys(K)およびGln(Q)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、以下の3つのCDRを含み:
-CDR1:NYYIG(配列番号1)、
-CDR2:X-IF-X-GG-X-Y-X-N-X-X-X-X-X-X10-G(配列番号2)、および
-CDR3:RNFDY(配列番号3)、
DIFPGGDYANSNEKFKG
は、Asp(D)、Ile(I)およびArg(R)から選択され、
は、Pro(P)およびSer(S)から選択され、
は、Asp(D)、Ser(S)およびGly(G)から選択され、
は、Ala(A)およびThr(T)から選択され、
は、Ser(S)およびTyr(Y)から選択され、
は、Asn(N)、Ala(A)およびSer(S)から選択され、
は、Glu(E)、Asp(D)、Pro(P)およびGln(Q)から選択され、
は、Lys(K)およびSer(S)から選択され、
は、Phe(F)およびVal(V)から選択され、
10は、Lys(K)およびGln(Q)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは以下の3つのCDRを含む:
-CDR1:NYYIG(配列番号1)、
-CDR2:DIFPGGDYANSNEKFKG(配列番号4)、および
-CDR3:RNFDY(配列番号3)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、以下の3つのCDRを含む:
-CDR1:NYYIG(配列番号1)、
-CDR2:DIFPGGDYANSNEKFKG(配列番号4)、および
-CDR3:RNFDY(配列番号3)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは以下の3つのCDRを含む:
-CDR1:NYYIG(配列番号1)、
-CDR2:DIFPGGDYANSNEKVKG(配列番号5)、および
-CDR3:RNFDY(配列番号3)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、以下の3つのCDRを含む:
-CDR1:NYYIG(配列番号1)、
-CDR2:DIFPGGDYANSNEKVKG(配列番号5)、および
-CDR3:RNFDY(配列番号3)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは以下の3つのCDRを含む:
-CDR1:NYYIG(配列番号1)、
-CDR2:DIFPGGGYTNYAEKFQG(配列番号6)、および
-CDR3:RNFDY(配列番号3)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、以下の3つのCDRを含む:
-CDR1:NYYIG(配列番号1)、
-CDR2:DIFPGGGYTNYAEKFQG(配列番号6)、および
-CDR3:RNFDY(配列番号3)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは以下の3つのCDRを含む:
-CDR1:NYYIG(配列番号1)、
-CDR2:DIFPGGSYTNYSESFQG(配列番号7)、および
-CDR3:RNFDY(配列番号3)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、以下の3つのCDRを含む:
-CDR1:NYYIG(配列番号1)、
-CDR2:DIFPGGSYTNYSESFQG(配列番号7)、および
-CDR3:RNFDY(配列番号3)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは以下の3つのCDRを含む:
-CDR1:NYYIG(配列番号1)、
-CDR2:DIFPGGSYTNYADSVKG(配列番号8)、および
-CDR3:RNFDY(配列番号3)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、以下の3つのCDRを含む:
-CDR1:NYYIG(配列番号1)、
-CDR2:DIFPGGSYTNYADSVKG(配列番号8)、および
-CDR3:RNFDY(配列番号3)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは以下の3つのCDRを含む:
-CDR1:NYYIG(配列番号1)、
-CDR2:RIFPGGGYTNYAQKFQG(配列番号9)、および
-CDR3:RNFDY(配列番号3)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、以下の3つのCDRを含む:
-CDR1:NYYIG(配列番号1)、
-CDR2:RIFPGGGYTNYAQKFQG(配列番号9)、および
-CDR3:RNFDY(配列番号3)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは以下の3つのCDRを含む:
-CDR1:NYYIG(配列番号1)、
-CDR2:IIFPGGSYTNYSPSFQG(配列番号10)、および
-CDR3:RNFDY(配列番号3)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、以下の3つのCDRを含む:
-CDR1:NYYIG(配列番号1)、
-CDR2:IIFPGGSYTNYSPSFQG(配列番号10)、および
-CDR3:RNFDY(配列番号3)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは以下の3つのCDRを含む:
-CDR1:NYYIG(配列番号1)、
-CDR2:DIFSGGSYTNYADSVKG(配列番号11)、および
-CDR3:RNFDY(配列番号3)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、以下の3つのCDRを含む:
-CDR1:NYYIG(配列番号1)、
-CDR2:DIFSGGSYTNYADSVKG(配列番号11)、および
-CDR3:RNFDY(配列番号3)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは以下の3つのCDRを含む:
-CDR1:NYYIG(配列番号1)、
-CDR2:DIFPGGDYTNYAEKFQG(配列番号100)、および
-CDR3:RNFDY(配列番号3)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、以下の3つのCDRを含む:
-CDR1:NYYIG(配列番号1)、
-CDR2:DIFPGGDYTNYAEKFQG(配列番号100)、および
-CDR3:RNFDY(配列番号3)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは以下の3つのCDRを含む:
-CDR1:NYYIG(配列番号1)、
-CDR2:DIFPGGGYANYAEKFQG(配列番号116)、および
-CDR3:RNFDY(配列番号3)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、以下の3つのCDRを含む:
-CDR1:NYYIG(配列番号1)、
-CDR2:DIFPGGGYANYAEKFQG(配列番号116)、および
-CDR3:RNFDY(配列番号3)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは以下の3つのCDRを含む:
-CDR1:NYYIG(配列番号1)、
-CDR2:DIFPGGGYTNYAEKFKG(配列番号117)、および
-CDR3:RNFDY(配列番号3)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、以下の3つのCDRを含む:
-CDR1:NYYIG(配列番号1)、
-CDR2:DIFPGGGYTNYAEKFKG(配列番号117)、および
-CDR3:RNFDY(配列番号3)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは以下の3つのCDRを含む:
-CDR1:NYYIG(配列番号1)、
-CDR2:DIFPGGGYTNYNEKFQG(配列番号118)、および
-CDR3:RNFDY(配列番号3)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、以下の3つのCDRを含む:
-CDR1:NYYIG(配列番号1)、
-CDR2:DIFPGGGYTNYNEKFQG(配列番号118)、および
-CDR3:RNFDY(配列番号3)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは以下の3つのCDRを含む:
-CDR1:NYYIG(配列番号1)、
-CDR2:DIFPGGGYTNSAEKFQG(配列番号119)、および
-CDR3:RNFDY(配列番号3)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、以下の3つのCDRを含む:
-CDR1:NYYIG(配列番号1)、
-CDR2:DIFPGGGYTNSAEKFQG(配列番号119)、および
-CDR3:RNFDY(配列番号3)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは以下の3つの相補性決定領域(CDR)を含む軽鎖可変領域(本明細書ではLCVRまたはVと略される)を含み:
-CDR1:X11-ASSSVS-X12-YMH(配列番号12)、
-CDR2:X13-TSN-X14-X15-X16(配列番号13)、および
-CDR3:X17-QRSSYPLTF(配列番号14)、
11は、Ser(S)およびArg(R)から選択され、
12は、存在しないか、またはAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択され、
13は、Asn(N)およびAla(A)から選択され、またはX13は、Ala(A)もしくはAsn(N)以外の任意のアミノ酸であり、
14は、Leu(L)、Ser(S)およびArg(R)から選択され、
15は、Pro(P)、Ala(A)およびGln(Q)から選択され、
16は、Ser(S)およびThr(T)から選択され、
17は、Gln(Q)およびHis(H)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、以下の3つのCDRを含み:
-CDR1:X11-ASSSVS-X12-YMH(配列番号12)、
-CDR2:X13-TSN-X14-X15-X16(配列番号13)、および
-CDR3:X17-QRSSYPLTF(配列番号14)、
11は、Ser(S)およびArg(R)から選択され、
12は、存在しないか、またはAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択され、
13は、Asn(N)およびAla(A)から選択され、またはX13は、Ala(A)またはAsn(N)以外の任意のアミノ酸であり、
14は、Leu(L)、Ser(S)およびArg(R)から選択され、
15は、Pro(P)、Ala(A)およびGln(Q)から選択され、
16は、Ser(S)およびThr(T)から選択され、
17は、Gln(Q)およびHis(H)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは以下の3つの相補性決定領域(CDR)を含み:
-CDR1:X11-ASSSVS-X12-YMH(配列番号12)、
-CDR2:X13-TSN-X14-X15-X16(配列番号13)、および
-CDR3:X17-QRSSYPLTF(配列番号14)、
11は、Ser(S)であり、
12は、存在しないか、またはAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択され、
13は、Asn(N)であり、またはX13は、Ala(A)もしくはAsn(N)以外の任意のアミノ酸であり、
14は、Leu(L)であり、
15は、Pro(P)であり、
16は、Ser(S)であり、
17は、Gln(Q)である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、以下の3つのCDRを含み:
-CDR1:X11-ASSSVS-X12-YMH(配列番号12)、
-CDR2:X13-TSN-X14-X15-X16(配列番号13)、および
-CDR3:X17-QRSSYPLTF(配列番号14)、
11は、Ser(S)であり、
12は、存在しないか、またはAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択され、
13は、Asn(N)であり、またはX13は、Ala(A)もしくはAsn(N)以外の任意のアミノ酸であり、
14は、Leu(L)であり、
15は、Pro(P)であり、
16は、Ser(S)であり、
17は、Gln(Q)である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは以下の3つのCDRを含み:
-CDR1:SASSSVS-X12-YMH(配列番号15)、
-CDR2:NTSNLPS(配列番号16)、および
-CDR3:QQRSSYPLTF(配列番号17)、
12は、存在しないか、またはAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、以下の3つのCDRを含み:
-CDR1:SASSSVS-X12-YMH(配列番号15)、
-CDR2:NTSNLPS(配列番号16)、および
-CDR3:QQRSSYPLTF(配列番号17)、
12は、存在しないか、またはAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは以下の3つのCDRを含む:
-CDR1:SASSSVSYMH(配列番号15)、
-CDR2:NTSNLPS(配列番号16)、および
-CDR3:QQRSSYPLTF(配列番号17)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、以下の3つのCDRを含む:
-CDR1:SASSSVSYMH(配列番号15)、
-CDR2:NTSNLPS(配列番号16)、および
-CDR3:QQRSSYPLTF(配列番号17)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは以下の3つのCDRを含み:
-CDR1:SASSSVS-X12-YMH(配列番号15)、
-CDR2:NTSNLPS(配列番号16)、および
-CDR3:QQRSSYPLTF(配列番号17)、
12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、以下の3つのCDRを含み:
-CDR1:SASSSVS-X12-YMH(配列番号15)、
-CDR2:NTSNLPS(配列番号16)、および
-CDR3:QQRSSYPLTF(配列番号17)、
12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは以下の3つのCDRを含み:
-CDR1:RASSSVS-X12-YMH(配列番号18)、
-CDR2:NTSNLPS(配列番号16)、および
-CDR3:QQRSSYPLTF(配列番号17)、
12は、存在しないか、またはAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、以下の3つのCDRを含み:
-CDR1:RASSSVS-X12-YMH(配列番号18)、
-CDR2:NTSNLPS(配列番号16)、および
-CDR3:QQRSSYPLTF(配列番号17)、
12は、存在しないか、またはAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは以下の3つのCDRを含む:
-CDR1:RASSSVSYMH(配列番号18)、
-CDR2:NTSNLPS(配列番号16)、および
-CDR3:QQRSSYPLTF(配列番号17)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、以下の3つのCDRを含む:
-CDR1:RASSSVSYMH(配列番号18)、
-CDR2:NTSNLPS(配列番号16)、および
-CDR3:QQRSSYPLTF(配列番号17)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは以下の3つのCDRを含み:
-CDR1:RASSSVS-X12-YMH(配列番号18)、
-CDR2:NTSNLPS(配列番号16)、および
-CDR3:QQRSSYPLTF(配列番号17)、
12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、以下の3つのCDRを含み:
-CDR1:RASSSVS-X12-YMH(配列番号18)、
-CDR2:NTSNLPS(配列番号16)、および
-CDR3:QQRSSYPLTF(配列番号17)、
12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは以下の3つのCDRを含み:
-CDR1:RASSSVS-X12-YMH(配列番号18)、
-CDR2:NTSNSPS(配列番号19)、および
-CDR3:QQRSSYPLTF(配列番号17)、
12は、存在しないか、またはAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、以下の3つのCDRを含み:
-CDR1:RASSSVS-X12-YMH(配列番号18)、
-CDR2:NTSNSPS(配列番号19)、および
-CDR3:QQRSSYPLTF(配列番号17)、
12は、存在しないか、またはAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは以下の3つのCDRを含む:
-CDR1:RASSSVSYMH(配列番号18)、
-CDR2:NTSNSPS(配列番号19)、および
-CDR3:QQRSSYPLTF(配列番号17)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、以下の3つのCDRを含む:
-CDR1:RASSSVSYMH(配列番号18)、
-CDR2:NTSNSPS(配列番号19)、および
-CDR3:QQRSSYPLTF(配列番号17)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは以下の3つのCDRを含み:
-CDR1:RASSSVS-X12-YMH(配列番号18)、
-CDR2:NTSNSPS(配列番号19)、および
-CDR3:QQRSSYPLTF(配列番号17)、
12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、以下の3つのCDRを含み:
-CDR1:RASSSVS-X12-YMH(配列番号18)、
-CDR2:NTSNSPS(配列番号19)、および
-CDR3:QQRSSYPLTF(配列番号17)、
12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは以下の3つのCDRを含み:
-CDR1:RASSSVS-X12-YMH(配列番号18)、
-CDR2:ATSNLQS(配列番号20)、および
-CDR3:QQRSSYPLTF(配列番号17)、
12は、存在しないか、またはAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、以下の3つのCDRを含み:
-CDR1:RASSSVS-X12-YMH(配列番号18)、
-CDR2:ATSNLQS(配列番号20)、および
-CDR3:QQRSSYPLTF(配列番号17)、
12は、存在しないか、またはAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは以下の3つのCDRを含む:
-CDR1:RASSSVSYMH(配列番号18)、
-CDR2:ATSNLQS(配列番号20)、および
-CDR3:QQRSSYPLTF(配列番号17)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、以下の3つのCDRを含む:
-CDR1:RASSSVSYMH(配列番号18)、
-CDR2:ATSNLQS(配列番号20)、および
-CDR3:QQRSSYPLTF(配列番号17)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは以下の3つのCDRを含み:
-CDR1:RASSSVS-X12-YMH(配列番号18)、
-CDR2:ATSNLQS(配列番号20)、および
-CDR3:QQRSSYPLTF(配列番号17)、
12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、以下の3つのCDRを含み:
-CDR1:RASSSVS-X12-YMH(配列番号18)、
-CDR2:ATSNLQS(配列番号20)、および
-CDR3:QQRSSYPLTF(配列番号17)、
12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは以下の3つのCDRを含み:
-CDR1:RASSSVS-X12-YMH(配列番号18)、
-CDR2:NTSNSPS(配列番号19)、および
-CDR3:HQRSSYPLTF(配列番号21)、
12は、存在しないか、またはAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、以下の3つのCDRを含み:
-CDR1:RASSSVS-X12-YMH(配列番号18)、
-CDR2:NTSNSPS(配列番号19)、および
-CDR3:HQRSSYPLTF(配列番号21)、
12は、存在しないか、またはAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは以下の3つのCDRを含む:
-CDR1:RASSSVSYMH(配列番号18)、
-CDR2:NTSNSPS(配列番号19)、および
-CDR3:HQRSSYPLTF(配列番号21)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、以下の3つのCDRを含む:
-CDR1:RASSSVSYMH(配列番号18)、
-CDR2:NTSNSPS(配列番号19)、および
-CDR3:HQRSSYPLTF(配列番号21)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは以下の3つのCDRを含み:
-CDR1:RASSSVS-X12-YMH(配列番号18)、
-CDR2:NTSNSPS(配列番号19)、および
-CDR3:HQRSSYPLTF(配列番号21)、
12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、以下の3つのCDRを含み:
-CDR1:RASSSVS-X12-YMH(配列番号18)、
-CDR2:NTSNSPS(配列番号19)、および
-CDR3:HQRSSYPLTF(配列番号21)、
12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは以下の3つのCDRを含み:
-CDR1:RASSSVS-X12-YMH(配列番号18)、
-CDR2:NTSNRAT(配列番号22)、および
-CDR3:QQRSSYPLTF(配列番号17)、
12は、存在しないか、またはAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、以下の3つのCDRを含み:
-CDR1:RASSSVS-X12-YMH(配列番号18)、
-CDR2:NTSNRAT(配列番号22)、および
-CDR3:QQRSSYPLTF(配列番号17)、
12は、存在しないか、またはAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは以下の3つのCDRを含む:
-CDR1:RASSSVSYMH(配列番号18)、
-CDR2:NTSNRAT(配列番号22)、および
-CDR3:QQRSSYPLTF(配列番号17)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、以下の3つのCDRを含む:
-CDR1:RASSSVSYMH(配列番号18)、
-CDR2:NTSNRAT(配列番号22)、および
-CDR3:QQRSSYPLTF(配列番号17)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは以下の3つのCDRを含み:
-CDR1:RASSSVS-X12-YMH(配列番号18)、
-CDR2:NTSNRAT(配列番号22)、および
-CDR3:QQRSSYPLTF(配列番号17)、
12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、以下の3つのCDRを含み:
-CDR1:RASSSVS-X12-YMH(配列番号18)、
-CDR2:NTSNRAT(配列番号22)、および
-CDR3:QQRSSYPLTF(配列番号17)、
12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは以下の3つのCDRを含み:
-CDR1:RASSSVS-X12-YMH(配列番号18)、
-CDR2:ATSNLPS(配列番号111)、および
-CDR3:QQRSSYPLTF(配列番号17)、
12は、存在しないか、またはAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、以下の3つのCDRを含み:
-CDR1:RASSSVS-X12-YMH(配列番号18)、
-CDR2:ATSNLPS(配列番号111)、および
-CDR3:QQRSSYPLTF(配列番号17)、
12は、存在しないか、またはAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは以下の3つのCDRを含む:
-CDR1:RASSSVSYMH(配列番号18)、
-CDR2:ATSNLPS(配列番号111)、および
-CDR3:QQRSSYPLTF(配列番号17)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、以下の3つのCDRを含む:
-CDR1:RASSSVSYMH(配列番号18)、
-CDR2:ATSNLPS(配列番号111)、および
-CDR3:QQRSSYPLTF(配列番号17)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは以下の3つのCDRを含み:
-CDR1:RASSSVS-X12-YMH(配列番号18)、
-CDR2:ATSNLPS(配列番号111)、および
-CDR3:QQRSSYPLTF(配列番号17)、
12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、以下の3つのCDRを含み:
-CDR1:RASSSVS-X12-YMH(配列番号18)、
-CDR2:ATSNLPS(配列番号111)、および
-CDR3:QQRSSYPLTF(配列番号17)、
12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは以下の3つのCDRを含み:
-CDR1:SASSSVS-X12-YMH(配列番号15)、
-CDR2:NTANLPS(配列番号120)、および
-CDR3:QQRSSYPLTF(配列番号17)、
12は、存在しないか、またはAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、以下の3つのCDRを含み:
-CDR1:SASSSVS-X12-YMH(配列番号15)、
-CDR2:NTANLPS(配列番号120)、および
-CDR3:QQRSSYPLTF(配列番号17)、
12は、存在しないか、またはAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは以下の3つのCDRを含む:
-CDR1:SASSSVS-X12-YMH(配列番号15)、
-CDR2:NTANLPS(配列番号120)、および
-CDR3:QQRSSYPLTF(配列番号17)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、以下の3つのCDRを含む:
-CDR1:SASSSVS-X12-YMH(配列番号15)、
-CDR2:NTANLPS(配列番号120)、および
-CDR3:QQRSSYPLTF(配列番号17)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは以下の3つのCDRを含み:
-CDR1:SASSSVS-X12-YMH(配列番号15)、
-CDR2:NTANLPS(配列番号120)、および
-CDR3:QQRSSYPLTF(配列番号17)、
12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、以下の3つのCDRを含み:
-CDR1:SASSSVS-X12-YMH(配列番号15)、
-CDR2:NTANLPS(配列番号120)、および
-CDR3:QQRSSYPLTF(配列番号17)、
12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは以下の3つのCDRを含み:
-CDR1:RASSSVS-X12-YMH(配列番号18)、
-CDR2:X13-TSNLPS(配列番号127)、および
-CDR3:QQRSSYPLTF(配列番号17)、
12は、存在しないか、またはAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択され、
13は、Ala(A)またはAsn(N)以外の任意のアミノ酸である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、以下の3つのCDRを含み:
-CDR1:RASSSVS-X12-YMH(配列番号18)、
-CDR2:X13-TSNLPS(配列番号127)、および
-CDR3:QQRSSYPLTF(配列番号17)、
12は、存在しないか、またはAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択され、
13は、Ala(A)またはAsn(N)以外の任意のアミノ酸である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは以下の3つのCDRを含み:
-CDR1:RASSSVSYMH(配列番号18)、
-CDR2:X13-TSNLPS(配列番号127)、および
-CDR3:QQRSSYPLTF(配列番号17)、
13は、Ala(A)またはAsn(N)以外の任意のアミノ酸である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、以下の3つのCDRを含み:
-CDR1:RASSSVSYMH(配列番号18)、
-CDR2:X13-TSNLPS(配列番号127)、および
-CDR3:QQRSSYPLTF(配列番号17)、
13は、Ala(A)またはAsn(N)以外の任意のアミノ酸である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは以下の3つのCDRを含み:
-CDR1:RASSSVS-X12-YMH(配列番号18)、
-CDR2:X13-TSNLPS(配列番号127)、および
-CDR3:QQRSSYPLTF(配列番号17)、
12は、存在しないか、またはAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択され、
13は、Ala(A)またはAsn(N)以外の任意のアミノ酸である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、以下の3つのCDRを含み:
-CDR1:RASSSVS-X12-YMH(配列番号18)、
-CDR2:X13-TSNLPS(配列番号127)、および
-CDR3:QQRSSYPLTF(配列番号17)、
12は、存在しないか、またはAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択され、
13は、Ala(A)またはAsn(N)以外の任意のアミノ酸である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、
-少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは以下の3つのCDRを含むHCVR:
-CDR1:NYYIG(配列番号1)、
-CDR2:X-IF-X-GG-X-Y-X-N-X-X-X-X-X-X10-G(配列番号2)、および
-CDR3:RNFDY(配列番号3)、ならびに
-少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは以下の3つのCDRを含むLCVR:
-CDR1:X11-ASSSVS-X12-YMH(配列番号12)、
-CDR2:X13-TSN-X14-X15-X16(配列番号13)、および
-CDR3:X17-QRSSYPLTF(配列番号14)、を含み、
は、Asp(D)、Ile(I)およびArg(R)から選択され、
は、Pro(P)およびSer(S)から選択され、
は、Asp(D)、Ser(S)およびGly(G)から選択され、
は、Ala(A)およびThr(T)から選択され、
は、Ser(S)およびTyr(Y)から選択され、
は、Asn(N)、Ala(A)およびSer(S)から選択され、
は、Glu(E)、Asp(D)、Pro(P)およびGln(Q)から選択され、
は、Lys(K)およびSer(S)から選択され、
は、Phe(F)およびVal(V)から選択され、
10は、Lys(K)およびGln(Q)から選択され、
11は、Ser(S)およびArg(R)から選択され、
12は、存在しないか、またはAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択され、
13は、Asn(N)およびAla(A)から選択され、またはX13は、Ala(A)もしくはAsn(N)以外の任意のアミノ酸であり、
14は、Leu(L)、Ser(S)およびArg(R)から選択され、
15は、Pro(P)、Ala(A)およびGln(Q)から選択され、
16は、Ser(S)およびThr(T)から選択され、
17は、Gln(Q)およびHis(H)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、
-以下の3つのCDRを含むHCVR:
-CDR1:NYYIG(配列番号1)、
-CDR2:X-IF-X-GG-X-Y-X-N-X-X-X-X-X-X10-G(配列番号2)、および
-CDR3:RNFDY(配列番号3)、ならびに
-以下の3つのCDRを含むLCVR:
-CDR1:X11-ASSSVS-X12-YMH(配列番号12)、
-CDR2:X13-TSN-X14-X15-X16(配列番号13)、および
-CDR3:X17-QRSSYPLTF(配列番号14)、を含み、
は、Asp(D)、Ile(I)およびArg(R)から選択され、
は、Pro(P)およびSer(S)から選択され、
は、Asp(D)、Ser(S)およびGly(G)から選択され、
は、Ala(A)およびThr(T)から選択され、
は、Ser(S)およびTyr(Y)から選択され、
は、Asn(N)、Ala(A)およびSer(S)から選択され、
は、Glu(E)、Asp(D)、Pro(P)およびGln(Q)から選択され、
は、Lys(K)およびSer(S)から選択され、
は、Phe(F)およびVal(V)から選択され、
10は、Lys(K)およびGln(Q)から選択され、
11は、Ser(S)およびArg(R)から選択され、
12は、存在しないか、またはAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択され、
13は、Asn(N)およびAla(A)から選択され、またはX13は、Ala(A)もしくはAsn(N)以外の任意のアミノ酸であり、
14は、Leu(L)、Ser(S)およびArg(R)から選択され、
15は、Pro(P)、Ala(A)およびGln(Q)から選択され、
16は、Ser(S)およびThr(T)から選択され、
17は、Gln(Q)およびHis(H)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、(i)少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは3つのHCVRのCDRと(ii)少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは3つのLCVRのCDRとの組み合わせを含み、前記組み合わせは、表2に定義される通りである。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、(i)3つのHCVRのCDRと(ii)3つのLCVRのCDRとの組み合わせを含み、前記組み合わせは、表2に定義されている通りである。
表2.HCVRのCDRとLCVRのCDRとの好ましい組み合わせ。CDRは、それらの配列番号(該当する場合はいつでも、X12は存在しないか、またはAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択され、X13はAla(A)またはAsn(N)以外の任意のアミノ酸)によって定義される。
Figure 2023518538000003
Figure 2023518538000004
Figure 2023518538000005
一実施形態では、本明細書の上で定義されるV-CDR1、V-CDR2、V-CDR3、V-CDR1、V-CDR2および/またはV-CDR3のいずれかは、1、2、3、4、5つ以上のアミノ酸が異なるアミノ酸によって置換されていることを特徴とすることができる。
一実施形態では、本明細書の上で定義されるV-CDR1、V-CDR2、V-CDR3、V-CDR1、V-CDR2および/またはV-CDR3のいずれかは、本明細書の上で定義される特定のCDRまたはCDRのセットと少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有するアミノ酸配列を有することを特徴とすることができる。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、(i)少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは3つのHCVRのCDRと(ii)少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは3つのLCVRのCDRとの組み合わせを含み、前記組み合わせは、表2に定義される組み合わせ#1、#2、#7、#14、#20、#26、#49、#50、#63、#65、#72、#79、#86および#92から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、(i)3つのHCVRのCDRと(ii)3つのLCVRのCDRとの組み合わせを含み、前記組み合わせは、表2に定義される組み合わせ#1、#2、#7、#14、#20、#26、#49、#50、#63、#65、#72、#79、#86および#92から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、
-以下の3つのCDRを含むHCVR:
配列番号1の配列のV-CDR1、
配列番号4、5、6、7、8,100、116、117、118および119の配列を含むか、またはそれらからなる群から選択されるV-CDR2、および
配列番号3の配列のV-CDR3、ならびに
-以下の3つのCDRを含むLCVR:
配列番号15および18(X12は存在しないか、またはAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択され、好ましくはX12は存在しない)の配列を含むか、またはそれらからなる群から選択されるV-CDR1、
配列番号16、111および120の配列を含むか、またはそれらからなる群から選択されるV-CDR2、および
配列番号17の配列のV-CDR3、を含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、
-以下の3つのCDRを含むHCVR:
配列番号1の配列のV-CDR1、
配列番号4および5の配列を含むか、またはそれからなる群から選択されるV-CDR2、および
配列番号3の配列のV-CDR3、ならびに
-以下の3つのCDRを含むLCVR:
配列番号15(X12は存在しないか、またはAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択され、好ましくはX12は存在しない)の配列のV-CDR1、
配列番号16の配列のV-CDR2、および
配列番号17の配列のV-CDR3、を含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、
-以下の3つのCDRを含むHCVR:
配列番号1の配列のV-CDR1、
配列番号4、5、6および100の配列を含むか、またはそれらからなる群から選択されるV-CDR2、および
配列番号3の配列のV-CDR3、ならびに
-以下の3つのCDRを含むLCVR:
配列番号15および18(X12は存在しないか、またはAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択され、好ましくはX12は存在しない)の配列を含むか、またはそれらからなる群から選択されるV-CDR1、
配列番号16の配列のV-CDR2、および
配列番号17の配列のV-CDR3、を含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、
-以下の3つのCDRを含むHCVR:
配列番号1の配列のV-CDR1、
配列番号4、6および100の配列を含むか、またはそれからなる群から選択されるV-CDR2、および
配列番号3の配列のV-CDR3、ならびに
-以下の3つのCDRを含むLCVR:
配列番号15および18(X12は存在しないか、またはAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択され、好ましくはX12は存在しない)の配列を含むか、またはそれからなる群から選択されるV-CDR1、
配列番号16の配列のV-CDR2、および
配列番号17の配列のV-CDR3、を含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、(i)少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは3つのHCVRのCDRと(ii)少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは3つのLCVRのCDRとの組み合わせを含み、前記組み合わせは、表2に定義される組み合わせ#1である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、(i)3つのHCVRのCDRと(ii)3つのLCVRのCDRとの組み合わせを含み、前記組み合わせは、表2に定義される組み合わせ#1である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、(i)配列番号1、4および3として記載される3つのHCVRのCDRと(ii)配列番号15、16および17として記載される3つのLCVRのCDRとの組み合わせを含み、配列番号15のX12は、存在しないか、またはAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択され、好ましくはX12は、存在しない。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、(i)少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは3つのHCVRのCDRと(ii)少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは3つのLCVRのCDRとの組み合わせを含み、前記組み合わせは、表2に定義される組み合わせ#2である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、(i)3つのHCVRのCDRと(ii)3つのLCVRのCDRとの組み合わせを含み、前記組み合わせは、表2に定義される組み合わせ#2である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、(i)配列番号1、4および3として記載される3つのHCVRのCDRと(ii)配列番号18、16および17として記載される3つのLCVRのCDRとの組み合わせを含み、配列番号18のX12は、存在しないか、またはAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択され、好ましくはX12は、存在しない。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、(i)少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは3つのHCVRのCDRと(ii)少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは3つのLCVRのCDRとの組み合わせを含み、前記組み合わせは、表2に定義される組み合わせ#7である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、(i)3つのHCVRのCDRと(ii)3つのLCVRのCDRとの組み合わせを含み、前記組み合わせは、表2に定義される組み合わせ#7である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、(i)配列番号1、5および3として記載される3つのHCVRのCDRと(ii)配列番号15、16および17として記載される3つのLCVRのCDRとの組み合わせを含み、配列番号15のX12は、存在しないか、またはAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択され、好ましくはX12は、存在しない。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、(i)少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは3つのHCVRのCDRと(ii)少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは3つのLCVRのCDRとの組み合わせを含み、前記組み合わせは、表2に定義される組み合わせ#14である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、(i)3つのHCVRのCDRと(ii)3つのLCVRのCDRとの組み合わせを含み、前記組み合わせは、表2に定義される組み合わせ#14である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、(i)配列番号1、6および3として記載される3つのHCVRのCDRと(ii)配列番号18、16および17として記載される3つのLCVRのCDRとの組み合わせを含み、配列番号18のX12は、存在しないか、またはAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択され、好ましくはX12は、存在しない。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、(i)少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは3つのHCVRのCDRと(ii)少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは3つのLCVRのCDRとの組み合わせを含み、前記組み合わせは、表2に定義される組み合わせ#20である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、(i)3つのHCVRのCDRと(ii)3つのLCVRのCDRとの組み合わせを含み、前記組み合わせは、表2に定義される組み合わせ#20である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、(i)配列番号1、7および3として記載される3つのHCVRのCDRと(ii)配列番号18、16および17として記載される3つのLCVRのCDRとの組み合わせを含み、配列番号18のX12は、存在しないか、またはAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択され、好ましくはX12は、存在しない。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、(i)少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは3つのHCVRのCDRと(ii)少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは3つのLCVRのCDRとの組み合わせを含み、前記組み合わせは、表2に定義される組み合わせ#26である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、(i)3つのHCVRのCDRと(ii)3つのLCVRのCDRとの組み合わせを含み、前記組み合わせは、表2に定義される組み合わせ#26である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、(i)配列番号1、8および3として記載される3つのHCVRのCDRと(ii)配列番号18、16および17として記載される3つのLCVRのCDRとの組み合わせを含み、配列番号18のX12は、存在しないか、またはAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択され、好ましくはX12は、存在しない。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、(i)少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは3つのHCVRのCDRと(ii)少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは3つのLCVRのCDRとの組み合わせを含み、前記組み合わせは、表2に定義される組み合わせ#49である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、(i)3つのHCVRのCDRと(ii)3つのLCVRのCDRとの組み合わせを含み、前記組み合わせは、表2に定義される組み合わせ#49である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、(i)配列番号1、100および3として記載される3つのHCVRのCDRと(ii)配列番号15、16および17として記載される3つのLCVRのCDRとの組み合わせを含み、配列番号15のX12は、存在しないか、またはAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択され、好ましくはX12は、存在しない。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、(i)少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは3つのHCVRのCDRと(ii)少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは3つのLCVRのCDRとの組み合わせを含み、前記組み合わせは、表2に定義される組み合わせ#50である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、(i)3つのHCVRのCDRと(ii)3つのLCVRのCDRとの組み合わせを含み、前記組み合わせは、表2に定義される組み合わせ#50である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、(i)配列番号1、100および3として記載される3つのHCVRのCDRと(ii)配列番号18、16および17として記載される3つのLCVRのCDRとの組み合わせを含み、配列番号18のX12は、存在しないか、またはAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択され、好ましくはX12は、存在しない。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、(i)少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは3つのHCVRのCDRと(ii)少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは3つのLCVRのCDRとの組み合わせを含み、前記組み合わせは、表2に定義される組み合わせ#63である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、(i)3つのHCVRのCDRと(ii)3つのLCVRのCDRとの組み合わせを含み、前記組み合わせは、表2に定義される組み合わせ#63である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、(i)配列番号1、100および3として記載される3つのHCVRのCDRと(ii)配列番号18、111および17として記載される3つのLCVRのCDRとの組み合わせを含み、配列番号18のX12は、存在しないか、またはAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択され、好ましくはX12は、存在しない。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、(i)少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは3つのHCVRのCDRと(ii)少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは3つのLCVRのCDRとの組み合わせを含み、前記組み合わせは、表2に定義される組み合わせ#65である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、(i)3つのHCVRのCDRと(ii)3つのLCVRのCDRとの組み合わせを含み、前記組み合わせは、表2に定義される組み合わせ#65である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、(i)配列番号1、116および3として記載される3つのHCVRのCDRと(ii)配列番号18、16および17として記載される3つのLCVRのCDRとの組み合わせを含み、配列番号18のX12は、存在しないか、またはAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択され、好ましくはX12は、存在しない。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、(i)少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは3つのHCVRのCDRと(ii)少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは3つのLCVRのCDRとの組み合わせを含み、前記組み合わせは、表2に定義される組み合わせ#72である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、(i)3つのHCVRのCDRと(ii)3つのLCVRのCDRとの組み合わせを含み、前記組み合わせは、表2に定義される組み合わせ#72である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、(i)配列番号1、117および3として記載される3つのHCVRのCDRと(ii)配列番号18、16および17として記載される3つのLCVRのCDRとの組み合わせを含み、配列番号18のX12は、存在しないか、またはAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択され、好ましくはX12は、存在しない。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、(i)少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは3つのHCVRのCDRと(ii)少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは3つのLCVRのCDRとの組み合わせを含み、前記組み合わせは、表2に定義される組み合わせ#79である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、(i)3つのHCVRのCDRと(ii)3つのLCVRのCDRとの組み合わせを含み、前記組み合わせは、表2に定義される組み合わせ#79である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、(i)配列番号1、118および3として記載される3つのHCVRのCDRと(ii)配列番号18、16および17として記載される3つのLCVRのCDRとの組み合わせを含み、配列番号18のX12は、存在しないか、またはAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択され、好ましくはX12は、存在しない。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、(i)少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは3つのHCVRのCDRと(ii)少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは3つのLCVRのCDRとの組み合わせを含み、前記組み合わせは、表2に定義される組み合わせ#86である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、(i)3つのHCVRのCDRと(ii)3つのLCVRのCDRとの組み合わせを含み、前記組み合わせは、表2に定義される組み合わせ#86である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、(i)配列番号1、119および3として記載される3つのHCVRのCDRと(ii)配列番号18、16および17として記載される3つのLCVRのCDRとの組み合わせを含み、配列番号18のX12は、存在しないか、またはAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択され、好ましくはX12は、存在しない。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、(i)少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは3つのHCVRのCDRと(ii)少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは3つのLCVRのCDRとの組み合わせを含み、前記組み合わせは、表2に定義される組み合わせ#92である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、(i)3つのHCVRのCDRと(ii)3つのLCVRのCDRとの組み合わせを含み、前記組み合わせは、表2に定義される組み合わせ#92である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、(i)配列番号1、4および3として記載される3つのHCVRのCDRと(ii)配列番号15、120および17として記載される3つのLCVRのCDRとの組み合わせを含み、配列番号15のX12は、存在しないか、またはAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択され、好ましくはX12は、存在しない。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは少なくとも3つ、さらにより好ましくは4つの以下のフレームワーク領域(FR)を含むHCVRを含む:
-FR1:QVQLQQSGAELVRPVTSVKMSCKAAGYTFT(配列番号25)、
-FR2:WVKQRPGHGLEWIG(配列番号26)、
-FR3:KATLTADTSSSTAYMQLSSLTSEDSAIYYCVR(配列番号27)、
-FR4:WGQGTTLTVSS(配列番号28)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、4つの以下のFRを含むHCVRを含む:
-FR1:QVQLQQSGAELVRPVTSVKMSCKAAGYTFT(配列番号25)、
-FR2:WVKQRPGHGLEWIG(配列番号26)、
-FR3:KATLTADTSSSTAYMQLSSLTSEDSAIYYCVR(配列番号27)、
-FR4:WGQGTTLTVSS(配列番号28)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは少なくとも3つ、さらにより好ましくは4つの以下のFRを含むHCVRを含む:
-FR1:QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFT(配列番号29)、
-FR2:WVRQAPGQGLEWIG(配列番号30)、
-FR3:RVTLTADTSISTAYMELSRLRSDDTVVYYCVR(配列番号31)、
-FR4:WGQGTLVTVSS(配列番号32)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、4つの以下のFRを含むHCVRを含む:
-FR1:QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFT(配列番号29)、
-FR2:WVRQAPGQGLEWIG(配列番号30)、
-FR3:RVTLTADTSISTAYMELSRLRSDDTVVYYCVR(配列番号31)、
-FR4:WGQGTLVTVSS(配列番号32)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは少なくとも3つ、さらにより好ましくは4つの以下のFRを含むHCVRを含む:
-FR1:EVQLVQSGAEVKKPGESLKISCKASGYTFT(配列番号33)、
-FR2:WVRQMPGKGLEWIG(配列番号34)、
-FR3:QVTLSADKSISTAYLQLSSLKASDTAMYYCVR(配列番号35)、
-FR4:WGQGTLVTVSS(配列番号32)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、4つの以下のFRを含むHCVRを含む:
-FR1:EVQLVQSGAEVKKPGESLKISCKASGYTFT(配列番号33)、
-FR2:WVRQMPGKGLEWIG(配列番号34)、
-FR3:QVTLSADKSISTAYLQLSSLKASDTAMYYCVR(配列番号35)、
-FR4:WGQGTLVTVSS(配列番号32)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは少なくとも3つ、さらにより好ましくは4つの以下のFRを含むHCVRを含む:
-FR1:QVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGYTFT(配列番号36)、
-FR2:WIRQAPGKGLEWIG(配列番号37)、
-FR3:RFTLSADTAKNSAYLQMNSLRAEDTAVYYCVR(配列番号38)、
-FR4:WGQGTLVTVSS(配列番号32)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、4つの以下のFRを含むHCVRを含む:
-FR1:QVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGYTFT(配列番号36)、
-FR2:WIRQAPGKGLEWIG(配列番号37)、
-FR3:RFTLSADTAKNSAYLQMNSLRAEDTAVYYCVR(配列番号38)、
-FR4:WGQGTLVTVSS(配列番号32)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは少なくとも3つ、さらにより好ましくは4つの以下のFRを含むHCVRを含む:
-FR1:EVQLVQSGAEVKKPGESLKISCKGSGYTFT(配列番号39)、
-FR2:WVRQMPGKGLEWIG(配列番号34)、
-FR3:QVTLSADKSISTAYLQLSSLKASDTAMYYCVR(配列番号35)、
-FR4:WGQGTLVTVSS(配列番号32)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、4つの以下のFRを含むHCVRを含む:
-FR1:EVQLVQSGAEVKKPGESLKISCKGSGYTFT(配列番号39)、
-FR2:WVRQMPGKGLEWIG(配列番号34)、
-FR3:QVTLSADKSISTAYLQLSSLKASDTAMYYCVR(配列番号35)、
-FR4:WGQGTLVTVSS(配列番号32)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは少なくとも3つ、さらにより好ましくは4つの以下のFRを含むHCVRを含む:
-FR1:QVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFS(配列番号40)、
-FR2:WIRQAPGKGLEWIG(配列番号37)、
-FR3:RFTLSADTAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCVR(配列番号41)、
-FR4:WGQGTLVTVSS(配列番号32)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、4つの以下のFRを含むHCVRを含む:
-FR1:QVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFS(配列番号40)、
-FR2:WIRQAPGKGLEWIG(配列番号37)、
-FR3:RFTLSADTAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCVR(配列番号41)、
-FR4:WGQGTLVTVSS(配列番号32)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは少なくとも3つ、さらにより好ましくは4つの以下のFRを含むHCVRを含む:
-FR1:EVQLVQSGAEVKKPGESLKISCKGSGYSFT(配列番号42)、
-FR2:WVRQMPGKGLEWIG(配列番号34)、
-FR3:QVTLSADKSISTAYLQLSSLKASDTAMYYCVR(配列番号35)、
-FR4:WGQGTLVTVSS(配列番号32)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、4つの以下のFRを含むHCVRを含む:
-FR1:EVQLVQSGAEVKKPGESLKISCKGSGYSFT(配列番号42)、
-FR2:WVRQMPGKGLEWIG(配列番号34)、
-FR3:QVTLSADKSISTAYLQLSSLKASDTAMYYCVR(配列番号35)、
-FR4:WGQGTLVTVSS(配列番号32)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは少なくとも3つ、さらにより好ましくは4つの以下のFRを含むHCVRを含む:
-FR1:QVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFS(配列番号40)、
-FR2:WIRQAPGKGLEWVG(配列番号43)、
-FR3:RFTLSADTAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCVR(配列番号41)、
-FR4:WGQGTLVTVSS(配列番号32)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、4つの以下のFRを含むHCVRを含む:
-FR1:QVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFS(配列番号40)、
-FR2:WIRQAPGKGLEWVG(配列番号43)、
-FR3:RFTLSADTAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCVR(配列番号41)、
-FR4:WGQGTLVTVSS(配列番号32)。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは少なくとも3つ、さらにより好ましくは4つの以下のFRを含むLCVRを含み:
-FR1:QIVLTQSPTIMSASPGEKVTITC(配列番号44)、
-FR2:WFQQKTGTSPRLWIY(配列番号45)、
-FR3:GVPARFSGSGSGTS-X18-SLTISRMEAEDAATYYC(配列番号46)、
-FR4:GAGTKLELK(配列番号47)、
18は、Tyr(Y)およびPhe(F)から選択され、好ましくは、X18は、Tyr(Y)である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、4つの以下のFRを含むLCVRを含み:
-FR1:QIVLTQSPTIMSASPGEKVTITC(配列番号44)、
-FR2:WFQQKTGTSPRLWIY(配列番号45)、
-FR3:GVPARFSGSGSGTS-X18-SLTISRMEAEDAATYYC(配列番号46)、
-FR4:GAGTKLELK(配列番号47)
18は、Tyr(Y)およびPhe(F)から選択され、好ましくは、X18は、Tyr(Y)である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは少なくとも3つ、さらにより好ましくは4つの以下のFRを含むLCVRを含み:
-FR1:DIQLTQSPSFLSASVGDRVTITC(配列番号48)、
-FR2:WFQQKPGKAPKLWIY(配列番号49)、
-FR3:GVPSRFSGSGSGTE-X18-TLTISSLQPEDFATYYC(配列番号50)、
-FR4:GGGTKVEIK(配列番号51)、
18は、Tyr(Y)およびPhe(F)から選択され、好ましくは、X18は、Tyr(Y)である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、4つの以下のFRを含むLCVRを含み:
-FR1:DIQLTQSPSFLSASVGDRVTITC(配列番号48)、
-FR2:WFQQKPGKAPKLWIY(配列番号49)、
-FR3:GVPSRFSGSGSGTE-X18-TLTISSLQPEDFATYYC(配列番号50)、
-FR4:GGGTKVEIK(配列番号51)、
18は、Tyr(Y)およびPhe(F)から選択され、好ましくは、X18は、Tyr(Y)である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは少なくとも3つ、さらにより好ましくは4つの以下のFRを含むLCVRを含み:
-FR1:EIVLTQSPDFQSVTPKEKVTITC(配列番号52)、
-FR2:WFQQKPDQSPKLWIY(配列番号53)、
-FR3:GVPSRFSGSGSGTD-X18-TLTINSLEAEDAATYYC(配列番号54)、
-FR4:GGGTKVEIK(配列番号51)、
18は、Tyr(Y)およびPhe(F)から選択され、好ましくは、X18は、Tyr(Y)である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、4つの以下のFRを含むLCVRを含み:
-FR1:EIVLTQSPDFQSVTPKEKVTITC(配列番号52)、
-FR2:WFQQKPDQSPKLWIY(配列番号53)、
-FR3:GVPSRFSGSGSGTD-X18-TLTINSLEAEDAATYYC(配列番号54)、
-FR4:GGGTKVEIK(配列番号51)、
18は、Tyr(Y)およびPhe(F)から選択され、好ましくは、X18は、Tyr(Y)である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは少なくとも3つ、さらにより好ましくは4つの以下のFRを含むLCVRを含み:
-FR1:EIVLTQSPATLSLSPGERATLSC(配列番号55)、
-FR2:WFQQKPGQAPRLWIY(配列番号56)、
-FR3:GIPARFSGSGSGTD-X18-TLTISSLEPEDFAVYYC(配列番号57)、
-FR4:GGGTKVEIK(配列番号51)、
18は、Tyr(Y)およびPhe(F)から選択され、好ましくは、X18は、Tyr(Y)である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、4つの以下のFRを含むLCVRを含み:
-FR1:EIVLTQSPATLSLSPGERATLSC(配列番号55)、
-FR2:WFQQKPGQAPRLWIY(配列番号56)、
-FR3:GIPARFSGSGSGTD-X18-TLTISSLEPEDFAVYYC(配列番号57)、
-FR4:GGGTKVEIK(配列番号51)、
18は、Tyr(Y)およびPhe(F)から選択され、好ましくは、X18は、Tyr(Y)である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは少なくとも3つ、さらにより好ましくは4つの以下のFRを含むLCVRを含み:
-FR1:DIQLTQSPSFLSASVGDRVTITC(配列番号48)、
-FR2:WYQQKPGKAPKLWIY(配列番号58)、
-FR3:GVPSRFSGSGSGTE-X18-TLTISSLQPEDFATYYC(配列番号50)、
-FR4:GGGTKVEIK(配列番号51)、
18は、Tyr(Y)およびPhe(F)から選択され、好ましくは、X18は、Tyr(Y)である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、4つの以下のFRを含むLCVRを含み:
-FR1:DIQLTQSPSFLSASVGDRVTITC(配列番号48)、
-FR2:WYQQKPGKAPKLWIY(配列番号58)、
-FR3:GVPSRFSGSGSGTE-X18-TLTISSLQPEDFATYYC(配列番号50)、
-FR4:GGGTKVEIK(配列番号51)、
18は、Tyr(Y)およびPhe(F)から選択され、好ましくは、X18は、Tyr(Y)である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは少なくとも3つ、さらにより好ましくは4つの以下のFRを含むLCVRを含み:
-FR1:DIQLTQSPSFLSASVGDRVTITC(配列番号48)、
-FR2:WYQQKPGKAPKLWIY(配列番号58)、
-FR3:GVPSRFSGSGSGTE-X18-TLTISSLQPEDFATYYC(配列番号50)、
-FR4:GGGTKVEIK(配列番号51)、
18は、Tyr(Y)およびPhe(F)から選択され、好ましくはX18は、Phe(F)である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、4つの以下のFRを含むLCVRを含み:
-FR1:DIQLTQSPSFLSASVGDRVTITC(配列番号48)、
-FR2:WYQQKPGKAPKLWIY(配列番号58)、
-FR3:GVPSRFSGSGSGTE-X18-TLTISSLQPEDFATYYC(配列番号50)、
-FR4:GGGTKVEIK(配列番号51)、
18は、Tyr(Y)およびPhe(F)から選択され、好ましくはX18は、Phe(F)である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは少なくとも3つ、さらにより好ましくは4つの以下のFRを含むLCVRを含み:
-FR1:EIVLTQSPDFQSVTPKEKVTITC(配列番号52)、
-FR2:WYQQKPDQSPKLWIY(配列番号59)、
-FR3:GVPSRFSGSGSGTD-X18-TLTINSLEAEDAATYYC(配列番号54)、
-FR4:GGGTKVEIK(配列番号51)、
18は、Tyr(Y)およびPhe(F)から選択され、好ましくはX18は、Phe(F)である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、4つの以下のFRを含むLCVRを含み:
-FR1:EIVLTQSPDFQSVTPKEKVTITC(配列番号52)、
-FR2:WYQQKPDQSPKLWIY(配列番号59)、
-FR3:GVPSRFSGSGSGTD-X18-TLTINSLEAEDAATYYC(配列番号54)、
-FR4:GGGTKVEIK(配列番号51)、
18は、Tyr(Y)およびPhe(F)から選択され、好ましくはX18は、Phe(F)である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは少なくとも3つ、さらにより好ましくは4つの以下のFRを含むLCVRを含み:
-FR1:EIVLTQSPATLSLSPGERATLSC(配列番号55)、
-FR2:WYQQKPGQAPRLWIY(配列番号60)、
-FR3:GIPARFSGSGSGTD-X18-TLTISSLEPEDFAVYYC(配列番号57)、
-FR4:GGGTKVEIK(配列番号51)、
18は、Tyr(Y)およびPhe(F)から選択され、好ましくはX18は、Phe(F)である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、4つの以下のFRを含むLCVRを含み:
-FR1:EIVLTQSPATLSLSPGERATLSC(配列番号55)、
-FR2:WYQQKPGQAPRLWIY(配列番号60)、
-FR3:GIPARFSGSGSGTD-X18-TLTISSLEPEDFAVYYC(配列番号57)、
-FR4:GGGTKVEIK(配列番号51)、
18は、Tyr(Y)およびPhe(F)から選択され、好ましくはX18は、Phe(F)である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは少なくとも3つ、さらにより好ましくは4つの以下のFRを含むLCVRを含み:
-FR1:DIQLTQSPSFLSASVGDRVTITC(配列番号48)、
-FR2:WFQKPGKAPKLWIY(配列番号49)、
-FR3:GVPSRFSGSGSGTE-X18-TLTISSLQPEDFATYYC(配列番号50)、
-FR4:GGGTKVEIK(配列番号51)、
18は、Tyr(Y)およびPhe(F)から選択され、好ましくはX18は、Phe(F)である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、4つの以下のFRを含むLCVRを含み:
-FR1:DIQLTQSPSFLSASVGDRVTITC(配列番号48)、
-FR2:WFQKPGKAPKLWIY(配列番号49)、
-FR3:GVPSRFSGSGSGTE-X18-TLTISSLQPEDFATYYC(配列番号50)、
-FR4:GGGTKVEIK(配列番号51)、
18は、Tyr(Y)およびPhe(F)から選択され、好ましくはX18は、Phe(F)である。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントが、(i)少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは少なくとも3つ、さらにより好ましくは4つのHCVRのFRと(ii)少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つ、より好ましくは少なくとも3つ、さらにより好ましくは4つのLCVRのFRとの組み合わせを含み、前記組み合わせは、表3に定義される通りである。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、(i)4つのHCVRのFRと(ii)4つのLCVRのFRとの組み合わせを含み、前記組み合わせは、表3に定義される通りである。
表3.HCVRのFRとLCVRのFRとの好ましい組み合わせ。FRは、それらの配列番号(該当する場合はいつでも、X18は、Tyr(Y)およびPhe(F)から選択される)によって定義される。
Figure 2023518538000006
Figure 2023518538000007
一実施形態では、本明細書の上で定義されるV-FR1、V-FR2、V-FR3、V-FR4、V-FR1、V-FR2、V-FR3および/またはV-FR4のいずれかは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10個以上のアミノ酸が異なるアミノ酸によって置換されていることを特徴とすることができる。
一実施形態では、本明細書の上で定義されるV-FR1、V-FR2、V-FR3、V-FR4、V-FR1、V-FR2、V-FR3および/またはV-FR4のいずれかは、本明細書の上で定義される特定のFRまたはFRのセットと少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有するアミノ酸配列を有することを特徴とすることができる。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、
-本明細書で上記されるV-FR1、
-本明細書で上記されるV-CDR1、
-本明細書で上記されるV-FR2、
-本明細書で上記されるV-CDR2、
-本明細書で上記されるV-FR3、
-本明細書で上記されるV-CDR3、および
-本明細書で上記されるV-FR4、を含むか、またはそれらからなるHCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、
-配列番号25、29、33、36、39、40および42から選択されるV-FR1、
-配列番号1から選択されるV-CDR1、
-配列番号26、30、34、37および43から選択されるV-FR2、
-配列番号2から選択されるV-CDR2、
-配列番号27、31、35、38および41から選択されるV-FR3、
-配列番号3から選択されるV-CDR3、および
-配列番号28および32から選択されるV-FR4、を含むか、またはそれらからなるHCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、
-配列番号25、29、33、36、39、40および42から選択されるV-FR1、
-配列番号1から選択されるV-CDR1、
-配列番号26、30、34、37および43から選択されるV-FR2、
-配列番号4、5、6、7、8、9、10、11、100、116、117、118および119から選択されるV-CDR2、
-配列番号27、31、35、38および41から選択されるV-FR3、
-配列番号3から選択されるV-CDR3、および
-配列番号28および32から選択されるV-FR4、を含むか、またはそれらからなるHCVRを含む。
好ましい実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、V-FR1、V-CDR1、V-FR2、V-CDR2、V-FR3、V-CDR3およびV-FR4の組み合わせを含むか、またはそれらからなるHCVRを含み、前記組み合わせは、表4に定義される通りである。
表4.好ましいHCVR。CDRおよびFRは、それらの配列番号によって定義される。最後から2番目の列は、HCVR全体の配列番号を指す。
Figure 2023518538000008
好ましい実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号61の配列を含むか、もしくはそれからなるHCVR、または配列番号61の非CDR領域の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する非CDR領域の配列を含むか、もしくはそれからなるHCVRを含む。
配列番号61
QVQLQQSGAELVRPGTSVKMSCKAAGYTFTNYYIGWVKQRPGHGLEWIGDIFPGGDYANSNEKFKGKATLTADTSSSTAYMQLSSLTSEDSAIYYCVRRNFDYWGQGTTLTVSS
好ましい実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号62の配列を含むか、もしくはそれからなるHCVR、または配列番号62の非CDR領域の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する非CDR領域の配列を含むか、もしくはそれからなるHCVRを含む。
配列番号62
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTNYYIGWVRQAPGQGLEWIGDIFPGGDYANSNEKFKGRVTLTADTSISTAYMELSRLRSDDTVVYYCVRRNFDYWGQGTLVTVSS
好ましい実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号63の配列を含むか、もしくはそれからなるHCVR、または配列番号63の非CDR領域の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する非CDR領域の配列を含むか、もしくはそれからなるHCVRを含む。
配列番号63
EVQLVQSGAEVKKPGESLKISCKASGYTFTNYYIGWVRQMPGKGLEWIGDIFPGGDYANSNEKFKGQVTLSADKSISTAYLQLSSLKASDTAMYYCVRRNFDYWGQGTLVTVSS
好ましい実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号64の配列を含むか、もしくはそれからなるHCVR、または配列番号64の非CDR領域の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する非CDR領域の配列を含むか、もしくはそれからなるHCVRを含む。
配列番号64
QVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGYTFTNYYIGWIRQAPGKGLEWIGDIFPGGDYANSNEKVKGRFTLSADTAKNSAYLQMNSLRAEDTAVYYCVRRNFDYWGQGTLVTVSS
好ましい実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号65の配列を含むか、もしくはそれからなるHCVR、または配列番号65の非CDR領域の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する非CDR領域の配列を含むか、もしくはそれからなるHCVRを含む。
配列番号65
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTNYYIGWVRQAPGQGLEWIGDIFPGGGYTNYAEKFQGRVTLTADTSISTAYMELSRLRSDDTVVYYCVRRNFDYWGQGTLVTVSS
好ましい実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号66の配列を含むか、もしくはそれからなるHCVR、または配列番号66の非CDR領域の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する非CDR領域の配列を含むか、もしくはそれからなるHCVRを含む。
配列番号66
EVQLVQSGAEVKKPGESLKISCKGSGYTFTNYYIGWVRQMPGKGLEWIGDIFPGGSYTNYSESFQGQVTLSADKSISTAYLQLSSLKASDTAMYYCVRRNFDYWGQGTLVTVSS
好ましい実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号67の配列を含むか、もしくはそれからなるHCVR、または配列番号67の非CDR領域の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する非CDR領域の配列を含むか、もしくはそれからなるHCVRを含む。
配列番号67
QVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSNYYIGWIRQAPGKGLEWIGDIFPGGSYTNYADSVKGRFTLSADTAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCVRRNFDYWGQGTLVTVSS
好ましい実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号68の配列を含むか、もしくはそれからなるHCVR、または配列番号68の非CDR領域の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する非CDR領域の配列を含むか、もしくはそれからなるHCVRを含む。
配列番号68
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTNYYIGWVRQAPGQGLEWIGRIFPGGGYTNYAQKFQGRVTLTADTSISTAYMELSRLRSDDTVVYYCVRRNFDYWGQGTLVTVSS
好ましい実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号69の配列を含むか、もしくはそれからなるHCVR、または配列番号69の非CDR領域の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する非CDR領域の配列を含むか、もしくはそれからなるHCVRを含む。
配列番号69
EVQLVQSGAEVKKPGESLKISCKGSGYSFTNYYIGWVRQMPGKGLEWIGIIFPGGSYTNYSPSFQGQVTLSADKSISTAYLQLSSLKASDTAMYYCVRRNFDYWGQGTLVTVSS
好ましい実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号70の配列を含むか、もしくはそれからなるHCVR、または配列番号70の非CDR領域の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する非CDR領域の配列を含むか、もしくはそれからなるHCVRを含む。
配列番号70
QVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSNYYIGWIRQAPGKGLEWVGDIFSGGSYTNYADSVKGRFTLSADTAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCVRRNFDYWGQGTLVTVSS
好ましい実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号101の配列を含むか、もしくはそれからなるHCVR、または配列番号101の非CDR領域の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する非CDR領域の配列を含むか、もしくはそれからなるHCVRを含む。
配列番号101
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTNYYIGWVRQAPGQGLEWIGDIFPGGDYTNYAEKFQGRVTLTADTSISTAYMELSRLRSDDTVVYYCVRRNFDYWGQGTLVTVSS
好ましい実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号121の配列を含むか、もしくはそれからなるHCVR、または配列番号121の非CDR領域の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する非CDR領域の配列を含むか、もしくはそれからなるHCVRを含む。
配列番号121
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTNYYIGWVRQAPGQGLEWIGDIFPGGGYANYAEKFQGRVTLTADTSISTAYMELSRLRSDDTVVYYCVRRNFDYWGQGTLVTVSS
好ましい実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号122の配列を含むか、もしくはそれからなるHCVR、または配列番号122の非CDR領域の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する非CDR領域の配列を含むか、もしくはそれからなるHCVRを含む。
配列番号122
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTNYYIGWVRQAPGQGLEWIGDIFPGGGYTNYAEKFKGRVTLTADTSISTAYMELSRLRSDDTVVYYCVRRNFDYWGQGTLVTVSS
好ましい実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号123の配列を含むか、もしくはそれからなるHCVR、または配列番号123の非CDR領域の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する非CDR領域の配列を含むか、もしくはそれからなるHCVRを含む。
配列番号123
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTNYYIGWVRQAPGQGLEWIGDIFPGGGYTNYNEKFQGRVTLTADTSISTAYMELSRLRSDDTVVYYCVRRNFDYWGQGTLVTVSS
好ましい実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号124の配列を含むか、もしくはそれからなるHCVR、または配列番号124の非CDR領域の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する非CDR領域の配列を含むか、もしくはそれからなるHCVRを含む。
配列番号124
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTNYYIGWVRQAPGQGLEWIGDIFPGGGYTNSAEKFQGRVTLTADTSISTAYMELSRLRSDDTVVYYCVRRNFDYWGQGTLVTVSS
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、
-本明細書で上記されるV-FR1、
-本明細書で上記されるV-CDR1、
-本明細書で上記されるV-FR2、
-本明細書で上記されるV-CDR2、
-本明細書で上記されるV-FR3、
-本明細書で上記されるV-CDR3、および
-本明細書で上記されるV-FR4、を含むか、またはそれらからなるLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、
-配列番号44、48、52および55から選択されるV-FR1、
-配列番号12から選択されるV-CDR1、
-配列番号45、49、53、56、58、59および60から選択されるV-FR2、
-配列番号13から選択されるV-CDR2、
-配列番号46、50、54および57から選択されるV-FR3、
-配列番号14から選択されるV-CDR3、ならびに
-配列番号47および51から選択されるV-FR4、を含むか、またはそれらからなるHCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、
-配列番号44、48、52および55から選択されるV-FR1、
-配列番号15および18から選択されるV-CDR1、
-配列番号45、49、53、56、58、59および60から選択されるV-FR2、
-配列番号16、19、20、22,111および120から選択されるV-CDR2、
-配列番号46、50、54および57から選択されるV-FR3、
-配列番号17および21から選択されるV-CDR3、ならびに
-配列番号47および51から選択されるV-FR4、を含むか、またはそれらからなるHCVRを含む。
好ましい実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、V-FR1、V-CDR1、V-FR2、V-CDR2、V-FR3、V-CDR3およびV-FR4の組み合わせを含むか、またはそれらからなるLCVRを含み、前記組み合わせは、表5に定義される通りである。
表5.好ましいLCVR。CDRおよびFRは、それらの配列番号によって定義される。最後から2番目の列は、LCVR全体の配列番号を指す(X12が存在しないか、またはAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択され、X18がTyr(Y)およびPhe(F)から選択される第1の配列番号、ならびに好ましいX12およびX18が定義されている場合、第2の配列番号を有する)。
Figure 2023518538000009
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、本明細書の上で定義されるV-FR1、V-CDR1、V-FR2、V-CDR2、V-FR3、V-CDR3およびV-FR4の組み合わせを含むか、またはそれらからなるLCVRを含み、X12が存在しない場合(すなわち、X12がAsn(N)、Ser(S)またはGly(G)のいずれかである場合)、X18は、Phe(F)である。一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、本明細書の上で定義されるV-FR1、V-CDR1、V-FR2、V-CDR2、V-FR3、V-CDR3およびV-FR4の組み合わせを含むか、またはそれらからなるLCVRを含み、X12が存在しない場合、X18は、Tyr(Y)およびPhe(F)から選択される。
好ましい実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、X12がAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される配列番号71の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVR、または配列番号71の非CDR領域の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する非CDR領域の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVRを含む。
配列番号71
QIVLTQSPTIMSASPGEKVTITCSASSSVS-X12-YMHWFQQKTGTSPRLWIYNTS NLPSGVPARFSGSGSGTSFSLTISRMEAEDAATYYCQQRSSYPLTFGAGTKLELK
好ましい実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、X12がAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される配列番号72の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVR、または配列番号72の非CDR領域の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する非CDR領域の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVRを含む。
配列番号72
DIQLTQSPSFLSASVGDRVTITCSASSSVS-X12-YMHWFQQKPGKAPKLWIYNTS NLPSGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPEDFATYYCQQRSSYPLTFGGGTKVEIK
好ましい実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、X12がAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される配列番号73の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVR、または配列番号73の非CDR領域の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する非CDR領域の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVRを含む。
配列番号73
EIVLTQSPDFQSVTPKEKVTITCSASSSVS-X12-YMHWFQQKPDQSPKLWIYNTS NLPSGVPSRFSGSGSGTDFTLTINSLEAEDAATYYCQQRSSYPLTFGGGTKVEIK
好ましい実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、X12がAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される配列番号74の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVR、または配列番号74の非CDR領域の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する非CDR領域の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVRを含む。
配列番号74
EIVLTQSPATLSLSPGERATLSCSASSSVS-X12-YMHWFQQKPGQAPRLWIYNTS NLPSGIPARFSGSGSGTDFTLTISSLEPEDFAVYYCQQRSSYPLTFGGGTKVEIK
好ましい実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、X12がAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される配列番号75の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVR、または配列番号75の非CDR領域の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する非CDR領域の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVRを含む。
配列番号75
DIQLTQSPSFLSASVGDRVTITCRASSSVS-X12-YMHWYQQKPGKAPKLWIYNTS NLPSGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPEDFATYYCQQRSSYPLTFGGGTKVEIK
好ましい実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、X12がAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される配列番号76の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVR、または配列番号76の非CDR領域の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する非CDR領域の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVRを含む。
配列番号76
EIVLTQSPDFQSVTPKEKVTITCRASSSVS-X12-YMHWYQQKPDQSPKLWIYNTS NSPSGVPSRFSGSGSGTDFTLTINSLEAEDAATYYCQQRSSYPLTFGGGTKVEIK
好ましい実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、X12がAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される配列番号77の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVR、または配列番号77の非CDR領域の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する非CDR領域の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVRを含む。
配列番号77
EIVLTQSPATLSLSPGERATLSCRASSSVS-X12-YMHWFQQKPGQAPRLWIYNTS NLPSGIPARFSGSGSGTDFTLTISSLEPEDFAVYYCQQRSSYPLTFGGGTKVEIK
好ましい実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、X12がAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される配列番号78の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVR、または配列番号78の非CDR領域の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する非CDR領域の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVRを含む。
配列番号78
DIQLTQSPSFLSASVGDRVTITCRASSSVS-X12-YMHWYQQKPGKAPKLWIYATS NLQSGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPEDFATYYCQQRSSYPLTFGGGTKVEIK
好ましい実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、X12がAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される配列番号79の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVR、または配列番号79の非CDR領域の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する非CDR領域の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVRを含む。
配列番号79
EIVLTQSPDFQSVTPKEKVTITCRASSSVS-X12-YMHWYQQKPDQSPKLWIYNTS NSPSGVPSRFSGSGSGTDFTLTINSLEAEDAATYYCHQRSSYPLTFGGGTKVEIK
好ましい実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、X12がAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される配列番号80の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVR、または配列番号80の非CDR領域の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する非CDR領域の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVRを含む。
配列番号80
EIVLTQSPATLSLSPGERATLSCRASSSVS-X12-YMHWYQQKPGQAPRLWIYNTS NRATGIPARFSGSGSGTDFTLTISSLEPEDFAVYYCQQRSSYPLTFGGGTKVEIK
好ましい実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、X12がAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される配列番号102の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVR、または配列番号102の非CDR領域の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する非CDR領域の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVRを含む。
配列番号102
DIQLTQSPSFLSASVGDRVTITCRASSSVS-X12-YMHWFQQKPGKAPKLWIYNTS NLPSGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPEDFATYYCQQRSSYPLTFGGGTKVEIK
好ましい実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、X12がAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される配列番号112の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVRを、または配列番号112の非CDR領域の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する非CDR領域の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVRを含む。
配列番号112
DIQLTQSPSFLSASVGDRVTITCRASSSVS-X12-YMHWYQQKPGKAPKLWIYATS NLPSGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPEDFATYYCQQRSSYPLTFGGGTKVEIK
好ましい実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、X12がAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される配列番号125の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVR、または配列番号125の非CDR領域の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する非CDR領域の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVRを含む。
配列番号125
QIVLTQSPTIMSASPGEKVTITCSASSSVS-X12-YMHWFQQKTGTSPRLWIYNTA NLPSGVPARFSGSGSGTSFSLTISRMEAEDAATYYCQQRSSYPLTFGAGTKLELK
好ましい実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、X12がAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択され、X13がAla(A)またはAsn(N)以外の任意のアミノ酸である配列番号128の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVR、または配列番号128の非CDR領域の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する非CDR領域の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVRを含む。
配列番号128
DIQLTQSPSFLSASVGDRVTITCRASSSVS-X12-YMHWYQQKPGKAPKLWIY-X13-TSNLPSGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPEDFATYYCQQRSSYPLTFGGGTKVEIK
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号71~80、102、112、125または128を含むか、またはそれらからなるLCVRを含み、X12は、存在しない。
好ましい実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号81の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVR、または配列番号81の非CDR領域の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する非CDR領域の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVRを含む。
配列番号81
QIVLTQSPTIMSASPGEKVTITCSASSSVSYMHWFQQKTGTSPRLWIYNTSNLPSGVPARFSGSGSGTSYSLTISRMEAEDAATYYCQQRSSYPLTFGAGTKLELK
好ましい実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号82の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVR、または配列番号82の非CDR領域の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する非CDR領域の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVRを含む。
配列番号82
DIQLTQSPSFLSASVGDRVTITCSASSSVSYMHWFQQKPGKAPKLWIYNTSNLPSGVPSRFSGSGSGTEYTLTISSLQPEDFATYYCQQRSSYPLTFGGGTKVEIK
好ましい実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号83の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVR、または配列番号83の非CDR領域の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する非CDR領域の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVRを含む。
配列番号83
EIVLTQSPDFQSVTPKEKVTITCSASSSVSYMHWFQQKPDQSPKLWIYNTSNLPSGVPSRFSGSGSGTDYTLTINSLEAEDAATYYCQQRSSYPLTFGGGTKVEIK
好ましい実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号84の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVR、または配列番号84の非CDR領域の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する非CDR領域の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVRを含む。
配列番号84
EIVLTQSPATLSLSPGERATLSCSASSSVSYMHWFQQKPGQAPRLWIYNTSNLPSGIPARFSGSGSGTDYTLTISSLEPEDFAVYYCQQRSSYPLTFGGGTKVEIK
好ましい実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号85の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVR、または配列番号85の非CDR領域の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する非CDR領域の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVRを含む。
配列番号85
DIQLTQSPSFLSASVGDRVTITCRASSSVSYMHWYQQKPGKAPKLWIYNTSNLPSGVPSRFSGSGSGTEYTLTISSLQPEDFATYYCQQRSSYPLTFGGGTKVEIK
好ましい実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号86の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVR、または配列番号86の非CDR領域の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する非CDR領域の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVRを含む。
配列番号86
EIVLTQSPDFQSVTPKEKVTITCRASSSVSYMHWYQQKPDQSPKLWIYNTSNSPSGVPSRFSGSGSGTDFTLTINSLEAEDAATYYCQQRSSYPLTFGGGTKVEIK
好ましい実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号87の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVR、または配列番号87の非CDR領域の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する非CDR領域の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVRを含む。
配列番号87
EIVLTQSPATLSLSPGERATLSCRASSSVSYMHWFQQKPGQAPRLWIYNTSNLPSGIPARFSGSGSGTDYTLTISSLEPEDFAVYYCQQRSSYPLTFGGGTKVEIK
好ましい実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号88の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVR、または配列番号88の非CDR領域の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する非CDR領域の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVRを含む。
配列番号88
DIQLTQSPSFLSASVGDRVTITCRASSSVSYMHWYQQKPGKAPKLWIYATSNLQSGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPEDFATYYCQQRSSYPLTFGGGTKVEIK
好ましい実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号89の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVR、または配列番号89の非CDR領域の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する非CDR領域の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVRを含む。
配列番号89
EIVLTQSPDFQSVTPKEKVTITCRASSSVSYMHWYQQKPDQSPKLWIYNTSNSPSGVPSRFSGSGSGTDFTLTINSLEAEDAATYYCHQRSSYPLTFGGGTKVEIK
好ましい実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号90の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVR、または配列番号90の非CDR領域の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する非CDR領域の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVRを含む。
配列番号90
EIVLTQSPATLSLSPGERATLSCRASSSVSYMHWYQQKPGQAPRLWIYNTSNRATGIPARFSGSGSGTDFTLTISSLEPEDFAVYYCQQRSSYPLTFGGGTKVEIK
好ましい実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号103の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVR、または配列番号103の非CDR領域の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する非CDR領域の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVRを含む。
配列番号103
DIQLTQSPSFLSASVGDRVTITCRASSSVSSYMHWFQQKPGKAPKLWIYNTSNLPSGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPEDFATYYCQQRSSYPLTFGGGTKVEIK
好ましい実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号113の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVR、または配列番号113の非CDR領域の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する非CDR領域の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVRを含む。
配列番号113
DIQLTQSPSFLSASVGDRVTITCRASSSVSYMHWYQQKPGKAPKLWIYATSNLPSGVPSRFSGSGSGTEYTLTISSLQPEDFATYYCQQRSSYPLTFGGGTKVEIK
好ましい実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号126の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVR、または配列番号126の非CDR領域の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する非CDR領域の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVRを含む。
配列番号126
QIVLTQSPTIMSASPGEKVTITCSASSSVSYMHWFQQKTGTSPRLWIYNTANLPSGVPARFSGSGSGTSYSLTISRMEAEDAATYYCQQRSSYPLTFGAGTKLELK
好ましい実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、X13がAla(A)またはAsn(N)以外の任意のアミノ酸である配列番号129の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVR、または配列番号129の非CDR領域の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する非CDR領域の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVRを含む。
配列番号129
DIQLTQSPSFLSASVGDRVTITCRASSSVSYMHWYQQKPGKAPKLWIY-X13-TS NLPSGVPSRFSGSGSGTEYTLTISSLQPEDFATYYCQQRSSYPLTFGGGTKVEIK
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、
-本明細書の上で定義されるHCVR、および
-本明細書の上で定義されるLCVR、を含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、
-配列番号61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、101、121、122、123および124から選択されるHCVR、または配列番号61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、101、121、122、123もしくは124の非CDR領域の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する非CDR領域の配列を含むか、もしくはそれからなるHCVR、ならびに
-X12がAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択され、X13がAla(A)もしくはAsn(N)以外の任意のアミノ酸である配列番号71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、102、112、125および128から選択されるLCVR、または配列番号71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、102、112、125もしくは128の非CDR領域の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する非CDR領域の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、
-配列番号61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、101、121、122、123および124から選択されるHCVR、または配列番号61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、101、121、122、123もしくは124の非CDR領域の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する非CDR領域の配列を含むか、もしくはそれからなるHCVR、ならびに
-X13がAla(A)またはAsn(N)以外の任意のアミノ酸である配列番号81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、103、113、126および129から選択されるLCVR、または配列番号81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、103、113、126もしくは129の非CDR領域の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する非CDR領域の配列を含むか、もしくはそれからなるLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号61のHCVRおよび配列番号71のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号61のHCVRおよび配列番号72のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号61のHCVRおよび配列番号73のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号61のHCVRおよび配列番号74のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号61のHCVRおよび配列番号75のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号61のHCVRおよび配列番号76のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号61のHCVRおよび配列番号77のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号61のHCVRおよび配列番号78のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号61のHCVRおよび配列番号79のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号61のHCVRおよび配列番号80のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号61のHCVRおよび配列番号102のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号61のHCVRおよび配列番号112のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号61のHCVRおよび配列番号125のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号62のHCVRおよび配列番号71のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号62のHCVRおよび配列番号72のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号62のHCVRおよび配列番号73のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号62のHCVRおよび配列番号74のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号62のHCVRおよび配列番号75のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号62のHCVRおよび配列番号76のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号62のHCVRおよび配列番号77のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号62のHCVRおよび配列番号78のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号62のHCVRおよび配列番号79のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号62のHCVRおよび配列番号80のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号62のHCVRおよび配列番号102のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号62のHCVRおよび配列番号112のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号62のHCVRおよび配列番号125のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号63のHCVRおよび配列番号71のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号63のHCVRおよび配列番号72のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号63のHCVRおよび配列番号73のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号63のHCVRおよび配列番号74のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号63のHCVRおよび配列番号75のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号63のHCVRおよび配列番号76のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号63のHCVRおよび配列番号77のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号63のHCVRおよび配列番号78のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号63のHCVRおよび配列番号79のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号63のHCVRおよび配列番号80のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号63のHCVRおよび配列番号102のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号63のHCVRおよび配列番号112のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号63のHCVRおよび配列番号125のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号64のHCVRおよび配列番号71のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号64のHCVRおよび配列番号72のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号64のHCVRおよび配列番号73のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号64のHCVRおよび配列番号74のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号64のHCVRおよび配列番号75のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号64のHCVRおよび配列番号76のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号64のHCVRおよび配列番号77のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号64のHCVRおよび配列番号78のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号64のHCVRおよび配列番号79のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号64のHCVRおよび配列番号80のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号64のHCVRおよび配列番号102のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号64のHCVRおよび配列番号112のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号64のHCVRおよび配列番号125のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号65のHCVRおよび配列番号71のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号65のHCVRおよび配列番号72のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号65のHCVRおよび配列番号73のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号65のHCVRおよび配列番号74のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号65のHCVRおよび配列番号75のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号65のHCVRおよび配列番号76のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号65のHCVRおよび配列番号77のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号65のHCVRおよび配列番号78のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号65のHCVRおよび配列番号79のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号65のHCVRおよび配列番号80のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号65のHCVRおよび配列番号102のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号65のHCVRおよび配列番号112のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号65のHCVRおよび配列番号125のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号66のHCVRおよび配列番号71のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号66のHCVRおよび配列番号72のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号66のHCVRおよび配列番号73のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号66のHCVRおよび配列番号74のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号66のHCVRおよび配列番号75のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号66のHCVRおよび配列番号76のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号66のHCVRおよび配列番号77のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号66のHCVRおよび配列番号78のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号66のHCVRおよび配列番号79のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号66のHCVRおよび配列番号80のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号66のHCVRおよび配列番号102のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号66のHCVRおよび配列番号112のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号66のHCVRおよび配列番号125のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号67のHCVRおよび配列番号71のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号67のHCVRおよび配列番号72のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号67のHCVRおよび配列番号73のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号67のHCVRおよび配列番号74のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号67のHCVRおよび配列番号75のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号67のHCVRおよび配列番号76のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号67のHCVRおよび配列番号77のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号67のHCVRおよび配列番号78のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号67のHCVRおよび配列番号79のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号67のHCVRおよび配列番号80のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号67のHCVRおよび配列番号102のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号67のHCVRおよび配列番号112のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号67のHCVRおよび配列番号125のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号68のHCVRおよび配列番号71のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号68のHCVRおよび配列番号72のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号68のHCVRおよび配列番号73のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号68のHCVRおよび配列番号74のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号68のHCVRおよび配列番号75のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号68のHCVRおよび配列番号76のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号68のHCVRおよび配列番号77のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号68のHCVRおよび配列番号78のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号68のHCVRおよび配列番号79のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号68のHCVRおよび配列番号80のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号68のHCVRおよび配列番号102のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号68のHCVRおよび配列番号112のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号68のHCVRおよび配列番号125のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号69のHCVRおよび配列番号71のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号69のHCVRおよび配列番号72のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号69のHCVRおよび配列番号73のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号69のHCVRおよび配列番号74のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号69のHCVRおよび配列番号75のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号69のHCVRおよび配列番号76のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号69のHCVRおよび配列番号77のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号69のHCVRおよび配列番号78のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号69のHCVRおよび配列番号79のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号69のHCVRおよび配列番号80のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号69のHCVRおよび配列番号102のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号69のHCVRおよび配列番号112のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号69のHCVRおよび配列番号125のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号70のHCVRおよび配列番号71のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号70のHCVRおよび配列番号72のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号70のHCVRおよび配列番号73のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号70のHCVRおよび配列番号74のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号70のHCVRおよび配列番号75のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号70のHCVRおよび配列番号76のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号70のHCVRおよび配列番号77のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号70のHCVRおよび配列番号78のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号70のHCVRおよび配列番号79のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号70のHCVRおよび配列番号80のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号70のHCVRおよび配列番号102のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号70のHCVRおよび配列番号112のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号70のHCVRおよび配列番号125のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号101のHCVRおよび配列番号71のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号101のHCVRおよび配列番号72のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号101のHCVRおよび配列番号73のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号101のHCVRおよび配列番号74のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号101のHCVRおよび配列番号75のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号101のHCVRおよび配列番号76のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号101のHCVRおよび配列番号77のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号101のHCVRおよび配列番号78のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号101のHCVRおよび配列番号79のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号101のHCVRおよび配列番号80のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号101のHCVRおよび配列番号102のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号101のHCVRおよび配列番号112のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号101のHCVRおよび配列番号125のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号121のHCVRおよび配列番号71のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号121のHCVRおよび配列番号72のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号121のHCVRおよび配列番号73のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号121のHCVRおよび配列番号74のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号121のHCVRおよび配列番号75のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号121のHCVRおよび配列番号76のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号121のHCVRおよび配列番号77のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号121のHCVRおよび配列番号78のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号121のHCVRおよび配列番号79のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号121のHCVRおよび配列番号80のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号121のHCVRおよび配列番号102のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号121のHCVRおよび配列番号112のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号121のHCVRおよび配列番号125のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号122のHCVRおよび配列番号71のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号122のHCVRおよび配列番号72のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号122のHCVRおよび配列番号73のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号122のHCVRおよび配列番号74のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号122のHCVRおよび配列番号75のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号122のHCVRおよび配列番号76のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号122のHCVRおよび配列番号77のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号122のHCVRおよび配列番号78のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号122のHCVRおよび配列番号79のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号122のHCVRおよび配列番号80のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号122のHCVRおよび配列番号102のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号122のHCVRおよび配列番号112のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号122のHCVRおよび配列番号125のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号123のHCVRおよび配列番号71のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号123のHCVRおよび配列番号72のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号123のHCVRおよび配列番号73のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号123のHCVRおよび配列番号74のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号123のHCVRおよび配列番号75のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号123のHCVRおよび配列番号76のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号123のHCVRおよび配列番号77のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号123のHCVRおよび配列番号78のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号123のHCVRおよび配列番号79のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号123のHCVRおよび配列番号80のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号123のHCVRおよび配列番号102のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号123のHCVRおよび配列番号112のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号123のHCVRおよび配列番号125のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号124のHCVRおよび配列番号71のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号124のHCVRおよび配列番号72のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号124のHCVRおよび配列番号73のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号124のHCVRおよび配列番号74のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号124のHCVRおよび配列番号75のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号124のHCVRおよび配列番号76のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号124のHCVRおよび配列番号77のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号124のHCVRおよび配列番号78のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号124のHCVRおよび配列番号79のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号124のHCVRおよび配列番号80のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号124のHCVRおよび配列番号102のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号124のHCVRおよび配列番号112のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号124のHCVRおよび配列番号125のLCVRを含み、X12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号61のHCVRおよび配列番号81のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号61のHCVRおよび配列番号82のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号61のHCVRおよび配列番号83のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号61のHCVRおよび配列番号84のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号61のHCVRおよび配列番号85のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号61のHCVRおよび配列番号86のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号61のHCVRおよび配列番号87のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号61のHCVRおよび配列番号88のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号61のHCVRおよび配列番号89のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号61のHCVRおよび配列番号90のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号61のHCVRおよび配列番号103のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号61のHCVRおよび配列番号113のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号61のHCVRおよび配列番号126のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号62のHCVRおよび配列番号81のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号62のHCVRおよび配列番号82のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号62のHCVRおよび配列番号83のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号62のHCVRおよび配列番号84のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号62のHCVRおよび配列番号85のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号62のHCVRおよび配列番号86のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号62のHCVRおよび配列番号87のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号62のHCVRおよび配列番号88のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号62のHCVRおよび配列番号89のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号62のHCVRおよび配列番号90のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号62のHCVRおよび配列番号103のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号62のHCVRおよび配列番号113のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号62のHCVRおよび配列番号126のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号63のHCVRおよび配列番号81のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号63のHCVRおよび配列番号82のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号63のHCVRおよび配列番号83のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号63のHCVRおよび配列番号84のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号63のHCVRおよび配列番号85のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号63のHCVRおよび配列番号86のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号63のHCVRおよび配列番号87のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号63のHCVRおよび配列番号88のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号63のHCVRおよび配列番号89のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号63のHCVRおよび配列番号90のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号63のHCVRおよび配列番号103のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号63のHCVRおよび配列番号113のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号63のHCVRおよび配列番号126のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号64のHCVRおよび配列番号81のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号64のHCVRおよび配列番号82のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号64のHCVRおよび配列番号83のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号64のHCVRおよび配列番号84のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号64のHCVRおよび配列番号85のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号64のHCVRおよび配列番号86のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号64のHCVRおよび配列番号87のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号64のHCVRおよび配列番号88のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号64のHCVRおよび配列番号89のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号64のHCVRおよび配列番号90のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号64のHCVRおよび配列番号103のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号64のHCVRおよび配列番号113のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号64のHCVRおよび配列番号126のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号65のHCVRおよび配列番号81のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号65のHCVRおよび配列番号82のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号65のHCVRおよび配列番号83のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号65のHCVRおよび配列番号84のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号65のHCVRおよび配列番号85のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号65のHCVRおよび配列番号86のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号65のHCVRおよび配列番号87のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号65のHCVRおよび配列番号88のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号65のHCVRおよび配列番号89のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号65のHCVRおよび配列番号90のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号65のHCVRおよび配列番号103のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号65のHCVRおよび配列番号113のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号65のHCVRおよび配列番号126のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号66のHCVRおよび配列番号81のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号66のHCVRおよび配列番号82のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号66のHCVRおよび配列番号83のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号66のHCVRおよび配列番号84のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号66のHCVRおよび配列番号85のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号66のHCVRおよび配列番号86のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号66のHCVRおよび配列番号87のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号66のHCVRおよび配列番号88のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号66のHCVRおよび配列番号89のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号66のHCVRおよび配列番号90のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号66のHCVRおよび配列番号103のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号66のHCVRおよび配列番号113のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号66のHCVRおよび配列番号126のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号67のHCVRおよび配列番号81のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号67のHCVRおよび配列番号82のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号67のHCVRおよび配列番号83のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号67のHCVRおよび配列番号84のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号67のHCVRおよび配列番号85のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号67のHCVRおよび配列番号86のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号67のHCVRおよび配列番号87のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号67のHCVRおよび配列番号88のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号67のHCVRおよび配列番号89のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号67のHCVRおよび配列番号90のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号67のHCVRおよび配列番号103のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号67のHCVRおよび配列番号113のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号67のHCVRおよび配列番号126のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号68のHCVRおよび配列番号81のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号68のHCVRおよび配列番号82のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号68のHCVRおよび配列番号83のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号68のHCVRおよび配列番号84のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号68のHCVRおよび配列番号85のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号68のHCVRおよび配列番号86のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号68のHCVRおよび配列番号87のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号68のHCVRおよび配列番号88のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号68のHCVRおよび配列番号89のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号68のHCVRおよび配列番号90のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号68のHCVRおよび配列番号103のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号68のHCVRおよび配列番号113のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号68のHCVRおよび配列番号126のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号69のHCVRおよび配列番号81のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号69のHCVRおよび配列番号82のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号69のHCVRおよび配列番号83のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号69のHCVRおよび配列番号84のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号69のHCVRおよび配列番号85のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号69のHCVRおよび配列番号86のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号69のHCVRおよび配列番号87のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号69のHCVRおよび配列番号88のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号69のHCVRおよび配列番号89のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号69のHCVRおよび配列番号90のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号69のHCVRおよび配列番号103のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号69のHCVRおよび配列番号113のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号69のHCVRおよび配列番号126のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号70のHCVRおよび配列番号81のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号70のHCVRおよび配列番号82のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号70のHCVRおよび配列番号83のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号70のHCVRおよび配列番号84のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号70のHCVRおよび配列番号85のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号70のHCVRおよび配列番号86のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号70のHCVRおよび配列番号87のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号70のHCVRおよび配列番号88のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号70のHCVRおよび配列番号89のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号70のHCVRおよび配列番号90のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号70のHCVRおよび配列番号103のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号70のHCVRおよび配列番号113のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号70のHCVRおよび配列番号126のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号101のHCVRおよび配列番号81のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号101のHCVRおよび配列番号82のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号101のHCVRおよび配列番号83のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号101のHCVRおよび配列番号84のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号101のHCVRおよび配列番号85のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号101のHCVRおよび配列番号86のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号101のHCVRおよび配列番号87のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号101のHCVRおよび配列番号88のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号101のHCVRおよび配列番号89のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号101のHCVRおよび配列番号90のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号101のHCVRおよび配列番号103のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号101のHCVRおよび配列番号113のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号101のHCVRおよび配列番号126のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号121のHCVRおよび配列番号81のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号121のHCVRおよび配列番号82のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号121のHCVRおよび配列番号83のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号121のHCVRおよび配列番号84のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号121のHCVRおよび配列番号85のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号121のHCVRおよび配列番号86のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号121のHCVRおよび配列番号87のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号121のHCVRおよび配列番号88のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号121のHCVRおよび配列番号89のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号121のHCVRおよび配列番号90のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号121のHCVRおよび配列番号103のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号121のHCVRおよび配列番号113のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号121のHCVRおよび配列番号126のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号122のHCVRおよび配列番号81のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号122のHCVRおよび配列番号82のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号122のHCVRおよび配列番号83のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号122のHCVRおよび配列番号84のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号122のHCVRおよび配列番号85のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号122のHCVRおよび配列番号86のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号122のHCVRおよび配列番号87のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号122のHCVRおよび配列番号88のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号122のHCVRおよび配列番号89のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号122のHCVRおよび配列番号90のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号122のHCVRおよび配列番号103のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号122のHCVRおよび配列番号113のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号122のHCVRおよび配列番号126のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号123のHCVRおよび配列番号81のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号123のHCVRおよび配列番号82のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号123のHCVRおよび配列番号83のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号123のHCVRおよび配列番号84のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号123のHCVRおよび配列番号85のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号123のHCVRおよび配列番号86のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号123のHCVRおよび配列番号87のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号123のHCVRおよび配列番号88のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号123のHCVRおよび配列番号89のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号123のHCVRおよび配列番号90のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号123のHCVRおよび配列番号103のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号123のHCVRおよび配列番号113のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号123のHCVRおよび配列番号126のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号124のHCVRおよび配列番号81のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号124のHCVRおよび配列番号82のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号124のHCVRおよび配列番号83のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号124のHCVRおよび配列番号84のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号124のHCVRおよび配列番号85のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号124のHCVRおよび配列番号86のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号124のHCVRおよび配列番号87のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号124のHCVRおよび配列番号88のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号124のHCVRおよび配列番号89のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号124のHCVRおよび配列番号90のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号124のHCVRおよび配列番号103のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号124のHCVRおよび配列番号113のLCVRを含む。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントは、配列番号124のHCVRおよび配列番号126のLCVRを含む。
一実施形態では、本明細書の上で定義されるHCVRおよび/またはLCVRのいずれも、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35個以上のアミノ酸が異なるアミノ酸によって置換されていることを特徴とすることができる。
一実施形態では、本明細書の上で定義されるHCVRおよび/またはLCVRのいずれかの非CDR領域の配列は、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35個以上のアミノ酸が異なるアミノ酸によって置換されていることを特徴とすることができる。
一実施形態では、本明細書の上で定義されるHCVRおよび/またはLCVRのいずれかは、本明細書の上で定義される特定のHCVRおよび/またはLCVRと少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有するアミノ酸配列を有することを特徴とすることができる。
一実施形態では、本明細書の上で定義されるHCVRおよび/またはLCVRのいずれかの非CDR領域の配列は、本明細書の上で定義される特定のHCVRおよび/またはLCVRの非CDR領域の配列と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有するアミノ酸配列を有することを特徴とすることができる。
本明細書はまた、「抗体または抗原結合フラグメント」の節で上に開示したhCD45RCに結合する抗体またはその結合フラグメントをコードする単離された核酸を記載する。
一実施形態では、単離された核酸が精製される。
一実施形態では、単離された核酸は、
(1)吸光度法または蛍光法(例えば、260nmおよび280nmでの吸光度比(A260/280)を測定するなどによって)によって決定される核酸の80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%以上を超える重量、最も好ましくは96%、97%、98%もしくは99%を超える重量、または
(2)アガロースゲル電気泳動および挿入剤、例えば臭化エチジウム、SYBR Green、GelGreenなどを使用することによって示される均一性、に精製される。
一実施形態では、抗原結合フラグメントをコードする核酸は、「抗体または抗原結合フラグメント」の節に開示される抗体またはその結合フラグメントのHCVRをコードする配列を含むか、またはそれからなる。
一実施形態では、抗原結合フラグメントをコードする核酸は、配列番号95の配列、または配列番号95と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有し、配列番号61とマウス抗体もしくはキメラ抗体またはその結合フラグメントのHCVRをコードする任意の配列を含むか、またはそれからなる。
配列番号95
CAGGTCCAGCTGCAACAGTCTGGCGCTGAGCTGGTTAGGCCTGGGACTTCAGTGAAGATGTCCTGCAAGGCCGCTGGATACACCTTCACTAACTACTACATAGGTTGGGTAAAGCAGAGGCCTGGACATGGCCTTGAGTGGATCGGAGATATTTTCCCTGGAGGTGACTATGCCAACAGCAATGAGAAGTTCAAGGGCAAAGCCACACTGACTGCAGACACATCCTCCAGCACAGCCTACATGCAGCTCAGCAGCCTGACATCTGAGGACTCTGCCATCTATTACTGTGTGAGAAGGAACTTTGACTACTGGGGCCAAGGCACCACTCTCACAGTGTCCTCA
一実施形態では、抗原結合フラグメントをコードする核酸は、「抗体または抗原結合フラグメント」の節に開示される抗体またはその結合フラグメントのLCVRをコードする配列を含むか、またはそれからなる。
一実施形態では、抗原結合フラグメントをコードする核酸は、配列番号96の配列、または配列番号96と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有し、配列番号81のマウスもしくはキメラ抗体またはその結合フラグメントのLCVRをコードする任意の配列を含むか、またはそれらからなる。
配列番号96
CAAATTGTTCTCACCCAGTCTCCAACAATCATGTCTGCATCTCCAGGGGAGAAGGTGACCATAACCTGCAGTGCCAGCTCAAGTGTAAGTTACATGCACTGGTTCCAGCAGAAGACAGGCACTTCTCCCAGACTCTGGATTTATAACACATCCAACCTGCCTTCTGGAGTCCCCGCTCGCTTCAGTGGCAGTGGATCTGGGACCTCTTACTCTCTCACAATCAGCCGAATGGAGGCTGAAGATGCTGCCACTTATTACTGCCAGCAAAGGAGTAGTTACCCACTCACGTTCGGTGCTGGGACCAAGCTGGAGCTGAAA
一実施形態では、抗原結合フラグメントをコードする核酸は、
-「抗体または抗原結合フラグメント」の節で開示される抗体またはその結合フラグメントのHCVRをコードする配列、および
-「抗体または抗原結合フラグメント」の節で開示される抗体またはその結合フラグメントのLCVRをコードする配列、を含むか、またはそれらからなる。
一実施形態では、抗原結合フラグメントをコードする核酸は、
-配列番号95の配列、または配列番号95と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する任意の配列、および
-配列番号96の配列、または配列番号96と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上の同一性を共有する任意の配列、を含むか、またはそれらからなる。
当業者は、本明細書に開示される他のすべてのHCVRおよびLCVR、特に「抗体または抗原結合フラグメント」の節に開示されるヒト化抗体またはその結合フラグメントをコードする核酸配列を設計できることは容易に理解されよう。
当業者は、例えば、コドン最適化などによって組換え産生速度を改善するために核酸配列を改変することを目的とする分子生物学的方法に精通していることがさらに理解される。最終的に、本出願は、本明細書に開示される任意のHCVRおよび/またはLCVRをコードする任意の核酸を包含する。
本発明は、ヒトCD45RCに特異的なキメラ受容体を提供し、前記CARは、
(a)少なくとも1つの細胞外結合ドメインであって、前記結合ドメインが、前記ヒトCD45RCに結合する、少なくとも1つの細胞外結合ドメイン、
(b)任意選択で、少なくとも1つの細胞外ヒンジドメイン、
(c)少なくとも1つの膜貫通ドメイン、ならびに
(d)少なくとも1つの細胞内シグナル伝達ドメインであって、細胞内ドメインが、少なくとも1つのT細胞一次シグナル伝達ドメインおよび任意選択で、少なくとも1つのT細胞共刺激シグナル伝達ドメインを含む、少なくとも1つの細胞内シグナル伝達ドメイン、を含む。
本明細書で使用される場合、「キメラ受容体」(CR)または「キメラ抗原受容体」(CAR)という用語は、1つのポリペプチドまたはポリペプチドのセット、典型的には最も単純な実施形態では2つのポリペプチドを指し、免疫細胞内にある場合、細胞に標的リガンドに対する特異性および細胞内シグナル生成を提供する。いくつかの実施形態では、ポリペプチドのセットは、互いに連続している。いくつかの実施形態では、キメラ受容体は、ポリペプチドのセットを含むキメラ融合タンパク質である。いくつかの実施形態では、ポリペプチドのセットは、二量体化分子の存在下で、ポリペプチドを互いに連結することができる、例えばリガンド結合ドメインを細胞内シグナル伝達ドメインに連結することができる二量体化スイッチを含む。一実施形態では、キメラ受容体は、キメラ受容体融合タンパク質のアミノ末端(N-ter)に任意選択のリーダー配列を含む。一実施形態では、キメラ受容体は、細胞外リガンド結合ドメインのN末端にリーダー配列をさらに含み、リーダー配列は、任意選択で、細胞プロセシングおよび細胞膜へのキメラ受容体の局在化中にリガンド結合ドメインから切断される。
いくつかの実施形態では、キメラ受容体は、1つ以上のポリペプチドを含む。
いくつかの実施形態では、細胞外結合ドメインは、抗原結合ドメインであり、したがってキメラ受容体は、キメラ抗原受容体(またはCAR)とも呼ばれ得る。
本発明のキメラ受容体またはキメラ抗原受容体は、少なくとも1つの細胞外結合ドメインを含み、前記結合ドメインは、ヒトCD45RCに結合する。
いくつかの実施形態では、本発明のキメラ受容体の細胞外ドメインは少なくとも1つのリガンド結合ドメインまたは抗原結合ドメインを含む。いくつかの実施形態では、抗原結合ドメインは、抗体または抗原結合フラグメントである。
いくつかの実施形態では、本発明のキメラ受容体は、ヒトCD45RCに対する抗体またはその抗原結合フラグメント、例えば、「抗体または抗原結合フラグメント」の節に上述した任意の抗体またはその抗原結合フラグメントなどを含む。
いくつかの実施形態では、本発明のCARの細胞外結合ドメインは、「抗体または抗原結合フラグメント」の節に上述したヒトCD45RCに対する抗体を含む。
いくつかの実施形態では、本発明のCARの細胞外結合ドメインは、「抗体または抗原結合フラグメント」の節に上述したヒトCD45RCに対する抗原結合フラグメントを含む。
一実施形態では、細胞外結合ドメインは、
(a)以下の3つのCDRを含むHCVR:
(i)配列番号1のV-CDR1、
(ii)配列番号4、5、6、8、100、116、117、118および119の配列を含む群から選択される配列を有するV-CDR2、および
(iii)配列番号3の配列のV-CDR3、ならびに
(b)以下の3つのCDRを含むLCVR:
(i)配列番号15(SASSSVS-X12-YMH)および18(RASSSVS-X12-YMH)(X12は存在しないか、またはAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される)の配列を含む群から選択される配列を有するV-CDR1、
(ii)配列番号16の配列のV-CDR2、および
(iii)配列番号17の配列のV-CDR3、を含む少なくとも1つの抗原結合フラグメントを含む。
一実施形態では、細胞外結合ドメインは、
(a)以下の3つのCDRを含むHCVR:
(i)配列番号1の配列のV-CDR1、
(ii)配列番号4および5の配列を含む群から選択される配列を有するV-CDR2、および
(iii)配列番号3の配列のV-CDR3、ならびに
(b)以下の3つのCDRを含むLCVR:
(i)配列番号15(X12は存在しない)の配列のV-CDR1、
(ii)配列番号16の配列のV-CDR2、および
(iii)配列番号17の配列のV-CDR3、を含む少なくとも1つの抗原結合フラグメントを含む。
一実施形態では、細胞外結合ドメインは、
(a)以下の3つのCDRを含むHCVR:
(i)配列番号1の配列のV-CDR1、
(ii)配列番号4のV-CDR2、および
(iii)配列番号3の配列のV-CDR3、ならびに
(b)以下の3つのCDRを含むLCVR:
(i)配列番号15(X12は存在しない)の配列のV-CDR1、
(ii)配列番号16の配列のV-CDR2、および
(iii)配列番号17の配列のV-CDR3、を含む少なくとも1つの抗原結合フラグメントを含む。
一実施形態では、細胞外結合ドメインは、
(a)以下の3つのCDRを含むHCVR:
(i)配列番号1の配列のV-CDR1、
(ii)配列番号4、6および100の配列を含む群から選択される配列を有するV-CDR2、および
(iii)配列番号3の配列のV-CDR3、ならびに
(b)以下の3つのCDRを含むLCVR:
(i)配列番号15および18(X12は存在しない)の配列を含む群から選択される配列を有するV-CDR1、
(ii)配列番号16の配列のV-CDR2、および
(iii)配列番号17の配列のV-CDR3、を含む少なくとも1つの抗原結合フラグメントを含む。
一実施形態では、細胞外結合ドメインは、
1)配列番号61の配列のHCVRおよび配列番号81の配列のLCVR、
2)配列番号62の配列のHCVRおよび配列番号82の配列のLCVR、
3)配列番号62の配列のHCVRおよび配列番号83の配列のLCVR、
4)配列番号62の配列のHCVRおよび配列番号84の配列のLCVR、
5)配列番号63の配列のHCVRおよび配列番号82の配列のLCVR、
6)配列番号63の配列のHCVRおよび配列番号83の配列のLCVR、
7)配列番号63の配列のHCVRおよび配列番号84の配列のLCVR、
8)配列番号64の配列のHCVRおよび配列番号82の配列のLCVR、
9)配列番号64の配列のHCVRおよび配列番号83の配列のLCVR、
10)配列番号64の配列のHCVRおよび配列番号84の配列のLCVR、
11)配列番号101の配列のHCVRおよび配列番号85の配列のLCVR、
12)配列番号101の配列のHCVRおよび配列番号103の配列のLCVR、
13)配列番号65の配列のHCVRおよび配列番号85の配列のLCVR、
14)配列番号65の配列のHCVRおよび配列番号103の配列のLCVR、
15)配列番号62の配列のHCVRおよび配列番号85の配列のLCVR、
16)配列番号101の配列のHCVRおよび配列番号82の配列のLCVR、
17)配列番号121の配列のHCVRおよび配列番号85の配列のLCVR、
18)配列番号122の配列のHCVRおよび配列番号85の配列のLCVR、
19)配列番号123の配列のHCVRおよび配列番号85の配列のLCVR、
20)配列番号124の配列のHCVRおよび配列番号85の配列のLCVR、
21)配列番号63の配列のHCVRおよび配列番号85の配列のLCVR、
22)配列番号67の配列のHCVRおよび配列番号85の配列のLCVR、
23)配列番号67の配列のHCVRおよび配列番号103の配列のLCVR、または
24)1)~23)に記載のHCVRおよびLCVRの非CDR領域の配列と少なくとも70%の同一性を共有する非CDR領域の配列を含むHCVRおよびLCVR、を含む少なくとも1つの抗原結合フラグメントを含む。
一実施形態では、細胞外結合ドメインは、
(a)以下の3つのCDRを含むHCVR:
(i)配列番号1の配列のV-CDR1、
(ii)配列番号4、5、6、8、100、116、117、118および119の配列を含む群から選択される配列を有するV-CDR2、および
(iii)配列番号3の配列のV-CDR3、ならびに
(b)以下の3つのCDRを含むLCVR:
(i)配列番号15および18(配列番号15および18中のX12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される)の配列を含む群から選択される配列を有するV-CDR1、
(ii)配列番号16の配列のV-CDR2、および
(iii)配列番号17の配列のV-CDR3、を含む少なくとも1つの抗原結合フラグメントを含み、
好ましくは、LCVRのKabat位置L71のアミノ酸残基は、Phe(F)である。
本発明のCARに含まれる抗体またはその抗原結合フラグメントは、リガンド結合ドメインが、例えば、単一ドメイン抗体フラグメント(sdAb)、一本鎖抗体(scFv)、ヒト化抗体または二重特異性抗体(Harlow et al.,1999,In:Using Antibodies:A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Laboratory Press,NY;Harlow et al.,1989,In:Antibodies:A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor,New York;Houston et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 85:5879-5883(1988);Bird et al.,Science 242:423-426(1988))を含む連続ポリペプチド鎖の一部として発現される種々の形態で存在し得る。いくつかの態様では、本発明のキメラ受容体の抗原結合ドメインは、抗体フラグメントまたは抗原結合フラグメントを含む。いくつかの態様では、キメラ受容体は、scFvを含む抗原結合フラグメントを含む。
いくつかの実施形態では、前記抗体または抗原結合フラグメントは、ヒト化抗体、一本鎖抗体、二量体一本鎖抗体、Fv、scFv、Fab、F(ab)’、脱フコシル化抗体、二重特異性抗体、ダイアボディ、トリアボディおよびテトラボディからなる群から選択される抗体分子である。
「一本鎖抗体」とは、連続アミノ酸残基の1つの中断されていない配列を含むか、またはそれからなる一次構造を有するタンパク質である任意の抗体またはそのフラグメントを指し、(1)一本鎖Fv分子(scFv)、(2)1つの軽鎖可変ドメインのみを含有する単鎖タンパク質、または軽鎖可変ドメインの3つのCDRを含有し、関連する重鎖部分を含まないそのフラグメント、および(3)1つの重鎖可変領域のみを含有する一本鎖タンパク質、または関連する軽鎖部分を有さない重鎖可変領域の3つのCDRを含有するそのフラグメント、が含まれるが、これらに限定されない。
「一本鎖Fv」は、「sFv」または「scFv」とも略され、単一のアミノ酸鎖に接続されたVおよびV抗体ドメインを含む抗体フラグメントを指す。好ましくは、scFvアミノ酸配列は、scFvが抗原結合のための所望の構造を形成することを可能にするペプチドリンカーをVドメインとVドメインとの間にさらに含む(Pluckthun,1994.Antibodies from Escherichia coli.In Rosenberg&Moore(Eds.),The pharmacology of monoclonal antibodies.Handbook of Experimental Pharmacology,113:269-315.Springer:Berlin,Heidelberg)。
「Fv」は、完全な抗原認識部位および抗原結合部位を含有する最小の抗体フラグメントを指す。このフラグメントは、1つのHCVRと1つのLCVRとが密接に非共有結合した二量体からなる。これらの2つのドメインの折り畳みから、抗原結合に寄与し、抗体に抗原結合特異性を付与する6つの超可変ループ(各々重鎖および軽鎖からの3つのループ)が生じる。しかしながら、単一の可変ドメイン(または抗原に特異的な3つのCDRのみを含むFvの半分)でさえ、結合部位全体よりも低い親和性ではあるが、抗原を認識して結合する能力を有する。
「ダイアボディ」とは、可変ドメインの鎖内ではなく鎖間対合が達成され、二価フラグメント、すなわち2つの抗原結合部位を有するフラグメントをもたらすように、HCVRとLCVRとの間に短いリンカー(約5~10残基)を有するscFvフラグメントを構築することによって調製される小さな抗体フラグメントを指す。二重特異性ダイアボディは、2つの抗体のHCVRおよびLCVRが異なるポリペプチド鎖上に存在する2つの「クロスオーバー」scFvフラグメントのヘテロ二量体である。ダイアボディは、特許EP0404097、特許出願WO1993011161およびHolliger et al.,1993.Proc Natl Acad Sci USA.90(14):6444-8でより完全に記載されている。
いくつかの実施形態では、前記抗体は、ユニボディ、単一ドメイン抗体およびナノボディからなる群から選択される抗体フラグメントである。
「ユニボディ」は、当技術分野で周知であり、IgG4抗体のヒンジ領域を欠く抗体フラグメントを指す。ヒンジ領域の欠失は、伝統的なIgG4抗体のサイズの本質的に半分であり、IgG4抗体の二価結合領域ではなく一価結合領域を有する分子をもたらす。
「ドメイン抗体」は、当技術分野で周知であり、抗体の重鎖または軽鎖のいずれかの可変領域に対応する抗体の最小機能的結合単位を指す。
「単一ドメイン抗体」は、当技術分野で周知であり、天然に存在する重鎖抗体の独特の構造的および機能的特性を含有する抗体由来タンパク質を指す(Muyldermans,2013.Annu Rev Biochem.82:775-97)。これらの重鎖抗体は、単一の可変ドメイン(VH)-そのような一例は、ナノボディ(登録商標)-、または単一の可変ドメイン(VH)ならびに2つの定常ドメイン(C2およびC3)-例えばラクダ抗体-、または単一の可変ドメイン(VH)ならびに5つの定常ドメイン(C1、C2、C3、C4およびC5)-例えばサメ抗体を含有し得る。
いくつかの実施形態では、前記抗体は、アフィボディ、アフィリン、アフィチン、アデクチン、アトリマー、エバシン、DARPin、アンチカリン、アビマー、フィノマー、バーサボディおよびデュオカリンからなる群から選択される抗体模倣物である。
「アフィボディ」は、当技術分野で周知であり、ブドウ球菌プロテインAのIgG結合ドメインのうちの1つに由来する、58個のアミノ酸残基のタンパク質ドメインに基づく親和性タンパク質を指す(Frejd&Kim,2017.Exp Mol Med.49(3):e306;特許US5,831,012)。
「DARPins」(設計アンキリンリピートタンパク質)は、当技術分野で周知であり、非抗体タンパク質の結合能力を利用するために開発された抗体模倣DRP(設計リピートタンパク質)技術を指す(Binz et al.,2003.J Mol Biol.332(2):489-503;Pluchthun,2015.Annu Rev Pharmacol Toxicol.55:489-511)。
「抗カリン」は、当技術分野で周知であり、結合特異性がリポカリンに由来する別の抗体模倣技術を指す(Skerra,2008.FEBS J.275(11):2677-83)。抗カリンはまた、「デュオカリン」と呼ばれる二重標的化タンパク質としてフォーマットされ得る(Schlehuber&Skerra,2001.Biol Chem.382(9):1335-42)。
「アビマー」は、当技術分野で周知であり、別の抗体模倣技術を指す(Silverman et al.,2005.Nat Biotechnol.23(12):1556-61)。
「Versabodies」は、当技術分野で周知であり、別の抗体模倣技術を指す(特許出願US20070191272)。それらは、典型的なタンパク質が有する疎水性コアに置き換わる、高いジスルフィド密度の足場を形成する、>15%のシステインを有する3~5kDaの小さなタンパク質である。疎水性コアを含む多数の疎水性アミノ酸を少数のジスルフィドで置き換えると、MHC提示に最も寄与する残基が疎水性であるため、より小さく、より親水性であり(より少ない凝集および非特異的結合)、プロテアーゼおよび熱に対してより耐性であり、T細胞エピトープの密度がより低いタンパク質をもたらす。これらの特性の4つはすべて免疫原性に影響を及ぼすことが周知であり、それらは、一緒になって免疫原性の大きな減少を引き起こすと予想される。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントはまた、多重特異性抗体またはその結合フラグメント、すなわち、その1つが本発明によるhCD45RCである、2つ以上、例えば少なくとも2つの異なる抗原に対して免疫特異性である多重特異性抗体またはその結合フラグメントを包含する。
一実施形態では、抗体またはその結合フラグメントはまた、抗体のポリマーまたはその結合フラグメント、すなわち同一であるか異なるかにかかわらず、直接的または間接的に共有結合している2つ以上、例えば少なくとも2つの抗体またはその結合フラグメントを包含する。
抗体のフラグメントおよび誘導体(特に明記しない限り、または文脈と明らかに矛盾しない限り、本出願で使用される「抗体」という用語に包含される)は、当技術分野で公知の技術によって産生することができる。「フラグメント」は、インタクトな抗体の一部、一般に抗原結合部位または可変領域を含む。抗体フラグメントの例には、Fab、Fab’、Fab’-SH、F(ab’)、およびFvフラグメント、ダイアボディ、(1)一本鎖Fv分子、(2)1つの軽鎖可変ドメインのみを含有する一本鎖ポリペプチド、または関連する重鎖部分を含まない、軽鎖可変ドメインの3つのCDRを含有するそのフラグメント、および(3)1つの重鎖可変領域のみを含有する一本鎖ポリペプチド、または関連する軽鎖部分を含まない、重鎖可変領域の3つのCDRを含有するそのフラグメントを含むが、これらに限定されない、連続アミノ酸残基の1つの中断されていない配列からなる一次構造を有するポリペプチド(本明細書では「一本鎖抗体フラグメント」または「一本鎖ポリペプチド」と呼ばれる)である任意の抗体フラグメント、ならびに抗体フラグメントから形成された多重特異性抗体が含まれる。本抗体のフラグメントは、標準的な方法を使用して得ることができる。所与のCDRの正確なアミノ酸配列境界は、Kabatら、(1991)、「Sequences of Proteins of Immunological Interest」第5版、Public Health Service,National Institutes of Health,Bethesda,MD(「Kabat」番号付けスキーム)、Al-Lazikani et al.,JMB 273:927-948(1997)(「Chothia」番号付けスキーム)によって記載されているものを含む、多くの周知のスキームのいずれか、またはそれらの組み合わせを使用して決定することができる。
いくつかの実施形態では、本発明のCARの抗原結合ドメインは、例えばscFvなどの抗体フラグメントを含むか、またはそれからなる。特定の実施形態では、抗原結合ドメインは、scFvである。
いくつかの実施形態では、本発明のCARは、第1の抗原に対する細胞外結合ドメイン、hCD45RC、および別の抗原に対する少なくとも1つの他の細胞外結合ドメインを含む。そのようなCARは、少なくとも2つの異なる抗原に結合することができる。
一実施形態では、前記少なくとも1つの他の細胞外結合ドメインは、特異的抗原に対する抗体またはその抗原結合フラグメントである。
一実施形態では、前記少なくとも1つの他の細胞外結合ドメインは、例えば、scFvなどの抗体フラグメントを含むか、またはそれからなる。
一実施形態では、scFvは、V鎖とV鎖とを連結するリンカーを含む。
一実施形態では、リンカーは、好ましくは2~10アミノ酸の範囲の長さを有する短いオリゴまたはポリペプチドである。
例えば、グリシン-セリン二重鎖は、特に好適なリンカー(GSリンカー)を提供する。Gly/Serリンカーの例には、GSリンカー、GSリンカー、GSリンカー、GSリンカーが含まれるが、これらに限定されない。
Sリンカーの非限定的な例は、GGSである。
Sリンカーは、(GGGS)または(配列番号130)とも呼ばれるアミノ酸配列(Gly-Gly-Gly-Ser)を含み、nは、1以上の正の整数である(例えば、n=1、n=2、n=3、n=4、n=5、n=6、n=7、n=8、n=9またはn=10など)。GSリンカーの例には、GGGSGGGGSGGGS(配列番号131)が含まれるが、これらに限定されない。
Sリンカーの例には、GGGGS(配列番号132)に対応する(GlySer)、GGGGSGGGGS(配列番号133)に対応する(GlySer)、GGGGSGGGGSGGGGS(配列番号134)に対応する(GlySer)、GGGGSGGGGSGGGGSGGGGS(配列番号135)に対応する(GlySer)が含まれるが、これらに限定されない。
一実施形態では、リンカーは、配列番号136の配列によってコードされ得る(GS)リンカー(配列番号134)である。
配列番号136
GGAGGTGGAGGCTCTGGCGGTGGAGGAAGTGGTGGGGGAGGCTCT
一実施形態では、リンカーは、配列番号137の配列によってコードされ得る(GS)リンカー(配列番号134)である。
配列番号137
GGTGGCGGTGGCTCGGGCGGTGGTGGGTCGGGTGGCGGCGGATCT
一実施形態では、scFvは、配列番号138のアミノ酸配列をコードする配列番号173の核酸配列を含むか、またはそれからなる。
配列番号138
AAGGTCCAGCTGCAACAGTCTGGCGCTGAGCTGGTTAGGCCTGGGACTTCAGTGAAGATGTCCTGCAAGGCCGCTGGATACACCTTCACTAACTACTACATAGGTTGGGTAAAGCAGAGGCCTGGACATGGCCTTGAGTGGATCGGAGATATTTTCCCTGGAGGTGACTATGCCAACAGCAATGAGAAGTTCAAGGGCAAAGCCACACTGACTGCAGACACATCCTCCAGCACAGCCTACATGCAGCTCAGCAGCCTGACATCTGAGGACTCTGCCATCTATTACTGTGTGAGAAGGAACTTTGACTACTGGGGCCAAGGCACCACTCTCACAGTGTCCTCAGGTGGCGGTGGCTCGGGCGGTGGTGGGTCGGGTGGCGGCGGATCTCAAATTGTTCTCACCCAGTCTCCAACAATCATGTCTGCATCTCCAGGGGAGAAGGTGACCATAACCTGCAGTGCCAGCTCAAGTGTAAGTTACATGCACTGGTTCCAGCAGAAGACAGGCACTTCTCCCAGACTCTGGATTTATAACACATCCAACCTGCCTTCTGGAGTCCCCGCTCGCTTCAGTGGCAGTGGATCTGGGACCTCTTACTCTCTCACAATCAGCCGAATGGAGGCTGAAGATGCTGCCACTTATTACTGCCAGCAAAGGAGTAGTTACCCACTCACGTTCGGTGCTGGGACCAAGCTGGAGCTGAAA
配列番号173
KVQLQQSGAELVRPGTSVKMSCKAAGYTFTNYYIGWVKQRPGHGLEWIGDIFPGGDYANSNEKFKGKATLTADTSSSTAYMQLSSLTSEDSAIYYCVRRNFDYWGQGTTLTVSSGGGGSGGGGSGGGGSQIVLTQSPTIMSASPGEKVTITCSASSSVSYMHWFQQKTGTSPRLWIYNTSNLPSGVPARFSGSGSGTSYSLTISRMEAEDAATYYCQQRSSYPLTFGAGTKLELK
いくつかの実施形態では、本発明のCARに含まれる抗体は、多重特異性抗体分子であり、例えば、複数の免疫グロブリン可変ドメイン配列を含み、複数の第1の免疫グロブリン可変ドメイン配列は、第1のエピトープに対する結合特異性を有し、複数の第2の免疫グロブリン可変ドメイン配列は、第2のエピトープに対する結合特異性を有する。いくつかの実施形態では、多重特異性抗体分子は、二重特異性抗体分子である。二重特異性抗体は、2つの抗原に対する特異性を有し、第1のエピトープに対する結合特異性を有する第1の免疫グロブリン可変ドメイン配列および第2のエピトープに対する結合特異性を有する第2の免疫グロブリン可変ドメイン配列によって特徴付けられる。
いくつかの実施形態では、細胞外ドメインは、本明細書の「抗体または抗原結合フラグメント」の節に記載される抗原結合ドメイン(例えば、抗原結合フラグメント)を含む。
いくつかの実施形態では、細胞外結合ドメインは、ヒンジドメインによって膜貫通ドメインに接続される。
一実施形態では、ヒンジドメインは、本明細書で上記されるように、好ましくは2~10アミノ酸の範囲の長さを有する短いオリゴペプチドリンカーまたはポリペプチドリンカーである。
いくつかの実施形態では、ヒンジドメインは、上記のGly/Serリンカーである。
本発明で使用され得るヒンジドメインの別の例は、参照により本明細書に組み込まれるWO2012/138475に記載されている。
一実施形態では、ヒンジドメインは、アミノ酸配列AGSSSSGGSTTGGSTT(配列番号139)、アミノ酸配列GTTAASGSSGGSSSGA(配列番号140)、アミノ酸配列SSATATAGTGSSTGST(配列番号141)、およびアミノ酸配列TSGSTGTAASSTSTST(配列番号142)を含む群から選択されるアミノ酸配列を含む。
一実施形態では、ヒンジドメインは、GGTGGCGGAGGTTCTGGAGGTGGAGGTTCC(配列番号143)のヌクレオチド配列によってコードされる。
別の実施形態では、ヒンジドメインは、KIRRDSS(配列番号144)に対応するKIRDSヒンジである。
一実施形態では、ヒンジドメインは、CD8ヒンジのアミノ酸配列(配列番号145)または配列番号145と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはそれからなる。一実施形態では、ヒンジドメインは、核酸配列(配列番号146)または配列番号146と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有する核酸配列によってコードされるCD8ヒンジである。
配列番号145
TTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACD
配列番号146
ACCACGACGCCAGCGCCGCGACCACCAACACCGGCGCCCACCATCGCGTCGCAGCCCCTGTCCCTGCGCCCAGAGGCGTGCCGGCCAGCGGCGGGGGGCGCAGTGCACACGAGGGGGCTGGACTTCGCCTGTGAT
別の実施形態では、ヒンジドメインは、IgG4ヒンジのアミノ酸配列(配列番号147)、または配列番号147と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはそれからなる。
配列番号147
ESKYGPPCPPCPAPEFLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLGKM
一実施形態では、ヒンジドメインは、核酸配列(配列番号148)または配列番号148と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有する核酸配列によってコードされるIgG4ヒンジである。
配列番号148
GAGAGCAAGTACGGCCCTCCCTGCCCCCCTTGCCCTGCCCCCGAGTTCCTGGGCGGACCCAGCGTGTTCCTGTTCCCCCCCAAGCCCAAGGACACCCTGATGATCAGCCGGACCCCCGAGGTGACCTGTGTGGTGGTGGACGTGTCCCAGGAGGACCCCGAGGTCCAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCACAACGCCAAGACCAAGCCCCGGGAGGAGCAGTTCAATAGCACCTACCGGGTGGTGTCCGTGCTGACCGTGCTGCACCAGGACTGGCTGAACGGCAAGGAATACAAGTGTAAGGTGTCCAACAAGGGCCTGCCCAGCAGCATCGAGAAAACCATCAGCAAGGCCAAGGGCCAGCCTCGGGAGCCCCAGGTGTACACCCTGCCCCCTAGCCAAGAGGAGATGACCAAGAACCAGGTGTCCCTGACCTGCCTGGTGAAGGGCTTCTACCCCAGCGACATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAACGGCCAGCCCGAGAACAACTACAAGACCACCCCCCCTGTGCTGGACAGCGACGGCAGCTTCTTCCTGTACAGCCGGCTGACCGTGGACAAGAGCCGGTGGCAGGAGGGCAACGTCTTTAGCTGCTCCGTGATGCACGAGGCCCTGCACAACCACTACACCCAGAAGAGCCTGAGCCTGTCCCTGGGCAAGATG
別の実施形態では、ヒンジドメインは、IgDヒンジのアミノ酸配列(配列番号149)、または配列番号149と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはそれからなる。
配列番号149
RWPESPKAQASSVPTAQPQAEGSLAKATTAPATTRNTGRGGEEKKKEKEKEEQEERETKTPECPSHTQPLGVYLLTPAVQDLWLRDKATFTCFVVGSDLKDAHLTWEVAGKVPTGGVEEGLLERHSNGSQSQHSRLTLPRSLWNAGTSVTCTLNHPSLPPQRLMALREPAAQAPVKLSLNLLASSDPPEAASWLLCEVSGFSPPNILLMWLEDQREVNTSGFAPARPPPQPGSTTFWAWSVLRVPAPPSPQPATYTCVVSHEDSRTLLNASRSLEVSYVTDH
一実施形態では、ヒンジドメインは、配列番号150の核酸配列、または配列番号150と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有する核酸配列によってコードされるIgDヒンジである。
配列番号150
AGGTGGCCCGAAAGTCCCAAGGCCCAGGCATCTAGTGTTCCTACTGCACAGCCCCAGGCAGAAGGCAGCCTAGCCAAAGCTACTACTGCACCTGCCACTACGCGCAATACTGGCCGTGGCGGGGAGGAGAAGAAAAAGGAGAAAGAGAAAGAAGAACAGGAAGAGAGGGAGACCAAGACCCCTGAATGTCCATCCCATACCCAGCCGCTGGGCGTCTATCTCTTGACTCCCGCAGTACAGGACTTGTGGCTTAGAGATAAGGCCACCTTTACATGTTTCGTCGTGGGCTCTGACCTGAAGGATGCCCATTTGACTTGGGAGGTTGCCGGAAAGGTACCCACAGGGGGGGTTGAGGAAGGGTTGCTGGAGCGCCATTCCAATGGCTCTCAGAGCCAGCACTCAAGACTCACCCTTCCGAGATCCCTGTGGAACGCCGGGACCTCTGTCACATGTACTCTAAATCATCCTAGCCTGCCCCCACAGCGTCTGATGGCCCTTAGAGAGCCAGCCGCCCAGGCACCAGTTAAGCTTAGCCTGAATCTGCTCGCCAGTAGTGATCCCCCAGAGGCCGCCAGCTGGCTCTTATGCGAAGTGTCCGGCTTTAGCCCGCCCAACATCTTGCTCATGTGGCTGGAGGACCAGCGAGAAGTGAACACCAGCGGCTTCGCTCCAGCCCGGCCCCCACCCCAGCCGGGTTCTACCACATTCTGGGCCTGGAGTGTCTTAAGGGTCCCAGCACCACCTAGCCCCCAGCCAGCCACATACACCTGTGTTGTGTCCCATGAAGATAGCAGGACCCTGCTAAATGCTTCTAGGAGTCTGGAGGTTTCCTACGTGACTGACCATT
別の実施形態では、ヒンジ領域は、CD28ヒンジのアミノ酸配列(配列番号151)、または配列番号151と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはそれからなる。
配列番号151
IEVMYPPPYLDNEKSNGTIIHVKGKHLCPSPLFPGPSKP
一実施形態では、ヒンジドメインは、配列番号152の核酸、または配列番号152と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有する核酸配列によってコードされるCD28ヒンジである。
配列番号152
ATTGAAGTTATGTATCCTCCTCCTTACCTAGACAATGAGAAGAGCAATGGAACCATTATCCATGTGAAAGGGAAACACCTTTGTCCAAGTCCCCTATTTCCCGGACCTTCTAAGCCC
本発明のキメラ受容体において使用され得る膜貫通ドメインの例には、T細胞受容体のアルファ鎖、ベータ鎖もしくはゼータ鎖の膜貫通ドメイン、またはCD28、CD3ガンマ、CD3デルタ、CD3イプシロン、CD3ゼータ、CD45、CD4、CD5、CD8、CD9、CD16、CD22、CD33、CD37、CD64、CD80、CD86、CD134、CD137、CD154、KIRDS2、OX40、CD2、CD27、LFA-1(CD1la、CD18)、ICOS(CD278)、4-1BB(CD137)、GITR、CD40、BAFFR、HVEM(LIGHTR)、SLAMF7、NKp80(KLRFl)、CD160、CD19、IL2Rベータ、IL2Rガンマ、IL7Ra、ITGA1、VLA1、CD49a、ITGA4、IA4、CD49D、ITGA6、VLA-6、CD49f、ITGAD、CD11d、ITGAE、CD103、ITGAL、CD11a、LFA-1、ITGAM、CD11b、PD1、ITGAX、CDl1c、ITGB1、CD29、ITGB2、CD18、LFA-1、ITGB7、TNFR2、DNAM1(CD226)、SLAMF4(CD244、2B4)、CD84、CD96(Tactile)、CEACAM1、CRTAM、Ly9(CD229)、CD160(BY55)、PSGL1、CDIOO(SEMA4D)、SLAMF6(NTB-A、Lyl08)、SLAM(SLAMF1、CD150、IPO-3)、BLAME(SLAMF8)、SELPLG(CD162)、LTBR、PAG/Cbp、NKp44、NKp30、NKp46、NKG2Dおよび/またはNKG2Cの膜貫通ドメインが含まれるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、膜貫通ドメインは、それが由来する分子の膜貫通ドメイン全体を含み得るか、またはその機能的フラグメントもしくは変異体を含み得る。
一実施形態では、膜貫通ドメインは、CD8膜貫通ドメイン(配列番号153)のアミノ酸配列、または配列番号153と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはそれからなる。別の実施形態では、膜貫通ドメインは、配列番号153のアミノ酸配列の少なくとも1、2もしくは3つの改変を有するが、20、10もしくは5個以下の改変を有するアミノ酸配列、または配列番号153と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはそれからなる。
配列番号153
IYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYC
別の実施形態では、膜貫通ドメインは、CD8膜貫通ドメイン(配列番号154)のヌクレオチド配列、または配列番号154と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有するヌクレオチド配列によってコードされる。
配列番号154
ATCTACATCTGGGCGCCCTTGGCCGGGACTTGTGGGGTCCTTCTCCTGTCACTGGTTATCACCCTTTACTGC
別の実施形態では、膜貫通ドメインは、CD28膜貫通ドメイン(配列番号155)のアミノ酸配列、または配列番号155と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはそれからなる。
配列番号155
FWVLVVVGGVLACYSLLVTVAFIIFWV
一実施形態では、膜貫通ドメインは、配列番号156の核酸配列、または配列番号156と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有する核酸配列によってコードされるCD28膜貫通ドメインである。
配列番号156
TTTTGGGTGCTGGTGGTGGTTGGTGGAGTCCTGGCTTGCTATAGCTTGCTAGTAACAGTGGCCTTTATTATTTTCTGGGTG
いくつかの実施形態では、膜貫通ドメインは組換えであり得る。特定の実施形態では、組換え膜貫通ドメインは、バリンまたはロイシンなどの主に疎水性アミノ酸を含む。
本明細書で使用される場合、「細胞内シグナル伝達ドメイン」という用語は、分子の細胞内部分を指す。細胞内シグナル伝達ドメインは、キメラ受容体含有細胞の免疫エフェクター機能を促進するシグナルを生成する。キメラ受容体-T細胞における免疫エフェクター機能の例には、サイトカインの分泌を含む、細胞溶解活性、抑制活性、調節活性およびヘルパー活性が含まれ得る。
いくつかの実施形態では、本発明のCARの細胞内ドメインは、少なくとも1つのT細胞一次シグナル伝達ドメイン(またはそれに由来する配列)、および任意選択でT細胞共刺激分子の1つ以上の細胞内ドメイン(またはそれに由来する配列)を含む。
本明細書で使用される場合、「共刺激分子」または「共刺激細胞内シグナル伝達ドメイン」という用語は、共刺激リガンドと特異的に結合し、それによってT細胞による共刺激応答、例えば限定されないが増殖を媒介するT細胞上の同族結合パートナーを指す。共刺激分子は、効率的な免疫応答に寄与する抗原受容体またはそれらのリガンド以外の細胞表面分子である。共刺激シグナル伝達ドメインは、共刺激分子の細胞内部分であり得る。共刺激分子は、以下のタンパク質ファミリーで表すことができる:TNF受容体タンパク質、免疫グロブリン様タンパク質、サイトカイン受容体、インテグリン、シグナル伝達リンパ球活性化分子(SLAMタンパク質)および活性化NK細胞受容体。
いくつかの実施形態では、細胞内ドメインは、それが由来する分子の細胞内部分全体、または天然の細胞内シグナル伝達ドメイン全体、またはその機能的フラグメントもしくは変異体を含み得る。
いくつかの実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、少なくとも1つの一次シグナル伝達ドメイン(例えば、T細胞一次シグナル伝達ドメイン)またはそのフラグメントもしくは変異体からなる。
いくつかの実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、少なくとも1つの共刺激シグナル伝達ドメイン(例えば、T細胞共刺激分子細胞内ドメイン)またはそのフラグメントもしくは変異体からなる。
いくつかの実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、T細胞共刺激分子またはそのフラグメントもしくは変異体の1つ以上の細胞内ドメインを含む。いくつかの実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、T細胞共刺激分子またはそのフラグメントもしくは変異体の1つ以上の細胞内ドメインからなる。
一実施形態では、本発明のCARの細胞内シグナル伝達ドメインは、少なくとも1つの共刺激ドメインまたはそのフラグメントもしくは変異体および少なくとも1つの一次シグナル伝達ドメインまたはそのフラグメントもしくは変異体を含む。
一実施形態では、本発明のCARの細胞内シグナル伝達ドメインは、1つの共刺激ドメインまたはそのフラグメントもしくは変異体および1つの一次シグナル伝達ドメインまたはそのフラグメントもしくは変異体からなる。
一実施形態では、本発明のCARの細胞内シグナル伝達ドメインは、少なくとも1つの共刺激ドメインまたはそのフラグメントもしくは変異体および1つの一次シグナル伝達ドメインまたはそのフラグメントもしくは変異体を含み、組換えタンパク質の発現を可能にする発現系をさらに含む。一実施形態では、組換えタンパク質は、IL-12などの炎症促進性サイトカインである。一実施形態では、前記炎症促進性サイトカインは、CAR操作細胞によって放出される。
本明細書で使用される場合、「発現系」は、系の転写のための追加のフラグメントに作動可能に結合された目的の組換えペプチド、ポリペプチドまたはタンパク質をコードする核酸配列をコードするフラグメントで構成される直鎖または環状DNA分子を指す。
いくつかの実施形態では、発現系は、炎症誘発性サイトカインをコードする核酸配列を含む。一実施形態では、発現系は、IL-12をコードする核酸配列を含む。
さらなるフラグメントは、プロモーターおよび終止コドン配列を含み得る。発現系は、1つ以上の複製起点、1つ以上の選択マーカーおよびリボソーム結合部位をコードする配列をさらに含有し得る。
「作動可能に結合された」とは、フラグメントが本来機能するように配置されていることを意味し、例えば、一旦転写がプロモーターで開始すると、コードされたフラグメントを通過して終止コドンに至る。
本発明の意味における「プロモーター」は、RNAポリメラーゼの結合および転写の開始を可能にする発現制御エレメントである。
本発明の一実施形態では、核酸配列は、「強力な」プロモーターの制御下にある。強力なプロモーターは、一方ではRNAポリメラーゼ、通常は天然に存在する対応するRNAポリメラーゼに対するプロモーター配列の高い結合親和性によって特徴付けられ、他方ではそのRNAポリメラーゼによるmRNAの速い形成速度によって特徴付けられる。
別の実施形態では、核酸配列は「誘導性プロモーター」の制御下にある。「誘導性プロモーター」は、外部因子、例えば誘導因子(「誘導因子」とも称される)分子の存在もしくはリプレッサー分子の非存在、または温度、浸透圧もしくはpH値の上昇もしくは低下などの物理的因子によって調節され得るプロモーターである。
本発明の一実施形態では、プロモーターはまた、構成的であってもよく、すなわち、一方では誘導を必要とせず、他方では抑制の可能性なしに発現を制御するプロモーターであり得る。したがって、一定のレベルで連続的で安定した発現が存在する。
有利には、目的の組換えペプチド、ポリペプチドまたはタンパク質の発現は、例えば選択下などの特定の条件で誘導される。
一実施形態では、発現系は、構成的発現系である。別の実施形態では、発現系は、誘導性発現系である。
一実施形態では、発現系は、発現カセットである。
いくつかの実施形態では、本発明のCARの細胞内シグナル伝達ドメインは、少なくとも1つまたは2つの共刺激ドメインまたはそのフラグメントもしくは変異体および少なくとも1つの一次シグナル伝達ドメインまたはそのフラグメントもしくは変異体を含む。特定の実施形態では、共刺激ドメインの1つ以上は、T細胞共刺激分子の細胞内ドメインである。特定の実施形態では、少なくとも1つの一次シグナル伝達ドメインは、T細胞一次シグナル伝達ドメインである。
いくつかの実施形態では、本発明のCARの細胞内シグナル伝達ドメインは、少なくとも1つまたは2つの共刺激ドメインまたはそのフラグメントもしくは変異体、および少なくとも1つの一次シグナル伝達ドメインまたはそのフラグメントもしくは変異体、および組換え炎症促進性サイトカインの発現を可能にする少なくとも1つの発現系を含む。
したがって、一実施形態では、CAR操作細胞は、IL-12などの組換え炎症促進性サイトカインを発現する。
本発明のいくつかの実施形態では、一次シグナル伝達ドメインは、CD3ゼータ、CD3ガンマ、CD3デルタ、CD3イプシロン、共通FcRガンマ(FCER1G)、FcRベータ(FcイプシロンRib)、CD79a、CD79b、FcガンマRIIa、DAP10およびDAP12、ならびにそれらに由来する配列からなる群から選択されるタンパク質のシグナル伝達ドメインを含む。
いくつかの実施形態では、一次シグナル伝達ドメインは、CD3ゼータまたはそのフラグメントもしくは変異体の少なくとも1つの機能的シグナル伝達ドメインを含むか、またはそれからなるT細胞一次シグナル伝達ドメインである。
いくつかの実施形態では、T細胞一次シグナル伝達ドメインは、配列番号157のCD3ゼータアミノ酸配列、または配列番号157に対して少なくとも約70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはそれらからなる。
配列番号157
RVKFSRSADAPAYKQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR
いくつかの実施形態では、CD3ゼータ一次シグナル伝達ドメインは、配列番号157のアミノ酸配列、または配列番号157と少なくとも約70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有するアミノ酸配列と比較して、少なくとも1つ、2つまたは3つの改変を有するが、20、10もしくは5個以下の改変を有するアミノ酸配列を含むか、またはそれらからなる。
したがって、いくつかの実施形態では、T細胞一次シグナル伝達ドメインをコードする核酸配列は、配列番号162のCD3ゼータドメイン核酸配列、または配列番号162と少なくとも約70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有するヌクレオチド配列を含むか、またはそれらからなる。
いくつかの実施形態では、CD3ゼータ一次シグナル伝達ドメインは、配列番号157の配列からの、または配列番号157と少なくとも約70%の同一性を有する配列からの少なくとも2、10、20、30、40、50、60、70、80、90、100、110もしくは112個のアミノ酸、例えば、配列番号157からの少なくとも2、10、20、30、40、50、60、70、80、90、100、110もしくは112個の連続アミノ酸を含む。
いくつかの実施形態では、CD3ゼータ一次シグナル伝達ドメインは、配列番号162の配列からの、または配列番号162と少なくとも約70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有する配列からの少なくとも6、30、60、90、120、150、180、210、240、270、300、330もしくは336個のヌクレオチドのヌクレオチド配列、例えば配列番号162からの少なくとも6、30、60、90、120、150、180、210、240、270、300、330もしくは336個の連続ヌクレオチドによってコードされる。
配列番号162
AGAGTGAAGTTCAGCAGGAGCGCAGACGCCCCCGCGTACCAGCAGGGCCAGAACCAGCTCTATAACGAGCTCAATCTAGGACGAAGAGAGGAGTACGATGTTTTGGACAAGAGACGTGGCCGGGACCCTGAGATGGGGGGAAAGCCGAGAAGGAAGAACCCTCAGGAAGGCCTGTACAATGAACTGCAGAAAGATAAGATGGCGGAGGCCTACAGTGAGATTGGGATGAAAGGCGAGCGCCGGAGGGGCAAGGGGCACGATGGCCTTTACCAGGGTCTCAGTACAGCCACCAAGGACACCTACGACGCCCTTCACATGCAGGCCCTGCCCCCTCGC
いくつかの実施形態では、刺激的に作用するT細胞一次シグナル伝達ドメインは、免疫受容活性化チロシンモチーフ(ITAMS)として公知のシグナル伝達モチーフを含み得る。本発明において特に有用なITAM含有T細胞一次細胞内シグナル伝達ドメインの例には、CD3ゼータ、共通FcRガンマ(FCER1G)、FcガンマRIIa、FcRベータ(FcイプシロンR1b)、CD3ガンマ、CD3デルタ、CD3イプシロン、CD5、CD22、CD66b、CD79a、CD79b、DAP10およびDAP12のもの(またはそれらに由来するもの)が含まれるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、T細胞一次シグナル伝達ドメインは、改変ITAMドメイン、例えばネイティブITAMドメインと比較して変化した(例えば、増加または減少した)活性を有する突然変異ITAMドメインを含む。いくつかの実施形態では、一次シグナル伝達ドメインは、改変ITAM含有一次細胞内シグナル伝達ドメイン、例えば、最適化されたおよび/または切形のITAM含有一次細胞内シグナル伝達ドメインを含む。特定の実施形態では、一次シグナル伝達ドメインは、1つ、2つ、3つ、4つ以上のITAMモチーフを含み得る。
いくつかの実施形態では、本発明のCARの細胞内シグナル伝達ドメインは、1つ以上の共刺激シグナル伝達ドメインと組み合わされたT細胞一次シグナル伝達ドメイン(例えば、CD3ゼータシグナル伝達ドメインまたはそのフラグメントもしくは変異体など)を含み、前記共刺激シグナル伝達ドメインは、共刺激細胞内シグナル伝達ドメイン全体またはそのフラグメントもしくは変異体である。
いくつかの実施形態では、共刺激シグナル伝達ドメインは、T細胞共刺激分子の細胞内または細胞質ドメインである。
いくつかの実施形態では、共刺激シグナル伝達ドメインは、T細胞共刺激分子のシグナル伝達ドメインである。
共刺激シグナル伝達ドメインの例には、4-1BB(CD137)、ICOS(CD278)、CD27、CD28、CTLA-4(CD152)、PD-1、MHCクラスI分子、BTLA、Tollリガンド受容体、OX40、CD30、CD40、リンパ球機能関連抗原-1(LFA-1)、CD2、CD7、LIGHT、NKG2C、B7-H3、CD83と特異的に結合するリガンド、CDS、ICAM-1、GITR、ARHR、BAFFR、HVEM(LIGHTR)、SLAMF7、NKp80(KLRF1)、NKp44、NKp30、NKp46、CD160(BY55)、CD19、CD19a、CD4、CD8アルファ、CD8ベータ、IL2ra、IL6Ra、IL2Rベータ、IL2Rガンマ、IL7Rアルファ、IL-13RA1/RA2、IL-33R(IL1RL1)、IL-10RA/RB、IL-4R、IL-5R(CSF2RB)、IL-21R、ITGA4、VLA1、CD49a、ITGA4、IA4、CD49D、ITGA6、VLA-6、CD49f、ITGAD、CD11d、ITGAE、CD103、ITGAL、CD11a/CD18、ITGAM、CD11b、ITGAX、CD11c、ITGB1、CD29、ITGB2、CD18、ITGB7、NKG2D、NKG2C、CD95、TGFBR1/2/3、TRANCE/RANKL、DNAM1(CD226)、SLAMF4(CD244、2B4)、CD84、CD96(Tactile)、CEACAM1、CRTAM、Ly9(CD229)、PSGL1、CD100(SEMA4D)、CD69、SLAMF6(NTB-A、Lyl08)、SLAM(SLAMF1、CD150、IPO-3)、BLAME(SLAMF8)、SELPLG(CD162)、LTBR、LAT、GADS、SLP-76、PAG/Cbp、共通ガンマ鎖、CD83、NKp44、NKp30、NKp46、NKG2Dと特異的に結合するリガンド、およびそれらの任意の組み合わせからなる群から選択されるタンパク質の細胞内または細胞質シグナル伝達ドメインが含まれるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、キメラ受容体は、CD28、4-1BB、OX40、ICOS、CD27およびDAP10からなる群から選択されるT細胞共刺激分子の少なくとも1つの細胞内シグナル伝達ドメインまたは細胞質シグナル伝達ドメインを含む。
いくつかの実施形態では、キメラ受容体は、少なくとも1つの共刺激シグナル伝達ドメインを含み、前記共刺激シグナル伝達ドメインは、共刺激シグナル伝達ドメイン全体またはそのフラグメントもしくは変異体である。
いくつかの実施形態では、T細胞共刺激シグナル伝達ドメインは、4-1BB共刺激細胞内シグナル伝達ドメイン(例えば、配列番号163のアミノ酸配列を含むか、またはそれからなる)のアミノ酸配列、または配列番号163と少なくとも約70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはそれらからなる。いくつかの実施形態では、T細胞共刺激シグナル伝達ドメインは、配列番号163のアミノ酸配列と比較して、少なくとも1つ、2つまたは3つの改変を有するが、20、10または5個以下の改変を有するアミノ酸配列を含むか、またはそれからなる。
配列番号163
KRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEEDGCSCRFPEEEEGGCEL
いくつかの実施形態では、T細胞共刺激シグナル伝達ドメインは、4-1BB共刺激細胞内シグナル伝達ドメインヌクレオチド配列(例えば、配列番号164の配列を含むか、もしくはそれからなる)、または配列番号164と少なくとも約70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有するヌクレオチド配列によってコードされる。
配列番号164
AAACGGGGCAGAAAGAAACTCCTGTATATATTCAAACAACCATTTATGAGACCAGTACAAACTACTCAAGAGGAAGATGGCTGTAGCTGCCGATTTCCAGAAGAAGAAGAAGGAGGATGTGAACTG
いくつかの実施形態では、4-1BB共刺激細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号163の配列からの、または配列番号163と少なくとも約70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%または99%の同一性を有する配列からの少なくとも2、3、6、9、12、15、18、21、24、27、30、33、36、39または42個のアミノ酸、例えば配列番号163からの少なくとも2、3、6、9、12、15、18、21、24、27、30、33、36、39または42個の連続アミノ酸を含む。
いくつかの実施形態では、4-1BB共刺激細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号164の配列からの、または配列番号164と少なくとも約70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%または99%の同一性を有する配列からの少なくとも6、18、27、36、45、54、63、72、81、96、99、108、117または126個ヌクレオチド配列、例えば、配列番号164からの少なくとも6、18、27、36、45、54、63、72、81、96、99、108、117または126個の連続ヌクレオチドによってコードされる。
いくつかの実施形態では、T細胞共刺激シグナル伝達ドメインは、CD28共刺激細胞内シグナル伝達ドメイン(例えば、配列番号167のアミノ酸配列を含むか、またはそれからなる)のアミノ酸配列、または配列番号167と少なくとも約70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはそれからなる。いくつかの実施形態では、T細胞共刺激シグナル伝達ドメインは、配列番号167のアミノ酸配列と比較して、少なくとも1つ、2つまたは3つの改変を有するが、20、10または5個以下の改変を有するアミノ酸配列を含むか、またはそれからなる。
配列番号167
RSKRSRLLHSDYMNMTPRRPGPTRKHYQPYAPPRDFAAYRS
いくつかの実施形態では、T細胞共刺激シグナル伝達ドメインは、CD28共刺激細胞内シグナル伝達ドメインヌクレオチド配列(例えば、配列番号168の配列を含むか、もしくはそれからなる)、または配列番号168と少なくとも約70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有するヌクレオチド配列によってコードされる。
配列番号168
AGGAGTAAGAGGAGCAGGCTCCTGCACAGTGACTACATGAACATGACTCCCCGCCGCCCCGGGCCCACCCGCAAGCATTACCAGCCCTATGCCCCACCACGCGACTTCGCAGCCTATCGCTCC
いくつかの実施形態では、CD28共刺激細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号167の配列からの、または配列番号167と少なくとも約70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有する配列からの少なくとも2、3、6、9、12、15、18、21、24、27、30、33、36、39もしくは41個のアミノ酸、例えば配列番号167からの少なくとも2、3、6、9、12、15、18、21、24、27、30、33、36、39もしくは41個の連続アミノ酸を含む。
いくつかの実施形態では、CD28共刺激細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号168の配列からの、または配列番号168と少なくとも約70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有する配列からの少なくとも6、18、27、36、45、54、63、72、81、96、99、108、117もしくは123個のヌクレオチドのヌクレオチド配列、例えば配列番号168からの少なくとも6、18、27、36、45、54、63、72、81、96、99、108、117もしくは123個の連続ヌクレオチドによってコードされる。
本発明のいくつかの実施形態では、キメラ受容体は、T細胞共刺激分子の少なくとも1つの細胞内ドメインを含む。特定の実施形態では、少なくとも1つの細胞内ドメインは、4-1BBの細胞内ドメインおよびCD28の細胞内ドメインから選択され得る。特定の実施形態では、前記共刺激細胞内シグナル伝達ドメインは、共刺激細胞内シグナル伝達ドメイン全体またはそのフラグメントもしくは変異体である。
本発明のいくつかの実施形態では、キメラ受容体は、T細胞共刺激分子の少なくとも2つの細胞内ドメインの組み合わせを含む。特定の実施形態では、前記共刺激細胞内シグナル伝達ドメインは、共刺激細胞内シグナル伝達ドメイン全体またはそのフラグメントもしくは変異体である。
いくつかの実施形態では、キメラ受容体は、4-1BB共刺激細胞内シグナル伝達ドメイン(例えば、配列番号163のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなる)またはそのフラグメントもしくは変異体のアミノ酸配列、およびCD28共刺激細胞内シグナル伝達ドメイン(例えば、配列番号167のアミノ酸配列を含むか、もしくはそれからなる)またはそのフラグメントもしくは変異体のアミノ酸配列を含む。
本発明のいくつかの実施形態では、キメラ受容体は、少なくとも3つの共刺激細胞内シグナル伝達ドメインを含み得、前記ドメインは、共刺激細胞内シグナル伝達ドメイン全体またはそのフラグメントもしくは変異体である。
いくつかの実施形態では、本発明のCARの細胞内シグナル伝達ドメインは、
-配列番号163のアミノ酸配列を有する4-1BB共刺激細胞内シグナル伝達ドメインまたはそのフラグメントもしくは変異体、および/または配列番号167のアミノ酸配列を有するCD28共刺激細胞内シグナル伝達ドメイン、ならびに/または
-配列番号157のアミノ酸配列を有するCD3ゼータ一次細胞内シグナル伝達ドメインまたはそのフラグメントもしくは変異体、を含み、
細胞内ドメインに含まれる配列は、同じフレームで単一のポリペプチド鎖として発現される。
したがって、いくつかの実施形態では、本発明のCARの細胞内シグナル伝達ドメインをコードする核酸配列は、
-配列番号164の4-1BB共刺激細胞内シグナル伝達ドメイン核酸配列またはそのフラグメントもしくは変異体、および/または配列番号168のCD28共刺激細胞内シグナル伝達ドメイン核酸配列またはそのフラグメントもしくは変異体、ならびに/または
-配列番号162のCD3ゼータ一次細胞内シグナル伝達ドメインまたはそのフラグメントもしくは変異体、を含み、
細胞内ドメインに含まれる配列は、同じフレームで単一のポリペプチド鎖として発現される。
いくつかの実施形態では、本発明のCARの細胞内シグナル伝達ドメインは、ランダムにまたは指定された順序で互いに結合され得る少なくとも2つの異なるドメイン(例えば、一次シグナル伝達ドメインまたはそのフラグメントもしくは変異体およびT細胞共刺激分子またはそのフラグメントもしくは変異体の少なくとも1つの細胞内ドメイン)を含む。
任意選択で、短いオリゴペプチドリンカーまたはポリペプチドリンカー、例えば、2~10アミノ酸長(例えば、2、3、4、5、6、7、8、9または10アミノ酸)は、異なるシグナル伝達ドメイン間の連結を形成し得る。いくつかの実施形態では、グリシン-セリン二重鎖(GS)は、好適なリンカーとして使用される。いくつかの実施形態では、単一アミノ酸、例えばアラニン(A)、グリシン(G)は、好適なリンカーとして使用される。リンカーの他の例を本明細書中に記載する。
いくつかの実施形態では、本発明のCARの細胞内シグナル伝達ドメインは、2つ以上(例えば、2、3、4、5つ以上)の共刺激細胞内シグナル伝達ドメインを含む。いくつかの実施形態では、2つ以上(例えば、2、3、4、5つ以上)の共刺激シグナル伝達ドメインのいずれかまたはすべては、リンカー分子、例えば本明細書に記載されるリンカー分子によって分離されている。
いくつかの実施形態では、本発明のキメラ受容体の細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ゼータの一次細胞内シグナル伝達ドメイン(例えば、配列番号157および4-1BBの共刺激細胞内シグナル伝達ドメイン(例えば、配列番号163)を含む。
いくつかの実施形態では、本発明のキメラ受容体の細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ゼータの一次細胞内シグナル伝達ドメイン(例えば、配列番号157およびCD28の共刺激細胞内シグナル伝達ドメイン(例えば、配列番号167)を含む。
いくつかの実施形態では、本発明のCARは、本明細書に記載される細胞外結合ドメイン、本明細書に記載される膜貫通ドメイン、本明細書に記載される細胞内シグナル伝達ドメイン、および任意選択で、本明細書に記載されるスペーサーまたはヒンジドメインの任意の組み合わせを含む。
いくつかの実施形態では、本発明のCARは、タグ、例えば、品質管理、濃縮、インビボ追跡などのためのタグなどをさらに含む。前記タグは、N末端、C末端および/または内部に局在し得る。本発明のCARに使用され得るタグの例は、当業者に周知である。
第1の実施形態によれば、本発明のCARは、少なくとも1つの細胞外CD45RC結合ドメイン、任意選択で細胞外ヒンジドメイン、少なくとも1つの膜貫通ドメインおよび少なくとも1つの細胞内シグナル伝達ドメインを含む。
一実施形態では、本発明のCARは、CD45RC結合ドメイン、CD8の膜貫通ドメイン(好ましくは、配列番号153)、およびCD3-ゼータ一次シグナル伝達ドメイン(好ましくは、配列番号157)を含む。
一実施形態では、本発明のCARは、CD45RC結合ドメイン、CD28の膜貫通ドメイン(好ましくは、配列番号155)、およびCD3-ゼータ一次シグナル伝達ドメイン(好ましくは、配列番号157)を含む。
別の実施形態では、本発明のCARは、CD45RC結合ドメイン、CD8のヒンジドメイン(好ましくは、配列番号145)、CD8の膜貫通ドメイン(好ましくは、配列番号153)、およびCD3-ゼータ一次シグナル伝達ドメイン(好ましくは、配列番号157)を含む。
一実施形態では、本発明のCARは、CD45RC結合ドメイン、CD8のヒンジドメイン(好ましくは、配列番号145)、CD28の膜貫通ドメイン(好ましくは、配列番号155)、およびCD3-ゼータ一次シグナル伝達ドメイン(好ましくは、配列番号157)を含む。
別の実施形態では、本発明のCARは、CD45RC結合ドメイン、IgG4のヒンジドメイン(好ましくは、配列番号147)、CD8の膜貫通ドメイン(好ましくは、配列番号153)、およびCD3-ゼータ一次シグナル伝達ドメイン(好ましくは、配列番号157)を含む。
一実施形態では、本発明のCARは、CD45RC結合ドメイン、IgG4のヒンジドメイン(好ましくは、配列番号147)、CD28の膜貫通ドメイン(好ましくは、配列番号155)、およびCD3-ゼータ一次シグナル伝達ドメイン(好ましくは、配列番号157)を含む。
別の実施形態では、本発明のCARは、CD45RC結合ドメイン、IgDのヒンジドメイン(好ましくは、配列番号149)、CD8の膜貫通ドメイン(好ましくは、配列番号153)、およびCD3-ゼータ一次シグナル伝達ドメイン(好ましくは、配列番号157)を含む。
一実施形態では、本発明のCARは、CD45RC結合ドメイン、IgDのヒンジドメイン(好ましくは、配列番号149)、CD28の膜貫通ドメイン(好ましくは、配列番号155)、およびCD3-ゼータ一次シグナル伝達ドメイン(好ましくは、配列番号157)を含む。
別の実施形態では、本発明のCARは、CD45RC結合ドメイン、CD28のヒンジドメイン(好ましくは、配列番号151)、CD8の膜貫通ドメイン(好ましくは、配列番号153)、およびCD3-ゼータ一次シグナル伝達ドメイン(好ましくは、配列番号157)を含む。
一実施形態では、本発明のCARは、CD45RC結合ドメイン、CD28のヒンジドメイン(好ましくは、配列番号151)、CD28の膜貫通ドメイン(好ましくは、配列番号155)、およびCD3-ゼータ一次シグナル伝達ドメイン(好ましくは、配列番号157)を含む。
第2の実施形態によれば、本発明のCARは、CD45RC結合ドメイン、任意選択で細胞外ヒンジドメイン、膜貫通ドメイン、T細胞共刺激分子の単一細胞内ドメインおよびT細胞一次シグナル伝達ドメインを含む。
一実施形態では、本発明のCARは、CD45RC結合ドメイン、CD8の膜貫通ドメイン(好ましくは、配列番号153)、4-1BBの細胞内ドメイン(好ましくは、配列番号163)、およびCD3-ゼータ一次シグナル伝達ドメイン(好ましくは、配列番号157)を含む。
一実施形態では、本発明のCARは、CD45RC結合ドメイン、CD8の膜貫通ドメイン(好ましくは、配列番号153)、CD28の細胞内ドメイン(好ましくは、配列番号167)、およびCD3-ゼータ一次シグナル伝達ドメイン(好ましくは、配列番号157)を含む。
一実施形態では、本発明のCARは、CD45RC結合ドメイン、CD28の膜貫通ドメイン(好ましくは、配列番号155)、4-1BBの細胞内ドメイン(好ましくは、配列番号163)、およびCD3-ゼータ一次シグナル伝達ドメイン(好ましくは、配列番号157)を含む。
一実施形態では、本発明のCARは、CD45RC結合ドメイン、CD28の膜貫通ドメイン(好ましくは、配列番号155)、CD28の細胞内ドメイン(好ましくは、配列番号167)、およびCD3-ゼータ一次シグナル伝達ドメイン(好ましくは、配列番号157)を含む。
別の実施形態では、本発明のCARは、CD45RC結合ドメイン、CD8のヒンジドメイン(好ましくは、配列番号145)、CD8の膜貫通ドメイン(好ましくは、配列番号153)、4-1BBの細胞内ドメイン(好ましくは、配列番号163)、およびCD3-ゼータ一次シグナル伝達ドメイン(好ましくは、配列番号157)を含む。
一実施形態では、本発明のCARは、CD45RC結合ドメイン、CD8のヒンジドメイン(好ましくは、配列番号145)、CD8の膜貫通ドメイン(好ましくは、配列番号153)、CD28の細胞内ドメイン(好ましくは、配列番号155)、およびCD3-ゼータ一次シグナル伝達ドメイン(好ましくは、配列番号157)を含む。
一実施形態では、本発明のCARは、CD45RC結合ドメイン、CD8のヒンジドメイン(好ましくは、配列番号145)、CD28の膜貫通ドメイン(好ましくは、配列番号155)、4-1BBの細胞内ドメイン(好ましくは、配列番号163)、およびCD3-ゼータ一次シグナル伝達ドメイン(好ましくは、配列番号157)を含む。
一実施形態では、本発明のCARは、CD45RC結合ドメイン、CD8のヒンジドメイン(好ましくは、配列番号145)、CD28の膜貫通ドメイン(好ましくは、配列番号155)、CD28の細胞内ドメイン(好ましくは、配列番号167)、およびCD3-ゼータ一次シグナル伝達ドメイン(好ましくは、配列番号157)を含む。
別の実施形態では、本発明のCARは、CD45RC結合ドメイン、IgG4のヒンジドメイン(好ましくは、配列番号147)、CD8の膜貫通ドメイン(好ましくは、配列番号153)、4-1BBの細胞内ドメイン(好ましくは、配列番号163)、およびCD3-ゼータ一次シグナル伝達ドメイン(好ましくは、配列番号157)を含む。
一実施形態では、本発明のCARは、CD45RC結合ドメイン、IgG4のヒンジドメイン(好ましくは、配列番号147)、CD8の膜貫通ドメイン(好ましくは、配列番号153)、CD28の細胞内ドメイン(好ましくは、配列番号167)、およびCD3-ゼータ一次シグナル伝達ドメイン(好ましくは、配列番号157)を含む。
一実施形態では、本発明のCARは、CD45RC結合ドメイン、IgG4のヒンジドメイン(好ましくは、配列番号147)、CD28の膜貫通ドメイン(好ましくは、配列番号155)、4-1BBの細胞内ドメイン(好ましくは、配列番号163)、およびCD3-ゼータ一次シグナル伝達ドメイン(好ましくは、配列番号157)を含む。
一実施形態では、本発明のCARは、CD45RC結合ドメイン、IgG4のヒンジドメイン(好ましくは、配列番号147)、CD28の膜貫通ドメイン(好ましくは、配列番号155)、CD28の細胞内ドメイン(好ましくは、配列番号167)、およびCD3-ゼータ一次シグナル伝達ドメイン(好ましくは、配列番号157)を含む。
別の実施形態では、本発明のCARは、CD45RC結合ドメイン、IgDのヒンジドメイン(好ましくは、配列番号149)、CD8の膜貫通ドメイン(好ましくは、配列番号153)、4-1BBの細胞内ドメイン(好ましくは、配列番号163)、およびCD3-ゼータ一次シグナル伝達ドメイン(好ましくは、配列番号157)を含む。
一実施形態では、本発明のCARは、CD45RC結合ドメイン、IgDのヒンジドメイン(好ましくは、配列番号149)、CD8の膜貫通ドメイン(好ましくは、配列番号153)、CD28の細胞内ドメイン(好ましくは、配列番号167)、およびCD3-ゼータ一次シグナル伝達ドメイン(好ましくは、配列番号157)を含む。
一実施形態では、本発明のCARは、CD45RC結合ドメイン、IgDのヒンジドメイン(好ましくは、配列番号149)、CD28の膜貫通ドメイン(好ましくは、配列番号155)、4-1BBの細胞内ドメイン(好ましくは、配列番号163)、およびCD3-ゼータ一次シグナル伝達ドメイン(好ましくは、配列番号157)を含む。
一実施形態では、本発明のCARは、CD45RC結合ドメイン、IgDのヒンジドメイン(好ましくは、配列番号149)、CD28の膜貫通ドメイン(好ましくは、配列番号155)、CD28の細胞内ドメイン(好ましくは、配列番号167)、およびCD3-ゼータ一次シグナル伝達ドメイン(好ましくは、配列番号157)を含む。
別の実施形態では、本発明のCARは、CD45RC結合ドメイン、CD28のヒンジドメイン(好ましくは、配列番号151)、CD8の膜貫通ドメイン(好ましくは、配列番号153)、4-1BBの細胞内ドメイン(好ましくは、配列番号163)、およびCD3-ゼータ一次シグナル伝達ドメイン(好ましくは、配列番号157)を含む。
一実施形態では、本発明のCARは、CD45RC結合ドメイン、CD28のヒンジドメイン(好ましくは、配列番号151)、CD8の膜貫通ドメイン(好ましくは、配列番号153)、CD28の細胞内ドメイン(好ましくは、配列番号167)、およびCD3-ゼータ一次シグナル伝達ドメイン(好ましくは、配列番号157)を含む。
一実施形態では、本発明のCARは、CD45RC結合ドメイン、CD28のヒンジドメイン(好ましくは、配列番号151)、CD28の膜貫通ドメイン(好ましくは、配列番号155)、4-1BBの細胞内ドメイン(好ましくは、配列番号163)、およびCD3-ゼータ一次シグナル伝達ドメイン(好ましくは、配列番号157)を含む。
一実施形態では、本発明のCARは、CD45RC結合ドメイン、CD28のヒンジドメイン(好ましくは、配列番号151)、CD28の膜貫通ドメイン(好ましくは、配列番号155)、CD28の細胞内ドメイン(好ましくは、配列番号167)、およびCD3-ゼータ一次シグナル伝達ドメイン(好ましくは、配列番号157)を含む。
第3の実施形態によれば、本発明のCARは、CD45RC結合ドメイン、任意選択で細胞外ヒンジドメイン、膜貫通ドメイン、T細胞共刺激分子の2つの細胞内ドメインおよびT細胞一次シグナル伝達ドメインを含む。
一実施形態では、本発明のCARは、CD45RC結合ドメイン、CD8の膜貫通ドメイン(好ましくは、配列番号153)、4-1BBの細胞内ドメイン(好ましくは、配列番号163)、CD28の細胞内ドメイン(好ましくは、配列番号167)、およびCD3-ゼータ一次シグナル伝達ドメイン(好ましくは、配列番号157)を含む。
一実施形態では、本発明のCARは、CD45RC結合ドメイン、CD28の膜貫通ドメイン(好ましくは、配列番号155)、4-1BBの細胞内ドメイン(好ましくは、配列番号163)、CD28の細胞内ドメイン(好ましくは、配列番号167)、およびCD3-ゼータ一次シグナル伝達ドメイン(好ましくは、配列番号157)を含む。
一実施形態では、本発明のCARは、CD45RC結合ドメイン、CD8のヒンジドメイン(好ましくは、配列番号145)、CD8の膜貫通ドメイン(好ましくは、配列番号153)、4-1BBの細胞内ドメイン(好ましくは、配列番号163)、CD28の細胞内ドメイン(好ましくは、配列番号167)、およびCD3-ゼータ一次シグナル伝達ドメイン(好ましくは、配列番号157)を含む。
一実施形態では、本発明のCARは、CD45RC結合ドメイン、CD8のヒンジドメイン(好ましくは、配列番号145)、CD28の膜貫通ドメイン(好ましくは、配列番号155)、4-1BBの細胞内ドメイン(好ましくは、配列番号163)、CD28の細胞内ドメイン(好ましくは、配列番号167)、およびCD3-ゼータ一次シグナル伝達ドメイン(好ましくは、配列番号157)を含む。
一実施形態では、本発明のCARは、CD45RC結合ドメイン、IgG4のヒンジドメイン(好ましくは、配列番号147)、CD8の膜貫通ドメイン(好ましくは、配列番号153)、4-1BBの細胞内ドメイン(好ましくは、配列番号163)、CD28の細胞内ドメイン(好ましくは、配列番号167)、およびCD3-ゼータ一次シグナル伝達ドメイン(好ましくは、配列番号157)を含む。
一実施形態では、本発明のCARは、CD45RC結合ドメイン、IgG4のヒンジドメイン(好ましくは、配列番号147)、CD28の膜貫通ドメイン(好ましくは、配列番号155)、4-1BBの細胞内ドメイン(好ましくは、配列番号163)、CD28の細胞内ドメイン(好ましくは、配列番号167)、およびCD3-ゼータ一次シグナル伝達ドメイン(好ましくは、配列番号157)を含む。
一実施形態では、本発明のCARは、CD45RC結合ドメイン、IgDのヒンジドメイン(好ましくは、配列番号149)、CD8の膜貫通ドメイン(好ましくは、配列番号153)、4-1BBの細胞内ドメイン(好ましくは、配列番号163)、CD28の細胞内ドメイン(好ましくは、配列番号167)、およびCD3-ゼータ一次シグナル伝達ドメイン(好ましくは、配列番号157)を含む。
一実施形態では、本発明のCARは、CD45RC結合ドメイン、IgDのヒンジドメイン(好ましくは、配列番号149)、CD28の膜貫通ドメイン(好ましくは、配列番号155)、4-1BBの細胞内ドメイン(好ましくは、配列番号163)、CD28の細胞内ドメイン(好ましくは、配列番号167)、およびCD3-ゼータ一次シグナル伝達ドメイン(好ましくは、配列番号157)を含む。
一実施形態では、本発明のCARは、CD45RC結合ドメイン、CD28のヒンジドメイン(好ましくは、配列番号151)、CD8の膜貫通ドメイン(好ましくは、配列番号153)、4-1BBの細胞内ドメイン(好ましくは、配列番号163)、CD28の細胞内ドメイン(好ましくは、配列番号167)、およびCD3-ゼータ一次シグナル伝達ドメイン(好ましくは、配列番号157)を含む。
一実施形態では、本発明のCARは、CD45RC結合ドメイン、CD28のヒンジドメイン(好ましくは、配列番号151)、CD28の膜貫通ドメイン(好ましくは、配列番号155)、4-1BBの細胞内ドメイン(好ましくは、配列番号163)、CD28の細胞内ドメイン(好ましくは、配列番号167)、およびCD3-ゼータ一次シグナル伝達ドメイン(好ましくは、配列番号157)を含む。
一実施形態では、本発明のCARは、(i)CD45RC結合ドメイン、(ii)ヒトCD8のヒンジ領域、(iii)ヒトCD8の膜貫通ドメイン、(iv)ヒトCD28の細胞内ドメインおよび(v)ヒトCD3ζ鎖の細胞内ドメインを含む。
一実施形態では、ヒトCD8のヒンジ領域、ヒトCD8の膜貫通ドメイン、ヒトCD28の細胞内ドメインおよびヒトCD3ζ鎖の細胞内ドメインを含むCARの部分は、配列番号169のアミノ酸配列または配列番号169と少なくとも約95、好ましくは約96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有するアミノ酸配列に対応する。
一実施形態では、本発明のCARは、配列番号169のアミノ酸配列、または配列番号169と少なくとも約95、好ましくは約96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有する配列もしくはアミノ酸配列に結合されたCD45RC結合ドメインを含む。
配列番号169
TTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACDIYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYCRSKRSRLLHSDYMNMTPRRPGPTRKHYQPYAPPRDFAAYRSRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR
一実施形態では、ヒトCD8のヒンジ領域、ヒトCD8の膜貫通ドメイン、ヒトCD28の細胞内ドメインおよびヒトCD3ζ鎖の細胞内ドメインを含むCARの部分は、配列番号170のヌクレオチド配列、または配列番号170と少なくとも約95、好ましくは約96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有するヌクレオチド配列に対応する。
別の実施形態では、本発明のCARは、(i)CD45RC結合ドメイン、(ii)ヒトCD8のヒンジ領域、(iii)ヒトCD8の膜貫通ドメイン、(iv)ヒトCD28の細胞内ドメインおよび(v)ヒトCD3ζの細胞内ドメインを含む。
一実施形態では、ヒトCD8のヒンジ領域、ヒトCD8の膜貫通ドメイン、ヒトCD28の細胞内ドメインおよびヒトCD3ζの細胞内ドメインを含むCARの部分は、配列番号169のアミノ酸配列、または配列番号169と少なくとも約95、好ましくは約96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有する任意のアミノ酸配列を含むか、またはそれからなる。
一実施形態では、CD45RC結合ドメイン、ヒトCD8のヒンジ領域、ヒトCD8の膜貫通ドメイン、ヒトCD28の細胞内ドメインおよびヒトCD3ζの細胞内ドメインを含むCARの部分は、配列番号171のアミノ酸配列、または配列番号171と少なくとも約95、好ましくは約96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有する任意のアミノ酸配列を含むか、またはそれからなる。
配列番号170
ACCACGACGCCAGCGCCGCGACCACCAACACCGGCGCCCACCATCGCGTCGCAGCCCCTGTCCCTGCGCCCAGAGGCGTGCCGGCCAGCGGCGGGGGGCGCAGTGCACACGAGGGGGCTGGACTTCGCCTGTGATATCTACATCTGGGCGCCCTTGGCCGGGACTTGTGGGGTCCTTCTCCTGTCACTGGTTATCACCCTTTACTGCAGGAGTAAGAGGAGCAGGCTCCTGCACAGTGACTACATGAACATGACTCCCCGCCGCCCCGGGCCCACCCGCAAGCATTACCAGCCCTATGCCCCACCACGCGACTTCGCAGCCTATCGCTCCAGAGTGAAGTTCAGCAGGAGCGCAGACGCCCCCGCGTACCAGCAGGGCCAGAACCAGCTCTATAACGAGCTCAATCTAGGACGAAGAGAGGAGTACGATGTTTTGGACAAGAGACGTGGCCGGGACCCTGAGATGGGGGGAAAGCCGAGAAGGAAGAACCCTCAGGAAGGCCTGTACAATGAACTGCAGAAAGATAAGATGGCGGAGGCCTACAGTGAGATTGGGATGAAAGGCGAGCGCCGGAGGGGCAAGGGGCACGATGGCCTTTACCAGGGTCTCAGTACAGCCACCAAGGACACCTACGACGCCCTTCACATGCAGGCCCTGCCCCCTCGC
配列番号171
KVQLQQSGAELVRPGTSVKMSCKAAGYTFTNYYIGWVKQRPGHGLEWIGDIFPGGDYANSNEKFKGKATLTADTSSSTAYMQLSSLTSEDSAIYYCVRRNFDYWGQGTTLTVSSGGGGSGGGGSGGGGSQIVLTQSPTIMSASPGEKVTITCSASSSVSYMHWFQQKTGTSPRLWIYNTSNLPSGVPARFSGSGSGTSYSLTISRMEAEDAATYYCQQRSSYPLTFGAGTKLELKTTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACDIYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYCRSKRSRLLHSDYMNMTPRRPGPTRKHYQPYAPPRDFAAYRSRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR
本発明はまた、本発明のCARをコードする核酸に関する。
したがって、本発明はさらに、本明細書に記載されるCARをコードする核酸配列に関し、前記核酸配列は、
-細胞外結合ドメインの少なくとも1つの核酸配列であって、前記結合ドメインが、前記ヒトCD45RCに結合する、細胞外結合ドメインの少なくとも1つの核酸配列、
-任意選択で、細胞外ヒンジドメインの少なくとも1つの核酸配列、
-膜貫通ドメインの少なくとも1つの核酸配列、ならびに
-細胞内ドメインの少なくとも1つの核酸配列であって、細胞内ドメインの少なくとも1つの核酸配列が、一次細胞内シグナル伝達ドメインの少なくとも1つの核酸配列および任意選択で共刺激細胞内シグナル伝達ドメインの少なくとも1つの核酸配列を含む、細胞内ドメインの少なくとも1つの核酸配列、を含む。
いくつかの実施形態では、細胞外結合ドメインの少なくとも1つの核酸配列は、「抗体または抗原結合フラグメント」の節で上に開示したhCD45RCに結合する抗体またはその結合フラグメントをコードする核酸を含むか、またはそれからなる。
いくつかの実施形態では、本発明によるCARをコードする核酸配列は、配列番号172の配列、または配列番号172と少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有する配列を有する。
配列番号172
AAGGTCCAGCTGCAACAGTCTGGCGCTGAGCTGGTTAGGCCTGGGACTTCAGTGAAGATGTCCTGCAAGGCCGCTGGATACACCTTCACTAACTACTACATAGGTTGGGTAAAGCAGAGGCCTGGACATGGCCTTGAGTGGATCGGAGATATTTTCCCTGGAGGTGACTATGCCAACAGCAATGAGAAGTTCAAGGGCAAAGCCACACTGACTGCAGACACATCCTCCAGCACAGCCTACATGCAGCTCAGCAGCCTGACATCTGAGGACTCTGCCATCTATTACTGTGTGAGAAGGAACTTTGACTACTGGGGCCAAGGCACCACTCTCACAGTGTCCTCAGGTGGCGGTGGCTCGGGCGGTGGTGGGTCGGGTGGCGGCGGATCTCAAATTGTTCTCACCCAGTCTCCAACAATCATGTCTGCATCTCCAGGGGAGAAGGTGACCATAACCTGCAGTGCCAGCTCAAGTGTAAGTTACATGCACTGGTTCCAGCAGAAGACAGGCACTTCTCCCAGACTCTGGATTTATAACACATCCAACCTGCCTTCTGGAGTCCCCGCTCGCTTCAGTGGCAGTGGATCTGGGACCTCTTACTCTCTCACAATCAGCCGAATGGAGGCTGAAGATGCTGCCACTTATTACTGCCAGCAAAGGAGTAGTTACCCACTCACGTTCGGTGCTGGGACCAAGCTGGAGCTGAAAACCACGACGCCAGCGCCGCGACCACCAACACCGGCGCCCACCATCGCGTCGCAGCCCCTGTCCCTGCGCCCAGAGGCGTGCCGGCCAGCGGCGGGGGGCGCAGTGCACACGAGGGGGCTGGACTTCGCCTGTGATATCTACATCTGGGCGCCCTTGGCCGGGACTTGTGGGGTCCTTCTCCTGTCACTGGTTATCACCCTTTACTGCAGGAGTAAGAGGAGCAGGCTCCTGCACAGTGACTACATGAACATGACTCCCCGCCGCCCCGGGCCCACCCGCAAGCATTACCAGCCCTATGCCCCACCACGCGACTTCGCAGCCTATCGCTCCAGAGTGAAGTTCAGCAGGAGCGCAGACGCCCCCGCGTACCAGCAGGGCCAGAACCAGCTCTATAACGAGCTCAATCTAGGACGAAGAGAGGAGTACGATGTTTTGGACAAGAGACGTGGCCGGGACCCTGAGATGGGGGGAAAGCCGAGAAGGAAGAACCCTCAGGAAGGCCTGTACAATGAACTGCAGAAAGATAAGATGGCGGAGGCCTACAGTGAGATTGGGATGAAAGGCGAGCGCCGGAGGGGCAAGGGGCACGATGGCCTTTACCAGGGTCTCAGTACAGCCACCAAGGACACCTACGACGCCCTTCACATGCAGGCCCTGCCCCCTCGC
一実施形態では、本発明の核酸は、単離された核酸である。一実施形態では、本発明の単離された核酸は、精製される。
一実施形態では、単離された核酸は、
(1)吸光度法または蛍光法(例えば、260nmおよび280nmでの吸光度比(A260/280)を測定するなどによって)によって決定される核酸の80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%以上を超える重量、最も好ましくは96%、97%、98%もしくは99%を超える重量、または
(2)アガロースゲル電気泳動および挿入剤、例えば臭化エチジウム、SYBR Green、GelGreenなどを使用することによって示される均一性、に精製される。
当業者は、例えば、コドン最適化などによって組換え産生速度を改善するために核酸配列を改変することを目的とする分子生物学的方法に精通していることがさらに理解される。
本発明はまた、本明細書中に記載されるCARをコードする核酸配列を含むベクターを提供する。
本発明で使用され得るベクターの例には、DNAベクター、RNAベクター、プラスミド、ファージミド、ファージ誘導体、ウイルスおよびコスミドが含まれるが、これらに限定されない。
ウイルスベクター技術は、当技術分野で周知であり、例えば、Sambrook et al.(2001,Molecular Cloning:A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Laboratory,New York)、ならびに他のウイルス学および分子生物学のマニュアルに記載されている。ベクターとして有用なウイルスには、レトロウイルス、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス、ヘルペスウイルスおよびレンチウイルスが含まれるが、これらに限定されない。
本明細書で使用される場合、「レンチウイルス」という用語は、レトロウイルス科の属を指す。レンチウイルスは、非分裂細胞に感染することができるという点でレトロウイルスの中で独特であり、それらは、宿主細胞のDNAにかなりの量の遺伝情報を送達することができるので、それらは遺伝子送達ベクターの最も効率的な方法の1つである。HIV、SIVおよびFIVは、すべてレンチウイルスの例である。
一般に、好適なベクターは、少なくとも1つの生物において機能的な複製起点、プロモーター配列、好都合な制限エンドヌクレアーゼ部位および1つ以上の選択可能なマーカー(例えば、参照により本明細書に組み込まれるPCT特許公開WO01/96584およびWO01/29058および米国特許第6、326、193号を参照されたい)を含有する。
哺乳動物細胞への遺伝子移入のために、いくつかのウイルスベースのシステムが開発されている。例えば、レトロウイルスは、遺伝子送達システムのための便利なプラットフォームを提供する。選択された遺伝子をベクターに挿入し、当該分野で公知の技術を使用してレトロウイルス粒子にパッケージングすることができる。次いで、組換えウイルスを単離し、インビボまたはエクスビボのいずれかで対象の細胞に送達することができる。多くのレトロウイルス系は、当技術分野で公知である。いくつかの実施形態では、アデノウイルスベクターが使用される。さらに、多くのアデノウイルスベクターが当技術分野で公知である。いくつかの実施形態では、レンチウイルスベクターが使用される。
さらなる転写活性要素、例えばプロモーターおよびエンハンサーは、転写開始の頻度を調節する。典型的には、コアプロモーター、これらは、開始部位の30~110bp上流の領域に位置するが、いくつかのプロモーターは、最近、開始部位の下流にも機能的エレメントを含有することが示されており、エンハンサーエレメントは、一般に、開始部位の500~2000bp上流に位置する。プロモーターエレメント間の間隔は、しばしば柔軟であり、その結果、エレメントが互いに反転または移動した場合にプロモーター機能が保存される。チミジンキナーゼ(tk)プロモーターでは、活性が低下し始める前に、プロモーターエレメント間の間隔を50bpまで広げることができる。プロモーターに応じて、個々のエレメントは、転写を活性化するために協調的または独立して機能し得るようである。
好適なプロモーターの一例は、前初期サイトメガロウイルス(CMV)プロモーター配列である。このプロモーター配列は、それに作動可能に結合された任意のポリヌクレオチド配列の高レベルの発現を駆動することができる強力な構成的プロモーター配列である。好適なプロモーターの別の例は、伸長成長因子-Ia(EF-Ia)である。好適なプロモーターの別の例は、ホスホグリセリン酸キナーゼ(PGK)プロモーターである。しかしながら、シミアンウイルス40(SV40)初期プロモーター、マウス乳腺腫瘍ウイルス(MMTV)、ヒト免疫不全ウイルス(HIV)長末端反復(LTR)プロモーター、MoMuLVプロモーター、トリ白血病ウイルスプロモーター、エプスタイン・バーウイルス前初期プロモーター、およびラウス肉腫ウイルスプロモーター、ならびにアクチンプロモーター、ミオシンプロモーター、ヘモグロビンプロモーター、およびクレアチンキナーゼプロモーターなどであるが、これらに限定されないヒト遺伝子プロモーターが含まれるが、これらに限定されない他の構成的プロモーター配列も使用され得る。さらに、本発明は、構成的プロモーターの使用に限定されるべきではない。誘導性プロモーターも本発明の一部として企図される。誘導性プロモーターの使用は、そのような発現が望まれる場合に作動可能に結合されるポリヌクレオチド配列の発現をオンにすることができるか、または発現が望まれない場合に発現をオフにすることができる分子スイッチを提供する。誘導性プロモーターの例には、メタロチオニンプロモーター、グルココルチコイドプロモーター、プロゲステロンプロモーターおよびテトラサイクリンプロモーターが含まれるが、これらに限定されない。加えて、2つ以上の遺伝子の効率的かつ協調的な発現を可能にする双方向プロモーターも、本発明において興味深いものであり得る。双方向プロモーターの例には、i)サイトメガロウイルス(CMV)またはマウス乳腺腫瘍ウイルス(MMTV)ゲノムに由来する第1の最小プロモーター配列およびii)動物遺伝子に由来する完全に効率的なプロモーター配列を含む双方向プロモーターを開示する、参照により本明細書に組み込まれる米国特許出願公開第2006/200869号にLuigi Naldiniによって記載されるプロモーターが含まれるが、これらに限定されない。
CARポリペプチドまたはその一部の発現を評価するために、T細胞に導入される発現ベクターはまた、CD34、CD271またはレポーター遺伝子などの選択可能なマーカー遺伝子のいずれか、またはその両方を含有して、ウイルスベクターを介してトランスフェクトまたは感染されることが求められる細胞の集団からの発現細胞の同定および選択を容易にすることができる。他の態様では、選択可能なマーカーは、別個のDNA片に担持され、同時トランスフェクション手順で使用され得る。選択可能なマーカーおよびレポーター遺伝子の両方は、宿主細胞における発現を可能にするために適切な調節配列の側面に位置し得る。有用な選択可能なマーカーには、例えば、ネオマイシンなどのような抗生物質耐性遺伝子が含まれる。
本発明のいくつかの実施形態では、自殺遺伝子技術が使用され得る。異なる自殺遺伝子技術は、それらの作用機序に応じて当技術分野で記載されている(例えば、Jones et al.,Frontiers in Pharmacology 5:254(2014)を参照されたい)。非毒性薬物を毒性薬物に変換する遺伝子指向型酵素プロドラッグ療法(GDEPT)の例には、単純ヘルペスウイルスチミジンキナーゼ(HSV-TK)およびシトシンデアミナーゼ(CD)が含まれる。他の例は、例えば誘導性Fas(iFas)または誘導性カスパーゼ9(iCasp9)系などのアポトーシス成分に結合された薬物結合ドメインで構成されるキメラタンパク質である。他の例には、抗c-myc抗体の投与によって操作された細胞の表面でc-mycの過剰発現を誘導してその欠失を誘導するなどの治療抗体によって媒介される系が含まれる。EGFRの使用は、c-myc系と比較して同様の系として記載されている。
レポーター遺伝子は、潜在的にトランスフェクトされた細胞を同定し、調節配列の機能性を評価するために使用される。一般に、レポーター遺伝子は、レシピエント生物もしくは組織に存在しないか、またはレシピエント生物もしくは組織によって発現されず、その発現が何らかの容易に検出可能な特性、例えば酵素活性によって明らかにされるポリペプチドをコードする遺伝子である。レポーター遺伝子の発現は、DNAがレシピエント細胞に導入された後の好適な時点でアッセイされる。好適なレポーター遺伝子には、ルシフェラーゼ、ベータ-ガラクトシダーゼ、クロラムフェニコールアセチルトランスフェラーゼ、分泌型アルカリホスファターゼまたは緑色蛍光タンパク質遺伝子をコードする遺伝子が含まれ得る(例えば、Ui-Tei et al.,FEBS Letters 479:79-82(2000)を参照されたい)。好適な発現系は、周知であり、公知の技術を使用して調製され得るか、または商業的に入手され得る。一般に、レポーター遺伝子の最高レベルの発現を示す最小5’フランキング領域を有する構築物がプロモーターとして同定される。そのようなプロモーター領域は、レポーター遺伝子に結合され、プロモーター駆動転写を調節する能力について薬剤を評価するために使用され得る。
遺伝子を細胞に導入および発現させる方法は、当技術分野で公知である。発現ベクターに関連して、ベクターは、当技術分野における任意の方法によって、宿主細胞、例えば哺乳動物、細菌、酵母または昆虫細胞に容易に導入することができる。例えば、発現ベクターは、物理的、化学的または生物学的手段によって宿主細胞に移入することができる。
ポリヌクレオチドを宿主細胞に導入するための物理的方法には、リン酸カルシウム沈殿、リポフェクション、パーティクルボンバード、マイクロインジェクション、エレクトロポレーションなどが含まれる。ベクターおよび/または外因性核酸を含む細胞を産生するための方法は、当技術分野で周知である。例えば、Sambrook et al.(2001,Molecular Cloning:A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Laboratory,New York)を参照されたい。本発明のいくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、リン酸カルシウムトランスフェクションを使用して宿主細胞に導入される。
目的のポリヌクレオチドを宿主細胞に導入するための生物学的方法には、DNAおよびRNAベクターの使用が含まれる。ウイルスベクター、特にレトロウイルスベクターは、哺乳動物、例えばヒト細胞に遺伝子を挿入するための最も広く使用されている方法となっている。他のウイルスベクターは、レンチウイルス、ポックスウイルス、単純ヘルペスウイルスI、アデノウイルスおよびアデノ随伴ウイルスなどに由来し得る。例えば、米国特許第5,350,674号および同第5,585,362号を参照されたい。
ポリヌクレオチドを宿主細胞に導入するための化学的手段には、高分子複合体、ナノカプ細胞、ミクロスフェア、ビーズなどのコロイド分散系、ならびに水中油型エマルジョン、ミ細胞、混合ミ細胞およびリポソームを含む脂質ベースの系が含まれる。インビトロおよびインビボで送達ビヒクルとして使用するための例示的なコロイド系は、リポソーム(例えば、人工膜小胞)である。
非ウイルス送達系が利用される場合、例示的な送達ビヒクルは、リポソームである。宿主細胞(インビトロ、エクスビボまたはインビボ)への核酸の導入のために、脂質製剤の使用が企図される。別の態様では、核酸は、脂質と会合し得る。脂質と会合した核酸は、リポソームの水性内部にカプセル化されていてもよく、リポソームの脂質二重層内に散在していてもよく、リポソームおよびオリゴヌクレオチドの両方と会合した結合分子を介してリポソームに付着していてもよく、リポソームに封入されていてもよく、リポソームと複合体を形成していてもよく、脂質を含有する溶液中に分散されていてもよく、脂質と混合されていてもよく、脂質と組み合わされていてもよく、脂質中に懸濁液として含有されていてもよく、ミセルと含有もしくは複合体を形成していてもよく、またはそうでなければ脂質と会合していてもよい。脂質、脂質/DNAまたは脂質/発現ベクター関連組成物は、溶液中のいかなる特定の構造にも限定されない。例えば、それらは、二重層構造、ミセルとして、または「崩壊した」構造で存在し得る。それらはまた、溶液中に単に散在してもよく、場合によってはサイズまたは形状が均一でない凝集体を形成する。脂質は、天然に存在する脂質または合成脂質であり得る脂肪物質である。例えば、脂質には、細胞質に天然に存在する脂肪滴、ならびに脂肪酸、アルコール、アミン、アミノアルコールおよびアルデヒドなどの長鎖脂肪族炭化水素およびそれらの誘導体を含有する化合物のクラスが含まれる。
使用に好適な脂質は、商業的供給源から得ることができる。例えば、ジミリスチルホスファチジルコリン(「DMPC」)は、Sigma,St.Louis、MOから入手することができ、リン酸ジセチル(「DCP」)は、K&KLaboratories(Plainview,NY)から得ることができ、コレステロール(「Choi」)は、Calbiochem-Behringから得ることができ、ジミリスチルホスファチジルグリセロール(「DMPG」)および他の脂質は、Avanti Polar Lipids、Inc.(Birmingham,AL)から入手され得る。クロロホルムまたはクロロホルム/メタノール中の脂質の保存溶液は、約-20℃で保存することができる。クロロホルムは、メタノールよりも容易に蒸発するので、唯一の溶媒として使用される。「リポソーム」は、封入された脂質二重層または凝集体の生成によって形成された種々の単層および多層脂質ビヒクルを包含する総称である。リポソームは、リン脂質二重層膜および内部水性媒体を有する小胞構造を有することを特徴とすることができる。多層リポソームは、水性媒体によって分離された複数の脂質層を有する。それらは、リン脂質が過剰の水溶液に懸濁されると自然に形成する。脂質成分は、閉じた構造の形成前に自己再配置を受け、脂質二重層の間に水および溶解した溶質を捕捉する(Ghosh et al.,1991 Glycobiology 5:505-10)。しかしながら、溶液中で通常の小胞構造とは異なる構造を有する組成物も包含される。例えば、脂質は、ミセル構造をとるか、または単に脂質分子の不均一な凝集体として存在し得る。リポフェクタミン-核酸複合体も企図される。
外因性核酸を宿主細胞に導入するために使用される方法にかかわらず、宿主細胞における組換えDNA配列の存在を確認するために、種々のアッセイが実行され得る。そのようなアッセイには、例えば、当業者に周知の「分子生物学的」アッセイ、例えば、サザンブロッティングおよびノーザンブロッティング、RT-PCRおよびPCR、「生化学的」アッセイ、例えば、免疫学的手段(ELISAおよびウエスタンブロット)によって、または本発明の範囲内に入る薬剤を同定するための本明細書に記載されるアッセイによって、特定のペプチドの存在または非存在を検出することなどが含まれる。
いくつかの実施形態では、本発明の免疫細胞は、RNAの導入によって改変される。いくつかの実施形態では、インビトロ転写RNA CARは、一過性トランスフェクションの形態として細胞に導入することができる。RNAは、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)生成鋳型を使用したインビトロ転写によって産生される。任意の供給源からの目的のDNAを、適切なプライマーおよびRNAポリメラーゼを使用して、PCRによってインビトロmRNA合成のための鋳型に直接変換することができる。DNAの供給源は、例えば、ゲノムDNA、プラスミドDNA、ファージDNA、cDNA、合成DNA配列または任意の他の適切なDNA供給源であり得る。特定の実施形態では、インビトロ転写のための鋳型は、本発明のCARである。
いくつかの実施形態では、PCRに使用されるDNAは、オープンリーディングフレームを含有する。DNAは、例えば、生物のゲノムからの天然に存在するDNA配列からであり得る。いくつかの実施形態では、DNAは、目的の全長遺伝子または遺伝子の一部である。遺伝子は、5’および/または3’非翻訳領域(UTR)の一部またはすべてを含み得る。遺伝子は、エクソンおよびイントロンを含み得る。いくつかの実施形態では、PCRに使用されるDNAは、ヒト遺伝子である。いくつかの実施形態では、PCRに使用されるDNAは、5’および3’UTRを含むヒト遺伝子である。あるいは、DNAは、天然に存在する生物において通常発現されない人工DNA配列であり得る。例示的な人工DNA配列は、融合タンパク質をコードするオープンリーディングフレームを形成するために一緒にライゲートされる遺伝子の部分を含有するものである。一緒にライゲートされるDNAの部分は、単一の生物または2つ以上の生物からであり得る。
PCRを使用して、トランスフェクションに使用されるmRNAのインビトロ転写のための鋳型を生成し得る。PCRを実行するための方法は、当技術分野で周知である。PCRに使用するためのプライマーは、PCRの鋳型として使用されるDNAの領域と実質的に相補的な領域を有するように設計されている。本明細書で使用される「実質的に相補的」は、プライマー配列中の塩基の大部分もしくはすべてが相補的であるか、または1つ以上の塩基が非相補的であるか、またはミスマッチであるヌクレオチドの配列を指す。実質的に相補的な配列は、PCRに使用されるアニーリング条件下で、意図するDNA標的とアニーリングまたはハイブリダイズすることができる。プライマーは、DNA鋳型の任意の部分に実質的に相補的であるように設計することができる。例えば、プライマーは、5’および3’UTRを含み得る、細胞内で通常転写される遺伝子の部分(オープンリーディングフレーム)を増幅するように設計することができる。プライマーは、目的の特定のドメインをコードする遺伝子の一部を増幅するように設計することもできる。いくつかの実施形態では、プライマーは、5’および3’UTRのすべてまたは一部を含むヒトcDNAのコーディング領域を増幅するように設計される。PCRに有用なプライマーは、当技術分野で周知の合成方法によって生成される。
「フォワードプライマー」は、増幅されるDNA配列の上流にあるDNA鋳型上のヌクレオチドに実質的に相補的なヌクレオチドの領域を含有するプライマーである。「上流」は、本明細書では、コード鎖に対して増幅されるDNA配列の場所5’を指すために使用される。「リバースプライマー」は、増幅されるDNA配列の下流にある二本鎖DNA鋳型に実質的に相補的なヌクレオチドの領域を含有するプライマーである。「下流」は、本明細書では、コード鎖に対して増幅されるDNA配列の場所3’を指すために使用される。
PCRに有用な任意のDNAポリメラーゼを、本明細書中に開示される方法において使用することができる。試薬およびポリメラーゼは、いくつかの供給元から市販されている。
安定性および/または翻訳効率をプロモートする能力を有する化学構造も使用され得る。いくつかの実施形態では、RNAは、5’および3’UTRを有し得る。いくつかの実施形態では、5’UTRは、ゼロ~3000ヌクレオチド長である。コーディング領域に付加される5’および3’UTR配列の長さは、UTRの異なる領域にアニーリングするPCRのプライマーを設計することを含むが、これらに限定されない異なる方法によって変更することができる。このアプローチを使用して、当業者は、転写されたRNAのトランスフェクション後に最適な翻訳効率を達成するために必要な5’および3’UTRの長さを改変することができる。5’および3’UTRは、目的の遺伝子の天然に存在する内因性の5’および3’UTRであり得る。あるいは、目的の遺伝子に対して内因性ではないUTR配列は、UTR配列をフォワードプライマーおよびリバースプライマーに組み込むことによって、または鋳型の任意の他の改変によって加えることができる。目的の遺伝子に対して内因性ではないUTR配列の使用は、RNAの安定性および/または翻訳効率を改変するために有用であり得る。例えば、3’UTR配列中のAUリッチエレメントがmRNAの安定性を低下させ得ることが公知である。したがって、3’UTRは、当技術分野で周知のUTRの特性に基づいて転写RNAの安定性を増加させるように選択または設計することができる。
いくつかの実施形態では、5’UTRは、内因性遺伝子のコザック配列を含有し得る。あるいは、目的の遺伝子に対して内因性ではない5’UTRが上記のようにPCRによって付加されている場合、コンセンサスなKozak配列は、5’UTR配列を付加することによって再設計することができる。Kozak配列は、いくつかのRNA転写物の翻訳効率を高めることができるが、効率的な翻訳を可能にするためにすべてのRNAに必要であるとは思われない。多くのmRNAに対するKozak配列の必要性は、当技術分野で公知である。他の実施形態では、5’UTRは、RNAゲノムが細胞内で安定であるRNAウイルスに由来し得る。他の実施形態では、様々なヌクレオチド類似体を3’または5’UTRにおいて使用して、mRNAのエキソヌクレアーゼ分解を妨げることができる。
遺伝子クローニングを必要とせずにDNA鋳型からRNAを合成することを可能にするために、転写のプロモーターを、転写される配列の上流でDNA鋳型に結合させるべきである。RNAポリメラーゼのプロモーターとして機能する配列がフォワードプライマーの5’末端に付加されると、RNAポリメラーゼプロモーターは、転写されるオープンリーディングフレームの上流のPCR産物に組み込まれる。いくつかの実施形態では、プロモーターは、本明細書の他の箇所に記載されるように、T7ポリメラーゼプロモーターである。他の有用なプロモーターには、T3およびSP6RNAポリメラーゼプロモーターが含まれるが、これらに限定されない。T7、T3およびSP6プロモーターについてのコンセンサスなヌクレオチド配列は、当技術分野で公知である。
いくつかの実施形態では、mRNAは、リボソーム結合、翻訳の開始および細胞中のmRNAの安定性を決定する5’末端のキャップおよび3’ポリ(A)尾部の両方を有する。環状DNA鋳型、例えばプラスミドDNAでは、RNAポリメラーゼは、真核細胞での発現に好適ではない長いコンカテマー産物を産生する。3’UTRの終わりに線状化されたプラスミドDNAの転写は、転写後にポリアデニル化されたとしても真核生物トランスフェクションにおいて有効ではない正常なサイズのmRNAをもたらす。
線状DNA鋳型では、ファージT7RNAポリメラーゼは、鋳型の最後の塩基を越えて転写物の3’末端を伸長させることができる(Schenborn and Mierendorf,Nuc Acids Res.,13:6223-36(1985);Nacheva and Berzal-Herranz,Eur.J.Biochem.,270:1485-65(2003)。
DNA鋳型にポリA/Tストレッチを統合する従来の方法は、分子クローニングである。しかしながら、プラスミドDNAに統合されたポリA/T配列は、プラスミド不安定性を引き起こす可能性があり、これが細菌細胞から得られたプラスミドDNA鋳型がしばしば欠失および他の異常で高度に汚染される理由である。これにより、クローニング手順が面倒で時間がかかるだけでなく、しばしば信頼性が低くなる。それが、クローニングなしでポリA/T3’伸長を有するDNA鋳型の構築を可能にする方法が非常に望ましい理由である。
転写DNA鋳型のポリA/Tセグメントは、100Tテール(サイズは50~5000Tであり得る)などのポリTテールを含有するリバースプライマーを使用することによってPCR中に、またはDNAライゲーションもしくはインビトロ組換えを含むが、これらに限定されない任意の他の方法によるPCR後に産生することができる。ポリ(A)テールはまた、RNAに安定性を提供し、それらの分解を低減する。一般に、ポリ(A)尾部の長さは、転写されたRNAの安定性と正に相関する。いくつかの実施形態では、ポリ(A)尾部は、100~5000個のアデノシンである。
RNAのポリ(A)尾部は、大腸菌ポリAポリメラーゼ(E-PAP)などのポリ(A)ポリメラーゼの使用を伴うインビトロ転写後にさらに伸長することができる。いくつかの実施形態では、ポリ(A)尾部の長さを100ヌクレオチドから300~400ヌクレオチドに増加させると、RNAの翻訳効率が約2倍増加する。さらに、3’末端への異なる化学基の結合は、mRNA安定性を増加させることができる。そのような結合は、改変/人工ヌクレオチド、アプタマーおよび他の化合物を含有することができる。例えば、ATP類似体は、ポリ(A)ポリメラーゼを使用してポリ(A)尾部に組み込むことができる。ATP類似体は、RNAの安定性をさらに増加させることができる。
RNA上の5’キャップはまた、RNA分子に安定性を提供し得る。いくつかの実施形態では、本明細書中に開示される方法によって産生されるRNAは、5’キャップを含む。5’キャップは、当技術分野で公知であり、本明細書に記載される技術を使用して提供される(Cougot et al.,Trends in Biochem.Sci.29:436-444(2001);Stepinski et al.,RNA 7:1468-95(2001);Elango,et al.,Biochim.Biophys.Res.Commun.330:958-966(2005))。
本明細書中に開示される方法によって産生されるRNAはまた、内部リボソーム進入部位(IRES)配列を含有することができる。IRES配列は、mRNAへのキャップ非依存性リボソーム結合を開始し、翻訳の開始を促進する任意のウイルス、染色体または人工的に設計された配列であり得る。細胞の透過性および生存性を促進する因子、例えば、糖、ペプチド、脂質、タンパク質、酸化防止剤および界面活性剤を含有することができる、細胞エレクトロポレーションに好適な任意の溶質を含むことができる。
RNAは、いくつかの異なる方法のいずれか、例えば、エレクトロポレーション(例えば、Amaxa Nucleofector-II(Amaxa Biosystems,Cologne,Germany)、ECM 830(BTX)(Harvard Instruments,Boston,Mass.)、Gene Pulser II(BioRad,Denver,Colo.)、もしくはMultiporator(Eppendort,Hamburg Germany))、リポフェクションを使用したカチオン性リポソーム媒介トランスフェクション、ポリマーカプセル化、ペプチド媒介トランスフェクション、または「遺伝子銃」などの生物学的粒子送達系を含むが、これらに限定されない市販の方法を使用して標的細胞に導入することができる(例えば、Nishikawa et al.Hum Gene Ther.12(8):861-70(2001)を参照されたい)。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるCAR配列は、レトロウイルスベクターまたはレンチウイルスベクターを使用することによって本発明の免疫細胞に送達される。CAR発現レトロウイルスベクターおよびレンチウイルスベクターは、形質導入された細胞をキャリアとして使用して、またはカプセル化されたベクター、結合したベクターもしくは裸のベクターの無細胞局所送達もしくは全身送達を使用して、異なる種類の真核細胞ならびに組織および生物全体に送達することができる。使用される方法は、安定した発現が必要または十分である任意の目的のためであり得る。
本明細書で使用される場合、「レンチウイルスベクター」という用語は、特にMilone et al.,Mol.Ther.17(8):1453-1464(2009)で提供される自己不活化レンチウイルスベクターを含む、レンチウイルスゲノムの少なくとも一部に由来するベクターを指す。診療所で使用され得るレンチウイルスベクターの他の例には、Oxford BioMedicaのLENTIVECTOR(登録商標)遺伝子送達技術、LentigenのLENTIMAX(商標)ベクターシステムなどが含まれるが、これらに限定されない。非臨床型のレンチウイルスベクターも利用可能であり、当業者に公知であろう。
いくつかの実施形態では、CAR配列は、インビトロ転写mRNAを使用することによって本発明の免疫細胞に送達される。インビトロ転写されたmRNA CARは、トランスフェクトされた細胞をキャリアとして使用して、またはカプセル化されたmRNA、結合したmRNAもしくは裸のmRNAの無細胞局所送達もしくは全身送達を使用して、異なる種類の真核細胞ならびに組織および生物全体に送達することができる。使用される方法は、一過性発現が必要または十分である任意の目的のためであり得る。
いくつかの実施形態では、所望のCARは、トランスポゾンによって細胞内で発現させることができる。
いくつかの実施形態では、本発明の免疫細胞は、例えばT細胞である。本明細書に記載されるT細胞(Treg、Teff、メモリーT細胞、NKTまたはMAIT細胞など)の拡大および遺伝子改変の前に、細胞は、対象から得られる。T細胞は、末梢血単核細胞、骨髄、リンパ節組織、臍帯血、胸腺組織、感染部位からの組織、腹水、胸水、脾臓組織および腫瘍を含む多くの供給源から得ることができる。本発明の特定の実施形態では、当技術分野で利用可能な任意の数のT細胞株が使用され得る。本発明の特定の実施形態では、T細胞は、Ficoll(商標)分離、赤血球溶解および単球枯渇後のPERCOLL(商標)勾配による遠心分離、向流遠心分離溶出、白血球アフェレーシス、ならびにその後の細胞表面マーカーに基づく磁気またはフローサイトメトリー単離などの当業者に公知の任意の数の技術を使用して、対象から採取された血液単位から得ることができる。いくつかの実施形態では、個体の循環血液からの細胞は、アフェレーシスによって得られる。アフェレーシス産物は、典型的には、T細胞、単球、顆粒球、B細胞、他の有核白血球、赤血球および血小板を含むリンパ球を含有する。いくつかの実施形態では、個体の循環血液からの細胞は、白血球搬出法によって得られる。
いくつかの実施形態では、白血球搬出法によって収集された細胞を洗浄して、血漿画分を除去し、その後のプロセシングステップのために細胞を適切な緩衝液または培地に入れてもよい。本発明のいくつかの実施形態では、細胞は、リン酸緩衝生理食塩水(PBS)で洗浄される。いくつかの実施形態では、洗浄液は、カルシウムを欠いており、マグネシウムを欠いていてもよく、またはすべてではないにしても多くの二価カチオンを欠いていてもよい。洗浄後、細胞は、例えば、Ca2+フリー、Mg2+フリーPBS、PlasmaLyte A、または緩衝液を含むもしくは含まない他の生理食塩水などの種々の生体適合性緩衝液のいずれかに再懸濁されてもよい。あるいは、白血球除去試料の望ましくない成分を除去し、細胞を培養培地に直接再懸濁してもよい。
別の実施形態では、T細胞は、例えばPERCOLL(商標)勾配による遠心分離または向流遠心溶出によって、赤血球を溶解し、単球を枯渇させることによって末梢血リンパ球から単離される。T細胞の特定の亜集団は、陽性または陰性選択技術によってさらに単離することができる。例えば、いくつかの実施形態では、T細胞は、所望のT細胞の陽性選択に十分な時間、DYNABEADS(登録商標)M-450CD3/CD28Tなどの抗CD3/抗CD28(すなわち、3×28)コンジュゲートビーズとのインキュベーションによって単離される。いくつかの実施形態では、期間は、約30分である。さらなる実施形態では、期間は、30分~36時間以上の範囲であり、その間のすべての整数値である。さらなる実施形態では、期間は、少なくとも1、2、3、4、5または6時間である。いくつかの実施形態では、期間は、10~24時間である。特定の実施形態では、インキュベーション期間は、24時間である。他の細胞型と比較してT細胞が少ない任意の状況では、より長いインキュベーション時間を使用してT細胞を単離し得る。したがって、T細胞が抗CD3/抗CD28ビーズに結合することを可能にする時間を単純に短縮もしくは延長することによって、および/またはビーズとT細胞との比を増加もしくは減少させることによって(本明細書にさらに記載されるように)、T細胞の亜集団を、培養開始時またはプロセス中の他の時点で優先的に選択することができる。さらに、ビーズまたは他の表面上の抗CD3および/または抗CD28抗体の比を増加または減少させることによって、T細胞の亜集団を、培養開始時または他の所望の時点で優先的に選択することができる。当業者は、本発明の文脈において複数回の選択も使用できることを認識するであろう。
いくつかの実施形態では、選択手順を実行し、活性化および拡大プロセスにおいて「選択されていない」細胞を使用することが望ましい場合がある。「選択されていない」細胞は、さらなる選択ラウンドに供することもできる。陰性選択によるT細胞集団の濃縮は、陰性選択細胞に固有の表面マーカーに対する抗体の組み合わせを用いて成し遂げることができる。1つの方法は、陰性選択された細胞上に存在する細胞表面マーカーに対するモノクローナル抗体のカクテルを使用する、負磁気免疫接着またはフローサイトメトリーによる細胞選別および/または選択である。例えば、陰性選択によってCD4細胞を濃縮するために、モノクローナル抗体カクテルは、典型的には、CD14、CD20、CD11b、CD16、HLA-DRおよびCD8に対する抗体を含む。特定の実施形態では、調節性T細胞は、抗CD25コンジュゲートビーズまたは他の同様の選択方法によって枯渇化される。
陽性または陰性選択による細胞の所望の集団の単離のために、細胞および表面(例えば、ビーズなどの粒子)の濃度を変動させることができる。特定の実施形態では、細胞とビーズとの最大接触を確実にするために、ビーズと細胞とが一緒に混合される体積を有意に減少させることが望ましい場合がある(すなわち、細胞の濃度を増加させる)。例えば、いくつかの実施形態では、20億細胞/mLの濃度が使用される。いくつかの実施形態では、10億細胞/mLの濃度が使用される。さらなる実施形態では、1億細胞/mL超が使用される。さらなる実施形態では、1000、1500、2000、2500、3000、3500、4000、4500または5000万細胞/mLの細胞濃度が使用される。いくつかの実施形態では、7500万、8000万、8500万、9000万、9500万、または1億細胞/mLの細胞濃度が使用される。さらなる実施形態では、1億2500万または1億5000万細胞/mLの濃度を使用することができる。高濃度の使用は、細胞収量の増加、細胞活性化および細胞拡大をもたらすことができる。さらに、高細胞濃度の使用は、CD28陰性T細胞などの目的の標的抗原を弱く発現し得る細胞、または多くの腫瘍細胞が存在する試料(すなわち、白血病性血液、腫瘍組織など)からのより効率的な捕捉を可能にする。そのような細胞集団は、治療的価値を有し得、得ることが望ましい場合がある。
刺激のためのT細胞は、洗浄ステップ後に凍結することもできる。理論に拘束されないことを望むが、凍結およびその後の解凍ステップは、細胞集団中の顆粒球およびある程度単球を除去することによって、より均一な生成物を提供する。血漿および血小板を除去する洗浄ステップの後、細胞を凍結溶液に懸濁してもよい多くの凍結溶液および凍結パラメータが当技術分野で公知であり、これに関連して有用であるが、1つの方法は、20%のDMSOおよび8%のヒト血清アルブミンを含有するPBS、または10%のデキストラン40および5%のデキストロース、20%のヒト血清アルブミンおよび7.5%のDMSO、もしくは31.25%のPlasmalyte-A、31.25%のデキストロース5%、0.45%のNaCl、10%のデキストラン40および5%のデキストロース、20%のヒト血清アルブミン、ならびに7.5%のDMSOを含有する培養培地、または例えばHespanおよびPlasmaLyte Aを含有する他の好適な細胞凍結培地を使用することを伴い、次いで、細胞を1分あたり1℃の速度で-80℃に凍結し、液体窒素貯蔵タンクの気相中で貯蔵する。制御された凍結の他の方法、および-20℃または液体窒素中で直ちに制御されない凍結を使用してもよい。
特定の実施形態では、凍結保存された細胞は、本明細書に記載されるように解凍され、洗浄され、活性化の前に室温で1時間静置される。
本発明の文脈において、本明細書中に記載されるような拡大された細胞が必要とされるかもしれないときよりも前の期間における対象からの血液試料または白血球除去産物の収集も企図される。したがって、拡大させる細胞の供給源は、必要な任意の時点で収集することができ、T細胞などの所望の細胞を単離し、本明細書に記載されるものなどのT細胞療法から利益を得る任意の数の疾患または状態のためのT細胞療法で後に使用するために凍結することができる。いくつかの実施形態では、血液試料または白血球アフェレーシス産物は、一般に健康な対象から採取される。特定の実施形態では、血液試料または白血球除去療法産物は、疾患を発症するリスクがあるが、まだ疾患を発症していない一般に健康な対象から採取され、目的の細胞は、後の使用のために単離され、凍結される。特定の実施形態では、T細胞を拡大させ、凍結し、後で使用し得る。
望ましいCARを発現するためのT細胞の遺伝子改変の前であろうと後であろうと、T細胞は、一般に、例えば、米国特許第6,352,694号、同第6,534,055号、同第6,905,680号、同第6,692,964号、同第5,858,358号、同第6,887,466号、同第6,905,681号、同第7,144,575号、同第7,067,318号、同第7,172,869号、同第7,232,566号、同第7,175,843号、同第5,883,223号、同第6,905,874号、同第6,797,514号および同第6,867,041号、ならびに参照により本明細書に組み込まれる米国特許出願公開第2006/0121005号に記載される方法を使用して活性化および拡大培養することができる。
一般に、本発明のT細胞(例えば、Treg、Teff、メモリーT細胞、NKTまたはMAIT細胞)は、CD3/TCR複合体関連シグナルを刺激する薬剤および細胞の表面上の共刺激分子を刺激するリガンドが付着した表面との接触によって拡大される。特に、T細胞(例えば、Treg、Teff、メモリーT細胞、NKTまたはMAIT細胞)は、本明細書に記載されるように、例えば表面に固定化された抗CD3抗体もしくはその抗原結合フラグメントもしくは抗CD2抗体との接触によって、またはカルシウムイオノフォアと組み合わせたプロテインキナーゼCアクチベータ(例えば、ブリオスタチン)との接触によって刺激され得る。T細胞の表面上の補助分子の共刺激のために、補助分子に結合するリガンドが使用される。例えば、T細胞の増殖を刺激するのに適切な条件下で、T細胞の集団を抗CD3抗体および抗CD28抗体と接触させることができる。CD4T細胞の増殖を刺激するために、抗CD3抗体および抗CD28抗体が使用され得る。抗CD28抗体の例には、9.3、B-T3、XR-CD28(Diaclone,Besancon,France)が含まれるが、これらに限定されない。当技術分野で一般的に公知の他の拡大方法を使用することができる(Berg et al.,Transplant Proc.30(8):3975-3977(1998);Haanen et al.,J Exp.Med.190(9):1319-1328(1999);Garland et al.,J.Immunol Meth.227(l-2):53-63(1999))。
特定の実施形態では、本発明のT細胞(例えば、Treg、Teff、メモリーT、NKTまたはMAIT細胞)の一次刺激シグナルおよび共刺激シグナルは、異なるプロトコルによって提供され得る。例えば、各シグナルを提供する薬剤は、溶液中にあってもよく、および/または表面に連結されていてもよい。表面に連結される場合、薬剤は、同じ表面(すなわち、「シス」形成では)または別個の表面(すなわち、「トランス」形成)に連結され得る。あるいは、一方の薬剤を表面に連結させ、他方の薬剤を溶液中に結合させてもよい。いくつかの実施形態では、共刺激シグナルを提供する薬剤は、細胞表面に結合しており、一次活性化シグナルを提供する薬剤は、溶液中にあるか、または表面に連結している。特定の実施形態では、両方の薬剤を溶液中に存在させることができる。いくつかの実施形態では、薬剤は、可溶性形態であり、次いでFc受容体を発現する細胞または薬剤に結合する抗体もしくは他の結合剤などの表面に架橋され得る。これに関して、本発明においてT細胞の活性化および拡大での使用が意図されている人工抗原提示細胞(aAPC)について、例えば、参照により本明細書に組み込まれる米国特許出願公開第2004/0101519号および同第2006/0034810号を参照されたい。
いくつかの実施形態では、2つの薬剤は、同じビーズ、すなわち「シス」上、または別々のビーズ、すなわち「トランス」上のいずれかのビーズ上に固定化される。例として、一次活性化シグナルを提供する薬剤は、抗CD3抗体またはその抗原結合フラグメントであり、共刺激シグナルを提供する薬剤は、抗CD28抗体またはその抗原結合フラグメントであり、両方の薬剤は、同じビーズに等量の分子量で共固定化される。いくつかの実施形態では、CD4T細胞拡大およびT細胞成長のためのビーズに結合した各抗体の1:1の比が使用される。本発明の特定の態様では、ビーズに結合した抗CD3:抗CD28抗体の比は、1:1の比を使用して観察される拡大と比較してT細胞拡大の増加が観察されるように使用される。いくつかの実施形態では、1:1の比を使用して観察される拡大と比較して、約1~約3倍の増加が観察される。いくつかの実施形態では、ビーズに結合した抗CD3:抗CD28抗体の比は、100:1~1、100およびそれらの間のすべての整数値の範囲である。いくつかの実施形態では、抗CD3抗体よりも多くの抗CD28抗体が粒子に結合している、すなわち、CD3:CD28の比は、1未満である。本発明の特定の実施形態では、ビーズに結合した抗CD28抗体対抗CD3抗体の比は、2:1より大きい。特定の一実施形態では、ビーズに結合した抗体の1:100のCD3:CD28比が使用される。いくつかの実施形態では、ビーズに結合した抗体の1:75のCD3:CD28比が使用される。さらなる実施形態では、ビーズに結合した抗体の1:50のCD3:CD28比が使用される。いくつかの実施形態では、ビーズに結合した抗体の1:30のCD3:CD28比が使用される。特定の実施形態では、ビーズに結合した抗体の1:10のCD3:CD28比が使用される。いくつかの実施形態では、ビーズに結合した抗体の1:3のCD3:CD28比が使用される。いくつかの実施形態では、ビーズに結合した抗体の3:1のCD3:CD28比が使用される。
1:500~500:1およびその間の任意の整数値の細胞に対する粒子の比を使用して、T細胞または他の標的細胞を刺激し得る。当業者が容易に理解することができるように、粒子対細胞の比は、標的細胞に対する粒径に依存し得る。例えば、小さなサイズのビーズは、少数の細胞にしか結合し得ず、一方、より大きなビーズは、多数に結合し得る。特定の実施形態では、T細胞は、1:100~100:1の範囲の細胞対粒子の比およびその間の任意の整数値で刺激することができる。特定の実施形態では、比は、1:9~9:1およびその間の任意の整数値を含む。T細胞刺激をもたらす抗CD3および抗CD28連結粒子対T細胞の比は、上記のように変動し得るが、値の特定の実施形態は、1:100、1:50、1:40、1:30、1:20、1:10、1:9、1:8、1:7、1:6、1:5、1:4、1:3、1:2、1:1、2:1、3:1、4:1、5:1、6:1、7:1、8:1、9:1、10:1および15:1を含み、1つの特定の比は、T細胞あたり少なくとも1:1の粒子である。いくつかの実施形態では、1:1以下の粒子対細胞の比が使用される。特定の実施形態では、粒子:細胞比は、1:5である。さらなる実施形態では、粒子対細胞の比は、刺激の日に応じて変動し得る。例えば、いくつかの実施形態では、粒子対細胞の比は、1日目では1:1~10:1であり、追加の粒子は、(追加日の細胞数に基づいて)1:1~1:10の最終比で、最大10日間、毎日またはその後1日おきに細胞に加えられる。特定の一実施形態では、粒子対細胞の比は、刺激の1日目では1:1であり、刺激の3日目および5日目では1:5に調整される。いくつかの実施形態では、粒子は、刺激の1日目では1:1、刺激の3日目および5日目では1:5の最終比まで毎日または1日おきに加えられる。いくつかの実施形態では、粒子対細胞の比は、刺激の1日目では2:1であり、刺激の3日目および5日目に1:10に調整される。いくつかの実施形態では、粒子は、刺激の1日目では1:1であり、刺激の3日目および5日目では1:10の最終比まで毎日または1日おきに加えられる。当業者は、種々の他の比率が本発明での使用に好適であり得ることを理解するであろう。特に、比率は、粒径ならびに細胞のサイズおよび種類に応じて変動する。
本発明のさらなる実施形態では、免疫細胞を薬剤コーティングされたビーズと組み合わせ、続いてビーズと細胞を分離し、次いで細胞を培養する。代替の実施形態では、培養の前に、薬剤コーティングされたビーズおよび細胞は分離されず、一緒に培養される。いくつかの実施形態では、ビーズおよび細胞は、最初に磁力などの力の印加によって濃縮され、細胞表面マーカーのライゲーションの増加をもたらし、それによって細胞刺激を誘導する。
例として、細胞表面タンパク質は、抗CD3および抗CD28抗体が付着した常磁性ビーズ(3×28ビーズ)を本発明の免疫細胞と接触させることによってライゲートされ得る。いくつかの実施形態では、細胞(例えば、10個~10個のT細胞)およびビーズ(例えば、1:1の比のDYNABEADS(登録商標)M-450CD3/CD28T常磁性ビーズ)は、PBS(例えば、カルシウムおよびマグネシウムなどの二価カチオンを含まない)などの緩衝液中で組み合わされる。ここでも、当業者は、状況に応じて任意の細胞濃度が使用され得ることを容易に理解することができる。例えば、標的細胞は、試料中で非常に希少であり得、試料の0.01%のみを構成し得るか、または試料全体(すなわち、100%)が目的の標的細胞を含み得る。したがって、任意の細胞数が本発明の文脈内にある。特定の実施形態では、細胞と粒子との最大接触を確実にするために、粒子と細胞とが一緒に混合される体積を有意に減少させることが望ましい場合がある(すなわち、細胞の濃度を増加させる)。例えば、一実施形態では、約20億細胞/mLの濃度が使用される。別の実施形態では、1億細胞/mL超が使用される。さらなる実施形態では、1000、1500、2000、2500、3000、3500、4000、4500または5000万細胞/mLの細胞濃度が使用される。さらに別の実施形態では、7500万、8000万、8500万、9000万、9500万、または1億細胞/mLの細胞濃度が使用される。さらなる実施形態では、1億2500万または1億5000万細胞/mLの濃度を使用することができる。高濃度の使用は、細胞収量、細胞活性化および/または細胞拡大の増加をもたらし得る。さらに、高細胞濃度の使用は、CD28陰性T細胞などの目的の標的抗原を弱く発現し得る細胞のより効率的な捕捉を可能にする。そのような細胞集団は、治療的価値を有し得、特定の実施形態では得ることが望ましい場合がある。
本発明のいくつかの実施形態では、混合物を数時間(例えば、約3時間)~約14日間またはその間の任意の時間毎の整数値で培養し得る。いくつかの実施形態では、混合物は、21日間培養され得る。本発明のいくつかの実施形態では、ビーズおよびT細胞は、約8日間一緒に培養される。いくつかの実施形態では、ビーズおよびT細胞は、2~3日間一緒に培養される。T細胞の培養時間が60日以上であり得るように、数サイクルの刺激も所望され得る。T細胞培養に適切な条件には、血清(例えば、ウシ胎児血清またはヒト胎児血清)、インターロイキン-2(IL-2)、インスリン、IFN-γ、IL-4、IL-7、GM-CSF、IL-10、IL-12、IL-15、TGFβおよびTNF-αまたは当業者に公知の細胞成長のための任意の他の添加剤を含む、増殖および生存に必要な因子を含有し得る適切な培地(例えば、最小必須培地もしくはRPMI培地1640、またはX-vivo15(Lonza))が含まれる。細胞の成長のための他の添加剤には、界面活性剤、プラスマネート、ならびにN-アセチル-システインおよび2-メルカプトエタノールなどの還元剤が含まれるが、これらに限定されない。培地には、RPMI1640、AIM-V、DMEM、MEM、a-MEM、F-12、X-Vivo15、およびX-Vivo20、Optimizerが含まれ得、これらには、アミノ酸、ピルビン酸ナトリウム、およびビタミンが添加されており、無血清であるか、または適切な量の血清(もしくは血漿)もしくは所定のホルモンのセット、ならびに/またはT細胞の成長および拡大に十分な量のサイトカインが補充されている。抗生物質、例えばペニシリンおよびストレプトマイシンは、実験培養物にのみ含まれ、対象に注入される細胞の培養物には含まれない。標的細胞は、成長を支援するのに必要な条件下、例えば、適切な温度(例えば、37℃)および雰囲気(例えば、空気+5%CO)で維持される。
様々な刺激時間に曝露されたT細胞は、異なる特徴を示し得る。例えば、典型的な血液またはアフェレーズされた末梢血単核細胞産物は、細胞傷害性またはサプレッサーT細胞集団(Tc、CD8)よりも大きいヘルパーT細胞集団(Th、CD4)を有する。CD3およびCD28受容体を刺激することによるT細胞のエクスビボ拡大は、約8~9日前には主にTh細胞からなるT細胞の集団を産生し、約8~9日後には、T細胞の集団はTc細胞のますます大きな集団を含む。治療の目的に応じて、いくつかの実施形態では、主にTh細胞を含むT細胞集団を対象に注入することが有利であり得る。いくつかの実施形態では、Tc細胞の抗原特異的サブセットが単離されている場合、このサブセットをより高度に拡大することが有益であり得る。
さらに、CD4マーカーおよびCD8マーカーに加えて、他の表現型マーカーは、有意に変動するが、大部分は、細胞拡大プロセスの過程中に再現性よく変動する。そのような再現性は、特定の目的のために活性化T細胞産物を合わせる能力を可能にする。
本発明のいくつかの実施形態では、例えばPCT特許公開WO2007/110785(参照により本明細書に組み込まれる)に記載されているように、調節性T細胞を得るために、T細胞は、ラパマイシンの存在下で培養され得る。調節性T細胞を生成する別の方法は、米国特許出願公開第2016/024470号(参照により本明細書に組み込まれる)に記載されており、T細胞は、例えばTCR/CD3抗体、TCR共刺激因子活性化因子、例えばCD28、CD137(4-1BB)、GITR、B7-1/2、CD5、ICOS、OX40、CD40またはCD137抗体、およびラパマイシンなどのT細胞受容体(TCR)/CD3活性化因子とともに培養される。
本発明のいくつかの実施形態では、本明細書に記載されるCARの発現によって遺伝子改変されたT細胞はまた、ROR-C、FoxP3、Foxo1、T-betまたはGata3、c-MafまたはAhRなどの少なくとも1つの細胞内因子の発現によって遺伝子改変されていてもよい。いくつかの実施形態では、本発明の遺伝子組換え免疫細胞は、FoxP3を発現する。いくつかの実施形態では、本発明の遺伝子組換え免疫細胞は、Foxo1を発現する。
一実施形態では、本発明の遺伝子組換え免疫細胞は、同種異系Treg、Teff、メモリーT細胞、またはNKTもしくはMAIT細胞であり得る。例えば、同種異系T細胞は、機能的ヒト白血球抗原(HLA)、例えばHLAクラスIおよび/またはHLAクラスIIの発現を欠くT細胞であり得る。
一実施形態では、本明細書に記載されるT細胞は、その表面に機能的HLAを発現しないように操作することができる。例えば、本明細書に記載されるT細胞は、細胞表面発現HLA、例えばHLAクラス1および/またはHLAクラスIIまたは非古典的HLA分子がダウンレギュレートされるように操作することができる。
機能的TCRおよび/またはHLAの発現を欠く改変された免疫細胞は、TCRおよび/またはHLAの1つ以上のサブユニットのノックアウトまたはノックダウンを含む任意の好適な手段によって得ることができる。例えば、T細胞は、siRNA、shRNA、クラスター化して規則的な配置の短い回文配列リピート(CRISPR)転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼ(TALEN)、ジンクフィンガーエンドヌクレアーゼ(ZFN)、メガヌクレアーゼ(mn、ホーミングエンドヌクレアーゼとしても公知)、またはメガTAL(TALエフェクターをmn切断ドメインと組み合わせる)を使用したTCRおよび/またはHLAのノックダウンを含むことができる。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるCARをコードする核酸は、例えば、欠失される遺伝子の遺伝子座などの免疫細胞のゲノムの特定の遺伝子座に挿入される。いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるCARをコードする核酸は、TCRおよび/またはHLA遺伝子座内に挿入され、それによってTCRおよび/またはHLA発現の阻害をもたらす。
いくつかの実施形態では、TCRおよび/またはHLA発現は、T細胞においてTCRおよび/またはHLAをコードする核酸を標的とするsiRNAまたはshRNAを使用して阻害することができる。T細胞におけるsiRNAおよびshRNAの発現は、例えばレンチウイルス発現系などの任意の従来の発現系を使用して達成することができる。HLAクラスIおよび/またはHLAクラスII遺伝子の発現をダウンレギュレートする例示的なsiRNAおよびshRNAは、例えば、米国特許出願公開第2007/0036773号に記載されている。TCRの成分の発現をダウンレギュレートする例示的なshRNAは、例えば、米国特許出願公開第2012/0321667号に記載されている。
本明細書で使用される「CRISPR」または「TCRおよび/またはHLAに対するCRISPR」または「TCRおよび/またはHLAを阻害するCRISPR」は、クラスター化して規則的な配置の短い回文配列リピートのセット、またはそのようなリピートのセットを含む系を指す。本明細書で使用される「Cas」は、CRISPR関連タンパク質を指す。「CRISPR/Cas」系は、TCRおよび/またはHLA遺伝子をサイレンシングまたは突然変異させるために使用することができるCRISPRおよびCas由来の系を指す。
天然に存在するCRISPR/Cas系は、配列決定された真正細菌ゲノムの約40%および配列決定された古細菌の90%に見られる。例えば、Grissa et al.(BMC Bioinformatics 8:172(2007))を参照されたい。この系は、プラスミドおよびファージなどの外来遺伝要素に対する耐性を付与し、獲得免疫の形態を提供する原核生物免疫系の一種である。例えば、Barrangou et al.,Science 315:1709-1712(2007);Marragini et al.,Science 322:1843-1845(2008)を参照されたい。CRISPR/Cas系は、マウスまたは霊長類などの真核生物における遺伝子編集(特定の遺伝子のサイレンシング、増強または変化)での使用のために改変されている。例えば、Wiedenheft et al.,Nature 482:331-8(2012)を参照されたい。これは、特異的に設計されたCRISPRおよび1つ以上の適切なCasコード配列を含有するプラスミドを真核細胞に導入することによって成し遂げられる。CRISPR遺伝子座と呼ばれることもあるCRISPR配列は、交互のリピートおよびスペーサーを含む。天然に存在するCRISPRでは、スペーサーは通常、プラスミドまたはファージ配列などの細菌にとって外来の配列を含み、TCRおよび/またはHLA CRISPR/Cas系において、スペーサーは、TCRおよび/またはHLA遺伝子配列に由来する。CRISPR遺伝子座からのRNAは、Casタンパク質によって構成的に発現され、低分子RNAにプロセシングされる。これらは、反復配列の側面に位置するスペーサーを含む。RNAは、RNAまたはDNAレベルで外因性遺伝要素をサイレンシングするように他のCasタンパク質を誘導する。例えば、Horvath et al.,Science 327:167-170(2010);Makarova et al.,Biology Direct 1:7(2006)を参照されたい。したがって、スペーサーは、siRNAと同様に、RNA分子の鋳型として機能する。例えば、Pennisi,Science 341:833-836(2013)を参照されたい。したがって、CRISPR/Casシステムを使用して、TCRおよび/またはHLA遺伝子を編集する(塩基対を付加もしくは欠失させる)か、またはTCRおよび/もしくはHLAの発現を減少させる早期停止を導入することができる。CRISPR/Cas系は、代替的または追加的に、TCRおよび/またはHLA遺伝子を可逆的にオフにするRNA干渉のように使用することができる。例えば、哺乳動物細胞では、RNAは、Casタンパク質をTCRおよび/またはHLAプロモーターに導き、RNAポリメラーゼを立体的に遮断することができる。
当技術分野で公知の技術、例えば米国特許出願公開第2014/0068797号およびCong、Science 339:819-823(2013)に記載されている技術を使用して、TCRおよび/またはHLAを阻害する人工CRISPR/Cas系を生成することができる。当技術分野で公知の他の人工CRISPR/Cas系、例えば、Tsai,Nature Biotechnol.32:6569-576(2014)および米国特許第8,871,445号、同第8,865,406号、同第8,795,965号、同第8,771,945号および同第8,697,359号に記載されているものもまた、TCRおよび/またはHLAを阻害するために生成され得る。
「TALEN」または「TCRおよび/またはHLAに対するTALEN」または「TCRおよび/またはHLAを阻害するTALEN」は、転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼ、TCRおよび/またはHLA遺伝子を編集するために使用することができる人工ヌクレアーゼを指す。TALENは、TALエフェクターDNA結合ドメインをDNA切断ドメインに融合することによって人工的に産生される。転写活性化因子様エフェクター(TALE)は、TCRおよび/またはHLA遺伝子の一部を含む任意の所望のDNA配列に結合するように操作することができる。操作されたTALEをDNA切断ドメインと組み合わせることによって、TCRおよび/またはHLA配列を含む任意の所望のDNA配列に特異的な制限酵素を産生することができる。次いで、これらを細胞に導入することができ、それらは、ゲノム編集に使用することができる。例えば、Boch,Nature Biotech.29:135-6(2011);Boch et al.,Science 326:1509-12(2009);およびMoscou et al.,Science 326:3501(2009)を参照されたい。
TALEは、キサントモナス細菌によって分泌されるタンパク質である。DNA結合ドメインは、12番目および13番目のアミノ酸を除いて高度に保存された33~34反復アミノ酸配列を含有する。これらの2つの位置は、非常に可変的であり、特異的ヌクレオチド認識との強い相関を示す。したがって、それらは、所望のDNA配列に結合するように操作することができる。TALENを産生するために、TALEタンパク質は、野生型または突然変異型のフォックルエンドヌクレアーゼであるヌクレアーゼ(N)に融合される。TALENでの使用のために、Foklに対するいくつかの突然変異が行われ、これらは、例えば、切断特異性または活性を改善する。例えば、Cermak et al.,Nucl.Acids Res.39:e82(2011);Miller et al.,Nature Biotech.29:143-8(2011);Hockemeyer et al.,Nature Biotech.29:731-734(2011);Wood et al.,Science 333:307(2011);Doyon et al.,Nature Methods 8:74-79(2010);Szczepek et al.,Nature Biotech.25:786-793(2007);およびGuo et al.,J.Mol.Biol.200:96(2010)を参照されたい。Foklドメインは、二量体として機能し、適正な配向および間隔を有する標的ゲノム内の部位に固有のDNA結合ドメインを有する2つの構築物を必要とする。TALE DNA結合ドメインとFokl切断ドメインとの間のアミノ酸残基の数、および2つの個々のTALEN結合部位の間の塩基の数の両方が、高レベルの活性を達成するための重要なパラメータであるようである(Miller et al.,Nature Biotech.29:143-8(2011))。TCRおよび/またはHLATALENを細胞内部で使用して、二本鎖切断(DSB)を産生することができる。修復機構が非相同末端結合を介して破壊を不適切に修復する場合、破壊部位に突然変異を導入することができる。例えば、不適切な修復は、フレームシフト突然変異を導入し得る。あるいは、TALENとともに外来DNAを細胞に導入することができ、外来DNAおよび染色体配列の配列に応じて、このプロセスを使用して、TCRおよび/もしくはHLA遺伝子の欠陥を修正するか、またはそのような欠陥をwt HLA遺伝子に導入して、TCRおよび/もしくはHLAの発現を減少させることができる。TCRおよび/またはHLAの配列に特異的なTALENは、モジュール構成要素を使用する様々なスキームを含む、当技術分野で公知の任意の方法を使用して構築することができる(Zhang et al.,Nature Biotech.29:149-53(2011);Geibler et al.,PLoS ONE 6:el9509(2011))。
「ZFN」または「ジンクフィンガーヌクレアーゼ」または「TCRおよび/またはHLAに対するZFN」または「TCRおよび/またはHLAを阻害するZFN」は、ジンクフィンガーヌクレアーゼ、TCRおよび/またはHLA遺伝子を編集するために使用することができる人工ヌクレアーゼを指す。TALENと同様に、ZFNは、DNA結合ドメインに融合したFoklヌクレアーゼドメイン(またはその誘導体)を含む。ZFNの場合、DNA結合ドメインは、1つ以上のジンクフィンガーを含む。例えば、Carroll et al.,Genetics Society of America 188:773-782(2011);およびKim et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 93:1156-1160(1996)を参照されたい。ジンクフィンガーは、1つ以上の亜鉛イオンによって安定化された小さなタンパク質構造モチーフである。ジンクフィンガーは、例えばCysHisを含むことができ、約3bpの配列を認識することができる。約6、9、12、15または18bpの配列を認識するマルチフィンガーポリペプチドを産生するために、公知の特異性の様々なジンクフィンガーを組み合わせることができる。ファージディスプレイ、酵母1ハイブリッドシステム、細菌1ハイブリッドおよび2ハイブリッドシステム、ならびに哺乳動物細胞を含む、特定の配列を認識するジンクフィンガー(およびそれらの組み合わせ)を生成するための様々な選択およびモジュール式アセンブリ技術が利用可能である。
TALENと同様に、ZFNは、DNAを切断するために二量体化しなければならない。したがって、非パリンドロームDNA部位を標的とするには、一対のZFNが必要である。2つの個々のZFNは、それらのヌクレアーゼが適正に離間した状態でDNAの反対鎖に結合しなければならない(Bitinaite et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 95:10570-5(1998))。また、TALENと同様に、ZFNは、DNAに二本鎖切断を生じさせることができ、不適切に修復された場合、フレームシフト突然変異を生じさせ、細胞におけるTCRおよび/またはHLAの発現および量の減少をもたらすことができる。ZFNを相同組換えとともに使用して、TCRおよび/またはHLA遺伝子を突然変異させることもできる。TCRおよび/またはHLAの配列に特異的なZFNは、当技術分野で公知の任意の方法を使用して構築することができる。例えば、Provasi,Nature Med.18:807-815(2011);Torikai,Blood 122:1341-1349(2013);Cathomen et al.,Mol.Ther.16:1200-7(2008);Quo et al.,J.Mol.Biol.400:96(2010);ならびに米国特許出願公開第2011/0158957号および同第2012/0060230号を参照されたい。
「メガヌクレアーゼ」または「TCRおよび/またはHLAに対するメガヌクレアーゼ」または「TCRおよび/またはHLAを阻害するメガヌクレアーゼ」は、TCRおよび/またはHLA遺伝子を編集するために使用することができる大きな(>14塩基対)認識部位を有するモノマーエンドヌクレアーゼを指す。メガヌクレアーゼ(mn)は、細菌ホーミングエンドヌクレアーゼに由来し、ユニークな標的部位のために操作された自然ヌクレアーゼ活性を有する単量体タンパク質である。ホーミングエンドヌクレアーゼは、それらの宿主ゲノムの個々の遺伝子座で二本鎖切断を生成し、それによって部位特異的遺伝子変換事象を駆動することができるDNA切断酵素である(Stoddard,Structure 19(1):7-15(2011))。小さいサイズにもかかわらず、ホーミングエンドヌクレアーゼは、長いDNA配列(典型的には20~30個の塩基対)を認識する。ホーミングエンドヌクレアーゼは、非常に普及しており、微生物ならびにファージおよびウイルスに見られる。LAGLIDADGおよびHis-Cysボックス酵素(これらの酵素の最も配列特異的である)は、それらのDNA標的部位の主溝にドッキングする逆平行βシートに依存する(Flick et al.,Nature 394(6688):96-101(1998);Jurica et al.,Mol.Cell.2(4):469-76(1998)。そこで、それらは、複数の連続する塩基対にわたって不均一に分布する配列特異的および非特異的接触の集合を確立する(Chevalier et al.,J Mol Biol 329(2):253-269(2003);Scalley-Kim et al.,J Mol Biol.372(5):1305-19(2007)。
LAGLIDADGホーミングエンドヌクレアーゼ(LHE)ファミリーは、遺伝子ターゲティング用途に使用される操作された酵素の主要な供給源である。LHEファミリーは、主に古細菌内ならびに藻類および真菌の葉緑体およびミトコンドリアゲノムにコードされる(Chevalier et al.,in Homing Endonucleases and Inteins.Nucleic Acids and Molecular Biology,vol.16(2005);Dalgaard et al.,Nucleic Acids Res.25(22):4626-38(1997);Sethuraman et al.,Mol Biol Evol.26(10):2299-315(2009)。タンパク質鎖あたり単一の保存されたLAGLIDADGモチーフ(配列番号174)を有するメガヌクレアーゼは、パリンドロームDNA標的配列およびほぼパリンドロームDNA標的配列を切断するホモ二量体タンパク質を形成するが、タンパク質鎖あたり2つのそのようなモチーフを含有するメガヌクレアーゼは、完全に非対称なDNA配列を標的とすることができるより大きな擬似対称モノマーを形成する。
メガヌクレアーゼは、TCRおよび/またはHLAを標的とし、したがってDNAに二本鎖切断を生じさせるように操作することができ、これは、不適切に修復された場合にフレームシフト突然変異を生じさせ、細胞におけるTCRおよび/またはHLAの発現および量の減少をもたらし得る。
「MegaTAL」または「TCRおよび/またはHLAに対するmegaTAL」または「TCRおよび/またはHLAを阻害するためのmegaTAL」は、TCRおよび/またはHLA遺伝子を編集するために使用することができる人工ヌクレアーゼを指す。MegaTALは、LAGLIDADGホーミングエンドヌクレアーゼファミリーに由来するメガヌクレアーゼのN末端への最小TAL(転写活性化因子様)エフェクタードメインの融合によって得られるハイブリッドモノマーヌクレアーゼである(Boissel et al.,Nucleic Acids Res.42(4):2591-601(2014);Takeuchi et al,Methods Mol Biol.1239:105-32(2015))。したがって、MegaTALは、TALエフェクターDNA結合ドメインによって提供されるさらなる親和性および特異性を有する部位特異的メガヌクレアーゼ切断ヘッドからなる。
MegaTALは、TCRおよび/またはHLAを標的とし、したがってDNAに二本鎖切断を生じさせるように操作することができ、これは不適切に修復された場合にフレームシフト突然変異を生じさせ、細胞におけるTCRおよび/またはHLAの発現および量の減少をもたらし得る。
いくつかの実施形態では、テロメラーゼ遺伝子によるトランスフェクションは、T細胞のテロメアを長くし、患者におけるT細胞の持続性を改善することができる。例えば、June,Journal of Clinical Investigation 117:1466-1476(2007)を参照されたい。したがって、いくつかの実施形態では、本発明の遺伝子組換え免疫細胞は、テロメラーゼサブユニット、例えばテロメラーゼの触媒サブユニット、例えばTERT、例えばhTERTを異所性に発現する。いくつかの態様では、本開示は、細胞を、テロメラーゼサブユニット、例えばテロメラーゼの触媒サブユニット、例えばTERT、例えばhTERTをコードする核酸と接触させることを含む、本発明のキメラ受容体発現細胞を産生する方法を提供する。細胞を、キメラ受容体(例えば、本明細書中に記載されるCAR)をコードする構築物と接触させる前、接触させると同時に、または接触させた後に、核酸と接触させ得る。
本発明はさらに、本発明の免疫細胞を得るための方法に関し、前記方法は、少なくとも1つの免疫細胞に本明細書に記載されるCARをコードする核酸を形質導入し、任意選択で形質導入された細胞を拡大させることを含む。いくつかの実施形態では、方法は、エクスビボ法である。
一実施形態では、本発明の免疫細胞を得るための方法は、
-PBMC集団(例えば、白血球アフェレーシスによって回収される)からの免疫細胞の単離ステップと、
-本明細書で上記されるCARをコードする核酸配列が免疫細胞内に導入または移入される遺伝子改変ステップと、
-任意選択で、拡大ステップと、
-任意選択で、洗浄ステップと、
-任意選択で、凍結ステップと、を含む。
一実施形態では、遺伝子改変ステップは、遺伝子破壊ステップ、遺伝子修正ステップまたは遺伝子付加ステップ、好ましくは遺伝子付加ステップに対応する。一実施形態では、遺伝子改変ステップは、トランスフェクション、形質導入または遺伝子編集を含むが、これらに限定されない群から選択される方法によって実施される。
本発明において使用され得る遺伝子編集の方法の例には、操作されたヌクレアーゼに基づく方法、組換えアデノ随伴ウイルス(またはAAV)に基づく方法、トランスポゾンに基づく方法(例えば、スリーピングビューティートランスポゾンシステム)、相同組換えに基づく方法、部位特異的リコンビナーゼを使用した条件付きターゲティング(例えば、Cre-LoxPおよびFlp-FRT系)、ならびにマルチプレックス自動ゲノムエンジニアリング(MAGE)が含まれるが、これらに限定されない。
操作されたヌクレアーゼの非限定的な例には、クラスター化して規則的な配置の短い回文配列リピート(CRISPR)転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼ(TALEN)、ジンクフィンガーエンドヌクレアーゼ(ZFN)、メガヌクレアーゼ(mn、ホーミングエンドヌクレアーゼとしても公知)、またはメガTAL(TALエフェクターとmn切断ドメインとを組み合わせる)が含まれるが、これらに限定されない。
一実施形態では、本発明の免疫細胞を得るための方法は、
-PBMC集団(例えば、白血球アフェレーシスによって回収される)からの免疫細胞の単離ステップと、
-本明細書で上記されるCARをコードする核酸配列を含むベクターによる形質導入またはトランスフェクションステップと、
-任意選択で、拡大ステップと、
-任意選択で、洗浄ステップと、
-任意選択で、凍結ステップと、を含む。
本発明はさらに、本明細書に記載されるCARを発現する免疫細胞、およびそのような免疫細胞の集団に関する。
いくつかの実施形態では、本発明のCARをコードする核酸を免疫細胞に導入し、それによって細胞表面にCARを発現する操作された細胞を生成する。したがって、本発明はまた、本発明のCARをコードする核酸に関する。
いくつかの実施形態では、本発明の免疫細胞は、哺乳動物免疫細胞、例えばヒト免疫細胞、家畜(例えば、ウシ、ブタもしくはウマ)からの免疫細胞、またはペット(例えば、ネコもしくはイヌ)からの免疫細胞である。
いくつかの実施形態では、免疫細胞は、リンパ球、骨髄由来細胞およびそれらの任意の組み合わせからなる群から選択される。特定の実施形態では、免疫細胞は、例えば、T細胞、B細胞、ナチュラルキラー(NK)細胞およびそれらの任意の組み合わせからなる群から選択されるリンパ球である。特定の実施形態では、免疫細胞は、T細胞であり、これは、特定の実施形態では、CD4T細胞、CD8T細胞、γδ T細胞、二重陰性(DN)T細胞およびそれらの任意の組み合わせからなる群から選択される。特定の実施形態では、免疫細胞は、例えばTヘルパー細胞、調節性T細胞、エフェクターT細胞およびそれらの任意の組み合わせなどのCD4T細胞である。いくつかの実施形態では、免疫細胞は、例えば細胞傷害性CD8T細胞またはCD8調節性T細胞などのCD8T細胞である。いくつかの実施形態では、免疫細胞は、γδ T細胞である。いくつかの実施形態では、免疫細胞は、定義されたガンマデルタTCR(TEGγδ)細胞を発現するように操作されたT細胞である。いくつかの実施形態では、免疫細胞は、DNT細胞である。いくつかの実施形態では、免疫細胞は、NK細胞である。
いくつかの実施形態では、免疫細胞は、例えば細胞療法での使用に好適な任意の調節性免疫細胞などの調節性免疫細胞である。特定の実施形態では、調節性免疫細胞は、調節性T細胞、CD4調節性T細胞、CD8調節性T細胞、調節性γδ T細胞、調節性DNT細胞、調節性B細胞、調節性NK細胞、調節性マクロファージ、調節性樹状細胞およびそれらの任意の組み合わせからなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、調節性免疫細胞は、調節性T細胞(Treg)、特に胸腺由来Tregまたは適応型もしくは誘導型Tregである。特定の実施形態では、免疫細胞は、CD4調節性T細胞(Treg)である。一定の実施形態では、Tregは、胸腺由来Tregまたは適応型もしくは誘導型Tregである。特定の実施形態では、Tregは、CD4Foxp3調節性T細胞またはCD4FoxP3調節性T細胞(Tr1細胞)である。特定の実施形態では、免疫細胞は、CD4Foxp3調節性T細胞である。
いくつかの実施形態では、免疫細胞は、CD8調節性T細胞である。CD8調節性T細胞の例には、CD8CD28調節性T細胞、CD8CD103調節性T細胞、CD8Foxp3調節性T細胞、CD8CD122調節性T細胞およびそれらの任意の組み合わせが含まれるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、調節性免疫細胞は、調節性γδT細胞である。
いくつかの実施形態では、調節性免疫細胞は、調節性DNT細胞である。
いくつかの実施形態では、調節性免疫細胞は、調節性NK細胞である。
いくつかの実施形態では、免疫細胞は、例えば細胞療法での使用に好適な任意のエフェクター免疫細胞などのエフェクター免疫細胞である。特定の実施形態では、エフェクター免疫細胞は、エフェクターT細胞、CD4エフェクターT細胞、CD8エフェクターT細胞、エフェクターγδ T細胞、エフェクターDNT細胞、エフェクターNK細胞およびそれらの任意の組み合わせからなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、免疫細胞は、エフェクターT細胞である。特定の実施形態では、エフェクター免疫細胞は、CD4エフェクターT細胞である。CD4エフェクターT細胞の例には、Th1細胞、Th2細胞、Th9細胞、Th17細胞、Th22細胞、CD4T濾胞性ヘルパー(Tfh)細胞およびそれらの任意の組み合わせが含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、エフェクター免疫細胞は、CD8エフェクターT細胞である。CD8エフェクターT細胞の例には、CD8CD45ROCCR7CD62LエフェクターT細胞、CD8CD45RACCR7CD62LエフェクターT細胞およびそれらの任意の組み合わせが含まれるが、これらに限定されない。
一実施形態では、免疫細胞は、エフェクターγδT細胞である。
一実施形態では、免疫細胞は、エフェクターDNT細胞である。
いくつかの実施形態では、免疫細胞は、エフェクターNK細胞である。
いくつかの実施形態では、免疫細胞は、T細胞、ナチュラルキラー(NK)細胞、γδ T細胞、二重陰性(DN)細胞、調節性免疫細胞、調節性T細胞、エフェクター免疫細胞、エフェクターT細胞およびそれらの任意の組み合わせからなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、本発明のCARをコードする核酸は、ゲノム編集後にTreg細胞に分化する非Tregリンパ系細胞に導入される。編集された非Treg細胞は、上記のように患者に移植する前にTreg細胞に分化され得る。あるいは、編集された非Treg細胞は、患者に移植された後、Treg細胞に分化するように誘導され得る。
いくつかの実施形態では、分子の発現レベルは、フローサイトメトリー、免疫蛍光または画像分析、例えば高含有量分析によって決定される。特定の実施形態では、分子の発現レベルは、フローサイトメトリーによって決定される。特定の実施形態では、フローサイトメトリー分析を行う前に、細胞を固定し、透過処理し、それによって細胞内タンパク質の検出を可能にする。
いくつかの実施形態では、細胞集団中の分子の発現レベルを決定することは、分子を発現する細胞集団の細胞のパーセンテージ(すなわち、分子についての細胞「+」)を決定することを含む。特定の実施形態では、分子を発現する細胞の前記パーセンテージは、FACSによって測定される。
「発現する」、「陽性」または「+」および「発現しない」、「陰性」または「-」という用語は、当技術分野で周知であり、「+」に対応する細胞マーカーの発現レベルが高いまたは中間(「+/-」とも呼ばれる)であり、「-」に対応する細胞マーカーの発現レベルがゼロであるという点で、目的の細胞マーカーの発現レベルを指す。
「低」または「lo」または「lo/-」という用語は、当技術分野で周知であり、細胞マーカーの発現レベルが全体として分析されている細胞の集団におけるその細胞マーカーの発現レベルと比較して低いという点で、目的の細胞マーカーの発現レベルを指す。より具体的には、「lo」という用語は、1つ以上の他の異なる細胞集団よりも低いレベルで細胞マーカーを発現する異なる細胞集団を指す。
「高」または「hi」または「明るい」という用語は、当技術分野で周知であり、全体として分析されている細胞の集団における細胞マーカーの発現レベルと比較して細胞マーカーの発現レベルが高いという点で、目的の細胞マーカーの発現レベルを指す。
一般に、染色強度のトップ2、3、4または5%の細胞は、「hi」と示され、集団の上位半分に入るものは「+」として分類される。蛍光強度の50%を下回る細胞は、「lo」細胞と呼ばれ、5%を下回る細胞は、「-」細胞と示される。
目的の細胞マーカーの発現レベルは、このマーカーに特異的な蛍光標識抗体で染色した細胞集団からの細胞の中央蛍光強度または平均蛍光強度(MFI)を、無関係な特異性を有するが同じアイソタイプ、同じ蛍光プローブを有し、同じ種に起源がある蛍光標識抗体で染色した同じ細胞集団からの細胞の蛍光強度(FI)と比較することによって決定される(アイソタイプコントロールと呼ばれる)。このマーカーに特異的な蛍光標識抗体で染色され、アイソタイプコントロールで染色された細胞と同等のMFIまたはより低いMFIを示す集団からの細胞は、このマーカーを発現していないと見なされ、(-)または陰性と示される。このマーカーに特異的な蛍光標識抗体で染色され、アイソタイプコントロールで染色された細胞よりも優れたMFI値を示す集団からの細胞は、このマーカーを発現していると見なされ、(+)または陽性と示される。
本発明はまた、本明細書で定義される免疫細胞の単離されたおよび/または実質的に精製された集団に関する。
したがって、本発明は、免疫細胞の単離された集団および/または実質的に精製された集団を提供し、その集団の細胞は、本明細書中に記載されるようなCARを含む。
本明細書で使用される場合、「単離された集団」は、その天然環境(末梢血など)から取り出され、単離され、精製され、または分離され、それが天然に存在するが、それに基づいて細胞が単離された細胞表面マーカーを欠く他の細胞から少なくとも約75%遊離、80%遊離、85%遊離、および特定の実施形態では約90%、95%、96%、97%、98%、99%遊離している細胞集団を指す。
本発明はさらに、本明細書で定義される免疫細胞の濃縮集団に関する。
いくつかの実施形態では、本発明の単離された、精製された、および/または濃縮された免疫細胞集団は、凍結および解凍されている。
いくつかの実施形態では、本発明の調節性免疫細胞は、CD4CD25Foxp3Treg、Tr1細胞、TGF-β分泌Th3細胞、調節性NKT細胞、調節性γδ T細胞、調節性CD8T細胞および二重陰性調節性T細胞からなる群から選択され得る。
いくつかの実施形態では、免疫細胞は、自己細胞である。
いくつかの実施形態では、免疫細胞は、異種細胞である。
いくつかの実施形態では、免疫細胞は、同種異系細胞である。
いくつかの実施形態では、本発明の免疫細胞集団は、その細胞表面に本発明のCAR(本明細書では「第1の受容体」と呼ばれる)、およびヒトCD45RCとは異なる別のリガンドに結合する別の受容体(本明細書では「第2の受容体」と呼ばれる)を発現する。特定の実施形態では、第2の受容体は、例えば本明細書に記載されるように、細胞外リガンド結合ドメイン、任意選択でヒンジドメイン、少なくとも1つの膜貫通ドメインおよび少なくとも1つの細胞内シグナル伝達ドメインを含む。
いくつかの実施形態では、第2の受容体は、内因性である(例えば、内因性TCRなど)。いくつかの実施形態では、第2の受容体は、外因性であり、その発現は、それをコードする核酸の形質転換または形質導入によって本発明の免疫細胞集団において誘導される。前記外因性受容体は、外因性TCRまたはCARであり得る。したがって、いくつかの実施形態では、本発明の免疫細胞集団は、2つのCARを発現し、第1のCARは、ヒトCD45RCを認識し、第2のCARは、異なるリガンドを認識する。いくつかの実施形態では、本発明の免疫細胞集団は、2つのCARを発現し、第1のCARは、ヒトCD45RC上の第1のエピトープを認識し、第2のCARは、ヒトCD45RC上の第2の異なるエピトープを認識する。いくつかの実施形態では、本発明の免疫細胞集団は、2つのCARを発現し、第1のCARは、ヒトCD45RCを認識し、第2のCARは、第2の異なる抗原(例えば、ヒトCD45RCの抗原変異体など)を認識する。
いくつかの実施形態では、本発明のCARおよび第2の受容体(例えば、第2のCAR)の少なくとも1つは、誘導可能である、すなわち、細胞表面でのその発現は、誘導され得る。
いくつかの実施形態では、本発明のCARおよび第2の受容体(例えば、第2のCAR)の少なくとも1つの発現は、他方の受容体の活性化によって誘導される。特定の実施形態では、本発明のCARの発現は、第2の受容体の活性化によって誘導される。特定の実施形態では、第2の受容体の発現は、本発明のCARの活性化によって誘導される。誘導性CARは、例えば、Roybal et al(Cell,2006)などによって当技術分野で記載されている。
一実施形態では、本発明のCARは、第1の細胞内シグナル伝達ドメインを含み、第2の受容体は、異なる第2の細胞内シグナル伝達ドメインを含む。第1の実施形態では、本発明のCARは、T細胞一次シグナル伝達ドメイン(例えば、CD3ゼータなど)を含み、第2の受容体は、共刺激シグナル伝達ドメイン(例えば、4-1BB、CD28、または4-1BBおよびCD28の共刺激シグナル伝達ドメインの組み合わせなど)を含む。第2の実施形態では、本発明のCARは共刺激シグナル伝達ドメイン(例えば、4-1BB、CD28、または4-1BBおよびCD28の共刺激シグナル伝達ドメインの組み合わせなど)を含み、第2の受容体は、T細胞一次シグナル伝達ドメイン(例えば、CD3ゼータなど)を含む。
したがって、これらの実施形態によれば、本発明の免疫細胞集団の完全な活性化は、本発明のCARのヒトCD45RCへの結合および第2の受容体が向けられているリガンドへの第2の受容体の結合の両方を必要とする。
一実施形態では、第2の受容体によって認識されるリガンドは、疾患組織もしくは器官、または自己免疫応答の部位に発現または存在する。その結果、ヒトCD45RCを発現する細胞に対する抑制活性は、前記リガンドが存在し、免疫細胞集団の細胞上の第2の受容体によって認識される場合、疾患組織もしくは器官において、または自己免疫応答の部位においてのみ誘導されるであろう。
一実施形態では、本発明のキメラ受容体は、キメラ受容体によって認識されるヒトCD45RCとは異なるリガンドを認識する細胞外リガンド結合ドメインをさらに含む。一実施形態では、前記リガンド結合ドメインは、抗体またはその抗原結合フラグメントである。
一実施形態では、本発明のキメラ受容体は、ヒトCD45RC結合ドメインおよび前記ヒトCD45RCとは異なるリガンドを認識する別のリガンド結合ドメインを含む細胞外リガンド結合ドメインを含む。一実施形態では、前記リガンド結合ドメインは、ヒトCD45RCおよび異なるリガンドの両方を認識する二機能性抗体である。
本発明のさらなる目的は、本発明によるhCD45RCに結合する、CARを発現する単離されたT細胞集団を含む組成物である。
本発明のさらなる目的は、本発明によるhCD45RCへのCAR結合を発現する単離T細胞集団をコードする少なくとも1つの核酸を含む組成物である。
本発明のさらなる目的は、本発明によるhCD45RCに結合するCARを発現する単離T細胞集団をコードする少なくとも1つの核酸を含む少なくとも1つの発現ベクターを含む組成物である。
本発明のさらなる目的は、本発明によるhCD45RCに結合する、CARを発現する単離されたT細胞集団、および少なくとも1つの薬学的に許容される賦形剤を含む医薬組成物である。
本発明のさらなる目的は、本発明によるhCD45RCへのCAR結合を発現する単離されたT細胞集団をコードする少なくとも1つの核酸、および少なくとも1つの薬学的に許容される賦形剤を含む医薬組成物である。
本発明のさらなる目的は、本発明によるhCD45RCに結合するCARを発現する単離されたT細胞集団をコードする少なくとも1つの核酸、および少なくとも1つの薬学的に許容される賦形剤またはビヒクルを含む少なくとも1つの発現ベクターを含む医薬組成物である。
「薬学的に許容される賦形剤」という用語は、ありとあらゆる溶媒、分散媒、コーティング、抗菌剤および抗真菌剤、等張剤および吸収遅延剤などを含む。前記賦形剤は、動物、好ましくはヒトに投与した場合、有害なアレルギー反応または他の不都合な反応を生じない。ヒトへの投与のために、調製物は、例えばFDA OfficeまたはEMAなどの規制当局によって要求される無菌性、発熱原性、ならびに一般的な安全性および純度の基準を満たすべきである。
これらの組成物に使用され得る薬学的に許容され得る賦形剤には、イオン交換体、アルミナ、ステアリン酸アルミニウム、レシチン、血清タンパク質、例えばヒト血清アルブミン、緩衝物質、例えばリン酸塩、グリシン、ソルビン酸、ソルビン酸カリウム、飽和植物脂肪酸の部分グリセリド混合物、水、塩または電解質、例えば硫酸プロタミン、リン酸水素二ナトリウム、リン酸水素カリウム、塩化ナトリウム、亜鉛塩、コロイド状シリカ、三ケイ酸マグネシウム、ポリビニルピロリドン、細胞ロース系物質(例えば、カルボキシメチル細胞ロースナトリウム)、ポリエチレングリコール、ポリアクリレート、ワックス、ポリエチレン-ポリオキシプロピレン-ブロックポリマー、ポリエチレングリコールおよび羊毛脂が含まれるが、これらに限定されない。
一実施形態では、本発明による医薬組成物は、対象に注射することができる製剤に対して薬学的に許容されるビヒクルを含む。これらは、特に等張性の滅菌生理食塩水(リン酸一ナトリウムもしくは二ナトリウム、塩化ナトリウム、カリウム、カルシウムもしくはマグネシウムなど、またはそのような塩の混合物)、または場合に応じて滅菌水または生理食塩水を添加すると注射可能な溶液の構成を可能にする乾燥組成物、特に凍結乾燥組成物であり得る。
本発明のさらなる目的は、本発明によるhCD45RCに結合する、CARを発現する単離されたT細胞集団を含む医薬である。
本発明のさらなる目的は、本発明によるhCD45RCへのCAR結合を発現する単離されたT細胞集団をコードする少なくとも1つの核酸を含む医薬である。
本発明のさらなる目的は、本発明によるhCD45RCに結合するCARを発現する単離T細胞集団をコードする少なくとも1つの核酸を含む少なくとも1つの発現ベクターを含む医薬である。
本発明はさらに、本発明によるCAR、組成物または医薬組成物を発現する単離されたT細胞集団を投与することによって、それを必要とする対象において免疫寛容を誘導する方法に関する。それはまた、免疫寛容を誘導する際にそれを必要とする対象に使用するための、本発明によるCAR、組成物または医薬組成物を発現するT細胞集団に関する。
本明細書で使用される「免疫寛容」という用語は、他の物質または組織に対する免疫応答を維持しながら免疫応答を引き出す能力を有する特定の物質または組織に対する免疫系の不応答性の状態に関する。
本明細書で使用される「免疫応答」という用語は、T細胞媒介性および/またはB細胞媒介性の免疫応答を含む。例示的な免疫応答には、T細胞応答(例えば、サイトカイン産生および細胞傷害性)だけでなく、T細胞活性化(例えば、マクロファージ)によって間接的に影響を受ける免疫応答も含まれるが、これらに限定されない。免疫応答に関与する免疫細胞には、リンパ球(CD4、CD8、T1およびT2細胞を含むB細胞およびT細胞など)、抗原提示細胞(例えば、樹状細胞などのプロフェッショナル抗原提示細胞)、ナチュラルキラー細胞、骨髄系細胞(マクロファージ、好酸球、肥満細胞、好塩基球および顆粒球など)が含まれる。
本発明はさらに、本発明によるCAR、組成物、医薬組成物を発現する単離されたT細胞集団を投与することによって、それを必要とする対象においてCD45RChigh細胞を枯渇させる方法に関する。それはまた、CD45RChigh細胞を枯渇させる際に、それを必要とする対象に使用するための、本発明によるCAR、組成物、医薬組成物を発現する単離されたT細胞集団に関する。
hCD45RCの相対的な発現レベルは、サイトメトリーを使用して測定される。3つのタイプの細胞を区別することができる:高レベル、中間レベルまたは陰性レベルのhCD45RC発現を示す細胞。
一実施形態では、本発明によるCAR、組成物、医薬組成物を発現する単離されたT細胞集団は、CD45RChighT細胞を枯渇させる。
「CD45RChigh細胞抗原」または「CD45RChigh細胞表面マーカー」
本明細書で使用される場合、「CD45RChigh細胞抗原」または「CD45RChigh細胞表面マーカー」という用語は、それに結合する抗CD45RC剤(抗体またはアプタマーなど)で標的とすることができるCD45RChigh細胞(T細胞、B細胞およびナチュラルキラー(NK)細胞を含む)の表面に発現または提示される、配列番号23の配列の抗原(またはエピトープ)を指す。例示的なCD45RChighT細胞表面マーカーには、前述のCD45RCまたはT細胞の前記集団を特徴付ける他の抗原が含まれるが、これらに限定されない。特定の目的のCD45RChighT細胞表面マーカーは、哺乳動物の他の非CD45RChighT細胞と比較して、CD45RChighT細胞上に優先的に発現される。
次いで、上記のようにCD45RC細胞表面マーカーに対する抗体を育てた後、当業者は、CD45RChigh細胞に作用し、抗体依存性細胞媒介性細胞傷害(ADCC)、補体依存性細胞傷害(CDC)、または抗体の直接結合後のCD45RChighであるがCD45RClow/-細胞死ではない誘導(例えば、アポトーシスを介して)を介してCD45RChigh細胞を枯渇させるために使用することができる抗体を容易に選択することができる(Picarda et al.,2017.JCI Insight.2(3):e90088)。
「CD45RChighT細胞」は、上記に定義されるように、CD45RCマーカーを高レベルで発現するT細胞である。CD45RChighT細胞を枯渇させる本発明によるCAR、組成物、医薬組成物を発現する単離されたT細胞集団はまた、CD45RChighNK細胞またはCD45RChighB細胞などの他のタイプのCD45RChigh細胞を枯渇させることができることが当業者によって容易に理解される。
本明細書で使用される場合、CD45RCを発現する細胞に関して、「枯渇する」または「枯渇すること」という用語は、対象の細胞数の測定可能な減少を指す。低減は、少なくとも約10%、例えば、少なくとも約20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上であり得る。いくつかの実施形態では、この用語は、対象または試料中のCD45RChigh細胞の数が検出可能な限界未満の量まで減少することを指す。本発明によれば、CAR、組成物、医薬組成物を発現する単離されたT細胞集団は、CD45RCを強く発現するエフェクター細胞、特にCD45RChigheffとして設計されたエフェクター細胞の枯渇を特異的に媒介する。
特に、本発明によるCAR、組成物、医薬組成物を発現する前記単離されたT細胞集団は、hCD45RCに結合し、プロアポトーシスシグナルを伝達することによって、および/または抗体依存性細胞媒介性細胞傷害(ADCC)、補体依存性細胞傷害(CDC)もしくは抗体依存性食作用を活性化することによって、CD45RChighT細胞を枯渇させる。
いくつかの実施形態では、本発明によるCAR、組成物、医薬組成物を発現する単離されたT細胞集団は、補体依存性細胞傷害性を媒介する。
特定の実施形態では、本発明による単離されたCARは、細胞傷害剤または成長阻害剤にコンジュゲートされ得る。
本発明はさらに、本発明によるCAR、組成物、医薬組成物を発現する単離されたT細胞集団を投与することによって、それを必要とする対象において調節性T細胞を拡大および/または増強する方法に関する。本発明はまた、調節性T細胞を拡大および/または増強する際に、それを必要とする対象に使用するための本発明によるCAR、組成物、医薬組成物を発現する単離されたT細胞集団に関する。
本明細書で使用される場合、「拡大する」という用語は、所与の細胞集団(例えば、Tregなどの免疫細胞)を変換および/または増幅するプロセスを指す。細胞集団の拡大は、インビボ、インビトロまたはエクスビボで起こり得る。
本明細書で使用される場合、「増強する」という用語は、所与の細胞集団(例えば、Treg細胞の抑制能の増大)の機能を増加させるプロセスを指す。細胞集団の増強は、インビボ、インビトロまたはエクスビボで起こり得る。
「調節性T細胞」または「Treg」は、異常なまたは過剰な免疫応答を抑制し、免疫寛容において役割を果たすT細胞である。Tregは、典型的には「フォークヘッドボックスP3(Foxp3)調節性T細胞」および/または「CD45RClow/-細胞」である。
本明細書で使用される場合、「フォークヘッドボックスP3(Foxp3)調節性T細胞」および「CD45RClow/-細胞」という用語は、その特徴的なマーカーが転写因子Foxp3であるヒトおよびげっ歯類におけるCD4および/またはCD8T細胞の0.1~10%を指す。
一実施形態では、方法および使用は、Foxp3および/またはCD45RClow/-Tregを拡大および/または増強するためのものである。
一実施形態では、CD45RClow/-Tregは、刺激によって拡大される。一実施形態では、CD45RClow/-Tregは、IL-2およびIL-15の存在下での刺激によって拡大される。一実施形態では、CD45RClow/-Tregは、抗CD3/抗CD28抗体および/または同種抗原提示細胞(APC)および/または特異的抗原による刺激によって拡大される。
追加的または代替的に、本発明は、CD45RClow/-Tregを精製するインビトロまたはエクスビボ方法に関する。
一実施形態では、CD45RClow/-Tregは、CD8/CD4T細胞である。
一実施形態では、CD45RClow/-Tregは、CD8/CD4T細胞である。
一実施形態では、CD45RClow/-Tregは、CD8/CD4T細胞である。
一実施形態では、精製CD45RClow/-Tregは、それを必要とする対象への投与前、投与と同時に、または投与後にさらに拡大および/または増強することができる。
本発明はさらに、本発明によるCAR、組成物、医薬組成物を発現する単離されたT細胞集団をそれを必要とする対象に投与することによって、移植拒絶を予防および/または低減する方法に関する。それはまた、移植拒絶の予防および/または低減する際に、それを必要とする対象に使用するための本発明によるCAR、組成物、医薬組成物を発現する単離されたT細胞集団に関する。
「移植拒絶を予防すること」および「移植拒絶を低減すること」」という用語は、免疫移植拒絶の予防または阻害、および免疫移植拒絶の発症または進行の遅延を包含することを意味する。これらの用語はまた、対象における移植器官の生存の延長、または対象における移植器官の不全の食い止めを包含することを意味する。さらに、これらの用語は、例えば、間質性線維症、慢性移植動脈硬化症または血管炎などの免疫拒絶に関連する免疫学的合併症の改善を含む、免疫移植拒絶の症状の改善を包含することを意味する。
「移植」という用語およびその変形例は、移植器官(移植片とも呼ばれる)のレシピエントへの挿入を指し、移植は、同系(ドナーとレシピエントとが遺伝的に同一である場合)、同種(ドナーとレシピエントとが異なる遺伝的起源であるが同じ種である場合)、または異種(ドナーとレシピエントとが異なる種からのものである場合)である。したがって、典型的なシナリオでは、宿主は、ヒトであり、移植片は、同じまたは異なる遺伝的起源のヒトに由来する同種移植片である。別のシナリオでは、移植片は、系統発生的に広く分離された種からの動物、例えば、ヒト宿主に移植されているヒヒの心臓を含む、移植片が移植される種とは異なる種に由来する。
本明細書で使用される「移植拒絶」という用語は、急性および慢性の両方の移植拒絶を包含する。
「急性拒絶」は、移植された組織が免疫学的に外来性である場合の組織移植レシピエントの免疫系による拒絶である。急性拒絶は、そのエフェクター機能を実施し、移植組織を破壊するレシピエントの免疫細胞による移植組織の浸潤によって特徴付けられる。急性拒絶の発症は、急速であり、一般にヒトでは移植手術後数週間以内に起こる。一般に、急性拒絶は、ラパマイシン、シクロスポリン、抗CD40Lモノクローナル抗体などの免疫抑制薬で阻害または抑制することができる。
「慢性拒絶」は、一般に、急性拒絶の免疫抑制の成功の存在下であっても、生着後数ヶ月~数年以内にヒトにおいて起こる。線維化は、あらゆるタイプの臓器移植の慢性拒絶における一般的な因子である。
一実施形態では、移植拒絶は、同種移植拒絶である。したがって、一実施形態では、移植器官のドナーは、ヒトである。移植器官のドナーは、生体ドナーまたは死亡ドナー、すなわち死後ドナーであり得る。
一実施形態では、移植器官は、臓器、組織または細胞である。
本明細書で使用される場合、「器官」という用語は、生物内で特定の機能または機能群を実行する固体の血管新生器官を指す。臓器という用語には、心臓、肺、腎臓、肝臓、膵臓、皮膚、子宮、骨、軟骨、小腸または大腸、膀胱、脳、乳房、血管、食道、卵管、胆嚢、卵巣、膵臓、前立腺、胎盤、脊髄、上下を含む四肢、脾臓、胃、精巣、胸腺、甲状腺、気管、尿管、尿道、子宮が含まれるが、これらに限定されない。
本明細書で使用される場合、「組織」という用語は、ヒトまたは動物の任意の種類の組織を指し、血管組織、皮膚組織、肝臓組織、膵臓組織、神経組織、泌尿生殖組織、胃腸組織、骨および軟骨を含む骨格組織、脂肪組織、腱および靭帯を含む結合組織、羊膜組織、絨毛膜組織、硬膜、周皮、筋肉組織、腺組織、顔組織、眼組織を含むが、これらに限定されない。
本明細書で使用される場合、「細胞」という用語は、目的の細胞が濃縮された組成物、好ましくは前記細胞の少なくとも30%、好ましくは少なくとも50%、さらにより好ましくは少なくとも65%を含む組成物を指す。
一実施形態では、「細胞」は、骨髄、末梢血または臍帯血に由来する多能性造血幹細胞、または心筋細胞、β-膵臓細胞、肝細胞、ニューロンなどを含むが、これらに限定されない異なる細胞系統の多能性(すなわち、胚性幹細胞[ES]もしくは人工多能性幹細胞[iPS])もしくは多能性幹細胞由来分化細胞を含むか、またはそれからなる群から選択される。
移植が同種造血幹細胞移植(HSCT)である一実施形態では、「細胞」は、通常骨髄、末梢血または臍帯血に由来する多能性造血幹細胞を含むか、またはそれからなる群から選択される。
「HSCT」または「造血幹細胞移植」は、白血病およびリンパ腫(急性骨髄性白血病(AML)、急性リンパ性白血病(ALL)、慢性骨髄性白血病(CML)、骨髄異形成症候群(MDS)、骨髄増殖性症候群、ホジキンリンパ腫、非ホジキンリンパ腫、慢性リンパ性白血病(CLL)および多発性骨髄腫を含むが、これらに限定されない)に罹患した患者に治癒的であり得る移植療法である。しかしながら、同種HSCTの重要な制限は、移植片対宿主病(GVHD)の発症であり、これは、この治療を受けたヒトの約30~50%において重篤な形態で起こる。
したがって、一実施形態では、本発明によるCAR、組成物、医薬組成物を発現する単離されたT細胞集団は、GVHDを予防および/または低減するために使用される。
さらなる実施形態では、本発明によるCAR、組成物、医薬組成物を発現する単離されたT細胞集団は、白血病ならびに/またはリンパ腫(急性骨髄性白血病(AML)、急性リンパ性白血病(ALL)、慢性骨髄性白血病(CML)、骨髄異形成症候群(MDS)、骨髄増殖性症候群、ホジキンリンパ腫、非ホジキンリンパ腫、慢性リンパ性白血病(CLL)および多発性骨髄腫を含むが、これらに限定されない)を予防および/または治療するために多能性造血幹細胞と組み合わせて使用され得る。
追加的または代替的に、本発明によるCAR、組成物、医薬組成物を発現する単離されたT細胞集団は、移植片操作のために使用され得る。
一実施形態では、グラフトされる移植片は、CD45RChigh細胞を枯渇させるために、移植前に本発明によるCAR、組成物、医薬組成物を発現する単離されたT細胞集団で処理される。
好ましい実施形態では、移植器官は、骨髄であり、CD45RChighT細胞を枯渇させるために、移植前に本発明によるCAR、組成物、医薬組成物を発現する単離されたT細胞集団で処置される。一実施形態では、骨髄は、CD45RChighT細胞およびCD45RClow/-T細胞を含有するCD34細胞を含む。
本発明はさらに、本発明によるCAR、組成物、医薬組成物を発現する単離されたT細胞集団をそれを必要とする対象に投与することによって、hCD45RChigh関連の疾患、障害または状態を予防、低減および/または治療する方法に関する。本発明はまた、hCD45RChigh関連疾患、障害または状態の予防および/または治療に使用するための、本発明によるCAR、組成物、医薬組成物を発現する単離されたT細胞集団に関する。
本明細書で使用される場合、「hCD45RChigh関連の疾患、障害または状態」という用語は、対象においてhCD45RC細胞を発現する細胞の割合の増加および/または対象の細胞におけるhCD45RCの発現レベルの増加によって引き起こされるか、または増強される疾患、障害もしくは状態を指す。
「対象におけるCD45RChigh細胞の割合の増加」とは、例えば、実質的に健康な対象におけるCD45RChigh細胞の数など、基準と比較した場合の所与の対象におけるCD45RCを発現する細胞(すなわち、CD45RChigh細胞)の数の約5%、好ましくは約10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、60%、70%、80%、90%、100%以上の増加を意味する。
「対象の細胞におけるhCD45RCの発現レベルの増加」とは、例えば、実質的に健康な対象の細胞におけるhCD45RCの発現レベルなど、基準と比較した場合の所与の対象の細胞における、mRNAレベルであろうとタンパク質レベルであろうとなかろうと、hCD45RCの発現レベルの約5%、好ましくは約10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、60%、70%、80%、90%、100%以上の増加を意味する。
一実施形態では、hCD45RChigh関連疾患、障害または状態は、自己免疫疾患、望ましくない免疫応答、単原性疾患およびリンパ腫または癌を含むか、またはそれらからなる群から選択される。
一実施形態では、hCD45RChigh関連疾患、障害または状態は、自己免疫疾患、望ましくない免疫応答および単一遺伝子疾患を含むか、またはそれらからなる群から選択される。
本明細書で使用される場合、「自己免疫疾患」という用語は、免疫系が正常な宿主の一部である抗原(すなわち自己抗原)に対して免疫応答(例えば、B細胞応答またはT細胞応答)を生じ、その結果、組織が損傷する疾患を指す。自己免疫疾患では、宿主の免疫系が特定の抗原を「自己」として認識することができず、免疫反応が抗原を発現する宿主の組織に対して高められる。
本発明で企図される例示的な自己免疫疾患には、関節リウマチ、若年性関節炎、コラーゲン誘発性関節炎、アジュバント誘発性関節炎、シェーグレン症候群、多発性硬化症、実験的自己免疫性脳脊髄炎、炎症性腸疾患(クローン病および潰瘍性大腸炎を含む)、自己免疫性胃萎縮症、尋常性天疱瘡、乾癬、白斑、1型糖尿病、非肥満性糖尿病、重症筋無力症、グレーブス病、橋本甲状腺炎、硬化性胆管炎、硬化性唾液腺炎、全身性エリテマトーデス、自己免疫性血小板減少症紫斑病、グッドパスチャー症候群、アジソン病、全身性硬化症、多発性筋炎、皮膚筋炎、後天性血友病、血栓性紫斑病、ブドウ膜炎、IgG4関連自己免疫疾患(例えば、表が参照により組み込まれるKlegerら、2015.Dtsch Arztebl Int.112(8):128-135の表1に記載されている疾患など)などが含まれるが、これらに限定されない。
好ましい実施形態では、自己免疫疾患は、全身性エリテマトーデスである。
好ましい実施形態では、自己免疫疾患は、クローン病および潰瘍性大腸炎を含む炎症性腸疾患である。好ましい実施形態では、自己免疫疾患は、クローン病である。好ましい実施形態では、自己免疫疾患は、潰瘍性大腸炎である。
本明細書で使用される場合、「望ましくない免疫応答」という用語は、任意の望ましくない免疫反応、好ましくは(i)遺伝子治療の過程で発現されるタンパク質、(ii)遺伝子治療の過程で使用されるベクター(例えばウイルスベクターなど)および/または(iii)治療用タンパク質を対象とする任意の望ましくない免疫反応を指す。そのようなタンパク質には、例えば、第VIII因子(血友病A)および他の凝固因子、酵素補充療法、モノクローナル抗体(例えば、ナタリズマブ、リツキシマブ、インフリキシマブ)、ポリクローナル抗体、酵素およびサイトカイン(例えば、IFNβ)が含まれる。「望ましくない免疫応答」という用語はまた、アレルギーおよびアレルギー反応を指す。
一実施形態では、本発明によるCAR、組成物、医薬組成物を発現する単離されたT細胞集団は、免疫応答を抑制するために、特に対応する遺伝的欠損を有する対象において遺伝子療法によって発現が回復した場合に特定のタンパク質に対する免疫反応を予防するために、対象に投与され得る。したがって、本発明によるCAR、組成物、医薬組成物を発現する単離されたT細胞集団は、突然変異のために対象に通常存在しないタンパク質に対する免疫反応性を予防するために使用され得るが、その再構成は、遺伝子療法によって達成される。さらに、タンパク質療法は、より普及しつつある医学的革新の一分野であり、酵素、抗体またはサイトカインなどのタンパク質を治療製品として直接対象に適用することを伴う。そのような医薬の送達における主要な障害のうちの1つは、治療用タンパク質自体に対する免疫応答を伴う。タンパク質ベースの治療薬の投与は、免疫抑制剤の投与を伴うことが多く、免疫抑制剤は、タンパク質のより長い寿命、したがって生物の細胞および組織へのタンパク質の取り込みの増加を促進するために使用される。しかしながら、一般的な免疫抑制剤は、実施される免疫抑制の非特異的な性質のために不利であり得、患者において望ましくない副作用をもたらす。したがって、このアプローチは、患者に投与される治療用抗体、サイトカイン、酵素または任意の他のタンパク質などの治療用タンパク質およびペプチドに対する免疫応答を抑制するために適用することができる。
一実施形態では、本発明によるCAR、組成物、医薬組成物を発現する単離されたT細胞集団は、免疫応答を抑制するために、特に遺伝子療法に使用されるベクター、特に遺伝子療法に使用されるウイルスベクターに対する免疫反応を予防するために、対象に投与され得る。そのようなウイルスベクターには、例えば、アデノ随伴ウイルス(AAV)ベクター、アデノウイルス(Ad)ベクター、レンチウイルスベクターなどが含まれる。総説については、Nayak&Herzog、2010.Gene Ther.17(3):295-304を参照されたい。
本明細書で使用される場合、「アレルギー(allergy)」または「アレルギー(allergies)」という用語は、免疫系の不適切な反応を指す。アレルゲンとして公知の通常は無害な環境物質に対してアレルギー反応が起こり、これらの反応は、獲得され、予測可能であり、迅速である。厳密には、アレルギーは、過敏症の4つの形態のうちの1つであり、I型(または即時型)過敏症と呼ばれる。それは、IgEとして公知の抗体の一種による肥満細胞および好塩基球と呼ばれる特定の白血球の過剰な活性化によって特徴付けられ、極端な炎症反応をもたらす。一般的なアレルギー反応には、湿疹、蕁麻疹、花粉症、喘息、食物アレルギー、ならびにスズメバチおよびハチなどの刺す昆虫の毒液に対する反応が含まれる。
本明細書で使用される「単遺伝子性疾患」という用語は、以下の遺伝子の中から選択される単一の遺伝子の突然変異に起因する疾患を指す:
(i)免疫機能に関連しないが、その欠損が炎症および/または免疫反応に関連する遺伝子、例えば以下の疾患で欠損している遺伝子:デュシェンヌ型筋ジストロフィー(DMD)、嚢胞性線維症、リソソーム病およびα1-抗トリプシン欠損症、ならびに
(ii)免疫系に関与し、その欠損が炎症および/または自己免疫反応を生じさせる遺伝子、例えば以下の疾患で欠損している遺伝子:IPEX(免疫調節異常多腺性内分泌不全症・腸症・X連鎖症候群)などのT細胞原発性免疫不全、APECED(自己免疫性多腺性内分泌不全症・カンジダ症・外胚葉ジストロフィー)、B細胞原発性免疫不全、マックル・ウェルズ症候群、自己炎症性・自己免疫混合症候群、NLRP12関連遺伝性周期性発熱症候群、および腫瘍壊死因子受容体1関連周期性症候群。
好ましい実施形態では、自己免疫疾患は、APECED(自己免疫性多腺性内分泌不全症・カンジダ症・外胚葉ジストロフィー)である。
好ましい実施形態では、自己免疫疾患は、デュシェンヌ型筋ジストロフィー(DMD)である。
本明細書で使用される「リンパ腫または癌」という用語は、CD45RChigh細胞に関連するリンパ腫または癌を包含する。CD45RChigh細胞に関連する例示的なリンパ腫または癌には、急性骨髄性白血病(AML)、急性リンパ性白血病(ALL)、慢性骨髄性白血病(CML)、骨髄異形成症候群(MDS)/骨髄増殖性症候群、リンパ腫(例えば、ホジキンリンパ腫および非ホジキンリンパ腫など)、慢性リンパ性白血病(CLL)ならびに多発性骨髄腫が含まれるが、これらに限定されない。
したがって、本発明は、それを必要とする対象においてCD45RChigh細胞を枯渇させ、それによって調節性T細胞、好ましくはFoxp3および/もしくはCD45RClowTregを消費および/もしくは増強し、それによって移植拒絶を予防および/もしくは低減する、または本発明によるCAR、組成物、医薬組成物を発現するT細胞集団を投与することによって、hCD45RChigh関連の疾患、障害もしくは状態を予防、低減および/もしくは治療する方法に関する。
好ましい実施形態では、hCD45RChigh関連疾患、障害または状態は、全身性エリテマトーデス、炎症性腸疾患(クローン病および潰瘍性大腸炎を含む)、APECED(自己免疫性多腺性内分泌不全症・カンジダ症・外胚葉ジストロフィー)またはデュシェンヌ型筋ジストロフィー(DMD)である。
好ましい実施形態では、hCD45RChigh関連疾患、障害または状態は、全身性エリテマトーデス、炎症性腸疾患(クローン病および潰瘍性大腸炎を含む)、またはAPECED(自己免疫性多腺性内分泌不全症・カンジダ症・外胚葉ジストロフィー)である。
それはまた、それを必要とする対象においてCD45RChigh細胞を枯渇させ、それによって調節性T細胞、好ましくはFoxp3および/もしくはCD45RClowTregを消費および/もしくは増強し、それによって移植拒絶を予防および/もしくは低減するか、またはhCD45RChigh関連疾患、障害もしくは状態を予防、低減および/もしくは治療するのに使用するための本発明によるCAR、組成物、医薬組成物を発現するT細胞集団に関する。
本発明のCAR操作免疫細胞は、単独で、または本明細書中に記載される医薬組成物(例えば、希釈剤および/またはIL-2もしくは他のサイトカインもしくは細胞集団を含むが、これらに限定されない他の成分と組み合わせて)として投与され得る。
本発明の医薬組成物は、エアロゾル吸入、注射、摂取、輸血、インプランテーションまたは移植を含む任意の好適な方法で対象に投与され得る。いくつかの実施形態では、本明細書に記載される医薬組成物は、非経口投与によって対象に投与され得る。特定の実施形態では、本明細書中に記載される医薬組成物は、対象に皮下、皮内、腫瘍内、結節内、髄内、筋肉内、胸骨内、静脈内(i.v.)注射、注入技術または腹腔内投与され得る。特定の実施形態では、本発明のCAR改変免疫細胞組成物は、皮内または皮下注射によって対象に投与され得る。いくつかの実施形態では、本発明のCAR改変免疫細胞組成物は、i.v.注射によって投与され得る。いくつかの実施形態では、CAR改変免疫細胞の組成物は、リンパ節、感染部位、炎症部位または組織もしくは臓器拒絶部位に直接注射され得る。いくつかの実施形態では、CAR改変免疫細胞の組成物は、自己免疫疾患および/または炎症性疾患の部位に直接注射され得る。
いくつかの実施形態では、対象は、自己細胞が投与される(または投与されることになる)。
いくつかの実施形態では、対象は、同種異系細胞が投与される(または投与されることになる)。
いくつかの実施形態では、対象は、哺乳動物であり得る。特定の実施形態では、対象は、ヒトであり得る。
本発明の医薬組成物は、予防または治療される疾患に適切な方法で投与され得る。投与の量および頻度は、対象の状態ならびに対象の疾患の種類および重症度などの要因によって決定されるが、適切な投与量は、臨床試験によって決定され得る。
「有効量」または「治療量」が示される場合、投与される本発明の組成物の正確な量は、対象の年齢、体重、抗体価および状態の個体差を考慮して決定され得る。本明細書中に記載されるようなCAR操作された免疫細胞を含む医薬組成物は、これらの範囲内のすべての整数値を含む少なくとも1×10、1×10、1×10、1×10、1×10、1×10、1×10もしくは1×10細胞/kg体重、または1×10~100×10細胞/kg体重の投与量で投与され得ると一般に述べることができる。CAR操作免疫細胞組成物はまた、これらの投与量のいずれかまたはそれらの任意の組み合わせで複数回投与され得る。CAR操作された免疫細胞は、免疫療法において一般に公知である注入技術を使用することによって投与することができる。特定の対象に対する最適な投与量および治療レジメンは、疾患の徴候について対象をモニタリングし、それに応じて治療を調整することによって容易に決定することができる。
一実施形態では、本発明によるCAR、組成物または医薬組成物を発現する単離された免疫細胞集団は、治療薬の前、治療薬と同時に、または治療薬の後に投与されるべきである。
いくつかの実施形態では、本発明のCAR操作された免疫細胞は、免疫抑制剤、細胞毒素、化学療法剤、サイトカイン、免疫刺激剤、溶解性ペプチドおよび放射性同位体などの薬剤による治療を含むが、これらに限定されない任意の数の関連する治療様式と併せて(例えば、前に、同時に、または後に)対象に投与され得る。
本発明によるCAR、組成物、医薬組成物を発現する単離されたT細胞集団と、本明細書に列挙されるものの中から選定され得るが、これらに限定されない特定の治療薬との同時投与は、予防および/または治療される疾患または状態に依存することが当業者によって理解されるであろう。
免疫抑制剤の例には、例えば、シロリムス、エベロリムス、リダフォロリムス、テムシロリムス、ウミロリムスおよびゾタロリムスなどのmTOR阻害剤;例えば、アナキンラなどのIL-1受容体アンタゴニスト;例えば、アザチオプリン、レフルノミド、メトトレキサート、ミコフェノール酸およびテリフルノミドなどの代謝拮抗剤;例えば、アプレミラスト、レナリドマイド、ポマリドマイドおよびサリドマイドなどのIMiD;ならびに例えば、エクリズマブ、アダリムマブ、アベリモマブ、セルトリズマブペゴール、ゴリムマブ、インフリキシマブ、ネレモマブ、メポリズマブ、オマリズマブ、ファラリモマブ、エルシリモマブ、レブリキズマブ、ウステキヌマブ、セキヌマブ、ムロモナブ-CD3、オテリキシズマブ、テプリズマブ、ビシリズマブ、クレノリキシマブ、ケリキシマブ、ザノリムマブ、エファリズマブ、エルリズマブ、オビヌツズマブ、リツキシマブ、オクレリズマブ、パスコリズマブ、ゴミリキシマブ、ルミリキシマブ、テネリキシマブ、トラリズマブ、アセリズマブ、ガリキシマブ、ガビリモマブ、ルプリズマブ、ベリムマブ、ブリシビモド、イピリムマブ、トレメリムマブ、ベルチリムマブ、レルデリムマブ、メテリムマブ、ナタリズマブ、トシリズマブ、オデュリモマブ、バシリキシマブ、ダクリズマブ、イノリモマブ、ゾリモマブアリトックス、アトロリムマブ、セデリズマブ、フォントリズマブ、マスリモマブ、モロリムマブ、ペキセリズマブ、レスリズマブ、ロベリズマブ、シプリズマブ、タリズマブ、テリモマブアリトックス、バパリキシマブ、ベパリモマブ、アバタセプト、ベラタセプト、エタネルセプト、ペグスネルセプト、アフリベルセプト、アレファセプトおよびリロナセプトなどの抗体が含まれるが、これらに限定されない。
細胞毒の例には、放射性核種(例えば、35S、14C、32P、125I、131I、90Y、89Zr、201Tl、186Re、188Re、57Cu、213Bi、211At)、複合放射性核種および化学療法剤が含まれるが、これらに限定されない。細胞毒のさらなる例には、代謝拮抗物質(例えば、5-フルオロウリシル(5-FU)、メトトレキサート(MTX)、フルダラビンなど)、抗微小管剤(例えば、ビンクリスチン、ビンブラスチン、コルヒチン、タキサン(パクリタキ細胞およびドセタキ細胞など)など)、アルキル化剤(例えば、シクロホスファミド、メルファラン、ビスクロロエチルニトロソウレア(BCNU)など)、白金剤(例えば、シスプラチン(cDDPとも称される)、カルボプラチン、オキサリプラチン、JM-216、CI-973など)、アントラサイクリン(例えば、ドキソルビシン、ダウノルビシンなど)、抗生物質剤(例えば、マイトマイシン-C)、トポイソメラーゼ阻害剤(例えば、エトポシド、テノポシドおよびカンプトテシン)、またはリシン、ジフテリア毒素(DT)、シュードモナス外毒素(PE)A、PE40、アブリン、サポリン、アメリカヤマゴボウウイルスタンパク質、臭化エチジウム、グルココルチコイド、炭疽毒素などの他の細胞毒性剤などが含まれるが、これらに限定されない。
化学療法剤の例には、白金配位化合物(例えば、シスプラチン、カルボプラチンまたはオキサリプラチンなど);タキサン化合物(例えば、パクリタキ細胞またはドセタキ細胞など);トポイソメラーゼI阻害剤(例えば、イリノテカンまたはトポテカンなど);トポイソメラーゼII阻害剤(例えば、エトポシドまたはテニポシドなど);ビンカアルカロイド(例えば、ビンブラスチン、ビンクリスチンまたはビノレルビンなど);抗腫瘍ヌクレオシド誘導体(例えば、5-フルオロウラシル、ゲムシタビンまたはカペシタビンなど);アルキル化剤(例えば、ナイトロジェンマスタードまたはニトロソウレア、シクロホスファミド、クロラムブシル、カルムスチンまたはロムスチンなど;抗腫瘍アントラサイクリン誘導体(例えば、ダウノルビシン、ドキソルビシン、イダルビシンまたはミトキサントロンなど);抗HER2抗体(例えば、トラスツズマブなど);エストロゲン受容体アンタゴニストまたは選択的エストロゲン受容体モジュレーター(例えば、タモキシフェン、トレミフェン、ドロロキシフェン、ファスロデックスまたはラロキシフェンなど);アロマターゼ阻害剤(例えば、エキセメスタン、アナストロゾール、レトラゾールまたはボロゾールなど);分化誘導剤(例えば、レチノイド、ビタミンDおよびアキュタンなどのレチノイン酸代謝阻害剤[RAMBA]など);DNAメチルトランスフェラーゼ阻害剤(例えば、アザシチジンなど);キナーゼ阻害剤(例えば、フラボピリドール、メシル酸イマチニブまたはゲフィチニブなど);ファルネシルトランスフェラーゼ阻害剤;ならびにHDAC阻害剤が含まれるが、これらに限定されない。
サイトカインの例には、ケモカイン(例えば、CCL1、CCL2/MCP1、CCL3/MIP1α、CCL4/MIP1β、CCL5/RANTES、CCL6、CCL7、CCL8、CCL9、CCL11、CCL12、CCL13、CCL14、CCL15、CCL16、CCL17、CCL18/PARC/DCCK1/AMAC1/MIP4、CCL19、CCL20、CCL21、CCL22、CCL23、CCL24、CCL25、CCL26、CCL27、CCL28、CXCL1/KC、CXCL2、CXCL3、CXCL4、CXCL5、CXCL6、CXCL7、CXCL8/IL8、CXCL9、CXCL10、CXCL11、CXCL12、CXCL13、CXCL14、CXCL15、CXCL16、CXCL17、CX3CL1、XCL1およびXCL2など)、腫瘍壊死因子(例えば、TNFA、リンホトキシン、TNFSF4、TNFSF5/CD40LG、TNFSF6、TNFSF7、TNFSF8、TNFSF9、TNFSF10、TNFSF11、TNFSF13、TNFSF13BおよびEDAなど)、ならびにインターロイキン(例えば、IL-1α、IL-1β、IL-1Ra、IL-2、IL-3、IL-4、IL-5、IL-6、IL-7、IL-9、IL-10、IL-11、IL-12、IL-13、IL-14、IL-15、IL-16、IL-17、IL-18、IL-19、IL-20、IL-21、IL-22、IL-23、IL-24、IL-25、IL-26、IL-27、IL-28、IL-29、IL-30、IL-31、IL-32、IL-33、IL-34、IL-35、IL-36α、IL-36β、IL-36γ、IL-36Ra、IL-37、IL-38、IFNα、IFNβ、IFNκ、IFNωおよびGM-CSFなど)が含まれるが、これらに限定されない。
免疫刺激薬の例には、フィルグラスチム、ペグフィルグラスチム、レノグラスチム、モルグラモスチム、サルグラモスチム、アンセスチム、アルブミンインターフェロン、インターフェロンアルファ、ペグインターフェロンアルファ、インターフェロンベータ、ペグインターフェロンベータ、インターフェロンガンマ、アルデスロイキン、オプレルベキン、成長ホルモン、イムノシアニン、ペガデマーゼ、プロラクチン、タソネルミン、ヒスタミン二塩酸塩、ポリICLC、ビタミンD、レンチナン、プレリキサフォル、ロキニメックス、ミファムルチド、酢酸グラチラマー、チモペンチン、チモシンα1、チムリン、ポリイノシン酸:ポリシチジル酸、ピドチモド、バチルス・カルメット-ゲリンワクチン、悪性黒色腫ワクチンおよびシプロイ細胞Tワクチンが含まれるが、これらに限定されない。
溶解性ペプチドの例には、毒素(例えば、ジプテリア毒素またはシュードモナス外毒素など)が含まれるが、これらに限定されない。
放射性同位元素の例には、テクネチウム(例えば、Tc-99およびTc-97)、カリウム(例えば、K-40)、ルビジウム(例えば、Rb-82)、ヨウ素(例えば、I-123、I-124、I-125、I-129、I-131)、セシウム(例えば、Cs-135、Cs-137)、コバルト(例えば、Co-60)、パラジウム(例えば、Pd-103、Pd-107)、カドミウム(例えば、Cd-113)、ストロンチウム(例えば、Sr-89、Sr-90)、ユーロピウム(例えば、Eu-55)、スズ(例えば、Sn-121、Sn-126)、リン(例えば、P-32、P-33)、タリウム(例えば、Tl-201)、インジウム(例えば、In-111)、ガリウム(例えば、Ga-67、Ga-68)、イットリウム(例えば、Y-90)、イリジウム(例えば、Ir-192)、ビスマス(例えば、Bi-213)、ラジウム(例えば、Ra-223、Ra-225)、およびルテニウム(例えば、Ru-106)の放射性核種が含まれるが、これらに限定されない。
本発明のCAR操作された免疫細胞は、免疫抑制剤の前、後またはそれと同時に対象に投与され得る。
本発明のCAR操作された免疫細胞および/または免疫抑制剤は、移植後に対象に投与され得る。あるいは、または加えて、本発明のCAR操作された免疫細胞および/または免疫抑制剤は、移植前に対象に投与され得る。いくつかの実施形態では、本発明のCAR操作された免疫細胞および/または免疫抑制剤は、移植手術中に対象に投与され得る。
いくつかの実施形態では、CAR操作された免疫細胞の対象への投与は、免疫抑制療法が開始された後で実施される。
いくつかの実施形態では、方法は、例えば、移植器官レシピエントを経時的に、および適用可能な場合は異なる免疫抑制療法レジメンで監視するために、複数回実施される。
いくつかの実施形態では、免疫抑制療法は、移植器官レシピエントが移植器官に耐性であると予測される場合に低減される。いくつかの実施形態では、移植器官レシピエントが移植器官に耐性であると予測される場合、免疫抑制療法は、処方されず、例えば免疫抑制療法は、中止される。
本発明のCAR操作された免疫細胞は、移植臓器または組織の拒絶の診断後に投与され得、その後、臓器または組織の拒絶の症状が鎮静するまで、本発明のCAR操作された免疫細胞および免疫抑制剤の両方の用量が投与され得る。
さらなる実施形態では、本発明のCAR操作された免疫細胞組成物は、骨髄移植と併せて(例えば、前に、同時に、または後に)対象に投与され得る。
いくつかの実施形態では、本発明のCAR操作された免疫細胞は、CD20と反応する薬剤、例えばリツキシマブなどのB細胞除去療法の後に投与され得る。例えば、いくつかの実施形態では、対象は、高用量化学療法による標準的な治療を受け、その後、末梢血幹細胞移植を受けてもよい。特定の実施形態では、移植後、対象は、本発明の拡大されたCAR操作された免疫細胞の注入を受けてもよい。特定の実施形態では、拡大されたCAR操作免疫細胞は、手術の前または後に投与され得る。
いくつかの実施形態では、対象(例えば、ヒト)は、本発明の免疫細胞または免疫集団の初回投与、および1回以上の後続の投与を受け、1回以上の後続の投与は、前の投与の15日未満、例えば、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3または2日後に投与される。
いくつかの実施形態では、治療有効量の本発明の免疫細胞を対象に投与するか、または投与する予定である。
いくつかの実施形態では、対象に投与される本発明の免疫細胞集団の免疫細胞の数は、少なくとも10、10、10、10、10、10、10または10細胞である。
いくつかの実施形態では、対象に投与される本発明の免疫細胞集団の免疫細胞の数は、約10~約10、約10~約10、約10~約10、または約10~約10細胞の範囲である。
いくつかの実施形態では、対象に投与される本発明の免疫細胞集団の免疫細胞の数は、約10~約10、約10~10、約10~10、約10~10、約10~10、約10~10または約10~10細胞の範囲である。いくつかの実施形態では、対象に投与される本発明の免疫集団の免疫細胞の数は、約10、約10、約10、約10、約10、約10、約10または約10細胞である。
いくつかの実施形態では、対象に投与される本発明の免疫細胞集団の免疫細胞の数は、少なくとも10、10、10、10、10、10、10または10細胞/kg体重である。
いくつかの実施形態では、対象に投与される本発明の免疫細胞集団の免疫細胞の数は、約10~10細胞/kg体重または10~10細胞/kg体重の範囲であり、これらの範囲内のすべての整数値を含む。
いくつかの実施形態では、対象は、1週間に2回以上の本発明の免疫細胞集団の投与、例えば、1週間に対象に投与される本発明の免疫細胞集団の2、3または4回の投与を受ける。
いくつかの実施形態では、免疫細胞集団は、活性剤と組み合わせて、それを必要とする対象に投与される。いくつかの実施形態によれば、免疫細胞集団は、活性剤の投与前、投与と同時に、または投与後に投与される。
いくつかの実施形態では、本発明の活性化免疫細胞を対象に投与し、その後、血液を再採血し(またはアフェレーシスを実行し)、そこから本発明に従って免疫細胞を活性化し、これらの活性化され拡大した免疫細胞を対象に再注入することが望ましい場合がある。このプロセスは、数週間ごとに複数回実施することができる。特定の実施形態では、免疫細胞は、10cc~400ccの採血から活性化することができる。特定の実施形態では、免疫細胞は、20cc、30cc、40cc、50cc、60cc、70cc、80cc、90cc、または100ccの採血から活性化される。理論に拘束されるものではないが、この複数回の採血/複数回の再注入プロトコルを使用することは、免疫細胞の特定の集団を選択するのに役立ち得る。
本明細書中に記載されるCAR、細胞集団および組成物は、本明細書中に記載されるような治療方法において使用され得ること、本明細書中に記載されるような医薬として使用するためのものであり得ること、本明細書中に記載されるような治療において使用するためのものであり得ること、および/または本明細書中に記載されるような治療のための医薬の製造において使用するためのものであり得ることが理解される。
本明細書から明らかなように、本発明のCAR、または前記CARに含まれる抗体もしくは抗原結合フラグメント、または前記CARを発現するように操作された免疫細胞集団は、多くの利点を提示する。
一実施形態では、本発明のCAR、または前記CARに含まれる抗体もしくは抗原結合フラグメント、または前記CARを発現するように操作された免疫細胞集団は、約5×10-7M以下、好ましくは約2.5×10-7M以下、約1×10-7M以下、約7.5×10-8M以下、約5×10-8M以下、約1×10-8M以下の平衡解離定数(K)でヒトCD45RCに結合する。
一実施形態では、本発明のCAR、または前記CARに含まれる抗体もしくは抗原結合フラグメント、または前記CARを発現するように操作された免疫細胞集団は、CD45RChigh細胞に対する細胞傷害活性を有する。
一実施形態では、その標的抗原に結合すると、本発明のCARは、CAR形質導入細胞活性化を誘導する。
一実施形態では、その標的抗原に結合すると、本発明のCARは、CAR形質導入T細胞活性化を誘導する。一実施形態では、その標的抗原に結合すると、本発明のCARは、CAR形質導入Treg活性化を誘導する。一実施形態では、その標的抗原に結合すると、本発明のCARは、CAR形質導入CD4Treg活性化を誘導する。別の実施形態では、その標的抗原に結合すると、本発明のCARは、CAR形質導入CD8Treg活性化を誘導する。
一実施形態では、本発明の前記CARを発現するように操作された免疫細胞集団は、標的細胞(例えば、CD45RCT細胞)に対してアポトーシス促進活性を有する。
一実施形態では、本発明の前記CARを発現するように操作された免疫細胞集団は、CD4Tregの集団であり、前記CAR形質導入CD4Tregは、標的細胞(例えば、CD45RCT細胞)に対してアポトーシス促進活性を有する。一実施形態では、本発明の前記CARを発現するように操作された免疫細胞集団は、CD8Tregの集団であり、前記CARを形質導入されたCD8Tregは、標的細胞(例えば、CD45RCT細胞)に対してアポトーシス促進活性を有する。
一実施形態では、本発明のCAR、または前記CARに含まれる抗体もしくは抗原結合フラグメント、または前記CARを発現するように操作された免疫細胞集団は、移植片拒絶(例えば、皮膚移植片拒絶)およびGVHDを減少させるかまたは抑止する。
A1(1)~B(2)は、ヒト血液中の異なる白血球型に対するCD45RCの発現レベル(ABIS-45RCまたは市販のMT2抗体によって検出される)を示す図である。ABIS-45RCまたはMT2による染色は、健常志願者からの全血(EDTA)中の異なる細胞型で実現された。次いで、サイトメーター分析(Navios、BeckmanCoulter)の前に赤血球を溶解した(Versalyse、Beckman Coulter)。最初に、細胞を形態学的にゲートし、ダブレット細胞および生細胞をゲーティングした。(A(1)~A(3))異なる白血球型で分析された3人の健常志願者のうち1人からのABIS-45RCまたはMT2によって検出されたCD45RC発現の代表的なドットプロット分析。ABIS-45RCが左パネルに示され、MT2が右パネルに示されている。x軸は、示されるように、白血球の各タイプについて標識された細胞系統マーカーの蛍光強度を示し、y軸は、抗CD45RC抗体標識の蛍光強度を表す。水平線は、左上のドットプロットに示されるように、高レベル、中レベル/低レベルおよび負レベルのCD45RC発現を有する細胞を定義し、数字は、各カテゴリーにおける細胞のパーセンテージを表す。(B(1)およびB(2))ABIS-45RC(B(1))またはMT2(B(2))で標識された3人のドナーの異なる白血球タイプに対するCD45RChigh、CD45RClowおよびCD45RCの平均発現+/-SEM。 ABIS-45RC抗体および市販の抗CD45RCMT2抗体の両方が同じエピトープについて競合することを示す図である。PBMCを健常志願者の血液から単離し、T細胞を抗CD3標識mAbで標識し、キメラABIS-45RC(表示濃度)および1.33mg/mLで標識した抗CD45RC(マウスクローンMT2)-FITCで標識した。ABIS-45RC反応性は、ビオチンロバ抗ヒトIgG+ストレプトパPerCP-Cy5.5二次抗体を使用して明らかにした。上段のドットプロットの窓内の数字は、両方の抗体によって共標識された細胞のパーセンテージを表す。 A~Fは、ABIS-45RCによって誘導される細胞傷害性が市販の抗CD45RCMT2と比較して高いことを示す図である。健常志願者のPBMC(n=3)を、培地、アイソタイプ陰性対照(2.5もしくは10mg/mL)、ABIS-CD45RC(2.5または10mg/mL)または陽性対照としてのデキサメタゾン(10mg/mL)とともに表示の時点について37℃でインキュベートし、次いで、アネキシンV-PEで標識することによって細胞を抗CD3-FITCマウス抗体およびアポトーシス細胞で標識した。(A~E)グラフは、示された細胞集団におけるアネキシンV細胞の%を示す。(F)アネキシンV(初期アポトーシス)細胞およびDAPI(後期アポトーシス)細胞の代表的なドットプロット。数字は、各カテゴリー内の細胞のパーセンテージを示す。 A~Cは、免疫ヒト化NSG免疫不全マウスにおいてGVHDを処置するためのABIS-45RCの使用を示す図である。(A)健常ドナーボランティアからの末梢血単核細胞(PBMC)を、以前(-1日目)の視床下(2Gy)照射されたNSG免疫不全マウスに静脈内(iv)(0日目)注入したことを示す実験手順。ABIS-45RCを、0日目~20日目までの間に示されたプロトコルで腹腔内(ip)投与した。アイソタイプコントロールは、ヒトIgG(IVIg調製物)であり、ABIS-45RCと同じプロトコルを使用して投与した。(B~C)NSGマウスの生存曲線および統計を、Kaplan-Meier分析(*p<0.01、**p<0.001)を使用して分析した。 A~Jは、2つの濃度(左パネルでは2μg/mL、右パネルでは1μg/mL)でのヒト化ABIS-45RC抗体変異体およびマウスABIS-45RC抗体のヒトT細胞に対する反応性を示す、フローサイトメトリードットプロットの組み合わせである。(A)ヒト化ABIS-45RC変異体A、(B)ヒト化ABIS-45RC変異体B、(C)ヒト化ABIS-45RC変異体C、(D)ヒト化ABIS-45RC変異体D、(E)ヒト化ABIS-45RC変異体E、(F)ヒト化ABIS-45RC変異体F、(G)ヒト化ABIS-45RC変異体G、(H)ヒト化ABIS-45RC変異体H、(I)ヒト化ABIS-45RC変異体I、(J)マウスABIS-45RC。 ABIS-45RC(左パネル)および操作されたAsn/PheABIS-45RC(右パネル)の両方がヒトT細胞に対する反応性の同等のパターンを有することを示すフローサイトメトリーの2つのドットプロットを示す図である。 A~Cは、3人の健常志願者からのヒト血液中のCD3白血球上のCD45RCの発現レベルを示す図である。最初に、細胞を形態学的にゲートし、ダブレット細胞および生細胞をゲーティングした。(A)分析した3人の健常志願者のうち1人からのマウスABIS-45RCによって検出されたCD45RC発現の代表的なドットプロット分析、(B)分析された3人の健常志願者のうち1人からのヒト化ABIS-45RC変異体A1によって検出されたCD45RC発現の代表的なドットプロット分析、(C)分析した3人の健常志願者のうち1人からのヒト化ABIS-45RC変異体A3によって検出されたCD45RC発現の代表的なドットプロット分析。x軸は、FSCを示し、y軸は、抗CD45RC抗体標識の蛍光強度を表す。四角は、示されるように、高レベル、中レベル/低レベルおよび負レベルのCD45RC発現を有する細胞を定義し、数字は、各カテゴリーにおける細胞のパーセンテージを表す。 A~Bは、ABIS-45RCまたはヒト化変異体A1およびA3によって誘導されるアポトーシスが同等であることを示す図である。健常志願者からのPBMCを、アイソタイプ陰性対照(10μg/mL)、マウスABIS-CD45RC(10μg/mL)、ヒト化変異体A1(10μg/mL)またはヒト化変異体A3(10μg/mL)とともに、指示された時点で37℃でインキュベートし、次いで、アネキシンV-PEで標識することによって、細胞を抗CD3および抗CD45RA抗体ならびにアポトーシス細胞で標識した。グラフは、アイソタイプコントロール条件と比較して、CD3CD45RAhi細胞(A)およびCD3細胞(B)におけるアポトーシス倍数を示す。 抗ヒトCD45RC処置により処置されたヒト化マウスの皮膚移植片生存を示す図である。ヒト皮膚拒絶を誘導するために全ヒトPBMCを移入したNSGマウスを、ラパマイシン(Rapa)とともにマウスABIS-45RCまたはヒト化変異体A1で処置した。結果を皮膚移植片生存スコアで表す。 CAR構造およびCD45RC-CARの例示的な構造の概略図を示す。CARは、細胞外ドメイン(例えば、scFvCD45RC)、任意選択でヒンジドメイン(例えば、CD8aに由来する)、膜貫通(TM)ドメイン(例えば、CD8に由来する)、共刺激細胞内ドメイン(例えば、CD28に由来する)および一次シグナル伝達ドメイン(例えば、CD3ζに由来する)を含む。同じプラスミドにおいて、GFPコード配列は、任意選択でT2A自己スプライシング配列(図示せず)によってそれらから分離されたCD45RC-CAR配列のすぐ3’に存在していてもよい。したがって、GFPは、CAR-CD45RC発現の代用マーカーとして使用され得る。 CD45RC-CARおよびGFPをコードするプラスミドでトランスフェクトしたHEK(ヒト胎児腎臓293細胞)細胞が、トランスフェクションの3日後にGFPを発現することを示す図である(左パネル)。トランスフェクションの陽性対照として、GFPのみをコードするプラスミドでHEK細胞をトランスフェクトした(右パネル)。 非形質導入Jurkat細胞と比較して、6日間の培養後にCD45RC-CARおよびGFPをコードするレンチウイルスベクターをJurkat細胞に形質導入できることを示す図である。 Jurkat細胞が形質導入されたCD45RC-CARを細胞表面で発現し(プロテインL染色によって示されるように)、CARの発現がGFPの発現と相関することを示す図である。 CD45RC-CARレンチウイルスベクターで形質導入されたJurkat細胞がヒトT細胞においてアポトーシスを誘導できることを示す図である。ヒトT細胞を、CD45RC-CARまたはCtrl-CAR(異なる抗原特異性を有する対照CAR)で形質導入されたJurkat細胞とともに、異なる細胞比条件で培養した。18時間の培養後、フローサイトメトリーによってアポトーシスを評価した。CARを作製するために使用される抗CD45RCモノクローナル抗体(キメラヒトIgG1)を陽性対照として使用し、ヒト非反応性IgG1をアイソタイプコントロールとして使用し、このアッセイで発現されない標的を認識するCARを発現するCtrl-CARJurkatを使用し、非形質導入Jurkat細胞を陰性対照として使用した。 CD45RC-CARレンチウイルスベクターで形質導入されたJurkat細胞が、ヒトT細胞との接触後に活性化され得ることを示す図である。ヒトT細胞を、CD45RC-CAR(選別された、もしくはGFPの発現に基づいていない)またはCtrl-CARで形質導入されたJurkat細胞とともに、異なる細胞比条件で培養した。T細胞活性化のマーカーであるCD69の平均蛍光強度(MFI)を、18時間の培養後にフローサイトメトリーによって評価した。Ctrl-CARJurkatを選別または選別せず、非形質導入Jurkatを陰性対照として使用した。 CD45RC標的へのCD45RC-CAR結合を示す図である。HEK 293TにCD45RC-CARレンチウイルスベクターを形質導入せず、または形質導入し、5日間培養した。次いで、細胞をビオチン化CD45R-ABCタンパク質とインキュベートし、次いでストレプトアビジン-APC-Cy7で染色し、フローサイトメトリーによって分析した。 A~Bは、CD45RC-CARレンチウイルスベクターで形質導入されたCD4+Tregの拡大を示す図である。CD4+Tregを0日目と1日目との間で活性化し、次いで、1日目および2日目にCD45RC-CARで2回形質導入した。GFP+細胞を7日目に選別した。CD45RC-CAR CD4+Tregを拡大の7または14日後にGFP発現について分析した:(A)7および14日目のCD45RC-CAR形質導入CD4+TregにおけるGFP発現の代表的なヒストグラムおよびドットプロット、(B)7および14日目にCD45RC-CARを発現する細胞のパーセンテージ。 CD45RC-CAR CD4+TregがCARを介して特異的に活性化されることを示す図である。14日間拡大させたCD45RC-CAR CD4+TregおよびCtrl-CAR CD4+Tregを、被覆CD45R-ABCタンパク質とともに、ブレフェルジンAの存在下で最後の4時間24時間培養し、次いで、活性化マーカーについてフローサイトメトリーによって分析した。各マーカーのMFIは、非刺激細胞に対する比として表される。 A~Cは、CD45RC-CARCD4+Tregがアポトーシスを介してCD45RChighT細胞の細胞死を誘導することを示す図である。CD45RC-CAR(平均60%GFP+形質導入細胞)、Ctrl-CAR(>90%LNGFR+形質導入細胞)または非形質導入CD4+Tregで形質導入された同種異系CD4+Treg、ならびに抗CD45RCmAb(10μg/mLのABIS-45RC)で4時間インキュベートし、引き続いてアネキシンVおよびDAPIで染色したPBMCでアポトーシスを分析した。結果を、(A)T細胞、(B)CD45RClow/negT細胞、(C)CD45RChighT細胞の中のアネキシンV細胞の相対的割合として表す。灰色ひし形の単離点は、抗CD45RCmAbの存在下でのアポトーシスを表す。
本発明を以下の実施例によってさらに説明する。
実施例を通して、以下の命名法が適用される。
「ABIS-45RC」:本発明のマウス抗hCD45RC抗体であって、
-配列番号61の重鎖可変領域、
-配列番号93の重鎖定常領域、
-配列番号81の軽鎖可変領域、および
-配列番号94の軽鎖定常領域、を含む、抗hCD45RC抗体。
「抗45RC変異体A」:ABIS-45RCのヒト化変異体であって、
-配列番号62の重鎖可変領域、
-配列番号91の重鎖定常領域、
-配列番号82の軽鎖可変領域、および
-配列番号92の軽鎖定常領域、を含む、ABIS-45RCのヒト化変異体。
「抗45RC変異体B」:ABIS-45RCのヒト化変異体であって、
-配列番号62の重鎖可変領域、
-配列番号91の重鎖定常領域、
-配列番号83の軽鎖可変領域、および
-配列番号92の軽鎖定常領域、を含む、ABIS-45RCのヒト化変異体。
「抗45RC変異体C」:ABIS-45RCのヒト化変異体であって、
-配列番号62の重鎖可変領域、
-配列番号91の重鎖定常領域、
-配列番号84の軽鎖可変領域、および
-配列番号92の軽鎖定常領域、を含む、ABIS-45RCのヒト化変異体。
「抗45RC変異体D」:ABIS-45RCのヒト化変異体であって、
-配列番号63の重鎖可変領域、
-配列番号91の重鎖定常領域、
-配列番号82の軽鎖可変領域、および
-配列番号92の軽鎖定常領域、を含む、ABIS-45RCのヒト化変異体。
「抗45RC変異体E」:ABIS-45RCのヒト化変異体であって、
-配列番号63の重鎖可変領域、
-配列番号91の重鎖定常領域、
-配列番号83の軽鎖可変領域、および
-配列番号92の軽鎖定常領域、を含む、ABIS-45RCのヒト化変異体。
「抗45RC変異体F」:ABIS-45RCのヒト化変異体であって、
-配列番号63の重鎖可変領域、
-配列番号91の重鎖定常領域、
-配列番号84の軽鎖可変領域、および
-配列番号92の軽鎖定常領域、を含む、ABIS-45RCのヒト化変異体。
「抗45RC変異体G」:ABIS-45RCのヒト化変異体であって、
-配列番号64の重鎖可変領域、
-配列番号91の重鎖定常領域、
-配列番号83の軽鎖可変領域、および
-配列番号92の軽鎖定常領域、を含む、ABIS-45RCのヒト化変異体。
「抗45RC変異体H」:ABIS-45RCのヒト化変異体であって、
-配列番号64の重鎖可変領域、
-配列番号91の重鎖定常領域、
-配列番号84の軽鎖可変領域、および
-配列番号92の軽鎖定常領域、を含む、ABIS-45RCのヒト化変異体。
「抗45RC変異体I」:ABIS-45RCのヒト化変異体であって、
-配列番号64の重鎖可変領域、
-配列番号91の重鎖定常領域、
-配列番号82の軽鎖可変領域、および
-配列番号92の軽鎖定常領域、を含む、ABIS-45RCのヒト化変異体。
「抗45RC変異体A1」:ABIS-45RCのヒト化変異体であって、
-配列番号101の重鎖可変領域、
-配列番号91の重鎖定常領域、
-配列番号85の軽鎖可変領域、および
-配列番号92の軽鎖定常領域、を含む、ABIS-45RCのヒト化変異体。
「抗45RC変異体A2」:ABIS-45RCのヒト化変異体であって、
-配列番号101の重鎖可変領域、
-配列番号91の重鎖定常領域、
-配列番号103の軽鎖可変領域、および
-配列番号92の軽鎖定常領域、を含む、ABIS-45RCのヒト化変異体。
「抗45RC変異体A3」:ABIS-45RCのヒト化変異体であって、
-配列番号65の重鎖可変領域、
-配列番号91の重鎖定常領域、
-配列番号85の軽鎖可変領域、および
-配列番号92の軽鎖定常領域、を含む、ABIS-45RCのヒト化変異体。
「抗45RC変異体A4」:ABIS-45RCのヒト化変異体であって、
-配列番号65の重鎖可変領域、
-配列番号91の重鎖定常領域、
-配列番号103の軽鎖可変領域、および
-配列番号92の軽鎖定常領域、を含む、ABIS-45RCのヒト化変異体。
「抗45RC変異体A5」:ABIS-45RCのヒト化変異体であって、
-配列番号62の重鎖可変領域、
-配列番号91の重鎖定常領域、
-配列番号85の軽鎖可変領域、および
-配列番号92の軽鎖定常領域、を含む、ABIS-45RCのヒト化変異体。
「抗45RC変異体A6」:ABIS-45RCのヒト化変異体であって、
-配列番号101の重鎖可変領域、
-配列番号91の重鎖定常領域、
-配列番号82の軽鎖可変領域、および
-配列番号92の軽鎖定常領域、を含む、ABIS-45RCのヒト化変異体。
「抗45RC変異体A7」:ABIS-45RCのヒト化変異体であって、
-配列番号121の重鎖可変領域、
-配列番号91の重鎖定常領域、
-配列番号85の軽鎖可変領域、および
-配列番号92の軽鎖定常領域、を含む、ABIS-45RCのヒト化変異体。
「抗45RC変異体A8」:ABIS-45RCのヒト化変異体であって、
-配列番号122の重鎖可変領域、
-配列番号91の重鎖定常領域、
-配列番号85の軽鎖可変領域、および
-配列番号92の軽鎖定常領域、を含む、ABIS-45RCのヒト化変異体。
「抗45RC変異体A9」:ABIS-45RCのヒト化変異体であって、
-配列番号123の重鎖可変領域、
-配列番号91の重鎖定常領域、
-配列番号85の軽鎖可変領域、および
-配列番号92の軽鎖定常領域、を含む、ABIS-45RCのヒト化変異体。
「抗45RC変異体A10」:ABIS-45RCのヒト化変異体であって、
-配列番号124の重鎖可変領域、
-配列番号91の重鎖定常領域、
-配列番号85の軽鎖可変領域、および
-配列番号92の軽鎖定常領域、を含む、ABIS-45RCのヒト化変異体。
「抗45RC変異体D1」:ABIS-45RCのヒト化変異体であって、
-配列番号63の重鎖可変領域、
-配列番号91の重鎖定常領域、
-配列番号85の軽鎖可変領域、および
-配列番号92の軽鎖定常領域、を含む、ABIS-45RCのヒト化変異体。
「抗45RC変異体I1」:ABIS-45RCのヒト化変異体であって、
-配列番号67の重鎖可変領域、
-配列番号91の重鎖定常領域、
-配列番号85の軽鎖可変領域、および
-配列番号92の軽鎖定常領域、を含む、ABIS-45RCのヒト化変異体。
「抗45RC変異体I2」:ABIS-45RCのヒト化変異体であって、
-配列番号67の重鎖可変領域、
-配列番号91の重鎖定常領域、
-配列番号103の軽鎖可変領域、および
-配列番号92の軽鎖定常領域、を含む、ABIS-45RCのヒト化変異体。
「MT2」:参照AM39022PU-NによりOriGeneで市販されているマウス抗hCD45RC抗体。
「操作されたAsn/PheABIS-45RC」:CDR1への1つの残基の挿入およびFR3への1つの残基の置換によってそのLCVRを操作することによってキメラ化されたマウスABIS-45RC(実施例8に記載)。操作されたAsn/PheABIS-45RCは、
-配列番号61の重鎖可変領域、
-配列番号93の重鎖定常領域、
-X12がAsn(N)である、配列番号71の軽鎖可変領域、および
-配列番号94の軽鎖定常領域、を含む。
「操作されたSer/PheABIS-45RC」:CDR1への1つの残基の挿入およびFR3への1つの残基の置換によってそのLCVRを操作することによってキメラ化されたマウスABIS-45RC(実施例8に記載)。操作されたSer/PheABIS-45RCは、
-配列番号61の重鎖可変領域、
-配列番号93の重鎖定常領域、
-X12がSer(S)である、配列番号71の軽鎖可変領域、および
-配列番号94の軽鎖定常領域、を含む。
「操作されたGly/PheABIS-45RC」:CDR1への1つの残基の挿入およびFR3への1つの残基の置換によってそのLCVRを操作することによってキメラ化されたマウスABIS-45RC(実施例8に記載)。操作されたGly/PheABIS-45RCは、
-配列番号61の重鎖可変領域、
-配列番号93の重鎖定常領域、
-X12がGly(G)である、配列番号71の軽鎖可変領域、および
-配列番号94の軽鎖定常領域、を含む。
「キメラN50AABIS-45RC」:マウスABIS-45RC重鎖およびヒト化軽鎖を含む、マウスABIS-45RCのキメラ変異体。キメラN50AABIS-45RCは、
-配列番号61の重鎖可変領域、
-配列番号93の重鎖定常領域、
-配列番号113の軽鎖可変領域、および
-配列番号92の軽鎖定常領域、を含む。
「キメラS52AABIS-45RC」:マウスABIS-45RC重鎖およびヒト化軽鎖を含む、マウスABIS-45RCのキメラ変異体。キメラS52AABIS-45RCは、
-配列番号61の重鎖可変領域、
-配列番号93の重鎖定常領域、
-配列番号126の軽鎖可変領域、および
-配列番号92の軽鎖定常領域、を含む。
「キメラN50XABIS-45RC」:マウスABIS-45RC重鎖およびヒト化軽鎖を含む、マウスABIS-45RCのキメラ変異体。キメラN50XABIS-45RCは、
-配列番号61の重鎖可変領域、
-配列番号93の重鎖定常領域、
-X13がAla(A)またはAsn(N)以外の任意のアミノ酸である、配列番号129の軽鎖可変領域、および
-配列番号92の軽鎖定常領域、を含む。
ABIS-45RCの反応性
材料および方法
PBMC染色およびデータ取得
50μLまたは100μLの新鮮EDTA全血を、適切なモノクローナル抗体(Ab)の組み合わせで染色し、続いて赤血球溶解を行った(versalyse,Beckman Coulter)。洗浄後、細胞をNaviosフローサイトメーターで分析し、Kaluzaソフトウェア(Beckman Coulter,Marseille,France)およびFlowJoソフトウェア(Tree Star Inc.)を使用してデータを分析した。
抗体およびフローサイトメトリー
表6.フローサイトメトリー分析に使用される抗体。左列の各抗体について、使用したクローンを右列に示す。
Figure 2023518538000010
結果
第1のスクリーニングとして、ABIS-45RCは、市販の抗CD45RCmAbMT2クローンを使用して選別されたCD45RC-細胞に対して反応せず、ABIS-45RCがCD45RCを認識できることを示唆した(データは示さず)。
ABIS-45RCをさらに特徴付けるために、本発明者らは、ヒトPBMCとのその反応性を分析した。図1Aおよび図1Bに示すように、T CD4およびT CD8細胞の画分は、ABIS-45RChighであり、残りは、ABIS-45RClowまたはABIS-45RCである。ほとんどのBおよびNK細胞ならびにpDCは、ABIS-45RChighであった。NKT、iNKT MAIT、ILC2、ILC3およびCD14intCD16単球の大部分は、ABIS-45RChighまたはABIS-45RClowであった。CD14highCD16単球、mDC、好塩基球および好中球は、主にABIS-45RCであった。CD4TregおよびCD8Foxp3Tregは、主にABIS-45RClow/-であった。
主要PBMC集団の分析は、ABIS-45RCが市販の抗CD45RCマウスMT2抗体に匹敵する反応性のパターンを有することを示した(図1およびPicarda et al.,2017.JCI Insight.2(3):e90088)。
ABIS-45RCと市販の抗CD45RC抗体「MT2」との比較
材料および方法
PBMCの単離
血液健常ボランティアを収集し、末梢血単核細胞(PBMC)をFicoll勾配遠心分離によって単離し、これにより顆粒球、血小板およびリーミング赤血球汚染物質などの血液製剤の望ましくない画分の除去が可能になる。
抗体およびフローサイトメトリー
ヒトPBMCを、1.33mg/mLで標識したABIS-45RC抗体(マウスクローンMT2、Biolegend)、抗CD3抗体および抗CD45RC-FITCで標識した。ABIS-45RC反応性は、ビオチンロバ抗ヒトIgGストレプトアビジンPerCP-Cy5.5二次抗体を使用して明らかにした。
Canto IIサイトメーター(BD Biosciences)を使用して蛍光強度を測定し、データをFLOWJOソフトウェア(Tree Star Inc.)を使用して分析した。細胞を最初にそれらの形態によってゲートし、死細胞をDAPI陰性細胞を選択することによって除外した。
細胞傷害性分析
ヒトPBMCを、培地とともに37℃、アイソタイプコントロール抗体(MsIgG1、クローン107.3、10μg/ml)、ABIS-45RCまたは抗CD45RC(マウスクローンMT2)とともに2.5または10μg/mlで10分~18時間インキュベートした。次いで、細胞を抗CD3(クローンSK7、BD Biosciences)、アネキシンVおよびDAPIで染色した。フローサイトメトリーによってT細胞または非T細胞の中でアネキシンVおよびDAPI細胞をゲーティングすることによって、アポトーシスのパーセンテージを得た。
結果
ABIS-45RC抗体および市販の抗CD45RCMT2抗体の両方が同じエピトープについて競合する
図2に示すように、市販の抗CD45RCMT2クローンとの共標識は、両方の抗体が競合し、したがってヒトCD45RCの同じまたは近いエピトープを認識することを示した。
ABIS-45RCによって誘導される細胞傷害性は、市販の抗CD45RCと比較して高い
図3に示すように、ABIS-45RCはT細胞に対して細胞傷害性であったが、非T細胞に対しては細胞傷害性でなかった。さらに、T細胞の細胞傷害性は、CD45RC発現のレベルと直接相関しており、重要なことに、ABIS-45RCは、10μg/mLのMT2クローンと比較して、2.5μg/mLでより良好に機能した。
ABIS-45RCの親和性
材料および方法
手短に言えば、プラスミドトランスフェクション後にCD45RCを発現する1×10個のCD45RChighPBMCまたはCHO細胞を、Mem-PER膜単離キット(Thermo-fisher)を使用して可溶化した。ABIS-45RCをバイオチップCM5に固定化し、細胞膜を25℃でインキュベートして、BIAcore 3000およびBIAcore T200での単一サイクル速度論および較正遊離濃度分析を使用して親和定数を測定した。
結果
CD45RC抗体の親和性の測定を、抗体-抗原相互作用を特徴付けるための技術である表面プラズモン共鳴(SPR)によって評価し、5×10-8Mの親和性(K)、2.91×10-1.sec-1のKonおよび1.44×10-2sec-1のKoffを明らかにした。
ABIS-45RCによる移植片対宿主病(GVHD)の処置
材料および方法
PBMCの単離
健康な個体からEtablissement Francais du Sang(Nantes,France)で血液を収集した。書面によるインフォームドコンセントを施設のガイドラインに従って提供した。PBMCをFicoll-Paque密度勾配遠心分離(Eurobio,Courtaboeuf,France)によって単離した。残りの赤血球および血小板を低張液および遠心分離で排除した。
動物
8~12週齢のNOD/SCID/IL2Rγ-/-(NSG)マウスをSPF条件で本発明者ら自身の動物施設で飼育した(認定番号C44-278)。
GVHDモデル
成体NSG免疫不全マウスを、GVHDの発症に有利に働く組織における病変を誘導するために全身亜致死照射した(-1日目に2Gyの照射線量)。翌日(0日目)、健常志願者からの1.5×10個のPBMC(CD45RChighおよびCD45RClow/-T細胞を含む)をこれらのマウスに静脈内注射した。ヒトPBMC、特にT細胞は、病変を誘発するマウス組織に反応し、これを攻撃する。これらのT細胞ならびに肝臓、腸、肺および皮膚において認められる病変は、ヒトにおける骨髄移植後に認められるGVHD、またはドナーおよびレシピエントとしてげっ歯類を使用する他のGVHD実験系を模倣する。特に、これらの組織病変は、典型的には、注射されたPBMCの数に応じて、および本発明者らの実験系において、PBMCの注射後13日目頃に始まる体重減少を誘発する。体重減少を毎日監視し、不必要な苦痛を避けるために、元の体重の20%に低下したときに動物を屠殺する。
処置
NSGマウスを、0日目から2.5日ごとに20日間、0.8mg/kgの精製ABIS-45RC、MT2抗CD45RC抗体または無関係な対照(ヒト精製IgGを含み、主にIgG1抗体を含有する、臨床的に使用されるIVIg調製物)で腹腔内処置した。
ABIS-45RCまたは対照抗体で処置したNSGマウスにも、0日目~10日目まで0.4mg/日の最適以下の用量のラパマイシンを腹腔内投与した。
実験手順を図4Aに要約する。
結果
PBMCでの処置は体重減少のみを誘発し、14日目頃に開始し、図4に示すように、33日目までにすべてのマウスが死亡した(生存期間中央値:11日間(図4B)~15日間(図4C))。
対照抗体およびラパマイシンによる処置は、統計学的有意性に達することなく生存を延長しただけであった(生存期間中央値:21日間(図4C))。
MT2による処置は、マウスの生存を有意に延長したが(生存期間中央値:19日(図4B))、ABIS-45RCによる処置はマウスの生存のこの延長を最大72日間有意に増加させた(生存期間中央値:35日(図4B))。
最後に、ラパマイシンとのABIS-45RCの併用投与は、GVHDの結果としての死を完全に予防した(100%生存、図4C)。
ABIS-45RCのヒト化
CDRをヒト生殖系列抗体配列に移植することによるABIS-45RCのヒト化のための設計を行った。ABIS-45RCを、LCVRからの3つのCDR(配列番号15、16および17)を、ABIS-45RCのLCVRと可能な限り相同であるヒト生殖細胞系LCVRに移植することによってヒト化した。同様に、HCVRからの3つのCDR(配列番号1、4および3を有する)を、ABIS-45RCのHCVRと可能な限り相同であるヒト生殖系列HCVRにグラフトした。
加えて、選択されたヒト生殖系列可変領域のフレームワーク領域(FR)中の少数のアミノ酸残基を、マウス可変領域中に存在するアミノ酸残基に変化させた(いわゆる復帰突然変異)。免疫グロブリン可変領域の構造に関する情報に基づいて、およびABIS-45RCのFvの相同性分子モデルのガイダンスを用いて、FR中のこれらの少数の残基は、CDRを正しい立体配座で、またはHCVR/LCVRパッキングで維持することにおいて重要な役割を有すると同定され、したがって、それらは、第1のヒト化バージョン(バージョンA)で保持されるか、または可能であれば、その後のヒト化バージョン(バージョンBおよびC)でそれらのヒト生殖系列対応物で置換された。相同性分子モデルの指針の下で、バージョンBおよびCでは、可能であると判断された場合、CDR残基もそれらのヒト生殖系列対応物に置換された。
相同モデル構築
確立されたプロトコル(Ramos,2012.Methods Mol Biol.907:39-55)に従って、ABIS-45RCのモデルを構築した。
軽鎖
本節において、別段の指定がない限り、アミノ酸番号付けは、配列番号81に基づく。
LCVRのフレームワーク残基を使用して、タンパク質BLASTを介して解明された抗体構造の配列を検索した。トップヒットは、89個のうち83個のABIS-45RCのLCVRと同一のFR残基、および89個のうち85個のABIS-45RCのLCVRと類似のFR残基を有するタンパク質データバンク(PDB)ID:4NCC(分解能2.50Å)、ならびに87個のうち83個のABIS-45RCのLCVRと同一のフレームワーク残基、および87個のうち84個のABIS-45RCのLCVRと類似のフレームワーク残基を有するPDB ID:1QOK(分解能2.40Å)であった。
これらの2つの構造の配列は両方とも、置換T9A、T39P、R44K、N49SおよびP54Aを有するABIS-45RCのLCVR(配列番号81)の配列とは異なっていた。加えて、PDBID:4NCCは、置換L95F、A99GおよびL105Iを有するABIS-45RCのLCVRと配列が異なっていた。
2つの構造の比較は、高い相同性を示した。しかしながら、炭素鎖は、領域A13-E17およびE104-K106においてわずかに異なる立体配座を採用した。
その後のCDR検索の結果および2つのN末端残基の存在に基づいて、PDBID:4NCCの構造のLCVRをLCVRフレームワーク鋳型として選択し、PDBID:1QOKを参照してL105Iの回転異性体コンフォメーションを選択した(PyMolにおいて)。
続いて、ABIS-45RCLCVRのCDR1、CDR2およびCDR3の配列を、各末端に2つの残基を付加して使用して、タンパク質BLASTを介して解明された抗体構造の配列を検索した。
CDR1の場合、トップヒットは、9個のうち9個の同一の残基を有する配列のクラスターからなっていた。これらの中には、PDBID:4NCCおよびPDBID:1QOKがあった。したがって、PDBID:4NCC構造をCDR1の鋳型として採用した。
CDR2の場合、トップヒットは、7個のうち6個の同一の残基を有する配列のクラスターからなっていた。これらの中には、再びPDBID:4NCCおよびPDBID:1QOKがあった。したがって、PDBID:4NCC構造もCDR2の鋳型として採用した。
CDR3について、ギャップを含有しないトップヒットは、13個のうち13個の同一の残基を有する、PDBID:1QOKであった。しかしながら、PDBID:4NCCは、僅差の2番目であり、13個のうち12個の同一の残基を有していた。2つの構造の比較は、L95F置換を除いて、本質的に同一の立体配座を示した。したがって、PDBID:4NCC構造をCDR3の鋳型として採用し、L95Fの回転異性体立体配座をPDBID:1QOKを参照して選択した(PyMolにおいて)。
したがって、すべてのLCVRのCDRの一次鋳型としてPDBID:4NCCが選択されたため、CDR鋳型をLCVRフレームワーク鋳型に適合させる必要はなかった。
最後に、ABIS-45RCLCVR配列と一致させるために、最適な回転異性体を選択して、LCVR部分モデルを手動で8つの位置で突然変異誘発に供した(PyMolにおいて)。
重鎖
本節において、別段の指定がない限り、アミノ酸番号付けは、配列番号61に基づく。
次に、HCVRのフレームワーク残基を使用して、タンパク質BLASTを介して溶解した抗体構造の配列を検索した。トップヒットは、90個のうち84個のABIS-45RCのHCVRと同一のフレームワーク残基、および90個のうち85個のABIS-45RCのHCVRと類似のフレームワーク残基を有するPDBID:3OPZ(3.40Å分解能)であった。
PDBID:3OPZは、N末端残基を欠落しており、かなり低い分解能で分解されたので、最も高い同一性/類似性スコアを有する追加のヒットも調査した。これらの中でトップは、91個のうち78個のABIS-45RCのHCVRと同一のフレームワーク残基、および91個のうち87個のABIS-45RCのHCVRと類似のフレームワーク残基を有するPDBID:4CAD(解像度2.50Å)、ならびに91個のうち75個のABIS-45RCのHCVRと同一のフレームワーク残基、および91個のうち87個のABIS-45RCのHCVRと類似のフレームワーク残基を有するPDBID:1RUR(1.50Å分解能)であった。
PDBID:3OPZおよびPDBID:4CAD構造の比較は、代替の残留回転異性体が主な違いであることと高い相同性を示した。
PDBID:3OPZおよびPDBID:1RUR構造の比較は、同様に高い相同性を示したが、PDBID:3OPZおよびPDBID:4CAD構造と比較して、V-FR2ループL45-G49に有意な立体配座変化があった。
さらに、配列に基づいて、ABIS-45RCのHCVRおよびPDBID:4CADは、6位にグルタミンが存在するため、N末端鎖5-12のHonegger III型(Honegger&Pluckthun,2001.J Mol Biol.309(3):687-99)立体配座を示すと予測された。しかしながら、PDBID:1RURは、6位にグルタミン酸が存在するため、Honegger I型立体配座を示すと予測された。それにもかかわらず、3つの構造は、5-12鎖の同一の立体配座を示した。また、ABIS-45RCのHCVR、PDBID:4CADおよびPDBID:1RURの配列は、改訂されたShiraiのHCVRのCDR3に関する規則によって定義されたK型(ねじれ塩基配座)を採用すると予測された(Kuroda et al.,2008.Proteins.73(3):608-20)。
その後のCDR検索の結果、より高い全体的な配列類似性、PDBID:3OPZとの構造的一致、およびより高い実験分解能に基づいて、構造PDBID:1RURのHCVRをHCVRフレームワーク鋳型として選択したが、ループ鋳型フラグメントをフレームワーク鋳型にアンカーするために、45-49末端の2つの残基NおよびC末端オーバーハングを使用して、HCVR鋳型においてPDBID:4CAD(PDBID:3OPZと同じ立体配座を有する)の45-49ループをPDBID:1RURのループに置換した。
続いて、各末端に2つの残基を付加したHCVRのCDR1、CDR2およびCDR3の配列を使用して、タンパク質BLASTを介して解明された抗体構造の配列を検索した。
CDR1については、12個のうち9個の同一の残基を有する配列ヒットのクラスターが存在した。これらの中にはPDBID:1RURがあった。したがって、PDBID:1RUR構造をCDR1の鋳型として選択した。
CDR2については、トップヒットは、12個のうち8個のABIS-45RCのHCVRと同一の残基、および12個のうち9個のABIS-45RCのHCVRと類似の残基を有するPDBID:3NTC(1.55Å分解能)であった。しかしながら、PDBID:1RURは、僅差の2番目であり、12個のうち7個のABIS-45RCのHCVRと同一の残基、および12個のうち9個のABIS-45RCのHCVRと類似の残基を有していた。2つの構造の比較は、本質的に同一の立体配座を示し、PDBID:3NTCのより高い同一性は、BLAST検索の目的でCDR2配列に付加された2つのC末端残基に起因した。したがって、PDBID:1RUR構造がCDR2の鋳型として好ましかった。
CDR3については、ギャップを含有しない2つのトップヒットは、PDBID:1NGY(分解能2.20Å)およびPDBID:1NGZ(分解能1.60Å)であり、いずれも11個のうち8個のABIS-45RCのHCVRと同一の残基、および11個のうち9個のABIS-45RCのHCVRと類似の残基を有していた。2つの構造の比較は、有意に異なる主鎖立体配座を示した。理論に束縛されるつもりはないが、本発明者らは、この差は101位の残基に起因し得ると仮定した。PDBID:1NGYでは、より大きなメチオニンは、PDBID:1NGZのより小さなセリンの配向を採用することができず、これはタンパク質のコアにその側鎖を誘導する。ABIS-45RCのHCVR配列と一致するための所望の置換は、F101であるので、PDBID:1NGY構造をCDR3の鋳型として採用した。次に、HCVR部分モデルを完成させるために、CDR鋳型フラグメントをフレームワーク鋳型にアンカーするために、その末端に2つの残基オーバーハングを使用して、CDR3鋳型を改変PDBID:1RURHCVR鋳型にグラフトした(PyMolにおいて)。
最後に、ABIS-45RCのHCVR配列と一致させるために、最適な回転異性体を選択して、HCVR部分モデルを手動で23個の位置で突然変異誘発に供した(PyMolにおいて)。
最終モデルアセンブリ
続いて、HCVRおよびLCVR部分モデルの最良の三次配置を選択して、最終モデルを組み立てた。HCVRおよびLCVR鋳型配列をパッキング角度予測サーバー(PAPS)(Abhinandan&Martin,2010.Protein Eng Des Sel.23(9):689-97)に提出して、予測される最良適合三次配置を見つけた。PAPSサーバーは、-45.6°の相対充填角を有する解明された抗体構造PDBID:1MNUが、HCVRおよびLCVRの最良の三次配置を提供すると予測した。したがって、HCVRおよびLCVR部分モデルの保存されたアンカーセグメントの主鎖座標をPDBID:1MNUに適合させることによって、最終モデルを組み立てた(PyMolにおいて)。
最後に、この最終モデルの座標は、GROMOS96力場(Scott et al.,1999.J Phys Chem A.103(19):3596-3607)を用いて、GROMACS(Van der Spoel et al.,2005.J Comput Chem.26(16):1701-18)を用いて一連のエネルギー最小化に供した。
ヒト生殖系列
ABIS-45RCのHCVRおよびLCVRのCDRグラフトバージョンの設計のために、3つのヒト生殖系列の2倍を選択した:
-HCVRについては、IGHV1-2*01、IGHV5-51*01およびIGHV3-11*05、ならびに
-LCVRの場合、IGKV1-9*01、IGKV6-21*02およびIGKV3-11*01。
ヒト化HCVRおよびLCVRの設計
HCVRおよびLCVRの両方のヒト化バージョンAは、CDR残基の変化を明示的に最小化および/または回避する保存的バージョンである。したがって、これらのバージョンは、キメラ抗体(ヒト定常領域[配列番号91および92]に融合したABIS-45RCのHCVR[配列番号61]ならびにLCVR[配列番号81])と同様またはより良好な結合および/または効力活性を与えると予想される。
HCVRおよびLCVRの両方のヒト化バージョンBは、少なくとも85%の最も近いヒト生殖細胞系との配列同一性のパーセンテージに達するように設計されている。これは、FRおよび/またはCDRアミノ酸残基を生殖細胞化(すなわち、マウス残基を対応するヒト生殖系列残基で置換すること)することによって達成することができる。85%は、抗体の国際一般名(INN)に関する2014年世界保健機関(WHO)ガイダンスによる「ヒト化」単位のサブステム-zu-を得るために必要なカットオフパーセンテージの同一性である。
HCVRおよびLCVRの両方のヒト化バージョンCは、ヒトらしさの最高度(すなわち、対応するヒト生殖細胞系との配列同一性の最高度)に達するように設計されている。相同性分子モデルの検査に続いて、いくつかの残基が生殖細胞系の候補として同定された。したがって、合理的に生殖系列化され得るすべての残基が考慮されている。
IGHV1-2*01を使用したHCVR
IGHV1-2*01からヒト化HCVRバージョンAを設計するために、マウスCDR(配列番号1、4および3を有する)をIGHV1-2*01にグラフトし、FR2およびFR3の4残基を親マウス残基に復帰突然変異させて、抗体の完全な活性を維持した。これらの残基は、配列番号61のI48、L70、A72およびV97である。得られたHCVRは、配列番号62に記載される通りであり、IGHV1-2*01ヒト生殖細胞系と81.6%の配列同一性を共有する。
IGHV1-2*01からヒト化HCVRバージョンBを設計するために、バージョンAに加えて、CDR2中の5アミノ酸残基をさらに生殖系列化した(すなわち、対応するIGHV1-2*01ヒト生殖系列残基によって置換された)。これらの残基は、配列番号61のD56G、A58T、S60Y、N61AおよびK65Qである。得られたHCVRは、配列番号65に記載される通りであり、IGHV1-2*01ヒト生殖細胞系と86.7%の配列同一性を共有する。
IGHV1-2*01からヒト化HCVRバージョンCを設計するために、バージョンBに加えて、CDR2中の2つのアミノ酸残基をさらに生殖系列化した。これらの残基は、配列番号61のD50RおよびE62Qである。得られたHCVRは、配列番号68に記載される通りであり、IGHV1-2*01ヒト生殖細胞系と88.8%の配列同一性を共有する。
IGHV1-2*01からのHCVRの様々な他のヒト化バージョンを、バージョンBから開始してさらに設計した。実際、十分にヒト化されたモノクローナル抗体を得るためには、85%が十分であると考えられる(IGHV1-2*01からのバージョンBは、IGHV1-2*01ヒト生殖細胞系と86.7%の配列同一性を共有する)。したがって、突然変異を導入するリスクを低減するために、バージョンD、E、F、GおよびHは、85%に達し、それ以上にならないように設計された。
IGHV1-2*01から得られたHCVRバージョンD、E、F、GおよびHは、それぞれ配列番号101、121、122、123および124に記載される通りであり、すべてIGHV1-2*01ヒト生殖細胞系と85.7%の配列同一性を共有する。
IGHV5-51*01を使用したHCVR
IGHV5-51*01からヒト化HCVRバージョンAを設計するために、マウスCDR(配列番号1、4および3を有する)をIGHV5-51*01にグラフトし、FR1、FR2およびFR3の6残基を親マウス残基に復帰突然変異させて、抗体の完全な活性を維持した。これらの残基は、配列番号61のA24、T28、I48、L70、L83およびV97である。得られたHCVRは、配列番号63に記載される通りであり、IGHV5-51*01ヒト生殖細胞系と79.6%の配列同一性を共有する。
IGHV5-51*01からヒト化HCVRバージョンBを設計するために、バージョンAに加えて、FR1中の1アミノ酸残基およびCDR2中の6アミノ酸残基をさらに生殖系列化した。これらの残基は、配列番号61のA24G、D56S、A58T、S60Y、N61S、K63SおよびK65Qである。得られたHCVRは、配列番号66に記載される通りであり、IGHV5-51*01ヒト生殖細胞系と86.7%の配列同一性を共有する。
IGHV5-51*01からヒト化HCVRバージョンCを設計するために、バージョンBに加えて、FR1中の1アミノ酸残基およびCDR2中の2アミノ酸残基をさらに生殖系列化した。これらの残基は、配列番号61のT28S、D50IおよびE62Pである。得られたHCVRは、配列番号69に記載される通りであり、IGHV5-51*01ヒト生殖細胞系と89.8%の配列同一性を共有する。
IGHV3-11*05を使用したHCVR
IGHV3-11*05からヒト化HCVRバージョンAを設計するために、マウスCDR(配列番号1、4および3を有する)をIGHV3-11*05にグラフトし、FR1、FR2およびFR3中の9残基を親マウス残基に復帰突然変異させて、抗体の完全な活性を維持した。これらの残基は、配列番号61のY27、T30、I48、G49、L70、A72、T74、A79およびV97である。得られたHCVRは、配列番号64に記載される通りであり、IGHV3-11*05ヒト生殖細胞系と76.5%の配列同一性を共有する。
IGHV3-11*05からヒト化HCVRバージョンBを設計するために、バージョンAに加えて、FR1中の2アミノ酸残基、CDR2中の6アミノ酸残基およびFR3中の1アミノ酸残基をさらに生殖系列化した。これらの残基は、配列番号61のY27F、T30S、D56S、A58T、S60Y、N61A、E62D、K63SおよびA79Lである。得られたHCVRは、配列番号67に記載される通りであり、IGHV3-11*05ヒト生殖細胞系と89.8%の配列同一性を共有する。
IGHV3-11*05からのヒト化HCVRバージョンCを設計するために、バージョンBに加えて、FR2中の1アミノ酸残基およびCDR2中の1アミノ酸残基をさらに生殖系列化した。これらの残基は、配列番号61のI48VおよびP53Sである。得られたHCVRは、配列番号70に記載される通りであり、IGHV3-11*05ヒト生殖細胞系と87.8%の配列同一性を共有する。
IGKV1-9*01を使用したLCVR
IGKV1-9*01からヒト化LCVRバージョンAを設計するために、マウスCDR(X12は、存在しない配列番号15、16および17)をIGKV1-9*01にグラフトし、FR2およびFR3の3残基を親マウス残基に復帰突然変異させて、抗体の完全な活性を維持した。これらの残基は、配列番号81のF35、W46およびY70である。得られたLCVRは、配列番号82に記載される通りであり、IGKV1-9*01ヒト生殖細胞系と83.2%の配列同一性を共有する。
IGKV1-9*01からヒト化LCVRバージョンBを設計するために、バージョンAに加えて、CDR1中の1アミノ酸残基およびFR2中の1アミノ酸残基をさらに生殖系列化した。これらの残基は、配列番号81のS24RおよびF35Yである。得られたLCVRは、配列番号85に記載される通りであり、IGKV1-9*01ヒト生殖細胞系と85.3%の配列同一性を共有する。
IGKV1-9*01からヒト化LCVRバージョンCを設計するために、バージョンBに加えて、CDR2中の2アミノ酸残基およびFR3中の1アミノ酸残基をさらに生殖系列化した。これらの残基は、配列番号81のN49A、P54QおよびY70Fである。得られたLCVRは、配列番号88に記載される通りであり、IGKV1-9*01ヒト生殖細胞系と88.4%の配列同一性を共有する。
ヒト生殖細胞系IGKV1-9*01に見られるような余分な残基(Ser、S)をCDR1に導入するために、IGKV1-9*01からのLCVRバージョンDをさらに設計した。CDR1ループへの余分な残基の導入は、結合活性が保存されたことを示した(データは示さず)。バージョンBのCDR1にセリン残基を導入すると、配列同一性が86.3%になるので、突然変異を導入するリスクを低減するために、Kabat残基L36を元のマウス残基Phe(F)に戻すバージョンDを設計した。得られたLCVRは、配列番号103に記載される通りである。
IGKV6-21*02を使用したLCVR
IGKV6-21*02からヒト化LCVRバージョンAを設計するために、マウスCDR(X12は、存在しない配列番号15、16および17)をIGKV6-21*02にグラフトし、FR2およびFR3中の4残基を親マウス残基に復帰突然変異させて、抗体の完全な活性を維持した。これらの残基は、配列番号81のF35、W46、Y48およびY70である。得られたLCVRは、配列番号83に記載される通りであり、IGKV6-21*02ヒト生殖細胞系と81.1%の配列同一性を共有する。
IGKV6-21*02からヒト化LCVRバージョンBを設計するために、バージョンAに加えて、CDR1中の1アミノ酸残基、FR2中の1アミノ酸残基、CDR2中の1アミノ酸残基およびFR3中の1アミノ酸残基をさらに生殖細胞系化した。これらの残基は、配列番号81のS24R、F35Y、L53SおよびY70Fである。得られたLCVRは、配列番号86に記載される通りであり、IGKV6-21*02ヒト生殖細胞系と85.3%の配列同一性を共有する。
IGKV6-21*02からヒト化LCVRバージョンCを設計するために、バージョンBに加えて、CDR3中の1アミノ酸残基をさらに生殖細胞系化した。この残基は、配列番号81のQ88Hである。得られたLCVRは、配列番号89に記載される通りであり、IGKV6-21*02ヒト生殖細胞系と86.3%の配列同一性を共有する。
IGKV3-11*01を使用したLCVR
IGKV3-11*01からヒト化LCVRバージョンAを設計するために、マウスCDR(X12は、存在しない配列番号15、16および17)をIGKV3-11*01にグラフトし、FR2およびFR3中の3残基を親マウス残基に復帰突然変異させて、抗体の完全な活性を維持した。これらの残基は、配列番号81のF35、W46およびY70である。得られたLCVRは、配列番号84に記載される通りであり、IGKV3-11*01ヒト生殖細胞系と84.2%の配列同一性を共有する。
IGKV3-11*01からヒト化LCVRバージョンBを設計するために、バージョンAに加えて、CDR1中の1アミノ酸残基をさらに生殖細胞系化した。この残基は、配列番号81のS24Rである。得られたLCVRは、配列番号87に記載される通りであり、IGKV3-11*01ヒト生殖細胞系と85.3%の配列同一性を共有する。
IGKV3-11*01からヒト化LCVRバージョンCを設計するために、バージョンBに加えて、FR2中の1アミノ酸残基、CDR2中の3アミノ酸残基およびFR3中の1アミノ酸残基をさらに生殖系列化した。これらの残基は、配列番号81のF35Y、L53R、P54A、S55およびY70Fである。得られたLCVRは、配列番号90に記載される通りであり、IGKV3-11*01ヒト生殖細胞系と90.5%の配列同一性を共有する。
ヒト化抗45RC抗体の産生、精製および特徴付け
分析サイズ排除クロマトグラフィー(SEC-HPLC)および示差走査熱量測定(DSC)を使用して、9つのヒト化抗45RC変異体A~Iのプロファイルおよび熱安定性をそれぞれ比較した。これらの変異体は、実施例5に記載される「バージョンA」HCVRおよびLCVRを含む抗体に対応する。分析サイズ排除クロマトグラフィー(SEC-HPLC)および示差走査熱量測定(DSC)も使用して、4つの他のヒト化抗45RC変異体A1、A2、I1およびI2のプロファイルおよび熱安定性をそれぞれ比較した。
材料および方法
SEC-HPLC
Superdex 200 Increase5/150GLカラム(GE Healthcare)を備えたShimadzu Prominence HPLCシステムを使用した。カラムは、試料分析中に使用したのと同じ緩衝液および条件(GE Healthcareの分子量SEC較正キットを使用して、PBS 1X中、0.25mL/分で、カラムオーブンを30℃に設定)で事前に較正した。
すべての試料を遠心分離し(20.000g、5分、4℃)、SEC分析の前に、IgG分析プログラムを備えたNanodrop ND-1000分光光度計によってそれらのタンパク質含有量を定量した。
アイソクラティックプログラムは、各試料約15μgを0.25mL/分で18分間注射するように設定した。SEC分析後、280nmクロマトグラムを生データから抽出し、ピーク積分によって分析した。
DSC
Microcal(商標)VP-キャピラリーDSCシステムを使用して、示差走査熱量測定実験を実行した。
1×PBS緩衝液中の試料を遠心分離し(20.000g、5分、4℃)、DSC分析の前に、それらのタンパク質含有量をIgG分析プログラムを用いてNanodrop ND-1000分光光度計で定量した。次いで、試料をPBSで希釈して1mg/mLの最終濃度にした。
予備平衡時間は3分であり、その後に続くサーモグラムは、60℃/時間の走査速度、25秒のフィルタリング時間および培地フィードバックで20℃~110℃の間で取得した。
試料分析の前に、5回の緩衝液/緩衝液スキャンを測定して装置を安定化し、各タンパク質/緩衝液スキャンの間に緩衝液/緩衝液スキャンを実行した。
データを非2状態アンフォールディングモデルに当てはめ、移行前後の調整されたベースラインを差し引いた。熱量エンタルピー(ΔH)は、遷移のピーク下の面積として決定する一方、van’t Hoffエンタルピー(ΔHv)は、使用されるモデルから決定する。
結果
SEC-HPLC
SECパラメータの概要を以下の表7に示す。
表7.ヒト化ABIS-45RC変異体A-I、A1、A2、I1およびI2のSECパラメータ。
Figure 2023518538000011
上記の表7は、抗CD45RC抗体(変異体A~H、I1およびI2の各々についてのピーク3、ならびに変異体I、A1およびA2の各々についてのピーク2)に対応するピークを太字で示し、RTおよび計算されたMWは、単量体抗体、非沈殿抗体および非解離抗体について予想される。
DSC
DSCパラメータの概要を以下の表8に示す。
表8.ヒト化ABIS-45RC変異体A-I、A1、A2、I1およびI2のDSCパラメータ。抗体の変性は、2つのステップで起こり、したがって2つの融解温度が各ステップのうちの1つに与えられる。
Figure 2023518538000012
ヒト化ABIS-45RC変異体A-Iの反応性
材料および方法
PBMCの単離
血液健常ボランティアを収集し、末梢血単核細胞(PBMC)をFicoll勾配遠心分離によって単離し、これにより顆粒球、血小板およびリーミング赤血球汚染物質などの血液製剤の望ましくない画分の除去が可能になる。
抗体およびフローサイトメトリー
ヒトPBMCをマウスABIS-45RC抗体またはヒト化ABIS-45RC抗体変異体A-Iの各々(2μg/mLおよび1μg/mL)、ならびに抗CD3抗体で標識した。マウスおよびヒト化ABIS-45RC抗体の反応性は、ビオチンロバ抗ヒトIgGストレプトアビジンPerCP-Cy5.5二次抗体を使用して明らかにした。
Canto IIサイトメーター(BD Biosciences)を使用して蛍光強度を測定し、データをFLOWJOソフトウェア(Tree Star Inc.)を使用して分析した。細胞を最初にそれらの形態によってゲートし、死細胞をDAPI陰性細胞を選択することによって除外した。
結果
ABIS-45RC抗体および市販の抗CD45RCMT2抗体の両方が同じエピトープについて競合する
ヒト化ABIS-45RC抗体(変異体A、図5A、変異体B、図5B、変異体C、図5C、変異体D、図5D、変異体E、図5E、変異体F、図5F、変異体G、図5G、変異体H、図5H、変異体I、図5I)またはマウスABIS-45RC(図5J)のいずれかによる標識は、抗体が同様の方法でヒトCD45RCを認識したことを示す。
操作された抗体
ABIS-45RCのLCVRのCDR1は、マウス抗体に固有のカノニカル構造を有し、10アミノ酸残基の長さを有する(X12が存在しない配列番号15、すなわち、SASSSVSYMH)。
実施例5に記載されるLCVRのヒト化バージョンA、BおよびCの設計のために、この10アミノ酸残基のCDR1を、復帰突然変異および/または生殖系列を有するが、残基の付加または欠失がないヒト生殖系列にグラフトした。しかしながら、ヒト生殖系列では、LCVRのCDR1は、11アミノ酸残基の最小長を有する。
したがって、ヒト化抗体のヒトらしさを増大させるために、本発明者らは、ABIS-45RCVL-CDR1「SASSSVSYMH」を操作して、それを1つの余分な残基だけ伸長させようと努めてきた。1つの候補位置は、配列番号15の8位(X12と示される)、すなわち配列番号81のS30とY31との間である。ヒト化設計の候補生殖系列のすべてにおいて、この位置は、Asn(N)、Ser(S)またはGly(G)で占められ、マウス生殖系列では、この位置は空である。
そのような挿入の構造的関連性および安定性を調べるために、ABIS-45RCVL-CDR1を、アスパラギン、すなわち配列番号15の挿入によって拡大し、X12は、Asn(N)、すなわちSASSSVSYMHであった。次いで、タンパク質BLASTを介して、解明された抗体構造の配列の検索を行った。トップヒットは、構造PDBID:5CMAのLCVR CDR1であった。続いて、この構造セグメントを、その末端にある2残基オーバーハングを使用してABIS-45RCモデルにグラフトして、CDR鋳型フラグメントをモデルにアンカーした。さらなる残基を収容するために、隣接残基をシフトさせる配座変化があり、それによってY70とのわずかな立体衝突を呈することが観察された。しかしながら、すべてのヒト生殖系列において、この残基は、より適応性の高いフェニルアラニンである。
操作されたマウス抗体
上記に基づいて、本発明者らは、VL-CDR1にアスパラギン残基(Asn、N)を挿入し、配列番号81のY70をフェニルアラニン(Phe、F)にさらに突然変異させることによって、ABIS-RC45抗体を操作した。得られた「人工Asn/PheABIS-RC45」LCVRは、配列番号71に記載され、X12は、Asn(N)である。
他の2つのマウス抗体も同様に、VL-CDR1にセリン残基(Ser、S)またはグリシン残基(Gly、G)を挿入し、さらに配列番号81のY70をフェニルアラニン(Phe、F)に突然変異させることによって産生された。得られた2つの「人工Ser/PheABIS-RC45」および「人工Gly/PheABIS-RC45」LCVRは、配列番号71に記載され、X12は、それぞれSer(S)またはGly(G)である。
操作されたヒト化抗体
上記に基づいて、配列番号72~80に記載されるように、操作されたヒト化LCVRバージョンA、BおよびC(実施例5に記載)をさらに設計することができ、X12は、Asn(N)、Ser(S)またはGly(G)であり、70位の残基は、Phe(F)である。
操作されたAsn/PheABIS-45RCの反応性
材料および方法
健常志願者からの血液を採取し、末梢血単核細胞(PBMC)を、顆粒球、血小板およびリーミング赤血球汚染物質などの血液製剤の望ましくない画分の除去を可能にするFicoll勾配遠心分離によって単離した。
ヒトPBMCを、ABIS-45RCまたは操作されたAsn/PheABIS-45RCおよび抗CD3抗体で標識した。ビオチンロバ抗ヒトIgGストレプトアビジンPerCP-Cy5.5二次抗体を使用して反応性を明らかにした。
Canto IIサイトメーター(BD Biosciences)を使用して蛍光強度を測定し、データをFLOWJOソフトウェア(Tree Star Inc.)を使用して分析した。細胞を最初にそれらの形態によってゲートし、死細胞をDAPI陰性細胞を選択することによって除外した。
結果
図6に示されるように、ABIS-45RC(左パネル)または操作されたAsn/PheABIS-45RC(右パネル)のいずれかによる標識化は、両方の抗体が同様の様式でヒトCD45RCを認識したことを示す。
ヒト化ABIS-45RCの反応性
材料および方法
健常志願者からの血液を採取し、末梢血単核細胞(PBMC)を、顆粒球、血小板およびリーミング赤血球汚染物質などの血液製剤の望ましくない画分の除去を可能にするFicoll勾配遠心分離によって単離した。
ヒトPBMCを、20、5、1.25または0.3μg/mLのABIS-45RCまたはヒト化ABIS-45RCおよび抗CD3抗体で標識した。ビオチンロバ抗ヒトIgGストレプトアビジンPercpCy5.5二次抗体を使用して反応性を明らかにした。
Canto IIサイトメーター(BD Biosciences)を使用して蛍光強度を測定し、データをFLOWJOソフトウェア(Tree Star Inc.)を使用して分析した。細胞を最初にそれらの形態によってゲートし、死細胞をDAPI陰性細胞を選択することによって除外した。
結果
様々な濃度のマウスABIS-45RC(図7A)またはヒト化ABIS-45RC変異体A1(図7B)または変異体A3(図7C)のいずれかによる標識化は、両方の抗体が同様の方法でヒトCD45RCを認識したことを示す。
ヒト化ABIS-45RC変異体による細胞死誘導
材料および方法
ヒトPBMCを培地、アイソタイプコントロールAbまたは抗CD45RC変異体(10μg/mL)とともに6時間インキュベートした。次いで、細胞を抗CD3および抗CD45RA、アネキシンVおよびDAPIで染色した。総アポトーシスのパーセンテージを、フローサイトメトリーによってT細胞または非T細胞の中のDAPIアネキシンV+DAPIアネキシンV細胞をゲーティングすることによって得た。
結果
ABIS-45RCまたはヒト化変異体A1またはA3は、CD3細胞の細胞死を効率的に誘導したが(図8A)、CD3細胞の細胞死を誘導しなかった(図8B)。
ABIS-45RCおよびヒト化変異体A1によるヒト皮膚拒絶の治療
材料および方法
PBMCの単離
健康な個体からEtablissement Francais du Sang(Nantes,France)で血液を収集した。書面によるインフォームドコンセントを施設のガイドラインに従って提供した。PBMCをFicoll-Paque密度勾配遠心分離(Eurobio,Courtaboeuf,France)によって単離した。残りの赤血球および血小板を低張液および遠心分離で排除した。
動物
8~12週齢のNOD/SCID/IL2Rγ-/-(NSG)マウスをSPF条件で本発明者ら自身の動物施設で飼育した(認定番号C44-278)。
ヒト皮膚移植モデル
ヒトの皮膚を、腹部形成術の健常志願者から得て、移植を以前に記載されたように実行した(Bezie et al.,2018.Front Immunol.8:2014)。1ヶ月後、同種異系健常志願者からの5×10個のPBMCに、抗体の有無にかかわらず静脈内注射した。
移植片拒絶を、乾燥(スコア1)、剛性(スコア2)、痂皮(スコア3)、部分的喪失(スコア4)および肉眼的観察による皮膚の完全喪失(スコア5)に基づいて0~5までスコア化した。
ヒトPBMCの生着をフローサイトメトリーによって血液中で監視した。
処置
NSGマウスを、0日目~20日間にわたって2.5日ごとに0.8mg/kgの精製ABIS-45RC抗体またはヒト化変異体A1抗体で腹腔内処置するとともに、0日目~10日目までラパマイシンを0.4mg/日の最適以下の用量で腹腔内投与した。
結果
PBMCによる処置は体重減少のみを誘発し、14日目頃に開始し、図9に示すように、33日目までにすべてのマウスが死亡した。
本発明者らは以前に、ラパマイシンのみによる処置は生存期間を延長しなかったことを示した(生存期間中央値:21日(Bezie et al.,2018.Front Immunol.8:2014))。ここで、ABIS-45RCまたはヒト化変異体A1による処置は、皮膚移植片拒絶を完全に無効にした。
CD45RC-CARを用いた細胞操作
材料および方法
レンチウイルスベクター
CAR-CD45Rをコードする自己不活性化第二世代レンチウイルスベクターを生成した。このベクターにおいて、EF1αプロモーターは、以下の配列を指示された順序で制御する:シグナルペプチド、リンカーによって融合された抗CD45RCmAb(ABIS-45RC)の重鎖および軽鎖の可変領域、CD8-CD28共刺激シグナル領域の膜貫通領域、CD3ゼータ形質導入シグナル領域、P2A自己スプライシング配列、GFP。レンチウイルスベクターをVSV-Gでシュードタイプ化した。対照として使用したCtrl-CARは、EF1αプロモーターの制御下にあるCD45RC(CD8-CD28共刺激シグナル領域の膜貫通領域およびCD3ゼータ形質導入シグナル)ならびにCMVプロモーターの制御下にあるLNGFR以外の抗原特異性を有するモノクローナル抗体の可変重鎖および可変軽鎖をコードする。このCtrl-CARレンチウイルスベクターもVSV-Gシュードタイプ化した。
細胞形質導入
HEK(293)またはJurkat細胞を回収し、1日目に計数し、次いで、2mLのDMEM10%FBS、10μg/mLペニシリン-ストレプトマイシン、2nM L-グルタミン中500000細胞/ウェルで6ウェルプレートに播種した。2日目に、培地をピペッティングによって除去し、2mLの新鮮な培地(37℃で予熱)を加える。並行して、1ウェルあたり500μLの以下の調製物を加えた:
-室温(RT)で5分間、-2.5μgのDNAを250μLのOptimem(Gibco,life technology)で希釈する
-10μLのリポフェクタミン(商標)2000(Life technology,Invitrogen)を250μLのOptimem中で室温にて5分間希釈する
-DNAとリポフェクタミンとを室温で20分間混合する。
GFP検出
Canto IIサイトメーター(BD Biosciences)を使用して蛍光強度を測定し、データをFLOWJOソフトウェア(Tree Star Inc.)を使用して分析した。細胞をそれらの形態によってゲートし、次いで、DAPI陰性細胞を選択することによって死細胞を除外した。細胞をプロテインL(Genscript)で染色した後、フローサイトメトリーによってGFPを分析した。
結果
CARは、少なくとも1つの細胞外ドメイン、任意選択でヒンジドメイン、膜貫通ドメイン、少なくとも1つの共刺激ドメインおよび少なくとも1つの一次シグナル伝達ドメインを有するように設計された(図10)。本発明の1つのCAR構築物は、scFvCD45RC、CD8aヒンジドメインおよび膜貫通ドメイン、CD28共刺激ドメインおよびCD3ζ一次シグナル伝達ドメインを有するCARである。任意選択で、GFPコード配列は、T2A自己スプライシング配列(図示せず)によってそれらから分離されたCD45RC-CAR配列のすぐ3’に存在し得る。この場合、GFPは、CAR-CD45RC発現の代用マーカーとして使用され得る。
本発明者らは、GFP染色によって示されるように、HEK細胞がGFPモックプラスミドと比較してCD45RC-CARでトランスフェクトされ得ることを示した(図11)。加えて、このCAR構築は、ヒト不死化T細胞株(Jurkat)においてレンチウイルスベクターで形質導入することもできる。実際、CARの存在を示すGFPのレベルは、CD45RCCARを形質導入されたJurkat細胞では58.7%であり、形質導入されていないJurkat細胞ではわずか1.25%である(図12)。特に、Jurkat細胞におけるCARの表面発現は、プロテインL染色によって確認され、GFP染色との良好な相関を実証し、レンチウイルスが機能的であることを全体的に実証した(図13)。
標的T細胞アポトーシスのCD45RC-CAR誘導
材料および方法
全T細胞を、ヒトPBMCから磁気選別(Miltenyi Biotech)を使用して陰性選別した。細胞をCPD 670で標識し、完全培地RPMI中の1ウェルあたり(20,000細胞の96ウェルボトムVプレートに播種した(10%SVF、アミノ酸、ペニシリン/ストレプトマイシン、グルタミン、ピルビン酸ナトリウム、HEPES)。100,000個のJurkat細胞を完全DMEM培地中96ウェル底プレートに播種し、実施例13に記載される10uLのCD45RC-CARまたはCtrl-CAR対照レンチウイルスベクターで形質導入し、37℃で2日間インキュベートした。次いで、ジャーカット細胞を計数し、完全RPMI培地(比1:0-1:1-1:5-1:10)中の異なる比のT:ジャーカット細胞でT細胞に加えた。細胞を37℃で18時間インキュベートした。インキュベーション後、細胞をアネキシン緩衝液中のアネキシンVで20分間標識した。DAPIをアネキシン緩衝液に加え、細胞をCanto IIサイトメーター(BD Biosciences)で直接分析した。
結果
ヒトT細胞を、Ctrl-CARのCD45RC-CARを予め形質導入したJurkat細胞の存在下で18時間培養し、次いで、アポトーシスをフローサイトメトリーによって評価した。CD45RC-CARを有するJurkat細胞の存在下では、T細胞は15%アポトーシスであり、Ctrl-CARまたは形質導入されていない細胞ではわずか7~8%であった(図14)。観察されたアポトーシスのレベルは、抗CD45RC抗体で得られたレベルと同等であった。したがって、CD45RC-CARを発現するJurkat細胞は、ヒトT細胞においてアポトーシスを誘導することができる。
T細胞活性化のCD45RC-CAR誘導
材料および方法
全T細胞を、ヒトPBMCから磁気選別(Miltenyi Biotech)を使用して陰性選別した。細胞をCPD 670で標識し、完全培地RPMI中の1ウェルあたり(20,000細胞の96ウェルボトムVプレートに播種した(10%SVF、アミノ酸、ペニシリン/ストレプトマイシン、グルタミン、ピルビン酸ナトリウム、HEPES)。100,000個のJurkat細胞を完全DMEM培地中96ウェル底プレートに播種し、実施例13に記載される10uLのCD45RC-CARまたはCtrl-CAR対照レンチウイルスベクターで形質導入し、37℃で2日間インキュベートした。次いで、ジャーカット細胞を計数し、完全RPMI培地(比1:0-1:1-1:5-1:10)中の異なる比のT:ジャーカット細胞でT細胞に加えた。細胞を37℃で18時間インキュベートした。インキュベーション後、細胞を抗CD69 mAbで20分間標識した。DAPIを加え、細胞をCanto IIサイトメーター(BD Biosciences)で直接分析した。
結果
ヒトT細胞を、CD45RC-CARまたはCtrl-CARを形質導入したJurkat細胞の存在下で18時間培養し、その後、T細胞活性化を、CD69活性化マーカーを使用するフローサイトメトリーによって測定した。
本発明者らは、CD45RC-CARが、Ctrl-CARおよび形質導入されていないJurkat細胞と比較して、T細胞活性化(CD69発現によって示される)を誘導することを観察した。興味深いことに、細胞が選別される場合、すなわち、CD45RC-CARがすべての細胞によって発現される場合、活性化は、選別されていないCD45RC-CAR Jurkat細胞と比較してさらに良好である(図15)。全体として、これはCARが機能的であることを示した。
CD4Treg活性化および標的T細胞アポトーシスのCD45RC-CAR誘導
材料および方法
CD4Tregレンチウイルス形質導入および拡大プロトコル
0日目に、CD4CD127low CD25CD45RCTregをFACSAria(商標)で選別し、1μg/mLの抗CD3モノクローナル抗体(クローンOKT3)で予めコーティングした96ウェル平底プレート中に100μLの培地あたり10細胞で播種した。0日目に使用した培地は、ペニシリン、ストレプトマイシン、ピルビン酸ナトリウム、HEPES緩衝液、アミノ酸、グルタミン、5%CTS血清、抗CD28 mAb(1μg/mLのクローンCD28.2)および1000U/mL IL-2を補充したRPMI1640であった。1日目および2日目に、抗CD45RCキメラ抗原受容体(CD45RC-CAR)およびGFP、または異なる抗原特異性を有する対照CAR(Ctrl-CAR)およびLNGFRをコードする、実施例13に記載されるレンチウイルスベクター10μLを細胞に形質導入した。3日目に、10%CTSの血清最終濃度に達するように培地を加えた。7日目に、細胞を回収し、GFPまたはLNGFRに基づくCAR発現に基づいて選別し、次いで、抗CD3および抗CD28 mAbで新たに刺激して、2回目の7日間の拡大を行った。サイトカインを2日ごとに培地に新たに加え、必要に応じて新鮮な培地を加えた。
CD45RC-CAR検出
HEK 293T細胞にも、1日目に1回、CD45RC-CARをコードするレンチウイルスを形質導入した。CD4Tregに、上記で説明したようにレンチウイルスを形質導入した。HEK 293TおよびCD4Tregを最後の形質導入の5日後に分析した。細胞をヒトFcブロック(BD Biosciences)で処理し、次いで、PBSBSA1%に希釈した社内でビオチン化した2μg/mLのCD45R-ABCタンパク質(R&D)とともに4℃で1時間インキュベートした。4μg/mLのストレプトアビジン-APC-Cy7を用いてCD45R-ABC-ビオチンタンパク質を明らかにした。死細胞を除外するためにDAPIを加え、細胞をFACSCanto(商標)で分析した。
CAR媒介活性化アッセイ
全部で10個のCD45RC-CAR CD4TregまたはCtrl-CAR CD4Tregを、完全培地RPMI(10%CTS血清、アミノ酸、ペニシリン/ストレプトマイシン、グルタミン、ピルビン酸ナトリウム、HEPES)中でCD45R-ABCタンパク質(PBS中1μg/mL、37℃で1時間30分)で予めコーティングした96ウェルU底プレートに播種した。細胞を37℃で24時間インキュベートし、ブレフェルジンAを培養の最後の4時間に加えた。インキュベーション後、細胞を生存色素でマークし、抗CD69、抗CD25、抗CD71mAbで30分間細胞外染色した。細胞を固定し、透過処理し、抗CTLA-4mAbで1時間細胞内染色した。細胞をFACSCanto(商標)で分析した。
アポトーシスアッセイ
ヒトPBMCをCPD670で標識し、完全培地RPMI(10%ヒトAB血清、アミノ酸、ペニシリン/ストレプトマイシン、グルタミン、ピルビン酸ナトリウム、HEPES)中の96ウェルV底プレート(50,000細胞/ウェル)に播種した。CD45RC-CARまたはCtrl-CARを形質導入されていないまたは形質導入されたCD4Tregを拡大の15日後に計数し、完全RPMI培地中でPBMC:Tregの異なる比で同種PBMCに加えた(比1:0-1:1-1:2-1:5)。細胞を37℃で4時間インキュベートした。インキュベーション後、細胞を抗CD3、抗CD19、抗CD14、抗CD56および抗CD45RAmAbで染色し、次いで、細胞をアネキシン緩衝液中のアネキシンVで20分間標識した。DAPIをアネキシン緩衝液に加え、細胞をFACSCanto(商標)で迅速に分析した。抗CD45RAmAbを、各細胞サブセットにおけるCD45RChigh細胞の同定のための代用マーカーとして使用した。アポトーシスの対照として、ABIS-45RCをPBMCと10μg/mLでインキュベートした。全アポトーシス細胞のパーセンテージを、アネキシンDAPI細胞およびアネキシンDAPI細胞の合計によって計算した。
結果
ヒトHEK293に、CD45RC-CARおよびGFPをコードするレンチウイルスベクターを形質導入し、細胞蛍光定量法によって分析した(図16)。ビオチンで標識され、ストレプトアビジン-APC-Cy7で明らかにされたCD45R-ABCタンパク質を使用するCD45RC-CAR検出は、形質導入されていない細胞と比較して、明確な陽性シグナルおよびGFPとの共発現を示し、CD45RC-CARが発現され、CD45RCに対するその特異性において機能的であることを実証した。
CD45RC-CARによるCD4Tregの形質導入、および7日目にGFPを使用した細胞選別選択、引き続いて14日間のインビトロ拡大により、形質導入細胞の74.38%+/-17.3%の集団の獲得が可能になり(図17)、CD4Tregを形質導入することができること、およびCD45RC-CAR CD4Tregを拡大させることができることが実証された。
次いで、本発明者らは、細胞をCD45R-ABCタンパク質とインキュベートし、細胞蛍光定量法によって活性化マーカーを分析することによって、CD45RC-CARを形質導入され拡大されたCD4Tregの活性化を分析した(図18)。それらは、CD45RC-CARによって形質導入されたがCtrl-CARによって形質導入されなかったCD4Tregにおいて、CD45R-ABCタンパク質と24時間インキュベートしたときにCD69、CD25、CD71およびCTLA-4のタンパク質発現の増加を観察し、CARがTregをシグナル伝達し、直接活性化していることを実証した。
14日間の拡大後の同種CARを形質導入したまたは形質導入していないCD4TregによるPBMCの異なる細胞集団でのアポトーシスを分析し、CD45RC-CARを作製するために使用した抗CD45RC mAbで得られたアポトーシスと比較した(図19)。本発明者らは、CD45RC-CARを形質導入されたCD4Tregが、アポトーシスを誘導しなかったCtrl-CARおよび形質導入されていないCD4Tregとは対照的に、抗CD45RC mAbと同等のCD45RChighT細胞のアポトーシスを誘導したことを観察した。CD45RC-CAR CD4Tregのこのアポトーシス効果は用量依存的であり、PBMC:CD4Tregの比率が高いほど増加した。
まとめると、これらの結果は、CD45RC-CARがCD45RC-CAR形質導入CD4Tregの活性化を誘導したので、CD45RC-CARが機能的であることを示した。さらに、CD45RC-CARを形質導入されたCD4Tregは、CD45RChighT細胞のアポトーシスを誘導した。

Claims (15)

  1. ヒトCD45RCに特異的なキメラ抗原受容体(CAR)であって、前記CARが、
    (a)少なくとも1つの細胞外結合ドメインであって、前記結合ドメインが、前記ヒトCD45RCに結合する、少なくとも1つの細胞外結合ドメイン、
    (b)任意選択で、少なくとも1つの細胞外ヒンジドメイン、
    (c)少なくとも1つの膜貫通ドメイン、ならびに
    (d)少なくとも1つの細胞内シグナル伝達ドメインであって、前記細胞内ドメインが、少なくとも1つのT細胞一次シグナル伝達ドメインおよび任意選択で少なくとも1つのT細胞共刺激シグナル伝達ドメインを含む、少なくとも1つの細胞内シグナル伝達ドメイン、を含む、キメラ抗原受容体(CAR)。
  2. 前記細胞外結合ドメインが、ヒトCD45RCに結合する少なくとも1つの抗原結合フラグメントを含み、前記抗原結合フラグメントが、
    (a)以下の3つのCDRを含むHCVR:
    (i)配列番号1の配列のV-CDR1、
    (ii)配列番号4、5、6、8、100、116、117、118および119の配列を含む群から選択される配列を有するV-CDR2、および
    (iii)配列番号3の配列のV-CDR3、ならびに
    (b)以下の3つのCDRを含むLCVR:
    (i)配列番号15(SASSSVS-X12-YMH)および18(RASSSVS-X12-YMH)(X12は存在しないか、またはAsn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される)の配列を含む群から選択される配列を有するV-CDR1、
    (ii)配列番号16、111および120の配列を含む群から選択される配列を有するVL-CDR2、および
    (iii)配列番号17の配列のV-CDR3、を含む、請求項1に記載のCAR。
  3. 前記細胞外結合ドメインが、ヒトCD45RCに結合する少なくとも1つの抗原結合フラグメントを含み、前記抗原結合フラグメントが、
    (a)以下の3つのCDRを含むHCVR:
    (i)配列番号1の配列のV-CDR1、
    (ii)配列番号4および5の配列を含む群から選択される配列を有するV-CDR2、および
    (iii)配列番号3の配列のV-CDR3、ならびに
    (b)以下の3つのCDRを含むLCVR:
    (i)配列番号15(X12は存在しない)の配列のV-CDR1、
    (ii)配列番号16の配列のV-CDR2、および
    (iii)配列番号17の配列のV-CDR3、を含む、請求項1または2に記載のCAR。
  4. 前記細胞外結合ドメインが、ヒトCD45RCに結合する少なくとも1つの抗原結合フラグメントを含み、前記抗原結合フラグメントが、
    (a)以下の3つのCDRを含むHCVR:
    (i)配列番号1の配列のV-CDR1、
    (ii)配列番号4のV-CDR2、および
    (iii)配列番号3の配列のV-CDR3、ならびに
    (b)以下の3つのCDRを含むLCVR:
    (i)配列番号15(X12は存在しない)の配列のV-CDR1、
    (ii)配列番号16の配列のV-CDR2、および
    (iii)配列番号17の配列のV-CDR3、を含む、請求項1~3のいずれか一項に記載のCAR。
  5. 前記細胞外結合ドメインが、ヒトCD45RCに結合する少なくとも1つの抗原結合フラグメントを含み、前記抗原結合フラグメントが、
    (a)以下の3つのCDRを含むHCVR:
    (i)配列番号1の配列のV-CDR1、
    (ii)配列番号4、6および100の配列を含む群から選択される配列を有するV-CDR2、および
    (iii)配列番号3の配列のV-CDR3、ならびに
    (b)以下の3つのCDRを含むLCVR:
    (i)配列番号15および18(X12は存在しない)の配列を含む群から選択される配列を有するV-CDR1、
    (ii)配列番号16、111および120の配列を含む群から選択される配列を有するVL-CDR2、および
    (iii)配列番号17の配列のV-CDR3、を含む、請求項1~4のいずれか一項に記載のCAR。
  6. 前記細胞外結合ドメインが、ヒトCD45RCに結合する少なくとも1つの抗原結合フラグメントを含み、前記抗原結合フラグメントが、
    1)配列番号61の配列のHCVRおよび配列番号81の配列のLCVR、
    2)配列番号62の配列のHCVRおよび配列番号82の配列のLCVR、
    3)配列番号62の配列のHCVRおよび配列番号83の配列のLCVR、
    4)配列番号62の配列のHCVRおよび配列番号84の配列のLCVR、
    5)配列番号63の配列のHCVRおよび配列番号82の配列のLCVR、
    6)配列番号63の配列のHCVRおよび配列番号83の配列のLCVR、
    7)配列番号63の配列のHCVRおよび配列番号84の配列のLCVR、
    8)配列番号64の配列のHCVRおよび配列番号82の配列のLCVR、
    9)配列番号64の配列のHCVRおよび配列番号83の配列のLCVR、
    10)配列番号64の配列のHCVRおよび配列番号84の配列のLCVR、
    11)配列番号101の配列のHCVRおよび配列番号85の配列のLCVR、
    12)配列番号101の配列のHCVRおよび配列番号103の配列のLCVR、
    13)配列番号65の配列のHCVRおよび配列番号85の配列のLCVR、
    14)配列番号65の配列のHCVRおよび配列番号103の配列のLCVR、
    15)配列番号62の配列のHCVRおよび配列番号85の配列のLCVR、
    16)配列番号101の配列のHCVRおよび配列番号82の配列のLCVR、
    17)配列番号121の配列のHCVRおよび配列番号85の配列のLCVR、
    18)配列番号122の配列のHCVRおよび配列番号85の配列のLCVR、
    19)配列番号123の配列のHCVRおよび配列番号85の配列のLCVR、
    20)配列番号124の配列のHCVRおよび配列番号85の配列のLCVR、
    21)配列番号63の配列のHCVRおよび配列番号85の配列のLCVR、
    22)配列番号67の配列のHCVRおよび配列番号85の配列のLCVR、
    23)配列番号67の配列のHCVRおよび配列番号103の配列のLCVR、
    24)配列番号61の配列のHCVRおよび配列番号113の配列のLCVR、
    25)配列番号61の配列のHCVRおよび配列番号126の配列のLCVR、または
    26)1)~23)に記載のHCVRおよびLCVRの非CDR領域の配列と少なくとも70%の同一性を共有する非CDR領域の配列を含むHCVRおよびLCVR、を含む、請求項1~5のいずれか一項に記載のCAR。
  7. 前記細胞外結合ドメインが、ヒトCD45RCに結合する少なくとも1つの抗原結合フラグメントを含み、前記抗原結合フラグメントが、
    (a)以下の3つのCDRを含むHCVR:
    (i)配列番号1の配列のV-CDR1、
    (ii)配列番号4、5、6、8、100、116、117、118および119の配列を含む群から選択される配列を有するVH-CDR2、および
    (iii)配列番号3の配列のV-CDR3、ならびに
    (b)以下の3つのCDRを含むLCVR:
    (i)配列番号15および18(配列番号15および18中のX12は、Asn(N)、Ser(S)およびGly(G)から選択される)の配列を含む群から選択される配列を有するV-CDR1、
    (ii)配列番号16の配列のV-CDR2、および
    (iii)配列番号17の配列のV-CDR3、を含み、
    好ましくは、前記LCVRのKabat位置L71のアミノ酸残基が、Phe(F)である、請求項1~6のいずれか一項に記載のCAR。
  8. (i)好ましくは配列番号61の配列を有するHCVRおよび好ましくは配列番号134の配列を有するリンカーによって結合された、配列番号81の配列を有するLCVRを含む抗ヒトCD45RC scFv、
    (ii)好ましくは配列番号145の配列を有するCD8αに由来するヒンジドメイン、
    (iii)好ましくは配列番号153の配列を有するヒトCD8α膜貫通ドメイン、ならびに
    (iv)好ましくは配列番号167の配列を有するヒトCD28シグナル伝達ドメインおよび好ましくは配列番号157の配列を有するヒトCD3ゼータシグナル伝達ドメインを含む細胞内シグナル伝達ドメイン、を含む、請求項1~7のいずれか一項に記載のCAR。
  9. 請求項1~8のいずれか一項に記載のCARをコードする核酸。
  10. 請求項9に記載の核酸を含む発現ベクター。
  11. 免疫細胞集団であって、請求項1~8のいずれか一項に記載のCARを細胞表面に発現するように操作された、免疫細胞集団。
  12. 前記免疫細胞集団が、調節性T細胞集団であり、好ましくは、前記調節性T細胞集団が、CD4CD25Foxp3Treg、Tr1細胞、TGF-β分泌Th3細胞、調節性NKT細胞、調節性γδ T細胞、調節性CD8T細胞および二重陰性調節性T細胞からなる群から選択される、請求項11に記載の免疫細胞集団。
  13. 組成物であって、請求項1~8のいずれか一項に記載のCARを細胞表面に発現するように操作された少なくとも1つの免疫細胞集団を含み、前記組成物が、好ましくは少なくとも1つの薬学的に許容される賦形剤または担体をさらに含む医薬組成物である、組成物。
  14. 医薬として使用するための、請求項11もしくは請求項12に記載の免疫細胞集団、または請求項13に記載の医薬組成物。
  15. 免疫寛容の誘導、移植拒絶の予防もしくは低減、または移植片対宿主病(GVHD)の予防もしくは治療における使用、あるいは、それを必要とする対象における自己免疫疾患、望まれない免疫応答、単一遺伝子疾患、リンパ腫および癌からなる群から選択されるCD45RChigh関連状態の予防、低減および/または治療における使用のための、請求項11もしくは請求項12に記載の免疫細胞集団、または請求項13に記載の組成物。

JP2022555951A 2020-03-20 2021-03-19 ヒトcd45rcに特異的なキメラ抗原受容体およびその使用 Pending JP2023518538A (ja)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
EP20305298.0 2020-03-20
EP20305298 2020-03-20
PCT/EP2021/057132 WO2021186056A1 (en) 2020-03-20 2021-03-19 Chimeric antigen receptor specific for human cd45rc and uses thereof

Publications (2)

Publication Number Publication Date
JP2023518538A true JP2023518538A (ja) 2023-05-02
JPWO2021186056A5 JPWO2021186056A5 (ja) 2024-03-27

Family

ID=71465223

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP2022555951A Pending JP2023518538A (ja) 2020-03-20 2021-03-19 ヒトcd45rcに特異的なキメラ抗原受容体およびその使用

Country Status (11)

Country Link
US (1) US20230147657A1 (ja)
EP (1) EP4121457A1 (ja)
JP (1) JP2023518538A (ja)
KR (1) KR20230004510A (ja)
CN (1) CN115916823A (ja)
AU (1) AU2021237790A1 (ja)
BR (1) BR112022018795A2 (ja)
CA (1) CA3172120A1 (ja)
IL (1) IL296546A (ja)
MX (1) MX2022011683A (ja)
WO (1) WO2021186056A1 (ja)

Families Citing this family (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20230032871A1 (en) * 2021-07-14 2023-02-02 Innovative Cellular Therapeutics Holdings, Ltd. Recombinant Viral Particle for Gene and/or Cellular Therapy

Family Cites Families (39)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5858358A (en) 1992-04-07 1999-01-12 The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Navy Methods for selectively stimulating proliferation of T cells
US6534055B1 (en) 1988-11-23 2003-03-18 Genetics Institute, Inc. Methods for selectively stimulating proliferation of T cells
US6352694B1 (en) 1994-06-03 2002-03-05 Genetics Institute, Inc. Methods for inducing a population of T cells to proliferate using agents which recognize TCR/CD3 and ligands which stimulate an accessory molecule on the surface of the T cells
US6905680B2 (en) 1988-11-23 2005-06-14 Genetics Institute, Inc. Methods of treating HIV infected subjects
DE3920358A1 (de) 1989-06-22 1991-01-17 Behringwerke Ag Bispezifische und oligospezifische, mono- und oligovalente antikoerperkonstrukte, ihre herstellung und verwendung
US5585362A (en) 1989-08-22 1996-12-17 The Regents Of The University Of Michigan Adenovirus vectors for gene therapy
DE69233528T2 (de) 1991-11-25 2006-03-16 Enzon, Inc. Verfahren zur Herstellung von multivalenten antigenbindenden Proteinen
US5350674A (en) 1992-09-04 1994-09-27 Becton, Dickinson And Company Intrinsic factor - horse peroxidase conjugates and a method for increasing the stability thereof
SE9400088D0 (sv) 1994-01-14 1994-01-14 Kabi Pharmacia Ab Bacterial receptor structures
US7175843B2 (en) 1994-06-03 2007-02-13 Genetics Institute, Llc Methods for selectively stimulating proliferation of T cells
US6692964B1 (en) 1995-05-04 2004-02-17 The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Navy Methods for transfecting T cells
US7067318B2 (en) 1995-06-07 2006-06-27 The Regents Of The University Of Michigan Methods for transfecting T cells
US6673901B2 (en) 1997-06-12 2004-01-06 Research Corporation Technologies, Inc. Artificial antibody polypeptides
CA2386270A1 (en) 1999-10-15 2001-04-26 University Of Massachusetts Rna interference pathway genes as tools for targeted genetic interference
US6326193B1 (en) 1999-11-05 2001-12-04 Cambria Biosciences, Llc Insect control agent
ES2302726T3 (es) 2000-02-24 2008-08-01 Invitrogen Corporation Estimulacion y concentracion simultanea de celulas.
US6867041B2 (en) 2000-02-24 2005-03-15 Xcyte Therapies, Inc. Simultaneous stimulation and concentration of cells
US7572631B2 (en) 2000-02-24 2009-08-11 Invitrogen Corporation Activation and expansion of T cells
US6797514B2 (en) 2000-02-24 2004-09-28 Xcyte Therapies, Inc. Simultaneous stimulation and concentration of cells
WO2001096584A2 (en) 2000-06-12 2001-12-20 Akkadix Corporation Materials and methods for the control of nematodes
US7745140B2 (en) 2002-01-03 2010-06-29 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Activation and expansion of T-cells using an engineered multivalent signaling platform as a research tool
US8501464B2 (en) 2003-04-24 2013-08-06 Ospedale San Raffaele S.R.L. Lentiviral vectors carrying synthetic bi-directional promoters and uses thereof
ES2653570T3 (es) 2004-05-27 2018-02-07 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Células presentadoras de antígeno artificiales novedosas y usos de las mismas
US20070036773A1 (en) 2005-08-09 2007-02-15 City Of Hope Generation and application of universal T cells for B-ALL
US20070191272A1 (en) 2005-09-27 2007-08-16 Stemmer Willem P Proteinaceous pharmaceuticals and uses thereof
GB0603081D0 (en) 2006-02-15 2006-03-29 Dynal Biotech Asa Oslo Method
US9181527B2 (en) 2009-10-29 2015-11-10 The Trustees Of Dartmouth College T cell receptor-deficient T cell compositions
US8956828B2 (en) 2009-11-10 2015-02-17 Sangamo Biosciences, Inc. Targeted disruption of T cell receptor genes using engineered zinc finger protein nucleases
CA2805442C (en) 2010-07-21 2020-05-12 Sangamo Biosciences, Inc. Methods and compositions for modification of an hla locus
CA2832540C (en) 2011-04-08 2020-09-15 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Anti-epidermal growth factor receptor variant iii chimeric antigen receptors and use of same for the treatment of cancer
PL2800811T3 (pl) 2012-05-25 2017-11-30 Emmanuelle Charpentier Sposoby i kompozycje do kierowanej RNA modyfikacji docelowego DNA i do modulacji transkrypcji kierowanej RNA
KR20150105635A (ko) 2012-12-12 2015-09-17 더 브로드 인스티튜트, 인코퍼레이티드 서열 조작을 위한 crispr-cas 성분 시스템, 방법 및 조성물
JP6552965B2 (ja) 2012-12-12 2019-07-31 ザ・ブロード・インスティテュート・インコーポレイテッド 配列操作のための改善された系、方法および酵素組成物のエンジニアリングおよび最適化
US8697359B1 (en) 2012-12-12 2014-04-15 The Broad Institute, Inc. CRISPR-Cas systems and methods for altering expression of gene products
JP6692343B2 (ja) 2014-08-01 2020-05-13 アンスティチュ ナショナル ドゥ ラ サンテ エ ドゥ ラ ルシェルシュ メディカル 薬物としての使用のための抗cd45rc抗体
CN109153714A (zh) * 2016-03-04 2019-01-04 诺华股份有限公司 表达多重嵌合抗原受体(car)分子的细胞及其用途
US20210147801A1 (en) * 2017-07-13 2021-05-20 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Methods for increasing expansion and immunosuppressive capacity of a population of cd8+cd45rclow/- tregs
EP3498293A1 (en) 2017-12-15 2019-06-19 Institut National De La Sante Et De La Recherche Medicale (Inserm) Treatment of monogenic diseases with an anti-cd45rc antibody
EP3626265A1 (en) * 2018-09-21 2020-03-25 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Anti-human cd45rc antibodies and uses thereof

Also Published As

Publication number Publication date
KR20230004510A (ko) 2023-01-06
CN115916823A (zh) 2023-04-04
IL296546A (en) 2022-11-01
US20230147657A1 (en) 2023-05-11
EP4121457A1 (en) 2023-01-25
MX2022011683A (es) 2022-12-08
WO2021186056A1 (en) 2021-09-23
CA3172120A1 (en) 2021-09-23
AU2021237790A1 (en) 2022-10-13
BR112022018795A2 (pt) 2023-01-10

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP7134204B2 (ja) キメラ受容体及びその使用方法
US20210079059A1 (en) Treatment of cancer using gfr alpha-4 chimeric antigen receptor
JP7219376B2 (ja) キメラ抗原受容体をキナーゼ阻害薬と併用して使用したサイトカイン放出症候群の治療及び予防
JP2022088432A (ja) キメラ抗原受容体とpd-1阻害薬との併用療法
JP2022062040A (ja) プロm2マクロファージ分子の阻害剤と組み合わせてキメラ抗原受容体を用いる癌の処置
US20200085869A1 (en) Therapeutic regimens for chimeric antigen receptor therapies
JP7281774B2 (ja) 抗hla-a2抗体及びその使用方法
JP6466401B2 (ja) ヒト化抗cd19キメラ抗原受容体を使用するがんの処置
ES2814962T3 (es) Fijación eficaz como objetivo de la leucemia humana primaria utilizando células T modificadas con receptor de antígeno quimérico anti-CD123
US20210213063A1 (en) Combination therapy with chimeric antigen receptor (car) therapies
JP2019513347A (ja) 複数のキメラ抗原受容体(car)分子を発現する細胞およびその使用
JP2018518939A (ja) Cd20療法、cd22療法、およびcd19キメラ抗原受容体(car)発現細胞との併用療法
KR20170037626A (ko) 인간화 항-bcma 키메라 항원 수용체를 사용한 암의 치료
TW201833326A (zh) Cd70結合分子及使用彼之方法
US20240067732A1 (en) Anti-hla-a2 antibodies and uses thereof
KR20210046006A (ko) Tnfr2 도메인을 포함하는 신규한 car 작제물
US20230147657A1 (en) Chimeric antigen receptor specific for human cd45rc and uses thereof
RU2782276C2 (ru) Анти-hla-a2 антитела и способы их применения
RU2808254C2 (ru) Новые конструкции химерного антигенного рецептора, содержащие домены tnfr2
TW202307210A (zh) Cd19和cd22嵌合抗原受體及其用途
RU2815417C2 (ru) Лечение злокачественной опухоли с использованием химерного рецептора антигена против cd19

Legal Events

Date Code Title Description
A521 Request for written amendment filed

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523

Effective date: 20221118

A521 Request for written amendment filed

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523

Effective date: 20240315

A621 Written request for application examination

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621

Effective date: 20240315