JP2023510921A - C-p結合をモジュールエナンチオダイバージェント合成するための試薬およびその使用 - Google Patents

C-p結合をモジュールエナンチオダイバージェント合成するための試薬およびその使用 Download PDF

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Abstract

本開示は、キラルP(V)をベースとする試薬、およびキラルホスフィン、ホスフィンオキシドおよび特定のオリゴヌクレオチドをモジュール、スケーラブルおよび立体特異的に合成するためのその使用を記載する。

Description

本願は2020年1月16日付け出願の米国仮特許出願番号62/962,066の利益を主張する。
P中心の立体化学の制御は、様々な分野で起こる、直面することの多い課題である。Corbridge,D.E.C.、Phosphorus: Chemistry, Biochemistry and Technology, 6th ed.; Taylor & Francis, 2013を参照のこと。最近の一例として、アンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)療法の出現に由来するものが挙げられ、それではホスホロチオエート連結におけるP立体中心の正確な制御が、効力および物理特性に影響を与え得る。Bohr,H.G.ら、「Electronic Structures of LNA Phosphorothioate Oligonucleotides」Mol. Ther.Nucleic Acids 2017, 8, 428-441を参照のこと;また、Iwamoto,N.、「Control of Phosphorothioate Stereochemistry Substantially Increases the Efficacy of Antisense Oligonucleotides」Nat. Biotechnol. 2017, 35(9), 845-851も参照のこと。米国特許出願公開2019/0322694では、それほど費用のかからないリモネンの足場に構築されたP(V)を基礎とする試薬を用いて、かかるシステムの立体化学の結果(リン-硫黄の組み込み、または略してΨ)を正確に制御する方法が記載された。かかる方法の利点は、古典的なホスホルアミダイトP(III)を基礎とする試薬と異なり、Ψの可能とするASO合成がレドックスにて経済的であり、空気および水分に耐性のビルディングブロックを含むことである。
関心が高まりつつある、もう一つ別のPを基礎とするキラル連結が、メチル-ホスホネートオリゴヌクレオチド、またはMPOにおいて見られる。Pritchard,C.E.ら、「Methylphosphonate mapping of phosphate contacts critical for RNA recognition by the human immunodeficiency virus tat and rev proteins」Nucleic Acids Res. 1994, 22(13), 2592-2600を参照のこと;また、Koch,M.ら、Role of a ribosomal RNA ホスフェート oxygen during the EF-G-triggered GTP hydrolysis, Proc.Natl. Acad. Sci. 2015, 112(20), E2561;Hamma,T.ら、「Interactions of Hairpin Oligo-2’-O-Methylribonucleotides Containing Methylphosphonate Linkages with HIV TAR RNA」Antisense and Nucleic Acid Drug Dev. 2003, 13(1), 19-30も参照のこと。かかる構造は、ホスホジエステラーゼ分解に対して耐性が大きいため、優れた安定性を有すると考えられる。Agrawal,S.ら、「Oligodeoxynucleoside Methylphosphonates: Synthesis and Enzymic Degradation」Tetrahedron Lett. 1987, 28(31), 3539-3542;Reynolds, M.A.ら、「Synthesis and Thermodynamics of Oligonucleotides Containing Chirally Pure R P Methylphosphonate Linkages」Nucleic Acids Res. 1996, 24(22), 4584-4591を参照のこと。架橋性酸素原子がないため、骨格は電荷的に中性であり、H結合できない。このことは、DNA-RNA二重鎖を形成する際に安定化または不安定化のいずれかの効果をもたらし得る。ホスホロチオエートをベースとするASOと同様に、MPOはリンにキラリティーを導入し、その結果、SおよびRの異性体は異なる結合親和性および生物学的活性を有する。実際、最初のASOアナログの一つはMPO連結を利用した。現在、MPOをベースとするビルディングブロックの製造は、ジアステレオマーの面倒な分離を必要とする、P(III)をベースとする方法と結び付けられる。Miller,P.S.ら、Nonionic nucleic acid analogs. Synthesis and characterization of dideoxyribonucleoside methylphosphonates. Biochemistry 1979, 18(23), 5134-5143;Engels,J.ら、Eine neue Synthese von Nukleosidmethylphosphonaten. Angew. Chem. Int. Ed. Eng. 1982, 21(S12), 2010-2015;Lebedev,A.V.ら、「A new DMAP-catalyzed phosphonamidite coupling reaction for synthesis of oligonucleotide methylphosphonate derivatives」Tetrahedron Lett. 1990, 31(6), 851-854;Helinski,J.ら、「N,N-diisopropyl-O-P-nitrophenyl-P-methylphosphonoamidite: Novel Difunctional PIII Reagent in Oligonucleoside Methylphosphonate Synthesis Containing 4-Nitrophenoxy Group」Tetrahedron Lett. 1991, 32(37), 4981-4984を参照のこと。これらの制限が、現代の治療用途について、かかる連結の幅広い探査を妨げてきたのは確かである。
加えて、リンにてキラルである立体的なPを基礎とするシステムは、既知の最も重要なリガンドのいくつかを代表する。Vineyard,B.D.ら、Asymmetric Hydrogenation: Rhodium Chiral Bisphosphine Catalyst, J. Am. Chem. Soc. 1977, 99(18), 5946-5952を参照のこと;また、Knowles,W.S.、「Asymmetric Hydrogenations(Nobel Lecture 2001)」Adv. Synth. Catal. 2003, 345(1-2), 3-13も参照のこと。例えば、その中でDIPAMPは、不斉水素添加に利用された最初のキラルホスフィンであり、伝説的なL-DOPAプロセスにて中心的役割を果たした。それ以後、DuanPhosおよびBIBOPなど、新しい立体炭素中心を略完全に制御しながら導入する、多数の有用なリガンド足場が出現している。P-キラルホスフィンの簡単なモジュール合成は、その有用性が大きいにもかかわらず、依然として未解決の課題である。
従って、オリゴヌクレオチド化学および不斉合成を含む用途で、Pを基礎とする立体化学を制御するために効率的で直接的な方法が必要とされている。
1の態様において、本開示は、式(I):
Figure 2023510921000001
[式中:R、R、R、R、およびnは下記に定義されるとおりである]
で示される化合物またはその塩に関する。
1の態様において、本開示は、式(Ia):
Figure 2023510921000002
で示される化合物、その塩、そのエナンチオマー、またはその組み合わせに関する。
1の態様において、本開示は、チオホスフィン酸の製造方法であって、カルバニオン試薬を、式(Ia):
Figure 2023510921000003
[式中:Rは下記に定義されるとおりである]
で示される化合物、その塩、そのエナンチオマー、またはその組み合わせと反応させ、チオホスフィン酸を形成することを含む、方法に関する。
1の態様において、上記の方法にて形成されるチオホスフィン酸は、式(II):
Figure 2023510921000004
[式中:RおよびRは下記に定義されるとおりである]
で表される。
1の態様において、該方法は、そのチオホスフィン酸をアルキル化試薬と反応させてチオホスフィン酸エステルを形成することをさらに含む。
1の態様において、上記の方法にて形成されるチオホスフィン酸エステルは、式(III):
Figure 2023510921000005
[式中:R、R、およびR’は下記に定義されるとおりである]
で表される。
1の態様において、該方法は、そのチオホスフィン酸エステルをアルコキシド剤と反応させて有機ホスフィネートを形成することをさらに含む。
1の態様において、上記の方法にて形成される有機ホスフィネートは、式(IV):
Figure 2023510921000006
[式中:R、R、およびR’は下記に定義されるとおりである]
で表される。
1の態様において、該方法は、その有機ホスフィネートをカルバニオン試薬と反応させ、ホスフィンオキシドを形成することをさらに含む。
1の態様において、上記の方法にて形成されるホスフィンオキシドは、式(V):
Figure 2023510921000007
[式中:R、R、およびRは下記に定義されるとおりである]
で表される。
1の態様において、該方法は、そのホスフィンオキシドを還元剤と反応させ、ホスフィンを形成することをさらに含む。
1の態様において、上記の方法にて形成されるホスフィンは、式(VI):
Figure 2023510921000008
[式中:R、R、およびRは下記に定義されるとおりである]
で表される。
1の態様において、本開示は、ヌクレオシドをロードした有機リン化合物を製造する方法であって、式(Ia)の化合物またはそのエナンチオマーをヌクレオシドと反応させることを含む、方法に関する。
1の態様において、上記の方法にて形成されるヌクレオシドをロードした有機リン化合物は、式(VII)または(VIIa):
Figure 2023510921000009
[式中:R、R’、またはNuは下記に定義されるとおりである]
で表されるか、あるいはそのジアステレオマーである。
1の態様において、該方法は、そのヌクレオシドをロードした有機リン化合物を第2ヌクレオシドと反応させ、ジヌクレオチドを形成することをさらに含む。
1の態様において、上記の方法にて形成されるジヌクレオチドは、式(VIII)または(VIIIa):
Figure 2023510921000010
[式中:R、Nu、またはNuは下記に定義されるとおりである]
で表される。
1の態様において、該方法は、
a)そのジヌクレオチドを式(Ia)の化合物と反応させ、ロードされたジヌクレオチドを形成し;
b)工程(a)にて形成のロードされたジヌクレオチドを第3ヌクレオシドと反応させ、トリヌクレオチドを形成し;
c)工程(a)および(b)を1回または複数回繰り返し、所望の数のヌクレオチドを有するオリゴヌクレオチドを形成する
ことをさらに含む。
1の態様において、該方法は、
a)ジヌクレオチドを、式C:
Figure 2023510921000011
で示される化合物またはそのエナンチオマーと反応させ、ロードされたキメラジヌクレオチドを形成し;および
b)工程(a)にて形成のそのロードされたキメラジヌクレオチドを第3ヌクレオシドと反応させ、ホスホネート連結およびホスホロチオエート連結を有するキメラトリヌクレオチドを形成する
ことをさらに含む。
1の態様において、本開示は、式(IIIa):
Figure 2023510921000012
[式中:RおよびRは下記に定義されるとおりである]
で示される化合物またはそのエナンチオマーに関する。
1の態様において、本開示は、式(IVa):
Figure 2023510921000013
[式中:RおよびRは下記に定義されるとおりである]
で示される化合物またはそのエナンチオマーに関する。
1の態様において、本開示は、式(VII):
Figure 2023510921000014
[式中:R、R’、およびNuは下記に定義されるとおりである]
で示される化合物またはそのエナンチオマーに関する。
1の態様において、本開示は、式(Ia):
Figure 2023510921000015
[式中:Rは下記に定義されるとおりである]
で示される化合物またはそのエナンチオマーを製造する方法であって、
カルバニオン試薬を、式A:
Figure 2023510921000016
で示される化合物またはそのエナンチオマーと反応させて式(Ia)の化合物を形成することを含む、方法に関する。
開示の試薬
開示の試薬および化合物は、C-P結合をモジュールエナンチオダイバージェント合成するためのP(V)ベースの化合物である。
a. ホスホノジチオエート試薬
1の態様において、ホスホノジチオエート試薬は、式(I):
Figure 2023510921000017
[式中:
はC1-6アルキル、C2-6アルケニル、C2-6アルキニル、C3-10シクロアルキル、C6-10アリール、またはC結合のヘテロアリールであり、ここでRは、所望により、1または複数の同じまたは異なるR基で置換されてもよく;
は、重水素、CD、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、C2-6アルキニル、ハロゲン、CF、C1-6アルコキシ、C3-10シクロアルキル、C6-10アリール、またはC結合のヘテロアリールであり;
は、水素、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、またはC2-6アルキニルであり;
は、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、またはC2-6アルキニルであり;
は、水素と置き換わる置換基であって、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、C2-6アルキニル、C3-10シクロアルキル、またはC6-10アリールのうちの一つであり;および
nは0、1、2、3、4、5、6、7、または8である]
で示される化合物またはその塩である。
1の態様において、ホスホノジチオエート試薬は、式(Ia):
Figure 2023510921000018
[式中:Rは上記にて定義されるとおりである]
で示される化合物、その塩、そのエナンチオマー、またはその組み合わせである。
1の態様において、Rは、
Figure 2023510921000019
からなる群より選択され、
ここで
Figure 2023510921000020
はRと式(I)のリンとの間の結合である。
1の態様において、Rは-CHである。もう一つ別の態様において、Rはフェニルである。
1の態様において、ホスホノジチオエート試薬は、表1に列挙される1または複数のいずれかの化合物である。
表1
Figure 2023510921000021
Figure 2023510921000022
Figure 2023510921000023
1の態様において、本開示のホスホノジチオエート試薬は、(当該分野にて標準的な方法により測定される場合に)少なくとも50%(すなわち、少なくとも75%の一方のエナンチオマーと、最大25%の他方のエナンチオマー)、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、または少なくとも99%の光学純度またはエナンチオマー過剰率を有する。
b. チオホスフィン酸エステル試薬
もう一つ別の態様において、本開示は、式(IIIa):
Figure 2023510921000024
[式中:
およびRは、各々、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、C2-6アルキニル、C3-10シクロアルキル、C6-10アリール、またはC結合のヘテロアリールであり;
ここで、RおよびRの各々は、所望により、1または複数の同じまたは異なるR基で置換されてもよく;
は、重水素、CD、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、C2-6アルキニル、ハロゲン、CF、C1-6アルコキシ、C3-10シクロアルキル、C6-10アリール、またはC結合のヘテロアリールである]
で表されるチオホスフィン酸エステル試薬またはそのエナンチオマーを提供する。
1の態様において、チオホスフィン酸エステル試薬は表2に列挙される1または複数のいずれかの化合物である。
Figure 2023510921000025
Figure 2023510921000026
1の態様において、本開示のチオホスフィン酸エステル試薬は、(当該分野にて標準的な方法により測定される場合に)少なくとも50%(すなわち、少なくとも75%の一方のエナンチオマーと、最大25%の他方のエナンチオマー)、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、または少なくとも99%の光学純度またはエナンチオマー過剰率を有する。
c. 有機ホスフィネート試薬
もう一つ別の態様において、本開示は、式(IVa):
Figure 2023510921000027
[式中:
およびRは、各々、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、C2-6アルキニル、C3-10シクロアルキル、C6-10アリール、またはC結合のヘテロアリールであり;
ここで、RおよびRの各々は、所望により、1または複数の同じまたは異なるR基で置換されてもよく;
は、重水素、CD、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、C2-6アルキニル、ハロゲン、CF、C1-6アルコキシ、C3-10シクロアルキル、C6-10アリール、またはC結合のヘテロアリールである]
で表される有機ホスフィネート試薬またはそのエナンチオマーを提供する。
1の態様において、有機ホスフィネート試薬は、表3に列挙される1または複数のいずれかの化合物である。
表3
Figure 2023510921000028
1の態様において、本開示の有機ホスフィネート試薬は、(当該分野にて標準的な方法により測定される場合に)少なくとも50%(すなわち、少なくとも75%の一方のエナンチオマーと、最大25%の他方のエナンチオマー)、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、または少なくとも99%の光学純度またはエナンチオマー過剰率を有する。
d. ヌクレオシドをロードした有機リン試薬
1の態様において、本開示は、式(VII)または(VIIa):
Figure 2023510921000029
[式中:
は、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、またはC2-6アルキニルであり;
R’は、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、またはC2-6アルキニルであり;
Nuはヌクレオシドであり、
ここで、Nuは、所望により、相互に独立して、1または複数の同じまたは異なる修飾、あるいは1または複数の同じまたは異なる保護基を含んでもよい]
で表される、ヌクレオシドをロードした有機リン試薬またはそのジアステレオマーを提供する。
1の態様において、RおよびR’は、各々、-CHである。
1の態様において、Nuは、
Figure 2023510921000030
からなる群より選択されるヌクレオシドであって、ここで
Tは
Figure 2023510921000031
であり;
Bz
Figure 2023510921000032
であり;
iBu
Figure 2023510921000033
であり;および
Bz
Figure 2023510921000034
である、ヌクレオシドである。
1の態様において、ヌクレオシドをロードした有機リン試薬は、表4に列挙される1または複数のいずれかの化合物である。
表4
Figure 2023510921000035
1の態様において、本開示のヌクレオシドをロードした有機リン試薬は、(当該分野にて標準的な方法により測定される場合に)少なくとも5:1、少なくとも10:1、少なくとも15:1、少なくとも20:1、少なくとも25:1、少なくとも30:1、少なくとも35:1、少なくとも40:1、少なくとも45:1、少なくとも50:1、少なくとも55:1、少なくとも60:1、少なくとも65:1、少なくとも70:1、少なくとも75:1、少なくとも80:1、少なくとも85:1、少なくとも90:1、少なくとも95:1、または少なくとも99:1のジアステレオマー比率(「d.r.」)を有する。
1の態様において、ヌクレオシドはリボヌクレオシドである。もう一つ別の態様において、ヌクレオシドはデオキシリボヌクレオシドである。
ヌクレオシドは、天然に存在するヌクレオシド、または天然に存在しないヌクレオシドアナログとすることができる。本明細書で使用される「ヌクレオシドアナログ」は、糖および/または塩基部分を修飾することによる、DNAまたはRNAヌクレオシドなどの、天然のヌクレオシドの変種である。アナログは、オリゴヌクレオチドの文脈において、原則として、天然のヌクレオシドに対して「サイレント」または「均等」であるにすぎない、すなわち、オリゴヌクレオチドが作用する間に機能的作用を及ぼさない、とすることができる。かかる「均等」アナログは、例えば、それらは製造がより容易であるか、より安価であるか、または貯蔵または製造条件に対してより安定であるか、あるいはタグまたはラベルを表すならば、それでも有用であるとすることができる。しかしながら、いくつかの態様において、アナログは、オリゴヌクレオチドが機能する間に、例えば、標的に対して結合アフィニティの増加、および/または細胞内ヌクレアーゼに対する耐性の増加、および/または細胞内への輸送の容易性の増加を生じさせることによって、機能的作用を有するであろう。
本明細書で利用される有用なヌクレオシドはまた、修飾糖を含み得る。2’-糖の修飾には、フルオロ、O-アルキル、O-アルキルアミノ、O-アルキルアルコキシ、保護O-アルキルアミノ、O-アルキルアミノアルキル、O-アルキルイミダゾール、および式(O-アルキル)(式中、mは1~約10である)のポリエーテルが含まれる。これらのポリエーテルのうち好ましいものは、クラウンエーテル、およびOuchiら、Drug Design and Discovery 1992, 9, 93; Ravasioら、J. Org. Chem. 1991, 56, 4329; およびDelgardoら、Critical Reviews in Therapeutic Drug Carrier Systems 1992, 9, 249(これらの各々は全体が出典明示により本明細書に組み込まれる)に開示されるポリエーテルなどの、直鎖状または環状ポリエチレングリコール(PEG)、およびPEG含有の基である。糖修飾を具現化するさらなるヌクレオシドは、Cook、Anti-Cancer Drug Design, 1991, 6, 585-607および米国公開番号2016/237427(出典明示によりその全体を本明細書に組み込む)に開示される。フルオロ、O-アルキル、O-アルキルアミノ、O-アルキルイミダゾール、O-アルキルアミノアルキル、およびアルキルアミノ置換が、米国特許第6,166,197号、発明の名称「2’および5’-置換のピリミジンヌクレオチドを有するオリゴマー化合物」(出典明示によりその全体を本明細書に組み込む)に記載される。
2’-糖の修飾のあるさらに有用なヌクレオシドには、2’-SRおよび2’-NR基が含まれ、ここで各Rは、独立して、水素、保護基あるいは置換または非置換のアルキル、アルケニル、またはアルキニルである。2’-SRヌクレオシドは米国特許第5,670,633号(1997年9月23日登録、その全体を出典明示により本明細書に組み込む)に開示される。
有用なヌクレオシドにはまた、セレン(Se)で誘導体化されるヌクレオシドが含まれる。Se誘導体化ヌクレオシドの例には、糖の2’および/または5’位のO-原子がSeで置換されたヌクレオシドが含まれる。他の例として、フラノース環で酸素をSeで置換したもの、核酸塩基および非架橋ホスフェートが挙げられる。かかる核酸は、例えば、Pallanら、Nat. Protoc., 2(3): 647-51 (2007)、およびNat. Protoc., 2(3) ;640-646 (2007)(出典明示によりその全体を本明細書に組み込む)に記載される。
適切なヌクレオシドの他の例には、Schinaziら、Nucleosides and Nucleotides, 17: 635-647(1998);Biochem., 35(18): 5741-5746(1996);J.Org.Chem., 79(8): 3465-3472(2014)(出典明示によりその全体を本明細書に組み込む)が含まれる。
さらに有用なヌクレオシドアナログには、限定されないが、ロック核酸(LNA);2’-O-アルキル-RNA;2’-アミノ-DNA;2’-フルオロ-DNA;アラビノ核酸(ANA);2’-フルオロ-ANA、ヘキシトール核酸(HNA)、インターカレート核酸(INA)、拘束エチルヌクレオシド(cEt)、2’-O-メチル核酸(2’-OMe)、2’-O-メトキシエチル核酸(2’-MOE)、またはそれらの任意の組み合わせが含まれる。
「ヘキシトール核酸」または「HNA」は、2-[S]-位に核酸塩基が位置付けられる、リン酸化2,3-ジデオキシ-D-アラビノ-ヘキシトール単位で構成される。
「cEt」または「拘束エチル」は、4’-炭素と2’-炭素を結ぶ架橋を含む、糖部分を有する二環ヌクレオシドを意味し、ここで該架橋は式:4’-CH(CH)-0-2’で表される。
「2’-O-メトキシエチル」(2’-MOE、および2’-O(CH-OCH、およびMOEとも称される)は、フラノシル環の2’位でのO-メトキシ-エチル修飾をいう。2’-O-メトキシエチル修飾の糖は修飾糖である。
「2’-F」は、フラノシル糖環の2’位にてフルオロ基を含むように修飾することをいう。
本明細書で使用される場合、「2’-OMe」または「2’-OCH」または「2’-O-メチル」は、各々、フラノシル糖環の2’位にて-OCH基を含むように修飾することをいう。
適切なヌクレオチドアナログの例は、その全体が出典明示により組み込まれる、WO2007/031091によって提供されるか、あるいはそこに言及されている。
LNAまたは2’-置換糖などのオリゴマー中にアフィニティ強化ヌクレオチドアナログを組み込むことで、特異的に結合するオリゴマーの大きさを小さくするが可能となり、その上限を非特異的または異常な結合が起こる前のオリゴマーの大きさまで下げることもできる。
いくつかの実施態様において、ヌクレオシドは、二環糖を含む、ヌクレオシドアナログである。非限定的な例示としての二環糖には、cEt、2’,4’-拘束の2’-O-メトキシエチル(cMOE)、LNA、α-LNA、β-LNA、2’-O,4’-C-エチレン-架橋の核酸(ENA)、アミノ-LNA、オキシ-LNA、またはチオ-LNAが含まれる。
「LNA」なる語は、「ロック核酸」として知られる、二環ヌクレオシドアナログをいう。それはLNAモノマーをいうこともでき、あるいは「LNAオリゴヌクレオチド」の文脈で使用される場合、LNAは1または複数のかかる二環ヌクレオチドアナログを含有するオリゴヌクレオチドをいう。LNAヌクレオシドは、リボース糖環のC2’とC4’の間にリンカー基(架橋など)が存在することで特徴付けられる。この架橋は、限定されないが、-CH-O-、-CH-S-、-CH-NH-、-CH-N(CH)-、-CH-CH-O-、-CH-CH(CH)-、-CH-CH-S-、-CH-CH-NH-、-CH-CH-CH-、-CH-CH-CH-O-、-CH-CH-CH(CH)-、-CH=CH-CH-、-CH-O-CH-O-、-CH-NH-O-、-CH-N(CH)-O-、-CH-O-CH-、-CH(CH)-O-、および-CH(CH-O-CH)-O-、および/または、-CH-CH-、および-CH=CH-より選択される、バイラジカル(二価基)を包含する。すべてのキラル中心について、不斉基をRまたはS配向のいずれかで見出すことができる。
いくつかの実施態様において、バイラジカルは-C(R)-O-C(R)-O-とすることができ、ここでR、R、R、およびRは、水素、ハロゲン、C1-6アルキル、置換C1-6アルキル、C2-6アルケニル、置換C2-6アルケニル、C2-6アルキニルまたは置換C2-6アルキニル、C1-6アルコキシル、置換C1-6アルコキシル、アシル、置換アシル、C1-6アミノアルキルまたは置換C1-6アミノアルキルからなる群より独立して選択され、例えば水素である。
適切な二環ヌクレオシドは、WO2007/134181、WO2008/154401、WO2008/150729、WO2009/067647(アルファ-L-二環核酸アナログ)およびWO2009006478Aに開示されており、そのすべてが出典明示により全体として本明細書に組み込まれる。
さらなる二環ヌクレオシドアナログおよびアンチセンスオリゴヌクレオチドにおけるその使用が、WO2011/115818、WO2011/085102、WO2011/017521、WO2009/100320、WO2010/036698、WO2009/124295、およびWO2009/006478Aに開示されており、その各々が出典明示により全体として本明細書に組み込まれる。
「チオ-LNA」なる語は、下記の一般式III中のYがSまたは-CH-S-より選択される、ロックヌクレオシドを含む。チオ-LNAは、ベータ-Dおよびアルファ-L-構成の両方にあり得る。
「アミノ-LNA」なる語は、下記の一般式III中のYが、-N(H)-、N(R)-、CH-N(H)-、および-CH-N(R)-(ここで、Rは水素およびC1-4アルキルより選択される)より選択される、ロックヌクレオシドを含む。アミノ-LNAは、ベータ-Dおよびアルファ-L-構成の両方にあり得る。
「オキシ-LNA」なる語は、下記の一般式III中のYが-O-を表す、ロックヌクレオシドを含む。オキシ-LNAは、ベータ-Dおよびアルファ-L-構成の両方にあり得る。
「ENA」なる語は、以下の一般式にてYが-CH-O-(ここで、-CH-O-の酸素原子は、塩基Bに対して2’位に結合する)である、ロックヌクレオシドを含む。Rは水素またはメチルである。
いくつかの例示としての実施態様において、LNAは、ベータ-D-オキシ-LNA、アルファ-L-オキシ-LNA、ベータ-D-アミノ-LNA、およびベータ-D-チオ-LNAより選択される。
いくつかの実施態様において、ヌクレオシドアナログは、例えば:2’-O-アルキル-RNA単位、2’-アミノ-DNA単位、2’-フルオロ-DNA単位、LNA単位、アラビノ核酸(ANA)単位、2’-フルオロ-ANA単位、HNA単位、INA(インターカレーティング核酸-Christensen, 2002. Nucl. Acids. Res. 2002 30:4918-4925、出典明示により本明細書に組み込まれる)単位および2’-MOE単位であり得る。
「核酸塩基」なる語は、ヌクレオチドの塩基部分をいい、天然に存在する変種ならびに天然に存在しない変種の両方を網羅する。かくして、「核酸塩基」は、既知のプリンおよびピリミジン型ヘテロサイクルだけでなく、ヘテロ環式アナログおよびその互変異性体をも網羅する。
典型的な核酸塩基には、限定されないが、アデニン、グアニン、シトシン、チミジン、ウラシル、キサンチン、ヒポキサンチン、5-メチルシトシン、イソシトシン、シュードイソシトシン、5-ブロモウラシル、5-プロピニルウラシル、6-アミノプリン、2-アミノプリン、イノシン、ジアミノプリン、および2-クロロ-6-アミノプリンが挙げられる。
いくつかの実施態様において、ヌクレオシドは、アデニン、グアニン、シトシン、ウリジン、チミン、5-メチルシトシン等などの天然に存在する核酸塩基を含む。他の実施態様において、ヌクレオシドは、他の天然核酸塩基、ならびにキサンチン、ヒポキサンチン、2-アミノアデニン、アデニンおよびグアニンの6-メチルおよび他のアルキル誘導体、アデニンおよびグアニンの2-プロピルおよび他のアルキル誘導体、5-ハロのウラシルおよびシトシン、6-アゾのウラシル、シトシンおよびチミン、5-ウラシル(シュードウラシル)、4-チオウラシル、8-ハロ、オキサ、アミノ、チオール、チオアルキル、ヒドロキシルおよび他の8-置換のアデニンおよびグアニン、5-トリフルオロメチルおよび他の5-置換のウラシルおよびシトシン、7-メチルグアニンなどの修飾核酸塩基を含む。さらには、天然に存在する、および天然に存在しない、核酸塩基には、米国特許第3,687,808号(Meriganら)に;Sanghvi、in Antisense Research and Application, Chapter 15, S.T.CrookeおよびB.Lebleu編、CRC Press, 1993に;Englischら、Angewandte Chemie, International Edition, 1991, 30, 613-722(特に、622および623頁)に;the Concise Encyclopedia of Polymer Science and Engineering, J.I.Kroschwitz編, John Wiley & Sons, 1990,858-859頁;Zhangら、Nature, 2017, 551、644-647(疎水性塩基);FeldmanおよびRomesberg、Acc. Chem., Res., 2018, 51, 394-403;およびCook、Anti-Cancer Drug Design, 1991, 6、585-607に開示されている核酸塩基が含まれ、上記した各文献はその全体を出典明示により本明細書の一部とする。
本明細書に記載のヌクレオシドおよび核酸塩基を修飾した他の例には、次の修飾が挙げられるが、これらに限定されない:2-メチルチオ-N6-(シス-ヒドロキシイソペンテニル)アデノシン;2-メチルチオ-N6-メチルアデノシン;2-メチルチオ-N6-トレオニルカルバモイルアデノシン;N6-グリシニルカルバモイルアデノシン;N6-イソペンテニルアデノシン;N6-メチルアデノシン;N6-トレオニルカルバモイルアデノシン;1,2’-O-ジメチルアデノシン;1-メチルアデノシン;2’-O-メチルアデノシン;2’-O-リボシルアデノシン(ホスフェート);2-メチルアデノシン;2-メチルチオ-N6-イソペンテニルアデノシン;2-メチルチオ-N6-ヒドロキシノルバリル カルバモイルアデノシン;2’-O-メチルアデノシン;2’-O-リボシルアデノシン(ホスフェート);イソペンテニルアデノシン;N6-(シス-ヒドロキシイソペンテニル)アデノシン;N6,2’-O-ジメチルアデノシン;N6,2’-O-ジメチルアデノシン;N6,N6,2’-O-トリメチルアデノシン;N6,N6-ジメチルアデノシン;N6-アセチルアデノシン;N6-ヒドロキシノルバリルカルバモイルアデノシン;N6-メチル-N6-トレオニルカルバモイルアデノシン;2-メチルチオ-N6-イソペンテニルアデノシン;7-デアザ-アデノシン;N1-メチル-アデノシン;N6,N6-(ジメチル)アデニン;N6-シス-ヒドロキシ-イソペンテニル-アデノシン;α-チオ-アデノシン;2-(アミノ)アデニン;2-(アミノプロピル)アデニン;2-(メチルチオ)-N6-(イソペンテニル)アデニン;2-(アルキル)アデニン;2-(アミノアルキル)アデニン;2-(アミノプロピル)アデニン;2-(ハロ)アデニン;2-(プロピル)アデニン;2’-アミノ-2’-デオキシアデノシン トリホスフェート;2’-アジド-2’-デオキシ- アデノシン トリホスフェート;2’-デオキシ-2’-a-アミノアデノシン トリホスフェート;2’-デオキシ-2’-a-アジドアデノシン トリホスフェート;6-(アルキル)アデニン;6-(メチル)アデニン;7-(デアザ)アデニン;8-(アルキニル)アデニン;8-(アルケニル)アデニン;8-(アルキル)アデニン;8-(アルキニル)アデニン;8-(アミノ)アデニン;8-(ハロ)アデニン;8-(ヒドロキシル)アデニン;8-(チオアルキル)アデニン;8-(チオール)アデニン;8-アジド-アデノシン;アザアデニン;デアザアデニン;N6-(メチル)アデニン;N6-(イソペンチル)アデニン;7-デアザ-8-アザ-アデノシン;7-メチルアデニン;1-デアザアデノシン トリホスフェート;2’-フルオロ-N6-Bz-デオキシアデノシン トリホスフェート;2’-メトキシ-2-アミノ- アデノシン トリホスフェート;2’O-メチル-N6-Bz-デオキシアデノシン トリホスフェート;2’-a-エチニルアデノシン トリホスフェート;2-アミノアデニン;2-アミノアデノシン トリホスフェート;2-アミノ- アデノシン トリホスフェート;2’-a-トリフルオロメチルアデノシン トリホスフェート;2-アジドアデノシン トリホスフェート;2’-b-エチニルアデノシン トリホスフェート;2-ブロモアデノシン トリホスフェート;2’-b-トリフルオロメチルアデノシン トリホスフェート;2-クロロアデノシン トリホスフェート;2’-デオキシ-2’,2’-ジフルオロアデノシン トリホスフェート;2’-デオキシ-2’-a-メルカプトアデノシン トリホスフェート;2’-デオキシ-2’-a-チオメトキシアデノシン トリホスフェート;2’-デオキシ-2’-b-アミノアデノシン トリホスフェート;2’-デオキシ-2’-b-アジドアデノシン トリホスフェート;2’-デオキシ-2’-b-ブロモアデノシン トリホスフェート;2’-デオキシ-2’-b-クロロアデノシン トリホスフェート;2’-デオキシ-2’-b-フルオロアデノシン トリホスフェート;2’-デオキシ-2’-b-ヨードアデノシン トリホスフェート;2’-デオキシ-2’-b-メルカプトアデノシン トリホスフェート;2’-デオキシ-2’-b-チオメトキシアデノシン トリホスフェート;2-フルオロアデノシン トリホスフェート;2-ヨードアデノシン トリホスフェート;2-メルカプトアデノシン トリホスフェート;2-メトキシ-アデニン;2-メチルチオ-アデニン;2-トリフルオロメチルアデノシン トリホスフェート;3-デアザ-3-ブロモアデノシン トリホスフェート;3-デアザ-3-クロロアデノシン トリホスフェート;3-デアザ-3-フルオロアデノシン トリホスフェート;3-デアザ-3-ヨードアデノシン トリホスフェート;3-デアザアデノシン トリホスフェート;4’-アジドアデノシン トリホスフェート;4’-炭素環式アデノシン トリホスフェート;4’-エチニルアデノシン トリホスフェート;5’-ホモ-アデノシン トリホスフェート;8-アザ-アデノシン トリホスフェート;8-ブロモ-アデノシン トリホスフェート;8-トリフルオロメチルアデノシン トリホスフェート;9-デアザアデノシン トリホスフェート;2-アミノプリン;7-デアザ-2,6-ジアミノプリン;7-デアザ-8-アザ-2,6-ジアミノプリン;7-デアザ-8-アザ-2-アミノプリン;2,6-ジアミノプリン;7-デアザ-8-アザ-アデニン、7-デアザ-2-アミノプリン;2-チオシチジン;3-メチルシチジン;5-ホルミルシチジン;5-ヒドロキシメチルシチジン;5-メチルシチジン;N4-アセチルシチジン;2’-O-メチルシチジン;5,2’-O-ジメチルシチジン;5-ホルミル-2’-O-メチルシチジン;リシジン;N4,2’-O-ジメチルシチジン;N4-アセチル-2’-O-メチルシチジン;N4-メチルシチジン;N4,N4-ジメチル-2’-OMe-シチジン TP;4-メチルシチジン;5-アザ-シチジン;シュードイソシチジン;ピロロ-シチジン;α-チオ-シチジン;2-(チオ)シトシン;2’-アミノ-2’-デオキシ-シチジン トリホスフェート;2’-アジド-2’-デオキシ-シチジン トリホスフェート;2’-デオキシ-2’-a-アミノシチジン トリホスフェート;2’-デオキシ-2’-a-アジドシチジン トリホスフェート;3(デアザ)-5-(アザ)シトシン;3(メチル)シトシン;3-(アルキル)シトシン;3-(デアザ)-5-(アザ)シトシン;3-(メチル)シチジン;4,2’-O-ジメチルシチジン;5-(ハロ)シトシン;5-(メチル)シトシン;5-(プロピニル)シトシン;5-(トリフルオロメチル)シトシン;5-(アルキル)シトシン;5-(アルキニル)シトシン;5-(ハロ)シトシン;5-(プロピニル)シトシン;5-(トリフルオロメチル)シトシン;5-ブロモ-シチジン;5-ヨード-シチジン;
5-プロピニルシトシン;6-(アゾ)シトシン;6-アザ-シチジン;アザシトシン;デアザシトシン;N4-(アセチル)シトシン;1-メチル-1-デアザ-シュードイソシチジン;1-メチル-シュードイソシチジン;2-メトキシ-5-メチル-シチジン;2-メトキシ-シチジン;2-チオ-5-メチル-シチジン;4-メトキシ-1-メチル-シュードイソシチジン;4-メトキシ-シュードイソシチジン;4-チオ-1-メチル-1-デアザ-シュードイソシチジン;4-チオ-1-メチル-シュードイソシチジン;4-チオ-シュードイソシチジン;5-アザ-ゼブラリン;5-メチル-ゼブラリン;ピロロ-シュードイソシチジン;ゼブラリン;(E)-5-(2-ブロモ-ビニル)シチジン トリホスフェート;2,2’-アンヒドロ-シチジン トリホスフェート ヒドロクロリド;2’-フルオロ-N4-Bz-シチジン トリホスフェート;2’-フルオロ-N4-アセチル-シチジン トリホスフェート;2’-O-メチル-N4-アセチル-シチジン トリホスフェート;2’O-メチル-N4-Bz-シチジン トリホスフェート;2’-a-エチニルシチジン トリホスフェート;2’-a-トリフルオロメチルシチジン トリホスフェート;2’-b-エチニルシチジン トリホスフェート;2’-b-トリフルオロメチルシチジン トリホスフェート;2’-デオキシ-2’,2’-ジフルオロシチジン トリホスフェート;2’-デオキシ-2’-a-メルカプトシチジン トリホスフェート;2’-デオキシ-2’-a-チオメトキシシチジン トリホスフェート;2’-デオキシ-2’-b-アミノシチジン トリホスフェート;2’-デオキシ-2’-b-アジドシチジン トリホスフェート;2’-デオキシ-2’-b-ブロモシチジン トリホスフェート;2’-デオキシ-2’-b-クロロシチジン トリホスフェート;2’-デオキシ-2’-b-フルオロシチジン トリホスフェート;2’-デオキシ-2’-b-ヨードシチジン トリホスフェート;2’-デオキシ-2’-b-メルカプトシチジン トリホスフェート;2’-デオキシ-2’-b-チオメトキシシチジン トリホスフェート;2’-O-メチル-5-(1-プロピニル)シチジン トリホスフェート;3’-エチニルシチジン トリホスフェート;4’-アジドシチジン トリホスフェート;4’-炭素環式シチジン トリホスフェート;4’-エチニルシチジン トリホスフェート;5-(1-プロピニル)-アラシチジン トリホスフェート;5-(2-クロロ-フェニル)-2-チオシチジン トリホスフェート;5-(4-アミノ-フェニル)-2-チオシチジン トリホスフェート;5-アミノアリル-シチジン トリホスフェート;5-シアノシチジン トリホスフェート;5-エチニル-アラシチジン トリホスフェート;5-エチニルシチジン トリホスフェート;5’-ホモ-シチジン トリホスフェート;5-メトキシシチジン トリホスフェート;5-トリフルオロメチル-シチジン トリホスフェート;N4-アミノ-シチジン トリホスフェート;N4-ベンゾイル-シチジン トリホスフェート;シュードイソシチジン;7-メチルグアノシン;N2,2’-O-ジメチルグアノシン;N2-メチルグアノシン;ワイオシン;1,2’-O-ジメチルグアノシン;1-メチルグアノシン;2’-O-メチルグアノシン;2’-O-リボシルグアノシン(ホスフェート);2’-O-メチルグアノシン;2’-O-リボシルグアノシン(ホスフェート);7-アミノメチル-7-デアザグアノシン;7-シアノ-7-デアザグアノシン;アルカエオシン;メチルワイオシン;N2,7-ジメチルグアノシン;N2,N2,2’-O-トリメチルグアノシン;N2,N2,7-トリメチルグアノシン;N2,N2-ジメチルグアノシン;N2,7,2’-O-トリメチルグアノシン;6-チオ-グアノシン;7-デアザ-グアノシン;8-オキソ-グアノシン;N1-メチル-グアノシン;α-チオ-グアノシン;2(プロピル)グアニン;2-(アルキル)グアニン;2’-アミノ-2’-デオキシ-グアノシン トリホスフェート;2’-アジド-2’-デオキシ-グアノシン トリホスフェート;2’-デオキシ-2’-a-アミノグアノシン トリホスフェート;2’-デオキシ-2’-a-アジドグアノシン トリホスフェート;6-(アルキル)グアニン;;6-メチル-グアノシン;7-(アルキル)グアニン;7-(デアザ)グアニン;7-(メチル)グアニン;8-(アルケニル)グアニン;8-(アルキル)グアニン;8-(アルキニル)グアニン;8-(アミノ)グアニン;8-(ハロ)グアニン;8-(ヒドロキシル)グアニン;8-(チオアルキル)グアニン;8-(チオール)グアニン;アザグアニン;デアザグアニン;N-(メチル)グアニン;1-メチル-6-チオ-グアノシン;6-メトキシ-グアノシン;6-チオ-7-デアザ-8-アザ-グアノシン;6-チオ-7-デアザ-グアノシン;6-チオ-7-メチル-グアノシン;7-デアザ-8-アザ-グアノシン;7-メチル-8-オキソ-グアノシン;N2,N2-ジメチル-6-チオ-グアノシン;N2-メチル-6-チオ-グアノシン;1-Me-グアノシン トリホスフェート;2’-フルオロ-N2-イソブチル-グアノシン トリホスフェート;2’-O-メチル-N2-イソブチル-グアノシン トリホスフェート;2’-a-エチニルグアノシン トリホスフェート;2’-a-トリフルオロメチルグアノシン トリホスフェート;2’-b-エチニルグアノシン トリホスフェート;2’-b-トリフルオロメチルグアノシン トリホスフェート;2’-デオキシ-2’,2’-ジフルオログアノシン トリホスフェート;2’-デオキシ-2’-a-メルカプトグアノシン トリホスフェート;2’-デオキシ-2’-a-チオメトキシグアノシン トリホスフェート;2’-デオキシ-2’-b-アミノグアノシン トリホスフェート;2’-デオキシ-2’-b-アジドグアノシン トリホスフェート;2’-デオキシ-2’-b-ブロモグアノシン トリホスフェート;2’-デオキシ-2’-b-クロログアノシン トリホスフェート;
2’-デオキシ-2’-b-フルオログアノシン トリホスフェート;2’-デオキシ-2’-b-ヨードグアノシン トリホスフェート;2’-デオキシ-2’-b-メルカプトグアノシン トリホスフェート;2’-デオキシ-2’-b-チオメトキシグアノシン トリホスフェート;4’-アジドグアノシン トリホスフェート;4’-炭素環式グアノシン トリホスフェート;4’-エチニルグアノシン トリホスフェート;5’-ホモ-グアノシン トリホスフェート;8-ブロモ-グアノシン トリホスフェート;9-デアザグアノシン トリホスフェート;N2-イソブチル-グアノシン トリホスフェート;1-メチルイノシン;イノシン;1,2’-O-ジメチルイノシン;7-メチルイノシン;2’-O-メチルイノシン;エポキシキューオシン;ガラクトシルキューオシン;マンノシルキューオシン;キューオシン;アライアミノチミジン;アザチミジン;デアザチミジン;デオキシチミジン;2-チオウリジン;3-メチルウリジン;5-カルボキシメチルウリジン;5-ヒドロキシウリジン;5-メチルウリジン;5-タウリノメチル-2-チオウリジン;5-タウリノメチルウリジン;ジヒドロウリジン;シュードウリジン;1-メチル-3-(3-アミノ-5-カルボキシプロピル)シュードウリジン;1-メチルシュードウリジン;1-エチルシュードウリジン;2’-O-メチルウリジン;2’-O-メチルシュードウリジン;2’-O-メチルウリジン;2-チオ-2’-O-メチルウリジン;3-(3-アミノ-3-カルボキシプロピル)ウリジン;3,2’-O-ジメチルウリジン;3-メチルシュードウリジン トリホスフェート;4-チオウリジン;5-(カルボキシヒドロキシメチル)ウリジン;5-(カルボキシヒドロキシメチル)ウリジン メチルエステル;5,2’-O-ジメチルウリジン;5,6-ジヒドロ-ウリジン;5-アミノメチル-2-チオウリジン;5-カルバモイルメチル-2’-O-メチルウリジン;5-カルバモイルメチルウリジン;5-カルボキシヒドロキシメチルウリジン;5-カルボキシヒドロキシメチルウリジン メチルエステル;5-カルボキシメチルアミノメチル-2’-O-メチルウリジン;5-カルボキシメチルアミノメチル-2-チオウリジン;5-カルボキシメチルアミノメチルウリジン;5-カルバモイルメチルウリジン トリホスフェート;5-メトキシカルボニルメチル-2’-O-メチルウリジン;5-メトキシカルボニルメチル-2-チオウリジン;5-メトキシカルボニルメチルウリジン;5-メトキシウリジン;5-メチル-2-チオウリジン;5-メチルアミノメチル-2-セレノウリジン;5-メチルアミノメチル-2-チオウリジン;5-メチルアミノメチルウリジン;5-メチルジヒドロウリジン;5-オキシ酢酸-ウリジン トリホスフェート;5-オキシ酢酸メチルエステル-ウリジン トリホスフェート;N1-メチルシュードウラシル;N1-エチルシュードウラシル;ウリジン 5-オキシ酢酸;ウリジン 5-オキシ酢酸メチルエステル;3-(3-アミノ-3-カルボキシプロピル)-ウリジン トリホスフェート;5-(イソペンテニルアミノメチル)-2-チオウリジン トリホスフェート;5-(イソペンテニルアミノメチル)-2’-O-メチルウリジン トリホスフェート;5-(イソペンテニルアミノメチル)ウリジン トリホスフェート;5-プロピニルウラシル;α-チオ-ウリジン;1-(アミノアルキルアミノ-カルボニルエチレニル)-2-(チオ)シュードウラシル;1-(アミノアルキルアミノカルボニルエチレニル)-2,4-(ジチオ)シュードウラシル;1-(アミノアルキルアミノカルボニルエチレニル)-4-(チオ)シュードウラシル;1-(アミノアルキルアミノカルボニルエチレニル)シュードウラシル;1-(アミノカルボニルエチレニル)-2-(チオ)シュードウラシル;1-(アミノカルボニルエチレニル)-2,4-(ジチオ)シュードウラシル;1-(アミノカルボニルエチレニル)-4-(チオ)シュードウラシル;1-(アミノカルボニルエチレニル)シュードウラシル;1-置換-2-(チオ)シュードウラシル;1-置換-2,4-(ジチオ)シュードウラシル;1-置換-4-(チオ)シュードウラシル;1-置換シュードウラシル;1-(アミノアルキルアミノ-カルボニルエチレニル)-2-(チオ)-シュードウラシル;1-メチル-3-(3-アミノ-3-カルボキシプロピル)シュードウリジン トリホスフェート;1-メチル-3-(3-アミノ-3-カルボキシプロピル)シュードウリジン トリホスフェート;1-メチル-シュードウリジン トリホスフェート;1-エチル-シュードウリジン トリホスフェート;2-(チオ)シュードウラシル;2’-デオキシウリジン;2’-フルオロウリジン;2-(チオ)ウラシル;2,4-(ジチオ)シュードウラシル;2’-メチル、2’-アミノ、2’-アジド、2’-フルオログアノシン;2’-アミノ-2’-デオキシウリジン トリホスフェート;2’-アジド-2’-デオキシウリジン トリホスフェート;2’-アジドデオキシウリジン トリホスフェート;2’-デオキシウリジン;2’-フルオロウリジン;2’-デオキシ-2’-a-アミノウリジン トリホスフェート;2’-デオキシ-2’-a-アジドウリジン トリホスフェート;2-メチルシュードウリジン;3-(3-アミノ-3-カルボキシプロピル)ウラシル;4-(チオ)シュードウラシル;4-チオウラシル;5-(1,3-ジアゾール-1-アルキル)ウラシル;5-(2-アミノプロピル)ウラシル;5-(アミノアルキル)ウラシル;5-(ジメチルアミノアルキル)ウラシル;5-(グアニジニウムアルキル)ウラシル;5-(メトキシカルボニルメチル)-2-(チオ)ウラシル;5-(メトキシカルボニル-メチル)ウラシル;5-(メチル)-2-(チオ)ウラシル;5-(メチル)-2,4-(ジチオ)ウラシル;5-(メチル)-4-(チオ)ウラシル;5-(メチルアミノメチル)-2-(チオ)ウラシル;5-(メチルアミノメチル)-2,4-(ジチオ)ウラシル;5-(メチルアミノメチル)-4-(チオ)ウラシル;5-(プロピニル)ウラシル;5-(トリフルオロメチル)ウラシル;5-(2-アミノプロピル)ウラシル;5-(アルキル)-2-(チオ)シュードウラシル;5-(アルキル)-2,4-(ジチオ)シュードウラシル;5-(アルキル)-4-(チオ)シュードウラシル;5-(アルキル)シュードウラシル;5-(アルキル)ウラシル;5-(アルキニル)ウラシル;5-(アリルアミノ)ウラシル;5-(シアノアルキル)ウラシル;5-(ジアルキルアミノアルキル)ウラシル;5-(ジメチルアミノアルキル)ウラシル;5-(グアニジニウムアルキル)ウラシル;5-(ハロ)ウラシル;5-(1,3-ジアゾール-1-アルキル)ウラシル;5-(メトキシ)ウラシル;5-(メトキシカルボニルメチル)-2-(チオ)ウラシル;5-(メトキシカルボニル-メチル)ウラシル;
5-(メチル)-2-(チオ)ウラシル;5-(メチル)-2,4-(ジチオ )ウラシル;5-(メチル)-4-(チオ)ウラシル;5-(メチル)-2-(チオ)シュードウラシル;5-(メチル)-2,4-(ジチオ)シュードウラシル;5-(メチル)-4-(チオ)シュードウラシル;5-(メチル)シュードウラシル;5-(メチルアミノメチル)-2-(チオ)ウラシル;5-(メチルアミノメチル)-2,4-(ジチオ )ウラシル;5-(メチルアミノメチル)-4-(チオ)ウラシル;5-(プロピニル)ウラシル;5-(トリフルオロメチル)ウラシル;5-アミノアリル-ウリジン;5-ブロモ-ウリジン;5-ヨード-ウリジン;5-ウラシル;6-(アゾ)ウラシル;6-アザ-ウリジン;アライアミノ-ウラシル;アザウラシル;デアザウラシル;N3(メチル)ウラシル;シュードウリジン トリホスフェート-1-2-エタン酸;シュードウラシル;4-チオ-シュードウリジン トリホスフェート;1-カルボキシメチル-シュードウリジン;1-メチル-1-デアザシュードウリジン;1-プロピニルウリジン;1-タウリノメチル-1-メチルウリジン;1-タウリノメチル-4-チオウリジン;1-タウリノメチル-シュードウリジン;2-メトキシ-4-チオシュードウリジン;2-チオ-1-メチル-1-デアザシュードウリジン;2-チオ-1-メチルシュードウリジン;2-チオ-5-アザウリジン;2-チオ-ジヒドロシュードウリジン;2-チオ-ジヒドロウリジン;2-チオシュードウリジン;4-メトキシ-2-チオシュードウリジン;4-メトキシシュードウリジン;4-チオ-1-メチルシュードウリジン;4-チオシュードウリジン;5-アザウリジン;ジヒドロシュードウリジン;(±)1-(2-ヒドロキシプロピル)シュードウリジン トリホスフェート;(2R)-1-(2-ヒドロキシプロピル)シュードウリジン トリホスフェート;(2S)-1-(2-ヒドロキシプロピル)シュードウリジン トリホスフェート;(E)-5-(2-ブロモ-ビニル)アラウリジン トリホスフェート;(E)-5-(2-ブロモ-ビニル)ウリジン トリホスフェート;(Z)-5-(2-ブロモ-ビニル)アラウリジン トリホスフェート;(Z)-5-(2-ブロモ-ビニル)ウリジン トリホスフェート;1-(2,2,2-トリフルオロエチル)シュードウリジン トリホスフェート;1-(2,2,3,3,3-ペンタフルオロプロピル)シュードウリジン トリホスフェート;1-(2,2-ジエトキシエチル)シュードウリジン トリホスフェート;1-(2,4,6-トリメチルベンジル)シュードウリジン トリホスフェート;1-(2,4,6-トリメチル-ベンジル)シュードウリジン トリホスフェート;1-(2,4,6-トリメチル-フェニル)シュードウリジン トリホスフェート;1-(2-アミノ-2-カルボキシエチル)シュードウリジン トリホスフェート;1-(2-アミノエチル)シュードウリジン トリホスフェート;1-(2-ヒドロキシエチル)シュードウリジン トリホスフェート;1-(2-メトキシエチル)シュードウリジン トリホスフェート;1-(3,4-ビス-トリフルオロメトキシベンジル)シュードウリジン トリホスフェート;1-(3,4-ジメトキシベンジル)シュードウリジン トリホスフェート;1-(3-アミノ-3-カルボキシプロピル)シュードウリジン トリホスフェート;1-(3-アミノプロピル)シュードウリジン トリホスフェート;1-(3-シクロプロピル-プロパ-2-イニル)シュードウリジン トリホスフェート;1-(4-アミノ-4-カルボキシブチル)シュードウリジン トリホスフェート;1-(4-アミノベンジル)シュードウリジン トリホスフェート;1-(4-アミノ-ブチル)シュードウリジン トリホスフェート;1-(4-アミノ-フェニル)シュードウリジン トリホスフェート;1-(4-アジドベンジル)シュードウリジン トリホスフェート;1-(4-ブロモベンジル)シュードウリジン トリホスフェート;1-(4-クロロベンジル)シュードウリジン トリホスフェート;1-(4-フルオロベンジル)シュードウリジン トリホスフェート;1-(4-ヨードベンジル)シュードウリジン トリホスフェート;1-(4-メタンスルホニルベンジル)シュードウリジン トリホスフェート;1-(4-メトキシベンジル)シュードウリジン トリホスフェート;1-(4-メトキシ-ベンジル)シュードウリジン トリホスフェート;1-(4-メトキシ-フェニル)シュードウリジン トリホスフェート;1-(4-メチル-ベンジル)シュードウリジン トリホスフェート;1-(4-ニトロ-ベンジル)シュードウリジン トリホスフェート;1(4-ニトロ-フェニル)シュード-ウリジン トリホスフェート;1-(4-チオメトキシベンジル)シュードウリジン トリホスフェート;1-(4-トリフルオロメトキシベンジル)シュードウリジン トリホスフェート;1-(4-トリフルオロメチルベンジル)シュードウリジン トリホスフェート;1-(5-アミノ-ペンチル)シュードウリジン トリホスフェート;1-(6-アミノ-ヘキシル)シュードウリジン トリホスフェート;1,6-ジメチル-シュードウリジン トリホスフェート;1-[3-(2-{2-[2-(2-アミノエトキシ)エトキシ]-エトキシ}エトキシ)プロピオニル]シュードウリジン トリホスフェート;1-{3-[2-(2-アミノエトキシ)エトキシ]プロピオニル}シュードウリジン トリホスフェート;1-アセチルシュードウリジン トリホスフェート;1-アルキル-6-(1-プロピニル)シュードウリジン トリホスフェート;1-アルキル-6-(2-プロピニル)シュードウリジン トリホスフェート;1-アルキル-6-アリルシュードウリジン トリホスフェート;1-アルキル-6-エチニルシュードウリジン トリホスフェート;1-アルキル-6-ホモアリルシュードウリジン トリホスフェート;
1-アルキル-6-ビニルシュードウリジン トリホスフェート;1-アリルシュードウリジン トリホスフェート;1-アミノメチルシュードウリジン トリホスフェート;1-ベンゾイルシュードウリジン トリホスフェート;1-ベンジルオキシメチルシュードウリジン トリホスフェート;1-ベンジル-シュードウリジン トリホスフェート;1-ビオチニル-PEG2-シュードウリジン トリホスフェート;1-ビオチニルシュードウリジン トリホスフェート;1-ブチル-シュードウリジン トリホスフェート;1-シアノメチルシュードウリジン トリホスフェート;1-シクロブチルメチル-シュードウリジン トリホスフェート;1-シクロブチル-シュードウリジン トリホスフェート;1-シクロヘプチルメチル-シュードウリジン トリホスフェート;1-シクロヘプチル-シュードウリジン トリホスフェート;1-シクロヘキシルメチル-シュードウリジン トリホスフェート;1-シクロヘキシル-シュードウリジン トリホスフェート;1-シクロオクチルメチル-シュードウリジン トリホスフェート;1-シクロオクチル-シュードウリジン トリホスフェート;1-シクロペンチルメチル-シュードウリジン トリホスフェート;1-シクロペンチル-シュードウリジン トリホスフェート;1-シクロプロピルメチル-シュードウリジン トリホスフェート;1-シクロプロピル-シュードウリジン トリホスフェート;1-ヘキシル-シュードウリジン トリホスフェート;1-ホモアリルシュードウリジン トリホスフェート;1-ヒドロキシメチルシュードウリジン トリホスフェート;1-イソ-プロピル-シュードウリジン トリホスフェート;1-Me-2-チオ-シュードウリジン トリホスフェート;1-Me-4-チオ-シュードウリジン トリホスフェート;1-Me-アルファ-チオ-シュードウリジン トリホスフェート;1-メタンスルホニルメチルシュードウリジン トリホスフェート;1-メトキシメチルシュードウリジン トリホスフェート;1-メチル-6-(2,2,2-トリフルオロエチル)シュードウリジン トリホスフェート;1-メチル-6-(4-モルホリノ)-シュードウリジン トリホスフェート;1-メチル-6-(4-チオモルホリノ)-シュードウリジン トリホスフェート;1-メチル-6-(置換フェニル)シュードウリジン トリホスフェート;1-メチル-6-アミノ-シュードウリジン トリホスフェート;1-メチル-6-アジド-シュードウリジン トリホスフェート;1-メチル-6-ブロモ-シュードウリジン トリホスフェート;1-メチル-6-ブチル-シュードウリジン トリホスフェート;1-メチル-6-クロロ-シュードウリジン トリホスフェート;1-メチル-6-シアノ-シュードウリジン トリホスフェート;1-メチル-6-ジメチルアミノ-シュードウリジン トリホスフェート;1-メチル-6-エトキシ-シュードウリジン トリホスフェート;1-メチル-6-エチルカルボキシレート-シュードウリジン トリホスフェート;1-メチル-6-エチル-シュードウリジン トリホスフェート;1-メチル-6-フルオロ-シュードウリジン トリホスフェート;1-メチル-6-ホルミル-シュードウリジン トリホスフェート;1-メチル-6-ヒドロキシアミノ-シュードウリジン トリホスフェート;1-メチル-6-ヒドロキシ-シュードウリジン トリホスフェート;1-メチル-6-ヨード-シュードウリジン トリホスフェート;1-メチル-6-イソ-プロピル-シュードウリジン トリホスフェート;1-メチル-6-メトキシ-シュードウリジン トリホスフェート;1-メチル-6-メチルアミノ-シュードウリジン トリホスフェート;1-メチル-6-フェニル-シュードウリジン トリホスフェート;1-メチル-6-プロピル-シュードウリジン トリホスフェート;1-メチル-6-tert-ブチル-シュードウリジン トリホスフェート;1-メチル-6-トリフルオロメトキシ-シュードウリジン トリホスフェート;1-メチル-6-トリフルオロメチル-シュードウリジン トリホスフェート;1-モルホリノメチルシュードウリジン トリホスフェート;1-ペンチル-シュードウリジン トリホスフェート;1-フェニル-シュードウリジン トリホスフェート;1-ピバロイルシュードウリジン トリホスフェート;1-プロパルギルシュードウリジン トリホスフェート;1-プロピル-シュードウリジン トリホスフェート;1-プロピニル-シュードウリジン;1-p-トリル-シュードウリジン トリホスフェート;1-tert-ブチル-シュードウリジン トリホスフェート;1-チオメトキシメチルシュードウリジン トリホスフェート;1-チオモルホリノメチルシュードウリジン トリホスフェート;1-トリフルオロアセチルシュードウリジン トリホスフェート;1-トリフルオロメチルシュードウリジン トリホスフェート;1-ビニルシュードウリジン トリホスフェート;2,2’-アンヒドロ-ウリジン トリホスフェート;2’-ブロモデオキシウリジン トリホスフェート;2’-F-5-メチル-2’-デオキシ-ウリジン トリホスフェート;2’-メトキシ-5-メチル-ウリジン トリホスフェート;2’-メトキシシュードウリジン トリホスフェート;2’-a-エチニルウリジン トリホスフェート;2’-a-トリフルオロメチルウリジン トリホスフェート;2’-b-エチニルウリジン トリホスフェート;2’-b-トリフルオロメチルウリジン トリホスフェート;2’-デオキシ-2’,2’-ジフルオロウリジンtriホスフェート;2’-デオキシ-2’-a-メルカプトウリジン トリホスフェート;2’-デオキシ-2’-a-チオメトキシウリジン トリホスフェート;2’-デオキシ-2’-b-アミノウリジン トリホスフェート;2’-デオキシ-2’-b-アジドウリジン トリホスフェート;2’-デオキシ-2’-b-ブロモウリジン トリホスフェート;2’-デオキシ-2’-b-クロロウリジン トリホスフェート;
2’-デオキシ-2’-b-フルオロウリジン トリホスフェート;2’-デオキシ-2’-b-ヨードウリジン トリホスフェート;2’-デオキシ-2’-b-メルカプトウリジン トリホスフェート;2’-デオキシ-2’-b-チオメトキシウリジン トリホスフェート;2-メトキシ-4-チオ-ウリジン;2-メトキシウリジン;2’-O-メチル-5-(1-プロピニル)ウリジン トリホスフェート;3-アルキル-シュードウリジン トリホスフェート;4’-アジドウリジン トリホスフェート;4’-炭素環式ウリジン トリホスフェート;4’-エチニルウリジン トリホスフェート;5-(1-プロピニル)-アラウリジン トリホスフェート;5-(2-ルラニル)ウリジン トリホスフェート;5-シアノウリジン トリホスフェート;5-ジメチルアミノウリジン トリホスフェート;5’-ホモ-ウリジン トリホスフェート;5-ヨード-2’-フルオロ-デオキシウリジン トリホスフェート;5-フェニルエチニルウリジン トリホスフェート;5-三重水素メチル-6-重水素ウリジン トリホスフェート;5-トリフルオロメチル-ウリジン トリホスフェート;5-ビニルアラウリジン トリホスフェート;6-(2,2,2-トリフルオロエチル)シュードウリジン トリホスフェート;6-(4-モルホリノ)シュードウリジン トリホスフェート;6-(4-チオモルホリノ)シュードウリジン トリホスフェート;6-(置換フェニル)シュードウリジン トリホスフェート;6-アミノシュードウリジン トリホスフェート;6-アジドシュードウリジン トリホスフェート;6-ブロモシュードウリジン トリホスフェート;6-ブチルシュードウリジン トリホスフェート;6-クロロシュードウリジン トリホスフェート;6-シアノシュードウリジン トリホスフェート;6-ジメチルアミノシュードウリジン トリホスフェート;6-エトキシシュードウリジン トリホスフェート;6-エチルカルボキシレート-シュードウリジン トリホスフェート;6-エチルシュードウリジン トリホスフェート;6-フルオロシュードウリジン トリホスフェート;6-ホルミルシュードウリジン トリホスフェート;6-ヒドロキシアミノ-シュードウリジン トリホスフェート;6-ヒドロキシシュードウリジン トリホスフェート;6-ヨードシュードウリジン トリホスフェート;6-イソプロピルシュードウリジン トリホスフェート;6-メトキシシュードウリジン トリホスフェート;6-メチルアミノシュードウリジン トリホスフェート;6-メチルシュードウリジン トリホスフェート;6-フェニルシュードウリジン トリホスフェート;6-プロピルシュードウリジン トリホスフェート;6-tert-ブチルシュードウリジン トリホスフェート;6-トリフルオロメトキシシュードウリジン トリホスフェート;6-トリフルオロメチルシュードウリジン トリホスフェート;アルファ-チオシュードウリジン トリホスフェート;シュードウリジン 1-(4-メチルベンゼンスルホン酸)トリホスフェート;シュードウリジン 1-(4-メチル安息香酸)トリホスフェート;シュードウリジン トリホスフェート 1-[3-(2-エトキシ)]プロピオン酸;シュードウリジン トリホスフェート 1-[3-{2-(2-[2-(2-エトキシ)エトキシ]エトキシ)エトキシ}]プロピオン酸;シュードウリジン トリホスフェート 1-[3-{2-(2-[2-{2(2-エトキシ)-エトキシ}-エトキシ]エトキシ)エトキシ}]プロピオン酸;シュードウリジン トリホスフェート 1-[3-{2-(2-[2-エトキシ]エトキシ)エトキシ}]プロピオン酸;
シュードウリジン トリホスフェート 1-[3-{2-(2-エトキシ)-エトキシ}]プロピオン酸;シュードウリジン トリホスフェート 1-メチルホスホン酸;シュードウリジン トリホスフェート 1-メチルホスホン酸ジエチルエステル;シュードウリジン トリホスフェート-N1-3-プロピオン酸;シュードウリジン トリホスフェート-N1-4-ブタン酸;シュードウリジン トリホスフェート-N1-5-ペンタン酸;シュードウリジン トリホスフェート-N1-6-ヘキサン酸;シュードウリジン トリホスフェート-N1-7-ヘプタン酸;シュードウリジン トリホスフェート-N1-メチル-p-安息香酸;シュードウリジン トリホスフェート-N1-p-安息香酸;ワイブトシン;ヒドロキシワイブトシン;イソワイオシン;ペルオキシワイブトシン;アンダー修飾ヒドロキシワイブトシン;4-デメチルワイオシン;2,6-(ジアミノ)プリン;1-(アザ)-2-(チオ)-3-(アザ)-フェノキサジン-1-イル:1,3-(ジアザ)-2-(オキソ)-フェンチアジン-1-イル;1,3-(ジアザ)-2-(オキソ)-フェノキサジン-1-イル;1,3,5-(トリアザ)-2,6-(ジオキサ)ナフタレン;2(アミノ)プリン;2,4,5-(トリメチル)フェニル;2’-メチル、2’-アミノ、2’-アジド、2’-フルオロシチジン;2’-メチル、2’-アミノ、2’-アジド、2’-フルオロアデニン;2’-メチル、2’-アミノ、2’-アジド、2’-フルオロウリジン;2’-アミノ-2’-デオキシリボース;2-アミノ-6-クロロ-プリン;2-アザイノシニル;2’-アジド-2’-デオキシリボース;2’-フルオロ-2’-デオキシリボース;2’-フルオロ-修飾塩基;2’-O-メチルリボース;2-オキソ-7-アミノピリドピリミジン-3-イル;2-オキソ-ピリドピリミジン-3-イル;2-ピリジノン;3-ニトロピロール;3-(メチル)-7-(プロピニル)イソカルボスチリリル;3-(メチル)イソカルボスチリリル;4-(フルオロ)-6-(メチル)ベンズイミダゾール;4-(メチル)ベンズイミダゾール;4-(メチル)インドリル;4,6-(ジメチル)インドリル;5-ニトロインドール;5-置換ピリミジン;5-(メチル)イソカルボスチリリル;5-ニトロインドール;6-(アザ)ピリミジン;6-(アゾ)チミン;6-(メチル)-7-(アザ)インドリル;6-クロロプリン;6-フェニル-ピロロ-ピリミジン-2-オン-3-イル;7-(アミノアルキルヒドロキシ)-1-(アザ)-2-(チオ )-3-(アザ)-フェンチアジン-1-イル;7-(アミノアルキルヒドロキシ)-1-(アザ)-2-(チオ)-3-(アザ)-フェノキサジン-1-イル;7-(アミノアルキルヒドロキシ)-1,3-(ジアザ)-2-(オキソ)-フェノキサジン-1-イル;7-(アミノアルキルヒドロキシ)-1,3-(ジアザ)-2-(オキソ)-フェンチアジン-1-イル;7-(アミノアルキルヒドロキシ)-1,3-(ジアザ)-2-(オキソ)-フェノキサジン-1-イル;7-(アザ)インドリル;7-(グアニジニウムアルキルヒドロキシ)-1-(アザ)-2-(チオ)-3-(アザ)-フェノキサジン-1-イル;7-(グアニジニウムアルキルヒドロキシ)-1-(アザ)-2-(チオ)-3-(アザ)-フェンチアジン-1-イル;7-(グアニジニウムアルキルヒドロキシ)-1-(アザ)-2-(チオ)-3-(アザ)-フェノキサジン-1-イル;7-(グアニジニウムアルキルヒドロキシ)-1,3-(ジアザ)-2-(オキソ)-フェノキサジン-1-イル;7-(グアニジニウムアルキル-ヒドロキシ)-1,3-(ジアザ)-2-(オキソ)-フェンチアジン-1-イル;7-(グアニジニウムアルキルヒドロキシ)-1,3-(ジアザ)-2-(オキソ)-フェノキサジン-1-イル;7-(プロピニル)イソカルボスチリリル;7-(プロピニル)イソカルボスチリリル、7-デアザイノシニル;7-置換-1-(アザ)-2-(チオ)-3-(アザ)-フェノキサジン-1-イル;7-置換-1,3-(ジアザ)-2-(オキソ)-フェノキサジン-1-イル;9-(メチル)-イミジゾピリジニル;アミノインドリル;アントラセニル;ビス-オルト-(アミノアルキルヒドロキシ)-6-フェニル-ピロロ-ピリミジン-2-オン-3-イル;ビス-オルト置換-6-フェニル-ピロロ-ピリミジン-2-オン-3-イル;ジフルオロトリル;ハイポキサンチン;イミジゾピリジニル;イノシニル;イソカルボスチリリル;イソグアニシン;N2-置換プリン;N6-メチル-2-アミノプリン;N6-置換プリン;N-アルキル化誘導体;ナフタレニル;ニトロベンズイミダゾリル;ニトロイミダゾリル;ニトロインダゾリル;ニトロピラゾリル;ヌブラリン;O6-置換プリン;O-アルキル化誘導体;オルト-(アミノアルキルヒドロキシ)-6-フェニル-ピロロ-ピリミジン-2-オン-3-イル;オルト置換-6-フェニル-ピロロ-ピリミジン-2-オン-3-イル;オキソホルマイシン トリホスフェート;パラ-(アミノアルキルヒドロキシ)-6-フェニル-ピロロ-ピリミジン-2-オン-3-イル;パラ置換-6-フェニル-ピロロ-ピリミジン-2-オン-3-イル;ペンタセニル;フェナントラセニル;フェニル;ピレニル;ピリドピリミジン-3-イル;2-オキソ-7-アミノ-ピリドピリミジン-3-イル;ピロロ-ピリミジン-2-オン-3-イル;ピロロピリミジニル;ピロロピリジニル;スチルベンジル;置換1,2,4-トリアゾール;テトラセニル;ツベルチジン;キサンチン;キサントシン-5’-トリホスフェート;2-チオ-ゼブラリン;5-アザ-2-チオゼブラリン;7-デアザ-2-アミノプリン;ピリジン-4-オン リボヌクレオシド;2-アミノ-リボシド-トリホスフェート;ホルマイシンA トリホスフェート;ホルマイシンB トリホスフェート;ピロロシン トリホスフェート;2’-ヒドロキシル-アラアデノシン トリホスフェート;2’-ヒドロキシル-アラシチジン トリホスフェート;2’-ヒドロキシル-アラウリジン トリホスフェート;2’-ヒドロキシル-アラグアノシン トリホスフェート;5-(2-カルボメトキシビニル)ウリジン トリホスフェート;およびN6-(19-アミノ-ペンタオキサノナデシル)アデノシン トリホスフェート。
いくつかの実施態様では、ヌクレオシドの核酸塩基または修飾核酸塩基は保護基を含む。適切な保護基が上記されている。当業者は保護基の選択が核酸塩基または修飾核酸塩基の性質によって規定されることを理解するであろう。例えば、アミンはAc、iBu、Bn、またはBzによって保護され得る。
P-キラルホスフィンを製造する方法
本開示は、P-キラルホスフィンを製造する方法を提供する。合成方法が以下のスキーム1に示される。
スキーム1
Figure 2023510921000036
スキーム1は、TLO-Psi試薬(1)によって可能となったモジュラーホスフィン合成を説明するものであって、それは組み立て工程方式:ローディング工程(Rを導入するため)、カップリング工程(Rを導入するため)、置換工程(脱離基を導入し、つづいてRを導入する)、および還元工程で行われる。X線結晶学で確認すると、Pでの正味の立体保持が、この順序の全ての工程で観察される。
明確にするために、(-)-または(+)-TLO-Psiのいずれかに由来する化合物を接尾辞aおよびbで表す[(-)についてはaで、(+)についてはbで表す]。しかしながら、手元に一方の試薬しかない場合、このモジュラー方法において添加の順序を変えるだけで、カップリングまたは置換生成物のいずれかのエナンチオマーに至り得た(逆も同様である)。
キラルホスフィンを製造する工程において、意外にも、トランス-リモネンオキシド(「TLO-Psi」)から由来のP(V)試薬が、シス-リモネンオキシド(「CLO-Psi」)から由来のP(V)試薬よりも優れた反応性を有することが分かる。スキーム2は、TLO-Psiから由来の試薬8aが、カルバニオン試薬をスムーズに反応してチオホスフィン酸9aを、その後でチオホスフィン酸エステル11aを生成する一方で、CLO-Psiから由来の試薬3では、そのような反応性を有しないことを示す。
スキーム2
Figure 2023510921000037
1の態様において、本開示はチオホスフィン酸の製造方法であって、
カルバニオン試薬を、式(Ia):
Figure 2023510921000038
[式中
は、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、C2-6アルキニル、C3-10シクロアルキル、C6-10アリール、またはC結合のヘテロアリールであり、ここでRは、所望により、1または複数の同じまたは異なるR基で置換されてもよく;
は、重水素、CD、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、C2-6アルキニル、ハロゲン、CF、C1-6アルコキシ、C3-10シクロアルキル、C6-10アリール、、またはC結合のヘテロアリールである]
で示される化合物、その塩、そのエナンチオマー、またはその組み合わせと反応させ、チオホスフィン酸を形成する、ことを含む、方法を提供する。
1の態様において、上記の方法にて形成されるチオホスフィン酸は、式(II):
Figure 2023510921000039
[式中
およびRは、各々独立して、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、C2-6アルキニル、C3-10シクロアルキル、C6-10アリール、またはC結合のヘテロアリールであり、ここでRおよびRの各々は、所望により、1または複数の同じまたは異なるR基で置換されてもよく;および
は、重水素、CD、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、C2-6アルキニル、ハロゲン、CF、C1-6アルコキシ、C3-10シクロアルキル、C6-10アリールまたはC結合のヘテロアリールである]
で示される。
1の態様において、カルバニオン試薬は、有機リチウム試薬RLiであって、ここでRは前記にて定義されるとおりである。
1の態様において、上記の方法にて形成されるチオホスフィン酸は、式(IIa):
Figure 2023510921000040
[式中、RおよびRは上記にて定義されるとおりである]
で示される化合物、またはそのエナンチオマーである。
1の態様において、チオホスフィン酸を製造する方法は有機溶媒中で実施される。1の態様では、有機溶媒には、限定されないが、エーテル、THF、ヘキサン、およびジオキサンが含まれる。
1の態様において、チオホスフィン酸を製造する方法は、室温で約2ないし約12時間、約2ないし約10時間、約2ないし約8時間、または約2ないし約6時間で実施される。
1の態様において、該方法は、チオホスフィン酸をアルキル化試薬と反応させ、チオホスフィン酸エステルを形成することをさらに含む。
1の態様において、チオホスフィン酸エステルは、式(III):
Figure 2023510921000041
[式中
およびRは、各々独立して、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、C2-6アルキニル、C3-10シクロアルキル、C6-10アリール、またはC結合のヘテロアリールであり;
ここで、RおよびRの各々は、所望により、1または複数の同じまたは異なるR基で置換されてもよく;
は、重水素、CD、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、C2-6アルキニル、ハロゲン、CF、C1-6アルコキシ、C3-10シクロアルキル、C6-10アリール、またはC結合のヘテロアリールであり;および
R’は、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、またはC2-6アルキニルである]
で表される。
1の態様において、チオホスフィン酸エステルは、式(IIIa):
Figure 2023510921000042
[式中:RおよびRは上記にて定義されるとおりである]
で示される化合物、またはそのエナンチオマーである。
1の態様において、チオホスフィン酸エステルは、
Figure 2023510921000043
からなる群より選択される。
1の態様において、アルキル化試薬には、限定されないが、ヨウ化メチル、ヨウ化エチル、およびヨウ化プロピルが含まれる。
1の態様において、チオホスフィン酸エステルを製造する方法は、有機溶媒中、塩基の存在下で、室温にて実施される。1の態様において、有機溶媒には、限定されないが、エーテル、THF、ヘキサン、およびジオキサンが含まれる。1の態様において、有機溶媒はTHFである。1の態様において、塩基には、限定されないが、トリエチルアミン、DIPEA、ピリジン、2,6-ルチジン、およびイミダゾールが含まれる。
1の態様において、該方法は、チオホスフィン酸エステルをアルコキシド剤と反応させ、有機ホスフィネートを形成することをさらに含む。
1の態様において、有機ホスフィネートは、式(IV):
Figure 2023510921000044
[式中:
およびRは、各々独立して、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、C2-6アルキニル、C3-10シクロアルキル、C6-10アリール、またはC結合のヘテロアリールであり;
ここで、RおよびRの各々は、所望により、1または複数の同じまたは異なるR基で置換されてもよく;
は、重水素、CD、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、C2-6アルキニル、ハロゲン、CF、C1-6アルコキシ、C3-10シクロアルキル、C6-10アリール、またはC結合のヘテロアリールであり;および
R’は、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、またはC2-6アルキニルである]
で示される。
1の態様において、有機ホスフィネートは、式(IVa):
Figure 2023510921000045
で示される化合物、またはそのエナンチオマーである。
1の態様において、有機ホスフィネートは、
Figure 2023510921000046
からなる群より選択される。
1の態様において、ホスフィンオキシドを製造する方法は、有機溶媒中で実施される。1の態様において、有機溶媒には、限定されないが、アルコール、エーテル、THF、ヘキサン、およびジオキサンが含まれる。1の態様において、該方法は、アルコール中で実施される。1の態様において、該方法は、室温で約4時間にわたって実施される。
1の態様において、該方法は、有機ホスフィネートをカルバニオン試薬と反応させ、ホスフィンオキシドを形成することをさらに含む。
1の態様において、該ホスフィンオキシドは、式(V):
Figure 2023510921000047
[式中
、R、およびRは、各々独立して、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、C2-6アルキニル、C3-10シクロアルキル、C6-10アリール、またはC結合のヘテロアリールであり;
ここで、R、R、およびRの各々は、所望により、1または複数の同じまたは異なるR基で置換されてもよく;
は、重水素、CD、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、C2-6アルキニル、ハロゲン、CF、C1-6アルコキシ、C3-10シクロアルキル、C6-10アリール、またはC結合のヘテロアリールである]
で示される。
1の態様において、ホスフィンオキシドは、式(Va):
Figure 2023510921000048
で示される化合物、またはそのエナンチオマーである。
1の態様において、カルバニオン試薬は、RMgBrのグリニャール試薬であり、ここでRは上記にて定義されるとおりである。
1の態様において、グリニャール試薬は、
Figure 2023510921000049
からなる群より選択される。
1の態様において、ホスフィンオキシドは、
Figure 2023510921000050
からなる群より選択される。
エナンチオマー的に純粋な[RP(O)SH]で示されるチオホスフィン酸を製造する場合、最後の置換反応の間に最適な脱離基についての研究を行う。以下の表5は、クロロホスフィンスルフィド(エントリー1)が求核攻撃に対して活性でないのに対して、クロロホスフィンオキシド(エントリー2)は容易に反応するが、エナンチオマー割合(「e.r.」)は低いことを示す。対照的に、チオホスフィン酸エステル(遊離SHのアルキル化)は有能な脱離基として機能する。意外にも、脱離基をメトキシとすると、反応性を高く維持しながら、置換反応のe.r.が98:2にまで上昇することが分かる。
Figure 2023510921000051
1の態様において、ホスフィンオキシドを製造する方法は、有機溶媒中で実施される。1の態様において、有機溶媒には、限定されないが、エーテル、THF、ヘキサン、およびジオキサンが含まれる。1の態様において、該方法はTHF中で実施される。1の態様において、該方法は、-78℃で、約2ないし約12時間、約2ないし約10時間、約2ないし約8時間、約2ないし約6時間、または約2ないし約4時間にわたって行われる。
1の態様において、該方法は、ホスフィンオキシドを還元剤と反応させ、ホスフィンを形成することをさらに含む。
1の態様において、ホスフィンは、式(VI):
Figure 2023510921000052
[式中
、R、およびRは、独立して、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、C2-6アルキニル、C3-10シクロアルキル、C6-10アリール、またはC結合のヘテロアリールであり;
ここで、R、R、およびRの各々は、所望により、1または複数の同じまたは異なるR基で置換されてもよく;および
は、重水素、CD、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、C2-6アルキニル、ハロゲン、CF、C1-6アルコキシ、C3-10シクロアルキル、C6-10アリール、またはC結合のヘテロアリールである]
で示される化合物である。
1の態様において、ホスフィンは、式(VIa):
Figure 2023510921000053
で示される化合物、またはそのエナンチオマーである。
1の態様において、還元剤には、限定されないが、HSiCl(EtNと共にまたはなしで)、犠牲剤(sacrificial)としてのPPhを含むHSiCl、ポリメチルヒドロシロキサン(PMHS)およびTi(OiPr)、およびMeOTf/メーヤワイン(Meerwain)塩、およびNaBHが含まれる。
1の態様において、ホスフィンを製造する方法は、有機溶媒中で実施される。1の態様において、有機溶媒には、限定されないが、ジクロロメタン、エーテル、THF、ヘキサン、およびジオキサンが含まれる。1の態様において、該方法はジクロロメタン中で実施される。1の態様において、該方法は、50℃で約2ないし約4時間にわたって実施される。
上記の反応条件は例示であり、限定することを意図していない。当業者であれば、反応時間および温度、溶媒の同一性および量等などの反応条件が、当該分野にて公知の方法に従って変化させることができることを理解するであろう。
オリゴヌクレオチドを製造する方法
本開示はオリゴヌクレオチドを製造する方法を提供する。その合成方法は以下のスキーム3に描かれている。
スキーム3は、ホスホン酸メチルの連結を有するジヌクレオチドを生成するための、効果的なワークフローを示す。メチルをTLO-Psiの試薬に導入した後、化合物12aまたは12bをヌクレオシドと反応させ、(R)-12または(S)-12で示されるヌクレオシドをロードした有機リン化合物を得る。次に、各化合物を第2のヌクレオシドとカップリングさせ、高い立体特異性を有するジヌクレオチドを得る。
スキーム3
Figure 2023510921000054
上記のジヌクレオチドを製造する開発において、意外にも、トランス-リモネンオキシド(「TLO-Psi」)から由来のP(V)試薬が、同じくシス-リモネンオキシド(「CLO-Psi」)から由来のP(V)試薬よりも優れた反応性を有することが分かる。スキーム4は、化合物12aが1-アダマンチル メタノール(Ad-CH-OH)と容易に反応し、化合物の(S)-6を生成し得、その一方で化合物5はそのような反応性のないことを示す。
スキーム4
Figure 2023510921000055
1の態様において、本開示は、ヌクレオシドをロードした有機リン化合物を製造する方法であって、ヌクレオシドを、式(Ia):
Figure 2023510921000056
[式中:
は、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、C2-6アルキニル、C3-10シクロアルキル、C6-10アリール、またはC結合のヘテロアリールであり、ここでRは、所望により、1または複数の同じまたは異なるR基で置換されてもよく;
は、重水素、CD、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、C2-6アルキニル、ハロゲン、CF、C1-6アルコキシ、C3-10シクロアルキル、C6-10アリール、またはC結合のヘテロアリールである]
で示される化合物、その塩、そのエナンチオマー、またはその組み合わせと反応させ、ヌクレオシドをロードした有機リン化合物を形成することを含む、方法を提供する。
1の態様において、ヌクレオシドをロードした有機リン化合物は、式(VII)または(VIIa):
Figure 2023510921000057
[式中
は、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、またはC2-6アルキニルであり;
R’は、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、またはC2-6アルキニルであり;
Nuはヌクレオシドであって、
ここで、Nuは、所望により、相互に独立して、1または複数の同じまたは異なる修飾、あるいは1または複数の同じまたは異なる保護基を含んでもよい]
で表される、ヌクレオシドをロードした有機リン試薬、またはそのジアステレオマーである。
1の態様において、RおよびR’の各々は-CHである。
1の態様において、Nuは、
Figure 2023510921000058
からなる群より選択される、ヌクレオシドであり、
ここで、
Tは
Figure 2023510921000059
であり;
Bz
Figure 2023510921000060
であり;
iBu
Figure 2023510921000061
であり;および
Bz
Figure 2023510921000062
である。
1の態様において、ヌクレオシドをロードした有機リン化合物を製造する方法は有機溶媒中で行われる。1の態様において、有機溶媒には、限定されないが、エーテル、THF、ヘキサン、およびジオキサンが含まれる。
1の態様において、ヌクレオシドをロードした有機リン化合物を製造する方法は、室温で約2ないし約12時間、約2ないし約10時間、約2ないし約8時間、または約2ないし約6時間で実施される。
1の態様において、ヌクレオシドをロードした有機リン化合物を製造する方法は、塩基の存在下で実施される。1の態様において、塩基には、限定されないが、DBU、トリエチルアミン、DIPEA、ピリジン、2,6-ルチジン、およびイミダゾールが含まれる。
1の態様において、該方法は、ヌクレオシドをロードした有機リン化合物を第2のヌクレオシドと反応させ、ジヌクレオチドを形成することをさらに含む。
1の態様において、ジヌクレオチドは、式(VIII)または(VIIIa):
Figure 2023510921000063
[式中:
は、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、またはC2-6アルキニルであり;
NuおよびNuの各々はヌクレオシドであって;
ここで、NuおよびNuのいずれか一方または両方は、相互に独立して、1または複数の同じまたは異なる修飾、あるいは1または複数の同じまたは異なる保護基を所望により含んでもよい]
で示される化合物である。
1の態様において、Rは-CHであって;NuおよびNuは、各々独立して、
Figure 2023510921000064
からなる群より選択されるヌクレオシドであり、
ここで
Tは、
Figure 2023510921000065
であり;
Bz
Figure 2023510921000066
であり;
iBu
Figure 2023510921000067
であって;および
Bz
Figure 2023510921000068
である。
1の態様において、ジヌクレオチドを製造する方法は有機溶媒中で実施される。1の態様において、有機溶媒には、限定されないが、エーテル、THF、ヘキサン、およびジオキサンが含まれる。
1の態様において、ジヌクレオチドを製造する方法は、室温で約2ないし約16時間、約2ないし約14時間、約2ないし約12時間、または約2ないし約10時間で実施される。
1の態様において、ジヌクレオチドを製造する方法は塩基の存在下で実施される。1の態様において、塩基には、限定されないが、DBU、トリエチルアミン、DIPEA、ピリジン、2,6-ルチジン、およびイミダゾールが含まれる。
1の態様において、該方法は:
a)そのジヌクレオチドを式(Ia)の化合物と反応させ、ロードされたジヌクレオチドを形成し;
b)工程(a)にて形成のロードされたジヌクレオチドを第3ヌクレオシドと反応させ、トリヌクレオチドを形成し;
c)工程(a)および(b)を1回または複数回繰り返し、所望の数のヌクレオチドを有するオリゴヌクレオチドを形成する
ことをさらに含む。
1の態様において、オリゴヌクレオチドを製造する方法の工程a)の反応条件は、ヌクレオシドをロードした有機リン化合物を製造する方法における反応条件と同じである。1の態様において、オリゴヌクレオチドを製造する方法の工程b)の反応条件は、ジヌクレオチドを製造する方法における反応条件と同じである。
1の態様において、ジヌクレオチドは、式(VIII)または(VIIIa):
Figure 2023510921000069
[式中:
は、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、またはC2-6アルキニルであり;
NuおよびNuの各々はヌクレオシドであり;
ここで、NuおよびNuのいずれか一方または両方は、所望により、相互に独立して、1または複数の同じまたは異なる修飾、あるいは1または複数の同じまたは異なる保護基を含んでもよい]
で示される、化合物またはそのエナンチオマーである。
1の態様において、ジヌクレオチドを形成する方法は、
a)ジヌクレオチドを、式C:
Figure 2023510921000070
で示される化合物、またはそのエナンチオマーと反応させ、ロードしたキメラジヌクレオチドを形成し;および
b)工程(a)にて形成されたそのロードしたキメラジヌクレオチドを、第3のヌクレオシドと反応させ、ホスホネート連結およびホスホロチオエート連結を担持するキメラトリヌクレオチドを形成すること
をさらに含む。
1の態様において、キメラトリヌクレオチドを形成する方法の工程a)は有機溶媒中で実施される。1の態様において、有機溶媒には、限定されないが、ACN、エーテル、THF、ヘキサン、およびジオキサンが含まれる。
1の態様において、ヌクレオシドをロードした有機リン化合物を製造する方法は、室温で約2ないし約12時間、約2ないし約10時間、約2ないし約8時間、または約2ないし約6時間で実施される。
1の態様において、ヌクレオシドをロードした有機リン化合物を製造する方法は塩基の存在下で実施される。1の態様において、塩基には、限定されないが、DBU、トリエチルアミン、DIPEA、ピリジン、2,6-ルチジン、およびイミダゾールが含まれる。
上記の反応条件は例示であり、限定することを意図していない。当業者であれば、反応時間および温度、溶媒の同一性および量等などの反応条件が、当該分野にて公知の方法に従って変化させることができることを理解するであろう。
式(Ia)の化合物を製造する方法
1の態様において、本開示は、式(Ia):
Figure 2023510921000071
[式中:
は、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、C2-6アルキニル、C3-10シクロアルキル、C6-10アリール、またはC結合のヘテロアリールであり;
ここでRは、所望により、1または複数の同じまたは異なるR基で置換されてもよく;
は、重水素、CD、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、C2-6アルキニル、ハロゲン、CF、C1-6アルコキシ、C3-10シクロアルキル、C6-10アリール、またはC結合のヘテロアリールである]
で示される化合物、またはそのエナンチオマーを製造する方法であって、
カルバニオン試薬を、式A:
Figure 2023510921000072
の化合物、またはそのエナンチオマーと反応させ、式(Ia)の化合物を形成することを含む、方法に関する。
1の態様において、カルバニオン試薬はグリニャール試薬である。1の態様において、該グリニャール試薬はRMgBrであり、ここでRは上記にて定義されるとおりである。
1の態様において、該グリニャール試薬は、
Figure 2023510921000073
からなる群より選択される。
1の態様において、式(Ia)の化合物を製造する方法は、室温で約2ないし約12時間、約2ないし約10時間、約2ないし約8時間、または約2ないし約6時間で実施される。
1の態様において、式(Ia)の化合物を製造する方法は有機溶媒中で実施される。1の態様において、有機溶媒には、限定されないが、エーテル、THF、ヘキサン、およびジオキサンが含まれる。
上記の反応条件は例示であり、限定することを意図していない。当業者であれば、反応時間および温度、溶媒の同一性および量等などの反応条件が、当該分野にて公知の方法に従って変化させることができることを理解するであろう。
定義
特記されない限り、明細書および特許請求の範囲を含め、本願にて使用される次の用語は、下記に示される定義を有する。本明細書および添付した特許請求の範囲にて使用される場合、単数形「a」、「an」および「the」は、文脈が明らかに他を指示しない限り、複数の参照語を含むことを留意すべきである。特記されない限り、質量分析、NMR、HPLC、タンパク質化学、生化学、組換えDNA技法、および薬学の従来の方法が利用される。本願において、「または」または「および」の使用は、特記されない限り、「および/または」を意味する。さらには、「含んでいる」なる語の使用は、「含む」、および「含まれる」などの他の形態と同様に、限定するものではない。
単位、接頭辞、および記号は、国際単位系(SI)で認められる形式で記載される。数値の範囲は、その範囲を規定する数値を含む。数値の範囲が示される場合、その範囲で示された上限と下限の間に介在する各整数値、およびその各分数もまた、それらの値の間にある各々の下位群と共に、具体的に開示されるものと認識すべきである。任意の範囲の上限および下限は、独立して、その範囲に含めることも、除外することもでき、その限界のいずれかが含まれ、いずれも含まれない、または両方が含まれる場合に、その各範囲もまた、本発明の範囲内に包含される。数値が明示されている場合、その示されている数値とほぼ同じ量または値である数値もまた、本発明の範囲内にあることを理解すべきである。組み合わせが開示されている場合、その組み合わせの要素の各サブコンビネーションもまた、具体的に開示されており、本発明の範囲内にある。反対に、異なる要素または一群の要素が個々に開示されている場合、その組み合わせも開示されている。発明の任意の要素が複数の選択肢を有するものとして開示されている場合、各選択肢が単独でまたは他の選択肢との任意の組み合わせで排除されている発明の例もここでは開示されており;発明の複数の要素はそのような除外を含むことができ、かかる除外を含む要素のあらゆる組み合わせが本明細書で開示される。
本開示は、本発明の化合物に存在する原子のすべての同位体を包含するものとする。同位体は、原子番号は同じであるが、質量数の異なる、それらの原子を包含する。一般的な例として、限定するものではなく、水素の同位体には、重水素および三重水素が含まれる。水素の同位体は、H(水素)、H(重水素)およびH(三重水素)と表記することができる。それらはまた、一般には、重水素についてはDと、三重水素についてはTと表記される。本願では、CDは、すべての水素原子が重水素である、メチル基を示す。炭素の同位体は13Cおよび14Cを包含する。本発明の同位体で標識された化合物は、一般に、当業者に既知の技法によって製造され得るか、または他では利用される標識されていない試薬の代わりに適切に同位体標識された試薬を用い、本明細書に記載の方法に類似する方法によって製造され得る。
本開示において、「立体異性体」なる語は、それ自体で、化合物(例えば、本明細書に記載のいずれの式の化合物)が有し得る、可能性のあるあらゆる異なる異性体の、ならびにコンフォメーションの形態をいい、特に可能性のあるあらゆる立体化学的におよびコンフォメーション的に異性体の形態、基本分子構造のあらゆるジアステレオマー、エナンチオマーおよび/またはコンフォマーをいう。本開示のいくつかの化合物は、異なる互変異性体の形態で存在してもよく、そのすべては本開示の範囲内に包含される。
本開示において、「エナンチオマー」なる語は、本開示の化合物の各個々の光学活性な形態を意味する。
本開示において、「ジアステレオマー」なる語は、互いの鏡像ではなく、互いに重ね合わせることができない、立体異性体を意味する。
本開示において、「核酸」なる語は、ポリ-またはオリゴ-リボヌクレオチド(RNA)およびポリ-またはオリゴ-デオキシリボヌクレオチド(DNA);核酸塩基および/または修飾核酸塩基のN-グリコシドまたはC-グリコシドから由来のRNAまたはDNA;糖および/または修飾糖から由来の核酸;およびホスフェート架橋および/または修飾リン原子架橋から由来の核酸を包含する。該用語は、核酸塩基、修飾核酸塩基、糖、修飾糖、ホスホネート架橋、または修飾リン原子架橋の任意の組み合わせを含有する核酸を包含する。例として、限定されないが、リボース部分を含有する核酸、デオキシリボース部分を含有する核酸、リボースおよびデオキシリボース部分を含有する核酸、リボースおよび修飾リボース部分を含有する核酸が挙げられる。接頭辞「ポリ-」は、約1ないし約10,000個のヌクレオチドのモノマー単位を含有する核酸をいい、接頭辞「オリゴ-」は、約1ないし約200個のヌクレオチドのモノマー単位を含有する核酸をいう。「核酸」なる語はまた、CDNを包含しうる。
本開示において、互換的に使用される「核酸塩基」および「ヌクレオシド塩基部分」なる語は、1の核酸鎖を配列特異的に相補鎖に結合する、水素結合に関与する核酸の部分をいう。最も一般的な天然に存在する核酸塩基は、アデニン(A)、グアニン(G)、ウラシル(U)、シトシン(C)、およびチミン(T)である。
本開示において、核酸塩基は、略語のA、G、U、C、T、Hypで表され得る。略語Aはアデニンをいい;Gはグアニンをいい;Uはウラシルをいい;Cはシトシンをいい;Tはチミンをいい;Hypはヒポキサンチンをいう。
本開示において、互換的に使用される「修飾核酸塩基」および「修飾ヌクレオシド塩基部分」なる語は、核酸塩基を置換することのできる部分をいう。修飾核酸塩基は、核酸塩基の空間配置、電子特性、または他のいくつかの物理化学的特性を模倣し、1の核酸鎖を配列特異的にもう一つ別の鎖に結合する、水素結合の特性を保持する。修飾核酸塩基は、一般に、オリゴヌクレオチド二本鎖の融解挙動、細胞内酵素による認識、または活動に実質的に影響を及ぼすことなく、天然に存在する塩基(例えば、ウラシル、チミン、アデニン、シトシン、グアニン)と対合し得る。互換的に使用される「修飾核酸塩基」および「修飾ヌクレオシド塩基部分」なる語は、さらに、最も古典的な意味ではヌクレオシド塩基ではないが、ヌクレオシド塩基として機能する、特定の「普遍的塩基」を含め、ヌクレオシド塩基として機能し得る、ヘテロ環化合物を包含するものとする。普遍的塩基として特に言及されるのは、3-ニトロピロールである。
本開示において、「ヌクレオシド」なる語は、核酸塩基(アデニン、グアニン、チミン、ウラシル、5-メチルウラシル等などの窒素塩基)または修飾核酸塩基が五炭素糖(リボースまたはデオキシリボース)または修飾糖に共有結合している化合物のグリコシルアミンをいう。
本開示において、「糖」なる語は、閉鎖および/または開放型の単糖をいう。糖には、限定されないが、リボース、デオキシリボース、ペントフラノース、ペントピラノース、モルホリノ、炭素環アナログ、ヘキソピラノース部分、およびロック核酸において見られる糖などの二環式糖が含まれる。ロック核酸の例として、限定されないが、WO2016/079181に開示の核酸が挙げられる。
本開示において、「修飾糖」なる語は、糖を置換し得る部分をいう。修飾糖は、糖の空間配置、電子特性、または他のいくつかの物理化学特性を模倣する。
本開示において、「ヌクレオチド」なる語は、核酸塩基または修飾核酸塩基が糖または修飾糖に共有結合し、糖または修飾糖がホスフェート基またはチオホスフェート基などの修飾リン原子部分に共有結合する、部分をいう。
本開示において、「ペプチド」なる語は、ペプチド結合により連結したアミノ酸モノマーの鎖をいう。一般に、ペプチドは約50個以下のアミノ酸を有するであろう。「ペプチド」なる語は、天然に存在する、および天然に存在しないアミノ酸の両方を包含する。ペプチドは直鎖状または環状とすることができる。
本開示において、「タンパク質」なる語は、生物学的に機能するように配置された1または複数のポリペプチドを含む。生物学的に機能するタンパク質の例として、限定されないが、酵素、抗体、サイトカイン、ホルモン、膜貫通型タンパク質等が挙げられる。
本開示において、「部分」なる語は、分子の特定のセグメントまたは官能基をいう。化学的部分は分子に埋め込まれているか、付与されている、認識された化学的実体であることが多い。
本開示において、本明細書にて互換的に使用される「固体支持体」または「樹脂」なる語は、核酸および/またはペプチドの合成による大量生産を可能とし、必要な時に再利用され得る、いずれの支持体をもいう。本明細書で使用される場合、該用語は、核酸および/またはペプチドを合成するのに行われる反応工程にて利用される媒体にて不溶性であり、反応性基を含むように誘導体化されている、ポリマーをいう。
本開示において、「連結部分」なる語は、末端ヌクレオシドと固体支持体との間に、または末端ヌクレオシドと、もう一つ別のヌクレオシド、ヌクレオチド、または核酸との間に、所望により位置付けられてもよい、任意の部分をいう。
本開示において、「精製された」なる語は、核酸に関連して用いられる場合、少なくとも1の汚染物質から分離されるものをいう。本明細書で使用される場合、「汚染物質」とは、該物質とは別のもう一つの物質を不適格、不純または劣悪とする、任意の物質である。かくして、精製されたオリゴヌクレオチドは、それを精製方法に供する前に存在していたものとは異なる形態または設定で存在する。
本開示において、それ自体で、またはもう一つ別の基の一部として使用される「アルキル」なる語は、1ないし12個の炭素原子(すなわち、C1-12アルキル)、または指定された数の炭素原子、例えば、メチルなどのCアルキル、エチルなどのCアルキル、プロピルまたはイソプロピルなどのCアルキル等を含有する、非置換の直鎖または分岐鎖の脂肪族炭化水素をいう。1の態様において、アルキル基はC1-10アルキルである。もう一つ別の態様において、アルキル基はC1-6アルキルである。もう一つ別の態様において、アルキル基はC1-4アルキルである。非限定的な例示としてのC1-10アルキル基には、メチル、エチル、プロピル、イソプロピル、ブチル、sec-ブチル、tert-ブチル、イソ-ブチル、3-ペンチル、ヘキシル、ヘプチル、オクチル、ノニル、およびデシルが含まれる。非限定的な例示としてのC1-6アルキル基には、メチル、エチル、プロピル、イソプロピル、ブチル、sec-ブチル、tert-ブチル、イソブチル、およびヘキシルが含まれる。非限定的な例示としてのC1-4アルキル基には、メチル、エチル、プロピル、イソプロピル、ブチル、sec-ブチル、tert-ブチル、およびイソブチルが含まれる。
本開示において、「所望により置換されてもよいアルキル」なる語は、1または複数のR基を有する、上記にて定義されるとおりの、アルキル基である。
本開示において、それ自体で、またはもう一つ別の基の一部として使用される「シクロアルキル」なる語は、3ないし12個の炭素原子(すなわち、C3-12シクロアルキル)、または指定された数の炭素原子を有する、1~3個の環を含有する、非置換の飽和および部分的に不飽和の、例えば、1または2個の二重結合を含有する、環状脂肪族炭化水素をいう。1の態様において、シクロアルキル基は2個の環を有する。1の態様において、シクロアルキル基は1個の環を有する。もう一つ別の態様において、シクロアルキルは飽和である。もう一つ別の態様において、シクロアルキルは不飽和である。もう一つ別の態様において、シクロアルキル基はC3-8シクロアルキル基である。もう一つ別の態様において、シクロアルキル基はC3-7シクロアルキル基である。もう一つ別の態様において、シクロアルキル基はC5-7シクロアルキル基である。もう一つ別の態様において、シクロアルキル基はC3-6シクロアルキル基である。「シクロアルキル」なる語には、環CH-が-C(=O)-で置換されている基が含まれる。非限定的な例示としてのシクロアルキル基には、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロヘキシル、シクロヘプチル、シクロオクチル、ノルボルニル、デカリン、アダマンチル、シクロヘキセニル、シクロペンテニル、シクロヘキセニル、およびシクロペンタノンが含まれる。
本開示において、「所望により置換されてもよいシクロアルキル」なる語は、1または複数のR基を有する、上記にて定義されるとおりのシクロアルキル基である。
所望により置換されてもよいシクロアルキルなる語には、所望により置換されてもよいアリール、例えば、フェニルの縮合した、または所望により置換されてもよいヘテロアリール、例えば、ピリジルの縮合した、シクロアルキル基が含まれる。縮合した所望により置換されてもよいアリール、または縮合した所望により置換されてもよいヘテロアリール基を有する、所望により置換されてもよいシクロアルキルは、シクロアルキル環上の利用可能な任意の炭素原子で分子の残基に結合してもよい。1の態様において、所望により置換されてもよいシクロアルキル基は、フェニル基の縮合した5員、6員、または7員のシクロアルキル基であって、ここで該フェニルは、1、2または3個の置換基で所望により置換されてもよい。
本開示において、それ自体で、またはもう一つ別の基の一部として使用される「アルケニル」なる語は、1、2または3個の炭素-炭素の二重結合を含有する、アルキルをいう。1の態様において、アルケニル基はC2-6アルケニル基である。もう一つ別の態様において、アルケニル基はC2-4アルケニル基である。非限定的な例示としてのアルケニル基には、エテニル、プロぺニル、イソプロぺニル、ブテニル、sec-ブテニル、ペンテニル、およびヘキセニルが含まれる。
本開示において、それ自体で、またはもう一つ別の基の一部として本明細書で使用される「所望により置換されてもよいアルケニル」なる語は、非置換であるか、または1または複数のR置換基で置換されるかのいずれかである、アルケニルをいう。
本開示において、それ自体で、またはもう一つ別の基の一部として使用される「アルキニル」なる語は、1ないし3個の炭素-炭素の三重結合を含有する、アルキルをいう。1の態様において、アルキニルは1個の炭素-炭素の三重結合を有する。1の態様において、アルキニル基はC2-6アルキニル基である。もう一つ別の態様において、アルキニル基はC2-4アルキニル基である。非限定的な例示としてのアルキニル基には、エチニル、プロピニル、ブチニル、2-ブチニル、ペンチニル、およびヘキシニルが含まれる。
本開示において、それ自体で、またはもう一つ別の基の一部として本明細書で使用される「所望により置換されてもよいアルキニル」なる語は、非置換であるか、または1または複数のR置換基で置換されるかのいずれかである、アルキニルをいう。
本開示において、それ自体で、またはもう一つ別の基の一部として使用される「アリール」なる語は、非置換の芳香族環系を含む基をいう。1の態様において、アリール基は、5ないし14個の炭素原子を有する単環、二環、または多環式芳香族環、すなわち、C5-14アリール、C6-12アリール、C6-10アリール、またはC6-8アリールを有する。非限定的な例示としてのアリール基には、フェニル(「Ph」と略される)、ナフチル、フェナンチリル、アントラシル、インデニル、アズレニル、ビフェニル、ビフェニレニル、およびフルオレニル基が含まれる。1の態様において、アリール基は、フェニルまたはナフチルである。1の態様において、アリール基は、芳香族環が金属原子と結合する有機金属基を包含する。非限定的な例示としてのアリール基には、フェロセンおよびコバルトセンが含まれる。結合する基または点は芳香族環上にある。
本開示において、それ自体で、またはもう一つ別の基の一部として本明細書で使用される「所望により置換されてもよいアリール」なる語は、非置換であるか、または1または複数のR置換基で置換されるかのいずれかである、アリールをいう。
1の態様において、所望により置換されてもよいアリールは所望により置換されてもよいフェニルである。1の態様において、所望により置換されてもよいフェニルは4個の置換基を有する。もう一つ別の態様において、所望により置換されてもよいフェニルは3個の置換基を有する。もう一つ別の態様において、所望により置換されてもよいフェニルは2個の置換基を有する。もう一つ別の態様において、所望により置換されてもよいフェニルは1個の置換基を有する。非限定的な例示としての置換アリール基には、2-メチルフェニル、2-メトキシフェニル、2-フルオロフェニル、2-クロロフェニル、2-ブロモフェニル、3-メチルフェニル、3-メトキシフェニル、3-フルオロフェニル、3-クロロフェニル、4-メチルフェニル、4-エチルフェニル、4-メトキシフェニル、4-フルオロフェニル、4-クロロフェニル、2,6-ジ-フルオロフェニル、2,6-ジ-クロロフェニル、2-メチル、3-メトキシフェニル、2-エチル、3-メトキシフェニル、3,4-ジ-メトキシフェニル、3,5-ジ-フルオロフェニル 3,5-ジ-メチルフェニル、3,5-ジメトキシ、4-メチルフェニル、2-フルオロ-3-クロロフェニル、および3-クロロ-4-フルオロフェニルが含まれる。「所望により置換されてもよいアリール」なる語は、所望により置換されてもよいシクロアルキルの縮合したフェニル基、および所望により置換されてもよいヘテロシクロ環の縮合したフェニル基を包含する。所望により置換されてもよいシクロアルキルの縮合した、および所望により置換されてもよいヘテロサイクルの縮合した、所望により置換されてもよいアリールは、アリール環上にある任意の利用可能な炭素原子で該分子の残部と結合される。非限定的な例示として、
Figure 2023510921000074
が挙げられる。
本開示において、それ自体で、またはもう一つ別の基の一部として使用される「アリールオキシ」なる語は、末端の酸素原子に結合した所望により置換されてもよいアリールをいう。非限定的な例示としてのアリールオキシ基はPhO-である。
本開示において、「ヘテロサイクル」、「ヘテロシクリル」、または「ヘテロサイクリック基」なる語は、飽和、部分的に不飽和、または完全に不飽和であり、炭素原子と、N、OおよびSからなる群より独立して選択される1、2、3または4個のヘテロ原子とを含有する、安定した3、4、5、6、または7員の単環式、または二環式のヘテロ環式環、あるいは7、8、9、10、11、12、13、または14員の多環式のヘテロ環式環を意味し、上記したヘテロ環式環のいずれかがベンゼン環に縮合した任意の多環式基を包含するものとする。窒素および硫黄のヘテロ原子は、所望により、酸化されてもよい(すなわち、N→OおよびS(O)(ここで、pは0、1または2である))。窒素原子は置換されていても、置換されていなくてもよい(すなわち、NまたはNRであり、ここでRは、規定されるとすれば、Hまたはもう一つ別の置換基である)。ヘテロ環式環は、安定した構造をもたらす、任意のヘテロ原子または炭素原子で、そのペンダント基に結合してもよい。本明細書に記載のヘテロ環式環は、得られる化合物が安定しているならば、炭素または窒素原子上で置換されてもよい。ヘテロサイクルにある窒素は所望により四級化されてもよい。ヘテロサイクルにあるSおよびO原子の総数が1を超える場合、その時にはこれらのヘテロ原子は相互に隣接していないことが好ましい。ヘテロサイクルにあるSおよびO原子の総数が1を超えないことが好ましい。「ヘテロサイクル」なる語が用いられる場合、ヘテロアリールを包含するものとする。
ヘテロサイクルの例として、限定されないが、アクリジニル、アゼチジニル、アゾチニル、ベンズイミダゾリル、ベンゾフラニル、ベンゾチオフラニル、ベンゾチオフェニル、ベンゾキサゾリル、ベンゾキサゾリニル、ベンズチアゾリル、ベンズトリアゾリル、ベンズテトラゾリル、ベンズイソキサゾリル、ベンズイソチアゾリル、ベンズイミダゾリニル、カルバゾリル、4aH-カルバゾリル、カルボリニル、クロマニル、クロメニル、シンノリニル、デカヒドロキノリニル、2H,6H-1,5,2-ジチアジニル、ジヒドロフロ[2,3-b]テトラヒドロフラン、フラニル、フラザニル、イミダゾリジニル、イミダゾリニル、イミダゾリル、1H-インダゾリル、イミダゾロピリジニル、インドレニル、インドリニル、インドリジニル、インドリル、3H-インドリル、イサチノイル、イソベンゾフラニル、イソクロマニル、イソインダゾリル、イソインドリニル、イソインドリル、イソキノリニル、イソチアゾリル、イソチアゾロピリジニル、イソキサゾリル、イソキサゾロピリジニル、メチレンジオキシフェニル、モルホリニル、ナフチリジニル、オクタヒドロイソキノリニル、オキサジアゾリル、1,2,3-オキサジアゾリル、1,2,4-オキサジアゾリル、1,2,5-オキサジアゾリル、1,3,4-オキサジアゾリル、オキサゾリジニル、オキサゾリル、オキサゾロピリジニル、オキサゾリジニル、ペルイミジニル、オキシインドリル、ピリミジニル、フェナントリジニル、フェナントロリニル、フェナジニル、フェノチアジニル、フェノキサチイニル、フェノキサジニル、フタラジニル、ピペラジニル、ピペリジニル、ピペリドニル、4-ピペリドニル、ピペロニル、フテリジニル、プリニル、ピラニル、ピラジニル、ピラゾリジニル、ピラゾリニル、ピラゾロピリジニル、ピラゾリル、ピリダジニル、ピリドオキサゾリル、ピリドイミダゾリル、ピリドチアゾリル、ピリジニル、ピリミジニル、ピロリジニル、ピロリニル、2-ピロリドニル、2H-ピロリル、ピロリル、キナゾリニル、キノリニル、4H-キノリジニル、キノキサリニル、キヌクリジニル、テトラゾリル、テトラヒドロフラニル、テトラヒドロイソキノリニル、テトラヒドロキノリニル、6H-1,2,5-チアジアジニル、1,2,3-チアジアゾリル、1,2,4-チアジアゾリル、1,2,5-チアジアゾリル、1,3,4-チアジアゾリル、チアントレニル、チアゾリル、チエニル、チアゾロピリジニル、チエノチアゾリル、チエノオキサゾリル、チエノイミダゾリル、チオフェニル、トリアジニル、1,2,3-トリアゾリル、1,2,4-トリアゾリル、1,2,5-トリアゾリル、1,3,4-トリアゾリル、およびキサンテニルが挙げられる。また、例えば、上記のヘテロサイクルを含有する、縮合環およびスピロ化合物も包含される。
本明細書で使用する場合、「二環式ヘテロサイクル」または「二環式ヘテロ環基」なる語は、2個の縮合環を含有し、炭素原子と、N、OおよびSからなる群より独立して選択される1、2、3または4個のヘテロ原子とからなる、安定した9員または10員のヘテロ環式環系を意味するものとする。2個の縮合環のうち、1個の環は、5員のヘテロアリール環、6員のヘテロアリール環、またはベンゾ環を含む、5または6員の単環式芳香族環であって、各々が第2の環に縮合する。第2の環は、飽和、部分的に不飽和、または不飽和であり、5員のヘテロサイクル、6員のヘテロサイクル、または炭素サイクルを含む、5員または6員の単環式環である(ただし、第2の環が炭素サイクルである場合、第1の環はベンゾ以外の環である)。
二環式ヘテロ環基は、安定した構造をもたらす、任意のヘテロ原子または炭素原子でそのペンダント基に結合してもよい。本明細書に記載の二環式ヘテロ環基は、得られる化合物が安定しているならば、炭素または窒素原子上で置換されてもよい。ヘテロサイクルにあるSおよびO原子の総数が1を超える場合、その時にはこれらのヘテロ原子は相互に隣接していないことが好ましい。ヘテロサイクルにあるSおよびO原子の総数が1以下であることが好ましい。
二環式ヘテロ環基の例が、限定されないが、キノリニル、イソキノリニル、フタラジニル、キナゾリニル、インドリル、イソインドリル、インドリニル、1H-インダゾリル、ベンズイミダゾリル、1,2,3,4-テトラヒドロキノリニル、1,2,3,4-テトラヒドロイソキノリニル、5,6,7,8-テトラヒドロキノリニル、2,3-ジヒドロベンゾフラニル、クロマニル、1,2,3,4-テトラヒドロキノキサリニル、および1,2,3,4-テトラヒドロキナゾリニルである。
架橋環もまた、ヘテロサイクルの定義に含まれる。架橋環は、1または複数の、好ましくは1ないし3個の原子(すなわち、C、O、N、またはS)が2個の隣接しない炭素または窒素原子を連結する場合に発生する。架橋環の例として、限定されないが、1個の炭素原子、2個の炭素原子、1個の窒素原子、2個の窒素原子、および炭素窒素基が挙げられる。架橋は、常に、単環式環を三環式環に変換することに留意する。環が架橋されると、環について言及された置換基が架橋上にも存在してもよい。
「ヘテロシクリルアルキル」なる語は、化合物のコアに接続されたアルキル基に結合した、ヘテロシクリルまたは置換ヘテロシクリルをいう。
本明細書で使用される場合、「芳香族ヘテロ環基」または「ヘテロアリール」なる語は、硫黄、酸素、または窒素などの少なくとも1個のヘテロ原子の環メンバーを含む、安定した単環式および多環式芳香族炭化水素を意味するものとする。ヘテロアリール基には、限定されないが、ピリジル、ピリミジニル、ピラジニル、ピリダジニル、トリアジニル、フリル、キノリル、イソキノリル、チエニル、イミダゾリル、チアゾリル、インドリル、ピロイル、オキサゾリル、ベンゾフリル、ベンゾチエニル、ベンズチアゾリル、イソキサゾリル、ピラゾリル、トリアゾリル、テトラゾリル、インダゾリル、1,2,4-チアジアゾリル、イソチアゾリル、プリニル、カルバゾリル、ベンズイミダゾリル、インドリニル、ベンゾジオキソラニル、およびベンゾジオキサンが含まれる。ヘテロアリール基は置換されているか、または置換されていない。窒素原子は置換されているか、または置換されていない(すなわち、NまたはNRであり、ここでRは、定義されるとすれば、Hまたはもう一つ別の置換基である)。窒素および硫黄のヘテロ原子は、所望により酸化されてもよい(すなわち、N→OおよびS(O)であり、ここでpは0、1または2である)。
1の態様において、「ヘテロアリール」または「ヘテロ芳香族」なる語は、5ないし14個の環原子を有する非置換の単環式および二環式芳香族環系、すなわち、1個の環の少なくとも1個の炭素原子が、酸素、窒素および硫黄からなる群より独立して選択されるヘテロ原子で置き換えられている、5-ないし14-員のヘテロアリールをいう。1の態様において、ヘテロアリールは、酸素、窒素および硫黄からなる群より独立して選択される、1、2、3、または4個のヘテロ原子を含有する。1の態様において、ヘテロアリールは3個のヘテロ原子を有する。もう一つ別の態様において、ヘテロアリールは2個のヘテロ原子を有する。もう一つ別の態様において、ヘテロアリールは1個のヘテロ原子を有する。もう一つ別の態様において、ヘテロアリールは5-ないし10員のヘテロアリールである。もう一つ別の態様において、ヘテロアリールは5員または6員のヘテロアリールである。もう一つ別の態様において、ヘテロアリールは5個の環原子を有し、例えば、チエニルであって、4個の炭素原子と、1個の硫黄原子を有する5員のヘテロアリールである。もう一つ別の態様において、ヘテロアリールは6個の環原子を有し、例えば、ピリジルであって、5個の炭素原子と、1個の窒素原子を有する6員のヘテロアリールである。非限定的な例示としてのヘテロアリール基には、チエニル、ベンゾ[b]チエニル、ナフト[2,3-b]チエニル、チアントレニル、フリル、ベンゾフリル、ピラニル、イソベンゾフラニル、ベンゾオキサゾニル、クロメニル、キサンテニル、2H-ピロリル、ピロリル、イミダゾリル、ピラゾリル、ピリジル、ピラジニル、ピリミジニル、ピリダジニル、イソインドリル、3H-インドリル、インドリル、インダゾリル、プリニル、イソキノリル、キノリル、フタラジニル、ナフチリジニル、シンノリニル、キナゾリニル、フテリジニル、4aH-カルバゾリル、カルバゾリル、β-カルボリニル、フェナントリジニル、アクリジニル、ピリミジニル、フェナントロリニル、フェナジニル、チアゾリル、イソチアゾリル、フェノチアゾリル、イソキサゾリル、フラザニル、およびフェノキサジニルが含まれる。1の態様において、ヘテロアリールは、チエニル(例えば、チエン-2-イル、およびチエン-3-イル)、フリル(例えば、2-フリル、および3-フリル)、ピロリル(例えば、1H-ピロール-2-イル、および1H-ピロール-3-イル)、イミダゾリル(例えば、2H-イミダゾール-2-イル、および2H-イミダゾール-4-イル)、ピラゾリル(例えば、1H-ピラゾール-3-イル、1H-ピラゾール-4-イル、および1H-ピラゾール-5-イル)、ピリジル(例えば、ピリジン-2-イル、ピリジン-3-イル、およびピリジン-4-イル)、ピリミジニル(例えば、ピリミジン-2-イル、ピリミジン-4-イル、およびピリミジン-5-イル)、チアゾリル(例えば、チアゾール-2-イル、チアゾール-4-イル、およびチアゾール-5-イル)、イソチアゾリル(例えば、イソチアゾール-3-イル、イソチアゾール-4-イル、およびイソチアゾール-5-イル)、オキサゾリル(例えば、オキサゾール-2-イル、オキサゾール-4-イル、およびオキサゾール-5-イル)、イソキサゾリル(例えば、イソキサゾール-3-イル、イソキサゾール-4-イル、およびイソキサゾール-5-イル)、またはインダゾリル(例えば、1H-インダゾール-3-イル)である。「ヘテロアリール」なる語にはまた、可能なN-オキシドが含まれる。非限定的な例示としてのN-オキシドはピリジルN-オキシドである。
1の態様において、ヘテロアリールは5員または6員のヘテロアリールである。1の態様において、ヘテロアリールは5員のヘテロアリールであり、すなわち、ヘテロアリールは、環の少なくとも1個の炭素原子が、窒素、酸素、および硫黄より独立して選択されるヘテロ原子と置き換わっている、5個の環原子を有する単環式芳香族環系である。非限定的な例示としての5員のヘテロアリール基には、チエニル、フリル、ピロリル、オキサゾリル、ピラゾリル、イミダゾリル、チアゾリル、イソチアゾリル、およびイソキサゾリルが含まれる。
もう一つ別の態様において、ヘテロアリールは6員のヘテロアリールであり、例えば、ヘテロアリールは、環の少なくとも1個の炭素原子が窒素原子と置き換わっている、6個の環原子を有する、単環式芳香族環系である。非限定的な例示としての6員のヘテロアリール基には、ピリジル、ピラジニル、ピリミジニル、およびピリダジニルが含まれる。
1の態様において、ヘテロアリールの結合する基または点は芳香族環上にあり、炭素原子またはヘテロ原子のいずれかとすることができる。
本開示において、それ自体で、またはもう一つ別の基の一部として使用される「C-結合ヘテロアリール」または「炭素-結合ヘテロアリール」なる語は、そのヘテロアリール環上の任意の利用可能な炭素原子で分子の残基と結合するヘテロアリールをいう。
本開示において、それ自体で、またはもう一つ別の基の一部として使用される「所望により置換されてもよいヘテロアリール」なる語は、非置換の、または1ないし4個の置換基、例えば、ハロ、ニトロ、シアノ、ヒドロキシ、アミノ、アルキルアミノ、ジアルキルアミノ、ハロアルキル、ヒドロキシアルキル、アルコキシ、ハロアルコキシ、アリールオキシ、アラルキルオキシ、アルキルチオ、カルボキシアミド、スルホンアミド、アルキルカルボニル、アリールカルボニル、アルキルスルホニル、アリールスルホニル、カルボキシ、カルボキシアルキル、所望により置換されてもよいアルキル、所望により置換されてもよいシクロアルキル、アルケニル、アルキニル、アリール、ヘテロアリール、ヘテロシクロ、(アルコキシ)アルキル、(アミノ)アルキル、(カルボキシアミド)アルキル、メルカプトアルキル、および(ヘテロシクロ)アルキルからなる群より独立して選択される1または2個の置換基で置換されるかのいずれかである、ヘテロアリールをいう。1の態様において、所望により置換されてもよいヘテロアリールは1個の置換基を有する。任意の利用可能な炭素または窒素原子が置換され得る。非限定的な例示としての置換ヘテロアリール基には、限定されないが、
Figure 2023510921000075
が含まれる。
「所望により置換されてもよいヘテロアリール」なる語は、所望により置換されてもよいシクロアルキルと縮合するか、または所望により置換されてもよいヘテロシクロ基と縮合した、ヘテロアリール基を包含する。所望により置換されてもよいシクロアルキルと縮合するか、または所望により置換されてもよいヘテロシクロ基と縮合した、所望により置換されてもよいヘテロアリールは、ヘテロアリール環上の任意の利用可能な炭素原子で残りの分子と結合してもよい。非限定的な例示として、
Figure 2023510921000076
が挙げられる。
本開示において、「ハロゲン」なる語は、フッ素、塩素、臭素およびヨウ素を包含するものとする。
本開示において、「インターヌクレオシド連結」なる語は、オリゴヌクレオチドまたはCDNでの2個の隣接するヌクレオシドの間で天然に存在する、または修飾された連結をいう。天然に存在するRNAおよびDNAは、ホスホロジエステルインターヌクレオシド連結を含有する。修飾されたインターヌクレオシド連結の一例がホスホロチオエート連結である。
本開示において、「キメラ核酸」または「キメラ配列」なる語は、異なるインターヌクレオシド連結を有する核酸をいう。1の態様において、キメラ核酸はホスホロチオエート連結とホスホネート連結の組み合わせを有する。
本開示において、「ヘテロキラル核酸」なる語は、リン原子を異なる立体化学的配置にて含有するインターヌクレオシド連結を含む、核酸をいう。同様にして、「ホモキラル核酸」なる語は、リン原子を同じ立体化学的配置にて含有するインターヌクレオシド連結を含む、核酸をいう。
本開示において、「保護基」なる語は、アルコール、アミン、カルボニル、カルボン酸、ホスフェート、末端アルキン等などの官能基を、望ましくない化学反応から保護する基をいう。いくつかの態様において、官能基は求核基である。アルコール保護基の例として、限定されないが、アセチル(Ac)、ベンゾイル(Bz)、ベンジル(Bn)、β-メトキシエトキシメチルエーテル(MEM)、ジメトキシトリチル(DMT)、メトキシメチルエーテル(MOM)、メトキシトリチル(MMT)、p-メトキシベンジルエーテル(PMB)、トリメチルシリル(TMS)、tert-ブチルジメチルシリル(TBS)、tert-ブチルジフェニルシリルエーテル(TBDPS)、トリ-イソ-プロピルシリルオキシメチル(TOM)、トリチル(トリフェニルメチル、Tr)、ピバロイル(Piv)等が挙げられる。1の態様において、保護基は4,4’-ジメトキシトリチルである。アミン保護基の例として、限定されないが、カルボベンジルオキシ(Cbz)、イソブチリル(iBu)、p-メトキシベンジル カルボニル(MOZ)、tert-ブチルカルボニル(Boc)、アセチル(Ac)、ベンゾイル(Bz)、ベンジル(Bn)、p-メトキシベンジル(PMB)、p-メトキシフェニル(PMP)、トシル(Ts)等が挙げられる。カルボニル保護基の例として、限定されないが、アセタールとケタール、アシラール、ジチアン等が挙げられる。カルボン保護基の例として、限定されないが、メチルエステル、ベジルエステル、tert-ブチルエステル、シリルエステル、オルトエステル、オキサゾリン等が挙げられる。ホスフェート保護基の例として、限定されないが、2-シアノエチル、メチル等が挙げられる。末端アルキン保護基の例として、限定されないが、プロパルギルおよびシリル基が挙げられる。1の態様において、保護基は、本開示の方法にて使用されるヌクレオシドの5’-ヒドロキシ基を保護するのに使用される。1の態様において、保護基はDMTである。もう一つ別の態様において、保護基は、本開示の方法にて使用されるヌクレオシドの核酸塩基を保護するのに使用される。いくつかの態様において、保護基はアミン保護基である。1の態様において、保護基はAcである。もう一つ別の態様において、保護基はBzである。さらにもう一つ別の態様において、保護基はiBuである。
[実施例]
本開示の化合物/試薬および方法の有用な実施態様は以下の実施例にて提供される。この実施例は本発明を説明するためにのみ付与されることを理解すべきである。
一般的実験
テトラヒドロフラン(THF)、N,N-ジメチルホルムアミド(DMF)、ジクロロメタン(DCM)、アセトニトリル(MeCN)およびメタノール(MeOH)は、予め脱気処理に付された溶媒を活性アルミナカラムに通すことにより得られた。DBUはChem-Impex社より購入した。従来の核酸塩基保護(T=なし、A=ベンゾイル、G=イソブチリル、C=ベンゾイル)を有するすべての5’-DMTr保護ヌクレオシドはChem-Impex社から購入した。すべての試薬は、市販の最高の品質のものを購入し、特記されない限り、精製することなく用いた。収率は、特記されない限り、クロマトグラフィー的かつ分光学(H NMR)的に均質な材料に言及する。反応は、薄層クロマトグラフィー(TLC)、GC/MS、GC/FID、またはLC/MSを介してモニター観察された。TLCは、イー・メルク(E. Merck)社製0.25mmシリカプレート(60F-254)を使用し、可視化剤として短波長のUV光、および現像剤としてリンモリブデン酸、p-アニスアルデヒド、またはKMnO、および熱を用いて行われた。NMRスペクトルは、ブルカー(Bruker)社製DRX-600、DRX-500、およびAMX-400装置に記録し、残留する重水素化していない溶媒(CHCl、CHCl、DMSO、MeOH、アセトンを、H NMRでは、各々、7.26、5.32、2.50、3.31および2.05ppmで、13C NMRでは、各々、77.16、53.84、39.52、49.00および29.84ppm)を用いて較正した。多重度を説明するのに以下の略語を用いた:s=単重項、d=二重項、t=三重項、q=四重項、m=多重項、br=ブロード。カラムクロマトグラフィーはイー・メルク社製シリカゲル(60、粒径0.043~0.063mm)を用いて行われ、分取性TLC(pTLC)はメルク社製シリカプレート(60F-254)で実施された。高分解能質量スペクトル(HRMS)は、アジレント(Agilent)社製LC/MSD TOF質量分光器に、飛行時間型リフレクトロン実験の電子噴射イオン化時間で記録された。融点はフィッシャー-ジョーンズ(Fisher-Johns)12-144融点装置で記録され、修正されなかった。エナンチオマー比は、フォトダイオードアレイ検出器を装着したウォーターズ(Waters)社製UPC2 SFCまたはアジレント・テクノロジーズ(Agilent Technologies)社製1220 Infinity IILCHPLCを用いて決定された。旋光性データは、アントンパール(Anton Paar)社製100 Modular Circular Polarimeterで記録された。
実施例1
PI試薬の合成
Figure 2023510921000077
a. SI-1およびSI-2の合成
化合物SI-1およびSI-2(共にエナンチオマー)を、公開されている操作に従って合成した。Knouseら、Unlocking P(V):Reagents for chiral phosphorothioate synthesis, Science 2018, 361, 1234を参照のこと。
Figure 2023510921000078
Figure 2023510921000079
Figure 2023510921000080
Figure 2023510921000081
の合成は、これまでに報告された、詳細な図式ガイドで示され得る、Ψ試薬の合成と同様の操作に従う。Knouseら、Unlocking P(V):Reagents for chiral phosphorothioate synthesis, Science 2018, 361, 1234を参照のこと。SI-1(1.00g、1.68ミリモル、1.0当量)およびトランス-(+)-リモネンオキシド SI-2(0.383g、2.52ミリモル、1.5当量)のジクロロメタン(5.0mL)中溶液に、トリフルオロ酢酸(0.19mL、2.52ミリモル、1.5当量)を添加した。反応物を35℃までの加温に供し、1時間撹拌させた。反応混合物を外界温度まで冷やし、ヘキサン(10mL)をバッチに加え、二相混合物を形成させた。ストリームを水(5mL)、飽和NaHCO(10mL)、およびKHPO(10%水溶液、3mL)で洗浄した。有機相をMgSOパッドを介して濾過し、約3mLに濃縮した。メタノール(5mL)を加え、バッチを約3mLに濃縮し;この操作を2回繰り返した。この混合物を5-10℃に冷却し、5分間撹拌した。得られたスラリーを濾過し、反応器およびケーキを冷メタノール(1mL)で洗浄した。フィルターケーキを真空下で乾燥させ、
Figure 2023510921000082
を結晶性白色固体として得た(0.56g、収率75%、>20:1 d.r.、>98:2 e.r.)。
物理的状態:白色結晶性固体;融点=104-106℃;[α]25 =-125°(CHCl中c=1.00);R=0.50(ヘキサン:トルエン=1:1)
H NMR(600MHz、CDCl) δ 4.96(s,1H)、4.70(d,J=2.1Hz,1H)、2.90(dd,J=13.4、2.9Hz,1H)、2.42(s,1H)、2.10(ddp,J=13.7、6.4、2.2Hz,2H)、2.02(ddd,J=12.5、4.3、2.7Hz,1H)、1.77-1.66(m,2H)、1.65(s,3H)、1.64(s,3H)、1.52(td,J=13.3、4.2Hz,1H)
13C NMR(151MHz、CDCl) δ 148.86、147.19、144.69、144.02、142.28、138.75、137.05、111.83、104.30、93.64、93.60、58.65、58.64、38.81、34.21、34.13、28.39、28.32、24.89、22.18、18.74
19F NMR(376MHz、CDCl) δ -128.54(dd,J=20.7、4.6Hz,2F)、-146.87(ddd,J=25.5、14.7、6.0Hz,1F)、-159.16--160.51(m,2F)
31P NMR(162MHz、CDCl) δ 102.08
HRMS(ESI-TOF):C1617OPSとして、計算値 [M+H]:447.0094、測定値:447.0093
Figure 2023510921000083
Figure 2023510921000084
1bの合成は1aについて説明されているのと同じ操作で行われた。すべての特徴となるデータは旋光性の[α]25 =+124°(CHCl中c=1.00)を除いて同一であった。
実施例2
アダマンチルメタノールローディングのホスホノチオエートの合成
Figure 2023510921000085
アルゴン下にてフレーム乾燥させた培養管に、1-アダマンタンメタノール(16.6mg、0.1ミリモル、1.0当量)、12a(52.5mg、0.2ミリモル、2.0当量)、およびMeCN(1mL)を装填した。DBU(0.05mL、3.0ミリモル、3.0当量)を加え、得られた溶液を室温で4時間撹拌した。2mLの1xPBS溶液を加え、その混合物をDCM(3x3mL)で抽出した。有機物を合わせ、ブライン(1mL)で洗浄し、NaSO上で乾燥させ、濾過し、濃縮した。得られた粗油をTHF(1mL)に溶かした。EtN(2当量)およびBnBr(2当量)を加え、得られた混合物を12時間撹拌した。反応物を1mLの水でクエンチさせ、EtOAc(3x3mL)で抽出した。有機物を合わせ、NaSO上で乾燥させ、濾過し、濃縮した。シリカゲルクロマトグラフィー(ヘキサン/EtOAc=5:2)に付して精製し、24.0mg(69%)の表記化合物SI-3を得た。
物理的状態:無色油;R=0.40(ヘキサン/EtOAc=5:2)
H NMR(400MHz、CDCl) δ 7.41-7.22(m,5H)、4.14-3.97(m,2H)、3.65(dd,J=9.6、6.5Hz,1H)、3.46(dd,J=9.7、6.8Hz,1H)、1.98(s,3H)、1.77-1.57(m,9H)、1.50(d,J=2.9Hz,6H)
13C NMR(151MHz、CDCl) δ 138.13、138.11、129.05、128.82、127.64、74.81、74.76、39.02、37.03、34.68、34.65、33.68、33.63、28.10、20.35、19.62
31P NMR(162MHz、CDCl) δ 53.64
HRMS(ESI-TOF):C1928PSとして、計算値 [M+H]:351.1548、測定値:351.1546
実施例3
グリニャール試薬と有機リチウム試薬の合成
a. グリニャール試薬の合成
グリニャール試薬はすべて、LiClの存在下でMg挿入を介して臭化アリールから製造されるか、または商業的供給源より購入した。
1. Mg挿入の一般的操作:
LiCl(0.530g、12.5ミリモル、1.25当量)を真空下でフレーム乾燥させた。冷却した後、フラスコをAr雰囲気下に置き、Mg削りくず(0.608g、25ミリモル、2.5当量)、ヨウ素(2、3粒)およびTHF(2mL)を添加した。アルゴン下にある別のフラスコにおいて、臭化アリール(10ミリモル、1.0当量)のTHF(8mL)中溶液を製造した。2、3滴の臭化アリールのTHF中溶液をMg含有のフラスコに加え、溶液の色が褐色から無色に変わるまでヒートガンで穏やかに加熱した。次に、残りの臭化アリール溶液をゆっくりと添加した。完全に添加してから、該混合物を油浴(55℃)に入れ、1~2時間加熱した。グリニャールは、公開されているノッシェル(knochel)の操作に従って、使用前にヨウ素/LiClに対して滴定された。
次のグリニャール試薬が上記の操作を用いて合成された:
Figure 2023510921000086
次のグリニャール試薬はシグマ-アルドリッチ(Sigma-Aldrich)より直接購入された:
Figure 2023510921000087
b. グリニャール試薬の合成
特記されない限り、有機リチウム試薬はすべて、臭化アリールをリチウム-ハロゲン交換に付すことで、末端アルキンの直接脱プロトン化を介して新たに製造されるか、または商業的供給源より購入された。FcLiは公開操作に従って製造された。Han, Z. S.ら、Efficient Asymmetric Synthesis of P-Chiral Phosphine Oxides via Properly Designed and Activated Benzoxazaphosphinine-2-oxide Agents. J. Am. Chem. Soc. 2013, 135, 2474-2477を参照のこと。
1. リチウム-ハロゲン交換の一般的操作:
アルゴン雰囲気下のフレーム乾燥させた丸底フラスコに、臭化アリール(11ミリモル、1.1当量)およびTHF(40mL)を装填した。混合物を-78℃に冷却し、nBuLi溶液(10ミリモル、1.0当量)を滴下して加えた。得られた混合物を-78℃で30分間撹拌させ、そのまま使用した。
次の有機リチウム試薬を上記した方法を用いて合成した:
Figure 2023510921000088
末端アルキンの直接脱プロトン化はリチウム-ハロゲン交換と同じ操作に従う。次の有機リチウム試薬は、直接脱プロトン化で合成された:
Figure 2023510921000089
2. FcLiの合成:
Figure 2023510921000090
アルゴン雰囲気下のフレーム乾燥させた丸底フラスコに、フェロセン(186mg、1ミリモル、1.0当量)、tBuOK(0.15mL、1.0M、0.15ミリモル、0.15当量)およびTHF(8mL)を装填した。反応物を-78℃に冷却し、tBuLi(1.18mL、1.7M、2ミリモル、2.0当量)を滴下して加えた。得られた混合物を-78℃で1時間撹拌させ、0℃で30分間保持し、次にそのまま使用した。
次の有機リチウム試薬はシグマ-アルドリッチ社から購入した:
Figure 2023510921000091
実施例4
P-キラルホスフィンの合成
a. ローディング
Figure 2023510921000092
1. 一般的操作A
フレーム乾燥させた250mLの丸底フラスコに、1(4.46g、10ミリモル、1当量)を装填した。該フラスコをエバキュエートさせ、アルゴンで埋め戻し、その後で無水THF(100mL、0.1M)をシリンジを介して導入した。次にグリニャール試薬(20ミリモル、2当量)を滴下して加え、得られた溶液を、31P NMRが出発材料の完全な消費を示すまで、室温で撹拌させた。NHCl飽和水溶液(20mL)をゆっくりと添加して反応物をクエンチさせ、水(80mL)およびEtOAc(150mL)で希釈した。2層を分離し、水層をEtOAc(2x80mL)で2回洗浄した。有機層を合わせ、NaHCO飽和水溶液(50mL)、ブライン(50mL)で洗浄し、無水NaSO上で乾燥させた。次に混合物を濾過し、真空下で濃縮し、シリカゲルクロマトグラフィーに付して精製し、所望の生成物を得た。
2. 化合物8a:
Figure 2023510921000093
1aとグリニャール試薬SI-10を10ミリモルのスケールで2時間の反応時間にて一般的操作Aに従って処理した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン/トルエン=2:1~1:2)に付して精製し、1.93g(60%、>20:1 d.r.)の表記化合物8aを得た。50ミリモルのスケールでは、精製後に、9.20g(57%、>20:1 d.r.)の8aが得られた。
物理的状態:白色固体;融点=108-110℃;[α]25 =-27.3°(CHCl中c=1.00);R=0.35(ヘキサン/トルエン=1:2)
H NMR(400MHz、CDCl) δ 7.87(ddd,J=15.2、8.1、1.5Hz,2H)、7.56-7.40(m,3H)、4.98(s,1H)、4.89(s,1H)、3.86(dd,J=13.2、3.1Hz,1H)、2.50(s,1H)、2.26-2.09(m,3H)、2.08-1.84(m,2H)、1.83(s,3H)、1.73(s,3H)
13C NMR(126MHz、CDCl) δ 145.45、138.93、138.02、132.21、132.19、130.30、130.20、128.70、128.58、111.94、92.62、92.59、57.25、57.24、39.00、34.91、34.82、29.05、28.98、25.36、22.83、19.33
31P NMR(162MHz、CDCl) δ 97.21
HRMS(ESI-TOF):C1622OPSとして、計算値 [M+H]:325.0850、測定値:325.0849
3. 化合物8b:
Figure 2023510921000094
1bとグリニャール試薬SI-10を10ミリモルのスケールで2時間の反応時間にて一般的操作Aに従って処理した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン/トルエン=2:1~1:2)に付して精製し、2.11g(65%、>20:1 d.r.)の表記化合物8bを得た。すべての物理的および分光学的特性は、旋光性が[α]25 =+31.6°(CHCl中c=1.00)であることを除いて、8aと同一である。
4. 化合物12a:
Figure 2023510921000095
1aとグリニャール試薬SI-11を10ミリモルのスケールで2時間の反応時間にて一般的操作Aに従って処理した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン/トルエン/EtOAc=1:1:0~1:2:0~1:2:0.05)に付して精製し、1.73g(66%、>20:1 d.r.)の表記化合物12aを得た。
物理的状態:白色固体;融点=102-105℃;[α]25 =+136.4°(CHCl中c=0.50);R=0.20(ヘキサン/トルエン=1:2)
H NMR(400MHz、CDCl) δ 5.01(s,1H)、4.89(s,1H)、3.74(dd,J=13.3、3.1Hz,1H)、2.48(s,1H)、2.23(d,J=13.8Hz,1H)、2.20(s,3H)、2.17(d,J=0.8Hz,3H)、2.11(d,J=11.2Hz,1H)、2.06-2.00(m,1H)、1.80(d,J=8.1Hz,3H)、1.76(s,3H)、1.68(s,3H)
13C NMR(151MHz、CDCl) δ 145.25、112.07、92.26、92.23、56.99、56.97、38.93、35.16、35.08、31.27、30.74、28.99、28.93、25.21、22.78、18.85
31P NMR(162MHz、CDCl) δ 106.19
HRMS(ESI-TOF):C1120OPSとして、計算値[M+H]:263.0693、測定値:263.0697
5. 化合物12b:
Figure 2023510921000096
1bとグリニャール試薬SI-11を5ミリモルのスケールで2時間の反応時間にて一般的操作Aに従って処理した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン/トルエン/EtOAc=1:1:0~1:2:0~1:2:0.05)に付して精製し、923mg(70%、>20:1 d.r.)の表記化合物12bを得た。25ミリモルのスケールで、精製後に3.41g(52%、>20:1 d.r.)の12bが得られた。すべての物理的および分光学的特性は、旋光性が[α]25 =-130.2°(CHCl中c=0.50)であることを除いて、8aと同一である。
6. 化合物13a:
Figure 2023510921000097
1aとグリニャール試薬SI-5を0.5ミリモルのスケールで12時間の反応時間にて一般的操作Aに従って処理した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン/トルエン=2:1~1:2)に付して精製し、60mg(33%、>20:1 d.r.)の表記化合物13aを得た。
物理的状態:無色ゲル;[α]25 =-25.0°(CHCl中c=0.70);R=0.41(ヘキサン/EtOAc=92:8)
H NMR(400MHz、CDCl) δ 7.51(dd,J=15.2、1.8Hz,1H)、7.23-7.09(m,2H)、4.85(d,J=1.4Hz,1H)、4.78(s,1H)、3.55(ddd,J=13.3、3.2、1.6Hz,1H)、2.70(s,3H)、2.44(t,J=5.3Hz,1H)、2.33(s,3H)、2.23-2.06(m,3H)、2.02-1.81(m,3H)、1.79(s,3H)、1.66(s,3H)
13C NMR(151MHz、CDCl) δ 145.29、137.41、136.73、136.68、136.63、135.04、134.95、132.36、132.34、132.29、132.19、129.44、129.38、111.88、92.48、92.44、77.37、77.16、77.08、76.95、56.19、56.17、38.89、34.78、34.71、28.96、28.89、25.35、22.78、21.56、21.53、21.13、19.69
31P NMR(162MHz、CDCl) δ 94.99
HRMS(ESI-TOF):C1826OPSとして、計算値[M+H]:353.1163、測定値:353.1168
7. 化合物13b:
Figure 2023510921000098
1bとグリニャール試薬SI-5を0.5ミリモルのスケールで12時間の反応時間にて一般的操作Aに従って処理した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン/トルエン=2:1~1:2)に付して精製し、58mg(32%、>20:1 d.r.)の表記化合物13bを得た。すべての物理的および分光学的特性は、旋光性が[α]25 =+31°(CHCl中c=0.60)であることを除いて、13aと同一である。
8. 化合物14a:
Figure 2023510921000099
1aとグリニャール試薬SI-6を1ミリモルのスケールで12時間の反応時間にて一般的操作Aに従って処理した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン/トルエン=2:1~1:2)に付して精製し、292mg(77%、>20:1 d.r.)の表記化合物14aを得た。
物理的状態:淡黄色固体;融点=114-116℃;
[α]25 =-121.8°(CHCl中c=1.00);
=0.24(ヘキサン/EtO=9:1)
H NMR(500MHz、CDCl) δ 8.84(dd,J=8.4、0.9Hz,1H)、8.03-7.83(m,3H)、7.65(ddd,J=8.5、6.9、1.4Hz,1H)、7.56(ddd,J=8.1、6.9、1.2Hz,1H)、7.47(ddd,J=8.1、7.3、3.6Hz,1H)、4.80(d,J=1.4Hz,1H)、4.73(s,1H)、3.57(ddd,J=13.3、3.2、1.6Hz,1H)、2.44(d,J=6.0Hz,1H)、2.22(ddd,J=12.4、4.4、2.8Hz,1H)、2.16-2.08(m,2H)、2.02-1.78(m,3H)、1.86(s,3H)、1.62(d,J=1.3Hz,3H)
13C NMR(151MHz、CDCl) δ 163.86、163.74、159.73、159.72、145.52、145.34、145.15、136.41、136.32、134.58、133.59、131.03、130.99、129.45、129.43、129.17、129.08、128.80、127.79、114.09、114.07、114.03、97.12、87.93、87.76、87.69、86.90、86.86、85.92、85.89、75.87、75.84、72.60、65.22、65.18、63.37、55.55、42.11、40.79、40.77、26.16、18.50、12.25、11.30、-4.52、-4.65
31P NMR(162MHz、CDCl) δ 92.77
HRMS(ESI-TOF):C2024OPSとして、計算値[M+H]:375.1006、測定値:375.1006
9. 化合物14b:
Figure 2023510921000100
1bとグリニャール試薬SI-6を0.5ミリモルのスケールで12時間の反応時間にて一般的操作Aに従って処理した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン/トルエン=2:1~1:2)に付して精製し、152mg(80%、>20:1 d.r.)の表記化合物14bを得た。すべての物理的および分光学的特性は、旋光性が[α]25 =+125.1°(DCM中c=0.35)であることを除いて、14aと同一である。
10. 化合物15a:
Figure 2023510921000101
1aとグリニャール試薬SI-4を0.5ミリモルのスケールで12時間の反応時間にて一般的操作Aに従って処理した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン/トルエン=2:1~1:2)に付して精製し、74mg(37%、>20:1 d.r.)の表記化合物15aを得た。
物理的状態:淡黄色ゲル
[α]25 =-83.8°(DCM中c=0.22)
=0.31(ヘキサン/EtO=9:1)
H NMR(400MHz、CDCl) δ 7.44(dd,J=7.6、1.4Hz,1H)、7.40-7.27(m,8H)、4.95(d,J=1.4Hz,1H)、4.89-4.82(m,1H)、3.74(ddd,J=13.3、3.2、1.6Hz,1H)、2.50(s,1H)、2.25-2.10(m,3H)、1.97-1.77(m,3H)、1.75(s,3H)、1.74-1.71(m,3H)
13C NMR(151MHz、CDCl) δ 145.07、143.68、140.20、131.89、131.05、129.01、128.55、128.41、128.25、127.68、112.31、93.62、93.59、56.99、56.97、38.84、34.76、34.68、28.76、28.69、25.31、22.78、19.60
31P NMR(162MHz、CDCl) δ 77.83
HRMS(ESI-TOF):C2226OPSとして、計算値 [M+H]:401.1163、測定値:401.1157
11. 化合物15b:
Figure 2023510921000102
1bとグリニャール試薬SI-4を4ミリモルのスケールで2時間の反応時間にて一般的操作Aに従って処理した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン/トルエン=2:1~1:2)に付して精製し、882mg(55%、>20:1 d.r.)の表記化合物15bを得た。すべての物理的および分光学的特性は、旋光性が[α]25 =+95.7°(CHCl中c=1.00)であることを除いて、15aと同一である。
12. 化合物16a:
Figure 2023510921000103
1aとグリニャール試薬SI-7を0.5ミリモルのスケールで12時間の反応時間にて一般的操作Aに従って処理した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン/トルエン=2:1)に付して精製し、126mg(68%、>20:1 d.r.)の表記化合物16aを得た。
物理的状態:淡黄色ゲル
[α]25 =-48.8°(CHCl中c=0.50)
=0.2(ヘキサン/トルエン=2:1)
H NMR(400MHz、CDCl) δ 8.41(d,J=17.9Hz,1H)、7.95-7.81(m,4H)、7.63-7.53(m,2H)、4.99(d,J=1.4Hz,1H)、4.92(s,1H)、3.95(dd,J=13.3、3.1Hz,1H)、2.51(s,1H)、2.26-2.15(m,3H)、2.09(td,J=13.3、12.6、4.1Hz,1H)、1.99-1.88(m,2H)、1.87(s,3H)、1.73(s,3H)
13C NMR(151MHz、CDCl) δ 144.93、135.15、134.39、134.31、134.29、131.82、131.71、131.46、131.38、128.80、128.20、128.10、127.93、127.29、126.61、124.81、124.72、111.35、92.14、92.11、56.73、56.72、38.47、34.38、34.31、28.49、28.43、24.82、22.26、18.84
31P NMR(162MHz、CDCl) δ 97.21
HRMS(ESI-TOF):C2024OPSとして、計算値 [M+H]:375.1006、測定値:375.0999
13. 化合物16b:
Figure 2023510921000104
1bとグリニャール試薬SI-7を0.5ミリモルのスケールで12時間の反応時間にて一般的操作Aに従って処理した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン/トルエン=2:1)に付して精製し、137mg(72%、>20:1 d.r.)の表記化合物16bを得た。すべての物理的および分光学的特性は、旋光性が[α]25 =+40.1°(DCM中c=0.21)であることを除いて、16aと同一である。
14. 化合物17a:
Figure 2023510921000105
1aとグリニャール試薬SI-13を2ミリモルのスケールで12時間の反応時間にて一般的操作Aに従って処理した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン/トルエン/EtOAc=2:1:0~1:1:0~1:1:0.05)に付して精製し、420mg(59%、>20:1 d.r.)の表記化合物17aを得た。
物理的状態:無色油
[α]25 =-38.2°(DCM中c=0.50)
=0.22(ヘキサン/EtO=9:1)
H NMR(400MHz、CDCl) δ 7.98(ddd,J=17.3、7.7、1.7Hz,1H)、7.52-7.42(m,1H)、7.01(tdd,J=7.6、3.4、1.0Hz,1H)、6.95(ddd,J=8.2、7.1、0.9Hz,1H)、4.95(q,J=1.4Hz,1H)、4.88(s,1H)、3.98(ddd,J=13.5、3.1、0.7Hz,1H)、3.92(s,3H)、2.48(s,1H)、2.25-2.07(m,3H)、2.00-1.84(m,3H)、1.82(s,3H)、1.73(dt,J=1.4、0.7Hz,3H)
13C NMR(151MHz、CDCl) δ 159.92、159.89、145.68、134.24、134.22、134.07、134.01、125.12、124.37、120.49、120.39、111.99、111.94、111.88、92.25、92.22、56.65、56.64、55.93、39.05、34.93、34.85、28.82、28.76、25.26、22.78、19.49
31P NMR(162MHz、CDCl) δ 93.72
HRMS(ESI-TOF):C1724PSとして、計算値 [M+H]:355.0955、測定値:355.0951
15. 化合物17b:
Figure 2023510921000106
1bとグリニャール試薬SI-13を2.5ミリモルのスケールで12時間の反応時間にて一般的操作Aに従って処理した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン/トルエン/EtOAc=2:1:0~1:1:0~1:1:0.05)に付して精製し、525mg(59%、>20:1 d.r.)の表記化合物17bを得た。すべての物理的および分光学的特性は、旋光性が[α]25 =+50.8°(CHCl中c=1.00)であることを除いて、17aと同一である。
16. 化合物18a:
Figure 2023510921000107
1aとグリニャール試薬SI-15を1ミリモルのスケールで0.5時間の反応時間にて一般的操作Aに従って処理した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン/トルエン=2:1~1:1)に付して精製し、146mg(54%、>20:1 d.r.)の表記化合物18aを得た。
物理的状態:無色油
[α]25 =+12.5°(CHCl中c=0.28)
=0.41(ヘキサン/EtO=9:1)
H NMR(500MHz、CDCl) δ 6.38(ddd,J=29.8、17.7、11.4Hz,1H)、6.20(ddd,J=29.4、17.7、1.3Hz,1H)、5.98(ddd,J=57.5、11.4、1.3Hz,1H)、4.99(d,J=1.5Hz,1H)、4.88(s,1H)、3.74(dd,J=13.3、3.2Hz,1H)、2.48(s,1H)、2.22(dd,J=13.8、1.8Hz,1H)、2.16-2.09(m,1H)、2.06(dd,J=7.3、4.7Hz,1H)、1.92-1.77(m,3H)、1.75(dt,J=1.5、0.8Hz,3H)、1.72(s,3H)
13C NMR(151MHz、CDCl) δ 163.86、163.74、159.73、159.72、145.52、145.34、145.15、136.41、136.32、134.58、133.59、131.03、130.99、129.45、129.43、129.17、129.08、128.80、127.79、114.09、114.07、114.03、97.12、87.93、87.76、87.69、86.90、86.86、85.92、85.89、75.87、75.84、72.60、65.22、65.18、63.37、55.55、42.11、40.79、40.77、26.16、18.50、12.25、11.30、-4.52、-4.65
31P NMR(162MHz、CDCl) δ 93.96
HRMS(ESI-TOF):C1220OPSとして、計算値 [M+H]:275.0693、測定値:275.0695
17. 化合物18b:
Figure 2023510921000108
1bとグリニャール試薬SI-15を0.5ミリモルのスケールで0.5時間の反応時間にて一般的操作Aに従って処理した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン/トルエン=2:1~1:1)に付して精製し、85mg(63%、>20:1 d.r.)の表記化合物18bを得た。すべての物理的および分光学的特性は、旋光性が[α]25 =-7.96°(DCM中c=0.21)であることを除いて、18aと同一である。
18. 化合物19a:
Figure 2023510921000109
1aとグリニャール試薬SI-14を1ミリモルのスケールで1時間の反応時間にて一般的操作Aに従って処理した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン/トルエン=2:1~1:2)に付して精製し、232mg(67%、>20:1 d.r.)の表記化合物19aを得た。
物理的状態:淡黄色固体
融点=107-110℃
[α]25 =+115.3°(DCM中c=0.22)
=0.24(ヘキサン/EtO=9:1)
H NMR(500MHz、CDCl) δ 7.57-7.49(m,2H)、7.48-7.40(m,1H)、7.40-7.33(m,2H)、5.02(d,J=1.5Hz,1H)、4.95(s,1H)、4.14(dt,J=13.2、2.7Hz,1H)、2.51(t,J=6.0Hz,1H)、2.29(ddd,J=13.8、3.4、1.7Hz,1H)、2.15(d,J=15.0Hz,1H)、2.10(ddd,J=12.5、4.4、2.9Hz,1H)、2.03-1.86(m,2H)、1.85-1.79(m,1H)、1.78(s,3H)、1.67(s,3H)
13C NMR(151MHz、CDCl) δ 145.31、132.66、132.65、130.72、128.62、120.06、120.03、112.15、99.29、99.03、93.04、93.01、87.23、85.86、57.13、57.10、39.01、35.14、35.06、29.03、28.96、25.49、22.86、19.79
31P NMR(162MHz、CDCl) δ 60.28
HRMS(ESI-TOF):C1822OPSとして、計算値 [M+H]:349.0850、測定値:349.0841
19. 化合物19b:
Figure 2023510921000110
1bとグリニャール試薬SI-14を0.5ミリモルのスケールで1時間の反応時間にて一般的操作Aに従って処理した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン/トルエン=2:1~1:2)に付して精製し、118mg(68%、>20:1 d.r.)の表記化合物19bを得た。すべての物理的および分光学的特性は、旋光性が[α]25 =-104.0°(DCM中c=0.20)であることを除いて、19aと同一である。
b. カップリング
1. 一般的操作B(ワン-ポット型MeIクエンチ):
Figure 2023510921000111
14mLのTHF中の有機リチウム試薬(4.0ミリモル、2.0当量、実施例3の「グリニャール試薬と有機リチウム試薬の合成」を参照のこと)を、まだ-78℃でない場合に、かかる温度に冷却した。出発材料(2.0ミリモル、1.0当量)のTHF(6mL)中溶液を、アルゴン雰囲気下にてフレーム乾燥させたフラスコ中で製造し、次にそれを有機リチウム試薬を含有するフラスコに滴下して加えた。得られた混合物を-78℃を維持しながら3時間にわたって撹拌した。少量のアリコートの31P NMR分析が出発材料が完全に消費されたことを示した後、該反応物を過剰量のヨウ化メチル(8.0ミリモル、4.0当量)でクエンチさせ、室温までの加温に供し、さらにもう1時間撹拌した。得られた混合物に、NHCl飽和水溶液(20mL)およびEtOAc(40mL)を添加した。層を分離し、水層をEtOAc(2x20mL)で洗浄した。有機層を合わせ、ブライン(20mL)で洗浄し、無水NaSO上で乾燥させ、濾過して濃縮した。残渣をシリカゲルクロマトグラフィーに付して精製し、所望の生成物を得た。
2. 一般的操作C(段階型):
Figure 2023510921000112
14mLのTHF中の有機リチウム試薬(4.0ミリモル、2.0当量、実施例3の「グリニャール試薬と有機リチウム試薬の合成」を参照のこと)を、まだ-78℃でない場合に、かかる温度に冷却した。出発材料(2.0ミリモル、1.0当量)のTHF(6mL)中溶液をアルゴン雰囲気下にてフレーム乾燥させたフラスコ中で製造し、次にそれを有機リチウム試薬を含有するフラスコに滴下して加えた。得られた混合物を-78℃を維持しながら3時間にわたって撹拌した。少量のアリコートの31P NMR分析が出発材料が完全に消費されたことを示した後、反応物をNHCl飽和水溶液(20mL)をゆっくりと添加しながら注意してクエンチさせ、次に水(10mL)およびDCM(40mL)で希釈した。層を分離し、水層をDCM(2x20mL)で洗浄した。有機層を合わせ、ブライン(20mL)で洗浄し、無水NaSO上で乾燥させ、濾過して濃縮した。残渣をTHF(10mL)に溶かし、そこにEtN(4.0ミリモル、2.0当量)およびMeI(4.0ミリモル、2.0当量)を加えた。1時間撹拌した後、反応物を水(20mL)で希釈し、EtOAc(3x40mL)で抽出した。有機層を合わせ、ブライン(20mL)で洗浄し、無水NaSO上で乾燥させ、濾過して濃縮した。残渣をシリカゲルクロマトグラフィーに付して精製し、所望の生成物を得た。
3. 化合物11a
8aと有機リチウム試薬SI-16を4ミリモルのスケールで一般的操作Bに従って処理した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン/EtOAc=2:1~1:2)に付して精製し、916mg(82%、>98:2 e.r.)の表記化合物11aを得た。20ミリモルのスケールで、精製後に、4.70g(84%、>98:2 e.r.)の11aを得た。
物理的状態:淡黄色固体
融点=89-92℃
[α]25 =-13.1°(CHCl中c=1.00)
=0.42(ヘキサン/EtOAc=1:2)
H NMR(400MHz、CDCl) δ 7.97(dddd,J=14.2、7.6、1.8、0.4Hz,1H)、7.94-7.86(m,2H)、7.55-7.40(m,4H)、7.08(tdd,J=7.5、2.5、0.9Hz,1H)、6.89(ddd,J=8.3、6.1、0.9Hz,1H)、3.71(s,3H)、2.27(d,J=12.3Hz,3H)
13C NMR(126MHz、CDCl) δ 160.45、160.41、134.73、134.55、134.53、134.01、133.95、133.85、131.89、131.86、131.53、131.44、128.36、128.25、121.66、120.99、120.89、120.82、111.66、111.60、55.57、10.43、10.41
31P NMR(162MHz、CDCl) δ 41.34
HRMS(ESI-TOF):C1416PSとして、計算値 [M+H]:279.0609、測定値:279.0612
4. 化合物11b
Figure 2023510921000113
8bと有機リチウム試薬SI-16を5ミリモルのスケールで一般的操作Bに従って処理した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン/EtOAc=2:1~1:2)に付して精製し、1.07g(77%、>98:2 e.r.)の表記化合物11bを得た。すべての物理的および分光学的特性は、旋光性が[α]25 =+15.6(CHCl中c=1.00)であることを除いて、11aと同一である。
5. 化合物20a
Figure 2023510921000114
8aと有機リチウム試薬SI-17を0.5ミリモルのスケールで一般的操作Bに従って処理した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン/EtOAc=3:1~1:1)に付して精製し、72.0mg(52%、>98:2 e.r.)の表記化合物20aを得た。
物理的状態:白色非晶質固体
[α]25 =+15.5°(CHCl中c=0.40)
=0.45(ヘキサン/EtOAc=1:2)
H NMR(400MHz、CDCl) δ 7.85-7.76(m,2H)、7.65(dd,J=14.8、8.3Hz,1H)、7.57-7.50(m,1H)、7.50-7.43(m,2H)、7.07(ddd,J=5.5、1.6、0.8Hz,2H)、2.49(s,1H)、2.35(s,4H)、2.27(d,J=11.9Hz,3H)
13C NMR(126MHz、CDCl) δ 143.15、143.13、142.59、142.51、134.02、133.17、133.14、133.12、133.04、133.02、132.22、132.20、131.68、131.60、128.81、128.71、127.83、126.98、126.46、126.35、21.65、21.62、21.50、10.83、10.81
31P NMR(162MHz、CDCl) δ 46.50
HRMS(ESI-TOF):C1518OPSとして、計算値 [M+H]:277.0816、測定値:277.0818
6. 化合物20b
Figure 2023510921000115
8bと有機リチウム試薬SI-17を1ミリモルのスケールで一般的操作Bに従って処理した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン/EtOAc=3:1~1:1)に付して精製し、176mg(64%、>98:2 e.r.)の表記化合物20bを得た。すべての物理的および分光学的特性は、旋光性が[α]25 =-15.1°(CHCl中c=0.40)であることを除いて、20aと同一である。
7. 化合物21a
Figure 2023510921000116
8aと有機リチウム試薬SI-18を0.2ミリモルのスケールで一般的操作Cに従って処理した。pTLC(ヘキサン/EtOAc=1:1)に付して精製し、47mg(81%、61:39 e.r.)の表記化合物21aを得た。
物理的状態:無色油
[α]25 =-4.9°(CHCl中c=0.45)
=0.45(ヘキサン/EtOAc=1:2)
H NMR(400MHz、CDCl) δ 7.82-7.73(m,2H)、7.53-7.39(m,3H)、6.89(dd,J=4.3、0.6Hz,2H)、2.44(s,6H)、2.39(d,J=11.8Hz,3H)、2.29(s,3H)
13C NMR(151MHz、CDCl) δ 143.55、143.48、142.30、142.28、137.36、136.66、131.89、131.87、131.39、131.31、130.51、130.44、128.92、128.83、125.85、125.16、23.76、23.74、21.19、21.18、11.02、11.00
31P NMR(162MHz、CDCl) δ 47.36
HRMS(ESI-TOF):C1620OPSとして、計算値 [M+H]:291.0972、測定値:291.0975
8. 化合物21b
Figure 2023510921000117
8bと有機リチウム試薬SI-18を0.2ミリモルのスケールで一般的操作Cに従って処理した。pTLC(ヘキサン/EtOAc=1:1)に付して精製し、48mg(83%、37:63 e.r.)の表記化合物21bを得た。すべての物理的および分光学的特性は、旋光性が[α]25 =+3.5°(CHCl中c=1.00)であることを除いて、21aと同一である。
9. 化合物22a
Figure 2023510921000118
8aと有機リチウム試薬SI-27を2ミリモルのスケールで一般的操作Bに従って処理した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン/EtOAc=2:1~1:2)に付して精製し、364mg(80%、>98:2 e.r.)の表記化合物22aを得た。
物理的状態:白色固体
融点=80-82℃
[α]25 =+142.5°(CHCl中c=1.00)
=0.56(ヘキサン:EtOAc=1:2)
H NMR(400MHz、CDCl) δ 7.92-7.85(m,2H)、7.56-7.44(m,3H)、2.12(d,J=10.5Hz,3H)、1.17(d,J=16.9Hz,9H)
13C NMR(151MHz、CDCl) δ 133.23、133.17、132.06、132.04、130.64、130.03、128.47、128.39、36.67、36.20、24.80、9.61、9.59
31P NMR(162MHz、CDCl) δ 68.92
HRMS(ESI-TOF):C1118OPSとして、計算値 [M+H]:229.0806、測定値:229.0818
10. 化合物22b
Figure 2023510921000119
8bと有機リチウム試薬SI-27を2ミリモルのスケールで一般的操作Bに従って処理した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン/EtOAc=2:1~1:2)に付して精製し、352mg(77%、>98:2 e.r.)の表記化合物22bを得た。すべての物理的および分光学的特性は、旋光性が[α]25 =-135.2°(CHCl中c=1.00)であることを除いて、22aと同一である。
11. 化合物23a
Figure 2023510921000120
8aと有機リチウム試薬SI-19を0.2ミリモルのスケールで一般的操作Cに従って処理した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン/EtOAc=1:2~純粋EtOAc)に付して精製し、15.1mg(30%、>98:2 e.r.)の表記化合物23aを得た。
物理的状態:淡黄色油
[α]25 =-21.6°(CHCl中c=0.38)
=0.34(ヘキサン/EtOAc=1:4)
H NMR(600MHz、CDCl) δ 8.81(d,J=4.7Hz,1H)、8.16(ddt,J=7.7、5.5、1.1Hz,1H)、8.12-8.02(m,2H)、7.83(tdd,J=7.7、4.8、1.7Hz,1H)、7.57-7.52(m,1H)、7.50-7.45(m,2H)、7.40(dddd,J=7.6、4.8、2.7、1.3Hz,1H)、2.23(d,J=12.2Hz,3H)
13C NMR(151MHz、CDCl) δ 156.56、155.64、150.74、150.60、136.49、136.42、132.63、132.61、132.18、132.14、132.07、131.48、128.73、128.66、128.65、128.15、128.00、125.92、125.90、10.21、10.19
31P NMR(162MHz、CDCl) δ 40.29
HRMS(ESI-TOF):C1213NOPSとして、計算値 [M+H]:250.0455、測定値:250.0459
12. 化合物23b
Figure 2023510921000121
8bと有機リチウム試薬SI-19を0.2ミリモルのスケールで一般的操作Cに従って処理した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン/EtOAc=1:2~純粋なEtOAc)に付して精製し、15.9mg(32%、98:2 e.r.)の表記化合物23bを得た。すべての物理的および分光学的特性は、旋光性が[α]25 =+24.1°(CHCl中c=0.80)であることを除いて、23aと同一である。
13. 化合物24a
Figure 2023510921000122
8aと有機リチウム試薬SI-23を0.05ミリモルのスケールで一般的操作Cに従って処理した。pTLC(ヘキサン/EtOAc=1:1)に付して精製し、8.6mg(63%、>98:2 e.r.)の表記化合物24aを得た。
物理的状態:白色非晶質固体
[α]25 =-10.5°(CHCl中c=0.43)
=0.50(ヘキサン/EtOAc=1:2)
H NMR(500MHz、CDCl) δ 8.01(dd,J=15.1、8.4Hz,2H)、7.66-7.50(m,5H)、7.46(t,J=7.5Hz,1H)、7.38(t,J=8.1Hz,2H)、2.40(d,J=14.1Hz,3H)
13C NMR(126MHz、CDCl) δ 133.07、133.04、132.93、132.76、132.74、131.90、131.12、131.03、128.98、128.86、128.75、119.75、119.71、104.97、104.71、83.08、81.64、11.56、11.53
31P NMR(162MHz、CDCl) δ 18.40
HRMS(ESI-TOF):C1514OPSとして、計算値 [M+H]:273.0503、測定値:273.0508
14. 化合物24b
Figure 2023510921000123
8bと有機リチウム試薬SI-23を0.05ミリモルのスケールで一般的操作Cに従って処理した。
pTLC(ヘキサン/EtOAc=1:1)に付して精製し、8.3mg(61%、>98:2 e.r.)の表記化合物24bを得た。すべての物理的および分光学的特性は、旋光性が[α]25 =+11.9°(CHCl中c=0.42)であることを除いて、24aと同一である。
15. 化合物25a
Figure 2023510921000124
8aと有機リチウム試薬SI-20を1ミリモルのスケールで一般的操作Cに従って処理した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン/EtOAc=3:1~2:1)に付して精製し、94mg(32%、96:4 e.r.)の表記化合物25aを得た。
物理的状態:白色非晶質固体
[α]25 =-39.2°(CHCl中c=0.24)
=0.44(ヘキサン/EtOAc=1:1)
H NMR(400MHz、CDCl) δ 8.78-8.72(m,1H)、8.08-7.98(m,2H)、7.94-7.84(m,3H)、7.60-7.44(m,6H)、2.34(d,J=12.1Hz,3H)
13C NMR(151MHz、CDCl) δ 134.17、134.10、133.94、133.92、133.67、133.47、133.40、133.26、133.20、132.96、132.53、132.51、131.83、131.76、129.02、129.01、128.97、128.88、128.82、128.13、127.51、127.12、127.09、126.72、124.58、124.48、11.19、11.17
31P NMR(162MHz、CDCl) δ 46.99
HRMS(ESI-TOF):C1716OPSとして、計算値 [M+H]:299.0659、測定値:299.0662
16. 化合物25b
Figure 2023510921000125
8bと有機リチウム試薬SI-20を1ミリモルのスケールで一般的操作Cに従って処理した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン/EtOAc=3:1~2:1)に付して精製し、68mg(23%、97:3 e.r.)の表記化合物25bを得た。すべての物理的および分光学的特性は、旋光性が[α]25 =+37.5°(CHCl中c=1.00)であることを除いて、25aと同一である。
c. 脱離基導入
1. 一般的操作D
Figure 2023510921000126
フレーム乾燥させた50mLの丸底フラスコに、出発材料(1.0ミリモル、1.0当量)を充填した。該フラスコをエバキュエートし、アルゴンで埋め戻し、次に無水メタノール(8mL)を、つづいてNaOMe(2.0mL、MeOH中0.5M溶液、1.0ミリモル、1.0当量)をシリンジを介して導入した。得られた混合物を室温で4時間撹拌し、その後でNHCl飽和水溶液(10mL)およびEtOAc(20mL)を加えた。層を分離し、水層をEtOAc(2x10mL)で洗浄した。有機層を合わせ、ブライン(10mL)で洗浄し、無水NaSO上で乾燥させ、濾過して濃縮した。(注意:濃縮した後に白色の沈殿物が観察されるならば、もう一度濾過すること。)
粗生成物をシリカゲルクロマトグラフィーに付して精製し、所望の生成物を得た。
2. 化合物SI-28a
Figure 2023510921000127
11aを用いて1ミリモルのスケールで一般的操作Dに従って処理した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン/EtOAc=1:1~1:4)に付して精製し、186mg(70%、98:2 e.r.)の表記化合物SI-28aを得た。16ミリモルのスケールで、精製後に3.24g(77%、97:3 e.r.)のSI-28aを得た。
物理的状態:無色油
[α]25 =-16.5°(CHCl中c=0.84)
=0.25(ヘキサン/EtOAc=1:3)
H NMR(400MHz、CDCl) δ 7.98(ddd,J=13.3、7.5、1.8Hz,1H)、7.88-7.80(m,2H)、7.50(dddd,J=9.6、6.8、2.1、1.1Hz,2H)、7.46-7.38(m,2H)、7.06(tdd,J=7.5、2.6、0.9Hz,1H)、6.87(dd,J=6.1、2.2Hz,1H)、3.75(d,J=11.4Hz,3H)、3.71(s,3H)
13C NMR(151MHz、CDCl) δ 161.11、161.08、134.90、134.86、134.59、134.57、132.54、131.93、131.90、131.87、131.86、131.59、128.18、128.10、120.79、120.71、119.41、118.51、111.39、111.34、55.62、51.53、51.49
31P NMR(162MHz、CDCl) δ 31.78
HRMS(ESI-TOF):C1416Pとして、計算値 [M+H]:263.0837、測定値:263.0842
3. 化合物SI-28b
Figure 2023510921000128
有機リチウム試薬11bを用いて0.9ミリモルのスケールで一般的操作Dに従って処理した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン/EtOAc=1:1~1:4)に付して精製し、151mg(64%、98:2 e.r.)の表記化合物SI-28bを得た。すべての物理的および分光学的特性は、旋光性が[α]25 =+19.2°(CHCl中c=0.91)であることを除いて、SI-28aと同一である。
4. 化合物SI-29a
Figure 2023510921000129
有機リチウム試薬25aを用いて0.30ミリモルのスケールで一般的操作Dに従って処理した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン:/EtOAc=2:1~1:1)に付して精製し、68.4mg(80%、92:8 e.r.)の表記化合物SI-29aを得た。
物理的状態:白色非晶質固体
[α]25 =-18.6°(CHCl中c=0.65)
=0.33(ヘキサン/EtOAc=1:1)
H NMR(600MHz、CDCl) δ 8.55-8.48(m,1H)、8.21(ddd,J=14.8、7.1、1.3Hz,1H)、8.04(d,J=8.1Hz,1H)、7.91-7.85(m,1H)、7.85-7.77(m,2H)、7.56(ddd,J=8.3、7.1、2.8Hz,1H)、7.53-7.47(m,3H)、7.42(td,J=7.5、3.1Hz,2H)、3.82(d,J=11.1Hz,3H)
13C NMR(151MHz、CDCl) δ 134.31、134.26、133.84、133.80、133.78、133.77、133.07、132.99、132.40、132.30、132.28、131.56、131.49、129.03、129.02、128.73、128.64、127.64、127.21、126.47、126.43、126.33、124.80、124.70、51.75、51.71
31P NMR(162MHz、CDCl) δ 34.77
HRMS(ESI-TOF):C1716Pとして、計算値 [M+H]:283.0888、測定値:283.0890
5. 化合物SI-29b
Figure 2023510921000130
有機リチウム試薬25bを用いて0.22ミリモルのスケールで一般的操作Dに従って処理した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン/EtOAc=2:1~1:1)に付して精製し、50.6mg(81%、92:8 e.r.)の表記化合物SI-29bを得た。すべての物理的および分光学的特性は、旋光性が[α]25 =+14.3°(CHCl中c=0.59)であることを除いて、SI-29aと同一である。
6. 化合物SI-30a
Figure 2023510921000131
有機リチウム試薬20aを用いて0.66ミリモルのスケールで一般的操作Dに従って処理した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン:EtOAc2:1~1:1)に付して精製し、97mg(56%、97:3 e.r.)の表記化合物SI-30aを得た。
物理的状態:無色油
[α]25 =+16.1°(CHCl中c=0.80)
=0.30(ヘキサン/EtOAc=1:2)
H NMR(400MHz、CDCl) δ 7.83-7.68(m,3H)、7.55-7.48(m,1H)、7.48-7.38(m,2H)、7.10(dt,J=7.9、2.2Hz,1H)、7.03(d,J=4.9Hz,1H)、3.74(d,J=11.1Hz,3H)、2.36(s,3H)、2.34(s,3H)
13C NMR(126MHz、CDCl) δ 143.07、143.05、142.03、141.94、133.66、133.59、132.53、132.50、132.43、132.09、132.07、131.72、131.64、131.43、128.63、128.53、126.47、126.36、125.26、51.30、51.25、21.55、21.26、21.22
31P NMR(162MHz、CDCl) δ 34.34
HRMS(ESI-TOF):C1518Pとして、計算値 [M+H]:261.1044、測定値:261.1050
7. 化合物SI-30b
Figure 2023510921000132
有機リチウム試薬20bを用いて0.59ミリモルのスケールで一般的操作Dに従って処理した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン:EtOAc2:1~1:1)に付して精製し、80mg(52%、98:2 e.r.)の表記化合物SI-30bを得た。すべての物理的および分光学的特性は、旋光性が[α]25 =-16.9°(CHCl中c=0.80)であることを除いて、SI-30aと同一である。
d. 置換
1. 一般的操作E:
Figure 2023510921000133
アルゴン下にてフレーム乾燥させた13x100mmの培養管に、THF(0.5mL)中の出発材料(0.05ミリモル、1.0当量)を充填した。グリニャール試薬(特記されない限り、0.10ミリモル、2.0当量)を滴下して加え、反応物を室温で12時間撹拌した。NHCl飽和水溶液(1mL)およびEtOAc(2mL)を加えた。層を分離し、水層をEtOAc(2x2mL)で洗浄した。有機層を合わせ、ブライン(1mL)で洗浄し、無水NaSO上で乾燥させ、濾過して濃縮した。粗生成物をpTLCまたはシリカゲルクロマトグラフィーに付して精製し、所望の生成物を得た。
2. 一般的操作F:
Figure 2023510921000134
アルゴン下にてフレーム乾燥させた13x100mmの培養管に、THF(0.5mL)中の出発材料(0.05ミリモル、1.0当量)を充填し、-78℃に冷却した。有機リチウム試薬(特記されない限り、0.10ミリモル、2.0当量)を滴下して加え、反応物を-78℃で3時間撹拌した。NHCl飽和水溶液(1mL)およびEtOAc(2mL)を加えた。層を分離し、水層をEtOAc(2x2mL)で洗浄した。有機層を合わせ、ブライン(1mL)で洗浄し、無水NaSO上で乾燥させ、濾過して濃縮した。粗生成物をpTLCまたはシリカゲルクロマトグラフィーに付して精製し、所望の生成物を得た。
3. 一般的操作G:
Figure 2023510921000135
0.3mLのTHF中の有機リチウム試薬(特記されない限り、0.10ミリモル、2.0当量)をアルゴン下にてフレーム乾燥させた13x100mmの培養管において製造した(「グリニャール試薬と有機リチウム試薬の合成」を参照のこと)。THF(0.2mL)中の出発材料(0.05ミリモル、1.0当量)を滴下して加え、反応物を-78℃で3時間撹拌した。NHCl飽和水溶液(1mL)およびEtOAc(2mL)を加えた。層を分離し、水層をEtOAc(2x2mL)で洗浄した。有機層を合わせ、ブライン(1mL)で洗浄し、無水NaSO上で乾燥させ、濾過して濃縮した。粗生成物をpTLCまたはシリカゲルクロマトグラフィーに付して精製し、所望の生成物を得た。
4. 化合物26a
Figure 2023510921000136
SI-28aとグリニャール試薬SI-11とを0.05ミリモルのスケールで一般的操作Eに従って処理した。pTLC(EtOAc中5%MeOH)に付して精製し、10.9mg(89%、98:2 e.r.)の表記化合物26aを得た。12ミリモルのスケールで、精製後に2.54g(84%、97:3 e.r.)の26aを得た。
物理的状態:白色固体
融点=81-83℃
[α]25 =+30.4°(CHCl中c=0.55)
=0.43(EtOAc中5%MeOH)
H NMR(400MHz、CDCl) δ 7.95(ddd,J=13.1、7.5、1.8Hz,1H)、7.79-7.68(m,2H)、7.55-7.37(m,4H)、7.10(t,J=7.5Hz,1H)、6.88(dd,J=8.3、5.2Hz,1H)、3.72(s,3H)、2.08(d,J=14.0Hz,3H)
13C NMR(151MHz、CDCl) δ 160.04、160.01、135.34、134.67、134.06、134.05、134.03、131.42、131.40、130.40、130.34、128.38、128.30、121.80、121.22、121.15、111.03、110.99、55.42、16.53、16.03
31P NMR(162MHz、CDCl) δ 29.41
HRMS(ESI-TOF):C1416Pとして、計算値 [M+H]:247.0888、測定値:247.0889
5. 化合物26b
Figure 2023510921000137
SI-28bとグリニャール試薬SI-11とを0.05ミリモルのスケールで一般的操作Eに従って処理した。pTLC(EtOAc中5%MeOH)に付して精製し、10.0mg(81%、98:2 e.r.)の表記化合物26bを得た。すべての物理的および分光学的特性は、旋光性が[α]25 =-28.5°(CHCl中c=0.64)であることを除いて、26aと同一である。
6. 化合物27a
Figure 2023510921000138
SI-28aとグリニャール試薬SI-12とを0.05ミリモルのスケールで一般的操作Eに従って処理した。pTLC(EtOAc中5%MeOH)に付して精製し、11.4mg(87%、97:3 e.r.)の表記化合物27aを得た。
7. 化合物27b
Figure 2023510921000139
SI-28bとグリニャール試薬SI-12とを0.03ミリモルのスケールで一般的操作Eに従って処理した。pTLC(EtOAc中5%MeOH)に付して精製し、6.6mg(85%、97:3 e.r.)の表記化合物27bを得た。すべての物理的および分光学的特性は、旋光性が[α]25 =-18.1°(CHCl中c=0.33)であることを除いて、27aと同一である。
8. 化合物28a
Figure 2023510921000140
SI-28aと有機リチウム試薬SI-25とを0.05ミリモルのスケールで一般的操作Fに従って処理した。pTLC(ヘキサン/EtOAc=1:3)に付して精製し、10.5mg(77%、97:3 e.r.)の表記化合物28aを得た。
物理的状態:白色非晶質固体
[α]25 =+13.8°(CHCl中c=0.50)
=0.5(EtOAc)
H NMR(400MHz、CDCl) δ 8.08(ddd,J=12.4、7.6、1.8Hz,1H)、7.88(ddd,J=11.2、7.9、1.7Hz,2H)、7.52-7.36(m,4H)、7.09(t,J=7.7Hz,1H)、6.87(dd,J=8.3、5.2Hz,1H)、3.83(s,3H)、2.87(dq,J=14.1、7.1Hz,1H)、1.15(ddd,J=38.7、17.0、7.2Hz,6H)
13C NMR(151MHz、CDCl) δ 159.43、159.39、134.88、134.85、133.70、133.65、133.63、133.07、131.26、131.24、131.22、131.20、128.23、128.16、121.44、121.37、121.12、120.50、110.64、110.59、55.30、26.66、26.17、15.45、15.44、15.09、15.07
31P NMR(162MHz、CDCl) δ 38.08
HRMS(ESI-TOF):C1620Pとして、計算値 [M+H]:275.1201、測定値:275.1203
9. 化合物28b
Figure 2023510921000141
SI-28bと有機リチウム試薬SI-25とを0.03ミリモルのスケールで一般的操作Fに従って処理した。pTLC(ヘキサン/EtOAc=1:3)に付して精製し、5.6mg(68%、>98:2 e.r.)の表記化合物28bを得た。すべての物理的および分光学的特性は、旋光性が[α]25 =+12.6°(CHCl中c=0.28)であることを除いて、28aと同一である。
10. 化合物29a
Figure 2023510921000142
SI-28aと有機リチウム試薬SI-26とを0.05ミリモルのスケールで一般的操作Fに従って処理した。pTLC(ヘキサン/EtOAc=1:3)に付して精製し、13.6mg(94%、97:3 e.r.)の表記化合物29aを得た。
物理的状態:無色油
[α]25 =+5.3°(CHCl中c=0.43)
=0.54(EtOAc)
H NMR(600MHz、アセトン-d) δ 8.01-7.94(m,1H)、7.88-7.80(m,2H)、7.57-7.41(m,4H)、7.14-7.09(m,1H)、7.09-7.04(m,1H)、3.85(s,3H)、2.51-2.40(m,1H)、2.38-2.26(m,1H)、1.61-1.48(m,1H)、1.47-1.35(m,3H)、0.90-0.81(m,3H)
13C NMR(151MHz、アセトン-d) δ 160.67、160.64、136.89、136.23、134.97、134.94、134.51、134.50、131.82、131.81、131.51、131.45、128.96、128.89、123.05、122.43、121.67、121.60、111.99、111.94、55.72、29.77、29.28、24.64、24.61、24.58、24.54、13.95
31P NMR(162MHz、アセトン-d) δ 29.39
HRMS(ESI-TOF):C1722Pとして、計算値 [M+H]:289.1357、測定値:289.1362
11. 化合物29b
Figure 2023510921000143
SI-28bと有機リチウム試薬SI-26とを0.03ミリモルのスケールで一般的操作Fに従って処理した。pTLC(ヘキサン/EtOAc=1:3)に付して精製し、7.4mg(86%、97:3 e.r.)の表記化合物29bを得た。すべての物理的および分光学的特性は、旋光性が[α]25 =-7.1°(CHCl中c=0.37)であることを除いて、29aと同一である。
12. 化合物30a
Figure 2023510921000144
SI-28aと有機リチウム試薬SI-27とを0.05ミリモルのスケールで一般的操作Fに従って処理した。pTLC(ヘキサン/EtOAc=1:3)に付して精製し、12.0mg(83%、90:10 e.r.)の表記化合物30aを得た。
物理的状態:白色非晶質固体
[α]25 =+10.7°(CHCl中c=0.27)
=0.53(EtOAc)
H NMR(400MHz、CDCl) δ 8.16(ddd,J=12.1、7.6、1.8Hz,1H)、7.99-7.88(m,2H)、7.54-7.36(m,4H)、7.11(tt,J=7.5、1.2Hz,1H)、6.91(dd,J=8.3、5.1Hz,1H)、3.75(s,3H)、1.26(d,J=15.4Hz,9H)
13C NMR(151MHz、CDCl) δ 159.73、159.70、136.27、136.24、133.70、133.69、133.27、132.65、132.18、132.12、131.18、131.16、127.97、127.89、121.27、121.20、120.56、119.97、110.97、110.93、54.77、35.10、34.63、26.11、26.10
31P NMR(162MHz、CDCl) δ 43.50
HRMS(ESI-TOF):C1722Pとして、計算値 [M+H]:289.1357、測定値:289.1361
13. 化合物30b
Figure 2023510921000145
SI-28bと有機リチウム試薬SI-27とを0.03ミリモルのスケールで一般的操作Fに従って処理した。pTLC(ヘキサン/EtOAc=1:3)に付して精製し、6.8mg(79%、87:13 e.r.)の表記化合物30bを得た。すべての物理的および分光学的特性は、旋光性が[α]25 =-12.5°(CHCl中c=0.33)であることを除いて、30aと同一である。
14. 化合物31a
Figure 2023510921000146
SI-28aとグリニャール試薬SI-8(4.0当量)とを0.05ミリモルのスケールで一般的操作Eに従って処理した。pTLC(ヘキサン/EtOAc=1:2)に付して精製し、14.5mg(90%、96:4 e.r.)の表記化合物31aを得た。
物理的状態:無色ゲル
[α]25 =-6.7°(CHCl中c=0.73)
=0.35(ヘキサン/EtOAc=1:3)
H NMR(400MHz、CDCl) δ 7.75(ddd,J=13.4、7.6、1.8Hz,1H)、7.68(ddd,J=12.5、8.2、1.3Hz,2H)、7.59(dd,J=12.3、8.0Hz,2H)、7.55-7.45(m,2H)、7.44-7.37(m,2H)、7.23(dd,J=8.3、2.7Hz,2H)、7.10-7.02(m,1H)、6.90(dd,J=8.3、5.2Hz,1H)、3.55(s,3H)、2.38(s,3H)
13C NMR(126MHz、CDCl) δ 161.01(d,J=3.2Hz)、141.96(d,J=2.6Hz)、135.08(d,J=7.1Hz)、134.28(d,J=1.8Hz)、133.67(d,J=107.6Hz)、132.01(d,J=10.6Hz)、131.88(d,J=10.2Hz)、131.44(d,J=2.7Hz)、129.85(d,J=109.8Hz)、128.99(d,J=12.9Hz)、128.16(d,J=12.4Hz)、121.02(d,J=11.6Hz)、120.62(d,J=103.8Hz)、111.50(d,J=6.5Hz)、55.37、21.71
31P NMR(162MHz、CDCl) δ 27.45
HRMS(ESI-TOF):C2020Pとして、計算値 [M+H]:323.1201、測定値:323.1200
15. 化合物31b
Figure 2023510921000147
SI-28bとグリニャール試薬SI-8(4.0当量)とを0.05ミリモルのスケールで一般的操作Eに従って処理した。pTLC(ヘキサン/EtOAc=1:2)に付して精製し、13.6mg(84%、97:3 e.r.)の表記化合物31bを得た。すべての物理的および分光学的特性は、旋光性が[α]25 =+6.5°(CHCl中c=0.68)であることを除いて、31aと同一である。
16. 化合物32a
Figure 2023510921000148
SI-28aとグリニャール試薬SI-9とを0.05ミリモルのスケールで一般的操作Eに従って処理した。pTLC(ヘキサン/EtOAc=1:3)に付して精製し、15.8mg(93%、97:3 e.r.)の表記化合物32aを得た。
物理的状態:白色非晶質固体
[α]25 =-9.5°(CHCl中c=0.78)
=0.33(ヘキサン/EtOAc=1:3)
H NMR(400MHz、CDCl) δ 7.76-7.64(m,3H)、7.56-7.46(m,2H)、7.45-7.38(m,2H)、7.36-7.28(m,2H)、7.22(ddt,J=12.1、7.5、1.2Hz,1H)、7.10-7.00(m,2H)、6.91(dd,J=8.2、5.3Hz,1H)、3.78(s,3H)、3.57(s,3H)
13C NMR(151MHz、CDCl) δ 161.14、161.12、159.49、159.39、135.10、135.05、134.93、134.44、134.43、134.23、133.61、132.89、131.91、131.85、131.61、131.59、129.46、129.36、128.29、128.20、124.28、124.22、121.08、121.00、120.69、120.01、117.84、117.82、116.77、116.69、111.62、111.57、55.52、55.44
31P NMR(162MHz、CDCl) δ 27.38
HRMS(ESI-TOF):C2020Pとして、計算値 [M+H]:339.1150、測定値:339.1150
17. 化合物32b
Figure 2023510921000149
SI-28bとグリニャール試薬SI-9とを0.05ミリモルのスケールで一般的操作Eに従って処理した。pTLC(ヘキサン/EtOAc=1:3)に付して精製し、15.8mg(93%、97:3 e.r.)の表記化合物32bを得た。すべての物理的および分光学的特性は、旋光性が[α]25 =+8.1°(CHCl中c=0.78)であることを除いて、32aと同一である。
18. 化合物33a
Figure 2023510921000150
SI-28aとグリニャール試薬SI-7(10当量)とを0.05ミリモルのスケールで一般的操作Eに従って処理した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン/EtOAc=1:2~純粋なEtOAc)に付して精製し、16.7mg(93%、95:5 e.r.)の表記化合物33aを得た。
物理的状態:無色ゲル
[α]25 =-7.6°(CHCl中c=0.50)
=0.37(ヘキサン/EtOAc=1:4)
H NMR(600MHz、CDCl) δ 8.37-8.31(m,1H)、7.90-7.83(m,3H)、7.76(dddd,J=23.9、12.5、8.0、1.6Hz,3H)、7.67(ddd,J=10.2、8.4、1.5Hz,1H)、7.60-7.49(m,4H)、7.44(ddd,J=8.9、7.0、3.0Hz,2H)、7.12-7.05(m,1H)、6.96-6.90(m,1H)、3.55(s,3H)
13C NMR(151MHz、CDCl) δ 161.14、161.12、135.19、135.14、134.75、134.73、134.50、134.49、133.79、133.73、133.02、132.66、132.57、131.97、131.90、131.66、131.64、130.81、130.09、129.09、128.36、128.28、128.03、127.88、127.86、127.78、127.20、127.13、126.76、121.17、121.09、120.71、120.02、111.60、111.56、55.44
31P NMR(162MHz、CDCl) δ 27.55
HRMS(ESI-TOF):C2320Pとして、計算値 [M+H]:359.1201、測定値:359.1205
19. 化合物33b
Figure 2023510921000151
SI-28bとグリニャール試薬SI-7(10当量)とを0.05ミリモルのスケールで一般的操作Eに従って処理した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン/EtOAc=1:2~純粋なEtOAc)に付して精製し、16.5mg(92%、80:20 e.r.)の表記化合物33bを得た。すべての物理的および分光学的特性は、旋光性が[α]25 =+8.1°(CHCl中c=0.83)であることを除いて、33aと同一である。
20. 化合物34a
Figure 2023510921000152
SI-28aと有機リチウム試薬SI-20とを0.05ミリモルのスケールで一般的操作Gに従って処理した。pTLC(ヘキサン/EtOAc=1:3)に付して精製し、11.7mg(65%、98:2 e.r.)の表記化合物34aを得た。
物理的状態:白色結晶性固体
融点=167-169℃
[α]25 =+21.3(CHCl中c=0.52)
=0.36(ヘキサン/EtOAc=1:3)
H NMR(400MHz、CDCl) δ 8.57(d,J=8.5Hz,1H)、7.98(d,J=8.0Hz,1H)、7.87(d,J=8.2Hz,1H)、7.83-7.70(m,3H)、7.57-7.36(m,8H)、7.08(tdd,J=7.5、2.1、0.9Hz,1H)、6.91(dd,J=7.9、5.3Hz,1H)、3.46(s,3H)
13C NMR(151MHz、CDCl) δ 161.17、161.15、134.99、134.94、134.36、134.35、134.05、133.94、133.88、133.82、133.34、133.18、133.10、132.84、132.82、132.25、132.18、131.58、131.56、129.60、128.89、128.80、128.79、128.31、128.23、127.62、127.58、127.17、126.32、124.39、124.29、121.42、121.29、121.22、120.74、111.75、111.71、55.45
31P NMR(162MHz、CDCl) δ 30.93
HRMS(ESI-TOF):C2320Pとして、計算値 [M+H]:359.1201、測定値:359.1197
21. 化合物34b
Figure 2023510921000153
SI-28bと有機リチウム試薬SI-20とを0.03ミリモルのスケールで一般的操作Gに従って処理した。pTLC(ヘキサン/EtOAc=1:3)に付して精製し、5.7mg(53%、97:3 e.r.)の表記化合物34bを得た。すべての物理的および分光学的特性は、旋光性が[α]25 =-22.5°(CHCl中c=0.29)であることを除いて、34aと同一である。
22. 化合物35a
Figure 2023510921000154
SI-28aと有機リチウム試薬SI-24とを0.05ミリモルのスケールで一般的操作Gに従って処理した。pTLC(ヘキサン/EtOAc=1:3)に付して精製し、19.3mg(93%、97:3 e.r.)の表記化合物35aを得た。
物理的状態:橙色ゲル
[α]25 =-38.2°(CHCl中c=0.10)
=0.29(ヘキサン/EtOAc=1:3)
H NMR(400MHz、CDCl) δ 7.95(ddd,J=13.4、7.5、1.8Hz,1H)、7.71-7.62(m,2H)、7.54-7.45(m,1H)、7.44(td,J=7.2、1.6Hz,1H)、7.41-7.34(m,2H)、7.10(tdd,J=7.5、1.8、0.9Hz,1H)、6.87(dd,J=8.3、5.3Hz,1H)、4.59(s,1H)、4.47(s,1H)、4.44(s,2H)、4.12(s,5H)、3.51(s,3H)
13C NMR(126MHz、CDCl) δ 160.44、160.41、136.23、135.35、134.48、134.43、133.84、133.83、131.00、130.98、130.90、127.90、127.80、123.26、122.42、120.92、120.83、111.64、111.59、73.41、72.97、72.87、72.45、72.29、72.19、71.42、71.33、71.17、71.08、69.69、55.35
31P NMR(162MHz、CDCl) δ 27.37
HRMS(ESI-TOF):C2322FeOPとして、計算値 [M+H]:415.0754、測定値:415.0747
23. 化合物35b
Figure 2023510921000155
SI-28bと有機リチウム試薬SI-24とを0.05ミリモルのスケールで一般的操作Gに従って処理した。pTLC(ヘキサン:EtOAc=1:3)に付して精製し、18.3mg(88%、97:3 e.r.)の表記化合物35bを得た。すべての物理的および分光学的特性は、旋光性が[α]25 =+39.0(CHCl中c=0.10)であることを除いて、35aと同一である。
24. 化合物36a
Figure 2023510921000156
SI-28aと有機リチウム試薬SI-21とを0.05ミリモルのスケールで一般的操作Gに従って処理した。pTLC(ヘキサン/EtOAc=1:3)に付して精製し、18.3mg(83%、93:7 e.r.)の表記化合物36aを得た。
物理的状態:白色固体
融点=187- 189℃
[α]25 =+49.6°(CHCl中c=0.74)
=0.25(ヘキサン/EtOAc=1:3)
H NMR(400MHz、CDCl) δ 7.70-7.58(m,3H)、7.55-7.45(m,2H)、7.41-7.30(m,3H)、7.30-7.24(m,2H)、7.19(dddd,J=7.6、4.2、1.3、0.5Hz,1H)、7.03(t,J=8.3Hz,1H)、6.89(tdd,J=7.5、2.0、0.9Hz,1H)、6.76(dd,J=8.0、5.2Hz,1H)、6.28(dd,J=8.4、0.8Hz,1H)、6.19(dd,J=8.4、0.8Hz,1H)、3.52(s,3H)、3.50(s,3H)、3.43(s,3H)
13C NMR(126MHz、CDCl) δ 160.58、160.55、157.95、157.61、139.20、139.13、134.76、134.70、134.35、133.66、133.56、133.50、133.27、133.26、132.70、132.56、132.48、132.11、132.03、131.01、130.99、130.70、130.68、129.22、127.51、127.41、126.39、126.28、122.33、121.51、120.60、120.50、117.83、117.80、111.02、110.97、103.04、102.92、55.37、55.28、55.12
31P NMR(162MHz、CDCl) δ 26.90
HRMS(ESI-TOF):C2726Pとして、計算値 [M+H]:445.1569、測定値:445.1565
25. 化合物36b
Figure 2023510921000157
SI-28bと有機リチウム試薬SI-21とを0.05ミリモルのスケールで一般的操作Gに従って処理した。pTLC(ヘキサン/EtOAc=1:3)に付して精製し、18.3mg(83%、93:7 e.r.)の表記化合物36bを得た。すべての物理的および分光学的特性は、旋光性が[α]25 =-44.5°(CHCl中c=1.00)であることを除いて、36aと同一である。
26. 化合物37a
Figure 2023510921000158
SI-29aと有機リチウム試薬SI-22(4当量)とを0.05ミリモルのスケールで一般的操作Gに従って処理した。pTLC(ヘキサン/EtOAc=1:2)に付して精製し、11.4mg(56%、94:6 e.r.)の表記化合物37aを得た。
物理的状態:黄色非晶質固体
[α]25 =-23.5°(CHCl中c=0.38)
=0.40(ヘキサン/EtOAc=1:2)
H NMR(400MHz、アセトン-d) δ 8.65(d,J=8.6Hz,1H)、8.12(d,J=8.2Hz,1H)、8.00(d,J=8.3Hz,1H)、7.79-7.70(m,3H)、7.67(tt,J=7.6、1.6Hz,1H)、7.64-7.47(m,7H)、7.45-7.36(m,2H)、3.91(ddd,J=10.1、8.8、7.7Hz,1H)、3.80(ddd,J=10.5、8.4、7.7Hz,1H)、3.65-3.48(m,2H)
13C NMR(151MHz、アセトン-d) δ 164.58、164.56、135.47、134.90、134.84、134.76、134.71、134.64、134.61、134.56、134.15、134.11、134.10、134.02、133.34、133.32、133.11、133.04、132.45、132.43、132.38、132.36、131.66、131.27、131.21、130.97、130.83、130.75、129.63、129.63、129.15、129.07、128.59、128.56、127.45、127.16、125.25、125.15、68.28、55.74
31P NMR(162MHz、アセトン-d) δ 32.05
HRMS(ESI-TOF):C2521NOPとして、計算値 [M+H]:398.1310、測定値:398.1306
27. 化合物37b
Figure 2023510921000159
SI-29bと有機リチウム試薬SI-22(4当量)とを0.05ミリモルのスケールで一般的操作Gに従って処理した。pTLC(ヘキサン/EtOAc=1:2)に付して精製し、8.0mg(40%、89:11と94:6の間のe.r.、十分でないキラルHPLC分離、下記参照)の表記化合物37bを得た。すべての物理的および分光学的特性は、旋光性が[α]25 =+22.8°(CHCl中c=0.40)であることを除いて、37aと同一である。
28. 化合物38a
Figure 2023510921000160
SI-30aと有機リチウム試薬SI-24とを0.05ミリモルのスケールで一般的操作Gに従って処理した。pTLC(ヘキサン/EtOAc=1:3)に付して精製し、16.6mg(84%、98:2 e.r.)の表記化合物38aを得た。
物理的状態:橙色非晶質固体
[α]25 =+88.0°(CHCl中c=0.10)
=0.35(ヘキサン/EtOAc=1:3)
H NMR(400MHz、CDCl) δ 7.76-7.67(m,2H)、7.51(dtd,J=16.2、8.6、8.1、6.2Hz,3H)、7.11(dd,J=14.0、7.8Hz,1H)、6.99(s,1H)、6.92(d,J=7.9Hz,1H)、4.72(s,1H)、4.54(s,1H)、4.40(s,1H)、4.21(s,5H)、3.93(s,1H)、2.30(d,J=4.1Hz,6H)
13C NMR(151MHz、CDCl) δ 142.33、142.27、142.10、142.08、134.78、134.09、133.58、133.49、132.56、132.49、131.45、131.43、131.32、131.26、130.16、129.45、128.33、128.25、125.79、125.71、74.30、73.52、72.84、72.75、72.35、72.28、71.97、71.90、71.33、71.26、69.81、21.47、21.39、21.36
31P NMR(162MHz、CDCl) δ 31.77
HRMS(ESI-TOF):C2424FeOPとして、計算値 [M+H]:413.0961、測定値:413.0954
29. 化合物38b
Figure 2023510921000161
SI-30bと有機リチウム試薬SI-24とを0.05ミリモルのスケールで一般的操作Gに従って処理した。pTLC(ヘキサン/EtOAc=1:3)に付して精製し、15.8mg(76%、97:3と98:2との間のe.r.、十分でないキラルHPLC分離、下記参照)の表記化合物38bを得た。すべての物理的および分光学的特性は、旋光性が[α]25 =-79.0°(CHCl中c=0.10)であることを除いて、38aと同一である。
e. ホスフィンオキシドの立体特異的還元
Figure 2023510921000162
キラルホスフィンの還元は報告されている操作に従ってなされる(Rajendran, K. V.ら、Simple unprecedented conversion of phosphine oxides and sulfides to phosphine boranes using sodium borohydride. Chem. Comm. 2012, 48, 817-819を参照のこと)。26a(0.5ミリモル、1.0当量)のDCM(1mL)中溶液を、アルゴン雰囲気下、メーヤワイン塩(0.5ミリモル、1.0当量)のDCM(1mL)中の撹拌した溶液に室温で滴下して加えた。反応混合物を穏やかに2時間還流させ、その時点で31P NMRはホスフィンオキシドのアルコキシホスホニウム塩への変換が完了したことを示した。室温に冷却した後、ジグライム(1mL)に溶かした水素化ホウ素ナトリウム(3ミリモル、6.0当量)を該反応混合物に滴下して加えた。この混合物を穏やかに2時間還流させた。31P NMRが塩のホスフィンボランへの完全な変換を示した時点で、該反応混合物を水(5mL)で洗浄し、有機層を単離し、無水MgSO上で乾燥させた。乾燥剤を濾過で除去し、溶媒を真空下で除去し、無色油を得、それをシリカゲルクロマトグラフィー(ヘキサン/EtOAc=4:1)に付して精製し、39a(60%、96:4 e.r.)を白色固体として得た。分光学的データはすべて、文献のデータと同じであった。エナンチオマー割合は、キラルパック(Chiralpak)AD-Hカラムで、溶出液としてヘキサン中2%イソプロパノールを、流速として1mL/分を用いて測定された。
実施例5
3’-O-保護のヌクレオシドの合成
1. 3’-O-保護のヌクレオシドを合成する一般的操作(一般的操作G)
Figure 2023510921000163
3’-O-TBS保護のヌクレオシドの合成方法は文献に記載の操作を採用した。5’-O-DMTr保護のヌクレオシド(10ミリモル、1.0当量)およびイミダゾール(3.14g、46.2ミリモル、2.0当量)のDMF(30mL)中溶液を0℃に冷却し、それにTBSCl(20ミリモル、2.0当量)を添加した。反応物を室温で3日間撹拌し、次にEtOAc(80mL)で希釈し、水(100mLx3)で洗浄した。有機層をMgSO上で乾燥させ、溶媒を真空下で除去した。残渣を100mLのDCMおよび40mLのMeOHに溶かし、ついで0℃に冷却した。p-トルエンスルホン酸(20ミリモル、2.0当量)のMeOH(10mL)中溶液を加え、該反応混合物を0℃で30分間撹拌した。ピリジン(1mL)を添加して過剰量の酸を中和した。粗反応混合物を蒸発乾固させ、EtOAc(100mL)に希釈し、飽和NaHCO(50mL)およびブライン(50mL)で洗浄した。有機層をNaSO上で乾燥させ、濾過し、真空下で濃縮した。粗生成物をシリカゲルクロマトグラフィー(純粋なDCM~DCM中5%MeOHの勾配)に付して精製し、所望の生成物を得た。
2. 化合物SI-31
Figure 2023510921000164
5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)チミジンを用いて10ミリモルのスケールで一般的操作Gに従って処理した。SI-31(2.8g、79%)を、文献に報告されているのと同じ分光学的特性を有する、白色泡沫体として単離した。Huang, H.-S.ら、A Practical Method for Regioselective 5’-O-tert-Butyldimethylsilyl Deprotection of Persilylated Nucleosides by Methanolic Phosphomolybdic Acid. Synlett 2018, 29, 2437-2443を参照のこと。
3. 化合物SI-32
Figure 2023510921000165
N6-ベンゾイル-5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-2’-デオキシアデノシンを用いて10ミリモルのスケールで一般的操作Gに従って処理した。SI-32(3.8g、81%)を、文献に報告されているのと同じ分光学的特性を有する、白色泡沫体として単離した。Molina, A.G.ら、Acetylated and Methylated β-Cyclodextrins as Viable Soluble Supports for the Synthesis of Short 2’-Oligodeoxyribo-nucleotides in Solution. Molecules 2012, 17, 12102-12120を参照のこと。
4. 化合物SI-33
Figure 2023510921000166
N4-ベンゾイル-5’- O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-2’-デオキシシチジンを用いて10ミリモルのスケールで一般的操作Gに従って処理した。SI-33(3.7g、83%)を、文献に報告されているのと同じ分光学的特性を有する、白色泡沫体として単離した。Huang, H.-S.ら、Synlett 2018, 29, 2437-2443を参照のこと。
5. 化合物SI-34
Figure 2023510921000167
N2-イソブチリル-5’-O-(4,4’- ジメトキシトリチル)-2’-デオキシグアノシンを用いて10ミリモルのスケールで一般的操作Gに従って処理した。SI-34(3.3g、72%)を、文献に報告されているのと同じ分光学的特性を有する、白色泡沫体として単離した。Huang, H.-S.ら、Synlett 2018, 29, 2437-2443を参照のこと。
実施例6
MPO合成
a. ローディング
1. 一般的操作H
Figure 2023510921000168
アルゴン下にてフレーム乾燥させた50mLの丸底フラスコに、ヌクレオシド(1.0ミリモル、1.0当量)、12(524.6mg、2.0ミリモル、2.0当量)、およびTHF(10mL)を充填した。DBU(3.0ミリモル、3.0当量)を滴下して加え、得られた溶液を室温で12時間撹拌した。次に、反応物を20mLの1xPBS溶液でクエンチさせ、DCM(3x30mL)で抽出した。有機層を合わせ、NaHCO飽和水溶液(10mL)、ブライン(10mL)で洗浄し、NaSO上で乾燥させ、濾過して濃縮した。残渣をTHF(5mL)に再び溶かした。EtN(2当量)およびMeI(2当量)を加え、不均一な混合物を1時間激しく撹拌した。反応物を10mLの水でクエンチさせ、EtOAc(3x20mL)で抽出した。有機層を合わせ、NaSO上で乾燥させ、濾過して濃縮した。残渣をシリカゲルクロマトグラフィーに付して精製し、所望の生成物を得た。
核酸塩基の命名法:本開示において、核酸塩基については、特記されない限り、次の命名規則が採用されるであろう:
Figure 2023510921000169
2. 化合物(R)-40
Figure 2023510921000170
12bと、5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)チミジンとを0.5ミリモルのスケールで一般的操作Hに従って処理した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中2%~5%MeOH)に付して精製し、275mg(85%、>20:1 d.r.)の表記化合物(R)-40を得た。
物理的状態:白色泡沫体
=0.3(EtOAc)
H NMR(600MHz、アセトン-d) δ 10.01(s,1H)、7.58(d,J=1.3Hz,1H)、7.53-7.47(m,2H)、7.41-7.31(m,6H)、7.30-7.23(m,1H)、6.95-6.89(m,4H)、6.38(dd,J=8.3、6.0Hz,1H)、5.32(ddt,J=10.9、5.3、2.5Hz,1H)、4.23(q,J=3.2Hz,1H)、3.79(s,6H)、3.49-3.40(m,2H)、2.63-2.57(m,2H)、2.18(d,J=13.1Hz,3H)、1.82(d,J=15.7Hz,3H)、1.50(d,J=1.2Hz,3H)
13C NMR(151MHz、アセトン-d) δ 164.22、159.94、159.93、151.35、145.81、138.60、136.58、136.44、136.24、131.13、130.15、129.86、129.14、129.13、128.90、128.88、128.39、127.95、127.51、126.23、114.18、113.71、111.44、87.82、85.26、85.21、85.19、76.47、76.43、64.33、55.67、55.57、39.94、39.92、21.51、19.11、18.39、12.51、12.49、12.28
31P NMR(162MHz、アセトン-d) δ 56.16
HRMS(ESI-TOF):C3337PSNaとして、計算値 [M+Na]:675.1906、測定値:675.1914
3. 化合物(S)-40
Figure 2023510921000171
12aと、5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)チミジンとを1ミリモルのスケールで一般的操作Hに従って処理した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中2%~5%MeOH)に付して精製し、574mg(88%、>20:1 d.r.)の表記化合物(S)-40を得た。
物理的状態:白色泡沫体
=0.34(EtOAc)
H NMR(600MHz、アセトン-d) δ 10.13(s,1H)、7.61(d,J=1.3Hz,1H)、7.53-7.47(m,2H)、7.40-7.35(m,4H)、7.33(t,J=7.8Hz,2H)、7.28-7.22(m,1H)、6.94-6.87(m,4H)、6.39(dd,J=8.3、6.1Hz,1H)、5.38(ddd,J=10.0、5.4、2.9Hz,1H)、4.36(q,J=3.0Hz,1H)、3.78(s,6H)、3.46(ddd,J=49.2、10.6、3.2Hz,2H)、2.63-2.53(m,2H)、2.31(d,J=13.0Hz,3H)、1.82(d,J=15.7Hz,3H)、1.46(d,J=1.3Hz,3H)
13C NMR(151MHz、アセトン-d) δ 164.19、159.77、159.75、151.29、145.77、136.51、136.34、136.11、131.03、129.02、128.77、127.78、114.05、111.31、87.71、85.72、85.70、85.11、76.74、76.70、64.10、55.54、39.35、39.32、19.09、18.37、12.36、12.34、12.14
31P NMR(162MHz、アセトン-d) δ 56.63
HRMS(ESI-TOF):C3337PSNaとして、計算値 [M+Na]:675.1906、測定値:675.1988
4. 化合物(R)-41
Figure 2023510921000172
12bと、N6-ベンゾイル-5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-2’-デオキシアデノシンとを1ミリモルのスケールで一般的操作Hに従って処理した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中2%~5%MeOH)に付して精製し、628mg(82%、20:1 d.r.)の表記化合物(R)-41を得た。
物理的状態:白色泡沫体
=0.23(DCM/MeOH=98:2)
H NMR(600MHz、アセトン-d) δ 9.97(s,1H)、8.55(s,1H)、8.41(s,1H)、8.12(d,J=7.6Hz,2H)、7.64(t,J=7.4Hz,1H)、7.56(dd,J=8.3、6.9Hz,2H)、7.51-7.44(m,2H)、7.38-7.30(m,4H)、7.28(dd,J=8.3、6.6Hz,2H)、7.25-7.17(m,1H)、6.90-6.80(m,4H)、6.60(dd,J=7.7、6.2Hz,1H)、5.48(ddt,J=8.8、5.6、2.7Hz,1H)、4.37(td,J=5.3、2.5Hz,1H)、3.77(d,J=1.9Hz,6H)、3.51-3.28(m,3H)、2.92-2.85(m,1H)、2.27(d,J=13.0Hz,3H)、1.85(d,J=15.7Hz,3H)
13C NMR(151MHz、アセトン-d) δ 165.93、159.80、159.78、153.02、152.69、151.42、146.06、143.84、136.77、136.75、135.18、133.34、131.11、131.04、129.88、129.54、129.26、129.16、129.10、128.73、127.75、126.46、126.24、114.04、87.40、85.78、85.73、76.98、76.93、64.29、55.65、38.56、21.53、19.21、18.49、12.65、12.63
31P NMR(162MHz、アセトン-d) δ 55.94
HRMS(ESI-TOF):C4041PSとして、計算値 [M+H]:766.2464、測定値:766.2474
5. 化合物(S)-41
Figure 2023510921000173
12aと、N6-ベンゾイル-5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-2’-デオキシアデノシンとを1ミリモルのスケールで一般的操作Hに従って処理した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中2%~5%MeOH)に付して精製し、690mg(90%、>20:1 d.r.)の表記化合物(S)-41を得た。
物理的状態:白色泡沫体
=0.38(EtOAc/アセトン=2:1)
H NMR(600MHz、アセトン-d) δ 10.06(s,1H)、8.54(s,1H)、8.41(s,1H)、8.11(d,J=7.7Hz,2H)、7.65-7.58(m,1H)、7.53(t,J=7.9Hz,2H)、7.47(dd,J=8.4、1.3Hz,2H)、7.34(d,J=8.6Hz,4H)、7.25(t,J=7.7Hz,2H)、7.21-7.16(m,1H)、6.82(t,J=9.1Hz,4H)、6.59(dd,J=7.8、6.2Hz,1H)、5.49(ddd,J=12.3、5.5、2.5Hz,1H)、4.52(td,J=5.0、2.5Hz,1H)、3.75(d,J=2.6Hz,6H)、3.51-3.41(m,2H)、3.41-3.33(m,1H)、2.77(ddd,J=14.1、6.2、2.7Hz,1H)、2.33(d,J=13.0Hz,3H)、1.85(d,J=15.7Hz,3H)
13C NMR(151MHz、アセトン-d) δ 165.90、159.57、159.55、152.86、152.55、151.28、145.98、143.66、136.67、135.01、133.17、130.99、130.93、129.36、129.15、128.99、128.55、127.53、126.26、113.87、87.18、86.17、86.14、85.63、76.94、76.89、64.25、55.50、38.10、38.07、19.21、18.49、12.35、12.33
31P NMR(162MHz、アセトン-d) δ 56.03
HRMS(ESI-TOF):C4041PSとして、計算値 [M+H]:766.2464、測定値:766.2480
6. 化合物(R)-42
Figure 2023510921000174
12bと、N2-イソブチリル-5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-2’-デオキシグアノシンとを1ミリモルのスケールで一般的操作Hに従って処理した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中2%~5%MeOH)に付して精製し、343mg(46%、>20:1 d.r.)の表記化合物(R)-42を得た。
物理的状態:白色泡沫体
=0.18(EtOAc/アセトン=2:1)
H NMR(600MHz、アセトン-d) δ 12.02(s,1H)、10.52(s,1H)、7.96(s,1H)、7.47-7.42(m,2H)、7.35-7.17(m,7H)、6.89-6.82(m,4H)、6.33(dd,J=7.5、6.0Hz,1H)、5.54-5.47(m,1H)、4.28(td,J=4.6、3.0Hz,1H)、3.81-3.78(m,6H)、3.43-3.37(m,1H)、3.12(ddd,J=13.6、7.4、5.9Hz,1H)、2.82(td,J=6.3、5.7、2.9Hz,1H)、2.33(d,J=0.7Hz,2H)、2.23(d,J=13.1Hz,3H)、1.90(d,J=15.7Hz,3H)、1.24(dd,J=6.9、2.7Hz,6H)
13C NMR(151MHz、アセトン-d) δ 180.83、159.80、159.78、155.87、149.35、149.22、145.94、138.12、136.72、136.64、131.10、131.02、129.88、129.16、129.11、128.89、128.40、127.77、126.24、122.35、114.01、87.40、85.40、85.35、84.67、76.55、76.51、64.26、55.63、39.14、36.74、21.53、19.43、19.35、19.21、18.49、12.61、12.58
31P NMR(162MHz、アセトン-d) δ 57.29
HRMS(ESI-TOF):C3743PSとして、計算値 [M+H]:748.2570、測定値:748.2568
7. 化合物(S)-42
Figure 2023510921000175
12aと、N2-イソブチリル-5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-2’-デオキシグアノシンとを1ミリモルのスケールで一般的操作Hに従って処理した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中2%~5%MeOH)に付して精製し、441mg(59%、>20:1 d.r.)の表記化合物(S)-42を得た。
物理的状態:白色泡沫体
=0.25(EtOAc/アセトン=2:1)
H NMR(600MHz、アセトン-d) δ 12.04(s,1H)、10.84(s,1H)、7.92(s,1H)、7.41-7.37(m,2H)、7.30-7.15(m,7H)、6.79(dd,J=9.0、2.5Hz,4H)、6.40(dd,J=8.0、5.8Hz,1H)、5.59(ddt,J=10.8、5.6、2.7Hz,1H)、4.62-4.55(m,1H)、3.75(d,J=2.1Hz,6H)、3.43(dd,J=10.4、5.0Hz,1H)、3.32(dd,J=10.4、3.8Hz,1H)、3.06(ddd,J=13.9、8.0、5.9Hz,1H)、2.82-2.72(m,2H)、2.38(d,J=13.4Hz,3H)、1.98(d,J=15.6Hz,3H)、1.15(dd,J=34.6、6.8Hz,6H)
13C NMR(151MHz、アセトン-d) δ 180.81、159.55、155.79、149.27、149.24、145.80、137.82、136.54、130.88、130.86、128.95、128.54、127.56、122.03、113.83、87.07、85.87、85.85、84.46、76.90、76.85、64.11、55.47、39.14、39.11、36.44、19.35、19.31、19.19、18.60、12.46、12.43
31P NMR(162MHz、アセトン-d) δ 58.75
HRMS(ESI-TOF):C3743PSとして、計算値 [M+H]:748.2570、測定値:748.2573
8. 化合物(R)-43
Figure 2023510921000176
12bと、N4-ベンゾイル-5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-2’-デオキシシチジンとを1ミリモルのスケールで一般的操作Hに従って処理した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中2%~5%MeOH)に付して精製し、652mg(88%、>20:1 d.r.)の表記化合物(R)-43を得た。
物理的状態:白色泡沫体
=0.21(DCM/MeOH=98:2)
H NMR(600MHz、アセトン-d) δ 9.79(s,1H)、8.25(d,J=7.4Hz,1H)、8.17(ddt,J=7.5、6.2、2.6Hz,2H)、7.68-7.65(m,1H)、7.61-7.55(m,2H)、7.51(dt,J=8.8、2.2Hz,2H)、7.42-7.34(m,5H)、7.31-7.17(m,3H)、6.96-6.92(m,4H)、6.29(t,J=6.4Hz,1H)、5.27(ddt,J=10.4、7.2、3.8Hz,1H)、4.38(q,J=3.8Hz,1H)、3.82(s,6H)、3.54(d,J=4.0Hz,2H)、2.88(ddd,J=14.4、6.3、3.5Hz,1H)、2.50(dt,J=12.3、5.9Hz,1H)、2.22(d,J=13.0Hz,3H)、1.84(d,J=15.7Hz,3H)
13C NMR(151MHz、アセトン-d) δ 159.94、145.68、145.16、138.63、136.51、136.45、133.75、131.18、131.16、129.89、129.61、129.24、129.21、129.17、128.90、127.96、126.25、114.20、87.89、87.76、85.94、85.89、75.80、75.76、63.74、55.67、41.31、21.54、19.21、18.48、12.53、12.51
31P NMR(162MHz、アセトン-d) δ 56.15
HRMS(ESI-TOF):C3941PSとして、計算値 [M+H]:742.2352、測定値:742.2360
9. 化合物(S)-43
Figure 2023510921000177
12aと、N4-ベンゾイル-5’-O-(4,4’-ジメトキシトリチル)-2’-デオキシシチジンとを1ミリモルのスケールで一般的操作Hに従って処理した。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中2%~5%MeOH)に付して精製し、534mg(72%、>20:1 d.r.)の表記化合物(S)-43を得た。
物理的状態:白色泡沫体
=0.33(EtOAc/アセトン=2:1)
H NMR(600MHz、アセトン-d) δ 10.07(s,1H)、8.25(d,J=7.5Hz,1H)、8.15(dd,J=8.4、1.3Hz,2H)、7.66-7.59(m,1H)、7.57-7.51(m,2H)、7.51-7.47(m,2H)、7.40-7.35(m,4H)、7.33(dd,J=8.4、7.1Hz,2H)、7.29-7.21(m,2H)、6.93-6.88(m,4H)、6.25(t,J=6.4Hz,1H)、5.33(ddt,J=9.7、6.5、3.3Hz,1H)、4.47(q,J=3.6Hz,1H)、3.78(d,J=1.3Hz,6H)、3.51(ddd,J=37.0、10.8、3.8Hz,2H)、2.80(ddd,J=14.3、6.2、3.4Hz,1H)、2.50(dt,J=14.2、6.5Hz,1H)、2.31(d,J=13.1Hz,3H)、1.83(d,J=15.7Hz,3H)
13C NMR(151MHz、アセトン-d) δ 163.77、159.70、159.69、145.60、145.05、136.47、136.33、134.59、133.57、131.05、130.98、129.41、129.13、129.04、128.74、127.72、114.04、97.09、87.70、86.33、86.30、75.76、75.72、63.44、55.51、40.72、40.69、19.10、18.38、12.37、12.35
31P NMR(162MHz、アセトン-d) δ 56.56
HRMS(ESI-TOF):C3941PSとして、計算値 [M+H]:742.2352、測定値:742.2343
b. カップリング
1. 一般的操作I
Figure 2023510921000178
カップリング工程は報告された操作の修正版に従ってなされる。培養管にLiCl(12.7mg、0.3ミリモル、10当量)を充填し、真空下でフレーム乾燥させ、冷却させ室温に戻した。ローディングした化合物(0.06ミリモル、2.0当量)および3’-TBS-ヌクレオシド(0.03ミリモル、1.0当量)を該培養管に加え、次にそれを密封してArで3回埋め戻した。DMF(0.5mL)を加え、LiClがすべて溶解するまで、反応物を約15分間撹拌した。次にDBU(91.3mg、0.09mL、0.6ミリモル、20当量)をシリンジを介して導入し、得られた混合物を16時間にわたって一夜撹拌した。1xPBS溶液(10mL)を添加して反応物をクエンチさせ、DCM(3x10mL)で抽出した。有機層を合わせ、水(2x10mL)およびブライン(10mL)で洗浄し、MgSO上で乾燥させ、濾過して濃縮した。必要に応じて、残りのDMFはトルエンと共沸的に除去され得る。残渣をpTLCに付して精製し、所望の生成物を得た。
2. 化合物(S)-44
Figure 2023510921000179
(S)-40と、SI-31とを用い、0.03ミリモルのスケールで一般的操作Iに従って処理された。pTLC(EtOAc/DCM:アセトン=5:5:2)に付して精製し、23.9mg(83%、>20:1 d.r.)の表記化合物(S)-44を得た。
物理的状態:白色非晶質固体
=0.32(EtOAc/DCM/アセトン=5:5:2)
H NMR(600MHz、アセトン-d) δ 10.12(s,1H)、10.06(s,1H)、7.58(q,J=1.2Hz,1H)、7.54(q,J=1.3Hz,1H)、7.51-7.47(m,2H)、7.39-7.31(m,6H)、7.28-7.23(m,1H)、6.93-6.88(m,4H)、6.37(t,J=7.1Hz,1H)、6.30(dd,J=7.7、6.1Hz,1H)、5.34(dtd,J=8.3、4.2、2.6Hz,1H)、4.52(dt,J=6.1、3.2Hz,1H)、4.27(q,J=3.0Hz,1H)、4.26-4.22(m,1H)、4.09(ddd,J=11.4、7.0、3.5Hz,1H)、4.00(dt,J=5.2、3.3Hz,1H)、3.79(s,6H)、3.48-3.39(m,2H)、2.61-2.55(m,2H)、2.31-2.16(m,2H)、1.81(d,J=1.3Hz,3H)、1.59(d,J=17.7Hz,3H)、1.45(d,J=1.2Hz,3H)、0.91(s,9H)、0.12(d,J=2.0Hz,6H)
13C NMR(151MHz、アセトン-d) δ 164.26、164.19、159.80、159.78、151.29、151.26、145.73、136.55、136.45、136.33、136.17、131.05、131.04、129.05、128.79、127.83、114.07、111.30、111.11、87.74、86.32、86.27、85.74、85.49、85.46、85.07、76.99、76.95、73.06、65.66、65.62、64.22、55.57、40.73、39.57、39.54、26.13、18.49、12.57、12.18、12.13、11.24、-4.56、-4.65
31P NMR(162MHz、アセトン-d) δ 33.33
HRMS(ESI-TOF):C486113PSiとして、計算値 [M+Na]:983.3640、測定値:983.3629
3. 化合物(S)-45
Figure 2023510921000180
(S)-40と、SI-32とを用い、0.03ミリモルのスケールで一般的操作Iに従って処理された。pTLC(EtOAc/DCM/アセトン=5:5:2)に付して精製し、29.3mg(91%、20:1 d.r.)の表記化合物(S)-45を得た。
物理的状態:白色非晶質固体
=0.32(EtOAc/DC/アセトン=5:5:2)
H NMR(600MHz、アセトン-d) δ 10.25(s,1H)、10.06(s,1H)、8.64(s,1H)、8.46(s,1H)、8.10(d,J=7.7Hz,2H)、7.64-7.60(m,1H)、7.57-7.51(m,3H)、7.47-7.44(m,2H)、7.36-7.28(m,6H)、7.24-7.19(m,1H)、6.88(dd,J=9.0、1.2Hz,4H)、6.56(t,J=6.5Hz,1H)、6.33(dd,J=8.0、6.1Hz,1H)、5.26(ddt,J=8.2、5.5、2.7Hz,1H)、4.88(dt,J=6.0、4.0Hz,1H)、4.26-4.10(m,4H)、3.76(s,6H)、3.41-3.31(m,2H)、3.06(dt,J=13.0、6.2Hz,1H)、2.56-2.49(m,3H)、1.50(d,J=17.7Hz,3H)、1.42(d,J=1.2Hz,3H)、0.95(s,9H)、0.18(s,6H)
13C NMR(151MHz、アセトン-d) δ 165.88、164.25、159.75、159.73、152.85、152.63、151.33、151.23、145.74、143.57、136.45、136.31、136.22、135.01、133.18、131.03、131.01、129.37、129.21、129.01、128.77、127.77、126.04、114.05、111.26、87.69、86.64、86.60、85.43、85.40、85.36、85.09、76.91、76.87、73.07、65.14、65.10、64.14、55.55、40.44、39.57、39.55、26.18、18.55、12.11、11.16、-4.51、-4.61
31P NMR(162MHz、アセトン-d) δ 32.99
HRMS(ESI-TOF):C556412PSiとして、計算値 [M+H]:1074.4198、測定値:1074.4181
4. 化合物(S)-46
Figure 2023510921000181
(S)-40と、SI-33とを用い、0.03ミリモルのスケールで一般的操作Iに従って処理された。pTLC(EtOAc/アセトン=15:1)に付して精製し、25.5mg(81%、>20:1 d.r.)の表記化合物(S)-46を得た。
物理的状態:白色非晶質固体
=0.50(EtOAc/アセトン=10:1)
H NMR(600MHz、アセトン-d) δ 10.09(s,1H)、9.95(s,1H)、8.22(d,J=7.6Hz,1H)、8.17-8.13(m,2H)、7.67-7.62(m,1H)、7.58(d,J=1.3Hz,1H)、7.55(t,J=7.8Hz,2H)、7.50-7.46(m,2H)、7.39-7.29(m,7H)、7.26-7.21(m,1H)、6.89(d,J=9.0Hz,4H)、6.37(t,J=7.0Hz,1H)、6.23(t,J=6.3Hz,1H)、5.35(dtd,J=8.1、4.3、2.5Hz,1H)、4.54(dt,J=6.1、4.0Hz,1H)、4.35-4.28(m,2H)、4.17(ddd,J=11.4、6.8、3.5Hz,1H)、4.12(q,J=4.1Hz,1H)、3.77(s,6H)、3.45(ddd,J=31.5、10.6、3.3Hz,2H)、2.60(dd,J=7.1、4.4Hz,2H)、2.46(ddd,J=13.6、6.3、4.1Hz,1H)、2.24(dt,J=13.5、6.3Hz,1H)、1.61(d,J=17.7Hz,3H)、1.45(d,J=1.3Hz,3H)、0.91(s,9H)、0.12(d,J=1.6Hz,6H)
13C NMR(151MHz、アセトン-d) δ 164.19、163.70、159.77、159.76、151.27、145.73、145.27、136.46、136.32、136.25、134.62、133.59、131.04、129.44、129.16、129.04、128.78、127.81、114.06、114.05、111.24、97.15、87.85、87.72、86.91、86.87、85.48、85.45、85.20、77.05、77.01、72.59、65.27、65.23、64.24、55.55、42.10、39.57、39.55、26.14、18.49、12.22、12.15、11.28、-4.53、-4.68
31P NMR(162MHz、アセトン-d) δ 33.43
HRMS(ESI-TOF):C546413PSiとして、計算値 [M+H]:1050.4086、測定値:1050.4083
5. 化合物(S)-47
Figure 2023510921000182
(S)-40と、SI-34とを用い、0.03ミリモルのスケールで一般的操作Iに従って処理された。pTLC(EtOAc/アセトン=10:1)に付して精製し、25.0mg(80%、>20:1 d.r.)の表記化合物(S)-47を得た。
物理的状態:白色非晶質固体
=0.37(EtOAc/アセトン=10:1)
H NMR(600MHz、アセトン-d) δ 12.06(s,1H)、11.00(s,1H)、10.06(s,1H)、7.97(s,1H)、7.58(d,J=1.3Hz,1H)、7.48(dd,J=8.4、1.2Hz,2H)、7.38-7.29(m,6H)、7.26-7.20(m,1H)、6.91-6.86(m,4H)、6.38(dd,J=7.7、6.5Hz,1H)、6.33(dd,J=8.9、5.7Hz,1H)、5.36(ddt,J=7.8、5.8、3.1Hz,1H)、4.63(dt,J=5.2、1.8Hz,1H)、4.45(ddd,J=11.0、7.0、4.9Hz,1H)、4.37-4.29(m,2H)、4.18(td,J=5.4、5.0、1.6Hz,1H)、3.77(d,J=1.7Hz,6H)、3.45(qd,J=10.6、3.4Hz,2H)、2.99-2.89(m,1H)、2.84-2.80(m,1H)、2.63-2.58(m,2H)、2.27(ddd,J=13.3、5.8、1.9Hz,1H)、1.62(d,J=17.6Hz,3H)、1.45(d,J=1.1Hz,3H)、1.16(dd,J=16.4、6.9Hz,6H)、0.92(s,9H)、0.13(d,J=3.7Hz,6H)
13C NMR(151MHz、アセトン-d) δ 181.00、164.13、159.80、159.78、155.81、151.25、149.07、148.92、145.67、139.55、136.40、136.30、136.22、131.02、131.00、129.04、128.78、127.85、123.14、114.05、111.28、87.74、87.07、87.02、86.90、85.48、85.45、85.25、77.51、77.48、73.92、66.07、66.03、64.26、55.56、39.92、39.47、39.44、36.41、26.17、19.40、19.23、18.56、12.14、11.71、10.78、-4.54、-4.61
31P NMR(162MHz、アセトン-d) δ 34.75
HRMS(ESI-TOF):C526613PSiとして、計算値 [M+Na]:1078.4123、測定値:1078.4097
6. 化合物(S)-48
Figure 2023510921000183
(S)-41と、SI-31とを用い、0.03ミリモルのスケールで一般的操作Iに従って処理された。pTLC(EtOAc/アセトン=7:1)に付して精製し、24.2mg(75%、>20:1 d.r.)の表記化合物(S)-48を得た。
物理的状態:白色非晶質固体
=0.32(EtOAc/アセトン=7:1)
H NMR(600MHz、アセトン-d) δ 10.28(s,1H)、10.08(s,1H)、8.55(s,1H)、8.41(s,1H)、8.12(d,J=7.6Hz,2H)、7.63(t,J=7.4Hz,1H)、7.59(d,J=1.3Hz,1H)、7.54(t,J=7.8Hz,2H)、7.45(dd,J=8.5、1.3Hz,2H)、7.35-7.30(m,4H)、7.26(t,J=7.6Hz,2H)、7.22-7.16(m,1H)、6.86-6.81(m,4H)、6.58(dd,J=7.7、6.2Hz,1H)、6.34(dd,J=7.7、6.1Hz,1H)、5.47(td,J=5.7、2.9Hz,1H)、4.56(dt,J=6.1、3.2Hz,1H)、4.42(td,J=5.1、2.6Hz,1H)、4.32(ddd,J=11.4、7.7、5.2Hz,1H)、4.19(ddd,J=11.4、7.1、3.5Hz,1H)、4.05(dt,J=5.5、3.2Hz,1H)、3.76(d,J=2.6Hz,6H)、3.51-3.41(m,2H)、3.37(ddd,J=13.9、7.8、6.1Hz,1H)、2.81(ddd,J=14.1、6.2、2.8Hz,1H)、2.34-2.21(m,2H)、1.83(d,J=1.2Hz,3H)、1.63(d,J=17.7Hz,3H)、0.91(s,9H)、0.13(s,6H)
13C NMR(151MHz、アセトン-d) δ 164.56、163.02、158.28、158.26、151.54、151.22、150.01、144.58、142.37、135.30、135.26、133.68、131.86、129.65、129.58、128.03、127.87、127.66、127.26、126.27、124.90、112.56、109.82、85.93、85.05、85.01、84.61、84.58、84.42、84.27、75.95、75.91、71.72、64.36、64.32、62.93、54.18、39.46、36.94、36.91、24.81、17.16、11.27、10.92、9.97、-5.88、-5.96
31P NMR(162MHz、アセトン-d) δ 33.03
HRMS(ESI-TOF):C556412PSiとして、計算値 [M+H]:1074.4198、測定値:1074.4185
7. 化合物(S)-49
Figure 2023510921000184
(S)-41と、SI-32とを用い、0.03ミリモルのスケールで一般的操作Iに従って処理された。pTLC(EtOAc中10%MeOH)に付して精製し、27.5mg(77%、>20:1 d.r.)の表記化合物(S)-49を得た。
物理的状態:白色非晶質固体
=0.28(EtOAc中10%MeOH)
H NMR(600MHz、アセトン-d) δ 9.99(d,J=12.5Hz,2H)、8.66(s,1H)、8.52(d,J=7.4Hz,2H)、8.42(s,1H)、8.13(t,J=6.2Hz,4H)、7.65(dt,J=15.2、7.4Hz,2H)、7.56(dt,J=15.6、7.6Hz,4H)、7.47-7.42(m,2H)、7.34-7.30(m,4H)、7.26(dd,J=8.5、7.0Hz,2H)、7.21-7.16(m,1H)、6.85-6.80(m,4H)、6.61(t,J=6.5Hz,1H)、6.55(dd,J=7.7、6.2Hz,1H)、5.40(ddt,J=8.4、5.8、2.7Hz,1H)、4.93(dt,J=6.0、4.0Hz,1H)、4.35(td,J=5.1、2.5Hz,1H)、4.31(dd,J=7.2、4.4Hz,2H)、4.20(q,J=4.2Hz,1H)、3.76(d,J=2.0Hz,6H)、3.46-3.36(m,2H)、3.31(dt,J=14.2、7.6Hz,1H)、3.09(dt,J=12.9、6.2Hz,1H)、2.76(ddd,J=14.0、6.2、2.8Hz,1H)、2.58(ddd,J=13.4、6.5、4.3Hz,1H)、1.55(d,J=17.7Hz,3H)、0.97(s,9H)、0.21(s,6H)
13C NMR(151MHz、アセトン-d) δ 165.92、165.85、159.60、159.58、152.91、152.82、152.65、152.51、151.20、145.95、143.83、143.55、136.66、136.65、135.07、134.99、133.22、133.19、130.98、130.92、129.41、129.39、129.20、129.17、128.99、128.58、127.56、126.48、126.29、126.19、113.89、87.21、86.72、86.68、85.88、85.85、85.64、85.42、77.27、77.24、73.09、65.14、65.10、64.24、55.51、40.64、38.14、26.20、18.57、12.11、11.16、-4.50、-4.58
31P NMR(162MHz、アセトン-d) δ 32.60
HRMS(ESI-TOF):C62671011PSiとして、計算値 [M+H]:1187.4576、測定値:1187.4561
8. 化合物(S)-50
Figure 2023510921000185
(S)-41と、SI-33とを用い、0.03ミリモルのスケールで一般的操作Iに従って処理された。pTLC(EtOAc/アセトン=7:1)に付して精製し、26.8mg(77%、>20:1 d.r.)の表記化合物(S)-50を得た。
物理的状態:白色非晶質固体
=0.50(EtOAc/アセトン=5:1)
H NMR(600MHz、アセトン-d) δ 10.06(s,2H)、8.55(s,1H)、8.46(s,1H)、8.31(d,J=7.5Hz,1H)、8.16-8.10(m,4H)、7.67-7.60(m,2H)、7.55(q,J=8.6、7.7Hz,4H)、7.47(d,J=7.3Hz,2H)、7.41(s,1H)、7.35-7.31(m,4H)、7.26(t,J=7.7Hz,2H)、7.22-7.17(m,1H)、6.86-6.80(m,4H)、6.62(dd,J=7.6、6.2Hz,1H)、6.28(t,J=6.3Hz,1H)、5.50(ddt,J=8.5、5.8、2.6Hz,1H)、4.60(dt,J=6.2、4.0Hz,1H)、4.46(dt,J=8.0、3.9Hz,1H)、4.40(ddd,J=11.8、7.3、4.8Hz,1H)、4.31(ddt,J=10.3、6.9、3.3Hz,1H)、4.18(q,J=4.0Hz,1H)、3.76(dd,J=2.4、1.5Hz,6H)、3.53-3.44(m,2H)、3.41(dt,J=13.7、6.7Hz,1H)、2.85(ddd,J=14.0、6.2、2.8Hz,1H)、2.50(ddt,J=11.8、5.7、2.8Hz,1H)、2.29(dt,J=13.2、6.3Hz,1H)、1.67(d,J=17.7Hz,3H)、0.93(s,9H)、0.15(s,6H)
13C NMR(151MHz、アセトン-d) δ 166.11、163.70、159.60、159.58、152.81、152.56、151.17、145.92、145.34、143.93、136.64、136.61、134.96、134.56、133.60、133.27、130.98、130.91、129.44、129.39、129.18、129.14、128.99、128.58、127.59、126.14、113.89、97.10、87.94、87.24、86.98、86.94、85.97、85.94、85.70、77.37、77.33、72.57、65.30、65.26、64.29、55.51、42.21、38.24、38.22、26.15、18.49、12.31、11.36、-4.52、-4.65
31P NMR(162MHz、アセトン-d) δ 33.17
HRMS(ESI-TOF):C616712PSiとして、計算値 [M+H]:1163.4464、測定値:1163.4448
9. 化合物(S)-51
Figure 2023510921000186
(S)-41と、SI-34とを用い、0.03ミリモルのスケールで一般的操作Iに従って処理された。pTLC(EtOAc中10%MeOH)に付して精製し、20.0mg(60%、>20:1 d.r.)の表記化合物(S)-51を得た。
物理的状態:白色非晶質固体
=0.25(EtOAc:アセトン=5:1)
H NMR(600MHz、アセトン-d) δ 12.08(s,1H)、11.07(s,1H)、10.00(s,1H)、8.54(s,1H)、8.43(s,1H)、8.13(d,J=7.6Hz,2H)、8.01(s,1H)、7.67-7.61(m,1H)、7.55(t,J=7.7Hz,2H)、7.47-7.40(m,2H)、7.34-7.27(m,4H)、7.23(dd,J=8.3、6.8Hz,2H)、7.20-7.15(m,1H)、6.80(t,J=8.7Hz,4H)、6.62(dd,J=7.6、6.2Hz,1H)、6.36(dd,J=8.8、5.7Hz,1H)、5.50(ddt,J=8.4、5.8、2.7Hz,1H)、4.71-4.64(m,1H)、4.53(ddd,J=11.6、7.1、4.7Hz,1H)、4.47(td,J=5.1、2.5Hz,1H)、4.40(dt,J=11.1、6.1Hz,1H)、4.22(t,J=4.5Hz,1H)、3.74(d,J=2.7Hz,6H)、3.50-3.38(m,3H)、2.99(ddd,J=13.7、8.8、5.2Hz,1H)、2.85-2.82(m,2H)、2.31(ddd,J=13.2、5.8、1.9Hz,1H)、1.65(d,J=17.6Hz,3H)、1.15(dd,J=24.8、6.8Hz,6H)、0.93(s,9H)、0.15(d,J=1.4Hz,6H)
13C NMR(151MHz、アセトン-d) δ 181.01、165.88、159.61、159.58、155.87、152.84、152.51、151.32、149.11、148.97、145.85、143.87、139.57、136.61、136.57、135.03、133.23、130.95、130.88、129.41、129.17、128.99、128.56、127.61、126.31、123.15、113.86、87.20、87.14、87.10、86.92、86.00、85.97、85.71、77.72、77.68、73.91、66.12、66.08、64.35、55.51、40.06、38.10、38.07、36.41、26.18、19.39、19.23、18.56、11.84、10.91、-4.50、-4.57
31P NMR(162MHz、アセトン-d) δ 34.58
HRMS(ESI-TOF):C59691012PSiとして、計算値 [M+H]:1169.4682、測定値:1169.4675
10. 化合物(S)-52
Figure 2023510921000187
(S)-43と、SI-31とを用い、0.03ミリモルのスケールで一般的操作Iに従って処理された。pTLC(EtOAc/DCM:アセトン=5:5:3)に付して精製し、14.2mg(46%、>20:1 d.r.)の表記化合物(S)-52を得た。
物理的状態:白色非晶質固体
=0.33(EtOAc/DCM:アセトン=5:5:3)
H NMR(600MHz、アセトン-d) δ 9.98(s,1H)、9.90(s,1H)、8.24(d,J=7.5Hz,1H)、8.18-8.12(m,2H)、7.68-7.63(m,1H)、7.58-7.53(m,3H)、7.50-7.47(m,2H)、7.39-7.32(m,6H)、7.28-7.19(m,2H)、6.95-6.88(m,4H)、6.31(dd,J=7.7、6.1Hz,1H)、6.23(t,J=6.2Hz,1H)、5.27(ddt,J=7.7、6.2、3.9Hz,1H)、4.54(dt,J=6.1、3.1Hz,1H)、4.37(q,J=3.8Hz,1H)、4.26(ddd,J=11.4、7.7、5.2Hz,1H)、4.10(ddd,J=11.4、7.0、3.6Hz,1H)、4.02(dt,J=5.2、3.3Hz,1H)、3.80(d,J=1.5Hz,6H)、3.55-3.46(m,2H)、2.82-2.77(m,1H)、2.52(dt,J=14.2、6.3Hz,1H)、2.31-2.19(m,2H)、1.82(d,J=1.2Hz,3H)、1.61(d,J=17.7Hz,3H)、0.91(s,9H)、0.12(d,J=1.8Hz,6H)
13C NMR(151MHz、アセトン-d) δ 164.20、163.77、159.77、151.25、145.56、145.05、136.53、136.40、136.34、134.60、133.62、131.05、131.02、129.47、129.13、129.09、128.80、127.81、114.09、111.10、97.08、87.79、87.60、86.33、86.29、86.00、85.97、85.76、75.89、75.85、73.08、65.57、65.53、63.41、55.55、40.85、40.83、40.75、26.14、18.50、12.60、12.20、11.25、-4.55、-4.64
31P NMR(162MHz、アセトン-d) δ 33.25
HRMS(ESI-TOF):C546413PSiとして、計算値 [M+Na]:1072.3905、測定値:1072.3926
11. 化合物(S)-53
Figure 2023510921000188
(S)-43と、SI-32とを用い、0.03ミリモルのスケールで一般的操作Iに従って処理された。pTLC(EtOAc/DCM/アセトン=10:10:7)に付して精製し、27.6mg(79%、>20:1 d.r.)の表記化合物(S)-53を得た。
物理的状態:白色非晶質固体
=0.34(EtOAc/DCM/アセトン=5:5:3)
H NMR(600MHz、アセトン-d) δ 10.03(s,2H)、8.64(s,1H)、8.47(s,1H)、8.22(d,J=7.5Hz,1H)、8.13(ddd,J=8.7、4.0、2.6Hz,4H)、7.65-7.59(m,2H)、7.56-7.50(m,4H)、7.46-7.41(m,2H)、7.34-7.28(m,6H)、7.27-7.15(m,2H)、6.90-6.85(m,4H)、6.56(t,J=6.5Hz,1H)、6.18(t,J=6.1Hz,1H)、5.21(ddt,J=8.0、6.3、4.2Hz,1H)、4.90(dt,J=5.9、4.0Hz,1H)、4.28-4.17(m,3H)、4.14(q,J=4.3Hz,1H)、3.77(d,J=1.7Hz,6H)、3.42(dd,J=3.6、1.2Hz,2H)、3.06(dt,J=13.5、6.2Hz,1H)、2.73(ddd,J=14.1、6.3、4.4Hz,1H)、2.57-2.46(m,2H)、1.55(d,J=17.8Hz,3H)、0.95(s,9H)、0.17(s,6H)
13C NMR(151MHz、アセトン-d) δ 165.90、163.82、159.69、152.86、152.61、151.24、145.50、145.05、143.58、136.40、136.29、135.06、134.59、133.55、133.16、130.99、130.95、129.39、129.22、129.19、129.08、129.04、128.76、127.72、126.18、114.06、97.01、87.71、87.53、86.63、86.59、85.77、85.74、85.34、75.55、75.51、73.10、65.04、65.00、63.17、55.53、40.73、40.71、40.45、26.19、18.56、12.15、11.21、-4.51、-4.60
31P NMR(162MHz、アセトン-d) δ 33.13
HRMS(ESI-TOF):C616712PSiとして、計算値 [M+H]:1163.4464、測定値:1163.4436
12. 化合物(S)-54
Figure 2023510921000189
(S)-43と、SI-33とを用い、0.03ミリモルのスケールで一般的操作Iに従って処理された。pTLC(DCM/アセトン=2:1)に付して精製し、22.4mg(66%、>20:1 d.r.)の表記化合物(S)-54を得た。
物理的状態:白色非晶質固体
=0.31(DCM/アセトン=2:1)
H NMR(600MHz、アセトン-d) δ 10.02(s,2H)、8.24(dd,J=24.8、7.5Hz,2H)、8.15(ddd,J=8.6、2.4、1.3Hz,4H)、7.65-7.61(m,2H)、7.53(dd,J=8.2、7.4Hz,4H)、7.47(dd,J=8.5、1.3Hz,2H)、7.38-7.31(m,7H)、7.25-7.20(m,2H)、6.89(dd,J=9.0、1.9Hz,4H)、6.24(td,J=6.3、1.8Hz,2H)、5.29(ddt,J=8.0、6.3、4.2Hz,1H)、4.57(dt,J=6.1、4.0Hz,1H)、4.39(q,J=3.8Hz,1H)、4.34(ddd,J=11.8、7.3、4.8Hz,1H)、4.20(ddd,J=11.5、6.8、3.6Hz,1H)、4.14(q,J=4.0Hz,1H)、3.78(d,J=1.0Hz,6H)、3.51(t,J=3.4Hz,2H)、2.81(ddd,J=14.1、6.3、4.3Hz,1H)、2.57(dt,J=14.2、6.1Hz,1H)、2.47(ddd,J=13.5、6.3、4.1Hz,1H)、2.27(dt,J=13.6、6.3Hz,1H)、1.66(d,J=17.7Hz,3H)、0.91(s,9H)、0.12(s,6H)
13C NMR(151MHz、アセトン-d) δ 163.84、163.72、159.72、159.70、145.50、145.33、145.14、136.40、136.30、134.56、133.58、131.01、130.98、129.44、129.41、129.16、129.06、128.78、127.78、114.07、114.06、97.10、87.91、87.74、87.68、86.89、86.84、85.91、85.87、75.86、75.82、72.58、65.20、65.16、63.36、55.54、42.09、40.78、40.75、26.14、18.48、12.23、11.29、-4.54、-4.67
31P NMR(162MHz、アセトン-d) δ 33.53
HRMS(ESI-TOF):C606713PSiとして、計算値 [M+H]:1139.4351、測定値:1139.4324
13. 化合物(S)-55
Figure 2023510921000190
(S)-43と、SI-34とを用い、0.03ミリモルのスケールで一般的操作Iに従って処理された。pTLC(EtOAc中10%MeOH)に付して精製し、20.3mg(59%、>20:1 d.r.)の表記化合物(S)-55を得た。
物理的状態:白色非晶質固体
=0.33(EtOAc中10%MeOH)
H NMR(600MHz、アセトン-d) δ 12.08(s,1H)、11.07(s,1H)、8.26(d,J=7.5Hz,1H)、8.20-8.14(m,2H)、7.98(s,1H)、7.70-7.66(m,1H)、7.59(t,J=7.8Hz,2H)、7.52-7.47(m,2H)、7.40-7.32(m,6H)、7.28-7.23(m,1H)、6.92(dd,J=9.0、2.8Hz,4H)、6.36(dd,J=9.0、5.7Hz,1H)、6.27(t,J=6.3Hz,1H)、5.30(tt,J=7.0、3.6Hz,1H)、4.67(d,J=5.2Hz,1H)、4.51-4.43(m,2H)、4.40(dt,J=11.2、6.2Hz,1H)、4.21(t,J=5.0Hz,1H)、3.79(d,J=0.8Hz,6H)、3.53(qd,J=10.7、3.8Hz,2H)、3.00(ddd,J=13.7、9.0、5.2Hz,1H)、2.91-2.84(m,2H)、2.54(dt,J=21.2、6.9Hz,2H)、2.35-2.28(m,2H)、1.64(d,J=17.6Hz,3H)、1.20(d,J=6.8Hz,3H)、1.16(d,J=6.9Hz,3H)、0.94(s,9H)、0.15(d,J=5.4Hz,6H)
13C NMR(151MHz、アセトン-d) δ 180.96、159.78、155.87、149.12、148.93、145.52、139.61、136.39、136.29、133.67、131.04、130.99、129.51、129.40、129.09、128.79、127.84、126.50、123.23、114.08、108.73、87.79、87.15、87.10、87.02、86.09、76.39、73.95、66.21、63.49、62.77、55.54、40.81、39.99、36.44、26.17、19.41、19.25、18.57、11.68、10.75、-4.53、-4.60
31P NMR(162MHz、アセトン-d) δ 34.67
HRMS(ESI-TOF):C586913PSiとして、計算値 [M+H]:1145.4569、測定値:1145.4559
14. 化合物(S)-56
Figure 2023510921000191
(S)-42と、SI-31とを用い、0.03ミリモルのスケールで一般的操作Iに従って処理された。pTLC(EtOAc/DCM/アセトン=5:5:3)に付して精製し、13.3mg(42%、>20:1 d.r.)の表記化合物(S)-56を得た。
物理的状態:白色非晶質固体
=0.19(EtOAc/DCM/アセトン=5:5:3)
H NMR(600MHz、アセトン-d) δ 12.03(s,1H)、10.51(s,1H)、10.17(s,1H)、7.92(s,1H)、7.59(d,J=1.3Hz,1H)、7.44-7.41(m,2H)、7.32-7.29(m,4H)、7.28-7.25(m,2H)、7.23-7.18(m,1H)、6.86-6.80(m,4H)、6.34(t,J=6.8Hz,1H)、6.25(dd,J=7.9、5.8Hz,1H)、5.50(ddt,J=8.4、5.6、2.8Hz,1H)、4.58(dt,J=6.3、3.8Hz,1H)、4.33(td,J=4.7、2.7Hz,1H)、4.24-4.15(m,2H)、3.98(qd,J=3.6、1.1Hz,1H)、3.77(s,6H)、3.38(ddd,J=47.0、10.3、4.7Hz,2H)、3.03(ddd,J=13.9、8.0、5.9Hz,1H)、2.89(p,J=6.9Hz,1H)、2.70(ddd,J=13.9、5.9、2.9Hz,1H)、2.37-2.22(m,2H)、1.92(d,J=1.2Hz,3H)、1.66(d,J=17.7Hz,3H)、1.23(dd,J=6.9、0.8Hz,6H)、0.91(s,9H)、0.12(s,6H)
13C NMR(151MHz、アセトン-d) δ 179.49、163.52、158.30、158.29、154.41、149.87、147.98、147.86、144.50、136.52、135.63、135.25、135.18、129.66、129.60、127.68、127.25、126.29、120.77、112.54、109.65、85.97、84.70、84.66、84.35、84.32、84.16、82.89、75.87、75.83、71.18、63.65、63.60、63.00、54.15、39.60、37.65、35.19、24.76、18.02、17.90、17.13、11.46、11.14、10.18、-5.91、-6.04
31P NMR(162MHz、アセトン-d) δ 33.50
HRMS(ESI-TOF):C526613PSiとして、計算値 [M+H]:1056.4304、測定値:1056.4304
15. 化合物(S)-57
Figure 2023510921000192
(S)-42と、SI-32とを用い、0.03ミリモルのスケールで一般的操作Iに従って処理された。pTLC(EtOAc/DCM/アセトン=1:1:1)に付して精製し、25.0mg(71%、>20:1 d.r.)の表記化合物(S)-57を得た。
物理的状態:白色非晶質固体
=0.26(EtOAc/DCM/アセトン=1:1:1)
H NMR(600MHz、アセトン-d) δ 11.97(s,1H)、10.73(s,1H)、10.03(s,1H)、8.69(s,1H)、8.51(s,1H)、8.07(d,J=7.6Hz,2H)、7.90(s,1H)、7.63(t,J=7.4Hz,1H)、7.55-7.49(m,2H)、7.41-7.36(m,2H)、7.28-7.20(m,6H)、7.19-7.14(m,1H)、6.79(dd,J=9.0、2.9Hz,4H)、6.57(t,J=6.4Hz,1H)、6.16(dd,J=7.5、6.0Hz,1H)、5.35(ddt,J=8.8、6.1、3.2Hz,1H)、4.95(q,J=4.9Hz,1H)、4.28-4.09(m,4H)、3.74(d,J=1.7Hz,6H)、3.36-3.25(m,2H)、3.12(dt,J=12.8、6.1Hz,1H)、2.96(ddd,J=13.6、7.6、6.0Hz,1H)、2.84-2.81(m,1H)、2.64-2.53(m,2H)、1.53(d,J=17.7Hz,3H)、1.19(dd,J=19.1、6.9Hz,6H)、0.95(s,9H)、0.18(d,J=3.5Hz,6H)
13C NMR(151MHz、アセトン-d) δ 180.76、166.01、159.59、155.79、152.91、152.68、151.19、149.27、149.09、145.87、143.90、138.06、136.61、136.56、134.78、133.31、130.95、130.91、129.41、129.16、129.00、128.57、127.57、126.20、122.22、113.86、87.20、86.55、86.51、85.51、85.47、84.38、76.87、76.83、72.83、64.96、64.92、64.20、55.49、40.42、38.68、38.65、36.53、26.18、19.38、19.23、18.55、12.21、11.26、-4.49、-4.61
31P NMR(162MHz、アセトン-d) δ 33.01
HRMS(ESI-TOF):C59691012PSiとして、計算値 [M+H]:1169.4682、測定値:1169.4667
16. 化合物(S)-58
Figure 2023510921000193
(S)-42と、SI-33とを用い、0.03ミリモルのスケールで一般的操作Iに従って処理された。pTLC(EtOAc/アセトン=5:1)に付して精製し、17.4mg(51%、>20:1 d.r.)の表記化合物(S)-58を得た。
物理的状態:白色非晶質固体
=0.51(EtOAc/アセトン=5:1)
H NMR(600MHz、アセトン-d) δ 12.04(s,1H)、10.68(s,1H)、10.00(s,1H)、8.28(d,J=7.5Hz,1H)、8.10-8.03(m,2H)、7.94(s,1H)、7.66-7.60(m,1H)、7.53(dd,J=8.3、7.3Hz,2H)、7.46-7.38(m,3H)、7.30-7.26(m,4H)、7.26-7.21(m,2H)、7.20-7.15(m,1H)、6.84-6.76(m,4H)、6.30-6.24(m,2H)、5.46(dp、J=8.6、3.0Hz,1H)、4.58(dt,J=6.2、4.3Hz,1H)、4.39-4.34(m,1H)、4.34-4.24(m,2H)、4.14(dt,J=4.7、3.6Hz,1H)、3.75(d,J=0.8Hz,6H)、3.46-3.33(m,2H)、3.08(dt,J=13.7、6.7Hz,1H)、2.73(ddd,J=13.8、6.1、3.2Hz,1H)、2.52(ddd,J=13.5、6.5、4.6Hz,1H)、2.30(dt,J=13.6、6.1Hz,1H)、1.67(d,J=17.6Hz,3H)、1.38(s,1H)、1.22(dd,J=6.9、0.8Hz,6H)、0.91(s,9H)、0.12(d,J=0.9Hz,6H)
13C NMR(151MHz、アセトン-d) δ 180.72、163.78、159.61、159.60、155.87、149.33、149.10、145.85、145.44、138.09、136.60、136.53、134.50、133.64、130.98、130.92、129.46、129.09、129.01、128.58、127.60、122.17、113.87、97.20、87.91、87.24、86.77、86.72、85.76、85.73、84.39、77.25、77.22、72.27、65.00、64.96、64.37、55.49、42.23、38.89、38.86、36.54、26.13、19.35、19.31、18.49、12.29、11.35、-4.54、-4.69
31P NMR(162MHz、アセトン-d) δ 33.52
HRMS(ESI-TOF):C586913PSiとして、計算値 [M+H]:1145.4569、測定値:1145.4556
17. 化合物(S)-59
Figure 2023510921000194
(S)-42と、SI-34とを用い、0.03ミリモルのスケールで一般的操作Iに従って処理された。pTLC(EtOAc/アセトン/MeOH=5:5:1)に付して精製し、13.4mg(39%、>20:1 d.r.)の表記化合物(S)-59を得た。
物理的状態:白色非晶質固体
=0.21(EtOAc/アセトン/MeOH=5:5:1)
H NMR(600MHz、アセトン-d) δ 12.10(s,2H)、10.82(s,1H)、10.72(s,1H)、8.06(s,1H)、7.92(s,1H)、7.47-7.42(m,2H)、7.34-7.25(m,6H)、7.24-7.19(m,1H)、6.87-6.81(m,4H)、6.34(t,J=6.6Hz,1H)、6.22(dd,J=8.3、5.7Hz,1H)、5.37(ddt,J=8.1、5.3、2.5Hz,1H)、4.75(dt,J=6.1、3.3Hz,1H)、4.37-4.23(m,3H)、4.15(q,J=3.9Hz,1H)、3.78(s,6H)、3.44-3.33(m,2H)、3.05-2.87(m,3H)、2.84-2.82(m,1H)、2.68(ddd,J=14.0、5.7、2.5Hz,1H)、2.44(ddd,J=13.4、6.2、3.7Hz,1H)、1.59(d,J=17.8Hz,3H)、1.25(dd,J=6.8、1.7Hz,6H)、1.17(d,J=6.8Hz,3H)、1.10(d,J=6.9Hz,3H)、0.95(s,9H)、0.18(d,J=2.9Hz,6H)
13C NMR(151MHz、アセトン-d) δ 180.92、180.78、159.67、156.16、155.78、149.55、149.46、149.23、149.09、145.84、138.86、137.65、136.60、136.50、131.00、130.95、129.01、128.62、127.67、122.57、122.10、113.91、87.31、86.89、86.85、85.72、85.66、85.63、84.16、77.35、77.31、73.15、65.31、65.27、64.46、55.51、40.40、38.94、38.92、36.64、36.43、26.16、19.37、19.26、19.15、18.54、12.08、11.13、-4.51、-4.65
31P NMR(162MHz、アセトン-d) δ 34.00
HRMS(ESI-TOF):C56711013PSiとして、計算値 [M+H]:1151.4787、測定値:1151.4779
18. 化合物(R)-48
Figure 2023510921000195
(R)-41と、SI-31とを用い、0.03ミリモルのスケールで一般的操作Iに従って処理された。pTLC(EtOAc/アセトン=7:1)に付して精製し、22.1mg(69%、>20:1 d.r.)の表記化合物(R)-48を得た。
物理的状態:白色非晶質固体
=0.31(EtOAc/DCM/アセトン=5:5:2)
H NMR(600MHz、アセトン-d) δ 10.01(s,1H)、9.95(s,1H)、8.57(s,1H)、8.38(s,1H)、8.14(d,J=7.7Hz,2H)、7.69-7.64(m,1H)、7.63(q,J=1.2Hz,1H)、7.58(t,J=7.6Hz,2H)、7.49-7.44(m,2H)、7.36-7.32(m,3H)、7.32- 7.12(m,4H)、6.89-6.80(m,4H)、6.60(dd,J=7.6、6.2Hz,1H)、6.29(dd,J=7.7、6.1Hz,1H)、5.44(ddt,J=8.5、5.8、2.9Hz,1H)、4.60(dt,J=6.2、3.2Hz,1H)、4.41(td,J=4.9、2.6Hz,1H)、4.37-4.28(m,1H)、4.26-4.19(m,1H)、4.09(q,J=4.0Hz,1H)、3.79(s,6H)、3.49-3.44(m,2H)、3.38-3.32(m,1H)、2.82-2.78(m,1H)、2.37-2.30(m,1H)、2.25(ddd,J=13.4、6.2、3.3Hz,1H)、1.81(d,J=1.2Hz,3H)、1.61(d,J=17.6Hz,3H)、0.92(s,9H)、0.14(d,J=2.7Hz,6H)
13C NMR(151MHz、アセトン-d) δ 165.94、164.32、159.78、159.76、153.02、152.76、151.41、151.35、146.06、143.61、136.76、136.69、135.21、133.35、132.16、131.12、131.05、129.90、129.78、129.56、129.30、129.18、129.13、128.74、127.74、126.38、126.26、114.05、113.97、111.27、87.39、86.40、86.35、86.14、86.10、85.94、85.61、77.24、77.20、73.24、68.46、65.79、65.75、64.49、55.65、40.81、39.81、38.61、31.32、26.26、24.64、23.78、18.64、14.46、12.63、12.30、11.45、11.35、-4.41、-4.52
31P NMR(162MHz、アセトン-d) δ 32.39
HRMS(ESI-TOF):C556412PSiとして、計算値 [M+H]:1074.4198、測定値:1074.4189
19. 化合物(R)-46
Figure 2023510921000196
(R)-40と、SI-33とを用い、0.03ミリモルのスケールで一般的操作Iに従って処理された。pTLC(EtOAc/アセトン=15:1)に付して精製し、22.0mg(70%、>20:1 d.r.)の表記化合物(R)-46を得た。
物理的状態:白色非晶質固体
=0.63(EtOAc/アセトン=7:1)
H NMR(600MHz、アセトン-d) δ 10.08(s,1H)、8.30(d,J=7.5Hz,1H)、8.16-8.12(m,2H)、7.66-7.62(m,1H)、7.58(d,J=1.3Hz,1H)、7.57-7.52(m,2H)、7.49-7.45(m,2H)、7.41-7.30(m,7H)、7.26-7.21(m,1H)、6.89(dd,J=8.9、1.7Hz,3H)、6.37(dd,J=8.1、6.1Hz,1H)、6.22(t,J=6.3Hz,1H)、5.35(ddt,J=8.4、5.6、2.7Hz,1H)、4.57(dt,J=6.2、4.1Hz,1H)、4.38-4.25(m,3H)、4.18(q,J=4.2Hz,1H)、3.77(s,6H)、3.43(qd,J=10.6、3.4Hz,2H)、2.65-2.54(m,2H)、2.48(ddd,J=13.5、6.3、4.2Hz,1H)、2.29(dt,J=13.6、6.3Hz,1H)、1.55(d,J=17.7Hz,3H)、1.43(d,J=1.2Hz,3H)、0.92(s,9H)、0.13(d,J=1.5Hz,6H)
13C NMR(151MHz、アセトン-d) δ 164.17、163.70、159.78、159.76、151.28、145.70、145.42、136.44、136.32、136.21、133.57、131.03、131.00、129.42、129.17、129.03、128.77、127.81、114.05、111.29、88.05、87.71、86.86、86.82、85.39、85.35、85.06、77.07、77.04、72.72、65.43、65.39、64.24、55.55、42.01、39.61、39.58、26.14、18.51、12.18、12.14、11.23、-4.51、-4.66
31P NMR(162MHz、アセトン-d) δ 32.91
HRMS(ESI-TOF):C546413PSiとして、計算値 [M+H]:1050.4086、測定値:1050.4081
20. 化合物(R)-57
Figure 2023510921000197
(R)-42と、SI-32とを用い、0.03ミリモルのスケールで一般的操作Iに従って処理された。pTLC(EtOAc/アセトン=9:2)に付して精製し、22.1mg(63%、>20:1 d.r.)の表記化合物(R)-57を得た。
物理的状態:白色非晶質固体
=0.29(EtOAc/アセトン=5:1)
H NMR(600MHz、アセトン-d) δ 11.96(s,1H)、10.82(s,1H)、10.01(s,1H)、8.67(s,1H)、8.55(s,1H)、8.12(d,J=7.6Hz,2H)、7.90(s,1H)、7.63(t,J=7.4Hz,1H)、7.53(t,J=7.8Hz,2H)、7.38-7.33(m,2H)、7.26-7.19(m,6H)、7.18-7.13(m,1H)、6.81-6.76(m,4H)、6.57(t,J=6.5Hz,1H)、6.17(t,J=6.3Hz,1H)、5.56(dq,J=9.1、5.1Hz,1H)、4.95(dt,J=6.2、4.5Hz,1H)、4.38(ddd,J=11.0、7.0、3.9Hz,1H)、4.31(dt,J=11.2、6.2Hz,1H)、4.15(dq,J=16.6、4.1Hz,2H)、3.74(d,J=0.9Hz,6H)、3.29(d,J=4.3Hz,2H)、3.16(dt,J=12.9、6.2Hz,1H)、2.93-2.89(m,1H)、2.83-2.79(m,1H)、2.59-2.50(m,2H)、1.43(d,J=17.7Hz,3H)、1.14(dd,J=8.5、6.8Hz,6H)、0.93(s,9H)、0.16(d,J=2.5Hz,6H)
13C NMR(151MHz、アセトン-d) δ 180.76、166.10、159.57、159.56、156.00、152.71、151.02、148.97、145.81、144.13、138.61、136.65、136.55、134.69、133.36、130.97、130.92、130.85、129.43、129.21、128.97、128.54、128.52、127.56、125.99、122.25、113.84、87.06、86.62、86.58、85.48、84.93、84.89、84.33、75.86、75.82、73.04、65.84、65.79、63.63、55.48、40.15、38.51、36.57、26.15、19.39、19.17、18.53、12.07、11.11、-4.49、-4.64
31P NMR(162MHz、アセトン-d) δ 33.13
HRMS(ESI-TOF):C59691012PSiとして、計算値 [M+H]:1169.4682、測定値:1169.4670
21. 化合物(R)-55
Figure 2023510921000198
(R)-43と、SI-34とを用い、0.03ミリモルのスケールで一般的操作Iに従って処理された。pTLC(EtOAc中10%MeOH)に付して精製し、16.1mg(48%、>20:1 d.r.)の表記化合物(R)-55を得た。
物理的状態:白色非晶質固体
=0.30(EtOAc中10%MeOH)
H NMR(600MHz、アセトン-d) δ 12.02(s,1H)、10.86(s,1H)、8.20-8.16(m,2H)、8.14(d,J=7.6Hz,1H)、7.93(s,1H)、7.69-7.63(m,1H)、7.56(t,J=7.8Hz,2H)、7.46-7.41(m,2H)、7.35-7.28(m,5H)、7.22(ddt,J=7.8、6.8、1.3Hz,1H)、6.94-6.87(m,4H)、6.33(dd,J=8.5、6.0Hz,1H)、6.15(t,J=6.3Hz,1H)、5.25-5.18(m,1H)、4.79-4.72(m,2H)、4.36-4.29(m,1H)、4.29-4.18(m,3H)、3.79(d,J=3.0Hz,6H)、3.41(m,2H)、3.00(ddd,J=13.6、8.6、5.4Hz,1H)、2.80-2.74(m,3H)、2.44(dt,J=13.8、6.3Hz,1H)、2.34(ddd,J=13.4、6.1、2.0Hz,1H)、1.62(d,J=17.7Hz,3H)、1.49-1.36(m,1H)、1.18(d,J=6.9Hz,3H)、1.08(d,J=6.8Hz,3H)、0.97-0.86(m,9H)、0.18(d,J=6.5Hz,6H)
13C NMR(151MHz、アセトン-d) δ 181.04、168.14、159.91、159.88、156.08、149.03、148.95、145.62、139.61、136.55、136.33、133.74、133.61、132.17、131.17、131.04、129.90、129.78、129.62、129.18、129.14、128.90、127.90、126.26、123.35、114.21、88.08、87.91、87.20、87.15、87.08、86.05、86.01、76.62、74.18、68.46、65.91、65.87、63.73、55.68、40.98、40.07、39.81、36.46、32.76、31.32、27.91、26.32、24.64、23.78、19.60、19.35、18.73、14.46、11.96、11.45、11.01、-4.40、-4.51
31P NMR(162MHz、アセトン-d) δ 33.24
HRMS(ESI-TOF):C586913PSiとして、計算値 [M+H]:1145.4569、測定値:1145.4553
22. 化合物(R)-44
Figure 2023510921000199
(R)-40と、SI-31とを用い、1.5ミリモルのスケールで一般的操作Iに従って処理された。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM/MeOH=95:5)に付して精製し、1.1g(75%、>20:1 d.r.)の表記化合物(R)-44を得た。
物理的状態:白色非晶質固体
=0.38(EtOAc/DCM:アセトン=5:5:2)
H NMR(600MHz、アセトン-d) δ 10.02(s,1H)、9.96(s,1H)、7.63(q,J=1.2Hz,1H)、7.58(q,J=1.2Hz,1H)、7.52-7.47(m,2H)、7.40-7.32(m,6H)、7.30-7.24(m,1H)、6.95-6.90(m,4H)、6.39(dd,J=8.3、5.9Hz,1H)、6.30(dd,J=7.6、6.1Hz,1H)、5.33(ddt,J=8.2、5.4、2.6Hz,1H)、4.60(dt,J=6.2、3.2Hz,1H)、4.33-4.27(m,3H)、4.24(ddd,J=11.4、6.7、4.7Hz,1H)、4.11-4.05(m,1H)、3.81(s,6H)、3.47-3.43(m,2H)、2.65-2.53(m,2H)、2.33(ddd,J=13.6、7.6、6.1Hz,1H)、2.25(ddd,J=13.4、6.2、3.3Hz,1H)、1.83(d,J=1.2Hz,3H)、1.55(d,J=17.6Hz,3H)、1.45(d,J=1.2Hz,3H)、0.93(s,9H)、0.15(d,J=1.5Hz,6H)
13C NMR(151MHz、アセトン-d) δ 164.32、164.20、159.95、159.93、151.39、151.35、145.80、136.70、136.59、136.43、136.25、131.16、129.18、128.92、127.97、114.20、111.44、111.23、87.88、86.37、86.33、85.95、85.55、85.51、85.15、77.24、77.20、73.26、65.71、65.67、64.40、55.68、40.83、39.65、39.63、26.26、18.64、12.61、12.24、11.29、-4.41、-4.52
31P NMR(162MHz、アセトン-d) δ 32.53
HRMS(ESI-TOF):C486113PSiとして、計算値 [M+Na]:983.3640、測定値:983.3632
実施例7
MPO二量体のΨ活性化
1. TBSの脱保護に供するSI-35の獲得
Figure 2023510921000200
ジヌクレオチド(S)-44(290mg、0.3ミリモル、1.0当量)およびTBAF(THF中1.0M、0.75mL、0.75ミリモル、2.5当量)のTHF(5mL)中混合物を室温で12時間撹拌し、その後で該混合物を減圧下で濃縮乾固させ、トルエン(2x3mL)と共に蒸発させた。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM/MeOH=9:1)に付して精製し、223mg(75%、>20:1 d.r.)の表記化合物SI-35を得た。
物理的状態:白色非晶質固体
=0.43(DCM/MeOH=85:15)
H NMR(600MHz、アセトン-d) δ 10.05(d,J=15.0Hz,1H)、9.98(d,J=14.4Hz,1H)、7.57(dq,J=13.1、1.2Hz,2H)、7.51-7.46(m,2H)、7.39-7.33(m,4H)、7.33-7.31(m,2H)、7.28-7.23(m,1H)、6.94-6.88(m,4H)、6.36(t,J=7.1Hz,1H)、6.31(dd,J=7.7、6.2Hz,1H)、5.32(dtt,J=10.4、4.2、2.0Hz,1H)、4.59(s,1H)、4.44-4.40(m,1H)、4.27(q,J=3.2Hz,1H)、4.26-4.18(m,1H)、4.08(ddd,J=11.1、7.3、3.3Hz,1H)、4.01(dt,J=6.2、3.3Hz,1H)、3.79(s,6H)、3.46(dd,J=10.6、3.5Hz,1H)、3.42(dd,J=10.6、3.3Hz,1H)、2、2.60-2.55(m,2H)、2.25(ddd,J=13.6、6.2、3.4Hz,1H)、2.19(dddd,J=13.9、7.6、6.2、1.2Hz,1H)、1.82(d,J=1.2Hz,3H)、1.58(d,J=17.7Hz,3H)、1.46(d,J=1.2Hz,3H)
13C NMR(151MHz、アセトン-d) δ 164.34、164.26、164.19、159.92、159.90、151.39、151.32、145.87、136.61、136.55、136.49、136.32、131.18、131.15、129.17、128.91、127.95、114.19、111.40、111.22、87.84、86.18、86.14、85.68、85.57、85.53、85.23、76.91、76.87、71.89、71.78、66.26、66.22、64.33、55.68、40.52、40.47、39.67、39.64、12.66、12.25、12.19、11.24
31P NMR(162MHz、アセトン-d) δ 33.29
HRMS(ESI-TOF):C424713Pとして、計算値 [M+Na]:869.2775、測定値:869.2766
2. (+)-CLO-Ψのローディングによる60の獲得
Figure 2023510921000201
SI-35(170mg、0.2ミリモル、1.0当量)および(+)-CLO-Ψ(120mg、0.26ミリモル、1.3当量)を、フレーム乾燥させた丸底フラスコにて、無水アセトニトリル(2mL、0.1M)に溶かした。DBU(39μL、0.26ミリモル、1.3当量)を該反応混合物に撹拌しながら滴下して加えた。30分後、該反応混合物を1xPBS溶液(10mL)を添加してクエンチさせ、DCM(10mLx3)で抽出した。有機層を合わせ、水(10mLx2)およびブライン(10mL)で洗浄し、MgSO上で乾燥させ、濾過して濃縮した。残りの粗生成物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM:MeOH=98:2)に付して精製し、168mg(77%、>20:1 d.r.)の表記化合物60を得た。
物理的状態:淡黄色非晶質固体
=0.48(DCM:MeOH=95:5)
H NMR(600MHz、アセトン-d) δ 7.60(t,J=1.2Hz,1H)、7.55(q,J=1.3Hz,1H)、7.54-7.48(m,2H)、7.41-7.33(m,4H)、7.31-7.22(m,2H)、7.21-7.12(m,1H)、6.96-6.90(m,4H)、6.39(t,J=7.1Hz,1H)、6.29(dd,J=7.9、6.4Hz,1H)、5.34(dddt,J=19.3、11.2、5.6、2.7Hz,2H)、5.02(t,J=1.5Hz,1H)、4.98-4.94(m,1H)、4.54(dt,J=12.8、3.3Hz,1H)、4.36-4.27(m,3H)、4.18(ddd,J=9.7、7.1、2.6Hz,1H)、4.02-3.97(m,1H)、3.81(s,6H)、3.52-3.42(m,2H)、3.29-3.23(m,1H)、2.67(s,1H)、2.60(dd,J=7.2、4.3Hz,2H)、2.51-2.44(m,1H)、2.39-2.34(m,1H)、2.16-2.09(m,1H)、2.03-1.86(m,3H)、1.84(d,J=1.2Hz,3H)、1.82-1.79(m,3H)、1.71(s,3H)、1.63(d,J=17.7Hz,3H)、1.47(d,J=1.2Hz,3H)
13C NMR(151MHz、アセトン-d) δ 164.16、159.91、159.89、151.31、151.26、146.54、145.83、138.60、136.58、136.56、136.45、136.26、131.16、131.14、129.86、129.18、129.14、128.92、127.96、126.22、114.20、112.24、111.52、111.40、87.87、87.18、86.01、85.57、85.54、85.16、84.33、84.30、84.26、79.38、79.33、77.13、77.09、67.11、65.53、65.49、64.41、64.38、59.48、55.70、54.92、49.38、46.32、44.03、39.89、39.72、39.69、38.45、38.41、34.62、34.56、32.77、28.36、28.26、27.36、27.32、24.71、24.52、24.06、22.92、22.15、21.51、20.48、20.23、13.94、12.64、12.28、12.22、11.33
31P NMR(162MHz、アセトン-d) δ 101.46、33.22
HRMS(ESI-TOF):C526214Naとして、計算値 [M+Na]:1115.3077、測定値:1115.3088
実施例8
P-キラルホスフィン:順序を逆にしたローディングとカップリングの実験
Figure 2023510921000202
一般的操作Cに従って、化合物11bを、17aから0.05ミリモルのスケールで収率35%および>98:2 e.r.で製造した。すべての物理的および分光学的データは8bより合成された11bと一致する。立体化学の結果の決定は、反応生成物および8bから由来の11bの標体サンプルをキラルHPLC分析(キラルパックAD-H、イソプロパノール/ヘキサン=15:85、0.8mL/分、280nm)に付すことで行われた。
実施例9
MPO:順序を逆にしたローディングとカップリングの実験
1. ローディング
Figure 2023510921000203
アルゴン下にてフレーム乾燥させた50mLの丸底フラスコに、ヌクレオシド(1.0ミリモル、1.0当量)、12a(524.6mg、2.0ミリモル、2.0当量)、およびTHF(10mL)を充填した。DBU(3.0ミリモル、3.0当量)を滴下して加え、得られた溶液を室温で12時間撹拌した。次に該反応物を20mLの1xPBS溶液でクエンチさせ、DCM(3x30mL)で抽出した。有機層を合わせ、NaHCO飽和水溶液(10mL)、ブライン(10mL)で洗浄し、NaSO上で乾燥させ、濾過して濃縮した。残渣をTHF(5mL)に再び溶かした。EtN(2当量)およびMeI(2当量)を加え、不均一な混合物を1時間激しく撹拌した。反応物を10mLの水でクエンチさせ、EtOAc(3x20mL)で抽出した。有機層を合わせ、NaSO上で乾燥させ、濾過して濃縮した。残渣をシリカゲルクロマトグラフィーに付して精製し、所望の生成物SI-36を得た。
物理的状態:白色非晶質固体
=0.3(EtOAc)
H NMR(600MHz、アセトン-d) δ 10.00(s,1H)、7.54(q,J=1.3Hz,1H)、6.39-6.31(m,1H)、4.66(dt,J=6.4、3.3Hz,1H)、4.36-4.17(m,2H)、4.15-4.07(m,1H)、2.40-2.22(m,5H)、1.90-1.79(m,6H)、0.94(s,9H)、0.17(d,J=3.3Hz,6H)
13C NMR(151MHz、アセトン-d) δ 164.29、164.21、151.37、136.64、136.55、132.16、129.77、111.18、86.37、86.32、85.89、85.72、73.66、73.35、68.45、65.08、64.85、64.81、40.86、40.73、39.80、31.31、27.29、26.26、24.64、23.77、18.83、18.63、18.11、14.46、12.68、12.58、12.29、12.27、11.45、-4.43、-4.45、-4.55
2. ヌクレオシド3’-OHのカップリング:
Figure 2023510921000204
一般的操作Iに従って、5’-DMTr-dT-3’-OHをSI-36とのカップリング反応に付し、所望するdT-dT二量体の生成物を得た。その31P NMR δ 32.57は、報告された(R)dT-dTの31Pシフトに相当する(上記参照)。かくして、反応生成物のリンでの立体化学はRであると同定された。

Claims (43)

  1. 式(I):
    Figure 2023510921000205
    [式中:
    は、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、C2-6アルキニル、C3-10シクロアルキル、C6-10アリール、またはC結合のヘテロアリールであり、ここでRは、所望により、1または複数の同じまたは異なるR基で置換されてもよく;
    は、重水素、CD、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、C2-6アルキニル、ハロゲン、CF、C1-6アルコキシ、C3-10シクロアルキル、C6-10アリール、またはC結合のヘテロアリールであり;
    は、水素、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、またはC2-6アルキニルであり;
    は、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、またはC2-6アルキニルであり;
    は、水素と置き換わる置換基であって、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、C2-6アルキニル、C3-10シクロアルキル、またはC6-10アリールのうちの一つであり;および
    nは0、1、2、3、4、5、6、7、または8である]
    で示される化合物またはその塩。
  2. 式(Ia):
    Figure 2023510921000206
    で示される、請求項1に記載の化合物、その塩、そのエナンチオマー、またはその組み合わせ。

  3. Figure 2023510921000207
    からなる群より選択され、ここで
    Figure 2023510921000208
    が、式(I)のRとリンとの間の結合である、請求項1に記載の化合物。
  4. が-CHである、請求項3に記載の化合物。
  5. がフェニルである、請求項3に記載の化合物。
  6. チオホスフィン酸を製造する方法であって、
    カルバニオン試薬を、式(Ia):
    Figure 2023510921000209
    [式中:
    は、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、C2-6アルキニル、C3-10シクロアルキル、C6-10アリール、またはC結合のヘテロアリールであり、ここでRは、所望により、1または複数の同じまたは異なるR基で置換されてもよく;
    は、重水素、CD、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、C2-6アルキニル、ハロゲン、CF、C1-6アルコキシ、C3-10シクロアルキル、C6-10アリール、またはC結合のヘテロアリールである]
    で示される化合物、その塩、そのエナンチオマー、またはその組み合わせと反応させ、チオホスフィン酸を形成することを含む、方法。
  7. チオホスフィン酸が、式(II):
    Figure 2023510921000210
    [式中:
    およびRの各々は、独立して、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、C2-6アルキニル、C3-10シクロアルキル、C6-10アリール、またはC結合のヘテロアリールであり、ここでRおよびRの各々は1または複数の同じまたは異なるR基で置換されてもよく;
    が、重水素、CD、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、C2-6アルキニル、ハロゲン、CF、C1-6アルコキシ、C3-10シクロアルキル、C6-10アリール、またはC結合のヘテロアリールである]
    で示される化合物である、請求項6に記載の方法。
  8. カルバニオン試薬が有機リチウム試薬のRLiであり、ここでRが請求項7にて定義されるとおりである、請求項7に記載の方法。
  9. チオホスフィン酸が、式(IIa):
    Figure 2023510921000211
    [式中:RおよびRは請求項1に記載されるとおりである]
    で示される化合物またはそのエナンチオマーである、請求項7に記載の方法。
  10. チオホスフィン酸をアルキル化試薬と反応させ、チオホスフィン酸エステルを形成することをさらに含む、請求項6に記載の方法。
  11. チオホスフィン酸エステルが、式(III):
    Figure 2023510921000212
    [式中:
    およびRの各々は、独立して、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、C2-6アルキニル、C3-10シクロアルキル、C6-10アリール、またはC結合のヘテロアリールであり;
    ここで、RおよびRの各々は、1または複数の同じまたは異なるR基で置換されてもよく;
    は、重水素、CD、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、C2-6アルキニル、ハロゲン、CF、C1-6アルコキシ、C3-10シクロアルキル、C6-10アリール、またはC結合のヘテロアリールであり;および
    R’はC1-6アルキル、C2-6アルケニル、またはC2-6アルキニルである]
    で示される化合物である、請求項10に記載の方法。
  12. チオホスフィン酸エステルが、式(IIIa):
    Figure 2023510921000213
    で示される化合物またはそのエナンチオマーである、請求項11に記載の方法。
  13. チオホスフィン酸エステルが、
    Figure 2023510921000214
    からなる群より選択される、請求項12に記載の方法。
  14. チオホスフィン酸エステルをアルコキシド剤と反応させ、有機ホスフィネートを形成することをさらに含む、請求項10に記載の方法。
  15. 有機ホスフィネートが、式(IV):
    Figure 2023510921000215
    [式中:
    およびRは、各々独立して、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、C2-6アルキニル、C3-10シクロアルキル、C6-10アリール、またはC結合のヘテロアリールであり;
    ここで、RおよびRの各々は、1または複数の同じまたは異なるR基で置換されてもよく;
    は、重水素、CD、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、C2-6アルキニル、ハロゲン、CF、C1-6アルコキシ、C3-10シクロアルキル、C6-10アリール、またはC結合のヘテロアリールであり;および
    R’は、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、またはC2-6アルキニルである]
    で示される化合物である、請求項14に記載の方法。
  16. 有機ホスフィネートが、式(IVa):
    Figure 2023510921000216
    で示される化合物、またはそのエナンチオマーである、請求項15に記載の方法。
  17. 有機ホスフィネートが、
    Figure 2023510921000217
    からなる群より選択される、請求項16に記載の方法。
  18. 有機ホスフィネートをカルバニオン試薬と反応させ、ホスフィンオキシドを形成することをさらに含む、請求項14に記載の方法。
  19. ホスフィンオキシドが、式(V):
    Figure 2023510921000218
    [式中:
    、R、およびRは、各々独立して、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、C2-6アルキニル、C3-10シクロアルキル、C6-10アリール、またはC結合のヘテロアリールであり;
    ここで、R、R、およびRの各々は、1または複数の同じまたは異なるR基で置換されてもよく;
    は、重水素、CD、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、C2-6アルキニル、ハロゲン、CF、C1-6アルコキシ、C3-10シクロアルキル、C6-10アリール、またはC結合のヘテロアリールである]
    で示される化合物である、請求項18に記載の方法。
  20. ホスフィンオキシドが、式(Va):
    Figure 2023510921000219
    で示される化合物、またはそのエナンチオマーである、請求項19に記載の方法。
  21. カルバニオン試薬がグリニャール試薬である、請求項18に記載の方法。
  22. ホスフィンオキシドが、
    Figure 2023510921000220
    からなる群より選択される、請求項20に記載の方法。
  23. ホスフィンオキシドを還元剤と反応させ、ホスフィンを形成することをさらに含む、請求項18に記載の方法。
  24. ホスフィンが、式(VI):
    Figure 2023510921000221
    [式中:
    、R、およびRは、独立して、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、C2-6アルキニル、C3-10シクロアルキル、C6-10アリール、またはC結合のヘテロアリールであり;
    ここで、R、R、およびRの各々は、1または複数の同じまたは異なるR基で置換されてもよく;および
    は、重水素、CD、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、C2-6アルキニル、ハロゲン、CF、C1-6アルコキシ、C3-10シクロアルキル、C6-10アリール、またはC結合のヘテロアリールである]
    で示される化合物である、請求項23に記載の方法。
  25. ホスフィンが、式(VIa):
    Figure 2023510921000222
    で示される化合物、またはそのエナンチオマーである、請求項23に記載の方法。
  26. ヌクレオシドをロードした有機リン化合物を製造する方法であって、式(Ia)の化合物またはそのエナンチオマーを、ヌクレオシドと反応させることを含む、方法。
  27. ヌクレオシドをロードした有機リン化合物が、式(VII)または(VIIa):
    Figure 2023510921000223
    [式中:
    は、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、またはC2-6アルキニルであり;
    R’は、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、またはC2-6アルキニルであり;
    Nuはヌクレオシドであり、
    ここで、Nuは、相互に独立して、1または複数の同じまたは異なる修飾、あるいは1または複数の同じまたは異なる保護基を含んでもよい]
    で示される化合物またはそのジアステレオマーである、請求項26に記載の方法。
  28. およびR’の各々が-CHである、請求項27に記載の方法。
  29. Nuが、
    Figure 2023510921000224
    からなる群より選択され、ここで
    Tが
    Figure 2023510921000225
    であり;
    Bz
    Figure 2023510921000226
    であり;
    iBu
    Figure 2023510921000227
    であり;および
    Bz
    Figure 2023510921000228
    である、請求項26に記載の方法。
  30. ヌクレオシドをロードした有機リン化合物を、第2のヌクレオシドと反応させ、ジヌクレオチドを形成することをさらに含む、請求項26に記載の方法。
  31. ジヌクレオチドが、式(VIII)または(VIIIa):
    Figure 2023510921000229
    [式中:
    は、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、またはC2-6アルキニルであり;
    NuおよびNuの各々はヌクレオシドであり;
    ここで、NuおよびNuのいずれか一方または両方は、相互に独立して、1または複数の同じまたは異なる修飾、あるいは1または複数の同じまたは異なる保護基を含んでもよい]
    で示される化合物である、請求項30に記載の方法。
  32. が-CHであり;
    NuおよびNuが、各々独立して、
    Figure 2023510921000230
    からなる群より選択され、ここで
    Tが
    Figure 2023510921000231
    であり;
    Bz
    Figure 2023510921000232
    であり;
    iBu
    Figure 2023510921000233
    であり;および
    Bz
    Figure 2023510921000234
    である、請求項31に記載の方法。
  33. a)ジヌクレオチドを、式(Ia)の化合物と反応させ、ロードしたジヌクレオチドを形成し;
    b)工程(a)にて形成されたロードしたジヌクレオチドを、第3のヌクレオシドと反応させ、トリヌクレオチドを形成し;
    c)工程(a)および(b)を1または複数回繰り返し、所望の数のヌクレオチドを有するオリゴヌクレオチドを形成すること
    をさらに含む、請求項30に記載の方法。
  34. ジヌクレオチドが、式(VIII)または(VIIIa):
    Figure 2023510921000235
    [式中:
    は、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、またはC2-6アルキニルであり;
    NuおよびNuの各々はヌクレオシドであり;
    ここで、NuおよびNuのいずれか一方または両方は、相互に独立して、1または複数の同じまたは異なる修飾、あるいは1または複数の同じまたは異なる保護基を含んでもよい]
    で示される、化合物またはそのエナンチオマーである、請求項33に記載の方法。
  35. a)ジヌクレオチドを、式C:
    Figure 2023510921000236
    で示される化合物、またはそのエナンチオマーと反応させ、ロードしたキメラジヌクレオチドを形成し;および
    b)工程(a)にて形成されたそのロードしたキメラジヌクレオチドを、第3のヌクレオシドと反応させ、ホスホネート連結およびホスホロチオエート連結を担持するキメラトリヌクレオチドを形成すること
    をさらに含む、請求項30に記載の方法。
  36. 式(IIIa):
    Figure 2023510921000237
    [式中:
    およびRの各々は、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、C2-6アルキニル、C3-10シクロアルキル、C6-10アリール、またはC結合のヘテロアリールであり;
    ここで、RおよびRの各々は、1または複数の同じまたは異なるR基で置換されてもよく;
    は、重水素、CD、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、C2-6アルキニル、ハロゲン、CF、C1-6アルコキシ、C3-10シクロアルキル、C6-10アリール、またはC結合のヘテロアリールである]
    で示される化合物またはそのエナンチオマー。
  37. Figure 2023510921000238
    からなる群より選択される、請求項36に記載の化合物。
  38. 式(IVa):
    Figure 2023510921000239
    [式中:
    およびRの各々は、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、C2-6アルキニル、C3-10シクロアルキル、C6-10アリール、またはC結合のヘテロアリールであり;
    ここで、RおよびRの各々は、1または複数の同じまたは異なるR基で置換されてもよく;
    は、重水素、CD、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、C2-6アルキニル、ハロゲン、CF、C1-6アルコキシ、C3-10シクロアルキル、C6-10アリール、またはC結合のヘテロアリールである]
    で示される化合物またはそのエナンチオマー。
  39. Figure 2023510921000240
    からなる群より選択される、請求項38に記載の化合物。
  40. 式(VII):
    Figure 2023510921000241
    [式中:
    は、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、またはC2-6アルキニルであり;
    R’は、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、またはC2-6アルキニルであり;および
    Nuはヌクレオシドである]
    で示される化合物、またはそのエナンチオマー。
  41. Nu
    Figure 2023510921000242
    からなる群より選択され、ここで
    Tが
    Figure 2023510921000243
    であり;
    Bz
    Figure 2023510921000244
    であり;
    iBu
    Figure 2023510921000245
    であり;
    Bz
    Figure 2023510921000246
    である、請求項40に記載の化合物。
  42. 式(Ia):
    Figure 2023510921000247
    [式中:
    は、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、C2-6アルキニル、C3-10シクロアルキル、C6-10アリール、またはC結合のヘテロアリールであり;
    ここで、Rは1または複数の同じまたは異なるR基で置換されてもよく;
    は、重水素、CD、C1-6アルキル、C2-6アルケニル、C2-6アルキニル、ハロゲン、CF、C1-6アルコキシ、C3-10シクロアルキル、C6-10アリール、またはC結合のヘテロアリールである]
    で示される化合物、またはそのエナンチオマーを製造する方法であって、
    カルバニオン試薬を、式A:
    Figure 2023510921000248
    で示される化合物、またはそのエナンチオマーと反応させ、式(Ia)の化合物を形成することを含む、方法。
  43. カルバニオン試薬がグリニャール試薬である、請求項42に記載の方法。
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