JP2023509966A - 腫瘍溶解性ウイルス様小胞の組成物および使用方法 - Google Patents
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Abstract
Description
本願は、米国特許法第119条(e)項の下、2020年1月10日付で出願された米国特許仮出願第62/959,435号に基づく利益を主張し、その内容は参照によりその全文が本明細書に組み込まれる。
配列表
本発明は、ウイルス様小胞(VLV)を産生する高力価ハイブリッドウイルスベクター、ならびに悪性腫瘍または感染性疾患を標的にするための組成物およびその方法に関する。VLVは、インビトロで進化したセムリキ森林熱ウイルス(SFV)RNA依存性RNAレプリカーゼと、水疱性口内炎ウイルス(VSV)糖タンパク質をコードする、プラス鎖キャップポリアデニル化RNAを有する、キャプシドを含まない自己複製人工ウイルスプラットフォームである。本発明のVLVおよびその医薬組成物は、悪性腫瘍および感染性疾患の処置、予防および防止のための方法において有用なポリヌクレオチドおよび/またはポリペプチド治療薬をコードする。
腫瘍溶解性ウイルスは、癌細胞を標的として癌細胞で特異的に複製し、癌細胞の溶解および/または死滅をもたらすことができる。これらのウイルスは、ウイルスを癌細胞に向けたり、T細胞の浸潤または活性を活性化する可能性を高めたり、腫瘍溶解を促進する他の複数の活性を注入したりする導入遺伝子を発現することができる。
-中和抗体免疫がすでに存在する;
-自然免疫経路(補体、インターフェロン経路)を介するクリアランスが迅速である;
-導入遺伝子の発現によりウイルスの複製能力が低下する;
-導入遺伝子発現によりウイルスの免疫クリアランスが促進される;
-腫瘍に十分な自然免疫応答を誘導できない;
-1または複数の導入遺伝子を追加する能力に制限がある;
-病原性が高いままである;
-大規模な製造が困難である。
一部の実施形態では、本発明は、以下の動作可能に連結された配列要素:
a)DNAプロモーター配列を含む第1のDNA配列、
b)アルファウイルス非構造タンパク質ポリヌクレオチド配列をコードする第2のDNA配列、
c)アルファウイルスサブゲノムRNAプロモーターをコードする第3のDNA配列、
d)サイトカインアゴニストポリペプチドをコードする配列ドメイン、サイトカインアンタゴニストポリペプチドをコードする配列ドメイン、ショートヘアピンRNA(shRNA)をコードする配列ドメイン、およびそれらの組合せからなる群からそれぞれ独立して選択される少なくとも1つの配列ドメインを含む第4のDNA配列、
e)ベシクロウイルス糖タンパク質をコードする第5のDNA配列、を含む悪性腫瘍または感染性疾患の処置、予防、または防止のための高力価ハイブリッドウイルスベクターに関する。
a)IL-12をコードする配列ドメイン、
b)IL-17RA-DNをコードする配列ドメイン;および
c)PD-L1-shRNAをコードする配列ドメイン、を含む悪性腫瘍または感染性疾患の処置、予防、または防止のための高力価ハイブリッドウイルスベクターに関する。
a)配列番号6と少なくとも70%の配列同一性を有する配列ドメイン、
b)配列番号8と少なくとも70%の配列同一性を有する配列ドメイン;および
c)配列番号10と少なくとも70%の配列同一性を有する配列ドメイン、を含む悪性腫瘍または感染性疾患の処置、予防、または防止のための高力価ハイブリッドウイルスベクターに関する。
a)サブゲノムプロモーター配列と、IL-12をコードする配列ドメイン、
b)サブゲノムプロモーター配列と、IL-17RA-DNをコードする配列ドメイン;および
c)サブゲノムプロモーター配列と、PD-L1-shRNAをコードする配列ドメイン、からなる悪性腫瘍または感染性疾患の処置、予防、または防止のための高力価ハイブリッドウイルスベクターに関する。
a)サブゲノムプロモーター配列と、配列番号6と少なくとも70%の配列同一性を有する配列ドメイン、
b)サブゲノムプロモーター配列と、配列番号8と少なくとも70%の配列同一性を有する配列ドメイン;および
c)サブゲノムプロモーター配列と、配列番号10と少なくとも70%の配列同一性を有する配列ドメイン、からなる悪性腫瘍または感染性疾患の処置、予防、または防止のための高力価ハイブリッドウイルスベクターに関する。
a)DNAプロモーター配列を含む第1のDNA配列、
b)アルファウイルス非構造タンパク質ポリヌクレオチド配列をコードする第2のDNA配列、
c)アルファウイルスサブゲノムRNAプロモーターをコードする第3のDNA配列、
d)悪性腫瘍または感染性疾患の単一または複数の特異的抗原を発現する発現カセットを含む第4のDNA配列;および
e)ベシクロウイルス糖タンパク質をコードする第5のDNA配列、を含む腫瘍溶解性ウイルス様小胞(VLV)を生成するための高力価ハイブリッドウイルスベクターに関する。
a)DNAプロモーター配列を含む第1のDNA配列、
b)アルファウイルス非構造タンパク質ポリヌクレオチド配列をコードする第2のDNA配列、
c)アルファウイルスサブゲノムRNAプロモーターをコードする第3のDNA配列、
d)サイトカインアゴニストポリペプチドをコードする配列ドメイン、サイトカインアンタゴニストポリペプチドをコードする配列ドメイン、ショートヘアピンRNA(shRNA)をコードする配列ドメイン、およびそれらの組合せからなる群からそれぞれ独立して選択される少なくとも1つの配列ドメインを含む第4のDNA配列、
e)ベシクロウイルス糖タンパク質をコードする第5のDNA配列、を含む悪性腫瘍または感染性疾患の処置、予防、または防止のための高力価ハイブリッドウイルスベクターによって産生されるウイルス様小胞(VLV)を含む組成物に関する。
a)サイトカインアゴニストポリペプチドをコードする配列ドメイン、サイトカインアンタゴニストポリペプチドをコードする配列ドメイン、ショートヘアピンRNA(shRNA)をコードする配列ドメイン、およびそれらの組合せからなる群からそれぞれ独立して選択される少なくとも1つの配列ドメインを含む高力価ウイルスベクターを生成するステップ、
b)ステップ(a)の高力価ウイルスベクターでBHK-21細胞をトランスフェクトするステップ、
c)ステップ(b)のトランスフェクトされたBHK-21細胞を緩衝液中で適切な時間および適切な温度でインキュベートしてVLVを増殖させるステップ;および
d)限外濾過、遠心分離、タンジェンシャルフロー濾過、アフィニティー精製、イオン交換クロマトグラフィー、およびそれらの組合せからなる群から選択される技術によって、VLVをBHK-21細胞および緩衝液から単離するステップ;
ここで、ステップ(d)の単離は、高力価のVLVをもたらす。
a)DNAプロモーター配列を含む第1のDNA配列、
b)アルファウイルス非構造タンパク質ポリヌクレオチド配列をコードする第2のDNA配列、
c)アルファウイルスサブゲノムRNAプロモーターをコードする第3のDNA配列、
d)サイトカインアゴニストポリペプチドをコードする配列ドメイン、サイトカインアンタゴニストポリペプチドをコードする配列ドメイン、ショートヘアピンRNA(shRNA)をコードする配列ドメイン、およびそれらの組合せからなる群からそれぞれ独立して選択される少なくとも1つの配列ドメインを含む第4のDNA配列、を含む悪性腫瘍または感染性疾患の処置、予防、または防止のための高力価ハイブリッドウイルスベクターによって産生されたウイルス様小胞(VLV)を含む組成物である。
図面の簡単な説明
本発明は、ウイルス様小胞(VLV)は、サイトカインアゴニスト、サイトカインアンタゴニスト、ショートヘアピンRNA、および他のポリヌクレオチドまたはポリペプチドをコードする1つまたは複数の配列で武装することができ、その各々が、癌、悪性腫瘍または感染性疾患の処置、予防、および防止に有用であるという予期せぬ発見に関する。本発明のVLVは、これをコードする高力価ハイブリッドウイルスベクターから産生される。ウイルス様小胞(VLV)は、アルファウイルス非構造タンパク質およびベシクロウイルス糖タンパク質をコードするプラス鎖キャップポリアデニル化RNAを有する、キャプシドを含まない自己複製人工ウイルスプラットフォームである。
定義
説明
組成物
ベクターにコードされる要素
表1.配列番号の説明
表2.SFV非構造タンパク質に対する変異。
発明の方法
医薬組成物および製剤
投与/投薬
投与経路
キット
次に、以下の実施例を参照して本発明を説明する。これらの実施例は、例示のみを目的として提供されており、本発明は決してこれらの実施例に限定されると解釈されるべきではない。むしろ、本明細書に提供される教示の結果として明らかになるあらゆる変形を包含すると解釈されるべきである。
材料および方法
実施例1:IL-12サイトカインを発現するVLV
実施例2:分泌されたIL-12の定量化
表3.分泌されたIL-12の紫外可視分光法による定量化のための較正曲線。
実施例3:マウスにおけるVLV-IL-12投与は腫瘍体積を制限する
実施例4:IL-17RA-DNを発現するVLV
実施例5:PD-L1 shRNAチェックポイント阻害剤を発現するVLV
実施例6:三価のCARG2020 VLV
実施例7:マウスにおける三価のCARG2020 VLVの投与は腫瘍体積を制限する
実施例8:CARG2020はTh1免疫を活性化し、腫瘍におけるPD-L1およびIL-17関連シグナル伝達をダウンレギュレートする。
実施例9:VLVは腫瘍溶解性である
実施例10:結腸癌細胞、卵巣癌細胞および急性リンパ芽球性白血病細胞における腫瘍溶解性の同定
実施例11:腫瘍溶解経路分析
参照による組み込み
等価物
Claims (44)
- 以下の動作可能に連結された配列要素:
a)DNAプロモーター配列を含む第1のDNA配列、
b)アルファウイルス非構造タンパク質ポリヌクレオチド配列をコードする第2のDNA配列、
c)アルファウイルスサブゲノムRNAプロモーターをコードする第3のDNA配列、
d)サイトカインアゴニストポリペプチドをコードする配列ドメイン、サイトカインアンタゴニストポリペプチドをコードする配列ドメイン、ショートヘアピンRNA(shRNA)をコードする配列ドメイン、およびそれらの組合せからなる群からそれぞれ独立して選択される少なくとも1つの配列ドメインを含む、第4のDNA配列、
e)ベシクロウイルス糖タンパク質をコードする第5のDNA配列、を含む悪性腫瘍または感染性疾患の処置、予防、または防止のための高力価ハイブリッドウイルスベクター。 - 前記第1のDNA配列の前記DNAプロモーター配列が、RNA依存性RNAポリメラーゼの構成的プロモーターを含む、請求項1に記載の高力価ハイブリッドウイルスベクター。
- 前記DNAプロモーター配列が、バクテリオファージRNAポリメラーゼの構成的プロモーターを含む、請求項2に記載の高力価ハイブリッドウイルスベクター。
- 前記プロモーター配列が、サイトメガロウイルス(CMV)プロモーター配列である、請求項2に記載の高力価ハイブリッドウイルスベクター。
- 前記第2のDNA配列の前記アルファウイルス非構造タンパク質ポリヌクレオチド配列が、セムリキ森林熱ウイルス(SFV)非構造タンパク質ポリヌクレオチド配列である、請求項1に記載の高力価ハイブリッドウイルスベクター。
- 前記第2のDNA配列によってコードされる前記SFV非構造タンパク質ポリペプチド配列が、1またはそれを超えるアミノ酸変異を含む、請求項5に記載の高力価ハイブリッドウイルスベクター。
- 前記SFV非構造タンパク質ポリペプチド配列が、配列番号13に対して少なくとも約70%の配列同一性を有する配列を含む、請求項6に記載の高力価ハイブリッドウイルスベクター。
- 前記SFV非構造タンパク質ポリペプチド配列が、配列番号13を含む、請求項6に記載の高力価ハイブリッドウイルスベクター。
- 前記第2のDNA配列の前記アルファウイルス非構造タンパク質ポリヌクレオチド配列が、アルファウイルスRNA依存性ポリメラーゼを含む、請求項1に記載の高力価ハイブリッドウイルスベクター。
- 前記アルファウイルスRNA依存性ポリメラーゼが、セムリキ森林熱ウイルス(SFV)RNA依存性ポリメラーゼである、請求項9に記載の高力価ハイブリッドウイルスベクター。
- 前記第3のDNA配列の前記アルファウイルスサブゲノムRNAプロモーターが、セムリキ森林熱ウイルス(SFV)サブゲノムRNAプロモーターである、請求項1に記載の高力価ハイブリッドウイルスベクター。
- 前記第4のDNA配列が、IL-2、IL-7、IL-15、IL-18、IL-19、IL-35、IL-21、GM-CSF、IL-17、Flt3L、およびそれらの組合せからなる群からそれぞれ独立して選択されるサイトカインアゴニストまたはアンタゴニストポリペプチドをコードする少なくとも1つの配列ドメインを含む、請求項1に記載の高力価ハイブリッドウイルスベクター。
- 前記第4のDNA配列が、PD-L2、PD-L1、CTLA-4、LAG-3、TIM-3、TIGIT、CD90、BTLA、CD160、PD-1、およびそれらの組合せからなる群からそれぞれ独立して選択されるshRNAポリヌクレオチドチェックポイント阻害剤をコードする少なくとも1つの配列ドメインを含む、請求項1に記載の高力価ハイブリッドウイルスベクター。
- 前記第4のDNA配列が3つの配列ドメインを含む、請求項1に記載の高力価ハイブリッドウイルスベクター。
- 前記第4のDNA配列が、
a)IL-12をコードする配列ドメイン、
b)IL-17RA-DNをコードする配列ドメイン;および
c)PD-L1-shRNAをコードする配列ドメイン
を含む、請求項14に記載の高力価ハイブリッドウイルスベクター。 - 前記第4のDNA配列が、
a)配列番号6と少なくとも70%の配列同一性を有する配列ドメイン、
b)配列番号8と少なくとも70%の配列同一性を有する配列ドメイン;および
c)配列番号10と少なくとも70%の配列同一性を有する配列ドメイン
を含む、請求項14に記載の高力価ハイブリッドウイルスベクター。 - 前記第4のDNA配列の各配列ドメインの前に、サブゲノムプロモーター、2Aペプチド配列をコードする配列、またはそれらの組合せからなる群から独立して選択される配列がある、請求項16に記載の高力価ハイブリッドウイルスベクター。
- 前記高力価ハイブリッドウイルスベクターが三価であり、前記第4のDNA配列が3つの配列ドメインからなる、請求項1に記載の高力価ハイブリッドウイルスベクター。
- 前記第4のDNA配列が、
a)サブゲノムプロモーター配列と、IL-12をコードする配列ドメイン、
b)サブゲノムプロモーター配列と、IL-17RA-DNをコードする配列ドメイン;および
c)サブゲノムプロモーター配列と、PD-L1-shRNAをコードする配列ドメイン
からなる、請求項18に記載の高力価ハイブリッドウイルスベクター。 - 前記第4のDNA配列が、
a)サブゲノムプロモーター配列と、配列番号6と少なくとも70%の配列同一性を有する配列ドメイン、
b)サブゲノムプロモーター配列と、配列番号8と少なくとも70%の配列同一性を有する配列ドメイン;および
c)サブゲノムプロモーター配列と、配列番号10と少なくとも70%の配列同一性を有する配列ドメイン
からなる、請求項19に記載の高力価ハイブリッドウイルスベクター。 - 前記第4のDNA配列が、TDO、IDO1、IDO2、およびそれらの組合せからなる群から選択される免疫抑制調節因子のポリヌクレオチドまたはポリペプチド阻害剤をコードする配列ドメインをさらに含む、請求項1に記載の高力価ハイブリッドウイルスベクター。
- 前記第4のDNA配列の前記配列ドメインのそれぞれが、単一または複数のサブゲノムプロモーターの制御下で発現し、単一または複数のサブゲノムRNAをもたらす、請求項1に記載の高力価ハイブリッドウイルスベクター。
- 前記第4のDNA配列の前記配列ドメインのそれぞれが、リボソームスキッピング2Aペプチドを含む共通サブゲノムRNAから同時翻訳される、請求項1に記載の高力価ハイブリッドウイルスベクター。
- 前記悪性腫瘍または感染性疾患の単一または複数の特異的抗原を発現する発現カセットを含む第6のDNA配列をさらに含む、請求項1に記載の高力価ハイブリッドウイルスベクター;および
- 前記発現カセットが腫瘍または感染病原体の特異的抗原を発現して、前記抗原に対する体液性および/または細胞性免疫応答を誘導する、請求項23に記載の高力価ハイブリッドウイルスベクター。
- 前記第5のDNA配列の前記ベシクロウイルス糖タンパク質が、水疱性口内炎インディアナウイルス、水疱性口内炎ニュージャージーウイルス、チャンディプラウイルスまたは構造的に関連するベシクロウイルスのエンベロープ糖タンパク質を含む、請求項1に記載の高力価ハイブリッドウイルスベクター。
- ウイルス様小胞(VLV)1mLあたり少なくとも5×107個のプラーク形成単位(pfu)の力価が得られる、請求項1に記載の高力価ハイブリッドウイルスベクター。
- ウイルス様小胞(VLV)1mLあたり少なくとも1×108個のプラーク形成単位(pfu)の力価が得られる、請求項1に記載の高力価ハイブリッドウイルスベクター。
- 以下の動作可能に連結された配列要素:
a)DNAプロモーター配列を含む第1のDNA配列、
b)アルファウイルス非構造タンパク質ポリヌクレオチド配列をコードする第2のDNA配列、
c)アルファウイルスサブゲノムRNAプロモーターをコードする第3のDNA配列、
d)前記悪性腫瘍または感染性疾患の単一または複数の特異的抗原を発現する発現カセットを含む第4のDNA配列;および
e)ベシクロウイルス糖タンパク質をコードする第5のDNA配列、を含む腫瘍溶解性ウイルス様小胞(VLV)を生成するための高力価ハイブリッドウイルスベクター。 - 請求項1に記載の高力価ハイブリッドウイルスベクターにより生成されるレプリコンRNAを含有するウイルス様小胞(VLV)。
- 前記レプリコンRNAが、プラス鎖をキャップされポリアデニル化されている、請求項30に記載のVLV。
- 請求項1に記載の高力価ハイブリッドウイルスベクターにより産生されたウイルス様小胞(VLV)を含む組成物。
- 前記VLVが自己複製する、請求項30または32に記載のVLV。
- 前記VLVが腫瘍溶解性である、請求項30または32に記載のVLV。
- 前記VLVがキャプシドを含まない、請求項30または32に記載のVLV。
- 悪性腫瘍または感染性疾患の処置、予防、または防止のための、ウイルス様小胞(VLV)を産生する方法であって、
a)サイトカインアゴニストポリペプチドをコードする配列ドメイン、サイトカインアンタゴニストポリペプチドをコードする配列ドメイン、ショートヘアピンRNA(shRNA)をコードする配列ドメイン、およびそれらの組合せからなる群からそれぞれ独立して選択される少なくとも1つの配列ドメインを含む高力価ウイルスベクターを生成するステップと、
b)ステップ(a)の前記高力価ウイルスベクターでBHK-21細胞をトランスフェクトするステップと、
c)ステップ(b)の前記トランスフェクトされたBHK-21細胞を緩衝液中で適切な時間および適切な適切な温度でインキュベートしてVLVを増殖させるステップと、
d)限外濾過、遠心分離、タンジェンシャルフロー濾過、アフィニティー精製、イオン交換クロマトグラフィー、およびそれらの組合せからなる群から選択される技術によって、前記VLVを前記BHK-21細胞および緩衝液から単離するステップとを含み、
ステップ(d)の前記単離により、高力価のVLVが得られる方法。 - 対象において悪性腫瘍を処置および防止する方法であって、前記方法が、治療有効量の請求項32に記載の組成物を、それを必要とする哺乳動物の対象に投与することを含む方法。
- 感染性疾患を有する対象を処置する方法であって、前記方法が、治療有効量の請求項32に記載の組成物を、それを必要とする哺乳動物の対象に投与することを含む方法。
- 感染性疾患に対して対象を免疫化する方法であって、前記方法が、治療有効量の請求項32に記載の組成物を、それを必要とする哺乳動物の対象に投与することを含む方法。
- 悪性腫瘍に関連する遺伝子をダウンレギュレーションする方法であって、前記方法が、治療有効量の請求項32に記載の組成物を、それを必要とする哺乳動物の対象に投与することを含む方法。
- 前記遺伝子が、PD-L1、CXCL1、CXCL2、およびそれらの組合せからなる群から選択される、請求項40に記載の方法。
- 前記哺乳動物対象がヒトまたは動物である、請求項37から40のいずれか一項に記載の方法。
- 悪性腫瘍または感染性疾患の、必要とする哺乳動物対象における前記処置、予防、または防止のための薬物の製造における請求項32に記載の組成物の使用。
- 前記哺乳動物対象がヒトまたは動物である、請求項43に記載の使用。
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