JP2022532918A - Mcl-1阻害剤抗体-薬物コンジュゲートおよび使用方法 - Google Patents

Mcl-1阻害剤抗体-薬物コンジュゲートおよび使用方法 Download PDF

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Abstract

ヒト腫瘍学標的に結合する抗体-薬物コンジュゲートが開示される。抗体-薬物コンジュゲートは、Mcl-1阻害剤薬物部分を含む。本開示はさらに、本明細書において提供される抗体-薬物コンジュゲートを投与することによるがんの治療における使用のための方法および組成物に関する。Mcl-1阻害剤薬物部分を含むリンカー-薬物コンジュゲートおよびその調製方法も開示される。

Description

関連出願
本出願は、その内容全体が参照により本明細書に組み込まれる、2019年5月20日に出願された米国仮特許出願第62/850,098号の35 U.S.C.§119(e)の下での出願日に対する利益および優先権を主張する。
本開示は、Mcl-1阻害剤と、抗原標的、例えば、腫瘍または他のがん細胞上で発現された抗原を結合する抗体またはその抗原結合性断片とを含む抗体-薬物コンジュゲート(ADC)に関する。本開示はさらに、標的抗原を発現するがんの処置および/もしくは診断において有用な、かつ/またはMcl-1発現および/もしくは活性を調節することにより処置に適用できる方法ならびに組成物、ならびにその組成物の調製方法に関する。Mcl-1阻害剤薬物部分を含むリンカー-薬物コンジュゲートおよびその調製方法も開示される。
アポトーシスまたはプログラム細胞死は、胚発生および組織恒常性の維持にとって極めて重要な生理的過程である。アポトーシス型細胞死は一般に、核の凝縮およびDNA断片化などの形態学的変化、ならびに細胞の主要構造成分に損傷を与え得るカスパーゼの活性化などの生化学的変化を伴う。アポトーシスの制御は複雑であり、典型的には、いくつかの細胞内シグナル伝達経路の活性化または抑制を伴う(Cory et al. (2002) Nature Review Cancer 2:647-656)。
アポトーシスの制御解除は、ある特定の病態に関連する。例えば、アポトーシスの増加は、パーキンソン病、アルツハイマー病などの神経変性疾患、および虚血に関連する。逆に、アポトーシスにおける欠損は、がんの発生ならびに化学療法抵抗性、自己免疫疾患、炎症性疾患およびウイルス感染においてある役割を果たし得る。アポトーシスの欠如は、がんの表現型の特徴のうちの1つである(Hanahan et al. (2000) Cell 100:57-70)。Bcl-2ファミリーの抗アポトーシスタンパク質は、結腸がん、乳がん、小細胞肺がん、非小細胞肺がん、膀胱がん、卵巣がん、前立腺がん、慢性リンパ性白血病、リンパ腫、骨髄腫および膵臓がんなどの多くのタイプのがんに関連する。
骨髄細胞白血病1(Mcl-1)(抗アポトーシスBcl-2ファミリーメンバー)は、細胞生存の制御因子である。Mcl-1遺伝子の増幅および/またはMcl-1タンパク質の過剰発現が複数のがん型において観察されており、腫瘍発生に関係付けられる(Beroukhim et al. (2010) Nature 463(7283):899-905)。Mcl-1は、ヒトがんにおいて最も頻繁に増幅される遺伝子のうちの1つであり、様々な抗がん剤に対する薬物耐性を媒介することが示されている決定的な生存因子でもある。
Mcl-1は、Bim、Noxa、BakおよびBaxなどのプロアポトーシスタンパク質に結合し、その死誘導活性を中和することにより細胞生存を促進すると考えられる。Mcl-1の阻害は、これらのプロアポトーシスタンパク質を放出し、しばしば、生存のためにMcl-1に依存する腫瘍細胞におけるアポトーシスを誘導する。したがって、アポトーシスシグナル伝達経路においてMcl-1またはその上流および/もしくは下流のタンパク質を治療標的にすることは、様々な悪性腫瘍を処置するための、およびある特定のヒトがんにおいて薬物耐性を克服するための有望な戦略となり得る。
一部の実施形態では、本開示は、部分的に、がん細胞に対する生物学的活性を有する新規な抗体-薬物コンジュゲート(ADC)化合物を提供する。この化合物は、哺乳動物において腫瘍増殖を減速、阻害および/もしくは逆転することができ、かつ/またはヒトがん患者の処置に有用であり得る。さらに具体的には、本開示は、一部の実施形態では、がん細胞を結合し、死滅させることができるADC化合物に関する。一部の実施形態では、本明細書に開示のADC化合物は、Mcl-1阻害剤を全長抗体または抗原結合性断片に結合するリンカーを含む。一部の実施形態では、ADC化合物は、結合後に標的細胞内に内部移行することもできる。
一部の実施形態では、ADC化合物は、式(1):
Ab-(L-D)(1)
(式中、Abは、抗体またはその抗原結合性断片であり、
DはMcl-1阻害剤であり、
Lは、AbをDに共有結合するリンカーであり、
pは、1~16の整数である)
により表すことができる。一部の実施形態では、Abは、がん細胞を標的にする抗体またはその抗原結合性断片である。
一部の実施形態では、pは、1~8の整数である。一部の実施形態では、pは、1~5の整数である。一部の実施形態では、pは、2~4の整数である。一部の実施形態では、pは2である。一部の実施形態では、pは4である。一部の実施形態では、pは、液体クロマトグラフィー-質量分析(LC-MS)により決定される。
一部の実施形態では、リンカー(L)は、結合基と、少なくとも1つのスペーサー基と、少なくとも1つの切断可能な基とを含む。いくつかの場合では、切断可能な基は、ピロリン酸基および/または自壊性基を含む。特定の実施形態では、Lは、結合基と、少なくとも1つの架橋スペーサー基と、ピロリン酸基および/または自壊性基を含む少なくとも1つの切断可能な基とを含む。
一部の実施形態では、抗体-薬物コンジュゲートは、式(A):
Figure 2022532918000001
(式中、Rは結合基であり、Lは架橋スペーサー基であり、Eは切断可能な基である)のものであるリンカー-薬物(または「リンカー-ペイロード」)部分-(L-D)を含む。
一部の実施形態では、切断可能な基はピロリン酸基を含む。一部の実施形態では、切断可能な基は
Figure 2022532918000002
を含む。
一部の実施形態では、架橋スペーサー基はポリオキシエチレン(PEG)基を含む。いくつかの場合では、PEG基は、PEG1、PEG2、PEG3、PEG4、PEG5、PEG6、PEG7、PEG8、PEG9、PEG10、PEG11、PEG12、PEG13、PEG14およびPEG15から選択されてよい。一部の実施形態では、架橋スペーサー基は-CO-CH-CH-PEG12-を含んでよい。他の実施形態では、架橋スペーサー基は、ブタノイル、ペンタノイル、ヘキサノイル、ヘプタノイルまたはオクタノイル基を含む。一部の実施形態では、架橋スペーサー基はヘキサノイル基を含む。
一部の実施形態では、結合基は、マレイミド基、チオール基、シクロオクチン基およびアジド基から選択される少なくとも1つの反応性基から形成されている。例えば、マレイミド基は構造:
Figure 2022532918000003
を有してよい。
アジド基は構造:-N=N=Nを有してよい。
シクロオクチン基は構造:
Figure 2022532918000004
を有してよく、ここで、
Figure 2022532918000005
は、抗体との結合である。
いくつかの場合では、シクロオクチン基は構造:
Figure 2022532918000006
を有し、ここで、
Figure 2022532918000007
は、抗体との結合である。
一部の実施形態では、結合基は、
Figure 2022532918000008
を含む式を有し、ここで、
Figure 2022532918000009
は、抗体との結合である。
一部の実施形態では、抗体は、
Figure 2022532918000010
から選択される結合基によりリンカー(L)に連結されており、
ここで、
Figure 2022532918000011
は、抗体との結合であり、ここで、
Figure 2022532918000012
は、架橋スペーサー基との結合である。
一部の実施形態では、架橋スペーサー基は、切断可能な基に連結されている。
一部の実施形態では、架橋スペーサー基は-CO-CH-CH-PEG12-である。
一部の実施形態では、切断可能な基は-ピロリン酸-CH-CH-NH-である。
一部の実施形態では、切断可能な基は、Mcl-1阻害剤(D)に連結されている。
一部の実施形態では、切断可能な基は、フェニル-ピリミジニル基を介してMcl-1阻害剤(D)基に連結されている。
一部の実施形態では、リンカーは、結合基と、少なくとも1つの架橋スペーサー基と、ペプチド基と、少なくとも1つの切断可能な基とを含む。
一部の実施形態では、抗体-薬物コンジュゲートは、式(B):
Figure 2022532918000013
(式中、Rは結合基であり、Lは架橋スペーサーであり、Lpは、1~6個のアミノ酸残基を含むペプチド基であり、Eは切断可能な基であり、Lは架橋スペーサーであり、mは、0または1であり、DはMcl-1阻害剤である)のものであるリンカー-薬物部分-(L-D)を含む。いくつかの場合では、mは1であり、架橋スペーサーは、
Figure 2022532918000014
を含む。
一部の実施形態では、少なくとも1つの架橋スペーサーはPEG基を含む。いくつかの場合では、PEG基は、PEG1、PEG2、PEG3、PEG4、PEG5、PEG6、PEG7、PEG8、PEG9、PEG10、PEG11、PEG12、PEG13、PEG14およびPEG15から選択される。いくつかの場合では、少なくとも1つの架橋スペーサーは、-C(O)-CH-CH-PEG1-**-C(O)-CH-PEG3-**-C(O)-CH-CH-PEG12**-NH-CH-CH-PEG1-**、ポリヒドロキシアルキル基および-C(O)-N(CH)-CH-CH-N(CH)-C(O)-**(式中、**は、結合基との少なくとも1つの架橋スペーサーの直接結合点または間接結合点を示し、は、ペプチド基との少なくとも1つの架橋スペーサーの直接結合点または間接結合点を示す)から選択される。
一部の実施形態では、Lは、-C(O)-CH-CH-PEG1-**-C(O)-CH-PEG3-**-C(O)-CH-CH-PEG12**-NH-CH-CH-PEG1-**およびポリヒドロキシアルキル基(式中、**は、RとのLの直接結合点または間接結合点を示し、は、LpとのLの直接結合点または間接結合点を示す)から選択される。
一部の実施形態では、mは1であり、Lは-C(O)-N(CH)-CH-CH-N(CH)-C(O)-である。
一部の実施形態では、ペプチド基は、1~12個のアミノ酸残基を含む。一部の実施形態では、ペプチド基(Lp)は、1~10個のアミノ酸残基を含む。一部の実施形態では、ペプチド基(Lp)は、1~8個のアミノ酸残基を含む。一部の実施形態では、ペプチド基(Lp)は、1~6個のアミノ酸残基を含む。一部の実施形態では、ペプチド基は、1~4個のアミノ酸残基を含む。一部の実施形態では、ペプチド基は、1~3個のアミノ酸残基を含む。一部の実施形態では、ペプチド基は、1~2個のアミノ酸残基を含む。いくつかの場合では、アミノ酸残基は、L-グリシン(Gly)、L-バリン(Val)、L-シトルリン(Cit)、L-システイン酸(スルホ-Ala)、L-リシン(Lys)、L-イソロイシン(Ile)、L-フェニルアラニン(Phe)、L-メチオニン(Met)、L-アスパラギン(Asn)、L-プロリン(Pro)、L-アラニン(Ala)、L-ロイシン(Leu)、L-トリプトファン(Trp)およびL-チロシン(Tyr)から選択される。例えば、ペプチド基は、Val-Cit、Val-Ala、Val-Lysおよび/またはスルホ-Ala-Val-Alaを含んでよい。一部の実施形態では、ペプチド基(Lp)は、
Figure 2022532918000015
基に結合された1個のアミノ酸残基を含む。一部の実施形態では、ペプチド基(Lp)は、
Figure 2022532918000016
基を含む。
いくつかの場合では、ペプチド基は、
Figure 2022532918000017
から選択される基を含む。
一部の実施形態では、自壊性基は、パラ-アミノベンジル-カルバメート、パラ-アミノベンジル-アンモニウム、パラ-アミノ-(スルホ)ベンジル-アンモニウム、パラ-アミノ-(スルホ)ベンジル-カルバメート、パラ-アミノ-(アルコキシ-PEG-アルキル)ベンジル-カルバメート、パラ-アミノ-(ポリヒドロキシカルボキシテトラヒドロピラニル)アルキル-ベンジル-カルバメートまたはパラ-アミノ-(ポリヒドロキシカルボキシテトラヒドロピラニル)アルキル-ベンジル-アンモニウムを含む。
一部の実施形態では、mは1であり、架橋スペーサーは、
Figure 2022532918000018
を含む。
一部の実施形態では、リンカー-薬物部分-(L-D)は、
Figure 2022532918000019
Figure 2022532918000020
Figure 2022532918000021
Figure 2022532918000022
から選択される化合物から形成されている。
一部の実施形態では、抗体-薬物コンジュゲートは、
Figure 2022532918000023
Figure 2022532918000024
Figure 2022532918000025
Figure 2022532918000026
Figure 2022532918000027
から選択される式を含み、
ここで、
Figure 2022532918000028
は、抗体との結合である、リンカー-薬物基-(L-D)を含む。
一部の実施形態では、抗体-薬物コンジュゲートは、式(C):
Figure 2022532918000029
(式中、Rは結合基であり、Lは架橋スペーサーであり、Lは、1~6個のアミノ酸を含むペプチド基であり、DはMcl-1阻害剤であり、G-L-Aは自壊性スペーサーであり、Lは、結合、メチレン、ネオペンチレンまたはC-Cアルケニレンであり、Aは、結合、-OC(=O)-
Figure 2022532918000030
、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、ここで、各Rは、H、C~CアルキルおよびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、Lはスペーサー部分であり、Rは親水性部分である)のものであるリンカー薬物基-(L-D)を含む。
一部の実施形態では、抗体-薬物コンジュゲートは、式(D):
Figure 2022532918000031
(式中、Rは結合基であり、Lは架橋スペーサーであり、Lpは、1~6個のアミノ酸を含むペプチド基であり、Aは、結合、-OC(=O)-
Figure 2022532918000032
、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、ここで、各Rは、H、C~CアルキルおよびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、Lはスペーサー部分であり、Rは親水性部分である)のものであるリンカー薬物基-(L-D)を含む。
一部の実施形態では、Lは、
Figure 2022532918000033
または-CH(OH)CH(OH)CH(OH)CH(OH)-**を含み、ここで、各nは、1~12の整数であり、ここで、Lは、Lpとの直接結合点または間接結合点を示し、L**は、Rとの直接結合点または間接結合点を示す。
一部の実施形態では、Lは、
Figure 2022532918000034
であり、nは、1~12の整数であり、ここで、Lは、Lpとの直接結合点または間接結合点を示し、L**は、Rとの直接結合点または間接結合点を示す。
一部の実施形態では、Lは、
Figure 2022532918000035
であり、nは1であり、ここで、Lは、Lpとの直接結合点または間接結合点を示し、L**は、Rとの直接結合点または間接結合点を示す。
一部の実施形態では、Lは、
Figure 2022532918000036
であり、nは12であり、ここで、Lは、Lpとの直接結合点または間接結合点を示し、L**は、Rとの直接結合点または間接結合点を示す。
一部の実施形態では、Lは、
Figure 2022532918000037
であり、nは、1~12の整数であり、ここで、Lは、Lpとの直接結合点または間接結合点を示し、L**は、Rとの直接結合点または間接結合点を示す。
一部の実施形態では、Lは、
Figure 2022532918000038
を含み、ここで、Lは、Lpとの直接結合点または間接結合点を示し、L**は、Rとの直接結合点または間接結合点を示す。
一部の実施形態では、Lは、
-C(=O)(CHO(CH**-C(=O)((CHO)(CH**-C(=O)(CH**
-C(=O)NH((CHO)(CH**
-C(=O)O(CHSSC(R(CHC(=O)NR(CHNRC(=O)(CH**
-C(=O)O(CHC(=O)NH(CH**-C(=O)(CHNH(CH**
-C(=O)(CHNH(CHC(=O)-**-C(=O)(CH(CH**
-C(=O)((CHO)(CH(CH**-C(=O)(CHNHC(=O)(CH**
-C(=O)((CHO)(CHNHC(=O)(CH**-C(=O)(CHNHC(=O)(CH(CH**
-C(=O)((CHO)(CHNHC(=O)(CH(CH**
-C(=O)((CHO)(CHC(=O)NH(CH**-C(=O)(CHC(R**または
-C(=O)(CHC(=O)NH(CH**を含む架橋スペーサーであり、ここで、Lは、Lpとの直接結合点または間接結合点を示し、L**は、Rとの直接結合点または間接結合点を示し、ここで、Xは、
Figure 2022532918000039
であり、
各mは、1、2、3、4、5、6、7、8、9および10から独立して選択され、
各nは、1、2、3、4、5、6、7、8、9および10から独立して選択され、
各tは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29および30から独立して選択される。
一部の実施形態では、Rは、ポリエチレングリコール、ポリアルキレングリコール、ポリオール、ポリサルコシン、糖、オリゴ糖、ポリペプチド、または1~3個の
Figure 2022532918000040
基で置換されたC-Cアルキルを含む親水性部分である。一部の実施形態では、Rは、
Figure 2022532918000041
(式中、nは、1~6の間の整数である)、
Figure 2022532918000042
である。
一部の実施形態では、親水性部分は、式:
Figure 2022532918000043
(式中、Rは、H、-CH、CHCHNHC(=O)OR、-CHCHNHC(=O)Rまたは-CHCHC(=O)ORであり、R’は、OH、-OCH、CHCHNHC(=O)OR、-CHCHNHC(=O)Rまたは-OCHCHC(=O)ORであり、mおよびnのそれぞれは、2~25の間(例えば、3~25の間)の整数である)のポリエチレングリコールを含む。
一部の実施形態では、親水性部分は、
Figure 2022532918000044
を含む。
一部の実施形態では、親水性部分は、ポリサルコシン、例えば、以下の部分
Figure 2022532918000045
(式中、nは、3~25の間の整数であり、Rは、H、-CHまたは-CHCHC(=O)OHである)を含むポリサルコシンを含む。
一部の実施形態では、Lは、構造
Figure 2022532918000046
(式中、
Wは、-CH-、-CHO-、-CHN(R)C(=O)O-、-NHC(=O)C(RNHC(=O)O-、
-NHC(=O)C(RNH-、-NHC(=O)C(RNHC(=O)-、-CHN(X-R)C(=O)O-、-C(=O)N(X-R)-、
-CHN(X-R)C(=O)-、-C(=O)NR-、-C(=O)NH-、-CHNRC(=O)-、-CHNRC(=O)NH-、
-CHNRC(=O)NR-、-NHC(=O)-、-NHC(=O)O-、-NHC(=O)NH-、-OC(=O)NH-、
-S(O)NH-、-NHS(O)-、-C(=O)-、-C(=O)O-または-NH-であり、ここで、各Rは、H、C~CアルキルおよびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、
Xは、結合、トリアゾリルまたは-CH-トリアゾリル-である)
を有するスペーサー部分である。
一部の実施形態では、Lは、構造
Figure 2022532918000047
(式中、
Wは、-CH-、-CHO-、-CHN(R)C(=O)O-、-NHC(=O)C(RNHC(=O)O-、
-NHC(=O)C(RNH-、-NHC(=O)C(RNHC(=O)-、-CHN(X-R)C(=O)O-、-C(=O)N(X-R)-、
-CHN(X-R)C(=O)-、-C(=O)NR-、-C(=O)NH-、-CHNRC(=O)-、-CHNRC(=O)NH-、
-CHNRC(=O)NR-、-NHC(=O)-、-NHC(=O)O-、-NHC(=O)NH-、-OC(=O)NH-、
-S(O)NH-、-NHS(O)-、-C(=O)-、-C(=O)O-または-NH-であり、ここで、各Rは、H、C~CアルキルおよびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、
Xは、-CH-トリアゾリル-C1~4アルキレン-OC(O)NHS(O)NH-、-C4-6シクロアルキレン-OC(O)NHS(O)NH-、-(CHCHO)-C(O)NHS(O)NH-、-(CHCHO)-C(O)NHS(O)NH-(CHCHO)-または-CH-トリアゾリル-C1~4アルキレン-OC(O)NHS(O)NH-(CHCHO)-であり、ここで、各nは独立して、1、2または3である)
を有するスペーサー部分である。
一部の実施形態では、結合基は、少なくとも1つの反応性基を含む反応により形成される。いくつかの場合では、結合基は、リンカーに結合されている第1の反応性基と、抗体に結合されているか、または抗体のアミノ酸残基である第2の反応性基とを反応させることにより形成される。
一部の実施形態では、反応性基のうちの少なくとも1つは、
チオール、
マレイミド、
ハロアセトアミド、
アジド、
アルキン、
シクロオクテン、
トリアリールホスフィン、
オキサノルボルナジエン、
シクロオクチン、
ジアリールテトラジン、
モノアリールテトラジン、
ノルボルネン、
アルデヒド、
ヒドロキシルアミン、
ヒドラジン、
NH-NH-C(=O)-、
ケトン、
ビニルスルホン、
アジリジン、
アミノ酸残基、
Figure 2022532918000048
、-ONH、-NH
Figure 2022532918000049
、-N
Figure 2022532918000050
、-SH、-SR、-SSR、-S(=O)(CH=CH)、-(CHS(=O)(CH=CH)、-NHS(=O)(CH=CH)、-NHC(=O)CHBr、-NHC(=O)CHI、
Figure 2022532918000051
、-C(O)NHNH
Figure 2022532918000052
Figure 2022532918000053
を含み、
ここで、
各Rは、HおよびC~Cアルキルから独立して選択され、
各Rは、2-ピリジルまたは4-ピリジルであり、
各Rは、H、C~Cアルキル、F、Clおよび-OHから独立して選択され、
各Rは、H、C~Cアルキル、F、Cl、-NH、-OCH、-OCHCH、-N(CH、-CN、-NOおよび-OHから独立して選択され、
各Rは、H、C1~6アルキル、フルオロ、-C(=O)OHで置換されたベンジルオキシ、-C(=O)OHで置換されたベンジル、-C(=O)OHで置換されたC1~4アルコキシおよび-C(=O)OHで置換されたC1~4アルキルから独立して選択される。
一部の実施形態では、第1の反応性基および第2の反応性基は、
チオールおよびマレイミド、
チオールおよびハロアセトアミド、
チオールおよびビニルスルホン、
チオールおよびアジリジン、
アジドおよびアルキン、
アジドおよびシクロオクチン、
アジドおよびシクロオクテン、
アジドおよびトリアリールホスフィン、
アジドおよびオキサノルボルナジエン、
ジアリールテトラジンおよびシクロオクテン、
モノアリールテトラジンおよびノルボルネン、
アルデヒドおよびヒドロキシルアミン、
アルデヒドおよびヒドラジン、
アルデヒドおよびNH-NH-C(=O)-、
ケトンおよびヒドロキシルアミン、
ケトンおよびヒドラジン、
ケトンおよびNH2-NH-C(=O)-、
ヒドロキシルアミンおよび
Figure 2022532918000054

アミンおよび
Figure 2022532918000055
、または
CoAもしくはCoA類似体およびセリン残基
を含む。
一部の実施形態では、結合基は、
Figure 2022532918000056
Figure 2022532918000057
Figure 2022532918000058
Figure 2022532918000059
から選択される基を含み、
ここで、
32は、H、C1~4アルキル、フェニル、ピリミジンまたはピリジンであり、
35は、H、C1~6アルキル、フェニル、または1~3個の-OH基で置換されたC1~4アルキルであり、
各Rは、H、C1~6アルキル、フルオロ、-C(=O)OHで置換されたベンジルオキシ、-C(=O)OHで置換されたベンジル、-C(=O)OHで置換されたC1~4アルコキシおよび-C(=O)OHで置換されたC1~4アルキルから独立して選択され、
37は、H、フェニルおよびピリジンから独立して選択され、
qは、0、1、2または3であり、
は、Hまたはメチルであり、
は、H、-CHまたはフェニルである。
一部の実施形態では、ペプチド基(Lp)は、1~6個のアミノ酸残基を含む。一部の実施形態では、ペプチド基(Lp)は、1~4個のアミノ酸残基を含む。一部の実施形態では、ペプチド基は、1~3個のアミノ酸残基を含む。一部の実施形態では、ペプチド基は、1~2個のアミノ酸残基を含む。一部の実施形態では、アミノ酸残基は、L-グリシン(Gly)、L-バリン(Val)、L-シトルリン(Cit)、L-システイン酸(スルホ-Ala)、L-リシン(Lys)、L-イソロイシン(Ile)、L-フェニルアラニン(Phe)、L-メチオニン(Met)、L-アスパラギン(Asn)、L-プロリン(Pro)、L-アラニン(Ala)、L-ロイシン(Leu)、L-トリプトファン(Trp)およびL-チロシン(Tyr)から選択される。一部の実施形態では、ペプチド基は、Val-Cit、Phe-Lys、Val-Ala、Val-Lys、Leu-Cit、スルホ-Ala-Valおよび/またはスルホ-Ala-Val-Alaを含む。一部の実施形態では、Lpは、
Figure 2022532918000060
から選択される。
一部の実施形態では、リンカー-薬物基-(L-D)は、式:
Figure 2022532918000061
(式中、
Rは、H、-CHまたは-CHCHC(=O)OHであり、
Aは、結合、-OC(=O)-
Figure 2022532918000062
、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、ここで、各Rは、H、C~CアルキルおよびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
DはMcl-1阻害剤である)
の化合物を含むか、またはそれから形成されている。
一部の実施形態では、リンカー-薬物基-(L-D)は、式:
Figure 2022532918000063
(式中、
Rは、H、-CHまたは-CHCHC(=O)OHであり、
Aは、結合、-OC(=O)-
Figure 2022532918000064
、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、ここで、各Rは、H、C~CアルキルおよびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
DはMcl-1阻害剤である)
の化合物を含むか、またはそれから形成されている。
一部の実施形態では、リンカー-薬物基-(L-D)は、式:
Figure 2022532918000065
(式中、
Rは、H、-CHまたは-CHCHC(=O)OHであり、
Aは、結合、-OC(=O)-
Figure 2022532918000066
、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、ここで、各Rは、H、C~CアルキルおよびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
DはMcl-1阻害剤である)
の化合物を含むか、またはそれから形成されている。
一部の実施形態では、リンカー-薬物基-(L-D)は、式:
Figure 2022532918000067
(式中、
各Rは、H、-CHおよび-CHCHC(=O)OHから独立して選択され、
Aは、結合、-OC(=O)-
Figure 2022532918000068
、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、ここで、各Rは、H、C~CアルキルおよびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
DはMcl-1阻害剤である)
の化合物を含むか、またはそれから形成されている。
一部の実施形態では、リンカー-薬物基-(L-D)は、式:
Figure 2022532918000069
(式中、
各Rは、H、-CHおよび-CHCHC(=O)OHから独立して選択され、
Aは、結合、-OC(=O)-
Figure 2022532918000070
、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、ここで、各Rは、H、C~CアルキルおよびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
DはMcl-1阻害剤である)
の化合物を含むか、またはそれから形成されている。
一部の実施形態では、リンカー-薬物基-(L-D)は、式:
Figure 2022532918000071
(式中、
Xaは、-CH-、-OCH-、-NHCH-または-NRCH-であり、各Rは独立して、H、-CHまたは-CHCHC(=O)OHであり、
Aは、結合、-OC(=O)-
Figure 2022532918000072
、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、ここで、各Rは、H、C~CアルキルおよびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
DはMcl-1阻害剤である)
の化合物を含むか、またはそれから形成されている。
一部の実施形態では、リンカー-薬物基-(L-D)は、式:
Figure 2022532918000073
(式中、
Rは、H、-CHまたは-CHCHC(=O)OHであり、
Aは、結合、-OC(=O)-
Figure 2022532918000074
、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、ここで、各Rは、H、C~CアルキルおよびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
DはMcl-1阻害剤である)
の化合物を含むか、またはそれから形成されている。
一部の実施形態では、リンカー-薬物基-(L-D)は、式:
Figure 2022532918000075
(式中、
Xbは、-CH-、-OCH-、-NHCH-または-NRCH-であり、各Rは独立して、H、-CHまたは-CHCHC(=O)OHであり、
Aは、結合、-OC(=O)-
Figure 2022532918000076
、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、ここで、各Rは、H、C~CアルキルおよびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
DはMcl-1阻害剤である)
の化合物を含むか、またはそれから形成されている。
一部の実施形態では、リンカー-薬物基-(L-D)は、式:
Figure 2022532918000077
(式中、
Aは、結合、-OC(=O)-
Figure 2022532918000078
、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、ここで、各Rは、H、C~CアルキルおよびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
DはMcl-1阻害剤である)
の化合物を含むか、またはそれから形成されている。
一部の実施形態では、リンカー-薬物基-(L-D)は、式:
Figure 2022532918000079
(式中、
Aは、結合、-OC(=O)-
Figure 2022532918000080
、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、ここで、各Rは、H、C~CアルキルおよびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
DはMcl-1阻害剤である)
の化合物を含むか、またはそれから形成されている。
一部の実施形態では、リンカー-薬物基-(L-D)は、式:
Figure 2022532918000081
(式中、
Aは、結合、-OC(=O)-
Figure 2022532918000082
、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、ここで、各Rは、H、C~CアルキルおよびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
DはMcl-1阻害剤である)
の化合物を含むか、またはそれから形成されている。
一部の実施形態では、リンカー-薬物基-(L-D)は、式:
Figure 2022532918000083
(式中、
Aは、結合、-OC(=O)-
Figure 2022532918000084
、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、ここで、各Rは、H、C~CアルキルおよびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
DはMcl-1阻害剤である)
の化合物を含むか、またはそれから形成されている。
一部の実施形態では、リンカー-薬物基-(L-D)は、式:
Figure 2022532918000085
(式中、
Aは、結合、-OC(=O)-
Figure 2022532918000086
、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、ここで、各Rは、H、C~CアルキルおよびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
DはMcl-1阻害剤である)
の化合物を含むか、またはそれから形成されている。
一部の実施形態では、リンカー-薬物基-(L-D)は、式:
Figure 2022532918000087
(式中、
Aは、結合、-OC(=O)-
Figure 2022532918000088
、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、ここで、各Rは、H、C~CアルキルおよびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
DはMcl-1阻害剤である)
の化合物を含むか、またはそれから形成されている。
一部の実施形態では、リンカー-薬物基-(L-D)は、式:
Figure 2022532918000089
(式中、
Aは、結合、-OC(=O)-
Figure 2022532918000090
、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、ここで、各Rは、H、C~CアルキルおよびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
DはMcl-1阻害剤である)
の化合物を含むか、またはそれから形成されている。
一部の実施形態では、リンカー-薬物基-(L-D)は、式:
Figure 2022532918000091
(式中、
各Rは独立して、H、-CHまたは-CHCHC(=O)OHであり、
Aは、結合、-OC(=O)-
Figure 2022532918000092
、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、
ここで、各Rは、H、C~CアルキルおよびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
DはMcl-1阻害剤である)
の化合物を含むか、またはそれから形成されている。
一部の実施形態では、Aは結合である。
一部の実施形態では、Rは-CHである。
一部の実施形態では、Mcl-1阻害剤(D)は、式(I):
Figure 2022532918000093
(式中、
環Dは、シクロアルキル基、ヘテロシクロアルキル基、アリール基またはヘテロアリール基であり、
環Eは、フリル、チエニルまたはピロリル環であり、
01、X03、X04およびX05は互いに独立して、炭素原子または窒素原子であり、
02は、C-R026基または窒素原子であり、
Figure 2022532918000094
は、環が芳香族であることを意味し、
は、窒素原子またはC-R03基であり、
は、窒素原子またはC-R04基であり、
01は、ハロゲン原子、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基、線状もしくは分枝状(C-C)アルケニル基、線状もしくは分枝状(C-C)アルキニル基、線状もしくは分枝状(C~C)ハロアルキル基、ヒドロキシ基、ヒドロキシ(C~C)アルキル基、線状もしくは分枝状(C~C)アルコキシ基、-S-(C~C)アルキル基、シアノ基、ニトロ基、-Cy08、-(C~C)アルキル-NR011011’、-O-(C~C)アルキル-NR011011’、-O-(C~C)アルキル-R012、-C(O)-OR011、-O-C(O)-R011、-C(O)-NR011011’、-NR011-C(O)-R011’、-NR011-C(O)-OR011’、-(C~C)アルキル-NR011-C(O)-R011’、-SO-NR011011’または-SO-(C~C)アルキルであり、
02、R03、R04およびR05は互いに独立して、水素原子、ハロゲン原子、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基、線状もしくは分枝状(C-C)アルケニル基、線状もしくは分枝状(C-C)アルキニル基、線状もしくは分枝状(C~C)ハロアルキル、ヒドロキシ基、ヒドロキシ(C~C)アルキル基、線状もしくは分枝状(C~C)アルコキシ基、-S-(C~C)アルキル基、シアノ基、ニトロ基、-(C~C)アルキル-NR011011’、-O-Cy01、-(C~C)アルキル-Cy01、-(C~C)アルケニル-Cy01
-(C~C)アルキニル-Cy01、-O-(C~C)アルキル-NR011011’、-O-(C~C)アルキル-R031
-O-(C~C)アルキル-R012、-C(O)-OR011、-O-C(O)-R011、-C(O)-NR011011’、-NR011-C(O)-R011’、
-NR011-C(O)-OR011’、-(C~C)アルキル-NR011-C(O)-R011’、-SO-NR011011’、または
-SO-(C~C)アルキルであり、
あるいは対(R01、R02)、(R02、R03)、(R03、R04)または(R04、R05)は、それらが結合している炭素原子と一緒に、5~7個の環員を含む芳香族または非芳香族環を形成し、これは必要に応じて、O、SおよびNから選択される1~3個のヘテロ原子を含み、ここで、得られた環は、ハロゲン、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル、(C~C)アルキル-NR011011’、-NR013013’、-(C~C)アルキル-Cy01またはオキソから選択される1個もしくは2個の基で必要に応じて置換されており、
06およびR07は互いに独立して、水素原子、ハロゲン原子、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基、線状もしくは分枝状(C-C)アルケニル基、線状もしくは分枝状(C-C)アルキニル基、線状もしくは分枝状(C~C)ハロアルキル、ヒドロキシ基、線状もしくは分枝状(C~C)アルコキシ基、-S-(C~C)アルキル基、シアノ基、ニトロ基、-(C~C)アルキル-NR011011’、-O-(C~C)アルキル-NR011011’、-O-Cy01
-(C~C)アルキル-Cy01、-(C~C)アルケニル-Cy01、-(C~C)アルキニル-Cy01、-O-(C~C)アルキル-R012
-C(O)-OR11、-O-C(O)-R011、-C(O)-NR011011’、-NR11-C(O)-R011’、-NR011-C(O)-OR011’、
-(C~C)アルキル-NR011-C(O)-R011’、-SO-NR011011’、または-SO-(C~C)アルキルであり、
あるいは対(R06、R07)は、2個の隣接する炭素原子と縮合されたとき、それらが結合している炭素原子と一緒に、5~7個の環員を含む芳香族または非芳香族環を形成し、これは必要に応じて、O、SおよびNから選択される1~3個のヘテロ原子を含み、ここで、得られた環は、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基、-NR013013’、-(C~C)アルキル-Cy01またはオキソで必要に応じて置換されており、
は、-CH-基、-NH-基または酸素原子であり、
08は、水素原子、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基、-CHR0a0b基、アリール基、ヘテロアリール基、アリール(C~C)アルキル基またはヘテロアリール(C~C)アルキル基であり、
09は、水素原子、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基、線状もしくは分枝状(C-C)アルケニル基、線状もしくは分枝状(C-C)アルキニル基、-Cy02、-(C~C)アルキル-Cy02、-(C-C)アルケニル-Cy02、-(C-C)アルキニル-Cy02、-Cy02-Cy03、-(C-C)アルキニル-O-Cy02、-Cy02-(C~C)アルキル-O-(C~C)アルキル-Cy03、ハロゲン原子、シアノ基、-C(O)-R014または-C(O)-NR014014’であり、
010は、水素原子、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基、線状もしくは分枝状(C-C)アルケニル基、線状もしくは分枝状(C-C)アルキニル基、アリール(C~C)アルキル基、(C~C)シクロアルキルアルキル基、線状もしくは分枝状(C~C)ハロアルキルまたは-(C~C)アルキル-O-Cy04であり、
あるいは対(R09、R010)は、2個の隣接する炭素原子と縮合されたとき、それらが結合している炭素原子と一緒に、5~7個の環員を含む芳香族または非芳香族環を形成し、これは必要に応じて、O、SおよびNから選択される1~3個のヘテロ原子を含み、
011およびR011’は互いに独立して、水素原子、必要に応じて置換された線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基、または-(C~C)アルキル-Cy01であり、
あるいは対(R011、R011’)は、それらが結合している窒素原子と一緒に、5~7個の環員を含む芳香族または非芳香族環を形成し、これは必要に応じて、窒素原子に加えて、O、SおよびNから選択される1~3個のヘテロ原子を含み、ここで、窒素は、水素原子および線状または分枝状(C~C)アルキル基から選択される1個または2個の基で置換されてよく、ここで、線状または分枝状(C~C)アルキル基の炭素原子のうちの1個または複数は、必要に応じて重水素化されており、
012は、-Cy05、-Cy05-(C~C)アルキル-O-(C~C)アルキル-Cy06、-Cy05-(C~C)アルキル-Cy06
-Cy05-(C~C)アルキル-NR011-(C~C)アルキル-Cy06、-Cy05-Cy06-O-(C~C)アルキル-Cy07
-Cy05-(C~C)アルキル-O-(C~C)アルキル-Cy09、-Cy05-(C~C)アルキル-Cy09、-NH-C(O)-NH-R011
-Cy05-(C~C)アルキル-NR011-(C~C)アルキル-Cy09、-C(O)-NR011011’、-NR011011’、-OR011
-NR011-C(O)-R011’、-O-(C~C)アルキル-OR011、-SO-R011、および-C(O)-OR011であり、
013、R013’、R014およびR014’は互いに独立して、水素原子または必要に応じて置換された線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基であり、
0aは、水素原子または線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基であり、
0bは、-O-C(O)-O-R0c基、-O-C(O)-NR0c0c’基または-O-P(O)(OR0c基であり、
0cおよびR0c’は互いに独立して、水素原子、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基、シクロアルキル基、(C~C)アルコキシ(C~C)アルキル基または(C~C)アルコキシカルボニル(C~C)アルキル基であり、
あるいは対(R0c、R0c’)は、それらが結合している窒素原子と一緒に、5~7個の環員から構成される非芳香族環を形成し、これは、窒素原子に加えて、酸素および窒素から選択される1~3個のヘテロ原子を含んでよく、ここで、窒素は、線状または分枝状(C~C)アルキル基で必要に応じて置換されており、
Cy01、Cy02、Cy03、Cy04、Cy05、Cy06、Cy07、Cy08およびCy010は互いに独立して、シクロアルキル基、ヘテロシクロアルキル基、アリール基またはヘテロアリール基を表し、それらのそれぞれは、必要に応じて置換されており、
Cy09
Figure 2022532918000095
であり、
またはCy09は、-O-P(O)(OR020;-O-P(O)(O;-(CHp0-O-(CHR018-CHR019-O)q0-R020;ヒドロキシ;ヒドロキシ(C~C)アルキル;-(CHr0-U-(CHs0-ヘテロシクロアルキル;および-U-(CHq0-NR021021’から選択される基で置換されているヘテロアリール基であり、
015は、水素原子;-(CHp0-O-(CHR018-CHR019-O)q0-R020基;線状もしくは分枝状(C~C)アルコキシ(C~C)アルキル基;-U-(CHq0-NR021021’基;または-(CHr0-U-(CHs0-ヘテロシクロアルキル基であり、
016は、水素原子;ヒドロキシ基;ヒドロキシ(C~C)アルキル基;-(CHr0-U-(CHs0-ヘテロシクロアルキル基;(CHr0-U-V-O-P(O)(OR020基;-O-P(O)(O基;-O-S(O)OR020基;-S(O)OR020基;-(CHp0-O-(CHR018-CHR019-O)q0-R020基;-(CHp0-O-C(O)-NR022023基;または-U-(CHq0-NR021021’基であり、
017は、水素原子;-(CHp0-O-(CHR018-CHR019-O)q0-R020基;-CH-P(O)(OR020基、-O-P(O)(OR020基;-O-P(O)(O基;ヒドロキシ基;ヒドロキシ(C~C)アルキル基;-(CHr0-U-(CHs0-ヘテロシクロアルキル基;-U-(CHq0-NR021021’基;またはアルドン酸であり、
は、薬学的に許容される一価カチオンであり、
は、結合または酸素原子であり、
は、-(CHs0-基または-C(O)-基であり、
018は、水素原子または(C~C)アルコキシ(C~C)アルキル基であり、
019は、水素原子またはヒドロキシ(C~C)アルキル基であり、
020は、水素原子または線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基であり、
021およびR021’は互いに独立して、水素原子、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基、またはヒドロキシ(C~C)アルキル基であり、
あるいは対(R021、R021’)は、それらが結合している窒素原子と一緒に、5~7個の環員を含む芳香族または非芳香族環を形成し、これは必要に応じて、窒素原子に加えて、O、SおよびNから選択される1~3個のヘテロ原子を含み、ここで、得られた環は、水素原子または線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基で必要に応じて置換されており、
022は、(C~C)アルコキシ(C~C)アルキル基、-(CHp0-NR024024’基または-(CHp0-O-(CHR018-CHR019-O)q0-R020基であり、
023は、水素原子または(C~C)アルコキシ(C~C)アルキル基であり、
あるいは対(R022、R023)は、それらが結合している窒素原子と一緒に、5~18個の環員を含む芳香族または非芳香族環を形成し、これは必要に応じて、窒素原子に加えて、O、SおよびNから選択される1~5個のヘテロ原子を含み、ここで、得られた環は、水素原子、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基またはヘテロシクロアルキル基で必要に応じて置換されており、
024およびR024’は互いに独立して、水素原子または線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基であり、
あるいは対(R024、R024’)は、それらが結合している窒素原子と一緒に、5~7個の環員から構成される芳香族または非芳香族環を形成し、これは、窒素原子に加えて、O、SおよびNから選択される1~3個のヘテロ原子を含んでよく、ここで、得られた環は、水素原子または線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基で必要に応じて置換されており、
025は、水素原子、ヒドロキシ基またはヒドロキシ(C~C)アルキル基であり、
026は、水素原子、ハロゲン原子、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基、またはシアノ基であり、
027は、水素原子または線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基であり、
028は、-O-P(O)(O)(O)基、-O-P(O)(O)(OR030)基、-O-P(O)(OR030)(OR030’)基、-(CHp0-O-SO-O基、-(CHp0-SO-O基、-(CHp0-O-SO-OR030基、-Cy010、-(CHp0-SO-OR030基、-O-C(O)-R029基、-O-C(O)-OR029基または-O-C(O)-NR029029’基であり、
029およびR029’は互いに独立して、水素原子、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基または線状もしくは分枝状アミノ(C~C)アルキル基を表し、
030およびR030’は互いに独立して、水素原子、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基またはアリール(C~C)アルキル基であり、
031
Figure 2022532918000096
であり、ここで、アンモニウムカチオンは必要に応じて、双性イオン型として存在するか、または一価のアニオン性対イオンを有し、
は、0または1に等しい整数であり、
は、0、1、2または3に等しい整数であり、
は、1、2、3または4に等しい整数であり、
およびsは、独立して0または1に等しい整数であり、
ここで、最大で、R03基、R09基またはR012基のうちの1つは、存在する場合、リンカーに共有結合されており、ここで、原子の価数を、それに結合された1個または複数の置換基が超えない)
の化合物もしくは鏡像異性体、ジアステレオ異性体、アトロプ異性体、重水素化誘導体、および/または前述のいずれかの薬学的に許容される塩を含む。
一部の実施形態では、Cy01、Cy02、Cy03、Cy04、Cy05、Cy06、Cy07、Cy08およびCy010は、互いに独立して、シクロアルキル基、ヘテロシクロアルキル基、アリール基またはヘテロアリール基であり、それらのそれぞれは、ハロ;-(C~C)アルコキシ;-(C~C)ハロアルキル;-(C~C)ハロアルコキシ;-(CHp0-O-SO-OR030
-(CHp0-SO-OR030;-O-P(O)(OR020;-O-P(O)(O;-CH-P(O)(OR020
-(CHp0-O-(CHR018-CHR019-O)q0-R020;ヒドロキシ;ヒドロキシ(C~C)アルキル;
-(CHr0-U-(CHs0-ヘテロシクロアルキル;または-U-(CHq0-NR021021’から選択される1個または複数の基で必要に応じて置換されている。
一部の実施形態では、Dは、式(II):
Figure 2022532918000097
(式中、
は、窒素原子またはC-R04基であり、
01は、ハロゲン原子、線状または分枝状(C~C)アルキル基、線状または分枝状(C-C)アルケニル基、線状または分枝状(C-C)アルキニル基、線状または分枝状(C~C)ハロアルキル基、ヒドロキシ基、線状または分枝状(C~C)アルコキシ基、-S-(C~C)アルキル基、シアノ基、-Cy08、-NR011011’であり、
02、R03およびR04は互いに独立して、水素原子、ハロゲン原子、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基、線状もしくは分枝状(C-C)アルケニル基、線状もしくは分枝状(C-C)アルキニル基、線状もしくは分枝状(C~C)ハロアルキル、ヒドロキシ基、線状もしくは分枝状(C~C)アルコキシ基、-S-(C~C)アルキル基、シアノ基、ニトロ基、-(C~C)アルキル-NR011011’、-O-Cy01、-(C~C)アルキル-Cy01
-(C~C)アルケニル-Cy01、-(C~C)アルキニル-Cy01、-O-(C~C)アルキル-NR011011’、
-O-(C~C)アルキル-R031、-C(O)-OR011、-O-C(O)-R011、-C(O)-NR011011’、-NR011-C(O)-R011’、
-NR011-C(O)-OR011’、-(C~C)アルキル-NR011-C(O)-R011’、-SO-NR011011’、または
-SO-(C~C)アルキルであり、
あるいは対(R02、R03)または(R03、R04)は、それらが結合している炭素原子と一緒に、5~7個の環員を含む芳香族または非芳香族環を形成し、これは必要に応じて、O、SおよびNから選択される1~3個のヘテロ原子を含み、ここで、環は、線状または分枝状(C~C)アルキル、-NR013013’、-(C~C)アルキル-Cy01およびオキソから選択される基で必要に応じて置換されており、
06およびR07は互いに独立して、水素原子、ハロゲン原子、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基、線状もしくは分枝状(C-C)アルケニル基、線状もしくは分枝状(C-C)アルキニル基、線状もしくは分枝状(C~C)ハロアルキル、ヒドロキシ基、線状もしくは分枝状(C~C)アルコキシ基、-S-(C~C)アルキル基、シアノ基、ニトロ基、-(C~C)アルキル-NR011011’、-O-Cy01、-(C~C)アルキル-Cy01、-(C~C)アルケニル-Cy01
-(C~C)アルキニル-Cy01、-O-(C~C)アルキル-R012、-C(O)-OR011、-O-C(O)-R011、-C(O)-NR011011’、
-NR011-C(O)-R011’、-NR011-C(O)-OR011’、-(C~C)アルキル-NR011-C(O)-R011’、-SO-NR011011’、または-SO-(C~C)アルキルであり、
あるいは対(R06、R07)は、2個の隣接する炭素原子と縮合されたとき、それらが結合している炭素原子と一緒に、5~7個の環員を含む芳香族または非芳香族環を形成し、これは必要に応じて、O、SおよびNから選択される1~3個のヘテロ原子を含み、ここで、得られた環は、線状または分枝状(C~C)アルキル基、-NR013013’、-(C~C)アルキル-Cy01およびオキソから選択される基で必要に応じて置換されており、
08は、水素原子、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基、アリール基、ヘテロアリール基、アリール-(C~C)アルキル基またはヘテロアリール(C~C)アルキル基であり、
09は、線状または分枝状(C~C)アルキル基、線状または分枝状(C-C)アルケニル基、線状または分枝状(C-C)アルキニル基、-Cy02、-(C~C)アルキル-Cy02、-(C-C)アルケニル-Cy02、-(C-C)アルキニル-Cy02、-Cy02-Cy03、-(C-C)アルキニル-O-Cy02、-Cy02-(C~C)アルキル-O-(C~C)アルキル-Cy03、ハロゲン原子、シアノ基、-C(O)-R014、-C(O)-NR014014’であり、
011およびR011’は互いに独立して、水素原子、必要に応じて置換された線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基、または-(C~C)アルキル-Cy01であり、
あるいは対(R011、R011’)は、それらが結合している窒素原子と一緒に、5~7個の環員を含む芳香族または非芳香族環を形成し、これは必要に応じて、窒素原子に加えて、O、SおよびNから選択される1~3個のヘテロ原子を含み、ここで、N原子は、線状または分枝状(C~C)アルキル基で必要に応じて置換されており、ここで、線状または分枝状(C~C)アルキル基の炭素原子のうちの1個または複数は、必要に応じて重水素化されており、
012は、-Cy05、-Cy05-(C~C)アルキル-Cy06
-Cy05-(C~C)アルキル-O-(C~C)アルキル-Cy06、-Cy05-(C~C)アルキル-NR011-(C~C)アルキル-Cy06
-Cy05-Cy06-O-(C~C)アルキル-Cy07、-Cy05-(C~C)アルキル-Cy09、-NH-C(O)-NH-R011
-C(O)-NR011011’、-NR011011’、-OR011、-NR011-C(O)-R011’、-O-(C~C)アルキル-OR011
-SO-R011、または-C(O)-OR011を表し、
013、R013’、R014およびR014’は互いに独立して、水素原子、または必要に応じて置換された線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基であり、
Cy01、Cy02、Cy03、Cy05、Cy06、Cy07およびCy08は互いに独立して、必要に応じて置換されたシクロアルキル基、必要に応じて置換されたヘテロシクロアルキル基、必要に応じて置換されたアリール基または必要に応じて置換されたヘテロアリール基であり、
Cy09
Figure 2022532918000098
であり、
ここで、R015、R016およびR017は、式(I)のために定義した通りであり、
031
Figure 2022532918000099
であり、ここで、R027およびR028は、式(I)のために定義した通りであり、
ここで、最大で、R03基、R09基またはR012基のうちの1つは、存在する場合、リンカーに共有結合されている)
の化合物もしくは鏡像異性体、ジアステレオ異性体、アトロプ異性体、重水素化誘導体、および/または前述のいずれかの薬学的に許容される塩を含む。
一部の実施形態では、Dは、式(III):
Figure 2022532918000100
(式中、
01は、線状または分枝状(C~C)アルキル基であり、
03は、-O-(C~C)アルキル-NR011011’または
Figure 2022532918000101
であり、
ここで、R011およびR011’は互いに独立して、水素原子、必要に応じて置換された線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基、または-(C~C)アルキル-Cy01であり、
あるいは対(R011、R011’)は、それらが結合している窒素原子と一緒に、5~7個の環員を含む芳香族または非芳香族環を形成し、これは必要に応じて、窒素原子に加えて、O、SおよびNから選択される1~3個のヘテロ原子を含み、ここで、N原子は、水素原子または線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基から選択される1個または2個の基で置換されてよく、
ここで、R027は水素原子であり、R028は、-(CHp0-O-SO-O基または-(CHp0-SO-OR030基であり、
09は、線状もしくは分枝状(C-C)アルキニル基または-Cy02であり、
012は、-Cy05、-Cy05-(C~C)アルキル-Cy06または-Cy05-(C~C)アルキル-Cy09であり、
Cy01、Cy02、Cy05およびCy06は互いに独立して、シクロアルキル基、ヘテロシクロアルキル基、アリール基またはヘテロアリール基であり、それらのそれぞれは、必要に応じて置換されており、
Cy09
Figure 2022532918000102
であり、
015、R016およびR017は、式(I)のために定義した通りであり、
ここで、最大で、R03基、R09基またはR012基のうちの1つは、存在する場合、リンカーに共有結合されている)
の化合物もしくは鏡像異性体、ジアステレオ異性体、アトロプ異性体、重水素化誘導体、および/または前述のいずれかの薬学的に許容される塩を含む。
一部の実施形態では、Cy01、Cy02、Cy05、Cy06は、互いに独立して、シクロアルキル基、ヘテロシクロアルキル基、アリール基またはヘテロアリール基であり、それらのそれぞれは、ハロ;-(C~C)アルコキシ;-(C~C)ハロアルキル;-(C~C)ハロアルコキシ;-(CHp0-O-SO-OR030;-(CHp0-SO-OR030
-O-P(O)(OR020;-O-P(O)(O;-CH-P(O)(OR020
-(CHp0-O-(CHR018-CHR019-O)q0-R020;ヒドロキシ;ヒドロキシ(C~C)アルキル;
-(CHr0-U-(CHs0-ヘテロシクロアルキル;または-U-(CHq0-NR021021’から選択される1個または複数の基で必要に応じて置換されている。
一部の実施形態では、R01は、メチルまたはエチルである。
一部の実施形態では、R03は-O-CH-CH-NR011011’(式中、R011およびR011’は、それらを保持している窒素原子と一緒に、水素原子または線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基で置換されてよいピペラジニル基を形成する)である。
一部の実施形態では、R03は、式:
Figure 2022532918000103
(式中、R027は水素原子であり、R028は-(CHp0-O-SO-OR030基であり、pは、0、1、2または3に等しい整数であり、ここで、R030は、水素原子、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基またはアリール(C~C)アルキル基を表す)
を含む。
一部の実施形態では、R03は、式:
Figure 2022532918000104
(式中、
Figure 2022532918000105
は、リンカーとの結合である)
を含む。
一部の実施形態では、Cy01、Cy02、Cy03、Cy04、Cy05、Cy06、Cy07、Cy08およびCy010は互いに独立して、必要に応じて置換されたシクロアルキル基、必要に応じて置換されたヘテロシクロアルキル基、必要に応じて置換されたアリール基または必要に応じて置換されたヘテロアリール基であり、ここで、必要に応じた置換基は、必要に応じて置換された線状もしくは分枝状(C~C)アルキル、必要に応じて置換された線状もしくは分枝状(C-C)アルケニル基、必要に応じて置換された線状もしくは分枝状(C-C)アルキニル基、必要に応じて置換された線状もしくは分枝状(C~C)アルコキシ、必要に応じて置換された(C~C)アルキル-S-、ヒドロキシ、オキソ(もしくは適切な場合にはN-オキシド)、ニトロ、シアノ、-C(O)-OR’、-O-C(O)-R’、-C(O)-NR’R’’、-NR’R’’、-(C=NR’)-OR’’、線状もしくは分枝状(C~C)ハロアルキル、トリフルオロメトキシまたはハロゲンから選択され、ここで、R’およびR’’は、それぞれ独立して水素原子または必要に応じて置換された線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基であり、ここで、線状または分枝状(C~C)アルキル基の炭素原子のうちの1個または複数は、必要に応じて重水素化されている。
一部の実施形態では、R09は、Cy02基、好ましくはアリール基、より好ましくはフェニル基である。一部の実施形態では、Cy02は、必要に応じて置換されたアリール基である。
一部の実施形態では、Cy05は、ピラゾリル基およびピリミジニル基から選択されるヘテロアリール基を含む。
一部の実施形態では、Cy05はピリミジニル基である。
一部の実施形態では、Cy05はピリミジニル基であり、Cy06はフェニル基である。
一部の実施形態では、リンカー(L)は、Lから式(I)、(II)または(III)のR03までの共有結合によりDに結合されている。一部の実施形態では、リンカー(L)は、Lから式(I)、(II)または(III)のR09までの共有結合によりDに結合されている。
一部の実施形態では、Dは、
Figure 2022532918000106
Figure 2022532918000107
もしくは鏡像異性体、ジアステレオ異性体、アトロプ異性体、重水素化誘導体、および/または前述のいずれかの薬学的に許容される塩を含む。
一部の実施形態では、-(L-D)は、表Aから選択される化合物もしくは鏡像異性体、ジアステレオ異性体、アトロプ異性体、重水素化誘導体、および/またはその薬学的に許容される塩から形成されている。表A中の化合物について、それらの電子電荷に応じて、これらの化合物は、1個の薬学的に許容される一価のアニオン性対イオンM を含むことができる。一部の実施形態では、一価のアニオン性対イオンM は、臭化物、塩化物、ヨウ化物、酢酸、トリフルオロ酢酸、安息香酸、メシル酸、トシル酸、トリフル酸、ギ酸または同種のものから選択され得る。一部の実施形態では、一価のアニオン性対イオンM は、トリフルオロ酢酸またはギ酸である。
Figure 2022532918000108
Figure 2022532918000109
Figure 2022532918000110
Figure 2022532918000111
Figure 2022532918000112
Figure 2022532918000113
Figure 2022532918000114
Figure 2022532918000115
Figure 2022532918000116
Figure 2022532918000117
Figure 2022532918000118
Figure 2022532918000119
Figure 2022532918000120
Figure 2022532918000121
Figure 2022532918000122
Figure 2022532918000123
Figure 2022532918000124
Figure 2022532918000125
Figure 2022532918000126
Figure 2022532918000127
Figure 2022532918000128
Figure 2022532918000129
Figure 2022532918000130
Figure 2022532918000131
Figure 2022532918000132
Figure 2022532918000133
Figure 2022532918000134
Figure 2022532918000135
Figure 2022532918000136
Figure 2022532918000137
Figure 2022532918000138
Figure 2022532918000139
Figure 2022532918000140
Figure 2022532918000141
Figure 2022532918000142
Figure 2022532918000143
Figure 2022532918000144
Figure 2022532918000145
Figure 2022532918000146
Figure 2022532918000147
Figure 2022532918000148
Figure 2022532918000149
Figure 2022532918000150
Figure 2022532918000151
Figure 2022532918000152
一部の実施形態では、抗体-薬物コンジュゲートは、表1aに示された構造のいずれか1つによる式を有する。
Figure 2022532918000153
Figure 2022532918000154
Figure 2022532918000155
Figure 2022532918000156
Figure 2022532918000157
Figure 2022532918000158
Figure 2022532918000159
Figure 2022532918000160
Figure 2022532918000161
Figure 2022532918000162
Figure 2022532918000163
Figure 2022532918000164
一部の実施形態では、抗体-薬物コンジュゲートは、表1bに示された構造のいずれか1つによる式を有する。
Figure 2022532918000165
Figure 2022532918000166
Figure 2022532918000167
Figure 2022532918000168
Figure 2022532918000169
Figure 2022532918000170
Figure 2022532918000171
Figure 2022532918000172
Figure 2022532918000173
Figure 2022532918000174
Figure 2022532918000175
Figure 2022532918000176
本明細書で使用される場合、「L/P」は、本明細書に開示のリンカー-ペイロード、リンカー-薬物またはリンカー-化合物を指し、「L#-P#」および「L#-C#」という用語は、本明細書に開示のある特定のリンカー-薬物を指すために同義で使用され、一方、「P#」および「C#」というコードは、特に指定のない限りある特定の化合物を指すために同義で使用される。例えば、「L1-C1」および「L1-P1」はいずれも、本明細書に開示の同じリンカー-ペイロード構造を指し、一方、「C1」および「P1」はいずれも、鏡像異性体、ジアステレオ異性体、アトロプ異性体、重水素化誘導体、および/または前述のいずれかの薬学的に許容される塩を含む本明細書に開示の同じ化合物を示す。
一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片は、がん細胞上の標的抗原に結合する。一部の実施形態では、標的抗原は、BCMA、CD33、HER2、CD38、CD48、CD79b、PCAD、CD74、CD138、SLAMF7、CD123、CLL1、FLT3、CD7、CKIT、CD56、DLL3、DLK1、B7-H3、EGFR、CD71、EPCAM、FOLR1、ENPP3、MET、AXL、SLC34A2、ネクチン4、TROP2、LIV1、CD46またはGPNMBである。一部の実施形態では、標的抗原は、4-1BB、5AC、5T4、アルファ-フェトプロテイン、アンジオポエチン2、ASLG659、TCLI、BMPRIB、ブレビカンBCAN、BEHAB、C242抗原、C5、CA-125、CA-125(模倣物)、CA-IX(炭酸脱水酵素9)、CCR4、CD140a、CD152、CD19、CD20、CD200、CD21(C3DR)I)、CD22(B細胞受容体CD22-Bアイソフォーム)、CD221、CD23(gE受容体)、CD28、CD30(TNFRSF8)、CD37、CD4、CD40、CD44 v6、CD51、CD52、CD70、CD72(Lyb-2、B細胞分化抗原CD72)、CD79a、CD80、CEA、CEA関連抗原、ch4D5、CLDN18.2、CRIPTO(CR、CRI、CRGF、TDGF1)、CTLA-4、CXCR5、DLL4、DR5、E16(LATI、SLC7A5)、EGFL7、EphB2R(DRT、ERK、Hek5、EPHT3、Tyro5)、エピシアリン、ERBB3、ETBR(エンドセリンB型受容体)、FCRHI(Fc受容体様タンパク質I)、FcRH2(IFGP4、IRTA4、SPAPI、SPAP IB、SPAP IC)、フィブロネクチンエクストラドメイン-B、Frizzled受容体、GD2、GD3ガングリオシド、GEDA、HER1、HER2/neu、HER3、HGF、HLA-DOB、HLA-DR、ヒト散乱因子受容体キナーゼ、IGF-I受容体、IL-13、IL20R(ZCYTOR7)、IL-6、ILGF2、ILFRIR、インテグリンu、IRTA2(免疫グロブリンスーパーファミリー受容体転座関連2)、ルイス-Y抗原、LY64(RP105)、MCP-I、MDP(DPEPI)、MPF、MSLN、SMR、メソテリン、巨核球、PD-I、PDCDI、PDGF-R u、前立腺特異的膜抗原、PSCA(前立腺幹細胞抗原前駆体)、PSCA hlg、RANKL、RON、SDCI、Sema Sb、STEAP I、STEAP2、PCANAP I、STAMP I、STEAP2、STMP、前立腺がん関連遺伝子I、TAG-72、TEMI、テネイシンC、TENB2、(TMEFF2、トモレグリン、TPEF、HPPI、TR)、TGF-IJ、TRAIL-E2、TRAIL-Rl、TRAIL-R2、T17M4(BR22450、FLJ20041、TRPM4、TRPM4B、一過性受容器電位カチオンチャネルサブファミリーM、メンバー4)、TWEAK-R、TYRP I(糖タンパク質75)、VEGF、VEGF-A、EGFR-I、VEGFR-2またはビメンチンである。一部の実施形態では、標的抗原は、BCMA、CD33、PCAD、HER2、CD38、CD46、CD48またはCD79bである。一部の実施形態では、標的抗原は、BCMA、CD33、CD48、PCADまたはHER2である。一部の実施形態では、標的抗原は、CD38またはCD48である。
一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片は、抗BCMA抗体または抗原結合性断片である。一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片は、配列番号15(HCDR1)、配列番号16(HCDR2)および配列番号17(HCDR3)のアミノ酸配列を含む3つの重鎖相補性決定領域(HCDR)と、配列番号18(LCDR1)、配列番号19(LCDR2)および配列番号20(LCDR3)のアミノ酸配列を含む3つの軽鎖相補性決定領域(LCDR)とを含む。一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片は、配列番号1のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号2のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む。一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片は、IgG1重鎖定常ドメインまたは修飾IgG1重鎖定常ドメインを含む。一部の実施形態では、IgG1重鎖定常ドメインは、152位および375位にシステイン残基(C)を含む。一部の実施形態では、IgG1重鎖定常ドメインは、156位および379位にシステイン残基(C)を含む。一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片は、Igカッパ軽鎖定常ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片は、抗CD33抗体または抗原結合性断片である。一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片は、配列番号21(HCDR1)、配列番号22(HCDR2)および配列番号23(HCDR3)のアミノ酸配列を含む3つの重鎖相補性決定領域(HCDR)と、配列番号24(LCDR1)、配列番号25(LCDR2)および配列番号26(LCDR3)のアミノ酸配列を含む3つの軽鎖相補性決定領域(LCDR)とを含む。一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片は、配列番号3のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号4のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む。一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片は、IgG1重鎖定常ドメインまたは修飾IgG1重鎖定常ドメインを含む。一部の実施形態では、IgG1重鎖定常ドメインは、297位にグルタミン残基(Q)を含む。一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片は、Igカッパ軽鎖定常ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片は、抗PCAD抗体または抗原結合性断片である。一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片は、配列番号33(HCDR1)、配列番号34(HCDR2)および配列番号35(HCDR3)のアミノ酸配列を含む3つの重鎖相補性決定領域(HCDR)と、配列番号36(LCDR1)、配列番号37(LCDR2)および配列番号38(LCDR3)のアミノ酸配列を含む3つの軽鎖相補性決定領域(LCDR)とを含む。一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片は、配列番号7のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号8のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む。
一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片は、抗HER2抗体または抗原結合性断片である。一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片は、配列番号39(HCDR1)、配列番号40(HCDR2)および配列番号41(HCDR3)のアミノ酸配列を含む3つの重鎖相補性決定領域(HCDR)と、配列番号42(LCDR1)、配列番号43(LCDR2)および配列番号44(LCDR3)のアミノ酸配列を含む3つの軽鎖相補性決定領域(LCDR)とを含む。一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片は、配列番号9のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号10のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む。一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片は、IgG1重鎖定常ドメインまたは修飾IgG1重鎖定常ドメインを含む。一部の実施形態では、IgG1重鎖定常ドメインは、297位にグルタミン残基(Q)を含む。一部の実施形態では、IgG1重鎖定常ドメインは、297位にセリン残基(S)を含む。一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片は、Igカッパ軽鎖定常ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片は、抗CD38抗体または抗原結合性断片である。一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片は、抗CD46抗体または抗原結合性断片である。一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片は、抗CD48抗体または抗原結合性断片である。一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片は、抗CD79b抗体または抗原結合性断片である。
本明細書において同じく提供されるのは、一部の実施形態では、抗体-薬物コンジュゲート(例えば、本明細書に記載の例示的な抗体-薬物コンジュゲートのいずれか)の複数コピーを含む組成物である。一部の実施形態では、組成物中の抗体-薬物コンジュゲートの平均pは、約2~約4である。
本明細書において同じく提供されるのは、一部の実施形態では、抗体-薬物コンジュゲート(例えば、本明細書に記載の例示的な抗体-薬物コンジュゲートのいずれか)または組成物(例えば、本明細書に記載の例示的な組成物のいずれか)と、薬学的に許容される担体とを含む医薬組成物である。
本明細書においてさらに提供されるのは、一部の実施形態では、記載されたADC化合物および組成物のための、例えばがんの処置における、治療的使用である。一部の実施形態では、本開示は、がん(例えば、BCMA、CD33、PCADまたはHER2など、ADCの抗体または抗原結合性断片によって標的にされた抗原を発現するがん)を処置する方法を提供する。一部の実施形態では、本開示は、対象におけるがん細胞集団の拡大を低減または減速する方法を提供する。一部の実施形態では、本開示は、がんを有するか、または有することが疑われる対象が本明細書に開示のADC化合物または組成物での処置に応答するかどうか判定する方法を提供する。
例示的な実施形態は、がんを有するか、または有することが疑われる対象を処置する方法であって、対象に治療有効量の抗体-薬物コンジュゲート、組成物または医薬組成物(例えば、本明細書に開示の例示的な抗体-薬物コンジュゲート、組成物または医薬組成物のいずれか)を投与することを含む方法である。一部の実施形態では、がんは標的抗原を発現する。一部の実施形態では、標的抗原は、BCMA、CD33、HER2、CD38、CD48、CD79b、PCAD、CD74、CD138、SLAMF7、CD123、CLL1、FLT3、CD7、CKIT、CD56、DLL3、DLK1、B7-H3、EGFR、CD71、EPCAM、FOLR1、ENPP3、MET、AXL、SLC34A2、ネクチン4、TROP2、LIV1、CD46またはGPNMBである。一部の実施形態では、標的抗原は、4-1BB、5AC、5T4、アルファ-フェトプロテイン、アンジオポエチン2、ASLG659、TCLI、BMPRIB、ブレビカンBCAN、BEHAB、C242抗原、C5、CA-125、CA-125(模倣物)、CA-IX(炭酸脱水酵素9)、CCR4、CD140a、CD152、CD19、CD20、CD200、CD21(C3DR)I)、CD22(B細胞受容体CD22-Bアイソフォーム)、CD221、CD23(gE受容体)、CD28、CD30(TNFRSF8)、CD37、CD4、CD40、CD44 v6、CD51、CD52、CD70、CD72(Lyb-2、B細胞分化抗原CD72)、CD79a、CD80、CEA、CEA関連抗原、ch4D5、CLDN18.2、CRIPTO(CR、CRI、CRGF、TDGF1)、CTLA-4、CXCR5、DLL4、DR5、E16(LATI、SLC7A5)、EGFL7、EphB2R(DRT、ERK、Hek5、EPHT3、Tyro5)、エピシアリン、ERBB3、ETBR(エンドセリンB型受容体)、FCRHI(Fc受容体様タンパク質I)、FcRH2(IFGP4、IRTA4、SPAPI、SPAP IB、SPAP IC)、フィブロネクチンエクストラドメイン-B、Frizzled受容体、GD2、GD3ガングリオシド、GEDA、HER1、HER2/neu、HER3、HGF、HLA-DOB、HLA-DR、ヒト散乱因子受容体キナーゼ、IGF-I受容体、IL-13、IL20R(ZCYTOR7)、IL-6、ILGF2、ILFRIR、インテグリンu、IRTA2(免疫グロブリンスーパーファミリー受容体転座関連2)、ルイス-Y抗原、LY64(RP105)、MCP-I、MDP(DPEPI)、MPF、MSLN、SMR、メソテリン、巨核球、PD-I、PDCDI、PDGF-R u、前立腺特異的膜抗原、PSCA(前立腺幹細胞抗原前駆体)、PSCA hlg、RANKL、RON、SDCI、Sema Sb、STEAP I、STEAP2、PCANAP I、STAMP I、STEAP2、STMP、前立腺がん関連遺伝子I、TAG-72、TEMI、テネイシンC、TENB2、(TMEFF2、トモレグリン、TPEF、HPPI、TR)、TGF-IJ、TRAIL-E2、TRAIL-Rl、TRAIL-R2、T17M4(BR22450、FLJ20041、TRPM4、TRPM4B、一過性受容器電位カチオンチャネルサブファミリーM、メンバー4)、TWEAK-R、TYRP I(糖タンパク質75)、VEGF、VEGF-A、EGFR-I、VEGFR-2またはビメンチンである。一部の実施形態では、標的抗原は、BCMA、CD33、PCAD、HER2、CD38、CD46、CD48またはCD79bである。一部の実施形態では、標的抗原は、BCMA、CD33、CD48、PCADまたはHER2である。一部の実施形態では、標的抗原は、CD38またはCD48である。一部の実施形態では、がんは、腫瘍または血液がんである。一部の実施形態では、がんは、乳がん、多発性骨髄腫、形質細胞性骨髄腫、白血病、リンパ腫、胃がん、急性骨髄性白血病、膀胱がん、脳がん、骨髄がん、子宮頸がん、慢性リンパ性白血病、結腸直腸がん、食道がん、肝細胞がん、リンパ芽球性白血病、濾胞性リンパ腫、T細胞もしくはB細胞由来のリンパ性悪性腫瘍、黒色腫、骨髄性白血病、骨髄腫、口腔がん、卵巣がん、非小細胞肺がん、慢性リンパ性白血病、前立腺がん、小細胞肺がんまたは脾臓がんである。一部の実施形態では、がんは、リンパ腫または胃がんである。
別の例示的な実施形態は、対象における腫瘍の増殖を低減または阻害する方法であって、対象に治療有効量の抗体-薬物コンジュゲート、組成物または医薬組成物(例えば、本明細書に開示の例示的な抗体-薬物コンジュゲート、組成物または医薬組成物のいずれか)を投与することを含む方法である。一部の実施形態では、腫瘍は標的抗原を発現する。一部の実施形態では、標的抗原は、BCMA、CD33、HER2、CD38、CD48、CD79b、PCAD、CD74、CD138、SLAMF7、CD123、CLL1、FLT3、CD7、CKIT、CD56、DLL3、DLK1、B7-H3、EGFR、CD71、EPCAM、FOLR1、ENPP3、MET、AXL、SLC34A2、ネクチン4、TROP2、LIV1、CD46またはGPNMBである。一部の実施形態では、標的抗原は、4-1BB、5AC、5T4、アルファ-フェトプロテイン、アンジオポエチン2、ASLG659、TCLI、BMPRIB、ブレビカンBCAN、BEHAB、C242抗原、C5、CA-125、CA-125(模倣物)、CA-IX(炭酸脱水酵素9)、CCR4、CD140a、CD152、CD19、CD20、CD200、CD21(C3DR)I)、CD22(B細胞受容体CD22-Bアイソフォーム)、CD221、CD23(gE受容体)、CD28、CD30(TNFRSF8)、CD37、CD4、CD40、CD44 v6、CD51、CD52、CD70、CD72(Lyb-2、B細胞分化抗原CD72)、CD79a、CD80、CEA、CEA関連抗原、ch4D5、CLDN18.2、CRIPTO(CR、CRI、CRGF、TDGF1)、CTLA-4、CXCR5、DLL4、DR5、E16(LATI、SLC7A5)、EGFL7、EphB2R(DRT、ERK、Hek5、EPHT3、Tyro5)、エピシアリン、ERBB3、ETBR(エンドセリンB型受容体)、FCRHI(Fc受容体様タンパク質I)、FcRH2(IFGP4、IRTA4、SPAPI、SPAP IB、SPAP IC)、フィブロネクチンエクストラドメイン-B、Frizzled受容体、GD2、GD3ガングリオシド、GEDA、HER1、HER2/neu、HER3、HGF、HLA-DOB、HLA-DR、ヒト散乱因子受容体キナーゼ、IGF-I受容体、IL-13、IL20R(ZCYTOR7)、IL-6、ILGF2、ILFRIR、インテグリンu、IRTA2(免疫グロブリンスーパーファミリー受容体転座関連2)、ルイス-Y抗原、LY64(RP105)、MCP-I、MDP(DPEPI)、MPF、MSLN、SMR、メソテリン、巨核球、PD-I、PDCDI、PDGF-R u、前立腺特異的膜抗原、PSCA(前立腺幹細胞抗原前駆体)、PSCA hlg、RANKL、RON、SDCI、Sema Sb、STEAP I、STEAP2、PCANAP I、STAMP I、STEAP2、STMP、前立腺がん関連遺伝子I、TAG-72、TEMI、テネイシンC、TENB2、(TMEFF2、トモレグリン、TPEF、HPPI、TR)、TGF-IJ、TRAIL-E2、TRAIL-Rl、TRAIL-R2、T17M4(BR22450、FLJ20041、TRPM4、TRPM4B、一過性受容器電位カチオンチャネルサブファミリーM、メンバー4)、TWEAK-R、TYRP I(糖タンパク質75)、VEGF、VEGF-A、EGFR-I、VEGFR-2またはビメンチンである。一部の実施形態では、標的抗原は、BCMA、CD33、PCAD、HER2、CD38、CD46、CD48またはCD79bである。一部の実施形態では、標的抗原は、BCMA、CD33、CD48、PCADまたはHER2である。一部の実施形態では、標的抗原は、CD38またはCD48である。一部の実施形態では、腫瘍は、乳がん、胃がん、膀胱がん、脳がん、子宮頸がん、結腸直腸がん、食道がん、肝細胞がん、黒色腫、口腔がん、卵巣がん、非小細胞肺がん、前立腺がん、小細胞肺がんまたは脾臓がんである。一部の実施形態では、腫瘍は胃がんである。一部の実施形態では、抗体-薬物コンジュゲート、組成物または医薬組成物の投与は、腫瘍の増殖を少なくとも約10%、少なくとも約20%、少なくとも約30%、少なくとも約40%、少なくとも約50%、少なくとも約60%、少なくとも約70%、少なくとも約80%、少なくとも約90%、少なくとも約95%または少なくとも約99%低減または阻害する。
別の例示的な実施形態は、対象におけるがん細胞集団の拡大を低減または減速する方法であって、対象に治療有効量の抗体-薬物コンジュゲート、組成物または医薬組成物(例えば、本明細書に開示の例示的な抗体-薬物コンジュゲート、組成物または医薬組成物のいずれか)を投与することを含む方法である。一部の実施形態では、がん細胞集団は標的抗原を発現する。一部の実施形態では、標的抗原は、BCMA、CD33、HER2、CD38、CD48、CD79b、PCAD、CD74、CD138、SLAMF7、CD123、CLL1、FLT3、CD7、CKIT、CD56、DLL3、DLK1、B7-H3、EGFR、CD71、EPCAM、FOLR1、ENPP3、MET、AXL、SLC34A2、ネクチン4、TROP2、LIV1、CD46またはGPNMBである。一部の実施形態では、標的抗原は、4-1BB、5AC、5T4、アルファ-フェトプロテイン、アンジオポエチン2、ASLG659、TCLI、BMPRIB、ブレビカンBCAN、BEHAB、C242抗原、C5、CA-125、CA-125(模倣物)、CA-IX(炭酸脱水酵素9)、CCR4、CD140a、CD152、CD19、CD20、CD200、CD21(C3DR)I)、CD22(B細胞受容体CD22-Bアイソフォーム)、CD221、CD23(gE受容体)、CD28、CD30(TNFRSF8)、CD37、CD4、CD40、CD44 v6、CD51、CD52、CD70、CD72(Lyb-2、B細胞分化抗原CD72)、CD79a、CD80、CEA、CEA関連抗原、ch4D5、CLDN18.2、CRIPTO(CR、CRI、CRGF、TDGF1)、CTLA-4、CXCR5、DLL4、DR5、E16(LATI、SLC7A5)、EGFL7、EphB2R(DRT、ERK、Hek5、EPHT3、Tyro5)、エピシアリン、ERBB3、ETBR(エンドセリンB型受容体)、FCRHI(Fc受容体様タンパク質I)、FcRH2(IFGP4、IRTA4、SPAPI、SPAP IB、SPAP IC)、フィブロネクチンエクストラドメイン-B、Frizzled受容体、GD2、GD3ガングリオシド、GEDA、HER1、HER2/neu、HER3、HGF、HLA-DOB、HLA-DR、ヒト散乱因子受容体キナーゼ、IGF-I受容体、IL-13、IL20R(ZCYTOR7)、IL-6、ILGF2、ILFRIR、インテグリンu、IRTA2(免疫グロブリンスーパーファミリー受容体転座関連2)、ルイス-Y抗原、LY64(RP105)、MCP-I、MDP(DPEPI)、MPF、MSLN、SMR、メソテリン、巨核球、PD-I、PDCDI、PDGF-R u、前立腺特異的膜抗原、PSCA(前立腺幹細胞抗原前駆体)、PSCA hlg、RANKL、RON、SDCI、Sema Sb、STEAP I、STEAP2、PCANAP I、STAMP I、STEAP2、STMP、前立腺がん関連遺伝子I、TAG-72、TEMI、テネイシンC、TENB2、(TMEFF2、トモレグリン、TPEF、HPPI、TR)、TGF-IJ、TRAIL-E2、TRAIL-Rl、TRAIL-R2、T17M4(BR22450、FLJ20041、TRPM4、TRPM4B、一過性受容器電位カチオンチャネルサブファミリーM、メンバー4)、TWEAK-R、TYRP I(糖タンパク質75)、VEGF、VEGF-A、EGFR-I、VEGFR-2またはビメンチンである。一部の実施形態では、標的抗原は、BCMA、CD33、PCAD、HER2、CD38、CD46、CD48またはCD79bである。一部の実施形態では、標的抗原は、BCMA、CD33、CD48、PCADまたはHER2である。一部の実施形態では、標的抗原は、CD38またはCD48である。一部の実施形態では、がん細胞集団は、腫瘍または血液がんに由来する。一部の実施形態では、がん細胞集団は、乳がん、多発性骨髄腫、形質細胞性骨髄腫、白血病、リンパ腫、胃がん、急性骨髄性白血病、膀胱がん、脳がん、骨髄がん、子宮頸がん、慢性リンパ性白血病、結腸直腸がん、食道がん、肝細胞がん、リンパ芽球性白血病、濾胞性リンパ腫、T細胞もしくはB細胞由来のリンパ性悪性腫瘍、黒色腫、骨髄性白血病、骨髄腫、口腔がん、卵巣がん、非小細胞肺がん、慢性リンパ性白血病、前立腺がん、小細胞肺がんまたは脾臓がんに由来する。一部の実施形態では、がん細胞集団は、リンパ腫または胃がんに由来する。一部の実施形態では、抗体-薬物コンジュゲート、組成物または医薬組成物の投与は、がん細胞集団を少なくとも約10%、少なくとも約20%、少なくとも約30%、少なくとも約40%、少なくとも約50%、少なくとも約60%、少なくとも約70%、少なくとも約80%、少なくとも約90%、少なくとも約95%または少なくとも約99%低減する。一部の実施形態では、抗体-薬物コンジュゲート、組成物または医薬組成物の投与は、がん細胞集団の拡大を少なくとも約10%、少なくとも約20%、少なくとも約30%、少なくとも約40%、少なくとも約50%、少なくとも約60%、少なくとも約70%、少なくとも約80%、少なくとも約90%、少なくとも約95%または少なくとも約99%減速する。
別の例示的な実施形態は、がんを有するか、または有することが疑われる対象の処置における使用のための抗体-薬物コンジュゲート、組成物または医薬組成物(例えば、本明細書に開示の例示的な抗体-薬物コンジュゲート、組成物または医薬組成物のいずれか)である。一部の実施形態では、がんは標的抗原を発現する。一部の実施形態では、標的抗原は、BCMA、CD33、HER2、CD38、CD48、CD79b、PCAD、CD74、CD138、SLAMF7、CD123、CLL1、FLT3、CD7、CKIT、CD56、DLL3、DLK1、B7-H3、EGFR、CD71、EPCAM、FOLR1、ENPP3、MET、AXL、SLC34A2、ネクチン4、TROP2、LIV1、CD46またはGPNMBである。一部の実施形態では、標的抗原は、4-1BB、5AC、5T4、アルファ-フェトプロテイン、アンジオポエチン2、ASLG659、TCLI、BMPRIB、ブレビカンBCAN、BEHAB、C242抗原、C5、CA-125、CA-125(模倣物)、CA-IX(炭酸脱水酵素9)、CCR4、CD140a、CD152、CD19、CD20、CD200、CD21(C3DR)I)、CD22(B細胞受容体CD22-Bアイソフォーム)、CD221、CD23(gE受容体)、CD28、CD30(TNFRSF8)、CD37、CD4、CD40、CD44 v6、CD51、CD52、CD70、CD72(Lyb-2、B細胞分化抗原CD72)、CD79a、CD80、CEA、CEA関連抗原、ch4D5、CLDN18.2、CRIPTO(CR、CRI、CRGF、TDGF1)、CTLA-4、CXCR5、DLL4、DR5、E16(LATI、SLC7A5)、EGFL7、EphB2R(DRT、ERK、Hek5、EPHT3、Tyro5)、エピシアリン、ERBB3、ETBR(エンドセリンB型受容体)、FCRHI(Fc受容体様タンパク質I)、FcRH2(IFGP4、IRTA4、SPAPI、SPAP IB、SPAP IC)、フィブロネクチンエクストラドメイン-B、Frizzled受容体、GD2、GD3ガングリオシド、GEDA、HER1、HER2/neu、HER3、HGF、HLA-DOB、HLA-DR、ヒト散乱因子受容体キナーゼ、IGF-I受容体、IL-13、IL20R(ZCYTOR7)、IL-6、ILGF2、ILFRIR、インテグリンu、IRTA2(免疫グロブリンスーパーファミリー受容体転座関連2)、ルイス-Y抗原、LY64(RP105)、MCP-I、MDP(DPEPI)、MPF、MSLN、SMR、メソテリン、巨核球、PD-I、PDCDI、PDGF-R u、前立腺特異的膜抗原、PSCA(前立腺幹細胞抗原前駆体)、PSCA hlg、RANKL、RON、SDCI、Sema Sb、STEAP I、STEAP2、PCANAP I、STAMP I、STEAP2、STMP、前立腺がん関連遺伝子I、TAG-72、TEMI、テネイシンC、TENB2、(TMEFF2、トモレグリン、TPEF、HPPI、TR)、TGF-IJ、TRAIL-E2、TRAIL-Rl、TRAIL-R2、T17M4(BR22450、FLJ20041、TRPM4、TRPM4B、一過性受容器電位カチオンチャネルサブファミリーM、メンバー4)、TWEAK-R、TYRP I(糖タンパク質75)、VEGF、VEGF-A、EGFR-I、VEGFR-2またはビメンチンである。一部の実施形態では、標的抗原は、BCMA、CD33、PCAD、HER2、CD38、CD46、CD48またはCD79bである。一部の実施形態では、標的抗原は、BCMA、CD33、CD48、PCADまたはHER2である。一部の実施形態では、標的抗原は、CD38またはCD48である。一部の実施形態では、がんは、腫瘍または血液がんである。一部の実施形態では、がんは、乳がん、多発性骨髄腫、形質細胞性骨髄腫、白血病、リンパ腫、胃がん、急性骨髄性白血病、膀胱がん、脳がん、骨髄がん、子宮頸がん、慢性リンパ性白血病、結腸直腸がん、食道がん、肝細胞がん、リンパ芽球性白血病、濾胞性リンパ腫、T細胞もしくはB細胞由来のリンパ性悪性腫瘍、黒色腫、骨髄性白血病、骨髄腫、口腔がん、卵巣がん、非小細胞肺がん、慢性リンパ性白血病、前立腺がん、小細胞肺がんまたは脾臓がんである。一部の実施形態では、がんは、リンパ腫または胃がんである。
別の例示的な実施形態は、がんを有するか、または有することが疑われる対象の処置における抗体-薬物コンジュゲート、組成物または医薬組成物(例えば、本明細書に開示の例示的な抗体-薬物コンジュゲート、組成物または医薬組成物のいずれか)の使用である。一部の実施形態では、がんは標的抗原を発現する。一部の実施形態では、標的抗原は、BCMA、CD33、HER2、CD38、CD48、CD79b、PCAD、CD74、CD138、SLAMF7、CD123、CLL1、FLT3、CD7、CKIT、CD56、DLL3、DLK1、B7-H3、EGFR、CD71、EPCAM、FOLR1、ENPP3、MET、AXL、SLC34A2、ネクチン4、TROP2、LIV1、CD46またはGPNMBである。一部の実施形態では、標的抗原は、4-1BB、5AC、5T4、アルファ-フェトプロテイン、アンジオポエチン2、ASLG659、TCLI、BMPRIB、ブレビカンBCAN、BEHAB、C242抗原、C5、CA-125、CA-125(模倣物)、CA-IX(炭酸脱水酵素9)、CCR4、CD140a、CD152、CD19、CD20、CD200、CD21(C3DR)I)、CD22(B細胞受容体CD22-Bアイソフォーム)、CD221、CD23(gE受容体)、CD28、CD30(TNFRSF8)、CD37、CD4、CD40、CD44 v6、CD51、CD52、CD70、CD72(Lyb-2、B細胞分化抗原CD72)、CD79a、CD80、CEA、CEA関連抗原、ch4D5、CLDN18.2、CRIPTO(CR、CRI、CRGF、TDGF1)、CTLA-4、CXCR5、DLL4、DR5、E16(LATI、SLC7A5)、EGFL7、EphB2R(DRT、ERK、Hek5、EPHT3、Tyro5)、エピシアリン、ERBB3、ETBR(エンドセリンB型受容体)、FCRHI(Fc受容体様タンパク質I)、FcRH2(IFGP4、IRTA4、SPAPI、SPAP IB、SPAP IC)、フィブロネクチンエクストラドメイン-B、Frizzled受容体、GD2、GD3ガングリオシド、GEDA、HER1、HER2/neu、HER3、HGF、HLA-DOB、HLA-DR、ヒト散乱因子受容体キナーゼ、IGF-I受容体、IL-13、IL20R(ZCYTOR7)、IL-6、ILGF2、ILFRIR、インテグリンu、IRTA2(免疫グロブリンスーパーファミリー受容体転座関連2)、ルイス-Y抗原、LY64(RP105)、MCP-I、MDP(DPEPI)、MPF、MSLN、SMR、メソテリン、巨核球、PD-I、PDCDI、PDGF-R u、前立腺特異的膜抗原、PSCA(前立腺幹細胞抗原前駆体)、PSCA hlg、RANKL、RON、SDCI、Sema Sb、STEAP I、STEAP2、PCANAP I、STAMP I、STEAP2、STMP、前立腺がん関連遺伝子I、TAG-72、TEMI、テネイシンC、TENB2、(TMEFF2、トモレグリン、TPEF、HPPI、TR)、TGF-IJ、TRAIL-E2、TRAIL-Rl、TRAIL-R2、T17M4(BR22450、FLJ20041、TRPM4、TRPM4B、一過性受容器電位カチオンチャネルサブファミリーM、メンバー4)、TWEAK-R、TYRP I(糖タンパク質75)、VEGF、VEGF-A、EGFR-I、VEGFR-2またはビメンチンである。一部の実施形態では、標的抗原は、BCMA、CD33、PCAD、HER2、CD38、CD46、CD48またはCD79bである。一部の実施形態では、標的抗原は、BCMA、CD33、CD48、PCADまたはHER2である。一部の実施形態では、標的抗原は、CD38またはCD48である。一部の実施形態では、がんは、腫瘍または血液がんである。一部の実施形態では、がんは、乳がん、多発性骨髄腫、形質細胞性骨髄腫、白血病、リンパ腫、胃がん、急性骨髄性白血病、膀胱がん、脳がん、骨髄がん、子宮頸がん、慢性リンパ性白血病、結腸直腸がん、食道がん、肝細胞がん、リンパ芽球性白血病、濾胞性リンパ腫、T細胞もしくはB細胞由来のリンパ性悪性腫瘍、黒色腫、骨髄性白血病、骨髄腫、口腔がん、卵巣がん、非小細胞肺がん、慢性リンパ性白血病、前立腺がん、小細胞肺がんまたは脾臓がんである。一部の実施形態では、がんは、リンパ腫または胃がんである。
別の例示的な実施形態は、がんを有するか、または有することが疑われる対象を処置するための医薬の製造方法における抗体-薬物コンジュゲート、組成物または医薬組成物(例えば、本明細書に開示の例示的な抗体-薬物コンジュゲート、組成物または医薬組成物のいずれか)の使用である。一部の実施形態では、がんは標的抗原を発現する。一部の実施形態では、標的抗原は、BCMA、CD33、HER2、CD38、CD48、CD79b、PCAD、CD74、CD138、SLAMF7、CD123、CLL1、FLT3、CD7、CKIT、CD56、DLL3、DLK1、B7-H3、EGFR、CD71、EPCAM、FOLR1、ENPP3、MET、AXL、SLC34A2、ネクチン4、TROP2、LIV1、CD46またはGPNMBである。一部の実施形態では、標的抗原は、4-1BB、5AC、5T4、アルファ-フェトプロテイン、アンジオポエチン2、ASLG659、TCLI、BMPRIB、ブレビカンBCAN、BEHAB、C242抗原、C5、CA-125、CA-125(模倣物)、CA-IX(炭酸脱水酵素9)、CCR4、CD140a、CD152、CD19、CD20、CD200、CD21(C3DR)I)、CD22(B細胞受容体CD22-Bアイソフォーム)、CD221、CD23(gE受容体)、CD28、CD30(TNFRSF8)、CD37、CD4、CD40、CD44 v6、CD51、CD52、CD70、CD72(Lyb-2、B細胞分化抗原CD72)、CD79a、CD80、CEA、CEA関連抗原、ch4D5、CLDN18.2、CRIPTO(CR、CRI、CRGF、TDGF1)、CTLA-4、CXCR5、DLL4、DR5、E16(LATI、SLC7A5)、EGFL7、EphB2R(DRT、ERK、Hek5、EPHT3、Tyro5)、エピシアリン、ERBB3、ETBR(エンドセリンB型受容体)、FCRHI(Fc受容体様タンパク質I)、FcRH2(IFGP4、IRTA4、SPAPI、SPAP IB、SPAP IC)、フィブロネクチンエクストラドメイン-B、Frizzled受容体、GD2、GD3ガングリオシド、GEDA、HER1、HER2/neu、HER3、HGF、HLA-DOB、HLA-DR、ヒト散乱因子受容体キナーゼ、IGF-I受容体、IL-13、IL20R(ZCYTOR7)、IL-6、ILGF2、ILFRIR、インテグリンu、IRTA2(免疫グロブリンスーパーファミリー受容体転座関連2)、ルイス-Y抗原、LY64(RP105)、MCP-I、MDP(DPEPI)、MPF、MSLN、SMR、メソテリン、巨核球、PD-I、PDCDI、PDGF-R u、前立腺特異的膜抗原、PSCA(前立腺幹細胞抗原前駆体)、PSCA hlg、RANKL、RON、SDCI、Sema Sb、STEAP I、STEAP2、PCANAP I、STAMP I、STEAP2、STMP、前立腺がん関連遺伝子I、TAG-72、TEMI、テネイシンC、TENB2、(TMEFF2、トモレグリン、TPEF、HPPI、TR)、TGF-IJ、TRAIL-E2、TRAIL-Rl、TRAIL-R2、T17M4(BR22450、FLJ20041、TRPM4、TRPM4B、一過性受容器電位カチオンチャネルサブファミリーM、メンバー4)、TWEAK-R、TYRP I(糖タンパク質75)、VEGF、VEGF-A、EGFR-I、VEGFR-2またはビメンチンである。一部の実施形態では、標的抗原は、BCMA、CD33、PCAD、HER2、CD38、CD46、CD48またはCD79bである。一部の実施形態では、標的抗原は、BCMA、CD33、CD48、PCADまたはHER2である。一部の実施形態では、標的抗原は、CD38またはCD48である。一部の実施形態では、がんは、腫瘍または血液がんである。一部の実施形態では、がんは、乳がん、多発性骨髄腫、形質細胞性骨髄腫、白血病、リンパ腫、胃がん、急性骨髄性白血病、膀胱がん、脳がん、骨髄がん、子宮頸がん、慢性リンパ性白血病、結腸直腸がん、食道がん、肝細胞がん、リンパ芽球性白血病、濾胞性リンパ腫、T細胞もしくはB細胞由来のリンパ性悪性腫瘍、黒色腫、骨髄性白血病、骨髄腫、口腔がん、卵巣がん、非小細胞肺がん、慢性リンパ性白血病、前立腺がん、小細胞肺がんまたは脾臓がんである。一部の実施形態では、がんは、リンパ腫または胃がんである。
別の例示的な実施形態は、対象からの生物学的試料を用意すること;試料を抗体-薬物コンジュゲートと接触させること;および試料中のがん細胞との抗体-薬物コンジュゲートの結合を検出することにより、がんを有するか、または有することが疑われる対象が抗体-薬物コンジュゲート、組成物または医薬組成物(例えば、本明細書に開示の例示的な抗体-薬物コンジュゲート、組成物または医薬組成物のいずれか)での処置に応答するかどうか判定する方法である。一部の実施形態では、試料中のがん細胞は標的抗原を発現する。一部の実施形態では、がんは標的抗原を発現する。一部の実施形態では、標的抗原は、BCMA、CD33、HER2、CD38、CD48、CD79b、PCAD、CD74、CD138、SLAMF7、CD123、CLL1、FLT3、CD7、CKIT、CD56、DLL3、DLK1、B7-H3、EGFR、CD71、EPCAM、FOLR1、ENPP3、MET、AXL、SLC34A2、ネクチン4、TROP2、LIV1、CD46またはGPNMBである。一部の実施形態では、標的抗原は、4-1BB、5AC、5T4、アルファ-フェトプロテイン、アンジオポエチン2、ASLG659、TCLI、BMPRIB、ブレビカンBCAN、BEHAB、C242抗原、C5、CA-125、CA-125(模倣物)、CA-IX(炭酸脱水酵素9)、CCR4、CD140a、CD152、CD19、CD20、CD200、CD21(C3DR)I)、CD22(B細胞受容体CD22-Bアイソフォーム)、CD221、CD23(gE受容体)、CD28、CD30(TNFRSF8)、CD37、CD4、CD40、CD44 v6、CD51、CD52、CD70、CD72(Lyb-2、B細胞分化抗原CD72)、CD79a、CD80、CEA、CEA関連抗原、ch4D5、CLDN18.2、CRIPTO(CR、CRI、CRGF、TDGF1)、CTLA-4、CXCR5、DLL4、DR5、E16(LATI、SLC7A5)、EGFL7、EphB2R(DRT、ERK、Hek5、EPHT3、Tyro5)、エピシアリン、ERBB3、ETBR(エンドセリンB型受容体)、FCRHI(Fc受容体様タンパク質I)、FcRH2(IFGP4、IRTA4、SPAPI、SPAP IB、SPAP IC)、フィブロネクチンエクストラドメイン-B、Frizzled受容体、GD2、GD3ガングリオシド、GEDA、HER1、HER2/neu、HER3、HGF、HLA-DOB、HLA-DR、ヒト散乱因子受容体キナーゼ、IGF-I受容体、IL-13、IL20R(ZCYTOR7)、IL-6、ILGF2、ILFRIR、インテグリンu、IRTA2(免疫グロブリンスーパーファミリー受容体転座関連2)、ルイス-Y抗原、LY64(RP105)、MCP-I、MDP(DPEPI)、MPF、MSLN、SMR、メソテリン、巨核球、PD-I、PDCDI、PDGF-R u、前立腺特異的膜抗原、PSCA(前立腺幹細胞抗原前駆体)、PSCA hlg、RANKL、RON、SDCI、Sema Sb、STEAP I、STEAP2、PCANAP I、STAMP I、STEAP2、STMP、前立腺がん関連遺伝子I、TAG-72、TEMI、テネイシンC、TENB2、(TMEFF2、トモレグリン、TPEF、HPPI、TR)、TGF-IJ、TRAIL-E2、TRAIL-Rl、TRAIL-R2、T17M4(BR22450、FLJ20041、TRPM4、TRPM4B、一過性受容器電位カチオンチャネルサブファミリーM、メンバー4)、TWEAK-R、TYRP I(糖タンパク質75)、VEGF、VEGF-A、EGFR-I、VEGFR-2またはビメンチンである。一部の実施形態では、標的抗原は、BCMA、CD33、PCAD、HER2、CD38、CD46、CD48またはCD79bである。一部の実施形態では、標的抗原は、BCMA、CD33、CD48、PCADまたはHER2である。一部の実施形態では、標的抗原は、CD38またはCD48である。一部の実施形態では、がんは、腫瘍または血液がんである。一部の実施形態では、がんは、乳がん、多発性骨髄腫、形質細胞性骨髄腫、白血病、リンパ腫、胃がん、急性骨髄性白血病、膀胱がん、脳がん、骨髄がん、子宮頸がん、慢性リンパ性白血病、結腸直腸がん、食道がん、肝細胞がん、リンパ芽球性白血病、濾胞性リンパ腫、T細胞もしくはB細胞由来のリンパ性悪性腫瘍、黒色腫、骨髄性白血病、骨髄腫、口腔がん、卵巣がん、非小細胞肺がん、慢性リンパ性白血病、前立腺がん、小細胞肺がんまたは脾臓がんである。一部の実施形態では、がんは、リンパ腫または胃がんである。一部の実施形態では、試料は、組織生検試料、血液試料または骨髄試料である。
記載されたADC化合物および組成物を作製する方法も開示される。例示的な実施形態は、コンジュゲーションを可能にする条件下、Mcl-1阻害剤に連結された切断可能なリンカーと抗体または抗原結合性断片を反応させることにより抗体-薬物コンジュゲートを作製する方法である。
細菌性トランスグルタミナーゼ(BTG)を使用する例示的な部位特異的抗体コンジュゲーションを示す図である。 A4-Fuk細胞での遊離Mcl-1ペイロード(P1)、CD38標的化Mcl-1 ADC、および非標的化アイソタイプADCの用量応答曲線を示す。 KMS021 BM細胞での遊離Mcl-1ペイロード(P1)、CD38標的化Mcl-1 ADC、および非標的化アイソタイプADCの用量応答曲線を示す。 NCI-H929細胞での遊離Mcl-1ペイロード(P1)、CD48標的化Mcl-1 ADC、および非標的化アイソタイプADCの用量応答曲線を示す。 OPM-2細胞での遊離Mcl-1ペイロード(P1)、CD48標的化Mcl-1 ADC、および非標的化アイソタイプADCの用量応答曲線を示す。 AMO1細胞での遊離Mcl-1ペイロード(P1)、CD48標的化Mcl-1 ADC、および非標的化アイソタイプADCの用量応答曲線を示す。 RS4、11細胞での遊離Mcl-1ペイロード(P1)、CD79b標的化Mcl-1 ADC、および非標的化アイソタイプADCの用量応答曲線を示す。 HCC1954細胞での遊離Mcl-1ペイロード(P1)、およびHER2標的化Mcl-1 ADCの用量応答曲線を示す。 HCC2218細胞での遊離Mcl-1ペイロード(P1)、およびHER2標的化Mcl-1 ADCの用量応答曲線を示す。 AMO1-CD33クローンD2細胞での遊離Mcl-1ペイロード(P1)、CD33標的化Mcl-1 ADC、および非標的化アイソタイプADCの用量応答曲線を示す。 MOLM-13細胞での遊離Mcl-1ペイロード(P1)、CD33標的化Mcl-1 ADC、および非標的化アイソタイプADCの用量応答曲線を示す。 NCI-H929細胞での遊離Mcl-1ペイロード(P1)、BCMA標的化Mcl-1 ADC、および非標的化アイソタイプADCの用量応答曲線を示す。 MTT細胞生存率アッセイの結果を示す。全ての試験した抗CD33 ADCおよび対応するペイロードは、AMO1-CD33クローンD2細胞の生存率での用量依存的減少を誘発した一方、対応する裸の抗体では著しい効果は観察されなかった。 MTT細胞生存率アッセイの結果を示す。全ての試験した抗CD33 ADCおよび対応するペイロードは、AMO1-CD33クローンD2細胞の生存率での用量依存的減少を誘発した一方、対応する裸の抗体では著しい効果は観察されなかった。 CTG細胞生存率アッセイの結果を示す。全ての試験した抗HER2 ADCおよび対応するペイロードは、HCC1954細胞の生存率での用量依存的減少を誘発した一方、対応する裸の抗体では著しい効果は観察されなかった。 CTG細胞生存率アッセイの結果を示す。全ての試験した抗HER2 ADCおよび対応するペイロードは、HCC1954細胞の生存率での用量依存的減少を誘発した一方、対応する裸の抗体では著しい効果は観察されなかった。 MTT細胞生存率アッセイの結果を示す。全ての試験した抗BCMA ADCおよび対応するペイロードは、NCI-H929細胞の生存率での用量依存的減少を誘発した一方、対応する裸の抗体では著しい効果は観察されなかった。 MTT細胞生存率アッセイの結果を示す。全ての試験した抗BCMA ADCおよび対応するペイロードは、NCI-H929細胞の生存率での用量依存的減少を誘発した一方、対応する裸の抗体では著しい効果は観察されなかった。 MTT細胞生存率アッセイの結果を示す。全ての試験した抗BCMA ADCおよび対応するペイロードは、NCI-H929細胞の生存率での用量依存的減少を誘発した一方、対応する裸の抗体では著しい効果は観察されなかった。 MTT細胞生存率アッセイの結果を示す。全ての試験した抗BCMA ADCおよび対応するペイロードは、NCI-H929細胞の生存率での用量依存的減少を誘発した一方、対応する裸の抗体では著しい効果は観察されなかった。 アイソタイプ対照IgG1-リンカー-ペイロードFcサイレント、抗BCMA_CysmAb Fcサイレント、または抗BCMA_CysmAb Fcサイレント_L7-P1(10および/または30mg/kg、IVで1回投与、n=6)で処置した際のNCI-H929を移植した雌のSCIDマウスの腫瘍体積(mm)を示す。 アイソタイプ対照IgG1-リンカー-ペイロードFcサイレント、抗BCMA_CysmAb Fcサイレント、または抗BCMA_CysmAb Fcサイレント_L7-P1(10および/または30mg/kg、IVで1回投与、n=6)で処置した際のNCI-H929を移植した雌のSCIDマウスの体重減少のパーセンテージ(%)を示す。 NCI-H929細胞において抗CD48 ADCを試験するCTG細胞生存率アッセイの結果を示す。 KHM1B細胞において抗CD48 ADCを試験するCTG細胞生存率アッセイの結果を示す。 KMS21BM細胞において抗CD48 ADCを試験するCTG細胞生存率アッセイの結果を示す。 抗BCMA_CysmAb Fcサイレントまたは異なる抗BCMA_CysmAb FcサイレントADC(20mg/kg、IVで1回投与、n=6)で処置した際の無作為化後の時間(日数)でのH929を移植した雌のSCIDマウスの腫瘍体積(mm)を示す。 抗BCMA_CysmAb Fcサイレントまたは異なる抗BCMA_CysmAb FcサイレントADC(20mg/kg、IVで1回投与、n=6)で処置した際の無作為化後の時間(日数)でのH929を移植した雌のSCIDマウスの体重減少の%を示す。 IgG1-リンカー-ペイロードFcサイレント、抗CD48_CysmAb Fcサイレント、または抗CD48_CysmAb Fcサイレント_L5-P1(30mg/kg、IVで1回投与、n=8)で処置した際の無作為化後の時間(日数)でのH929を移植した雌のSCIDマウスの腫瘍体積(mm)を示す。 IgG1-リンカー-ペイロードFcサイレント、抗CD48_CysmAb Fcサイレント、または抗CD48_CysmAb Fcサイレント_L5-P1(30mg/kg、IVで1回投与、n=8)で処置した際の無作為化後の時間(日数)でのH929を移植した雌のSCIDマウスの体重減少の%を示す。 CTG細胞生存率アッセイの結果を示す。抗CD46-Mcl-1 ADC Ab C-L9-C1および対応するペイロードC1は、KMS21BM細胞の生存率での用量依存的減少を誘発した一方、対応する裸の抗体では著しい効果は観察されなかった。 MTT細胞生存率アッセイの結果を示す。全てのADCは、AMO1-CD33クローンD2細胞の生存率において単剤での用量依存的減少を誘発した。興味深いことに、ADCの活性は、BCL2阻害剤化合物A1と組み合わせた場合に著しく改善される一方、これらの細胞を、対応する裸の抗体を単剤で、または1μMの化合物A1と組み合わせて処置した後では著しい効果は観察されなかった。 MTT細胞生存率アッセイの結果を示す。全てのADCは、AMO1-CD33クローンD2細胞の生存率において単剤での用量依存的減少を誘発した。興味深いことに、ADCの活性は、BCL2阻害剤化合物A1と組み合わせた場合に著しく改善される一方、これらの細胞を、対応する裸の抗体を単剤で、または1μMの化合物A1と組み合わせて処置した後では著しい効果は観察されなかった。 MTT細胞生存率アッセイの結果を示す。全ての抗BCMA-Mcl-1 ADCは、AMO1細胞の生存率での用量依存的減少を誘発した。興味深いことに、ADCの活性は、BCL2阻害剤化合物A1と組み合わせた場合に著しく改善された一方、これらの細胞を、対応する裸の抗体を単剤で、または1μMの化合物A1と組み合わせて処置した後では著しい効果は観察されなかった。 MTT細胞生存率アッセイの結果を示す。全ての抗BCMA-Mcl-1 ADCは、AMO1細胞の生存率での用量依存的減少を誘発した。興味深いことに、ADCの活性は、BCL2阻害剤化合物A1と組み合わせた場合に著しく改善された一方、これらの細胞を、対応する裸の抗体を単剤で、または1μMの化合物A1と組み合わせて処置した後では著しい効果は観察されなかった。 MTT細胞生存率アッセイの結果を示す。全ての抗BCMA-Mcl-1 ADCは、H929細胞の生存率での用量依存的減少を誘発した。興味深いことに、ADCの活性は、BCL2阻害剤化合物A1と組み合わせた場合に著しく改善される一方、これらの細胞を、対応する裸の抗体を単剤で、または1μMの化合物A1と組み合わせて処置した後では著しい効果は観察されなかった。 MTT細胞生存率アッセイの結果を示す。全ての抗BCMA-Mcl-1 ADCは、H929細胞の生存率での用量依存的減少を誘発した。興味深いことに、ADCの活性は、BCL2阻害剤化合物A1と組み合わせた場合に著しく改善される一方、これらの細胞を、対応する裸の抗体を単剤で、または1μMの化合物A1と組み合わせて処置した後では著しい効果は観察されなかった。 KMS-21BM、KMS-20、KMS-27、およびNCI-H929に対するCD48 MCL-1抗体薬物コンジュゲートCD48-L7-P1、アイソタイプIgG1-L7-P1 ADC、およびMCL-1遊離ペイロードP1の阻害活性を示す。 KMS-21BM、KMS-20、KMS-27、およびNCI-H929に対するベネトクラクスと組み合わせたCD48 MCL-1抗体薬物コンジュゲートCD48-L7-P1、アイソタイプIgG1-L7-P1 ADC、およびMCL-1遊離ペイロードP1の阻害活性を示す。 KMS-21BM、KMS-20、KMS-27、およびNCI-H929に対するベネトクラクスと組み合わせたCD48 MCL-1抗体薬物コンジュゲートCD48-L7-P1、アイソタイプIgG1-L7-P1 ADC、およびMCL-1遊離ペイロードP1の阻害活性を示す。
開示される組成物および方法は、本開示の一部を形成する添付の図面と関連させた以下の詳細な説明への参照によって、より容易に理解することができる。
本文全体にわたり、本記載は組成物および組成物を使用する方法に言及する。本開示が組成物に関連する特性または実施形態を説明または特許請求する場合、そのような特性または実施形態は、組成物を使用する方法に等しく使用可能である。同様に、本開示が組成物を使用する方法に関連する特性または実施形態を説明または特許請求する場合、そのような特性または実施形態は、組成物に等しく使用可能である。
値の範囲が表現される場合、これは範囲内の任意の特定の値を使用する実施形態を含む。さらに、範囲内で述べられる値への言及は、その範囲内の各およびあらゆる値を含む。すべての範囲は、それらの端点を含み、組合せ可能である。同様に、値が近似として表現されるとき、先行詞「約」を使用することによって、特定の値が別の実施形態を形成することが理解される。特定の数値への言及は、文脈上別段に明記されていない限り、少なくともその特定の値を含む。「または」の使用は、その使用の特定の文脈上別段に記されていない限り、「および/または」を意味することとなる。本明細書で引用されているすべての引用文献は、任意の目的のために参照により組み込まれる。参照と本明細書とが矛盾する場合、本明細書が優先される。
本明細書の文脈上別段に示されない限り、例えば接続の特定の点を表す記号の不在下で、構造または構造の断片が描かれる場合、それ自体またはADCの他の構成成分へ結合させて使用することができ、これは任意の方向で、例えば抗体を化学的部分、例えばリンカー-薬物に任意の好適な結合点で結合させて、使用することができる。しかし示される場合、ADCの構成成分は、所与の式において示される方向で結合している。例えば式(1)がAb-(L-D)として説明され、群「-(L-D)」が
Figure 2022532918000177
として説明される場合、式(1)の緻密な構造は
Figure 2022532918000178
である。これは
Figure 2022532918000179
ではない。
明瞭にするために、別個の実施形態の文脈において本明細書で記載される、開示される組成物および方法のある特定の特性はまた、単一の実施形態において組み合わせて提供されてもよいことが諒解される。逆に、簡潔にするために、単一の実施形態の文脈において記載される、開示される組成物および方法の様々な特性はまた、別個にもしくは任意の部分組合せにおいて提供されてもよい。
本出願全体にわたり使用される場合、抗体薬物コンジュゲートは、「標的抗原/抗体-リンカー-ペイロード」という一般形式の命名規則を使用して特定することができる。例のみとして、抗体薬物コンジュゲートが「標的X-L0-P0」と称される場合、そのようなコンジュゲートは、標的Xに結合する抗体、L0と命名されるリンカーおよびP0と命名されるペイロードを含むであろう。あるいは、抗体薬物コンジュゲートが「抗標的X-L0-P0」と称される場合、そのようなコンジュゲートは、標的Xに結合する抗体、L0と命名されるリンカーおよびP0と命名されるペイロードを含むであろう。あるいは、抗体薬物コンジュゲートが「AbX-L0-P0」と称される場合、そのようなコンジュゲートは、AbXと命名される抗体、L0と命名されるリンカーおよびP0と命名されるペイロードを含むであろう。非特異的アイソタイプ対照抗体を含む対照抗体薬物コンジュゲートは、「アイソタイプ対照IgG1-L0-P0」または「IgG1-L0-P0」として言及されることがある。
本明細書で示される任意の式は、化合物の標識されていない形態ならびに同位体で標識された形態を表すことも意図されている。同位体で標識された化合物は、1つまたは複数の原子が選択された原子量または質量数を有する原子により置換されていることを除いて、本明細書で示される式により表される構造を有する。本発明の化合物中に組み入れることのできる同位体には、例えば水素、炭素、窒素、酸素、フッ素および塩素の同位体、例えばH、11C、13C、14C、15N、18Fおよび36Clが挙げられる。したがって、本開示は、例えば、放射性同位体、例えばHおよび14Cを含む上述の同位体のいずれかの1つまたは複数を組み込む化合物、またはその中に非放射性同位体、例えばHおよび13Cが存在するものを含むことを理解されたい。そのような同位体で標識された化合物は、代謝試験(14Cを用いる)、反応動力学試験(例えばHまたはHを用いる)、検出もしくはイメージング技術、例えば薬物もしくは物質の組織分布アッセイを含む陽電子放射断層撮影(PET)もしくは単一光子放射断層撮影(SPECT)において、または患者の放射線処置において、有用である。特に、18Fまたは標識された化合物は、PETまたはSPECT試験に特に望ましいことがある。同位体で標識された化合物は、一般的に、当業者に公知の従来の技術により、例えば以前採用された標識されていない試薬の代わりに適切な同位体で標識された試薬を使用して、調製することができる。
定義
記載の態様に関する様々な用語が、本明細書および特許請求の範囲の全体にわたり使用される。そのような用語は、特に断りのない限り、当該技術分野における通常の意味を与えられることとなる。他の具体的に定義された用語は、本明細書で提供される定義と一致する方法で解釈されることとなる。
本明細書で使用される場合、単数形「1つの」(「a」、「an」)および「その」(「the」)は、文脈上別段に記されていない限り、複数形を含む。「含む(comprising)」、「有する」、「化学式のものである」におけるような「のものである」、「含む(including)」および「含有する」という用語は、特に断りのない限り、オープンな用語(すなわち「限定されるものではないが、含む」を意味する)と解釈される。加えて、「含む(comprising)」または別のオープンエンドの用語が一実施形態において使用される場合はいつでも、同じ実施形態を中間的な用語「から本質的になる」またはクローズな用語「からなる」を使用してより狭く特許請求することができることを理解されたい。
「約」または「およそ」という用語は、数値および範囲の文脈において使用される場合、本明細書に含有される教示から当業者に明らかであるような、実施形態を意図されているように行うことができるような、列挙された値または範囲に近似するかまたはそれに近い値または範囲を指す。一部の実施形態では、約は、数量のプラスまたはマイナス20%、15%、10%、5%、1%、0.5%または0.1%を意味する。一実施形態では、「約」という用語は、特定の値よりも10%多いかまたは少ない値の範囲を指す。別の実施形態では、「約」という用語は、特定の値よりも5%多いかまたは少ない値の範囲を指す。別の実施形態では、「約」という用語は、特定の値よりも1%多いかまたは少ない値の範囲を指す。
「抗体-薬物コンジュゲート」、「抗体コンジュゲート」、「コンジュゲート」、「イムノコンジュゲート」および「ADC」という用語は互換的に使用され、1つまたは複数の抗体または抗原結合性断片と連結する1つまたは複数の治療化合物(例えばMcl-1阻害剤)を指す。一部の実施形態では、ADCは、一般式:Ab-(L-D)(式1)(式中、Ab=抗体または抗原結合性断片、L=リンカー部分、D=薬物部分(例えばMcl-1阻害剤薬物部分)およびp=抗体または抗原結合性断片あたりの薬物部分の数である)により定義される。Mcl-1阻害剤薬物部分を含むADCでは、「p」は、抗体または抗原結合性断片に連結したMcl-1阻害剤化合物の数を指す。
「抗体」という用語は、最も広い意味で、免疫グロブリン分子の可変領域中の少なくとも1つの抗原認識部位を通して、標的、例えばタンパク質、ポリペプチド、炭水化物、ポリヌクレオチド、脂質または上記の組合せを認識し特異的に結合する、免疫グロブリン分子を指す。抗体は、ポリクローナルもしくはモノクローナルの、複数鎖もしくは単鎖の、または無傷免疫グロブリンであることができ、天然供給源または組換え供給源に由来することができる。「無傷」抗体は、典型的に、ジスルフィド結合により相互接続されている少なくとも2つの重(H)鎖および2つの軽(L)鎖を含む糖タンパク質である。各重鎖は、重鎖可変領域(本明細書でVHと略される)および重鎖定常領域から構成される。重鎖定常領域は、3つのドメイン、CH1、CH2およびCH3を含む。各軽鎖は、軽鎖可変領域(本明細書でVLと略される)および軽鎖定常領域から構成される。軽鎖定常領域は、1つのドメイン、CLから構成される。VHおよびVL領域は、フレームワーク領域(FR)と名付けられるより保存的な領域が介在する、相補性決定領域(CDR)と名付けられる超可変性の領域にさらに細分することができる。各VHおよびVLは、以下の順序:FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、FR4でアミノ末端からカルボキシル末端へと配列される、3つのCDRおよび4つのFRから構成される。重鎖および軽鎖の可変領域は、抗原と相互作用する結合ドメインを含有する。抗体の定常領域は、免疫系の様々な細胞(例えばエフェクター細胞)および古典的補体系の第1の構成成分(C1q)を含む宿主組織または因子への、免疫グロブリンの結合を媒介することができる。抗体は、モノクローナル抗体、ヒト抗体、ヒト化抗体、ラクダ化抗体(camelised antibody)またはキメラ抗体であることができる。抗体は、任意のアイソタイプ(例えばIgG、IgE、IgM、IgD、IgAおよびIgY)、クラス(例えばIgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1およびIgA2)またはサブクラスのものであることができる。抗体は、無傷抗体またはその抗原結合性断片であることができる。
「抗体断片」または「抗原結合性断片」または「機能性抗体断片」という用語は、本明細書で使用される場合、抗原(例えばBCMA、CD33、PCADまたはHER2)のエピトープと特異的に相互作用する(例えば結合、立体障害、安定化/不安定化、空間的分布により)能力を保持する少なくとも1つの抗体の部分を指す。抗原結合性断片は、抗原発現細胞中に内在化する能力も保持することができる。一部の実施形態では、抗原結合性断片は、免疫エフェクター活性も保持する。抗体、抗体断片、抗原結合性断片等の用語は、より大きな巨大分子、例えばADCの文脈における抗体由来の結合ドメインの使用を包含することを意図されている。全長抗体の断片は、全長抗体の抗原結合機能を行うことができることが示されている。抗体断片の例には、限定されるものではないが、Fab、Fab’、F(ab’)2、Fv断片、scFv抗体断片、ジスルフィド連結したFvs(sdFv)、VHおよびCH1ドメインからなるFd断片、線状抗体、単一ドメイン抗体、例えばsdAb(VLまたはVHのいずれか)、ラクダVHHドメイン、抗体断片、例えばヒンジ領域でジスルフィド架橋により連結された2つのFab断片を含む二価の断片から形成された多重特異性抗体、ならびに抗体の単離されたCDRまたは他のエピトープ結合断片が挙げられる。抗原結合性断片は、単一ドメイン抗体、マキシボディ、ミニボディ、ナノボディ、イントラボディ、ダイアボディ、トリアボディ、テトラボディ、二重特異性または多重特異性抗体構築物、ADC、v-NARおよびbis-scFv中に組み込むこともできる(例えば、Holliger and Hudson (2005) Nat Biotechnol. 23(9):1126-36を参照されたい)。抗原結合性断片は、ポリペプチドをベースとする足場、例えばフィブロネクチンIII型(Fn3)中に移植することもできる(フィブロネクチンポリペプチドミニボディを説明する米国特許第6,703,199号明細書を参照されたい)。「scFv」という用語は、軽鎖の可変領域を含む少なくとも1つの抗原結合性断片および重鎖の可変領域を含む少なくとも1つの抗原結合性断片を含む融合タンパク質を指し、ここで軽鎖および重鎖可変領域は、例えば合成リンカー、例えば短い可撓性のポリペプチドリンカーを介して連続して連結され、単一鎖ポリペプチドとして発現することが可能であり、ここでscFvは、それが由来する無傷抗体の特異性を保持する。指定のない限り、scFvは、VLおよびVH可変領域をいずれかの順序で有することができ、例えばポリペプチドのN末端およびC末端に対して、scFvはVL-リンカー-VHを含むことができるか、またはVH-リンカー-VLを含むことができる。抗原結合性断片は当業者に公知の従来の技術を使用して得られ、結合断片は、無傷抗体と同じ方法で、有用性(例えば結合親和性、内在化)についてスクリーニングされる。抗原結合性断片は、例えば、無傷タンパク質の切断、例えばプロテアーゼまたは化学的切断により調製することができる。
「相補性決定領域」または「CDR」という用語は、本明細書で使用される場合、抗原特異性および結合親和性を付与する抗体可変領域中のアミノ酸の配列を指す。例えば一般的に、各重鎖可変領域中には3つのCDR(例えばHCDR1、HCDR2およびHCDR3)、各軽鎖可変領域中には3つのCDR(LCDR1、LCDR2、およびLCDR3)が存在する。所与のCDRの正確なアミノ酸配列境界は、Kabat et al. (1991)“Sequences of Proteins of Immunological Interest,” 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD(「Kabat」番号付けスキーム);Al-Lazikani et al. (1997) J Mol Biol. 273(4):927-48(「Chothia」番号付けスキーム);ImMunoGenTics(IMGT)番号付け(Lefranc (2001) Nucleic Acids Res. 29(1):207-9; Lefranc et al. (2003) Dev Comp Immunol. 27(1):55-77)(「IMGT」番号付けスキーム)により記載されるものを含む多数の周知のスキームのいずれか、またはそれらの組合せを使用して決定することができる。所与のCDR領域(例えばHC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2またはLC CDR3)についての組み合わされたKabatおよびChothia番号付けスキームでは、一部の実施形態では、CDRは、Chothia CDRの一部と定義されたアミノ酸残基と共に、Kabat CDRの一部と定義されるアミノ酸残基に対応する。本明細書で使用される場合、「Chothia」番号付けスキームにより定義されたCDRは、「超可変ループ」と称される場合もある。
一部の実施形態では、Kabatの下で、重鎖可変ドメイン(VH)中のCDRアミノ酸残基は、31~35(HCDR1)(例えば35位の後の挿入)、50~65(HCDR2)および95~102(HCDR3)と番号付けられ;軽鎖可変ドメイン(VL)中のCDRアミノ酸残基は、24~34(LCDR1)(例えば27位の後の挿入)、50~56(LCDR2)および89~97(LCDR3)と番号付けられる。一部の実施形態では、Chothiaの下で、VH中のCDRアミノ酸は、26~32(HCDR1)(例えば31位の後の挿入)、52~56(HCDR2)および95~102(HCDR3)と番号付けられ;VL中のアミノ酸残基は、26~32(LCDR1)(例えば30位の後の挿入)、50~52(LCDR2)および91~96(LCDR3)と番号付けられる。KabatおよびChothiaの両方のCDR定義を組み合わせることにより、一部の実施形態では、CDRは、例えばヒトVH中のアミノ酸残基26~35(HCDR1)、50~65(HCDR2)および95~102(HCDR3)およびヒトVL中のアミノ酸残基24~34(LCDR1)、50~56(LCDR2)および89~97(LCDR3)を含むかまたはそれからなる。一部の実施形態では、IMGTの下で、VH中のCDRアミノ酸残基は、およそ26~35(CDR1)、51~57(CDR2)および93~102(CDR3)と番号付けられ、VL中のCDRアミノ酸残基は、およそ27~32(CDR1)、50~52(CDR2)および89~97(CDR3)と番号付けられる。一部の実施形態では、IMGTの下で、抗体のCDR領域は、プログラムIMGT/Domain Gap Alignを使用して決定することができる。
「モノクローナル抗体」という用語は、本明細書で使用される場合、実質的に相同な抗体の集団から得られた抗体を指し、すなわち集団を構成する個々の抗体は、少量で生じることのある天然に存在する突然変異の可能性を除き、同一である。モノクローナル抗体は高度に特異的であり、単一の抗原エピトープに対するものである。対照的に、従来の(ポリクローナル)抗体製剤には、典型的に、異なるエピトープに対する(またはそれに特異的な)多くの抗体が挙げられる。修飾語句「モノクローナル」は、実質的に相同な抗体の集団から得られるような抗体の特性を表し、任意の特定の方法による必要とされる抗体の作製としては解釈されない。例えば、本開示により使用されることとなるモノクローナル抗体は、例えば、Kohler et al. (1975) Nature 256:495により最初に記載されたハイブリドーマ法により作製することができ、または組換えDNA法(例えば米国特許第4,816,567号明細書を参照されたい)により作製することができる。モノクローナル抗体は、例えば、Clackson et al. (1991)Nature352:624-8、およびMarks et al. (1991)J Mol Biol.222:581-97において記載された技術を使用して、ファージ抗体ライブラリーから単離することもできる。この用語は、単一分子組成物の抗体分子の製剤も含む。モノクローナル抗体組成物は、特定のエピトープについての単一の結合特異性および親和性を示す。
本明細書で記載されるモノクローナル抗体は、非ヒト、ヒト、またはヒト化であることができる。この用語は「キメラ」抗体を具体的に含み、ここで重鎖および/または軽鎖の部分は、特定の種に由来するかまたは特定の抗体クラスもしくはサブクラスに属する対応する抗体中の配列と同一または相同であり、一方で鎖の残部は別の種に由来するかまたは別の抗体クラスもしくはサブクラスに属する抗体中の、ならびにこれらが標的抗原と特異的に結合する、および/または所望の生物活性を示す限り、そのような抗体の断片中の、対応する配列と同一であるかまたは相同である。
「ヒト抗体」という用語は、本明細書で使用される場合、ヒトにより産生される抗体またはヒトにより産生される抗体のアミノ酸配列を有する抗体を指す。この用語は、フレームワークおよびCDR領域の両方がヒト由来の配列に由来する可変領域を有する抗体を含む。さらに抗体が定常領域を含有する場合、定常領域も、そのようなヒト配列、例えばヒト生殖細胞系配列、またはヒト生殖細胞系配列の突然変異バージョン、またはKnappik et al. ((2000) J Mol Biol. 296(1):57-86)において記載されるようなヒトフレームワーク配列分析に由来するコンセンサスフレームワーク配列を含有する抗体に由来する。免疫グロブリン可変ドメイン、例えばCDRの構造および位置は、周知の番号付けスキーム、例えばKabat番号付けスキーム、Chothia番号付けスキーム、またはKabatとChothiaとの組合せ、および/またはImMunoGenTics(IMGT)番号付けを使用して定義することができる。本発明のヒト抗体は、ヒト配列によりコードされていないアミノ酸残基(例えば、in vitroのランダムまたは部位特異的突然変異誘発により、もしくはin vivoの体細胞突然変異により誘発される突然変異、または安定性または作製を促進するための保存的置換)を含むことができる。しかし、「ヒト抗体」という用語は、本明細書で使用される場合、他の哺乳動物種、例えばマウスの生殖細胞系に由来するCDR配列がヒトフレームワーク配列に移植されている抗体を含むことは意図されない。
「組換えヒト抗体」という用語は、本明細書で使用される場合、組換え手段により調製、発現、生成または単離されるヒト抗体、例えば、ヒト免疫グロブリン遺伝子についてのトランスジェニックもしくはトランス染色体である動物(例えばマウス)またはそれから調製されたハイブリドーマから単離された抗体、ヒト抗体を発現するように形質転換された宿主細胞、例えばトランスフェクトーマから単離された抗体、組換えコンビナトリアルヒト抗体ライブラリーから単離された抗体、および他のDNA配列へのヒト免疫グロブリン遺伝子配列のすべてまたは一部のスプライシングを伴う任意の他の手段により調製、発現、生成または単離される抗体を指す。そのような組換えヒト抗体は、フレームワークおよびCDR領域がヒト生殖細胞系免疫グロブリン配列に由来する可変領域を有する。しかし、一部の実施形態では、そのような組換えヒト抗体は、in vitroの突然変異誘発(または、ヒトIg配列についてのトランスジェニック動物が使用される場合、in vivoの体細胞突然変異誘発)を受けることができ、よって、組換え抗体のVHおよびVL領域のアミノ酸配列は、ヒト生殖細胞系VHおよびVL配列に由来し関連する一方で、in vivoのヒト抗体生殖細胞系レパートリー中に天然に存在しないであろう配列である。
「キメラ抗体」という用語は、本明細書で使用される場合、免疫グロブリン分子のアミノ酸配列が2つ以上の種に由来する抗体を指す。一部の事例では、重鎖および軽鎖の両方の可変領域は、所望の特異性、親和性および活性を有する1つの種に由来する抗体の可変領域に対応し、一方で定常領域は、別の種(例えばヒト)の種における免疫反応を最小化するために、後者の種に由来する抗体と相同である。
本明細書で使用される場合、「ヒト化抗体」は、非ヒト(例えばマウス)抗体およびヒト抗体からの配列を含有する抗体の形態を指す。そのような抗体は、非ヒト免疫グロブリンに由来する最小配列を含有するキメラ抗体の一種である。一般に、ヒト化抗体は、すべてまたは実質的にすべての超可変ループが非ヒト免疫グロブリンのものに対応し、すべてまたは実質的にすべてのフレームワーク(FR)領域がヒト免疫グロブリン配列のものである、実質的にすべての少なくとも1つ、典型的には2つの可変ドメインを含むこととなる。ヒト化抗体は、必要に応じて、典型的にはヒト免疫グロブリンのものである免疫グロブリン定常領域(Fc)の少なくとも一部も含むこととなる。ヒト化抗体は、抗体特異性、親和性および/または活性を改良および最適化するために、Fvフレームワーク領域および/または置換された非ヒト残基中のいずれかにおける残基の置換によりさらに修飾することができる。
「Fc領域」という用語は、本明細書で使用される場合、CH3、CH2および抗体の定常ドメインのヒンジ領域の少なくとも一部を含むポリペプチドを指す。必要に応じて、Fc領域は、一部の抗体クラスにおいて存在するCH4ドメインを含むことができる。Fc領域は、抗体の定常ドメインのヒンジ領域全体を含むことができる。一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片は、抗体のFc領域およびCH1領域を含む。一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片は、抗体のFc領域およびCH3領域を含む。一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片は、抗体のFc領域、CH1領域および定常ドメインからのカッパ/ラムダ領域を含む。一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片は、定常領域、例えば重鎖定常領域および/または軽鎖定常領域を含む。一部の実施形態では、そのような定常領域は野生型定常領域と比較して修飾される。すなわち、ポリペプチドは、3つの重鎖定常ドメイン(CH1、CH2、またはCH3)および/または軽鎖定常領域ドメイン(CL)の1つまたは複数に対する変更または修飾を含むことができる。修飾の例には、1つまたは複数のドメイン中の1つまたは複数のアミノ酸の付加、欠失または置換が挙げられる。そのような変更は、エフェクター機能、半減期等を最適化するために含められてもよい。
「内在化」は、抗体または抗原結合性断片への言及において本明細書で使用される場合、細胞に結合する際に細胞の脂質二重膜を通過して、内部の区画、好ましくは細胞中の分解性の区画へと取り込まれる(すなわち「内在化する」)ことが可能な抗体または抗原結合性断片を指す。例えば、抗HER2抗体の内在化は、細胞膜上のHER2と結合した後に細胞中に取り込まれることが可能であるものである。一部の実施形態では、本明細書で開示されるADC中で使用される抗体または抗原結合性断片は、細胞表面抗原(例えばBCMA、CD33、PCADまたはHER2)を標的とし、内在化抗体または内在化抗原結合性断片である(すなわち、ADCは、抗原結合後に細胞膜を通って移行する)。一部の実施形態では、内在化抗体または抗原結合性断片は、細胞表面上の受容体に結合する。細胞膜上の受容体を標的とする内在化抗体または内在化抗原結合性断片は、受容体媒介性エンドサイトーシスを誘発することができる。一部の実施形態では、内在化抗体または内在化抗原結合性断片は、受容体媒介性エンドサイトーシスを介して細胞中に取り込まれる。
「非内在化」は、抗体または抗原結合性断片への言及において本明細書で使用される場合、細胞に結合する際に細胞表面に留まる抗体または抗原結合性断片を指す。一部の実施形態では、本明細書で開示されるADC中で使用される抗体または抗原結合性断片は、細胞表面抗原を標的とし、非内在化抗体または非内在化抗原結合性断片である(すなわち、ADCは、抗原結合後に細胞表面に留まり、細胞膜を通って移行しない)。一部の実施形態では、非内在化抗体または抗原結合性断片は、非内在化受容体または他の細胞表面抗原に結合する。代表的な非内在化細胞表面抗原には、限定されるものではないが、CA125およびCEAが挙げられ、非内在化抗原標的に結合する抗体も当該技術分野において公知である(例えばBast et al. (1981) J Clin Invest. 68(5):1331-7;Scholler and Urban (2007) Biomark Med. 1(4):513-23;およびBoudousq et al. (2013) PLoS One 8(7):e69613を参照されたい)。
「B細胞成熟抗原」または「BCMA」という用語は、本明細書で使用される場合、ヒトBCMAの任意の天然型を指す(腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリーメンバー17(TNFRSF17)としても公知である)。この用語は、全長ヒトBCMA(例えばUniProt参照配列:Q02223;配列番号72)、および細胞プロセシングから生じ得るヒトBCMAの任意の形態を包含する。この用語は、限定されるものではないが、スプライスバリアント、対立遺伝子バリアントおよびヒトBCMAの1つまたは複数の生物機能を保持するアイソフォームを含む、ヒトBCMAの機能的バリアントまたは断片も包含する(すなわち、この用語が野生型タンパク質のみを指すために使用されると文脈が示さない限り、バリアントおよび断片が包含される)。BCMAは、ヒトから単離することができ、組換えでまたは合成方法により作製することができる。
「抗BCMA抗体」または「BCMAと結合する抗体」という用語は、本明細書で使用される場合、BCMAに結合する、例えば特異的に結合する、抗体またはその抗原結合性断片の任意の形態を指す。この用語は、モノクローナル抗体(全長モノクローナル抗体を含む)、ポリクローナル抗体、およびBCMAに結合する、例えば特異的に結合する限り、生物学的に機能性の抗原結合性断片を包含する。国際公開第2012/163805号パンフレットは、代表的な抗BCMA抗体配列を含む代表的なBCMA結合配列を提供し、それについて本明細書で参照により組み込まれる。一部の実施形態では、本明細書で開示されるADC中で使用される抗BCMA抗体は、内在化抗体または内在化抗原結合性断片である。J6M0(国際公開第2012/163805号パンフレット)は、代表的な抗BCMA抗体である。
「骨髄性細胞表面抗原CD33」または「CD33」という用語は、本明細書で使用される場合、任意の天然型のヒトCD33を指す(シアル酸結合Ig様レクチン3(SIGLEC3)としても公知である)。この用語は、全長ヒトCD33(例えばUniProt参照配列:P20138;配列番号73)、および細胞プロセシングから生じ得るヒトCD33の任意の形態を包含する。この用語は、限定されるものではないが、ヒトCD33の1つまたは複数の生物機能を保持するスプライスバリアント、対立遺伝子バリアントおよびアイソフォームを含む、ヒトCD33の機能的バリアントまたは断片も包含する(すなわち、この用語が野生型タンパク質のみを指すために使用されると文脈が示さない限り、バリアントおよび断片が包含される)。CD33は、ヒトから単離することができ、組換えでまたは合成方法により作製することができる。
「抗CD33抗体」または「CD33と結合する抗体」という用語は、本明細書で使用される場合、CD33に結合する、例えば特異的に結合する、抗体またはその抗原結合性断片の任意の形態を指す。この用語は、モノクローナル抗体(全長モノクローナル抗体を含む)、ポリクローナル抗体、およびCD33に結合する、例えば特異的に結合する限り、生物学的に機能性の抗原結合性断片を包含する。米国特許出願公開第2013/0078241号明細書は、代表的な抗CD33抗体配列を含む代表的なCD33結合配列を提供し、それについて本明細書で参照により組み込まれる。一部の実施形態では、本明細書で開示されるADC中で使用される抗CD33抗体は、内在化抗体または内在化抗原結合性断片である。MuMy9-6ch(米国特許出願公開第2013/0078241号明細書)は、代表的な抗CD33抗体である。
「P-カドヘリン」または「PCAD」という用語は、本明細書で使用される場合、ヒトPCADの任意の天然型を指す(カドヘリン3、1型またはCDH3としても公知である)。この用語は、全長ヒトPCAD(例えばUniProt参照配列:P22223;配列番号74)、および細胞プロセシングから生じ得るヒトPCADの任意の形態を包含する。この用語は、限定されるものではないが、ヒトPCADの1つまたは複数の生物機能を保持するスプライスバリアント、対立遺伝子バリアントおよびアイソフォームを含む、ヒトPCADの機能的バリアントまたは断片も包含する(すなわち、この用語が野生型タンパク質のみを指すために使用されると文脈が示さない限り、バリアントおよび断片が包含される)。PCADは、ヒトから単離することができ、組換えでまたは合成方法により作製することができる。
「抗PCAD抗体」または「PCADと結合する抗体」という用語は、本明細書で使用される場合、PCADに結合する、例えば特異的に結合する、抗体またはその抗原結合性断片の任意の形態を指す。この用語は、モノクローナル抗体(全長モノクローナル抗体を含む)、ポリクローナル抗体、およびPCADに結合する、例えば特異的に結合する限り、生物学的に機能性の抗原結合性断片を包含する。国際公開第2016/203432号パンフレットは、代表的な抗PCAD抗体配列を含む代表的なPCAD結合配列を提供し、それについて本明細書で参照により組み込まれる。一部の実施形態では、本明細書で開示されるADC中で使用される抗PCAD抗体は、内在化抗体または内在化抗原結合性断片である。NOV169N31Q(国際公開第2016/203432号パンフレット)は、代表的な抗PCAD抗体である。
「ヒト上皮増殖因子受容体2」、「HER2」または「HER2/NEU」という用語は、本明細書で使用される場合、ヒトHER2の任意の天然型を指す。この用語は、全長ヒトHER2(例えばUniProt参照配列:P04626;配列番号75)、および細胞プロセシングから生じ得るヒトHER2の任意の形態を包含する。この用語は、限定されるものではないが、ヒトHER2の1つまたは複数の生物機能を保持するスプライスバリアント、対立遺伝子バリアントおよびアイソフォームを含む、ヒトHER2の機能的バリアントまたは断片も包含する(すなわち、この用語が野生型タンパク質のみを指すために使用されると文脈が示さない限り、バリアントおよび断片が包含される)。HER2は、ヒトから単離することができ、組換えでまたは合成方法により作製することができる。
「抗HER2抗体」または「HER2と結合する抗体」という用語は、本明細書で使用される場合、HER2に結合する、例えば特異的に結合する、抗体またはその抗原結合性断片の任意の形態を指す。この用語は、モノクローナル抗体(全長モノクローナル抗体を含む)、ポリクローナル抗体、およびHER2に結合する、例えば特異的に結合する限り、生物学的に機能性の抗原結合性断片を包含する。米国特許第5,821,337号明細書および第6,870,034号明細書は、代表的な抗HER2抗体配列を含む代表的なHER2結合配列を提供し、それについて本明細書で参照により組み込まれる。一部の実施形態では、本明細書で開示されるADC中で使用される抗HER2抗体は、内在化抗体または内在化抗原結合性断片である。トラスツズマブ(米国特許第5,821,337号明細書および第6,870,034号明細書;Molina et al. (2001) Cancer Res. 61(12):4744-9も参照されたい)は、代表的な抗HER2抗体である。
「表面抗原分類38」または「CD38」という用語は、本明細書で使用される場合、ヒトCD38の任意の天然型を指す(ADP-リボシルシクラーゼ/環状ADP-リボースヒドロラーゼとしても公知である)。この用語は、全長ヒトCD38(例えばUniProt参照配列:P28907;配列番号76)、および細胞プロセシングから生じ得るヒトCD38の任意の形態を包含する。この用語は、限定されるものではないが、ヒトCD38の1つまたは複数の生物機能を保持するスプライスバリアント、対立遺伝子バリアントおよびアイソフォームを含む、ヒトCD38の機能的バリアントまたは断片も包含する(すなわち、この用語が野生型タンパク質のみを指すために使用されると文脈が示さない限り、バリアントおよび断片が包含される)。CD38は、ヒトから単離することができ、組換えでまたは合成方法により作製することができる。
「表面抗原分類48」または「CD48」という用語は、本明細書で使用される場合、ヒトCD48の任意の天然型を指す(Bリンパ球活性化マーカー(B-lymphocyte activation marker)(BLAST-1)またはシグナル伝達リンパ球活性化分子2(signaling lymphocytic activation molecule 2)(SLAMF2)としても公知である)。この用語は、全長ヒトCD48(例えばUniProt参照配列:P09326;配列番号77)、および細胞プロセシングから生じ得るヒトCD48の任意の形態を包含する。この用語は、限定されるものではないが、ヒトCD48の1つまたは複数の生物機能を保持するスプライスバリアント、対立遺伝子バリアントおよびアイソフォームを含む、ヒトCD48の機能的バリアントまたは断片も包含する(すなわち、この用語が野生型タンパク質のみを指すために使用されると文脈が示さない限り、バリアントおよび断片が包含される)。CD48は、ヒトから単離することができ、組換えでまたは合成方法により作製することができる。
「表面抗原分類79b」または「CD79b」という用語は、本明細書で使用される場合、ヒトCD79bの任意の天然型を指す(B細胞抗原受容体複合体関連タンパク質ベータ鎖としても公知である)。この用語は、全長ヒトCD79b(例えばUniProt参照配列:P40259;配列番号78)、および細胞プロセシングから生じ得るヒトCD79bの任意の形態を包含する。この用語は、限定されるものではないが、ヒトCD79bの1つまたは複数の生物機能を保持するスプライスバリアント、対立遺伝子バリアントおよびアイソフォームを含む、ヒトCD79bの機能的バリアントまたは断片も包含する(すなわち、この用語が野生型タンパク質のみを指すために使用されると文脈が示さない限り、バリアントおよび断片が包含される)。CD79bは、ヒトから単離することができ、組換えでまたは合成方法により作製することができる。
「結合特異性」という用語は、本明細書で使用される場合、個々の抗体または抗原結合断片が異なる抗原決定基にわたり1つの抗原決定基と優先的に反応する能力を指す。特異度は、抗体または断片が異なる抗原決定基にわたり1つの抗原決定基に優先的に結合する程度を示す。また、本明細書で使用される場合、「特異的」、「特異的に結合する(specifically binds)」および「特異的に結合する(binds specifically)」という用語は、タンパク質の異種集団および他の生物製剤中の、抗体または抗原結合性断片(例えば抗HER2抗体)と標的抗原(例えばHER2)との間の結合反応を指す。抗体は、所与の状態のセット下で、適切な抗原への結合と無関係な抗原または抗原混合物への結合とを比較することにより、結合の特異性について試験することができる。抗体が、無関係な抗原または抗原混合物よりも少なくとも2倍、5倍、7倍、10倍以上の親和性で適切な抗原に結合する場合、これは特異的であると考えられる。「特異的抗体」または「標的特異的抗体」は、標的抗原(例えばBCMA、CD33、PCAD、またはHER2)にのみ結合するが、他の抗原には結合しない(または最小の結合を示す)ものである。一部の実施形態では、標的抗原(例えばBCMA、CD33、PCADまたはHER2)に特異的に結合する抗体または抗原結合性断片は、1x10-6M未満、1x10-7M未満、1x10-8M未満、1x10-9M未満、1x10-10M未満、1x10-11M未満、1x10-12Mまたは1x10-13M未満のKを有する。一部の実施形態では、Kは1pM~500pMである。一部の実施形態では、Kは、500pM~1μM、1μM~100nMまたは100mM~10nMの間である。
「親和性」という用語は、本明細書で使用される場合、単一の抗原部位での抗体と抗原との間の相互作用の強さを指す。理論により拘束されるものではないが、各抗原結合部位中、抗体の可変領域「アーム」は、弱い非共有結合力を通して抗原と無数の部位で相互作用し、相互作用が多いほど、典型的に親和性はより強くなる。抗体の結合親和性は、抗原決定基と抗体の結合部位との間で働く誘引力と反発力との和である。
「kon」または「k」という用語は、抗体/抗原複合体を形成するための抗体の抗原への会合についての結合速度定数(on-rate constant)を指す。この速度は、標準アッセイ、例えば表面プラズモン共鳴、バイオレイヤー干渉法またはELISAアッセイを使用して決定することができる。
「koff」または「k」という用語は、抗体/抗原複合体からの抗体の解離についての解離速度定数(off-rate constant)を指す。この速度は、標準アッセイ、例えば表面プラズモン共鳴、バイオレイヤー干渉法またはELISAアッセイを使用して決定することができる。
「K」という用語は、特定の抗体-抗原相互作用の平衡解離定数を指す。Kは、k/kにより算出される。この速度は、標準アッセイ、例えば表面プラズモン共鳴、バイオレイヤー干渉法またはELISAアッセイを使用して決定することができる。
「エピトープ」という用語は、抗体(または抗原結合性断片)により認識され特異的に結合されることが可能な抗原の部分を指す。エピトープ決定基は、一般的に、アミノ酸または炭水化物または糖側鎖のような分子の化学的に活性な表面群からなり、特定の三次元構造特性および特定の電荷特性を有することができる。抗原がポリペプチドである場合、エピトープは連続的なアミノ酸またはポリペプチドの三次フォールディングにより並列した非連続的なアミノ酸から形成されることができる。エピトープは「線状」または「立体構造」であることができる。立体構造エピトープと線状エピトープとは、変性溶媒の存在下で前者への結合は失われるが、後者への結合は失われないという点で区別される。抗体(または抗原結合性断片)により結合されたエピトープは、抗原-抗体複合体の直接の可視化によるエピトープ同定のためのX線結晶構造解析、および抗体の抗原の断片もしくは突然変異した変形形態への結合のモニタリング、または抗体および抗原の異なる部分の溶媒接近性(solvent accessibility)のモニタリングを含む、当該技術分野において公知の任意のエピトープマッピング技術を使用して同定することができる。抗体エピトープをマッピングするための例示的なストラテジーには、限定されるものではないが、アレイベースのオリゴペプチドスキャン(array-based oligo-peptide scanning)、限定加水分解(limited proteolysis)、部位特異的突然変異誘発(site-directed mutagenesis)、ハイスループット変異導入マッピング(high-throughput mutagenesis mapping)、水素重水素交換(hydrogen-deuterium exchange)、および質量分析が挙げられる(例えば、Gershoni et al. (2007) BioDrugs 21:145-56;およびHager-Braun and Tomer (2005) Expert Rev Proteomics 2:745-56を参照されたい)。
競合結合およびエピトープビニングも、同一または重複するエピトープを共有する抗体を決定するために使用することができる。競合結合は、交差ブロッキングアッセイ、例えば“Antibodies, A Laboratory Manual,” Cold Spring Harbor Laboratory, Harlow and Lane(1st edition 1988, 2nd edition 2014)において記載されるアッセイを使用して評価することができる。一部の実施形態では、競合結合は、試験抗体または結合タンパク質が、標的抗原、例えばBCMA、CD33、PCADまたはHER2への参照抗体または結合タンパク質の結合(例えば、表3-5において特定されるものから選択されるCDRおよび/または可変ドメインを含む結合タンパク質)を、交差ブロッキングアッセイにおいて少なくとも約50%(例えば50%、60%、70%、80%、90%、95%、99%、99.5%以上、またはその間の任意のパーセンテージ)低減させる場合に同定され、および/または逆も同様である。一部の実施形態では、競合結合は、共有されるまたは類似の(例えば特に重複する)エピトープによるか、または抗体もしくは結合タンパク質が近くのエピトープに結合する立体障害によるものであり得る(例えばTzartos, Methods in Molecular Biology (Morris, ed.(1998) vol. 66, pp. 55-66)を参照されたい)。一部の実施形態では、競合結合は、類似のエピトープを共有する結合タンパク質の群を選別するために使用することができる。例えば、結合について競合する結合タンパク質は、重複するまたは近くのエピトープを有する結合タンパク質の群として「ビニング」することができ、一方で競合しないものは、重複するまたは近くのエピトープを有しない結合タンパク質の別の群に入れられる。
本明細書で使用される場合、「ペプチド」、「ポリペプチド」および「タンパク質」という用語は互換的に使用され、アミノ酸残基のポリマーを指す。この用語は、ペプチド結合により互いに接続されている2つ以上のアミノ酸を含むアミノ酸ポリマー、1つまたは複数のアミノ酸残基が対応する天然に生じるアミノ酸の人工的化学的模倣物であるアミノ酸ポリマー、ならびに天然に生じるアミノ酸ポリマーおよび天然に生じないアミノ酸ポリマーを包含する。この用語は、例えば、生物学的に活性な断片、実質的に相同なポリペプチド、オリゴペプチド、ホモ二量体、ヘテロ二量体、ポリペプチドのバリアント、修飾ポリペプチド、誘導体、アナログ、融合タンパク質を特に含む。この用語は、天然ペプチド、組換えペプチド、合成ペプチドまたはそれらの組合せも含む。特に断りのない限り、特定のポリペプチド配列は、保存的に修飾されたそのバリアントも暗に包含する。
「組換え」タンパク質は、組換え技術を使用して、例えば組換え核酸の発現を通して作製されたタンパク質(例えば抗体)を指す。
「単離された」タンパク質は、その天然状態で通常伴う物質の少なくとも一部を伴わないタンパク質を指す。例えば、生体中に存在する天然に生じるポリヌクレオチドまたはポリペプチドは単離されていないが、生体中の共存する物質の一部またはすべてから分離された同じポリヌクレオチドまたはポリペプチドは単離されている。この定義は、当該技術分野において公知の広範な生物および/または宿主細胞中の抗体の作製を含む。
「単離された抗体」は、本明細書で使用される場合、その供給源環境の構成成分(重量)の1つまたは複数(例えば多数)から、例えばハイブリドーマ細胞培養またはその作製のために使用される異なる細胞培養の構成成分から、同定および分離された抗体である。一部の実施形態では、分離は、そうでなければ所望の用途(例えば治療的使用)のための抗体の好適性を妨げ得る構成成分を十分に除去するように行われる。単離された抗体を調製するための方法は当該技術分野において公知であり、限定なしに、タンパク質Aクロマトグラフィー、アニオン交換クロマトグラフィー、カチオン交換クロマトグラフィー、ウイルス保持濾過(virus retentive filtration)および限外濾過が挙げられる。
本明細書で使用される場合、「バリアント」という用語は、参照核酸配列またはアミノ酸配列とそれぞれ異なるが、参照配列の1つまたは複数の生物特性を保持する核酸配列またはアミノ酸配列を指す。バリアントは、参照配列に対して、1つまたは複数のアミノ酸置換、欠失および/または挿入(または対応するコドンの置換、欠失および/または挿入)を含有することができる。核酸バリアント中の変化は、参照核酸配列によりコードされるペプチドのアミノ酸配列を変更しないことがあり、またはアミノ酸置換、付加、欠失、融合および/または短縮化を生じることがある。一部の実施形態では、本明細書で開示される核酸バリアントは、未修飾の核酸によりコードされるものと同一のアミノ酸配列をコードするか、または未修飾のアミノ酸配列の1つまたは複数の機能的特性を保持する修飾アミノ酸配列をコードする。ペプチドバリアントの配列中の変化は、典型的に限定的または保存的であり、そのため未修飾ペプチドおよびバリアントの配列は全体に密接に類似しており、多くの領域で同一である。一部の実施形態では、ペプチドバリアントは、未修飾のペプチド配列の1つまたは複数の機能的性質を保持する。バリアントと未修飾のペプチドとは、1つまたは複数の置換、付加、欠失の任意の組合せにより、アミノ酸配列が異なることがある。
核酸またはペプチドのバリアントは、天然に生じるバリアントまたは天然に生じることが知られていないバリアントであることができる。核酸およびペプチドのバリアントは、突然変異誘発技術により、直接合成により、または当該技術分野において公知の他の技術により、作製することができる。バリアントは、参照配列の物理的操作を必ずしも必要としない。配列が参照配列と比較して異なる核酸またはアミノ酸を含有する限り、これは、どれだけ合成されたかにかかわらず「バリアント」と考えられる。一部の実施形態では、バリアントは、参照配列と比較して高い配列同一性(すなわち、60%またはそれより高い核酸またはアミノ酸配列の同一性)を有する。一部の実施形態では、ポリペプチドが参照配列または参照配列の対応するセグメント(例えば機能断片)、例えば参照配列の1つまたは複数の機能を同様に保持するバリアントと少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%のアミノ酸配列同一性を有する限り、ペプチドバリアントはアミノ酸置換、欠失および/または挿入を有するポリペプチドを包含する。一部の実施形態では、ポリヌクレオチドが参照配列または参照配列の対応するセグメント(例えば機能断片)と少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%の核酸配列同一性を有する限り、核酸バリアントはアミノ酸置換、欠失および/または挿入を有するポリヌクレオチドを包含する。
「保存的に修飾されたバリアント」という用語は、アミノ酸および核酸配列の両方に適用する。核酸配列について、保存的に修飾されたバリアントは、同一のまたは本質的に同一のアミノ酸配列をコードする核酸を指す。遺伝コードの縮重のために、多数の機能的に同一な核酸は、任意の所与のタンパク質をコードする。例えば、コドンGCA、GCC、GCGおよびGCUはすべて、アミノ酸アラニンをコードする。よって、アラニンがコドンにより指定されるあらゆる位置で、コドンは、コードされたポリペプチドを変更することなく、記載される対応するコドンのいずれかに変更されることができる。そのような核酸変形形態は「サイレント変形形態(silent variation)」であり、これは、保存的に修飾された変形形態の1種である。ポリペプチドをコードする本明細書におけるあらゆる核酸配列は、核酸のあらゆる考えられるサイレント変形形態も記載する。当業者は、核酸における各コドン(従来メチオニンの唯一のコドンであるAUG、および従来トリプトファンの唯一のコドンであるTGGを除く)を修飾して機能的に同一の分子を得られることを認識するであろう。したがって、ポリペプチドをコードする核酸の各サイレント変形形態は、各記載される配列中に暗に示される。ポリペプチド配列については、保存的に修飾されたバリアントは、ポリペプチド配列に対する個々の置換、欠失または付加を含み、化学的に類似のアミノ酸でのアミノ酸の置換を生じる。機能的に類似のアミノ酸を提供する保存的置換は、当該技術分野において周知である。
「保存的配列修飾」という用語は、本明細書で使用される場合、例えばアミノ酸配列を含有する抗体または抗原結合性断片の結合特性に著しく影響も与えず変更もしない、アミノ酸修飾を指す。そのような保存的修飾には、アミノ酸置換、付加および欠失が挙げられる。修飾は、当該技術分野において公知の標準技術、例えば部位特異的突然変異誘発およびPCR媒介性突然変異誘発により、抗体または抗原結合性断片中に導入することができる。保存的アミノ酸置換は、アミノ酸残基が類似の側鎖を有するアミノ酸残基で代替されるものである。類似の側鎖を有するアミノ酸残基のファミリーは、当該技術分野において定義されている。これらのファミリーには、塩基性側鎖(例えば、リシン、アルギニン、ヒスチジン)、酸性側鎖(例えばアスパラギン酸、グルタミン酸)、非荷電極性側鎖(例えばグリシン、アスパラギン、グルタミン、セリン、トレオニン、チロシン、システイン、トリプトファン)、非極性側鎖(例えばアラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェニルアラニン、メチオニン)、ベータ分岐側鎖(例えばトレオニン、バリン、イソロイシン)および芳香族側鎖(例えばチロシン、フェニルアラニン、トリプトファン、ヒスチジン)を有するアミノ酸が挙げられる。よって、一部の実施形態では、抗体中の1つまたは複数のアミノ酸残基は、同じ側鎖ファミリーからの他のアミノ酸残基で代替されることができ、変更された抗体は、本明細書で記載される機能アッセイを使用して試験することができる。
「相同」または「同一性」という用語は、本明細書で使用される場合、2つのポリマー分子の間、例えば2つの核酸分子、例えば2つのDNA分子もしくは2つのRNA分子の間、または2つのポリペプチド分子の間の、サブユニットの配列同一性を指す。2つの分子の両方の中のサブユニットの位置は、同じモノマーサブユニットにより占められ、例えば2つのDNA分子中の各々の位置がアデニンにより占められる場合、これらはその位置で相同または同一である。2つの配列の間の相同性は、合致するまたは相同な位置の数の一次関数である。例えば、2つの配列中の位置の半分(例えば10のサブユニットの長さのポリマー中、5つの位置)が合致するかまたは相同である場合、2つの配列は50%相同であり、位置の90%(例えば10のうち9つ)が合致するかまたは相同な場合、2つの配列は90%相同である。
「配列同一性」のパーセンテージは、比較窓にわたり2つの最適にアラインメントされた配列を比較することにより決定することができ、ここで、比較窓中のアミノ酸配列の断片は、2つの配列の最適な配列比較について、参照配列(付加も欠失も含まない)と比較して付加または欠失(例えばギャップまたはオーバーハング)を含むことができる。パーセンテージは、同一なアミノ酸残基が両方の配列中で生じる位置の数を決定して合致する位置の数を得ること、合致する位置の数を比較窓中の位置の合計数で割ること、および結果に100を乗算し、配列同一性のパーセンテージを得ることにより、計算することができる。出力は、問い合わせ配列に対する対象配列のパーセント同一性である。2つの配列の間のパーセント同一性は、2つの配列の最適な配列比較のために導入される必要のあるギャップの数および各ギャップの長さを考慮した、配列により共有される同一な位置の数の関数である。一般的に、本明細書で開示されるタンパク質と、標的抗原(例えばBCMA、CD33、PCADまたはHER2)のバリアントおよび抗体可変ドメインのバリアント(個々のバリアントCDRを含む)を含むそのバリアントとの間のアミノ酸同一性または相同性は、本明細書で示される配列の少なくとも80%であり、例えば少なくとも85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、ほぼ100%または100%の同一性または相同性である。
配列の比較および2つの配列の間のパーセント同一性の決定は、数値計算用アルゴリズムを使用して達成することができる。一部の実施形態では、2つのアミノ酸配列の間のパーセント同一性は、Blossum62行列またはPAM250行列のいずれか、ならびに16、14、12、10、8、6または4のギャップ重みおよび1、2、3、4、5または6の長さ重みを使用する、GCGソフトウェアパッケージ中のGAPプログラム中に組み込まれているNeedleman and Wunsch((1970) J Mol Biol. 48:444-53)アルゴリズムを使用して決定される。一部の実施形態では、2つのヌクレオチド配列の間のパーセント同一性は、NWSgapdna.CMP行列、ならびに40、50、60、70または80のギャップ重みおよび1、2、3、4、5または6の長さ重みを使用する、GCGソフトウェアパッケージ中のGAPプログラムを使用して決定される。パラメーターの代表的なセットは、12のギャップペナルティ、4のギャップ伸長ペナルティ(gap extend penalty)および5のフレームシフトギャップペナルティを有するBlossum 62スコア行列である。2つのアミノ酸またはヌクレオチド配列の間のパーセント同一性は、PAM120重み残基表(PAM120 weight residue table)、12のギャップ長さペナルティおよび4のギャップペナルティを使用する、ALIGNプログラム(バージョン2.0)中に組み込まれているMeyers and Miller((1989) CABIOS 4:11-17)のアルゴリズムを使用しても決定することができる。
「薬剤」という用語は、化学化合物、化学化合物の混合物、生物学的巨大分子、生物学的材料から作製された抽出物、またはそれらの2つ以上の組合せを指すために、本明細書で使用される。「治療剤」または「薬物」という用語は、生物学的プロセスおよび/または生物活性を調節することが可能な薬剤を指す。本明細書で記載されるようなMcl-1阻害剤およびそれらを含むADCは、代表的な治療剤である。
「化学療法剤」または「抗がん剤」という用語は、(作用機序にかかわらず)がんを処置するのに有効なすべての薬剤を指すために、本明細書で使用される。転移または血管新生の阻害は、化学療法剤の性質であることが多い。化学療法剤には、抗体、生物学的分子および小分子が挙げられ、本明細書で記載されるようなMcl-1阻害剤およびそれらを含むADCを包含する。化学療法剤は、細胞傷害剤または細胞分裂阻害剤であってよい。「細胞分裂阻害剤」という用語は、細胞の成長および/または細胞の増殖を阻害または抑制する薬剤を指す。「細胞傷害剤」という用語は、主に細胞の発現活性および/または機能を妨害することにより細胞死を引き起こす物質を指す。
「骨髄性細胞白血病1」または「Mcl-1」という用語は、本明細書で使用される場合、Bcl-2タンパク質ファミリーの抗アポトーシスメンバーであるヒトMcl-1の任意の天然型を指す。この用語は、全長ヒトMcl-1(例えばUniProt参照配列:Q07820;配列番号71)、および細胞プロセシングから生じ得るヒトMcl-1の任意の形態を包含する。この用語は、限定されるものではないが、ヒトMcl-1の1つまたは複数の生物機能を保持するスプライスバリアント、対立遺伝子バリアントおよびアイソフォームを含む、ヒトMcl-1の機能的バリアントまたは断片も包含する(すなわち、この用語が野生型タンパク質のみを指すために使用されると文脈が示さない限り、バリアントおよび断片が包含される)。Mcl-1は、ヒトから単離することができ、組換えでまたは合成方法により作製することができる。
「阻害する」または「阻害」または「阻害すること」という用語は、本明細書で使用される場合、生物活性またはプロセスを測定可能な量まで低減させることを意味するが、完全な予防または阻害を含み得るが、必要とはしない。一部の実施形態では、「阻害」は、Mcl-1および/またはその1つもしくは複数の上流調節因子もしくは下流の標的の発現および/または活性を低減させることを意味する。
「Mcl-1阻害剤」という用語は、本明細書で使用される場合、Mcl-1および/またはその1つもしくは複数の上流調節因子もしくは下流の標的の発現および/または活性を低減させることが可能な薬剤を指す。代表的なMcl-1調節因子(Mcl-1の代表的な阻害剤を含む)は、国際公開第2015/097123号パンフレット;国際公開第2016/207216号パンフレット;国際公開第2016/207217号パンフレット;国際公開第2016/207225号パンフレット;国際公開第2016/207226号パンフレット;国際公開第2017/125224号パンフレット;国際公開第2019/035899号パンフレット、国際公開第2019/035911号パンフレット、国際公開第2019/035914号パンフレット、国際公開第2019/035927号パンフレット、米国特許出願公開第2019/0055264号明細書、国際公開第2016/033486号パンフレット、国際公開第2017/147410号パンフレット、国際公開第2018/183418号パンフレットおよび国際公開第2017/182625号パンフレットにおいて記載されており、その各々は、開示されるADCの薬物部分として含めることができる代表的なMcl-1阻害剤を含めて、代表的なMcl-1調節因子として本明細書で参照により組み込まれる。例えば、開示されるADCの薬物部分として含めることができる代表的なMcl-1阻害剤は、式:
Figure 2022532918000180
(式中、各変数は国際公開第2019/035911号パンフレット;国際公開第2019/035899号パンフレット;国際公開第2019/035914号パンフレット;または国際公開第2019/035927号パンフレットにおけるように定義されている)
のものである。特定の例には、例えば
Figure 2022532918000181
(式中、薬物ペイロードとしての各化合物は、化合物のピペラジニル官能基中のN-メチルの窒素原子を介して抗体またはリンカーにコンジュゲートすることができる)
が挙げられる。本明細書で使用される場合、「誘導体」および「アナログ」という用語は、Mcl-1阻害剤等に対して言及される場合、元の化合物と比較して本質的に同じか、類似するか、または強化された生物機能または活性を保持するが、変更された化学的または生物学的構造を有する、任意のそのような化合物を意味する。
本明細書で使用される場合、「Mcl-1阻害剤薬物部分」、「Mcl-1阻害剤」等は、ADCの構成成分、またはMcl-1阻害剤化合物もしくは元の化合物と比較して本質的に同じか、類似するか、もしくは強化された生物機能または活性を保持する、ADCへの結合のために修飾された化合物の構造を提供する組成物を指す。一部の実施形態では、Mcl-1阻害剤薬物部分は、式(1)のADC中の構成成分(D)である。
「がん」という用語は、本明細書で使用される場合、がんを引き起こす細胞に典型的な特性、例えば無制限増殖、不死性、転移の潜在性、急速な成長および増殖速度ならびに/またはある特定の形態学的特性を有する細胞の存在を指す。多くの場合、がん細胞は腫瘍または塊の形態であり得るが、そのような細胞は対象中に単独で存在することがあり、または血流中に独立した細胞、例えば白血病またはリンパ腫細胞として循環することがある。「がん」という用語は、血液がん、固形腫瘍、肉腫、癌腫ならびに他の固形および非固形腫瘍がんを含む、すべての種類のがんおよびがん転移を含む。血液がんには、B細胞悪性腫瘍、血液のがん(白血病)、形質細胞のがん(骨髄腫、例えば多発性骨髄腫)またはリンパ節のがん(リンパ腫)を挙げることができる。代表的なB細胞悪性腫瘍には、慢性リンパ性白血病(CLL)、濾胞性リンパ腫、マントル細胞リンパ腫およびびまん性大細胞型B細胞リンパ腫が挙げられる。白血病には、急性リンパ性白血病(ALL)、急性骨髄性白血病(AML)、慢性リンパ性白血病(CLL)、慢性骨髄性白血病(CML)、慢性骨髄単球性白血病(CMML)、急性単球性白血病(AMoL)等を挙げることができる。リンパ腫には、ホジキンリンパ腫、非ホジキンリンパ腫等を挙げることができる。他の血液がんには、骨髄異形成症候群(MDS)を挙げることができる。固形腫瘍には、癌腫、例えば腺癌、例えば乳がん、膵臓がん、前立腺がん、結腸または結腸直腸がん、肺がん、胃がん、子宮頸がん、子宮内膜がん、卵巣がん、胆管細胞癌、神経膠腫、黒色腫等を挙げることができる。一部の実施形態では、がんは、乳がん、多発性骨髄腫、形質細胞性骨髄腫、白血病、リンパ腫、胃がん、急性骨髄性白血病、膀胱がん、脳がん、骨髄がん、子宮頸がん、慢性リンパ性白血病、結腸直腸がん、食道がん、肝細胞がん、リンパ芽球性白血病、濾胞性リンパ腫、T細胞もしくはB細胞由来のリンパ性悪性腫瘍、黒色腫、骨髄性白血病、骨髄腫、口腔がん、卵巣がん、非小細胞肺がん、慢性リンパ性白血病、前立腺がん、小細胞肺がんまたは脾臓がんである。一部の実施形態では、がんはリンパ腫または胃がんである。
本明細書で使用される場合、「腫瘍」という用語は、良性または悪性のいずれかで、前がん病変を含む、過剰な細胞増殖または増殖に起因する組織の任意の塊を指す。一部の実施形態では、腫瘍は、乳がん、胃がん、膀胱がん、脳がん、子宮頸がん、結腸直腸がん、食道がん、肝細胞がん、黒色腫、口腔がん、卵巣がん、非小細胞肺がん、前立腺がん、小細胞肺がんまたは脾臓がんである。一部の実施形態では、腫瘍は胃がんである。
「腫瘍細胞」および「がん細胞」という用語は、本明細書で互換的に使用することができ、非腫瘍形成性細胞およびがん幹細胞の両方を含む、腫瘍またはがんに由来する個々の細胞または細胞の全集団を指す。「腫瘍細胞」および「がん細胞」という用語は、再生および分化する能力を喪失した細胞に対してのみ言及する場合、これらの細胞をがん幹細胞から区別するために、「非腫瘍形成性」という用語により修飾されることとなる。
「標的陰性」、「標的抗原陰性」または「抗原陰性」という用語は、本明細書で使用される場合、細胞または組織による標的抗原発現の不在を指す。「標的陽性」、「標的抗原陽性」または「抗原陽性」という用語は、標的抗原発現の存在を指す。例えば、標的抗原を発現していない細胞または細胞系は、標的陰性と記載することができ、一方で標的抗原を発現している細胞または細胞系は、標的陽性と記載することができる。
「対象」および「患者」という用語は、本明細書で互換的に使用され、処置を必要とする任意のヒトまたは非ヒト動物を指す。非ヒト動物には、すべての脊椎動物(例えば哺乳動物および非哺乳動物)、例えば任意の哺乳動物が挙げられる。哺乳動物の非限定的な例には、ヒト、チンパンジー、類人猿、サル、ウシ、ウマ、ヒツジ、ヤギ、ブタ、ウサギ、イヌ、ネコ、ラット、マウスおよびモルモットが挙げられる。非哺乳動物の非限定的な例には、鳥類および魚類が挙げられる。一部の実施形態では、対象はヒトである。
「処置を必要とする対象」という用語は、本明細書で使用される場合、処置(例えば、本明細書で記載される代表的なADC化合物のいずれか1つまたは複数を用いる処置)から生物学的に、医学的にまたは生活の質において利益を受けるであろう対象を指す。
本明細書で使用される場合、「処置する」、「処置すること」または「処置」という用語は、疾患、障害または状態の任意の結果の任意の改善、例えば生存期間の延長、罹患率の低減、および/または代わりの治療法に起因する副作用の低減を指す。一部の実施形態では、処置は、疾患、障害または状態の遅延または好転(すなわち、疾患またはその臨床症状の少なくとも1つの発症を遅延または停止または低減すること)を含む。一部の実施形態では、処置は、患者により認識され得ないものを含む、疾患、障害または状態の身体的パラメーターの少なくとも1つを、遅延、緩和または好転することを含む。一部の実施形態では、処置は、疾患、障害または状態を、身体的に(例えば認識可能な症状の安定化)、生理学的に(例えば身体パラメーターの安定化)のいずれか、または両方で調節することを含む。一部の実施形態では、処置は、本明細書で列挙された処置の利益を得るための、記載されたADC化合物または組成物の、対象、例えば患者への投与を含む。処置は、疾患、障害または状態(例えばがん)、疾患、障害または状態(例えばがん)の症状、または疾患、障害または状態(例えばがん)の傾向を、治癒する、回復する、緩和する、遅延する、予防する、軽減する、変更する、強制する、好転する、やわらげる、改善するまたは影響を与えるためのものであることができる。一部の実施形態では、疾患、障害または状態を有する対象を処置することに加えて、本明細書で開示される組成物は、その疾患、障害または状態を発症する可能性を予防または低減するために予防的に提供することもできる。
本明細書で使用される場合、疾患、障害または状態を「予防する」、「予防すること」または「予防」という用語は、疾患、障害もしくは状態の予防処置、または疾患、障害もしくは状態の開始もしくは進行を遅延することを指す。
本明細書で使用される場合、「医薬組成物」は、対象への投与に好適な少なくとも1つの他の(および任意選択で1つを超える他の)構成成分、例えば薬学的に許容される担体、安定剤、希釈剤、分散剤、懸濁化剤、増粘剤および/または賦形剤に加えた、組成物、例えばADC化合物または組成物の製剤を指す。本明細書で提供される医薬組成物は、投与を可能にし、続いて活性成分の意図された生物活性を提供し、および/または治療効果を達成するような形態である。本明細書で提供される医薬組成物は、好ましくは、製剤が投与されるであろう対象に対して許容できないほど毒性の追加の構成成分を含有しない。
本明細書で使用される場合、「薬学的に許容される担体」および「生理的に許容される担体」という用語は、互換的に使用することができ、対象に著しい刺激を引き起こさず、投与されるADC化合物もしくは組成物および/または組成物中の任意の追加の治療剤の生物活性および性質を抑止しない担体または希釈剤を指す。薬学的に許容される担体は、組成物を強化または安定化することができるか、または組成物の調製を容易にするために使用することができる。薬学的に許容される担体には、当業者に公知であるような(例えばRemington's Pharmaceutical Sciences, 18th Ed. Mack Printing Company, 1990, pp. 1289- 1329を参照されたい)、溶媒、分散媒、コーティング、界面活性剤、抗酸化剤、保存剤(例えば抗菌剤、抗真菌剤)、等張剤、吸収遅延剤(absorption delaying agent)、塩、保存剤、薬物安定剤、結合剤、賦形剤、崩壊剤、滑沢剤、甘味剤、香料、染料等およびそれらの組合せを挙げることができる。任意の従来の担体が活性成分と不適合でない限り、治療または医薬組成物におけるその使用が企図される。担体は、対象における有害な副作用を最小化するように、および/または活性成分の劣化を最小化するように、選択することができる。アジュバントも、これらの製剤のいずれかに含めることができる。
本明細書で使用される場合、「賦形剤」という用語は、活性成分の投与をさらに容易にするために医薬組成物に添加される、不活性な物質を指す。非経口投与のための製剤は、賦形剤、例えば、滅菌水または生理食塩水、ポリアルキレングリコール、例えばポリエチレングリコール、植物油または水素化ナフタレンを含有することができる。他の代表的な賦形剤には、限定されるものではないが、炭酸カルシウム、リン酸カルシウム、様々な糖およびデンプンの種類、セルロース誘導体、ゼラチン、エチレン-酢酸ビニルコポリマー粒子、ならびに例えばポリソルベート20を含む界面活性剤が挙げられる。
「薬学的に許容される塩」という用語は、本明細書で使用される場合、本発明の化合物の生物活性および性質を抑止せず、それが投与される対象に著しい刺激を引き起こさない塩を指す。そのような塩の例には、限定されるものではないが、:(a)無機酸、例えば塩酸、臭化水素酸、硫酸、リン酸、硝酸等を用いて形成された酸付加塩;および有機酸、例えば酢酸、シュウ酸、酒石酸、コハク酸、マレイン酸、フマル酸、グルコン酸、クエン酸、リンゴ酸、アスコルビン酸、安息香酸、タンニン酸、パルミチン酸、アルギン酸、ポリグルタミン酸、ナフタレンスルホン酸、メタンスルホン酸、p-トルエンスルホン酸、ナフタレンジスルホン酸、ポリガラクツロン酸等を用いて形成された塩;ならびに(b)アニオン元素(elemental anion)、例えば塩素、臭素およびヨウ素から形成された塩が挙げられる。例えば、本明細書で参照により組み込まれる、Haynes et al., "Commentary: Occurrence of Pharmaceutically Acceptable Anions and Cations in the Cambridge Structural Database," J. Pharmaceutical Sciences, vol. 94, no. 10 (2005)、およびBerge et al., "Pharmaceutical Salts," J. Pharmaceutical Sciences, vol. 66, no. 1 (1977)を参照されたい。
一部の実施形態では、本明細書で記載される抗体-薬物コンジュゲート(ADC)、リンカー、ペイロードおよびリンカー-ペイロードは、それらの電荷に応じて、一価のアニオン性対イオンM を含有することができる。任意の好適なアニオン性対イオンを使用することができる。ある特定の実施形態では、一価のアニオン性対イオンは、薬学的に許容される一価のアニオン性対イオンである。ある特定の実施形態では、一価アニオン性対イオンM は、ブロミド、クロリド、ヨージド、アセテート、トリフルオロアセテート、ベンゾエート、メシレート、トシレート、トリフレート、ホルメート等から選択することができる。一部の実施形態では、一価のアニオン性対イオンM は、トリフルオロアセテートまたはホルメートである。
本明細書で使用される場合、「治療有効量」または「治療有効用量」という用語は、所望の治療結果(すなわち、酵素またはタンパク質活性の低減または阻害、症状の好転、症状または状態の緩和、疾患進行の遅延、腫瘍サイズの低減、腫瘍増殖の阻害、転移の予防)をもたらすための、本明細書で記載される化合物、例えば本明細書で記載されるADC化合物または組成物の量を指す。一部の実施形態では、治療有効量は、所望されない副作用を誘導することも引き起こすこともない。一部の実施形態では、治療有効量は、副作用を、患者の状態に照らして治療を行う医師により許容されるもののみ誘導および引き起こす。一部の実施形態では、治療有効量は、がん細胞の増殖もしくは拡がり、腫瘍のサイズもしくは数、ならびに/またはがんの他のレベル、ステージ、進行および/もしくは重症度の尺度の、検出可能な死滅、低減および/または阻害に有効である。この用語は、標的細胞における特定の反応、例えば細胞増殖の低減、遅延または阻害を誘導することとなる用量にも適用する。治療有効量は、最初に低用量を投与し、次に所望の効果が達成されるまで用量を徐々に増大することにより、決定することができる。治療有効量は、意図されている用途(in vitroまたはin vivo)または処置されている対象および疾患の状態、例えば対象の体重および年齢、疾患状態の重症度、投与方法等に応じて変動させることができ、これらは当業者により容易に決定することができる。特定の量は、例えば、特定の医薬組成物、対象および彼らの年齢および既存の健康状態または健康状態についてのリスク、従うこととなる投薬レジメン、疾患の重症度、他の薬剤と組み合わせて投与されるかどうか、投与のタイミング、それが投与される組織、ならびにそれが運ばれる物理的な送達システムに応じて変動させることができる。がんの場合、ADCの治療有効量は、がん細胞の数を低減させ、腫瘍サイズを低減し、腫瘍転移を阻害(例えば遅延または停止)し、腫瘍増殖を阻害(例えば遅延または停止)し、および/または1つもしくは複数の症状を軽減することができる。
本明細書で使用される場合、「予防有効量」または「予防有効用量」という用語は、必要な投薬量および期間で所望の予防結果を達成するのに有効な、本明細書で開示される化合物、例えば本明細書で記載されるADC化合物または組成物の量を指す。典型的には、予防用量は疾患の前または早期の段階で対象に使用されるため、予防有効量は治療有効量未満となる。一部の実施形態では、予防有効量は、がんに伴う症状を含む疾患症状の開始を予防することができる。
「p」または「薬物負荷」または「薬物:抗体比」または「薬物と抗体との比」または「DAR」という用語は、抗体もしくは抗原結合性断片あたりの薬物部分の数、すなわち薬物負荷、または式(1)のADC中の抗体もしくは抗原結合性断片(Ab)あたりの-L-D部分の数を指す。Mcl-1阻害剤薬物部分を含むADCでは、「p」は、抗体または抗原結合性断片に連結したMcl-1阻害剤化合物の数を指す。例えば、2つのMcl-1阻害剤化合物が抗体または抗原結合性断片に連結する場合、p=2である。式(1)のADCの複数のコピーを含む組成物において、「平均p」は、抗体または抗原結合性断片あたりの-L-D部分の平均の数を指し、「平均薬物負荷」とも称される。
抗体-薬物コンジュゲート
本開示の抗体-薬物コンジュゲート(ADC)化合物は、抗がん活性を有するものを含む。特に、ADC化合物は、薬物部分(例えばMcl-1阻害剤)にコンジュゲートした(すなわち、リンカーにより共有結合した)抗体または抗原結合性断片を含み、ここで薬物部分は、抗体または抗原結合性断片にコンジュゲートしていない場合、細胞傷害または細胞分裂阻害効果を有する。一部の実施形態では、薬物部分は、抗体または抗原結合性断片にコンジュゲートしていない場合、Mcl-1および/またはその1つもしくは複数の上流調節因子もしくは下流の標的の発現および/または活性を低減させることが可能である。理論により拘束されるものではないが、Mcl-1の発現および/または活性を標的とすることにより、一部の実施形態では、本明細書で開示されるADCは、強力な抗がん剤を提供することができる。また、理論により拘束されるものではないが、薬物部分を腫瘍細胞またはがんの発現に関連する抗原に結合する抗体にコンジュゲートすることにより、ADCは、単独で投与される場合の薬物部分と比較して、改善された活性、より良好な細胞傷害特異性、および/または標的外の(off-target)死滅の低減をもたらすことができる。
一部の実施形態では、したがって、ADCの構成成分は、(i)単離されている抗体および薬物部分により示される1つまたは複数の治療性質を保持する、(ii)抗体または抗原結合性断片の特定の結合性質を維持する;(iii)薬物負荷および薬物対抗体比を最適化する;(iv)抗体または抗原結合性断片への安定した結合を介した、薬物部分の送達、例えば細胞内送達を可能とする;(v)標的部位への移行または送達まで、無傷のコンジュゲートとしてのADCの安定性を保持する(vi)投与前後のADCの凝集を最小化する;(vii)切断または細胞環境中の他の放出機構の後に、薬物部分の治療効果、例えば細胞傷害効果を可能とする;;(viii)単離されている抗体および薬物部分と同等かそれよりも優れた、in vivoの抗がん処置の有効性を示す;(ix)薬物部分による標的外死滅を最小化する;ならびに/または(x)所望の薬物動態学および薬力学性質、製剤化適性(formulatability)および毒性学/免疫学プロファイルを示すように選択される。これらの性質の各々は、治療的使用のための改善されたADCを提供することができる(Ab et al. (2015) Mol Cancer Ther. 14:1605-13)。
本開示のADC化合物は、細胞傷害剤または細胞分裂阻害剤の有効量を、がん細胞または腫瘍組織へと選択的に送達することができる。一部の実施形態では、ADCの細胞傷害および/または細胞分裂阻害活性は、細胞中の標的抗原の発現に依存する。一部の実施形態では、開示されるADCは、標的外死滅を最小化する一方で、標的抗原を発現するがん細胞の死滅に特に有効である。一部の実施形態では、開示されるADCは、標的抗原を発現しないがん細胞に対する細胞傷害および/または細胞分裂阻害効果を示さない。
代表的なBCMA発現がんには、限定されるものではないが、多発性骨髄腫が挙げられる(Cho et al. (2018) Front Immunol. 9:1821)。
代表的なCD33発現がんには、限定されるものではないが、結腸直腸がん、膵臓がん、リンパ腫および白血病(例えば急性骨髄性白血病)が挙げられる(Human Protein Atlas; Walter (2014) Expert Opin Ther Targets 18(7):715-8)。
代表的なPCAD発現がんには、限定されるものではないが、乳がん、胃がん、子宮内膜がん、卵巣がん、膵臓がん、膀胱がん、前立腺がんおよび黒色腫が挙げられる(Vieira and Paredes (2015) Mol Cancer 14:178)。
代表的なHER2発現がんには、限定されるものではないが、乳がん、胃がん、膀胱がん、尿路上皮細胞癌腫、食道がん、肺がん(例えば肺腺癌)、子宮がん(例えば子宮漿液性子宮内膜癌(uterine serous endometrial carcinoma)、唾液管癌、子宮頸がん、子宮内膜がんおよび卵巣がんが挙げられる(English et al. (2013) Mol Diagn Ther. 17:85-99)。
ある特定の態様では、抗体またはその抗原結合性断片(Ab)、Mcl-1阻害剤薬物部分(D)、およびAbをDに共有結合するリンカー部分(L)を含むADC化合物が、本明細書で提供される。一部の実施形態では、がん細胞を標的とする抗体またはその抗原結合性断片(Ab)、Mcl-1阻害剤薬物部分(D)、およびAbをDに共有結合するリンカー部分(L)を含むADC化合物が、本明細書で提供される。一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片は、腫瘍関連抗原(例えばBCMA、CD33、PCADまたはHER2)に、例えば高い特異性および高い親和性で結合することが可能である。一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片は、結合の際に、標的細胞中、例えば細胞中の分解性の区画中に内在化される。一部の実施形態では、ADCは、標的細胞に結合すると内在化し、分解を受け、Mcl-1阻害剤薬物部分を放出してがん細胞を死滅させる。Mcl-1阻害剤薬物部分は、酵素的作用、加水分解、酸化または任意の他の機構により、ADCの抗体および/またはリンカー部分から放出されることができる。
代表的なADC は、式(1):
Ab-(L-D) (1)
(式中、Ab=抗体または抗原結合性断片、L=リンカー部分、D=Mcl-1阻害剤薬物部分、およびp=抗体または抗原結合性断片あたりのMcl-1阻害剤薬物部分の数である)
を有する。
抗体
式(1)の抗体または抗原結合性断片(Ab)には、その範囲内で、細胞上の標的抗原に特異的に結合する任意の抗体または抗原結合性断片が挙げられる。一部の実施形態では、式(1)の抗体または抗原結合性断片(Ab)には、その範囲内で、がん細胞上の標的抗原に特異的に結合する任意の抗体または抗原結合性断片が挙げられる。抗体または抗原結合性断片は、例えばBIAcore(登録商標)分析により測定される場合、≦1mM、≦100nMもしくは≦10nM、またはその間の任意の量の解離定数(K)で、標的抗原に結合することができる。一部の実施形態では、Kは1pM~500pMである。一部の実施形態では、Kは、500pM~1μM、1μM~100nMまたは100mM~10nMの間である。
一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片は、2本の重鎖および2本の軽鎖を有する、4本鎖の抗体である(免疫グロブリンまたは全長もしくは無傷抗体とも称される)。一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片は、免疫グロブリンの抗原結合性断片である。一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片は、標的がん抗原に結合する能力を保持し、および/または免疫グロブリンの少なくとも1つの機能を提供する、免疫グロブリンの抗原結合性断片である。
一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片は、内在化抗体またはその内在化抗原結合性断片である。一部の実施形態では、内在化抗体またはその内在化抗原結合性断片は、細胞の表面上に発現する標的がん抗原に結合し、結合の際に細胞に進入する。一部の実施形態では、ADCのMcl-1阻害剤薬物部分は、ADCが、標的がん抗原を発現する細胞中に進入し存在した後に(すなわち、ADCが内在化した後に)、例えば切断により、抗体もしくは抗原結合性断片の分解により、または任意の他の好適な放出機構により、ADCの抗体または抗原結合性断片から放出される。
一部の実施形態では、抗体は、抗体依存性細胞傷害(ADCC)または補体依存性細胞傷害(CDC)の媒介を低減させるかまたはそれを全く媒介しない、突然変異を含む。一部の実施形態では、これらの突然変異は、Fcサイレンシング、Fcサイレント、またはFcサイレント突然変異として公知である。一部の実施形態では、IgG1定常領域のアミノ酸残基L234およびL235は、A234およびA235に置換される(「LALA」としても公知)。一部の実施形態では、IgG1定常領域のアミノ酸残基N297は、A297に置換される(「N297A」としても公知)。一部の実施形態では、IgG1定常領域のアミノ酸残基D265およびP329は、A265およびA329に置換される(「DAPA」としても公知)。他の抗体Fcサイレンシング突然変異も使用することができる。一部の実施形態では、Fcサイレンシング突然変異は、組合せで、例えばD265A、N297AおよびP329A(「DANAPA」としても公知)において使用される。
代表的な抗原標的に加えて、本開示の代表的な抗体のアミノ酸配列を、表2~6に記載する。
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一部の実施形態では、本明細書で開示されるADCの抗体または抗原結合性断片は、上記の表に列挙される重鎖および軽鎖可変ドメインの任意のセット、または上記の表に列挙される重鎖および軽鎖可変ドメインの任意のセットからの6つのCDRのセットを含むことができる。一部の実施形態では、本明細書で開示されるADCの抗体または抗原結合性断片は、ADCがその標的がん抗原に(例えば、1x10-8M未満のKで)結合する能力を保持し、本明細書で開示されるADCの1つまたは複数の機能的性質(例えば、内在化する、抗原標的、例えば腫瘍または他のがん細胞等に発現する抗原へ結合する能力)を保持する限り、保存的に修飾された、および/または上記の表に列挙される配列と相同なアミノ酸配列を含むことができる。
一部の実施形態では、本明細書で開示されるADCの抗体または抗原結合性断片は、ヒト重鎖および軽鎖定常ドメインまたはその断片をさらに含む。例えば、開示されるADCの抗体または抗原結合性断片は、ヒトIgG重鎖定常ドメイン(例えばIgG1)およびヒトカッパまたはラムダ軽鎖定常ドメインを含むことができる。一部の実施形態では、開示されるADCの抗体または抗原結合性断片は、ヒト免疫グロブリンGサブタイプ1(IgG1)重鎖定常ドメインを、ヒトIgカッパ軽鎖定常ドメインとともに含む。
一部の実施形態では、ADCについての標的がん抗原はBCMAである。
一部の実施形態では、抗BCMA抗体またはその抗原結合性断片は、以下のような3つの重鎖CDRおよび3つの軽鎖CDR:配列番号15からなる重鎖CDR1(HCDR1)、配列番号16からなる重鎖CDR2(HCDR2)、配列番号17からなる重鎖CDR3(HCDR3);配列番号18からなる軽鎖CDR1(LCDR1)、配列番号19からなる軽鎖CDR2(LCDR2)および配列番号20からなる軽鎖CDR3(LCDR3)を含む。
一部の実施形態では、抗BCMA抗体またはその抗原結合性断片は、配列番号1のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号2のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。一部の実施形態では、抗BCMA抗体またはその抗原結合性断片は、配列番号1の重鎖可変領域アミノ酸配列、および配列番号2の軽鎖可変領域アミノ酸配列、または開示される配列と少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、抗BCMA抗体またはその抗原結合性断片は、配列番号1と少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%もしくは少なくとも99%同一である重鎖可変領域アミノ酸配列、および/または配列番号2と少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%もしくは少なくとも99%同一である軽鎖可変領域アミノ酸配列を有する。
一部の実施形態では、抗BCMA抗体またはその抗原結合性断片は、内在化抗体または内在化抗原結合性断片である。一部の実施形態では、抗BCMA抗体は、ヒトIgG1重鎖定常ドメインまたは修飾IgG1重鎖定常ドメインを含む。一部の実施形態では、IgG1重鎖定常ドメインは、EU番号付けシステムにより番号付けされた野生型(非修飾)IgG1重鎖定常ドメイン中の152および375に対応するアミノ酸位置にシステイン残基(C)を含む。一部の実施形態では、IgG1重鎖定常ドメインは、野生型(非修飾)IgG1重鎖定常ドメイン中の156および379に対応するアミノ酸位置にシステイン残基(C)を含む。一部の実施形態では、抗BCMA抗体は、ヒトIgカッパ軽鎖定常ドメインまたは修飾Igカッパ軽鎖定常ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗BCMA抗体は、配列番号57の重鎖アミノ酸配列または配列番号57と少なくとも95%同一である配列、および配列番号58の軽鎖アミノ酸配列または配列番号58と少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、抗BCMA抗体は、配列番号57の重鎖アミノ酸配列、および配列番号58の軽鎖アミノ酸配列、または開示される配列と少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、抗BCMA抗体は、配列番号57と少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%または少なくとも99%同一である重鎖アミノ酸配列、および配列番号58と少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%または少なくとも99%同一である軽鎖アミノ酸配列を有する。一部の実施形態では、抗BCMA抗体は、J6M0(国際公開第2012/163805号パンフレット)またはその抗原結合性断片である。
一部の実施形態では、抗BCMA抗体またはその抗原結合性断片は、J6M0の3つの重鎖CDRおよび3つの軽鎖CDRを含み、ここでCDRは、HCDR1(配列番号15)、HCDR2(配列番号16)、HCDR3(配列番号17);LCDR1(配列番号18)、LCDR2(配列番号19)およびLCDR3(配列番号20)の1、2、3、4、5または6つ以下のアミノ酸付加、欠失または置換を含む。
一部の実施形態では、ADCについての標的がん抗原はCD33である。
一部の実施形態では、抗CD33抗体またはその抗原結合性断片は、以下のような3つの重鎖CDRおよび3つの軽鎖CDR:配列番号21からなる重鎖CDR1(HCDR1)、配列番号22からなる重鎖CDR2(HCDR2)、配列番号23からなる重鎖CDR3(HCDR3);配列番号24からなる軽鎖CDR1(LCDR1)、配列番号25からなる軽鎖CDR2(LCDR2)および配列番号26からなる軽鎖CDR3(LCDR3)を含む。
一部の実施形態では、抗CD33抗体またはその抗原結合性断片は、配列番号3のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号4のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。一部の実施形態では、抗CD33抗体またはその抗原結合性断片は、配列番号3の重鎖可変領域アミノ酸配列、および配列番号4の軽鎖可変領域アミノ酸配列、または開示される配列と少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、抗CD33抗体またはその抗原結合性断片は、配列番号3と少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%もしくは少なくとも99%同一である重鎖可変領域アミノ酸配列、および/または配列番号4と少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%もしくは少なくとも99%同一である軽鎖可変領域アミノ酸配列を有する。
一部の実施形態では、抗CD33抗体またはその抗原結合性断片は、内在化抗体または内在化抗原結合性断片である。一部の実施形態では、抗CD33抗体は、ヒトIgG1重鎖定常ドメインまたは修飾IgG1重鎖定常ドメインを含む。一部の実施形態では、IgG1重鎖定常ドメインは、野生型(非修飾)IgG1重鎖定常ドメイン中の297に対応するアミノ酸位置にグルタミン残基(Q)を含む。一部の実施形態では、抗CD33抗体は、ヒトIgカッパ軽鎖定常ドメインまたは修飾Igカッパ軽鎖定常ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗CD33抗体は、配列番号59の重鎖アミノ酸配列または配列番号59と少なくとも95%同一である配列、および配列番号60の軽鎖アミノ酸配列または配列番号60と少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、抗CD33抗体は、配列番号59の重鎖アミノ酸配列、および配列番号60の軽鎖アミノ酸配列、または開示される配列と少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、抗CD33抗体は、配列番号59と少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%または少なくとも99%同一である重鎖アミノ酸配列、および配列番号60と少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%または少なくとも99%同一である軽鎖アミノ酸配列を有する。一部の実施形態では、抗CD33抗体は、MuMy9-6ch(米国特許出願公開第2013/0078241号明細書)またはその抗原結合性断片である。
一部の実施形態では、抗CD33抗体またはその抗原結合性断片は、MuMy9-6chの3つの重鎖CDRおよび3つの軽鎖CDRを含み、ここでCDRは、HCDR1(配列番号21)、HCDR2(配列番号22)、HCDR3(配列番号23);LCDR1(配列番号24)、LCDR2(配列番号25)およびLCDR3(配列番号26)の1、2、3、4、5または6つ以下のアミノ酸付加、欠失または置換を含む。
一部の実施形態では、抗CD33抗体またはその抗原結合性断片は、以下のような3つの重鎖CDRおよび3つの軽鎖CDR:配列番号27からなる重鎖CDR1(HCDR1)、配列番号28からなる重鎖CDR2(HCDR2)、配列番号29からなる重鎖CDR3(HCDR3);配列番号30からなる軽鎖CDR1(LCDR1)、配列番号31からなる軽鎖CDR2(LCDR2)および配列番号32からなる軽鎖CDR3(LCDR3)を含む。
一部の実施形態では、抗CD33抗体またはその抗原結合性断片は、配列番号5のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号6のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。一部の実施形態では、抗CD33抗体またはその抗原結合性断片は、配列番号5の重鎖可変領域アミノ酸配列、および配列番号6の軽鎖可変領域アミノ酸配列、または開示される配列と少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、抗CD33抗体またはその抗原結合性断片は、配列番号5と少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%もしくは少なくとも99%同一である重鎖可変領域アミノ酸配列、および/または配列番号6と少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%もしくは少なくとも99%同一である軽鎖可変領域アミノ酸配列を有する。
一部の実施形態では、抗CD33抗体またはその抗原結合性断片は、内在化抗体または内在化抗原結合性断片である。一部の実施形態では、抗CD33抗体は、ヒトIgG1重鎖定常ドメインまたは修飾IgG1重鎖定常ドメインを含む。一部の実施形態では、IgG1重鎖定常ドメインは、EU番号付けシステムにより番号付けされた野生型(非修飾)IgG1重鎖定常ドメイン中の152および375に対応するアミノ酸位置にシステイン残基(C)を含む。
一部の実施形態では、抗CD33抗体は、配列番号61の重鎖アミノ酸配列または配列番号61と少なくとも95%同一である配列、および配列番号62の軽鎖アミノ酸配列または配列番号62と少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、抗CD33抗体は、配列番号61の重鎖アミノ酸配列、および配列番号62の軽鎖アミノ酸配列、または開示される配列と少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、抗CD33抗体は、配列番号61と少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%または少なくとも99%同一である重鎖アミノ酸配列、および配列番号62と少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%または少なくとも99%同一である軽鎖アミノ酸配列を有する。一部の実施形態では、抗CD33抗体は、ゲムツズマブまたはその抗原結合性断片である。
一部の実施形態では、抗CD33抗体またはその抗原結合性断片は、ゲムツズマブの3つの重鎖CDRおよび3つの軽鎖CDRを含み、ここでCDRは、HCDR1(配列番号27)、HCDR2(配列番号28)、HCDR3(配列番号29);LCDR1(配列番号30)、LCDR2(配列番号31)およびLCDR3(配列番号32)の1、2、3、4、5または6つ以下のアミノ酸付加、欠失または置換を含む。
一部の実施形態では、ADCについての標的がん抗原はPCADである。
一部の実施形態では、抗PCAD抗体またはその抗原結合性断片は、以下のような3つの重鎖CDRおよび3つの軽鎖CDR:配列番号33からなる重鎖CDR1(HCDR1)、配列番号34からなる重鎖CDR2(HCDR2)、配列番号35からなる重鎖CDR3(HCDR3);配列番号36からなる軽鎖CDR1(LCDR1)、配列番号37からなる軽鎖CDR2(LCDR2)および配列番号38からなる軽鎖CDR3(LCDR3)を含む。
一部の実施形態では、抗PCAD抗体またはその抗原結合性断片は、配列番号7のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号8のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。一部の実施形態では、抗PCAD抗体またはその抗原結合性断片は、配列番号7の重鎖可変領域アミノ酸配列、および配列番号8の軽鎖可変領域アミノ酸配列、または開示される配列と少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、抗PCAD抗体またはその抗原結合性断片は、配列番号7と少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%もしくは少なくとも99%同一である重鎖可変領域アミノ酸配列、および/または配列番号8と少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%もしくは少なくとも99%同一である軽鎖可変領域アミノ酸配列を有する。
一部の実施形態では、抗PCAD抗体またはその抗原結合性断片は、内在化抗体または内在化抗原結合性断片である。一部の実施形態では、抗PCAD抗体は、ヒトIgG1重鎖定常ドメインまたは修飾IgG1重鎖定常ドメインを含む。一部の実施形態では、IgG1重鎖定常ドメインは、EU番号付けシステムにより番号付けされた野生型(非修飾)IgG1重鎖定常ドメイン中の152および375に対応するアミノ酸位置にシステイン残基(C)を含む。
一部の実施形態では、抗PCAD抗体は、配列番号63の重鎖アミノ酸配列または配列番号63と少なくとも95%同一である配列、および配列番号64の軽鎖アミノ酸配列または配列番号64と少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、抗PCAD抗体は、配列番号63の重鎖アミノ酸配列、および配列番号64の軽鎖アミノ酸配列、または開示される配列と少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、抗PCAD抗体は、配列番号63と少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%または少なくとも99%同一である重鎖アミノ酸配列、および配列番号64と少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%または少なくとも99%同一である軽鎖アミノ酸配列を有する。一部の実施形態では、抗PCAD抗体は、NOV169N31Q(国際公開第2016/203432号パンフレット)またはその抗原結合性断片である。
一部の実施形態では、抗PCAD抗体またはその抗原結合性断片は、NOV169N31Qの3つの重鎖CDRおよび3つの軽鎖CDRを含み、ここでCDRは、HCDR1(配列番号33)、HCDR2(配列番号34)、HCDR3(配列番号35);LCDR1(配列番号36)、LCDR2(配列番号37)およびLCDR3(配列番号38)の1、2、3、4、5または6つ以下のアミノ酸付加、欠失または置換を含む。
一部の実施形態では、ADCについての標的がん抗原はHER2である。
一部の実施形態では、抗HER2抗体またはその抗原結合性断片は、以下のような3つの重鎖CDRおよび3つの軽鎖CDR:配列番号39からなる重鎖CDR1(HCDR1)、配列番号40からなる重鎖CDR2(HCDR2)、配列番号41からなる重鎖CDR3(HCDR3);配列番号42からなる軽鎖CDR1(LCDR1)、配列番号43からなる軽鎖CDR2(LCDR2)および配列番号44からなる軽鎖CDR3(LCDR3)を含む。
一部の実施形態では、抗HER2抗体またはその抗原結合性断片は、配列番号9のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号10のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。一部の実施形態では、抗HER2抗体またはその抗原結合性断片は、配列番号9の重鎖可変領域アミノ酸配列、および配列番号10の軽鎖可変領域アミノ酸配列、または開示される配列と少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、抗HER2抗体またはその抗原結合性断片は、配列番号9と少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%もしくは少なくとも99%同一である重鎖可変領域アミノ酸配列、および/または配列番号10と少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%もしくは少なくとも99%同一である軽鎖可変領域アミノ酸配列を有する。
一部の実施形態では、抗HER2抗体またはその抗原結合性断片は、内在化抗体または内在化抗原結合性断片である。一部の実施形態では、抗HER2抗体は、ヒトIgG1重鎖定常ドメインまたは修飾IgG1重鎖定常ドメインを含む。一部の実施形態では、IgG1重鎖定常ドメインは、野生型(非修飾)IgG1重鎖定常ドメイン中の297に対応するアミノ酸位置にグルタミン残基(Q)を含む。一部の実施形態では、IgG1重鎖定常ドメインは、野生型(非修飾)IgG1重鎖定常ドメイン中の297に対応するアミノ酸位置にセリン残基(S)を含む。一部の実施形態では、IgG1重鎖定常ドメインは、EU番号付けシステムにより番号付けされた野生型(非修飾)IgG1重鎖定常ドメイン中の152および375に対応するアミノ酸位置にシステイン残基(C)を含む。一部の実施形態では、抗HER2抗体は、ヒトIgカッパ軽鎖定常ドメインまたは修飾Igカッパ軽鎖定常ドメインを含む。
一部の実施形態では、抗HER2抗体は、配列番号65の重鎖アミノ酸配列または配列番号65と少なくとも95%同一である配列、および配列番号66の軽鎖アミノ酸配列または配列番号66と少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、抗HER2抗体は、配列番号65の重鎖アミノ酸配列、および配列番号66の軽鎖アミノ酸配列、または開示される配列と少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、抗HER2抗体は、配列番号65と少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%または少なくとも99%同一である重鎖アミノ酸配列、および配列番号66と少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%または少なくとも99%同一である軽鎖アミノ酸配列を有する。一部の実施形態では、抗HER2抗体は,トラスツズマブ(米国特許第5,821,337号明細書および第6,870,034号明細書;Molina et al. (2001) Cancer Res. 61(12):4744-9も参照されたい)またはその抗原結合性断片である。
一部の実施形態では、抗HER2抗体またはその抗原結合性断片は、トラスツズマブの3つの重鎖CDRおよび3つの軽鎖CDRを含み、ここでCDRは、HCDR1(配列番号39)、HCDR2(配列番号40)、HCDR3(配列番号41);LCDR1(配列番号42)、LCDR2(配列番号43)およびLCDR3(配列番号44)の1、2、3、4、5または6つ以下のアミノ酸付加、欠失または置換を含む。
一部の実施形態では、ADCについての標的がん抗原はCD38である。
一部の実施形態では、抗CD38抗体またはその抗原結合性断片は、以下のような3つの重鎖CDRおよび3つの軽鎖CDR:配列番号45からなる重鎖CDR1(HCDR1)、配列番号46からなる重鎖CDR2(HCDR2)、配列番号47からなる重鎖CDR3(HCDR3);配列番号48からなる軽鎖CDR1(LCDR1)、配列番号49からなる軽鎖CDR2(LCDR2)および配列番号50からなる軽鎖CDR3(LCDR3)を含む。
一部の実施形態では、抗CD38抗体またはその抗原結合性断片は、配列番号11のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号12のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。一部の実施形態では、抗CD38抗体またはその抗原結合性断片は、配列番号11の重鎖可変領域アミノ酸配列、および配列番号12の軽鎖可変領域アミノ酸配列、または開示される配列と少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、抗CD38抗体またはその抗原結合性断片は、配列番号11と少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%もしくは少なくとも99%同一である重鎖可変領域アミノ酸配列、および/または配列番号12と少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%もしくは少なくとも99%同一である軽鎖可変領域アミノ酸配列を有する。
一部の実施形態では、抗CD38抗体またはその抗原結合性断片は、内在化抗体または内在化抗原結合性断片である。一部の実施形態では、抗CD38抗体は、ヒトIgG1重鎖定常ドメインまたは修飾IgG1重鎖定常ドメインを含む。一部の実施形態では、IgG1重鎖定常ドメインは、EU番号付けシステムにより番号付けされた野生型(非修飾)IgG1重鎖定常ドメイン中の152および375に対応するアミノ酸位置にシステイン残基(C)を含む。
一部の実施形態では、抗CD38抗体は、配列番号67の重鎖アミノ酸配列または配列番号67と少なくとも95%同一である配列、および配列番号68の軽鎖アミノ酸配列または配列番号68と少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、抗CD33抗体は、配列番号67の重鎖アミノ酸配列、および配列番号68の軽鎖アミノ酸配列、または開示される配列と少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、抗CD38抗体は、配列番号67と少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%または少なくとも99%同一である重鎖アミノ酸配列、および配列番号68と少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%または少なくとも99%同一である軽鎖アミノ酸配列を有する。一部の実施形態では、抗CD38抗体は、ダラツムマブまたはその抗原結合性断片である。
一部の実施形態では、抗CD38抗体またはその抗原結合性断片は、ゲムツズマブの3つの重鎖CDRおよび3つの軽鎖CDRを含み、ここでCDRは、HCDR1(配列番号45)、HCDR2(配列番号46)、HCDR3(配列番号47);LCDR1(配列番号48)、LCDR2(配列番号49)およびLCDR3(配列番号50)の1、2、3、4、5または6つ以下のアミノ酸付加、欠失または置換を含む。
一部の実施形態では、ADCについての標的がん抗原はCD46である。
一部の実施形態では、抗CD46抗体または抗原結合性断片は、本明細書で参照により組み込まれる国際公開第2018/089807号パンフレットに記載されるものである。一部の実施形態では、抗CD46抗体またはその抗原結合性断片は、配列番号90のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号91のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。一部の実施形態では、抗CD46抗体またはその抗原結合性断片は、配列番号90の重鎖可変領域アミノ酸配列、および配列番号91の軽鎖可変領域アミノ酸配列、または開示される配列と少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、抗CD46抗体またはその抗原結合性断片は、配列番号90と少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%もしくは少なくとも99%同一である重鎖可変領域アミノ酸配列、および/または配列番号91と少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%もしくは少なくとも99%同一である軽鎖可変領域アミノ酸配列を有する。
一部の実施形態では、ADCについての標的がん抗原はCD48である。
一部の実施形態では、抗CD48抗体またはその抗原結合性断片は、以下のような3つの重鎖CDRおよび3つの軽鎖CDR:配列番号51からなる重鎖CDR1(HCDR1)、配列番号52からなる重鎖CDR2(HCDR2)、配列番号53からなる重鎖CDR3(HCDR3);配列番号54からなる軽鎖CDR1(LCDR1)、配列番号55からなる軽鎖CDR2(LCDR2)および配列番号56からなる軽鎖CDR3(LCDR3)を含む。
一部の実施形態では、抗CD48抗体またはその抗原結合性断片は、配列番号13のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号14のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。一部の実施形態では、抗CD48抗体またはその抗原結合性断片は、配列番号13の重鎖可変領域アミノ酸配列、および配列番号14の軽鎖可変領域アミノ酸配列、または開示される配列と少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、抗CD48抗体またはその抗原結合性断片は、配列番号13と少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%もしくは少なくとも99%同一である重鎖可変領域アミノ酸配列、および/または配列番号14と少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%もしくは少なくとも99%同一である軽鎖可変領域アミノ酸配列を有する。
一部の実施形態では、抗CD48抗体またはその抗原結合性断片は、内在化抗体または内在化抗原結合性断片である。一部の実施形態では、抗CD48抗体は、ヒトIgG1重鎖定常ドメインまたは修飾IgG1重鎖定常ドメインを含む。一部の実施形態では、IgG1重鎖定常ドメインは、EU番号付けシステムにより番号付けされた野生型(非修飾)IgG1重鎖定常ドメイン中の152および375に対応するアミノ酸位置にシステイン残基(C)を含む。
一部の実施形態では、抗CD48抗体は、配列番号69の重鎖アミノ酸配列または配列番号69と少なくとも95%同一である配列、および配列番号70の軽鎖アミノ酸配列または配列番号70と少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、抗CD48抗体は、配列番号69の重鎖アミノ酸配列、および配列番号70の軽鎖アミノ酸配列、または開示される配列と少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、抗CD48抗体は、配列番号69と少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%または少なくとも99%同一である重鎖アミノ酸配列、および配列番号70と少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%または少なくとも99%同一である軽鎖アミノ酸配列を有する。一部の実施形態では、抗CD48抗体は、SGN-48Aまたはその抗原結合性断片である。
一部の実施形態では、抗CD48抗体またはその抗原結合性断片は、ゲムツズマブの3つの重鎖CDRおよび3つの軽鎖CDRを含み、ここでCDRは、HCDR1(配列番号51)、HCDR2(配列番号52)、HCDR3(配列番号53);LCDR1(配列番号54)、LCDR2(配列番号55)およびLCDR3(配列番号56)の1、2、3、4、5または6つ以下のアミノ酸付加、欠失または置換を含む。
一部の実施形態では、ADCについての標的がん抗原はCD79Bである。
一部の実施形態では、抗CD48抗体またはその抗原結合性断片は、以下のような3つの重鎖CDRおよび3つの軽鎖CDR:配列番号82からなる重鎖CDR1(HCDR1)、配列番号83からなる重鎖CDR2(HCDR2)、配列番号84からなる重鎖CDR3(HCDR3);配列番号85からなる軽鎖CDR1(LCDR1)、配列番号86からなる軽鎖CDR2(LCDR2)および配列番号87からなる軽鎖CDR3(LCDR3)を含む。
一部の実施形態では、抗CD79B抗体またはその抗原結合性断片は、配列番号80のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、および配列番号81のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。一部の実施形態では、抗CD79B抗体またはその抗原結合性断片は、配列番号80の重鎖可変領域アミノ酸配列、および配列番号81の軽鎖可変領域アミノ酸配列、または開示される配列と少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、抗CD79B抗体またはその抗原結合性断片は、配列番号80と少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%もしくは少なくとも99%同一である重鎖可変領域アミノ酸配列、および/または配列番号81と少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%もしくは少なくとも99%同一である軽鎖可変領域アミノ酸配列を有する。
一部の実施形態では、抗CD79B抗体またはその抗原結合性断片は、内在化抗体または内在化抗原結合性断片である。一部の実施形態では、抗CD79B抗体は、ヒトIgG1重鎖定常ドメインまたは修飾IgG1重鎖定常ドメインを含む。一部の実施形態では、IgG1重鎖定常ドメインは、EU番号付けシステムにより番号付けされた野生型(非修飾)IgG1重鎖定常ドメイン中の152および375に対応するアミノ酸位置にシステイン残基(C)を含む。
一部の実施形態では、抗CD79B抗体は、配列番号88の重鎖アミノ酸配列または配列番号88と少なくとも95%同一である配列、および配列番号89の軽鎖アミノ酸配列または配列番号89と少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、抗CD33抗体は、配列番号88の重鎖アミノ酸配列、および配列番号89の軽鎖アミノ酸配列、または開示される配列と少なくとも95%同一である配列を含む。一部の実施形態では、抗CD79B抗体は、配列番号88と少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%または少なくとも99%同一である重鎖アミノ酸配列、および配列番号89と少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%または少なくとも99%同一である軽鎖アミノ酸配列を有する。一部の実施形態では、抗CD79B抗体は、ポラチズマブまたはその抗原結合性断片である。
一部の実施形態では、抗CD79B抗体またはその抗原結合性断片は、ゲムツズマブの3つの重鎖CDRおよび3つの軽鎖CDRを含み、ここでCDRは、HCDR1(配列番号82)、HCDR2(配列番号83)、HCDR3(配列番号84);LCDR1(配列番号85)、LCDR2(配列番号86)およびLCDR3(配列番号87)の1、2、3、4、5または6つ以下のアミノ酸付加、欠失または置換を含む。
2つ以上のポリペプチド中の残基は、残基がポリペプチド構造中の類似の位置を占める場合、「対応する」と言われる。2つ以上のポリペプチド中の類似の位置は、ポリペプチド配列をアミノ酸配列または構造の類似性に基づいて配列比較することにより決定することができる。当業者は、良好な配列比較を生成するために、いずれかの配列にギャップを導入することが必要となり得ることを理解する。
一部の実施形態では、アミノ酸置換は単一の残基でのものである。挿入は、通常約1~約20程度のアミノ酸残基で起こるが、生物機能(例えば標的抗原への結合)が保持される限り、著しく大きな挿入も許容されることがある。欠失は、通常約1~約20のアミノ酸残基の範囲にわたるが、一部の場合では欠失ははるかにより大きいことがある。置換、欠失、挿入またはそれらの任意の組合せは、最終の誘導体またはバリアントに到達するために使用することができる。一般的に、これらの変化は、分子、特に抗原結合タンパク質の免疫原性および特異性の変更を最小化するために、少数のアミノ酸上で行われる。しかし、より大きな変化は、ある特定の状況において許容されることがある。保存的置換は、表7のように示された以下のチャートに従って行うことができる。
Figure 2022532918000200
バリアント抗体配列がADC中で使用される一部の実施形態では、バリアントは典型的に同じ質の生物活性を示し、同じ免疫反応を誘発するが、バリアントは、必要に応じて抗原結合タンパク質の特性を修飾するように選択することもできる。あるいは、バリアントは、抗原結合タンパク質の生物活性が変更されるように設計することができる。例えば、グリコシル化部位は、変更または除去することができる。
様々な抗体を、がん細胞を標的とするために、本明細書で使用されるADCで使用することができる。下記に示すように、本明細書で開示されるADC中のリンカー-ペイロードは、異なる腫瘍抗原標的抗体を用いると非常に有効である。がん細胞で発現するが健康な細胞では発現しない、またはがん細胞で健康な細胞よりも高いレベルで発現する好適な抗原は、抗体がそれらを対象とするため、当該技術分野において公知である。これらの抗原標的に対するさらなる抗体は、当業者により調製することができる。これらの抗体は、本明細書で開示されるリンカーおよびMcl-1阻害剤ペイロードとともに使用することができる。一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片はBCMAを標的とし、BCMA標的抗体または抗原結合性断片はJ6M0である。一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片はCD33を標的とし、一部の実施形態では、CD33標的抗体または抗原結合性断片はMuMy9-6chである。一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片はPCADを標的とし、一部の実施形態では、PCAD標的抗体または抗原結合性断片はNOV169N31Qである。一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片はHER2を標的とし、一部の実施形態では、HER2標的抗体または抗原結合性断片はトラスツズマブである。一部の実施形態では、開示されるリンカーおよびMcl-1阻害剤ペイロードは、いくつかの異なる腫瘍標的抗体を用いると非常に有効である一方、BCMA標的抗体、例えばJ6M0、CD33標的抗体、例えばMuMy9-6ch、PCAD標的抗体、例えばNOV169N31QおよびHER2標的抗体、例えばトラスツズマブは、特に改善された薬物:抗体比、凝集レベル、安定性(すなわち、in vitroおよびin vivoの安定性)、腫瘍標的化(すなわち、細胞傷害性、効力)、最小化された標的外死滅および/または処置有効性を提供した。改善された処置有効性はin vitroまたはin vivoで測定することができ、低減した腫瘍成長速度および/または低減した腫瘍体積を挙げることができる。
一部の実施形態では、同じ標的に対する代わりの抗体または異なる抗原標的に対する抗体が使用され、上記に記載した好都合な機能的性質(例えば、改善された安定性、改善された腫瘍標的化、改善された処置有効性等)の少なくともいくつかを提供する。一部の実施形態では、これらの好都合な機能的性質の一部またはすべては、開示されるリンカーおよびMcl-1阻害剤ペイロードが代わりのBCMA、CD33、CD46、CD48、PCADまたはHER2標的抗体または抗原結合性断片にコンジュゲートする場合に、観察される。一部の他の実施形態では、これらの好都合な機能的性質の一部またはすべては、開示されるリンカーおよびMcl-1阻害剤ペイロードがBCMA標的抗体または抗原結合性断片にコンジュゲートする場合に、観察される。一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片はBCMAを標的とする。一部の実施形態では、BCMA標的抗体または抗原結合性断片は、J6M0である。他の実施形態では、これらの好都合な機能的性質の一部またはすべては、開示されるリンカーおよびMcl-1阻害剤ペイロードがCD33標的抗体または抗原結合性断片にコンジュゲートする場合に、観察される。一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片はCD33を標的とする。一部の実施形態では、CD33標的抗体または抗原結合性断片は、MuMy9-6chである。他の実施形態では、これらの好都合な機能的性質の一部またはすべては、開示されるリンカーおよびMcl-1阻害剤ペイロードがPCAD標的抗体または抗原結合性断片にコンジュゲートする場合に、観察される。一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片はPCADを標的とする。一部の実施形態では、PCAD標的抗体または抗原結合性断片は、NOV169N31Qである。他の実施形態では、これらの好都合な機能的性質の一部またはすべては、開示されるリンカーおよびMcl-1阻害剤ペイロードがHER2標的抗体または抗原結合性断片にコンジュゲートする場合に、観察される。一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片はHER2を標的とする。一部の実施形態では、HER2標的抗体または抗原結合性断片は、トラスツズマブである。
リンカー
一部の実施形態では、ADCにおけるリンカーは、治療上有効であるように十分に細胞外で安定している。一部の実施形態では、リンカーが細胞外で安定しているため、ADCは細胞外条件で存在する場合(例えば、細胞への輸送または送達前)には無傷のままである。ADCの文脈で使用される「無傷」という用語は、抗体または抗原結合性断片が薬物部分(例えば、Mcl-1阻害剤)に結合したままであることを意味する。
本明細書で使用される場合、リンカー、またはリンカーを含むADCの文脈での「安定な」は、ADCが細胞外条件で存在する場合に、ADCの試料中のリンカーの20%以下、約15%以下、約10%以下、約5%以下、約3%以下、または約1%以下(またはそれらの間の任意のパーセンテージ)が切断されている(または全ADCが別段無傷ではない場合である)ことを意味する。一部の実施形態では、本明細書に開示されるリンカーおよび/またはADCは、代替的なリンカー、ならびに/または代替的なリンカーおよび/もしくはMcl-1阻害剤ペイロードを有するADCと比較して安定である。一部の実施形態では、本明細書に開示されるADCは、約48時間超、60時間超、約72時間超、約84時間超、または約96時間超、無傷のままであり得る。
リンカーが細胞外で安定であるかどうかは、例えば、ADCを血漿中に所定の時間期間(例えば、2、4、6、8、16、24、48、または72時間)含ませ、次いで血漿中に存在する遊離薬物部分の量を定量することにより決定することができる。安定性により、標的がん細胞に局在化するための、かつ正常組織およびがん組織の両方を無差別に損傷することによりADCの治療指数を低下させる可能性がある薬物部分の時期尚早な放出を防止するためのADC時間が許容され得る。一部の実施形態では、リンカーが標的細胞の外側で安定しており、その細胞の内側に入るとADCから薬物部分を放出するため、薬物はその標的に結合することができる。したがって、有効なリンカーは:(i)抗体または抗原結合性断片の特異的結合特性を維持し;(ii)抗体または抗原結合性断片への安定な結合を介して薬物部分の送達、例えば細胞内送達を可能にし;(iii)ADCがその標的部位に輸送または送達されるまで、安定かつ無傷のままであり;かつ(iv)切断または代替的な放出機構後の薬物部分の治療効果、例えば細胞傷害効果を可能にする。
リンカーは、ADCの物理化学的特性に影響を及ぼすことがある。多くの細胞傷害剤が性質上疎水性であるため、それらと、追加の疎水性部分を有する抗体とを連結することにより、凝集が生じる場合がある。ADC凝集物は不溶性であり、抗体上への達成可能な薬物装填量を制限することが多く、このことはADCの効力に負の影響を及ぼす可能性がある。生物製剤のタンパク質凝集は一般に、免疫原性の増加にも関連付けられている。以下に示す通り、本明細書に開示されるリンカーは、低い凝集レベルおよび望ましいレベルの薬物装填量を有するADCをもたらす。
リンカーは「切断可能」であっても「非切断可能」であってよい(Ducry and Stump (2010) Bioconjugate Chem. 21:5-13)。切断可能なリンカーは、ある特定の環境因子に供される場合、例えば、標的細胞内に内在化される場合に、薬物部分(例えば、Mcl-1阻害剤)を放出するように設計されるのに対し、非切断可能なリンカーは一般に、抗体または抗原結合性断片自体の分解に依存する。
「アルキル」という用語は、本明細書で使用される場合、炭素および水素原子のみからなり、不飽和を含まない、直鎖状または分枝状炭化水素鎖ラジカルを指す。「C~Cアルキル」という用語は、本明細書で使用される場合、炭素および水素原子のみからなり、不飽和を含まず、1~6個の炭素原子を有し、単結合により分子の残部に結合されている、直鎖状または分枝状炭化水素鎖ラジカルを指す。「C~Cアルキル」基の非限定的な例としては、メチル(Cアルキル)、エチル(Cアルキル)、1-メチルエチル(Cアルキル)、n-プロピル(Cアルキル)、イソプロピル(Cアルキル)、n-ブチル(Cアルキル)、イソブチル(Cアルキル)、sec-ブチル(Cアルキル)、tert-ブチル(Cアルキル)、n-ペンチル(Cアルキル)、イソペンチル(Cアルキル)、ネオペンチル(Cアルキル)およびヘキシル(Cアルキル)が挙げられる。
「アルケニル」という用語は、本明細書で使用される場合、炭素および水素原子のみからなり、少なくとも1つの二重結合を含む、直鎖状または分枝状炭化水素鎖ラジカル基を指す。「C~Cアルケニル」という用語は、本明細書で使用される場合、炭素および水素原子のみからなり、少なくとも1つの二重結合を含み、2~6個の炭素原子を有し、単結合により分子の残部に結合されている、直鎖状または分枝状炭化水素鎖ラジカル基を指す。「C~Cアルケニル」基の非限定的な例としては、エテニル(Cアルケニル)、プロパ-1-エニル(Cアルケニル)、ブタ-1-エニル(Cアルケニル)、ペンタ-1-エニル(Cアルケニル)、ペンタ-4-エニル(Cアルケニル)、ペンタ-1,4-ジエニル(Cアルケニル)、ヘキサ-1-エニル(Cアルケニル)、ヘキサ-2-エニル(Cアルケニル)、ヘキサ-3-エニル(Cアルケニル)、ヘキサ-1-,4-ジエニル(Cアルケニル)、ヘキサ-1-,5-ジエニル(Cアルケニル)およびヘキサ-2-,4-ジエニル(Cアルケニル)が挙げられる。「C~Cアルケニル」という用語は、本明細書で使用される場合、炭素および水素原子のみからなり、少なくとも1つの二重結合を含み、2~3個の炭素原子を有し、単結合により分子の残部に結合されている、直鎖状または分枝状炭化水素鎖ラジカル基を指す。「C~Cアルケニル」基の非限定的な例としては、エテニル(Cアルケニル)およびプロパ-1-エニル(Cアルケニル)が挙げられる。
「アルキレン」という用語は、本明細書で使用される場合、炭素および水素原子のみからなり、不飽和を含まない、二価の直鎖状または分枝状炭化水素鎖ラジカルを指す。「C~Cアルキレン」という用語は、本明細書で使用される場合、炭素および水素原子のみからなり、不飽和を含まず、1~6個の炭素原子を有する、二価の直鎖状または分枝状炭化水素鎖ラジカルを指す。「C~Cアルキレン」基の非限定的な例としては、メチレン(Cアルキレン)、エチレン(Cアルキレン)、1-メチルエチレン(Cアルキレン)、n-プロピレン(Cアルキレン)、イソプロピレン(Cアルキレン)、n-ブチレン(Cアルキレン)、イソブチレン(Cアルキレン)、sec-ブチレン(Cアルキレン)、tert-ブチレン(Cアルキレン)、n-ペンチレン(Cアルキレン)、イソペンチレン(Cアルキレン)、ネオペンチレン(Cアルキレン)、およびヘキシレン(Cアルキレン)が挙げられる。
「アルケニレン」という用語は、本明細書で使用される場合、炭素および水素原子のみからなり、少なくとも1つの二重結合を含む、二価の直鎖状または分枝状炭化水素鎖ラジカルを指す。「C~Cアルケニレン」という用語は、本明細書で使用される場合、炭素および水素原子のみからなり、少なくとも1つの二重結合を含み、2~6個の炭素原子を有する、二価の直鎖状または分枝状炭化水素鎖ラジカル基を指す。「C~Cアルケニレン」基の非限定的な例としては、エテニレン(Cアルケニレン)、プロパ-1-エニレン(Cアルケニレン)、ブタ-1-エニレン(Cアルケニレン)、ペンタ-1-エニレン(Cアルケニレン)、ペンタ-4-エニレン(Cアルケニレン)、ペンタ-1,4-ジエニレン(Cアルケニレン)、ヘキサ-1-エニレン(Cアルケニレン)、ヘキサ-2-エニレン(Cアルケニレン)、ヘキサ-3-エニレン(Cアルケニレン)、ヘキサ-1-,4-ジエニレン(Cアルケニレン)、ヘキサ-1-,5-ジエニレン(Cアルケニレン)およびヘキサ-2-,4-ジエニレン(Cアルケニレン)が挙げられる。「C~Cアルケニレン」という用語は、本明細書で使用される場合、炭素および水素原子のみからなり、少なくとも1つの二重結合を含み、2~3個の炭素原子を有する、二価の直鎖状または分枝状炭化水素鎖ラジカル基を指す。「C~Cアルケニレン」基の非限定的な例としては、エテニレン(Cアルケニレン)およびプロパ-1-エニレン(Cアルケニレン)が挙げられる。
「シクロアルキル」または「C~Cシクロアルキル」という用語は、本明細書で使用される場合、飽和の、単環式、縮合二環式、縮合三環式または橋架多環式環系を指す。縮合二環式または橋架多環式環系の非限定的な例としては、ビシクロ[1.1.1]ペンタン、ビシクロ[2.1.1]ヘキサン、ビシクロ[2.2.1]ヘプタン、ビシクロ[3.1.1]ヘプタン、ビシクロ[3.2.1]オクタン、ビシクロ[2.2.2]オクタンおよびアダマンタニルが挙げられる。単環式C~Cシクロアルキル基の非限定的な例としては、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロヘキシル、シクロヘプチルおよびシクロオクチル基が挙げられる。
「ハロアルキル」という用語は、本明細書で使用される場合、炭化水素鎖に沿った水素の代わりに1個または複数のハロゲン基で置換された線状または分枝状アルキル鎖を指す。ハロアルキル基における置換に適したハロゲン基の例としては、フッ素、臭素、塩素、およびヨウ素が挙げられる。ハロアルキル基は、アルキル鎖における水素の代わりに複数のハロゲン基による置換を含んでよく、ここで、前記ハロゲン基は、アルキル鎖における同じ炭素または別の炭素に結合することができる。
本明細書で使用される場合、アルキル、アルケニル、アルキニル、アルコキシ、アミノ、アリール、ヘテロアリール、シクロアルキル、およびヘテロシクロアルキル基は、必要に応じて置換された線状もしくは分枝状(C~C)アルキル、必要に応じて置換された線状もしくは分枝状(C~C)アルケニル基、必要に応じて置換された線状もしくは分枝状(C~C)アルキニル基、必要に応じて置換された線状もしくは分枝状(C~C)アルコキシ、必要に応じて置換された(C~C)アルキル-S-、ヒドロキシ、オキソ(もしくは適切な場合、N-オキシド)、ニトロ、シアノ、-C(O)-OR’、-O-C(O)-R’、-C(O)-NR’R’’、-NR’R’’、-(C=NR’)-OR’’、線状もしくは分枝状(C~C)ハロアルキル、トリフルオロメトキシ、またはハロゲンから選択される1~4個の基で必要に応じて置換されてよく、ここで、R’およびR’’は、それぞれ独立して、水素原子または必要に応じて置換された線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基であり、ここで、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基の炭素原子のうちの1個もしくは複数は、必要に応じて重水素化されている。
「ポリオキシエチレン」、「ポリエチレングリコール」または「PEG」という用語は、本明細書で使用される場合、(OCHCH)基から構成される直鎖、分枝鎖または星形の構成物を指す。ある特定の実施形態では、ポリエチレンまたはPEG基は、-(OCHCH -(式中、tは、1~40または4~40であり、ここで、「-」は、自壊性スペーサーに向けられた末端を示し、「-」は、末端基R’との結合点を示し、ここで、R’は、OH、OCHまたはOCHCHC(=O)OHである)である。他の実施形態では、ポリエチレンまたはPEG基は、-(CHCHO) -(式中、tは、1~40または4~40であり、ここで、「-」は、自壊性スペーサーに向けられた末端を示し、「-」は、末端基R’’との結合点を示し、ここで、R’’は、H、CHまたはCHCHC(=O)OHである)である。例えば、「PEG12」という用語は、本明細書で使用される場合、tが12であることを意味する。
「ポリアルキレングリコール」という用語は、本明細書で使用される場合、(O(CH基から構成される直鎖、分枝鎖または星形の構成物を指す。ある特定の実施形態では、ポリエチレンまたはPEG基は、-(O(CH -(式中、mは、1~10であり、tは、1~40または4~40であり、ここで、「-」は、自壊性スペーサーに向けられた末端を示し、「-」は、末端基R’との結合点を示し、ここで、R’は、OH、OCHまたはOCHCHC(=O)OHである)である。他の実施形態では、ポリエチレンまたはPEG基は、-((CHO) -(式中、mは、1~10であり、tは、1~40または4~40であり、ここで、「-」は、自壊性スペーサーに向けられた末端を示し、「-」は、末端基R’’との結合点を示し、ここで、R’’は、H、CHまたはCHCHC(=O)OHである)である。
「反応性基」という用語は、本明細書で使用される場合、抗体、抗体断片、または抗体もしくは抗体断片に結合されている別の反応性基の官能基と共有結合を形成することができる官能基である。そのような官能基の非限定的な例としては、本明細書において提供される表8の反応性基が挙げられる。
「結合基(attachment group)」または「連結基(coupling group)」という用語は、本明細書で使用される場合、架橋スペーサーと抗体またはその断片とを連結する二価部分を指す。結合または連結基は、反応基と抗体またはその断片上の官能基との間の反応により形成される二価部分である。そのような二価部分の非限定的な例としては、本明細書において提供される表8および表9に示す二価化学部分が挙げられる。
「架橋スペーサー」という用語は、本明細書で使用される場合、1つまたは複数のリンカー成分であって、一緒に共有結合されて二価部分を形成し、これが、二価ペプチドスペーサーと反応性基とを連結し、二価ペプチドスペーサーと連結基とを連結し、または結合基と少なくとも1つの切断可能な基とを連結する、リンカー成分を指す。ある特定の実施形態では、「架橋スペーサー」は、アミド結合を介して二価ペプチドスペーサーのN-末端に結合されているカルボキシル基を含む。
「スペーサー部分」という用語は、本明細書で使用される場合、一緒に共有結合されて、自壊性スペーサーと親水性部分とを連結する部分を形成する、1つまたは複数のリンカー成分を指す。
「二価ペプチドスペーサー」という用語は、本明細書で使用される場合、一緒に共有結合されて、架橋スペーサーと自壊性スペーサーとを連結する部分を形成する、1個または複数のアミノ酸残基を含む、二価リンカーを指す。1個または複数のアミノ酸残基は、アラニン(Ala)、システイン(Cys)、アスパラギン酸(Asp)、グルタミン酸(Glu)、フェニルアラニン(Phe)、グリシン(Gly)、ヒスチジン(His)、イソロイシン(Ile)、リシン(Lys)、ロイシン(Leu)、メチオニン(Met)、アスパラギン(Asn)、プロリン(Pro)、グルタミン(Gln)、アルギニン(Arg)、セリン(Ser)、トレオニン(Thr)、バリン(Val)、トリプトファン(Trp)、チロシン(Tyr)、シトルリン(Cit)、ノルバリン(Nva)、ノルロイシン(norleucune)(Nle)、セレノシステイン(Sec)、ピロリシン(Pyl)、ホモセリン、ホモシステイン、およびデスメチルピロリシンから選択されるアミノ酸の残基であり得る。
ある特定の実施形態では、「二価ペプチドスペーサー」は、各残基が、アラニン(Ala)、システイン(Cys)、アスパラギン酸(Asp)、グルタミン酸(Glu)、フェニルアラニン(Phe)、グリシン(Gly)、ヒスチジン(His)、イソロイシン(Ile)、リシン(Lys)、ロイシン(Leu)、メチオニン(Met)、アスパラギン(Asn)、プロリン(Pro)、グルタミン(Gln)、アルギニン(Arg)、セリン(Ser)、トレオニン(Thr)、バリン(Val)、トリプトファン(Trp)、チロシン(Tyr)、シトルリン(Cit)、ノルバリン(Nva)、ノルロイシン(Nle)、セレノシステイン(Sec)、ピロリシン(Pyl)、ホモセリン、ホモシステイン、およびデスメチルピロリシンから選択されるアミノ酸の残基から独立して選択される、2~4個のアミノ酸残基の組合せ、例えば、-ValCit;-CitVal;-AlaAla;-AlaCit;-CitAla;-AsnCit;-CitAsn;-CitCit;-ValGlu;-GluVal;-SerCit;-CitSer;-LysCit;-CitLys;-AspCit;-CitAsp;-AlaVal;-ValAla;-PheAla;-AlaPhe;-PheLys;-LysPhe;-ValLys;-LysVal;-AlaLys;-LysAla;-PheCit;-CitPhe;-LeuCit;-CitLeu;-IleCit;-CitIle;-PheArg;-ArgPhe;-CitTrp;-TrpCit;-PhePheLys;-LysPhePhe;-DPhePheLys;-DLysPhePhe;-GlyPheLys;-LysPheGly;-GlyPheLeuGly-[配列番号160];-GlyLeuPheGly-[配列番号161];-AlaLeuAlaLeu-[配列番号162]、-GlyGlyGly;-GlyGlyGlyGly-[配列番号163];-GlyPheValGly-[配列番号164];および-GlyValPheGly-[配列番号165]であり、ここで、「-」は、架橋スペーサーとの結合点を示し、「」は、自壊性スペーサーとの結合点を示す。
「リンカー成分」という用語は、本明細書で使用される場合、リンカーの一部である化学部分を指す。リンカー成分の例としては、以下が挙げられる:アルキレン基:線状または分枝状のいずれかであり得る-(CH-(この場合、nは、1~18である);アルケニレン基;アルキニレン基;アルケニル基;アルキニル基;エチレングリコールユニット:-OCHCH-または-CHCHO-;ポリエチレングリコールユニット:(-CHCHO-)(式中、この場合のxは、2~20である);-O-;-S-;カルボニル:-C(=O);エステル:C(=O)-OまたはO-C(=O);炭酸塩:-OC(=O)O-;アミン:-NH-;第三級アミン;アミド:-C(=O)-NH-、-NH-C(=O)-または-C(=O)N(C1~6アルキル);カルバメート:-OC(=O)NH-または-NHC(=O)O;尿素:-NHC(=O)NH;スルホンアミド:-S(O)NH-または-NHS(O);エーテル:-CHO-または-OCH-;カルボキシ、スルホン酸、ヒドロキシル、アミン、アミノ酸、糖類、リン酸およびホスホン酸から独立して選択される1個または複数の基で置換されたアルキレン);カルボキシ、スルホン酸、ヒドロキシル、アミン、アミノ酸、糖類、リン酸およびホスホン酸から独立して選択される1個または複数の基で置換されたアルケニレン);カルボキシ、スルホン酸、ヒドロキシル、アミン、アミノ酸、糖類、リン酸およびホスホン酸から独立して選択される1個または複数の基で置換されたアルキニレン);1個または複数のメチレン基が1つまたは複数の-S-、-NH-または-O-部分で置き換えられたC~C10アルキレン;2つの利用可能な結合点を有する環系、例えば、フェニル(1,2- 1,3-および1,4-ジ置換フェニルを含む)、C~Cヘテロアリール、C~Cシクロアルキル(1,1-ジ置換シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチルまたはシクロヘキシル、および1,4-ジ置換シクロヘキシルを含む)、およびC~Cヘテロシクロアルキルから選択される二価の環;アラニン(Ala)、システイン(Cys)、アスパラギン酸(Asp)、グルタミン酸(Glu)、フェニルアラニン(Phe)、グリシン(Gly)、ヒスチジン(His)、イソロイシン(Ile)、リシン(Lys)、ロイシン(Leu)、メチオニン(Met)、アスパラギン(Asn)、プロリン(Pro)、グルタミン(Gln)、アルギニン(Arg)、セリン(Ser)、トレオニン(Thr)、バリン(Val)、トリプトファン(Trp)、チロシン(Tyr)、シトルリン(Cit)、ノルバリン(Nva)、ノルロイシン(Nle)、セレノシステイン(Sec)、ピロリジン(Pyl)、ホモセリン、ホモシステイン、およびデスメチルピロリジンから選択されるアミノ酸の残基;各残基が、アラニン(Ala)、システイン(Cys)、アスパラギン酸(Asp)、グルタミン酸(Glu)、フェニルアラニン(Phe)、グリシン(Gly)、ヒスチジン(His)、イソロイシン(Ile)、リシン(Lys)、ロイシン(Leu)、メチオニン(Met)、アスパラギン(Asn)、プロリン(Pro)、グルタミン(Gln)、アルギニン(Arg)、セリン(Ser)、トレオニン(Thr)、バリン(Val)、トリプトファン(Trp)、チロシン(Tyr)、シトルリン(Cit)、ノルバリン(Nva)、ノルロイシン(Nle)、セレノシステイン(Sec)、ピロリシン(Pyl)、ホモセリン、ホモシステイン、およびデスメチルピロリシンから選択されるアミノ酸の残基から独立して選択される、2個以上のアミノ酸残基の組合せ、例えば、Val-Cit;Cit-Val;Ala-Ala;Ala-Cit;Cit-Ala;Asn-Cit;Cit-Asn;Cit-Cit;Val-Glu;Glu-Val;Ser-Cit;Cit-Ser;Lys-Cit;Cit-Lys;Asp-Cit;Cit-Asp;Ala-Val;Val-Ala;Phe-Lys;Lys-Phe;Val-Lys;Lys-Val;Ala-Lys;Lys-Ala;Phe-Cit;Cit-Phe;Leu-Cit;Cit-Leu;Ile-Cit;Cit-Ile;Phe-Arg;Arg-Phe;Cit-Trp;およびTrp-Cit;ならびに自壊性スペーサーであって、酸誘発性切断、ぺプチダーゼ誘発性切断、エステラーゼ誘発性切断、グリコシダーゼ誘発性切断、ホスホジエステラーゼ誘発性切断、ホスファターゼ誘発性切断、プロテアーゼ誘発性切断、リパーゼ誘発性切断またはジスルフィド結合切断に対して感受性である1つまたは複数の保護(トリガー)基を含む、自壊性スペーサー。
そのような自壊性スペーサーの非限定的な例としては、
Figure 2022532918000201
(式中、
PGは、保護(トリガー)基であり、
は、O、NHまたはSであり、
は、O、NH、NCHまたはSであり、
は、OまたはNHであり、
は、CH、CHOまたはCHNHであり、
は、CH、OまたはNHであり、
は、結合、CH、OまたはNHであり、
LGは、本発明のリンカー-薬物基の薬物部分(D)などの脱離基である)
が挙げられる。
そのような自壊性スペーサーの追加の非限定的な例は、Angew. Chem. Int. Ed. 2015, 54, 7492 - 7509に記載されている。
加えて、リンカー成分は、2つの反応性基間の反応により容易に形成される化学部分であり得る。そのような化学部分の非限定的な例を表8に示す。
Figure 2022532918000202
Figure 2022532918000203
Figure 2022532918000204
Figure 2022532918000205
Figure 2022532918000206
Figure 2022532918000207
ここで、表8中のR32は、H、C1~4アルキル、フェニル、ピリミジンまたはピリジンであり、表8中のR35は、H、C1~6アルキル、フェニル、または1~3個の-OH基で置換されたC1~4アルキルであり、表8中の各Rは、H、C1~6アルキル、フルオロ、-C(=O)OHで置換されたベンジルオキシ、-C(=O)OHで置換されたベンジル、-C(=O)OHで置換されたC1~4アルコキシ、および-C(=O)OHで置換されたC1~4アルキルから独立して選択され、表8中のR37は、H、フェニルおよびピリジンから独立して選択され、表8中のqは、0、1、2または3であり、表8中のRおよびR13は、Hまたはメチルであり、表8中のRおよびR14は、H、-CHまたはフェニルであり、表8中のRは、Hまたは任意の好適な置換基であり、表8中のR50は、Hである。
加えて、リンカー成分は、以下の表9に列挙した基であり得る。
Figure 2022532918000208
Figure 2022532918000209
Figure 2022532918000210
Figure 2022532918000211
本明細書で使用される場合、化合物の部分構造が例示される場合には、波線(
Figure 2022532918000212
)は、部分構造と分子の残部との結合点を示す。
「自壊性スペーサー」および「自壊性基」という用語は、本明細書で使用される場合、酸誘発性切断、ぺプチダーゼ誘発性切断、エステラーゼ誘発性切断、グリコシダーゼ誘発性切断、ホスホジエステラーゼ誘発性切断、ホスファターゼ誘発性切断、プロテアーゼ誘発性切断、リパーゼ誘発性切断またはジスルフィド結合切断により活性化される1つまたは複数のトリガー基(TG)を含む部分を指し、活性化後、保護基は除去され、これにより、脱離基の時間的連続放出につながる分解反応のカスケードが生じる。反応のそのようなカスケードは、限定するものではないが、1,4-、1,6-または1,8-脱離反応であり得る。
自壊性のスペーサーまたは基の非限定的な例としては、
Figure 2022532918000213
(ここで、このような基は、必要に応じて置換されてよく、
式中、
TGは、トリガー基であり、
は、O、NHまたはSであり、
は、O、NH、NCHまたはSであり、
は、OまたはNHであり、
は、CH、CHOまたはCHNHであり、
は、CH、OまたはNHであり、
は、結合、CH、OまたはNHであり、
LGは、本発明のリンカー-薬物基の薬物部分(D)などの脱離基である)
が挙げられる。
自壊性スペーサーの追加の非限定的な例は、Angew. Chem. Int. Ed. 2015, 54, 7492 - 7509に記載されている。
ある特定の実施形態では、自壊性スペーサーは、構造
Figure 2022532918000214
(式中、Lpは、酵素切断可能な二価ペプチドスペーサーであり、A、D、LおよびRは、本明細書で定義した通りである)
を有する部分である。
好ましい実施形態では、自壊性スペーサーは、構造
Figure 2022532918000215
(式中、Lpは、酵素切断可能な二価ペプチドスペーサーであり、D、LおよびRは、本明細書で定義した通りである)
を有する部分である。一部の実施形態では、Dは、MCl1阻害剤を含有する四級化された第三級アミンである。
他の好ましい実施形態では、自壊性スペーサーは、構造
Figure 2022532918000216
(式中、Lpは、酵素切断可能な二価ペプチドスペーサーであり、D、LおよびRは、本明細書で定義した通りである)
を有する部分である。
「親水性部分」という用語は、本明細書で使用される場合、薬物部分(D)が本発明のリンカー基に結合されている場合に薬物部分(D)の水溶性が増加する親水性特性を有する部分を指す。そのような親水性基の例としては、限定するものではないが、ポリエチレングリコール、ポリアルキレングリコール、糖類、オリゴ糖類、ポリペプチド、1~3個の
Figure 2022532918000217
基で置換されたC~Cアルキルが挙げられる。
薬物部分
一部の実施形態では、リンカー部分の前駆体である中間体を、適切な条件下で薬物部分(例えば、Mcl-1阻害剤)と反応させる。一部の実施形態では、反応性基を薬物および/または中間体もしくはリンカー上で使用する。薬物と中間体との間の反応の生成物、または誘導体化薬物(薬物プラスリンカー)を、その後、薬物および中間体または誘導体化薬物と抗体または抗原結合性断片とのコンジュゲーションを容易にする条件下で、抗体または抗原結合性断片と反応させる。代替的に、中間体またはリンカーを、最初に抗体もしくは抗原結合性断片、または誘導体化抗体もしくは抗原結合性断片と反応させ、次いで薬物または誘導体化薬物と反応させてよい。
いくつかの異なる反応が、薬物部分および/またはリンカー部分と抗体または抗原結合性断片との共有結合に利用可能である。これは多くの場合、リシンのアミン基、グルタミン酸およびアスパラギン酸の遊離カルボン酸基、システインのスルフヒドリル基、ならびに芳香族アミノ酸の様々な部分を含む、抗体または抗原結合性断片の1個または複数のアミノ酸残基の反応により達成される。例えば、非特異的共有結合は、薬物部分上のカルボキシ(またはアミノ)基と抗体または抗原結合性断片上のアミノ(またはカルボキシ)基とを連結するカルボジイミド反応を使用して行われ得る。加えて、ジアルデヒドまたはイミドエステルなどの二官能性剤も、薬物部分上のアミノ基と抗体または抗原結合性断片上のアミノ基とを連結するために使用してよい。薬物(例えば、Mcl-1阻害剤)と結合剤との結合には、シッフ塩基反応も利用可能である。この方法は、グリコールまたはヒドロキシ基を含有する薬物の過ヨウ素酸酸化と、これによりアルデヒドを形成し、次いでこれを結合剤と反応させることとを伴う。結合は、結合剤のアミノ基とのシッフ塩基の形成を介して生じる。イソチオシアネートも、薬物を結合剤に共有結合させるためのカップリング剤として使用することができる。他の技術は当業者に公知であり、本開示の範囲内である。当技術分野で公知の様々な化学を使用して、生成し、抗体または抗原結合性断片と連結することができる薬物部分の例としては、Mcl-1阻害剤、例えば、本明細書に記載および例示されるMcl-1阻害剤が挙げられる。
好適な薬物部分は、式(I)、(II)、(III)の化合物、もしくはその鏡像異性体、ジアステレオ異性体、アトロプ異性体、重水素化誘導体、および/または薬学的に許容される酸もしくは塩基との付加塩を含み得る。加えて、薬物部分は、本明細書に記載されるMcl-1阻害剤(D)の任意の化合物を含み得る。
本明細書で使用される場合、「アトロプ異性体」は、立体ひずみまたは他の寄与因子に起因するエネルギー差が、個々の配座異性体の単離を可能にするほど十分に高い、回転に対する障壁を生み出す場合における、単結合の周りの束縛回転を理由に生じる立体異性体である(Bringmann et al. Angew. Chem. Int. Ed. 2005, 44, 5384-5427)。例えば、本発明による式(II)の化合物について、アトロプ異性体は、以下の通りであり得る:
Figure 2022532918000218
例えば、好ましいアトロプ異性体は、(5aS)とも称される(5S)であり得る。
本開示の薬物部分は、国際特許出願公開第WO2015/097123号;第WO2016/207216号;第WO2016/207217号;第WO2016/207225号;第WO2016/207226号;第WO2017/125224号;第WO2019/035899号;第WO2019/035911号;第WO2019/035914号;第WO2019/035927号;第WO2016/033486号;第WO2017/147410号;第WO2018/183418号;および第WO2017/182625号、ならびに米国特許出願公開第2019/0055264号(これらのそれぞれはその全体が参照により本明細書に組み込まれる)に開示されている化合物のうちのいずれか1つであってよい。
一部の実施形態では、本開示の薬物部分は、式(I):
Figure 2022532918000219
(式中、
環Dは、シクロアルキル基、ヘテロシクロアルキル基、アリール基またはヘテロアリール基であり、
環Eは、フリル、チエニルまたはピロリル環であり、
01、X03、X04およびX05は互いに独立して、炭素原子または窒素原子であり、
02は、C-R026基または窒素原子であり、
Figure 2022532918000220
は、環が芳香族であることを意味し、
は、窒素原子またはC-R03基であり、
は、窒素原子またはC-R04基であり、
01は、ハロゲン原子、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基、線状もしくは分枝状(C~C)アルケニル基、線状もしくは分枝状(C~C)アルキニル基、線状もしくは分枝状(C~C)ハロアルキル基、ヒドロキシ基、ヒドロキシ(C~C)アルキル基、線状もしくは分枝状(C~C)アルコキシ基、-S-(C~C)アルキル基、シアノ基、ニトロ基、-Cy08、-(C~C)アルキル-NR011011’、-O-(C~C)アルキル-NR011011’、-O-(C~C)アルキル-R012、-C(O)-OR011、-O-C(O)-R011、-C(O)-NR011011’、-NR011-C(O)-R011’、-NR011-C(O)-OR011’、-(C~C)アルキル-NR011-C(O)-R011’、-SO-NR011011’または-SO-(C~C)アルキルであり、
02、R03、R04およびR05は互いに独立して、水素原子、ハロゲン原子、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基、線状もしくは分枝状(C~C)アルケニル基、線状もしくは分枝状(C~C)アルキニル基、線状もしくは分枝状(C~C)ハロアルキル、ヒドロキシ基、ヒドロキシ(C~C)アルキル基、線状もしくは分枝状(C~C)アルコキシ基、-S-(C~C)アルキル基、シアノ基、ニトロ基、-(C~C)アルキル-NR011011’、-O-Cy01、-(C~C)アルキル-Cy01、-(C~C)アルケニル-Cy01
-(C~C)アルキニル-Cy01、-O-(C~C)アルキル-NR011011’、-O-(C~C)アルキル-R031
-O-(C~C)アルキル-R012、-C(O)-OR011、-O-C(O)-R011、-C(O)-NR011011’、-NR011-C(O)-R011’、
-NR011-C(O)-OR011’、-(C~C)アルキル-NR011-C(O)-R011’、-SO-NR011011’、または
-SO-(C~C)アルキルであり、
あるいは対(R01、R02)、(R02、R03)、(R03、R04)または(R04、R05)は、それらが結合している炭素原子と一緒に、5~7個の環員を含む芳香族または非芳香族環を形成し、これは必要に応じて、O、SおよびNから選択される1~3個のヘテロ原子を含み、ここで、得られた環は、ハロゲン、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル、(C~C)アルキル-NR011011’、-NR013013’、-(C~C)アルキル-Cy01またはオキソから選択される1個もしくは2個の基で必要に応じて置換されており、
06およびR07は互いに独立して、水素原子、ハロゲン原子、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基、線状もしくは分枝状(C~C)アルケニル基、線状もしくは分枝状(C~C)アルキニル基、線状もしくは分枝状(C~C)ハロアルキル、ヒドロキシ基、線状もしくは分枝状(C~C)アルコキシ基、-S-(C~C)アルキル基、シアノ基、ニトロ基、-(C~C)アルキル-NR011011’、-O-(C~C)アルキル-NR011011’、-O-Cy01
-(C~C)アルキル-Cy01、-(C~C)アルケニル-Cy01、-(C~C)アルキニル-Cy01、-O-(C~C)アルキル-R012
-C(O)-OR011、-O-C(O)-R011、-C(O)-NR011011’、-NR011-C(O)-R011’、-NR011-C(O)-OR011’、
-(C~C)アルキル-NR011-C(O)-R011’、-SO-NR011011’、または-SO-(C~C)アルキルであり、
あるいは対(R06、R07)は、2個の隣接する炭素原子と縮合されたとき、それらが結合している炭素原子と一緒に、5~7個の環員を含む芳香族または非芳香族環を形成し、これは必要に応じて、O、SおよびNから選択される1~3個のヘテロ原子を含み、ここで、得られた環は、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基、-NR013013’、-(C~C)アルキル-Cy01またはオキソで必要に応じて置換されており、
は、-CH-基、-NH-基または酸素原子であり、
08は、水素原子、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基、-CHR0a0b基、アリール基、ヘテロアリール基、アリール(C~C)アルキル基またはヘテロアリール(C~C)アルキル基であり、
09は、水素原子、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基、線状もしくは分枝状(C~C)アルケニル基、線状もしくは分枝状(C~C)アルキニル基、-Cy02、-(C~C)アルキル-Cy02、-(C~C)アルケニル-Cy02、-(C~C)アルキニル-Cy02、-Cy02-Cy03、-(C~C)アルキニル-O-Cy02、-Cy02-(C~C)アルキル-O-(C~C)アルキル-Cy03、ハロゲン原子、シアノ基、-C(O)-R014または-C(O)-NR014014’であり、
010は、水素原子、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基、線状もしくは分枝状(C~C)アルケニル基、線状もしくは分枝状(C~C)アルキニル基、アリール(C~C)アルキル基、(C~C)シクロアルキルアルキル基、線状もしくは分枝状(C~C)ハロアルキルまたは-(C~C)アルキル-O-Cy04であり、
あるいは対(R09、R010)は、2個の隣接する炭素原子と縮合されたとき、それらが結合している炭素原子と一緒に、5~7個の環員を含む芳香族または非芳香族環を形成し、これは必要に応じて、O、SおよびNから選択される1~3個のヘテロ原子を含み、
011およびR011’は互いに独立して、水素原子、必要に応じて置換された線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基、または-(C~C)アルキル-Cy01であり、
あるいは対(R011、R011’)は、それらが結合している窒素原子と一緒に、5~7個の環員を含む芳香族または非芳香族環を形成し、これは必要に応じて、窒素原子に加えて、O、SおよびNから選択される1~3個のヘテロ原子を含み、ここで、N原子は、線状または分枝状(C~C)アルキル基から選択される1個または2個の基で置換されてよく、ここで、線状または分枝状(C~C)アルキル基の炭素原子のうちの1個または複数は、必要に応じて重水素化されており、
012は、-Cy05、-Cy05-(C~C)アルキル-O-(C~C)アルキル-Cy06、-Cy05-(C~C)アルキル-Cy06
-Cy05-(C~C)アルキル-NR011-(C~C)アルキル-Cy06、-Cy05-Cy06-O-(C~C)アルキル-Cy07
-Cy05-(C~C)アルキル-O-(C~C)アルキル-Cy09、-Cy05-(C~C)アルキル-Cy09、-NH-C(O)-NH-R011
-Cy05-(C~C)アルキル-NR011-(C~C)アルキル-Cy09、-C(O)-NR011011’、-NR011011’、-OR011
-NR011-C(O)-R011’、-O-(C~C)アルキル-OR011、-SO-R011、-C(O)-OR011であり、
013、R013’、R014およびR014’は互いに独立して、水素原子、または必要に応じて置換された線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基であり、
0aは、水素原子または線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基であり、
0bは、-O-C(O)-O-R0c基、-O-C(O)-NR0c0c’基または-O-P(O)(OR0c基であり、
0cおよびR0c’は互いに独立して、水素原子、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基、シクロアルキル基、(C~C)アルコキシ(C~C)アルキル基または(C~C)アルコキシカルボニル(C~C)アルキル基であり、
あるいは対(R0c、R0c’)は、それらが結合している窒素原子と一緒に、5~7個の環員から構成される非芳香族環を形成し、これは、窒素原子に加えて、酸素および窒素から選択される1~3個のヘテロ原子を含んでよく、ここで、窒素は、線状または分枝状(C~C)アルキル基で必要に応じて置換されており、
Cy01、Cy02、Cy03、Cy04、Cy05、Cy06、Cy07、Cy08およびCy010は互いに独立して、必要に応じて置換されたシクロアルキル基、必要に応じて置換されたヘテロシクロアルキル基、必要に応じて置換されたアリール基または必要に応じて置換されたヘテロアリール基であり、
Cy09
Figure 2022532918000221
であり、
またはCy09は、-O-P(O)(OR020;-O-P(O)(O;-(CHp0-O-(CHR018-CHR019-O)q0-R020;ヒドロキシ;ヒドロキシ(C~C)アルキル;-(CHr0-U-(CHs0-ヘテロシクロアルキル;および-U-(CHq0-NR021021’から選択される基で置換されているヘテロアリール基であり、
015は、水素原子;-(CHp0-O-(CHR018-CHR019-O)q0-R020基;線状もしくは分枝状(C~C)アルコキシ(C~C)アルキル基;-U-(CHq0-NR021021’基;または-(CHr0-U-(CHs0-ヘテロシクロアルキル基であり、
016は、水素原子;ヒドロキシ基;ヒドロキシ(C~C)アルキル基;-(CHr0-U-(CHs0-ヘテロシクロアルキル基;(CHr0-U-V-O-P(O)(OR020基;-O-P(O)(O基;-O-S(O)OR020基;-S(O)OR020基;-(CHp0-O-(CHR018-CHR019-O)q0-R020基;-(CHp0-O-C(O)-NR022023基;または-U-(CHq0-NR021021’基であり、
017は、水素原子;-(CHp0-O-(CHR018-CHR019-O)q0-R020基;-CH-P(O)(OR020基、-O-P(O)(OR020基;-O-P(O)(O基;ヒドロキシ基;ヒドロキシ(C~C)アルキル基;-(CHr0-U-(CHs0-ヘテロシクロアルキル基;-U-(CHq0-NR021021’基;またはアルドン酸であり、
は、薬学的に許容される一価カチオンであり、
は、結合または酸素原子であり、
は、-(CHs0-基または-C(O)-基であり、
018は、水素原子または(C~C)アルコキシ(C~C)アルキル基であり、
019は、水素原子またはヒドロキシ(C~C)アルキル基であり、
020は、水素原子または線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基であり、
021およびR021’は互いに独立して、水素原子、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基、またはヒドロキシ(C~C)アルキル基であり、
あるいは対(R021、R021’)は、それらが結合している窒素原子と一緒に、5~7個の環員を含む芳香族または非芳香族環を形成し、これは必要に応じて、窒素原子に加えて、O、SおよびNから選択される1~3個のヘテロ原子を含み、ここで、得られた環は、水素原子または線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基で必要に応じて置換されており、
022は、(C~C)アルコキシ(C~C)アルキル基、-(CHp0-NR024024’基または-(CHp0-O-(CHR018-CHR019-O)q0-R020基であり、
023は、水素原子または(C~C)アルコキシ(C~C)アルキル基であり、
あるいは対(R022、R023)は、それらが結合している窒素原子と一緒に、5~18個の環員を含む芳香族または非芳香族環を形成し、これは必要に応じて、窒素原子に加えて、O、SおよびNから選択される1~5個のヘテロ原子を含み、ここで、得られた環は、水素原子、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基またはヘテロシクロアルキル基で必要に応じて置換されており、
024およびR024’は互いに独立して、水素原子または線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基であり、
あるいは対(R024、R024’)は、それらが結合している窒素原子と一緒に、5~7個の環員から構成される芳香族または非芳香族環を形成し、これは、窒素原子に加えて、O、SおよびNから選択される1~3個のヘテロ原子を含んでよく、ここで、得られた環は、水素原子または線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基で必要に応じて置換されており、
025は、水素原子、ヒドロキシ基またはヒドロキシ(C~C)アルキル基であり、
026は、水素原子、ハロゲン原子、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基、またはシアノ基であり、
027は、水素原子または線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基であり、
028は、-O-P(O)(O)(O)基、-O-P(O)(O)(OR030)基、-O-P(O)(OR030)(OR030’)基、-(CHp0-O-SO-基、-(CHp0-SO-O基、-(CHp0-O-SO-OR030基、-Cy010、-(CHp0-SO-OR030基、-O-C(O)-R029基、-O-C(O)-OR029基または-O-C(O)-NR029029’基であり、
029およびR029’は互いに独立して、水素原子、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基または線状もしくは分枝状アミノ(C~C)アルキル基であり、
030およびR030’は互いに独立して、水素原子、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基またはアリール(C~C)アルキル基であり、
031
Figure 2022532918000222
であり、ここで、アンモニウムイオンは必要に応じて、双性イオン型として存在するか、または一価のアニオン性対イオンを有し、
は、0または1に等しい整数であり、
は、0、1、2または3に等しい整数であり、
は、1、2、3または4に等しい整数であり、
およびsは、独立して0または1に等しい整数であり、
ここで、最大で、R03基、R09基またはR012基のうちの1つは、存在する場合、リンカーに共有結合されており、
ここで、原子の価数を、それに結合された1個または複数の置換基が超えない)
の化合物もしくは鏡像異性体、ジアステレオ異性体、アトロプ異性体、重水素化誘導体、および/または前述のいずれかの薬学的に許容される塩を含み得る。
一部の実施形態では、本開示の薬物部分は、式(II):
Figure 2022532918000223
(式中、
は、窒素原子またはC-R04基であり、
01は、ハロゲン原子、線状または分枝状(C~C)アルキル基、線状または分枝状(C~C)アルケニル基、線状または分枝状(C~C)アルキニル基、線状または分枝状(C~C)ハロアルキル基、ヒドロキシ基、線状または分枝状(C~C)アルコキシ基、-S-(C~C)アルキル基、シアノ基、-Cy08、-NR011011’であり、
02、R03およびR04は互いに独立して、水素原子、ハロゲン原子、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基、線状もしくは分枝状(C~C)アルケニル基、線状もしくは分枝状(C~C)アルキニル基、線状もしくは分枝状(C~C)ハロアルキル、ヒドロキシ基、線状もしくは分枝状(C~C)アルコキシ基、-S-(C~C)アルキル基、シアノ基、ニトロ基、-(C~C)アルキル-NR011011’、-O-Cy01、-(C~C)アルキル-Cy01
-(C~C)アルケニル-Cy01、-(C~C)アルキニル-Cy01、-O-(C~C)アルキル-NR011011’、
-O-(C~C)アルキル-R031、-C(O)-OR011、-O-C(O)-R011、-C(O)-NR011011’、-NR011-C(O)-R011’、
-NR011-C(O)-OR011’、-(C~C)アルキル-NR011-C(O)-R011’、-SO-NR011011’、または
-SO-(C~C)アルキルであり、
あるいは対(R02、R03)または(R03、R04)は、それらが結合している炭素原子と一緒に、5~7個の環員を含む芳香族または非芳香族環を形成し、これは必要に応じて、O、SおよびNから選択される1~3個のヘテロ原子を含み、ここで、環は、線状または分枝状(C~C)アルキル、-NR013013’、-(C~C)アルキル-Cy01およびオキソから選択される基で必要に応じて置換されており、
06およびR07は互いに独立して、水素原子、ハロゲン原子、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基、線状もしくは分枝状(C~C)アルケニル基、線状もしくは分枝状(C~C)アルキニル基、線状もしくは分枝状(C~C)ハロアルキル、ヒドロキシ基、線状もしくは分枝状(C~C)アルコキシ基、-S-(C~C)アルキル基、シアノ基、ニトロ基、-(C~C)アルキル-NR011011’、-O-Cy01、-(C~C)アルキル-Cy01、-(C~C)アルケニル-Cy01
-(C~C)アルキニル-Cy01、-O-(C~C)アルキル-R012、-C(O)-OR011、-O-C(O)-R011、-C(O)-NR011011’、
-NR011-C(O)-R011’、-NR011-C(O)-OR011’、-(C~C)アルキル-NR011-C(O)-R011’、-SO-NR011011’、または-SO-(C~C)アルキルであり、
あるいは対(R06、R07)は、2個の隣接する炭素原子と縮合されたとき、それらが結合している炭素原子と一緒に、5~7個の環員を含む芳香族または非芳香族環を形成し、これは必要に応じて、O、SおよびNから選択される1~3個のヘテロ原子を含み、ここで、得られた環は、線状または分枝状(C~C)アルキル基、-NR013013’、-(C~C)アルキル-Cy01およびオキソから選択される基で必要に応じて置換されており、
08は、水素原子、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基、アリール基、ヘテロアリール基、アリール-(C~C)アルキル基またはヘテロアリール(C~C)アルキル基であり、
09は、線状または分枝状(C~C)アルキル基、線状または分枝状(C~C)アルケニル基、線状または分枝状(C~C)アルキニル基、-Cy02、-(C~C)アルキル-Cy02、-(C~C)アルケニル-Cy02、-(C~C)アルキニル-Cy02、-Cy02-Cy03、-(C~C)アルキニル-O-Cy02、-Cy02-(C~C)アルキル-O-(C~C)アルキル-Cy03、ハロゲン原子、シアノ基、-C(O)-R014、-C(O)-NR014014’であり、
011およびR011’は互いに独立して、水素原子、必要に応じて置換された線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基、または-(C~C)アルキル-Cy01であり、
あるいは対(R011、R011’)は、それらが結合している窒素原子と一緒に、5~7個の環員を含む芳香族または非芳香族環を形成し、これは必要に応じて、窒素原子に加えて、O、SおよびNから選択される1~3個のヘテロ原子を含み、ここで、N原子は、線状または分枝状(C~C)アルキル基で必要に応じて置換されており、ここで、線状または分枝状(C~C)アルキル基の炭素原子のうちの1個または複数は、必要に応じて重水素化されており、
012は、-Cy05、-Cy05-(C~C)アルキル-Cy06、-Cy05-(C~C)アルキル-O-(C~C)アルキル-Cy06
-Cy05-(C~C)アルキル-NR011-(C~C)アルキル-Cy06、-Cy05-Cy06-O-(C~C)アルキル-Cy07
-Cy05-(C~C)アルキル-Cy09、-NH-C(O)-NH-R011、-C(O)-NR011011’、-NR011011’、-OR011
-NR011-C(O)-R011’、-O-(C~C)アルキル-OR011、-SO-R011、または-C(O)-OR011であり、
013、R013’、R014およびR014’は互いに独立して、水素原子、または必要に応じて置換された線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基であり、
Cy01、Cy02、Cy03、Cy05、Cy06、Cy07およびCy08は互いに独立して、必要に応じて置換されたシクロアルキル基、必要に応じて置換されたヘテロシクロアルキル基、必要に応じて置換されたアリール基または必要に応じて置換されたヘテロアリール基であり、
Cy09
Figure 2022532918000224
であり、
ここで、R015、R016およびR017は、式(I)のために定義した通りであり、
031
Figure 2022532918000225
であり、ここで、R027およびR028は、式(I)のために定義した通りであり、
ここで、最大で、R03基、R09基またはR012基のうちの1つは、存在する場合、リンカーに共有結合されている)
の化合物もしくは鏡像異性体、ジアステレオ異性体、アトロプ異性体、重水素化誘導体、および/または前述のいずれかの薬学的に許容される塩を含み得る。
一部の実施形態では、本開示の薬物部分は、式(III):
Figure 2022532918000226
(式中、
01は、線状または分枝状(C~C)アルキル基であり、
03は、-O-(C~C)アルキル-NR011011’または
Figure 2022532918000227
であり、
ここで、R011およびR011’は互いに独立して、水素原子、必要に応じて置換された線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基、または-(C~C)アルキル-Cy01であり、
あるいは対(R011、R011’)は、それらが結合している窒素原子と一緒に、5~7個の環員を含む芳香族または非芳香族環を形成し、これは必要に応じて、窒素原子に加えて、O、SおよびNから選択される1~3個のヘテロ原子を含み、ここで、N原子は、水素原子または線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基から選択される1個または2個の基で置換されてよく、
ここで、R027は水素原子であり、R028は、-(CHp0-O-SO-O基または-(CHp0-SO-OR030基であり、
09は、線状もしくは分枝状(C~C)アルキニル基または-Cy02であり、
012は、-Cy05、-Cy05-(C~C)アルキル-Cy06または-Cy05-(C~C)アルキル-Cy09であり、
Cy01、Cy02、Cy05およびCy06は互いに独立して、シクロアルキル基、ヘテロシクロアルキル基、アリール基またはヘテロアリール基であり、それらのそれぞれは、必要に応じて置換されており、
Cy09は、
Figure 2022532918000228
であり、
p0、R015、R016およびR017は、式(I)のために定義した通りであり、
ここで、最大で、R03基、R09基またはR012基のうちの1つは、存在する場合、リンカーに共有結合されている)
の化合物もしくは鏡像異性体、ジアステレオ異性体、アトロプ異性体、重水素化誘導体、および/または前述のいずれかの薬学的に許容される塩を含み得る。
一部の実施形態では、Cy01、Cy02、Cy03、Cy04、Cy05、Cy06、Cy07、Cy08およびCy010は互いに独立して、必要に応じて置換されたシクロアルキル基、必要に応じて置換されたヘテロシクロアルキル基、必要に応じて置換されたアリール基または必要に応じて置換されたヘテロアリール基であり、ここで、必要に応じた置換基は、必要に応じて置換された線状もしくは分枝状(C~C)アルキル、必要に応じて置換された線状もしくは分枝状(C~C)アルケニル基、必要に応じて置換された線状もしくは分枝状(C~C)アルキニル基、必要に応じて置換された線状もしくは分枝状(C~C)アルコキシ、必要に応じて置換された(C~C)アルキル-S-、ヒドロキシ、オキソ(もしくは適切な場合、N-オキシド)、ニトロ、シアノ、-C(O)-OR’、-O-C(O)-R’、-C(O)-NR’R’’、-NR’R’’、-(C=NR’)-OR’’、線状もしくは分枝状(C~C)ハロアルキル、トリフルオロメトキシ、またはハロゲンから選択され、ここで、R’およびR’’は、それぞれ独立して、水素原子または必要に応じて置換された線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基であり、ここで、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基の炭素原子のうちの1個もしくは複数は、必要に応じて重水素化されている。
一部の実施形態では、薬物部分(D)は、
Figure 2022532918000229
Figure 2022532918000230
もしくは鏡像異性体、ジアステレオ異性体、アトロプ異性体、重水素化誘導体、および/または前述のいずれかの薬学的に許容される塩を含む。
加えて、本開示の薬物部分は、以下:
Figure 2022532918000231
Figure 2022532918000232
のうちのいずれか1つを含み得る。
一部の実施形態では、リンカー-薬物(または「リンカー-ペイロード」)部分 -(L-D)は、表Aにおける化合物もしくは鏡像異性体、ジアステレオ異性体、アトロプ異性体、重水素化誘導体、および/または前述のいずれかの薬学的に許容される塩を含み得る。
薬物ロード
薬物ロードはpで表され、本明細書において薬物対抗体比率(DAR)とも称される。薬物ロードは、薬物部分抗体または抗原結合性断片あたり1から16の範囲であってもよい。一部の実施形態では、pは1から16の整数である。一部の実施形態では、pは、1から16、1から15、1から14、1から13、1から12、1から11、1から10、1から9、1から8、1から7、1から6、1から5、1から4、1から3、または1から2の整数である。一部の実施形態では、pは、2から10、2から9、2から8、2から7、2から6、2から5、2から4、または2から3の整数である。一部の実施形態では、pは1から16の整数である。一部の実施形態では、pは1から8の整数である。一部の実施形態では、pは1から5の整数である。一部の実施形態では、pは2から4の整数である。一部の実施形態では、pは、1、2、3、4、5、6、7、または8である。一部の実施形態では、pは2である。一部の実施形態では、pは4である。
薬物ロードは、抗体または抗原結合性断片における結合部位の数によって制限される場合がある。一部の実施形態では、ADCのリンカー部分(L)は、抗体または抗原結合性断片における1つまたは複数のアミノ酸残基の化学的活性基を介して抗体または抗原結合性断片に結合する。例えば、リンカーは、遊離アミノ、イミノ、ヒドロキシル、チオール、またはカルボキシル基を介して抗体または抗原結合性断片に(例えば、N-またはC-末端に、1つまたは複数のリシン残基のイプシロンアミノ基に、1つまたは複数のグルタミン酸またはアスパラギン酸残基の遊離カルボン酸基に、または1つまたは複数のシステイン残基のスルフヒドリル基に)結合してもよい。リンカーが結合する部位は、抗体または抗原結合性断片のアミノ酸配列における天然の残基であっても、例えば、DNA組換え技術によって(例えば、システイン残基をアミノ酸配列に導入することによって)またはタンパク質生化学によって(例えば、還元、pH調整、または加水分解することによって)、抗体または抗原結合性断片に導入してもよい。
一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片にコンジュゲートすることができる薬物部分の数は、遊離システイン残基の数によって限定される。例えば、結合がシステインチオール基である場合、抗体は、たった1つまたはいくつかのシステインチオール基を有していても、リンカーが結合し得るたった1つまたはいくつかの十分な反応性のチオール基を有していてもよい。一般的に、抗体は、薬物部分に連結し得る多くの遊離および反応性システインチオール基を含有しない。実際に、抗体における大部分のシステインチオール残基は、鎖間または鎖内ジスルフィド結合のいずれかに関与する。その結果、一部の実施形態では、システインへのコンジュゲーションは、抗体の少なくとも部分的な還元を必要とする場合がある。リンカー-毒素が抗体に過剰に結合すると、ジスルフィド結合を形成するのに利用可能なシステイン残基が減少することによって抗体の安定性が損なわれる場合がある。その結果、最適な薬物:抗体比率は、ADCの効力を増加させ(1抗体あたりの結合された薬物部分の数を増加させることによって)、抗体または抗原結合性断片の安定性を損なわないはずである。一部の実施形態では、最適な比率は、2、4、6、または8であってもよい。一部の実施形態では、最適な比率は、2または4であってもよい。
一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片は、1つまたは複数の遊離システイン残基を生成するために、コンジュゲーションの前に還元条件に曝露されている。抗体は、一部の実施形態では、還元剤、例えば、ジチオスレイトール(DTT)またはトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン(TCEP)を用いて部分的または全体的な還元条件下で還元して、反応性システインチオール基を生成してもよい。不対のシステインは、限定されたモル当量のTCEPを用いて部分的な還元を介して生成してもよく、これは、軽鎖および重鎖(H-L対あたり1対)ならびにヒンジ領域における2つの重鎖(ヒトIgG1の場合H-H対あたり2対)を連結させる鎖間ジスルフィド結合を還元し、同時に鎖内ジスルフィド結合は完全なままにすることができる(Stefano et al. (2013) Methods Mol Biol. 1045:145-71)。実施形態では、抗体内のジスルフィド結合は、例えば還元および酸化電圧を交互に印加する作用電極を用いることによって電気化学的に還元される。このアプローチは、ジスルフィド結合還元の、分析デバイス(例えば、電気化学的検出デバイス、NMR分光計、または質量分析計)または化学的分離デバイス(例えば、液体クロマトグラフィー(例えば、HPLC)または電気泳動デバイス(例えば、米国特許出願公開第2014/0069822号明細書を参照のこと))へのオンラインカップリングを可能にすることができる。一部の実施形態では、抗体は変性条件を受けて、アミノ酸残基、例えばシステインの反応性求核基を示す。
ADCの薬物ロードは、異なる方法で、例えば:(i)抗体に対するモル過剰の薬物-リンカー中間体またはリンカー試薬を限定すること;(ii)コンジュゲーション反応時間または温度を限定すること;(iii)システインチオール改変に関する還元条件を部分的にするかまたは限定すること;および/または(iv)システイン残基の数および位置を改変して、リンカー-薬物結合の数および/または位置が制御されるように、抗体のアミノ酸配列を組換え技術によって遺伝子操作することによって制御してもよい。
一部の実施形態では、遊離システイン残基は、抗体または抗原結合性断片のアミノ酸配列に導入される。例えば、親抗体の1つまたは複数のアミノ酸がシステインアミノ酸で置き換えられたシステイン操作抗体を調製してもよい。いずれの形態の抗体も、そのように操作しても、すなわち突然変異させてもよい。例えば、親Fab抗体断片を操作して、「ThioFab」と称されるシステイン操作Fabを形成してもよい。同様に、親モノクローナル抗体を操作して、「ThioMab」を形成してもよい。単一の部位を突然変異させると、ThioFabにおいて単一の操作されたシステイン残基が得られ、一方単一の部位を突然変異させると、IgG抗体の二量体特性に起因するThioMabにおいて2つの操作されたシステイン残基が得られる。親ポリペプチドのアミノ酸配列バリアントをコードするDNAは、当技術分野において既知のさまざまな方法によって調製することができる(例えば、国際公開第2006/034488号パンフレットに記載の方法を参照のこと)。それらの方法としては、これらに限定されるものではないが、ポリペプチドをコードする初期に調製されたDNAに部位特異的(またはオリゴヌクレオチド介在性)突然変異誘発、PCR突然変異誘発、およびカセット突然変異誘発を行うことによる調製がある。組換え抗体のバリアントも、合成オリゴヌクレオチドを用いた制限断片操作によってまたはオーバーラップ伸長PCRによって構築してもよい。式(1)のADCとしては、これらに限定されるものではないが、1、2、3、または4個の操作されたシステインアミノ酸を有する抗体がある、(Lyon et al. (2012) Methods Enzymol. 502:123-38)。一部の実施形態では、1つまたは複数の遊離システイン残基が、操作を使用していない抗体または抗原結合性断片においてすでに存在し、その場合、現存する遊離システイン残基を使用して、抗体または抗原結合性断片を薬物部分にコンジュゲートしてもよい。
抗体または抗原結合性断片の複数のコピーとリンカー部分とを含む反応混合物において、1つを超える求核基が、薬物-リンカー中間体とまたはリンカー部分試薬、続いて薬物部分試薬と反応する場合、その後得られた製品は、混合物において抗体または抗原結合性断片の各コピーに結合された1つまたは複数の薬物部分の分布を伴うADC化合物の混合物であり得る。一部の実施形態では、コンジュゲーション反応から得られるADCの混合物中の薬物ロードは、抗体または抗原結合性断片あたり1から16の結合薬物部分の範囲である。抗体または抗原結合性断片あたりの平均薬物部分の数(すなわち、平均薬物ロード、または平均p)は、当技術分野において既知の任意の従来の方法によって、例えば、質量分析法(例えば、液体クロマトグラフィー-質量分析法(LC-MS))および/または高性能液体クロマトグラフィー(例えば、HIC-HPLC)によって計算してもよい。一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片あたりの平均薬物部分の数は、液体クロマトグラフィー-質量分析法(LC-MS)によって判定される。一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片あたりの平均薬物部分の数は、約1.5から約3.5、約2.5から約4.5、約3.5から約5.5、約4.5から約6.5、約5.5から約7.5、約6.5から約8.5、または約7.5から約9.5である。一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片あたりの平均薬物部分の数は、約2から約4、約3から約5、約4から約6、約5から約7、約6から約8、約7から約9、約2から約8、または約4から約8である。
一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片あたりの平均薬物部分の数は約2である。一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片あたりの平均薬物部分の数は、約1.5、約1.6、約1.7、約1.8、約1.9、約2、約2.1、約2.2、約2.3、約2.4、または約2.5である。一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片あたりの平均薬物部分の数は2である。
一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片あたりの平均薬物部分の数は約4である。一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片あたりの平均薬物部分の数は、約3.5、約3.6、約3.7、約3.8、約3.9、約4、約4.1、約4.2、約4.3、約4.4、または約4.5である。一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片あたりの平均薬物部分の数は4である。
一部の実施形態では、「約」という用語は、抗体または抗原結合性断片あたりの平均薬物部分の数に関して使用される場合、プラスまたはマイナス20%、15%、10%、5%、または1%を意味する。一実施形態では、「約」という用語は、特定の値よりも10%多いかまたは少ない値の範囲を指す。別の実施形態では、「約」という用語は、特定の値よりも5%多いかまたは少ない値の範囲を指す。別の実施形態では、「約」という用語は、特定の値よりも1%多いかまたは少ない値の範囲を指す。
個々のADC化合物または「種」は、質量分光法によって混合物中で同定し、例えば、UPLCまたはHPLC、例えば疎水性相互作用クロマトグラフィー(HIC-HPLC)によって分離してもよい。一部の実施形態では、単一のロード値を有する均質なまたはほぼ均質なADC製品は、例えば、電気泳動またはクロマトグラフィーによってコンジュゲーション混合物から単離してもよい。
一部の実施形態では、高薬物ロード(例えば、p>16)は、ある特定の抗体-薬物コンジュゲートの凝集、不溶性、毒性、または細胞透過性の損失をもたらす場合がある。高薬物ロードは、ある特定のADCの薬物動態(例えば、クリアランス)にも負の影響を与える場合がある。一部の実施形態では、低薬物ロード(例えば、p<2)は、標的発現細胞に対するある特定のADCの効力を低下させる場合がある。一部の実施形態では、本開示のADCに関する薬物ロードは、約2から約16、約2から約10、約2から約8;約2から約6;約2から約5;約3から約5;約2から約4;または約4から約8の範囲である。
一部の実施形態では、約2の薬物ロードおよび/または平均薬物ロードは、例えば、抗体または抗原結合性断片の鎖内ジスルフィドの部分的な還元を使用して達成され、有益な特性を提供する。一部の実施形態では、約4または約6または約8の薬物ロードおよび/または平均薬物ロードは、例えば、抗体または抗原結合性断片の鎖内ジスルフィドの部分的な還元を使用して達成され、有益な特性を提供する。一部の実施形態では、約2未満の薬物ロードおよび/または平均薬物ロードは、許容されない高レベルの非コンジュゲート抗体種をもたらし、これは標的抗原への結合に関してADCと競合する場合があり、および/または処置の有効性を低下させる場合がある。一部の実施形態では、約16を超える薬物ロードおよび/または平均薬物ロードは、許容されない高レベルの製品不均質性および/またはADC凝集をもたらす場合がある。約16を超える薬物ロードおよび/または平均薬物ロードは、ADCの安定性に影響を与える場合もあり、これは、抗体または抗原結合性断片を安定化させるために必要とされる1つまたは複数の化学的結合の損失に起因する。
本開示は、記載されるADCを産生する方法を含む。簡潔には、ADCは、抗体または抗原結合性断片のままの抗体または抗原結合性断片と、薬物部分(例えば、Mcl-1阻害剤)と、薬物部分および抗体または抗原結合性断片を連結するリンカーとを含む。一部の実施形態では、ADCは、薬物部分と抗体または抗原結合性断片とに共有結合するための反応性官能基を有するリンカーを使用して調製してもよい。一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片は、リンカーまたは薬物-リンカー中間体と反応性である官能基を調製するために官能化される。例えば、一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片のシステインチオールは、リンカーまたは薬物-リンカー中間体の反応性官能基との結合を形成してADCを作製することができる。一部の実施形態では、抗体または抗原結合性断片は、細菌トランスグルタミナーゼ(BTG)を用いて調製され、これはシクロオクチンBCN(N-[(1R,8S,9s)-ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イルメチルオキシカルボニル]-1,8-ジアミノ-3,6-ジオキサオクタン)部分を含有するアミンを用いて特に官能化された反応性グルタミンである。一部の実施形態では、リンカーまたは薬物-リンカー中間体の、抗体または抗原結合性断片のBCN部分への部位特異的コンジュゲーションは、例えば、本明細書において記載され、例示されるように行われる。ADCの生成は、当業者に既知の技術によって達成することができる。
一部の実施形態では、ADCは、抗体または抗原結合性断片とリンカーおよび薬物部分(例えば、Mcl-1阻害剤)とを連続的な様式で接触させ、その結果、最初に抗体または抗原結合性断片がリンカーに共有結合で連結され、次いで予め形成された抗体-リンカー中間体と薬物部分とが反応することによって産生される。抗体-リンカー中間体は、精製ステップを受けてから薬物部分を接触させてもさせなくてもよい。他の実施形態では、ADCは、抗体または抗原結合性断片と、リンカーと薬物部分とを反応させることによって予め形成されたリンカー-薬物化合物とを接触させることによって産生される。予め形成されたリンカー-薬物化合物は、精製ステップを受けてから抗体または抗原結合性断片と接触させてもさせなくてもよい。他の実施形態では、抗体または抗原結合性断片は、1つの反応混合物中でリンカーおよび薬物部分と接触させ、抗体または抗原結合性断片とリンカーとの間、およびリンカーと薬物部分との間の共有結合の同時形成を可能にする。ADCを産生するこの方法は、抗体または抗原結合性断片を抗体または抗原結合性断片と接触させてから、リンカーを反応混合物に添加する反応を含んでいてもよく、逆もまた同様である。一部の実施形態では、ADCは、抗体または抗原結合性断片と薬物部分、例えばMcl-1阻害剤に連結したリンカーとを、コンジュゲーションを可能にする条件下で反応させることによって産生される。
上述の方法に従って調製されたADCは、精製ステップを受けてもよい。精製ステップは、タンパク質を精製するための当技術分野において既知の任意の生化学的方法、またはこれらの方法の任意の組合せを伴っていてもよい。それらとしては、これらに限定されるものではないが、タンジェンシャルフロー濾過(TFF)、アフィニティークロマトグラフィー、イオン交換クロマトグラフィー、任意の電荷または等電点ベースのクロマトグラフィー、混合様式のクロマトグラフィー、例えば、CHT(セラミックヒドロキシアパタイト)、疎水性相互作用クロマトグラフィー、サイズ排除クロマトグラフィー、透析、濾過、選択的沈殿、またはこれらの任意の組合せがある。
治療的使用および組成物
本明細書における開示は、障害、例えばがんに関する対象の処置において、本明細書において記載される組成物、例えば開示されるADC化合物および組成物を使用する方法である。組成物、例えばADCは、単独で、または少なくとも1つの追加の不活性薬剤および/もしくは活性薬剤、例えば少なくとも1つの追加の治療剤と組み合わせて投与してもよく、任意の薬学的に許容される製剤、投薬量、および投薬レジメンにおいて投与してもよい。処置の有効性は、毒性ならびに有効性の指標に関して評価してもよく、それに従って調整される。有効性の測定としては、これらに限定されるものではないが、in vitroまたはin vivoで観察された細胞分裂停止および/もしくは細胞毒性効果、腫瘍体積の減少、腫瘍成長阻害、ならびに/または生存の延長がある。
ADCが細胞に対して細胞分裂停止および/または細胞毒性効果を与えるかどうかを判定する方法は既知である。例えば、ADCの細胞毒性または細胞分裂停止活性は、例えば、ADCの標的抗原を発現する哺乳動物細胞を細胞培養培地中で曝露させ;細胞を約6時間から約6日間の期間培養し;細胞生存率を測定すること(例えば、CellTiter-Glo(登録商標)(CTG)またはMTT細胞生存率アッセイを使用して)によって測定してもよい。細胞ベースのin vitroアッセイを使用して、生存率(増殖)、細胞毒性、およびADCのアポトーシスの誘導(カスパーゼ活性化)も測定してもよい。
細胞毒性を判定するために、壊死またはアポトーシス(プログラムされた細胞死)を測定してもよい。壊死は、形質膜の透過性の増加、細胞の膨潤、および形質膜の破裂を典型的には伴う。アポトーシスは、例えばDNA断片化を測定することによって定量化することができる。DNA断片化を定量的にin vitroで判定するための市販の測光的方法が利用可能である。そのようなアッセイの例としては、TUNEL(断片化されたDNAにおける標識されたヌクレオチドの取り込みを検出する)およびELISAベースのアッセイがあり、Biochemica (1999) 2:34-7 (Roche Molecular Biochemicals)において記載されている。
アポトーシスはまた、細胞における形態学的変化を測定することによって判定してもよい。例えば、壊死と同様に、形質膜の完全性の損失は、ある特定の染料(例えば、蛍光性染料、例えば、アクリジンオレンジまたは臭化エチジウム)の取込みを測定することによって判定してもよい。アポトーシス細胞の数を測定するための方法は、DukeおよびCohenによって、Current Protocols in Immunology (Coligan et al., eds. (1992) pp. 3.17.1-3.17.16)において記載されている。細胞はまた、DNA染料(例えば、アクリジンオレンジ、臭化エチジウム、またはヨウ化プロピジウム)で標識してもよく、クロマチン濃縮および核膜の内側に沿った辺縁趨向に関して観察された。アポトーシスはまた、一部の実施形態では、カスパーゼ活性に関するスクリーニングによって判定してもよい。一部の実施形態では、Caspase-Glo(登録商標)アッセイを使用して、カスパーゼ-3およびカスパーゼ-7の活性を測定してもよい。一部の実施形態では、アッセイは、カスパーゼ活性、ルシフェラーゼ活性、および細胞溶解に最適化された試薬において発光性カスパーゼ-3/7基質を提供する。一部の実施形態では、「添加-混合-測定」形式でCaspase-Glo(登録商標)3/7試薬を添加すると、細胞溶解、続いて基質のカスパーゼ開裂およびルシフェラーゼによって生成される「グロータイプ」発光シグナルの生成が生じる場合がある。一部の実施形態では、発光は、存在するカスパーゼ活性の量に比例する場合があり、アポトーシスの指標としての役割を果たすことができる。アポトーシスを判定するために測定され得る他の形態学的変化としては、例えば、細胞質の濃縮、膜小疱形成の増加、および細胞の収縮がある。がん細胞に対するこれらの効果のいずれかを判定することで、ADCが癌の処置において有用であることが示される。
細胞生存率は、例えば染料、例えばニュートラルレッド、トリパンブルー、クリスタルバイオレット、またはALAMAR(商標)ブルーの細胞における取込みを判定することによって測定してもよい(例えば、Page et al. (1993) Intl J Oncology 3:473-6を参照のこと)。そのようなアッセイでは、細胞は、染料を含有する媒体中でインキュベートされ、洗浄され、染料の細胞取込みを反映する残存する染料が分光光度法で測定される。
細胞生存率はまた、例えば、代謝的に活性を示す細胞の指標であるATPを定量化することによって測定してもよい。一部の実施形態では、調製されたADCまたはMcl-1阻害剤化合物のin vitro効力および/または細胞生存率は、本明細書において提供される例において記載されているように、CellTiter-Glo(登録商標)(CTG)細胞生存率アッセイを使用して評価してもよい。このアッセイでは、一部の実施形態では、単一の試薬(CellTiter-Glo(登録商標)試薬)を血清添加培地中で培養された細胞に直接添加される。試薬を添加すると、細胞溶解、および存在するATPの量に比例した発光シグナルの生成が生じる。ATPの量は、培養物中に存在する細胞の数に直接比例する。
細胞生存率はまた、例えば、テトラゾリウム塩の還元を測定することによって測定してもよい。一部の実施形態では、調製されたADCまたはMcl-1阻害剤化合物のin vitro効力および/または細胞生存率は、本明細書において提供される例において記載されているように、MTT細胞生存率アッセイを使用して評価してもよい。このアッセイでは、一部の実施形態では、黄色テトラゾリウムMTT(3-(4、5-ジメチルチアゾリル-2)-2,5-ジフェニルテトラゾリウム臭化物)は、代謝的に活性を示す細胞によって、一部はデヒドロゲナーゼ酵素の作用によって還元されて、還元等価物、例えばNADHおよびNADPHを生成する。次いで、得られた細胞内パープルホルマザンを可溶化し、分光学的手段によって定量化してもよい。
ある特定の態様では、本開示は、Mcl-1および/または1つまたは複数の上流のモジュレーターまたは下流のこれらの標的の発現および/または活性を攪乱することによって、がん細胞または組織を殺傷し、それらの成長を阻害またはモジュレートする方法を特徴付ける。方法は、Mcl-1発現および/または活性の撹乱が治療上の利益を提供する任意の対象に使用してもよい。Mcl-1の発現および/または活性を攪乱することから利益を得る場合がある対象としては、これらに限定されるものではないが、がん、例えば腫瘍または血液がんを有するかまたは有するリスクがあるものがある。一部の実施形態では、がんは、乳がん、多発性骨髄腫、形質細胞性骨髄腫、白血病、リンパ腫、胃がん、急性骨髄性白血病、膀胱がん、脳がん、骨髄がん、子宮頸がん、慢性リンパ性白血病、結腸直腸がん、食道がん、肝細胞がん、リンパ芽球性白血病、濾胞性リンパ腫、T細胞もしくはB細胞由来のリンパ性悪性腫瘍、黒色腫、骨髄性白血病、骨髄腫、口腔がん、卵巣がん、非小細胞肺がん、慢性リンパ性白血病、前立腺がん、小細胞肺がん、または脾臓がんである。一部の実施形態では、がんは、リンパ腫または胃がんである。
一部の実施形態では、開示されるADCは、BCMAを発現する任意の細胞または組織、例えばBCMA発現がん細胞または組織において投与してもよい。例示的な実施形態は、BCMA発現がん細胞または組織を殺傷する方法を含む。方法は、BCMAを発現する任意の細胞または組織、例えば癌性細胞または転移性病変部で使用してもよい。BCMA発現がんの非限定的な例としては、多発性骨髄腫がある(Cho et al. (2018) Front Immunol. 9:1821)。BCMA発現細胞の非限定的な例としては、NCI-H929多発性骨髄腫細胞、およびBCMAをコードする組換え核酸またはその一部を含む細胞がある。
一部の実施形態では、開示されるADCは、CD33を発現する任意の細胞または組織、例えばCD33発現がん細胞または組織において投与してもよい。例示的な実施形態は、CD33発現がん細胞または組織を殺傷する方法を含む。方法は、CD33を発現する任意の細胞または組織、例えば癌性細胞または転移性病変部に使用してもよい。CD33発現癌の非限定的な例としては、結腸直腸がん、膵臓がん、リンパ腫、および白血病(例えば、急性骨髄性白血病)がある(Human Protein Atlas; Walter (2014) Expert Opin Ther Targets 18(7):715-8)。CD33発現細胞の非限定的な例としては、MOLM-13白血病細胞、およびCD33をコードする組換え核酸またはその一部を含む細胞がある。
一部の実施形態では、開示されるADCは、PCADを発現する任意の細胞または組織、例えばPCAD発現がん細胞または組織において投与してもよい。例示的な実施形態は、PCAD発現がん細胞または組織を殺傷する方法を含む。方法は、PCADを発現する任意の細胞または組織、例えば癌性細胞または転移性病変部で使用してもよい。PCAD発現癌の非限定的な例としては、乳がん、胃がん、子宮内膜がん、卵巣がん、膵臓がん、膀胱がん、前立腺がん、および黒色腫がある(Vieira and Paredes (2015) Mol Cancer 14:178)。
一部の実施形態では、開示されるADCは、HER2を発現する任意の細胞または組織、例えばHER2発現がん細胞または組織において投与してもよい。例示的な実施形態は、HER2発現がん細胞または組織を殺傷する方法を含む。方法は、HER2を発現する任意の細胞または組織、例えば癌性細胞または転移性病変部で使用してもよい。HER2発現癌の非限定的な例としては、乳がん、胃がん、膀胱がん、尿路上皮細胞癌、食道がん、肺がん(例えば、肺腺癌)、子宮がん(例えば、子宮漿液性子宮内膜癌)、唾液管癌、子宮頸がん、子宮内膜がん、および卵巣がんがある(English et al. (2013) Mol Diagn Ther. 17:85-99)。HER2発現細胞の非限定的な例としては、HCC1954およびHCC2218乳がん細胞、およびHER2をコードする組換え核酸またはその一部を含む細胞がある。
例示的な方法は、本明細書において記載されるように、細胞とADCとを、有効量、すなわち細胞を殺傷するのに十分な量で接触させるステップを含む。方法は、培養物中の細胞に、例えば、in vitro、in vivo、ex vivo、またはin situで使用してもよい。例えば、HER2を発現する細胞(例えば、腫瘍または転移性病変部の生検によって収集された細胞;確立されたがん細胞系からの細胞;または組換え細胞)は、培養培地中でin vitroで培養してもよく、接触させるステップは、ADCを培養培地に添加することにより影響を受け得る。方法は、特にHER2を発現するがん細胞を含むHER2を発現する細胞の殺傷をもたらすことになる。あるいは、ADCは、in vivoで効果を有するように、任意の好適な投与経路(例えば、静脈内、皮下、または腫瘍組織と直接接触させること)によって対象に投与してもよい。このアプローチは、他の細胞表面抗原(例えば、BCMA、CD33、PCAD)を標的とする抗体に関して使用してもよい。
開示されるADC治療用組成物のin vivo効果は、好適な動物モデルにおいて評価してもよい。例えば、異種がんモデルを使用してもよく、がん外植片または継代異種移植組織は、免疫不全動物、例えばヌードまたはSCIDマウスに導入される(Klein et al. (1997) Nature Med. 3:402-8)。有効性は、腫瘍形成、腫瘍の縮小または転移の阻害などを測定するアッセイを使用して予測してもよい。
メカニズムによる腫瘍死滅の促進、例えばアポトーシスを評価するin vivoアッセイも使用してもよい。一部の実施形態では、治療用組成物を用いて処置された担腫瘍マウスからの異種移植片を、アポトーシス病巣の存在に関して調べ、未処置の対照異種移植片担持マウスと比較してもよい。処置されたマウスの腫瘍において認められるアポトーシス病巣の程度によって、組成物の治療的有効性の適応が提供される。
障害、例えばがんを処置する方法が本明細書においてさらに提供される。本明細書において記載される組成物、例えば本明細書において開示されるADCは、治療目的のために非ヒト哺乳動物またはヒト対象に投与してもよい。治療的方法は、Mcl-1阻害剤、例えばADCを含む治療有効量の組成物を、がんを有するかまたは有することが疑われる対象に投与することを含み、阻害剤は、抗原に結合するターゲッティング抗体に連結されており、その抗原は、(1)がん細胞上に発現されている、(2)結合にアクセス可能であり、および/または(3)非がん細胞と比較してがん細胞表面上に局在化されているかまたは主に発現されている。
例示的な実施形態は、がんを有するかまたは有することが疑われる対象を処置する方法であって、対象に本明細書において開示される治療有効量の組成物、例えば、ADC、組成物、または医薬組成物(例えば、本明細書において開示される例示的なADC、組成物、または医薬組成物のいずれか)を投与することを含む方法である。一部の実施形態では、がんは標的抗原を発現する。一部の実施形態では、標的抗原は、BCMA、CD33、HER2、CD38、CD48、CD79b、PCAD、CD74、CD138、SLAMF7、CD123、CLL1、FLT3、CD7、CKIT、CD56、DLL3、DLK1、B7-H3、EGFR、CD71、EPCAM、FOLR1、ENPP3、MET、AXL、SLC34A2、ネクチン4、TROP2、LIV1、CD46、またはGPNMBである。一部の実施形態では、標的抗原は、4-1BB、5AC、5T4、アルファ-フェトプロテイン、アンジオポエチン2、ASLG659、TCLI、BMPRIB、ブレビカンBCAN、BEHAB、C242抗原、C5、CA-125、CA-125(模倣体)、CA-IX(炭酸脱水酵素9)、CCR4、CD140a、CD152、CD19、CD20、CD200、CD21(C3DR)I)、CD22(B細胞受容体CD22-Bアイソフォーム)、CD221、CD23(gE受容体)、CD28、CD30(TNFRSF8)、CD37、CD4、CD40、CD44v6、CD51、CD52、CD70、CD72(Lyb-2、B-細胞分化抗原CD72)、CD79a、CD80、CEA、CEA-関連抗原、ch4D5、CLDN18.2、CRIPTO(CR、CRI、CRGF、TDGF1)、CTLA-4、CXCR5、DLL4、DR5、E16(LATI、SLC7A5)、EGFL7、EphB2R(DRT、ERK、Hek5、EPHT3、Tyro5)、エピシアリン、ERBB3、ETBR(エンドセリンB型受容体)、FCRHI(Fc受容体様タンパク質I)、FcRH2(IFGP4、IRTA4、SPAPI、SPAP IB、SPAP IC)、フィブロネクチンエクストラドメイン-B、フリズルド受容体、GD2、GD3ガングリオシド、GEDA、HER1、HER2/neu、HER3、HGF、HLA-DOB、HLA-DR、ヒト散乱因子受容体キナーゼ、IGF-I受容体、IL-13、IL20R(ZCYTOR7)、IL-6、ILGF2、ILFRIR、インテグリンu、IRTA2(免疫グロブリンスーパーファミリー受容体転移関連2)、ルイス-Y抗原、LY64(RP105)、MCP-I、MDP(DPEPI)、MPF、MSLN、SMR、メソテリン、巨核球、PD-I、PDCDI、PDGF-R u、前立腺特異的膜抗原、PSCA(前立腺幹細胞抗原前駆体)、PSCA hlg、RANKL、RON、SDCI、Sema Sb、STEAPI、STEAP2、PCANAPI、STAMP I、STEAP2、STMP、前立腺がん関連遺伝子I、TAG-72、TEMI、テネイシンC、TENB2、(TMEFF2、トモレグリン、TPEF、HPPI、TR)、TGF-IJ、TRAIL-E2、TRAIL-Rl、TRAIL-R2、T17M4(BR22450、FLJ20041、TRPM4、TRPM4B、一過性受容体電位カチオンチャネルサブファミリーM、メンバー4)、TWEAK-R、TYRPI(糖タンパク質75)、VEGF、VEGF-A、EGFR-I、VEGFR-2、またはビメンチンである。一部の実施形態では、標的抗原は、BCMA、CD33、PCAD、HER2、CD38、CD46、CD48、またはCD79bである。一部の実施形態では、標的抗原は、BCMA、CD33、CD48、PCAD、またはHER2である。一部の実施形態では、標的抗原は、CD38またはCD48である。一部の実施形態では、がんは、腫瘍または血液がんである。一部の実施形態では、がんは、乳がん、多発性骨髄腫、形質細胞性骨髄腫、白血病、リンパ腫、胃がん、急性骨髄性白血病、膀胱がん、脳がん、骨髄がん、子宮頸がん、慢性リンパ性白血病、結腸直腸がん、食道がん、肝細胞がん、リンパ芽球性白血病、濾胞性リンパ腫、T細胞もしくはB細胞由来のリンパ性悪性腫瘍、黒色腫、骨髄性白血病、骨髄腫、口腔がん、卵巣がん、非小細胞肺がん、慢性リンパ性白血病、前立腺がん、小細胞肺がん、または脾臓がんである。一部の実施形態では、がんは、リンパ腫または胃がんである。
別の例示的な実施形態は、Mcl-1阻害剤を、BCMAを発現する細胞に送達する方法であって、Mcl-1阻害剤を、BCMAエピトープに免疫特異的に結合する抗体にコンジュゲートし、細胞をADCに曝露することを含む方法である。本開示のADCが適応されるBCMAを発現する例示的ながん細胞としては、多発性骨髄腫細胞がある。
別の例示的な実施形態は、Mcl-1阻害剤を、CD33を発現する細胞に送達する方法であって、Mcl-1阻害剤を、D33エピトープに免疫特異的に結合する抗体にコンジュゲートし、細胞をADCに曝露することを含む方法である。本開示のADCが適応されるCD33を発現する例示的ながん細胞としては、白血病細胞がある。
別の例示的な実施形態は、Mcl-1阻害剤を、PCADを発現する細胞に送達する方法であって、Mcl-1阻害剤を、PCADエピトープに免疫特異的に結合する抗体にコンジュゲートし、細胞をADCに曝露することを含む方法である。本開示のADCが適応されるPCADを発現する例示的ながん細胞としては、乳がんおよび胃がん細胞がある。
別の例示的な実施形態は、Mcl-1阻害剤を、HER2を発現する細胞に送達する方法であって、Mcl-1阻害剤を、HER2エピトープに免疫特異的に結合する抗体にコンジュゲートし、細胞をADCに曝露することを含む方法である。本開示のADCが適応されるHER2を発現する例示的ながん細胞としては、乳がん細胞がある。
ある特定の態様では、本開示は、腫瘍(例えば、BCMA発現腫瘍、CD33発現腫瘍、PCAD発現腫瘍、HER2発現腫瘍)の成長を減少させるかまたは阻害する方法であって、治療有効量のADCまたはADCを含む組成物を投与することを含む方法をさらに提供する。一部の実施形態では、処置は、患者の腫瘍の成長を減少させるかもしくは阻害し、転移性病変の数もしくはサイズを減少させ、腫瘍ロードを減少させ、原発性腫瘍ロードを減少させ、侵襲性を減少させ、生存期間を延長し、および/または生活の質を維持するかもしくは改善するのに十分である。一部の実施形態では、腫瘍は、単独で投与された場合のADCの抗体もしくは抗原結合性断片(例えば、抗BCMA抗体、抗CD33抗体、抗PCAD抗体、抗HER2抗体)での処置に対して耐性もしくは難治性であり、および/または腫瘍は、単独で投与された場合のMcl-1阻害剤薬物部分での処置に対して耐性もしくは難治性である。
例示的な実施形態は、対象における腫瘍の成長を減少させるかまたは阻害する方法であって、治療有効量のADC、組成物、または医薬組成物(例えば、本明細書において開示される例示的なADC、組成物、または医薬組成物のいずれか)を対象に投与することを含む方法である。一部の実施形態では、腫瘍は標的抗原を発現する。一部の実施形態では、標的抗原は、BCMA、CD33、HER2、CD38、CD48、CD79b、PCAD、CD74、CD138、SLAMF7、CD123、CLL1、FLT3、CD7、CKIT、CD56、DLL3、DLK1、B7-H3、EGFR、CD71、EPCAM、FOLR1、ENPP3、MET、AXL、SLC34A2、ネクチン4、TROP2、LIV1、CD46、またはGPNMBである。一部の実施形態では、標的抗原は、4-1BB、5AC、5T4、アルファ-フェトプロテイン、アンジオポエチン2、ASLG659、TCLI、BMPRIB、ブレビカンBCAN、BEHAB、C242抗原、C5、CA-125、CA-125(模倣体)、CA-IX(炭酸脱水酵素9)、CCR4、CD140a、CD152、CD19、CD20、CD200、CD21(C3DR)I)、CD22(B細胞受容体CD22-Bアイソフォーム)、CD221、CD23(gE受容体)、CD28、CD30(TNFRSF8)、CD37、CD4、CD40、CD44v6、CD51、CD52、CD70、CD72(Lyb-2、B-細胞分化抗原CD72)、CD79a、CD80、CEA、CEA-関連抗原、ch4D5、CLDN18.2、CRIPTO(CR、CRI、CRGF、TDGF1)、CTLA-4、CXCR5、DLL4、DR5、E16(LATI、SLC7A5)、EGFL7、EphB2R(DRT、ERK、Hek5、EPHT3、Tyro5)、エピシアリン、ERBB3、ETBR(エンドセリンB型受容体)、FCRHI(Fc受容体様タンパク質I)、FcRH2(IFGP4、IRTA4、SPAPI、SPAP IB、SPAP IC)、フィブロネクチンエクストラドメイン-B、フリズルド受容体、GD2、GD3ガングリオシド、GEDA、HER1、HER2/neu、HER3、HGF、HLA-DOB、HLA-DR、ヒト散乱因子受容体キナーゼ、IGF-I受容体、IL-13、IL20R(ZCYTOR7)、IL-6、ILGF2、ILFRIR、インテグリンu、IRTA2(免疫グロブリンスーパーファミリー受容体転移関連2)、ルイス-Y抗原、LY64(RP105)、MCP-I、MDP(DPEPI)、MPF、MSLN、SMR、メソテリン、巨核球、PD-I、PDCDI、PDGF-R u、前立腺特異的膜抗原、PSCA(前立腺幹細胞抗原前駆体)、PSCA hlg、RANKL、RON、SDCI、Sema Sb、STEAP I、STEAP2、PCANAP I、STAMP I、STEAP2、STMP、前立腺がん関連遺伝子I、TAG-72、TEMI、テネイシンC、TENB2、(TMEFF2、トモレグリン、TPEF、HPPI、TR)、TGF-IJ、TRAIL-E2、TRAIL-Rl、TRAIL-R2、T17M4(BR22450、FLJ20041、TRPM4、TRPM4B、一過性受容体電位カチオンチャネルサブファミリーM、メンバー4)、TWEAK-R、TYRPI(糖タンパク質75)、VEGF、VEGF-A、EGFR-I、VEGFR-2、またはビメンチンである。一部の実施形態では、標的抗原は、BCMA、CD33、PCAD、HER2、CD38、CD46、CD48、またはCD79bである。一部の実施形態では、標的抗原は、BCMA、CD33、CD48、PCAD、またはHER2である。一部の実施形態では、標的抗原は、CD38またはCD48である。一部の実施形態では、腫瘍は、乳がん、胃がん、膀胱がん、脳がん、子宮頸がん、結腸直腸がん、食道がん、肝細胞がん、黒色腫、口腔がん、卵巣がん、非小細胞肺がん、前立腺がん、小細胞肺がん、または脾臓がんである。一部の実施形態では、腫瘍は胃がんである。一部の実施形態では、ADC、組成物、または医薬組成物の投与は、腫瘍の成長を、処置非存在下での成長と比較して少なくとも約10%、少なくとも約20%、少なくとも約30%、少なくとも約40%、少なくとも約50%、少なくとも約60%、少なくとも約70%、少なくとも約80%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、または少なくとも約99%減少させるかまたは阻害する。
別の例示的な実施形態は、対象における腫瘍の成長を遅延または減速する方法であって、治療有効量のADC、組成物、または医薬組成物(例えば、本明細書において開示される例示的なADC、組成物、または医薬組成物のいずれか)を対象に投与することを含む方法である。一部の実施形態では、腫瘍は標的抗原を発現する。一部の実施形態では、標的抗原は、BCMA、CD33、HER2、CD38、CD48、CD79b、PCAD、CD74、CD138、SLAMF7、CD123、CLL1、FLT3、CD7、CKIT、CD56、DLL3、DLK1、B7-H3、EGFR、CD71、EPCAM、FOLR1、ENPP3、MET、AXL、SLC34A2、ネクチン4、TROP2、LIV1、CD46、またはGPNMBである。一部の実施形態では、標的抗原は、4-1BB、5AC、5T4、アルファ-フェトプロテイン、アンジオポエチン2、ASLG659、TCLI、BMPRIB、ブレビカンBCAN、BEHAB、C242抗原、C5、CA-125、CA-125(模倣体)、CA-IX(炭酸脱水酵素9)、CCR4、CD140a、CD152、CD19、CD20、CD200、CD21(C3DR)I)、CD22(B細胞受容体CD22-Bアイソフォーム)、CD221、CD23(gE受容体)、CD28、CD30(TNFRSF8)、CD37、CD4、CD40、CD44v6、CD51、CD52、CD70、CD72(Lyb-2、B-細胞分化抗原CD72)、CD79a、CD80、CEA、CEA-関連抗原、ch4D5、CLDN18.2、CRIPTO(CR、CRI、CRGF、TDGF1)、CTLA-4、CXCR5、DLL4、DR5、E16(LATI、SLC7A5)、EGFL7、EphB2R(DRT、ERK、Hek5、EPHT3、Tyro5)、エピシアリン、ERBB3、ETBR(エンドセリンB型受容体)、FCRHI(Fc受容体様タンパク質I)、FcRH2(IFGP4、IRTA4、SPAPI、SPAP IB、SPAP IC)、フィブロネクチンエクストラドメイン-B、フリズルド受容体、GD2、GD3ガングリオシド、GEDA、HER1、HER2/neu、HER3、HGF、HLA-DOB、HLA-DR、ヒト散乱因子受容体キナーゼ、IGF-I受容体、IL-13、IL20R(ZCYTOR7)、IL-6、ILGF2、ILFRIR、インテグリンu、IRTA2(免疫グロブリンスーパーファミリー受容体転移関連2)、ルイス-Y抗原、LY64(RP105)、MCP-I、MDP(DPEPI)、MPF、MSLN、SMR、メソテリン、巨核球、PD-I、PDCDI、PDGF-R u、前立腺特異的膜抗原、PSCA(前立腺幹細胞抗原前駆体)、PSCA hlg、RANKL、RON、SDCI、Sema Sb、STEAP I、STEAP2、PCANAP I、STAMP I、STEAP2、STMP、前立腺がん関連遺伝子I、TAG-72、TEMI、テネイシンC、TENB2、(TMEFF2、トモレグリン、TPEF、HPPI、TR)、TGF-IJ、TRAIL-E2、TRAIL-Rl、TRAIL-R2、T17M4(BR22450、FLJ20041、TRPM4、TRPM4B、一過性受容体電位カチオンチャネルサブファミリーM、メンバー4)、TWEAK-R、TYRPI(糖タンパク質75)、VEGF、VEGF-A、EGFR-I、VEGFR-2、またはビメンチンである。一部の実施形態では、標的抗原は、BCMA、CD33、PCAD、HER2、CD38、CD46、CD48、またはCD79bである。一部の実施形態では、標的抗原は、BCMA、CD33、CD48、PCAD、またはHER2である。一部の実施形態では、標的抗原は、CD38またはCD48である。一部の実施形態では、腫瘍は、乳がん、胃がん、膀胱がん、脳がん、子宮頸がん、結腸直腸がん、食道がん、肝細胞がん、黒色腫、口腔がん、卵巣がん、非小細胞肺がん、前立腺がん、小細胞肺がん、または脾臓がんである。一部の実施形態では、腫瘍は胃がんである。一部の実施形態では、ADC、組成物、または医薬組成物の投与は、腫瘍の成長を、処置非存在下での成長と比較して少なくとも約10%、少なくとも約20%、少なくとも約30%、少なくとも約40%、少なくとも約50%、少なくとも約60%、少なくとも約70%、少なくとも約80%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、または少なくとも約99%遅延または減速する。
ある特定の態様では、本開示は、がん細胞集団(例えば、BCMA発現がん細胞集団、CD33発現がん細胞集団、PCAD発現がん細胞集団、HER2発現がん細胞集団)の拡大を低減または減速する方法であって、治療有効量のADCまたはADCを含む組成物を投与することを含む方法をさらに提供する。
例示的な実施形態は、対象におけるがん細胞集団の拡大を低減または減速する方法であって、治療有効量のADC、組成物、または医薬組成物(例えば、本明細書において開示される例示的なADC、組成物、または医薬組成物のいずれか)を対象に投与することを含む方法である。一部の実施形態では、がん細胞集団は標的抗原を発現する。一部の実施形態では、標的抗原は、BCMA、CD33、HER2、CD38、CD48、CD79b、PCAD、CD74、CD138、SLAMF7、CD123、CLL1、FLT3、CD7、CKIT、CD56、DLL3、DLK1、B7-H3、EGFR、CD71、EPCAM、FOLR1、ENPP3、MET、AXL、SLC34A2、ネクチン4、TROP2、LIV1、CD46、またはGPNMBである。一部の実施形態では、標的抗原は、4-1BB、5AC、5T4、アルファ-フェトプロテイン、アンジオポエチン2、ASLG659、TCLI、BMPRIB、ブレビカンBCAN、BEHAB、C242抗原、C5、CA-125、CA-125(模倣体)、CA-IX(炭酸脱水酵素9)、CCR4、CD140a、CD152、CD19、CD20、CD200、CD21(C3DR)I)、CD22(B細胞受容体CD22-Bアイソフォーム)、CD221、CD23(gE受容体)、CD28、CD30(TNFRSF8)、CD37、CD4、CD40、CD44v6、CD51、CD52、CD70、CD72(Lyb-2、B-細胞分化抗原CD72)、CD79a、CD80、CEA、CEA-関連抗原、ch4D5、CLDN18.2、CRIPTO(CR、CRI、CRGF、TDGF1)、CTLA-4、CXCR5、DLL4、DR5、E16(LATI、SLC7A5)、EGFL7、EphB2R(DRT、ERK、Hek5、EPHT3、Tyro5)、エピシアリン、ERBB3、ETBR(エンドセリンB型受容体)、FCRHI(Fc受容体様タンパク質I)、FcRH2(IFGP4、IRTA4、SPAPI、SPAP IB、SPAP IC)、フィブロネクチンエクストラドメイン-B、フリズルド受容体、GD2、GD3ガングリオシド、GEDA、HER1、HER2/neu、HER3、HGF、HLA-DOB、HLA-DR、ヒト散乱因子受容体キナーゼ、IGF-I受容体、IL-13、IL20R(ZCYTOR7)、IL-6、ILGF2、ILFRIR、インテグリンu、IRTA2(免疫グロブリンスーパーファミリー受容体転移関連2)、ルイス-Y抗原、LY64(RP105)、MCP-I、MDP(DPEPI)、MPF、MSLN、SMR、メソテリン、巨核球、PD-I、PDCDI、PDGF-R u、前立腺特異的膜抗原、PSCA(前立腺幹細胞抗原前駆体)、PSCA hlg、RANKL、RON、SDCI、Sema Sb、STEAP I、STEAP2、PCANAP I、STAMP I、STEAP2、STMP、前立腺がん関連遺伝子I、TAG-72、TEMI、テネイシンC、TENB2、(TMEFF2、トモレグリン、TPEF、HPPI、TR)、TGF-IJ、TRAIL-E2、TRAIL-Rl、TRAIL-R2、T17M4(BR22450、FLJ20041、TRPM4、TRPM4B、一過性受容体電位カチオンチャネルサブファミリーM、メンバー4)、TWEAK-R、TYRPI(糖タンパク質75)、VEGF、VEGF-A、EGFR-I、VEGFR-2、またはビメンチンである。一部の実施形態では、標的抗原は、BCMA、CD33、PCAD、HER2、CD38、CD46、CD48、またはCD79bである。一部の実施形態では、標的抗原は、BCMA、CD33、CD48、PCAD、またはHER2である。一部の実施形態では、標的抗原は、CD38またはCD48である。一部の実施形態では、がん細胞集団は、腫瘍または血液がんに由来する。一部の実施形態では、がん細胞集団は、乳がん、多発性骨髄腫、形質細胞性骨髄腫、白血病、リンパ腫、胃がん、急性骨髄性白血病、膀胱がん、脳がん、骨髄がん、子宮頸がん、慢性リンパ性白血病、結腸直腸がん、食道がん、肝細胞がん、リンパ芽球性白血病、濾胞性リンパ腫、T細胞もしくはB細胞由来のリンパ性悪性腫瘍、黒色腫、骨髄性白血病、骨髄腫、口腔がん、卵巣がん、非小細胞肺がん、慢性リンパ性白血病、前立腺がん、小細胞肺がん、または脾臓がんに由来する。一部の実施形態では、がん細胞集団は、リンパ腫または胃がんに由来する。一部の実施形態では、ADC、組成物、または医薬組成物の投与は、処置非存在下での集団と比較して、がん細胞集団を少なくとも約10%、少なくとも約20%、少なくとも約30%、少なくとも約40%、少なくとも約50%、少なくとも約60%、少なくとも約70%、少なくとも約80%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、または少なくとも約99%減少させる。一部の実施形態では、ADC、組成物、または医薬組成物の投与は、処置非存在下での拡大と比較して、がん細胞集団の拡大を少なくとも約10%、少なくとも約20%、少なくとも約30%、少なくとも約40%、少なくとも約50%、少なくとも約60%、少なくとも約70%、少なくとも約80%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、または少なくとも約99%減速する。
がんを有するかまたは有することが疑われる対象が、開示されるADCおよび組成物での処置に対して応答することになるかどうか判定する方法も本明細書において提供される。例示的な実施形態は、がんを有するかまたは有することが疑われる対象が、ADC、組成物、または医薬組成物(例えば、本明細書において開示される例示的なADC、組成物、または医薬組成物のいずれか)での処置に対して応答することになるかどうかを、対象からの生物学的試料を用意すること;試料とADCとを接触させること;およびADCの試料中のがん細胞への結合を検出することによって判定する方法である。一部の実施形態では、試料は、組織生検試料、血液試料、または骨髄試料である。一部の実施形態では、方法は、対象からの生物学的試料を提供すること;試料とADCとを接触させること;および試料中のがん細胞死の1つまたは複数のマーカー(例えば、1つまたは複数のアポトーシスマーカーの発現の増加、培養物中のがん細胞集団の拡大の減少など)を検出することを含む。
開示されるADCおよび組成物の治療的使用が本明細書においてさらに提供される。例示的な実施形態は、がん(例えば、BCMA発現がん、CD33発現がん、PCAD発現がん、HER2発現がん)を有するかまたは有することが疑われる対象の処置において使用するための、ADC、組成物、または医薬組成物(例えば、本明細書において開示される例示的なADC、組成物、または医薬組成物のいずれか)である。別の例示的な実施形態は、がん(例えば、BCMA発現がん、CD33発現がん、PCAD発現がん、HER2発現がん)を有するかまたは有することが疑われる対象の処置における、ADC、組成物、または医薬組成物(例えば、本明細書において開示される例示的なADC、組成物、または医薬組成物のいずれか)の使用である。別の例示的な実施形態は、がん(例えば、BCMA発現がん、CD33発現がん、PCAD発現がん、HER2発現がん)を有するかまたは有することが疑われる対象を処置するための医薬の製造方法における、ADC、組成物、または医薬組成物(例えば、本明細書において開示される例示的なADC、組成物、または医薬組成物のいずれか)の使用である。標的抗原(例えば、BCMA、CD33、PCAD、HER2)を発現する癌を有する対象を同定するための方法は、当技術分野において既知であり、開示されるADC化合物または組成物での処置に好適な患者を同定するために使用してもよい。
さらに、本開示のADCは、ADCが獣医用目的でまたはヒト疾患の動物モデルとして結合することができる抗原を発現する非ヒト哺乳動物に投与してもよい。後者に関して、そのような動物モデルは、開示されるADCの治療的有効性を評価する(例えば、投薬量および投与の時間経過を試験する)のに有用であり得る。
前述の方法の実施において使用される治療用組成物は、所望の送達方法に好適な薬学的に許容される担体を含む医薬組成物に製剤化してもよい。例示的な実施形態は、本開示のADCと、薬学的に許容される担体、例えば選択される投与手段、例えば、静脈内投与に好適なものとを含む医薬組成物である。医薬組成物はまた、例えば、がんを処置または阻止するのに好適な1つまたは複数の追加の不活性薬剤および/または治療剤(例えば、標準ケア用薬剤など)を含んでいてもよい。医薬組成物は、1つまたは複数の担体、賦形剤、および/または安定化剤構成成分なども含んでいてもよい。そのような医薬組成物を製剤化する方法および好適な製剤は当技術分野において既知である(例えば、"Remington's Pharmaceutical Sciences," Mack Publishing Co., Easton, PAを参照のこと)。
好適な担体としては、治療用組成物と組み合わせた場合、治療用組成物の抗腫瘍機能を保持し、患者の免疫系と一般的に非反応性である任意の材料がある。薬学的に許容される担体としては、生理学的に適合する任意のおよび全ての溶媒、分散媒体、コーティング、抗菌および抗真菌剤、等張化および吸収遅延剤などがある。薬学的に許容される担体の例としては、水、生理食塩水、リン酸緩衝食塩水、デキストロース、グリセロール、エタノール、メシル酸塩などのうちの1つまたは複数、ならびにこれらの組合せがある。多くの場合、等張化剤、例えば、糖、多価アルコール、例えばマンニトール、ソルビトール、または塩化ナトリウムが組成物中に含まれる。薬学的に許容される担体は、ADCの貯蔵期間または有効性を高める少量の補助物質、例えば、湿潤または乳化剤、防腐剤または緩衝液をさらに含んでいてもよい。
本開示の医薬組成物は、当技術分野において既知のさまざまな方法によって投与してもよい。投与経路および/または様式は、所望の結果に応じて変更してもよい。一部の実施形態では、治療用製剤は可溶化され、治療用組成物をがん部位に送達することができる任意の経路を介して投与される。潜在的に有効な投与経路としては、これらに限定されるものではないが、非経口(例えば、静脈内、皮下)、腹腔内、筋肉内、腫瘍内、皮内、器官内、同所(Orthotopic)などがある。一部の実施形態では、投与は、静脈内、皮下、腹腔内、または筋肉内である。薬学的に許容される担体は、投与経路、例えば、静脈内または皮下投与(例えば、注射または注入による)に好適であるべきである。投与経路に応じて、活性化合物、すなわちADCおよび/または任意の追加の治療剤は、材料で被覆して、化合物を不活性化する場合がある酸および他の自然の条件の作用から化合物を保護してもよい。投与は全身性であっても局所であってもよい。
本明細書において開示される治療用組成物は、製造および貯蔵の条件下で無菌および安定であり得、さまざまな形態であってもよい。これらとしては、例えば、液体、半固体、および固体投薬形態、例えば液体溶液(例えば、注射可能なおよび注入可能な溶液)、分散液または懸濁液、錠剤、ピル剤、散剤、リポソーム剤、および坐剤がある。形態は、意図される投与様式および治療的適用に依存する。一部の実施形態では、開示されるADCは、非経口投与に好適な医薬組成物に取り込まれてもよい。注射用溶液は、フリントまたはアンバーバイアル、アンプル、もしくは予め充填されたシリンジ、または他の既知の送達または貯蔵デバイス中の、液体または凍結乾燥された投薬形態のいずれかから構成されていてもよい。一部の実施形態では、ADCまたは医薬組成物のうちの1つまたは複数は、密閉された容器中の乾燥無菌凍結乾燥粉末または水不含濃縮物として供給され、対象に投与するために適切な濃度に復元することができる(例えば、水または生理食塩水を用いて)。
典型的には、治療有効量または有効量の開示される組成物、例えば、開示されるADCが本開示の医薬組成物において用いられる。組成物、例えば、ADCを含むものは、当技術分野において既知の従来の方法によって薬学的に許容される投薬形態に製剤化してもよい。前述の方法を使用して癌を処置するための投薬量および投与プロトコールは、方法および標的のがんに伴って変化することになり、当技術分野において認められた多数の他の因子に一般的に依存することになる。
本明細書において開示される組成物に関する投薬レジメン、例えば、ADCを単独でまたは少なくとも1つの追加の不活性および/または活性治療剤と組み合わせて含むものが、最適な所望の応答(例えば、治療的応答)を提供するために調整されていてもよい。例えば、一方または両方の薬剤の単回ボーラスを一度に投与しても、いくつかの分割用量を所定の期間にわたって投与してもよいか、または一方または両方の薬剤の用量を、治療的状況の緊急性によって示されるにつれて比例的に増加させても減少させてもよい。一部の実施形態では、処置は、許容される投与経路を介したADC調製物の単回ボーラスまたは繰り返し投与を伴う。一部の実施形態では、ADCは、毎日、毎週、毎月、またはこれらの間の任意の期間患者に投与される。任意の特定の対象に関しては、特定の投薬レジメンを、個体のニーズ、および処置を行う臨床医の専門的な判断に従って経時的に調整してもよい。非経口組成物は、投与を容易にし、投薬量を均一にするために投薬単位形態で製剤化してもよい。投薬単位形態は、本明細書で使用される場合、処置されることになる対象のための単位投薬量として適した物理的に個別の単位を指し;各単位は、必要とされる医薬担体と関連して所望の治療効果を生成するように計算された所定の量の活性化合物を含有する。
ADCおよび/または任意の追加の治療剤を含む組成物に関する投薬量値は、活性化合物の特有の特徴、および達成されることになる特定の治療効果に基づいて選択してもよい。医師または獣医師は、医薬組成物中に用いられるADCの投薬を、所望の治療効果を達成するのに必要とされるものよりも低いレベルで開始し、所望の効果が達成されるまで投薬量を次第に増加させてもよい。一般的に、本開示の組成物の有効用量は、がんの処置に関しては、投与手段、標的部位、患者の生理学的状況、患者がヒトであるか動物であるか、投与される他の医薬品、および処置が予防的であるか治療的であるかを含む多くの異なる因子に応じて変更してもよい。選択される投薬量レベルは、用いられる本開示の特定の組成物、またはそのエステル、塩、もしくはアミドの活性、投与経路、投与時間、用いられる特定の化合物の排泄速度、処置期間、用いられる特定の組成物との組合せにおいて使用される他の薬物、化合物および/または材料、処置される患者の年齢、性別、体重、状態、一般的な健康および過去の既往歴、ならびに類似の因子を含むさまざまな薬物動態因子にも依存する場合がある。処置投薬量は、安全性および有効性を最適化するために漸増させてもよい。
本明細書において提供される化合物の毒性および治療的有効性は、細胞培養物または動物モデルにおける標準的な医薬手順によって判定してもよい。例えば、LD50、ED50、EC50、およびIC50を判定してもよく、毒性と治療効果との間の用量比率(LD50/ED50)を治療インデックスとして計算してもよい。in vitroおよびin vivoアッセイから得られたデータを、ヒトにおいて使用するための投薬量の範囲の推定または定式化において使用してもよい。例えば、本明細書において開示される組成物および方法は、異種がんモデル(例えば、NCI-H929多発性骨髄腫マウスモデル)において最初に評価してもよい。
一部の実施形態では、ADCまたはADCを含む組成物は単一の機会で投与される。他の実施形態では、ADCまたはADCを含む組成物は複数の機会で投与される。単一の投薬間の間隔は、例えば、毎日、毎週、毎月、または毎年であってもよい。間隔は、薬剤の比較的一貫した血漿濃度を維持するために、患者において投与された薬剤(例えば、ADC)の血液レベルの測定に基づいて不規則であってもよい。ADCまたはADCを含む組成物の投薬量および投与頻度も、処置が予防的か治療的かによって変化する場合がある。予防的適用では、比較的低投薬量を、長期間にわたって比較的低頻度の間隔で投与してもよい。一部の患者は、一生処置を受け続ける。治療的適用では、比較的短い間隔での比較的高い投薬量が、疾患の進行が低下または終了するまで、好ましくは患者が疾患の1つまたは複数の症状の部分的または完全な改善を示すまでときとして必要とされる。その後、患者は低い、例えば予防的レジメンを投与してもよい。
上記の治療的アプローチは、さまざまな追加の外科的、化学療法、または放射線治療法レジメンのうちのいずれか1つと組み合わせてもよい。一部の実施形態では、本明細書において開示されるADCまたは組成物は、1つまたは複数の追加の治療剤、例えば、1つまたは複数の化学療法剤、処置される特定の状態のための1つまたは複数の標準ケア薬剤と同時製剤化および/または同時投与される。
本明細書において記載される治療的および/または診断的適用における使用のためのキットも提供される。そのようなキットは、担体、パッケージ、または容器を含んでいてもよく、これらは、1つまたは複数の容器、例えば、バイアル、チューブなどを収容するために区画化されており、各容器は、本明細書において開示される方法において使用されることになる個別の要素のうちの1つを含んでいる。ラベルは、キット内のADCまたは組成物が、特定の治療法または非治療的適用、例えば、予後的、予防的、診断的、または実験室的な適用のために使用されることを示すために容器上にまたはそれと一緒に存在していてもよい。ラベルは、in vivoまたはin vitroでの使用のいずれか、例えば、本明細書において記載されるものに対する指示も示す場合がある。指示およびまたは他の情報は、キットとともにまたはその上に含まれる挿入物またはラベルにも含まれていてもよい。ラベルは、容器上にあってもそれに付随していてもよい。ラベルは、ラベルを形成する文字、数、または他の文字が容器自体に成形またはエッチングされている場合、容器上にあってもよい。ラベルは、容器を同様に保持する貯蔵容器(receptacle)または輸送容器(carrier)内に存在する場合、例えば添付文書として容器に付随されていてもよい。ラベルは、キット内のADCまたは組成物が、本明細書において記載される状態、例えばがんを診断または処置するために使用されることを示していてもよい。
一部の実施形態では、キットは、ADCまたはADCを含む組成物を含む。一部の実施形態では、キットは、これらに限定されないが:使用のための取扱説明書;他の試薬、例えば、治療剤(例えば、標準ケア用薬剤);投与のためのADCを調製するためのデバイス、容器、または他の材料;薬学的に許容される担体;およびADCを対象に投与するためのデバイス、容器、または他の材料を含む、1つまたは複数の追加の構成成分をさらに含む。使用のための取扱説明書は、例えば、がんを有するかまたは有することが疑われる患者において推奨される投薬量および/または投与様式を含む治療的適用のためのガイダンスを含んでいてもよい。一部の実施形態では、キットは、ADCと、がんの処置、阻止、および/または診断におけるADCの使用のための取扱説明書とを含む。
組合せ療法
一部の実施形態では、本開示は、処置する方法であって、本明細書において開示される抗体-薬物コンジュゲートを1つまたは複数追加の治療剤と組み合わせて投与する方法を提供する。例示的な組合せパートナーは本明細書において開示される。
ある特定の実施形態では、本明細書において記載される組合せは、PD-1阻害剤を含む。一部の実施形態では、PD-1阻害剤は、PDR001(Novartis)、ニボルマブ(Bristol-Myers Squibb)、ペンブロリズマブ(Merck&Co)、ピジリズマブ(CureTech)、MEDI0680(Medimmune)、REGN2810(Regeneron)、TSR-042(Tesaro)、PF-06801591(Pfizer)、BGB-A317(Beigene)、BGB-108(Beigene)、INCSHR1210(Incyte)、またはAMP-224(Amplimmune)から選択される。一部の実施形態では、PD-1阻害剤はPDR001である。PDR001はスパルタリズマブとしても既知である。
ある特定の実施形態では、本明細書において記載される組合せはLAG-3阻害剤を含む。一部の実施形態では、LAG-3阻害剤は、LAG525(Novartis)、BMS-986016(Bristol-Myers Squibb)、またはTSR-033(Tesaro)から選択される。
ある特定の実施形態では、本明細書において記載される組合せは、TIM-3阻害剤を含む。一部の実施形態では、TIM-3阻害剤は、MBG453(Novartis)、TSR-022(Tesaro)、LY-3321367(Eli Lily)、Sym23(Symphogen)、BGB-A425(Beigene)、INCAGN-2390(Agenus)、BMS-986258(BMS)、RO-7121661(Roche)、またはLY-3415244(Eli Lilly)である。
ある特定の実施形態では、本明細書において記載される組合せはPDL1阻害剤を含む。一実施形態では、PDL1阻害剤は、FAZ053(Novartis)、アテゾリズマブ(Genentech)、デュルバルマブ(Astra Zeneca)、またはアベルマブ(Pfizer)から選択される。
ある特定の実施形態では、本明細書において記載される組合せはGITRアゴニストを含む。一部の実施形態では、GITRアゴニストは、GWN323(NVS)、BMS-986156、MK-4166またはMK-1248(Merck)、TRX518(Leap Therapeutics)、INCAGN1876(Incyte/Agenus)、AMG 228(Amgen)またはINBRX-110(Inhibrx)から選択される。
一部の実施形態では、本明細書において記載される組合せはIAP阻害剤を含む。一部の実施形態では、IAP阻害剤は、LCL161または国際出願PCT2008/016893号明細書で開示される化合物を含む。
実施形態では、組合せは、mTOR阻害剤、例えばRAD001(エベロリムスとしても既知である)を含む。
実施形態では、組合せは、HDAC阻害剤、例えばLBH589を含む。LBH589はパノビノスタットとしても既知である。
実施形態では、組合せは、IL-17阻害剤、例えばCJM112を含む。
ある特定の実施形態では、本明細書において記載される組合せはエストロゲン受容体(ER)アンタゴニストを含む。一部の実施形態では、エストロゲン受容体アンタゴニストはPD-1阻害剤、CDK4/6阻害剤、またはその両方と組み合わせて使用される。一部の実施形態では、組合せは、ER陽性(ER+)がんまたは乳がん(例えば、ER+乳がん)を処置するために使用される。
一部の実施形態では、エストロゲン受容体アンタゴニストは選択的エストロゲン受容体分解誘導薬(degrader)(SERD)である。SERDはエストロゲン受容体アンタゴニストであり、これは受容体に結合し、例えば、受容体の分解または下方調節をもたらす(Boer K. et al., (2017) Therapeutic Advances in Medical Oncology 9(7): 465-479)。ERは、例えば、ヒト生殖系の成長、発生および生理機能に重要なホルモン活性化転写因子である。ERは、例えば、エストロゲンホルモン(17ベータエストラジオール)によって活性化される。ERの発現およびシグナル伝達は、癌(例えば乳がん)、例えば、ER陽性(ER+)乳がんに関与する。一部の実施形態では、SERDは、LSZ102、フルベストラント、ブリラネストラント、またはエラセストラントから選択される。
一部の実施形態では、SERDは国際出願PCT2014/130310号明細書で開示される化合物を含み、これはその全体が参照により本明細書に組み込まれるものとする。
一部の実施形態では、SERDはLSZ102を含む。LSZ102は、化学名:(E)-3-(4-((2-(2-(1,1-ジフルオロエチル)-4-フルオロフェニル)-6-ヒドロキシベンゾ[b]チオフェン-3-イル)オキシ)フェニル)アクリル酸を有する。一部の実施形態では、SERDは、フルベストラント(CAS登録番号:129453-61-8)、または国際出願PCT2001/051056号明細書で開示される化合物を含み、これはその全体が参照により本明細書に組み込まれるものとする。一部の実施形態では、SERDは、エラセストラント(CAS登録番号:722533-56-4)、または米国特許第7,612,114号明細書で開示される化合物を含み、それは、その全体が参照により組み込まれるものとする。エラセストラントは、RAD1901、ER-306323または(6R)-6-{2-[エチル({4-[2-(エチルアミノ)エチル]フェニル}メチル)アミノ]-4-メトキシフェニル}-5,6,7,8-テトラヒドロナフタレン-2-オールとしても既知である。エラセストラントは、選択的エストロゲン受容体モジュレーター(SERM)およびSERDの経口で生物学的に利用可能な非ステロイド性の組合せである。エラセストラントはまた、例えば、Garner F et al., (2015) Anticancer Drugs 26(9):948-56で開示されている。一部の実施形態では、SERDは、ブリラネストラント(CAS登録番号:1365888-06-7)、または国際出願PCT2015/136017号明細書で開示される化合物であり、それはその全体が参照により組み込まれるものとする。
一部の実施形態では、SERDは、例えば、McDonell et al. (2015) Journal of Medicinal Chemistry 58(12) 4883-4887で開示されるような、RU 58668、GW7604、AZD9496、バゼドキシフェン、ピペンドキシフェン、アルゾキシフェン、OP-1074、またはアコルビフェンから選択される。
他の例示的なエストロゲン受容体アンタゴニストは、例えば、国際公開第2011/156518号パンフレット、国際公開第2011/159769号パンフレット、国際公開第2012/037410号パンフレット、国際公開第2012/037411号パンフレット、および米国特許第2012/0071535号明細書で開示され、これら全てはその全体が参照により本明細書に組み込まれるものとする。
ある特定の実施形態では、本明細書において記載される組合せは、サイクリン依存性キナーゼ4または6(CDK4/6)阻害剤を含む。一部の実施形態では、CDK4/6阻害剤は、PD-1阻害剤、エストロゲン受容体(ER)アンタゴニスト、またはその両方と組み合わせて使用される。一部の実施形態では、組合せは、ER陽性(ER+)がんまたは乳がん(例えば、ER+乳がん)を処置するために使用される。一部の実施形態では、CDK4/6阻害剤は、リボシクリブ、アベマシクリブ(Eli Lilly)、またはパルボシクリブから選択される。
一部の実施形態では、CDK4/6阻害剤は、リボシクリブ(CAS登録番号:1211441-98-3)、または米国特許第8,415,355号明細書および同第8,685,980号明細書で開示される化合物を含み、これらはその全体が参照により組み込まれるものとする。
一部の実施形態では、CDK4/6阻害剤は、国際出願PCT2010/020675号明細書および米国特許第8,415,355号明細書および同第8,685,980号明細書で開示される化合物を含み、これらはその全体が参照により組み込まれるものとする。
一部の実施形態では、CDK4/6阻害剤はリボシクリブ(CAS登録番号:1211441-98-3)を含む。リボシクリブはLEE011、KISQALI(登録商標)、または7-シクロペンチル-N,N-ジメチル-2-((5-(ピペラジン-1-イル)ピリジン-2-イル)アミノ)-7H-ピロロ[2,3-d]ピリミジン-6-カルボキサミドとしても既知である。
一部の実施形態では、CDK4/6阻害剤はアベマシクリブ(CAS登録番号:1231929-97-7)を含む。アベマシクリブは、LY835219またはN-[5-[(4-エチル-1-ピペラジニル)メチル]-2-ピリジニル]-5-フルオロ-4-[4-フルオロ-2-メチル-1-(1-メチルエチル)-1H-ベンズイミダゾール-6-イル]-2-ピリミジナミンとしても既知である。アベマシクリブは、CDK4およびCDK6に対する選択的なCDK阻害剤であり、例えば、Torres-Guzman R et al. (2017) Oncotarget 10.18632/oncotarget.17778で開示されている。
一部の実施形態では、CDK4/6阻害剤はパルボシクリブ(CAS登録番号:571190-30-2)を含む。パルボシクリブは、PD-0332991、IBRANCE(登録商標)または6-アセチル-8-シクロペンチル-5-メチル-2-{[5-(1-ピペラジニル)-2-ピリジニル]アミノ}ピリド[2,3-d]ピリミジン-7(8H)-オンとしても既知である。パルボシクリブはCDK4を11nMのIC50で阻害し、CDK6を16nMのIC50で阻害し、例えば、Finn et al. (2009) Breast Cancer Research 11(5):R77で開示されている。
ある特定の実施形態では、本明細書において記載される組合せは、ケモカイン(C-X-Cモチーフ)受容体2(CXCR2)阻害剤を含む。一部の実施形態では、CXCR2阻害剤は、6-クロロ-3-((3,4-ジオキソ-2-(ペンタン-3-イルアミノ)シクロブタ-1-エン-1-イル)アミノ)-2-ヒドロキシ-N-メトキシ-N-メチルベンゼンスルホンアミド、ダニリキシン、レパリキシン、またはナバリキシンから選択される。
一部の実施形態では、CSF-1/1R結合剤は、マクロファージコロニー刺激因子(M-CSF)阻害剤、例えば、モノクローナル抗体またはM-CSFに対するFab(例えばMCS110)、CSF-1Rチロシンキナーゼ阻害剤(例えば、4-((2-(((1R,2R)-2-ヒドロキシシクロヘキシル)アミノ)ベンゾ[d]チアゾール-6-イル)オキシ)-N-メチルピコリンアミドまたはBLZ945)、受容体チロシンキナーゼ阻害剤(RTK)(例えばペキシダルチニブ)、またはCSF-1Rターゲッティング抗体(例えば、エマクツズマブまたはFPA008)から選択される。一部の実施形態では、CSF-1/1R阻害剤はBLZ945である。一部の実施形態では、CSF-1/1R結合剤はMCS110である。他の実施形態では、CSF-1/1R結合剤はペキシダルチニブである。
ある特定の実施形態では、本明細書において記載される組合せはc-MET阻害剤を含む。c-METは、多くの腫瘍細胞型において過剰発現するかまたは突然変異した受容体チロシンキナーゼであり、腫瘍細胞の増殖、生存、浸潤、転移、および腫瘍血管新生において鍵となる役割を果たす。c-METの阻害は、c-METタンパク質を過剰発現するかまたは構造的に活性化されたc-METタンパク質を発現する腫瘍細胞における細胞死を誘導する場合がある。一部の実施形態では、c-MET阻害剤は、カプマチニブ(INC280)、JNJ-3887605、AMG337、LY2801653、MSC2156119J、クリゾチニブ、チバンチニブ、またはゴルバチニブから選択される。
ある特定の実施形態では、本明細書において記載される組合せは、形質転換増殖因子ベータ(TGF-β TGFβ、TGFb、またはTGF-ベータとしても既知であり、本明細書において区別せずに使用される)阻害剤を含む。一部の実施形態では、TGF-β阻害剤は、フレソリムマブまたはXOMA089から選択される。
ある特定の実施形態では、本明細書において記載される組合せは、アデノシンA2a受容体(A2aR)アンタゴニスト(例えば、A2aR経路阻害剤、例えば、アデノシン阻害剤、例えば、A2aRまたはCD-73阻害剤)を含む。一部の実施形態では、A2aRアンタゴニストは、PD-1阻害剤と、CXCR2阻害剤、CSF-1/1R結合剤、LAG-3阻害剤、GITRアゴニスト、c-MET阻害剤、またはIDO阻害剤のうちの1つまたは複数(例えば、2つ、3つ、4つ、5つ、または全て)とを組み合わせて使用される。一部の実施形態では、組合せは、膵臓がん、結腸直腸がん、胃がん、または黒色腫(例えば難治性黒色腫)を処置するために使用される。一部の実施形態では、A2aRアンタゴニストは、PBF509(NIR178)(Palobiofarma/Novartis)、CPI444/V81444(Corvus/Genentech)、AZD4635/HTL-1071(AstraZeneca/Heptares)、ビパデナント(Redox/Juno)、GBV-2034(Globavir)、AB928(Arcus Biosciences)、テオフィリン、イストラデフィリン(Kyowa Hakko Kogyo)、トザデナント/SYN-115(Acorda)、KW-6356(Kyowa Hakko Kogyo)、ST-4206(Leadiant Biosciences)、またはプレラデナント/SCH 420814(Merck/Schering)から選択される。理論に束縛されることを望むものではないが、一部の実施形態では、A2aRの阻害はIL-1bの上方調節につながると考えられる。
ある特定の実施形態では、本明細書において記載される組合せは、インドールアミン2,3-ジオキシゲナーゼ(IDO)および/またはトリプトファン2,3-ジオキシゲナーゼ(TDO)の阻害剤を含む。一部の実施形態では、IDO阻害剤は、PD-1阻害剤および、TGF-β阻害剤、A2aRアンタゴニスト、CSF-1/1R結合剤、c-MET阻害剤、またはGITRアゴニストのうちの1つまたは複数(例えば、2つ、3つ、4つ、または全て)と組み合わせて使用される。一部の実施形態では、組合せは、膵臓がん、結腸直腸がん、胃がん、または黒色腫(例えば難治性黒色腫)を処置するために使用される。一部の実施形態では、IDO阻害剤は、(4E)-4-[(3-クロロ-4-フルオロアニリノ)-ニトロソメチリデン]-1,2,5-オキサジアゾール-3-アミン(エパカドスタットまたはINCB24360としても既知である)、インドキシモド(NLG8189)、(1-メチル-D-トリプトファン)、α-シクロヘキシル-5H-イミダゾ[5,1-a]イソインドール-5-エタノール(NLG919としても既知である)、インドキシモド、BMS-986205(以前のF001287)から選択される。
ある特定の実施形態では、本明細書において記載される組合せは、ガレクチン、例えば、ガレクチン-1またはガレクチン-3の阻害剤を含む。一部の実施形態では、組合せは、ガレクチン-1阻害剤およびガレクチン-3阻害剤を含む。一部の実施形態では、組合せは、ガレクチン-1とガレクチン-3の両方を標的とする二重特異性阻害剤(例えば二特異性抗体分子)を含む。一部の実施形態では、ガレクチン阻害剤は、本明細書において記載される1つまたは複数の治療剤と組み合わせて使用される。一部の実施形態では、ガレクチン阻害剤は、抗ガレクチン抗体分子、GR-MD-02(Galectin Therapeutics)、ガレクチン-3C(Mandal Med)、Anginex、またはOTX-008(OncoEthix、Merck)から選択される。
一部の実施形態では、本明細書において記載される組合せはMEK阻害剤を含む。一部の実施形態では、MEK阻害剤は、トラメチニブ、セルメチニブ、AS703026、BIX02189、BIX02188、CI-1040、PD0325901、PD98059、U0126、XL-518、G-38963、またはG02443714から選択される。一部の実施形態では、MEK阻害剤はトラメチニブである。
一実施形態では、本明細書において記載される組合せはインターロイキン-1ベータ(IL-1β)阻害剤を含む。一部の実施形態では、IL-1β阻害剤は、カナキヌマブ、ゲボキズマブ、Anakinra、またはRilonaceptから選択される。
ある特定の実施形態では、本明細書において記載される組合せはIL-15/IL-15Ra複合体を含む。一部の実施形態では、IL-15/IL-15Ra複合体は、NIZ985(Novartis)、ATL-803(Altor)またはCYP0150(Cytune)から選択される。
ある特定の実施形態では、本明細書において記載される組合せは、マウスダブルミニッツ2相同体(MDM2)阻害剤を含む。MDM2のヒト相同体はHDM2としても既知である。一部の実施形態では、本明細書において記載されるMDM2阻害剤はHDM2阻害剤としても既知である。一部の実施形態では、MDM2阻害剤は、HDM201またはCGM097から選択される。
実施形態では、MDM2阻害剤は、障害、例えば、本明細書において記載される障害を処置するための、(S)-1-(4-クロロフェニル)-7-イソプロポキシ-6-メトキシ-2-(4-(メチル(((1r,4S)-4-(4-メチル-3-オキソピペラジン-1-イル)シクロヘキシル)メチル)アミノ)フェニル)-1,2-ジヒドロイソキノリン-3(4H)-オン(CGM097としても既知である)または国際公開第2011/076786号パンフレットで開示される化合物を含む。一実施形態では、本明細書において開示される治療剤はCGM097と組み合わせて使用される。
一部の実施形態では、本明細書において記載される組合せはメチル化阻害剤(HMA)を含む。一部の実施形態では、HMAは、デシタビンまたはアザシチジンから選択される。
ある特定の実施形態では、本明細書において記載される組合せは、Bcl2ファミリーの生存促進タンパク質のいずれにも作用する阻害剤を含む。ある特定の実施形態では、本明細書において記載される組合せはBcl-2阻害剤を含む。一部の実施形態では、Bcl-2阻害剤はベネトクラックス
Figure 2022532918000233
である。
一実施形態では、Bcl-2阻害剤は、国際公開第2013/110890号パンフレットおよび国際公開第2015/011400号パンフレットに記載されている化合物から選択される。一部の実施形態では、Bcl-2阻害剤は、ナビトクラックス(ABT-263)、ABT-737、BP1002、SPC2996、APG-1252、メシル酸オバトクラクス(GX15-070MS)、PNT2258、Zn-d5、BGB-11417、またはオブリメルセン(G3139)を含む。一部の実施形態では、Bcl-2阻害剤は、N-(4-ヒドロキシフェニル)-3-[6-[(3S)-3-(モルホリノメチル)-3,4-ジヒドロ-1H-イソキノリン-2-カルボニル]-1,3-ベンゾジオキソール-5-イル]-N-フェニル-5,6,7,8-テトラヒドロインドリジン-1-カルボキサミド、化合物A1:
Figure 2022532918000234
である。
一部の実施形態では、Bcl-2阻害剤は、(S)-5-(5-クロロ-2-(3-(モルホリノメチル)-1,2,3,4-テトラヒドロイソキノリン-2-カルボニル)フェニル)-N-(5-シアノ-1,2-ジメチル-1H-ピロール-3-イル)-N-(4-ヒドロキシフェニル)-1,2-ジメチル-1H-ピロール-3-カルボキサミド)、化合物A2:
Figure 2022532918000235
である。
一実施形態では、本明細書において開示される抗体-薬物コンジュゲートまたは組合せは、in vivoでのがんの処置に好適である。例えば、組合せは、癌性腫瘍の成長を阻害するために使用してもよい。組合せはまた、標準的なケアと処置(例えば、癌または感染性障害のための)、ワクチン(例えば、治療的がんワクチン)、細胞療法、放射線療法、外科手術、または本明細書における障害を処置するための任意の他の治療剤またはモダリティのうちの1つまたは複数と組み合わせて使用してもよい。例えば、免疫の抗原特異的強化を達成するために、組合せを、目的の抗原とともに投与してもよい。本明細書において開示される組合せは、順番または同時のいずれかで投与してもよい。
追加の実施形態
本開示は、リンカー-薬物基、抗体-薬物コンジュゲート、リンカー基、およびコンジュゲーションの方法に対する以下の追加の実施形態を提供する。
リンカー-薬物基
一部の実施形態では、本発明のリンカー-薬物基は、式(A’):
Figure 2022532918000236
(式中、
は反応基であり、
は架橋スペーサーであり、
Lpは二価ペプチドスペーサーであり、
G-L-Aは自壊性スペーサーであり、
は親水性部分であり、
は、結合、メチレン、ネオペンチレン、またはC~Cアルケニレンであり、
Aは、結合、-OC(=O)-
Figure 2022532918000237
、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-、または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、およびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
はスペーサー部分であり、
Dは、例えば本明細書に開示される抗体薬物コンジュゲートまたはイムノコンジュゲートから放出される場合のMCl-1タンパク質の活性を阻害することが可能である薬物部分である)
の構造を有する化合物、またはその薬学的に許容される塩であり得る。
本発明のリンカー-薬物基のある特定の態様および例は、以下の列挙された実施形態のリストにおいて示される。各実施形態で特定される特徴が、本発明のさらなる実施形態を提供する他の特異的な特徴と組み合わせることができることは認識されよう。
実施形態1.
が反応基であり、
が架橋スペーサーであり、
Lpが2~4個のアミノ酸残基を含む二価ペプチドスペーサーであり、
G-L-Aが自壊性スペーサーであり、
が親水性部分であり、
が、結合、メチレン、ネオペンチレン、またはC~Cアルケニレンであり、
Aが、結合、-OC(=O)-
Figure 2022532918000238
、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-、または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、およびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
がスペーサー部分であり、
Dが、本明細書に定義される薬物部分、例えばMCl-1阻害剤である、
式(A’)の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
実施形態2.
が反応基であり、
が架橋スペーサーであり、
Lpが2~4個のアミノ酸残基を含む二価ペプチドスペーサーであり、
Figure 2022532918000239
基が、
Figure 2022532918000240
から選択され、ここで、
Figure 2022532918000241
は、Dとの(例えば薬物部分のNまたはOとの)結合点を示し、
Figure 2022532918000242
***は、Lpとの結合点を示し、
が親水性部分であり、
が、結合、メチレン、ネオペンチレン、またはC~Cアルケニレンであり、
Aが、結合、-OC(=O)-
Figure 2022532918000243
、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-、または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、およびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
がスペーサー部分であり、
Dが、本明細書に定義される薬物部分、例えばMCl-1阻害剤である、
式(A’)の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
実施形態3.式(B’):
Figure 2022532918000244
(式中、
は反応基であり、
は架橋スペーサーであり、
Lpは2~4個のアミノ酸残基を含む二価ペプチドスペーサーであり、
は親水性部分であり、
Aは、結合、-OC(=O)-
Figure 2022532918000245
、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-、または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、およびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
はスペーサー部分であり、
Dは、本明細書に定義され、NまたはOを含む薬物部分であり、ここで、Dは、薬物部分のAからNまたはOとの直接結合を介してAに接続している)
の構造を有する、式(A’)の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
実施形態4.
が、
Figure 2022532918000246
、-ONH、-NH
Figure 2022532918000247
、-N
Figure 2022532918000248
、-SH、-SR、-SSR、-S(=O)(CH=CH)、-(CHS(=O)(CH=CH)、-NHS(=O)(CH=CH)、-NHC(=O)CHBr、-NHC(=O)CHI、
Figure 2022532918000249
、-C(O)NHNH
Figure 2022532918000250
Figure 2022532918000251
であり、
が、-C(=O)(CHO(CH**
-C(=O)((CHO)(CH**
-C(=O)(CH**
-C(=O)NH((CHO)(CH**
-C(=O)O(CHSSC(R(CHC(=O)NR(CHNRC(=O)(CH**
-C(=O)O(CHC(=O)NH(CH**
-C(=O)(CHNH(CH**-C(=O)(CHNH(CHC(=O)-**
-C(=O)(CH(CH**-C(=O)((CHO)(CH(CH**
-C(=O)(CHNHC(=O)(CH**
-C(=O)((CHO)(CHNHC(=O)(CH**
-C(=O)(CHNHC(=O)(CH(CH**
-C(=O)((CHO)(CHNHC(=O)(CH(CH**
-C(=O)((CHO)(CHC(=O)NH(CH**
-C(=O)(CHC(R**;または
-C(=O)(CHC(=O)NH(CH**であり、
が、Lpとの結合点を示し、L**が、Rとの結合点を示し、
が、ポリエチレングリコール、ポリアルキレングリコール、糖、オリゴ糖、ポリペプチド、または1~3個の
Figure 2022532918000252
基で置換されたC~Cアルキルから選択される親水性部分であり、
各Rが、HおよびC~Cアルキルから独立して選択され、
が、2-ピリジルまたは4-ピリジルであり、
各Rが、H、C~Cアルキル、F、Cl、および-OHから独立して選択され、
各Rが、H、C~Cアルキル、F、Cl、-NH、-OCH、-OCHCH、-N(CH、-CN、-NO、および-OHから独立して選択され、
各Rが、H、C1~6アルキル、フルオロ、-C(=O)OHで置換されたベンジルオキシ、-C(=O)OHで置換されたベンジル、-C(=O)OHで置換されたC1~4アルコキシ、および-C(=O)OHで置換されたC1~4アルキルから独立して選択され、
が、
Figure 2022532918000253
であり、
各mが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、および10から独立して選択され、
各nが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、および10から独立して選択され、
各tが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、および30から独立して選択され、
Lpが、グリシン、バリン、シトルリン、リシン、イソロイシン、フェニルアラニン、メチオニン、アスパラギン、プロリン、アラニン、ロイシン、トリプトファン、およびチロシンから選択されるアミノ酸残基を含む二価ペプチドスペーサーであり、
Aが、結合、-OC(=O)-
Figure 2022532918000254
、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-、または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、およびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
が、構造
Figure 2022532918000255
を有するスペーサー部分であり、
ここで、
Wは、-CHO-**、-CHN(R)C(=O)O-**、-NHC(=O)C(RNHC(=O)O-**
-NHC(=O)C(RNH-**、-NHC(=O)C(RNHC(=O)-**
-CHN(X-R)C(=O)O-**、-C(=O)N(X-R)-**、-CHN(X-R)C(=O)-**
-C(=O)NR**、-C(=O)NH-**、-CHNRC(=O)-**、-CHNRC(=O)NH-**、-CHNRC(=O)NR**、-NHC(=O)-**、-NHC(=O)O-**、-NHC(=O)NH-**、-OC(=O)NH-**、-S(O)NH-**、-NHS(O)**、-C(=O)-、-C(=O)O-**または
-NH-であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、またはC~Cシクロアルキルから独立して選択され、ここで、Wの**は、Xとの結合点を示し、
Xは、結合、トリアゾリル、または***-CH-トリアゾリル-であり、ここで、Xの***は、Wとの結合点を示し、Xのは、Rとの結合点を示し、
は、Rとの結合点を示し、
Dが、本明細書に定義され、NまたはOを含む薬物部分であり、ここで、Dは、薬物部分のAからNまたはOとの直接結合を介してAに接続している、
式(A’)もしくは実施形態1から3のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
実施形態5.
が、
Figure 2022532918000256
、-ONH
Figure 2022532918000257
であり、
が、-C(=O)(CHO(CH**-C(=O)((CHO)(CH**-C(=O)(CH**、または-C(=O)NH((CHO)(CH-であり、Lは、Lpとの結合点を示し、L**は、Rとの結合点を示し、
各mが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、および10から独立して選択され、
各nが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、および10から独立して選択され、
各tが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、および30から独立して選択され、
Lpが、
Figure 2022532918000258
から選択される二価ペプチドスペーサーであり、Lpのが、Lとの結合点を示し、Lpの**が、Gの-NH-基との結合点を示し、
が、構造
Figure 2022532918000259
を有するスペーサー部分であり、
ここで、
Wは、-CHO-**、-CHN(R)C(=O)O-**、-NHC(=O)CHNHC(=O)O-**
-NHC(=O)CHNH-**、-NHC(=O)CHNHC(=O)-**、-CHN(X-R)C(=O)O-**、-C(=O)N(X-R)-**、-CHN(X-R)C(=O)-**
-C(=O)NR**、-C(=O)NH-**、-CHNRC(=O)-**、-CHNRC(=O)NH-**、-CHNRC(=O)NR**、-NHC(=O)-**、-NHC(=O)O-**、-NHC(=O)NH-**、-OC(=O)NH-**、-S(O)NH-**、-NHS(O)**、-C(=O)-、-C(=O)O-**または
-NH-であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、またはC~Cシクロアルキルから独立して選択され、ここで、Wの**は、Xとの結合点を示し、
Xは、結合、トリアゾリル、または***-CH-トリアゾリル-であり、ここで、Xの***は、Wとの結合点を示し、Xのは、Rとの結合点を示し、
は、Rとの結合点を示し、
が、ポリエチレングリコール、ポリアルキレングリコール、糖、オリゴ糖、ポリペプチド、または1~3個の
Figure 2022532918000260
基で置換されたC~Cアルキルから選択される親水性部分であり、
Aが、結合、-OC(=O)-
Figure 2022532918000261
、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-、または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、およびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
Dが、本明細書に定義され、NまたはOを含む薬物部分であり、ここで、Dは、薬物部分のAからNまたはOとの直接結合を介してAに接続している、
式(A’)もしくは実施形態1から4のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
実施形態6.
Figure 2022532918000262
であり、
が、-C(=O)(CHO(CH**-C(=O)((CHO)(CH**-C(=O)(CH**、または-C(=O)NH((CHO)(CH-であり、Lが、Lpとの結合点を示し、L**が、Rとの結合点を示し、
各mが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、および10から独立して選択され、
各nが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、および10から独立して選択され、
各tが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、および30から独立して選択され、
Lpが、
Figure 2022532918000263
から選択される二価ペプチドスペーサーであり、Lpのが、Lとの結合点を示し、Lpの**が、Gの-NH-基との結合点を示し、
が、構造
Figure 2022532918000264
を有するスペーサー部分であり、
ここで、
Wは、-CHO-**、-CHN(R)C(=O)O-**、-NHC(=O)CHNHC(=O)O-**
-CHN(X-R)C(=O)O-**、-C(=O)N(X-R)-**、-CHN(X-R)C(=O)-**、-C(=O)NR**、-C(=O)NH-**、-CHNRC(=O)-**、-CHNRC(=O)NH-**、-CHNRC(=O)NR**、-NHC(=O)-**、-NHC(=O)O-**、-NHC(=O)NH-**、-OC(=O)NH-**、-S(O)NH-**、-NHS(O)**、-C(=O)-、-C(=O)O-**または
-NH-であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、またはC~Cシクロアルキルから独立して選択され、ここで、Wの**は、Xとの結合点を示し、
Xは、結合、トリアゾリル、または***-CH-トリアゾリル-であり、ここで、Xの***は、Wとの結合点を示し、Xのは、Rとの結合点を示し、
は、Rとの結合点を示し、
が、ポリエチレングリコール、ポリアルキレングリコール、糖、オリゴ糖、ポリペプチド、または1~3個の
Figure 2022532918000265
基で置換されたC~Cアルキルから選択される親水性部分であり、
Aが、結合、-OC(=O)-
Figure 2022532918000266
、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-、または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、およびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
Dが、本明細書に定義され、NまたはOを含む薬物部分であり、ここで、Dは、薬物部分のAからNまたはOとの直接結合を介してAに接続している、
式(A’)もしくは実施形態1から5のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
実施形態7.
が、
Figure 2022532918000267
であり、
が、-C(=O)(CHO(CH**-C(=O)((CHO)(CH**-C(=O)(CH**、または-C(=O)NH((CHO)(CH-であり、Lが、Lpとの結合点を示し、L**が、Rとの結合点を示し、
各mが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、および10から独立して選択され、
各nが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、および10から独立して選択され、
各tが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、および30から独立して選択され、
Lpが、
Figure 2022532918000268
から選択される二価ペプチドスペーサーであり、Lpのが、Lとの結合点を示し、Lpの**が、Gの-NH-基との結合点を示し、
が、構造
Figure 2022532918000269
を有するスペーサー部分であり、
ここで、
Wが、-CHO-**、-CHN(R)C(=O)O-**、-NHC(=O)CHNHC(=O)O-**
-CHN(X-R)C(=O)O-**、-C(=O)N(X-R)-**、-C(=O)NR**、-C(=O)NH-**、-CHNRC(=O)-**、-CHNRC(=O)NH-**、-CHNRC(=O)NR**
-NHC(=O)-**、-NHC(=O)O-**、または-NHC(=O)NH-**であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、またはC~Cシクロアルキルから独立して選択され、ここで、Wの**は、Xとの結合点を示し、
Xは、結合、トリアゾリル、または***-CH-トリアゾリル-であり、ここで、Xの***は、Wとの結合点を示し、Xのは、Rとの結合点を示し、
は、Rとの結合点を示し、
が、ポリエチレングリコール、ポリアルキレングリコール、糖、オリゴ糖、ポリペプチド、または1~3個の
Figure 2022532918000270
基で置換されたC~Cアルキルから選択される親水性部分であり、
Aが、結合または-OC(=O)であり、が、Dとの結合点を示し、
Dが、本明細書に定義され、NまたはOを含む薬物部分であり、ここで、Dは、薬物部分のAからNまたはOとの直接結合を介してAに接続している、
式(A’)もしくは実施形態1から6のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
実施形態8.
が、
Figure 2022532918000271
であり、
が、-C(=O)(CHO(CH**-C(=O)((CHO)(CH**-C(=O)(CH**、または-C(=O)NH((CHO)(CH-であり、Lが、Lpとの結合点を示し、L**が、Rとの結合点を示し、
各mが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、および10から独立して選択され、
各nが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、および10から独立して選択され、
各tが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、および30から独立して選択され、
Lpが、
Figure 2022532918000272
から選択される二価ペプチドスペーサーであり、Lpのが、Lとの結合点を示し、Lpの**が、Gの-NH-基との結合点を示し、
が、構造
Figure 2022532918000273
を有するスペーサー部分であり、
ここで、
Wは、-CHO-**、-CHN(R)C(=O)O-**、-NHC(=O)CHNHC(=O)O-**、-CHN(X-R)C(=O)O-**、または-C(=O)N(X-R)-**であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、またはC~Cシクロアルキルから独立して選択され、ここで、Wの**は、Xとの結合点を示し、
Xは、***-CH-トリアゾリル-であり、ここで、Xの***は、Wとの結合点を示し、Xのは、Rとの結合点を示し、
は、Rとの結合点を示し、
が、ポリエチレングリコール、ポリアルキレングリコール、糖、オリゴ糖、ポリペプチド、または1~3個の
Figure 2022532918000274
基で置換されたC~Cアルキルから選択される親水性部分であり、
Aが、結合または-OC(=O)であり、が、Dとの結合点を示し、
Dが、本明細書に定義され、NまたはOを含む薬物部分であり、ここで、Dは、薬物部分のAからNまたはOとの直接結合を介してAに接続している、
式(A’)もしくは実施形態1から7のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
実施形態9.Rが、表8から選択される反応基である、式(A’)もしくは実施形態1から8のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
実施形態10.
が、
Figure 2022532918000275
、-ONH、-NH
Figure 2022532918000276
、-N
Figure 2022532918000277
、-SH、-SR、-SSR、-S(=O)(CH=CH)、-(CHS(=O)(CH=CH)、-NHS(=O)(CH=CH)、-NHC(=O)CHBr、-NHC(=O)CHI、
Figure 2022532918000278
、-C(O)NHNH
Figure 2022532918000279
である、
式(A’)もしくは実施形態1から9のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
実施形態11.
が、
Figure 2022532918000280
、-ONH、-NH
Figure 2022532918000281
、-N
Figure 2022532918000282
、-SH、-SR、-SSR、-S(=O)(CH=CH)、-(CHS(=O)(CH=CH)、-NHS(=O)(CH=CH)、-NHC(=O)CHBr、-NHC(=O)CHI、
Figure 2022532918000283
、-C(O)NHNH
Figure 2022532918000284
である、
式(A’)もしくは実施形態1から9のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
実施形態12.
が、
Figure 2022532918000285
、-ONH
Figure 2022532918000286
である、
式(A’)もしくは実施形態1から9のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
実施形態13.
が、
Figure 2022532918000287
、-ONH
Figure 2022532918000288
である、
式(A’)もしくは実施形態1から9のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
実施形態14.Rが、
Figure 2022532918000289
である、式(A’)もしくは実施形態1から9のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
実施形態15.Rが、-ONHである、式(A’)もしくは実施形態1から9のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
実施形態16.Rが、
Figure 2022532918000290
である、式(A’)もしくは実施形態1から9のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
実施形態17.
が、
Figure 2022532918000291
である、
式(A’)もしくは実施形態1から9のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
実施形態18.構造:
Figure 2022532918000292
(式中、Rは、H、-CH、または-CHCHC(=O)OHである)
を有する、式(A’)もしくは実施形態1から9のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
実施形態19.構造:
Figure 2022532918000293
(式中、Rは、H、-CH、または-CHCHC(=O)OHである)
を有する、式(A’)もしくは実施形態1から9のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
実施形態20.構造:
Figure 2022532918000294
(式中、Rは、H、-CH、または-CHCHC(=O)OHである)
を有する、式(A’)もしくは実施形態1から9のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
実施形態21.構造:
Figure 2022532918000295
(式中、各Rは、H、-CH、または-CHCHC(=O)OHから独立して選択される)
を有する、式(A’)もしくは実施形態1から9のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
実施形態22.構造:
Figure 2022532918000296
(式中、各Rは、H、-CH、または-CHCHC(=O)OHから独立して選択される)
を有する、式(A’)もしくは実施形態1から9のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
実施形態23.構造:
Figure 2022532918000297
(式中、Xaは、-CH-、-OCH-、-NHCH-、または-NRCH-であり、各Rは、独立して、H、-CH、または-CHCHC(=O)OHである)
を有する、式(A’)もしくは実施形態1から9のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
実施形態24.構造:
Figure 2022532918000298
(式中、Rは、H、-CH、または-CHCHC(=O)OHである)
を有する、式(A’)もしくは実施形態1から9のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
実施形態25.構造:
Figure 2022532918000299
(式中、Xbは-CH-、-OCH-、-NHCH-、または-NRCH-であり、各Rは、独立して、H、-CH、または-CHCHC(=O)OHである)
を有する、式(A’)もしくは実施形態1から9のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
実施形態26.構造:
Figure 2022532918000300
を有する、式(A’)もしくは実施形態1から9のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
実施形態27.構造:
Figure 2022532918000301
を有する、式(A’)もしくは実施形態1から9のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
実施形態28.構造:
Figure 2022532918000302
を有する、式(A’)もしくは実施形態1から9のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
実施形態29.構造:
Figure 2022532918000303
を有する、式(A’)もしくは実施形態1から9のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
実施形態30.構造:
Figure 2022532918000304
を有する、式(A’)もしくは実施形態1から9のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
実施形態31.表Aにおける化合物の構造を有する、式(A’)もしくは実施形態1から9のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩。
実施形態32.式(C’)
Figure 2022532918000305
(式中、
は架橋スペーサーであり、
Lpは二価ペプチドスペーサーであり、
G-L-Aは自壊性スペーサーであり、
は親水性部分であり、
は、結合、メチレン、ネオペンチレン、またはC~Cアルケニレンであり、
Aは、結合、-OC(=O)-
Figure 2022532918000306
、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-、または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、およびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
はスペーサー部分である)
の構造を有する、式(A’)のリンカー-薬物基のリンカー。
実施形態33.
が架橋スペーサーであり、
Lpが2~4個のアミノ酸残基を含む二価ペプチドスペーサーであり、
G-L-Aが自壊性スペーサーであり、
が親水性部分であり、
が、結合、メチレン、ネオペンチレン、またはC~Cアルケニレンであり、
Aが、結合、-OC(=O)-
Figure 2022532918000307
、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-、または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、およびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
がスペーサー部分である、
実施形態32に記載のリンカー。
実施形態34.
が架橋スペーサーであり、
Lpが2~4個のアミノ酸残基を含む二価ペプチドスペーサーであり、
Figure 2022532918000308
基が、
Figure 2022532918000309
から選択され、ここで、
Figure 2022532918000310
は、Dとの(例えば薬物部分のNまたはOとの)結合点を示し、
Figure 2022532918000311
***は、Lpとの結合点を示し、
が親水性部分であり、
が、結合、メチレン、ネオペンチレン、またはC~Cアルケニレンであり、
Aが、結合、-OC(=O)-
Figure 2022532918000312
、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-、または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、およびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
がスペーサー部分である、
実施形態32または33に記載のリンカー。
実施形態35.
が、-C(=O)(CHO(CH**-C(=O)((CHO)(CH**-C(=O)(CH**
-C(=O)NH((CHO)(CH**
-C(=O)O(CHSSC(R(CHC(=O)NR(CHNRC(=O)(CH**
-C(=O)O(CHC(=O)NH(CH**-C(=O)(CHNH(CH**
-C(=O)(CHNH(CHC(=O)-**-C(=O)(CH(CH**
-C(=O)((CHO)(CH(CH**-C(=O)(CHNHC(=O)(CH**
-C(=O)((CHO)(CHNHC(=O)(CH**
-C(=O)(CHNHC(=O)(CH(CH**
-C(=O)((CHO)(CHNHC(=O)(CH(CH**
-C(=O)((CHO)(CHC(=O)NH(CH**
-C(=O)(CHC(R**または-C(=O)(CHC(=O)NH(CH**であり、Lが、Lpとの結合点を示し、
が、ポリエチレングリコール、ポリアルキレングリコール、糖、オリゴ糖、ポリペプチド、または1~3個の
Figure 2022532918000313
基で置換されたC~Cアルキルから選択される親水性部分であり、
各Rが、HおよびC~Cアルキルから独立して選択され、
が、
Figure 2022532918000314
であり、
各mが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、および10から独立して選択され、
各nが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、および10から独立して選択され、
各tが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、および30から独立して選択され、
Lpが、グリシン、バリン、シトルリン、リシン、イソロイシン、フェニルアラニン、メチオニン、アスパラギン、プロリン、アラニン、ロイシン、トリプトファン、およびチロシンから選択されるアミノ酸残基を含む二価ペプチドスペーサーであり、
Aが、結合、-OC(=O)-
Figure 2022532918000315
、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-、または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、およびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
が、構造
Figure 2022532918000316
を有するスペーサー部分であり、
ここで、
Wは、-CHO-**、-CHN(R)C(=O)O-**、-NHC(=O)C(RNHC(=O)O-**
-NHC(=O)C(RNH-**、-NHC(=O)C(RNHC(=O)-**、-CHN(X-R)C(=O)O-**、-C(=O)N(X-R)-**、-CHN(X-R)C(=O)-**
-C(=O)NR**、-C(=O)NH-**、-CHNRC(=O)-**、-CHNRC(=O)NH-**、-CHNRC(=O)NR**、-NHC(=O)-**、-NHC(=O)O-**、-NHC(=O)NH-**、-OC(=O)NH-**、-S(O)NH-**、-NHS(O)**、-C(=O)-、-C(=O)O-**または
-NH-であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、またはC~Cシクロアルキルから独立して選択され、ここで、Wの**は、Xとの結合点を示し、
Xは、結合、トリアゾリル、または***-CH-トリアゾリル-であり、ここで、Xの***は、Wとの結合点を示し、Xのは、Rとの結合点を示し、
は、Rとの結合点を示す、
実施形態32から34のいずれか一項に記載のリンカー。
実施形態36.
が、-C(=O)(CHO(CH**-C(=O)((CHO)(CH**-C(=O)(CH**、または-C(=O)NH((CHO)(CH-であり、Lが、Lpとの結合点を示し、
各mが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、および10から独立して選択され、
各nが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、および10から独立して選択され、
各tが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、および30から独立して選択され、
Lpが、
Figure 2022532918000317
から選択される二価ペプチドスペーサーであり、Lpのが、Lとの結合点を示し、
が、構造
Figure 2022532918000318
を有するスペーサー部分であり、
ここで、
Wは、-CHO-**、-CHN(R)C(=O)O-**、-NHC(=O)CHNHC(=O)O-**
-NHC(=O)CHNH-**、-NHC(=O)CHNHC(=O)-**、-CHN(X-R)C(=O)O-**、-C(=O)N(X-R)-**、-CHN(X-R)C(=O)-**
-C(=O)NR**、-C(=O)NH-**、-CHNRC(=O)-**、-CHNRC(=O)NH-**、-CHNRC(=O)NR**、-NHC(=O)-**、-NHC(=O)O-**、-NHC(=O)NH-**、-OC(=O)NH-**、-S(O)NH-**、-NHS(O)**、-C(=O)-、-C(=O)O-**または-NH-であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、またはC~Cシクロアルキルから独立して選択され、ここで、Wの**は、Xとの結合点を示し、
Xは、結合、トリアゾリル、または***-CH-トリアゾリル-であり、ここで、Xの***は、Wとの結合点を示し、Xのは、Rとの結合点を示し、
は、Rとの結合点を示し、
が、ポリエチレングリコール、ポリアルキレングリコール、糖、オリゴ糖、ポリペプチド、または1~3個の
Figure 2022532918000319
基で置換されたC~Cアルキルから選択される親水性部分であり、
Aが、結合、-OC(=O)-
Figure 2022532918000320
、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-、または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、およびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示す、
実施形態32から35のいずれか一項に記載のリンカー。
実施形態37.
が、-C(=O)(CHO(CH**-C(=O)((CHO)(CH**-C(=O)(CH**、または-C(=O)NH((CHO)(CH-であり、Lが、Lpとの結合点を示し、
各mが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、および10から独立して選択され、
各nが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、および10から独立して選択され、
各tが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、および30から独立して選択され、
Lpが、
Figure 2022532918000321
から選択される二価ペプチドスペーサーであり、Lpのが、Lとの結合点を示し、Lpの**が、Gの-NH-基との結合点を示し、
が、構造
Figure 2022532918000322
を有するスペーサー部分であり、
ここで、
Wは、-CHO-**、-CH2N(Rb)C(=O)O-**、-NHC(=O)CHNHC(=O)O-**、-CHN(X-R)C(=O)O-**、-C(=O)N(X-R)-**、-CHN(X-R)C(=O)-**、-C(=O)NR**、-C(=O)NH-**、-CHNRC(=O)-**、-CHNRC(=O)NH-**、-CHNRC(=O)NR**、-NHC(=O)-**、-NHC(=O)O-**、-NHC(=O)NH-**、-OC(=O)NH-**、-S(O)NH-**、-NHS(O)**、-C(=O)-、-C(=O)O-**または
-NH-であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、またはC~Cシクロアルキルから独立して選択され、ここで、Wの**は、Xとの結合点を示し、
Xは、結合、トリアゾリル、または***-CH-トリアゾリル-であり、ここで、Xの***は、Wとの結合点を示し、Xのは、Rとの結合点を示し、
は、Rとの結合点を示し、
が、ポリエチレングリコール、ポリアルキレングリコール、糖、オリゴ糖、ポリペプチド、または1~3個の
Figure 2022532918000323
基で置換されたC~Cアルキルから選択される親水性部分であり、
Aが、結合、-OC(=O)-
Figure 2022532918000324
、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-、または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、およびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示す、
実施形態32から36のいずれか一項に記載のリンカー。
実施形態38.
が、-C(=O)(CHO(CH**-C(=O)((CHO)(CH**-C(=O)(CH**、または-C(=O)NH((CHO)(CH-であり、Lが、Lpとの結合点を示し、
各mが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、および10から独立して選択され、
各nが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、および10から独立して選択され、
各tが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、および30から独立して選択され、
Lpが、
Figure 2022532918000325
から選択される二価ペプチドスペーサーであり、Lpのが、Lとの結合点を示し、
が、構造
Figure 2022532918000326
を有するスペーサー部分であり、
ここで、
Wは、-CHO-**、-CH2N(Rb)C(=O)O-**、-NHC(=O)CHNHC(=O)O-**、-CHN(X-R)C(=O)O-**、-C(=O)N(X-R)-**、-C(=O)NR**、-C(=O)NH-**、-CHNRC(=O)-**、-CHNRC(=O)NH-**、-CHNRC(=O)NR**
-NHC(=O)-**、-NHC(=O)O-**、または-NHC(=O)NH-**であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、またはC~Cシクロアルキルから独立して選択され、ここで、Wの**は、Xとの結合点を示し、
Xは、結合、トリアゾリル、または***-CH-トリアゾリル-であり、ここで、Xの***は、Wとの結合点を示し、Xのは、Rとの結合点を示し、
は、Rとの結合点を示し、
が、ポリエチレングリコール、ポリアルキレングリコール、糖、オリゴ糖、ポリペプチド、または1~3個の
Figure 2022532918000327
基で置換されたC~Cアルキルから選択される親水性部分であり、
Aが、結合または-OC(=O)であり、が、Dとの結合点を示す、
実施形態32から37のいずれか一項に記載のリンカー。
実施形態39.
が、-C(=O)(CHO(CH**-C(=O)((CHO)(CH**-C(=O)(CH**、または-C(=O)NH((CHO)(CH-であり、Lが、Lpとの結合点を示し、
各mが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、および10から独立して選択され、
各nが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、および10から独立して選択され、
各tが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、および30から独立して選択され、
Lpが、
Figure 2022532918000328
から選択される二価ペプチドスペーサーであり、Lpのが、Lとの結合点を示し、
が、構造
Figure 2022532918000329
を有するスペーサー部分であり、
ここで、
Wは、-CHO-**、-CHN(R)C(=O)O-**、-NHC(=O)CHNHC(=O)O-**、-CHN(X-R)C(=O)O-**、または-C(=O)N(X-R)-**であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、またはC~Cシクロアルキルから独立して選択され、ここで、Wの**は、Xとの結合点を示し、
Xは、***-CH-トリアゾリル-であり、ここで、Xの***は、Wとの結合点を示し、Xのは、Rとの結合点を示し、
は、Rとの結合点を示し、
が、ポリエチレングリコール、ポリアルキレングリコール、糖、オリゴ糖、ポリペプチド、または1~3個の
Figure 2022532918000330
基で置換されたC~Cアルキルから選択される親水性部分であり、
Aが、結合または-OC(=O)であり、が、Dとの結合点を示す、
実施形態32から38のいずれか一項に記載のリンカー。
実施形態40.式(D’)
Figure 2022532918000331
(式中、
は架橋スペーサーであり、
Lpは二価ペプチドスペーサーであり、
は親水性部分であり、
Aは、結合、-OC(=O)-
Figure 2022532918000332
、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-、または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、およびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
はスペーサー部分である)
の構造を有する構造を有する式(C’)のリンカー。
実施形態41.
が架橋スペーサーであり、
Lpが2~4個のアミノ酸残基を含む二価ペプチドスペーサーであり、
が親水性部分であり、
Aが、結合、-OC(=O)-
Figure 2022532918000333
、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-、または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、およびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
がスペーサー部分である、
実施形態40に記載のリンカー。
実施形態42.
が、-C(=O)(CHO(CH**-C(=O)((CHO)(CH**-C(=O)(CH**
-C(=O)NH((CHO)(CH**
-C(=O)O(CHSSC(R(CHC(=O)NR(CHNRC(=O)(CH**
-C(=O)O(CHC(=O)NH(CH**-C(=O)(CHNH(CH**
-C(=O)(CHNH(CHC(=O)-**-C(=O)(CH(CH**
-C(=O)((CHO)(CH(CH**-C(=O)(CHNHC(=O)(CH**
-C(=O)((CHO)(CHNHC(=O)(CH**
-C(=O)(CHNHC(=O)(CH(CH**
-C(=O)((CHO)(CHNHC(=O)(CH(CH**
-C(=O)((CHO)(CHC(=O)NH(CH**-C(=O)(CHC(R**または
-C(=O)(CHC(=O)NH(CH**であり、Lが、Lpとの結合点を示し、
が、ポリエチレングリコール、ポリアルキレングリコール、糖、オリゴ糖、ポリペプチド、または1~3個の
Figure 2022532918000334
基で置換されたC~Cアルキルから選択される親水性部分であり、
各Rが、HおよびC~Cアルキルから独立して選択され、
が、
Figure 2022532918000335
であり、
各mが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、および10から独立して選択され、
各nが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、および10から独立して選択され、
各tが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、および30から独立して選択され、
Lpが、グリシン、バリン、シトルリン、リシン、イソロイシン、フェニルアラニン、メチオニン、アスパラギン、プロリン、アラニン、ロイシン、トリプトファン、およびチロシンから選択されるアミノ酸残基を含む二価ペプチドスペーサーであり、
Aが、結合、-OC(=O)-
Figure 2022532918000336
、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-、または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、およびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
が、構造
Figure 2022532918000337
を有するスペーサー部分であり、
ここで、
Wは、-CHO-**、-CH2N(Rb)C(=O)O-**、-NHC(=O)CHNHC(=O)O-**、-CHN(X-R)C(=O)O-**、-C(=O)N(X-R)-**、-CHN(X-R)C(=O)-**、-C(=O)NR**、-C(=O)NH-**、-CHNRC(=O)-**、-CHNRC(=O)NH-**、-CHNRC(=O)NR**、-NHC(=O)-**、-NHC(=O)O-**、-NHC(=O)NH-**、-OC(=O)NH-**、-S(O)NH-**、-NHS(O)**、-C(=O)-、-C(=O)O-**または
-NH-であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、またはC~Cシクロアルキルから独立して選択され、ここで、Wの**は、Xとの結合点を示し、
Xは、結合、トリアゾリル、または***-CH-トリアゾリル-であり、ここで、Xの***は、Wとの結合点を示し、Xのは、Rとの結合点を示し、
は、Rとの結合点を示す、
実施形態40または41に記載のリンカー。
実施形態43.
が、-C(=O)(CHO(CH**-C(=O)((CHO)(CH**-C(=O)(CH**、または-C(=O)NH((CHO)(CH-であり、Lが、Lpとの結合点を示し、
各mが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、および10から独立して選択され、
各nが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、および10から独立して選択され、
各tが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、および30から独立して選択され、
Lpが、
Figure 2022532918000338
から選択される二価ペプチドスペーサーであり、Lpのが、Lとの結合点を示し、Lpの**が、Gの-NH-基との結合点を示し、
が、構造
Figure 2022532918000339
を有するスペーサー部分であり、
ここで、
Wは、-CHO-**、-CH2N(Rb)C(=O)O-**、-NHC(=O)CHNHC(=O)O-**、-CHN(X-R)C(=O)O-**、-C(=O)N(X-R)-**、-CHN(X-R)C(=O)-**、-C(=O)NR**、-C(=O)NH-**、-CHNRC(=O)-**、-CHNRC(=O)NH-**、-CHNRC(=O)NR**、-NHC(=O)-**、-NHC(=O)O-**、-NHC(=O)NH-**、-OC(=O)NH-**、-S(O)NH-**、-NHS(O)**、-C(=O)-、-C(=O)O-**または
-NH-であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、またはC~Cシクロアルキルから独立して選択され、ここで、Wの**は、Xとの結合点を示し、
Xは、結合、トリアゾリル、または***-CH-トリアゾリル-であり、ここで、Xの***は、Wとの結合点を示し、Xのは、Rとの結合点を示し、
は、Rとの結合点を示し、
が、ポリエチレングリコール、ポリアルキレングリコール、糖、オリゴ糖、ポリペプチド、または1~3個の
Figure 2022532918000340
基で置換されたC~Cアルキルから選択される親水性部分であり、
Aが、結合、-OC(=O)-
Figure 2022532918000341
、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-、または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、およびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示す、
実施形態40から42のいずれか一項に記載のリンカー。
実施形態44.
が、-C(=O)(CHO(CH**-C(=O)((CHO)(CH**-C(=O)(CH**、または-C(=O)NH((CHO)(CH-であり、Lが、Lpとの結合点を示し、
各mが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、および10から独立して選択され、
各nが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、および10から独立して選択され、
各tが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、および30から独立して選択され、
Lpが、
Figure 2022532918000342
から選択される二価ペプチドスペーサーであり、Lpのが、Lとの結合点を示し、Lpの**が、Gの-NH-基との結合点を示し、
が、構造
Figure 2022532918000343
を有するスペーサー部分であり、
ここで、
Wは、-CHO-**、-CHN(Rb)C(=O)O-**、-NHC(=O)CHNHC(=O)O-**、-CHN(X-R)C(=O)O-**、-C(=O)N(X-R)-**、-CHN(X-R)C(=O)-**、-C(=O)NR**、-C(=O)NH-**、-CHNRC(=O)-**、-CHNRC(=O)NH-**、-CHNRC(=O)NR**、-NHC(=O)-**、-NHC(=O)O-**、-NHC(=O)NH-**、-OC(=O)NH-**、-S(O)NH-**、-NHS(O)**、-C(=O)-、-C(=O)O-**または
-NH-であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、またはC~Cシクロアルキルから独立して選択され、ここで、Wの**は、Xとの結合点を示し、
Xは、結合、トリアゾリル、または***-CH-トリアゾリル-であり、ここで、Xの***は、Wとの結合点を示し、Xのは、Rとの結合点を示し、
は、Rとの結合点を示し、
が、ポリエチレングリコール、ポリアルキレングリコール、糖、オリゴ糖、ポリペプチド、または1~3個の
Figure 2022532918000344
基で置換されたC~Cアルキルから選択される親水性部分であり、
Aが、結合、-OC(=O)-
Figure 2022532918000345
、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-、または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、およびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示す、
実施形態40から43のいずれか一項に記載のリンカー。
実施形態45.
が、-C(=O)(CHO(CH**-C(=O)((CHO)(CH**-C(=O)(CH**、または-C(=O)NH((CHO)(CH-であり、Lが、Lpとの結合点を示し、
各mが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、および10から独立して選択され、
各nが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、および10から独立して選択され、
各tが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、および30から独立して選択され、
Lpが、
Figure 2022532918000346
から選択される二価ペプチドスペーサーであり、Lpのが、Lとの結合点を示し、Lpの**が、Gの-NH-基との結合点を示し、
が、構造
Figure 2022532918000347
を有するスペーサー部分であり、
ここで、
Wは、-CHO-**、-CHN(Rb)C(=O)O-**、-NHC(=O)CHNHC(=O)O-**、-CHN(X-R)C(=O)O-**、-C(=O)N(X-R)-**、-C(=O)NR**、-C(=O)NH-**、-CHNRC(=O)-**、-CHNRC(=O)NH-**、-CHNRC(=O)NR**
-NHC(=O)-**、-NHC(=O)O-**、または-NHC(=O)NH-**であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、またはC~Cシクロアルキルから独立して選択され、ここで、Wの**は、Xとの結合点を示し、
Xは、結合、トリアゾリル、または***-CH-トリアゾリル-であり、ここで、Xの***は、Wとの結合点を示し、Xのは、Rとの結合点を示し、
は、Rとの結合点を示し、
が、ポリエチレングリコール、ポリアルキレングリコール、糖、オリゴ糖、ポリペプチド、または1~3個の
Figure 2022532918000348
基で置換されたC~Cアルキルから選択される親水性部分であり、
Aが、結合または-OC(=O)であり、が、Dとの結合点を示す、
実施形態40から44のいずれか一項に記載のリンカー。
実施形態46.
が、-C(=O)(CHO(CH**-C(=O)((CHO)(CH**-C(=O)(CH**、または-C(=O)NH((CHO)(CH-であり、Lが、Lpとの結合点を示し、
各mが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、および10から独立して選択され、
各nが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、および10から独立して選択され、
各tが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、および30から独立して選択され、
Lpが、
Figure 2022532918000349
から選択される二価ペプチドスペーサーであり、Lpのが、Lとの結合点を示し、Lpの**が、Gの-NH-基との結合点を示し、
が、構造
Figure 2022532918000350
を有するスペーサー部分であり、
ここで、
Wは、-CHO-**、-CHN(R)C(=O)O-**、-NHC(=O)CHNHC(=O)O-**、-CHN(X-R)C(=O)O-**、または-C(=O)N(X-R)-**であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、またはC~Cシクロアルキルから独立して選択され、ここで、Wの**は、Xとの結合点を示し、
Xは、***-CH-トリアゾリル-であり、ここで、Xの***は、Wとの結合点を示し、Xのは、Rとの結合点を示し、
は、Rとの結合点を示し、
が、ポリエチレングリコール、ポリアルキレングリコール、糖、オリゴ糖、ポリペプチド、または1~3個の
Figure 2022532918000351
基で置換されたC~Cアルキルから選択される親水性部分であり、
Aが、結合または-OC(=O)であり、が、Dとの結合点を示す、
実施形態40から45のいずれか一項に記載のリンカー。
実施形態47.構造:
Figure 2022532918000352
(式中、Rは、H、-CH、または-CHCHC(=O)OHである)
を有する、実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー。
実施形態48.構造:
Figure 2022532918000353
(式中、Rは、H、-CH、または-CHCHC(=O)OHである)
を有する、実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー。
実施形態49.構造:
Figure 2022532918000354
(式中、Rは、H、-CH、または-CHCHC(=O)OHである)
を有する、実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー。
実施形態50.構造:
Figure 2022532918000355
(式中、各Rは、H、-CH、または-CHCHC(=O)OHから独立して選択される)
を有する、実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー。
実施形態51.構造:
Figure 2022532918000356
(式中、各Rは、H、-CH、または-CHCHC(=O)OHから独立して選択される)
を有する、実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー。
実施形態52.構造:
Figure 2022532918000357
(式中、Xaは、-CH-、-OCH-、-NHCH-、または-NRCH-であり、各Rは、独立して、H、-CH、または-CHCHC(=O)OHである)
を有する、実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー。
実施形態53.構造:
Figure 2022532918000358
(式中、Rは、H、-CH、または-CHCHC(=O)OHである)
を有する、実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー。
実施形態54.構造:
Figure 2022532918000359
(式中、Xbは、-CH-、-OCH-、-NHCH-、または-NRCH-であり、各Rは、独立して、H、-CH、または-CHCHC(=O)OHである)
を有する、実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー。
実施形態55.構造:
Figure 2022532918000360
を有する、実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー。
実施形態56.構造:
Figure 2022532918000361
を有する、実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー。
実施形態57.構造:
Figure 2022532918000362
を有する、実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー。
実施形態58.構造:
Figure 2022532918000363
を有する、実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー。
実施形態59.構造:
Figure 2022532918000364
を有する、実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー。
例示目的のために、本明細書に示された一般的な反応スキームは、本発明の化合物ならびに重要な中間体を合成するための潜在的な経路をもたらす。個々の反応ステップのより詳細な記載については、以下の実施例の項を参照のこと。特異的な出発材料および試薬をスキームに示し、以下に考察するが、他の出発材料および試薬は、容易に置換されて、様々な誘導体および/または反応条件をもたらすことができる。加えて、以下に記載の方法により調製された化合物の多くは、当業者に周知の従来の化学反応を使用する本開示を考慮してさらに改変され得る。
例として、式(B’)の化合物の一般的な合成は、以下のスキーム1に示す。
Figure 2022532918000365
本発明の抗体薬物コンジュゲート
本発明は、本明細書でイムノコンジュゲートとも呼ばれる抗体薬物コンジュゲートをもたらすが、これは、1つまたは複数の親水性部分を含むリンカーを含む。
本発明の抗体薬物コンジュゲートは、式(E’):
Figure 2022532918000366
(式中、
Abは抗体またはその断片であり、
100は連結基であり、
は架橋スペーサーであり、
Lpは二価ペプチドスペーサーであり、
G-L-Aは自壊性スペーサーであり、
は親水性部分であり、
は、結合、メチレン、ネオペンチレン、またはC~Cアルケニレンであり、
Aは、結合、-OC(=O)-
Figure 2022532918000367
、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-、または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、およびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのが、Dとの結合点を示し、
はスペーサー部分であり、
Dは、本明細書に定義される薬物部分、例えばMCl-1阻害剤であり、NまたはOを含み得、ここで、Dは、薬物部分のAからNまたはOとの直接結合を介してAに結合することができ、
yは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、または16である)。
の構造を有する。
本発明の抗体薬物コンジュゲートのある特定の態様および例は、以下のリストの列挙された実施形態のリストにおいて示される。各実施形態で特定される特徴が、本発明のさらなる実施形態を提供する他の特異的な特徴と組み合わせることができることは認識されよう。
実施形態60.
Abが抗体またはその断片であり、
100が連結基であり、
が架橋スペーサーであり、
Lpが2~4個のアミノ酸残基を含む二価ペプチドスペーサーであり、
G-L-Aが自壊性スペーサーであり、
が親水性部分であり、
が、結合、メチレン、ネオペンチレン、またはC~Cアルケニレンであり、
Aが、結合、-OC(=O)-
Figure 2022532918000368
、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-、または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、およびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
がスペーサー部分であり、
Dが、本明細書に定義される薬物部分であり、ここで、Dは、AからD(例えば薬物部分のNまたはO)との直接結合を介してAに接続しており、
yが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、または16である、
式(E’)のイムノコンジュゲート。
実施形態61.
Abが抗体またはその断片であり、
100が連結基であり、
が架橋スペーサーであり、
Lpが2~4個のアミノ酸残基を含む二価ペプチドスペーサーであり、
Figure 2022532918000369
基が、
Figure 2022532918000370
から選択され、ここで、
Figure 2022532918000371
は、Dとの(例えば薬物部分のNまたはOとの)結合点を示し、
Figure 2022532918000372
***は、Lpとの結合点を示し、
が親水性部分であり、
が、結合、メチレン、ネオペンチレン、またはC~Cアルケニレンであり、
Aが、結合、-OC(=O)-
Figure 2022532918000373
、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-、または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、およびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
がスペーサー部分であり、
Dが、本明細書に定義され、NまたはOを含む薬物部分であり、ここで、Dは、薬物部分のAからNまたはOとの直接結合を介してAに接続しており、
yが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、または16である、
式(E’)または実施形態60のイムノコンジュゲート。
実施形態62.式(F’)
Figure 2022532918000374
(式中、
Abは抗体またはその断片であり、
100は連結基であり、
は架橋スペーサーであり、
Lpは2~4個のアミノ酸残基を含む二価ペプチドスペーサーであり、
は親水性部分であり、
Aは、結合、-OC(=O)-
Figure 2022532918000375
、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-、または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、およびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
はスペーサー部分であり、
Dは、本明細書に定義され、NまたはOを含む薬物部分であり、ここで、Dは、薬物部分のAからNまたはOとの直接結合を介してAに接続しており、
yは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、または16である)
の構造を有する、式(E’)または実施形態60もしくは61に記載のイムノコンジュゲート。
実施形態63.
Abが抗体またはその断片であり、
100が、
Figure 2022532918000376
、-S-、-C(=O)-、-ON=***、-NHC(=O)CH***、-S(=O)CHCH***、-(CHS(=O)CHCH***、-NHS(=O)CHCH***、-NHC(=O)CHCH***、-CHNHCHCH***、-NHCHCH***
Figure 2022532918000377
であり、R100***が、Abとの結合点を示し、
が、-C(=O)(CHO(CH**-C(=O)((CHO)(CH**-C(=O)(CH**
-C(=O)NH((CHO)(CH**
-C(=O)O(CHSSC(R(CHC(=O)NR(CHNRC(=O)(CH**
-C(=O)O(CHC(=O)NH(CH**-C(=O)(CHNH(CH**
-C(=O)(CHNH(CHC(=O)-**-C(=O)(CH(CH**
-C(=O)((CHO)(CH(CH**-C(=O)(CHNHC(=O)(CH**
-C(=O)((CHO)(CHNHC(=O)(CH**
-C(=O)(CHNHC(=O)(CH(CH**
-C(=O)((CHO)(CHNHC(=O)(CH(CH**
-C(=O)((CHO)(CHC(=O)NH(CH**-C(=O)(CHC(R**または
-C(=O)(CHC(=O)NH(CH**であり、Lは、Lpとの結合点を示し、L**が、R100との結合点を示し、
が、ポリエチレングリコール、ポリアルキレングリコール、糖、オリゴ糖、ポリペプチド、または1~3個の
Figure 2022532918000378
基で置換されたC~Cアルキルから選択される親水性部分であり、
各Rが、HおよびC~Cアルキルから独立して選択され、
が、2-ピリジルまたは4-ピリジルであり、
各Rが、H、C~Cアルキル、F、Cl、および-OHから独立して選択され、
各Rが、H、C~Cアルキル、F、Cl、-NH、-OCH、-OCHCH、-N(CH、-CN、-NO、および-OHから独立して選択され、
各Rが、H、C1~6アルキル、フルオロ、-C(=O)OHで置換されたベンジルオキシ、-C(=O)OHで置換されたベンジル、-C(=O)OHで置換されたC1~4アルコキシ、および-C(=O)OHで置換されたC1~4アルキルから独立して選択され、
が、
Figure 2022532918000379
であり、
各mが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、および10から独立して選択され、
各nが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、および10から独立して選択され、
各tが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、および30から独立して選択され、
Lpが、バリン、シトルリン、リシン、イソロイシン、フェニルアラニン、メチオニン、アスパラギン、プロリン、アラニン、ロイシン、トリプトファン、およびチロシンから選択されるアミノ酸残基を含む二価ペプチドスペーサーであり、
Aが、結合、-OC(=O)-
Figure 2022532918000380
、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-、または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、およびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
が、構造
Figure 2022532918000381
を有するスペーサー部分であり、
ここで、
Wは、-CHO-**、-CHN(Rb)C(=O)O-**、-NHC(=O)C(RNHC(=O)O-**
-NHC(=O)C(RNH-**、-NHC(=O)C(RNHC(=O)-**、-CHN(X-R)C(=O)O-**、-C(=O)N(X-R)-**、-CHN(X-R)C(=O)-**、-C(=O)NR**、-C(=O)NH-**、-CHNRC(=O)-**、-CHNRC(=O)NH-**、-CHNRC(=O)NR**、-NHC(=O)-**、-NHC(=O)O-**、-NHC(=O)NH-**、-OC(=O)NH-**、-S(O)NH-**、-NHS(O)**、-C(=O)-、-C(=O)O-**または-NH-であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、またはC~Cシクロアルキルから独立して選択され、ここで、Wの**は、Xとの結合点を示し、
Xは、結合、トリアゾリル、または***-CH-トリアゾリル-であり、ここで、Xの***は、Wとの結合点を示し、Xのは、Rとの結合点を示し、
は、Rとの結合点を示し、
Dが、本明細書に定義され、NまたはOを含む薬物部分であり、ここで、Dは、薬物部分のAからNまたはOとの直接結合を介してAに接続しており、
yが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、または16である、
式(D’)または実施形態60から62のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート。
実施形態64.
Abが抗体またはその断片であり、
100が、
Figure 2022532918000382
であり、R100***が、Abとの結合点を示し、
が、-C(=O)(CHO(CH**-C(=O)((CHO)(CH**-C(=O)(CH**、または-C(=O)NH((CHO)(CH-であり、Lが、Lpとの結合点を示し、L**が、R100との結合点を示し、
各mが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、および10から独立して選択され、
各nが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、および10から独立して選択され、
各tが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、および30から独立して選択され、
Lpが、
Figure 2022532918000383
から選択される二価ペプチドスペーサーであり、Lpのが、Lとの結合点を示し、Lpの**が、Gの-NH-基との結合点を示し、
が、構造
Figure 2022532918000384
を有するスペーサー部分であり、
ここで、
Wは、-CHO-**、-CHN(Rb)C(=O)O-**、-NHC(=O)CHNHC(=O)O-**
-NHC(=O)CHNH-**、-NHC(=O)CHNHC(=O)-**、-CHN(X-R)C(=O)O-**、-C(=O)N(X-R)-**、-CHN(X-R)C(=O)-**、-C(=O)NR**
-C(=O)NH-**、-CHNRC(=O)-**、-CHNRC(=O)NH-**、-CHNRC(=O)NR**、-NHC(=O)-**、-NHC(=O)O-**、-NHC(=O)NH-**
-OC(=O)NH-**、-S(O)NH-**、-NHS(O)**、-C(=O)-、-C(=O)O-**または
-NH-であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、またはC~Cシクロアルキルから独立して選択され、ここで、Wの**は、Xとの結合点を示し、
Xは、結合、トリアゾリル、または***-CH-トリアゾリル-であり、ここで、Xの***は、Wとの結合点を示し、Xのは、Rとの結合点を示し、
は、Rとの結合点を示し、
が、ポリエチレングリコール、ポリアルキレングリコール、糖、オリゴ糖、ポリペプチド、または1~3個の
Figure 2022532918000385
基で置換されたC~Cアルキルから選択される親水性部分であり、
Aが、結合、-OC(=O)-
Figure 2022532918000386
、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-、または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、およびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
Dが、本明細書に定義され、NまたはOを含む薬物部分であり、ここで、Dは、薬物部分のAからNまたはOとの直接結合を介してAに接続しており、
yが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、または16である、
式(D’)または実施形態60から63のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート。
実施形態65.
Abが抗体またはその断片であり、
100が、
Figure 2022532918000387
であり、R100***が、Abとの結合点を示し、
が、-C(=O)(CHO(CH**-C(=O)((CHO)(CH**-C(=O)(CH**、または-C(=O)NH((CHO)(CH-であり、Lが、Lpとの結合点を示し、L**が、R100との結合点を示し、
各mが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、および10から独立して選択され、
各nが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、および10から独立して選択され、
各tが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、および30から独立して選択され、
Lpが、
Figure 2022532918000388
から選択される二価ペプチドスペーサーであり、Lpのが、Lとの結合点を示し、Lpの**が、Gの-NH-基との結合点を示し、
が、構造
Figure 2022532918000389
を有するスペーサー部分であり、
ここで、
Wは、-CHO-**、-CHN(Rb)C(=O)O-**、-NHC(=O)CHNHC(=O)O-**、-CHN(X-R)C(=O)O-**、-C(=O)N(X-R)-**、-CHN(X-R)C(=O)-**、-C(=O)NR**、-C(=O)NH-**、-CHNRC(=O)-**、-CHNRC(=O)NH-**、-CHNRC(=O)NR**、-NHC(=O)-**、-NHC(=O)O-**、-NHC(=O)NH-**、-OC(=O)NH-**、-S(O)NH-**、-NHS(O)**、-C(=O)-、-C(=O)O-**または-NH-であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、またはC~Cシクロアルキルから独立して選択され、ここで、Wの**は、Xとの結合点を示し、
Xは、結合、トリアゾリル、または***-CH-トリアゾリル-であり、ここで、Xの***は、Wとの結合点を示し、Xのは、Rとの結合点を示し、
は、Rとの結合点を示し、
が、ポリエチレングリコール、ポリアルキレングリコール、糖、オリゴ糖、ポリペプチド、または、結合、-OC(=O)-
Figure 2022532918000390
、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-、もしくは-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-である、1~3個のAで置換されたC~Cアルキルから選択される親水性部分であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、およびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
Dが、本明細書に定義され、NまたはOを含む薬物部分であり、ここで、Dは、薬物部分のAからNまたはOとの直接結合を介してAに接続しており、
yが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、または16である、
式(E’)または実施形態60から64のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート。
実施形態66.
Abが抗体またはその断片であり、
100が、
Figure 2022532918000391
であり、R100***が、Abとの結合点を示し、
が、-C(=O)(CHO(CH**-C(=O)((CHO)(CH**-C(=O)(CH**、または-C(=O)NH((CHO)(CH-であり、Lが、Lpとの結合点を示し、L**が、R100との結合点を示し、
各mが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、および10から独立して選択され、
各nが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、および10から独立して選択され、
各tが、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、および30から独立して選択され、
Lpが、
Figure 2022532918000392
から選択される二価ペプチドスペーサーであり、Lpのが、Lとの結合点を示し、Lpの**が、Gの-NH-基との結合点を示し、
が、構造
Figure 2022532918000393
を有するスペーサー部分であり、
ここで、
Wは、-CHO-**、-CHN(Rb)C(=O)O-**、-NHC(=O)CHNHC(=O)O-**、-CHN(X-R)C(=O)O-**、-C(=O)N(X-R)-**、-C(=O)NR**
-C(=O)NH-**、-CHNRC(=O)-**、-CHNRC(=O)NH-**
-CHNRC(=O)NR**、-NHC(=O)-**、-NHC(=O)O-**、または-NHC(=O)NH-**であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、またはC~Cシクロアルキルから独立して選択され、ここで、Wの**は、Xとの結合点を示し、
Xは、結合、トリアゾリル、または***-CH-トリアゾリル-であり、ここで、Xの***は、Wとの結合点を示し、Xのは、Rとの結合点を示し、
は、Rとの結合点を示し、
が、ポリエチレングリコール、ポリアルキレングリコール、糖、オリゴ糖、ポリペプチド、または1~3個の
Figure 2022532918000394
基で置換されたC~Cアルキルから選択される親水性部分であり、
Aが、結合または-OC(=O)であり、が、Dとの結合点を示し、
Dが、本明細書に定義され、NまたはOを含む薬物部分であり、ここで、Dは、薬物部分のAからNまたはOとの直接結合を介してAに接続しており、
yが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、または16である、
式(E’)または実施形態60から65のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート。
実施形態67.
Abが抗体またはその断片であり、
100が、
Figure 2022532918000395
であり、R100***が、Abとの結合点を示し、
が、-C(=O)(CHO(CH**-C(=O)((CHO)(CH**-C(=O)(CH**、または-C(=O)NH((CHO)(CH-であり、Lが、Lpとの結合点を示し、L**が、R100との結合点を示し、
各mが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、および10から独立して選択され、
各nが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、および10から独立して選択され、
各tが、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、および30から独立して選択され、
Lpが、
Figure 2022532918000396
から選択される二価ペプチドスペーサーであり、Lpのが、Lとの結合点を示し、Lpの**が、Gの-NH-基との結合点を示し、
が、構造
Figure 2022532918000397
を有するスペーサー部分であり、
ここで、
Wは、-CHO-**、-CHN(R)C(=O)O-**、-NHC(=O)CHNHC(=O)O-**、-CHN(X-R)C(=O)O-**、または-C(=O)N(X-R)-**であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、またはC~Cシクロアルキルから独立して選択され、ここで、Wの**は、Xとの結合点を示し、
Xは、***-CH-トリアゾリル-であり、ここで、Xの***は、Wとの結合点を示し、Xのは、Rとの結合点を示し、
は、Rとの結合点を示し、
が、ポリエチレングリコール、ポリアルキレングリコール、糖、オリゴ糖、ポリペプチド、または1~3個の
Figure 2022532918000398
基で置換されたC~Cアルキルから選択される親水性部分であり、
Aが、結合または-OC(=O)であり、が、Dとの結合点を示し、
Dが、本明細書に定義され、NまたはOを含む薬物部分であり、ここで、Dは、薬物部分のAからNまたはOとの直接結合を介してAに接続しており、
yが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、または16である、
式(E’)または実施形態60から66のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート。
実施形態68.
100が、
Figure 2022532918000399
-S-、-C(=O)-、-ON=***、-NHC(=O)CH***、-S(=O)CHCH***、-(CHS(=O)CHCH***、-NHS(=O)CHCH***、-NHC(=O)CHCH***、-CHNHCHCH***、-NHCHCH***
Figure 2022532918000400
であり、R100***が、Abとの結合点を示す、
式(E’)または実施形態60から63のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート。
実施形態69.
100が、
Figure 2022532918000401
であり、R100***が、Abとの結合点を示す、
式(E’)または実施形態60から63のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート。
実施形態70.
100が、
Figure 2022532918000402
であり、R100***が、Abとの結合点を示す、
式(E’)または実施形態60から63のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート。
実施形態71.構造:
Figure 2022532918000403
(式中、Rは、H、-CH、または-CHCHC(=O)OHであり、yは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、または16である)
を有する、式(E’)または実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート。
実施形態72.構造:
Figure 2022532918000404
(式中、Rは、H、-CH、または-CHCHC(=O)OHであり、yは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、または16である)
を有する、式(E’)または実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート。
実施形態73.構造:
Figure 2022532918000405
(式中、Rは、H、-CH、または-CHCHC(=O)OHであり、yは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、または16である)
を有する、式(E’)または実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート。
実施形態74.構造:
Figure 2022532918000406
(式中、各Rは、H、-CH、または-CHCHC(=O)OHから独立して選択され、yは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、または16である)
を有する、式(E’)または実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート。
実施形態75.構造:
Figure 2022532918000407
(式中、各Rは、H、-CH、または-CHCHC(=O)OHから独立して選択され、yは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、または16である)
を有する、式(E’)または実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート。
実施形態76.構造:
Figure 2022532918000408
(式中、Xaは、-CH-、-OCH-、-NHCH-、または-NRCH-であり、各Rは、独立して、H、-CH、または-CHCHC(=O)OHであり、yは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、または16である)
を有する、式(E’)または実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート。
実施形態77.構造:
Figure 2022532918000409
(式中、Rは、H、-CH、または-CHCHC(=O)OHであり、yは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、または16である)
を有する、式(E’)または実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート。
実施形態78.構造:
Figure 2022532918000410
(式中、Xbは、-CH-、-OCH-、-NHCH-、または-NRCH-であり、各Rは、独立して、H、-CH、または-CHCHC(=O)OHであり、yは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、または16である)
を有する、式(E’)または実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート。
実施形態79.構造:
Figure 2022532918000411
(式中、yが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、または16である)
を有する、式(E’)または実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート。
実施形態80.構造:
Figure 2022532918000412
(式中、yが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、または16である)
を有する、式(E’)または実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート。
実施形態81.構造:
Figure 2022532918000413
(式中、yが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、または16である)
を有する、式(E’)または実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート。
実施形態82.構造:
Figure 2022532918000414
(式中、yが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、または16である)
を有する、式(E’)または実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート。
実施形態83.構造:
Figure 2022532918000415
(式中、yが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、または16である)
を有する、式(E’)または実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート。
本発明のリンカー-薬物基、リンカー、および抗体薬物コンジュゲートのある特定の態様および例は、以下の追加の列挙された実施形態のリストにおいて示される。各実施形態で特定される特徴が、本発明のさらなる実施形態を提供する他の特異的な特徴と組み合わせることができることは認識されよう。
実施形態84.
Gが、
Figure 2022532918000416
であり、Gのが、Lとの結合点を示し、Gの**が、Lとの結合点を示し、Gの***が、Lpとの結合点を示す、
式(A’)もしくは実施形態1もしくは2に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩、式(C’)または実施形態32から39のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)または実施形態60もしくは61に記載のイムノコンジュゲート。
実施形態85.
Gが、
Figure 2022532918000417
であり、Gのが、Lとの結合点を示し、Gの**が、Lとの結合点を示し、Gの***が、Lpとの結合点を示す、
式(A’)もしくは実施形態1もしくは2に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩、式(C’)または実施形態32から39のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)または実施形態60もしくは61に記載のイムノコンジュゲート。
実施形態86.
が、-C(=O)(CHO(CH**-C(=O)((CHO)(CH**-C(=O)(CH**
-C(=O)NH((CHO)(CH**
-C(=O)O(CHSSC(R(CHC(=O)NR(CHNRC(=O)(CH**
-C(=O)O(CHC(=O)NH(CH**-C(=O)(CHNH(CH**
-C(=O)(CHNH(CHC(=O)-**-C(=O)(CH(CH**
-C(=O)((CHO)(CH(CH**-C(=O)(CHNHC(=O)(CH**
-C(=O)((CHO)(CHNHC(=O)(CH**-C(=O)(CHNHC(=O)(CH(CH**-C(=O)((CHO)(CHNHC(=O)(CH(CH**
-C(=O)((CHO)(CHC(=O)NH(CH**-C(=O)(CHC(R**または
-C(=O)(CHC(=O)NH(CH**であり、Lが、Lpとの結合点を示し、L**が、存在する場合、Rとの結合点を示す、またはL**が、存在する場合、R100との結合点を示す、
式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩、式(C’)または実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)または実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート。
実施形態87.
が、-C(=O)(CHO(CH**-C(=O)((CHO)(CH**-C(=O)(CH**
-C(=O)NH((CHO)(CH**-C(=O)(CHNH(CH**
-C(=O)(CHNH(CHC(=O)-**-C(=O)(CHNHC(=O)(CH**
-C(=O)((CHO)(CHNHC(=O)(CH**-C(=O)((CHO)(CHC(=O)NH(CH**-C(=O)(CHC(R**または-C(=O)(CHC(=O)NH(CH**であり、Lが、Lpとの結合点を示し、L**が、存在する場合、Rとの結合点を示す、またはL**が、存在する場合、R100との結合点を示す、
式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩、式(C’)または実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)または実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート。
実施形態88.
が、-C(=O)(CHO(CH**-C(=O)((CHO)(CH**-C(=O)(CH**-C(=O)NH((CHO)(CH**-C(=O)(CHNH(CH**-C(=O)(CHNH(CHC(=O)-**、または-C(=O)(CHNHC(=O)(CH**であり、Lが、Lpとの結合点を示し、L**が、存在する場合、Rとの結合点を示す、またはL**が、存在する場合、R100との結合点を示す、
式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩、式(C’)または実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)または実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート。
実施形態89.
が、-C(=O)(CHO(CH**-C(=O)((CHO)(CH**-C(=O)(CH**、または-C(=O)NH((CHO)(CH**であり、Lが、Lpとの結合点を示し、L**が、存在する場合、Rとの結合点を示す、またはL**が、存在する場合、R100との結合点を示す、
式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩、式(C’)または実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)または実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート。
実施形態90.Lが、-C(=O)(CHO(CH**であり、Lが、Lpとの結合点を示し、L**が、存在する場合、Rとの結合点を示す、またはL**が、存在する場合、R100との結合点を示す、式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩、式(C’)または実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)または実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート。
実施形態91.Lが、-C(=O)((CHO)(CH**であり、Lが、Lpとの結合点を示し、L**が、存在する場合、Rとの結合点を示す、またはL**が、存在する場合、R100との結合点を示す、式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩、式(C’)または実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)または実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート。
実施形態92.Lが、-C(=O)(CH**であり、Lが、Lpとの結合点を示し、L**が、存在する場合、Rとの結合点を示す、またはL**が、存在する場合、R100との結合点を示す、式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩、式(C’)または実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)または実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート。
実施形態93.Lが、-C(=O)NH((CHO)(CH**であり、Lが、Lpとの結合点を示し、L**が、存在する場合、Rとの結合点を示す、またはL**が、存在する場合、R100との結合点を示す、式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物またはその薬学的に許容される塩、式(C’)または実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)または実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート。
実施形態94.Lpが、酵素により切断可能な二価ペプチドスペーサーである、式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物、もしくはその薬学的に許容される塩、式(C’)もしくは実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート、または実施形態84から93のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、リンカー、およびイムノコンジュゲート。
実施形態95.Lpが、グリシン、バリン、シトルリン、リシン、イソロイシン、フェニルアラニン、メチオニン、アスパラギン、プロリン、アラニン、ロイシン、トリプトファン、およびチロシンから選択されるアミノ酸残基を含む二価ペプチドスペーサーである、式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物、もしくはその薬学的に許容される塩、式(C’)もしくは実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート、または実施形態84から94のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、リンカー、およびイムノコンジュゲート。
実施形態96.Lpが、2~4個のアミノ酸残基を含む二価ペプチドスペーサーである、式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物、もしくはその薬学的に許容される塩、式(C’)もしくは実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート、または実施形態84から95のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、リンカー、およびイムノコンジュゲート。
実施形態97.Lpが、各々がグリシン、バリン、シトルリン、リシン、イソロイシン、フェニルアラニン、メチオニン、アスパラギン、プロリン、アラニン、ロイシン、トリプトファン、およびチロシンから独立して選択される2~4個のアミノ酸残基を含む二価ペプチドスペーサーである、式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物、もしくはその薬学的に許容される塩、式(C’)もしくは実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート、または実施形態84から96のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、リンカー、およびイムノコンジュゲート。
実施形態98.
Lpが、
Figure 2022532918000418
から選択される二価ペプチドスペーサーであり、Lpのが、Lとの結合点を示し、Lpの**が、式(B’)の-NH-基との結合点を示す、またはLpの**が、式(A’)のGとの結合点を示す、
式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物、もしくはその薬学的に許容される塩、式(C’)もしくは実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート、または実施形態84から97のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、リンカー、およびイムノコンジュゲート。
実施形態99.
Lpが、
Figure 2022532918000419
であり、Lpのが、Lとの結合点を示し、Lpの**が、式(B’)の-NH-基との結合点を示す、またはLpの**が、式(A’)のGとの結合点を示す、
式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物、もしくはその薬学的に許容される塩、式(C’)もしくは実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート、または実施形態84から98のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、リンカー、およびイムノコンジュゲート。
実施形態100.
Lpが、
Figure 2022532918000420
であり、Lpのが、Lとの結合点を示し、Lpの**が、式(B’)の-NH-基との結合点を示す、またはLpの**が、式(A’)のGとの結合点を示す、
式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物、もしくはその薬学的に許容される塩、式(C’)もしくは実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート、または実施形態84から98のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、リンカー、およびイムノコンジュゲート。
実施形態101.
Lpが、
Figure 2022532918000421
であり、Lpのが、Lとの結合点を示し、Lpの**が、式(B’)の-NH-基との結合点を示す、またはLpの**が、式(A’)のGとの結合点を示す、
式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物、もしくはその薬学的に許容される塩、式(C’)もしくは実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート、または実施形態84から98のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、リンカー、およびイムノコンジュゲート。
実施形態102.
Lpが、
Figure 2022532918000422
であり、Lpのが、Lとの結合点を示し、Lpの**が、式(B’)の-NH-基との結合点を示す、またはLpの**が、式(A’)のGとの結合点を示す、
式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物、もしくはその薬学的に許容される塩、式(C’)もしくは実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート、または実施形態84から98のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、リンカー、およびイムノコンジュゲート。
実施形態103.
Lpが、
Figure 2022532918000423
であり、Lpのが、Lとの結合点を示し、Lpの**が、式(B’)の-NH-基との結合点を示す、またはLpの**が、式(A’)のGとの結合点を示す、
式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物、もしくはその薬学的に許容される塩、式(C’)もしくは実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート、または実施形態84から98のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、リンカー、およびイムノコンジュゲート。
実施形態104.Lが、結合、メチレン、またはC~Cアルケニレンである、式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物、もしくはその薬学的に許容される塩、式(C’)もしくは実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート、または実施形態84から103のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、リンカー、およびイムノコンジュゲート。
実施形態105.Lが、結合、またはメチレンである、式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物、もしくはその薬学的に許容される塩、式(C’)もしくは実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート、または実施形態84から104のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、リンカー、およびイムノコンジュゲート。
実施形態106.Lが、結合である、式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物、もしくはその薬学的に許容される塩、式(C’)もしくは実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート、または実施形態84から105のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、リンカー、およびイムノコンジュゲート。
実施形態107.Lが、メチレンである、式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物、もしくはその薬学的に許容される塩、式(C’)もしくは実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート、または実施形態84から105のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、リンカー、およびイムノコンジュゲート。
実施形態108.
Aが、結合、-OC(=O)-、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-、または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、またはC~Cシクロアルキルから独立して選択される、
式(A’)もしくは実施形態1から30のいずれか一項に記載の化合物、もしくはその薬学的に許容される塩、式(C’)もしくは実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)もしくは実施形態60から83のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート、または実施形態84から107のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、リンカー、およびイムノコンジュゲート。
実施形態109.Aが、結合または-OC(=O)である、式(A’)もしくは実施形態1から30のいずれか一項に記載の化合物、もしくはその薬学的に許容される塩、式(C’)もしくは実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)もしくは実施形態60から83のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート、または実施形態84から107のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、リンカー、およびイムノコンジュゲート。
実施形態110.Aが、結合である、式(A’)もしくは実施形態1から30のいずれか一項に記載の化合物、もしくはその薬学的に許容される塩、式(C’)もしくは実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)もしくは実施形態60から83のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート、または実施形態84から109のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、リンカー、およびイムノコンジュゲート。
実施形態111.Aが、-OC(=O)である、式(A’)もしくは実施形態1から30のいずれか一項に記載の化合物、もしくはその薬学的に許容される塩、式(C’)もしくは実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)もしくは実施形態60から83のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート、または実施形態84から109のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、リンカー、およびイムノコンジュゲート。
実施形態112.
Aが、
Figure 2022532918000424
である、
式(A’)もしくは実施形態1から30のいずれか一項に記載の化合物、もしくはその薬学的に許容される塩、式(C’)もしくは実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)もしくは実施形態60から83のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート、または実施形態84から107のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、リンカー、およびイムノコンジュゲート。
実施形態113.
Aが、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-、または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、またはC~Cシクロアルキルから独立して選択される、
式(A’)もしくは実施形態1から30のいずれか一項に記載の化合物、もしくはその薬学的に許容される塩、式(C’)もしくは実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)もしくは実施形態60から83のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート、または実施形態84から107のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、リンカー、およびイムノコンジュゲート。
実施形態114.
が、構造
Figure 2022532918000425
を有するスペーサー部分であり、
ここで、
Wは、-CHO-**、-CHN(R)C(=O)O-**、-NHC(=O)C(RNHC(=O)O-**
-NHC(=O)C(RNH-**、-NHC(=O)C(RNHC(=O)-**、-CHN(X-R)C(=O)O-**
-C(=O)N(X-R)-**、-CHN(X-R)C(=O)-**、-C(=O)NR**、-C(=O)NH-**
-CHNRC(=O)-**、-CHNRC(=O)NH-**、-CHNRC(=O)NR**、-NHC(=O)-**
-NHC(=O)O-**、-NHC(=O)NH-**、-OC(=O)NH-**、-S(O)NH-**、-NHS(O)**
-C(=O)-、-C(=O)O-**または-NH-であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、またはC~Cシクロアルキルから独立して選択され、ここで、Wの**は、Xとの結合点を示し、
Xは、結合、トリアゾリル、または***-CH-トリアゾリル-であり、ここで、Xの***は、Wとの結合点を示し、Xのは、Rとの結合点を示し、
が、Rとの結合点を示す、
式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物、もしくはその薬学的に許容される塩、式(C’)もしくは実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート、または実施形態84から113のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、リンカー、およびイムノコンジュゲート。
実施形態115.
が、構造
Figure 2022532918000426
を有するスペーサー部分であり、
ここで、
Wは、-CHO-**、-CHN(R)C(=O)O-**、-NHC(=O)CHNHC(=O)O-**
-NHC(=O)CHNH-**、-NHC(=O)CHNHC(=O)-**、-CHN(X-R)C(=O)O-**
-C(=O)N(X-R)-**、-CHN(X-R)C(=O)-**、-C(=O)NR**、-C(=O)NH-**
-CHNRC(=O)-**、-CHNRC(=O)NH-**、-CHNRC(=O)NR**、-NHC(=O)-**
-NHC(=O)O-**、-NHC(=O)NH-**、-OC(=O)NH-**、-S(O)NH-**、-NHS(O)**
-C(=O)-、-C(=O)O-**または-NH-であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、またはC~Cシクロアルキルから独立して選択され、ここで、Wの**は、Xとの結合点を示し、
Xは、結合であり、
が、Rとの結合点を示す、
式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物、もしくはその薬学的に許容される塩、式(C’)もしくは実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート、または実施形態84から114のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、リンカー、およびイムノコンジュゲート。
実施形態116.
が、構造
Figure 2022532918000427
を有するスペーサー部分であり、
ここで、
Wは、-CHO-**、-CHN(R)C(=O)O-**、-NHC(=O)CHNHC(=O)O-**
-NHC(=O)CHNH-**、-NHC(=O)CHNHC(=O)-**、-CHN(X-R)C(=O)O-**
-C(=O)N(X-R)-**、-CHN(X-R)C(=O)-**、-C(=O)NR**、-C(=O)NH-**、-CHNRC(=O)-**、-CHNRC(=O)NH-**、-CHNRC(=O)NR**、-NHC(=O)-**
-NHC(=O)O-**、-NHC(=O)NH-**、-OC(=O)NH-**、-S(O)NH-**、-NHS(O)**
-C(=O)-、-C(=O)O-**または-NH-であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、またはC~Cシクロアルキルから独立して選択され、ここで、Wの**は、Xとの結合点を示し、
Xは、トリアゾリルであり、ここで、Xの***は、Wとの結合点を示し、Xのは、Rとの結合点を示し、
が、Rとの結合点を示す、
式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物、もしくはその薬学的に許容される塩、式(C’)もしくは実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート、または実施形態84から115のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、リンカー、およびイムノコンジュゲート。
実施形態117.
が、構造
Figure 2022532918000428
を有するスペーサー部分であり、
ここで、
Wは、-CHO-**、-CHN(R)C(=O)O-**、-NHC(=O)CHNHC(=O)O-**
-NHC(=O)CHNH-**、-NHC(=O)CHNHC(=O)-**、-CHN(X-R)C(=O)O-**
-C(=O)N(X-R)-**、-CHN(X-R)C(=O)-**、-C(=O)NR**、-C(=O)NH-**
-CHNRC(=O)-**、-CHNRC(=O)NH-**、-CHNRC(=O)NR**、-NHC(=O)-**
-NHC(=O)O-**、-NHC(=O)NH-**、-OC(=O)NH-**、-S(O)NH-**、-NHS(O)**
-C(=O)-、-C(=O)O-**または-NH-であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、またはC~Cシクロアルキルから独立して選択され、ここで、Wの**は、Xとの結合点を示し、
Xは、***-CH-トリアゾリル-であり、ここで、Xの***は、Wとの結合点を示し、Xのは、Rとの結合点を示し、
が、Rとの結合点を示す、
式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物、もしくはその薬学的に許容される塩、式(C’)もしくは実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート、または実施形態84から115のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、リンカー、およびイムノコンジュゲート。
実施形態118.
が、構造
Figure 2022532918000429
を有するスペーサー部分であり、
ここで、
Wは、-CHO-**、-CHN(R)C(=O)O-**、-NHC(=O)CHNHC(=O)O-**、-CHN(X-R)C(=O)O-**、-C(=O)N(X-R)-**であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、またはC~Cシクロアルキルから独立して選択され、ここで、Wの**は、Xとの結合点を示し、
Xは、結合、トリアゾリル、または***-CH-トリアゾリル-であり、ここで、Xの***は、Wとの結合点を示し、Xのは、Rとの結合点を示し、
が、Rとの結合点を示す、
式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物、もしくはその薬学的に許容される塩、式(C’)もしくは実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート、または実施形態84から115のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、リンカー、およびイムノコンジュゲート。
実施形態119.
が、構造
Figure 2022532918000430
を有するスペーサー部分であり、
ここで、
Wは、-CHO-**、-CHN(R)C(=O)O-**、-NHC(=O)CHNHC(=O)O-**、-CHN(X-R)C(=O)O-**、-C(=O)N(X-R)-**であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、またはC~Cシクロアルキルから独立して選択され、ここで、Wの**は、Xとの結合点を示し、
Xは、結合であり、
が、Rとの結合点を示す、
式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物、もしくはその薬学的に許容される塩、式(C’)もしくは実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート、または実施形態84から115のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、リンカー、およびイムノコンジュゲート。
実施形態120.
が、構造
Figure 2022532918000431
を有するスペーサー部分であり、
ここで、
Wは、-CHO-**、-CHN(R)C(=O)O-**、-NHC(=O)CHNHC(=O)O-**、-CHN(X-R)C(=O)O-**、-C(=O)N(X-R)-**であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、またはC~Cシクロアルキルから独立して選択され、ここで、Wの**は、Xとの結合点を示し、
Xは、トリアゾリルであり、ここで、Xの***は、Wとの結合点を示し、Xのは、Rとの結合点を示し、
が、Rとの結合点を示す、
式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物、もしくはその薬学的に許容される塩、式(C’)もしくは実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート、または実施形態84から115のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、リンカー、およびイムノコンジュゲート。
実施形態121.
が、構造
Figure 2022532918000432
を有するスペーサー部分であり、
ここで、
Wは、-CHO-**、-CHN(R)C(=O)O-**、-NHC(=O)CHNHC(=O)O-**、-CHN(X-R)C(=O)O-**、-C(=O)N(X-R)-**であり、ここで、各Rは、H、C~Cアルキル、またはC~Cシクロアルキルから独立して選択され、ここで、Wの**は、Xとの結合点を示し、
Xは、***-CH-トリアゾリル-であり、ここで、Xの***は、Wとの結合点を示し、Xのは、Rとの結合点を示し、
が、Rとの結合点を示す、
式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物、もしくはその薬学的に許容される塩、式(C’)もしくは実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート、または実施形態84から115のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、リンカー、およびイムノコンジュゲート。
実施形態122.Rが、ポリエチレングリコール、ポリアルキレングリコール、糖、オリゴ糖、ポリペプチド、または1~3個の
Figure 2022532918000433
基で置換されたC~Cアルキルから選択される親水性部分である、化合物またはその薬学式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物、もしくはその薬学的に許容される塩、式(C’)もしくは実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート、または実施形態84から121のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、リンカー、およびイムノコンジュゲート。
実施形態123.Rが、糖である、式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物、もしくはその薬学的に許容される塩、式(C’)もしくは実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート、または実施形態84から122のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、リンカー、およびイムノコンジュゲート。
実施形態124.Rが、オリゴ糖である、式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物、もしくはその薬学的に許容される塩、式(C’)もしくは実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート、または実施形態84から122のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、リンカー、およびイムノコンジュゲート。
実施形態125.Rが、ポリペプチドである、式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物、もしくはその薬学的に許容される塩、式(C’)もしくは実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート、または実施形態84から122のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、リンカー、およびイムノコンジュゲート。
実施形態126.Rが、ポリアルキレングリコールである、式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物、もしくはその薬学的に許容される塩、式(C’)もしくは実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート、または実施形態84から122のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、リンカー、およびイムノコンジュゲート。
実施形態127.Rが、構造-(O(CHR’を有するポリアルキレングリコールであり、R’が、OH、OCH、またはOCHCHC(=O)OHであり、mが、1~10であり、tが、4~40である、式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物、もしくはその薬学的に許容される塩、式(C’)もしくは実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート、または実施形態84から122のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、リンカー、およびイムノコンジュゲート。
実施形態128.Rが、構造-((CHO)R’’-を有するポリアルキレングリコールであり、R’’が、H、CH、またはCHCHC(=O)OHであり、mが、1~10であり、tが、4~40である、式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物、もしくはその薬学的に許容される塩、式(C’)もしくは実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート、または実施形態84から122のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、リンカー、およびイムノコンジュゲート。
実施形態129.Rが、ポリエチレングリコールである、式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物、もしくはその薬学的に許容される塩、式(C’)もしくは実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート、または実施形態84から122のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、リンカー、およびイムノコンジュゲート。
実施形態130.Rが、構造-(OCHCHR’を有するポリエチレングリコールであり、R’が、OH、OCH、またはOCHCHC(=O)OHであり、tが、4~40である、式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物、もしくはその薬学的に許容される塩、式(C’)もしくは実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート、または実施形態84から122のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、リンカー、およびイムノコンジュゲート。
実施形態131.Rが、構造-(CHCHO)R’’-を有するポリエチレングリコールであり、R’’が、H、CH、またはCHCHC(=O)OHであり、tが、4~40である、式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物、もしくはその薬学的に許容される塩、式(C’)もしくは実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート、または実施形態84から122のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、リンカー、およびイムノコンジュゲート。
実施形態132.
が、
Figure 2022532918000434
であり、Rが、XまたはLとの結合点を示す、
式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物、もしくはその薬学的に許容される塩、式(C’)もしくは実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート、または実施形態84から122のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、リンカー、およびイムノコンジュゲート。
実施形態133.
が、
Figure 2022532918000435
であり、Rが、XまたはLとの結合点を示す、
式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物、もしくはその薬学的に許容される塩、式(C’)もしくは実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート、または実施形態84から122のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、リンカー、およびイムノコンジュゲート。
実施形態134.
が、
Figure 2022532918000436
であり、Rが、XまたはLとの結合点を示す、
式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物、もしくはその薬学的に許容される塩、式(C’)もしくは実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート、または実施形態84から122のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、リンカー、およびイムノコンジュゲート。
実施形態135.
が、
Figure 2022532918000437
であり、Rが、XまたはLとの結合点を示す、
式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物、もしくはその薬学的に許容される塩、式(C’)もしくは実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート、または実施形態84から122のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、リンカー、およびイムノコンジュゲート。
実施形態136.
が、
Figure 2022532918000438
である、
式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物、もしくはその薬学的に許容される塩、式(C’)もしくは実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート、または実施形態84から135のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、リンカー、およびイムノコンジュゲート。
実施形態137.
が、
Figure 2022532918000439
である、
式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物、もしくはその薬学的に許容される塩、式(C’)もしくは実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート、または実施形態84から135のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、リンカー、およびイムノコンジュゲート。
実施形態138.
各mが、1、2、3、4、および5から独立して選択される、
式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物、もしくはその薬学的に許容される塩、式(C’)もしくは実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート、または実施形態84から137のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、リンカー、およびイムノコンジュゲート。
実施形態139.
各mが、1、2、および3から独立して選択される、
式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物、もしくはその薬学的に許容される塩、式(C’)もしくは実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート、または実施形態84から137のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、リンカー、およびイムノコンジュゲート。
実施形態140.
各nが、1、2、3、4、および5から独立して選択される、
式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物、もしくはその薬学的に許容される塩、式(C’)もしくは実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート、または実施形態84から139のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、リンカー、およびイムノコンジュゲート。
実施形態141.
各nが、1、2、3、4、および5から独立して選択される、
式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物、もしくはその薬学的に許容される塩、式(C’)もしくは実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート、または実施形態84から139のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、リンカー、およびイムノコンジュゲート。
実施形態142.
各tが、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、および30から独立して選択される、
式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物、もしくはその薬学的に許容される塩、式(C’)もしくは実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート、または実施形態84から141のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、リンカー、およびイムノコンジュゲート。
実施形態143.
各tが、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、または25から独立して選択される、
式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物、もしくはその薬学的に許容される塩、式(C’)もしくは実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート、または実施形態84から141のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、リンカー、およびイムノコンジュゲート。
実施形態144.
各tが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、および18から独立して選択される、
式(A’)もしくは実施形態1から17のいずれか一項に記載の化合物、もしくはその薬学的に許容される塩、式(C’)もしくは実施形態32から46のいずれか一項に記載のリンカー、および式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート、または実施形態84から141のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、リンカー、およびイムノコンジュゲート。
実施形態145.yが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、または14である、式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項、または実施形態84から144のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート。
実施形態146.yが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、または12である、式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項、または実施形態84から144のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート。
実施形態147.yが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10である、式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項、または実施形態84から144のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート。
実施形態148.yが、1、2、3、4、5、6、7、または8である、式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項、または実施形態84から144のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート。
実施形態149.yが、1、2、3、4、5、または6である、式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項、または実施形態84から144のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート。
実施形態150.yが、1、2、3、または4である、式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項、または実施形態84から144のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート。
実施形態151.yが、1または2である、式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項、または実施形態84から144のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート。
実施形態152.yが、2である、式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項、または実施形態84から144のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート。
実施形態153.yが、4である、式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項、または実施形態84から144のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート。
実施形態154.yが、6である、式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項、または実施形態84から144のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート。
実施形態155.yが、8である、式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項、または実施形態84から144のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート。
実施形態156.Dが、イムノコンジュゲートから放出される場合、MCl-1阻害剤である、式(A’)もしくは実施形態1から30のいずれか一項に記載の化合物、もしくはその薬学的に許容される塩、式(E’)もしくは実施形態60から70のいずれか一項に記載のイムノコンジュゲート、または実施形態84から155のいずれか一項に記載の化合物もしくはその薬学的に許容される塩、およびイムノコンジュゲート。
他のリンカー基
本明細書に開示のMCl-1阻害剤のADCまたはイムノコンジュゲートの調製に適しているリンカー基の他の例には、そのそれぞれの内容全体が参照により組み込まれる国際公開第2018200812号パンフレット、国際公開第2017214456号パンフレット、国際公開第2017214458号パンフレット、国際公開第2017214462号パンフレット、国際公開第2017214233号パンフレット、国際公開第2017214282号パンフレット、国際公開第2017214301号パンフレット、国際公開第2017214322号パンフレット、国際公開第2017214335号パンフレット、国際公開第2017214339号パンフレット、国際公開第2016094509号パンフレット、国際公開第2016094517号パンフレットおよび国際公開第2016094505号パンフレットなどの国際出願公開に開示されているものが含まれる。
例えば、本明細書に開示のMCl-1阻害剤のイムノコンジュゲートは、
Figure 2022532918000440
(式中、
Lcはリンカー成分であり、各Lcは、本明細書に開示されるようなリンカー成分から独立して選択され、
xは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19および20から選択される整数であり、
yは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19および20から選択される整数であり、
pは、1、2、3、4、5、6、7、8、9および10から選択される整数であり、
Dは、本明細書に開示のMCl-1阻害剤であり、
各切断要素(C)は、自壊性スペーサー、および酸誘導切断、ペプチダーゼ誘導切断、エステラーゼ誘導切断、グリコシダーゼ誘導切断、ホスホジエステラーゼ誘導切断、ホスファターゼ誘導切断、プロテアーゼ誘導切断、リパーゼ誘導切断またはジスルフィド結合切断から選択される切断を受けやすい基から独立して選択される)
から選択されるリンカー-ペイロード(「-L-D」)構造を有することができる。
一部の実施形態では、Lは、以下から選択される構造を有し、またはLは、以下から選択される構造成分を含む。
Figure 2022532918000441
Figure 2022532918000442
Figure 2022532918000443
一部の実施形態では、Lcはリンカー成分であり、各Lcは、
Figure 2022532918000444
から独立して選択される。
一部の実施形態では、リンカーLは、-**C(=O)O(CHNR11C(=O)(CH-;-**C(=O)O(CHNR11C(=O)(CHO(CH-;
**C(=O)O(CHNR11C(=O)X1a2aC(=O)(CH-;
**C(=O)OC(R12(CHNR11C(=O)X1a2aC(=O)(CH-;
**C(=O)O(CHNR11C(=O)X1a2aC(=O)(CHO(CH-;
**C(=O)O(CHNR11C(=O)X1a2aC(=O)(CHO(CHC(=O)-;
**C(=O)O(CHNR11C(=O)XC(=O)NR11(CHNR11C(=O)(CHO(CH-;
**C(=O)O(CHNR11C(=O)XC(=O)(CHNR11C(=O)(CH-;
**C(=O)XC(=O)NR11(CHNR11C(=O)(CHO(CH-;
**C(=O)(CHNR11C(=O)X1a2aC(=O)(CH-;
**C(=O)O(CHC(=O)X1a2aC(=O)(CH-;
**C(=O)(CHNR11C(=O)((CHO)(CH
**C(=O)O(CHC(=O)(CH-;-**C(=O)O(CHC(=O)(CHO(CH-;
**C(=O)O(CHC(=O)X1a2aC(=O)(CH-;
**C(=O)O(CHC(=O)X1a2aC(=O)(CHO(CH-;
**C(=O)O(CHC(=O)X1a2aC(=O)(CHO(CHC(=O)-;
**C(=O)O(CHC(=O)XC(=O)NR11(CHNR11C(=O)(CHO(CH-;
**C(=O)XC(=O)X(CHNR11C(=O)(CHO(CH-;
**C(=O)(CHC(=O)X1a2aC(=O)(CH-;
**C(=O)O((CHO)(CHNR11C(=O)XC(=O)(CH-;
**C(=O)O((CHO)(CHNR11C(=O)XC(=O)(CHNR11C(=O)(CH-;
**C(=O)O((CHO)(CHNR11C(=O)XC(=O)(CH(CH-;
**C(=O)O((CHO)(CHNR11C(=O)XC(=O)((CHO)(CH-;
**C(=O)O((CHO)(CHNR11C(=O)XC(=O)((CHO)(CHNR11C(=O)(CH-;
**C(=O)O((CHO)(CHNR11C(=O)XC(=O)((CHO)(CHNR11C(=O)(CH(CH-;
**C(=O)O((CHO)(CHNR11C(=O))XC(=O)((CHO)(CH(CH-;
**C(=O)O((CHO)(CHNR11C(=O)XC(=O)(CHNR11C(=O)((CHO)(CH-;
**C(=O)O((CHO)(CHNR11C(=O)XC(=O)(CHNR11C(=O)((CHO)(CH(CH-;
**C(=O)O((CHO)(CHNR11C(=O)X(CH(CH-;
**C(=O)O((CHO)(CHNR11C(=O)X((CHO)(CH-;
**C(=O)O((CHO)(CHNR11C(=O)X((CHO)(CHNR11C(=O)(CH-;
**C(=O)O((CHO)(CHNR11C(=O)X((CHO)(CHNR11C(=O)(CH(CH-;
**C(=O)O((CHO)(CHNR11C(=O)X((CHO)(CH(CH-;
**C(=O)O((CHO)(CHNR11C(=O)X(CHNR11((CHO)(CH-;
**C(=O)O((CHO)(CHNR11C(=O)XC(=O)(CHNR11((CHO)(CH(CH-;
**C(=O)O((CHO)(CHNR11C(=O)X(CH-;
**C(=O)O((CHO)(CHNR11C(=O)XC(=O)((CHO)(CH-;
**C(=O)O((CHO)(CHNR11C(=O)X(CH(CH-;-**C(=O)O(CH-;
**C(=O)O((CHO)(CH-;-**C(=O)O(CHNR11(CH-;
**C(=O)O(CHNR11(CHC(=O)X2a1aC(=O)-;
**C(=O)O(CH(CH-;-**C(=O)O((CHO)(CH(CH-;
**C(=O)O((CHO)(CHNR11C(=O)(CH-;-**C(=O)O(CHNR11C(=O(CH(CH-;
**C(=O)O((CHO)(CHNR11C(=O)(CH(CH-;
**C(=O)O((CHO)(CH-;-**C(=O)O((CHO)(CH(CH-;
**C(=O)O((CHO)(CHC(=O)NR11(CH-;-**C(=O)O(CHC(R12-;
**C(=O)OCHC(R12SS(CHNR11C(=O)(CH-、および
**C(=O)O(CHC(=O)NR11(CH-から選択されるリンカー成分を含み、ここで、**は、薬物部分(D)との結合点を示し、他の末端は、R100、すなわち、本明細書に記載されるようなカップリング基に結合され得、
ここで、
1a
Figure 2022532918000445
であり、ここで、は、X2aとの結合点を示し、
2aは、
Figure 2022532918000446
から選択され、ここで、は、X1aとの結合点を示し、
Figure 2022532918000447
であり、
は、-O(CHSSC(R12(CH-または-(CHC(R12SS(CHO-であり、
Figure 2022532918000448
であり、ここで、**は、薬物部分に対する向きを示し、
Figure 2022532918000449
であり、ここで、**は、薬物部分に対する向きを示し、
各R11は、HおよびC~Cアルキルから独立して選択され、
各R12は、HおよびC~Cアルキルから独立して選択され、
各mは、1、2、3、4、5、6、7、8、9および10から独立して選択され、
各nは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17および18から独立して選択される。
コンジュゲーションの方法
本発明は、1つまたは複数の親水性部分を有するリンカーを含む抗体薬物コンジュゲートを作製するために本発明のリンカー-薬物基を抗体または抗体断片にコンジュゲートする様々な方法を提供する。
式(E’)の抗体薬物コンジュゲートの生成のための一般的な反応スキームが以下のスキーム2に示される:
Figure 2022532918000450
(式中、RGは、適合性のR基と反応して対応するR100基を形成する反応性基である(そのような基は、表8および表9に示されている))。D、R、L、Lp、Ab、yおよびR100は、本明細書に定義される通りである。
スキーム3はさらに、式(E’)の抗体薬物コンジュゲートの生成のためのこの一般的な手法を示し、ここで、抗体は、R基(本明細書に定義される通り)と反応してR100基(本明細書に定義される通り)を介してリンカー-薬物基を抗体に共有結合する反応性基(RG)を含む。例示のみを目的として、スキーム3は、4個のRG基を有する抗体を示す。
Figure 2022532918000451
1つの態様では、リンカー-薬物基は、抗体内の修飾システイン残基を介して抗体にコンジュゲートされている(例えば国際公開第2014/124316号パンフレット参照)。スキーム4は、式(E’)の抗体薬物コンジュゲートの生成のためのこの手法を示し、ここで、抗体内の改変されたシステイン残基から生成された遊離チオール基が、R基(式中、Rはマレイミドである)と反応して、R100基(式中、R100はスクシンイミド環である)を介してリンカー-薬物基を抗体に共有結合する。例示のみを目的として、スキーム4は、4個の遊離チオール基を有する抗体を示す。
Figure 2022532918000452
別の態様では、リンカー-薬物基は、抗体内のリシン残基を介して抗体にコンジュゲートされている。スキーム5は、式(E’)の抗体薬物コンジュゲートの生成のためのこの手法を示し、ここで、抗体内のリシン残基からの遊離アミン基が、R基(式中、Rは、NHSエステル、ペンタフルオロフェニルまたはテトラフルオロフェニルである)と反応して、R100基(式中、R100はアミドである)を介してリンカー-薬物基を抗体に共有結合する。例示のみを目的として、スキーム5は、4個のアミン基を有する抗体を示す。
Figure 2022532918000453
別の態様では、リンカー-薬物基は、抗体の天然に存在するジスルフィド架橋におけるオキシム架橋の形成を介して抗体にコンジュゲートされている。オキシム架橋は、抗体の鎖間ジスルフィド架橋の還元によりケトン架橋を初めに形成し、1,3-ジハロアセトン(例えば、1,3-ジクロロアセトン)を使用して再架橋することにより形成される。ヒドロキシルアミンを含むリンカー-薬物基とのその後の反応はそれによって、リンカー-薬物基を抗体に結合するオキシム結合(オキシム架橋)を形成する(例えば国際公開第2014/083505号パンフレット参照)。スキーム6は、式(E’)の抗体薬物コンジュゲートの生成のためのこの手法を示す。
Figure 2022532918000454
式(F’)の抗体薬物コンジュゲートの生成のための一般的な反応スキームが以下のスキーム7に示される:
Figure 2022532918000455
(式中、RGは、適合性のR基と反応して対応するR100基を形成する反応性基である(そのような基は、表8および表9に示されている))。D、R、L、Lp、Ab、yおよびR100は、本明細書に定義される通りである。
スキーム8はさらに、式(F’)の抗体薬物コンジュゲートの生成のためのこの一般的な手法を示し、ここで、抗体は、R基(本明細書に定義される通り)と反応してR100基(本明細書に定義される通り)を介してリンカー-薬物基を抗体に共有結合する反応性基(RG)を含む。例示のみを目的として、スキーム8は、4個のRG基を有する抗体を示す。
Figure 2022532918000456
1つの態様では、リンカー-薬物基は、抗体内の修飾システイン残基を介して抗体にコンジュゲートされている(例えば国際公開第2014/124316号パンフレット参照)。スキーム9は、式(F’)の抗体薬物コンジュゲートの生成のためのこの手法を示し、ここで、抗体内の改変されたシステイン残基から生成された遊離チオール基が、R基(式中、Rはマレイミドである)と反応して、R100基(式中、R100はスクシンイミド環である)を介してリンカー-薬物基を抗体に共有結合する。例示のみを目的として、スキーム9は、4個の遊離チオール基を有する抗体を示す。
Figure 2022532918000457
別の態様では、リンカー-薬物基は、抗体内のリシン残基を介して抗体にコンジュゲートされている。スキーム10は、式(F’)の抗体薬物コンジュゲートの生成のためのこの手法を示し、ここで、抗体内のリシン残基からの遊離アミン基が、R基(式中、Rは、NHSエステル、ペンタフルオロフェニルまたはテトラフルオロフェニルである)と反応して、R100基(式中、R100はアミドである)を介してリンカー-薬物基を抗体に共有結合する。例示のみを目的として、スキーム10は、4個のアミン基を有する抗体を示す。
Figure 2022532918000458
別の態様では、リンカー-薬物基は、抗体の天然に存在するジスルフィド架橋におけるオキシム架橋の形成を介して抗体にコンジュゲートされている。オキシム架橋は、抗体の鎖間ジスルフィド架橋の還元によりケトン架橋を初めに形成し、1,3-ジハロアセトン(例えば、1,3-ジクロロアセトン)を使用して再架橋することにより形成される。ヒドロキシルアミンを含むリンカー-薬物基とのその後の反応はそれによって、リンカー-薬物基を抗体に結合するオキシム結合(オキシム架橋)を形成する(例えば国際公開第2014/083505号パンフレット参照)。スキーム11は、式(F’)の抗体薬物コンジュゲートの生成のためのこの手法を示す。
Figure 2022532918000459
提供されるのはまた、本発明の抗体コンジュゲートを評価するための分析方法論のいくつかの態様のためのプロトコールである。そのような分析方法論および結果は、コンジュゲートが有利な特性、例えば、その製造をより容易に、患者へのその投与をより容易に、それをより効果的に、かつ/または潜在的に患者にとってより安全にするであろう特性を有することを示すことができる。一例は、サイズ排除クロマトグラフィー(SEC)による分子サイズの決定であり、ここで、試料中の所望の抗体種の量が、試料中に存在する高分子量夾雑物(例えば、ダイマー、マルチマーまたは凝集抗体)または低分子量夾雑物(例えば、抗体断片、分解産物または個々の抗体鎖)の量に対して決定される。一般に、例えば、これらに限定されないがクリアランス速度、免疫原性および毒性などの抗体試料の他の特性に対する凝集体の影響のために、より多量のモノマーおよびより少量の、例えば凝集抗体を有することが望ましい。さらなる例は、疎水性相互作用クロマトグラフィー(HIC)による疎水性の決定であり、ここで、試料の疎水性が、既知の特性の1組の標準抗体に対して評価される。一般に、これらに限定されないが凝集、経時的な凝集、表面への付着、肝毒性、クリアランス速度および薬物動態学的曝露などの抗体試料の他の特性に対する疎水性の影響のために、低い疎水性を有することが望ましい。Damle, N.K., Nat Biotechnol. 2008; 26(8):884-885;Singh, S.K., Pharm Res. 2015; 32(11):3541-71を参照されたい。疎水性相互作用クロマトグラフィーにより測定されたとき、より高い疎水性指標スコア(すなわち、HICカラムからのより速い溶出)は、コンジュゲートのより低い疎水性を反映する。以下の実施例に示されるように、試験された抗体コンジュゲートの大部分が0.8超の疎水性指標を示した。一部の実施形態では、提供されるのは、疎水性相互作用クロマトグラフィーにより決定される0.8以上の疎水性指標を有する抗体コンジュゲートである。
以下の実施例は、本開示の例示的な実施形態を提供する。当業者は、本開示の精神または範囲を変更することなく行うことができる多くの改変および変形形態を認識するであろう。そのような改変および変形形態は、本開示の範囲内に包含される。提供される実施例は、本開示を何ら限定するものではない。
[実施例1]
リンカー、リンカー-ペイロード、およびそれらの前駆体の合成および特徴付け。
例示的なリンカー、リンカー-ペイロード、およびそれらの前駆体は、この実施例に記載した例示的な方法を使用して合成した。
略語:
CuI ヨウ化銅(I)
DCC ジシクロヘキシルカルボジイミド
DCM ジクロロメタン
DEA N-エチルエタンアミン
DIPEA:N,N-ジイソプロピルエチルアミン
DMF:ジメチルホルムアミド
DMSO:ジメチルスルホキシド
EEDQ エチル2-エトキシ-2H-キノリン-1-カルボキシレート
Fmoc-Cit-OH (2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-5-ウレイド-ペンタン酸
HBTU:(2-(1H-ベンゾトリアゾール-1-イル)-1,1,3,3-テトラメチルウロニウムヘキサフルオロホスフェート
HOAt:1-ヒドロキシ-7-アザベンゾトリアゾール
MgSO 硫酸マグネシウム
NHCl 塩化アンモニウム
NMP N-メチルピロリドン
Pd(PPhCl ジクロロ-トリ(トリフェニルホスフィン)パラジウム
PBr トリブロモホスファン
Pt/C 10% 炭素上白金 10%
SOCl 塩化チオニル
THF テトラヒドロフラン
TBAI テトラブチルアンモニウム、ヨウ化物
TFA トリフルオロ酢酸
材料、方法および一般手順:
商業的供給源から入手したすべての試薬は、さらに精製することなく使用した。無水溶媒は商業的供給源から入手し、さらに乾燥させることなく使用した。フラッシュクロマトグラフィーは、予め充填されたシリカゲルカートリッジ(Macherey-Nagel Chromabond Flash)を備えるCombiFlash(登録商標) Rf(Teledyne ISCO)で行った。薄層クロマトグラフィーは、Merck Type 60 F254シリカゲルでコーティングした5×10cmのプレートを用いて行った。マイクロ波加熱は、CEM Discover(登録商標)機器で行った。
H-NMR測定は、DMSO-dまたはCDClを溶媒として使用して、400MHz Bruker Avanceまたは500MHz Avance Neo分光計で行った。H NMRデータは、溶媒の残留ピーク(DMSO-dについて2.50ppm、およびCDClについて7.26ppm)を内部標準として使用して、百万分率(ppm)で与えられる、化学シフト値の形式である。分裂パターンは、s(一重線)、d(二重線)、t(三重線)、q(四重線)、quint(五重線)、m(多重線)、br s(幅広一重線)、br t(幅広三重線)dd(二重線の二重線)、td(二重線の三重線)、dt(三重線の二重線)、ddd(二重線の二重線の二重線)として示される。IR測定は、ATR Golden Gateデバイス(SPECAC)を備え付けたBruker Tensor 27で行った。HRMS測定は、LTQ OrbiTrap Velos Pro質量分析計(ThermoFisher Scientific)で行った。試料は、およそ0.01~0.05mg/mLの濃度範囲でCHCN/H2O(2/1:v/v)に溶解し、0.1mL/分の流速で2μLの注入によりソースに導入した。ESIイオン化パラメーターは以下の通りとした:3.5kVおよび350℃移動イオンキャピラリー。すべてのスペクトルは、ロックマスを使用して30,000または60,000の分解能で陽イオンモードにて取得した。
HRMS測定は、LTQ OrbiTrap Velos Pro質量分析計(ThermoFisher Scientific GmbH,Bremen,Germany)で行った。試料は、およそ0.01~0.05mg/mLの濃度範囲でCHCN/HO(2/1:v/v)に溶解し、0.1mL/分の流速で2μLの注入によりソースに導入した。ESIイオン化パラメーターは以下の通りとした:3.5kVおよび350℃移動イオンキャピラリー。すべてのスペクトルは、ロックマスを使用して30000または60000の分解能で陽イオンモードにて取得した。
UPLC(登録商標)-MS:
UPLC(登録商標)-MSデータは、以下のパラメーター(表10)で機器を使用して取得した:
Figure 2022532918000460
分取HPLC:
分取HPLC(「Prep-HPLC」)データは、以下のパラメーター(表11)で機器を使用して取得した:
Figure 2022532918000461
3つの分取HPLC方法を使用した:
a.TFA法:溶媒:A 水+0.05%TFA、B アセトニトリル+0.05%TFA、15~30CVで5~100%Bの勾配
b.NHHCO法:溶媒:A 水+0.02M NHHCO、B アセトニトリル/水 80/20+0.02M NHHCO、15~30CVで5~100%Bの勾配
c.中性法:溶媒:A 水、B アセトニトリル、15~30CVで5~100%Bの勾配
純粋な化合物を含有するすべての画分を合わせ、直接凍結乾燥して、化合物を非晶質粉末として得た。
分取SFC精製:
分取キラルSFCは、PIC solution Prep200システムで行った。試料は、150mg/mLの濃度でエタノールに溶解した。移動相は、40%エタノール/COに定組成で保持した。機器にはChiralpak IAカラムおよび3mLのループを取り付けた。ABPR(自動背圧調節器)は100barにセットした。
L23-P3の調製:
(2R)-2-[(5Sa)-5-[4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[2-(2-アジドエトキシ)アセチル]アミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]フェニル]メトキシカルボニル]ピペラジン-1-イル]エトキシ]-3-クロロ-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸
Figure 2022532918000462
ステップ1:(2S)-2-[[(2S)-2-[[2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]アセチル]アミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-N-[4-(ヒドロキシメチル)フェニル]-5-ウレイド-ペンタンアミド
THF(20mL)中の2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]酢酸(Broadpharmから購入、1.4g、6mmol)の溶液に、1-ヒドロキシピロリジン-2,5-ジオン(690mg、6mmol)およびN,N’-ジシクロヘキシルカルボジイミド(1.2g、6mmol)を添加した。反応混合物を室温で終夜撹拌した。沈殿物を濾別し、濾液を濃縮して、(2,5-ジオキソピロリジン-1-イル)2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]アセテート(1.9g、6mmol)を得、さらに精製することなく直ちに使用した。
DMF(15mL)中の(2,5-ジオキソピロリジン-1-イル)2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]アセテート(1.6g;4.85mmol)の溶液に、(2S)-2-[[(2S)-2-アミノ-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-N-[4-(ヒドロキシメチル)フェニル]-5-ウレイド-ペンタンアミド(1.96g;5.17mmol)を添加した。混合物を室温で2時間撹拌し、濃縮した。残留物を水(20mL)およびアセトニトリル(5mL)に希釈し、室温で終夜撹拌した。混合物を、中性法を使用する逆相C18クロマトグラフィーにより精製して、(2S)-2-[[(2S)-2-[[2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]アセチル]アミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-N-[4-(ヒドロキシメチル)フェニル]-5-ウレイド-ペンタンアミド(1.07g、1.8mmol)を得た。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 9.95 (s, 1H), 8.3 (d, 1H), 7.55 (d, 2H), 7.46 (d, 1H), 7.22 (d, 2H), 5.98 (t, 1H), 5.4 (s, 1H), 5.08 (t, 1H), 4.43 (d, 2H), 4.4 (q, 1H), 4.33 (dd, 1H), 3.95 (s, 2H), 3.6 (m, 10H), 3.38 (t, 2H), 3 (m, 2H), 2 (m, 1H), 1.7/1.6 (2m, 2H), 1.5-1.3 (m, 2H), 0.89/0.82 (2d, 6H).
ステップ2:[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]アセチル]アミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]フェニル]メチル(4-ニトロフェニル)カーボネート
DMF(30mL)中の(2S)-2-[[(2S)-2-[[2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]アセチル]アミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-N-[4-(ヒドロキシメチル)フェニル]-5-ウレイド-ペンタンアミド(100mg、0.168mmol)の溶液に、DIPEA(32μL、0.179mmol)およびビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(100mg、0.329mmol)を添加した。混合物を室温で4時間撹拌し、濃縮乾固した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(ジクロロメタン中メタノールの勾配)により精製して、4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]アセチル]アミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]フェニル]メチル(4-ニトロフェニル)カーボネート(65mg、0.088mmol)を得た。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 9.95 (s, 1H), 8.3 (d, 1H), 7.55 (d, 2H), 7.46 (d, 1H), 7.22 (d, 2H), 5.98 (t, 1H), 5.4 (s, 1H), 5.08 (t, 1H), 4.43 (d, 2H), 4.4 (q, 1H), 4.33 (dd, 1H), 3.95 (s, 2H), 3.6 (m, 10H), 3.38 (t, 2H), 3 (m, 2H), 3.02-2.95 (m, 2H), 2 (m, 1H), 1.7 (m, 1H), 1.6 (m, 1H), 0.89 (d, 3H), 0.82 (d, 3H).
ステップ3:(2R)-2-[(5S)-5-[4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]アセチル]アミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]フェニル]メトキシカルボニル]ピペラジン-1-イル]エトキシ]-3-クロロ-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸 L23-P3
DMF(16mL)中の((2R)-2-[(5S)-5-[3-クロロ-2-メチル-4-(2-ピペラジン-1-イルエトキシ)フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸 P3(147mg、0.17mmol)の溶液に、DIPEA(85μL、0.51mmol)、4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]アセチル]アミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]フェニル]メチル(4-ニトロフェニル)カーボネート(136mg、0.179mmol)、2,6-ルチジン(99μL、0.85mmol)およびHOAt(7mg、0.05mmol)を連続的に添加した。混合物を室温で終夜撹拌し、Xbridgeカラム上への反応混合物の直接堆積による、かつNHHCO法を使用するC18逆相分取HPLCにより精製して、L23-P3(110mg、0.074mmol)を得た。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 10.05 (s, 1H), 8.87 (d, 1H), 8.59 (s, 1H), 8.32 (d, 1H), 7.67 (br s, 1H), 7.59 (d, 2H), 7.52 (dd, 1H), 7.45 (td, 1H), 7.44 (d, 1H), 7.36 (dl, 1H), 7.29 (m, 2H), 7.27 (d, 2H), 7.2 (t, 2H), 7.19 (d, 1H), 7.14 (d, 1H), 7.13 (t, 1H), 7.03 (t, 1H), 6.99 (d, 1H), 6.71 (t, 1H), 6.24 (dl, 1H), 5.99 (t, 1H), 5.48 (dd, 1H), 5.41 (br s, 1H), 5.23 (m, 2H), 4.97 (s, 2H), 4.39 (m, 1H), 4.32 (dd, 1H), 4.21 (m, 2H), 3.95 (m, 2H), 3.75 (s, 3H), 3.65-3.50 (m, 10H), 3.34 (m, 2H), 3.02/2.95 (m, 2H), 2.73 (t, 2H), 2.49/2.3 (m,2H), 2.45 (m, 4H), 2.3 (m, 4H), 2 (m, 1H), 1.82 (s, 3H), 1.7/1.59 (m, 2H), 1.44/1.37 (m, 2H), 0.87 (d, 3H), 0.82 (d, 3H). 13C NMR (100 MHz, dmso-d6): δ 158.3, 152.9, 131.6, 131.6, 131.3, 131.3, 131, 129, 128.8, 121, 120.8, 119.5, 116.4, 116.1, 112.8, 112.4, 111.2, 74.5, 70.1, 69.3, 67.7, 66.4, 57, 56.7, 56.2, 53.7, 53.2, 50.4, 43.6, 39, 32.8, 31.6, 29.6, 27.3, 19.3, 17.7.
IR波長(cm-1):3500~2500、2106、1656。HR-ESI+:m/z[M+H]+=1479.5422/1479.5405(測定値/理論値)。
L24-P1の調製:
(2R)-2-[(5S)-5-[4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]アセチル]アミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]-3-クロロ-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸;2,2,2-トリフルオロアセテート;2,2,2-トリフルオロ酢酸
Figure 2022532918000463
ステップ1:(2S)-2-[[(2S)-2-[[2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]アセチル]アミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-N-[4-(ブロモメチル)フェニル]-5-ウレイド-ペンタンアミド
THF(10mL)中の(2S)-2-[[(2S)-2-[[2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]アセチル]アミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-N-[4-(ヒドロキシメチル)フェニル]-5-ウレイド-ペンタンアミド(330mg、0.55mmol;L23-P3の合成のステップ1に従って得た)の溶液に、ジクロロメタン中三臭化リン1Mの溶液(1mL、1mmol)を0℃で滴下添加した。混合物を0℃で1時間撹拌し、微粉NaHCO(100mg)を添加した。10分間撹拌した後、反応物を酢酸エチルで希釈し、濾過した。有機層を硫酸マグネシウムで乾燥させ、濃縮した。残留物である(2S)-2-[[(2S)-2-[[2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]アセチル]アミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-N-[4-(ブロモメチル)フェニル]-5-ウレイド-ペンタンアミド(283mg、0.43mmol)をさらに精製することなく使用した。HR-ESI+:m/z[M+H]+==595.3200/595.3198(測定値/理論値)。
ステップ2:((2R)-2-[(5S)-5-[4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]アセチル]アミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]-3-クロロ-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸;2,2,2-トリフルオロアセテート;2,2,2-トリフルオロ酢酸 L24-P1
DMF(1mL)中のエチル(2R)-2-[(5S)-5-[3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパノエート二塩酸塩(P1)(345mg、0.355mmol)の溶液に、(2S)-2-[[(2S)-2-[[2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]アセチル]アミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-N-[4-(ブロモメチル)フェニル]-5-ウレイド-ペンタンアミド(233mg、0.355mmol)およびDIPEA(50μL、0.304mmol)を連続的に添加した。混合物を室温で終夜撹拌した。水(0.5mL)中の水酸化リチウム一水和物(15mg、3.55mmol)の溶液を添加し、反応物を室温で24時間撹拌した。反応混合物を、XBridgeカラム上への反応混合物の直接堆積による、かつTFA法を使用するC18逆相分取HPLCにより精製して、L24-P1(80mg、0.054mmol)を得た。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 13.2 (m, 1H), 10.25 (m, 1H), 8.88 (d, 1H), 8.6 (s, 1H), 8.36 (d, 1H), 7.72 (d, 2H), 7.63 (d, 1H), 7.52 (dd, 1H), 7.46 (t, 1H), 7.44 (m, 1H), 7.43 (m, 2H), 7.37 (d, 1H), 7.3 (dd, 2H), 7.21 (t, 2H), 7.2 (d, 1H), 7.15 (d, 1H), 7.15 (t, 1H), 7.03 (t, 1H), 7 (t, 1H), 6.72 (t, 1H), 6.22 (d, 1H), 6 (t, 1H), 5.52 (m, 2H), 5.49 (dd, 1 H), 5.25 (dd, 2H), 4.5 (br s, 2H), 4.39 (m, 1H), 4.32 (m, 1H), 4.25 (m, 2H), 3.95 (br s, 2H), 3.76 (s, 3H), 3.4/3.24 (m, 4H), 3.35 (m, 2H), 3.28/2.51 (m, 2H), 3.04/2.83 (m, 4H), 3.02/2.96 (m, 2H), 2.92 (m, 2H), 2.87 (s, 3H), 1.99 (m,1 H), 1.83 (s, 3H), 1.69/1.61 (m, 2H), 1.46/1.38 (m, 2H), 0.88/0.82 (m, 6H). 13C NMR (125 MHz, dmso-d6): δ 134.2, 131.4, 131.3, 131.3, 131.2, 130.7, 128.7, 120.9, 120.5, 119.2, 116.3, 115.8, 112.7, 112.3, 111, 74, 70.2, 69.6, 67.8, 58.9, 56.9, 56.1, 55.4, 54, 50.5, 46.6, 44.9, 39, 32.7, 31.6, 29.8, 27.5, 19.7/18.4, 18.
IR波長(cm-1):3700~2200、3000~2000、2109、1662、1250~1050。HR-ESI+:m/z[M+Na]+=1473.5656/1473.5628(測定値/理論値)。
L13-C4の調製:
(2R)-2-[(5S)-5-[4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]プロパノイルアミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]フェニル]メトキシカルボニル]ピペラジン-1-イル]エトキシ]-3-クロロ-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-[4-(ホスホノメチル)フェニル]ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸
Figure 2022532918000464
ステップ1:(2S)-2-[3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]プロパノイルアミノ]-N-[(1S)-2-[4-(ヒドロキシメチル)アニリノ]-1-メチル-2-オキソ-エチル]-3-メチル-ブタンアミドの合成
DMF(20mL)中の(2S)-2-アミノ-N-[(1S)-2-[4-(ヒドロキシメチル)アニリノ]-1-メチル-2-オキソ-エチル]-3-メチル-ブタンアミド(0.9g、3.07mmol;L18-C3の合成のステップ3に従って得た)および3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]プロパン酸(Broadpharmから購入、2g、3.07mmol)の溶液に、DIPEA(1mL、6.13mmol)、3-(エチルイミノメチレンアミノ)プロピル-ジメチル-アンモニウム;クロリド(EDC)(0.65g、3.37mmol)および[ジメチルアミノ(トリアゾロ[4,5-b]ピリジン-3-イルオキシ)メチレン]-ジメチル-アンモニウム;ヘキサフルオロホスフェート(HATU)(1.28g、3.37mmol)を連続的に添加した。混合物を室温で終夜撹拌し、Xbridgeカラム上への反応混合物の直接堆積による、かつNHHCO法を使用するC18逆相分取HPLCにより精製して、(2S)-2-[3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]プロパノイルアミノ]-N-[(1S)-2-[4-(ヒドロキシメチル)アニリノ]-1-メチル-2-オキソ-エチル]-3-メチル-ブタンアミド(1.64g、1.81mmol)を得た。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 9.82 (m, 1H), 8.14 (d, 1H), 7.87 (d, 1H), 7.54 (d, 2H), 7.23 (d, 2H), 5.08 (t, 1H), 4.43 (d, 2H), 4.39 (m, 1H), 4.2 (m, 1H), 3.65-3.44 (m, 48H), 3.39 (t, 2H), 2.50-2.30 (m, 2H), 1.97 (m, 1H), 1.31 (d, 3H), 0.87/0.84 (m, 6 H). IR波長 (cm-1): 3600-3200, 3287, 2106, 1668, 1630, 1100.
HR-ESI+:m/z[M+H]+=919.5265/919.5234(測定値/理論値)。
ステップ2:[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]プロパノイルアミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]フェニル]メチル(4-ニトロフェニル)カーボネート
THFおよびジクロロメタンの混合物(それぞれ5および2.5mL)中の(2S)-2-[3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]プロパノイルアミノ]-N-[(1S)-2-[4-(ヒドロキシメチル)アニリノ]-1-メチル-2-オキソ-エチル]-3-メチル-ブタンアミド(210mg、0.228mmol)の溶液に、ピリジン(30μL、0.479mmol)およびクロロギ酸4-ニトロフェニル(97mg、0.479mmol)を連続的に添加した。反応物を室温で3時間撹拌し、さらにクロロギ酸4-ニトロフェニル(40mg、0.197mmol)およびピリジン(30μL、0.479mmol)を添加した。反応混合物を0℃で55時間撹拌し、蒸発乾固させた。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(ジクロロメタン中MeOHの勾配)により精製して、[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]プロパノイルアミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]フェニル]メチル(4-ニトロフェニル)カーボネート(118mg、0.110mmol)を得た。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 10.00 (s, 1H), 8.31 (d, 2H), 8.19 (d, 1H), 7.88 (d, 1H), 7.64 (d, 2H), 7.58 (d, 2H), 7.41 (d, 2H), 5.25 (s, 2H), 4.39 (m, 1H), 4.21 (m, 1H), 3.63-3.47 (m, 48H), 3.39 (t, 2H), 2.50-2.35 (m, 2H), 1.98 (m, 1H), 1.31 (d, 3H), 0.89/0.85 (m, 6H).
IR波長(cm-1):3278、2108、1763、1633、1526、1525、1350、1215、1110。
ステップ3:(2R)-2-[(5S)-5-[4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]プロパノイルアミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]フェニル]メトキシカルボニル]ピペラジン-1-イル]エトキシ]-3-クロロ-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-[4-(ホスホノメチル)フェニル]ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸(L13-C4)
DMF(5mL)中の[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]プロパノイルアミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]フェニル]メチル(4-ニトロフェニル)カーボネート(52mg、47.6μmol)の溶液に、(2R)-2-[(5S)-5-[3-クロロ-2-メチル-4-(2-ピペラジン-1-イルエトキシ)フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-[4-(ホスホノメチル)フェニル]ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸 C4(36.7mg、39.7μmol)およびDIPEA(26μL、108μmol)を連続的に添加した。反応物を室温で1時間撹拌し、Xbridgeカラム上への反応混合物の直接堆積による、かつNHHCO法を使用するC18逆相分取HPLCにより精製して、L13-C4(36mg、19μmol)を得た。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 10.1 (br s, 1H), 8.81 (br s, 1 H), 8.55 (m, 1 H), 8.32 (br s, 1H), 8.19 (d, 2H), 8.02 (br s, 1H), 7.66 (m, 1H), 7.58 (d, 2H), 7.37 (d, 1H), 7.29 (dd, 2H), 7.28 (d, 2H), 7.25 (d, 2H), 7.19 (t, 2H), 7.17 (d, 1H), 7.08 (t, 1H), 6.96 (d, 1H), 6.68 (t, 1H), 6.21 (d, 1H), 5.5 (m, 1H), 5.22 (m, 2H), 4.96 (s, 2H), 4.4 (m, 1H), 4.2 (dd, 1H), 4.18 (m, 2H), 3.62/3.41 (m, 24H), 3.5 (m, 4H), 3.38 (m, 2H), 3.28 (m, 4H), 2.87 (m, 2H), 2.7 (m, 2H), 2.48/2.36 (m, 2H), 2.41 (m, 4H), 1.99 (m, 1H), 1.79 (s, 3H), 1.3 (d, 3H), 0.87/0.83 (m, 6H). 13C NMR (100 MHz, dmso-d6): δ 130.7, 130.7, 130.6, 130.3, 129, 128.4, 127.4, 121, 119.6, 116.3, 116.1, 112.1, 70.2/67.3, 69.5, 67.5, 66.4, 58.2, 56.4, 53.2, 50.3, 49.6, 43.8, 36.3, 31, 19, 18.5, 17.8. 19F NMR (376 MHz, dmso-d6): δ -112.4. 31P NMR (200 MHz, dmso-d6): δ 17.8.
IR波長(cm-1):3290、2102、1698、1651、1237、1094、833、756。HR-ESI+:m/z[M+H]+=1867.7129/1867.7154(測定値/理論値)。
L19-C3の調製:
(2R)-2-[(5S)-5-[4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]アセチル]アミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]フェニル]メトキシカルボニル]ピペラジン-1-イル]エトキシ]-3-クロロ-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸
Figure 2022532918000465
ステップ1:[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]フェニル]メチル(4-ニトロフェニル)カーボネート
THF/ジクロロメタン混合物(それぞれ100および30mL)中の9H-フルオレン-9-イルメチルN-[(1S)-1-[[(1S)-2-[4-(ヒドロキシメチル)アニリノ]-1-メチル-2-オキソ-エチル]カルバモイル]-2-メチル-プロピル]カルバメート(1g、1.66mmol)の懸濁液に、ピリジン(269μL、3.32mmol)およびクロロギ酸4-ニトロフェニル(670mg、3.30mmol)を連続的に添加した。反応物を室温で終夜撹拌し、さらにクロロギ酸4-ニトロフェニルを添加した(335mg、1.66mmol)。反応物を室温で3時間撹拌し、濃縮し、残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(ヘプタン中酢酸エチルの勾配)により精製して、[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]フェニル]メチル(4-ニトロフェニル)カーボネート(658mg、0.97mmol)を得た。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 10.07 (m, 1H), 8.31 (d, 2H), 8.19 (d, 1H), 7.89 (d, 2H), 7.74 (t, 2H), 7.64 (d, 2H), 7.57 (d, 2H), 7.41 (m, 2H), 7.41 (d, 2H), 7.4 (m, 1H), 7.32 (t, 2H), 5.24 (s, 2H), 4.43 (m, 1H), 4.36-4.19 (m, 3H), 3.92 (dd, 1H), 2 (m, 1H), 1.32 (d, 3H), 0.9/0.87 (m, 6 H).
IR波長(cm-1):3350~3200、1760、1690、1670、1630、1523、1290。
ステップ2:(2R)-2-[(5S)-5-[3-クロロ-4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]フェニル]メトキシカルボニル]ピペラジン-1-イル]エトキシ]-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸
DMF(1mL)中の(2R)-2-[(5S)-5-[3-クロロ-2-メチル-4-(2-ピペラジン-1-イルエトキシ)フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸 C3(100mg、0.116mmol)の溶液に、[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]フェニル]メチル(4-ニトロフェニル)カーボネート(87mg、0.128mmol)およびDIPEA(38μL、0.232mmol)を連続的に添加した。反応混合物を室温で終夜撹拌し、濃縮した。残留物を水に溶かし、濾過して、(2R)-2-[5-[3-クロロ-4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]フェニル]メトキシカルボニル]ピペラジン-1-イル]エトキシ]-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸(110mg、0.078mmol)を得、さらに精製することなく次のステップで使用した。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 10.05 (br s, 1 H), 8.88 (d, 1H), 8.57 (s, 1H), 8.23 (d, 1H), 7.88 (d, 2H), 7.75 (m, 1H), 7.74 (2d, 2H), 7.58 (d, 2H), 7.53 (dd, 1H), 7.45 (m, 1H), 7.45 (d, 1H), 7.41 (m, 1H), 7.4 (m, 2H), 7.31 (m, 2H), 7.29 (m, 2H), 7.26 (d, 2H), 7.2 (t, 2H), 7.18 (m, 1H), 7.14 (d, 1H), 7.11 (t, 1H), 7.03 (t, 1H), 6.98 (d, 1H), 6.69 (t, 1H), 6.2 (d, 1H), 5.46 (d, 1H), 5.22 (m, 2H), 4.97 (s, 2H), 4.42 (t, 1H), 4.26 (m, 2H), 4.21 (m, 1H), 4.2 (m, 2H), 3.91 (m, 1H), 3.75 (s, 3H), 3.35/2.45 (m, 2H), 3.29 (m, 4H), 2.73 (t, 2H), 2.44 (m, 4H), 1.99 (m, 1H), 1.8 (s, 3H), 1.29 (d, 3H), 0.88/0.85 (m, 6H). 13C NMR (100 MHz, dmso-d6): δ 158.3, 152.7, 131.6, 131.4, 131.3, 131.1, 131.1, 128.9, 128.5, 128, 127.6, 125.8, 120.9, 120.5, 120.5, 119.4, 116.4, 116, 112.7, 112.2, 111.1, 69.4, 67.8, 66.5, 66.1, 60.7, 56.8, 56.1, 53.2, 49.6, 47.1, 43.8, 33.3, 30.9, 19.7, 18.9, 18.1.
ステップ3:(2R)-2-[(5S)-5-[4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-アミノ-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]フェニル]メトキシカルボニル]ピペラジン-1-イル]エトキシ]-3-クロロ-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸
DMF(3mL)中の(2R)-2-[(5S)-5-[3-クロロ-4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]フェニル]メトキシカルボニル]ピペラジン-1-イル]エトキシ]-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸(176mg、0.125mmol)の溶液に、0℃でピペリジン(300μL、1.25mmol)を滴下添加した。反応混合物を室温で1時間撹拌し、濃縮した。残留物を、Xbridgeカラム上への反応混合物の直接堆積による、かつNHHCO法を使用するC18逆相分取HPLCにより精製して、(2R)-2-[(5S)-5-[4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-アミノ-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]フェニル]メトキシカルボニル]ピペラジン-1-イル]エトキシ]-3-クロロ-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸(130mg、0.11mmol)を得た。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 10.2 (s, 1H), 8.9 (d, 1H), 8.6 (dl, 1H), 8.55 (s, 1H), 7.85 (d, 1H), 7.6 (d, 2H), 7.55 (dd, 1H), 7.45 (m, 2H), 7.25 (d, 2H), 7.25 (m, 4H), 7.2 (m, 3H), 7.15 (d, 1H), 7.1 (t, 1H), 7.05 (t, 1H), 6.95 (d, 1H), 6.65 (t, 1H), 6.15 (d, 1H), 5.4 (dd, 1H), 5.2 (m, 2H), 4.95 (s, 2H), 4.45 (m, 1H), 4.2 (m, 2H), 3.75 (s, 3H), 3.4/2.35 (m, 2H), 3.3 (m, 5H), 2.6 (t, 2H), 2.4 (m, 4H), 2 (m, 3H), 1.8 (s, 3H), 1.3 (d, 3H), 0.9/0.85 (m, 6H).
IR波長(cm-1):3600~2500、1678。
ステップ4:(2R)-2-[(5S)-5-[4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]アセチル]アミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]フェニル]メトキシカルボニル]ピペラジン-1-イル]エトキシ]-3-クロロ-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸 L19-C3
DMF(0.3mL)中の2R)-2-[(5S)-5-[4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-アミノ-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]フェニル]メトキシカルボニル]ピペラジン-1-イル]エトキシ]-3-クロロ-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸(50mg、0.042mmol)の溶液に、DIPEA(14μL、0.085mmol)、[ジメチルアミノ-(2,5-ジオキソピロリジン-1-イル)オキシ-メチレン]-ジメチル-アンモニウム;テトラフルオロボレート(14mg、0.046mmol)、およびDMF(0.5mL)中の2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]酢酸(28mg、0.12mmol)の溶液を連続的に添加した。反応混合物を室温で2時間撹拌し、Xbridgeカラム上への反応混合物の直接堆積による、かつNHHCO法を使用するC18逆相分取HPLCにより精製して、L19-C3(22mg、0.016mmol)を得た。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 10.02 (s, 1H), 8.88 (d, 1H), 8.4 (d, 1H), 7.72 (br s, 1H), 7.58 (s, 1H), 7.58 (d, 2H), 7.53 (d, 1H), 7.45 (d, 1H), 7.45 (t, 1H), 7.38 (d, 1H), 7.29 (dd, 2H), 7.27 (d, 2H), 7.2 (t, 2H), 7.18 (d, 1H), 7.14 (d, 1H), 7.11 (t, 1H), 7.03 (t, 1H), 6.98 (d, 1H), 6.7 (t, 1H), 6.21 (d, 1H), 5.46 (dd, 1H), 5.23 (m, 2H), 4.97 (s, 2H), 4.4 (m, 1H), 4.29 (dd, 1H), 4.22 (m, 2H), 3.94 (s, 2H), 3.75 (s, 3H), 3.65-3.53 (m, 10H), 3.35 (m, 2H), 3.3 (m, 4H), 3.3/2.5 (m, 2H), 2.73 (t, 2H), 2.44 (m, 4H), 2 (m, 1H), 1.81 (s, 3H), 1.3 (d, 3H), 0.88/0.82 (m, 6H). 13C NMR (100 MHz, dmso-d6): δ 158, 152.7, 131.4, 131.4, 131.3, 131.1, 131.1, 128.9, 128.6, 120.9, 120.7, 119.5, 116.2, 112.5, 112.1, 111.1, 70.4, 70.4, 69.7, 67.5, 66.2, 56.8, 56.7, 56.1, 53.3, 50.4, 49.5, 43.8, 31.7, 19.5, 0.82, 18.3, 18.2. 19F NMR (376 MHz, dmso-d6): δ -112.3.
IR波長(cm-1):3294、2104、1697、1663、1288、1238、1120、1076、1051、1020、833、755。HR-ESI+:m/z[M+H]+=1395.5083/1395.5070(測定値/理論値)。
L15-C5の調製:
(2R)-3-[2-[[2-[3-[[[2-[3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]プロパノイルアミノ]エトキシ-ヒドロキシ-ホスホリル]オキシ-ヒドロキシ-ホスホリル]オキシメチル]フェニル]ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]-2-[(5S)-5-[3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-プロパン酸
Figure 2022532918000466
ステップ1:(2R)-2-[(5S)-5-[3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-[3-(ホスホノオキシメチル)フェニル]ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸;ビス2,2,2-トリフルオロ酢酸
THF(0.5mL)中のエチル(2R)-2-[(5S)-5-[3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-[3-(ヒドロキシメチル)フェニル]ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパノエート(110mg、0.123mmol;国際公開第2016/207216号に従って調製した)の溶液に、アルゴン下、-40℃でジホスホリルクロリド(51μL、0.368mmol)を滴下添加した。反応混合物を-40℃で30分間撹拌した。さらにジホスホリルクロリド(10μL、0.074mmol)を-40℃で添加し、反応物を-40℃で20分間撹拌し、炭酸カリウムの飽和水溶液(0.1mL)の添加によりクエンチし、室温に加温した。pHを炭酸カリウム(粉末)の添加により10に調整し、反応物を室温で20分間撹拌した。反応混合物を、0℃で2M HCl水溶液をゆっくりと添加することによりpH2に酸性化し、ジクロロメタン(4回)で抽出した。合わせた有機層を濃縮し、ジオキサン(3mL)で希釈し、水(0.3mL)中の水酸化リチウム一水和物(17mg、0.403mmol)の溶液を添加した。反応混合物を室温で4日間撹拌し、4M HCl水溶液(0.4mL、0.4mmol)により中和し、蒸発させた。残留物を、Xbridgeカラム上への反応混合物の直接堆積による、かつTFA法を使用するC18逆相分取HPLCにより精製して、(2R)-2-[(5S)-5-[3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-[3-(ホスホノオキシメチル)フェニル]ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸;2,2,2-トリフルオロ酢酸を2TFA塩(41mg、43μmol)として得た。MS(ESI)m/z[M+2H]/2+=487.5。
ステップ2:2-[3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]プロパノイルアミノ]エチルジヒドロゲンホスフェート
ジクロロメタン(2mL)中の3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]プロパン酸(200mg、0.311mmol)の溶液に、1-ヒドロキシピロリジン-2,5-ジオン(79mg、0.684mmol)、3-(エチルイミノメチレンアミノ)プロピル-ジメチル-アンモニウム;クロリド(107mg、0.56mmol)を添加した。反応混合物を室温で終夜撹拌し、ジクロロメタンで希釈し、NaHCOの飽和水溶液で分配し、ジクロロメタンで抽出した。合わせた有機層をブラインで洗浄し、硫酸マグネシウムで乾燥させ、およそ1mLにまで濃縮した。残留物をDMF(1mL)で希釈し、リン酸二水素2-アミノエチル(30mg、0.214mmol)を添加し、反応混合物を80℃で終夜撹拌し、ジクロロメタンで希釈し、水で洗浄した。水層を分離し、凍結乾燥して、2-[3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]プロパノイルアミノ]エチルジヒドロゲンホスフェート(165mg、0.2mmol)を得た。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 3.45-3.65 (m, 53H), 3.26-3.39 (m, 2H), 3.12 (m, 2H), 2.27 (t, 2H).
HR-ESI+:m/z[M+H]+=767.3697/767.3686(測定値/理論値)。
ステップ3:(2R)-3-[2-[[2-[3-[[[2-[3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]プロパノイルアミノ]エトキシ-ヒドロキシ-ホスホリル]オキシ-ヒドロキシ-ホスホリル]オキシメチル]フェニル]ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]-2-[(5S)-5-[3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-プロパン酸(L15-C5)
DMF(0.2mL)中の2-[3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]プロパノイルアミノ]エチルジヒドロゲンホスフェート(49mg、0.064mmol)の溶液に、ジ(イミダゾール-1-イル)メタノン(11mg、0.066mmol)、トリエチルアミン(17μL、0.066mmol)および4Å分子篩(50mg)を連続的に添加した。反応物を室温で2時間撹拌した。固体を濾過により除去し、濾液を塩化亜鉛(23mg、0.172mmol)および(2R)-2-[(5S)-5-[3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-[3-(ホスホノオキシメチル)フェニル]ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸;ビス2,2,2-トリフルオロ酢酸(41mg、0.043mmol)で処理した。混合物を50℃に終夜加熱した。反応混合物を、Xbridgeカラム上への反応混合物の直接堆積による、かつNHHCO法を使用するC18逆相分取HPLCにより精製して、L15-C5(11mg、6μmol)を得た。HR-ESI+:m/z[M+H]+=1703.5962/1703.5959(測定値/理論値)。
L17-C3の調製:
(2R)-2-[(5S)-5-[4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S,3R,4S,5R)-6-アジド-2,3,4,5-テトラヒドロキシ-ヘキシル]アミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]フェニル]メトキシカルボニル]ピペラジン-1-イル]エトキシ]-3-クロロ-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸;2,2,2-トリフルオロ酢酸
Figure 2022532918000467
1%のDIPEAを含有するDMSO/水 80/20の混合物(20mL)中の(2R)-2-[(5S)-5-[4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-アミノ-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]フェニル]メトキシカルボニル]ピペラジン-1-イル]エトキシ]-3-クロロ-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸(230mg、0.194mmol;L19-C3の調製のステップ5に従って得た)および6-デオキシ-6-アジド-D-ガラクトース(120mg、0.584mmol;Ekholm et al., ChemMedChem 2016, 11, 2501-2505に従って得た)の溶液に、室温でシアノ水素化ホウ素ナトリウム(24mg、0.389mmol)を添加した。反応混合物を65℃で48時間加熱した。次いで、さらにシアノ水素化ホウ素ナトリウム(24mg、0.389mmol)および6-デオキシ-6-アジド-D-ガラクトース(120mg、0.584mmol)を室温で添加した。反応混合物を65℃でさらに48時間加熱し、Xbridgeカラム上への反応混合物の直接堆積による、かつTFA法を使用するC18逆相分取HPLCにより精製して、L17-C3(38mg、28μmol)を得た。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 13.2 (br s, 1H), 10.2 (s, 1H), 8.88 (d, 1H), 8.85 (d, 1H), 8.62 (s, 1H), 8.53 (br s, 1H), 7.63 (d, 1H), 7.59 (d, 2H), 7.52 (d, 1H), 7.45 (t, 1H), 7.42 (d, 1H), 7.33 (dd, 2H), 7.33 (d, 2H), 7.27 (d, 1H), 7.27 (d, 1H), 7.21 (t, 2H), 7.15 (t, 1H), 7.04 (t, 1H), 7.01 (d, 1H), 6.73 (t, 1H), 6.21 (d, 1H), 5.51 (d, 1H), 5.28/5.22 (m, 2H), 5.04 (br s, 2H), 4.52 (m, 1H), 4.49 (m, 2H), 4.12 (m, 1H), 3.89 (m, 1H), 3.78 (m, 1H), 3.76 (s, 3H), 3.63 (m, 6H), 3.42/3.21 (m, 2H), 3.38 (m, 1H), 3.37 (m, 1H), 3.28/2.52 (m, 2H), 3.22 (m, 4H), 2.96 (m, 2H), 2.21 (m, 1H), 1.86 (s, 3H), 1.36 (d, 3H), 1.03/0.94 (m, 6H). 13C NMR (125 MHz, dmso-d6): δ 157.8, 152.5, 131.4, 131.3, 131.3, 130.6, 129.1, 129, 128.8, 120.8, 120.6, 119.4, 116.2, 116.1, 112.3, 111.3, 111.3, 74.2, 71.3, 70.4, 69.5, 69.2, 67.1, 65.6, 64.5, 64.5, 56.2, 54.8, 54.2, 51.9, 50.3, 49.9, 32.7, 29.4, 19.3, 18.9, 18. 19F NMR (470 MHz, dmso-d6): δ -74.4, -112.1.
IR波長(cm-1):2200~3500、2104、1669、1181、1132、798、758、720。HR-ESI+:m/z[M+H]+=1369.4918/1369.4913(測定値/理論値)。
L24-P7の調製:
(2R)-2-[(5S)-5-[4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]アセチル]アミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]-3-クロロ-2-エチル-フェニル]-6-プロパ-1-イニル-チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸;2,2,2-トリフルオロアセテート;2,2,2-トリフルオロ酢酸
Figure 2022532918000468
THF(5mL)中の(2S)-2-[[(2S)-2-[[2-(2-アジドエトキシ)アセチル]アミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-N-[4-(ブロモメチル)フェニル]-5-ウレイド-ペンタンアミド(72mg、0.109mmol)の溶液に、(2R)-2-[(5S)-5-[3-クロロ-2-エチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル]-6-プロパ-1-イニル-チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸 P7(30mg、0.036mmol)およびDIPEA(19μL、0.108mmol)を連続的に添加した。反応混合物を室温で終夜撹拌し、Xbridgeカラム上への反応混合物の直接堆積による、かつTFA法を使用するC18逆相分取HPLCにより精製して、L24-P7(25mg、18μmol)を得た。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 10.25 (s, 1H), 8.85 (d, 1H), 8.62 (s, 1H), 8.35 (d, 1H), 7.72 (d, 2H), 7.6 (d, 1H), 7.5 (d, 1H), 7.45 (t, 1H), 7.43 (d, 2H), 7.4 (d, 1H), 7.22 (d, 1H), 7.17 (m, 1H), 7.15 (m, 1H), 7.13 (d, 1H), 7.02 (t, 1H), 7 (d, 1H), 6.78 (t, 1H), 6.3 (d, 1H), 5.98 (br s, 1H), 5.5 (dd, 1H), 5.4 (br s, 1H), 5.28/5.2 (m, 2H), 4.5 (br s, 2H), 4.38 (m, 1H), 4.3 (dd, 1H), 4.25 (m, 2H), 3.94 (br s, 2H), 3.74 (s, 3H), 3.70/3.50 (m, 10H), 3.50 (m, 8 H), 3.35 (t, 2H), 3.22/2.5 (m, 2 H), 3.0 (m, 2H), 2.95 (t, 2H), 2.9 (br s, 3H), 2.55/2.4 (m, 2H), 2.0 (s, 3H), 1.98 (m, 1H), 1.70/1.30 (m, 4H), 0.88/0.82 (m, 6H), 0.72 (t, 3H).
IR波長(cm-1):3321、2111、1660、1188、1124、798,756,719。HR-ESI+:m/z[M+H-CF3COOH]+=1409.59077/1409.5903(測定値/理論値)。
L24-P6の調製:
(2R)-2-[(5S)-5-[4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]アセチル]アミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]-3-クロロ-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-[2-(ヒドロキシメチル)フェニル]ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸;2,2,2-トリフルオロアセテート;2,2,2-トリフルオロ酢酸
Figure 2022532918000469
DMF(1mL)中の(2S)-2-[[(2S)-2-[[2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]アセチル]アミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-N-[4-(ブロモメチル)フェニル]-5-ウレイド-ペンタンアミド(55.3mg、84μmol)の溶液に、エチル(2R)-2-[(5S)-5-[3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-[2-(ヒドロキシメチル)フェニル]ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパノエート(53.2mg、59μmol;欧州特許第2886545号に従って合成した)およびDIPEA(44μL、0.252mmol)を連続的に添加した。反応混合物を室温で1時間撹拌し、減圧下で濃縮した。残留物をジオキサン(1mL)で希釈し、水(0.3mL)中の水酸化リチウム一水和物(14mg、0.0334mmol)の溶液を添加した。反応混合物を室温で終夜撹拌し、1M HCl水溶液(0.33mL、0.33mmol)の添加により中和し、減圧下で濃縮した。粗生成物を、Xbridgeカラム上への反応混合物の直接堆積による、かつTFA法を使用するC18逆相分取HPLCにより精製して、L24-P6(47mg、32μmol)を得た。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 10.27 (s, 1H), 8.94 (d, 1H), 8.61 (s, 1H), 8.38 (d, 1H), 7.93 (d, 1H), 7.73 (d, 2H), 7.68 (t, 1H), 7.66 (d, 1H), 7.5 (t, 1H), 7.45 (d, 1H), 7.43 (d, 2H), 7.38 (d, 1H), 7.37 (m, 1H), 7.3 (dd, 2H), 7.21 (d, 1H), 7.2 (t, 2H), 7.16 (t, 1H), 7.02 (d, 1H), 6.72 (t, 1H), 6.21 (d, 1H), 6.01 (m, 1H), 5.5 (d, 1H), 5.4 (m, 1H), 5.3 (m, 2H), 4.8 (s, 2H), 4.39 (m, 1H), 4.32 (dd, 1H), 4.25 (m, 2H), 3.95 (s, 2H), 3.57 (m, 16H), 3.42/3.26 (m, 2 H), 3.36 (m, 2H), 3.29/2.51 (m, 2H), 3.11/2.92 (m, 8H), 2.98 (m, 2H), 2.97 (m, 2H), 1.99 (m, 1H), 1.83 (s, 3H), 1.68/1.62 (m, 2H), 1.45/1.39 (m, 2H), 0.88/0.82 (m, 6H). 13C NMR (100 MHz, dmso-d6): δ 158.2, 152.1, 134.2, 131.4, 131.3, 130.9, 130.8, 130.2, 128.7, 128.1, 127, 120.8, 119.3, 116.3, 115.7, 112.2, 111, 74, 70.5, 70.1, 69.5, 67.7, 62.3, 58.8, 57.2, 55.5, 54.1, 50.5, 46.6, 38.9, 32.5, 31.5, 29.6, 27.6, 19.6, 18.6, 18.3. 19F NMR (376 MHz, dmso-d6): δ -74.6, -112.5.
IR波長(cm-1):3303、2104、1730、1662、1182、1124、833,796,761。HR-ESI+:m/z[M+2H]/2+=726.2957/726.2941(測定値/理論値)。
L20-C6の調製:
(2R)-3-[2-[[2-[2-[[2-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]アセチル]アミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]フェニル]メトキシカルボニル-メチル-アミノ]エチル-メチル-カルバモイル]オキシメチル]フェニル]ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]-2-[(5S)-5-[3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-プロパン酸
Figure 2022532918000470
ステップ1:エチル(2R)-3-[2-[[2-[2-[[2-[tert-ブトキシカルボニル(メチル)アミノ]エチル-メチル-カルバモイル]オキシメチル]フェニル]ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]-2-[(5S)-5-[3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-プロパノエート
ジクロロメタン(0.5mL)中の(エチル(2R)-2-[(5S)-5-[3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-[2-(ヒドロキシメチル)フェニル]ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパノエート(50mg、55μmol;欧州特許第2886545号に従って合成した)の溶液に、クロロギ酸4-ニトロフェニル(19mg、94μmol)およびDIPEA(69μL、0.5mmol)を連続的に添加した。反応混合物を室温で1時間撹拌し、tert-ブチルN-メチル-N-[2-(メチルアミノ)エチル]カルバメート(54mg、0.287mmol)を添加した。混合物を室温で終夜撹拌し、減圧下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(ジクロロメタン中メタノールの勾配)により精製して、エチル(2R)-3-[2-[[2-[2-[[2-[tert-ブトキシカルボニル(メチル)アミノ]エチル-メチル-カルバモイル]オキシメチル]フェニル]ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]-2-[(5S)-5-[3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-プロパノエート(30mg、27μmol)を得た。1H NMR (500 MHz, dmso-d6): δ 9.00 (d, 1H), 8.58 (s, 1H), 7.98 (m, 1H), 7.61 (d, 1H), 7.51 (t, 1H), 7.48 (d, 1H), 7.45 (t, 1H), 7.31 (dd, 2H), 7.31 (d, 1H), 7.22 (t, 2H), 7.18 (t, 1H), 7.17 (d, 1H), 7.02 (d, 1H), 6.76 (t, 1H), 6.32 (d, 1H), 5.52 (dd, 1H), 5.47 (br s, 2H), 5.26 (m, 2H), 4.2 (m, 2H), 4.07 (m, 2H), 3.24/3.17 (2m, 4H), 3.17/2.6 (2m, 2H), 2.77/2.64 (m, 6H), 2.7 (m, 2H), 2.49/2.28 (m, 8H), 2.12 (br s, 3H), 1.87 (s, 3H), 1.3 (3s, 9H), 1.07 (t, 3H). 13C NMR (125 MHz, dmso-d6): δ 158.2, 152.4, 131, 130.1, 130.1, 129, 128.3, 128.2, 121.5, 121.4, 120.9, 116.3, 115.8, 112, 111.1, 74.1, 69.2, 68.1, 65.6, 61.2, 56.8, 55.2, 53.1, 46.5, 45.9, 34.5, 32.4, 28.3, 17.4, 14.9.19F NMR (470 MHz, dmso-d6): δ -112.2.
IR波長(cm-1):1750、1693、1221/1160/1120、834/756。
ステップ2:2R)-3-[2-[[2-[2-[[2-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]アセチル]アミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]フェニル]メトキシカルボニル-メチル-アミノ]エチル-メチル-カルバモイル]オキシメチル]フェニル]ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]-2-[(5Sa)-5-[3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-プロパン酸 L20-C6
ジクロロメタン(0.5mL)中のエチル(2R)-3-[2-[[2-[2-[[2-[tert-ブトキシカルボニル(メチル)アミノ]エチル-メチル-カルバモイル]オキシメチル]フェニル]ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]-2-[(5S)-5-[3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-プロパノエート(25mg、22μmol)の溶液に、0℃でトリフルオロ酢酸(35μL、447mmol)を添加した。反応混合物を室温で6時間撹拌し、減圧下で濃縮した。残留物をDMF(0.5mL)で希釈し、[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]アセチル]アミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]フェニル]メチル(4-ニトロフェニル)カーボネート(20mg、22μmol;L23-P3の調製のステップ3に従って得た)およびDIPEA(78μL、0.447mmol)を連続的に添加した。反応混合物を室温で終夜撹拌し、減圧下で濃縮し、ジオキサン(0.5mL)で希釈し、水(0.3mL)中の水酸化リチウム一水和物(3.7mg、89μmol)の溶液を添加した。反応物を室温で終夜撹拌し、1M HCl水溶液の滴下添加により0℃でpH7まで中和し、減圧下で濃縮した。
粗生成物を、Xbridgeカラム上への反応混合物の直接堆積による、かつNHHCO法を使用するC18逆相分取HPLCにより精製して、L20-C6(13mg、8μmol)を得た。1H NMR (500 MHz, dmso-d6): δ 8.88 (m, 1H), 8.54 (s, 1 H), 7.97 (d, 1H), 7.77 (m, 1H), 7.6 (d, 2H), 7.5 (m, 1H), 7.47 (m, 1H), 7.46 (m, 1H), 7.41 (d, 1H), 7.29 (dd, 2H), 7.21 (t, 2H), 7.19 (d, 1H), 7.18 (m, 2H), 7.12 (t, 1H), 6.97 (d, 1H), 6.7 (t, 1H), 6.19 (d, 1H), 5.49 (d, 1H), 5.45 (m, 4H), 5.23 (m, 2H), 4.89 (m, 2H), 4.4 (m, 1H), 4.32 (dd, 1H), 4.22 (m, 2H), 3.94 (s, 2H), 3.56 (m, 10H), 3.39/2.44 (m, 2H), 3.34 (t, 2H), 3.28 (m, 4H), 2.99 (m, 2H), 2.75/2.7 (m, 6H), 2.73 (m, 2H), 2.5/2.37 (m, 8H), 2.18 (s, 3H), 2.04 (m, 1H), 1.81 (s, 3H), 1.74/1.62 (m, 2H), 1.46/1.38 (m, 2H), 0.86/0.8 (m, 6H). 13C NMR (125 MHz, dmso-d6): δ 158.3, 152.9, 131.5, 131.4, 131.3, 131, 130, 128.3, 128.3, 128, 127.7, 120.8, 119.3, 116.2, 115.6, 112.1, 111.1, 75.3, 70.5, 70.2, 69.2, 67.6, 66.6, 65.4, 57.2, 56.7, 55.1/52.9, 54, 50.5, 46.5, 45.1, 39.1, 34.4, 31.5, 29.6, 27.4, 19.9, 18.2, 18. 19F NMR (470 MHz, dmso-d6): δ -112.5.
IR波長(cm-1):3323、2106、1691、1660、1220、1120、1051、759。HR-ESI+:m/z[M+H]+=1609.6517/1609.6500(測定値/理論値)。
L22-C1の調製:
(2R)-2-[(5Sa)-5-[3-クロロ-4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[3-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]プロパノイルアミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸;2,2,2-トリフルオロアセテート;2,2,2-トリフルオロ酢酸
Figure 2022532918000471
ステップ1:(2R)-2-[(5S)-5-[4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-アミノ-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]-3-クロロ-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸;2,2,2-トリフルオロアセテート;ビス-2,2,2-トリフルオロ酢酸
DMF(20mL)中の9H-フルオレン-9-イルメチルN-[(1S)-1-[[(1S)-2-[4-(ヒドロキシメチル)アニリノ]-1-メチル-2-オキソ-エチル]カルバモイル]-2-メチル-プロピル]カルバメート(200mg、0.388mmol)の溶液に、トリフェニルホスフィン(152mg、0.581mmol)およびN-ブロモスクシンイミド(103mg、0.581mmol)を連続的に添加した。反応混合物を室温で終夜撹拌し、(2R)-2-[(5S)-5-[3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸 C1(302mg、345mmol)およびDIPEA(120μL、0.691mmol)を添加した。反応物を室温で2時間撹拌し、ジエチルアミン(49μL、486mmol)を添加した。反応物を室温で24時間撹拌し、減圧下で濃縮し、Xbridgeカラム上への反応混合物の直接堆積による、かつTFA法を使用するC18逆相分取HPLCにより精製して、(2R)-2-[(5S)-5-[4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-アミノ-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]-3-クロロ-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸;2,2,2-トリフルオロアセテート;ビス-2,2,2-トリフルオロ酢酸(253mg、0.220mmol)を得た。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 10.4 (s, 1H), 8.89 (d, 1H), 8.75 (d, 1H), 8.61 (s, 1H), 8.08 (大きい, 3H), 7.72 (d, 2H), 7.63 (d, 1H), 7.52 (d, 1H), 7.46 (t, 1H), 7.45 (d, 2H), 7.39 (d, 1H), 7.31 (dd, 2H), 7.21 (d, 1H), 7.21 (t, 2H), 7.15 (d, 1H), 7.15 (t, 1H), 7.04 (t, 1H), 7.01 (d, 1H), 6.72 (t, 1H), 6.22 (d, 1H), 5.5 (dd, 1H), 5.25 (m, 2H), 4.53 (m, 2H), 4.52 (m, 1H), 4.28 (m, 2H), 3.76 (s, 3H), 3.62 (m, 1H), 3.43/3.29 (m, 4H), 3.28/2.5 (m, 2H), 3.13/2.94 (m, 4H), 3.01 (m, 2H), 2.9 (br s, 3H), 2.07 (m, 1H), 1.84 (d, 3H), 1.36 (d, 3H), 0.95 (d, 6H). 13C NMR (125 MHz, dmso-d6): δ 253, 158.2, 134.3, 131.5, 131.4, 131.4, 131.3, 131, 128.9, 121.1, 120.6, 119.5, 116.3, 115.9, 113, 112.3, 111.1, 74.1, 69.8, 67.5, 58.7, 57.9, 56.5, 55.4, 49.8, 46.5, 45.2, 32.9, 30.4, 18.6, 18.4, 18.3. 19F NMR (470 MHz, dmso-d6): δ -74, -112.6.
ステップ2:(2R)-2-[(5S)-5-[3-クロロ-4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[3-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]プロパノイルアミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸;2,2,2-トリフルオロアセテート;ビス-2,2,2-トリフルオロ酢酸 L22-C1
DMF(0.4mL)中の(2R)-2-[(5S)-5-[4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-アミノ-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]-3-クロロ-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸;2,2,2-トリフルオロアセテート;ビス-2,2,2-トリフルオロ酢酸(150mg、0.130mmol)の溶液に、(2,5-ジオキソピロリジン-1-イル)3-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]プロパノエート(60mg、194mmol)を添加した。反応混合物を室温で3時間撹拌し、減圧下で濃縮し、Xbridgeカラム上への反応混合物の直接堆積による、かつTFA法を使用するC18逆相分取HPLCにより精製して、L22-C1(67mg、37μmol)を得た。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 10.14 (s, 1H), 8.88 (d, 1H), 8.61 (s, 1H), 8.22 (d, 1H), 7.84 (d, 1H), 7.73 (d, 2H), 7.63 (d, 1H), 7.52 (dd, 1H), 7.45 (td, 1H), 7.44 (d, 2H), 7.38 (d, 1H), 7.31 (dd, 2H), 7.21 (d, 1H), 7.21 (t, 2H), 7.15 (t, 1H), 7.14 (d, 1H), 7.02 (t, 1H), 7.01 (d, 1H), 7 (s, 2H), 6.71 (t, 1H), 6.21 (d, 1H), 5.5 (dd, 1H), 5.25 (m, 2H), 4.53 (br s, 2H), 4.38 (m, 1H), 4.25 (m, 2H), 4.19 (dd, 1H), 3.76 (s, 3H), 3.58 (m, 2H), 3.54 (t, 2H), 3.48 (m, 2H), 3.43/3.3 (m, 4H), 3.28/2.51 (m, 2H), 3.16/2.98 (m, 4H), 3.04 (m, 2H), 2.91 (br s, 3H), 2.43/2.33 (m, 2H), 1.93 (m, 1H), 1.84 (s, 3H), 1.31 (d, 3H), 0.87/0.82 (m, 6H). 13C NMR (100 MHz, dmso-d6): δ 158, 152.8, 135.2, 134, 131.4, 131.3, 131.3, 131.2, 131, 128.9, 120.8, 120.6, 119.3, 116.3, 115.8, 112.4, 112.3, 111.1, 74.2, 69.6, 67.4, 67.4, 67.1, 67, 58.4, 57.9, 56.2, 55.2, 49.7, 46.5, 45.1, 37.1, 36.3, 32.7, 30.9, 19.6, 18.5, 18.2, 18.2. 19F NMR (376 MHz, dmso-d6): δ -74.6, -112.2.
IR波長(cm-1):2000~3500、1760/1705、1733、1668、1180/1128、829/798/758/720/696。HR-ESI+:m/z[M+H]+=1345.4944/1345.4954(測定値/理論値)
L9-C9の調製:
3-[4-[[2-[(2R)-2-カルボキシ-2-[(5S)-5-[3-クロロ-4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[3-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]プロパノイルアミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-エチル]フェノキシ]メチル]ピリミジン-2-イル]ベンゼンスルホネート;2,2,2-トリフルオロアセテート;2,2,2-トリフルオロ酢酸
Figure 2022532918000472
ステップ1:(2S)-2-[[(2S)-2-[3-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]プロパノイルアミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-N-[4-(ヒドロキシメチル)フェニル]-5-ウレイド-ペンタンアミド
THF(42mL)中の3-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]プロパン酸(855mg、4.01mmol)の溶液に、N,N’-ジシクロヘキシルメタンジイミン(1.05g、5.08mmol)および1-ヒドロキシピロリジン-2,5-ジオン(510mg、4.43mmol)を添加した。反応混合物を室温で20時間撹拌した。沈殿物を濾過により除去し、濾液をDMF(42mL)中の(2S)-2-[[(2S)-2-アミノ-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-N-[4-(ヒドロキシメチル)フェニル]-5-ウレイド-ペンタンアミド(1.27g、3.35mmol)の溶液に添加した。反応混合物を室温で20時間撹拌し、ジエチルエーテル(250mL)で希釈した。固体を濾過により回収して、(2S)-2-[[(2S)-2-[3-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]プロパノイルアミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-N-[4-(ヒドロキシメチル)フェニル]-5-ウレイド-ペンタンアミド(1.81g;3.15mmol)を白色固体として得た。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 9.87 (s, 1H), 8.05 (d, 1H), 7.82 (d, 1H), 7.53 (d, 2H), 7.21 (d, 2H), 7.00 (s, 2H), 5.95 (t, 1H), 5.39 (s, 2H), 5.07 (t, 1H), 4.41 (d, 2H), 4.34-4.40 (m, 1H), 4.18-4.22 (m, 1H), 3.42-3.65 (m, 4H), 2.88-3.02 (m, 2H), 2.73 (s, 2H), 2.28-2.45 (m, 2H), 1.91-1.99 (m, 1H), 1.53-1.75 (m, 2H), 1.30-1.147 (m, 2H), 0.85 (d, 3H), 0.81 (d, 3H). 13C NMR (125 MHz, dmso-d6): δ 171.05, 170.83, 170.32, 170.09, 158.82, 137.49, 137.37, 134.50, 126.88, 118.81, 66.66, 66.53, 62.57, 57.49, 53.06, 36.74, 35.76, 30.51, 29.31, 26.79, 25.20, 19.16, 18.07.
MS(ESI)m/z[M+H]+=575.2。
ステップ2:(2S)-N-[4-(ブロモメチル)フェニル]-2-[[(2S)-2-[3-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]プロパノイルアミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタンアミド
THF(1mL)中の(2S)-2-[[(2S)-2-[3-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]プロパノイルアミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-N-[4-(ヒドロキシメチル)フェニル]-5-ウレイド-ペンタンアミド(37.2mg、65μmol)の溶液に、アルゴン下、0℃で三臭化リン(45μL、97mmol)を滴下添加した。反応物を0℃で1時間、室温で2時間撹拌した。反応の進行をUPLC-MSにより追跡した:アリコートを大過剰のアセトニトリル中モルホリンにより処理し、続いて、対応するモルホリン付加物の形成が生じた。反応物をTHF(3mL)で希釈し、2滴のNaHCOの飽和溶液の添加によりクエンチし、室温で5分間撹拌し、硫酸マグネシウムで乾燥させ、濾過した。粗製の(2S)-N-[4-(ブロモメチル)フェニル]-2-[[(2S)-2-[3-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]プロパノイルアミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタンアミドを含有する残留物(45mg、理論上65μmol)を、次のステップで直ちに使用した。MS(ESI)m/z[M+H]+=662.62(モルホリン付加物)
ステップ3:3-[4-[[2-[(2R)-2-カルボキシ-2-[(5S)-5-[3-クロロ-4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[3-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]プロパノイルアミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-エチル]フェノキシ]メチル]ピリミジン-2-イル]ベンゼンスルホネート L9-C9
DMF(0.8mL)中の(2R)-2-{[(5S)-5-{3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル}-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ}-3-(2-{[2-(3-スルホフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ}フェニル)プロパン酸 C9(15mg、16mmol)の溶液に、THF(1mL)およびDIPEA(14μL、81μmol)中の(2S)-N-[4-(ブロモメチル)フェニル]-2-[[(2S)-2-[3-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]プロパノイルアミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタンアミド(ステップ2からの45mgの粗製物、理論上65μmol)の溶液を添加した。反応物を室温で撹拌し、50℃で2時間加熱した。粗生成物を、Xbridgeカラム上への反応混合物の直接堆積による、かつTFA法を使用するC18逆相分取HPLCにより精製して、L9-C9(5.2mg、3.5μmol)を得た。HR-ESI+:m/z[M+H]+=1481.4917/1481.4896(測定値/理論値)。
L9-C13の調製:
(2R)-2-[6-(3-アミノ-4,5-ジフルオロ-フェニル)-(5S)-5-[3-クロロ-4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[3-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]プロパノイルアミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]-2-メチル-フェニル]チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸;2,2,2-トリフルオロアセテート;2,2,2-トリフルオロ酢酸
Figure 2022532918000473
手順は、L9-C9の合成のプロセスの通りであり、ステップ3で使用するC9を(2R)-2-{[(5S)-6-(3-アミノ-4,5-ジフルオロフェニル)-5-{3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル}チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ}-3-(2-{[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ}フェニル)プロパン酸 C13により置き換え、精製にTFA法を使用する。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 10.2 (s), 8.9 (d, 1H), 8.6 (s, 1H), 8.12 (d), 7.8 (d), 7.7 (d, 2H), 7.6 (d, 1H), 7.5 (d, 1H), 7.45 (d, 2H), 7.42 (m, 1H), 7.32 (d, 1H), 7.2 (d, 1H), 7.18 (m, 1H), 7.18 (m, 1H), 7.02 (d, 1H), 7 (s, 2H), 7 (m, 1H), 6.75 (t, 1H), 6.65 (d, 1H), 6.25 (d, 1H), 6.15 (dd, 1H), 5.98 (m, 1H), 5.48 (dd, 1H), 5.4 (br s, 1H), 5.24 (dd, 2H), 4.51 (br s, 2H), 4.38 (m, 1H), 4.28 (m, 2H), 4.22 (m, 1H), 3.80-3.40 (m, 8H), 3.75 (s, 3H), 3.26 (m, 4H), 3.1 (m, 2H), 2.98 (m, 4H), 2.9 (br s, 3H), 2.9/2.5 (2m, 2H), 2.43/2.3 (2m, 2H), 1.92 (m, 1H), 1.88 (s, 3H), 1.70-1.30 (m, 4H), 0.82 (2d, 6H). 19F NMR (470 MHz, dmso-d6): δ -74.3, -139.3, -160.4.
HR-ESI+:m/z[M+H]+=1464.5482/1464.5449(測定値/理論値)。
L14-C3の調製:
(2S,3S,4R,5R,6S)-6-[2-[(5S)-5-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[2-(2-アジドエトキシ)アセチル]アミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]-2-[[4-[2-[4-[4-[(1R)-1-カルボキシ-2-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]エトキシ]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル]-2-クロロ-3-メチル-フェノキシ]エチル]ピペラジン-1-カルボニル]オキシメチル]フェニル]エチル]-3,4,5-トリヒドロキシ-テトラヒドロピラン-2-カルボン酸
Figure 2022532918000474
ステップ1:2-ヨード-4-ニトロ-安息香酸
アセトニトリル(280mL)中の2-アミノ-4-ニトロ-安息香酸(10.0g、54.90mmol)の溶液に、p-トルエンスルホン酸一水和物(32.0g、168.2mmol)を添加した。混合物を室温で15分間撹拌し、次いで、水(140mL)に溶解した亜硝酸ナトリウム(8.00g、115.9mmol)およびヨウ化カリウム(24.0g、144.6mmol)の溶液を15分間で滴下添加した。反応混合物を19時間撹拌した。反応の完了後、混合物をチオ硫酸ナトリウム(13.02g、82.36mmol)でクエンチし、塩化水素3Mの水溶液(25mL)で酸性化した。水層を酢酸エチル(2×250mL)で抽出し、合わせた有機層を塩化水素1Mの水溶液(100mL)で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮乾固した。得られた残留物をジクロロメタン(1L)に溶かし、HCl 1Mの水溶液(100mL)で洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮乾固して、2-ヨード-4-ニトロ-安息香酸(15.0g、51.2mmol)を橙色粉末として得た。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 13.8 (br s, 1H), 8.64 (s, 1H), 8.27 (d, 1H), 7.86 (d, 1H).
ステップ2:(2-ヨード-4-ニトロ-フェニル)メタノール
THF(70mL)中の2-ヨード-4-ニトロ-安息香酸(5.0g、17.06mmol)の溶液に、THF中ボラン1Mの溶液(85mL、85.0mmol)を添加した。反応混合物を65℃で4時間撹拌した。反応の完了後、反応混合物を室温に冷却し、メタノール(200mL)の添加によりクエンチした。混合物を室温で30分間撹拌し、次いで濃縮乾固した。粗生成物をシリカゲルクロマトグラフィー(シクロヘキサン中酢酸エチルの勾配)により精製して、(2-ヨード-4-ニトロ-フェニル)メタノール(3.38g、12.11mmol)を黄色固体として得た。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 8.54 (d, 1H), 8.29 (dd, 1H), 7.70 (d, 1H), 5.82 (t, 1H), 4.47 (d, 2H).
ステップ3:(4-アミノ-2-ヨード-フェニル)メタノール
エタノール(100mL)および水(25mL)中の(2-ヨード-4-ニトロ-フェニル)メタノール(3.70g、13.26mmol)の溶液に、鉄(3.70g、66.25mmol)および塩化アンモニウム(800mg、14.96mmol)を連続的に添加した。反応混合物を80℃で3時間撹拌した。反応の完了後、反応混合物をCelite(登録商標)で濾過し、エタノールで洗浄し、濃縮乾固した。得られた残留物を酢酸エチル(100mL)に溶かし、炭酸水素ナトリウムの飽和溶液(100mL)で洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮乾固して、(4-アミノ-2-ヨード-フェニル)メタノール(2.48g、9.95mmol)を黄色油状物として得た。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 7.02-7.10 (m, 2H), 6.57 (d, 1H), 5.16 (s, 2H), 4.97 (t, 1H), 4.28 (d, 2H).
ステップ4:4-[[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシメチル]-3-ヨード-アニリン
ジクロロメタン(150mL)中の(4-アミノ-2-ヨード-フェニル)メタノール(3.51g、13.37mmol)の溶液に、イミダゾール(0.95g、13.95mmol)を添加した。混合物を0℃に冷却し、次いでジクロロメタン(150mL)中のtert-ブチル-クロロ-ジメチル-シラン(2.40mL、13.85mmol)の溶液を15分間かけて滴下添加した。氷浴を取り外し、反応混合物を室温で16時間撹拌した。反応の完了後、反応混合物をメタノール(20mL)でクエンチし、濃縮乾固した。粗生成物をシリカゲルクロマトグラフィー(シクロヘキサン中酢酸エチルの勾配)により精製して、4-[[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシメチル]-3-ヨード-アニリン(3.64g;10.03mmol;75%)を黄色油状物として得た。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 7.05 (s, 1H), 7.03 (d, 1H), 6.55 (d, 1H), 5.24 (s, 2H), 4.46 (s, 2H), 0.88 (s, 9H), 0.06 (s, 6H).
ステップ5:(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパン酸
水(90mL)中の(2S)-2-アミノプロパン酸(3.22g、36.09mmol)の溶液に、炭酸ナトリウム(7.29g、68.74mmol)、およびジメトキシエタン(90mL)中の(2,5-ジオキソピロリジン-1-イル)(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノエート(15.0g、34.37mmol)の溶液を連続的に添加した。反応混合物を室温で16時間撹拌した。反応の完了後、混合物を塩化水素1Mの水溶液でpH=1まで酸性化し、次いで水層を酢酸エチル(3×500mL)で抽出した。合わせた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮乾固して、粗混合物を得、これをジエチルエーテル(50mL)で摩砕して、(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパン酸(11.25g、27.41mmol)を白色固体として得た。1H NMR (400 MHz, dmso-d6) δ 12.48 (s, 1H), 8.21 (d, 1H), 7.89 (d, 2H), 7.72-7.79 (m, 2H), 7.28-7.46 (m, 5H), 4.15-4.32 (m, 4H), 3.90 (t, 1H), 1.90-2.02 (m, 1H), 1.28 (d, 3H), 0.86-0.90 (m, 6H).
ステップ6:9H-フルオレン-9-イルメチルN-[(1S)-1-[[(1S)-2-[4-[[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシメチル]-3-ヨード-アニリノ]-1-メチル-2-オキソ-エチル]カルバモイル]-2-メチル-プロピル]カルバメート
ジクロロメタン(18mL)およびメタノール(18mL)中の(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパン酸(1.50g、3.65mmol)の溶液に、4-[[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシメチル]-3-ヨード-アニリン(1.33g、3.65mmol)およびエチル2-エトキシ-2H-キノリン-1-カルボキシレート(1.36g、5.48mmol)を連続的に添加した。無色懸濁液を室温で16時間撹拌した。濃縮乾固した後、粗生成物をシリカゲルクロマトグラフィー(シクロヘキサン中酢酸エチルの勾配)により、次いでC18クロマトグラフィー(水中メタノールの勾配)により精製して、9H-フルオレン-9-イルメチルN-[(1S)-1-[[(1S)-2-[4-[[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシメチル]-3-ヨード-アニリノ]-1-メチル-2-オキソ-エチル]カルバモイル]-2-メチル-プロピル]カルバメート(1.18g、1.56mmol)を白色固体として得た。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 10.05 (s, 1H). 8.16-8.24 (m, 2H), 7.88 (d, 2H), 7.71-7.77 (m, 2H), 7.55 (d, 1H), 7.37-7.48 (m, 3H), 7.27-7.37 (m, 3H), 4.56 (s, 2H), 4.38 (t, 1H), 4.18-4.33 (m, 3H), 3.91 (t, 1H), 2.08-2.20 (m, 1H), 1.30 (d, 3H), 0.83-0.95 (m, 15H), 0.06 (s, 6H).
ステップ7:(3R,4S,5R,6R)-3,4,5-トリベンジルオキシ-6-(ベンジルオキシメチル)テトラヒドロピラン-2-オン
DMSO(120mL)中の(3R,4S,5R,6R)-3,4,5-トリベンジルオキシ-6-(ベンジルオキシメチル)テトラヒドロピラン-2-オール(30.0g、55.49mmol)の懸濁液を室温で30分間撹拌し(完全な可溶化まで)、次いで無水酢酸(90mL)を室温で15分間かけて滴下添加した。ベージュ色溶液を16時間撹拌し、次いで0℃に冷却し、塩化水素1Mの水溶液(100mL)をゆっくりと添加した。反応混合物を室温で20分間撹拌し、次いで酢酸を蒸発させた。得られた残留物を水(200mL)および酢酸エチル(200mL)で希釈した。水層を酢酸エチル(2×200mL)で抽出し、合わせた有機層を水(2×500mL)、炭酸水素ナトリウムの飽和溶液(2×500mL)で洗浄し、次いで硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮乾固して、粗混合物を得た。粗生成物をシリカゲルクロマトグラフィー(シクロヘキサン中酢酸エチルの勾配)により精製して、(3R,4S,5R,6R)-3,4,5-トリベンジルオキシ-6-(ベンジルオキシメチル)テトラヒドロピラン-2-オン(25.05g、46.51mmol)を無色油状物として得た。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 7.19-7.39 (m, 20H), 4.85 (d, 1H), 4.57-4.72 (m, 5H), 4.46-4.56 (m, 3H), 4.36 (d, 1H), 3.98-4.05 (m, 1H), 3.84-3.92 (m, 1H), 3.65-3.76 (m, 2H).
ステップ8:(3R,4S,5R,6R)-3,4,5-トリベンジルオキシ-6-(ベンジルオキシメチル)-2-(2-トリメチルシリルエチニル)テトラヒドロピラン-2-オール
THF(325mL)中のトリメチルシリルアセチレン(24mL、168.6mmol)の溶液に、-78℃にて20分間でヘキサン中ブチルリチウム2.5Mの溶液(59.41mL、148.5mmol)を添加した。無色溶液を-78℃で45分間、次いで0℃で45分間撹拌した。反応混合物を-78℃に冷却し、THF(325mL)中の(3R,4S,5R,6R)-3,4,5-トリベンジルオキシ-6-(ベンジルオキシメチル)テトラヒドロピラン-2-オン(25.0g、46.41mmol)の溶液を45分間かけて滴下添加した。反応混合物をこの温度で4時間撹拌し、次いで水(200mL)でクエンチした。水層を酢酸エチル(2×200mL)で抽出した。合わせた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮乾固して、(3R,4S,5R,6R)-3,4,5-トリベンジルオキシ-6-(ベンジルオキシメチル)-2-(2-トリメチルシリルエチニル)テトラヒドロピラン-2-オール(29.56g、46.41mmol)を、2つのジアステレオ異性体を4/6の比で含有するベージュ色油状物として得た。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 7.13-7.43 (m, 20H), 4.87-4.99 (m, 1H), 4.65-4.83 (m, 4H), 3.43-3.57 (m, 3H), 3.70-3.85 (m, 2H), 3.55-3.68 (m, 3H), 3.43-3.53 (m, 2H), 0.11-0.22 (m, 9H).
ステップ9:トリメチル-[2-[(2S,3S,4R,5R,6R)-3,4,5-トリベンジルオキシ-6-(ベンジルオキシメチル)テトラヒドロピラン-2-イル]エチニル]シラン
アセトニトリル(83mL)およびジクロロメタン(193mL)中の(3R,4S,5R,6R)-3,4,5-トリベンジルオキシ-6-(ベンジルオキシメチル)-2-(2-トリメチルシリルエチニル)テトラヒドロピラン-2-オール(29.56g、46.42mmol)の溶液に、アセトニトリル/ジクロロメタンの混合物(37mL/18mL)中のトリエチルシラン(44.98mL、278.5mmol)の溶液を-15℃にて20分間で、続いてアセトニトリル(37mL)中の三フッ化ホウ素ジエチルエーテレート(23.53mL、185.7mmol)の溶液を-15℃で30分間かけて添加した。無色溶液を同じ温度で5時間撹拌し、次いで水(500mL)で希釈した。水層を酢酸エチル(2×500mL)で抽出した。合わせた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮乾固して、トリメチル-[2-[(2S,3S,4R,5R,6R)-3,4,5-トリベンジルオキシ-6-(ベンジルオキシメチル)テトラヒドロピラン-2-イル]エチニル]シラン(28.82g、46.41mmol)を褐色油状物として得た。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 7.10-7.44 (m, 20H), 4.93 (d, 1H), 4.67-4.86 (m, 4H), 4.43-4.57 (m, 3H), 4.16-4.28 (m, 1H), 3.42-3.68 (m, 6H), 0.15 (s, 9H).
ステップ10:(2R,3R,4R,5S,6S)-3,4,5-トリベンジルオキシ-2-(ベンジルオキシメチル)-6-エチニル-テトラヒドロピラン
メタノール(1.12L)およびジクロロメタン(240mL)中のトリメチル-[2-[(2S,3S,4R,5R,6R)-3,4,5-トリベンジルオキシ-6-(ベンジルオキシメチル)テトラヒドロピラン-2-イル]エチニル]シラン(28.80g、46.39mmol)の溶液に、水酸化ナトリウム1Mの水溶液(80mL)を添加した。ベージュ色溶液を室温で1時間撹拌し、次いで塩化水素1Mの水溶液でpH=1まで酸性化し、水(500mL)で希釈した。メタノールを蒸発させ、次いで水層を酢酸エチル(2×1L)で抽出した。合わせた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮乾固した。粗生成物をシリカゲルクロマトグラフィー(シクロヘキサン中酢酸エチルの勾配)により精製して、(2R,3R,4R,5S,6S)-3,4,5-トリベンジルオキシ-2-(ベンジルオキシメチル)-6-エチニル-テトラヒドロピラン(20.00g、36.45mmol)を無色油状物として得た。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 3.42-3.67 (m, 7H), 4.17 (d, 1H), 4.44-4.56 (m, 3H), 4.67-4.86 (m, 4H), 4.90 (d, 1H), 7.15-7.40 (m, 20H).
ステップ11:(2S,3R,4R,5S,6R)-2-エチニル-6-(ヒドロキシメチル)テトラヒドロピラン-3,4,5-トリオール
エタンチオール(400mL)中の(2R,3R,4R,5S,6S)-3,4,5-トリベンジルオキシ-2-(ベンジルオキシメチル)-6-エチニル-テトラヒドロピラン(20.00g、36.45mmol)の溶液に、室温で5分間かけて三フッ化ホウ素ジエチルエーテレート(147.8mL、1166mmol)を滴下添加した。ベージュ色溶液を室温で16時間撹拌し、次いで0℃に冷却し、次亜塩素酸ナトリウムの飽和水溶液を含有するガストラップを備え付けた。炭酸水素ナトリウムの飽和水溶液(500mL)を0℃にて1時間で滴下添加した(二酸化炭素の形成)。濃縮乾固した後、粗生成物をシリカゲルクロマトグラフィー(ジクロロメタン中メタノールの勾配)により精製して、(2S,3R,4R,5S,6R)-2-エチニル-6-(ヒドロキシメチル)テトラヒドロピラン-3,4,5-トリオール(4.05g、21.52mmol)を白色固体として得た。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 5.28 (d, 1H), 4.99 (d, 1H), 4.91 (d, 1H), 4.52 (t, 1H), 3.77 (d, 1H), 3.60-3.69 (m, 1H), 3.35-3.43 (m, 1H), 3.32 (s, 1H), 2.97-3.13 (m, 4H).
ステップ12:メチル(2S,3S,4R,5R,6S)-6-エチニル-3,4,5-トリヒドロキシ-テトラヒドロピラン-2-カルボキシレート
炭酸水素ナトリウムの飽和水溶液(81mL)およびTHF(81mL)中の(2S,3R,4R,5S,6R)-2-エチニル-6-(ヒドロキシメチル)テトラヒドロピラン-3,4,5-トリオール(4.05g、21.52mmol)の溶液に、(2,2,6,6-テトラメチルピペリジン-1-イル)オキシル(168mg、1.08mmol)を添加した。黄色懸濁液を0℃に冷却し、1,3-ジブロモ-5,5-ジメチル-イミダゾリジン-2,4-ジオン(12.31g、43.04mmol)を少量ずつ30分間で添加した。反応混合物を0℃で4時間撹拌し、次いでメタノール(40mL)の添加によりクエンチした。この温度で30分間撹拌した後、炭酸カリウムの飽和水溶液(10mL)およびジクロロメタン(100mL)を添加した。有機層を水(2×200mL)で抽出し、次いで、合わせた水層を塩化水素3Mの水溶液でpH=1まで酸性化し、濃縮乾固した。得られた残留物をメタノール(100mL)および塩化水素3Mの水溶液(20mL)に溶かした。混合物を濃縮乾固し、メタノール(4×100mL)と数回共蒸発させた。粗生成物をシリカゲルクロマトグラフィー(ジクロロメタン セリウムディベロッパー(Cerium developer)中メタノールの勾配)により精製して、メチル(2S,3S,4R,5R,6S)-6-エチニル-3,4,5-トリヒドロキシ-テトラヒドロピラン-2-カルボキシレート(3.00g、13.88mmol)をベージュ色固体として得た。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 5.46 (d, 1H), 5.32 (d, 1H), 5.18 (d, 1H), 3.93-4.00 (m, 1H), 3.75 (dd, 1H), 3.65 (s, 3H), 3.40-3.44 (m, 1H), 3.31 (s, 1H), 3.09-3.19 (m, 2H).
ステップ13:メチル(2S,3S,4R,5S,6S)-3,4,5-トリアセトキシ-6-エチニル-テトラヒドロピラン-2-カルボキシレート
DMF(37.5mL)およびピリジン(12.5mL)中のメチル(2S,3S,4R,5R,6S)-6-エチニル-3,4,5-トリヒドロキシ-テトラヒドロピラン-2-カルボキシレート(3.00g、13.88mmol)の溶液に、N,N-ジメチルピリジン-4-アミン(84.8mg、0.693mmol)を添加した。反応混合物を0℃に冷却し、次いで無水酢酸(20.0mL、213mmol)を5分間で滴下添加した。無色溶液を室温で3時間撹拌し、次いで塩化水素1Mの水溶液(200mL)で希釈した。水層を酢酸エチル(2×200mL)で抽出した。合わせた有機層を塩化水素1Mの水溶液(2×200mL)、続いて炭酸カリウムの飽和水溶液(200mL)で洗浄し、次いで硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮乾固して、粗混合物を得た。粗生成物をシリカゲルクロマトグラフィー(シクロヘキサン セリウムディベロッパー中酢酸エチルの勾配)により精製して、メチル(2S,3S,4R,5S,6S)-3,4,5-トリアセトキシ-6-エチニル-テトラヒドロピラン-2-カルボキシレート(4.60g、13.44mmol)を白色固体として得た。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 5.33 (t, 1H), 4.93-5.01 (m, 2H), 4.70 (d, 1H), 4.44 (d, 1H), 3.67 (s, 1H), 3.64 (s, 3H), 2.02 (s, 3H), 1.94-2.01 (m, 6H).
ステップ14:メチル(2S,3S,4R,5S,6S)-3,4,5-トリアセトキシ-6-[2-[2-[[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシメチル]-5-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]フェニル]エチニル]テトラヒドロピラン-2-カルボキシレート
DMF(7.3mL)中のメチル(2S,3S,4R,5S,6S)-3,4,5-トリアセトキシ-6-エチニル-テトラヒドロピラン-2-カルボキシレート(496mg、1.45mmol)の溶液に、9H-フルオレン-9-イルメチルN-[(1S)-1-[[(1S)-2-[4-[[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシメチル]-3-ヨード-アニリノ]-1-メチル-2-オキソ-エチル]カルバモイル]-2-メチル-プロピル]カルバメート(730mg、0.966mmol)、DIPEA(738μL、4.47mmol)、ヨウ化銅(18.4mg、96.6mmol)およびジクロロ-ビス-(トリフェニルホスフィン)パラジウム(II)(67.8mg、96.6mmol)を連続的に添加した。黄色溶液をアルゴンでフラッシュし、次いで室温で16時間撹拌した。水(100mL)で希釈した後、水層を酢酸エチル(2×100mL)で抽出した。合わせた有機層を水(2×200mL)、および塩化アンモニウムの飽和水溶液(2×200mL)で洗浄し、次いで硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮乾固した。粗生成物をシリカゲルクロマトグラフィー(シクロヘキサン中酢酸エチルの勾配)により精製して、メチル(2S,3S,4R,5S,6S)-3,4,5-トリアセトキシ-6-[2-[2-[[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシメチル]-5-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]フェニル]エチニル]テトラヒドロピラン-2-カルボキシレート(782mg、0.806mmol)を黄色固体として得た。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 10.09 (s, 1H). 8.20 (d, 1H), 7.89 (d, 2H), 7.70-7.78 (m, 3H), 7.55 (d, 1H), 7.32-7.46 (m, 4H), 7.27-7.32 (m, 2H), 5.41 (t, 1H), 4.96-5.14 (m, 3H), 4.67 (s, 2H), 4.51 (d, 1H), 4.36-4.44 (m, 1H), 4.16-4.32 (m, 3H), 3.88-3.95 (m, 1H), 3.64 (s, 3H), 1.94-2.07 (m, 10H), 1.30 (d, 3H), 0.84-0.93 (m, 15H), 0.08 (s, 6H).
ステップ15:メチル(3S,4R,5S,6S)-3,4,5-トリアセトキシ-6-[2-[2-[[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシメチル]-5-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]フェニル]エチル]テトラヒドロピラン-2-カルボキシレート
THF(15mL)中のメチル(2S,3S,4R,5S,6S)-3,4,5-トリアセトキシ-6-[2-[2-[[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシメチル]-5-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]フェニル]エチニル]テトラヒドロピラン-2-カルボキシレート(750mg、0.773mmol)の溶液を、アルゴンでフラッシュした。炭素上乾燥白金5%(75mg、50%)を添加した。反応混合物をアルゴン、Hで連続的にフラッシュし、H雰囲気(P atm)下、室温で16時間撹拌した。反応混合物をCelite(登録商標)パッドに通して濾過し、THFで洗浄し、次いで濃縮乾固した。完全なシーケンス(炭素上乾燥白金5%(75mg、50%)の添加、H雰囲気(1bar)下、室温で16時間の撹拌、およびCelite(登録商標)パッドに通して濾過)を、さらに4回行った。粗生成物をシリカゲルクロマトグラフィー(シクロヘキサン中酢酸エチルの勾配)により精製して、メチル(3S,4R,5S,6S)-3,4,5-トリアセトキシ-6-[2-[2-[[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシメチル]-5-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]フェニル]エチル]テトラヒドロピラン-2-カルボキシレート(470mg、0.483mmol)を白色固体として得た。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 9.90 (s, 1H), 8.16 (d, 1H), 7.89 (d, 2H), 7.70-7.78 (m, 2H), 7.37-7.49 (m, 4H), 7.27-7.32 (m, 3H), 7.23 (d, 1H), 5.29 (t, 1H), 4.95 (t, 1H), 4.78 (t, 1H), 4.60 (s, 2H), 4.34-4.44 (m, 2H), 4.16-4.32 (m, 3H), 3.88-3.95 (m, 1H), 3.72-3.79 (m, 1H), 3.64 (s, 3H), 2.69-2.78 (m, 1H), 2.50-2.60 (m, 1H), 1.92-2.03 (m, 10H), 1.55-1.75 (m, 2H), 1.30 (d, 3H), 0.84-0.93 (m, 15H), 0.05 (s, 6H).
ステップ16:メチル(3S,4R,5S,6S)-3,4,5-トリアセトキシ-6-[2-[5-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]-2-(ヒドロキシメチル)フェニル]エチル]テトラヒドロピラン-2-カルボキシレート
THF(540μL)および水(540μL)中のメチル(3S,4R,5S,6S)-3,4,5-トリアセトキシ-6-[2-[2-[[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシメチル]-5-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]フェニル]エチル]テトラヒドロピラン-2-カルボキシレート(470mg、0.483mmol)の溶液に、酢酸(1.6mL、28.28mmol)を添加した。無色溶液を室温で16時間撹拌し、次いで水(100mL)で希釈した。水層を酢酸エチル(2×100mL)で抽出した。合わせた有機層を水(2×200mL)、および炭酸水素ナトリウムの飽和水溶液(200mL)で洗浄し、次いで硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮乾固した。粗生成物をシリカゲルクロマトグラフィー(シクロヘキサン中酢酸エチルの勾配)により精製して、メチル(3S,4R,5S,6S)-3,4,5-トリアセトキシ-6-[2-[5-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]-2-(ヒドロキシメチル)フェニル]エチル]テトラヒドロピラン-2-カルボキシレート(354mg、0.412mmol)を白色固体として得た。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 9.87 (s, 1H), 8.16 (d, 1H), 7.89 (d, 2H), 7.70-7.78 (m, 2H), 7.37-7.50 (m, 4H), 7.27-7.37 (m, 3H), 7.25 (d, 1H), 5.29 (t, 1H), 4.91-4.98 (m, 2H), 4.78 (t, 1H), 4.34-4.44 (m, 4H), 4.16-4.32 (m, 3H), 3.88-3.95 (m, 1H), 3.72-3.79 (m, 1H), 3.64 (s, 3H), 2.64-2.73 (m, 1H), 2.50-2.60 (m, 1H), 1.92-2.03 (m, 10H), 1.69-1.79 (m, 1H), 1.52-1.65 (m, 1H), 1.30 (d, 3H), 0.84-0.93 (m, 6H).
ステップ17:メチル(3S,4R,5S,6S)-3,4,5-トリアセトキシ-6-[2-[5-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]-2-[(4-ニトロフェノキシ)カルボニルオキシメチル]フェニル]エチル]テトラヒドロピラン-2-カルボキシレート
THF(7.75mL)中のメチル(3S,4R,5S,6S)-3,4,5-トリアセトキシ-6-[2-[5-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]-2-(ヒドロキシメチル)フェニル]エチル]テトラヒドロピラン-2-カルボキシレート(310mg、0.361mmol)の溶液に、ピリジン(146μL、1.80mmol)およびクロロギ酸4-ニトロフェニル(182mg、0.901mmol)を連続的に添加した。白色懸濁液を室温で16時間撹拌し、次いで濃縮乾固して、粗混合物を得た。粗生成物をシリカゲルクロマトグラフィー(ジクロロメタン中酢酸エチルの勾配)により精製して、メチル(3S,4R,5S,6S)-3,4,5-トリアセトキシ-6-[2-[5-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]-2-[(4-ニトロフェノキシ)カルボニルオキシメチル]フェニル]エチル]テトラヒドロピラン-2-カルボキシレート(257mg、0.251mmol)を白色固体として得た。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 10.04 (s, 1H), 8.31 (d, 2H), 8.20 (d, 1H), 7.89 (d, 2H), 7.66-7.78 (m, 2H), 7.56 (d, 2H), 7.28-7.52 (m, 8H), 5.31 (t, 1H), 5.25 (s, 2H), 4.96 (t, 1H), 4.79 (t, 1H), 4.40 (d, 2H), 4.16-4.32 (m, 3H), 3.88-3.95 (m, 1H), 3.74-3.83 (m, 1H), 3.61 (s, 3H), 2.74-2.84 (m, 1H), 2.60-2.71 (m, 1H), 1.90-2.03 (m, 10H), 1.72-1.83 (m, 1H), 1.58-1.71 (m, 1H), 1.30 (d, 3H), 0.82-0.94 (m, 6H).
LC-MS:MS(ESI)m/z[M+Na]+=1047.6。
ステップ18:(2R)-2-[(5S)-5-[3-クロロ-4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]-2-[2-[(2SR,3SR,4RS,5SR,6SR)-3,4,5-トリアセトキシ-6-メトキシカルボニル-テトラヒドロピラン-2-イル]エチル]フェニル]メトキシカルボニル]ピペラジン-1-イル]エトキシ]-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸
ジメチルホルムアミド(3.0mL)中の(2R)-2-[(5Sa)-5-[3-クロロ-2-メチル-4-(2-ピペラジン-1-イルエトキシ)フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸(C3)(118mg、0.121mmol)の溶液に、ジメチルホルムアミド(3.0mL)中のメチル(3S,4R,5S,6S)-3,4,5-トリアセトキシ-6-[2-[5-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]-2-[(4-ニトロフェノキシ)カルボニルオキシメチル]フェニル]エチル]テトラヒドロピラン-2-カルボキシレート(130mg、0.127mmol)の溶液、およびDIPEA(60μL、0.363mmol)を連続的に添加した。反応混合物を室温で2時間撹拌した。(2R)-2-[(5S)-5-[3-クロロ-4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]-2-[2-[(2SR,3SR,4RS,5SR,6SR)-3,4,5-トリアセトキシ-6-メトキシカルボニル-テトラヒドロピラン-2-イル]エチル]フェニル]メトキシカルボニル]ピペラジン-1-イル]エトキシ]-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸をジメチルホルムアミド中溶液として得、このまま次のステップで使用した。UPLC-MS:MS(ESI)m/z[M+H]+=1745.6+1747.6。
ステップ19:(2R)-2-[(5S)-5-[3-クロロ-4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]-2-[2-[(2SR,3SR,4RS,5SR,6SR)-3,4,5-トリアセトキシ-6-メトキシカルボニル-テトラヒドロピラン-2-イル]エチル]フェニル]メトキシカルボニル]ピペラジン-1-イル]エトキシ]-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸
ステップ18からのDMF(3.0mL)中の2SR,3SR,4RS,5RS,6SR)-6-[2-[(5S)-5-[[(2S)-2-[[(2S)-2-アミノ-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]-2-[[4-[2-[4-[4-[(1R)-1-カルボキシ-2-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]エトキシ]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル]-2-クロロ-3-メチル-フェノキシ]エチル]ピペラジン-1-カルボニル]オキシメチル]フェニル]エチル]-3,4,5-トリヒドロキシ-テトラヒドロピラン-2-カルボン酸(0.121mmol)の溶液に、メタノール(2mL)、および水(2ml)に溶解した水酸化リチウム一水和物(64.0mg、1.52mmol)を連続的に添加した。反応混合物を室温で1時間撹拌した。粗生成物を、Xbridgeカラム上への反応混合物の直接堆積による、かつNHHCO法を使用するC18逆相分取HPLCにより精製して、(2R)-2-[(5S)-5-[3-クロロ-4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]-2-[2-[(2SR,3SR,4RS,5SR,6SR)-3,4,5-トリアセトキシ-6-メトキシカルボニル-テトラヒドロピラン-2-イル]エチル]フェニル]メトキシカルボニル]ピペラジン-1-イル]エトキシ]-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸(124mg、0.0895mmol)を白色粉末として得た。UPLC-MS:MS(ESI)m/z[M+H]+=1384.3+1386.3。
ステップ20:(2,3,4,5,6-ペンタフルオロフェニル)2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]アセテート2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]酢酸
THF(500μL)に溶解した2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]酢酸(75mg、0.342mmol)の溶液に、THF(500μL)中の2,3,4,5,6-ペンタフルオロフェノール(75.5mg、0.410mmol)の溶液、およびTHF(500μL)中のN,N’-ジシクロヘキシルメタンジイミン(84.7mg、0.410mmol)の溶液を添加した。反応混合物を室温で15時間撹拌し、反応の進行をUPLC-MSにより追跡した。小さい使い捨てのフリット上での懸濁液の簡単な濾過により、(2,3,4,5,6-ペンタフルオロフェニル)2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]アセテートをTHF溶液として得た。この溶液をさらに精製することなく次のステップで使用した。UPLC-MS:MS(ESI)m/z[M-N2+H]+=372.3。
ステップ21:(2SR,3SR,4RS,5RS,6SR)-6-[2-[(5S)-5-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]アセチル]アミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]-2-[[4-[2-[4-[4-[(1R)-1-カルボキシ-2-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]エトキシ]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル]-2-クロロ-3-メチル-フェノキシ]エチル]ピペラジン-1-カルボニル]オキシメチル]フェニル]エチル]-3,4,5-トリヒドロキシ-テトラヒドロピラン-2-カルボン酸 L14-C3
DMF(500μL)中の(2R)-2-[(5S)-5-[3-クロロ-4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]-2-[2-[(2SR,3SR,4RS,5SR,6SR)-3,4,5-トリアセトキシ-6-メトキシカルボニル-テトラヒドロピラン-2-イル]エチル]フェニル]メトキシカルボニル]ピペラジン-1-イル]エトキシ]-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸(118mg、0.085mmol)の溶液に、ステップ20からのTHF中の(2,3,4,5,6-ペンタフルオロフェニル)2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]アセテート(0.342mmol)の溶液、およびDIPEA(42.2μL、0.256mmol)を連続的に添加した。反応混合物を室温で1時間撹拌し、反応の進行をUPLC-MSにより追跡した。粗生成物を、Xbridgeカラム上への反応混合物の直接堆積による、かつNHHCO法を使用するC18逆相分取HPLCにより精製して、L14-C3を白色粉末として得た。UPLC-MS:MS(ESI)m/z[M+H]+=1599.0+1601.2。IR波長(cm-1):3263、2105、1652、1600、1284/1240/1089、756。1H NMR(400 MHz, dmso-d6): δ 9.98 (s), 8.85 (d, 1H), 8.52 (s, 1H), 8.38 (d, 1H), 7.93 (d, 1H), 7.56 (d, 1H), 7.5 (t, 1H), 7.49 (d, 1H), 7.47 (d, 1H), 7.44 (d, 1H), 7.42 (s, 1H), 7.3 (dd, 2H), 7.22 (d, 1H), 7.2 (t, 2H), 7.19 (t, 1H), 7.13 (d, 1H), 7.08 (t, 1H), 7.02 (t, 1H), 6.95 (d, 1H), 6.65 (t, 1H), 6.11 (d, 1H), 5.43 (d, 1H), 5.27/5.2 (m, 2H), 4.93 (br s, 2H), 4.38 (m, 1H), 4.35/4.2 (2m, 2H), 4.3 (m, 1H), 3.94 (s, 2H), 3.75 (s, 3H), 3.58 (m, 10H), 3.57 (m, 1H), 3.51/2.29 (2dd, 2H), 3.35 (m, 2H), 3.25 (m, 4H), 3.2 (m, 1H), 3.2 (m, 1H), 3.06 (m, 1H), 2.96 (m, 1H), 2.75 (m, 2H), 2.72/2.5 (m, 2H), 2.41 (m, 4 H), 2 (m, 1H), 1.99/1.6 (m, 2H), 1.8 (s, 3H), 1.3 (d, 3H), 0.88/0.82 (2d, 6H). 13C NMR (100 MHz, dmso-d6): δ 158.2, 152.7, 131.9, 131.4, 131.4, 131.3, 131.1, 131, 127.8, 120.6, 120.5, 120.1, 116.8, 116.3, 116, 112.6, 112, 111.6, 79.6, 79.6, 78.5, 76.8, 74.2, 73.1, 70.3, 70.3, 69.3, 66.3, 65.1, 56.8, 56.3, 56.1, 52.6, 50.3, 49.4, 43.8, 34.2, 33.5, 31.7, 28, 19.6/18.4, 18.2, 18. 19F NMR (376 MHz, dmso-d6): δ -112.5.
HR-ESI+:m/z[M+H]+=1599.5724(1599.5704)(測定値/理論値)
L18-C3の調製:
(2R)-2-[(5S)-5-[4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2R)-2-[[2-(2-アジドエトキシ)アセチル]アミノ]-3-スルホ-プロパノイル]アミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]フェニル]メトキシカルボニル]ピペラジン-1-イル]エトキシ]-3-クロロ-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸
Figure 2022532918000475
ステップ1:9H-フルオレン-9-イルメチルN-[(1S)-1-[[(1S)-2-[4-(ヒドロキシメチル)アニリノ]-1-メチル-2-オキソ-エチル]カルバモイル]-2-メチル-プロピル]カルバメート
ジクロロメタン(70mL)およびメタノール(30mL)中の(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパン酸(6.0g、14.6mmol;L14-C3の調製のステップ5に従って得た)の溶液に、(4-アミノフェニル)メタノール(2.16g、17.5mmol)およびエチル2-エトキシ-2H-キノリン-1-カルボキシレート(5.42g、21.93mmol)を連続的に添加した。赤色溶液を室温で16時間撹拌した(数分後に沈殿)。反応の完了後、反応混合物をジエチルエーテル(70mL)で希釈した。得られた沈殿物を濾別し、乾燥させて、9H-フルオレン-9-イルメチルN-[(1S)-1-[[(1S)-2-[4-(ヒドロキシメチル)アニリノ]-1-メチル-2-オキソ-エチル]カルバモイル]-2-メチル-プロピル]カルバメート(5.16g、10.01mmol)をベージュ色固体として得た。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 9.91 (s, 1H), 8.15 (d, 1H), 7.89 (d, 2H), 7.70-7.78 (m, 2H), 7.53 (d, 2H), 7.38-7.46 (m, 3H), 7.29-7.35 (m, 2H), 7.23 (d, 2H), 5.08 (t, 1H), 4.37-4.50 (m, 3H), 4.16-4.34 (m, 3H), 3.91 (t, 1H), 1.92-2.02 (m, 1H), 1.30 (d, 3H), 0.83-0.91 (m, 6H).
ステップ2:(2S)-2-アミノ-N-[(1S)-2-[4-(ヒドロキシメチル)アニリノ]-1-メチル-2-オキソ-エチル]-3-メチル-ブタンアミド
DMF(120mL)中の9H-フルオレン-9-イルメチルN-[(1S)-1-[[(1S)-2-[4-(ヒドロキシメチル)アニリノ]-1-メチル-2-オキソ-エチル]カルバモイル]-2-メチル-プロピル]カルバメート(5.16g、10.01mmol)の溶液に、ピペリジン(52mL、525mmol)を添加した。反応混合物を室温で2時間撹拌し、次いでピペリジンを蒸発させ、得られた溶液を水(500mL)で希釈した。得られた固体を濾別し、濾液をジエチルエーテル(2×500mL)で2回洗浄した。水層を濃縮乾固して、粗反応混合物を得た。粗生成物をシリカゲルクロマトグラフィー(ジクロロメタン中メタノール(7Mアンモニアを含有)の勾配)により精製して、(2S)-2-アミノ-N-[(1S)-2-[4-(ヒドロキシメチル)アニリノ]-1-メチル-2-オキソ-エチル]-3-メチル-ブタンアミド(2.02g、6.89mmol)をベージュ色固体として得た。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 10.0 (s, 1H), 8.17 (s, 1H), 7.53 (d, 2H), 7.23 (d, 2H), 5.12 (t, 1H), 4.39-4.52 (m, 3H), 2.96-3.02 (m, 1H), 1.86-1.97 (m, 1H), 1.70 (br s, 2H), 1.29 (d, 3H), 0.88 (d, 3H), 0.78 (d, 3H).
ステップ3:[(2R)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-オキソ-3-ソジオオキシ-プロピル]スルホニルオキシナトリウム
水(127mL)中の[(2R)-2-アミノ-3-オキソ-3-ソジオオキシ-プロピル]スルホニルオキシナトリウム一水和物(3.00g、12.98mmol)の溶液に、炭酸ナトリウム(4.13g、38.94mmol)を添加した。ジオキサン(127mL)中の9H-フルオレン-9-イルメチルカルボノクロリデート(3.69g、14.28mmol)の溶液を、室温にて15分間で滴下添加した。混合物をこの温度で4時間撹拌した。反応の完了後、混合物をHCl 1Mの水溶液でpH=7に中和し、炭酸水素ナトリウムの飽和水溶液(50mL)で希釈し、濃縮乾固した。粗生成物を、中性法を使用するC18逆相クロマトグラフィーにより精製して、[(2R)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-オキソ-3-ソジオオキシ-プロピル]スルホニルオキシナトリウム(4.4g、10.11mmol)を白色固体として得た。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 7.88 (d, 2H). 7.70 (d, 2H), 7.39-7.44 (m, 2H), 7.29-7.36 (m, 2H), 6.71 (s, 1H), 3.84-4.25 (m, 4H), 2.73-2.91 (m, 2H).
ステップ4:[(2R)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-[[(1S)-1-[[(1S)-2-[4-(ヒドロキシメチル)アニリノ]-1-メチル-2-オキソ-エチル]カルバモイル]-2-メチル-プロピル]アミノ]-3-オキソ-プロピル]スルホニルオキシナトリウム
DMF(395mL)中の(2S)-2-アミノ-N-[(1S)-2-[4-(ヒドロキシメチル)アニリノ]-1-メチル-2-オキソ-エチル]-3-メチル-ブタンアミド(1.19g、4.04mmol)の溶液に、[(2R)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-オキソ-3-ソジオオキシ-プロピル]スルホニルオキシナトリウム(4.40g、10.11mmol)、DIPEA(6.01mL、36.38mmol)およびHBTU(3.83g、10.11mmol)を連続的に添加した。白色懸濁液を室温で22時間撹拌し、次いで0℃に冷却した。水(1.5L)、炭酸ナトリウムの飽和溶液(20mL)および固体塩化ナトリウムで希釈して、白色エマルションを得、これを濾過し、濾液を濃縮乾固して、粗混合物を得た。粗生成物を逆相C18クロマトグラフィー(水中メタノールの勾配)により精製して、[(2R)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-[[(1S)-1-[[(1S)-2-[4-(ヒドロキシメチル)アニリノ]-1-メチル-2-オキソ-エチル]カルバモイル]-2-メチル-プロピル]アミノ]-3-オキソ-プロピル]スルホニルオキシナトリウム(936mg、1.36mmol)をベージュ色固体として得た。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 9.39 (s, 1H). 8.25-8.31 (m, 1H), 8.11-8.17 (m, 1H), 7.89 (d, 2H), 7.70 (d, 2H), 7.64 (d, 2H), 7.50-7.55 (m, 1H), 7.38-7.46 (m, 2H), 7.29-7.35 (m, 2H), 7.20 (d, 2H), 5.07 (s, 1H), 4.51 (s, 1H), 4.42 (s, 2H), 4.19-4.33 (m, 4H), 4.01 (s, 1H), 2.90-3.10 (m, 2H), 2.08-2.20 (m, 1H), 1.31 (d, 3H), 0.8-0.93 (m, 6H).
ステップ5:(2R)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-[[(1S)-2-メチル-1-[[(1S)-1-メチル-2-[4-[(4-ニトロフェノキシ)カルボニルオキシメチル]アニリノ]-2-オキソ-エチル]カルバモイル]プロピル]アミノ]-3-オキソ-プロパン-1-スルホネート
THF(24mL)中の[(2R)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-[[(1S)-1-[[(1S)-2-[4-(ヒドロキシメチル)アニリノ]-1-メチル-2-オキソ-エチル]カルバモイル]-2-メチル-プロピル]アミノ]-3-オキソ-プロピル]スルホニルオキシナトリウム(600mg、0.87mmol)の懸濁液に、DIPEA(432μL、2.61mmol)、続いてクロロギ酸4-ニトロフェニル(439mg、2.17mmol)を添加した。混合物を室温で4時間撹拌した。追加のクロロギ酸4-ニトロフェニル(439mg、2.17mmol)を添加し、反応混合物を室温でさらに16時間撹拌した。追加のクロロギ酸4-ニトロフェニル(439mg、2.17mmol)を添加した。室温で5時間撹拌した後、混合物を濃縮乾固し、シリカゲルクロマトグラフィー(シクロヘキサン中酢酸エチルの勾配)により、次いで中性法を使用する逆相C18クロマトグラフィーにより精製して、(2R)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-[[(1S)-2-メチル-1-[[(1S)-1-メチル-2-[4-[(4-ニトロフェノキシ)カルボニルオキシメチル]アニリノ]-2-オキソ-エチル]カルバモイル]プロピル]アミノ]-3-オキソ-プロパン-1-スルホネート(303mg、0.32mmol)を白色固体として得た。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 9.52 (s, 1H), 8.25-8.37 (m, 3H), 8.06-8.24 (m, 4H), 7.89 (d, 2H), 7.76 (d, 2H), 7.70 (d, 2H), 7.49-7.61 (m, 3H), 7.35-7.45 (m, 4H), 7.26-7.35 (m, 2H), 5.23 (s, 2H), 4.48 (s, 1H), 4.20-4.33 (m, 4H), 4.01 (s, 1H), 3.57-3.66 (m, 2H), 3.10-3.18 (m, 2H), 2.90-3.10 (m, 2H), 2.08-2.20 (m, 1H), 1.33 (d, 3H), 1.21-1.26 (m, 15H), 0.86-0.92 (m, 6H).
UPLC-MS:MS(ESI)m/z[M-H]-:830.5。
ステップ6:(2R)-2-[(5S)-5-[3-クロロ-4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)ブタノイル]アミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]フェニル]メトキシカルボニル]ピペラジン-1-イル]エトキシ]-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸
DMF(1.5mL)中の(2R)-2-[(5S)-5-[3-クロロ-2-メチル-4-(2-ピペラジン-1-イルエトキシ)フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸;2,2,2-トリフルオロ酢酸(C3)(128mg、0.149mmol)の溶液に、DMF(1.5mL)中の(2R)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-[[(1S)-2-メチル-1-[[(1S)-1-メチル-2-[4-[(4-ニトロフェノキシ)カルボニルオキシメチル]アニリノ]-2-オキソ-エチル]カルバモイル]プロピル]アミノ]-3-オキソ-プロパン-1-スルホネート(150mg、0.156mmol)の溶液、およびDIPEA(77μl、0.468mmol)を連続的に添加した。反応混合物を室温で2時間撹拌し、反応の進行をUPLC-MSにより追跡した。(2R)-2-[(5S)-5-[3-クロロ-4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)ブタノイル]アミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]フェニル]メトキシカルボニル]ピペラジン-1-イル]エトキシ]-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸をジメチルホルムアミド中溶液として得、これをこのまま次のステップで使用した。UPLC-MS:MS(ESI)m/z[M+H]+=1553.2+1555.3。
ステップ7:(2R)-2-[(5S)-5-[4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-アミノブタノイル]アミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]フェニル]メトキシカルボニル]ピペラジン-1-イル]エトキシ]-3-クロロ-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸
前のステップで得たジメチルホルムアミド(3mL)中の(2R)-2-[(5S)-5-[3-クロロ-4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)ブタノイル]アミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]フェニル]メトキシカルボニル]ピペラジン-1-イル]エトキシ]-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸(0.156mmol)の溶液に、ピペリジン(30.6μL、0.312mmol)を添加した。反応混合物を室温で15時間撹拌し、反応の進行をUPLC-MSにより追跡した。粗生成物を、Xbridgeカラム上への反応混合物の直接堆積による、かつNHHCO法を使用するC18逆相分取HPLCにより精製して、(2R)-2-[(5S)-5-[4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-アミノブタノイル]アミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]フェニル]メトキシカルボニル]ピペラジン-1-イル]エトキシ]-3-クロロ-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸(148mg=0.111mmol)を白色粉末として得た。UPLC-MS:MS(ESI)m/z[M+H]+=1331.4+1333.5。
ステップ8:(2R)-2-[(5S)-5-[4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]アセチル]アミノ]ブタノイル]アミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]フェニル]メトキシカルボニル]ピペラジン-1-イル]エトキシ]-3-クロロ-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸;2,2,2-トリフルオロ酢酸 L18-C3
DMF(1.5mL)中の(2R)-2-[(5S)-5-[4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-アミノブタノイル]アミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]フェニル]メトキシカルボニル]ピペラジン-1-イル]エトキシ]-3-クロロ-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸(148mg、0.111mmol)の溶液に、THF(1mL)中の(2,3,4,5,6-ペンタフルオロフェニル)2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]アセテート(0.596mmol;L14-C3の調製のステップ20に従って得た)の溶液、およびDIPEA(74μL、0.447mmol)を連続的に添加した。反応混合物を室温で1時間撹拌し、反応の進行をUPLC-MSにより追跡した。粗生成物を、Xbridgeカラム上への反応混合物の直接堆積による、かつNHHCO法を使用するC18逆相分取HPLCにより精製して、L18-C3(60mg、0.0389mmol)を白色粉末として得た。IR波長(cm-1):3288、2101、1659、1237,1039、833、755。1H NMR(400 MHz, dmso-d6): δ (m, 10H), 9.42 (s, 1H), 8.88 (d, 1H), 8.58 (s, 1H), 8.32 (d, 1H), 8.18 (d, 1H), 8.12 (d, 1H), 7.71 (m, 1H), 7.7 (d, 2H), 7.54 (dd, 1H), 7.46 (td, 1H), 7.39 (d, 1H), 7.29 (dd, 2H), 7.25 (d, 2H), 7.21 (t, 2H), 7.18 (d, 1H), 7.15 (d, 1H), 7.13 (t, 1H), 7.04 (t, 1H), 6.99 (d, 1H), 6.71 (t, 1H), 6.22 (d, 1H), 5.47 (m, 1H), 5.23 (AB, 2H), 4.98 (s, 2H), 4.71 (q, 1H), 4.3 (m, 1H), 4.24/4.19 (2m, 2H), 3.97 (dd, 1H), 3.92 (m, 2H), 3.76 (s, 3 H), 3.37 (t, 2H), 3.31 (m, 4H), 3.12/2.97 (2dd, 2H), 2.74 (t, 2H), 2.45 (m, 4H), 2.15 (m, 1H), 1.81 (s, 3H), 1.33 (d, 3H), 0.91 (2d, 6H). 13C NMR (100 MHz, dmso-d6): δ 157.9, 152.3, 131.3, 131.2, 131.1, 131, 130.7, 128.9, 128.6, 120.7, 120.4, 119.6, 116.4, 112.7, 112, 111.3, 70.6, 70.3, 69.4, 67.5, 66.3, 59.7, 56.7, 56.1, 53.4, 52.5, 50.8, 50.4, 49.9, 44, 29.9, 19.6, 17.8, 17.6. 19F NMR (376 MHz, dmso-d6): δ ppm 112.3.
HR-ESI+:m/z[M+H]+=1546.503(1546.5009)(測定値/理論値)。
L16-C3の調製:
(2R)-2-[(5S)-5-[4-[2-[4-[[4-[[(2S)-6-アミノ-2-[[(2S)-2-[[2-(2-アジドエトキシ)アセチル]アミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]ヘキサノイル]アミノ]フェニル]メトキシカルボニル]ピペラジン-1-イル]エトキシ]-3-クロロ-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸
Figure 2022532918000476
ステップ1:(2S)-6-(tert-ブトキシカルボニルアミノ)-2-[[2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]ヘキサン酸
水(30mL)中の(2S)-2-アミノ-6-(tert-ブトキシカルボニルアミノ)ヘキサン酸(2.96g、12mmol)および炭酸水素ナトリウム(1.01g、12mmol)の溶液に、ジメトキシエタン(30mL)中の(2,5-ジオキソピロリジン-1-イル)2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノエート(5.0g、11.5mmol)の溶液を添加し、THF(15mL)を、溶解性を向上させるために添加した。反応混合物を室温で16時間撹拌した。塩酸1Mの水溶液(15mL)を添加し、水層を酢酸エチル(3×75mL)で抽出した。合わせた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮乾固して、粗化合物を得た。超音波処理しながらジクロロメタン/ペンタン中で摩砕して、(2S)-6-(tert-ブトキシカルボニルアミノ)-2-[[2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]ヘキサン酸(4.9g、8.63mmol)を白色固体として得た。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 12.48 (s, 1H), 7.89 (d, 2H), 7.74 (t, 2H), 7.28-7.44 (m, 6H), 6.73 (s, 1H), 4.10-4.33 (m, 5H), 3.9 (t, 1H), 2.82-2.90 (m, 2H), 1.52-1.73 (m, 2H), 1.34 (s, 9H), 1.22-1.31 (m, 4H), 0.83-0.91 (m, 6H).
ステップ2:9H-フルオレン-9-イルメチルN-[1-[[(1S)-5-(tert-ブトキシカルボニルアミノ)-1-[[4-(ヒドロキシメチル)フェニル]カルバモイル]ペンチル]カルバモイル]-2-メチル-プロピル]カルバメート
ジクロロメタン(19mL)およびメタノール(9.5mL)中の(2S)-6-(tert-ブトキシカルボニルアミノ)-2-[[2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]ヘキサン酸(1.5g、2.64mmol)の溶液に、メタノール(1.5mL)中の(4-アミノフェニル)メタノール(651.0mg、5.28mmol)を添加した。次いで、エチル2-エトキシ-2H-キノリン-1-カルボキシレート(1.31g、5.28mmol)を添加した。反応混合物を室温で16時間撹拌し、次いで濃縮乾固した。粗生成物をシリカゲルクロマトグラフィー(ジクロロメタン中メタノールの勾配)により精製して、9H-フルオレン-9-イルメチルN-[1-[[(1S)-5-(tert-ブトキシカルボニルアミノ)-1-[[4-(ヒドロキシメチル)フェニル]カルバモイル]ペンチル]カルバモイル]-2-メチル-プロピル]カルバメート(544mg、0.80mmol)を淡赤色固体として得た。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 9.93 (s, 1H). 8.01 (d, 1H), 7.89 (d, 2H), 7.74 (t, 2H), 7.52 (d, 2H), 7.37-7.45 (m, 3H), 7.32 (t, 2H), 7.22 (d, 2H), 6.71 (s, 1H), 5.08 (br s, 1H), 4.43 (d, 2H), 4.21-4.40 (m, 4H), 3.92 (t, 1H), 2.83-2.91 (m, 2H), 1.94-2.01 (m, 1H), 1.55-1.74 (m, 2H), 1.21-1.42 (m, 4H), 1.33 (s, 9H), 0.87 (t, 6H).
ステップ3:[4-[[(2S)-6-(tert-ブトキシカルボニルアミノ)-2-[[2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]ヘキサノイル]アミノ]フェニル]メチル(4-ニトロフェニル)カーボネート
THF(19mL)中の9H-フルオレン-9-イルメチルN-[1-[[(1S)-5-(tert-ブトキシカルボニルアミノ)-1-[[4-(ヒドロキシメチル)フェニル]カルバモイル]ペンチル]カルバモイル]-2-メチル-プロピル]カルバメート(600.0mg、0.892mmol)の溶液に、ピリジン(361μL、4.46mmol)、次いでクロロギ酸4-ニトロフェニル(448mg、2.22mmol)を添加した。混合物を室温で16時間撹拌し、次いで濃縮乾固した。粗生成物をシリカゲルクロマトグラフィー(シクロヘキサン中酢酸エチルの勾配)により精製して、[4-[[(2S)-6-(tert-ブトキシカルボニルアミノ)-2-[[2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]ヘキサノイル]アミノ]フェニル]メチル(4-ニトロフェニル)カーボネート(524mg;0.62mmol;70%)を淡桃色固体として得た。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 10.13 (s, 1H), 8.31 (d, 2H), 8.1 (d, 1H), 7.89 (d, 2H), 7.74 (t, 2H), 7.63 (d, 2H), 7.57 (d, 2H), 7.28-7.45 (m, 7H), 6.72 (s, 1H), 5.24 (s, 2H), 4.35-4.42 (m, 1H), 4.27-4.33 (m, 1H), 4.22 (s, 2H), 3.92 (t, 1H), 2.83-2.91 (m, 2H), 1.96-2.00 (m, 1H), 1.58-1.73 (m, 2H), 1.20-1.30 (m, 4H), 1.33 (s, 9H), 0.86 (t, 6H). 13C NMR (100 MHz, dmso-d6): δ171.22, 170.67, 156.1, 155.5, 155.27, 151.92, 145.15, 143.87, 143.75, 140.68, 139.34, 129.43, 129.31, 127.6, 127.03, 125.38, 125.32, 122.58, 120.07, 119.11, 77.28, 70.23, 65.67, 60.11, 54.89, 53.43, 46.67, 31.69, 30.39, 29.22, 28.23, 22.74, 19.19, 18.26.
LC-MS:MS(ESI)m/z[M+Na]+=837.4。
ステップ4:(2R)-2-[(5S)-5-[4-[2-[4-[[4-[[(2S)-6-(tert-ブトキシカルボニルアミノ)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]ヘキサノイル]アミノ]フェニル]メトキシカルボニル]ピペラジン-1-イル]エトキシ]-3-クロロ-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸
DMF(1.5mL)中の(2R)-2-[(5S)-5-[3-クロロ-2-メチル-4-(2-ピペラジン-1-イルエトキシ)フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸 C3(166.3mg、0.170mmol)の溶液に、DMF(1.5mL)中の[4-[[(2S)-6-(tert-ブトキシカルボニルアミノ)-2-[[2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]ヘキサノイル]アミノ]フェニル]メチル(4-ニトロフェニル)カーボネート(150mg、0.179mmol)の溶液、およびDIPEA(85μl、0.510mmol)を連続的に添加した。反応混合物を室温で1時間撹拌し、反応の進行をUPLC-MSにより追跡した。粗生成物を、Xbridgeカラム上への反応混合物の直接堆積による、かつNHHCO法を使用するC18逆相分取HPLCにより精製して、(2R)-2-[(5S)-5-[4-[2-[4-[[4-[[(2S)-6-(tert-ブトキシカルボニルアミノ)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]ヘキサノイル]アミノ]フェニル]メトキシカルボニル]ピペラジン-1-イル]エトキシ]-3-クロロ-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸(134mg、0.0859mmol)を白色粉末として得た。UPLC-MS:MS(ESI)m/z[M+H]+=1559.1+1561.3、[M+Na]+:1581.0+1583.2。IR波長(cm-1):3309、1698、1238、1162、757、744。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 10.05 (s, 1H), 8.87 (d, 1H), 8.6 (m, 1H), 8.06 (d, 1H), 7.88 (d, 2H), 7.74 (2d, 2H), 7.64 (m, 1H), 7.57 (d, 2H), 7.52 (dd, 1H), 7.44 (t, 1H), 7.43 (d, 1H), 7.4 (t, 2H), 7.35 (d, 1H), 7.3 (t, 2H), 7.3 (dd, 2H), 7.26 (d, 2H), 7.2 (t, 2H), 7.18 (d, 1H), 7.14 (d, 1H), 7.12 (t, 1H), 7.03 (t, 1H), 6.99 (d, 1H), 6.72 (t, 1H), 6.71 (m, 1H), 6.24 (d, 1H), 5.49 (dd, 1H), 5.23 (m, 2H), 4.97 (s, 2H), 4.38 (m, 1H), 4.29/4.23 (m, 2H), 4.22 (m, 1H), 4.2 (m, 2H), 3.92 (dd, 1H), 3.74 (s, 3H), 3.29 (m, 4H), 3.29/2.5 (2dd, 2H), 2.87 (m, 2H), 2.74 (t, 2H), 2.45 (m, 4H), 1.99 (m, 1H), 1.82 (s, 3 H), 1.68/1.6 (2m, 2H), 1.36/1.28 (2m, 4H), 1.32 (s, 9H), 0.86 (2d, 6H). 13C NMR (100 MHz, dmso-d6): δ 158, 131.4, 131.2, 131.2, 131, 130.8, 128.9, 128.5, 127.9, 127.5, 125.6, 120.8, 120.5, 120.4, 119.3, 116, 115.9, 112.4, 112.2, 111.2, 74.1, 69.2, 67.9, 66.7, 66.2, 60.6, 56.6, 56.2, 53.8, 53, 47.1, 43.7, 40, 32.6, 32.2, 30.6, 29.8/23.2, 28.5, 18.8, 18.1. 19F NMR (376 MHz, dmso-d6): δ -112.
ステップ5:(2R)-2-[(5S)-5-[4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-アミノ-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-6-(tert-ブトキシカルボニルアミノ)ヘキサノイル]アミノ]フェニル]メトキシカルボニル]ピペラジン-1-イル]エトキシ]-3-クロロ-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸
ジメチルホルムアミド(3mL)中の(2R)-2-[(5S)-5-[4-[2-[4-[[4-[[(2S)-6-(tert-ブトキシカルボニルアミノ)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]ヘキサノイル]アミノ]フェニル]メトキシカルボニル]ピペラジン-1-イル]エトキシ]-3-クロロ-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸(134mg、0.0859mmol)の溶液に、ピペリジン(17μL、0.172mmol)を添加した。反応混合物を室温で18時間撹拌し、反応の進行をUPLC-MSにより追跡した。粗生成物を、Xbridgeカラム上への反応混合物の直接堆積による、かつNHHCO法を使用するC18逆相分取HPLCにより精製して、(2R)-2-[(5S)-5-[4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-アミノ-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-6-(tert-ブトキシカルボニルアミノ)ヘキサノイル]アミノ]フェニル]メトキシカルボニル]ピペラジン-1-イル]エトキシ]-3-クロロ-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸(88mg、0.0658mmol)を白色粉末として得た。UPLC-MS:MS(ESI)m/z[M+H]+=1337.4+1339.4、[M+Na]+=1359.4+1361.4。IR波長(cm-1):3307、1683、1290、1238、1162、835、754。1H NMR (400 MHz, dmso-d6) δ ppm 10.23 (s, 1H), 8.88 (d, 1H), 8.53 (m, 1H), 8.47 (br, 1H), 7.86 (d, 1H), 7.58 (d, 2H), 7.54 (d, 1H), 7.48 (d, 1H), 7.45 (t, 1H), 7.27 (dd, 2H), 7.25 (d, 2H), 7.19 (t, 2H), 7.18 (d, 1H), 7.14 (d, 1H), 7.08 (t, 1H), 7.03 (t, 1H), 6.96 (t, 1H), 6.72 (t, 1H), 6.67 (t, 1H), 6.14 (d, 1H), 5.42 (d, 1H), 5.21 (m, 2H), 4.97 (s, 2H), 4.4 (m, 1H), 4.21 (m, 2H), 3.75 (s, 3H), 3.42/2.35 (m, 2H), 3.29 (m, 4H), 3.24 (m, 1H), 2.87 (q, 2H), 2.72 (t, 2H), 2.43 (m, 4H), 1.99 (m, 1H), 1.78 (s, 3H), 1.7/1.61 (2m, 2H), 1.36 (m, 2H), 1.34 (s, 9H), 1.26 (m, 2H), 0.89/0.82 (2d, 6H). 13C NMR (100 MHz, dmso-d6): δ ppm 158.4, 131.3, 131.2, 131.1, 131, 128.4, 128, 120.8, 120.6, 120.4, 119.7, 116.1, 115.9, 112.7, 111.7, 111.2, 76.2, 69.2, 67.4, 66.3, 59.2, 56.6, 56.3, 53.6, 53.1, 43.8, 40.1, 33.2, 32.4, 31.3, 29.3, 28.8, 22.9, 19.7/17.5, 17.9. 19F NMR (376 MHz, dmso-d6): δ ppm -112.4.
ステップ6:(2R)-2-[(5S)-5-[4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]アセチル]アミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-6-(tert-ブトキシカルボニルアミノ)ヘキサノイル]アミノ]フェニル]メトキシカルボニル]ピペラジン-1-イル]エトキシ]-3-クロロ-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸
DMF(500μL)中の(2R)-2-[(5S)-5-[4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-アミノ-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-6-(tert-ブトキシカルボニルアミノ)ヘキサノイル]アミノ]フェニル]メトキシカルボニル]ピペラジン-1-イル]エトキシ]-3-クロロ-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸(82mg、0.0613mmol)の溶液に、THF中の(2,3,4,5,6-ペンタフルオロフェニル)2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]アセテート(0.245mmol;L14-C3の調製のステップ20に従って得た)の溶液、およびDIPEA(30.4μL、0.184mmol)を連続的に添加した。反応混合物を室温で1時間撹拌し、反応の進行をUPLC-MSにより追跡した。粗生成物を、Xbridgeカラム上への反応混合物の直接堆積による、かつNHHCO法を使用するC18逆相分取HPLCにより精製して、(2R)-2-[(5S)-5-[4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]アセチル]アミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-6-(tert-ブトキシカルボニルアミノ)ヘキサノイル]アミノ]フェニル]メトキシカルボニル]ピペラジン-1-イル]エトキシ]-3-クロロ-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸(60mg、0.0386mmol)を白色粉末として得た。UPLC-MS:MS(ESI)m/z[M+H]+=1552.2+1554.2、[M+Na]+=1574.1+1576.3。
ステップ7:(2R)-2-[(5S)-5-[4-[2-[4-[[4-[[(2S)-6-アミノ-2-[[(2S)-2-[[2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]アセチル]アミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]ヘキサノイル]アミノ]フェニル]メトキシカルボニル]ピペラジン-1-イル]エトキシ]-3-クロロ-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸 L16-C3
ジクロロメタン(3mL)中の(2R)-2-[(5S)-5-[4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]アセチル]アミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-6-(tert-ブトキシカルボニルアミノ)ヘキサノイル]アミノ]フェニル]メトキシカルボニル]ピペラジン-1-イル]エトキシ]-3-クロロ-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸(23mg、0.0148mmol)の溶液に、2,2,2-トリフルオロ酢酸(400μl、4.57mmol)を添加した。反応混合物を室温で2時間撹拌し、反応の進行をUPLC-MSにより追跡した。粗生成物を、Xbridgeカラム上への反応混合物の直接堆積による、かつNHHCO法を使用するC18逆相分取HPLCにより精製して、L16-C3(5mg、0.00344mmol)を白色粉末として得た。UPLC-MS:MS(ESI)m/z[M+H]+=1552.4+1554.5、[M+Na]+=1574.4+1576.4。IR波長(cm-1):3250、2250~3500、2102、1660、1288、1238、1121、833、755。1H NMR(400 MHz, dmso-d6): δ ppm 10.24 (s, 1H), 8.85 (d, 1H), 8.49 (s, 1H), 8.49 (d, 1H), 7.98 (d, 1H), 7.6 (d, 2H), 7.55 (d, 1H), 7.51 (d, 1H), 7.5 (d, 1H), 7.46 (t, 1H), 7.26 (d, 2H), 7.25 (dd, 2H), 7.18 (t, 2H), 7.17 (d, 1H), 7.14 (d, 1H), 7.05 (t, 1H), 7.02 (t, 1H), 6.89 (d, 1H), 6.6 (t, 1H), 6.05 (d, 1H), 5.32 (d, 1H), 5.21/5.15 (m, 2H), 5.02/4.96 (m, 2H), 4.36 (q, 1H), 4.31 (dd, 1H), 4.2 (m, 2H), 3.94 (s, 2H), 3.77 (s, 3 H), 3.58 (m, 10 H), 3.46/2.28 (d+t, 2H), 3.34 (t, 2H), 3.29 (m, 4 H), 2.8 (m, 2H), 2.67 (t, 2H), 2.43 (m, 4 H), 2.01 (m, 1H), 1.75 (s, 3 H), 1.69/1.6 (2m, 2H), 1.51 (m, 2H), 1.31 (m, 2H), 0.86/0.8 (2d, 6 H). 13C NMR (100 MHz, dmso-d6): δ ppm 157.9, 153.7, 131.4, 131.4, 131.3, 131.1, 130.9, 129.3, 127.6, 120.9, 120.4, 119.8, 116.2, 116.1, 112.6, 111.8, 111.8, 78.1, 70.5, 70.4, 69.3, 66.6, 66.6, 56.9, 56.5, 56.3, 54, 52.3, 50.4, 44, 39, 33.8, 32.2, 31.8, 28.2, 23.1, 19.7/18.1, 18.3. 19F NMR (376 MHz, dmso-d6): δ ppm -112.6.
HR-ESI+:m/z[M+H]+=1452.5661(1452.5648)(測定値/理論値)。
L21-C1の調製:
(2S,3S,4R,5R,6S)-6-[2-[2-[[4-[2-[4-[4-[(1R)-1-カルボキシ-2-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]エトキシ]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル]-2-クロロ-3-メチル-フェノキシ]エチル]-1-メチル-ピペラジン-1-イウム-1-イル]メチル]-5-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[3-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]プロパノイルアミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]フェニル]エチル]-3,4,5-トリヒドロキシ-テトラヒドロピラン-2-カルボン酸;2,2,2-トリフルオロアセテート
Figure 2022532918000477
ステップ1:tert-ブチル-[(2-ヨード-4-ニトロ-フェニル)メトキシ]-ジメチル-シラン
ジクロロメタン(300mL)中の(2-ヨード-4-ニトロ-フェニル)メタノール(172g、61.64mmol;L14-C3の調製のステップ2に従って得た)の溶液に、イミダゾール(5.04g、73.97mmol)を添加した。混合物を0℃に冷却し、次いでジクロロメタン(300mL)中のtert-ブチル-クロロ-ジメチル-シラン(11.15g、73.97mmol)の溶液を15分間で滴下添加した。氷浴を取り外し、反応混合物を室温で16時間撹拌した。反応の完了後、反応混合物をメタノール(20mL)でクエンチし、濃縮乾固した。粗生成物をシリカゲルクロマトグラフィー(シクロヘキサン中酢酸エチルの勾配)により精製して、tert-ブチル-[(2-ヨード-4-ニトロ-フェニル)メトキシ]-ジメチル-シラン(19.65g、49.96mmol)を白色固体として得た。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 8.57 (s, 1H), 8.31 (d, 1H), 7.66 (d, 1H), 4.67 (s, 2H), 0.92 (s, 9H), 0.14 (s, 6H).
ステップ2:メチル(2S,3S,4R,5S,6S)-3,4,5-トリアセトキシ-6-[2-[2-[[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシメチル]-5-ニトロ-フェニル]エチニル]テトラヒドロピラン-2-カルボキシレート
DMF(55mL)中のtert-ブチル-[(2-ヨード-4-ニトロ-フェニル)メトキシ]-ジメチル-シラン化合物(3.0g、7.63mmol)の溶液に、メチル(2S,3S,4R,5S,6S)-3,4,5-トリアセトキシ-6-エチニル-テトラヒドロピラン-2-カルボキシレート(3.39g、9.92mmol;L14-C3の調製のステップ13に従って得た)、DIPEA(5.80mL、35.09mmol)、ヨウ化銅(145mg、0.763mmol)およびジクロロ-ビス-(トリフェニルホスフィン)パラジウム(II)(535mg、0.763mmol)を連続的に添加した。黄色溶液をアルゴンでフラッシュし、室温で16時間撹拌した。水(300mL)で希釈した後、水層を酢酸エチル(2×300mL)で抽出した。合わせた有機層を水(2×300mL)で洗浄し、次いで硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮乾固した。粗生成物をシリカゲルクロマトグラフィー(シクロヘキサン中酢酸エチルの勾配)により精製して、メチル(2S,3S,4R,5S,6S)-3,4,5-トリアセトキシ-6-[2-[2-[[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシメチル]-5-ニトロ-フェニル]エチニル]テトラヒドロピラン-2-カルボキシレート(4.01g、6.60mmol)をベージュ色固体として得た。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 8.32 (dd, 1H), 8.19 (d, 1H), 7.75 (d, 1H), 5.45 (t, 1H), 5.16 (t, 1H), 5.02-5.07 (m, 2H), 4.82 (s, 2H), 4.55 (d, 1H), 3.65 (s, 3H), 1.98-2.07 (m, 9H), 0.92 (m,9H), 0.14 (s, 6H).
ステップ3:メチル(2S,3S,4R,5S,6S)-3,4,5-トリアセトキシ-6-[2-[2-(ヒドロキシメチル)-5-ニトロ-フェニル]エチニル]テトラヒドロピラン-2-カルボキシレート
THF(48mL)および水(48mL)中のメチル(2S,3S,4R,5S,6S)-3,4,5-トリアセトキシ-6-[2-[2-[[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシメチル]-5-ニトロ-フェニル]エチニル]テトラヒドロピラン-2-カルボキシレート(4.01g、6.60mmol)の溶液に、酢酸(193mL、3.36mol)を添加した。無色溶液を室温で2日間撹拌し、次いで水(300mL)で希釈した。水層をジクロロメタン(2×300mL)で抽出した。合わせた有機層を水(2×300mL)、および炭酸水素ナトリウムの飽和水溶液(400mL)で洗浄し、次いで硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮乾固した。粗生成物をシリカゲルクロマトグラフィー(シクロヘキサン中酢酸エチルの勾配)により精製して、メチル(2S,3S,4R,5S,6S)-3,4,5-トリアセトキシ-6-[2-[2-(ヒドロキシメチル)-5-ニトロ-フェニル]エチニル]テトラヒドロピラン-2-カルボキシレート(2.67g、5.41mmol)を白色固体として得た。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 8.29 (dd, 1H), 8.15 (d, 1H), 7.79 (d, 1H), 5.68 (t, 1H), 5.45 (t, 1H), 5.16 (t, 1H), 5.02-5.07 (m, 2H), 4.62 (d, 2H), 4.55 (d, 1H), 3.65 (s, 3H), 1.98-2.07 (m, 9H).
ステップ4:メチル(2S,3S,4R,5S,6S)-3,4,5-トリアセトキシ-6-[2-[5-アミノ-2-(ヒドロキシメチル)フェニル]エチル]テトラヒドロピラン-2-カルボキシレート
THF(59mL)中のメチル(2S,3S,4R,5S,6S)-3,4,5-トリアセトキシ-6-[2-[2-(ヒドロキシメチル)-5-ニトロ-フェニル]エチニル]テトラヒドロピラン-2-カルボキシレート(2.67g、5.41mmol)の溶液を、アルゴンでフラッシュした。炭素上白金5%乾燥(1.34g、50%w/w)を添加した。反応混合物をアルゴン、Hで連続的にフラッシュし、H雰囲気(P atm)下、室温で2日間撹拌した。反応混合物をCelite(登録商標)パッドに通して濾過し、酢酸エチル/メタノール 9/1の溶液(500mL)で洗浄し、次いで濃縮乾固した。すべてのシーケンス(炭素上白金5%乾燥(1.34g、50%w/w)の添加、H(P atm)下、室温で16時間の撹拌、およびCelite(登録商標)パッドに通して濾過)を繰り返して、完全に変換させた。粗生成物をシリカゲルクロマトグラフィー(シクロヘキサン中酢酸エチルの勾配)により精製して、メチル(2S,3S,4R,5S,6S)-3,4,5-トリアセトキシ-6-[2-[5-アミノ-2-(ヒドロキシメチル)フェニル]エチル]テトラヒドロピラン-2-カルボキシレート(1.12g、2.40mmol)を白色固体として得た。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 6.93 (d, 1H). 6.67-6.33 (m, 2H), 5.30 (t, 1H), 4.96 (t, 1H), 4.88 (s, 2H), 4.81 (t, 1H), 4.61 (t, 1H), 4.39 (d, 1H), 4.29-4.24 (m, 2H), 3.78-3.72 (m, 1H), 3.65 (s, 3H), 2.65-2.54 (m, 2H), 2.07-1.98 (m, 9H), 1.79-1.68 (m, 1H), 1.63-1.52 (m, 1H).
ステップ5:メチル(2S,3S,4R,5S,6S)-3,4,5-トリアセトキシ-6-[2-[5-[[(2S)-2-(tert-ブトキシカルボニルアミノ)-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]-2-(ヒドロキシメチル)フェニル]エチル]テトラヒドロピラン-2-カルボキシレート
DMF(21mL)中のメチル(2S,3S,4R,5S,6S)-3,4,5-トリアセトキシ-6-[2-[5-アミノ-2-(ヒドロキシメチル)フェニル]エチル]テトラヒドロピラン-2-カルボキシレート(1.00g、2.14mmol)の溶液に、(2S)-2-(tert-ブトキシカルボニルアミノ)-5-ウレイド-ペンタン酸(589mg、2.14mmol)、DIPEA(707μl、4.28mmol)およびHBTU(1.22g、3.21mmol)を連続的に添加した。反応混合物を室温で72時間撹拌した。反応の完了後、混合物を水(100mL)で希釈し、濃縮乾固した。粗生成物をシリカゲルクロマトグラフィー(ジクロロメタン中メタノールの勾配)により精製して、メチル(2S,3S,4R,5S,6S)-3,4,5-トリアセトキシ-6-[2-[5-[[(2S)-2-(tert-ブトキシカルボニルアミノ)-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]-2-(ヒドロキシメチル)フェニル]エチル]テトラヒドロピラン-2-カルボキシレート(1.05g、1.45mmol)をベージュ色固体として得た。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 9.82 (s, 1H), 7.35-7.42 (m, 2H), 7.24 (d, 1H), 6.95 (d, 1H), 5.94 (t, 1H), 5.37 (s, 2H), 5.30 (t, 1H), 4.91-4.99 (m, 2H), 4.79 (t, 1H), 4.36-4.42 (m, 3H), 4.01-4.08 (m, 1H), 3.76 (t, 1H), 3.65 (s, 3H), 2.95-3.04 (m, 2H), 2.54-2.65 (m, 2H), 1.98-2.07 (m, 9H), 1.68-1.79 (m, 1H), 1.49-1.63 (m, 3H), 1.30-1.42 (m, 11H).
ステップ6:メチル(2S,3S,4R,5S,6S)-3,4,5-トリアセトキシ-6-[2-[5-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]-2-(ヒドロキシメチル)フェニル]エチル]テトラヒドロピラン-2-カルボキシレート
ジクロロメタン(7.5mL)中の化合物メチル(2S,3S,4R,5S,6S)-3,4,5-トリアセトキシ-6-[2-[5-[[(2S)-2-(tert-ブトキシカルボニルアミノ)-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]-2-(ヒドロキシメチル)フェニル]エチル]テトラヒドロピラン-2-カルボキシレート(950mg、1.31mmol)の溶液に、0℃でトリフルオロ酢酸(1.9mL、25.6mmol)を添加した。反応混合物を室温で3時間撹拌した。反応の完了後、反応混合物を濃縮乾固し、トルエン(2×50mL)と共蒸発させて、粗化合物を得た。
DMF(13mL)に溶解したこの粗製物に、(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタン酸(467mg、1.38mmol)、DIPEA(867μl、5.24mmol)およびHBTU(845mg、2.23mmol)を連続的に添加した。反応混合物を室温で16時間撹拌した。反応の完了後、炭酸水素塩の飽和水溶液(20mL)を添加し、混合物を室温で1時間撹拌し、水(100mL)で希釈し、濃縮乾固した。粗生成物をシリカゲルクロマトグラフィー(ジクロロメタン中メタノールの勾配)により、次いで中性法を使用する逆相C18クロマトグラフィーにより精製して、メチル(2S,3S,4R,5S,6S)-3,4,5-トリアセトキシ-6-[2-[5-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]-2-(ヒドロキシメチル)フェニル]エチル]テトラヒドロピラン-2-カルボキシレート(680mg、0.720mmol)を白色固体として得た。LC-MS:MS(ESI)m/z[M+H]+=946.3。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 9.90 (s, 1H). 8.07 (d, 2H), 7.89 (d, 2H), 7.74 (t, 2H), 7.44-7.38 (m, 3H), 7.36-7.28 (m, 3H), 7.24 (d, 1H), 5.94 (t, 1H), 5.37 (s, 2H), 5.30 (t, 1H), 4.99-4.92 (m, 2H), 4.79 (t, 1H), 4.42-4.36 (m, 4H), 4.32-4.19 (m, 3H), 3.94-3.90 (m, 1H), 3.76 (t, 1H), 3.65 (s, 3H), 2.99-2.94 (m, 2H), 2.65-2.54 (m, 2H), 2.07-1.98 (m, 10H), 1.70-1.55 (m, 4H), 1.46-1.36 (m, 2H), 0.89-0.84 (m, 6H). 13C NMR (100 MHz, dmso-d6): δ 171.19, 170.33, 169.58, 169.45, 169.27, 167.77, 158.81, 156.12, 143.89, 143.76, 140.69, 139.48, 137.54, 134.88, 128.44, 127.62, 127.06, 125.35, 120.08, 119.42, 116.65, 75.78, 74.61, 72.65, 71.20, 69.49, 65.68, 60.49, 60.10, 53.14, 52.40, 46.68, 32.32, 30.43, 29.54, 27.19, 26.77, 20.39, 20.34, 20.24, 19.22, 18.25.
ステップ7:メチル(2S,3S,4R,5S,6S)-3,4,5-トリアセトキシ-6-[2-[2-(ブロモメチル)-5-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]フェニル]エチル]テトラヒドロピラン-2-カルボキシレート
THF(8.2mL)中の化合物メチル(2S,3S,4R,5S,6S)-3,4,5-トリアセトキシ-6-[2-[5-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]-2-(ヒドロキシメチル)フェニル]エチル]テトラヒドロピラン-2-カルボキシレート(154mg、0.163mmol)の溶液に、トリフェニルホスフィン(85.4mg、0.326mmol)および1-ブロモピロリジン-2,5-ジオン(58.0mg、0.326mmol)を連続的に添加した。反応混合物を室温で2時間撹拌した。反応の進行をUPLC-MSにより追跡した:アリコートを大過剰のMeOHにより処理し、続いて、対応するメチルエーテルの形成が生じた。予期された臭化物誘導体はUPLC-MS条件で安定していた。5時間後、トリフェニルホスフィン(85.4mg、0.326mmol)および1-ブロモピロリジン-2,5-ジオン(58.0mg、0.326mmol)を添加し、反応混合物を室温で15時間撹拌した。得られた粗製のメチル(2S,3S,4R,5S,6S)-3,4,5-トリアセトキシ-6-[2-[2-(ブロモメチル)-5-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]フェニル]エチル]テトラヒドロピラン-2-カルボキシレートを、このまま次のステップで使用した。UPLC-MS:MS(ESI)m/z[M+OMe-Br+H]+=960.7。
ステップ8:(2R)-2-[(5S)-5-[3-クロロ-4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]-2-[2-[(2S,3S,4R,5S,6S)-3,4,5-トリアセトキシ-6-メトキシカルボニル-テトラヒドロピラン-2-イル]エチル]フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸
前のステップ(ステップ7)からのDMF中のメチル(2S,3S,4R,5S,6S)-3,4,5-トリアセトキシ-6-[2-[2-(ブロモメチル)-5-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]フェニル]エチル]テトラヒドロピラン-2-カルボキシレート(0.167mmol)の溶液に、(2R)-2-[(5Sa)-5-[3-クロロ-2-メチル-4-(2-ピペラジン-1-イルエトキシ)フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸(C1)(143mg、0.163mmol)およびDIPEA(114μL、0.652mmol)を連続的に添加した。反応混合物を室温で15時間撹拌し、反応の進行をUPLC-MSにより追跡した(アリコートを大過剰のMeOHにより処理した)。粗生成物を、Xbridgeカラム上への反応混合物の直接堆積による、かつTFA法を使用するC18逆相分取HPLCにより精製して、(2R)-2-[(5Sa)-5-[3-クロロ-4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]-2-[2-[(2S,3S,4R,5S,6S)-3,4,5-トリアセトキシ-6-メトキシカルボニル-テトラヒドロピラン-2-イル]エチル]フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸(21.3mg、0.0111mmol)を白色粉末として得た。UPLC-MS:MS(ESI)m/z[M+H]+=1802.9+1804.9。IR波長(cm-1):1755、1672、1226、1201、1130。1H NMR (400 MHz, dmso-d6) δ ppm 13.3 (br s, 1H), 10.2 (s, 1H), 8.88 (d, 1H), 8.61 (s, 1H), 8.14 (d, 1H), 7.88 (d, 2H), 7.73 (dd, 2H), 7.65 (d, 1H), 7.63 (d, 1H), 7.62 (m, 1H), 7.54 (br s, 1H), 7.51 (dd, 1H), 7.45 (t, 1H), 7.4 (t, 2H), 7.38 (m, 1H), 7.32 (t, 2H), 7.3 (dd, 2H), 7.2 (d, 1H), 7.2 (t, 2H), 7.15 (t, 1H), 7.15 (d, 1H), 7.03 (t, 1H), 7.01 (dd, 1H), 6.72 (t, 1H), 6.22 (d, 1H), 6 (br s, 1H), 5.51 (dd, 1H), 5.34 (t, 1H), 5.3 (br s, 2H), 5.27/5.21 (m, 2H), 4.98 (t, 1H), 4.85 (t, 1H), 4.57/4.49 (m, 2H), 4.39 (m, 1H), 4.35 (d, 1H), 4.27 (m, 2H), 4.26 (m, 2H), 4.23 (m, 1H), 3.93 (t, 1H), 3.76 (s, 3H), 3.71 (m, 1H), 3.64 (s, 3H), 3.4 (m, 4H), 3.29/2.51 (2dd, 2H), 3.13/2.94 (2m, 4H), 3 (m, 2H), 2.98 (m, 2H), 2.93 (br s, 3 H), 2.81 (m, 2H), 1.99/1.95 (3s, 9H), 1.98 (m, 1H), 1.84 (s, 3H), 1.77/1.59 (2m, 2H), 1.64 (2m, 2H), 1.41 (2m, 2H), 0.88/0.85 (2d, 6H). 13C NMR (100 MHz, dmso-d6): δ ppm 158.1, 152.9, 135.6, 131.5, 131.4, 131.3, 131.2, 131, 128.9, 128.1, 127.5, 125.7, 120.9, 120.6, 120.4, 120.3, 117, 116, 116, 112.8, 112.2, 111.2, 75.6, 74.9, 73.8, 72.9, 71.4, 69.6, 69.4, 67.5, 66.1, 60.4, 58.3, 56, 55.4, 53.9, 52.8, 47.2, 46.2, 44.3, 39, 32.8, 32.8, 31, 29.6, 27.4, 27.2, 21.1, 19.5/18.7, 18.1. 19F NMR (376 MHz, dmso-d6) δ ppm -74, -112.
ステップ9:(2S,3S,4R,5R,6S)-6-[2-[(5S)-5-[[(2S)-2-[[(2S)-2-アミノ-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]-2-[[4-[2-[4-[4-[(1R)-1-カルボキシ-2-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]エトキシ]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル]-2-クロロ-3-メチル-フェノキシ]エチル]-1-メチル-ピペラジン-1-イウム-1-イル]メチル]フェニル]エチル]-3,4,5-トリヒドロキシ-テトラヒドロピラン-2-カルボン酸
メタノール(6.0mL)中の(2R)-2-[(5S)-5-[3-クロロ-4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]-2-[2-[(2S,3S,4R,5S,6S)-3,4,5-トリアセトキシ-6-メトキシカルボニル-テトラヒドロピラン-2-イル]エチル]フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸(21.3mg、0.0111mmol)の溶液に、水(4ml)中の水酸化リチウム一水和物(4.66mg μL、0.111mmol)の溶液を添加した。反応混合物を室温で60時間撹拌し、反応の進行をUPLC-MSにより追跡した。粗生成物を、Xbridgeカラム上への反応混合物の直接堆積による、かつTFA法を使用するC18逆相分取HPLCにより精製して、(2S,3S,4R,5R,6S)-6-[2-[(5S)-5-[[(2S)-2-[[(2S)-2-アミノ-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]-2-[[4-[2-[4-[4-[(1R)-1-カルボキシ-2-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]エトキシ]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル]-2-クロロ-3-メチル-フェノキシ]エチル]-1-メチル-ピペラジン-1-イウム-1-イル]メチル]フェニル]エチル]-3,4,5-トリヒドロキシ-テトラヒドロピラン-2-カルボン酸(47.8mg、0.029mmol)を白色粉末として得た。UPLC-MS:MS(ESI)m/z[M+H]+=1440.6+1442.6。
ステップ10:(2S,3S,4R,5R,6S)-6-[2-[2-[[4-[2-[4-[4-[(1R)-1-カルボキシ-2-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]エトキシ]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル]-2-クロロ-3-メチル-フェノキシ]エチル]-1-メチル-ピペラジン-1-イウム-1-イル]メチル]-5-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[3-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]プロパノイルアミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]フェニル]エチル]-3,4,5-トリヒドロキシ-テトラヒドロピラン-2-カルボン酸;2,2,2-トリフルオロアセテート L21-C1
DMF(1.5mL)中の(2S,3S,4R,5R,6S)-6-[2-[(5S)-5-[[(2S)-2-[[(2S)-2-アミノ-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]-2-[[4-[2-[4-[4-[(1R)-1-カルボキシ-2-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]エトキシ]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル]-2-クロロ-3-メチル-フェノキシ]エチル]-1-メチル-ピペラジン-1-イウム-1-イル]メチル]フェニル]エチル]-3,4,5-トリヒドロキシ-テトラヒドロピラン-2-カルボン酸(47.1mg、0.0282mmol)の溶液に、DMF(500μL)中の(2,5-ジオキソピロリジン-1-イル)3-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]プロパノエート(Broadpharmから購入、13.1mg、0.0423mmol)の溶液、およびDIPEA(17.2μL、0.0988mmol)を連続的に添加した。
反応混合物を室温で1時間撹拌し、反応の進行をUPLC-MSにより追跡した。粗生成物を、Xbridgeカラム上への反応混合物の直接堆積による、かつTFA法を使用するC18逆相分取HPLCにより精製して、L21-C1(65mg、0.0310mmol)を白色粉末として得た。HR-ESI+:m/z[M+H]+=1635.6093(1635.6068)(測定値/理論値)。
L9-C1の調製:
(2R)-2-[(5S)-5-[3-クロロ-4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[3-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]プロパノイルアミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸;2,2,2-トリフルオロアセテート;2,2,2-トリフルオロ酢酸
Figure 2022532918000478
ステップ1:9H-フルオレン-9-イルメチルN-[(1S)-1-[[(1S)-1-[[4-(ブロモメチル)フェニル]カルバモイル]-4-ウレイド-ブチル]カルバモイル]-2-メチル-プロピル]カルバメート
THF(3.8ml)中の9H-フルオレン-9-イルメチルN-[(1S)-1-[[(1S)-1-[[4-(ブロモメチル)フェニル]カルバモイル]-4-ウレイド-ブチル]カルバモイル]-2-メチル-プロピル]カルバメート(150mg、0.249mmol)の溶液を0℃に冷却した。0℃でトリブロモホスファン(ジクロロメタン中1M)(374μL、0.249mmol)を滴下添加した。反応物を0℃で5分間、室温で1時間撹拌した。反応の進行をUPLC-MSにより追跡した(アリコートを大過剰のMeOHにより処理した)。反応混合物を酢酸エチル(3ml)で希釈し、炭酸水素ナトリウムの飽和水溶液(1×6ml)で洗浄した。有機層を硫酸マグネシウムで乾燥させ、濾過した。DMF(10ml)を添加し、酢酸エチルおよびTHFを蒸発させる。9H-フルオレン-9-イルメチルN-[(1S)-1-[[(1S)-1-[[4-(ブロモメチル)フェニル]カルバモイル]-4-ウレイド-ブチル]カルバモイル]-2-メチル-プロピル]カルバメートの得られた溶液を、そのまま次のステップで使用する。UPLC-MS:MS(ESI)m/z[M+Na]+=686.5+688.6。
ステップ2:(2R)-2-[(5S)-5-[3-クロロ-4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸
前のステップ(ステップ1)からのDMF中の9H-フルオレン-9-イルメチルN-[(1S)-1-[[(1S)-1-[[4-(ブロモメチル)フェニル]カルバモイル]-4-ウレイド-ブチル]カルバモイル]-2-メチル-プロピル]カルバメート(0.249mmol)の溶液に、DMF(10ml)、(2R)-2-[(5Sa)-5-[3-クロロ-2-メチル-4-(2-ピペラジン-1-イルエトキシ)フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸(C1)(218mg、0.249mmol)およびDIPEA(130μL、0.748mmol)を連続的に添加した。反応混合物を室温で15時間撹拌し、反応の進行をUPLC-MSにより追跡した(アリコートを大過剰のMeOHにより処理した)。DMF中の(2R)-2-[(5Sa)-5-[3-クロロ-4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸の得られた溶液を、そのまま次のステップで使用した。UPLC-MS:MS(ESI)m/z[M+Na]+=1458.7+1460.7。
ステップ3:(2R)-2-[(5S)-5-[4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-アミノ-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]-3-クロロ-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸;2,2,2-トリフルオロアセテート;ビス2,2,2-トリフルオロ酢酸
前のステップ(ステップ2)で得たジメチルホルムアミド(3mL)中の(2R)-2-[(5S)-5-[3-クロロ-4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸(0.249mmol)の溶液に、ピペリジン(49.3μL、0.499mmol)を添加した。反応混合物を室温で5時間撹拌し、反応の進行をUPLC-MSにより追跡した。粗生成物を、Xbridgeカラム上への反応混合物の直接堆積による、かつTFA法を使用するC18逆相分取HPLCにより精製して、(2R)-2-[(5S)-5-[4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-アミノ-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]-3-クロロ-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸;2,2,2-トリフルオロアセテート;ビス2,2,2-トリフルオロ酢酸(31.2mg=0.0213mmol)を白色粉末として得た。UPLC-MS:MS(ESI)m/z[M+Na]+=1236.7+1238.7。
ステップ4:(2R)-2-[(5S)-5-[3-クロロ-4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[3-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]プロパノイルアミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸;2,2,2-トリフルオロアセテート;2,2,2-トリフルオロ酢酸 L9-C1
DMF(1.5mL)中の(2R)-2-[(5Sa)-5-[4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-アミノ-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]-3-クロロ-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸(31.2mg、0.0213mmol)の溶液に、DMF(500μL)中の(2,5-ジオキソピロリジン-1-イル)3-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]プロパノエート(23.8mg、0.0768mmol)の溶液、およびDIPEA(31.2μL、0.179mmol)を連続的に添加した。反応混合物を室温で15時間撹拌し、反応の進行をUPLC-MSにより追跡した。粗生成物を、Xbridgeカラム上への反応混合物の直接堆積による、かつTFA法を使用するC18逆相分取HPLCにより精製して、L9-C1(6mg、0.00303mmol)を白色粉末として得た。HR-ESI+:m/z[M]+=1431.5437(1431.5433)(測定値/理論値)。
L9-C8の調製:
(2R)-2-[(5S)-5-[3-クロロ-4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[3-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]プロパノイルアミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(3-スルホオキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸;2,2,2-トリフルオロアセテート;2,2,2-トリフルオロ酢酸
Figure 2022532918000479
ステップ1:(2R)-2-[(5Sa)-5-[3-クロロ-4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(3-スルホオキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸
DMF(3mL)中の9H-フルオレン-9-イルメチルN-[(1S)-1-[[(1S)-1-[[4-(ブロモメチル)フェニル]カルバモイル]-4-ウレイド-ブチル]カルバモイル]-2-メチル-プロピル]カルバメート(0.0230mmol;L9-C1の調製のステップ1に従って得た)の溶液に、DMF(5ml)、アンモニウム;[3-[4-[[2-[(2R)-2-カルボキシ-2-[(5Sa)-5-[3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-エチル]フェノキシ]メチル]ピリミジン-2-イル]フェニル]サルフェート(C8)(22mg、0.0230mmol)およびDIPEA(12μL、0.069mmol)を連続的に添加した。反応混合物を室温で15時間撹拌し、反応の進行をUPLC-MSにより追跡した(アリコートを大過剰のMeOHにより処理した)。DMF中の(2R)-2-[(5Sa)-5-[3-クロロ-4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸の得られた溶液を、次のステップで使用した。UPLC-MS:MS(ESI)m/z[M-SOH]+=1444.8+1446.7。
ステップ2:(2R)-2-[(5S)-5-[4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-アミノ-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]-3-クロロ-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(3-スルホオキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸;ビス2,2,2-トリフルオロ酢酸
前のステップ(ステップ1)で得たジメチルホルムアミド(3mL)中の(2R)-2-[(5Sa)-5-[3-クロロ-4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(3-スルホオキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸(0.0230mmol)の溶液に、ピペリジン(9μL、0.0920mmol)を添加した。反応混合物を室温で5時間撹拌し、反応の進行をUPLC-MSにより追跡した。粗生成物を、Xbridgeカラム上への反応混合物の直接堆積による、かつTFA法を使用するC18逆相分取HPLCにより精製して、[3-[4-[[2-[(2R)-2-[5-[4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-アミノ-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]-3-クロロ-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-2-カルボキシ-エチル]フェノキシ]メチル]ピリミジン-2-イル]フェニル]サルフェート;ビス2,2,2-トリフルオロ酢酸(10.0mg=0.00633mmol)を白色粉末として得た。UPLC-MS:MS(ESI)m/z[M-SO]+=1224.12。
ステップ3:(2R)-2-[(5S)-5-[3-クロロ-4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[3-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]プロパノイルアミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(3-スルホオキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸;2,2,2-トリフルオロアセテート;2,2,2-トリフルオロ酢酸
DMF(1mL)中の(2R)-2-[(5S5-[4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-アミノ-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]-3-クロロ-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(3-スルホオキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸(10mg、0.00653mmol)の溶液に、DMF(500μL)中の(2,5-ジオキソピロリジン-1-イル)3-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]プロパノエート(3.1mg、0.00980mmol)の溶液、およびDIPEA(4μL、0.0229mmol)を連続的に添加した。反応混合物を室温で15時間撹拌し、反応の進行をUPLC-MSにより追跡した。粗生成物を、Xbridgeカラム上への反応混合物の直接堆積による、かつTFA法を使用するC18逆相分取HPLCにより精製して、L9-C8(6mg、0.00401mmol)を白色粉末として得た。UPLC-MS:MS(ESI)m/z[M+Na]+=1519.5+1521.2、[M+H-SO3]+1417.7+1419.6。HR-ESI+:m/z[M+H]+=1497.486(1497.4845)(測定値/理論値)。
L9-C10の調製:
(2R)-2-[(5S)5-[3-クロロ-4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[3-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]プロパノイルアミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]-2-メチル-フェニル]-6-[4-フルオロ-3-(2,2,2-トリフルオロエトキシ)フェニル]チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸;2,2,2-トリフルオロアセテート;2,2,2-トリフルオロ酢酸
Figure 2022532918000480
手順は、L9-C9の合成のプロセスの通りであり、ステップ3で使用するC9を(2R)-2-[((5Sa)-5-{3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル}-6-[4-フルオロ-3-(2,2,2-トリフルオロエトキシ)フェニル]チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル)オキシ]-3-(2-{[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ}フェニル)プロパン酸 C10により置き換え、精製にTFA法を使用する。HR-ESI+:m/z[M+H]+=1529.543/1529.5413(測定値/理論値)。
L9-C11の調製:
(2R)-2-[(5S)-5-[3-クロロ-4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[3-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]プロパノイルアミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(4-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸;2,2,2-トリフルオロアセテート;2,2,2-トリフルオロ酢酸。
Figure 2022532918000481
手順は、L9-C9の合成のプロセスの通りであり、ステップ3で使用するC9を(2R)-2-{[(5Sa)-5-{3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル}-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ}-3-(2-{[2-(4-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ}フェニル)プロパン酸 C11により置き換え、精製にTFA法を使用する。HR-ESI+:m/z[M+H]+=1431.5442/14.31.5433(測定値/理論値)。
L9-C12の調製:
(2R)-2-[(5S)-5-[3-クロロ-4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[3-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]プロパノイルアミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2,2,2-トリフルオロエチル)ピラゾール-3-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸;2,2,2-トリフルオロアセテート;2,2,2-トリフルオロ酢酸
Figure 2022532918000482
手順は、L9-C9の合成のプロセスの通りであり、ステップ3で使用するC9を(2R)-2-{[(5Sa)-5-{3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル}-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ}-3-(2-{[1-(2,2,2-トリフルオロエチル)-1H-ピラゾール-5-イル]メトキシ}フェニル)プロパン酸 C12により置き換え、精製にTFA法を使用する。HR-ESI+:m/z[M+H]+=1395.5048/1395;5045(測定値/理論値)。
L9-C14の調製:
(2R)-2-[5-[3-クロロ-4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[3-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]プロパノイルアミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(3-ヒドロキシ-2-メトキシ-フェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸;2,2,2-トリフルオロアセテート
Figure 2022532918000483
ステップ1:(2R)-2-[5-[3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシ-3-スルホオキシ-フェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸
500mgのエチル(2R)-2-[5-[3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[(2-クロロピリミジン-4-イル)メトキシ]フェニル]プロパノエート(0.60mmol、国際公開2016/207216号調製1)および202mgの(3-ヒドロキシ-2-メトキシ-フェニル)ボロン酸(1.20mmol)を、9mLの1,4-ジオキサンに溶解し、次いで42mgのPd(PPhCl(0.06mmol)、588mgのCsCO(1.80mmol)および9mLの水を添加し、混合物を完全な変換までN雰囲気下、70℃で撹拌した。次いで、これを水で希釈し、2M HCl水溶液で中和し、DCMで抽出した。合わせた有機相をNaSOで乾燥させ、濾過し、濾液を減圧下で濃縮した。粗エステルを、溶離液としてヘプタン、EtOAcおよびMeOH中0.7M NH溶液を使用するフラッシュクロマトグラフィーにより精製して、ジアステレオ異性体の混合物を得た。次いで、これを23.6mLのピリジンに溶解し、0.97mLのSO×ピリミジン(5.98mmol)を添加し、混合物を完全な変換まで70℃で撹拌した。次いで、これを減圧下で濃縮し、2mLのジオキサンに溶解し、次いで200mgのKOH(3.57mmol)および1mLの水を添加した。混合物を完全な加水分解まで室温で撹拌した。次いで、これを2M HCl水溶液で中和し、溶離液として25mM NHHCO水溶液およびMeCNを使用する分取RP-HPLC上に直接注入した。後に溶出するジアステレオ異性体を表題の生成物として収集した。1H NMR (500 MHz, DMSO-d6) δ: 8.92 (d, 1H), 8.63 (s, 1H), 7.68 (dd, 1H), 7.63 (d, 1H), 7.34 (d, 1H), 7.30 (dd, 2H), 7.29 (d, 1H), 7.20 (t, 2H), 7.16 (t, 1H), 7.15 (d, 1H), 7.10 (t, 1H), 7.02 (d, 1H), 6.73 (t, 1H), 6.38 (d, 1H), 5.50 (dd, 1H), 5.29/5.23 (d+d, 2H), 4.21/4.16 (m+m, 2H), 3.84 (s, 3H), 3.25/2.55 (dd+dd, 2H), 3.18-2.75 (m, 10H), 2.65 (brs, 3H), 1.82 (s, 3H).
474410ClFのHRMS計算値:970.2233;実測値971.2297(M+H)。
ステップ2:(2R)-2-[5-[3-クロロ-4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[3-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]プロパノイルアミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(3-ヒドロキシ-2-メトキシ-フェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸;2,2,2-トリフルオロアセテート L9-C14
DMF(309μL)中の(2R)-2-[5-[3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシ-3-スルホオキシ-フェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸(20.0mg;0.0206mmol)の溶液に、(2S)-N-[4-(クロロメチル)フェニル]-2-[[(2S)-2-[3-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]プロパノイルアミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタンアミド(17.5mgL;0.0206mmol)、DIPEA(10.8μL;0.0618mmol)およびTBAI(1mg;0.0027mmol)を連続的に添加した。反応混合物を70℃で18時間撹拌した。粗生成物を、X-Bridgeカラム上への反応混合物の直接堆積による、かつTFA法を使用するC18逆相分取HPLCにより精製して、L9-C14(10.5mg;0.00725mmol)を白色粉末として得た。HR-ESI+:m/z[M+H]+=1448.5437/1448.5466[測定値/理論値]。
L9-P15の調製:
(11R,20R)-23,26-ジクロロ-20-[[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[3-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]プロパノイルアミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]メチル]-3-(4-フルオロフェニル)-14-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]-24,25-ジメチル-10,18,21-トリオキサ-4-チア-6,8-ジアザペンタシクロ[20.2.2.12,5.113,17.09,28]オクタコサ-1(24),2,5(28),6,8,13,15,17(27),22,25-デカエン-11-カルボン酸;2,2,2-トリフルオロアセテート
Figure 2022532918000484
DMF(630μL)中の(11R,20R)-23,26-ジクロロ-3-(4-フルオロフェニル)-14-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]-24,25-ジメチル-20-[(4-メチルピペラジン-1-イル)メチル]-10,18,21-トリオキサ-4-チア-6,8-ジアザペンタシクロ[20.2.2.12,5.113,17.09,28]オクタコサ-1(25),2,5(28),6,8,13,15,17(27),22(26),23-デカエン-11-カルボン酸 P15(国際公開第2019/035914号に従って得た;10.0mg;0.0105mmol)の溶液に、(2S)-N-[4-(ブロモメチル)フェニル]-2-[[(2S)-2-[3-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]プロパノイルアミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタンアミド(10.0mg;0.0158mmol)、DIPEA(5.5μL;0.0315mmol)およびTBAI(0.5mg、0.0010mmol)を連続的に添加した。反応混合物を室温で0.5時間撹拌した。粗生成物を、X-Bridgeカラム上への反応混合物の直接堆積による、かつTFA法を使用するC18逆相分取HPLCにより精製して、L9-P15(11.9mg、0.00733mmol)を白色粉末として得た。HR-ESI+:m/z[M-CFCO]+=1507.5183/1507.5155
L9-P16の調製:
(11R,20R)-23,26-ジクロロ-14-[[2-[4-[[(2S)-1,4-ジオキサン-2-イル]メトキシメチル]-4-フルオロ-シクロヘキシル]ピリミジン-4-イル]メトキシ]-20-[[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[3-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]プロパノイルアミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]メチル]-3-(4-フルオロフェニル)-24,25-ジメチル-10,18,21-トリオキサ-4-チア-6,8-ジアザペンタシクロ[20.2.2.12,5.113,17.09,28]オクタコサ-1(25),2,5(28),6,8,13,15,17(27),22(26),23-デカエン-11-カルボン酸;2,2,2-トリフルオロアセテート
Figure 2022532918000485
DMF(1mL)中の(11R,20R)-23,26-ジクロロ-14-[[2-[4-[[(2S)-1,4-ジオキサン-2-イル]メトキシメチル]-4-フルオロ-シクロヘキシル]ピリミジン-4-イル]メトキシ]-3-(4-フルオロフェニル)-24,25-ジメチル-20-[(4-メチルピペラジン-1-イル)メチル]-10,18,21-トリオキサ-4-チア-6,8-ジアザペンタシクロ[20.2.2.12,5.113,17.09,28]オクタコサ-1(24),2,5(28),6,8,13,15,17(27),22,25-デカエン-11-カルボン酸 P16(国際公開第2019/035911号に従って得た;14.7mg;0.0137mmol)の溶液に、(2S)-N-[4-(ブロモメチル)フェニル]-2-[[(2S)-2-[3-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]プロパノイルアミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタンアミド(13.1mg;0.0205mmol)およびDIPEA(7.1μL;0.0410mmol)を連続的に添加した。反応混合物を室温で2時間撹拌した。粗生成物を、TFA法を使用してX-Bridgeカラム上への反応混合物の直接堆積により精製して、L9-P16(7.9mg;0.00420mmol)を白色粉末として得た。IR(cm-1):3327、1768/1706、1666、1199/1118、831/798。HR-ESI+:m/z[M-CFCO]+=1631.6071/1631.6054[測定値/理論値]
L9-P17の調製:
(11R,20R)-23,26-ジクロロ-14-[[2-[4-[[(2S)-1,4-ジオキサン-2-イル]メトキシ]シクロヘキシル]ピリミジン-4-イル]メトキシ]-20-[[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[3-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]プロパノイルアミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]メチル]-3-(4-フルオロフェニル)-24,25-ジメチル-10,18,21-トリオキサ-4-チア-6,8-ジアザペンタシクロ[20.2.2.12,5.113,17.09,28]オクタコサ-1(24),2,5(28),6,8,13,15,17(27),22,25-デカエン-11-カルボン酸;2,2,2-トリフルオロアセテート
Figure 2022532918000486
DMF(1mL)中の(11R,20R)-23,26-ジクロロ-14-[[2-[4-[[(2S)-1,4-ジオキサン-2-イル]メトキシ]シクロヘキシル]ピリミジン-4-イル]メトキシ]-3-(4-フルオロフェニル)-24,25-ジメチル-20-[(4-メチルピペラジン-1-イル)メチル]-10,18,21-トリオキサ-4-チア-6,8-ジアザペンタシクロ[20.2.2.12,5.113,17.09,28]オクタコサ-1(24),2,5(28),6,8,13,15,17(27),22,25-デカエン-11-カルボン酸 P17(国際公開第2019/035911号に従って得た;14.5mg;0.0139mmol)の溶液に、(2S)-N-[4-(ブロモメチル)フェニル]-2-[[(2S)-2-[3-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]プロパノイルアミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタンアミド(13.3mg;0.0208mmol)およびDIPEA(7.3μL;0.0417mmol)を連続的に添加した。反応混合物を室温で8時間撹拌した。粗生成物を、X-Bridgeカラム上への反応混合物の直接堆積により、かつTFA法を使用して精製して、L9-P17(7.0mg、0.00437mmol)を白色粉末として得た。IR(cm-1):3700~2400、1771/1738/1705、1665、1194/1128。HR-ESI+:m/z[M-CFCO]+=1599.6013/1599.5992。HR-ESI+:m/z[M-CFCO+H]2+=800.3049/800.3035[測定値/理論値]
L25-P1の調製:
2-[[4-[2-[4-[4-[(1R)-1-カルボキシ-2-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]エトキシ]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル]-2-クロロ-3-メチル-フェノキシ]エチル]-1-メチル-ピペラジン-1-イウム-1-イル]メチル]-5-[[(2S)-2-[[1-[2-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]エチルカルバモイル]シクロブタンカルボニル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]ベンゼンスルホネート;2,2,2-トリフルオロ酢酸
Figure 2022532918000487
ステップ1:tert-ブチル1-[2-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]エチルカルバモイル]シクロブタンカルボキシレート
DCM(5.85ml)中の1-tert-ブトキシカルボニルシクロブタンカルボン酸(58.6mg;0.293mmol)の溶液に、1-[2-(2-アミノエトキシ)エチル]ピロール-2,5-ジオン(53.9mg;0.293mmol)、EDC(84.2mg;0.439mmol)、HOBt(59.3mg;0.439mmol)、およびDIPEA(204μL;1.17mmol)を連続的に添加した。反応混合物を室温で18時間撹拌した。反応の進行をUPLC-MSによりモニタリングした。反応混合物を濃縮乾固し、DMF(1ml)に可溶化し、溶液を、カラム上への反応混合物の直接堆積による、かつTFA法を使用するX-BridgeカラムC18により精製して、表題化合物(57.3mg;0.156mmol)を得た。IR(cm-1):3390、1697/1666。1H NMR (400 MHz, dmso-d6) δ ppm 7.5 (t, 1H), 7.02 (s, 2H), 3.55/3.5 (2t, 4H), 3.38 (t, 2H), 3.17 (q, 2H), 2.33 (m, 4H), 1.77 (m, 2H), 1.38 (s, 9H).
UPLC-MS:MS(ESI):m/z[M+Na]+=389.26[M+H-tBu]+=311.22
ステップ2:1-[2-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]エチルカルバモイル]シクロブタンカルボン酸
DCM(0.175mL)中のtert-ブチル1-[2-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]エチルカルバモイル]シクロブタンカルボキシレート(7mg;0.0191mmol)の溶液に、TFA(51.2μL;0.668mmol)を添加した。反応混合物を室温で3.5時間撹拌し、次いで濃縮乾固して、表題化合物(5.8mg;0.0187mmol)を無色油状物として得た。粗生成物を次のステップで使用した。UPLC-MS:MS(ESI):m/z[M+H]+=311.35、[M+Na]+=333.37
ステップ3:(2,3,4,5,6-ペンタフルオロフェニル)1-[2-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]エチルカルバモイル]シクロブタンカルボキシレート
THF(3mL)中の1-[2-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]エチルカルバモイル]シクロブタンカルボン酸(18.2mg;0.0587mmol)の溶液に、2,3,4,5,6-ペンタフルオロフェノール(13.0mg;0.0704mmol)およびDCC(14.5mg;0.0704mmol)を連続的に添加した。反応混合物を室温で15時間撹拌し、反応の進行をUPLC-MSによりモニタリングした。反応混合物は懸濁液であった。沈殿物を濾別し、THF(1ml)で洗浄して、THF中の(2,5-ジオキソピロリジン-1-イル)1-[2-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]エチルカルバモイル]シクロブタンカルボキシレートの溶液を得る。粗生成物溶液をステップ9で使用した。UPLC-MS:MS(ESI):m/z[M+H]+=477.28、[M+Na]+=499.23
ステップ4:メチル(2R)-2-[5-[3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパノエート
DCM(25mL)およびメタノール(25mL)中の(2R)-2-[5-[3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸 P1(5.0g;5.712mmol)の溶液に、ジアゾメチル(トリメチル)シランの溶液(EtO中2M)(5.712mL;11.42mmol)を滴下添加した。反応混合物を室温で2時間撹拌し、反応の進行をUPLC-MSによりモニタリングした。完了後、反応物を、黄色が赤色になるまで酢酸をゆっくりと添加することによりクエンチし、濃縮乾固して、粗混合物を得た。粗生成物をシリカゲルクロマトグラフィー(DCM中メタノールの勾配)により精製して、表題化合物(4.52g;5.082mmol)を得た。UPLC-MS:MS(ESI):m/z[M+H]+=889.27+891.6、[M+Na]+=911.31、[M+2H]2+=445.59。IR(cm-1):1753、1238/1053。1H NMR (400 MHz, dmso-d6) δ ppm 8.6 (s, 1H), 8.45 (d, 1H), 7.6 (d, 1H), 7.52 (dd, 1H), 7.45 (td, 1H), 7.3 (m, 3H), 7.25-7.1 (m, 5H), 7.02 (t+d, 2H), 6.78 (t, 1H), 6.31 (dd, 1H), 5.52 (dd, 1H), 5.25 (AB, 2H), 4.2 (m, 2H), 3.78/3.65 (2s, 6H), 3.2/2.58 (2dd, 2H), 2.71 (t, 2H), 2.5/2.3 (2ml, 8H), 2.12 (s, 3H), 1.88 (s, 3H).
ステップ5:5-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]-2-(ヒドロキシメチル)ベンゼンスルホン酸
DCM(22.2mL)およびメタノール(22.2mL)中のFmoc-Cit-OH(2.224g;5.596mmol)の溶液に、ナトリウム5-アミノ-2-(ヒドロキシメチル)ベンゼンスルホネート(1.89mg;8.395mmol)およびEEDQ(2.768g;11.19ml)を連続的に添加した。反応混合物を室温で25時間撹拌し、次いで濃縮乾固した。粗生成物をシリカゲルクロマトグラフィー(DCM中メタノールの勾配)により精製して、表題化合物(2.81g;4.823mmol)を白色粉末として得た。IR(cm-1):3700~3000、1660(大きい)、1180。1H NMR (400 MHz, dmso-d6) δ ppm 10.02 (s, 1H), 7.88 (m, 3H), 7.76 (2t, 2H), 7.7 (dd, 1H), 7.61 (d, 1H), 5.99 (t, 1H), 5.38 (m, 2H), 5.03 (t, 1H), 4.72 (d, 2H), 4.3-4.2 (m, 3H), 4.15 (m, 1H), 3.06-2.90 (m, 2H), 1.75-1.30 (m, 4H).
UPLC-MS:MS(ESI):m/z[M+H]+=583.42、[M+Na]+=565.31。
ステップ6:2-(クロロメチル)-5-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]ベンゼンスルホン酸
NMP(5mL)中の5-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]-2-(ヒドロキシメチル)ベンゼンスルホン酸(543.6mg;0.933mmol)の溶液に、室温でNMP(200μL)中のSOCl(68.1μL;0.933mmol)の溶液を添加した。反応混合物を室温で15分間撹拌し、反応の進行をUPLC-MSによりモニタリングした。完全な変換を達成するためには、SOCl添加(68μL)をさらに7回行わなければならない。過剰のSOClを真空下で蒸発させ、残留物を、TFA法を使用してOasisカラム上への反応混合物の直接堆積により精製して、表題化合物(362mg;0.512mmol)を白色固体として得た。UPLC-MS:MS(ESI):m/z[M+H]+=601.19+603.23[M+Na]+=622.93
ステップ7:2-[[4-[2-[2-クロロ-4-[6-(4-フルオロフェニル)-4-[(1R)-2-メトキシ-1-[[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]メチル]-2-オキソ-エトキシ]チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル]-3-メチル-フェノキシ]エチル]-1-メチル-ピペラジン-1-イウム-1-イル]メチル]-5-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]ベンゼンスルホネート
NMP(10mL)に溶解したステップ6からの2-(クロロメチル)-5-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]ベンゼンスルホン酸(195.6mg;0.277mmol)の溶液に、ステップ4からのメチル(2R)-2-[5-[3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパノエート(123mg;0.138mmol)、DIPEA(385μL、2.213mmol)およびTBAI(10mg、0.027mmol)を連続的に添加した。反応混合物を70℃で12時間撹拌し、反応の進行をUPLC-MSによりモニタリングした。NMPに溶解した粗生成物を次のステップで直接使用した。UPLC-MS:MS(ESI):m/z[M+H]+=1231.12+1233.45、[M+2H]2+=616.34+617.37
ステップ8:5-[[(2S)-2-アミノ-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]-2-[[4-[2-[4-[4-[(1R)-1-カルボキシ-2-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]エトキシ]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル]-2-クロロ-3-メチル-フェノキシ]エチル]-1-メチル-ピペラジン-1-イウム-1-イル]メチル]ベンゼンスルホネート;2,2,2-トリフルオロ酢酸
NMP中の2-[[4-[2-[2-クロロ-4-[6-(4-フルオロフェニル)-4-[(1R)-2-メトキシ-1-[[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]メチル]-2-オキソ-エトキシ]チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル]-3-メチル-フェノキシ]エチル]-1-メチル-ピペラジン-1-イウム-1-イル]メチル]-5-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]ベンゼンスルホネートの前の溶液に、水(4mL)中の水酸化リチウム一水和物(82.2mg;1.106mmol)の溶液を添加した。反応混合物を室温で1.5時間撹拌し、反応の進行をUPLC-MSによりモニタリングした。粗生成物溶液を、TFA法を使用してX-Bridgeカラム上への反応混合物の直接堆積により精製して、表題化合物(45.6mg;0.0374mmol)を白色粉末として得た。UPLC-MS:MS(ESI):m/z[M+H]+=1217.46、[M+Na]+=1241.16、[M+2H]2+=609.61
ステップ9:2-[[4-[2-[4-[4-[(1R)-1-カルボキシ-2-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]エトキシ]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル]-2-クロロ-3-メチル-フェノキシ]エチル]-1-メチル-ピペラジン-1-イウム-1-イル]メチル]-5-[[(2S)-2-[[1-[2-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]エチルカルバモイル]シクロブタンカルボニル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]ベンゼンスルホネート L25-P1
DMF(1.4mL)中の5-[[(2S)-2-アミノ-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]-2-[[4-[2-[4-[4-[(1R)-1-カルボキシ-2-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]エトキシ]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル]-2-クロロ-3-メチル-フェノキシ]エチル]-1-メチル-ピペラジン-1-イウム-1-イル]メチル]ベンゼンスルホネート(22.6mg;0.0186mmol)の溶液に、(2,3,4,5,6-ペンタフルオロフェニル)1-[2-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]エチルカルバモイル]シクロブタンカルボキシレート(ステップ3から)(26.8mg;0.0562mmol)のTHF溶液、およびDIPEA(12.9μL;0.0742mmol)を連続的に添加した。反応混合物を室温で2時間撹拌した。粗生成物溶液を、X-Bridgeカラム上への反応混合物の直接堆積により、かつTFA法を使用して精製して、L25-P1(7.5mg;0.0050mmol)を白色粉末として得た。IR(cm-1):3321、1705/1624、1666、1581、1180/1124、833/798/756/719/696。1H NMR (400/500 MHz, dmso-d6) δ ppm 10.4 (s), 8.88 (d, 1H), 8.61 (s, 1H), 8.13 (df, 1H), 7.92 (dd, 1H), 7.78 (d), 7.74 (t), 7.63 (d, 1H), 7.52 (dd, 1H), 7.47 (d, 1H), 7.46 (t, 1H), 7.38 (d, 1H), 7.3 (dd, 2H), 7.23 (d, 1H), 7.21 (t, 2H), 7.16 (t, 1H), 7.14 (d, 1H), 7.03 (t, 1H), 7.01 (d, 1H), 7 (s, 2H), 6.73 (t, 1H), 6.22 (d, 1H), 5.99 (m), 5.55 (sl), 5.5 (dd, 1H), 5.25 (AB, 2H), 5.1 (sl, 2H), 4.37 (m, 1H), 4.33 (m, 2H), 3.76 (s, 3H), 3.7 (m, 10H), 3.55 (m, 2H), 3.5 (m, 2H), 3.42 (m, 2H), 3.28/2.52 (2dd, 2H), 3.21 (m, 2H), 3.04 (sl, 3H), 2.97 (m, 2H), 2.4 (m, 4H), 1.85 (w, 3H), 1.74/1.62 (2m, 2H), 1.73 (m, 2H), 1.43/1.35 (2m, 2H). 13C NMR (400/500 MHz, dmso-d6) δ ppm 157.5, 152.8, 135.4, 134.9, 131.5, 131.4, 131.4, 131.2, 131.1, 128.7, 121, 120.6, 119.2, 119.2, 116.3, 116, 112.8, 112.2, 111, 74, 69.5, 68.9, 67.4, 66.6, 56.2, 55.3/46.5, 54.1, 45.7, 39.4, 39.2, 37.2, 32.9, 29.7, 29.7, 27.3, 18, 16. 19F NMR (400/500 MHz, dmso-d6) δ ppm -74.6, -112.2.
HR-ESI+:m/z[M+H]+=1509.4867/1509.4851[測定値/理論値]
L26-P1の調製:
(2R)-2-[5-[3-クロロ-4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[3-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]プロパノイルアミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]-2-[3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-メトキシエトキシ)エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]プロピル]フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパノエート;2,2,2-トリフルオロアセテート
Figure 2022532918000488
ステップ1:3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-メトキシエトキシ)エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]プロパ-1-イン
THF(25.0mL)中の2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-メトキシエトキシ)エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エタノール(1.95g;6.50mmol)の溶液に、0℃で水素化ナトリウム(260.0mg;6.57mmol)を添加した。5分後、トルエン中3-ブロモプロパ-1-インの溶液(1.42mL;13.14mmol)を添加した。反応混合物を0℃で1時間、室温で2日間撹拌し、反応の進行をUPLC-MSによりモニタリングした。次いで、反応混合物を濾過し、濾液を濃縮乾固し、シリカゲルクロマトグラフィー(勾配 メタノール中DCM)により精製して、表題化合物(1.74g;4.12mmol)を無色油状物として得た。1H NMR (CDCl3): 2.43 (t, 1H, J = 2.4 Hz), 3.37 (s, 3H), 3.53-3.55 (m, 2H), 3.64-3.70 (m, 30H), 4.20 (d, 2H, J = 2.4 Hz).
ステップ2:9H-フルオレン-9-イルメチルN-[(1S)-1-[[4-[[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシメチル]-3-ヨード-フェニル]カルバモイル]-4-ウレイド-ブチル]カルバメート
メタノール(70mL)およびDCM(140mL)中の[[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシメチル]-3-ヨード-アニリン(10.0g;27.52mmol)の溶液に、Fmoc-Cit-OH(12.0g;30.28mmol)およびEEDQ(8.17g;33.03mmol)を連続的に添加した。反応混合物を室温で14時間撹拌した。反応の完了後、得られた残留物を、溶離液としてDCM/メタノール(100/0~88/12)を使用するシリカゲル上でのカラムクロマトグラフィーにより精製して、表題化合物(17.09g;21.97mmol)を白色固体として得た。1H NMR (DMSO): δ 0.09 (s, 6H), 0.91 (s, 9H), 1.38-1.48 (m, 2H), 1.59-1.68 (m, 2H), 2.93-3.05 (m, 2H), 4.06-4.15 (m, 2H), 4.20-4.29 (m, 3H), 4.56 (s, 2H), 5.41 (s, 2H), 5.98 (t, 1H, J = 5.5 Hz), 7.30-7.43 (m, 5H), 7.55 (dd, 1H, J = 8.8, 2.1 Hz), 7.69 (d, 1H, J = 7.8 Hz), 7.74 (dd, 1H, J = 7.2, 3.4 Hz), 7.89 (d, 1H, J = 7.5 Hz), 8.25 (d, 1H, J = 1.5 Hz), 10.12 (s, 1H).
ステップ3:(2S)-2-アミノ-N-[4-[[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシメチル]-3-ヨード-フェニル]-5-ウレイド-ペンタンアミド
THF(120mL)中の9H-フルオレン-9-イルメチルN-[(1S)-1-[[4-[[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシメチル]-3-ヨード-フェニル]カルバモイル]-4-ウレイド-ブチル]カルバメート(17.08g;23.00mmol)の溶液に、THF中ジメチルアミン2M(44.5mL;89.00mmol)を添加した。反応混合物を室温で15時間撹拌した。濃縮乾固した後、得られた残留物を、溶離液として水/アセトニトリル(98/02~0/100)を使用するC18上でのカラムクロマトグラフィーにより精製して、化合物表題化合物(5.47g;10.50mmol)を白色固体として得た。1H NMR (DMSO): δ 0.0 (s, 6H), 0.81 (s, 9H), 1.27-1.38 (m, 3H), 1.47-1.53 (m, 1H), 2.83-2.89 (m, 2H), 3.16-3.19 (m, 1H), 4.46 (s, 2H), 5.26 (s, 2H), 5.82 (t, 1H, J = 5.6 Hz), 7.24 (d, 1H, J = 8.5 Hz), 7.50 (dd, 1H, J = 8.3, 2.0 Hz), 8.17 (d, 1H, J = 2.0 Hz).
ステップ4:9H-フルオレン-9-イルメチルN-[(1S)-1-[[(1S)-1-[[4-[[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシメチル]-3-ヨード-フェニル]カルバモイル]-4-ウレイド-ブチル]カルバモイル]-2-メチル-プロピル]カルバメート
2-メチルテトラヒドロフラン(240mL)中の(2S)-2-アミノ-N-[4-[[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシメチル]-3-ヨード-フェニル]-5-ウレイド-ペンタンアミド(3.00g;5.76mmol)の溶液に、Fmoc-Val-OSu(8.65g;8.65mmol)およびDIPEA(1.90mL;11.53mmol)を連続的に添加した。反応混合物を室温で15時間撹拌した。反応混合物を焼結漏斗に通して濾過し、回収した固体を2-メチルテトラヒドロフラン(2×250mL)で洗浄し、次いで高真空下で乾燥させて、表題化合物(3.57g;4.24mmol)を白色固体として得た。1H NMR (DMSO): δ 0.10 (s, 6H), 0.83-0.95 (m, 15H), 1.27-1.52 (m, 2H), 1.52-1.75 (m, 2H), 1.93-2.07 (m, 1H), 2.88-3.09 (m, 2H), 3.93 (t, 1H, J = 8.0 Hz), 4.17-4.49 (m, 4H), 4.56 (s, 2H), 5.40 (s, 2H), 5.96 (t, 1H, J = 5.6 Hz), 7.27-7.37 (m, 3H), 7.37-7.48 (m, 3H), 7.54 (d, 1H, J = 8.0 Hz), 7.74 (t, 2H, J = 7.2 Hz), 7.88 (d, 2H, J = 7.6 Hz), 8.13 (d, 1H, J = 7.6 Hz), 8.22 (s, 1H), 10.11 (s, 1H).
ステップ5:9H-フルオレン-9-イルメチルN-[(1S)-1-[[(1S)-1-[[4-[[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシメチル]-3-[3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-メトキシエトキシ)エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]プロパ-1-イニル]フェニル]カルバモイル]-4-ウレイド-ブチル]カルバモイル]-2-メチル-プロピル]カルバメート
ジメチルホルムアミド(15.40mL)中の9H-フルオレン-9-イルメチルN-[(1S)-1-[[(1S)-1-[[4-[[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシメチル]-3-ヨード-フェニル]カルバモイル]-4-ウレイド-ブチル]カルバモイル]-2-メチル-プロピル]カルバメート(1.23g;1.46mmol)の溶液に、3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-メトキシエトキシ)エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]プロパ-1-イン(930.0mg;2.20mmol)およびDIPEA(2.47mL;14.92mmol)を連続的に添加した。アルゴンで3回パージした後、Pd(PPhCl(220mg;0.307mmol)およびCuI(68.0mg;0.36mmol)を添加し、反応混合物をアルゴンで3回パージした。反応混合物を室温で3時間撹拌し、反応の進行をUPLC-MSによりモニタリングした。混合物を酢酸イソプロピル(200mL)で希釈し、ブライン(3×150mL)で洗浄した。合わせた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮乾固した。粗生成物を、X-Bridgeカラム上への反応混合物の直接堆積による、かつ中性法を使用するC18逆相分取HPLCにより精製して、表題化合物(790.0mg;0.70mmol)を淡黄色ガム状物として得た。1H NMR (DMSO): δ 0.08 (s, 6H), 0.85-0.90 (m, 15H), 1.36-1.45 (m, 2H), 1.58-1.71 (m, 2H), 1.97-2.00 (m, 1H), 2.93-3.03 (m, 2H), 3.23 (s, 3H), 3.40-3.43 (m, 2H), 3.49-3.52 (m, 25H), 3.56-3.58 (m, 2H), 3.63-3.66 (m, 2H), 3.93 (dd, 1H, J = 8.9, 6.9 Hz), 4.23-4.32 (m, 3H), 4.37-4.43 (m, 3H), 4.75 (s, 2H), 5.39 (s, 2H), 5.97 (t, 1H, J = 6.1 Hz), 7.30-7.43 (m, 6H), 7.51-7.54 (m, 1H), 7.72-7.78 (m, 3H), 7.88 (d, 2H J = 7.5 Hz), 8.12 (d, 2H, J = 7.4 Hz), 10.10 (s, 1H).
ステップ6:9H-フルオレン-9-イルメチルN-[(1S)-1-[[(1S)-1-[[4-(ヒドロキシメチル)-3-[3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-メトキシエトキシ)エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]プロパ-1-イニル]フェニル]カルバモイル]-4-ウレイド-ブチル]カルバモイル]-2-メチル-プロピル]カルバメート
テトラヒドロフラン(0.60mL)および水(0.90mL)中の9H-フルオレン-9-イルメチルN-[(1S)-1-[[(1S)-1-[[4-[[tert-ブチル(ジメチル)シリル]オキシメチル]-3-[3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-メトキシエトキシ)エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]プロパ-1-イニル]フェニル]カルバモイル]-4-ウレイド-ブチル]カルバモイル]-2-メチル-プロピル]カルバメート(452mg;0.40mmol)の溶液に、酢酸(4.17mL;72.78mmol)を添加した。反応混合物を室温で22時間撹拌し、反応の進行をUPLC-MSによりモニタリングした。濃縮乾固した後、粗生成物を、X-Bridgeカラム上への反応混合物の直接堆積による、かつ中性法を使用するC18逆相分取HPLCにより精製して、表題化合物(327mg、0.32mmol)を白色ガム状物として得た。1H NMR (DMSO): δ 0.87 (dd, 6H, J = 11.7, 6.8 Hz), 1.36-1.45 (m, 2H), 1.58-1.71 (m, 2H), 1.97-2.00 (m, 1H), 2.93-3.02 (m, 2H), 3.23 (s, 3H), 3.31 (s, 5H), 3.40-3.43 (m, 2H), 3.48-3.53 (m, 21H), 3.54-3.64 (m, 6H), 3.91-3.95 (m, 1H), 4.23-4.42 (m, 4H), 4.56 (d, 2H, J = 5.5 Hz), 5.19 (t, 1H, J = 5.6 Hz), 5.39 (s, 2H), 5.96 (t, 1H, J = 5.8 Hz), 7.30-7.34 (m, 2H), 7.39-7.43 (m, 4H), 7.50-7.52 (m, 1H), 7.72-7.76 (s, 3H), 7.88 (d, 1H J = 7.5 Hz), 8.12 (d, 2H, J = 7.4 Hz), 10.06 (s, 1H).
ステップ7:9H-フルオレン-9-イルメチルN-[(1S)-1-[[(1S)-1-[[4-(ヒドロキシメチル)-3-[3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-メトキシエトキシ)エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]プロピル]フェニル]カルバモイル]-4-ウレイド-ブチル]カルバモイル]-2-メチル-プロピル]カルバメート
THF(3.7mL)中の9H-フルオレン-9-イルメチルN-[(1S)-1-[[(1S)-1-[[4-(ヒドロキシメチル)-3-[3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-メトキシエトキシ)エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]プロパ-1-イニル]フェニル]カルバモイル]-4-ウレイド-ブチル]カルバモイル]-2-メチル-プロピル]カルバメート(327.0mg;0.32mmol)の溶液に、酢酸(0.37mL)を添加した。アルゴンで3回パージした後、Pt/C5%(195mg)を添加し、アルゴンでさらに3回パージした後、反応混合物を水素雰囲気下に置き、室温で18時間撹拌し、反応の進行をUPLC-MSによりモニタリングした。混合物をPTFEに通して濾過し、濾液を濃縮乾固し、次いでジクロロメタン/ペンタン(1/4混合物、50mL)中で摩砕した。沈殿物を濾過により回収して、乾燥後に表題化合物(130mg;0.13mmol)を白色固体として得た。1H NMR (DMSO): δ 0.85-0.89 (m, 6H), 1.23-1.46 (m, 2H), 1.56-1.76 (m, 4H), 1.97-2.02 (m, 1H), 2.56-2.60 (m, 2H), 2.91-3.04 (m, 2H), 3.23 (s, 3H), 3.38-3.43 (m, 4H), 3.48-3.54 (m, 30H), 3.93 (dd, 1H, J = 8.9, 6.9 Hz), 4.21-4.31 (m, 3H), 4.38-4.41 (m, 1H), 4.45 (d, 2H, J = 5.3 Hz), 4.94 (t, 1H, J = 5.3 Hz), 5.37 (s, 2H), 5.95 (t, 1H, J = 5.8 Hz), 7.25 (d, 1H, J = 8.3 Hz), 7.30-7.34 (m, 2H), 7.39-7.43 (s, 5H), 7.72-7.76 (m, 2H), 7.88 (d, 1H J = 7.5 Hz), 8.06 (d, 2H, J = 7.6 Hz), 9.88 (s, 1H).
UPLC-MS:MS(ESI)m/z[M+H]+=1026.52
ステップ8:9H-フルオレン-9-イルメチルN-[(1S)-1-[[(1S)-1-[[4-(ブロモメチル)-3-[3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-メトキシエトキシ)エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]プロピル]フェニル]カルバモイル]-4-ウレイド-ブチル]カルバモイル]-2-メチル-プロピル]カルバメート
THF(6.6mL)中の9H-フルオレン-9-イルメチルN-[(1S)-1-[[(1S)-1-[[4-(ヒドロキシメチル)-3-[3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-メトキシエトキシ)エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]プロピル]フェニル]カルバモイル]-4-ウレイド-ブチル]カルバモイル]-2-メチル-プロピル]カルバメート(60mg;0.0584mmol)の溶液に、0℃でPBr(THF中1M溶液)(0.0877mL;0.0877mmol)を滴下添加した。次いで、溶液を室温で3時間撹拌した。ブロモ予期化合物を反応させるためにアリコートモルホリンを添加して入れた後、反応の進行をUPLC-MSによりモニタリングした。反応物を飽和NHCl水溶液(50μL)で後処理した。5分後、混合物をMgSOで乾燥させ、濾過し、THF(2ml)で洗浄して、ブロモ表題化合物をTHF溶液として得、粗製のまま次のステップで使用した。
ステップ9:(2R)-2-[5-[3-クロロ-4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]-2-[3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-メトキシエトキシ)エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]プロピル]フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸;2,2,2-トリフルオロアセテート
前のステップからの9H-フルオレン-9-イルメチルN-[(1S)-1-[[(1S)-1-[[4-(ブロモメチル)-3-[3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-メトキシエトキシ)エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]プロピル]フェニル]カルバモイル]-4-ウレイド-ブチル]カルバモイル]-2-メチル-プロピル]カルバメート(0.0584mmol)のTHF溶液に、DMF(1.5mL)、(2R)-2-[5-[3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸 P1(46.1mg;0.0527mmol)およびDIPEA(0.173mL;0.995mmol)を連続的に添加した。反応混合物を室温で20時間撹拌し、反応の進行をUPLC-MSによりモニタリングした。予期表題化合物およびFmoc脱保護化合物(ステップ10で予期される)を含有する粗混合物を、次の脱保護ステップで使用する。UPLC-MS:MS(ESI)m/z[M-Fmoc+H+H]+=1660.99
ステップ10:(2R)-2-[5-[4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-アミノ-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]-2-[3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-メトキシエトキシ)エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]プロピル]フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]-3-クロロ-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸;2,2,2-トリフルオロアセテート;2,2,2-トリフルオロ酢酸
DMF中の前のステップで得た粗混合物に、ピペリジン(11.6μL;0.117mmol)を添加した。反応混合物を室温で15時間撹拌し、反応の進行をUPLC-MSによりモニタリングした。反応の完了後、粗生成物を、TFA法を使用する、X-Bridgeカラム上への反応混合物の直接堆積によるC18逆相分取HPLCにより精製して、表題化合物(29.2mg;0.0155mmol)を白色粉末として得た。IR:3600~2300、1672、1602、1541+1516。HR-ESI+:m/z[M-CFCOO]+=1660.7574(理論値1660.7575)
ステップ11:(2R)-2-[5-[3-クロロ-4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[3-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]プロパノイルアミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]-2-[3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-メトキシエトキシ)エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]プロピル]フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパノエート;2,2,2-トリフルオロアセテート L26-P1
DMF(1.28mL)中の(2R)-2-[5-[4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-アミノ-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]-2-[3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-(2-メトキシエトキシ)エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]プロピル]フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]-3-クロロ-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸;2,2,2-トリフルオロアセテート;2,2,2-トリフルオロ酢酸(42.5mg;0.0225mmol)の溶液に、(2,5-ジオキソピロリジン-1-イル)3-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]プロパノエート(Brodpharm 21854)(7.71mg;0.0247mmol)の溶液、およびDIPEA(19.6μL;0.112mmol)を連続的に添加した。反応混合物を室温で15時間撹拌し、反応の進行をUPLC-MSによりモニタリングした。粗生成物を、X-Bridgeカラム上への反応混合物の直接堆積による、かつTFA法を使用するC18逆相分取HPLCにより精製して、L26-P1(28mg;0.0151mmol)を白色粉末として得た。HR-ESI+:m/z[M-CFCOO]+=1855.8105(理論値1855.8106)
L27-P1の調製:
(2R)-2-[5-[3-クロロ-4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[3-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]プロパノイルアミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-3-メチル-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]-2-スルホ-フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸
Figure 2022532918000489
ステップ1:2-(クロロメチル)-5-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]ベンゼンスルホネート
5-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]-2-(ヒドロキシメチル)ベンゼンスルホン酸(300mg;0.4263mmol)を、室温で無水NMP(6mL)に溶解した。並行して、NMP(6mL)中のSOCl(206μL)の溶液を調製した。反応物に、SOCl溶液の溶液900μLを75分間にわたって6回添加した。最後の添加後、反応混合物を室温で15分間撹拌した。粗生成物を、TFA法を使用してOasisカラム上への反応混合物の直接堆積により精製して、表題化合物(138mg;0.1971mmol)を白色粉末として得た。1H NMR (400 MHz, dmso-d6) δ ppm 10.15+8.1+7.42+6.0 (s+2d+m, 4H), 7.9 (m,HH), 7.75 (m, 3H), 7.42+7.31 (2m, 5H), 5.23 (s, 2H), 4.4 (m, 1H), 4.3-4.2 (m, 3H), 3.95 (dd, 1H), 3.0 (m, 2H), 2.0 (m, 1H), 1.7 + 1.6 (2m, 2H), 1.48 + 1.37 (2m, 2H), 0.88 (2d, 6H).
HR-ESI+:m/z[M+H]+=700.2199/700.2202[測定値/理論値]
ステップ2:5-[[(2S)-2-[[(2S)-2-アミノ-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]-2-[[4-[2-[2-クロロ-4-[6-(4-フルオロフェニル)-4-[(1R)-2-メトキシ-1-[[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]メチル]-2-オキソ-エトキシ]チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル]-3-メチル-フェノキシ]エチル]-1-メチル-ピペラジン-1-イウム-1-イル]メチル]ベンゼンスルホン酸
無水NMP(2.5mL)中の2-(クロロメチル)-5-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]ベンゼンスルホネート(82.4mg;0.1177mmol)の溶液に、室温でDIEA(94μL;0.540mmol)、続いてメチル(2R)-2-[5-[3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパノエート(60mg;0.067mmol)およびTBAI(12.4mg;0.034mmol)を添加した。反応物を80℃で4時間、室温で終夜撹拌した。次いで、2-(クロロメチル)-5-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]ベンゼンスルホネートを再度添加し(14mg;0,017mmol)、続いてTBAI(17μL;0.0337mmol)を添加し、反応物を80℃で4時間、次いで室温で終夜撹拌した。Fmoc脱保護ステップを、DEA(53μL;0.515mmol)を反応物に添加し、室温で終夜撹拌することで実現した。精製を、溶液A:HO/CHCN/NHHCO(1960ml/40/3.16g)から溶液B:CHCN/HO/NHHCO(1600ml/400ml/3.16g)の勾配で溶出するOasis上への混合物の直接注入により実現して、表題化合物(17mg;0.009mmol)を得た。UPLC-MS:MS(ESI)m/z[M]+=1329
ステップ3:(2R)-2-[5-[4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-アミノ-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]-2-スルホ-フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]-3-クロロ-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸
ジオキサン/水(1mL/1mL)中の5-[[(2S)-2-[[(2S)-2-アミノ-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]-2-[[4-[2-[2-クロロ-4-[6-(4-フルオロフェニル)-4-[(1R)-2-メトキシ-1-[[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]メチル]-2-オキソ-エトキシ]チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル]-3-メチル-フェノキシ]エチル]-1-メチル-ピペラジン-1-イウム-1-イル]メチル]ベンゼンスルホン酸(18mg;0.014mmol)の混合物に、LiOH・HO(2.3mg;0.054mmol)を添加し、反応物を室温で4時間撹拌した。溶液をHCl 1Nの添加によりpH6~7に調整し、ジオキサンを減圧下で蒸発させた。精製を、溶液A:HO/CHCN/NHHCO(1960ml/40/3.16g)から溶液B:CHCN/HO/NHHCO(1600ml/400ml/3.16g)の勾配で溶出するOasis上への混合物の直接注入により実現して、表題化合物化合物(11mg;0.008mmol)を得た。
ステップ4:(2R)-2-[5-[3-クロロ-4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[3-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]プロパノイルアミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-3-メチル-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]-2-スルホ-フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸 L27-P1
DMF(0.4mL)中の(2R)-2-[5-[4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-アミノ-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]-2-スルホ-フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]-3-クロロ-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸(10.5mg;0.007mmol)の溶液に、(2,5-ジオキソピロリジン-1-イル)3-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]プロパノエート(5.7mg;0.018mmol)を添加し、溶液を室温で4時間撹拌した。溶液を、カラム上への反応混合物の直接堆積による、かつTFA法を使用するX-BridgeカラムC18により精製して、L27-P1(10mg;0.006mmol)を得た。HR-ESI+:[M+H]+1511.5018/1511.5002[測定値/理論値]
L28-P1の調製:
(2R)-2-[5-[3-クロロ-4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[3-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]プロパノイルアミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]-2-スルホ-フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸;2,2,2-トリフルオロアセテート
Figure 2022532918000490
ステップ1:9H-フルオレン-9-イルメチルN-[(1S)-1-[[(1S)-2-[4-(クロロメチル)-3-メチル-アニリノ]-1-メチル-2-オキソ-エチル]カルバモイル]-2-メチル-プロピル]カルバメート
NMP(5mL)中の5-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]-2-(ヒドロキシメチル)ベンゼンスルホネート(504.1mg;0.816mmol)の溶液に、NMP(500μL)中のSOCl(60μL;0.816mmol)の溶液を75分間にわたって6回添加した。反応混合物を室温で15分間撹拌した。粗生成物を、TFA法を使用してOasisカラム上への反応混合物の直接堆積により精製して、70%表題化合物(384mmol)および30%の出発材料(170mmol)の混合物としての(337mg)を白色粉末として得た。IR(cm-1):3600~2400、1688+1648、1599、1518、1022。UPLC-MS:MS(ESI)m/z[M+H]+=614.17+616.18(Cl)
ステップ2:(2R)-2-[5-[4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-アミノ-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]-2-メチル-フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]-3-クロロ-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸;2,2,2-トリフルオロアセテート
NMP(4.5ml)中のメチル(2R)-2-[5-[3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパノエート(152mg;0.171mmol)の溶液に、9H-フルオレン-9-イルメチルN-[(1S)-1-[[(1S)-2-[4-(クロロメチル)-3-メチル-アニリノ]-1-メチル-2-オキソ-エチル]カルバモイル]-2-メチル-プロピル]カルバメート(150mg;0.171mmol)、DIPEA(238μL;1.37mmol)およびTBAI(76mg;0.205mmol)を連続的に添加した。反応混合物を80℃で28時間撹拌した。反応混合物を室温まで冷却する。次いで、水(500μL)中のLiOH.HO(13.7mg、0.342mmol)の溶液を添加する。反応混合物を室温で48時間撹拌した。粗生成物を、X-Bridgeカラム上への反応混合物の直接堆積による、かつTFA法を使用するC18逆相分取HPLCにより精製して、表題化合物(40mg;0.0325mmol)を白色粉末として得た。UPLC-MS:MS(ESI)m/z[M]+=1230.61+1232.61(Cl)
ステップ3:(2R)-2-[5-[3-クロロ-4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[3-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]プロパノイルアミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]-2-スルホ-フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸;2,2,2-トリフルオロアセテート L28-P1
DMF(180μL)に溶解した(2R)-2-[5-[4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-アミノ-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]-2-メチル-フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]-3-クロロ-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸;2,2,2-トリフルオロアセテート(6.0mg;0.0049mmol)の溶液に、(2,5-ジオキソピロリジン-1-イル)3-[2-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]エチルカルバモイル]オキセタン-3-カルボキシレート(2.3mg;0.0073mmol)およびDIPEA(3.0μL;0.017mmol)を連続的に添加した。反応混合物を室温で1.5時間撹拌し、UPLC-MSによりモニタリングした。粗生成物を、TFA法を使用してX-Bridgeカラム上への反応混合物の直接堆積により精製して、L28-P1(2.9mg;0.0020mmol)を白色粉末として得た。HR-ESI+:m/z[M+H]+=1425.4534/1425.4527[測定値/理論値]
L29-C3の調製:
(2R)-2-[5-[4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[2-(2-アジドエトキシ)アセチル]アミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]-2-スルホ-フェニル]メトキシカルボニル]ピペラジン-1-イル]エトキシ]-3-クロロ-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸
Figure 2022532918000491
ステップ1:ナトリウム;5-[[(2S)-2-(tert-ブトキシカルボニルアミノ)プロパノイル]アミノ]-2-(ヒドロキシメチル)ベンゼンスルホネート
DMF(38.6mL)中のBoc-L-Ala-OH(588mg;3.11mmol)の溶液に、HATU(1.77g;4.67mmol)、ナトリウム5-アミノ-2-(ヒドロキシメチル)ベンゼンスルホネート(771mg;3.42mmol)およびDIPEA(1.29mL;7.78mmol)を連続的に添加した。反応混合物を室温で16時間撹拌し、次いで濃縮乾固し、水と共蒸発させて、粗反応混合物を得た。得られた残留物を、溶離液として酢酸エチル/メタノール 95:5~80:20を使用するシリカゲル上でのカラムクロマトグラフィーにより精製して、表題化合物(1.17g;2.95mmol)を白色固体として得た。1H NMR (DMSO): δ 1.24 (s, 9H), 1.38 (m, 3H), 4.05-1.44 (m, 1H), 4.73 (d, 2H, J = 4.8 Hz), 5.04 (t, 1H, J = 5.6 Hz); 6.97-7.02 (m, 1H), 7.33 (d, 1H, J = 8 Hz), 7.65-7.70 (m, 1H), 7.83 (s, 1H), 9.91 (s, 1H).
ステップ2:5-[[(2S)-2-アミノプロパノイル]アミノ]-2-(ヒドロキシメチル)ベンゼンスルホネート、塩酸塩
ナトリウム5-[[(2S)-2-(tert-ブトキシカルボニルアミノ)プロパノイル]アミノ]-2-(ヒドロキシメチル)ベンゼンスルホネート(1.17g;2.95mmol;1当量)をジオキサン中HCl 4Nの溶液(10mL)中に懸濁させた。混合物を室温で2時間撹拌し、次いで濃縮乾固して、粗混合物(982mg;2.95mmol)を白色固体として得た。1H NMR (DMSO): δ 1.45 (d, 3H, J = 5.6 Hz), 3.91-4.0 (m, 1H), 4.76 (s, 2H), 7.41 (d, 1H, J = 7.6 Hz), 7.66 (d, 1H, J = 7.6 Hz), 7.85 (s, 1H), 8.17 (s, 2H), 10.44 (s, 1H).
ステップ3:5-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]-2-(ヒドロキシメチル)ベンゼンスルホネート
DMF(34.5mL)中の5-[[(2S)-2-アミノプロパノイル]アミノ]-2-(ヒドロキシメチル)ベンゼンスルホネート、塩酸塩(981mg;2.95mmol)の溶液に、Fmoc-L-Val-OSu(1.29g;2.95mmol;1当量)およびDIPEA(975μL;5.9mmol)を添加した。混合物を室温で終夜撹拌し、次いで濃縮乾固し、水と共蒸発させて、粗混合物を得た。得られた残留物を、溶離液として酢酸エチル/メタノール 95:5~80:20を使用するシリカゲル上でのカラムクロマトグラフィーにより精製して、表題化合物(1.28g;2.072mmol)を無色油状物として得た。1H NMR (DMSO): δ 0.80-0.92 (m, 6H), 1.30 (d, 3H, J = 6.4 Hz), 2.02-2.10 (m, 1H), 4.17-4.31 (m, 3H), 4.37-4.44 (m, 1H), 4.73 (d, 2H, J = 5.6 Hz), 5.04 (t, 1H, J = 6.4 Hz), 7.28-7.36 (m, 3H), 7.37-7.47 (m, 3H), 7.66 (d, 1H, J = 8.4 Hz), 7.71-7.77 (m, 2H), 7.83-7.85 (m, 1H), 7.88 (d, 2H, J = 7.6 Hz), 8.14 (d, 1H, J = 6.4 Hz), 9.99 (s, 1H).
ステップ4:5-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]-2-[(4-ニトロフェノキシ)カルボニルオキシメチル]ベンゼンスルホン酸
THF(65mL)中の5-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]-2-(ヒドロキシメチル)ベンゼンスルホネート(1.28g;2.07mmol)の懸濁液に、ピリジン(875μL;10.8mmol)、続いてクロロギ酸4-ニトロフェニル(1.09g;5.41mmol)を添加した。混合物を室温で終夜撹拌した。次いで、追加のクロロギ酸4-ニトロフェニル(1.09g;5.41mmol;2.5当量)を添加した。室温で5時間撹拌した後、混合物を濃縮乾固し、次いで、30分で溶離液として水/アセトニトリル 90/10~0/100を使用するC18上でのカラムクロマトグラフィーにより精製した。合わせた管のアセトニトリルを除去し、残りを凍結乾燥して、表題化合物(650mg;0.83mmol)を白色固体として得た。1H NMR (DMSO): δ 0.88 (m, 6H), 1.31 (d, 3H, J = 4.8 Hz), 1.97-2.03 (m, 1H), 3.92 (t, 1H, J = 6.8 Hz), 4.23 (s, 2H), 4.24-4.34 (m, 1H), 4.42 (t, 1H J = 5.6 Hz), 5.69 (s, 2H), 7.30-7.48 (m, 6H), 7.62 (d, 2H, J = 8 Hz), 7.72-7.76 (m, 3H), 7.89 (d, 2H, J = 6.4 Hz), 7.94 (s, 1H), 8.18 (d, 1H, J = 5.6 Hz), 8.33 (d, 2H, J = 7.6 Hz), 10.11 (s, 1H). 13C NMR (DMSO): δ 18.01, 18.26, 19.21, 30.4, 46.66, 49.05, 59.91, 65.67, 67.82, 117.7, 119.1, 120.06, 122.66, 125.37, 126.33, 127.05, 127.62, 128.0, 138.06, 140.67, 143.77, 143.86, 145.1, 146.23, 151.96, 155.47, 156.12, 171.0, 171.15.
LCMS(2~100ACN/HO+0.05%TFA):90.41% Tr=12.7分。ポジティブモード578.41検出。ネガティブモード759.17検出
ステップ5:(2S)-2-[[5-[3-クロロ-4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]-2-スルホ-フェニル]メトキシカルボニル]ピペラジン-1-イル]エトキシ]-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]メチル]-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸
DMF(1.5mL)中の(2S)-2-[[5-[3-クロロ-2-メチル-4-(2-ピペラジン-1-イルエトキシ)フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]メチル]-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸;2,2,2-トリフルオロ酢酸(178.4mg;0.183mmol)の懸濁液に、5-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]-2-[(4-ニトロフェノキシ)カルボニルオキシメチル]ベンゼンスルホン酸(150mg;0.192mmol)およびDIPEA(91μL;0.549mmol)を連続的に添加し、混合物を室温で終夜15分間撹拌した。粗生成物を、NHHCO法を使用してX-Bridgeカラム上への反応混合物の直接堆積により精製して、表題化合物(176mg、0.118mmol)を白色固体として得た。UPLC-MS:MS(ESI)m/z[M+H]+=1482.15+1484.56(Cl)
ステップ6:(2S)-2-[[5-[4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-アミノ-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]-2-スルホ-フェニル]メトキシカルボニル]ピペラジン-1-イル]エトキシ]-3-クロロ-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]メチル]-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸
DMF(1.0mL)中の(2S)-2-[[5-[3-クロロ-4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]-2-スルホ-フェニル]メトキシカルボニル]ピペラジン-1-イル]エトキシ]-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]メチル]-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸(176mg;0.118mmol)の溶液に、ピペリジン(24.17μL;0.237mmol)を添加した。反応混合物を室温で18時間撹拌した。粗生成物を、NHHCO法を使用してX-Bridgeカラム上への反応混合物の直接堆積により精製して、表題化合物(102mg;0.0809mmol)を白色粉末として得た。IR(cm-1):3620~2680、1683、1235。UPLC-MS:MS(ESI)m/z[M+H]+=1260.37+1262.37(Cl)。1H NMR (400 MHz, dmso-d6) δ ppm 10.20 (m, NH), 8.90 (m, 2H), 8.90 (m, 1H), 8.60 (m, NH), 8.60 (s, 1H), 7.90 (m, 1H), 7.78 (m, 1H), 7.70 (d, 1H), 7.55 (d, 1H), 7.48 (t, 1H), 7.45 (d, 1H), 7.3/7.2 (m, 4H), 7.20 (m, 1H), 7.20 (d, 1H), 7.15 (t, 1H), 7.15 (d, 1H), 7.05 (t, 1H), 7.00 (d, 1H), 6.7 (t, 1H), 6.2 (d, 1H), 5.48 (s, 2H), 5.50 (m, 1H), 5.23 (s, 2H), 4.50 (m, 1H), 4.25 (m, 2H), 3.75 (s, 3H), 3.4 (m, 4H), 3.40 (m, 1H), 3.35 (m, 1H) 2.80 (m, 2H), 2.5 (m, 4H), 2.50 (m, 1H), 2.05 (m, 1H), 1.80 (s, 3H), 1.30 (d, 3H), 0.90 (dd, 6H)
ステップ7:(2,3,4,5,6-ペンタフルオロフェニル)2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]アセテート
THF(500μL)中の2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]酢酸(74mg;0.317mmol)の溶液に、THF(500μL)に溶解した2,3,4,5,6-ペンタフルオロフェノール(70mg;0.380mmol)、およびTHF(500μL)に溶解したDCC(78.5mg;0.380mmol)を連続的に添加した。反応混合物を室温で18時間撹拌した。粗懸濁液をパスツールピペット中で綿パッドに通して濾過し、溶液をさらに後処理することなくステップ8で使用する。
ステップ8:(2R)-2-[5-[4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[2-(2-アジドエトキシ)アセチル]アミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]-2-スルホ-フェニル]メトキシカルボニル]ピペラジン-1-イル]エトキシ]-3-クロロ-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸 L29-C3
DMF(500μL)中の(2S)-2-[[5-[4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-アミノ-3-メチル-ブタノイル]アミノ]プロパノイル]アミノ]-2-スルホ-フェニル]メトキシカルボニル]ピペラジン-1-イル]エトキシ]-3-クロロ-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]メチル]-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸(100mg;0.0793mmol)の溶液に、ステップ7からのTHF中の(2,3,4,5,6-ペンタフルオロフェニル)2-[2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エトキシ]アセテートの溶液(0.317mmol)、およびDIPEA(39.3μL;0.238mmol)を連続的に添加した。反応混合物を室温で15分間撹拌した。粗生成物を、NHHCO法を使用してX-Bridgeカラム上への反応混合物の直接堆積により精製して、L29-C3(43mg、0.0291mmol)を白色粉末として得た。IR(cm-1):3257、2102、1663、1236/1082、834/756。1H NMR (400 MHz, dmso-d6) δ ppm 10.03 (s, NH), 8.87 (d, 1H), 8.59 (sNC, 1H), 8.35 (d, NH), 7.89 (df, 1H), 7.69 (dd, 1H), 7.66 (m, 1H), 7.53 (d, 1H), 7.45 (t, 1H), 7.36 (d, 1H), 7.29 (dd, 2H), 7.21 (d, 1H), 7.20 (t, 2H), 7.19 (d, 1H), 7.14 (d, 1H), 7.13 (m, 1H), 7.09 (m, NH), 7.03 (t, 1H), 7.00 (d, 1H), 6.72 (t, 1H), 6.24 (d, 1H), 5.48 (dNC, 1H), 5.44 (s, 2H), 5.23(AB, 2H), 4.40 ( t, 1H), 4.30 (dd, 1H), 4.24 (m, 2H), 3.94 (s, 2H), 3.75 (s, 3H), 3.58 (m, 10H), 3.38 (m, 4H), 3.36 (t, 2H), 3.30 (NC, 1H), 2.75 (t, 2H), 2.50 (m, 4H), 2.50 (m, 1H), 2.00 (m, 1H), 1.51 (s, 3H), 1.30 (d, 3H), 0.88/0.82 (2d, 6H). 13C NMR (100/126 MHz, dmso-d6) δppm 158.2, 131.6, 131.1, 130.9, 130.9, 130.9, 130.9, 128.3, 126.7, 120.7, 120.4, 119.3, 117.9, 116.2, 112.5, 112.1, 110.8, 70.2, 70.2; 69.6, 67.7, 64.0, 56.7, 56.5, 55.8, 53.2, 50.4, 49.2, 43.8, 31.7, 19.7, 18.7, 18.4, 17.8. 19F NMR (376/470 MHz, dmso-d6) δ ppm -112.0.
HR-ESI+:m/z[M+H]+=1475.4643/1475.4638;[2M+H+Ca]3+=996.6289/996.6273;[M+2H]2+=738.2378/738.2355;[M+H+Na]2+=749.2255/749.2265。
[実施例2]
追加のリンカー、リンカー-ペイロード、およびそれらの前駆体の合成および特徴付け。
例示的なリンカー、リンカー-ペイロード、およびそれらの前駆体は、この実施例に記載した例示的な方法を使用して合成した。
2-(ブロモメチル)-4-ニトロ安息香酸の合成
Figure 2022532918000492
CCl(3000mL)中の2-メチル-4-ニトロ安息香酸(300g、1.5371mol)の撹拌溶液に、NBS(300.93g、1.6908mol)およびAIBN(37.86g、0.2305mol)を室温で添加した。反応混合物を80℃で16時間撹拌した。反応混合物をTLC分析によりモニタリングした。反応混合物を飽和NaHCO溶液(2L)で希釈し、酢酸エチル(2×2L)で抽出した。合わせた有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、減圧下で濃縮した。粗化合物を、溶離液として石油エーテル中2~3%の酢酸エチルを使用するシリカゲル上でのカラムクロマトグラフィーにより精製して、2-(ブロモメチル)-4-ニトロ安息香酸を得た。1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 8.35 (d, J=2.0 Hz, 1H), 8.20 (q, J=8.8, 2.4 Hz, 1H), 8.12 (d, J=8.8 Hz, 1H), 4.97 (s, 2H), 4.00 (s, 3H).
4-ニトロ-2-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)安息香酸の合成
Figure 2022532918000493
ACN(5000mL)中の2-(ブロモメチル)-4-ニトロ安息香酸(250g、0.9122mol)の混合物に、プロパ-2-イン-1-オール(255.68g、265.50mL、4.5609mol、d=0.963g/mL)およびCsCO(743.03g、2.2805mol)を室温で添加した。得られた混合物を80℃に16時間加熱した。反応混合物をceliteパッドに通して濾過し、酢酸エチル(2L)で洗浄した。濾液を減圧下で濃縮した。得られた粗化合物に、飽和NaHCO溶液(1L)を添加し、水層を、2N HCl(2L)を使用することによりPH2に酸性化した。濾過、真空乾燥後、4-ニトロ-2-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)安息香酸を得た。1H NMR (400 MHz, DMSO): δ 13.61 (brs, 1H), 8.37 (d, J=2.4 Hz, 1H), 8.23 (dd, J=2.4, 8.4 Hz, 1H), 8.10 (d, J=8.8 Hz, 1H), 4.95 (s, 2H), 4.37 (d, J=2.4 Hz, 2H), 3.52 (t, J=2.4 Hz, 1H)
メチル4-ニトロ-2-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)ベンゾエートの合成
Figure 2022532918000494
MeOH(1300mL)中の4-ニトロ-2-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)安息香酸(130g、0.5527mol)の撹拌溶液に、SOCl(526.08g、320.78mL、4.4219mol、d=1.64g/mL)を0℃でゆっくりと添加した。反応物を70℃で4時間撹拌した。反応溶媒を減圧下で蒸発させた。得られた残留物を酢酸エチル(1000mL)に溶解し、飽和NaHCO(600mL)、水(500mL)およびブライン溶液(500mL)で洗浄した。分離した有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下で蒸発させて、メチル4-ニトロ-2-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)ベンゾエートを得た。1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 8.56 (t, J=0.8 Hz, 1H), 8.18 - 8.09 (m, 2H), 5.03 (s, 2H), 4.35 (d, J=2.4 Hz, 2H), 3.96 (s, 3H), 2.49 (t, J=2.4 Hz, 1H).
メチル4-アミノ-2-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)ベンゾエートの合成
Figure 2022532918000495
EtOH(1100mL)およびHO(550mL)の混合物中のメチル4-ニトロ-2-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)ベンゾエート(110g、0.4414mol)の溶液に、Fe粉末(197.21g、3.5310mol)およびNHCl(188.88g、3.5310mol)を室温で添加した。得られた混合物を80℃で16時間加熱した。反応混合物を室温に冷却し、celite(登録商標)に通して濾過し、酢酸エチル(2L)で洗浄した。濾液を半分の体積まで減圧下で濃縮した。残留物に、酢酸エチル(1.5L)を添加し、2層を分離し、水層を酢酸エチル(2L)で抽出した。合わせた有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、減圧下で濃縮して、粗生成物を得た。SiOカラムクロマトグラフィー(石油エーテル中15~20%の酢酸エチル)により精製して、メチル4-アミノ-2-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)ベンゾエートを得た。1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 7.67 (d, J=8.8 Hz, 1H), 6.78 (t, J=1.6 Hz, 1H), 6.48 (q, J=8.4, 2.4 Hz, 1H), 4.79 (s, 2H), 4.25 (d, J=2.4 Hz, 2H), 3.70 (d, J=4.0 Hz, 3H), 3.42 (t, J=2.4 Hz, 1H).
(4-アミノ-2-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)フェニル)メタノールの合成
Figure 2022532918000496
THF(1000mL)の撹拌溶液に、LiAlH4(THF中1M)(21.23g、798.2mmol、798.2mL)を0℃でゆっくりと添加した。THF(800mL)中のメチル4-アミノ-2-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)ベンゾエート(70g、319.3mmol)の溶液を0℃でゆっくりと添加した。反応物を室温で4時間撹拌した。反応混合物を0℃に冷却し、次いで水(22mL)を非常にゆっくりと添加し、続いて20%NaOH(22mL)および水(66mL)を添加した。反応混合物を0℃で30分間撹拌した。無水硫酸ナトリウムを添加して、過剰の水を吸収させた。混合物をcelite(登録商標)に通して濾過した。濾過ケーキを酢酸エチル(1000mL)および10%MeOH/DCM(500mL)で洗浄した。濾液を減圧下で濃縮した。得られた粗化合物をSiOカラムクロマトグラフィー(溶離液として石油エーテル中35~40%の酢酸エチル)により精製して、(4-アミノ-2-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)フェニル)メタノールを得た。1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 6.98 (d, J=8.0 Hz, 1H), 6.56 (d, J=2.4 Hz, 1H), 6.43 (dd, J=2.4, 8.0 Hz, 1H), 4.98 (s, 2H), 4.64 (t, J=5.2 Hz, 1H), 4.47 (s, 2H), 4.34 (d, J=5.6 Hz, 2H), 4.15 (d, J=2.4 Hz, 2H), 3.46 (t, J=2.4 Hz, 1H).
(9H-フルオレン-9-イル)メチル(S)-(1-((4-(ヒドロキシメチル)-3-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)フェニル)アミノ)-1-オキソ-5-ウレイドペンタン-2-イル)カルバメートの合成
Figure 2022532918000497
DMF(10mL)中の(4-アミノ-2-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)フェニル)メタノール(1.92g、10.04mmol、1.0当量)、(9H-フルオレン-9-イル)メチル(S)-(1-アミノ-1-オキソ-5-ウレイドペンタン-2-イル)カルバメート(3.99g、10.04mmol、1.0当量)、および(1-[ビス(ジメチルアミノ)メチレン]-1H-1,2,3-トリアゾロ[4,5-b]ピリジニウム3-オキシドヘキサフルオロホスフェート(4.20g、11.04mmol、1.1当量)の溶液に、N,N-ジイソプロピルエチルアミン(2.62mL、15.06mmol、1.5当量)を添加した。周囲温度で1時間撹拌した後、混合物を水(200mL)に注ぎ入れた。得られた固体を濾過し、水ですすぎ、真空下で乾燥させて、(9H-フルオレン-9-イル)メチル(S)-(1-((4-(ヒドロキシメチル)-3-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)フェニル)アミノ)-1-オキソ-5-ウレイドペンタン-2-イル)カルバメートを得た。LCMS:MH+=571.5;Rt=0.93分(2分酸性法)。
(S)-2-アミノ-N-(4-(ヒドロキシメチル)-3-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)フェニル)-5-ウレイドペンタンアミドの合成
Figure 2022532918000498
(9H-フルオレン-9-イル)メチル(S)-(1-((4-(ヒドロキシメチル)-3-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)フェニル)アミノ)-1-オキソ-5-ウレイドペンタン-2-イル)カルバメート(6.08g、10.65mmol、1.0当量)に、ジメチルアミン(THF中2M、21.31mL、42.62mmol、4当量)を添加した。周囲温度で1.5時間撹拌した後、形成されたガム状残留物から、上澄み溶液をデカントした。残留物をエーテル(3×50mL)で摩砕し、得られた固体を濾過し、エーテルで洗浄し、真空下で乾燥させた。(S)-2-アミノ-N-(4-(ヒドロキシメチル)-3-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)フェニル)-5-ウレイドペンタンアミドを得た。LCMS:MH+ 349.3;Rt=0.42分(2分酸性法)。
tert-ブチル((S)-1-(((S)-1-((4-(ヒドロキシメチル)-3-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)フェニル)アミノ)-1-オキソ-5-ウレイドペンタン-2-イル)アミノ)-3-メチル-1-オキソブタン-2-イル)カルバメートの合成
Figure 2022532918000499
DMF(10mL)中の(S)-2-アミノ-N-(4-(ヒドロキシメチル)-3-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)フェニル)-5-ウレイドペンタンアミド(3.50g、10.04mmol、1.0当量)、(tert-ブトキシカルボニル)-L-バリン(2.62g、12.05mmol、1.2当量)、および(1-[ビス(ジメチルアミノ)メチレン]-1H-1,2,3-トリアゾロ[4,5-b]ピリジニウム3-オキシドヘキサフルオロホスフェート(4.58g、12.05mmol、1.2当量)の溶液に、N,N-ジイソプロピルエチルアミン(3.50mL、20.08mmol、2.0当量)を添加した。周囲温度で2時間撹拌した後、混合物を水(200mL)に注ぎ入れ、得られた懸濁液をEtOAc(3×100mL)で抽出した。合わせた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、真空下で濃縮した。ISCO SiOクロマトグラフィー(0~20%メタノール/ジクロロメタン)による精製後、tert-ブチル((S)-1-(((S)-1-((4-(ヒドロキシメチル)-3-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)フェニル)アミノ)-1-オキソ-5-ウレイドペンタン-2-イル)アミノ)-3-メチル-1-オキソブタン-2-イル)カルバメートを得た。1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.00 (s, 1H), 7.96 (d, J = 7.7 Hz, 1H), 7.55 (dq, J = 4.9, 2.2 Hz, 2H, アリール), 7.32 (d, J = 8.9 Hz, 1H, アリール), 6.76 (d, J = 8.9 Hz, 1H), 5.95 (t, J = 5.8 Hz, 1H), 5.38 (s, 2H), 5.01 (t, J = 5.5 Hz, 1H), 4.54 (s, 2H), 4.45 (dd, J = 25.2, 5.3 Hz, 3H), 4.20 (d, J = 2.4 Hz, 2H), 3.83 (dd, J = 8.9, 6.7 Hz, 1H), 3.49 (t, J = 2.4 Hz, 1H), 2.97 (dh, J = 26.0, 6.5 Hz, 2H), 1.96 (h, J = 6.6 Hz, 1H), 1.74 - 1.50 (m, 2H), 1.39 (m, 11H), 0.84 (dd, J = 16.2, 6.7 Hz, 6H).
LCMS:MNa+ 570.5;Rt=0.79分(2分酸性法)。
tert-ブチル((S)-1-(((S)-1-((4-(クロロメチル)-3-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)フェニル)アミノ)-1-オキソ-5-ウレイドペンタン-2-イル)アミノ)-3-メチル-1-オキソブタン-2-イル)カルバメートの合成
Figure 2022532918000500
0℃のアセトニトリル(13.3mL)中のtert-ブチル((S)-1-(((S)-1-((4-(ヒドロキシメチル)-3-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)フェニル)アミノ)-1-オキソ-5-ウレイドペンタン-2-イル)アミノ)-3-メチル-1-オキソブタン-2-イル)カルバメート(2.00グラム、3.65mmol、1.0当量)の溶液に、塩化チオニル(0.53mL、7.30mmol、2.0当量)を添加した。氷浴中で1時間撹拌した後、溶液を水(40mL)で希釈し、得られた白色沈殿物を濾過により収集し、空気乾燥し、高真空下で乾燥させて、tert-ブチル((S)-1-(((S)-1-((4-(クロロメチル)-3-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)フェニル)アミノ)-1-オキソ-5-ウレイドペンタン-2-イル)アミノ)-3-メチル-1-オキソブタン-2-イル)カルバメートを得た。LCMS:MNa+ 588.5;Rt=2.17分(5分酸性法)。
2-(((tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ)メチル)-5-ニトロ安息香酸の合成
Figure 2022532918000501
MeOH(1000mL)中の6-ニトロイソベンゾフラン-1(3H)-オン(90g、502.43mmol、1.00当量)の溶液に、HO(150mL)中のKOH(28.19g、502.43mmol、1.00当量)を添加した。褐色混合物を25℃で1.5時間撹拌した。褐色混合物を減圧下で濃縮して、残留物を得、DCM(2000mL)に溶解した。混合物に、TBDPSCl(296.91g、1.08mol、277.49mL、2.15当量)およびイミダゾール(171.03g、2.51mol、5.00当量)を添加し、25℃で12時間撹拌した。混合物を減圧下で濃縮して、残留物を得た。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(石油エーテル/酢酸エチル=1/0、1/1)により精製して、2-(((tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ)メチル)-5-ニトロ安息香酸を白色固体として得た。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 1.13 (s, 9 H) 5.26 (s, 2 H) 7.34 - 7.48 (m, 6 H) 7.68 (br d, J=8 Hz, 4 H) 8.24 (br d, J=8 Hz, 1 H) 8.46 (br d, J=8 Hz, 1 H) 8.74 (s, 1 H).
(2-(((tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ)メチル)-5-ニトロフェニル)メタノールの合成
Figure 2022532918000502
THF(205mL)中の2-(((tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ)メチル)-5-ニトロ安息香酸(41g、94.14mmol、1当量)の混合物に、BH.THF(1M、470.68mL、5当量)を添加した。黄色混合物を60℃で2時間撹拌した。混合物にMeOH(400mL)を添加し、減圧下で濃縮して、残留物を得た。次いで、HO(200mL)およびDCM(300mL)を添加し、DCM(3×200mL)で抽出し、ブライン(300mL)で洗浄し、無水MgSOで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮して、残留物を得た。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(石油エーテル/酢酸エチル=1/0、1/1)により精製した。(2-(((tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ)メチル)-5-ニトロフェニル)メタノールを白色固体として得た。1H NMR (400 MHz, メタノール-d4) δ ppm 1.10 (s, 9 H) 4.58 (s, 2 H) 4.89 (s, 2 H) 7.32 - 7.51 (m, 6 H) 7.68 (dd, J=8, 1.38 Hz, 4 H) 7.76 (d, J=8 Hz, 1 H) 8.15 (dd, J=8 2.26 Hz, 1 H) 8.30 (d, J=2 Hz, 1 H).
2-(((tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ)メチル)-5-ニトロベンズアルデヒドの合成
Figure 2022532918000503
DCM(450mL)中の(2-(((tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ)メチル)-5-ニトロフェニル)メタノール(34g、80.65mmol、1当量)の溶液に、MnO(56.09g、645.22mmol、8当量)を添加した。黒色混合物を25℃で36時間撹拌した。混合物にMeOH(400mL)を添加し、減圧下で濃縮して、残留物を得た。次いで、HO(200mL)およびDCM(300mL)を添加し、DCM(3×200mL)で抽出し、ブライン(300mL)で洗浄し、無水MgSOで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮して、残留物を得た。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(CHCl=100%)により精製した。2-(((tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ)メチル)-5-ニトロベンズアルデヒドを白色固体として得た。1H NMR (400 MHz, クロロホルム-d) δ ppm 1.14 (s, 9 H) 5.26 (s, 2 H) 7.34 - 7.53 (m, 6 H) 7.60 - 7.73 (m, 4 H) 8.13 (d, J=8Hz, 1 H) 8.48 (dd, J=8, 2.51 Hz, 1 H) 8.67 (d, J=2 Hz, 1 H) 10.16 (s, 1 H).
N-(2-(((tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ)メチル)-5-ニトロベンジル)プロパ-2-イン-1-アミンの合成
Figure 2022532918000504
DCM(130mL)中の2-(((tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ)メチル)-5-ニトロベンズアルデヒド(12.6g、30.03mmol、1当量)の溶液に、プロパ-2-イン-1-アミン(4.14g、75.08mmol、4.81mL、2.5当量)およびMgSO(36.15g、300.33mmol、10当量)を添加し、次いで懸濁液混合物を25℃で24時間撹拌した。少量の反応溶液を取り、NaBHで処理し、TLCは、1つの新しいポイントが形成されたことを示した。反応混合物を濾過し、減圧下で濃縮して、残留物を得た。(E)-N-[[2-[[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシメチル]-5-ニトロ-フェニル]メチル]プロパ-2-イン-1-イミンを黄色固体として得た。1H NMR (400 MHz, クロロホルム-d) δ ppm 1.11 (s, 9 H) 2.48 (t, J=2.38 Hz, 1 H) 4.52 (t, J=2.13 Hz, 2 H) 5.09 (s, 2 H) 7.35 - 7.49 (m, 6 H) 7.63 - 7.72 (m, 4 H) 7.79 (d, J=8.53 Hz, 1 H) 8.25 (dd, J=8.53, 2.51 Hz, 1 H) 8.68 (d, J=2.26 Hz, 1 H) 8.84 (t, J=1.88 Hz, 1 H).
(E)-N-[[2-[[tert-ブチル(ジフェニル)シリル]オキシメチル]-5-ニトロ-フェニル]メチル]プロパ-2-イン-1-イミン(12g、26.28mmol、1当量)をMeOH(100mL)およびTHF(50mL)に溶解し、次いでNaBH(1.49g、39.42mmol、1.5当量)を添加し、黄色混合物を-20℃で2時間撹拌した。LCMSは、所望の化合物が検出されたことを示した。反応混合物を-20℃でMeOH(200mL)の添加によりクエンチし、次いで減圧下で濃縮して、残留物を得た。残留物をEtOAc(500mL)で溶解し、ブライン(150mL)で洗浄し、無水NaSOで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮して、残留物を得た。残留物をフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(0~10%酢酸エチル/石油エーテル勾配の溶離液)により精製した。N-(2-(((tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ)メチル)-5-ニトロベンジル)プロパ-2-イン-1-アミンを淡黄色油状物として得た。1H NMR (400 MHz, クロロホルム-d) δ ppm 1.12 (s, 9 H) 2.13 (t, J=2.38 Hz, 1 H) 3.33 (d, J=2.51 Hz, 2 H) 3.80 (s, 2 H) 4.93 (s, 2 H) 7.36 - 7.49 (m, 6 H) 7.69 (dd, J=7.91, 1.38 Hz, 4 H) 7.77 (d, J=8.53 Hz, 1 H) 8.16 (dd, J=8.41, 2.38 Hz, 1 H) 8.24 (d, J=2.26 Hz, 1 H).
(9H-フルオレン-9-イル)メチル(2-(((tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ)メチル)-5-ニトロベンジル)(プロパ-2-イン-1-イル)カルバメートの合成
Figure 2022532918000505
ジオキサン(90mL)中のN-(2-(((tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ)メチル)-5-ニトロベンジル)プロパ-2-イン-1-アミン(9g、19.62mmol、1当量)およびFMOC-OSU(7.28g、21.59mmol、1.1当量)の溶液に、飽和NaHCO(90mL)を添加し、白色懸濁液を20℃で12時間撹拌した。反応混合物をHO(150mL)で希釈し、EtOAc(150mL×2)で抽出した。合わせた有機層をブライン(200mL)で洗浄し、無水NaSOで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮して、残留物を得た。残留物をフラッシュシリカゲルクロマトグラフィー(0~30%酢酸エチル/石油エーテルの溶離液)により精製した。(9H-フルオレン-9-イル)メチル(2-(((tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ)メチル)-5-ニトロベンジル)(プロパ-2-イン-1-イル)カルバメート(7.7g、11.08mmol、収率56.48%、純度98%)を白色固体として得た。1H NMR (400 MHz, クロロホルム-d) δ ppm 1.12 (s, 9 H) 2.17 (br d, J=14.31 Hz, 1 H) 3.87 - 4.97 (m, 9 H) 6.98 - 8.28 (m, 21 H).
(9H-フルオレン-9-イル)メチル(5-アミノ-2-(((tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ)メチル)ベンジル)(プロパ-2-イン-1-イル)カルバメートの合成
Figure 2022532918000506
10%AcOH/CHCl(100mL)中の(9H-フルオレン-9-イル)メチル(2-(((tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ)メチル)-5-ニトロベンジル)(プロパ-2-イン-1-イル)カルバメート(5.0g、7.34mmol、1.0当量)の氷浴冷却溶液に、Zn(7.20g、110mmol、15当量)を添加した。氷浴を取り外し、得られた混合物を2時間撹拌し、その時点で、これをcelite(登録商標)のパッドに通して濾過した。揮発物を真空中で除去し、残留物をEtOAcに溶解し、NaHCO(飽和)、NaCl(飽和)で洗浄し、MgSOで乾燥させ、濾過し、濃縮し、ISCO SiOクロマトグラフィー(0~75%EtOAc/ヘプタン)の後、(9H-フルオレン-9-イル)メチル(5-アミノ-2-(((tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ)メチル)ベンジル)(プロパ-2-イン-1-イル)カルバメートを得た。LCMS:MH+=651.6;Rt=3.77分(5分酸性法)。
(9H-フルオレン-9-イル)メチル(5-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(((tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ)メチル)ベンジル)(プロパ-2-イン-1-イル)カルバメートの合成
Figure 2022532918000507
CHCl(40mL)中の(9H-フルオレン-9-イル)メチル(5-アミノ-2-(((tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ)メチル)ベンジル)(プロパ-2-イン-1-イル)カルバメート(2.99g、4.59mmol、1.0当量)および(S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタン酸(1.72g、4.59mmol、1.0当量)に、エチル2-エトキシキノリン-1(2H)-カルボキシレート(2.27g、9.18mmol、2.0当量)を添加した。10分間撹拌した後、MeOH(1mL)を添加し、溶液は均一になった。反応物を16時間撹拌し、揮発物を真空中で除去し、ISCO SiOクロマトグラフィー(0~15%MeOH/CH2Cl2)による精製後、(9H-フルオレン-9-イル)メチル(5-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(((tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ)メチル)ベンジル)(プロパ-2-イン-1-イル)カルバメートを得た。LCMS:MH+=1008.8;Rt=3.77分(5分酸性法)。
プロパ-2-イン-1-イル(5-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(((tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ)メチル)ベンジル)(プロパ-2-イン-1-イル)カルバメートの合成
Figure 2022532918000508
(9H-フルオレン-9-イル)メチル(5-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(((tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ)メチル)ベンジル)(プロパ-2-イン-1-イル)カルバメート(1.60g、1.588mmol、1.0当量)に、MeOH中2Mジメチルアミン(30mL、60mmol、37当量)およびTHF(10mL)を添加した。3時間静置した後、揮発物を真空中で除去し、残留物をEtOで摩砕して、FMOC脱保護副産物を除去した。得られた固体に、CHCl(16mL)およびピリジン(4mL)を添加し、不均一溶液に、プロパルギルクロロホルメート(155uL、1.588mmol、1.0当量)を添加した。30分間撹拌した後、追加のプロパルギルクロロホルメート(155uL、1.588mmol、1.0当量)を添加した。さらに20分間撹拌した後、MeOH(1mL)を添加して、残ったクロロホルメートをクエンチし、揮発物を真空中で除去した。ISCO SiOクロマトグラフィー(0~15%MeOH/CHCl)により精製して、プロパ-2-イン-1-イル(5-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(((tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ)メチル)ベンジル)(プロパ-2-イン-1-イル)カルバメートを得た。LCMS:MH+=867.8;Rt=3.40分(5分酸性法)。
プロパ-2-イン-1-イル(5-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(ヒドロキシメチル)ベンジル)(プロパ-2-イン-1-イル)カルバメートの合成
Figure 2022532918000509
THF(7.5mL)中のプロパ-2-イン-1-イル(5-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(((tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ)メチル)ベンジル)(プロパ-2-イン-1-イル)カルバメート(984mg、1.135mmol、1.0当量)の溶液に、THF中1.0Mフッ化テトラブチルアンモニウム(2.27mL、2.27mmol、2.0当量)を添加した。6時間静置した後、揮発物を真空中で除去し、残留物をISCO SiOクロマトグラフィー(0~40%MeOH/CH2Cl2)により精製して、プロパ-2-イン-1-イル(5-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(ヒドロキシメチル)ベンジル)(プロパ-2-イン-1-イル)カルバメートを得た。LCMS:MH+=629.6;Rt=1.74分(5分酸性法)。
プロパ-2-イン-1-イル(5-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(クロロメチル)ベンジル)(プロパ-2-イン-1-イル)カルバメートの合成
Figure 2022532918000510
CHCl(10mL)中のプロパ-2-イン-1-イル(5-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(ヒドロキシメチル)ベンジル)(プロパ-2-イン-1-イル)カルバメート(205mg、0.326mmol、1.0当量)に、ピリジン(158uL、1.96mmol、5当量)を添加した。不均一な混合物を0℃の氷浴中で冷却し、塩化チオニル(71uL、0.98mmol、3当量)を添加した。氷浴中で3時間撹拌した後、反応物をISCO SiOクロマトグラフィー(0~30%MeOH/CHCl)により直接精製して、プロパ-2-イン-1-イル(5-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(クロロメチル)ベンジル)(プロパ-2-イン-1-イル)カルバメートを得た。LCMS:MH+=647.6;Rt=2.54分(5分酸性法)。
2-(ヒドロキシメチル)-N-メチル-5-ニトロベンズアミドの合成
Figure 2022532918000511
MeOH(1500mL)中の6-ニトロイソベンゾフラン-1(3H)-オン(500g、2.79mol)の撹拌懸濁液に、MeNH(3.00kg、29.94mol、600mL、純度31.0%)を25℃で添加し、1時間撹拌した。固体を濾過し、水で2回(600mL)洗浄し、高真空下で乾燥させて、残留物を得た。生成物である2-(ヒドロキシメチル)-N-メチル-5-ニトロベンズアミドを白色固体として得た。LCMS:Rt=0.537分、MSm/z=193.2。1H NMR: 400 MHz DMSO δ 8.57 (br d, J = 4.4 Hz, 1H), 8.31 (dd, J = 2.4, 8.6 Hz, 1H), 8.21 (d, J = 2.4 Hz, 1H), 7.86 (d, J = 8.8 Hz, 1H), 5.54 (t, J = 5.6 Hz, 1H), 4.72 (d, J = 5.5 Hz, 2H), 2.78 (d, J = 4.4 Hz, 3H).
(2-((メチルアミノ)メチル)-4-ニトロフェニル)メタノールの合成
Figure 2022532918000512
THF(5000mL)中の2-(ヒドロキシメチル)-N-メチル-5-ニトロベンズアミド(560g、2.66mol)の溶液を0℃に冷却し、次いでBH3-Me2S(506g、6.66mol)(THF中2.0M)を60分間滴下添加し、70℃に5時間加熱した。LCMSは、出発材料が消費されたことを示した。完了後、メタノール中4M HCl(1200mL)を0℃で反応混合物に添加し、65℃で8時間加熱した。反応混合物を0℃に冷却し、固体を濾過し、減圧中で濃縮した。生成物である(2-((メチルアミノ)メチル)-4-ニトロフェニル)メタノール(520g)を白色固体として得た。LCMS:Rt=0.742分、MSm/z=197.1[M+H]+。1H NMR: 400 MHz DMSO δ 9.25 (br s, 2H), 8.37 (d, J = 2.4 Hz, 1H), 8.14 (dd, J = 2.4, 8.5 Hz, 1H), 7.63 (d, J = 8.4 Hz, 1H), 5.72 (br s, 1H), 4.65 (s, 2H), 4.15 (br s, 2H), 2.55 - 2.45 (m, 3H)
1-(2-(((tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ)メチル)-5-ニトロフェニル)-N-メチルメタンアミンの合成
Figure 2022532918000513
DCM(2600mL)中の(2-((メチルアミノ)メチル)-4-ニトロフェニル)メタノール(520g、2.65mol)およびイミダゾール(721g、10.6mol)の溶液を0℃に冷却し、TBDPS-CL(1.09kg、3.98mol、1.02L)を滴下添加し、2時間撹拌した。混合物を氷冷水(1000mL)に注ぎ入れ、酢酸エチルで抽出した。合わせた有機層をブラインで洗浄し、NaSOで乾燥させ、濾過し、真空下で蒸発させて、粗生成物を得た。粗生成物を、酢酸エチル:石油エーテル(10/1~1)で溶出するシリカゲル上でのクロマトグラフィーにより精製して、残留物を得た。生成物である1-(2-(((tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ)メチル)-5-ニトロフェニル)-N-メチルメタンアミンを黄色液体として得た。LCMS:生成物:Rt=0.910分、MSm/z=435.2[M+H]+。1H NMR: 400 MHz CDCl3 δ 8.23 (d, J=2.4 Hz, 1H), 8.15 (dd, J=2.4, 8.4 Hz, 1H), 7.76 (d, J=8.4 Hz, 1H), 7.71 - 7.66 (m, 4H), 7.50 - 7.37 (m, 6H), 4.88 (s, 2H), 3.65 (s, 2H), 2.39 (s, 3H), 1.12 (s, 9H)
(9H-フルオレン-9-イル)メチル(2-(((tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ)メチル)-5-ニトロベンジル)(メチル)カルバメートの合成
Figure 2022532918000514
THF(4000mL)中の1-(2-(((tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ)メチル)-5-ニトロフェニル)-N-メチルメタンアミン(400g、920.3mmol)の溶液に、FMOC-OSU(341.5g、1.01mol)およびEtN(186.2g、1.84mol、256.2mL)を添加し、混合物を25℃で1時間撹拌した。混合物を水(1600mL)に注ぎ入れ、酢酸エチル(1000mL×2)で抽出した。合わせた有機層をブラインで洗浄し、NaSOで乾燥させ、濾過し、真空下で蒸発させて、粗生成物を得た。粗生成物を、石油エーテル:酢酸エチル(1/0~1/1)で溶出するシリカゲル上でのクロマトグラフィーにより精製して、(9H-フルオレン-9-イル)メチル(2-(((tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ)メチル)-5-ニトロベンジル)(メチル)カルバメートを白色固体として得た。LCMS:Rt=0.931分、MSm/z=657.2[M+H]+。1H NMR: EW16000-26-P1A, 400 MHz CDCl3 δ 8.21 - 7.96 (m, 1H), 7.87 - 7.68 (m, 3H), 7.68 - 7.62 (m, 4H), 7.62 - 7.47 (m, 2H), 7.47 - 7.28 (m, 9H), 7.26 - 7.05 (m, 2H), 4.81 (br s, 1H), 4.62 - 4.37 (m, 4H), 4.31 - 4.19 (m, 1H), 4.08 - 3.95 (m, 1H), 2.87 (br d, J = 5.2 Hz, 3H), 1.12 (s, 9H).
(9H-フルオレン-9-イル)メチル(5-アミノ-2-(((tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ)メチル)ベンジル)(メチル)カルバメートの合成
Figure 2022532918000515
MeOH(90mL)およびEtOAc(30mL)中の(9H-フルオレン-9-イル)メチル(2-(((tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ)メチル)-5-ニトロベンジル)(メチル)カルバメート(3.0g、4.57mmol、1.0当量)の溶液を脱気し、三方活栓を介してNバルーンにパージした。脱気/Nパージを2回繰り返した後、10%Pd/C deGussa型(0.486g、0.457mmol、0.1当量)を添加した。得られた混合物を脱気し、三方活栓を介して2Hバルーンにパージした。脱気/Hパージを2回繰り返した後、反応物をHバルーン圧下で4時間撹拌した。反応物を脱気し、Nにパージし、celiteのパッドに通して濾過し、MeOHでさらに溶出した。揮発物を真空中で除去し、高真空でポンピングした後、(9H-フルオレン-9-イル)メチル(5-アミノ-2-(((tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ)メチル)ベンジル)(メチル)カルバメートを得た。LCMS:MH+=627.7;Rt=1.59分(2分酸性法)。
(9H-フルオレン-9-イル)メチル(5-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(((tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ)メチル)ベンジル)(メチル)カルバメートの合成
Figure 2022532918000516
2:1 CHCl/MeOH(60mL)中の(9H-フルオレン-9-イル)メチル(5-アミノ-2-(((tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ)メチル)ベンジル)(メチル)カルバメート(2.86g、4.56mmol、1.0当量)および(S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタン酸(1.71g、4.56mmol、1.0当量)に、エチル2-エトキシキノリン-1(2H)-カルボキシレート(2.256g、9.12mmol、2.0当量)を添加した。均一な溶液を16時間撹拌し、その時点で、追加の(S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタン酸(0.340g、0.2当量)およびエチル2-エトキシキノリン-1(2H)-カルボキシレート(0.452g、0.4当量)を添加して、反応を完了させた。さらに5時間撹拌した後、揮発物を真空中で除去し、ISCO SiOクロマトグラフィー(0~5%MeOH/CHCl)による精製後、(9H-フルオレン-9-イル)メチル(5-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(((tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ)メチル)ベンジル)(メチル)カルバメートを得た。LCMS:MH+=984.1;Rt=1.54分(2分酸性法)。
プロパ-2-イン-1-イル(5-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(((tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ)メチル)ベンジル)(メチル)カルバメートの合成
Figure 2022532918000517
THF(10mL)中の(9H-フルオレン-9-イル)メチル(5-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(((tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ)メチル)ベンジル)(メチル)カルバメート(2.05g、2.085mmol、1.0当量)に、MeOH中2.0Mジメチルアミン(10.42mL、20.85mmol、10当量)を添加した。16時間撹拌した後、揮発物を真空中で除去した。残留物をCHCl(20mL)に溶解し、DIEA(0.533mL、4.17mmol、2当量)およびプロパルギルクロロホルメート(0.264mL、2.71mmol、1.3当量)を添加した。室温で16時間撹拌した後、反応物をCHCl(20mL)で希釈し、NaHCO(飽和)、NaCl(飽和)で洗浄し、MgSOで乾燥させ、濾過し、濃縮し、ISCO SiOクロマトグラフィー(0~15%MeOH/CHCl)により精製して、プロパ-2-イン-1-イル(5-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(((tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ)メチル)ベンジル)(メチル)カルバメートを得た。LCMS:MH+=843.8;Rt=1.35分(2分酸性法)。
プロパ-2-イン-1-イル(5-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(ヒドロキシメチル)ベンジル)(メチル)カルバメートの合成
Figure 2022532918000518
THF(10.0mL)中のプロパ-2-イン-1-イル(5-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(((tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ)メチル)ベンジル)(メチル)カルバメート(1.6g、1.90mmol、1.0当量)の0℃溶液に、THF中1.0Mフッ化テトラブチルアンモニウム(3.80mL、3.80mmol、2.0当量)を添加した。室温に加温し、16時間撹拌した後、揮発物を真空中で除去し、残留物をEtOAcに溶解し、NaHCO(飽和)、NaCl(飽和)で洗浄し、MgSOで乾燥させ、濾過し、濃縮し、残留物をISCO SiOクロマトグラフィー(0~30%MeOH/CH2Cl2)により精製して、プロパ-2-イン-1-イル(5-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(ヒドロキシメチル)ベンジル)(メチル)カルバメートを得た。LCMS:MH+=605.7;Rt=0.81分(2分酸性法)。
プロパ-2-イン-1-イル(5-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(クロロメチル)ベンジル)(メチル)カルバメートの合成
Figure 2022532918000519
CHCl(10mL)中のプロパ-2-イン-1-イル(5-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(ヒドロキシメチル)ベンジル)(メチル)カルバメート(350mg、0.579mmol、1.0当量)に、ピリジン(0.278mL、3.47mmol、6当量)を添加した。不均一な混合物を0℃の氷浴中で冷却し、塩化チオニル(0.126mL、1.73mmol、3当量)を添加した。氷浴中で3時間撹拌した後、反応物をISCO SiOクロマトグラフィー(0~30%MeOH/CHCl)により精製して、プロパ-2-イン-1-イル(5-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(クロロメチル)ベンジル)(プロパ-2-イン-1-イル)カルバメートを得た。LCMS:MH+=623.7;Rt=2.19分(5分酸性法)。
(9H-フルオレン-9-イル)メチル(5-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(ヒドロキシメチル)ベンジル)(メチル)カルバメートの合成
Figure 2022532918000520
THF(20mL)に溶解した(9H-フルオレン-9-イル)メチル(5-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(((tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ)メチル)ベンジル)(メチル)カルバメート(2.6g、2.64mmol、1.0当量)に、酢酸(0.757mL、13.22mmol、5.0当量)およびTHF中1.0M TBAF(2.91mL、2.91mmol、1.1当量)を添加した。溶液を72時間撹拌し、その時点で、揮発物を真空中で除去した。ISCO SiOクロマトグラフィー(0~30%MeOH/CHCl)による精製後、(9H-フルオレン-9-イル)メチル(5-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(ヒドロキシメチル)ベンジル)(メチル)カルバメートを得た。LCMS:MH+=745.5;Rt=1.07分(2分酸性法)。
(9H-フルオレン-9-イル)メチル(5-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(クロロメチル)ベンジル)(メチル)カルバメートの合成
Figure 2022532918000521
CHCl(10mL)中の(9H-フルオレン-9-イル)メチル(5-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(ヒドロキシメチル)ベンジル)(メチル)カルバメート(200mg、0.269mmol、1.0当量)に、ピリジン(0.130mL、1.61mmol、6当量)を添加した。不均一な混合物を0℃の氷浴中で冷却し、塩化チオニル(0.059mL、0.806mmol、3当量)を添加した。氷浴中で短時間撹拌した後、反応物を室温まで加温しながら2時間撹拌した。反応物をISCO SiOクロマトグラフィー(0~30%MeOH/CHCl)により精製して、(9H-フルオレン-9-イル)メチル(5-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(クロロメチル)ベンジル)(メチル)カルバメートを得た。LCMS:MH+=763.2;Rt=1.18分(2分酸性法)。
一般手順1
1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((プロパ-2-イン-1-イル((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)カルボニル)アミノ)メチル)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000522
DMF(0.5mL)に溶解した(R)-2-((5-(3-クロロ-2-メチル-4-(2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ)フェニル)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)プロパン酸塩酸塩(73.8mg、0.81mmol、1.0当量)およびプロパ-2-イン-1-イル(5-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(クロロメチル)ベンジル)(プロパ-2-イン-1-イル)カルバメート(78mg、0.122mmol、1.5当量)に、DIEA(70uL、0.405mmol、5.0当量)、続いてヨウ化テトラブチルアンモニウム(25.4mg、0.069mmol、0.85当量)を添加した。5時間撹拌した後、反応物をDMSO(3mL)で希釈し、RP-HPLC ISCO goldクロマトグラフィー(10~100%MeCN/H2O、0.1%NH4OH修飾剤)により精製した。凍結乾燥して、1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((プロパ-2-イン-1-イル((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)カルボニル)アミノ)メチル)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。LCMS:M+=1486.3;Rt=2.70分(5分塩基性法)。
一般手順2
1-(2-(((((1-(2,5,8,11,14,17,20,23-オクタオキサペンタコサン-25-イル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)カルボニル)((1-(2,5,8,11,14,17,20,23-オクタオキサペンタコサン-25-イル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メチル)アミノ)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000523
1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((プロパ-2-イン-1-イル((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)カルボニル)アミノ)メチル)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(24mg、0.016mmol、1.0当量)および25-アジド-2,5,8,11,14,17,20,23-オクタオキサペンタコサン(26.5mg、0.065mmol、4当量)に、t-BuOH(1mL)を添加した。混合物をハウス真空により脱気し、三方活栓を介してNバルーンにパージした。脱気/パージを3回繰り返した。アスコルビン酸ナトリウムの16mg/mL水溶液(297uL、0.024mmol、1.5当量)を添加し、溶液を脱気し、Nに3回パージした。硫酸銅の4mg/mL水溶液(298uL、0.0048mmol、0.3当量)を添加し、溶液を脱気し、Nに3回パージした。N下で3時間撹拌した後、反応物をDMSO(3mL)で希釈し、RP-HPLC ISCO goldクロマトグラフィー(10~100%MeCN/H2O、0.1%TFA修飾剤)により精製した。凍結乾燥して、1-(2-(((((1-(2,5,8,11,14,17,20,23-オクタオキサペンタコサン-25-イル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)カルボニル)((1-(2,5,8,11,14,17,20,23-オクタオキサペンタコサン-25-イル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メチル)アミノ)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS M+=2307.0730、Rt=2.69分(5分酸性法)。
一般手順3
1-(2-(((((1-(2,5,8,11,14,17,20,23-オクタオキサペンタコサン-25-イル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)カルボニル)((1-(2,5,8,11,14,17,20,23-オクタオキサペンタコサン-25-イル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メチル)アミノ)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(L1-P1)の合成
Figure 2022532918000524
1-(2-(((((1-(2,5,8,11,14,17,20,23-オクタオキサペンタコサン-25-イル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)カルボニル)((1-(2,5,8,11,14,17,20,23-オクタオキサペンタコサン-25-イル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メチル)アミノ)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(19mg、0.0082mmol、1.0当量)に、25%TFA/CHCl(2mL)を添加した。45分間静置した後、揮発物を真空中で除去し、CHClを添加し、揮発物を真空中で除去し、ポンプオンした。残留物をDMF(1mL)に溶解し、DIEA(22uL、0.124mmol、15当量)および2,5-ジオキソピロリジン-1-イル3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパノエート(5.1mg、0.016mmol、2当量)を添加した。18時間静置した後、溶液をDMSO(3mL)で希釈し、RP-ISCO goldクロマトグラフィーにより精製した。凍結乾燥して、1-(2-(((((1-(2,5,8,11,14,17,20,23-オクタオキサペンタコサン-25-イル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)カルボニル)((1-(2,5,8,11,14,17,20,23-オクタオキサペンタコサン-25-イル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メチル)アミノ)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(L1-P1)を得た。HRMS:M+=2399.0797、Rt=2.43分(5分酸性での実行)。1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 0.83 (dd, J=13.82, 6.72 Hz, 6 H) 1.30 - 1.52 (m, 2 H) 1.55 - 1.76 (m, 2 H) 1.83 (s, 3 H) 1.88 - 2.08 (m, 1 H) 2.28 - 2.46 (m, 7 H) 2.73 - 2.84 (m, 4 H) 2.84 - 3.08 (m, 8 H) 3.15 - 3.27 (m, 3 H) 3.43 - 3.66 (m, 68 H) 3.73 - 3.83 (m, 7 H) 4.16 - 4.30 (m, 3 H) 4.32 - 4.43 (m, 2 H) 4.47 (br s, 6 H) 4.60 (br s, 3 H) 5.16 - 5.30 (m, 3 H) 5.40 (br s, 2 H) 5.44 - 5.52 (m, 1 H) 5.99 (br t, J=5.07 Hz, 1 H) 6.21 (d, J=6.48 Hz, 1 H) 6.71 (t, J=7.40 Hz, 1 H) 6.97 - 7.04 (m, 2 H), 7.00 (s, 2H) 7.12 - 7.23 (m, 5 H) 7.27 - 7.54 (m, 8 H) 7.63 (d, J=5.14 Hz, 1 H) 7.78 - 7.94 (m, 3 H) 7.99 (br s, 1 H) 8.05 - 8.23 (m, 2 H) 8.60 (s, 1 H) 8.88 (d, J=5.13 Hz, 1 H) 10.24 (br s, 1 H).
1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(((((1-(26-カルボキシ-3,6,9,12,15,18,21,24-オクタオキサヘキサコシル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)カルボニル)((1-(26-カルボキシ-3,6,9,12,15,18,21,24-オクタオキサヘキサコシル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メチル)アミノ)メチル)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000525
1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((プロパ-2-イン-1-イル((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)カルボニル)アミノ)メチル)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(30mg、0.020mmol、1.0当量)および1-アジド-3,6,9,12,15,18,21,24-オクタオキサヘプタコサン-27-酸(28.3mg、0.061mmol、3当量)を用いて一般手順2に従って、1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(((((1-(26-カルボキシ-3,6,9,12,15,18,21,24-オクタオキサヘキサコシル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)カルボニル)((1-(26-カルボキシ-3,6,9,12,15,18,21,24-オクタオキサヘキサコシル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メチル)アミノ)メチル)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=2420.0867、Rt=2.57分(5分酸性法)。
4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(2-(((((1-(26-カルボキシ-3,6,9,12,15,18,21,24-オクタオキサヘキサコシル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)カルボニル)((1-(26-カルボキシ-3,6,9,12,15,18,21,24-オクタオキサヘキサコシル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メチル)アミノ)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(L10-P1)の合成
Figure 2022532918000526
1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(((((1-(26-カルボキシ-3,6,9,12,15,18,21,24-オクタオキサヘキサコシル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)カルボニル)((1-(26-カルボキシ-3,6,9,12,15,18,21,24-オクタオキサヘキサコシル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メチル)アミノ)メチル)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(30mg、0.012mmol、1.0当量)を用いて一般手順3に従って、4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(2-(((((1-(26-カルボキシ-3,6,9,12,15,18,21,24-オクタオキサヘキサコシル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)カルボニル)((1-(26-カルボキシ-3,6,9,12,15,18,21,24-オクタオキサヘキサコシル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メチル)アミノ)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(L10-P1)を得た。HRMS:M+=2515.0879、Rt=2.43分(5分酸性法)。1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 0.83 (dd, J=13.82, 6.72 Hz, 6 H) 1.30 - 1.52 (m, 2 H) 1.55 - 1.76 (m, 2 H) 1.83 (s, 3 H) 1.88 - 2.08 (m, 1 H) 2.28 - 2.46 (m, 7 H) 2.73 - 2.84 (m, 4 H) 2.84 - 3.08 (m, 8 H) 3.15 - 3.27 (m, 3 H) 3.43 - 3.66 (m, 68 H) 3.73 - 3.83 (m, 7 H) 4.16 - 4.30 (m, 3 H) 4.32 - 4.43 (m, 2 H) 4.47 (br s, 6 H) 4.60 (br s, 3 H) 5.16 - 5.30 (m, 3 H) 5.40 (br s, 2 H) 5.44 - 5.52 (m, 1 H) 5.99 (br t, J=5.07 Hz, 1 H) 6.21 (d, J=6.48 Hz, 1 H) 6.71 (t, J=7.40 Hz, 1 H) 6.97 - 7.04 (m, 2 H), 7.00 (s, 2H) 7.12 - 7.23 (m, 5 H) 7.27 - 7.54 (m, 8 H) 7.63 (d, J=5.14 Hz, 1 H) 7.78 - 7.94 (m, 3 H) 7.99 (br s, 1 H) 8.05 - 8.23 (m, 2 H) 8.60 (s, 1 H) 8.88 (d, J=5.13 Hz, 1 H) 10.24 (br s, 1 H).
1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((メチル((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)カルボニル)アミノ)メチル)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000527
(R)-2-((5-(3-クロロ-2-メチル-4-(2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ)フェニル)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)プロパン酸塩酸塩(300mg、0.329mmol、1.0当量)およびプロパ-2-イン-1-イル(5-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(クロロメチル)ベンジル)(メチル)カルバメート(246mg、0.395mmol、1.2当量)を用いて一般手順1に従って、1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((メチル((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)カルボニル)アミノ)メチル)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=1461.5800、Rt=2.53分(5分酸性法)。
1-(2-(((((1-(2,5,8,11,14,17,20,23-オクタオキサペンタコサン-25-イル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)カルボニル)(メチル)アミノ)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000528
1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((メチル((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)カルボニル)アミノ)メチル)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(20mg、0.14mmol、1.0当量)および25-アジド-2,5,8,11,14,17,20,23-オクタオキサペンタコサン(16.8mg、0.041mmol、3.0当量)を用いて一般手順2に従って、1-(2-(((((1-(2,5,8,11,14,17,20,23-オクタオキサペンタコサン-25-イル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)カルボニル)(メチル)アミノ)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=1872.8359、Rt=2.56分(5分酸性法)。
1-(2-(((((1-(2,5,8,11,14,17,20,23-オクタオキサペンタコサン-25-イル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)カルボニル)(メチル)アミノ)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(L4-P1)の合成
Figure 2022532918000529
1-(2-(((((1-(2,5,8,11,14,17,20,23-オクタオキサペンタコサン-25-イル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)カルボニル)(メチル)アミノ)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(16.9mg、0.009mmol、1.0当量)を用いて一般手順3に従って、1-(2-(((((1-(2,5,8,11,14,17,20,23-オクタオキサペンタコサン-25-イル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)カルボニル)(メチル)アミノ)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(L4-P1)を得た。HRMS:M+=1967.8375、Rt=2.46分(5分酸性法)。
1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(((((1-(26-カルボキシ-3,6,9,12,15,18,21,24-オクタオキサヘキサコシル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)カルボニル)(メチル)アミノ)メチル)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000530
1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((メチル((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)カルボニル)アミノ)メチル)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(12mg、0.0082mmol、1.0当量)および1-アジド-3,6,9,12,15,18,21,24-オクタオキサヘプタコサン-27-酸(11.5mg、0.025mmol、3.0当量)を用いて一般手順2に従って、1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(((((1-(26-カルボキシ-3,6,9,12,15,18,21,24-オクタオキサヘキサコシル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)カルボニル)(メチル)アミノ)メチル)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=1928.8459、Rt=2.52分(5分酸性法)。
4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(2-(((((1-(26-カルボキシ-3,6,9,12,15,18,21,24-オクタオキサヘキサコシル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)カルボニル)(メチル)アミノ)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(L3-P1)の合成
Figure 2022532918000531
1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(((((1-(26-カルボキシ-3,6,9,12,15,18,21,24-オクタオキサヘキサコシル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)カルボニル)(メチル)アミノ)メチル)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(12mg、0.006mmol、1.00当量)を用いて一般手順3に従って、4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(2-(((((1-(26-カルボキシ-3,6,9,12,15,18,21,24-オクタオキサヘキサコシル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)カルボニル)(メチル)アミノ)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(L3-P1)を得た。HRMS:M+=2024.8516、Rt=2.42分(5分酸性法)。
1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((メチルアミノ)メチル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000532
DMF(2mL)に溶解した4-メトキシベンジル(R)-2-((5-(3-クロロ-2-メチル-4-(2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ)フェニル)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)プロパノエート(160mg、0.161mmol、1.0当量)および(9H-フルオレン-9-イル)メチル(5-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(クロロメチル)ベンジル)(メチル)カルバメート(153mg、0.201mmol、1.25当量)に、DIEA(0.056mL、0.321mmol、2.0当量)、続いてヨウ化テトラブチルアンモニウム(65.3mg、0.177mmol、1.1当量)を添加した。16時間静置した後、THF中2.0ジメチルアミン(0.804mL、1.67mmol、10当量)を添加した。2時間静置した後、揮発物を真空中で除去し、DMSO(6mL)を添加し、溶液をRP-HPLC ISCO goldクロマトグラフィー(10~100%MeCN/H2O、0.1%TFA修飾剤)により精製した。凍結乾燥して、1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((メチルアミノ)メチル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=1499.3700;Rt=2.59分(5分酸性法)。
1-(4-((R)-2-((R)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(2-メチル-3-オキソ-4,7,10,13,16,19,22,25,28-ノナオキサ-2-アザノナコシル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000533
DMF(1.5mL)に溶解した1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((メチルアミノ)メチル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(40mg、0.027mmol、1.0当量)および2,5-ジオキソピロリジン-1-イル(2,5,8,11,14,17,20,23-オクタオキサペンタコサン-25-イル)カーボネート(30.8mg、0.059mmol、2.2当量)に、DIEA(0.009mL、0.053mmol、2.0当量)を添加した。1時間静置した後、DMSO(3mL)を添加し、溶液をRP-HPLC ISCO goldクロマトグラフィー(10~100%MeCN/H2O、0.1%TFA修飾剤)により精製した。凍結乾燥して、1-(4-((R)-2-((R)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(2-メチル-3-オキソ-4,7,10,13,16,19,22,25,28-ノナオキサ-2-アザノナコシル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=1909.3800;Rt=2.92分(5分酸性法)。
4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(4-((R)-2-((R)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(2-メチル-3-オキソ-4,7,10,13,16,19,22,25,28-ノナオキサ-2-アザノナコシル)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(L2-P1)の合成
Figure 2022532918000534
1-(4-((R)-2-((R)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(2-メチル-3-オキソ-4,7,10,13,16,19,22,25,28-ノナオキサ-2-アザノナコシル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(25.3mg、0.013mmol、1.0当量)を用いて一般手順3に従って、4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(4-((R)-2-((R)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(2-メチル-3-オキソ-4,7,10,13,16,19,22,25,28-ノナオキサ-2-アザノナコシル)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(L2-P1)を得た。HRMS:M+=1884.7900、Rt=2.50分(5分酸性法)。
1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(80-カルボキシ-2-メチル-3-オキソ-6,9,12,15,18,21,24,27,30,33,36,39,42,45,48,51,54,57,60,63,66,69,72,75,78-ペンタコサオキサ-2-アザオクタコンチル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000535
DMF(2mL)に溶解した1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((メチルアミノ)メチル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(150mg、0.093mmol、1.0当量)および79-((2,5-ジオキソピロリジン-1-イル)オキシ)-79-オキソ-4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49,52,55,58,61,64,67,70,73,76-ペンタコサオキサノナヘプタコンタン酸(134mg、0.102mmol、1.1当量)に、DIEA(0.081mL、0.464mmol、5.0当量)を添加した。18時間静置した後、DMSO(6mL)を添加し、溶液をRP-HPLC ISCO goldクロマトグラフィー(10~100%MeCN/H2O、0.1%TFA修飾剤)により精製した。凍結乾燥して、1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(80-カルボキシ-2-メチル-3-オキソ-6,9,12,15,18,21,24,27,30,33,36,39,42,45,48,51,54,57,60,63,66,69,72,75,78-ペンタコサオキサ-2-アザオクタコンチル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=2700.8701;Rt=2.83分(5分酸性法)。
4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(2-(80-カルボキシ-2-メチル-3-オキソ-6,9,12,15,18,21,24,27,30,33,36,39,42,45,48,51,54,57,60,63,66,69,72,75,78-ペンタコサオキサ-2-アザオクタコンチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(L11-P1)の合成
Figure 2022532918000536
1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(80-カルボキシ-2-メチル-3-オキソ-6,9,12,15,18,21,24,27,30,33,36,39,42,45,48,51,54,57,60,63,66,69,72,75,78-ペンタコサオキサ-2-アザオクタコンチル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを用いて一般手順3に従って、4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(2-(80-カルボキシ-2-メチル-3-オキソ-6,9,12,15,18,21,24,27,30,33,36,39,42,45,48,51,54,57,60,63,66,69,72,75,78-ペンタコサオキサ-2-アザオクタコンチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(L11-P1)を得た。HRMS:M+=2674.8201、Rt=2.44分(5分酸性法)。
1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000537
(R)-2-((5-(3-クロロ-2-メチル-4-(2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ)フェニル)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)プロパン酸(50mg、0.057mmol、1.0当量)およびtert-ブチル((S)-1-(((S)-1-((4-(クロロメチル)フェニル)アミノ)-1-オキソ-5-ウレイドペンタン-2-イル)アミノ)-3-メチル-1-オキソブタン-2-イル)カルバメート(34.1mg、0.069mmol、1.2当量)を用いて一般手順1に従って、1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。LCMS:M+=1337.2、Rt=1.11分(2分酸性法)。
4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウムまたは(2R)-2-[(5S)-5-[3-クロロ-4-[2-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[3-[2-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)エトキシ]プロパノイルアミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]フェニル]メチル]-4-メチル-ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]-2-メチル-フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸(L9-P1)の合成
Figure 2022532918000538
1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(55mg、0.041mmol、1.0当量)を用いて一般手順3に従って、4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(L9-P1)を得た。HRMS:M+=1431.5400、Rt=2.50分(5分酸性法)。
1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000539
4-メトキシベンジル(R)-2-((5-(3-クロロ-2-メチル-4-(2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ)フェニル)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)プロパノエート(85mg、0.085mmol、1.0当量)およびtert-ブチル((S)-1-(((S)-1-((4-(クロロメチル)-3-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)フェニル)アミノ)-1-オキソ-5-ウレイドペンタン-2-イル)アミノ)-3-メチル-1-オキソブタン-2-イル)カルバメート(58mg、0.102mmol、1.2当量)を用いて一般手順1に従って、1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=1524.6200、Rt=2.95分(5分酸性法)。
1-(2-(((1-(2,5,8,11,14,17,20,23-オクタオキサペンタコサン-25-イル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000540
1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(20mg、0.014mmol、1.0当量)および25-アジド-2,5,8,11,14,17,20,23-オクタオキサペンタコサン(5.8mg、0.014mmol、1当量)を用いて一般手順2に従って、1-(2-(((1-(2,5,8,11,14,17,20,23-オクタオキサペンタコサン-25-イル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。LCMS:[(M+)+H+]+2/2=908.5、Rt=1.15分(2分酸性法)。
1-(2-(((1-(2,5,8,11,14,17,20,23-オクタオキサペンタコサン-25-イル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(L8-P1)の合成
Figure 2022532918000541
1-(2-(((1-(2,5,8,11,14,17,20,23-オクタオキサペンタコサン-25-イル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(20mg、0.010mmol、1.0当量)を用いて一般手順3に従って、1-(2-(((1-(2,5,8,11,14,17,20,23-オクタオキサペンタコサン-25-イル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(L8-P1)を得た。HRMS:M+=1908.8097、Rt=2.37分(5分酸性法)。
4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000542
1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(123.1mg、0.075mmol、1.0当量)を用いて一般手順3に従って、4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=1499.5601、Rt=2.50分(5分酸性法)。
4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(2-(((1-(26-カルボキシ-3,6,9,12,15,18,21,24-オクタオキサヘキサコシル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(L7-P1)の合成
Figure 2022532918000543
4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(40mg、0.027mmol、1.0当量)および1-アジド-3,6,9,12,15,18,21,24-オクタオキサヘプタコサン-27-酸(37.4mg、0.080mmol、3.0当量)を用いて一般手順2に従って、4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(2-(((1-(26-カルボキシ-3,6,9,12,15,18,21,24-オクタオキサヘキサコシル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(L7-P1)を得た。HRMS:M+=1965.5601、Rt=2.35分(5分酸性法)。
1-(2-(((1-(2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68,71-テトラコサオキサトリヘプタコンタン-73-イル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(L5-P1)の合成
Figure 2022532918000544
4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(20.4mg、0.014mmol、1.0当量)および73-アジド-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68,71-テトラコサオキサトリヘプタコンタン(28.1mg、0.025mmol、1.5当量)を用いて一般手順2に従って、1-(2-(((1-(2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68,71-テトラコサオキサトリヘプタコンタン-73-イル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(L5-P1)を得た。HRMS:M+=2613.2100、Rt=2.44分(5分酸性法)。
プロパ-2-イン-1-イル(5-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((((4-ニトロフェノキシ)カルボニル)オキシ)メチル)ベンジル)(メチル)カルバメートの合成
Figure 2022532918000545
DMF(2mL)中のプロパ-2-イン-1-イル(5-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(ヒドロキシメチル)ベンジル)(メチル)カルバメート(249mg、0.412mmol)および4-ニトロフェニル(4-ニトロソフェニル)カーボネート(356mg、1.24mmol、3.0当量)の溶液を、均一になるまで撹拌し、16時間静置した。溶液をDMSO(6mL)で希釈し、RP-HPLC ISCO goldクロマトグラフィー(10~100%MeCN/H2O、修飾剤なし)により精製した。凍結乾燥して、プロパ-2-イン-1-イル(5-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((((4-ニトロフェノキシ)カルボニル)オキシ)メチル)ベンジル)(メチル)カルバメートを得た。LC/MS MH+=770.7、Rt=2.45分(5分酸性法)。
プロパ-2-イン-1-イル(5-((R)-2-((R)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(((メチル(2-(メチルアミノ)エチル)カルバモイル)オキシ)メチル)ベンジル)(メチル)カルバメートの合成
Figure 2022532918000546
DMF(1ml)中のプロパ-2-イン-1-イル(5-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((((4-ニトロフェノキシ)カルボニル)オキシ)メチル)ベンジル)(メチル)カルバメート(100mg、0.130mmol)の溶液に、N,N’-ジメチル-エチレンジアミン(22.90mg、0.260mmol)を添加し、続いてDIPEA(0.113ml、0.650mmol)を室温で添加した。得られた溶液を室温で終夜撹拌した。反応物をDMSOで希釈し、RP-HPLC ISCO goldクロマトグラフィー(10~100%MeCN/HO、0.1%NH4OH修飾剤)により精製した。凍結乾燥して、プロパ-2-イン-1-イル(5-((R)-2-((R)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(((メチル(2-(メチルアミノ)エチル)カルバモイル)オキシ)メチル)ベンジル)(メチル)カルバメートを得た。LCMS:MH+=719.9、Rt=0.73分(2分酸性法)。
(R)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロ-3-ヒドロキシフェニル)-4-((1-メトキシ-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチル-1-(3-スルホプロピル)ピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000547
MeOH(1.5mL)中の(R)-4-(2-(4-(4-(1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロ-3-ヒドロキシフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチル-1-(3-スルホプロピル)ピペラジン-1-イウムまたは(2R)-2-[(5S)-5-[3-クロロ-2-メチル-4-[2-[4-メチル-4-(3-スルホプロピル)ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]フェニル]-6-(4-フルオロ-3-ヒドロキシ-フェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸(100mg、0.099mmol)の溶液に、数滴のHSO(濃)を添加した。終夜撹拌した後、MeOHを真空中で除去し、残留物をDMSOに溶解し、RP-HPLC ISCO goldクロマトグラフィー(10~100%MeCN/H2O、0.1%TFA修飾剤)により精製した。凍結乾燥して、(R)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロ-3-ヒドロキシフェニル)-4-((1-メトキシ-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチル-1-(3-スルホプロピル)ピペラジン-1-イウムを得た。HRMS M+=1027.2900、Rt=2.31分(5分酸性法)。
4-(2-(4-(6-(3-(((2-((((4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((メチル((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)カルボニル)アミノ)メチル)ベンジル)オキシ)カルボニル)(メチル)アミノ)エチル)(メチル)カルバモイル)オキシ)-4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-メトキシ-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチル-1-(3-スルホプロピル)ピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000548
0℃のCH2Cl2(1mL)中の(R)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロ-3-ヒドロキシフェニル)-4-((1-メトキシ-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチル-1-(3-スルホプロピル)ピペラジン-1-イウム(50mg、0.049mmol、1.0当量)の溶液に、TEA(34uL、0.243mmol、5.0当量)、続いてクロロギ酸4-ニトロフェニル(10.8mg、0.054mmol、1.1当量)を添加した。15分間撹拌した後、DMF(1mL)中のプロパ-2-イン-1-イル(5-((R)-2-((R)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(((メチル(2-(メチルアミノ)エチル)カルバモイル)オキシ)メチル)ベンジル)(メチル)カルバメート(66.3mg、0.092mmol、2.0当量)の溶液、続いてDIEA(40uL、0.231mmol、5.0当量)を添加した。2時間撹拌した後、揮発物を真空中で除去し、溶液をDMSO(3ml)で希釈し、RP-HPLC ISCO goldクロマトグラフィー(10~100%MeCN/H2O、0.1%TFA修飾剤)により精製した。凍結乾燥して、4-(2-(4-(6-(3-(((2-((((4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((メチル((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)カルボニル)アミノ)メチル)ベンジル)オキシ)カルボニル)(メチル)アミノ)エチル)(メチル)カルバモイル)オキシ)-4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-メトキシ-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチル-1-(3-スルホプロピル)ピペラジン-1-イウムを得た。HRMS M+=1771.6700、Rt=2.57分(5分酸性法)。
4-(2-(4-(6-(3-(((2-((((4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((メチル((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)カルボニル)アミノ)メチル)ベンジル)オキシ)カルボニル)(メチル)アミノ)エチル)(メチル)カルバモイル)オキシ)-4-フルオロフェニル)-4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチル-1-(3-スルホプロピル)ピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000549
THF(1mL)中の4-(2-(4-(6-(3-(((2-((((4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((メチル((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)カルボニル)アミノ)メチル)ベンジル)オキシ)カルボニル)(メチル)アミノ)エチル)(メチル)カルバモイル)オキシ)-4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-メトキシ-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチル-1-(3-スルホプロピル)ピペラジン-1-イウム(23mg、0.013mmol、1.0当量)の溶液に、2N LiOH(0.032mL、0.065mmol、5当量)を添加した。2時間撹拌した後、溶液をAcOHで中和し、RP-HPLC ISCO goldクロマトグラフィー(10~100%MeCN/H2O、0.1%TFA修飾剤)により精製した。凍結乾燥して、4-(2-(4-(6-(3-(((2-((((4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((メチル((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)カルボニル)アミノ)メチル)ベンジル)オキシ)カルボニル)(メチル)アミノ)エチル)(メチル)カルバモイル)オキシ)-4-フルオロフェニル)-4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチル-1-(3-スルホプロピル)ピペラジン-1-イウムを得た。HRMS M+=1757.6200、Rt=2.46分(5分酸性法)。
4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(3-(((2-((((4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((メチル((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)カルボニル)アミノ)メチル)ベンジル)オキシ)カルボニル)(メチル)アミノ)エチル)(メチル)カルバモイル)オキシ)-4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチル-1-(3-スルホプロピル)ピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000550
4-(2-(4-(6-(3-(((2-((((4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((メチル((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)カルボニル)アミノ)メチル)ベンジル)オキシ)カルボニル)(メチル)アミノ)エチル)(メチル)カルバモイル)オキシ)-4-フルオロフェニル)-4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチル-1-(3-スルホプロピル)ピペラジン-1-イウム(17mg、0.0097mmol、1.0当量)を用いて一般手順3に従って、4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(3-(((2-((((4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((メチル((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)カルボニル)アミノ)メチル)ベンジル)オキシ)カルボニル)(メチル)アミノ)エチル)(メチル)カルバモイル)オキシ)-4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチル-1-(3-スルホプロピル)ピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=1852.5200、Rt=2.29分(5分酸性法)。
4-(2-(4-(6-(3-(((2-((((2-(((((1-(2,5,8,11,14,17,20,23-オクタオキサペンタコサン-25-イル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)カルボニル)(メチル)アミノ)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)オキシ)カルボニル)(メチル)アミノ)エチル)(メチル)カルバモイル)オキシ)-4-フルオロフェニル)-4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチル-1-(3-スルホプロピル)ピペラジン-1-イウム(L12-P2)の合成
Figure 2022532918000551
4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(3-(((2-((((4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((メチル((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)カルボニル)アミノ)メチル)ベンジル)オキシ)カルボニル)(メチル)アミノ)エチル)(メチル)カルバモイル)オキシ)-4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチル-1-(3-スルホプロピル)ピペラジン-1-イウム(10mg、0.0054mmol、1.0当量)および25-アジド-2,5,8,11,14,17,20,23-オクタオキサペンタコサン(4.4mg、0.011mmol、2当量)を用いて一般手順2に従って、4-(2-(4-(6-(3-(((2-((((2-(((((1-(2,5,8,11,14,17,20,23-オクタオキサペンタコサン-25-イル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)カルボニル)(メチル)アミノ)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)オキシ)カルボニル)(メチル)アミノ)エチル)(メチル)カルバモイル)オキシ)-4-フルオロフェニル)-4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチル-1-(3-スルホプロピル)ピペラジン-1-イウム(L12-P2)を得た。HRMS:M+=2261.8601、Rt=2.24分(5分酸性法)。
4-(2-(4-(6-(3-((4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((メチル((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)カルボニル)アミノ)メチル)ベンジル)オキシ)-4-フルオロフェニル)-4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチル-1-(3-スルホプロピル)ピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000552
(R)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロ-3-ヒドロキシフェニル)-4-((1-メトキシ-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチル-1-(3-スルホプロピル)ピペラジン-1-イウム(40mg、0.039mmol、1.0当量)およびプロパ-2-イン-1-イル(5-((R)-2-((R)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(クロロメチル)ベンジル)(メチル)カルバメート(36.4mg、0.058mmol、1.5当量)を使用して一般手順1に従ったが、アルキル化が完了した後、2N LiOH(0.097mL、0.195mmol、5.0当量)を添加し、2時間撹拌した後、中和し、RP-HPLCにより精製するように改変した。凍結乾燥して、4-(2-(4-(6-(3-((4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((メチル((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)カルボニル)アミノ)メチル)ベンジル)オキシ)-4-フルオロフェニル)-4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチル-1-(3-スルホプロピル)ピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=1599.5856、Rt=1.34分(2分酸性法)。
4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(3-((4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((メチル((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)カルボニル)アミノ)メチル)ベンジル)オキシ)-4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチル-1-(3-スルホプロピル)ピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000553
4-(2-(4-(6-(3-((4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((メチル((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)カルボニル)アミノ)メチル)ベンジル)オキシ)-4-フルオロフェニル)-4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチル-1-(3-スルホプロピル)ピペラジン-1-イウム(46mg、0.029mmol、1.0当量)を用いて一般手順3に従って、4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(3-((4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((メチル((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)カルボニル)アミノ)メチル)ベンジル)オキシ)-4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチル-1-(3-スルホプロピル)ピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=1694.5699、Rt=2.55分(5分酸性法)。
4-(2-(4-(6-(3-((2-(((((1-(2,5,8,11,14,17,20,23-オクタオキサペンタコサン-25-イル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)カルボニル)(メチル)アミノ)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)オキシ)-4-フルオロフェニル)-4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチル-1-(3-スルホプロピル)ピペラジン-1-イウム(L4-P2)の合成
Figure 2022532918000554
4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(3-((4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((メチル((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)カルボニル)アミノ)メチル)ベンジル)オキシ)-4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチル-1-(3-スルホプロピル)ピペラジン-1-イウム(44mg、0.026mmol、1.0当量)および25-アジド-2,5,8,11,14,17,20,23-オクタオキサペンタコサン(21.2mg、0.052mmol、2当量)を用いて一般手順2に従って、4-(2-(4-(6-(3-((2-(((((1-(2,5,8,11,14,17,20,23-オクタオキサペンタコサン-25-イル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)カルボニル)(メチル)アミノ)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)オキシ)-4-フルオロフェニル)-4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチル-1-(3-スルホプロピル)ピペラジン-1-イウム(L4-P2)を得た。HRMS:M+=2103.8000、Rt=2.47分(5分酸性法)。
一般手順4:
1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(39-メチル-38-オキソ-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35-ドデカオキサ-39-アザテトラコンタン-40-イル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000555
DMF(1mL)に溶解した1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((メチルアミノ)メチル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(60mg、0.040mmol、1.0当量)および2,5-ジオキソピロリジン-1-イル2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35-ドデカオキサオクタトリアコンタン-38-オエート(35.7mg、0.052mmol、1.3当量)に、DIPEA(0.035mL、0.200mmol、5.0当量)を添加した。18時間静置した後、DMSO(2mL)を添加し、溶液をRP-HPLC ISCO goldクロマトグラフィー(10~70%MeCN/H2O、0.1%TFA修飾剤)により精製した。凍結乾燥して、1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(39-メチル-38-オキソ-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35-ドデカオキサ-39-アザテトラコンタン-40-イル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:[M+Na]+=2092.9399;Rt=2.88分(5分酸性法)。
4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(39-メチル-38-オキソ-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35-ドデカオキサ-39-アザテトラコンタン-40-イル)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(L32-P1)の合成
Figure 2022532918000556
1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(39-メチル-38-オキソ-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35-ドデカオキサ-39-アザテトラコンタン-40-イル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(43.4mg、0.021mmol、1当量)を用いて一般手順3に従って、4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(39-メチル-38-オキソ-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35-ドデカオキサ-39-アザテトラコンタン-40-イル)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:[M+Na]+=2066.8799;Rt=2.44分(5分酸性法)。
1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(51-メチル-50-オキソ-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47-ヘキサデカオキサ-51-アザドペンタコンタン-52-イル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000557
2,5-ジオキソピロリジン-1-イル2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47-ヘキサデカオキサペンタコンタン-50-オエート(44.8mg、0.021mmol、1当量)を用いて一般手順4に従って、1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(51-メチル-50-オキソ-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47-ヘキサデカオキサ-51-アザドペンタコンタン-52-イル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=2246.0400;Rt=2.88分(5分酸性法)。
4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(51-メチル-50-オキソ-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47-ヘキサデカオキサ-51-アザドペンタコンタン-52-イル)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(L31-P1)の合成
Figure 2022532918000558
1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(51-メチル-50-オキソ-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47-ヘキサデカオキサ-51-アザドペンタコンタン-52-イル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(47.5mg、0.021mmol、1当量)を用いて一般手順3に従って、4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(51-メチル-50-オキソ-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47-ヘキサデカオキサ-51-アザドペンタコンタン-52-イル)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=2221.0000;Rt=2.45分(5分酸性法)。
1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(75-メチル-74-オキソ-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68,71-テトラコサオキサ-75-アザヘキサヘプタコンタン-76-イル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000559
2,5-ジオキソピロリジン-1-イル2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68,71-テトラコサオキサテトラヘプタコンタン-74-オエート(52.6mg、0.043mmol、1.3当量)を用いて一般手順4に従って、1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(75-メチル-74-オキソ-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68,71-テトラコサオキサ-75-アザヘキサヘプタコンタン-76-イル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=2598.2500;Rt=2.88分(5分酸性法)。
4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(75-メチル-74-オキソ-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68,71-テトラコサオキサ-75-アザヘキサヘプタコンタン-76-イル)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(L30-P1)の合成
Figure 2022532918000560
1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(75-メチル-74-オキソ-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68,71-テトラコサオキサ-75-アザヘキサヘプタコンタン-76-イル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(38.8mg、0.014mmol、1当量)を用いて一般手順3に従って、4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(75-メチル-74-オキソ-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68,71-テトラコサオキサ-75-アザヘキサヘプタコンタン-76-イル)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=2573.2000;Rt=2.47分(5分酸性法)。
1-(2-(((S)-2-((((9H-フルオレン-9-イル)メトキシ)カルボニル)アミノ)-5-(tert-ブトキシ)-N-メチル-5-オキソペンタンアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000561
5-(tert-ブチル)1-(2,5-ジオキソピロリジン-1-イル)(((9H-フルオレン-9-イル)メトキシ)カルボニル)-L-グルタメート(39.0mg、0.075mmol、1.1当量)を用いて一般手順4に従って、1-(2-(((S)-2-((((9H-フルオレン-9-イル)メトキシ)カルボニル)アミノ)-5-(tert-ブトキシ)-N-メチル-5-オキソペンタンアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=1906.8101;Rt=3.03分(5分酸性法)。
1-(2-(((S)-2-アミノ-5-(tert-ブトキシ)-N-メチル-5-オキソペンタンアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000562
DMSO(2mL)に溶解した11-(2-(((S)-2-((((9H-フルオレン-9-イル)メトキシ)カルボニル)アミノ)-5-(tert-ブトキシ)-N-メチル-5-オキソペンタンアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(38.8mg、0.026mmol、1.0当量)に、ジメチルアミン(0.192mL、0.384mmol、20当量)を添加した。4時間静置した後、DMSO(2mL)を添加し、溶液をRP-HPLC ISCO goldクロマトグラフィー(10~70%MeCN/H2O、0.1%TFA修飾剤)により精製した。凍結乾燥して、1-(2-(((S)-2-アミノ-5-(tert-ブトキシ)-N-メチル-5-オキソペンタンアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=1684.4000;Rt=2.64分(5分酸性法)。
一般手順5
1-(2-(((R)-2-((((9H-フルオレン-9-イル)メトキシ)カルボニル)アミノ)-N-メチル-3-スルホプロパンアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000563
DMF(2mL)に溶解した(((9H-フルオレン-9-イル)メトキシ)カルボニル)(スルホ)-D-アラニン(55.2mg、0.141mmol、1.3当量)および2-(3H-[1,2,3]トリアゾロ[4,5-b]ピリジン-3-イル)-1,1,3,3-テトラメチルイソウロニウムヘキサフルオロホスフェート(V)(41.3mg、0.109mmol、1.0当量)に、DIPEA(0.024mL、0.138mmol、8.0当量)を添加した。10分間静置した後、1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((メチルアミノ)メチル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(200mg、0.109mmol、1.0当量)を添加した。2.5時間静置した後、DMSO(4mL)を添加し、溶液をRP-HPLC ISCO goldクロマトグラフィー(10~70%MeCN/H2O、0.1%TFA修飾剤)により精製した。凍結乾燥して、1-(2-(((R)-2-((((9H-フルオレン-9-イル)メトキシ)カルボニル)アミノ)-N-メチル-3-スルホプロパンアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=1872.7000;Rt=3.09分(5分酸性法)。
1-(2-(((R)-2-アミノ-N-メチル-3-スルホプロパンアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000564
THF(2mL)に溶解した1-(2-(((R)-2-((((9H-フルオレン-9-イル)メトキシ)カルボニル)アミノ)-N-メチル-3-スルホプロパンアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(173mg、0.087mmol、1.0当量)に、ジメチルアミン(0.870mL、1.740mmol、20当量)を添加した。5時間静置した後、すべての揮発物を真空中で除去した。固体をジエチルエーテルで摩砕した。DMSO(2mL)を添加し、溶液をRP-HPLC ISCO goldクロマトグラフィー(10~100%MeCN/H2O、0.1%TFA修飾剤)により精製した。凍結乾燥して、1-(2-(((R)-2-アミノ-N-メチル-3-スルホプロパンアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=1650.5800;Rt=2.71分(5分酸性法)。
1-(2-(((R)-2-アミノ-N-メチル-3-スルホプロパンアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(L70-P1)の合成
Figure 2022532918000565
1-(2-(((S)-2-アミノ-5-(tert-ブトキシ)-N-メチル-5-オキソペンタンアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(145mg、0.088mmol、1当量)を用いて一般手順3に従って、1-(2-(((R)-2-アミノ-N-メチル-3-スルホプロパンアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=1625.5601;Rt=2.32分(5分酸性法)。
一般手順6
1-(2-(((S)-5-(tert-ブトキシ)-N-メチル-5-オキソ-2-(2-スルホアセトアミド)ペンタンアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000566
DMF(1mL)に溶解した2-スルホ酢酸(4.83mg、0.035mmol、2.0当量)および2-(3H-[1,2,3]トリアゾロ[4,5-b]ピリジン-3-イル)-1,1,3,3-テトラメチルイソウロニウムヘキサフルオロホスフェート(V)(9.85mg、0.026mmol、1.5当量)に、DIPEA(0.024mL、0.138mmol、8.0当量)を添加した。10分間静置した後、1-(2-(((S)-2-アミノ-5-(tert-ブトキシ)-N-メチル-5-オキソペンタンアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(29.1mg、0.017mmol、1.0)を添加した。45分間静置した後、DMSO(2mL)を添加し、溶液をRP-HPLC ISCO goldクロマトグラフィー(10~70%MeCN/H2O、0.1%TFA修飾剤)により精製した。凍結乾燥して、1-(2-(((S)-5-(tert-ブトキシ)-N-メチル-5-オキソ-2-(2-スルホアセトアミド)ペンタンアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=1806.7000;Rt=3.10分(5分酸性法)。
4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(2-(((S)-4-カルボキシ-N-メチル-2-(2-スルホアセトアミド)ブタンアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(L71-P1)の合成
Figure 2022532918000567
1-(2-(((S)-5-(tert-ブトキシ)-N-メチル-5-オキソ-2-(2-スルホアセトアミド)ペンタンアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(23.7mg、0.011mmol、1当量)を用いて一般手順3に従って、4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(2-(((S)-4-カルボキシ-N-メチル-2-(2-スルホアセトアミド)ブタンアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=1725.5900;Rt=2.39分(5分酸性法)。
1-(2-((S)-40-(3-(tert-ブトキシ)-3-オキソプロピル)-42-メチル-38,41-ジオキソ-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35-ドデカオキサ-39,42-ジアザトリテトラコンタン-43-イル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000568
1-(2-(((S)-2-アミノ-5-(tert-ブトキシ)-N-メチル-5-オキソペンタンアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(30mg、0.018mmol、1.0当量)およびMal-PEG12-NHSエステル(18.31mg、0.027mmol、1.5当量)を用いて一般手順4に従って、1-(2-((S)-40-(3-(tert-ブトキシ)-3-オキソプロピル)-42-メチル-38,41-ジオキソ-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35-ドデカオキサ-39,42-ジアザトリテトラコンタン-43-イル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=2255.0400;Rt=2.97分(5分酸性法)。
4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(2-((S)-40-(2-カルボキシエチル)-42-メチル-38,41-ジオキソ-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35-ドデカオキサ-39,42-ジアザトリテトラコンタン-43-イル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(L72-P1)の合成
Figure 2022532918000569
1-(2-((S)-40-(3-(tert-ブトキシ)-3-オキソプロピル)-42-メチル-38,41-ジオキソ-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35-ドデカオキサ-39,42-ジアザトリテトラコンタン-43-イル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(20.1mg、8.91μmmol、1当量)を用いて一般手順3に従って、4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(2-((S)-40-(2-カルボキシエチル)-42-メチル-38,41-ジオキソ-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35-ドデカオキサ-39,42-ジアザトリテトラコンタン-43-イル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:[M]+=2173.9199;Rt=2.40分(5分酸性法)。
1-(2-((2-(ビス(2-(tert-ブトキシ)-2-オキソエチル)アミノ)-N-メチルアセトアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000570
1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((メチルアミノ)メチル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(17.0mg、0.011mmol、1.0当量)およびビス(2-(tert-ブトキシ)-2-オキソエチル)グリシン(10.97mg、0.017mmol、1.5当量)を用いて一般手順5に従って、1-(2-((2-(ビス(2-(tert-ブトキシ)-2-オキソエチル)アミノ)-N-メチルアセトアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=1784.8000;Rt=3.31分(5分酸性法)。
1-(2-((2-(ビス(カルボキシメチル)アミノ)-N-メチルアセトアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(L67-P1)の合成
Figure 2022532918000571
1-(2-((2-(ビス(2-(tert-ブトキシ)-2-オキソエチル)アミノ)-N-メチルアセトアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(9.2mg、5.12μmmol、1当量)を用いて一般手順3に従って、1-(2-((2-(ビス(カルボキシメチル)アミノ)-N-メチルアセトアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=1647.6100;Rt=2.28分(5分酸性法)。
一般手順7
1-(2-(((S)-3-アミノ-4-(tert-ブトキシ)-N-メチル-4-オキソブタンアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000572
試薬は、DMFストック溶液として使用した。(S)-3-((((9H-フルオレン-9-イル)メトキシ)カルボニル)アミノ)-4-(tert-ブトキシ)-4-オキソブタン酸(8.04mg、161μL、0.020mmol、1.2当量)および2-(3H-[1,2,3]トリアゾロ[4,5-b]ピリジン-3-イル)-1,1,3,3-テトラメチルイソウロニウムヘキサフルオロホスフェート(V)(6.81mg、681μL、0.018mmol、1.1当量)に、DIPEA(22.68μL、0.130mmol、8.0当量)を添加した。10分間静置した後、1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((メチルアミノ)メチル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(30mg、353μL、0.016mmol、1.0当量)を添加した。45分間静置した後、ジメチルアミン(163μl、0.326mmol)を添加した。16時間静置した後、DMSO(2mL)を添加し、溶液をRP-HPLC ISCO goldクロマトグラフィー(10~100%MeCN/H2O、0.1%TFA修飾剤)により精製した。凍結乾燥して、1-(2-(((S)-3-アミノ-4-(tert-ブトキシ)-N-メチル-4-オキソブタンアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=1670.2300;Rt=2.69分(5分酸性法)。
1-(2-(((S)-4-(tert-ブトキシ)-N-メチル-4-オキソ-3-(2-スルホアセトアミド)ブタンアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000573
1-(2-(((S)-3-アミノ-4-(tert-ブトキシ)-N-メチル-4-オキソブタンアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(20.6mg、10.23μmol、1当量)を用いて一般手順6に従って、1-(2-(((S)-4-(tert-ブトキシ)-N-メチル-4-オキソ-3-(2-スルホアセトアミド)ブタンアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=1792.6899;Rt=3.17分(5分酸性法)。
4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(2-(((S)-3-カルボキシ-N-メチル-3-(2-スルホアセトアミド)プロパンアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(L79-P1)の合成
Figure 2022532918000574
1-(2-(((S)-4-(tert-ブトキシ)-N-メチル-4-オキソ-3-(2-スルホアセトアミド)ブタンアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(25.3mg、0.012mmol、1当量)を用いて一般手順3に従って、4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(2-(((S)-3-カルボキシ-N-メチル-3-(2-スルホアセトアミド)プロパンアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=1711.5699;Rt=2.48分(5分酸性法)。
4-ベンジル1-(tert-ブチル)((3-(tert-ブトキシ)-3-オキソプロポキシ)カルボニル)-L-アスパルテートの合成
Figure 2022532918000575
DMF(2mL)に溶解したtert-ブチル3-ヒドロキシプロパノエート(111mg、0.760mmol、1当量)およびビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(289mg、0.950mmol、1.2当量)に、DIPEA(0.221mL、1.267mmol、2.0当量)を添加した。1時間静置した後、4-ベンジル1-(tert-ブチル)L-アスパルテート(200mg、0.633mmol)を添加した。16時間静置した後、DMSO(4mL)を添加し、溶液をRP-HPLC ISCO goldクロマトグラフィー(10~100%MeCN/H2O、0.1%TFA修飾剤)により精製した。凍結乾燥して、4-ベンジル1-(tert-ブチル)((3-(tert-ブトキシ)-3-オキソプロポキシ)カルボニル)-L-アスパルテートを得た。HRMS:[M+H]+=452.4;Rt=2.68分(5分酸性法)。
((S)-4-(tert-ブトキシ)-3-(((3-(tert-ブトキシ)-3-オキソプロポキシ)カルボニル)アミノ)-4-オキソブタン酸の合成
Figure 2022532918000576
MeOH(2mL)に溶解した4-ベンジル1-(tert-ブチル)((3-(tert-ブトキシ)-3-オキソプロポキシ)カルボニル)-L-アスパルテート(52.7mg、0.117mmol)に、水酸化パラジウム(8.20mg、0.012mmol、0.1当量)を添加した。反応雰囲気を水素に切り替えた。16時間撹拌した後、反応混合物をceliteパッドに通して濾過した。濾液を真空中で除去して、4-ベンジル1-(tert-ブチル)((3-(tert-ブトキシ)-3-オキソプロポキシ)カルボニル)-L-アスパルテートを得た。
1-(2-((S)-5-(tert-ブトキシカルボニル)-2,13,13-トリメチル-3,7,11-トリオキソ-8,12-ジオキサ-2,6-ジアザテトラデシル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000577
1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((メチルアミノ)メチル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(20mg、235μL、0.011mmol、1当量)および4-ベンジル1-(tert-ブチル)((3-(tert-ブトキシ)-3-オキソプロポキシ)カルボニル)-L-アスパルテート(7.84mg、204μL、0.022mmol、2当量)を用いて一般手順7に従って、1-(2-((S)-5-(tert-ブトキシカルボニル)-2,13,13-トリメチル-3,7,11-トリオキソ-8,12-ジオキサ-2,6-ジアザテトラデシル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=1842.8000;Rt=3.23分(5分酸性法)。
4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(2-(((S)-3-カルボキシ-3-(((2-カルボキシエトキシ)カルボニル)アミノ)-N-メチルプロパンアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(L102-P1)の合成
Figure 2022532918000578
1-(2-((S)-5-(tert-ブトキシカルボニル)-2,13,13-トリメチル-3,7,11-トリオキソ-8,12-ジオキサ-2,6-ジアザテトラデシル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(17.6mg、0.008mmol、1当量)を用いて一般手順3に従って、4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(2-(((S)-3-カルボキシ-3-(((2-カルボキシエトキシ)カルボニル)アミノ)-N-メチルプロパンアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=1705.6200;Rt=2.41分(5分酸性法)。
tert-ブチルN-(((9H-フルオレン-9-イル)メトキシ)カルボニル)-O-((4-ニトロフェノキシ)カルボニル)-L-セリネートの合成
Figure 2022532918000579
DMF(2mL)に溶解したtert-ブチル(((9H-フルオレン-9-イル)メトキシ)カルボニル)-L-セリネート(300mg、0.782mmol、1当量)およびビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(357mg、1.174mmol、1.5当量)に、DIPEA(0.136mL、0.782mmol、1.0当量)を添加した。16時間静置した後、DMSO(4mL)を添加し、溶液をRP-HPLC ISCO goldクロマトグラフィー(10~100%MeCN/H2O、0.1%TFA修飾剤)により精製した。凍結乾燥して、tert-ブチルN-(((9H-フルオレン-9-イル)メトキシ)カルボニル)-O-((4-ニトロフェノキシ)カルボニル)-L-セリネートを得た。HRMS:M+=566.4;Rt=3.01分(5分酸性法)。
1-(2-(((((S)-2-アミノ-3-(tert-ブトキシ)-3-オキソプロポキシ)カルボニル)(メチル)アミノ)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000580
tert-ブチルN-(((9H-フルオレン-9-イル)メトキシ)カルボニル)-O-((4-ニトロフェノキシ)カルボニル)-L-セリネート(7.14mg、143μL、0.013mmol、1.2当量)および1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((メチルアミノ)メチル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(20mg、235μL、0.011mmol、1.0当量)に、DIPEA(15.1μL、0.087mmol、8.0当量)を添加した。16時間静置した後、ジメチルアミン(109μl、0.217mmol、20当量)を添加した。反応物を室温で1時間撹拌した。DMSO(4mL)を添加し、溶液をRP-HPLC ISCO goldクロマトグラフィー(10~100%MeCN/H2O、0.1%TFA修飾剤)により精製した。凍結乾燥して、1-(2-(((((S)-2-アミノ-3-(tert-ブトキシ)-3-オキソプロポキシ)カルボニル)(メチル)アミノ)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=1686.7200;Rt=2.71分(5分酸性法)。
1-(2-(((((S)-3-(tert-ブトキシ)-3-オキソ-2-(2-スルホアセトアミド)プロポキシ)カルボニル)(メチル)アミノ)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000581
1-(2-(((((S)-2-アミノ-3-(tert-ブトキシ)-3-オキソプロポキシ)カルボニル)(メチル)アミノ)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(22.9mg、0.011mmol、1当量)を用いて一般手順6に従って、1-(2-(((((S)-3-(tert-ブトキシ)-3-オキソ-2-(2-スルホアセトアミド)プロポキシ)カルボニル)(メチル)アミノ)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=1808.6899;Rt=3.18分(5分酸性法)。
4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(2-(((((S)-2-カルボキシ-2-(2-スルホアセトアミド)エトキシ)カルボニル)(メチル)アミノ)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(L77-P1)の合成
Figure 2022532918000582
1-(2-(((((S)-2-アミノ-3-(tert-ブトキシ)-3-オキソプロポキシ)カルボニル)(メチル)アミノ)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(15.3mg、7.11μmol、1当量)を用いて一般手順3に従って、4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(2-(((((S)-2-カルボキシ-2-(2-スルホアセトアミド)エトキシ)カルボニル)(メチル)アミノ)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=1727.5800;Rt=2.47分(5分酸性法)。
4-ベンジル1-(tert-ブチル)(4-(ジエトキシホスホリル)ブタノイル)-L-アスパルテートの合成
Figure 2022532918000583
DMF(2mL)に溶解した4-ベンジル1-(tert-ブチル)L-アスパルテート(200mg、0.633mmol、1.0当量)および4-(ジエトキシホスホリル)ブタン酸(213mg、0.950mmol、1.5当量)に、ジシクロヘキシルメタンジイミン(157mg、0.760mmol、1.2当量)、1H-[1,2,3]トリアゾロ[4,5-b]ピリジン-1-オール水和物(146mg、0.950mmol、1.5当量)およびDIPEA(0.110mL、0.633mmol、1.0当量)を添加した。16時間静置した後、DMSO(4mL)を添加し、溶液をRP-HPLC ISCO goldクロマトグラフィー(10~100%MeCN/H2O、0.1%TFA修飾剤)により精製した。凍結乾燥して、4-ベンジル1-(tert-ブチル)(4-(ジエトキシホスホリル)ブタノイル)-L-アスパルテートを得た。HRMS:[M+H]+=486.4;Rt=2.15分(5分酸性法)。
(S)-4-(tert-ブトキシ)-3-(4-(ジエトキシホスホリル)ブタンアミド)-4-オキソブタン酸の合成
Figure 2022532918000584
MeOH(2mL)に溶解した4-ベンジル1-(tert-ブチル)(4-(ジエトキシホスホリル)ブタノイル)-L-アスパルテート(YUBI5-040-EXP082-001)(100mg、0.206mmol、1.0当量)に、水酸化パラジウム(14.46mg、0.021mmol、0.1当量)を添加した。反応雰囲気を水素に切り替えた。16時間撹拌した後、反応混合物をceliteパッドに通して濾過した。濾液を真空中で除去して、(S)-4-(tert-ブトキシ)-3-(4-(ジエトキシホスホリル)ブタンアミド)-4-オキソブタン酸を得た。HRMS:[M+H]+=396.3;Rt=1.35分(5分酸性法)。
1-(2-(((S)-4-(tert-ブトキシ)-3-(4-(ジエトキシホスホリル)ブタンアミド)-N-メチル-4-オキソブタンアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000585
1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((メチルアミノ)メチル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(30mg、353μL、0.016mmol、1当量)および(S)-4-(tert-ブトキシ)-3-(4-(ジエトキシホスホリル)ブタンアミド)-4-オキソブタン酸(12.87mg、161μl、0.033mmol、2当量)を用いて一般手順7に従って、1-(2-(((S)-4-(tert-ブトキシ)-3-(4-(ジエトキシホスホリル)ブタンアミド)-N-メチル-4-オキソブタンアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。MS:M/2+=940.3;Rt=2.60分(5分酸性法)。
4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(2-(((S)-3-カルボキシ-3-(4-(ジエトキシホスホリル)ブタンアミド)-N-メチルプロパンアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(L103-P1)の合成
Figure 2022532918000586
1-(2-(((S)-4-(tert-ブトキシ)-3-(4-(ジエトキシホスホリル)ブタンアミド)-N-メチル-4-オキソブタンアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(20mg、0.009mmol、1当量)を用いて一般手順3に従って、4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(2-(((S)-3-カルボキシ-3-(4-(ジエトキシホスホリル)ブタンアミド)-N-メチルプロパンアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=1795.6700;Rt=2.44分(5分酸性法)。
1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(((S)-2,6-ジアミノ-N-メチルヘキサンアミド)メチル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000587
1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((メチルアミノ)メチル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(20mg、0.011mmol、1当量)および(S)-2,5-ビス((((9H-フルオレン-9-イル)メトキシ)カルボニル)アミノ)ペンタン酸(7.51mg、0.013mmol、1.2当量)を用いて一般手順7に従って、1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(((S)-2,6-ジアミノ-N-メチルヘキサンアミド)メチル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=1627.4000;Rt=2.48分(5分酸性法)。
1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(((S)-N-メチル-2,6-ビス(2-スルホアセトアミド)ヘキサンアミド)メチル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000588
1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(((S)-2,6-ジアミノ-N-メチルヘキサンアミド)メチル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(9.7mg、0.0049mmol、1当量)を用いて一般手順6に従って、1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(((S)-N-メチル-2,6-ビス(2-スルホアセトアミド)ヘキサンアミド)メチル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=1871.6700;Rt=3.02分(5分酸性法)。
4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(((S)-N-メチル-2,6-ビス(2-スルホアセトアミド)ヘキサンアミド)メチル)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(L78-P1)の合成
Figure 2022532918000589
-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(((S)-N-メチル-2,6-ビス(2-スルホアセトアミド)ヘキサンアミド)メチル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(15mg、7.55μmol、1当量)を用いて一般手順3に従って、4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(((S)-N-メチル-2,6-ビス(2-スルホアセトアミド)ヘキサンアミド)メチル)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=1846.6000;Rt=2.49分(5分酸性法)。
4-ベンジル1-(tert-ブチル)((2S,3S,4S,5R,6S)-3,4,5,6-テトラアセトキシテトラヒドロ-2H-ピラン-2-カルボニル)-L-アスパルテートの合成
Figure 2022532918000590
DMF(3.2mL)に溶解した(2S,3S,4S,5R,6S)-3,4,5,6-テトラアセトキシテトラヒドロ-2H-ピラン-2-カルボン酸(344mg、0.950mmol)および4-ベンジル1-(tert-ブチル)L-アスパルテート(300mg、0.950mmol)に、DIPEA(0.165mL、0.950mmol、1.0当量)を添加し、1H-[1,2,3]トリアゾロ[4,5-b]ピリジン-1-オール水和物(154mg、0.997mmol、1.05当量)および3-(((エチルイミノ)メチレン)アミノ)-N,N-ジメチルプロパン-1-アミン塩酸塩(191mg、0.997mmol、1.05当量)を添加した。16時間静置した後、DMSO(4mL)を添加し、溶液をRP-HPLC ISCO goldクロマトグラフィー(10~70%MeCN/H2O、0.1%TFA修飾剤)により精製した。凍結乾燥して、4-ベンジル1-(tert-ブチル)((2S,3S,4S,5R,6S)-3,4,5,6-テトラアセトキシテトラヒドロ-2H-ピラン-2-カルボニル)-L-アスパルテートを得た。HRMS:M+=641.5;Rt=2.55分(5分酸性法)。
(S)-4-(tert-ブトキシ)-4-オキソ-3-((2S,3S,4S,5R,6S)-3,4,5,6-テトラアセトキシテトラヒドロ-2H-ピラン-2-カルボキサミド)ブタン酸の合成
Figure 2022532918000591
MeOH(2mL)に溶解した4-ベンジル1-(tert-ブチル)((2S,3S,4S,5R,6S)-3,4,5,6-テトラアセトキシテトラヒドロ-2H-ピラン-2-カルボニル)-L-アスパルテート(100mg、0.160mmol、1.0当量)に、水酸化パラジウム(11.26mg、0.016mmol、0.1当量)を添加した。反応雰囲気を水素に切り替えた。16時間撹拌した後、反応混合物をceliteパッドに通して濾過した。濾液を真空中で除去して、(S)-4-(tert-ブトキシ)-4-オキソ-3-((2S,3S,4S,5R,6S)-3,4,5,6-テトラアセトキシテトラヒドロ-2H-ピラン-2-カルボキサミド)ブタン酸を得た。HRMS:[M-H]-=532.3、Rt=1.71分(5分酸性法)。
1-(2-(((S)-4-(tert-ブトキシ)-N-メチル-4-オキソ-3-((2R,3R,4R,5S,6R)-3,4,5,6-テトラアセトキシテトラヒドロ-2H-ピラン-2-カルボキサミド)ブタンアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000592
1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((メチルアミノ)メチル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(30mg、0.016mmol、1.0当量)および(S)-4-(tert-ブトキシ)-4-オキソ-3-((2S,3S,4S,5R,6S)-3,4,5,6-テトラアセトキシテトラヒドロ-2H-ピラン-2-カルボキサミド)ブタン酸(12.2mg、968μL、0.023mmol、1.4当量)を用いて一般手順7に従って、1-(2-(((S)-4-(tert-ブトキシ)-N-メチル-4-オキソ-3-((2R,3R,4R,5S,6R)-3,4,5,6-テトラアセトキシテトラヒドロ-2H-ピラン-2-カルボキサミド)ブタンアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=2014.7800;Rt=3.21分(5分酸性法)。
1-(4-((S)-2-((S)-2-アミノ-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(((S)-3-カルボキシ-N-メチル-3-((2R,3R,4R,5S,6R)-3,4,5,6-テトラアセトキシテトラヒドロ-2H-ピラン-2-カルボキサミド)プロパンアミド)メチル)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000593
DCM(32mL)に溶解した1-(2-(((S)-4-(tert-ブトキシ)-N-メチル-4-オキソ-3-((2R,3R,4R,5S,6R)-3,4,5,6-テトラアセトキシテトラヒドロ-2H-ピラン-2-カルボキサミド)ブタンアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(22.7mg、0.009mmol、1.0当量)に、TFA(0.67mL)を添加した。45分間撹拌した後、溶媒を真空中で除去して、1-(4-((S)-2-((S)-2-アミノ-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(((S)-3-カルボキシ-N-メチル-3-((2R,3R,4R,5S,6R)-3,4,5,6-テトラアセトキシテトラヒドロ-2H-ピラン-2-カルボキサミド)プロパンアミド)メチル)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=1738.6200;Rt=2.30分(5分酸性法)。
1-(4-((S)-2-((S)-2-アミノ-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(((S)-3-カルボキシ-N-メチル-3-((2R,3R,4R,5S,6S)-3,4,5,6-テトラヒドロキシテトラヒドロ-2H-ピラン-2-カルボキサミド)プロパンアミド)メチル)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000594
THF(1mL)およびMeOH(1mL)に溶解した1-(4-((S)-2-((S)-2-アミノ-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(((S)-3-カルボキシ-N-メチル-3-((2R,3R,4R,5S,6R)-3,4,5,6-テトラアセトキシテトラヒドロ-2H-ピラン-2-カルボキサミド)プロパンアミド)メチル)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(22.7mg、0.009mmol、1.0当量)に、水酸化リチウム(5.04mg、0.120mmol、10当量)を添加した。2時間撹拌した後、溶媒を真空中で除去した。水(1mL)、TFA(0.2mL)、MeCN(1mL)およびDMSO(4mL)を添加し、溶液をRP-HPLC ISCO goldクロマトグラフィー(10~70%MeCN/H2O、0.1%TFA修飾剤)により精製した。凍結乾燥して、1-(4-((S)-2-((S)-2-アミノ-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(((S)-3-カルボキシ-N-メチル-3-((2R,3R,4R,5S,6S)-3,4,5,6-テトラヒドロキシテトラヒドロ-2H-ピラン-2-カルボキサミド)プロパンアミド)メチル)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=1570.5900;Rt=2.02分(5分酸性法)。
4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(2-(((S)-3-カルボキシ-N-メチル-3-((2R,3R,4R,5S,6S)-3,4,5,6-テトラヒドロキシテトラヒドロ-2H-ピラン-2-カルボキサミド)プロパンアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(L68-P1)の合成
Figure 2022532918000595
DMF(1mL)に溶解した1-(4-((S)-2-((S)-2-アミノ-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(((S)-3-カルボキシ-N-メチル-3-((2R,3R,4R,5S,6S)-3,4,5,6-テトラヒドロキシテトラヒドロ-2H-ピラン-2-カルボキサミド)プロパンアミド)メチル)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(10.8mg、0.0056mmol、1.0当量)および2,5-ジオキソピロリジン-1-イル3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパノエート(5.25mg、0.017mmol、3.5当量)に、DIPEA(7.86μL、0.045mmol、8当量)を添加した。1.5時間静置した後、DMSO(2mL)を添加し、溶液をRP-HPLC ISCO goldクロマトグラフィー(10~70%MeCN/H2O、0.1%TFA修飾剤)により精製した。凍結乾燥して、4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(2-(((S)-3-カルボキシ-N-メチル-3-((2R,3R,4R,5S,6S)-3,4,5,6-テトラヒドロキシテトラヒドロ-2H-ピラン-2-カルボキサミド)プロパンアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=1765.6500;Rt=2.31分(5分酸性法)。
4-ベンジル1-(tert-ブチル)((((3R,4S,5S,6S)-3,4,5-トリアセトキシ-6-(メトキシカルボニル)テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)オキシ)カルボニル)-L-アスパルテートの合成
Figure 2022532918000596
DMF(2mL)に溶解した((3R,4S,5S,6S)-2-ヒドロキシ-6-(メトキシカルボニル)テトラヒドロ-2H-ピラン-3,4,5-トリイルトリアセテート(254mg、0.760mmol、1.2当量)およびビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(289mg、0.950mmol、1.5当量)に、DIPEA(0.221mL、1.267mmol、2.0当量)を添加した。1時間静置した後、4-ベンジル1-(tert-ブチル)L-アスパルテート(200mg、0.633mmol、1.0当量)を添加した。16時間静置した後、DMSO(6mL)を添加し、溶液をRP-HPLC ISCO goldクロマトグラフィー(10~70%MeCN/H2O、0.1%TFA修飾剤)により精製した。凍結乾燥して、4-ベンジル1-(tert-ブチル)((((3R,4S,5S,6S)-3,4,5-トリアセトキシ-6-(メトキシカルボニル)テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)オキシ)カルボニル)-L-アスパルテートを得た。HRMS:[M-H]-=638.4;Rt=2.61分(5分酸性法)。
(3S)-4-(tert-ブトキシ)-4-オキソ-3-(((((3R,4S,5S,6S)-3,4,5-トリアセトキシ-6-(メトキシカルボニル)テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)オキシ)カルボニル)アミノ)ブタン酸の合成
Figure 2022532918000597
MeOH(2mL)に溶解した4-ベンジル1-(tert-ブチル)((((3R,4S,5S,6S)-3,4,5-トリアセトキシ-6-(メトキシカルボニル)テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)オキシ)カルボニル)-L-アスパルテート(50mg、0.078mmol、1.0当量)に、水酸化パラジウム(5.49mg、7.82μmol、0.1当量)を添加した。反応雰囲気を水素に切り替えた。16時間撹拌した後、反応混合物をceliteパッドに通して濾過した。濾液を真空中で除去して、(3S)-4-(tert-ブトキシ)-4-オキソ-3-(((((3R,4S,5S,6S)-3,4,5-トリアセトキシ-6-(メトキシカルボニル)テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)オキシ)カルボニル)アミノ)ブタン酸を得た。HRMS:[M-H]-:548.4、Rt=1.79分(5分酸性法)。
1-(2-(((3S)-4-(tert-ブトキシ)-N-メチル-4-オキソ-3-(((((3R,4S,5S,6S)-3,4,5-トリアセトキシ-6-(メトキシカルボニル)テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)オキシ)カルボニル)アミノ)ブタンアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000598
1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((メチルアミノ)メチル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(30mg、0.016mmol、1.0当量)および(3S)-4-(tert-ブトキシ)-4-オキソ-3-(((((3R,4S,5S,6S)-3,4,5-トリアセトキシ-6-(メトキシカルボニル)テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)オキシ)カルボニル)アミノ)ブタン酸(12.5mg、0.250mL、0.023mmol、1.4当量)を用いて一般手順7に従って、1-(2-(((3S)-4-(tert-ブトキシ)-N-メチル-4-オキソ-3-(((((3R,4S,5S,6S)-3,4,5-トリアセトキシ-6-(メトキシカルボニル)テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)オキシ)カルボニル)アミノ)ブタンアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=2030.7900;Rt=3.19分(5分酸性法)。
1-(4-((S)-2-((S)-2-アミノ-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(((3S)-3-カルボキシ-N-メチル-3-(((((3R,4S,5S,6S)-3,4,5-トリアセトキシ-6-(メトキシカルボニル)テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)オキシ)カルボニル)アミノ)プロパンアミド)メチル)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000599
DCM(2mL)に溶解した1-(2-(((3S)-4-(tert-ブトキシ)-N-メチル-4-オキソ-3-(((((3R,4S,5S,6S)-3,4,5-トリアセトキシ-6-(メトキシカルボニル)テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)オキシ)カルボニル)アミノ)ブタンアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(25.8mg、10.86μmol、1.0当量)に、TFA(0.67mL)を添加した。2時間撹拌した後、溶媒を真空中で除去して、1-(4-((S)-2-((S)-2-アミノ-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(((3S)-3-カルボキシ-N-メチル-3-(((((3R,4S,5S,6S)-3,4,5-トリアセトキシ-6-(メトキシカルボニル)テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)オキシ)カルボニル)アミノ)プロパンアミド)メチル)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=1754.6200;Rt=2.31分(5分酸性法)。
1-(4-((S)-2-((S)-2-アミノ-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(((3S)-3-カルボキシ-3-(((((3R,4S,5S,6S)-6-カルボキシ-3,4,5-トリヒドロキシテトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)オキシ)カルボニル)アミノ)-N-メチルプロパンアミド)メチル)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000600
THF(1mL)およびMeOH(1mL)に溶解した1-(4-((S)-2-((S)-2-アミノ-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(((3S)-3-カルボキシ-N-メチル-3-(((((3R,4S,5S,6S)-3,4,5-トリアセトキシ-6-(メトキシカルボニル)テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)オキシ)カルボニル)アミノ)プロパンアミド)メチル)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(26mg、0.012mmol、1.0当量)に、水酸化リチウム(5.20mg、0.124mmol、10当量)を添加した。2時間撹拌した後、溶媒を真空中で除去した。水(1mL)、TFA(0.2mL)、MeCN(1mL)およびDMSO(4mL)を添加し、溶液をRP-HPLC ISCO goldクロマトグラフィー(10~70%MeCN/H2O、0.1%TFA修飾剤)により精製した。凍結乾燥して、1-(4-((S)-2-((S)-2-アミノ-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(((3S)-3-カルボキシ-3-(((((3R,4S,5S,6S)-6-カルボキシ-3,4,5-トリヒドロキシテトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)オキシ)カルボニル)アミノ)-N-メチルプロパンアミド)メチル)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=1614.5800;Rt=2.04分(5分酸性法)。
4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(2-(((3S)-3-カルボキシ-3-(((((3R,4S,5S,6S)-6-カルボキシ-3,4,5-トリヒドロキシテトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)オキシ)カルボニル)アミノ)-N-メチルプロパンアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(L69-P1)の合成
Figure 2022532918000601
DMF(1mL)に溶解した1-(4-((S)-2-((S)-2-アミノ-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(((3S)-3-カルボキシ-3-(((((3R,4S,5S,6S)-6-カルボキシ-3,4,5-トリヒドロキシテトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)オキシ)カルボニル)アミノ)-N-メチルプロパンアミド)メチル)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(10mg、5.11μmol、1.0当量)および2,5-ジオキソピロリジン-1-イル3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパノエート(4.75mg、0.015mmol、3.5当量)に、DIPEA(7.12μl、0.041mmol、8当量)を添加した。1.5時間静置した後、DMSO(2mL)を添加し、溶液をRP-HPLC ISCO goldクロマトグラフィー(10~70%MeCN/H2O、0.1%TFA修飾剤)により精製した。凍結乾燥して、4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(2-(((3S)-3-カルボキシ-3-(((((3R,4S,5S,6S)-6-カルボキシ-3,4,5-トリヒドロキシテトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)オキシ)カルボニル)アミノ)-N-メチルプロパンアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=1809.6300;Rt=2.32分(5分酸性法)。
1-(2-((3-(2-(2-アミノエトキシ)エトキシ)-N-メチルプロパンアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000602
DMF(1mL)中の1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((メチルアミノ)メチル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(45mg、0.026mmol)、1-(9H-フルオレン-9-イル)-3-オキソ-2,7,10-トリオキサ-4-アザトリデカン-13-酸(12mg、0.030mmol)、HBTU(12mg、0.032mmol)、およびDIPEA(0.023mL、0.13mmol)の混合物を、室温で30分間撹拌した。MeNH(THF中2M、0.065mL、0.13mmol)を添加し、混合物を室温で1時間撹拌した。追加量のMeNH(THF中2M、0.1mL、0.2mmol)を添加した。混合物を室温で1時間撹拌し続け、DMSO(3mL)で希釈し、溶液をRP-HPLC ISCO goldクロマトグラフィー(MeCN/HO、0.1%TFA修飾剤)により精製した。凍結乾燥して、1-(2-((3-(2-(2-アミノエトキシ)エトキシ)-N-メチルプロパンアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=1658.7200、Rt=2.57分(5分酸性法)。
1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(2-メチル-3,13-ジオキソ-15-ホスホノ-6,9-ジオキサ-2,12-ジアザペンタデシル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000603
DMF(0.5mL)中の3-ホスホプロピオン酸(11mg、0.071mmol)、HBTU(27mg、0.071mmol)、およびDIPEA(0.060mL、0.34mmol)の混合物を、室温で10分間撹拌した。この混合物を、DMF(0.5mL)中の1-(2-((3-(2-(2-アミノエトキシ)エトキシ)-N-メチルプロパンアミド)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(40mg、0.021mmol)およびDIPEA(0.010mL、0.057mmol)の溶液に添加した。混合物を室温で2日間撹拌した。混合物をDMSO(3mL)で希釈し、溶液をRP-HPLC ISCO goldクロマトグラフィー(MeCN/HO、0.1%TFA修飾剤)により精製した。凍結乾燥して、1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(2-メチル-3,13-ジオキソ-15-ホスホノ-6,9-ジオキサ-2,12-ジアザペンタデシル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=1794.7100、Rt=2.78分(5分酸性法)。
4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(2-メチル-3,13-ジオキソ-15-ホスホノ-6,9-ジオキサ-2,12-ジアザペンタデシル)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(L41-P1)の合成
Figure 2022532918000604
1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(2-メチル-3,13-ジオキソ-15-ホスホノ-6,9-ジオキサ-2,12-ジアザペンタデシル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを用いて一般手順3に従って(TFA/CHClによる第1のステップ後の生成物を、RP-HPLC ISCO goldクロマトグラフィー[MeCN/HO、0.1%NHOH修飾剤]により精製したことを除く)、4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(2-メチル-3,13-ジオキソ-15-ホスホノ-6,9-ジオキサ-2,12-ジアザペンタデシル)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=1769.4500、Rt=2.33分(5分酸性法)。
1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,44,44-ペンタデカメチル-3,6,9,12,15,18,21,24,27,30,33,36,39,42-テトラデカオキソ-43-オキサ-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38-トリデカアザペンタテトラコンチル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000605
DMF(0.25mL)中の1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((メチルアミノ)メチル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(43.6mg、0.025mmol、1.0当量)、3,6,9,12,15,18,21,24,27,30,33,36,42,42-テトラデカメチル-4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40-トリデカオキソ-41-オキサ-3,6,9,12,15,18,21,24,27,30,33,36-ドデカアザトリテトラコンタン酸(25.9mg、0.025mmol、1.0当量)、およびHATU(10.5mg、0.028mmol、1.1当量)の撹拌溶液に、DIPEA(22μL、0.126mmol、5.0当量)を添加した。得られた溶液を周囲温度で1時間撹拌した。反応物を1mLのDMSOで希釈し、RP-HPLC ISCO goldクロマトグラフィー(10~100%MeCN/H2O、0.1%TFA修飾剤)により精製した。凍結乾燥して、1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,44,44-ペンタデカメチル-3,6,9,12,15,18,21,24,27,30,33,36,39,42-テトラデカオキソ-43-オキサ-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38-トリデカアザペンタテトラコンチル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS M+ 2508.1499 Rt=2.78分(5分酸性法)。
1-(2-(41-カルボキシ-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38-トリデカメチル-3,6,9,12,15,18,21,24,27,30,33,36,39-トリデカオキソ-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38-トリデカアザヘンテトラコンチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(L35-P1)の合成
Figure 2022532918000606
1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,44,44-ペンタデカメチル-3,6,9,12,15,18,21,24,27,30,33,36,39,42-テトラデカオキソ-43-オキサ-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38-トリデカアザペンタテトラコンチル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(50.4mg、0.019mmol、1.0当量)を用いて一般手順3に従って、1-(2-(41-カルボキシ-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38-トリデカメチル-3,6,9,12,15,18,21,24,27,30,33,36,39-トリデカオキソ-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38-トリデカアザヘンテトラコンチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+ 2427.0400、rt=2.30分(5分酸性法)。
1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,62,62-ヘンイコサメチル-3,6,9,12,15,18,21,24,27,30,33,36,39,42,45,48,51,54,57,60-イコサオキソ-61-オキサ-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56-ノナデカアザトリヘキサコンチル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000607
DMF(0.25mL)中の1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((メチルアミノ)メチル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(31.9mg、0.018mmol、1.0当量)、3,6,9,12,15,18,21,24,27,30,33,36,39,42,45,48,51,54,60,60-イコサメチル-4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49,52,55,58-ノナデカオキソ-59-オキサ-3,6,9,12,15,18,21,24,27,30,33,36,39,42,45,48,51,54-オクタデカアザヘンヘキサコンタン酸(26.8mg、0.018mmol、1.0当量)、およびHATU(7.7mg、0.020mmol、1.1当量)の撹拌溶液に、DIPEA(16μL、0.092mmol、5.0当量)を添加した。得られた溶液を周囲温度で1時間撹拌した。反応物を1mLのDMSOで希釈し、RP-HPLC ISCO goldクロマトグラフィー(10~100%MeCN/H2O、0.1%TFA修飾剤)により精製した。凍結乾燥して、1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,62,62-ヘンイコサメチル-3,6,9,12,15,18,21,24,27,30,33,36,39,42,45,48,51,54,57,60-イコサオキソ-61-オキサ-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56-ノナデカアザトリヘキサコンチル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS M+ 2934.3601 Rt=2.73分(5分酸性法)。
1-(2-(59-カルボキシ-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56-ノナデカメチル-3,6,9,12,15,18,21,24,27,30,33,36,39,42,45,48,51,54,57-ノナデカオキソ-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56-ノナデカアザノナペンタコンチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(L36-P1)の合成
Figure 2022532918000608
1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,62,62-ヘンイコサメチル-3,6,9,12,15,18,21,24,27,30,33,36,39,42,45,48,51,54,57,60-イコサオキソ-61-オキサ-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56-ノナデカアザトリヘキサコンチル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(45.5mg、0.015mmol、1.0当量)を用いて一般手順3に従って、1-(2-(59-カルボキシ-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56-ノナデカメチル-3,6,9,12,15,18,21,24,27,30,33,36,39,42,45,48,51,54,57-ノナデカオキソ-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56-ノナデカアザノナペンタコンチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+ 2853.2766、rt=2.20分(5分酸性法)。
1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68,71,74,80,80-ヘプタコサメチル-3,6,9,12,15,18,21,24,27,30,33,36,39,42,45,48,51,54,57,60,63,66,69,72,75,78-ヘキサコサオキソ-79-オキサ-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68,71,74-ペンタコサアザヘンオクタコンチル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000609
DMF(0.25mL)中の1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((メチルアミノ)メチル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(27.8mg、0.016mmol、1.0当量)、3,6,9,12,15,18,21,24,27,30,33,36,39,42,45,48,51,54,57,60,63,66,69,72,78,78-ヘキサコサメチル-4,7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49,52,55,58,61,64,67,70,73,76-ペンタコサオキソ-77-オキサ-3,6,9,12,15,18,21,24,27,30,33,36,39,42,45,48,51,54,57,60,63,66,69,72-テトラコサアザノナヘプタコンタン酸(30.2mg、0.016mmol、1.0当量)、およびHATU(6.7mg、0.018mmol、1.1当量)の撹拌溶液に、DIPEA(14μL、0.080mmol、5.0当量)を添加した。得られた溶液を周囲温度で1時間撹拌した。反応物を1mLのDMSOで希釈し、RP-HPLC ISCO goldクロマトグラフィー(10~100%MeCN/H2O、0.1%TFA修飾剤)により精製した。凍結乾燥して、1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68,71,74,80,80-ヘプタコサメチル-3,6,9,12,15,18,21,24,27,30,33,36,39,42,45,48,51,54,57,60,63,66,69,72,75,78-ヘキサコサオキソ-79-オキサ-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68,71,74-ペンタコサアザヘンオクタコンチル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS M+ 3360.5798 Rt=2.68分(5分酸性法)。
1-(2-(77-カルボキシ-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68,71,74-ペンタコサメチル-3,6,9,12,15,18,21,24,27,30,33,36,39,42,45,48,51,54,57,60,63,66,69,72,75-ペンタコサオキソ-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68,71,74-ペンタコサアザヘプタヘプタコンチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(L37-P1)の合成
Figure 2022532918000610
1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68,71,74,80,80-ヘプタコサメチル-3,6,9,12,15,18,21,24,27,30,33,36,39,42,45,48,51,54,57,60,63,66,69,72,75,78-ヘキサコサオキソ-79-オキサ-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68,71,74-ペンタコサアザヘンオクタコンチル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(41.3mg、0.012mmol、1.0当量)を用いて一般手順3に従って、1-(2-(77-カルボキシ-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68,71,74-ペンタコサメチル-3,6,9,12,15,18,21,24,27,30,33,36,39,42,45,48,51,54,57,60,63,66,69,72,75-ペンタコサオキソ-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68,71,74-ペンタコサアザヘプタヘプタコンチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+ 3279.4678、rt=2.21分(5分酸性法)。
tert-ブチル1-((N-((2-アジドエトキシ)カルボニル)スルファモイル)アミノ)-3,6,9,12,15,18-ヘキサオキサヘンイコサン-21-オエートの合成
Figure 2022532918000611
CHCl(15ml)中の2-アジドエタン-1-オール(105mg、1.21mmol)に、硫黄イソシアナチジン酸クロリド(0.105ml、1.21mmol)を0℃で添加した。混合物を0℃で30分間撹拌した。次いで、TEA(0.336ml、2.41mmol)、およびCHCl(1mL)中のtert-ブチル1-アミノ-3,6,9,12,15,18-ヘキサオキサヘンイコサン-21-オエート(518mg、1.27mmol)を添加した。混合物を0℃で1時間、室温で2時間撹拌し、次いで飽和NH4Cl、および1N HCl(2.4mL)でクエンチした。水性物をCH2Cl2(5×)で抽出した。有機層を無水NaSOで乾燥させ、濾過し、回転蒸発により濃縮して、透明油状物を得た。フラッシュクロマトグラフィー(CHCl中0~15%MeOH、ELSD検出)により精製して、tert-ブチル1-((N-((2-アジドエトキシ)カルボニル)スルファモイル)アミノ)-3,6,9,12,15,18-ヘキサオキサヘンイコサン-21-オエートを透明油状物(474mg、0.788mmol)として得た:LCMS:M+NH4+=619.5、Rt=0.94分(酸性、2分)。1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 11.33 (s, 1H), 7.76 (s, 1H), 4.28 - 4.20 (m, 2H), 3.60 (td, J = 5.6, 5.0, 2.9 Hz, 4H), 3.55 - 3.45 (m, 22H), 3.16 - 3.04 (m, 2H), 2.46 - 2.38 (m, 2H), 1.41 (s, 9H).
1-((N-((2-アジドエトキシ)カルボニル)スルファモイル)アミノ)-3,6,9,12,15,18-ヘキサオキサヘンイコサン-21-酸の合成
Figure 2022532918000612
0℃のCHCl(1mL)中のtert-ブチル1-((N-((2-アジドエトキシ)カルボニル)スルファモイル)アミノ)-3,6,9,12,15,18-ヘキサオキサヘンイコサン-21-オエート(145mg、0.241mmol)に、TFA(1mL、12.98mmol)を添加した。混合物を室温で1.45時間撹拌し、次いで25℃の水浴にて回転蒸発により濃縮し、高真空中で30分間乾燥させた。残留物を無水トルエン(3×2mL)と共沸乾燥させ、真空中で終夜乾燥させて、1-((N-((2-アジドエトキシ)カルボニル)スルファモイル)アミノ)-3,6,9,12,15,18-ヘキサオキサヘンイコサン-21-酸を透明油状物(147mg、理論収率に基づいて89重量%)として得た:LCMS:M+=546.3、0.65分(酸性、2分、ELSD);1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 11.30 (s, 1H), 7.77 - 7.71 (m, 1H), 4.25 - 4.19 (m, 2H), 3.63 - 3.55 (m, 4H), 3.54 - 3.45 (m, 22H), 3.07 (q, J = 6.0 Hz, 2H), 2.47 - 2.40 (m, 2H).
1-(4-((S)-2-((S)-2-アミノ-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムトリフルオロアセテートの合成
Figure 2022532918000613
0℃の1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムトリフルオロアセテート(321mg、0.210mmol)に、CH2Cl2中25%TFA(12.3mL、40.0mmol)を添加した。反応混合物を室温に上昇させ、1時間撹拌し、次いで高真空下、室温の水浴にて濃縮した。粗製物をDMSO(3mL)で希釈し、RP-HPLC ISCO goldクロマトグラフィー(150g、10~80%MeCN/H2O、0.1%TFA修飾剤)により精製した。凍結乾燥して、1-(4-((S)-2-((S)-2-アミノ-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムトリフルオロアセテートを白色粉末(224mg、0.158mmol)として得た:HRMS:M+=1304.5100、Rt=2.15分(5分酸性)
4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウムトリフルオロアセテートの合成
Figure 2022532918000614
1-(4-((S)-2-((S)-2-アミノ-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムトリフルオロアセテート(164mg、0.115mmol)およびMal-Peg1-NHSエステル(72mg、0.23mmol)を用いて一般手順3に従って、4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウムトリフルオロアセテートを白色粉末(170mg、0.105mmol)として得た。HRMS:M+=1499.5699、Rt=2.45分(5分酸性);1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.16 (s, 1H), 8.81 (d, J = 5.1 Hz, 1H), 8.54 (s, 1H), 8.07 (d, J = 7.2 Hz, 1H), 7.75 (d, J = 8.5 Hz, 1H), 7.69 (d, J = 6.9 Hz, 2H), 7.56 (d, J = 5.1 Hz, 1H), 7.45 (dd, J = 7.5, 1.8 Hz, 1H), 7.42 - 7.29 (m, 3H), 7.24 (dd, J = 8.9, 5.4 Hz, 2H), 7.18 - 7.05 (m, 5H), 6.99 - 6.91 (m, 4H), 6.65 (t, J = 7.4 Hz, 1H), 6.15 (d, J = 7.0 Hz, 1H), 5.91 (s, 1H), 5.43 (dd, J = 9.8, 3.5 Hz, 1H), 5.23 - 5.12 (m, 2H), 4.54 (d, J = 11.2 Hz, 4H), 4.33 - 4.09 (m, 7H), 3.69 (s, 3H), 3.42 - 2.78 (m, 32H, DMSOと重複), 2.39 - 2.20 (m, 2H), 1.91 - 1.81 (m, 1H), 1.77 (s, 3H), 1.46 (dd, J = 93.8, 31.3 Hz, 3H), 0.76 (dd, J = 13.8, 6.7 Hz, 6H); 19F NMR (376 MHz, DMSO-d6): -112.18 ppm
4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(2-(((1-(2-(((N-(20-カルボキシ-3,6,9,12,15,18-ヘキサオキサイコシル)スルファモイル)カルバモイル)オキシ)エチル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウムトリフルオロアセテート(L59-P1)の合成
Figure 2022532918000615
4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウムトリフルオロアセテート(32mg、0.021mmol)および1-((N-((2-アジドエトキシ)カルボニル)スルファモイル)アミノ)-3,6,9,12,15,18-ヘキサオキサヘンイコサン-21-酸(26.2mg、0.043mmol)を用いて一般手順2に従って、4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(2-(((1-(2-(((N-(20-カルボキシ-3,6,9,12,15,18-ヘキサオキサイコシル)スルファモイル)カルバモイル)オキシ)エチル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウムトリフルオロアセテートを白色粉末として得た:HRMS:M+=2044.7700、Rt=2.36分(5分酸性)。
3-(2-(2-(2-((N-((2-アジドエトキシ)カルボニル)スルファモイル)アミノ)エトキシ)エトキシ)エトキシ)プロパン酸の合成
Figure 2022532918000616
CHCl(15ml)中の2-アジドエタン-1-オール(105mg、1.21mmol)に、硫黄イソシアナチジン酸クロリド(0.105ml、1.21mmol)を0℃で添加した。混合物を0℃で30分間撹拌した。0℃で、TEA(0.336ml、2.41mmol)、およびCHCl(1mL)中のtert-ブチル3-(2-(2-(2-アミノエトキシ)エトキシ)エトキシ)プロパノエート(401mg、技術純度>80%、1.447mmol)を添加した。0℃で1時間、次いで室温で1時間撹拌した後、混合物を飽和NHCl、および1N HCl(2.4mL)でクエンチした。水性物をCHCl(5×)で抽出した。有機層を無水NaSOで乾燥させ、濾過し、回転蒸発により濃縮して、透明油状物を得た。フラッシュクロマトグラフィー(CHCl中0~15%MeOH、ELSD検出)による精製に続いて、tert-ブチル3-(2-(2-(2-((N-((2-アジドエトキシ)カルボニル)スルファモイル)アミノ)エトキシ)エトキシ)エトキシ)プロパノエートを濃厚な透明油状物(356mg、0.910mmol)として得た:LCMS:MS+NH4+=487.4、Rt=0.90分(酸性、2分、ELSD);1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 11.31 (s, 1H), 7.78 - 7.70 (m, 1H), 4.26 - 4.19 (m, 2H), 3.58 (td, J = 5.6, 5.0, 3.7 Hz, 4H), 3.53 - 3.39 (m, 10H), 3.10 - 3.03 (m, 2H), 2.44 - 2.39 (m, 2H), 1.40 (s, 9H).
0℃のCHCl(1mL)中のtert-ブチル3-(2-(2-(2-((N-((2-アジドエトキシ)カルボニル)スルファモイル)アミノ)エトキシ)エトキシ)エトキシ)プロパノエート(162mg、0.345mmol)に、TFA(1mL、13.0mmol)を添加した。室温で2時間撹拌した後、混合物を25℃の水浴で回転蒸発により濃縮した。残留物を、無水トルエン(3×2mL)を用いる共沸蒸留により高真空中で30分間、真空中で終夜乾燥させて、3-(2-(2-(2-((N-((2-アジドエトキシ)カルボニル)スルファモイル)アミノ)エトキシ)エトキシ)エトキシ)プロパン酸を濃厚な油状物(139mg、0.335mmol)として得た:LCMS:MS+NH4+=431.4、Rt=0.62分(酸性、2分、ELSD):1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 11.32 (d, J = 15.4 Hz, 1H), 7.78 - 7.69 (m, 1H), 4.27 - 4.15 (m, 2H), 3.67 - 3.54 (m, 8H), 3.49 - 3.42 (m, 4H), 3.07 (q, J = 6.0 Hz, 2H), 2.47 - 2.39 (m, 4H).
4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(2-(((1-(2-(((N-(2-(2-(2-(2-カルボキシエトキシ)エトキシ)エトキシ)エチル)スルファモイル)カルバモイル)オキシ)エチル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウムトリフルオロアセテート(L60-P1)の合成
Figure 2022532918000617
4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウムトリフルオロアセテート(15mg、10μmol)および3-(2-(2-(2-((N-((2-アジドエトキシ)カルボニル)スルファモイル)アミノ)エトキシ)エトキシ)エトキシ)プロパン酸(12mg、0.029mmol)を用いて一般手順2に従って、4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(2-(((1-(2-(((N-(2-(2-(2-(2-カルボキシエトキシ)エトキシ)エトキシ)エチル)スルファモイル)カルバモイル)オキシ)エチル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウムトリフルオロアセテートを白色粉末として得た:HRMS:MS+=1912.7000、Rt=2.38分(5分酸性)。
(2R,3R,4S,5R,6R)-2-(アセトキシメチル)-6-(2-(2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)エトキシ)エトキシ)テトラヒドロ-2H-ピラン-3,4,5-トリイルトリアセテートの合成
Figure 2022532918000618
CHCl(6mL)中のtert-ブチル(2-(2-ヒドロキシエトキシ)エチル)カルバメート(1535mg、7.48mmol)、Ag2CO3(8248mg、14.96mmol)および一片の結晶ヨウ素の混合物を、粉末化4A分子篩(1400mg)とともに15分間撹拌した。混合物に、CHCl(6.00ml)中の(2R,3R,4S,5R,6R)-2-(アセトキシメチル)-6-ブロモテトラヒドロ-2H-ピラン-3,4,5-トリイルトリアセテート(2050mg、4.99mmol)を添加し、また、添加前に15分間、粉末化4A分子篩(1400mg)とともに撹拌した。得られた混合物をアルミニウム箔で覆い、室温で60時間撹拌し、次いでceliteに通して濾過し、EtOAc洗浄した。濾液を濃縮して、透明油状物を得、これをフラッシュクロマトグラフィー(CHCl中0~10%MeOH、ELSD検出)により精製して、適切な画分の濃縮後に、濃厚な油状物(640mg)を、所望の(2R,3R,4S,5R,6R)-2-(アセトキシメチル)-6-(2-(2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)エトキシ)エトキシ)テトラヒドロ-2H-ピラン-3,4,5-トリイルトリアセテートおよび(2S,3aR,5R,6R,7S,7aR)-5-(アセトキシメチル)-2-(2-(2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)エトキシ)エトキシ)-2-メチルテトラヒドロ-5H-[1,3]ジオキソロ[4,5-b]ピラン-6,7-ジイルジアセテートの47/53%混合物として得た:LCMS:MS+=536.4、Rt=0.96分(2分、酸、ELSD);1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 6.77 (s, 2H), 5.78 (s, 2H), 5.76 (s, 1H), 5.28 (t, J = 9.5 Hz, 1H), 5.04 (t, J = 3.1 Hz, 1H), 4.91 (t, J = 9.7 Hz, 1H), 4.87 - 4.74 (m, 3H), 4.38 (ddd, J = 5.2, 3.1, 0.9 Hz, 1H), 4.24 - 4.10 (m, 3H), 4.07 - 3.96 (m, 2H), 3.92 (dt, J = 8.8, 4.1 Hz, 1H), 3.80 (dt, J = 11.2, 4.4 Hz, 1H), 3.68 - 3.60 (m, 1H), 3.57 - 3.45 (m, 7H), 3.38 (td, J = 6.2, 1.5 Hz, 7H), 3.07 (dt, J = 6.1, 3.0 Hz, 4H), 2.08 (s, 3H), 2.06 (s, 3H), 2.04 (s, 6H), 2.01 (s, 3H), 2.00 (s, 3H), 1.95 (s, 3H), 1.65 (s, 3H), 1.39 (s, 19H).
(2R,3R,4S,5R,6S)-2-(アセトキシメチル)-6-(2-(2-アミノエトキシ)エトキシ)テトラヒドロ-2H-ピラン-3,4,5-トリイルトリアセテートの合成
Figure 2022532918000619
0℃のCHCl(16mL)中の(2R,3R,4S,5R,6R)-2-(アセトキシメチル)-6-(2-(2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)エトキシ)エトキシ)テトラヒドロ-2H-ピラン-3,4,5-トリイルトリアセテートおよび(2S,3aR,5R,6R,7S,7aR)-5-(アセトキシメチル)-2-(2-(2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)エトキシ)エトキシ)-2-メチルテトラヒドロ-5H-[1,3]ジオキソロ[4,5-b]ピラン-6,7-ジイルジアセテートの47/53%混合物(622mg、1.161mmol)に、TFA(4.0mL、52mmol)を添加した。反応混合物を室温に上昇させ、1時間撹拌した。混合物を濃縮し、残留物を真空下で60分間乾燥させて、薄黄色油状物を得た。粗生成物をDMSO(4mL)で希釈し、RP-HPLC ISCO goldクロマトグラフィー(5~60%MeCN/H2O、0.1%TFA修飾剤、ELSD検出)により精製した。適切な画分を凍結乾燥して、TFA塩としての(2R,3R,4S,5R,6S)-2-(アセトキシメチル)-6-(2-(2-アミノエトキシ)エトキシ)テトラヒドロ-2H-ピラン-3,4,5-トリイルトリアセテートを白色粉末(195mg、0.355mmol)として得た:LCMS:MS+=436.4、Rt=0.58分(酸性、2分);1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 7.72 (s, 3H), 5.27 (t, J = 9.4 Hz, 1H), 4.92 (t, J = 9.6 Hz, 1H), 4.86 - 4.75 (m, 2H), 4.22 - 4.15 (m, 1H), 4.07 - 3.94 (m, 3H), 3.89 - 3.53 (m, 14H, DMSOと混合), 3.03 - 2.91 (m, 2H), 2.03 (s, 3H), 2.01 (s, 3H), 1.99 (s, 3H), 1.94 (s, 3H).
2-アジドエチル(N-(2-(2-(((2R,3R,4S,5S,6R)-3,4,5-トリヒドロキシ-6-(ヒドロキシメチル)テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)オキシ)エトキシ)エチル)スルファモイル)カルバメートの合成
Figure 2022532918000620
CHCl(2.5ml)中の2-アジドエタン-1-オール(16mg、0.18mmol)に、硫黄イソシアナチジン酸クロリド(0.016ml、0.184mmol)を0℃で添加した。混合物を0℃で1時間撹拌し、次いでTEA(0.128ml、0.919mmol)、およびCHCl(1.5mL)中のTFA塩としての(2R,3R,4S,5R,6R)-2-(アセトキシメチル)-6-(2-(2-アミノエトキシ)エトキシ)テトラヒドロ-2H-ピラン-3,4,5-トリイルトリアセテート(116mg、0.211mmol)を添加した。0℃で1時間、次いで室温で1時間撹拌した後、混合物を飽和NHCl、および1N HCl(0.919mL、0.919mmol)でクエンチした。水性物をCHCl(5×)で抽出した。有機層を無水NaSOで乾燥させ、濾過し、回転蒸発により濃縮して、(2R,3R,4S,5R,6R)-2-(アセトキシメチル)-6-(2-(2-((N-((2-アジドエトキシ)カルボニル)スルファモイル)アミノ)エトキシ)エトキシ)テトラヒドロ-2H-ピラン-3,4,5-トリイルトリアセテートを透明油状物(121mg)として得た:LCMS:MS+=628、Rt=0.85分(酸性、2分、ELSD);1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 11.32 (s, 1H), 7.79 - 7.71 (m, 1H), 5.26 (t, J = 9.5 Hz, 1H), 4.90 (t, J = 9.7 Hz, 1H), 4.85 - 4.73 (m, 2H), 4.25 - 4.14 (m, 3H), 4.06 - 3.94 (m, 2H), 3.79 (ddd, J = 11.3, 5.3, 3.8 Hz, 1H), 3.68 - 3.40 (m, 8H), 3.16 - 3.00 (m, 3H), 2.02 (s, 3H), 2.00 (s, 3H), 1.98 (s, 3H), 1.94 (s, 3H).
上記の生成物をジオキサン(3ml)に溶解し、0℃に冷却した。LiOH.HO(水中0.5M、2.94ml、1.47mmol)を添加した。得られた透明溶液を室温で1時間撹拌し、次いで0℃にてHCl(5N、0.147mL、0.735mmol)でクエンチした。混合物を20℃の水浴にて回転蒸発により濃縮して、ジオキサンの大部分を除去した。残留溶液(約3mL)を分取HPLC(Sunfire 5μm 30×50mmカラム、水中2~12%のアセトニトリル 0.1%FA含有、流速:75mL/分、MS 459.3、476.3検出)により精製して、凍結乾燥により適切な画分の溶媒を除去した後に、2-アジドエチル(N-(2-(2-(((2R,3R,4S,5S,6R)-3,4,5-トリヒドロキシ-6-(ヒドロキシメチル)テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)オキシ)エトキシ)エチル)スルファモイル)カルバメートを半固体(64mg、0.14mmol)として得た:LCMS:M+NH4+=477.3、MS-=458(酸性、2分、ELSD);1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 11.32 (s, 1H), 7.71 (s, 1H), 4.96 (d, J = 4.9 Hz, 1H), 4.89 (dd, J = 13.7, 4.8 Hz, 2H), 4.47 (t, J = 5.9 Hz, 1H), 4.22 (t, J = 5.0 Hz, 2H), 4.15 (d, J = 7.8 Hz, 1H), 3.90 - 3.81 (m, 1H), 3.67 (ddd, J = 12.0, 5.7, 2.0 Hz, 1H), 3.62 - 3.39 (m, 8H), 3.19 - 2.90 (m, 6H).
4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(((1-(2-(((N-(2-(2-(((2R,3R,4S,5S,6R)-3,4,5-トリヒドロキシ-6-(ヒドロキシメチル)テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)オキシ)エトキシ)エチル)スルファモイル)カルバモイル)オキシ)エチル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)メチル)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウムトリフルオロアセテート(L63-P1)の合成
Figure 2022532918000621
4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウムトリフルオロアセテート(36mg、0.022mmol)および2-アジドエチル(N-(2-(2-(((2R,3R,4S,5S,6R)-3,4,5-トリヒドロキシ-6-(ヒドロキシメチル)テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)オキシ)エトキシ)エチル)スルファモイル)カルバメート(22mg、0.048mmol)を用いて一般手順2に従って、4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(((1-(2-(((N-(2-(2-(((2R,3R,4S,5S,6R)-3,4,5-トリヒドロキシ-6-(ヒドロキシメチル)テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)オキシ)エトキシ)エチル)スルファモイル)カルバモイル)オキシ)エチル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)メチル)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウムトリフルオロアセテートを白色粉末として得た:HRMS:MS+=1958.6899、Rt=2.31分(5分酸性);1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 11.17 (s, 1H), 10.16 (s, 1H), 8.81 (d, J = 5.2 Hz, 1H), 8.54 (s, 1H), 8.07 (d, J = 13.5 Hz, 2H), 7.74 (d, J = 8.6 Hz, 1H), 7.68 (q, J = 4.3, 2.7 Hz, 3H), 7.56 (d, J = 5.1 Hz, 1H), 7.45 (dd, J = 7.6, 1.8 Hz, 1H), 7.42 - 7.28 (m, 3H), 7.23 (ddd, J = 8.5, 5.4, 2.6 Hz, 2H), 7.17 - 7.04 (m, 5H), 6.99 - 6.91 (m, 4H), 6.65 (t, J = 7.4 Hz, 1H), 6.14 (dd, J = 7.6, 1.8 Hz, 1H), 5.93 (s, 1H), 5.43 (dd, J = 9.8, 3.6 Hz, 1H), 5.23 - 5.11 (m, 2H), 4.59 (dd, J = 11.3, 7.4 Hz, 8H), 4.42 - 4.06 (m, 12H), 3.53 - 3.17 (m, 27H, DMSOと重複), 3.09 - 2.80 (m, 17H, DMSOと重複), 2.39 - 2.20 (m, 3H), 1.86 (h, J = 6.9 Hz, 1H), 1.77 (s, 3H), 1.68 - 1.21 (m, 5H), 0.76 (dd, J = 13.8, 6.8 Hz, 6H); 19F NMR (376 MHz, DMSO-d6): -112.18 ppm.
(2R,3R,4S,5R,6R)-2-(アセトキシメチル)-6-((2,2-ジメチル-4-オキソ-3,8,11-トリオキサ-5-アザトリデカン-13-イル)オキシ)テトラヒドロ-2H-ピラン-3,4,5-トリイルトリアセテートの合成
Figure 2022532918000622
CHCl(3mL)中のtert-ブチル(2-(2-(2-ヒドロキシエトキシ)エトキシ)エチル)カルバメート(1046mg、4.20mmol)、AgCO(4627mg、8.39mmol)および一片の結晶ヨウ素の混合物を、粉末化4A分子篩(700mg)とともに15分間撹拌した。混合物に、CHCl(3.00mL)中の(2R,3R,4S,5R,6R)-2-(アセトキシメチル)-6-ブロモテトラヒドロ-2H-ピラン-3,4,5-トリイルトリアセテート(1150mg、2.80mmol)を添加した(また、粉末化4A分子篩(700mg)とともに15分間撹拌した)。得られた混合物をアルミニウム箔で覆い、室温で60時間撹拌し、次いでceliteに通して濾過し、EtOAc洗浄した。濾液を濃縮して、透明油状物を得た。フラッシュクロマトグラフィー(ヘプタン中20~100%EtOAc、ELSD検出)により精製して、(2R,3R,4S,5R,6R)-2-(アセトキシメチル)-6-((2,2-ジメチル-4-オキソ-3,8,11-トリオキサ-5-アザトリデカン-13-イル)オキシ)テトラヒドロ-2H-ピラン-3,4,5-トリイルトリアセテートおよび(2S,3aR,5R,6R,7S,7aR)-5-(アセトキシメチル)-2-((2,2-ジメチル-4-オキソ-3,8,11-トリオキサ-5-アザトリデカン-13-イル)オキシ)-2-メチルテトラヒドロ-5H-[1,3]ジオキソロ[4,5-b]ピラン-6,7-ジイルジアセテートの28/72%混合物を濃厚な透明油状物(307mg、0.529mmol)として得た:LCMS:MS+=580.4、Rt=0.96分(酸、2分、ELSDのみ);1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 6.74 (s, 3H), 5.76 (s, 8H), 5.26 (t, J = 9.5 Hz, 1H), 5.02 (t, J = 3.1 Hz, 3H), 4.90 (t, J = 9.7 Hz, 1H), 4.84 - 4.72 (m, 5H), 4.37 (ddd, J = 5.2, 3.1, 0.9 Hz, 3H), 4.18 (dd, J = 12.2, 5.0 Hz, 1H), 4.11 (d, J = 4.5 Hz, 5H), 4.08 - 3.94 (m, 4H), 3.91 (dt, J = 8.6, 4.1 Hz, 3H), 3.85 - 3.75 (m, 1H), 3.66 - 3.58 (m, 1H), 3.58 - 3.51 (m, 7H), 3.42 - 3.31 (m, 14H), 3.06 (q, J = 5.9 Hz, 8H), 2.07 (s, 7H), 2.05 (s, 7H), 2.02 (s, 10H), 1.99 (d, J = 1.0 Hz, 6H), 1.99 (s, 3H), 1.94 (s, 3H), 1.63 (s, 7H), 1.38 (s, 36H), 1.18 (t, J = 7.1 Hz, 4H).
(2R,3R,4S,5R,6R)-2-(アセトキシメチル)-6-(2-(2-(2-アミノエトキシ)エトキシ)エトキシ)テトラヒドロ-2H-ピラン-3,4,5-トリイルトリアセテートの合成
Figure 2022532918000623
0℃のCHCl(8mL)中の(2R,3R,4S,5R,6R)-2-(アセトキシメチル)-6-((2,2-ジメチル-4-オキソ-3,8,11-トリオキサ-5-アザトリデカン-13-イル)オキシ)テトラヒドロ-2H-ピラン-3,4,5-トリイルトリアセテートおよび(2S,3aR,5R,6R,7S,7aR)-5-(アセトキシメチル)-2-((2,2-ジメチル-4-オキソ-3,8,11-トリオキサ-5-アザトリデカン-13-イル)オキシ)-2-メチルテトラヒドロ-5H-[1,3]ジオキソロ[4,5-b]ピラン-6,7-ジイルジアセテートの混合物(323mg、0.557mmol)に、TFA(1.9mL、25mmol)を添加した。室温で45分間撹拌した後、混合物を濃縮し、残留物を真空下で60分間乾燥させて、薄黄色油状物を得た。フラッシュクロマトグラフィー(CHCl中0~20%MeOH、MeOH中0.2%NHOH修飾剤含有、ELSD検出)により精製して、(2R,3R,4S,5R,6R)-2-(アセトキシメチル)-6-(2-(2-(2-アミノエトキシ)エトキシ)エトキシ)テトラヒドロ-2H-ピラン-3,4,5-トリイルトリアセテートを透明油状物(82mg、0.171mmol)として得た。LCMS:MS+=480.4、Rt=0.61分(酸性、2分、ELSD);1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 7.76 (s, 2H), 5.28 (t, J = 9.4 Hz, 1H), 4.93 (t, J = 9.7 Hz, 1H), 4.86 - 4.75 (m, 2H), 4.20 (dd, J = 12.2, 5.0 Hz, 1H), 4.08 - 3.95 (m, 2H), 3.88 - 3.79 (m, 1H), 3.67 - 3.53 (m, 11H, DMSOと重複), 3.00 (q, J = 5.5 Hz, 2H), 2.04 (s, 3H), 2.02 (s, 3H), 2.00 (s, 3H), 1.96 (s, 3H).
2-アジドエチル(N-(2-(2-(2-(((2R,3R,4S,5S,6R)-3,4,5-トリヒドロキシ-6-(ヒドロキシメチル)テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)オキシ)エトキシ)エトキシ)エチル)スルファモイル)カルバメートの合成
Figure 2022532918000624
CHCl(2mL)中の2-アジドエタン-1-オール(12.5mg、0.144mmol)に、硫黄イソシアナチジン酸クロリド(0.012ml、0.14mmol)を0℃で添加した。混合物を0℃で45分間撹拌し、次いでTEA(0.040ml、0.29mmol)、およびCHCl(1mL)中の(2R,3R,4S,5R,6R)-2-(アセトキシメチル)-6-(2-(2-(2-アミノエトキシ)エトキシ)エトキシ)テトラヒドロ-2H-ピラン-3,4,5-トリイルトリアセテート(77mg、0.16mmol)を添加した。0℃で1時間、次いで室温で1時間撹拌した後、混合物を飽和NHCl、および1N HCl(0.29mL)でクエンチした。水性物をCHCl(5×)で抽出した。有機層を無水NaSOで乾燥させ、濾過し、回転蒸発により濃縮して、(2R,3R,4S,5R,6R)-2-(アセトキシメチル)-6-(2-(2-(2-((N-((2-アジドエトキシ)カルボニル)スルファモイル)アミノ)エトキシ)エトキシ)エトキシ)テトラヒドロ-2H-ピラン-3,4,5-トリイルトリアセテートを透明油状物(75mg)として得た:LCMS:0.97分、MS+=672.4、96、Rt-0.87分(酸性、2分、ELSD)。
0℃のジオキサン(4mL)中の上記の生成物に、LiOH.H2O(水中0.5M、3.45ml、1.72mmol)を添加した。得られた透明溶液を室温で1時間撹拌し、次いで20℃の水浴で回転蒸発により濃縮した。残留物を分取HPLC(Sunfire 5μm 30×50mmカラム、水中2~12%のアセトニトリル 0.1%FA含有、流速:75mL/分、MS 503.5、520.3検出)により精製して、凍結乾燥後、2-アジドエチル(N-(2-(2-(2-(((2R,3R,4S,5S,6R)-3,4,5-トリヒドロキシ-6-(ヒドロキシメチル)テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)オキシ)エトキシ)エトキシ)エチル)スルファモイル)カルバメートを透明な薄い膜(22mg、0.044mmol)として得た:LCMS:MS+=504.3、Rt=0.52分(酸性、2分、ELSD);1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 11.31 (s, 1H), 7.74 (s, 1H), 4.96 (d, J = 4.9 Hz, 1H), 4.89 (dd, J = 12.5, 4.8 Hz, 2H), 4.47 (t, J = 5.9 Hz, 1H), 4.22 (t, J = 5.0 Hz, 2H), 4.15 (d, J = 7.8 Hz, 1H), 3.93 - 3.82 (m, 1H), 3.67 (dd, J = 11.2, 5.8 Hz, 1H), 3.62 - 3.40 (m, 12H), 3.17 - 2.90 (m, 6H).
4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(((1-(2-(((N-(2-(2-(2-(((2R,3R,4S,5S,6R)-3,4,5-トリヒドロキシ-6-(ヒドロキシメチル)テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)オキシ)エトキシ)エトキシ)エチル)スルファモイル)カルバモイル)オキシ)エチル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)メチル)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウムトリフルオロアセテート(L62-P1)の合成
Figure 2022532918000625
4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウムトリフルオロアセテート(32mg、0.020mmol)および2-アジドエチル(N-(2-(2-(2-(((2S,3R,4S,5S,6R)-3,4,5-トリヒドロキシ-6-(ヒドロキシメチル)テトラヒドロ-2H-ピラン-2=イル)オキシ)エトキシ)エトキシ)エチル)スルファモイル)カルバメート(21mg、0.042mmol)を用いて一般手順2に従って、4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(((1-(2-(((N-(2-(2-(2-(((2R,3R,4S,5S,6R)-3,4,5-トリヒドロキシ-6-(ヒドロキシメチル)テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)オキシ)エトキシ)エトキシ)エチル)スルファモイル)カルバモイル)オキシ)エチル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)メチル)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウムトリフルオロアセテートを白色粉末として得た:HRMS:MS+=2002.7100、Rt=2.37分(5分酸性)。
ジ-tert-ブチル3,3’-((3-((((9H-フルオレン-9-イル)メトキシ)カルボニル)アミノ)プロパノイル)アザンジイル)ジプロピオネートの合成
Figure 2022532918000626
CHCl(3mL)中のジ-tert-ブチル3,3’-アザンジイルジプロピオネート(403mg、1.47mmol)、3-((((9H-フルオレン-9-イル)メトキシ)カルボニル)アミノ)プロパン酸(505mg、1.62mmol)およびDIPEA(0.309mL、1.77mmol)の混合物に、N-(ジメチルアミノプロピル)-N’-エチル-カルボジイミド塩酸塩.HCl(367mg、1.92mmol)を添加した。室温で2時間撹拌した後、混合物を飽和NHClでクエンチし、CHCl(3×)で抽出した。合わせた有機相をブラインで洗浄し、無水NaSOで乾燥させ、濾過し、濃縮した。得られた粗生成物をフラッシュクロマトグラフィー(ヘプタン中0~50%EtOAc)により精製して、ジ-tert-ブチル3,3’-((3-((((9H-フルオレン-9-イル)メトキシ)カルボニル)アミノ)プロパノイル)アザンジイル)ジプロピオネートを白色泡状物(290mg、0.511mmol)として得た:LCMS:MS+=567.5、Rt=1.32分(酸、2分);PMR:1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 7.94 - 7.88 (m, 2H), 7.70 (d, J = 7.5 Hz, 2H), 7.47 - 7.40 (m, 2H), 7.40 - 7.31 (m, 2H), 7.22 (t, J = 5.7 Hz, 1H), 4.31 (d, J = 6.8 Hz, 2H), 4.26 - 4.18 (m, 1H), 3.56 - 3.03 (m, 8H), 2.50 - 2.38 (m, 4H), 1.41 (s, 9H), 1.40 (s, 9H).
ジ-tert-ブチル3,3’-((3-アミノプロパノイル)アザンジイル)ジプロピオネート、1-(9H-フルオレン-9-イル)-N,N-ジメチルメタンアミンの合成
Figure 2022532918000627
CHCl(3mL)中のジ-tert-ブチル3,3’-((3-((((9H-フルオレン-9-イル)メトキシ)カルボニル)アミノ)プロパノイル)アザンジイル)ジプロピオネート(288mg、0.508mmol)に、ジメチルアミン(THF中2N、1mL、2mmol)を添加した。混合物を室温で1時間撹拌した。さらにジメチルアミン(THF中2N、1mL、2mmol)を添加した。さらに4時間撹拌した後、混合物を濃縮し、残留物をフラッシュクロマトグラフィー(CHCl中0~25%MeOH、37分、0.2%NHOH修飾剤がMeOH中にあった、ELSD検出)により精製して、ジ-tert-ブチル3,3’-((3-アミノプロパノイル)アザンジイル)ジプロピオネート、1-(9H-フルオレン-9-イル)-N,N-ジメチルメタンアミンを薄褐色油状物(62mg、0.472mmol)として得た:LCMS:MS+=345.4、Rt=0.76分(酸性、2分、ELSD);1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 4.05 (s, 2H), 3.51 (t, J = 7.2 Hz, 2H), 3.43 (t, J = 7.3 Hz, 2H), 3.31 (s, 2H), 2.79 (t, J = 6.4 Hz, 2H), 2.55 - 2.45 (m,17H, DMSOと重複), 2.41 (t, J = 7.3 Hz, 2H), 1.41 (s, 9H), 1.40 (s, 9H).
3,3’-((3-((N-((2-アジドエトキシ)カルボニル)スルファモイル)アミノ)プロパノイル)アザンジイル)ジプロピオン酸の合成
Figure 2022532918000628
CHCl(2.5ml)中の2-アジドエタン-1-オール(16mg、0.18mmol)に、硫黄イソシアナチジン酸クロリド(0.016ml、0.18mmol)を0℃で添加した。混合物を0℃で30分間撹拌し、次いでTEA(0.051ml、0.37mmol)、およびCHCl(1mL)中のジ-tert-ブチル3,3’-((3-アミノプロパノイル)アザンジイル)ジプロピオネート(73mg、0.21mmol)を添加した。0℃で1時間、次いで室温で1時間撹拌した後、混合物を飽和NHCl、および1N HCl(0.37mL)でクエンチした。水性物をCHCl(5×)で抽出した。有機層を無水NaSOで乾燥させ、濾過し、回転蒸発により濃縮した。得られた残留物をフラッシュクロマトグラフィー(CHCl中0~10%MeOH、ELSDおよびUV214検出)により精製して、ジ-tert-ブチル3,3’-((3-((N-((2-アジドエトキシ)カルボニル)スルファモイル)アミノ)プロパノイル)アザンジイル)ジプロピオネートを濃厚な透明油状物(70mg、0.13mmol)として得た:LCMS MS+=537.4、Rt=1.08分(酸性、2分、ELSD);1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 11.39 (s, 1H), 7.65 - 7.59 (m, 1H), 4.28 - 4.23 (m, 2H), 3.63 - 3.59 (m, 2H), 3.54 - 3.47 (m, 2H), 3.47 - 3.38 (m, 2H), 3.18 - 3.09 (m, 2H), 2.61 - 2.54 (m, 4H), 2.43 (dd, J = 8.5, 6.0 Hz, 2H), 1.43 (s, 9H), 1.42 (s, 9H).
0℃のCHCl(2ml)中の上記の生成物に、TFA(2ml)を添加した。室温で1.5時間撹拌した後、混合物を25℃の水浴にて回転蒸発により濃縮した。残留物を高真空中で30分間乾燥させ、次いで無水トルエン(3×3mL)を用いる共沸蒸留により乾燥させ、高真空中で終夜さらに乾燥させて、3,3’-((3-((N-((2-アジドエトキシ)カルボニル)スルファモイル)アミノ)プロパノイル)アザンジイル)ジプロピオン酸を白色固体(72mg、理論収率に基づいて77重量%。これを次のステップで直接使用した)として得た:LCMS MS+=425.3、Rt=0.52分(酸性、2分、ELSD);1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 12.28 (s, 1H), 11.35 (s, 1H), 7.58 (t, J = 5.8 Hz, 1H), 4.26 - 4.20 (m, 2H), 3.61 - 3.55 (m, 2H), 3.50 (t, J = 7.4 Hz, 2H), 3.42 (t, J = 7.4 Hz, 2H), 3.12 (q, J = 6.8 Hz, 2H), 2.56 (dd, J = 15.1, 7.4 Hz, 4H), 2.43 (t, J = 7.4 Hz, 2H), 2.08 (s, 1H).
1-(2-(((1-(2-(((N-(3-(ビス(2-カルボキシエチル)アミノ)-3-オキソプロピル)スルファモイル)カルバモイル)オキシ)エチル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムトリフルオロアセテート(L61-P1)の合成
Figure 2022532918000629
4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウムトリフルオロアセテート(20mg、0.012mmol)および3,3’-((3-((N-((2-アジドエトキシ)カルボニル)スルファモイル)アミノ)プロパノイル)アザンジイル)ジプロピオン酸(15mg、0.027mmol)を用いて一般手順2に従って、1-(2-(((1-(2-(((N-(3-(ビス(2-カルボキシエチル)アミノ)-3-オキソプロピル)スルファモイル)カルバモイル)オキシ)エチル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムトリフルオロアセテートを白色粉末として得た:HRMS:MS+=1923.6500 Rt=2.34分(5分酸性);1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 11.21 (s, 1H), 10.16 (s, 1H), 8.81 (d, J = 5.1 Hz, 1H), 8.54 (s, 1H), 8.08 (d, J = 13.7 Hz, 2H), 7.77 - 7.50 (m, 5H), 7.47 - 7.20 (m, 6H), 7.18 - 7.04 (m, 5H), 6.99 - 6.90 (m, 4H), 6.65 (t, J = 7.4 Hz, 1H), 6.14 (dd, J = 7.6, 1.7 Hz, 1H), 5.92 (s, 1H), 5.43 (dd, J = 9.8, 3.5 Hz, 1H), 5.24 - 5.11 (m, 3H), 4.65 - 4.51 (m, 9H), 4.45 - 3.81 (m, 52H, DMSOと重複), 3.68 (s, 3H), 3.54 - 2.77 (m, 31H), 2.39 - 2.20 (m, 5H), 1.86 (q, J = 6.8 Hz, 1H), 1.77 (s, 3H), 1.69 - 1.00 (m, 6H), 0.76 (dd, J = 13.9, 6.8 Hz, 6H); 19F NMR (376 MHz, DMSO-d6): -112.16 ppm.
1-(2-(((1-(2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35-ドデカオキサヘプタトリアコンタン-37-イル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-アミノ-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000630
1-(4-((S)-2-((S)-2-アミノ-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(87.5mg、0.063mmol、1.0当量)およびmPEG12-アジド(73.3mg、0.125mmol、2当量)を用いて一般手順2に従って、1-(2-(((1-(2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35-ドデカオキサヘプタトリアコンタン-37-イル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-アミノ-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=1889.8544、Rt=2.19分(5分酸性法)。
1-(2-(((1-(2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35-ドデカオキサヘプタトリアコンタン-37-イル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(L104-P1)の合成
Figure 2022532918000631
1-(2-(((1-(2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35-ドデカオキサヘプタトリアコンタン-37-イル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-アミノ-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(22mg、0.011mmol、1.0当量)を用いて一般手順3に従って、1-(2-(((1-(2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35-ドデカオキサヘプタトリアコンタン-37-イル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=2084.9099、Rt=2.45分(5分酸性法)。
4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000632
1-(4-((S)-2-((S)-2-アミノ-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(155mg、0.119mmol、1.0当量)を用いて一般手順3に従って、4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=1499.5699、Rt=2.39分(5分酸性法)。
1-(2-(((1-(2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47-ヘキサデカオキサノナテトラコンタン-49-イル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(L34-P1)の合成
Figure 2022532918000633
4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(50mg、0.033mmol、1.0当量)およびm-PEG16-アジド(Broadpharm BP-23558から)(50.8mg、0.067mmol、2当量)を用いて一般手順2に従って、1-(2-(((1-(2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47-ヘキサデカオキサノナテトラコンタン-49-イル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=2261.0196、Rt=2.28分(5分酸性法)。
1-(4-((S)-2-((S)-2-アミノ-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(((1-((2R,3R,4R,5S,6R)-3,4-ジヒドロキシ-6-(ヒドロキシメチル)-5-(((2S,3R,4S,5R,6R)-3,4,5-トリヒドロキシ-6-(ヒドロキシメチル)テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)オキシ)テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)メチル)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000634
1-(4-((S)-2-((S)-2-アミノ-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(87.5mg、0.063mmol、1.0当量)および1-アジド-1-デオキシ-ベータ-D-ラクトピラノシド(22.99mg、0.063mmol、1当量)を用いて一般手順2に従って、1-(4-((S)-2-((S)-2-アミノ-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(((1-((2R,3R,4R,5S,6R)-3,4-ジヒドロキシ-6-(ヒドロキシメチル)-5-(((2S,3R,4S,5R,6R)-3,4,5-トリヒドロキシ-6-(ヒドロキシメチル)テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)オキシ)テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)メチル)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=1671.6400、Rt=1.95分(5分酸性法)。
4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(2-(((1-((2R,3R,4R,5S,6R)-3,4-ジヒドロキシ-6-(ヒドロキシメチル)-5-(((2S,3R,4S,5R,6R)-3,4,5-トリヒドロキシ-6-(ヒドロキシメチル)テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)オキシ)テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(L46-P1)の合成
Figure 2022532918000635
1-(4-((S)-2-((S)-2-アミノ-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(((1-((2R,3R,4R,5S,6R)-3,4-ジヒドロキシ-6-(ヒドロキシメチル)-5-(((2S,3R,4S,5R,6R)-3,4,5-トリヒドロキシ-6-(ヒドロキシメチル)テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)オキシ)テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)メチル)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(35mg、0.020mmol、1.0当量)を用いて一般手順3に従って、4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(2-(((1-((2R,3R,4R,5S,6R)-3,4-ジヒドロキシ-6-(ヒドロキシメチル)-5-(((2S,3R,4S,5R,6R)-3,4,5-トリヒドロキシ-6-(ヒドロキシメチル)テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)オキシ)テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)メチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=1866.6899、Rt=2.28分(5分酸性法)。
4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(4-((6S,9S,12S)-9-イソプロピル-2,2-ジメチル-4,7,10-トリオキソ-6-(プロパ-2-イン-1-イル)-12-(3-ウレイドプロピル)-3-オキサ-5,8,11-トリアザトリデカン-13-アミド)-2-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000636
DMF(0.5ml)中のBoc-プロパルギル-Gly-OH(40mg、0.188mmol、1当量)およびHATU(71.3mg、0.188mmol、1当量)の混合物に、DIPEA(65.5μl、0.375mmol、2当量)を添加した。混合物を室温で30分間撹拌した。次いで、DMF(1ml)中の1-(4-((S)-2-((S)-2-アミノ-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(245mg、0.188mmol、1当量)の溶液を、反応混合物中に添加した。反応混合物を室温で30分間撹拌した。粗混合物をC18カラム(100カートリッジ、MeCN/水 0.1%ギ酸含有、15CVにわたって0~100%)で分離して、4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(4-((6S,9S,12S)-9-イソプロピル-2,2-ジメチル-4,7,10-トリオキソ-6-(プロパ-2-イン-1-イル)-12-(3-ウレイドプロピル)-3-オキサ-5,8,11-トリアザトリデカン-13-アミド)-2-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=1499.6000、Rt=2.91分(5分酸性法)。
1-(4-((S)-2-((S)-2-((S)-2-アミノペンタ-4-インアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000637
0℃の氷水浴で、4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(4-((6S,9S,12S)-9-イソプロピル-2,2-ジメチル-4,7,10-トリオキソ-6-(プロパ-2-イン-1-イル)-12-(3-ウレイドプロピル)-3-オキサ-5,8,11-トリアザトリデカン-13-アミド)-2-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(56mg、0.037mmol)に、TFA(DCM中25%)2mLを添加し、次いで、反応混合物を室温に上昇させ、1時間撹拌した。粗混合物を高真空下で濃縮した。次いで、混合物をMeOHに溶解し、C-18カラム(50gカートリッジ、MeCN/水 0.1%ギ酸含有 16CVにわたって0~100%)により精製して、1-(4-((S)-2-((S)-2-((S)-2-アミノペンタ-4-インアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=1399.5400、Rt=2.17分(5分酸性法)。
1-(4-((S)-2-((S)-2-((S)-2-アミノ-3-(1-((2R,3R,4R,5S,6R)-3,4-ジヒドロキシ-6-(ヒドロキシメチル)-5-(((2S,3R,4S,5R,6R)-3,4,5-トリヒドロキシ-6-(ヒドロキシメチル)テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)オキシ)テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(((1-((2S,3S,4S,5R,6S)-3,4-ジヒドロキシ-6-(ヒドロキシメチル)-5-(((2R,3S,4R,5S,6S)-3,4,5-トリヒドロキシ-6-(ヒドロキシメチル)テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)オキシ)テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)メチル)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムの合成
Figure 2022532918000638
1-(4-((S)-2-((S)-2-((S)-2-アミノペンタ-4-インアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((プロパ-2-イン-1-イルオキシ)メチル)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(44mg、0.031mmol、1.0当量)および1-アジド-1-デオキシ-ベータ-D-ラクトピラノシド(69.2mg、0.188mmol、6当量)を用いて一般手順2に従って、1-(4-((S)-2-((S)-2-((S)-2-アミノ-3-(1-((2R,3R,4R,5S,6R)-3,4-ジヒドロキシ-6-(ヒドロキシメチル)-5-(((2S,3R,4S,5R,6R)-3,4,5-トリヒドロキシ-6-(ヒドロキシメチル)テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)オキシ)テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(((1-((2S,3S,4S,5R,6S)-3,4-ジヒドロキシ-6-(ヒドロキシメチル)-5-(((2R,3S,4R,5S,6S)-3,4,5-トリヒドロキシ-6-(ヒドロキシメチル)テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)オキシ)テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)メチル)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=2133.7800、Rt=1.95分(5分酸性法)。
4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(2-(((1-((2S,3S,4S,5R,6S)-3,4-ジヒドロキシ-6-(ヒドロキシメチル)-5-(((2R,3S,4R,5S,6S)-3,4,5-トリヒドロキシ-6-(ヒドロキシメチル)テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)オキシ)テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)メチル)-4-((2S,5S,8S)-8-((1-((2R,3R,4R,5S,6R)-3,4-ジヒドロキシ-6-(ヒドロキシメチル)-5-(((2S,3R,4S,5R,6R)-3,4,5-トリヒドロキシ-6-(ヒドロキシメチル)テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)オキシ)テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メチル)-15-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)-5-イソプロピル-4,7,10-トリオキソ-2-(3-ウレイドプロピル)-13-オキサ-3,6,9-トリアザペンタデカンアミド)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(L47-P1)の合成
Figure 2022532918000639
1-(4-((S)-2-((S)-2-((S)-2-アミノ-3-(1-((2R,3R,4R,5S,6R)-3,4-ジヒドロキシ-6-(ヒドロキシメチル)-5-(((2S,3R,4S,5R,6R)-3,4,5-トリヒドロキシ-6-(ヒドロキシメチル)テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)オキシ)テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(((1-((2S,3S,4S,5R,6S)-3,4-ジヒドロキシ-6-(ヒドロキシメチル)-5-(((2R,3S,4R,5S,6S)-3,4,5-トリヒドロキシ-6-(ヒドロキシメチル)テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)オキシ)テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)メチル)ベンジル)-4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(19mg、0.009mmol、1.0当量)を用いて一般手順3に従って、4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(2-(((1-((2S,3S,4S,5R,6S)-3,4-ジヒドロキシ-6-(ヒドロキシメチル)-5-(((2R,3S,4R,5S,6S)-3,4,5-トリヒドロキシ-6-(ヒドロキシメチル)テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)オキシ)テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メトキシ)メチル)-4-((2S,5S,8S)-8-((1-((2R,3R,4R,5S,6R)-3,4-ジヒドロキシ-6-(ヒドロキシメチル)-5-(((2S,3R,4S,5R,6R)-3,4,5-トリヒドロキシ-6-(ヒドロキシメチル)テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)オキシ)テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)-1H-1,2,3-トリアゾール-4-イル)メチル)-15-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)-5-イソプロピル-4,7,10-トリオキソ-2-(3-ウレイドプロピル)-13-オキサ-3,6,9-トリアザペンタデカンアミド)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=2328.8301、Rt=2.15分(5分酸性法)。
1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(78-カルボキシ-2-メチル-3-オキソ-7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49,52,55,58,61,64,67,70,73,76-テトラコサオキサ-2,4-ジアザオクタヘプタコンチル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム
Figure 2022532918000640
THF(2mL)中の1-アミノ-3,6,9,12,15,18,21,24,27,30,33,36,39,42,45,48,51,54,57,60,63,66,69,72-テトラコサオキサペンタヘプタコンタン-75-酸(50mg、0.044mmol)、ビス(4-ニトロフェニル)カーボネート(13mg、0.043mmol)、およびDIPEA(20μL、0.12mmol)の混合物を、室温で2時間撹拌した。混合物を、窒素ガスを吹きつけることにより濃縮した。得られた固体残留物をDMF(1mL)に溶かした。1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-((メチルアミノ)メチル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(50mg、0.029mmol)およびDIPEA(100μL、0.573mmol)を添加した。混合物を室温で5分間撹拌した。混合物をDMSO(2mL)で希釈し、溶液をRP-HPLC ISCO goldクロマトグラフィー(MeCN/HO、0.1%TFA修飾剤)により精製した。凍結乾燥して、1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(78-カルボキシ-2-メチル-3-オキソ-7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49,52,55,58,61,64,67,70,73,76-テトラコサオキサ-2,4-ジアザオクタヘプタコンチル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを得た。HRMS:M+=2671.2700、Rt=2.88分(5分酸性法)。
4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(2-(78-カルボキシ-2-メチル-3-オキソ-7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49,52,55,58,61,64,67,70,73,76-テトラコサオキサ-2,4-ジアザオクタヘプタコンチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(L42-P1)
Figure 2022532918000641
1-(4-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)-2-(78-カルボキシ-2-メチル-3-オキソ-7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49,52,55,58,61,64,67,70,73,76-テトラコサオキサ-2,4-ジアザオクタヘプタコンチル)ベンジル)-4-(2-(2-クロロ-4-(6-(4-フルオロフェニル)-4-(((R)-1-((4-メトキシベンジル)オキシ)-3-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)-1-オキソプロパン-2-イル)オキシ)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-メチルピペラジン-1-イウムを用いて一般手順3に従って、4-(2-(4-(4-((R)-1-カルボキシ-2-(2-((2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル)メトキシ)フェニル)エトキシ)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル)-2-クロロ-3-メチルフェノキシ)エチル)-1-(2-(78-カルボキシ-2-メチル-3-オキソ-7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40,43,46,49,52,55,58,61,64,67,70,73,76-テトラコサオキサ-2,4-ジアザオクタヘプタコンチル)-4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)エトキシ)プロパンアミド)-3-メチルブタンアミド)-5-ウレイドペンタンアミド)ベンジル)-1-メチルピペラジン-1-イウム(L42-P1)を得た。HRMS:M+=2646.7700、Rt=2.38分(5分酸性法)。
以下の化合物は、上記の手順と同様の手順を使用して調製した。
Figure 2022532918000642
Figure 2022532918000643
Figure 2022532918000644
Figure 2022532918000645
Figure 2022532918000646
L43-P1、L44-P1およびL45-P1におけるポリエチレングリコールを調製するための合成方法を以下に記載する。
2-オキソ-6,9,12,15,18,21,24,27,30,33,36,39,42,45,48,51,54,57,60,63,66,69,72,75-テトラコサオキサ-3-アザオクタヘプタコンタン-78-酸の合成
Figure 2022532918000647
ジクロロメタン(0.5mL)中の1-アミノ-3,6,9,12,15,18,21,24,27,30,33,36,39,42,45,48,51,54,57,60,63,66,69,72-テトラコサオキサペンタヘプタコンタン-75-酸(100mg、0.087mmol、1.0当量)およびDIPEA(24.8mg、34μL、0.192mmol、2.2当量)の撹拌溶液に、無水酢酸(8.9mg、8.25μL、1.0当量)を添加した。得られた混合物を周囲温度で1.5時間撹拌した。溶媒を減圧下で除去した。得られた残留物をDMSO(1mL)に溶かし、RP-HPLC ISCO goldクロマトグラフィー(10~100%MeCN/H2O、0.1%TFA修飾剤)により精製した。凍結乾燥して、2-オキソ-6,9,12,15,18,21,24,27,30,33,36,39,42,45,48,51,54,57,60,63,66,69,72,75-テトラコサオキサ-3-アザオクタヘプタコンタン-78-酸(62.3mg、0.052mmol、収率60%)を得た。LC/MS [M-H]- 1187.3 Rt=0.75分(2分酸性法)。1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 7.86 (s, 1H), 3.60 (t, J = 6.4 Hz, 3H), 3.50 (d, J = 4.9 Hz, 91H), 3.40 (t, J = 5.9 Hz, 2H), 3.18 (q, J = 5.8 Hz, 2H), 2.44 (t, J = 6.4 Hz, 2H), 1.80 (s, 3H).
4-オキソ-3,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68,71,74,77-ペンタコサオキサ-5-アザオクタコンタン-80-酸の合成
Figure 2022532918000648
ジクロロメタン(0.5mL)中の1-アミノ-3,6,9,12,15,18,21,24,27,30,33,36,39,42,45,48,51,54,57,60,63,66,69,72-テトラコサオキサペンタヘプタコンタン-75-酸(100mg、0.087mmol、1.0当量)およびDIPEA(24.8mg、34μL、0.192mmol、2.2当量)の撹拌溶液に、クロロギ酸エチル(9.5mg、8.34μL、1.0当量)を添加した。得られた混合物を周囲温度で1.5時間撹拌した。溶媒を減圧下で除去した。得られた残留物をDMSO(1mL)に溶かし、RP-HPLC ISCO goldクロマトグラフィー(10~100%MeCN/H2O、0.1%TFA修飾剤)により精製した。凍結乾燥して、4-オキソ-3,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68,71,74,77-ペンタコサオキサ-5-アザオクタコンタン-80-酸(75mg、0.062mmol、収率71%)を得た。LC/MS [M-H]- 1217.3 Rt=0.81分(2分酸性法)。1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 7.03 (s, 1H), 3.97 (q, J = 7.1 Hz, 2H), 3.60 (t, J = 6.4 Hz, 2H), 3.50 (d, J = 5.0 Hz, 92H), 3.40 (t, J = 6.1 Hz, 2H), 3.11 (q, J = 5.9 Hz, 2H), 2.45 (q, J = 6.5 Hz, 2H), 1.15 (t, J = 7.1 Hz, 3H,).
4-オキソ-2,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68,71,74,77-ペンタコサオキサ-5-アザオクタコンタン-80-酸の合成
Figure 2022532918000649
ジクロロメタン(0.5mL)中の1-アミノ-3,6,9,12,15,18,21,24,27,30,33,36,39,42,45,48,51,54,57,60,63,66,69,72-テトラコサオキサペンタヘプタコンタン-75-酸(100mg、0.087mmol、1.0当量)およびDIPEA(24.8mg、34μL、0.192mmol、2.2当量)の撹拌溶液に、メトキシアセチルクロリド(11.36mg、9.57μL、1.2当量)を添加した。得られた混合物を周囲温度で1.5時間撹拌した。溶媒を減圧下で除去した。得られた残留物をDMSO(1mL)に溶かし、RP-HPLC ISCO goldクロマトグラフィー(10~100%MeCN/H2O、0.1%TFA修飾剤)により精製した。凍結乾燥して、4-オキソ-2,8,11,14,17,20,23,26,29,32,35,38,41,44,47,50,53,56,59,62,65,68,71,74,77-ペンタコサオキサ-5-アザオクタコンタン-80-酸(69mg、0.057mmol、収率65%)を得た。LC/MS [M-H]- 1217.4 Rt=0.75分(2分酸性法)。1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 7.68 (s, 1H), 3.79 (s, 2H), 3.60 (t, J = 6.4 Hz, 2H), 3.51 (s, 92H), 3.43 (t, J = 6.0 Hz, 2H), 3.30 (s, 3H), 3.26 (q, J = 6.0 Hz, 2H), 2.44 (t, J = 6.4 Hz, 2H).
[実施例3]
Mcl-1ペイロードの合成および特徴付け
例示的なペイロードは、この実施例に記載した例示的な方法を使用して合成した。
C1の調製:
(2R)-2-{[(5S)-5-{3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル}-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ}-3-(2-{[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ}フェニル)プロパン酸
Figure 2022532918000650
C1は、国際公開第2015/097123号における実施例30に従って調製した。
C2の調製:
(2R)-2-[(5S)-5-[3-クロロ-2-メチル-4-[2-[4-メチル-4-(3-スルホプロピル)ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]フェニル]-6-(4-フルオロ-3-ヒドロキシ-フェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸
Figure 2022532918000651
ステップA:5-ブロモ-4-クロロ-6-(4-フルオロ-3-テトラヒドロピラン-2-イルオキシ-フェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン
4.49gの5-ブロモ-4-クロロ-6-ヨード-チエノ[2,3-d]ピリミジン(11.96mmol;国際公開第2015/097123号、調製1aに従って得た)および4.31gの(4-フルオロ-3-テトラヒドロピラン-2-イルオキシ-フェニル)ボロン酸(17.94mmol)を、60mLのTHFに溶解し、次いで134mgのPd(OAc)2(0.60mmol)、508mgのtBuXPhos(1.20mmol)、11.69gのCs2CO3(35.88mmol)および60mLの水を添加し、混合物を、さらなる変換が観察されなくなるまでN2雰囲気下、70℃で撹拌した。次いで、これを水で希釈し、2M HCl水溶液で中和し、DCMで抽出した。合わせた有機層をNaSOで乾燥させ、濾過し、濾液を減圧下で濃縮した。粗生成物生成物を、溶離液としてヘプタンおよびEtOAcを使用するフラッシュクロマトグラフィーにより精製して、5-ブロモ-4-クロロ-6-(4-フルオロ-3-テトラヒドロピラン-2-イルオキシ-フェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジンを得た。1H NMR (500 MHz, DMSO-d6) δ: 9.02 (s, 1H), 7.64 (dd, J = 7.9, 2.1 Hz, 1H), 7.47 (dd, J = 11.0, 8.5 Hz, 1H), 7.36 (m, 1H), 5.63 (m, 1H), 3.81 (m, 1H), 3.61 (m, 1H), 1.94-1.78 (m, 3H), 1.69-1.50 (m, 3H). 13C NMR (125 MHz, DMSO-d6) δ: 166.6, 153.9, 153.1, 152.7, 144.3, 139.2, 127.7, 126.6, 124.2, 119.9, 117.1, 100.7, 97.2, 61.6, 29.5, 24.5, 18.2.
1713SBrClFのHRMS計算値:441.9554;実測値442.9624(M+H)。
ステップB:エチル(2R)-2-[5-ブロモ-6-(4-フルオロ-3-テトラヒドロピラン-2-イルオキシ-フェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパノエート
3.09gの5-ブロモ-4-クロロ-6-(4-フルオロ-3-テトラヒドロピラン-2-イルオキシ-フェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン(6.97mmol)、3.28gのエチル(2R)-2-ヒドロキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパノエート(8.02mmol;国際公開第2015/097123号、調製3bsに従って得た)を、70mLのtert-ブタノールに溶解し、次いで6.82gのCsCO(20.9mmol)を添加し、混合物を、さらなる変換が観察されなくなるまでN雰囲気下、70℃で撹拌した。次いで、これを水で希釈し、2M HCl水溶液で中和し、DCMで抽出した。合わせた有機層をNaSOで乾燥させ、濾過し、濾液を減圧下で濃縮した。粗生成物を、溶離液としてヘプタンおよびEtOAcを使用するフラッシュクロマトグラフィーにより精製して、エチル(2R)-2-[5-ブロモ-6-(4-フルオロ-3-テトラヒドロピラン-2-イルオキシ-フェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパノエートをジアステレオ異性体の混合物として得た。C4036SBrFのHRMS計算値:814.1472;実測値815.1539(M+H)。
ステップC:エチル(2R)-2-[5-[3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル]-6-(4-フルオロ-3-テトラヒドロピラン-2-イルオキシ-フェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパノエート
3.65gのエチル(2R)-2-[5-ブロモ-6-(4-フルオロ-3-テトラヒドロピラン-2-イルオキシ-フェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパノエート(4.47mmol)および2.12gの1-[2-[2-クロロ-3-メチル-4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)フェノキシ]エチル]-4-メチル-ピペラジン(5.36mmol;国際公開第2015/097123号、調製5bに従って得た)を、22mLのジオキサンに溶解し、次いで315mgのPdCl×AtaPhos(0.45mmol)、4.37gのCsCO(13.41mmol)および22mLの水を添加し、混合物を完全な変換までN雰囲気下、70℃で撹拌した。次いで、これを水で希釈し、2M HCl水溶液で中和し、EtOAcで抽出した。合わせた有機層をNaSOで乾燥させ、濾過し、濾液を減圧下で濃縮した。粗生成物生成物を、溶離液としてEtOAcおよびMeOH、次いでDCMおよびMeOHを使用するフラッシュクロマトグラフィーにより精製して、エチル(2R)-2-[5-[3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル]-6-(4-フルオロ-3-テトラヒドロピラン-2-イルオキシ-フェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパノエートを2つのジアステレオ異性体対の混合物として得た。C5456SClFのHRMS計算値:1002.3553;実測値1003.3614および1003.3622(M+H)。
ステップD:(2R)-2-[(5Sa)-5-[3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル]-6-(4-フルオロ-3-テトラヒドロピラン-2-イルオキシ-フェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸
3.47gのエチル(2R)-2-[5-[3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル]-6-(4-フルオロ-3-テトラヒドロピラン-2-イルオキシ-フェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパノエート(3.46mmol)を、35mLのジオキサンに溶解し、次いで1.45gのLiOH×HO(34.6mmol)および35mLの水を添加した。混合物を完全な加水分解まで室温で撹拌した。次いで、これを水で希釈し、2M HCl水溶液でpH4に酸性化し、DCMで抽出した。合わせた有機相をNaSOで乾燥させ、濾過し、濾液を減圧下で濃縮した。アトロプ異性体を、溶離液として25mM NHHCO水溶液およびMeCNを使用する分取逆相クロマトグラフィーにより精製および分離した。後に溶出するアトロプ異性体対を(2R)-2-[(5Sa)-5-[3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル]-6-(4-フルオロ-3-テトラヒドロピラン-2-イルオキシ-フェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸として単離した。C5252SClFのHRMS計算値:974.3240;実測値975.3303(M+H)。
ステップE:(4-メトキシフェニル)メチル(2R)-2-[(5Sa)-5-[3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル]-6-(4-フルオロ-3-テトラヒドロピラン-2-イルオキシ-フェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパノエート
2.39gの(2R)-2-[(5Sa)-5-[3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル]-6-(4-フルオロ-3-テトラヒドロピラン-2-イルオキシ-フェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸(2.45mmol)、1.13gのDTBAD(4.91mmol)および1.29gのPPh(4.91mmol)を、49mLのトルエンに溶解し、次いで0.61mLのPMB-OH(4.91mmol)を添加し、反応混合物を完全な変換まで50℃で撹拌した。次いで、混合物をDCMで希釈し、次いで減圧下で濃縮し、次いで溶離液としてヘプタンおよびEtOAcを使用するフラッシュクロマトグラフィーにより精製して、(4-メトキシフェニル)メチル(2R)-2-[(5Sa)-5-[3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル]-6-(4-フルオロ-3-テトラヒドロピラン-2-イルオキシ-フェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパノエートをジアステレオ異性体の混合物として得た。C6060SClFのHRMS計算値:1094.3815;実測値1095.3880(M+H)。
ステップF:(2R)-2-[(5S)-5-[3-クロロ-2-メチル-4-[2-[4-メチル-4-(3-スルホプロピル)ピペラジン-4-イウム-1-イル]エトキシ]フェニル]-6-(4-フルオロ-3-ヒドロキシ-フェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸(C2)
600mgの(4-メトキシフェニル)メチル(2R)-2-[(5Sa)-5-[3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル]-6-(4-フルオロ-3-テトラヒドロピラン-2-イルオキシ-フェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパノエート(0.548mmol)を、11mLのMeCNに溶解し、次いで0.48mLのオキサチオラン2,2-ジオキシド(5.48mmol)を添加し、混合物を完全な変換までN雰囲気下、60℃で撹拌した。次いで、これを減圧下で濃縮し、8mLのDCMに溶解し、次いで2.2mLのTFAを添加し、混合物をTHPおよびPMBの完全な切断まで室温で撹拌した。次いで、これを濃縮した(加熱浴を取り外した)。これを10mLのTHFに溶解し、減圧下、30℃の浴中で再度濃縮した。粗生成物を、溶離液として5mM NHHCO水溶液およびMeCNを使用する分取逆相クロマトグラフィーにより精製して、C2を得た。1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ: 13.19 (br s, 1H), 10.16 (br s, 1H), 8.89 (d, J = 5.2 Hz, 1H), 8.58 (s, 1H), 7.68 (br s, 1H), 7.52 (dd, J = 7.5, 1.8 Hz, 1H), 7.46 (m, 1H), 7.33 (d, J = 8.3 Hz, 1H), 7.22-7.09 (m, 4H), 7.06-7.00 (m, 2H), 6.86 (dd, J = 8.3, 2.0 Hz, 1H), 6.74 (t, J = 7.4 Hz, 1H), 6.66 (m, 1H), 6.23 (d, J = 6.7 Hz, 1H), 5.46 (dd, J = 9.8, 3.3 Hz, 1H), 5.27 (d, J = 15.2 Hz, 1H), 5.22 (d, J = 15.2 Hz, 1H), 4.23 (m, 2H), 3.76 (s, 3H), 3.46 (m, 2H), 3.41-3.23 (m, 5H), 2.97 (s, 3H), 2.94-2.77 (m, 6H), 2.48 (m, 1H), 2.45 (t, J = 7.0 Hz, 2H), 2.00-1.90 (m, 2H), 1.86 (s, 3H). 13C NMR (100 MHz, DMSO-d6) δ: 170.8, 166.2, 165.9, 164.7, 157.7, 157.2, 155.4, 153.6, 152.7, 152.3, 149.9, 145.1, 137.0, 135.9, 131.0, 130.8, 130.3, 129.2, 128.34, 128.32, 128.2, 128.0, 122.0, 120.5, 120.1, 118.8, 118.2, 116.6, 115.6, 112.2, 111.9, 110.6, 73.3, 69.0, 67.3, 59.2, 59.1, 55.71, 55.68, 47.6, 46.1, 31.8, 18.1, 17.6.
505010ClFのHRMS計算値:1012.2703;実測値1013.2775(M+H)。
C3の調製:
(2R)-2-{[(5Sa)-5-{3-クロロ-2-メチル-4-[2-(ピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル}-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ}-3-(2-{[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ}フェニル)プロパン酸
Figure 2022532918000652
C3は、国際公開第2015/097123号における実施例744に従って調製した。
C4の調製:
(2R)-2-{[(5Sa)-5-{3-クロロ-2-メチル-4-[2-(ピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル}-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ}-3-(2-{[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ}フェニル)プロパン酸
Figure 2022532918000653
ステップ1:エチル(2R)-2-[5-ブロモ-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[(2-クロロピリミジン-4-イル)メトキシ]フェニル]プロパノエート
THF(38mL)中のエチル(2R)-3-[2-[(2-クロロピリミジン-4-イル)メトキシ]フェニル]-2-ヒドロキシ-プロパノエート(25g、74.2mmol)の溶液に、5-ブロモ-6-(4-フルオロフェニル)-4-ヨード-チエノ[2,3-d]ピリミジン(23g、67.5mmol)および炭酸セシウム(67g、203mmol)を連続的に添加した。反応物を終夜加熱還流し、揮発物を蒸発させた。残留物を酢酸エチルおよび水(それぞれ500および400mL)で希釈した。溶液を濾過する。有機層を分離し、ブラインで洗浄し、硫酸マグネシウムで乾燥させ、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(石油エーテル中酢酸エチルの勾配)により精製して、エチル(2R)-2-[5-ブロモ-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[(2-クロロピリミジン-4-イル)メトキシ]フェニル]プロパノエートをわずかに橙色の固体として得た。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 8.83 (d, 1H), 8.65 (s, 1H), 7.75 (m, 2H), 7.71 (d, 1H), 7.48 (d, 1H), 7.45 (m, 2H), 7.25 (t, 1H), 7.06 (d, 1H), 6.95 (t, 1H), 5.75 (dd, 1H), 5.28 (2d, 2H), 4.18 (q, 2H), 3.6/3.3 (2dd, 2H), 1.12 (t, 3H).
IR波長(cm-1):1749。
ステップ2:(4-ブロモ-2-クロロ-3-メチル-フェノキシ)-トリイソプロピル-シラン
ジクロロメタン(1.5L)中の4-ブロモ-2-クロロ-3-メチル-フェノール(100g、482mmol)の溶液に、イミダゾール(82g、1.2mol)を添加し、クロロ(トリイソプロピル)シラン(102mL、482mmol)を1時間かけて滴下添加した。反応物を室温で1時間撹拌し、水を添加した(500mL)。有機層をブライン(200mL)で洗浄し、硫酸マグネシウムで乾燥させ、濃縮した。残留物をさらに精製することなく使用した。1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 7.48 (s, 1H), 7.2 (dd, 1H), 6.7 (d, 1H), 1.3 (m, 3H), 1.1 (2s, 18H).
ステップ3:tert-ブチル-[2-クロロ-3-メチル-4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)フェノキシ]-ジメチル-シラン
アルゴン下、-78℃のTHF(350mL)中の(4-ブロモ-2-クロロ-3-メチル-フェノキシ)-トリイソプロピル-シラン(27.2g、71.9mmol)の溶液に、THF中n-ブチルリチウム1.6Mの溶液(49.5mL、79.9mmol)を30分間かけて滴下添加した。反応物を-78℃で2時間撹拌し、THF(50mL)中の2-イソプロポキシ-4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン(16.1g、86.4mmol)の溶液を30分間かけて滴下添加した。-78℃で2時間撹拌した後、反応混合物を、水(20mL)をゆっくりと添加することによりクエンチし、室温に加温し、水(200mL)で希釈し、酢酸エチルで抽出した。合わせた有機層をブラインで洗浄し、硫酸マグネシウムで乾燥させ、真空下で濃縮した。残留物をさらに精製することなく使用した。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 7.5 (d, 1H), 6.82 (d, 1H), 2.52 (s, 3H), 1.32 (m, 3H), 1.3 (s, 12H), 1.08 (s, 18H).
ステップ4:2-クロロ-3-メチル-4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)フェノール
THF(750mL)中のtert-ブチル-[2-クロロ-3-メチル-4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)フェノキシ]-ジメチル-シラン(25.4g、59.8mmol)の溶液に、室温でTHF中フッ化テトラブチルアンモニウム1Mの溶液(90mL、90mmol)を滴下添加した。反応混合物を2時間撹拌し、濃縮し、酢酸エチルで希釈し、水で分配し、酢酸エチルで抽出した。合わせた有機層をブラインで洗浄し、硫酸マグネシウムで乾燥させ、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(ジクロロメタン中エタノールの勾配)により精製して、2-クロロ-3-メチル-4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)フェノールを得た。1H NMR (400 MHz, dmso-d6): δ 10.4 (m, 1H), 7.4 (d, 1H), 6.8 (d, 1H), 2.5 (s, 3H), 1.3 (s, 12H).
IR波長(cm-1):3580~3185、1591、857、827。
ステップ5:エチル(2R)-2-{[(5S)-5-(3-クロロ-4-ヒドロキシ-2-メチルフェニル)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ}-3-{2-[(2-クロロピリミジン-4-イル)メトキシ]フェニル}プロパノエート
THF/HO 1/1の混合物(800mL)中のエチル(2R)-2-[5-ブロモ-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[(2-クロロピリミジン-4-イル)メトキシ]フェニル]プロパノエート(43.8g、61.2mmol)および2-クロロ-3-メチル-4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)フェノール(19.7g、73.5mmol)の溶液に、炭酸セシウム(40g、122mmol)を添加した。反応物を、溶液にアルゴンを20分間バブリングすることにより脱気し、ビス(ジ-tert-ブチル(4-ジメチルアミノフェニル)ホスフィン)ジクロロパラジウム(II)(4.35g、6.1mmol)を添加した。反応混合物をアルゴン下、80℃で終夜加熱した。反応物を水で希釈し、酢酸エチルで分配し、酢酸エチルで抽出した。合わせた有機層をブラインで洗浄し、硫酸マグネシウムで乾燥させ、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(ジクロロメタン中メタノールの勾配)により精製して、エチル(2R)-2-[5-(3-クロロ-4-ヒドロキシ-2-メチル-フェニル)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[(2-クロロピリミジン-4-イル)メトキシ]フェニル]プロパノエートをジアステレオ異性体 85/15(aS/aRまたはS/R)の混合物として得た。光学的に純粋なaS(またはS)を分取SFC精製により得た。
ステップ6:tert-ブチル4-(2-{2-クロロ-4-[4-{[(2R)-3-{2-[(2-クロロピリミジン-4-イル)メトキシ]フェニル}-1-エトキシ-1-オキソプロパン-2-イル]オキシ}-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル]-3-メチルフェノキシ}エチル)ピペラジン-1-カルボキシレート
THF中のトリフェニルホスフィン(2.66g、10mmol)の溶液に、アルゴン下、室温でアゾジカルボン酸ジイソプロピル(2.33g、10mmol)を添加した。15分間撹拌した後、THF(8mL)中のtert-ブチル4-(2-ヒドロキシエチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(2.33g、10mmol)の溶液を添加した。反応物を室温で1時間撹拌し、次いでTHF(8mL)中の(2R)-2-[(5S)-5-(3-クロロ-4-ヒドロキシ-2-メチル-フェニル)-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[(2-クロロピリミジン-4-イル)メトキシ]フェニル]プロパン酸(3.57g、5mmol)の溶液を滴下添加した。反応物を室温で96時間撹拌し、濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(ジクロロメタン中メタノール(7Mアンモニアを含有)の勾配)により精製して、tert-ブチル4-(2-{2-クロロ-4-[4-{[(2R)-3-{2-[(2-クロロピリミジン-4-イル)メトキシ]フェニル}-1-エトキシ-1-オキソプロパン-2-イル]オキシ}-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル]-3-メチルフェノキシ}エチル)ピペラジン-1-カルボキシレートを得た。1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 8.95 (d, 1H), 8.58 (s, 1H), 8.32 (d, 2H), 7.58 (d, 1H), 7.41 (dd, 2H), 7.32 (d, 1H), 7.29 (dd, 2H), 7.22 (t, 2H), 7.21 (d, 1H), 7.19 (t, 1H), 7.05 (d, 1H), 6.75 (t, 1H), 6.31 (dd, 1H), 5.53 (dd, 1H), 5.29 (dd, 2H), 4.2 (m, 2H), 4.05 (q, 2H), 3.97 (m, 4H), 3.3 (m, 2H), 3.2 (t, 4H), 3.19/2.59 (m, 2H), 2.72 (t, 2H), 2.4 (t, 4H), 1.87 (s, 3H), 1.37 (s, 9H), 1.18 (t, 6H), 1.05 (t, 3H). 13C NMR (125 MHz, CDCl3): δ 158, 152, 131, 131, 130, 130, 128, 127, 120.5, 116, 116, 112, 110, 73, 68.5, 67, 62, 61, 56, 52, 43, 32, 32, 28, 17, 16, 14.
ステップ7:tert-ブチル4-(2-{2-クロロ-4-[4-{[(2R)-3-{2-[(2-{4-[(ジエトキシホスホリル)メチル]フェニル}ピリミジン-4-イル)メトキシ]フェニル}-1-エトキシ-1-オキソプロパン-2-イル]オキシ}-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル]-3-メチルフェノキシ}エチル)ピペラジン-1-カルボキシレート
ジオキサン(2.5mL)中のtert-ブチル4-(2-{2-クロロ-4-[4-{[(2R)-3-{2-[(2-クロロピリミジン-4-イル)メトキシ]フェニル}-1-エトキシ-1-オキソプロパン-2-イル]オキシ}-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル]-3-メチルフェノキシ}エチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(337mg、0.367mmol)および[4-(ジエトキシホスホリルメチル)フェニル]ボロン酸(200mg、0.735mmol)の溶液に、水(2.5mL)および炭酸セシウム(241mg、0.735mmol)を添加した。反応混合物を、溶液にアルゴンを30分間バブリングすることにより脱気し、ビス(トリフェニルホスフィン)パラジウム(II)ジクロリド(2.5mg、3.6μmol)を添加し、反応混合物を密封容器内でマイクロ波照射により90℃で3時間加熱した。反応物を酢酸エチルおよび水で希釈した。水層を酢酸エチルで抽出し、合わせた有機層をブラインで洗浄し、硫酸マグネシウムで乾燥させ、真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(ジクロロメタン中メタノールの勾配)により精製して、tert-ブチル4-(2-{2-クロロ-4-[4-{[(2R)-3-{2-[(2-{4-[(ジエトキシホスホリル)メチル]フェニル}ピリミジン-4-イル)メトキシ]フェニル}-1-エトキシ-1-オキソプロパン-2-イル]オキシ}-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル]-3-メチルフェノキシ}エチル)ピペラジン-1-カルボキシレートを得た。1H NMR (500 MHz, dmso-d6): δ 8.95 (d, 1H), 8.58 (s, 1H), 8.32 (d, 2H), 7.58 (d, 1H), 7.41 (dd, 2H), 7.32 (d, 1H), 7.29 (dd, 2H), 7.22 (t, 2H), 7.21 (d, 1H), 7.19 (t, 1H), 7.05 (d, 1H), 6.75 (t, 1H), 6.31 (dd, 1H), 5.53 (dd, 1H), 5.29 (2d, 2H), 4.2 (m, 2H), 4.05 (q, 2H), 3.97 (m, 4H), 3.3 (m, 2H), 3.2 (t, 4H), 3.19/2.59 (2dd, 2H), 2.72 (t, 2H), 2.4 (t, 4H), 1.87 (s, 3H), 1.37 (s, 9H), 1.18 (t, 6H), 1.05 (t, 3H). 13C NMR (125 MHz, dmso-d6) δ 158, 152, 131, 131, 130, 130, 128, 127, 120.5, 116, 116, 112, 110, 73, 68.5, 67, 62, 61, 56, 52, 43, 32, 32, 28, 17, 16, 14
ステップ8:(2R)-2-[(5S)-5-[3-クロロ-2-メチル-4-(2-ピペラジン-1-イルエトキシ)フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-[4-(ホスホノメチル)フェニル]ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸の合成
ジクロロメタン(5mL)中のtert-ブチル4-(2-{2-クロロ-4-[4-{[(2R)-3-{2-[(2-{4-[(ジエトキシホスホリル)メチル]フェニル}ピリミジン-4-イル)メトキシ]フェニル}-1-エトキシ-1-オキソプロパン-2-イル]オキシ}-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-5-イル]-3-メチルフェノキシ}エチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(540mg、0.486mmol)の溶液に、ブロモトリメチルシラン(186μL、1.46mmol)を添加した。反応混合物を終夜加熱還流した。さらにブロモトリメチルシランを室温で添加し(186μL、1.46mmol)、反応物を20時間加熱還流し、濃縮乾固した。残留物をメタノールに溶かし、室温で3時間撹拌し、濃縮して、褐色粘性油状物を得、これをジオキサン(4mL)および水(4mL)で希釈した。水酸化リチウム一水和物(100mg、24mmol)を少量ずつ添加し、反応混合物を室温で1時間撹拌し、45℃で3時間加熱し、濃縮した。残留物を水(5mL)で希釈し、2M HCl水溶液の滴下添加によりpH2に酸性化した。沈殿物を濾過し、THFで洗浄し、Xbridgeカラム上への反応混合物の直接堆積による、かつNHHCO法を使用するC18逆相分取HPLCにより精製して、C4を得た。1H NMR (500 MHz, dmso-d6): δ 8.88 (br d, 1 H), 8.25 (d, 2 H), 7.75 (t, 1 H), 7.59 (s, 1 H), 7.52 (d, 1 H), 7.35 (d, 2 H), 7.23 (dd, 2 H), 7.18 (d, 1 H), 7.15 (t, 2 H), 7.11 (t, 1 H), 7.02 (d, 1 H), 6.82 (d, 1 H), 6.64 (m, 1 H), 5.51 (d, 1 H), 5.28/5.07 (m, 2 H), 3.82/3.55 (2m, 2 H), 3.35/2.55 (br s, 2 H), 2.81 (d, 2 H), 2.55 (m, 4 H), 2.4/2.27 (2m, 2 H), 2.21 (m, 4 H), 1.65 (br s, 3 H). 13C NMR (125 MHz, dmso-d6): δ 131.5, 130.2, 129.7, 127.4, 127.2, 120.3, 115.9, 115.3, 111.9, 110.3, 75.1, 69.2, 67.3, 56.4, 49.9, 42.4, 40, 38.9, 18.1. 31P NMR (200 MHz, dmso-d6): δ 15
HR-ESI+:m/z[M+H]+=925.2356/925.2346(測定値/理論値)
C5の調製:
(2R)-2-{[(5Sa)-5-{3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル}-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ}-3-(2-{[2-(4-ヒドロキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ}フェニル)プロパン酸
Figure 2022532918000654
C5は、国際公開第2016/207216号における実施例3に従って調製した。
C6の調製:
(2R)-2-{[(5S)-5-{3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル}-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ}-3-[2-({2-[2-(ヒドロキシメチル)フェニル]ピリミジン-4-イル}メトキシ)フェニル]プロパン酸
Figure 2022532918000655
C6は、国際公開第2015/097123号における実施例728に従って調製した。
C7の調製:
(2R)-2-[(5S)-5-[3-クロロ-2-エチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル]-6-プロパ-1-イニル-チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸
Figure 2022532918000656
ステップA:エチル(2R)-2-(5-ヨード-6-プロパ-1-イニル-チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル)オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパノエート
5.0gの4-クロロ-5-ヨード-6-プロパ-1-イニル-チエノ[2,3-d]ピリミジン(15.0mmol;国際公開第2015/097123号、調製2fに従って得た)および6.10gのエチル(2R)-2-ヒドロキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパノエート(15.0mmol;国際公開第2015/097123号、調製3bsに従って得た)を、150mLのtert-ブタノールに溶解し、次いで14.7gのCsCO(45.0mmol)を添加し、混合物を、さらなる変換が観察されなくなるまでN雰囲気下、50℃で撹拌した。次いで、水およびブラインを添加し、混合物をEtOAcで抽出した。合わせた有機層をNaSOで乾燥させ、濾過し、濾液を減圧下で濃縮した。粗生成物を、溶離液としてヘプタンおよびEtOAcを使用するフラッシュクロマトグラフィーにより精製して、エチル(2R)-2-(5-ヨード-6-プロパ-1-イニル-チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル)オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパノエートを得た。1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ: 8.89 (d, J = 5.1 Hz, 1H), 8.59 (s, 1H), 7.62 (d, J = 5.2 Hz, 1H), 7.55 (dd, J = 7.5, 1.6 Hz, 1H), 7.51 (dd, J = 7.5, 1.6 Hz, 1H), 7.43 (m, 1H), 7.26 (m, 1H), 7.11 (m, 2H), 7.02 (td, J = 7.5, 0.9 Hz, 1H), 6.94 (td, J = 7.4, 0.8 Hz, 1H), 5.79 (dd, J = 9.1, 4.6 Hz, 1H), 5.31 (d, J = 14.9 Hz, 1H), 5.26 (d, J = 14.9 Hz, 1H), 4.13 (m, 2H), 3.76 (s, 3H), 3.60 (dd, J = 13.8, 4.5 Hz, 1H), 3.33 (m, 1H), 2.21 (s, 3H), 1.10 (t, J = 7.1 Hz, 3H). 13C NMR (100 MHz, DMSO-d6) δ: 169.4, 166.5, 165.7, 164.8, 161.3, 157.7, 155.8, 153.6, 132.2, 131.0, 130.8, 128.3, 124.0, 120.9, 120.1, 115.5, 112.2, 112.0, 110.5, 98.9, 79.5, 74.4, 74.3, 69.1, 61.1, 55.7, 13.9, 4.6.
ステップB:2-クロロ-3-エチル-4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)フェノール
33.7gの[2-クロロ-3-エチル-4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)フェノキシ]-トリイソプロピル-シラン(76.9mmol;国際公開第2015/097123号、調製5eに従って得た)を、600mLのTHFに溶解し、0℃に冷却し、次いで92.3mLのTBAF(92.3mmol、THF中1M溶液)を滴下添加し、混合物を完全な変換まで撹拌した。次いで、これをブラインで希釈し、クエン酸で酸性化し、次いでDCMで抽出した。合わせた有機層をNaSOで乾燥させ、濾過し、濾液を減圧下で濃縮した。粗生成物を、溶離液としてヘプタンおよびEtOAcを使用するフラッシュクロマトグラフィーにより精製して、2-クロロ-3-エチル-4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)フェノールを得た。1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ: 7.63 (d, J = 8.2 Hz, 1H), 6.86 (d, J = 8.2 Hz, 1H), 5.87 (s, 1H), 3.09 (q, J = 7.44 Hz, 2H), 1.33(s, 12H), 1.15 (t, J = 7.44 Hz, 3H).
ステップC:エチル(2R)-2-[5-(3-クロロ-2-エチル-4-ヒドロキシ-フェニル)-6-プロパ-1-イニル-チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパノエート
353mgのエチル(2R)-2-(5-ヨード-6-プロパ-1-イニル-チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル)オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパノエート(0.50mmol)および282mgの2-クロロ-3-エチル-4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)フェノール(0.55mmol)を、2mLのジオキサンに溶解し、次いで35mgのPdCl×AtaPhos(0.05mmol)、326mgのCsCO(1.00mmol)および1mLの水を添加し、混合物をN雰囲気下、マイクロ波反応器内にて100℃で20分間撹拌した。次いで、これをブラインで希釈し、1M HCl水溶液でpH5に酸性化し、DCMで抽出した。合わせた有機層をNaSOで乾燥させ、濾過し、濾液を減圧下で濃縮した。粗生成物を、溶離液としてヘプタンおよびEtOAcを使用するフラッシュクロマトグラフィーにより精製した。次いで、これを、溶離液として5mM NHHCO水溶液およびMeCNを使用する分取逆相クロマトグラフィーによりさらに精製して、エチル(2R)-2-[5-(3-クロロ-2-エチル-4-ヒドロキシ-フェニル)-6-プロパ-1-イニル-チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパノエートをアトロプ異性体の2:1混合物として得た。1H NMR (500 MHz, DMSO-d6) δ: 10.35/10.29 (s, 1H), 8.93 (d, J = 5.1 Hz, 1H), 8.59/8.57 (s, 1H), 7.63/7.60 (d, J = 5.1 Hz, 1H), 7.54-6.93 (m, 8 H), 6.84/6.74 (t, J = 7.5 Hz, 1H), 6.43/6.18 (dd, J = 7.5, 1.4 Hz, 1H), 5.51/5.40 (m, 1H), 5.30-5.16 (m, 2H), 4.17-3.99 (m, 2H), 3.76/3.75 (s, 3H), 3.34-3.14 (m, 1H), 2.93-2.35 (m, 3H), 2.02/1.98 (s, 3H), 1.08/1.04 (t, J = 7.0 Hz, 3H), 0.94/0.76 (t, J = 7.5 Hz, 3H).
ステップD:(2R)-2-[(5Sa)-5-[3-クロロ-2-エチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル]-6-プロパ-1-イニル-チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸、C7
322mgのエチル(2R)-2-[5-(3-クロロ-2-エチル-4-ヒドロキシ-フェニル)-6-プロパ-1-イニル-チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパノエート(0.44mmol)、190mgの2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エタノール(1.32mmol)および346mgのPPh(1.32mmol)を、10mLの乾燥トルエンに溶解し、次いで304mgのDTBAD(1.32mmol)を添加し、混合物を、さらなる変換が観察されなくなるまでN雰囲気下、50℃で撹拌した。次いで、混合物を減圧下で濃縮し、残留物を、溶離液としてヘプタン、EtOAcおよびMeOHを使用するフラッシュクロマトグラフィーにより精製し、次いで溶離液として5mM NHHCO水溶液およびMeCNを使用する分取逆相クロマトグラフィーによりさらに精製して、エステル中間体を得た。これを2mLのジオキサンに溶解し、次いで84mgのLiOH×HO(2.00mmol)および1mLの水を添加した。混合物を完全な加水分解まで50℃で撹拌した。次いで、これをブラインで希釈し、2M HCl水溶液で中和し、DCMで抽出した。合わせた有機相をNaSOで乾燥させ、濾過し、濾液を減圧下で濃縮した。アトロポ異性体を、溶離液として5mM NHHCO水溶液およびMeCNを使用する分取逆相クロマトグラフィーにより精製および分離した。後に溶出するアトロポ異性体をC7として単離した。1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ: 8.88 (d, J = 5.2 Hz, 1H), 8.60 (s, 1H), 7.76 (d, J = 5.0 Hz, 1H), 7.54 (dd, J = 7.6, 1.8 Hz, 1H), 7.46 (m, 1H), 7.26 (d, J = 8.5 Hz, 1H), 7.20-7.13 (m, 3H), 7.04 (td, J = 7.5, 0.9 Hz, 1H), 7.00 (d, J = 8.0 Hz, 1H), 6.78 (t, J = 7.5 Hz, 1H), 6.32 (dd, J = 7.4, 1.5 Hz, 1H), 5.48 (dd, J = 9.7, 2.9 Hz, 1H), 5.27 (d, J = 15.0 Hz, 1H), 5.19 (d, J = 15.0 Hz, 1H), 4.23 (m, 2H), 3.76 (s, 3H), 3.31 (m, 1H), 2.75 (m, 2H), 2.47 (m, 1H), 2.64-2.36 (m, 10H), 2.22 (s, 3H), 2.01 (s, 3H), 0.74 (t, J = 7.5 Hz, 3H). 13C NMR (100 MHz, DMSO-d6) δ: 165.95, 165.89, 164.7, 157.8, 157.2, 155.3, 154.0, 141.6, 135.6, 131.0, 130.8, 130.1, 128.4, 128.0, 127.2, 121.4, 120.1, 117.8, 112.2, 111.7, 97.2, 74.9, 68.9, 67.1, 56.1, 55.7, 54.0, 32.7, 24.4, 13.1, 4.4.
4545SClのHRMS計算値:832.2810;実測値833.2878(M+H)。
C8の調製:
(2R)-2-[(5S)-5-[3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(3-スルホオキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸
Figure 2022532918000657
210mgのエチル(2R)-2-[5-[3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(3-ヒドロキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパノエート(0.24mmol;国際公開第2016/207216号、調製2に従って得た)を、9.3mLのピリジンに溶解し、次いで0.38mLのSO×ピリジン(2.36mmol)を添加し、混合物を完全な変換まで70℃で撹拌した。次いで、混合物を減圧下で濃縮し、残留物を2mLのジオキサンに溶解し、次いで200mgのKOH(3.56mmol)および1mLの水を添加した。混合物をEtエステルの完全な加水分解まで70℃で撹拌した。次いで、これを5M HCl水溶液で中和し、溶離液として25mM NHHCO水溶液およびMeCNを使用する分取逆相クロマトグラフィー(直接注入)により精製して、C8を得た。1H NMR (500 MHz, DMSO-d6) δ: 8.93 (d, J = 5.1 Hz, 1H), 8.63 (s, 1H), 8.27 (m, 1H), 8.13 (m, 1H), 7.61 (d, J = 5.1 Hz, 1H), 7.43 (t, J = 7.8 Hz, 1H), 7.33 (d, J = 7.8 Hz, 1H), 7.32-7.27 (m, 3H), 7.23-7.13 (m, 4H), 7.05 (d, J = 7.8 Hz, 1H), 6.73 (t, J = 7.5 Hz, 1H), 6.31 (dd, J = 7.5, 1.3 Hz, 1H), 5.51 (dd, J = 9.8, 3.5 Hz, 1H), 5.34 (d, J = 15.2 Hz, 1H), 5.27 (d, J = 15.2 Hz, 1H), 4.24-4.08 (m, 2H), 3.26 (dd, J = 14.3, 3.4 Hz, 1H), 3.10-2.52 (m, 14H), 1.82 (s, 3H). 13C NMR (125 MHz, DMSO-d6) δ: 170.8, 166.5, 166.4, 162.8, 162.7, 158.3, 155.3, 154.0, 153.6, 152.9, 137.8, 136.8, 135.9, 131.12, 131.05, 130.4, 130.3, 129.1, 128.5, 128.2, 127.8, 124.4, 123.5, 122.7, 121.9, 120.5, 120.2, 118.8, 116.0, 115.9, 112.0, 110.5, 73.5, 69.1, 67.2, 55.4, 43.1, 31.8, 17.5.
4642ClFのHRMS計算値:940.2127;実測値941.2191(M+H)。
C9の調製:
2R)-2-{[5-{3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル}-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ}-3-(2-{[2-(3-スルホフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ}フェニル)プロパン酸
Figure 2022532918000658
750mgのエチル(2R)-2-[(5Sa)-5-[3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[(2-メチルスルファニルピリミジン-4-イル)メトキシ]フェニル]プロパノエート(0.89mmol;国際公開第2015/097123号、調製10aに従って得た)を、9mLのTHFに溶解し、次いで726mgの[3-(2,2-ジメチルプロポキシスルホニル)フェニル]ボロン酸(2.67mmol)、62mgのPd(PPh(0.05mmol)および509mgのチオフェン-2-カルボニルオキシ銅(2.67mmol)を添加し、混合物を完全な変換まで75℃で撹拌した。次いで、これを減圧下で濃縮し、溶離液としてヘプタン、EtOAcおよびMeOH中0.7M NH溶液を使用するフラッシュクロマトグラフィーにより精製した。次いで、これを20mLの1,1,1,3,3,3-ヘキサフルオロプロパン-2-オールに溶解し、4.5mLのTFAを添加し、混合物をスルホン酸エステルの完全な加水分解まで80℃で撹拌した。混合物を減圧下で濃縮し、次いで5mLのジオキサンに溶解し、次いで210mgのLiOH×HO(5.00mmol)および2mLの水を添加した。混合物を完全な加水分解まで室温で撹拌した。次いで、これをブラインで希釈し、2M HCl水溶液で中和し、DCMで抽出した。合わせた有機相をNaSOで乾燥させ、濾過し、濾液を減圧下で濃縮した。形成されたアトロプ異性体を、溶離液として25mM NHHCO水溶液およびMeCNを使用する分取逆相クロマトグラフィーにより精製および分離し、次いで溶離液として0.1%TFA水溶液およびMeCNを使用してさらに精製して、C9を得た。1H NMR (500 MHz, DMSO-d6) δ: 13.19 (br s, 1H), 9.48 (br s, 1H), 8.94 (d, J = 5.1 Hz, 1H), 8.74 (t, J = 1.6 Hz, 1H), 8.65 (s, 1H), 8.37 (dt, J = 7.8, 2.9 Hz, 1H), 7.78 (dt, J = 7.6, 1.5 Hz, 1H), 7.60 (d, J = 5.1 Hz, 1H), 7.51 (t, J = 7.7 Hz, 1H), 7.29 (m, 3H), 7.22-7.14 (m, 3H), 7.13-7.05 (m, 2H), 6.74 (t, J = 7.5 Hz, 1H), 6.38 (d, J = 7.6 Hz, 1H), 5.53 (dd, J = 9.6, 3.6 Hz, 1H), 5.37 (d, J = 15.3 Hz, 1H), 5.31 (d, J = 15.3 Hz, 1H), 4.2 (m, 2H), 3.50-2.88 (m, 11H), 2.76 (s, 3H), 2.61 (dd, J = 14.2, 9.7 Hz, 1H), 1.79 (s, 3H). 13C NMR (125 MHz, DMSO-d6) δ: 170.8, 166.5, 163.0, 162.7, 161.1, 158.4, 155.4, 153.3, 152.9, 148.6, 136.6, 136.0, 131.1, 130.1, 129.0, 128.5, 128.3, 128.1, 127.9, 125.3, 124.4, 121.9, 120.5, 118.8, 116.2, 116.0, 115.9, 112.1, 110.5, 73.2, 69.1, 66.5, 55.0, 51.7, 49.7, 42.1, 31.5, 17.5.
4642ClFのHRMS計算値:924.2178;実測値925.2274(M+H)。
C10の調製:
(2R)-2-[(5S)-5-[3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル]-6-[4-フルオロ-3-(2,2,2-トリフルオロエトキシ)フェニル]チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸
Figure 2022532918000659
250mgのエチル(2R)-2-[5-[3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル]-6-ヨード-チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパノエート(0.27mmol;国際公開第2015/097123号、調製30に従って得た)および79mgの[4-フルオロ-3-(2,2,2-トリフルオロエトキシ)フェニル]ボロン酸(0.40mmol)を、1mLのTHFに溶解し、次いで3.0mgのPdOAc(0.013mmol)、5.7mgのtBuXPhos(0.013mmol)、174mgのCsCO(0.53mmol)および0.27mLの水を添加し、混合物をN雰囲気下、70℃で2時間撹拌した。次いで、これをブラインで希釈し、2-MeTHFで抽出した。合わせた有機層をNaSOで乾燥させ、濾過し、濾液を減圧下で濃縮した。粗エステル生成物を、溶離液としてヘプタン、EtOAcおよびMeOH中0.7M NH溶液を使用するフラッシュクロマトグラフィーにより精製した。次いで、これを5.3mLのジオキサンに溶解し、次いで64mgのLiOH×HO(1.52mmol)および1.3mLの水を添加した。混合物を完全な加水分解まで室温で撹拌した。次いで、これをブラインで希釈し、2M HCl水溶液で中和し、DCMで抽出した。合わせた有機相をNaSOで乾燥させ、濾過し、濾液を減圧下で濃縮した。アトロプ異性体を、溶離液として25mM NHHCO水溶液およびMeCNを使用する分取逆相クロマトグラフィーにより精製および分離した。後に溶出するアトロプ異性体をC10として単離した。1H NMR (500 MHz, DMSO-d6) δ: 8.91 (d, J = 5.2 Hz, 1H), 8.57 (s, 1H), 7.82 (d, J = 5.1 Hz, 1H), 7.53 (dd, J = 7.5, 1.7 Hz, 1H), 7.45 (m, 2H), 7.27 (dd, J = 11.0, 8.6 Hz, 1H), 7.22 (d, J = 8.6 Hz, 1H), 7.16-7.09 (m, 3H), 7.03 (t, J = 7.5 Hz, 1H), 6.98 (d, J = 8.3 Hz, 1H), 6.92 (m, 1H), 6.69 (t, J = 7.4 Hz, 1H), 6.16 (d, J = 7.2 Hz, 1H), 5.47 (dd, J = 10.3, 2.6 Hz, 1H), 5.25 (d, J = 15.1 Hz, 1H), 5.19 (d, J = 15.1 Hz, 1H), 4.75-4.53 (m, 2H), 4.21 (t, J = 5.5 Hz, 2H), 3.75 (s, 3H), 3.41 (d, J = 12.0 Hz, 1H), 2.77-2.30 (m, 12H), 2.24 (s, 3H), 1.81 (s, 3H). 13C NMR (125 MHz, DMSO-d6) δ: 171.3, 166.2, 166.0, 164.6, 163.5, 157.9, 157.2, 155.3, 153.7, 153.1, 152.1, 150.5, 144.6, 135.8, 131.0, .130.8, 130.7, 129.6, 129.1, 128.4, 128.1, 127.8, 125.4, 123.7, 122.0, 120.4, 120.1, 118.8, 117.0, 116.7, 115.6, 112.2, 111.7, 110.5, 74.8, 68.9, 67.2, 65.6, 56.0, 55.7, 53.8, 52.0, 44.6, 32.7, 17.5.
4945SClFのHRMS計算値:972.2695;実測値973.2761(M+H)。
C11の調製:
(2R)-2-{[(5Sa)-5-{3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル}-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ}-3-(2-{[2-(4-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ}フェニル)プロパン酸
Figure 2022532918000660
C11は、国際公開第2015/097123号における実施例107に従って調製した。
C12の調製
(2R)-2-{[(5S)-5-{3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル}-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ}-3-(2-{[1-(2,2,2-トリフルオロエチル)-1H-ピラゾール-5-イル]メトキシ}フェニル)プロパン酸
Figure 2022532918000661
C12は、国際公開第2015/097123号における実施例77に従って調製した。
C13の調製
(2R)-2-[(5S)-6-(3-アミノ-4,5-ジフルオロ-フェニル)-5-[3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル]チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパン酸
Figure 2022532918000662
250mgのエチル(2R)-2-[5-[3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル]-6-ヨード-チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]フェニル]プロパノエート(0.27mmol;国際公開第2015/097123号、調製30に従って得た)および102mgの2,3-ジフルオロ-5-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)アニリン(0.41mmol)を、1mLのTHFに溶解し、次いで3.0mgのPdOAc(0.013mmol)、5.7mgのtBuXPhos(0.013mmol)、174mgのCsCO(0.53mmol)および0.27mLの水を添加し、混合物をN雰囲気下、70℃で2時間撹拌した。次いで、これをブラインで希釈し、2-MeTHFで抽出した。合わせた有機層をNaSOで乾燥させ、濾過し、濾液を減圧下で濃縮した。粗エステル生成物を、溶離液としてヘプタン、EtOAcおよびMeOH中0.7M NH溶液を使用するフラッシュクロマトグラフィーにより精製した。次いで、これを0.7mLのジオキサンに溶解し、次いで60mgのLiOH×HO(1.43mmol)および0.18mLの水を添加した。混合物を完全な加水分解まで室温で撹拌した。次いで、これをブラインで希釈し、2M HCl水溶液で中和し、DCMで抽出した。合わせた有機相をNaSOで乾燥させ、濾過し、濾液を減圧下で濃縮した。アトロポ異性体を、溶離液として25mM NHHCO水溶液およびMeCNを使用する分取逆相クロマトグラフィーにより精製および分離した。後に溶出するアトロプ異性体をC13として単離した。1H NMR (500 MHz, DMSO-d6) δ: 8.89 (d, J = 5.2 Hz, 1H), 8.56 (s, 1H), 7.76 (d, J = 5.0 Hz, 1H), 7.53 (dd, J = 7.6, 1.8 Hz, 1H), 7.45 (m, 1H), 7.36 (d, J = 8.6 Hz, 1H), 7.20 (d, J = 8.7 Hz, 1H), 7.13 (m, 2H), 7.03 (td, J = 7.5, 1.0 Hz, 1H), 6.99 (d, J = 8.1 Hz, 1H), 6.71 (t, J = 7.3 Hz, 1H), 6.62 (m, 1H), 6.21 (d, J = 7.5, 1.3 Hz, 1H), 6.12 (m, 1H), 5.73 (s, 2H), 5.46 (dd, J = 10.1, 3.1 Hz, 1H), 5.25 (d, J = 15.1 Hz, 1H), 5.19 (d, J = 15.2 Hz, 1H), 4.22 (m, 2H), 3.75 (s, 3H), 3.35 (m, 1H), 2.73 (m, 2H), 2.65-2.35 (m, 9H), 2.22 (s, 3H), 1.85 (s, 3H). 13C NMR (125 MHz, DMSO-d6) δ: 171.1, 166.0, 165.3, 163.3, 157.8, 157.2, 155.3, 153.7, 152.9, 149.0, 138.9, 137.1, 135.8, 131.0, 130.8, 130.4, 128.7, 128.4, 128.1, 127.8, 125.2, 122.0, 120.4, 120.1, 118.9, 115.6, 112.2, 111.9, 110.6, 103.2, 74.5, 68.9, 67.1, 56.0, 55.7, 53.9, 52.1, 44.7, 32.6, 17.6.
4744SClFのHRMS計算値:907.2730;実測値908.2803(M+H)。
C14の調製
(2R)-2-{[(5Sa)-5-{3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル}-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ}-3-(2-{[2-(3-ヒドロキシ-2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ}フェニル)プロパン酸
Figure 2022532918000663
210mgのエチル(2R)-2-[5-[3-クロロ-2-メチル-4-[2-(4-メチルピペラジン-1-イル)エトキシ]フェニル]-6-(4-フルオロフェニル)チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-イル]オキシ-3-[2-[(2-クロロピリミジン-4-イル)メトキシ]フェニル]プロパノエート(0.25mmol、国際公開第2016/207216号調製1)および84mgの(3-ヒドロキシ-2-メトキシ-フェニル)ボロン酸(0.50mmol)を、3.8mLの1,4-ジオキサンに溶解し、次いで18mgのPd(PPhCl(0.025mmol)、240mgのCsCO(0.75mmol)および3.8mLの水を添加し、混合物を完全な変換までN雰囲気下、70℃で撹拌した。次いで、これを水で希釈し、2M HCl水溶液で中和し、DCMで抽出した。合わせた有機相をNaSOで乾燥させ、濾過し、濾液を減圧下で濃縮した。粗エステルを、溶離液としてヘプタン、EtOAcおよびMeOH中0.7M NH溶液を使用するフラッシュクロマトグラフィーにより精製して、ジアステレオ異性体の混合物を得た。これを2mLのジオキサンに溶解し、次いで245mgのLiOH×HO(5.85mmol)および1mLの水を添加した。混合物を完全な加水分解まで室温で撹拌した。次いで、これを2M HCl水溶液で中和し、溶離液として0.1%TFA水溶液およびMeCNを使用する分取RP-HPLC上に直接注入した。後に溶出するジアステレオ異性体をC14として収集した。1H NMR (500 MHz, DMSO-d6) δ: 9.53 (brs, 1H), 8.91 (d, 1H), 8.56 (s, 1H), 7.79 (d, 1H), 7.42 (d, 1H), 7.26 (m, 2H), 7.19 (d, 1H), 7.18 (m, 2H), 7.12 (t, 1H), 7.06 (dd, 1H), 6.98 (m, 1H), 6.98 (m, 1H), 6.97 (d, 1H), 6.68 (t, 1H), 6.16 (d, 1H), 5.47 (m, 1H), 5.27/5.20 (d+d, 2H), 4.26/4.19 (m+m, 2H), 3.76 (s, 3H), 3.38/2.42 (dd+dd, 2H), 2.74 (m, 2H), 2.55 (br., 4H), 2.47 (br., 4H), 2.25 (s, 3H), 1.80 (s,3 H).
4744SClFのHRMS計算値:890.2665;実測値891.2721(M+H)。
P15の調製
(11R,20R)-23,26-ジクロロ-3-(4-フルオロフェニル)-14-[[2-(2-メトキシフェニル)ピリミジン-4-イル]メトキシ]-24,25-ジメチル-20-[(4-メチルピペラジン-1-イル)メチル]-10,18,21-トリオキサ-4-チア-6,8-ジアザペンタシクロ[20.2.2.12,5.113,17.09,28]オクタコサ-1(25),2,5(28),6,8,13,15,17(27),22(26),23-デカエン-11-カルボン酸
Figure 2022532918000664
P15は、国際公開第2019/035914号における実施例116に従って調製した。
P16の調製
(11R,20R)-23,26-ジクロロ-14-[[2-[4-[[(2S)-1,4-ジオキサン-2-イル]メトキシメチル]-4-フルオロ-シクロヘキシル]ピリミジン-4-イル]メトキシ]-3-(4-フルオロフェニル)-24,25-ジメチル-20-[(4-メチルピペラジン-1-イル)メチル]-10,18,21-トリオキサ-4-チア-6,8-ジアザペンタシクロ[20.2.2.12,5.113,17.09,28]オクタコサ-1(24),2,5(28),6,8,13,15,17(27),22,25-デカエン-11-カルボン酸
Figure 2022532918000665
P16は、国際公開第2019/035911号における実施例28に従って調製した。
P17の調製
(11R,20R)-23,26-ジクロロ-14-[[2-[4-[[(2S)-1,4-ジオキサン-2-イル]メトキシ]シクロヘキシル]ピリミジン-4-イル]メトキシ]-3-(4-フルオロフェニル)-24,25-ジメチル-20-[(4-メチルピペラジン-1-イル)メチル]-10,18,21-トリオキサ-4-チア-6,8-ジアザペンタシクロ[20.2.2.12,5.113,17.09,28]オクタコサ-1(24),2,5(28),6,8,13,15,17(27),22,25-デカエン-11-カルボン酸
Figure 2022532918000666
P17は、国際公開第2019/035911号における実施例44に従って調製した。
[実施例4]
Mcl-1阻害剤ADCの合成および特徴付け
例示的な抗体-薬物コンジュゲート(ADC)は、この実施例に記載した例示的な方法を使用して合成した。例示的なADCの調製に使用する抗体を表12に記載する。「CysmAb」という用語は、マレイミド基を介してリンカー-ペイロードを抗体にコンジュゲートするために使用される、抗体の重鎖におけるシステイン突然変異を指す。一部の実施形態では、E152CおよびS375C(EUシステムに従って番号付けされる)を含むCysmAb突然変異である。突然変異は、E156CおよびS379Cとしても番号付けされることがあり、これらはE152CおよびS375C EU突然変異に対応する。
Figure 2022532918000667
BTG:抗体(Ab GおよびAb T)に、細菌性トランスグルタミナーゼ(BTG) - シクロオクチンBCN(N-[(1R,8S,9s)-ビシクロ[6.1.0]ノナ-4-イン-9-イルメチルオキシカルボニル]-1,8-ジアミノ-3,6-ジオキサオクタン、BCN-POE3-NH2としても公知、CAS番号:1263166-93-3)を含有するアミンで特異的に官能化された反応性グルタミンを付与した。細菌性トランスグルタミナーゼを使用するBCN部分への部位特異的抗体コンジュゲーションは、Innate Pharma 2013(ADC Summit,San Francisco,California,2013年10月15日におけるプレゼンテーション)、国際公開第2017/059160号、および国際公開第2016/144608号に記載されている方法(これらのすべてはそのような方法について参照により本明細書に組み込まれる)を使用して行った。これらの改変は、以下に記載した通りの方法Aおよび方法Bを使用する、記載されたアジド含有前駆体のコンジュゲーションを可能にする。図1も参照されたい。
Redox:抗体(抗CD33、抗BCMA、抗PCAD)を、適切なサイズの使い捨てカラム内で混合しながら、PBS中、1mlの樹脂に対して10mgのAbの比率で、RMP Protein A樹脂(GE)とともに15分間インキュベートした。システインHClを20mMの最終濃度まで添加し、室温で30分間撹拌しながらインキュベートして、反応性システインを脱ブロック化した。樹脂を、真空マニホールド上にて50カラム体積のPBSで迅速に洗浄した。次いで、樹脂を、250nM CuClを含有する等体積のPBS中に再懸濁させた。抗体鎖間ジスルフィドの再形成を、時点を取ることによりモニタリングした。各時点で、25μlの樹脂スラリーを取り出し、1μlの20mM MC-valcit-MMAEを添加し、管を数回撹拌した。樹脂を遠心分離し、上清を取り出し、次いで50μlの抗体溶出緩衝剤(Thermo Fisher Scientific)で溶出した。樹脂をペレット化し、上清を、Agilent PLRP-S 4000A 5um、4.6×50mmカラムを使用する逆相クロマトグラフィー(緩衝剤Aは水、0.1%TFA、緩衝剤Bはアセトニトリル、0.1%TFA、カラムを80℃で保持、流速1.5ml/分)により分析した。
抗体がその鎖間ジスルフィド結合を再形成したことが決定されたら、樹脂を10カラム体積のPBSで洗浄し、樹脂を等体積のPBS中に再懸濁させ、水切りして、樹脂を緩やかに沈降させた。再酸化した抗体を抗体溶出緩衝剤でprotein A樹脂から溶出し、1/10体積の1M Tris pH9.0で中和した。次いで、抗体を、PD-10カラムを使用してPBSに緩衝液交換した。タンパク質濃度を5mg/mlに調整し、単回使用コンジュゲーションのためにアリコートした(以下の方法C1~C18を参照されたい)。
方法A(DAR2):プロピレングリコール(PG、1.5ml、20%のカップリング体積)を抗体(Ab)溶液(3mg/ml、3.3ml)に添加した。混合物をボルテックス中で30秒間撹拌し、続いて4倍モル過剰のリンカー-弾頭ペイロード(5mM、PG/DMA中533.8μl)を添加した。反応物を64rpmにて室温で終夜撹拌した。溶液を20分間遠心分離(4℃で14000G)し、次いでHiLoad 26/600 Superdex 200 pg(GE Healthcare、28989336)SECクロマトグラフィーカラム上に装填した。ADCをPBS中20%PG(Sigma、P3813、10PAK)で溶出し、続いてPBS 1× pH7.4(Sigma、P3813、10PAK)中で2サイクルの透析(16および4時間)を行った。ADCを、Vivaspin 20、50KD、PES(Sartorius Stedim、VS2031)を使用して濃縮し、0.2μm滅菌PESフィルター、25mm(Whatmann、G896-2502)に通して滅菌濾過し、4℃で貯蔵した。
代替的に、プロピレングリコール(PG、673μl、20%のカップリング体積)を抗体(Ab)溶液(1.8mg/ml、2.8ml、5mg)に添加した。混合物をボルテックス中で30秒間撹拌し、続いて4倍モル過剰のリンカー-弾頭ペイロード(5mM、PG/DMA中27μl)を添加した。反応物を64rpmにて室温で終夜撹拌した。溶液を20分間遠心分離(4℃で14000G)し、次いでHiLoad 26/600 Superdex 200 pg(GE Healthcare、28989336)SECクロマトグラフィーカラム上に装填した。ADCをPBS中20%PG(Sigma、P3813、10PAK)で溶出し、続いてPBS 1× pH7.4(Sigma、P3813、10PAK)中で2サイクルの透析(16および4時間)を行った。ADCを、Vivaspin 20、50KD、PES(Sartorius Stedim、VS2031)を使用して濃縮し、0.2μm滅菌PESフィルター、25mm(Whatmann、G896-2502)に通して滅菌濾過し、4℃で貯蔵した。
方法B(DAR4):プロピレングリコール(PG、1.5ml、20%のカップリング体積)をAb溶液(3mg/ml、3.3ml)に添加した。混合物をボルテックス中で30秒間撹拌し、続いて10倍モル過剰のリンカー-弾頭ペイロード(5mM、PG/DMA中533.8μl)を添加した。反応物を64rpmにて室温で終夜撹拌した。次いで、溶液を、10倍モル過剰のDBCO含有Tentagel樹脂(0.1~0.2mmol/g、Iris Biotech、CS-0477.0500)とともに6時間インキュベートした。次に、溶液を20分間遠心分離(4℃で14000G)し、次いでHiLoad 26/600 Superdex 200 pg(GE Healthcare、28989336)SECクロマトグラフィーカラム上に装填した。ADCをPBS中20%PG(Sigma、P3813、10PAK)で溶出し、続いてPBS 1× pH7.4(Sigma、P3813、10PAK)中で2サイクルの透析(16および4時間)を行った。ADCを、Vivaspin 20、50KD、PES(Sartorius Stedim、VS2031)を使用して濃縮し、0.2μm滅菌PESフィルター、25mm(Whatmann、G896-2502)に通して滅菌濾過し、4℃で貯蔵した。
代替的に、プロピレングリコール(PG、266μl、20%のカップリング体積)をAb溶液(4.5mg/ml、1.4ml、6.3mg)に添加した。混合物をボルテックス中で30秒間撹拌し、続いて10倍モル過剰のリンカー-弾頭ペイロード(5mM、PG/DMA中84μl)を添加した。反応物を64rpmにて室温で終夜撹拌した。この溶液を、10倍モル過剰のDBCO含有Tentagel樹脂(0.1~0.2mmol/g、Iris Biotech、CS-0477.0500)とともに6時間インキュベートした。次いで、溶液を20分間遠心分離(4℃で14000G)し、これをHiLoad 26/600 Superdex 200 pg(GE Healthcare、28989336)SECクロマトグラフィーカラム上に装填した。ADCをPBS中20%PG(Sigma Life Science、P3813、10PAK)で溶出し、続いてPBS 1× pH7.4(Sigma Life Science、P3813、10PAK)中で2サイクルの透析(16および4時間)を行った。コンジュゲートを、Vivaspin 20、50KD、PES(Sartorius Stedim、VS2031)を使用して濃縮し、0.2μm滅菌PESフィルター、25mm(Whatmann、G896-2502)に通して滅菌濾過し、4℃で貯蔵した。
方法C:抗体を、Bioradサイズの使い捨てカラム内で混合することにより、PBS中、1mlの樹脂に対して10mgのAbの比率で、rmp Protein A樹脂(GE Healthcare)上に30分間結合させた。反応性システインを脱ブロック化するために、システイン塩酸塩一水和物を20mMの最終濃度まで添加した。混合物を室温で30分間撹拌し、続いて、樹脂を真空マニホールド上にて50カラム体積のPBSで5回洗浄した。次いで、樹脂を、250nM CuClを含有する等体積のPBS中に再懸濁させ、1時間30分インキュベートした。再酸化した抗体を真空マニホールド上にて50カラム体積のPBSで5回洗浄し、等体積のPBS中に再懸濁させた。混合物に、10倍モル過剰の20mMリンカー-ペイロード溶液および等体積のDMSOを添加した。反応物を室温で2時間インキュベートした。コンジュゲーションをモニタリングするために、20μlの樹脂スラリーを取り出し、遠心分離し、上清を取り出し、次いで40μlの抗体溶出緩衝剤(Thermo Fisher Scientific)で溶出した。上清を、Agilent PLRP-S 4000A 5um、4.6×50mmカラムを使用する逆相クロマトグラフィー(緩衝剤Aは水、0.1%TFA、緩衝剤Bはアセトニトリル、0.1%TFA、カラムを80℃で保持、流速1.5ml/分)により分析した。樹脂を真空マニホールド上にて50カラム体積のPBSで5回洗浄することにより、過剰のリンカー-ペイロードを除去した後、ADCを抗体溶出緩衝剤でprotein Aから溶出し、1/10体積の1M Tris pH9.0で中和した。すべての例示されたADC(Ab C - L9-C1、Ab B - L9-P15、Ab B - L26-P1、Ab B - L9-P16、Ab B - L9-P17を除く)をHiLoad 26/600 Superdex 200 pg(GE Healthcare、28989336)SECクロマトグラフィーカラム上で精製し、PBS中20%PG(Sigma Life Science、P3813、10PAK)で溶出した。ADCをPBS 1× pH7.4(Sigma Life Science、P3813、10PAK)中での透析により緩衝液交換し、Vivaspin 20、50KD、PES(Sartorius Stedim、VS2031)を使用して濃縮し、0.2μm滅菌PESフィルター、25mm(Whatmann、G896-2502)に通して滅菌濾過し、4℃で貯蔵した。Ab C - L9-C1、Ab B - L9-P15、Ab B - L26-P1、Ab B - L9-P16およびAb B - L9-P17のADCについては、それらをPBS 1× pH7.4(Sigma Life Science、P3813、10PAK)中での透析により緩衝液交換し、Vivaspin 20、50KD、PES(Sartorius Stedim、VS2031)を使用して濃縮し、0.2μm滅菌PESフィルター、25mm(Whatmann、G896-2502)に通して滅菌濾過し、4℃で貯蔵しただけであった。
代替的に、抗体を、適切なサイズの使い捨てカラム内で混合しながら、PBS中、1mlの樹脂に対して10mgのAbの比率で、RMP Protein A樹脂(GE)とともに15分間インキュベートした。システインHClを20mMの最終濃度まで添加し、室温で30分間撹拌しながらインキュベートして、反応性システインを脱ブロック化した。樹脂を、真空マニホールド上にて50カラム体積のPBSで迅速に洗浄した。次いで、樹脂を、250nM CuClを含有する等体積のPBS中に再懸濁させた。抗体鎖間ジスルフィドの再形成を、時点を取ることによりモニタリングした。各時点で、25μLの樹脂スラリーを取り出し、1μLの20mM MC-valcit-MMAEを添加し、管を数回振った。樹脂を遠心沈殿し、上清を取り出し、次いで50μLの抗体溶出緩衝剤(Thermo)で溶出した。樹脂をペレット化し、上清を、Agilent PLRP-S 4000A 5um、4.6×50mmカラムを使用する逆相クロマトグラフィー(緩衝剤Aは水、0.1%TFA、緩衝剤Bはアセトニトリル、0.1%TFA、カラムを80℃で保持、流速1.5ml/分)により分析した。抗体がその鎖間ジスルフィド結合を再形成したことが決定されたら、樹脂を10カラム体積のPBSで洗浄し、樹脂を等体積のPBS中に再懸濁させ、DMSO中8~12当量のリンカー-ペイロードを添加し、反応物中10%DMSOの最終濃度とし、次いで室温で3時間インキュベートした。次いで、樹脂を50カラム体積のPBSで洗浄した。ADCを抗体溶出緩衝剤でprotein A樹脂から溶出した。次いで、ADCをPBSまたは他の好適な緩衝剤に緩衝液交換し、凝集物を除去する必要がある場合には、凝集物を除去するための分取サイズ排除クロマトグラフィーを行った(S200 Increase;GE)。以下の分析-パーセントモノマーを決定するための分析SEC、DARを決定するための質量分析、内毒素負荷を決定するためのLAL試験を行い、タンパク質濃度は、抗体の消衰係数および分子量を利用するA280により決定した。
方法C1-(CD33-L1-P1):CD33抗体の溶液(1.0mg、1×PBS緩衝液中6.5mg/ml溶液154μl、0.0067μmol、1.0当量)に、L1-P1(DMSO中20mM溶液2.53μl、0.051μmol、7.5当量)を添加した。得られた混合物を周囲温度にて400rpmで1時間振盪し、その時点で、混合物を超遠心分離により精製した(4mlのAmicon 10kDカットオフ膜フィルター、試料をPBS緩衝剤で4mlの総体積に希釈し、続いて7500×gで10分間遠心分離し、6回繰り返した)。5.0mg/mlに希釈した後、CD33-L1-P1を得た(0.842mg、0.0053μmol、79%)。以下の分析:パーセントモノマーを決定するための分析サイズ排除クロマトグラフィー(SEC)、DARを決定するための質量分析(MS)を行い、タンパク質濃度は、抗体の消衰係数および分子量を利用するA280により決定した。HRMSデータ(タンパク質法)は、DAR3およびDAR4種についてピークのMS強度を比較することにより計算される3.9のDARとともに、157884の質量を示した。SECは、210および280nmにおける高分子量ピーク吸光度の面積とモノマーADCについてのピーク吸光度の面積との比較により決定した、</=1%凝集を示した。
方法C2-(PCAD-L1-P1):PCAD抗体(2.0mg、5.6mg/ml溶液357μl、0.013μmol、1.0当量)およびL1-P1(DMSO中20mM溶液5.04μl、0.101μmol、7.5当量)を用いて方法C1に従って、PCAD-L1-P1を得た(1.73mg、0.0109μmol、81%)。HRMSデータ(タンパク質法)は、3.9のDARとともに、158268の質量を示した。SECは、</=1%凝集を示した。
方法C3-(PCAD-L10-P1):PCAD抗体(2.0mg、5.6mg/ml溶液357μl、0.013μmol、1.0当量)およびL10-P1(DMSO中20mM溶液5.04μl、0.101μmol、7.5当量)を用いて方法C1に従って、PCAD-L10-P1を得た(1.97mg、0.012μmol、92%)。HRMSデータ(タンパク質法)は、3.9のDARとともに、158731の質量を示した。SECは、</=1%凝集を示した。
方法C4-(CD33-L10-P1):CD33抗体(1.1mg、6.5mg/ml溶液169μl、0.0074μmol、1.0当量)およびL10-P1(DMSO中20mM溶液2.53μl、0.051μmol、6.8当量)を用いて方法C1に従って、CD33-L10-P1を得た(1.08mg、0.0068μmol、92%)。HRMSデータ(タンパク質法)は、3.9のDARとともに、158346の質量を示した。SECは、</=1%凝集を示した。
方法C5-(PCAD-L4-P1):PCAD抗体(2.0mg、5.6mg/ml溶液357μl、0.013μmol、1.0当量)およびL4-P1(DMSO中20mM溶液5.38μl、0.108μmol、8.0当量)を用いて方法C1に従って、PCAD-L4-P1を得た(2.1mg、0.013μmol、99%)。HRMSデータ(タンパク質法)は、4.2のDARとともに、156533の質量を示した。SECは、1%凝集を示した。
方法C6-(PCAD-L3-P1):PCAD抗体(1.0mg、5.6mg/ml溶液179μl、0.0067μmol、1.0当量)およびL3-P1(DMSO中20mM溶液2.69μl、0.054μmol、8.0当量)を用いて方法C1に従って、PCAD-L3-P1を得た(1.05mg、0.0067μmol、99%)。HRMSデータ(タンパク質法)は、3.9のDARとともに、156763の質量を示した。SECは、1%凝集を示した。
方法C7-(CD33-L2-P1):CD33抗体(2.0mg、5.7mg/ml溶液351μl、0.013μmol、1.0当量)およびL2-P1(DMSO中20mM溶液5.4μl、0.108μmol、8.0当量)を用いて方法C1に従って、CD33-L2-P1を得た(2.1mg、0.013μmol、99%)。HRMSデータ(タンパク質法)は、3.9のDARとともに、155821の質量を示した。SECは、</=1%凝集を示した。
方法C8-(PCAD-L9-P1):PCAD抗体(2.0mg、5.6mg/ml溶液357μl、0.013μmol、1.0当量)およびL9-P1(DMSO中20mM溶液6.73μl、0.13μmol、10.0当量)を用いて方法C1に従って、PCAD-L9-P1を得た(1.90mg、0.012μmol、91%)。HRMSデータ(タンパク質法)は、3.9のDARとともに、154392の質量を示した。SECは、</=1%凝集を示した。
方法C9-(CD33-L9-P1):CD33抗体(1.0mg、6.5mg/ml溶液154μl、0.0067μmol、1.0当量)およびL9-P1(DMSO中20mM溶液3.37μl、0.067μmol、10.0当量)を用いて方法C1に従って、CD33-L9-P1を得た(0.84mg、0.0055μmol、81%)。HRMSデータ(タンパク質法)は、3.9のDARとともに、154009の質量を示した。SECは、1%凝集を示した。
方法C10-(CD33-L8-P1):CD33抗体(1.0mg、6.5mg/ml溶液154μl、0.0067μmol、1.0当量)およびL8-P1(DMSO中30mg/ml溶液3.43μl、0.054μmol、8.0当量)を用いて方法C1に従って、CD33-L8-P1を得た(0.91mg、0.0058μmol、87%)。HRMSデータ(タンパク質法)は、3.9のDARとともに、1555921の質量を示した。SECは、1%凝集を示した。
方法C11-(PCAD-L8-P1):PCAD抗体(2.5mg、5.6mg/ml溶液472μl、0.017μmol、1.0当量)およびL8-P1(DMSO中30mg/ml溶液10.7μl、0.17μmol、10.0当量)を用いて方法C1に従って、PCAD-L8-P1を得た(1.57mg、0.010μmol、60%)。HRMSデータ(タンパク質法)は、3.9のDARとともに、156307の質量を示した。SECは、</=1%凝集を示した。
方法C12-(CD33-L7-P1):CD33抗体(1.0mg、6.5mg/ml溶液154μl、0.0067μmol、1.0当量)およびL7-P1(DMSO中30mg/ml溶液3.54μl、0.054μmol、8.0当量)を用いて方法C1に従って、CD33-L7-P1を得た(0.56mg、0.0036μmol、53%)。HRMSデータ(タンパク質法)は、3.9のDARとともに、156151の質量を示した。SECは、1%凝集を示した。
方法C13-(PCAD-L7-P1):PCAD抗体(2.5mg、5.6mg/ml溶液472μl、0.017μmol、1.0当量)およびL7-P1(DMSO中30mg/ml溶液11.03μl、0.17μmol、10.0当量)を用いて方法C1に従って、PCAD-L7-P1を得た(2.60mg、0.017μmol、99%)。HRMSデータ(タンパク質法)は、3.9のDARとともに、156539の質量を示した。SECは、</=1%凝集を示した。
方法C14-(BCMA-L5-P1):BCMA抗体(2.0mg、8.0mg/ml溶液250μl、0.013μmol、1.0当量)およびL5-P1(DMSO中20mM溶液5.38μl、0.108μmol、8当量)を用いて方法C1に従って、BCMA-L5-P1を得た(2.1mg、0.013μmol、99%)。HRMSデータ(タンパク質法)は、3.9のDARとともに159197の質量を示した。SECは、1%凝集を示した。
方法C15-(CD33-L12-P2):CD33抗体(2.0mg、5.8mg/ml溶液345μl、0.013μmol、1.0当量)およびL12-P2(DMSO中20mM溶液4.05μl、0.081μmol、6.0当量)を用いて方法C1に従って、CD33-L12-P2を得た(2.1mg、0.013μmol、99%)。HRMSデータ(タンパク質法)は、3.9のDARとともに、157331の質量を示した。SECは、1%凝集を示した。
方法C16-(BCMA-L12-P2):BCMA抗体(2.0mg、8.0mg/ml溶液250μl、0.013μmol、1.0当量)およびL12-P2(DMSO中20mM溶液3.03μl、0.061μmol、4.5当量)を用いて方法C1に従って、BCMA-L12-P2を得た(2.1mg、0.013μmol、99%)。HRMSデータ(タンパク質法)は、3.8のDARとともに、157792の質量を示した。SECは、1%凝集を示した。
方法C17-(CD33-L4-P2):CD33抗体(2.0mg、5.8mg/ml溶液345μl、0.013μmol、1.0当量)およびL4-P2(DMSO中20mM溶液3.03μl、0.061μmol、4.5当量)を用いて方法C1に従って、CD33-L4-P2を得た(2.1mg、0.013μmol、99%)。HRMSデータ(タンパク質法)は、3.9のDARとともに、156700の質量を示した。SECは、1%凝集を示した。
方法C18-(BCMA-L4-P2):BCMA抗体(2.0mg、8.0mg/ml溶液250μl、0.013μmol、1.0当量)およびL4-P2(DMSO中20mM溶液3.03μl、0.061μmol、4.5当量)を用いて方法C1に従って、BCMA-L4-P2を得た(2.1mg、0.013μmol、99%)。HRMSデータ(タンパク質法)は、3.9のDARとともに、157164の質量を示した。SECは、1%凝集を示した。
実施例に記載した他のADC、例えばCD38 Mcl1-阻害剤ADC、CD48 Mcl1-阻害剤ADC、およびCD79b Mcl1-阻害剤ADC(例えば、表24~26に記載したもの)は、上記の方法と同様の方法により合成した。
分析方法
液体クロマトグラフィー-質量分析(LC/MS)I
一般的な方法論:例示的なADCの薬物対抗体比(DAR)は、以下の方法(すなわち、LC-I、LCIIおよびLC-III)のうちのいずれか1つによる液体クロマトグラフィー-質量分析(LC/MS)により決定した。すべてのLC方法について、移動相Aは、精製されたMSグレードの水(Biosolve,Dieuze,France、00232141B1BS)であり、移動相Bは、MSグレードのアセトニトリル(Biosolve,Dieuze,France、0001204101BS)であり、移動相Dは、1%のギ酸(FA)が補充された精製されたMSグレードの水(Honeywell/Fluka,Bucharest,Romania、56302)であった。移動相Dは、0.1%FA移動相組成を維持するために10%に固定し、カラム温度は80℃にセットした。一般的なMS方法は、平均DARを決定するためにネイティブMSを使用した1つのADCを除いて、すべての合成されたADCに対して最適化した(以下のMS-Iおよび表22を参照されたい)。
LC-I:ADCをMassPREP Micro脱塩カラム(2.1×5.0mm、Waters,Saint-Quentin-en-Yvelines,France、186004032)上に装填した。無傷の質量分析のために、脱塩ステップを0.5ml/分の流速で5%移動相Bにて0.5分間行った。溶出ステップを、0.2ml/分の流速で、5%Bで0.51分~90%Bで2.0分の勾配を用いて行った。2回の洗浄ステップを、0.5ml/分の流速で5%B~90%Bにて2.1分~2.7分および2.8分~3.4分にセットした。最後に、コンディショニングステップを、3.5分に5%B(0.5ml/分)で0.5分間使用した。
還元状態におけるADC分析のために、脱塩ステップを0.2ml/分の流速で5%Bにて0.5分間行った。次いで、溶出ステップを、0.2ml/分の流速で、10%Bで0.51分~80%Bで7.61分の勾配を用いて開始した。2回の洗浄ステップを、5%B~90%B(0.5ml/分)で8.1分~8.6分および8.7分~9.2分にセットした。最後に、コンディショニングステップを、9.3分に0.5ml/分の流速で5%Bにて0.5分間行った。
LC-II:ADCをMabPac RPカラム(2.1×100mm、4μm、Thermo Fisher Scientific,Rockford,IL、088647)上に装填した。無傷の状態および還元状態の両方における分析のために、脱塩ステップを0.4mL/分の流速で20%のBにて1.4分間行った。次いで、溶出ステップを、0.3ml/分の流速で、20%Bで1.5分~70%Bで11.5分の勾配を用いて行った。洗浄ステップを、0.5ml/分の流速で、90%Bにて11.75分~13.75分にセットした。最後に、コンディショニングステップを、14.0分に0.4ml/分の流速で20%Bにて1.0分間使用した。
LC-III:ADCをBioresolve RP mAbポリフェニル、450A、2.7μm、2.1×150mm(Waters,Saint-Quentin-en-Yvelines,France、186008946)上に装填した。無傷の状態および還元状態の両方における分析のために、脱塩ステップを0.4ml/分の流速で20%のBにて1.4分間行った。溶出ステップを、0.3ml/分の流速で、20%Bで1.5分~70%Bで11.5分の勾配を用いて行った。洗浄ステップを、0.5ml/分の流速で90%Bにて11.75分~13.75分にセットした。最後に、コンディショニングステップを、14.0分に0.4ml/分の流速で20%Bにて1.0分間使用した。
MS-I:ADCをMS適合性の緩衝剤と緩衝液交換し、陽イオンモードで動作する自動化チップベースのナノESI源(Triversa Nanomate、Advion Biosciences,Ithaca,NY,USA)を備え付けたハイブリッドQ-TOF MS機器(Synapt G2-S HDMS、Waters,Manchester,UK)に直接注入した。機器のMSパラメーターは、気相におけるネイティブ3D構造を保存し、効率的なイオン脱溶媒和および透過を確実にするために調製された。
LC-MS分析を、Xevo G2 XS Q-TOF ESI質量分析計(Waters,Manchester,UK)と組み合わせたWaters UPLC H-Class Bioクロマトグラフィーシステムを使用して行った。ADCは、無傷の状態(前処置なし)で、または5mM(最終濃度)のジチオトレイトールDTT(Thermo Scientific,Rockford,IL、20291)による還元に続いて分析した。その後、処置したADCを、前述のLC-I、LC-II、またはLC-III(表22)のいずれかを使用して分析した。分析物のエレクトロスプレーイオン化飛行時間型質量スペクトルを、MassLynx(商標)取得ソフトウェア(Waters,Manchester,UK)を使用して取得した。行われた単一のネイティブMS実験に関して、ADCを、平均DARを決定するためにMS-I方法論を使用して分析した。次いで、抽出した強度対m/zスペクトルを、使用した処置に応じて各無傷抗体種または各還元抗体断片の質量を決定するために、MassLynx(商標)ソフトウェアの最大エントロピー(MaxEnt)法を使用して逆重畳積分した。最後に、DARは、結合した薬物の数を各面積に乗算することにより重み付けした、コンジュゲートしていないおよびコンジュゲートした所定の種(mAbまたは関連断片)の積分したMS(全イオン電流)またはUV(280nm)ピーク面積を合計することにより、逆重畳積分したスペクトルまたはUVクロマトグラムから決定した。合計し、重み付けした面積を総面積の合計で除算し、その結果が全ADCについての最終平均DAR値を生成する。
液体クロマトグラフィー-質量分析(LC/MS)II
LC/MSデータを、以下のパラメーター(表13)で機器を使用して取得した:
Figure 2022532918000668
LC/MSデータを生成するために使用した方法は、以下の通りであった(表14~16):
Figure 2022532918000669
Figure 2022532918000670
Figure 2022532918000671
高分解能質量分析(HRMS)
HRMSデータを、以下のパラメーター(表17)で機器を使用して取得した:
Figure 2022532918000672
リンカー/ペイロードおよび合成中間体についてのHRMSデータを生成するために使用した方法は、以下の通りであった(表18および19):
Figure 2022532918000673
Figure 2022532918000674
ADCについてのHRMSデータを生成するために使用した方法は、以下の通りであった(表20):
Figure 2022532918000675
サイズ排除クロマトグラフィー(SEC)I
サイズ排除クロマトグラフィー(SEC)を、精製後のADCの質および凝集パーセンテージ(%)を決定するために行った。分析は、定組成条件 100%PBS pH7.4(Sigma、P3813、10PAK)、流速0.45ml/分 12分間で、分析カラムSuperdex 200 Increase 5/150 GL(GE Healthcare、28990945)上で行った。ADC試料の%凝集画分を、280nmにおけるピーク面積吸光度に基づいて定量した。計算は、280nmにおける高分子量溶離液を高分子量の同じ波長におけるピーク面積吸光度の合計で除算したものと、モノマー溶離液との間の比を、100%で乗算したものに基づいていた。
サイズ排除クロマトグラフィー(SEC)II
SECデータを、以下のパラメーター(表21)および12分の実行時間長で機器を使用して取得した:
Figure 2022532918000676
結果
コンジュゲーションの一部は、2~20mgの間の抗体範囲で行った。すべての例示されたADCを、モノマーパーセンテージを決定するための分析サイズ排除クロマトグラフィーSuperdex 200 Increase 5/150 GL(GE Healthcare、28990945)およびDAR決定のためのLC-MSにより特徴付けした。例示的なADCの特徴付けを表22に要約する(カップリングおよびLC/MS方法、凝集状態、およびDAR)。平均DAR値を、上記のLC/MS方法(LC/MS I)を使用して決定し、パーセンテージ凝集を、上記のSEC方法(SEC I)を使用して決定した。
Figure 2022532918000677
[実施例5]
in vitro評価I
蛍光偏光(FP)によるMcl-1の阻害
各化合物の相対的結合能を、蛍光偏光(FP)を介して決定した。方法は、Mcl-1タンパク質(UniProt参照配列:Q07820;配列番号71)に結合するフルオレセイン標識リガンド(フルオレセイン-βAla-Ahx-A-REIGAQLRRMADDLNAQY-OH;MW 2,765)を利用し、リーダーを使用して蛍光偏光度(mP)単位において測定された高い異方性をもたらした。リガンドと同じ部位に競争的に結合する化合物の添加により、mP単位での低下が示す通り、系において未結合リガンドの割合が高くなる。
各化合物の11点連続希釈をDMSOで調製し、2μlを平底の結合性の低い384ウェルプレートに移した(最終DMSO濃度5%)。次いで、フルオレセイン標識リガンド(最終濃度1nM)およびMcl-1タンパク質(最終濃度5nM)を含有する、38μlの緩衝剤(10mM 4-(2-ヒドロキシエチル)-1-ピペラジンエタンスルホン酸[HEPES]、150mM NaCl、0.05%のTween20、pH7.4)を加えた。
アッセイプレートを室温で約2時間インキュベートした後、Biomek Synergy2リーダー(励起528nm、発光640nm、カットオフ510nm)でFPを測定し、mP単位を計算した。増加する用量の試験化合物の結合を、「5%DMSOのみ」と「100%阻害」との対照間で確立されたウィンドウと比較したmPでの減少パーセンテージとして表した。11点用量応答曲線を、4パラメーターロジスティックモデル(シグモイド用量応答モデル)を使用してXL-Fitソフトウェアでプロットし、mPで50%減少させる阻害濃度(IC50)を決定した。結果を以下の表23に提示する。結果は、試験した化合物がMcl-1タンパク質とフルオレセイン標識ペプチドとの間の相互作用を阻害することを示唆する。
in vitro細胞毒性
細胞毒性試験を、NCI-H929多発性骨髄腫の細胞系で実施した。細胞をマイクロプレートに分注し、試験化合物に48時間曝露した。次いで、比色アッセイ、Microculture Tetrazolium Assay(Carmichael et al. (1987) Cancer Res. 47:936-42)により、細胞生存率を定量化した。
結果をIC50(細胞生存率を50%阻害する化合物の濃度)で表し、そして、以下の表23に提示する。結果は、試験した化合物が、NCI-H929細胞において細胞毒性であることを示す。
Figure 2022532918000678
[実施例6]
in vitro評価II
Mcl-1 ADCを、9個の内因性がん細胞系および目的の標的を過剰発現するように操作された1個の同質遺伝子細胞系で試験した。6個の標的を評価した:HER2、BCMA、CD38、CD48、CD79b、およびCD33。
細胞系
HER2:HCC1954(RPMI-1640+10%のFBSで培養されたATCC番号CRL-2338)およびHCC2218(RPMI-1640+10%のFBSで培養されたATCC番号CRL-2343)。
BCMA:NCI-H929(RPMI-1640+10%のFBS+0.05mM 2-メルカプトエタノールで培養されたATCC番号CRL-9068)。
CD38:A4-Fuk(RPMI-1640+10%のFBSで培養されたJCRB番号JCRB0097)およびKMS-21BM(RPMI-1640+10%のFBSで培養されたJCRB番号JCRB1185)。
CD48:NCI-H929(RPMI-1640+10%のFBS+0.05mM 2-メルカプトエタノールで培養されたATCC番号CRL-9068)、OPM-2(RPMI-1640+10%のFBSで培養されたDSMZ番号ACC-50)、およびAMO1(RPMI-1640+20%のFBSで培養されたDSMZ番号ACC-538)。
CD79b:RS4;11(RPMI-1640+10%のFBSで培養されたATCC番号CRL-1873)。
CD33:MOLM-13(RPMI-1640+10%のFBSで培養されたDSMZ番号ACC-554)および同質遺伝子細胞系、AMO1-CD33クローンD2。AMO1細胞系をトランスフェクトして、目的の外因性タンパク質、CD33、AMO1-CD33クローンD2(RPMI-1640+20%のFBSで培養)を発現する安定なAMO1細胞系を生成する。
細胞増殖および生存の阻害
Mcl-1 ADCの細胞増殖および生存を阻害する能力を、Promega CellTiter-Glo(登録商標)増殖アッセイを使用して評価した。細胞系を、組織培養インキュベーターにおいて5%のCO、37℃でそれらの成長に最適な培地で培養した。増殖アッセイのために播種する前に、細胞を、アッセイの少なくとも2日前に分けて、最適な成長密度を確実にした。播種の日に、付着細胞を、0.25%のトリプシンを使用して組織培養フラスコから外した。細胞生存率および細胞密度を、細胞計数器(Vi-Cell XR生死細胞アナライザー、Beckman Coulter)を使用して決定した。85%超の生存率の細胞を、白色の透明底の384ウェルTC処置プレート(Corning、カタログ番号3765)に播種した。細胞を、45μlの標準的な成長培地において1ウェル当たり1,000個の細胞の密度で播種した。プレートを、組織培養インキュベーターにおいて5%のCO、37℃で終夜インキュベートした。次の日、遊離Mcl-1ペイロード(P1)、標的化Mcl-1 ADC、および非標的化アイソタイプADCを、標準的な成長培地において10倍で調製した。次いで、調製した薬物処置を細胞に加え、1ウェル当たり0.0005~500nMの最終濃度および50μlの最終体積とした。各薬物濃度を4回試験した。プレートを、組織培養インキュベーターにおいて5%のCO、37℃で5日間インキュベートした後、細胞生存率を、25μlのCellTiter Glo(登録商標)(Promega、カタログ番号G7573)、細胞を溶解しアデノシン三リン酸(ATP)の総含有量を測定する試薬の添加によって評価した。プレートを、室温で10分間インキュベートして発光シグナルを安定化した後、ルミネセンスリーダー(EnVisionマルチラベルプレートリーダー、PerkinElmer)を使用して読み取った。薬物処置の効果を評価するために、未処置細胞(100%の生存率)を含有するウェル由来の発光計数を使用して、処置した試料を正規化した。様々な勾配モデルを適用して、GraphPad PRISMバージョン7.02のソフトウェアにおいて、データに対して非線形回帰曲線を適合した。IC50およびAmax値を、得られた曲線から外挿した。
目的の6つの標的を発現する代表的ながん細胞系の用量応答曲線は、図2A~図7に示す。細胞成長または生存を50%阻害するのに必要な処置の濃度(IC50)を、試験した細胞系の代表的なIC50値で計算し、表24~29に概説する。
代表的ながん細胞系は、10~60nMの範囲であるIC50値でのHER2陽性がん細胞系を除いて、0.038~5.6nMの活性の範囲であるIC50値でMcl-1ペイロード(P1)に感度を有することが示された。A4-FukおよびKMS-21BM細胞で試験したCD38標的化Mcl-1 ADC CD38-L7-P1は、アイソタイプが一致した非標的化対照ADC、IgG-L7-P1に対して、高いin vitro有効性を示した。しかし、細胞成長の最大阻害は、50%に達した(図2Aおよび図2B)。Mcl-1ペイロード、P1への感度にかかわらず、CD48標的化Mcl-1 ADC、CD48-L7-P1は、細胞増殖の阻害を誘発せず、本実験におけるアイソタイプが一致した非標的化対照ADC、IgG-L7-P1に類似した(図3A~図3C)。類似の傾向は、CD79b標的化Mcl-1 ADC、CD79b-L7-P1に対して観察された(図4)。HER2標的化Mcl-1 ADC、Her2-L9-P1は、Mcl-1ペイロード(P1)のものと類似のHCC2218細胞での細胞傷害活性を示したが、HCC1954細胞では不活性であった(図5Aおよび図5B)。同質遺伝子細胞系AMO1-CD33クローンD2の細胞増殖は、0.089~0.476nMの範囲であるIC50で、CD33-L2-P1、CD33-L3-P1およびCD33-L7-P1により阻害された。一致した非標的化Mcl-1 ADC、IgG-L7-P1では、活性はほとんど観察されなかった。CD33-L12-P2およびCD33-L4-P2は、同質遺伝子細胞系AMO1-CD33クローンD2では不活性であった。CD33-L7-P1 ADCのみをMOLM-13細胞で試験し、一致した非標的化Mcl-1 ADC、IgG-L7-P1によるバックグラウンド活性をほとんど有していなかったにもかかわらず、その活性は適度であった(図6Aおよび図6B)。様々なリンカー(L1、L3~L5、L7~L10)を使用するBCMA標的化ADCは、NCI-H929細胞の細胞増殖を阻害する類似の細胞傷害活性を示した。アイソタイプが一致した非標的化対照、IgG-L7-P1は、最も高い試験濃度500nMで、細胞系で同じ活性を示した。BCMA-L12-P2およびBCMA-L4-P2 ADCは、NCI-H929細胞系では不活性であった(図7)。
本試験では、Mcl-1 ADCが、BCMA、CD33、およびより少ない程度でCD38を発現する様々ながん細胞系で細胞増殖を阻害することが可能であることが示される。Mcl-1 ADCは、CD38、CD79b、およびHER2を発現するがん細胞系でのアイソタイプが一致した非標的化対照に対して、ほとんど細胞傷害活性を示さなかった。
Figure 2022532918000679
Figure 2022532918000680
Figure 2022532918000681
Figure 2022532918000682
Figure 2022532918000683
Figure 2022532918000684
[実施例7]
in vitro評価 - 抗CD33 ADC(Gln部位特異的コンジュゲーション)
AMO1-CD33操作された細胞系の生成(クローンD2)
AMO1は、CD33を発現しない多発性骨髄腫のヒト細胞系である。hCD33を発現するAMO1クローンを生成するために、AMO1細胞を、8μg/mlのポリブレンの存在下、感染多重度(MOI)8でhCD33(クローンID:PLOHS 100004356)をコードするレンチウイルス粒子(GEヘルスケア-Dharmacon)で形質導入した。細胞をGFPレポーター遺伝子発現に基づいて分類し、細胞表面のhCD33の存在をフローサイトメトリーで評価した。その後、AMO1-CD33細胞を、異なるレベルのhCD33の発現でクローンを分離するために単一細胞として分類した。AMO1-CD33クローンD2を、フローサイトメトリーにより測定される通り、hCD33の高いその発現に基づいて選択した。
MTTアッセイを使用する細胞生存率
MTT比色アッセイは、生細胞によるテトラゾリウム塩のミトコンドリア還元に基づく。生存細胞数はホルマザン塩の作製に比例し、これは、540nmで分光光度法により読み取ることができる。
AMO1-CD33クローンD2細胞を、20%の熱不活性化ウシ胎児血清、ペニシリン(100IU/ml)、ストレプトマイシン(100μg/ml)、およびL-グルタミン(2mM)を補充したRPMI 1640で培養した。細胞を、5%のCOを含有する湿潤雰囲気下、37℃で培養した。細胞を96マイクロウェルプレート(1ウェル当たり150μl)に播種し、ADCに48時間曝露した(3.16倍連続希釈;各々8個の濃度、3回)。インキュベーション時間の終了時に、15μlのMTT溶液(5mg/ml)をウェルごとに加え、細胞をさらに4時間インキュベートした。次いで、100μlの10%の硫酸ドデシルナトリウム(SDS)/HCl 10mMをウェルごとに加え、プレートを終夜インキュベートした後、540nmで光学密度を測定した。IC50値を、標準的な4パラメーター曲線フィッティングを使用して計算した。本アッセイに対して、IC50は、MTTシグナルが対照に対して測定されたものの50%まで低下する場合の化合物濃度として定義した。各実験を少なくとも2回実施し、結果は再現性を有した。
結果:図8Aおよび8Bに示す通り、全ての試験した抗CD33 ADCおよび対応するペイロードは、MTTアッセイにおいてAMO1-CD33クローンD2細胞の生存率での用量依存的減少を誘発した一方、対応する裸の抗体では著しい効果は観察されなかった。
[実施例8]
in vitro評価 - 抗HER2 ADC(Gln部位特異的コンジュゲーション)
CTGアッセイを使用する細胞生存率
HCC1954細胞を、10%の熱不活性化ウシ胎児血清、ペニシリン(100IU/ml)、ストレプトマイシン(100μg/ml)、およびL-グルタミン(2mM)を補充したRPMIで培養した。細胞を、5%のCOを含有する湿潤雰囲気下、37℃で培養した。細胞を96マイクロウェルプレートに播種し、ADCに120時間曝露した(5倍連続希釈;各々9個の濃度、3回)。細胞生存率でのADCの効果を、75μlの試薬/ウェルでCellTiterGlo(登録商標)試薬を使用する細胞のATPレベルの定量化により、37℃/5%のCOでのインキュベーションの5日後に評価した。全ての状態を3回試験した。ルミネセンスを多目的プレートリーダーで定量化した。IC50値を、標準的な4パラメーター曲線フィッティングを使用して計算した。本アッセイに対して、IC50は、CTGシグナルが対照に対して測定されたものの50%まで低下する場合の化合物濃度として定義した。各実験を少なくとも2回実施し、結果は再現性を有した。
結果:図9Aおよび9Bに示す通り、全ての試験した抗HER2 ADCおよび対応するペイロードは、CTGアッセイにおいてHCC1954細胞の生存率での用量依存的減少を誘発した一方、対応する裸の抗体では著しい効果は観察されなかった。
[実施例9]
in vitro評価 - MTTアッセイを使用するNCI-H929(多発性骨髄腫)細胞生存率の抗BCMA ADC(Cys部位特異的コンジュゲーション)の効果
MTT比色アッセイは、生細胞によるテトラゾリウム塩のミトコンドリア還元に基づく。生存細胞数はホルマザン塩の作製に比例し、これは、540nmで分光光度法により読み取ることができる。
NCI-H929細胞を、10%の熱不活性化ウシ胎児血清、ペニシリン(100IU/ml)、ストレプトマイシン(100μg/ml)、およびL-グルタミン(2mM)を補充したRPMI 1640で培養した。細胞を、5%のCOを含有する湿潤雰囲気下、37℃で培養した。細胞を96マイクロウェルプレート(1ウェル当たり150μl)に播種し、ADCに48時間曝露した(3.16倍連続希釈;各々8個の濃度、3回)。インキュベーション時間の終了時に、15μlのMTT溶液(5mg/ml)をウェルごとに加え、細胞をさらに4時間インキュベートした。次いで、100μlの10%の硫酸ドデシルナトリウム(SDS)/HCl 10mMをウェルごとに加え、プレートを終夜インキュベートした後、540nmで光学密度を測定した。IC50値を、標準的な4パラメーター曲線フィッティングを使用して計算した。本アッセイに対して、IC50は、MTTシグナルが対照に対して測定されたものの50%まで低下する場合の化合物濃度として定義した。各実験を少なくとも2回実施し、結果は再現性を有した。
結果:図10A、10B、10C、および10Dに示す通り、全ての試験した抗BCMA-Mcl1i ADCおよび対応するペイロードは、MTTアッセイにおいてNCI-H929細胞の生存率での用量依存的減少を誘発した一方、対応する裸の抗体では著しい効果は観察されなかった。
[実施例10]
in vitro評価 - 抗CD48 ADC
NCI-H929、KHM1B、およびKMS21BM細胞を、10%の熱不活性化ウシ胎児血清、ペニシリン(100IU/ml)、ストレプトマイシン(100μg/ml)、およびL-グルタミン(2mM)を補充したRPMIで培養した。細胞を、5%のCOを含有する湿潤雰囲気下、37℃で培養した。細胞を96マイクロウェルプレートに播種し、ADCに72時間曝露した(3.16倍連続希釈;各々8個の濃度、3回)。細胞生存率でのADCの効果を、75μlの試薬/ウェルでCellTiterGlo(登録商標)試薬を使用する細胞のATPレベルの定量化により、37℃/5%のCOでのインキュベーションの3日後に評価した。全ての状態を3回試験した。ルミネセンスを多目的プレートリーダーで定量化した。IC50値を、標準的な4パラメーター曲線フィッティングを使用して計算した。本アッセイに
対して、IC50は、CTGシグナルが対照に対して測定されたものの50%まで低下する場合の化合物濃度として定義した。各実験を少なくとも2回実施し、結果は再現性を有した。
結果:CTGアッセイにおける細胞の生存率での試験した抗CD48 ADCの効果は、図13A(NCI-H929)、図13B(KHM1B)、および図13C(KMS21BM)に示す。試験した抗CD48 ADCが、CTGアッセイにおいてNCI-H929、KHM1B、およびKMS21BM細胞の生存率での明らかな減少を誘発したことを示した。
[実施例11]
in vivo評価I
リン酸塩緩衝食塩水(PBS)において製剤化される例示的なBCMA標的化ADCを、静脈内(IV)投与後のNCI-H929多発性骨髄腫マウスモデルにおいてin vivoでの治療有効性に対して評価した。
材料および方法
以下の化合物を本実施例において使用した(ADCは、実施例4に記載の方法を介して合成した):IgG1-リンカー-ペイロードFcサイレント、抗BCMA_CysmAb FcサイレントAb、抗BCMA_CysmAb Fcサイレント_L7-P1。
NCI-H929細胞(ATCC番号CRL-9068)を、10%のFBSを補充したRPMIで培養した。細胞を100%のマトリゲル(BD Biosciences)内で再懸濁し、5×10個の細胞を含有する0.1mlのマトリゲルを、雌のSCIDマウス(Charles River)の右側腹へ皮下接種した。腫瘍が適切な体積に達した場合、マウスをEasy statソフトウェアを使用して、1群当たり6匹の動物に無作為化した。IgG1-リンカー-ペイロードFcサイレント、抗BCMA_CysmAb Fcサイレント、および抗BCMA_CysmAb Fcサイレント_L7-P1(10mg/kgまたは30mg/kg)を、PBSにおいて1回IV注射した。体重を1週間に3回モニタリングし、腫瘍サイズを電子ノギスを使用して測定した。腫瘍体積を式:(最小直径)(最大直径)/2を使用して最小および最大の腫瘍直径を測定することにより推定した。対照動物の少なくとも半数が試験に依然として存在する最終日(d17)、腫瘍成長阻害を式:
Figure 2022532918000685
を使用して計算した。DxでのDTV(デルタ腫瘍体積)を、DxでのTV-無作為化でのTVで計算した。奏功を以下の通り評価した:少なくとも3回の測定に対して腫瘍サイズが25mm以下であった場合、CR(完全奏効)、少なくとも3回の測定に対して腫瘍サイズが25mmと114mm(開始サイズの半分)との間であった場合、PR(部分奏効)。マウスを、腫瘍体積が2000mmを超えた最初の測定、または動物の健康悪化の最初の兆候で殺処分した。全ての実験を、2018年における現行のフランスの規制にしたがって実行した。SCIDマウスを施設でのガイドラインによって飼育した。
結果
NCI-H929異種移植片での抗BCMA_CysmAb Fcサイレント_L7-P1の有効性は、図11に示す。処置は、腫瘍細胞接種の11日後に開始した(平均サイズ:229.2mm)。IgG1-リンカー-ペイロードFcサイレント(非標的化ADC FS)、抗BCMA_CysmAb Fcサイレント(裸の抗体FS)、および抗BCMA_CysmAb Fcサイレント_L7-P1(BCMA標的化ADC FS)を、10および/または30mg/kgで、IVで1回投与した。17日目に、30mg/kgでBCMA標的化ADC FSにより誘発された腫瘍成長阻害(%TGI)は、図11および表30に示す通り、裸の抗体FS(それぞれTGI=99.2%対34.7%、p<0.0001)、および対応する非標的化ADC FS(TGI=37.7%、p<0.0001)より大きい。10mg/kgで、裸の抗体FSは、抗腫瘍活性を示さなかった一方、BCMA標的化ADC FSは、75.6%のTGI(p=0.0038)を誘発した。完全退縮(CR)は、BCMA標的化ADC FSで処置された動物で排他的に達成された。処置による臨床関連の体重減少または他の臨床兆候は観察されなかった(図12)。
Figure 2022532918000686
[実施例12]
in vivo評価II
3個のBCMA標的化ADCのin vivoでの治療効果を、静脈内(IV)投与後のH929多発性骨髄腫モデルにおいて決定した。
材料および方法
以下の化合物を本実施例において使用した(ADCは、実施例4に記載の方法を介して合成した):抗BCMA_CysmAb Fcサイレント、抗BCMA_CysmAb Fcサイレント_L11-P1、Ab B Fcサイレント-L27-P1、および抗BCMA_CysmAb Fcサイレント_L5-P1。
H929細胞は、ATCCから得られるが、10%のFBSを補充したRPMIで培養した。細胞を100%のマトリゲル(BD Biosciences)内で再懸濁し、5×10個の細胞を含有する0.1mlを、Charles Riverより供給される雌のSCIDマウスの右側腹へ皮下接種した。腫瘍が適切な体積に達した場合、マウスをEasy statソフトウェアを使用して、1群当たり6匹の動物に無作為化した。抗BCMA_CysmAb Fcサイレント、抗BCMA_CysmAb Fcサイレント_L11-P1/L5-P1、Ab B Fcサイレント-L27-P1(20mg/kg)を、20mMのヒスチジン/NaClで、IVで1回注射した。マウスの体重を1週間に3回モニタリングし、腫瘍サイズを電子ノギスを使用して測定した。腫瘍体積を式:(最小直径)(最大直径)/2を使用して最小および最大の腫瘍直径を測定することにより推定した。対照動物の少なくとも半数が試験に依然として存在する最終日(d14)、腫瘍成長阻害を式:
Figure 2022532918000687
を使用して計算し、DxでのDTV(デルタ腫瘍体積)を、DxでのTV-無作為化でのTVで計算した。
奏功を以下の通り評価した:少なくとも3回の測定に対して腫瘍サイズが25mm以下であった場合、CR(完全奏効)、少なくとも3回の測定に対して腫瘍サイズが25mmと90.6mm(開始サイズの半分)との間に含まれた場合、PR(部分奏効)。
マウスを、腫瘍体積が2000mmを超えた最初の測定、または動物の健康悪化の最初の兆候で殺処分した。全ての実験を、Servier研究所(IdRS)倫理委員会の承認後の2018年における現行のフランスの規制にしたがって実行した。SCIDマウスを施設でのガイドラインによって飼育した。
結果
H929異種移植片での異なるリンカーを含有する抗BCMA_CysmAb FcサイレントADCの有効性は、図14に示す。処置は、腫瘍細胞接種の11日後に開始した(平均サイズ:181.3mm)。抗BCMA_CysmAb Fcサイレント(裸の抗体FS)および異なる抗BCMA_CysmAb FcサイレントADC(BCMA標的化ADC FS)を、20mg/kgで、IVで1回投与した。14日目に、3つのBCMA標的化ADC FS(L5-P1、L27-P1およびL11-P1)が、図14および表31に示す通り、裸の抗体FSと比較して強力な腫瘍成長阻害(%TGI)(それぞれTGI=84.3%、96.5%、108.6%対-1.7%、p<0.01)を誘発したことを見出した。完全退縮(CR)は、BCMA標的化ADC FSで処置された動物で排他的に達成された(表31)。処置による臨床関連の体重減少または他の臨床兆候は観察されなかった(図15)。
Figure 2022532918000688
[実施例13]
in vivo評価III
リン酸塩緩衝食塩水(PBS)において製剤化されるCD48標的化ADCのin vivoでの治療効果を、静脈内(IV)投与後のH929多発性骨髄腫モデルにおいて決定した。
材料および方法
以下の化合物を本実施例において使用した:IgG1-リンカー-ペイロードFcサイレント、抗CD48_CysmAb Fcサイレント、抗CD48_CysmAb Fcサイレント_L5-P1。本明細書の実施例で使用される抗CD48抗体は、米国特許公開第20180092984号明細書に記載のヒト化MEM102(hMEM102)であり、これを、CysmAb突然変異で操作してリンカー-ペイロードとのコンジュゲーションを促進した。ADCは、実施例4に記載の方法を介して合成した。
H929細胞は、ATCCから得られるが、10%のFBSを補充したRPMIで培養した。細胞を100%のマトリゲル(BD Biosciences)内で再懸濁し、5×10個の細胞を含有する0.1mlを、Charles Riverより供給される雌のSCIDマウスの右側腹へ皮下接種した。腫瘍が適切な体積に達した場合、マウスをEasy statソフトウェアを使用して、1群当たり8匹の動物に無作為化した。IgG1-リンカー-ペイロードFcサイレント、抗CD48_CysmAb Fcサイレント、および抗CD48_CysmAb Fcサイレント_L5-P1(30mg/kg)を、PBSにおいて1回IV注射した。マウスの体重を1週間に3回モニタリングし、腫瘍サイズを電子ノギスを使用して測定した。腫瘍体積を式:(最小直径)(最大直径)/2を使用して最小および最大の腫瘍直径を測定することにより推定した。対照動物の少なくとも半数が試験に依然として存在する最終日(d16)、腫瘍成長阻害を式:
Figure 2022532918000689
を使用して計算し、DxでのDTV(デルタ腫瘍体積)を、DxでのTV-無作為化でのTVで計算した。
マウスを、腫瘍体積が2000mmを超えた最初の測定、または動物の健康悪化の最初の兆候で殺処分した。全ての実験を、Servier研究所(IdRS)倫理委員会の承認後の2018年における現行のフランスの規制にしたがって実行した。SCIDマウスを施設でのガイドラインによって飼育した。
結果
H929異種移植片での抗CD48_CysmAb Fcサイレント_L5-P1の有効性は、図16に示す。処置は、腫瘍細胞接種の10日後に開始した(平均サイズ:133.1mm)。IgG1-リンカー-ペイロードFcサイレント(非標的化ADC FS)、抗CD48_CysmAb Fcサイレント(裸の抗体FS)、および抗CD48_CysmAb Fcサイレント_L5-P1(CD48標的化ADC FS)を、30mg/kgで、IVで1回投与した。16日目に、30mg/kgでCD48標的化ADC FSにより誘発された腫瘍成長阻害(%TGI)は、図16および表32に示す通り、裸の抗体FS(それぞれTGI=98.8%対-22.9%、p<0.001)、および対応する非標的化ADC FS(TGI=-50.4%)より大きい。処置による臨床関連の体重減少または他の臨床兆候は観察されなかった(図17)。
Figure 2022532918000690
[実施例14]
in vitro評価 - CTGアッセイを使用するKMS21BM(多発性骨髄腫)細胞生存率の抗CD46-Mcl-1 ADC(Ab C-L9-C1)および対応するペイロードの効果
KMS21BM細胞を、5%のCOを含有する湿潤雰囲気下、37℃で、10%の熱不活性化ウシ胎児血清、ペニシリン(100IU/ml)、ストレプトマイシン(100μg/ml)、およびL-グルタミン(2mM)を補充したRPMI 1640で培養した。KMS21BM細胞を96マイクロウェルプレートに播種し、ADCに72時間曝露した(3.16倍連続希釈;各々9個の濃度、3回)。細胞生存率のADC、裸の抗体、または対応するペイロードC1の効果を、75μLの試薬/ウェルでCellTiterGloを使用する細胞のATPレベルの定量化により、37℃/5%のCOでのインキュベーションの3日後に評価した。全ての状態を3回試験した。ルミネセンスを多目的プレートリーダーで定量化した。IC50(表33)を、標準的な4パラメーター曲線フィッティングを使用して計算した。IC50は、CTGシグナルが対照に対して測定されたものの50%まで低下する場合の化合物濃度として定義した。各実験を少なくとも2回実施し、結果は再現性を有した。図18に示す通り、抗CD46-Mcl-1 ADC(Ab C-L9-C1)および対応するペイロードC1は、CTGアッセイにおいてKMS21BM細胞の生存率での用量依存的減少を誘発した一方、対応する裸の抗体では著しい効果は観察されなかった。
Figure 2022532918000691
[実施例15]
in vitro評価 - MTTアッセイを使用するAMO1-CD33クローンD2細胞生存率においてBCL2阻害剤化合物A1と組み合わせた抗CD33-Mcl-1 ADCの効果
AMO1-CD33クローンD2細胞を、20%の熱不活性化ウシ胎児血清、ペニシリン(100IU/ml)、ストレプトマイシン(100μg/ml)、およびL-グルタミン(2mM)を補充したRPMI 1640で培養した。細胞を、5%のCOを含有する湿潤雰囲気下、37℃で培養した。細胞を96マイクロウェルプレート(1ウェル当たり150μL)に播種し、1μMのBCL2阻害剤化合物A1の非存在下または存在下で、ADC、裸の抗体、または対応するペイロードに48時間曝露した(3.16倍連続希釈;各々8個の濃度、3回)。インキュベーション時間の終了時に、15μLのMTT溶液(5mg/ml)をウェルごとに加え、細胞をさらに4時間インキュベートした。次いで、100μLの10%の硫酸ドデシルナトリウム(SDS)/HCl 10mMをウェルごとに加え、プレートを終夜インキュベートした後、540nmで光学密度を測定した。IC50を、標準的な4パラメーター曲線フィッティングを使用して計算した。IC50は、MTTシグナルが対照に対して測定されたものの50%まで低下する場合の化合物濃度として定義した。各実験を少なくとも2回実施し、結果は再現性を有した。
図19Aおよび19Bに示す通り、全てのADCは、AMO1-CD33クローンD2細胞の生存率において単剤での用量依存的減少を誘発した。興味深いことに、ADCの活性は、BCL2阻害剤化合物A1と組み合わせた場合に著しく改善される一方、これらの細胞を、対応する裸の抗体を単剤で、または1μMの化合物A1と組み合わせて処置した後では著しい効果は観察されなかった。
[実施例16]
in vitro評価 - MTTアッセイを使用するAMO1細胞生存率の、単剤での、およびBCL2阻害剤化合物A1と組み合わせた抗BCMA-Mcl-1 ADCの効果
MTT比色アッセイは、生細胞によるテトラゾリウム塩のミトコンドリア還元に基づく。生存細胞数はホルマザン塩の作製に比例し、これは、540nmで分光光度法により読み取ることができる。
AMO1細胞を、20%の熱不活性化ウシ胎児血清、ペニシリン(100IU/ml)、ストレプトマイシン(100μg/ml)、およびL-グルタミン(2mM)を補充したRPMI 1640で培養した。細胞を、5%のCOを含有する湿潤雰囲気下、37℃で培養した。細胞を96マイクロウェルプレート(1ウェル当たり150μL)に播種し、1μMの化合物A1化合物の非存在下または存在下で、ADCまたは対応するペイロードに48時間曝露した(3.16倍連続希釈;各々8個の濃度、3回)。インキュベーション時間の終了時に、15μLのMTT溶液(5mg/ml)をウェルごとに加え、細胞をさらに4時間インキュベートした。次いで、100μLの10%の硫酸ドデシルナトリウム(SDS)/HCl 10mMをウェルごとに加え、プレートを終夜インキュベートした後、540nmで光学密度を測定した。C50を、標準的な4パラメーター曲線フィッティングを使用して計算した。IC50は、MTTシグナルが対照に対して測定されたものの50%まで低下する場合の化合物濃度として定義した。各実験を少なくとも2回実施し、結果は再現性を有した。図20Aおよび20Bに示す通り、全ての抗BCMA-Mcl-1 ADCは、MTTアッセイにおいてAMO1細胞の生存率での用量依存的減少を誘発した。興味深いことに、ADCの活性は、BCL2阻害剤化合物A1と組み合わせた場合に著しく改善された一方、これらの細胞を、対応する裸の抗体を単剤で、または1μMの化合物A1と組み合わせて処置した後では著しい効果は観察されなかった。
[実施例17]
in vitro評価 - MTTアッセイを使用するNCI-H929細胞生存率のBCL2阻害剤化合物A1と組み合わせた抗BCMA-Mcl-1 ADCの効果
MTT比色アッセイは、生細胞によるテトラゾリウム塩のミトコンドリア還元に基づく。生存細胞数はホルマザン塩の作製に比例し、これは、540nmで分光光度法により読み取ることができる。
NCI-H929細胞を、10%の熱不活性化ウシ胎児血清、ペニシリン(100IU/ml)、ストレプトマイシン(100μg/ml)、およびL-グルタミン(2mM)を補充したRPMIで培養した。細胞を、5%のCOを含有する湿潤雰囲気下、37℃で培養した。細胞を96マイクロウェルプレート(1ウェル当たり150μL)に播種し、1μMの化合物A1の非存在下または存在下で、ADCまたは対応するペイロードに48時間曝露した(3.16倍連続希釈;各々8個の濃度、3回)。インキュベーション時間の終了時に、15μLのMTT溶液(5mg/ml)をウェルごとに加え、細胞をさらに4時間インキュベートした。次いで、100μLの10%の硫酸ドデシルナトリウム(SDS)/HCl 10mMをウェルごとに加え、プレートを終夜インキュベートした後、540nmで光学密度を測定した。IC50を、標準的な4パラメーター曲線フィッティングを使用して計算した。IC50は、MTTシグナルが対照に対して測定されたものの50%まで低下する場合の化合物濃度として定義した。各実験を少なくとも2回実施し、結果は再現性を有した。図21Aおよび21Bに示す通り、全ての抗BCMA-Mcl-1 ADCは、MTTアッセイにおいてH929細胞の生存率での用量依存的減少を誘発した。興味深いことに、ADCの活性は、BCL2阻害剤化合物A1と組み合わせた場合に著しく改善される一方、これらの細胞を、対応する裸の抗体を単剤で、または1μMの化合物A1と組み合わせて処置した後では著しい効果は観察されなかった。
[実施例18]
in vitro評価 - 抗CD48 ADC
細胞系
CD48 MCL-1抗体薬物コンジュゲートCD48-L7-P1、アイソタイプIgG1-L7-P1 ADC、およびMCL-1遊離ペイロードP1を、4個の内因性がん細胞系に対して試験した。KMS-21BM(RPMI-1640+10%のFBSで培養されたJCRB番号JCRB1185)、KMS-20(RPMI-1640+10%のFBSで培養されたJCRB番号JCRB1196)、KMS-27(RPMI-1640+10%のFBSで培養されたJCRB番号JCRB1188)、およびNCI-H929(RPMI-1640+10%のFBS+0.05mM 2-メルカプトエタノールで培養されたATCC番号CRL-9068)。
細胞増殖および生存の阻害
CD48 MCL-1抗体薬物コンジュゲートCD48-L7-P1、アイソタイプIgG1-L7-P1 ADC、およびMCL-1遊離ペイロードP1の細胞増殖および生存を阻害する能力を、Promega CellTiter-Glo(登録商標)増殖アッセイを使用して評価した。
細胞系を、組織培養インキュベーターにおいて5%のCO、37℃でそれらの成長に最適な培地で培養した。増殖アッセイのために播種する前に、細胞を、アッセイの少なくとも2日前に分けて、最適な成長密度を確実にした。播種の日に、懸濁細胞を回収した。細胞生存率および細胞密度を、細胞計数器(Vi-Cell XR生死細胞アナライザー、Beckman Coulter)を使用して決定した。85%超の生存率の細胞を、白色の透明底の384ウェルTC処置プレート(Corning、カタログ番号3765)に播種した。細胞を、45μLの標準的な成長培地において1ウェル当たり1,000個の細胞の密度で播種した。プレートを、組織培養インキュベーターにおいて5%のCO、37℃で終夜インキュベートした。次の日、遊離MCL-1ペイロード(P1)、標的化MCL-1 ADC、および非標的化アイソタイプADCを、標準的な成長培地において10倍で調製した。次いで、調製した薬物処置を細胞に加え、1ウェル当たり0.0005~500nMの最終濃度および50μLの最終体積とした。各薬物濃度を4回試験した。プレートを、組織培養インキュベーターにおいて5%のCO、37℃で5日間インキュベートした後、細胞生存率を、25μLのCellTiter Glo(登録商標)(Promega、カタログ番号G7573)、細胞を溶解しアデノシン三リン酸(ATP)の総含有量を測定する試薬の添加によって評価した。プレートを、室温で10分間インキュベートして発光シグナルを安定化した後、ルミネセンスリーダー(EnVisionマルチラベルプレートリーダー、PerkinElmer)を使用して読み取った。薬物処置の効果を評価するために、未処置細胞(100%の生存率)を含有するウェル由来の発光計数を使用して、処置した試料を正規化した。様々な勾配モデルを適用して、GraphPad PRISMバージョン7.02のソフトウェアにおいて、データに対して非線形回帰曲線を適合した。IC50およびAmax値を、得られた曲線から外挿した。
結果
目的のCD48標的を発現する代表的ながん細胞系の用量応答曲線は、図22に示す(四角=CD48-L7-P1、丸=IgG-L7-P1、三角=遊離MCL1ペイロードP1)。細胞成長または生存を50%阻害するのに必要な処置の濃度(IC50)を、表34に概説する試験した細胞系の代表的なIC50値で計算した。
Figure 2022532918000692
[実施例19]
in vitro評価 - 様々ながん細胞系の細胞生存率の、単剤での、およびベネトクラクスと組み合わせた抗CD48 ADCの効果
細胞系
CD48 MCL-1抗体薬物コンジュゲートを、4個の内因性がん細胞系に対して試験した。KMS-21BM(RPMI-1640+10%のFBSで培養されたJCRB番号JCRB1185)、KMS-20(RPMI-1640+10%のFBSで培養されたJCRB番号JCRB1196)、KMS-27(RPMI-1640+10%のFBSで培養されたJCRB番号JCRB1188)、およびNCI-H929(RPMI-1640+10%のFBS+0.05mM 2-メルカプトエタノールで培養されたATCC番号CRL-9068)。
細胞増殖および生存の阻害
CD48 MCL-1抗体薬物コンジュゲートの細胞増殖および生存を阻害する能力を、Promega CellTiter-Glo(登録商標)増殖アッセイを使用して評価した。細胞系を、組織培養インキュベーターにおいて5%のCO、37℃でそれらの成長に最適な培地で培養した。増殖アッセイのために播種する前に、細胞を、アッセイの少なくとも2日前に分けて、最適な成長密度を確実にした。播種の日に、懸濁細胞を回収した。細胞生存率および細胞密度を、細胞計数器(Vi-Cell XR生死細胞アナライザー、Beckman Coulter)を使用して決定した。85%超の生存率の細胞を、白色の透明底の384ウェルTC処置プレート(Corning、カタログ番号3765)に播種した。細胞を、45μLの標準的な成長培地において1ウェル当たり1,000個の細胞の密度で播種した。プレートを、組織培養インキュベーターにおいて5%のCO、37℃で終夜インキュベートした。次の日、遊離MCL-1ペイロード(P1)、標的化MCL-1 ADC、および非標的化アイソタイプADCを、標準的な成長培地において10倍で調製した。次いで、調製した薬物処置を細胞に加え、1ウェル当たり0.0005~300nMの最終濃度および50μLの最終体積とした。各薬物濃度を4回試験した。2つの状態を各化合物に対して評価した。化合物を、単剤で、およびベネトクラクスと組み合わせて評価した。ベネトクラクスを、5nMまたは50nMのいずれかの最終濃度で投与した。プレートを、組織培養インキュベーターにおいて5%のCO、37℃で5日間インキュベートした後、細胞生存率を、25μLのCellTiter Glo(登録商標)(Promega、カタログ番号G7573)、細胞を溶解しアデノシン三リン酸(ATP)の総含有量を測定する試薬の添加によって評価した。プレートを、室温で10分間インキュベートして発光シグナルを安定化した後、ルミネセンスリーダー(EnVisionマルチラベルプレートリーダー、PerkinElmer)を使用して読み取った。薬物処置の効果を評価するために、未処置細胞(100%の生存率)を含有するウェル由来の発光計数を使用して、処置した試料を正規化した。様々な勾配モデルを適用して、GraphPad PRISMバージョン7.02のソフトウェアにおいて、データに対して非線形回帰曲線を適合した。IC50およびAmax値を、得られた曲線から外挿した。
結果
目的のCD48標的を発現する代表的ながん細胞系の用量応答曲線は、図23Aおよび23Bに示す。細胞成長または生存を50%阻害するのに必要な処置の濃度(IC50)を、表35~37に概説する試験した細胞系の代表的なIC50値で計算した。
Figure 2022532918000693
Figure 2022532918000694
Figure 2022532918000695
[実施例20]
がん細胞系のパネルでのin vitroでのADC活性の評価
以下の化合物を本実施例において使用した:CD33_CysmAb-L7-P1、CLL1_CysmAb-L7-P1、FLT3_CysmAb-L7-P1、cKIT_CysmAb-L7-P1、CD123_CysmAb-L7-P1、BCMA_CysmAb-L7-P1、CD138_CysmAb-L7-P1、CD38_CysmAb-L7-P1、CD48_CysmAb-L7-P1、SLAMF7_CysmAb-L7-P1、アイソタイプIgG1_CysmAb-L7-P1、および遊離ペイロードP1。本実施例で使用される抗CD33抗体は、ゲムツズマブである。本実施例で使用される抗CLL1抗体は、国際公開第2016/205200号パンフレットに記載のm6E7である。本実施例で使用される抗cKIT抗体は、国際公開第2014/150937号パンフレットに記載される。本実施例で使用されるCD123抗体は、タラコツズマブとしても公知のCSL362である。本実施例で使用される抗BCMA抗体は、ベランタマブとしても公知のJ6M0である。本実施例で使用される抗CD138抗体は、インダツキシマブ(indatuximab)である。本実施例で使用される抗CD38抗体は、ダラツムマブである。本実施例で使用される抗CD48抗体は、米国特許公開第20180092984号明細書に記載のヒト化MEM102(hMEM102)である。本実施例で使用される抗SLAMF7抗体は、アジンツキシズマブ(azintuxizumab)である。これらの抗体の各々を、CysmAb突然変異で操作して、上記で示したリンカー-ペイロードとのコンジュゲーションを促進した。ADCは、実施例4に記載の方法を介して合成した。
抗体薬物コンジュゲートを、ATCC(アメリカンタイプカルチャーコレクション)から得られるがん細胞系、または親異種移植片モデル由来の細胞系に対して試験した。細胞を、組織培養インキュベーターにおいて5%のCO、37℃でそれらの成長に最適な培地で培養した。増殖アッセイのために播種する前に、細胞を、アッセイの少なくとも2日前に分けて、最適な成長密度を確実にした。播種の日に、細胞を、0.25%のトリプシンを使用して組織培養フラスコから外した。細胞生存率および細胞密度を、細胞計数器(Vi-Cell XR生死細胞アナライザー、Beckman Coulter)を使用して決定した。85%超の生存率の細胞を、白色の透明底の384ウェルプレート(Greiner、カタログ番号781098)に、50μLの標準的な成長培地において1ウェル当たり1,000個の細胞の密度で播種した。プレートを、組織培養インキュベーターにおいて37℃で終夜インキュベートした。
ADCを、所望の濃度まで標準的なリン酸塩緩衝液で調製した。一連の10希釈を、各ADCに対して行った。次いで、調製した薬物処置を細胞に加え、0.000005~300nMの最終濃度とした。音響移動デバイス(Echo555、Beckman Coulter)を使用して、細胞にADCを加えた。各処置を、三重アッセイプレートで試験した。プレートを、組織培養インキュベーターにおいて37℃で終夜または5日間インキュベートした。ADCの細胞増殖および生存を阻害する能力を、Promega CellTiter-Glo(登録商標)増殖アッセイを使用して評価した。プレートを、室温で20分間インキュベートして発光シグナルを安定化した後、マルチモードプレートリーダー(Pherastar、BMG)を使用して読み取った。未処置細胞の発光計数を、播種の後の日(0日目の読取り)および処置の5日後(5日目の読取り)に行った。未処置細胞の5日目の読取りを、0日目の読取りと比較した。インキュベーション期間に少なくとも1つの細胞倍増でのアッセイは、有効だと考えられた。薬物処置の効果を評価するために、未処置細胞(100%の生存率)を含有するウェル由来の発光計数を使用して、処置した試料を正規化した。細胞成長または生存を50%阻害するのに必要な処置の濃度(GI50)を、4パラメーターロジスティック回帰方程式を使用して計算した(表38および39)。
Figure 2022532918000696
Figure 2022532918000697
Figure 2022532918000698

Claims (91)

  1. 式(1):
    Ab-(L-D)(1)
    (式中、Abは、抗体またはその抗原結合性断片であり、
    DはMcl-1阻害剤であり、
    Lは、AbをDに共有結合するリンカーであり、
    pは、1~16の整数である)
    の抗体-薬物コンジュゲート。
  2. pが、1~6もしくは2~4の整数であり、またはpが、2もしくは4であり、あるいはpが、液体クロマトグラフィー-質量分析(LC-MS)により決定される、請求項1に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  3. Lが、
    結合基と、
    少なくとも1つの架橋スペーサー基と、
    少なくとも1つの切断可能な基、必要に応じてピロリン酸基および/または自壊性基を含む少なくとも1つの切断可能な基と
    を含む、請求項1または2に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  4. -(L-D)が、式(A):
    Figure 2022532918000699
    (式中、
    は結合基であり、
    は架橋スペーサー基であり、
    Eは切断可能な基である)
    のものである、請求項3に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  5. 前記切断可能な基がピロリン酸基を含み、または前記切断可能な基が
    Figure 2022532918000700
    を含む、請求項3または4に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  6. 前記架橋スペーサー基が、
    (i)ポリオキシエチレン(PEG)基;
    (ii)PEG1、PEG2、PEG3、PEG4、PEG5、PEG6、PEG7、PEG8、PEG9、PEG10、PEG11、PEG12、PEG13、PEG14およびPEG15から選択されるPEG基;
    (iii)-CO-CH-CH-PEG12-基;
    (iv)ブタノイル、ペンタノイル、ヘキサノイル、ヘプタノイルもしくはオクタノイル基;または
    (v)ヘキサノイル基
    を含む、請求項3または4に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  7. (i)前記結合基が、マレイミド基、チオール基、シクロオクチン基およびアジド基から選択される少なくとも1つの反応性基から形成されており、必要に応じて、ここで、
    a)前記マレイミド基は構造:
    Figure 2022532918000701
    を有し、
    b)前記アジド基は構造:-N=N=Nを有し、
    c)前記シクロオクチン基は構造:
    Figure 2022532918000702
    を有し、ここで、
    Figure 2022532918000703
    は、前記抗体との結合であり、または
    d)前記シクロオクチン基は構造:
    Figure 2022532918000704
    を有し、
    ここで、
    Figure 2022532918000705
    は、前記抗体との結合であり、または
    (ii)前記結合基は、
    Figure 2022532918000706
    を含む式を有し、
    ここで、
    Figure 2022532918000707
    は、前記抗体との結合である、請求項6に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  8. 前記抗体が、
    Figure 2022532918000708
    から選択される結合基により前記リンカー(L)に連結されており、
    ここで、
    Figure 2022532918000709
    は、前記抗体との結合であり、ここで、
    Figure 2022532918000710
    は、前記架橋スペーサー基との結合である、請求項7に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  9. 前記架橋スペーサー基が-CO-CH-CH-PEG12-である、請求項8に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  10. 前記架橋スペーサー基が、切断可能な基に連結されており、必要に応じて前記切断可能な基は-ピロリン酸-CH-CH-NH-である、請求項8または9に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  11. 前記切断可能な基が、前記Mcl-1阻害剤(D)に連結されており、または前記切断可能な基が、フェニル-ピリミジニル基を介して前記Mcl-1阻害剤(D)に連結されている、請求項8から10のいずれか一項に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  12. 前記リンカーが、
    結合基と、
    少なくとも1つの架橋スペーサー基と、
    ペプチド基と、
    少なくとも1つの切断可能な基と
    を含む、請求項1から3のいずれか一項に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  13. -(L-D)が、式(B):
    Figure 2022532918000711
    (式中、
    は結合基であり、
    は架橋スペーサーであり、
    Lpは、1~6個のアミノ酸残基を含むペプチド基であり、またはLpは、
    Figure 2022532918000712
    基を含み、
    Eは切断可能な基であり、
    は架橋スペーサーであり、
    mは、0または1であり、
    DはMcl-1阻害剤である)
    のものである、請求項12に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  14. (i)前記結合基が、マレイミド基、チオール基、シクロオクチン基および/またはアジド基を含む少なくとも1つの反応性基から形成されており、必要に応じて、ここで、
    a)前記マレイミド基は構造:
    Figure 2022532918000713
    を有し、
    b)前記アジド基は構造:-N=N=Nを有し、
    c)前記シクロオクチン基は構造:
    Figure 2022532918000714
    を有し、ここで、
    Figure 2022532918000715
    は、前記抗体との結合であり、または
    d)前記シクロオクチン基は構造:
    Figure 2022532918000716
    を有し、
    ここで、
    Figure 2022532918000717
    は、前記抗体との結合であり、または
    (ii)前記結合基は、
    Figure 2022532918000718
    を含む式を有し、
    ここで、
    Figure 2022532918000719
    は、前記抗体との結合である、請求項12または13に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  15. (i)少なくとも1つの架橋スペーサーがPEG基を含み、必要に応じて前記PEG基は、PEG1、PEG2、PEG3、PEG4、PEG5、PEG6、PEG7、PEG8、PEG9、PEG10、PEG11、PEG12、PEG13、PEG14およびPEG15から選択され、または
    (ii)少なくとも1つの架橋スペーサーが、-C(O)-CH-CH-PEG1-**-C(O)-CH-PEG3-**-C(O)-CH-CH-PEG12**-NH-CH-CH-PEG1-**、ポリヒドロキシアルキル基および-C(O)-N(CH)-CH-CH-N(CH)-C(O)-**(式中、**は、前記結合基との前記少なくとも1つの架橋スペーサーの直接結合点または間接結合点を示し、は、前記ペプチド基との前記少なくとも1つの架橋スペーサーの直接結合点または間接結合点を示す)
    から選択される、請求項12から14のいずれか一項に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  16. が、-C(O)-CH-CH-PEG1-**-C(O)-CH-PEG3-**-C(O)-CH-CH-PEG12**-NH-CH-CH-PEG1-**およびポリヒドロキシアルキル基(式中、**は、RとのLの直接結合点または間接結合点を示し、は、LpとのLの直接結合点または間接結合点を示す)から選択される、請求項12から15のいずれか一項に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  17. mが1であり、Lが-C(O)-N(CH)-CH-CH-N(CH)-C(O)-である、請求項12から16のいずれか一項に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  18. (i)前記ペプチド基が、1~6個、1~4個、1~3個または1~2個のアミノ酸残基を含み、必要に応じて前記アミノ酸残基は、L-グリシン(Gly)、L-バリン(Val)、L-シトルリン(Cit)、L-システイン酸(スルホ-Ala)、L-リシン(Lys)、L-イソロイシン(Ile)、L-フェニルアラニン(Phe)、L-メチオニン(Met)、L-アスパラギン(Asn)、L-プロリン(Pro)、L-アラニン(Ala)、L-ロイシン(Leu)、L-トリプトファン(Trp)およびL-チロシン(Tyr)から選択され、
    (ii)前記ペプチド基が、Val-Cit、Val-Ala、Val-Lysおよび/またはスルホ-Ala-Val-Alaを含み、
    (iii)前記ペプチド基が、
    Figure 2022532918000720
    から選択される、請求項12から17のいずれか一項に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  19. (i)前記切断可能な基が、ピロリン酸基および/もしくは自壊性基を含み、(ii)前記切断可能な基が自壊性基を含み、または(iii)前記切断可能な基が、パラ-アミノベンジル-カルバメート、パラ-アミノベンジル-アンモニウム、パラ-アミノ-(スルホ)ベンジル-アンモニウム、パラ-アミノ-(スルホ)ベンジル-カルバメート、パラ-アミノ-(アルコキシ-PEG-アルキル)ベンジル-カルバメート、パラ-アミノ-(ポリヒドロキシカルボキシテトラヒドロピラニル)アルキル-ベンジル-カルバメートもしくはパラ-アミノ-(ポリヒドロキシカルボキシテトラヒドロピラニル)アルキル-ベンジル-アンモニウムを含む自壊性基を含む、請求項12から18のいずれか一項に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  20. mが、0または1であり、またはmが1であり、前記架橋スペーサーが、
    Figure 2022532918000721
    を含む、請求項13から19のいずれか一項に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  21. -(L-D)が、
    Figure 2022532918000722
    Figure 2022532918000723
    Figure 2022532918000724
    Figure 2022532918000725
    から選択される化合物から形成されている、請求項13から20のいずれか一項に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  22. -(L-D)が、
    Figure 2022532918000726
    Figure 2022532918000727
    Figure 2022532918000728
    Figure 2022532918000729
    Figure 2022532918000730
    から選択される式を含み、
    ここで、
    Figure 2022532918000731
    は、前記抗体との結合である、請求項13から21のいずれか一項に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  23. -(L-D)が、式(C):
    Figure 2022532918000732
    (式中、
    は結合基であり、
    は架橋スペーサーであり、
    は、1~6個のアミノ酸を含むペプチド基であり、
    DはMcl-1阻害剤であり、
    -L-Aは自壊性スペーサーであり、
    は、結合、メチレン、ネオペンチレンまたはC~Cアルケニレンであり、
    Aは、結合、-OC(=O)-
    Figure 2022532918000733
    、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、
    ここで、各Rは、H、C~CアルキルおよびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
    はスペーサー部分であり、
    は親水性部分である)
    のものである、請求項1または2に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  24. -(L-D)が、式(D):
    Figure 2022532918000734
    (式中、
    は結合基であり、
    は架橋スペーサーであり、
    Lpは、1~6個のアミノ酸を含むペプチド基であり、
    Aは、結合、-OC(=O)-
    Figure 2022532918000735
    、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、
    ここで、各Rは、H、C~CアルキルおよびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
    はスペーサー部分であり、
    は親水性部分である)
    のものである、請求項23に記載の抗体-薬物コンジュゲート、またはその薬学的に許容される塩。
  25. (1)Lが、
    Figure 2022532918000736
    または-CH(OH)CH(OH)CH(OH)CH(OH)-**を含み、
    ここで、各nは、1~12の整数であり、ここで、Lは、Lpとの直接結合点または間接結合点を示し、L**は、Rとの直接結合点または間接結合点を示し、
    (2)Lが、
    Figure 2022532918000737
    であり、nが、1~12の整数であり、またはnが1であり、またはnが12であり、ここで、Lは、Lpとの直接結合点または間接結合点を示し、L**は、Rとの直接結合点または間接結合点を示し、
    (3)Lが、
    Figure 2022532918000738
    であり、nが、1~12の整数であり、ここで、Lは、Lpとの直接結合点または間接結合点を示し、L**は、Rとの直接結合点または間接結合点を示し、
    (4)Lが、
    Figure 2022532918000739
    を含み、ここで、Lは、Lpとの直接結合点または間接結合点を示し、L**は、Rとの直接結合点または間接結合点を示し、
    (5)Lが、-C(=O)(CHO(CH**-C(=O)((CHO)(CH**-C(=O)(CH**
    -C(=O)NH((CHO)(CH**
    -C(=O)O(CHSSC(R(CHC(=O)NR(CHNRC(=O)(CH**
    -C(=O)O(CHC(=O)NH(CH**-C(=O)(CHNH(CH**
    -C(=O)(CHNH(CHC(=O)-**-C(=O)(CH(CH**
    -C(=O)((CHO)(CH(CH**-C(=O)(CHNHC(=O)(CH**
    -C(=O)((CHO)(CHNHC(=O)(CH**
    -C(=O)(CHNHC(=O)(CH(CH**
    -C(=O)((CHO)(CHNHC(=O)(CH(CH**
    -C(=O)((CHO)(CHC(=O)NH(CH**-C(=O)(CHC(R**または
    -C(=O)(CHC(=O)NH(CH**を含む架橋スペーサーであり、ここで、Lは、Lpとの直接結合点または間接結合点を示し、L**は、Rとの直接結合点または間接結合点を示し、
    は、
    Figure 2022532918000740
    であり、
    各mは、1、2、3、4、5、6、7、8、9および10から独立して選択され、
    各nは、1、2、3、4、5、6、7、8、9および10から独立して選択され、
    各tは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29および30から独立して選択され、
    各Rは、HおよびC~Cアルキルから独立して選択される、請求項23または24に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  26. が、ポリエチレングリコール、ポリアルキレングリコール、ポリオール、ポリサルコシン、糖、オリゴ糖、ポリペプチド、または1~3個の
    Figure 2022532918000741
    基で置換されたC~Cアルキルを含む親水性部分である、請求項23から25のいずれか一項に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  27. が、
    Figure 2022532918000742
    (式中、nは、1~6の間の整数である)、
    Figure 2022532918000743
    である、請求項23から26のいずれか一項に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  28. 前記親水性部分が、
    (i)ポリサルコシン、例えば、以下の部分:
    Figure 2022532918000744
    (式中、nは、3~25の間の整数であり、Rは、H、-CHまたは-CHCHC(=O)OHである)を含むポリサルコシン、または
    (ii)式:
    Figure 2022532918000745
    のポリエチレングリコール、または以下の式:
    (式中、Rは、H、-CH、CHCHNHC(=O)OR、-CHCHNHC(=O)Rまたは-CHCHC(=O)ORであり、R’は、OH、-OCH、-CHCHNHC(=O)OR、-CHCHNHC(=O)Rまたは-OCHCHC(=O)ORであり、ここで、Rは、HまたはOHもしくはC1~4アルコキシルのいずれかで必要に応じて置換されたC1~4アルキルであり、mおよびnのそれぞれは、独立して2~25の間の整数である)により表される部分
    を含む、請求項23または24に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  29. 前記親水性部分が、
    Figure 2022532918000746
    を含む、請求項23から27のいずれか一項に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  30. (i)Lが、構造
    Figure 2022532918000747
    (式中、
    Wは、-CH-、-CHO-、-CHN(R)C(=O)O-、-NHC(=O)C(RNHC(=O)O-、
    -NHC(=O)C(RNH-、-NHC(=O)C(RNHC(=O)-、-CHN(X-R)C(=O)O-、-C(=O)N(X-R)-、-CHN(X-R)C(=O)-、-C(=O)NR-、-C(=O)NH-、-CHNRC(=O)-、-CHNRC(=O)NH-、-CHNRC(=O)NR-、-NHC(=O)-、-NHC(=O)O-、-NHC(=O)NH-、-OC(=O)NH-、
    -S(O)NH-、-NHS(O)-、-C(=O)-、-C(=O)O-または-NH-であり、ここで、各Rは、H、C~CアルキルおよびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、
    Xは、結合、トリアゾリルまたは-CH-トリアゾリル-である)
    を有するスペーサー部分であり、または
    (ii)Lが、構造
    Figure 2022532918000748
    (式中、
    Wは、-CH-、-CHO-、-CHN(R)C(=O)O-、-NHC(=O)C(RNHC(=O)O-、
    -NHC(=O)C(RNH-、-NHC(=O)C(RNHC(=O)-、-CHN(X-R)C(=O)O-、-C(=O)N(X-R)-、
    -CHN(X-R)C(=O)-、-C(=O)NR-、-C(=O)NH-、-CHNRC(=O)-、-CHNRC(=O)NH-、
    -CHNRC(=O)NR-、-NHC(=O)-、-NHC(=O)O-、-NHC(=O)NH-、-OC(=O)NH-、
    -S(O)NH-、-NHS(O)-、-C(=O)-、-C(=O)O-または-NH-であり、ここで、各Rは、H、C~CアルキルおよびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、
    Xは、-CH-トリアゾリル-C1~4アルキレン-OC(O)NHS(O)NH-、-C4~6シクロアルキレン-OC(O)NHS(O)NH-、-(CHCHO)-C(O)NHS(O)NH-、-(CHCHO)-C(O)NHS(O)NH-(CHCHO)-または-CH-トリアゾリル-C1~4アルキレン-OC(O)NHS(O)NH-(CHCHO)-であり、ここで、各nは独立して、1、2または3である)
    を有するスペーサー部分である、請求項23から29のいずれか一項に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  31. 前記結合基が、少なくとも1つの反応性基を含む反応により形成される、請求項3から30のいずれか一項に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  32. 前記結合基が、
    前記リンカーに結合されている第1の反応性基と、
    前記抗体に結合されているか、または前記抗体のアミノ酸残基である第2の反応性基と
    を反応させることにより形成され、ここで、必要に応じて、
    (i)前記反応性基のうちの少なくとも1つは、
    チオール、
    マレイミド、
    ハロアセトアミド、
    アジド、
    アルキン、
    シクロオクテン、
    トリアリールホスフィン、
    オキサノルボルナジエン、
    シクロオクチン、
    ジアリールテトラジン、
    モノアリールテトラジン、
    ノルボルネン、
    アルデヒド、
    ヒドロキシルアミン、
    ヒドラジン、
    NH-NH-C(=O)-、
    ケトン、
    ビニルスルホン、
    アジリジン、
    アミノ酸残基、
    Figure 2022532918000749
    、-ONH、-NH
    Figure 2022532918000750
    、-N
    Figure 2022532918000751
    、-SH、-SR、-SSR、-S(=O)(CH=CH)、-(CHS(=O)(CH=CH)、-NHS(=O)(CH=CH)、-NHC(=O)CHBr、-NHC(=O)CHI、
    Figure 2022532918000752
    、-C(O)NHNH
    Figure 2022532918000753
    Figure 2022532918000754
    を含み、
    ここで、
    各Rは、HおよびC~Cアルキルから独立して選択され、
    各Rは、2-ピリジルまたは4-ピリジルであり、
    各Rは、H、C~Cアルキル、F、Clおよび-OHから独立して選択され、
    各Rは、H、C~Cアルキル、F、Cl、-NH、-OCH、-OCHCH、-N(CH、-CN、-NOおよび-OHから独立して選択され、
    各Rは、H、C1~6アルキル、フルオロ、-C(=O)OHで置換されたベンジルオキシ、-C(=O)OHで置換されたベンジル、-C(=O)OHで置換されたC1~4アルコキシおよび-C(=O)OHで置換されたC1~4アルキルから独立して選択され、かつ/または
    (ii)前記第1の反応性基および第2の反応性基は、
    チオールおよびマレイミド、
    チオールおよびハロアセトアミド、
    チオールおよびビニルスルホン、
    チオールおよびアジリジン、
    アジドおよびアルキン、
    アジドおよびシクロオクチン、
    アジドおよびシクロオクテン、
    アジドおよびトリアリールホスフィン、
    アジドおよびオキサノルボルナジエン、
    ジアリールテトラジンおよびシクロオクテン、
    モノアリールテトラジンおよびノルボルネン、
    アルデヒドおよびヒドロキシルアミン、
    アルデヒドおよびヒドラジン、
    アルデヒドおよびNH-NH-C(=O)-、
    ケトンおよびヒドロキシルアミン、
    ケトンおよびヒドラジン、
    ケトンおよびNH-NH-C(=O)-、
    ヒドロキシルアミンおよび
    Figure 2022532918000755

    アミンおよび
    Figure 2022532918000756
    、または
    CoAもしくはCoA類似体およびセリン残基
    を含む、請求項3から31のいずれか一項に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  33. 前記結合基が、
    Figure 2022532918000757
    Figure 2022532918000758
    Figure 2022532918000759
    Figure 2022532918000760
    から選択される基を含み、
    ここで、
    32は、H、C1~4アルキル、フェニル、ピリミジンまたはピリジンであり、
    35は、H、C1~6アルキル、フェニル、または1~3個の-OH基で置換されたC1~4アルキルであり、
    各Rは、H、C1~6アルキル、フルオロ、-C(=O)OHで置換されたベンジルオキシ、-C(=O)OHで置換されたベンジル、-C(=O)OHで置換されたC1~4アルコキシおよび-C(=O)OHで置換されたC1~4アルキルから独立して選択され、
    37は、H、フェニルおよびピリジンから独立して選択され、
    qは、0、1、2または3であり、
    は、Hまたはメチルであり、
    は、H、-CHまたはフェニルである、請求項3から32のいずれか一項に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  34. 前記ペプチド基が、1~4個または1~3個または1個もしくは2個のアミノ酸残基を含み、必要に応じて前記アミノ酸残基は、L-グリシン(Gly)、L-バリン(Val)、L-シトルリン(Cit)、L-システイン酸(スルホ-Ala)、L-リシン(Lys)、L-イソロイシン(Ile)、L-フェニルアラニン(Phe)、L-メチオニン(Met)、L-アスパラギン(Asn)、L-プロリン(Pro)、L-アラニン(Ala)、L-ロイシン(Leu)、L-トリプトファン(Trp)およびL-チロシン(Tyr)から選択される、請求項23から33のいずれか一項に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  35. 前記ペプチド基が、Val-Cit、Phe-Lys、Val-Ala、Val-Lys、Leu-Cit、スルホ-Ala-Valおよび/またはスルホ-Ala-Val-Alaを含む、請求項23から33のいずれか一項に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  36. Lpが、
    Figure 2022532918000761
    から選択される、請求項23から35のいずれか一項に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  37. -(L-D)が、式:
    (1)
    Figure 2022532918000762
    (式中、
    Rは、H、-CHまたは-CHCHC(=O)OHであり、
    Aは、結合、-OC(=O)-
    Figure 2022532918000763
    、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、
    ここで、各Rは、H、C~CアルキルおよびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
    DはMcl-1阻害剤である)
    (2)
    Figure 2022532918000764
    (式中、
    Rは、H、-CHまたは-CHCHC(=O)OHであり、
    Aは、結合、-OC(=O)-
    Figure 2022532918000765
    、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、
    ここで、各Rは、H、C~CアルキルおよびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
    DはMcl-1阻害剤である)
    (3)
    Figure 2022532918000766
    (式中、
    Rは、H、-CHまたは-CHCHC(=O)OHであり、
    Aは、結合、-OC(=O)-
    Figure 2022532918000767
    、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、
    ここで、各Rは、H、C~CアルキルおよびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
    DはMcl-1阻害剤である)
    (4)
    Figure 2022532918000768
    (式中、
    各Rは、H、-CHおよび-CHCHC(=O)OHから独立して選択され、
    Aは、結合、-OC(=O)-
    Figure 2022532918000769
    、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、
    ここで、各Rは、H、C~CアルキルおよびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
    DはMcl-1阻害剤である)
    (5)
    Figure 2022532918000770
    (式中、
    各Rは、H、-CHおよび-CHCHC(=O)OHから独立して選択され、
    Aは、結合、-OC(=O)-
    Figure 2022532918000771
    、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、
    ここで、各Rは、H、C~CアルキルおよびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
    DはMcl-1阻害剤である)
    (6)
    Figure 2022532918000772
    (式中、
    Xaは、-CH-、-OCH-、-NHCH-または-NRCH-であり、各Rは独立して、H、-CHまたは-CHCHC(=O)OHであり、
    Aは、結合、-OC(=O)-
    Figure 2022532918000773
    、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、
    ここで、各Rは、H、C~CアルキルおよびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
    DはMcl-1阻害剤である)
    (7)
    Figure 2022532918000774
    (式中、
    Rは、H、-CHまたは-CHCHC(=O)OHであり、
    Aは、結合、-OC(=O)-
    Figure 2022532918000775
    、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、
    ここで、各Rは、H、C~CアルキルおよびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
    DはMcl-1阻害剤である)
    (8)
    Figure 2022532918000776
    (式中、
    Xbは、-CH-、-OCH-、-NHCH-または-NRCH-であり、各Rは独立して、H、-CHまたは-CHCHC(=O)OHであり、
    Aは、結合、-OC(=O)-
    Figure 2022532918000777
    、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、
    ここで、各Rは、H、C~CアルキルおよびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
    DはMcl-1阻害剤である)
    (9)
    Figure 2022532918000778
    (式中、
    Aは、結合、-OC(=O)-
    Figure 2022532918000779
    、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、
    ここで、各Rは、H、C~CアルキルおよびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
    DはMcl-1阻害剤である)
    (10)
    Figure 2022532918000780
    (式中、
    Aは、結合、-OC(=O)-
    Figure 2022532918000781
    、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、
    ここで、各Rは、H、C~CアルキルおよびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
    DはMcl-1阻害剤である)
    (11)
    Figure 2022532918000782
    (式中、
    Aは、結合、-OC(=O)-
    Figure 2022532918000783
    、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、
    ここで、各Rは、H、C~CアルキルおよびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
    DはMcl-1阻害剤である)
    (12)
    Figure 2022532918000784
    (式中、
    Aは、結合、-OC(=O)-
    Figure 2022532918000785
    、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、
    ここで、各Rは、H、C~CアルキルおよびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
    DはMcl-1阻害剤である)
    (13)
    Figure 2022532918000786
    (式中、
    Aは、結合、-OC(=O)-
    Figure 2022532918000787
    、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、
    ここで、各Rは、H、C~CアルキルおよびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
    DはMcl-1阻害剤である)
    (14)
    Figure 2022532918000788
    (式中、
    Aは、結合、-OC(=O)-
    Figure 2022532918000789
    、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、
    ここで、各Rは、H、C~CアルキルおよびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
    DはMcl-1阻害剤である)
    (15)
    Figure 2022532918000790
    (式中、
    Aは、結合、-OC(=O)-
    Figure 2022532918000791
    、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、
    ここで、各Rは、H、C~CアルキルおよびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
    DはMcl-1阻害剤である)、または
    (16)
    Figure 2022532918000792
    (式中、
    各Rは独立して、H、-CHまたは-CHCHC(=O)OHであり、
    Aは、結合、-OC(=O)-
    Figure 2022532918000793
    、-OC(=O)N(CH)CHCHN(CH)C(=O)-または-OC(=O)N(CH)C(RC(RN(CH)C(=O)-であり、
    ここで、各Rは、H、C~CアルキルおよびC~Cシクロアルキルから独立して選択され、Aのは、Dとの結合点を示し、
    DはMcl-1阻害剤である)
    の化合物を含むか、またはそれから形成されている、請求項23から36のいずれか一項に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  38. Aが結合であり、かつ/またはRが-CHである、請求項23から37のいずれか一項に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  39. Dが、式(I):
    Figure 2022532918000794
    (式中、
    環Dは、シクロアルキル基、ヘテロシクロアルキル基、アリール基またはヘテロアリール基であり、
    環Eは、フリル、チエニルまたはピロリル環であり、
    01、X03、X04およびX05は互いに独立して、炭素原子または窒素原子であり、
    02は、C-R026基または窒素原子であり、
    Figure 2022532918000795
    は、前記環が芳香族であることを意味し、
    は、窒素原子またはC-R03基であり、
    は、窒素原子またはC-R04基であり、
    01は、ハロゲン原子、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基、線状もしくは分枝状(C~C)アルケニル基、線状もしくは分枝状(C~C)アルキニル基、線状もしくは分枝状(C~C)ハロアルキル基、ヒドロキシ基、ヒドロキシ(C~C)アルキル基、線状もしくは分枝状(C~C)アルコキシ基、-S-(C~C)アルキル基、シアノ基、ニトロ基、-Cy08、-(C~C)アルキル-NR011011’、-O-(C~C)アルキル-NR011011’、-O-(C~C)アルキル-R012、-C(O)-OR011、-O-C(O)-R011、-C(O)-NR011011’、-NR011-C(O)-R011’、-NR011-C(O)-OR011’、-(C~C)アルキル-NR011-C(O)-R011’、-SO-NR011011’または-SO-(C~C)アルキルであり、
    02、R03、R04およびR05は互いに独立して、水素原子、ハロゲン原子、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基、線状もしくは分枝状(C~C)アルケニル基、線状もしくは分枝状(C~C)アルキニル基、線状もしくは分枝状(C~C)ハロアルキル、ヒドロキシ基、ヒドロキシ(C~C)アルキル基、線状もしくは分枝状(C~C)アルコキシ基、-S-(C~C)アルキル基、シアノ基、ニトロ基、-(C~C)アルキル-NR011011’、-O-Cy01、-(C~C)アルキル-Cy01
    -(C~C)アルケニル-Cy01、-(C~C)アルキニル-Cy01、-O-(C~C)アルキル-NR011011’、
    -O-(C~C)アルキル-R031、-O-(C~C)アルキル-R012、-C(O)-OR011、-O-C(O)-R011、-C(O)-NR011011’、-NR011-C(O)-R011’、-NR011-C(O)-OR011’、-(C~C)アルキル-NR011-C(O)-R011’、-SO-NR011011’、または-SO-(C~C)アルキルであり、
    あるいは対(R01、R02)、(R02、R03)、(R03、R04)または(R04、R05)は、それらが結合している炭素原子と一緒に、5~7個の環員を含む芳香族または非芳香族環を形成し、これは必要に応じて、O、SおよびNから選択される1~3個のヘテロ原子を含み、ここで、前記得られた環は、ハロゲン、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル、(C~C)アルキル-NR011011’、-NR013013’、-(C~C)アルキル-Cy01またはオキソから選択される1個もしくは2個の基で必要に応じて置換されており、
    06およびR07は互いに独立して、水素原子、ハロゲン原子、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基、線状もしくは分枝状(C~C)アルケニル基、線状もしくは分枝状(C~C)アルキニル基、線状もしくは分枝状(C~C)ハロアルキル、ヒドロキシ基、線状もしくは分枝状(C~C)アルコキシ基、-S-(C~C)アルキル基、シアノ基、ニトロ基、-(C~C)アルキル-NR011011’、
    -O-(C~C)アルキル-NR011011’、-O-Cy01、-(C~C)アルキル-Cy01、-(C~C)アルケニル-Cy01
    -(C~C)アルキニル-Cy01、-O-(C~C)アルキル-R012、-C(O)-OR011、-O-C(O)-R011
    -C(O)-NR011011’、-NR011-C(O)-R011’、-NR011-C(O)-OR011’、
    -(C~C)アルキル-NR011-C(O)-R011’、-SO-NR011011’、または-SO-(C~C)アルキルであり、
    あるいは対(R06、R07)は、2個の隣接する炭素原子と縮合されたとき、それらが結合している炭素原子と一緒に、5~7個の環員を含む芳香族または非芳香族環を形成し、これは必要に応じて、O、SおよびNから選択される1~3個のヘテロ原子を含み、ここで、前記得られた環は、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基、-NR013013’、-(C~C)アルキル-Cy01またはオキソで必要に応じて置換されており、
    は、-CH-基、-NH-基または酸素原子であり、
    08は、水素原子、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基、-CHR0a0b基、アリール基、ヘテロアリール基、アリール(C~C)アルキル基またはヘテロアリール(C~C)アルキル基であり、
    09は、水素原子、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基、線状もしくは分枝状(C~C)アルケニル基、線状もしくは分枝状(C~C)アルキニル基、-Cy02、-(C~C)アルキル-Cy02、-(C~C)アルケニル-Cy02、-(C~C)アルキニル-Cy02、-Cy02-Cy03、-(C~C)アルキニル-O-Cy02、-Cy02-(C~C)アルキル-O-(C~C)アルキル-Cy03、ハロゲン原子、シアノ基、-C(O)-R014または-C(O)-NR014014’であり、
    010は、水素原子、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基、線状もしくは分枝状(C~C)アルケニル基、線状もしくは分枝状(C~C)アルキニル基、アリール(C~C)アルキル基、(C~C)シクロアルキルアルキル基、線状もしくは分枝状(C~C)ハロアルキルまたは-(C~C)アルキル-O-Cy04であり、
    あるいは対(R09、R010)は、2個の隣接する炭素原子と縮合されたとき、それらが結合している炭素原子と一緒に、5~7個の環員を含む芳香族または非芳香族環を形成し、これは必要に応じて、O、SおよびNから選択される1~3個のヘテロ原子を含み、
    011およびR011’は互いに独立して、水素原子、必要に応じて置換された線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基、または-(C~C)アルキル-Cy01であり、
    あるいは対(R011、R011’)は、それらが結合している窒素原子と一緒に、5~7個の環員を含む芳香族または非芳香族環を形成し、これは必要に応じて、前記窒素原子に加えて、O、SおよびNから選択される1~3個のヘテロ原子を含み、ここで、前記N原子は、線状または分枝状(C~C)アルキル基から選択される1個または2個の基で置換されてよく、ここで、前記線状または分枝状(C~C)アルキル基の炭素原子のうちの1個または複数は、必要に応じて重水素化されており、
    012は、-Cy05、-Cy05-(C~C)アルキル-O-(C~C)アルキル-Cy06、-Cy05-(C~C)アルキル-Cy06、-Cy05-(C~C)アルキル-NR011-(C~C)アルキル-Cy06、-Cy05-Cy06-O-(C~C)アルキル-Cy07、-Cy05-(C~C)アルキル-O-(C~C)アルキル-Cy09、-Cy05-(C~C)アルキル-Cy09
    -NH-C(O)-NH-R011、-Cy05-(C~C)アルキル-NR011-(C~C)アルキル-Cy09、-C(O)-NR011011’、-NR011011’、-OR011、-NR011-C(O)-R011’、-O-(C~C)アルキル-OR011、-SO-R011、-C(O)-OR011であり、
    013、R013’、R014およびR014’は互いに独立して、水素原子、または必要に応じて置換された線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基であり、
    0aは、水素原子または線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基であり、
    0bは、-O-C(O)-O-R0c基、-O-C(O)-NR0c0c’基または-O-P(O)(OR0c基であり、
    0cおよびR0c’は互いに独立して、水素原子、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基、シクロアルキル基、(C~C)アルコキシ(C~C)アルキル基または(C~C)アルコキシカルボニル(C~C)アルキル基であり、
    あるいは対(R0c、R0c’)は、それらが結合している窒素原子と一緒に、5~7個の環員から構成される非芳香族環を形成し、これは、前記窒素原子に加えて、酸素および窒素から選択される1~3個のヘテロ原子を含んでよく、ここで、前記窒素は、線状または分枝状(C~C)アルキル基で必要に応じて置換されており、
    Cy01、Cy02、Cy03、Cy04、Cy05、Cy06、Cy07、Cy08およびCy010は互いに独立して、シクロアルキル基、ヘテロシクロアルキル基、アリール基またはヘテロアリール基であり、それらのそれぞれは、必要に応じて置換されており、
    Cy09
    Figure 2022532918000796
    であり、
    またはCy09は、-O-P(O)(OR020;-O-P(O)(O;-(CHp0-O-(CHR018-CHR019-O)q0-R020;ヒドロキシ;ヒドロキシ(C~C)アルキル;-(CHr0-U-(CHs0-ヘテロシクロアルキル;および-U-(CHq0-NR021021’から選択される基で置換されているヘテロアリール基であり、
    015は、水素原子;-(CHp0-O-(CHR018-CHR019-O)q0-R020基;線状もしくは分枝状(C~C)アルコキシ(C~C)アルキル基;-U-(CHq0-NR021021’基;または-(CHr0-U-(CHs0-ヘテロシクロアルキル基であり、
    016は、水素原子;ヒドロキシ基;ヒドロキシ(C~C)アルキル基;-(CHr0-U-(CHs0-ヘテロシクロアルキル基;(CHr0-U-V-O-P(O)(OR020基;-O-P(O)(O基;-O-S(O)OR020基;-S(O)OR020基;-(CHp0-O-(CHR018-CHR019-O)q0-R020基;-(CHp0-O-C(O)-NR022023基;または-U-(CHq0-NR021021’基であり、
    017は、水素原子;-(CHp0-O-(CHR018-CHR019-O)q0-R020基;-CH-P(O)(OR020基、-O-P(O)(OR020基;-O-P(O)(O基;ヒドロキシ基;ヒドロキシ(C~C)アルキル基;-(CHr0-U-(CHs0-ヘテロシクロアルキル基;-U-(CHq0-NR021021’基;またはアルドン酸であり、
    は、薬学的に許容される一価カチオンであり、
    は、結合または酸素原子であり、
    は、-(CHs0-基または-C(O)-基であり、
    018は、水素原子または(C~C)アルコキシ(C~C)アルキル基であり、
    019は、水素原子またはヒドロキシ(C~C)アルキル基であり、
    020は、水素原子または線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基であり、
    021およびR021’は互いに独立して、水素原子、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基、またはヒドロキシ(C~C)アルキル基であり、
    あるいは対(R021、R021’)は、それらが結合している窒素原子と一緒に、5~7個の環員を含む芳香族または非芳香族環を形成し、これは必要に応じて、前記窒素原子に加えて、O、SおよびNから選択される1~3個のヘテロ原子を含み、ここで、前記得られた環は、水素原子または線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基で必要に応じて置換されており、
    022は、(C~C)アルコキシ(C~C)アルキル基、-(CHp0-NR024024’基または-(CHp0-O-(CHR018-CHR019-O)q0-R20基であり、
    023は、水素原子または(C~C)アルコキシ(C~C)アルキル基であり、
    あるいは対(R022、R023)は、それらが結合している窒素原子と一緒に、5~18個の環員を含む芳香族または非芳香族環を形成し、これは必要に応じて、前記窒素原子に加えて、O、SおよびNから選択される1~5個のヘテロ原子を含み、ここで、前記得られた環は、水素原子、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基またはヘテロシクロアルキル基で必要に応じて置換されており、
    024およびR024’は互いに独立して、水素原子または線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基であり、
    あるいは対(R024、R024’)は、それらが結合している窒素原子と一緒に、5~7個の環員から構成される芳香族または非芳香族環を形成し、これは、前記窒素原子に加えて、O、SおよびNから選択される1~3個のヘテロ原子を含んでよく、ここで、前記得られた環は、水素原子または線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基で必要に応じて置換されており、
    025は、水素原子、ヒドロキシ基またはヒドロキシ(C~C)アルキル基であり、
    026は、水素原子、ハロゲン原子、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基、またはシアノ基であり、
    027は、水素原子または線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基であり、
    028は、-O-P(O)(O)(O)基、-O-P(O)(O)(OR030)基、-O-P(O)(OR030)(OR030’)基、-(CHp0-O-SO-O基、-(CHp0-SO-O基、-(CHp0-O-SO-OR030基、-Cy010、-(CHp0-SO-OR030基、-O-C(O)-R029基、-O-C(O)-OR029基または-O-C(O)-NR029029’基であり、
    029およびR029’は互いに独立して、水素原子、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基または線状もしくは分枝状アミノ(C~C)アルキル基であり、
    030およびR030’は互いに独立して、水素原子、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基またはアリール(C~C)アルキル基であり、
    031
    Figure 2022532918000797
    であり、ここで、前記アンモニウムは必要に応じて、双性イオン型として存在するか、または一価のアニオン性対イオンを有し、
    は、0または1に等しい整数であり、
    は、0、1、2または3に等しい整数であり、
    は、1、2、3または4に等しい整数であり、
    およびsは、独立して0または1に等しい整数であり、
    ここで、最大で、前記R03基、R09基またはR012基のうちの1つは、存在する場合、前記リンカーに共有結合されており、
    ここで、原子の価数を、それに結合された1個または複数の置換基が超えない)
    の化合物もしくは鏡像異性体、ジアステレオ異性体、アトロプ異性体、重水素化誘導体、および/または前述のいずれかの薬学的に許容される塩を含む、請求項1から38のいずれか一項に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  40. Cy01、Cy02、Cy03、Cy04、Cy05、Cy06、Cy07、Cy08およびCy010が、互いに独立して、シクロアルキル基、ヘテロシクロアルキル基、アリール基またはヘテロアリール基であり、それらのそれぞれは、ハロ;-(C~C)アルコキシ;-(C~C)ハロアルキル;-(C~C)ハロアルコキシ;-(CHp0-O-SO-OR030;-(CHp0-SO-OR030;-O-P(O)(OR020;-O-P(O)(O;-CH-P(O)(OR020
    -(CHp0-O-(CHR018-CHR019-O)q0-R020;ヒドロキシ;ヒドロキシ(C~C)アルキル;-(CHr0-U-(CHs0-ヘテロシクロアルキル;または-U-(CHq0-NR021021’から選択される1個または複数の基で必要に応じて置換されている、請求項39に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  41. Dが、式(II):
    Figure 2022532918000798
    (式中、
    は、窒素原子またはC-R04基であり、
    01は、ハロゲン原子、線状または分枝状(C~C)アルキル基、線状または分枝状(C~C)アルケニル基、線状または分枝状(C~C)アルキニル基、線状または分枝状(C~C)ハロアルキル基、ヒドロキシ基、線状または分枝状(C~C)アルコキシ基、-S-(C~C)アルキル基、シアノ基、-Cy08、-NR011011’であり、
    02、R03およびR04は互いに独立して、水素原子、ハロゲン原子、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基、線状もしくは分枝状(C~C)アルケニル基、線状もしくは分枝状(C~C)アルキニル基、線状もしくは分枝状(C~C)ハロアルキル、ヒドロキシ基、線状もしくは分枝状(C~C)アルコキシ基、-S-(C~C)アルキル基、シアノ基、ニトロ基、-(C~C)アルキル-NR011011’、-O-Cy01、-(C~C)アルキル-Cy01、-(C~C)アルケニル-Cy01、-(C~C)アルキニル-Cy01、-O-(C~C)アルキル-NR011011’、-O-(C~C)アルキル-R031、-C(O)-OR011、-O-C(O)-R011、-C(O)-NR011011’、-NR011-C(O)-R011’、-NR011-C(O)-OR011’、-(C~C)アルキル-NR011-C(O)-R011’、-SO-NR011011’、または-SO-(C~C)アルキルであり、
    あるいは対(R02、R03)または(R03、R04)は、それらが結合している炭素原子と一緒に、5~7個の環員を含む芳香族または非芳香族環を形成し、これは必要に応じて、O、SおよびNから選択される1~3個のヘテロ原子を含み、ここで、前記環は、線状または分枝状(C~C)アルキル、-NR013013’、-(C~C)アルキル-Cy01およびオキソから選択される基で必要に応じて置換されており、
    06およびR07は互いに独立して、水素原子、ハロゲン原子、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基、線状もしくは分枝状(C~C)アルケニル基、線状もしくは分枝状(C~C)アルキニル基、線状もしくは分枝状(C~C)ハロアルキル、ヒドロキシ基、線状もしくは分枝状(C~C)アルコキシ基、-S-(C~C)アルキル基、シアノ基、ニトロ基、-(C~C)アルキル-NR011011’、
    -O-Cy01、-(C~C)アルキル-Cy01、-(C~C)アルケニル-Cy01、-(C~C)アルキニル-Cy01
    -O-(C~C)アルキル-R012、-C(O)-OR011、-O-C(O)-R011、-C(O)-NR011011’、-NR011-C(O)-R011’、-NR011-C(O)-OR011’、-(C~C)アルキル-NR011-C(O)-R011’、-SO-NR011011’、または
    -SO-(C~C)アルキルであり、
    あるいは対(R06、R07)は、2個の隣接する炭素原子と縮合されたとき、それらが結合している炭素原子と一緒に、5~7個の環員を含む芳香族または非芳香族環を形成し、これは必要に応じて、O、SおよびNから選択される1~3個のヘテロ原子を含み、ここで、前記得られた環は、線状または分枝状(C~C)アルキル基、-NR013013’、-(C~C)アルキル-Cy01およびオキソから選択される基で必要に応じて置換されており、
    08は、水素原子、線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基、アリール基、ヘテロアリール基、アリール-(C~C)アルキル基またはヘテロアリール(C~C)アルキル基であり、
    09は、線状または分枝状(C~C)アルキル基、線状または分枝状(C~C)アルケニル基、線状または分枝状(C~C)アルキニル基、-Cy02、-(C~C)アルキル-Cy02、-(C~C)アルケニル-Cy02、-(C~C)アルキニル-Cy02、-Cy02-Cy03、-(C~C)アルキニル-O-Cy02、-Cy02-(C~C)アルキル-O-(C~C)アルキル-Cy03、ハロゲン原子、シアノ基、-C(O)-R014、-C(O)-NR014014’であり、
    011およびR011’は互いに独立して、水素原子、必要に応じて置換された線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基、または-(C~C)アルキル-Cy01であり、
    あるいは対(R011、R011’)は、それらが結合している窒素原子と一緒に、5~7個の環員を含む芳香族または非芳香族環を形成し、これは必要に応じて、前記窒素原子に加えて、O、SおよびNから選択される1~3個のヘテロ原子を含み、ここで、前記N原子は、線状または分枝状(C~C)アルキル基で必要に応じて置換されており、ここで、前記線状または分枝状(C~C)アルキル基の炭素原子のうちの1個または複数は、必要に応じて重水素化されており、
    012は、-Cy05、-Cy05-(C~C)アルキル-Cy06、-Cy05-(C~C)アルキル-O-(C~C)アルキル-Cy06、-Cy05-(C~C)アルキル-NR011-(C~C)アルキル-Cy06、-Cy05-Cy06-O-(C~C)アルキル-Cy07、-Cy05-(C~C)アルキル-Cy09、-NH-C(O)-NH-R011、-C(O)-NR011011’、-NR011011’、-OR011、-NR011-C(O)-R011’、-O-(C~C)アルキル-OR011、-SO-R011、または-C(O)-OR011であり、
    013、R013’、R014およびR014’は互いに独立して、水素原子、または必要に応じて置換された線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基であり、
    Cy01、Cy02、Cy03、Cy05、Cy06、Cy07およびCy08は互いに独立して、シクロアルキル基、ヘテロシクロアルキル基、アリール基またはヘテロアリール基であり、それらのそれぞれは、必要に応じて置換されており、
    Cy09
    Figure 2022532918000799
    であり、
    ここで、R015、R016およびR017は、式(I)のために定義した通りであり、
    031
    Figure 2022532918000800
    であり、ここで、R027およびR028は、式(I)のために定義した通りであり、
    ここで、最大で、前記R03基、R09基またはR012基のうちの1つは、存在する場合、前記リンカーに共有結合されている)
    の化合物もしくは鏡像異性体、ジアステレオ異性体、アトロプ異性体、重水素化誘導体、および/または前述のいずれかの薬学的に許容される塩を含む、請求項1から40のいずれか一項に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  42. Dが、式(III):
    Figure 2022532918000801
    (式中、
    01は、線状または分枝状(C~C)アルキル基であり、
    03は、-O-(C~C)アルキル-NR011011’または
    Figure 2022532918000802
    であり、
    ここで、R011およびR011’は互いに独立して、水素原子、必要に応じて置換された線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基、または-(C~C)アルキル-Cy01であり、
    あるいは対(R011、R011’)は、それらが結合している窒素原子と一緒に、5~7個の環員を含む芳香族または非芳香族環を形成し、これは必要に応じて、前記窒素原子に加えて、O、SおよびNから選択される1~3個のヘテロ原子を含み、ここで、前記N原子は、水素原子または線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基から選択される1個または2個の基で置換されてよく、
    ここで、R027は水素原子であり、R028は、-(CHp0-O-SO-O基または-(CHp0-SO-OR030基であり、
    09は、線状もしくは分枝状(C~C)アルキニル基または-Cy02であり、
    012は、-Cy05、-Cy05-(C~C)アルキル-Cy06または-Cy05-(C~C)アルキル-Cy09であり、
    Cy01、Cy02、Cy05およびCy06は互いに独立して、シクロアルキル基、ヘテロシクロアルキル基、アリール基またはヘテロアリール基であり、それらのそれぞれは、必要に応じて置換されており、
    Cy09
    Figure 2022532918000803
    であり、
    015、R016およびR017は、式(I)のために定義した通りであり、
    ここで、最大で、前記R03基、R09基またはR012基のうちの1つは、存在する場合、前記リンカーに共有結合されている)
    の化合物もしくは鏡像異性体、ジアステレオ異性体、アトロプ異性体、重水素化誘導体、および/または前述のいずれかの薬学的に許容される塩を含む、請求項1から41のいずれか一項に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  43. 01が、メチルまたはエチルである、請求項42に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  44. 03が-O-CH-CH-NR011011’(式中、R011およびR011’は、それらを保持している窒素原子と一緒に、水素原子または線状もしくは分枝状(C~C)アルキル基)である基で置換されてよいピペラジニル基を形成する)である、請求項42に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  45. 03が、式:
    Figure 2022532918000804
    (式中、R027は水素原子であり、R028は-(CHp0-SO-OR030基である)
    を含む、請求項42に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  46. 03が、式:
    Figure 2022532918000805
    (式中、
    Figure 2022532918000806
    は、前記リンカーとの結合である)
    を含む、請求項42に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  47. 09がCy02である、請求項42に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  48. Cy02が、必要に応じて置換されたアリール基である、請求項47に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  49. Cy05が、ピラゾリル基およびピリミジニル基から選択されるヘテロアリール基を含む、請求項42に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  50. Cy05がピリミジニル基である、請求項42に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  51. 前記Lが、Lから式(I)、(II)または(III)のR03までの共有結合によりDに結合されており、かつ/または前記Lが、Lから式(I)、(II)または(III)のR09までの共有結合によりDに結合されている、請求項1から50のいずれか一項に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  52. (1)Dが、
    Figure 2022532918000807
    もしくは鏡像異性体、ジアステレオ異性体、アトロプ異性体、重水素化誘導体、および/または前述のいずれかの薬学的に許容される塩を含む、
    (2)Dが、
    Figure 2022532918000808
    もしくは鏡像異性体、ジアステレオ異性体、アトロプ異性体、重水素化誘導体、および/または前述のいずれかの薬学的に許容される塩を含む、
    (3)Dが、
    Figure 2022532918000809
    もしくは鏡像異性体、ジアステレオ異性体、アトロプ異性体、重水素化誘導体、および/または前述のいずれかの薬学的に許容される塩を含む、
    (4)Dが、
    Figure 2022532918000810
    もしくは鏡像異性体、ジアステレオ異性体、アトロプ異性体、重水素化誘導体、および/または前述のいずれかの薬学的に許容される塩を含む、
    (5)Dが、
    Figure 2022532918000811
    もしくは鏡像異性体、ジアステレオ異性体、アトロプ異性体、重水素化誘導体、および/または前述のいずれかの薬学的に許容される塩を含む、
    (6)Dが、
    Figure 2022532918000812
    もしくは鏡像異性体、ジアステレオ異性体、アトロプ異性体、重水素化誘導体、および/または前述のいずれかの薬学的に許容される塩を含む、
    (7)Dが、
    Figure 2022532918000813
    もしくは鏡像異性体、ジアステレオ異性体、アトロプ異性体、重水素化誘導体、および/または前述のいずれかの薬学的に許容される塩を含む、
    (8)Dが、
    Figure 2022532918000814
    もしくは鏡像異性体、ジアステレオ異性体、アトロプ異性体、重水素化誘導体、および/または前述のいずれかの薬学的に許容される塩を含む、
    (9)Dが、
    Figure 2022532918000815
    もしくは鏡像異性体、ジアステレオ異性体、アトロプ異性体、重水素化誘導体、および/または前述のいずれかの薬学的に許容される塩を含む、
    (10)Dが、
    Figure 2022532918000816
    もしくは鏡像異性体、ジアステレオ異性体、アトロプ異性体、重水素化誘導体、および/または前述のいずれかの薬学的に許容される塩を含む、
    (11)Dが、
    Figure 2022532918000817
    もしくは鏡像異性体、ジアステレオ異性体、アトロプ異性体、重水素化誘導体、および/または前述のいずれかの薬学的に許容される塩を含む、
    (12)Dが、
    Figure 2022532918000818
    もしくは鏡像異性体、ジアステレオ異性体、アトロプ異性体、重水素化誘導体、および/または前述のいずれかの薬学的に許容される塩を含む、
    (13)Dが、
    Figure 2022532918000819
    もしくは鏡像異性体、ジアステレオ異性体、アトロプ異性体、重水素化誘導体、および/または前述のいずれかの薬学的に許容される塩を含む、
    (14)Dが、
    Figure 2022532918000820
    もしくは鏡像異性体、ジアステレオ異性体、アトロプ異性体、重水素化誘導体、および/または前述のいずれかの薬学的に許容される塩を含む、
    (15)Dが、
    Figure 2022532918000821
    もしくは鏡像異性体、ジアステレオ異性体、アトロプ異性体、重水素化誘導体、および/または前述のいずれかの薬学的に許容される塩を含む、
    (16)Dが、
    Figure 2022532918000822
    もしくは鏡像異性体、ジアステレオ異性体、アトロプ異性体、重水素化誘導体、および/または前述のいずれかの薬学的に許容される塩を含む、あるいは
    (17)Dが、
    Figure 2022532918000823
    もしくは鏡像異性体、ジアステレオ異性体、アトロプ異性体、重水素化誘導体、および/または前述のいずれかの薬学的に許容される塩を含む、請求項1から42のいずれか一項に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  53. -(L-D)が、表A中の化合物もしくは鏡像異性体、ジアステレオ異性体、アトロプ異性体、重水素化誘導体、および/または前述のいずれかの薬学的に許容される塩から形成されている、請求項1から42のいずれか一項に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  54. 前記抗体または抗原結合性断片が、がん細胞上の標的抗原に結合する、請求項1から53のいずれか一項に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  55. (i)前記標的抗原が、BCMA、CD33、HER2、CD38、CD48、CD79b、PCAD、CD74、CD138、SLAMF7、CD123、CLL1、FLT3、CD7、CKIT、CD56、DLL3、DLK1、B7-H3、EGFR、CD71、EPCAM、FOLR1、ENPP3、MET、AXL、SLC34A2、ネクチン4、TROP2、LIV1、CD46もしくはGPNMBである;
    (ii)前記標的抗原が、BCMA、CD33、PCAD、HER2、CD38、CD46、CD48もしくはCD79bである;または
    (iii)前記標的抗原が、BCMA、CD33、CD48、PCADもしくはHER2である、請求項54に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  56. 前記抗体または抗原結合性断片が、抗BCMA抗体または抗原結合性断片である、請求項1から55のいずれか一項に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  57. 前記抗体または抗原結合性断片が、
    (a)配列番号15(HCDR1)、配列番号16(HCDR2)および配列番号17(HCDR3)のアミノ酸配列を含む3つの重鎖相補性決定領域(HCDR)と、
    配列番号18(LCDR1)、配列番号19(LCDR2)および配列番号20(LCDR3)のアミノ酸配列を含む3つの軽鎖相補性決定領域(LCDR)とを含む、または
    (b)前記抗体または抗原結合性断片が、配列番号1のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号2のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む、
    請求項56に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  58. (a)前記抗体または抗原結合性断片が、IgG1重鎖定常ドメインまたは修飾IgG1重鎖定常ドメインを含み、必要に応じて前記IgG1重鎖定常ドメインは、152位および375位にシステイン残基(C)を含み、もしくは前記IgG1重鎖定常ドメインは、156位および379位にシステイン残基(C)を含み、かつ/または
    (b)前記抗体または抗原結合性断片が、Igカッパ軽鎖定常ドメインを含む、
    請求項56または57に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  59. 前記抗体または抗原結合性断片が、抗CD33抗体または抗原結合性断片である、請求項1から58のいずれか一項に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  60. (a)前記抗体または抗原結合性断片が、配列番号21(HCDR1)、配列番号22(HCDR2)および配列番号23(HCDR3)のアミノ酸配列を含む3つの重鎖相補性決定領域(HCDR)と、配列番号24(LCDR1)、配列番号25(LCDR2)および配列番号26(LCDR3)のアミノ酸配列を含む3つの軽鎖相補性決定領域(LCDR)とを含み、かつ/または
    (b)前記抗体または抗原結合性断片が、配列番号3のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号4のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む、
    請求項59に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  61. (a)前記抗体または抗原結合性断片が、IgG1重鎖定常ドメインまたは修飾IgG1重鎖定常ドメインを含み、必要に応じて前記IgG1重鎖定常ドメインは、297位にグルタミン(Q)を含み、かつ/または
    (b)前記抗体または抗原結合性断片が、Igカッパ軽鎖定常ドメインを含む、
    請求項59または60に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  62. 前記抗体または抗原結合性断片が、抗PCAD抗体または抗原結合性断片である、請求項1から55のいずれか一項に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  63. (a)前記抗体または抗原結合性断片が、配列番号33(HCDR1)、配列番号34(HCDR2)および配列番号35(HCDR3)のアミノ酸配列を含む3つの重鎖相補性決定領域(HCDR)と、配列番号36(LCDR1)、配列番号37(LCDR2)および配列番号38(LCDR3)のアミノ酸配列を含む3つの軽鎖相補性決定領域(LCDR)とを含み、かつ/または
    (b)前記抗体または抗原結合性断片が、配列番号7のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号8のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む、
    請求項62に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  64. 前記抗体または抗原結合性断片が、抗HER2抗体または抗原結合性断片である、請求項1から55のいずれか一項に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  65. (a)前記抗体または抗原結合性断片が、配列番号39(HCDR1)、配列番号40(HCDR2)および配列番号41(HCDR3)のアミノ酸配列を含む3つの重鎖相補性決定領域(HCDR)と、配列番号42(LCDR1)、配列番号43(LCDR2)および配列番号44(LCDR3)のアミノ酸配列を含む3つの軽鎖相補性決定領域(LCDR)とを含み、かつ/または
    (b)前記抗体または抗原結合性断片が、配列番号9のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号10のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含む、
    請求項64に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  66. (a)前記抗体または抗原結合性断片が、IgG1重鎖定常ドメインまたは修飾IgG1重鎖定常ドメインを含み、必要に応じて前記IgG1重鎖定常ドメインは、297位にグルタミン(Q)を含み、もしくは前記IgG1重鎖定常ドメインは、297位にセリン(S)を含み、かつ/または
    (b)前記抗体または抗原結合性断片が、Igカッパ軽鎖定常ドメインを含む、
    請求項64または65に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  67. 前記抗体または抗原結合性断片が、抗CD38抗体もしくは抗原結合性断片;抗CD46抗体もしくは抗原結合性断片;抗CD48抗体もしくは抗原結合性断片;または抗CD79b抗体もしくは抗原結合性断片である、請求項1から55のいずれか一項に記載の抗体-薬物コンジュゲート。
  68. 請求項1から67のいずれか一項に記載の抗体-薬物コンジュゲートの複数コピーを含む組成物であって、前記組成物中の前記抗体-薬物コンジュゲートの平均pが、約2~約16、例えば、約2~約8、例えば、約2~約4である、組成物。
  69. 請求項1から67のいずれか一項に記載の抗体-薬物コンジュゲートまたは請求項68に記載の組成物と、薬学的に許容される担体とを含む医薬組成物。
  70. がんを有するか、または有することが疑われる対象を治療する方法であって、前記対象に治療有効量の請求項1から67のいずれか一項に記載の抗体-薬物コンジュゲート、請求項68に記載の組成物、または請求項69に記載の医薬組成物を投与することを含む方法。
  71. 前記がんが標的抗原を発現する、請求項70に記載の方法。
  72. 前記がんが、腫瘍または血液がんであり、必要に応じて、前記がんが、乳がん、多発性骨髄腫、形質細胞性骨髄腫、白血病、リンパ腫、胃がん、急性骨髄性白血病、膀胱がん、脳がん、骨髄がん、子宮頸がん、慢性リンパ性白血病、結腸直腸がん、食道がん、肝細胞がん、リンパ芽球性白血病、濾胞性リンパ腫、T細胞もしくはB細胞由来のリンパ性悪性腫瘍、黒色腫、骨髄性白血病、骨髄腫、口腔がん、卵巣がん、非小細胞肺がん、慢性リンパ性白血病、前立腺がん、小細胞肺がんまたは脾臓がんである、請求項70または71に記載の方法。
  73. 対象における腫瘍の増殖を低減または阻害する方法であって、前記対象に治療有効量の請求項1から67のいずれか一項に記載の抗体-薬物コンジュゲート、請求項68に記載の組成物、または請求項69に記載の医薬組成物を投与することを含む方法。
  74. 前記腫瘍が標的抗原を発現する、請求項73に記載の方法。
  75. 前記腫瘍が、乳がん、胃がん、膀胱がん、脳がん、子宮頸がん、結腸直腸がん、食道がん、肝細胞がん、黒色腫、口腔がん、卵巣がん、非小細胞肺がん、前立腺がん、小細胞肺がんまたは脾臓がんである、請求項73または74に記載の方法。
  76. 前記抗体-薬物コンジュゲート、組成物または医薬組成物の投与が、前記腫瘍の前記増殖を少なくとも約10%、少なくとも約20%、少なくとも約30%、少なくとも約40%、少なくとも約50%、少なくとも約60%、少なくとも約70%、少なくとも約80%、少なくとも約90%、少なくとも約95%または少なくとも約99%低減または阻害する、請求項73から75のいずれか一項に記載の方法。
  77. 対象におけるがん細胞集団の拡大を低減または減速する方法であって、前記対象に治療有効量の請求項1から67のいずれか一項に記載の抗体-薬物コンジュゲート、請求項68に記載の組成物、または請求項69に記載の医薬組成物を投与することを含む方法。
  78. 前記がん細胞集団が標的抗原を発現する、請求項77に記載の方法。
  79. 前記がん細胞集団が、腫瘍または血液がんに由来し、必要に応じて前記がん細胞集団が、乳がん、多発性骨髄腫、形質細胞性骨髄腫、白血病、リンパ腫、胃がん、急性骨髄性白血病、膀胱がん、脳がん、骨髄がん、子宮頸がん、慢性リンパ性白血病、結腸直腸がん、食道がん、肝細胞がん、リンパ芽球性白血病、濾胞性リンパ腫、T細胞もしくはB細胞由来のリンパ性悪性腫瘍、黒色腫、骨髄性白血病、骨髄腫、口腔がん、卵巣がん、非小細胞肺がん、慢性リンパ性白血病、前立腺がん、小細胞肺がんまたは脾臓がんに由来する、請求項77または78に記載の方法。
  80. 前記抗体-薬物コンジュゲート、組成物または医薬組成物の投与が、少なくとも約10%、少なくとも約20%、少なくとも約30%、少なくとも約40%、少なくとも約50%、少なくとも約60%、少なくとも約70%、少なくとも約80%、少なくとも約90%、少なくとも約95%または少なくとも約99%前記がん細胞集団を低減するか、または前記がん細胞集団の前記拡大を減速する、請求項77から79のいずれか一項に記載の方法。
  81. がんを有するか、または有することが疑われる対象が請求項1から67のいずれか一項に記載の抗体-薬物コンジュゲート、請求項68に記載の組成物、または請求項69に記載の医薬組成物での治療に応答するかどうか判定する方法であって、前記対象からの生物学的試料を用意すること;前記試料を前記抗体-薬物コンジュゲートと接触させること;および前記試料中のがん細胞との前記抗体-薬物コンジュゲートの結合を検出することを含む方法。
  82. 前記試料中の前記がん細胞が標的抗原を発現する、請求項81に記載の方法。
  83. 前記がんが標的抗原を発現する、請求項81または請求項82に記載の方法。
  84. 前記がんが、腫瘍または血液がんであり、必要に応じて前記がんが、乳がん、多発性骨髄腫、形質細胞性骨髄腫、白血病、リンパ腫、胃がん、急性骨髄性白血病、膀胱がん、脳がん、骨髄がん、子宮頸がん、慢性リンパ性白血病、結腸直腸がん、食道がん、肝細胞がん、リンパ芽球性白血病、濾胞性リンパ腫、T細胞もしくはB細胞由来のリンパ性悪性腫瘍、黒色腫、骨髄性白血病、骨髄腫、口腔がん、卵巣がん、非小細胞肺がん、慢性リンパ性白血病、前立腺がん、小細胞肺がんまたは脾臓がんである、請求項81から83のいずれか一項に記載の方法。
  85. 前記試料が、組織生検試料、血液試料または骨髄試料である、請求項82から84のいずれか一項に記載の方法。
  86. (i)前記標的抗原が、BCMA、CD33、HER2、CD38、CD48、CD79b、PCAD、CD74、CD138、SLAMF7、CD123、CLL1、FLT3、CD7、CKIT、CD56、DLL3、DLK1、B7-H3、EGFR、CD71、EPCAM、FOLR1、ENPP3、MET、AXL、SLC34A2、ネクチン4、TROP2、LIV1、CD46もしくはGPNMBである;(ii)前記標的抗原が、BCMA、CD33、PCAD、HER2、CD38、CD46、CD48もしくはCD79bである;または(iii)BCMA、CD33、CD48、PCADもしくはHER2、請求項70から85のいずれか一項に記載の方法。
  87. 請求項1から67のいずれか一項に記載の抗体-薬物コンジュゲートを作製する方法であって、コンジュゲーションを可能にする条件下、MCL1阻害剤に連結された切断可能なリンカーと抗体または抗原結合性断片を反応させることを含む方法。
  88. それを必要とする前記対象に少なくとも1種の追加の治療剤を投与することをさらに含み、好ましくは前記1種の追加の治療剤はBcl-2阻害剤であり、より好ましくは前記1種の追加の治療剤は、ベネトクラクス、化合物A1または化合物A2である、請求項70から86のいずれか一項に記載の方法。
  89. 以下の構造:
    Figure 2022532918000824
    Figure 2022532918000825
    Figure 2022532918000826
    のうちの1つを有する化合物またはその塩(例えば、その薬学的に許容される塩)。
  90. 請求項1に記載の式(1)の抗体-薬物コンジュゲートの調製のために合成中間体として使用される請求項89に記載の化合物。
  91. プロアポトーシス剤としての使用のための請求項89に記載の化合物または薬学的に許容される酸もしくは塩基とのその付加塩。
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