JP2022518240A - 養子細胞療法のための標的共刺激を提供する受容体 - Google Patents

養子細胞療法のための標的共刺激を提供する受容体 Download PDF

Info

Publication number
JP2022518240A
JP2022518240A JP2021541684A JP2021541684A JP2022518240A JP 2022518240 A JP2022518240 A JP 2022518240A JP 2021541684 A JP2021541684 A JP 2021541684A JP 2021541684 A JP2021541684 A JP 2021541684A JP 2022518240 A JP2022518240 A JP 2022518240A
Authority
JP
Japan
Prior art keywords
cells
costar
receptor
cell
seq
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
JP2021541684A
Other languages
English (en)
Inventor
ジョン ブリッジマン
ロバート ホーキンス
Original Assignee
インスティル バイオ (ユーケイ) リミテッド
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by インスティル バイオ (ユーケイ) リミテッド filed Critical インスティル バイオ (ユーケイ) リミテッド
Publication of JP2022518240A publication Critical patent/JP2022518240A/ja
Pending legal-status Critical Current

Links

Images

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/705Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K35/00Medicinal preparations containing materials or reaction products thereof with undetermined constitution
    • A61K35/12Materials from mammals; Compositions comprising non-specified tissues or cells; Compositions comprising non-embryonic stem cells; Genetically modified cells
    • A61K35/14Blood; Artificial blood
    • A61K35/17Lymphocytes; B-cells; T-cells; Natural killer cells; Interferon-activated or cytokine-activated lymphocytes
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/46Cellular immunotherapy
    • A61K39/461Cellular immunotherapy characterised by the cell type used
    • A61K39/4611T-cells, e.g. tumor infiltrating lymphocytes [TIL], lymphokine-activated killer cells [LAK] or regulatory T cells [Treg]
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/46Cellular immunotherapy
    • A61K39/463Cellular immunotherapy characterised by recombinant expression
    • A61K39/4631Chimeric Antigen Receptors [CAR]
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/46Cellular immunotherapy
    • A61K39/464Cellular immunotherapy characterised by the antigen targeted or presented
    • A61K39/4643Vertebrate antigens
    • A61K39/4644Cancer antigens
    • A61K39/464402Receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/46Cellular immunotherapy
    • A61K39/464Cellular immunotherapy characterised by the antigen targeted or presented
    • A61K39/4643Vertebrate antigens
    • A61K39/4644Cancer antigens
    • A61K39/464469Tumor associated carbohydrates
    • A61K39/46447Mucins, e.g. MUC-1
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/46Cellular immunotherapy
    • A61K39/464Cellular immunotherapy characterised by the antigen targeted or presented
    • A61K39/4643Vertebrate antigens
    • A61K39/4644Cancer antigens
    • A61K39/46448Cancer antigens from embryonic or fetal origin
    • A61K39/464482Carcinoembryonic antigen [CEA]
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/705Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
    • C07K14/70503Immunoglobulin superfamily
    • C07K14/7051T-cell receptor (TcR)-CD3 complex
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/705Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
    • C07K14/70503Immunoglobulin superfamily
    • C07K14/70521CD28, CD152
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/705Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
    • C07K14/70546Integrin superfamily
    • C07K14/7055Integrin beta1-subunit-containing molecules, e.g. CD29, CD49
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/705Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
    • C07K14/70596Molecules with a "CD"-designation not provided for elsewhere
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K16/00Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/28Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • C07K16/30Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants from tumour cells
    • C07K16/3007Carcino-embryonic Antigens
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N5/00Undifferentiated human, animal or plant cells, e.g. cell lines; Tissues; Cultivation or maintenance thereof; Culture media therefor
    • C12N5/06Animal cells or tissues; Human cells or tissues
    • C12N5/0602Vertebrate cells
    • C12N5/0634Cells from the blood or the immune system
    • C12N5/0636T lymphocytes
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/60Immunoglobulins specific features characterized by non-natural combinations of immunoglobulin fragments
    • C07K2317/62Immunoglobulins specific features characterized by non-natural combinations of immunoglobulin fragments comprising only variable region components
    • C07K2317/622Single chain antibody (scFv)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide
    • C07K2319/01Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif
    • C07K2319/02Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif containing a signal sequence
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide
    • C07K2319/01Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif
    • C07K2319/03Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif containing a transmembrane segment
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide
    • C07K2319/50Fusion polypeptide containing protease site
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2510/00Genetically modified cells

Abstract

本発明は、養子細胞療法(ACT)に有用なキメラ共刺激抗原受容体(CoStAR)を含む細胞に関する。CoStARは、定義された抗原への応答を増強する細胞活性のモジュレーターとして作用することができる。本発明はまた、CoStARタンパク質、CoStARをコードする核酸、およびそれらの治療用途を提供する。

Description

関連出願および参照による組込み
2019年1月22日に出願した英国特許出願番号第1900858.0号および2019年12月20日に出願した米国特許出願番号第62/951,770号を参照する。
上記の出願、およびその中でもしくはその実行の間に引用したすべての書類(「出願で引用した書類」)、および出願で引用した書類の中で引用しもしくは参照したすべての書類、および本明細書で引用しもしくは参照したすべての書類(「本明細書で引用した書類」)、および本明細書で引用した書類の中で引用しまたは参照したすべての書類は、本明細書に記述した任意の製品についての、および参照により本明細書に組み込まれた任意の書類における、製造者の指示書、説明書、製品規格書、および製品シートとともに、参照により本明細書に組み込まれ、本発明の実施において採用することができる。より具体的には、参照したすべての書類は、個別の書類のそれぞれが参照によって組み込まれると具体的かつ個別に指示されているのと同程度に、参照により組み込まれる。
配列の声明
本出願は、電子的に提出され、参照により全体として本明細書に組み込まれる、配列リストを含む。
発明の分野
本発明は、養子細胞療法(ACT)に有用なキメラ共刺激抗原受容体(CoStAR)を含む細胞に関する。CoStARは、定義された抗原への応答を増強する細胞活性のモジュレーターとして作用することができる。本発明はまた、CoStARタンパク質、CoStARをコードする核酸、およびそれらの治療用途を提供する。
自己T細胞を使用してがんの退縮を媒介する養子細胞療法(ACT)は、初期の臨床試験において大いに期待されてきた。ex vivoで増殖した腫瘍反応性または腫瘍浸潤性の天然に存在するリンパ球(TIL)の使用等のいくつかの一般的なアプローチが行なわれてきた。さらに、T細胞は定義された腫瘍抗原に向かって再標的化するように遺伝子改変され得る。これは、ペプチド(p)-主要組織適合性複合体(MHC)特異的T細胞受容体(TCR)の遺伝子導入または腫瘍特異的一本鎖抗体断片(scFv)とT細胞シグナル伝達ドメイン(例えばCD3ζ)との間の合成融合を介して行なうことができ、後者はキメラ抗原受容体(CAR)と称されている。
TILおよびTCRの導入は黒色腫を標的とする場合に特に良好であることが証明されており(Rosenberg et al. 2011、Morgan 2006)、一方CAR療法はある種のB細胞悪性腫瘍の治療において大いに期待されてきた(Grupp et al. 2013)。
白血病におけるCAR療法の成功は、一部には、それからのシグナルがCD3ζによって提供されるシグナルとシナジー効果を生じて抗腫瘍活性を増強する共刺激ドメイン(例えばCD28またはCD137)のCAR構築物への組込みに帰属されてきた。この見解の根拠はT細胞の活性化の古典的なシグナル1/シグナル2のパラダイムに関連している。ここでTCR複合体によって提供されるシグナル1は、CD28、CD137、またはCD134等の共刺激受容体によって提供されるシグナル2とのシナジー効果を生じて、シグナル1単独の場合に付随する活性化誘起細胞死(AICD)なしに細胞がクローン性に増殖し、IL2を産生し、および長期に生存することを可能にする。さらに、シグナル2の関与によって、シグナル1を介して生成したシグナルが増強され、細胞が抗腫瘍応答の間に遭遇するような低結合活性の相互作用により良く応答することが可能になる。
標的共刺激は、非CAR系T細胞療法に有益な影響を有することになる。例えば、共刺激ドメインをキメラTCRに組み込むことによって、pMHCに対するT細胞の応答が増強されることが示された(Govers 2014)。腫瘍浸潤性リンパ球(TIL)はその内因性TCRを利用して腫瘍の認識を媒介するが、内因性TCRを操作することは可能ではなかった。即ち、腫瘍細胞が発現する共刺激リガンドは極めて少ないので、TILは多大の制限を免れない。TILの標的共刺激を誘起する能力またはまさに他のいずれの養子T細胞療法の成果も有益であろう。
新規なCoStARおよびCoStARを含みまたは発現する細胞は、CAR系および非CAR系のT細胞療法に同様に有益である。本発明は、定義された疾患関連抗原、例えば腫瘍関連抗原との関与に際して新規なキメラ共刺激受容体を発現し、共刺激シグナルをT細胞に提供する細胞を使用する。シグナル1およびシグナル2を個別に使用して、操作されたT細胞において抗原特異的応答を駆動するいくつかの報告がある(Alvarez-Vallina & Hawkins 1996)。しかし、完全長のCD28分子を利用したものはない。短縮された形態に対して、CD28等の完全長の受容体を使用することには特定の利点がある。完全長のCD28はダイマーであり、受容体がその天然の形態で機能することを可能にする。キメラ抗原受容体は、モノマーとして発現した場合にはまさに最適に機能することができない(Bridgeman et al. 2010)。本発明は、疾患関連抗原または腫瘍関連抗原等の定義された抗原との関与に際してシグナル2を誘起する標的共刺激受容体をも提供する。完全長のCD28分子は、受容体のB7ファミリーの結合メンバーにおける天然の機能に対して重要なモチーフを含んでいる。これはB7によるCARのライゲーションがT細胞の活性化を誘発し得るCD28受容体およびCD3ζ受容体をタンデムに有するCARの観点からは潜在的に危険であるが、シグナル2受容体のみを有する受容体については有利な特性がある。
本発明者らは、Tリンパ球(T細胞)を操作してCoStAR(共刺激抗原受容体)を発現させ、定義された腫瘍関連抗原との関与に際してT細胞の活性化を強化することができることを示した。本発明者らは、操作された細胞が腫瘍関連抗原CEAとの関与に際してCoStARを介してシグナル2を受容することが許容されると、IFNγおよびIL-2の分泌によって測定したシグナル1マイトゲン(OKT3)によるT細胞の活性化が増強されることを示した。即ち第1の態様では、本発明は
(i)腫瘍関連抗原特異的ドメイン、例えば一本鎖抗体断片、
(ii)完全長の共刺激受容体シグナル伝達鎖またはドメイン
を含む組換え共刺激抗原受容体(CoStAR)を提供する。
本発明はまた、
(i)腫瘍関連抗原特異的ドメイン、例えば一本鎖抗体断片、
(ii)完全長の共刺激受容体シグナル伝達鎖またはドメイン
を含む組換え共刺激抗原受容体を含む細胞、例えばT細胞またはNK細胞を含むリンパ球を提供する。
本明細書に記載したCoStARは、その指定された腫瘍抗原へのCoStARの結合が受容体の活性化をもたらし、共刺激シグナルを提供して、組換えTCR、キメラ抗原受容体(CAR)、または内因性TCRによって提供される同時並行のシグナル1媒介シグナルを強化するように設計される。腫瘍抗原は、CEAまたは5T4等の癌精巣または癌胎児性の抗原のファミリーの分子からのもの等の腫瘍関連抗原であり、一本鎖抗体断片を使用して標的とされ得る。あるいは、腫瘍抗原はMHCを介してペプチドとして提示される抗原であり、pMHC特異的一本鎖抗体断片または一本鎖TCRを使用して標的とされ得る。
ある特定の実施形態では、シグナル伝達ドメインまたはシグナル伝達鎖は、CD2、CD9、CD26、CD27、CD28、CD29、CD38、CD40、CD43、CD46、CD49d、CD55、CD73、CD81、CD82、CD99、CD100、CD134(OX40)、CD137(41BB)、CD150(SLAM)、CD270(HVEM)、CD278(ICOS)、CD357(GITR)、またはEphB6を含むがこれらに限定されない完全長(シグナルペプチドがないタンパク質配列の全体)の共刺激受容体を含む。共刺激ドメインは、1つの受容体ドメイン単独、または各ドメインが直接もしくは50アミノ酸長さまでの可撓性リンカーを介して連結されたタンデム状の複数(即ち融合受容体)からなっていてよい。ある特定の実施形態では、シグナル伝達ドメインは完全長の共刺激受容体の断片を含み、断片は二量化に有効である。一本鎖抗体断片をシグナル伝達ドメインに連結するリンカーがあってもよい。存在する場合にはこのリンカーは1~50アミノ酸長さであってよい。リンパ球は、腫瘍浸潤性リンパ球(TIL)、T制御細胞(Treg)、もしくは初代T細胞を含むT細胞、またはNK細胞であってよい。CoStARに加えて、リンパ球、T細胞、またはNK細胞は、組換えT細胞受容体(TCR)またはキメラ抗原受容体(CAR)を含み得る。
十分な経験を持つ者であれば、シグナルペプチドが成熟タンパク質から切断される正確な点の同定を正確に決定することが困難であることを知ることになる。また予測ソフトウェアを適用することはできるが、成熟タンパク質の上流における配列の人工的なスプライシングはシグナルペプチドのペプチダーゼの新たな部位を創成し、したがって本書における用語「完全長」は、成熟タンパク質のN最末端における5アミノ酸までの欠失または変異を有する成熟タンパク質全体を意味しており、これは共刺激ドメインのキメラ受容体への最適のスプライシングのために重要なプロセスである。これは、CD28の細胞内ドメインのみが使用されCD8の膜貫通ドメインが利用されたLanitis et al (2013)において使用された配列、および短縮されたCD28受容体が使用されモチーフIEVに短縮されたKrause et al (1998)における配列等の公開された以前の配列と明らかに異なっている。
第2の態様では、本発明は上および本明細書に記載したCoStARをコードする核酸配列を提供する。
第3の態様では、本発明は第2の態様による核酸配列および、存在する場合にはTCRおよび/またはCAR核酸配列を含むベクターを提供する。
第4の態様では、本発明はCoStARをコードする核酸またはベクターをリンパ球に導入するステップを含む、本発明の第1の態様によるリンパ球、またはT細胞もしくはNK細胞を作成する方法を提供する。
別の態様では、本発明は第3の態様によるベクターまたは第1の態様によるリンパ球(T細胞またはNK細胞を含む)と、薬学的に許容される担体、希釈剤、または賦形剤とを含む医薬組成物、ならびにその治療用途を提供する。
第5の態様では、本発明は養子細胞療法における使用のためを含む細胞、例えば第1の態様によるT細胞もしくはNK細胞を含むリンパ球、または第3の態様によるベクターを提供する。
第6の態様では、本発明はがんを治療する方法における使用のためを含む第1の態様によるT細胞もしくはNK細胞を含むリンパ球、または第3の態様によるベクターを提供する。
第7の態様では、本発明はがんを治療するための医薬の製造における第1の態様によるリンパ球の使用または第3の態様によるベクターの使用を提供する。
第8の態様では、本発明はがんの治療における使用のための第1の態様によるリンパ球、第3の態様によるベクター、または本明細書で開示した医薬組成物を提供する。
一実施形態では、CoStAR受容体は本明細書で定義した完全長のCD28受容体を含む。一実施形態では、CoStARは、配列番号2で示されるものまたはタンパク質レベルで少なくとも80%の配列同一性を有するそのバリアント等の完全長のヒトCD28を含むか、またはこれらからなる融合シグナル伝達ドメイン、ならびに配列番号4で示されるものまたはタンパク質レベルで少なくとも80%もしくは90%の配列同一性を有するそのバリアント等のヒトCD137からの細胞内ドメイン、配列番号5で示されるものまたはタンパク質レベルで少なくとも80%もしくは90%の配列同一性を有するそのバリアント等のヒトCD134からの細胞内ドメイン、配列番号6で示されるものまたはタンパク質レベルで少なくとも80%もしくは90%の配列同一性を有するそのバリアント等のヒトCD2からの細胞内ドメイン、配列番号7で示されるものまたはタンパク質レベルで少なくとも80%もしくは90%の配列同一性を有するそのバリアント等のヒトCD29からの細胞内ドメイン、配列番号8で示されるものまたはタンパク質レベルで少なくとも80%もしくは90%の配列同一性を有するそのバリアント等のヒトGITRからの細胞内ドメイン、配列番号9で示されるものまたはタンパク質レベルで少なくとも80%もしくは90%の配列同一性を有するそのバリアント等のヒトIL2Rγからの細胞内ドメイン、配列番号10で示されるものまたはタンパク質レベルで少なくとも80%もしくは90%の配列同一性を有するそのバリアント等のヒトCD40からの細胞内ドメイン、配列番号11で示されるものまたはタンパク質レベルで少なくとも80%もしくは90%の配列同一性を有するそのバリアント等のヒトCD150からの細胞内ドメイン、または配列番号12で示されるものまたはタンパク質レベルで少なくとも80%もしくは90%の配列同一性を有するそのバリアント等のヒトCD2およびヒトCD40からの細胞内ドメインから選択される他の1つの部分と融合させた腫瘍関連抗原結合ドメインを含む。一実施形態では、上記の部分の1つのバリアントは、上に列挙した融合配列に関して、1個、2個、3個、4個、もしくは5個、または10個までのN末端アミノ酸残基を欠いている。
例として与えられるが、本発明を特定の実施形態だけに限定するものでない以下の詳細な記載は、付随図と併用して最も良好に理解することができる。
単一の共刺激および融合共刺激ドメイン受容体の構造的組織を示す図。請求項に開示されるCoStAR受容体の概略図を示す。1番目に単一の共刺激受容体に基づくCoStAR、2番目に第2の共刺激ドメインと融合させた完全長共刺激受容体シグナル伝達ドメインからなる融合CoStAR。 潜在的CoStAR構成のゲノム組織を示す図。図に示すように、および請求項に記載されるように、CoStARは抗原結合性ドメイン、必要に応じたスペーサードメイン、および共刺激ドメインからなる。CoStARは:A)単一の(Ai)または融合(Aii)共刺激受容体からなるCoStARによりプロモーターから単独で発現させることができ;B)CoStARの直接染色を可能にするためにNまたはC末端のエピトープタグ(例えばHisタグ、DYKDDDDK(配列番号14)等)と;C)2A切断配列またはリボソーム内部進入部位(IRES)を使用して分離されるマーカー遺伝子と一緒に;D)第2のプロモーターから発現されるマーカー遺伝子と一緒に;E)2A切断配列またはリボソーム内部進入部位(IRES)を使用して分離される目的のタンパク質、例えばキメラ抗原受容体またはT細胞受容体と一緒に;F)第2のプロモーターから発現される目的のタンパク質、例えばキメラ抗原受容体またはT細胞受容体と一緒に発現させることができる。CoStARおよびマーカー遺伝子/キメラ抗原受容体/T細胞受容体/目的の他のタンパク質は、いずれかの配向またはお互いに3’(3プライム)もしくは5’(5プライム)側に発現させることができることは、当業者に明らかだろう。 LS174TおよびLoVo腫瘍提示抗原に応答したT細胞中のCoStARの機能的活性を示す図。ドナー1(AとD)、ドナー2(B)およびドナー3(CとE)からの正常なドナーT細胞集団を、癌胎児性抗原を標的にするCoStARを発現させるためにレンチウイルスで工学操作し、導入遺伝子を富化するためにCD34磁気選択を使用して磁気によって選別した。T細胞を、野生型の工学操作されていないCEA+腫瘍細胞(非活性化腫瘍)、または指示されたエフェクター対標的比の細胞表面固着抗CD3単鎖抗体断片(活性化腫瘍)を発現するように工学操作したCEA+腫瘍細胞と混合し、ELISAによってIL-2を上清中で測定した。データは、LS174T細胞(A、BとC)およびLoVo(DとE)を使用して得た。 T細胞増殖に及ぼすCoStARの影響を示す図。5×105の形質導入および非形質導入T細胞を、IL-2の存在下(A)または不在下(B)で6.25×103の野生型LoVoまたはLoVo-OKT3細胞と混合し、細胞数を3日後に計数した。同じ細胞比での別のアッセイでは、2ドナーからのT細胞に増殖色素をロードし、細胞が経た増殖サイクルの数を、フローサイトメトリーを使用して6日後に色素希釈によって決定した。 一次ヒトT細胞におけるCoStAR融合受容体のIL-2活性を示す図。7人のドナー(対照CoStARが3人のドナーであること以外は)からの正常なドナーCD8+T細胞を、指示されたCEA-標的化CoStARでレンチウイルスにより形質導入し、LoVo-OKT3細胞の存在下で一晩の刺激の後にIL-2生成を調査した。IL-2陽性細胞の割合は、CD34陰性(CoStAR非形質導入)およびCD34+(CoStAR形質導入)集団における細胞内フロー染色を使用して決定した。アスタリスクは、対応のあるウィルコクソン符号付順位検定を*p<0.05で使用した、形質導入および非形質導入集団の間の有意差を示す。 一次ヒトT細胞におけるCoStAR活性の多重パラメーター分析を示す図。正常なドナーCD8+T細胞を、指示されたCEA-標的化CoStARでレンチウイルスにより形質導入し、LoVo-OKT3細胞の存在下で一晩の刺激の後にIL-2生成を調査した。IL-2(7人のドナー)(図6A)、IFNγ(7人のドナー)(図6B)、bcl-xL(5人のドナー)(図6C)およびCD107a(6人のドナー)(図6D)陽性細胞の割合を、CD34陰性(CoStAR非形質導入)およびCD34+(CoStAR形質導入)集団における細胞内フロー染色を使用して決定した。対照は非特異的CA125標的化CoStARであり、全ての場合に3人のドナーからのものである。ヒートマップは全てのドナーの平均であり、色の強度は規定の条件下の特定のリードアウトに陽性である細胞の百分率に関係する。 一次ヒトT細胞におけるCoStAR活性の多重パラメーター分析を示す図。正常なドナーCD8+T細胞を、指示されたCEA-標的化CoStARでレンチウイルスにより形質導入し、LoVo-OKT3細胞の存在下で一晩の刺激の後にIL-2生成を調査した。IL-2(7人のドナー)(図6A)、IFNγ(7人のドナー)(図6B)、bcl-xL(5人のドナー)(図6C)およびCD107a(6人のドナー)(図6D)陽性細胞の割合を、CD34陰性(CoStAR非形質導入)およびCD34+(CoStAR形質導入)集団における細胞内フロー染色を使用して決定した。対照は非特異的CA125標的化CoStARであり、全ての場合に3人のドナーからのものである。ヒートマップは全てのドナーの平均であり、色の強度は規定の条件下の特定のリードアウトに陽性である細胞の百分率に関係する。 CD40は、CD28ベースのCoStARからのIL-2生成を増強することを示す図。3人の健康なドナーからの一次ヒトT細胞は、形質導入をしないか、または細胞外ドメインがトランケーションされたCD28(Tr CD28)、完全長CD28(FL CD28)もしくはCEA特異的scFv(MFE23)を含むCD28.CD40ベースのCoStARで形質導入をした。形質導入細胞はCD34マーカー遺伝子を使用して選択し、分析の前に増量した。T細胞は8:1のエフェクター対標的比でOKT3発現CEA+LoVo細胞と20時間混合し、その後ELISAによってIL-2生成を分析した。 CoStAR媒介T細胞増量に及ぼすシグナル伝達ドメインおよび標的抗原の影響を示す図。T細胞は、CA125、FolRまたはCEA特異的scFvもしくはFolR特異的結合性ペプチド(C7)を含む、DYKDDDDK(配列番号14)エピトープ標識CD28またはCD28.CD40ベースのCoStARで形質導入をした。T細胞は、OKT3発現CA125+/FolR+/CEA細胞系OVCAR3と混合した。形質導入細胞の数は7日おきから最高21日おきに計数し、各計数の後に新鮮なOVCAR3細胞を加えた。 (A~I)CoStAR媒介T細胞増量に及ぼすシグナル伝達ドメインおよび標的抗原の影響を示す図。T細胞は、CA125、FolRまたはCEA特異的scFvもしくはFolR特異的結合性ペプチド(C7)を含む、DYKDDDDK(配列番号14)エピトープ標識CD28またはCD28.CD40ベースのCoStARで形質導入をした。T細胞は、OKT3発現CA125+/FolR+/CEA細胞系OVCAR3と混合した。形質導入細胞の数は7日おきから最高21日おきに計数し、各計数の後に新鮮なOVCAR3細胞を加えた。 (AおよびB)CD40ベースのCoStARは、TCR移入モデルにおいてT細胞の共刺激を増強することを示す図。3人の健康なドナーからの一次ヒトT細胞を、CEA特異的TCRと、MFE(白丸または黒丸)またはCA125(白四角)特異的scFvを含むDYKDDDK標識CD28またはCD28.CD40ベースのCoStARとで形質導入をした。T細胞は、1:1のエフェクター対標的比でCEA+/CA125-H508細胞と混合し、TCR+/CoStAR+、TCR+/CoStAR-、TCR-/CoStAR+およびTCR-/CoStAR集団の中の応答したCD4+またはCD8+T細胞の数を決定するために、細胞内サイトカイン染色を実行した。活性における有意差を決定するために、2元配置ANOVA(テューキーの検定)を実行した:*p>0.05、**p>0.01、***p>0.001、****p>0.0001。
特に定義されない限り、本明細書で使用される全ての専門用語および科学用語は、この発明が属する分野の当業技術者が通常理解するのと同じ意味を有する。
共刺激抗原受容体(CoStAR)
以下を含む組換え共刺激抗原受容体(CoStAR)が本明細書で提供される:(i)疾患または腫瘍関連抗原結合性ドメイン;および(ii)刺激性受容体タンパク質の細胞外リガンド結合性セグメント、および(iii)受容体タンパク質の細胞内シグナル伝達ドメインを含む第1の細胞内セグメント、および(iv)必要に応じて、第2の受容体タンパク質の細胞内シグナル伝達ドメインを含む第2の細胞内セグメント。ある特定の実施形態では、細胞外セグメントおよび第1の細胞内セグメントは、同じ受容体タンパク質のセグメントを含む。ある特定の実施形態では、細胞外セグメントおよび第1の細胞内セグメントは、異なる受容体タンパク質のセグメントを含む。本発明の実施形態では、細胞外セグメントと第1の細胞内セグメントの間に介在膜貫通ドメインがある。必要に応じた第2の細胞内セグメントおよび/または必要に応じた第3の細胞内セグメントを含む実施形態は、細胞内セグメントの間にスペーサーをさらに含むことができる。単純な形では、本発明のCoStARは、その同族抗原へのscFvの係合および/またはその同族リガンドへのCD28の係合に依存する共刺激シグナルを伝える完全長CD28と融合させた、単鎖抗体断片(scFv)を含む。本明細書で使用されるように、「完全長タンパク質」または「完全長受容体」は、受容体タンパク質、例えばCD28受容体タンパク質を指す。用語「完全長」は、そのシグナルペプチドが切断された後に、成熟受容体タンパク質のN末端で最高約5つまたは最高10個のアミノ酸、例えば1、2、3、4、5、6、7、8、9または10個のアミノ酸が欠如している受容体タンパク質を包含する。例えば、受容体N末端シグナルペプチドの特異的切断部位は規定することができるが、正確な切断点の変動が観察された。用語「完全長」は、受容体N末端シグナルペプチドのアミノ酸の有無を暗示しない。一実施形態では、用語「完全長」(例えば、本発明のある特定の態様による完全長CD28)は、そのシグナルペプチドが切断された後に、成熟受容体タンパク質のN末端で最高約5つ、例えば1、2、3、4、5、または最高10個のアミノ酸が欠如しているN末端シグナルペプチドが欠如している成熟受容体タンパク質(例えば、本発明のある特定の態様によるCD28)を包含する。配列番号2は、シグナルペプチドを含む成熟CD28タンパク質を示す。上で指摘した通り、本発明の様々な態様による「完全長」CD28受容体はシグナルペプチドを含まず、成熟受容体タンパク質のN末端で最高約5つ、例えば1、2、3、4、5、または最高10個のアミノ酸が欠如していてもよい(例えば、N末端残基N、K、I、Lおよび/またはV)。これは、例示的な融合、例えば配列番号4~12で示される(ボックス領域に示すように、これらは成熟受容体タンパク質のN末端で最高約5つ、例えば1、2、3、4、5、または最高10個のアミノ酸が欠如していてもよいことに留意する)。
CoStARはモジュール形を有し、1つまたは複数のタンパク質から得られる細胞外、膜貫通および細胞内ドメインを、疾患関連抗原、例えば腫瘍関連抗原に結合する抗体から得られるscFvと一緒に含むように構築することができる。
本発明により、一実施形態では、CoStARは疾患関連の、例えば腫瘍関連の抗原受容体、例えば、限定されずに、腫瘍関連抗原特異的scFv、およびその同族リガンドに結合して細胞内シグナルを提供することが可能である一次共刺激受容体タンパク質を含む。ある特定の実施形態では、一次共刺激受容体は完全長未満のタンパク質であってよいが、同族リガンドに結合してシグナルを伝達するのに十分である。ある特定の実施形態では、一次共刺激受容体ドメインは、完全長、例えば限定されずに完全長CD28である。したがって、抗原特異的結合性ドメインおよびリガンド特異的受容体は、それぞれ同族の抗原およびリガンドに結合することが可能である。図1は、CoStAR構築物の2つの実施形態を表す。両方のCoStARは、抗原結合性ドメイン、必要に応じたスペーサー、ならびに細胞外リガンド結合性セグメントおよび細胞内シグナル伝達ドメインを含む完全長共刺激受容体タンパク質を含む。別の実施形態では、CoStARは抗原結合性ドメイン、必要に応じたスペーサー、共刺激受容体タンパク質の細胞外リガンド結合性部分、膜貫通ドメイン、および第2の異なる共刺激受容体タンパク質の細胞内シグナル伝達ドメインを含む。ある特定の実施形態では、細胞外リガンド結合性部分は、CD28トランケーション、例えば、配列番号13におけるようなアミノ酸IEVの後のC末端CD28トランケーションを含み、細胞内シグナル伝達ドメインが続く。ある特定の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインはCD40からのものである。細胞外リガンド結合性および細胞内シグナル伝達ドメインを分離する膜貫通ドメインは、限定されずにCD28、CD40からのものであってよい。図1の左の構築物と比較して、図1の右の構築物は、追加の第2の細胞内受容体シグナル伝達ドメインおよび必要に応じたスペーサーをさらに含む。さらなる実施形態では、CoStARは追加の共刺激ドメイン、例えば第3の細胞内共刺激シグナル伝達ドメインを含むことができ、この点で、ある特定のキメラ抗原受容体(CAR)に類似していてよく、それは第1(CD3ζだけ)、第2(1つの共刺激ドメイン+CD3ζ)または第3世代(1つを超える共刺激ドメイン+CD3ζ)に分類されている。
本発明のCoStARで有益な共刺激受容体タンパク質には、限定されずに、CD2、CD9、CD26、CD27、CD28、CD29、CD38、CD40、CD43、CD46、CD49d、CD55、CD73、CD81、CD82、CD99、CD100、CD134(OX40)、CD137(41BB)、CD150(SLAM)、CD270(HVEM)、CD278(ICOS)、CD357(GITR)またはEphB6が含まれ、それらはそれらの天然形では、細胞外リガンド結合性ドメインおよび細胞内シグナル伝達ドメインを含む。例えば、CD2はT細胞の表面で見出される細胞接着分子として特徴付けられ、T細胞活性化のために必要な細胞内シグナルを開始することが可能である。CD27は、B細胞の上でのその発現がB細胞における抗原受容体活性化によって誘導されるTNFスーパーファミリー(TNFSF)に属しているII型膜貫通糖タンパク質として特徴付けられる。CD28はT細胞の上のタンパク質の1つであり、抗原提示細胞の上のCD80(B7.1)およびCD86(B7.2)リガンドの受容体である。CD137(4-1BB)リガンドはほとんどの白血球で、および一部の非免疫細胞で見出される。OX4リガンドは多くの抗原提示細胞、例えばDC2(樹状細胞)、マクロファージおよびBリンパ球の上で発現される。一実施形態では、共刺激受容体タンパク質は、本明細書で規定される完全長CD28である。
本発明の実施形態では、CoStARは、治療活性を有する細胞、例えば、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)の治療集団においてプロモーターの制御下で単独で発現させることができる。あるいは、CoStARは、例えば配列番号3~12に記載されるキメラ抗原受容体(CAR)および/またはT細胞受容体(TCR)などの治療的導入遺伝子と一緒に発現させることができる(成熟受容体タンパク質のN末端で最高約5つ、例えば1、2、3、4、5、または最高10個のアミノ酸が欠如していてもよいことに留意する)。したがって、一態様では、本発明は、成熟受容体タンパク質のN末端で最高約5つ、例えば1、2、3、4、5、または最高10個のアミノ酸が欠如しているそれらの配列の1つを含む、配列番号3~12のいずれかに示す配列を有するCoStar構築物にも関する。好適なTCRおよびCAR、例えばHLA-A*02-NYESO-1特異的TCR(Rapoport et al. Nat Med 2015)または抗CD19scFv.CD3ζ融合CAR(Kochenderfer et al. J Clin Oncol 2015)は文献で周知であり、それらは骨髄腫またはB細胞悪性腫瘍をそれぞれ処置するために首尾よく使用されている。本明細書に記載されるCoStARは、任意の公知のCARまたはTCRと一緒に発現させることができ、したがってin vitroまたはin vivo細胞増量を可能にする調節可能な増殖スイッチ、および抗がん活性のためのTCRまたはCARの形の従来の活性化機構を細胞に提供する。したがって、本発明は、本明細書に記載されるCoStARならびに腫瘍関連抗原に特異的に結合するTCRおよび/またはCARを含む養子細胞療法で使用するための細胞を提供する。CD28を含む例示的なCoStARは、細胞外抗原結合性ドメインならびに配列番号2に示すアミノ酸配列を含む細胞外膜貫通および細胞内シグナル伝達ドメインを含む。
本明細書で使用される用語「抗原結合性ドメイン」は、ダイアボディ、Fab、Fab’、F(ab’)2、Fv断片、ジスルフィド安定化Fv断片(dsFv)、(dsFv)2、二重特異的dsFv(dsFv-dsFv’)、ジスルフィド安定化ダイアボディ(dsダイアボディ)、単鎖抗体分子(scFv)、scFv二量体(二価ダイアボディ)、1つまたは複数のCDRを含む抗体の一部から形成される多重特異的抗体、ラクダ化単一ドメイン抗体、ナノボディ、ドメイン抗体、二価ドメイン抗体、または抗原に結合するが完全な抗体構造を含まない任意の他の抗体断片を限定されずに含む、抗体断片を指す。抗原結合性ドメインは、親抗体または親抗体断片(例えば、親scFv)が結合する同じ抗原に結合することが可能である。一部の実施形態では、抗原結合性断片は、1つまたは複数の異なるヒト抗体からのフレームワーク(FR)に接がれる特定のヒト抗体からの1つまたは複数の相補性決定領域(CDR)を含むことができる。
抗原結合性ドメインは、腫瘍関連抗原(TAA)および感染性疾患関連抗原を限定されずに含む任意の疾患関連抗原に特異的にすることができる。ある特定の実施形態では、リガンド結合性ドメインは二重特異的である。抗原は、バーキットリンパ種、神経芽細胞腫、黒色腫、骨肉腫、腎細胞癌、乳がん、前立腺がん、肺癌および結腸がんを含む大部分のヒトがんで同定されている。TAAには、限定されずに、CD19、CD20、CD22、CD24、CD33、CD38、CD123、CD228、CD138、BCMA、GPC3、CEA、葉酸受容体(FRα)、メソテリン、CD276、gp100、5T4、GD2、EGFR、MUC-1、PSMA、EpCAM、MCSP、SM5-1、MICA、MICB、ULBPおよびHER-2が含まれる。TAAには、新生抗原、ペプチド/MHC複合体およびHSP/ペプチド複合体もさらに含まれる。
ある特定の実施形態では、抗原結合性ドメインは、規定の腫瘍特異的ペプチド-MHC複合体に結合するT細胞受容体またはその結合性断片を含む。用語「T細胞受容体」または「TCR」は、T細胞の表面で対になるαβまたはγδ鎖で構成されるヘテロダイマー受容体を指す。各α、β、γおよびδ鎖は、2つのIg様ドメインで構成される:相補性決定領域(CDR)を通して抗原認識を付与する可変ドメイン(V)と、それに続く連結ペプチドおよび膜貫通(TM)領域によって細胞膜に固着している定常ドメイン(C)。TM領域は、CD3シグナル伝達器官の不変サブユニットに結合する。Vドメインの各々は3つのCDRを有する。これらのCDRは、主要組織適合複合体によってコードされるタンパク質(pMHC)に結合している抗原性ペプチドの間の複合体と相互作用する(Davis and Bjorkman (1988) Nature, 334, 395-402; Davis et al. (1998) Annu Rev Immunol, 16, 523-544; Murphy (2012), xix, 868 p.)。
ある特定の実施形態では、抗原結合性ドメインは腫瘍発現タンパク質の天然のリガンドまたはその腫瘍結合性断片を含む。例えば、CD71としても知られるトランスフェリン受容体1(TfR1)は、細胞の鉄ホメオスタシスおよび増殖の鍵調節因子であるホモダイマータンパク質である。TfR1は様々な細胞で低いレベルで発現されるが、それは、過剰発現が劣った予後診断と関連付けられている悪性細胞を含む、急増殖する細胞ではより高いレベルで発現される。本発明の一実施形態では、抗原結合性ドメインはトランスフェリンまたはそのトランスフェリン受容体結合性断片を含む。
ある特定の実施形態では、抗原結合性ドメインは規定の腫瘍関連抗原、例えば限定されずにFRα、CEA、5T4、CA125、SM5-1またはCD71に特異的である。ある特定の実施形態では、腫瘍関連抗原は、腫瘍特異的ペプチド-MHC複合体であってよい。ある特定のそのような実施形態では、ペプチドは新生抗原である。他の実施形態では、腫瘍関連抗原は、ペプチド-熱ショックタンパク質複合体である。
本発明の実施形態では、CoStARの細胞外、膜貫通および細胞内ドメインシグナル伝達ドメインは、配列番号1に示す配列を有する。
本明細書で使用されるように、用語「特異的に結合する」または「に特異的である」は、生体分子を含む分子の不均一な集団の存在下で標的の存在の決定因子である、測定可能で再現可能な相互作用、例えば標的と抗体または抗体部分の間の結合を指す。例えば、標的(エピトープであってよい)に特異的に結合する抗体部分は、他の標的へのその結合より大きな親和性、結合力で、より容易に、および/またはより長い持続期間で標的に結合する抗体部分である。一部の実施形態では、抗原に特異的に結合する抗体部分は、抗原(例えば細胞表面抗原またはペプチド/MHCタンパク質複合体)の1つまたは複数の抗原性決定因子と、他の標的への結合親和性の少なくとも約10倍である結合親和性で反応する。
スペーサードメイン
本発明のCoStARは、抗原結合性ドメインと共刺激受容体の間にスペーサー領域を必要に応じて含む。本明細書で使用されるように、用語「スペーサー」は、共刺激タンパク質の外部のリガンド結合性ドメインから抗原結合性ドメインを分離する、CoStARの細胞外構造領域を指す。スペーサーは、標的化抗原および受容体リガンドにアクセスする柔軟性を提供する。ある特定の実施形態では、例えば膜近位のエピトープまたはグリコシル化された抗原を標的にするために、長いスペーサーが用いられる(Guest R.D. et al. The role of extracellular spacer regions in the optimal design of chimeric immune receptors: evaluation of four different scFvs and antigens. J. Immunother. 2005;28:203-211;Wilkie S. et al., Retargeting of human T cells to tumor-associated MUC1: the evolution of a chimeric antigen receptor. J. Immunol. 2008;180:4901-4909を参照する)。他の実施形態では、例えば膜遠位のエピトープを標的にするために、CoStARは短いスペーサーを有する(Hudecek M. et al., Receptor affinity and extracellular domain modifications affect tumor recognition by ROR1-specific chimeric antigen receptor T cells. Clin. Cancer Res. 2013;19:3153-3164;Hudecek M. et al., The nonsignalling extracellular spacer domain of chimeric antigen receptors is decisive for in vivo antitumor activity. Cancer Immunol. Res. 2015;3:125-135を参照)。ある特定の実施形態では、スペーサーはIgG1、IgG2またはIgG4を限定されずに含むIgGヒンジの全部もしくは一部を含むかまたはそれに由来する。「Igヒンジに由来する」とは、IgGヒンジに挿入、欠失または突然変異を含むスペーサーを意味する。ある特定の実施形態では、スペーサーは1つまたは複数の抗体定常ドメイン、例えばCH2および/またはCH3ドメインの全部または一部を含むことができる。ある特定の実施形態では、CH2ドメインの全部または一部を含むスペーサーでは、CH2ドメインはFc受容体に結合しないように改変される。例えば、骨髄細胞でのFc受容体結合は、CAR T細胞機能を損なうことが見出されている。ある特定の実施形態では、スペーサーは、CD28、CD8またはヒンジ領域を含む他のタンパク質からのIg様ヒンジの全部または一部を含む。スペーサーを含む本発明のある特定の実施形態では、スペーサーは長さが1~50アミノ酸である。
シグナル伝達ドメイン
上記の通り、ある特定の実施形態では、CoStARは、限定されずにCD2、CD9、CD26、CD27、CD28、CD29、CD38、CD40、CD43、CD46、CD49d、CD55、CD73、CD81、CD82、CD99、CD100、CD134(OX40)、CD137(41BB)、CD150(SLAM)、CD270(HVEM)、CD278(ICOS)、CD357(GITR)またはEphB6の細胞外リガンド結合性および細胞内シグナル伝達部分を含むことができる、完全長一次共刺激受容体を含む。他の実施形態では、共刺激受容体は、例えば前記タンパク質の1つの細胞外リガンド結合性ドメインおよび前記タンパク質のもう1つの細胞内シグナル伝達ドメインを含む、キメラタンパク質を含む。ある特定の実施形態では、CoStARのシグナル伝達部分は、単一のシグナル伝達ドメインを含む。他の実施形態では、CoStARのシグナル伝達部分は第2の細胞内シグナル伝達ドメイン、例えば、限定されずにCD2、CD27、CD28、CD40、CD134(OX40)、CD137(4-1BB)、CD150(SLAM)を含む。ある特定の実施形態では、第1および第2の細胞内シグナル伝達ドメインは同じである。他の実施形態では、第1および第2の細胞内シグナル伝達ドメインは異なる。ある特定の実施形態では、共刺激受容体は二量体化が可能である。理論によって縛られることなく、シグナル開始のためにCoStARは二量体化するかまたは他のアクセサリー分子と結合すると考えられる。ある特定の実施形態では、CoStARは膜貫通ドメイン相互作用を通して二量体化するかまたはアクセサリー分子と結合する。ある特定の実施形態では、アクセサリー分子による二量体化または結合は、共刺激受容体の細胞内部分および/または細胞外部分における共刺激受容体相互作用によって支援される。
膜貫通ドメイン
膜貫通の主要な機能はT細胞膜にCoStARを固着させることであるが、ある特定の実施形態では、膜貫通ドメインはCoStAR機能に影響する。ある特定の実施形態では、膜貫通ドメインは、完全長一次共刺激受容体ドメインに含まれる。CoStAR構築物が1つの受容体の細胞外ドメインおよび第2の受容体の細胞内シグナル伝達ドメインを含む本発明の実施形態では、膜貫通ドメインは、細胞外ドメインまたは細胞内ドメインのそれであってよい。ある特定の実施形態では、膜貫通ドメインは、CD4、CD8α、CD28またはICOからのものである。Gueden等は、ICOS膜貫通ドメインの使用をCAR T細胞持続性および全体的抗腫瘍有効性の増加と関連付けた(Guedan S. et al., Enhancing CAR T cell persistence through ICOS and 4-1BB costimulation. JCI Insight. 2018;3:96976)。一実施形態では、膜貫通ドメインは、細胞膜にまたがる疎水性のαヘリックスを含む。
本発明によるCoStARシグナル伝達ドメインの例は、配列番号3~12で提供される。
変異体
一部の実施形態では、本明細書で提供される抗体部分または他の部分のアミノ酸配列変異体が企図される。例えば、抗体部分の結合親和性および/または他の生物学的特性を向上させることが望ましいことがある。抗体部分のアミノ酸配列変異体は、抗体部分をコードするヌクレオチド配列に適当な改変を導入することによって、またはペプチド合成によって調製することができる。そのような改変には、例えば、抗体部分のアミノ酸配列中の残基からの欠失、および/またはそれへの挿入および/またはその置換が含まれる。その最終構築物が所望の特徴、例えば抗原結合性を有する限り、最終構築物に到達するために欠失、挿入および置換の任意の組合せを加えることができる。
一部の実施形態では、1つまたは複数のアミノ酸の置換、欠失または挿入を含む抗体の結合性ドメイン部分が提供される。突然変異のための目的の部位には、抗体の結合性ドメインの重鎖および軽鎖可変領域(VR)およびフレームワーク(FR)が含まれる。アミノ酸置換を目的の結合性ドメインに導入することができ、生成物を所望の活性、例えば、保持/改善された抗原結合性または低下した免疫原性についてスクリーニングすることができる。ある特定の実施形態では、アミノ酸置換は一次共刺激受容体ドメイン(細胞外または細胞内)、二次共刺激受容体ドメインまたは細胞外共受容体ドメインのうちの1つまたは複数に導入することができる。したがって、本発明は、本明細書に特に開示されるCoStARタンパク質および構成要素部分、ならびにその変異体、すなわちCoStARタンパク質および本明細書に特に開示されるアミノ酸配列と少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも87%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%の配列同一性を有する構成要素部分を包含する。特定の配列を指す場合の用語「パーセント類似性」、「パーセント同一性」および「パーセント相同性」は、University of Wisconsin GCGソフトウェアプログラムBestFitに示される通りに使用する。他のアルゴリズム、例えばBLAST、psiBLASTまたはTBLASTN(Altschul et al. (1990) J. Mol. Biol. 215: 405-410の方法を使用する)、FASTA(Pearson and Lipman (1988) PNAS USA 85: 2444-2448の方法を使用する)を使用することができる。
特定のアミノ酸配列変異体は、1アミノ酸、2、3、4、5~10、10~20または20~30アミノ酸の挿入、付加、置換または欠失によって参照配列から異なってもよい。一部の実施形態では、変異体配列は1、2、3、4、5、6、7、8、9、10またはそれより多くの残基が挿入、欠失または置換されている参照配列を含むことができる。例えば、5、10、15、最高20、最高30または最高40残基が挿入、欠失または置換されていてもよい。
一部の好ましい実施形態では、変異体は1、2、3、4、5、6、7、8、9、10またはそれより多くの保存的置換によって参照配列から異なってもよい。保存的置換は、類似の特性を有する異なるアミノ酸によるアミノ酸の置き換えを含む。例えば、脂肪族残基は、別の脂肪族残基と置き換えることができ、無極性残基は別の無極性残基と置き換えることができ、酸性残基は別の酸性残基と置き換えることができ、塩基性残基は別の塩基性残基と置き換えることができ、極性残基は別の極性残基と置き換えることができ、または芳香族残基は別の芳香族残基と置き換えることができる。保存的置換は、例えば、以下の群の中のアミノ酸の間で起こることができる:
保存的置換を下の表に示す。
Figure 2022518240000002
アミノ酸は、共通する側鎖特性によって異なるクラスに分類することができる:a.疎水性:ノルロイシン、Met、Ala、Val、Leu、Ile;b.中性親水性:Cys、Ser、Thr、Asn、Gln;c.酸性:Asp、Glu;d.塩基性:His、Lys、Arg;e.鎖配向に影響する残基:Gly、Pro;芳香族:Trp、Tyr、Phe。非保存的置換は、これらのクラスの1つのメンバーを別のクラスと交換することを伴う。
細胞
本発明で使用される細胞は、養子細胞療法で有益である任意のリンパ球、例えば、T細胞またはナチュラルキラー(NK)細胞、NKT細胞、ガンマ/デルタT細胞またはT調節細胞であってよい。細胞は、患者にとって同種異系または自家であってよい。
T細胞またはTリンパ球は、細胞媒介性免疫で中心的な役割を演ずるタイプのリンパ球である。それらは、細胞表面のT細胞受容体(TCR)の存在によって他のリンパ球、例えばB細胞およびナチュラルキラー細胞(NK細胞)から区別することができる。下で要約される通り、各種のT細胞がある。細胞傷害性T細胞(TC細胞またはCTL)は、ウイルス感染細胞および腫瘍細胞を破壊し、移植拒絶にも結びつけられている。CTLは、それらの表面にCD8分子を発現する。
これらの細胞は、全ての有核細胞の表面に存在するMHCクラスIと関連する抗原に結合することによってそれらの標的を認識する。調節T細胞によって分泌されるIL-10、アデノシンおよび他の分子を通して、CD8+細胞はアネルギー状態に不活性化することができ、それは実験的自己免疫性脳脊髄炎などの自己免疫性疾患を阻止する。
記憶T細胞は、感染症が解消した後に長期間持続する抗原特異的T細胞のサブセットである。それらはそれらの同族抗原への再曝露により多数のエフェクターT細胞に速やかに増大し、このように、過去の感染症に対する「記憶」を免疫系に提供する。記憶T細胞は3つのサブタイプを含む:中央記憶T細胞(TCM細胞)および2種類のエフェクター記憶T細胞(TEM細胞およびTEMRA細胞)。記憶細胞は、CD4+またはCD8+であってよい。記憶T細胞は、細胞表面タンパク質CD45ROを一般的に発現する。以前はサプレッサーT細胞として知られる調節T細胞(Treg細胞)は、免疫寛容の維持のために重要である。それらの主要な役割は、免疫反応の終了に向けてT細胞媒介性免疫を停止すること、および胸腺における負の選択の過程から逃れた自己反応性T細胞を抑制することである。
CD4+Treg細胞の2つの主要なクラス、天然に存在するTreg細胞および適応性Treg細胞、が記載されている。天然に存在するTreg細胞(CD4+CD25+FoxP3+Treg細胞としても知られる)は胸腺に生じ、発達中のT細胞と、TSLPで活性化された骨髄性(CD11c+)および形質細胞様(CD123+)樹状細胞の間の相互作用と関連付けられている。天然に存在するTreg細胞は、FoxP3と呼ばれる細胞内分子の存在によって他のT細胞から区別することができる。適応性Treg細胞(Tr1細胞またはTh3細胞としても知られる)は、正常な免疫応答の間に生じることができる。
ナチュラルキラー細胞(または、NK細胞)は、先天性免疫系の一部を形成するタイプの細胞溶解性細胞である。NK細胞は、MHC非依存的にウイルス感染細胞からの先天性シグナルへの急速な応答を提供する。NK細胞(先天性リンパ系細胞の群に属する)は、大顆粒リンパ球(LGL)と規定され、BおよびTリンパ球を生成する共通リンパ球前駆体と区別される第3の種類の細胞を構成する。
ある特定の実施形態では、本発明の治療的細胞は、CoStARを発現するように工学操作される自家細胞を含む。ある特定の実施形態では、本発明の治療的細胞は、CoStARを発現するように工学操作される同種異系細胞を含む。CoStARを発現する自家細胞は、レシピエント同種抗原のTCR媒介認識のために、移植片対宿主病(GVDH)を回避することにおいて有利である可能性がある。さらに、CoStARレシピエントの免疫系は注入されたCoStAR細胞を攻撃し、拒絶を引き起こす可能性がある。ある特定の実施形態では、GVHDを予防するため、および拒絶を低減するために、ゲノム編集によって内因性TcRが同種異系CoStAR細胞から取り出される。
核酸
本発明の態様は、本明細書に記載されるCoStAR、ポリペプチドまたはタンパク質(その機能的部分および機能的変異体を含む)のいずれかをコードする本発明の核酸配列を提供する。本明細書で使用されるように、用語「ポリヌクレオチド」、「ヌクレオチド」および「核酸」は、互いに同義であるものである。遺伝子コードの同義性の結果として、多数の異なるポリヌクレオチドおよび核酸が同じポリペプチドをコードすることができることを、当業者は理解する。さらに、当業者は、ルーチン技術を使用して、ポリペプチドが発現される予定の任意の特定の宿主生物体のコドン利用を反映するために、例えばコドン最適化のために、ここで記載されるポリヌクレオチドによってコードされるポリペプチド配列に影響しないヌクレオチド置換を加えることができることを理解すべきである。本発明による核酸は、DNAまたはRNAを含むことができる。それらは、一本鎖または二本鎖であってよい。それらは、それらの中に合成のまたは改変されたヌクレオチドを含むポリヌクレオチドであってもよい。オリゴヌクレオチドに対するいくつかの異なるタイプの改変が、当技術分野で公知である。これらには、メチルホスホネートおよびホスホロチオエート主鎖、分子の3’および/または5’末端でのアクリジンまたはポリリジン鎖の付加が含まれる。本発明のために、ポリヌクレオチドは当技術分野で利用可能な任意の方法によって改変することができることを理解すべきである。目的のポリヌクレオチドのin vivo活性または寿命を増強するために、そのような改変を実行することができる。
ヌクレオチド配列に関する用語「変異体」、「相同体」または「誘導体」は、その配列からのまたはそれへの1つ(または複数)の核酸の任意の置換、変更、改変、置き換え、欠失または付加を含む。核酸配列は、配列番号2で示すタンパク質配列またはその変異体をコードすることができる。ヌクレオチド配列は、配列番号1で示すコドン最適化ヒトCD28核酸配列またはその変異体を含むことができる(図1に表す)。
本発明は、CoStARをコードする核酸配列およびT細胞受容体(TCR)および/またはキメラ抗原受容体(CAR)をコードするさらなる核酸配列を含む核酸配列も提供する。
核酸配列には、2つ以上の核酸配列の同時発現を可能にする配列が連結することができる。例えば、構築物は内部プロモーター、リボソーム内部進入部位(IRES)配列または切断部位をコードする配列を含むことができる。切断部位は、ポリペプチドが生成されるとき、いかなる外部の切断活性も必要とせずにそれが個別のタンパク質に直ちに切断されるように、自己切断性であってよい。口蹄疫ウイルス(FMDV)および2A自己切断ペプチドを含む、様々な自己切断部位が公知である。同時発現配列は、リボソーム内部進入部位配列(IRES)であってよい。同時発現配列は、内部プロモーターであってよい。
ベクター
一態様では、本発明は、本発明の核酸配列または核酸構築物を含むベクターを提供する。
そのようなベクターは、それが本発明の第1の態様による1つまたは複数のCoStAR、および任意に1つまたは複数の他の目的のタンパク質(POI)、例えばTCRまたはCARを発現するように、核酸配列または核酸構築物を宿主細胞に導入するために使用することができる。ベクターは、例えば、プラスミドまたはウイルスベクター、例えばレトロウイルスベクターもしくはレンチウイルスベクター、またはトランスポゾンベースのベクターもしくは合成mRNAであってよい。
本発明の核酸は、標準の遺伝子送達プロトコールを使用した核酸免疫化および遺伝子療法のために使用することもできる。遺伝子送達の方法は、当技術分野で公知である。例えば、参照により本明細書で完全に組み込まれる、米国特許第5,399,346号、5,580,859号、5,589,466号を参照。
レンチウイルスなどのレトロウイルスに由来するベクターは、長期の遺伝子導入を達成するのに好適なツールであり、その理由は、それらが導入遺伝子または複数の導入遺伝子の長期の安定した組入れおよび娘細胞におけるその増殖を可能にするからである。ベクターは、T細胞またはNK細胞を含むリンパ球をトランスフェクトまたは形質導入させることが可能であってよい。本発明は、本発明の核酸が挿入されるベクターも提供する。CoStARおよび任意にTCRまたはCARをコードする天然または合成の核酸の発現は、CoStARおよびTCR/CARポリペプチドをコードする核酸またはその一部を1つまたは複数のプロモーターに作動可能に連結し、この構築物を発現ベクターに組み込むことによって一般的に達成される。
追加のプロモーターエレメント、例えばエンハンサーは、転写開始の頻度を調節する。一般的に、これらは開始部位の30~110bp上流の領域に位置するが、いくつかのプロモーターが開始部位の下流の機能的エレメントも含有することが最近示された。プロモーターエレメント間の間隔はしばしば弾力的であるので、プロモーター機能はエレメントがお互いに対して逆になる場合または移動する場合も保存される。チミジンキナーゼ(tk)プロモーターでは、プロモーターエレメント間の間隔は、活性が低下し始めるまでに50bpの間隔まで増加することができる。
好適なプロモーターの1つの例は、前初期のサイトメガロウイルス(CMV)プロモーター配列である。このプロモーター配列は、それに作動可能に連結される任意のポリヌクレオチド配列の高レベル発現を促進することが可能な強力な構成的プロモーター配列である。好適なプロモーターの別の例は、伸長増殖因子1α(EF-1α)である。しかし、シミアンウイルス40(SV40)初期プロモーター、マウス乳房腫瘍ウイルス(MMTV)、ヒト免疫欠損ウイルス(HIV)末端反復配列(LTR)プロモーター、MoMuLVプロモーター、トリ白血病ウイルスプロモーター、EBウイルス前初期プロモーター、ラウス肉腫ウイルスプロモーター、ならびにヒト遺伝子プロモーター、例えば、限定されずに、アクチンプロモーター、ミオシンプロモーター、ヘモグロビンプロモーターおよびクレアチンキナーゼプロモーターを限定されずに含む他の構成的プロモーター配列を使用することもできる。
ベクターは、真核生物細胞における複製および組入れに好適であってよい。一般的なクローニングベクターは、転写および翻訳ターミネーター、開始配列、ならびに所望の核酸配列の発現の調節のために有益なプロモーターを含有する。ウイルスベクター技術は当技術分野で周知であり、例えば、Sambrook et al.(2001, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, New York)、ならびに他のウイルス学および分子生物学マニュアルに記載される、国際公開第01/96584号;国際公開第01/29058号;および米国特許第6,326,193号も参照する。一部の実施形態では、構築物は配列番号3~12に示す通りである(図2に模式的に表される)。一部の実施形態では、核酸は、単一のプロモーターの制御下の複数の導入遺伝子(例えば、CoStARおよびTCRおよび/またはCAR等)の発現を可能にする多シストロン構築物である。一部の実施形態では、導入遺伝子(例えば、CoStARおよびTCRおよび/またはCAR等)は自己切断性の2Aペプチドによって分離される。本発明の核酸構築物で有益な2Aペプチドの例には、F2A、P2A、T2AおよびE2Aが含まれる。本発明の他の実施形態では、本発明の核酸構築物は、2つのプロモーターを含む多シストロン構築物である;1つのプロモーターはCoStARの発現を促進し、他のプロモーターはTCRまたはCARの発現を促進する。一部の実施形態では、本発明の二重プロモーター構築物は、片方向性である。他の実施形態では、本発明の二重プロモーター構築物は、双方向性である。CoStARポリペプチドまたはその一部の発現を調査するために、細胞に導入される発現ベクターは、ウイルスベクターを通してトランスフェクトまたは形質導入しようと追求される細胞の集団からの発現細胞の同定および選択を容易にするために、選択可能なマーカー遺伝子またはリポーター遺伝子または両方を含有することもできる。
細胞の供与源
増量および遺伝子改変の前に、細胞(例えば、免疫エフェクター細胞、例えばT細胞またはNK細胞)の供与源が対象から得られる。用語「対象」は、免疫応答を導き出すことができる生物体を含むものである(例えば哺乳動物)。対象の例には、ヒト、イヌ、ネコ、マウス、ラットおよびこれらのトランスジェニック種が含まれる。T細胞は、末梢血単核細胞、骨髄、リンパ節組織、臍帯血、胸腺組織、感染部位からの組織、腹水、胸水、脾臓組織および腫瘍を含むいくつかの供与源から得ることができる。
一態様では、T細胞は、赤血球を溶解させ、例えばPERCOLL(商標)勾配を通した遠心分離または向流遠心分離エラトリエーションにより単球を除去することによって、末梢血リンパ球から単離される。
T細胞、例えばCD3+、CD28+、CD4+、CD8+、CD45RA+およびCD45RO+T細胞の特異的亜集団は、正または負の選択技術によってさらに単離することができる。例えば、一態様では、T細胞は、抗CD3/抗CD28コンジュゲートビーズ、例えばDYNABEADS(登録商標)M-450CD3/CD28Tとの、所望のT細胞の正の選択に十分な時間のインキュベーションによって単離される。一態様では、この時間は約30分である。さらなる態様では、この時間は30分~36時間またはそれより長く、その間の全ての整数が含まれる。さらなる態様では、この時間は少なくとも1、2、3、4、5または6時間である。さらに別の好ましい態様では、この時間は10~24時間である。一態様では、インキュベーション時間は24時間である。腫瘍組織からまたは免疫不全の個人から腫瘍浸潤性リンパ球(TIL)を単離する場合のように他の細胞型と比較してわずかなT細胞しかない任意の状況では、T細胞を単離するためにより長いインキュベーション時間を使用することができる。さらに、より長いインキュベーション時間の使用は、CD8+T細胞の捕捉の効率を増加させることができる。したがって、T細胞をCD3/CD28ビーズに結合させる時間を単に短くするかもしくは延長することによって、および/またはビーズ対T細胞比を増加もしくは減少させることによって(本明細書でさらに記載される)、培養開始時またはプロセスの間の他の時点に、T細胞の亜集団を正にまたは負に優先的に選択することができる。さらに、ビーズまたは他の表面での抗CD3および/または抗CD28抗体の比を増加または減少させることによって、培養開始時または他の所望の時点に、T細胞の亜集団を正にまたは負に優先的に選択することができる。当業者は、本発明との関連で複数回の選択を使用することもできることを認めるだろう。ある特定の態様では、選択手順を実行し、活性化および増量プロセスにおいて「未選択」細胞を使用することが望ましいかもしれない。「未選択」細胞は、さらなる回の選択にかけることもできる。
負の選択によるT細胞集団の富化は、負に選択される細胞に特異な表面マーカーに向けられる抗体の組合せで達成することができる。1つの方法は、負に選択される細胞に存在する細胞表面マーカーに向けられるモノクローナル抗体の混合を使用する、負の磁気免疫接着またはフローサイトメトリーによる細胞選別および/または選択である。例えば、負の選択によってCD4+細胞を富化するために、モノクローナル抗体カクテルは、CD14、CD20、CD16、HLA-DRおよびCD8に対する抗体を一般的に含む。ある特定の態様では、CD4+、CD25+、CD62Lhi、GITR+、CD137、PD1、TIM3、LAG-3、CD150およびFoxP3+を一般的に発現する調節T細胞を富化するかまたは正に選択することが望ましいかもしれない。あるいは、ある特定の態様では調節T細胞は、抗CD25コンジュゲートビーズまたは他の類似の選択方法によって除去される。
本明細書に記載される方法は、例えば本明細書に記載される負の選択技術を例えば使用する、調節T細胞除去集団、CD25+除去細胞である免疫エフェクター細胞、例えばT細胞の特異的亜集団の選択を例えば含むことができる。好ましくは、調節T除去細胞の集団は、30%未満、25%、20%、15%、10%、5%、4%、3%、2%、1%のCD25+細胞を含有する。
標的抗原に特異的に結合するCoStARエフェクター細胞の特異的亜集団は、正の選択技術によって富化することができる。例えば、一部の実施形態では、エフェクター細胞は、標的抗原コンジュゲートビーズとの、所望のabTCRエフェクター細胞の正の選択に十分な時間のインキュベーションによって富化される。一部の実施形態では、この時間は約30分である。一部の実施形態では、この時間は30分~36時間またはそれより長い(これらの値の間の全ての範囲を含む)。一部の実施形態では、この時間は少なくとも1、2、3、4、5または6時間である。一部の実施形態では、この時間は10~24時間である。一部の実施形態では、インキュベーション時間は24時間である。不均一な細胞集団中に低レベルで存在するエフェクター細胞の単離のために、より長いインキュベーション時間、例えば24時間の使用は細胞収量を増加させることができる。他の細胞型と比較してわずかなエフェクター細胞しかない任意の状況では、エフェクター細胞を単離するためにより長いインキュベーション時間を使用することができる。当業者は、本発明との関連で複数回の選択を使用することもできることを認めるだろう。
刺激のためのT細胞は、洗浄ステップの後に冷凍されてもよい。血漿および血小板を取り除く洗浄ステップの後、細胞は凍結溶液中に懸濁されてもよい。多くの凍結溶液およびパラメーターが当技術分野で公知であり、これに関連して有益であるが、1つの方法は、20%DMSOおよび8%ヒト血清アルブミンを含有するPBS、または10%デキストラン40および5%ブドウ糖、20%ヒト血清アルブミンおよび7.5%DMSO、もしくは31.25%Plasmalyte-A、31.25%ブドウ糖5%、0.45%NaCl、10%デキストラン40および5%ブドウ糖、20%ヒト血清アルブミンおよび7.5%DMSOを含有する培地、または、例えばHespanおよびPlasmaLyte Aを含有する他の好適な細胞凍結媒体の使用を含み、その後細胞は1分につき1度の速度で-80℃に冷凍され、液体窒素保存タンクの気相の中で保存される。制御された凍結の他の方法、ならびに-20℃または液体窒素における即時的な無制御の凍結も使用することができる。
同種異系CoStAR
本明細書に記載される実施形態では、免疫エフェクター細胞は、同種異系免疫エフェクター細胞、例えばT細胞またはNK細胞であってよい。例えば、細胞は同種異系T細胞、例えば、内因性T細胞受容体(TCR)および/またはヒト白血球抗原(HLA)、例えばHLAクラスIおよび/またはHLAクラスIIの発現が欠如している同種異系T細胞であってよい。
機能的内因性TCRが欠如しているT細胞は、例えば、それが表面にいかなる機能的TCRも発現しないように工学操作することができるか、機能的TCRを含む1つまたは複数のサブユニットをそれが発現しないように工学操作することができるか(例えば、それがTCRアルファ、TCRベータ、TCRガンマ、TCRデルタ、TCRイプシロンおよび/またはTCRゼータを発現しない(または、その低減した発現を示す)ように工学操作する)、または、それがその表面にごくわずかな機能的TCRしか生成しないように工学操作することができる。あるいは、T細胞は、かなり障害のあるTCRを、例えばTCRのサブユニットの1つまたは複数の突然変異またはトランケーション形の発現によって発現することができる。用語「かなり障害のあるTCR」は、このTCRが宿主で有害な免疫反応を導き出さないことを意味する。
本明細書に記載されるT細胞は、例えば、それがその表面に機能的HLAを発現しないように工学操作することができる。例えば、本明細書に記載されるT細胞は、細胞表面発現HLA、例えばHLAクラスIおよび/またはHLAクラスIIが下方制御されるように工学操作することができる。一部の態様では、ベータ-2ミクログロブリン(B2M)の発現を低減するか排除することによって、HLAの下方制御を達成することができる。
一部の実施形態では、T細胞は、機能的TCRおよび機能的HLA、例えばHLAクラスIおよび/またはHLAクラスIIが欠如していてもよい。機能的TCRおよび/またはHLAの発現が欠如している改変されたT細胞は、TCRまたはHLAの1つまたは複数のサブユニットのノックアウトまたはノックダウンを含む任意の好適な手段によって得ることができる。例えば、T細胞は、siRNA、shRNA、クリスパー(CRISPR)、転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼ(TALEN)またはジンクフィンガーエンドヌクレアーゼ(ZFN)を使用したTCRおよび/またはHLAのノックダウンを含むことができる。
一部の実施形態では、同種異系細胞は、阻害性分子を発現しないかまたは低レベルで発現する細胞、例えば本明細書に記載される任意の方法によって工学操作される細胞であってよい。例えば、細胞は、例えば免疫エフェクター応答を開始するCoStAR発現細胞の能力を低下させることができる阻害性分子を発現しないかまたは低レベルで発現する細胞であってよい。阻害性分子の例には、PD1、PD-L1、PD-L2、CTLA4、TIM3、CEACAM(例えば、CEACAM-1、CEACAM-3および/またはCEACAM-5)、LAG3、VISTA、BTLA、TIGIT、LAIR1、CD160、2B4、CD80、CD86、B7-H3(CD276)、B7-H4(VTCN1)、HVEM(TNFRSF14またはCD270)、KIR、A2aR、MHCクラスI、MHCクラスII、Gal9、アデノシンおよびTGFRベータが含まれる。阻害性分子の例えばDNA、RNAまたはタンパク質レベルでの阻害による阻害は、CAR発現細胞の性能を最適化することができる。実施形態では、阻害性核酸、例えば本明細書に記載される、例えば阻害性核酸、例えばdsRNA、例えばsiRNAもしくはshRNA、クリスパー(CRISPR)、転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼ(TALEN)またはジンクフィンガーエンドヌクレアーゼ(ZFN)を使用することができる。
内因性TCRまたはHLAを阻害するsiRNAおよびshRNA
一部の実施形態では、TCR発現および/またはHLA発現は、TCRおよび/またはHLAをコードする核酸を標的にするsiRNAまたはshRNA、および/または本明細書に記載されるT細胞中の阻害性分子(例えば、PD1、PD-L1、PD-L2、CTLA4、TIM3、CEACAM(例えば、CEACAM-1、CEACAM-3および/またはCEACAM-5)、LAG3、VISTA、BTLA、TIGIT、LAIR1、CD160、2B4、CD80、CD86、B7-H3(CD276)、B7-H4(VTCN1)、HVEM(TNFRSF14またはCD270)、KIR、A2aR、MHCクラスI、MHCクラスII、Gal9、アデノシンおよびTGFRベータ)を使用して阻害することができる。
T細胞中のsiRNAおよびshRNAの発現は、任意の従来の発現系、例えばレンチウイルス発現系を使用して達成することができる。TCRの構成要素の発現を下方制御する例示的なshRNAは、例えば、米国特許出願公開第2012/0321667号に記載される。HLAクラスIおよび/またはHLAクラスII遺伝子の発現を下方制御する例示的なsiRNAおよびshRNAは、例えば、米国特許出願公開第2007/0036773号に記載される。
TCRまたはHLAを阻害するCRISPR
本明細書で使用されるように、「CRISPR」または「TCRおよび/またはHLAを阻害するCRISPR」は、クリスパーのセットまたはそのような反復配列のセットを含む系を指す。本明細書で使用される「Cas」は、CRISPR関連タンパク質を指す。「CRISPR/Cas」系はCRISPRおよびCasに由来する系を指し、それは、TCRおよび/またはHLA遺伝子、および/または本明細書に記載される阻害性分子(例えば、PD1、PD-L1、PD-L2、CTLA4、TIM3、CEACAM(例えば、CEACAM-1、CEACAM-3および/またはCEACAM-5)、LAG3、VISTA、BTLA、TIGIT、LAIR1、CD160、2B4、CD80、CD86、B7-H3(CD276)、B7-H4(VTCN1)、HVEM(TNFRSF14またはCD270)、KIR、A2aR、MHCクラスI、MHCクラスII、GAL9、アデノシンおよびTGFRベータ)の発現を抑制するかまたはその突然変異を起こさせるために使用することができる。
天然に存在するCRISPR/Cas系は、配列決定された真正細菌ゲノムの概ね40%および配列決定された古細菌の90%で見出される。Grissa et al. (2007) BMC Bioinformatics 8: 172。この系は、プラスミドおよびファージなどの外来遺伝子エレメントへの抵抗性を付与し、獲得免疫の型を提供するタイプの原核生物の免疫系である。Barrangou et al. (2007) Science 315: 1709-1712;Marragini et al. ( 2008) Science 322: 1843-1845。
T細胞の活性化および増殖
T細胞は、一般に例えば米国特許第6,352,694号、第6,534,055号、第6,905,680号、第6,692,964号、第5,858,358号、第6,887,466号、第6,905,681号、第7,144,575号、第7,067,318号、第7,172,869号、第7,232,566号、第7,175,843号、第5,883,223号、第6,905,874号、第6,797,514号、第6,867,041号、および米国特許出願公開第20060121005号に記載されている方法を使用して活性化し増殖することができる。
一般に、本発明のT細胞は、CD3/TCR複合体関連シグナルを刺激する薬剤およびT細胞の表面上の共刺激分子を刺激するリガンドが結合された表面と接触させることによって、増殖させることができる。特に、T細胞の集団は、本明細書に記載したようにして、例えば抗CD3抗体もしくはその抗原結合性断片、または表面上に固定された抗CD2抗体との接触によって、またはカルシウムイオノフォアと組み合わせたプロテインキナーゼCアクチベーター(例えばブリオスタチン)との接触によって、刺激することができる。T細胞の表面上のアクセサリー分子の共刺激のためには、アクセサリー分子に結合するリガンドが使用される。例えば、T細胞の刺激増殖に適切な条件下で、T細胞の集団を抗CD3抗体および抗CD28抗体と接触させることができる。CD4+ T細胞またはCD8+ T細胞の増殖を刺激するために、抗CD3抗体および抗CD28抗体を使用することができる。抗CD28抗体の例には、9.3、B-T3、XR-CD28(Diaclone、Besancon、France)が含まれ、当技術で一般に公知の他の方法と同様に使用することができる(Berg et al., Transplant Proc. 30(8):3975-3977, 1998、Haanen et al., J. Exp. Med. 190(9):13191328, 1999、Garland et al., J. Immunol Meth. 227(l-2):53-63, 1999)。
一部の実施形態では、増殖はフラスコもしくは容器、または当業者には公知のガス透過性容器を使用して実施することができ、7日、8日、9日、10日、11日、12日、13日、または14日、約7日~約14日、約8日~約14日、約9日~約14日、約10日~約14日、約11日~約14日、約12日~約14日、または約13日~約14日、継続することができる。一部の実施形態では、第2のTIL増殖は約14日継続することができる。
ある特定の実施形態では、増殖はインターロイキン-2(IL-2)またはインターロイキン-15(IL-15)の存在下に非特異的T細胞受容体刺激を使用して実施することができる。非特異的T細胞受容体刺激剤には、例えば約30ng/mlのOKT3等の抗CD3抗体、マウスモノクローナル抗CD3抗体(Ortho-McNeil、Raritan、N.J.またはMiltenyi Biotech、Auburn、Calif.から市販)、またはUHCT-1(BioLegend、San Diego、Calif.、USAから市販)が含まれ得る。CoStAR細胞は、任意にT細胞増殖因子、例えば300IU/mlのIL-2またはIL-15の存在下で、任意にベクターから発現させることができるがんの抗原部分を含む1つまたは複数の抗原、例えばエピトープ、例えばヒト白血球抗原A2(HLA-A2)結合ペプチド、例えば0.3μMのMART-1:26-35(27L)またはgpl 00:209-217(210M)を含ませることによって、in vitroで増殖させることができる。その他の好適な抗原には、例えばNY-ESO-1、TRP-1、TRP-2、チロシナーゼがん抗原、MAGE-A3、SSX-2、およびVEGFR2、またはこれらの抗原部分が含まれ得る。CoStAR細胞は、HLA-A2を発現している抗原提示細胞にパルスした同じがん抗原で再刺激することによって迅速に増殖させてもよい。あるいは、CoStAR細胞は、例えば照射した自己リンパ球によって、または照射したHLA-A2+同種リンパ球およびIL-2によって、さらに刺激することができる。一部の実施形態では、刺激は増殖の一部として起こる。一部の実施形態では、増殖は照射した自己リンパ球の存在下で、または照射したHLA-A2+同種リンパ球およびIL-2によって起こる。
ある特定の実施形態では、細胞培養培地はIL-2を含む。一部の実施形態では、細胞培養培地は約1000IU/mL、約1500IU/mL、約2000IU/mL、約2500IU/mL、約3000IU/mL、約3500IU/mL、約4000IU/mL、約4500IU/mL、約5000IU/mL、約5500IU/mL、約6000IU/mL、約6500IU/mL、約7000IU/mL、約7500IU/mL、もしくは約8000IU/mL、または1000~2000IU/mL、2000~3000IU/mL、3000~4000IU/mL、4000~5000IU/mL、5000~6000IU/mL、6000~7000IU/mL、7000~8000IU/mL、もしくは8000IU/mLのIL-2を含む。
ある特定の実施形態では、細胞培養培地はOKT3抗体を含む。一部の実施形態では、細胞培養培地は約0.1ng/mL、約0.5ng/mL、約1ng/mL、約2.5ng/mL、約5ng/mL、約7.5ng/mL、約10ng/mL、約15ng/mL、約20ng/mL、約25ng/mL、約30ng/mL、約35ng/mL、約40ng/mL、約50ng/mL、約60ng/mL、約70ng/mL、約80ng/mL、約90ng/mL、約100ng/mL、約200ng/mL、約500ng/mL、約1μg/mL、または0.1ng/mL~1ng/mL、1ng/mL~5ng/mL、5ng/mL~10ng/mL、10ng/mL~20ng/mL、20ng/mL~30ng/mL、30ng/mL~40ng/mL、40ng/mL~50ng/mL、もしくは50ng/mL~100ng/mLのOKT3抗体を含む。
ある特定の実施形態では、増殖の間の組合せとしてIL-2、IL-7、IL-15、および/またはIL-21の組合せが採用される。ある特定の実施形態では、IL-2、IL-7、IL-15、および/またはIL-21、ならびにそれらの任意の組合せが、増殖の間に含まれ得る。一部の実施形態では、増殖の間の組合せとして、IL-2、IL-15、およびIL-21の組合せが採用される。一部の実施形態では、IL-2、IL-15、およびIL-21、ならびにそれらの任意の組合せを含ませることができる。
ある特定の実施形態では、増殖はIL-2、OKT-3、および抗原提示フィーダー細胞を含む補完した細胞培養培地の中で実施することができる。
ある特定の実施形態では、増殖培養培地は、約500IU/mLのIL-15、約400IU/mLのIL-15、約300IU/mLのIL-15、約200IU/mLのIL-15、約180IU/mLのIL-15、約160IU/mLのIL-15、約140IU/mLのIL-15、約120IU/mLのIL-15、もしくは約100IU/mLのIL-15、または約500IU/mLのIL-15~約100IU/mLのIL-15、もしくは約400IU/mLのIL-15~約100IU/mLのIL-15、もしくは約300IU/mLのIL-15~約100IU/mLのIL-15、もしくは約200IU/mLのIL-15、または約180IU/mLのIL-15を含む。
一部の実施形態では、増殖培養培地は、約20IU/mLのIL-21、約15IU/mLのIL-21、約12IU/mLのIL-21、約10IU/mLのIL-21、約5IU/mLのIL-21、約4IU/mLのIL-21、約3IU/mLのIL-21、約2IU/mLのIL-21、約1IU/mLのIL-21、もしくは約0.5IU/mLのIL-21、または約20IU/mL~約0.5IU/mLのIL-21、もしくは約15IU/mL~約0.5IU/mLのIL-21、もしくは約12IU/mL~約0.5IU/mLのIL-21、もしくは約10IU/mL~約0.5IU/mLのIL-21、もしくは約5IU/mL~約1IU/mLのIL-21、もしくは約2IU/mLのIL-21を含む。一部の実施形態では、細胞培養培地は約1IU/mLのIL-21、または約0.5IU/mLのIL-21を含む。
一部の実施形態では、抗原提示フィーダー細胞(APC)はPBMCである。一実施形態では、増殖におけるCoStAR細胞のPBMCおよび/または抗原提示細胞に対する比は、約1~25、約1~50、約1~100、約1~125、約1~150、約1~175、約1~200、約1~225、約1~250、約1~275、約1~300、約1~325、約1~350、約1~375、約1~400、もしくは約1~500、または1~50と1~300の間、または1~100と1~200の間である。
ある特定の態様では、T細胞に対する一次刺激シグナルと共刺激シグナルは、異なるプロトコールによって提供され得る。例えば、それぞれのシグナルを提供する薬剤は、溶液中であってもよく、表面に連結されていてもよい。表面に連結される場合には、薬剤は同一表面に連結されてもよく(即ち「シス」フォーメーションで)、個別の表面に連結されてもよい(即ち「トランス」フォーメーションで)。あるいは、1つの薬剤が表面に連結され、他の薬剤が溶液中にあってもよい。一態様では、共刺激シグナルを提供する薬剤は細胞表面に結合し、一次活性化シグナルを提供する薬剤は溶液中にあるか、表面に連結される。ある特定の態様では、両方の薬剤が溶液中にあってもよい。一態様では、薬剤は可溶性の形態で、薬剤に結合することになるFc受容体または抗体もしくはその他の結合剤を発現している細胞等の表面に架橋してもよい。これに関して、本発明におけるT細胞の活性化および増殖における使用を意図した人工的な抗原提示細胞(aAPC)については、例えば米国特許出願公開第20040101519号および第20060034810号を参照されたい。
一態様では、2つの薬剤が同一のビーズに、即ち「シス」に、または個別のビーズに、即ち「トランス」に、ビーズに固定される。例として、一次活性化シグナルを提供する薬剤は抗CD3抗体またはその抗原結合性断片であり、共刺激シグナルを提供する薬剤は抗CD28抗体またはその抗原結合性断片である。両方の薬剤は等モル量で同一のビーズに共固定化される。一態様では、CD4+ T細胞の増殖およびT細胞の成長のため、ビーズに結合した1:1の比の各抗体が使用される。本発明のある特定の態様では、1:1の比を使用して観察される増殖と比較してT細胞の増殖の増大が観察されるような、ビーズに結合した抗CD3抗体:抗CD28抗体の比が使用される。ある特定の態様では、1:1の比を使用して観察される増殖と比較して、約1倍~約3倍の増大が観察される。一態様では、ビーズに結合したCD3:CD28抗体の比は、100:1~1:100およびその間のすべての整数値の範囲である。本発明の一態様では、抗CD3抗体より多い抗CD28抗体が粒子に結合される。即ち、CD3:CD28の比は1より小さい。本発明のある特定の態様では、ビーズに結合した抗CD28抗体の抗CD3抗体に対する比は、2:1より大きい。1つの特定の態様では、ビーズに結合した1:100のCD3:CD28抗体の比が使用される。一態様では、ビーズに結合した1:75のCD3:CD28抗体の比が使用される。さらなる態様では、ビーズに結合した1:50のCD3:CD28抗体の比が使用される。一態様では、ビーズに結合した1:30のCD3:CD28抗体の比が使用される。1つの好ましい態様では、ビーズに結合した1:10のCD3:CD28抗体の比が使用される。一態様では、ビーズに結合した1:3のCD3:CD28抗体の比が使用される。さらに1つの態様では、ビーズに結合した3:1のCD3:CD28抗体の比が使用される。
T細胞またはその他の標的細胞を刺激するために、1:500~500:1およびその間の任意の整数値の粒子対細胞の比が使用され得る。当業者には容易に認識されるように、粒子と細胞の比は標的細胞に対する粒子の大きさに依存し得る。例えば、小サイズのビーズは数個の細胞にのみ結合し得るが、大きなビーズは多くの細胞に結合し得る。ある特定の態様では、細胞と粒子の比は1:100~100:1およびその間の任意の整数値の範囲であり、さらなる態様では、1:9~9:1およびその間の任意の整数値を含む比も、T細胞を刺激するために使用することができる。T細胞の刺激をもたらす抗CD3および抗CD28を連結した粒子とT細胞の比は上記のように変動し得るが、ある特定の好ましい値は、1:100、1:50、1:40、1:30、1:20、1:10、1:9、1:8、1:7、1:6、1:5、1:4、1:3、1:2、1:1、2:1、3:1、4:1、5:1、6:1、7:1、8:1、9:1、10:1、および15:1を含み、1つの好ましい比はT細胞あたりの粒子が少なくとも1:1である。一態様では、1:1またはそれ未満の粒子対細胞の比が使用される。1つの特定の態様では、好ましい粒子対細胞の比は1:5である。さらなる態様では、粒子と細胞の比は刺激の日に応じて変動し得る。例えば一態様では、粒子と細胞の比は1日目には1:1~10:1であり、その後10日目まで毎日または1日おきにさらなる粒子が細胞に添加され、最終の比が(添加の日における細胞計数に基づいて)1:1~1:10になる。1つの特定の態様では、粒子と細胞の比は刺激の1日目には1:1であり、刺激の3日目および5日目に1:5に調整される。一態様では、粒子は毎日または1日おきのベースで添加され、最終の比が刺激の1日目に1:1、3日目および5日目に1:5になる。一態様では、粒子と細胞の比は刺激の1日目に2:1であり、刺激の3日目および5日目に1:10に調整される。一態様では、粒子は毎日または1日おきのベースで添加され、最終の比が刺激の1日目に1:1、3日目および5日目に1:10になる。当業者であれば、本発明における使用のために種々の他の比も好適であることが認識されよう。特に、比は粒子サイズならびに細胞のサイズおよび型に応じて変動することになる。一態様では、使用のための最も典型的な比は1日目で1:1、2:1、および3:1の近辺である。
本発明のさらなる態様では、T細胞等の細胞は薬剤でコートされたビーズと組み合わされ、続いてビーズと細胞が分離され、次いで細胞が培養される。代替の態様では、培養に先立って薬剤でコートされたビーズと細胞は分離されず、ともに培養される。さらなる態様では、磁力等の力の印加によってビーズと細胞が最初に濃縮され、細胞表面マーカーのライゲーションの増大がもたらされ、それにより細胞の刺激が誘起される。
CoStAR細胞の調製
ウイルス系および非ウイルス系の遺伝子操作ツールを使用してCoStAR T細胞を産生し、治療用遺伝子の永久的または一時的な発現をもたらすことができる。レトロウイルス系遺伝子送達はよく特徴付けられ成熟した技術であり、CARを宿主細胞のゲノムに永久的に一体化するために使用されてきた(Scholler J., e.g. Decade-long safety and function of retroviral-modified chimeric antigen receptor T cells. Sci. Transl. Med. 2012;4:132ra53、Rosenberg S.A. et al., Gene transfer into humans-immunotherapy of patients with advanced melanoma, using tumor-infiltrating lymphocytes modified by retroviral gene transduction. N. Engl. J. Med. 1990;323:570-578)。
非ウイルスDNAトランスフェクション法も使用することができる。例えば、Singhらは、CAR T細胞を操作するために開発され、臨床試験(例えばClinicalTrials.gov: NCT00968760 およびNCT01653717を参照)において使用されているスリーピングビューティ(SB)トランスポゾンシステムの使用を記載している(Singh H., et al., Redirecting specificity of T-cell populations for CD19 using the Sleeping Beauty system. Cancer Res. 2008;68:2961-2971)。同じ技術がCoStAR細胞を操作するために適用可能である。
トランスジーンを送達するために多種のSB酵素が使用されてきた。Matesは、第1世代のトランスポザーゼと比較してほぼ100倍の効率増強を有する超活性トランスポザーゼ(SB100X)を記載している。SB100Xは、造血幹細胞または前駆細胞を富化したヒトCD34(+)細胞において35~50%安定な遺伝子導入を支持した(Mates L. et al., Molecular evolution of a novel hyperactive Sleeping Beauty transposase enables robust stable gene transfer in vertebrates. Nat. Genet. 2009;41:753-761)。多種のトランスジーンを、マルチシストロン性の単一のプラスミド(例えばThokala R. et al., Redirecting specificity of T cells using the Sleeping Beauty system to express chimeric antigen receptors by mix-and-matching of VL and VH domains targeting CD123+ tumors. PLoS ONE. 2016;11:e0159477)または多種のプラスミド(例えばHurton L.V. et al., Tethered IL-15 augments antitumor activity and promotes a stem-cell memory subset in tumor-specific T cells. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2016;113:E7788-E7797)から送達することができる。そのようなシステムを本発明のCoStARとともに使用することができる。
Moritaらは、より大きなトランスジーンを一体化するためのピギーバックトランスポゾンシステムを記載している(Morita D. et al., Enhanced expression of anti-CD19 chimeric antigen receptor in piggyBac transposon-engineered T cells. Mol. Ther. Methods Clin. Dev. 2017;8:131-140)。NakazawaらはHER2特異的キメラ抗原受容体を発現するEBV特異的細胞傷害性T細胞を産生するシステムの使用を記載している(Nakazawa Y et al, PiggyBac-mediated cancer immunotherapy using EBV-specific cytotoxic T-cells expressing HER2-specific chimeric antigen receptor. Mol. Ther. 2011;19:2133-2143)。Manuriらは、CD-19特異的T細胞を産生するシステムを使用した。(Manuri P.V.R. et al., piggyBac transposon/transposase system to generate CD19-specific T cells for the treatment of B-lineage malignancies. Hum. Gene Ther. 2010;21:427-437)。
トランスポゾン技術は容易で経済的である。1つの潜在的な欠点は、現在採用されている長い増殖プロトコールが、T細胞の分化、活性の低下、および注入された細胞の持続性の低さをもたらし得ることである。Monjeziらは、高効率の一体化によってこれらの難点を最小化するミニサークルベクターの開発を記載している(Monjezi R. et al., Enhanced CAR T-cell engineering using non-viral Sleeping Beauty transposition from minicircle vectors. Leukemia. 2017;31:186-194)。これらのトランスポゾン技術を、本発明のCoStARに使用することができる。
医薬組成物
本発明はまた、本発明のベクターまたはCoStAR発現細胞を薬学的に許容される担体、希釈剤、または賦形剤、および任意に1つもしくは複数のさらなる薬学的に活性なポリペプチドおよび/または化合物とともに含む医薬組成物に関する。
一部の実施形態では、上記のCoStARおよび薬学的に許容される担体を含む医薬組成物が提供される。一部の実施形態では、上記の実施形態のいずれかによるCoStARをコードする核酸および薬学的に許容される担体を含む医薬組成物が提供される。一部の実施形態では、上記のCoStARを発現するエフェクター細胞および薬学的に許容される担体を含む医薬組成物が提供される。そのような製剤は、例えば静脈内注入に適した形態であってよい。
本明細書で使用される場合、「薬学的に許容される」または「薬学的に親和性の」は、生物学的にまたはその他に望ましくないものでない材料を意味し、例えばその材料は、顕著な望ましくない生物学的影響を惹起することなく、またはその材料が含まれる組成物の他の成分のいずれにも有害な様式で相互作用することなく、患者に投与する医薬組成物に組み込むことができる。薬学的に許容される担体または賦形剤は、好ましくは毒性試験および製造試験の必要な標準に合格しており、および/または米国食品医薬品局が作成した不活性成分のガイドに含まれている。
本発明の一態様は、組換えCoStARを発現する改変されたT細胞の集団を提供する。好適な集団は上記の方法によって生成され得る。
改変されたT細胞の集団は医薬としての使用のためであってよい。例えば、本明細書に記載した改変されたT細胞の集団は、がんの免疫療法、例えば養子T細胞療法において使用し得る。
本発明の他の態様は、がんの治療のための医薬の製造のための本明細書に記載した改変されたT細胞の集団の使用、がんの治療のための本明細書に記載した改変されたT細胞の集団を提供し、がんの治療の方法は、本明細書に記載した改変されたT細胞の集団を、それを必要とする個体に投与するステップを含み得る。
改変されたT細胞の集団は自己であってよい。即ち、改変されたT細胞は、元々はそれらが引き続いて投与される同じ個体から得られたものである(即ち、ドナーおよびレシピエントの個体は同一である)。個体への投与のための改変されたT細胞の好適な集団は、その個体から得られたT細胞の初期の集団を準備するステップ、T細胞を改変してcAMP PDEまたはその断片およびその個体のがん細胞に特異的に結合する抗原受容体を発現させるステップ、ならびに改変されたT細胞を培養するステップを含む方法によって生成され得る。
改変されたT細胞の集団は同種であってよい。即ち、改変されたT細胞は、元々はそれらが引き続いて投与される個体とは異なる個体から得られたものである(即ち、ドナーおよびレシピエントの個体は異なっている)。ドナーおよびレシピエントの個体は、GVHDおよびその他の望ましくない免疫的な影響を避けるためにHLAが一致され得る。レシピエント個体への投与のための改変されたT細胞の好適な集団は、ドナー個体から得られたT細胞の初期の集団を準備するステップ、T細胞を改変してレシピエント個体のがん細胞に特異的に結合するCoStARを発現させるステップ、ならびに改変されたT細胞を培養するステップを含む方法によって生成され得る。
改変されたT細胞の投与に続いて、レシピエント個体はレシピエント個体のがん細胞に対するT細胞媒介免疫応答を呈する。これはその個体におけるがんの状態に対して有益な効果を有する。
がんの状態は悪性がん細胞の異常な増殖によって特徴付けられ、AML、CML、ALL、およびCLL等の白血病、ホジキンリンパ腫、非ホジキンリンパ腫、および多発性骨髄腫等のリンパ腫、ならびに肉腫、皮膚がん、黒色腫、膀胱がん、脳がん、乳がん、子宮がん、卵巣がん、前立腺がん、肺がん、結腸直腸がん、頸がん、肝がん、頭頚部がん、食道がん、膵がん、腎がん、副腎がん、胃がん、睾丸がん、胆嚢および胆管のがん、甲状腺がん、胸腺がん、骨のがん、および脳がん等の固形がん、ならびに原発巣不明のがん(CUP)を含み得る。
個体内のがん細胞は個体の正常な体細胞からは免疫学的に区別され得る(即ち、がん腫瘍は免疫原性であり得る)。例えば、がん細胞は個体内において、がん細胞によって発現される1つまたは複数の抗原に対して全身的免疫応答を誘発することができる。免疫応答を誘発する腫瘍抗原はがん細胞に特異的であってよく、またはその個体の1つもしくは複数の正常細胞によって共有され得る。
上記の治療に適した個体は哺乳動物、例えばげっ歯類(例えばモルモット、ハムスター、ラット、マウス)、ネズミ科(例えばマウス)、イヌ科(例えばイヌ)、ネコ科(例えばネコ)、ウマ科(例えばウマ)、霊長類、類人猿(例えばサルまたはエイプ)、サル(例えばマーモセット、ヒヒ)、エイプ(例えばゴリラ、チンパンジー、オランウータン、ギボン)、またはヒトであってよい。
好ましい実施形態では、個体はヒトである。他の好ましい実施形態では、非ヒト哺乳動物、特にヒトにおける治療効果を示すためのモデルとして従来から使用されている哺乳動物(例えばネズミ科、霊長類、ブタ科、イヌ科、またはウサギ科の動物)が採用され得る。
治療の方法
用語「治療有効量」は、個体における疾患または障害を「治療する」ために有効な本明細書で開示したCoStARまたはCoStARを含む組成物の量を指す。がんの場合には、治療有効量の本明細書で開示したCoStARまたはCoStARを含む組成物は、がん細胞の数を低減させ、腫瘍の大きさもしくは質量を低減させ、周囲臓器へのがん細胞の浸潤を阻止し(即ち、ある程度遅延させ、好ましくは停止させ)、腫瘍の転移を阻止し(即ち、ある程度遅延させ、好ましくは停止させ)、腫瘍の成長をある程度阻止し、および/またはがんに付随する症状の1つまたは複数をある程度緩和することができる。本明細書で開示したCoStARまたはCoStARを含む組成物は、存在するがん細胞の成長を防止しおよび/または殺滅することができる程度に、細胞増殖抑制性および/または細胞傷害性であり得る。一部の実施形態では、治療有効量は増殖阻止量である。一部の実施形態では、治療有効量は患者の無増悪生存率を改善する量である。ウイルス感染のような感染性疾患の場合には、治療有効量の本明細書で開示したCoStARまたはCoStARを含む組成物は、病原体に感染した細胞の数を低減し、病原体に誘導された抗原の生成もしくは放出を低減し、未感染細胞への病原体の拡散を阻止し(即ち、ある程度遅延させ、好ましくは停止させ)、および/または感染に付随する1つまたは複数の症状をある程度緩和することができる。一部の実施形態では、治療有効量は患者の生存を延長する量である。
本発明の方法における使用のためのCoStARを発現するT細胞およびNK細胞を含む細胞は、患者自身の末梢血から(自己)、またはドナー末梢血からの造血幹細胞移植の設定で(同種)、または関係のないドナーからの末梢血から(同種)、ex vivoで創成され得る。あるいは、T細胞またはNK細胞は、誘起可能な前駆細胞または胚前駆細胞のT細胞またはNK細胞へのex vivo分化によって誘導され得る。これらの場合には、CoStARならびに任意にCARおよび/またはTCRを発現するT細胞は、ウイルスベクターによる形質導入、DNAもしくはRNAによるトランスフェクションを含む多くの手段の1つによって、CoStARならびに任意にCARおよび/またはTCRをコードするDNAまたはRNAを導入することによって、産生される。
本発明のCoStARを発現し、かつ任意にTCRおよび/またはCARを発現するT細胞またはNK細胞は、血液がんまたは固形腫瘍の治療に使用され得る。
疾患を治療する方法は、本発明のベクターまたはT細胞もしくはNK細胞を含む細胞の治療用途に関する。これに関して、ベクターまたはT細胞もしくはNK細胞は、疾患に関連する少なくとも1つの症状を減少させ、低減し、または改善するために、および/または疾患の進行を遅らせ、低減し、または阻止するために、存在する疾患または状態を有する対象に投与され得る。本発明の方法は、T細胞に媒介されるがん細胞の殺滅を惹起しまたは促進し得る。本発明によるベクターまたはT細胞もしくはNK細胞は、1つまたは複数のさらなる治療剤とともに、患者に投与され得る。1つまたは複数のさらなる治療剤は、患者に共投与され得る。「共投与」は、1つまたは複数のさらなる治療剤と本発明のベクターまたはT細胞もしくはNK細胞を時間的に十分近く投与し、それによりベクターまたはT細胞もしくはNK細胞が1つまたは複数のさらなる治療剤の効果を増強し得るようにすること、またはその逆を意味する。これに関し、ベクターまたは細胞を最初に投与し、1つまたは複数のさらなる治療剤を2番目に投与すること、またはその逆ができる。あるいは、ベクターまたは細胞と1つまたは複数のさらなる治療剤とを同時に投与することができる。1つの共投与される有用な治療剤はIL-2である。それは、現在の細胞療法において投与された細胞の活性を強化するためにこれが現在使用されているからである。しかし、IL-2治療には毒性および耐性の問題が付随している。
既述のように、患者への投与については、CoStARエフェクター細胞は患者にとって同種または自己であり得る。ある特定の実施形態では、同種細胞は、GVHDおよび/またはCoStAR細胞に対する患者の免疫応答を最小化または防止するために、例えば遺伝子編集によってさらに遺伝子改変される。
CoStARエフェクター細胞は、標的抗原に関連するがんおよび新生物疾患を治療するために使用される。本明細書に記載した方法のいずれかを使用して治療され得るがんおよび新生物疾患には、血管新生されていない腫瘍、まだ実質的に血管新生されていない腫瘍、ならびに血管新生された腫瘍が含まれる。がんは非固形腫瘍(血液系腫瘍、例えば白血病およびリンパ腫)を含み、または固形腫瘍を含み得る。本発明のCoStARエフェクター細胞によって治療されるべきがんの型には、それだけに限らないが、癌腫、芽細胞腫、および肉腫、ならびにある種の白血病またはリンパ性悪性疾患、良性および悪性の腫瘍、ならびに悪性疾患、例えば肉腫、癌腫、および黒色腫が含まれる。成人の腫瘍/がんおよび小児の腫瘍/がんも含まれる。
血液系のがんは、血液または骨髄のがんである。血液系(または造血系)のがんには、急性白血病(急性リンパ性白血病、急性骨髄球性白血病、急性骨髄性白血病、ならびに骨髄芽球性、前骨髄球性、骨髄単球性、単球性、および赤血球性の白血病等)、慢性白血病(慢性骨髄球性(顆粒球性)白血病、慢性骨髄性白血病、および慢性リンパ球性白血病等)を含む白血病、真性赤血球増加症、リンパ腫、ホジキン病、非ホジキンリンパ腫(不活性および高悪性度の形態)、多発性骨髄腫、形質細胞腫、ワルデンストロームのマクログロブリン血症、重鎖疾患、骨髄異形成症候群、ヘアリー細胞白血病、および骨髄異形成が含まれる。
固形腫瘍は、通常は嚢胞または液体区域を含まない異常な組織の塊である。固形腫瘍は良性または悪性であり得る。様々な型の固形腫瘍がそれらを形成する細胞の型によって命名されている(肉腫、癌腫、およびリンパ腫等)。肉腫および癌腫等の固形腫瘍の例には、副腎皮質癌、胆管癌、線維肉腫、粘液肉腫、脂肪肉腫、軟骨肉腫、骨肉腫、およびその他の肉腫、滑液腫瘍、中皮腫、エウィング腫瘍、平滑筋肉腫、横紋筋肉腫、結腸癌、胃がん、リンパ系悪性腫瘍、膵がん、乳がん、肺がん、卵巣がん、前立腺がん、幹細胞癌、扁平上皮細胞癌、基底細胞癌、腺癌、汗腺癌、甲状腺がん(例えば髄様甲状腺癌および乳頭甲状腺癌)、褐色細胞腫、脂肪腺癌、乳頭癌、乳頭腺癌、髄様癌、気管支癌、腎細胞癌、肝癌、胆管癌、絨毛癌、ウィルムズ腫瘍、頸がん(例えば頸癌および前侵襲性頸部異形成)、結腸直腸がん、肛門、肛門管、もしくは肛門直腸のがん、膣がん、陰門のがん(例えば扁平上皮細胞癌、上皮内癌、腺癌、および線維肉腫)、陰茎がん、口腔咽頭がん、食道がん、頭部がん(例えば扁平上皮細胞癌)、頸部がん(例えば扁平上皮細胞癌)、睾丸がん(例えば精上皮腫、奇形腫、胎児性癌、奇形癌、絨毛腫、肉腫、ライディッヒ細胞腫瘍、線維腫、線維腺腫、腺腫様腫瘍、および脂肪腫)、膀胱癌、腎がん、黒色腫、子宮のがん(例えば内膜癌)、尿路上皮がん(例えば扁平上皮細胞癌、移行細胞癌、腺癌、尿管がん、および尿膀胱がん)、ならびにCNS腫瘍(例えば神経膠腫(脳幹神経膠腫および混合神経膠腫等)、神経膠芽腫(多形性膠芽腫としても知られている)、星状細胞腫、CNSリンパ腫、胚細胞腫、髄芽細胞腫、神経鞘腫、クラニオファリンジオーマ、上衣細胞腫、松果体腫、血管芽細胞腫、聴神経腫、乏突起膠腫、メナンジオーマ、神経芽腫、網膜芽細胞腫、および脳転移)が含まれる。
「免疫学的有効量」、「抗腫瘍有効量」、「腫瘍阻止有効量」、または「治療量」が指示された場合には、投与すべき本発明の組成物の正確な量は、患者(対象)の年齢、体重、腫瘍の大きさ、感染もしくは転移の程度、および状態における個人差を考慮して、医師によって決定され得る。本明細書に記載したT細胞を含む医薬組成物は、これらの範囲内のすべての整数値を含んで体重1kgあたり104~109細胞、一部の場合には体重1kgあたり105~106細胞の用量で投与できることが一般に述べられる。T細胞組成物はこれらの用量で複数回、投与してもよい。細胞は免疫療法において一般に知られている注入手法を使用して投与することができる(例えばRosenberg et al., New Eng. J. of Med. 319:1676, 1988を参照されたい)。
組合せ療法
本明細書に記載したCoStARを発現している細胞は、他の公知の薬剤および療法と組み合わせて使用してよい。本明細書で使用される場合、「組み合わせて」投与されることは、2つ(またはそれ以上)の異なる治療が、障害による対象の苦痛の経過の間に対象に送達されること、例えば2つまたはそれ以上の治療が、対象がその障害を有していると診断された後、かつその障害が治癒されもしくは除去される前または治療が他の理由によって中止される前に、送達されることを意味する。一部の実施形態では、1つの治療の送達は第2の治療の送達が始まる際にまだ行なわれており、そのため投与に関して重複がある。これは本明細書において「同時」または「並行送達」と称する場合がある。他の実施形態では、1つの治療の送達は、他の治療の送達が始まる前に終わる。いずれの場合の一部の実施形態でも、組合せ投与であるので治療はより効果的である。例えば、第2の治療はより効果的であり、例えば第2の治療を少なくしても等価の効果が見られ、あるいは、第2の治療は、第1の治療なしに第2の治療が与えられた場合、または第1の治療で類似の状況が見られた場合に見られるよりも大幅に症状を低減する。一部の実施形態では、送達は、症状または障害に関連する他のパラメーターの低減が他の治療なしに1つの治療が送達された場合に観察されるよりも大きくなるようなものである。2つの治療の効果は、部分的に相加的、完全に相加的、または相加的よりも大きいことがある。送達は、送達された第1の治療の効果が、第2の治療が送達されたときにまだ検出可能であるようなものであってよい。
本明細書に記載したCoStAR発現細胞と少なくとも1つのさらなる治療剤とは、同時に、同じもしくは個別の組成物中で、または逐次的に、投与することができる。逐次的投与のため、本明細書に記載したCAR発現細胞を最初に投与し、さらなる薬剤を2番目に投与することができ、投与の順序を逆にすることもできる。
CoStAR療法および/またはその他の治療剤、手順、もしくは手段は、活性な障害の期間の間に、または寛解もしくはより不活性な疾患の期間の間に、投与することができる。CoStAR療法は、他の治療の前に、治療と同時に、治療の後に、または障害の寛解の間に、投与することができる。
組み合わせて投与する場合は、本療法およびさらなる薬剤(例えば第2または第3の薬剤)、またはそのすべては、個別に例えば単独療法として使用するそれぞれの薬剤の量または用量より多く、少なく、または等しい量または用量で投与してよい。ある特定の実施形態では、CoStAR療法、さらなる薬剤(例えば第2または第3の薬剤)、またはそのすべての投与される量または用量は、個別に例えば単独療法として使用するそれぞれの薬剤の量または用量より(例えば少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%、または少なくとも50%)少ない。他の実施形態では、所望の効果(例えばがんの治療)をもたらすCoStAR療法、さらなる薬剤(例えば第2または第3の薬剤)、またはそのすべての量または用量は、同じ治療効果を達成するために必要な、個別に例えば単独療法として使用するそれぞれの薬剤の量または用量より(例えば少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%、または少なくとも50%)少ない。
さらなる態様では、本明細書に記載したCoStAR発現細胞は、手術、化学療法、放射線、シクロスポリン、アザチオプリン、メトトレキサート、ミコフェノレート、およびFK506等の免疫抑制剤、抗体、またはCAMPATH、抗CD3抗体、もしくは他の抗体療法等の他の免疫切除剤、サイトキシン、フルダラビン、シクロスポリン、FK506、ラパマイシン、ミコフェノール酸、ステロイド、FR901228、サイトカイン、ならびに放射線、Izumoto et al. 2008 J Neurosurg 108:963-971に記載されているようなペプチドワクチンと組み合わせた治療レジメンにおいて使用し得る。
ある特定の例では、本発明の化合物は、他の抗がん剤、抗アレルギー剤、抗吐剤(または抗嘔吐剤)、疼痛軽減剤、細胞保護剤、およびそれらの組合せ等の他の治療剤と組み合わせられる。
一実施形態では、本明細書に記載したCoStAR発現細胞は、化学療法剤と組み合わせて使用することができる。例示的な化学療法剤には、アンスラサイクリン(例えばドキソルビシン(例えばリポソーマルドキソルビシン))、ビンカアルカロイド(例えばビンブラスチン、ビンクリスチン、ビンデシン、ビノレルビン)、アルキル化剤(例えばシクロホスファミド、デカルバジン、メルファラン、イフォスファミド、テモゾロミド)、免疫細胞抗体(例えばアレムツザマブ、ゲムツズマブ、リツキシマブ、オファツムマブ、トシツモマブ、ブレンツキシマブ)、代謝拮抗物質(例えば葉酸アンタゴニスト、ピリミジンアナログ、プリンアナログ、およびアデノシンデアミナーゼ阻害剤(例えばフルダラビン)を含む)、mTOR阻害剤、TNFRグルココルチコイド誘起TNFR関連タンパク質(GITR)アゴニスト、プロテアソーム阻害剤(例えばアクラシノマイシンA、グリオトキシン、またはボルテゾミブ)、サリドマイドもしくはサリドマイド誘導体(例えばレナリドマイド)等の免疫調節剤が含まれる。
組合せ療法における使用のために考慮される一般的な化学療法剤には、ブスルファン(Myleran(登録商標))、ブスルファン注射剤(Busulfex(登録商標))、クラドリビン(Leustatin(登録商標))、シクロホスファミド(Cytoxan(登録商標)またはNeosar(登録商標))、シタラビン、シトシンアラビノシド(Cytosar-U(登録商標))、シタラビンリポソーム注射剤(DepoCyt(登録商標))、ダウノルビシン塩酸(Cerubidine(登録商標))、ダウノルビシンシトラートリポソーム注射剤(DaunoXome(登録商標))、デキサメタゾン、ドキソルビシン塩酸(Adriamycin(登録商標)、Rubex(登録商標))、エトポシド(Vepesid(登録商標))、フルダラビンリン酸(Fludara(登録商標))、ヒドロキシ尿素(Hydrea(登録商標))、イダルビシン(Idamycin(登録商標))、ミトキサントロン(Novantrone(登録商標))、ゲムツズマブオゾガマイシン(mylotarg(登録商標))が含まれる。
実施形態では、組合せ療法における使用のために考慮される一般的な化学療法剤には、アナストロゾール(Arimidex(登録商標))、ビカルタミド(Casodex(登録商標))、ブレオマイシン硫酸(Blenoxane(登録商標))、ブスルファン(Myleran(登録商標))、ブスルファン注射剤(Busulfex(登録商標))、カペシタビン(Xeloda(登録商標))、N4-ペントキシカルボニル-5-デオキシ-5-フルオロシチジン、カルボプラチン(Paraplatin(登録商標))、カルムスチン(BiCNU(登録商標))、クロラムブシル(Leukeran(登録商標))、シスプラチン(Platinol(登録商標))、クラドリビン(Leustatin(登録商標))、シクロホスファミド(Cytoxan(登録商標)またはNeosar(登録商標))、シタラビン、シトシンアラビノシド(Cytosar-U(登録商標))、シタラビンリポソーム注射剤(DepoCyt(登録商標))、ダカルバジン(DTIC-Dome(登録商標))、ダクチノマイシン(Actinomycin D、Cosmegan)、ダウノルビシン塩酸(Cerubidine(登録商標))、ダウノルビシンシトラートリポソーム注射剤(DaunoXome(登録商標))、デキサメタゾン、ドセタキセル(Taxotere(登録商標))、ドキソルビシン塩酸(Adriamycin(登録商標)、Rubex(登録商標))、エトポシド(Vepesid(登録商標))、フルダラビンリン酸(Fludara(登録商標))、5-フルオロウラシル(Adrucil(登録商標)、Efudex(登録商標))、フルタミド(Eulexin(登録商標))、テザシチビン、ゲムシタビン(ジフルオロデオキシシチジン)、ヒドロキシ尿素(Hydrea(登録商標))、イダルビシン(Idamycin(登録商標))、イフォスファミド(IFEX(登録商標))、イリノテカン(Camptosar(登録商標))、L-アスパラギナーゼ(ELSPAR(登録商標))、ロイコボリンカルシウム、メルファラン(Alkeran(登録商標))、6-メルカプトプリン(Purinethol(登録商標))、メトトレキサート(Folex(登録商標))、ミトキサントロン(Novantrone(登録商標))、ミロタルグ、パクリタキセル(Taxol(登録商標))、フェニックス(イットリウム90/MX-DTPA)、ペントスタチン、ポリフェプロサン20とカルムスチンインプラント(Gliadel(登録商標))、タモキシフェンシトラート(Nolvadex(登録商標))、テニポシド(Vumon(登録商標))、6-チオグアニン、チオテパ、チラパザミン(Tirazone(登録商標))、トポテカン塩酸注射用(Hycamptin(登録商標))、ビンブラスチン(Velban(登録商標))、ビンクリスチン(Oncovin(登録商標))、およびビノレルビン(Navelbine(登録商標))が含まれる。
治療は、例えば腫瘍の退縮、腫瘍の質量もしくは寸法の縮小、進行の時間、生存の継続期間、無増悪生存率、全体の応答速度、応答の継続期間、生活の質、タンパク質の発現、および/または活性によって評価することができる。例えば放射線イメージングによる応答の測定を含む、治療の有効性を判定するアプローチを採用することができる。
本発明を以下の非限定的な節においてさらに説明する。
1.腫瘍関連抗原特異的結合ドメインと融合させた完全長の共刺激受容体を含むキメラ共刺激受容体(CoStAR)であって、完全長が、リーダー配列を欠き成熟タンパク質のN最末端における5アミノ酸までの欠失または変異を有する成熟タンパク質全体を意味しており、プロセスが共刺激ドメインのキメラ受容体への最適のスプライシングのために重要である、キメラ共刺激受容体。
2.前記共刺激受容体が、CD2、CD9、CD26、CD27、CD28、CD29、CD38、CD40、CD43、CD46、CD49d、CD55、CD73、CD81、CD82、CD99、CD100、CD134(OX40)、CD137(41BB)、CD150(SLAM)、CD270(HVEM)、CD278(ICOS)、CD357(GITR)、またはEphB6の群から選択される、節1に記載のCoStAR。
3.共刺激ドメインが、単一の受容体フォーマットと融合させた2つ以上の共刺激受容体ドメインからなり、結合領域が、直接融合であるか、または長さが50アミノ酸までのリンカー等のリンカー領域を含む、節1または2に概略を示したCoStAR融合受容体。
4.前記抗原特異的結合ドメインが、
I.癌胎児性抗原(CEA)、5T4、メラノトランスフェリン(CD228)、黒色腫関連コンドロイチン硫酸プロテオグリカン(MCSP/CSPG4)、CD71、葉酸受容体、もしくはCA125を含むがこれらに限定されない腫瘍関連抗原に結合する一本鎖抗体断片、または
II.腫瘍特異的ペプチド(p)-主要組織適合性(MHC)複合体に結合する一本鎖抗体断片、または
III.腫瘍特異的pMHC複合体抗原特異的一本鎖T細胞受容体(scTCR)、または
IV.トランスフェリン等であるがこれに限定されない天然の抗原結合性ポリペプチド、または
V.抗体に結合するドメイン(例えばCD16、CD32、またはCD64等であるがこれらに限定されないFc結合ドメイン)、またはその他の抗原認識の間接的な方法
から誘導される、節1~3のいずれか1項に記載のCoStAR。
5.マーカー遺伝子(例えばDYKDDDDK(配列番号14)エピトープタグ、CD34、CD19等)、キメラ抗原受容体(CAR)、T細胞受容体(TCR)、または養子細胞療法のための免疫療法用の別の受容体等の目的のタンパク質(POI)と融合っせた、節1~4のいずれか1項に記載のポリペプチドを含む融合タンパク質。
6.前記ポリペプチドと前記目的のタンパク質との間に自己切断性ペプチドを含む、節5に記載の融合タンパク質。
7.I.節1および2に記載の、例えば配列番号2で示されるもの、もしくはタンパク質レベルで少なくとも80%の配列同一性を有するそのバリアントなどのポリペプチドをコードすることができる配列番号1で示されるもの、または
II.節5に記載の、例えば配列番号3~12で示されるもの、もしくはタンパク質レベルで少なくとも80%の配列同一性を有するそのバリアント等のペプチドと融合させた配列番号2に示されるものなどの、融合タンパク質、
などの核酸配列。
8.節7に記載の核酸配列を含むベクター。
9.目的のトランスジーンも含む、節8に記載のベクター。
10.前記ベクターが標的細胞に形質導入するために使用される場合に、前記標的細胞が、節1に記載のポリペプチドとキメラ抗原受容体、T細胞受容体、もしくは免疫療法目的の別の受容体とを共発現するように、目的のトランスジーンが、キメラ抗原受容体、T細胞受容体、もしくは養子細胞療法のための免疫療法用の別の受容体をコードする、節9に記載のベクター。
11.節1に記載のポリペプチドを発現する細胞。
12.節1に概略を示したポリペプチドとPOIを細胞表面で共発現する、節11に記載の細胞。
13.節7に記載の核酸配列を含む細胞。
14.T細胞である、節11~13のいずれか1項に記載の細胞。
15.節8~10のいずれか1項に記載のベクターを細胞に形質導入またはトランスフェクトするステップを含む、節11~14のいずれか1項に記載の細胞を作成する方法。
16.POIを発現する細胞を選択する方法であって、
I.節10に記載のベクターをトランスフェクトまたは形質導入した細胞の表面におけるPOIエピトープの発現を検出するステップ、および
II.前記POIエピトープを発現すると同定される細胞を選択するステップ
を含む、方法。
17.POIを発現する細胞が富化された、精製された細胞の集団を調製する方法であって、
節16に記載の方法を使用して、細胞の集団からPOIを発現する細胞を選択するステップを含む、方法。
18.組織または細胞のドナーから単離された細胞の集団に、ex vivoで、
I.節7に記載のベクターを、形質導入またはトランスフェクトするステップ、および
II.節16に記載の方法によって、前記形質導入/トランスフェクトされた細胞の集団から前記POIを発現する細胞を選択するステップ
を含む、節17に記載の方法。
19.節1に記載のポリペプチドを発現する細胞が富化された、したがって、POIを発現する細胞が富化された、細胞集団。
20.形質導入された細胞をin vivoにおいて追跡する方法であって、前記細胞の表面における節1に記載のポリペプチドの発現を検出するステップを含む、方法。
21.対象における疾患を治療する方法であって、節11~14のいずれか1項に記載の細胞または節19に記載の細胞集団を対象に投与するステップを含む、方法。
22.I.節9に記載のベクターを対象から単離した細胞の試料に形質導入またはトランスフェクトするステップ、および
II.形質導入/トランスフェクトされた細胞を患者に返すステップ
を含む、節21に記載の方法。
23.がんを処置するための、節22に記載の方法。
24.養子細胞移植における使用のための、節11~14のいずれか1項に記載の細胞または節19に記載の細胞集団。
25.節4に記載の腫瘍関連抗原結合性ドメインからなるCoStAR受容体であって、
I.配列番号2で示されるもの、またはタンパク質レベルで少なくとも80%の配列同一性を有するそのバリアント等の、完全長のヒトCD28からなる融合シグナル伝達ドメイン、および
II.配列番号4で示されるもの、またはタンパク質レベルで少なくとも80%の配列同一性を有するそのバリアント等の、ヒトCD137からの細胞内ドメイン
と融合させた、CoStAR受容体。
26.節4に記載の腫瘍関連抗原結合性ドメインからなるCoStAR受容体であって、
I.配列番号2で示されるもの、またはタンパク質レベルで少なくとも80%の配列同一性を有するそのバリアント等の、完全長のヒトCD28からなる融合シグナル伝達ドメイン、および
II.配列番号5で示されるもの、またはタンパク質レベルで少なくとも80%の配列同一性を有するそのバリアント等の、ヒトCD134からの細胞内ドメイン
と融合させた、CoStAR受容体。
27.節4に記載の腫瘍関連抗原結合性ドメインからなるCoStAR受容体であって、
I.配列番号2で示されるもの、またはタンパク質レベルで少なくとも80%の配列同一性を有するそのバリアント等の、完全長のヒトCD28からなる融合シグナル伝達ドメイン、および
II.配列番号6で示されるもの、またはタンパク質レベルで少なくとも80%の配列同一性を有するそのバリアント等の、ヒトCD2からの細胞内ドメイン
と融合させた、CoStAR受容体。
28.節4に記載の腫瘍関連抗原結合性ドメインからなるCoStAR受容体であって、
I.配列番号2で示されるもの、またはタンパク質レベルで少なくとも80%の配列同一性を有するそのバリアント等の、完全長のヒトCD28からなる融合シグナル伝達ドメイン、および
II.配列番号7で示されるもの、またはタンパク質レベルで少なくとも80%の配列同一性を有するそのバリアント等の、ヒトCD29からの細胞内ドメイン
と融合させた、CoStAR受容体。
29.節4に記載の腫瘍関連抗原結合性ドメインからなるCoStAR受容体であって、
I.配列番号2で示されるもの、またはタンパク質レベルで少なくとも80%の配列同一性を有するそのバリアント等の、完全長のヒトCD28からなる融合シグナル伝達ドメイン、および
II.配列番号8で示されるもの、またはタンパク質レベルで少なくとも80%の配列同一性を有するそのバリアント等の、ヒトGITRからの細胞内ドメイン
と融合させた、CoStAR受容体。
30.節4に記載の腫瘍関連抗原結合性ドメインからなるCoStAR受容体であって、
I.配列番号2で示されるもの、またはタンパク質レベルで少なくとも80%の配列同一性を有するそのバリアント等の、完全長のヒトCD28からなる融合シグナル伝達ドメイン、および
II.配列番号9で示されるもの、またはタンパク質レベルで少なくとも80%の配列同一性を有するそのバリアント等の、ヒトIL2Rγからの細胞内ドメイン
と融合させた、CoStAR受容体。
31.節4に記載の腫瘍関連抗原結合性ドメインからなるCoStAR受容体であって、
I.配列番号2で示されるもの、またはタンパク質レベルで少なくとも80%の配列同一性を有するそのバリアント等の、完全長のヒトCD28からなる融合シグナル伝達ドメイン、および
II.配列番号10で示されるもの、またはタンパク質レベルで少なくとも80%の配列同一性を有するそのバリアント等の、ヒトCD40からの細胞内ドメイン
と融合させた、CoStAR受容体。
32.節4に記載の腫瘍関連抗原結合性ドメインからなるCoStAR受容体であって、
I.配列番号2で示されるもの、またはタンパク質レベルで少なくとも80%の配列同一性を有するそのバリアント等の、完全長のヒトCD28からなる融合シグナル伝達ドメイン、および
II.配列番号11で示されるもの、またはタンパク質レベルで少なくとも80%の配列同一性を有するそのバリアント等の、ヒトCD150からの細胞内ドメイン
と融合させた、CoStAR受容体。
33.節4に記載の腫瘍関連抗原結合性ドメインからなるCoStAR受容体であって、
I.配列番号2で示されるもの、またはタンパク質レベルで少なくとも80%の配列同一性を有するそのバリアント等の、完全長のヒトCD28からなる融合シグナル伝達ドメイン、および
II.配列番号12で示されるもの、またはタンパク質レベルで少なくとも80%の配列同一性を有するそのバリアント等の、ヒトCD2およびヒトCD40からの細胞内ドメイン
と融合させた、CoStAR受容体。
本発明は、以下の非限定的実施例でさらに実証される。
(実施例1)
CoStARを発現するT細胞の作製
材料および方法
構築物設計-MFE23 CoStARは、全体のヒトCD28核酸配列と融合させているオンコスタチンM1リーダー配列を有する、MFE23由来の単鎖抗体断片ヌクレオチド配列からなる。CoStARヌクレオチド配列はコドン最適化され、遺伝子はGenewiz社によって合成された。構築物は、XbaIおよびNheI部位を通して、pSF.Lenti(Oxford Genetics)にクローニングした。
レンチウイルス作製-レンチウイルス作製は、各プラスミド10μgと導入遺伝子を含有するpSF.Lentiレンチウイルスプラスミド10μgとを、50mM CaCl2を含有する無血清RPMIの中で一緒に混合することによって、3プラスミドパッケージングシステム(Cell Biolabs、San Diego、USA)を使用して実行した。混合物は、75cm2フラスコの中の293T細胞の50%集密単層に滴下した。トランスフェクションの48および72時間後にウイルス上清を収集し、プールし、LentiPacレンチウイルス上清濃縮(GeneCopoeia、Rockville、Maryland、USA)溶液を製造業者の使用説明書通りに使用して濃縮した。レンチウイルス上清を10倍に濃縮し、4μg/mlポリブレン(Sigma-Aldrich、Dorset、UK)の存在下で一次ヒトT細胞を直接的に感染させるために使用した。末梢血単核細胞を正常健康なドナーから単離し、その後製造業者の使用説明書によりT細胞活性化および増量ビーズ(Invitrogen)で24時間活性化し、その後レンチウイルス上清を加えた。
CEA.hFcタンパク質および抗hFc-PE二次抗体と抗CD34-APCを使用して、または抗CD34-PE抗体だけによって、感染の96時間後に細胞の形質導入を調査した。次に、1μg/ml PHAおよび200IU/ml IL-2を添加したRPMI+10%FCS中で×10のドナーミスマッチ照射PBMCフィーダーを1:20~1:200比で使用して、細胞をさらに増量した。14日後に、細胞を以前のように染色し、アッセイで使えるように保存した。
CoStARに陽性または陰性の細胞を野生型またはOKT3工学操作CEA陽性LoVoまたはLS174T細胞と混合することによって、機能アッセイを実行した。簡潔には、T細胞を96ウェルプレートの中で様々な比のLoVo細胞と混合し、IFNγまたはIL-2をELISAによって測定した。残りの細胞は、1:10希釈のWST-1試薬(Sigma、UK)と30分間インキュベートし、その後450nmで吸光度を読み取った。細胞傷害%は、以下の式=100-((実験読取値-T細胞単独)/(腫瘍単独)×100を使用して決定した。
最初に1×107細胞数/mlの濃度でT細胞に10μM eFluor450増殖色素(eBioscience、UK)を37℃で10分間ロードし、その後細胞を5容量の冷T細胞培地と氷上で5分間インキュベートすることによって増殖アッセイを実行した。次に未結合の色素を取り除くために細胞を過度に洗浄し、腫瘍細胞を含有する共培養に加えた。2、6および10日目に細胞を取り出し、1:200希釈のDRAQ7を加え、MACSQuantサイトメーターおよびMACSQuantifyソフトウェアを使用して細胞を分析した。
増殖アッセイのための細胞計数は、細胞をウェルから取り出し、抗CD2 PerCP eFluor710抗体(eBioscience、UK)により暗所で20分間染色し、続いてDRAQ7で染色することによって実行し、MACSQuant分析装置を使用して計数した。
結果-一次ヒトT細胞は、NHSBTから得得られたバフィーコートから単離した。T細胞は、Ficoll媒介単離およびT細胞の負単離キット(StemCell Technologies)によって単離した。単離したT細胞は、ヒトT細胞活性化および増量ビーズ(Invitrogen、UK)で活性化した。細胞を濃縮したレンチウイルス粒子とインキュベートし、数日にわたって増量した。レンチウイルスは、MFE.CoStAR.2A.tCD34構築物のDNA配列を含有した(2A切断配列を通してトランケーションされたヒトCD34と同時発現される完全長ヒトCD28と融合させているMFE23.scFv)。首尾よく形質導入された細胞は、材料および方法で概説される照射フィーダーを使用してさらに増量した。ドナー1の形質導入は22.69%(17.15のCD34+/CoStAR+プラス5.53%のCD34-/CoStAR+)と測定され、ドナー2は20.73%と測定され、ドナー3は13.34%と測定された。90%を超えてCoStAR陽性であるT細胞集団を得るために、抗CD34抗体を使用してCoStAR発現のために細胞を富化した。
T細胞活性に及ぼすCoStARの影響を試験するために生理的に関連するin vitroモデルを生成するために、非形質導入および形質導入細胞をCEA+腫瘍細胞系LoVoおよびLS174Tに対して試験した。マッチしない腫瘍系に応答したT細胞の活性化を可能にするために、フローサイトメトリーを使用して形質導入細胞を可視化するために、IRESエレメントを使用して、合成膜貫通ドメインを通して細胞膜に固着し、GFPマーカー遺伝子から分断される抗CD3単鎖抗体断片を発現するように、我々は腫瘍細胞を工学操作した。
LoVoおよびLS174Tの単細胞クローンを、バルクトランスフェクタントから生成した。非形質導入およびCoStAR形質導入T細胞を、様々なエフェクター対標的比で野生型非形質導入またはOKT3工学操作LS174TまたはLoVo細胞と混合した。24時間後に、IL-2 ELISA測定のために共培養培地をとった。3人のドナーからのCoStAR+およびCoStAR-T細胞集団から、OKT3工学操作LS174T細胞に応答して活性化依存性IL-2分泌が観察され、非工学操作腫瘍細胞に応答した形質導入および非形質導入T細胞からはバックグラウンドIL-2分泌だけが見られた(図3A~C)。OKT3工学操作腫瘍細胞に対するCoStAR強化IL-2分泌は、試験した全ての3人のドナーで見出された。効果は8:1および16:1のE:T比で最も明白であったが、より高いE:T比ではIL-2分泌は正確に測定するには低すぎた。より低いエフェクター対標的比では、IL-2分泌は非形質導入細胞から飽和していたようであった。これらの観察はLoVo細胞で繰り返され、3人のドナーのうちの2人はLS174Tに対して試験され、結果は類似していた(図3DとE)。
T細胞増量に及ぼすCoStARの影響を決定するために、形質導入または非形質導入T細胞を野生型またはOKT3-GFP工学操作LoVo細胞と混合し、3日後の全細胞数を数えた。CoStARは、IL-2の存在下(図4A)およびIL-2の不在下(図4B)で、野生型LoVo細胞でなくLoVo-OKT3に応答した工学操作T細胞の生存および/または増殖を強化した。この現象をさらに調査するために、6日間に各集団が経た細胞周期の数を数えるために、増殖色素を使用して2人のドナーからのT細胞で細胞増殖分析を実行した(図4CとD)。非工学操作細胞と比較して、LoVo-OKT3に応答して6日間にCoStAR工学操作細胞のより大きな割合が5、6または7増殖周期を経たが、CoStAR形質導入および非形質導入細胞は野生型LoVoに応答して同じ期間に平均概ね2周期を経た。
N末端の追加の共刺激ドメインと融合させているCD28からなる様々な融合受容体を作製した。CD137、CD2、CD29、CD134、CD150、CD40、GITRから得られた共刺激ドメイン、およびIL-2受容体γ鎖(IL2Rγ)からのシグナル伝達ドメインを選択した。誘導可能な共刺激の以前の研究で使用されたものに近い受容体が含まれた。CD28(IEV)と命名されたこの受容体は、CD28のC末端モチーフがアミノ酸三つ組「IEV」であるようにトランケーションされる。配列がGenewizによって新規に作製され、2A自己切断ペプチドによって融合CoStARから分離されるCD34マーカー遺伝子と一緒に、EF1αプロモーターの下にレンチウイルスベクターの中にクローニングした。EasySepビーズ(StemCell Technologies)を使用して一次CD8+T細胞を単離し、抗CD3/抗CD28活性化/増量Dynabeadsで活性化し、その後レンチウイルス粒子を添加した。短い増量期間の後、細胞をLoVoまたはLoVo-OKT3細胞と混合し、抗CD107a抗体およびブレフェルジンおよびモネンシンが含まれ、16時間のインキュベーションの後に固定し、マーカー遺伝子(CD34)に対する抗体ならびにIL-2、IFNγおよびbcl-xLに対する抗体で染色した。分析は、MACSQuant分析装置およびMACSQuantifyソフトウェアを使用して実行した。図5は、CD34-(CoStAR非形質導入)およびCD34+(CoStAR形質導入)からのIL-2応答を示す。統計分析は、試験した全ての受容体が変異体CoStAR受容体を含むときにIL-2を生成する細胞の割合の有意な増加を誘導することを実証した。3つの他の読取データを同時に測定した:IFNγ、正常なシグナル1条件下で放出されるが共刺激によって増強されるサイトカイン;CD107a、脱顆粒のマーカー;およびbcl-xL、共刺激によって上方制御される抗アポトーシスタンパク質。CoStARの組込みは、分析した全てのエフェクター機能を様々な程度で増強した。CD28.CD2およびCD28.CD40融合受容体は、試験した全ての受容体のうちで最も頑強な応答を導き出すようであった(図6を参照する)。
(実施例2)
集団ベースのサイトカイン分泌に及ぼすCD28およびCD28.CD40ベースのCoStARの影響を比較した。3人のドナーからの一次T細胞を、CD28(IEV)トランケーションCoStAR、完全長CD28 CoStARまたはCD28.CD40 CoStAR(配列番号10に示す完全長CD28を有するが、N末端のNおよびK残基が欠如する)で形質導入したか、非形質導入のままであった。CD34マーカー遺伝子を使用してT細胞をCoStAR発現のために富化し、増量後、細胞をLoVo-OKT3細胞と混合し、IL-2分泌をELISAによって分析した(図7を参照する)。非形質導入細胞は平均して0.80ng/mlのIL-2を生成し、CD28(IEV)および完全長CD28CoStARはそれぞれ4.6および5.0ng/mlのIL-2を生成した。しかし、CD28.CD40は3人のドナーの平均で29.0ng/mlのIL-2を誘導し、したがって、CD40を基本的CD28ベースのCoStARに組み込むことの明らかな利点を実証する。
次に、T細胞増量に及ぼすCoStARの影響を分析した。7人のドナーからのT細胞を、抗CA125(196-14)または葉酸拮抗受容体(MOV-19)scFv、または葉酸拮抗受容体ペプチド(C7)抗原結合性ドメインを有するCD28またはCD28.CD40 CoStARで形質導入した。ミスマッチ対照として抗CEA scFvを持つCD28 CoStARで追加の細胞を形質導入した。次に、細胞を膜結合OKT3(OvCAR-OKT3)を発現するように工学操作したCA125+/葉酸受容体+/CEA-細胞系OvCAR3と混合した。7、14および21日後にT細胞数を数え、7および14日目に新鮮なOvCAR-OKT3を加えた。抗CA125 scFvを含んでいる細胞の限定的増量が観察されたが(平均増量倍率:CD28:15.1;CD28.CD40:69.1)、scFvを有する葉酸受容体を標的にする細胞はCD28およびCD28.CD40コホートの両方で増量した(平均増量倍率:CD28:186.7;CD28.CD40:1295.0)。葉酸受容体を標的にするためにC7ペプチドを使用したとき、より限定された増量が見られた(平均増量倍率:CD28:71.5;CD28.CD40:28.0)。対照のCEA標的化受容体は、限定された増量を実証した(平均増量倍率:28.0)。
シグナル1およびシグナル2の相乗効果をより良好に理解するために、T細胞をHLA-A*02の関連でCEAペプチド(691~699)を認識するマウスの定常ドメイン改変TCR、ならびに細胞表面CEAタンパク質を標的にするCD28またはCD28.CD40 CoStARで工学操作した。対照として、細胞をCA125特異的CD28 CoStARでも形質導入した。T細胞をHLA-A*02+/CEA+ H508細胞と混合し、サイトカイン生成は細胞内フローサイトメトリー染色によって分析した。マウスのTCRβ定常ドメインに対する抗体(TCR工学操作細胞をマークする)ならびにDYKDDDDK(配列番号14)エピトープタグ(CoStAR工学操作細胞をマークする)を使用して、フローサイトメトリーゲーティングを実行した。したがって、各共培養ウェルでTCR-/CoStAR-、TCR+/CoStAR-、TCR-/CoStAR+およびTCR+/CoStAR+細胞を分析することが可能であった。次に、CD4+またはCD8+T細胞においてサイトカイン生成を各亜集団でプロットした(図9)。CD4+細胞では、CD28.CD40 CoStARは、TCR刺激単独より強くCD137およびTNFα生成を増強したが、CD4+細胞におけるTCR応答は、CD8へのTCRの依存性のために劣っていた。CD8+細胞ではより頑強なエフェクター活性がIL-2であり、特にCD107aはCD28.CD40 CoStAR群でより強力な誘導を示した。受容体をより良好に比較するために、TCR+/CoStAR+群でのエフェクター活性をCD4+およびCD8+細胞でプロットした(図10)。CD4+細胞では、CD137の誘導は、CEAまたはミスマッチ標的化CD28 CoStARと比較してCD28.CD40によって有意に増強された。CD8+細胞では、CD137の誘導は、CEAまたはミスマッチ標的化CD28 CoStARと比較して有意に増加したが、CD107aの誘導は対照CoStARと比較して増加した。したがって、CD28.CD40は広い範囲のモデルおよびエフェクター活性にわたって増強されたエフェクター活性を示す。
参考文献
Figure 2022518240000003
配列
配列番号1:全体のヒトCD28mRNA転写物変異体転写物、読取り枠は太字で強調される。
遺伝子座 NM_006139 4900bp mRNA 線状 PRI 07-OCT-2016
定義 Homo sapiens CD28分子(CD28)、転写物変異体1、mRNA。
受託 NM_006139
起源
Figure 2022518240000004
Figure 2022518240000005
Figure 2022518240000006
配列番号2:ヒトCD28タンパク質配列:
I.シグナルペプチドは太字で強調される(本発明によって使用されるとき、これは配列から欠失してもよい);および
II.膜貫通領域は下線付き;および
III.細胞外領域はシグナルペプチドと膜貫通領域の間にあり、細胞質領域は膜貫通領域に続く;および
IV.ボックス領域は成熟タンパク質の最初の5アミノ酸を表し、それは本発明の任意の態様で存在するか、不在であるかまたは突然変異していてもよい。さらに、本発明により使用されるとき、これらの残基(すなわちN、K、I、LまたはV)のうちの1つ、2つ、3つ、4つまたは5つは配列から欠失してもよい。
Figure 2022518240000007
下の配列番号3~12は、CoStARシグナル伝達ドメインの模範配列であり、それは、配列番号2ボックス領域でヒトCD28タンパク質と融合させてもよい(これは突然変異していても突然変異していなくてもよいが、図の単純さのためにその原形で残した):
I.二重下線領域は、CD28由来の領域を表す;および
II.下線領域は第2の共刺激受容体由来の領域である;および
III.イタリック体の配列は、第3の共刺激受容体由来の領域である。
ボックス領域は成熟CD28タンパク質の最初の5アミノ酸を表し、それは本発明の任意の態様で存在するか、不在であるかまたは突然変異していてもよいことに留意する。さらに、本発明により使用されるとき、これらの残基(すなわちN、K、I、LまたはV)のうちの1つ、2つ、3つ、4つまたは5つは配列から欠失してもよい。
配列番号3:トランケーションされた細胞質ドメインCD28変異体
Figure 2022518240000008
配列番号4:CD28.CD137融合
Figure 2022518240000009
配列番号5:CD28.CD134融合
Figure 2022518240000010
配列番号6:CD28.CD2融合
Figure 2022518240000011
配列番号7:CD28.CD29融合
Figure 2022518240000012
配列番号8:CD28.GITR融合
Figure 2022518240000013
配列番号9:CD28.IL2Rγ融合
Figure 2022518240000014
配列番号10:CD28.CD40融合
Figure 2022518240000015
配列番号11:CD28.CD150融合
Figure 2022518240000016
配列番号12:CD28.CD2.CD40融合
Figure 2022518240000017
配列番号13:トランケーションされた細胞外ドメインCD28(IEV)変異体
Figure 2022518240000018

Claims (35)

  1. 第1の共刺激受容体の細胞外リガンド結合性断片と、シグナル伝達ドメインに連結された腫瘍関連抗原特異的結合ドメインと融合させた第2の共刺激受容体の細胞内シグナル伝達断片とを含むキメラ共刺激受容体(CoStAR)。
  2. 腫瘍関連抗原特異的結合ドメインと融合させた完全長の共刺激受容体を含み、前記共刺激受容体の完全長が、リーダー配列のない成熟タンパク質全体を含み、前記成熟タンパク質が、成熟タンパク質のN最末端に5アミノ酸までの欠失または変異を有する、請求項1に記載のCoStAR。
  3. 腫瘍関連抗原特異的結合ドメインと融合させた完全長の共刺激受容体を含むキメラ共刺激受容体(CoStAR)であって、前記共刺激受容体の完全長が、リーダー配列のない成熟タンパク質全体を含み、且つ前記成熟タンパク質が、成熟タンパク質のN最末端に5アミノ酸までの欠失または変異を有する、CoStAR。
  4. 前記共刺激受容体が、CD2、CD9、CD26、CD27、CD28、CD29、CD38、CD40、CD43、CD46、CD49d、CD55、CD73、CD81、CD82、CD99、CD100、CD134(OX40)、CD137(41BB)、CD150(SLAM)、CD270(HVEM)、CD278(ICOS)、CD357(GITR)、またはEphB6の群から選択される、請求項1~3のいずれか1項に記載のCoStAR。
  5. 共刺激ドメインが、単一の受容体フォーマットと融合させた2つ以上の共刺激受容体ドメインを含むか、またはこれらからなり、結合領域が、直接融合であるか、または長さが50アミノ酸までのリンカー等のリンカー領域を含む、請求項1~4のいずれか1項に記載のCoStAR。
  6. 前記抗原特異的結合ドメインが、
    I.癌胎児性抗原(CEA)、5T4、メラノトランスフェリン(CD228)、Her2、EGFR、GPC3、黒色腫関連コンドロイチン硫酸プロテオグリカン(MCSP/CSPG4)、CD71、SM5-1、葉酸受容体、もしくはCA125を含むがこれらに限定されない腫瘍関連抗原に結合する一本鎖抗体断片、または
    II.腫瘍特異的ペプチド(p)-主要組織適合性(MHC)複合体に結合する一本鎖抗体断片、または
    III.腫瘍特異的pMHC複合体抗原特異的一本鎖T細胞受容体(scTCR)、または
    IV.トランスフェリン等であるがこれに限定されない天然の抗原結合性ポリペプチド、または
    V.抗体に結合するドメイン(たとえばCD16、CD32、またはCD64等であるがこれらに限定されないFc結合ドメイン)、またはその他の抗原認識の間接的な方法
    から選択される、請求項1~5のいずれか1項に記載のCoStAR。
  7. マーカー遺伝子(たとえばDYKDDDDK(配列番号14)エピトープタグ、CD34、CD19等)、キメラ抗原受容体(CAR)、T細胞受容体(TCR)、または養子細胞療法のための免疫療法用の別の受容体等の目的のタンパク質(POI)と融合させた、請求項1~6のいずれか1項に記載のポリペプチドを含む融合タンパク質。
  8. 前記ポリペプチドと前記目的のタンパク質との間に自己切断性ペプチドを含む、請求項8に記載の融合タンパク質。
  9. I.請求項1および2に記載の、例えば配列番号2で示されるものもしくはタンパク質レベルで少なくとも80%の配列同一性を有するそのバリアントをなどのポリペプチドをコードすることができる配列番号1で示されるもの、または
    II.配列番号3~12で示されるものもしくはタンパク質レベルで少なくとも80%の配列同一性を有するそのバリアント等の、融合タンパク質、
    などの核酸配列。
  10. 請求項10に記載の核酸配列を含むベクター。
  11. 目的のトランスジーンも含む、請求項10に記載のベクター。
  12. 前記ベクターが標的細胞に形質導入するために使用される場合に、前記標的細胞が、請求項1に記載のポリペプチドとキメラ抗原受容体、T細胞受容体、もしくは免疫療法目的の別の受容体とを共発現するように、目的のトランスジーンが、キメラ抗原受容体、T細胞受容体、または養子細胞療法のための免疫療法用の別の受容体をコードする、請求項11に記載のベクター。
  13. 請求項1に記載のポリペプチドを発現する細胞。
  14. 請求項1に記載のポリペプチドとPOIを細胞表面で共発現する、請求項13に記載の細胞。
  15. 請求項10に記載の核酸配列を含む細胞。
  16. T細胞である、請求項13~16のいずれか1項に記載の細胞。
  17. 請求項10~12のいずれか1項に記載のベクターを細胞に形質導入またはトランスフェクトするステップを含む、請求項13~16のいずれか1項に記載の細胞を作成する方法。
  18. POIを発現する細胞を選択する方法であって、
    I.請求項10~12のいずれか1項に記載のベクターをトランスフェクトまたは形質導入した細胞の表面におけるPOIエピトープの発現を検出するステップ、および
    II.前記POIエピトープを発現していると分かった細胞を選択するステップ
    を含む、方法。
  19. POIを発現する細胞が富化された、精製された細胞の集団を調製する方法であって、請求項19に記載の方法を使用して、細胞の集団からPOIを発現する細胞を選択するステップを含む、方法。
  20. 組織または細胞のドナーから単離された細胞の集団に、ex vivoで、
    I.請求項10~12のいずれか1項に記載のベクターを、形質導入またはトランスフェクトするステップ、および
    II.請求項18に記載の方法によって、前記形質導入/トランスフェクトされた細胞の集団から前記POIを発現する細胞を選択するステップ
    を含む、請求項19に記載の方法。
  21. 請求項1に記載のポリペプチドを発現する細胞が富化された、したがって、POIを発現する細胞が富化された、細胞集団。
  22. 形質導入された細胞をin vivoにおいて追跡する方法であって、前記細胞の表面における請求項1に記載のポリペプチドの発現を検出するステップを含む、方法。
  23. 対象における疾患を処置する方法であって、請求項13~16のいずれか1項に記載の細胞または請求項21に記載の細胞集団を対象に投与するステップを含む、方法。
  24. I.請求項10~12のいずれか1項に記載のベクターを対象から単離した細胞の試料に形質導入またはトランスフェクトするステップ、および
    II.形質導入/トランスフェクトされた細胞を患者に返すステップ
    を含む、請求項24に記載の方法。
  25. がんを処置するための、請求項24に記載の方法。
  26. 疾患の処置および/または養子細胞移植における使用のための、請求項13~16のいずれか1項に記載の細胞または請求項21に記載の細胞集団。
  27. 請求項6に記載の腫瘍関連抗原結合性ドメインを含むCoStAR受容体であって、
    I.配列番号2で示されるもの、またはタンパク質レベルで少なくとも80%の配列同一性を有するそのバリアントなどの、完全長のヒトCD28を含むか、またはこれらからなる融合シグナル伝達ドメイン、および
    II.配列番号4で示されるもの、またはタンパク質レベルで少なくとも80%もしくは90%の配列同一性を有するそのバリアントなどの、ヒトCD137からの細胞内ドメイン
    と融合させた、CoStAR受容体。
  28. 請求項6に記載の腫瘍関連抗原結合性ドメインを含むCoStAR受容体であって、
    I.配列番号2で示されるもの、またはタンパク質レベルで少なくとも80%の配列同一性を有するそのバリアントなどの、完全長のヒトCD28を含むか、またはこれらからなる融合シグナル伝達ドメイン、および
    II.配列番号5で示されるもの、またはタンパク質レベルで少なくとも80%もしくは90%の配列同一性を有するそのバリアントなどの、ヒトCD134からの細胞内ドメイン
    と融合させた、CoStAR受容体。
  29. 請求項6に記載の腫瘍関連抗原結合性ドメインを含むCoStAR受容体であって、
    I.配列番号2で示されるもの、またはタンパク質レベルで少なくとも80%の配列同一性を有するそのバリアントなどの、完全長のヒトCD28を含むか、またはこれらからなる融合シグナル伝達ドメイン、および
    II.配列番号6で示されるもの、またはタンパク質レベルで少なくとも80%もしくは90%の配列同一性を有するそのバリアントなどの、ヒトCD2からのの細胞内ドメイン
    と融合させた、CoStAR受容体。
  30. 請求項6に記載の腫瘍関連抗原結合性ドメインを含むCoStAR受容体であって、
    I.配列番号2で示されるもの、またはタンパク質レベルで少なくとも80%の配列同一性を有するそのバリアントなどの、完全長のヒトCD28を含むか、またはこれらからなる融合シグナル伝達ドメイン、および
    II.配列番号7で示されるもの、またはタンパク質レベルで少なくとも80%もしくは90%の配列同一性を有するそのバリアントなどの、ヒトCD29からの細胞内ドメイン
    と融合させた、CoStAR受容体。
  31. 請求項6に記載の腫瘍関連抗原結合性ドメインを含むCoStAR受容体であって、
    I.配列番号2で示されるもの、またはタンパク質レベルで少なくとも80%の配列同一性を有するそのバリアントなどの、完全長のヒトCD28を含むか、またはこれらからなる融合シグナル伝達ドメイン、および
    II.配列番号8で示されるもの、またはタンパク質レベルで少なくとも80%もしくは90%の配列同一性を有するそのバリアントなどの、ヒトGITRからの細胞内ドメイン
    と融合させた、CoStAR受容体。
  32. 請求項6に記載の腫瘍関連抗原結合性ドメインを含むCoStAR受容体であって、
    I.配列番号2で示されるもの、またはタンパク質レベルで少なくとも80%の配列同一性を有するそのバリアントなどの、完全長のヒトCD28を含むか、またはこれらからなる融合シグナル伝達ドメイン、および
    II.配列番号9で示されるもの、またはタンパク質レベルで少なくとも80%もしくは90%の配列同一性を有するそのバリアントなどの、ヒトIL2Rγからの細胞内ドメイン
    と融合させた、CoStAR受容体。
  33. 請求項6に記載の腫瘍関連抗原結合性ドメインを含むCoStAR受容体であって、
    I.配列番号2で示されるもの、またはタンパク質レベルで少なくとも80%の配列同一性を有するそのバリアントなどの、完全長のヒトCD28を含むか、またはこれらからなる融合シグナル伝達ドメイン、および
    II.配列番号10で示されるもの、またはタンパク質レベルで少なくとも80%もしくは90%の配列同一性を有するそのバリアントなどの、ヒトCD40からの細胞内ドメイン
    と融合させた、CoStAR受容体。
  34. 請求項6に記載の腫瘍関連抗原結合性ドメインを含むCoStAR受容体であって、
    I.配列番号2で示されるもの、またはタンパク質レベルで少なくとも80%の配列同一性を有するそのバリアントなどの、完全長のヒトCD28を含むか、またはこれらからなる融合シグナル伝達ドメイン、および
    II.配列番号11で示されるもの、またはタンパク質レベルで少なくとも80%もしくは90%の配列同一性を有するそのバリアントなどの、ヒトCD150からの細胞内ドメイン
    と融合させた、CoStAR受容体。
  35. 請求項6に記載の腫瘍関連抗原結合性ドメインを含むCoStAR受容体であって、
    I.配列番号2で示されるもの、またはタンパク質レベルで少なくとも80%の配列同一性を有するそのバリアントなどの、完全長のヒトCD28を含むか、またはこれらからなる融合シグナル伝達ドメイン、および
    II.配列番号12で示されるもの、またはタンパク質レベルで少なくとも80%もしくは90%の配列同一性を有するそのバリアントなどの、ヒトCD2およびヒトCD40からの細胞内ドメイン
    と融合させた、CoStAR受容体。
JP2021541684A 2019-01-22 2020-01-20 養子細胞療法のための標的共刺激を提供する受容体 Pending JP2022518240A (ja)

Applications Claiming Priority (5)

Application Number Priority Date Filing Date Title
GB1900858.0 2019-01-22
GBGB1900858.0A GB201900858D0 (en) 2019-01-22 2019-01-22 Receptors providing targeted costimulation for adoptive cell therapy
US201962951770P 2019-12-20 2019-12-20
US62/951,770 2019-12-20
PCT/GB2020/050120 WO2020152451A1 (en) 2019-01-22 2020-01-20 Receptors providing targeted costimulation for adoptive cell therapy

Publications (1)

Publication Number Publication Date
JP2022518240A true JP2022518240A (ja) 2022-03-14

Family

ID=65655981

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP2021541684A Pending JP2022518240A (ja) 2019-01-22 2020-01-20 養子細胞療法のための標的共刺激を提供する受容体

Country Status (19)

Country Link
US (1) US20220160760A1 (ja)
EP (1) EP3914611A1 (ja)
JP (1) JP2022518240A (ja)
KR (1) KR20210118426A (ja)
CN (1) CN113423726A (ja)
AU (1) AU2020211375A1 (ja)
BR (1) BR112021014360A2 (ja)
CA (1) CA3126431A1 (ja)
CL (1) CL2021001746A1 (ja)
CO (1) CO2021009302A2 (ja)
CR (1) CR20210398A (ja)
EA (1) EA202192024A1 (ja)
EC (1) ECSP21052180A (ja)
GB (1) GB201900858D0 (ja)
IL (1) IL284422A (ja)
MX (1) MX2021008657A (ja)
PE (1) PE20211662A1 (ja)
SG (1) SG11202106787SA (ja)
WO (1) WO2020152451A1 (ja)

Families Citing this family (13)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
GB201700621D0 (en) 2017-01-13 2017-03-01 Guest Ryan Dominic Method,device and kit for the aseptic isolation,enrichment and stabilsation of cells from mammalian solid tissue
EP4077641A1 (en) 2019-12-20 2022-10-26 Instil Bio (Uk) Limited Devices and methods for isolating tumor infiltrating lymphocytes and uses thereof
US20230277670A1 (en) * 2020-07-17 2023-09-07 John Bridgeman Chimeric molecules providing targeted costimulation for adoptive cell therapy
KR20230088333A (ko) * 2020-07-17 2023-06-19 인스틸 바이오 유케이 리미티드 입양 세포 요법을 위한 표적화된 공동자극을 제공하는 수용체
WO2022036495A1 (en) 2020-08-17 2022-02-24 Utc Therapeutics Inc. Lymphocytes-antigen presenting cells co-stimulators and uses thereof
JP2023554425A (ja) 2020-12-18 2023-12-27 インスティル バイオ (ユーケイ) リミテッド 腫瘍浸潤リンパ球の処理
WO2022130015A2 (en) 2020-12-18 2022-06-23 Instil Bio (Uk) Limited Processing of tumor infiltrating lymphocytes
WO2022130016A1 (en) 2020-12-18 2022-06-23 Instil Bio (Uk) Limited Tumor infiltrating lymphocytes and anti-cd47 therapeutics
JP2024512029A (ja) 2021-03-25 2024-03-18 アイオバンス バイオセラピューティクス,インコーポレイテッド T細胞共培養効力アッセイのための方法及び組成物、ならびに細胞療法製品との使用
TW202306997A (zh) * 2021-06-16 2023-02-16 英商英斯特生物科技有限公司 用於在過繼細胞療法中提供標靶共刺激之受體
WO2023288278A1 (en) * 2021-07-16 2023-01-19 Instil Bio (Uk) Limited Chimeric molecules providing targeted costimulation for adoptive cell therapy
US20240058447A1 (en) * 2022-05-25 2024-02-22 Instil Bio (Uk) Limited Use of fusion constructs for il-2 independent t cell therapy
WO2024030758A1 (en) * 2022-08-01 2024-02-08 Iovance Biotherapeutics, Inc. Chimeric costimulatory receptors, chemokine receptors, and the use of same in cellular immunotherapies

Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2015179801A1 (en) * 2014-05-23 2015-11-26 University Of Florida Research Foundation, Inc. Car based immunotherapy
JP2018508219A (ja) * 2015-03-05 2018-03-29 フレッド ハッチンソン キャンサー リサーチ センター 免疫調節性融合タンパク質およびその使用
CN108948211A (zh) * 2018-07-24 2018-12-07 北京美康基免生物科技有限公司 一种基于gd2的嵌合抗原受体及其应用

Family Cites Families (27)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6352694B1 (en) 1994-06-03 2002-03-05 Genetics Institute, Inc. Methods for inducing a population of T cells to proliferate using agents which recognize TCR/CD3 and ligands which stimulate an accessory molecule on the surface of the T cells
US6534055B1 (en) 1988-11-23 2003-03-18 Genetics Institute, Inc. Methods for selectively stimulating proliferation of T cells
US5858358A (en) 1992-04-07 1999-01-12 The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Navy Methods for selectively stimulating proliferation of T cells
US6905680B2 (en) 1988-11-23 2005-06-14 Genetics Institute, Inc. Methods of treating HIV infected subjects
US5703055A (en) 1989-03-21 1997-12-30 Wisconsin Alumni Research Foundation Generation of antibodies through lipid mediated DNA delivery
US5399346A (en) 1989-06-14 1995-03-21 The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services Gene therapy
US7175843B2 (en) 1994-06-03 2007-02-13 Genetics Institute, Llc Methods for selectively stimulating proliferation of T cells
US6692964B1 (en) 1995-05-04 2004-02-17 The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Navy Methods for transfecting T cells
US7067318B2 (en) 1995-06-07 2006-06-27 The Regents Of The University Of Michigan Methods for transfecting T cells
AU1086501A (en) 1999-10-15 2001-04-30 Carnegie Institution Of Washington Rna interference pathway genes as tools for targeted genetic interference
US6326193B1 (en) 1999-11-05 2001-12-04 Cambria Biosciences, Llc Insect control agent
US6867041B2 (en) 2000-02-24 2005-03-15 Xcyte Therapies, Inc. Simultaneous stimulation and concentration of cells
AU4328801A (en) 2000-02-24 2001-09-03 Xcyte Therapies Inc Simultaneous stimulation and concentration of cells
US6797514B2 (en) 2000-02-24 2004-09-28 Xcyte Therapies, Inc. Simultaneous stimulation and concentration of cells
US7572631B2 (en) 2000-02-24 2009-08-11 Invitrogen Corporation Activation and expansion of T cells
WO2001096584A2 (en) 2000-06-12 2001-12-20 Akkadix Corporation Materials and methods for the control of nematodes
US7745140B2 (en) 2002-01-03 2010-06-29 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Activation and expansion of T-cells using an engineered multivalent signaling platform as a research tool
CA2568344C (en) 2004-05-27 2016-01-19 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Novel artificial antigen presenting cells and uses therefor
US20070036773A1 (en) 2005-08-09 2007-02-15 City Of Hope Generation and application of universal T cells for B-ALL
US9181527B2 (en) 2009-10-29 2015-11-10 The Trustees Of Dartmouth College T cell receptor-deficient T cell compositions
GB201513540D0 (en) * 2015-07-31 2015-09-16 King S College London Therapeutic agents
TWI788307B (zh) * 2016-10-31 2023-01-01 美商艾歐凡斯生物治療公司 用於擴增腫瘤浸潤性淋巴細胞之工程化人造抗原呈現細胞
US20210079061A1 (en) * 2018-02-26 2021-03-18 Fred Hutchinson Cancer Research Center Compositions and methods for cellular immunotherapy
CN108440674A (zh) * 2018-04-28 2018-08-24 杭州荣泽生物科技有限公司 一种Trop-2特异性嵌合抗原受体细胞制备及其用途
GB201910605D0 (en) * 2019-07-24 2019-09-04 Immetacyte Ltd Tumour infltracting lymphocyte therapy amd uses thereo
WO2021038036A1 (en) * 2019-08-28 2021-03-04 King's College London B CELL TARGETED PARALLEL CAR (pCAR) THERAPEUTIC AGENTS
KR20240037185A (ko) * 2021-04-19 2024-03-21 이오반스 바이오테라퓨틱스, 인크. 키메라 공동자극 수용체, 케모카인 수용체, 및 세포 면역치료에서의 이의 용도

Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2015179801A1 (en) * 2014-05-23 2015-11-26 University Of Florida Research Foundation, Inc. Car based immunotherapy
JP2018508219A (ja) * 2015-03-05 2018-03-29 フレッド ハッチンソン キャンサー リサーチ センター 免疫調節性融合タンパク質およびその使用
CN108948211A (zh) * 2018-07-24 2018-12-07 北京美康基免生物科技有限公司 一种基于gd2的嵌合抗原受体及其应用

Also Published As

Publication number Publication date
CO2021009302A2 (es) 2021-08-09
CA3126431A1 (en) 2020-07-30
EA202192024A1 (ru) 2021-12-20
BR112021014360A2 (pt) 2021-10-05
WO2020152451A1 (en) 2020-07-30
EP3914611A1 (en) 2021-12-01
SG11202106787SA (en) 2021-07-29
KR20210118426A (ko) 2021-09-30
CN113423726A (zh) 2021-09-21
ECSP21052180A (es) 2021-08-31
CL2021001746A1 (es) 2022-02-11
AU2020211375A1 (en) 2021-08-26
GB201900858D0 (en) 2019-03-13
CR20210398A (es) 2021-12-06
PE20211662A1 (es) 2021-08-26
US20220160760A1 (en) 2022-05-26
IL284422A (en) 2021-08-31
MX2021008657A (es) 2021-08-19

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US20220160760A1 (en) Receptors providing targeted costimulation for adoptive cell therapy
KR102483822B1 (ko) 태그된 키메라 이펙터 분자 및 그의 리셉터
JP2023518049A (ja) 新規な抗原結合ドメインおよびそれを組み込んだ合成抗原受容体
CN114761037A (zh) 结合bcma和cd19的嵌合抗原受体及其用途
JP2019536452A (ja) 融合タンパク質を用いたtcrの再プログラミングのための組成物及び方法
US20230002470A1 (en) Receptors providing targeted costimulation for adoptive cell therapy
JP2021524248A (ja) 修飾されたリンカードメインを有するキメラ抗原受容体およびその使用
US20230277670A1 (en) Chimeric molecules providing targeted costimulation for adoptive cell therapy
US20230055694A1 (en) Receptors providing targeted costimulation for adoptive cell therapy
US20230331808A1 (en) Chimeric molecules providing targeted costimulation for adoptive cell therapy
US20230227576A1 (en) Receptors providing targeted costimulation for adoptive cell therapy
WO2021259237A1 (en) GENETIC ENGINEERING OF γδ T CELLS FOR IMMUNOTHERAPY
US20240058447A1 (en) Use of fusion constructs for il-2 independent t cell therapy
WO2023109941A1 (en) Cell modification
WO2023141530A2 (en) Receptors providing targeted costimulation for adoptive cell therapy
TW202216751A (zh) 用於過繼細胞療法之提供靶向共刺激之受體
TW202216752A (zh) 用於過繼細胞療法之提供靶向共刺激之嵌合分子

Legal Events

Date Code Title Description
A621 Written request for application examination

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621

Effective date: 20230116

A131 Notification of reasons for refusal

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131

Effective date: 20231227

A977 Report on retrieval

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A971007

Effective date: 20231227

A601 Written request for extension of time

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601

Effective date: 20240322